Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 101838254 101839877 101838756 N NA NA NA NA NA NA DPH5 346892 2 chr1 103628197 103632591 103628574 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 435987 3 chr1 104040680 104041981 104041819 N NA RNPC3 NA NA NA NA RNPC3 26597 4 chr1 104805141 104806358 104805774 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 736563 5 chr1 106239093 106240962 106240615 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 1358305 6 chr1 1066212 1069133 1068105 N NA C1orf159 C1orf159,LOC254099,TNFRSF18,SDF4,TNFRSF4,TTLL10,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223,MIR200B,B3GALT6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf159 14476 7 chr1 106954397 106956150 106955131 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 643117 8 chr1 107223044 107225166 107224029 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 374101 9 chr1 107472055 107476777 107473272 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 122490 10 chr1 107520446 107523392 107522061 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 75875 11 chr1 10863010 10866857 10864604 Y NA CASZ1 PEX14,CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 6303 12 chr1 10873157 10876651 10875537 N NA CASZ1 PEX14,CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 16450 13 chr1 108890857 108896423 108891884 N NA NA NA NA NA NA SLC25A24 147883 14 chr1 109077712 109081156 109078217 N NA NA FAM102B MCF7 ChIA-PET 22265404 PRPF38B 153776 15 chr1 111390150 111391360 111390223 N NA NA NA NA NA NA LRIF1 115206 16 chr1 112747531 112748194 112747968 N NA NA NA NA NA NA CTTNBP2NL 190606 17 chr1 113304559 113311860 113305345 N NA NA FAM19A3,PPM1J,RHOC,LRIG2,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 RHOC 54534 18 chr1 113783214 113786123 113784734 N NA NA MAGI3 IMR90 Hi-C 24141950 MAGI3 147352 19 chr1 113796516 113799996 113798238 N NA NA MAGI3 IMR90 Hi-C 24141950 MAGI3 133479 20 chr1 114573959 114577792 114576521 N NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 HIPK1 101963 21 chr1 114909827 114910913 114910200 N NA NA NA NA NA NA TRIM33 142868 22 chr1 115331962 115335883 115332740 N NA CSDE1,SIKE1 NA NA NA NA SIKE1 8654 23 chr1 115640667 115644498 115642128 N NA NA SYCP1,CASQ2,TSPAN2 IMR90 Hi-C 24141950 SIKE1 317359 24 chr1 115918857 115921012 115919961 N NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 263562 25 chr1 116398140 116400808 116399139 N NA NA IGSF3,SLC22A15 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A15 118311 26 chr1 116718682 116723010 116721657 N NA NA CD58 IMR90 Hi-C 24141950 ATP1A1 192785 27 chr1 116736929 116738099 116737857 N NA NA NA NA NA NA ATP1A1 177696 28 chr1 116745010 116747318 116746104 N NA NA NA NA NA NA ATP1A1 168477 29 chr1 116867796 116870155 116869535 N NA ATP1A1 ATP1A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1A1 45640 30 chr1 116872133 116874238 116873166 N NA ATP1A1 ATP1A1,IGSF3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1A1 41557 31 chr1 117395222 117397502 117396520 N NA NA TTF2,PTGFRN MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 55187 32 chr1 117807739 117812962 117811678 N NA NA VTCN1,TTF2,TRIM45 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAN1A2 97123 33 chr1 118112812 118115246 118113830 N NA NA FAM46C,GDAP2,WDR3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAN1A2 202727 34 chr1 118133190 118135613 118134516 N NA NA GDAP2,MAN1A2,FAM46C IMR90 Hi-C 24141950 MAN1A2 223105 35 chr1 118319090 118322043 118320450 N NA NA NA NA NA NA GDAP2 150259 36 chr1 119056293 119059967 119057017 N NA NA NA NA NA NA WDR3 583921 37 chr1 120202338 120204331 120203086 N NA ZNF697 ZNF697 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF697 11948 38 chr1 120228816 120230835 120229700 N NA ZNF697,PHGDH ZNF697,LOC644242,PHGDH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHGDH 23584 39 chr1 120409627 120412023 120410984 N NA NA NBPF7 IMR90 Hi-C 24141950 PHGDH 155208 40 chr1 120747036 120834347 120834191,120762205 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 71687 41 chr1 121129844 121145002 121130316,121141914 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 223810 42 chr1 121350741 121360012 121351581,121358964 N,N NA;NA NA EMBP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIST2H2BA 444707 43 chr1 121478016 121485555 121478886,121484447 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 571982 44 chr1 12764786 12766693 12765626 N NA NA NA NA NA NA VPS13D 474673 45 chr1 13130802 13131988 13130980 N NA NA NA NA NA NA VPS13D 840689 46 chr1 13980537 13981394 13980883 N NA PRDM2 KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 45341 47 chr1 142535315 142537832 142535913 N NA NA NA NA NA NA LOC375010 175773 48 chr1 142780904 142892327 142781045,142792695,142826263,142891030,142854186,142880347 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC375010 67299 49 chr1 142966438 142967876 142967382 N NA NA NA NA NA NA LOC375010 252833 50 chr1 143117645 143292937 143209887,143145074,143121640,143287994,143275051 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC375010 404040 51 chr1 143370979 143468881 143422829 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 275706 52 chr1 143648010 143658904 143657603 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 85683 53 chr1 143672060 143677249 143673465 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 67338 54 chr1 144394515 144399817 144397608 N NA NA NA NA NA NA NBPF9 215142 55 chr1 144532435 144535378 144533844 Y PDE4DIP NA PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NBPF9 79581 56 chr1 145394784 145398394 145395622 N NA TXNIP PDE4DIP,SEC22B,HFE2,GNRHR2,LIX1L,RBM8A,PIAS3,POLR3C,NUDT17,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 40068 57 chr1 14578005 14655261 14605458,14578194 N,N NA;NA NA PDPN,KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 551270 58 chr1 145968287 145971726 145968456,145969538 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GPR89C 84419 59 chr1 145978907 145980153 145979206 N NA NA NA NA NA NA GPR89C 95039 60 chr1 145994995 146010166 146009170 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 72599 61 chr1 146214533 146239348 146239103 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 131768 62 chr1 146341598 146343886 146342948 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 258833 63 chr1 146372134 146400272 146373541,146374915,146378905 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA PRKAB2 243857 64 chr1 146555082 146560018 146556424 N NA NA CHD1L,LOC728989,PRKAB2,FMO5 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAB2 84111 65 chr1 146565645 146570943 146570187 N NA NA FMO5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAB2 73186 66 chr1 146792635 146800067 146799579,146793479 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CHD1L 78344 67 chr1 146820725 146824149 146823376 N NA NA NA NA NA NA CHD1L 106434 68 chr1 14691047 14739395 14691877 N NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 664312 69 chr1 147188142 147190630 147188921 N NA ACP6 ACP6,LOC100289211 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACP6 45508 70 chr1 147509948 147513551 147511284,147510682 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GPR89B 109442 71 chr1 147520524 147521859 147520939 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 102742 72 chr1 147660682 147662816 147661594 N NA NBPF24 NA NA NA NA NBPF24 36081 73 chr1 147734206 147737264 147735748 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 109605 74 chr1 147805135 147821158 147807049,147806426 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA FLJ39739 110822 75 chr1 147859573 147874565 147860969 N NA NA NA NA NA NA FLJ39739 57415 76 chr1 14823452 14875210 14824577,14826781 N,N NA;NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 796717 77 chr1 148239039 148242718 148241319 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 213191 78 chr1 148244940 148249410 148248329 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 219092 79 chr1 148330745 148333888 148331758 N NA NA NA NA NA NA NBPF15 224300 80 chr1 148340256 148357688 148356723 N NA NA NA NA NA NA NBPF15 200500 81 chr1 148539447 148550418 148549052 N NA NBPF15 NA NA NA NA NBPF15 7770 82 chr1 148849267 148863815 148857973 N NA NA NA NA NA NA LOC645166 64471 83 chr1 148892117 148900500 148892712 N NA LOC645166 NA NA NA NA LOC645166 27786 84 chr1 149193179 149195231 149194512 N NA NA NA NA NA NA LOC388692 84245 85 chr1 149210400 149211770 149210688 N NA NA NA NA NA NA LOC388692 67706 86 chr1 149222967 149226404 149224402 N NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC388692 53072 87 chr1 149414032 149416068 149415310 N NA HIST2H2BF NA NA NA NA HIST2H2BF 14803 88 chr1 149512974 149516592 149514395 N NA NA NA NA NA NA FAM91A2 59670 89 chr1 150877098 150878925 150877740 N NA ARNT,SETDB1 ARNT,GOLPH3L,SETDB1,CERS2,HORMAD1,ENSA,CTSK,FAM63A,CTSS,RPRD2 IMR90 Hi-C 24141950 SETDB1 19890 90 chr1 151459659 151463753 151459902 N NA POGZ,TUFT1 CGN,TDRKH,RORC,TUFT1,THEM5,ZNF687,PSMD4,PI4KB,SELENBP1,POGZ,SNX27,CELF3,RIIAD1,OAZ3,MRPL9,LOC100132111,C2CD4D,PIP5K1A IMR90,MCF7,HELA,GM12878,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 POGZ 27718 91 chr1 152015863 152022441 152020593 N NA S100A11 S100A11,THEM4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S100A11 6352 92 chr1 157309321 157317786 157310044 N NA NA NA NA NA NA ETV3 200938 93 chr1 158400552 158402656 158400942 N NA NA NA NA NA NA ETV3 1292169 94 chr1 158617 175984 174709 N NA NA NA NA NA NA WASH7P 129247 95 chr1 15926527 15930433 15929203 N NA DDI2 DDI2,TMEM82,PLEKHM2,SLC25A34,FBLIM1,DNAJC16,AGMAT IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 13520 96 chr1 15934573 15935623 15935519 N NA DDI2 DDI2,PLEKHM2,SLC25A34,TMEM82,DNAJC16,AGMAT,FBLIM1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 8330 97 chr1 160882476 160883848 160883228 N NA NA CD244,ITLN2 IMR90 Hi-C 24141950 F11R 107285 98 chr1 160942504 160944549 160943907 N NA F11R NA NA NA NA F11R 46584 99 chr1 161357829 161376042 161359926,161369355 Y,Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A;NA NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 73663 100 chr1 161377481 161392970 161391966,161377991,161383400 N,N,N NA;NA;NA NA APOA2,TOMM40L,NDUFS2 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 93315 101 chr1 161396891 161400805 161397971 N NA NA APOA2,TOMM40L,NDUFS2 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 112725 102 chr1 161449178 161451374 161450334 N NA NA DUSP12,FCGR2A,FCRLA,FCRLB,FCGR3A IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 165012 103 chr1 162899604 162902342 162900489 N NA NA RGS4,RGS5,NUF2 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B7 139108 104 chr1 165002438 165004587 165003496 N NA NA NA NA NA NA PBX1 473841 105 chr1 16501321 16504285 16502514 N NA NA CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBXO42 174663 106 chr1 165061599 165063084 165062069 N NA NA NA NA NA NA PBX1 533002 107 chr1 165566544 165569900 165567552 N NA MGST3 RXRG,LOC400794,UCK2,LOC440700,ALDH9A1,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 30210 108 chr1 165939514 165943874 165940227 N NA NA NA NA NA NA UCK2 142782 109 chr1 166456704 166460456 166459274 N NA NA NA NA NA NA POGK 348268 110 chr1 167128432 167149533 167132251,167130338,167135398 N,N,N NA;NA;NA POU2F1 CD247,POU2F1,GPA33,DUSP27 IMR90 Hi-C 24141950 POU2F1 40533 111 chr1 16839538 16843421 16840321,16840954 N,N NA;NA CROCCP3 NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC,CROCCP2,MST1P2,MIR3675,ESPNP,ARHGEF19,C1orf144,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCCP3 20342 112 chr1 16853155 16855451 16854349 N NA CROCCP3 CROCC,NBPF1,CROCCP2 IMR90 Hi-C 24141950 CROCCP3 33959 113 chr1 16858282 16862917 16861855,16859026 N,N NA;NA CROCCP3 NBPF1,ESPNP,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 CROCCP3 39086 114 chr1 168603078 168607663 168605603 N NA NA NME7 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D2 407823 115 chr1 168632900 168636648 168635274 N NA NA NA NA NA NA SFT2D2 437645 116 chr1 168720118 168724164 168721063 N NA NA ATP1B1,DPT MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP1B1 351783 117 chr1 169732309 169736746 169735324 N NA METTL18,C1orf112 NA NA NA NA METTL18 27285 118 chr1 17196440 17202645 17199071,17201899 N,N NA;NA CROCC CROCC,NBPF1,MST1P2,CROCCP2,ESPNP,MIR3675,MST1P9 IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 45800 119 chr1 17206437 17207823 17207188 N NA CROCC NBPF1,ESPNP,CROCC,MST1P2,CROCCP2 IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 40622 120 chr1 17211845 17217484 17216543 N NA CROCC NBPF1,CROCC,MST1P2,CROCCP3,CROCCP2,ESPNP,MIR3675 IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 30961 121 chr1 17219752 17223697 17222285,17222957 N,N NA;NA CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 24748 122 chr1 17229396 17233079 17231538 Y PADI4,PADI2 CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 15366 123 chr1 173100642 173101942 173100925 N NA NA TNFSF4,TNFSF18,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506023 344352 124 chr1 173655993 173657855 173657308 N NA KLHL20 PRDX6,SLC9A11,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL20 26225 125 chr1 173991707 173993650 173992907 N NA RC3H1 ZBTB37,RC3H1,GAS5 IMR90 Hi-C 24141950 RC3H1 29497 126 chr1 174070848 174072607 174071743 N NA NA RABGAP1L IMR90 Hi-C 24141950 RABGAP1L 55945 127 chr1 175012776 175017972 175014983,175016603 N,N NA;NA CACYBP,MRPS14 TNN IMR90 Hi-C 24141950 MRPS14 20185 128 chr1 176382087 176385873 176382314 N NA NA TNR,PAPPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RFWD2 205717 129 chr1 17821515 17823373 17821724 N NA ARHGEF10L ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF10L 42957 130 chr1 178625974 178628916 178626439 N NA NA RALGPS2,C1orf220 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALGPS2 65384 131 chr1 178989781 178992491 178991217 N NA FAM20B RALGPS2,C1orf220,FAM20B,RASAL2,C1orf49,ABL2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20B 2583 132 chr1 180499876 180500915 180500191 N NA ACBD6 MR1,XPR1,KIAA1614 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACBD6 27854 133 chr1 181103273 181107502 181104284 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 45635 134 chr1 181978959 181981116 181980387 N NA NA NA NA NA NA GLUL 380225 135 chr1 182195989 182198724 182197507 N NA NA NA NA NA NA GLUL 162617 136 chr1 182725181 182726770 182726231 N NA NPL RNASEL,LOC284648,RGS16,RGS8 IMR90 Hi-C 24141950 NPL 31814 137 chr1 184251727 184254747 184253339 N NA NA C1orf21,EDEM3 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf21 101403 138 chr1 184331030 184333295 184332220 N NA C1orf21 RGL1,C1orf21,GLT25D2,TSEN15 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf21 22855 139 chr1 184994521 184997952 184995178 N NA RNF2 EDEM3,FAM129A,RNF2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF2 16599 140 chr1 185492644 185494546 185493556 N NA NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 206183 141 chr1 186534596 186537106 186535812,186535892 N,N NA;NA NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 C1orf27 189706 142 chr1 186692575 186697085 186692884 N NA NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 C1orf27 347685 143 chr1 187525969 187527088 187526534 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1181079 144 chr1 187791932 187795423 187792354 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1447042 145 chr1 187806259 187808088 187807180 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1461369 146 chr1 188609914 188611339 188610793 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 2265024 147 chr1 18924502 18926969 18925841 N NA NA PAX7 IMR90 Hi-C 24141950 UBR4 609777 148 chr1 189723905 189730139 189724201 N NA NA NA NA NA NA UCHL5 3298384 149 chr1 191689688 191690847 191689875 N NA NA NA NA NA NA UCHL5 1337676 150 chr1 192215222 192218233 192216614 N NA NA NA NA NA NA UCHL5 810290 151 chr1 192906925 192910464 192908902 N NA NA RGS13,RGS2,UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 UCHL5 118059 152 chr1 19336479 19340068 19337549 N NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR4 196678 153 chr1 194004813 194007687 194005134 N NA NA NA NA NA NA CDC73 913725 154 chr1 194490113 194490394 194490270 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1399025 155 chr1 194927393 194927873 194927651 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1836305 156 chr1 197747267 197754276 197752777 N NA DENND1B NA NA NA NA DENND1B 2644 157 chr1 199869282 199872110 199870638 N NA NA NA NA NA NA ZNF281 507056 158 chr1 200436499 200439287 200438001 N NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 57333 159 chr1 200451185 200452225 200451886 N NA NA C1orf98,NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 72019 160 chr1 200456513 200457839 200456951 N NA NA C1orf98,NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 77347 161 chr1 201138106 201141207 201139961 Y NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 14474 162 chr1 201234103 201238001 201236045 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA IGFN1,PKP1,LAD1,TNNT2,TNNI1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 110471 163 chr1 20146613 20147890 20146994 N NA TMCO4 TMCO4,RNF186,OTUD3 IMR90 Hi-C 24141950 TMCO4 20203 164 chr1 202075642 202078705 202077086 N NA ARL8A NAV1,ARL8A,GPR37L1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARL8A 35166 165 chr1 203375604 203385324 203380958 N NA NA FMOD,BTG2,PRELP IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 100940 166 chr1 204019245 204020742 204019991 N NA SOX13 LINC00303 IMR90 Hi-C 24141950 SOX13 21504 167 chr1 204475096 204476891 204475941 N NA PIK3C2B,MDM4 PPP1R15B,MDM4,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MDM4 8616 168 chr1 20575095 20585202 20577298,20582124 N,N NA;NA NA VWA5B1,UBXN10,PLA2G2C,LOC339505,MUL1,CAMK2N1,PLA2G2A IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2N1 227526 169 chr1 206072608 206131048 206087142,206130885 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC41A1 290447 170 chr1 206490863 206507166 206491886 N NA SRGAP2 NA NA NA NA SRGAP2 9034 171 chr1 208110353 208112940 208111667 N NA NA CD34 IMR90 Hi-C 24141950 CD46 184970 172 chr1 208118845 208125847 208120246,208124258 N,N NA;NA NA CD34 IMR90 Hi-C 24141950 CD46 193462 173 chr1 208133589 208143562 208137041 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD46 208206 174 chr1 209314181 209316091 209315322 N NA NA NA NA NA NA C1orf74 641799 175 chr1 211320638 211322925 211322356 N NA NA HHAT IMR90 Hi-C 24141950 RCOR3 109783 176 chr1 211389156 211395139 211391034 N NA RCOR3 HHAT IMR90 Hi-C 24141950 RCOR3 37569 177 chr1 211685671 211690322 211688931 N NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61777 178 chr1 212320218 212324795 212320755,212324173 N,N NA;NA NA TMEM206,DTL,PPP2R5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INTS7 111216 179 chr1 212374580 212377154 212375622 N NA NA DTL,TMEM206 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5A 81725 180 chr1 212400951 212404033 212402340 N NA NA DTL,PPP2R5A,TMEM206 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5A 54846 181 chr1 212700947 212704396 212702723 N NA NA ATF3,FAM71A,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 94718 182 chr1 212727684 212734031 212732373 Y NA NA ATF3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 121455 183 chr1 213211311 213212325 213211670 N NA ANGEL2,RPS6KC1 ANGEL2,RPS6KC1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KC1 12263 184 chr1 2151767 2157932 2157211 N NA SKI SKI,MORN1,C1orf86 IMR90 Hi-C 24141950 SKI 2202 185 chr1 21745057 21760915 21754476 N NA NBPF3 RAP1GAP,ECE1,NBPF3,ALPL,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 NBPF3 5706 186 chr1 218743747 218745917 218744692 N NA NA LOC728463,RRP15,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 285118 187 chr1 218818457 218826460 218819817 N NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15,LYPLAL1,LOC643723 IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 359828 188 chr1 219726959 219730202 219729087 N NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 379767 189 chr1 219885220 219888588 219886824 N NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 EPRS 331412 190 chr1 220472644 220476286 220473946 N NA RAB3GAP2 RAB3GAP2,MARC2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB3GAP2 26801 191 chr1 220904415 220907292 220906108 N NA C1orf115,MARC2 C1orf115,MARC2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MARC2 14384 192 chr1 221376081 221378890 221377330 N NA NA HLX IMR90 Hi-C 24141950 MARC1 416042 193 chr1 222017682 222033807 222019422,222029835 N,N NA;NA NA MIA3,DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 102166 194 chr1 222471289 222528157 222524926 N NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1A 235118 195 chr1 222528740 222565538 222556096,222565154 N,N NA;NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1A 197737 196 chr1 222582192 222596624 222595979 N NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1A 166651 197 chr1 222637125 222640210 222638633 N NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1A 123065 198 chr1 22281748 22285835 22283756 N NA NA RAP1GAP,USP48,LDLRAD2,HSPG2,LINC00339,CDC42,CELA3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00339 65872 199 chr1 224049930 224058371 224052652 N NA TP53BP2 TP53BP2,CAPN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TP53BP2 16256 200 chr1 224070803 224073011 224072612 N NA TP53BP2 TP53BP2 IMR90 Hi-C 24141950 TP53BP2 37129 201 chr1 224134052 224151267 224150166 N NA NA NA NA NA NA TP53BP2 100378 202 chr1 224169835 224224703 224171470,224180388,224191634 N,Y,N NA;NA;NA NA NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 77088 203 chr1 224536222 224541919 224536856 N NA NVL,CNIH4 WDR26,CNIH4 IMR90 Hi-C 24141950 CNIH4 2676 204 chr1 224641316 224726612 224645312,224691611,224642156 N,N,N NA;NA;NA WDR26 WDR26,FBXO28,CNIH4,CNIH3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR26 19315 205 chr1 22541632 22542467 22541852 N NA NA ZBTB40,C1QB,EPHA8,WNT4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 162512 206 chr1 22581827 22586000 22584340 N NA NA WNT4,EPHA8,C1QB IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 192344 207 chr1 225892105 225923137 225916559,225893669,225922027,225899452,225910247 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA SRP9 ENAH,SRP9,TMEM63A,EPHX1,PYCR2 IMR90 Hi-C 24141950 SRP9 42378 208 chr1 226613996 226615108 226614644 N NA PARP1 NA NA NA NA PARP1 18195 209 chr1 226679949 226681508 226680934 N NA NA PARP1,C1orf95 IMR90 Hi-C 24141950 PARP1 84148 210 chr1 226970972 226973438 226971983 N NA ITPKB C1orf95,ITPKB,ADCK3,CDC42BPA IMR90 Hi-C 24141950 ITPKB 44096 211 chr1 227001959 227004101 227002952 Y NA NA ITPKB,C1orf95 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSEN2 54172 212 chr1 22739735 22742139 22740874 Y NA ZBTB40 CDC42,WNT4,C1QC,C1QA,ZBTB40,EPHB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 36205 213 chr1 227530741 227533986 227532089 N NA CDC42BPA CDC42BPA IMR90 Hi-C 24141950 CDC42BPA 24915 214 chr1 227537873 227540696 227539377 N NA CDC42BPA CDC42BPA IMR90 Hi-C 24141950 CDC42BPA 32047 215 chr1 227570100 227572141 227570913 N NA NA CDC42BPA IMR90 Hi-C 24141950 CDC42BPA 64274 216 chr1 227624136 227625698 227625234 N NA NA CDC42BPA,PSEN2,C1orf95,ITPKB,ADCK3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42BPA 118310 217 chr1 227671991 227677246 227675524 N NA NA LOC100130093 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF678 73974 218 chr1 227736811 227740014 227737871 N NA ZNF678 ZNF678 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF678 11206 219 chr1 228972928 228975105 228974027 Y RHOU NA RHOU,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 297860 220 chr1 229002253 229005428 229003430 N NA NA RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 327185 221 chr1 229038282 229040950 229039314 N NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 363214 222 chr1 229121656 229123557 229122558 N NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RAB4A 283322 223 chr1 229194023 229197346 229195152 N NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RAB4A 209533 224 chr1 229227342 229230832 229229525 Y RHOU NA RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RAB4A 176047 225 chr1 229315242 229330594 229317877,229330041 N,N NA;NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RAB4A 76285 226 chr1 229352186 229360553 229357610,229359575,229354474 Y,N,N RAB4A;NA;NA RAB4A RHOU,NUP133,C1orf96 IMR90 Hi-C 24141950 RAB4A 46326 227 chr1 229978117 229982193 229980759,229980160 N,N NA;NA NA GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 URB2 216136 228 chr1 230066382 230068452 230067028 N NA NA NA NA NA NA GALNT2 134504 229 chr1 232799598 232802647 232801217 N NA NA TSNAX-DISC1,PCNXL2,KIAA1383 IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 283723 230 chr1 232839697 232841748 232840792 N NA NA NA NA NA NA NTPCR 244622 231 chr1 232899079 232901886 232900736 N NA NA PCNXL2,TSNAX-DISC1,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 184484 232 chr1 234676948 234682686 234678335,234680293,234678349 N,Y,N NA;NA;NA NA LOC100506795,IRF2BP2 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TARBP1 62099 233 chr1 235028602 235031059 235030237 N NA NA LINC00184,IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 261197 234 chr1 235052744 235055242 235054205 N NA NA LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506810,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 237014 235 chr1 235093754 235100803 235097225,235099529 N,N NA;NA NA IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 191453 236 chr1 235109025 235112496 235110217 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 179760 237 chr1 235131664 235134990 235133226 Y NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 157266 238 chr1 235242094 235245003 235243204 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47253 239 chr1 236065472 236067456 236066551 N NA LYST NID1,ARID4B,LYST,B3GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35252 240 chr1 236551765 236554503 236552839 N NA NA NA NA NA NA ERO1LB 106426 241 chr1 237132952 237134399 237133773 N NA NA NA NA NA NA MTR 174371 242 chr1 238489262 238491203 238489902 N NA NA NA NA NA NA MTR 1530681 243 chr1 23908371 23909316 23909086 N NA ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 22086 244 chr1 23938926 23947320 23946162 N NA NA ASAP3,HNRNPR,ZNF436,E2F2,ID3,MDS2,RPL11 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 52641 245 chr1 239748913 239753584 239751171 N NA NA RYR2 IMR90 Hi-C 24141950 FH 1929501 246 chr1 240808873 240810129 240809571 N NA NA GREM2,FMN2 IMR90 Hi-C 24141950 FH 872956 247 chr1 241591950 241594779 241592114 N NA NA NA NA NA NA FH 88306 248 chr1 242103455 242105810 242104492 N NA NA EXO1 IMR90 Hi-C 24141950 FH 420370 249 chr1 24245785 24248387 24246673 N NA PNRC2 GALE,HMGCL,SRSF10,LOC100506963,PITHD1 K562 ChIA-PET 22265404 PNRC2 37914 250 chr1 244510730 244512635 244511537 N NA NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 102801 251 chr1 244973189 244976500 244975266 N NA COX20,HNRNPU-AS1 NA NA NA NA COX20 22139 252 chr1 24620356 24624092 24621486 N NA NA LOC284632,IL28RA,C1orf201,RCAN3,GRHL3,IL22RA1,NIPAL3,RCAN3AS,MYOM3,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 NIPAL3 118153 253 chr1 246860995 246866354 246862673 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 21024 254 chr1 247388673 247390500 247389281 N NA NA AHCTF1,ZNF670-ZNF695,ZNF669,ZNF496 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF124 53355 255 chr1 25030554 25036304 25034432,25032226 N,N NA;NA CLIC4 SRRM1,CLIC4,RUNX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 35456 256 chr1 25356620 25360589 25358905 N NA NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 198424 257 chr1 26419102 26421070 26420013 N NA NA PDIK1L,FAM110D,CATSPER4,CNKSR1,ZNF593,AIM1L,PAFAH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNKSR1 82911 258 chr1 26935744 26936739 26936275 N NA NA RPS6KA1,ARID1A,PIGV,SFN,ZDHHC18,GPATCH3,GPN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS6KA1 79495 259 chr1 26942357 26971546 26947546,26951762 Y,N SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1;NA NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 50976 260 chr1 27353559 27355772 27354859 N NA TRNP1 FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRNP1 33364 261 chr1 27391737 27393030 27392491 N NA NA WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,C1orf172,TRNP1,WASF2,FGR IMR90 Hi-C 24141950 TRNP1 71542 262 chr1 30323601 30325869 30324710 N NA NA PTPRU,MECR IMR90 Hi-C 24141950 PTPRU 760573 263 chr1 30680263 30683738 30680516,30682304 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100129196 507881 264 chr1 30931971 30937481 30934635 N NA NA NA NA NA NA LOC100129196 254138 265 chr1 31139791 31142128 31141053 N NA LOC100129196 NA NA NA NA LOC100129196 49491 266 chr1 31146765 31150587 31148890 N NA LOC100129196 NA NA NA NA LOC100129196 41032 267 chr1 31153145 31156455 31154740,31154772 N,N NA;NA LOC100129196 NA NA NA NA LOC100129196 35164 268 chr1 31295280 31311040 31297395 N NA NA LOC100129196,MATN1,SDC3,PUM1,LAPTM5,SNORD103A IMR90 Hi-C 24141950 SDC3 70440 269 chr1 31546368 31549932 31547372 N NA PUM1 PUM1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PUM1 7804 270 chr1 31585658 31587166 31586439 N NA PUM1 PUM1,NKAIN1,PRO0611 IMR90 Hi-C 24141950 PUM1 47094 271 chr1 31596520 31598442 31597048 N NA NA PRO0611,PUM1,NKAIN1,SNRNP40 IMR90 Hi-C 24141950 PUM1 57956 272 chr1 32911229 32913830 32911862 N NA NA ZBTB8A,ZBTB8B,RBBP4 IMR90 Hi-C 24141950 BSDC1 51167 273 chr1 33180527 33183885 33182469 Y KIAA1522 KIAA1522 SYNC,S100PBP,YARS,KIAA1522,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1522 23627 274 chr1 33436483 33441472 33439088 N NA NA NA NA NA NA AK2 61040 275 chr1 35515436 35516670 35516201 N NA ZMYM6,ZMYM1 NA NA NA NA ZMYM6 17867 276 chr1 36135003 36136172 36135298 N NA PSMB2 CLSPN,C1orf216,PSMB2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 27558 277 chr1 36954624 36956209 36955102 N NA OSCP1,MRPS15 CSF3R,MRPS15 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS15 24584 278 chr1 39112246 39114136 39113873 N NA NA NA NA NA NA RRAGC 211204 279 chr1 39190477 39192282 39191268 N NA NA NA NA NA NA RRAGC 133058 280 chr1 40489468 40491836 40490412 N NA CAP1 MFSD2A,TRIT1,CAP1,BMP8B,MYCL1,PPT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAP1 14419 281 chr1 41035627 41036618 41036331 N NA NA NA NA NA NA DEM1 61194 282 chr1 41803667 41808965 41807862 N NA NA NA NA NA NA SCMH1 95852 283 chr1 41825255 41856211 41853542,41826817 N,Y NA;NA NA EDN2 IMR90 Hi-C 24141950 EDN2 94133 284 chr1 42459405 42504150 42501693 N NA NA HIVEP3,CCDC30 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ3 297398 285 chr1 4287409 4289723 4288290 N NA NA NA NA NA NA LOC100133612 470441 286 chr1 44851482 44852476 44852351 N NA ERI3 RNF220,C1orf228,TMEM53 IMR90 Hi-C 24141950 ERI3 30543 287 chr1 46225841 46227784 46226811 N NA IPP,MAST2 GPBP1L1,TMEM69,IPP K562 ChIA-PET 22265404 IPP 9356 288 chr1 46229998 46232055 46230743 N NA IPP,MAST2 GPBP1L1,TMEM69 K562 ChIA-PET 22265404 IPP 13513 289 chr1 47221393 47224687 47223053 N NA KIAA0494 NA NA NA NA KIAA0494 36657 290 chr1 47410455 47412291 47411159 N NA NA NA NA NA NA KIAA0494 225719 291 chr1 48021836 48046484 48024615 N NA NA MGC12982,FOXD2,LOC388630 IMR90 Hi-C 24141950 CMPK1 222367 292 chr1 51494621 51497733 51495243 N NA NA FAF1 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 68685 293 chr1 51515638 51517228 51515829 N NA NA RNF11 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 89702 294 chr1 51521241 51521836 51521468 N NA NA FAF1 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 95305 295 chr1 52031084 52051415 52035601,52033558 Y,Y NA;NA EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL9 31131 296 chr1 53043727 53045170 53044076 N NA ZCCHC11 GPX7,ZCCHC11,ZFYVE9,FAM159A,ZYG11A,CC2D1B,ZYG11B,ORC1,BTF3L4,ECHDC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC11 24965 297 chr1 54919593 54920836 54920632 N NA SSBP3 TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 47501 298 chr1 54952141 54956106 54954098 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,TMEM59,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,C1orf177,YIPF1,HEATR8-TTC4,DIO1,HSPB11 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 80049 299 chr1 54974012 54974984 54974669 N NA NA TCEANC2,SSBP3,CDCP2,YIPF1,CYB5RL,MRPL37,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A,TTC22,PARS2 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 101920 300 chr1 56298399 56300373 56299350 N NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507634 617318 301 chr1 564287 570642 565661,568257,570298 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LINC00115 192260 302 chr1 57099059 57108260 57107901 N NA PRKAA2 USP24 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAA2 2730 303 chr1 58725094 58741862 58734811 N NA NA DAB1 IMR90 Hi-C 24141950 OMA1 270584 304 chr1 58898212 58899490 58899327 N NA NA DAB1,CYP2J2,OMA1,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 OMA1 112956 305 chr1 59083713 59087650 59085705 N NA NA TACSTD2,OMA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OMA1 71267 306 chr1 59398144 59401081 59398790 N NA NA FGGY,JUN,LOC100131060 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131060 147321 307 chr1 59448269 59449767 59448809 N NA NA FGGY,MIR4711,LOC100131060,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131060 197446 308 chr1 59534716 59538680 59536838 N NA NA MIR4711,FGGY,JUN,LOC100131060,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 223945 309 chr1 60432011 60434076 60432872 N NA CYP2J2 NA NA NA NA CYP2J2 39588 310 chr1 60968785 60971068 60970098 N NA NA NA NA NA NA NFIA 571878 311 chr1 60972623 60992555 60976594,60991437 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NFIA 550391 312 chr1 61016875 61124505 61087357,61105673,61038950 N,N,N NA;NA;NA NA C1orf87 IMR90 Hi-C 24141950 NFIA 418441 313 chr1 61330556 61331319 61330936 N NA NA INADL IMR90 Hi-C 24141950 NFIA 211627 314 chr1 61513614 61522364 61515767 N NA NFIA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 20582 315 chr1 62032752 62055422 62034915 N NA NA C1orf87,NFIA,INADL IMR90 Hi-C 24141950 TM2D1 135673 316 chr1 62098132 62109971 62102773,62106515,62108472 N,N,N NA;NA;NA NA INADL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM2D1 81124 317 chr1 63407050 63409333 63408197 N NA NA LINC00466 IMR90 Hi-C 24141950 ATG4C 157273 318 chr1 6769707 6770905 6769982 N NA DNAJC11 CAMTA1,DNAJC11 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC11 7741 319 chr1 67936496 67937716 67937306 N NA SERBP1 IL23R,IL12RB2,SERBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERBP1 40373 320 chr1 68037356 68061309 68038566,68054066 N,N NA;NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 89551 321 chr1 6827464 6828164 6828049 N NA NA DNAJC11,CAMTA1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC11 65498 322 chr1 69759902 69762006 69760944 N NA NA NA NA NA NA LRRC40 909355 323 chr1 69860371 69861937 69861525 N NA NA NA NA NA NA LRRC40 809424 324 chr1 71052355 71056136 71053896 N NA NA NA NA NA NA HHLA3 231862 325 chr1 71192434 71194218 71193055 N NA NA NA NA NA NA ZRANB2 352754 326 chr1 71216418 71221057 71217710 N NA NA NA NA NA NA ZRANB2 325915 327 chr1 72883846 72885465 72884839 N NA NA NA NA NA NA ZRANB2 1336874 328 chr1 73060062 73281561 73275555,73178283,73278726 N,N,N NA;NA;NA NA ZRANB2-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 ZRANB2 1513090 329 chr1 73294598 73365947 73364694 N NA NA NA NA NA NA ZRANB2 1747626 330 chr1 73381484 73405269 73381652 N NA NA NA NA NA NA TYW3 1793567 331 chr1 76414085 76415883 76414930 N NA NA NA NA NA NA RABGGTB 162199 332 chr1 77151886 77153878 77153252 N NA NA ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 531254 333 chr1 77165340 77166815 77165867 N NA NA ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 518317 334 chr1 78507453 78509079 78508107 N NA DNAJB4 NA NA NA NA DNAJB4 36817 335 chr1 78664500 78666266 78666028 N NA NA MGC27382,PTGFR IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB4 193864 336 chr1 78687155 78691132 78688195 N NA NA MGC27382 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB4 216519 337 chr1 79215150 79216697 79215909 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 99673 338 chr1 80672016 80673054 80672369 N NA NA NA NA NA NA IFI44 1556539 339 chr1 8117301 8120148 8118052 N NA ERRFI1 ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 30908 340 chr1 81184290 81185187 81184465 N NA NA NA NA NA NA IFI44 2068813 341 chr1 8129708 8132411 8130865 N NA ERRFI1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 43315 342 chr1 81404065 81411064 81405080 N NA NA NA NA NA NA IFI44 2288588 343 chr1 8142672 8143763 8142944 N NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 56279 344 chr1 82143299 82145562 82144678 N NA NA NA NA NA NA TTLL7 2319271 345 chr1 8228606 8231839 8229989 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 142213 346 chr1 8232666 8234418 8233224 N NA NA ERRFI1,SLC45A1,PARK7,RERE IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 146273 347 chr1 824130 825956 825030 N NA LOC100130417,SAMD11 NA NA NA NA LOC100130417 28861 348 chr1 8317902 8336638 8319641,8327288 N,N NA;NA NA PARK7,ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 231509 349 chr1 83597861 83604580 83598699 N NA NA NA NA NA NA TTLL7 860253 350 chr1 83638454 83649066 83647626 N NA NA NA NA NA NA TTLL7 815767 351 chr1 84485070 84488449 84485786 N NA TTLL7 NA NA NA NA TTLL7 20237 352 chr1 84517800 84524745 84518267 N NA PRKACB NA NA NA NA PRKACB 19000 353 chr1 84736357 84740350 84737815 N NA SAMD13 LPAR3,DNASE2B,UOX,SAMD13,SSX2IP IMR90 Hi-C 24141950 SAMD13 23699 354 chr1 85227138 85240209 85238310 N NA NA SSX2IP,GNG5,DNASE2B,TTLL7,UOX,MCOLN2,PRKACB,C1orf180,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 70898 355 chr1 85364604 85367030 85365940 N NA LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 5708 356 chr1 87258187 87259814 87258831 Y SH3GLB1 NA SEP15 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GLB1 87934 357 chr1 87295879 87297456 87296750 N NA NA NA NA NA NA SEP15 82651 358 chr1 88805267 88813022 88807623 N NA NA NA NA NA NA PKN2 336900 359 chr1 90695522 90696976 90696096 N NA NA NA NA NA NA ZNF326 234844 360 chr1 90840335 90842827 90841464 N NA NA NA NA NA NA ZNF326 379657 361 chr1 91263823 91268236 91267565 N NA NA NA NA NA NA ZNF644 219576 362 chr1 91281284 91319103 91317282 N NA NA BARHL2,ZNF644 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF644 168709 363 chr1 91344555 91358245 91356758 N NA NA NA NA NA NA ZNF644 129567 364 chr1 93268710 93271999 93270445 Y NA RPL5 EVI5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL5 25595 365 chr1 93518422 93518931 93518632 N NA MTF2 CCDC18,TMED5 IMR90 Hi-C 24141950 MTF2 25861 366 chr1 93889704 93891849 93890566 N NA FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 21839 367 chr1 94202290 94262354 94253421,94256350 N,N NA;NA NA BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2,FNBP1L,LOC100129046 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNTTIP2 82408 368 chr1 94716725 94723907 94718579 N NA ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 13418 369 chr1 94785659 94790802 94788648 N NA NA ARHGAP29,ABCA4,ABCD3,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 82352 370 chr1 9486408 9492486 9489097 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 107042 371 chr1 94870892 94873528 94872146 N NA ABCD3 ABCA4 IMR90 Hi-C 24141950 ABCD3 10405 372 chr1 95124273 95218851 95209647,95130146,95124511,95172945,95217023 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA F3,ABCD3,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCD3 240340 373 chr1 95559654 95563148 95561673 N NA ALG14,TMEM56-RWDD3 NA NA NA NA TMEM56-RWDD3 20331 374 chr1 95797012 95798677 95797403 N NA NA NA NA NA NA TMEM56-RWDD3 213533 375 chr1 96021761 96023881 96022719 N NA NA NA NA NA NA TMEM56-RWDD3 438282 376 chr1 96420101 96421832 96421195 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 765343 377 chr1 96501258 96504997 96503125 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 682178 378 chr1 96605848 96608467 96606108 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 578708 379 chr1 96912343 96914301 96913062 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 272874 380 chr1 96946633 96950628 96947794 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 236547 381 chr1 97016792 97019341 97018683 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 167834 382 chr1 97052718 97059308 97054235,97057500 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PTBP2 127867 383 chr1 97143906 97145210 97144704 N NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 41965 384 chr1 97330586 97332837 97331385 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 143411 385 chr10 100092219 100094270 100092871 N NA NA PYROXD2,HPS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PYROXD2 80708 386 chr10 101275884 101277702 101276502 N NA NA CNNM1,GOT1,SLC25A28 IMR90 Hi-C 24141950 GOT1 85354 387 chr10 101396667 101409281 101400408 N NA SLC25A28 ENTPD7,COX15 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A28 16446 388 chr10 102960903 102961757 102961577 N NA NA BTRC,C10orf76,POLL,DPCD,FLJ41350 IMR90 Hi-C 24141950 KAZALD1 139904 389 chr10 103025199 103026131 103025668 N NA NA NA NA NA NA BTRC 87694 390 chr10 103952953 103954927 103953885 N NA NOLC1 TMEM180,GBF1,PPRC1,ELOVL3,NOLC1,PITX3,CUEDC2,PSD,FBXL15,C10orf95,LOC100505761 IMR90 Hi-C 24141950 NOLC1 41020 391 chr10 105710303 105712705 105711848 N NA OBFC1,SLK SH3PXD2A,OBFC1,SLK,SFR1,WDR96,COL17A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLK 14765 392 chr10 106250986 106253047 106252577 N NA NA NA NA NA NA GSTO2 222355 393 chr10 109412454 109415199 109413806 N NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2268112 394 chr10 109672951 109673550 109673410 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2009761 395 chr10 110954834 110958267 110955439 N NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 725044 396 chr10 112189970 112194912 112190419,112193787 N,N NA;NA NA SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 125263 397 chr10 113555513 113557656 113556180 N NA NA NA NA NA NA GPAM 385881 398 chr10 113680301 113683757 113681868,113682515 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GPAM 259780 399 chr10 114119514 114123762 114122087 N NA NA GUCY2GP,ACSL5 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC6 82910 400 chr10 115273295 115274624 115274458 N NA NA NA NA NA NA DCLRE1A 339235 401 chr10 115717695 115719937 115718978 N NA NA ADRB1,NHLRC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NHLRC2 103304 402 chr10 116529181 116542056 116539782 N NA FAM160B1 ABLIM1,AFAP1L2,FAM160B1,ATRNL1,VWA2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160B1 39447 403 chr10 11685313 11686815 11685593 N NA USP6NL USP6NL,ECHDC3 IMR90 Hi-C 24141950 USP6NL 31634 404 chr10 119149808 119153656 119151484 N NA PDZD8 PDZD8 K562 ChIA-PET 22265404 PDZD8 14871 405 chr10 119704538 119706637 119705653 N NA NA NA NA NA NA RAB11FIP2 99477 406 chr10 120630562 120632404 120631824 N NA NA NA NA NA NA C10orf46 115804 407 chr10 121399456 121400715 121400570 N NA TIAL1,BAG3 BAG3,TIAL1,MCMBP,GRK5 IMR90 Hi-C 24141950 BAG3 10167 408 chr10 121462691 121463965 121463159 N NA NA INPP5F,MCMBP,SEC23IP IMR90 Hi-C 24141950 BAG3 51809 409 chr10 122011169 122015150 122012769 N NA NA NA NA NA NA SEC23IP 359084 410 chr10 122113391 122115197 122114480 N NA NA NA NA NA NA SEC23IP 461306 411 chr10 122704563 122707177 122705740 N NA NA ATE1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR11 93876 412 chr10 122829001 122831371 122830744 N NA NA FGFR2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR11 218314 413 chr10 12323632 12329106 12324898 N NA NA CDC123,CAMK1D,CCDC3,OPTN,LOC283070 IMR90 Hi-C 24141950 NUDT5 85489 414 chr10 123472387 123473694 123473293 N NA NA NA NA NA NA ATE1 213852 415 chr10 124962435 125022895 124963505 N NA BUB3 BUB3,GRB10,HMX2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,19890323,24141950 BUB3 48675 416 chr10 125863168 125866798 125865905 N NA NA CHST15 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LHPP 283543 417 chr10 127320538 127324096 127322282 N NA NA CTBP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 FLJ37035 83966 418 chr10 13099027 13100589 13099762 N NA OPTN CAMK1D,SEC61A2,NUDT5,CDC123,LOC283070,CCDC3 IMR90 Hi-C 24141950 OPTN 41493 419 chr10 131105152 131108186 131106336,131106653 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MGMT 157268 420 chr10 133810543 133819199 133811430 N NA BNIP3 BNIP3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 15108 421 chr10 133828332 133832577 133829328 N NA BNIP3 PPP2R2D,BNIP3 IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 32897 422 chr10 133858909 133863951 133862044 N NA NA BNIP3,JAKMIP3 IMR90 Hi-C 24141950 JAKMIP3 54362 423 chr10 134285918 134288483 134286351 N NA C10orf91 NA NA NA NA C10orf91 27204 424 chr10 135458693 135464279 135462705 N NA DUX4L2,DUX2 NA NA NA NA DUX4L2 19399 425 chr10 13574277 13578640 13574440 N NA NA BEND7,PRPF18 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF18 50299 426 chr10 15057293 15060471 15058840 N NA NA NA NA NA NA MEIG1 55855 427 chr10 15078937 15081167 15080045 N NA NA OLAH IMR90 Hi-C 24141950 RPP38 58015 428 chr10 15485268 15487279 15486353 N NA NA ITGA8,FAM188A IMR90 Hi-C 24141950 FAM171A1 72210 429 chr10 15957291 15964407 15957812 N NA NA NA NA NA NA FAM188A 54772 430 chr10 16291213 16293034 16292394 N NA NA NA NA NA NA PTER 185933 431 chr10 16341810 16343892 16342793 N NA NA NA NA NA NA PTER 135075 432 chr10 19015650 19016180 19015810 N NA NA NA NA NA NA ARL5B 67337 433 chr10 19375367 19384071 19377510 N NA NA NA NA NA NA ARL5B 427054 434 chr10 19753097 19754816 19754144 N NA NA NA NA NA NA PLXDC2 350556 435 chr10 19786556 19789620 19788230 N NA NA NA NA NA NA PLXDC2 315752 436 chr10 19890956 19893513 19891323 N NA NA NA NA NA NA PLXDC2 211859 437 chr10 19913387 19914019 19913706 N NA NA NA NA NA NA PLXDC2 191353 438 chr10 20819584 20821732 20821667 N NA NA NA NA NA NA NEBL 641384 439 chr10 21574682 21583921 21582005 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 111566 440 chr10 21616379 21619553 21617027 N NA NA C10orf140,MLLT10 IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 153263 441 chr10 21671269 21672276 21671434 N NA NA NA NA NA NA MLLT10 150825 442 chr10 22374832 22377511 22376292 N NA NA NA NA NA NA DNAJC1 82182 443 chr10 22412441 22420461 22412851 N NA NA NA NA NA NA DNAJC1 119791 444 chr10 22517326 22522371 22518411 N NA NA COMMD3-BMI1,LOC100499489,PIP4K2A,ARMC3,MSRB2,LOC100130992,DNAJC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3-BMI1 82941 445 chr10 23369152 23371420 23370569 N NA MSRB2 SPAG6,DNAJC1,MSRB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSRB2 13007 446 chr10 23524734 23526315 23525146 N NA NA KIAA1217 IMR90 Hi-C 24141950 MSRB2 140307 447 chr10 23765794 23767347 23766362 N NA OTUD1 NA NA NA NA OTUD1 37596 448 chr10 25393324 25395520 25394343 N NA NA ARHGAP21 IMR90 Hi-C 24141950 GPR158 68770 449 chr10 25938660 25974533 25971687,25955421,25940488 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA GPR158 474370 450 chr10 26907825 26909642 26908643 N NA NA NA NA NA NA PDSS1 76953 451 chr10 27253943 27261906 27260323 N NA NA NA NA NA NA ABI1 103927 452 chr10 28753035 28756112 28753788 N NA NA NA NA NA NA LOC220906 65171 453 chr10 28763636 28764594 28763957 N NA NA NA NA NA NA LOC220906 56689 454 chr10 29105455 29106232 29105764 N NA NA LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 139031 455 chr10 29187606 29188976 29188160 N NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 221182 456 chr10 29310964 29313494 29311618 N NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 344540 457 chr10 29392567 29397417 29395567 N NA NA BAMBI,WAC,LYZL1,LOC100507605 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC387647 301084 458 chr10 29411141 29412436 29411878 N NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 LOC387647 286065 459 chr10 3022529 3029754 3028444 N NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 79958 460 chr10 30380303 30381180 30380809 N NA NA KIAA1462,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 257087 461 chr10 30843169 30844666 30844605 N NA NA MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 120219 462 chr10 30871823 30873610 30872540 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA LOC729668 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 148873 463 chr10 31005240 31007042 31006243 N NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 282290 464 chr10 31093115 31095039 31093757 N NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 225827 465 chr10 31348858 31350272 31349116 N NA ZNF438 ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 27992 466 chr10 31890268 31893362 31892523 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 282244 467 chr10 32044141 32051347 32049177 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166423 468 chr10 32258000 32260903 32258933 N NA ARHGAP12 KIF5B,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 40230 469 chr10 32359123 32361155 32359877 N NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 13752 470 chr10 32402446 32404963 32403390 N NA NA NA NA NA NA KIF5B 57075 471 chr10 32459126 32462104 32460358 Y NA NA ARHGAP12,EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF5B 113755 472 chr10 32476501 32479474 32477393 N NA NA EPC1,KIF5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF5B 131130 473 chr10 32513661 32516140 32514056 N NA NA KIF5B,EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 119973 474 chr10 32640419 32669719 32650046,32666666,32668104,32654624 N,N,N,N NA;NA;NA;NA EPC1 EPC1,C10orf68 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPC1 4306 475 chr10 32731208 32847763 32735029,32788046,32800478,32842066,32834944 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA C10orf68 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPC1 95095 476 chr10 33267694 33274269 33269614 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 20401 477 chr10 33709878 33713898 33712232 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 86045 478 chr10 33765465 33769655 33767477 N NA NA NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 141632 479 chr10 33799549 33805921 33799758 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 175716 480 chr10 33977453 33986082 33978935 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 353620 481 chr10 34087210 34091121 34088482 N NA NA PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 463377 482 chr10 34233155 34235433 34234224 N NA NA NA NA NA NA NRP1 609322 483 chr10 35135604 35139200 35136510 N NA PARD3 CUL2,PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 PARD3 31351 484 chr10 35142021 35145849 35142712 N NA PARD3 CUL2,PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 PARD3 37768 485 chr10 3514215 3515644 3514885 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 299182 486 chr10 3523440 3525937 3524721 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 301536 487 chr10 35261730 35270139 35266979,35262929 N,N NA;NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 CUL2 109431 488 chr10 35391185 35393416 35391832 N NA CUL2,CREM CUL2,CCNY,CREM IMR90 Hi-C 24141950 CUL2 11615 489 chr10 3593888 3600424 3598625 N NA NA NA NA NA NA KLF6 227049 490 chr10 35978800 35982530 35979645 N NA NA NA NA NA NA CREM 563031 491 chr10 36928052 36929642 36928785 N NA NA FZD8,GJD4 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L7 962217 492 chr10 37076523 37077183 37076819 N NA NA FZD8,CCNY IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L7 814676 493 chr10 37106188 37107025 37106773 N NA NA FZD8,ACBD5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTRNR2L7 784834 494 chr10 37319613 37319909 37319801 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L7 571950 495 chr10 3790056 3790723 3790611 N NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 36750 496 chr10 3851429 3853355 3852503 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 23956 497 chr10 3892507 3897022 3895377 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 65034 498 chr10 39057360 39075956 39057525 N NA NA NA NA NA NA LOC399744 340286 499 chr10 42632873 42645803 42633964 N NA NA NA NA NA NA LOC84856 325136 500 chr10 42667407 42672622 42668345,42672233 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC84856 298317 501 chr10 42921337 42928181 42921461,42926917 N,N NA;NA LOC84856 NA NA NA NA LOC84856 42758 502 chr10 42930751 42932519 42931033 N NA LOC84856 NA NA NA NA LOC84856 38420 503 chr10 43264241 43266724 43265334 N NA BMS1 BMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMS1 11230 504 chr10 43847483 43850680 43849396 N NA NA HNRNPF,FXYD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPF 54016 505 chr10 44909852 44910978 44910245 N NA NA TMEM72-AS1,ZNF32-AS3 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA3P1 623987 506 chr10 45169515 45171001 45170778 N NA NA TMEM72-AS1,LOC100506835 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA3P1 883650 507 chr10 45247620 45250882 45248484 N NA NA ZNF32-AS3,ZNF32,TMEM72-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MARCH8 839472 508 chr10 45565571 45568637 45567355 N NA NA LOC338579,LOC100133308 IMR90 Hi-C 24141950 MARCH8 521717 509 chr10 45744355 45746543 45745429 N NA NA NA NA NA NA MARCH8 343811 510 chr10 45754779 45756541 45755619 N NA NA OR13A1 IMR90 Hi-C 24141950 MARCH8 333813 511 chr10 45824607 45829575 45825318 N NA NA NA NA NA NA MARCH8 260779 512 chr10 46192691 46200949 46193990 N NA FAM21C NA NA NA NA FAM21C 21699 513 chr10 46361613 46370824 46369162 N NA NA NA NA NA NA FAM21C 138965 514 chr10 47023016 47058370 47033306,47029897,47051872,47056885 N,N,N,N NA;NA;NA;NA GPRIN2 SYT15,GPRIN2,LOC643650,PPYR1,ANTXRL,ZNF488,RBP3 IMR90 Hi-C 24141950 GPRIN2 29470 515 chr10 47545543 47550646 47549377 N NA NA NA NA NA NA FAM21B 343377 516 chr10 47726997 47736474 47728082 N NA NA NA NA NA NA FAM21B 157549 517 chr10 49508007 49564123 49514564,49528300,49540916,49559488 N,N,N,N NA;NA;NA;NA MAPK8 FRMPD2,ARHGAP22,MAPK8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK8 45564 518 chr10 50757751 50760012 50758900 N NA ERCC6 ARHGAP22,VSTM4 IMR90 Hi-C 24141950 ERCC6 10604 519 chr10 51531192 51532644 51532101 N NA NCOA4 MSMB MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA4 32464 520 chr10 52037717 52038004 52037830 N NA NA SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM21A 210033 521 chr10 54578015 54588316 54579168 N NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1118660 522 chr10 54641627 54705403 54705256,54655038,54698433,54657171,54643906,54646970,54676356,54651377 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1182272 523 chr10 54783392 54845659 54789849,54784929 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1324037 524 chr10 54873392 54955140 54903960,54926751,54930009,54952446,54922841 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1414037 525 chr10 54959113 54998918 54996951,54976801,54964786,54985172,54992525 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1499758 526 chr10 55002195 55038087 55032970,55025324,55019095 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1542840 527 chr10 55064848 55076800 55067813,55074907,55072306 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1605493 528 chr10 55169373 55172614 55170842 N NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1710018 529 chr10 55236423 55242691 55241999,55238019 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1777068 530 chr10 55433090 55442131 55435967,55439737 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MTRNR2L5 1916619 531 chr10 55524020 55528841 55524186 N NA NA PCDH15 K562 5C 22955621 MTRNR2L5 1829909 532 chr10 5557579 5562055 5560234 N NA NA NET1,CALML5,CALML3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NET1 103061 533 chr10 5588234 5591085 5589617 N NA NA NA NA NA NA ASB13 117473 534 chr10 56828610 56832268 56829200 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L5 526482 535 chr10 57535057 57663671 57567646,57647661,57659603,57649630 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA MTRNR2L5 176307 536 chr10 58415887 58417462 58416176 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 294853 537 chr10 58930608 58931698 58931213 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 809574 538 chr10 59517214 59520872 59519778 N NA NA NA NA NA NA CISD1 507990 539 chr10 59607311 59610467 59609019 N NA NA NA NA NA NA CISD1 418395 540 chr10 59657290 59665902 59664997 N NA NA NA NA NA NA CISD1 362960 541 chr10 60221457 60223256 60221850 N NA NA NA NA NA NA TFAM 76281 542 chr10 60761758 60765132 60763128 N NA NA NA NA NA NA TFAM 616582 543 chr10 61167420 61174555 61167875 N NA NA NA NA NA NA SLC16A9 295094 544 chr10 61367089 61369717 61368667 N NA NA PHYHIPL,FAM13C,ANK3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A9 99932 545 chr10 62825411 62827790 62826546 N NA NA RHOBTB1 IMR90 Hi-C 24141950 ANK3 332127 546 chr10 62884185 62886129 62885116 N NA NA NA NA NA NA ANK3 390901 547 chr10 62938153 62940696 62939452 N NA NA C10orf107 IMR90 Hi-C 24141950 ANK3 444869 548 chr10 62959557 62960251 62959919 N NA NA NA NA NA NA ANK3 466273 549 chr10 63052888 63055819 63054438 N NA NA ARID5B,C10orf107,RHOBTB1,TMEM26 IMR90 Hi-C 24141950 ANK3 559604 550 chr10 63593620 63598508 63596722,63594587 N,N NA;NA NA RHOBTB1,C10orf107,ARID5B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID5B 62505 551 chr10 65423104 65709276 65666444,65564681,65424660,65525364,65663026,65691811,65472970,65595846,65468487,65463644,65442391,65432545,65611142 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA JMJD1C,LOC84989,NRBF2,REEP3,ZNF365 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 REEP3 141981 552 chr10 65793766 65881657 65793980,65831345,65824305 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA REEP3 512643 553 chr10 66220492 66221212 66220649 N NA NA NA NA NA NA REEP3 939369 554 chr10 66811004 66812829 66812330 N NA NA NA NA NA NA REEP3 1529881 555 chr10 67376078 67378451 67376499 N NA NA NA NA NA NA REEP3 2094955 556 chr10 69479605 69481928 69479925 N NA NA NA NA NA NA DNAJC12 116009 557 chr10 69521500 69525455 69524290 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 72482 558 chr10 69606885 69613976 69609333 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1,HERC4,MYPN K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DNAJC12 8948 559 chr10 71184276 71186912 71185775 N NA TSPAN15 TACR2,HK1,TSPAN15,COL13A1,NEUROG3,HKDC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TSPAN15 24314 560 chr10 72876868 72896507 72895011 N NA NA UNC5B,SLC29A3,CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 SLC29A3 182503 561 chr10 73619049 73622340 73620051 N NA PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3,SPOCK2,DNAJB12,ASCC1,ANAPC16 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 7967 562 chr10 73646208 73651558 73648654 N NA PSAP PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,CDH23,ASCC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 35126 563 chr10 73677825 73680046 73678454 N NA NA SPOCK2,ASCC1,PSAP,CHST3,ANAPC16,DNAJB12 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 66743 564 chr10 74060479 74063218 74061596 N NA DDIT4 ANAPC16,DDIT4 IMR90 Hi-C 24141950 DDIT4 26802 565 chr10 7474854 7476599 7475804 N NA NA PRKCQ IMR90 Hi-C 24141950 KIN 353391 566 chr10 76562567 76563658 76563215 N NA KAT6B ADK,KAT6B,DUSP13,DUPD1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6B 22513 567 chr10 77021558 77046892 77029353,77034776,77037399,77022606 N,N,N,N NA;NA;NA;NA COMTD1 COMTD1,ZNF503-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COMTD1 25788 568 chr10 77531093 77534181 77532000 N NA NA NA NA NA NA ZNF503 369580 569 chr10 77535684 77538910 77536564 N NA NA NA NA NA NA ZNF503 374171 570 chr10 80061122 80084126 80062391 N NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 267604 571 chr10 80166185 80170606 80166916 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 372667 572 chr10 80216799 80220669 80218671 N NA NA RPS24,ZMIZ1,POLR3A,LOC283050,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 423281 573 chr10 80240379 80249416 80241392 N NA NA ZMIZ1,LOC100132987,RPS24,LOC283050,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 446861 574 chr10 80287336 80290087 80288512 N NA NA RPS24,LOC283050,POLR3A,ZMIZ1,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 493818 575 chr10 80532653 80536749 80534241 N NA NA RPS24,LOC100132987,LOC283050,ZMIZ1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283050 290456 576 chr10 80550500 80551196 80550594 N NA NA RPS24,LOC283050,POLR3A,ZMIZ1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283050 276009 577 chr10 81724212 81748920 81725338,81741651 N,N NA;NA NA SFTPD,LOC100288974,MAT1A IMR90 Hi-C 24141950 FAM213A 89506 578 chr10 81769278 81773510 81772996 N NA NA NA NA NA NA FAM213A 64916 579 chr10 81884261 81885268 81884578 N NA FAM213A,LOC219347 PLAC9 IMR90 Hi-C 24141950 LOC219347 45312 580 chr10 82448162 82448846 82448614 N NA NA NA NA NA NA TSPAN14 234124 581 chr10 82799657 82802209 82801198 N NA NA NA NA NA NA TSPAN14 585619 582 chr10 83468926 83472844 83469705 N NA NA NA NA NA NA NRG3 162226 583 chr10 83494628 83499743 83495197 N NA NA NA NA NA NA NRG3 135327 584 chr10 84788645 84793144 84790916 N NA NA NA NA NA NA GHITM 1106041 585 chr10 84809887 84814773 84812478 N NA NA NA NA NA NA GHITM 1084412 586 chr10 84984854 85009484 84985786,84994547,84995908,85008301,84992043 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA GHITM 889701 587 chr10 85027247 85040845 85034074 N NA NA NA NA NA NA GHITM 858340 588 chr10 85068973 85086379 85070861 N NA NA NA NA NA NA GHITM 812806 589 chr10 85110271 85123056 85113033 N NA NA NA NA NA NA GHITM 776129 590 chr10 85132472 85136580 85134635 N NA NA NA NA NA NA GHITM 762605 591 chr10 85301345 85305517 85303230 N NA NA NA NA NA NA GHITM 593668 592 chr10 85336668 85337137 85336891 N NA NA NA NA NA NA GHITM 562048 593 chr10 85365108 85367510 85366323 N NA NA NA NA NA NA GHITM 531675 594 chr10 85463091 85465757 85464324 N NA NA NA NA NA NA GHITM 433428 595 chr10 85538198 85540977 85540961,85539335 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GHITM 358208 596 chr10 85629938 85633275 85631531 N NA NA NA NA NA NA GHITM 265910 597 chr10 85640049 85643238 85641642 N NA NA NA NA NA NA GHITM 255947 598 chr10 85643966 85645312 85644486 N NA NA NA NA NA NA GHITM 253873 599 chr10 85719006 85722887 85721004 N NA NA NA NA NA NA GHITM 176298 600 chr10 85799465 85801089 85800076 N NA NA NA NA NA NA GHITM 98096 601 chr10 87262068 87265014 87262669 N NA NA NA NA NA NA WAPAL 1016527 602 chr10 88158295 88165196 88160190 Y NA NA WAPAL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WAPAL 116345 603 chr10 88293856 88300298 88295343 N NA WAPAL WAPAL,OPN4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WAPAL 12315 604 chr10 89221177 89260941 89221745,89251932 N,N NA;NA MINPP1 NA NA NA NA MINPP1 3282 605 chr10 89891003 89893338 89891763 N NA NA PTEN,KLLN,RNLS IMR90 Hi-C 24141950 PTEN 267808 606 chr10 90861886 90900963 90898892 N NA NA CH25H,LIPA,FAS,STAMBPL1,MIR4679-2,MIR4679-1 IMR90 Hi-C 24141950 LIPA 110697 607 chr10 91132197 91135036 91133566 N NA NA LIPA,IFIT2,IFIT1B,IFIT1,IFIT5 IMR90 Hi-C 24141950 LIPA 120537 608 chr10 91847082 91847755 91847460 N NA NA NA NA NA NA PANK1 441753 609 chr10 92179917 92184638 92182270 N NA NA NA NA NA NA RPP30 447071 610 chr10 92372786 92403963 92402042,92400573 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RPP30 227746 611 chr10 92409763 92421585 92420944 N NA NA NA NA NA NA RPP30 210124 612 chr10 95729432 95731512 95731409 N NA PIPSL PIPSL,PLCE1,NOC3L,SLC35G1 IMR90 Hi-C 24141950 PIPSL 7760 613 chr10 96400221 96410134 96408705 N NA NA SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D12 238035 614 chr10 96930544 96935438 96933141 N NA NA SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2C9 232129 615 chr10 977867 991301 981698,978455 N,N NA;NA LARP4B,GTPBP4 DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI2-AS1,IDI1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTPBP4 43048 616 chr10 97877848 97885960 97879014 N NA LOC728558,ZNF518A LOC728558,CCNJ MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF518A 3512 617 chr11 100322502 100324192 100323007 N NA NA NA NA NA NA CNTN5 1430796 618 chr11 101057992 101059546 101058734 N NA NA NA NA NA NA YAP1 921646 619 chr11 101565723 101575348 101572914,101565987 N,N NA;NA NA NA NA NA NA YAP1 405844 620 chr11 102149206 102153225 102150745 N NA BIRC3 YAP1,BIRC2,MMP20,BIRC3,C11orf70,TMEM123,MMP7 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 34956 621 chr11 102182242 102185652 102183836 N NA BIRC3,BIRC2 YAP1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 2529 622 chr11 102337215 102339914 102338262 N NA TMEM123 BIRC2,TMEM123,MMP7,MMP20 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 13440 623 chr11 102347064 102348872 102347665 N NA TMEM123 TMEM123,MMP20,BIRC2,BIRC3,MMP7,MMP27 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM123 23289 624 chr11 103609346 103611383 103610103 N NA NA MIR4693 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC2H1 629186 625 chr11 1045285 1059370 1054497,1051292 N,N NA;NA NA AP2A2,MUC6,MUC2,MUC5B,MOB2 IMR90 Hi-C 24141950 AP2A2 119476 626 chr11 107020584 107024371 107022555 N NA NA NA NA NA NA CWF19L2 304201 627 chr11 107126518 107152680 107150795 N NA NA NA NA NA NA CWF19L2 175892 628 chr11 108475354 108479653 108477584 N NA EXPH5 EXPH5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXPH5 10980 629 chr11 108517301 108520440 108518990 N NA DDX10 ATM,ACAT1,NPAT IMR90 Hi-C 24141950 DDX10 15376 630 chr11 109046884 109054519 109048292 N NA NA NA NA NA NA DDX10 511068 631 chr11 10950269 10959711 10956209,10953044 N,N NA;NA NA EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC729013 70505 632 chr11 110175266 110178911 110176563 N NA RDX RDX,C11orf53 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RDX 7829 633 chr11 110231082 110234898 110233817,110231177 N,N NA;NA NA RDX MCF7 ChIA-PET 22265404 RDX 63645 634 chr11 110246973 110249964 110247947 N NA NA FDX1,RDX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FDX1 50697 635 chr11 111059167 111059735 111059419 N NA NA ARHGAP20,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf92 110804 636 chr11 112223068 112223848 112223387 N NA NA NA NA NA NA PTS 125980 637 chr11 112358043 112360663 112359181 N NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 PTS 260955 638 chr11 112444786 112446954 112445118 N NA NA NCAM1,BCO2,PTS IMR90 Hi-C 24141950 PTS 347698 639 chr11 112560801 112561559 112561242 N NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 PTS 463713 640 chr11 112751704 112753002 112752359 Y NCAM1 NA NA NA NA NA TTC12 432249 641 chr11 113904706 113908962 113907350 N NA ZBTB16 ZBTB16,HTR3A,NNMT IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB16 21469 642 chr11 113909678 113915065 113911714 N NA ZBTB16 ZBTB16,HTR3A,NNMT IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB16 15366 643 chr11 116060399 116065356 116064599 N NA NA CADM1,FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 578358 644 chr11 11711254 11718440 11713384 N NA NA GALNTL4 IMR90 Hi-C 24141950 GALNTL4 67693 645 chr11 11835333 11838061 11837139 N NA USP47 DKK3,USP47,EIF4G2,MICAL2,GALNTL4,MICALCL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP47 24909 646 chr11 118557064 118562865 118561009 N NA NA PHLDB1,TREH,DDX6,FOXR1,UPK2,BCL9L,MIR4492,CXCR5,RPS25,TRAPPC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX6 99107 647 chr11 118709443 118742234 118723471,118738955,118741004 N,N,Y NA;NA;MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6 DDX6,BCL9L DDX6,UPK2,FOXR1,TREH,PHLDB1,BCL9L,CXCR5,MIR4492,RPS25,SLC37A4,TRAPPC4,CCDC84,RPL23AP64 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCL9L 39379 648 chr11 121126971 121130626 121128858 N NA SC5DL SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 32762 649 chr11 1212680 1217764 1214775 N NA NA NA NA NA NA TOLLIP 113128 650 chr11 123140842 123143146 123141052 N NA NA CLMP,HSPA8 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 207941 651 chr11 124692832 124696280 124693815 N NA C11orf61 SIAE,SPA17,C11orf61 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf61 22533 652 chr11 125982261 125987186 125983627,125986107 Y,Y CDON;NA CDON HYLS1,CDON IMR90 Hi-C 24141950 CDON 49074 653 chr11 12648413 12649321 12648606 N NA TEAD1 TEAD1,MICALCL,PARVA IMR90 Hi-C 24141950 TEAD1 46648 654 chr11 129115389 129152606 129138545,129149499 N,N NA;NA NA ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 53296 655 chr11 129184811 129190115 129185877,129189231 Y,N NA;NA NA ARHGAP32,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 122718 656 chr11 129581936 129586270 129582774 N NA NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM45B 99471 657 chr11 129656510 129679814 129658366,129678263 N,N NA;NA TMEM45B NFRKB,TMEM45B,BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM45B 5927 658 chr11 129913709 129916494 129914040 N NA LINC00167,PRDM10,APLP2 PRDM10,LINC00167,APLP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APLP2 23222 659 chr11 129930552 129933232 129932123 N NA APLP2 APLP2,PRDM10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APLP2 6484 660 chr11 130379561 130381492 130380449 N NA NA ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB44 194954 661 chr11 130631596 130634190 130632811 N NA NA ADAMTS8,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 152192 662 chr11 13957501 13961154 13957851 N NA NA SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 FAR1 267295 663 chr11 1396975 1408511 1400100,1404474,1402090 N,Y,N NA;DUSP8,BRSK2;NA NA TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOLLIP 66083 664 chr11 15670838 15673824 15671968 N NA NA C11orf58,SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 757087 665 chr11 15728491 15731112 15729739 N NA NA SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 814740 666 chr11 15789725 15792067 15790936 N NA NA NA NA NA NA CYP2R1 875974 667 chr11 16643886 16650474 16648603 N NA NA SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 109674 668 chr11 17200642 17249419 17229598,17231591,17215027 N,N,N NA;NA;NA PIK3C2A,NUCB2 PIK3C2A,NUCB2,B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C2A 9288 669 chr11 17259464 17267400 17260722 N NA NUCB2 NUCB2,USH1C,B7H6,PIK3C2A IMR90 Hi-C 24141950 NUCB2 30886 670 chr11 18921332 18923082 18921957 N NA NA NA NA NA NA TMEM86A 200981 671 chr11 19000437 19001616 19001283 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC13 137076 672 chr11 20220058 20221176 20220403 N NA NA NA NA NA NA PRMT3 187900 673 chr11 20595147 20597445 20595586 N NA NA NA NA NA NA PRMT3 186071 674 chr11 21892771 21894590 21893503 N NA NA NA NA NA NA FANCF 752797 675 chr11 2222216 2235910 2234522,2223776 N,N NA;NA NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 CD81 162637 676 chr11 22932618 23030857 22943894,22950228,22946963,22972072,22998092,22941334 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LUZP2 IMR90 Hi-C 24141950 SVIP 81236 677 chr11 23043740 23055631 23046740 N NA NA NA NA NA NA SVIP 192358 678 chr11 23082888 23105065 23094470,23085757,23101061 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA SVIP 231506 679 chr11 23107631 23198603 23195212,23110367,23146641,23149083,23139902,23136267,23151222,23164758 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA SVIP 256249 680 chr11 23200082 23211288 23201578 N NA NA NA NA NA NA SVIP 348700 681 chr11 23214478 23242027 23215081,23218256,23233631 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA SVIP 363096 682 chr11 23246972 23282937 23249322 N NA NA NA NA NA NA SVIP 395590 683 chr11 23292283 23448211 23296525,23309932,23311396,23319726,23337825,23412699 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LUZP2 IMR90 Hi-C 24141950 SVIP 440901 684 chr11 23513515 23697563 23516107,23521093,23608645,23549805,23615888,23554845,23580732,23629868,23592457,23675721,23571474 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LUZP2 IMR90 Hi-C 24141950 SVIP 662133 685 chr11 23731611 23787922 23768631,23732196 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LUZP2 730594 686 chr11 23817335 24076773 23905948,23888365,24053551,23829573,23820511,23994750,23940686,23959198 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LUZP2 441743 687 chr11 24099357 24112903 24110554,24100625 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LUZP2 405613 688 chr11 24158393 24159153 24158679 N NA NA NA NA NA NA LUZP2 359363 689 chr11 24175116 24178971 24176334 N NA NA NA NA NA NA LUZP2 339545 690 chr11 24506665 24509749 24508243 N NA LUZP2 NA NA NA NA LUZP2 8767 691 chr11 25368236 25370129 25368508 N NA NA NA NA NA NA LUZP2 849720 692 chr11 25541282 25543880 25542498 N NA NA NA NA NA NA LUZP2 1022766 693 chr11 25544423 25552795 25545303,25550223 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LUZP2 1025907 694 chr11 25574242 25577739 25577615,25576188 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LUZP2 1055726 695 chr11 25653812 25658787 25654963 N NA NA NA NA NA NA LUZP2 1135296 696 chr11 25677878 25679251 25678074 N NA NA NA NA NA NA LUZP2 1159362 697 chr11 25753417 25756744 25756329 N NA NA LUZP2 IMR90 Hi-C 24141950 LUZP2 1234901 698 chr11 25787236 25790708 25788639 N NA NA NA NA NA NA LUZP2 1268720 699 chr11 25947600 25951208 25949814,25948375 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LUZP2 1429084 700 chr11 26037618 26038497 26037720 N NA NA NA NA NA NA LGR4 1455837 701 chr11 27222688 27224695 27223421 Y NA NA LGR4,LIN7C IMR90 Hi-C 24141950 LGR4 269639 702 chr11 28476631 28482979 28476803 N NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 346833 703 chr11 29726430 29728983 29727294 N NA NA NA NA NA NA C11orf46 615666 704 chr11 31169289 31170801 31170012 N NA NA NA NA NA NA DNAJC24 220576 705 chr11 32823347 32826000 32824586 N NA PRRG4 NA NA NA NA PRRG4 25481 706 chr11 32909780 32912789 32911118 N NA QSER1 QSER1 MCF7 ChIA-PET 22265404 QSER1 2003 707 chr11 33233353 33236236 33234045 N NA HIPK3 NA NA NA NA HIPK3 42932 708 chr11 34775854 34846539 34843355,34776006 N,N NA;NA NA EHF,APIP,PDHX,ELF5,CAT IMR90 Hi-C 24141950 PDHX 91138 709 chr11 3625724 3628861 3627625 N NA NA NA NA NA NA CHRNA10 63753 710 chr11 36960763 36961738 36961355 N NA NA NA NA NA NA TRAF6 428900 711 chr11 38150020 38214472 38185391,38213289 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TRAF6 1618157 712 chr11 38256366 38359874 38358653,38327560,38317068 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TRAF6 1724503 713 chr11 40348389 40352466 40350948 Y NA NA NA NA NA NA API5 2981039 714 chr11 40600636 40604781 40604171,40604232 N,N NA;NA NA NA NA NA NA API5 2728724 715 chr11 40732026 40758536 40756853 N NA NA NA NA NA NA API5 2574969 716 chr11 40772216 40788058 40787858 N NA NA NA NA NA NA API5 2545447 717 chr11 40799390 40816080 40810437,40815912 N,N NA;NA NA NA NA NA NA API5 2517425 718 chr11 40873544 40880389 40880064 N NA NA NA NA NA NA API5 2453116 719 chr11 40988208 41073231 41012740,41073058 N,N NA;NA NA NA NA NA NA API5 2260274 720 chr11 41104174 41121561 41120887,41115422,41107466 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA API5 2211944 721 chr11 41253045 41325164 41320458,41305190,41265994,41254464,41259178 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA API5 2008341 722 chr11 41326792 41522926 41482142,41486244,41463147,41422788,41519208,41327538,41469880 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA API5 1810579 723 chr11 41798104 41804502 41801159,41803048 N,N NA;NA NA NA NA NA NA API5 1529003 724 chr11 42009900 42010943 42010373 N NA NA NA NA NA NA API5 1322562 725 chr11 42054993 42058285 42056223 N NA NA NA NA NA NA API5 1275220 726 chr11 42068000 42071792 42069441 N NA NA NA NA NA NA API5 1261713 727 chr11 42074476 42077465 42076113 Y NA NA NA NA NA NA API5 1256040 728 chr11 4207637 4225294 4219473,4208579 N,N NA;NA NA OR52M1 IMR90 Hi-C 24141950 RRM1 91713 729 chr11 42281648 42285297 42283662 N NA NA NA NA NA NA API5 1048208 730 chr11 42340589 42343411 42341655 N NA NA NA NA NA NA API5 990094 731 chr11 42354827 42363785 42362481 N NA NA NA NA NA NA API5 969720 732 chr11 42386896 42390771 42389604 N NA NA NA NA NA NA API5 942734 733 chr11 4240985 4244157 4241570 N NA NA NA NA NA NA RRM1 125061 734 chr11 42447863 42456948 42450696 N NA NA NA NA NA NA API5 876557 735 chr11 42899117 42920909 42917849 N NA NA NA NA NA NA API5 412596 736 chr11 42967486 42975269 42972704 N NA NA NA NA NA NA API5 358236 737 chr11 43182042 43186494 43183615 N NA NA NA NA NA NA API5 147011 738 chr11 4337553 4339190 4337978 N NA NA NA NA NA NA TRIM21 75736 739 chr11 43543404 43545938 43544617 N NA NA NA NA NA NA HSD17B12 156205 740 chr11 45381933 45383295 45382271 N NA NA CHST1,PRDM11,EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 TP53I11 409325 741 chr11 45424479 45425642 45424875 N NA NA CHST1,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 CRY2 443027 742 chr11 45820684 45822008 45821214 N NA CRY2 NA NA NA NA CRY2 46661 743 chr11 46263373 46264640 46264001 N NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF21A 120388 744 chr11 4637972 4642839 4641090 N NA TRIM68 OR51L1,MMP26,OR52A5,OR52A1,TRIM5,TRIM22,OR51T1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM68 8483 745 chr11 4732950 4737072 4734656 N NA NA OR51E2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM68 103461 746 chr11 4759924 4764590 4762203 N NA NA OR51L1,MMP26,OR51E2,OR52J3 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM68 130435 747 chr11 47913736 47914927 47914819 N NA NUP160 PTPRJ IMR90 Hi-C 24141950 NUP160 43679 748 chr11 47937151 47939540 47938159 N NA NA PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 PTPRJ 62570 749 chr11 47967726 47970450 47968658 Y CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ PTPRJ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRJ 31660 750 chr11 48876841 48887281 48885896 N NA NA NA NA NA NA FOLH1 342941 751 chr11 49303960 49307811 49305031,49306554 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOLH1 73738 752 chr11 49454836 49456166 49455752 N NA NA NA NA NA NA FOLH1 224614 753 chr11 50216559 50217706 50217188 N NA NA NA NA NA NA FOLH1 986337 754 chr11 50658627 50675857 50660650 N NA NA NA NA NA NA FOLH1 1428405 755 chr11 51262962 51264608 51264077 N NA NA NA NA NA NA FOLH1 2032740 756 chr11 51568409 51576275 51569869 N NA NA NA NA NA NA FOLH1 2338187 757 chr11 51590051 51593518 51591263,51593386 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOLH1 2359829 758 chr11 54734824 54737807 54735578 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 2354606 759 chr11 54894037 54896523 54895792 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 2195890 760 chr11 55005674 55016527 55013540 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 2075886 761 chr11 55207326 55210087 55207648 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 1882326 762 chr11 55282566 55288818 55282729 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 1803595 763 chr11 56566608 56568365 56567216 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 524048 764 chr11 58425219 58430202 58427175 N NA NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 78632 765 chr11 58837820 58867296 58860708,58865655 N,N NA;NA LOC283194,FAM111A LOC283194,FAM111A,FAM111B IMR90 Hi-C 24141950 LOC283194 11895 766 chr11 59116799 59118257 59117611 N NA NA NA NA NA NA FAM111A 206481 767 chr11 5942180 5966231 5955276,5955188,5959655 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TRIM5 235841 768 chr11 60097029 60098613 60097985 N NA NA NA NA NA NA CCDC86 510816 769 chr11 6165599 6166758 6166162 N NA NA NA NA NA NA FAM160A2 89183 770 chr11 61878804 61882259 61880118 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 NA FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 143672 771 chr11 62093335 62095595 62094476 N NA NA ASRGL1,SCGB2A1,SCGB1D4,SCGB2A2 IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 218737 772 chr11 62691596 62693490 62692156 N NA NA NA NA NA NA SLC3A2 68112 773 chr11 62703380 62704557 62703582 N NA NA SLC22A8,SLC22A25,SLC22A6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC3A2 79896 774 chr11 64213904 64221046 64215356 N NA NA SLC22A12,NRXN2,SLC22A11,RASGRP2,PYGM IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 87279 775 chr11 64916156 64917009 64916914 N NA TM7SF2,ZNHIT2,MRPL49,FAU,SYVN1 SYVN1,CAPN1,SPDYC MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SYVN1 14153 776 chr11 66168353 66171007 66169126 N NA SLC29A2 SPTBN2,RIN1,BRMS1,RBM4B,B3GNT1,NPAS4,MRPL11 IMR90 Hi-C 24141950 SLC29A2 29062 777 chr11 67339508 67341149 67340275 N NA NDUFV1 LOC100130987,PITPNM1,AIP,CDK2AP2,CABP2,GSTP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV1 33174 778 chr11 67468781 67472119 67470125 N NA NA ALDH3B2,ACY3,NUDT8,TBX10 IMR90 Hi-C 24141950 NUDT8 71373 779 chr11 67525021 67526716 67525896 N NA FAM86C2P NA NA NA NA FAM86C2P 46091 780 chr11 69905939 69906902 69906094 N NA NA NA NA NA NA FADD 142367 781 chr11 70092992 70094725 70094010 N NA FADD,PPFIA1 PPFIA1,FADD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPFIA1 22081 782 chr11 70993883 71021770 70995410 N NA NA SHANK2,DHCR7,NADSYN1 IMR90 Hi-C 24141950 SHANK2 58075 783 chr11 71324502 71333037 71326321 N NA NA NA NA NA NA NADSYN1 160285 784 chr11 71408581 71426302 71409894 N NA NA NA NA NA NA FAM86C1 72255 785 chr11 7254423 7255513 7254623 N NA NA NA NA NA NA ZNF214 212837 786 chr11 73489209 73492333 73490683 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6584 787 chr11 74256184 74259572 74258038 Y KCNE3 NA KCNE3,P4HA3,LIPT2,PPME1,C2CD3,CHRDL2,RNF169,POLD3,PGM2L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIPT2 51429 788 chr11 75945774 75947696 75946741 N NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 144184 789 chr11 7755755 7759273 7756311 N NA NA NA NA NA NA PPFIBP2 220759 790 chr11 79210241 79210759 79210387 N NA NA ODZ4 IMR90 Hi-C 24141950 NARS2 924332 791 chr11 80468712 80470683 80469777 N NA NA NA NA NA NA NARS2 2182803 792 chr11 80536819 80540369 80539360 N NA NA NA NA NA NA RAB30 2242515 793 chr11 80541556 80543815 80542745 N NA NA NA NA NA NA RAB30 2239069 794 chr11 80631048 80634232 80632635 N NA NA NA NA NA NA RAB30 2148652 795 chr11 81865703 81867944 81866841 N NA NA NA NA NA NA RAB30 914940 796 chr11 85898761 85899846 85899107 N NA NA PICALM,CCDC83,SYTL2,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 55960 797 chr11 87408787 87415578 87409008 N NA NA GRM5 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 659901 798 chr11 89357095 89359850 89357295 N NA FOLH1B NA NA NA NA FOLH1B 32615 799 chr11 90015026 90017640 90015849 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 58494 800 chr11 90190737 90193549 90192390 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 234205 801 chr11 90524806 90527250 90525915 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 568274 802 chr11 90697765 90706906 90699379 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 741233 803 chr11 91756752 91762316 91760284 N NA NA NA NA NA NA SLC36A4 1168779 804 chr11 91889940 91893022 91891858 N NA NA NA NA NA NA SLC36A4 1038073 805 chr11 93377516 93379947 93378757 N NA KIAA1731 SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1731 14869 806 chr11 9348585 9350537 9349422 N NA TMEM41B TMEM41B,IPO7,DENND5A,ZNF143 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM41B 12270 807 chr11 9371815 9373087 9372961 N NA TMEM41B,IPO7 ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM41B,LOC644656 IMR90 Hi-C 24141950 IPO7 33082 808 chr11 93719308 93721061 93720053 N NA NA NA NA NA NA PANX1 141033 809 chr11 9383506 9387589 9384859,9386090 N,Y NA;ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 TMEM41B,IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 18580 810 chr11 93970562 93976042 93971752 N NA NA NA NA NA NA PANX1 108468 811 chr11 94440771 94443157 94441995 N NA NA PIWIL4 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD49 213618 812 chr11 94670482 94672787 94671740 N NA CWC15 PIWIL4 IMR90 Hi-C 24141950 CWC15 33989 813 chr11 94986254 94989364 94987654 Y NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 22008 814 chr11 95070803 95073740 95072484 N NA NA SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 SESN3 106557 815 chr11 95244490 95247158 95245957 N NA NA NA NA NA NA FAM76B 275796 816 chr11 95324005 95327740 95326525 N NA NA NA NA NA NA FAM76B 195214 817 chr11 95376836 95382499 95380453,95379493 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM76B 140455 818 chr11 95412529 95414589 95413918 N NA NA ENDOD1,SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 108365 819 chr11 95436084 95440647 95438138 N NA NA SESN3,SRSF8,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 82307 820 chr11 9585072 9592807 9590996,9587631 N,Y NA;DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 NA ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SWAP70 92821 821 chr11 96240036 96240755 96240175 N NA NA NA NA NA NA JRKL 116878 822 chr11 96456664 96458395 96457319 N NA NA NA NA NA NA JRKL 333506 823 chr11 96768444 96769177 96768974 N NA NA NA NA NA NA JRKL 645286 824 chr11 97258811 97261127 97260027 N NA NA NA NA NA NA JRKL 1135653 825 chr11 98089079 98109070 98090312 N NA NA NA NA NA NA CNTN5 782636 826 chr11 98118775 98146314 98119178 N NA NA NA NA NA NA CNTN5 745392 827 chr11 98705742 98710051 98706828 N NA NA NA NA NA NA CNTN5 181655 828 chr12 102895748 102899328 102897434 N NA NA PARPBP,IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NUP37 383387 829 chr12 103136521 103138194 103136914 N NA NA NA NA NA NA NUP37 624160 830 chr12 106090777 106091357 106090940 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 APPL2 460769 831 chr12 1062319 1083067 1080986 N NA RAD52,ERC1 RAD52,ERC1,LOC100292680,NINJ2,B4GALNT3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAD52 3456 832 chr12 108354446 108357031 108354843 N NA NA CMKLR1,WSCD2 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM4 199532 833 chr12 110118719 110122005 110120353 N NA NA MGC14436,C12orf34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MVK 107219 834 chr12 111207956 111208902 111208327 N NA PPP1CC CUX2,PPP1CC IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CC 27173 835 chr12 111428304 111430222 111429020 N NA NA CUX2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CC 247521 836 chr12 111826117 111834411 111826649 N NA FAM109A,SH2B3 ATXN2,SH2B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH2B3 9341 837 chr12 113784783 113786672 113785887 N NA SLC24A6,PLBD2 NA NA NA NA PLBD2 9699 838 chr12 115013826 115014948 115014533 N NA NA NA NA NA NA TBX3 107021 839 chr12 115168997 115201566 115169702 N NA TBX3 TBX3,MED13L IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 47028 840 chr12 115248884 115261918 115260327,115250932 N,N NA;NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 126915 841 chr12 115347397 115354118 115349218,115352243 N,N NA;NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 225428 842 chr12 115429892 115432753 115431302 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 307923 843 chr12 115436834 115439549 115437884 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 314865 844 chr12 115441190 115444055 115442437 N NA NA NA NA NA NA TBX3 319221 845 chr12 115631134 115634748 115632858 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 509165 846 chr12 115705227 115710381 115707081 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 583258 847 chr12 115722152 115724615 115723004 N NA NA NA NA NA NA TBX3 600183 848 chr12 115783006 115837433 115803292,115836322,115821913,115832802 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 661037 849 chr12 115887569 115892536 115889709 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 765600 850 chr12 115989418 116213419 116106016,116064172,116045098,116151526,116154382,116195051,116202113,116211951,116119484,116178597 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TBX3,RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 501572 851 chr12 116254029 116256705 116255412 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 458286 852 chr12 116266729 116269244 116267981 N NA NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 445747 853 chr12 116308691 116312666 116310801 N NA NA RBM19,TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 402325 854 chr12 117094533 117107664 117102501,117097070 N,N NA;NA NA MED13L,LINC00173,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf49 68179 855 chr12 11758214 11760216 11758521 N NA ETV6 ETV6 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 42572 856 chr12 117844057 117848078 117846201 N NA NA NA NA NA NA FBXO21 215757 857 chr12 119034845 119036188 119035748 N NA NA NA NA NA NA SUDS3 220487 858 chr12 119047965 119050055 119049316 N NA NA TMEM233 IMR90 Hi-C 24141950 SUDS3 233607 859 chr12 120333595 120334987 120334590 N NA NA NA NA NA NA CCDC64 92661 860 chr12 120409962 120413236 120412127 N NA CCDC64 CIT IMR90 Hi-C 24141950 CCDC64 14412 861 chr12 120728480 120732165 120729822,120730486 N,N NA;NA PXN PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PXN 24906 862 chr12 120831216 120833943 120832458 N NA COX6A1 SIRT4,PLA2G1B,MSI1,SRSF9,TRIAP1,DYNLL1,GATC,COX6A1 IMR90 Hi-C 24141950 COX6A1 41950 863 chr12 122122850 122126615 122124908 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B,RHOF K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 24043 864 chr12 12442008 12442813 12442449 N NA LRP6 NA NA NA NA LRP6 22197 865 chr12 125128176 125129701 125129053 N NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 76166 866 chr12 125203248 125206174 125205125 N NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 142345 867 chr12 125405281 125407495 125406277 N NA UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 5694 868 chr12 125540223 125543132 125541174 N NA AACS AACS,DHX37,BRI3BP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AACS 6793 869 chr12 125703189 125704337 125703352 N NA NA TMEM132B IMR90 Hi-C 24141950 AACS 153264 870 chr12 126296368 126298948 126297711 N NA NA NA NA NA NA AACS 746443 871 chr12 126783038 126789980 126783593 N NA NA NA NA NA NA AACS 1233113 872 chr12 127079351 127081506 127080314 N NA NA NA NA NA NA AACS 1529426 873 chr12 12736482 12741878 12740341 N NA DUSP16,CREBL2 LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2,APOLD1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP16 21034 874 chr12 127385526 127387093 127386586 N NA NA NA NA NA NA AACS 1835601 875 chr12 127485953 127587854 127533030,127502578,127498280,127544714,127579082,127561580 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TMEM132C IMR90 Hi-C 24141950 SLC15A4 1720687 876 chr12 127598652 127608911 127599844,127602948 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC15A4 1699630 877 chr12 127628119 127650519 127628275,127646929,127650399,127641570 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA SLC15A4 1658022 878 chr12 13024159 13025631 13024881 N NA NA NA NA NA NA DDX47 57879 879 chr12 131939571 131946844 131941491 Y NA NA NA NA NA NA SFSWAP 248791 880 chr12 13279778 13281879 13280549 N NA NA EMP1,GSG1 IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 126402 881 chr12 13287210 13289988 13288756 N NA NA EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HTR7P1 133834 882 chr12 133013832 133028778 133022752 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 GALNT9,EP400NL,POLE,P2RX2,LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 38379 883 chr12 133045446 133047503 133046635 N NA FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90 Hi-C 24141950 FBRSL1 19654 884 chr12 13541904 13543466 13542109 N NA NA NA NA NA NA HTR7P1 388528 885 chr12 1713825 1719057 1715114 N NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 10494 886 chr12 17228556 17229336 17228732 N NA NA NA NA NA NA DERA 1164370 887 chr12 17947623 17948763 17947885 N NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 1333863 888 chr12 18052291 18059381 18053307 N NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 1223245 889 chr12 18113412 18116768 18114038 N NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 1165858 890 chr12 20135343 20138180 20136675 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 542735 891 chr12 20506277 20507111 20506883 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 913669 892 chr12 21133603 21135693 21134696 N NA NA NA NA NA NA PYROXD1 454845 893 chr12 21886237 21888506 21887074 N NA NA NA NA NA NA LDHB 75448 894 chr12 22322286 22323561 22323444 N NA NA NA NA NA NA CMAS 123127 895 chr12 25121347 25123697 25122379 N NA NA NA NA NA NA LYRM5 224453 896 chr12 25536186 25540143 25539209 Y NA NA BCAT1,CASC1,KRAS,LYRM5,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 132332 897 chr12 26426032 26429269 26427327 N NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 ASUN 661985 898 chr12 28025986 28028342 28026910 N NA NA NA NA NA NA KLHDC5 92799 899 chr12 28057887 28062309 28060409 N NA NA CCDC91,PTHLH,KLHDC5,MRPS35,MANSC4 IMR90 Hi-C 24141950 KLHDC5 124700 900 chr12 30659308 30708911 30673119,30707486,30693732 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA IPO8 140018 901 chr12 31002406 31004114 31002683 N NA NA TSPAN11 IMR90 Hi-C 24141950 CAPRIN2 94958 902 chr12 31042521 31048225 31042671 N NA NA TSPAN11,LOC100506660 IMR90 Hi-C 24141950 CAPRIN2 135073 903 chr12 31765351 31771191 31769681 N NA NA DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 H3F3C 173984 904 chr12 31900343 31904872 31902292 Y C12orf35,AMN1,H3F3C H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 H3F3C 40303 905 chr12 31982114 31983573 31983472 N NA H3F3C NA NA NA NA H3F3C 36939 906 chr12 33770122 33772360 33771188 N NA NA NA NA NA NA ALG10 402856 907 chr12 34262602 34265241 34263581 N NA NA NA NA NA NA ALG10 87386 908 chr12 34358413 34372383 34361730,34364962,34371735 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ALG10 183197 909 chr12 34404579 34410258 34406931 N NA NA NA NA NA NA ALG10 229363 910 chr12 34414326 34416831 34415393 N NA NA NA NA NA NA ALG10 239110 911 chr12 34473202 34550866 34499778,34503791 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ALG10 297986 912 chr12 3454027 3454990 3454040 N NA NA PRMT8,EFCAB4B IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN9 267506 913 chr12 34583837 34586002 34584878 N NA NA NA NA NA NA ALG10 408621 914 chr12 34680943 34683543 34682893 N NA NA NA NA NA NA ALG10 505727 915 chr12 34843401 34847391 34845595 N NA NA NA NA NA NA ALG10 668185 916 chr12 37940375 37943473 37941603 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 767084 917 chr12 38027106 38029393 38028258 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 681164 918 chr12 38065911 38074040 38067844 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 636517 919 chr12 38205208 38210128 38207536 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 500429 920 chr12 38479607 38481084 38480523 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 229473 921 chr12 38526434 38534239 38530537,38532431 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ALG10B 176318 922 chr12 38599403 38602272 38600427 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 108285 923 chr12 3876795 3892389 3891503 N NA NA EFCAB4B,PRMT8 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 90219 924 chr12 39528627 39529392 39529280 N NA NA NA NA NA NA KIF21A 307800 925 chr12 3987045 3989090 3988239 N NA PARP11 PARP11,CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 4437 926 chr12 4138605 4143468 4140690 Y CCND2,PARP11 NA CCND2,PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 155997 927 chr12 42064953 42072505 42066717 N NA NA NA NA NA NA GXYLT1 466168 928 chr12 46542109 46545526 46543416 N NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A1 117682 929 chr12 46805677 47012197 46805837,46970857,46825016,46809005,46867641 N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;NA SLC38A2 SLC38A4,SLC38A2,SLC38A1,AMIGO2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 39032 930 chr12 47726895 47729473 47728070 N NA NA NA NA NA NA RPAP3 370371 931 chr12 47763122 47765598 47764422 N NA NA AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 334246 932 chr12 48413409 48416636 48414229 N NA NA TMEM106C,SENP1,PFKM,C12orf68,COL2A1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM106C 56079 933 chr12 49285554 49287330 49285846 N NA DDX23,FKBP11 DDX23,CACNB3,RND1,DDN,PRKAG1,CCDC65,FKBP11,WNT10B,MLL2,WNT1,ARF3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FKBP11 32000 934 chr12 49608237 49610142 49608954 N NA TUBA1A,TUBA1C TUBA1C,TUBA1A,MLL2,TUBA1B,RHEBL1,LMBR1L,DHH,PRPH,KCNH3,FAM186B,MCRS1,FMNL3,TMBIM6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 25376 935 chr12 49623431 49630261 49628403 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1A,TUBA1C RHEBL1,DHH,LMBR1L,TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 28604 936 chr12 51804219 51806258 51805021 N NA NA GALNT6 IMR90 Hi-C 24141950 DAZAP2 171711 937 chr12 5215051 5450376 5225756,5277141,5359799,5231659,5393757,5400394 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NTF3,ANO2,VWF,KCNA6 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA9 456787 938 chr12 52518949 52525968 52520399,52524333 N,N NA;NA NA NR4A1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf44 55191 939 chr12 53375138 53376883 53375393 N NA KRT18,KRT8,EIF4B KRT8,EIF4B,KRT84,KRT85,LOC283335,TENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF4B 23179 940 chr12 53391427 53393405 53391656 N NA KRT18,KRT8,EIF4B EIF4B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 EIF4B 6657 941 chr12 53735824 53739864 53738898 N NA PFDN5,C12orf10,AAAS,SP1 ESPL1,PFDN5,C12orf10,AAAS,CSAD,RARG,MFSD5,SP7,SP1,AMHR2,PCBP2,PRR13,ATF7,NPFF,TARBP2,MAP3K12,LOC100652999 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AAAS 20412 942 chr12 54147550 54150658 54148873 N NA CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 26243 943 chr12 54197352 54199965 54198364 N NA NA HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 76045 944 chr12 55116940 55117861 55117283 N NA NA KIAA0748 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 303890 945 chr12 55155260 55157507 55156409 N NA NA KIAA0748 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 342210 946 chr12 55285001 55287003 55286080 N NA NA NA NA NA NA ITGA5 471951 947 chr12 55877703 55879691 55878450 N NA NA NA NA NA NA BLOC1S1-RDH5 230127 948 chr12 56256110 56259043 56256889,56258316 N,N NA;NA SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 DNAJC14,ORMDL2,SARNP,TMEM198B,MMP19,WIBG,DGKA,SUOX,RAB5B IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC14 32690 949 chr12 56890179 56899260 56895003,56890349 N,N NA;NA SPRYD4,GLS2 BAZ2A,MIP,TIMELESS,GLS2,ATP5B,RBMS2,PTGES3 IMR90 Hi-C 24141950 GLS2 7998 950 chr12 56902296 56903737 56902896 N NA SPRYD4,GLS2 GLS2,RBMS2,BAZ2A IMR90 Hi-C 24141950 GLS2 20115 951 chr12 58529663 58532043 58529892,58531925 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100506844 199716 952 chr12 58818612 58821123 58819564 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA LOC100506844 488665 953 chr12 59158799 59161247 59159564 N NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 153015 954 chr12 59422942 59426745 59424392 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 108680 955 chr12 59796633 59799762 59798057 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 482371 956 chr12 59910010 59913829 59911592 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 595748 957 chr12 59987860 60007918 59989730 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 673598 958 chr12 60432864 60435970 60434531 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 1118602 959 chr12 60444811 60445957 60445063 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 1130549 960 chr12 60658334 60661790 60660035 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 1344072 961 chr12 60961471 60964178 60962879 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 1647209 962 chr12 61096380 61100104 61098081 N NA NA NA NA NA NA USP15 1554017 963 chr12 62846913 62850026 62847397 N NA MON2 PPM1H,MON2 IMR90 Hi-C 24141950 MON2 10571 964 chr12 6290113 6292790 6291275 N NA CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 16692 965 chr12 63339672 63340817 63340291 N NA PPM1H PPM1H MCF7 ChIA-PET 22265404 PPM1H 11007 966 chr12 63349590 63367827 63351909,63360962 N,N NA;NA PPM1H PPM1H MCF7 ChIA-PET 22265404 PPM1H 20925 967 chr12 63428615 63433986 63431379,63430339 N,N NA;NA NA PPM1H IMR90 Hi-C 24141950 PPM1H 99950 968 chr12 6385255 6393644 6387619,6389476 N,Y NA;CD9,PLEKHG6,PLEKHG6 NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF1A 57639 969 chr12 64079854 64081589 64080622 N NA NA NA NA NA NA TMEM5 92048 970 chr12 64227307 64229665 64228776 N NA SRGAP1 C12orf56 IMR90 Hi-C 24141950 SRGAP1 8876 971 chr12 64944039 64946868 64945622 N NA NA RASSF3,GNS,MIR548Z IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RASSF3 57425 972 chr12 64967674 64989629 64983571,64987511 N,N NA;NA RASSF3 RASSF3,MIR548Z,GNS,TBK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RASSF3 14664 973 chr12 65948482 65949638 65948920 N NA NA HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD3 385131 974 chr12 67380304 67463245 67462846 N NA NA CAND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 199816 975 chr12 67985963 67987932 67987374 N NA NA DYRK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DYRK2 54580 976 chr12 68242548 68244088 68243483 N NA NA NA NA NA NA DYRK2 200036 977 chr12 68838927 68841082 68840646 N NA NA NA NA NA NA MDM1 112766 978 chr12 68976631 68980207 68978763 N NA RAP1B IL26 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 24412 979 chr12 70406187 70409049 70407042 N NA NA NA NA NA NA CNOT2 227725 980 chr12 70577135 70630190 70628252 N NA CNOT2 PTPRB,CNOT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNOT2 6584 981 chr12 73191157 73191857 73191736 N NA NA NA NA NA NA TBC1D15 957670 982 chr12 73536718 73538772 73537952 N NA NA NA NA NA NA TBC1D15 1303231 983 chr12 73556584 73557313 73556917 N NA NA NA NA NA NA TBC1D15 1323097 984 chr12 73677232 73684134 73677443 N NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 1247417 985 chr12 74780718 74782107 74780859 N NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 149444 986 chr12 75169390 75170503 75170254 N NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 237839 987 chr12 75183722 75188582 75186120 N NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 252171 988 chr12 75244602 75247155 75245829 N NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 313051 989 chr12 75370882 75377137 75372505,75375055 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CAPS2 346699 990 chr12 76082210 76083135 76083013 N NA NA BBS10,OSBPL8,NAP1L1,PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 176792 991 chr12 76115643 76117155 76116652 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRR1 210225 992 chr12 76177406 76187357 76178584 Y NA NA PHLDA1,KRR1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 238199 993 chr12 76485665 76487683 76486370 N NA NAP1L1 NAP1L1,OSBPL8 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAP1L1 6927 994 chr12 78698696 78702217 78700587 N NA NA NA NA NA NA PAWR 1382573 995 chr12 78717757 78721365 78718731 N NA NA NA NA NA NA PAWR 1363425 996 chr12 78725919 78727330 78726071 N NA NA NA NA NA NA PAWR 1357460 997 chr12 78779052 78781277 78779732 N NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 1303513 998 chr12 78785352 78788728 78786902 N NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 1296062 999 chr12 78790184 78794463 78792880 N NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 1290327 1000 chr12 78941372 78945342 78943303 N NA NA NA NA NA NA PAWR 1139448 1001 chr12 78982041 78985992 78984193 N NA NA NA NA NA NA PAWR 1098798 1002 chr12 79045794 79052560 79051094 N NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 1032230 1003 chr12 79053904 79058118 79056741 N NA NA NA NA NA NA PAWR 1026672 1004 chr12 79089139 79121911 79119680,79107539 N,N NA;NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 962879 1005 chr12 79192826 79195414 79193612 N NA NA NA NA NA NA PAWR 889376 1006 chr12 79197454 79201564 79199727 N NA NA NA NA NA NA PAWR 883226 1007 chr12 79900300 79915147 79906951,79900336,79914300 N,N,N NA;NA;NA NA SYT1,PAWR IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 169643 1008 chr12 80423786 80426677 80425151 N NA NA PPP1R12A IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R12A 94551 1009 chr12 8125258 8129410 8125398 N NA NA SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 55949 1010 chr12 8175938 8182358 8179368 Y NA FOXJ2 SLC2A14,C3AR1,PEX5,SLC2A3,FOXJ2,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3001 1011 chr12 82178482 82184585 82180613 N NA PPFIA2 NA NA NA NA PPFIA2 25373 1012 chr12 82574930 82616247 82615276,82580281 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C12orf26 136029 1013 chr12 82636400 82641183 82637872 N NA NA NA NA NA NA C12orf26 111093 1014 chr12 82660179 82668820 82666867 N NA NA NA NA NA NA C12orf26 83456 1015 chr12 82677695 82701092 82697449 N NA NA NA NA NA NA C12orf26 51184 1016 chr12 82715588 82725723 82719508,82716415,82723572 N,N,N NA;NA;NA C12orf26,CCDC59 NA NA NA NA C12orf26 26553 1017 chr12 83027857 83029866 83028763 N NA NA TMTC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMTC2 51068 1018 chr12 856630 858145 857208 N NA WNK1 NINJ2,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 WNK1 3944 1019 chr12 87249527 87250953 87250049 N NA NA NA NA NA NA MKRN9P 927535 1020 chr12 87649915 87651776 87650489 N NA NA NA NA NA NA MKRN9P 526712 1021 chr12 87832644 87835232 87834223 N NA NA NA NA NA NA MKRN9P 343256 1022 chr12 88140767 88144027 88141355 N NA MKRN9P NA NA NA NA MKRN9P 34461 1023 chr12 88639930 88642315 88641278 N NA NA KITLG,LOC728084 IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 103857 1024 chr12 88660120 88663025 88661347 N NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 124047 1025 chr12 88793917 88798206 88795117 N NA NA NA NA NA NA KITLG 176044 1026 chr12 89076968 89079849 89078601 N NA NA NA NA NA NA KITLG 102718 1027 chr12 89584998 89587729 89586387 Y DUSP6,ATP2B1 NA DUSP6,POC1B IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 462115 1028 chr12 89604825 89608495 89606509 Y DUSP6,ATP2B1 NA LOC728084,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 441349 1029 chr12 89616824 89620839 89619819 Y DUSP6,ATP2B1 NA DUSP6,LOC728084,POC1B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP2B1 429005 1030 chr12 89698418 89700003 89699144 N NA NA LOC728084,POC1B IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 349841 1031 chr12 90269988 90273976 90272217 N NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 167256 1032 chr12 90302764 90337067 90312991,90336037 N,N NA;NA NA LOC338758,C12orf37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC338758 200032 1033 chr12 90340772 90350562 90342729 N NA NA LOC338758,ATP2B1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC338758 238040 1034 chr12 90355536 90360792 90357835 N NA NA ATP2B1,LOC338758,C12orf37 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 252804 1035 chr12 90438295 90444809 90443857,90438711 N,N NA;NA NA ATP2B1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 335563 1036 chr12 90502198 90503381 90502353 N NA NA ATP2B1,C12orf37 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 399466 1037 chr12 90726423 90729445 90727369 N NA NA NA NA NA NA LOC338758 623691 1038 chr12 90762996 90765619 90764101 N NA NA NA NA NA NA LOC338758 660264 1039 chr12 90903942 90904690 90904568 N NA NA NA NA NA NA LOC338758 801210 1040 chr12 91011057 91014396 91012721 N NA NA NA NA NA NA LOC338758 908325 1041 chr12 91028190 91030741 91029570 N NA NA NA NA NA NA LOC338758 925458 1042 chr12 91666749 91669993 91668153 N NA NA LUM,DCN,EPYC,KERA IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 1564017 1043 chr12 91780605 91784441 91782126 N NA NA LOC256021,CLLU1OS,CLLU1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEA1 1538666 1044 chr12 92010638 92046768 92012315 Y NA NA CLLU1OS,CLLU1,LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 1276339 1045 chr12 92111004 92116614 92112252 N NA NA NA NA NA NA EEA1 1206493 1046 chr12 92323555 92326197 92325196 N NA NA LOC256021 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EEA1 996910 1047 chr12 92936695 92938075 92937332 N NA NA NA NA NA NA EEA1 385032 1048 chr12 94033539 94035731 94034545 N NA CRADD SOCS2,LOC144481,CRADD IMR90 Hi-C 24141950 CRADD 35420 1049 chr12 94494486 94495838 94494663 N NA NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC41 357926 1050 chr12 94539239 94539518 94539397 N NA NA PLXNC1,CCDC41 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 314246 1051 chr12 94902182 94903178 94902525 N NA CCDC41,LOC144486 PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC144486 48403 1052 chr12 94930319 94931487 94930693 N NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC144486 76540 1053 chr12 95071087 95072645 95071788 N NA NA TMCC3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC144486 217308 1054 chr12 96494644 96496662 96495921 N NA NA CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 AMDHD1 157573 1055 chr12 96893911 96896010 96894805 N NA NA ELK3,CDK17,LTA4H,AMDHD1,CCDC38 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 99545 1056 chr12 97111578 97115993 97114105 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 185008 1057 chr12 97293841 97295943 97294564 N NA NEDD1 NA NA NA NA NEDD1 5058 1058 chr13 104148885 104252821 104205867,104149053,104188274 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 616436 1059 chr13 104612572 104613817 104612882 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1080123 1060 chr13 104616896 104619760 104618216 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1084447 1061 chr13 104656364 104663634 104661799 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1123915 1062 chr13 104732871 104735392 104733132 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1200422 1063 chr13 104780740 104785597 104783249 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1248291 1064 chr13 104794818 104799588 104797256 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1262369 1065 chr13 104820931 104825638 104822910,104822058 N,N NA;NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1288482 1066 chr13 104907530 104911237 104909455 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1375081 1067 chr13 105040424 105045676 105042176 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1507975 1068 chr13 105081355 105085778 105084387 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1548906 1069 chr13 105217165 105225352 105219700,105224094 N,N NA;NA NA ARGLU1 IMR90 Hi-C 24141950 METTL21CP1 1684716 1070 chr13 105241298 105245407 105243022 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1708849 1071 chr13 106034571 106039411 106035561 N NA NA NA NA NA NA EFNB2 1147977 1072 chr13 106622732 106626216 106624747 N NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 EFNB2 561172 1073 chr13 107350205 107354260 107352757 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 129691 1074 chr13 107567138 107570095 107569489 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 346624 1075 chr13 107611664 107614096 107612747 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 391150 1076 chr13 109162331 109169854 109162658 N NA NA NA NA NA NA ABHD13 291568 1077 chr13 109195755 109196557 109196097 N NA NA NA NA NA NA ABHD13 324992 1078 chr13 110666306 110668899 110667265 N NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 CARKD 598908 1079 chr13 111489352 111491352 111490112 N NA NA NA NA NA NA ANKRD10 76064 1080 chr13 112864672 112870197 112868278 N NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 372284 1081 chr13 114028926 114049787 114035291,114048447,114031459,114046532 N,N,N,N NA;NA;NA;NA GRTP1 CUL4A,MCF2L-AS1,MCF2L,LAMP1,GRTP1,ADPRHL1,DCUN1D2,F7,F10,PCID2,TMCO3 IMR90 Hi-C 24141950 GRTP1 10463 1082 chr13 19087721 19094082 19091777 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 598341 1083 chr13 19182815 19192605 19184434 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 499818 1084 chr13 19247385 19249061 19248188 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 443362 1085 chr13 19317814 19323179 19320239 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 369244 1086 chr13 19328139 19342179 19334986 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 350244 1087 chr13 20131382 20137447 20133450,20136110 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 70341 1088 chr13 21521702 21524857 21523693 N NA XPO4 CRYL1,LATS2,SAP18,SKA3 IMR90 Hi-C 24141950 XPO4 44789 1089 chr13 22898071 22900450 22898895 N NA NA NA NA NA NA EFHA1 719716 1090 chr13 23269888 23271028 23270468 N NA NA NA NA NA NA TNFRSF19 873481 1091 chr13 23387667 23388869 23388209 N NA NA NA NA NA NA TNFRSF19 755640 1092 chr13 23488661 23492304 23489720 N NA NA NA NA NA NA TNFRSF19 652205 1093 chr13 24537487 24545762 24540564,24544057 N,N NA;NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 73900 1094 chr13 24591016 24595012 24592218 N NA NA SPATA13,LINC00327 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 127429 1095 chr13 24648232 24651556 24649700 N NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATA13 83305 1096 chr13 24949402 24951270 24950352 N NA NA NA NA NA NA PARP4 135678 1097 chr13 25590942 25596710 25592727 N NA NA NA NA NA NA PABPC3 73566 1098 chr13 27379344 27380642 27379842 N NA NA CDX2 IMR90 Hi-C 24141950 WASF3 247504 1099 chr13 29346653 29350482 29347103 N NA NA POMP,SLC46A3 IMR90 Hi-C 24141950 POMP 113512 1100 chr13 30215102 30223976 30216063 N NA SLC7A1 NA NA NA NA SLC7A1 45277 1101 chr13 30496814 30500193 30498238,30499697 N,N NA;NA NA HSPH1,KATNAL1,UBL3,LOC440131 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBL3 71994 1102 chr13 30968174 30971126 30969751 Y USPL1 NA LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 68955 1103 chr13 30989775 30999511 30991302,30995896 N,N NA;NA HMGB1 USPL1,KATNAL1,LINC00426,HMGB1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 40570 1104 chr13 31412522 31414829 31412724 N NA NA USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 220692 1105 chr13 33412258 33414273 33413331 N NA NA KL,PDS5B,STARD13 IMR90 Hi-C 24141950 PDS5B 251694 1106 chr13 34318074 34321237 34319596 N NA NA NA NA NA NA PDS5B 1157510 1107 chr13 34322963 34326605 34324493 N NA NA NA NA NA NA PDS5B 1162399 1108 chr13 34571609 34575427 34574060 N NA NA NA NA NA NA NBEA 940997 1109 chr13 34908211 34910723 34909849 N NA NA NA NA NA NA NBEA 605701 1110 chr13 35165506 35166149 35165886 N NA NA NA NA NA NA NBEA 350275 1111 chr13 36581827 36588477 36582504 N NA NA NA NA NA NA RFXAP 804862 1112 chr13 37702456 37715367 37714472 N NA NA LINC00547,POSTN,TRPC4 IMR90 Hi-C 24141950 FAM48A 68606 1113 chr13 37729220 37839953 37740826,37730405 N,N NA;NA NA POSTN,LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 FAM48A 95370 1114 chr13 38597922 38614912 38600455,38612110 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UFM1 309030 1115 chr13 38855134 38864621 38862014 N NA NA NA NA NA NA UFM1 59321 1116 chr13 40897178 40898338 40897864 N NA NA NA NA NA NA MRPS31 447009 1117 chr13 41258782 41259986 41259633 N NA NA COG6 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS31 85361 1118 chr13 41858370 41859213 41858983 N NA NAA16 MTRF1,KBTBD6,NAA16 IMR90 Hi-C 24141950 NAA16 26128 1119 chr13 43284834 43286058 43285403 N NA NA ENOX1,TNFSF11,EPSTI1 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP11 438545 1120 chr13 44379211 44381762 44380373 N NA ENOX1 ENOX1,DNAJC15,EPSTI1,TNFSF11,CCDC122,LACC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENOX1 18095 1121 chr13 44540764 44550470 44541077 N NA NA SERP2,TSC22D1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 86938 1122 chr13 44624694 44626671 44625912 N NA NA SERP2,TSC22D1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 170868 1123 chr13 44713124 44718339 44714542,44716289 N,N NA;NA NA TSC22D1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC122 259298 1124 chr13 44791585 44797117 44793080,44796048 N,N NA;NA NA TSC22D1,SERP2,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 337759 1125 chr13 44883424 44886077 44885031 Y CCDC122,TSC22D1 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 264624 1126 chr13 45189882 45195738 45190761 N NA TSC22D1 TSC22D1,LINC00330,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 39181 1127 chr13 45332549 45335879 45334256 N NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 181848 1128 chr13 45426875 45430140 45428362 N NA NA TSC22D1,LINC00330,NUFIP1,TSC22D1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 133473 1129 chr13 46033918 46035145 46034304 N NA SLC25A30,COG3 TPT1-AS1,SLC25A30,COG3 IMR90 Hi-C 24141950 COG3 3885 1130 chr13 46237624 46244436 46238185 N NA NA NA NA NA NA COG3 198594 1131 chr13 46796999 46806695 46797652 N NA NA NA NA NA NA ZC3H13 170105 1132 chr13 46819886 46837561 46820998 N NA NA NA NA NA NA ZC3H13 192992 1133 chr13 48591809 48598868 48595354 N NA SUCLA2 NUDT15 IMR90 Hi-C 24141950 SUCLA2 16347 1134 chr13 49157949 49160071 49158966 N NA NA NA NA NA NA RB1 280066 1135 chr13 49440421 49442686 49440986 N NA NA FNDC3A,MLNR IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3A 107362 1136 chr13 50172555 50174614 50173881 N NA RCBTB1 CDADC1,ARL11,RCBTB1,CAB39L,SETDB2 IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB1 12836 1137 chr13 50722282 50726018 50723442 N NA DLEU2,ST13P4 DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P4 20136 1138 chr13 50795408 50799271 50797043 Y NA ST13P4 DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 ST13P4 49254 1139 chr13 50849099 50853815 50849814 N NA NA DLEU7,DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 ST13P4 102945 1140 chr13 50859004 50863575 50860728 N NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 ST13P4 112850 1141 chr13 50892428 51046048 50894644,51021154,50932031,51034536,50961322,50935958,50940566,51022856 N,N,N,Y,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA DLEU7,DLEU2,DLEU1,EBPL,CTAGE10P,TRIM13,RNASEH2B,GUCY1B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P4 146274 1142 chr13 51085634 51121559 51087416,51097432,51090531,51105819 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA DLEU2,DLEU1,EBPL,TRIM13,MIR3613,CTAGE10P,ST13P4,DLEU7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P4 339480 1143 chr13 53333008 53336543 53334479 N NA NA LECT1 IMR90 Hi-C 24141950 SUGT1 106177 1144 chr13 53432569 53433771 53432727 N NA NA PCDH8 MCF7 ChIA-PET 22265404 SUGT1 205738 1145 chr13 56545646 56545965 56545829 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 3318815 1146 chr13 58602745 58605091 58603091 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 2365500 1147 chr13 59980567 59982005 59980972 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 988586 1148 chr13 61210801 61212749 61211740 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 240210 1149 chr13 63754722 63755996 63754899 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 2784131 1150 chr13 63919218 63921523 63920175 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 2948627 1151 chr13 64829259 64831845 64830884 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 3858668 1152 chr13 66038776 66041009 66038937 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 4641616 1153 chr13 66686970 66687640 66687343 Y NA NA NA NA NA NA KLHL1 3994985 1154 chr13 68099991 68139571 68136763 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 2543054 1155 chr13 69971509 69972721 69971840 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 709904 1156 chr13 70140233 70144210 70142031 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 538415 1157 chr13 70147995 70151282 70150474 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 531343 1158 chr13 70233978 70242010 70235122,70239328,70239450 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA KLHL1 440615 1159 chr13 70788314 71033256 70806846,70863109,70898927,70799829,70931593,70805036,70962263,70950283,70822777,70866029,70933546,70875222,70955178,70872538,70917295,70996201,71018162 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA KLHL1 105689 1160 chr13 71045494 71073561 71048242 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 362869 1161 chr13 71140037 71163382 71142991 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 457412 1162 chr13 72767802 72770618 72769157 N NA NA NA NA NA NA KLHL1 2085177 1163 chr13 73741916 73742564 73742193 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 2313686 1164 chr13 75062926 75064878 75063084 N NA NA NA NA NA NA TBC1D4 991372 1165 chr13 75274882 75275123 75275053 N NA NA NA NA NA NA TBC1D4 781127 1166 chr13 76514467 76515632 76514864 N NA NA NA NA NA NA UCHL3 390540 1167 chr13 77166044 77167972 77167326 N NA NA NA NA NA NA CLN5 398087 1168 chr13 78051258 78053183 78052494 N NA NA NA NA NA NA MYCBP2 150081 1169 chr13 80724102 80727616 80726345 N NA NA NA NA NA NA NDFIP2 668843 1170 chr13 80863293 80864829 80864135 N NA NA NA NA NA NA NDFIP2 808034 1171 chr13 80942959 80944223 80943703 N NA NA NA NA NA NA NDFIP2 887700 1172 chr13 80950545 80952787 80951245 N NA NA NA NA NA NA NDFIP2 895286 1173 chr13 84964479 84965888 84964897 N NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1407595 1174 chr13 86093468 86096259 86095366 N NA NA NA NA NA NA SLITRK6 277224 1175 chr13 86282217 86286514 86284086 N NA NA NA NA NA NA SLITRK6 86969 1176 chr13 86298302 86300969 86299372 N NA NA NA NA NA NA SLITRK6 72514 1177 chr13 87171726 87172418 87171831 N NA NA NA NA NA NA SLITRK6 798243 1178 chr13 88876366 88877484 88876802 N NA NA NA NA NA NA SLITRK6 2502883 1179 chr13 90584605 90585967 90584961 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1414107 1180 chr13 90686799 90687888 90686955 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1312186 1181 chr13 91036729 91040881 91037865 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 959193 1182 chr13 91125629 91128165 91127107 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 871909 1183 chr13 91176852 91180583 91179701 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 819491 1184 chr13 91183600 91187474 91185328 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 812600 1185 chr13 91892679 91900410 91893733 N NA NA MIR17HG K562 ChIA-PET 22265404 MIR17HG 99664 1186 chr13 93874240 93876866 93875592 N NA NA GPC6 IMR90 Hi-C 24141950 TGDS 1371645 1187 chr13 95200687 95206076 95201841 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 42435 1188 chr13 95965607 95976946 95966855 N NA ABCC4 ABCC4 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC4 11920 1189 chr13 95995552 95996305 95996069 N NA ABCC4 ABCC4 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC4 41865 1190 chr13 96017991 96019684 96018723 N NA NA ABCC4 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC4 64304 1191 chr13 98382340 98384034 98383043 N NA NA NA NA NA NA RAP2A 295865 1192 chr14 100430059 100432638 100430909 N NA NA EML1,EVL IMR90 Hi-C 24141950 EVL 99113 1193 chr14 100668772 100684573 100670150,100673531,100680697 N,N,N NA;NA;NA DEGS2,YY1 DEGS2,EVL,YY1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 20529 1194 chr14 101046082 101058460 101053039 N NA NA WDR25,MEG3,BEGAIN,WARS,LINC00523,DLK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR25 203327 1195 chr14 101788848 101792231 101790296 N NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 435904 1196 chr14 101928586 101944496 101943491 N NA NA DIO3OS IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5C 283639 1197 chr14 102142870 102146650 102144905 N NA NA LINC00523 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5C 81485 1198 chr14 102187410 102190572 102188509 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 PPP2R5C 37563 1199 chr14 103725773 103729844 103726970 Y MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5 NA EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 70649 1200 chr14 105542617 105567679 105544979,105552642,105559713 N,N,N NA;NA;NA NA AHNAK2,GPR132,BTBD6,BRF1,JAG2,NUDT14 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 55192 1201 chr14 105575751 105580691 105576949 N NA NA BTBD6,BRF1,KIAA0284,PACS2 IMR90 Hi-C 24141950 JAG2 54470 1202 chr14 106024733 106027513 106026533 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 68541 1203 chr14 106283871 106316285 106289953 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 327679 1204 chr14 106456664 106459091 106457907 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 500472 1205 chr14 106986669 106989446 106987791 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 1030477 1206 chr14 106991781 106997128 106995268 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 1035589 1207 chr14 107240905 107270357 107252604 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 1284713 1208 chr14 19054053 19067606 19059984 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1706547 1209 chr14 19279250 19294734 19293403 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1479419 1210 chr14 19357808 19361501 19359305 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1412652 1211 chr14 19457560 19458384 19458297 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1315769 1212 chr14 19501158 19504489 19502506 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1269664 1213 chr14 19636834 19668217 19642197,19652756,19649984 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TTC5 1105936 1214 chr14 19670382 19696008 19671454 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1078145 1215 chr14 19744530 19754000 19747086,19744640 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TTC5 1020153 1216 chr14 19831511 19904803 19857497,19879224,19903018 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TTC5 869350 1217 chr14 19907201 19939725 19925383 N NA NA NA NA NA NA TTC5 834428 1218 chr14 21080819 21083263 21081748 N NA NA KLHL33,TMEM55B,PARP2,RPPH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNP 143281 1219 chr14 21120780 21128455 21125749,21121340,21128218 N,N,N NA;NA;NA NA RNASE4,OR6S1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNP 183242 1220 chr14 21136881 21141710 21137414,21140398 N,N NA;NA NA RNASE4 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNP 199343 1221 chr14 22079673 22080558 22080435 N NA NA NA NA NA NA METTL3 100216 1222 chr14 22182932 22184508 22183102 N NA NA NA NA NA NA METTL3 203475 1223 chr14 22186399 22189342 22187854 N NA NA NA NA NA NA METTL3 206942 1224 chr14 22801097 22804672 22802592 N NA NA NA NA NA NA DAD1 253471 1225 chr14 23203783 23221786 23220837,23207655,23210137 N,N,N NA;NA;NA OXA1L DAD1,SLC7A7 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 13945 1226 chr14 24162575 24166155 24163771 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX2 141717 1227 chr14 24355998 24368454 24367032 N NA C14orf165 C14orf167,DHRS4 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf165 35323 1228 chr14 25549020 25552998 25551136 N NA NA STXBP6 IMR90 Hi-C 24141950 SDR39U1 637013 1229 chr14 25839272 25841634 25840464 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 927265 1230 chr14 25977157 25979530 25978275 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1065150 1231 chr14 26127401 26129463 26128434 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 937497 1232 chr14 26310678 26313250 26311696 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 753710 1233 chr14 26592219 26596082 26594432 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 470878 1234 chr14 26749006 26751902 26750923 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 315058 1235 chr14 26754749 26758077 26756161 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 308883 1236 chr14 26883073 26886833 26885114 Y NOVA1 NA NA NA NA NA NOVA1 180127 1237 chr14 27335296 27341115 27336564 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 268336 1238 chr14 27761929 27770904 27770533 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 694969 1239 chr14 27931404 27964017 27961765 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 864444 1240 chr14 28248479 28291321 28288928 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 1181519 1241 chr14 28300816 28319977 28314689 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 1233856 1242 chr14 28650953 28659773 28657819 N NA NA NA NA NA NA NOVA1 1583993 1243 chr14 28733245 28735578 28734550 N NA NA NA NA NA NA PRKD1 1661321 1244 chr14 28863090 28885019 28863648,28878581,28870997,28882106 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA PRKD1 1511880 1245 chr14 28897069 29015512 28897220 N NA NA NA NA NA NA PRKD1 1381387 1246 chr14 29343863 29347534 29345669 N NA NA NA NA NA NA PRKD1 1049365 1247 chr14 29420301 29526029 29441154,29422018 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PRKD1 870870 1248 chr14 29882934 29884317 29883457 N NA NA NA NA NA NA PRKD1 512582 1249 chr14 29924452 29950830 29947455,29927956 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PRKD1 446069 1250 chr14 30672544 30676175 30674610 N NA NA PRKD1 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD1 275645 1251 chr14 30689551 30693796 30691787 N NA NA PRKD1,C14orf23,FOXG1 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD1 292652 1252 chr14 32009065 32010816 32009506 N NA NUBPL AKAP6,ARHGAP5,NUBPL IMR90 Hi-C 24141950 NUBPL 19775 1253 chr14 32437909 32440905 32439032 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 105000 1254 chr14 32671710 32739947 32672645,32682419 Y,N ARHGAP5;NA NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5,AKAP6,GPR33 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5 125215 1255 chr14 34549669 34556152 34554778 N NA NA EGLN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 EGLN3 129385 1256 chr14 34689539 34693501 34691696 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 237967 1257 chr14 34722765 34725080 34723717 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 206388 1258 chr14 34799471 34802906 34801287 N NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 128562 1259 chr14 34956053 34957136 34956543 N NA SPTSSA NA NA NA NA SPTSSA 24585 1260 chr14 35107060 35107927 35107909 N NA SNX6 NA NA NA NA SNX6 7694 1261 chr14 35389459 35392444 35390458 N NA BAZ1A BAZ1A,IGBP1P1 IMR90 Hi-C 24141950 BAZ1A 44606 1262 chr14 35818244 35825316 35823193 N NA NFKBIA KIAA0391,PPP2R3C,PSMA6,SNX6,NFKBIA IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIA 48644 1263 chr14 35910191 35912230 35911473 N NA NFKBIA RALGAPA1,KIAA0391,PPP2R3C IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIA 36231 1264 chr14 36724634 36727285 36725630 N NA NA MBIP IMR90 Hi-C 24141950 MBIP 62597 1265 chr14 38109378 38170400 38120673,38139829,38148733,38114513,38111694 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA FOXA1 FOXA1,MIPOL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FOXA1 44889 1266 chr14 38175323 38389736 38385291,38234566,38177647,38210631 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA MIPOL1,FOXA1,LOC283547,CLEC14A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXA1 110834 1267 chr14 38490595 38526981 38490772 N NA NA SSTR1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXA1 426106 1268 chr14 38586762 38633818 38587882 N NA NA CLEC14A IMR90 Hi-C 24141950 FOXA1 522273 1269 chr14 38762075 38831170 38781117,38782005,38798702,38763898 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA FOXA1,CLEC14A,SSTR1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXA1 697586 1270 chr14 38899749 38902268 38901068 N NA NA NA NA NA NA SEC23A 670169 1271 chr14 38933716 38935524 38934214 N NA NA NA NA NA NA SEC23A 636913 1272 chr14 38948835 38951196 38950014 N NA NA NA NA NA NA SEC23A 621241 1273 chr14 40760791 40797659 40795817 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 859087 1274 chr14 40800905 40826508 40817167 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 899201 1275 chr14 41412747 41664958 41418260,41635178,41424227 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FBXO33 1511043 1276 chr14 42635099 42638079 42635459 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 2728428 1277 chr14 42661119 42664278 42663316 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 2702229 1278 chr14 43128734 43130358 43129554 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 2236149 1279 chr14 43623240 43623574 43623424 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 1742933 1280 chr14 43933321 43935900 43934577,43934342 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C14orf28 1430607 1281 chr14 45069715 45071541 45071238 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 294966 1282 chr14 48269485 48371890 48370386 N NA LOC100506433 NA NA NA NA LOC100506433 5268 1283 chr14 49983279 49984882 49984426 N NA NA NA NA NA NA RPS29 68212 1284 chr14 50328184 50338281 50329602,50334984 Y,Y NA;RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 8645 1285 chr14 50405918 50424156 50415429,50418356 N,N NA;NA ARF6 ARF6,C14orf182,SOS2,C14orf183 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF6 46182 1286 chr14 51948060 51949790 51948798 N NA NA FRMD6,TMX1,LOC283553,FRMD6-AS1,GNG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FRMD6-AS1 168672 1287 chr14 52685261 52686862 52685873 N NA NA TXNDC16,C14orf166,GPR137C,ERO1L IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 229033 1288 chr14 53682866 53689522 53683223 N NA NA PSMC6 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD1 62820 1289 chr14 53726204 53728077 53727620 N NA NA NA NA NA NA DDHD1 106158 1290 chr14 54670031 54671989 54671305 N NA NA NA NA NA NA CNIH 236159 1291 chr14 55566228 55571203 55569509 N NA MAPK1IP1L LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK1IP1L 47866 1292 chr14 55695420 55696934 55696239 N NA FBXO34 TBPL2,FBXO34,ATG14 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO34 41087 1293 chr14 56306652 56307722 56307221 N NA NA PELI2,LINC00520 IMR90 Hi-C 24141950 KTN1 259727 1294 chr14 56355169 56359212 56356143 N NA NA PELI2 IMR90 Hi-C 24141950 PELI2 225881 1295 chr14 58636222 58639296 58637994 Y NA ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 27537 1296 chr14 59083388 59085282 59083722 N NA NA KIAA0586,DACT1,DAAM1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM9 189156 1297 chr14 60425352 60432980 60428226,60430944,60432362 N,N,N NA;NA;NA NA DHRS7 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf135 125649 1298 chr14 60507672 60528461 60516505,60512485,60526513 N,N,N NA;NA;NA C14orf135 DHRS7 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf135 30168 1299 chr14 61026875 61032133 61029647 N NA NA NA NA NA NA SIX4 158719 1300 chr14 61122112 61128349 61123888 N NA NA SLC38A6,SIX1,TRMT5,MNAT1 IMR90 Hi-C 24141950 SIX4 62503 1301 chr14 62731531 62777914 62731697,62751235,62776983 N,N,N NA;NA;NA NA KCNH5,RHOJ IMR90 Hi-C 24141950 SNAPC1 502456 1302 chr14 65076985 65080055 65078220 N NA NA HSPA2,ZBTB25,PPP1R36,SPTB,TEX21P,ZBTB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHG3 91138 1303 chr14 65130430 65131989 65131088 N NA PLEKHG3 SPTB,PLEKHG3,PPP1R36,CHURC1-FNTB IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG3 39204 1304 chr14 65148551 65150248 65149060 Y HSPA2,FNTB PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG3 20945 1305 chr14 65360277 65363523 65360862 N NA CHURC1-FNTB SPTB,PLEKHG3,RAB15,CHURC1-FNTB IMR90 Hi-C 24141950 CHURC1-FNTB 17556 1306 chr14 65649458 65653008 65650901 N NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 80231 1307 chr14 65708940 65716721 65710799 Y NA NA LOC645431,FUT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 139713 1308 chr14 65720763 65724201 65722441,65721860 Y,N NA;NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 151536 1309 chr14 65820185 65823051 65821681 N NA NA MIR4708,FUT8,LOC645431 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC645431 56284 1310 chr14 67905403 67908449 67907064 N NA NA RDH12,PLEKHH1,VTI1B,RDH11,TMEM229B,PIGH,PLEK2,ATP6V1D,EIF2S1,ARG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF2S1 78369 1311 chr14 69289697 69292996 69291771 N NA ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 26737 1312 chr14 70279472 70283072 70282305 N NA SRSF5,LOC100289511 SMOC1,SLC8A3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100289511 45042 1313 chr14 71757020 71835713 71787862,71834861,71797330 N,N,Y NA;NA;PCNX NA SIPA1L1,PCNX,LOC145474,SNORD56B IMR90 Hi-C 24141950 LOC145474 118865 1314 chr14 74302344 74304294 74303277 N NA C14orf43,PTGR2,ZNF410 C14orf43,PNMA1,DNAL1,HEATR4,ZNF410,PTGR2,MIR4505 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTGR2 14240 1315 chr14 75668476 75669157 75668855 N NA TMED10 TMED10,LOC731223,FOS,JDP2,NEK9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMED10 25127 1316 chr14 75719108 75728512 75721341,75725883,75726666 N,N,N NA;NA;NA NA TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2,BATF,PGF IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMED10 75759 1317 chr14 75736711 75738189 75737300 N NA NA LOC731223 IMR90 Hi-C 24141950 TMED10 93362 1318 chr14 75866131 75868991 75867299 N NA NA JDP2,TMED10,NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 TMED10 222782 1319 chr14 77199917 77202107 77200535 N NA NA NA NA NA NA ANGEL1 77176 1320 chr14 77287437 77289235 77288545 N NA ANGEL1 VASH1,ANGEL1,C14orf166B,KIAA1737 IMR90 Hi-C 24141950 ANGEL1 8154 1321 chr14 77362201 77375276 77372259 N NA NA C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737,ZDHHC22,TMED8,POMT2,GSTZ1 IMR90 Hi-C 24141950 ANGEL1 82918 1322 chr14 77378259 77387023 77379159,77385472 N,N NA;NA NA IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANGEL1 98976 1323 chr14 77421487 77425591 77423485 N NA NA IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 69443 1324 chr14 77434379 77436750 77435697 N NA NA IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BPL 58284 1325 chr14 77517376 77545606 77518028,77537333,77527582,77542585 N,N,N,N NA;NA;NA;NA IRF2BPL,KIAA1737 C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1737 18972 1326 chr14 77553130 77556497 77554811 Y NA KIAA1737 KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1737 8081 1327 chr14 78459238 78460684 78459637 N NA NA NA NA NA NA ADCK1 192812 1328 chr14 82075354 82078659 82077534 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 75149 1329 chr14 84070375 84086830 84078136,84086073 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SEL1L 2070170 1330 chr14 84095032 84110059 84105883 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 2094827 1331 chr14 84338842 84340176 84339320 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 2338637 1332 chr14 84565075 84568240 84565416 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 2564870 1333 chr14 85119499 85120853 85119929 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 3119294 1334 chr14 86271222 86273656 86271777 N NA NA NA NA NA NA SPATA7 2578332 1335 chr14 86294877 86297715 86295347 N NA NA NA NA NA NA SPATA7 2554273 1336 chr14 89506400 89509203 89507324 N NA NA EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 215422 1337 chr14 89568439 89571690 89569011 N NA NA EFCAB11,TDP1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 277461 1338 chr14 90136412 90138981 90137660 N NA NA FOXN3,LOC400236,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400236 252714 1339 chr14 90168368 90169509 90169034 N NA NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB11 251580 1340 chr14 90842020 90852207 90849232,90851377 N,N NA;NA C14orf102,CALM1 C14orf102,CALM1,TTC7B,EFCAB11,TDP1,PSMC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM1 11120 1341 chr14 90911703 90912445 90912102 N NA CALM1 CALM1,TTC7B MCF7 ChIA-PET 22265404 CALM1 48376 1342 chr14 90971793 90976734 90976070 N NA NA LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CALM1 108466 1343 chr14 90977997 90981836 90980185 N NA NA CALM1,C14orf102,LOC400238,TTC7B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CALM1 114670 1344 chr14 91292387 91295916 91294619 N NA TTC7B TTC7B,RPS6KA5,CCDC88C,C14orf159 IMR90 Hi-C 24141950 TTC7B 9626 1345 chr14 91551950 91556024 91553999 N NA RPS6KA5,C14orf159 RPS6KA5,CCDC88C IMR90 Hi-C 24141950 C14orf159 24333 1346 chr14 92000340 92002910 92001311 N NA SMEK1 SMEK1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMEK1 23696 1347 chr14 93224420 93227271 93225739 N NA LGMN,GOLGA5 SLC24A4,LGMN IMR90 Hi-C 24141950 LGMN 9373 1348 chr14 94997708 95000480 94998937 N NA NA SERPINA5 IMR90 Hi-C 24141950 IFI27L1 450069 1349 chr14 95521833 95523887 95522778 N NA NA NA NA NA NA DICER1 75953 1350 chr14 95803234 95809256 95806251 N NA CLMN CLMN,GSC,DICER1,DICER1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLMN 16989 1351 chr14 99361884 99362733 99362351 N NA NA NA NA NA NA SETD3 584493 1352 chr14 99438686 99440103 99439489 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 507123 1353 chr14 99831932 99833193 99832670 N NA NA NA NA NA NA SETD3 114033 1354 chr15 101240072 101241590 101240682 N NA NA ALDH1A3,ASB7 IMR90 Hi-C 24141950 ASB7 97317 1355 chr15 101261157 101263300 101262116 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB7 118402 1356 chr15 20005017 20023784 20022249 N NA NA NA NA NA NA HERC2P3 687649 1357 chr15 20030290 20050215 20034375 N NA NA NA NA NA NA HERC2P3 661218 1358 chr15 20276016 20277636 20276584 N NA NA NA NA NA NA HERC2P3 433797 1359 chr15 20351556 20362630 20353418 N NA NA NA NA NA NA HERC2P3 348803 1360 chr15 20432779 20435991 20434196 N NA NA REREP3,HERC2P3,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 HERC2P3 275442 1361 chr15 20467726 20479944 20473041,20478833,20470527 N,N,N NA;NA;NA NA CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 HERC2P3 231489 1362 chr15 20553396 20553944 20553556 N NA NA LOC348120,REREP3,POTEB,CHEK2P2,HERC2P3,NBEAP1,NF1P2,LOC727924,OR4N4 IMR90 Hi-C 24141950 HERC2P3 157489 1363 chr15 21359009 21364937 21360045 N NA NA NA NA NA NA LOC348120 213242 1364 chr15 21884884 21907451 21891861,21885494,21905977 N,N,Y NA;NA;NA LOC646214 NA NA NA NA LOC646214 33288 1365 chr15 21968114 21970873 21968285 N NA LOC646214 NA NA NA NA LOC646214 27375 1366 chr15 22175905 22180567 22176141 N NA NA NA NA NA NA LOC646214 235166 1367 chr15 22781538 22783142 22782454 N NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 50253 1368 chr15 23124020 23128952 23128044 N NA NIPA1 NA NA NA NA NIPA1 37177 1369 chr15 23423288 23424693 23423842 N NA HERC2P2,HERC2P7 NA NA NA NA HERC2P7 32566 1370 chr15 23469830 23499515 23498526 N NA NA NA NA NA NA HERC2P7 79108 1371 chr15 23773310 23774505 23773322 N NA MKRN3 NA NA NA NA MKRN3 35949 1372 chr15 25016809 25021693 25018381 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 47101 1373 chr15 25725804 25736383 25726773 N NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 41629 1374 chr15 26326220 26329148 26327501 Y NA NA LOC100128714,ATP10A,LOC503519 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 642045 1375 chr15 28708242 28711095 28709423 N NA NA NA NA NA NA HERC2 140947 1376 chr15 28823488 28833416 28825132,28829918 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HERC2P9 66172 1377 chr15 29028453 29030616 29029054 N NA WHAMMP2 NA NA NA NA WHAMMP2 45724 1378 chr15 29122259 29159560 29131264,29156691 N,N NA;NA NA APBA2 K562 ChIA-PET 22265404 APBA2 54280 1379 chr15 29942396 29951089 29949677 N NA NA NA NA NA NA TJP1 163617 1380 chr15 30247282 30248108 30247948 N NA NA TJP1 IMR90 Hi-C 24141950 TJP1 132576 1381 chr15 30384308 30389211 30387392 N NA NA NA NA NA NA TJP1 269602 1382 chr15 30692582 30720368 30718961,30694457,30700209 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAN1 475708 1383 chr15 30761650 30794840 30763241 N NA NA NA NA NA NA FAN1 401236 1384 chr15 30843025 30857951 30856303 N NA NA NA NA NA NA FAN1 338125 1385 chr15 31093947 31112985 31096157,31110025,31099177 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAN1 83091 1386 chr15 31119512 31122709 31120277 N NA NA NA NA NA NA FAN1 73367 1387 chr15 31187818 31189597 31188877 N NA FAN1 FAN1,TRPM1 IMR90 Hi-C 24141950 FAN1 6479 1388 chr15 31545714 31549042 31546895 N NA NA LOC283710,OTUD7A,KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 70041 1389 chr15 31587681 31599196 31595668,31588994 N,N NA;NA KLF13 OTUD7A,KLF13,LOC283710,MTMR10,TRPM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 19887 1390 chr15 32152843 32165088 32162969 N NA NA NA NA NA NA KLF13 533760 1391 chr15 32733942 32762620 32760326,32736093 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100288615 63322 1392 chr15 35310263 35313383 35311615 N NA AQR,ZNF770 AQR,ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 29766 1393 chr15 35381282 35386027 35384947 N NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 100785 1394 chr15 36485905 36489841 36487851 N NA NA NA NA NA NA C15orf41 381971 1395 chr15 37528082 37530272 37528468 N NA NA NA NA NA NA C15orf41 656270 1396 chr15 37952408 37954740 37952712 N NA NA NA NA NA NA SPRED1 590312 1397 chr15 38434052 38435088 38435020 N NA NA NA NA NA NA SPRED1 109964 1398 chr15 38536132 38538504 38537145 N NA SPRED1 SPRED1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SPRED1 6548 1399 chr15 38671176 38672231 38671340 N NA NA NA NA NA NA FAM98B 74097 1400 chr15 39157933 39261884 39261142,39186065 N,N NA;NA NA FSIP1,THBS1,C15orf53,GPR176,C15orf54,EIF2AK4 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 411605 1401 chr15 39294284 39309115 39307825,39305671 N,N NA;NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 547956 1402 chr15 39329548 39362486 39361980 N NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53,C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 510794 1403 chr15 39373531 39489562 39415491,39418052,39489163 N,N,N NA;NA;NA NA C15orf53,FSIP1,THBS1,RASGRP1,C15orf54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 383718 1404 chr15 39605452 39712507 39710701,39685714 N,N NA;NA NA C15orf53,FSIP1,THBS1,C15orf54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 160773 1405 chr15 39718558 39732965 39732564 N NA NA C15orf53,FSIP1,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 140315 1406 chr15 41908914 41912526 41911232 N NA MGA RTF1,RPAP1,TYRO3,MGA,MAPKBP1,SPTBN5,EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 40084 1407 chr15 43418772 43421768 43420130 N NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 3954 1408 chr15 44570615 44573080 44571803 N NA CASC4 FRMD5,CTDSPL2,CASC4 IMR90 Hi-C 24141950 CASC4 7829 1409 chr15 44982189 44994789 44990370 N NA SPG11,B2M B2M,TRIM69 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 B2M 8896 1410 chr15 45095813 45106203 45099578,45105140 N,N NA;NA NA SORD IMR90 Hi-C 24141950 B2M 92128 1411 chr15 45111007 45148577 45147725,45143609,45135952,45145292 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA SORD IMR90 Hi-C 24141950 B2M 107322 1412 chr15 45190702 45193391 45191930 N NA NA NA NA NA NA SORD 121911 1413 chr15 45506611 45510570 45507523 N NA NA LOC145663,GATM IMR90 Hi-C 24141950 SPATA5L1 183949 1414 chr15 46093189 46096051 46095051 N NA NA NA NA NA NA SQRDL 165933 1415 chr15 46162384 46162848 46162490 N NA NA NA NA NA NA SQRDL 235128 1416 chr15 46249847 46252333 46251295 N NA NA NA NA NA NA SQRDL 322591 1417 chr15 46550764 46553262 46551551 N NA NA NA NA NA NA SQRDL 623508 1418 chr15 46738683 46739851 46738829 N NA NA NA NA NA NA SQRDL 811427 1419 chr15 47457132 47458886 47458015 N NA NA NA NA NA NA MYEF2 1011672 1420 chr15 48199778 48202984 48201401 N NA NA SEMA6D IMR90 Hi-C 24141950 MYEF2 267574 1421 chr15 49966002 49968780 49967338 Y FGF7,DTWD1 NA GALK2,C15orf33,ATP8B4,DTWD1,FGF7,HDC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DTWD1 52776 1422 chr15 51088873 51091177 51090085 N NA SPPL2A USP8,SPPL2A,TRPM7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPPL2A 30963 1423 chr15 53022890 53023779 53023250 N NA NA MYO5C,FAM214A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM214A 52070 1424 chr15 55085222 55086842 55086241 N NA NA NA NA NA NA RSL24D1 402389 1425 chr15 55217670 55224823 55218264,55224499 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RSL24D1 264408 1426 chr15 56295372 56301443 56299353 N NA NA NEDD4,RFX7 IMR90 Hi-C 24141950 RFX7 234040 1427 chr15 56853699 56856065 56854637 N NA NA LOC145783 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF280D 169722 1428 chr15 58530082 58561844 58561668 N NA NA SLTM,FAM63B,ADAM10,LIPC IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 480333 1429 chr15 58608680 58626734 58614753,58624957 N,N NA;NA NA LIPC,FAM63B,ADAM10,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 415443 1430 chr15 58675967 58678327 58677064 N NA NA LIPC,FAM63B,ADAM10,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 363850 1431 chr15 59242393 59247785 59243352 N NA SLTM,RNF111 SLTM MCF7 ChIA-PET 22265404 SLTM 16541 1432 chr15 59844684 59847122 59845770 N NA NA NA NA NA NA GTF2A2 102615 1433 chr15 60054477 60061529 60060554 N NA NA NA NA NA NA BNIP2 72835 1434 chr15 60162566 60165175 60163915 N NA NA NA NA NA NA BNIP2 180924 1435 chr15 60187979 60190462 60189116 N NA NA NA NA NA NA BNIP2 206337 1436 chr15 60418057 60460401 60460054,60419767 N,N NA;NA NA BNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 NARG2 310943 1437 chr15 61967764 61977122 61974783 N NA NA NA NA NA NA VPS13C 375542 1438 chr15 61991657 61996535 61993154,61995119 N,N NA;NA NA RORA IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 356129 1439 chr15 62040348 62044916 62042054 N NA NA NA NA NA NA VPS13C 307748 1440 chr15 62653226 62653941 62653791 N NA NA TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 300562 1441 chr15 62676620 62690928 62678832,62682686 N,N NA;NA NA TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 323956 1442 chr15 62692878 62843696 62778789,62693275,62820902,62751533 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA MGC15885,TLN2,TPM1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 340214 1443 chr15 63690145 63705279 63695960,63700649 N,N NA;NA CA12 RAB8B,APH1B,USP3,FBXL22,LOC100130855,LACTB,CA12,RPS27L,TPM1,HERC1 IMR90 Hi-C 24141950 CA12 16070 1444 chr15 63715566 63718408 63716160 N NA CA12 APH1B,RAB8B,USP3,CA12,LACTB,LOC100130855,FBXL22 IMR90 Hi-C 24141950 CA12 41491 1445 chr15 63742469 63768352 63755161,63766055,63761968 N,N,N NA;NA;NA USP3 CA12,USP3,APH1B,LACTB,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,DAPK2,HERC1,FAM96A,SNX1,RPS27L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 28358 1446 chr15 65586638 65589560 65588510 N NA PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 7620 1447 chr15 65594977 65598214 65596920 Y DENND4A PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 15959 1448 chr15 66089470 66112399 66089701,66104489,66109778 N,N,N NA;NA;NA DENND4A,RAB11A DENND4A,SLC24A1,PPP1R2,C15orf44,PTPLAD1,RAB11A,MEGF11 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950,19890323 DENND4A 4839 1449 chr15 66123300 66127514 66125743 N NA DENND4A,RAB11A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB11A 34283 1450 chr15 66560927 66563592 66562218 N NA DIS3L MEGF11,DIS3L,MAP2K1,MIR4311 IMR90 Hi-C 24141950 DIS3L 22041 1451 chr15 66873476 66992049 66874624,66888868,66876368,66910183,66939718,66942097 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA SMAD6 SMAD6,LCTL,ZWILCH,SNORD18C,SNORD16,SNORD18B,RPL4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 2625 1452 chr15 67095034 67099647 67095654 Y NA NA SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 100360 1453 chr15 67223406 67236065 67224252 N NA NA SKOR1,SMAD3,LOC100506686,IQCH,MAP2K5,AAGAB,SMAD6,C15orf61 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 122130 1454 chr15 68205598 68209429 68207774 N NA NA CALML4,CLN6,PIAS1,LOC100506686,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 137143 1455 chr15 68275616 68276413 68275766 N NA NA PIAS1,IQCH,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 70159 1456 chr15 68763170 68766228 68764053 N NA NA CLN6,ITGA11,CORO2B IMR90 Hi-C 24141950 FEM1B 193029 1457 chr15 70242447 70245375 70244354 N NA NA C15orf50,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 144881 1458 chr15 70288493 70291974 70289630 Y NA NA LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 98282 1459 chr15 70393120 70394444 70393953 N NA TLE3 NA NA NA NA TLE3 2864 1460 chr15 70766780 70768019 70767206 N NA NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 287831 1461 chr15 70798401 70801387 70800431 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 254463 1462 chr15 72927618 72944836 72929337 N NA BBS4 CELF6 IMR90 Hi-C 24141950 BBS4 33684 1463 chr15 73945423 73950263 73947185,73948833 N,N NA;NA NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 19670 1464 chr15 74378998 74394978 74392650 N NA NA NA NA NA NA PML 91984 1465 chr15 75478053 75480794 75479680 N NA C15orf39 C15orf39 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf39 13427 1466 chr15 75613554 75617080 75614848 N NA COMMD4,MAN2C1 NEIL1,COMMD4 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD4 11294 1467 chr15 77191763 77198704 77197719 N NA SCAPER,RCN2 ETFA IMR90 Hi-C 24141950 SCAPER 15546 1468 chr15 78228086 78238431 78236984 N NA NA TBC1D2B,DNAJA4,IDH3A,CIB2,IREB2,LOC91450,SH2D7,WDR61,LOC645752,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 131563 1469 chr15 78254105 78255618 78255013 N NA NA IDH3A,DNAJA4,IREB2,LOC645752,TBC1D2B,WDR61,SH2D7,CIB2,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 114376 1470 chr15 79010552 79013548 79012643 N NA NA CHRNA5 IMR90 Hi-C 24141950 MORF4L1 151624 1471 chr15 79151222 79154058 79152771 Y IREB2 MORF4L1 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MORF4L1 11114 1472 chr15 79848501 79851231 79849260 N NA NA KIAA1024 IMR90 Hi-C 24141950 TMED3 245010 1473 chr15 80035919 80038175 80037095 N NA NA NA NA NA NA MTHFS 151452 1474 chr15 80060373 80070733 80069097 N NA NA TMED3,KIAA1024 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFS 118894 1475 chr15 81669990 81695440 81672634,81691410,81680946 N,N,N NA;NA;NA NA IL16,STARD5,TMC3,EFTUD1,MEX3B,MESDC2,C15orf26 IMR90 Hi-C 24141950 STARD5 53466 1476 chr15 81953706 81959942 81959712 N NA NA NA NA NA NA STARD5 337182 1477 chr15 82084454 82093869 82090590 N NA NA MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 244492 1478 chr15 82168017 82291036 82277882,82287624 N,N NA;NA MEX3B EFTUD1,MEX3B,IL16,STARD5,TMC3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEX3B 47325 1479 chr15 82359315 82363811 82360227 N NA MEX3B MEX3B MCF7 ChIA-PET 22265404 MEX3B 20954 1480 chr15 84946112 84947956 84946658 N NA LOC388152 NA NA NA NA LOC388152 47192 1481 chr15 85741544 85779941 85778051,85756979,85762332 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA AKAP13 143930 1482 chr15 86342629 86347716 86344234 N NA KLHL25 KLHL25 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHL25 4440 1483 chr15 86453361 86455270 86454322 N NA NA AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL25 115172 1484 chr15 86483237 86486449 86484991 N NA NA AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL25 145048 1485 chr15 86657487 86660731 86659289 N NA NA NA NA NA NA KLHL25 319298 1486 chr15 89483753 89486041 89483960 N NA MFGE8 NA NA NA NA MFGE8 27090 1487 chr15 89611868 89613308 89612103 N NA ABHD2 ABHD2,RLBP1 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD2 18073 1488 chr15 90487148 90487904 90487785 N NA C15orf38-AP3S2 MESP1,WDR93,IDH2,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf38-AP3S2 30926 1489 chr15 90691325 90694443 90692763 N NA IDH2,SEMA4B IDH2,C15orf38-AP3S2,SEMA4B,IQGAP1,ZNF710,C15orf58,CIB1,TTLL13,MESP1,WDR93,NGRN IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4B 33709 1490 chr15 90697187 90706861 90704605,90698636 N,N NA;NA SEMA4B IDH2,SEMA4B,ZNF710,C15orf58,MESP1,WDR93,IQGAP1,CIB1,NGRN,TTLL13 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 21291 1491 chr15 90707431 90710983 90708303,90709153 N,Y NA;NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 17169 1492 chr15 91381972 91406643 91382986 N NA MAN2A2 CRTC3,BLM,FURIN,FES IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAN2A2 40777 1493 chr15 93282533 93292764 93292074,93284897 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM174B 83502 1494 chr15 93302805 93312969 93305260,93310811 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM174B 103774 1495 chr15 93361562 93365880 93363739 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507217 60193 1496 chr15 93372748 93376870 93375282 Y NA LOC100507217 LOC100507217,CHD2,ASB9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507217 49203 1497 chr15 93398292 93401699 93399455 N NA LOC100507217,CHD2 LOC100507217 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100507217 24374 1498 chr15 93414047 93415383 93414443 N NA LOC100507217,CHD2 CHD2,LOC100507217 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507217 10690 1499 chr15 94273452 94274818 94273825 N NA NA NA NA NA NA MCTP2 566612 1500 chr15 94413527 94474973 94443889 N NA NA NA NA NA NA MCTP2 366457 1501 chr15 97409772 97410333 97409925 N NA NA NA NA NA NA ARRDC4 1093600 1502 chr15 98634695 98639760 98635284 N NA NA NA NA NA NA ARRDC4 130762 1503 chr15 99557059 99574835 99558185 N NA NA PGPEP1L,IGF1R MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TTC23 214980 1504 chr15 99600875 99603792 99602304 N NA NA IGF1R,PGPEP1L,FAM169B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TTC23 186023 1505 chr16 11469843 11473729 11472257 N NA NA NA NA NA NA SNN 288560 1506 chr16 11559536 11561620 11561109 N NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 SNN 200669 1507 chr16 11589873 11592453 11591410 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 SNN 169836 1508 chr16 11698007 11698643 11698541 N NA NA LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNN 63646 1509 chr16 11729720 11731658 11730387 N NA SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 SNN 30631 1510 chr16 12025860 12027773 12027134 N NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 15341 1511 chr16 12028460 12040119 12036780 N NA GSPT1 SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 GSPT1 17941 1512 chr16 12910929 12912434 12911308 N NA CPPED1 SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 CPPED1 13185 1513 chr16 12973366 12977128 12975399 N NA NA NA NA NA NA CPPED1 75622 1514 chr16 1345048 1349083 1347326 N NA BAIAP3 UNKL IMR90 Hi-C 24141950 BAIAP3 34523 1515 chr16 13699461 13701501 13700603 N NA NA NA NA NA NA ERCC4 312513 1516 chr16 13998482 13999626 13998979 N NA ERCC4 MKL2 IMR90 Hi-C 24141950 ERCC4 14388 1517 chr16 14437694 14440756 14438025 N NA NA PARN,ERCC4,MIR365A IMR90 Hi-C 24141950 MKL2 272498 1518 chr16 15192561 15204427 15203347 N NA NTAN1,RRN3 NA NA NA NA RRN3 4403 1519 chr16 15472839 15485863 15484616,15478043 N,N NA;NA MPV17L NA NA NA NA MPV17L 3748 1520 chr16 16487546 16490074 16489252 N NA NA NA NA NA NA PKD1P1 76080 1521 chr16 16711755 16713801 16712277 N NA NA NA NA NA NA PKD1P1 300289 1522 chr16 18417460 18449169 18417656,18431667,18431839,18447183 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA NOMO2 124265 1523 chr16 18458761 18470672 18469268,18469117 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NOMO2 102762 1524 chr16 18755375 18756972 18755907 N NA RPS15A NA NA NA NA RPS15A 44684 1525 chr16 19376066 19409428 19405103,19405457,19408159,19395286,19382215 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA CLEC19A,SYT17,TMC7,COQ7,ITPRIPL2,TMC5 IMR90 Hi-C 24141950 GDE1 124022 1526 chr16 20717805 20720057 20719090 N NA THUMPD1 NA NA NA NA THUMPD1 33142 1527 chr16 21844898 21856819 21848890,21855288 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UQCRC2 107790 1528 chr16 21859236 21882822 21879775,21860607,21878350 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA UQCRC2 81787 1529 chr16 21910695 21940067 21938969,21918373,21924421 N,N,N NA;NA;NA UQCRC2 NA NA NA NA UQCRC2 24542 1530 chr16 22206094 22208461 22207093 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 9131 1531 chr16 23307655 23309643 23308480 N NA NA SCNN1B MCF7 ChIA-PET 22265404 USP31 147064 1532 chr16 28276414 28279165 28277891 N NA SBK1 CCDC101,SBK1,NUPR1 IMR90 Hi-C 24141950 SBK1 24675 1533 chr16 28459756 28461906 28460699 N NA EIF3C,CLN3 NA NA NA NA EIF3C 21981 1534 chr16 28464866 28467404 28466206 N NA EIF3C,CLN3 NA NA NA NA EIF3C 27091 1535 chr16 28553570 28559874 28554686,28559005 Y,N SULT1A1,IL27;NA CLN3,NUPR1,CCDC101,SULT1A2 IL27,NUPR1,CCDC101,SULT1A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUPR1 3075 1536 chr16 28638501 28670593 28639220,28645836 N,N NA;NA SULT1A2,SULT1A1 IL27,APOBR IMR90 Hi-C 24141950 SULT1A1 3594 1537 chr16 28676256 28678788 28676740 N NA SULT1A1 NA NA NA NA SULT1A1 41349 1538 chr16 28790282 28792836 28790965 N NA ATXN2L NA NA NA NA ATXN2L 41578 1539 chr16 29064365 29068552 29065561 N NA RRN3P2 NA NA NA NA RRN3P2 17611 1540 chr16 2913467 2920177 2918230 Y NA ZG16B,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 13019 1541 chr16 29288519 29306587 29302456 N NA NA SNX29P2 IMR90 Hi-C 24141950 BOLA2B 159698 1542 chr16 29503563 29510657 29509982 N NA BOLA2B,SLX1B-SULT1A4 NA NA NA NA SLX1B-SULT1A4 37151 1543 chr16 29658900 29660867 29659373 N NA NA NA NA NA NA LOC440354 81360 1544 chr16 30642427 30652877 30645782,30643935 Y,N CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14;NA ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRR14 9364 1545 chr16 30655308 30658483 30656184 N NA ZNF689,PRR14,FBRS ITGAL,ZNF689,SEPHS2,SRCAP IMR90 Hi-C 24141950 PRR14 3758 1546 chr16 30815926 30822367 30816948 N NA RNF40,ZNF629 C16orf93,PHKG2,RNF40,ZNF629,MIR762,BCL7C,CTF1,MIR4519,FBXL19-AS1,FBXL19,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 17403 1547 chr16 30824027 30835165 30825809 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 25504 1548 chr16 31179579 31181661 31180775 N NA PRSS8,FUS ZNF646,ZNF668,KAT8,PRSS36,PRSS8,FUS IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FUS 9770 1549 chr16 3214735 3216524 3215490 N NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29678 1550 chr16 32311550 32312205 32311696 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 426471 1551 chr16 3231524 3235407 3232530,3234244 N,N NA;NA ZNF213 ZNF263,ZNF200 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF213 46467 1552 chr16 3237165 3238536 3238010 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 46921 1553 chr16 3243045 3244836 3243863 N NA ZNF200 NA NA NA NA ZNF200 40621 1554 chr16 32489015 32493106 32491704 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 603936 1555 chr16 32751160 32854834 32752519,32828221 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF267 866081 1556 chr16 33057462 33070209 33066037 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1172383 1557 chr16 33089715 33094330 33092642 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1204636 1558 chr16 33116904 33145031 33140521 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1231825 1559 chr16 33398381 33405704 33398780 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1513302 1560 chr16 33483771 33512438 33509768,33495498 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF267 1598692 1561 chr16 33699753 33703477 33700166 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1814674 1562 chr16 33800598 33802890 33801548 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1915519 1563 chr16 33843387 33855590 33848150,33852222,33845297 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF267 1958308 1564 chr16 33863941 33867836 33864868 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1978862 1565 chr16 33899445 33906425 33899603 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 2014366 1566 chr16 33914819 33936504 33926827,33934935 N,N NA;NA NA LINC00273 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF267 2029740 1567 chr16 33967451 33971822 33969879 N NA NA LINC00273 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF267 2082372 1568 chr16 33997173 33998772 33997963 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 2112094 1569 chr16 34020999 34023110 34022814 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 2135920 1570 chr16 34231131 34234356 34232765 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 2346052 1571 chr16 34905808 34907786 34906378 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 3020729 1572 chr16 35035889 35038036 35036929 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 3150810 1573 chr16 35263482 35283705 35281636 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 3378403 1574 chr16 3982782 3986045 3984642 N NA NA NA NA NA NA CREBBP 52661 1575 chr16 4179169 4181455 4180224 N NA ADCY9 SRL,TFAP4,CREBBP,ADCY9,TRAP1,LOC100507501,PAM16,CORO7-PAM16,GLIS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCY9 12983 1576 chr16 4334081 4363944 4350487,4339027,4355136,4357721,4362172 N,N,N,Y,N NA;NA;NA;CORO7;NA LOC100507501,TFAP4,GLIS2,PAM16 CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4,LOC100507501,HMOX2,NMRAL1,DNAJA3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 11080 1577 chr16 46807231 46808261 46807895 N NA NA MYLK3,C16orf87,VPS35,ORC6 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf87 56813 1578 chr16 47066822 47078120 47072010 N NA NA ABCC12,ABCC11,PHKB,MIR548AE2,DNAJA2,NETO2,ITFG1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJA2 59197 1579 chr16 47766192 47767998 47766515 N NA NA ITFG1,ABCC12,NETO2,DNAJA2,PHKB,ABCC11 IMR90 Hi-C 24141950 PHKB 270982 1580 chr16 47807530 47809280 47808729 N NA NA ITFG1,NETO2 IMR90 Hi-C 24141950 PHKB 312320 1581 chr16 48049083 48055517 48049422 N NA NA NA NA NA NA SIAH1 363712 1582 chr16 48474992 48479009 48476045 N NA NA SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 SIAH1 55763 1583 chr16 48515685 48517956 48516309 N NA NA NA NA NA NA SIAH1 96456 1584 chr16 48532280 48536317 48534097 N NA NA MIR548AE2,SIAH1,ABCC11,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 107803 1585 chr16 48662773 48693435 48672123,48664502 N,N NA;NA N4BP1 MIR548AE2,ABCC11,N4BP1,ITFG1,ABCC12,SIAH1,NETO2 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 18653 1586 chr16 5001232 5003333 5002408 N NA NA UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI IMR90 Hi-C 24141950 NAGPA 80609 1587 chr16 51269633 51270203 51269819 N NA NA NA NA NA NA BRD7 866788 1588 chr16 52326416 52330145 52328844 N NA NA NA NA NA NA CHD9 758800 1589 chr16 52689135 52691367 52690202 N NA NA NA NA NA NA CHD9 397578 1590 chr16 54521534 54525384 54523246 N NA NA NA NA NA NA IRX3 201156 1591 chr16 54542334 54544841 54543463 N NA NA NA NA NA NA IRX3 221956 1592 chr16 54572552 54577042 54574878 N NA NA NA NA NA NA IRX3 252174 1593 chr16 54677689 54685590 54679541,54683930 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CRNDE 277489 1594 chr16 54687146 54692853 54691541,54688891 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CRNDE 270226 1595 chr16 54772312 54774536 54773454 N NA NA NA NA NA NA CRNDE 188543 1596 chr16 56585025 56587468 56585953 N NA BBS2 AMFR,NUDT21,MT1B,BBS2,MT2A,MT3,MT1A,MT1JP,MT1DP,MT1M,MT1H,MT1X,MT1IP,MT1G,NUP93 IMR90 Hi-C 24141950 BBS2 31017 1597 chr16 57333275 57334905 57334185 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,POLR2C,DOK4,CCDC102A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,GPR114 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL2BP 54237 1598 chr16 57888614 57890475 57889060 N NA NA KIFC3,GPR56,KATNB1,CNGB1,C16orf80 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF319 143287 1599 chr16 58783411 58786777 58784927 N NA GOT2 NA NA NA NA GOT2 15165 1600 chr16 58849755 58851021 58850346 N NA NA NA NA NA NA GOT2 81509 1601 chr16 58886634 58888988 58887956 N NA NA NA NA NA NA GOT2 118388 1602 chr16 58924927 58927166 58926041 N NA NA NA NA NA NA GOT2 156681 1603 chr16 59397071 59399876 59397528 N NA NA NA NA NA NA GOT2 628825 1604 chr16 59656975 59659896 59658699 N NA NA NA NA NA NA GOT2 888729 1605 chr16 59919187 59921176 59919986 N NA NA NA NA NA NA GOT2 1150941 1606 chr16 60297126 60298660 60297753 N NA NA NA NA NA NA GOT2 1528880 1607 chr16 60491274 60557572 60556852 N NA NA NA NA NA NA GOT2 1723028 1608 chr16 62975401 62976683 62975764 N NA NA NA NA NA NA TK2 3607632 1609 chr16 63025574 63032425 63026374 N NA NA NA NA NA NA TK2 3551890 1610 chr16 63149632 63149908 63149752 N NA NA NA NA NA NA TK2 3434407 1611 chr16 64466728 64467725 64466957 N NA NA CDH11 IMR90 Hi-C 24141950 TK2 2116590 1612 chr16 67547179 67556664 67555326 N NA ATP6V0D1,FAM65A,CTCF AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,C16orf48,C16orf86 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM65A 6053 1613 chr16 68511017 68512164 68511557 N NA NA SMPD3,CDH3,CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 61497 1614 chr16 68563182 68568702 68564357 N NA ZFP90 CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 4959 1615 chr16 68648929 68650756 68649494 N NA NA CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 75268 1616 chr16 69429490 69432177 69430500 N NA TMED6,TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 9616 1617 chr16 69450148 69453661 69451944 N NA TERF2,CYB5B CYB5B,COG8,NIP7,TMED6,TERF2,MIR1538,NFAT5,NQO1,WWP2,NOB1,KCTD16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CYB5B 4837 1618 chr16 71622685 71624221 71623440 N NA MARVELD3 HP,HPR,TAT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARVELD3 35849 1619 chr16 72424213 72459392 72448628,72459218,72441419 N,Y,N NA;NA;NA NA HPR,ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 DHX38 296598 1620 chr16 72583101 72601339 72594773,72600297 N,N NA;NA NA HTA IMR90 Hi-C 24141950 DHX38 455486 1621 chr16 72641362 72662212 72661229,72644677 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZFHX3 430322 1622 chr16 72667072 72775918 72684725,72698959,72711875,72737088,72671844 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA ZFHX3,HP,HPR IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 316616 1623 chr16 73102713 73108676 73104542 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 10179 1624 chr16 73204311 73206123 73205334 N NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 111777 1625 chr16 74875545 74878585 74877657 N NA NA RFWD3,FA2H,WDR59 IMR90 Hi-C 24141950 WDR59 140432 1626 chr16 75867744 75869205 75867991 N NA NA NA NA NA NA TERF2IP 186109 1627 chr16 75888150 75889141 75888479 N NA NA NA NA NA NA TERF2IP 206515 1628 chr16 76137973 76139096 76138687 N NA NA NA NA NA NA TERF2IP 456338 1629 chr16 76253515 76257834 76255035 N NA NA NA NA NA NA TERF2IP 571880 1630 chr16 79405368 79407206 79406065 N NA NA MAF MCF7 ChIA-PET 22265404 MAF 227416 1631 chr16 79719954 79730712 79723071,79729437 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAF 85332 1632 chr16 79791921 79806805 79804488,79802198 N,N NA;NA NA WWOX,MAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAF 157299 1633 chr16 79920348 79923356 79921557 N NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 285726 1634 chr16 80222645 80225202 80223859 N NA NA NA NA NA NA MAF 588023 1635 chr16 80868941 80873687 80871505 N NA CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 30766 1636 chr16 80903297 80906069 80904929 N NA NA NA NA NA NA CDYL2 65122 1637 chr16 80908215 80912278 80910353 N NA NA NA NA NA NA CDYL2 70040 1638 chr16 80933390 80936160 80934370 N NA NA NA NA NA NA CDYL2 95215 1639 chr16 82255816 82266205 82265132 N NA NA PLCG2,SDR42E1,HSD17B2 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 51987 1640 chr16 82362242 82364829 82363612 N NA NA CDH13 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 158413 1641 chr16 8289298 8292377 8290938 N NA NA NA NA NA NA METTL22 423150 1642 chr16 85354234 85369598 85355709 Y NA NA FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311,LOC400548 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 275431 1643 chr16 85411437 85637787 85631811,85592054,85535184,85557438,85509449,85593853,85418577,85549950,85525940 N,N,N,Y,N,N,Y,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA KIAA0182 LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2,FAM92B,KIAA0513,LOC400548,C16orf74,ZDHHC7,COX4NB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 7242 1644 chr16 86002345 86002869 86002610 N NA NA COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550,C16orf74,IRF8 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1 169172 1645 chr16 86895251 86904640 86903430 N NA NA FOXL1,C16orf95,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 306410 1646 chr16 87548488 87549773 87549132 N NA ZCCHC14 JPH3,MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC14 23028 1647 chr16 87596155 87596493 87596412 N NA NA KLHDC4,MAP1LC3B,FBXO31,ZCCHC14,C16orf95,JPH3,CA5A IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC14 70695 1648 chr16 87808317 87820574 87812859 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 8719 1649 chr16 88272994 88302715 88273294,88298785 N,N NA;NA NA BANP,ZNF469,CA5A IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 217299 1650 chr16 89116928 89120983 89119444 N NA ACSF3 CBFA2T3,ACSF3,CDH15,PIEZO1,LOC400558,SLC22A31,TRAPPC2L,GALNS,LINC00304 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSF3 39234 1651 chr16 90148042 90156836 90148832 N NA NA GAS8,DBNDD1,PRDM7,LOC100130015 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GAS8 59034 1652 chr16 90261824 90294678 90261981 N NA NA NA NA NA NA GAS8 172816 1653 chr16 9075651 9077366 9076522 N NA USP7 USP7 IMR90 Hi-C 24141950 USP7 18310 1654 chr16 9140622 9143204 9141851 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 42333 1655 chr16 9457722 9465975 9459076 N NA NA ATF7IP2,GRIN2A IMR90 Hi-C 24141950 C16orf72 272185 1656 chr16 9678139 9684789 9678323 N NA NA NA NA NA NA C16orf72 492602 1657 chr17 1139751 1141414 1140806 N NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 49135 1658 chr17 1149003 1153373 1149849 N NA NA ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 58387 1659 chr17 12353022 12359367 12353302 N NA NA FLJ34690 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP44 333462 1660 chr17 12437966 12440715 12439644 N NA NA FLJ34690,MYOCD IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP44 252114 1661 chr17 13085022 13088621 13086162 N NA NA NA NA NA NA ELAC2 163641 1662 chr17 13520318 13520840 13520661 N NA NA COX10 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 451879 1663 chr17 14698688 14701436 14700409 N NA NA HS3ST3A1,HS3ST3B1 IMR90 Hi-C 24141950 CDRT4 669489 1664 chr17 16490325 16493302 16492797 N NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 17805 1665 chr17 16909389 16911137 16909864 N NA MPRIP FLCN IMR90 Hi-C 24141950 MPRIP 34937 1666 chr17 16920619 16923005 16922083 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 23069 1667 chr17 17286520 17287400 17286921 N NA NA PEMT,MED9,SMCR9,SREBF1,TOM1L2 IMR90 Hi-C 24141950 NT5M 79840 1668 chr17 17348186 17350528 17349708 N NA MED9,RASD1 MED9,PEMT MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MED9 29772 1669 chr17 18966141 18978281 18967578,18973823,18973829 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM83G 58081 1670 chr17 19007568 19010793 19008142 N NA NA NA NA NA NA FAM83G 99508 1671 chr17 19014632 19023410 19016108 N NA NA NA NA NA NA FAM83G 106572 1672 chr17 19349103 19350295 19349858 N NA NA NA NA NA NA B9D1 67608 1673 chr17 19404100 19412667 19411593,19408437 N,N NA;NA NA EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 122605 1674 chr17 19433061 19434754 19434061 N NA NA NA NA NA NA ALDH3A2 117310 1675 chr17 19505618 19507804 19506635 N NA ALDH3A2 SLC47A2,ALDH3A2,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH3A2 44260 1676 chr17 19528560 19532370 19530153 N NA ALDH3A2 ALDH3A2,SLC47A2 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH3A2 19694 1677 chr17 19897402 19899567 19898629 N NA AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 13082 1678 chr17 20430892 20437099 20435888 N NA NA NA NA NA NA CCDC144C 206405 1679 chr17 20439607 20442081 20439968 N NA NA NA NA NA NA CCDC144C 215120 1680 chr17 20517789 20520017 20519271 N NA NA NA NA NA NA CCDC144C 293302 1681 chr17 20810164 20813867 20812005 N NA NA USP22 IMR90 Hi-C 24141950 USP22 132485 1682 chr17 21176391 21184663 21179210 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 3305 1683 chr17 21727925 21730215 21728238 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L1 292222 1684 chr17 21755954 21758060 21757023 N NA NA KCNJ12 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L1 264377 1685 chr17 21850107 21851588 21850602 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L1 170849 1686 chr17 25262923 25292124 25285479,25288939,25263123 N,N,N NA;NA;NA NA KCNJ12 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 328982 1687 chr17 25295092 25298868 25298393 N NA NA KCNJ12 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 322238 1688 chr17 25371194 25473843 25385447,25416425,25411210 N,Y,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA WSB1 147263 1689 chr17 26293436 26294354 26293835 N NA NA C17orf108,NLK IMR90 Hi-C 24141950 C17orf108 73027 1690 chr17 27549961 27552363 27550197 N NA MYO18A NUFIP2,SEZ6,MYO18A,CRYBA1,TAOK1,ABHD15 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 42554 1691 chr17 27700689 27708532 27706562 N NA TAOK1 MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAOK1 9411 1692 chr17 28667657 28668649 28668495 N NA BLMH,CPD NSRP1,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH,TMIGD1,CPD,GOSR1,SUZ12P IMR90 Hi-C 24141950 CPD 37293 1693 chr17 28670297 28673061 28671689 N NA CPD NSRP1,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH,TMIGD1,CPD,GOSR1,SUZ12P IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPD 32881 1694 chr17 28695902 28698054 28697245 N NA CPD CPD,GOSR1,SLC6A4,TMIGD1 IMR90 Hi-C 24141950 CPD 7888 1695 chr17 29024333 29029724 29026078 N NA SUZ12P NA NA NA NA SUZ12P 6902 1696 chr17 30154843 30157542 30155424 N NA C17orf79 NA NA NA NA C17orf79 28784 1697 chr17 30424282 30426528 30425461 N NA RHOT1 RHOT1,SUZ12 IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 42945 1698 chr17 31237950 31240389 31239522 N NA MYO1D,TMEM98 MYO1D,ACCN1,TMEM98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM98 14539 1699 chr17 33554854 33562296 33561153 N NA SLFN5 NLE1,UNC45B,SLFN5,SLFN14,SLC35G3,SLFN12,SLFN11 IMR90 Hi-C 24141950 SLFN5 7790 1700 chr17 33647555 33648862 33647740 N NA NA UNC45B IMR90 Hi-C 24141950 SLFN5 77469 1701 chr17 35077251 35090178 35078698 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 119226 1702 chr17 3515381 3535834 3534863,3529117,3531631 N,N,N NA;NA;NA TRPV1,CTNS,TAX1BP3 TRPV3,TRPV1 IMR90 Hi-C 24141950 TRPV1 2676 1703 chr17 36448243 36449751 36449439 N NA LOC440434,MRPL45 NA NA NA NA MRPL45 3238 1704 chr17 37772082 37777539 37774550 N NA STARD3,TCAP PPP1R1B,STARD3,TCAP K562 ChIA-PET 22265404 STARD3 15794 1705 chr17 38751141 38754231 38752709 Y KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP3-2,CASC3,WIPF2,RARA,RARA,CCR7 SMARCE1 KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCE1 49872 1706 chr17 39806203 39823613 39822333,39823421,39817817 Y,Y,N NA;NA;NA EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9,KRT16,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-1,KRTAP17-1,KRT14 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 21514 1707 chr17 41557198 41557480 41557358 N NA DHX8 NA NA NA NA DHX8 3854 1708 chr17 41677974 41681827 41678851 N NA NA DHX8,MEOX1,SOST IMR90 Hi-C 24141950 DHX8 116640 1709 chr17 42212209 42214954 42212474,42213940 N,N NA;NA HDAC5,C17orf65,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 HDAC5 11195 1710 chr17 42683553 42687901 42686216 N NA NA GPATCH8,CCDC43,C17orf104,FZD2,DBF4B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC43 79264 1711 chr17 43274082 43278139 43275358 N NA HEXIM1,LOC100133991 HEXIM1,ACBD4,PLCD3,HEXIM2,LOC100133991,MAP3K14,TEX34 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100133991 47164 1712 chr17 43291350 43293212 43292283 N NA LOC100133991 NMT1,PLCD3,FMNL1,LOC100133991,MAP3K14,ARHGAP27 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100133991 32091 1713 chr17 44308687 44331101 44312145,44329592 N,N NA;NA KANSL1-AS1,KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1 IMR90 Hi-C 24141950 KANSL1 5947 1714 chr17 4481048 4482825 4481349 N NA MYBBP1A SMTNL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYBBP1A 22367 1715 chr17 45077859 45133060 45126412,45091802 N,N NA;NA NA GOSR2,RPRML,WNT9B,ITGB3,CDC27,WNT3 IMR90 Hi-C 24141950 GOSR2 77373 1716 chr17 47500413 47502337 47501858 N NA PHB ZNF652,SPOP,FAM117A,KAT7 IMR90 Hi-C 24141950 PHB 8171 1717 chr17 47612404 47614117 47612768 N NA NA NA NA NA NA PHB 120162 1718 chr17 47644895 47647486 47645456 N NA NA ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPOP 108039 1719 chr17 48313152 48315652 48313544 N NA NA ITGA3,PDK2,PPP1R9B,HILS1,SGCA,COL1A1,TMEM92 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R9B 85275 1720 chr17 48978580 49008097 48981846,48986813,48997144,48992881 Y,N,Y,N RSAD1;NA;UTP18,RSAD1,TOB1;NA LOC400604,TOB1 LINC00483,WFIKKN2,LOC400604,TOB1,SPAG9,SPATA20,EPN3,ANKRD40 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 33241 1721 chr17 49433997 49436581 49434636 N NA NA NA NA NA NA UTP18 96100 1722 chr17 49443997 49446189 49445083 N NA NA NA NA NA NA UTP18 106100 1723 chr17 49579504 49580698 49580611 N NA NA NA NA NA NA UTP18 241607 1724 chr17 50480820 50487320 50481183 N NA NA NA NA NA NA UTP18 1142923 1725 chr17 51183001 51183868 51183437 N NA NA NA NA NA NA TOM1L1 1794184 1726 chr17 51834191 51838248 51834749 N NA NA NA NA NA NA TOM1L1 1139804 1727 chr17 52202687 52210772 52203282 N NA NA NA NA NA NA TOM1L1 767280 1728 chr17 52592730 52594708 52593174 N NA NA NA NA NA NA TOM1L1 383344 1729 chr17 53313550 53317696 53315854 Y HLF NA STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 181645 1730 chr17 53523182 53526358 53524316 N NA MMD PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 23841 1731 chr17 53955887 53956348 53956231 N NA NA NA NA NA NA PCTP 127547 1732 chr17 55108727 55112044 55110694 N NA NA RNF126P1,SCPEP1 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP1 50509 1733 chr17 55291148 55295766 55292903 Y NA MSI2 MSI2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MSI2 38165 1734 chr17 58203636 58207432 58207114 N NA HEATR6 C17orf64 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR6 47344 1735 chr17 59587855 59591959 59588909 N NA NA BRIP1,TBX4,BCAS3 IMR90 Hi-C 24141950 INTS2 413418 1736 chr17 59629017 59630242 59629443 N NA NA BCAS3,TBX4 IMR90 Hi-C 24141950 INTS2 375135 1737 chr17 60213609 60214161 60213635 N NA NA MIR548W MCF7 ChIA-PET 22265404 MED13 70966 1738 chr17 60241844 60243416 60243335 N NA NA NA NA NA NA MED13 99201 1739 chr17 60295180 60296953 60296578 N NA NA MED13 IMR90 Hi-C 24141950 MED13 152537 1740 chr17 60357877 60359825 60357922 N NA NA NA NA NA NA METTL2A 141421 1741 chr17 61550524 61552413 61551709 N NA CYB561 ACE K562 ChIA-PET 22265404 CYB561 26802 1742 chr17 6279537 6280630 6280550 N NA NA LOC339166,WSCD1,AIPL1 IMR90 Hi-C 24141950 TXNDC17 263592 1743 chr17 63092268 63113143 63096801 N NA GNA13 RGS9,LRRC37A3,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 39348 1744 chr17 64244995 64246038 64245380 N NA NA PRKCA IMR90 Hi-C 24141950 PRKCA 52888 1745 chr17 64284354 64286361 64285982 N NA PRKCA PRKCA IMR90 Hi-C 24141950 PRKCA 12565 1746 chr17 64947287 64949634 64948258 N NA NA CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HELZ 291685 1747 chr17 65778294 65781594 65779695 N NA BPTF BPTF IMR90 Hi-C 24141950 BPTF 40186 1748 chr17 66014767 66027111 66016157 Y NA KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 4737 1749 chr17 66754980 66756685 66755678 N NA NA FAM20A,ABCA10,ABCA9,ABCA8,PRKAR1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 246870 1750 chr17 66822407 66825398 66823081 N NA NA ABCA8 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1A 314297 1751 chr17 67277082 67279545 67278683 N NA NA NA NA NA NA PRKAR1A 768972 1752 chr17 67294848 67325709 67299759,67323355 N,N NA;NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 786738 1753 chr17 67389704 67391776 67390665 N NA NA NA NA NA NA PRKAR1A 881594 1754 chr17 67791903 67792715 67792025 N NA NA KCNJ16 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1A 1283793 1755 chr17 6838211 6842817 6839924 Y XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49 NA ASGR1,LOC100506713,MED31,C17orf100,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,ALOX12P2,ALOX12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506713 72836 1756 chr17 68850892 68854243 68851875 N NA NA SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 1262918 1757 chr17 68992399 68994783 68993696 N NA NA NA NA NA NA SOX9 1122378 1758 chr17 70145338 70149481 70147845 Y NA SOX9 SOX9,LOC100499467 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOX9 28177 1759 chr17 70178299 70180246 70179204 N NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 61138 1760 chr17 70229231 70231278 70230255 N NA NA SOX9,LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 112070 1761 chr17 71102206 71104061 71102769 N NA SLC39A11 SLC39A11,LINC00511,COG1,FAM104A,C17orf80 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A11 13353 1762 chr17 74849361 74850517 74849831 N NA NA MFSD11,SEC14L1,SRSF2,METTL23 IMR90 Hi-C 24141950 SRSF2 115868 1763 chr17 75773555 75776978 75775406 Y TMEM235 NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 223340 1764 chr17 75915838 75917256 75916358 N NA NA TNRC6C,LOC100507351,MGAT5B,FLJ45079 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 83062 1765 chr17 75953329 75972498 75954678 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351,FLJ45079,TK1,SEPT9,LOC100131096 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 27820 1766 chr17 76308190 76310989 76309986 N NA NA PGS1,DNAH17,CYTH1,TMEM235,BIRC5,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGS1 63746 1767 chr17 77630732 77641095 77639113 N NA NA RBFOX3 IMR90 Hi-C 24141950 CBX2 110882 1768 chr17 79309590 79319928 79318506 N NA SLC38A10 ACTG1,SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,C17orf56,C17orf89,MIR3186,NPLOC4 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A10 40494 1769 chr17 79320805 79325570 79322700,79325386 N,N NA;NA BAHCC1 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BAHCC1 47970 1770 chr17 8586392 8586886 8586678 N NA NA MYH10 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 52313 1771 chr17 8594762 8598821 8596451 N NA NA MYH10,RPL26,RNF222 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 60683 1772 chr18 10222335 10225674 10224807 N NA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 300199 1773 chr18 10300950 10303066 10301866 N NA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 222807 1774 chr18 11476934 11480372 11477297 N NA NA PIEZO2 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 501055 1775 chr18 11615820 11633729 11625686 N NA NA NA NA NA NA IMPA2 347698 1776 chr18 11945585 11948849 11946502 N NA IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 32578 1777 chr18 12065704 12092931 12068298,12076729 N,N NA;NA NA GNAL IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 84277 1778 chr18 12140729 12187232 12148372 N NA NA NA NA NA NA IMPA2 159302 1779 chr18 12211287 12231161 12212079 N NA NA TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 AFG3L2 146114 1780 chr18 12907012 12910780 12907702 N NA PTPN2,SEH1L PSMG2,PTPN2,CEP76,SEH1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN2 22678 1781 chr18 12917049 12921072 12918576 N NA PTPN2,SEH1L PTPN2,PSMG2,CEP76,SEH1L IMR90 Hi-C 24141950 SEH1L 26911 1782 chr18 1391929 1394577 1392868 N NA NA NA NA NA NA YES1 579602 1783 chr18 13981016 13981987 13981927 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 150502 1784 chr18 14276477 14292833 14283886 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 143988 1785 chr18 14296092 14307738 14302123 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 163603 1786 chr18 14312667 14327085 14319863 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 180178 1787 chr18 14427561 14433432 14431490 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 295072 1788 chr18 14981955 14984711 14983776 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 849466 1789 chr18 14999191 15004572 15000340 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 866702 1790 chr18 15009570 15010624 15010271 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 877081 1791 chr18 15370912 15374186 15372408 N NA NA NA NA NA NA ZNF519 1238423 1792 chr18 18746380 18750460 18748415 N NA NA ROCK1 IMR90 Hi-C 24141950 ROCK1 54568 1793 chr18 18803469 18810623 18804389 N NA GREB1L GREB1L IMR90 Hi-C 24141950 GREB1L 11580 1794 chr18 19624024 19626363 19625010 N NA NA NA NA NA NA GATA6 123053 1795 chr18 19967 22431 20071,21669 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ROCK1P1 86634 1796 chr18 21998977 22003253 22001869 N NA OSBPL1A,IMPACT IMPACT,HRH4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IMPACT 3356 1797 chr18 22198828 22205145 22198991 N NA NA NA NA NA NA IMPACT 192219 1798 chr18 22296186 22296917 22296778 N NA NA NA NA NA NA IMPACT 289577 1799 chr18 2257213 2261373 2259535 N NA NA ADCYAP1 IMR90 Hi-C 24141950 METTL4 310116 1800 chr18 22613186 22613962 22613692 N NA NA ZNF521 IMR90 Hi-C 24141950 IMPACT 606577 1801 chr18 23554415 23556521 23555240 N NA NA NA NA NA NA SS18 114090 1802 chr18 24237610 24240912 24239317 N NA NA TAF4B,KCTD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SS18 566999 1803 chr18 24323678 24328692 24326366 N NA NA NA NA NA NA SS18 653067 1804 chr18 24342076 24343615 24342195 N NA NA NA NA NA NA SS18 671465 1805 chr18 24811369 24812760 24811876 N NA NA NA NA NA NA SS18 1140758 1806 chr18 25076222 25079628 25077442 N NA NA NA NA NA NA SS18 1405611 1807 chr18 28070505 28071953 28071133 N NA NA NA NA NA NA DSC2 610435 1808 chr18 2842142 2842642 2842404 N NA NA EMILIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 169303 1809 chr18 28777625 28781819 28779864 N NA NA NA NA NA NA DSC2 95237 1810 chr18 28820456 28823611 28822008 N NA NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 138068 1811 chr18 290627 295279 291804 N NA THOC1 YES1,COLEC12,CLUL1,CETN1 IMR90 Hi-C 24141950 THOC1 22568 1812 chr18 3044138 3046805 3045227 N NA LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 32193 1813 chr18 31845816 31912615 31884968,31905298,31911024 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA DTNA 160639 1814 chr18 32508371 32511920 32509472 N NA MAPRE2 MAPRE2 IMR90 Hi-C 24141950 MAPRE2 44972 1815 chr18 32515221 32517597 32516610 N NA MAPRE2 NA NA NA NA MAPRE2 39295 1816 chr18 33154386 33155079 33154905 N NA NA NA NA NA NA INO80C 76431 1817 chr18 3339654 3342131 3341050 N NA NA TGIF1,DLGAP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYL12B 77543 1818 chr18 33422654 33425209 33423733 N NA NA NA NA NA NA C18orf21 127379 1819 chr18 3394738 3397957 3396462 N NA NA DLGAP1,TGIF1,FLJ35776 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYL12B 132627 1820 chr18 35398175 35401943 35399714 N NA NA NA NA NA NA TPGS2 989017 1821 chr18 36299054 36301835 36300301 N NA NA NA NA NA NA TPGS2 1889896 1822 chr18 37488702 37491215 37489785 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 2043984 1823 chr18 39211333 39216309 39212567 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 318890 1824 chr18 39692737 39696159 39694478 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 157538 1825 chr18 40716973 40723556 40720372 N NA NA NA NA NA NA SYT4 134059 1826 chr18 40753413 40757036 40755291 N NA NA NA NA NA NA SYT4 100579 1827 chr18 40768007 40770655 40769586 N NA NA NA NA NA NA SYT4 86960 1828 chr18 40772411 40777285 40775189 N NA NA NA NA NA NA SYT4 80330 1829 chr18 40803819 40805673 40804102 N NA NA NA NA NA NA SYT4 51942 1830 chr18 40968255 40975138 40969224,40972993 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SYT4 110640 1831 chr18 41330276 41371298 41365397,41342727 N,N NA;NA NA SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 SYT4 472661 1832 chr18 41374854 41380115 41378102 N NA NA SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 SYT4 517239 1833 chr18 41453647 41457915 41456244 N NA NA NA NA NA NA SYT4 596032 1834 chr18 41509394 41518847 41512440,41516301 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SYT4 651779 1835 chr18 41534798 41537747 41536545 N NA NA NA NA NA NA SYT4 677183 1836 chr18 41644469 41649373 41647054 N NA NA NA NA NA NA SETBP1 611490 1837 chr18 41811599 41814305 41812704 N NA NA NA NA NA NA SETBP1 446558 1838 chr18 41900023 41900686 41900287 N NA NA NA NA NA NA SETBP1 360177 1839 chr18 42120981 42123282 42121869 N NA NA SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 SETBP1 137581 1840 chr18 44874023 44881059 44874590 N NA NA NA NA NA NA IER3IP1 171278 1841 chr18 44948603 44949788 44949200 N NA NA NA NA NA NA IER3IP1 245858 1842 chr18 45873667 45885439 45883688 N NA NA ZBTB7C IMR90 Hi-C 24141950 CTIF 179988 1843 chr18 45936156 45937985 45936821 N NA NA NA NA NA NA CTIF 127442 1844 chr18 46497775 46505951 46502336 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 20694 1845 chr18 47189077 47192755 47190825 N NA NA ACAA2,MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 RPL17-C18ORF32 170142 1846 chr18 47207045 47208772 47207953 N NA NA MYO5B,LIPG,ACAA2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL17-C18ORF32 188110 1847 chr18 47832740 47835305 47834283 Y CCDC11,MBD1,MBD1 MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 18048 1848 chr18 48886347 48887544 48886605 N NA NA NA NA NA NA MEX3C 162296 1849 chr18 49371321 49374728 49372078 N NA NA NA NA NA NA MEX3C 647270 1850 chr18 514692 517656 515949 N NA COLEC12 COLEC12,CLUL1 IMR90 Hi-C 24141950 COLEC12 13963 1851 chr18 51761263 51763923 51762634 N NA MBD2,POLI POLI,MBD2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MBD2 10105 1852 chr18 51779103 51783746 51781294 N NA MBD2,POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 12103 1853 chr18 52395731 52396287 52396019 N NA NA RAB27B,WDR7 IMR90 Hi-C 24141950 POLI 599882 1854 chr18 52432621 52436510 52434570 N NA NA CCDC68 IMR90 Hi-C 24141950 POLI 636772 1855 chr18 52443566 52445889 52444959 N NA NA CCDC68 IMR90 Hi-C 24141950 POLI 647717 1856 chr18 52710903 52712308 52711634 N NA NA NA NA NA NA POLI 915054 1857 chr18 53350721 53522338 53413536,53382760,53364653,53389170 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA TXNL1,TCF4,WDR7,MIR4529,LOC100505474 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 783582 1858 chr18 53560235 53721518 53564652,53707555,53560713 N,N,N NA;NA;NA NA TCF4,LOC100505474,TXNL1 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 584402 1859 chr18 55486508 55490686 55487556 N NA ATP8B1 ATP8B1,NEDD4L,LOC100505549,ALPK2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP8B1 16181 1860 chr18 55511645 55512826 55512140 N NA ATP8B1 ATP8B1,NEDD4L,ALPK2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP8B1 41318 1861 chr18 55528573 55530500 55528992 N NA NA ATP8B1,NEDD4L,ALPK2,LOC100505549 IMR90 Hi-C 24141950 ATP8B1 58246 1862 chr18 55685361 55686717 55685948 N NA NEDD4L NEDD4L,ATP8B1 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD4L 24893 1863 chr18 56280 72328 58468,71547 N,N NA;NA ROCK1P1 NA NA NA NA ROCK1P1 36737 1864 chr18 56443399 56459250 56446288,56452754,56456562 N,N,N NA;NA;NA NA ALPK2,ZNF532,LOC390858,GRP,NEDD4L,SEC11C,MALT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF532 70811 1865 chr18 56471707 56474322 56472924 N NA NA ZNF532,LOC390858,GRP,ALPK2,MALT1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF532 55739 1866 chr18 566439 570476 569036 N NA NA COLEC12,THOC1,CLUL1 IMR90 Hi-C 24141950 COLEC12 65710 1867 chr18 56674772 56677356 56675857 N NA NA ALPK2,ZNF532,LOC390858 IMR90 Hi-C 24141950 SEC11C 129769 1868 chr18 56762211 56763483 56762595 N NA SEC11C SEC11C IMR90 Hi-C 24141950 SEC11C 43642 1869 chr18 57516936 57520246 57519039 N NA PMAIP1 PMAIP1,CCBE1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 46946 1870 chr18 57636926 57639242 57637057 N NA NA PMAIP1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 69734 1871 chr18 57694628 57706094 57696908 N NA NA NA NA NA NA PMAIP1 127436 1872 chr18 59562623 59569082 59563078,59567530 N,N NA;NA NA RNF152 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIGN 285207 1873 chr18 60091101 60093948 60092545 N NA NA PHLPP1,ZCCHC2,BCL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC2 96710 1874 chr18 60296605 60297997 60297276 N NA NA PHLPP1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLPP1 84675 1875 chr18 60741034 60742890 60742088 N NA NA NA NA NA NA KDSR 291616 1876 chr18 61118985 61120439 61119824 N NA VPS4B NA NA NA NA VPS4B 29233 1877 chr18 61345833 61347374 61346414 N NA NA SERPINB7,HMSD,SERPINB10 HELA,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 VPS4B 256081 1878 chr18 61348370 61351687 61349833 N NA NA SERPINB10,SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 VPS4B 258618 1879 chr18 62272098 62273786 62272432 N NA NA NA NA NA NA VPS4B 1182346 1880 chr18 63571758 63575647 63573915 N NA NA NA NA NA NA DSEL 1608320 1881 chr18 63982300 63989094 63988075 N NA NA NA NA NA NA DSEL 1194873 1882 chr18 65026367 65028864 65027571 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 155103 1883 chr18 65895465 65899454 65896732 N NA NA NA NA NA NA TMX3 482899 1884 chr18 65944916 65945955 65945496 N NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 TMX3 436398 1885 chr18 66150146 66153099 66151880 N NA NA LOC643542,DSEL IMR90 Hi-C 24141950 TMX3 229254 1886 chr18 6623949 6624741 6624568 Y NA NA LOC100130480,ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 PTPRM 942573 1887 chr18 67027663 67029072 67028536 N NA NA RTTN IMR90 Hi-C 24141950 TMX3 645310 1888 chr18 68145842 68147553 68146792 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 189705 1889 chr18 68189029 68191947 68190547 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 232892 1890 chr18 70239725 70241585 70240614 N NA NA NA NA NA NA NETO1 293225 1891 chr18 70366970 70373769 70367940 N NA NA FBXO15 IMR90 Hi-C 24141950 NETO1 161041 1892 chr18 70631730 70639913 70632817 N NA NA NA NA NA NA NETO1 96920 1893 chr18 70658866 70662812 70661125 N NA NA NA NA NA NA NETO1 124056 1894 chr18 70706832 70717078 70710601,70708440,70714377,70715089 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA NETO1 172022 1895 chr18 70962795 70965859 70964157 N NA NA NA NA NA NA NETO1 427985 1896 chr18 70980043 70987879 70986101,70981717 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NETO1 445233 1897 chr18 71047627 71050478 71049117 N NA NA NA NA NA NA NETO1 512817 1898 chr18 71127755 71130793 71129126 N NA NA NA NA NA NA NETO1 592945 1899 chr18 71170516 71174255 71172485 N NA NA FBXO15 IMR90 Hi-C 24141950 NETO1 635706 1900 chr18 71197012 71200850 71199125 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 614896 1901 chr18 71290873 71296210 71293681,71292086 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TIMM21 519536 1902 chr18 71326059 71331247 71328921 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 484499 1903 chr18 71438815 71444141 71442211 N NA NA NETO1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 371605 1904 chr18 71455621 71458409 71457155 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 357337 1905 chr18 71473756 71476524 71474989 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 339222 1906 chr18 71508423 71510816 71509878 N NA NA LOC400655,NETO1,FBXO15 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 304930 1907 chr18 71653034 71654985 71654134 N NA NA NETO1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 160761 1908 chr18 71862824 71864843 71863197 N NA TIMM21 FBXO15,TIMM21,C18orf63,CYB5A,CNDP2 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 47078 1909 chr18 7198959 7201056 7199191 N NA NA NA NA NA NA PTPRM 366258 1910 chr18 7220102 7221092 7220340 N NA NA NA NA NA NA PTPRM 346222 1911 chr18 72843374 72854237 72844736 N NA NA NA NA NA NA ZADH2 67044 1912 chr18 7300897 7302630 7301337 N NA NA PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 PTPRM 264684 1913 chr18 73032738 73034361 73033018 N NA NA ZNF407,TSHZ1 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ1 110028 1914 chr18 7369339 7372927 7370825 N NA NA NA NA NA NA PTPRM 194387 1915 chr18 73878275 73969358 73967245,73968469 N,N NA;NA NA LOC339298 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131655 564893 1916 chr18 74356734 74358865 74357997 N NA NA NA NA NA NA LOC100131655 175386 1917 chr18 74471432 74473474 74472015 N NA NA NA NA NA NA LOC100131655 60777 1918 chr18 75146411 75255630 75149249 Y NA NA NA NA NA NA MBP 301637 1919 chr18 827638 829305 828325 N NA YES1 CLUL1,ENOSF1,YES1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YES1 15311 1920 chr18 8497091 8498741 8497696 N NA NA PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 110702 1921 chr18 89246 92036 91104 N NA ROCK1P1 NA NA NA NA ROCK1P1 17029 1922 chr18 8988753 8993297 8990747 N NA NA CCDC165,RAB12,RALBP1,NDUFV2,ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 109331 1923 chr18 9023139 9024396 9023753 N NA NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 78232 1924 chr18 9443882 9444277 9444083 N NA RALBP1 ANKRD12,TWSG1,RALBP1,PPP4R1 IMR90 Hi-C 24141950 RALBP1 31253 1925 chr19 13677957 13680418 13678726 N NA NA CACNA1A,NACC1,STX10,NFIX,LYL1,TRMT1,IER2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 178335 1926 chr19 13730405 13732133 13730777 N NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 126620 1927 chr19 14380424 14382766 14381214 N NA NA LOC100507373,C19orf57,LPHN1,PALM3,RLN3,LOC113230,IL27RA,CD97,DDX39A IMR90 Hi-C 24141950 LPHN1 63427 1928 chr19 14424730 14427932 14426453 N NA NA NA NA NA NA CD97 64024 1929 chr19 14450434 14465987 14464645 N NA CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,PODNL1,DCAF15,CC2D1A,PRKACA,SAMD1,PKN1,DDX39A,GIPC1,PTGER1,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 25969 1930 chr19 15722142 15723531 15722895 N NA NA NA NA NA NA AKAP8L 192309 1931 chr19 16381680 16383432 16383270 N NA NA EPS15L1 IMR90 Hi-C 24141950 AP1M1 73015 1932 chr19 169922 171723 170141 N NA FLJ45445 NA NA NA NA FLJ45445 30486 1933 chr19 1724629 1727424 1725814 Y C19orf26,MUM1,APC2 NA TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF3 72301 1934 chr19 18438686 18446665 18442396,18439613 N,N NA;NA JUND,LSM4,PGPEP1 PGPEP1,PIK3R2,MPV17L2,RAB3A,PDE4C,LSM4,LOC729966,JUND,MIR3188,KIAA1683,LRRC25 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LSM4 4685 1935 chr19 20161061 20168595 20163123,20167515 Y,N ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682;NA ZNF682 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 10784 1936 chr19 20762605 20763640 20763025 N NA ZNF737 NA NA NA NA ZNF737 13979 1937 chr19 20849559 20852358 20849874 N NA NA NA NA NA NA ZNF737 100933 1938 chr19 20929368 20939198 20932880 N NA NA NA NA NA NA ZNF85 166861 1939 chr19 20959441 20996199 20977708,20960530 N,N NA;NA NA ZNF486 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF85 109860 1940 chr19 21445446 21452100 21451812 N NA NA NA NA NA NA ZNF708 60112 1941 chr19 21537073 21539664 21537582 N NA ZNF708,ZNF738,ZNF493 NA NA NA NA ZNF738 2071 1942 chr19 21786381 21789015 21787538 N NA NA NA NA NA NA ZNF429 97944 1943 chr19 21798787 21799477 21799186 N NA NA NA NA NA NA ZNF429 110350 1944 chr19 22062954 22073456 22072417,22063193 N,N NA;NA ZNF43 NA NA NA NA ZNF43 28084 1945 chr19 23255877 23317297 23302829,23260900,23310349,23268566,23258276,23273023 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF91 260972 1946 chr19 23447413 23449449 23448345 N NA NA NA NA NA NA ZNF91 128820 1947 chr19 23459826 23464471 23460632 N NA NA NA NA NA NA ZNF91 113798 1948 chr19 23661726 23665369 23664086 N NA NA NA NA NA NA ZNF91 83457 1949 chr19 23712046 23720665 23715541 N NA NA NA NA NA NA ZNF91 133777 1950 chr19 23776956 23778571 23778194 N NA NA NA NA NA NA ZNF675 91446 1951 chr19 24062614 24066361 24065361 N NA ZNF726 NA NA NA NA ZNF726 31323 1952 chr19 24168875 24169154 24169036 N NA NA NA NA NA NA ZNF726 71191 1953 chr19 27731695 27736105 27731984 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 548743 1954 chr19 27764025 27765337 27764806 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 519511 1955 chr19 27795024 27811316 27808816 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 473532 1956 chr19 27895356 27907060 27897419 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 377788 1957 chr19 28206281 28249026 28232733,28246543 Y,N NA;NA LOC148189 NA NA NA NA LOC148189 35822 1958 chr19 28363855 28377751 28364476 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 79007 1959 chr19 28778893 28782940 28780214,28782332 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC148189 494045 1960 chr19 2951542 2958048 2953340 N NA ZNF77,TLE6 TLE2,ZNF77,NCLN,TLE6,GNA15 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF77 6573 1961 chr19 29745929 29746973 29746816 N NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 41793 1962 chr19 30407476 30408708 30408659 N NA NA NA NA NA NA CCNE1 104575 1963 chr19 31120778 31123061 31121575 N NA NA NA NA NA NA TSHZ3 717129 1964 chr19 32062589 32065545 32063559 N NA NA NA NA NA NA TSHZ3 222399 1965 chr19 32670677 32671719 32671092 N NA NA THEG5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF507 164795 1966 chr19 33063784 33066795 33065759 N NA PDCD5 PDCD5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDCD5 5299 1967 chr19 3333825 3338530 3336888,3334966 N,N NA;NA NFIC ZNF77,CELF5,NFIC,DOHH,FZR1,C19orf77,C19orf29-AS1,GIPC3,TBXA2R,C19orf29,PIP5K1C,APBA3,MRPL54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIC 21031 1968 chr19 34394479 34403974 34397010 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 106728 1969 chr19 34625656 34629067 34626341 N NA LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 34285 1970 chr19 35028006 35034950 35033682 N NA NA SCGB2B3P IMR90 Hi-C 24141950 SCGB2B2 50540 1971 chr19 35396462 35414385 35411783,35408443 N,N NA;NA ZNF30,ZNF792 ZNF302,ZNF599,ZNF30 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF30 3422 1972 chr19 37704390 37708530 37704858,37705712,37707361 N,N,N NA;NA;NA ZNF585A,ZNF585B,ZNF383 ZNF585B,ZNF383 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF585B 2939 1973 chr19 37803427 37823292 37803776,37808708,37812398 N,N,N NA;NA;NA HKR1,ZNF527 NA NA NA NA HKR1 2288 1974 chr19 39548957 39551302 39549278 N NA NA SAMD4B,FBXO27,GMFG IMR90 Hi-C 24141950 PAK4 65118 1975 chr19 40619990 40621078 40620617 N NA ZNF780A FCGBP,TTC9B,CNTD2,MAP3K10 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF780A 23145 1976 chr19 41557986 41560299 41559050 N NA NA NA NA NA NA HNRNPUL1 208092 1977 chr19 41578853 41579748 41579545 N NA NA CYP2A13,CYP2B6 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPUL1 188643 1978 chr19 41686654 41689713 41688127 N NA NA CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPUL1 78678 1979 chr19 42011543 42014217 42012978 N NA NA NA NA NA NA ATP5SL 65700 1980 chr19 42034572 42045757 42037989 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 88729 1981 chr19 44450605 44452985 44450771 N NA ZNF45,ZNF155 ZNF225,ZNF45 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF45 11194 1982 chr19 44710020 44714411 44711610 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 2280 1983 chr19 45934933 45956007 45946824,45953809 Y,Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB;NA ERCC1 ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L,LOC100287177,EML2 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERCC1 7756 1984 chr19 46634202 46638317 46636745 N NA NA NOVA2,IGFL3,IGFL2,DKFZp434J0226,IGFL1,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC61 135863 1985 chr19 46938983 46942165 46940029 N NA NA PNMAL1,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 PPP5C 88732 1986 chr19 482111 491697 489071,491626,486452 N,N,N NA;NA;NA SHC2,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPGS1 15800 1987 chr19 51079685 51080894 51080269 N NA NA NA NA NA NA JOSD2 65340 1988 chr19 51097098 51099696 51097901 N NA NA NA NA NA NA JOSD2 82753 1989 chr19 52424351 52425583 52424984 N NA ZNF577,ZNF649,ZNF613 ZNF350,ZNF432,ZNF649,ZNF577,ZNF613,ZNF614 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF613 5105 1990 chr19 53507994 53509610 53508832 N NA ZNF816-ZNF321P ZNF160,ZNF347 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF816-ZNF321P 41830 1991 chr19 54163204 54164408 54163523 N NA NA NA NA NA NA ZNF331 139027 1992 chr19 54922664 54924574 54923876 N NA LENG8 NA NA NA NA LENG8 35491 1993 chr19 56763052 56825833 56824734 N NA NA NLRP5,GALP,ZNF444,ZSCAN5A IMR90 Hi-C 24141950 ZNF542 53635 1994 chr19 57197381 57198487 57197925 N NA NA NA NA NA NA ZNF71 90717 1995 chr19 57476217 57477231 57476641 N NA NA NA NA NA NA ZNF264 225637 1996 chr19 6514643 6520660 6517045,6516715 Y,N NA;NA TUBB4A TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TUBB4A 12313 1997 chr19 7877321 7879160 7878058 N NA NA ARHGEF18,CAMSAP3,CD209,CLEC4GP1,EVI5L,LRRC8E IMR90 Hi-C 24141950 FLJ22184 60166 1998 chr19 7886757 7888276 7887539 N NA NA NA NA NA NA FLJ22184 51050 1999 chr2 100118373 100120039 100118631 N NA REV1 NA NA NA NA REV1 11893 2000 chr2 100812680 100815840 100814008 N NA NA AFF3 IMR90 Hi-C 24141950 CHST10 218290 2001 chr2 101301226 101302419 101301911 N NA NA TBC1D8,RPL31 IMR90 Hi-C 24141950 CHST10 267096 2002 chr2 102219391 102220575 102219733 N NA NA RFX8,CREG2,MAP4K4 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 93590 2003 chr2 102706480 102710156 102707679 N NA NA IL1R2,IL1RL2,IL1R1,MAP4K4 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 60246 2004 chr2 102735776 102744478 102739461,102737288 N,N NA;NA IL1R1 IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 25924 2005 chr2 106863790 106865254 106864237 N NA NA NA NA NA NA C2orf49 909777 2006 chr2 106881760 106882923 106882105 N NA NA UXS1 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 927747 2007 chr2 107176969 107179242 107178066 N NA NA LOC285000 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 1222956 2008 chr2 107313399 107315313 107314435 N NA NA NA NA NA NA C2orf49 1359386 2009 chr2 108835089 108838051 108836810 N NA NA SULT1C4,SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GCC2 227526 2010 chr2 110401439 110403960 110402448 Y NA SEPT10,SOWAHC SEPT10,SOWAHC,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHC 29528 2011 chr2 110447702 110450221 110448607 N NA NA EDAR,SEPT10 IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHC 75791 2012 chr2 110476941 110482176 110478654 N NA NA NA NA NA NA SOWAHC 105030 2013 chr2 111072748 111074209 111073459 N NA NA NA NA NA NA LOC151009 67904 2014 chr2 111362062 111367806 111366866 N NA NA NA NA NA NA LOC151009 219949 2015 chr2 112043434 112047942 112045823 N NA NA NA NA NA NA BCL2L11 164943 2016 chr2 113625573 113630287 113627177 N NA NA IL1B,CKAP2L,CHCHD5,POLR1B,IL36B,IL1A,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 SLC20A1 222139 2017 chr2 115059324 115061685 115059744 N NA NA NA NA NA NA ACTR3 411787 2018 chr2 116664474 116665160 116664901 N NA NA NA NA NA NA DDX18 1907095 2019 chr2 117309268 117317296 117310620 N NA NA NA NA NA NA DDX18 1254959 2020 chr2 117764359 117767218 117766253 N NA NA NA NA NA NA DDX18 805037 2021 chr2 117879502 117883030 117881229 N NA NA NA NA NA NA DDX18 689225 2022 chr2 117900151 117903627 117902250 N NA NA NA NA NA NA DDX18 668628 2023 chr2 118279449 118282257 118281179 N NA NA NA NA NA NA DDX18 289998 2024 chr2 118435208 118439252 118437191 N NA NA NA NA NA NA DDX18 133003 2025 chr2 118456126 118459306 118458115 N NA NA NA NA NA NA DDX18 112949 2026 chr2 118495895 118502814 118501135 N NA NA NA NA NA NA DDX18 69441 2027 chr2 118526859 118530981 118529049 N NA DDX18 NA NA NA NA DDX18 41274 2028 chr2 118806584 118810017 118808606 N NA CCDC93,INSIG2 NA NA NA NA CCDC93 34845 2029 chr2 118905524 118906602 118906203 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 59474 2030 chr2 118938374 118945865 118943569 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 92324 2031 chr2 121387298 121389446 121387959 N NA NA LOC84931,RALB,INHBB IMR90 Hi-C 24141950 RALB 376884 2032 chr2 122569755 122571763 122570990,122570570 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TSN 56634 2033 chr2 124434988 124438571 124436969 N NA NA NA NA NA NA TSN 1921867 2034 chr2 126034009 126035403 126034348 N NA NA NA NA NA NA BIN1 1829500 2035 chr2 126810052 126810809 126810627 N NA NA NA NA NA NA BIN1 1054094 2036 chr2 127728200 127730083 127729292 N NA NA NA NA NA NA BIN1 134820 2037 chr2 127885000 127887351 127886515,127886276 N,N NA;NA BIN1 ERCC3,BIN1,CYP27C1,IWS1,MYO7B IMR90 Hi-C 24141950 BIN1 20097 2038 chr2 127979141 127980819 127979924 N NA NA CYP27C1,BIN1,ERCC3,MAP3K2 IMR90 Hi-C 24141950 ERCC3 70933 2039 chr2 128110848 128155633 128122479,128145685 N,N NA;NA MAP3K2 IWS1,ERCC3,MAP3K2,MIR4783,PROC,CYP27C1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 10043 2040 chr2 129078578 129093971 129087878,129091586,129079749 N,N,N NA;NA;NA HS6ST1 HS6ST1,UGGT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HS6ST1 2407 2041 chr2 129112458 129119000 129113248 N NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 36287 2042 chr2 129154417 129162550 129158139,129155120 N,N NA;NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 78246 2043 chr2 129199203 129213088 129200206 N NA NA NA NA NA NA HS6ST1 123032 2044 chr2 129815455 129818716 129816400 N NA NA NA NA NA NA HS6ST1 739284 2045 chr2 129896445 129898195 129897147 N NA NA NA NA NA NA HS6ST1 820274 2046 chr2 130192469 130193822 130192673 N NA NA NA NA NA NA RAB6C 543413 2047 chr2 130439726 130445850 130439951 N NA NA NA NA NA NA RAB6C 291385 2048 chr2 130613174 130638414 130635221,130627180,130624723 N,N,N NA;NA;NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 RAB6C 98821 2049 chr2 130988389 130989988 130989674 N NA MZT2B,SMPD4 NA NA NA NA SMPD4 48066 2050 chr2 131029566 131030139 131029927 N NA NA NA NA NA NA CCDC115 69783 2051 chr2 131221916 131265543 131253721,131229239,131261609,131257942 N,N,N,N NA;NA;NA;NA LOC100216479 FAM168B Caco2 3C 20360044 LOC100216479 35797 2052 chr2 131365007 131367112 131366214 N NA NA NA NA NA NA CYP4F30P 70511 2053 chr2 131372758 131414086 131382529,131374322,131378671 N,N,N NA;NA;NA CYP4F30P NA NA NA NA CYP4F30P 23537 2054 chr2 131550478 131560695 131554993 N NA NA PLEKHB2,FAM168B,ARHGEF4 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYP4F30P 112855 2055 chr2 131589801 131671526 131594399,131598977 N,N NA;NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4F30P 152178 2056 chr2 132142136 132143550 132143287 N NA WTH3DI NA NA NA NA WTH3DI 20405 2057 chr2 132426893 132451807 132440010,132431742 N,N NA;NA C2orf27A NA NA NA NA C2orf27A 28257 2058 chr2 132567253 132571281 132570275 N NA NA NA NA NA NA C2orf27A 87189 2059 chr2 132580670 132582640 132581314 N NA NA NA NA NA NA C2orf27A 100606 2060 chr2 132587033 132588701 132587571 N NA NA NA NA NA NA C2orf27A 106969 2061 chr2 132797681 132806222 132803510,132800797 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 209320 2062 chr2 132827681 132831380 132828448 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 184162 2063 chr2 133039134 133047679 133043331 N NA ANKRD30BL NA NA NA NA ANKRD30BL 23592 2064 chr2 133088837 133092953 133090095 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 73295 2065 chr2 133102691 133113803 133105003,133110275,133113318 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 87149 2066 chr2 133119441 133123092 133121234 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 103899 2067 chr2 134430833 134433505 134432020 N NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 578325 2068 chr2 134473660 134476636 134475228 N NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 535194 2069 chr2 13641704 13645686 13643457 N NA NA NA NA NA NA LPIN1 1754964 2070 chr2 13660467 13664524 13663481 N NA NA NA NA NA NA LPIN1 1773727 2071 chr2 13666082 13673829 13670599,13667132 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LPIN1 1779342 2072 chr2 138503752 138506696 138505466 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 752654 2073 chr2 138814922 138900631 138825656,138898884 N,N NA;NA NA HNMT,NXPH2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SPOPL 358719 2074 chr2 138981731 139016465 138993562,139004313,139014435 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA SPOPL 242885 2075 chr2 139024553 139049001 139046450,139033593,139036455 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA SPOPL 210349 2076 chr2 139128194 139215489 139207105,139213995,139200741 N,N,N NA;NA;NA SPOPL SPOPL,LOC399715 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950,19890323 SPOPL 43861 2077 chr2 139217475 139225108 139223516,139218388 N,N NA;NA SPOPL LOC399715 MCF7 ChIA-PET 19890323 SPOPL 34242 2078 chr2 140484490 140486955 140485613 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 1225140 2079 chr2 140635442 140637577 140635820 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 1376092 2080 chr2 14155148 14158074 14157252 N NA NA NA NA NA NA NBAS 1543380 2081 chr2 143552295 143554385 143553761 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 4292945 2082 chr2 147903627 147905586 147903775 N NA NA NA NA NA NA ACVR2A 696984 2083 chr2 150110936 150113581 150111585 N NA NA NA NA NA NA MMADHC 330749 2084 chr2 151866486 151867050 151866685 N NA NA NA NA NA NA RIF1 399347 2085 chr2 156119704 156120711 156120587 N NA NA NA NA NA NA ARL6IP6 2545297 2086 chr2 156860525 156935852 156900825,156934964 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ACVR1 1796522 2087 chr2 156962381 157113258 156997116,156986748,156976628,157038856,157000146,157111248 N,N,N,Y,N,N NA;NA;NA;NR4A2;NA;NA NA NR4A2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ACVR1 1619116 2088 chr2 157256639 157258230 157257440 N NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACVR1 1474144 2089 chr2 157272263 157273613 157273059 N NA NA GPD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ACVR1 1458761 2090 chr2 158234905 158237566 158236167 N NA NA NA NA NA NA ACVR1 494808 2091 chr2 158753823 158755452 158754513 N NA ACVR1 ACVR1,PKP4 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1 21449 2092 chr2 160148520 160152302 160149292 N NA WDSUB1 WDSUB1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WDSUB1 5284 2093 chr2 160498067 160522146 160519752,160501918 N,N NA;NA BAZ2B,MARCH7 BAZ2B,TANC1,MARCH7,WDSUB1 IMR90 Hi-C 24141950 BAZ2B 25008 2094 chr2 162134084 162140040 162137137 N NA PSMD14 NA NA NA NA PSMD14 24746 2095 chr2 162377276 162378559 162377878 N NA NA NA NA NA NA PSMD14 212490 2096 chr2 162939654 162942381 162941225 N NA NA DPP4 IMR90 Hi-C 24141950 GCA 258202 2097 chr2 165830798 165845302 165838013 N NA NA NA NA NA NA COBLL1 132870 2098 chr2 167558 170698 169422 N NA NA NA NA NA NA SH3YL1 93370 2099 chr2 168144361 168150166 168149179 N NA NA NA NA NA NA STK39 953939 2100 chr2 168487884 168489707 168488396 N NA NA NA NA NA NA STK39 614398 2101 chr2 169111405 169115377 169113122 N NA STK39 STK39,CERS6 MCF7,Islet ChIA-PET,4C 22265404,24413736 STK39 7300 2102 chr2 169133064 169136718 169135470 N NA STK39 CERS6,STK39 Islet,IMR90 4C,Hi-C 24413736,24141950 STK39 28959 2103 chr2 169191776 169193684 169192721 N NA NA ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402 IMR90 Hi-C 24141950 STK39 87671 2104 chr2 169202708 169205887 169203649 N NA NA ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402 IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 STK39 98603 2105 chr2 172459938 172461300 172460369 N NA NA DYNC1I2,ITGA6,SLC25A12,HAT1,METAP1D,DLX1,DLX2 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2 82682 2106 chr2 173030595 173032842 173031768 N NA NA ITGA6,DYNC1I2 IMR90 Hi-C 24141950 METAP1D 165791 2107 chr2 173215071 173217023 173216022 N NA NA ITGA6,SLC25A12 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA6 75291 2108 chr2 174388919 174427428 174391878 N NA NA CIR1,LOC285084,SP9,OLA1 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 403002 2109 chr2 174714796 174717932 174716180 N NA NA OLA1 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 112498 2110 chr2 175584425 175585708 175584905 N NA NA CHN1,ATF2,WIPF1,CHRNA1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR155 232614 2111 chr2 177287304 177291217 177290338,177288008 N,N NA;NA NA MTX2,MIR1246 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 153181 2112 chr2 177608019 177610250 177609091 N NA NA HOXD-AS2,HOXD1,HOXD-AS1,HOXD9,HOXD8,HOXD10,PDE11A IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA3 467172 2113 chr2 179055226 179167104 179074201,179058818,179096465,179163454,179130057,179107093 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA RBM45,MIR548N IMR90 Hi-C 24141950 RBM45 78044 2114 chr2 180766096 180768104 180766974 N NA ZNF385B NA NA NA NA ZNF385B 39864 2115 chr2 180980537 180997773 180995225,180989879 N,N NA;NA NA ITGA4,UBE2E3,CERKL,NEUROD1 IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 108757 2116 chr2 181005244 181008119 181006492 N NA NA ITGA4,UBE2E3,CERKL,MIR4437 IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 133464 2117 chr2 181013026 181017896 181015436,181014160 N,N NA;NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 141246 2118 chr2 181019642 181023561 181021558 N NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 147862 2119 chr2 181122704 181125239 181123733 N NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 250924 2120 chr2 181167029 181175142 181172105 N NA NA NA NA NA NA CWC22 295249 2121 chr2 181179177 181195640 181189061,181193651 N,N NA;NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 307397 2122 chr2 181213268 181284817 181239881,181217837,181221513,181283489 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA CERKL,UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 341488 2123 chr2 181285739 181476371 181391682,181363016,181450355,181442541,181417978,181474410 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA UBE2E3,SHANK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 UBE2E3 368741 2124 chr2 181487439 181633567 181489735,181502931,181505067,181558442,181579964,181633352,181588081,181628515,181604129,181551539,181542888,181525622 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 211545 2125 chr2 181649204 181651600 181649881 N NA NA NA NA NA NA UBE2E3 193512 2126 chr2 18190692 18201233 18191478 N NA NA NA NA NA NA KCNS3 130747 2127 chr2 181999277 182060852 182000070,182027383 N,N NA;NA NA ITGA4,CERKL IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 154165 2128 chr2 182641588 182644861 182643411 N NA NA SSFA2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SSFA2 111611 2129 chr2 182674653 182677552 182675680 Y SSFA2 NA SSFA2 IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 78920 2130 chr2 18321231 18326737 18321403 N NA NA KCNS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNS3 261286 2131 chr2 183438460 183440482 183438805 N NA NA PDE1A IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC10 140517 2132 chr2 183734275 183739197 183738405,183736097 N,N NA;NA NA FRZB,NCKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC10 153276 2133 chr2 184131242 184134053 184132149 N NA NA NA NA NA NA NUP35 142159 2134 chr2 184471850 184472945 184472428 N NA NA NA NA NA NA NUP35 482767 2135 chr2 186036665 186040875 186037709 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 1310010 2136 chr2 186139609 186142632 186141147 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 1208253 2137 chr2 186369477 186526635 186412542,186492455,186369644 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZC3H15 824250 2138 chr2 186786829 186824770 186824178 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 526115 2139 chr2 186954751 187097780 186955899,187017997,187000020,187095875,187037294,187056098 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZC3H15 253105 2140 chr2 187182187 187186246 187184712 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 164639 2141 chr2 187236707 187268045 187260490,187266457 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZC3H15 82840 2142 chr2 187765882 187767118 187766549 N NA NA NA NA NA NA ITGAV 311092 2143 chr2 187862479 187921333 187867994 N NA NA NA NA NA NA ITGAV 407689 2144 chr2 188431828 188598664 188457409,188460498,188587170,188581551,188464273,188479137,188555585,188501195,188576047,188582768,188534740,188512553,188496264 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA TFPI TFPI,GULP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFPI 12609 2145 chr2 188600401 188613015 188608151,188602390 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TFPI 181182 2146 chr2 188626271 188743162 188718365,188660249,188645200,188696057,188712463,188627068,188742279 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TFPI,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 207052 2147 chr2 188809380 188814924 188811711,188813659 N,N NA;NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 GULP1 341472 2148 chr2 188820235 188833640 188823348,188827784,188831557 N,N,N NA;NA;NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 GULP1 322756 2149 chr2 188840542 188853494 188851290,188845349 N,N NA;NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 GULP1 302902 2150 chr2 188886089 188892195 188887883 N NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 GULP1 264201 2151 chr2 188916169 188922326 188918750,188918609 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GULP1 234070 2152 chr2 189086911 189091059 189089286 N NA NA NA NA NA NA GULP1 65337 2153 chr2 189096650 189100067 189098528 N NA NA NA NA NA NA GULP1 56329 2154 chr2 189102247 189117296 189106881,189112614 N,N NA;NA GULP1 GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 GULP1 39100 2155 chr2 189143203 189149594 189144582 N NA GULP1 GULP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 GULP1 6802 2156 chr2 192407116 192410451 192409046 N NA NA STAT4,OBFC2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC2A 132347 2157 chr2 192596816 192605842 192603022 N NA NA TMEFF2 IMR90 Hi-C 24141950 OBFC2A 54018 2158 chr2 192626458 192628693 192626804 N NA NA TMEFF2 IMR90 Hi-C 24141950 OBFC2A 83660 2159 chr2 193251991 193371079 193253098,193254847,193333211,193272057,193315560,193265919,193302999,193365702,193369624 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TMEFF2 192347 2160 chr2 193399483 193403658 193401718 N NA NA NA NA NA NA TMEFF2 339839 2161 chr2 193440484 193451362 193442173,193443268,193447652,193449869 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TMEFF2 380840 2162 chr2 19400488 19455213 19410137,19455056 N,N NA;NA NA NT5C1B-RDH14,MIR4757,TTC32,FLJ12334,OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC32 646531 2163 chr2 19479350 19510725 19505797 N NA NA NA NA NA NA TTC32 591019 2164 chr2 195052896 195053891 195053501 N NA NA NA NA NA NA SLC39A10 1467641 2165 chr2 196185678 196188291 196187280 N NA NA SLC39A10 K562 ChIA-PET 22265404 SLC39A10 333241 2166 chr2 196199259 196201871 196199506 N NA NA SLC39A10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A10 319661 2167 chr2 196203266 196206082 196205075 N NA NA NA NA NA NA SLC39A10 315450 2168 chr2 196227791 196229892 196228968 N NA NA SLC39A10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A10 291640 2169 chr2 196426472 196427937 196427170 Y NA NA SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 93595 2170 chr2 196464254 196464868 196464411 N NA NA SLC39A10 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A10 56664 2171 chr2 19812378 19816582 19815150 N NA NA NA NA NA NA TTC32 285162 2172 chr2 19836297 19837102 19836894 N NA NA NA NA NA NA TTC32 264642 2173 chr2 20273522 20274259 20274054 N NA LAPTM4A WDR35,MATN3,LAPTM4A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM4A 21733 2174 chr2 202944601 202947463 202946311 N NA NA CDK15,FZD7,ALS2,MPP4 IMR90 Hi-C 24141950 SUMO1 155859 2175 chr2 202961304 202964121 202962557 N NA NA CDK15,FZD7,ALS2,SUMO1 IMR90 Hi-C 24141950 SUMO1 139201 2176 chr2 203203444 203230349 203222004,203205609 N,N NA;NA BMPR2 ALS2,NOP58,BMPR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMPR2 10701 2177 chr2 203472985 203480736 203474572 Y NA FAM117B ICA1L,FAM117B,WDR12,NBEAL1,ALS2CR8,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM117B 19165 2178 chr2 204478819 204481011 204480146 N NA NA RAPH1,CYP20A1,CD28,ABI2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 78761 2179 chr2 204512124 204516311 204513228 N NA NA RAPH1,ABI2,CD28,CYP20A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAPH1 112066 2180 chr2 204763989 204766140 204765201 N NA NA CTLA4,RAPH1,NBEAL1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 363931 2181 chr2 204874841 204877968 204876454 N NA NA NA NA NA NA RAPH1 474783 2182 chr2 205397539 205401336 205398670 N NA PARD3B PARD3B,NRP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARD3B 9180 2183 chr2 20633981 20639611 20634682,20638465 N,Y NA;HS1BP3 RHOB HS1BP3,RHOB,GDF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 7224 2184 chr2 206748316 206749314 206748524 N NA NA PARD3B,NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 INO80D 201592 2185 chr2 207272581 207277169 207275820 N NA NA NA NA NA NA EEF1B2 248263 2186 chr2 20729023 20730266 20729537 N NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 82188 2187 chr2 20749652 20752534 20751120 N NA NA HS1BP3,RHOB IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 98330 2188 chr2 208131431 208136663 208132224,208134288 N,N NA;NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 257953 2189 chr2 208139186 208142050 208141171 N NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 252566 2190 chr2 208148374 208151089 208149714 N NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 243527 2191 chr2 208271838 208274540 208273077 N NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 120076 2192 chr2 208277832 208282361 208281102 N NA NA KLF7,MIR3130-1,FASTKD2,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 112255 2193 chr2 209064179 209065962 209064677 N NA NA NA NA NA NA IDH1 53844 2194 chr2 209427810 209428605 209428274 N NA NA NA NA NA NA PIKFYVE 296819 2195 chr2 209475849 209478710 209476141 N NA NA NA NA NA NA PIKFYVE 344858 2196 chr2 209675455 209681287 209676704 N NA NA NA NA NA NA PIKFYVE 544464 2197 chr2 209793255 209795309 209794313 N NA NA NA NA NA NA MAP2 493462 2198 chr2 210233093 210234858 210233810 Y NA NA NA NA NA NA MAP2 53913 2199 chr2 215545586 215549723 215548556 N NA NA NA NA NA NA BARD1 124705 2200 chr2 216025788 216029821 216027545 N NA NA NA NA NA NA ATIC 146858 2201 chr2 216080767 216083752 216081962 N NA NA ABCA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATIC 92927 2202 chr2 216131579 216135660 216134212,216131765 N,N NA;NA ATIC LOC100130451,SPAG16,MREG IMR90 Hi-C 24141950 ATIC 41019 2203 chr2 217414830 217418446 217416330 N NA NA DIRC3,IGFBP2,RPL37A,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 51310 2204 chr2 217484394 217487600 217485651 N NA NA DIRC3,IGFBP2,XRCC5,RPL37A,IGFBP5,RUFY4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL37A 120874 2205 chr2 21864978 21867160 21865665 N NA NA NA NA NA NA C2orf43 842151 2206 chr2 218852244 218853971 218853157 N NA NA RUFY4,TNS1 IMR90 Hi-C 24141950 ARPC2 227903 2207 chr2 220548240 220551035 220549911 N NA NA INHA,OBSL1,SLC4A3,STK11IP,EPHA4,DES,SPEG,GMPPA,ACCN4 IMR90,HELA,K562,GM12878,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 SLC4A3 55948 2208 chr2 223661839 223664137 223662603 N NA NA ACSL3,MOGAT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL3 61595 2209 chr2 22403997 22404488 22404291 N NA NA NA NA NA NA C2orf43 1381170 2210 chr2 224055127 224059117 224056000 N NA NA NA NA NA NA ACSL3 329395 2211 chr2 224290350 224291092 224290837 N NA NA NA NA NA NA AP1S3 411227 2212 chr2 224557927 224570353 224569568 Y NA NA AP1S3,SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131966 2213 chr2 225131763 225135400 225133352 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL44 309642 2214 chr2 225195780 225198461 225196431 N NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 251649 2215 chr2 225990606 225993109 225990995 N NA NA RHBDD1,NYAP2,COL4A4 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 540496 2216 chr2 226087275 226090079 226088181 N NA NA NYAP2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 637165 2217 chr2 226893924 226897518 226896121 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD1 803153 2218 chr2 227514231 227516056 227515051 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD1 184615 2219 chr2 229424036 229434461 229424298,229432809 N,N NA;NA NA NA NA NA NA AGFG1 1087148 2220 chr2 231436260 231439316 231437305 N NA NA NA NA NA NA CAB39 138241 2221 chr2 231719919 231721087 231720538 N NA ITM2C CAB39,ITM2C,LOC151484,GPR55,SPATA3,LOC348761 IMR90 Hi-C 24141950 ITM2C 8534 2222 chr2 232524788 232533826 232527130,232531253 Y,Y DIS3L2;NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 39409 2223 chr2 232557716 232568499 232561973,232567342 N,N NA;NA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 4736 2224 chr2 235076265 235077756 235077113 N NA NA NA NA NA NA MSL3P1 299210 2225 chr2 235270295 235273511 235271742 N NA NA NA NA NA NA MSL3P1 493240 2226 chr2 235280150 235281536 235280957 N NA NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 503095 2227 chr2 235371731 235373970 235372749 Y ARL4C NA NA NA NA NA SH3BP4 486658 2228 chr2 235540613 235544890 235542577 Y NA NA SH3BP4,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 315738 2229 chr2 235583853 235586043 235585247 N NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 274585 2230 chr2 235598420 235601039 235599970 N NA NA SH3BP4,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 259589 2231 chr2 237456080 237458579 237457434 N NA CXCR7 CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR7 19801 2232 chr2 237566916 237571933 237569729 N NA NA ASB18,IQCA1,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR7 88536 2233 chr2 237587449 237589843 237588785 N NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR7 109069 2234 chr2 237609668 237612910 237611222 N NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 131288 2235 chr2 237684240 237686949 237685750 Y CXCR7 NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 205860 2236 chr2 237720708 237724753 237722727 N NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 242328 2237 chr2 237731166 237736013 237733696 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 252786 2238 chr2 237875749 237918383 237904025,237895117,237914823 N,N,N NA;NA;NA NA IQCA1,CXCR7,AGAP1,ASB18 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 75701 2239 chr2 238381829 238385933 238384104 N NA MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 9945 2240 chr2 242921132 242949207 242921461 N NA NA LOC728323 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728323 81637 2241 chr2 24607128 24608623 24607769 N NA ITSN2 CENPO,ADCY3 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 23731 2242 chr2 26113205 26113436 26113418 N NA ASXL2 NA NA NA NA ASXL2 11893 2243 chr2 2615633 2620417 2617342 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 761236 2244 chr2 26223743 26225910 26224869 N NA RAB10 RAB10,KIF3C,FAM59B,ASXL2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 30819 2245 chr2 26233214 26237796 26234607 N NA RAB10 FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2,HADHA,HADHB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 18933 2246 chr2 26240080 26243120 26241187 Y RAB10 RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 13609 2247 chr2 2646731 2667834 2666430 N NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 713819 2248 chr2 27040167 27040712 27040305 N NA NA NA NA NA NA C2orf18 53025 2249 chr2 28938499 28941860 28939449,28938591 Y,N FOSL2,PPP1CB,PPP1CB;NA PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 32754 2250 chr2 28944449 28954485 28953471 N NA PPP1CB PLB1,PPP1CB IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 20129 2251 chr2 28955054 28960286 28959149 N NA PPP1CB PLB1,PPP1CB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 14328 2252 chr2 29323726 29324685 29324102 N NA NA CLIP4,FAM179A,ALK IMR90 Hi-C 24141950 WDR43 206193 2253 chr2 30333102 30335874 30334810 N NA YPEL5 ALK,YPEL5,CAPN13 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL5 33876 2254 chr2 3062608 3067997 3067598 N NA NA NA NA NA NA TSSC1 313656 2255 chr2 3133564 3140041 3138627 N NA NA MYT1L,TSSC1 IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 241612 2256 chr2 32029687 32052925 32029862,32049068 N,N NA;NA NA SPAST IMR90 Hi-C 24141950 MEMO1 182773 2257 chr2 34019393 34020678 34019892 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 195031 2258 chr2 34357125 34359549 34357264,34359437 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM98A 532763 2259 chr2 37699013 37701361 37700282 N NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD3 154791 2260 chr2 37719879 37722826 37721013 N NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD3 175657 2261 chr2 38029234 38033707 38030224 N NA NA CDC42EP3,QPCT,PRKD3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 129908 2262 chr2 38146344 38157675 38151556,38152604 N,N NA;NA NA CDC42EP3,QPCT,PRKG2,CYP1B1-AS1,FAM82A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CDC42EP3 247018 2263 chr2 38322126 38325024 38323539 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CDC42EP3 422800 2264 chr2 38651341 38655478 38653855 N NA NA ATL2,GALM,FAM82A1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRPLL 174700 2265 chr2 38719129 38720816 38719741 N NA NA ATL2 IMR90 Hi-C 24141950 HNRPLL 109362 2266 chr2 41245453 41246415 41245729 N NA NA NA NA NA NA EML4 1150075 2267 chr2 42240175 42242853 42240913 N NA NA LOC388942,C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 153637 2268 chr2 42358772 42362301 42360370 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 34189 2269 chr2 4249263 4250408 4249608 N NA NA NA NA NA NA RPS7 626410 2270 chr2 43033681 43038882 43037689 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 238010 2271 chr2 43102336 43105114 43103764 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 MTA3 306665 2272 chr2 43384995 43387426 43385982 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 66319 2273 chr2 43405270 43407546 43406345 Y OXER1 ZFP36L2,LOC100129726 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 46199 2274 chr2 44292041 44295674 44293450 N NA NA PREPL,PPM1B,SLC3A1 IMR90 Hi-C 24141950 LRPPRC 68897 2275 chr2 45499584 45502711 45501079 N NA NA SRBD1,SIX2,UNQ6975 IMR90 Hi-C 24141950 SRBD1 335722 2276 chr2 46634696 46637421 46636276 N NA NA EPAS1,PRKCE,RHOQ,PIGF,CRIPT IMR90 Hi-C 24141950 RHOQ 132446 2277 chr2 46888572 46891341 46890029 N NA PIGF SOCS5,LOC388946,MCFD2,LOC388948,CRIPT,PIGF,TTC7A IMR90 Hi-C 24141950 PIGF 44321 2278 chr2 47506866 47508053 47508051 N NA NA TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPCAM 88234 2279 chr2 47514397 47515716 47515267 N NA NA TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPCAM 80571 2280 chr2 48178290 48179546 48178623 N NA FBXO11 NA NA NA NA FBXO11 45358 2281 chr2 48181938 48182763 48182375 N NA FBXO11 NA NA NA NA FBXO11 49006 2282 chr2 48338250 48347430 48338907 N NA NA FOXN2,FBXO11,PPP1R21,STON1-GTF2A1L,MSH6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXN2 194365 2283 chr2 49456643 49458110 49456888 N NA NA NA NA NA NA PPP1R21 788735 2284 chr2 52338874 52343738 52341543 N NA NA NA NA NA NA ERLEC1 1670330 2285 chr2 5250879 5253119 5251838 N NA NA NA NA NA NA RPS7 1628026 2286 chr2 52640819 52643272 52642155 N NA NA NA NA NA NA ERLEC1 1370796 2287 chr2 53156127 53163210 53161774 N NA NA NA NA NA NA ERLEC1 850858 2288 chr2 53459937 53460572 53460259 N NA NA NA NA NA NA ERLEC1 553496 2289 chr2 55324446 55328927 55327542 N NA RTN4 C2orf63,EML6,RTN4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 46712 2290 chr2 56344636 56348086 56345747 N NA NA NA NA NA NA PNPT1 423625 2291 chr2 56391133 56402802 56399914 N NA NA NA NA NA NA PNPT1 470122 2292 chr2 56864270 56865006 56864565 N NA NA NA NA NA NA PNPT1 943259 2293 chr2 578334 580792 579608 N NA NA NA NA NA NA TMEM18 96647 2294 chr2 58478655 58479949 58479385 N NA FANCL NA NA NA NA FANCL 10140 2295 chr2 586425 587983 587205 N NA NA FAM110C,TPO IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 89456 2296 chr2 59412124 59412737 59412404 N NA NA NA NA NA NA FANCL 943609 2297 chr2 60938854 60941760 60939709 N NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 41605 2298 chr2 61832644 61833663 61832901 N NA NA NA NA NA NA XPO1 67226 2299 chr2 61867773 61869946 61868849 N NA NA XPO1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO1 102355 2300 chr2 61897426 61901256 61898939 N NA NA XPO1,FAM161A IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 132008 2301 chr2 61919314 61924815 61921939 Y NA NA NA NA NA NA XPO1 153896 2302 chr2 61934110 61936637 61935203 Y NA NA USP34,XPO1,FAM161A IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 168692 2303 chr2 61985520 61995302 61991502 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 120504 2304 chr2 62519731 62524064 62521073 N NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 96469 2305 chr2 62533337 62537333 62534270 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 110075 2306 chr2 62759061 62761834 62759919 N NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 335799 2307 chr2 62856625 62859350 62858474 N NA NA TMEM17,EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 433363 2308 chr2 63960586 63963256 63961917 N NA NA UGP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGP2 104842 2309 chr2 64454651 64457289 64455608 N NA NA PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 208437 2310 chr2 64920625 64982426 64974744,64978943,64957832 N,N,Y NA;NA;NA SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,LOC400958,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 39579 2311 chr2 64994768 64996816 64995501 Y SERTAD2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 113722 2312 chr2 65085550 65092733 65091966 N NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEP68 190762 2313 chr2 65709214 65711272 65709612 N NA SPRED2 CEP68,ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 49558 2314 chr2 65811850 65812967 65812121 N NA NA NA NA NA NA SPRED2 152194 2315 chr2 66322514 66323358 66323042 N NA NA NA NA NA NA SPRED2 662858 2316 chr2 67671633 67675005 67673525 N NA ETAA1 C1D,MEIS1,ETAA1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 47191 2317 chr2 67787931 67789934 67788920 N NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 163489 2318 chr2 68290 71195 69685 N NA FAM110C NA NA NA NA FAM110C 21702 2319 chr2 702587 704982 703069 N NA TMEM18 TPO IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 25148 2320 chr2 70479423 70482159 70481216 N NA TIA1,PCYOX1,SNRPG,FAM136A NA NA NA NA PCYOX1 3072 2321 chr2 71283841 71285145 71284240 N NA NAGK NA NA NA NA NAGK 10263 2322 chr2 71545696 71551633 71546306 N NA ZNF638 DYSF IMR90 Hi-C 24141950 ZNF638 7252 2323 chr2 71973482 71975543 71974593 N NA NA NA NA NA NA ZNF638 414597 2324 chr2 7242172 7252270 7242376 N NA NA NA NA NA NA ID2 1569843 2325 chr2 73087454 73088085 73087977 N NA SPR NA NA NA NA SPR 26427 2326 chr2 738829 744436 740514 N NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 61390 2327 chr2 75221696 75231886 75221867 N NA POLE4 HK2,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 POLE4 35921 2328 chr2 76604158 76606762 76605839 N NA NA NA NA NA NA GCFC2 666047 2329 chr2 7931337 7933387 7932274 N NA NA LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 888726 2330 chr2 82108177 82111544 82109957 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 2575042 2331 chr2 82347009 82348861 82347741 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 2337725 2332 chr2 82365772 82368260 82367308 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 2318326 2333 chr2 82450906 82453264 82452251 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 2233322 2334 chr2 82714996 82716992 82716189 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1969594 2335 chr2 82877591 82880861 82879488 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1805725 2336 chr2 82921248 82923415 82922152 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1763171 2337 chr2 82957279 82960571 82959153 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1726015 2338 chr2 83239232 83240090 83239921 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1446496 2339 chr2 83392820 83395876 83393939 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1290710 2340 chr2 85176772 85187050 85182025,85185672 N,N NA;NA TMSB10,KCMF1 TMSB10,KCMF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCMF1 11181 2341 chr2 85647155 85652762 85648744 N NA NA ELMOD3,GGCX,MAT2A MCF7 ChIA-PET 22265404 ELMOD3 65312 2342 chr2 85724851 85727193 85725633 N NA LOC100630918,MAT2A TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100630918 38816 2343 chr2 85968862 85970785 85969756 Y VAMP5,TMEM150A,ATOH8 NA ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf68 129683 2344 chr2 86181210 86183406 86182364 N NA NA POLR1A,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC90784 67585 2345 chr2 8632341 8634207 8633487 N NA NA LOC339788,LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 187906 2346 chr2 8639985 8641647 8640842 N NA NA LOC100506274,LOC339788,LINC00299,ID2 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 180466 2347 chr2 8678129 8681701 8680251 N NA NA LOC100506274,ID2,LOC339788,LINC00299 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 140412 2348 chr2 87408705 87446162 87418394,87410661 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC285074 105169 2349 chr2 87571579 87613438 87610528,87612012,87576528 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC285074 268043 2350 chr2 87915628 87924866 87915784 N NA NA NA NA NA NA PLGLB2 122740 2351 chr2 87960431 87964358 87962233 N NA NA NA NA NA NA PLGLB2 83248 2352 chr2 88790408 88791254 88791045 N NA NA C2orf51 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2AK3 135840 2353 chr2 90279872 90285237 90284533 N NA NA NA NA NA NA RPIA 1288696 2354 chr2 90423245 90433219 90425410,90429930 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC654342 1414756 2355 chr2 90526340 90533657 90527622 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 1314318 2356 chr2 91623199 91633550 91633268,91627312 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC654342 214425 2357 chr2 91659475 91670805 91670478,91665336 N,N NA;NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 LOC654342 177170 2358 chr2 9168529 9173886 9171902 N NA MBOAT2 MBOAT2 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT2 24653 2359 chr2 91749646 91775658 91750763 N NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 LOC654342 72317 2360 chr2 91879652 91884082 91883442 N NA LOC654342 NA NA NA NA LOC654342 31677 2361 chr2 91912101 91927979 91917863 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 64126 2362 chr2 92039718 92041639 92040828 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 191743 2363 chr2 92231564 92255055 92245008,92235867 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC654342 383589 2364 chr2 92273989 92289151 92288339 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 426014 2365 chr2 92299113 92301811 92300942 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 451138 2366 chr2 95871024 95895785 95873142 N NA ZNF514,ZNF2,PROM2 ZNF2,KCNIP3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF2 39841 2367 chr2 96184021 96217749 96217285,96192335,96214045,96210900 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAHD2A 115573 2368 chr2 96232972 96234230 96233383 N NA NA NA NA NA NA FAHD2A 164524 2369 chr2 96465845 96536823 96469078,96466366,96485001,96499498,96521901,96517787,96536173 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC729234 139476 2370 chr2 96539296 96618067 96611769,96594450,96617013 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC729234 58232 2371 chr2 96641745 96646492 96645737 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 29807 2372 chr2 96653383 96660326 96657627 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 15973 2373 chr2 9783902 9785679 9784886 N NA YWHAQ YWHAQ,ADAM17,TAF1B,GRHL1,KLF11 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAQ 12796 2374 chr2 9807888 9811209 9809194 N NA YWHAQ YWHAQ IMR90 Hi-C 24141950 YWHAQ 36782 2375 chr2 9946182 9950303 9949355 N NA TAF1B YWHAQ,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,KLF11,ADAM17,CYS1,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 33268 2376 chr2 9969571 9972134 9970719 N NA TAF1B GRHL1,TAF1B,HPCAL1,KLF11,RRM2,ADAM17,CYS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 11437 2377 chr20 10841414 10843723 10842454 N NA NA NA NA NA NA JAG1 186720 2378 chr20 10941671 10944258 10942786 N NA NA NA NA NA NA JAG1 286977 2379 chr20 11009985 11011392 11011019 N NA NA C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 JAG1 355291 2380 chr20 11612102 11616747 11613669 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 254730 2381 chr20 11984523 11986565 11986004 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 113046 2382 chr20 12159328 12161953 12160780 N NA NA BTBD3 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD3 287851 2383 chr20 12171612 12173809 12171755 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 300135 2384 chr20 12942838 12945478 12944093 N NA SPTLC3 SPTLC3 IMR90 Hi-C 24141950 SPTLC3 44149 2385 chr20 17801670 17804363 17802759 N NA NA BANF2,RRBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RRBP1 138742 2386 chr20 17854563 17856855 17856169 N NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,SNX5,DSTN IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 92635 2387 chr20 19109811 19112186 19110994 N NA NA DTD1,LOC100130264,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100270804 335118 2388 chr20 19145118 19148562 19145294 N NA NA NA NA NA NA LOC100270804 370425 2389 chr20 2058167 2059313 2058429 N NA STK35 LOC100289473 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 23215 2390 chr20 21068648 21073573 21070267 N NA PLK1S1 PLK1S1,NKX2-2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK1S1 33051 2391 chr20 21602101 21604536 21603061 N NA NA NA NA NA NA XRN2 318159 2392 chr20 2185270 2197010 2194437,2188192 N,N NA;NA NA PDYN,TGM3,TGM6,SIRPA IMR90 Hi-C 24141950 STK35 102742 2393 chr20 22167385 22168826 22167741 N NA NA NA NA NA NA XRN2 883443 2394 chr20 2223598 2228131 2226287 N NA NA PDYN,TGM3,SIRPA IMR90 Hi-C 24141950 STK35 141070 2395 chr20 2244039 2251631 2245751 N NA NA TGM3 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 161511 2396 chr20 23185188 23187355 23186307 N NA NA THBD IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 144018 2397 chr20 23316771 23319185 23318727 N NA NXT1,GZF1 CD93,SSTR4,THBD,NXT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NXT1 12188 2398 chr20 23673470 23676920 23675543 N NA NA CST2 IMR90 Hi-C 24141950 CST3 54896 2399 chr20 23735746 23739255 23737632 N NA NA NA NA NA NA CST3 117172 2400 chr20 23809645 23811066 23810564 N NA NA NA NA NA NA CST3 191071 2401 chr20 24909652 24915293 24911574 N NA NA SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf3 58132 2402 chr20 25156894 25167673 25161633 N NA ENTPD6 ACSS1,C20orf3,ENTPD6,PYGB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENTPD6 8666 2403 chr20 25824814 25860626 25846993,25844381,25848562,25834697,25850893 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF337 147345 2404 chr20 26096814 26099105 26097601 N NA NA NA NA NA NA LOC284801 90764 2405 chr20 26199683 26216983 26200435 N NA LOC284801 NA NA NA NA LOC284801 9814 2406 chr20 2659965 2661683 2660872 N NA NOP56,IDH3B NA NA NA NA IDH3B 15122 2407 chr20 29517609 29529420 29521052,29518178 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FRG1B 82459 2408 chr20 31491723 31499443 31492248 N NA NA BPIFB1,SUN5 IMR90 Hi-C 24141950 MAPRE1 84024 2409 chr20 32054067 32057445 32054460 N NA SNTA1,CBFA2T2 ZNF341,CBFA2T2,ACTL10,NECAB3,C20orf144 IMR90 Hi-C 24141950 CBFA2T2 20483 2410 chr20 32790342 32790777 32790640 N NA NA ASIP,AHCY,ITCH,PIGU,NCOA6 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 90257 2411 chr20 32801006 32806255 32803918 Y NA NA AHCY,ITCH,NCOA6,ASIP,DYNLRB1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 100921 2412 chr20 34035154 34037307 34036194 N NA UQCC,CEP250 MMP24,FAM83C,EIF6,UQCC,EDEM2,PROCR,CEP250,SPAG4,FER1L4,NFS1,HMGB3P1,GGT7,TRPC4AP,GDF5 GM12878,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 CEP250 5916 2413 chr20 3420553 3423028 3421113 N NA C20orf194,ATRN ATRN,C20orf194 IMR90 Hi-C 24141950 ATRN 28637 2414 chr20 34650725 34655811 34652704 Y NA LOC647979,EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC647979 11843 2415 chr20 36927694 36930199 36928611 N NA NA NA NA NA NA LOC388796 133819 2416 chr20 38614362 38616088 38615169 N NA NA NA NA NA NA MAFB 701788 2417 chr20 38912408 38917606 38915894 N NA NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 400270 2418 chr20 38987024 38989004 38988002 N NA NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 328872 2419 chr20 39042644 39045116 39044386 N NA NA NA NA NA NA MAFB 272760 2420 chr20 39600745 39603953 39601786,39601348 N,N NA;NA NA TOP1,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP1 53509 2421 chr20 4021474 4023766 4022572 N NA RNF24 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 25258 2422 chr20 40277104 40287075 40278850,40283112,40280690 N,N,N NA;NA;NA CHD6 CHD6 MCF7 ChIA-PET 22265404 CHD6 29971 2423 chr20 40320037 40324286 40322165 N NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 72904 2424 chr20 44622512 44626696 44623700 N NA ZNF335 ZNF335,MMP9,SLC12A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF335 21679 2425 chr20 46054102 46055129 46054911 N NA NA NCOA3,EYA2,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 68628 2426 chr20 4732957 4735604 4733437 N NA NA NA NA NA NA PRNP 66160 2427 chr20 48775438 48785823 48781299,48782769 N,N NA;NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1 TMEM189-UBE2V1,SNAI1,UBE2V1,FAM65C,MIR645,PTPN1,RNF114,CEBPB K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMEM189-UBE2V1 5103 2428 chr20 48998331 49001366 48999815 N NA NA LOC284751,CEBPB,PTPN1,PARD6B,FAM65C,MIR645 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 125525 2429 chr20 49030541 49035643 49032189 N NA NA LOC284751,CEBPB,PTPN1,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 91248 2430 chr20 49093001 49103344 49100169 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 23547 2431 chr20 49407899 49408926 49408527 N NA NA ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARD6B 59818 2432 chr20 49732553 49761989 49738439,49753588,49751929,49754843,49759790 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 92878 2433 chr20 49796718 49799969 49798342 N NA NA KCNG1,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 157043 2434 chr20 49835598 49840314 49838791 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 195923 2435 chr20 4994961 4997005 4995553 N NA NA NA NA NA NA C20orf30 96728 2436 chr20 50430760 50431584 50431508 N NA ATP9A ZFP64,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 ATP9A 45852 2437 chr20 50526243 50528776 50527376 N NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 ATP9A 141335 2438 chr20 50531073 50534225 50531992 N NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 ATP9A 146165 2439 chr20 50596847 50604137 50601666 Y NA NA SALL4,ATP9A,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP64 204387 2440 chr20 52237996 52242517 52240156 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 38360 2441 chr20 52254870 52261500 52256451 Y NA NA SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 55234 2442 chr20 52325236 52328033 52325967 N NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 125600 2443 chr20 52353392 52356996 52355243 N NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 153756 2444 chr20 52401395 52404992 52403365 N NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 201759 2445 chr20 52954335 52957174 52956719 N NA NA PFDN4 MCF7 ChIA-PET 22265404 PFDN4 129833 2446 chr20 52992572 52993169 52992746 N NA NA NA NA NA NA PFDN4 168070 2447 chr20 55286931 55288641 55287624 N NA NA NA NA NA NA TFAP2C 82573 2448 chr20 5608613 5610378 5609375 N NA GPCPD1 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 16941 2449 chr20 56291506 56305346 56293685 Y NA NA NA NA NA NA MTRNR2L3 356628 2450 chr20 56310791 56314923 56313494 N NA NA C20orf85 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L3 375913 2451 chr20 56329776 56344951 56333009,56338461,56336689 N,N,N NA;NA;NA NA PMEPA1,C20orf85 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L3 394898 2452 chr20 56347244 56350657 56348510,56348489 N,N NA;NA NA PMEPA1,PPP4R1L IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 MTRNR2L3 412366 2453 chr20 56567929 56573553 56568996,56572090 N,N NA;NA NA ZBP1,PMEPA1,C20orf85 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB22A 311218 2454 chr20 5682632 5685986 5684642 N NA C20orf196 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 45057 2455 chr20 57360629 57361785 57361171 N NA NA NA NA NA NA STX16-NPEPL1 134320 2456 chr20 58005022 58006384 58005373 N NA NA NA NA NA NA SLMO2-ATP5E 387121 2457 chr20 58008878 58009344 58009120 N NA NA NA NA NA NA SLMO2-ATP5E 390977 2458 chr20 58081185 58082194 58081643 N NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 433158 2459 chr20 58131107 58134134 58131943 N NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 381218 2460 chr20 60802047 60807378 60803205 Y NA GTPBP5,OSBPL2 GTPBP5,HRH3,SS18L1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 OSBPL2 6202 2461 chr20 62464880 62478082 62466622 Y OPRL1,ABHD16B TPD52L2,DNAJC5 PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPD52L2 18499 2462 chr20 6340943 6356122 6341171 N NA NA NA NA NA NA CRLS1 354204 2463 chr20 6683764 6686307 6685025 Y NA NA NA NA NA NA CRLS1 697025 2464 chr20 6693400 6693954 6693578 N NA NA BMP2 IMR90 Hi-C 24141950 CRLS1 706661 2465 chr20 679484 681975 681080 N NA SRXN1 C20orf54 IMR90 Hi-C 24141950 SRXN1 45594 2466 chr20 704135 705715 704606 N NA NA CSNK2A1,C20orf54 IMR90 Hi-C 24141950 SRXN1 70245 2467 chr20 7096657 7102941 7096908 N NA NA NA NA NA NA TMX4 897452 2468 chr20 8917703 8921211 8919428 N NA NA PLCB1,PLCB4 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 128490 2469 chr21 10084864 10086872 10084985 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 116271 2470 chr21 10103819 10106757 10105070 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 135226 2471 chr21 10159998 10214262 10163598,10172535 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 191405 2472 chr21 10372669 10394561 10373359 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 404076 2473 chr21 10492068 10493163 10492966 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 523475 2474 chr21 10563991 10616750 10584361,10598081,10602328 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA BAGE5 482175 2475 chr21 10635177 10641678 10639295 N NA NA NA NA NA NA BAGE5 457247 2476 chr21 10703727 10729253 10707103 N NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE5 369672 2477 chr21 10742245 10774540 10756592,10766212 N,N NA;NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 BAGE5 324385 2478 chr21 11165563 11188250 11169694,11181911,11171946,11187620 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE5 66638 2479 chr21 14368055 14371856 14369192 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1383653 2480 chr21 14514368 14520850 14518338 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1234659 2481 chr21 14744002 14747398 14745798 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1008111 2482 chr21 15050773 15108546 15095700,15078394,15103818 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 646963 2483 chr21 15230880 15245387 15231766,15240147 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 510122 2484 chr21 15250532 15264932 15259737,15251047 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 490577 2485 chr21 15398711 15457073 15402024,15399664 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 298436 2486 chr21 16178360 16198123 16196911 N NA NA LOC388813 IMR90 Hi-C 24141950 NRIP1 239003 2487 chr21 16220241 16247881 16243306,16237080 N,N NA;NA NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 189245 2488 chr21 16535233 16537401 16536251 N NA NA NRIP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRIP1 98107 2489 chr21 16654540 16657540 16655619 N NA NA NA NA NA NA NRIP1 217414 2490 chr21 16776074 16777469 16776633 N NA NA LOC388813 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 325027 2491 chr21 17299731 17409028 17340281,17368734,17407511,17350457,17302757,17404124,17379631,17381635,17376353,17364495,17397031,17385684,17305940,17331962 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA LINC00478 NA NA NA NA LINC00478 33814 2492 chr21 18005850 18036364 18006568 N NA NA NA NA NA NA LINC00478 563008 2493 chr21 18146841 18148812 18147627 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 703999 2494 chr21 18409670 18411139 18410555 N NA NA NA NA NA NA CXADR 474085 2495 chr21 18677219 18679000 18677769 N NA NA NA NA NA NA CXADR 206224 2496 chr21 18720745 18721759 18721007 N NA NA NA NA NA NA CXADR 163465 2497 chr21 22270446 22276638 22272612,22275229 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NCAM2 93995 2498 chr21 23111980 23114241 23112863 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 741347 2499 chr21 23221315 23226174 23224170 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 850682 2500 chr21 23268474 23273489 23270111 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 897841 2501 chr21 23292869 23295419 23294036 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 922236 2502 chr21 23629815 23633571 23631411 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 1259182 2503 chr21 23765514 23769620 23767189 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 1394881 2504 chr21 23785951 23795415 23787222,23790255 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NCAM2 1415318 2505 chr21 23886137 23887256 23886399 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 1515504 2506 chr21 24128834 24131341 24130077 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 1758201 2507 chr21 24139437 24143755 24141518 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 1768804 2508 chr21 24153938 24156895 24154978 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 1783305 2509 chr21 24298865 24302384 24300538,24300452 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NCAM2 1928232 2510 chr21 24523164 24526835 24525143 N NA NA NA NA NA NA NCAM2 2152531 2511 chr21 24982350 24984283 24982894 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 1995518 2512 chr21 25854583 25856003 25854967 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 1123798 2513 chr21 26888812 26905015 26903015 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 74786 2514 chr21 28594144 28595076 28594526 N NA NA NA NA NA NA ADAMTS1 376416 2515 chr21 29304930 29340783 29339396 N NA NA NA NA NA NA LINC00161 570857 2516 chr21 29536197 29606023 29599016,29552788,29567147,29587218,29578028,29602871 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00161 305617 2517 chr21 29608799 29613190 29611231 N NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00161 298450 2518 chr21 29622596 29658531 29625211,29640526,29656281 N,N,N NA;NA;NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00161 253109 2519 chr21 29936200 29962158 29959690 N NA LINC00161 ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00161 24560 2520 chr21 32359501 32360368 32359867 N NA NA NA NA NA NA SOD1 671567 2521 chr21 32955592 32958382 32956522 N NA NA TIAM1 IMR90 Hi-C 24141950 SOD1 73553 2522 chr21 32995712 33022524 33021629,33010124,33019399 N,N,N NA;NA;NA SOD1 TIAM1,SOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOD1 9411 2523 chr21 35293176 35295260 35293504,35293553 N,N NA;NA ATP5O,LOC100506334 ATP5O K562 ChIA-PET 22265404 ATP5O 5018 2524 chr21 36627872 36630545 36629028 N NA NA CLIC6,RUNX1,SETD4,LOC100506385 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SETD4 802274 2525 chr21 37269631 37272305 37270747 N NA NA CLIC6,LOC100506385,RUNX1,LINC00160 IMR90 Hi-C 24141950 SETD4 160514 2526 chr21 37335794 37338142 37336358 N NA NA CLIC6,LINC00160,KCNE1,LOC100506385,RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 SETD4 94677 2527 chr21 38006811 38035538 38020432,38031592,38034683,38028966 N,N,N,N NA;NA;NA;NA SIM2 CLDN14,HLCS,CHAF1B,SIM2,DSCR6 IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 36453 2528 chr21 38931210 38939251 38936228 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 191351 2529 chr21 40157818 40161449 40159840 N NA NA LINC00114,ETS2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMG1 393991 2530 chr21 40277722 40280523 40279245 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMG1 274917 2531 chr21 40321712 40323792 40322839 N NA NA ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 231648 2532 chr21 40360539 40363371 40362264 N NA NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 PSMG1 192069 2533 chr21 40912661 40914558 40913458 N NA NA NA NA NA NA WRB 160448 2534 chr21 42416191 42418766 42417283 N NA NA NA NA NA NA TMPRSS2 461319 2535 chr21 42896325 42905472 42900446 N NA TMPRSS2 TMPRSS2 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 16240 2536 chr21 42906174 42917525 42908481 N NA TMPRSS2 TMPRSS2,MX1,MX2 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 26089 2537 chr21 42939921 42943180 42940826 N NA NA TMPRSS2,MX1,BACE2,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 59836 2538 chr21 42950968 42955670 42955409,42952366 N,N NA;NA NA RIPK4,TMPRSS2,LINC00111,PRDM15 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 70883 2539 chr21 43023770 43027472 43025933 N NA NA PRDM15,RIPK4,LINC00111,C2CD2,MX1,TMPRSS2 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 143685 2540 chr21 43029993 43032546 43031059 N NA NA PRDM15,RIPK4,LINC00111,C2CD2,MX1,TMPRSS2,LINC00112,LINC00479 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMPRSS2 149908 2541 chr21 43474760 43479963 43476961 N NA ZNF295 ZNF295,UMODL1,C2CD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF295 44264 2542 chr21 44705810 44709381 44707736 N NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 137621 2543 chr21 44751786 44765576 44763798 N NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 81426 2544 chr21 45278250 45282307 45279869 N NA AGPAT3 AGPAT3,PDXK,LOC284837,TRAPPC10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT3 2809 2545 chr21 46973998 46979307 46975901 N NA SLC19A1 SLC19A1,LOC100129027,PCBP3,COL18A1,LINC00315,LOC642852 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 11613 2546 chr21 47007130 47014674 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2,COL18A1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 44745 2547 chr21 47098149 47206241 47099028,47168769 N,N NA;NA NA LOC642852,POFUT2,PCBP3,SLC19A1,LOC100129027,ADARB1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 135764 2548 chr21 9448522 9484222 9470424,9448783,9459943,9465781,9480350,9483056,9477993 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 484371 2549 chr21 9484763 9489104 9488085 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 479489 2550 chr21 9539807 9543748 9540684 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 424845 2551 chr21 9562879 9595664 9571627,9579613,9564770 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 372929 2552 chr21 9646532 9775553 9696062,9704240,9647871,9675675,9772137 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 193040 2553 chr22 16088022 16172680 16096589,16113937,16122955,16171733,16125332 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TPTEP1 910121 2554 chr22 16174889 16206888 16193061,16200807 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TPTEP1 875913 2555 chr22 16351302 16353489 16352042 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 729312 2556 chr22 16386767 16404370 16393942 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 678431 2557 chr22 16465989 16470095 16467780 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 612706 2558 chr22 16475002 16484954 16478076 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 597847 2559 chr22 16881112 16891223 16882730 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 191578 2560 chr22 17013538 17031845 17014312 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 50956 2561 chr22 17359514 17392919 17367457,17359676,17390085 N,N,N NA;NA;NA NA CECR2 IMR90 Hi-C 24141950 CECR7 124541 2562 chr22 17709128 17713180 17711334 N NA NA NA NA NA NA CECR5-AS1 68849 2563 chr22 17836412 17846251 17841385,17845296 N,N NA;NA NA CECR2 IMR90 Hi-C 24141950 CECR5-AS1 196133 2564 chr22 18785597 18790675 18789222 N NA NA NA NA NA NA DGCR6 103061 2565 chr22 18797195 18799331 18798395 N NA NA NA NA NA NA DGCR6 94405 2566 chr22 18827809 18834245 18833090 N NA NA NA NA NA NA DGCR6 59491 2567 chr22 18874870 18876057 18875075 N NA DGCR6 NA NA NA NA DGCR6 17679 2568 chr22 19590451 19598282 19594857,19594999 N,N NA;NA NA CLDN5,UFD1L,CLTCL1,HIRA,MRPL40,C22orf39,CDC45,LOC150185,SLC25A1,DGCR14 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT5 103705 2569 chr22 20433000 20434923 20434300 N NA PI4KAP1 NA NA NA NA PI4KAP1 34305 2570 chr22 20658372 20661861 20660880 N NA NA NA NA NA NA ZNF74 86544 2571 chr22 21029408 21030329 21030141 N NA NA KLHL22,SCARF2,MED15 IMR90 Hi-C 24141950 MED15 167522 2572 chr22 21587992 21591455 21590408 N NA NA NA NA NA NA BCRP2 130687 2573 chr22 21598778 21600455 21599525 N NA NA NA NA NA NA BCRP2 141473 2574 chr22 22469658 22472687 22472301 N NA NA VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 132511 2575 chr22 23748512 23751539 23749208 N NA ZDHHC8P1 GNAZ,RTDR1,BCR,ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 3713 2576 chr22 23877485 23886042 23878534,23881964 N,N NA;NA NA BCR,ZDHHC8P1,CES5AP1,IGLL1,GUSBP11,RGL4 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 132686 2577 chr22 23887401 23890733 23889012 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC8P1 142602 2578 chr22 25685725 25692856 25686353 N NA NA ADRBK2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5L 84688 2579 chr22 25801609 25837752 25836840 N NA LRP5L,CRYBB2P1 SEZ6L,CRYBB2P1,LRP5L,ADRBK2,MYO18B,KIAA1671,C22orf43 IMR90 Hi-C 24141950 CRYBB2P1 6302 2580 chr22 27282252 27283025 27282875 N NA NA MN1,MIR3199-1,PITPNB,TTC28-AS1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 TFIP11 373815 2581 chr22 30596802 30599577 30598811 N NA NA HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 GATSL3 86039 2582 chr22 30607401 30609496 30608327 N NA NA NA NA NA NA GATSL3 76120 2583 chr22 32374987 32376359 32375593 N NA YWHAH NA NA NA NA YWHAH 34508 2584 chr22 33577398 33578526 33577804 N NA NA NA NA NA NA FBXO7 706691 2585 chr22 34831907 34833571 34832797 N NA NA ISX IMR90 Hi-C 24141950 HMGXB4 819874 2586 chr22 35020703 35023084 35021161 N NA NA NA NA NA NA HMGXB4 630361 2587 chr22 35565636 35578999 35577746 N NA NA NA NA NA NA HMGXB4 74446 2588 chr22 35847602 35849605 35848722 N NA NA NA NA NA NA TOM1 152334 2589 chr22 35898216 35898924 35898298 N NA NA RBFOX2,RASD2,MB,MCM5,APOL3 IMR90 Hi-C 24141950 MB 120477 2590 chr22 36458208 36463589 36462044 N NA RBFOX2 RBFOX2,APOL5,APOL3,APOL6,MCM5,MB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBFOX2 33623 2591 chr22 36803120 36808993 36806214 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 19057 2592 chr22 37986566 37988271 37986721 N NA GGA1 CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP IMR90 Hi-C 24141950 GGA1 16210 2593 chr22 38440040 38442116 38440560 N NA PICK1 BAIAP2L2,LOC400927,KCNJ4,DMC1 IMR90 Hi-C 24141950 PICK1 11146 2594 chr22 38582865 38584119 38583628 N NA PLA2G6 PLA2G6,PICK1,BAIAP2L2,MAFF,CSNK1E K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2G6 5029 2595 chr22 39313944 39322140 39320368 N NA CBX6 APOBEC3A,CBX7,DNAL4,CBX6,APOBEC3C,PDGFB,GTPBP1,SUN2,APOBEC3H,APOBEC3G,RPL3,SNORD83A,RNU86,NPTXR,APOBEC3D,MGAT3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX6 45686 2596 chr22 41042350 41044322 41043050 N NA MKL1 MKL1,ST13,SGSM3,XPNPEP3,MCHR1,ADSL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 9660 2597 chr22 41046013 41061577 41047816,41059447 Y,N NA;NA MKL1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL,SLC25A17,DNAJB7,XPNPEP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 13323 2598 chr22 41119300 41123595 41122397 N NA NA XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17 IMR90 Hi-C 24141950 MKL1 86610 2599 chr22 41394734 41401912 41399204 N NA RBX1 RBX1,MIR1281,EP300,ST13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBX1 47383 2600 chr22 41406371 41436606 41407628,41417961 N,N NA;NA NA ST13,RBX1,MIR1281,EP300,DNAJB7,XPNPEP3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EP300 52008 2601 chr22 41445997 41449505 41446604 N NA EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 EP300 39109 2602 chr22 42719085 42744102 42739655 N NA NA TCF20,NFAM1,LOC100132273,NDUFA6,CYP2D7P1,LOC388906,MEI1,NHP2L1,C22orf46,WBP2NL,CYP2D6,C22orf32 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC388906 53326 2603 chr22 46951465 46970906 46957608 Y NA CELSR1 CERK,CELSR1,TRMU,GRAMD4,TBC1D22A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CELSR1 18398 2604 chr22 47732151 47734301 47733196 N NA NA NA NA NA NA FLJ46257 293017 2605 chr22 48104449 48185322 48104607 N NA NA TBC1D22A,FAM19A5 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ46257 77131 2606 chr22 48230965 48294282 48231122,48261756 N,N NA;NA NA TBC1D22A,MIR3201 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ46257 203647 2607 chr22 48822353 48825904 48824447 N NA NA NA NA NA NA FLJ46257 795035 2608 chr22 49381402 49387726 49381601 N NA NA NA NA NA NA BRD1 830726 2609 chr22 49963111 49974322 49969252 N NA NA NA NA NA NA BRD1 244130 2610 chr3 100199853 100202231 100201260 N NA NA TMEM45A IMR90 Hi-C 24141950 TOMM70A 79611 2611 chr3 100815893 100817108 100816535 N NA NA NA NA NA NA TFG 387759 2612 chr3 101637423 101644396 101637831,101640394 Y,N FAM55C;NA NA LOC152225,FAM55C,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 69065 2613 chr3 101955281 101959319 101957259 N NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 386923 2614 chr3 102248732 102250565 102249699 N NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 680374 2615 chr3 102253818 102257049 102255533 N NA NA FAM55C,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 685460 2616 chr3 102291130 102299439 102292601,102295881 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 722772 2617 chr3 102310537 102321859 102312839,102315743,102319732 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 742179 2618 chr3 102388552 102395483 102392603,102389705 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 820194 2619 chr3 102408395 102412074 102410056 N NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 840037 2620 chr3 102474803 102477394 102475835 N NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 906445 2621 chr3 102826161 102830274 102828756 N NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 1257803 2622 chr3 102851820 102853014 102852402 N NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 1283462 2623 chr3 102856433 102860492 102859419,102858754 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 1288075 2624 chr3 102969696 102971286 102970805 N NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 1401338 2625 chr3 103417124 103419970 103418288 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 1665587 2626 chr3 103754798 103757511 103755564 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 1328046 2627 chr3 104316576 104319600 104318164 N NA NA ALCAM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALCAM 765957 2628 chr3 105828679 105831731 105829256 N NA NA NA NA NA NA CBLB 240792 2629 chr3 106416646 106419274 106418111 N NA NA NA NA NA NA LOC344595 540265 2630 chr3 106590825 106594126 106592573 N NA NA NA NA NA NA LOC344595 365413 2631 chr3 106605290 106608740 106608259 N NA NA NA NA NA NA LOC344595 350799 2632 chr3 106615023 106621119 106620951 N NA NA NA NA NA NA LOC344595 338420 2633 chr3 109611289 109613260 109611842 N NA NA NA NA NA NA DZIP3 1302952 2634 chr3 112019276 112025955 112024670 N NA NA CD200,BTLA,ATG3,SLC35A5,C3orf52 IMR90 Hi-C 24141950 ATG3 254530 2635 chr3 112828613 112832464 112829019 N NA NA BOC,WDR52 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf17 90058 2636 chr3 116995892 116998958 116997542 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 1960794 2637 chr3 118285759 118288127 118286367 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 671625 2638 chr3 118975911 118977279 118976646 N NA B4GALT4 ARHGAP31 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT4 16159 2639 chr3 118996924 118999711 118998012 N NA B4GALT4 ARHGAP31,TMEM39A,B4GALT4 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT4 37172 2640 chr3 11900424 11903622 11901836 N NA TAMM41 SYN2 IMR90 Hi-C 24141950 TAMM41 12072 2641 chr3 11915078 11919602 11915413 N NA TAMM41 NA NA NA NA TAMM41 26726 2642 chr3 119819840 119829627 119820679 N NA GSK3B GSK3B,GPR156,LRRC58 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSK3B 6576 2643 chr3 120297381 120300575 120299611,120297760 N,N NA;NA NDUFB4 NA NA NA NA NDUFB4 14553 2644 chr3 120576180 120582357 120580836 N NA STXBP5L NA NA NA NA STXBP5L 44693 2645 chr3 120606462 120621319 120612684,120614599 N,N NA;NA STXBP5L NA NA NA NA STXBP5L 5731 2646 chr3 122381292 122383901 122382096 N NA NA PARP15,DTX3L,PARP9,PARP14 IMR90 Hi-C 24141950 PARP9 97769 2647 chr3 12314045 12314573 12314162 N NA NA PPARG,MKRN2,SYN2 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN2 211358 2648 chr3 127021754 127024864 127023185 N NA NA CHST13 IMR90 Hi-C 24141950 TPRA1 284704 2649 chr3 127266060 127268594 127267577 N NA TPRA1 CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 TPRA1 40974 2650 chr3 127581908 127582654 127582565 N NA NA PODXL2,KBTBD12,MGLL IMR90 Hi-C 24141950 SEC61A1 188558 2651 chr3 128152253 128158518 128154030 Y GATA2 NA EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,GATA2,C3orf27 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GATA2 53512 2652 chr3 128389643 128405130 128399849,128403277 N,N NA;NA RPN1,RAB7A RAB7A,RPN1,LOC653712,ACAD9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPN1 19924 2653 chr3 128943017 128948433 128944047,128945437 N,Y NA;MBD4,ISY1,CNBP CNBP,COPG1,C3orf37 KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPG1 20020 2654 chr3 128953326 128966014 128960010,128955095,128962522 N,N,N NA;NA;NA COPG1,C3orf37 CNBP,KIAA1257,COPG1,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,C3orf37 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPG1 2439 2655 chr3 130470062 130471654 130470837 N NA PIK3R4 ATP2C1 K562 ChIA-PET 22265404 PIK3R4 4366 2656 chr3 130510027 130511228 130510528 N NA PIK3R4 NA NA NA NA PIK3R4 44331 2657 chr3 130544729 130552454 130551122 N NA NA ATP2C1 K562 ChIA-PET 22265404 PIK3R4 79033 2658 chr3 131935055 131940130 131937923,131938000 N,N NA;NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 ACPP 96081 2659 chr3 131951745 131969082 131961753,131967528,131956683 N,N,N NA;NA;NA NA ACPP,CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 ACPP 67129 2660 chr3 131972415 131996070 131974605,131974769,131986728,131992490 N,N,N,N NA;NA;NA;NA ACPP ACPP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACPP 40141 2661 chr3 131996603 132002142 131998176 N NA ACPP ACPP IMR90 Hi-C 24141950 ACPP 34069 2662 chr3 132018443 132027057 132023860 N NA ACPP NA NA NA NA ACPP 9154 2663 chr3 132123035 132125145 132124196 N NA DNAJC13 ACPP IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC13 11408 2664 chr3 133254346 133255331 133255269 N NA CDV3 BFSP2 IMR90 Hi-C 24141950 CDV3 37103 2665 chr3 133258074 133270551 133269209,133264600 N,N NA;NA CDV3 BFSP2,CDV3 IMR90 Hi-C 24141950 CDV3 21883 2666 chr3 133819908 133851030 133834175,133849937 N,N NA;NA NA SLCO2A1,C3orf36,RAB6B,RYK IMR90 Hi-C 24141950 RYK 118556 2667 chr3 134097543 134103680 134100847 Y NA NA AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63 IMR90 Hi-C 24141950 CEP63 100895 2668 chr3 13482023 13484973 13482923 N NA NUP210,HDAC11 NUP210 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 20214 2669 chr3 135106146 135120106 135114836 N NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 564409 2670 chr3 135121243 135156684 135154224,135124506 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 527831 2671 chr3 135157596 135158824 135158379 N NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 525691 2672 chr3 136916350 136918273 136916730 N NA NA NA NA NA NA NCK1 335300 2673 chr3 137350569 137362662 137358597,137352585 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DBR1 531129 2674 chr3 138058610 138060450 138059361 N NA NA NME9,MRAS IMR90 Hi-C 24141950 ARMC8 152462 2675 chr3 138503728 138555737 138544084,138529890,138553823,138507739 N,N,N,N NA;NA;NA;NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 25527 2676 chr3 138565022 138568220 138567218 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 86821 2677 chr3 138591677 138638491 138599862,138620093,138622780,138634671,138596871 N,N,N,Y,N NA;NA;NA;NA;NA NA PIK3CB,CEP70,ESYT3,FAIM,MRPS22,MRAS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 113476 2678 chr3 13934824 13962675 13937055 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3,SLC6A6,WNT7A,TPRXL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 203696 2679 chr3 141373443 141385012 141379198 N NA NA ATP1B3,RASA2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF7 72039 2680 chr3 141564522 141566268 141565201 N NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 29202 2681 chr3 14266302 14268513 14266749 N NA XPC,LSM3 LSM3 MCF7 ChIA-PET 22265404 LSM3 46074 2682 chr3 14288929 14291720 14290800 N NA NA SLC6A6,GRIP2,LSM3 IMR90 Hi-C 24141950 LSM3 68701 2683 chr3 142895233 142898227 142896247 N NA NA CHST2,SLC9A9 IMR90 Hi-C 24141950 U2SURP 174861 2684 chr3 14412120 14414513 14413612 N NA NA SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LSM3 191892 2685 chr3 144173373 144174416 144173578 N NA NA NA NA NA NA U2SURP 1453001 2686 chr3 144508312 144509440 144508861 N NA NA NA NA NA NA U2SURP 1787940 2687 chr3 145538360 145544017 145539044 N NA NA NA NA NA NA U2SURP 2817988 2688 chr3 146677653 146682402 146678245 N NA NA NA NA NA NA GYG1 2026793 2689 chr3 148186993 148188242 148187428 N NA NA AGTR1 IMR90 Hi-C 24141950 GYG1 520953 2690 chr3 148319076 148321094 148320174 Y NA NA NA NA NA NA GYG1 388101 2691 chr3 148341559 148344895 148342854 N NA NA ZIC4 IMR90 Hi-C 24141950 GYG1 364300 2692 chr3 148820323 148821849 148821180 N NA HLTF,HPS3 HLTF,HPS3 IMR90 Hi-C 24141950 HLTF 15982 2693 chr3 148990117 149000061 148995445 N NA NA HPS3,CP,GYG1,TM4SF18,HLTF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPS3 142746 2694 chr3 149117486 149121540 149119227 N NA NA WWTR1,ANKUB1 IMR90 Hi-C 24141950 HPS3 270115 2695 chr3 149954433 149958835 149956379 N NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2,EIF2A,SERP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 167953 2696 chr3 149984575 149988096 149986715 N NA NA TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 138692 2697 chr3 149995583 149997887 149996882 N NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 128901 2698 chr3 150536795 150540526 150537281 N NA NA NA NA NA NA SIAH2 55532 2699 chr3 152785055 152786784 152785893 N NA NA RAP2B IMR90 Hi-C 24141950 RAP2B 93245 2700 chr3 152952380 152953836 152953109 N NA NA NA NA NA NA RAP2B 72351 2701 chr3 153680374 153683948 153681531 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF26 154844 2702 chr3 153706313 153718629 153715430 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF26 120163 2703 chr3 154236662 154242053 154239212 N NA NA NA NA NA NA DHX36 194376 2704 chr3 154404248 154478679 154461658,154424125,154475988 N,N,N NA;NA;NA NA GPR149,PLCH1,LOC100507537,MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 318757 2705 chr3 154479778 154485778 154482471 N NA NA LOC100507537,MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 311658 2706 chr3 154499667 154512351 154501194,154502737,154505413,154510345 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA LOC100507537,MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 285085 2707 chr3 154566919 154573295 154569762 N NA NA NA NA NA NA MME 224141 2708 chr3 154687936 154691160 154689849 N NA NA LOC100507537,MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 106276 2709 chr3 154928174 154932694 154929584 N NA NA NA NA NA NA MME 130738 2710 chr3 154949337 154954476 154951189 N NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 151901 2711 chr3 155029234 155042583 155031294,155034370,155040272 N,N,N NA;NA;NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 231798 2712 chr3 155057403 155061735 155060179,155058319 N,N NA;NA NA PLCH1 IMR90 Hi-C 24141950 MME 259967 2713 chr3 155453357 155457266 155455841 N NA NA C3orf33 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf33 66789 2714 chr3 155704939 155721905 155705677 N NA NA NA NA NA NA GMPS 116614 2715 chr3 156890800 156895038 156892889 N NA NA CCNL1,VEPH1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC730091 355949 2716 chr3 157736580 157746134 157737722 N NA NA NA NA NA NA RSRC1 81758 2717 chr3 16064448 16096703 16068936,16065118 N,N NA;NA NA ANKRD28,MIR563,GALNTL2,BTD,DPH3,OXNAD1,RFTN1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 163395 2718 chr3 161132379 161135820 161133866 Y NA NA NMD3,B3GALNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NMD3 193280 2719 chr3 161255780 161257044 161255974 N NA NA NA NA NA NA NMD3 316681 2720 chr3 162624191 162625252 162624310 N NA NA NA NA NA NA NMD3 1685092 2721 chr3 163706652 163709117 163707244 N NA NA NA NA NA NA SLITRK3 1205352 2722 chr3 164923835 164941154 164925025,164930571 N,N NA;NA SLITRK3 NA NA NA NA SLITRK3 9366 2723 chr3 165261672 165265068 165263074 N NA NA NA NA NA NA BCHE 290185 2724 chr3 165416912 165420435 165418797 N NA NA NA NA NA NA BCHE 134818 2725 chr3 165559895 165565337 165563348 N NA BCHE NA NA NA NA BCHE 4642 2726 chr3 165600159 165604347 165601980 N NA BCHE NA NA NA NA BCHE 44906 2727 chr3 165664887 165679812 165666884,165671840 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 109634 2728 chr3 165696471 165745070 165738610,165731670,165697112,165701316 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 141218 2729 chr3 165754719 165875138 165824570,165773180,165758312,165837730,165760762,165803314 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 199466 2730 chr3 165877631 165910131 165878262,165895488 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 322378 2731 chr3 165942662 165946835 165943893 N NA NA NA NA NA NA BCHE 387409 2732 chr3 165949919 166000696 165950598 N NA NA NA NA NA NA BCHE 394666 2733 chr3 166019177 166032204 166022091,166030079,166026051 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 463924 2734 chr3 166056284 166060989 166058527 N NA NA NA NA NA NA BCHE 501031 2735 chr3 166169709 166173393 166171423 N NA NA NA NA NA NA BCHE 614456 2736 chr3 166188489 166205601 166190516,166192797,166193859,166199268,166199320,166204117,166201128 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 633236 2737 chr3 166206829 166255295 166208805,166212257,166218695 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 651576 2738 chr3 166269514 166334394 166271954,166317213,166275987 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 714261 2739 chr3 166407873 166410059 166409133 N NA NA NA NA NA NA BCHE 852620 2740 chr3 166492703 166497285 166495957,166493985 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BCHE 937450 2741 chr3 166502423 166509666 166506969 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 942985 2742 chr3 166525130 166533304 166525190,166527598,166531002,166532448 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA PDCD10 919347 2743 chr3 166599640 166657029 166652764,166630240,166604626 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA PDCD10 795622 2744 chr3 166668541 166701359 166699332 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 751292 2745 chr3 166709015 166713052 166710665 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 739599 2746 chr3 166748297 166752038 166750621 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 700613 2747 chr3 166800773 166811349 166808886 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 641302 2748 chr3 166842473 166847506 166844320 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 605145 2749 chr3 166863666 166870823 166868965 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 581828 2750 chr3 167602945 167606786 167604743 N NA NA NA NA NA NA SERPINI1 149513 2751 chr3 167695275 167697828 167696170 N NA NA NA NA NA NA GOLIM4 115589 2752 chr3 168587757 168590458 168589262 N NA NA NA NA NA NA GOLIM4 774340 2753 chr3 168594473 168597086 168595937 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 781056 2754 chr3 169437544 169439521 169437861 N NA NA NA NA NA NA MYNN 51332 2755 chr3 169455489 169457025 169456547 N NA MYNN NA NA NA NA MYNN 33828 2756 chr3 170664836 170667369 170665837 N NA NA TNIK,PLD1,SLC2A2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 76791 2757 chr3 170692262 170693691 170692761 N NA NA TNIK IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 104217 2758 chr3 172278366 172281917 172280257 N NA NA NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 520948 2759 chr3 172324546 172328003 172325616 N NA NA TNFSF10 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 567128 2760 chr3 174068348 174072428 174071333 N NA NA NA NA NA NA NAALADL2 504683 2761 chr3 174141251 174322905 174154695,174158124,174287886,174284977,174258606,174268538 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NAALADL2,NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 254206 2762 chr3 175632117 175638723 175634244 N NA NA NA NA NA NA NAALADL2 1055006 2763 chr3 175656655 175661424 175659377 N NA NA NA NA NA NA NAALADL2 1079544 2764 chr3 175663542 175670741 175665998,175668607 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NAALADL2 1086431 2765 chr3 175724825 175728985 175727168 N NA NA NA NA NA NA NAALADL2 1147714 2766 chr3 175863692 175867902 175865339 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 1047146 2767 chr3 175924014 175927932 175926246 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 987116 2768 chr3 175990136 175994709 175992205,175990211 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 920339 2769 chr3 176429643 176461048 176459736,176457051,176455696 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 454000 2770 chr3 176477780 176540142 176485436,176478499,176539103,176515858 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 374906 2771 chr3 176550156 176643222 176587424,176601461,176640431,176573882,176579585 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 271826 2772 chr3 177016390 177022052 177018027 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 101342 2773 chr3 177030594 177033237 177030869 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 115546 2774 chr3 177062514 177064831 177063683 N NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 147466 2775 chr3 177074304 177079988 177075096,177078116 N,N NA;NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 159256 2776 chr3 177086683 177092255 177089910 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 171635 2777 chr3 177112851 177211287 177114748,177122018,177149332,177183234,177128745,177197298 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 197803 2778 chr3 177323238 177326665 177324960,177323380 N,N NA;NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 408190 2779 chr3 177335358 177344614 177337081,177341412 N,N NA;NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 420310 2780 chr3 177448961 177501934 177497093,177485200 N,N NA;NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 533913 2781 chr3 177525881 177527713 177526126 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 610833 2782 chr3 177528430 177532671 177530453 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 613382 2783 chr3 177541575 177544045 177542594 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 626527 2784 chr3 177568907 177572305 177570451 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 653859 2785 chr3 177614607 177617463 177615960 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 699559 2786 chr3 177683591 177687438 177684772 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 768543 2787 chr3 177778504 177783321 177781384 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 863456 2788 chr3 177798838 177806559 177800370,177804221 N,N NA;NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 883790 2789 chr3 177816362 177819480 177817848 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 901314 2790 chr3 177847497 177881580 177849953,177854498,177865028,177856290,177858512 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 908076 2791 chr3 177929244 177939284 177937237 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 850372 2792 chr3 177987937 178104326 177993733,178101983,178081034,178038348 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 685330 2793 chr3 178107919 178111135 178110281 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 678521 2794 chr3 178844187 178850762 178844462 N NA PIK3CA NA NA NA NA PIK3CA 15549 2795 chr3 179907386 179908639 179907873 N NA NA NA NA NA NA TTC14 411279 2796 chr3 180605274 180606501 180605609 N NA FXR1 NA NA NA NA FXR1 23733 2797 chr3 181537122 181538260 181537493 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 829560 2798 chr3 182001296 182004563 182002802 N NA NA NA NA NA NA ATP11B 506728 2799 chr3 182029772 182030950 182030358 N NA NA NA NA NA NA ATP11B 480341 2800 chr3 182269997 182271689 182271237 N NA NA NA NA NA NA ATP11B 239602 2801 chr3 183326375 183329418 183326761 N NA KLHL24 MCF2L2,LOC100505687,KLHL6,KLHL24,YEATS2 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL24 23993 2802 chr3 184180514 184181436 184181132 N NA NA POLR2H IMR90 Hi-C 24141950 EPHB3 98151 2803 chr3 184978243 184982545 184980527 N NA MAP3K13 VPS8,LOC339926,C3orf70 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K13 18184 2804 chr3 186540811 186547157 186545363 N NA EIF4A2,RFC4 EIF4A2,RFC4,FETUB,ST6GAL1,DNAJB11,TBCCD1,ADIPOQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFC4 16327 2805 chr3 186865183 186867424 186865946 N NA NA RPL39L K562 ChIA-PET 22265404 RFC4 340699 2806 chr3 187068374 187071820 187070469 N NA NA TPRG1 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 391693 2807 chr3 187122244 187123259 187122756 N NA NA NA NA NA NA BCL6 340254 2808 chr3 187525541 187528002 187526914 N NA NA LPP,BCL6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCL6 62028 2809 chr3 189899407 189902278 189901087 N NA NA LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 1144596 2810 chr3 19017201 19020171 19018376 N NA NA NA NA NA NA KCNH8 169846 2811 chr3 190425857 190429084 190427553 N NA NA NA NA NA NA CCDC50 617790 2812 chr3 190477069 190480600 190478913 N NA NA NA NA NA NA CCDC50 566274 2813 chr3 193559270 193561121 193560221 N NA NA HES1,LOC100131551 IMR90 Hi-C 24141950 OPA1 248337 2814 chr3 193568445 193570998 193569897 N NA NA LOC647323,LOC100131551,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OPA1 257512 2815 chr3 193638453 193641630 193640241 N NA NA LOC100131551 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 212301 2816 chr3 193739408 193794833 193788999,193793835 N,N NA;NA NA LOC647323,HES1,LOC100131551 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 59098 2817 chr3 193830079 193831985 193830778 N NA HES1 LOC647323,HES1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 21946 2818 chr3 193842894 193850027 193848733 N NA HES1 LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 3904 2819 chr3 193987422 193990376 193989052 N NA NA HES1,LOC647323,LOC100131551 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 133491 2820 chr3 194536241 194539607 194538067 N NA NA LOC100507391,XXYLT1,FAM43A,ACAP2,APOD,PPP1R2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 129619 2821 chr3 194600267 194602120 194601278 N NA NA XXYLT1,LOC100507391 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 193645 2822 chr3 194704301 194708382 194706046 N NA NA LOC100507391,XXYLT1,LSG1,PPP1R2,FAM43A,ACAP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XXYLT1 283513 2823 chr3 194753031 194755488 194754441 N NA NA XXYLT1,LOC100507391,LSG1,FAM43A,PPP1R2 IMR90 Hi-C 24141950 XXYLT1 236407 2824 chr3 195359637 195361477 195359831 N NA SDHAP2 NA NA NA NA SDHAP2 23433 2825 chr3 195745434 195752628 195750811,195748775 N,N NA;NA SDHAP1 SDHAP2,MUC20,MIR570,TFRC,LOC401109,ZDHHC19,OSTalpha IMR90 Hi-C 24141950 SDHAP1 28284 2826 chr3 196352667 196358001 196357351 N NA NA SENP5,FBXO45,C3orf43,PAK2,LRRC33 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBXO45 56942 2827 chr3 197842462 197847800 197846370 N NA NA NA NA NA NA LMLN 155391 2828 chr3 20588401 20590258 20588671 N NA NA NA NA NA NA KAT2B 506877 2829 chr3 20746614 20748416 20747587 N NA NA NA NA NA NA KAT2B 665090 2830 chr3 21028999 21031388 21030451 N NA NA NA NA NA NA KAT2B 947475 2831 chr3 21844128 21847051 21845500 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 1397733 2832 chr3 22005398 22006399 22006001 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 1238385 2833 chr3 22423180 22424514 22423751 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 820270 2834 chr3 23813511 23814400 23813926 N NA UBE2E1 NA NA NA NA UBE2E1 32984 2835 chr3 24869196 25109050 25076952,24950195,24999793,24921011,24871042,25105232,24880081 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA RARB IMR90 Hi-C 24141950 THRB 332883 2836 chr3 25276515 25373356 25291207,25338936,25276665,25333002,25301630,25304095 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TOP2B 332432 2837 chr3 25406572 25445124 25406731 N NA NA RARB IMR90 Hi-C 24141950 TOP2B 260664 2838 chr3 26422853 26433616 26426008 N NA NA NA NA NA NA OXSM 591290 2839 chr3 26824229 26826043 26824777 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 672202 2840 chr3 27627678 27631628 27628335 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 129433 2841 chr3 27862856 27863958 27863881 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 364611 2842 chr3 27877318 28061956 27963178,27893585,27884551,27982379,27999390,27996313,28036729,28006555,28060576 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CMC1 221168 2843 chr3 28099277 28127256 28100931 N NA NA NA NA NA NA CMC1 155868 2844 chr3 28829108 28831115 28829722 N NA NA NA NA NA NA AZI2 438490 2845 chr3 30299239 30301728 30300472 N NA NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 1272763 2846 chr3 30423095 30424867 30423956 N NA NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 1149624 2847 chr3 30452758 30455829 30452933 N NA NA NA NA NA NA STT3B 1118662 2848 chr3 3157691 3161325 3159489,3157902 N,N NA;NA TRNT1 TRNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRNT1 7275 2849 chr3 33483962 33488616 33487686,33486100 N,N NA;NA UBP1 UBP1 K562 ChIA-PET 22265404 UBP1 2065 2850 chr3 34050550 34052623 34051702 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 210487 2851 chr3 34224084 34226658 34225121 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 384021 2852 chr3 34454028 34461156 34454781 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 613965 2853 chr3 34682350 34683949 34683008 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 842287 2854 chr3 34930171 34933217 34931447 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 1090108 2855 chr3 35089548 35090191 35090034 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 1249485 2856 chr3 35294272 35301065 35299522 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 1454209 2857 chr3 35987545 35989540 35988878 N NA NA NA NA NA NA EPM2AIP1 1045255 2858 chr3 36112478 36113786 36113174 N NA NA NA NA NA NA EPM2AIP1 921009 2859 chr3 36255628 36258008 36256546 N NA NA NA NA NA NA EPM2AIP1 776787 2860 chr3 3676187 3679711 3678411 N NA NA NA NA NA NA LRRN1 161410 2861 chr3 3724926 3729917 3727996 N NA NA NA NA NA NA LRRN1 111204 2862 chr3 3923781 3939367 3924992,3936714 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LRRN1 82660 2863 chr3 39692249 39693614 39692440 N NA NA NA NA NA NA MYRIP 157689 2864 chr3 40731394 40733685 40732755 N NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF621 165018 2865 chr3 42516864 42519745 42518458 Y NA NA TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SS18L2 112553 2866 chr3 4258933 4298965 4279594,4283674,4295176 N,N,N NA;NA;NA SETMAR NA NA NA NA SETMAR 46023 2867 chr3 43318395 43320715 43318685 N NA SNRK HIGD1A,CCDC13,SNRK IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRK 7289 2868 chr3 43674599 43698709 43696709 N NA ANO10,ABHD5 ANO10,ABHD5 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANO10 11039 2869 chr3 45208181 45209724 45209199 Y LIMD1 CDCP1 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCP1 20267 2870 chr3 45223554 45226076 45224310 N NA CDCP1 LARS2,CDCP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCP1 35640 2871 chr3 45313025 45316100 45314762 N NA NA LARS2,CLEC3B IMR90 Hi-C 24141950 LARS2 113975 2872 chr3 45398367 45401274 45399407 N NA LARS2 LARS2,CDCP1,TMEM158 IMR90 Hi-C 24141950 LARS2 28801 2873 chr3 45414658 45419336 45415431 N NA LARS2 TMEM158,CLEC3B,LARS2,CDCP1 IMR90 Hi-C 24141950 LARS2 10739 2874 chr3 46087614 46089566 46088801 N NA NA FYCO1,SLC6A20,LZTFL1,XCR1,CCR9,LTF,CCR5,CXCR6 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 50298 2875 chr3 46202181 46203442 46203250 N NA NA CXCR6,FYCO1,CCR1,CCR3,CCR5,CCR2,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 164865 2876 chr3 46823917 46830843 46824813 N NA NA NA NA NA NA ALS2CL 88723 2877 chr3 49480334 49480825 49480792 N NA RHOA,TCTA,NICN1 NICN1,RHOA,TCTA IMR90 Hi-C 24141950 NICN1 13577 2878 chr3 5074982 5076801 5075680 N NA NA ITPR1,EGOT IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE40 53885 2879 chr3 51556716 51560550 51557668 N NA VPRBP,RAD54L2 RAD54L2,TEX264 IMR90 Hi-C 24141950 RAD54L2 15046 2880 chr3 52213318 52215007 52213596 N NA ALAS1 POC1A,RPL29,WDR82,DUSP7,ALAS1,TLR9,TWF2,PPM1M,MIR135A1,GLYCTK IMR90 Hi-C 24141950 ALAS1 17092 2881 chr3 5305610 5308680 5306611 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 76251 2882 chr3 53177877 53181420 53178312,53179571 N,N NA;NA RFT1,PRKCD RFT1,PRKCD,TKT IMR90 Hi-C 24141950 RFT1 13407 2883 chr3 56538823 56540250 56539377 N NA NA NA NA NA NA CCDC66 50934 2884 chr3 57696261 57699269 57697440 N NA FAM116A,SLMAP SLMAP,FAM116A IMR90 Hi-C 24141950 FAM116A 17445 2885 chr3 57956030 57963535 57958273,57962802 N,N NA;NA FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 30592 2886 chr3 57983018 57985367 57984572 N NA FLNB ARF4,FLNB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLNB 8760 2887 chr3 59091085 59092369 59091811 N NA NA NA NA NA NA KCTD6 613262 2888 chr3 59662681 59664806 59664217 N NA NA FHIT,FAM3D IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 1184858 2889 chr3 61487134 61488125 61487690 N NA NA NA NA NA NA PTPRG 59118 2890 chr3 64231863 64432152 64330469,64431108,64336486,64348474,64295771,64401011 Y,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LOC100287879,LOC100652759,PRICKLE2,PSMD6,LOC100507062,ATRNL1,ATXN7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 PSMD6 222743 2891 chr3 66665095 66667618 66666577 N NA NA LRIG1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 114250 2892 chr3 66812803 66820822 66813882 N NA NA LRIG1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 261958 2893 chr3 66879681 66881945 66880778 N NA NA LRIG1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 328836 2894 chr3 67306507 67317115 67314919 N NA NA NA NA NA NA SUCLG2 387923 2895 chr3 68654458 68655187 68654854 N NA NA NA NA NA NA C3orf64 407587 2896 chr3 68684815 68686544 68685478 N NA NA NA NA NA NA C3orf64 376230 2897 chr3 68708082 68708405 68708297 N NA NA NA NA NA NA C3orf64 354369 2898 chr3 69192107 69193789 69193025 N NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 58017 2899 chr3 69482388 69484120 69483315 N NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 348298 2900 chr3 70786704 70788313 70787327 N NA NA FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 565598 2901 chr3 70850769 70856181 70852906,70855258 N,N NA;NA NA FOXP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FOXP1 497730 2902 chr3 71977957 71979556 71978603 N NA NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR27 174756 2903 chr3 72675025 72676540 72675534 N NA NA RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 179251 2904 chr3 72734747 72737724 72735740 N NA NA EIF4E3,LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 SHQ1 159874 2905 chr3 72924438 72925789 72925031 N NA SHQ1 GXYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 SHQ1 26840 2906 chr3 73154077 73154364 73154251 N NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R2 107958 2907 chr3 74889822 74890743 74890514 N NA NA NA NA NA NA FAM86DP 593523 2908 chr3 75316118 75317285 75316584 N NA NA NA NA NA NA FAM86DP 166981 2909 chr3 75351635 75354193 75353089 N NA NA NA NA NA NA FAM86DP 130073 2910 chr3 75443660 75447943 75444287,75447268 N,N NA;NA FAM86DP NA NA NA NA FAM86DP 36323 2911 chr3 75594715 75610302 75608487 N NA NA NA NA NA NA FAM86DP 110449 2912 chr3 76477552 76480565 76478931 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 643297 2913 chr3 76483705 76485986 76485138 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 649450 2914 chr3 79951601 79952912 79952441 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1858038 2915 chr3 80514275 80516936 80515838 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1294014 2916 chr3 80530251 80631641 80630744,80570492 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GBE1 1179309 2917 chr3 80676662 80885471 80685217,80685227,80774306,80820133,80788119 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA GBE1 925479 2918 chr3 80938354 80947863 80939021 N NA NA NA NA NA NA GBE1 863087 2919 chr3 81099536 81108429 81100630 N NA NA NA NA NA NA GBE1 702521 2920 chr3 82854098 82856024 82854710 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1043148 2921 chr3 83808983 83809720 83809273 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1998033 2922 chr3 87098233 87101860 87098492 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 174553 2923 chr3 8723856 8727235 8725405 N NA NA NA NA NA NA RAD18 277924 2924 chr3 87381475 87383673 87382672 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 105062 2925 chr3 87407959 87410393 87409168 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 131546 2926 chr3 8751190 8753672 8752046 N NA NA NA NA NA NA RAD18 251487 2927 chr3 87782045 87788902 87782949 N NA NA NA NA NA NA ZNF654 399360 2928 chr3 87822746 87827221 87823232 N NA NA NA NA NA NA ZNF654 361041 2929 chr3 87980045 87983000 87980481 N NA NA NA NA NA NA ZNF654 205262 2930 chr3 89044810 89047294 89046524 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 109380 2931 chr3 89551987 89553388 89552626 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 395313 2932 chr3 89577949 89582359 89579201 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 421275 2933 chr3 89722247 89734639 89732095 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 565573 2934 chr3 89747241 89759896 89758864 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 590567 2935 chr3 89770452 89773108 89771573 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 613778 2936 chr3 89796226 89799132 89797376 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 639552 2937 chr3 89899937 89903317 89901930 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 743263 2938 chr3 90228281 90232218 90229516 N NA NA NA NA NA NA EPHA3 1071607 2939 chr3 90474014 90504963 90475203,90475023 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EPHA3 1317340 2940 chr3 9307152 9387607 9347076,9324255,9385452,9365908 N,N,N,N NA;NA;NA;NA SRGAP3,THUMPD3 SRGAP3,RAD18,C3orf32,CAV3,OXTR,THUMPD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGAP3 15841 2941 chr3 93505278 93508743 93506202 N NA NA NA NA NA NA ARL13B 190240 2942 chr3 94198303 94200910 94199365 N NA NA NA NA NA NA DHFRL1 416236 2943 chr3 94224253 94226981 94225614 N NA NA NA NA NA NA DHFRL1 442186 2944 chr3 94241913 94244599 94243626 N NA NA NA NA NA NA DHFRL1 459846 2945 chr3 94304808 94307468 94306420 N NA NA NA NA NA NA DHFRL1 522741 2946 chr3 9600347 9602651 9600519 N NA NA NA NA NA NA MTMR14 88466 2947 chr3 96268657 96269509 96269457 N NA NA NA NA NA NA EPHA6 263916 2948 chr3 96335908 96337462 96336859 N NA NA NA NA NA NA EPHA6 195963 2949 chr3 97538669 97551511 97541224 N NA NA GABRR3,CPOX,MINA IMR90 Hi-C 24141950 ARL6 55074 2950 chr3 98026820 98045838 98044040 Y NA NA GABRR3 IMR90 Hi-C 24141950 CLDND1 196072 2951 chr3 98378838 98380559 98379912 N NA NA NA NA NA NA CPOX 66383 2952 chr3 999208 1001011 1000130 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 2167589 2953 chr4 100643795 100645983 100644899 N NA NA DAPP1 IMR90 Hi-C 24141950 RG9MTD2 158606 2954 chr4 100905058 100928485 100917897,100919478 N,N NA;NA DNAJB14,H2AFZ,LOC256880 DNAJB14 IMR90 Hi-C 24141950 LOC256880 33422 2955 chr4 100937324 100953183 100939188 N NA NA NA NA NA NA LOC256880 65688 2956 chr4 101002696 101006083 101004360 N NA NA NA NA NA NA LOC256880 131060 2957 chr4 101013592 101022998 101014763,101018608 N,N NA;NA NA PPP3CA IMR90 Hi-C 24141950 LOC256880 141956 2958 chr4 101192134 101194496 101193091 N NA NA NA NA NA NA LOC256880 320498 2959 chr4 101501548 101509437 101506960,101502745 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA LOC256880 629912 2960 chr4 101523101 101530358 101525857 N NA NA NA NA NA NA LOC256880 651465 2961 chr4 101549678 101593330 101568096,101552137,101570577,101564969 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA PPP3CA 675298 2962 chr4 101699082 101703885 101702236 N NA NA NA NA NA NA PPP3CA 564743 2963 chr4 101715969 101718947 101717366 N NA NA NA NA NA NA PPP3CA 549681 2964 chr4 101788888 101790214 101789508 N NA NA NA NA NA NA PPP3CA 478414 2965 chr4 101814726 101816487 101815829 N NA NA NA NA NA NA PPP3CA 452141 2966 chr4 101817908 101821510 101820079 N NA NA NA NA NA NA PPP3CA 447118 2967 chr4 102313078 102316390 102314982 N NA PPP3CA,FLJ20021 NA NA NA NA FLJ20021 44144 2968 chr4 102569837 102572580 102571747 N NA NA NA NA NA NA BANK1 139184 2969 chr4 102612924 102616800 102615080 N NA NA NA NA NA NA BANK1 94964 2970 chr4 102649499 102653481 102651971 N NA NA PPP3CA IMR90 Hi-C 24141950 BANK1 58283 2971 chr4 103134808 103140421 103137241 N NA NA NA NA NA NA SLC39A8 125989 2972 chr4 103340323 103353277 103351822,103342017 N,N NA;NA NA NFKB1,SLC9B1,BDH2 IMR90 Hi-C 24141950 NFKB1 69209 2973 chr4 103357023 103362818 103360980 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA NA BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKB1 59668 2974 chr4 104643809 104645342 104644015 N NA NA NA NA NA NA BDH2 622785 2975 chr4 105048805 105051675 105050145 N NA NA NA NA NA NA TET2 1016167 2976 chr4 105123027 105125193 105123547 N NA NA NA NA NA NA TET2 942649 2977 chr4 105707278 105714548 105708344 N NA NA NA NA NA NA TET2 353294 2978 chr4 105724114 105728193 105724282 N NA NA NA NA NA NA TET2 339649 2979 chr4 105886263 105890173 105888213 N NA NA TET2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TET2 177669 2980 chr4 105891275 105895555 105893165 N NA NA TET2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TET2 172287 2981 chr4 105909487 105911917 105910701 N NA NA NA NA NA NA TET2 155925 2982 chr4 106246051 106251901 106251046 N NA NA NA NA NA NA PPA2 143326 2983 chr4 106405459 106408013 106406429 N NA PPA2 PPA2 K562 ChIA-PET 22265404 PPA2 10232 2984 chr4 106422965 106427622 106426612,106424324 N,N NA;NA PPA2,ARHGEF38 NA NA NA NA PPA2 27738 2985 chr4 109185040 109187899 109185678 N NA NA LOC641518 IMR90 Hi-C 24141950 LEF1 94928 2986 chr4 109257915 109260337 109259197 N NA NA HADH IMR90 Hi-C 24141950 LEF1 167803 2987 chr4 109309050 109311831 109310546 N NA NA NA NA NA NA LEF1 218938 2988 chr4 110307330 110309366 110308536 N NA SEC24B,1/2-SBSRNA4 COL25A1,OSTC,AGXT2L1,CFI IMR90 Hi-C 24141950 SEC24B 45605 2989 chr4 11048818 11049681 11049490 N NA NA NA NA NA NA HS3ST1 380856 2990 chr4 111340528 111342056 111341224 N NA NA ELOVL6 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL6 220708 2991 chr4 112815128 112820296 112816282 N NA NA NA NA NA NA C4orf32 246257 2992 chr4 113143913 113146140 113145078 N NA AP1AR NA NA NA NA AP1AR 6755 2993 chr4 113676380 113678030 113676902 N NA NA NA NA NA NA LARP7 118260 2994 chr4 113709113 113710388 113709604 N NA NA NA NA NA NA LARP7 150993 2995 chr4 11489581 11492594 11490432,11491331 Y,N NA;NA NA CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST1 59044 2996 chr4 114929264 114930025 114929791 N NA NA NA NA NA NA LARP7 1371144 2997 chr4 11604724 11608247 11607037 N NA NA CLNK IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST1 174187 2998 chr4 117597123 117599080 117598242 N NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 407656 2999 chr4 11843578 11845155 11844005 N NA NA NA NA NA NA HS3ST1 413041 3000 chr4 119320869 119321406 119321007 N NA NA PRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 CEP170P1 116089 3001 chr4 119511169 119579558 119529802,119512854 N,N NA;NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 27016 3002 chr4 120867128 120876764 120876502,120869864 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC645513 491190 3003 chr4 122641864 122644108 122643014 N NA ANXA5 BBS7,CCNA2,ANXA5 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA5 23717 3004 chr4 123071354 123088034 123073966 N NA KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 3724 3005 chr4 123573664 123578096 123573954 N NA NA NA NA NA NA BBS12 75761 3006 chr4 123697267 123699382 123698268 N NA BBS12 SPATA5,NUDT6,FGF2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBS12 43410 3007 chr4 124307210 124309592 124308013 N NA SPRY1 SPATA5,LOC285419 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 8364 3008 chr4 124429078 124430640 124429727 N NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 111122 3009 chr4 125870677 125873538 125871293 N NA NA ANKRD50 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD50 236790 3010 chr4 12641798 12642381 12642125 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 843608 3011 chr4 126707419 126708251 126707714 N NA NA NA NA NA NA ANKRD50 1073532 3012 chr4 12910510 12951952 12951775 N NA NA NA NA NA NA RAB28 534037 3013 chr4 129388862 129517615 129447213,129389757,129474759,129514221,129484952 N,Y,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA PHF17,PGRMC2,SCLT1,LARP1B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 178878 3014 chr4 13010633 13188216 13132897,13186950,13154903 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA RAB28 297773 3015 chr4 130557178 130777006 130616030,130578967,130636434,130774704 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA C4orf33 542349 3016 chr4 130783130 130797260 130783381 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 768301 3017 chr4 132211495 132212255 132211868 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 2196666 3018 chr4 132651947 132710595 132678507 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 2637118 3019 chr4 132895724 132900286 132897910 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 2880895 3020 chr4 133244339 133273332 133266409 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 3229510 3021 chr4 133736810 133739299 133737430 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 3721981 3022 chr4 135646678 135650008 135648951 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 3513495 3023 chr4 136367582 136370451 136368916 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 2793052 3024 chr4 136784639 136786316 136785646 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 2377187 3025 chr4 137213020 137222607 137214074 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 1940896 3026 chr4 137763675 137770656 137763977 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 1392847 3027 chr4 139250838 139253158 139251953 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 87335 3028 chr4 139254772 139256707 139255970 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 91269 3029 chr4 139318481 139319257 139318986 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 154978 3030 chr4 139817444 139843678 139819161,139831950 N,N NA;NA NA SLC7A11,LOC641365,LOC641364,PCDH18,CCRN4L IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 93265 3031 chr4 140106544 140112167 140106955 N NA ELF2 ELF2,NAA15,C4orf49,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 45938 3032 chr4 140490800 140492880 140491484 N NA SETD7 SETD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SETD7 13223 3033 chr4 141078833 141080354 141079753 Y NA MAML3 NA NA NA NA MAML3 3600 3034 chr4 141156834 141161386 141159278 N NA NA MAML3,MGST2,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAML3 81601 3035 chr4 141367404 141368284 141368034 N NA CLGN NA NA NA NA CLGN 18589 3036 chr4 141741350 141747896 141741732,141747544 N,N NA;NA NA TBC1D9 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D9 63879 3037 chr4 144733154 144733817 144733553 N NA NA NA NA NA NA SMARCA5 298538 3038 chr4 144756178 144757397 144756385 N NA NA NA NA NA NA SMARCA5 321562 3039 chr4 144877241 144878841 144877439 N NA NA NA NA NA NA SMARCA5 442625 3040 chr4 145689425 145691721 145690572 N NA NA NA NA NA NA ABCE1 327435 3041 chr4 146105681 146107413 146105831 N NA OTUD4 OTUD4,SMAD1,MMAA,ZNF827 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OTUD4 4849 3042 chr4 146253321 146256444 146255185 N NA NA NA NA NA NA SMAD1 146507 3043 chr4 146297429 146299969 146298804 N NA NA NA NA NA NA SMAD1 102982 3044 chr4 148036984 148041807 148039413 N NA NA EDNRA,ARHGAP10,PRMT10 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 496732 3045 chr4 148046190 148051705 148048116 N NA NA EDNRA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 486834 3046 chr4 148071392 148083593 148073891,148079783,148081018 N,N,N NA;NA;NA NA EDNRA,TMEM184C,ARHGAP10 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 454946 3047 chr4 148275863 148280626 148278598 N NA NA EDNRA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 257913 3048 chr4 148361215 148373241 148370836 N NA NA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 165298 3049 chr4 149873968 149881303 149875372 N NA NA NR3C2 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C2 510296 3050 chr4 150629771 150631608 150630681 N NA NA NA NA NA NA DCLK2 367818 3051 chr4 150769181 150775863 150769596 N NA NA NA NA NA NA DCLK2 223563 3052 chr4 15150369 15152833 15151671 Y NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 146071 3053 chr4 152176174 152191507 152189589 N NA SH3D19 SH3D19,FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3D19 26992 3054 chr4 152247600 152252839 152248817,152250964 N,N NA;NA NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160A1 77559 3055 chr4 153922080 153925646 153923395 N NA NA ARFIP1,FHDC1 IMR90 Hi-C 24141950 FHDC1 57945 3056 chr4 155090628 155094004 155091107 N NA NA NA NA NA NA PLRG1 377581 3057 chr4 156364672 156384556 156366680,156376117,156368257 N,N,N NA;NA;NA NA GUCY1B3,GUCY1A3 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 66550 3058 chr4 156449792 156452699 156451336 N NA NA GUCY1A3,GUCY1B3 IMR90 Hi-C 24141950 GUCY1A3 135163 3059 chr4 156564438 156566427 156565154 N NA GUCY1A3 NA NA NA NA GUCY1A3 21435 3060 chr4 156927513 156928519 156928100 N NA NA NA NA NA NA GUCY1A3 339651 3061 chr4 158911920 158924580 158914336,158917661,158921126 N,N,N NA;NA;NA NA FAM198B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM198B 169622 3062 chr4 158939413 158943796 158941677 N NA NA FAM198B,GRIA2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM198B 150406 3063 chr4 158999955 159012677 159011831,159005526 N,N NA;NA NA FAM198B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM198B 81525 3064 chr4 159198333 159208448 159200133 N NA NA NA NA NA NA TMEM144 66932 3065 chr4 159336320 159340450 159337084 N NA NA NA NA NA NA TMEM144 204919 3066 chr4 160358272 160359439 160358448 N NA NA FNIP2,PPID IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 169274 3067 chr4 160547653 160551082 160548271 N NA NA NA NA NA NA RAPGEF2 358655 3068 chr4 160690881 160693348 160691859 N NA NA NA NA NA NA RAPGEF2 501883 3069 chr4 161284353 161288719 161286295 N NA NA NA NA NA NA RAPGEF2 1095355 3070 chr4 161579968 161582550 161581449 N NA NA NA NA NA NA RAPGEF2 1390970 3071 chr4 161747782 161750302 161748597 N NA NA NA NA NA NA RAPGEF2 1558784 3072 chr4 162210656 162212827 162211923 N NA NA NA NA NA NA NAF1 1875246 3073 chr4 163202812 163206503 163205253 N NA NA NA NA NA NA NAF1 881570 3074 chr4 163342400 163342814 163342646 N NA NA NA NA NA NA NAF1 745259 3075 chr4 165920433 165924179 165922352 N NA C4orf39 NA NA NA NA C4orf39 42333 3076 chr4 165940242 165942190 165940437 N NA NA NA NA NA NA C4orf39 62142 3077 chr4 166496314 166503102 166499403,166502119,166502146 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CPE 196217 3078 chr4 166529271 166534541 166531552 N NA NA NA NA NA NA CPE 229174 3079 chr4 166566050 166580120 166577882 N NA NA NA NA NA NA TLL1 214290 3080 chr4 166584548 166589285 166587203 N NA NA NA NA NA NA TLL1 205125 3081 chr4 166606917 166612553 166609789 N NA NA NA NA NA NA TLL1 181857 3082 chr4 166641065 166645950 166643231 N NA NA NA NA NA NA TLL1 148460 3083 chr4 166649351 166652757 166650681 N NA NA NA NA NA NA TLL1 141653 3084 chr4 166785307 166788109 166786948 N NA TLL1 NA NA NA NA TLL1 6301 3085 chr4 169989633 169992879 169991701 N NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 58165 3086 chr4 170691525 170693445 170691971 N NA C4orf27 NA NA NA NA C4orf27 12432 3087 chr4 170748239 170751141 170750215 N NA NA MFAP3L IMR90 Hi-C 24141950 C4orf27 69146 3088 chr4 171443503 171453300 171444870,171448474,171451469 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA AADAT 432131 3089 chr4 171683065 171686976 171684857 N NA NA NA NA NA NA AADAT 671693 3090 chr4 174001985 174005801 174002681 N NA NA NA NA NA NA GALNT7 84103 3091 chr4 174276601 174277493 174276955 N NA HMGB2 HMGB2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGB2 21006 3092 chr4 174369861 174374164 174370622 N NA NA NA NA NA NA HMGB2 114266 3093 chr4 174535841 174543135 174538067 N NA NA NA NA NA NA HMGB2 280246 3094 chr4 175303688 175305741 175304510 N NA NA NA NA NA NA CEP44 98633 3095 chr4 178580726 178581592 178581001 N NA NA NA NA NA NA AGA 217069 3096 chr4 179316258 179332434 179332244 N NA NA NA NA NA NA AGA 952601 3097 chr4 180059121 180059596 180059430 N NA NA NA NA NA NA AGA 1695464 3098 chr4 181674196 181675823 181674975 N NA NA NA NA NA NA DCTD 2162807 3099 chr4 181864469 181866903 181865173 N NA NA NA NA NA NA DCTD 1971727 3100 chr4 181876679 181878391 181876914 N NA NA NA NA NA NA DCTD 1960239 3101 chr4 184267104 184268337 184267753 N NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 97452 3102 chr4 185188221 185190343 185189574 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 205383 3103 chr4 185199242 185206222 185205486 Y NA NA IRF2,LOC728175,CASP3,CCDC111,MLF1IP IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 189504 3104 chr4 185450000 185460837 185458767 N NA NA IRF2,CASP3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 54274 3105 chr4 188128191 188131995 188131229,188129294 N,N NA;NA NA LOC339975,FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 483204 3106 chr4 189270504 189271283 189270828 N NA NA FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AA4P 1123016 3107 chr4 189659413 189663319 189661315 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 730980 3108 chr4 189897070 189898889 189897912 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 495410 3109 chr4 190048282 190060703 190057854 N NA NA LOC401164,ZFP42,TRIML1 IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AA4P 333596 3110 chr4 190064213 190292841 190197877,190191404,190110369,190217538,190269980,190285430 N,N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LOC401164,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AA4P 101458 3111 chr4 190605717 190625560 190624356 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 211418 3112 chr4 190631256 190646333 190643760 N NA NA NA NA NA NA FRG1 215641 3113 chr4 190726807 190734030 190731711 N NA NA NA NA NA NA FRG1 127944 3114 chr4 19079342 19085668 19079502 N NA NA ANKRD33B MCF7 ChIA-PET 19890323 LCORL 1055859 3115 chr4 190967533 190972812 190971008 N NA NA NA NA NA NA FRG1 105559 3116 chr4 19555875 19595982 19556274,19559090 N,N NA;NA NA SLIT2 IMR90 Hi-C 24141950 PACRGL 1106054 3117 chr4 22957907 22958238 22958075 N NA NA NA NA NA NA GPR125 440235 3118 chr4 23177209 23179495 23178029 N NA NA NA NA NA NA GPR125 659537 3119 chr4 24447959 24448640 24448248 N NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 137544 3120 chr4 24597944 24610550 24599722 Y NA DHX15 SOD3,CCDC149,LGI2 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 11760 3121 chr4 26142116 26145818 26142880 N NA NA RBPJ,TBC1D19,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 175514 3122 chr4 27060677 27063546 27062384 N NA NA NA NA NA NA TBC1D19 475131 3123 chr4 27382997 27384607 27383985 N NA NA NA NA NA NA TBC1D19 797451 3124 chr4 2764708 2768253 2766275 N NA TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 6605 3125 chr4 2782914 2788854 2787429 N NA TNIP2,SH3BP2 SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SH3BP2 5896 3126 chr4 28128079 28133057 28129982 N NA NA NA NA NA NA TBC1D19 1542533 3127 chr4 29595606 29597255 29596591 N NA NA NA NA NA NA TBC1D19 3010060 3128 chr4 31400810 31403264 31400965 N NA NA NA NA NA NA TBC1D19 4815264 3129 chr4 34063809 34178731 34177751 N NA NA NA NA NA NA RELL1 3509268 3130 chr4 34302226 34340948 34336694 N NA NA NA NA NA NA RELL1 3347051 3131 chr4 34871 35803 35141 N NA ZNF718 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF718 17474 3132 chr4 3562455 3563882 3563090 N NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 28231 3133 chr4 36726960 36728636 36727548 N NA NA NA NA NA NA RELL1 959363 3134 chr4 37008261 37011130 37009896 N NA NA NA NA NA NA RELL1 676869 3135 chr4 37058230 37061516 37059863 N NA NA NA NA NA NA RELL1 626483 3136 chr4 3828496 3830890 3829376 Y LYAR,LYAR,ADRA2C NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 FAM86EP 126258 3137 chr4 38318776 38323470 38320518 N NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342320 3138 chr4 38324241 38324777 38324609 N NA NA KLF3,FLJ13197,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 341013 3139 chr4 38335524 38338185 38336639 N NA NA KLF3,FLJ13197,TBC1D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 327605 3140 chr4 40010628 40017115 40010981 N NA PDS5A,N4BP2,LOC344967 NA NA NA NA PDS5A 31052 3141 chr4 4013813 4040835 4014530 N NA NA NA NA NA NA FAM86EP 56665 3142 chr4 40668394 40670101 40668808 N NA RBM47 RBM47 IMR90 Hi-C 24141950 RBM47 36511 3143 chr4 41316302 41346612 41345954,41322339,41317474,41336387 N,N,N,N NA;NA;NA;NA LIMCH1 LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 LIMCH1 16192 3144 chr4 42819002 42819734 42819374 Y ATP8A1,GRXCR1 NA NA NA NA NA ATP8A1 159880 3145 chr4 43819376 43822369 43819662 N NA NA NA NA NA NA GUF1 858064 3146 chr4 4762765 4826071 4763038 N NA MSX1 LOC100507266,STX18,MSX1,D4S234E IMR90 Hi-C 24141950 MSX1 35321 3147 chr4 48925685 48927708 48926563 N NA OCIAD2 NA NA NA NA OCIAD2 16870 3148 chr4 49161514 49339057 49163276,49189130,49191665,49167562,49285957,49302340,49329996,49338580,49316960 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 252699 3149 chr4 49488821 49630577 49493048,49505116,49518337,49622587,49607156,49628723 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 580006 3150 chr4 53185394 53192098 53186189 N NA NA NA NA NA NA SGCB 280909 3151 chr4 54954591 54959601 54958111 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 23776 3152 chr4 55274228 55277353 55275494 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 343413 3153 chr4 55304878 55307166 55306260 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 374063 3154 chr4 56033639 56035945 56034122 N NA NA NA NA NA NA SRD5A3 176443 3155 chr4 57594346 57596949 57595017 N NA NA THEGL,HOPX IMR90 Hi-C 24141950 REST 177093 3156 chr4 57739351 57755278 57740622,57751331 Y,N PPAT,REST;NA REST THEGL,SPINK2,REST IMR90 Hi-C 24141950 REST 18764 3157 chr4 58332818 58339507 58333061 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 487709 3158 chr4 58428039 58437793 58428504 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 582930 3159 chr4 59157546 59158810 59157843 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 1312437 3160 chr4 59177873 59181033 59179994 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 1332764 3161 chr4 59530734 59533469 59532067 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 1685625 3162 chr4 59865982 59869699 59867589 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 2020873 3163 chr4 60208403 60210633 60209430 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 2363294 3164 chr4 60274655 60276598 60275631 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 2429546 3165 chr4 60354083 60364217 60363844 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 2508974 3166 chr4 60398623 60438066 60419970,60407834,60436773 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA POLR2B 2553514 3167 chr4 60447092 60485056 60455924,60449978,60484893 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA POLR2B 2601983 3168 chr4 612435 613828 613031 N NA NA PDE6B,ATP5I,MYL5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP5I 54299 3169 chr4 62237439 62243197 62239081 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 4392330 3170 chr4 62970740 62972243 62971333 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 5125631 3171 chr4 63460728 63461916 63461335 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 4949340 3172 chr4 63981578 63983451 63981737 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 4427805 3173 chr4 64783275 64784622 64783737 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 3626634 3174 chr4 65473172 65473457 65473283 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 2937799 3175 chr4 65708419 65734574 65725019,65731109 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CENPC1 2676682 3176 chr4 65925294 66044136 66024498,66037808,66042052 N,N,N NA;NA;NA NA EXOC4 MCF7 ChIA-PET 19890323 CENPC1 2367120 3177 chr4 66066086 66124464 66107533 Y NA NA NA NA NA NA CENPC1 2286792 3178 chr4 66762659 66977056 66792724,66859084,66865280,66950378,66901468 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CENPC1 1434200 3179 chr4 67222548 67268610 67222913 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 1142646 3180 chr4 6747736 6754733 6749247,6751334,6753323 N,N,N NA;NA;NA MRFAP1L1,CNO,KIAA0232 KIAA0232,LOC100129931,TADA2B,TBC1D14,MRFAP1L1,S100P IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0232 29726 3181 chr4 67558479 67561890 67560826 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 849366 3182 chr4 67970043 67973833 67972938 Y NA NA NA NA NA NA CENPC1 437423 3183 chr4 68145715 68149077 68146902 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 262179 3184 chr4 68263891 68267192 68265369 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 144064 3185 chr4 68296220 68300634 68300235 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 110622 3186 chr4 69454886 69468425 69460769,69463843,69468275 N,N,N NA;NA;NA UGT2B17 NA NA NA NA UGT2B17 20641 3187 chr4 69728872 69732978 69730603 N NA NA NA NA NA NA UGT2B15 192378 3188 chr4 69769716 69773641 69771170 N NA NA TMPRSS11E MCF7 ChIA-PET 22265404 UGT2B15 233222 3189 chr4 70034165 70038289 70038169,70036405 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UGT2B15 497671 3190 chr4 70104615 70107314 70105347 N NA NA NA NA NA NA UGT2B15 568121 3191 chr4 70185743 70188345 70187284 N NA NA NA NA NA NA UGT2B15 649249 3192 chr4 70207122 70211173 70209282 N NA NA NA NA NA NA UGT2B15 670628 3193 chr4 70253778 70257417 70255070 N NA NA NA NA NA NA UGT2B15 717284 3194 chr4 70563103 70563310 70563266 N NA NA NA NA NA NA UTP3 990886 3195 chr4 70732829 70735846 70734445 N NA NA NA NA NA NA UTP3 818350 3196 chr4 70848688 70851505 70849888 N NA NA NA NA NA NA UTP3 702691 3197 chr4 71927175 71930360 71928761 N NA NA NA NA NA NA SLC4A4 122643 3198 chr4 72008357 72012759 72008676 N NA SLC4A4 NA NA NA NA SLC4A4 40244 3199 chr4 73757900 73760474 73759338 N NA NA NA NA NA NA COX18 174998 3200 chr4 74638866 74640404 74639757 N NA NA CXCL6,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 383425 3201 chr4 74803631 74805370 74804617 N NA NA CXCL3,CXCL2,RASSF6,PF4V1 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 218459 3202 chr4 75642606 75649132 75642793 N NA NA EREG IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 618777 3203 chr4 76242362 76245632 76243514 N NA NA NA NA NA NA RCHY1 194008 3204 chr4 77748394 77751697 77749345 N NA NA SHROOM3,SOWAHB,SEPT11 IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHB 67305 3205 chr4 78062158 78070065 78063982,78067692 N,N NA;NA CCNG2 CCNI MCF7 ChIA-PET 22265404 CCNG2 8292 3206 chr4 78908750 78910036 78909338 N NA NA NA NA NA NA MRPL1 124945 3207 chr4 80572559 80574757 80573580 N NA NA NA NA NA NA ANTXR2 419720 3208 chr4 82157439 82161150 82159748 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 1133999 3209 chr4 82296909 82301387 82299168 N NA NA BMP3 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPD 993762 3210 chr4 83317931 83318734 83318629 N NA HNRNPD,HNRPDL,ENOPH1 HPSE,HNRNPD,ENOPH1,HNRPDL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPD 22782 3211 chr4 83498118 83499531 83498756 N NA NA TMEM150C,LINC00575,SCD5,SEC31A IMR90 Hi-C 24141950 ENOPH1 146392 3212 chr4 84104768 84108225 84105841 N NA NA COQ2,COPS4,PLAC8,HPSE IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 97842 3213 chr4 88159089 88163361 88161913 N NA KLHL8 KLHL8,AFF1,LOC100506746 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLHL8 17415 3214 chr4 89238450 89248086 89241277 N NA PPM1K HERC6 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1K 32562 3215 chr4 89284789 89287057 89286896 N NA NA MEPE,HERC6 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1K 78901 3216 chr4 89983176 90015678 90002040,90013223,90005283,90014384 N,N,N,N NA;NA;NA;NA FAM13A,TIGD2 HERC3,TIGD2,FAM13A IMR90 Hi-C 24141950 FAM13A 4853 3217 chr4 9042750 9080464 9043713,9060036 N,N NA;NA NA NA NA NA NA METTL19 600218 3218 chr4 90601789 90616073 90602558 N NA NA NA NA NA NA TIGD2 567821 3219 chr4 9121306 9165662 9153565,9155406 N,N NA;NA NA NA NA NA NA METTL19 678774 3220 chr4 92898566 92904659 92899804 N NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2224100 3221 chr4 95068079 95088355 95069282 N NA SMARCAD1 NA NA NA NA SMARCAD1 40404 3222 chr4 95348844 95351920 95350402 N NA PDLIM5 PDLIM5 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM5 21088 3223 chr4 95619907 95628807 95620074 N NA NA BMPR1B IMR90 Hi-C 24141950 BMPR1B 50321 3224 chr4 9581501 9598229 9591463 N NA NA NA NA NA NA WDR1 520344 3225 chr4 9633176 9636639 9636165 N NA NA NA NA NA NA WDR1 481934 3226 chr4 9646190 9711543 9679709,9687595,9662197,9692685,9698122 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA WDR1 407030 3227 chr4 97269825 97270657 97270309 N NA NA NA NA NA NA BMPR1B 1590697 3228 chr4 97348038 97352054 97351389 N NA NA NA NA NA NA BMPR1B 1668910 3229 chr4 97459215 97461936 97460265 N NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 1720591 3230 chr4 97695852 97700075 97698416 N NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 1482452 3231 chr4 97701975 97708583 97704447,97707929 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 1473944 3232 chr4 98170634 98173221 98171902 N NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 1009306 3233 chr4 99896907 99897856 99897265 N NA METAP1 NA NA NA NA METAP1 18932 3234 chr5 10008328 10017481 10011322 N NA NA LOC285692,FAM173B,SEMA5A,LOC100505806,TAS2R1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM173B 232533 3235 chr5 101117564 101119842 101118468 N NA NA NA NA NA NA ST8SIA4 878577 3236 chr5 101345131 101348005 101346365,101346342 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ST8SIA4 1106144 3237 chr5 102662662 102665648 102664185 N NA NA NA NA NA NA C5orf30 68220 3238 chr5 102694879 102697464 102696308 N NA NA NA NA NA NA C5orf30 100437 3239 chr5 102717865 102721996 102718894 N NA NA NA NA NA NA C5orf30 123423 3240 chr5 102778643 102781177 102780332 N NA NA C5orf30 MCF7 ChIA-PET 22265404 NUDT12 117313 3241 chr5 10334024 10335968 10335072 N NA MARCH6 MARCH6,ROPN1L,CMBL,CCT5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARCH6 17860 3242 chr5 103415440 103528164 103497165,103439625,103449080,103416357 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA NUDT12 516950 3243 chr5 103552475 103695622 103558245,103552635 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NUDT12 653985 3244 chr5 103787016 103799286 103788105 N NA NA NA NA NA NA NUDT12 888526 3245 chr5 105888941 105889686 105889157 N NA NA NA NA NA NA EFNA5 1116910 3246 chr5 106507649 106531099 106530740 N NA NA EFNA5 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA5 475497 3247 chr5 108988892 108992225 108989980 N NA MAN2A1 NA NA NA NA MAN2A1 32931 3248 chr5 109403034 109407810 109403885 N NA NA NA NA NA NA MAN2A1 377878 3249 chr5 112286020 112288602 112286915 N NA REEP5,DCP2 SRP19,DCP2,YTHDC2 IMR90 Hi-C 24141950 DCP2 23805 3250 chr5 113088798 113090001 113089448 N NA NA NA NA NA NA YTHDC2 239407 3251 chr5 113109102 113113646 113112755 N NA NA NA NA NA NA YTHDC2 259711 3252 chr5 113521414 113525054 113523845 N NA NA KCNN2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNN2 172962 3253 chr5 113580922 113583363 113581938 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 114653 3254 chr5 113600565 113603503 113601605 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 94513 3255 chr5 113664998 113683012 113668443,113681692 N,N NA;NA KCNN2 KCNN2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNN2 15004 3256 chr5 113900370 113903827 113901751 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 202354 3257 chr5 114032262 114074750 114038281,114035764 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KCNN2 334246 3258 chr5 114374623 114378317 114377354 N NA NA NA NA NA NA PGGT1B 220252 3259 chr5 114407332 114409735 114408499 N NA NA NA NA NA NA PGGT1B 188834 3260 chr5 114724376 114727097 114725120 N NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 91918 3261 chr5 114763255 114769781 114768522,114763792 N,N NA;NA NA FEM1C,TMED7-TICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 FEM1C 110810 3262 chr5 115026313 115027474 115026712 N NA NA NA NA NA NA TMED7-TICAM2 64437 3263 chr5 116156797 116158603 116157471 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 246246 3264 chr5 116640068 116642160 116641314 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 729517 3265 chr5 117113518 117115475 117114686 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 1202967 3266 chr5 117280046 117282765 117281208 N NA NA NA NA NA NA DTWD2 1041475 3267 chr5 117342068 117345718 117344122 N NA NA NA NA NA NA DTWD2 978522 3268 chr5 117866228 117868288 117867121 N NA NA NA NA NA NA DTWD2 455952 3269 chr5 118341022 118359143 118358432,118347286 N,N NA;NA DTWD2,DMXL1 DTWD2,TNFAIP8,DMXL1 IMR90 Hi-C 24141950 DTWD2 16782 3270 chr5 118361824 118376436 118365049,118373386 N,N NA;NA DTWD2,DMXL1 TNFAIP8,DMXL1,HSD17B4 IMR90 Hi-C 24141950 DMXL1 30648 3271 chr5 118392517 118402293 118400361 N NA DMXL1 DMXL1,TNFAIP8,DTWD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMXL1 4791 3272 chr5 119081693 119084760 119082889 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 293555 3273 chr5 119119329 119123300 119120878 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 331191 3274 chr5 119210584 119216684 119212377,119214969 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSD17B4 422446 3275 chr5 119286093 119288426 119287200 N NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B4 497955 3276 chr5 119342194 119345537 119343499 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 554056 3277 chr5 119387799 119390550 119389167 N NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B4 599661 3278 chr5 119482783 119484602 119484114 N NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B4 694645 3279 chr5 120399977 120401304 120400494 N NA NA NA NA NA NA SRFBP1 896352 3280 chr5 122092728 122094964 122094061 N NA SNX2 PRDM6 IMR90 Hi-C 24141950 SNX2 15786 3281 chr5 12253884 12455277 12452939,12420894,12359292 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TAG 119692 3282 chr5 123142202 123143993 123143057 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G3 294409 3283 chr5 123148696 123152107 123150446 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G3 300903 3284 chr5 123596513 123601169 123598675 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 479636 3285 chr5 123608158 123611697 123610210 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 469108 3286 chr5 124364330 124364782 124364568 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 283525 3287 chr5 124390521 124391437 124390902 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 309716 3288 chr5 125336595 125339289 125338279 N NA NA NA NA NA NA PHAX 597318 3289 chr5 125406367 125410498 125407096 N NA NA NA NA NA NA PHAX 526109 3290 chr5 126044674 126046201 126045098 N NA NA LMNB1,MEGF10 IMR90 Hi-C 24141950 PHAX 108067 3291 chr5 126532046 126539065 126533395 N NA NA NA NA NA NA C5orf63 122862 3292 chr5 127211010 127212392 127211631 N NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ33630 206374 3293 chr5 127253292 127327337 127294157,127303438,127324610,127256127,127282113,127292359 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1,CTXN3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLJ33630 91429 3294 chr5 130231151 130238985 130233583 N NA NA NA NA NA NA HINT1 262049 3295 chr5 130459322 130461376 130460339 N NA HINT1,LYRM7 NA NA NA NA HINT1 39658 3296 chr5 13344 16192 14803 N NA NA NA NA NA NA CCDC127 202105 3297 chr5 133800870 133803950 133801927 N NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 53272 3298 chr5 137405457 137407780 137406564 N NA FAM13B BRD8,FAM13B,NME5 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 36655 3299 chr5 137415680 137417042 137416163 N NA FAM13B NA NA NA NA FAM13B 46878 3300 chr5 137944199 137946277 137945450 N NA HSPA9 CTNNA1,SIL1,PAIP2,SLC23A1,MATR3 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA9 32881 3301 chr5 137953254 137955022 137953527 N NA HSPA9 SIL1,PAIP2,SLC23A1,MATR3,CTNNA1,HSPA9 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA9 41936 3302 chr5 138059848 138062632 138061134 N NA CTNNA1 CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2,HSPA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTNNA1 26475 3303 chr5 138597691 138599270 138598537 N NA MATR3 SIL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MATR3 10171 3304 chr5 138895899 138900915 138897679 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,MZB1,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 39836 3305 chr5 138923045 138925199 138924211 N NA UBE2D2 SPATA24,DNAJC18,ECSCR,TMEM173,UBE2D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2D2 15552 3306 chr5 139107823 139111888 139109031 N NA NA DNAJC18,UBE2D2,CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 79522 3307 chr5 13984681 14014137 14009126,14011941 N,N NA;NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 129692 3308 chr5 141400776 141402385 141400926 N NA GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 8156 3309 chr5 143971835 143973259 143972156 N NA NA NA NA NA NA YIPF5 421557 3310 chr5 145807550 145810133 145808378 Y POU4F3 TCERG1 LARS IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 16740 3311 chr5 14639175 14640478 14639701 Y NA FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 FAM105B 24305 3312 chr5 14650918 14653575 14652680 N NA FAM105B FAM105A,TRIO IMR90 Hi-C 24141950 FAM105B 11208 3313 chr5 146562621 146565109 146562922 N NA NA NA NA NA NA TCERG1 735748 3314 chr5 148187463 148194944 148187733,148193099 Y,N FBXO38,ADRB2;NA ADRB2 SH3TC2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 11212 3315 chr5 148282889 148300458 148284623 N NA NA AFAP1L1,SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 76733 3316 chr5 14927245 14929264 14928165 N NA NA FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 55358 3317 chr5 14981703 14984904 14982205,14983998 N,N NA;NA NA FAM105B,ANKH,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 109816 3318 chr5 149837285 149842204 149838244 N NA RPS14,NDST1 NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14,RBM22,DCTN4,CAMK2A,ARSI,TCOF1,CD74,C5orf62 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 7966 3319 chr5 149848976 149865158 149857492,149857619,149863299,149859476 N,N,N,N NA;NA;NA;NA RPS14,NDST1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22,TCOF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 19657 3320 chr5 15008887 15010673 15009327 N NA NA FAM105B,ANKH,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 137000 3321 chr5 150792254 150796062 150793678 N NA SLC36A1 FAT2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A1 31101 3322 chr5 151076474 151078443 151077280 N NA NA SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATOX1 59767 3323 chr5 151709359 151711880 151710656 N NA NA NA NA NA NA G3BP1 557883 3324 chr5 152264814 152272834 152265711 N NA NA NA NA NA NA G3BP1 1113338 3325 chr5 152416143 152417016 152416752 N NA NA NA NA NA NA FAM114A2 1001481 3326 chr5 153465725 153473864 153467073 N NA FAM114A2,MFAP3 GALNT10,FLJ38109,SAP30L IMR90 Hi-C 24141950 MFAP3 47206 3327 chr5 153554837 153561053 153558487,153555842 N,N NA;NA GALNT10 HAND1,GALNT10,FLJ38109,MFAP3,FAM114A2,SAP30L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GALNT10 9242 3328 chr5 154018753 154023884 154018916 N NA NA C5orf4,MFAP3,FAM114A2,LARP1,CNOT8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 68578 3329 chr5 154038478 154040878 154039801 N NA NA MFAP3,FAM114A2,LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 51584 3330 chr5 154501094 154504090 154501475 N NA NA HAVCR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL22 180461 3331 chr5 154780294 154781810 154781048 N NA NA PPP1R2P3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL22 459661 3332 chr5 15482572 15485313 15483601 N NA FBXL7 FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL7 14992 3333 chr5 157364143 157364649 157364532 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 77960 3334 chr5 158651608 158653211 158651844 N NA UBLCP1 UBLCP1,RNF145 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBLCP1 36878 3335 chr5 159741779 159744122 159743172 N NA NA TTC1,PWWP2A,FABP6,CCNJL,C1QTNF2 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf54 82938 3336 chr5 161462316 161465586 161463970 N NA NA NA NA NA NA CCNG1 1398991 3337 chr5 161796993 161798286 161797631 N NA NA NA NA NA NA CCNG1 1066291 3338 chr5 162565105 162566434 162565651 N NA NA NA NA NA NA CCNG1 298143 3339 chr5 163582199 163584166 163583526 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 651968 3340 chr5 163924450 163929712 163928351 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 994219 3341 chr5 163937149 163940331 163938663 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 1006918 3342 chr5 163943291 163947395 163945316,163943561 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1013060 3343 chr5 164005327 164006723 164006573 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 1075096 3344 chr5 164035680 164038475 164037522 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 1105449 3345 chr5 164062426 164067635 164064415 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 1132195 3346 chr5 164113669 164117654 164114996 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 1183438 3347 chr5 164237518 164243201 164241492,164238604 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1307287 3348 chr5 164245718 164255324 164247952,164252386 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1315487 3349 chr5 164258522 164267461 164260252,164264816 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1328291 3350 chr5 164390775 164510293 164489894,164400192,164484324,164457030,164402400,164468703,164407675,164478390 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1460544 3351 chr5 164541889 164682566 164629188,164548505,164632727,164610435,164636159,164639420,164550915,164666366,164642240,164543071,164553240,164608317 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1611658 3352 chr5 164706372 164811060 164707563,164806933,164720905,164754729 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1776141 3353 chr5 164883896 165036180 165023471,165018764,164886424 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1953665 3354 chr5 165197633 165204865 165199025 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 2267402 3355 chr5 165207474 165414757 165209743,165313104,165286877,165235488,165213292,165255410,165350536,165303680,165260518,165309269,165348175,165352222,165210969 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 2277243 3356 chr5 165429623 165498142 165481844,165473810,165431071,165456146,165489903 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA WWC1 2220923 3357 chr5 165555674 165573010 165556069 N NA NA NA NA NA NA WWC1 2146055 3358 chr5 165737128 165743033 165737436 N NA NA NA NA NA NA WWC1 1976032 3359 chr5 165796769 165797450 165797413 N NA NA NA NA NA NA WWC1 1921615 3360 chr5 165891357 166074868 165957470,165891652,166020565,165946664,165962786,166061023,166022425,165994812,166055960 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA EPHA6 MCF7 ChIA-PET 19890323 WWC1 1644197 3361 chr5 166177735 166251187 166178257,166222229,166215473 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA WWC1 1467878 3362 chr5 166403856 166488474 166406787 N NA NA ODZ2 IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 1230591 3363 chr5 166566437 166625977 166567777 N NA NA ODZ2 IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 1093088 3364 chr5 170762612 170764980 170763896 Y NA NPM1 KCNIP1,GABRP,RANBP17 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 49728 3365 chr5 170936941 170938535 170938058 N NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 122233 3366 chr5 171959894 171961894 171960687 N NA NA NEURL1B,ATP6V0E1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3PXD2B 78367 3367 chr5 172920441 172921881 172921331 Y NA NA STC2,LOC285593,BNIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 121785 3368 chr5 173192522 173194762 173193816 N NA NA CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 120569 3369 chr5 173294313 173296334 173295294 N NA CPEB4 CPEB4,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 18997 3370 chr5 17343285 17343782 17343664 N NA NA BASP1 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 406900 3371 chr5 17353683 17355447 17354436 N NA NA BASP1 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 417298 3372 chr5 173929124 173957974 173931128 N NA NA MSX2,MIR4634,FLJ16171 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSX2 193601 3373 chr5 173958487 173961738 173959768 N NA NA MSX2,MIR4634,FLJ16171 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSX2 189837 3374 chr5 175344287 175352578 175352035 N NA THOC3 CPLX2 IMR90 Hi-C 24141950 THOC3 42967 3375 chr5 1771354 1774413 1772947 N NA MRPL36,NDUFS6 NDUFS6,IRX4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL36 25543 3376 chr5 178230595 178247454 178244777 N NA ZNF354B AACSP1,ZNF879,AGXT2L2,GRM6 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 39500 3377 chr5 179079360 179084481 179081691 N NA HNRNPH1,CANX HNRNPH1 K562 ChIA-PET 22265404 HNRNPH1 28638 3378 chr5 180103012 180105763 180103795 N NA NA BTNL8 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT1 131374 3379 chr5 180523383 180525366 180524314 N NA NA NA NA NA NA TRIM41 124897 3380 chr5 180528478 180530022 180529080 N NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 120241 3381 chr5 180700095 180710364 180707991 N NA TRIM41,GNB2L1,TRIM52,LOC100132062 TRIM52 K562 ChIA-PET 22265404 TRIM52 11976 3382 chr5 18705237 18747639 18746032,18707761 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MYO10 1768852 3383 chr5 19160370 19162976 19161441 N NA NA NA NA NA NA MYO10 2223985 3384 chr5 20055481 20057688 20056514 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1401901 3385 chr5 20301240 20305433 20301599 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1154156 3386 chr5 20322140 20325167 20323635 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1134422 3387 chr5 20496483 20498773 20497667 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 960816 3388 chr5 20711065 20726916 20712233 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 732673 3389 chr5 20973278 20976815 20974697 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 482774 3390 chr5 20984394 20989016 20986080 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 470573 3391 chr5 21003398 21008910 21006208 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 450679 3392 chr5 21150893 21154725 21152903 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 304864 3393 chr5 21187534 21198606 21196698,21194435 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GUSBP1 260983 3394 chr5 21265004 21270686 21269189 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 188903 3395 chr5 21271380 21358164 21272575,21319956,21336870,21341027,21352196,21343130,21345956,21348620,21353615 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA GUSBP1 101425 3396 chr5 21368272 21376229 21370916 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 83360 3397 chr5 21380984 21423523 21417015 N NA GUSBP1 NA NA NA NA GUSBP1 36066 3398 chr5 2200196 2202747 2201076 N NA NA NA NA NA NA IRX4 317316 3399 chr5 22936709 22937703 22936991 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1477120 3400 chr5 24170437 24172519 24171417 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 2710848 3401 chr5 24370406 24372665 24370795 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 2910817 3402 chr5 25054311 25113290 25077858 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 2359109 3403 chr5 25384181 25476815 25384777 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1995584 3404 chr5 26571525 26579958 26573702,26578351 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC643401 892441 3405 chr5 26618031 26622672 26620309 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 849727 3406 chr5 26647025 26651607 26648848 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 820792 3407 chr5 26668779 26671313 26670836 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 801086 3408 chr5 26840 29754 27792 N NA NA LRRC14B,SDHA,PLEKHG4B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC127 188543 3409 chr5 27122391 27126152 27124502 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 346247 3410 chr5 27132882 27135737 27134495 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 336662 3411 chr5 27353880 27358772 27356479 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 113627 3412 chr5 27385265 27390877 27388493 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 81522 3413 chr5 27524984 27527239 27526181 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 52585 3414 chr5 27572494 27576066 27574075 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 100095 3415 chr5 27654226 27660465 27658083 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 181827 3416 chr5 27717347 27722384 27719709 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 244948 3417 chr5 27905525 27911313 27907955 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 433126 3418 chr5 27971926 27976787 27973636 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 499527 3419 chr5 28090806 28094376 28092113 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 618407 3420 chr5 28099407 28106234 28104281,28101320 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC643401 627008 3421 chr5 28131254 28134778 28132982 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 658855 3422 chr5 28144794 28149575 28147029 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 672395 3423 chr5 28188697 28201407 28190593,28193753 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC643401 716298 3424 chr5 28213681 28219978 28215360 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 741282 3425 chr5 28367936 28370308 28369113 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 895537 3426 chr5 28668807 28672883 28671056 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1196408 3427 chr5 28736844 28739588 28738024 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1264445 3428 chr5 28827947 28831320 28828866 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1355548 3429 chr5 31638087 31677335 31661926,31639188 N,N NA;NA NA PDZD2 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf22 105714 3430 chr5 31689274 31710189 31689561 N NA NA PDZD2 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf22 156901 3431 chr5 32329362 32334243 32331717 N NA MTMR12 ZFR,GOLPH3,MTMR12,SUB1 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR12 16248 3432 chr5 33238199 33240235 33239134 N NA NA NPR3,LOC340113,TARS IMR90 Hi-C 24141950 TARS 200663 3433 chr5 33430343 33437683 33436326 N NA TARS NPR3,SUB1,TARS,SLC45A2,AMACR,C1QTNF3-AMACR IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARS 3215 3434 chr5 34150025 34222850 34150456,34167729,34155579,34178085,34211149,34206335,34191196,34218478 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA C1QTNF3-AMACR C1QTNF3-AMACR,SLC45A2,AMACR,RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 C1QTNF3-AMACR 25392 3435 chr5 34224632 34251028 34243733,34234781,34249585,34245812 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 99999 3436 chr5 34304187 34308010 34304841 N NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 179554 3437 chr5 34412732 34438769 34418652 N NA NA C1QTNF3-AMACR,AMACR IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 217664 3438 chr5 34449053 34469596 34451540,34466921 N,N NA;NA NA RAI14,AMACR,SLC45A2,C1QTNF3-AMACR,TARS,RAD1,TTC23L,BRIX1 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 186837 3439 chr5 34509852 34513284 34511850 N NA NA TTC23L,RAI14,RAD1,BRIX1 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 143149 3440 chr5 34575702 34577731 34577167 N NA NA RAI14,TTC23L,RAD1 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 78702 3441 chr5 35274243 35276045 35275236 N NA NA PRLR MCF7 ChIA-PET 22265404 DNAJC21 344545 3442 chr5 35381909 35383247 35382514 N NA NA NA NA NA NA DNAJC21 452211 3443 chr5 36366272 36368987 36367231 N NA NA NA NA NA NA RANBP3L 64261 3444 chr5 36743819 36747455 36745138 N NA NA LOC646719,NIPBL MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC646719 129341 3445 chr5 38612669 38616141 38614431 N NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 55921 3446 chr5 38635464 38637735 38636948 N NA NA LIFR,EGFLAM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 78716 3447 chr5 38657724 38662006 38660617 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 100976 3448 chr5 39624081 39625879 39624875 N NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 549580 3449 chr5 40305461 40309302 40307263 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 370730 3450 chr5 40431089 40433311 40432034 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 246721 3451 chr5 40473016 40475098 40473568 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 204934 3452 chr5 40894025 40897794 40896129 N NA NA C6,PLCXD3 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37 58638 3453 chr5 42012910 42015413 42014395 N NA NA NA NA NA NA FBXO4 87554 3454 chr5 42856987 42860565 42858687 N NA SEPP1 NA NA NA NA SEPP1 44963 3455 chr5 42878707 42880552 42879602 N NA NA NA NA NA NA SEPP1 66683 3456 chr5 43572685 43574399 43573301 N NA NA PAIP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 C5orf28 88693 3457 chr5 43580428 43581596 43581081 N NA NA NA NA NA NA C5orf28 96436 3458 chr5 43968276 43969911 43968651 N NA NA NA NA NA NA C5orf28 484284 3459 chr5 44893735 44894595 44893918 N NA NA NA NA NA NA MRPS30 84708 3460 chr5 4502119 4632480 4615548 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 790327 3461 chr5 45977355 45978684 45977555 N NA NA NA NA NA NA MRPS30 1168328 3462 chr5 46349131 46354586 46350274 N NA NA NA NA NA NA MRPS30 1540104 3463 chr5 46376785 46389447 46385305 N NA NA NA NA NA NA MRPS30 1567758 3464 chr5 46398293 46403596 46401742 N NA NA NA NA NA NA MRPS30 1589266 3465 chr5 49561918 49565049 49563533 N NA NA NA NA NA NA EMB 172185 3466 chr5 49574803 49577884 49576471 N NA NA NA NA NA NA EMB 159350 3467 chr5 49587423 49594963 49589373 N NA NA NA NA NA NA EMB 142271 3468 chr5 49631686 49645671 49643196 N NA NA NA NA NA NA EMB 91563 3469 chr5 49945254 49952984 49947960,49949334,49947267 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA EMB 208020 3470 chr5 51904993 51909304 51905614 N NA NA NA NA NA NA MOCS2 496294 3471 chr5 52021883 52024637 52023675 N NA NA ITGA1 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS2 380961 3472 chr5 54864348 54873862 54865518,54869684 N,N NA;NA PPAP2A IL6ST,SKIV2L2,PPAP2A,SLC38A9,IL31RA IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2A 33475 3473 chr5 54894888 54899329 54897266 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 64015 3474 chr5 55345903 55348849 55346887 N NA NA ANKRD55,IL6ST,MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 55082 3475 chr5 55353560 55356736 55354284 N NA NA ANKRD55,MAP3K1,IL6ST IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 62739 3476 chr5 55564836 55565471 55565350 N NA NA MAP3K1,IL6ST,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 274015 3477 chr5 55717039 55719043 55718349 N NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K1 391857 3478 chr5 56424139 56426260 56424734 N NA GPBP1 MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 43515 3479 chr5 56841935 56846100 56842706 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 372160 3480 chr5 57157820 57159074 57158614 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 596892 3481 chr5 57369130 57376042 57370670,57374024 N,N NA;NA NA PLK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLK2 379924 3482 chr5 57422268 57425098 57423540 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 330868 3483 chr5 57630668 57633261 57632169 N NA NA PLK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PLK2 122705 3484 chr5 57831494 57838143 57832060 N NA NA NA NA NA NA PLK2 75528 3485 chr5 62047177 62049871 62048529 N NA NA NA NA NA NA IPO11 338604 3486 chr5 62597147 62598123 62597256 N NA NA NA NA NA NA IPO11 888574 3487 chr5 62796284 62796785 62796649 N NA NA NA NA NA NA IPO11 1087711 3488 chr5 63032356 63034133 63033363 N NA NA NA NA NA NA SREK1IP1 1030363 3489 chr5 63701942 63705081 63703154 N NA NA NA NA NA NA SREK1IP1 359415 3490 chr5 65168998 65171321 65169936 N NA NA NLN,SGTB,ERBB2IP IMR90 Hi-C 24141950 ERBB2IP 51061 3491 chr5 65416206 65424967 65416825 N NA SREK1 SGTB,NLN IMR90 Hi-C 24141950 SREK1 15118 3492 chr5 65796878 65799316 65797494 N NA NA NA NA NA NA MAST4 92860 3493 chr5 66510571 66513650 66511612 Y NA NA MAST4,PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAST4 618395 3494 chr5 66542719 66547356 66544801 N NA NA PIK3R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAST4 650543 3495 chr5 67293296 67296010 67294781 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 215574 3496 chr5 67638043 67795056 67646668,67692029,67711473,67752726,67752704,67702568,67713548,67793120 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA PIK3R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3R1 126459 3497 chr5 67801893 67864577 67829484,67840056,67863245 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA PIK3R1 290309 3498 chr5 67887437 67890769 67889681 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 375853 3499 chr5 67943689 67946672 67944958 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 432105 3500 chr5 68024856 68027753 68026703 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA SLC30A5 362023 3501 chr5 68040799 68043405 68042435 N NA NA NA NA NA NA SLC30A5 346371 3502 chr5 68179214 68181181 68180159 N NA NA NA NA NA NA SLC30A5 208595 3503 chr5 68247743 68250756 68249597 N NA NA NA NA NA NA SLC30A5 139020 3504 chr5 68330555 68340505 68339292 N NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 49271 3505 chr5 68359345 68360927 68360414 N NA SLC30A5 OCLN IMR90 Hi-C 24141950 SLC30A5 28849 3506 chr5 69029264 69071181 69070010 N NA GUSBP3 NA NA NA NA GUSBP3 22992 3507 chr5 69122462 69156658 69139669,69135758,69141758,69152205,69147455 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA GUSBP3 116190 3508 chr5 69166880 69177959 69171101 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 143113 3509 chr5 69612379 69664381 69613273,69652303 N,N NA;NA SMA4,GTF2H2B NA NA NA NA SMA4 26375 3510 chr5 69675386 69689450 69684761 N NA GTF2H2B NA NA NA NA GTF2H2B 21747 3511 chr5 69690671 69697209 69696400,69692478 N,N NA;NA GTF2H2B NA NA NA NA GTF2H2B 13988 3512 chr5 69884510 70031806 69886426,69936589,70003132,69949470,69894278,70013043,70025889,70027346,70019253 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA SMA5 NA NA NA NA SMA5 2961 3513 chr5 70042572 70053830 70047013 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 142660 3514 chr5 704937 771760 708618,714768,770159,759391 N,N,N,Y NA;NA;NA;TPPP TPPP TPPP,ZDHHC11,SLC9A3,BRD9,CEP72,TRIP13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPPP 11427 3515 chr5 70559619 70592242 70567713,70584442,70575479,70573968,70579016,70588302 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA GUSBP9 NA NA NA NA GUSBP9 4497 3516 chr5 70743262 70746907 70745110 N NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 4535 3517 chr5 70981350 70986273 70984835 N NA NA NA NA NA NA MCCC2 98235 3518 chr5 71038031 71043534 71039587 N NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 154916 3519 chr5 71046619 71066510 71048908,71053927 N,N NA;NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 163504 3520 chr5 71088556 71094687 71089375 N NA NA MRPS27,MAP1B IMR90 Hi-C 24141950 MCCC2 205441 3521 chr5 71124958 71128602 71126731 N NA NA NA NA NA NA MCCC2 241843 3522 chr5 71143598 71146802 71144349 N NA NA NA NA NA NA MAP1B 256316 3523 chr5 71171812 71173026 71171975 N NA NA MRPS27 IMR90 Hi-C 24141950 MAP1B 230092 3524 chr5 71217659 71223680 71221280 N NA NA NA NA NA NA MAP1B 179438 3525 chr5 71233724 71238779 71234961 N NA NA NA NA NA NA MAP1B 164339 3526 chr5 71304218 71308316 71306390 N NA NA PTCD2,MRPS27 IMR90 Hi-C 24141950 MAP1B 94802 3527 chr5 7187855 7188928 7188431 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 473137 3528 chr5 72633529 72634972 72634198 N NA NA FCHO2,TMEM174,FOXD1,BTF3,TMEM171 IMR90 Hi-C 24141950 BTF3 159278 3529 chr5 72705454 72707188 72706198 N NA NA FCHO2 IMR90 Hi-C 24141950 BTF3 87062 3530 chr5 73293485 73295896 73294611 N NA NA ENC1,RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 UTP15 431887 3531 chr5 73361898 73365030 73363784 N NA NA RGNEF,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 UTP15 500300 3532 chr5 73462040 73465505 73463962 N NA NA RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 HEXB 515464 3533 chr5 73622698 73625325 73624207 N NA NA RGNEF,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 HEXB 355644 3534 chr5 73972724 73973774 73973351 N NA HEXB HEXB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HEXB 7195 3535 chr5 74179236 74180237 74179840 N NA NA NA NA NA NA NSA2 116133 3536 chr5 74285769 74286580 74286136 N NA NA NA NA NA NA NSA2 222666 3537 chr5 74613632 74615573 74614875 N NA HMGCR NA NA NA NA HMGCR 17420 3538 chr5 75682739 75685661 75683894 N NA NA NA NA NA NA F2R 326207 3539 chr5 76840446 76842890 76841569 N NA NA LOC728723 IMR90 Hi-C 24141950 WDR41 52114 3540 chr5 77963523 77965940 77965118 N NA NA LHFPL2,SCAMP1,ARSB IMR90 Hi-C 24141950 SCAMP1 307184 3541 chr5 77976755 77980291 77978357 N NA NA SCAMP1,LHFPL2,ARSB IMR90 Hi-C 24141950 SCAMP1 320416 3542 chr5 78003778 78006484 78005137 N NA NA ARSB,LHFPL2,SCAMP1 IMR90 Hi-C 24141950 SCAMP1 347439 3543 chr5 79249039 79251905 79250668,79250675 N,N NA;NA MTX3 MTX3 IMR90 Hi-C 24141950 MTX3 35183 3544 chr5 79654155 79656406 79655363 N NA ZFYVE16 CMYA5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFYVE16 47432 3545 chr5 81074404 81075946 81075084 N NA SSBP2 SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 27332 3546 chr5 81137948 81140201 81138842 N NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 90876 3547 chr5 81145845 81150433 81147912 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 98773 3548 chr5 81721258 81779682 81723053,81725290,81731287 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ATP6AP1L 120092 3549 chr5 81825131 81914041 81825295,81830302 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATP6AP1L 223965 3550 chr5 84522497 84524936 84523206 N NA NA NA NA NA NA COX7C 1388848 3551 chr5 84647838 84677685 84654514,84675661,84663320 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA COX7C 1236099 3552 chr5 84703765 84718878 84716708 N NA NA NA NA NA NA COX7C 1194906 3553 chr5 84732414 84935509 84845332,84934364,84805075,84887607,84878349,84760782 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LOC729178 MCF7 ChIA-PET 19890323 COX7C 978275 3554 chr5 84958806 85022592 84959308 N NA NA NA NA NA NA COX7C 891192 3555 chr5 85303593 85305202 85303926,85304026 N,N NA;NA NA NA NA NA NA COX7C 608582 3556 chr5 86020174 86029647 86021908,86027863 N,N NA;NA NA NA NA NA NA COX7C 106390 3557 chr5 86836094 86838644 86837024 N NA NA NA NA NA NA CCNH 127244 3558 chr5 86846913 86851092 86847987 N NA NA NA NA NA NA CCNH 138063 3559 chr5 86978890 86984083 86982607,86980136 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CCNH 270040 3560 chr5 87325895 87327696 87326811 N NA NA NA NA NA NA TMEM161B 236969 3561 chr5 87434298 87438977 87437932 N NA NA LINC00461 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM161B 125688 3562 chr5 88914498 88916874 88914918 N NA NA NA NA NA NA CETN3 788729 3563 chr5 89360850 89371887 89369295 N NA NA NA NA NA NA CETN3 333716 3564 chr5 8937434 8939097 8938344 N NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 MTRR 1068217 3565 chr5 89399212 89400510 89399821 N NA NA NA NA NA NA CETN3 305093 3566 chr5 89447986 89505528 89471996,89503863 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CETN3 200075 3567 chr5 90556851 90559006 90557143 N NA NA GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 117158 3568 chr5 90565188 90566488 90565561 N NA NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 109676 3569 chr5 90574097 90579883 90576433 N NA NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 96281 3570 chr5 91057086 91059120 91058189 N NA NA NA NA NA NA ARRDC3 377937 3571 chr5 91494687 91549000 91495334,91528514 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ARRDC3 815538 3572 chr5 91709341 91751758 91733223,91710213 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ARRDC3 1030192 3573 chr5 94639211 94641825 94640465 N NA NA NA NA NA NA TTC37 248884 3574 chr5 94653871 94655090 94654869 N NA NA MCTP1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC37 235619 3575 chr5 97061481 97063292 97061979 N NA NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RIOK2 542476 3576 chr5 97667473 97669170 97667886 N NA NA NA NA NA NA FLJ35946 439618 3577 chr5 97880791 97886596 97882613 N NA NA NA NA NA NA FLJ35946 222192 3578 chr5 97911965 97914278 97913159 N NA NA NA NA NA NA FLJ35946 194510 3579 chr5 98435979 98442576 98437903,98440753 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100289230 171141 3580 chr5 98443712 98446465 98445166 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 178874 3581 chr5 98661865 98671260 98663430,98668968,98666902 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100289230 397027 3582 chr5 98751906 98767599 98753241 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 487068 3583 chr5 98779168 98784883 98780725 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 514330 3584 chr5 98804963 98811996 98806086,98809392 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100289230 540125 3585 chr5 98870409 98873433 98871271 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 605571 3586 chr5 98938012 98943459 98940570 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 673174 3587 chr5 99055274 99059493 99057717 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 664465 3588 chr5 99106636 99113997 99110701 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 609961 3589 chr5 99168128 99171040 99169622 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 552918 3590 chr5 99234597 99237938 99236456 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 486020 3591 chr5 99325110 99342795 99328007 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 381163 3592 chr5 99360211 99363414 99362182 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 360544 3593 chr5 99382246 99390993 99385338,99389076 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100133050 332965 3594 chr5 99395869 99398707 99397368 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 325251 3595 chr5 99401334 99406526 99405781 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 317432 3596 chr5 99409293 99411599 99410449 N NA NA NA NA NA NA LOC100133050 312359 3597 chr5 99517853 99522425 99519672,99520684 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100133050 201533 3598 chr5 99734144 99775856 99773741,99746131,99752626 N,N,N NA;NA;NA LOC100133050 NA NA NA NA LOC100133050 10186 3599 chr5 99798264 99852385 99850026 N NA FAM174A NA NA NA NA FAM174A 18739 3600 chr5 9989943 9992205 9991252 N NA NA TAS2R1,LOC285692,SEMA5A,LOC100505806 IMR90 Hi-C 24141950 FAM173B 257809 3601 chr6 100801038 100807547 100802840 N NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 521677 3602 chr6 101527417 101530149 101528161 N NA NA NA NA NA NA ASCC3 198193 3603 chr6 102782288 102870287 102865247,102828856,102869084 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA GRIK2 935427 3604 chr6 103188603 103192557 103190089 N NA NA NA NA NA NA GRIK2 1341742 3605 chr6 103247012 103257815 103248470 N NA NA NA NA NA NA GRIK2 1400151 3606 chr6 103328948 103332210 103330703 N NA NA NA NA NA NA GRIK2 1482087 3607 chr6 104142926 104143829 104143239 N NA NA NA NA NA NA HACE1 1163965 3608 chr6 105007586 105009541 105008177 N NA NA NA NA NA NA HACE1 298253 3609 chr6 10510517 10512413 10511443 N NA NA GCNT2,C6orf52,PAK1IP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100130275 97966 3610 chr6 106055868 106059326 106057230 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 204869 3611 chr6 106163771 106170167 106164497 N NA NA NA NA NA NA PREP 312772 3612 chr6 106300446 106304026 106300882 N NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 449447 3613 chr6 106871001 106873067 106871488 N NA NA RTN4IP1,AIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 97306 3614 chr6 109575816 109579259 109577496 N NA NA CD164,CEP57L1,PPIL6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CD164 124503 3615 chr6 109653911 109659583 109658081 N NA CD164 CD164,PPIL6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD164 44179 3616 chr6 110182461 110183154 110182815 N NA NA FIG4 IMR90 Hi-C 24141950 FIG4 170037 3617 chr6 110213093 110215129 110214336 N NA NA FIG4 IMR90 Hi-C 24141950 FIG4 200669 3618 chr6 110803529 110806780 110805178 N NA NA NA NA NA NA DDO 66776 3619 chr6 110810928 110818842 110813352 N NA NA NA NA NA NA DDO 74175 3620 chr6 110836350 110840906 110837101,110838939 N,N NA;NA NA GTF3C6,AMD1,RPF2,CDK19 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDO 99597 3621 chr6 110844657 110861974 110849828,110845658,110856156,110858669 N,N,N,Y NA;NA;NA;NA NA GTF3C6,AMD1,RPF2,CDK19,SLC16A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDO 107904 3622 chr6 111271118 111275839 111273860 N NA GTF3C6,RPF2 CDK19,SLC22A16,GTF3C6,AMD1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF3C6 3924 3623 chr6 112367129 112369653 112369415 N NA C6orf225,TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L,WISP3 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf225 39021 3624 chr6 112753846 112755299 112754878 N NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 345095 3625 chr6 112829038 112830367 112829528 N NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 420287 3626 chr6 113494394 113495893 113494975 N NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 682634 3627 chr6 113893929 113894513 113894309 N NA NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 284014 3628 chr6 11434201 11435912 11434866 N NA NA NEDD9,SYCP2L,C6orf228,ELOVL2,ERVFRD-1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 102599 3629 chr6 115795742 115802408 115796079 N NA NA NA NA NA NA FRK 579513 3630 chr6 117978763 117981174 117980123 N NA NUS1 NUS1 K562 ChIA-PET 22265404 NUS1 15443 3631 chr6 118149646 118151714 118151112 N NA NA NA NA NA NA NUS1 153029 3632 chr6 119059490 119059850 119059671 N NA NA NA NA NA NA ASF1A 155391 3633 chr6 11974526 11978277 11976767 N NA HIVEP1 ADTRP,HIVEP1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 34447 3634 chr6 120003023 120005709 120004418 N NA NA NA NA NA NA MCM9 750120 3635 chr6 120854038 120879380 120877754,120875703 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C6orf170 776264 3636 chr6 12331112 12333496 12331979 N NA NA EDN1,TMEM170B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIVEP1 318388 3637 chr6 126382562 126638263 126392832,126608130,126382720 N,N,N NA;NA;NA NA RSPO3,TRMT11 IMR90 Hi-C 24141950 TRMT11 74986 3638 chr6 126934437 126935918 126934600 N NA NA NA NA NA NA TRMT11 626861 3639 chr6 131688815 131690977 131689869 N NA NA NA NA NA NA AKAP7 231989 3640 chr6 131799356 131801484 131800382 N NA NA NA NA NA NA MED23 147879 3641 chr6 131804049 131805254 131804944 N NA NA NA NA NA NA MED23 144109 3642 chr6 131867472 131871072 131869754 N NA NA NA NA NA NA MED23 78291 3643 chr6 132591062 132593938 132592339 N NA NA STX7,CTGF,ENPP1 IMR90,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 STX7 240399 3644 chr6 133214223 133216615 133215463 N NA NA EYA4,RPS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS12 78515 3645 chr6 134465350 134468276 134467073 N NA NA SGK1,LOC154092,HBS1L,ALDH8A1,MIR3662 IMR90 Hi-C 24141950 SLC2A12 91561 3646 chr6 134721061 134723404 134722687 N NA NA ALDH8A1,SGK1,LOC154092 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A12 347272 3647 chr6 134941326 134944296 134943194 Y NA NA LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 431740 3648 chr6 134950350 134953306 134952218 N NA NA LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HBS1L 422730 3649 chr6 13559161 13562164 13560432 N NA SIRT5 TBC1D7,GFOD1,PHACTR1,SIRT5 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT5 12597 3650 chr6 13732538 13735319 13733743 N NA RANBP9 RANBP9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RANBP9 20742 3651 chr6 137629776 137631869 137630461 N NA NA IFNGR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR1 89209 3652 chr6 13843821 13846287 13844924 N NA CCDC90A NA NA NA NA CCDC90A 29029 3653 chr6 13848107 13850565 13849263 N NA CCDC90A NA NA NA NA CCDC90A 33315 3654 chr6 13872929 13878093 13874225 N NA NA DTNBP1,CCDC90A,CD83 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC90A 58137 3655 chr6 139669279 139672960 139670833 N NA CITED2 ECT2L IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 22825 3656 chr6 139805339 139810396 139807077 N NA NA NA NA NA NA CITED2 109554 3657 chr6 139857170 139859848 139858320 N NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 161385 3658 chr6 139907895 139911633 139909377 Y NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 212110 3659 chr6 139917363 139919748 139918651 N NA NA CITED2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 221578 3660 chr6 140361849 140366250 140363638 N NA NA CITED2,TXLNB,HECA,LOC645434,LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 666064 3661 chr6 140403326 140405852 140404619 N NA NA NA NA NA NA CITED2 707541 3662 chr6 140565766 140568614 140566881 N NA NA NA NA NA NA CITED2 869981 3663 chr6 140782518 140785926 140784037 N NA NA NA NA NA NA CITED2 1086733 3664 chr6 140792487 140795618 140793970 N NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1096702 3665 chr6 140931439 140935389 140933420 N NA NA NA NA NA NA CITED2 1235654 3666 chr6 141091841 141104131 141097946,141102727 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VTA1 1364279 3667 chr6 141195647 141200111 141197339 N NA NA NA NA NA NA VTA1 1268299 3668 chr6 141308199 141312365 141309483 N NA NA NA NA NA NA VTA1 1156045 3669 chr6 141404359 141406562 141405788 N NA NA NA NA NA NA VTA1 1061848 3670 chr6 141473365 141475882 141474705 N NA NA NA NA NA NA VTA1 992528 3671 chr6 141484444 141486997 141485443 N NA NA NA NA NA NA VTA1 981413 3672 chr6 141773808 141890169 141884367,141882525,141887150,141873940 N,N,N,Y NA;NA;NA;NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VTA1 578241 3673 chr6 141893135 141941991 141940037 N NA NA LOC100132735,MIR4465 IMR90 Hi-C 24141950 VTA1 526419 3674 chr6 141942965 142068847 142006225,142067388 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VTA1 399563 3675 chr6 142072556 142137552 142135746,142099939 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VTA1 330858 3676 chr6 142156655 142157593 142157216 N NA NA NA NA NA NA VTA1 310817 3677 chr6 143016700 143019317 143017972 N NA NA AIG1,ADAT2,LOC100507489,HIVEP2,LOC153910,PEX3 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP2 247021 3678 chr6 144536256 144538766 144537557 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 UTRN 74107 3679 chr6 144595502 144602134 144601791 N NA UTRN UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 10739 3680 chr6 145587432 145589538 145588544 N NA NA NA NA NA NA EPM2A 467453 3681 chr6 14762805 14766004 14764166 N NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 480523 3682 chr6 148246698 148248490 148247068 N NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 415239 3683 chr6 148511422 148517942 148512784 N NA NA SAMD5,SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 145787 3684 chr6 15055381 15057212 15056277 N NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 189315 3685 chr6 150780890 150781436 150781184 N NA NA PLEKHG1,IYD IMR90 Hi-C 24141950 LRP11 595410 3686 chr6 150833370 150834499 150834172 N NA NA NA NA NA NA LRP11 647890 3687 chr6 150875735 150877367 150876589 N NA NA PLEKHG1 IMR90 Hi-C 24141950 LRP11 690255 3688 chr6 1508851 1557136 1555433 N NA NA EXOC2,LOC285768,C6orf195,MYLK4,LOC100508120,GMDS IMR90 Hi-C 24141950 FOXC1 53545 3689 chr6 15089318 15092780 15090357 N NA NA JARID2 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 JARID2 153747 3690 chr6 151546110 151547134 151546709 N NA NA MTHFD1L,AKAP12 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB2 165543 3691 chr6 15174623 15175314 15175150 N NA NA NA NA NA NA JARID2 71213 3692 chr6 15211593 15212347 15212229 N NA JARID2 JARID2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 34180 3693 chr6 154887715 154891249 154889018,154890789 N,N NA;NA NA OPRM1,IPCEF1 IMR90 Hi-C 24141950 CNKSR3 55962 3694 chr6 154910480 154913438 154912117 N NA NA OPRM1,IPCEF1 IMR90 Hi-C 24141950 CNKSR3 78727 3695 chr6 155212340 155235270 155213018 N NA NA TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 157828 3696 chr6 156412766 156413935 156413268 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 685129 3697 chr6 156840331 156840961 156840566 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 258103 3698 chr6 156982184 156984394 156983363 N NA NA MIR4466,ARID1B MCF7 ChIA-PET 22265404 ARID1B 114670 3699 chr6 156996561 156998263 156997287 N NA NA ARID1B,MIR4466 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARID1B 100801 3700 chr6 157006490 157012340 157008183 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 86724 3701 chr6 157039284 157043377 157040859 N NA NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55687 3702 chr6 157070738 157072113 157070974 N NA ARID1B ARID1B,MIR4466 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1B 26951 3703 chr6 157613977 157615706 157615083 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC14 186851 3704 chr6 15907271 15909734 15908127 N NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 MYLIP 219583 3705 chr6 159288963 159294197 159290897 N NA EZR OSTCP1,C6orf99,EZR K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZR 48507 3706 chr6 15945253 15951583 15946083,15949779 N,N NA;NA NA MYLIP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYLIP 177734 3707 chr6 159827630 159829355 159829025 N NA NA FNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SOD2 284998 3708 chr6 159928367 159929378 159928683 N NA NA FNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SOD2 184975 3709 chr6 160703649 160742220 160704624,160727221 N,N NA;NA NA SLC22A3,SLC22A2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A1 160786 3710 chr6 161401088 161402195 161402074 N NA MAP3K4 NA NA NA NA MAP3K4 10627 3711 chr6 165282533 165285070 165283905 N NA NA PACRG IMR90 Hi-C 24141950 PDE10A 790518 3712 chr6 165340315 165352243 165341840 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 723345 3713 chr6 165393954 165397417 165396133 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 678171 3714 chr6 165477875 165486025 165484618 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 589563 3715 chr6 165492239 165498281 165496244,165494744 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PDE10A 577307 3716 chr6 165532033 165534323 165533341 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 541265 3717 chr6 165596557 165605860 165602599 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 469728 3718 chr6 165609399 165613626 165611184 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 461962 3719 chr6 165661391 165664083 165662551 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 411505 3720 chr6 166246827 166249802 166248235 N NA NA PDE10A IMR90 Hi-C 24141950 PDE10A 171239 3721 chr6 167866745 167871470 167867643,167870263 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MLLT4-AS1 356006 3722 chr6 168502789 168504791 168503460 N NA NA NA NA NA NA MLLT4 275118 3723 chr6 168786175 168819420 168789655 Y NA NA NTM,CCR6,SMOC2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 MLLT4 558504 3724 chr6 170344680 170349402 170346448 N NA NA SMOC2,LOC154449,DLL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf70 192959 3725 chr6 170448553 170480780 170475411,170462395 N,N NA;NA NA DLL1,LINC00574,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 118917 3726 chr6 170489837 170495338 170494508 N NA NA NA NA NA NA DLL1 104359 3727 chr6 170916916 170921624 170921037 N NA PDCD2 NA NA NA NA PDCD2 23136 3728 chr6 17094169 17094939 17094308 N NA NA ATXN1,GMPR,FLJ23152 IMR90 Hi-C 24141950 CAP2 298797 3729 chr6 17202198 17204854 17202938 N NA NA CAP2,RBM24,NUP153,FAM8A1,FLJ23152 IMR90 Hi-C 24141950 CAP2 188882 3730 chr6 17730969 17732713 17731448 N NA NUP153 NUP153 K562 ChIA-PET 22265404 NUP153 24151 3731 chr6 18038616 18040425 18039496 N NA NA KIF13A,NUP153,NHLRC1,KDM1B,TPMT IMR90 Hi-C 24141950 KIF13A 50762 3732 chr6 18327635 18330186 18328860 N NA NA NA NA NA NA RNF144B 57395 3733 chr6 18361794 18366045 18365294,18362475 N,N NA;NA RNF144B RNF144B IMR90 Hi-C 24141950 RNF144B 21536 3734 chr6 18720320 18722441 18720820 N NA NA NA NA NA NA RNF144B 332739 3735 chr6 19799557 19807405 19801088,19805050 N,N NA;NA NA ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 E2F3 594732 3736 chr6 19966657 19968502 19967996 N NA NA NA NA NA NA E2F3 433635 3737 chr6 20042618 20044249 20043113 N NA NA NA NA NA NA E2F3 357888 3738 chr6 21461835 21464132 21462474 N NA NA NA NA NA NA SOX4 129840 3739 chr6 21585282 21591798 21589232 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2174 3740 chr6 22362207 22365489 22363012 N NA NA SOX4 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 768235 3741 chr6 22459825 22465040 22460165 N NA NA NA NA NA NA SOX4 865853 3742 chr6 23409863 23433209 23427148 N NA NA LINC00340,SOX4,PRL IMR90 Hi-C 24141950 MRS2 969944 3743 chr6 24924283 24929010 24926055 N NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 GMNN 149124 3744 chr6 25005970 25008289 25006945 Y TDP2,C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 GMNN 230811 3745 chr6 25025408 25027484 25026610 N NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 GMNN 250249 3746 chr6 25140277 25142512 25141945 N NA NA NA NA NA NA LRRC16A 137144 3747 chr6 25153578 25155200 25154823 N NA NA NA NA NA NA LRRC16A 124456 3748 chr6 26570884 26575149 26572134 N NA HMGN4 BTN2A1,LOC285819,ABT1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H2BK,HIST1H4I K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN4 32312 3749 chr6 26704918 26709479 26705820 N NA ZNF322 LINC00240,ZNF322,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF322 44938 3750 chr6 26745035 26745448 26745337 N NA NA NA NA NA NA ZNF322 85055 3751 chr6 27042699 27047748 27044007,27046628 N,N NA;NA NA ZNF322,LINC00240,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H4I,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 66889 3752 chr6 27154605 27167009 27156394,27163873 Y,N NA;NA HIST1H2BK HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL,ZNF184,LOC100131289 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 39968 3753 chr6 27182351 27184113 27182927 N NA NA OR2B2,PRSS16,ZNF184 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 67714 3754 chr6 27197558 27201228 27198078,27200670 N,N NA;NA NA ZNF184,LOC100507173,OR2B2,LOC100131289,HIST1H2AH,MIR3143,HIST1H2BK,HIST1H4I,HIST1H2AG,HIST1H2BJ IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 82921 3755 chr6 27202888 27204433 27203408 Y NA NA OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 88251 3756 chr6 27446107 27448619 27447406 N NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 5210 3757 chr6 27463092 27465429 27463725 N NA ZNF184 HIST1H2BK,HIST1H4I,ABT1,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF184 22195 3758 chr6 27564558 27565664 27565165 N NA NA LOC100507173 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF184 123661 3759 chr6 27583693 27586687 27586019 Y NA NA NA NA NA NA ZNF184 142796 3760 chr6 27720106 27721708 27720735 Y NA NA HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC100131289,POM121L2,ZNF184,LOC100507173,HIST1H2AM,HIST1H2BO,HIST1H3I,HIST1H4L IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 279209 3761 chr6 28564537 28566845 28565337 Y NA SCAND3 SCAND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCAND3 9425 3762 chr6 28598833 28604945 28602910 N NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 43721 3763 chr6 28615502 28617027 28616028 N NA NA SCAND3,ZSCAN12 IMR90 Hi-C 24141950 SCAND3 60390 3764 chr6 28640745 28642818 28641734 N NA NA NA NA NA NA SCAND3 85633 3765 chr6 28649086 28652793 28650606 N NA NA NA NA NA NA SCAND3 93974 3766 chr6 28696107 28697928 28697089 N NA NA ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 SCAND3 140995 3767 chr6 28709694 28711450 28710546 N NA NA NA NA NA NA SCAND3 154582 3768 chr6 28750322 28752147 28751102 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 139621 3769 chr6 28847897 28849943 28849053 N NA TRIM27 TRIM27 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 41825 3770 chr6 28908646 28909562 28909097 N NA TRIM27 TRIM27,LOC401242,ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 16878 3771 chr6 28920626 28921975 28921270 N NA TRIM27 ZNF311,TRIM27 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRIM27 28858 3772 chr6 30483506 30486690 30484241 N NA HLA-E,PRR3,GNL1 HLA-E,PPP1R10,MRPS18B,ABCF1,PRR3,GNL1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 26323 3773 chr6 30843541 30846271 30845381 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1,VARS2 NA NA NA NA DDR1 5590 3774 chr6 31247712 31249852 31248950 N NA HLA-C NA NA NA NA HLA-C 7799 3775 chr6 31274555 31275677 31274788 N NA HLA-C,HLA-B MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-C 34642 3776 chr6 33475489 33478640 33476890 N NA NA SYNGAP1,CUTA,GGNBP1,BAK1 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB9 53133 3777 chr6 34190466 34193469 34192184 N NA HMGA1,C6orf1 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1 11108 3778 chr6 34677968 34680185 34679096 N NA C6orf106,SNRPC UHRF1BP1,SNRPC,C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,TAF11,SCUBE3 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf106 13343 3779 chr6 3493830 3496587 3495084 N NA SLC22A23 SLC22A23,BPHL,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A23 37037 3780 chr6 3499895 3503177 3501557 N NA SLC22A23 SLC22A23,PXDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC22A23 43102 3781 chr6 3664104 3666380 3665382 N NA NA SLC22A23,BPHL,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 183252 3782 chr6 3668675 3671879 3670510 N NA NA SLC22A23,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 177753 3783 chr6 37067976 37073726 37070959 N NA NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 64196 3784 chr6 37118424 37120736 37119077 N NA PIM1 CPNE5,PPIL1,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 17186 3785 chr6 37482591 37485871 37484218 N NA NA CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTSJD2 81684 3786 chr6 3911913 3915205 3913947 N NA NA SLC22A23,FAM50B,SLIT3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 FAM50B 62281 3787 chr6 39122964 39126932 39125389 N NA SAYSD1 GLP1R,DNAH8,KCNK17,KCNK16 IMR90 Hi-C 24141950 SAYSD1 40099 3788 chr6 40127885 40133653 40132357 Y NA NA KIF6 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS1 225595 3789 chr6 40837335 40943064 40875211,40910017,40940216 N,N,N NA;NA;NA NA UNC5CL,TSPO2,APOBEC2,C6orf130,LRFN2 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 97124 3790 chr6 40951543 40968036 40965164 Y NA NA APOBEC2,UNC5CL,C6orf130 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 72152 3791 chr6 41287156 41289918 41288398 N NA NA C6orf130 K562 ChIA-PET 22265404 FOXP4 224246 3792 chr6 41394526 41397829 41396146 N NA NA FOXP4 IMR90,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 FOXP4 116335 3793 chr6 41422125 41425692 41424457 N NA NA FOXP4,MDFI,TFEB,PRICKLE4,TOMM6 IMR90,K562,H1ESC,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 88472 3794 chr6 42433933 42435670 42434797 N NA TRERF1 TRERF1 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 14150 3795 chr6 42514290 42522370 42515400 N NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 9390 3796 chr6 4319545 4321959 4320636 N NA NA RPP40,CDYL,PPP1R3G IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183714 3797 chr6 43672158 43678913 43673359 N NA MRPS18A MRPS18A,RSPH9,XPO5,LOC100132354,C6orf223,MRPL14,TMEM63B,CAPN11,VEGFA,MAD2L1BP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 16609 3798 chr6 43712320 43714351 43713192 N NA VEGFA MRPS18A,LOC100132354,CAPN11,TMEM63B,RSPH9,VEGFA,MRPL14,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,HSP90AB1,SLC29A1,AARS2,TCTE1,SLC35B2,NFKBIE IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFA 23595 3799 chr6 43790661 43794801 43792157 N NA NA VEGFA,LOC100132354,MRPS18A,RSPH9,MAD2L1BP,GTPBP2,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 VEGFA 52715 3800 chr6 43813406 43816108 43814836 N NA NA LOC100132354,RSPH9,VEGFA,MRPS18A,C6orf223,POLH,GTPBP2 IMR90 Hi-C 24141950 VEGFA 75460 3801 chr6 44015914 44018108 44017327 N NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA,MAD2L1BP,C6orf223 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL14 77083 3802 chr6 44456786 44458915 44458093 Y NA NA SUPT3H,RUNX2,CLIC5,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 101535 3803 chr6 44697095 44702495 44698643 N NA NA SUPT3H,CLIC5,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 341844 3804 chr6 4596801 4598939 4597492 N NA NA RPP40,CDYL IMR90 Hi-C 24141950 RPP40 405332 3805 chr6 46152514 46161713 46154595,46159537,46158156 N,N,N NA;NA;NA ENPP5 NA NA NA NA ENPP5 13797 3806 chr6 4633520 4635084 4634601 N NA NA CDYL IMR90 Hi-C 24141950 RPP40 369187 3807 chr6 4645448 4648581 4647620 N NA NA CDYL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPP40 355690 3808 chr6 4693526 4694829 4693894 N NA NA CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPP40 309442 3809 chr6 47428578 47429938 47429234 N NA CD2AP CD2AP,GPR111 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CD2AP 15587 3810 chr6 48345513 48348793 48347310 N NA NA NA NA NA NA CD2AP 899988 3811 chr6 48859306 48863783 48861548 N NA NA NA NA NA NA MUT 567258 3812 chr6 48883384 48887123 48884464 N NA NA NA NA NA NA MUT 543918 3813 chr6 48925187 48928255 48926571 N NA NA NA NA NA NA MUT 502786 3814 chr6 49266831 49270246 49268205 N NA NA NA NA NA NA MUT 160795 3815 chr6 49634663 49637261 49636102 N NA NA RHAG,C6orf141 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MUT 203622 3816 chr6 49871899 49875904 49873816 N NA NA NA NA NA NA MUT 440858 3817 chr6 50388493 50415784 50389401 N NA NA NA NA NA NA MUT 957452 3818 chr6 50880182 50881059 50880633 N NA NA NA NA NA NA MCM3 1268523 3819 chr6 51337011 51339921 51338676 N NA NA NA NA NA NA MCM3 809661 3820 chr6 52782142 52786813 52783292 N NA NA NA NA NA NA GSTA4 73365 3821 chr6 52790042 52792220 52791302 N NA NA LOC730101,GSTA1,GSTA3,ICK,FBXO9 IMR90 Hi-C 24141950 GSTA4 67958 3822 chr6 52811846 52813633 52812744 N NA GSTA4 GSTA1,GSTA3,GSTA4 IMR90 Hi-C 24141950 GSTA4 46545 3823 chr6 53044622 53046683 53045948 N NA NA GCLC,KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO9 114826 3824 chr6 53257849 53263769 53260499,53259745 N,N NA;NA ELOVL5 ELOVL5 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL5 43872 3825 chr6 53296498 53299880 53298075 N NA NA GCM1,FBXO9,ELOVL5 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL5 82521 3826 chr6 53424466 53429136 53426889 N NA GCLC GCLC,KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 GCLC 14539 3827 chr6 53554794 53556494 53555413 N NA NA KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 103284 3828 chr6 53557964 53561415 53560489 N NA NA KLHL31,GCLC IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 98363 3829 chr6 53568399 53571441 53569674 N NA NA GCLC,KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 88337 3830 chr6 54639058 54640548 54640091 N NA NA NA NA NA NA LRRC1 979280 3831 chr6 55773291 55775901 55774208 N NA NA HMGCLL1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 1135483 3832 chr6 56263064 56263365 56263211 N NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 648019 3833 chr6 56757256 56762482 56758358 N NA NA PRIM2,DST,RAB23,BEND6,ZNF451,BAG2,KIAA1586 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 148902 3834 chr6 57166694 57168992 57167433 N NA NA BAG2,ZNF451,RAB23,PRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB23 79616 3835 chr6 57837107 57839751 57838523 N NA NA NA NA NA NA GUSBP4 447973 3836 chr6 58163132 58165500 58164400 N NA NA NA NA NA NA GUSBP4 122224 3837 chr6 58197031 58212051 58210809 N NA NA NA NA NA NA GUSBP4 75673 3838 chr6 58442115 58444847 58443369 N NA NA NA NA NA NA GUSBP4 154391 3839 chr6 5896853 5912170 5897015 N NA NA NA NA NA NA FARS2 635269 3840 chr6 6064966 6068114 6066045 N NA NA NA NA NA NA FARS2 803382 3841 chr6 61912813 61917445 61914533 N NA NA NA NA NA NA PHF3 2438986 3842 chr6 63138293 63141873 63139937 N NA NA NA NA NA NA PHF3 1214558 3843 chr6 63196728 63200268 63198734 N NA NA NA NA NA NA PHF3 1156163 3844 chr6 63232591 63235297 63233788 N NA NA NA NA NA NA PHF3 1121134 3845 chr6 63365024 63369238 63367284 N NA NA NA NA NA NA PHF3 987193 3846 chr6 63371134 63376784 63373538,63374956,63371546 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA PHF3 979647 3847 chr6 63429959 63432627 63431225 N NA NA NA NA NA NA PHF3 923804 3848 chr6 63445135 63449717 63446796 N NA NA NA NA NA NA PHF3 906714 3849 chr6 63680472 63686685 63682045,63685442 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PHF3 669746 3850 chr6 63787053 63788649 63787594 N NA NA NA NA NA NA PHF3 567782 3851 chr6 63884575 63887623 63886024 N NA NA NA NA NA NA PHF3 468808 3852 chr6 63921419 63923476 63922148 N NA NA NA NA NA NA PHF3 432955 3853 chr6 64220043 64221584 64220583 N NA NA PTP4A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHF3 134847 3854 chr6 64324981 64326379 64326236 N NA PHF3 NA NA NA NA PHF3 30052 3855 chr6 6680035 6695342 6687369,6689483 Y,N NA;NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 412488 3856 chr6 6746474 6751548 6749698 N NA NA RREB1,SSR1,RIOK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 356282 3857 chr6 6819450 6822301 6821311 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 285529 3858 chr6 68394849 68396531 68394990 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 2110518 3859 chr6 6905925 6908021 6906784 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 199809 3860 chr6 6914886 6917309 6916172 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 190521 3861 chr6 70303536 70306029 70304458 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 201020 3862 chr6 70329961 70333468 70332291 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 173581 3863 chr6 71107381 71110468 71109099 N NA FAM135A FAM135A K562 ChIA-PET 22265404 FAM135A 12639 3864 chr6 73264316 73267404 73265924 N NA NA KCNQ5,RIMS1,MIR4282 IMR90 Hi-C 24141950 KHDC1 752534 3865 chr6 74032934 74035426 74033765 N NA KHDC1 KHDC1 IMR90 Hi-C 24141950 KHDC1 12996 3866 chr6 74964026 74966256 74964392 N NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC17A5 600289 3867 chr6 7513502 7522160 7519977 N NA DSP DSP,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 DSP 19710 3868 chr6 7531365 7533236 7532663 Y NA DSP CAGE1,DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 8634 3869 chr6 7680792 7687804 7685791 N NA NA MUTED-TXNDC5,TXNDC5,BMP6,PIP5K1P1 IMR90 Hi-C 24141950 SNRNP48 90360 3870 chr6 76867019 76868755 76867778 N NA NA NA NA NA NA MYO6 408110 3871 chr6 77557838 77587848 77585529 N NA NA NA NA NA NA MYO6 1098929 3872 chr6 78620193 78620809 78620674 N NA NA NA NA NA NA PHIP 1167202 3873 chr6 79348153 79350731 79349545 N NA NA NA NA NA NA PHIP 437280 3874 chr6 79568985 79570358 79570043 N NA NA NA NA NA NA PHIP 217653 3875 chr6 80487283 80489673 80487875 Y NA NA NA NA NA NA SH3BGRL2 146283 3876 chr6 81235918 81238675 81237423 N NA NA NA NA NA NA BCKDHB 419574 3877 chr6 81509491 81511454 81509822 N NA NA NA NA NA NA BCKDHB 693147 3878 chr6 82177441 82178461 82177889 N NA NA NA NA NA NA IBTK 778987 3879 chr6 82783923 82816327 82785426,82793679,82801775,82800485,82811214 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA C9orf46,BCKDHB,ATRNL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 IBTK 141121 3880 chr6 85078054 85216339 85184828,85214291,85211924,85198111 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA TBX18 IMR90 Hi-C 24141950 ME1 937116 3881 chr6 85254284 85296737 85294578 N NA NA NA NA NA NA SNX14 1006892 3882 chr6 85313669 85319938 85318447 N NA NA NA NA NA NA SNX14 983691 3883 chr6 85324014 85341271 85336308 N NA NA NA NA NA NA SNX14 962358 3884 chr6 86118612 86120595 86119420 N NA NA NT5E IMR90 Hi-C 24141950 SNX14 183034 3885 chr6 86740224 86743893 86741188 N NA NA NA NA NA NA SNHG5 351773 3886 chr6 86784897 86787118 86785334 N NA NA NA NA NA NA SNHG5 396446 3887 chr6 87354568 87358429 87354880 N NA NA NA NA NA NA ZNF292 506840 3888 chr6 88435533 88437832 88436058 N NA AKIRIN2 AKIRIN2,AKIRIN2-AS1 K562 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 23548 3889 chr6 88553568 88554585 88554253 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 141583 3890 chr6 89064415 89065793 89064777 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 652430 3891 chr6 8943772 8945624 8944594 N NA NA NA NA NA NA LOC100506207 507916 3892 chr6 89752975 89754475 89754213 N NA PNRC1 PNRC1 IMR90 Hi-C 24141950 PNRC1 35954 3893 chr6 89772178 89773488 89772795 N NA PNRC1 NA NA NA NA PNRC1 16941 3894 chr6 9136344 9142928 9140959 N NA NA NA NA NA NA LOC100506207 700488 3895 chr6 91431836 91433989 91432863 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 134929 3896 chr6 92061502 92063895 92062217 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 764595 3897 chr6 9315982 9318847 9317469 N NA NA NA NA NA NA LOC100506207 880126 3898 chr6 93353914 93355367 93354394 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2057007 3899 chr6 93573649 93576060 93575027 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2276742 3900 chr6 9397313 9399752 9398556 N NA NA NA NA NA NA LOC100506207 961457 3901 chr6 9407343 9411053 9408537 N NA NA NA NA NA NA LOC100506207 971487 3902 chr6 9460649 9469700 9468320,9463809 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100130275 942851 3903 chr6 94905427 94913409 94907751 N NA NA NA NA NA NA MANEA 1111964 3904 chr6 95227874 95228915 95228355 N NA NA NA NA NA NA MANEA 796458 3905 chr6 95467407 95470624 95468047 N NA NA NA NA NA NA MANEA 554749 3906 chr6 95651025 95654696 95651917 N NA NA NA NA NA NA MANEA 370677 3907 chr6 95830448 95843881 95842688,95833903 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MANEA 181492 3908 chr6 95890210 95902374 95900835 N NA NA NA NA NA NA MANEA 122999 3909 chr6 95924094 95948222 95943613 N NA NA NA NA NA NA MANEA 77151 3910 chr6 95952077 95962065 95959501 N NA NA NA NA NA NA MANEA 63308 3911 chr6 95964370 95975144 95969972,95972118,95965619 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MANEA 50229 3912 chr6 95976911 95983328 95979401 N NA MANEA NA NA NA NA MANEA 42045 3913 chr6 96084769 96093585 96087857 N NA NA NA NA NA NA MANEA 59396 3914 chr6 96115654 96133704 96128297,96132381 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MANEA 90281 3915 chr6 96158217 96166383 96164257 N NA NA NA NA NA NA MANEA 132844 3916 chr6 96169720 96173777 96171983 N NA NA NA NA NA NA MANEA 144347 3917 chr6 96211739 96217411 96213976,96216609 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MANEA 186366 3918 chr6 96229768 96232936 96230915 N NA NA NA NA NA NA MANEA 204395 3919 chr6 96249923 96254803 96252820 N NA NA NA NA NA NA MANEA 224550 3920 chr6 96287671 96294083 96289526,96293066 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA MANEA 262298 3921 chr6 96306538 96313374 96308451 N NA NA NA NA NA NA MANEA 281165 3922 chr6 96329138 96334105 96331076 N NA NA NA NA NA NA MANEA 303765 3923 chr6 96427591 96431691 96427813 N NA NA NA NA NA NA MANEA 402218 3924 chr6 96841202 96842949 96842860 N NA NA NA NA NA NA UFL1 126753 3925 chr6 96897704 96926513 96916426,96919919 N,N NA;NA UFL1 NA NA NA NA UFL1 43189 3926 chr6 97181336 97189131 97186766 N NA NA NA NA NA NA GPR63 96222 3927 chr6 9811072 9813833 9811556 N NA NA NA NA NA NA LOC100130275 598718 3928 chr6 98547327 98549229 98548315 N NA NA NA NA NA NA FBXL4 846620 3929 chr6 98860009 98867886 98864561 N NA NA NA NA NA NA FBXL4 527963 3930 chr7 101282419 101284249 101283679 N NA NA CUX1,SH2B2,MYL10 IMR90 Hi-C 24141950 CUX1 174935 3931 chr7 102351786 102362932 102361820 N NA POLR2J2,FAM185A FBXL13,ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 26467 3932 chr7 103728312 103731453 103730576 N NA NA RELN IMR90 Hi-C 24141950 ORC5 117042 3933 chr7 105032821 105035222 105033542 N NA SRPK2 SRPK2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SRPK2 3480 3934 chr7 10503673 10506758 10504379 N NA NA NA NA NA NA NDUFA4 473055 3935 chr7 105704747 105707345 105705937 N NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45712 3936 chr7 105845549 105853294 105847364 N NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 72344 3937 chr7 105855844 105858293 105857517 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 67345 3938 chr7 105952193 105956154 105954177 N NA NAMPT NAMPT,CCDC71L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAMPT 26555 3939 chr7 105976302 105979810 105978137 N NA NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 50664 3940 chr7 106207681 106210395 106209317 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 91239 3941 chr7 106237655 106241130 106239384 N NA NA CCDC71L K562 ChIA-PET 22265404 CCDC71L 60504 3942 chr7 107495862 107498873 107497828 N NA DLD COG5,SLC26A3,GPR22,CBLL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLD 32713 3943 chr7 108253088 108257229 108254504 N NA THAP5,DNAJB9 THAP5,DNAJB9 MCF7 ChIA-PET 22265404 DNAJB9 42899 3944 chr7 108636809 108640453 108638493 N NA NA NA NA NA NA DNAJB9 426620 3945 chr7 10923446 10925975 10924255 N NA NA NA NA NA NA NDUFA4 53838 3946 chr7 109543322 109548065 109545713 N NA NA NA NA NA NA DNAJB9 1333133 3947 chr7 109555549 109565376 109559182 N NA NA NA NA NA NA DNAJB9 1345360 3948 chr7 109700980 109730313 109729225 N NA NA NA NA NA NA IMMP2L 1472260 3949 chr7 109772588 109780494 109780201,109772589 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IMMP2L 1422079 3950 chr7 109804080 110008338 109872995,109906003,109853911,109988948,109981515,109973983,109960181,110006830 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA IMMP2L 1194235 3951 chr7 111308856 111309874 111309637 N NA NA NA NA NA NA IMMP2L 106283 3952 chr7 112029969 112033611 112032123 N NA IFRD1 DOCK4,ZNF277,IFRD1 IMR90 Hi-C 24141950 IFRD1 29588 3953 chr7 112375188 112377936 112376343 N NA NA NA NA NA NA TMEM168 52542 3954 chr7 113051702 113056079 113054577 N NA NA NA NA NA NA LOC401397 293065 3955 chr7 113243335 113388129 113300764,113258644,113264168,113378501,113383188 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC401397 484698 3956 chr7 117534682 117535443 117535158 N NA NA NA NA NA NA NAA38 288643 3957 chr7 118260589 118265692 118261899,118265070 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NAA38 436503 3958 chr7 118494200 118498139 118495183 N NA NA NA NA NA NA NAA38 670114 3959 chr7 119296564 119298350 119296921 N NA NA NA NA NA NA KCND2 615372 3960 chr7 121826129 121873743 121856622,121871887,121842784 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM3C 789707 3961 chr7 122724854 122725914 122725561 N NA NA NA NA NA NA NDUFA5 472044 3962 chr7 123037237 123040261 123039065,123038607 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NDUFA5 157697 3963 chr7 123046444 123052064 123048184,123050838 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NDUFA5 145894 3964 chr7 124357152 124358072 124357947 N NA NA NA NA NA NA POT1 211965 3965 chr7 12536208 12541707 12536935 N NA NA THSD7A IMR90 Hi-C 24141950 VWDE 92356 3966 chr7 126914147 126914652 126914496 N NA NA NA NA NA NA ZNF800 118115 3967 chr7 12754220 12756495 12755513 Y VWDE,ARL4A NA NA NA NA NA VWDE 310368 3968 chr7 128007506 128010956 128008042 N NA RBM28,IMPDH1 NA NA NA NA RBM28 23544 3969 chr7 128235070 128278911 128242251,128269436,128254938,128235483 N,N,N,N NA;NA;NA;NA FLJ45340,FAM71F2 FAM71F1,CCDC136,KCP,LOC100130705,ATP6V1F,FLJ45340,CALU,IRF5,FAM71F2,OPN1SW,FLNC IMR90 Hi-C 24141950 FLJ45340 2384 3970 chr7 129426284 129443188 129426449 N NA NA NRF1,AHCYL2,SMO,FAM40B,LOC100287482,UBE2H,ZC3HC1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2H 149612 3971 chr7 13349538 13410291 13350861 N NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 VWDE 905686 3972 chr7 13544654 13545810 13545407 N NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 VWDE 1100802 3973 chr7 135457643 135582944 135458767,135470953,135476228,135579112 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA C7orf73,SLC13A4,FAM180A,MTPN IMR90 Hi-C 24141950 MTPN 79260 3974 chr7 135906885 135909500 135907173 N NA NA NA NA NA NA MTPN 244681 3975 chr7 138019101 138021073 138020048 N NA NA NA NA NA NA TRIM24 124006 3976 chr7 139181778 139183129 139182648 N NA NA HIPK2,TBXAS1,PARP12,KLRG2,CLEC2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LUC7L2 156673 3977 chr7 140355383 140358242 140356580 N NA ADCK2,NDUFB2,LOC100134713 DENND2A,MKRN1,LOC100134713,NDUFB2,ADCK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCK2 14711 3978 chr7 140771149 140771912 140771315 N NA NA NA NA NA NA MRPS33 56368 3979 chr7 14134225 14136356 14135386 N NA NA NA NA NA NA VWDE 1690373 3980 chr7 142510761 142513291 142511689 N NA NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 TRPV6 70199 3981 chr7 143464 151385 149354,146111 N,N NA;NA NA FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 PDGFA 408096 3982 chr7 148143477 148146159 148144862 N NA NA CNTNAP2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL1 249774 3983 chr7 148247477 148249517 148247789 N NA NA NA NA NA NA CUL1 146416 3984 chr7 148636036 148639575 148638465 Y NA NA EZH2,CUL1,ZNF786,ZNF398,ZNF425 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EZH2 54595 3985 chr7 149071155 149077278 149072774,149074742 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF777 80775 3986 chr7 149329147 149333945 149333178 N NA ZNF767 ZNF767,KRBA1,ZNF467 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF767 7266 3987 chr7 149601595 149627404 149625313 N NA ATP6V0E2,LOC401431 NA NA NA NA LOC401431 30644 3988 chr7 149719351 149768635 149767681 N NA NA NA NA NA NA LOC401431 148400 3989 chr7 149818413 149881314 149831606,149848885,149880773 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LRRC61 138982 3990 chr7 150202372 150205229 150202940 N NA NA NA NA NA NA LOC728743 99532 3991 chr7 150332653 150346573 150343289,150345449 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC728743 229813 3992 chr7 150347144 150353260 150348806 N NA NA NA NA NA NA LOC728743 244304 3993 chr7 150590370 150593129 150591516 N NA NA ATG9B,NOS3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCB8 132381 3994 chr7 152271032 152271747 152271640 N NA NA LOC100128822,XRCC2,FABP5P3,MLL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC100128822 109823 3995 chr7 152298090 152302976 152300661 N NA NA GALNT11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100128822 136881 3996 chr7 152403006 152403862 152403009 N NA NA XRCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ACTR3B 52989 3997 chr7 152441234 152448313 152444725 N NA ACTR3B MLL3,ACTR3B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR3B 8538 3998 chr7 152837893 152838991 152838459 N NA NA NA NA NA NA ACTR3B 381042 3999 chr7 153417761 153509557 153418214 N NA NA NA NA NA NA ACTR3B 960910 4000 chr7 155031214 155036016 155032484 N NA NA INSIG1 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 53470 4001 chr7 155158528 155161677 155158820 N NA NA PAXIP1,LOC100132707,HTR5A,INSIG1 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 69042 4002 chr7 156139489 156141938 156140644 N NA NA SHH,LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf13 291410 4003 chr7 156719422 156722376 156720442 N NA LMBR1,NOM1 CNPY1,NOM1,UBE3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOM1 20041 4004 chr7 157086664 157087735 157087272 N NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 41976 4005 chr7 158988469 158991159 158990116 N NA NA VIPR2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 339200 4006 chr7 16101012 16102120 16101736 N NA NA NA NA NA NA ANKMY2 583322 4007 chr7 164276 166188 165196 N NA NA FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 PDGFA 393293 4008 chr7 16996170 16998421 16997339 N NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN13 202819 4009 chr7 18884124 18886341 18885190 N NA NA NA NA NA NA TWIST1 270954 4010 chr7 19350165 19353246 19351671 N NA NA NA NA NA NA TWIST1 192870 4011 chr7 20834512 20838874 20837549 Y SP8 NA SP8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP4 628815 4012 chr7 21996335 21997629 21996748 N NA CDCA7L NA NA NA NA CDCA7L 10793 4013 chr7 22104881 22107947 22106349 N NA NA NA NA NA NA CDCA7L 119339 4014 chr7 22119712 22124548 22123023 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 134170 4015 chr7 22936037 22938617 22937635 N NA NA FAM126A,SNORD93 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM7 73616 4016 chr7 2371142 2384600 2380248,2374453 N,N NA;NA SNX8,EIF3B FTSJ2,NUDT1,SNX8,EIF3B,KIAA1908,MAD1L1,MAFK,TFAMP1,PSMG3,TMEM184A,ELFN1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 9874 4017 chr7 24230918 24233508 24232303 N NA NA NA NA NA NA MPP6 379577 4018 chr7 25352976 25356819 25354289 N NA NA NA NA NA NA CYCS 187996 4019 chr7 25386477 25389413 25387966 N NA NA NA NA NA NA CYCS 221497 4020 chr7 25395348 25397948 25396546 N NA NA NA NA NA NA CYCS 230368 4021 chr7 25399152 25401485 25400285 N NA NA NA NA NA NA CYCS 234172 4022 chr7 25422968 25426588 25424771 N NA NA NA NA NA NA CYCS 257988 4023 chr7 25427108 25430351 25428513,25428221 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CYCS 262128 4024 chr7 25637050 25645667 25642695 N NA NA NA NA NA NA CYCS 472070 4025 chr7 25657964 25661168 25660051 Y NA NA LOC441204 IMR90 Hi-C 24141950 CYCS 492984 4026 chr7 25750488 25752093 25751293 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA2B1 488320 4027 chr7 25893589 25899414 25894911,25896791 Y,Y NA;NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA2B1 340999 4028 chr7 26003449 26006251 26004880 N NA NA MIR148A MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA2B1 234162 4029 chr7 27063219 27066650 27064538 N NA NA LOC441204,HOXA3,HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA13,HOTTIP,SKAP2 IMR90,H1ESC,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 HOTAIRM1 69063 4030 chr7 27349349 27388645 27385027,27386693 N,N NA;NA NA HIBADH,HOTTIP,HOXA13,EVX1 IMR90,HELA,K562,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 HOXA-AS5 124322 4031 chr7 27400232 27407105 27401493 N NA NA EVX1 IMR90 Hi-C 24141950 HOXA-AS5 175205 4032 chr7 27499691 27505670 27504874 N NA NA JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 196950 4033 chr7 2898508 2902083 2900492 N NA GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 14549 4034 chr7 31523630 31525407 31523926 N NA NA CCDC129,PDE1C IMR90 Hi-C 24141950 GARS 889449 4035 chr7 34274297 34277868 34275730 N NA NA NA NA NA NA RP9 1125295 4036 chr7 36027278 36029307 36028190 N NA NA KIAA0895,EEPD1,ANLN IMR90 Hi-C 24141950 EEPD1 163529 4037 chr7 36075663 36079048 36076731 N NA NA EEPD1 IMR90 Hi-C 24141950 EEPD1 113788 4038 chr7 36167499 36169262 36168445 N NA EEPD1 EEPD1 IMR90 Hi-C 24141950 EEPD1 23574 4039 chr7 363438 374669 373236 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 PDGFA 184812 4040 chr7 37622404 37625106 37623898 N NA NA NA NA NA NA STARD3NL 592702 4041 chr7 380797 383178 382133 N NA NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 PDGFA 176303 4042 chr7 38695861 38696526 38696491 N NA NA AMPH IMR90 Hi-C 24141950 VPS41 252274 4043 chr7 39891803 39895105 39894398 N NA NA NA NA NA NA CDK13 94854 4044 chr7 43031780 43036197 43033549 N NA NA NA NA NA NA MRPL32 59841 4045 chr7 4564201 4565510 4564930 N NA NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 156420 4046 chr7 4577681 4579806 4578413 N NA NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 142124 4047 chr7 46595439 46598966 46597197 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 634568 4048 chr7 46706508 46707407 46707140 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 745637 4049 chr7 4682097 4685951 4683111 N NA FOXK1 SDK1,FOXK1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 35979 4050 chr7 46923117 46927773 46924905 N NA NA NA NA NA NA IGFBP3 962246 4051 chr7 46971062 46974078 46972868 N NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 1010191 4052 chr7 47091808 47093161 47092147 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 HUS1 926061 4053 chr7 49719336 49726353 49719690 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 791735 4054 chr7 5005906 5009623 5007381 N NA RNF216P1 NA NA NA NA RNF216P1 3993 4055 chr7 50924767 50927466 50925868 N NA NA COBL IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 63608 4056 chr7 51672793 51676006 51674614 N NA NA NA NA NA NA COBL 288278 4057 chr7 51995201 51996020 51995941 N NA NA NA NA NA NA COBL 610686 4058 chr7 53023226 53025531 53024234 N NA NA NA NA NA NA FLJ45974 854093 4059 chr7 53192897 53198463 53193864 N NA NA NA NA NA NA FLJ45974 681161 4060 chr7 53686313 53688726 53687657 N NA NA NA NA NA NA FLJ45974 190898 4061 chr7 53931763 53935237 53934591 N NA NA NA NA NA NA FLJ45974 52139 4062 chr7 54088659 54091524 54089336 N NA NA NA NA NA NA FLJ45974 209035 4063 chr7 54999430 55007492 55001026 N NA NA EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 79233 4064 chr7 55054890 55057446 55056422 N NA EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 29279 4065 chr7 55785704 55794299 55793250 N NA NA NA NA NA NA VOPP1 145504 4066 chr7 55812270 55830739 55825952,55830205 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF713 149592 4067 chr7 5584482 5598676 5589527,5595990 N,Y NA;CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 14250 4068 chr7 55945461 55956687 55945739,55955420 N,N NA;NA ZNF713 NA NA NA NA ZNF713 23644 4069 chr7 5606642 5614050 5610378 N NA ACTB RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 36410 4070 chr7 56353567 56360724 56355738 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 179380 4071 chr7 56442909 56457858 56456179 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 268722 4072 chr7 56737947 56739651 56738669 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 563760 4073 chr7 56902917 56912718 56905881 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 728730 4074 chr7 57670462 57674250 57672945 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 1496275 4075 chr7 57704295 57713123 57708985,57711124,57706542 N,N,Y NA;NA;ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1530108 4076 chr7 57851865 57855388 57854470 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 1677678 4077 chr7 57910660 57920774 57912776 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 1736473 4078 chr7 57967079 58006805 57972162,57989666,57996723,57999672 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CHCHD2 1792892 4079 chr7 58014794 58026039 58021845 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 1840607 4080 chr7 58027442 58041970 58030815 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 1853255 4081 chr7 58047230 58054432 58053833 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 1873043 4082 chr7 6117248 6123400 6119597,6121195 N,N NA;NA EIF2AK1,USP42 EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF2AK1 18388 4083 chr7 61370524 61377574 61375078 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 2395612 4084 chr7 61522119 61529494 61525427 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 2243692 4085 chr7 61534368 61544761 61542787 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 2228425 4086 chr7 61585840 61590357 61587002 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 2182829 4087 chr7 61611382 61641131 61614745,61635765 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF736 2132055 4088 chr7 61779395 61779953 61779638 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 1993233 4089 chr7 62027303 62030167 62029273 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 1743019 4090 chr7 62969539 62972344 62971053 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 800842 4091 chr7 63041191 63042867 63041912 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 730319 4092 chr7 63150756 63155884 63154772 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 617302 4093 chr7 63159889 63189295 63162411,63187957 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF736 583891 4094 chr7 63375878 63381817 63380513 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 391369 4095 chr7 63601785 63603142 63602131 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 170044 4096 chr7 63757385 63763610 63763105 N NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 9576 4097 chr7 63877305 63880206 63878422 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 104119 4098 chr7 64194739 64201008 64197204 N NA NA NA NA NA NA ZNF138 53763 4099 chr7 64468076 64479267 64471074 N NA ZNF117,CCT6P3 CCT6P3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF117 16662 4100 chr7 64724070 64726325 64725339 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 112443 4101 chr7 64953909 64957371 64954850 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 115141 4102 chr7 65017298 65018341 65018182 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 178530 4103 chr7 65881131 65897593 65882458,65895987 N,N NA;NA LINC00174 ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00174 15736 4104 chr7 65899409 65969083 65954396,65958615,65911503,65940917,65923058,65934818,65947731,65905346 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA LINC00174 ASL,LINC00174,CRCP,TPST1,LOC493754 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00174 34014 4105 chr7 66816271 66828440 66817495 N NA PMS2P4,STAG3L4 NA NA NA NA STAG3L4 48646 4106 chr7 66907278 66908955 66908294 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 139653 4107 chr7 66934544 66937419 66935943 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 166919 4108 chr7 67436073 67438044 67436695 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 668448 4109 chr7 68105662 68107243 68106731 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 956663 4110 chr7 68200938 68201736 68201475 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 862170 4111 chr7 68343997 68344521 68344153 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 719385 4112 chr7 68417323 68418872 68417656 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 645034 4113 chr7 71207931 71210011 71209212 N NA NA NA NA NA NA TYW1B 1088802 4114 chr7 72812565 72829675 72812809,72822017,72826600 N,N,N NA;NA;NA NA FKBP6,BAZ1B IMR90 Hi-C 24141950 NSUN5 89701 4115 chr7 74673979 74697009 74681121,74696361 N,N NA;NA LOC100093631 NA NA NA NA LOC100093631 20520 4116 chr7 74885150 74911273 74895081,74895198,74910661 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA PMS2L2 76942 4117 chr7 75792369 75800974 75793923,75795974 N,Y NA;RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 114976 4118 chr7 76575536 76586159 76576319 N NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 NA NA NA NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 23980 4119 chr7 77119544 77132170 77128158,77131696 N,N NA;NA PTPN12 CCDC146,PION,PTPN12,LOC100505854,RSBN1L IMR90 Hi-C 24141950 PTPN12 34603 4120 chr7 80333603 80336684 80334836 N NA NA SEMA3C IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 211983 4121 chr7 80622322 80623853 80622488 N NA NA SEMA3C MCF7 ChIA-PET 22265404 SEMA3C 73655 4122 chr7 80662113 80663978 80662311 N NA NA SEMA3C IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 113446 4123 chr7 80672478 80673765 80673307 N NA NA NA NA NA NA SEMA3C 123811 4124 chr7 81038749 81041047 81039951 N NA NA SEMA3C IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 490082 4125 chr7 81071421 81073787 81072342 N NA NA SEMA3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA3C 522754 4126 chr7 82116988 82121607 82118064 N NA NA CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 1568321 4127 chr7 8334526 8336520 8335537 N NA ICA1 ICA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ICA1 32341 4128 chr7 8389480 8393463 8391296 N NA NA NA NA NA NA ICA1 87295 4129 chr7 8431516 8457959 8431686,8450105,8455945 N,N,N NA;NA;NA NA NXPH1 IMR90 Hi-C 24141950 ICA1 129331 4130 chr7 84854514 84857134 84856090 N NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 1831880 4131 chr7 84879045 84883040 84879403 N NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 1805974 4132 chr7 88068506 88069464 88069082 N NA NA NA NA NA NA ADAM22 504940 4133 chr7 88077445 88079256 88078247 N NA NA NA NA NA NA ADAM22 513879 4134 chr7 89686261 89693540 89692378 N NA NA NA NA NA NA STEAP1 90149 4135 chr7 90212441 90294587 90226220,90252267,90248285 N,N,N NA;NA;NA CDK14 CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63,STEAP1 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CDK14 44125 4136 chr7 91194154 91196602 91195239 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 300371 4137 chr7 91208877 91209857 91209472 N NA NA NA NA NA NA MTERF 300159 4138 chr7 91386477 91392923 91388806 N NA NA NA NA NA NA MTERF 117093 4139 chr7 93214415 93271183 93214589 N NA NA CALCR MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC132 352762 4140 chr7 93948734 93951455 93950058 N NA NA COL1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CASD1 187715 4141 chr7 94369306 94369889 94369653 N NA NA NA NA NA NA PPP1R9A 167060 4142 chr7 94508299 94510416 94509463 N NA PPP1R9A NA NA NA NA PPP1R9A 26533 4143 chr7 95236979 95241069 95238638 N NA NA NA NA NA NA PON2 172595 4144 chr7 97646527 97650366 97649190 N NA MGC72080 LMTK2 IMR90 Hi-C 24141950 MGC72080 44889 4145 chr7 97718966 97720897 97719229 N NA LMTK2 LMTK2 IMR90 Hi-C 24141950 LMTK2 15300 4146 chr7 98156399 98157574 98157140 N NA NA NA NA NA NA BAIAP2L1 125972 4147 chr7 98391872 98393637 98392226 N NA NA NA NA NA NA TRRAP 82476 4148 chr8 100940742 100943093 100942053 N NA COX6C STK3 IMR90 Hi-C 24141950 COX6C 34500 4149 chr8 101497822 101499934 101498841 N NA NA RNF19A,GRHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 72078 4150 chr8 101766632 101768181 101767956 N NA PABPC1 SNX31 IMR90 Hi-C 24141950 PABPC1 32317 4151 chr8 102122937 102140289 102138904 N NA NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 77671 4152 chr8 102343082 102347536 102345296 Y NA NA GRHL2,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 125122 4153 chr8 102371406 102374838 102373265 Y NA NA GRHL2,NACAP1,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRHL2 129830 4154 chr8 102403848 102407236 102405249 N NA NA GRHL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRHL2 97432 4155 chr8 102408816 102410556 102409548 N NA NA NA NA NA NA GRHL2 94112 4156 chr8 102414899 102439400 102422194,102419772,102422318 N,N,N NA;NA;NA NA GRHL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRHL2 65268 4157 chr8 102446791 102452567 102450871 N NA NA NACAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRHL2 52101 4158 chr8 103696063 103700720 103698106 N NA KLF10 KLF10,UBR5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 28080 4159 chr8 105718827 105719922 105719405 N NA NA LRP12,ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 117575 4160 chr8 106855332 106951382 106946208,106855470,106949886 N,N,N NA;NA;NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 1254080 4161 chr8 106979833 107074383 106987764,107049860,107072800,107070017,107058340 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 1378581 4162 chr8 107951178 107951954 107951811 N NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3E 1309005 4163 chr8 1085382 1116755 1085540 N NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 ERICH1 404156 4164 chr8 109611158 109612843 109612245 N NA NA NA NA NA NA TTC35 155305 4165 chr8 110081637 110084057 110082256 N NA NA NA NA NA NA ENY2 262495 4166 chr8 111946388 111947421 111947035 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 1394459 4167 chr8 112112489 112114458 112113244 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 1560560 4168 chr8 112125119 112127857 112126640 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 1573190 4169 chr8 112562897 112563718 112563132 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 2010968 4170 chr8 115041626 115045027 115042085 N NA NA NA NA NA NA TRPS1 1636201 4171 chr8 115167227 115168526 115167586 N NA NA NA NA NA NA TRPS1 1512702 4172 chr8 115297446 115517019 115516478 N NA NA NA NA NA NA TRPS1 1164209 4173 chr8 115580519 115660482 115592680,115614396,115598432,115643357,115649489 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TRPS1 1020746 4174 chr8 115697563 116031476 115906915,115697726,115934376,115768825 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TRPS1 649752 4175 chr8 116161717 116209157 116206967,116198862 N,N NA;NA NA SLC30A8 IMR90 Hi-C 24141950 TRPS1 472071 4176 chr8 116214937 116219800 116216080 N NA NA NA NA NA NA TRPS1 461428 4177 chr8 116266782 116270802 116269709 N NA NA NA NA NA NA TRPS1 410426 4178 chr8 116272279 116278007 116275264 N NA NA NA NA NA NA TRPS1 403221 4179 chr8 117813940 117816758 117814755 N NA EIF3H,UTP23 NA NA NA NA UTP23 35198 4180 chr8 12494967 12505212 12504823 N NA NA NA NA NA NA LONRF1 107780 4181 chr8 125184119 125184404 125184262 N NA NA TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 200536 4182 chr8 126426433 126428367 126427060 N NA TRIB1 NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 14196 4183 chr8 127200085 127202924 127201455 N NA NA NA NA NA NA FAM84B 367787 4184 chr8 127508103 127509185 127508494 N NA NA FAM84B MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM84B 61526 4185 chr8 127659149 127799304 127751358,127659310,127769899 N,N,N NA;NA;NA NA FAM84B,LOC100130231 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM84B 88438 4186 chr8 127836032 127845009 127837453 N NA NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCAT1 180390 4187 chr8 127876760 127976961 127881785,127877529,127963511,127969197,127889239,127940221 N,N,Y,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA PCAT1 PVT1,MYC,PCAT1,LOC727677,POU5F1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCAT1 48438 4188 chr8 128088215 128115762 128101143,128095794,128089277,128114173,128105104,128115316 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 PCAT1 62816 4189 chr8 128181430 128229653 128181793,128202045,128229083 N,N,N NA;NA;NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCAT1 156031 4190 chr8 128255089 128259444 128256053 N NA NA LOC727677,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 PCAT1 229690 4191 chr8 128340096 128393838 128342630,128364647 N,N NA;NA NA LOC727677,PCAT1 IMR90 Hi-C 24141950 PCAT1 314697 4192 chr8 128514622 128524498 128520624,128522774 N,N NA;NA NA LOC727677,MYC,PCAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 223817 4193 chr8 128529682 128533288 128531784 N NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 215027 4194 chr8 129187682 129191398 129189275 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 380903 4195 chr8 129439290 129441911 129440573 N NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 632511 4196 chr8 129465030 129471388 129465363 N NA NA NA NA NA NA PVT1 658251 4197 chr8 132351594 132351912 132351732 N NA NA NA NA NA NA EFR3A 564444 4198 chr8 134318686 134321260 134320284 N NA NDRG1 TG,NDRG1,ST3GAL1,WISP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 9139 4199 chr8 134599664 134622969 134619932,134600148 N,N NA;NA ST3GAL1 ST3GAL1,ZFAT IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 15481 4200 chr8 134630946 134633598 134632100 N NA ST3GAL1 ST3GAL1,ZFAT,ZFAT-AS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ST3GAL1 46763 4201 chr8 13472327 13473109 13472845 N NA NA KIAA1456,DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 LONRF1 859335 4202 chr8 134729953 134736002 134734161,134731353 N,N NA;NA NA ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 145770 4203 chr8 134738641 134741742 134740424 N NA NA ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 154458 4204 chr8 13475607 13476720 13476488 N NA NA DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 LONRF1 862615 4205 chr8 134808932 134816303 134811377 N NA NA ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 224749 4206 chr8 134861759 134865989 134863804 N NA NA ST3GAL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ST3GAL1 277576 4207 chr8 134893118 134901519 134898475,134895112 N,N NA;NA NA ST3GAL1,ZFAT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 308935 4208 chr8 134910010 134915500 134912137 N NA NA ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 325827 4209 chr8 134965572 134968769 134966891 N NA NA ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 381389 4210 chr8 135044739 135047931 135046348 Y ST3GAL1 NA ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 460556 4211 chr8 135082798 135089463 135083142 N NA NA NA NA NA NA ST3GAL1 498615 4212 chr8 135298694 135302097 135300782 N NA NA NA NA NA NA ZFAT 423195 4213 chr8 135427734 135430246 135428441 N NA NA NA NA NA NA ZFAT 295046 4214 chr8 135753918 135757729 135756151 N NA ZFAT ZFAT,MIR30D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 28626 4215 chr8 136396059 136396803 136396226 N NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 72913 4216 chr8 137540143 137549145 137543094 N NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 1070427 4217 chr8 137615739 137854913 137765914,137712741,137616986 N,N,N NA;NA;NA NA KHDRBS3 IMR90 Hi-C 24141950 KHDRBS3 1146023 4218 chr8 140115549 140115834 140115678 N NA NA NA NA NA NA CHRAC1 1405563 4219 chr8 141472831 141476700 141474901 Y NA CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CHRAC1 44697 4220 chr8 142067413 142078792 142068836 N NA NA PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 56001 4221 chr8 142084575 142086785 142085982 N NA NA PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 73163 4222 chr8 143530927 143541384 143534290 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 TSNARE1 BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSNARE1 46384 4223 chr8 143895837 143898600 143897294 Y LY6E,GLI4 NA LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 C8orf55 87216 4224 chr8 145913846 145915367 145914909 N NA NA ARHGAP39,ZNF251,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF251 65603 4225 chr8 15362009 15362548 15362192 N NA TUSC3 NA NA NA NA TUSC3 35048 4226 chr8 16520092 16530895 16527623 N NA NA NA NA NA NA EFHA2 353852 4227 chr8 1688271 1695236 1694101 N NA CLN8 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 16634 4228 chr8 17344749 17347465 17346513 N NA SLC7A2 MTMR7,SLC7A2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC7A2 7132 4229 chr8 17692681 17697894 17694307 N NA MTUS1 MTUS1,FGL1 IMR90 Hi-C 24141950 MTUS1 34255 4230 chr8 18898162 18899975 18899209 N NA PSD3 PSD3,LOC100128993,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 26966 4231 chr8 19575693 19613118 19612954 N NA NA CSGALNACT1,SH2D4A,PSD3,INTS10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INTS10 61800 4232 chr8 20161050 20163327 20161507 N NA NA ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 106346 4233 chr8 20537595 20538642 20538237 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1B2 482891 4234 chr8 20757110 20758380 20757619 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1B2 702406 4235 chr8 21709049 21709567 21709314 N NA NA NA NA NA NA EPB49 201514 4236 chr8 22807128 22816057 22808330 Y NA NA PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2,KIAA1967,LOC254896,C8orf58 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF10B 110643 4237 chr8 23470392 23486647 23472223,23478130,23482530,23480367,23482574 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA ENTPD4,SLC25A37,NKX3-1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 53803 4238 chr8 24075242 24077458 24076373 N NA NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 534792 4239 chr8 24398277 24400581 24399473 N NA NA NA NA NA NA DOCK5 641706 4240 chr8 24538780 24541691 24540427 N NA NA NA NA NA NA DOCK5 500596 4241 chr8 247710 249846 248635 N NA NA NA NA NA NA RPL23AP53 65392 4242 chr8 25559974 25560901 25560440 N NA NA NA NA NA NA KCTD9 243990 4243 chr8 25579494 25595004 25587860 N NA NA NA NA NA NA KCTD9 263510 4244 chr8 25989960 25992805 25991427 N NA NA PPP2R2A,CDCA2,KCTD9,DPYSL2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R2A 156202 4245 chr8 26021632 26025764 26023157 N NA NA PPP2R2A IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R2A 123243 4246 chr8 26057502 26063675 26060814 N NA NA DPYSL2,PPP2R2A IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R2A 85332 4247 chr8 26122043 26128726 26123649 Y NA PPP2R2A PPP2R2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 20281 4248 chr8 26971038 26975336 26971372 N NA NA NA NA NA NA TRIM35 193498 4249 chr8 28455522 28457916 28456697 N NA NA NA NA NA NA EXTL3 101237 4250 chr8 28478724 28536395 28480061 N NA EXTL3 EXTL3,INTS9 IMR90 Hi-C 24141950 EXTL3 22758 4251 chr8 29143686 29146494 29144593 N NA NA KIF13B,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 61773 4252 chr8 29399201 29400960 29400120 N NA NA MIR3148,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 190934 4253 chr8 29626793 29629162 29628101 N NA NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 311487 4254 chr8 30185073 30188288 30186508 N NA NA MIR548O2,RBPMS,GTF2E2,DCTN6 IMR90 Hi-C 24141950 RBPMS 53656 4255 chr8 303526 307779 305542 N NA FBXO25 NA NA NA NA FBXO25 49029 4256 chr8 30771101 30772537 30771512,30771925 N,N NA;NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 100749 4257 chr8 32673565 32677696 32673785 N NA NA NA NA NA NA FUT10 652968 4258 chr8 327411 328517 328338 N NA FBXO25 FBXO25 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO25 28291 4259 chr8 32921435 32924020 32922659 N NA NA NA NA NA NA FUT10 406644 4260 chr8 33164829 33166807 33166451 N NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 163857 4261 chr8 33203273 33203818 33203419 N NA NA FUT10 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 126846 4262 chr8 33576960 33588737 33579863 Y NA NA NA NA NA NA TTI2 206257 4263 chr8 33650026 33650978 33650385 N NA NA NA NA NA NA TTI2 279323 4264 chr8 33716763 33778233 33737675,33747228,33717558 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TTI2 346060 4265 chr8 33792539 33856387 33792701,33849975,33827426 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TTI2 421836 4266 chr8 33871013 33896421 33871530 N NA NA NA NA NA NA TTI2 500310 4267 chr8 34072340 34074223 34073283 N NA NA NA NA NA NA TTI2 701637 4268 chr8 36245678 36252208 36246335 N NA NA NA NA NA NA ZNF703 1301093 4269 chr8 37158793 37162433 37159977 N NA NA ZNF703,KCNU1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF703 390868 4270 chr8 37206689 37219271 37217269 N NA NA ERLIN2,LOC728024,ZNF703 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 334030 4271 chr8 37328387 37331439 37330141 N NA NA ZNF703,ERLIN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF703 221862 4272 chr8 39708527 39712090 39710409 N NA NA NA NA NA NA ADAM9 854022 4273 chr8 39894338 39895230 39894574 N NA NA NA NA NA NA ADAM9 1039833 4274 chr8 39944609 39947672 39946064 N NA NA C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1090104 4275 chr8 40051761 40054976 40053079 N NA NA GOLGA7,C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1197256 4276 chr8 40353352 40354813 40353983 N NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA7 993268 4277 chr8 41307192 41308516 41307661 N NA GOLGA7 NA NA NA NA GOLGA7 39565 4278 chr8 41941225 41942880 41941776 N NA KAT6A AP3M2,ANK1,KAT6A IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 31720 4279 chr8 41996154 41998658 41997688 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 11806 4280 chr8 42097843 42099106 42098799 N NA IKBKB VDAC3,AP3M2,IKBKB IMR90 Hi-C 24141950 IKBKB 29714 4281 chr8 42437254 42439964 42438007 N NA SLC20A2 SLC20A2,C8orf40 IMR90 Hi-C 24141950 SLC20A2 40186 4282 chr8 42497305 42498884 42497863 N NA NA SLC20A2,CHRNA6,C8orf40 IMR90 Hi-C 24141950 SLC20A2 100237 4283 chr8 43092623 43097646 43092964,43095856 Y,N HOOK3;NA NA NA NA NA NA HGSNAT 97031 4284 chr8 43368337 43371001 43369355 N NA NA NA NA NA NA HGSNAT 372745 4285 chr8 43390341 43393537 43391283 N NA NA NA NA NA NA HGSNAT 394749 4286 chr8 43767535 43768999 43768718 N NA NA NA NA NA NA HGSNAT 771943 4287 chr8 46854725 46857592 46856402 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0146 1315897 4288 chr8 46875474 46879125 46877492 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 1294364 4289 chr8 47175585 47178755 47176088 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 994734 4290 chr8 47459339 47516364 47498829,47492064,47513320 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA KIAA0146 657125 4291 chr8 47524652 47544607 47529169,47532036 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KIAA0146 628882 4292 chr8 47661053 47662491 47661912 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 510998 4293 chr8 47741227 47743556 47742691 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 429933 4294 chr8 47789419 47791538 47789717 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 381951 4295 chr8 48024605 48026295 48025030 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 147194 4296 chr8 49166103 49168292 49166775 N NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 245108 4297 chr8 49169877 49171857 49170965 N NA NA SNAI2,MCM4 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 248882 4298 chr8 49173177 49175496 49174244 N NA NA SNAI2,MCM4 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 252182 4299 chr8 49424988 49429541 49427199 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 503993 4300 chr8 49560558 49562985 49562133 N NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 639563 4301 chr8 49700365 49704780 49701452 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 779370 4302 chr8 49857678 49859400 49858814 N NA NA NA NA NA NA UBE2V2 936683 4303 chr8 50651555 50654137 50653901 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V2 1730560 4304 chr8 521387 522622 522446 N NA NA NA NA NA NA ERICH1 158604 4305 chr8 532117 540446 533723 N NA NA NA NA NA NA ERICH1 140780 4306 chr8 53377716 53381159 53379899 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA RB1CC1 245867 4307 chr8 53642326 53646461 53642674 N NA RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 15300 4308 chr8 53897882 53901460 53899774 N NA NA NA NA NA NA OPRK1 262734 4309 chr8 53906552 53908641 53907756 N NA NA NA NA NA NA OPRK1 255553 4310 chr8 53954054 53964594 53954934 N NA NA NA NA NA NA OPRK1 199600 4311 chr8 53990763 53996371 53992133 N NA NA NA NA NA NA OPRK1 167823 4312 chr8 54058451 54060808 54059638 N NA NA NA NA NA NA OPRK1 103386 4313 chr8 54170691 54195831 54171751,54190267,54173512 N,N,N NA;NA;NA OPRK1 NA NA NA NA OPRK1 6497 4314 chr8 54298141 54329796 54306515,54326042,54328545,54301493,54311634 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA OPRK1 133947 4315 chr8 54448312 54478387 54449714,54477147 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 277463 4316 chr8 55520109 55520966 55520774 N NA NA NA NA NA NA MRPL15 472328 4317 chr8 56762920 56764669 56763542 N NA LYN LYN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LYN 27717 4318 chr8 5706801 5709182 5708354 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 554887 4319 chr8 57657677 57661134 57659248 N NA NA NA NA NA NA IMPAD1 245296 4320 chr8 57664740 57668222 57666449 N NA NA NA NA NA NA IMPAD1 238208 4321 chr8 57833551 57835642 57834474 N NA NA LOC100507632 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 70788 4322 chr8 58349924 58350276 58350235 N NA NA NA NA NA NA IMPAD1 443494 4323 chr8 58450376 58453698 58450922 N NA NA NA NA NA NA IMPAD1 543946 4324 chr8 58455894 58459960 58457803 N NA NA NA NA NA NA IMPAD1 549464 4325 chr8 58714698 58718327 58716240 N NA NA NA NA NA NA UBXN2B 605496 4326 chr8 58735936 58737772 58736607 N NA NA NA NA NA NA UBXN2B 586051 4327 chr8 58766726 58770280 58767989 N NA NA NA NA NA NA UBXN2B 553543 4328 chr8 58772672 58776228 58774026 N NA NA NA NA NA NA UBXN2B 547595 4329 chr8 58868790 58872025 58870097 N NA NA NA NA NA NA UBXN2B 451798 4330 chr8 59415187 59416978 59415709 N NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 48750 4331 chr8 60794291 60801388 60794687 N NA NA NA NA NA NA RAB2A 628081 4332 chr8 6129231 6131936 6130454 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 132133 4333 chr8 61346466 61358814 61350995 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 RAB2A 70655 4334 chr8 61557161 61570341 61564608,61566257 Y,N CA8,CHD7;NA CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 20983 4335 chr8 6171028 6172930 6172305 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 91139 4336 chr8 61810522 61815805 61812502 N NA NA CHD7,LOC100130298 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 219198 4337 chr8 61849010 61851833 61849979 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 257686 4338 chr8 6195647 6202958 6196750 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 61111 4339 chr8 61998077 61998920 61998398 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 406753 4340 chr8 62664254 62666981 62664509 N NA ASPH ASPH,MIR4470 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASPH 37055 4341 chr8 64282957 64284193 64283535 N NA NA NA NA NA NA YTHDF3 201836 4342 chr8 65313557 65318692 65313930 N NA NA NA NA NA NA ARMC1 1227760 4343 chr8 65942652 65945784 65943510 N NA NA NA NA NA NA ARMC1 600668 4344 chr8 66379648 66417424 66413104 N NA NA NA NA NA NA ARMC1 129028 4345 chr8 67183215 67185142 67183977 N NA NA NA NA NA NA RRS1 156121 4346 chr8 68721752 68725899 68723114 N NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 465840 4347 chr8 68834090 68836223 68835800 N NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 578178 4348 chr8 70112249 70115045 70113786 N NA NA NA NA NA NA SLCO5A1 632254 4349 chr8 70259999 70296398 70263781,70269735 N,N NA;NA NA LOC100505718,SULF1,C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO5A1 450901 4350 chr8 7040978 7049913 7047433 N NA NA NA NA NA NA FAM66B 162963 4351 chr8 70765749 70774636 70772842 N NA SLCO5A1 NA NA NA NA SLCO5A1 18450 4352 chr8 70818359 70823137 70819120 N NA NA NA NA NA NA SLCO5A1 71060 4353 chr8 7095072 7095800 7095352 N NA NA NA NA NA NA FAM66B 117076 4354 chr8 73376267 73394249 73391885 N NA NA NA NA NA NA TERF1 526848 4355 chr8 74075256 74078527 74077196 N NA NA NA NA NA NA RPL7 127342 4356 chr8 74263127 74263693 74263300 N NA NA RDH10,RPL7,STAU2,LOC100128126 IMR90 Hi-C 24141950 RDH10 56290 4357 chr8 74834204 74834672 74834491 N NA UBE2W,TCEB1 NA NA NA NA UBE2W 43094 4358 chr8 74983857 74992544 74985555 N NA NA NA NA NA NA TMEM70 95480 4359 chr8 75317477 75320235 75318577 N NA NA NA NA NA NA JPH1 83915 4360 chr8 75399859 75402146 75400920 N NA NA NA NA NA NA JPH1 166297 4361 chr8 75486331 75490503 75488592 N NA NA NA NA NA NA JPH1 252769 4362 chr8 75859940 75881295 75860931 N NA NA NA NA NA NA JPH1 626378 4363 chr8 76316419 76356760 76321817,76333037,76319857 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA JPH1 1082857 4364 chr8 76531888 76541361 76533382 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 1052154 4365 chr8 76862986 76866301 76864371 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 727214 4366 chr8 77002664 77021428 77010260,77019054 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZFHX4 572087 4367 chr8 77106271 77128259 77127190,77114204,77116722 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZFHX4 465256 4368 chr8 77195951 77227848 77220601 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 365667 4369 chr8 77246605 77249118 77247733 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 344397 4370 chr8 77324958 77326218 77325401 N NA NA PEX2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX4 267297 4371 chr8 77336984 77338525 77337415 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 254990 4372 chr8 78125261 78127764 78126682 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 531746 4373 chr8 78880343 78882663 78881792 N NA NA NA NA NA NA ZC2HC1A 695619 4374 chr8 79122863 79124553 79123848 N NA NA NA NA NA NA ZC2HC1A 453729 4375 chr8 79350484 79352613 79351254 N NA NA NA NA NA NA ZC2HC1A 225669 4376 chr8 81135622 81136754 81136037 N NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 TPD52 51786 4377 chr8 81192685 81194941 81193240 N NA NA NA NA NA NA TPD52 108849 4378 chr8 81292244 81294327 81293079 N NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB10 104121 4379 chr8 81475596 81486644 81476047,81480797 N,N NA;NA NA ZBTB10 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB10 77148 4380 chr8 81488566 81495604 81489895,81491500 N,N NA;NA NA ZBTB10,TPD52,PAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZBTB10 90118 4381 chr8 82233358 82236299 82234855 N NA NA NA NA NA NA PAG1 209055 4382 chr8 82478629 82517756 82505419,82482069 N,N NA;NA NA FABP5,ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA1 80833 4383 chr8 83203094 83205491 83204515 N NA NA NA NA NA NA SNX16 448573 4384 chr8 83473561 83475930 83474458 N NA NA NA NA NA NA SNX16 719040 4385 chr8 83810105 83810502 83810464 N NA NA NA NA NA NA SNX16 1055584 4386 chr8 84356964 84361602 84359615 N NA NA NA NA NA NA RALYL 733851 4387 chr8 84442795 84444299 84443843 N NA NA NA NA NA NA RALYL 651154 4388 chr8 84786039 84793548 84787170 N NA NA NA NA NA NA RALYL 301905 4389 chr8 84859137 84861411 84859941 N NA NA NA NA NA NA RALYL 234042 4390 chr8 855775 964124 932919,857910,923921 N,N,N NA;NA;NA NA DLGAP2,MYOM2 IMR90 Hi-C 24141950 ERICH1 174549 4391 chr8 86336663 86340255 86337178 N NA NA NA NA NA NA C8orf59 204020 4392 chr8 87187017 87190333 87188840 N NA NA WWP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 WWP1 164661 4393 chr8 87267255 87272062 87270729 N NA NA WWP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 WWP1 82932 4394 chr8 87300878 87304736 87302836 N NA NA WWP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 WWP1 50258 4395 chr8 87848011 87851549 87850275 N NA NA NA NA NA NA CPNE3 321355 4396 chr8 88483379 88499784 88488881,88484631 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MMP16 839933 4397 chr8 88507489 88628453 88624431,88508078 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MMP16 711264 4398 chr8 88671682 88733971 88672280,88698879 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MMP16 605746 4399 chr8 8958810 8961164 8960193 N NA NA ERI1,TNKS,LOC157273 IMR90 Hi-C 24141950 ERI1 98496 4400 chr8 89726005 89745534 89728247 N NA NA NA NA NA NA MMP16 386288 4401 chr8 89807863 89825541 89825378 N NA NA NA NA NA NA MMP16 468146 4402 chr8 89830583 89840704 89838438 N NA NA NA NA NA NA MMP16 490866 4403 chr8 89850919 89856542 89856191 N NA NA NA NA NA NA MMP16 511202 4404 chr8 90101052 90165307 90164063 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 604668 4405 chr8 90170629 90177711 90176099 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 592264 4406 chr8 90179935 90187821 90186196 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 582154 4407 chr8 90203728 90231485 90230680 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 538490 4408 chr8 90391968 90458110 90401665,90456000,90439629 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA RIPK2 311865 4409 chr8 90473109 90524966 90521621 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 245009 4410 chr8 90544765 90548681 90547387 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 221294 4411 chr8 90569303 90674056 90608918,90593680,90672098 N,N,N NA;NA;NA NA MMP16 IMR90 Hi-C 24141950 RIPK2 95919 4412 chr8 90688887 90712635 90698921,90710396 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RIPK2 57340 4413 chr8 91493926 91496990 91495267 N NA NA NA NA NA NA TMEM64 161143 4414 chr8 9239179 9241837 9240045 N NA NA TNKS IMR90 Hi-C 24141950 TNKS 171608 4415 chr8 9316155 9318019 9317513 N NA NA NA NA NA NA TNKS 95426 4416 chr8 94079415 94081811 94080781 N NA NA C8orf83 MCF7 ChIA-PET 22265404 C8orf83 101043 4417 chr8 95001873 95008352 95003891 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 72790 4418 chr8 95080036 95081376 95080242 N NA NA GEM,CDH17 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 150953 4419 chr8 98606924 98608269 98607330 N NA MTDH MATN2,MTDH,HRSP12,C8orf47,LAPTM4B,RPL30 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTDH 48138 4420 chr8 99367187 99371890 99371494 N NA NA POP1,STK3,VPS13B,NIPAL2,KCNS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NIPAL2 60566 4421 chr9 100562815 100569941 100565805 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 103124 4422 chr9 100805345 100811488 100807825 N NA NANS C9orf156,ANP32B K562 ChIA-PET 22265404 NANS 7471 4423 chr9 102017466 102024670 102021850 Y NA ALG2,SEC61B ALG2,SEC61B,NR4A3,LOC441461,STX17,ERP44,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC61B 32896 4424 chr9 103172402 103176359 103174091 Y NA NA C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 57143 4425 chr9 103187735 103201074 103189534 N NA NA C9orf30-TMEFF1,NR4A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 72476 4426 chr9 104969807 104972973 104971753 N NA NA NA NA NA NA RNF20 673674 4427 chr9 106373565 106375204 106374237 N NA NA NA NA NA NA NIPSNAP3A 1134765 4428 chr9 10666549 10667975 10667423 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 2582390 4429 chr9 107078927 107080216 107079822 N NA NA NA NA NA NA NIPSNAP3A 429753 4430 chr9 107728504 107737197 107730708,107734475 Y,N SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1;NA NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC286367 191871 4431 chr9 107744500 107747524 107746022 N NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC286367 207867 4432 chr9 107825061 107830301 107827413,107825211 N,N NA;NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 176628 4433 chr9 107845120 107846447 107846255 N NA NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 160482 4434 chr9 107886512 107890401 107889048 N NA NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 116528 4435 chr9 107914219 107919979 107917136,107919028 Y,N ABCA1;NA NA ABCA1,SLC44A1,FSD1L IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 86950 4436 chr9 10952090 10983352 10969708,10981158 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MPDZ 2267013 4437 chr9 110005342 110009235 110006255 N NA RAD23B RAD23B,ZNF462 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAD23B 36282 4438 chr9 110018160 110020909 110018364 N NA RAD23B ZNF462,RAD23B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAD23B 24608 4439 chr9 110148034 110168951 110149808 N NA NA NA NA NA NA RAD23B 102517 4440 chr9 110193405 110196535 110194999 N NA NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RAD23B 147888 4441 chr9 11029378 11067898 11064707 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 2182467 4442 chr9 110340375 110341463 110340926 N NA NA TMEM189-UBE2V1 MCF7 ChIA-PET 19890323 RAD23B 294858 4443 chr9 110643654 110644758 110643849 N NA NA NA NA NA NA RAD23B 598137 4444 chr9 110815410 110816975 110816031 N NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 769893 4445 chr9 111032958 111035669 111034442 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IKBKAP 660939 4446 chr9 112107586 112109132 112108088 N NA EPB41L4B C9orf5,EPB41L4B,PTPN3 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L4B 24565 4447 chr9 114596126 114615669 114596672 N NA UGCG UGCG,MIR3134,HSDL2,SUSD1,C9orf84 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 43537 4448 chr9 114637224 114643605 114637919 N NA UGCG UGCG,C9orf84,MIR3134,SUSD1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UGCG 15601 4449 chr9 117457455 117459284 117458176 N NA NA AKNA,LOC100505478,TNFSF15,DFNB31,TNFSF8,DEC1,TNC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 83749 4450 chr9 117606905 117609283 117607806 N NA TNFSF15 TNFSF15,TNFSF8,DFNB31,LOC100505478 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 38497 4451 chr9 117742444 117745168 117743598 N NA NA TNFSF8,TNFSF15,DFNB31,LOC100505478 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 174036 4452 chr9 118240736 118260013 118257775,118250316 N,N NA;NA NA TNC,DEC1,TNFSF15 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 672328 4453 chr9 118290028 118406766 118353977,118401645,118381995,118350490 Y,N,N,Y TNC;NA;NA;DEC1 NA TNC,DEC1,TNFSF8,DFNB31,AKNA,ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 721620 4454 chr9 118464987 118469761 118468170 N NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 896579 4455 chr9 118470840 118509863 118494733,118496684,118506398 N,N,N NA;NA;NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 902432 4456 chr9 11855431 11856533 11855968 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 1393832 4457 chr9 118620034 118622325 118620309 N NA NA NA NA NA NA ASTN2 827217 4458 chr9 11894364 11895899 11895216 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 1354466 4459 chr9 121656944 121658207 121657790 N NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 1684230 4460 chr9 122563890 122566190 122565011 N NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 776247 4461 chr9 122913261 122917083 122914821 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 425354 4462 chr9 12332550 12339929 12333988 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 910436 4463 chr9 12353227 12410156 12394767,12382217,12353970 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MPDZ 840209 4464 chr9 123829786 123839057 123833616,123837498 N,N NA;NA NA CNTRL,TRAF1,MEGF9,FBXW2,C5,RAB14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB14 125308 4465 chr9 124297961 124299949 124298675 N NA NA TTLL11,DAB2IP,GGTA1P IMR90 Hi-C 24141950 RAB14 333596 4466 chr9 12513430 12559809 12556952,12516450 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MPDZ 690556 4467 chr9 126982264 126984476 126983505 Y DENND1A NEK6 DENND1A,NEK6,PSMB7,LHX2,LOC100129034 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 35409 4468 chr9 129335175 129337007 129335455 N NA NA FAM125B,NRON,LMX1B IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB43 230278 4469 chr9 129552705 129555066 129553219 N NA ZBTB43 LMX1B,ZBTB43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBTB43 12219 4470 chr9 130365252 130372175 130371420 N NA STXBP1 AK1,STXBP1,LRSAM1,MIR3911,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,FAM129B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STXBP1 2311 4471 chr9 13069382 13072229 13070765 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 178136 4472 chr9 130747634 130752233 130748420 N NA DPM2,FAM102A FAM102A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM102A 4822 4473 chr9 130768172 130770648 130769164 N NA FAM102A FAM102A,SLC25A25,NAIF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM102A 25360 4474 chr9 132143239 132148296 132145407 N NA NA LOC100506190,C9orf50,METTL11A,C9orf106,SH3GLB2,PPP2R4,CRAT,IER5L,PTGES IMR90,K562,GM12878,HELA,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 C9orf106 59944 4475 chr9 132174137 132178486 132176099 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 72453 4476 chr9 132198027 132203099 132199512 N NA LOC100506190 C9orf50,PPP2R4,LOC100506190,IER5L,C9orf106,METTL11A,ASB6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 47840 4477 chr9 132219012 132226571 132220411,132223677 N,N NA;NA LOC100506190 PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 24368 4478 chr9 133880079 133882057 133880839 N NA NA LAMC3,AIF1L,FUBP3,ABL1,PRDM12,EXOSC2,FIBCD1,QRFP IMR90 Hi-C 24141950 NUP214 118924 4479 chr9 134236462 134259934 134248897,134258920,134251868 Y,N,N AIF1L,POMT1,PRRC2B;NA;NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,PPAPDC3,POMT1,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 45543 4480 chr9 134634984 134637500 134636081 N NA NA PRRC2B,POMT1,NTNG2,SETX,MED27 IMR90 Hi-C 24141950 UCK1 228322 4481 chr9 136099383 136100289 136099611 N NA NA NA NA NA NA RALGDS 74795 4482 chr9 137366573 137381115 137367399 Y COL5A1 NA COL5A1,RXRA,RNU6ATAC,WDR5 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 148257 4483 chr9 139014085 139024383 139022860,139021516 N,N NA;NA C9orf69 C9orf69 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 C9orf69 3354 4484 chr9 139158192 139163173 139159193 N NA QSOX2 QSOX2,LHX3,C9orf69 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 QSOX2 20505 4485 chr9 13984522 13988459 13985032 N NA NA C9orf146 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC21 705021 4486 chr9 14026055 14028375 14027361 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 665105 4487 chr9 14920351 14922834 14922520 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 226871 4488 chr9 15055237 15061568 15055939,15060618 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SNAPC3 361214 4489 chr9 15526702 15528907 15527384 N NA PSIP1 NA NA NA NA PSIP1 15699 4490 chr9 15545501 15548340 15546585 N NA PSIP1 SNAPC3,PSIP1,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 PSIP1 34498 4491 chr9 16985102 16986685 16985573 N NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 148353 4492 chr9 18392821 18394749 18393998 N NA NA ADAMTSL1,FAM154A IMR90 Hi-C 24141950 RRAGA 654623 4493 chr9 19139100 19141023 19139850 N NA HAUS6 HAUS6 IMR90 Hi-C 24141950 HAUS6 36198 4494 chr9 19203870 19276106 19230701,19234645,19205168,19219969,19217824 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA DENND4C DENND4C,HAUS6,PLIN2,RPS6 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4C 14643 4495 chr9 22154049 22156641 22155413 N NA NA CDKN2B-AS1,MTAP IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2A 159559 4496 chr9 2241513 2243933 2242041 Y NA NA FLJ35024,VLDLR,KIAA0020,SMARCA2 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA2 226171 4497 chr9 22507983 22572791 22509232 N NA NA NA NA NA NA CDKN2A 513493 4498 chr9 2291148 2293665 2292506 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 275806 4499 chr9 2297247 2300533 2298803 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 281905 4500 chr9 23572504 23600724 23597694,23598939 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CDKN2A 1578014 4501 chr9 23662133 23664670 23664505 N NA NA NA NA NA NA CDKN2A 1667643 4502 chr9 2421273 2492425 2443326,2478000,2484915,2452979,2491748 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA FLJ35024,VLDLR,KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 129368 4503 chr9 24380021 24382697 24381454 N NA NA NA NA NA NA CDKN2A 2385531 4504 chr9 24634509 24638046 24634899 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 2254780 4505 chr9 26327566 26332113 26330183 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 560713 4506 chr9 26680093 26685527 26682193 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 207299 4507 chr9 26800785 26803200 26801951 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 89626 4508 chr9 27675338 27694843 27690407 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 101474 4509 chr9 2899927 2900826 2900719 N NA NA NA NA NA NA KIAA0020 55797 4510 chr9 29187651 29190176 29188059 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 1613787 4511 chr9 29356819 29359146 29357469 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 1782955 4512 chr9 31570786 31572568 31571333 N NA NA NA NA NA NA ACO1 812033 4513 chr9 31847115 32069129 31848655 N NA NA NA NA NA NA ACO1 315472 4514 chr9 32155155 32190855 32155718 N NA NA NA NA NA NA ACO1 193746 4515 chr9 32691681 32695370 32694840 N NA NA NA NA NA NA NDUFB6 118499 4516 chr9 33414368 33417297 33415781 N NA AQP3 NFX1,AQP7,AQP3,NOL6,CHMP5,BAG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AQP3 30334 4517 chr9 34156557 34174055 34171236,34168353,34159532 N,N,N NA;NA;NA DCAF12,UBAP1 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2,SNORD121B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 4948 4518 chr9 36544638 36547067 36546602 N NA NA RNF38 IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 143443 4519 chr9 38123153 38124725 38123998 N NA NA SHB IMR90 Hi-C 24141950 SHB 53943 4520 chr9 38242508 38244153 38243830 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 148508 4521 chr9 38436592 38440136 38437643 Y NA ALDH1B1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 43931 4522 chr9 38473305 38475391 38474754 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 80644 4523 chr9 38671784 38673590 38672506 N NA NA NA NA NA NA FAM201A 50699 4524 chr9 38686681 38689548 38687448 N NA NA NA NA NA NA FAM201A 65596 4525 chr9 38978732 38980538 38979130 N NA NA NA NA NA NA FAM201A 357647 4526 chr9 42180289 42265813 42251674,42256461 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MGC21881 225213 4527 chr9 42286982 42294425 42292015 N NA NA NA NA NA NA MGC21881 331906 4528 chr9 44004911 44006343 44005713 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 983893 4529 chr9 44058224 44071855 44070743 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 918381 4530 chr9 44116585 44128704 44127816,44118848 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27C 861532 4531 chr9 44174309 44177813 44177169 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 812423 4532 chr9 44238795 44292085 44245763 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 698151 4533 chr9 44875064 44881558 44875753,44879137 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27C 108678 4534 chr9 45350090 45361258 45358939,45357071,45353697 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM27C 359854 4535 chr9 45422545 45552475 45437307,45441889,45435356 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM27A 174554 4536 chr9 45652756 45671294 45670120 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 55735 4537 chr9 45952163 45973417 45952506 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 225134 4538 chr9 46040356 46058176 46056296 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 313327 4539 chr9 46111138 46197611 46116526,46118084,46113135 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM27A 384109 4540 chr9 46383273 46396680 46387822,46391174,46386247 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA KGFLP1 290886 4541 chr9 5491850 5496849 5494815 N NA CD274 NA NA NA NA CD274 41347 4542 chr9 5851292 5855521 5854641 N NA ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 18211 4543 chr9 6037457 6039165 6037979 N NA KIAA2026,RANBP6 NA NA NA NA RANBP6 21817 4544 chr9 6078366 6081398 6080380 N NA NA NA NA NA NA RANBP6 62726 4545 chr9 65576048 65580769 65576920 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 2213420 4546 chr9 65808379 65809621 65808526 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 1984568 4547 chr9 66390842 66394879 66391656 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 1399310 4548 chr9 66454568 66490615 66464328 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 FAM27B 1303574 4549 chr9 66761814 66770304 66768847 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 1023885 4550 chr9 6678757 6701465 6680836 N NA NA KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KDM4C 56176 4551 chr9 66913231 66922131 66920683 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 872058 4552 chr9 66956268 66970300 66965451,66958131 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27B 823889 4553 chr9 66970842 66974755 66971128,66973810 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27B 819434 4554 chr9 6702029 6713339 6703405 N NA KDM4C KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 44302 4555 chr9 67309193 67329088 67320760,67311781,67322874,67325459 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM27B 465101 4556 chr9 67331188 67343391 67340188 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 450798 4557 chr9 67641097 67642609 67641487 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 151580 4558 chr9 67916842 67924183 67918962 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 122653 4559 chr9 68228528 68319659 68299918,68302405,68304335,68305982,68277336 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 134716 4560 chr9 68355823 68370380 68365056 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 83995 4561 chr9 68375380 68392322 68377425,68391470 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 62053 4562 chr9 68484477 68510009 68496152,68487841 N,N NA;NA LOC642236 NA NA NA NA LOC642236 30102 4563 chr9 68511779 68514302 68513012 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 57404 4564 chr9 68664061 68666173 68665111 N NA NA NA NA NA NA LOC100132352 60368 4565 chr9 68782806 68790858 68783452 N NA NA NA NA NA NA LOC100132352 56265 4566 chr9 69010170 69036481 69025013,69033830 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 165723 4567 chr9 69461406 69470473 69462158 N NA NA NA NA NA NA CBWD6 198813 4568 chr9 69689336 69718047 69711147,69691790,69716292 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CBWD6 426743 4569 chr9 69722159 69763791 69759828,69724277 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L5 415024 4570 chr9 69787159 69848731 69788377,69821849,69791667 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L5 330084 4571 chr9 69914146 69916404 69915274 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L5 262411 4572 chr9 70060539 70093304 70074297,70090077,70081376 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L5 85511 4573 chr9 70205512 70212072 70211404 N NA FOXD4L5 NA NA NA NA FOXD4L5 26697 4574 chr9 70326628 70344012 70340981,70340787,70332179 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L2 85719 4575 chr9 70582380 70664451 70598928,70621245,70646347,70649527,70652860 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CBWD3 92203 4576 chr9 70683037 70689693 70687446 N NA NA NA NA NA NA CBWD3 167146 4577 chr9 73075889 73077246 73076364 N NA NA TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 202011 4578 chr9 73088775 73098186 73095628 N NA NA TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMC5 214897 4579 chr9 76811991 76813723 76812693 N NA NA NA NA NA NA C9orf40 754079 4580 chr9 77038841 77045321 77039492 N NA NA NA NA NA NA C9orf40 522481 4581 chr9 77844169 77846924 77844941 Y NA NA NA NA NA NA OSTF1 140771 4582 chr9 77939043 77942312 77939552 N NA NA NA NA NA NA OSTF1 235645 4583 chr9 79764143 79767221 79765141 N NA VPS13A NA NA NA NA VPS13A 25140 4584 chr9 8006583 8008007 8007164 N NA NA NA NA NA NA C9orf123 206784 4585 chr9 80993982 80995281 80994323 N NA NA NA NA NA NA PSAT1 81923 4586 chr9 81498322 81498769 81498461 N NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 586263 4587 chr9 81711325 81723571 81712836 N NA NA NA NA NA NA PSAT1 799266 4588 chr9 82103501 82105966 82104519 N NA NA TLE4 MCF7 ChIA-PET 22265404 PSAT1 1191442 4589 chr9 83468997 83471722 83470396 N NA NA TLE1 IMR90 Hi-C 24141950 TLE1 831874 4590 chr9 84327291 84327974 84327817 N NA TLE1 TLE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TLE1 23695 4591 chr9 84331125 84334876 84332783 N NA TLE1 TLE1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TLE1 27529 4592 chr9 84339130 84342252 84340276 N NA TLE1 NA NA NA NA TLE1 35534 4593 chr9 84635398 84637725 84636340 N NA NA NA NA NA NA TLE1 331802 4594 chr9 84946218 84948218 84947247 N NA NA NA NA NA NA TLE1 642622 4595 chr9 85532455 85536211 85534839 N NA NA RASEF IMR90 Hi-C 24141950 RASEF 141832 4596 chr9 85743520 85828467 85747846,85813891,85765997,85753469,85757104,85828000,85781421 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA RASEF,FRMD3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RASEF 65477 4597 chr9 86675724 86678221 86676780 N NA NA NA NA NA NA RMI1 80087 4598 chr9 87664500 87665620 87664670 N NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 691324 4599 chr9 88015906 88018323 88017215 N NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 338621 4600 chr9 88387775 88395087 88388507 N NA AGTPBP1,LOC389765 NA NA NA NA LOC389765 25830 4601 chr9 88741222 88744388 88742477 N NA NA C9orf153,GOLM1,ISCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ISCA1 153102 4602 chr9 89018364 89022261 89020791 N NA ZCCHC6 GAS1,DAPK1,ZCCHC6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC6 48962 4603 chr9 89037534 89038838 89037897 N NA NA GAS1,DAPK1,LOC440173,C9orf170,LOC494127 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 68132 4604 chr9 89297895 89300390 89299426 N NA NA GAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 328493 4605 chr9 90009863 90012778 90011224 N NA NA LOC440173,DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSL1 328196 4606 chr9 90858524 90861026 90859113 N NA NA NXNL2 IMR90 Hi-C 24141950 SPIN1 142271 4607 chr9 91132500 91147166 91135045,91145906 N,N NA;NA NXNL2 SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2,CDK20,NXNL2,S1PR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NXNL2 2850 4608 chr9 91219356 91222279 91220507 N NA NA SHC3,MIR4289,LOC286238,S1PR3 IMR90 Hi-C 24141950 NXNL2 69340 4609 chr9 91229740 91232921 91230615 N NA NA SHC3,S1PR3,SPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 NXNL2 79724 4610 chr9 91389567 91391493 91390344 N NA NA SHC3,MIR4289,LOC286238,S1PR3,NXNL2,CKS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S1PR3 214869 4611 chr9 91415555 91417941 91416616 N NA NA LOC286238,MIR4289,S1PR3 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 188421 4612 chr9 91546605 91549938 91547867 N NA NA LOC286238,S1PR3,SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 56424 4613 chr9 91582164 91584168 91583282 N NA S1PR3 LOC286238,MIR4289,NXNL2,S1PR3,SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 22194 4614 chr9 91860613 91863865 91863032 N NA NA SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 62248 4615 chr9 92687232 92689937 92688952 N NA NA GADD45G,SYK MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GADD45G 467305 4616 chr9 92806167 92808408 92807112 N NA NA NA NA NA NA GADD45G 586240 4617 chr9 92825826 92828272 92826673 N NA NA NA NA NA NA GADD45G 605899 4618 chr9 92995722 92997823 92996119 N NA NA NA NA NA NA GADD45G 775795 4619 chr9 93124410 93125081 93124977 N NA NA NA NA NA NA GADD45G 904483 4620 chr9 93798984 93801247 93800115 N NA NA NFIL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 AUH 322959 4621 chr9 95650704 95658598 95654672,95650993 N,N NA;NA ZNF484 NA NA NA NA ZNF484 10414 4622 chr9 96781098 96789118 96782780 N NA PTPDC1 LOC158257,PTPDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPDC1 3958 4623 chr9 98533894 98536756 98534984 N NA NA LOC158435,C9orf102,FANCC,LINC00476,LINC00092,PTCH1,LOC158434,HSD17B3 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf102 101144 4624 chr9 99468871 99470648 99469193 N NA NA BDAG1,HSD17B3 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf21 51272 4625 chr9 99890892 99893605 99892130 N NA NA NA NA NA NA HIATL2 115030 4626 chr9 99956658 99962735 99962310 N NA NA NA NA NA NA HIATL2 180796 4627 chr9 99982370 99985664 99983716 N NA NA NA NA NA NA HIATL2 206508 4628 chrM 5978 16571 14032 N NA NA NA NA NA NA NA -1 4629 chrX 102657369 102689289 102659727 N NA WBP5,NGFRAP1 NGFRAP1,WBP5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NGFRAP1 26101 4630 chrX 103014643 103016262 103015290 N NA NA GLRA4 IMR90 Hi-C 24141950 MORF4L2 71557 4631 chrX 105040055 105042136 105041016 N NA NA NA NA NA NA TBC1D8B 1003783 4632 chrX 106593704 106595113 106594079 N NA NA NA NA NA NA RBM41 231647 4633 chrX 106688138 106762372 106692839 N NA NA PRPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PRPS1 109282 4634 chrX 106853671 106857685 106854917 N NA PRPS1 PRPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PRPS1 13969 4635 chrX 10912073 10920829 10918605 N NA NA NA NA NA NA MID1 60264 4636 chrX 109241932 109242786 109242352 N NA TMEM164 TMEM164 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM164 3077 4637 chrX 10991653 10994982 10993676 N NA NA NA NA NA NA HCCS 134424 4638 chrX 11020304 11043471 11036078 N NA NA CLCN4 IMR90 Hi-C 24141950 HCCS 85935 4639 chrX 11079108 11084393 11083834 N NA HCCS MID1 IMR90 Hi-C 24141950 HCCS 45013 4640 chrX 110860284 110863776 110861083 N NA NA NA NA NA NA ALG13 60570 4641 chrX 111793627 111795225 111794166 N NA NA NA NA NA NA ALG13 869281 4642 chrX 113035789 113040180 113037437 N NA NA NA NA NA NA ALG13 2111443 4643 chrX 113288785 113291824 113289645 N NA NA NA NA NA NA ALG13 2364439 4644 chrX 114958707 115012111 114982508,115005902 N,N NA;NA NA NA NA NA NA WDR44 2467925 4645 chrX 115050412 115059228 115057321 N NA NA NA NA NA NA WDR44 2420808 4646 chrX 115065737 115067435 115066982 N NA NA NA NA NA NA WDR44 2412601 4647 chrX 115370752 115372987 115371623 Y NA NA SLC6A14 MCF7 ChIA-PET 22265404 WDR44 2107049 4648 chrX 115561252 115562033 115561402 N NA NA NA NA NA NA WDR44 1918003 4649 chrX 115984307 115986331 115984695 N NA NA NA NA NA NA WDR44 1493705 4650 chrX 116628374 116630308 116628653 N NA NA NA NA NA NA WDR44 849728 4651 chrX 118009405 118010473 118010028 N NA NA NA NA NA NA PGRMC1 359738 4652 chrX 118847469 118848284 118848095 N NA NA SEPT6,SOWAHD IMR90 Hi-C 24141950 RPL39 77322 4653 chrX 119112148 119133464 119132562,119118392 N,N NA;NA NKAP NKAP IMR90 Hi-C 24141950 NKAP 34413 4654 chrX 11953024 11960030 11953397 N NA NA NA NA NA NA MSL3 176746 4655 chrX 119618431 119622799 119619909 N NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 15227 4656 chrX 119924403 119950765 119925002 N NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 160398 4657 chrX 120616436 120638729 120616635 N NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 852431 4658 chrX 121003533 121005418 121005149 N NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 1239528 4659 chrX 121404612 121408635 121405978,121405930 N,N NA;NA NA NA NA NA NA THOC2 1458269 4660 chrX 121439217 121440792 121439876 N NA NA NA NA NA NA THOC2 1426112 4661 chrX 121508185 121510019 121509975 N NA NA NA NA NA NA THOC2 1356885 4662 chrX 122113176 122142127 122138718 N NA NA NA NA NA NA THOC2 724777 4663 chrX 122182944 122185598 122184313 N NA NA NA NA NA NA THOC2 681306 4664 chrX 122897543 122904337 122899065 Y NA THOC2 STAG2,THOC2,XIAP K562,HELA,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 THOC2 30639 4665 chrX 122935529 122941678 122937057 N NA NA STAG2 K562 5C 22955621 XIAP 51984 4666 chrX 122953702 122955503 122954156 N NA XIAP THOC2,XIAP,STAG2 HELA,H1ESC,K562 5C 22955621 XIAP 38159 4667 chrX 124289238 124342827 124338498,124294146 N,N NA;NA NA NA NA NA NA STAG2 1194763 4668 chrX 1245780 1247669 1246661 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 263370 4669 chrX 125069443 125071647 125070007 N NA NA NA NA NA NA STAG2 1974968 4670 chrX 125605598 125607813 125606223 N NA NA NA NA NA NA STAG2 2511123 4671 chrX 125714906 125715405 125715305 N NA NA NA NA NA NA STAG2 2620431 4672 chrX 126057206 126062459 126058094 N NA NA NA NA NA NA OCRL 2611793 4673 chrX 126537335 126539756 126538585 N NA NA NA NA NA NA OCRL 2134496 4674 chrX 126728152 126728870 126728731 N NA NA NA NA NA NA OCRL 1945382 4675 chrX 127277921 127281284 127279335 N NA NA NA NA NA NA OCRL 1392968 4676 chrX 128983485 128994375 128985254 N NA ZDHHC9,UTP14A SASH3,ZDHHC9,APLN,BCORL1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC9 5575 4677 chrX 129033699 129035232 129034373 N NA UTP14A NA NA NA NA UTP14A 4865 4678 chrX 129726799 129729991 129728658 N NA NA NA NA NA NA FAM45B 97884 4679 chrX 130092660 130095781 130093132 N NA NA NA NA NA NA FAM45B 463745 4680 chrX 130457102 130495728 130495319 N NA NA NA NA NA NA MST4 661517 4681 chrX 130599315 130631761 130604986,130620208,130630249 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MST4 525484 4682 chrX 133194472 133196739 133195419 N NA NA NA NA NA NA PHF6 310603 4683 chrX 134200003 134201580 134200543 N NA FAM127A,FAM127B,LINC00087 NA NA NA NA FAM127B 13782 4684 chrX 134339693 134341828 134340777 N NA NA NA NA NA NA ZNF75D 88137 4685 chrX 134346973 134350718 134349206 N NA NA NA NA NA NA ZNF75D 79247 4686 chrX 134389611 134392125 134391778 N NA ZNF75D NA NA NA NA ZNF75D 37840 4687 chrX 13449599 13450922 13450200 N NA NA NA NA NA NA TCEANC 220385 4688 chrX 134539972 134541131 134540515 N NA NA NA NA NA NA ZNF449 61276 4689 chrX 13580300 13583678 13582562 N NA NA NA NA NA NA TCEANC 87629 4690 chrX 136520157 136521084 136520602 N NA NA NA NA NA NA RBMX 557218 4691 chrX 140212063 140212441 140212323 N NA NA NA NA NA NA LDOC1 58869 4692 chrX 140231027 140233489 140233019 N NA LDOC1 NA NA NA NA LDOC1 37821 4693 chrX 140904025 140905525 140904184 N NA NA NA NA NA NA LDOC1 632715 4694 chrX 141064515 141067201 141064673 N NA NA NA NA NA NA LDOC1 793205 4695 chrX 141267496 141268039 141268023 N NA NA NA NA NA NA LDOC1 996186 4696 chrX 141851895 141856094 141852498 N NA NA NA NA NA NA LDOC1 1580585 4697 chrX 144517298 144520048 144519652 N NA NA NA NA NA NA FMR1 2473421 4698 chrX 144712166 144714653 144713989 N NA NA NA NA NA NA FMR1 2278816 4699 chrX 144733 154932 148737 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 1356107 4700 chrX 145694727 145698228 145697057 N NA NA NA NA NA NA FMR1 1295241 4701 chrX 146433766 146435818 146434370 N NA NA NA NA NA NA FMR1 557651 4702 chrX 147133414 147134541 147134082 N NA NA NA NA NA NA FMR1 139945 4703 chrX 147546084 147547510 147546798 N NA NA NA NA NA NA FMR1 552615 4704 chrX 14827114 14830668 14827548 N NA NA NA NA NA NA MOSPD2 60859 4705 chrX 148958869 148964983 148962457 N NA NA NSMCE2 MCF7 ChIA-PET 19890323 CXorf40B 141733 4706 chrX 150090204 150091830 150090901 N NA CD99L2 CD99L2 IMR90 Hi-C 24141950 CD99L2 22915 4707 chrX 151659119 151676286 151670066,151674324 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAGEA6 190959 4708 chrX 151755536 151781562 151774290 N NA NA NA NA NA NA MAGEA6 85683 4709 chrX 152334379 152350639 152341127 N NA NA NA NA NA NA ZNF275 248974 4710 chrX 154648469 154653050 154652003 N NA F8A1,LOC100507404 NA NA NA NA F8A1 35226 4711 chrX 154657329 154660919 154659484 N NA F8A1,LOC100507404 NA NA NA NA F8A1 27357 4712 chrX 155200909 155203149 155201977 N NA NA NA NA NA NA LOC100507404 504708 4713 chrX 16898781 16902696 16901185 N NA RBBP7 RBBP7,TXLNG K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBBP7 10247 4714 chrX 16909134 16910657 16909542 N NA RBBP7 TXLNG,REPS2,RBBP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBBP7 20600 4715 chrX 17357888 17368321 17360736,17366377 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SCML1 387271 4716 chrX 18121785 18124318 18122605 N NA NA NA NA NA NA SCML1 366193 4717 chrX 18875101 18876543 18875431 N NA NA NA NA NA NA PHKA2 125937 4718 chrX 19150383 19151322 19150849 N NA NA NA NA NA NA PHKA2 147903 4719 chrX 1964481 1966941 1964760 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 445057 4720 chrX 21791950 21794493 21793081 N NA NA NA NA NA NA MBTPS2 63163 4721 chrX 22317300 22319726 22318955 N NA NA NA NA NA NA SMS 358585 4722 chrX 22694877 22700817 22695681 N NA NA NA NA NA NA SMS 736162 4723 chrX 22967730 22970482 22969679 N NA NA NA NA NA NA PRDX4 715163 4724 chrX 23677694 23679013 23678554 N NA PRDX4 PRDX4 IMR90 Hi-C 24141950 PRDX4 6632 4725 chrX 23791163 23793762 23792226 N NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 7513 4726 chrX 24121267 24134307 24121905 N NA EIF2S3,ZFX NA NA NA NA ZFX 33455 4727 chrX 24279830 24281432 24280318 N NA NA FAM48B2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFX 112068 4728 chrX 25735812 25740059 25737296 N NA NA NA NA NA NA POLA1 1023748 4729 chrX 26542867 26544831 26544164 N NA NA NA NA NA NA POLA1 1830803 4730 chrX 26766791 26767875 26767789 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1837806 4731 chrX 27039850 27042625 27041142 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1563056 4732 chrX 27051992 27150222 27071693,27127102,27148305,27145564 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1455459 4733 chrX 27216177 27244566 27242711 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1361115 4734 chrX 27340923 27395229 27393862 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1210452 4735 chrX 27420454 27422049 27421822 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1183632 4736 chrX 27532751 27538005 27536026,27532765 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1067676 4737 chrX 30036162 30040169 30037313 N NA NA NA NA NA NA TAB3 867342 4738 chrX 3279466 3280876 3279809 N NA NA NA NA NA NA PRKX 350799 4739 chrX 35517213 35518254 35517771 N NA NA NA NA NA NA PRRG1 1690274 4740 chrX 36551833 36554399 36553035 N NA NA NA NA NA NA PRRG1 654129 4741 chrX 36761399 36765599 36762763 N NA NA NA NA NA NA PRRG1 442929 4742 chrX 36977210 36998345 36989082,36980362 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PRRG1 210183 4743 chrX 37338064 37348957 37343269,37339074 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PRRG1 129536 4744 chrX 3785784 3855528 3824363,3824471,3799092,3794798,3854271,3837899,3833226 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA LOC389906 NA NA NA NA LOC389906 23849 4745 chrX 39134518 39140855 39138021 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 473833 4746 chrX 39546462 39550376 39548181 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 885777 4747 chrX 39594444 39596618 39595697 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 ATP6AP2 843598 4748 chrX 39811917 39814866 39813333 N NA NA BCOR MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP6AP2 625350 4749 chrX 39865764 39877003 39873425 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ATP6AP2 563213 4750 chrX 40326833 40329232 40327615 N NA NA NA NA NA NA ATP6AP2 110984 4751 chrX 40749667 40750833 40750805 N NA NA USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 154863 4752 chrX 40785007 40786614 40785999 N NA NA MED14,USP9X IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 158274 4753 chrX 40793583 40795957 40794386 N NA NA USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 148931 4754 chrX 42033409 42033682 42033632 N NA NA NA NA NA NA CASK 251122 4755 chrX 42143830 42145969 42144257 N NA NA NA NA NA NA CASK 361543 4756 chrX 42691465 42694780 42692962 N NA NA NA NA NA NA MAOA 820629 4757 chrX 43416762 43421254 43419859 N NA NA NA NA NA NA MAOA 94155 4758 chrX 43423244 43426472 43425014 N NA NA NA NA NA NA MAOA 88937 4759 chrX 43478140 43485194 43480076 N NA MAOA NA NA NA NA MAOA 30215 4760 chrX 43766829 43773107 43768742 N NA NA MAOB IMR90 Hi-C 24141950 MAOA 251420 4761 chrX 43882408 43885344 43883969 N NA NA NA NA NA NA MAOA 366999 4762 chrX 43919538 43922591 43921418 N NA NA NA NA NA NA MAOA 404129 4763 chrX 43981340 43983296 43982417 N NA NA NA NA NA NA MAOA 465931 4764 chrX 44305859 44309258 44306636 N NA NA NA NA NA NA KDM6A 423165 4765 chrX 44310023 44310307 44310163 N NA NA NA NA NA NA KDM6A 422116 4766 chrX 44335074 44337022 44335689 N NA NA NA NA NA NA KDM6A 395401 4767 chrX 44501894 44504889 44503372 N NA NA NA NA NA NA KDM6A 227534 4768 chrX 44543417 44592044 44560849,44557365,44546678 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA KDM6A 140379 4769 chrX 44653390 44654602 44654097 N NA NA NA NA NA NA KDM6A 77821 4770 chrX 45153368 45197682 45155673,45159425,45163825,45192532,45166330 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 KDM6A 420945 4771 chrX 45364564 45367505 45366130 N NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 KDM6A 632141 4772 chrX 45887504 45890421 45889214 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 416203 4773 chrX 45901198 45905819 45902785 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 400805 4774 chrX 46034259 46037432 46034532 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 269192 4775 chrX 46097439 46100795 46098461 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 205829 4776 chrX 46236617 46237889 46236991 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 68735 4777 chrX 46298515 46300189 46299157 N NA ZNF673 NA NA NA NA ZNF673 6435 4778 chrX 46650323 46653249 46652106 Y ZNF674,CHST7,RP2 SLC9A7,RP2 RP2,CXorf31,PHF16,SLC9A7,CHST7,ZNF674,LOC401588 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A7 31851 4779 chrX 47219896 47225397 47221403 N NA NA USP11,ZNF157,UBA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF41 116948 4780 chrX 4728454 4730052 4728609 N NA NA NA NA NA NA LOC389906 966519 4781 chrX 47661272 47669115 47662388 N NA ZNF81 ZNF81 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF81 27186 4782 chrX 48091587 48094467 48091892 N NA NA NA NA NA NA ZNF182 228193 4783 chrX 48527602 48530745 48529469 N NA NA NA NA NA NA WDR13 71722 4784 chrX 48995154 49010032 49009208 N NA WDR45,PLP2,PRICKLE3 MAGIX,PLP2,GPKOW IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 18152 4785 chrX 49395977 49398882 49397117 N NA NA NA NA NA NA LOC158572 245077 4786 chrX 49968053 49974026 49969269 N NA NA NA NA NA NA CLCN5 280828 4787 chrX 51999496 52007747 52005017 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 453341 4788 chrX 53193219 53199008 53194549 N NA NA KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 KDM5C 55596 4789 chrX 53798316 53800125 53798567 N NA NA NA NA NA NA HUWE1 84643 4790 chrX 5394486 5399499 5398717 N NA NA NA NA NA NA LOC389906 1632551 4791 chrX 54663611 54671764 54665870 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 106967 4792 chrX 55815990 55817570 55816389 N NA NA NA NA NA NA RRAGB 71880 4793 chrX 56024333 56025450 56025274 N NA NA NA NA NA NA RRAGB 280223 4794 chrX 56133157 56163346 56140021,56134247 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RRAGB 389047 4795 chrX 56210271 56216344 56211516 N NA NA NA NA NA NA UBQLN2 373682 4796 chrX 57699582 57701474 57700600 N NA NA NA NA NA NA ZXDB 81313 4797 chrX 57963556 57964647 57964458 N NA ZXDA NA NA NA NA ZXDA 26489 4798 chrX 58159553 58162330 58159692 N NA NA NA NA NA NA ZXDA 222486 4799 chrX 59973 76423 69353 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 1434616 4800 chrX 61681992 61741131 61725806,61688851,61684624,61736159 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA SPIN4 830087 4801 chrX 61842476 61850199 61848336 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 721019 4802 chrX 61862317 61872457 61871339 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 698761 4803 chrX 61961786 61963885 61962399 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 607333 4804 chrX 62511205 62519563 62517610 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 51655 4805 chrX 63342711 63358287 63351778 N NA NA NA NA NA NA FAM123B 67337 4806 chrX 64334664 64430584 64334951,64408272 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZC4H2 80040 4807 chrX 65292189 65294914 65293662 N NA NA NA NA NA NA LAS1L 537503 4808 chrX 65516869 65518650 65517256 N NA NA NA NA NA NA LAS1L 762183 4809 chrX 66062562 66065837 66064953 N NA NA NA NA NA NA AR 698037 4810 chrX 66118346 66123685 66119895,66122142 N,N NA;NA NA NA NA NA NA AR 640189 4811 chrX 66124545 66128961 66126401 N NA NA NA NA NA NA AR 634913 4812 chrX 66162213 66167227 66163017 N NA NA NA NA NA NA AR 596647 4813 chrX 66262460 66266242 66264268 N NA NA NA NA NA NA AR 497632 4814 chrX 66641904 66647759 66642533 N NA NA NA NA NA NA AR 116115 4815 chrX 66742328 66745186 66744531 N NA AR NA NA NA NA AR 18688 4816 chrX 67007507 67011877 67009423 N NA NA NA NA NA NA AR 243633 4817 chrX 67161617 67163427 67162342 N NA NA NA NA NA NA AR 397743 4818 chrX 68489644 68491474 68490226 N NA NA NA NA NA NA PJA1 104279 4819 chrX 68658322 68660480 68659585 N NA NA NA NA NA NA EDA 175431 4820 chrX 68667801 68670245 68668326 N NA NA NA NA NA NA EDA 165666 4821 chrX 6868641 6893854 6889065 N NA NA NA NA NA NA HDHD1 172377 4822 chrX 69341828 69342889 69342221 N NA IGBP1 NA NA NA NA IGBP1 10429 4823 chrX 70227121 70229613 70228410 N NA NA NA NA NA NA MED12 108793 4824 chrX 743615 745449 744262 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 765590 4825 chrX 74965787 74968084 74967032 N NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 2873 4826 chrX 7504917 7512535 7505695 N NA NA NA NA NA NA PNPLA4 383245 4827 chrX 7525412 7531172 7526156 N NA NA NA NA NA NA PNPLA4 364608 4828 chrX 75363358 75371648 75365125,75369808 N,N NA;NA CXorf26 NA NA NA NA CXorf26 21123 4829 chrX 75769417 75771130 75770106 N NA NA NA NA NA NA MAGEE1 121371 4830 chrX 76286408 76287223 76286951 N NA NA NA NA NA NA MAGEE1 638362 4831 chrX 79180108 79183914 79182418 N NA NA NA NA NA NA BRWD3 881319 4832 chrX 79784740 79786468 79785976 N NA NA NA NA NA NA BRWD3 278765 4833 chrX 79845150 79848397 79846731,79847394,79845975 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA BRWD3 216836 4834 chrX 80184491 80186951 80186083 N NA NA NA NA NA NA BRWD3 119258 4835 chrX 80221438 80222796 80221884 N NA NA NA NA NA NA BRWD3 156205 4836 chrX 80262656 80264076 80263280 N NA NA NA NA NA NA SH3BGRL 193227 4837 chrX 80937341 80938134 80937727 N NA NA NA NA NA NA SH3BGRL 480038 4838 chrX 81751736 81754280 81752738 N NA NA NA NA NA NA SH3BGRL 1294433 4839 chrX 82796722 82804436 82797717 N NA NA NA NA NA NA RPS6KA6 638507 4840 chrX 84063473 84068155 84064090 N NA NA NA NA NA NA APOOL 190743 4841 chrX 84977718 84979506 84977980 N NA NA NA NA NA NA CHM 323060 4842 chrX 86141269 86155445 86143007 N NA NA NA NA NA NA CHM 838703 4843 chrX 86404653 86406822 86405899 N NA NA NA NA NA NA CHM 1102087 4844 chrX 864138 866799 864722 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 644240 4845 chrX 86559164 86560045 86559431 N NA NA NA NA NA NA CHM 1256598 4846 chrX 87075290 87077437 87075810 N NA NA NA NA NA NA CHM 1772724 4847 chrX 88335083 88336151 88335751 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 2353446 4848 chrX 8904395 8906000 8904679 N NA NA NA NA NA NA TBL1X 525335 4849 chrX 89146663 89148848 89147661 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 1540749 4850 chrX 89832681 89836081 89834100 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 853516 4851 chrX 89906955 89910821 89908357 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 778776 4852 chrX 90108926 90111183 90110153 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 578414 4853 chrX 90352125 90354208 90353230 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 335389 4854 chrX 90799858 90809070 90808906 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 110261 4855 chrX 90904222 90933134 90929084 N NA NA NA NA NA NA PCDH11X 156525 4856 chrX 91006015 91052342 91007999,91034252 N,N NA;NA PCDH11X NA NA NA NA PCDH11X 37317 4857 chrX 9318967 9320890 9319921 N NA NA TBL1X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1X 110445 4858 chrX 94115811 94118496 94117522 N NA NA NA NA NA NA FAM133A 1186799 4859 chrX 949510 954029 950816 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 557010 4860 chrX 95312652 95320074 95312828 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 619588 4861 chrX 97142570 97143142 97142871 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 1202908 4862 chrX 99410386 99418430 99411614 N NA NA NA NA NA NA CSTF2 656918 4863 chrX 99999720 100001719 100000365 N NA NA SYTL4,SRPX2 IMR90 Hi-C 24141950 CSTF2 73629 4864 chrY 10011920 10015786 10014119 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2869907 4865 chrY 10037652 10038611 10037870 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2895639 4866 chrY 10082129 10084186 10083684 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2940116 4867 chrY 10090490 10095648 10091778 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2948477 4868 chrY 1052704 1053624 1052997 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 407415 4869 chrY 1195858 1197692 1196794 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 263347 4870 chrY 13240023 13299726 13252400,13257428 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TTTY15 1474572 4871 chrY 13306536 13374577 13351254,13323452 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TTTY15 1399721 4872 chrY 13459150 13490225 13461475,13470621,13490110 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TTTY15 1284073 4873 chrY 14574328 14576064 14575250 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 198234 4874 chrY 15084034 15084562 15084499 N NA NA NA NA NA NA USP9Y 270874 4875 chrY 15215188 15217271 15216322 N NA NA NA NA NA NA USP9Y 402028 4876 chrY 16148377 16148916 16148543 N NA NA NA NA NA NA USP9Y 1335217 4877 chrY 16321632 16321946 16321749 N NA NA NA NA NA NA USP9Y 1508472 4878 chrY 1658811 1662252 1660434 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 189387 4879 chrY 17563807 17575859 17567974,17575743 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA USP9Y 2750647 4880 chrY 17837 26792 19264 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 1434247 4881 chrY 17903449 17904221 17904102 N NA NA NA NA NA NA USP9Y 3090289 4882 chrY 18270896 18271170 18271053 N NA NA NA NA NA NA USP9Y 3457736 4883 chrY 18563829 18566109 18564394 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 3163135 4884 chrY 19182841 19184733 19183693 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 2544511 4885 chrY 19515400 19518412 19517039 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 2210832 4886 chrY 20041449 20043771 20042653 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 1685473 4887 chrY 20195059 20198567 20196432 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 1530677 4888 chrY 20247282 20249801 20248607 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 1479443 4889 chrY 20626222 20630057 20627483 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 1099187 4890 chrY 20796828 20801634 20798494 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 927610 4891 chrY 20837875 20841806 20839591 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 887438 4892 chrY 20843035 20848869 20845685,20848507 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 880375 4893 chrY 20938069 20940970 20938876 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 788274 4894 chrY 21438148 21438939 21438755 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 290305 4895 chrY 21500483 21502235 21500906 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 227009 4896 chrY 23084295 23088002 23084737 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 346684 4897 chrY 23317529 23322028 23317814 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 579918 4898 chrY 23475371 23476505 23476138 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 737760 4899 chrY 24095281 24099399 24096596 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 1357670 4900 chrY 24167938 24170864 24169120,24169135 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 1430327 4901 chrY 24708377 24710985 24709551 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 1970766 4902 chrY 24779729 24784212 24782202 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2042118 4903 chrY 24876676 24879636 24878480 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2139065 4904 chrY 24904216 24945221 24904782,24907307 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2166605 4905 chrY 25504530 25522109 25505143 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2766919 4906 chrY 25704952 25708882 25706705 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2967341 4907 chrY 25777017 25779985 25778464 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 3039406 4908 chrY 26421340 26460159 26455934,26422014 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 3683729 4909 chrY 26533329 26577588 26534450,26538664,26535336,26541100 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 3795718 4910 chrY 27076985 27078679 27077141 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 4339374 4911 chrY 27408847 27429396 27424219,27428865 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 4671236 4912 chrY 27545822 27547658 27546143 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 4808211 4913 chrY 27582878 27586826 27583036 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 4845267 4914 chrY 28160702 28164638 28160941 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5423091 4915 chrY 28182575 28185112 28184016 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5444964 4916 chrY 28254449 28258234 28256516 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5516838 4917 chrY 28356425 28365140 28364013 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5618814 4918 chrY 28375555 28416038 28414553,28411938,28377769 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5637944 4919 chrY 28436635 28438344 28437955 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5699024 4920 chrY 28507957 28514732 28511381 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5770346 4921 chrY 28760938 28761537 28761288 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 6023327 4922 chrY 3815170 3820187 3818238 N NA NA NA NA NA NA ZFY 1012058 4923 chrY 384954 385678 385168 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 1075361 4924 chrY 3921830 3927310 3923876 N NA NA NA NA NA NA PCDH11Y 996821 4925 chrY 4034255 4037226 4035746 N NA NA NA NA NA NA PCDH11Y 886905 4926 chrY 4042895 4046272 4044533 N NA NA NA NA NA NA PCDH11Y 877859 4927 chrY 4101474 4112376 4103583 N NA NA NA NA NA NA PCDH11Y 811755 4928 chrY 4350011 4354552 4352836 N NA NA NA NA NA NA PCDH11Y 569579 4929 chrY 4751724 4778944 4763176,4778066 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PCDH11Y 145187 4930 chrY 4858156 4886546 4880744,4868221,4866221 N,N,N NA;NA;NA PCDH11Y NA NA NA NA PCDH11Y 37585 4931 chrY 58973454 58998600 58985701 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 36235843 4932 chrY 58999852 59030615 59002775,59022119,59024751 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 36262241 4933 chrY 6451831 6452491 6451989 N NA NA NA NA NA NA TBL1Y 326236 4934 chrY 693615 695441 694432 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 765598 4935 chrY 770506 771806 770808 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 689233 4936 chrY 814138 816946 814721 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 644093 4937 chrY 8812361 8816977 8813508 N NA NA NA NA NA NA PRKY 1670348 4938 chrY 8978958 8979694 8979537 N NA NA NA NA NA NA PRKY 1836945 4939 chrY 899696 907686 900848 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 553353 4940 chrY 94714 104940 98770 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 1356099 4941 chrY 9908331 9910734 9909006 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2766318 4942 chrY 9918927 9926955 9926420,9920479 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PRKY 2776914 4943 chrY 9957827 9963695 9962215 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2815814 4944 chrY 9991047 10006600 9997695,10006235 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PRKY 2849034