Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 100064358 100066401 100065369 N NA NA NA NA NA NA FRRS1 164948 2 chr1 101061703 101069626 101062857 N NA NA NA NA NA NA CDC14A 243680 3 chr1 101665344 101667768 101666234 N NA NA SLC30A7 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 173982 4 chr1 102855897 102860053 102859037 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 1208525 5 chr1 102946523 102948150 102946784 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 1120428 6 chr1 108648873 108651513 108650431 Y FAM102B,VAV3 NA NA NA NA NA SLC25A24 91461 7 chr1 108806806 108809126 108807556 N NA NA NA NA NA NA SLC25A24 63832 8 chr1 108814664 108924397 108888902,108900914,108867781,108904480,108815814,108915470 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA SLC25A24 MCF7 ChIA-PET 22265404 NBPF6 68507 9 chr1 108963099 108981104 108963601 N NA NBPF6 NA NA NA NA NBPF6 11800 10 chr1 109043253 109048111 109045667 N NA NA HENMT1,FAM102B IMR90 Hi-C 24141950 NBPF6 50349 11 chr1 10959833 10962606 10961295 N NA NA PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARDBP 110073 12 chr1 109621539 109624833 109622547 N NA WDR47,TAF13,TMEM167B WDR47,SCARNA2 K562 ChIA-PET 22265404 TAF13 2915 13 chr1 110332682 110342466 110335778 Y GSTM2,CSF1 NA CSF1,FAM40A,AHCYL1,GSTM4,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 110767 14 chr1 110362670 110368975 110364484,110366838 N,N NA;NA NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 CSF1 84258 15 chr1 110417882 110421095 110420104 Y UBL4B CSF1 CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 32138 16 chr1 110433526 110436993 110435559 N NA CSF1 CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,AHCYL1,GNAI3,GSTM4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 16240 17 chr1 110521519 110523378 110522435 N NA AHCYL1 AHCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AHCYL1 4009 18 chr1 110622587 110627522 110622763 N NA FAM40A ALX3,FAM40A,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM40A 45346 19 chr1 111181923 111193197 111188729,111182777 N,Y NA;LRIF1,CD53 KCNA3 KCNA3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNA3 24458 20 chr1 111582697 111583992 111583460 N NA NA NA NA NA NA CEPT1 98257 21 chr1 112932141 112936343 112933391 N NA CTTNBP2NL CTTNBP2NL,WNT2B,MIR4256,ST7L,CAPZA1,RHOC,MOV10,PPM1J IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTTNBP2NL 2457 22 chr1 113390696 113397240 113393983,113396423 N,N NA;NA NA FAM19A3,PPM1J,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A1 101735 23 chr1 113407950 113425678 113409861 N NA NA FAM19A3,PPM1J,RHOC,AKR7A2P1,SLC16A1,MOV10,LRIG2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC16A1 73297 24 chr1 113584107 113593037 113585628 N NA LRIG2 SLC16A1,AKR7A2P1,RHOC,PPM1J,FAM19A3,LRIG2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRIG2 22794 25 chr1 114575089 114576698 114575592 N NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 53059 26 chr1 114910925 114911831 114911610 N NA NA NA NA NA NA TRIM33 141950 27 chr1 115676359 115680055 115676364,115677993,115679448 N,N,N NA;NA;NA NA SYCP1,VANGL1,CASQ2,NHLH2,NGF IMR90 Hi-C 24141950 SIKE1 353051 28 chr1 115720550 115724564 115722333 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 SIKE1 397242 29 chr1 115726029 115729550 115727778 N NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 SIKE1 402721 30 chr1 115967602 115970791 115969075 Y NA NA NGF,VANGL1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 213783 31 chr1 115972150 115975339 115973524 N NA NA NGF,VANGL1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 209235 32 chr1 116011351 116013871 116013045 N NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 170703 33 chr1 116036969 116039555 116038511 Y NA NA NGF,TSPAN2,CASQ2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VANGL1 145019 34 chr1 116087284 116090301 116088165 N NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 94273 35 chr1 116103017 116109501 116107019 N NA NA NGF,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 75073 36 chr1 116709563 116712470 116711150 N NA NA ATP1A1,SLC22A15,CD58,IGSF3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC22A15 190444 37 chr1 117417921 117426254 117421457 N NA PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 26435 38 chr1 118198968 118200518 118199800 N NA NA FAM46C K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GDAP2 271784 39 chr1 118319043 118321585 118320449 N NA NA NA NA NA NA GDAP2 150717 40 chr1 118355911 118374716 118364561,118369657,118372493,118373145,118367515 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA FAM46C,MAN1A2,GDAP2 IMR90 Hi-C 24141950 GDAP2 97586 41 chr1 119536018 119545939 119544797 N NA NA TBX15,WARS2 IMR90 Hi-C 24141950 WARS2 137356 42 chr1 119821190 119835049 119822157 N NA NA SPAG17,WARS2,HAO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WARS2 137895 43 chr1 120216524 120219393 120218101 N NA ZNF697,PHGDH ZNF697,PHGDH,LOC644242 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF697 26134 44 chr1 120629862 120635268 120630719,120633580 Y,N ZNF697,FCGR1B,NOTCH2;NA NOTCH2 NA NA NA NA NOTCH2 17545 45 chr1 120684636 120689456 120687349 N NA NA NA NA NA NA NOTCH2 72319 46 chr1 121115870 121150298 121117094 N NA NA NA NA NA NA FAM72B 276865 47 chr1 121159606 121167102 121160422 N NA NA NA NA NA NA FAM72B 320601 48 chr1 121483935 121485554 121485035 N NA NA NA NA NA NA FAM72B 644930 49 chr1 13972548 13976144 13973242 N NA NA NA NA NA NA PRDM2 50591 50 chr1 14247514 14250779 14248293 N NA NA NA NA NA NA PRDM2 220779 51 chr1 142535343 142543834 142535785,142539267,142541884 N,Y,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100286793 1200753 52 chr1 142783911 142788377 142786277 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 956210 53 chr1 142829234 142879213 142834371,142845194,142838170,142858223,142860641,142842625,142873131,142876363 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100286793 865374 54 chr1 142886914 142893118 142891040 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 851469 55 chr1 142966433 142967806 142967269 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 776781 56 chr1 143117642 143134078 143133838,143117902 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100286793 610509 57 chr1 143149893 143194110 143171255,143181313,143184337,143190828,143174706,143164321,143153085,143171251 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100286793 550477 58 chr1 143196091 143227064 143202342 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 517523 59 chr1 143238255 143241176 143241113 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 503411 60 chr1 143257615 143283057 143281310,143271670,143259338,143281407 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100286793 461530 61 chr1 143343048 143346719 143344165 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 397868 62 chr1 143359167 143361289 143360760 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 383298 63 chr1 143394603 143470541 143407556,143396830,143418938,143431686,143467689,143469725,143455942 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100286793 274046 64 chr1 143671033 143672580 143671701 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 72007 65 chr1 144536527 144540745 144538248 N NA NA PDE4DIP,SEC22B,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NBPF9 74214 66 chr1 144571492 144577541 144572913 N NA NBPF9 LOC728875,PDE4DIP IMR90 Hi-C 24141950 NBPF9 37418 67 chr1 145138714 145141222 145139259 N NA SEC22B NA NA NA NA SEC22B 42307 68 chr1 145188709 145190960 145189333 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B IMR90 Hi-C 24141950 NOTCH2NL 18151 69 chr1 145194901 145197047 145196051 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B IMR90 Hi-C 24141950 NOTCH2NL 12064 70 chr1 145394441 145397872 145395639 N NA TXNIP PDE4DIP,SEC22B,HFE2,GNRHR2,LIX1L,RBM8A,PIAS3,POLR3C,NUDT17,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 40590 71 chr1 145398547 145401220 145399017 N NA TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,RBM8A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115,ITGA10,NUDT17,POLR3C IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 37242 72 chr1 145978835 145980821 145979235 N NA NA NA NA NA NA GPR89C 94967 73 chr1 147520468 147523250 147520799 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 119962 74 chr1 147539062 147542182 147540676 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 138556 75 chr1 147702084 147720282 147718868,147710698 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FLJ39739 211698 76 chr1 147795846 147801620 147800924 N NA NA NA NA NA NA FLJ39739 130360 77 chr1 147804156 147809414 147807125 Y NA NA NA NA NA NA FLJ39739 122566 78 chr1 147824520 147826340 147825673 Y NA NA NA NA NA NA FLJ39739 105640 79 chr1 147856635 147858147 147857248 N NA NA NA NA NA NA FLJ39739 73833 80 chr1 147873902 147884829 147875098,147877406,147880648 N,N,N NA;NA;NA FLJ39739 NA NA NA NA FLJ39739 47151 81 chr1 14810904 14815505 14813828 N NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 TMEM51 663523 82 chr1 148246771 148248806 148248292 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 220923 83 chr1 14842482 14845752 14843958 Y KAZN NA NA NA NA NA TMEM51 633276 84 chr1 14847398 14850222 14849290 N NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 TMEM51 628806 85 chr1 148531216 148534519 148532097 N NA NBPF15 NA NA NA NA NBPF15 23669 86 chr1 148856103 148860097 148859432 N NA NA NA NA NA NA LOC645166 68189 87 chr1 148863434 148869278 148864524 N NA NA NA NA NA NA LOC645166 59008 88 chr1 148870695 148900514 148870990 N NA LOC645166 NA NA NA NA LOC645166 27772 89 chr1 149213818 149218444 149215583 Y NA NA NA NA NA NA LOC388692 61032 90 chr1 149222352 149224353 149223331 N NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC388692 55123 91 chr1 149230026 149232464 149230669 N NA LOC388692 NA NA NA NA LOC388692 47012 92 chr1 149522405 149525036 149523153 N NA NA NA NA NA NA FAM91A2 51226 93 chr1 150156319 150162252 150159598 N NA PLEKHO1,ANP32E HIST2H2AB,HIST2H2BE,HIST2H2AC,OTUD7B,MTMR11,SF3B4,VPS45,PLEKHO1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHO1 34149 94 chr1 150163254 150166590 150165172 N NA PLEKHO1,ANP32E HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB,OTUD7B,MTMR11,SF3B4,VPS45,PLEKHO1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHO1 41084 95 chr1 150509244 150513176 150510767 N NA TARS2,ECM1,MCL1 NA NA NA NA ECM1 28757 96 chr1 151443776 151448297 151445954 Y C1orf56,RIIAD1,OAZ3 POGZ,CGN RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D,THEM5 IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562,GM12878 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 POGZ 11835 97 chr1 151579763 151581998 151580950 Y NA SNX27 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 2664 98 chr1 151916122 151919447 151918450 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33761 99 chr1 152016747 152022344 152020635 N NA S100A11 S100A11,THEM4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S100A11 7236 100 chr1 152134867 152137259 152135484 N NA NA S100A11 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A11 125356 101 chr1 152138885 152147900 152140571 Y NA NA S100A11,TCHH MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 S100A11 129374 102 chr1 152433525 152434368 152433943 N NA NA RPTN,HRNR,CRNN,CRCT1,LCE5A,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S100A11 424014 103 chr1 153477824 153480845 153479480 N NA S100A6,S100A4,S100A3 PGLYRP4,S100A9,S100A2,S100A16 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A6 27872 104 chr1 154643127 154649168 154644414 N NA ADAR ADAR,KCNN3 IMR90 Hi-C 24141950 ADAR 42671 105 chr1 157359112 157362224 157360681 N NA NA NA NA NA NA ETV3 250729 106 chr1 157679676 157681233 157680994 N NA NA NA NA NA NA KIRREL 281830 107 chr1 157937600 157939533 157938524 N NA KIRREL AIM2,LOC646268,IFI16,KIRREL,CD1D IMR90 Hi-C 24141950 KIRREL 23530 108 chr1 158115352 158121084 158119571 Y NA NA LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 KIRREL 152289 109 chr1 159057354 159059450 159058289 N NA NA CD1D,IFI16 IMR90 Hi-C 24141950 IFI16 77672 110 chr1 15928927 15933150 15929382,15930016 N,N NA;NA DDI2 DDI2,DNAJC16,AGMAT,FBLIM1,PLEKHM2,SLC25A34,TMEM82 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 10803 111 chr1 159397503 159401002 159399124 N NA NA NA NA NA NA DARC 223700 112 chr1 159460136 159464547 159462788 N NA NA NA NA NA NA DARC 286333 113 chr1 160694916 160697893 160696768 N NA SLAMF7 CD48,SLAMF7 IMR90 Hi-C 24141950 SLAMF7 11184 114 chr1 161358018 161365262 161359884 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 73852 115 chr1 161367995 161374866 161369043 N NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 83829 116 chr1 161396898 161398654 161397762 N NA NA APOA2,TOMM40L,NDUFS2 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 112732 117 chr1 161442098 161446791 161443065 N NA NA NDUFS2,DUSP12,FCGR2A,FCRLA,FCRLB IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 157932 118 chr1 161535126 161537344 161535774 N NA NA DUSP12 IMR90 Hi-C 24141950 FCRLB 155113 119 chr1 161616516 161618728 161617156 N NA NA FCRLB MCF7 ChIA-PET 22265404 FCRLB 73729 120 chr1 163003855 163007369 163006177 N NA NA C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B7 243359 121 chr1 16489849 16497996 16490790 N NA EPHA2,ARHGEF19 CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144,SPEN,ZBTB17,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 7267 122 chr1 165084987 165087228 165086135 N NA NA NA NA NA NA MGST3 512882 123 chr1 165344343 165348083 165345660 N NA NA LRRC52,LOC400794 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 252027 124 chr1 165566800 165570532 165567822 N NA MGST3 RXRG,LOC400794,UCK2,LOC440700,ALDH9A1,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 29578 125 chr1 166455069 166462586 166455237,166458803 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM78B 319111 126 chr1 167129180 167131797 167130648 N NA NA CD247 IMR90 Hi-C 24141950 POU2F1 58269 127 chr1 167585767 167589015 167587130 Y POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1 NA RCSD1 IMR90 Hi-C 24141950 CREG1 62711 128 chr1 16822146 16840670 16826296,16840622,16833285 N,N,N NA;NA;NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC,CROCCP2,MST1P2,MIR3675,ESPNP,ARHGEF19,C1orf144,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NECAP2 54979 129 chr1 16846696 16848719 16847172 N NA NA CROCC,CROCCP3,NBPF1,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 79529 130 chr1 16857486 16859353 16858541 N NA NA NBPF1,ESPNP,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NBPF1 80629 131 chr1 168591253 168594015 168592658 N NA NA DPT,F5 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D2 395998 132 chr1 168597653 168598206 168598118 N NA NA DPT,F5,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D2 402398 133 chr1 169070859 169073043 169072024 Y C1orf114,ATP1B1 ATP1B1 XCL1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP1B1 2904 134 chr1 170095116 170097949 170096005 N NA NA PRRX1,KIFAP3 IMR90 Hi-C 24141950 SCYL3 232040 135 chr1 170277501 170279715 170278792 N NA NA LOC284688,PRRX1,GORAB,KIFAP3,METTL11B IMR90 Hi-C 24141950 GORAB 221548 136 chr1 170308461 170311123 170309634 N NA NA NA NA NA NA GORAB 190140 137 chr1 171401923 171405771 171403497 N NA PRRC2C PRRC2C IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2C 48895 138 chr1 171406574 171409223 171407441 N NA PRRC2C PRRC2C IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2C 45443 139 chr1 17201260 17203489 17202523 N NA CROCC CROCC,NBPF1,ESPNP,MST1P9,CROCCP2,MST1P2,MIR3675 IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 44956 140 chr1 17214800 17216933 17216139 N NA CROCC NBPF1,MIR3675,CROCC,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 31512 141 chr1 17219064 17224682 17222298,17223852 N,N NA;NA CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 23763 142 chr1 17229257 17233161 17231519,17232860 Y,N PADI4,PADI2;NA CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 15284 143 chr1 172606835 172610363 172606935,172608526 N,N NA;NA NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 C1orf9 104575 144 chr1 172859200 172904748 172891222,172887318,172878926,172876039,172883893,172900288 N,Y,Y,N,N,N NA;TNFSF18;TNFSF18;NA;NA;NA NA LOC100506023,TNFSF4,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2,PRDX6,CENPL IMR90 Hi-C 24141950 C1orf9 356940 145 chr1 173972622 173993498 173984553,173991576 N,N NA;NA RC3H1 LOC100506023,PRDX6,GAS5,SNORD75,SNORD81,SNORD47,SNORD78,SNORD79,SNORD77,SNORD44,SNORD76,SNORD80,ZBTB37,RABGAP1L,RC3H1 IMR90 Hi-C 24141950 RC3H1 10412 146 chr1 17453659 17456745 17455064 Y PADI4 NA PADI2,PADI1,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 72994 147 chr1 17493783 17496584 17495232 Y NA NA PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 113118 148 chr1 17514736 17520132 17517215 N NA NA NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 134071 149 chr1 176211067 176262858 176212827 N NA RFWD2 TNR,RFWD2,KIAA0040 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFWD2 34697 150 chr1 176371725 176372071 176371940 N NA NA NA NA NA NA RFWD2 195355 151 chr1 17768756 17785354 17779981,17770006 N,N NA;NA RCC2 RCC2,ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 2506 152 chr1 177943232 177946192 177945090 N NA NA NA NA NA NA RASAL2 116672 153 chr1 180499058 180501384 180499824 N NA ACBD6 MR1,XPR1,KIAA1614 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACBD6 27036 154 chr1 181102874 181107374 181104562 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 45236 155 chr1 181109969 181111873 181111029 N NA NA STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 52331 156 chr1 18198479 18204008 18201440 N NA NA ACTL8,ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF10L 332149 157 chr1 182088580 182089590 182088941 N NA NA RGSL1 IMR90 Hi-C 24141950 GLUL 271751 158 chr1 183148236 183152333 183149877 N NA LAMC2 LAMC1,LAMC2,NMNAT2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 2841 159 chr1 187039321 187046804 187041809,187039345 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C1orf27 694431 160 chr1 187659673 187661319 187660790 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1314783 161 chr1 188057032 188061255 188059066 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1712142 162 chr1 18884083 18885778 18885210 N NA NA NA NA NA NA IFFO2 397048 163 chr1 189973017 189990776 189988821 N NA NA NA NA NA NA RGS2 2787393 164 chr1 192513372 192514793 192514281 N NA NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS2 263376 165 chr1 192526029 192530595 192528826 N NA NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS2 247574 166 chr1 192705786 192709548 192708757 N NA NA NA NA NA NA RGS2 68621 167 chr1 192933285 192949853 192947701 N NA NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 UCHL5 78670 168 chr1 192956564 192957304 192956907 N NA NA NA NA NA NA UCHL5 71219 169 chr1 19335015 19338961 19337149 N NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 52189 170 chr1 193377163 193379509 193378077 N NA NA NA NA NA NA CDC73 286075 171 chr1 19358019 19359677 19358393 N NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IFFO2 75193 172 chr1 194625815 194628325 194627158 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1534727 173 chr1 198088806 198091344 198090390 Y NA NEK7 PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK7 34764 174 chr1 198465698 198467832 198466499 N NA NA PTPRC,ATP6V1G3 IMR90 Hi-C 24141950 NEK7 339590 175 chr1 199193557 199196555 199195533 N NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 286999 176 chr1 199239160 199244544 199242694 N NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 332602 177 chr1 199247085 199250912 199248349 N NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 340527 178 chr1 199710734 199713073 199711898 Y NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf98 629847 179 chr1 199726896 199729885 199728622 N NA NA C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf98 613035 180 chr1 200174743 200178548 200176357 N NA NA C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf98 164372 181 chr1 200238462 200241491 200240063 N NA NA NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf98 101429 182 chr1 200287944 200289841 200289085 N NA NA C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf98 53079 183 chr1 200383500 200388862 200385881,200386052 N,N NA;NA C1orf98,ZNF281 ZNF281,C1orf98 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF281 4334 184 chr1 200437612 200454673 200445440,200451710 N,N NA;NA NA NR5A2,C1orf98,ZNF281 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF281 58446 185 chr1 200456623 200458791 200456909 N NA NA C1orf98,NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 77457 186 chr1 201138088 201142964 201139984 Y NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 14456 187 chr1 201151970 201156050 201154194 N NA TMEM9 KIF21B,LAD1,CACNA1S,IGFN1,PKP1,TNNT2,TNNI1,TMEM9 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 28338 188 chr1 201227667 201230893 201229081 N NA NA NA NA NA NA TMEM9 104035 189 chr1 201235436 201237889 201236252 N NA NA IGFN1,PKP1,LAD1,TNNT2,TNNI1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 111804 190 chr1 203377049 203378800 203377802 N NA NA FMOD,BTG2,PRELP IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 102385 191 chr1 203431241 203434074 203432800 N NA NA FMOD,PPFIA4,CYB5R1,PRELP,ATP2B4,BTG2,LOC730227,OPTC IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 156577 192 chr1 203524027 203529349 203527896,203525782 N,Y NA;NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 66566 193 chr1 203963751 203966360 203965099 N NA NA ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13 IMR90 Hi-C 24141950 SOX13 75886 194 chr1 204024900 204027210 204026368 N NA SOX13 LINC00303 IMR90 Hi-C 24141950 SOX13 15036 195 chr1 204474978 204476839 204475938 N NA PIK3C2B,MDM4 PPP1R15B,MDM4,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MDM4 8668 196 chr1 205445618 205451127 205447196,205449880 N,Y NA;RAB7L1,CNTN2 CDK18 CDK18,KLHDC8A,NFASC,CNTN2,TMCC2,LOC284576,LEMD1,MIR135B,MFSD4,SLC45A3 IMR90 Hi-C 24141950 CDK18 22557 197 chr1 207405579 207407976 207406119 N NA NA NA NA NA NA CD55 86841 198 chr1 207413250 207421658 207414355 Y CD55 NA CD55,CR2,CR1,PFKFB2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CD55 73159 199 chr1 207560424 207569395 207563577,207567151 N,N NA;NA NA YOD1,PFKFB2,CD55,C4BPB,C4BPA IMR90 Hi-C 24141950 CD55 65607 200 chr1 208134797 208140156 208137753 N NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD46 209414 201 chr1 209211448 209214917 209212917 N NA NA NA NA NA NA LAMB3 610903 202 chr1 209217596 209221000 209219525 N NA NA NA NA NA NA LAMB3 604820 203 chr1 209540281 209544419 209542780 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587 NA MIR205HG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LAMB3 281401 204 chr1 209547220 209550577 209549054 N NA NA MIR205HG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAMB3 275243 205 chr1 209559086 209562619 209561480 N NA NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 LAMB3 263201 206 chr1 209576128 209583158 209578014,209582654 N,N NA;NA NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 LAMB3 242662 207 chr1 209583666 209591869 209585270,209589555 N,Y NA;LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 233951 208 chr1 209592662 209595971 209594735 N NA NA MIR205HG IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 229849 209 chr1 209988260 209990793 209989326 Y LOC642587,LAMB3,LAMB3,IRF6 C1orf74,DIEXF DIEXF,IRF6,TRAF3IP3 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DIEXF 10519 210 chr1 210072291 210075790 210074436 N NA SYT14 SYT14,DIEXF IMR90 Hi-C 24141950 SYT14 35729 211 chr1 210358656 210364888 210361722 N NA SERTAD4,C1orf133 SERTAD4 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD4 41307 212 chr1 210437163 210442725 210439058 N NA SERTAD4,C1orf133 NA NA NA NA C1orf133 29697 213 chr1 210464813 210468346 210466348 N NA NA SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf133 57347 214 chr1 210483464 210487015 210484687 N NA NA HHAT MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C1orf133 75998 215 chr1 211687414 211690420 211689004 N NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61679 216 chr1 211786066 211788113 211786889 N NA SLC30A1 SLC30A1,NEK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC30A1 33967 217 chr1 211792036 211795548 211794976 N NA SLC30A1 NEK2,LINC00467 IMR90 Hi-C 24141950 SLC30A1 39937 218 chr1 212406188 212409316 212408061 N NA PPP2R5A PPP2R5A,DTL,TMEM206 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5A 49563 219 chr1 213499447 213502294 213500813 Y RPS6KC1 NA PROX1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KC1 274859 220 chr1 215673018 215673298 215673158 N NA NA CENPF IMR90 Hi-C 24141950 KCTD3 67437 221 chr1 216634043 216641491 216638765,216635922 N,N NA;NA NA ESRRG IMR90 Hi-C 24141950 KCTD3 893308 222 chr1 218648409 218656546 218649382,218653601,218655029 N,N,N NA;NA;NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC728463 129389 223 chr1 218658949 218666991 218661910,218666312 N,Y NA;NA NA TGFB2,LOC728463,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC728463 139929 224 chr1 218668134 218674422 218671332 N NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728463 149114 225 chr1 218745609 218752055 218747325,218749544 N,N NA;NA NA LOC728463,RRP15,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728463 226589 226 chr1 218756876 218761834 218759480 N NA NA LOC728463,RRP15,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728463 237856 227 chr1 218830578 218840663 218833322,218838714 N,N NA;NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15,LYPLAL1,LOC643723 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728463 311558 228 chr1 218846072 218850181 218847986 Y NA NA LOC728463,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728463 327052 229 chr1 219476945 219480585 219478094 N NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 129753 230 chr1 219495334 219502329 219497682 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 148142 231 chr1 219755817 219759286 219756316 N NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 408625 232 chr1 220907225 220908689 220908544 N NA NA MARC2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB3GAP2 461382 233 chr1 221129341 221131940 221130610 N NA NA HLX,DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3GAP2 683498 234 chr1 221609582 221615818 221613049 N NA NA MARC1,C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 299698 235 chr1 222002018 222003955 222003165 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 86502 236 chr1 222130921 222137559 222135586,222131803 N,N NA;NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 215405 237 chr1 222160009 222162590 222161355 Y DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 244493 238 chr1 222638258 222639502 222638798 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1A 123773 239 chr1 22281164 22284912 22283485 N NA HSPG2 RAP1GAP,USP48,LDLRAD2,HSPG2,LINC00339,CDC42,CELA3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPG2 17414 240 chr1 223672741 223675674 223674349 N NA NA CAPN8,TLR5,SUSD4 IMR90 Hi-C 24141950 CAPN2 213621 241 chr1 224074402 224077185 224075339 N NA TP53BP2 TP53BP2 IMR90 Hi-C 24141950 TP53BP2 40728 242 chr1 224142487 224146734 224145435 N NA NA NA NA NA NA TP53BP2 108813 243 chr1 224177912 224186110 224180352 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 115681 244 chr1 224194829 224205260 224196998,224202560,224204201,224199736 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA FBXO28 96531 245 chr1 224268882 224271613 224270027 Y FBXO28 FBXO28 TP53BP2,NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 30178 246 chr1 224729193 224733719 224730678 Y NA NA CNIH3,CNIH4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 107192 247 chr1 225632324 225634149 225632723 N NA LBR TMEM63A,LBR,ENAH,SRP9,EPHX1,PYCR2,LEFTY2,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LBR 15767 248 chr1 225635949 225638366 225637139 N NA LBR TMEM63A,LBR,ENAH,SRP9,EPHX1,PYCR2,LEFTY2,C1orf55,H3F3A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LBR 19392 249 chr1 225640956 225644909 225642625 Y NA LBR EPHX1,LBR,ENAH,SRP9,TMEM63A,PYCR2,LEFTY2,C1orf55,H3F3A IMR90 Hi-C 24141950 LBR 24399 250 chr1 225851761 225860379 225859469,225857274 N,N NA;NA ENAH ENAH,SRP9,EPHX1,TMEM63A,PYCR2,C1orf55 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENAH 10916 251 chr1 225886351 225923390 225888918,225890488,225900511,225895912,225919331,225921567 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA ENAH,SRP9 ENAH,SRP9,EPHX1,TMEM63A,PYCR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRP9 42125 252 chr1 225931719 225945397 225940138 N NA SRP9 ENAH IMR90 Hi-C 24141950 SRP9 20118 253 chr1 226147975 226148781 226148365 N NA PYCR2,C1orf55 TMEM63A,ENAH,EPHX1,PYCR2,LEFTY2,C1orf55 IMR90 Hi-C 24141950 PYCR2 36010 254 chr1 227007535 227010551 227009139 Y NA PSEN2 ITPKB,C1orf95 IMR90 Hi-C 24141950 PSEN2 47722 255 chr1 227543571 227545687 227544722 N NA CDC42BPA CDC42BPA,ADCK3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42BPA 37745 256 chr1 22754619 22762988 22755454 N NA ZBTB40 C1QC,C1QA,ZBTB40,EPHB2,CDC42,C1QB,EPHA8 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 15356 257 chr1 229099266 229101136 229100104 N NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 C1orf96 377552 258 chr1 231275203 231277830 231276294 N NA NA FAM89A,TRIM67,LOC149373 IMR90 Hi-C 24141950 GNPAT 99089 259 chr1 234019511 234022620 234020903 N NA SLC35F3 SLC35F3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35F3 18059 260 chr1 234634061 234636673 234635060 N NA NA LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 108598 261 chr1 234679314 234681696 234680321 Y NA NA LOC100506795,IRF2BP2 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 63575 262 chr1 234699799 234701862 234700524 N NA IRF2BP2 IRF2BP2,RBM34,TOMM20 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 43409 263 chr1 234751688 234759180 234754044,234757791 N,Y NA;NA IRF2BP2 LINC00184,LOC100506810,ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 6417 264 chr1 234906085 234909956 234908245 Y IRF2BP2 NA LOC100506810,IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,TOMM20,RBM34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 160814 265 chr1 235091940 235094657 235093613 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 197599 266 chr1 235097159 235100028 235098740 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 192228 267 chr1 235104675 235108508 235106285 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 183748 268 chr1 235110037 235118875 235111183,235116569 Y,N IRF2BP2,ARID4B,ARID4B;NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 173381 269 chr1 235122199 235124528 235123359 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 167728 270 chr1 235132058 235135513 235133824 N NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 156743 271 chr1 235145959 235150045 235147790 N NA NA LINC00184,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 142211 272 chr1 235152880 235155720 235154188 N NA NA LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 136536 273 chr1 23524449 23526279 23525264 N NA LUZP1,HTR1D NA NA NA NA HTR1D 3227 274 chr1 236059255 236068134 236061187,236066495,236063967 N,N,N NA;NA;NA NA LYST,NID1,ARID4B,B3GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 GPR137B 237698 275 chr1 236069319 236088119 236072954,236080932 N,Y NA;LYST,GPR137B NA NID1,ARID4B,LYST,B3GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 GPR137B 217713 276 chr1 237140252 237146645 237141987 N NA NA NA NA NA NA MTR 181671 277 chr1 238224856 238226549 238225591 N NA NA CHRM3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC339535 422768 278 chr1 238810076 238813114 238811390 Y NA NA NA NA NA NA LOC339535 160759 279 chr1 23901749 23906337 23903784,23905428 Y,N ID3;NA E2F2,ID3 ID3,MDS2,E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 15464 280 chr1 23911531 23914825 23912250 Y PNRC2,RPL11 ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 25246 281 chr1 23917232 23921400 23919031 N NA ID3 E2F2,ID3,ASAP3,MDS2,TCEB3,HNRNPR IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 30947 282 chr1 241635435 241640150 241639150 Y KMO FH RGS7 IMR90 Hi-C 24141950 FH 42935 283 chr1 24344948 24348459 24345459 N NA SRSF10 LOC100506963,CNR2,LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,MIR378F,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,TCEB3,GALE,FUCA1,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF10 37995 284 chr1 244012560 244017207 244014841 N NA AKT3 LOC339529 IMR90 Hi-C 24141950 AKT3 5976 285 chr1 244326038 244328698 244327330 N NA NA SDCCAG8,LOC339529,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF238 111477 286 chr1 244431908 244433959 244432678 N NA NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 181477 287 chr1 244435169 244438358 244437189 N NA NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,ZNF238,ADSS,C1orf100 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 177078 288 chr1 244504255 244507177 244505157 Y AKT3,AKT3,ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADSS 108259 289 chr1 244898073 244901204 244899509 N NA NA PPPDE1,C1orf101,EFCAB2 IMR90 Hi-C 24141950 PPPDE1 81721 290 chr1 245081404 245083793 245082224 Y EFCAB2 NA SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPU 53577 291 chr1 24561469 24566331 24563206 N NA NA IL22RA1,C1orf201,GRHL3,NIPAL3,MYOM3,RCAN3 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf201 175256 292 chr1 24600360 24602996 24601646 N NA NA IL22RA1,LOC284632,IL28RA,C1orf201,RCAN3,GRHL3,MYOM3,NIPAL3,RCAN3AS IMR90 Hi-C 24141950 C1orf201 138591 293 chr1 24619852 24622508 24621244 N NA NA LOC284632,IL28RA,C1orf201,RCAN3,GRHL3,IL22RA1,NIPAL3,RCAN3AS,MYOM3,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf201 119079 294 chr1 247801114 247808867 247803605 N NA NA NA NA NA NA TRIM58 211634 295 chr1 249166484 249167649 249166755 N NA SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 ZNF692,PGBD2,MIR3124,SH3BP5L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF692 13169 296 chr1 25028277 25028978 25028615 N NA CLIC4 NA NA NA NA CLIC4 42782 297 chr1 25031989 25048440 25033166,25040294,25046066 N,N,N NA;NA;NA CLIC4 SRRM1,CLIC4,RUNX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 23320 298 chr1 25052377 25055598 25052531 N NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 16162 299 chr1 25348524 25350893 25349275 N NA NA RUNX3,CLIC4,C1orf63,SYF2 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 57023 300 chr1 25357672 25359887 25358882 N NA NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 66171 301 chr1 26248266 26250619 26249702 N NA STMN1 STMN1,PAFAH2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STMN1 15273 302 chr1 26333712 26339210 26338112 N NA PAFAH2 PAQR7,STMN1,EXTL1,PAFAH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAFAH2 9064 303 chr1 26945306 26950094 26947994 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72428 304 chr1 27501522 27502845 27502461 N NA SLC9A1 SLC9A1,WDTC1,SYTL1,FCN3,GPR3,MAP3K6,CD164L2,TMEM222,AHDC1,FGR IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A1 20071 305 chr1 27822687 27828977 27823279,27826725 N,N NA;NA WASF2 WASF2,SYTL1,GPR3,AHDC1,FGR K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WASF2 6009 306 chr1 28438700 28441644 28439671 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566 IMR90 Hi-C 24141950 EYA3 23552 307 chr1 30160670 30162895 30161552 N NA NA PTPRU,MECR,MATN1,LOC100129196 IMR90 Hi-C 24141950 PTPRU 597642 308 chr1 30180510 30184527 30182520 N NA NA PTPRU,MECR,LOC100129196,MATN1 IMR90 Hi-C 24141950 PTPRU 617482 309 chr1 30434640 30438468 30436091 N NA NA NA NA NA NA LOC100129196 753151 310 chr1 30445111 30448681 30446765 N NA NA NA NA NA NA LOC100129196 742938 311 chr1 30555685 30557958 30557047 N NA NA MECR,PTPRU,LOC100129196,MATN1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129196 633661 312 chr1 30982549 30986831 30984849 Y NA NA NA NA NA NA LOC100129196 204788 313 chr1 30993264 31005691 30997828,31000756 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100129196 185928 314 chr1 31122557 31126609 31125162 N NA NA PTPRU,MATN1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129196 65010 315 chr1 31250244 31253559 31251408 Y NA NA LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129196 58625 316 chr1 31268784 31270428 31269972 N NA NA MECR,LAPTM5,SDC3,SNORD103A,PUM1,MATN1,LOC100129196,SNORD103B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129196 77165 317 chr1 31295925 31301596 31297403 N NA NA LOC100129196,MATN1,SDC3,PUM1 IMR90 Hi-C 24141950 SDC3 79884 318 chr1 32014686 32016241 32015051 N NA TINAGL1 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TINAGL1 25845 319 chr1 32407969 32412423 32410138 N NA PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A2 3981 320 chr1 33188546 33193581 33190895 N NA KIAA1522 KIAA1522,SYNC,YARS MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KIAA1522 13931 321 chr1 33440691 33448213 33447003 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 10405 322 chr1 34732654 34735365 34733623 N NA NA NA NA NA NA GJB3 511425 323 chr1 34825288 34828460 34826471 N NA NA NA NA NA NA GJB3 418330 324 chr1 38603646 38606777 38604474 N NA NA POU3F1 IMR90 Hi-C 24141950 UTP11L 125262 325 chr1 39423640 39428571 39425640,39427980,39424922 N,N,N NA;NA;NA AKIRIN1 RHBDL2,GJA9-MYCBP,AKIRIN1,NDUFS5,RRAGC IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN1 28345 326 chr1 40262911 40278259 40265398 N NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1,NT5C1A,TRIT1,MYCL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPIE 58394 327 chr1 41055412 41057510 41055854 N NA NA KCNQ4,ZNF642,NFYC,ZNF684,RIMS3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF684 58179 328 chr1 41338092 41343442 41338171,41341460 N,N NA;NA NA CTPS,KCNQ4,CITED4,NFYC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTPS 101565 329 chr1 41363036 41365926 41363711 N NA NA CITED4,CTPS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTPS 79081 330 chr1 41430593 41435976 41433779,41435173 N,N NA;NA CTPS,LOC100507178 KCNQ4,RIMS3,NFYC,CITED4,LOC100507178,CTPS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTPS 9031 331 chr1 41897539 41903759 41901228,41898645 N,N NA;NA EDN2 EDN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EDN2 46585 332 chr1 42415868 42422768 42421240 N NA NA HIVEP3 IMR90 Hi-C 24141950 GUCA2A 207627 333 chr1 43548544 43555605 43549947 N NA NA FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,CCDC23,ERMAP,ZNF691,FAM183A,EBNA1BP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM183A 57989 334 chr1 4362923 4363499 4363237 N NA NA NA NA NA NA LOC100133612 545955 335 chr1 43970701 43973195 43972147 N NA PTPRF SZT2,HYI,PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 23352 336 chr1 43986754 43991254 43988999 Y PTPRF PTPRF PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 5293 337 chr1 44513239 44516555 44513822 N NA SLC6A9 ERI3,ST3GAL3,IPO13,B4GALT2,CCDC24,ATP6V0B,SLC6A9,DMAP1,RNF220,TMEM53,C1orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC6A9 16105 338 chr1 44651768 44652715 44652297 N NA DMAP1 KLF17,RNF220,ERI3 IMR90 Hi-C 24141950 DMAP1 26410 339 chr1 45711860 45715120 45712483 N NA NA ZSWIM5 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400752 54462 340 chr1 48012306 48015337 48013637 N NA NA FOXD2,MGC12982,LOC388630 IMR90 Hi-C 24141950 MGC12982 111993 341 chr1 48034828 48036751 48035687 N NA NA NA NA NA NA MGC12982 134515 342 chr1 48471803 48473834 48472641 N NA LOC388630 LOC388630 IMR90 Hi-C 24141950 LOC388630 9241 343 chr1 48511780 48514995 48513449 N NA LOC388630 NA NA NA NA LOC388630 49218 344 chr1 52022180 52027994 52024946 N NA EPS15 NRD1,OSBPL9,EPS15 IMR90 Hi-C 24141950 EPS15 37185 345 chr1 52031341 52037259 52033577,52035596 Y,Y NA;NA EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL9 45287 346 chr1 52039370 52043066 52040942 N NA OSBPL9 OSBPL9 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL9 39480 347 chr1 53610603 53612991 53612063 N NA CPT2 ZYG11B,ZYG11A,ECHDC2,SCP2,PODN,SLC1A7,C1orf123 IMR90 Hi-C 24141950 CPT2 49110 348 chr1 539679 541795 540788 N NA NA NA NA NA NA LOC100133331 215787 349 chr1 54877441 54880075 54878586 N NA SSBP3 TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 5349 350 chr1 54952536 54956258 54954735 N NA NA TCEANC2,SSBP3,TMEM59,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,C1orf177,YIPF1,DIO1,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACOT11 57549 351 chr1 54964244 54967242 54964861 N NA ACOT11 TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A IMR90 Hi-C 24141950 ACOT11 46565 352 chr1 55892962 55899997 55896008 N NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507634 211881 353 chr1 56037622 56040171 56038737 N NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507634 356541 354 chr1 56183034 56186306 56184604 Y NA NA PRKAA2,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507634 501953 355 chr1 564194 571142 567265 N NA NA NA NA NA NA LINC00115 191760 356 chr1 56694029 56711973 56708612 N NA NA NA NA NA NA PPAP2B 333284 357 chr1 56795665 56800022 56796320,56798064 N,Y NA;NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 245235 358 chr1 56837446 56843431 56841513 N NA NA USP24,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 201826 359 chr1 56913821 56916023 56914845 N NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 129234 360 chr1 58859902 58864184 58862268 N NA NA NA NA NA NA OMA1 148262 361 chr1 58866226 58869257 58868040 N NA NA NA NA NA NA OMA1 143189 362 chr1 58872587 58882446 58877679,58876648 N,N NA;NA NA NA NA NA NA OMA1 130000 363 chr1 59048922 59053733 59051263 N NA OMA1 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 OMA1 36476 364 chr1 59056549 59060051 59058419 N NA OMA1 FGGY,TACSTD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OMA1 44103 365 chr1 59192077 59194591 59193259 N NA MYSM1 FGGY,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 MYSM1 26330 366 chr1 59219664 59223240 59221351 Y NA JUN FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 26545 367 chr1 59480162 59482910 59481619 N NA NA FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 HSD52 129569 368 chr1 59614770 59619502 59616786 Y NA HSD52 HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 HSD52 2291 369 chr1 61521755 61524435 61523113 N NA NFIA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 18511 370 chr1 62797856 62800304 62799423 N NA NA NA NA NA NA USP1 101671 371 chr1 63195993 63197794 63196764 N NA DOCK7 DOCK7,ANGPTL3,USP1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK7 42024 372 chr1 64194895 64199404 64197402 Y NA NA ROR1,UBE2U,PGM1 IMR90 Hi-C 24141950 PGM1 135948 373 chr1 65461658 65474722 65469129,65473069 N,N NA;NA JAK1 JAK1 IMR90 Hi-C 24141950 JAK1 29471 374 chr1 65533006 65535983 65533863 N NA NA AK4,DNAJC6,LEPR,JAK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AK4 77249 375 chr1 66929184 66932332 66930783 Y NA NA PDE4B,SGIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MIER1 458246 376 chr1 6782879 6786234 6784779 N NA DNAJC11 CAMTA1,DNAJC11 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC11 20913 377 chr1 68023666 68026922 68025213 N NA NA GADD45A,GNG12,LOC100289178 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 123938 378 chr1 6803078 6806255 6803810 N NA DNAJC11 CAMTA1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC11 41112 379 chr1 68090484 68093062 68092349 N NA NA GADD45A,GNG12 IMR90 Hi-C 24141950 GADD45A 57798 380 chr1 68846861 68852368 68850394 N NA NA LOC100289178,WLS,RPE65 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 110431 381 chr1 71779335 71780276 71779568 N NA NA NEGR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZRANB2 232363 382 chr1 723572 727967 724310,726964 N,N NA;NA LINC00115,LOC643837 NA NA NA NA LINC00115 34935 383 chr1 72751085 72758364 72752607,72756373 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZRANB2 1204113 384 chr1 72811800 72814775 72812426 N NA NA NA NA NA NA ZRANB2 1264828 385 chr1 73290451 73294865 73293695 N NA NA NA NA NA NA ZRANB2 1743479 386 chr1 74007010 74008961 74007701 N NA NA NA NA NA NA TYW3 1189875 387 chr1 76428590 76431380 76430518 N NA NA NA NA NA NA MSH4 166034 388 chr1 77165039 77166760 77165981 Y NA NA ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 ST6GALNAC5 166426 389 chr1 79295175 79301199 79298474 N NA NA NA NA NA NA IFI44 179698 390 chr1 7947893 7950122 7948785 N NA NA CAMTA1,VAMP3,PER3,UTS2,TNFRSF9 IMR90 Hi-C 24141950 PARK7 71592 391 chr1 79787636 79790588 79788732 N NA NA NA NA NA NA IFI44 672159 392 chr1 8099596 8102375 8100815 N NA ERRFI1 PARK7,ERRFI1,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 13203 393 chr1 8103071 8109734 8103299,8107087 N,N NA;NA ERRFI1 ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 16678 394 chr1 8118801 8123721 8119794,8121936 N,N NA;NA ERRFI1 ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 32408 395 chr1 8134293 8161658 8135853,8137874,8143602,8149921,8156250 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA ERRFI1 RERE,ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 47900 396 chr1 81629724 81666920 81640695,81643583,81640687 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LPHN2 599162 397 chr1 8166117 8172028 8167283 N NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 79724 398 chr1 8175727 8184997 8178457,8181390 N,N NA;NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 89334 399 chr1 8192398 8196092 8194113 N NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 106005 400 chr1 8196810 8199065 8197902 N NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 110417 401 chr1 82146781 82152513 82147928 N NA NA NA NA NA NA LPHN2 113569 402 chr1 82165426 82173748 82172521,82169741 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA LPHN2 92334 403 chr1 8242528 8245825 8242875,8244585 N,N NA;NA NA RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 156135 404 chr1 8253135 8268122 8254772,8258054,8262618,8266633,8264193 Y,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1,TNFRSF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 166742 405 chr1 8269601 8274871 8272106 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 183208 406 chr1 85068896 85070402 85069188 N NA CTBS PRKACB,CTBS,MCOLN2,RPF1,GNG5,C1orf180,UOX,LPAR3,SSX2IP IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 28733 407 chr1 86075696 86080347 86077767 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 29252 408 chr1 86626158 86633272 86628955,86633095 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ODF2L 228753 409 chr1 86670960 86674318 86673227 N NA NA NA NA NA NA ODF2L 187707 410 chr1 86682440 86683148 86682508 N NA NA NA NA NA NA ODF2L 178877 411 chr1 87238126 87241729 87240164 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 67873 412 chr1 87690605 87694378 87692185 Y NA NA LOC339524,LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 99773 413 chr1 88149053 88150777 88150040 N NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 354902 414 chr1 88419832 88423308 88421927 N NA NA LMO4,LOC339524,LOC100505768 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 625681 415 chr1 88805928 88810736 88807372 N NA NA NA NA NA NA PKN2 339186 416 chr1 8881890 8883608 8882980 N NA RERE ERRFI1,RERE,ENO1,ENO1-AS1,SLC2A5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RERE 4191 417 chr1 89765022 89765398 89765123 N NA NA NA NA NA NA LRRC8B 224999 418 chr1 91335757 91357382 91356722,91338086 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF644 130430 419 chr1 91545734 91548027 91546452 N NA NA NA NA NA NA ZNF644 57922 420 chr1 92034443 92036593 92035529 N NA NA TGFBR3,HSP90B3P,EPHX4,CDC7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC7 68039 421 chr1 92047360 92049535 92048431,92048228 Y,Y NA;NA NA TGFBR3,CDC7,HSP90B3P IMR90 Hi-C 24141950 CDC7 80956 422 chr1 92074469 92076452 92075329 N NA NA TGFBR3,HSP90B3P,CDC7,BRDT IMR90 Hi-C 24141950 CDC7 108065 423 chr1 92405982 92409386 92407408 N NA NA TGFBR3,CDC7 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP2 355136 424 chr1 9255729 9257854 9257049 N NA H6PD SLC2A7,SLC25A33,SPSB1,H6PD,TMEM201,MIR34A,GPR157,PIK3CD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H6PD 37009 425 chr1 94157294 94170888 94159611,94168437 N,N NA;NA BCAR3 BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 9909 426 chr1 94198704 94206006 94201478,94204166 Y,Y NA;NA NA BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR3 51319 427 chr1 94218352 94221738 94219836 N NA NA BCAR3,MIR760,FNBP1L,LOC100129046 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 70967 428 chr1 94291279 94294717 94294211 N NA NA BCAR3,MIR760,DR1,LOC100131564,FNBP1L,LOC100129046 IMR90 Hi-C 24141950 DNTTIP2 50045 429 chr1 94296288 94300119 94298507 N NA DNTTIP2 BCAR3,FNBP1L,LOC100131564,LOC100129046 IMR90 Hi-C 24141950 DNTTIP2 44643 430 chr1 94429127 94432352 94430462 N NA NA ABCA4,ARHGAP29 IMR90 Hi-C 24141950 GCLM 54115 431 chr1 9471766 9476411 9473325 N NA NA SPSB1,H6PD,SLC25A33 IMR90 Hi-C 24141950 SPSB1 118825 432 chr1 94719832 94728026 94720723,94724802,94725761 N,N,N NA;NA;NA ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 16525 433 chr1 94730092 94738710 94736500 N NA ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 26785 434 chr1 94767626 94793304 94790814,94779022 N,N NA;NA NA ARHGAP29,ABCA4,ABCD3,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 64319 435 chr1 9486903 9492575 9489086 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 106953 436 chr1 9496807 9500659 9498555 N NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 98869 437 chr1 95044448 95046945 95045593 N NA F3 F3,SLC44A3,CNN3,LOC729970,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 37035 438 chr1 95070516 95072286 95071590 N NA NA F3,SLC44A3,CNN3,ABCD3,LOC729970 IMR90 Hi-C 24141950 F3 63103 439 chr1 95085861 95090969 95088326 N NA NA F3,SLC44A3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 78448 440 chr1 95111079 95115031 95114021,95112005 Y,N F3;NA NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 103666 441 chr1 95118411 95119569 95118624 N NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 110998 442 chr1 95162934 95165614 95164595 N NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 120287 443 chr1 95176461 95181795 95179454 Y F3 NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 104106 444 chr1 95187652 95190852 95189661 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 95049 445 chr1 95199196 95204332 95200804,95199765 N,N NA;NA NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 81569 446 chr1 95245136 95252301 95249745,95251719 N,N NA;NA SLC44A3 ABCD3,ABCA4,F3,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 33600 447 chr1 95551146 95554834 95552924 N NA ALG14,TMEM56-RWDD3 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 12639 448 chr1 96826865 96830339 96828324 Y NA NA PTBP2 IMR90 Hi-C 24141950 PTBP2 356836 449 chr1 96881170 96883503 96882379 N NA NA PTBP2 IMR90 Hi-C 24141950 PTBP2 303672 450 chr1 96936297 96941000 96938903 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 246175 451 chr1 98408051 98410992 98409217 N NA NA DPYD,MIR137HG IMR90 Hi-C 24141950 PTBP2 1220876 452 chr1 98549880 98599859 98552546 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 1362705 453 chr1 98787603 98791588 98789396 N NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 FRRS1 1439761 454 chr10 102411246 102419450 102415227 N NA NA PAX2,FAM178A IMR90 Hi-C 24141950 HIF1AN 115605 455 chr10 102454596 102458947 102456524 N NA NA PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 HIF1AN 158955 456 chr10 102487686 102490777 102489059 N NA NA PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM178A 181549 457 chr10 103477885 103491601 103489875 N NA FGF8 MGEA5,NPM3,DPCD,MIR3158-2,FBXW4,POLL,BTRC,FGF8 IMR90 Hi-C 24141950 FGF8 48525 458 chr10 104965176 104967237 104965991 N NA NT5C2 SFXN2,ARL3,C10orf26,NT5C2 IMR90 Hi-C 24141950 NT5C2 12113 459 chr10 104988095 104993955 104991574 N NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020,ARL3,C10orf26,USMG5,PDCD11,INA,PCGF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 35032 460 chr10 105120043 105122649 105120801 N NA PCGF6,TAF5,USMG5,PDCD11 NA NA NA NA TAF5 5075 461 chr10 107529263 107531287 107530219 N NA NA NA NA NA NA ITPRIP 1435600 462 chr10 108182434 108186616 108184818 N NA NA NA NA NA NA ITPRIP 2088771 463 chr10 109670646 109680518 109675063 N NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2002793 464 chr10 110223768 110227991 110225795 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1455320 465 chr10 110340246 110362432 110360338,110361657,110358828 Y,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1320879 466 chr10 111435647 111437450 111436629 N NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 245861 467 chr10 112085105 112088598 112086726 N NA SMNDC1 DUSP5,SMC3,RBM20,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 20398 468 chr10 112112485 112114187 112113239 N NA SMNDC1 SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 47778 469 chr10 112131934 112137439 112132913,112136349 N,N NA;NA NA SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 67227 470 chr10 112157060 112161179 112159012 N NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92353 471 chr10 112172064 112176031 112174321 Y SMC3,DUSP5 NA DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 81594 472 chr10 112205652 112207994 112207153 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 49631 473 chr10 112246084 112248610 112247336 N NA DUSP5 DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 9015 474 chr10 115784036 115787877 115785930 N NA NA NHLRC2 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf118 146487 475 chr10 11691159 11693282 11692093 N NA USP6NL USP6NL,ECHDC3 IMR90 Hi-C 24141950 USP6NL 37480 476 chr10 11725679 11728099 11727478,11727010 N,N NA;NA NA USP6NL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECHDC3 56257 477 chr10 119200318 119202110 119201183 N NA NA NA NA NA NA PDZD8 65381 478 chr10 119220285 119222865 119221832 N NA NA EMX2OS,FAM204A IMR90 Hi-C 24141950 PDZD8 85348 479 chr10 120402352 120404344 120403911 N NA NA NA NA NA NA C10orf46 110414 480 chr10 120598053 120601581 120598257,120599770 N,N NA;NA NA PRLHR IMR90 Hi-C 24141950 C10orf46 83295 481 chr10 120838 123789 122441 N NA NA ZMYND11 MCF7 ChIA-PET 22265404 LARP4B 807913 482 chr10 120946252 120959625 120950050,120951622 N,N NA;NA SFXN4,PRDX3 GRK5,SFXN4,PRDX3,RGS10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRDX3 7907 483 chr10 121641606 121644509 121643152 N NA MCMBP,SEC23IP BAG3,INPP5F,MCMBP,SEC23IP IMR90 Hi-C 24141950 SEC23IP 7576 484 chr10 122174527 122177184 122175645 N NA NA NA NA NA NA WDR11 433503 485 chr10 122182578 122186435 122183810,122186059 N,N NA;NA NA NA NA NA NA WDR11 424252 486 chr10 123460996 123463724 123462323 N NA NA NA NA NA NA ATE1 223822 487 chr10 12374273 12379602 12375786 N NA CAMK1D CAMK1D,OPTN,CCDC3,CDC123 IMR90 Hi-C 24141950 CAMK1D 11981 488 chr10 126918812 126975510 126920307,126952070 N,N NA;NA NA FLJ37035,CTBP2,LOC283038 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTBP2 69188 489 chr10 127321382 127323781 127322380 N NA NA CTBP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 C10orf137 84303 490 chr10 128084877 128088432 128086744 N NA NA FANK1,ADAM12,C10orf90 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 505591 491 chr10 128583303 128590350 128589620 N NA DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 3673 492 chr10 129931603 129932140 129931767 N NA MKI67 PTPRE,MKI67 IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 7135 493 chr10 130426544 130430355 130428714 N NA NA NA NA NA NA MKI67 502076 494 chr10 13115088 13123289 13119055,13121594 N,N NA;NA OPTN CAMK1D,CDC123,CCDC3,SEC61A2,NUDT5,LOC283070 IMR90 Hi-C 24141950 OPTN 18793 495 chr10 132095575 132100048 132098371 N NA NA NA NA NA NA GLRX3 160936 496 chr10 133836313 133838506 133837261 N NA BNIP3 BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 40878 497 chr10 133877534 133882807 133879405 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 82099 498 chr10 134292798 134296770 134296040 N NA NA INPP5A IMR90 Hi-C 24141950 INPP5A 54583 499 chr10 134328128 134332868 134331376 N NA INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 INPP5A 18485 500 chr10 134822047 134825767 134823052 N NA NA LOC399829,INPP5A IMR90 Hi-C 24141950 ZNF511 296656 501 chr10 135332411 135336683 135333835 N NA NA LOC619207,SYCE1 IMR90 Hi-C 24141950 MTG1 124790 502 chr10 135458500 135464936 135462765,135464885 N,N NA;NA DUX4L2 NA NA NA NA DUX4L2 18742 503 chr10 135523901 135524745 135524362 N NA DUX4L2 NA NA NA NA DUX4L2 40223 504 chr10 14423197 14430589 14424887,14428210 N,N NA;NA NA FRMD4A,MIR1265,FAM107B,HSPA14,CDNF IMR90 Hi-C 24141950 CDNF 449394 505 chr10 14437712 14440862 14438886 N NA NA FRMD4A,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 CDNF 439121 506 chr10 14445838 14449026 14447345 Y NA NA FRMD4A,FAM107B,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 CDNF 430957 507 chr10 14517472 14520434 14519056 Y NA NA FRMD4A IMR90 Hi-C 24141950 CDNF 359549 508 chr10 15063526 15069229 15067534 N NA NA NA NA NA NA ACBD7 61546 509 chr10 17546199 17548205 17547114 N NA NA CUBN,ST8SIA6,PTPLA IMR90 Hi-C 24141950 PTPLA 111168 510 chr10 17551935 17556333 17554601 N NA NA CUBN,ST8SIA6,PTPLA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPLA 103040 511 chr10 17568376 17570784 17569722 Y VIM NA PTPLA IMR90 Hi-C 24141950 PTPLA 88589 512 chr10 19926633 19929426 19927711 Y NA NA NA NA NA NA ARL5B 978320 513 chr10 21578229 21586192 21582222 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 C10orf114 200021 514 chr10 21605447 21608573 21608444 N NA NA C10orf114,C10orf140 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf114 177640 515 chr10 21618742 21631963 21625933,21619685,21630085 N,N,N NA;NA;NA NA C10orf140,MLLT10 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf114 154250 516 chr10 22331223 22332766 22331910 N NA DNAJC1 NEBL,SPAG6,ARMC3,DNAJC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJC1 38573 517 chr10 22517367 22537531 22518367,22535293 N,N NA;NA LOC100130992 COMMD3-BMI1,LOC100499489,PIP4K2A,ARMC3,MSRB2,LOC100130992,DNAJC1,SPAG6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100130992 3470 518 chr10 23103786 23107623 23105647 N NA NA COMMD3-BMI1,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 PIP4K2A 100283 519 chr10 25102592 25105449 25104020 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 89995 520 chr10 25114516 25117115 25115592 N NA NA PRTFDC1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP21 101919 521 chr10 2539582 2550589 2543647 N NA NA ADARB2 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 559123 522 chr10 2614414 2619925 2616095,2618852 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PFKP 489787 523 chr10 27607633 27609805 27608694 N NA NA PDSS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ACBD5 76565 524 chr10 28574198 28578342 28577334 N NA MPP7 MPP7 IMR90 Hi-C 24141950 MPP7 3131 525 chr10 28579109 28596023 28592076 N NA MPP7 MPP7,MKX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPP7 8042 526 chr10 29042777 29046103 29044038 Y NA NA LOC100507605,LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 76353 527 chr10 29227091 29230696 29228851 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 260667 528 chr10 29274002 29278454 29275458,29277180,29277157 N,N,N NA;NA;NA NA LYZL1,BAMBI,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 307578 529 chr10 29407188 29410222 29408947 N NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 LOC387647 288279 530 chr10 29428287 29431619 29430074 N NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 LOC387647 266882 531 chr10 29447633 29454210 29449134,29452874 Y,N NA;NA NA WAC,LYZL1,BAMBI,CMTM7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 LOC387647 244291 532 chr10 30035192 30037706 30036293 N NA SVIL SVIL IMR90 Hi-C 24141950 SVIL 10462 533 chr10 30071300 30075194 30072659 N NA SVIL SVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 46570 534 chr10 30091356 30095276 30093026 Y SVIL NA SVIL,KIAA1462,MIR604 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 66626 535 chr10 30183977 30186323 30184499 N NA NA SVIL,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 SVIL 159247 536 chr10 30237276 30241547 30238791,30240960,30238615 N,N,N NA;NA;NA NA SVIL,KIAA1462,MTPAP,MAP3K8,MIR604 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 106941 537 chr10 30386370 30388558 30387846 N NA KIAA1462 MTPAP,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 37882 538 chr10 30470340 30473278 30471782 Y KIAA1462 NA KIAA1462,MTPAP,SVIL IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 121852 539 chr10 30475055 30476558 30475527 N NA NA KIAA1462,SVIL IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 126567 540 chr10 30479236 30481005 30479916 N NA NA KIAA1462,SVIL IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 130748 541 chr10 30508532 30509954 30509276 N NA NA KIAA1462,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 128313 542 chr10 30675068 30677786 30676393 N NA MTPAP,MAP3K8 KIAA1462,MAP3K8 IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 36801 543 chr10 30711086 30714385 30712392 N NA MAP3K8 MAP3K8 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 8565 544 chr10 30798434 30804752 30799732,30801676 Y,N ZNF438,MAP3K8;NA NA MAP3K8,LOC729668,KIAA1462 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 75484 545 chr10 30825611 30827717 30826679 N NA NA MAP3K8,KIAA1462,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 102661 546 chr10 30975949 31000479 30980867,30984883 N,N NA;NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1,SVIL,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 252999 547 chr10 31072412 31073738 31073034 N NA NA ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 247128 548 chr10 31387897 31389726 31388484 N NA NA ZEB1-AS1,ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 67031 549 chr10 31416844 31433054 31423279 N NA NA ZEB1-AS1,ZEB1,ARHGAP12,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 95978 550 chr10 31890280 31902087 31891998 N NA NA ZEB1,ARHGAP12,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1 282179 551 chr10 32043615 32055100 32049214,32043971 Y,N ZEB1,KIF5B;NA NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 162670 552 chr10 32056915 32057560 32057425 N NA NA ZNF438,ZEB1,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 160210 553 chr10 32227934 32237594 32229772,32236757 N,N NA;NA ARHGAP12 ARHGAP12,KIF5B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 10164 554 chr10 32656125 32669386 32668136 N NA EPC1 EPC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPC1 20012 555 chr10 3267374 3271223 3269737 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 52341 556 chr10 32733267 32738203 32735079 N NA NA C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 EPC1 97154 557 chr10 32799986 32811818 32800784 N NA NA NA NA NA NA EPC1 163873 558 chr10 33268022 33279010 33269571,33271027,33274731 Y,N,N C10orf68;NA;NA ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 20729 559 chr10 33291616 33326067 33294780,33299044 N,N NA;NA ITGB1 ITGB1,C10orf68,PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 44323 560 chr10 33417542 33420992 33418298 N NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 170249 561 chr10 33424007 33427172 33426691 N NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 176714 562 chr10 33653653 33656157 33654590 N NA NRP1 PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 29820 563 chr10 33665289 33668061 33666773 N NA NRP1 PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 41456 564 chr10 34090235 34092790 34090959 N NA NA PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 466402 565 chr10 3464534 3468589 3466872,3468404 N,N NA;NA NA KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 249501 566 chr10 3493333 3498119 3494926 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 278300 567 chr10 3506948 3512927 3507163,3510586,3512248 N,Y,N NA;KLF6;NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 291915 568 chr10 3536000 3538139 3536662 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 289334 569 chr10 36200034 36204548 36201846 N NA NA FZD8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD8 269672 570 chr10 37778840 37780956 37779381 N NA NA NA NA NA NA ZNF248 365530 571 chr10 37823669 37826525 37824943 N NA NA NA NA NA NA ZNF248 319961 572 chr10 38023552 38024824 38024187 N NA NA NA NA NA NA ZNF248 121662 573 chr10 3845997 3855373 3848432,3852767 Y,Y KLF6;KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6,AKR1E2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 18524 574 chr10 3861681 3864601 3862670 N NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 34208 575 chr10 3866087 3869464 3867647 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 38614 576 chr10 38772292 38818949 38776662,38792397,38806405,38808743,38780093,38784218,38801961,38804556,38789181,38814728,38785759,38818546,38796441,38773574,38790687,38811473,38799531 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC399744 55218 577 chr10 38868814 38875960 38869421,38871414,38873845 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC399744 151740 578 chr10 3892139 3896176 3894800 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 64666 579 chr10 39076461 39113892 39077327,39094082,39081539,39101312,39107261,39096759,39090270,39087820,39085936,39111981,39104570,39078787,39106076,39110160 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC399744 359387 580 chr10 39121929 39155018 39138915,39129106,39146748,39141501,39124711,39126753,39143638,39133961,39154886,39149849 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC399744 404855 581 chr10 3927624 3933681 3929400,3932191 N,Y NA;NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 100151 582 chr10 42354815 42383878 42373380,42354968,42381495,42368497,42375840 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC441666 479615 583 chr10 42397676 42401074 42400437 N NA NA NA NA NA NA LOC441666 462419 584 chr10 42403964 42406001 42404625 N NA NA NA NA NA NA LOC441666 457492 585 chr10 42607882 42622938 42622191,42609116 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC441666 240555 586 chr10 42640159 42651500 42646702 N NA NA NA NA NA NA LOC441666 211993 587 chr10 42659947 42661831 42661381 N NA NA NA NA NA NA LOC441666 201662 588 chr10 42677666 42688322 42683759 N NA NA NA NA NA NA LOC441666 175171 589 chr10 42710052 42713903 42712720 N NA NA NA NA NA NA LOC441666 149590 590 chr10 42735872 42746329 42738236 N NA NA NA NA NA NA LOC441666 117164 591 chr10 4276794 4286812 4283009,4285185 N,N NA;NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 433450 592 chr10 4287408 4299721 4289591,4292072 N,N NA;NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 420541 593 chr10 43166140 43189041 43187269 N NA ZNF33B NA NA NA NA ZNF33B 32148 594 chr10 4322092 4323563 4322726 N NA NA LOC100216001,LOC338588,PITRM1,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100216001 396699 595 chr10 43246618 43251305 43249479 Y NA BMS1 BMS1 IMR90 Hi-C 24141950 BMS1 26649 596 chr10 43259586 43263516 43260617 N NA BMS1 BMS1 IMR90 Hi-C 24141950 BMS1 14438 597 chr10 43455365 43457376 43456054 N NA NA RASGEF1A IMR90 Hi-C 24141950 CSGALNACT2 176558 598 chr10 4357274 4359944 4358880 Y NA NA KLF6,LOC338588,LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 360318 599 chr10 43781753 43784343 43782943 Y CSGALNACT2 NA NA NA NA NA HNRNPF 120353 600 chr10 43799416 43802600 43801380 N NA NA ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPF 102096 601 chr10 4385772 4387845 4386913 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 332417 602 chr10 4393648 4397778 4396025 N NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 322484 603 chr10 44499108 44507857 44500655,44503924,44506308 N,N,N NA;NA;NA NA TMEM72-AS1,C10orf136,LOC100506835,LOC283033,CXCL12 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF32 354782 604 chr10 44545784 44549278 44547275 N NA NA C10orf136,LOC100506835,LOC283033,CXCL12,TMEM72-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF32 401458 605 chr10 44675026 44676951 44675917 N NA NA TMEM72-AS1,LOC283033,LOC100506835 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF32 530700 606 chr10 44744079 44747531 44745132 N NA NA NA NA NA NA ZNF32 599753 607 chr10 45201163 45203334 45202354 N NA NA LOC100506835,TMEM72-AS1,C10orf136,ZNF32-AS3,ZNF32 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf10 270996 608 chr10 46186539 46192958 46186694 N NA ZFAND4,FAM21C NA NA NA NA ZFAND4 18288 609 chr10 47021460 47025838 47022786 N NA NA NA NA NA NA FAM35B 123819 610 chr10 47054886 47059124 47057509 Y NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 LOC643650 92276 611 chr10 47060050 47062262 47061801 N NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 LOC643650 89138 612 chr10 4732809 4735601 4733924 N NA LOC100216001 KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 12547 613 chr10 47652756 47655746 47654434 N NA NA LOC643650,GPRIN2,PPYR1,AGAP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANXA8L2 91174 614 chr10 4766231 4769687 4768365 N NA LOC100216001 LOC100216001,LOC338588 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100216001 45969 615 chr10 4804518 4807580 4806567 N NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100216001 84256 616 chr10 4812037 4815479 4813709 Y NA NA KLF6,PITRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100216001 91775 617 chr10 48334941 48337848 48336271 N NA NA LOC643650,RBP3,ZNF488 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANXA8 79716 618 chr10 4848737 4852228 4850325 N NA NA KLF6,NET1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 128475 619 chr10 4853273 4856913 4855302 Y NA NA KLF6,NET1,AKR1E2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 133011 620 chr10 48569841 48573184 48572130 N NA NA GPRIN2,GDF10 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA8 314616 621 chr10 48896351 48901367 48900107 N NA NA NA NA NA NA ANXA8 641126 622 chr10 51651565 51720196 51652106 N NA TIMM23,AGAP6 NA NA NA NA AGAP6 27882 623 chr10 52401292 52403893 52402890 N NA SGMS1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 SGMS1 17555 624 chr10 5293236 5296041 5294419 N NA NA NA NA NA NA NET1 158477 625 chr10 5323838 5337908 5326588,5333867 N,Y NA;NA NA tAKR,AKR1E2,AKR1C2,AKR1C3,AKR1C4,AKR1CL1 IMR90 Hi-C 24141950 NET1 116610 626 chr10 5349007 5361312 5359787,5357608 Y,N GDI2;NA NA tAKR,AKR1C2 IMR90 Hi-C 24141950 NET1 93206 627 chr10 54245888 54249679 54246723 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSTF2T 786533 628 chr10 54292315 54295590 54293867 Y DKK1 NA LOC100506939,DKK1 IMR90 Hi-C 24141950 CSTF2T 832960 629 chr10 54299833 54301729 54301098 N NA NA LOC100506939 IMR90 Hi-C 24141950 CSTF2T 840478 630 chr10 5631082 5633458 5632087 N NA NA NET1,CALML5,ASB13 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASB13 75100 631 chr10 56781206 56783752 56782428 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 1337282 632 chr10 57496497 57499145 57498331 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 621889 633 chr10 57654689 57665725 57659665 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 455309 634 chr10 57726738 57730813 57728910 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 390221 635 chr10 59451052 59452835 59452236 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 574859 636 chr10 59493855 59495092 59494095 N NA NA NA NA NA NA IPMK 532602 637 chr10 59782003 59784827 59783628 N NA NA NA NA NA NA IPMK 242867 638 chr10 59907409 59909004 59908221 N NA NA NA NA NA NA IPMK 118690 639 chr10 60614713 60618574 60616488 N NA NA BICC1 IMR90 Hi-C 24141950 BICC1 341809 640 chr10 60691569 60693569 60692462 N NA NA NA NA NA NA BICC1 418665 641 chr10 61524286 61525923 61524489 N NA NA NA NA NA NA CCDC6 140491 642 chr10 63387146 63390053 63388750 N NA NA RHOBTB1,C10orf107 IMR90 Hi-C 24141950 ARID5B 270960 643 chr10 63593764 63599821 63596375 N NA NA RHOBTB1,C10orf107,ARID5B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID5B 61192 644 chr10 64491650 64494639 64492910 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA EGR2,ZNF365,JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 ADO 69877 645 chr10 64751509 64753438 64752169 N NA NA ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 NRBF2 139569 646 chr10 64867361 64868850 64867518 N NA NRBF2 ZNF365,ADO,NRBF2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRBF2 24157 647 chr10 65459124 65461819 65460070 N NA NA JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 178001 648 chr10 65471095 65473161 65472278 N NA NA JMJD1C,REEP3,ZNF365,NRBF2,LOC84989 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 REEP3 189972 649 chr10 65954551 65960104 65957160 N NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 625181 650 chr10 67300546 67316922 67315356 N NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 715261 651 chr10 67329521 67335590 67330724 N NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 744236 652 chr10 67553649 67560582 67554355 N NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 968364 653 chr10 6762831 6765445 6764290 Y NA NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC439949 140444 654 chr10 6777383 6808266 6779842 N NA NA LOC100507127 IMR90 Hi-C 24141950 LOC439949 154996 655 chr10 69521003 69525408 69524479 N NA NA NA NA NA NA SIRT1 119019 656 chr10 69607862 69612276 69609240 Y NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 32151 657 chr10 69846212 69861388 69854690,69857045 N,Y NA;NA HERC4 ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,RUFY2,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HERC4 11109 658 chr10 70819912 70823417 70821238 Y DDX21,VPS26A,SRGN NA KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS26A 60491 659 chr10 72415890 72419963 72416381 Y ADAMTS14 NA ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1 IMR90 Hi-C 24141950 SGPL1 155741 660 chr10 72729783 72732364 72730826 Y NA NA CDH23,UNC5B IMR90 Hi-C 24141950 PCBD1 81242 661 chr10 72733261 72735320 72734291 N NA NA CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PCBD1 84720 662 chr10 73618919 73622322 73620349 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3,SPOCK2,DNAJB12,ASCC1,ANAPC16 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 7837 663 chr10 73627009 73632156 73628340 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 15927 664 chr10 73646393 73653742 73648878 N NA PSAP PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,CDH23,ASCC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 35311 665 chr10 73715152 73717644 73716219 N NA CHST3 CHST3,ASCC1,DNAJB12,ANAPC16,PSAP,SPOCK2 IMR90 Hi-C 24141950 CHST3 6476 666 chr10 74019052 74022702 74020684 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 10975 667 chr10 74435352 74439198 74436512,74436347,74436313 N,Y,Y NA;CCDC109A,ASCC1,ASCC1;CCDC109A,ASCC1,ASCC1 MICU1,MCU MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MCU 12691 668 chr10 75698977 75703434 75700512 N NA PLAU NA NA NA NA PLAU 28115 669 chr10 79478716 79483606 79482601 N NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 202742 670 chr10 79491019 79499060 79495390 N NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 187288 671 chr10 79517885 79521545 79519581 N NA NA KCNMA1,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 164803 672 chr10 80061492 80065306 80062790 N NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 267974 673 chr10 80166135 80168533 80167122 N NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 372617 674 chr10 80200799 80220555 80218003,80219731 N,N NA;NA NA RPS24,LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 407281 675 chr10 80515583 80518789 80516731 Y ZMIZ1 NA LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ1 310003 676 chr10 81096652 81099061 81097828 N NA PPIF ZMIZ1,PPIF IMR90 Hi-C 24141950 PPIF 8159 677 chr10 81246665 81249697 81247913 N NA ZCCHC24 ZCCHC24,PPIF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC24 41282 678 chr10 81428878 81440034 81435665,81430965 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642361 145624 679 chr10 81554377 81561875 81555417 N NA LOC642361 NA NA NA NA LOC642361 23783 680 chr10 81739675 81743295 81741468 N NA NA MAT1A IMR90 Hi-C 24141950 LOC100288974 75021 681 chr10 8186607 8190578 8188748 N NA NA NA NA NA NA GATA3 89940 682 chr10 82006226 82009055 82007074 N NA ANXA11,LOC439990 NA NA NA NA LOC439990 38760 683 chr10 8200626 8202758 8201392 N NA NA NA NA NA NA GATA3 103959 684 chr10 83358864 83361185 83360377 N NA NA NA NA NA NA TSPAN14 1144826 685 chr10 8347758 8349926 8348679 N NA NA NA NA NA NA GATA3 251091 686 chr10 8372867 8375663 8374387 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 276200 687 chr10 8406615 8423307 8408731,8411863 N,N NA;NA NA FLJ45983,GATA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GATA3 309948 688 chr10 85834818 85837264 85835979 N NA NA NA NA NA NA GHITM 61921 689 chr10 8762402 8764729 8764065 N NA NA GATA3,FLJ45983 MCF7 ChIA-PET 22265404 GATA3 665735 690 chr10 88159101 88161017 88160055 Y NA NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 120524 691 chr10 89877795 89879506 89878572 N NA NA PTEN,KLLN,RNLS,ATAD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTEN 254600 692 chr10 89910779 89914126 89912727 Y NA NA KLLN,PTEN,RNLS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTEN 287584 693 chr10 89914973 89918978 89916319 N NA NA KLLN,PTEN,RNLS IMR90 Hi-C 24141950 PTEN 291778 694 chr10 91036587 91039992 91038093,91039234 N,N NA;NA IFIT3 IFIT1,LIPA,IFIT2,IFIT3,IFIT1B,IFIT5,PANK1 IMR90 Hi-C 24141950 IFIT3 47610 695 chr10 92688712 92692108 92690650 N NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 7680 696 chr10 92922268 92937095 92923294 N NA PCGF5 ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 42813 697 chr10 9295009 9298645 9297232 N NA NA TAF3,ITIH5,GATA3,FLJ45983 IMR90 Hi-C 24141950 GATA3 1198342 698 chr10 93410716 93414651 93412801 N NA PPP1R3C LOC100188947,PPP1R3C,HECTD2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3C 17858 699 chr10 93442676 93445081 93443869 N NA PPP1R3C RPP30,LOC100188947,PPP1R3C,HECTD2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3C 49818 700 chr10 94581082 94583861 94581987 N NA NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF11 228257 701 chr10 94919337 94921856 94920864 N NA NA NA NA NA NA CYP26C1 98316 702 chr10 94958038 94960199 94959176 N NA NA EXOC6,CYP26C1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP26C1 137017 703 chr10 9526868 9529472 9527619 N NA NA NA NA NA NA SFTA1P 1307405 704 chr10 96139519 96143153 96140869 N NA NOC3L,TBC1D12 TBC1D12,NOC3L IMR90 Hi-C 24141950 NOC3L 16836 705 chr10 96156200 96157185 96156476 N NA NOC3L,TBC1D12 TBC1D12 MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D12 5001 706 chr10 96939998 96946928 96943582 Y SORBS1,SORBS1 NA SORBS1,C10orf129,PDLIM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALDH18A1 469639 707 chr10 978048 988368 978950 N NA LARP4B,GTPBP4 DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI2-AS1,IDI1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTPBP4 45981 708 chr10 97877636 97882668 97878796 N NA ZNF518A LOC728558 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF518A 6804 709 chr10 98561205 98561709 98561443 N NA LCOR NA NA NA NA LCOR 30308 710 chr11 100397794 100398625 100398321 N NA NA CNTN5 IMR90 Hi-C 24141950 YAP1 1582567 711 chr11 102126019 102128138 102127162 N NA NA YAP1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 60043 712 chr11 102182352 102185864 102183977 N NA BIRC3,BIRC2 YAP1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 2317 713 chr11 102423416 102425972 102424151 N NA NA BIRC2,TMEM123,MMP7,MMP20 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 99641 714 chr11 102865625 102868843 102867237 Y NA NA MMP13,DCUN1D5,MMP3 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D5 94101 715 chr11 103394725 103405247 103396205,103400502,103403416 N,N,N NA;NA;NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC2H1 414565 716 chr11 103414628 103418244 103415987 N NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC2H1 434468 717 chr11 103478761 103481089 103480035 N NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC2H1 498601 718 chr11 103493622 103497984 103496246 Y NA NA DYNC2H1,PDGFD IMR90 Hi-C 24141950 DYNC2H1 513462 719 chr11 105049305 105052726 105051950 N NA NA CASP1 IMR90 Hi-C 24141950 CASP4 209980 720 chr11 105158008 105162174 105160934 N NA NA CASP1,GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP4 318683 721 chr11 105212126 105214233 105212846 N NA NA NA NA NA NA CASP4 372801 722 chr11 105363636 105389224 105386774 N NA NA NA NA NA NA KIAA1826 503730 723 chr11 106261829 106263851 106262870 N NA NA GUCY1A2 IMR90 Hi-C 24141950 AASDHPPT 313537 724 chr11 106268292 106271697 106269978 N NA NA GUCY1A2 IMR90 Hi-C 24141950 AASDHPPT 320000 725 chr11 107138966 107148394 107148108 N NA NA NA NA NA NA CWF19L2 180178 726 chr11 108479524 108491338 108480624,108487568 N,Y NA;EXPH5 EXPH5,DDX10 EXPH5,NPAT,ATM IMR90 Hi-C 24141950 EXPH5 15150 727 chr11 109416667 109420534 109418210 N NA NA C11orf87 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 543553 728 chr11 109421377 109424167 109423105 N NA NA C11orf87 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 539920 729 chr11 10950869 10957927 10951383,10953290,10955723 N,N,Y NA;NA;NA NA EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC729013 71105 730 chr11 110219240 110223914 110219992 N NA NA C11orf53,RDX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RDX 51803 731 chr11 110959720 110969587 110968130 N NA NA ARHGAP20,FDX1,C11orf53 IMR90 Hi-C 24141950 LAYN 441646 732 chr11 111100674 111102522 111101517 N NA NA FDX1,ARHGAP20,C11orf53 IMR90 Hi-C 24141950 LAYN 308711 733 chr11 111310843 111313465 111312574 N NA NA FDX1,ARHGAP20,C11orf53,C11orf93,C11orf92,MIR4491,POU2AF1,LOC100132078,LAYN,PPP2R1B,SIK2 IMR90 Hi-C 24141950 LAYN 97768 734 chr11 112653723 112657427 112655973 Y NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC12 527824 735 chr11 113533353 113536823 113535618 N NA NA NA NA NA NA ZW10 107662 736 chr11 114235716 114240136 114237770 N NA C11orf71,RBM7 NNMT,REXO2,RBM7,C11orf71 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf71 31003 737 chr11 115793921 115797649 115795739 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 846065 738 chr11 116341460 116343787 116342500 N NA NA NA NA NA NA BUD13 299927 739 chr11 119454032 119455800 119455212 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 143635 740 chr11 120074980 120077678 120076287 N NA NA LOC100499227,TMEM136,POU2F3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM136 118160 741 chr11 120387321 120391373 120388415 N NA NA GRIK4,TECTA IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF12 179703 742 chr11 120403110 120404026 120403691 N NA NA ARHGEF12,GRIK4,TBCEL IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF12 195492 743 chr11 120435945 120439460 120436986 N NA NA GRIK4,ARHGEF12 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF12 228327 744 chr11 12062049 12067857 12066178,12064182 N,N NA;NA DKK3 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK3 31132 745 chr11 12084491 12090697 12088464 N NA MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 41441 746 chr11 12095208 12128160 12101820,12098354,12108950,12111958 Y,Y,N,Y DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2;PARVA,MICALCL,MICAL2;NA;NA MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL,TEAD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 3978 747 chr11 121105575 121111971 121108207,121110522 N,N NA;NA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 51417 748 chr11 121525460 121527485 121526556 Y NA NA NA NA NA NA SC5DL 362072 749 chr11 121557373 121567088 121559355 N NA NA MIR100HG,MIR125B1,BLID,MIRLET7A2 IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 393985 750 chr11 121589042 121595267 121593363 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 425654 751 chr11 122424734 122430028 122427539,122425923 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UBASH3B 96370 752 chr11 122451397 122454748 122451934 N NA NA CRTAM,C11orf63,SC5DL,SORL1,HSPA8,UBASH3B IMR90 Hi-C 24141950 UBASH3B 71650 753 chr11 122504400 122508218 122505295,122505365 N,N NA;NA UBASH3B CRTAM,UBASH3B,C11orf63 IMR90 Hi-C 24141950 UBASH3B 18180 754 chr11 122511536 122517392 122513531 N NA UBASH3B UBASH3B,CRTAM,C11orf63 IMR90 Hi-C 24141950 UBASH3B 9006 755 chr11 123171113 123174712 123172880 Y NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 CLMP 105106 756 chr11 123295997 123322803 123302259 N NA NA CLMP,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD1B 73725 757 chr11 123325542 123347521 123327169,123346386 N,N NA;NA GRAMD1B CLMP,HSPA8,MIR4493,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD1B 49007 758 chr11 123348091 123362150 123349062 N NA GRAMD1B CLMP,MIR4493,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD1B 34378 759 chr11 124064496 124066548 124065784 N NA NA NA NA NA NA TBRG1 426194 760 chr11 124351013 124352633 124351765 Y NA NA OR10G9,PANX3,TBRG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBRG1 140109 761 chr11 124705476 124707765 124706985 N NA C11orf61 SIAE,SPA17,C11orf61,TBRG1,PKNOX2,CCDC15,NRGN,ROBO3,ROBO4,HEPACAM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf61 35177 762 chr11 126032716 126049152 126048020 N NA RPUSD4,FAM118B CDON,DDX25,HYLS1,PUS3 IMR90 Hi-C 24141950 RPUSD4 32435 763 chr11 127921303 127924812 127923106 N NA NA KCNJ1,FLI1,LOC100507392 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 532641 764 chr11 127930678 127932446 127931615 N NA NA FLI1,LOC100507392,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 525007 765 chr11 128049379 128052154 128050721 N NA NA ETS1,FLI1,KCNJ1,TP53AIP1,LOC100507392,KCNJ5,C11orf45,ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 405299 766 chr11 128074736 128081699 128080491,128078401,128076734 N,N,N NA;NA;NA NA FLI1,LOC100507392,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 375754 767 chr11 128284052 128292374 128285693,128287698,128291423 N,N,N NA;NA;NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 165079 768 chr11 129148888 129154099 129150176 Y NA NA ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf45 372762 769 chr11 129163925 129167114 129165779 N NA NA ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf45 387799 770 chr11 129506181 129508571 129507598 N NA NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 256919 771 chr11 130392746 130395488 130393606 N NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB44 208139 772 chr11 130448576 130452377 130450894 N NA NA ADAMTS15,ADAMTS8 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB44 263969 773 chr11 130499764 130515792 130507046,130501092 Y,N NA;NA NA ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19 IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 270590 774 chr11 130650565 130654568 130652719 N NA NA ADAMTS8,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 131814 775 chr11 130868132 130870968 130869729 N NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 81750 776 chr11 130901216 130905264 130903375 N NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 114834 777 chr11 13093982 13096935 13095339 N NA NA NA NA NA NA LOC100506305 82887 778 chr11 13138402 13141717 13139915 N NA NA LOC100506305,RASSF10 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506305 127307 779 chr11 13228414 13231044 13229533 N NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506305 217319 780 chr11 13235407 13240121 13236302,13238130 N,Y NA;NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506305 224312 781 chr11 13282158 13284918 13283413 Y NA NA ARNTL,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 BTBD10 199920 782 chr11 133443923 133447604 133446335 N NA NA NA NA NA NA LOC283174 324031 783 chr11 134525856 134528829 134526987 N NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 ACAD8 402422 784 chr11 134581525 134583490 134582271 N NA NA NA NA NA NA ACAD8 458091 785 chr11 134628704 134658380 134632334 N NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 ACAD8 505270 786 chr11 134707837 134711385 134709798 N NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 ACAD8 584403 787 chr11 134817566 134826762 134820056 N NA NA NA NA NA NA ACAD8 694132 788 chr11 1403480 1407047 1404661 Y DUSP8,BRSK2 NA TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOLLIP 72588 789 chr11 14398105 14403802 14398687,14402795 N,N NA;NA NA RRAS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPB1 117639 790 chr11 14430654 14438535 14436922 Y NA NA RRAS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPB1 82906 791 chr11 14442393 14446675 14444120,14445052 N,N NA;NA NA RRAS2,COPB1,SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 COPB1 74766 792 chr11 15127515 15130267 15128652 N NA NA INSC IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 213764 793 chr11 15291817 15293808 15291988 N NA NA PLEKHA7 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 378066 794 chr11 17205614 17239979 17229630,17215587 N,N NA;NA PIK3C2A PIK3C2A,NUCB2,B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C2A 14260 795 chr11 174058 175166 174582 N NA BET1L,RIC8A NA NA NA NA BET1L 32256 796 chr11 17703395 17706359 17705140 N NA NA SERGEF,TPH1,MRGPRX4,MYOD1 IMR90 Hi-C 24141950 SERGEF 328278 797 chr11 1792671 1794810 1793896 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2 IFITM10 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2 IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 IFITM10 20847 798 chr11 18077606 18081333 18079192 N NA SERGEF,SAAL1 NA NA NA NA SERGEF 42969 799 chr11 19007811 19010194 19008773 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC13 128498 800 chr11 21692713 21696670 21692881 N NA NA NA NA NA NA FANCF 950717 801 chr11 23743627 23748643 23747560 N NA NA NA NA NA NA SVIP 892245 802 chr11 23923945 23926548 23924786 Y NA NA NA NA NA NA SVIP 1072563 803 chr11 27222597 27225507 27223693 Y NA NA LGR4,LIN7C,CCDC34 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC34 159288 804 chr11 27228963 27235922 27231316,27235090 Y,Y NA;NA NA LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC34 148873 805 chr11 27933888 27936122 27935649 N NA NA BDNF,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 193624 806 chr11 27947688 27951088 27948635 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 178658 807 chr11 27953917 27958439 27956267 N NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 171307 808 chr11 27995063 28000280 27998996 N NA NA KIF18A,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 129466 809 chr11 28586963 28590531 28588364 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 457165 810 chr11 28627671 28630601 28628734 N NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 497873 811 chr11 28777242 28784354 28778830,28782512 Y,N NA;NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 647444 812 chr11 28853632 28860220 28855444,28858060 Y,Y NA;NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 723834 813 chr11 32026208 32028650 32028014 N NA NA IMMP1L,PAX6,DKFZp686K1684,RCN1 IMR90 Hi-C 24141950 RCN1 83827 814 chr11 32157784 32160280 32158938 N NA RCN1 RCN1,DKFZp686K1684,PAX6 IMR90 Hi-C 24141950 RCN1 45307 815 chr11 32232504 32235102 32233029,32234437 N,N NA;NA NA DNAJC24 IMR90 Hi-C 24141950 RCN1 120027 816 chr11 34018471 34020183 34019238 N NA NA CAPRIN1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CAPRIN1 53047 817 chr11 34065734 34068727 34066629 N NA CAPRIN1 LMO2,CAPRIN1,NAT10,CAT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAPRIN1 4503 818 chr11 34591472 34594139 34592283 N NA NA APIP,CAT,ELF5,EHF,PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CAT 131000 819 chr11 34620648 34622699 34621340 N NA NA APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 CAT 160176 820 chr11 347356 357666 355465 N NA IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 RIC8A,SIRT3,BET1L,IFITM3,IFITM1,IFITM5,PSMD13,IFITM2,NLRP6,ATHL1,PTDSS2,SIGIRR,ANO9,B4GALNT4,PKP3,RNH1,SCGB1C1,ODF3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 B4GALNT4 12129 821 chr11 35051108 35054055 35052438 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 106362 822 chr11 35059721 35063398 35062241 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 97019 823 chr11 35102908 35106032 35104870 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 54385 824 chr11 35131427 35134069 35133081 N NA CD44 PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 26348 825 chr11 35550898 35553179 35551949 N NA NA PAMR1,FJX1 IMR90 Hi-C 24141950 FJX1 86556 826 chr11 35618164 35623145 35620272 N NA FJX1 PAMR1,LDLRAD3,COMMD9,PRR5L IMR90 Hi-C 24141950 FJX1 16590 827 chr11 36837975 36840318 36839511 N NA NA NA NA NA NA C11orf74 221882 828 chr11 37524199 37528322 37525905 Y NA NA NA NA NA NA C11orf74 908106 829 chr11 37807391 37811688 37807527,37810247 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA C11orf74 1191298 830 chr11 38958928 38965800 38963315 N NA NA NA NA NA NA LRRC4C 1349864 831 chr11 39167781 39175346 39173561 N NA NA NA NA NA NA LRRC4C 1140318 832 chr11 39179724 39184825 39183437 Y NA NA NA NA NA NA LRRC4C 1130839 833 chr11 40050636 40051883 40050973 N NA NA NA NA NA NA LRRC4C 263781 834 chr11 40348797 40353288 40350893 Y NA LRRC4C NA NA NA NA LRRC4C 33133 835 chr11 40408575 40412010 40410152 N NA NA NA NA NA NA LRRC4C 92911 836 chr11 40896909 40900022 40898669 N NA NA NA NA NA NA LRRC4C 581245 837 chr11 41143727 41146867 41144736 N NA NA NA NA NA NA LRRC4C 828063 838 chr11 43664567 43673941 43665746 N NA HSD17B12 HSD17B12 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B12 28202 839 chr11 44036797 44039545 44037869 N NA ACCS ALKBH3,LOC100507300 IMR90 Hi-C 24141950 ACCS 48184 840 chr11 46256957 46272554 46264973,46270404,46258866 Y,Y,Y NA;CREB3L1;DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 26674 841 chr11 46293333 46295478 46294569 N NA CREB3L1 CREB3L1,DGKZ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 3750 842 chr11 47939068 47942842 47939804 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 NA PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 PTPRJ 59268 843 chr11 51541304 51545076 51541466 N NA NA NA NA NA NA LOC646813 1172986 844 chr11 58537440 58540182 58538787 N NA NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 190853 845 chr11 58644800 58651261 58649679 N NA NA NA NA NA NA FAM111B 223397 846 chr11 59318760 59320381 59319833 N NA NA PATL1,OSBP K562 ChIA-PET 22265404 OSBP 63236 847 chr11 5955938 5965992 5959839 N NA NA NA NA NA NA TRIM22 245121 848 chr11 60820416 60830469 60828750 N NA NA CD6 IMR90 Hi-C 24141950 VPS37C 98447 849 chr11 63940910 63951238 63942257 N NA MACROD1,STIP1,FERMT3,TRPT1,NUDT22,DNAJC4 MACROD1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 STIP1 2349 850 chr11 64766545 64769531 64767609 N NA ARL2-SNX15,SAC3D1 ARL2-SNX15 K562 ChIA-PET 22265404 ARL2-SNX15 12054 851 chr11 64771817 64776582 64772227,64774723,64774682 N,N,N NA;NA;NA ARL2-SNX15,SAC3D1 ARL2-SNX15,MAP4K2,CDC42BPG,MEN1,BATF2,GPHA2,C11orf85,MRPL49,ZNHIT2,SYVN1,FAU K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARL2-SNX15 5003 852 chr11 66732066 66736322 66733030 N NA PC PC,SYT12,RHOD IMR90 Hi-C 24141950 PC 6219 853 chr11 67328825 67333994 67330997 N NA GSTP1,NDUFV1 CABP2,GSTP1,LOC100130987,PITPNM1,AIP,CDK2AP2 IMR90 Hi-C 24141950 GSTP1 17072 854 chr11 68810677 68812533 68811459 N NA TPCN2 TPCN2 K562 ChIA-PET 22265404 TPCN2 3817 855 chr11 68889411 68892421 68890393 N NA NA FGF4,ORAOV1,CCND1,TPCN2,MYEOV,FGF19,ANO1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPCN2 73061 856 chr11 68923241 68928519 68924494 N NA NA ORAOV1,CCND1,FGF19,MYEOV IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 106891 857 chr11 68932804 68939325 68934201 N NA NA ORAOV1,CCND1,MYEOV IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 116454 858 chr11 69233910 69238058 69235445 Y NA NA MYEOV,ORAOV1,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 172288 859 chr11 69251103 69253367 69252140 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 189481 860 chr11 69256748 69260016 69258283 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 195126 861 chr11 69792901 69797018 69795182 N NA NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 FADD 252251 862 chr11 70096234 70102505 70098244 N NA FADD,PPFIA1 PPFIA1,FADD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPFIA1 14301 863 chr11 71009247 71019048 71010553 N NA NA SHANK2,DHCR7,NADSYN1 IMR90 Hi-C 24141950 DHCR7 140429 864 chr11 72867563 72870573 72868646 Y NA FCHSD2 STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 14420 865 chr11 72894614 72911197 72896746 N NA FCHSD2 FCHSD2,ATG16L2,ARHGEF17,P2RY2,P2RY6,ARAP1,STARD10,MIR4692,RELT IMR90,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 FCHSD2 41471 866 chr11 73489069 73492772 73490728 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6145 867 chr11 74741188 74753669 74742567 Y ARRB1 NEU3 XRRA1,OR2AT4,SLCO2B1,SPCS2,NEU3,LOC100507050,ARRB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEU3 41238 868 chr11 74852838 74855734 74854359 N NA NA LOC100507050 K562 ChIA-PET 22265404 NEU3 152888 869 chr11 75247285 75260394 75248499 N NA GDPD5,SERPINH1 GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDPD5 10686 870 chr11 75945703 75947773 75946754 N NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 144107 871 chr11 76286040 76295811 76293584,76288510 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C11orf30 129971 872 chr11 76534390 76540949 76534869 Y GDPD4 TSKU,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 30968 873 chr11 79872101 79875546 79874448 N NA NA NA NA NA NA NARS2 1586192 874 chr11 7996064 8000370 7999057 N NA EIF3F LOC283299,NLRP10 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3F 8497 875 chr11 8045849 8052897 8047195 N NA EIF3F TUB,RIC3,PPFIBP2,LOC283299,EIF3F,LMO1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3F 36982 876 chr11 85826011 85830104 85827719 N NA PICALM PICALM,C11orf73,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 45088 877 chr11 85884224 85887571 85885390 Y NA NA PICALM,CCDC83,EED,C11orf73 IMR90 Hi-C 24141950 EED 68235 878 chr11 86405064 86408798 86406931 N NA NA ME3,PRSS23 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 340088 879 chr11 86428295 86433661 86431782 N NA NA PRSS23,ME3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM135 315225 880 chr11 86435455 86439728 86437536 N NA NA PRSS23,ME3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 309158 881 chr11 86443365 86456279 86445626,86453193 N,Y NA;NA NA PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM135 292607 882 chr11 89975680 89980587 89976862 N NA CHORDC1 CHORDC1 K562 ChIA-PET 22265404 CHORDC1 19148 883 chr11 90185479 90190986 90188175 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 228947 884 chr11 90195935 90200806 90198936 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 239403 885 chr11 90794324 90801423 90795975 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 837792 886 chr11 91713501 91716948 91715047 N NA NA NA NA NA NA SLC36A4 1214147 887 chr11 918566 921588 919336 N NA AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 4221 888 chr11 92787394 92790942 92788827 N NA NA MTNR1B,SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 140153 889 chr11 9362877 9403186 9379171,9373805,9371206,9364478,9385983 N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 TMEM41B,IPO7 DENND5A,ZNF143,IPO7,TMEM41B,LOC644656,KRT8P41,SCUBE2,NRIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 2983 890 chr11 94464802 94466869 94465727 N NA AMOTL1 AMOTL1 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL1 34639 891 chr11 94469371 94473001 94470581 N NA AMOTL1 AMOTL1 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL1 28507 892 chr11 94986718 94988488 94987648 Y NA NA NA NA NA NA SRSF8 186662 893 chr11 9585297 9590118 9587699 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5110 894 chr11 9634072 9636722 9634859 N NA WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 38844 895 chr12 100381654 100384321 100384014 N NA NA NA NA NA NA UHRF1BP1L 152321 896 chr12 102959713 102989277 102960918 N NA NA IGF1,DRAM1,PARPBP IMR90 Hi-C 24141950 PARPBP 445757 897 chr12 103659975 103668669 103663435,103666926 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NT5DC3 566306 898 chr12 103953743 103956062 103954605 N NA NA NA NA NA NA NT5DC3 278913 899 chr12 105334551 105355024 105339087,105353075 N,N NA;NA C12orf45 TXNRD1,CHST11,SLC41A2,C12orf45,ALDH1L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf45 25074 900 chr12 105646005 105652103 105647986,105650596 N,N NA;NA APPL2 C12orf75,APPL2,KIAA1033,NUAK1,TCP11L2 IMR90 Hi-C 24141950 APPL2 15997 901 chr12 105810838 105813782 105812204 Y NA NA NUAK1,APPL2,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf75 86424 902 chr12 105954802 105957616 105956356 N NA NA NUAK1,CKAP4 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 230388 903 chr12 106314897 106317590 106316552 Y NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 NUAK1 216221 904 chr12 106326692 106330136 106328179 Y CKAP4 NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUAK1 203675 905 chr12 106409285 106412237 106410340 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 NUAK1 121574 906 chr12 106422273 106425900 106424308 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 NUAK1 107911 907 chr12 1078874 1090126 1087404 N NA RAD52,ERC1 RAD52,ERC1,LOC100292680,NINJ2,B4GALNT3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERC1 10278 908 chr12 10891212 10894229 10892613 N NA CSDA CSDA MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CSDA 15259 909 chr12 109127470 109129276 109128384 N NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 2175 910 chr12 110701990 110702678 110702473 N NA ATP2A2 IFT81,ANKRD13A,ATP2A2,GIT2,ANAPC7,C12orf76 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2A2 16354 911 chr12 110705766 110711916 110708520 N NA ATP2A2 ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81,ANAPC7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2A2 7116 912 chr12 114025382 114031022 114028133,114029319 N,Y NA;LHX5 NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 SDSL 165166 913 chr12 114164289 114166787 114165656 N NA NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 RBM19 237389 914 chr12 114753237 114756128 114754108 N NA NA NA NA NA NA RBM19 349061 915 chr12 115211301 115215869 115212173,115215022 N,N NA;NA NA TBX3,MED13L IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 89332 916 chr12 115271336 115274572 115272846 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 149367 917 chr12 115339710 115344887 115341265 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 217741 918 chr12 115350689 115354647 115353269 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 228720 919 chr12 115591667 115595785 115593599 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 469698 920 chr12 115756601 115781166 115774015,115775884,115759065,115779465 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 634632 921 chr12 115790666 115793891 115792003 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 668697 922 chr12 115811604 115814477 115813002 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 689635 923 chr12 115840417 115844673 115843132 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 718448 924 chr12 116007042 116010563 116008005 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 704428 925 chr12 116035447 116038366 116037512 N NA NA NA NA NA NA MED13L 676625 926 chr12 116096959 116098900 116098305 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 616091 927 chr12 116756240 116759053 116758018 N NA MED13L MED13L,MIR4472-2,LINC00173,C12orf49 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 41249 928 chr12 116773243 116774569 116773943 Y MAP1LC3B2,MED13L NA MED13L IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 58252 929 chr12 116795239 116799210 116796956 Y NA NA MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 80248 930 chr12 116816149 116830047 116820265,116828935 N,N NA;NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 101158 931 chr12 116871000 116874140 116872243 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 97100 932 chr12 116891228 116895361 116893313 N NA NA MIR4472-2,MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 75879 933 chr12 116961139 116965529 116963430 N NA LINC00173 LINC00173,MED13L,MIR4472-2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 5711 934 chr12 11777632 11782532 11780314 N NA ETV6 ETV6,MANSC1,BCL2L14 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 20256 935 chr12 118544419 118546124 118545725 N NA WSB2,PEBP1 NA NA NA NA PEBP1 27746 936 chr12 120377510 120380158 120378942 N NA CCDC64 CIT,TMEM233 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC64 47490 937 chr12 120714268 120715870 120715252 N NA PXN,SIRT4 GCN1L1,LOC100506649,PXN IMR90 Hi-C 24141950 PXN 10694 938 chr12 120719679 120720992 120720336 N NA PXN,SIRT4 GCN1L1,LOC100506649,PXN,RPLP0 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PXN 16105 939 chr12 120727618 120732429 120730452,120728697 N,Y NA;NA PXN,SIRT4 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIRT4 7695 940 chr12 12110485 12113960 12112094 N NA NA ETV6,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 LRP6 305851 941 chr12 121374236 121375567 121374508 N NA SPPL3 POP5,SPPL3,CABP1,MLEC,ACADS,UNC119B,CAMKK2,P2RX4 IMR90 Hi-C 24141950 SPPL3 32081 942 chr12 121496417 121499878 121498446 N NA C12orf43 SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RNF10,POP5,CABP1,HNF1A-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf43 42117 943 chr12 121565837 121568473 121566887 N NA NA P2RX4,P2RX7 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 P2RX4 79191 944 chr12 12160267 12164176 12162341 Y ETV6,LOH12CR1,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 LRP6 255635 945 chr12 122026342 122030096 122028160 N NA KDM2B,ORAI1 KDM2B,ANAPC5,CAMKK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KDM2B 7422 946 chr12 12205197 12207309 12206374 N NA NA LOC338817,MANSC1,BCL2L14 IMR90 Hi-C 24141950 LRP6 212502 947 chr12 122123932 122126606 122124930 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B,RHOF K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 24052 948 chr12 123839396 123847035 123845454 N NA SBNO1,SETD8 SBNO1,RILPL1 IMR90 Hi-C 24141950 SBNO1 4408 949 chr12 123848685 123853343 123850168 N NA SBNO1,SETD8 SBNO1,RILPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SBNO1 13697 950 chr12 12424683 12429576 12426277 N NA LRP6 BCL2L14,LRP6,MIR1244-2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP6 4872 951 chr12 12435135 12436922 12436376 N NA LRP6 BCL2L14,LRP6,MIR1244-2,ETV6,MANSC1,GPR19 IMR90 Hi-C 24141950 LRP6 15324 952 chr12 125065314 125066848 125065979 N NA NCOR2 NCOR2,SCARB1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NCOR2 13304 953 chr12 125138478 125141715 125140011 N NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 86468 954 chr12 125204277 125207840 125205748 Y UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 140679 955 chr12 125224515 125227144 125225522 N NA NA NCOR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCARB1 121375 956 chr12 126886386 126889059 126887399 N NA NA NA NA NA NA LOC387895 367749 957 chr12 127149948 127155349 127152766 N NA NA NA NA NA NA LOC387895 101459 958 chr12 12744853 12746437 12746001 N NA DUSP16,CREBL2 DUSP16,LOH12CR1,GPR19,CDKN1B,ETV6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CREBL2 18394 959 chr12 127554072 127561553 127556691 N NA NA NA NA NA NA LOC387895 297264 960 chr12 127566732 127569291 127568075 Y NA NA NA NA NA NA LOC387895 309924 961 chr12 127609068 127613515 127610327 N NA NA NA NA NA NA LOC387895 352260 962 chr12 127627660 127639027 127630661 N NA NA NA NA NA NA LOC387895 370852 963 chr12 127713644 127722091 127715601 Y NA NA NA NA NA NA LOC387895 456836 964 chr12 127883179 127887770 127885386 N NA NA NA NA NA NA LOC387895 626371 965 chr12 128277226 128279078 128278114 N NA NA NA NA NA NA LOC387895 1020418 966 chr12 131915318 131928005 131917144,131919146 N,N NA;NA NA GPR133 IMR90 Hi-C 24141950 SFSWAP 267630 967 chr12 13325460 13329581 13326738 Y EMP1 EMP1 HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EMP1 20021 968 chr12 13330950 13335735 13332620,13334426 N,N NA;NA EMP1 HTR7P1,HEBP1,KIAA1467,GSG1,EMP1 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 13867 969 chr12 13491885 13493847 13492601 N NA NA GRIN2B IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 142283 970 chr12 13589017 13590737 13589968 N NA NA NA NA NA NA EMP1 239415 971 chr12 13674999 13681701 13677068,13678140 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA EMP1 325397 972 chr12 14412276 14415211 14413222 N NA NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 103400 973 chr12 1709505 1712523 1710864 N NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 6174 974 chr12 1713477 1716553 1714966 N NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 10146 975 chr12 17872742 17877969 17877163 N NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 1404657 976 chr12 19584045 19587516 19584957 N NA AEBP2 AEBP2 IMR90 Hi-C 24141950 AEBP2 5092 977 chr12 19999132 20001642 20000125 N NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 AEBP2 406524 978 chr12 20013946 20017208 20015453 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 421338 979 chr12 20099017 20101935 20099677 Y PDE3A NA LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 AEBP2 506409 980 chr12 2142553 2153603 2144278,2144268 Y,N LRTM2;NA DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B,LRTM2 IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 28876 981 chr12 21571430 21575629 21571938 N NA PYROXD1 NA NA NA NA PYROXD1 14909 982 chr12 22254575 22256531 22254948 N NA NA ST8SIA1,KIAA0528 IMR90 Hi-C 24141950 CMAS 55416 983 chr12 24871326 24873651 24872543 N NA NA SOX5,LINC00477 IMR90 Hi-C 24141950 BCAT1 228742 984 chr12 25485508 25488819 25486903 N NA NA KRAS,LOC100506451,RASSF8 IMR90 Hi-C 24141950 KRAS 81654 985 chr12 25539079 25541406 25540021 N NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 135225 986 chr12 25610434 25612342 25611285 Y NA NA RASSF8,LOC100506451,IFLTD1,MIR4302 IMR90 Hi-C 24141950 KRAS 206580 987 chr12 26304523 26308701 26306530 N NA BHLHE41 ITPR2,BHLHE41,SSPN IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 26520 988 chr12 26420850 26430158 26424696,26427812 N,Y NA;NA NA SSPN,ITPR2,BHLHE41 IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 142847 989 chr12 26451327 26453873 26452257 N NA NA BHLHE41,SSPN,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 173324 990 chr12 27329374 27351594 27331468,27346882 N,Y NA;NA STK38L STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 45484 991 chr12 27995542 27999388 27997329 N NA NA PTHLH,KLHDC5,MRPS35 IMR90 Hi-C 24141950 KLHDC5 62355 992 chr12 28020246 28023213 28021193 N NA NA PTHLH,MRPS35,KLHDC5 IMR90 Hi-C 24141950 KLHDC5 87059 993 chr12 28174611 28181317 28176583,28179827 N,Y NA;PTHLH,PTHLH NA PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 228816 994 chr12 28283040 28285259 28283833 Y PTHLH,PTHLH NA PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 124874 995 chr12 28910909 28919247 28912969 N NA NA NA NA NA NA CCDC91 500776 996 chr12 29088943 29092149 29090219 N NA NA KLHDC5 IMR90 Hi-C 24141950 ERGIC2 441994 997 chr12 29190433 29207054 29194855 Y NA NA CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 ERGIC2 327089 998 chr12 29299190 29322295 29301603 N NA NA FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 ERGIC2 211848 999 chr12 31397085 31400166 31399348 N NA NA FAM60A,LOC100506660 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ13224 77084 1000 chr12 31781721 31789241 31788449 N NA DENND5B DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 DENND5B 37769 1001 chr12 31897010 31911202 31899891,31906194 Y,N AMN1,H3F3C;NA AMN1 METTL20,AMN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMN1 14902 1002 chr12 31915361 31918761 31916151 N NA AMN1 NA NA NA NA AMN1 33253 1003 chr12 31956448 31958882 31957788 N NA NA NA NA NA NA AMN1 74340 1004 chr12 32026666 32030214 32028451 N NA NA NA NA NA NA C12orf35 82139 1005 chr12 32049099 32051795 32051043 N NA NA AMN1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf35 60558 1006 chr12 32074345 32076750 32075796 N NA C12orf35 NA NA NA NA C12orf35 35603 1007 chr12 32085834 32091033 32087498 N NA C12orf35 BICD1,AMN1,C12orf35 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf35 21320 1008 chr12 32826772 32829838 32827807 N NA DNM1L BICD1,FGD4,C12orf35,DNM1L IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 2299 1009 chr12 33947321 33953090 33948645 N NA NA NA NA NA NA ALG10 222126 1010 chr12 34369210 34372417 34371730 N NA NA NA NA NA NA ALG10 193994 1011 chr12 34407825 34410471 34408514 N NA NA NA NA NA NA ALG10 232609 1012 chr12 34417112 34419036 34417862 N NA NA NA NA NA NA ALG10 241896 1013 chr12 34441933 34445482 34443232 N NA NA NA NA NA NA ALG10 266717 1014 chr12 34483915 34491669 34488973 N NA NA NA NA NA NA ALG10 308699 1015 chr12 34493559 34507914 34500426,34503782 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA ALG10 318343 1016 chr12 34837417 34839262 34838206 N NA NA NA NA NA NA ALG10 662201 1017 chr12 34840950 34842820 34842316 N NA NA NA NA NA NA ALG10 665734 1018 chr12 38448333 38453609 38450023 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 256948 1019 chr12 38534689 38544922 38536104,38538702,38541140,38543005 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ALG10B 165635 1020 chr12 39323976 39326239 39325014 N NA CPNE8 NA NA NA NA CPNE8 24556 1021 chr12 39376064 39377757 39376878 N NA NA NA NA NA NA CPNE8 76644 1022 chr12 39628570 39631926 39630099 N NA NA NA NA NA NA KIF21A 205266 1023 chr12 42102100 42104944 42103762 N NA NA NA NA NA NA GXYLT1 433729 1024 chr12 42168313 42168596 42168456 N NA NA PDZRN4 IMR90 Hi-C 24141950 GXYLT1 370077 1025 chr12 42325391 42327981 42326443 N NA NA PDZRN4 IMR90 Hi-C 24141950 GXYLT1 210692 1026 chr12 4250910 4253291 4252305 Y EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 129611 1027 chr12 4272527 4276271 4274065 N NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 106631 1028 chr12 43149813 43152366 43150765 N NA NA NA NA NA NA PPHLN1 429866 1029 chr12 43352758 43357216 43354464 N NA NA PRICKLE1 IMR90 Hi-C 24141950 PPHLN1 632811 1030 chr12 4363639 4365443 4364801 N NA CCND2 NA NA NA NA CCND2 17459 1031 chr12 43962228 43964901 43963355 N NA NA NA NA NA NA PUS7L 187695 1032 chr12 43971935 43973267 43972879 N NA NA NA NA NA NA PUS7L 179329 1033 chr12 45338426 45343800 45342780 N NA NA NA NA NA NA RACGAP1P 115394 1034 chr12 46067329 46070863 46068643 N NA NA ANO6 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400027 50841 1035 chr12 46777631 46795751 46779413 N NA SLC38A2 SLC38A1,SLC38A4 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A2 10986 1036 chr12 46820657 46828241 46824407,46825863 Y,Y NA;NA NA SLC38A2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 54012 1037 chr12 46849246 46890233 46887333,46864747,46851334,46867615 N,N,N,Y NA;NA;NA;NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A2 82601 1038 chr12 46897603 46920871 46918022 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A2 130958 1039 chr12 46941602 46950394 46943895,46949781,46947498 Y,N,N SLC38A2;NA;NA NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 174957 1040 chr12 46954629 46959054 46956524 N NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC38A2 187984 1041 chr12 47054193 47060296 47058917,47055303 Y,N SLC38A2;NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 287548 1042 chr12 47352081 47354820 47353594 N NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 118914 1043 chr12 47355991 47360267 47358226 N NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 113467 1044 chr12 47407687 47412957 47408439,47411877 N,N NA;NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 60777 1045 chr12 47416495 47418141 47417895 N NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 55593 1046 chr12 47477003 47482923 47479735,47482444 N,Y NA;NA AMIGO2 AMIGO2 K562 ChIA-PET 22265404 AMIGO2 3269 1047 chr12 47487088 47498683 47489472,47491348 N,N NA;NA AMIGO2 AMIGO2,FAM113B,MIR4698,RPAP3,SLC38A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AMIGO2 13354 1048 chr12 47663076 47668328 47665126,47667176 N,N NA;NA NA FAM113B,AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 189342 1049 chr12 47669403 47677666 47671422,47675992 N,N NA;NA NA AMIGO2,FAM113B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 195669 1050 chr12 47690126 47693320 47691300 N NA NA AMIGO2,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 216392 1051 chr12 48689444 48692753 48690505 N NA NA NA NA NA NA ZNF641 52276 1052 chr12 49616025 49617209 49616719 N NA TUBA1A,TUBA1C TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B,PRPH IMR90 Hi-C 24141950 TUBA1A 33164 1053 chr12 49623750 49630623 49628371 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1A,TUBA1C RHEBL1,DHH,LMBR1L,TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 28242 1054 chr12 49643865 49648370 49646809 N NA TUBA1C RHEBL1,TUBA1A,MLL2,TUBA1C,PRPH,TUBA1B,DHH,LMBR1L IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 10495 1055 chr12 5105499 5109250 5107352 N NA NA ANO2,KCNA6,VWF,KCNA1,NTF3 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA9 347235 1056 chr12 5194357 5199459 5195388,5198240 N,Y NA;NA NA KCNA6,NTF3,ANO2,VWF IMR90 Hi-C 24141950 NTF3 341821 1057 chr12 5271809 5277677 5276396,5273058 N,N NA;NA NA ANO2,NTF3,VWF IMR90 Hi-C 24141950 NTF3 263603 1058 chr12 53735399 53739884 53735654,53738919 N,N NA;NA PFDN5,C12orf10,AAAS,SP1 ESPL1,PFDN5,C12orf10,AAAS,CSAD,RARG,MFSD5,SP7,SP1,AMHR2,PCBP2,PRR13,ATF7,NPFF,TARBP2,MAP3K12,LOC100652999 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AAAS 19987 1059 chr12 53763754 53768970 53765027,53766616 N,N NA;NA AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 5009 1060 chr12 54162690 54165313 54164195 N NA CALCOCO1 HOTAIR,HOXC13,ATP5G2,CALCOCO1,HOXC12,HOXC10,HOXC11,HOXC8,HOXC4,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,ZNF385A,GPR84,FLJ12825 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 41383 1061 chr12 54237798 54240835 54239428 N NA NA HOXC13,HOXC8,HOXC9,MIR196A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HOXC13 91741 1062 chr12 54815816 54818194 54817185 Y GPR84,ZNF385A,ITGA5,NCKAP1L ZNF385A,ITGA5,GTSF1 ZNF385A IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 2766 1063 chr12 5497851 5507588 5500223,5498009 N,N NA;NA NTF3 VWF,ANO2 IMR90 Hi-C 24141950 NTF3 33692 1064 chr12 56892455 56897113 56894172,56894332 N,N NA;NA TIMELESS,SPRYD4,RBMS2 BAZ2A,MIP,TIMELESS,GLS2,ATP5B,RBMS2,PTGES3 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS2 18496 1065 chr12 57751036 57760868 57760538 N NA R3HDM2 INHBC,R3HDM2,ARHGAP9 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 46790 1066 chr12 57780611 57787500 57785766,57783067 N,N NA;NA NA R3HDM2,ARHGAP9,INHBC,STAC3 IMR90 Hi-C 24141950 INHBE 61596 1067 chr12 57793945 57816027 57796236,57814942,57814961 N,N,N NA;NA;NA INHBE,GLI1 R3HDM2,INHBC,STAC3,LRP1,SHMT2,NDUFA4L2,ARHGAP9,INHBE,MBD6,GLI1,DDIT3,MARS IMR90 Hi-C 24141950 INHBE 33069 1068 chr12 57818107 57823124 57821160 N NA INHBE,GLI1 R3HDM2,SHMT2,NDUFA4L2,STAC3,INHBE,GLI1,INHBC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INHBE 25972 1069 chr12 58257018 58262491 58258952 N NA CTDSP2 CTDSP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 16271 1070 chr12 58273458 58276184 58274797 N NA CTDSP2 AVIL,CTDSP2,TSFM,METTL21B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 32711 1071 chr12 58284879 58290565 58290486,58287695 N,N NA;NA CTDSP2,LOC100506844,XRCC6BP1 CTDSP2,TSFM,AVIL,CDK4,METTL21B,CYP27B1,METTL1,MARCH9,TSPAN31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506844 39382 1072 chr12 58818560 58825972 58819405 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC6BP1 483115 1073 chr12 59433578 59436800 59435373 Y NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 119316 1074 chr12 59447359 59450395 59447514,59449425 N,Y NA;LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA LRIG3 133097 1075 chr12 59988181 59998988 59990857 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 673919 1076 chr12 60541459 60543201 60542453 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 1227197 1077 chr12 6275401 6279036 6277154 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 30446 1078 chr12 63438298 63439684 63439225 N NA NA PPM1H IMR90 Hi-C 24141950 C12orf61 441084 1079 chr12 6385630 6390923 6388724 N NA NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF1A 60360 1080 chr12 6403258 6406839 6404489 Y NA TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2,VAMP1,SCNN1A,TAPBPL,LTBR IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 44444 1081 chr12 65173143 65189615 65174362 N NA GNS TBC1D30,GNS,WIF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GNS 19917 1082 chr12 65887364 65891710 65889189 Y NA NA MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 MSRB3 214941 1083 chr12 65892853 65896448 65894314 N NA NA MSRB3,HMGA2 IMR90 Hi-C 24141950 MSRB3 220430 1084 chr12 65924876 65933011 65927492,65930926,65931512 N,Y,N NA;HMGA2;NA NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 MSRB3 252453 1085 chr12 65958401 65963785 65959972,65962424 N,N NA;NA NA HMGA2,MSRB3,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 254455 1086 chr12 65995726 66007820 65996998 N NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 210420 1087 chr12 66023755 66027761 66025554 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 190479 1088 chr12 66041199 66044779 66043026 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 173461 1089 chr12 66051004 66052291 66051381 N NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 165949 1090 chr12 66088344 66091391 66089445 Y IRAK3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 126849 1091 chr12 66112495 66115993 66114238 N NA NA MSRB3,RPSAP52,HMGA2 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 102247 1092 chr12 66121712 66124518 66123037 N NA NA MSRB3,RPSAP52,HMGA2 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 93722 1093 chr12 66428090 66431838 66430268 N NA NA HMGA2,MSRB3,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 LLPH 92695 1094 chr12 67827522 67830416 67828267 N NA NA DYRK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CAND1 164461 1095 chr12 68219966 68222787 68221719 Y NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 177454 1096 chr12 68301914 68306244 68303887 N NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 259402 1097 chr12 68757221 68760137 68759035 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 31060 1098 chr12 68818697 68821176 68819876 N NA NA NA NA NA NA MDM1 92536 1099 chr12 68889550 68893283 68891658 N NA NA RAP1B,IL26,NUP107 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 111336 1100 chr12 68951437 68957708 68954291 Y CPM,RAP1B RAP1B MDM1 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 46911 1101 chr12 69445165 69448708 69447042 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM,MDM2 IMR90 Hi-C 24141950 CPSF6 184609 1102 chr12 69549629 69551889 69551007 N NA NA CPM,CPSF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPSF6 81428 1103 chr12 76049366 76056879 76052329 N NA NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8,KRR1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 143948 1104 chr12 76118408 76120754 76118918 N NA NA PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRR1 212990 1105 chr12 76370430 76373751 76372606 N NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 51805 1106 chr12 76497224 76503550 76502280,76499654 N,N NA;NA NAP1L1 OSBPL8,KRR1,NAP1L1,BBS10 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1 18486 1107 chr12 76576394 76579494 76577415 N NA NA NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1 97656 1108 chr12 76629594 76633166 76631448 N NA NA NAP1L1,PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 BBS10 109056 1109 chr12 76659567 76662606 76660831 N NA NA NAP1L1,PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 BBS10 79616 1110 chr12 76669160 76673643 76671514 N NA NA NAP1L1,PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 BBS10 68579 1111 chr12 76684278 76691182 76686685 N NA NA NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 BBS10 51040 1112 chr12 76692782 76698638 76694163 N NA BBS10 NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 BBS10 43584 1113 chr12 7707856 7710061 7708536 Y PEX5,CD163L1,SLC2A3,CD163 NA NA NA NA NA NANOGNB 207751 1114 chr12 77111660 77116484 77113845 N NA ZDHHC17 ZDHHC17 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZDHHC17 41370 1115 chr12 7735203 7738272 7736973 Y PEX5,SLC2A3,NECAP1,C3AR1 NA NA NA NA NA NANOGNB 179540 1116 chr12 77515041 77517410 77516192 N NA NA NA NA NA NA E2F7 55681 1117 chr12 775162 777258 776197 Y NA NA NINJ2,CCDC77,B4GALNT3,WNK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNK1 84831 1118 chr12 7761077 7764362 7762451 N NA NA PEX5,CD163L1,CD163 IMR90 Hi-C 24141950 NANOGNB 153450 1119 chr12 79890075 79901757 79900231 N NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 183033 1120 chr12 79938879 79944822 79941154 Y PAWR NA SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139968 1121 chr12 79959179 79960034 79959608 N NA NA PPP1R12A,PAWR,SYT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 124756 1122 chr12 80375266 80380112 80376122,80378093 N,N NA;NA PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 46031 1123 chr12 80426076 80428979 80427440 N NA NA PPP1R12A IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R12A 96841 1124 chr12 8042873 8046048 8043750 N NA SLC2A3 NA NA NA NA SLC2A3 42844 1125 chr12 80432581 80512261 80434909,80438021,80439487 N,N,N NA;NA;NA NA PPP1R12A,PAWR,SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R12A 103346 1126 chr12 80579868 80588797 80581173 N NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR,OTOGL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1R12A 250633 1127 chr12 81095798 81098432 81097141 N NA NA NA NA NA NA PPP1R12A 766563 1128 chr12 8110805 8125253 8111648,8123434,8113477 N,Y,N NA;CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3;NA SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC2A3 21913 1129 chr12 8159536 8164084 8162235 N NA FOXJ2 SLC2A3,FOXJ2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXJ2 21275 1130 chr12 8175549 8181689 8179374,8178117 Y,N NA;NA FOXJ2 SLC2A14,C3AR1,PEX5,SLC2A3,FOXJ2,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3670 1131 chr12 8398174 8401334 8399698 N NA FAM86FP NA NA NA NA FAM86FP 2632 1132 chr12 8550716 8553301 8552244 N NA NA CLEC6A IMR90 Hi-C 24141950 FAM86FP 155174 1133 chr12 87723807 87725559 87724652 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 703709 1134 chr12 87842506 87850363 87849330 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 578905 1135 chr12 87964709 87978784 87975981 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 450484 1136 chr12 87981888 87987558 87984412 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 441710 1137 chr12 88058668 88077547 88074035 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 351721 1138 chr12 88210395 88215883 88214735 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 213385 1139 chr12 8833995 8840107 8834909 N NA RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 10411 1140 chr12 88690837 88696172 88694114 N NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 154764 1141 chr12 88700921 88748164 88703990,88728250 Y,N NA;NA NA KITLG,TMTC3 IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 164848 1142 chr12 89318080 89321409 89319961 N NA NA KITLG,TMTC3,LOC728084 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 728435 1143 chr12 89763391 89766772 89764827 N NA NA POC1B,LOC728084 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 283072 1144 chr12 92601369 92603821 92602220 N NA NA LOC256021 K562 ChIA-PET 22265404 EEA1 719286 1145 chr12 92931598 92934444 92933250 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA EEA1 388663 1146 chr12 92943991 92948508 92946789 N NA NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 374599 1147 chr12 93349453 93360897 93350696,93354984 N,N NA;NA EEA1 LOC643339,UBE2N,NUDT4,EEA1,PLEKHG7,MRPL42 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 26346 1148 chr12 94017660 94021128 94018939 N NA NA CRADD,SOCS2,LOC144481 IMR90 Hi-C 24141950 CRADD 50023 1149 chr12 94494499 94498890 94496267 Y NA NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC41 354874 1150 chr12 95726709 95729945 95727943 N NA NA NR2C1,FGD6,VEZT,USP44 IMR90 Hi-C 24141950 VEZT 115187 1151 chr12 96198852 96201063 96199975 N NA NA NTN4,USP44,SNRPF,CCDC38 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPF 51646 1152 chr12 96801366 96822655 96819702,96821237 N,N NA;NA CDK17 CDK17,ELK3,LTA4H K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CDK17 7000 1153 chr12 96838568 96841209 96839747 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 44202 1154 chr12 96893976 96896684 96895040 N NA NA ELK3,CDK17,LTA4H,AMDHD1,CCDC38 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 99610 1155 chr12 96994863 96998140 96995022 N NA NA NA NA NA NA CDK17 200497 1156 chr12 97091698 97093701 97092940 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 207300 1157 chr12 98333633 98334172 98333653 N NA NA NA NA NA NA TMPO 575179 1158 chr12 98745160 98747484 98746488 N NA NA NA NA NA NA TMPO 161867 1159 chr13 100084432 100086730 100085163 Y GPR183 NA MIR548AN,UBAC2,DOCK9,UBAC2-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM9SF2 66998 1160 chr13 104531835 104536787 104533040,104535599 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEX30 1105686 1161 chr13 105791254 105793093 105792223 N NA NA NA NA NA NA LINC00460 1235818 1162 chr13 106332170 106333297 106332392 N NA NA NA NA NA NA LINC00460 695614 1163 chr13 106754831 106757978 106756557 N NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 270933 1164 chr13 106802909 106806166 106803871 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 222745 1165 chr13 106807169 106809951 106809000 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 218960 1166 chr13 108529766 108537808 108536339 N NA NA FAM155A IMR90 Hi-C 24141950 LIG4 332908 1167 chr13 109894458 109897712 109895996 N NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD13 1023695 1168 chr13 109907953 109911250 109909639 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD13 1037190 1169 chr13 109920254 109932431 109924220,109926669 N,N NA;NA NA IRS2,MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 1027200 1170 chr13 110491314 110494645 110492880 N NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 464986 1171 chr13 110520266 110525118 110522225 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 434513 1172 chr13 110582170 110584742 110583467 N NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 374889 1173 chr13 110657445 110660136 110658870 N NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 299495 1174 chr13 110662587 110672055 110664680,110670497 Y,N NA;NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 287576 1175 chr13 110745958 110748551 110747125 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 211080 1176 chr13 111605347 111638563 111607659,111618918,111624024 Y,N,Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10;NA;ING1,C13orf16 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10,LINC00346,ING1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD10 37931 1177 chr13 111656759 111660050 111658642 Y NA NA ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 89343 1178 chr13 112274197 112277047 112275494 N NA NA SOX1,SPACA7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 706781 1179 chr13 112329922 112331432 112330750 N NA NA NA NA NA NA ANKRD10 762506 1180 chr13 112606167 112610047 112609138 N NA NA ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP3 632434 1181 chr13 113259214 113261974 113260849 N NA TUBGCP3 ATP11A,TUBGCP3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBGCP3 16733 1182 chr13 113595977 113598747 113597047 N NA NA MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 ATP11A 251334 1183 chr13 19144314 19149633 19148014 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 542790 1184 chr13 19319371 19321925 19319498 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 370498 1185 chr13 19347157 19348655 19348019 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 343768 1186 chr13 19380160 19384812 19381151 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 307611 1187 chr13 19470653 19487614 19479449 N NA NA NA NA NA NA PHF2P1 204809 1188 chr13 20170911 20172916 20171772 N NA MPHOSPH8 MPHOSPH8 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH8 34872 1189 chr13 20450010 20453784 20450765 N NA ZMYM5 ZMYM5 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZMYM5 12234 1190 chr13 21806394 21808019 21807123 N NA NA NA NA NA NA SKA3 55653 1191 chr13 21870539 21880052 21872206 N NA NA ZDHHC20 MCF7 ChIA-PET 22265404 SKA3 119798 1192 chr13 23317844 23319805 23319221 N NA NA NA NA NA NA SACS 688036 1193 chr13 23487613 23494564 23489716 N NA NA NA NA NA NA SACS 513277 1194 chr13 24502616 24504742 24503367 N NA MIPEP SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 39029 1195 chr13 24553250 24554977 24554355 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 89663 1196 chr13 24722113 24726606 24723085 Y NA SPATA13 SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATA13 8255 1197 chr13 25590759 25595510 25592197 N NA NA NA NA NA NA PABPC3 74766 1198 chr13 27555710 27560793 27557422 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 185240 1199 chr13 27605473 27612213 27610410 N NA NA RASL11A,USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 133820 1200 chr13 27767527 27771871 27769538 N NA USP12 RPL21,USP12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 21494 1201 chr13 27800206 27805806 27804367 N NA RPL21,RASL11A USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21 19886 1202 chr13 28033555 28034388 28033840 N NA GTF3A,MTIF3 MTIF3,LNX2,GSX1,POLR1D,PRHOXNB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTIF3 8816 1203 chr13 29147635 29151632 29149005 Y POMP NA FLT1,PAN3 IMR90 Hi-C 24141950 POMP 81509 1204 chr13 30434678 30437639 30435964 N NA UBL3 UBL3,LOC440131 IMR90 Hi-C 24141950 UBL3 9858 1205 chr13 30496761 30499858 30497771 N NA NA HSPH1,KATNAL1,UBL3,LOC440131 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBL3 71941 1206 chr13 30710741 30714075 30712363 N NA NA UBL3,SLC7A1,KATNAL1,LINC00426,USPL1,HMGB1,ALOX5AP IMR90,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 KATNAL1 167509 1207 chr13 30714692 30718928 30717484 N NA NA UBL3,KATNAL1,HMGB1,USPL1,ALOX5AP,LINC00426,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 KATNAL1 162656 1208 chr13 30968106 30971184 30969738 Y USPL1 NA LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 68897 1209 chr13 30993559 30999879 30995410 N NA HMGB1 USPL1,KATNAL1,LINC00426,HMGB1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 40202 1210 chr13 31263423 31266488 31265016 N NA NA HMGB1,USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 71593 1211 chr13 31618487 31621660 31620074 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 114457 1212 chr13 31641053 31643183 31642094 Y NA NA USPL1,HSPH1 IMR90 Hi-C 24141950 HSPH1 92934 1213 chr13 31746071 31749644 31746791 Y NA HSPH1 RXFP2,B3GALTL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 9954 1214 chr13 32056911 32057913 32057546 N NA NA NA NA NA NA HSPH1 320794 1215 chr13 34360316 34362624 34361223 N NA RFC3 NBEA IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 29582 1216 chr13 34617659 34622902 34618935 N NA NA NA NA NA NA RFC3 225453 1217 chr13 34729364 34732314 34730823 N NA NA NA NA NA NA RFC3 337158 1218 chr13 34735395 34737545 34736795 N NA NA NA NA NA NA RFC3 343189 1219 chr13 35426045 35429143 35427444 N NA NA RFC3 IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 1033839 1220 chr13 36552190 36554611 36553810 N NA NA CCDC169-SOHLH2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC169-SOHLH2 317381 1221 chr13 37350947 37353961 37352688 N NA RFXAP NA NA NA NA RFXAP 39378 1222 chr13 41273578 41276258 41274957 N NA NA NA NA NA NA MRPS31 69089 1223 chr13 41858417 41859781 41858887 N NA MTRF1,NAA16 MTRF1,KBTBD6,NAA16 IMR90 Hi-C 24141950 MTRF1 20704 1224 chr13 42979340 42981626 42980031 Y TNFSF11,TNFSF11,AKAP11 NA NA NA NA NA AKAP11 133051 1225 chr13 43580172 43582810 43580975 N NA DNAJC15 ENOX1,DNAJC15,LACC1,CCDC122 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 14552 1226 chr13 44641543 44643820 44642782 N NA NA SERP2,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC122 187717 1227 chr13 44714203 44720133 44716295,44717498 N,N NA;NA NA TSC22D1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC122 260377 1228 chr13 44831583 44834067 44833762 N NA NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 315965 1229 chr13 44872652 44877719 44873495,44875390 N,Y NA;C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2,LACC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 272313 1230 chr13 44878752 44883523 44880708 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 266509 1231 chr13 44886060 44889290 44887627 N NA NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 260742 1232 chr13 44937586 44940176 44938912 N NA NA TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 209856 1233 chr13 45286140 45291206 45288456 Y KCTD4 NA NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 135439 1234 chr13 45292364 45298573 45294799 N NA NA TSC22D1,LINC00330,NUFIP1,TSC22D1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 141663 1235 chr13 45331804 45335417 45333113 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 181103 1236 chr13 45388826 45395143 45390055,45393567 Y,N NA;NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,LINC00330,NUFIP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NUFIP1 168470 1237 chr13 46780598 46788577 46786041 N NA NA CPB2,LOC100509894 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H13 153704 1238 chr13 47508830 47510611 47509521 N NA NA NA NA NA NA ESD 137463 1239 chr13 47784340 47786725 47785481 N NA NA NA NA NA NA ESD 412973 1240 chr13 48434542 48439027 48437818 N NA NA NA NA NA NA SUCLA2 136435 1241 chr13 48466871 48473391 48472740 N NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 SUCLA2 102071 1242 chr13 49348650 49351600 49350155 N NA NA ITM2B,CDADC1 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3A 198448 1243 chr13 50430604 50435376 50432416,50433886 N,N NA;NA NA KPNA3 IMR90 Hi-C 24141950 KPNA3 63547 1244 chr13 50782491 50789239 50783081 N NA ST13P4 DLEU7,DLEU2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P4 36337 1245 chr13 51102291 51105689 51103669 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613,CTAGE10P,ST13P4,DLEU7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P4 356137 1246 chr13 51251061 51255180 51252338 N NA NA DLEU7,RNASEH2B,DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 228634 1247 chr13 52919527 52924146 52922575 N NA NA VPS36,THSD1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 VPS36 100617 1248 chr13 56545644 56546344 56545826 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 3318813 1249 chr13 58066571 58068435 58066927 N NA NA NA NA NA NA DIAPH3 2669684 1250 chr13 63763871 63766332 63765012 N NA NA NA NA NA NA DIAPH3 3025752 1251 chr13 64648512 64651190 64650285 N NA NA NA NA NA NA DIAPH3 3910393 1252 chr13 68830230 68832527 68831459 N NA NA NA NA NA NA MZT1 4469411 1253 chr13 70052490 70054715 70052649 N NA NA NA NA NA NA MZT1 3247223 1254 chr13 75708558 75711241 75709684 N NA NA NA NA NA NA TBC1D4 345009 1255 chr13 76062604 76064525 76063731 N NA TBC1D4,COMMD6 UCHL3 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D4 6354 1256 chr13 80509569 80512580 80511020 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 402506 1257 chr13 81899197 81916292 81914229 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 984111 1258 chr13 86159163 86162527 86160352 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 5244077 1259 chr13 88650502 88654504 88652096 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 3345570 1260 chr13 89810272 89816540 89815584 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 2183534 1261 chr13 95200500 95205215 95202164 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 43296 1262 chr13 97777353 97780893 97778074 N NA NA MBNL2 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL2 93681 1263 chr13 97792559 97802776 97794501 N NA NA MBNL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBNL2 71798 1264 chr14 100245426 100247826 100246262 N NA NA EML1,CYP46A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC85C 174699 1265 chr14 100644274 100647320 100646349 N NA NA NA NA NA NA YY1 57782 1266 chr14 100657726 100661101 100659408 Y NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 44001 1267 chr14 100677420 100682100 100680995 N NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 23002 1268 chr14 101048395 101053679 101053014 N NA NA WDR25,MEG3,BEGAIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WARS 205715 1269 chr14 101907589 101910615 101909664 N NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 317520 1270 chr14 101918676 101922207 101919772 N NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 305928 1271 chr14 101937735 101944545 101943500,101942764 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 283590 1272 chr14 101945846 101948228 101947086 N NA NA DIO3OS,DIO3,MIR1247 MCF7 ChIA-PET 22265404 PPP2R5C 279907 1273 chr14 102186437 102189915 102188653 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C PPP2R5C,LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 PPP2R5C 38220 1274 chr14 102989330 102995042 102991575,102994004 N,Y NA;TRAF3,RCOR1 NA ANKRD9,RCOR1,TECPR2,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 63954 1275 chr14 103044055 103049560 103046162 N NA RCOR1 TECPR2,RCOR1,TRAF3,AMN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 9436 1276 chr14 103725796 103727636 103727020 Y MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5 NA EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 72857 1277 chr14 105546059 105568771 105558722,105553159 N,N NA;NA NA BTBD6,BRF1,AHNAK2,JAG2,NUDT14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 58634 1278 chr14 106659899 106662455 106660847 N NA NA NA NA NA NA LINC00221 276000 1279 chr14 19012436 19014342 19013647 N NA NA NA NA NA NA POTEG 539023 1280 chr14 19037528 19039706 19038639 N NA NA NA NA NA NA POTEG 513659 1281 chr14 19358635 19360696 19359605 N NA NA NA NA NA NA POTEG 192669 1282 chr14 19361431 19365377 19361691,19363952 N,N NA;NA NA NA NA NA NA POTEG 187988 1283 chr14 19413640 19417863 19414868 N NA NA NA NA NA NA POTEG 135502 1284 chr14 19504249 19535274 19505753,19505642 N,N NA;NA POTEG NA NA NA NA POTEG 18091 1285 chr14 19636329 19686388 19637702,19649962 N,N NA;NA NA NA NA NA NA POTEG 82964 1286 chr14 19746513 19752824 19752380 N NA NA NA NA NA NA POTEG 193148 1287 chr14 19821860 19828872 19826638 N NA NA NA NA NA NA POTEG 268495 1288 chr14 19866909 19868086 19867395 N NA NA NA NA NA NA POTEG 313544 1289 chr14 19891507 19895772 19894353 N NA NA NA NA NA NA POTEG 338142 1290 chr14 19901191 19908549 19903764 N NA NA NA NA NA NA POTEG 347826 1291 chr14 19922389 19939966 19923011,19925398,19934579,19937744 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA POTEG 369024 1292 chr14 20066728 20089743 20067723 N NA NA NA NA NA NA POTEG 513363 1293 chr14 20106851 20114120 20108147 N NA NA NA NA NA NA POTEG 553486 1294 chr14 20137418 20140496 20138392 N NA NA NA NA NA NA POTEG 584053 1295 chr14 21086922 21088630 21087744 N NA NA KLHL33 IMR90 Hi-C 24141950 RNASE4 63742 1296 chr14 21120651 21123981 21121356 N NA RNASE4 RNASE4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNASE4 28391 1297 chr14 21274976 21285254 21282750 N NA RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 3940 1298 chr14 21340163 21343967 21342041 N NA NA NA NA NA NA RNASE1 69127 1299 chr14 22726271 22728926 22726435 N NA NA NA NA NA NA DAD1 329217 1300 chr14 23005262 23006886 23006056 N NA NA MMP14,REM2,RBM23,PRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 51257 1301 chr14 23181690 23184140 23182522 N NA NA OXA1L,SLC7A7,DAD1,RBM23 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 51591 1302 chr14 24050936 24052742 24050940 N NA ZFHX2,JPH4 NA NA NA NA JPH4 2927 1303 chr14 24950266 24951319 24950582 N NA SDR39U1 NA NA NA NA SDR39U1 38259 1304 chr14 25579830 25581649 25580536 Y STXBP6 NA STXBP6 IMR90 Hi-C 24141950 SDR39U1 667823 1305 chr14 26668689 26671355 26669698 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1756682 1306 chr14 27309718 27363369 27311949 N NA NA NA NA NA NA FOXG1 1872909 1307 chr14 27948577 27951345 27949558 N NA NA NA NA NA NA FOXG1 1284933 1308 chr14 27982485 27984712 27983609 N NA NA NA NA NA NA FOXG1 1251566 1309 chr14 28135501 28148962 28142393 N NA NA NA NA NA NA FOXG1 1087316 1310 chr14 28312484 28318708 28314903 N NA NA NA NA NA NA FOXG1 917570 1311 chr14 29046634 29048282 29047265 N NA NA NA NA NA NA FOXG1 187996 1312 chr14 29297912 29325317 29299472 N NA NA NA NA NA NA FOXG1 61634 1313 chr14 30726984 30768305 30766170 N NA NA PRKD1,C14orf23 IMR90 Hi-C 24141950 G2E3 260024 1314 chr14 32395508 32398216 32396708 N NA NA AKAP6,NUBPL IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5-AS1 147689 1315 chr14 32405966 32408406 32407106 N NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5-AS1 137499 1316 chr14 32474425 32481047 32476071,32479786 N,N NA;NA NA NUBPL IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5-AS1 64858 1317 chr14 32671447 32674593 32672632 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5 124952 1318 chr14 32698297 32702335 32700092 N NA NA NUBPL,AKAP6,GPR33,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5 151802 1319 chr14 32735916 32739009 32736950 N NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5 189421 1320 chr14 33365253 33368004 33366578 Y NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5 818758 1321 chr14 34457665 34460911 34459194 N NA NA EGLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SPTSSA 470557 1322 chr14 34512234 34513837 34512811 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 417631 1323 chr14 34527551 34529026 34528467 N NA NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 402442 1324 chr14 34550054 34551926 34550776 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 379542 1325 chr14 34943693 34948715 34944658 N NA SPTSSA EAPP,SPTSSA,SNX6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPTSSA 12225 1326 chr14 35186425 35189698 35187697 N NA CFL2 NA NA NA NA CFL2 2396 1327 chr14 35439266 35440625 35440226 N NA SRP54 NA NA NA NA SRP54 11479 1328 chr14 35807996 35812860 35810962 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA PSMA6 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMA6 46422 1329 chr14 35834209 35835752 35834637 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NFKBIA PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKBIA 38208 1330 chr14 35887529 35891102 35889215 N NA NFKBIA PSMA6,NFKBIA,KIAA0391,PPP2R3C,FAM177A1,RALGAPA1 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIA 13569 1331 chr14 38612372 38613663 38612714 N NA NA NA NA NA NA MIPOL1 945254 1332 chr14 39959892 39962433 39961112 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 58188 1333 chr14 40104518 40108152 40104682 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 202814 1334 chr14 41397909 41399010 41398063 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 1496205 1335 chr14 44854235 44857445 44855158 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 509062 1336 chr14 46181915 46183682 46182831 N NA NA NA NA NA NA MIS18BP1 459310 1337 chr14 49031519 49034792 49032884 N NA NA NA NA NA NA RPS29 1018302 1338 chr14 49682871 49687174 49685510 N NA NA NA NA NA NA RPS29 365920 1339 chr14 49715392 49717693 49716452 N NA NA NA NA NA NA RPS29 335401 1340 chr14 49976175 49981062 49979244 Y C14orf182 NA NA NA NA NA RPS29 72032 1341 chr14 50327664 50336713 50328862,50334896 N,Y NA;RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 8125 1342 chr14 50399624 50402487 50401720 N NA ARF6 NA NA NA NA ARF6 39888 1343 chr14 50487619 50491789 50490294 N NA C14orf182 NEMF,ARF6,C14orf182,METTL21D,SOS2,C14orf183 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C14orf182 13381 1344 chr14 50504461 50508206 50506336 N NA C14orf182 C14orf182,ARF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C14orf182 30223 1345 chr14 51141055 51147056 51142595,51144461 N,Y NA;NA SAV1 ATL1,SAV1,CDKL1,NIN,PYGL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAV1 6032 1346 chr14 51301084 51303453 51302118 N NA NIN NIN MCF7 ChIA-PET 22265404 NIN 3245 1347 chr14 51312650 51314475 51313437 N NA NIN ATL1,NIN IMR90 Hi-C 24141950 NIN 14811 1348 chr14 51770807 51784021 51771741 N NA NA FRMD6,GNG2,C14orf166,LOC283553,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMX1 63921 1349 chr14 51793592 51797532 51794959 N NA NA NA NA NA NA TMX1 86706 1350 chr14 51860804 51867175 51864529 N NA NA LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 88680 1351 chr14 51907826 51930722 51909465,51915911,51911288 N,Y,N NA;NA;NA FRMD6 FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,GNG2,TMX1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 25133 1352 chr14 52241507 52244683 52242820 N NA NA PYGL,TMX1,GNG2,C14orf166,LOC283553,TRIM9,FRMD6-AS1,FRMD6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FRMD6-AS1 123045 1353 chr14 52293593 52296021 52295213 N NA NA GNG2,TMX1,TRIM9,LOC283553,FRMD6 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 160207 1354 chr14 53683380 53689058 53684452 N NA NA PSMC6 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD1 63334 1355 chr14 54716757 54721911 54719799 N NA NA NA NA NA NA CDKN3 141762 1356 chr14 55566726 55571600 55570098 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L MAPK1IP1L LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK1IP1L 48364 1357 chr14 55572410 55576975 55574908 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 NA LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK1IP1L 54048 1358 chr14 55695833 55697627 55696268 N NA DLGAP5,FBXO34 TBPL2,FBXO34,ATG14 IMR90 Hi-C 24141950 DLGAP5 37437 1359 chr14 55912905 55916209 55914378 N NA ATG14 NA NA NA NA ATG14 34329 1360 chr14 55919681 55923420 55921291 N NA ATG14 NA NA NA NA ATG14 41105 1361 chr14 57437968 57446247 57445441 N NA NA OTX2OS1 IMR90 Hi-C 24141950 MUDENG 289359 1362 chr14 57457964 57460596 57459223 Y NA NA NA NA NA NA MUDENG 275010 1363 chr14 58395826 58398342 58397314 N NA NA NA NA NA NA ACTR10 268491 1364 chr14 59196429 59199717 59198355 N NA NA NA NA NA NA TIMM9 302197 1365 chr14 59204096 59230096 59205779,59215659,59213264 N,N,N NA;NA;NA NA DACT1,GPR135 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM9 309864 1366 chr14 59364222 59367978 59366009 N NA NA DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM9 469990 1367 chr14 59383580 59385770 59384902 N NA NA NA NA NA NA TIMM9 489348 1368 chr14 59435749 59438384 59437137 N NA NA NA NA NA NA GPR135 493675 1369 chr14 59866283 59872108 59867396 N NA NA DAAM1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR135 59951 1370 chr14 60380963 60387999 60386567 N NA NA NA NA NA NA C14orf135 170630 1371 chr14 60645646 60647198 60646428 N NA DHRS7 C14orf135,DHRS7 IMR90 Hi-C 24141950 DHRS7 13435 1372 chr14 60796612 60799693 60798211 N NA NA C14orf39,SIX6,TMEM30B IMR90 Hi-C 24141950 C14orf39 153071 1373 chr14 61120311 61127978 61124405 N NA SIX1 SLC38A6,SIX1,TRMT5,MNAT1 IMR90 Hi-C 24141950 SIX1 4156 1374 chr14 61613562 61616404 61614966 N NA NA SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC38A6 165730 1375 chr14 61643049 61647872 61645082 N NA NA SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 140643 1376 chr14 62439587 62441459 62440674 N NA NA SYT16 IMR90 Hi-C 24141950 SNAPC1 210512 1377 chr14 63622016 63623564 63622556 N NA NA FLJ43390 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5E 386515 1378 chr14 63806739 63808513 63807525 N NA NA NA NA NA NA PPP2R5E 201566 1379 chr14 64215108 64217351 64215976 N NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 20352 1380 chr14 65110241 65122784 65112365,65121130,65115804 N,N,N NA;NA;NA PLEKHG3 ZBTB25,ZBTB1,SPTB,PLEKHG3,CHURC1-FNTB,MTHFD1,PPP1R36,HSPA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG3 48409 1381 chr14 65129353 65131072 65129977 N NA PLEKHG3 SPTB,PLEKHG3,PPP1R36,CHURC1-FNTB IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG3 40121 1382 chr14 65147441 65151321 65149022 Y HSPA2,FNTB PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG3 19872 1383 chr14 65307297 65309921 65308507 N NA NA SPTB,CHURC1-FNTB,HSPA2 IMR90 Hi-C 24141950 CHURC1-FNTB 71158 1384 chr14 65636484 65640225 65637870 N NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 67257 1385 chr14 65645610 65649285 65647273 N NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 76383 1386 chr14 65693849 65698248 65694649,65696938 N,N NA;NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 124622 1387 chr14 65701806 65712607 65704245 N NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 132579 1388 chr14 65720052 65727409 65721820,65725708 N,N NA;NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 150825 1389 chr14 65748367 65751321 65749478 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 LOC645431 128014 1390 chr14 65768508 65773284 65770557 N NA NA MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 LOC645431 106051 1391 chr14 66938869 66942221 66940716 N NA GPHN NA NA NA NA GPHN 31904 1392 chr14 69092020 69097162 69093757 N NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 165798 1393 chr14 69121105 69133978 69130241,69132618 N,N NA;NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 128982 1394 chr14 69141260 69156386 69148459,69150987,69141799,69153596,69154751 Y,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 106574 1395 chr14 69160357 69164028 69162226 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 98932 1396 chr14 69168599 69172726 69170054,69170887 Y,N NA;NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 90234 1397 chr14 69279608 69283606 69282258 N NA ZFP36L1 RAD51B,ZFP36L1,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 16648 1398 chr14 69289307 69293856 69291783 N NA ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26,ZFP36L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 26347 1399 chr14 69469817 69474694 69472148 N NA ACTN1 DCAF5,ACTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTN1 23734 1400 chr14 71283076 71296169 71289307,71283753 N,N NA;NA MAP3K9 MAP3K9,PCNX MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAP3K9 7188 1401 chr14 71757110 71758487 71757977 N NA NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC145474 196091 1402 chr14 71780975 71844201 71787100,71788611,71781026 N,N,N NA;NA;NA NA SIPA1L1,PCNX,LOC145474,SNORD56B IMR90 Hi-C 24141950 LOC145474 110377 1403 chr14 73072912 73077319 73075341 N NA NA RGS6,DPF3,DCAF4,RBM25 IMR90 Hi-C 24141950 DCAF4 315721 1404 chr14 73109109 73111967 73110146 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90 Hi-C 24141950 DCAF4 281073 1405 chr14 73372031 73374550 73372111 N NA DCAF4 RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DCAF4 18490 1406 chr14 74260833 74265033 74263463 N NA C14orf43 PNMA1,C14orf43,MIR4505,PTGR2,ZNF410,ENTPD5,C14orf45 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C14orf43 6937 1407 chr14 75083924 75089534 75087139 N NA LTBP2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1,NPC2,ISCA2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LTBP2 4890 1408 chr14 75700354 75703929 75701361 N NA FOS TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF IMR90 Hi-C 24141950 FOS 41552 1409 chr14 75723508 75728944 75725845 N NA FOS,LOC731223 TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2,BATF,PGF IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOS 16537 1410 chr14 77370568 77372423 77371306 N NA NA IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90 Hi-C 24141950 ANGEL1 91285 1411 chr14 77383147 77387312 77385876 N NA NA IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANGEL1 103864 1412 chr14 77420782 77430425 77422838,77428427 N,Y NA;NA NA IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 64609 1413 chr14 77525100 77528186 77526072 N NA IRF2BPL,KIAA1737 IRF2BPL,C14orf166B,KIAA1737 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 30066 1414 chr14 81897929 81905197 81902908 N NA NA STON2,GTF2A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEL1L 95008 1415 chr14 83107502 83115874 83108930 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 1107297 1416 chr14 83628938 83632256 83630505 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 1628733 1417 chr14 84105098 84111841 84105651 N NA NA NA NA NA NA FLRT2 1884647 1418 chr14 85698959 85702588 85700654 N NA NA NA NA NA NA FLRT2 293900 1419 chr14 85879431 85884223 85881779,85883359 Y,N FLRT2;NA NA NA NA NA NA FLRT2 112265 1420 chr14 85902138 85912683 85903992,85906964,85911237 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FLRT2 83805 1421 chr14 85936741 85939924 85938290 N NA NA FLRT2 IMR90 Hi-C 24141950 FLRT2 56564 1422 chr14 87039599 87042313 87040916 N NA NA LOC283585 IMR90 Hi-C 24141950 FLRT2 1043111 1423 chr14 88236749 88238326 88237714 N NA NA NA NA NA NA PTPN21 782797 1424 chr14 88239569 88247264 88241768 N NA NA NA NA NA NA PTPN21 773859 1425 chr14 88325948 88338758 88336414,88337569 Y,N KCNK10,GPR65;NA NA NA NA NA NA PTPN21 682365 1426 chr14 88339482 88341491 88340832 N NA NA NA NA NA NA PTPN21 679632 1427 chr14 88342522 88346488 88343940,88345705 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PTPN21 674635 1428 chr14 89451401 89454626 89453328 N NA NA EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 160423 1429 chr14 89478078 89480839 89478875 N NA NA EFCAB11,EML5,FOXN3,TTC8,TDP1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 187100 1430 chr14 89506185 89509390 89507485 N NA NA EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 215207 1431 chr14 91291665 91295840 91294613 N NA NA TTC7B,RPS6KA5,CCDC88C,C14orf159 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf159 284517 1432 chr14 93251384 93253877 93252452 N NA GOLGA5 GOLGA5 K562 ChIA-PET 22265404 GOLGA5 6773 1433 chr14 93604428 93608608 93605694 N NA MOAP1,C14orf109 ITPK1,CHGA,BTBD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MOAP1 42641 1434 chr14 95266797 95267943 95267558 N NA NA LINC00341 IMR90 Hi-C 24141950 DICER1 331897 1435 chr14 97572014 97575984 97573663 N NA NA NA NA NA NA VRK1 308330 1436 chr14 97644293 97647599 97646309 N NA NA C14orf177 IMR90 Hi-C 24141950 VRK1 380609 1437 chr14 97741458 97745683 97743637 N NA NA NA NA NA NA VRK1 477774 1438 chr14 99438801 99440102 99439640 N NA NA NA NA NA NA BCL11B 297720 1439 chr15 100026023 100028747 100027174 N NA NA MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 77386 1440 chr15 100911382 100919368 100913607 N NA NA NA NA NA NA LINS 223077 1441 chr15 101252475 101254326 101253300 N NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 ASB7 109720 1442 chr15 101260264 101265451 101261754 N NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB7 117509 1443 chr15 101266139 101268883 101267948 N NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 ASB7 123384 1444 chr15 101390711 101392877 101391753 N NA NA ASB7,ALDH1A3,LRRK1,LINS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRK1 66583 1445 chr15 101662530 101669235 101665253,101668546 N,N NA;NA NA CHSY1,LRRK1,SELS IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 122902 1446 chr15 102117521 102122324 102119464 N NA NA PCSK6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM2D3 70270 1447 chr15 20365063 20373138 20365627 N NA NA NA NA NA NA LOC646214 1567601 1448 chr15 20993115 20996213 20994465 N NA NA NBEAP1,POTEB,LOC348120,NF1P2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC646214 944526 1449 chr15 21891379 21893669 21892538 N NA LOC646214 NA NA NA NA LOC646214 47070 1450 chr15 22155698 22158118 22156800 N NA NA NA NA NA NA LOC646214 214959 1451 chr15 23126937 23129667 23127718 N NA NIPA1 NA NA NA NA NIPA1 40094 1452 chr15 23639003 23642918 23640692 N NA NA NA NA NA NA MKRN3 167536 1453 chr15 23666891 23670229 23668450 N NA NA NA NA NA NA MKRN3 140225 1454 chr15 25017190 25021577 25018382 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA PAR1 359212 1455 chr15 25748723 25750454 25749674 N NA NA LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 64548 1456 chr15 26126409 26131236 26127929,26129571 N,N NA;NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 442234 1457 chr15 26326490 26329725 26327619 Y NA NA LOC100128714,ATP10A,LOC503519 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 642315 1458 chr15 26331517 26334181 26332834 Y NA NA LOC503519 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 647342 1459 chr15 28708578 28710802 28709471 N NA NA NA NA NA NA HERC2 141283 1460 chr15 28830530 28842734 28834637 N NA NA NA NA NA NA HERC2P9 56854 1461 chr15 29948553 29952179 29949504 Y NA NA NA NA NA NA TJP1 162527 1462 chr15 29960830 29966020 29963301,29965948 N,N NA;NA NA TJP1 IMR90 Hi-C 24141950 TJP1 148686 1463 chr15 30210938 30222075 30213483,30217171 Y,Y NA;TJP1 NA TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 96232 1464 chr15 30226775 30229945 30228810 N NA NA TJP1 IMR90 Hi-C 24141950 TJP1 112069 1465 chr15 30336775 30339656 30337660 N NA NA TJP1,FAM189A1,APBA2 IMR90 Hi-C 24141950 ULK4P3 56279 1466 chr15 30619889 30622874 30620047 N NA NA NA NA NA NA DKFZP434L187 131650 1467 chr15 31096441 31101665 31097249 N NA NA NA NA NA NA FAN1 94411 1468 chr15 31115020 31124157 31116124 N NA NA NA NA NA NA FAN1 71919 1469 chr15 31527741 31531282 31528508 N NA NA NA NA NA NA KLF13 87801 1470 chr15 31727128 31728817 31727480 N NA NA KLF13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 108045 1471 chr15 31730082 31735252 31733088 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 110999 1472 chr15 32056151 32060270 32058423 N NA NA OTUD7A IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 437068 1473 chr15 33374618 33377053 33375762 N NA FMN1 SCG5,FMN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FMN1 14533 1474 chr15 33387917 33392047 33390556 N NA FMN1 SCG5,FMN1,GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 27832 1475 chr15 34787210 34789334 34788597 N NA NA NA NA NA NA GOLGA8A 57543 1476 chr15 35101404 35104951 35103256 N NA NA ACTC1,AQR IMR90 Hi-C 24141950 AQR 157044 1477 chr15 35309745 35313273 35311001 N NA AQR,ZNF770 AQR,ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 29248 1478 chr15 38191773 38194002 38192927 N NA NA LOC145845 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 351050 1479 chr15 38329862 38332093 38331021 N NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 212959 1480 chr15 38359651 38367509 38361463,38365621 N,N NA;NA NA SPRED1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRED1 177543 1481 chr15 38420892 38423290 38422357 Y NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 121762 1482 chr15 39170540 39178927 39177588 N NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1,GPR176 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 424212 1483 chr15 39185375 39188080 39186980 N NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 439047 1484 chr15 39369615 39372670 39371676 N NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 500610 1485 chr15 39419207 39422147 39420606 N NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 451133 1486 chr15 39427252 39429434 39428125 N NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 443846 1487 chr15 39431152 39434356 39432346 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438924 1488 chr15 39464549 39466037 39465377 N NA NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 407243 1489 chr15 39479670 39482444 39481377 N NA NA THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 390836 1490 chr15 39486653 39489556 39488457 N NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53,C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 383724 1491 chr15 41911414 41928796 41913550 N NA MGA RTF1,RPAP1,TYRO3,MGA,MAPKBP1,SPTBN5,EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 23814 1492 chr15 42769446 42772083 42770347 N NA ZFP106,SNAP23 LRRC57,HAUS2,VPS39,TMEM87A,SNAP23,ZFP106 IMR90 Hi-C 24141950 SNAP23 15421 1493 chr15 42776177 42785013 42783371 N NA ZFP106,SNAP23 LRRC57,HAUS2,VPS39,TMEM87A,SNAP23,ZFP106 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAP23 2491 1494 chr15 43413854 43418223 43415391 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 7499 1495 chr15 48103190 48108506 48104772 Y NA NA SEMA6D IMR90 Hi-C 24141950 MYEF2 362052 1496 chr15 50425855 50430846 50427489,50429642 N,Y NA;USP8,GABPB1 NA ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129387 215525 1497 chr15 50448290 50465157 50449843,50459860 N,N NA;NA NA GALK2,GABPB1,SLC27A2,LOC100129387 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129387 181214 1498 chr15 51176496 51178526 51177896 N NA AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 22343 1499 chr15 53149350 53153072 53150696 N NA NA NA NA NA NA ARPP19 288137 1500 chr15 55588651 55592372 55590239 N NA RAB27A,PIGB NA NA NA NA RAB27A 6638 1501 chr15 56310709 56339133 56332825,56311667 Y,N NA;NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 24874 1502 chr15 57097127 57099433 57098430 N NA NA LOC283663,ZNF280D,TCF12 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF280D 71340 1503 chr15 57624756 57628943 57626714 N NA LOC283663 CGNL1,TCF12 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283663 32193 1504 chr15 57647136 57650715 57649095 Y NA NA CGNL1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283663 54573 1505 chr15 57863070 57864706 57864060 N NA NA CGNL1,GCOM1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283663 270507 1506 chr15 58521012 58522804 58521618 N NA NA SLTM,ADAM10,LIPC,FAM63B IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 519373 1507 chr15 58623699 58625895 58624826 N NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 416282 1508 chr15 60121464 60123758 60122537 N NA NA NA NA NA NA BNIP2 139822 1509 chr15 60209878 60213519 60211889,60209950 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BNIP2 228236 1510 chr15 60224636 60227381 60226067 N NA NA NA NA NA NA BNIP2 242994 1511 chr15 60419516 60421338 60420197 N NA NA BNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA2 268847 1512 chr15 61846675 61851272 61848517 N NA NA NA NA NA NA VPS13C 501392 1513 chr15 62389716 62393623 62391675 N NA VPS13C NA NA NA NA VPS13C 37052 1514 chr15 62401661 62406758 62402569,62405323 N,Y NA;NA VPS13C NA NA NA NA VPS13C 48997 1515 chr15 62410362 62412886 62411755 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 57698 1516 chr15 62426508 62427531 62427522 N NA NA NA NA NA NA VPS13C 73844 1517 chr15 62428787 62432302 62430510 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 76123 1518 chr15 62677808 62749635 62682615,62695535,62684789,62736819 N,N,Y,N NA;NA;NA;NA NA TLN2,MGC15885,TPM1 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 189875 1519 chr15 62894899 62898558 62898207,62896041 N,N NA;NA TLN2 TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 40952 1520 chr15 63185196 63196411 63188291,63191433 N,N NA;NA NA TLN2,RAB8B,TPM1,APH1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPM1 138427 1521 chr15 63218745 63222988 63220611 N NA NA TPM1,TLN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPM1 111850 1522 chr15 63223844 63226898 63225433 N NA NA TPM1,TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TPM1 107940 1523 chr15 63231658 63235103 63233088 N NA NA TPM1,TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TPM1 99735 1524 chr15 63248709 63251225 63249474 N NA NA TPM1,TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TPM1 83613 1525 chr15 63266317 63270880 63267939 N NA NA TPM1,TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TPM1 63958 1526 chr15 63276178 63279798 63278056 N NA NA TPM1,TLN2,RAB8B IMR90 Hi-C 24141950 TPM1 55040 1527 chr15 63305076 63307518 63305891 N NA TPM1 TLN2,TPM1 IMR90 Hi-C 24141950 TPM1 27320 1528 chr15 63312689 63313577 63313452 N NA TPM1 TLN2,TPM1,RPS27L,RAB8B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPM1 21261 1529 chr15 63384319 63385511 63384384 N NA TPM1,LACTB NA NA NA NA LACTB 28488 1530 chr15 63387686 63391209 63389376 N NA LACTB LACTB,RAB8B IMR90 Hi-C 24141950 LACTB 22790 1531 chr15 63398065 63399990 63398753 N NA LACTB,RPS27L LACTB,RAB8B,TLN2,APH1B,CA12 IMR90 Hi-C 24141950 LACTB 14009 1532 chr15 63740544 63743269 63742149 N NA NA CA12,USP3,APH1B,LACTB,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,DAPK2 IMR90 Hi-C 24141950 USP3 53441 1533 chr15 63767757 63771063 63768600 N NA USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 25647 1534 chr15 65516707 65520335 65518237 N NA CLPX PARP16,CLPX,CILP IMR90 Hi-C 24141950 CLPX 39144 1535 chr15 65523048 65528597 65527179 N NA CLPX NA NA NA NA CLPX 45485 1536 chr15 65586909 65589587 65588586 N NA PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 7891 1537 chr15 65594836 65598815 65596893 Y DENND4A PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 15818 1538 chr15 66560648 66563447 66561898 N NA DIS3L MEGF11,DIS3L,MAP2K1,MIR4311 IMR90 Hi-C 24141950 DIS3L 22186 1539 chr15 66661084 66664669 66662473 N NA TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNORD18C,SNORD18B,SNORD16,SNAPC5,ZWILCH IMR90 Hi-C 24141950 TIPIN 12030 1540 chr15 66869570 66878057 66870861 Y MAP2K1 LCTL ZWILCH,SNORD16,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,LCTL,SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 LCTL 11735 1541 chr15 66908660 66911131 66909625,66910180 N,Y NA;SMAD3,MAP2K1 NA SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 LCTL 50825 1542 chr15 67128756 67135090 67133823 N NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 134082 1543 chr15 67142896 67181818 67146038,67143653,67175932,67180374 N,N,Y,N NA;NA;NA;NA NA SMAD6,LCTL,IQCH,LOC100506686,SMAD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 148222 1544 chr15 67333329 67347897 67336756,67341737 N,N NA;NA SMAD3 SMAD3,IQCH,AAGAB,LOC100506686 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD3 10298 1545 chr15 68174313 68180030 68177083 Y NA NA PIAS1,CLN6,CALML4,C15orf61,LOC100506686,IQCH,SKOR1 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 166542 1546 chr15 68231427 68233295 68231871 N NA NA PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 113277 1547 chr15 68835028 68836785 68835911,68835727 N,N NA;NA NA ITGA11,FEM1B,CORO2B,MIR548H4 IMR90 Hi-C 24141950 FEM1B 264887 1548 chr15 69849273 69851051 69849904 N NA NA TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 104114 1549 chr15 70050356 70054211 70053396,70051732 Y,N TLE3;NA NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 305197 1550 chr15 70199668 70202482 70201250 N NA NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 187774 1551 chr15 70441899 70442839 70442586 N NA NA TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 51643 1552 chr15 70485597 70491128 70489726 N NA NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 95341 1553 chr15 70666025 70669988 70668119 N NA NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 275769 1554 chr15 70766158 70768877 70767235 N NA NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 286973 1555 chr15 70777005 70780776 70779256 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UACA 275074 1556 chr15 70782798 70786441 70783802,70785455 N,Y NA;TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 269409 1557 chr15 70795202 70802861 70801137,70796740 N,N NA;NA NA LOC145837,TLE3,KIF23,C15orf50,UACA,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 252989 1558 chr15 70887576 70890704 70889342 N NA NA UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 165146 1559 chr15 71062382 71073221 71063690,71071139,71067683 N,N,N NA;NA;NA UACA UACA,LRRC49,THAP10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UACA 6532 1560 chr15 71078893 71089754 71081384,71086145 N,N NA;NA UACA UACA,LARP6,LRRC49,THAP10 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 23043 1561 chr15 71427664 71430670 71429184 N NA NA THSD4 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC49 242736 1562 chr15 72747829 72749916 72748837 N NA ARIH1 CELF6,TMEM202,HEXA,C15orf34,ARIH1 IMR90 Hi-C 24141950 ARIH1 16751 1563 chr15 72913691 72924236 72913842 N NA NA CELF6,HIGD2B,BBS4 IMR90 Hi-C 24141950 ARIH1 147024 1564 chr15 73681465 73684967 73682628 N NA NA HCN4,NEO1,C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 240786 1565 chr15 74390108 74394617 74392657 N NA NA NA NA NA NA PML 103094 1566 chr15 75021569 75031088 75030514 N NA EDC3,CYP1A1,CSK EDC3,CLK3,CYP1A1,CYP1A2,C15orf17,MPI,COX5A,SCAMP2,LOC440288,UBL7,ULK3,LMAN1L,CPLX3 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1A1 3692 1567 chr15 75399993 75401968 75400995 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA C15orf39,SCAMP5,PPCDC MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPCDC 84066 1568 chr15 75615181 75616716 75616628 N NA COMMD4,NEIL1,MAN2C1 NA NA NA NA COMMD4 11658 1569 chr15 77193415 77199281 77197758 N NA SCAPER,RCN2 ETFA IMR90 Hi-C 24141950 SCAPER 17198 1570 chr15 77831249 77836613 77835851 N NA NA PEAK1,TSPAN3,HMG20A,PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 HMG20A 118006 1571 chr15 78236317 78238222 78237041 N NA NA TBC1D2B,DNAJA4,IDH3A,CIB2,IREB2,LOC91450,SH2D7,WDR61,LOC645752,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 131772 1572 chr15 79931932 79933796 79933020 N NA NA KIAA1024,ST20-MTHFS IMR90 Hi-C 24141950 MTHFS 255831 1573 chr15 79971672 79974375 79973243 Y NA NA TMED3,KIAA1024 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFS 215252 1574 chr15 80034567 80035819 80035215 N NA NA NA NA NA NA MTHFS 153808 1575 chr15 81384138 81386434 81384708 N NA NA IL16,C15orf26 IMR90 Hi-C 24141950 MESDC1 90843 1576 chr15 81710770 81713020 81711837 N NA NA IL16,EFTUD1,MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 STARD5 94246 1577 chr15 82223565 82227082 82224452 N NA NA IL16,MEX3B,TMC3,EFTUD1 IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 111279 1578 chr15 82233001 82234681 82234073 N NA NA IL16,MEX3B,TMC3,EFTUD1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEX3B 103680 1579 chr15 82242246 82247851 82243279,82245593 N,N NA;NA NA IL16,TMC3,EFTUD1,MEX3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEX3B 90510 1580 chr15 82250656 82253205 82251804 N NA NA MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 85156 1581 chr15 82373608 82376127 82374712 N NA MEX3B MEX3B,EFTUD1 IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 35247 1582 chr15 82383974 82394889 82386985 N NA MEX3B MEX3B,EFTUD1 IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 45613 1583 chr15 84047077 84050811 84049116 N NA NA SH3GL3,BNC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDGFRP3 170756 1584 chr15 84941302 84950802 84948881 N NA NA NA NA NA NA LOC440300 80702 1585 chr15 84955138 84964097 84957721 N NA NA NA NA NA NA LOC440300 94538 1586 chr15 85276825 85280728 85278565 N NA SEC11A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF592 11090 1587 chr15 85854108 85860767 85856142 N NA NA AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 63104 1588 chr15 85872230 85876359 85872830,85874546 N,Y NA;NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 47512 1589 chr15 85885727 85887573 85886814 Y NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 36298 1590 chr15 86413876 86432215 86415492,86423399 N,N NA;NA NA AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL25 75687 1591 chr15 87809583 87812630 87811349 N NA NA NA NA NA NA MRPL46 1198003 1592 chr15 87890598 87910449 87908668 N NA NA NA NA NA NA MRPL46 1100184 1593 chr15 88211399 88214319 88212628 N NA NA NTRK3,LOC283738 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL46 796314 1594 chr15 88279394 88298321 88295951,88279829 N,N NA;NA NA NTRK3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL46 712312 1595 chr15 88358331 88362177 88360227 N NA NA LOC283738,NTRK3,AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL46 648456 1596 chr15 88920914 88923298 88921642 N NA NA AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL46 87335 1597 chr15 88927936 88929045 88928483 N NA NA AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL46 81588 1598 chr15 89334913 89337307 89336252 N NA NA ACAN IMR90 Hi-C 24141950 HAPLN3 101463 1599 chr15 89460832 89465892 89463066 N NA HAPLN3,MFGE8 MFGE8 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MFGE8 4169 1600 chr15 89530839 89535602 89533523 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 74176 1601 chr15 89558830 89560625 89559973 N NA NA MFGE8,HAPLN3,ABHD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABHD2 70756 1602 chr15 90108192 90112342 90109053 N NA C15orf42 LOC283761,C15orf42 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf42 6476 1603 chr15 90697059 90703666 90698415,90701605 N,Y NA;ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 SEMA4B IDH2,SEMA4B,ZNF710,C15orf58,MESP1,WDR93,IQGAP1,CIB1,NGRN,TTLL13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 24486 1604 chr15 90708060 90710520 90709146 Y NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 17632 1605 chr15 91998451 92001585 91999824 N NA NA NA NA NA NA VPS33B 432618 1606 chr15 92103513 92106191 92104508 N NA NA SV2B IMR90 Hi-C 24141950 VPS33B 537680 1607 chr15 93361661 93365744 93363703,93365147 Y,N ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2;NA NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507217 60329 1608 chr15 93372639 93376968 93375205 Y NA LOC100507217 LOC100507217,CHD2,ASB9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507217 49105 1609 chr15 94412615 94448720 94443873 N NA NA NA NA NA NA CHD2 969064 1610 chr15 94747955 94750782 94749356 N NA NA NA NA NA NA CHD2 1304404 1611 chr15 94772879 94786130 94774308 N NA NA MCTP2 IMR90 Hi-C 24141950 CHD2 1329328 1612 chr15 95386980 95389961 95388568 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 1479196 1613 chr15 95790058 95791044 95790678 N NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 1078113 1614 chr15 96098522 96102679 96100968 N NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 766478 1615 chr15 96595493 96597844 96597191 N NA NA NR2F2,LOC400456,LOC145820 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 271313 1616 chr15 96600440 96602854 96601795 N NA NA NR2F2,LOC400456,LOC145820 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 266303 1617 chr15 96815500 96819258 96817571 N NA NR2F2 LOC400456,NR2F2,LOC145820 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 49899 1618 chr15 96963504 96966152 96964776 N NA NA LOC145820,LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 94347 1619 chr15 97526065 97531935 97527718 N NA NA NA NA NA NA NR2F2 656908 1620 chr15 98630941 98633679 98631781,98631702 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IGF1R 559082 1621 chr15 98696979 98700242 98698427 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 492519 1622 chr15 99087575 99092937 99091318 N NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 99824 1623 chr15 99142363 99145597 99143758 N NA IGF1R NA NA NA NA IGF1R 47164 1624 chr15 99555955 99564119 99559153 Y NA NA PGPEP1L,IGF1R MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TTC23 225696 1625 chr15 99981583 99984972 99982967 N NA NA LYSMD4,MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 121161 1626 chr15 99989590 99992306 99991209 Y MEF2A,MEF2A NA MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 113827 1627 chr15 99994062 99997658 99995313 Y MEF2A,MEF2A NA MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 108475 1628 chr16 10315439 10317768 10316369 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP2 162144 1629 chr16 10421109 10437731 10422024,10426417,10429871,10435601 N,N,N,N NA;NA;NA;NA ATF7IP2 NA NA NA NA ATF7IP2 42181 1630 chr16 10821599 10825247 10823785 N NA NUBP1 EMP2,TEKT5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUBP1 12451 1631 chr16 11404487 11412592 11408159 N NA RMI2 CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 26719 1632 chr16 11421664 11429840 11422819 N NA RMI2 CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 9471 1633 chr16 11472642 11474815 11473525 Y ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,LITAF,CLEC16A,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 33331 1634 chr16 11732567 11738188 11734418 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN NA TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 51245 1635 chr16 1187024 1189373 1187776 N NA CACNA1H LMF1,SOX8,CACNA1H,SSTR5,LOC146336,C1QTNF8,TPSG1,METRN,PRR25,CHTF18,GNG13,RPUSD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNA1H 13868 1636 chr16 12704353 12709338 12707155 N NA NA SNX29,CPPED1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPPED1 188406 1637 chr16 13398164 13403377 13400258,13401973 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CPPED1 500420 1638 chr16 1344988 1348783 1347297 N NA UBE2I UNKL IMR90 Hi-C 24141950 UBE2I 10371 1639 chr16 13698190 13704006 13701082 N NA NA NA NA NA NA ERCC4 310008 1640 chr16 14138504 14146706 14144670 N NA MKL2 ERCC4,MKL2,PARN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL2 18490 1641 chr16 14456693 14461252 14458571 N NA NA PARN,ERCC4,MIR365A,MIR193B,MKL2,BFAR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARN 262876 1642 chr16 14491362 14495817 14494541 N NA NA PARN,MIR193B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARN 228311 1643 chr16 15992680 15994587 15993691 N NA FOPNL MYH11,ABCC1,FOPNL,ABCC6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOPNL 10233 1644 chr16 16012954 16013957 16013456 N NA FOPNL MYH11,ABCC1 IMR90 Hi-C 24141950 FOPNL 30507 1645 chr16 17661963 17666887 17666060 N NA NA XYLT1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC6P1 915683 1646 chr16 17896043 17898950 17897647 N NA NA NA NA NA NA ABCC6P1 683620 1647 chr16 18956295 18959851 18957804 N NA SMG1,TMC7 NA NA NA NA SMG1 18569 1648 chr16 19403696 19406467 19405105 N NA NA SYT17,TMC5 IMR90 Hi-C 24141950 GDE1 126983 1649 chr16 21941964 21945180 21943585 N NA UQCRC2 NA NA NA NA UQCRC2 19429 1650 chr16 22203198 22208181 22207146,22203865 Y,Y NA;POLR3E EEF2K UQCRC2,POLR3E,EEF2K,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 9411 1651 chr16 23738565 23739638 23739012 N NA PLK1 NA NA NA NA PLK1 48364 1652 chr16 24441291 24442689 24442423 N NA NA PRKCB IMR90 Hi-C 24141950 RBBP6 108219 1653 chr16 24678756 24684750 24682500,24680155 N,Y NA;NA NA TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11,RBBP6 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 56299 1654 chr16 24711504 24714681 24712804 N NA TNRC6A TNRC6A,RBBP6,SLC5A11 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 26368 1655 chr16 24732338 24736436 24734673 N NA TNRC6A TNRC6A,RBBP6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6A 4613 1656 chr16 28646745 28658542 28647565 N NA EIF3C NA NA NA NA EIF3C 41337 1657 chr16 28814592 28829792 28827996,28815129 N,N NA;NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 ATXN2L,TUFM,RABEP2,CD19,NFATC2IP,SPNS1,ATP2A1,SH2B1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN2L 4622 1658 chr16 2913511 2921076 2918236 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12120 1659 chr16 2921625 2927574 2925151 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLYWCH2 5622 1660 chr16 29275014 29280585 29277463,29280410 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BOLA2B 185700 1661 chr16 29282339 29292122 29283207 Y SPNS1 NA SNX29P2 IMR90 Hi-C 24141950 BOLA2B 174163 1662 chr16 29499461 29501023 29500662 N NA BOLA2B,SLX1B-SULT1A4 NA NA NA NA SLX1B-SULT1A4 33049 1663 chr16 29953986 29957670 29955479 N NA ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA,PPP4C,DOC2A,C16orf92,FAM57B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 15681 1664 chr16 30640993 30650565 30645745,30643866 Y,N CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14;NA ZNF785,ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,ZNF768,ZNF747,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRR14 11676 1665 chr16 30815748 30821272 30817043 N NA RNF40,C16orf93,ZNF629 C16orf93,PHKG2,RNF40,ZNF629,MIR762,BCL7C,CTF1,MIR4519,FBXL19-AS1,FBXL19,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 17225 1666 chr16 30824327 30831518 30825800 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 25804 1667 chr16 31025905 31031277 31027880 N NA HSD3B7,STX4 STX1B,DEC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404,19890323 STX4 13626 1668 chr16 31033107 31037208 31036208 N NA HSD3B7,STX4,ZNF668,ZNF646 ZNF668,ZNF646,STX4 K562 ChIA-PET 22265404 STX4 7695 1669 chr16 31263271 31267323 31265062 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM ITGAM NA NA NA NA ITGAM 3965 1670 chr16 32092146 32106277 32097391,32093110 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF267 207067 1671 chr16 32110776 32135939 32126950,32112809,32119956,32130821 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF267 225697 1672 chr16 3215026 3216546 3216071 N NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29969 1673 chr16 3221567 3223706 3222278 N NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 36510 1674 chr16 3233069 3235373 3234239 N NA ZNF213 ZNF263,ZNF200 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF213 48012 1675 chr16 32353617 32362463 32360674 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 468538 1676 chr16 3236740 3239309 3238034 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 46148 1677 chr16 32471889 32477565 32472828 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 586810 1678 chr16 32815816 32822417 32820193 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 930737 1679 chr16 32825399 32840910 32827999 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 940320 1680 chr16 32850674 32853432 32851544 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 965595 1681 chr16 33035129 33048191 33040859,33036414 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF267 1150050 1682 chr16 33057327 33066912 33061010 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1172248 1683 chr16 33071721 33080702 33074065 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1186642 1684 chr16 33137860 33143358 33140487 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1252781 1685 chr16 33316356 33321492 33319554 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 1419348 1686 chr16 33355114 33360760 33357571 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 1380080 1687 chr16 33493662 33512714 33509711,33497582,33495541 Y,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100130700 1228126 1688 chr16 33864274 33869058 33865854 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 871782 1689 chr16 33887266 33889360 33888160 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 851480 1690 chr16 33898466 33902858 33901827,33899094 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100130700 837982 1691 chr16 33932481 33937039 33935492 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 803801 1692 chr16 34021932 34022930 34022437 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 717910 1693 chr16 34424096 34430328 34429550 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 310512 1694 chr16 34439713 34445622 34442097 Y NA NA NA NA NA NA LOC100130700 295218 1695 chr16 34485661 34492203 34489323 N NA NA NA NA NA NA LOC100130700 248637 1696 chr16 34784726 34792931 34787316 N NA LOC100130700 NA NA NA NA LOC100130700 43886 1697 chr16 4185138 4187659 4186812 N NA NA SRL,TFAP4,CREBBP,ADCY9,TRAP1,LOC100507501,CORO7-PAM16,PAM16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507501 116131 1698 chr16 4346579 4351710 4349362 N NA LOC100507501,TFAP4,GLIS2,PAM16 TRAP1,ADCY9,SRL,CREBBP,LOC100507501,TFAP4,PAM16,GLIS2,CORO7-PAM16,VASN,HMOX2,NMRAL1,DNAJA3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 23578 1699 chr16 4353625 4356235 4355019 N NA LOC100507501,TFAP4,GLIS2,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLIS2 25990 1700 chr16 4363693 4365507 4364953 N NA TFAP4,GLIS2,PAM16 SRL,LOC100507501,CORO7-PAM16,VASN,PAM16 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLIS2 16718 1701 chr16 46460540 46467845 46463013 N NA NA NA NA NA NA SHCBP1 187466 1702 chr16 47066946 47073777 47071791 N NA NA ABCC12,ABCC11,PHKB,MIR548AE2,DNAJA2,NETO2,ITFG1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJA2 59321 1703 chr16 47920569 47923650 47921998 N NA NA ABCC12,NETO2,ITFG1,PHKB IMR90 Hi-C 24141950 MIR548AE2 350953 1704 chr16 48442569 48445804 48443476 N NA SIAH1 NA NA NA NA SIAH1 23340 1705 chr16 48447246 48451090 48447825 N NA SIAH1 NA NA NA NA SIAH1 28017 1706 chr16 48477228 48480493 48478956 N NA NA SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 SIAH1 57999 1707 chr16 48491131 48493269 48492023 N NA NA SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 SIAH1 71902 1708 chr16 48494814 48499852 48495959 N NA NA SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 SIAH1 75585 1709 chr16 48991422 48999828 48993016,48997873 N,N NA;NA NA NA NA NA NA N4BP1 347302 1710 chr16 49081571 49083742 49082621 N NA NA NA NA NA NA N4BP1 437451 1711 chr16 4991793 5005267 4993466,4997040,4995478 Y,N,N PPL;NA;NA NA UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507589 78436 1712 chr16 50019350 50024187 50020580 N NA CNEP1R1 NKD1,PAPD5 IMR90 Hi-C 24141950 CNEP1R1 35002 1713 chr16 50894953 50897629 50896154 N NA NA NA NA NA NA CYLD 118992 1714 chr16 54406172 54410378 54407914 N NA NA FTO IMR90 Hi-C 24141950 IRX3 85794 1715 chr16 54464551 54466064 54465025 N NA NA FTO IMR90 Hi-C 24141950 IRX3 144173 1716 chr16 55327888 55342641 55331293 N NA NA RPGRIP1L IMR90 Hi-C 24141950 MMP2 170440 1717 chr16 5654062 5658106 5654970 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 506273 1718 chr16 57333225 57334920 57334178 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,POLR2C,DOK4,CCDC102A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,GPR114 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL2BP 54187 1719 chr16 57349751 57353052 57350934 N NA NA CIAPIN1,CCL22,CX3CL1,POLR2C,COQ9,CCL17 IMR90 Hi-C 24141950 CX3CL1 53362 1720 chr16 57839955 57851545 57843290,57846515,57850396 N,N,N NA;NA;NA KIFC3 NA NA NA NA KIFC3 3516 1721 chr16 5787622 5788656 5788591 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 639833 1722 chr16 5870106 5872811 5870692 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 722317 1723 chr16 5886577 5888773 5887508 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 738788 1724 chr16 5900849 5902935 5902034 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 753060 1725 chr16 5931111 5960042 5950229,5956117 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM86A 783322 1726 chr16 59576299 59579034 59577452 N NA NA NA NA NA NA GOT2 808053 1727 chr16 6052017 6054246 6053123 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 904228 1728 chr16 61089028 61089955 61089598 N NA NA NA NA NA NA GOT2 2320782 1729 chr16 61161454 61170931 61162867 N NA NA NA NA NA NA GOT2 2393208 1730 chr16 63645362 63650012 63648342 N NA NA NA NA NA NA LOC100505865 2792415 1731 chr16 63690892 63693570 63691965 N NA NA NA NA NA NA LOC100505865 2748857 1732 chr16 64124935 64127440 64126423 N NA NA NA NA NA NA LOC100505865 2314987 1733 chr16 64203102 64205464 64204009 N NA NA NA NA NA NA LOC100505865 2236963 1734 chr16 64424479 64426274 64425214 N NA NA NA NA NA NA LOC100505865 2016153 1735 chr16 64942799 64945357 64944500 Y NA NA NA NA NA NA LOC100505865 1497070 1736 chr16 65233834 65235904 65235322 N NA NA LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505865 1206523 1737 chr16 66053812 66055127 66054360 N NA NA LOC283867,CDH11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505865 387300 1738 chr16 66301439 66305774 66304467 N NA NA CDH11,LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505865 136653 1739 chr16 66391677 66394279 66393404 N NA LOC100505865 CDH11,BEAN1,CMTM2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505865 48148 1740 chr16 67537444 67543776 67538398,67542172 Y,N NA;NA ATP6V0D1,FAM65A AGRP,TSNAXIP1,LRRC36,FAM65A,PARD6A,C16orf48,GFOD2,C16orf86,RLTPR,CTCF,ACD,PSKH1,RANBP10,CTRL IMR90 Hi-C 24141950 FAM65A 18941 1741 chr16 67549299 67557097 67555300 N NA ATP6V0D1,FAM65A,CTCF AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,C16orf48,C16orf86 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM65A 5620 1742 chr16 69446538 69450197 69447362 N NA TERF2,CYB5B CYB5B,COG8,NIP7,TMED6,TERF2,MIR1538,NFAT5,NQO1,WWP2,NOB1 IMR90 Hi-C 24141950 CYB5B 8301 1743 chr16 69551408 69555878 69552019 N NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2 IMR90 Hi-C 24141950 NFAT5 43991 1744 chr16 69562883 69565937 69564161 N NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33932 1745 chr16 72310667 72314785 72313182 N NA NA NA NA NA NA TXNL4B 182452 1746 chr16 72316068 72326724 72325533 N NA NA HPR IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 187853 1747 chr16 72560113 72564298 72560480 N NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 431898 1748 chr16 72695581 72722484 72697075,72698942 N,N NA;NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 370050 1749 chr16 73101437 73109211 73103679 N NA ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 8903 1750 chr16 73114469 73116649 73115126 N NA ZFHX3 ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 21935 1751 chr16 73682655 73687223 73685634 N NA NA HPR,TXNL4B,HP,ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 590121 1752 chr16 75173278 75176055 75174599 N NA ZFP1 WDR59,LDHD,ZNRF1,ZFP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP1 6366 1753 chr16 75592452 75596426 75594097 Y NA CHST5,TMEM231,GABARAPL2 CHST5,TMEM231,GABARAPL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM231 2282 1754 chr16 75793113 75796876 75795221 N NA NA KARS,ADAT1,TERF2IP,SYCE1L IMR90 Hi-C 24141950 TERF2IP 111478 1755 chr16 76263316 76290484 76268992,76265758 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TERF2IP 581681 1756 chr16 76943971 76946733 76945020 N NA NA NA NA NA NA SYCE1L 286616 1757 chr16 76979945 76983035 76980997 N NA NA NA NA NA NA SYCE1L 250314 1758 chr16 77220577 77224582 77223458 N NA SYCE1L NA NA NA NA SYCE1L 8767 1759 chr16 77813064 77815886 77814077 N NA NA NUDT7,VAT1L IMR90 Hi-C 24141950 SYCE1L 579715 1760 chr16 79402839 79408155 79403925,79406330 Y,N MAF;NA NA MAF MCF7 ChIA-PET 22265404 MAF 226467 1761 chr16 79661014 79663867 79662511 N NA MAF WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 26392 1762 chr16 79672578 79676333 79674670 Y NA MAF WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 37956 1763 chr16 79676974 79684314 79678954 N NA MAF WWOX,MAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAF 42352 1764 chr16 79688407 79699967 79692573,79698889 N,N NA;NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 53785 1765 chr16 7978333 8052958 7992637,8051574,8041093 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA METTL22 662569 1766 chr16 79789875 79799701 79792542,79798798 N,N NA;NA NA WWOX,MAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAF 155253 1767 chr16 79946045 79948897 79947202 N NA NA NA NA NA NA MAF 311423 1768 chr16 80060400 80062870 80061148 Y NA NA NA NA NA NA MAF 425778 1769 chr16 80182109 80203262 80193078,80201954,80197350 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAF 547487 1770 chr16 80204902 80211611 80206128,80208475,80210205 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAF 570280 1771 chr16 80231168 80233794 80231899 N NA NA NA NA NA NA MAF 596546 1772 chr16 80306202 80310065 80307947 N NA NA NA NA NA NA CDYL2 528110 1773 chr16 80322367 80337029 80334709 N NA NA NA NA NA NA CDYL2 501146 1774 chr16 8086063 8111741 8107302 N NA NA NA NA NA NA METTL22 603786 1775 chr16 8123365 8206742 8159688,8163649,8166301 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA METTL22 508785 1776 chr16 82238018 82242922 82238174 N NA MPHOSPH6 HSD17B2,PLCG2,MPHOSPH6,SDR42E1 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 34189 1777 chr16 8326559 8339470 8327940 N NA NA NA NA NA NA METTL22 376057 1778 chr16 8342997 8364005 8343568 N NA NA NA NA NA NA METTL22 351522 1779 chr16 84388402 84392810 84391015 Y OSGIN1,COTL1 NA ATP2C2 MCF7 ChIA-PET 22265404 KIAA1609 145478 1780 chr16 84563759 84567702 84566092 N NA KIAA1609 KIAA1609,COTL1,USP10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1609 25471 1781 chr16 84672944 84677470 84674358,84676739 N,N NA;NA COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 4661 1782 chr16 84722031 84723946 84722901 N NA KLHL36,USP10 USP10,KIAA1609,COTL1,KLHL36,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 USP10 9609 1783 chr16 84975894 84977802 84976572 N NA NA COTL1,USP10,CRISPLD2,ZDHHC7,FAM92B,KIAA0513 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC7 67339 1784 chr16 85159276 85162209 85160566 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC7 114135 1785 chr16 85205582 85255006 85208119,85232442 N,N NA;NA NA FAM92B,LOC400548,KIAA0182,KIAA0513,ZDHHC7,LINC00311,C16orf74 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00311 61558 1786 chr16 85271083 85272061 85271420 N NA LINC00311 LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 LINC00311 44503 1787 chr16 85546475 85552199 85548569 N NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 92830 1788 chr16 85581410 85622624 85588546,85591770 N,N NA;NA KIAA0182 GINS2,KIAA0182,LINC00311,LOC400548,FAM92B,KIAA0513,LOC727710,C16orf74,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 22405 1789 chr16 85920964 85923559 85922467 Y COX4I1,IRF8 IRF8 COX4NB,COX4I1,LOC400550,MTHFSD IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 9215 1790 chr16 86388053 86390483 86389130 N NA NA LOC146513,LOC400550 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 153650 1791 chr16 86419907 86424966 86421303 Y FOXF1,FOXC2 NA LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 119167 1792 chr16 86429410 86431980 86430757 N NA NA LOC400550,FOXF1,LOC146513,LOC732275 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 112153 1793 chr16 86696486 86705621 86698347,86701953 Y,N NA;NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ30679 107560 1794 chr16 86772439 86792959 86775152,86789390 Y,N NA;NA NA FOXC2,FOXL1,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ30679 183513 1795 chr16 86816372 86820048 86817362 N NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ30679 227446 1796 chr16 86956237 86966915 86958448,86965243,86962948 N,Y,Y NA;NA;NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ30679 367311 1797 chr16 86983649 86986792 86985633 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 364234 1798 chr16 87026867 87030049 87028504 N NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 320977 1799 chr16 87031767 87034059 87032937 N NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 316967 1800 chr16 87210213 87214512 87212851 N NA NA MTHFSD,FOXL1,LOC732275,FLJ30679,FOXC2,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 136514 1801 chr16 87612646 87620687 87612904,87615503 N,N NA;NA JPH3 MAP1LC3B,FBXO31,JPH3,CA5A,ZCCHC14,KLHDC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JPH3 15812 1802 chr16 87809345 87817667 87812229,87814535 N,N NA;NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 9747 1803 chr16 88271315 88276464 88273266,88276233 N,N NA;NA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 243550 1804 chr16 88278126 88285130 88279064 N NA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 234884 1805 chr16 88336836 88339008 88338073 N NA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 181006 1806 chr16 88345560 88352677 88349641 N NA NA BANP,CA5A IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 167337 1807 chr16 88363792 88372071 88366336 N NA NA BANP,CA5A IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 147943 1808 chr16 89080906 89092163 89085999 N NA NA ACSF3,CBFA2T3,LINC00304,LOC400558 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSF3 68054 1809 chr16 9135954 9175501 9172799,9162367,9167128 N,Y,N NA;NA;NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 10036 1810 chr17 1162069 1170198 1162876,1168751 N,N NA;NA NA CRK,SLC43A2,BHLHA9,YWHAE,TUSC5,MYO1C,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,ABR,SCARF1,PRPF8,RILP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAE 133358 1811 chr17 12421933 12425060 12423616 Y NA NA FLJ34690,MYOCD,ELAC2 IMR90 Hi-C 24141950 ELAC2 496321 1812 chr17 13247902 13253563 13250275 N NA NA HS3ST3B1,HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 ELAC2 326521 1813 chr17 13630342 13633909 13631772 N NA NA COX10 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 338810 1814 chr17 14608308 14609007 14608762 N NA NA NA NA NA NA PMP22 559637 1815 chr17 15175226 15184059 15176598,15182170 N,N NA;NA PMP22 PMP22 MCF7 ChIA-PET 22265404 PMP22 6582 1816 chr17 15300883 15303457 15302174 N NA NA PMP22,TEKT3,CDRT4,FAM18B2-CDRT4 IMR90 Hi-C 24141950 CDRT4 67468 1817 chr17 15311281 15314579 15313266 Y NA NA NA NA NA NA CDRT4 56346 1818 chr17 16419066 16422252 16420067 N NA NA FAM211A,CENPV,UBB,TRPV2,C17orf76-AS1,ZNF287 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF287 50268 1819 chr17 16768061 16770529 16768596 N NA NA NA NA NA NA USP32P1 77855 1820 chr17 16912618 16920211 16913821,16918058 N,N NA;NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90 Hi-C 24141950 MPRIP 25863 1821 chr17 16930589 16937454 16931572,16935549 N,N NA;NA MPRIP MPRIP,COPS3 IMR90 Hi-C 24141950 MPRIP 8620 1822 chr17 17314963 17316660 17315731 N NA NA NA NA NA NA MED9 63640 1823 chr17 17509574 17510409 17510095 N NA PEMT PEMT,NT5M,SMCR9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PEMT 14580 1824 chr17 17565894 17567446 17566805 Y NA RAI1 RAI1,SMCR9,PEMT,NT5M,TOM1L2,COPS3,MED9,RASD1,SMCR5,SREBF1,C17orf39,ATPAF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAI1 17341 1825 chr17 17578787 17580864 17579751 N NA RAI1 RAI1,SREBF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RAI1 3923 1826 chr17 18599593 18617985 18601254 N NA ZNF286B,TRIM16L NA NA NA NA TRIM16L 7417 1827 chr17 18963946 18969239 18965080,18967600 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM83G 55886 1828 chr17 19014173 19017715 19016094,19015243 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM83G 106113 1829 chr17 19090417 19095434 19091171,19093703 N,N NA;NA EPN2 NA NA NA NA EPN2 45256 1830 chr17 19408167 19412188 19411375 Y NA NA EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 126672 1831 chr17 19505425 19507816 19506647 N NA ALDH3A2 SLC47A2,ALDH3A2,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH3A2 44248 1832 chr17 19527790 19531091 19530382 N NA ALDH3A2 ALDH3A2,SLC47A2 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH3A2 20973 1833 chr17 20432782 20441494 20435537 N NA NA NA NA NA NA CCDC144C 208295 1834 chr17 20638894 20647637 20641522,20646568 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CCDC144NL 151816 1835 chr17 20678262 20680584 20679806 N NA NA NA NA NA NA CCDC144NL 118869 1836 chr17 20687874 20694399 20692193 N NA NA NA NA NA NA CCDC144NL 105054 1837 chr17 20704325 20707000 20705208 N NA NA NA NA NA NA CCDC144NL 92453 1838 chr17 20808983 20820441 20809420 N NA CCDC144NL USP22 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC144NL 9530 1839 chr17 20988279 21011877 21003032 N NA USP22,DHRS7B USP22,C17orf51,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 18364 1840 chr17 21176236 21182909 21179193 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 5059 1841 chr17 212204 212608 212241 N NA C17orf97 NA NA NA NA C17orf97 47510 1842 chr17 21510772 21556599 21514057,21516015 N,Y NA;NA NA CCDC144NL,MAP2K3,KCNJ12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C17orf51 55831 1843 chr17 21952662 21956299 21953881 N NA FLJ36000 NA NA NA NA FLJ36000 48600 1844 chr17 22049547 22055506 22052219 N NA MTRNR2L1 NA NA NA NA MTRNR2L1 27110 1845 chr17 22067794 22072129 22069678 Y NA MTRNR2L1 NA NA NA NA MTRNR2L1 45357 1846 chr17 25262940 25269452 25263265,25266303,25267938 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA WSB1 351654 1847 chr17 25353944 25355488 25354322 N NA NA NA NA NA NA WSB1 265618 1848 chr17 25383309 25387588 25385360 N NA NA NA NA NA NA WSB1 233518 1849 chr17 25388430 25503510 25414263,25416427,25456161 N,Y,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA WSB1 117596 1850 chr17 25676327 25680897 25680203 N NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 55221 1851 chr17 25706083 25708479 25707752 N NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 84977 1852 chr17 26358878 26364347 26361453 Y NA NLK NA NA NA NA NLK 5341 1853 chr17 28992036 29000000 28994649 N NA SUZ12P NA NA NA NA SUZ12P 36626 1854 chr17 29006509 29012136 29010683 N NA SUZ12P NA NA NA NA SUZ12P 24490 1855 chr17 29378046 29382091 29379358 N NA NF1 NF1,TEFM,ADAP2,MIR4733,OMG,RAB11FIP4 IMR90 Hi-C 24141950 NF1 39854 1856 chr17 29922823 29925410 29923875 Y EVI2A NA NA NA NA NA C17orf79 260916 1857 chr17 29999876 30002927 30001851 N NA NA RAB11FIP4,C17orf79,MIR193A,MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 C17orf79 183399 1858 chr17 30409013 30417740 30411374 N NA NA RHOT1 IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 51733 1859 chr17 30423559 30425078 30424493 N NA RHOT1 RHOT1,SUZ12 IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 44395 1860 chr17 3275548 3277055 3275725 N NA NA OR1D2 IMR90 Hi-C 24141950 OR3A2 93280 1861 chr17 35077045 35091581 35078693 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 119020 1862 chr17 35257572 35260919 35259034 N NA AATF AATF,LHX1,DHRS11,MRM1 IMR90 Hi-C 24141950 AATF 45256 1863 chr17 35274519 35280645 35275620,35278564 N,N NA;NA AATF LHX1,AATF MCF7 ChIA-PET 22265404 AATF 25530 1864 chr17 37385147 37386969 37385734 N NA CACNB1,RPL19 NA NA NA NA RPL19 28611 1865 chr17 37725927 37732402 37730144,37726617 N,N NA;NA NA CDK12,PGAP3,PPP1R1B,STARD3 IMR90 Hi-C 24141950 STARD3 60931 1866 chr17 37772746 37776201 37774470 N NA STARD3,TCAP PPP1R1B K562 ChIA-PET 22265404 STARD3 17132 1867 chr17 38272643 38276209 38275072,38275240 N,N NA;NA NR1D1,MSL1,CASC3 RARA MCF7 ChIA-PET 22265404 MSL1 2581 1868 chr17 38674316 38680152 38675053,38677991 Y,Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4;KRT24,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP2A 100114 1869 chr17 39801070 39805708 39802290,39804609 Y,N NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1;NA EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF1 39419 1870 chr17 39818878 39824997 39822870 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20130 1871 chr17 39835580 39838568 39836124 N NA EIF1 SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,EIF1,HAP1,JUP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF1 6559 1872 chr17 41398858 41401970 41400600 N NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581,DHX8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 34964 1873 chr17 41545415 41548313 41546509 N NA DHX8 LOC100130581,ARL4D,DHX8 IMR90 Hi-C 24141950 DHX8 13021 1874 chr17 41650943 41661008 41656817 N NA ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2,MEOX1,SOST,DUSP3,C17orf105 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 27181 1875 chr17 41667340 41674118 41669322,41672593 N,N NA;NA ETV4 LOC100130581,ARL4D,DHX8,ETV4,DUSP3,SOST,C17orf105,MEOX1 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 43578 1876 chr17 41796107 41802874 41797711 N NA NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5,ARL4D,PYY IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 53494 1877 chr17 42618636 42625126 42620863,42624680 N,Y NA;TMUB2,TMUB2,GRN GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD2 9686 1878 chr17 42663468 42668805 42664891 N NA FZD2 C17orf104,GPATCH8 IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 28656 1879 chr17 42676578 42679588 42677194 N NA FZD2 GPATCH8,CCDC43,C17orf104,FZD2,DBF4B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 41766 1880 chr17 43048914 43053283 43050029 N NA KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA C1QL1 3270 1881 chr17 43418782 43422031 43419272 N NA MAP3K14 LOC100133991,HEXIM1,MAP3K14,FMNL1,TEX34 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K14 24368 1882 chr17 43447407 43450833 43449323 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 52993 1883 chr17 43611679 43627765 43612788 N NA PLEKHM1 NA NA NA NA PLEKHM1 43533 1884 chr17 44337476 44340253 44337972 N NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC37A 32244 1885 chr17 44342356 44348178 44344329,44347888 Y,N NA;NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRC37A 24319 1886 chr17 45075347 45081002 45076732,45078652 N,N NA;NA NA GOSR2,RPRML,WNT9B,ITGB3 IMR90 Hi-C 24141950 GOSR2 74861 1887 chr17 45107367 45122421 45112970,45109057 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GOSR2 106881 1888 chr17 45134368 45154872 45143651,45135170,45147131,45153527 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NPEPPS,CDC27,MYL4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC27 111793 1889 chr17 45281007 45284079 45282663 N NA CDC27 ITGB3,CDC27,MYL4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC27 14342 1890 chr17 45959756 45965947 45963658 N NA SCRN2,SP2 PNPO,SP6,TBKBP1,TBX21,SCRN2,MRPL10,OSBPL7,LRRC46,SP2,PRR15L,CDK5RAP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP2 7569 1891 chr17 46548099 46552494 46550175,46548260 N,N NA;NA NA SKAP1,HOXB4,HOXB3,HOXB8,MIR10A,HOXB5,HOXB2,HOXB6,HOXB-AS3,MIR196A1,TTLL6,HOXB13,HOXB1 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB2 69899 1892 chr17 46558169 46566234 46561171,46564143,46564138 N,N,N NA;NA;NA NA SKAP1,HOXB3,HOXB-AS3,HOXB5,HOXB6,HOXB1,HOXB2,TTLL6,HOXB4,HOXB8,MIR10A,HOXB9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HOXB2 56159 1893 chr17 46747953 46764271 46748968,46755959 N,N NA;NA HOXB9,HOXB13 TTLL6,SKAP1,MIR3185,HOXB13,UBE2Z,IGF2BP1,HOXB6,HOXB-AS3,HOXB9,MIR196A1,CALCOCO2,HOXB8,HOXB-AS5,PRAC,ATP5G1,SNX11 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB13 41840 1894 chr17 46768638 46774149 46769047 N NA HOXB13 NA NA NA NA HOXB13 31962 1895 chr17 47048685 47051681 47049916 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNF8 26531 1896 chr17 47500588 47509412 47502004 N NA PHB ZNF652,SPOP,FAM117A,KAT7,NGFR,SLC35B1 IMR90 Hi-C 24141950 PHB 8346 1897 chr17 47646871 47647486 47647126 N NA NA ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPOP 108039 1898 chr17 47976818 47988064 47979400 N NA NA LOC284080,ITGA3,NXPH3,SLC35B1,FAM117A,KAT7,TAC4,PDK2,NGFR,SPOP,FLJ45513,DLX4,DLX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ45513 53546 1899 chr17 47989300 47999672 47990798 N NA NA KAT7,TAC4,FLJ45513,DLX3,SLC35B1,NGFR,DLX4,LOC284080,ITGA3,SPOP,FAM117A,NXPH3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ45513 66028 1900 chr17 48005769 48008711 48006388 N NA NA NGFR,SPOP,KAT7,ITGA3,SLC35B1,FLJ45513,TAC4,NXPH3,FAM117A,DLX4,DLX3 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ45513 82497 1901 chr17 48285594 48291716 48287458 N NA COL1A1 SGCA,HILS1,PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 6594 1902 chr17 49439416 49450935 49449661 N NA NA NA NA NA NA UTP18 101519 1903 chr17 4952570 4962099 4958937,4955375 N,N NA;NA ZFP3 ZFP3,ARRB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP3 19655 1904 chr17 51182986 51183869 51183605 N NA NA NA NA NA NA UTP18 1845089 1905 chr17 51703306 51706519 51705002 N NA NA NA NA NA NA COX11 1339545 1906 chr17 52387048 52387732 52387192 N NA NA NA NA NA NA COX11 658332 1907 chr17 53314009 53317237 53315854 Y HLF NA STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 182104 1908 chr17 53509537 53512437 53511570 N NA MMD MMD,TMEM100,PCTP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 10196 1909 chr17 53535094 53537817 53536223 N NA MMD NA NA NA NA MMD 35753 1910 chr17 53652236 53655324 53654472 N NA NA PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 152895 1911 chr17 54756878 54761562 54760116,54759490,54757138 N,N,N NA;NA;NA NA C17orf67 IMR90 Hi-C 24141950 NOG 85818 1912 chr17 54777309 54779335 54778746 N NA NA NOG IMR90 Hi-C 24141950 NOG 106249 1913 chr17 54780758 54786989 54785140 Y NA NA NOG,ANKFN1 IMR90 Hi-C 24141950 NOG 109698 1914 chr17 54830807 54835770 54833191 N NA NA NA NA NA NA DGKE 75690 1915 chr17 55234154 55235710 55234667 N NA NA OR4D1,MSX2P1,SRSF1,MSI2,MRPS23 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP1 71601 1916 chr17 56013903 56017009 56016088 N NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 33153 1917 chr17 56308130 56312605 56310236 Y SUPT4H1 MKS1 LPO,MKS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKS1 11164 1918 chr17 57503532 57506728 57505034 Y NA NA YPEL2,GDPD1,PRR11 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL2 94479 1919 chr17 57507492 57508571 57507885 N NA NA YPEL2,GDPD1,PRR11 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL2 98439 1920 chr17 58203420 58213581 58213067,58208433 N,N NA;NA HEATR6,LOC645638 C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC645638 37592 1921 chr17 60246594 60250673 60248450 N NA NA NA NA NA NA MED13 103951 1922 chr17 60368655 60373574 60371933 N NA NA NA NA NA NA METTL2A 127672 1923 chr17 6134149 6136988 6135713 N NA NA NA NA NA NA FAM64A 210747 1924 chr17 61526762 61528581 61528150 N NA CYB561 NA NA NA NA CYB561 3040 1925 chr17 62674404 62706899 62702917,62676139,62678638,62704992,62691370,62680009,62684311 N,Y,N,N,N,N,N NA;SMURF2;NA;NA;NA;NA;NA SMURF2 SMURF2,LOC146880 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMURF2 16018 1926 chr17 62922231 62937668 62936484,62923604 N,N NA;NA AMZ2P1 LRRC37A3,RGS9,GNA13,PLEKHM1P IMR90 Hi-C 24141950 AMZ2P1 34035 1927 chr17 63057328 63062462 63059925 N NA GNA13 AMZ2P1,GNA13,RGS9 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 4408 1928 chr17 63092463 63113669 63096800 N NA GNA13 RGS9,LRRC37A3,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 39543 1929 chr17 63116097 63120838 63119503 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 63177 1930 chr17 63340150 63344665 63341901 N NA NA CEP112,PRKCA,AXIN2 IMR90 Hi-C 24141950 AXIN2 213075 1931 chr17 64940806 64943491 64942265 N NA NA CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ IMR90 Hi-C 24141950 HELZ 297828 1932 chr17 64944181 64949843 64946083,64948068 N,N NA;NA NA CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HELZ 291476 1933 chr17 66014953 66023306 66016171 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 8542 1934 chr17 66755335 66756538 66755949 N NA NA FAM20A,ABCA10,ABCA9,ABCA8,PRKAR1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 247225 1935 chr17 67318989 67325069 67323734 N NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 810879 1936 chr17 67565045 67566582 67565750 N NA NA NA NA NA NA PRKAR1A 1056935 1937 chr17 67570630 67572812 67571565,67571657 N,N NA;NA NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1A 1062520 1938 chr17 67603835 67606668 67604989 N NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1A 1095725 1939 chr17 67756897 67759986 67758066 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1A 1248787 1940 chr17 69066455 69070015 69068015 Y NA NA NA NA NA NA SOX9 1047146 1941 chr17 69182754 69186975 69185396 N NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 930186 1942 chr17 69400362 69403202 69401585 N NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 713959 1943 chr17 69407518 69411237 69409221 N NA NA SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 705924 1944 chr17 69417752 69422160 69420540 N NA NA SOX9,LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 695001 1945 chr17 69433798 69438643 69435140,69437333 N,Y NA;NA NA SOX9,LOC100499467,SLC39A11 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 678518 1946 chr17 69626691 69631142 69627910,69629892 N,Y NA;NA NA LOC100499467,LINC00511 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 486019 1947 chr17 69894470 69898138 69896386 N NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 219023 1948 chr17 69917456 69921790 69920108,69918417 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SOX9 195371 1949 chr17 69970738 69973049 69971709 N NA NA NA NA NA NA SOX9 144112 1950 chr17 70022973 70031873 70026708 N NA NA NA NA NA NA SOX9 85288 1951 chr17 70292323 70294973 70293688 N NA NA SOX9,LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 175162 1952 chr17 70332676 70341394 70335409,70338950 Y,N NA;NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 215515 1953 chr17 70356704 70359943 70358460 N NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100499467 229000 1954 chr17 71115055 71117455 71116044 N NA SLC39A11,SSTR2 SLC39A11,LINC00511,COG1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A11 26202 1955 chr17 71143367 71148650 71144149,71146965 N,N NA;NA SSTR2,COG1 SLC39A11,COG1 IMR90 Hi-C 24141950 SSTR2 12510 1956 chr17 71150693 71153471 71152608 Y C17orf80,SSTR2 SSTR2,COG1 SLC39A11,COG1 IMR90 Hi-C 24141950 SSTR2 7689 1957 chr17 71702475 71703868 71703222 N NA NA SDK2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP4 394332 1958 chr17 73439615 73443486 73440730 N NA GRB2,KIAA0195 GRB2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0195 9178 1959 chr17 74835524 74840171 74836635 N NA MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MGAT5B 24627 1960 chr17 74997312 75000443 74998646 N NA NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 SEC14L1 84282 1961 chr17 75249712 75253776 75251326 N NA SEPT9 SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT9 23716 1962 chr17 75765382 75768104 75767076 N NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 232214 1963 chr17 75829353 75832213 75830805 Y TMC8,TMC6 NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 168105 1964 chr17 76261795 76267481 76265322 N NA NA TNRC6C,LOC100131096,TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,SOCS3,DNAH17,PGS1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 51518 1965 chr17 76577706 76591563 76588452 Y NA NA DNAH17,CYTH1,USP36,PGS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 186813 1966 chr17 76640689 76643953 76642204 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA DNAH17,CYTH1 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 134423 1967 chr17 76926200 76934940 76930722,76927183 N,N NA;NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2,USP36,LOC100507410,C1QTNF1,LGALS3BP MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TIMP2 4728 1968 chr17 77815270 77821631 77818889 N NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 2057 1969 chr17 78469946 78478581 78475705 N NA RPTOR ENDOV,RPTOR,CHMP6,LOC100294362 IMR90 Hi-C 24141950 RPTOR 40044 1970 chr17 7891510 7896552 7893700 N NA NA CHD3,EFNB3,DNAH2,KDM6B,CNTROB,KCNAB3,TRAPPC1,GUCY2D,ALOX15B,LOC284023 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTROB 56068 1971 chr17 79309757 79319696 79318310 N NA SLC38A10 ACTG1,SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,C17orf56,C17orf89,MIR3186,NPLOC4 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A10 40661 1972 chr17 79323297 79325193 79325129 N NA NA SLC38A10,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,NPLOC4,LINC00482,ACTG1,C17orf70,MIR3186,FSCN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 54201 1973 chr17 79921478 79927255 79926040 Y TSPAN10 SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1 ASPSCR1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ASPSCR1 8171 1974 chr17 80244866 80247987 80246173 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSNK1D 13272 1975 chr17 81029228 81032768 81031561 Y METRNL B3GNTL1,METRNL TBCD,B3GNTL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METRNL 4799 1976 chr17 8587524 8590042 8589033 N NA NA MYH10 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 53445 1977 chr17 9704831 9707559 9705990 N NA NA NA NA NA NA USP43 155881 1978 chr17 9723093 9725156 9723920 N NA NA NA NA NA NA USP43 174143 1979 chr18 10008061 10017706 10010864,10016054 N,N NA;NA NA APCDD1,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 94106 1980 chr18 1016545 1079730 1018156 N NA NA COLEC12 T cell 3C 21310710 YES1 204218 1981 chr18 11323862 11327042 11325374 N NA NA PIEZO2 IMR90 Hi-C 24141950 MPPE1 581754 1982 chr18 1182917 1191452 1190285,1184541 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LINC00470 168178 1983 chr18 11937249 11941103 11938937 N NA MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90 Hi-C 24141950 MPPE1 28453 1984 chr18 11942383 11957261 11955780,11947204,11955959 N,N,N NA;NA;NA MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL,MPPE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 24166 1985 chr18 12217694 12221185 12218824 N NA NA NA NA NA NA TUBB6 87072 1986 chr18 12232511 12234575 12233656 N NA NA TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 73682 1987 chr18 13796228 13799103 13797025 N NA NA C18orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNMT 69524 1988 chr18 13799953 13802826 13801044 N NA NA C18orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNMT 73249 1989 chr18 14430206 14432378 14431272 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 251110 1990 chr18 14965134 14973826 14970727 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 786038 1991 chr18 14975471 14977708 14976933 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 796375 1992 chr18 1508513 1521581 1509048 N NA NA NA NA NA NA LINC00470 148883 1993 chr18 19611119 19614372 19612549 N NA NA NA NA NA NA MIB1 289574 1994 chr18 19656661 19659003 19657872 N NA NA NA NA NA NA MIB1 335116 1995 chr18 19856906 19860081 19858012 N NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 MIB1 535361 1996 chr18 20013880 20016422 20015382 Y NA NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 496873 1997 chr18 20045053 20050255 20047141 N NA NA GATA6,CTAGE1,RBBP8 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 463040 1998 chr18 20130121 20133459 20131184 N NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 379836 1999 chr18 20135303 20142347 20140037,20136595 Y,N GATA6;NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 370948 2000 chr18 20217303 20221633 20217705,20219874 N,N NA;NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 291662 2001 chr18 20252456 20255807 20254428 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 257488 2002 chr18 20273451 20276878 20275078 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 236417 2003 chr18 20290012 20292984 20291353 N NA NA GATA6,CABLES1 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 220311 2004 chr18 20405679 20408178 20407086 N NA NA RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 105117 2005 chr18 20409277 20412908 20411662 Y RBBP8,RBBP8 NA RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 100387 2006 chr18 20684711 20689423 20687311 N NA NA TMEM241,CABLES1,RIOK3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBBP8 171416 2007 chr18 20694502 20697771 20695746 N NA NA TMEM241,CABLES1,RBBP8,RIOK3 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 181207 2008 chr18 22139766 22141710 22140777 N NA NA NA NA NA NA IMPACT 133157 2009 chr18 22444908 22448067 22446106 N NA NA ZNF521,LOC729950 IMR90 Hi-C 24141950 IMPACT 438299 2010 chr18 2299465 2299760 2299610 N NA NA NA NA NA NA METTL4 271729 2011 chr18 2301165 2304690 2302868,2303985 N,N NA;NA NA NA NA NA NA METTL4 266799 2012 chr18 23228451 23232022 23230387 N NA NA ZNF521 IMR90 Hi-C 24141950 SS18 438589 2013 chr18 24232391 24236978 24236245 N NA NA TAF4B,KCTD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF4B 425982 2014 chr18 25416966 25421046 25418825 N NA NA NA NA NA NA CDH2 336399 2015 chr18 25422235 25426250 25424283 N NA NA NA NA NA NA CDH2 331195 2016 chr18 25500488 25503916 25502002 N NA NA NA NA NA NA CDH2 253529 2017 chr18 25875827 25879360 25876148 N NA NA NA NA NA NA CDH2 118382 2018 chr18 26200058 26203805 26202452 N NA NA NA NA NA NA CDH2 442613 2019 chr18 26705868 26729359 26714048,26727860 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CDH2 948423 2020 chr18 26732767 26749067 26735274,26744224,26744865 Y,Y,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CDH2 975322 2021 chr18 26760260 26761596 26761441 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 1002815 2022 chr18 27733788 27757742 27755964 N NA NA NA NA NA NA DSG2 1320285 2023 chr18 29536154 29537643 29537042 N NA TRAPPC8 TRAPPC8 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC8 13063 2024 chr18 29580143 29584444 29581999 N NA NA NA NA NA NA TRAPPC8 57052 2025 chr18 3014396 3015441 3015364 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 2451 2026 chr18 33158635 33167601 33161944 N NA NA NA NA NA NA GALNT1 66932 2027 chr18 3366517 3369271 3367987 N NA NA TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 MYL12B 104406 2028 chr18 37525318 37526824 37526043 N NA NA NA NA NA NA LOC647946 193359 2029 chr18 38653248 38657892 38655283,38657181 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PIK3C3 877307 2030 chr18 38705324 38707732 38706799 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 827467 2031 chr18 39208309 39214861 39211887 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 320338 2032 chr18 39519244 39521508 39520609 Y NA PIK3C3 PIK3C3 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C3 13691 2033 chr18 41240631 41243237 41242326 N NA NA SLC14A2,SETBP1 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C3 1705432 2034 chr18 42174044 42177330 42175076 N NA NA NA NA NA NA EPG5 1369975 2035 chr18 43361762 43364933 43363329 N NA NA SIGLEC15,EPG5,SLC14A1,SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 182372 2036 chr18 43371860 43379420 43373541 Y PSTPIP2,EPG5 NA SIGLEC15,SLC14A1,EPG5,SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 167885 2037 chr18 43384162 43387619 43386522 N NA NA EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPG5 159686 2038 chr18 43734517 43740596 43735761 N NA C18orf25 NA NA NA NA C18orf25 13392 2039 chr18 44343178 44347322 44346735 N NA NA ST8SIA5,PIAS2 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS2 150173 2040 chr18 44790793 44815535 44791703 N NA NA KATNAL2,HDHD2 IMR90 Hi-C 24141950 IER3IP1 88048 2041 chr18 45677708 45691336 45687840 N NA NA ZBTB7C,MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 SMAD2 220193 2042 chr18 46014134 46015958 46015300 N NA CTIF CTIF,DYM IMR90 Hi-C 24141950 CTIF 49469 2043 chr18 46481613 46483556 46482549 N NA SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 4532 2044 chr18 46485872 46489551 46487386 N NA SMAD7 SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 8791 2045 chr18 46515748 46518561 46517118 N NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 38667 2046 chr18 47251067 47254802 47252731 Y LIPG NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 85449 2047 chr18 47832792 47835641 47834266 Y CCDC11,MBD1,MBD1 MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 18100 2048 chr18 48379564 48382139 48380886 N NA ME2 SMAD4 IMR90 Hi-C 24141950 ME2 23293 2049 chr18 53444870 53448470 53446999 N NA NA TCF4,MIR4529 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 857450 2050 chr18 53456366 53459357 53457779 N NA NA TCF4,LOC100505474,TXNL1 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 846563 2051 chr18 53498786 53502537 53501020 N NA NA TCF4,TXNL1,MIR4529 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 803383 2052 chr18 53505168 53507553 53506566 N NA NA TCF4,TXNL1,LOC100505474 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 798367 2053 chr18 54068951 54071548 54070335 Y NA NA TCF4,LOC100505474 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 234372 2054 chr18 54754620 54756933 54755405 N NA NA NA NA NA NA WDR7 436004 2055 chr18 55479964 55487390 55487037,55480637 N,Y NA;NA NA ATP8B1,NEDD4L,LOC100505549,ALPK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100505549 182430 2056 chr18 55503687 55509102 55505225 N NA NA NEDD4L,ATP8B1,LOC100505549 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505549 206153 2057 chr18 5566363 5567071 5566813 N NA EPB41L3 NA NA NA NA EPB41L3 22377 2058 chr18 55669773 55673429 55672235 N NA NA NEDD4L,ATP8B1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505549 372239 2059 chr18 5581208 5587657 5582405,5585389 N,N NA;NA EPB41L3 NA NA NA NA EPB41L3 37222 2060 chr18 5623969 5629699 5628821 N NA NA NA NA NA NA EPB41L3 79983 2061 chr18 56450927 56454480 56452716 N NA NA ZNF532,GRP,LOC390858,NEDD4L,ALPK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF532 75581 2062 chr18 56505379 56507999 56506908 N NA ZNF532 ALPK2,ZNF532,LOC390858 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF532 22062 2063 chr18 56514991 56527214 56516707,56522774 N,N NA;NA ZNF532 ZNF532 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF532 2847 2064 chr18 56674103 56676738 56675840 N NA NA ALPK2,ZNF532,LOC390858 IMR90 Hi-C 24141950 SEC11C 130387 2065 chr18 57069169 57076775 57071191 N NA LMAN1 GRP,CPLX4,LMAN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMAN1 42661 2066 chr18 57383884 57387801 57386252 N NA CCBE1 CCBE1 IMR90 Hi-C 24141950 CCBE1 19240 2067 chr18 57410169 57412389 57411896 N NA CCBE1 CCBE1 IMR90 Hi-C 24141950 CCBE1 45525 2068 chr18 57445462 57452350 57447290,57450577 N,N NA;NA NA CCBE1 IMR90 Hi-C 24141950 CCBE1 80818 2069 chr18 57548635 57556297 57549631,57553188 N,Y NA;PMAIP1 PMAIP1 PMAIP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PMAIP1 10895 2070 chr18 57619141 57622178 57620628 N NA NA PMAIP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PMAIP1 51949 2071 chr18 57623796 57628486 57625384 N NA NA PMAIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PMAIP1 56604 2072 chr18 57686171 57688894 57687276 N NA NA NA NA NA NA PMAIP1 118979 2073 chr18 5898909 5905220 5900425,5901731 N,N NA;NA TMEM200C L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM200C 6806 2074 chr18 5907617 5920367 5909258 N NA TMEM200C L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM200C 15514 2075 chr18 59264401 59275094 59270355,59274126 N,N NA;NA NA PIGN,RNF152 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1468 579430 2076 chr18 60730004 60731900 60730467 N NA NA BCL2,KDSR IMR90 Hi-C 24141950 KDSR 302606 2077 chr18 65026456 65028845 65027584 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 155122 2078 chr18 65084854 65086905 65085740 N NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 DSEL 97062 2079 chr18 6623650 6625874 6624216 N NA NA LOC100130480,ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400643 303994 2080 chr18 66289474 66292017 66291080 N NA NA LOC643542,DSEL IMR90 Hi-C 24141950 TMX3 90336 2081 chr18 6682854 6685125 6683297 N NA NA ARHGAP28,LOC100130480 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400643 244743 2082 chr18 6688113 6695526 6688504 N NA NA ARHGAP28,LOC100130480 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400643 234342 2083 chr18 6717826 6722996 6720075 N NA NA ARHGAP28,LOC100130480 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400643 206872 2084 chr18 6726822 6736749 6729499 N NA NA ARHGAP28,LOC100130480,TMEM200C IMR90 Hi-C 24141950 LOC400643 193119 2085 chr18 6746745 6765070 6747812,6758626 N,N NA;NA NA LOC100130480,ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400643 164798 2086 chr18 68048089 68053747 68051588 N NA NA RTTN,SOCS6 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 91952 2087 chr18 68298775 68301468 68299783 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 342638 2088 chr18 69323278 69325155 69323494 N NA NA NA NA NA NA NETO1 1209655 2089 chr18 70086363 70088694 70087406 N NA NA NA NA NA NA NETO1 446116 2090 chr18 71312199 71315544 71314201 N NA NA LOC100505817 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400655 380466 2091 chr18 7156859 7160242 7158433 N NA LAMA1 LAMA1 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA1 39046 2092 chr18 7172051 7173358 7172820 N NA NA LAMA1,LOC400643,ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA1 54238 2093 chr18 71969964 71972801 71971377 N NA CYB5A TIMM21,CYB5A,C18orf63 IMR90 Hi-C 24141950 CYB5A 10713 2094 chr18 73337401 73338341 73338087 N NA NA NA NA NA NA ZADH2 416120 2095 chr18 73957103 73968950 73967365 N NA NA NA NA NA NA ZNF516 238196 2096 chr18 74918013 74925298 74919946 N NA NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF236 381897 2097 chr18 74934241 74936097 74935384 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 398125 2098 chr18 75078463 75080468 75079241 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 542347 2099 chr18 75333804 75335898 75334316 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 797688 2100 chr18 75350 75874 75745 N NA ROCK1P1 NA NA NA NA ROCK1P1 33191 2101 chr18 75681123 75712514 75703662,75699005 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATP9B 1116883 2102 chr18 75829291 75831241 75830241 N NA NA NA NA NA NA ATP9B 998156 2103 chr18 76052161 76055953 76054121 N NA NA NA NA NA NA ATP9B 773444 2104 chr18 76253992 76256037 76254519 N NA NA NA NA NA NA ATP9B 573360 2105 chr18 76564697 76577808 76575646 N NA NA SALL3 IMR90 Hi-C 24141950 ATP9B 251589 2106 chr18 76606835 76614178 76607928,76611886,76610841 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ATP9B 215219 2107 chr18 77329102 77333277 77330691 N NA NA NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 106524 2108 chr18 77389520 77391570 77390596 N NA CTDP1 NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 48231 2109 chr18 77550218 77557791 77551785 Y PQLC1,CTDP1 NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 110417 2110 chr18 78015636 78016886 78016288 N NA NA LOC100130522,PARD6G IMR90 Hi-C 24141950 LOC100130522 109829 2111 chr18 8889530 8892751 8891114 N NA NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC165 172161 2112 chr18 8942558 8958436 8944044,8948195 N,N NA;NA NA CCDC165,RAB12 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 144192 2113 chr18 9015865 9020865 9017516 Y ANKRD12 NA CCDC165,NDUFV2,ANKRD12,RALBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDUFV2 81763 2114 chr19 1178331 1185542 1184016,1180683 Y,N SBNO2;NA SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 SBNO2 4049 2115 chr19 12609768 12612864 12610800 N NA ZNF564 ZNF433,ZNF625-ZNF20,ZNF44,ZNF442,ZNF564,ZNF440,ZNF878,ZNF20,ZNF563,ZNF709 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF564 49492 2116 chr19 14327679 14329594 14328224 N NA LPHN1 NA NA NA NA LPHN1 10682 2117 chr19 14338578 14346404 14342806,14339290 N,N NA;NA LPHN1 LOC100507373 IMR90 Hi-C 24141950 LPHN1 21581 2118 chr19 14356777 14372642 14359958 N NA LPHN1 LOC100507373,CD97,C19orf57,LPHN1 IMR90 Hi-C 24141950 LPHN1 39780 2119 chr19 14443602 14457022 14444363 N NA CD97 LPHN1,LOC100507373,ASF1B,PODNL1,DCAF15,CC2D1A,PRKACA,SAMD1,PKN1,DDX39A,GIPC1,PTGER1,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 34934 2120 chr19 14462745 14479674 14474436,14464387,14469509 N,N,N NA;NA;NA CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD97 12282 2121 chr19 15414895 15427476 15419028,15421196,15426452,15426388 N,N,N,N NA;NA;NA;NA BRD4 AKAP8,AKAP8L,BRD4,SYDE1,ILVBL,NOTCH3,EPHX3 IMR90 Hi-C 24141950 BRD4 23633 2122 chr19 15722644 15723531 15723131 N NA NA NA NA NA NA AKAP8L 192811 2123 chr19 16426035 16429231 16427798 N NA KLF2 NA NA NA NA KLF2 6420 2124 chr19 1671145 1672454 1671850 N NA TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF3 18817 2125 chr19 1720670 1728110 1721625,1725862 N,Y NA;C19orf26,MUM1,APC2 NA TCF3,MEX3D,ATP8B3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,LOC100288123,REXO1,ADAMTSL5 IMR90 Hi-C 24141950 TCF3 68342 2126 chr19 22064382 22070155 22069445 N NA NA NA NA NA NA ZNF100 113952 2127 chr19 22070831 22073435 22072181 N NA NA NA NA NA NA ZNF100 120401 2128 chr19 23271982 23272352 23272139 N NA NA NA NA NA NA ZNF492 454856 2129 chr19 23727492 23744828 23732691,23737336,23730722 Y,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF675 125189 2130 chr19 24139431 24141809 24140541 N NA NA NA NA NA NA ZNF675 269414 2131 chr19 2468094 2472890 2469600 N NA TIMM13,LMNB2,GADD45B GADD45B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 GADD45B 3233 2132 chr19 27731703 27735747 27731984 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 549101 2133 chr19 28452247 28453875 28453295 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 167399 2134 chr19 28460200 28465775 28462668,28463375 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA LOC148189 175352 2135 chr19 28703611 28704952 28704627 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 418763 2136 chr19 29062438 29118529 29114420 N NA NA LOC284395 IMR90 Hi-C 24141950 UQCRFS1 585607 2137 chr19 29170530 29176558 29174528 N NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 527578 2138 chr19 29451451 29453565 29452500 N NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 250571 2139 chr19 30718520 30728299 30719680 N NA NA NA NA NA NA CCNE1 415619 2140 chr19 30814812 30831081 30815339 N NA NA ZNF536 IMR90 Hi-C 24141950 CCNE1 511911 2141 chr19 31207047 31211972 31210465 N NA NA NA NA NA NA TSHZ3 628218 2142 chr19 31556450 31558539 31557533 N NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 281651 2143 chr19 31629292 31633047 31631571 N NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 207143 2144 chr19 31703526 31707686 31705192 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 132504 2145 chr19 31938118 31940930 31939393 N NA NA DKFZp566F0947 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 97928 2146 chr19 31942602 31944285 31942956 N NA NA NA NA NA NA TSHZ3 102412 2147 chr19 32164041 32169253 32166491 N NA NA NA NA NA NA TSHZ3 323851 2148 chr19 32594720 32596863 32595663 N NA NA NA NA NA NA ZNF507 239651 2149 chr19 34556257 34560901 34558615 N NA NA NA NA NA NA LSM14A 102451 2150 chr19 34624466 34627956 34625431 N NA LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35396 2151 chr19 35103912 35109184 35106600 N NA NA SCGB2B3P,ZNF302,ZNF599 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF302 59383 2152 chr19 36421599 36423797 36422541 N NA NFKBID,LRFN3 NFKBID,HCST MCF7 ChIA-PET 22265404 LRFN3 4225 2153 chr19 37549225 37557251 37555744 N NA ZNF420 ZNF829,ZNF345,ZNF585A,ZNF570 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF420 12131 2154 chr19 37775537 37793247 37783960 N NA HKR1 NA NA NA NA HKR1 32333 2155 chr19 39562038 39571361 39564977,39569536 N,N NA;NA PAK4 PAPL,SAMD4B,GMFG,LRFN1,PAK4 IMR90 Hi-C 24141950 PAK4 45059 2156 chr19 40053400 40056161 40054268 Y PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 EID2B,EID2 DLL3,EID2,EID2B,LGALS16,LGALS17A,CLC,LEUTX,ZNF780A,LGALS13,LOC100129935,LGALS14 IMR90 Hi-C 24141950 EID2 22562 2157 chr19 40797432 40800086 40799118 N NA AKT2 AKT2,CNTD2,TTC9B IMR90 Hi-C 24141950 AKT2 6130 2158 chr19 4130021 4133918 4131496 N NA MAP2K2,SIRT6 MAP2K2,EEF2,ZBTB7A,ANKRD24,CREB3L3,SIRT6 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAP2K2 5895 2159 chr19 41680081 41684903 41682177 Y NA AXL CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 AXL 40205 2160 chr19 42026413 42029278 42028188 N NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 80570 2161 chr19 42033061 42039931 42037996 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 87218 2162 chr19 43623949 43626504 43624793 Y NA NA PSG5,PSG4,PSG9 IMR90 Hi-C 24141950 PSG4 83286 2163 chr19 44203766 44209063 44205154,44207085 N,N NA;NA PLAUR SMG9,LYPD5,PLAUR,IRGC,KCNN4 IMR90 Hi-C 24141950 PLAUR 29268 2164 chr19 45087844 45093773 45091859 N NA NA MIR4531,PVR,CEACAM16,TOMM40,CEACAM22P,IGSF23,BCL3,CBLC,BCAM,CEACAM19 IMR90 Hi-C 24141950 PVR 53325 2165 chr19 45240172 45245134 45242326 Y RELB,CLASRP,BCL3 BCL3 BCL3 K562 ChIA-PET 22265404 BCL3 6844 2166 chr19 45941326 45942548 45942002 N NA CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1 ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERCC1 14149 2167 chr19 45946167 45950397 45946894 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1 ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERCC1 18990 2168 chr19 4615290 4622263 4616526,4618574 N,N NA;NA TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 17264 2169 chr19 46633528 46636457 46634994 N NA NA NOVA2,IGFL3,IGFL2,DKFZp434J0226,IGFL1,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC61 135189 2170 chr19 46691664 46693541 46692368 N NA NA NOVA2,IGFL3,IGFL2,IGFL1,DKFZp434J0226 IMR90 Hi-C 24141950 PPP5C 156710 2171 chr19 46701261 46707432 46705672 N NA NA IGFL3,DKFZp434J0226 IMR90 Hi-C 24141950 PPP5C 142819 2172 chr19 47361478 47378376 47363468 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1,ARHGAP35 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1,TMEM160,SAE1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP2S1 7275 2173 chr19 48101007 48106060 48102427,48103741 Y,Y NA;GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 GLTSCR1 SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLTSCR1 5393 2174 chr19 486557 491845 489094 N NA TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPGS1 15652 2175 chr19 5433835 5451112 5435771 N NA NA KDM4B,PTPRS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRS 93021 2176 chr19 56819553 56830596 56826442 N NA ZNF542 NA NA NA NA ZNF542 48872 2177 chr19 56833251 56835608 56834199 N NA ZNF542 NA NA NA NA ZNF542 43860 2178 chr19 6514942 6520795 6516793 N NA TUBB4A,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 10215 2179 chr19 6608839 6615415 6610991 N NA CD70 EMR4P,DENND1C,TUBB4A,CD70 IMR90 Hi-C 24141950 CD70 17676 2180 chr19 7432918 7435860 7434123 N NA ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,C19orf45,PEX11G,CLEC4G,CLEC4M,CD209,CLEC4GP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 24139 2181 chr19 7441837 7444966 7443598 N NA ARHGEF18 INSR,ARHGEF18 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 15033 2182 chr19 9185127 9187637 9186451 N NA NA NA NA NA NA ZNF317 63419 2183 chr2 101333428 101352003 101350268 N NA NA NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 84610 2184 chr2 101354219 101362713 101359305 N NA NA NPAS2,TBC1D8,RPL31 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 73900 2185 chr2 101367588 101370623 101368213 N NA NA NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 65990 2186 chr2 101382574 101385263 101383925 N NA NA NPAS2,RPL31 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 51350 2187 chr2 101395244 101397960 101397361 Y C2orf29 NPAS2 NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 38653 2188 chr2 101820950 101823905 101822270 N NA C2orf29 TBC1D8,RPL31 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf29 45440 2189 chr2 10245703 10247133 10245848 N NA RRM2,C2orf48 NOL10,ATP6V1C2,CYS1,RRM2,C2orf48,HPCAL1,ODC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRM2 15562 2190 chr2 102679484 102684322 102681641 N NA NA IL1R1,IL1RL2,IL1R2,IL1RL1,IL18R1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 365319 2191 chr2 103750265 103753564 103752284 N NA NA NA NA NA NA MFSD9 396928 2192 chr2 103977346 103981509 103978391 N NA NA NA NA NA NA MFSD9 624009 2193 chr2 10417624 10420041 10418816 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 22999 2194 chr2 10422280 10427245 10423580,10425800 Y,Y NA;HPCAL1 HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1,C2orf48,MIR4261 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 15795 2195 chr2 104425260 104427894 104426415 N NA NA NA NA NA NA MFSD9 1071923 2196 chr2 105757832 105771147 105760328 N NA NA GPR45,MRPS9 IMR90 Hi-C 24141950 GPR45 87053 2197 chr2 105849725 105852898 105852064 N NA GPR45 NA NA NA NA GPR45 5302 2198 chr2 105854114 105854751 105854601 N NA GPR45 NA NA NA NA GPR45 3449 2199 chr2 106062254 106066063 106064053 N NA NA FHL2,C2orf49 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 108241 2200 chr2 106071045 106073798 106071899 N NA NA C2orf49,FHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C2orf49 117032 2201 chr2 106668943 106671625 106669843 N NA NA NCK2,UXS1 IMR90 Hi-C 24141950 UXS1 139170 2202 chr2 107313522 107315088 107314561 N NA NA NA NA NA NA UXS1 502727 2203 chr2 107708099 107709270 107708872 N NA NA NA NA NA NA RGPD4 734118 2204 chr2 108200207 108203724 108202649 N NA NA NA NA NA NA RGPD4 239664 2205 chr2 108248232 108251905 108250441 N NA NA NA NA NA NA RGPD4 191483 2206 chr2 108363818 108366547 108364736,108364836 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RGPD4 76841 2207 chr2 10856143 10857459 10856266 N NA NOL10 NA NA NA NA NOL10 26031 2208 chr2 108694959 108695962 108695234 N NA NA NA NA NA NA RGPD4 251571 2209 chr2 108815105 108818442 108816422 N NA NA NA NA NA NA GCC2 247135 2210 chr2 109028556 109030927 109029740 N NA GCC2 LIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 GCC2 34650 2211 chr2 109678111 109682973 109680225 N NA NA MALL,SEPT10,SH3RF3,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 SH3RF3 63024 2212 chr2 110449864 110491798 110451562,110458600,110466776 N,N,N NA;NA;NA NA EDAR,SEPT10,SOWAHC IMR90 Hi-C 24141950 RGPD6 58537 2213 chr2 111369732 111371969 111370452 N NA NA NA NA NA NA BUB1 63715 2214 chr2 111973368 111986599 111985201 N NA NA BCL2L11 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L11 94877 2215 chr2 112037379 112039534 112038363 N NA NA NA NA NA NA BCL2L11 158888 2216 chr2 112416111 112418444 112417268 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 LOC541471 163419 2217 chr2 112451562 112459059 112456627 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 182682 2218 chr2 113447355 113451934 113449636 N NA FLJ42351,SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC20A1 43921 2219 chr2 113469853 113473673 113470934 N NA CKAP2L FLJ42351,SLC20A1,IL37,CKAP2L,POLR1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP2L 48581 2220 chr2 113913026 113915228 113913925 N NA PSD4 IL1RN,LOC654433,PAX8,PSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSD4 16332 2221 chr2 114078982 114103275 114087736,114082533 N,Y NA;NA NA PAX8,LOC654433,IL1RN,IL1F10 IMR90 Hi-C 24141950 CBWD2 91993 2222 chr2 11513900 11515813 11514463 N NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 29189 2223 chr2 11525282 11527523 11526580 N NA ROCK2 ROCK2,PDIA6,PQLC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 40571 2224 chr2 117246684 117250154 117248578 N NA NA NA NA NA NA DDX18 1322101 2225 chr2 118345531 118353243 118351060 N NA NA NA NA NA NA DDX18 219012 2226 chr2 118613106 118615732 118614319 N NA DDX18 NA NA NA NA DDX18 40851 2227 chr2 118938164 118946486 118943545 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 92114 2228 chr2 119064941 119076337 119068229 Y NA NA NA NA NA NA INSIG2 218891 2229 chr2 119424160 119428273 119426093 N NA NA NA NA NA NA STEAP3 553111 2230 chr2 119495691 119497673 119496342 N NA NA NA NA NA NA STEAP3 483711 2231 chr2 119670061 119673945 119671240 N NA NA NA NA NA NA STEAP3 307439 2232 chr2 119679159 119683098 119681074 N NA NA NA NA NA NA STEAP3 298286 2233 chr2 119868330 119870822 119869643 N NA NA NA NA NA NA STEAP3 110562 2234 chr2 120993126 120998556 120996915 N NA TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B,LOC84931 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 11858 2235 chr2 121297245 121300416 121298549 N NA NA RALB,GLI2,INHBB,LOC84931 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLI2 254451 2236 chr2 121302136 121306804 121303874 Y NA NA GLI2,RALB,LOC84931,INHBB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLI2 248063 2237 chr2 121485669 121517864 121494123,121499882,121499795,121487469,121491943 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 37003 2238 chr2 12244740 12247722 12246675 N NA NA TRIB2,MIR4262,LOC100506474,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 358000 2239 chr2 122561332 122563461 122562058 N NA TSN NA NA NA NA TSN 48211 2240 chr2 122826519 122843086 122828380 N NA NA NA NA NA NA TSN 313398 2241 chr2 123112359 123138178 123113601 N NA NA NA NA NA NA TSN 599238 2242 chr2 12456729 12463297 12458447,12461472 N,N NA;NA NA LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 393701 2243 chr2 124710239 124712510 124711626 N NA NA NA NA NA NA TSN 2197118 2244 chr2 124713805 124715430 124714456 N NA NA NA NA NA NA TSN 2200684 2245 chr2 12643464 12645678 12644806 N NA NA TRIB2,LPIN1,MIR4262,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 211320 2246 chr2 127727784 127730937 127729488 N NA NA NA NA NA NA BIN1 133966 2247 chr2 127973561 127977129 127975760 Y NA NA NA NA NA NA ERCC3 74623 2248 chr2 128111221 128158654 128146143 N NA MAP3K2 IWS1,ERCC3,MAP3K2,MIR4783,PROC,CYP27C1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 10416 2249 chr2 129293797 129301545 129294916 Y NA NA UGGT1,HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 217626 2250 chr2 130192659 130201835 130201069,130192673 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA RAB6C 535400 2251 chr2 130631317 130637173 130635308 N NA NA NA NA NA NA RAB6C 100062 2252 chr2 130985864 130993529 130987588 N NA MZT2B NA NA NA NA MZT2B 46363 2253 chr2 131008021 131012206 131010968 N NA NA NA NA NA NA MZT2B 68520 2254 chr2 131036978 131038243 131038092 N NA NA NA NA NA NA CCDC115 61679 2255 chr2 131554466 131559114 131555801 Y CCDC115 NA PLEKHB2,FAM168B,ARHGEF4 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYP4F30P 116843 2256 chr2 131584225 131586745 131585763 N NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4F30P 146602 2257 chr2 131590765 131602360 131594331 N NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4F30P 153142 2258 chr2 132765236 132769197 132768173 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 246345 2259 chr2 132788013 132799796 132796661,132796596 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 215746 2260 chr2 132825968 132827084 132826752 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 188458 2261 chr2 132841120 132848418 132842814 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 167124 2262 chr2 132868754 132872500 132870099 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 143042 2263 chr2 133018587 133035740 133023582,133032426,133034432,133025611 N,N,N,Y NA;NA;NA;NA ANKRD30BL ANKRD30BL,GPR39,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD30BL 3045 2264 chr2 133039130 133040440 133039336 N NA ANKRD30BL NA NA NA NA ANKRD30BL 23588 2265 chr2 133041519 133046452 133044103 N NA ANKRD30BL NA NA NA NA ANKRD30BL 25977 2266 chr2 133102230 133113743 133104976,133110157 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GPR39 60404 2267 chr2 134413708 134417301 134415344 N NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 594529 2268 chr2 134876043 134879117 134877458 N NA NA NA NA NA NA MGAT5 132713 2269 chr2 136994887 136998018 136996542 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA DARS 251665 2270 chr2 137068121 137069262 137068989 N NA NA NA NA NA NA DARS 324899 2271 chr2 137521577 137531681 137523026 N NA NA NA NA NA NA DARS 778355 2272 chr2 138814203 138819293 138818123 N NA NA NA NA NA NA HNMT 92395 2273 chr2 138828560 138831973 138829220 N NA NA HNMT,NXPH2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HNMT 106752 2274 chr2 139150221 139154711 139153726 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 104639 2275 chr2 139220242 139224924 139223623 N NA SPOPL NA NA NA NA SPOPL 34426 2276 chr2 139230105 139242543 139240521 N NA SPOPL SPOPL MCF7 ChIA-PET 22265404 SPOPL 16807 2277 chr2 139370835 139375085 139373068 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 111485 2278 chr2 139400001 139404372 139402511 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 140651 2279 chr2 139706394 139708811 139707331 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 447044 2280 chr2 140167706 140189753 140168740 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 908356 2281 chr2 142942579 142946114 142943721 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 3683229 2282 chr2 143595485 143616154 143614988 Y KYNU NA KYNU IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPOPL 4336135 2283 chr2 144657793 144659617 144659037 N NA NA GTDC1 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR2A 3942953 2284 chr2 145106145 145110220 145107649 N NA NA ARHGAP15,ZEB2,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACVR2A 3492350 2285 chr2 145111948 145118462 145116360 N NA NA ARHGAP15,ZEB2,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACVR2A 3484108 2286 chr2 145416160 145419098 145417495 Y ZEB2 NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ACVR2A 3183472 2287 chr2 146501708 146504154 146503034 N NA NA DKFZp686O1327,ZEB2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR2A 2098416 2288 chr2 147336456 147337477 147336902 N NA NA NA NA NA NA ACVR2A 1265093 2289 chr2 147389936 147393609 147391652 N NA NA NA NA NA NA ACVR2A 1208961 2290 chr2 147576980 147578824 147577920 N NA NA NA NA NA NA ACVR2A 1023746 2291 chr2 14895912 14898103 14896892 N NA NA NA NA NA NA NBAS 803351 2292 chr2 150504388 150506399 150505066 N NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 60058 2293 chr2 150597085 150602115 150598320,150601164 N,N NA;NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 152755 2294 chr2 150623407 150627396 150625741 N NA NA NA NA NA NA MMADHC 179077 2295 chr2 150902083 150903963 150902926 N NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 440246 2296 chr2 150983076 150984639 150983101 N NA NA NA NA NA NA RND3 359570 2297 chr2 150996991 150999174 150998260 N NA NA RND3,RBM43,MMADHC IMR90 Hi-C 24141950 RND3 345035 2298 chr2 151021854 151023915 151023201 N NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 320294 2299 chr2 151351751 151355000 151352552 N NA RND3 NA NA NA NA RND3 7542 2300 chr2 151425984 151428010 151427362 N NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 81775 2301 chr2 151476944 151480509 151478550 N NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 132735 2302 chr2 151498078 151502388 151500564 N NA NA MMADHC,RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 153869 2303 chr2 152612404 152635853 152635286 N NA ARL5A ARL5A,NEB K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARL5A 49156 2304 chr2 154077522 154080588 154079175 N NA NA NA NA NA NA ARL6IP6 503115 2305 chr2 156119916 156121046 156120672 N NA NA NA NA NA NA NR4A2 1068241 2306 chr2 157100160 157112692 157110952 N NA NA NA NA NA NA NR4A2 76595 2307 chr2 157194869 157208973 157198320,157200609 N,N NA;NA NR4A2 GPD2,GALNT5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR4A2 5582 2308 chr2 157256474 157257861 157257491 N NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 34104 2309 chr2 158029246 158031824 158030375 Y NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1 700550 2310 chr2 158101934 158104874 158103137 Y NA NA NR4A2,GALNT5 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1 627500 2311 chr2 15820754 15821329 15821209 N NA NA NA NA NA NA DDX1 88984 2312 chr2 159579623 159581890 159580751 N NA NA CCDC148,LOC554201,PKP4,UPP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANC1 243256 2313 chr2 1607484 1611212 1609683 Y PXDN NA NA NA NA NA TMEM18 930045 2314 chr2 161059964 161068179 161062198,161066065 N,Y NA;CD302 NA ITGB6,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS1 282139 2315 chr2 161069707 161073083 161071380 Y ITGB6 NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 277235 2316 chr2 161077223 161079527 161078497 Y ITGB6 NA RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS1 270791 2317 chr2 161084369 161086263 161085325 Y NA NA ITGB6,TANK,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS1 264055 2318 chr2 161550793 161553719 161552414 N NA NA RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 200475 2319 chr2 161603250 161606022 161604499 N NA NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 252932 2320 chr2 161607936 161610743 161609275 N NA NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 257618 2321 chr2 161979004 161981148 161979936 Y TANK,TANK TANK PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 12318 2322 chr2 162134964 162139481 162137126 N NA PSMD14 NA NA NA NA PSMD14 25305 2323 chr2 162355373 162358921 162357770 N NA NA NA NA NA NA PSMD14 190587 2324 chr2 163780915 163783026 163782028 N NA NA NA NA NA NA GCA 580332 2325 chr2 164067843 164071617 164070118 N NA NA NA NA NA NA FIGN 520896 2326 chr2 164205078 164207089 164206231 N NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385424 2327 chr2 164626651 164633853 164628400,164631821 N,N NA;NA FIGN FIGN MCF7 ChIA-PET 22265404 FIGN 34138 2328 chr2 164901597 164904384 164903052 N NA NA NA NA NA NA FIGN 309084 2329 chr2 165823461 165826208 165824718 N NA NA SLC38A11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506124 902243 2330 chr2 165834924 165840239 165837910 N NA NA NA NA NA NA LOC100506124 888212 2331 chr2 168146750 168150697 168149190 N NA NA NA NA NA NA STK39 953408 2332 chr2 168400717 168402344 168401414 N NA NA NA NA NA NA STK39 701761 2333 chr2 169203444 169204326 169203604 N NA NA ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402 IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 STK39 99339 2334 chr2 171017572 171020360 171018586 N NA NA NA NA NA NA UBR3 333554 2335 chr2 172118985 172120010 172119569 N NA NA TLK1,METTL8,DCAF17 IMR90 Hi-C 24141950 DCAF17 170751 2336 chr2 173110414 173113477 173112561 N NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA6 178837 2337 chr2 173115427 173119665 173118097 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA6 172649 2338 chr2 173146785 173151571 173148925 N NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA6 140743 2339 chr2 173562182 173564050 173563099 N NA NA NA NA NA NA PDK1 141403 2340 chr2 17388205 17391182 17389967 N NA NA NA NA NA NA FAM49A 541071 2341 chr2 174513171 174536581 174518222,174523235 N,N NA;NA NA OLA1,CIR1,SP9,LOC285084 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7 293610 2342 chr2 17482593 17486597 17485009 N NA NA NA NA NA NA SMC6 448499 2343 chr2 174896174 174899856 174897291 Y SP3,SP3 NA SP3,OLA1,CDCA7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 65744 2344 chr2 17595656 17599845 17598546 N NA NA NA NA NA NA SMC6 335251 2345 chr2 17619808 17623683 17622740 N NA NA NA NA NA NA SMC6 311413 2346 chr2 17651698 17653855 17652690 N NA NA NA NA NA NA SMC6 281241 2347 chr2 176606626 176609331 176607662 N NA NA NA NA NA NA KIAA1715 257687 2348 chr2 176952130 176954446 176953250 N NA HOXD9,HOXD8 HOXD12,HOXD13 MCF7 ChIA-PET 22265404 HOXD9 32967 2349 chr2 177283670 177285841 177284682 N NA NA NA NA NA NA MTX2 149547 2350 chr2 177417496 177420203 177418996 N NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 LOC375295 82099 2351 chr2 177426115 177429001 177427473 N NA NA HOXD-AS2,HOXD8,MIR10B,HOXD9,HOXD4,HOXD3,HOXD-AS1,HOXD1,LOC375295 IMR90 Hi-C 24141950 LOC375295 73301 2352 chr2 178028305 178031276 178030461 Y NFE2L2 HNRNPA3 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 46146 2353 chr2 179044470 179046831 179044849 N NA NA MIR548N,PRKRA IMR90 Hi-C 24141950 RBM45 67288 2354 chr2 181387994 181390890 181388813 N NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 454222 2355 chr2 181606290 181609063 181607848 N NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 236049 2356 chr2 182653862 182658221 182655853 N NA NA SSFA2,PPP1R1C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SSFA2 98251 2357 chr2 183474446 183474867 183474651 N NA NA PDE1A IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC10 106132 2358 chr2 18479680 18481878 18480913 N NA NA NA NA NA NA GEN1 544503 2359 chr2 186271535 186274486 186272294 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 1076399 2360 chr2 187128256 187132521 187130320 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 218364 2361 chr2 187407933 187412246 187408715,187411392 N,N NA;NA ITGAV ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGAV 42544 2362 chr2 187820600 187824549 187822056 N NA NA NA NA NA NA ITGAV 365810 2363 chr2 190065514 190070407 190069303 N NA NA GULP1,COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 235752 2364 chr2 190072084 190076867 190075384 N NA NA COL5A2,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 229292 2365 chr2 190148958 190152481 190151121 Y NA NA COL5A2,GULP1,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 153678 2366 chr2 190266672 190269465 190267657 N NA WDR75 COL5A2,GULP1,COL3A1,MIR1245B IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 36694 2367 chr2 190796792 190802440 190798800 N NA NA PMS1,MSTN IMR90 Hi-C 24141950 ORMDL1 147695 2368 chr2 190976942 190980062 190979174 N NA NA MFSD6,C2orf88,HIBCH,OSGEPL1,ORMDL1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBCH 204709 2369 chr2 191460768 191474748 191472413 N NA NAB1 MFSD6,NAB1,TMEM194B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAB1 39100 2370 chr2 191642927 191659192 191658014 N NA NA GLS,STAT1,TMEM194B,NAB1,MFSD6 IMR90 Hi-C 24141950 GLS 86355 2371 chr2 191704226 191711124 191706081,191708863 N,N NA;NA GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 34423 2372 chr2 191722530 191725841 191723713 N NA GLS GLS,STAT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 19706 2373 chr2 192034006 192038211 192036808 N NA NA MYO1B,STAT4,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 71896 2374 chr2 192064676 192068849 192067280 N NA MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 41258 2375 chr2 192080237 192086205 192083384 N NA MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 23902 2376 chr2 192093621 192095914 192094862 N NA MYO1B STAT4,MYO1B,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 14193 2377 chr2 192437667 192440912 192439147 N NA NA TMEFF2,OBFC2A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OBFC2A 101886 2378 chr2 192446037 192448909 192447304 Y NA NA OBFC2A K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OBFC2A 93889 2379 chr2 192475701 192479702 192477608 N NA NA OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OBFC2A 63096 2380 chr2 192500869 192504127 192503418 Y OBFC2A OBFC2A OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OBFC2A 38671 2381 chr2 192530467 192532358 192531544 Y OBFC2A OBFC2A OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OBFC2A 10440 2382 chr2 192730151 192733811 192731872 N NA NA TMEFF2 IMR90 Hi-C 24141950 OBFC2A 187353 2383 chr2 192774516 192776655 192775515 Y OBFC2A,SDPR NA NA NA NA NA OBFC2A 231718 2384 chr2 194033792 194038684 194035534 N NA NA NA NA NA NA OBFC2A 1490994 2385 chr2 194211236 194215683 194212416 N NA NA NA NA NA NA OBFC2A 1668438 2386 chr2 194767417 194795345 194768695 N NA NA NA NA NA NA SLC39A10 1726187 2387 chr2 196476385 196484972 196478239 N NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 36560 2388 chr2 19737292 19740029 19738630 N NA NA NA NA NA NA TTC32 361715 2389 chr2 197464426 197468174 197466560 N NA CCDC150 CCDC150,HECW2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC150 36182 2390 chr2 199235649 199237448 199236736 N NA NA NA NA NA NA MARS2 665621 2391 chr2 199650321 199651183 199650838 N NA NA NA NA NA NA MARS2 1080293 2392 chr2 200091907 200096745 200094589 N NA NA NA NA NA NA C2orf69 679234 2393 chr2 202661379 202664186 202663024,202662229 N,N NA;NA ALS2 ALS2,CDK15,FZD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALS2 15484 2394 chr2 20290394 20293657 20291476 N NA LAPTM4A LAPTM4A,MATN3,TTC32,WDR35,PUM2,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM4A 38605 2395 chr2 20304843 20308519 20306700 N NA NA LAPTM4A,TTC32,WDR35,MATN3,PUM2,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM4A 53054 2396 chr2 203113414 203116714 203114300 N NA SUMO1,NOP58 NOP58,CDK15,FZD7,SUMO1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUMO1 10092 2397 chr2 20340636 20342318 20341442 Y NA NA PUM2,WDR35,MATN3,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC1 82876 2398 chr2 20364172 20367860 20366611 N NA NA PUM2,SDC1,MATN3 IMR90 Hi-C 24141950 SDC1 57334 2399 chr2 204486785 204489672 204488307 N NA NA CYP20A1,RAPH1,CD28,ABI2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 86727 2400 chr2 204547275 204551693 204549578 N NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 147217 2401 chr2 205178959 205206975 205203535 N NA NA PARD3B,NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 778901 2402 chr2 205342143 205346160 205344505 N NA NA PARD3B,NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 942085 2403 chr2 20636859 20640422 20638739 N NA RHOB HS1BP3,GDF7,RHOB IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 6413 2404 chr2 20708657 20711741 20709964 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 61822 2405 chr2 20712289 20745688 20714764,20729283,20717542,20744537 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 65454 2406 chr2 20777387 20780488 20779077 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 70376 2407 chr2 20781828 20796838 20784436,20793192,20795815 Y,Y,N NA;APOB;NA NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 54026 2408 chr2 208047218 208050989 208049606 N NA KLF7 KLF7 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF7 16604 2409 chr2 208102478 208124998 208104250,208106183,208118909,208123396 N,N,N,Y NA;NA;NA;NA NA KLF7,CREB1,METTL21A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 71864 2410 chr2 208174241 208177653 208176353 Y CREB1,CCNYL1 NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF7 143627 2411 chr2 208193723 208196846 208195792 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 163109 2412 chr2 208199950 208204510 208202698,208199967 Y,N NA;NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 169336 2413 chr2 208257541 208261493 208259883 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 133123 2414 chr2 208266135 208267539 208267263 N NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 127077 2415 chr2 208347284 208350852 208348501 Y NA CREB1 KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 43764 2416 chr2 208351399 208354874 208353024 N NA CREB1 KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 39742 2417 chr2 208366563 208371579 208369601 N NA CREB1 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1,CPO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 23037 2418 chr2 208372890 208380335 208378705 Y CREB1 CREB1 CREB1,KLF7,METTL21A,CPO,CCNYL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 14281 2419 chr2 208655348 208661163 208659210,208657035 N,Y NA;FZD5 FZD5 PLEKHM3,CCNYL1,FZD5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD5 21205 2420 chr2 210232020 210235409 210233802 Y NA NA NA NA NA NA RPE 631972 2421 chr2 213539602 213542554 213540412 N NA NA NA NA NA NA BARD1 2131874 2422 chr2 213575776 213577814 213576763 N NA NA NA NA NA NA BARD1 2096614 2423 chr2 214051922 214057373 214053100 Y NA NA IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 BARD1 1617055 2424 chr2 214100917 214103267 214102459 N NA NA ABCA12,IKZF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BARD1 1571161 2425 chr2 216161445 216163588 216162742 N NA ATIC ATIC,ABCA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATIC 13091 2426 chr2 217575971 217581078 217578922 N NA NA DIRC3 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 212451 2427 chr2 217637948 217641358 217639453 Y NA NA DIRC3,TNS1,IGFBP5,TNP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL37A 274428 2428 chr2 217926546 217931762 217929975 N NA NA DIRC3,IGFBP5,TNS1,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 563026 2429 chr2 217954158 217972874 217971210,217966517,217968700,217954782 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA IGFBP5,DIRC3,TNP1,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 590638 2430 chr2 218026048 218028851 218027439 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,TNP1,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 662528 2431 chr2 218843380 218862372 218859683,218849399 N,N NA;NA TNS1 RUFY4,TNS1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS1 34584 2432 chr2 219709044 219714782 219712556,219710584 N,N NA;NA WNT6 NA NA NA NA WNT6 9764 2433 chr2 220270180 220273687 220271730 N NA DNPEP DES,SPEG,TMEM198,MIR3132,GMPPA,CHPF,ACCN4,OBSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNPEP 17518 2434 chr2 220548164 220615608 220553620,220550013 N,N NA;NA NA INHA,OBSL1,SLC4A3,STK11IP,EPHA4,DES,SPEG,GMPPA,ACCN4 IMR90,HELA,K562,GM12878,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 SLC4A3 55872 2435 chr2 220831974 220930954 220833472 N NA NA EPHA4,MIR4268 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A3 339682 2436 chr2 222505297 222507996 222506503 N NA NA NA NA NA NA FARSB 1012831 2437 chr2 222861252 222866467 222862030,222864706 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FARSB 654360 2438 chr2 222979174 222981217 222979937 N NA NA PAX3,SGPP2 IMR90 Hi-C 24141950 FARSB 539610 2439 chr2 223620613 223624159 223621495 N NA NA MOGAT1,ACSL3 IMR90 Hi-C 24141950 FARSB 99786 2440 chr2 223651086 223654652 223652694 N NA NA ACSL3,MOGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL3 71080 2441 chr2 223698186 223703922 223702551 N NA ACSL3 ACSL3,MOGAT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL3 21810 2442 chr2 223707919 223710278 223708981 N NA ACSL3 ACSL3,MOGAT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL3 15454 2443 chr2 224586440 224593503 224589731 N NA NA AP1S3 MCF7 ChIA-PET 22265404 AP1S3 108816 2444 chr2 225543039 225546837 225543751 N NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 92929 2445 chr2 225954452 225958071 225956119 N NA DOCK10 DOCK10,NYAP2,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK10 47122 2446 chr2 225964101 225971636 225965473,225969652 N,N NA;NA NA DOCK10,COL4A4,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK10 56771 2447 chr2 22602366 22610187 22605804 N NA NA NA NA NA NA KLHL29 998111 2448 chr2 226599768 226602276 226600657 N NA NA RHBDD1,COL4A4,LOC646736,IRS1,COL4A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DOCK10 692438 2449 chr2 226853355 226861403 226858244,226860488 Y,N NA;NA NA IRS1,LOC646736,COL4A4,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 802103 2450 chr2 226894729 226898050 226895975 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 765456 2451 chr2 226978153 226984693 226980057,226983636 Y,Y NA;NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 678813 2452 chr2 227077324 227080276 227078833 N NA NA IRS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRS1 583230 2453 chr2 227274100 227278172 227276712 Y NA NA IRS1,NYAP2,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 385334 2454 chr2 227287751 227294117 227288539,227291791 N,N NA;NA NA IRS1,LOC646736,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 369389 2455 chr2 227341621 227344867 227343312 N NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 318639 2456 chr2 227352837 227355605 227354374 N NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 307901 2457 chr2 227444853 227449733 227448511 Y NA NA IRS1,LOC646736,NYAP2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 213773 2458 chr2 227512930 227528735 227515199,227517344,227513280,227526093 N,Y,N,N NA;IRS1;NA;NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 134771 2459 chr2 228669009 228673807 228670459 Y AGFG1,CCL20 CCL20 NA NA NA NA CCL20 4751 2460 chr2 228716947 228720480 228718686 N NA CCL20 WDR69 IMR90 Hi-C 24141950 CCL20 38389 2461 chr2 228726078 228730264 228727987 N NA CCL20 NA NA NA NA CCL20 47520 2462 chr2 229415767 229432875 229431697 N NA NA NA NA NA NA CCL20 737209 2463 chr2 229564210 229567047 229565171 N NA NA NA NA NA NA CCL20 885652 2464 chr2 231481041 231483699 231482115 N NA NA CAB39,SP140,FBXO36,SLC16A14,SP110,SP140L,SP100,ITM2C,SPATA3,LOC348761,LOC151475 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 93858 2465 chr2 231530803 231534768 231533178 N NA CAB39 CAB39 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 42789 2466 chr2 231820697 231823960 231822235 Y GPR55 NA NA NA NA NA ITM2C 91076 2467 chr2 232506382 232509223 232507554 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 64012 2468 chr2 232529199 232534652 232531481,232534593 N,N NA;NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38583 2469 chr2 232535549 232540939 232538086 N NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32296 2470 chr2 232543306 232548499 232545926 Y COPS7B PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 24736 2471 chr2 235111090 235113807 235111973 N NA NA SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 334035 2472 chr2 235148870 235154219 235150267 N NA NA SH3BP4,TRPM8,AGAP1,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 371815 2473 chr2 235157290 235161784 235158757,235160715 N,Y NA;NA NA SH3BP4,TRPM8,AGAP1,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 380235 2474 chr2 235165817 235168411 235166969 N NA NA SH3BP4,TRPM8,ARL4C,AGAP1,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 388762 2475 chr2 235198849 235203459 235200521 Y ARL4C NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 421794 2476 chr2 235214876 235219030 235216720 Y ARL4C NA ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 437821 2477 chr2 235356557 235358918 235357634 N NA NA SPP2,TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 579502 2478 chr2 235409923 235412851 235411342 N NA NA TRPM8,SPP2,ARL4C,SH3BP4,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 632868 2479 chr2 235582850 235584704 235583671 N NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 805795 2480 chr2 235587247 235592789 235588094,235591114 N,N NA;NA NA SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 810192 2481 chr2 235593720 235596767 235594962 N NA NA SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 816665 2482 chr2 235780372 235784946 235783006 N NA NA SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 1003317 2483 chr2 235787582 235792926 235789946 N NA NA SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 1010527 2484 chr2 236078219 236081269 236079979 N NA NA AGAP1,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 1301164 2485 chr2 236170562 236174175 236172444 Y NA NA AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR7 1304205 2486 chr2 236301127 236306643 236302899 N NA NA AGAP1,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR7 1171737 2487 chr2 236376154 236378911 236377852 N NA NA AGAP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 1099469 2488 chr2 237550091 237553649 237551670 N NA NA NA NA NA NA CXCR7 71711 2489 chr2 237567123 237576122 237571313 N NA NA ASB18,IQCA1,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR7 88743 2490 chr2 237582310 237586017 237584300 N NA NA NA NA NA NA CXCR7 103930 2491 chr2 237650837 237656781 237654623,237652815 Y,N CXCR7;NA NA CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 172457 2492 chr2 237674376 237695578 237678357,237685479,237691252 N,Y,N NA;CXCR7;NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 195996 2493 chr2 238078220 238083060 238080181 Y COL6A3 NA COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 84136 2494 chr2 238084921 238089665 238086505 N NA NA COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 90837 2495 chr2 238090216 238099972 238091705,238092973 N,Y NA;NA NA COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 96132 2496 chr2 238129467 238134602 238131991 Y COL6A3 NA COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 135383 2497 chr2 238162780 238166062 238164929 N NA NA COL6A3,MLPH IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 168696 2498 chr2 238170355 238176955 238173356 N NA NA NA NA NA NA COPS8 176271 2499 chr2 238186987 238193253 238190288 N NA NA COL6A3,MLPH,COPS8,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 192903 2500 chr2 238195570 238202536 238199640 N NA NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 201486 2501 chr2 238203440 238209116 238206817 N NA NA COPS8,COL6A3,MLPH IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 209356 2502 chr2 238329555 238345029 238338831,238330409,238342631 N,N,N NA;NA;NA NA COL6A3,MLPH,PRLH,LRRFIP1,COPS8,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP1 191195 2503 chr2 238363812 238366397 238364959 N NA NA COPS8,LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP1 169827 2504 chr2 239592300 239594358 239593548 N NA NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 162315 2505 chr2 240845425 240847781 240846641 N NA NA LOC150935,MIR4786 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 117038 2506 chr2 241193741 241196494 241195488 N NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90 Hi-C 24141950 MYEOV2 117977 2507 chr2 241307632 241315767 241309730,241313884 Y,Y GPC1;NA NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 59348 2508 chr2 243152431 243160210 243153354 N NA NA NA NA NA NA LOC728323 121587 2509 chr2 24712010 24714767 24713731 N NA NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA1 92579 2510 chr2 2609852 2620669 2617325 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 760984 2511 chr2 26979275 26980962 26980811 Y C2orf18 C2orf18,CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C2orf18 6180 2512 chr2 28667630 28674824 28669438,28672510 N,N NA;NA NA BRE,RBKS,PLB1,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSL2 51851 2513 chr2 28901267 28907477 28902546,28906372 N,N NA;NA NA PPP1CB,SPDYA,PLB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 67137 2514 chr2 29329137 29334771 29330864 N NA CLIP4 CLIP4,FAM179A,ALK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP4 3537 2515 chr2 30328537 30332527 30330104 N NA YPEL5 ALK,YPEL5 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL5 37223 2516 chr2 30335557 30340759 30336648,30338375 N,N NA;NA YPEL5 CAPN13,YPEL5 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL5 28991 2517 chr2 30587854 30590764 30589534 N NA NA LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 79359 2518 chr2 30632464 30636034 30633233 N NA LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 34089 2519 chr2 32066660 32067847 32067174 N NA NA NA NA NA NA MEMO1 167851 2520 chr2 33649938 33653104 33651001 N NA NA TTC27,LTBP1,RASGRP3,FAM98A IMR90 Hi-C 24141950 FAM98A 171258 2521 chr2 33901944 33903012 33902572 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 77582 2522 chr2 34329278 34331464 34330298 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 504916 2523 chr2 35685387 35689647 35687609 N NA NA NA NA NA NA CRIM1 893723 2524 chr2 35725023 35726880 35725821 N NA NA NA NA NA NA CRIM1 856490 2525 chr2 36874971 36878139 36877364 N NA FEZ2 FEZ2,LOC100288911,CRIM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FEZ2 49639 2526 chr2 37552300 37557098 37553627 N NA PRKD3 QPCT,FAM82A1,PRKD3,EIF2AK2,C2orf56 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD3 8078 2527 chr2 37761498 37764675 37763291 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 134651 2528 chr2 37787229 37803745 37789291 N NA NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 95581 2529 chr2 37914508 37919653 37916414 N NA CDC42EP3 NA NA NA NA CDC42EP3 15182 2530 chr2 37936171 37941362 37938728,37940699 Y,Y NA;CDC42EP3 CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 36845 2531 chr2 37993902 38001858 37995816 Y NA NA CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 94576 2532 chr2 38006038 38016304 38008327,38014135,38011150,38014185 Y,N,N,N NA;NA;NA;NA NA CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 106712 2533 chr2 38053354 38057982 38055448,38056051 N,N NA;NA NA CDC42EP3,LOC100505876,QPCT,PRKD3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 154028 2534 chr2 38148891 38156824 38152450 N NA NA CDC42EP3,PRKG2,CYP1B1-AS1,FAM82A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CDC42EP3 249565 2535 chr2 38315765 38316854 38315923 N NA NA CYP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATL2 287578 2536 chr2 3831596 3834010 3832749 N NA NA NA NA NA NA RPS7 208743 2537 chr2 3835743 3837890 3836852 N NA NA NA NA NA NA RPS7 212890 2538 chr2 38664543 38667855 38666407 N NA NA ATL2,GALM,FAM82A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATL2 60111 2539 chr2 38738960 38743951 38742713 N NA NA ATL2,GALM IMR90 Hi-C 24141950 HNRPLL 86227 2540 chr2 38754413 38756830 38755387 N NA NA ATL2 IMR90 Hi-C 24141950 HNRPLL 73348 2541 chr2 392663 395165 394101 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 127794 2542 chr2 41940392 41944314 41942491 N NA NA NA NA NA NA PKDCC 330847 2543 chr2 42085954 42097296 42087537 N NA NA EML4,LOC388942,C2orf91,PKDCC IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 177865 2544 chr2 42326016 42332519 42329606 Y NA NA EML4,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 50855 2545 chr2 42358449 42361848 42360336 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 34642 2546 chr2 43034899 43038885 43038242 N NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 239228 2547 chr2 43062482 43064730 43063345 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,ABCG8 IMR90 Hi-C 24141950 MTA3 266811 2548 chr2 43144203 43145547 43144798 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 308198 2549 chr2 43150533 43153263 43152076 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 300482 2550 chr2 43176911 43180013 43177854 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 273732 2551 chr2 43190727 43193367 43191866 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 260378 2552 chr2 43213277 43219766 43213818 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 233979 2553 chr2 43266971 43271262 43269209 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 182483 2554 chr2 43272795 43275263 43274037 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 178482 2555 chr2 43276886 43280019 43278661 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 173726 2556 chr2 43285701 43287652 43286653 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 166093 2557 chr2 43300668 43305896 43301500,43302376 N,Y NA;NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 147849 2558 chr2 43308585 43315913 43309882,43313754 N,Y NA;NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 137832 2559 chr2 43384521 43387964 43386173 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65781 2560 chr2 43395300 43401045 43396256 N NA NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 52700 2561 chr2 43405163 43408267 43406179 Y OXER1 ZFP36L2,LOC100129726 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45478 2562 chr2 44292462 44294124 44293333 N NA NA PREPL,PPM1B,SLC3A1 IMR90 Hi-C 24141950 LRPPRC 69318 2563 chr2 45145191 45146478 45145569 N NA NA NA NA NA NA CAMKMT 556148 2564 chr2 47415030 47421549 47417661,47419775 N,N NA;NA C2orf61,CALM2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 11290 2565 chr2 47425245 47427122 47426216 N NA C2orf61,CALM2 EPCAM,TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 21505 2566 chr2 47476809 47479556 47477911 N NA NA CALM2,TTC7A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM2 73069 2567 chr2 47495819 47501649 47497075,47499581 Y,N NA;NA NA TTC7A,CALM2,C2orf61,MCFD2,SOCS5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM2 92079 2568 chr2 47545865 47563367 47561018,47562470 N,N NA;NA NA CALM2,TTC7A,SOCS5,MCFD2,MSH2,EPCAM MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MSH2 66896 2569 chr2 47568627 47574430 47572596 N NA NA EPCAM,MSH2 IMR90 Hi-C 24141950 MSH2 55833 2570 chr2 47880472 47882732 47881464 N NA NA MSH2,EPCAM,KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 127489 2571 chr2 48269772 48273035 48271399 N NA NA STON1-GTF2A1L,PPP1R21 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO11 136840 2572 chr2 48332215 48335627 48334411 N NA NA FOXN2,FBXO11,MSH6,PPP1R21,STON1-GTF2A1L IMR90 Hi-C 24141950 FBXO11 199283 2573 chr2 48337607 48341798 48338861 N NA NA FOXN2,FBXO11,PPP1R21,STON1-GTF2A1L,MSH6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXN2 199997 2574 chr2 48488939 48516442 48491295 N NA FOXN2 NA NA NA NA FOXN2 25353 2575 chr2 49456646 49457951 49456881 N NA NA NA NA NA NA PPP1R21 788738 2576 chr2 501960 509504 503454 N NA NA NA NA NA NA TMEM18 167935 2577 chr2 52094690 52096857 52095427 N NA NA NA NA NA NA CHAC2 1898072 2578 chr2 52335914 52339144 52337118 N NA NA NA NA NA NA CHAC2 1655785 2579 chr2 53355694 53358581 53357625 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 636348 2580 chr2 53630517 53632770 53631320 N NA NA NA NA NA NA CHAC2 362159 2581 chr2 54324731 54326138 54325124 N NA NA SPTBN1,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 126754 2582 chr2 55337038 55345013 55339041,55343006 Y,N CCDC88A,RTN4,RTN4;NA NA C2orf63,RTN4,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 59304 2583 chr2 556182 560974 558160 N NA NA TPO IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 116465 2584 chr2 55712477 55713782 55713199 N NA CCDC104 MTIF2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC104 32958 2585 chr2 56001766 56010228 56007221 N NA NA MIR216A,MIR216B,MIR217,EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PNPT1 80755 2586 chr2 56065445 56067736 56066533 Y NA NA EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 EFEMP1 83562 2587 chr2 56069713 56071687 56070432 Y NA NA EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 EFEMP1 79611 2588 chr2 56967793 56971617 56968866 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 816495 2589 chr2 57599460 57602330 57600857 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 671447 2590 chr2 57947204 57948774 57948026 N NA NA NA NA NA NA VRK2 325003 2591 chr2 58108412 58110817 58109902 N NA NA FLJ30838 IMR90 Hi-C 24141950 VRK2 162960 2592 chr2 58651380 58657879 58655131 N NA NA FANCL IMR90 Hi-C 24141950 FANCL 182865 2593 chr2 5937287 5940731 5938406 Y NA NA NA NA NA NA RNF144A 1116792 2594 chr2 60795087 60798609 60796819 N NA BCL11A FLJ30838 IMR90 Hi-C 24141950 BCL11A 14454 2595 chr2 61824394 61827507 61825790 N NA NA NA NA NA NA XPO1 58976 2596 chr2 61846640 61850145 61848311 N NA NA XPO1,USP34 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO1 81222 2597 chr2 61983240 61994459 61991499 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 121347 2598 chr2 62683109 62686692 62684565 N NA TMEM17 COMMD1,EHBP1,OTX1,LOC100132215,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 46912 2599 chr2 62804114 62810424 62806093 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 70510 2600 chr2 6326001 6345774 6326860 N NA NA NA NA NA NA RNF144A 711749 2601 chr2 64032804 64034703 64033400 N NA UGP2 UGP2 IMR90 Hi-C 24141950 UGP2 33395 2602 chr2 64051366 64056080 64055129 N NA UGP2 NA NA NA NA UGP2 12018 2603 chr2 64502747 64505145 64503674 N NA NA PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 131142 2604 chr2 64887448 64892255 64891856,64890003 N,N NA;NA SERTAD2 SERTAD2,LOC339807 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 6402 2605 chr2 64921894 64927197 64926272 N NA SERTAD2 SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 40848 2606 chr2 64976090 64980569 64977730,64979136 N,N NA;NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 95044 2607 chr2 64993249 64998799 64995223,64997906 Y,N SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2;NA NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 112203 2608 chr2 65033192 65036334 65034668 N NA NA SERTAD2,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 152146 2609 chr2 65056527 65060431 65058679 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A4 155148 2610 chr2 65061408 65068946 65065241,65062471 N,N NA;NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A4 146633 2611 chr2 65081428 65083129 65082028 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A4 132450 2612 chr2 65085077 65092780 65086765,65091938 N,N NA;NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 122799 2613 chr2 65101560 65104977 65103537 N NA NA AFTPH,LOC339807,SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 110602 2614 chr2 65438996 65447483 65445644 N NA ACTR2 LOC400958,CEP68,ACTR2,RAB1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR2 7346 2615 chr2 65766405 65769665 65768208 N NA NA ACTR2,SPRED2,LOC400958 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 106749 2616 chr2 65779741 65783703 65780553 N NA NA SPRED2,ACTR2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRED2 120085 2617 chr2 65806420 65809674 65807624 N NA NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 146764 2618 chr2 65856567 65861017 65857705 N NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 196911 2619 chr2 65865309 65868879 65867073 N NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 205653 2620 chr2 65884773 65898135 65890046,65886277,65893460,65891295 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 225117 2621 chr2 66103354 66105690 66104796 N NA NA NA NA NA NA SPRED2 443698 2622 chr2 67114782 67117884 67115937 N NA NA LOC644838,MEIS1,ETAA1 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS1 452250 2623 chr2 67482160 67491024 67484236,67487663 N,N NA;NA NA MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 133418 2624 chr2 67787103 67789901 67788784 N NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 162661 2625 chr2 68097070 68100737 68099251 Y NA NA MEIS1,C1D IMR90 Hi-C 24141950 C1D 189422 2626 chr2 68138525 68147474 68145214 N NA NA C1D IMR90 Hi-C 24141950 C1D 142685 2627 chr2 68953129 68955938 68954990 N NA NA GKN2,ANTXR1,ARHGAP25,FBXO48,APLF IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APLF 258438 2628 chr2 69898557 69903370 69902788 N NA AAK1 AAK1,ANXA4,NFU1 IMR90 Hi-C 24141950 AAK1 27580 2629 chr2 69931262 69934265 69932700 N NA ANXA4 AAK1,GFPT1,ANXA4,GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA4 34862 2630 chr2 70796434 70798279 70797150 N NA NA TGFA IMR90 Hi-C 24141950 FAM136A 267214 2631 chr2 70822525 70825144 70823637 Y TGFA NA NA NA NA NA FAM136A 293305 2632 chr2 71112998 71116977 71114984 N NA NA ATP6V1B1,VAX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX261 105024 2633 chr2 71942783 71946654 71944224 Y NA NA DYSF IMR90 Hi-C 24141950 ZNF638 383898 2634 chr2 71969176 71971745 71970187,71971556 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CYP26B1 403218 2635 chr2 72011163 72014333 72012201 Y NA NA DYSF,EXOC6B IMR90 Hi-C 24141950 CYP26B1 360630 2636 chr2 72057239 72060489 72058400 Y NA NA EXOC6B,DYSF,CYP26B1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP26B1 314474 2637 chr2 72108959 72111337 72110478 N NA NA EXOC6B,DYSF IMR90 Hi-C 24141950 CYP26B1 263626 2638 chr2 72267140 72269897 72268414 N NA NA DYSF IMR90 Hi-C 24141950 CYP26B1 105066 2639 chr2 73089027 73090226 73089661 N NA SPR NA NA NA NA SPR 24286 2640 chr2 7330564 7333617 7332191 N NA NA KIDINS220 IMR90 Hi-C 24141950 LOC386597 271751 2641 chr2 73403121 73405512 73404420 N NA SMYD5 EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMYD5 35854 2642 chr2 74206255 74207718 74206928 N NA NA DGUOK,TET3,C2orf78,STAMBP,BOLA3,MOB1A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DGUOK 52302 2643 chr2 74966528 74970024 74968564 N NA NA HK2,SEMA4F IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4F 85135 2644 chr2 74975612 74984067 74982721 Y NA NA HK2,SEMA4F,LOXL3 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4F 94219 2645 chr2 75831143 75835378 75832958 N NA FAM176A,MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM176A 34295 2646 chr2 7752079 7754322 7753227 N NA NA NA NA NA NA LOC386597 693266 2647 chr2 7847004 7849819 7848025 N NA NA LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 LOC386597 788191 2648 chr2 78727637 78729199 78728046 N NA NA NA NA NA NA GCFC2 2789526 2649 chr2 78943244 78946752 78945508 N NA NA NA NA NA NA GCFC2 3005133 2650 chr2 7964474 7967804 7966622 N NA NA LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 854309 2651 chr2 81531147 81532774 81531731 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 3153812 2652 chr2 81707245 81762812 81708860,81723334 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SUCLG1 2923774 2653 chr2 81883910 81887364 81885501 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 2799222 2654 chr2 84719008 84723246 84721109 N NA SUCLG1 C2orf89,DNAH6,TMSB10 IMR90 Hi-C 24141950 SUCLG1 32422 2655 chr2 85121021 85126907 85125715,85122428 N,N NA;NA TMSB10 DNAH6,TMSB10,C2orf89,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 TMSB10 5856 2656 chr2 85730072 85733924 85732269 N NA LOC100630918,MAT2A MAT2A,LOC100630918,USP39,RNF181,TMEM150A,GGCX,SH2D6 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100630918 32085 2657 chr2 85967048 85972407 85969441,85971871 N,N NA;NA NA ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf68 127869 2658 chr2 87387499 87400276 87387831 N NA NA NA NA NA NA RGPD2 246564 2659 chr2 87448756 87457883 87449155 N NA NA NA NA NA NA LINC00152 297091 2660 chr2 8772385 8778784 8774160,8776961 N,N NA;NA ID2 LINC00299,LOC339788,LOC100506274,ID2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 43329 2661 chr2 87748276 87751411 87749830 N NA LINC00152 NA NA NA NA LINC00152 3563 2662 chr2 88628633 88632144 88629804,88630607 N,N NA;NA NA NA NA NA NA THNSL2 158819 2663 chr2 88645305 88656275 88649821 N NA NA NA NA NA NA THNSL2 175491 2664 chr2 88957573 88962295 88959097 N NA EIF2AK3,RPIA EIF2AK3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPIA 28881 2665 chr2 89155646 89159007 89157866 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 90227 2666 chr2 89849534 89880182 89863786,89858073,89850321,89865284,89866647,89855277,89860460,89874013 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 784115 2667 chr2 90393614 90395373 90394414 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1328195 2668 chr2 90411430 90413965 90412796 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1346011 2669 chr2 90446502 90454882 90447603 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1381083 2670 chr2 91615561 91617441 91615927 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 230534 2671 chr2 91629985 91644206 91634434 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 203769 2672 chr2 91668014 91679574 91669429 N NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 LOC654342 168401 2673 chr2 91759593 91775405 91759975 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 LOC654342 72570 2674 chr2 91785658 91788667 91787360 N NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 LOC654342 59308 2675 chr2 91903215 91905478 91905091 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 55240 2676 chr2 92006613 92017203 92008389 N NA GGT8P NA NA NA NA GGT8P 43245 2677 chr2 92045024 92052512 92046146 N NA NA NA NA NA NA GGT8P 81656 2678 chr2 9210230 9212970 9211368 N NA NA MBOAT2,ASAP2,ITGB1BP1,CPSF3,KIDINS220 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBOAT2 66354 2679 chr2 92256345 92261819 92260437 N NA NA NA NA NA NA GGT8P 292977 2680 chr2 92293009 92301982 92297747,92300883 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GGT8P 329641 2681 chr2 9251833 9253839 9252651 N NA NA MBOAT2,ASAP2,KIDINS220 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBOAT2 107957 2682 chr2 9318288 9320626 9319817 N NA NA ASAP2,CPSF3,ITGB1BP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBOAT2 174412 2683 chr2 96185479 96210631 96192064 N NA NA NA NA NA NA FAHD2A 117031 2684 chr2 96306856 96314609 96307716 N NA NA NA NA NA NA FAHD2A 238408 2685 chr2 96346198 96354523 96348479,96353435 Y,N NA;NA NA KCNIP3,FAHD2A IMR90 Hi-C 24141950 FAHD2A 277750 2686 chr2 96394192 96395362 96394811 N NA NA FAHD2A,KCNIP3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC729234 280937 2687 chr2 96470124 96475131 96474744 N NA NA NA NA NA NA LOC729234 201168 2688 chr2 96489144 96501659 96500847 N NA NA NA NA NA NA LOC729234 174640 2689 chr2 96583841 96594098 96588921,96593330 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC729234 82201 2690 chr2 96594947 96606568 96596819 N NA NA NA NA NA NA LOC729234 69731 2691 chr2 96654770 96660175 96657821 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 16124 2692 chr2 96727660 96729635 96729040 N NA NA LOC285033,ADRA2B,DUSP2,ASTL,CIAO1,TMEM127,LOC729234 IMR90 Hi-C 24141950 LOC729234 51361 2693 chr2 96980434 96982687 96981265 N NA TMEM127,CIAO1,SNRNP200,NCAPH SNRNP200 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNRNP200 9127 2694 chr2 97077701 97081416 97080211,97077751 N,N NA;NA NA NCAPH,TMEM127,CIAO1,SNRNP200,ITPRIPL1,ARID5A,NEURL3,KANSL3,CNNM4,ANKRD39,CNNM3,SEMA4C,ANKRD23,FAM178B IMR90 Hi-C 24141950 NCAPH 76217 2695 chr2 97088130 97090817 97089516 N NA NA NCAPH,ITPRIPL1 IMR90 Hi-C 24141950 NCAPH 86646 2696 chr2 9795029 9798919 9796744 N NA YWHAQ YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAQ 23923 2697 chr2 9814345 9817953 9815728 Y NA YWHAQ YWHAQ,ADAM17 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAQ 43239 2698 chr2 98234473 98236639 98235787 N NA COX5B,ACTR1B NA NA NA NA COX5B 25882 2699 chr2 9829591 9832803 9830733 N NA NA YWHAQ,ADAM17,KLF11 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAQ 58485 2700 chr2 9892463 9895846 9893498 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 87725 2701 chr2 9939736 9943389 9941775,9940031 N,N NA;NA TAF1B YWHAQ,KLF11,CYS1,TAF1B,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,HPCAL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 40182 2702 chr2 9958899 9962495 9960394 N NA TAF1B RRM2,GRHL1,TAF1B,ODC1,ADAM17,CYS1,KLF11,HPCAL1,YWHAQ IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 21076 2703 chr20 10308092 10311613 10308989 N NA NA SNAP25 IMR90 Hi-C 24141950 MKKS 103253 2704 chr20 10843945 10845669 10844892 N NA NA NA NA NA NA JAG1 189251 2705 chr20 10981806 10983725 10982730 N NA NA JAG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAG1 327112 2706 chr20 11174929 11178430 11176800 N NA NA C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 JAG1 520235 2707 chr20 11187957 11190163 11188704 N NA NA C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 JAG1 533263 2708 chr20 11195998 11198690 11197474 N NA NA C20orf94,JAG1,LOC339593 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAG1 541304 2709 chr20 11828143 11832682 11831160 Y BTBD3 NA NA NA NA NA JAG1 1173449 2710 chr20 12319540 12327041 12321569 N NA NA NA NA NA NA TASP1 1292542 2711 chr20 1394684 1399903 1397462,1399591 N,N NA;NA FKBP1A-SDCBP2 SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A-SDCBP2 20868 2712 chr20 16843290 16846257 16844903 N NA NA PCSK2 IMR90 Hi-C 24141950 SNRPB2 132681 2713 chr20 17003892 17009836 17005300 N NA NA NA NA NA NA SNRPB2 293283 2714 chr20 17815503 17825024 17824183,17816052 N,N NA;NA NA BANF2,RRBP1,BFSP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 124466 2715 chr20 17828337 17832502 17830696 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 116988 2716 chr20 1784964 1799212 1790211,1793893,1786034,1797084 N,Y,Y,N NA;NA;SIRPA,SIRPA;NA NA LOC100289473,SIRPA,PDYN,STK35,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 283316 2717 chr20 1800154 1803261 1801002 N NA NA SIRPA,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 279267 2718 chr20 18098012 18101654 18099402 N NA CSRP2BP NA NA NA NA CSRP2BP 21214 2719 chr20 18232860 18235006 18233422 N NA ZNF133 CSRP2BP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF133 34115 2720 chr20 19737409 19758940 19738489 N NA NA SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1,LOC100130264,NAA20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIN2 108225 2721 chr20 19797036 19799023 19797866 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RIN2 68142 2722 chr20 19859948 19862884 19861214 Y NA RIN2 SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIN2 4281 2723 chr20 20711083 20713317 20711664 N NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 17817 2724 chr20 21413041 21421040 21413712,21417092 N,Y NA;NA NA XRN2 IMR90 Hi-C 24141950 NKX2-2 73624 2725 chr20 21536722 21563910 21538378 N NA NKX2-2 PLK1S1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX2-2 42058 2726 chr20 2186623 2196017 2188195 N NA NA PDYN,TGM3,TGM6 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 104095 2727 chr20 2217145 2219362 2218111 N NA NA SIRPA,PDYN IMR90 Hi-C 24141950 STK35 134617 2728 chr20 22252580 22254484 22253831 N NA NA NA NA NA NA NKX2-2 757916 2729 chr20 22354781 22357951 22356070 N NA NA NA NA NA NA NKX2-2 860117 2730 chr20 22740633 22746304 22744419 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 585069 2731 chr20 22750367 22758111 22752434,22756427 N,N NA;NA NA NXT1,GZF1,CSTL1,CST11 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 573262 2732 chr20 22774478 22777976 22777031 N NA NA GZF1,NXT1 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 553397 2733 chr20 23122981 23124876 23123891 Y NA NA LOC200261 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 206497 2734 chr20 23127696 23130048 23128798 N NA NA CD93,THBD K562 ChIA-PET 22265404 NXT1 201325 2735 chr20 23673205 23677854 23674017 N NA NA CST2 IMR90 Hi-C 24141950 CST3 54631 2736 chr20 23735046 23738255 23736022 N NA NA NA NA NA NA CST3 116472 2737 chr20 23879617 23882842 23879776 N NA NA NA NA NA NA CST3 261043 2738 chr20 24082644 24085155 24083358 N NA NA NA NA NA NA CST3 464070 2739 chr20 2498396 2509162 2505828 N NA SNRPB,ZNF343 SNRPB,ZNF343,TMC2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF343 8618 2740 chr20 25827675 25830133 25829191 N NA NA NA NA NA NA ZNF337 150206 2741 chr20 25833187 25856092 25834312,25848695,25843811,25846534 N,N,N,Y NA;NA;NA;ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 155718 2742 chr20 25964327 25967327 25965902 N NA NA NA NA NA NA NCOR1P1 127350 2743 chr20 26103859 26107620 26106527 N NA NCOR1P1 NA NA NA NA NCOR1P1 9182 2744 chr20 26114945 26119356 26116485 Y NA NCOR1P1 NA NA NA NA NCOR1P1 20268 2745 chr20 26209639 26214638 26213072 N NA LOC284801 NA NA NA NA LOC284801 19770 2746 chr20 26256405 26258506 26257329 N NA NA NA NA NA NA LOC284801 66536 2747 chr20 29515331 29526613 29517837,29521002 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FRG1B 85266 2748 chr20 29805371 29833625 29811025,29831150,29813034,29819134,29815286,29821224,29806595,29825697,29833101 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA FRG1B 193492 2749 chr20 30181847 30187584 30182886 Y NA ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 5502 2750 chr20 31338168 31342945 31341550 N NA COMMD7,DNMT3B COMMD7,DNMT3B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 COMMD7 6354 2751 chr20 32802822 32811249 32804050 N NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 102737 2752 chr20 33802409 33806025 33803298 Y NA PROCR TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6 IMR90 Hi-C 24141950 PROCR 42635 2753 chr20 34672439 34676066 34673797 N NA LOC647979 LOC647979,EPB41L1,PHF20,C20orf152,SCAND1,C20orf4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC647979 33557 2754 chr20 35491218 35493925 35492904 N NA KIAA0889 KIAA0889,NDRG3,DSN1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KIAA0889 2942 2755 chr20 36800029 36801639 36800954 N NA TGM2 KIAA1755,RPRD1B,TGM2,BPI,VSTM2L,TTI1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGM2 6329 2756 chr20 36811606 36817727 36812757,36815890 N,N NA;NA TGM2 RPRD1B,TGM2,KIAA1755,BPI IMR90 Hi-C 24141950 TGM2 17906 2757 chr20 38478059 38483934 38480366,38478516 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DHX35 887078 2758 chr20 39134357 39137620 39135408 Y MAFB NA NA NA NA NA TOP1 519842 2759 chr20 39635109 39640087 39637129 N NA TOP1 TOP1,ZHX3,CHD6,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 17375 2760 chr20 39957117 39959633 39958302 Y NA ZHX3,LPIN3 PLCG1,ZHX3,LPIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPIN3 9927 2761 chr20 4004483 4005380 4005194 N NA RNF24 CDC25B,PANK2,MIR103B2,RNF24,SMOX,HSPA12B,CENPB,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF24 8267 2762 chr20 4017429 4020651 4019545 N NA RNF24 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 21213 2763 chr20 4023904 4032245 4026608 N NA RNF24 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 27688 2764 chr20 40271614 40273822 40272459 N NA CHD6 CHD6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHD6 24481 2765 chr20 40319913 40325444 40322046 N NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 72780 2766 chr20 4033450 4036012 4034214 N NA RNF24 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 37234 2767 chr20 4044125 4047427 4045453 Y C20orf27,CENPB,C20orf29 RNF24 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 47909 2768 chr20 4061146 4075444 4063823,4065990,4071724 Y,Y,N NA;PANK2,RNF24,RNF24;NA NA RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228,CDC25B,C20orf29,SMOX,ADRA1D IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF24 64930 2769 chr20 4114118 4118977 4116439 Y PANK2,PANK2,SMOX NA ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF24 117902 2770 chr20 41956409 41962868 41961889 N NA NA NA NA NA NA SRSF6 123636 2771 chr20 42001999 42009874 42008364 N NA NA NA NA NA NA SRSF6 76630 2772 chr20 42072061 42075186 42073883 N NA SRSF6 SRSF6 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SRSF6 11318 2773 chr20 42383148 42385608 42384649 N NA NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 87439 2774 chr20 42472754 42475313 42474113 N NA NA TOX2,L3MBTL1,GTSF1L,MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 177045 2775 chr20 43320188 43323501 43321835 Y WISP2,KCNK15 ADA,LOC79015 LOC100505783,HNF4A,TTPAL,PKIG,ADA,LOC79015,RIMS4,KCNK15,WISP2,YWHAB,SERINC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC79015 19808 2776 chr20 4486228 4489698 4488019 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 PRNP 177099 2777 chr20 4492216 4495238 4493299 N NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 PRNP 171559 2778 chr20 45398180 45400588 45399432 N NA NA NCOA3,EYA2,ZMYND8,C1orf201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 SLC2A10 59901 2779 chr20 46017740 46022543 46018943,46021643 N,Y NA;NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,SLC2A10,EYA2,NCOA3,PARD6B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMYND8 32266 2780 chr20 46080679 46099659 46082013 N NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,LOC100131496,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 30942 2781 chr20 46555397 46557510 46556517 N NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA3 424796 2782 chr20 46596202 46606006 46601661 N NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA3 465601 2783 chr20 46653139 46698657 46687632,46653890 N,Y NA;NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA3 522538 2784 chr20 46920634 46926016 46923096 N NA NA SULF2,NCOA3,PREX1,ARFGEF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARFGEF2 612259 2785 chr20 47460356 47464447 47463389 Y ZNFX1 NA PREX1,ARFGEF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARFGEF2 73828 2786 chr20 47470054 47471686 47471022 N NA NA PREX1 IMR90 Hi-C 24141950 ARFGEF2 66589 2787 chr20 47520766 47521729 47521282 N NA ARFGEF2 PREX1,SULF2,NCOA3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARFGEF2 16546 2788 chr20 47807978 47813077 47810363 N NA STAU1,DDX27 STAU1,DDX27,ZNFX1 IMR90 Hi-C 24141950 STAU1 3074 2789 chr20 47958807 47965643 47959953,47961719,47964575 N,Y,N NA;NA;NA NA KCNB1,SLC9A8,B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNFX1 64051 2790 chr20 48390129 48394808 48393025 N NA SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 34442 2791 chr20 48544242 48547290 48545434 N NA SPATA2,RNF114 SPATA2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNF114 5624 2792 chr20 48649658 48652832 48651228 N NA NA TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 50145 2793 chr20 48778812 48787865 48782729 N NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,CEBPB SNAI1,UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,FAM65C,MIR645,PTPN1,RNF114,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM189-UBE2V1 8477 2794 chr20 48840160 48843005 48841361 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB CEBPB PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645,RAD51C IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 CEBPB 33040 2795 chr20 48856941 48858829 48857974 N NA CEBPB PTPN1,MIR645,CEBPB,FAM65C IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 49821 2796 chr20 48863080 48866555 48864909 N NA LOC284751 PTPN1,MIR645,CEBPB,FAM65C,LOC284751,PARD6B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC284751 42702 2797 chr20 48881673 48887236 48883903 N NA LOC284751 PARD6B,CEBPB,PTPN1,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC284751 22021 2798 chr20 48900260 48904657 48902033 N NA LOC284751 PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC284751 4600 2799 chr20 48988161 48991785 48990067 N NA NA LOC284751,PTPN1,MIR645,TMEM189-UBE2V1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC284751 78904 2800 chr20 49038167 49041583 49039307 N NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 85308 2801 chr20 49049067 49059094 49057077 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 67797 2802 chr20 49090247 49102221 49094935,49100207 N,Y NA;TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24670 2803 chr20 49104074 49105692 49105018 N NA PTPN1 LOC284751,MIR645,FAM65C,PARD6B,TMEM189-UBE2V1,PTPN1,SNAI1,CEBPB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 21199 2804 chr20 49107964 49114596 49109085,49113464 N,N NA;NA PTPN1 PARD6B,TMEM189-UBE2V1,PTPN1,SNAI1,FAM65C,CEBPB,LOC284751,MIR645 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 12295 2805 chr20 49261391 49266073 49262290 N NA NA FAM65C,PARD6B,PTPN1,ADNP,BCAS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARD6B 82008 2806 chr20 49340272 49343412 49341565 Y NA PARD6B NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PARD6B 4669 2807 chr20 49406433 49408836 49407289 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 2631 2808 chr20 49940201 49957513 49948233,49944198,49952699,49955574 Y,Y,N,N NA;NA;NA;NA NA KCNG1,ATP9A,MOCS3,DPM1,NFATC2,BCAS4 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 300526 2809 chr20 5045166 5047691 5046831 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 C20orf30 SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf30 46042 2810 chr20 50463344 50481323 50478424 N NA NA ZFP64,ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP9A 78436 2811 chr20 5050377 5053547 5052053 N NA C20orf30 SLC23A2,RASSF2,C20orf30,PRND,PRNT IMR90 Hi-C 24141950 C20orf30 40186 2812 chr20 50546201 50547853 50547395 N NA NA SALL4,ATP9A,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ATP9A 161293 2813 chr20 50600258 50604158 50601930 N NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP64 204366 2814 chr20 50610595 50615294 50610620,50614025 N,N NA;NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 193230 2815 chr20 50646522 50651045 50648558 N NA NA SALL4,ATP9A,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 157479 2816 chr20 51105952 51123828 51111051,51107419 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZFP64 297428 2817 chr20 51474533 51477334 51476041 N NA NA NA NA NA NA ZFP64 666009 2818 chr20 51538820 51541679 51539850 N NA NA NA NA NA NA ZNF217 657957 2819 chr20 51558756 51560927 51559911 N NA NA NA NA NA NA ZNF217 638709 2820 chr20 52225611 52230506 52226399,52228306 N,N NA;NA ZNF217 ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 25975 2821 chr20 52237320 52241904 52240168,52239222 Y,N ZNF217;NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 37684 2822 chr20 52288748 52290203 52289413 N NA NA BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 89112 2823 chr20 52350399 52355134 52353092 N NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 150763 2824 chr20 52356126 52358917 52356881 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 156490 2825 chr20 52368059 52371415 52370047 N NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 168423 2826 chr20 52388303 52395271 52391041 N NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 188667 2827 chr20 52443873 52447839 52445661 N NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 244237 2828 chr20 52500182 52512226 52501546,52501697,52510307,52509914,52507476 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA BCAS1,ZNF217,SUMO1P1,BMP7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 278290 2829 chr20 52513811 52520018 52517173,52514573 Y,N ZNF217;NA NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 270498 2830 chr20 52521458 52525741 52523612 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 264775 2831 chr20 52529988 52535444 52532463,52534565 Y,N ZNF217;NA NA SUMO1P1,ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 255072 2832 chr20 52737796 52744781 52740189,52738314 Y,Y NA;NA CYP24A1 DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT,CYP24A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 45735 2833 chr20 53775268 53780504 53777213 N NA NA NA NA NA NA PFDN4 950766 2834 chr20 55263217 55266339 55264541 Y NA NA BMP7,TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM209A 163432 2835 chr20 55359918 55371217 55362973 N NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM209A 260133 2836 chr20 55433657 55436265 55435017 N NA NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM209A 333872 2837 chr20 55561536 55565756 55563321 N NA NA TFAP2C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR5095 347457 2838 chr20 55581389 55584677 55582674 N NA NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR5095 328536 2839 chr20 5625958 5631233 5627013 N NA GPCPD1 GPCPD1,C20orf196,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 34286 2840 chr20 56320603 56325830 56323772 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 34011 2841 chr20 56335268 56337875 56336550 N NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 48676 2842 chr20 56344256 56349073 56347890 N NA NA PMEPA1,PPP4R1L IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 PMEPA1 57664 2843 chr20 56369012 56371906 56370504 N NA NA PPP4R1L,PMEPA1,ZBP1,MIR4532 Islet,IMR90 4C,Hi-C 24413736,24141950 PMEPA1 82420 2844 chr20 56591126 56594905 56592532 N NA NA ZBP1,PMEPA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1L 289590 2845 chr20 56705021 56708844 56706763 N NA NA ZBP1,PCK1,CTCFL,C20orf85,PMEPA1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R1L 175651 2846 chr20 57637740 57639992 57638907 N NA SLMO2-ATP5E CTSZ,TH1L,SLMO2-ATP5E,ZNF831,GNAS,TUBB1 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2-ATP5E 19839 2847 chr20 58616559 58617840 58616849 N NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 101207 2848 chr20 59691598 59695789 59693721 N NA NA LOC284757,C20orf197 IMR90 Hi-C 24141950 TAF4 945077 2849 chr20 59701047 59704097 59702789 Y NA NA C20orf197,LOC284757,CDH4 IMR90 Hi-C 24141950 TAF4 936769 2850 chr20 59758352 59760946 59759514 N NA NA CDH26,LOC284757,FAM217B,C20orf197,CDH4 IMR90 Hi-C 24141950 TAF4 879920 2851 chr20 61075669 61078529 61077126 Y DPH3P1,OGFR,DIDO1 NA NA NA NA NA RPS21 113548 2852 chr20 61191341 61193639 61192991 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 80158 2853 chr20 61194853 61196453 61195138 N NA NA C20orf166,RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO4A1 77344 2854 chr20 61267826 61271144 61268611 N NA SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 2653 2855 chr20 62477047 62478342 62477789 N NA TPD52L2,DNAJC5 NA NA NA NA TPD52L2 18239 2856 chr20 6974272 6977110 6975355 Y NA NA NA NA NA NA BMP2 225527 2857 chr20 810077 812256 810726 N NA FAM110A NA NA NA NA FAM110A 2100 2858 chr20 9014300 9017419 9016026 Y NA NA PLCB4,PLCB1 IMR90 Hi-C 24141950 TMX4 1013907 2859 chr20 9030597 9035293 9032785 N NA NA PLCB1,PLCB4 IMR90 Hi-C 24141950 TMX4 1030204 2860 chr21 10084807 10089012 10085333,10087292 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 116214 2861 chr21 10162467 10211357 10180790,10163820,10182258 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 193874 2862 chr21 10214657 10216068 10215709 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 246064 2863 chr21 10492762 10493164 10492989 N NA NA NA NA NA NA TPTE 497756 2864 chr21 10587554 10590298 10589087 N NA NA NA NA NA NA TPTE 400622 2865 chr21 10592135 10611430 10597570,10605398 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TPTE 379490 2866 chr21 10774125 10778724 10774997,10777479 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TPTE 212196 2867 chr21 10779829 10812283 10780692,10800124,10786836,10790968,10783513,10794888,10792859,10802677,10804438,10812191,10807635 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TPTE 178637 2868 chr21 10813685 10860799 10836694,10823986,10851169,10826110,10858723,10818290,10844690,10838951,10841364,10860071,10852801,10831455,10828503,10820617,10847526,10856451 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TPTE 130121 2869 chr21 10993088 10994500 10993850 N NA TPTE NA NA NA NA TPTE 2168 2870 chr21 11167025 11185473 11169688 N NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE5 68100 2871 chr21 14561455 14563971 14562553 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1191538 2872 chr21 14571374 14576343 14574847 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1179166 2873 chr21 14742562 14751184 14745706 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1004325 2874 chr21 15281479 15288667 15282354 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 466842 2875 chr21 15398732 15408337 15399670 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 347172 2876 chr21 15449120 15456713 15456160,15449321 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 298796 2877 chr21 16793469 16801161 16796215 N NA NA LOC388813,SAMSN1 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 301335 2878 chr21 18742877 18745956 18744013 N NA NA CXADR IMR90 Hi-C 24141950 CXADR 139268 2879 chr21 18859872 18863693 18862168 N NA CXADR CXADR IMR90 Hi-C 24141950 CXADR 21531 2880 chr21 23553619 23564281 23563032 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 3415520 2881 chr21 25258338 25261278 25259731 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 1718523 2882 chr21 27221494 27228480 27227271 N NA NA NA NA NA NA ATP5J 113529 2883 chr21 27761125 27764424 27762586 N NA NA NA NA NA NA APP 217679 2884 chr21 27776965 27784919 27778190 N NA NA NA NA NA NA APP 233519 2885 chr21 28938304 28944922 28942868 Y NA NA ADAMTS5,ADAMTS1,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 1312771 2886 chr21 29065270 29068332 29066554 N NA NA ADAMTS5,ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 1189361 2887 chr21 29260062 29267888 29264036,29265993 N,N NA;NA NA NA NA NA NA N6AMT1 989805 2888 chr21 29461033 29463505 29462729 N NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 794188 2889 chr21 29533532 29538024 29534713 N NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 719669 2890 chr21 29761181 29775434 29774571 N NA NA ADAMTS1,LINC00113 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 482259 2891 chr21 32141429 32144322 32142884 N NA NA NA NA NA NA TIAM1 786968 2892 chr21 32995308 33005059 33002668 N NA SOD1 TIAM1,SOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOD1 26876 2893 chr21 34574900 34578053 34576557 N NA IFNAR2 IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432,C21orf119,URB1,GART,SON,DONSON,CRYZL1 IMR90,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 24178 2894 chr21 34753111 34757323 34755636 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 NA IFNGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNAR1 55897 2895 chr21 35401129 35404698 35402508 Y GART,GART MRPS6 MRPS6,LOC100506334 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 41125 2896 chr21 36011440 36014340 36012999 N NA RCAN1 FAM165B,KCNE1,CLIC6,RCAN1 IMR90 Hi-C 24141950 RCAN1 24058 2897 chr21 36455949 36459825 36457441 Y NA RUNX1 RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 34354 2898 chr21 36507231 36513344 36509210,36511184 N,N NA;NA NA RUNX1,CLIC6,SETD4,LOC100506385 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 85636 2899 chr21 36568156 36572525 36570673 N NA NA RUNX1,SETD4,CLIC6,LINC00160,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 146561 2900 chr21 36573514 36581450 36575818,36578627,36578625,36581023 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385,MIR802 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 151919 2901 chr21 36584014 36586516 36585229 N NA NA RUNX1,SETD4,LOC100506385,MIR802 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 162419 2902 chr21 36588190 36591581 36590094 N NA NA RUNX1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 166595 2903 chr21 36626162 36631325 36627862,36629099 N,N NA;NA NA CLIC6,RUNX1,SETD4,LOC100506385 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 204567 2904 chr21 36636350 36639378 36638091 N NA NA RUNX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RUNX1 214755 2905 chr21 36769890 36772415 36771111 N NA NA CLIC6,RUNX1,LINC00160,MIR802 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 348295 2906 chr21 36849553 36851730 36851064 N NA NA RUNX1,LOC100506385,CLIC6,CBR1,LOC100133286,SETD4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 427958 2907 chr21 36899941 36902272 36901378 N NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 478346 2908 chr21 36935117 36938977 36937101 N NA NA RUNX1,LOC100506385,LINC00160,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 SETD4 493842 2909 chr21 37293893 37296465 37295141 N NA NA CLIC6,LOC100506385,RUNX1,LINC00160 IMR90 Hi-C 24141950 SETD4 136354 2910 chr21 37374460 37377152 37376522 N NA NA CLIC6,KCNE1,LOC100506385,RCAN1,RUNX1,LINC00160 IMR90 Hi-C 24141950 SETD4 55667 2911 chr21 37997811 38000842 37999593 N NA NA CLDN14,HLCS,CHAF1B IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 71149 2912 chr21 39615877 39619649 39616905 Y KCNJ15 NA KCNJ6,KCNJ15,DSCR10 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 557582 2913 chr21 39693822 39698104 39695801 N NA NA KCNJ6,DSCR10,KCNJ15,DSCR8 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 479127 2914 chr21 40296591 40299576 40298048 N NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 119360 2915 chr21 40385334 40387938 40386869 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 167502 2916 chr21 41003953 41008467 41005602 N NA B3GALT5 SH3BGR IMR90 Hi-C 24141950 B3GALT5 20787 2917 chr21 43061246 43064210 43062270 Y MX1 NA PRDM15,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM15 235372 2918 chr21 44576747 44584574 44583333,44582595 N,N NA;NA U2AF1 SIK1,RRP1B,HSF2BP,U2AF1,LINC00313,LINC00319,CRYAA IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 49059 2919 chr21 44725523 44728873 44727131 Y RRP1,HSF2BP NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319,CRYAA,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 118129 2920 chr21 44749321 44755234 44753553 N NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91768 2921 chr21 44910426 44918032 44914595,44911949 Y,N PDXK,U2AF1,SIK1;NA NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 63424 2922 chr21 45621351 45624550 45622736 N NA ICOSLG PFKL,AIRE MCF7 ChIA-PET 22265404 ICOSLG 36284 2923 chr21 46429054 46438236 46432444 N NA LINC00162 ADARB1,SSR4P1,ITGB2,PTTG1IP,C21orf67,FAM207A,LINC00162,LINC00163 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC00162 4412 2924 chr21 46738315 46743501 46739636 Y NA POFUT2,LOC642852 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC642852 30348 2925 chr21 46747216 46751686 46749958 Y NA POFUT2,LOC642852 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC642852 39249 2926 chr21 46781520 46793885 46785574 N NA NA ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1,PCBP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC642852 73553 2927 chr21 47391871 47397395 47394365 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 NA COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A2 120638 2928 chr21 47457985 47460117 47459098 N NA NA COL6A1,COL6A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 57916 2929 chr21 47470976 47475056 47473953 N NA COL6A2 COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56,MCM3AP IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 42977 2930 chr21 47479790 47482482 47480811 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 35551 2931 chr21 47483886 47486514 47485445 N NA COL6A2 COL6A2,COL6A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 31519 2932 chr21 9468439 9473479 9469705 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 495114 2933 chr21 9537771 9550785 9540653 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 417808 2934 chr21 9594112 9595666 9595029 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 372927 2935 chr21 9654064 9689851 9664275,9665771,9656906 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 278742 2936 chr21 9694551 9708918 9696004,9697881,9704658 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 259675 2937 chr21 9719613 9729289 9720694,9725379 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 239304 2938 chr22 16122402 16124403 16123239 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 958398 2939 chr22 16159921 16163371 16162041 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 919430 2940 chr22 16190543 16208063 16190681,16193066,16195049,16205443 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TPTEP1 874738 2941 chr22 16332191 16372259 16335608 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 710542 2942 chr22 16374001 16381738 16375711 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 701063 2943 chr22 16632066 16637893 16632963 N NA NA NA NA NA NA TPTEP1 444908 2944 chr22 17331460 17334332 17332534 N NA NA NA NA NA NA CECR7 183128 2945 chr22 17381730 17388676 17382732 N NA NA NA NA NA NA CECR7 128784 2946 chr22 18831385 18834733 18832861 N NA NA NA NA NA NA DGCR6 59003 2947 chr22 19563364 19565922 19564635 N NA NA HIRA,CLDN5,LOC150185,CLTCL1,UFD1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC45 95950 2948 chr22 19617691 19620317 19618879 N NA NA CDC45,UFD1L,CLDN5,CLTCL1,SLC25A1,HIRA,DGCR2,DGCR14,TSSK2,LOC150185,TXNRD2,MRPL40,GSC2,C22orf39,GP1BB,SEPT5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT5 81670 2949 chr22 19678240 19681433 19679535 N NA SEPT5,GP1BB UFD1L,TXNRD2,CLDN5,SEPT5,HIRA,GP1BB,TBX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT5 20554 2950 chr22 19682036 19684743 19683269 N NA SEPT5,GP1BB UFD1L,TXNRD2,CLDN5,SEPT5,HIRA,GP1BB,TBX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT5 17244 2951 chr22 20989474 21014736 21004078,21011382 N,N NA;NA NA MED15,KLHL22,PI4KA,SERPIND1,SCARF2,ZNF74 IMR90 Hi-C 24141950 MED15 127588 2952 chr22 22521566 22526630 22523106 N NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 125833 2953 chr22 23268382 23272231 23271139 Y NA NA MIR650 IMR90 Hi-C 24141950 GNAZ 140438 2954 chr22 23766091 23767715 23766694 N NA NA NA NA NA NA C22orf43 206793 2955 chr22 23862205 23864374 23863239 N NA NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 C22orf43 110134 2956 chr22 23879806 23882671 23881556 N NA NA BCR,ZDHHC8P1,CES5AP1,IGLL1,GUSBP11,RGL4 IMR90 Hi-C 24141950 C22orf43 91837 2957 chr22 25344622 25408456 25346350,25348614,25381810,25387933,25392681 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA KIAA1671 SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1671 15485 2958 chr22 25667268 25669441 25667624 N NA IGLL3P NA NA NA NA IGLL3P 44783 2959 chr22 25785654 25801207 25799810 N NA LRP5L,CRYBB2P1 ADRBK2,LRP5L,SEZ6L,CRYBB2P1,MYO18B IMR90 Hi-C 24141950 LRP5L 8110 2960 chr22 25822307 25823481 25822638 N NA LRP5L,CRYBB2P1 MYO18B,CRYBB2P1,KIAA1671,LRP5L,ADRBK2 IMR90 Hi-C 24141950 CRYBB2P1 20573 2961 chr22 26810679 26814597 26813354 N NA ASPHD2 ASPHD2,HPS4 IMR90 Hi-C 24141950 ASPHD2 10683 2962 chr22 27108898 27163544 27115546,27110171 N,Y NA;NA NA MIAT,MN1,PITPNB,TTC28-AS1,TTC28 IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 122809 2963 chr22 27241797 27261606 27244408 N NA NA MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 255708 2964 chr22 27299797 27316385 27300578 N NA NA MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 313708 2965 chr22 27498291 27503236 27501723 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 512202 2966 chr22 27505686 27513891 27509362,27512003 Y,Y NA;NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 519597 2967 chr22 27528600 27533227 27531161 N NA NA MIAT IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 542511 2968 chr22 27534240 27537467 27536257 N NA NA MIAT IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 548151 2969 chr22 27594073 27627674 27608764,27598910,27616648,27621217 N,N,Y,N NA;NA;NA;NA NA MIAT,MN1,PITPNB IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 607984 2970 chr22 27633582 27637531 27635585 N NA NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 TPST2 647493 2971 chr22 27693481 27694935 27694088 N NA NA MIAT IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 620320 2972 chr22 27851707 27854692 27853291,27854595 N,N NA;NA NA MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 460563 2973 chr22 27856116 27859864 27857542 N NA NA MN1,MIAT,PITPNB IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 455391 2974 chr22 27868415 27877922 27871282 Y NA NA PITPNB,MN1,TTC28,TTC28-AS1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 437333 2975 chr22 27926875 27929602 27927956 N NA NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 385653 2976 chr22 27937775 27941901 27940320 N NA NA NA NA NA NA PITPNB 373354 2977 chr22 28059819 28068237 28063993,28065531,28066164 N,Y,N NA;PITPNB,MN1;NA NA MN1,TTC28,TTC28-AS1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 247018 2978 chr22 28081425 28085201 28082745 Y MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 230054 2979 chr22 28111911 28116675 28115027 N NA NA NA NA NA NA PITPNB 198580 2980 chr22 28213656 28218936 28218148 N NA NA PITPNB IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 96319 2981 chr22 29981926 29989855 29984301 N NA THOC5,NIPSNAP1,NF2 NIPSNAP1,THOC5,NF2,UQCR10,ZMAT5,ASCC2,MTMR3 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NIPSNAP1 4600 2982 chr22 30599256 30608366 30602195,30606880 N,N NA;NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 34430 2983 chr22 31456592 31458253 31457342 N NA SMTN,SELM OSBP2,TUG1,MORC2,LIMK2,SMTN,INPP5J IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMTN 19029 2984 chr22 32036989 32048340 32046619,32046551,32042873 N,N,Y NA;NA;RNF185,LIMK2 PISD PISD,SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L MCF7,GM12878,K562,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 PISD 10179 2985 chr22 35153012 35165451 35157361 N NA NA NA NA NA NA HMGXB4 487994 2986 chr22 35176180 35196367 35176962 N NA NA NA NA NA NA HMGXB4 457078 2987 chr22 35235907 35238974 35237936 N NA NA NA NA NA NA HMGXB4 414471 2988 chr22 35241405 35247228 35245551,35241679 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HMGXB4 406217 2989 chr22 35260097 35264213 35262985 Y NA NA NA NA NA NA HMGXB4 389232 2990 chr22 35588125 35628955 35626994 N NA HMGXB4 LARGE,HMGXB4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGXB4 24490 2991 chr22 35841722 35873468 35859986,35842573,35867531 N,Y,N NA;NA;NA MCM5 RASD2,MB,TOM1,RBFOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MCM5 45606 2992 chr22 35886045 35888705 35887472 N NA RASD2 RASD2,RBFOX2,MCM5,HMOX1 IMR90 Hi-C 24141950 RASD2 48647 2993 chr22 36022120 36038400 36025010 N NA APOL6 MB,APOL5,RBFOX2,APOL6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 APOL6 6024 2994 chr22 36460176 36467702 36462114 N NA RBFOX2 RBFOX2,APOL3,APOL6,MCM5,MB,APOL5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBFOX2 35591 2995 chr22 36838039 36841511 36840080 N NA TXN2 MYH9 IMR90 Hi-C 24141950 TXN2 36176 2996 chr22 37234647 37236258 37235603 N NA NA CACNG2,PVALB,TEX33,IFT27,CSF2RB,LOC100506241,NCF4 IMR90 Hi-C 24141950 IFT27 62470 2997 chr22 37248524 37250473 37249661 N NA NA IFT27,CSF2RB,CACNG2,EIF3D,NCF4,LOC100506241,TEX33,KCTD17 IMR90 Hi-C 24141950 IFT27 76347 2998 chr22 37918534 37920934 37920308 N NA MFNG,CARD10,CDC42EP1 CARD10 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CARD10 3324 2999 chr22 37987128 37988772 37988621 N NA CDC42EP1,GGA1,SH3BP1 CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP IMR90 Hi-C 24141950 GGA1 15709 3000 chr22 38427729 38434605 38430609 N NA PICK1 MAFF,EIF3L,MICALL1,C22orf23,POLR2F,SOX10,PICK1,PLA2G6,CSNK1E,TMEM184B,DMC1,DDX17,CBY1,LOC646851,BAIAP2L2,LOC400927,KCNJ4 IMR90 Hi-C 24141950 PICK1 18657 3001 chr22 39306500 39309405 39307907 N NA CBX6,APOBEC3A CBX6,APOBEC3A,CBX7 IMR90 Hi-C 24141950 CBX6 38242 3002 chr22 39317740 39321949 39319925 N NA CBX6,APOBEC3A APOBEC3A,CBX7,PDGFB,CBX6,GTPBP1,DNAL4,SUN2,APOBEC3H,APOBEC3G,RPL3,SNORD83A,RNU86,NPTXR,APOBEC3C,APOBEC3D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APOBEC3A 31578 3003 chr22 39569277 39575219 39571592,39574318 N,N NA;NA CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 20739 3004 chr22 39578201 39582481 39580452 N NA CBX7 PDGFB MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 29663 3005 chr22 39647866 39656485 39650638 N NA NA CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL3 59185 3006 chr22 41046084 41054278 41047806 Y NA MKL1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL,SLC25A17,DNAJB7,XPNPEP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 13394 3007 chr22 41411542 41421991 41418561 Y MKL1,EP300 NA ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBX1 64191 3008 chr22 43143314 43148087 43144330 N NA NA CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT IMR90 Hi-C 24141950 CYB5R3 97909 3009 chr22 43163899 43167691 43166428 N NA NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3,TTLL1 IMR90 Hi-C 24141950 ARFGAP3 85717 3010 chr22 44720307 44723358 44722064 N NA NA PARVB,SAMM50,KIAA1644 IMR90 Hi-C 24141950 PARVG 151471 3011 chr22 44750093 44761817 44759337 Y NA NA PARVB,KIAA1644,LINC00207,SAMM50,PARVG,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132188 3012 chr22 44843857 44847261 44845424 Y PARVG,PARVG LDOC1L PARVB,SAMM50,KIAA1644,LINC00207,PARVG,LINC00229,LDOC1L IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 46744 3013 chr22 45466341 45481584 45468350 N NA NA LOC100506714,PRR5-ARHGAP8,PHF21B,NUP50 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506714 78078 3014 chr22 45641571 45644469 45642171 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 4921 3015 chr22 45658670 45661371 45660029 N NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0930 22020 3016 chr22 46033524 46036054 46035051 Y NA ATXN10 FAM118A,FBLN1,ATXN10,WNT7B IMR90 Hi-C 24141950 ATXN10 31624 3017 chr22 46391993 46395872 46393563 Y C22orf26 NA C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381,MIRLET7BHG IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC150381 53854 3018 chr22 46941607 46945043 46943647 N NA NA NA NA NA NA CERK 189109 3019 chr22 47148572 47152090 47150540 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 6428 3020 chr22 47723165 47736529 47733323,47725469 N,N NA;NA LOC339685 NA NA NA NA LOC339685 4792 3021 chr22 47790374 47793138 47791440 N NA LOC339685 NA NA NA NA LOC339685 49053 3022 chr22 48230414 48255150 48231602,48232796 N,N NA;NA NA TBC1D22A,MIR3201 IMR90 Hi-C 24141950 LOC339685 489093 3023 chr22 48507702 48510344 48508851 N NA NA NA NA NA NA LOC339685 766381 3024 chr22 49433538 49449577 49448262 N NA NA LOC100128946 IMR90 Hi-C 24141950 C22orf34 601613 3025 chr22 49491851 49497627 49494716 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 553563 3026 chr22 49762263 49767655 49765166 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 283535 3027 chr22 49963635 49974284 49969233 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 76906 3028 chr22 50115887 50122416 50118309 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 64697 3029 chr22 50344330 50347518 50346157 Y NA ALG12,CRELD2,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 6625 3030 chr22 51093979 51098816 51094881 N NA ARSA SHANK3,PPP6R2,SBF1,SYCE3,MIOX,ADM2,ARSA,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARSA 27378 3031 chr3 100324612 100325217 100324699 N NA NA TFG MCF7 ChIA-PET 22265404 TFG 102917 3032 chr3 100753561 100757160 100755253 Y NA NA ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 TFG 325427 3033 chr3 100783433 100786081 100784973 Y ABI3BP NA ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 TFG 355299 3034 chr3 101643784 101657570 101655219,101645513,101648777 N,Y,N NA;NA;NA LOC152225 FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 LOC152225 2133 3035 chr3 101807510 101813584 101809443,101812060 N,N NA;NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 LOC152225 147807 3036 chr3 102017051 102019594 102018198 N NA NA NA NA NA NA LOC152225 357348 3037 chr3 102118468 102120591 102119195 N NA NA NA NA NA NA LOC152225 458765 3038 chr3 102229698 102232184 102231328 N NA NA NA NA NA NA LOC152225 569995 3039 chr3 103249554 103252154 103250155 N NA NA NA NA NA NA LOC152225 1589851 3040 chr3 104060161 104079774 104078534 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 1005783 3041 chr3 104149601 104158709 104156122 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 926848 3042 chr3 104159512 104176217 104163615 N NA NA ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 ALCAM 909340 3043 chr3 104622985 104627490 104625895 N NA NA ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 ALCAM 458067 3044 chr3 105072974 105079994 105074275,105078486 N,Y NA;NA ALCAM ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 ALCAM 5563 3045 chr3 106063320 106065136 106064412 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 977763 3046 chr3 106252398 106254762 106253037 N NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 BBX 987021 3047 chr3 106446086 106449288 106447384 N NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 BBX 792495 3048 chr3 106483159 106486028 106484413 N NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 BBX 755755 3049 chr3 107084270 107087915 107085869 Y NA NA LOC344595,LOC100302640 IMR90 Hi-C 24141950 BBX 153868 3050 chr3 107147803 107152618 107150831,107148848 N,Y NA;NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 89165 3051 chr3 107702728 107705626 107704406 Y CD47 NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 104309 3052 chr3 107710275 107714175 107712761 N NA NA MYH15,CD47,LOC285205,IFT57,HHLA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 95760 3053 chr3 107716085 107721446 107718398 N NA NA CD47,IFT57,HHLA2,MYH15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 88489 3054 chr3 107726322 107729713 107727880 Y CD47 NA CD47,IFT57,MYH15,HHLA2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CD47 80222 3055 chr3 109524463 109529493 109525904 Y NA NA PVRL3 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1524 1215972 3056 chr3 109646568 109649667 109647297 N NA NA PVRL3,PVRL3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 1141348 3057 chr3 110131542 110135325 110133349 N NA NA PVRL3,PVRL3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 655690 3058 chr3 110244045 110247869 110246117 N NA NA PVRL3-AS1,PVRL3 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 543146 3059 chr3 110295271 110296612 110295948 N NA NA PVRL3,PVRL3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 494403 3060 chr3 110499462 110535009 110533990 N NA NA PVRL3-AS1,PVRL3 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 256006 3061 chr3 110609076 110693500 110630376,110684024,110688770,110690175 N,N,Y,N NA;NA;NA;NA NA PVRL3,PVRL3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 97515 3062 chr3 11136632 11139992 11138353 Y NA HRH1 HRH1,ATG7 IMR90 Hi-C 24141950 HRH1 38787 3063 chr3 111391937 111423361 111393444,111395738 N,N NA;NA PHLDB2 CD96,PHLDB2,ZBED2,TAGLN3,ABHD10 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB2 27966 3064 chr3 112108928 112109679 112109011 N NA NA CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3 IMR90 Hi-C 24141950 ATG3 170806 3065 chr3 112365056 112368833 112366076 N NA NA CCDC80,CD200R1L,GTPBP8,CD200R1,C3orf17 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC35A5 84161 3066 chr3 112371463 112374744 112372621 Y NA NA CCDC80,CD200R1L IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 90568 3067 chr3 112389263 112391927 112390760 N NA NA NA NA NA NA SLC35A5 108368 3068 chr3 112394864 112397178 112395824 Y CCDC80 NA CCDC80 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC35A5 113969 3069 chr3 112414151 112416526 112415207 N NA NA CD200R1L,CCDC80 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 133256 3070 chr3 112815788 112823422 112817081 N NA NA BOC,KIAA2018,WDR52 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf17 77233 3071 chr3 114957119 114968621 114958817,114964548 N,N NA;NA NA GAP43,LSAMP IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB20 90992 3072 chr3 115230581 115233863 115231843 N NA NA NA NA NA NA ZBTB20 364454 3073 chr3 118558995 118562895 118561086 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT4 396857 3074 chr3 119852571 119857669 119854485 N NA GSK3B GSK3B MCF7 ChIA-PET 22265404 GSK3B 39307 3075 chr3 119986329 120008554 119992539,120004038,120007710 N,N,N NA;NA;NA GPR156 LRRC58 IMR90 Hi-C 24141950 GPR156 23187 3076 chr3 120187574 120192279 120188785,120190828 N,N NA;NA FSTL1 GSK3B,FSTL1 IMR90 Hi-C 24141950 FSTL1 17656 3077 chr3 120273682 120280871 120278675 N NA NDUFB4 FSTL1,LRRC58,GPR156,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34257 3078 chr3 122774799 122776691 122775670 N NA PDIA5 SEMA5B,PDIA5 IMR90 Hi-C 24141950 PDIA5 9165 3079 chr3 123749539 123758536 123750564 N NA ROPN1 KALRN,CCDC14 IMR90 Hi-C 24141950 ROPN1 39340 3080 chr3 125926115 125928602 125927646 N NA ALDH1L1 CCDC37,ALDH1L1,KLF15,ZXDC IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1L1 26630 3081 chr3 126290006 126293684 126292525 Y NA NA NA NA NA NA TXNRD3 80283 3082 chr3 126940919 126956950 126945790 Y MCM2 NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 233482 3083 chr3 127264608 127268207 127267059 N NA TPRA1,MCM2 CHST13,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 TPRA1 41361 3084 chr3 127583874 127586785 127585260 N NA MGLL PODXL2,MGLL,KBTBD12,SEC61A1 IMR90 Hi-C 24141950 MGLL 41781 3085 chr3 127605431 127607497 127606501 N NA NA PODXL2,KBTBD12 IMR90 Hi-C 24141950 MGLL 63338 3086 chr3 128957352 128961548 128959976 N NA COPG1,C3orf37 KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPG1 6905 3087 chr3 129344064 129345597 129345054 N NA NA NA NA NA NA IFT122 185096 3088 chr3 129654574 129655769 129655019 N NA TMCC1,LOC100507032 TMCC1,TRH,LOC100507032,IFT122,MBD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507032 41860 3089 chr3 131852345 131856099 131855023 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC13 280454 3090 chr3 133844128 133851069 133849978 N NA NA C3orf36,SLCO2A1,RAB6B,RYK IMR90 Hi-C 24141950 RYK 118517 3091 chr3 134033382 134036416 134035418 N NA NA ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMOTL2 56990 3092 chr3 134038761 134054007 134039717,134046158,134052097 N,N,N NA;NA;NA AMOTL2 ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,CEP63 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL2 39399 3093 chr3 134144406 134148272 134146521 N NA NA ANAPC13,AMOTL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMOTL2 51000 3094 chr3 134148991 134151428 134149692 N NA NA ANAPC13 IMR90 Hi-C 24141950 CEP63 53147 3095 chr3 135230990 135236014 135234085 N NA NA EPHB1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R3A 448501 3096 chr3 135614018 135617606 135615685 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 66909 3097 chr3 13578589 13580951 13580924 N NA NA HDAC11,FBLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HDAC11 56874 3098 chr3 13584000 13587260 13584943,13586092 N,N NA;NA NA HDAC11 MCF7 ChIA-PET 22265404 HDAC11 62285 3099 chr3 138509212 138525371 138523507 N NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 31011 3100 chr3 138527431 138531780 138529509,138527965 N,N NA;NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 49230 3101 chr3 138537555 138546002 138542574,138544206 N,N NA;NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 59354 3102 chr3 138549785 138555654 138553851 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 71584 3103 chr3 138633651 138636821 138634963 N NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 155450 3104 chr3 139016766 139022971 139018421,139021281 Y,N FOXL2,C3orf72;NA MRPS22 BPESC1,FOXL2,MRPS22,COPB2,C3orf72 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS22 39890 3105 chr3 139028078 139031565 139029601 N NA MRPS22 BPESC1,FOXL2,C3orf72,MRPS22,COPB2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS22 31296 3106 chr3 13931300 13940241 13932439,13937037 Y,Y NA;NA NA C3orf19,WNT7A,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 226130 3107 chr3 139490619 139492981 139491798 N NA NA NA NA NA NA COPB2 382097 3108 chr3 140726644 140733477 140732071 N NA NA SPSB4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A36 65982 3109 chr3 14359922 14363489 14361303 N NA NA SLC6A6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 80617 3110 chr3 14365082 14368458 14366838 N NA NA SLC6A6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 75648 3111 chr3 14679558 14682320 14681723 N NA C3orf19,C3orf20 GRIP2,C3orf19,SLC6A6,FGD5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C3orf19 10933 3112 chr3 148365734 148367392 148366345 N NA NA ZIC4,AGTR1 IMR90 Hi-C 24141950 GYG1 341803 3113 chr3 14844476 14846416 14845284 N NA NA NA NA NA NA C3orf20 127870 3114 chr3 149098857 149100061 149099874 N NA TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 3289 3115 chr3 149103567 149108417 149104863 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1,HLTF,HPS3,WWTR1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 7999 3116 chr3 149794785 149801800 149796946,149800173 N,N NA;NA NA RNF13,PFN2,TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC646903 105719 3117 chr3 149952920 149956548 149954709 N NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 170240 3118 chr3 149964189 149970560 149968077 N NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2,TM4SF1,TM4SF4,LOC646903,EIF2A,SERP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 156228 3119 chr3 150017868 150020042 150018766 N NA NA TSC22D2,EIF2A,SERP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 106746 3120 chr3 150024625 150032365 150026478 N NA NA TSC22D2,SERP1,EIF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 94423 3121 chr3 150036330 150040274 150037893 N NA NA TSC22D2,SERP1,EIF2A,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 86514 3122 chr3 150061170 150064278 150062965 N NA NA PFN2,RNF13,LOC646903,TSC22D2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 62510 3123 chr3 150065041 150069613 150067120 N NA NA PFN2,RNF13,LOC646903,TSC22D2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 57175 3124 chr3 150081780 150084929 150083259 N NA TSC22D2 RNF13,PFN2,TSC22D2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 41859 3125 chr3 150087466 150091751 150089049 N NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 35037 3126 chr3 150113459 150121576 150117077 N NA TSC22D2 TSC22D2,RNF13,PFN2,LOC646903 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 5212 3127 chr3 151311285 151313112 151312018 N NA NA NA NA NA NA GPR87 276649 3128 chr3 151642833 151646269 151644207 N NA NA MED12L,P2RY13,GPR87 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 339560 3129 chr3 151738306 151741128 151739870 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 244701 3130 chr3 152760276 152762340 152761076 N NA NA RAP2B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAP2B 117689 3131 chr3 152768081 152771656 152769386 N NA NA RAP2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAP2B 108373 3132 chr3 152774410 152778236 152775786 N NA NA RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 101793 3133 chr3 152847418 152850916 152848953 N NA RAP2B NA NA NA NA RAP2B 29113 3134 chr3 152854877 152860570 152857597,152858669 N,N NA;NA RAP2B RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 19459 3135 chr3 152926446 152928530 152927757 N NA RAP2B NA NA NA NA RAP2B 46417 3136 chr3 153001301 153003951 153002370 N NA NA RAP2B IMR90 Hi-C 24141950 RAP2B 121272 3137 chr3 153331503 153333280 153332580 Y NA NA NA NA NA NA RAP2B 451474 3138 chr3 15401490 15410085 15402816,15405839,15408762 N,N,N NA;NA;NA NA CAPN7,COL6A4P1,LOC100505696,SH3BP5 IMR90 Hi-C 24141950 METTL6 58957 3139 chr3 154787029 154790304 154788970 Y NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 C3orf33 733751 3140 chr3 156321272 156326051 156323658 N NA SSR3 TIPARP-AS1,TIPARP,CCNL1,SSR3,LOC339894,LOC100498859 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SSR3 48299 3141 chr3 156346975 156350122 156348571 N NA TIPARP,TIPARP-AS1 LOC339894,LOC100498859,CCNL1,SSR3,TIPARP-AS1,TIPARP,LEKR1 IMR90 Hi-C 24141950 TIPARP 42083 3142 chr3 156890877 156896540 156892852 N NA CCNL1 CCNL1,VEPH1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCNL1 12395 3143 chr3 157501426 157505819 157503113 N NA NA NA NA NA NA SHOX2 318133 3144 chr3 159642914 159649049 159647252 N NA NA IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 57574 3145 chr3 159846000 159849595 159848287 N NA NA IL12A,IFT80,SMC4,C3orf80 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 139377 3146 chr3 16099178 16104305 16102020 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 198125 3147 chr3 16105749 16123733 16109907,16115863,16106860,16120325 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 182763 3148 chr3 16129776 16134142 16131827 N NA NA GALNTL2,BTD,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 172354 3149 chr3 16142262 16146996 16143941 N NA NA GALNTL2,BTD,ANKRD28,MIR563,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 159500 3150 chr3 16170218 16173473 16171834 N NA NA GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 133023 3151 chr3 16180311 16194882 16185489,16182061,16185622,16190473 N,Y,N,N NA;GALNTL2;NA;NA NA GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 111614 3152 chr3 161858957 161860929 161859956 N NA NA NA NA NA NA NMD3 919858 3153 chr3 162011767 162014756 162013336 N NA NA NA NA NA NA NMD3 1072668 3154 chr3 165071780 165074294 165072590 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 2378357 3155 chr3 165360113 165362311 165361455 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 2090340 3156 chr3 166648944 166652208 166650017 N NA NA NA NA NA NA PDCD10 800443 3157 chr3 166696336 166704802 166697594,166702559 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PDCD10 747849 3158 chr3 16769661 16772800 16770483 N NA NA NA NA NA NA PLCL2 153652 3159 chr3 16781741 16785112 16783161 N NA NA NA NA NA NA PLCL2 141340 3160 chr3 168602032 168604235 168602595 N NA NA EGFEM1P IMR90 Hi-C 24141950 GOLIM4 788615 3161 chr3 168723426 168724808 168723618 N NA NA NA NA NA NA MYNN 766045 3162 chr3 170441219 170447705 170444544,170442487 Y,Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2;CLDN11 NA CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 140340 3163 chr3 170456728 170460885 170459132 N NA NA CLDN11,SLC7A14,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 127160 3164 chr3 170461630 170465690 170463309 Y CLDN11 NA SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 122355 3165 chr3 170518873 170522191 170520577 N NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 65854 3166 chr3 171240970 171244489 171242290 N NA NA TNIK,SLC2A2,EIF5A2,PLD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLD1 283795 3167 chr3 171538823 171544050 171543015 N NA PLD1 PLD1,TMEM212,FNDC3B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLD1 10539 3168 chr3 171547469 171549040 171548297 N NA PLD1 PLD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PLD1 19185 3169 chr3 171601137 171624861 171618842 N NA NA FNDC3B,PLD1,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 PLD1 72853 3170 chr3 171677001 171680168 171678669 N NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 77250 3171 chr3 171684003 171686340 171685115 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 71078 3172 chr3 172184520 172187451 172185697 N NA NA FNDC3B,NCEH1,TNFSF10,PLD1,ECT2 IMR90 Hi-C 24141950 NCEH1 241557 3173 chr3 172279394 172282142 172280792 N NA NA NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 NCEH1 146866 3174 chr3 177073648 177079436 177076563 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 158600 3175 chr3 177166229 177172578 177167224,177170243 Y,N NA;NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 251181 3176 chr3 177173619 177179956 177176255 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 258571 3177 chr3 177184570 177198715 177196746,177191203,177187322 N,N,N NA;NA;NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 269522 3178 chr3 180588521 180591951 180590029 N NA FXR1 NA NA NA NA FXR1 38283 3179 chr3 181499378 181501419 181500380 N NA NA NA NA NA NA DNAJC19 791816 3180 chr3 181668801 181671258 181670236 N NA NA NA NA NA NA ATP11B 840033 3181 chr3 182081740 182083415 182082501 N NA NA NA NA NA NA ATP11B 427876 3182 chr3 182399022 182402010 182400833 N NA NA SOX2-OT IMR90 Hi-C 24141950 ATP11B 109281 3183 chr3 182458211 182459692 182458723 N NA NA ATP11B MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP11B 51599 3184 chr3 184502920 184507699 184504576,184506707 Y,N NA;NA VPS8 VPS8,MAGEF1,CLCN2,EPHB3,EIF4G1,PSMD2,FAM131A,THPO,CHRD,POLR2H IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 22232 3185 chr3 184510433 184512906 184511155 N NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 17025 3186 chr3 184992646 184996639 184995282 N NA NA VPS8,C3orf70,LOC339926,EHHADH,MAP3K13 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM41A 220206 3187 chr3 188654269 188676956 188662753,188665690,188668884 N,N,Y NA;NA;NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPP-AS2 782393 3188 chr3 188849349 188851284 188850375 N NA NA LOC100131635,BCL6 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 977473 3189 chr3 189893093 189894571 189893855 N NA NA LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 IL1RAP 337269 3190 chr3 189899587 189906101 189900989,189903748 N,N NA;NA NA LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 IL1RAP 325739 3191 chr3 189946515 189949786 189948472 N NA NA LEPREL1,CLDN16,CLDN1,TMEM207,IL1RAP IMR90 Hi-C 24141950 IL1RAP 282054 3192 chr3 190061026 190066099 190063221 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 NA LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 IL1RAP 165741 3193 chr3 190207938 190210873 190209721 N NA IL1RAP LEPREL1,TMEM207 IMR90 Hi-C 24141950 IL1RAP 20967 3194 chr3 190786072 190789335 190788275 N NA NA OSTN,GMNC,SNAR-I,CCDC50 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 257539 3195 chr3 191142482 191147377 191143251 N NA NA FGF12 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 95608 3196 chr3 191490782 191495952 191492493 N NA NA NA NA NA NA CCDC50 443908 3197 chr3 193583144 193590203 193587618 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 263728 3198 chr3 193784998 193791019 193788972 N NA NA LOC647323,HES1,LOC100131551 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 62912 3199 chr3 194257399 194259944 194258708 N NA FLJ34208 TMEM44,ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ34208 49530 3200 chr3 194275093 194277423 194277273 N NA NA ATP13A3,TMEM44,FLJ34208,LRRC15,CPN2,GP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ34208 67224 3201 chr3 195183147 195185187 195183816 N NA ACAP2 LSG1,ACAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACAP2 19330 3202 chr3 195347492 195350450 195348115 N NA SDHAP2 MUC4,APOD,MUC20,MIR570,SDHAP2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SDHAP2 34460 3203 chr3 195359030 195361931 195360874 N NA SDHAP2 NA NA NA NA SDHAP2 22979 3204 chr3 195640958 195643272 195641764 N NA TNK2 TNK2,MUC20,MIR570,SDHAP2,MUC4 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNK2 5078 3205 chr3 195720698 195725826 195723735 N NA SDHAP1 NA NA NA NA SDHAP1 3548 3206 chr3 196253704 196257361 196255787 Y NA RNF168,WDR53,FBXO45 UBXN7,MUC20,TFRC,LOC401109,OSTalpha,ZDHHC19,PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19-TCTEX1D2,RNF168,C3orf43,WDR53,CEP19,PAK2,FBXO45 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 23065 3207 chr3 197118690 197124368 197121658 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 93243 3208 chr3 197147610 197150386 197148880 N NA NA BDH1,DLG1,LOC100507086 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 122163 3209 chr3 197180801 197187504 197183571 N NA NA BDH1,DLG1,LOC100507086 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BDH1 112690 3210 chr3 19739011 19745573 19744240,19744228 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RAB5A 242999 3211 chr3 20904074 20908616 20907561 N NA NA NA NA NA NA SGOL1 676350 3212 chr3 22777708 22787529 22779059 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 457255 3213 chr3 23043580 23048295 23047287 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 196489 3214 chr3 23091276 23095275 23093219 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 149509 3215 chr3 23110004 23112838 23111462 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 131946 3216 chr3 23196262 23215788 23204107,23201654,23211641,23213679 N,N,N,N NA;NA;NA;NA UBE2E2 UBE2E1,UBE2E2,RPL15,NKIRAS1,NR1D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E2 28996 3217 chr3 23652697 23672015 23654285 N NA NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 175369 3218 chr3 23708082 23743630 23709607,23727430,23711263 N,Y,N NA;NA;NA NA UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 103754 3219 chr3 23780337 23784164 23782033 Y NR1D2,UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 63220 3220 chr3 24088903 24092776 24089659 N NA NA THRB IMR90 Hi-C 24141950 NR1D2 102152 3221 chr3 24718608 24721467 24720133 N NA NA THRB,LOC644990 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR1D2 731857 3222 chr3 24725513 24727412 24726132 N NA NA THRB,RPL15,NKIRAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR1D2 738762 3223 chr3 24729210 24731921 24730352 N NA NA NA NA NA NA NR1D2 742459 3224 chr3 27519580 27525370 27524910 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 21335 3225 chr3 27544278 27546678 27545175 N NA SLC4A7 SLC4A7,EOMES,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 46033 3226 chr3 27547796 27551375 27549232 N NA SLC4A7 SLC4A7,EOMES,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 49551 3227 chr3 27562512 27566779 27563362,27565650 N,N NA;NA NA NEK10,SLC4A7,AZI2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 64267 3228 chr3 27573208 27579738 27575717,27576705 Y,N NA;NA NA AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 74963 3229 chr3 27592732 27597412 27595171 N NA NA SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 94487 3230 chr3 27625991 27628545 27627548 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 127746 3231 chr3 27673671 27683588 27674789 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 175426 3232 chr3 28097730 28102447 28099508 N NA NA NA NA NA NA CMC1 180677 3233 chr3 29228579 29231339 29229861 N NA NA RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 AZI2 837961 3234 chr3 30323061 30324728 30323821 N NA NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 323266 3235 chr3 30325773 30329051 30327672 Y TGFBR2 NA TGFBR2,RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 318943 3236 chr3 30332529 30336766 30333981 N NA NA RBMS3,TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 311228 3237 chr3 30381637 30390541 30384758,30389295 N,Y NA;TGFBR2 NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 257453 3238 chr3 30537419 30539626 30538356 N NA NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 108368 3239 chr3 30552262 30554961 30553252 N NA NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 93033 3240 chr3 30578976 30583507 30580613 Y TGFBR2 NA TGFBR2,RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 64487 3241 chr3 30584515 30587762 30586439 Y TGFBR2 NA TGFBR2,RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 60232 3242 chr3 31081386 31085924 31083087,31084779 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TGFBR2 433392 3243 chr3 31117937 31120620 31118865 N NA NA NA NA NA NA STT3B 453871 3244 chr3 31133461 31136461 31134956 N NA NA NA NA NA NA STT3B 438030 3245 chr3 34989715 34991690 34990337 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 1149652 3246 chr3 36718083 36722713 36719047,36720889 N,N NA;NA NA NA NA NA NA STAC 295986 3247 chr3 36998708 37000682 37000005 N NA EPM2AIP1,MLH1 EPM2AIP1,MLH1 K562 ChIA-PET 22265404 EPM2AIP1 34113 3248 chr3 3705134 3712765 3706823,3708488 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CRBN 483733 3249 chr3 37224256 37226047 37225001 N NA LRRFIP2 LRRFIP2,MLH1,EPM2AIP1,GOLGA4 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 6405 3250 chr3 39025397 39029409 39026265 N NA NA EXOG,SCN5A,SCN10A IMR90 Hi-C 24141950 WDR48 64098 3251 chr3 3933461 3940902 3936615 N NA NA NA NA NA NA SETMAR 404086 3252 chr3 40939106 40942071 40940998 N NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 298871 3253 chr3 4100328 4103533 4101981 N NA NA NA NA NA NA SETMAR 241455 3254 chr3 41011028 41014925 41013247 N NA NA ULK4,CTNNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTNNB1 226017 3255 chr3 41198417 41202239 41201011 N NA CTNNB1 ULK4,CTNNB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTNNB1 38703 3256 chr3 42053126 42055377 42054771 N NA NA TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 77369 3257 chr3 42061699 42066133 42062388 Y NA NA TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 66613 3258 chr3 42077125 42102790 42078044,42084929 Y,N ULK4;NA TRAK1 TRAK1,ULK4,ZNF621,ZNF620 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 29956 3259 chr3 4282232 4286818 4283696 N NA NA NA NA NA NA SETMAR 58170 3260 chr3 4293172 4297876 4295284 N NA SETMAR NA NA NA NA SETMAR 47112 3261 chr3 43799243 43802244 43800610 N NA NA ANO10,ABHD5 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD5 66868 3262 chr3 44524382 44535684 44534995 N NA ZNF445 ZNF445,C3orf77 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF445 5220 3263 chr3 44545454 44558899 44552194 N NA ZNF445 ZNF445 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF445 26292 3264 chr3 45207793 45211377 45209195 Y LIMD1 NA LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM158 56437 3265 chr3 49493681 49495020 49495011 N NA RHOA,TCTA,NICN1,DAG1 NICN1,RHOA,TCTA,DAG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DAG1 11116 3266 chr3 49496017 49501260 49499487 N NA RHOA,TCTA,NICN1,DAG1 DAG1 MCF7 ChIA-PET 22265404 DAG1 4876 3267 chr3 5049662 5071710 5063597,5055446,5065879,5068147 Y,Y,N,Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40;EDEM1,ARL8B,BHLHE40;NA;EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 28565 3268 chr3 55200582 55205658 55203748 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 316012 3269 chr3 55222024 55227458 55226294,55223670 N,Y NA;WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 294212 3270 chr3 55235347 55238255 55237190 N NA NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 283415 3271 chr3 57250010 57256744 57252176 N NA APPL1 ARHGEF3,IL17RD,APPL1 IMR90 Hi-C 24141950 APPL1 5021 3272 chr3 57734700 57739628 57738309 N NA SLMAP SLMAP,ARF4,FAM116A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLMAP 3546 3273 chr3 57935024 57940552 57938102 N NA NA FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 53575 3274 chr3 57954019 57965463 57955724,57960708,57964055 Y,Y,N FLNB;FLNB;NA FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 28664 3275 chr3 57968165 57974061 57969717 Y PDE12,PXK FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 20066 3276 chr3 59189249 59191357 59190121 N NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 711426 3277 chr3 63036005 63039532 63036973 N NA NA NA NA NA NA THOC7 810065 3278 chr3 63627184 63632856 63631166 N NA NA NA NA NA NA THOC7 216741 3279 chr3 63708626 63713816 63710534 N NA NA NA NA NA NA THOC7 135781 3280 chr3 64033740 64036095 64034888 N NA LOC100507062,PSMD6 PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 24620 3281 chr3 64234295 64253173 64251909 Y NA PRICKLE2 LOC100287879,LOC100652759,PRICKLE2,PSMD6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRICKLE2 23164 3282 chr3 64325867 64330218 64326813,64328805 N,N NA;NA NA PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879 IMR90 Hi-C 24141950 PRICKLE2 114736 3283 chr3 64335040 64341045 64337507 N NA NA PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879,PSMD6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRICKLE2 123909 3284 chr3 65024879 65026689 65025547 N NA NA ADAMTS9-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 PRICKLE2 813748 3285 chr3 66100426 66103311 66101744 N NA NA MAGI1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 MAGI1 75917 3286 chr3 67021708 67023207 67022637 N NA KBTBD8 FAM19A4 IMR90 Hi-C 24141950 KBTBD8 25520 3287 chr3 68707988 68708403 68708249 N NA NA NA NA NA NA C3orf64 354371 3288 chr3 69493669 69495422 69494640 N NA NA NA NA NA NA MITF 293164 3289 chr3 70047054 70052936 70048792 N NA NA NA NA NA NA MITF 258468 3290 chr3 70329454 70332795 70330993 N NA NA NA NA NA NA MITF 540868 3291 chr3 70896967 70900976 70899291 N NA NA NA NA NA NA FOXP1 452935 3292 chr3 70904658 70907984 70906674 N NA NA FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 445927 3293 chr3 72030621 72031784 72031678 N NA NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 397481 3294 chr3 72052883 72056441 72054322 Y RYBP,EIF4E3 NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 419743 3295 chr3 72147185 72151475 72150143 N NA NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 344299 3296 chr3 72327282 72330320 72329049 N NA NA RYBP,SHQ1,LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 165454 3297 chr3 72384999 72390167 72386326 Y NA NA SHQ1,RYBP,GXYLT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 105607 3298 chr3 72392772 72398671 72396027 Y RYBP NA SHQ1,RYBP,GXYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 97103 3299 chr3 72518927 72539797 72532249,72524209,72537141 Y,N,N RYBP;NA;NA RYBP LOC201617,RYBP,SHQ1,PPP4R2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 23153 3300 chr3 72589992 72604719 72599613 N NA NA RYBP,SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 94218 3301 chr3 73159615 73161061 73159994 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R2 113496 3302 chr3 73834892 73837610 73835811 Y NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R2 788773 3303 chr3 75421546 75424433 75422059 N NA NA NA NA NA NA FAM86DP 59833 3304 chr3 75434602 75435826 75435108 N NA FAM86DP NA NA NA NA FAM86DP 48440 3305 chr3 75983275 75984901 75983853 N NA NA NA NA NA NA LOC401074 261843 3306 chr3 76483377 76485879 76484418 N NA NA NA NA NA NA LOC401074 761945 3307 chr3 8017765 8021311 8019467 N NA NA NA NA NA NA RAD18 983848 3308 chr3 80238274 80240880 80239409 Y ROBO1 NA NA NA NA NA GBE1 1570070 3309 chr3 82854292 82855929 82854502 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1043342 3310 chr3 83562498 83564962 83563823 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1751548 3311 chr3 83982801 83985176 83983895 N NA NA NA NA NA NA GBE1 2171851 3312 chr3 84286950 84298909 84296656 N NA NA CADM2 K562 ChIA-PET 22265404 GBE1 2476000 3313 chr3 84968112 84969312 84968194,84968553 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VGLL3 2070945 3314 chr3 86841486 86844885 86843091 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 195372 3315 chr3 87044487 87046561 87045314 N NA VGLL3 VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 4230 3316 chr3 87136015 87146780 87138884 N NA NA NA NA NA NA VGLL3 95758 3317 chr3 87381477 87383982 87382630 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 105064 3318 chr3 87391070 87395011 87391228 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 114657 3319 chr3 88236964 88239984 88238183 N NA ZNF654,C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 37948 3320 chr3 93562048 93564555 93563127 N NA NA NA NA NA NA ARL13B 134428 3321 chr3 9385270 9399026 9398016,9390415 N,N NA;NA THUMPD3,LOC440944,SETD5 RAD18,THUMPD3,SETD5,LOC440944 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THUMPD3 5691 3322 chr3 93943800 93946452 93944639 N NA NA NA NA NA NA DHFRL1 161733 3323 chr3 96146479 96150852 96147642,96149066 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ARL6 1332743 3324 chr3 96204016 96206850 96205574 N NA NA NA NA NA NA ARL6 1276745 3325 chr3 97539541 97570027 97540993 N NA NA GABRR3,CPOX,MINA IMR90 Hi-C 24141950 ARL6 55946 3326 chr3 97614172 97618087 97616026 N NA NA NA NA NA NA MINA 73208 3327 chr3 98639824 98653367 98641683 N NA DCBLD2 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 19291 3328 chr3 98679447 98693038 98681092,98688625 N,N NA;NA NA MIR548G,COL8A1,DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 58914 3329 chr3 98693929 98708491 98695153,98699967,98705074 N,N,N NA;NA;NA NA DCBLD2,MIR548G,COL8A1,ST3GAL6 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 73396 3330 chr3 98826522 98830156 98827578 N NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 205989 3331 chr3 98847138 98849753 98848244 Y DCBLD2 NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 226605 3332 chr3 99224284 99226056 99224991 N NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf26 310622 3333 chr3 9925309 9927770 9926353 Y LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC RPUSD3,JAGN1,IL17RC,CRELD1 IL17RE,IL17RC,JAGN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 JAGN1 4501 3334 chr3 99944542 99947446 99945791 N NA TMEM30C,TBC1D23 C3orf26,MIR548G,FILIP1L,TMEM30C,TBC1D23 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 32240 3335 chr4 100642927 100645453 100644901 N NA NA DAPP1 IMR90 Hi-C 24141950 RG9MTD2 157738 3336 chr4 101657905 101660460 101659736 Y NA NA NA NA NA NA PPP3CA 608168 3337 chr4 101743776 101746348 101744703 N NA NA NA NA NA NA PPP3CA 522280 3338 chr4 10181697 10184438 10183129 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 63124 3339 chr4 102660151 102665728 102660432 N NA NA NA NA NA NA FLJ20021 391217 3340 chr4 103336832 103352909 103351494 N NA NA NFKB1,SLC9B1,BDH2 IMR90 Hi-C 24141950 NFKB1 69577 3341 chr4 103359484 103362013 103360952 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA NA BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKB1 60473 3342 chr4 105980227 105985065 105982497 N NA NA TET2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TET2 82777 3343 chr4 106007502 106011070 106009650 N NA NA PPA2,TET2 IMR90 Hi-C 24141950 TET2 56772 3344 chr4 106012635 106015018 106013913 N NA NA PPA2,TET2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TET2 52824 3345 chr4 108124108 108125959 108125633 N NA NA NA NA NA NA PAPSS1 515460 3346 chr4 111983709 111989172 111985709,111988201 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ELOVL6 863889 3347 chr4 112243721 112246262 112244825 N NA NA NA NA NA NA C4orf32 820291 3348 chr4 112626879 112630292 112629051 N NA NA NA NA NA NA C4orf32 436261 3349 chr4 112694532 112698877 112697403 N NA NA NA NA NA NA C4orf32 367676 3350 chr4 112880422 112883280 112881086 N NA NA NA NA NA NA C4orf32 183273 3351 chr4 113003864 113006814 113005448 N NA NA NA NA NA NA C4orf32 59739 3352 chr4 114705069 114706597 114706103 Y NA CAMK2D ARSJ,ANK2,CAMK2D IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2D 21986 3353 chr4 114935183 114939508 114936914 N NA ARSJ NA NA NA NA ARSJ 34305 3354 chr4 11496644 11502955 11498708 N NA NA HS3ST1,CLNK IMR90 Hi-C 24141950 ZNF518B 1037612 3355 chr4 11505837 11508581 11507232 N NA NA HS3ST1,CLNK IMR90 Hi-C 24141950 ZNF518B 1046805 3356 chr4 115201576 115204392 115202867 Y ARSJ NA ARSJ,ANK2 IMR90 Hi-C 24141950 ARSJ 300698 3357 chr4 11636153 11638648 11637268 N NA NA CLNK IMR90 Hi-C 24141950 ZNF518B 1177121 3358 chr4 11699888 11702144 11700691 N NA NA CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF518B 1240856 3359 chr4 118244704 118276190 118246355,118247087 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SNHG8 923727 3360 chr4 119511409 119564110 119512804 N NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 42464 3361 chr4 119770996 119775567 119771812 N NA SEC24D SYNPO2,SEC24D IMR90 Hi-C 24141950 SEC24D 13670 3362 chr4 120022974 120026461 120023938 N NA NA SYNPO2,USP53,MYOZ2 IMR90 Hi-C 24141950 USP53 107321 3363 chr4 120647323 120657780 120648903,120651471,120655705 N,N,N NA;NA;NA NA PDE5A,MAD2L1 IMR90 Hi-C 24141950 PDE5A 97342 3364 chr4 122514673 122517501 122516620 N NA NA QRFPR IMR90 Hi-C 24141950 ANXA5 100646 3365 chr4 122630136 122634894 122632938 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 11989 3366 chr4 122711556 122714214 122712767 N NA EXOSC9,CCNA2 CCNA2 IMR90 Hi-C 24141950 EXOSC9 8258 3367 chr4 123071755 123076743 123073619 N NA KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 15015 3368 chr4 123706031 123708710 123707440 N NA FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 39153 3369 chr4 123717358 123721004 123719340 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 26859 3370 chr4 124429093 124430409 124430119 N NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA5 584868 3371 chr4 125127833 125129383 125128523 N NA NA SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD50 504504 3372 chr4 12641808 12642380 12642105 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 843609 3373 chr4 126624376 126627042 126625871 N NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD50 990489 3374 chr4 126648355 126652589 126650396 N NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD50 1014468 3375 chr4 127770566 127772660 127771724 N NA NA NA NA NA NA PLK4 1029356 3376 chr4 12852805 12855247 12854489 N NA NA LOC285547 IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 630742 3377 chr4 129160866 129164424 129162955 N NA PGRMC2 LARP1B,PGRMC2,PHF17 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 45560 3378 chr4 129274100 129278864 129275934 N NA NA PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 64116 3379 chr4 129306582 129311332 129308870 N NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 96598 3380 chr4 129441230 129493441 129442582,129450386,129445803,129464160,129474119 N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;NA NA PHF17,LARP1B,PGRMC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 231246 3381 chr4 131464685 131465746 131465472 N NA NA NA NA NA NA SCLT1 1449921 3382 chr4 132896356 132898097 132897343 N NA NA NA NA NA NA PABPC4L 2224806 3383 chr4 133039096 133041143 133040128 N NA NA NA NA NA NA PABPC4L 2081760 3384 chr4 134997747 135002688 135000096 N NA NA NA NA NA NA PABPC4L 120215 3385 chr4 13890131 13896571 13893905,13890529 N,N NA;NA NA CPEB2,LOC441009 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1L 260803 3386 chr4 13906002 13911595 13908278 N NA NA LOC441009,CPEB2,LOC152742 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1L 276674 3387 chr4 140519383 140521004 140520514 N NA SETD7 SETD7 IMR90 Hi-C 24141950 SETD7 41806 3388 chr4 142075872 142077819 142076672 N NA NA RNF150 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF330 64230 3389 chr4 146199650 146202224 146200531 Y NA NA NA NA NA NA OTUD4 98818 3390 chr4 14842595 14845309 14843675 N NA NA NA NA NA NA CPEB2 158989 3391 chr4 14856396 14859394 14858114 Y CPEB2 NA CPEB2,LOC441009 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CPEB2 144904 3392 chr4 150084821 150086985 150085732 N NA NA ARHGAP10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP10 1431368 3393 chr4 150918207 150924152 150919369,150923259 N,N NA;NA NA DCLK2,LRBA IMR90 Hi-C 24141950 LRBA 1012497 3394 chr4 150926804 150930131 150928613 N NA NA DCLK2,LRBA IMR90 Hi-C 24141950 LRBA 1006518 3395 chr4 152727144 152730525 152728275 N NA PET112 FBXW7,PET112 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 44969 3396 chr4 152910076 152912402 152911869 N NA NA FBXW7,FAM160A1,PET112 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 227901 3397 chr4 153178387 153182053 153179804 N NA NA PET112,FAM160A1,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 121611 3398 chr4 154034462 154038340 154036553 N NA TRIM2 KIAA0922,ARFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM2 35930 3399 chr4 154597389 154599075 154598309 Y TLR2 NA TLR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 KIAA0922 209891 3400 chr4 154990712 154996531 154994871 Y NA NA NA NA NA NA PLRG1 475054 3401 chr4 155044707 155047760 155046142 N NA NA NA NA NA NA PLRG1 423825 3402 chr4 156312315 156317147 156313928 N NA MAP9 CTSO,ACCN5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 14193 3403 chr4 156547675 156552535 156550042 N NA NA GUCY1A3,GUCY1B3 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 249553 3404 chr4 156575021 156577683 156576334 N NA NA NA NA NA NA MAP9 276899 3405 chr4 156893135 156897169 156895243 N NA NA PDGFC IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 595013 3406 chr4 157396222 157399104 157397687 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 1098100 3407 chr4 1577500 1582246 1581937 N NA NA RNF212,TMED11P,KIAA1530,FAM53A,SLBP,CTBP1,C4orf42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLBP 131784 3408 chr4 157895469 157900601 157898117 N NA NA GLRB IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 1597347 3409 chr4 157917906 157921953 157920401 N NA NA PDGFC IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 1619784 3410 chr4 157922751 157926107 157925178 N NA NA PDGFC IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 1624629 3411 chr4 157932993 157937638 157935348 N NA NA PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 1634871 3412 chr4 157977779 157981376 157980182 N NA NA PDGFC,CTSO IMR90 Hi-C 24141950 C4orf46 1611826 3413 chr4 15894755 15897321 15895818 Y FGFBP1 NA CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 FAM200B 211403 3414 chr4 15905792 15910203 15907802 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 NA CC2D2A,FGFBP1,BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM200B 222440 3415 chr4 160022827 160025580 160024128 N NA NA C4orf45,FNIP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAPGEF2 163418 3416 chr4 160148909 160159591 160149878 N NA RAPGEF2 FNIP2,C4orf45,RAPGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 29407 3417 chr4 160322243 160325375 160323340 N NA NA RAPGEF2,FNIP2,C4orf45 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 133245 3418 chr4 160329531 160333079 160331275 N NA NA FNIP2,RAPGEF2,PPID IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 140533 3419 chr4 160336956 160341762 160338695,160339951 N,N NA;NA NA FNIP2,RAPGEF2,PPID IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 147958 3420 chr4 166500351 166503477 166501430 N NA NA NA NA NA NA MSMO1 251533 3421 chr4 168629047 168631806 168629374 N NA NA NA NA NA NA DDX60L 769832 3422 chr4 169406722 169410398 169408365 Y DDX60,DDX60L DDX60L,PALLD DDX60,DDX60L,PALLD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX60L 5084 3423 chr4 17027864 17034158 17029379,17032804 N,N NA;NA NA LDB2 IMR90 Hi-C 24141950 QDPR 479699 3424 chr4 17067862 17069679 17068807 N NA NA LDB2 IMR90 Hi-C 24141950 QDPR 444178 3425 chr4 170711546 170714439 170712981 N NA C4orf27 NA NA NA NA C4orf27 32453 3426 chr4 171704537 171710240 171704716 N NA NA NA NA NA NA AADAT 693165 3427 chr4 171899276 171902999 171900749 N NA NA NA NA NA NA AADAT 887904 3428 chr4 174265502 174270050 174267395 N NA HMGB2,SAP30 HMGB2 IMR90 Hi-C 24141950 HMGB2 9907 3429 chr4 17549893 17554311 17551023 N NA QDPR,LAP3 MED28,FAM184B IMR90 Hi-C 24141950 LAP3 24616 3430 chr4 176339231 176342282 176340710 Y NA NA NA NA NA NA SPCS3 898808 3431 chr4 177225833 177229177 177227629,177227565 N,N NA;NA SPCS3 SPCS3,ASB5,WDR17 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SPCS3 11913 3432 chr4 177320743 177332292 177322244,177325712,177330903 N,N,N NA;NA;NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 SPCS3 79653 3433 chr4 177355764 177367335 177358605,177364845 N,N NA;NA NA NEIL3,VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 SPCS3 114674 3434 chr4 177521351 177523981 177522462 N NA NA NA NA NA NA VEGFC 189914 3435 chr4 177758263 177763577 177760809,177762920 N,N NA;NA VEGFC VEGFC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFC 44368 3436 chr4 177802946 177807412 177804482 N NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 VEGFC 89051 3437 chr4 177822539 177826250 177823432 N NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 VEGFC 108644 3438 chr4 178405883 178408364 178406766 N NA AGA NEIL3 IMR90 Hi-C 24141950 AGA 42226 3439 chr4 180146879 180148485 180147355 N NA NA NA NA NA NA AGA 1783222 3440 chr4 181580040 181582535 181580770 N NA NA NA NA NA NA MGC45800 1483133 3441 chr4 181747531 181750037 181748826 N NA NA NA NA NA NA MGC45800 1315631 3442 chr4 181843713 181846197 181844842 Y NA NA NA NA NA NA MGC45800 1219471 3443 chr4 181854126 181856317 181855009 N NA NA NA NA NA NA MGC45800 1209351 3444 chr4 182469533 182472145 182470469 N NA NA NA NA NA NA MGC45800 593523 3445 chr4 182566321 182570365 182568898 N NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 MGC45800 495303 3446 chr4 182686373 182688271 182687848 N NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 MGC45800 377397 3447 chr4 182871631 182875408 182873802 N NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 MGC45800 190260 3448 chr4 182878575 182894167 182878706,182880442,182892835 N,N,N NA;NA;NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 MGC45800 171501 3449 chr4 182935238 182941882 182940404,182937265 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MGC45800 123786 3450 chr4 182946393 183008625 182996517,182984382,183004481,183007604 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 MGC45800 57043 3451 chr4 183013052 183016964 183014580 N NA MGC45800 NA NA NA NA MGC45800 48704 3452 chr4 183127975 183138301 183129232 N NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 MGC45800 62307 3453 chr4 183158630 183234481 183160538,183164796,183167858 N,N,N NA;NA;NA ODZ3 ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ODZ3 10656 3454 chr4 183894918 183899365 183897110 Y NA NA WWC2,FAM92A3 IMR90 Hi-C 24141950 DCTD 56288 3455 chr4 184268572 184274234 184270419 Y NA NA CLDN24,CLDN22,WWC2 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 91555 3456 chr4 185184131 185193520 185187204,185189652 Y,Y IRF2,CASP3;IRF2,CASP3 NA IRF2,ENPP6,LOC728175,CASP3,ACSL1,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 202206 3457 chr4 185456859 185460646 185458778 N NA NA IRF2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2 61133 3458 chr4 187690980 187691872 187691753 N NA FAT1 LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 45993 3459 chr4 187757260 187771014 187761748,187766457 N,N NA;NA NA FAT1,LOC339975 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAT1 112273 3460 chr4 188521959 188526379 188524310 N NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 TRIML2 500029 3461 chr4 189044766 189051917 189048906 Y NA TRIML2 NA NA NA NA TRIML2 18358 3462 chr4 189312388 189315919 189313346 N NA NA TRIML1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC401164 60813 3463 chr4 189324217 189329844 189326259 N NA LOC401164 TRIML1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC401164 46888 3464 chr4 189633921 189638496 189636230 N NA NA LOC401164 IMR90 Hi-C 24141950 LOC401164 257189 3465 chr4 189861855 189868724 189863044 N NA NA LOC339975,LOC401164,ZFP42 IMR90 Hi-C 24141950 LOC401164 485123 3466 chr4 190122021 190126444 190124122 N NA NA LOC401164,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AA4P 267855 3467 chr4 190192696 190197264 190194740 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 197035 3468 chr4 190589568 190614061 190594209,190601417,190610559 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 195269 3469 chr4 190616042 190645739 190642843 N NA NA NA NA NA NA FRG1 216235 3470 chr4 190648657 190659566 190656278 N NA NA NA NA NA NA FRG1 202408 3471 chr4 190966768 190973012 190970997 N NA NA NA NA NA NA FRG1 104794 3472 chr4 19449855 19460536 19457832 N NA NA SLIT2 IMR90 Hi-C 24141950 PACRGL 1241500 3473 chr4 24000538 24002488 24001585 N NA NA NA NA NA NA DHX15 583696 3474 chr4 24051031 24052945 24052185 N NA NA NA NA NA NA DHX15 533239 3475 chr4 24473816 24476708 24475116 N NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 109476 3476 chr4 24643393 24645639 24644781 N NA NA CCDC149 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 57209 3477 chr4 25457932 25459710 25458769 N NA NA NA NA NA NA ANAPC4 79084 3478 chr4 25604061 25606674 25604543 N NA NA NA NA NA NA ANAPC4 225213 3479 chr4 25701176 25702509 25701544 N NA NA NA NA NA NA SEL1L3 162101 3480 chr4 26088966 26091274 26089799 N NA NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 C4orf52 173152 3481 chr4 26197849 26200385 26199208 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 120947 3482 chr4 26220023 26224826 26223307 N NA NA RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 96506 3483 chr4 28288270 28291004 28289736 N NA NA NA NA NA NA STIM2 1425957 3484 chr4 32022890 32043668 32023885 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 4202311 3485 chr4 32717971 32719471 32718670 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 3526508 3486 chr4 3290146 3292215 3290962 N NA NA RGS12 IMR90 Hi-C 24141950 HTT 213738 3487 chr4 33839278 33842272 33841232 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 2403707 3488 chr4 34181702 34184858 34183765 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 2061121 3489 chr4 34328302 34338156 34336656 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 1907823 3490 chr4 34591116 34598300 34597128 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 1647679 3491 chr4 34993428 35041861 35020468,35023084,35020547,35026948 N,Y,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ARAP2 1204118 3492 chr4 37003964 37007690 37004507 N NA NA NA NA NA NA RELL1 680309 3493 chr4 3746264 3749811 3748390 N NA NA LOC100133461,FLJ35424,LRPAP1,ADRA2C IMR90 Hi-C 24141950 FAM86EP 207337 3494 chr4 37812453 37816684 37814531 N NA PGM2 TBC1D1,RELL1 IMR90 Hi-C 24141950 PGM2 11598 3495 chr4 38191791 38194305 38192656 Y NA NA TBC1D1,KLF3,FLJ13197,FAM114A1,TLR6 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D1 299086 3496 chr4 38314451 38317804 38316320 N NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF3 347986 3497 chr4 38318767 38323248 38320626 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342542 3498 chr4 38368979 38371321 38370408 N NA NA FLJ13197,KLF3 IMR90 Hi-C 24141950 KLF3 294469 3499 chr4 38373389 38377991 38376131 N NA NA FLJ13197,KLF3 IMR90 Hi-C 24141950 KLF3 287799 3500 chr4 3904682 3908422 3906083 N NA FAM86EP NA NA NA NA FAM86EP 48726 3501 chr4 40284390 40287150 40285488 N NA NA N4BP2,RHOH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC344967 225571 3502 chr4 40318277 40322263 40319228 N NA NA N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC344967 259458 3503 chr4 40668361 40670000 40668997 N NA NA RBM47 IMR90 Hi-C 24141950 NSUN7 81914 3504 chr4 40673301 40678786 40675107 Y RBM47 NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NSUN7 73128 3505 chr4 4079017 4082999 4080553 N NA NA NA NA NA NA FAM86EP 121869 3506 chr4 41904767 41907694 41906173 N NA TMEM33 NA NA NA NA TMEM33 29443 3507 chr4 44148963 44153579 44152198 N NA NA NA NA NA NA GUF1 526854 3508 chr4 4763468 4771577 4765521 N NA NA LOC100507266,STX18 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507266 219610 3509 chr4 48330994 48335166 48333358 N NA SLAIN2 SLAIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLAIN2 8447 3510 chr4 49093126 49157893 49095808,49114625,49122021,49100773,49105386,49107128,49116578,49112426,49109926,49094049,49129220,49141650,49152858,49126597,49155542,49154256 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 184311 3511 chr4 49161188 49168573 49163495 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 252373 3512 chr4 49176248 49206407 49181096,49201279 N,N NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 267433 3513 chr4 49226434 49244196 49231476 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 317619 3514 chr4 49269189 49310770 49283559,49289421,49277610,49271887,49294259,49300395,49306870 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 360374 3515 chr4 49311607 49317528 49314284 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 402792 3516 chr4 49490848 49511952 49497130 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 582033 3517 chr4 49520919 49547284 49537849,49522356 N,N NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 612104 3518 chr4 49591823 49619163 49599270,49613946 N,N NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 683008 3519 chr4 49621717 49624774 49622990 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 712902 3520 chr4 49628254 49630591 49628727 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 719439 3521 chr4 49633154 49660237 49652029,49658875,49655918,49641194,49646478,49634657,49660107 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA OCIAD2 724339 3522 chr4 53640078 53652078 53644004,53649754 N,N NA;NA ERVMER34-1 NA NA NA NA ERVMER34-1 22271 3523 chr4 54551520 54555891 54554501 Y CHIC2 NA LNX1,CHIC2,FIP1L1,SCFD2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 LNX1 93796 3524 chr4 54567684 54570799 54569035 Y CHIC2 NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 LNX1 109960 3525 chr4 54764555 54776665 54775084,54772295 N,Y NA;NA NA FIP1L1,LNX1,SCFD2,RPL21P44,CHIC2,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 RPL21P44 76784 3526 chr4 54807527 54830286 54809135,54829170 N,N NA;NA RPL21P44 CHIC2,RPL21P44,GSX2,PDGFRA,LNX1,SCFD2,FIP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21P44 23163 3527 chr4 55015921 55036763 55019916,55031726,55033758,55035842 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA LNX1,CHIC2,GSX2,SCFD2,RPL21P44 IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 58501 3528 chr4 55062716 55064305 55063490 N NA PDGFRA CHIC2,GSX2,SCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 30959 3529 chr4 55082263 55084853 55083842 N NA PDGFRA SCFD2,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 10411 3530 chr4 55242675 55247236 55244831 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 147411 3531 chr4 55363499 55367237 55365004 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 268235 3532 chr4 55389828 55393514 55391980 N NA NA NA NA NA NA PDGFRA 294564 3533 chr4 55433213 55435210 55434573 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 337949 3534 chr4 56037772 56055567 56039569,56042278,56043902,56051473,56047979 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA SRD5A3 156821 3535 chr4 56573264 56575927 56574029 N NA NA NA NA NA NA NMU 70799 3536 chr4 56633343 56635736 56634705 N NA NA NA NA NA NA EXOC1 84080 3537 chr4 57622410 57625908 57622761,57624077 N,N NA;NA NA PAICS,HOPX,THEGL IMR90 Hi-C 24141950 REST 148134 3538 chr4 58365500 58369056 58367992,58366137 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IGFBP7 388949 3539 chr4 60417939 60420043 60419269 N NA NA NA NA NA NA IGFBP7 2441388 3540 chr4 60683646 60685614 60684840 N NA NA NA NA NA NA IGFBP7 2707095 3541 chr4 61522809 61525974 61524408 N NA NA NA NA NA NA IGFBP7 3546258 3542 chr4 61694171 61702148 61697049 N NA NA NA NA NA NA IGFBP7 3717620 3543 chr4 61970238 61973252 61970446 N NA NA NA NA NA NA IGFBP7 3993687 3544 chr4 62069525 62070334 62070269 N NA NA NA NA NA NA IGFBP7 4092974 3545 chr4 64289797 64290185 64289962 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 4121071 3546 chr4 67236429 67239117 67237705 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 1172139 3547 chr4 67428002 67433106 67431058 Y NA NA NA NA NA NA CENPC1 978150 3548 chr4 67439216 67442701 67440933 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 968555 3549 chr4 67521271 67524084 67522764 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 887172 3550 chr4 6768987 6770737 6770383 N NA KIAA0232 KIAA0232,TBC1D14,LOC100129931,GRPEL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0232 13722 3551 chr4 68264159 68266794 68266118 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 144462 3552 chr4 68306839 68313307 68311846 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 97949 3553 chr4 69225994 69228863 69227208 N NA YTHDC1 YTHDC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 YTHDC1 10170 3554 chr4 69232173 69237536 69234541 N NA YTHDC1 YTHDC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 YTHDC1 16349 3555 chr4 71995157 71998378 71996930 N NA NA DCK,SLC4A4 IMR90 Hi-C 24141950 DCK 135892 3556 chr4 72009675 72012994 72009849 N NA NA NA NA NA NA DCK 150410 3557 chr4 72467358 72470818 72468374 N NA NA NA NA NA NA NPFFR2 426703 3558 chr4 72871841 72873332 72872518 N NA NPFFR2 NA NA NA NA NPFFR2 24189 3559 chr4 73632727 73635033 73633808 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS3 198211 3560 chr4 73711293 73714784 73712313 N NA NA NA NA NA NA COX18 220688 3561 chr4 73722991 73725531 73724197 N NA NA NA NA NA NA COX18 209941 3562 chr4 73760938 73764266 73762378 Y NA NA NA NA NA NA COX18 171206 3563 chr4 74569521 74571892 74570424 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 NA MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD17 445019 3564 chr4 74587308 74589998 74588023 N NA NA CXCL3,IL8,CXCL1,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 433831 3565 chr4 74590795 74593900 74591904 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 NA IL8,CXCL1,CXCL3,CXCL2,RASSF6,PF4V1,CXCL5,MTHFD2L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTHFD2L 429929 3566 chr4 74973654 74977766 74975441 Y CXCL1,AREG MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 46063 3567 chr4 75283219 75284958 75284010 N NA NA NA NA NA NA MTHFD2L 259390 3568 chr4 75404001 75407719 75405285 N NA NA EREG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTHFD2L 380172 3569 chr4 75410450 75412661 75411444 N NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MTHFD2L 386621 3570 chr4 75548031 75551923 75550244 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTHFD2L 524202 3571 chr4 75583333 75586904 75585136 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTHFD2L 559504 3572 chr4 76377828 76382736 76381172 N NA NA NA NA NA NA RCHY1 56904 3573 chr4 76606220 76618332 76617365 N NA G3BP2,USO1 USO1,G3BP2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 G3BP2 7553 3574 chr4 76629580 76632891 76631582 N NA G3BP2,USO1 G3BP2,USO1 IMR90 Hi-C 24141950 USO1 16938 3575 chr4 77751295 77755615 77752748 N NA NA SHROOM3,SOWAHB,SEPT11 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT11 115280 3576 chr4 78922694 78925171 78923959 N NA NA NA NA NA NA MRPL1 138889 3577 chr4 80273355 80274852 80274075 N NA NA NA NA NA NA PAQR3 412773 3578 chr4 81046498 81051080 81048865 N NA NA PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR2 52021 3579 chr4 81157679 81163583 81159438,81162341 N,N NA;NA FGF5 FGF5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF5 24159 3580 chr4 82135965 82138207 82136634 N NA NA NA NA NA NA FGF5 948223 3581 chr4 82551521 82554378 82553983 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 740771 3582 chr4 84277311 84285527 84279177 N NA NA NA NA NA NA COQ2 71244 3583 chr4 84703250 84704825 84703855 N NA NA NKX6-1 IMR90 Hi-C 24141950 AGPAT9 246183 3584 chr4 84771222 84778561 84772542,84776419 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA AGPAT9 314155 3585 chr4 84786187 84789413 84788192 N NA NA NA NA NA NA AGPAT9 329120 3586 chr4 84810088 84813287 84811849 N NA NA NA NA NA NA AGPAT9 353021 3587 chr4 84872184 84879859 84873334 N NA NA NA NA NA NA AGPAT9 415117 3588 chr4 84975935 84978542 84977968 N NA NA NA NA NA NA AGPAT9 518868 3589 chr4 85035229 85039755 85036864 N NA NA NA NA NA NA AGPAT9 578162 3590 chr4 85046507 85053873 85047802 N NA NA NA NA NA NA AGPAT9 589440 3591 chr4 85285802 85303630 85301440 N NA NA NA NA NA NA WDFY3 583914 3592 chr4 88156057 88158220 88157400 N NA KLHL8 LOC100506746,KLHL8,AFF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHL8 14383 3593 chr4 88327620 88330758 88329429 N NA HSD17B11,NUDT9 NUDT9 IMR90 Hi-C 24141950 NUDT9 12970 3594 chr4 89098683 89100831 89099651 Y HERC6,HERC5 NA PKD2 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1K 105057 3595 chr4 90389313 90392926 90391438 Y NA NA NA NA NA NA TIGD2 355345 3596 chr4 90601675 90617293 90602589 N NA NA NA NA NA NA TIGD2 567707 3597 chr4 9148457 9161937 9150784,9155485,9153569 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA METTL19 705925 3598 chr4 9171385 9173264 9172474 N NA NA NA NA NA NA METTL19 728853 3599 chr4 92746025 92750110 92748403 N NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2378649 3600 chr4 93005926 93013164 93011865 N NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2115595 3601 chr4 94969008 94976869 94974710 N NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 151890 3602 chr4 9521246 9523444 9522312 N NA NA NA NA NA NA WDR1 595129 3603 chr4 99884109 99887659 99885293 N NA METAP1 NA NA NA NA METAP1 29129 3604 chr5 10011017 10013950 10011465 N NA NA LOC285692 IMR90 Hi-C 24141950 FAM173B 236064 3605 chr5 10015477 10018178 10016777 N NA NA LOC285692,SEMA5A,LOC100505806,TAS2R1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM173B 231836 3606 chr5 102087986 102098787 102091741,102094460,102088615 Y,N,N NA;NA;NA NA PAM,PPIP5K2 IMR90 Hi-C 24141950 PAM 102740 3607 chr5 102717675 102720704 102717834 N NA NA NA NA NA NA C5orf30 123233 3608 chr5 103404678 103406133 103404828 N NA NA NA NA NA NA NUDT12 506188 3609 chr5 103787304 103791262 103788061 N NA NA NA NA NA NA NUDT12 888814 3610 chr5 104726928 104729966 104728708 N NA NA NA NA NA NA NUDT12 1828438 3611 chr5 10527414 10531530 10528449 N NA ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 32905 3612 chr5 10549887 10558516 10552302,10549908,10556158 N,N,N NA;NA;NA ANKRD33B MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD33B 5919 3613 chr5 10559746 10561812 10560855 N NA ANKRD33B ANKRD33B,ROPN1L,MARCH6 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33B 2623 3614 chr5 105731934 105734476 105733598 Y NA NA EFNA5 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA5 1272120 3615 chr5 107059820 107063557 107060688 N NA NA FBXL17 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA5 53224 3616 chr5 107141810 107144118 107142626 N NA NA FBXL17 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA5 135214 3617 chr5 10874799 10878008 10875683 N NA NA DAP IMR90 Hi-C 24141950 DAP 113412 3618 chr5 108790531 108792683 108791606,108791507 N,N NA;NA PJA2 PJA2 IMR90 Hi-C 24141950 PJA2 44856 3619 chr5 109459798 109462317 109460245 N NA NA NA NA NA NA LOC100289673 240915 3620 chr5 112304170 112307659 112305131 N NA REEP5,DCP2 APC,SRP19,REEP5,YTHDC2,MCC,DCP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DCP2 4748 3621 chr5 113511948 113514805 113512838 N NA NA NA NA NA NA YTHDC2 662557 3622 chr5 1139178 1142070 1140070 Y NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,SLC12A7,TRIP13,ZDHHC11,LOC728613,SLC6A18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 27006 3623 chr5 113992899 113995882 113994246 N NA NA NA NA NA NA PGGT1B 602687 3624 chr5 114431067 114433468 114432286 N NA NA NA NA NA NA PGGT1B 165101 3625 chr5 114795625 114799865 114797018 N NA NA NA NA NA NA FEM1C 80726 3626 chr5 1160169 1162315 1161665 N NA SLC12A7 TRIP13,SLC6A3,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A7 47997 3627 chr5 119112237 119115840 119112401 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 324099 3628 chr5 119739710 119744106 119741766 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 951572 3629 chr5 119791873 119794927 119793798 N NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B4 1003735 3630 chr5 121029287 121031877 121030784 N NA NA NA NA NA NA SRFBP1 265779 3631 chr5 12244116 12247338 12245729 N NA NA NA NA NA NA TAG 327631 3632 chr5 123035574 123037985 123036583 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G3 187781 3633 chr5 123251106 123253775 123252433 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G3 403313 3634 chr5 123862525 123865044 123864165 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 215761 3635 chr5 124378711 124381027 124379729 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 297906 3636 chr5 124742864 124749688 124744601,124747777 N,N NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 662059 3637 chr5 124818701 124822784 124821005,124822620 N,N NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 737896 3638 chr5 125688580 125692824 125690236 N NA NA GRAMD3,ALDH7A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALDH7A1 238258 3639 chr5 126562957 126569228 126565446 N NA NA MEGF10,LMNB1,C5orf63 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf63 153773 3640 chr5 127033313 127035983 127034049 N NA NA NA NA NA NA PRRC1 180004 3641 chr5 127259081 127271891 127267941,127270924 N,N NA;NA NA SLC12A2,FLJ33630 MCF7 ChIA-PET 22265404 FLJ33630 146875 3642 chr5 127914059 127916412 127915499 N NA FBN2 FBN2 IMR90 Hi-C 24141950 FBN2 40324 3643 chr5 129624190 129626494 129625338 N NA NA NA NA NA NA CHSY3 383667 3644 chr5 131148938 131150587 131149134 N NA FNIP1 FNIP1,ACSL6 IMR90 Hi-C 24141950 FNIP1 16182 3645 chr5 131153653 131156656 131155533 N NA FNIP1 FNIP1,ACSL6 IMR90 Hi-C 24141950 FNIP1 20897 3646 chr5 131436247 131440943 131438618 N NA NA PDLIM4,IL3,CSF2,P4HA2 IMR90 Hi-C 24141950 P4HA2 122613 3647 chr5 131840876 131847053 131843440,131846333 N,N NA;NA IRF1,RAD50 IRF1,SLC22A5,C5orf56,IL4,KIF3A IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 14411 3648 chr5 132116233 132120021 132118045 N NA KIF3A,SEPT8,SHROOM1 SEPT8,RAD50,IL4,SHROOM1,LOC553103,SLC22A4,IL5,CCNI2,SOWAHA,AFF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SEPT8 3166 3649 chr5 133801056 133804857 133802091 N NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 53458 3650 chr5 133837827 133841189 133839908,133839260 N,N NA;NA PHF15 PHF15,UBE2B,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF15 20609 3651 chr5 134792485 134794624 134793207 N NA NA H2AFY K562 ChIA-PET 22265404 PITX1 422521 3652 chr5 134823863 134825686 134824590 N NA NA NA NA NA NA PITX1 453899 3653 chr5 135327423 135331130 135329608 N NA NA TGFBI,VTRNA2-1,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD5 137406 3654 chr5 135333752 135336968 135335261 Y NA NA TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD5 131568 3655 chr5 135340739 135344999 135342307 N NA NA TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD5 123537 3656 chr5 135345699 135358319 135347207,135346481,135349967,135352729,135356220,135352820,135356286 Y,N,N,Y,Y,N,Y NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD5 110217 3657 chr5 13589120 13590962 13589796 N NA NA NA NA NA NA TRIO 552867 3658 chr5 136144949 136146913 136146312 N NA NA SPOCK1 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD5 676413 3659 chr5 136150268 136156284 136150847 N NA NA SPOCK1 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD5 681732 3660 chr5 138076897 138080248 138077810 N NA CTNNA1 CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNA1 8859 3661 chr5 138895948 138900323 138897685 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,MZB1,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM173 33605 3662 chr5 139086485 139109857 139089519,139104640,139104703 N,Y,Y NA;NA;NA NA CXXC5,UBE2D2,DNAJC18 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CXXC5 58184 3663 chr5 139123578 139135939 139125077,139127245,139128035,139132856 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA DNAJC18,UBE2D2,CXXC5,NRG2,CYSTM1 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 95277 3664 chr5 139535576 139539596 139536597 N NA PURA,CYSTM1 CYSTM1,NRG2,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 CYSTM1 15057 3665 chr5 13985452 13990768 13986103 N NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 153061 3666 chr5 14012078 14016259 14015484 N NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 127570 3667 chr5 14018489 14041247 14020939,14033939,14029509,14034653,14039653,14035426 N,N,N,Y,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 102582 3668 chr5 141071868 141074113 141072643 N NA FCHSD1,ARAP3 ARAP3,RNF14,KIAA0141,PCDH1,LOC729080,PCDH12,GNPDA1,NDFIP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARAP3 10068 3669 chr5 14107502 14112381 14110948 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 31448 3670 chr5 141156411 141158610 141158293 N NA NA LOC729080,KIAA0141,PCDH12,RNF14,PCDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ARAP3 94611 3671 chr5 141402923 141405587 141404653 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 10303 3672 chr5 141630114 141632938 141630783 N NA NA FGF1,NDFIP1,SPRY4,GNPDA1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 141790 3673 chr5 141739382 141747233 141740514,141742607 N,N NA;NA NA NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1,RNF14,ARHGAP26 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDFIP1 251058 3674 chr5 141849473 141854322 141852159 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 361149 3675 chr5 142886761 142888050 142887368 N NA NA HMHB1,ARHGAP26,NR3C1,YIPF5,KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 662228 3676 chr5 142914863 142916956 142916174 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 633322 3677 chr5 142933017 142935123 142933992 Y NR3C1,NR3C1 NA ARHGAP26,NR3C1,HMHB1,KCTD16,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 615155 3678 chr5 143002932 143006217 143004837 N NA NA ARHGAP26,NR3C1,HMHB1,YIPF5,KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 544061 3679 chr5 143008271 143011343 143009754 N NA NA ARHGAP26,NR3C1,HMHB1,KCTD16,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 538935 3680 chr5 143265515 143269433 143267521 N NA NA ARHGAP26,NR3C1,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 280845 3681 chr5 143299250 143304777 143300991,143303693 N,N NA;NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 245501 3682 chr5 143357352 143360125 143358930 N NA NA ARHGAP26,NR3C1,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 190153 3683 chr5 144088836 144094858 144092781 N NA NA NA NA NA NA YIPF5 538558 3684 chr5 144932530 144935279 144933983 N NA NA KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 279620 3685 chr5 144950838 144968268 144967769 N NA NA KCTD16,SH3RF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 246631 3686 chr5 145303640 145308523 145305145 N NA SH3RF2 KCTD16,SH3RF2,GRXCR2 IMR90 Hi-C 24141950 SH3RF2 7603 3687 chr5 14651660 14653567 14653127 N NA FAM105B FAM105A,TRIO IMR90 Hi-C 24141950 FAM105B 11216 3688 chr5 146913741 146916337 146915310 Y DPYSL3 DPYSL3 DPYSL3 IMR90 Hi-C 24141950 DPYSL3 24122 3689 chr5 148289175 148295887 148293195,148290583 N,Y NA;NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 AFAP1L1 355514 3690 chr5 148513040 148515369 148514634 N NA NA AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3,ADRB2 IMR90 Hi-C 24141950 AFAP1L1 136032 3691 chr5 148939986 148945527 148942256,148944455 N,N NA;NA CSNK1A1 AFAP1L1,GRPEL2,MIR143HG,IL17B,PCYOX1L,CSNK1A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSNK1A1 8979 3692 chr5 14925039 14928595 14926486 N NA NA FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 53152 3693 chr5 149538499 149541670 149539280 N NA NA NA NA NA NA ARSI 140855 3694 chr5 149692889 149698932 149694289,149696865 N,Y NA;SYNPO,PDGFRB ARSI,TCOF1 CSF1R,PDGFRB,CAMK2A,CD74,SLC6A7,ARSI,CDX1,TCOF1,HMGXB3,PPARGC1B,RPS14,NDST1,TIGD6 IMR90 Hi-C 24141950 ARSI 10364 3695 chr5 149836582 149856177 149838598,149849441,149853209 Y,Y,N SYNPO,ZNF300,SLC6A7;NA;NA RPS14,NDST1 NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14,RBM22,DCTN4,CAMK2A,ARSI,TCOF1,CD74,C5orf62 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 7263 3696 chr5 15007821 15010029 15008949 Y ANKH NA FAM105B,ANKH,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 135934 3697 chr5 15019658 15022979 15021303 N NA NA ANKH,LOC100130744,FAM105B IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 147771 3698 chr5 151074897 151080430 151078869,151076217 Y,N ATOX1,SPARC;NA SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 8282 3699 chr5 152513723 152516218 152515043 N NA NA NA NA NA NA FAM114A2 902279 3700 chr5 154060829 154065165 154062642 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27297 3701 chr5 157129535 157135756 157134773 N NA THG1L,LSM11 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19 IMR90 Hi-C 24141950 THG1L 22567 3702 chr5 157144414 157148117 157147300 N NA THG1L,LSM11 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19 IMR90 Hi-C 24141950 THG1L 10206 3703 chr5 157374712 157377718 157375964 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 88529 3704 chr5 157811037 157813703 157812185 N NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 524854 3705 chr5 158666027 158669397 158667545 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145,UBLCP1 UBLCP1,ADRA1B IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 20692 3706 chr5 159328661 159335955 159329920,159332785,159334928 N,N,N NA;NA;NA NA LOC285626,IL12B,LOC285627,ADRA1B,TTC1,RNF145 IMR90 Hi-C 24141950 TTC1 100225 3707 chr5 159337998 159340857 159339596 N NA NA LOC285626,IL12B,ADRA1B,RNF145 IMR90 Hi-C 24141950 TTC1 95323 3708 chr5 159590893 159594470 159592893 Y NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2,C5orf54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 44441 3709 chr5 160368180 160374259 160368693 N NA NA NA NA NA NA PTTG1 519315 3710 chr5 166333740 166336025 166334573 N NA NA NA NA NA NA WWC1 1383040 3711 chr5 166635115 166638254 166636117 N NA NA NA NA NA NA WWC1 1080811 3712 chr5 168775633 168779535 168778017 N NA NA SLIT3,FAM196B,DOCK2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC99 231103 3713 chr5 168780781 168783478 168782064 N NA NA FAM196B,DOCK2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC99 227160 3714 chr5 169056011 169060206 169057084 N NA CCDC99 DOCK2,FAM196B,CCDC99 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC99 45373 3715 chr5 16957189 16960388 16957993 N NA MYO10 MYO10,LOC285696 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 20804 3716 chr5 169577296 169578556 169577832 N NA NA KCNIP1,KCNMB1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC257358 179879 3717 chr5 169585697 169587445 169586286 N NA NA SLIT3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC257358 170990 3718 chr5 169729587 169741038 169735544,169739374 N,N NA;NA LOC257358 LCP2,KCNIP1,C5orf58 IMR90 Hi-C 24141950 LOC257358 17397 3719 chr5 16992044 16997061 16993056,16995718 N,N NA;NA NA MYO10,LOC285696 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 55659 3720 chr5 16998333 17002681 17000910 N NA NA MYO10,LOC285696 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 61948 3721 chr5 17011867 17013910 17012555 N NA NA MYO10,LOC285696 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO10 75482 3722 chr5 17055796 17058930 17056535 N NA NA LOC285696,MYO10 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 119411 3723 chr5 170920429 170925157 170922126 N NA NA FBXW11,NPM1,MIR3912 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FGF18 73762 3724 chr5 170946277 170950644 170948195 N NA NA FBXW11,FGF18,STK10 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 99610 3725 chr5 170987922 170991043 170989907 N NA NA FGF18,FBXW11 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 141255 3726 chr5 171021833 171024927 171023361 N NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 175166 3727 chr5 171093644 171110483 171095024 Y NA NA FBXW11,FGF18,STK10 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 246977 3728 chr5 172158690 172162170 172160819 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,NKX2-5,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 36033 3729 chr5 172202707 172207447 172205753 N NA DUSP1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP1 4504 3730 chr5 172208361 172212867 172209796 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 10158 3731 chr5 172218581 172223763 172222570 Y NA DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 20378 3732 chr5 172226035 172228462 172227867 N NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 27832 3733 chr5 172232062 172236685 172234411 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24538 3734 chr5 172880296 172886648 172881913,172883859,172883949 N,Y,Y NA;CPEB4;CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 157018 3735 chr5 173189723 173194668 173191560,173193656 N,N NA;NA NA CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 120663 3736 chr5 173208376 173210055 173209254 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 105276 3737 chr5 173307162 173311214 173309519 N NA CPEB4 BOD1,CPEB4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 4117 3738 chr5 173658187 173664100 173659118,173662046 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CPEB4 342856 3739 chr5 173754474 173757622 173755138 N NA NA BOD1,FLJ16171,MIR4634,HMP19 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 393953 3740 chr5 173763480 173773813 173765501 N NA NA HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 377762 3741 chr5 173781406 173797326 173782467 N NA NA FLJ16171,MIR4634,DRD1,MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 354249 3742 chr5 173837898 173846058 173840756 N NA NA MIR4634,FLJ16171,DRD1,MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 305517 3743 chr5 173929847 173940062 173931145,173931974 N,N NA;NA NA MSX2,MIR4634,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 211513 3744 chr5 173958656 173963082 173959689 N NA NA MSX2,MIR4634,FLJ16171 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSX2 188493 3745 chr5 174035385 174037953 174036109 N NA NA MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 113622 3746 chr5 174251434 174254434 174252867 N NA NA NA NA NA NA MSX2 99859 3747 chr5 174648713 174675889 174673268,174667560,174673671 N,N,N NA;NA;NA NA DRD1,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 229625 3748 chr5 174701681 174717126 174715211 N NA NA FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 188388 3749 chr5 174770262 174774181 174771511 N NA NA FLJ16171,DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 131333 3750 chr5 174804434 174806920 174805475 N NA NA FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 98594 3751 chr5 174998751 175002096 175000203 N NA NA FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 93237 3752 chr5 175005301 175011481 175006578 N NA NA FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 99787 3753 chr5 175015365 175021059 175017723 N NA NA CPLX2 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 109851 3754 chr5 175428136 175431239 175429423 N NA THOC3 NA NA NA NA THOC3 32591 3755 chr5 175462248 175477399 175463501 N NA NA NA NA NA NA THOC3 66703 3756 chr5 175854147 175856763 175855256 N NA NOP16,CLTB,FAF2 FAF2,CDHR2,RNF44,GPRIN1,SNCB,EIF4E1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLTB 10577 3757 chr5 176209559 176216245 176211785 N NA NA HK3,UIMC1,UNC5A IMR90 Hi-C 24141950 HK3 110088 3758 chr5 177233802 177238022 177234619 N NA NA NA NA NA NA LOC728554 64240 3759 chr5 17743250 17744701 17744247 N NA NA NA NA NA NA MYO10 806865 3760 chr5 178100248 178102189 178101355 N NA CLK4 NA NA NA NA CLK4 46194 3761 chr5 178211156 178215559 178214194 N NA NA ZNF354A MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF354A 53453 3762 chr5 178925330 178927544 178926479 N NA NA ADAMTS2,COL23A1,ZNF879,ZFP2,ZNF454,ZNF354C,AGXT2L2,HNRNPAB,AACSP1,CLK4 IMR90 Hi-C 24141950 RUFY1 50018 3763 chr5 178968449 178971799 178969629 N NA RUFY1 RUFY1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RUFY1 5763 3764 chr5 179340129 179342359 179341521 N NA TBC1D9B TBC1D9B,RNF130 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TBC1D9B 5273 3765 chr5 179850231 179854446 179850915 N NA NA NA NA NA NA CNOT6 66971 3766 chr5 180523530 180525386 180524316 N NA NA NA NA NA NA TRIM41 124877 3767 chr5 180528049 180529995 180529066 N NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 120268 3768 chr5 180541034 180546065 180542312 N NA NA BTNL8,MGAT1,OR2Y1,ZFP62,OR2V2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 104198 3769 chr5 180559487 180562046 180560758 N NA NA NA NA NA NA TRIM41 88217 3770 chr5 18727092 18748050 18746007 N NA NA NA NA NA NA MYO10 1790707 3771 chr5 18790521 18795186 18792494 N NA NA NA NA NA NA MYO10 1854136 3772 chr5 21181478 21183300 21182693 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 276289 3773 chr5 21443341 21444909 21443491 N NA GUSBP1 NA NA NA NA GUSBP1 14680 3774 chr5 23012313 23015398 23013956 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1552724 3775 chr5 23314014 23316639 23315197 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1854425 3776 chr5 23630251 23633070 23631935 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 2170662 3777 chr5 24160087 24165359 24162686 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 2700498 3778 chr5 25107200 25111521 25108027 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 2360878 3779 chr5 25343542 25350125 25345234 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 2122274 3780 chr5 25488474 25496445 25490394 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1975954 3781 chr5 2653051 2659726 2656475,2658748 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NDUFS6 851555 3782 chr5 27149308 27151544 27150045 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 320855 3783 chr5 27240926 27243281 27242045 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 229118 3784 chr5 27314317 27317391 27316353 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 155008 3785 chr5 27327268 27329869 27328780 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 142530 3786 chr5 28076820 28096801 28078108 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 604421 3787 chr5 28745763 28749293 28748512 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1273364 3788 chr5 28804789 28832935 28810074 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1332390 3789 chr5 29077053 29100486 29077711,29079994 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC643401 1604654 3790 chr5 30504065 30506230 30505519 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 1026052 3791 chr5 30571466 30574050 30573254 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 958232 3792 chr5 30606480 30610625 30609909 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 921657 3793 chr5 32199606 32202381 32200747 N NA GOLPH3 MTMR12 IMR90 Hi-C 24141950 GOLPH3 25181 3794 chr5 32521379 32525284 32523159 N NA NA ZFR IMR90 Hi-C 24141950 SUB1 60321 3795 chr5 3309599 3315741 3311326 N NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1508103 3796 chr5 3324388 3325975 3325029 N NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1522892 3797 chr5 33271445 33273106 33272618 N NA NA NPR3 IMR90 Hi-C 24141950 TARS 167792 3798 chr5 33308578 33312997 33310912 N NA NA NPR3,LOC340113,TARS IMR90 Hi-C 24141950 TARS 127901 3799 chr5 34133343 34137383 34135142 N NA C1QTNF3-AMACR NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 8710 3800 chr5 34184645 34189504 34188472 N NA NA C1QTNF3-AMACR,SLC45A2,AMACR,RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 C1QTNF3-AMACR 60012 3801 chr5 34210860 34213201 34211942 N NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 86227 3802 chr5 34570379 34572602 34571016 N NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 83831 3803 chr5 34584959 34589379 34587109 N NA NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 67054 3804 chr5 34607885 34610929 34610024 N NA RAI14 RAI14 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 45504 3805 chr5 35403332 35407621 35405176 N NA NA SPEF2 IMR90 Hi-C 24141950 IL7R 449370 3806 chr5 35477962 35482179 35479399 N NA NA CAPSL,PRLR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL7R 374812 3807 chr5 36441059 36444540 36442937 N NA NA NA NA NA NA SLC1A3 161917 3808 chr5 36488754 36497191 36490681,36495206,36494412 N,N,N NA;NA;NA NA SLC1A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A3 109266 3809 chr5 36500664 36504611 36502826 N NA NA SLC1A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A3 101846 3810 chr5 36572094 36574711 36573625 N NA SLC1A3 SLC1A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A3 31746 3811 chr5 36739200 36741266 36740355 N NA NA LOC646719,NIPBL MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SLC1A3 132743 3812 chr5 37846487 37850144 37848144 N NA NA NA NA NA NA WDR70 467075 3813 chr5 38059937 38061772 38060597 N NA NA NA NA NA NA LIFR 494976 3814 chr5 38103733 38108985 38104498 N NA NA NA NA NA NA LIFR 447763 3815 chr5 38647107 38652464 38649028 N NA NA EGFLAM,LIFR,OSMR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 90359 3816 chr5 38657887 38662570 38660623 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 101139 3817 chr5 39500243 39503882 39502056 N NA NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 74908 3818 chr5 39512319 39514910 39513553 N NA NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 86984 3819 chr5 39515916 39522127 39518471,39520463,39516687 N,N,N NA;NA;NA NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 90581 3820 chr5 39759624 39762791 39760961 Y NA NA PTGER4,PRKAA1,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 334289 3821 chr5 40220003 40231721 40220559,40223476,40230653 N,N,N NA;NA;NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 524351 3822 chr5 40382390 40387715 40385773 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 368357 3823 chr5 40476150 40482972 40478133,40481105 N,N NA;NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 273100 3824 chr5 40488702 40492707 40490633,40491990 Y,N PTGER4,CARD6;NA NA NA NA NA NA TTC33 263365 3825 chr5 40550613 40554247 40552535 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 201825 3826 chr5 41525971 41528488 41527539 N NA NA NA NA NA NA OXCT1 342303 3827 chr5 42892251 42895311 42894269 N NA NA NA NA NA NA LOC648987 123602 3828 chr5 42942490 42946332 42945324 N NA NA LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 LOC648987 72581 3829 chr5 42948740 42958131 42950827 N NA NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 LOC648987 60782 3830 chr5 43103903 43107636 43104495,43105950 N,Y NA;NA LOC100132356,ZNF131 LOC153684,LOC100132356,ZNF131,LOC648987,NIM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF131 14006 3831 chr5 43564511 43578642 43577709 N NA C5orf34,PAIP1,NNT NNT,PAIP1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PAIP1 6990 3832 chr5 4431313 4432519 4431328 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 990288 3833 chr5 44794615 44799859 44799098 N NA MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 9168 3834 chr5 44874414 44878007 44876025 N NA NA NA NA NA NA MRPS30 65387 3835 chr5 4608560 4621875 4615108 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 800932 3836 chr5 4719898 4722184 4721222 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 700623 3837 chr5 49665175 49668073 49666861 N NA NA NA NA NA NA EMB 69161 3838 chr5 49890392 49896997 49891242 N NA NA NA NA NA NA PARP8 64736 3839 chr5 5022908 5030868 5026126 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 391939 3840 chr5 50261782 50264982 50263786 N NA NA NA NA NA NA PARP8 300049 3841 chr5 50520914 50523334 50522338 Y NA NA NA NA NA NA PARP8 559181 3842 chr5 50627020 50631725 50627224 N NA NA NA NA NA NA PARP8 665287 3843 chr5 50946369 50949656 50948135 N NA NA NA NA NA NA PARP8 984636 3844 chr5 50952350 50954423 50953337 N NA NA NA NA NA NA PARP8 990617 3845 chr5 51171 59145 54078 Y PLEKHG4B,C5orf55 NA LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CCDC127 159152 3846 chr5 51969018 51973028 51970438 N NA NA ITGA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA1 111108 3847 chr5 52654903 52659505 52656972 Y FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 116759 3848 chr5 5348759 5353055 5351732,5350461 Y,N NA;NA NA ADAMTS16 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0947 69752 3849 chr5 53971663 53999097 53980473,53998075 N,N NA;NA NA CDC20B,HSPB3,SNX18,GPX8 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 158074 3850 chr5 54039282 54041846 54040385 Y SNX18,SNX18 NA SNX18,GPX8,CDC20B IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 225693 3851 chr5 551353 555003 554141 N NA NA SLC9A3,TPPP,CEP72 IMR90 Hi-C 24141950 CEP72 57402 3852 chr5 55353528 55355730 55354176 N NA NA ANKRD55,MAP3K1,IL6ST IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 62707 3853 chr5 55573143 55580520 55575163,55576008 N,Y NA;NA NA MAP3K1,MIER3,SETD9 IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 282322 3854 chr5 55593364 55595902 55593763 N NA NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 302543 3855 chr5 55613967 55617348 55615126 N NA NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 323146 3856 chr5 55623650 55626892 55624916 N NA NA MAP3K1,IL6ST IMR90 Hi-C 24141950 IL6ST 332829 3857 chr5 55641174 55647884 55643467,55646459 N,Y NA;NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL6ST 350353 3858 chr5 56730084 56732938 56731767 Y NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 260309 3859 chr5 56736127 56740814 56738014 N NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 266352 3860 chr5 56788797 56791683 56790690 Y NA NA ACTBL2,PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 319022 3861 chr5 56987778 56990983 56989168 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 518003 3862 chr5 57110917 57113628 57112120 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 641142 3863 chr5 57129585 57135547 57131246,57133591,57134320 N,Y,N NA;NA;NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 620419 3864 chr5 57136109 57139402 57137717 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 616564 3865 chr5 57183230 57188692 57185475,57184722 N,N NA;NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK2 567274 3866 chr5 57454075 57460011 57455967,57457903 N,N NA;NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 295955 3867 chr5 57478592 57482231 57480897 N NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK2 273735 3868 chr5 57541684 57557502 57555782,57551939 N,N NA;NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK2 198464 3869 chr5 57701968 57704513 57703390 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 51453 3870 chr5 57705590 57707669 57706545 Y NA PLK2 PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 48297 3871 chr5 58185599 58188616 58187440 N NA NA PDE4D IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 429633 3872 chr5 60566649 60575024 60571870 Y ZSWIM6 NA NDUFAF2 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM6 53076 3873 chr5 60579033 60604759 60599250,60602782 N,Y NA;NA ZSWIM6 NDUFAF2,ZSWIM6,C5orf43 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 23341 3874 chr5 61100545 61101964 61101132 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 472445 3875 chr5 61261709 61266810 61263011,61265754 N,N NA;NA NA DEPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIF2A 335179 3876 chr5 61377122 61379777 61378321 N NA NA NA NA NA NA KIF2A 222212 3877 chr5 6158263 6161370 6159878 N NA NA NA NA NA NA FLJ33360 176035 3878 chr5 62008337 62009208 62008844 N NA NA NA NA NA NA IPO11 299764 3879 chr5 6403303 6406129 6403872 N NA MED10 MED10 IMR90 Hi-C 24141950 MED10 24664 3880 chr5 6417664 6420509 6419400 N NA MED10 NA NA NA NA MED10 39025 3881 chr5 6422905 6424440 6424122 N NA MED10 NA NA NA NA MED10 44266 3882 chr5 6426744 6430676 6428074 N NA MED10 MED10 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED10 48105 3883 chr5 65148823 65159832 65158441,65154696 N,N NA;NA NA ERBB2IP,SGTB,NLN,LOC100303749 IMR90 Hi-C 24141950 ERBB2IP 62550 3884 chr5 65160487 65189769 65167480,65170297,65181740 N,N,N NA;NA;NA ERBB2IP NLN,SGTB,ERBB2IP IMR90 Hi-C 24141950 ERBB2IP 32613 3885 chr5 65749564 65751241 65750695 N NA NA MAST4 IMR90 Hi-C 24141950 SREK1 309479 3886 chr5 66498896 66504548 66500204,66502805 N,Y NA;NA NA MAST4,CD180,PIK3R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3R1 1007036 3887 chr5 66529189 66532301 66529983 N NA NA PIK3R1,MAST4,CD180 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3R1 979283 3888 chr5 66532903 66536251 66534179 N NA NA PIK3R1,MAST4,CD180 IMR90,MCF7,CD4 T Hi-C,ChIA-PET,3C 24141950,22265404,22270183 PIK3R1 975333 3889 chr5 66596231 66598818 66597333 Y NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3R1 912766 3890 chr5 6703185 6706814 6705005 N NA PAPD7 SRD5A1,NSUN2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PAPD7 7904 3891 chr5 67180502 67193073 67185498 N NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3R1 318511 3892 chr5 67292872 67295428 67294947 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 216156 3893 chr5 67628375 67631358 67630081 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 116791 3894 chr5 67727177 67731807 67730035,67728721 N,N NA;NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3R1 215593 3895 chr5 67751396 67754353 67752666 Y PIK3R1 NA PIK3R1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PIK3R1 239812 3896 chr5 67843575 67846205 67844249 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 331991 3897 chr5 68025368 68027709 68026700 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA SLC30A5 362067 3898 chr5 68192872 68196907 68194859 N NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC30A5 192869 3899 chr5 68219102 68222203 68220591 N NA NA NA NA NA NA SLC30A5 167573 3900 chr5 68338046 68340649 68339034 N NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 49127 3901 chr5 6844391 6850587 6848575,6846570 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PAPD7 129673 3902 chr5 70567038 70570247 70568257 N NA NA NA NA NA NA BDP1 181195 3903 chr5 70583949 70587637 70585869 N NA NA NA NA NA NA BDP1 163805 3904 chr5 71226534 71230265 71228577,71226726 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAP1B 172853 3905 chr5 71361723 71364995 71363218 N NA MAP1B CARTPT,MRPS27,MAP1B,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP1B 38123 3906 chr5 71682353 71686513 71684311 N NA NA PTCD2,ZNF366,TNPO1,MRPS27 IMR90 Hi-C 24141950 PTCD2 66153 3907 chr5 71696679 71700224 71696914,71698426 N,N NA;NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 PTCD2 80479 3908 chr5 71846721 71849642 71847909 N NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 PTCD2 230521 3909 chr5 71894043 71898120 71895964 N NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNPO1 214298 3910 chr5 72508749 72526030 72510752,72512003 N,Y NA;FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM174,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 218322 3911 chr5 72605810 72609495 72608082 N NA NA FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 134857 3912 chr5 72615970 72619657 72617885 N NA NA FCHO2,TMEM171,BTF3,FOXD1,TMEM174 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 124695 3913 chr5 72664773 72672311 72666971,72670475 N,Y NA;NA NA FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 72041 3914 chr5 7320856 7322962 7322018 N NA NA NA NA NA NA FASTKD3 546188 3915 chr5 73329338 73334188 73331156 N NA NA FAM169A,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 RGNEF 407355 3916 chr5 73358757 73360888 73359532 N NA NA RGNEF,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 RGNEF 436774 3917 chr5 73527385 73530286 73528074 N NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENC1 406963 3918 chr5 73545801 73548215 73547094 N NA NA ENC1,RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 ENC1 389034 3919 chr5 73837227 73840978 73839250 N NA NA CTIF,RGNEF,ENC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 ENC1 96271 3920 chr5 73871716 73873629 73872337 N NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENC1 63620 3921 chr5 74615359 74618649 74616991 Y COL4A3BP,COL4A3BP HMGCR NA NA NA NA HMGCR 14344 3922 chr5 76085260 76088266 76086618 Y F2R F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 26567 3923 chr5 76103291 76108555 76107312 N NA F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 6278 3924 chr5 77174691 77177028 77176022 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 102506 3925 chr5 78495363 78499225 78497930 N NA JMY DMGDH,HOMER1 IMR90 Hi-C 24141950 JMY 32700 3926 chr5 79654353 79656355 79655255 N NA ZFYVE16 CMYA5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFYVE16 47483 3927 chr5 81145272 81150701 81147794,81147174 Y,N NA;NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 98200 3928 chr5 81652010 81656520 81653281 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 77775 3929 chr5 81691776 81694521 81692950 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 117541 3930 chr5 81700210 81703445 81701776 N NA NA VCAN,ATP6AP1L IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 125975 3931 chr5 82247182 82267163 82265270 N NA NA ATP6AP1L IMR90 Hi-C 24141950 TMEM167A 106109 3932 chr5 82268361 82274530 82271654 N NA NA NA NA NA NA TMEM167A 98742 3933 chr5 83213878 83217899 83215006 Y HAPLN1 NA NA NA NA NA HAPLN1 196982 3934 chr5 83973499 83985484 83984517,83980751 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EDIL3 292888 3935 chr5 8515699 8519025 8517109 N NA NA NA NA NA NA LOC100505738 57899 3936 chr5 85566596 85567904 85567770 N NA NA NA NA NA NA COX7C 345880 3937 chr5 86203836 86208059 86206671 N NA NA NA NA NA NA COX7C 290052 3938 chr5 86420875 86426824 86423747 N NA NA NA NA NA NA RASA1 137246 3939 chr5 86446524 86451002 86447446 N NA NA RASA1,MIR4280 IMR90 Hi-C 24141950 RASA1 113068 3940 chr5 88607910 88612529 88609708,88610432 Y,N MEF2C;NA NA NA NA NA NA LOC100505894 1043211 3941 chr5 8906687 8908264 8907564 N NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505738 448887 3942 chr5 89341229 89355678 89352041,89354244 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CETN3 349925 3943 chr5 89385285 89393876 89392786 N NA NA NA NA NA NA CETN3 311727 3944 chr5 90567757 90570507 90569046 N NA NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 105657 3945 chr5 90574127 90580024 90576235 N NA NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 96140 3946 chr5 90595007 90612118 90599301,90599231,90609164 N,N,N NA;NA;NA NA GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 64046 3947 chr5 90626626 90629629 90628276 N NA LOC100129716,ARRDC3 GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 46535 3948 chr5 92485854 92488384 92487632 N NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0825 1465925 3949 chr5 92524246 92527860 92526677,92525710 N,N NA;NA NA NR2F1,FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0825 1426449 3950 chr5 95045577 95049519 95047593 N NA RHOBTB3 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 17331 3951 chr5 95169045 95173749 95170796 Y GLRX,ELL2 GLRX,C5orf27 RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 10468 3952 chr5 95366451 95369357 95367773 N NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 68676 3953 chr5 95402025 95404440 95404100 N NA NA ELL2,CAST,MIR583,C5orf27 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELL2 104250 3954 chr5 95561247 95565002 95562945 Y NA NA ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 263472 3955 chr5 955831 960107 957215,959267 Y,N NA;NA NKD2 NA NA NA NA NKD2 49061 3956 chr5 95589821 95596765 95590855,95595129 N,Y NA;ELL2 NA ELL2,C5orf27,RFESD,GLRX IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 292046 3957 chr5 95614750 95617152 95615871 N NA NA ELL2,C5orf27 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 316975 3958 chr5 95844120 95847195 95845539 N NA NA PCSK1 IMR90 Hi-C 24141950 CAST 150546 3959 chr5 95907743 95909568 95908352 N NA NA PCSK1,CAST,ELL2,C5orf27,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 CAST 88173 3960 chr5 97643126 97647854 97645383 N NA NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RGMB 457145 3961 chr5 97648474 97651616 97650107 Y RGMB NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RGMB 453383 3962 chr5 97746040 97746742 97746663 N NA NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RGMB 358257 3963 chr5 97748742 97752510 97750966 Y RGMB NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RGMB 352489 3964 chr5 9922869 9926111 9924943 N NA NA LOC285692,SEMA5A,LOC100505806 IMR90 Hi-C 24141950 FAM173B 323903 3965 chr5 99382060 99390552 99389211,99383287,99385092 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM174A 480572 3966 chr6 100622901 100625184 100623989 N NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 CCNC 606211 3967 chr6 100675381 100678750 100676972 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 650474 3968 chr6 100742962 100747037 100745129 N NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 582187 3969 chr6 10315832 10317892 10316778 Y TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GCNT2 203676 3970 chr6 10450635 10454137 10452254 N NA NA NA NA NA NA GCNT2 67431 3971 chr6 10479551 10482481 10481608 N NA GCNT2 PAK1IP1,C6orf52,GCNT2,MAK IMR90 Hi-C 24141950 GCNT2 39087 3972 chr6 105880026 105882483 105881276 N NA PREP ATG5,PRDM1,BVES IMR90 Hi-C 24141950 PREP 29027 3973 chr6 106033796 106045579 106035800,106039688,106044073 N,N,N NA;NA;NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 182797 3974 chr6 106047446 106051697 106049047 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 196447 3975 chr6 106055212 106059902 106056895 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 204213 3976 chr6 106439249 106441178 106440478 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 93017 3977 chr6 106603929 106608550 106607328 N NA NA ATG5,LIN28B,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 69734 3978 chr6 106898477 106901584 106899448 N NA NA AIM1,RTN4IP1,QRSL1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 124782 3979 chr6 108452988 108456665 108455263 Y NA NA LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 57047 3980 chr6 109055918 109060442 109057696 N NA NA FOXO3,LINC00222 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXO3 174892 3981 chr6 110813074 110814212 110813580 N NA NA NA NA NA NA CDC40 311450 3982 chr6 110849357 110857568 110856255,110849932 N,N NA;NA NA GTF3C6,AMD1,RPF2,CDK19,SLC16A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMD1 338419 3983 chr6 112619721 112621499 112620310 N NA NA LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 210970 3984 chr6 112650493 112653275 112651549 N NA NA LAMA4,FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 241742 3985 chr6 112786161 112791047 112788071 N NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 377410 3986 chr6 113440158 113445750 113441915 N NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 HDAC2 846609 3987 chr6 113502659 113504878 113504044 N NA NA FLJ34503,MARCKS,HDAC2 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC2 787481 3988 chr6 113671871 113675721 113673925 Y NA NA LAMA4,FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 HDAC2 616638 3989 chr6 113678910 113685555 113682603 N NA NA MARCKS,FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC2 606804 3990 chr6 113950911 113954818 113953144 N NA NA MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC2 337541 3991 chr6 113964944 113968181 113966670 N NA NA MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC2 324178 3992 chr6 113974664 113976642 113975808 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 HDAC2 315717 3993 chr6 114013729 114016755 114015310 Y NA NA MARCKS MCF7 ChIA-PET 22265404 HDAC2 275604 3994 chr6 11426689 11436738 11428816,11433271,11434251 N,N,Y NA;NA;NA NA NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf228 332423 3995 chr6 114309809 114310885 114309998 N NA HDAC2 HDAC2 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC2 17450 3996 chr6 114823060 114824368 114823408 N NA NA NA NA NA NA HDAC2 530701 3997 chr6 11609052 11611053 11609788 Y NA NA TMEM170B,HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 401671 3998 chr6 11613083 11615009 11614219 N NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 397715 3999 chr6 11684950 11687839 11685813 N NA NA HIVEP1,ADTRP,TMEM170B,EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 324885 4000 chr6 117489999 117491717 117490871 N NA NA NA NA NA NA ROS1 255301 4001 chr6 117782136 117792303 117784283,117785093 N,N NA;NA ROS1,DCBLD1 DCBLD1,GOPC,ROS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DCBLD1 11517 4002 chr6 117934543 117953952 117937221,117938827,117938876 Y,N,N NA;NA;NA GOPC,NUS1 ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 GOPC 10838 4003 chr6 117965593 117979466 117978290 N NA GOPC,NUS1 ROS1,NUS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUS1 17151 4004 chr6 11805421 11808315 11807144 N NA NA HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 204409 4005 chr6 11809220 11812494 11810786 N NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 200230 4006 chr6 1190194 1191911 1190814 N NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF2 198158 4007 chr6 122014359 122017594 122016222 N NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 GJA1 257614 4008 chr6 122020319 122023234 122021590 N NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 GJA1 263574 4009 chr6 122101063 122102900 122102159 N NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 GJA1 344318 4010 chr6 12322702 12326486 12324600 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 32173 4011 chr6 12348540 12350686 12349629 N NA NA TMEM170B,HIVEP1,EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 58011 4012 chr6 12490143 12493050 12491920 N NA NA HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 199614 4013 chr6 125444170 125447064 125445592 N NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 27815 4014 chr6 125469800 125472565 125470607 N NA TPD52L1 HDDC2,TPD52L1,NCOA7 IMR90 Hi-C 24141950 TPD52L1 2314 4015 chr6 12571733 12575297 12573575 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 281204 4016 chr6 12591370 12595257 12591634,12593010 N,Y NA;EDN1 NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 300841 4017 chr6 130067389 130071625 130070358 N NA NA ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 PTPRK 1225519 4018 chr6 130921629 130924542 130922842 N NA NA NA NA NA NA EPB41L2 459920 4019 chr6 131112624 131124542 131122674 N NA NA L3MBTL3,SAMD3 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L2 259920 4020 chr6 132380721 132382895 132381895 N NA NA LOC100507254,CTGF,ENPP1 IMR90,K562,HELA,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 CTGF 108203 4021 chr6 132383620 132387712 132385069 N NA NA LOC100507254,CTGF,ENPP1 IMR90,H1ESC,HELA,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 CTGF 111102 4022 chr6 133227525 133230253 133229281 N NA NA EYA4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS12 91817 4023 chr6 133888947 133891087 133890294 N NA NA LINC00326,EYA4,MGC34034,TBPL1,TCF21,HMGA1P7,SLC2A12 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 382221 4024 chr6 133929298 133933201 133931511 N NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 340107 4025 chr6 133943507 133945745 133944520 N NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 327563 4026 chr6 133951027 133955245 133953146 N NA NA MGC34034,TCF21,SLC2A12 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 318063 4027 chr6 133961189 133964282 133962449 N NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 309026 4028 chr6 133964886 133967448 133966573 N NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 305860 4029 chr6 134065585 134069728 134067150 N NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 203580 4030 chr6 134087893 134091826 134090522 N NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 181482 4031 chr6 134379583 134382849 134381629 N NA NA SLC2A12,TBPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TBPL1 106275 4032 chr6 134736493 134745297 134741874,134742953,134738250,134744102 Y,N,N,Y SGK1,SGK1,SGK1;NA;NA;SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 463185 4033 chr6 134870564 134874633 134872190 N NA NA LOC154092,SGK1,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 501403 4034 chr6 137554468 137560156 137555470,137558780 Y,Y MAP3K5,IFNGR1;MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 13901 4035 chr6 137734774 137739059 137737313 N NA NA NA NA NA NA IFNGR1 194207 4036 chr6 138128340 138134854 138130105,138132735 N,Y NA;TNFAIP3 NA TNFAIP3,PERP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53727 4037 chr6 138246359 138250426 138248366 N NA NA IFNGR1,TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 57778 4038 chr6 139723048 139726076 139724274 N NA CITED2 CITED2,TXLNB,LOC645434,LOC100132735 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 27263 4039 chr6 139727196 139732782 139729831 N NA CITED2 CITED2,TXLNB,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 31411 4040 chr6 139836015 139839148 139837360 N NA NA CITED2,LOC100132735 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 140230 4041 chr6 139854127 139856978 139854956 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 158342 4042 chr6 139857634 139863333 139861146 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC100132735 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 161849 4043 chr6 139889429 139892962 139890395 N NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 193644 4044 chr6 139907370 139910885 139909066 N NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 211585 4045 chr6 14000390 14002465 14001698 N NA NA RNF182 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC90A 185598 4046 chr6 140028893 140031145 140030213 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 333108 4047 chr6 140084589 140087983 140086616 N NA NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 388804 4048 chr6 140264816 140266574 140265641 N NA NA CITED2,HECA IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 569031 4049 chr6 140371215 140373336 140372399 N NA NA CITED2,TXLNB,LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 675430 4050 chr6 140381728 140385026 140383394 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 685943 4051 chr6 14074563 14076453 14075552 Y RANBP9,CD83 NA DTNBP1,RNF182 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC90A 259771 4052 chr6 140856543 140860920 140859626 N NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1160758 4053 chr6 140892234 140894459 140893637 N NA NA NA NA NA NA CITED2 1196449 4054 chr6 141192292 141199978 141197349 N NA NA NA NA NA NA VTA1 1268432 4055 chr6 141584329 141588755 141585453,141587766 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VTA1 879655 4056 chr6 141803588 141806605 141804965 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 661805 4057 chr6 141882489 141884873 141883889 N NA NA CITED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 VTA1 583537 4058 chr6 142028639 142051086 142050756 N NA NA NA NA NA NA VTA1 417324 4059 chr6 142187778 142190790 142189953 N NA NA NA NA NA NA VTA1 277620 4060 chr6 142330827 142339172 142331278,142335711 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VTA1 129238 4061 chr6 143717316 143722565 143719056 N NA ADAT2,PEX3 AIG1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAT2 49276 4062 chr6 144535248 144538705 144537489 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 UTRN 74168 4063 chr6 144584449 144588440 144586603 N NA UTRN UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 24433 4064 chr6 145217374 145220566 145218926 N NA NA UTRN,EPM2A IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 604501 4065 chr6 145242538 145249402 145243914,145247863 N,N NA;NA NA EPM2A,UTRN IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 629665 4066 chr6 145275641 145278403 145278194 N NA NA UTRN IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 662768 4067 chr6 145516394 145519501 145517702 N NA NA UTRN IMR90 Hi-C 24141950 FBXO30 616420 4068 chr6 14705350 14708195 14706727 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 538332 4069 chr6 14731753 14736232 14733953 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 510295 4070 chr6 14742575 14745320 14744063 N NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 501207 4071 chr6 148294513 148297310 148295714 N NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 366419 4072 chr6 149548788 149557348 149555336 N NA NA TAB2,UST IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 82088 4073 chr6 15065235 15069900 15067079 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 176627 4074 chr6 150756481 150759408 150757099 N NA NA PLEKHG1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R14C 292293 4075 chr6 150810796 150816906 150813904,150812257 N,N NA;NA NA PLEKHG1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R14C 346608 4076 chr6 151546605 151547141 151547115 N NA AKAP12 MTHFD1L,AKAP12 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP12 13993 4077 chr6 153186079 153198067 153196687 N NA NA FBXO5 K562 ChIA-PET 22265404 FBXO5 106673 4078 chr6 153490069 153493299 153491805 Y NA NA OPRM1,IPCEF1 IMR90 Hi-C 24141950 MTRF1L 166144 4079 chr6 153603307 153607045 153604062 N NA NA NA NA NA NA MTRF1L 279382 4080 chr6 153990213 153990497 153990360 N NA NA NA NA NA NA MTRF1L 666288 4081 chr6 154926398 154928738 154927853 Y SCAF8 NA NA NA NA NA CNKSR3 94645 4082 chr6 154935615 154938260 154936849 N NA NA IPCEF1,OPRM1 IMR90 Hi-C 24141950 CNKSR3 103862 4083 chr6 154974054 154975775 154975143 Y SCAF8 NA OPRM1,IPCEF1,CNKSR3 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 78737 4084 chr6 155041709 155044899 155042734 N NA SCAF8 SCAF8 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 9613 4085 chr6 155812899 155816385 155814913 N NA NA NOX3,TFB1M IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFB1M 177282 4086 chr6 156114780 156121510 156116944,156119835 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TFB1M 479163 4087 chr6 156740652 156743473 156742576 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 355591 4088 chr6 156747607 156749959 156748668 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 349105 4089 chr6 156977861 156980865 156979481 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 118199 4090 chr6 157005738 157011394 157008077 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 87670 4091 chr6 157039652 157044067 157040591 N NA NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 54997 4092 chr6 158183909 158186953 158185712 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 57341 4093 chr6 158193888 158199298 158195276 N NA SNX9 SNX9,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 44996 4094 chr6 158658236 158660381 158658801 N NA NA TULP4,TMEM181,DYNLT1,SYTL3 IMR90 Hi-C 24141950 GTF2H5 68857 4095 chr6 159369441 159370786 159370164 N NA NA EZR,MIR3918,C6orf99 IMR90 Hi-C 24141950 RSPH3 50412 4096 chr6 160014596 160017644 160015991 N NA NA FNDC1,ACAT2,LOC100129518,SOD2 IMR90 Hi-C 24141950 SOD2 96709 4097 chr6 160132561 160145438 160139690 N NA SOD2,WTAP,ACAT2,LOC100129518 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2714 4098 chr6 160320884 160322645 160321524 N NA NA NA NA NA NA IGF2R 67486 4099 chr6 163775365 163777759 163777132 N NA NA DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 57916 4100 chr6 165239625 165241643 165240564 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 833945 4101 chr6 165590308 165592947 165591793 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 482641 4102 chr6 166129552 166132777 166131358 N NA NA PDE10A IMR90 Hi-C 24141950 PDE10A 53964 4103 chr6 166179058 166181963 166180944 N NA NA NA NA NA NA PDE10A 103470 4104 chr6 166445400 166447504 166446486 N NA LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 43873 4105 chr6 167288849 167292849 167292134 N NA NA NA NA NA NA RNASET2 77228 4106 chr6 168407436 168409451 168408397 Y NA NA SMOC2,KIF25 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 179765 4107 chr6 168554958 168559578 168558153,168556261 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA SMOC2 282253 4108 chr6 169561995 169587649 169563413,169572754,169568243,169574385 N,Y,Y,N NA;NA;NA;NA NA C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf120 514608 4109 chr6 169825963 169828877 169827537 N NA NA NA NA NA NA C6orf120 273380 4110 chr6 17011895 17014931 17012793 N NA NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 ATXN1 250174 4111 chr6 170400378 170413290 170403554 N NA NA NA NA NA NA FAM120B 202554 4112 chr6 170746098 170750869 170747655 N NA NA FAM120B,LINC00242,LINC00574 IMR90 Hi-C 24141950 PSMB1 111548 4113 chr6 170767480 170770209 170768834 N NA NA FAM120B,C6orf70,TCTE3,LINC00574,PHF10,PSMB1,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 PSMB1 92208 4114 chr6 17267229 17271494 17268590,17270287 N,N NA;NA RBM24 NUP153,CAP2 IMR90 Hi-C 24141950 RBM24 10315 4115 chr6 17579960 17583881 17580756 N NA NA CAP2,RBM24,NUP153,KIF13A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NUP153 122937 4116 chr6 19718996 19721115 19719964 N NA NA ID4 IMR90 Hi-C 24141950 ID4 116486 4117 chr6 19757951 19759421 19759410 N NA NA ID4 IMR90 Hi-C 24141950 ID4 78180 4118 chr6 19801907 19804401 19803780 N NA ID4 ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID4 33200 4119 chr6 22834051 22837046 22835909 N NA NA LINC00340 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 1240079 4120 chr6 22877960 22883025 22881436 N NA NA CDKAL1,LINC00340,SOX4,LOC729177 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 1283988 4121 chr6 22890653 22894253 22892948 Y NA NA SOX4,LINC00340,LOC729177 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 1296681 4122 chr6 22913410 22916630 22915805 N NA NA SOX4,LINC00340 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 1319438 4123 chr6 24741607 24744859 24743999 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,FAM65B,KIAA0319,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 22204 4124 chr6 25174908 25176662 25175641 N NA NA CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 GMNN 399749 4125 chr6 25192673 25195064 25193832 Y NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 GMNN 417514 4126 chr6 26321094 26324608 26322856 Y NA BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 40790 4127 chr6 26328269 26329418 26329001 N NA BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BH,HIST1H3F,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A3P,BTN3A1,BTN1A1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 35980 4128 chr6 26341117 26343436 26342544 N NA BTN3A2,BTN2A2 HIST1H4F,HIST1H1D,ABT1,HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,BTN2A2,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11,BTN3A3,BTN1A1,HIST1H2BI,HIST1H3G,BTN3A2,BTN2A3P,HIST1H4H,BTN3A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 21962 4129 chr6 26349944 26353520 26351886 N NA BTN3A2,BTN2A2,BTN3A1 HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,BTN2A2,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11,BTN3A3,BTN1A1,BTN2A3P,BTN3A2,HIST1H4D,BTN3A1,HIST1H3F,HIST1H2BH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 11878 4130 chr6 26569076 26569981 26569622 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,HIST1H2AE,HIST1H2BG,ABT1,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4 K562 ChIA-PET 22265404 ABT1 27190 4131 chr6 26571563 26573279 26572197 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,ABT1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H2BK,HIST1H4I K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ABT1 23892 4132 chr6 26577160 26578265 26577647 N NA HMGN4,ABT1 ABT1,HIST1H2BK,HIST1H4I,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HCG11,HMGN4 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ABT1 18906 4133 chr6 27058788 27066104 27060129,27065236 N,N NA;NA HIST1H2BK ZNF322,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 48533 4134 chr6 27143926 27154388 27144808,27146502 N,N NA;NA HIST1H2BK HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173,HIST1H3J IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 29289 4135 chr6 27154980 27157785 27155962 N NA HIST1H2BK HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 40343 4136 chr6 27181190 27181912 27181761 N NA NA OR2B2,PRSS16,ZNF184 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 66553 4137 chr6 27445948 27447778 27446579 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 5051 4138 chr6 27485511 27487920 27485516,27487085 N,N NA;NA ZNF184 LOC100131289,HIST1H2BJ,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2AH,MIR3143,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF184 44614 4139 chr6 27514727 27515583 27515188 N NA NA HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2BL,HIST1H3H,HIST1H2AI,ZNF391,ZNF184 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 73830 4140 chr6 27519909 27521805 27520890 N NA NA HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL,ZNF184,HIST1H2BJ,HIST1H2AG K562 ChIA-PET 22265404 ZNF184 79012 4141 chr6 27524902 27526702 27525274 N NA NA NA NA NA NA ZNF184 84005 4142 chr6 27564548 27565595 27565013 N NA NA LOC100507173 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507173 96219 4143 chr6 27572346 27575886 27573265 N NA NA PRSS16,LOC100507173 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507173 85928 4144 chr6 27621795 27625043 27623722 N NA LOC100507173 ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507173 36771 4145 chr6 27651702 27652645 27652567 N NA LOC100507173 HIST1H3H,HIST1H2BL,LOC100507173,ZNF184 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100507173 9169 4146 chr6 27654793 27657128 27656031 Y NA LOC100507173 LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100507173 4686 4147 chr6 27700187 27708126 27706241 Y NA LOC100507173 NA NA NA NA LOC100507173 38373 4148 chr6 27720082 27721328 27720186 N NA NA HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC100131289,POM121L2,ZNF184,LOC100507173,HIST1H2AM,HIST1H2BO,HIST1H3I,HIST1H4L IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507173 58268 4149 chr6 28004172 28007767 28005764 N NA ZNF165 NA NA NA NA ZNF165 40715 4150 chr6 28413537 28417501 28414783 N NA ZSCAN12,ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 2258 4151 chr6 28601151 28603923 28603177 Y NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3 SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 46039 4152 chr6 28702256 28704536 28703030 N NA NA NA NA NA NA SCAND3 147144 4153 chr6 28705064 28706828 28705622 N NA NA NA NA NA NA SCAND3 149952 4154 chr6 28709884 28712105 28710829 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 154772 4155 chr6 28715010 28716694 28715680 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 159898 4156 chr6 28724811 28727324 28726233 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 164444 4157 chr6 28770152 28771353 28770616 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 120415 4158 chr6 28784081 28785818 28785111 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 105950 4159 chr6 28790610 28792470 28791288 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 99298 4160 chr6 28838228 28843148 28840011 N NA TRIM27 LOC401242 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM27 48620 4161 chr6 28908303 28909931 28909129 N NA TRIM27 TRIM27,LOC401242,ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 16535 4162 chr6 28915208 28918176 28916435 N NA TRIM27 NA NA NA NA TRIM27 23440 4163 chr6 29616373 29619973 29617824 N NA GABBR1 HLA-G,GABBR1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GABBR1 15411 4164 chr6 30483000 30485950 30484213 N NA HLA-E,PRR3,GNL1 HLA-E,PPP1R10,MRPS18B,ABCF1,PRR3,GNL1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 25817 4165 chr6 30715332 30721983 30717236,30720298 N,Y NA;TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1,MDC1,C6orf136,DHX16,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 3005 4166 chr6 30730996 30734603 30732227 N NA MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 IER3 18669 4167 chr6 30735164 30740622 30737267 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 22837 4168 chr6 30747584 30752281 30750414 N NA FLOT1,IER3 CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,DDR1,CDSN,NRM,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 35257 4169 chr6 30780824 30784246 30782710 N NA NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 67615 4170 chr6 30787020 30789376 30787881 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 62485 4171 chr6 31053417 31055779 31055064 N NA PSORS1C1 PPP1R10,MRPS18B K562 ChIA-PET 22265404 PSORS1C1 26829 4172 chr6 32211777 32213620 32212437 N NA NA HLA-DOB,NOTCH4 IMR90 Hi-C 24141950 PBX2 53814 4173 chr6 32576779 32578775 32577762 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA NA TAP2 227772 4174 chr6 32985323 32988702 32986934 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA BRD2 HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2,COL11A2,VPS52 IMR90 Hi-C 24141950 BRD2 48886 4175 chr6 33806458 33809647 33808051 N NA LEMD2 LEMD2,GRM4,MLN,IP6K3,LOC100507584,MIR1275,GGNBP1,LINC00336 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD2 49552 4176 chr6 34710628 34712731 34711904 N NA C6orf106,SNRPC,UHRF1BP1 SCUBE3,C6orf106,UHRF1BP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPC 12140 4177 chr6 35114652 35117630 35116311 N NA NA ANKS1A,TCP11,SNRPC,UHRF1BP1,PPARD,ZNF76 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF76 109880 4178 chr6 3517491 3520084 3518821 N NA NA SLC22A23,PXDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMG4 258329 4179 chr6 36546573 36549001 36547837 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 PXT1,ETV7,SRSF3,STK38,KCTD20,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 13089 4180 chr6 36611682 36613740 36612499 N NA SRSF3,CDKN1A SRSF3,CPNE5,CDKN1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN1A 30497 4181 chr6 36633691 36638291 36635003 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN1A 5946 4182 chr6 37025655 37030268 37027404 N NA NA CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 MTCH1 71706 4183 chr6 37086665 37108618 37095250,37099779,37105654,37102542 N,N,N,Y NA;NA;NA;NA PIM1 PIM1,PPIL1,FGD2,CPNE5,MTCH1,TMEM217,C6orf89,TBC1D22B,CDKN1A,MIR3925 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 29304 4184 chr6 37680653 37682556 37681458 N NA NA FTSJD2,CCDC167,MIR4462,MDGA1,BTBD9,ZFAND3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 104751 4185 chr6 3802856 3806845 3803969 N NA NA SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL,PXDC1,PSMG4,PRPF4B IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 214724 4186 chr6 3824954 3828334 3826356 Y C6orf145 NA SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 193235 4187 chr6 3909165 3912356 3910956 N NA NA SLC22A23,FAM50B,SLIT3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 PRPF4B 109213 4188 chr6 40131112 40134151 40132331 Y NA NA KIF6 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS1 228822 4189 chr6 40917372 40920157 40919047 N NA NA NA NA NA NA UNC5CL 86781 4190 chr6 40923451 40927424 40926230 N NA NA UNC5CL IMR90 Hi-C 24141950 UNC5CL 79514 4191 chr6 40928387 40930978 40930192 N NA NA UNC5CL,TSPO2 IMR90 Hi-C 24141950 UNC5CL 75960 4192 chr6 40963603 40966721 40965394 Y NA UNC5CL UNC5CL,APOBEC2,C6orf130 IMR90 Hi-C 24141950 UNC5CL 40217 4193 chr6 41395986 41400140 41396321,41398865 N,N NA;NA NA FOXP4 IMR90,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 FOXP4 114024 4194 chr6 41430190 41433685 41432451 N NA NA FOXP4,TFEB,MDFI,USP49 IMR90,H1ESC,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 80479 4195 chr6 41438689 41440316 41438743 N NA NA FOXP4,TFEB,MDFI,USP49 IMR90,GM12878,H1ESC,K562,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 FOXP4 73848 4196 chr6 41449482 41458984 41456461 Y NA NA FOXP4,TFEB,MDFI IMR90,H1ESC,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 55180 4197 chr6 41463037 41475913 41473124 N NA FOXP4 FOXP4 IMR90,H1ESC,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 38251 4198 chr6 42513757 42517342 42515542 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14418 4199 chr6 4351039 4353239 4352253 N NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 215208 4200 chr6 43669260 43671552 43670667 N NA MRPS18A MRPS18A,RSPH9,XPO5,LOC100132354,C6orf223,MRPL14,TMEM63B,CAPN11,VEGFA,MAD2L1BP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 13711 4201 chr6 43691100 43694541 43692962,43692303 Y,N TJAP1,MAD2L1BP;NA MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 35551 4202 chr6 44005155 44012357 44009514 Y SLC35B2,MRPL14 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 MRPL14 82834 4203 chr6 44023889 44028887 44025933 N NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223,XPO5,MRPL14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL14 66304 4204 chr6 44456203 44463424 44458195,44461961 Y,N NA;NA NA SUPT3H,RUNX2,CLIC5,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 100952 4205 chr6 44607707 44613426 44610756,44609960 Y,N NFKBIE;NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 252456 4206 chr6 44615889 44620524 44618881 N NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 260638 4207 chr6 44643482 44646027 44644679 N NA NA RUNX2,CLIC5,SUPT3H IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 288231 4208 chr6 44665980 44671141 44669188,44667836 N,N NA;NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 310729 4209 chr6 44702363 44704741 44703456 N NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 347112 4210 chr6 45556381 45560441 45558616 N NA NA RUNX2,CDC5L,SUPT3H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC25A27 1060211 4211 chr6 45620305 45636035 45624611 N NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC25A27 984617 4212 chr6 4646524 4647952 4647238 N NA NA CDYL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPP40 356319 4213 chr6 47101118 47105219 47102612 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF21 172461 4214 chr6 48073334 48080095 48074426,48078552 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CD2AP 627809 4215 chr6 48793046 48796445 48794955,48793559 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CENPQ 634651 4216 chr6 5029742 5035575 5032060 N NA RPP40 RPP40 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPP40 25471 4217 chr6 50388034 50413123 50389389 N NA NA NA NA NA NA CENPQ 956938 4218 chr6 50991931 50994323 50993061 N NA NA NA NA NA NA MCM3 1155259 4219 chr6 52461668 52465116 52463188 Y NA TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 19806 4220 chr6 52792870 52795417 52793052,52794327 N,N NA;NA NA LOC730101,GSTA1,GSTA3,ICK,FBXO9,TMEM14A,GSTA4 IMR90 Hi-C 24141950 GSTA4 64761 4221 chr6 53221947 53226355 53224410,53225055 Y,Y NA;NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 7970 4222 chr6 53479341 53482071 53481117 N NA NA GCLC,KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 GCLC 69414 4223 chr6 53537229 53539467 53538162 N NA NA KLHL31,GCLC MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRC1 120311 4224 chr6 53598073 53601213 53599773 N NA NA GCLC,ICK,LRRC1,KLHL31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRC1 58565 4225 chr6 53846164 53851924 53849352,53847279 N,N NA;NA NA MLIP,TINAG,FAM83B,HCRTR2 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 186386 4226 chr6 54154726 54157414 54156095 N NA NA NA NA NA NA LRRC1 494948 4227 chr6 54283575 54286032 54284877 N NA NA TINAG IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 623797 4228 chr6 55006123 55010989 55010292 N NA NA NA NA NA NA BMP5 729386 4229 chr6 55745850 55748646 55747592 N NA BMP5 HCRTR2,GFRAL IMR90 Hi-C 24141950 BMP5 5475 4230 chr6 55761564 55764656 55763598 N NA BMP5 HMGCLL1,GFRAL IMR90 Hi-C 24141950 BMP5 21189 4231 chr6 55779905 55782568 55781162 N NA BMP5 HMGCLL1,BMP5 IMR90 Hi-C 24141950 BMP5 39530 4232 chr6 56198919 56202111 56200293 N NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 DST 305583 4233 chr6 56233168 56236628 56235403 N NA NA DST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DST 271066 4234 chr6 56586006 56650790 56644708,56614564 N,N NA;NA NA DST,BEND6,KIAA1586,PRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 DST 78312 4235 chr6 56678068 56735666 56688306,56705994,56727373,56732303,56733654,56720881 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA ZNF451,BAG2,DST,BEND6,KIAA1586,RAB23,PRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 DST 170374 4236 chr6 56760848 56770833 56769623 N NA NA PRIM2,DST,RAB23,BEND6,ZNF451,BAG2,KIAA1586 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1586 140551 4237 chr6 56772411 56805145 56803995 N NA NA BAG2,ZNF451,BEND6,PRIM2,KIAA1586,RAB23 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1586 106239 4238 chr6 57131970 57140391 57132740 N NA RAB23,PRIM2 RAB23,BAG2,BEND6,PRIM2,ZNF451 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRIM2 42031 4239 chr6 58141487 58143006 58142342 N NA NA NA NA NA NA GUSBP4 144718 4240 chr6 58773082 58780281 58773777,58777884 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA GUSBP4 485358 4241 chr6 63780533 63784121 63780841 N NA NA NA NA NA NA PTP4A1 497799 4242 chr6 64151323 64152882 64152254 N NA NA NA NA NA NA PTP4A1 129038 4243 chr6 66545255 66547903 66546527 N NA NA NA NA NA NA PHF3 2188824 4244 chr6 6680553 6688723 6687356 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 419107 4245 chr6 66972688 66981176 66974394 N NA NA NA NA NA NA PHF3 2616257 4246 chr6 6735901 6738541 6737570 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 369289 4247 chr6 6810742 6813819 6811785 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 294011 4248 chr6 7048789 7052484 7051201 N NA NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 55346 4249 chr6 7057465 7061208 7058762 N NA RREB1 RREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 46622 4250 chr6 709638 713906 711325 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 16529 4251 chr6 71084035 71109996 71085619,71108836 N,N NA;NA FAM135A FAM135A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM135A 13111 4252 chr6 71817025 71822327 71817797,71821095 N,N NA;NA NA NA NA NA NA OGFRL1 176150 4253 chr6 71890720 71893001 71891415 N NA NA RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 105476 4254 chr6 71905230 71915078 71907165 Y NA NA OGFRL1,MIR30A IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 83399 4255 chr6 71958844 71961306 71960088 Y OGFRL1 OGFRL1 OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 37171 4256 chr6 72169214 72172622 72170869 N NA NA MIR30C2,OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 170737 4257 chr6 72177333 72180145 72178972 Y NA NA OGFRL1,MIR30C2,LINC00472 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 178856 4258 chr6 72186043 72190726 72188794 Y NA NA OGFRL1,LINC00472 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 187566 4259 chr6 72458740 72461699 72458910 N NA NA NA NA NA NA OGFRL1 460263 4260 chr6 73259608 73266103 73263069 N NA NA KCNQ5,RIMS1,MIR4282 IMR90 Hi-C 24141950 KCNQ5 65468 4261 chr6 74094625 74101803 74098811,74101542 N,N NA;NA DDX43 MTO1 K562 ChIA-PET 22265404 DDX43 2482 4262 chr6 74276302 74279693 74277441 N NA EEF1A1 MTO1,EEF1A1,MB21D1,SLC17A5,COL12A1,COX7A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EEF1A1 45547 4263 chr6 75315591 75318451 75316660 N NA NA COL12A1,CD109 IMR90 Hi-C 24141950 COL12A1 597172 4264 chr6 7690712 7693898 7692146 N NA NA PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 SNRNP48 100280 4265 chr6 79305055 79317650 79309372,79315983 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 259539 4266 chr6 79559754 79569533 79564266,79568238 N,N NA;NA IRAK1BP1 NA NA NA NA IRAK1BP1 7656 4267 chr6 80486577 80489993 80487879 Y NA NA NA NA NA NA TTK 224329 4268 chr6 81147058 81150685 81148616 N NA NA NA NA NA NA TTK 432736 4269 chr6 81249227 81256020 81251089,81253598 N,Y NA;NA NA FAM46A,BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 TTK 534905 4270 chr6 81348197 81349119 81348613 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 TTK 633875 4271 chr6 85326329 85330037 85328534 N NA NA NA NA NA NA TBX18 143862 4272 chr6 85332709 85335395 85334178 Y NA NA NA NA NA NA TBX18 138504 4273 chr6 86110139 86115880 86114042 N NA NA NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX14 187749 4274 chr6 86363895 86365044 86363985 N NA SYNCRIP,SNHG5 SYNCRIP K562 ChIA-PET 22265404 SYNCRIP 10852 4275 chr6 88453692 88455335 88453843 N NA AKIRIN2 ORC3,RARS2,RNGTT IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 41707 4276 chr6 91077978 91080834 91079128 Y NA NA BACH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K7 216073 4277 chr6 91167120 91170114 91168409 Y NA NA BACH2,MDN1,CASP8AP2,GJA10 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K7 126793 4278 chr6 93331587 93336232 93334624 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2034680 4279 chr6 93430187 93434814 93433574 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2133280 4280 chr6 9480721 9483306 9482452 N NA NA TFAP2A,LOC100130275,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 GCNT2 1038262 4281 chr6 9515328 9525318 9516648,9520829,9523903 Y,N,N NA;NA;NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 GCNT2 996250 4282 chr6 96938811 96945386 96942910 N NA UFL1 NA NA NA NA UFL1 24316 4283 chr6 99460127 99462376 99461665 N NA NA NA NA NA NA FBXL4 64278 4284 chr7 100428985 100436988 100435131 N NA EPHB4,SLC12A9,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 3842 4285 chr7 100992320 100995696 100992766 N NA RABL5 EMID2,CUX1 IMR90 Hi-C 24141950 RABL5 27227 4286 chr7 100997333 101002277 101001229 N NA RABL5 NA NA NA NA RABL5 32240 4287 chr7 101330429 101333471 101331762 N NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 125713 4288 chr7 101359896 101364066 101362223 N NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 95118 4289 chr7 101369133 101374564 101372940 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 84620 4290 chr7 101375302 101378704 101377352 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 80480 4291 chr7 101384675 101387282 101386596 N NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 71902 4292 chr7 101397096 101399618 101397908 N NA NA CUX1 IMR90 Hi-C 24141950 CUX1 59566 4293 chr7 101433607 101438251 101435373 N NA CUX1 CUX1,MYL10,SH2B2 IMR90 Hi-C 24141950 CUX1 20933 4294 chr7 102376884 102379742 102378711 N NA FAM185A NA NA NA NA FAM185A 9657 4295 chr7 104583604 104587052 104585766 Y MLL5 LOC100216546 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100216546 44560 4296 chr7 105041260 105045228 105042295 N NA SRPK2 SRPK2,PUS7,MLL5 IMR90 Hi-C 24141950 SRPK2 11919 4297 chr7 105704700 105707249 105705730 N NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45808 4298 chr7 105950444 105955235 105954093 N NA NAMPT CCDC71L,NAMPT IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 24806 4299 chr7 105984105 105987087 105985921 N NA NA NAMPT,CCDC71L,PIK3CG K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAMPT 58467 4300 chr7 106058428 106067644 106065618 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 132790 4301 chr7 106073477 106082103 106077036 N NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 147839 4302 chr7 106318299 106330312 106324560 N NA CCDC71L PIK3CG,CCDC71L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 16665 4303 chr7 106403543 106437001 106408670,106415833,106420548,106418301,106413847 Y,N,N,N,N NAMPT,PIK3CG,HBP1;NA;NA;NA;NA NA CCDC71L,PIK3CG,PRKAR2B,HBP1,NAMPT,CBLL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 101909 4304 chr7 106462782 106466950 106464692 N NA NA PIK3CG,PRKAR2B,NLGN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CCDC71L 161148 4305 chr7 106488240 106490286 106489495 N NA NA PIK3CG IMR90 Hi-C 24141950 CCDC71L 186606 4306 chr7 109051815 109060214 109055829 N NA NA NA NA NA NA DNAJB9 841626 4307 chr7 109067567 109087545 109085609 N NA NA NA NA NA NA DNAJB9 857378 4308 chr7 109263743 109292229 109286879,109281791 N,N NA;NA NA IMMP2L IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB9 1053554 4309 chr7 110172579 110175337 110174463 N NA NA NA NA NA NA ZNF277 1671306 4310 chr7 112029708 112034144 112032154 N NA IFRD1 DOCK4,ZNF277,IFRD1 IMR90 Hi-C 24141950 IFRD1 29055 4311 chr7 112335534 112341461 112337394 N NA NA NA NA NA NA TMEM168 89017 4312 chr7 112621387 112637251 112635785,112625657 N,N NA;NA NA C7orf60 IMR90 Hi-C 24141950 LOC401397 121386 4313 chr7 113224538 113235623 113234018 Y NA NA NA NA NA NA LOC401397 465901 4314 chr7 113687773 113689515 113688421 N NA NA NA NA NA NA MDFIC 872694 4315 chr7 115954020 115958573 115956376 N NA NA CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 181082 4316 chr7 115962148 115970131 115968013 N NA NA CAV2,CAV1,TES,CAPZA2,ST7,MET IMR90,K562,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 CAV2 169524 4317 chr7 115993844 115998609 115995191 N NA NA CAV2,CAV1,TES,MET,ST7,ST7-AS2 IMR90,H1ESC,GM12878,HELA,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 CAV2 141046 4318 chr7 116032855 116035086 116033941 N NA NA CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV2 104569 4319 chr7 116065132 116068104 116066663 N NA NA TES,CAV2,CAV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 71551 4320 chr7 116074123 116076600 116074906 N NA NA TES,CAV2,CAV1,MET IMR90,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 CAV2 63055 4321 chr7 116081117 116085374 116082939 N NA NA TES,CAV2,CAV1,MET IMR90,MCF7,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 CAV2 54281 4322 chr7 116270495 116272298 116271176 Y NA MET TES,MET,CAV1,CAPZA2 IMR90,GM12878,H1ESC,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 MET 40161 4323 chr7 118003266 118010044 118004050 N NA NA NA NA NA NA NAA38 179180 4324 chr7 119232430 119240073 119238561 N NA NA NA NA NA NA ING3 1350744 4325 chr7 119500227 119522817 119506285,119522203 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ING3 1068000 4326 chr7 119543080 119548159 119547180 N NA NA NA NA NA NA ING3 1042658 4327 chr7 12105811 12108600 12106424 N NA NA NA NA NA NA TMEM106B 142248 4328 chr7 121143971 121146621 121145034 N NA NA FAM3C IMR90 Hi-C 24141950 FAM3C 107549 4329 chr7 121168868 121172532 121170484 N NA NA FAM3C,WNT16 IMR90 Hi-C 24141950 FAM3C 132446 4330 chr7 1214391 1218261 1215934 N NA C7orf50,ZFAND2A CYP2W1,C7orf50,ZFAND2A,UNCX,COX19,GPR146,GPER,MICALL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND2A 14536 4331 chr7 123409022 123411358 123410606 N NA WASL WASL MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WASL 19906 4332 chr7 1237151 1240090 1238912 N NA ZFAND2A C7orf50,MICALL2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 37296 4333 chr7 12752602 12769529 12755411,12758983 Y,Y VWDE,ARL4A;ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 26150 4334 chr7 127773741 127777813 127775939 N NA NA SND1,MIR129-1 IMR90 Hi-C 24141950 MGC27345 170003 4335 chr7 127803478 127806687 127804882 N NA NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 MGC27345 141129 4336 chr7 129208527 129211382 129209577 N NA NRF1 FAM40B,AHCYL2,LOC100287482,NRF1,ZC3HC1 IMR90 Hi-C 24141950 NRF1 40173 4337 chr7 129418425 129427502 129420126 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 165298 4338 chr7 129608936 129615184 129610125 N NA UBE2H AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2H 16136 4339 chr7 130522020 130526692 130524587 N NA NA MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329 IMR90 Hi-C 24141950 LOC646329 71377 4340 chr7 131307621 131322653 131310712,131314814,131318450 N,N,N NA;NA;NA NA PODXL,MKLN1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PODXL 66245 4341 chr7 131406686 131410738 131408763 N NA NA NA NA NA NA PODXL 165310 4342 chr7 131511271 131514692 131512076 N NA NA NA NA NA NA PODXL 269895 4343 chr7 131577708 131594088 131582024 N NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 PODXL 336332 4344 chr7 131748731 131754057 131750446 N NA NA NA NA NA NA PODXL 507355 4345 chr7 137942161 137948397 137943235 N NA NA NA NA NA NA TRIM24 196682 4346 chr7 140325383 140328477 140326571 N NA ADCK2 DENND2A,MKRN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCK2 44476 4347 chr7 140335189 140339677 140338795 N NA ADCK2 DENND2A,MKRN1 IMR90 Hi-C 24141950 ADCK2 33276 4348 chr7 141009 152091 149202 N NA NA FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 PDGFA 407390 4349 chr7 142189756 142192566 142190883 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L6 181565 4350 chr7 142246162 142248068 142247345 N NA NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L6 126063 4351 chr7 142504419 142509191 142506388,142508979 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MTRNR2L6 130288 4352 chr7 1436394 1438611 1437327 N NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 MICALL2 60498 4353 chr7 144550389 144551688 144551105 N NA NA NA NA NA NA FAM115A 951111 4354 chr7 145340759 145343041 145341754 N NA NA NA NA NA NA FAM115A 1741481 4355 chr7 148636185 148639457 148638270 N NA NA EZH2,CUL1,ZNF786,ZNF398,ZNF425 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EZH2 54744 4356 chr7 148662021 148664847 148662967 N NA NA CUL1,EZH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDIA4 60935 4357 chr7 154996298 155000396 154997923 N NA NA INSIG1,LOC202781,PAXIP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 89090 4358 chr7 155018510 155023132 155022055 N NA NA INSIG1 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 66354 4359 chr7 155049411 155050875 155050094 N NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 38611 4360 chr7 1550556 1556487 1553105 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 6538 4361 chr7 155742828 155746690 155744475 Y NA NA LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM33 305625 4362 chr7 157099869 157105939 157102389 N NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 23772 4363 chr7 158387612 158398697 158390489,158397485 N,N NA;NA NA PTPRN2,NCAPG2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NCAPG2 98823 4364 chr7 16954666 16964999 16955940 N NA NA AGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 BZW2 268907 4365 chr7 17028758 17038138 17029652 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 BZW2 342999 4366 chr7 17272236 17275244 17274019 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 BZW2 586477 4367 chr7 17312919 17317686 17315207 N NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 BZW2 627160 4368 chr7 17409651 17415073 17411999 N NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 565058 4369 chr7 17441282 17449529 17442644,17446027,17448278 N,N,N NA;NA;NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 530602 4370 chr7 17637110 17640710 17640103 N NA NA AHR,TSPAN13 IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 339421 4371 chr7 17700817 17704158 17702691 N NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 275973 4372 chr7 17715482 17718712 17717560 N NA NA AHR,HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 261419 4373 chr7 17735190 17737422 17736164 N NA NA HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 242709 4374 chr7 17806661 17807439 17806849 N NA NA NA NA NA NA SNX13 172692 4375 chr7 20008585 20010973 20009918 Y NA NA NA NA NA NA TWISTNB 259925 4376 chr7 20071146 20073129 20071225 N NA NA NA NA NA NA TWISTNB 322486 4377 chr7 22120479 22124633 22123050 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 134937 4378 chr7 22599276 22600802 22599798 N NA LOC100506178 LOC100506178 K562 ChIA-PET 22265404 LOC100506178 2154 4379 chr7 22690625 22692809 22691718 N NA NA LOC100506178,SNORD93,TOMM7,IL6,FAM126A IMR90 Hi-C 24141950 IL6 73957 4380 chr7 22819483 22824415 22821836 N NA TOMM7 LOC100506178,FAM126A IMR90 Hi-C 24141950 TOMM7 38006 4381 chr7 22935631 22938755 22937094,22937214 N,N NA;NA NA FAM126A,SNORD93 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM7 73210 4382 chr7 23064113 23066930 23065756 N NA FAM126A FAM126A,LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,GPNMB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 10343 4383 chr7 24516138 24519334 24517552 N NA NA NA NA NA NA MPP6 93751 4384 chr7 25063600 25077689 25066544,25073139 N,N NA;NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 43840 4385 chr7 25607422 25609170 25608512 N NA NA NA NA NA NA C7orf31 387605 4386 chr7 25886328 25890900 25887995,25889489 N,N NA;NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA3,HOXA4,SKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA2B1 349513 4387 chr7 25893533 25898454 25895740 N NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA2B1 341959 4388 chr7 26290726 26293043 26291780 N NA CBX3,SNX10 HOXA10-HOXA9,HOXA9,SNX10,CBX3,HNRNPA2B1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX10 38472 4389 chr7 26316655 26319513 26317663 N NA SNX10 HNRNPA2B1,CBX3,NFE2L3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SNX10 12002 4390 chr7 27273479 27278452 27275299 N NA HOXA11,HOXA-AS5 NA NA NA NA HOXA-AS5 48452 4391 chr7 27377133 27380784 27379375 N NA NA HOTTIP,HOXA13 K562,H1ESC 5C 22955621 HOXA-AS5 152106 4392 chr7 27383485 27387969 27386164 N NA NA NA NA NA NA HOXA-AS5 158458 4393 chr7 27492346 27498422 27493727,27497554 N,N NA;NA NA JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 204198 4394 chr7 27716185 27720062 27717734 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 13565 4395 chr7 28894207 28897003 28895090 N NA NA CREB5 IMR90 Hi-C 24141950 JAZF1 673770 4396 chr7 2901656 2906766 2903459 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 GNA12 GNA12,AMZ1,FOXK1,KIAA0415 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GNA12 17697 4397 chr7 2912592 2915223 2913703 N NA GNA12 AMZ1,GNA12,FOXK1,KIAA0415 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA12 28633 4398 chr7 3232017 3236192 3234333 N NA NA SDK1,CARD11 IMR90 Hi-C 24141950 CARD11 148508 4399 chr7 34359245 34364717 34360758 N NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 861057 4400 chr7 36154677 36158782 36155861 N NA NA EEPD1,KIAA0895 IMR90 Hi-C 24141950 ANLN 270650 4401 chr7 36785094 36787858 36786712 N NA NA ELMO1,AOAH IMR90 Hi-C 24141950 ANLN 355662 4402 chr7 37609111 37611340 37609926 N NA NA NA NA NA NA EPDR1 348823 4403 chr7 38357614 38376263 38375424 N NA NA STARD3NL,LOC100506776 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STARD3NL 139806 4404 chr7 39892213 39895134 39894477 N NA NA NA NA NA NA CDK13 94825 4405 chr7 40957034 40959867 40958649 N NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf11 782783 4406 chr7 41044066 41047235 41046132 N NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 695471 4407 chr7 41065006 41072297 41067983,41070344 N,N NA;NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 670409 4408 chr7 41145448 41151744 41147218,41149973 N,Y NA;NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 590962 4409 chr7 41155585 41158212 41156562 N NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 584494 4410 chr7 41227615 41231068 41229667 N NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 511638 4411 chr7 41618142 41621954 41619835,41620623 N,N NA;NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 120752 4412 chr7 41925022 41927564 41925974 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 182316 4413 chr7 41954503 41958019 41956210 N NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA,GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 211797 4414 chr7 41969480 41971967 41970268 N NA NA LOC285954,C7orf10,GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 226774 4415 chr7 42532010 42535305 42533237 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 255392 4416 chr7 42716898 42719482 42717966 N NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 232207 4417 chr7 42729191 42747478 42746406 N NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 204211 4418 chr7 42895600 42898952 42898364,42896641 N,Y NA;NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 52737 4419 chr7 43872792 43876159 43874525 N NA NA HECW1,STK17A,C7orf44,BLVRA,UBE2D4,URGCP,POLR2J4 IMR90 Hi-C 24141950 BLVRA 74520 4420 chr7 44772220 44776929 44773831 N NA ZMIZ2 DDX56,TMED4,OGDH,PPIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ2 11601 4421 chr7 46016381 46019815 46017850 N NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 207764 4422 chr7 46177775 46180727 46178851 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 369158 4423 chr7 46185092 46191355 46186245 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 376475 4424 chr7 46196639 46206417 46201420 N NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 388022 4425 chr7 46295220 46298911 46297195 N NA NA NA NA NA NA SEPT7P2 486603 4426 chr7 46377575 46381781 46378171 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 568958 4427 chr7 46493906 46497410 46495778 N NA NA IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 685289 4428 chr7 4651881 4659414 4653216 N NA NA SDK1,FOXK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 62516 4429 chr7 46607476 46610487 46608319 N NA NA NA NA NA NA SEPT7P2 798859 4430 chr7 46693384 46695647 46694602 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 884767 4431 chr7 4670815 4675492 4671744 N NA FOXK1 SDK1,FOXK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 46438 4432 chr7 46802550 46805343 46803891 Y NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 816399 4433 chr7 4681389 4685185 4682350 N NA FOXK1 SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 36745 4434 chr7 46849757 46852589 46851230 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 769153 4435 chr7 46947327 46950603 46949142 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 671139 4436 chr7 47010424 47012971 47011994 N NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 608771 4437 chr7 4717288 4718817 4717780 N NA FOXK1 FOXK1 K562 ChIA-PET 22265404 FOXK1 3113 4438 chr7 47629236 47647413 47631988,47636389,47644570,47641283 N,N,Y,Y NA;NA;NA;NA TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1,C7orf65 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 7494 4439 chr7 47763140 47766326 47764931 N NA NA TNS3,C7orf65,PKD1L1,C7orf69,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 141398 4440 chr7 50887820 50891831 50889439 Y NA NA COBL,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 FIGNL1 369732 4441 chr7 50893703 50896608 50894587,50894435 N,N NA;NA NA GRB10,COBL IMR90 Hi-C 24141950 FIGNL1 375615 4442 chr7 50904431 50908203 50906370 N NA NA COBL,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 FIGNL1 386343 4443 chr7 51029383 51031230 51030139 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 511295 4444 chr7 55000087 55006512 55001061 N NA NA EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 80213 4445 chr7 55034556 55036090 55035243 Y EGFR NA EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 50635 4446 chr7 55061501 55065507 55063867 Y EGFR EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 21218 4447 chr7 55322811 55325906 55323247 N NA NA EGFR,SEC61G,LANCL2 IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 107235 4448 chr7 5587878 5607325 5602382,5589040,5595551 N,N,Y NA;NA;CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 17646 4449 chr7 55953982 55957726 55954905 N NA ZNF713 NA NA NA NA ZNF713 22605 4450 chr7 5608568 5613694 5609878,5612169 Y,N SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1;NA ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FSCN1 18742 4451 chr7 57253050 57254237 57254080 N NA NA NA NA NA NA LOC650226 736982 4452 chr7 57554531 57556948 57554968 N NA NA NA NA NA NA LOC650226 1038463 4453 chr7 57632698 57668416 57639563,57637174 Y,N ZNF479,ZNF716;NA NA NA NA NA NA LOC650226 1116630 4454 chr7 57701013 57712588 57711498,57703483 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC650226 1184945 4455 chr7 57880355 57888476 57882725 N NA NA NA NA NA NA LOC650226 1364287 4456 chr7 57899547 57904741 57902820 N NA NA NA NA NA NA LOC650226 1383479 4457 chr7 61078931 61080684 61079771 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 2692502 4458 chr7 6115311 6126542 6116956,6121188 N,N NA;NA EIF2AK1,USP42 EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF2AK1 16451 4459 chr7 61779154 61779873 61779555 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 1993313 4460 chr7 61816044 61825319 61820369 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 1947867 4461 chr7 6320122 6325585 6323475 N NA CYTH3 USP42,CYTH3,C7orf70 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH3 7880 4462 chr7 63248759 63250284 63249515 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 522902 4463 chr7 6344655 6348989 6346937 N NA CYTH3,C7orf70 NA NA NA NA CYTH3 32413 4464 chr7 64459624 64472535 64467171,64470618 N,N NA;NA CCT6P3 ZNF117,CCT6P3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CCT6P3 26197 4465 chr7 64939894 64942568 64940939 N NA NA ZNF92 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF92 101126 4466 chr7 64953722 64956113 64954805 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 114954 4467 chr7 64973452 64976914 64975034 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 134684 4468 chr7 65510466 65517625 65512601,65516220 N,N NA;NA ASL ASL,CRCP,TPST1,KCTD7,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 ASL 23151 4469 chr7 65935774 65938650 65937416 N NA NA TPST1,CRCP,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00174 70379 4470 chr7 65956792 65969187 65958594 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC493754 74311 4471 chr7 65971484 65973532 65972619 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC493754 69966 4472 chr7 65978521 65985489 65984690 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC493754 58009 4473 chr7 66075925 66082510 66077620 N NA LOC493754,KCTD7 ASL,LOC493754,KCTD7 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD7 11358 4474 chr7 67217071 67262821 67219782 Y NA NA NA NA NA NA STAG3L4 449446 4475 chr7 67284610 67291500 67286305 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 516985 4476 chr7 67771115 67773278 67772008 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 1003490 4477 chr7 68155115 68162486 68157127 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 901420 4478 chr7 68169250 68174113 68171586 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 889793 4479 chr7 68262959 68266958 68264849 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 796948 4480 chr7 6919413 6924178 6922018 N NA NA NA NA NA NA CCZ1B 53487 4481 chr7 7028906 7050920 7030345 N NA NA NA NA NA NA CCZ1B 162980 4482 chr7 7214707 7218399 7216576 N NA C1GALT1 C1GALT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1GALT1 3847 4483 chr7 73042651 73045028 73043597 N NA TBL2 MLXIPL K562 ChIA-PET 22265404 TBL2 49638 4484 chr7 73415665 73421445 73417205 N NA NA ELN,MLXIPL,EIF4H,WBSCR28,LIMK1,WBSCR27,CLDN4,CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 LIMK1 76662 4485 chr7 73692440 73697356 73694145 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2,EIF4H,RFC2,LAT2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 6449 4486 chr7 74049452 74052110 74050419 N NA GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19920 4487 chr7 75458671 75466025 75463177,75459426 N,N NA;NA RHBDD2 HIP1,STYXL1,POR,MDH2,CCL26,CCL24,RHBDD2,TMEM120A IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 42292 4488 chr7 75471573 75474176 75472268 N NA RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,POR,CCL24 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 34141 4489 chr7 75501081 75503740 75501920 N NA RHBDD2,POR HIP1,POR,MDH2,RHBDD2,CCL26,TMEM120A,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4577 4490 chr7 75991705 75995108 75993793 N NA YWHAG,ZP3,SRCRB4D YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 3363 4491 chr7 76583263 76589016 76584658 N NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 NA NA NA NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 21123 4492 chr7 76742883 76748512 76745192 N NA NA NA NA NA NA LOC100132832 74086 4493 chr7 77054468 77056951 77055330 N NA PION PION,LOC100505854,PTPN12,RSBN1L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PION 8751 4494 chr7 77161068 77162802 77162151 N NA PTPN12 PTPN12,PION MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTPN12 3971 4495 chr7 79124331 79127051 79125214 N NA MAGI2-AS3 MAGI2 IMR90 Hi-C 24141950 MAGI2-AS3 42058 4496 chr7 79716163 79718488 79716951 N NA GNAI1 CD36 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 45652 4497 chr7 79916327 79918957 79917670 N NA NA GNAI1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 152187 4498 chr7 79948725 79953495 79953051,79950086,79953198 N,N,N NA;NA;NA NA GNAI1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 184585 4499 chr7 80788619 80793635 80788907,80790797,80792506 Y,N,N NA;NA;NA NA SEMA3C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GNAI1 1024479 4500 chr7 81232001 81235662 81233596 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 1467861 4501 chr7 8343417 8372681 8345878,8344005 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC729852 663075 4502 chr7 83988266 83990322 83988742 N NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 2698692 4503 chr7 84040116 84043610 84041679 N NA NA SEMA3A IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1324L 2645404 4504 chr7 84266633 84269082 84267524 Y NA NA SEMA3A IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1324L 2419932 4505 chr7 90221789 90298306 90224570,90255423,90228072 N,N,N NA;NA;NA CDK14 CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63,STEAP1 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CDK14 40406 4506 chr7 91455491 91470639 91468889 N NA MTERF NA NA NA NA MTERF 39377 4507 chr7 92052301 92055495 92054389 N NA GATAD1 GATAD1,ANKIB1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GATAD1 21270 4508 chr7 93689294 93707486 93690296 N NA NA TFPI2,GNG11,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 55604 4509 chr7 93809838 93812998 93812041 N NA NA TFPI2,GNGT1,GNG11,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 176148 4510 chr7 93927753 93931717 93930742 N NA NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 CASD1 207453 4511 chr7 96017315 96019667 96018385 N NA NA SLC25A13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A13 65856 4512 chr7 98047247 98055887 98048058 N NA BAIAP2L1 BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAIAP2L1 16820 4513 chr7 98186242 98193681 98191798,98189703 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BAIAP2L1 155815 4514 chr7 98197977 98201195 98199411 Y NA NA NPTX2 IMR90 Hi-C 24141950 BAIAP2L1 167550 4515 chr7 98415326 98421756 98417027,98420440 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TRRAP 54357 4516 chr7 98863217 98866414 98865079 N NA NA SMURF1,MYH16,ARPC1A,KPNA7 IMR90 Hi-C 24141950 ARPC1A 57082 4517 chr8 101347495 101350607 101348517 N NA RNF19A NA NA NA NA RNF19A 25168 4518 chr8 101426225 101431362 101427942 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471,CMTM7 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 RNF19A 103898 4519 chr8 101773041 101775295 101773997 Y NA PABPC1 SNX31,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 38726 4520 chr8 101800169 101814582 101802162 N NA NA PABPC1,SNX31 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 65854 4521 chr8 101858936 101861229 101859673 N NA NA ANKRD46,PABPC1,ZNF706,YWHAZ,SNX31 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 104394 4522 chr8 101997079 102000365 101999317 N NA YWHAZ ZNF706,FLJ42969,YWHAZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 31456 4523 chr8 102011793 102017504 102016042 Y NA YWHAZ FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 46170 4524 chr8 102036883 102041148 102039058 N NA NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 71260 4525 chr8 102122195 102141830 102139052 N NA NA YWHAZ,ZNF706,FLJ42969,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 76130 4526 chr8 102160242 102163700 102161946 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 54260 4527 chr8 102164552 102173037 102166886,102171647 N,N NA;NA ZNF706 FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44923 4528 chr8 102298665 102303006 102300262 N NA NA FLJ42969,YWHAZ,PABPC1,ANKRD46,ZNF706,SNX31,RRM2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 80705 4529 chr8 102456316 102459846 102458251 N NA NA NA NA NA NA ZNF706 238356 4530 chr8 102461408 102466197 102462396,102464444 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF706 243448 4531 chr8 103539190 103546150 103539457,103540884 N,N NA;NA NA UBR5,ODF1 IMR90 Hi-C 24141950 UBR5 114273 4532 chr8 103739753 103744223 103742097 Y NA NA KLF10,UBR5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 71770 4533 chr8 103749127 103753014 103750970 Y AZIN1,KLF10,KLF10 NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 81144 4534 chr8 103799361 103804846 103802494 N NA NA UBR5,KLF10,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 71551 4535 chr8 103916415 103924819 103918665,103922639 Y,N NA;NA AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 40018 4536 chr8 103936741 103939647 103937348 N NA NA AZIN1,ATP6V1C1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 60344 4537 chr8 104115548 104118861 104117631 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 NA C8orf56,BAALC,FZD6,CTHRC1,SLC25A32,DCAF13,RIMS2,LOC100499183,ATP6V1C1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1C1 82300 4538 chr8 105654542 105656972 105655393 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 53290 4539 chr8 105676423 105678867 105677798 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP12 75171 4540 chr8 106080617 106083533 106082126 N NA NA ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 247614 4541 chr8 106288755 106291808 106290592 Y NA ZFPM2 ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 39339 4542 chr8 106891898 106907529 106907286 N NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 560751 4543 chr8 106937788 106947347 106946301 N NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 606641 4544 chr8 106969801 106971767 106971032 N NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 638654 4545 chr8 107035250 107059164 107040335,107049758,107058396 N,N,N NA;NA;NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 704103 4546 chr8 107070258 107074731 107072761 N NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 739111 4547 chr8 107094022 107096626 107095362 N NA NA NA NA NA NA ZFPM2 762875 4548 chr8 107868623 107872393 107870412 N NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3E 1388566 4549 chr8 111905435 111908047 111906804 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 1353506 4550 chr8 112316602 112318943 112317747 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 1764673 4551 chr8 11329580 11333522 11332068 N NA NA C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 SLC35G5 141085 4552 chr8 115668083 115669894 115668216 N NA NA NA NA NA NA TRPS1 1011334 4553 chr8 116066892 116070015 116068491 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 611213 4554 chr8 11733842 11737581 11735497 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A,GATA4 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 8196 4555 chr8 117361499 117366465 117363957 N NA NA LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3H 401597 4556 chr8 117456270 117459143 117457353 Y NA NA LINC00536,TRPS1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3H 308919 4557 chr8 11748017 11752028 11749340 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTSB 22371 4558 chr8 117484017 117485984 117484977 N NA NA LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3H 282078 4559 chr8 117527714 117531430 117529841 Y C8orf85 NA NA NA NA NA EIF3H 236632 4560 chr8 117571464 117574242 117572610 N NA NA EIF3H IMR90 Hi-C 24141950 EIF3H 193820 4561 chr8 117586562 117588679 117587341 N NA NA EIF3H,TRPS1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3H 179383 4562 chr8 11759038 11765616 11759966 N NA CTSB CTSB,FAM167A,NEIL2,GATA4,BLK,FDFT1,C8orf12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTSB 33392 4563 chr8 11768870 11771481 11769258 N NA CTSB NEIL2,GATA4,FDFT1,BLK,CTSB IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 43224 4564 chr8 118625409 118635967 118632478 N NA NA EXT1,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 92444 4565 chr8 118680106 118683454 118682251 N NA NA EXT1,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 147141 4566 chr8 119777607 119779121 119778335 N NA NA TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 185262 4567 chr8 119908137 119911583 119909574 N NA NA SAMD12,TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 52800 4568 chr8 120187867 120190584 120189060 N NA NA MAL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF11B 223484 4569 chr8 121981938 121984778 121983526 Y NA NA MTBP,HAS2,HAS2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MTBP 524272 4570 chr8 122053309 122054697 122053405 N NA NA NA NA NA NA MTBP 595643 4571 chr8 122154963 122159674 122157929 N NA NA NA NA NA NA MTBP 697297 4572 chr8 122173515 122178775 122176565 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 MTBP 715849 4573 chr8 122360292 122362145 122361291 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 MTBP 902626 4574 chr8 122735866 122738234 122736689 N NA NA NA NA NA NA ZHX2 1055667 4575 chr8 122753908 122756586 122754808 N NA NA NA NA NA NA ZHX2 1037315 4576 chr8 122822296 122825991 122824274 N NA NA NA NA NA NA ZHX2 967910 4577 chr8 123137196 123141001 123139621 N NA NA NA NA NA NA ZHX2 652900 4578 chr8 123579013 123582494 123580961 N NA NA SNTB1,HAS2,HAS2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX2 211407 4579 chr8 123692560 123704506 123702495,123699420 N,N NA;NA NA WDR67,ZHX2,DERL1,ZHX1-C8ORF76,MIR4663,FAM83A,LOC100131726 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX2 89395 4580 chr8 124297712 124299205 124298244 N NA ZHX1-C8ORF76 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1-C8ORF76 10985 4581 chr8 124624379 124631059 124625265,124627261 N,N NA;NA NA FBXO32,ANXA13,KLHL38 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO32 70886 4582 chr8 125211487 125213885 125212409 Y NA NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM65 171055 4583 chr8 125237478 125242849 125241269 N NA NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,WDYHV1,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 142091 4584 chr8 125254622 125261135 125259766,125257642 N,N NA;NA NA TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 123805 4585 chr8 125281235 125294694 125283891,125286800 N,N NA;NA NA FAM91A1,TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 90246 4586 chr8 126422327 126427610 126423052 N NA TRIB1 NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 14953 4587 chr8 126474318 126477578 126475841 N NA TRIB1 NSMCE2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB1 31755 4588 chr8 126523768 126531243 126525476 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 81205 4589 chr8 126648654 126651563 126649868 Y TRIB1 NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 206091 4590 chr8 126666997 126669417 126668257 N NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB1 224434 4591 chr8 126690575 126694325 126692736 N NA NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB1 248012 4592 chr8 127444594 127448412 127446181,127447344 Y,Y NA;FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 122299 4593 chr8 127591130 127594527 127592306 Y NA FAM84B FAM84B IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 20419 4594 chr8 127639638 127642318 127640990 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 68927 4595 chr8 127835618 127847591 127837199,127846179,127840358 N,N,Y NA;NA;NA NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 264907 4596 chr8 128218081 128225135 128218781,128222776,128223565 N,N,N NA;NA;NA NA LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYC 523180 4597 chr8 128226119 128230004 128227548 Y NA NA LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYC 518311 4598 chr8 128235877 128239468 128237514 Y NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 508847 4599 chr8 128264201 128266057 128265149 N NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 482258 4600 chr8 128302276 128308961 128306927 N NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 439354 4601 chr8 128351708 128353581 128352525 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 394734 4602 chr8 129138162 129146280 129140139 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 331383 4603 chr8 129195519 129199724 129196528,129199700 N,N NA;NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 388740 4604 chr8 129207616 129211763 129209771 N NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 400837 4605 chr8 129212403 129218054 129214339 N NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 405624 4606 chr8 129269577 129273520 129271009 N NA NA NA NA NA NA PVT1 462798 4607 chr8 129332445 129346257 129339269,129335868 Y,N NA;NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 525666 4608 chr8 129566384 129569366 129568226 N NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 759605 4609 chr8 129669418 129670770 129669923 N NA NA MYC,MIR1208,PVT1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PVT1 862639 4610 chr8 129677090 129679993 129678577 N NA NA MIR1208,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 870311 4611 chr8 129694044 129698616 129696669 N NA NA NA NA NA NA PVT1 887265 4612 chr8 129798471 129800977 129800181 N NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 991692 4613 chr8 129893872 129896890 129895796 N NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 1087093 4614 chr8 129911835 129914408 129913192 N NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 1105056 4615 chr8 129983708 129986976 129985003 N NA NA NA NA NA NA FAM49B 1041921 4616 chr8 130471027 130473020 130472223 N NA NA NA NA NA NA FAM49B 555877 4617 chr8 130487720 130490685 130489662 N NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 538212 4618 chr8 130491302 130493843 130492655 N NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 535054 4619 chr8 130526211 130528138 130527555 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 500759 4620 chr8 130696012 130700504 130697988 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM49B 328393 4621 chr8 130718301 130724320 130720417,130721682 Y,N NA;NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 304577 4622 chr8 131494023 131497968 131495431,131497486 N,N NA;NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507117 397009 4623 chr8 131534942 131542338 131537202,131535475,131540703 N,N,Y NA;NA;NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507117 437928 4624 chr8 131616107 131617731 131617050 N NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507117 519093 4625 chr8 131660352 131664710 131661987,131662748 N,N NA;NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507117 563338 4626 chr8 131683314 131689429 131685186 N NA NA ASAP1,LOC100507117 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507117 586300 4627 chr8 131693554 131698084 131694816 N NA NA ASAP1,LOC100507117 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507117 596540 4628 chr8 131703647 131705584 131704605 N NA NA ASAP1,ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507117 606633 4629 chr8 132825409 132830307 132827928 N NA NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 86049 4630 chr8 132867501 132871216 132869756 Y EFR3A EFR3A ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 45140 4631 chr8 134194256 134198141 134196020 N NA WISP1 TG,SLA,PHF20L1,ST3GAL1,WISP1 IMR90 Hi-C 24141950 WISP1 5141 4632 chr8 134367253 134370655 134369341 N NA NA WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 57706 4633 chr8 134385617 134389652 134388557 N NA NA TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 76070 4634 chr8 134393607 134395416 134394346 N NA NA TG,NDRG1,WISP1,PHF20L1,SLA IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 84060 4635 chr8 134417646 134422311 134420949 N NA NA TG,NDRG1,WISP1,PHF20L1,ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 108099 4636 chr8 134685495 134688136 134686890 N NA NA ST3GAL1,ZFAT MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ST3GAL1 101312 4637 chr8 134697072 134699571 134698273 N NA NA ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 112889 4638 chr8 134930197 134932902 134931912 N NA NA ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 346014 4639 chr8 135789580 135791893 135790578 N NA NA NA NA NA NA ZFAT 64288 4640 chr8 137793985 137818375 137794188,137807180 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 1324269 4641 chr8 138197593 138201100 138199530 N NA NA NA NA NA NA COL22A1 1725136 4642 chr8 138589680 138592693 138591184 N NA NA NA NA NA NA COL22A1 1333543 4643 chr8 138990953 138992701 138991598 N NA NA NA NA NA NA COL22A1 933535 4644 chr8 139961459 139967662 139964504 N NA COL22A1 COL22A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL22A1 35223 4645 chr8 139986114 140009276 139988234 N NA NA NA NA NA NA COL22A1 59878 4646 chr8 140153520 140158385 140156252 N NA NA NA NA NA NA COL22A1 227284 4647 chr8 140226341 140228495 140227988 N NA NA NA NA NA NA COL22A1 300105 4648 chr8 140352765 140354778 140353649 N NA NA NA NA NA NA COL22A1 426529 4649 chr8 140382045 140383341 140382726 N NA NA COL22A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL22A1 455809 4650 chr8 141472885 141476809 141474946 Y NA CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1,PTK2 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHRAC1 44588 4651 chr8 141500773 141502881 141502003 N NA CHRAC1 TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHRAC1 18516 4652 chr8 141505109 141510308 141506746 N NA CHRAC1 TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHRAC1 11089 4653 chr8 142022604 142030460 142027644,142030364,142024730 N,N,N NA;NA;NA PTK2 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 11192 4654 chr8 142046035 142050620 142048094,142048997 Y,N PTK2;NA PTK2 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 34623 4655 chr8 142052750 142054772 142053425 N NA PTK2 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90 Hi-C 24141950 PTK2 41338 4656 chr8 142066356 142073467 142069458 N NA NA PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 54944 4657 chr8 142084455 142087510 142085990 N NA NA PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 51210 4658 chr8 142304874 142313257 142312562 N NA NA PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 118750 4659 chr8 142740130 142742270 142740985 N NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 308123 4660 chr8 143531552 143533669 143531899 N NA TSNARE1,BAI1 BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BAI1 11708 4661 chr8 143895541 143898302 143897227 Y LY6E,GLI4 NA C8orf55,LOC100288181,LYNX1,LY6D,PSCA,JRK,SLURP1,LY6E,LOC100133669 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C8orf55 86920 4662 chr8 145867932 145870997 145869850 N NA NA ARHGAP39,ZNF251,ZNF250 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF251 109973 4663 chr8 145911473 145914537 145912700 N NA NA ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF251 66433 4664 chr8 146265119 146272520 146271401 N NA TMED10P1,C8orf77,ZNF252,C8orf33 ZNF250,ZNF251,ZNF16,TMED10P1,ZNF252,C8orf33 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C8orf33 5304 4665 chr8 15273806 15276038 15274682 N NA NA NA NA NA NA TUSC3 121558 4666 chr8 16264154 16268774 16266250 N NA NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA2 615973 4667 chr8 16271577 16276153 16273313 N NA NA NA NA NA NA EFHA2 608594 4668 chr8 16460067 16463340 16461052 N NA NA NA NA NA NA EFHA2 421407 4669 chr8 16573085 16577267 16575103 N NA NA NA NA NA NA EFHA2 307480 4670 chr8 16584666 16587016 16585786 N NA NA TUSC3 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA2 297731 4671 chr8 16605763 16627374 16607082 N NA NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA2 257373 4672 chr8 16688844 16690466 16690082 N NA NA EFHA2,ZDHHC2,FGF20 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA2 194281 4673 chr8 16695081 16697104 16696119 N NA NA EFHA2,ZDHHC2,FGF20,MSR1,CNOT7,VPS37A IMR90 Hi-C 24141950 EFHA2 187643 4674 chr8 1692889 1695903 1693882 Y CLN8 CLN8 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 15967 4675 chr8 17769196 17770691 17769926 N NA PCM1 MTUS1,FGL1,MTMR7,PDGFRL,PCM1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCM1 9675 4676 chr8 17973565 17994935 17975702 N NA ASAH1 ASAH1,PSD3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASAH1 31058 4677 chr8 18952438 18954798 18953444 N NA NA LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 81242 4678 chr8 18992526 18994087 18993284 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 121330 4679 chr8 19148429 19150767 19149291 N NA NA PSD3,LOC100128993,SH2D4A,CSGALNACT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSD3 277233 4680 chr8 19978457 19981289 19980409 N NA NA LPL,INTS10,ATP6V1B2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 73415 4681 chr8 20159352 20165747 20161529 N NA NA ATP6V1B2,LZTS1,SLC18A1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 104648 4682 chr8 2199162 2211132 2200050 N NA NA CSMD1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF10 427013 4683 chr8 2213948 2218447 2216274 N NA NA CSMD1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF10 441799 4684 chr8 2226174 2228721 2226960 N NA NA CSMD1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF10 454025 4685 chr8 2262346 2270049 2263190 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 490197 4686 chr8 22830589 22832526 22831554 N NA RHOBTB2 BIN3,PEBP4,LOC254896,TNFRSF10B,RHOBTB2,C8orf58,KIAA1967 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 12404 4687 chr8 23576014 23579942 23578045,23576576 N,N NA;NA NKX3-1 ENTPD4,NKX3-1,SLC25A37 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 35564 4688 chr8 2359761 2365698 2363930 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 587612 4689 chr8 23608695 23611294 23609933 N NA NA SLC25A37,STC1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 68245 4690 chr8 23617514 23620937 23619249 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 77064 4691 chr8 23654637 23658773 23656535 N NA NA STC1,SLC25A37 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 114187 4692 chr8 23746506 23748925 23747246 N NA NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 206056 4693 chr8 2480786 2482914 2481038 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 708637 4694 chr8 24846721 24862994 24854385,24857563,24861147 N,N,Y NA;NA;NA NEFL EBF2 IMR90 Hi-C 24141950 NEFL 32590 4695 chr8 24923868 24932962 24931095 N NA NA NA NA NA NA DOCK5 109325 4696 chr8 25036075 25038648 25037299 N NA DOCK5 NA NA NA NA DOCK5 3639 4697 chr8 2572497 2585639 2584802 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 800348 4698 chr8 2589819 2602042 2591307 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 817670 4699 chr8 25970426 25973361 25971954 N NA NA PPP2R2A,CDCA2,KCTD9 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R2A 175646 4700 chr8 26122891 26125208 26123334 N NA PPP2R2A PPP2R2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 23799 4701 chr8 26304000 26317380 26307023,26315126,26315321 Y,N,N NA;NA;NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 54103 4702 chr8 28481370 28524183 28482631 N NA EXTL3 EXTL3 IMR90 Hi-C 24141950 EXTL3 34970 4703 chr8 29316101 29317903 29317061 N NA NA C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 HMBOX1 568190 4704 chr8 29349887 29358204 29351510,29356570 N,Y NA;KIF13B,DUSP4,DUSP4 NA C8orf75,LOC286135,MIR3148,DUSP4,MIR548O2,TMEM66 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 582445 4705 chr8 29384018 29390535 29387435 N NA NA C8orf75,MIR3148,DUSP4,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 550114 4706 chr8 29519819 29523801 29522882 Y KIF13B NA C8orf75,LOC286135,MIR548O2,TMEM66,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 416848 4707 chr8 29621223 29632319 29628089,29624901,29630924 N,N,N NA;NA;NA NA C8orf75,DUSP4,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 308330 4708 chr8 29660431 29663543 29661974 N NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 277106 4709 chr8 29885752 29887423 29886786 N NA NA C8orf75,HMBOX1,KIF13B,DUSP4,LOC286135 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 53226 4710 chr8 30111435 30116163 30112662 N NA NA NA NA NA NA DCTN6 97622 4711 chr8 30136510 30140386 30137229 N NA NA RBPMS,LOC100128750,MIR548O2,DCTN6,GTF2E2,LOC100507341 IMR90 Hi-C 24141950 DCTN6 122697 4712 chr8 30735516 30741845 30737702 N NA NA WRN IMR90 Hi-C 24141950 PPP2CB 65164 4713 chr8 32795087 32868715 32816023,32826023 N,N NA;NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 461949 4714 chr8 32875696 32890163 32876489 N NA NA NA NA NA NA FUT10 440501 4715 chr8 32936017 32964081 32962583 N NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 366583 4716 chr8 33048544 33054840 33053571 N NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 275824 4717 chr8 33060843 33078227 33070764,33076103 N,N NA;NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 252437 4718 chr8 33095698 33103585 33095902,33101611 N,N NA;NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 227079 4719 chr8 33108177 33112073 33110397 N NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 218591 4720 chr8 33554481 33560646 33555767 N NA NA NA NA NA NA RNF122 129838 4721 chr8 33575812 33700924 33579875 Y NA NA NA NA NA NA RNF122 151169 4722 chr8 34714158 34719792 34715932 N NA NA NA NA NA NA RNF122 1289515 4723 chr8 34769833 34772535 34771284 N NA NA NA NA NA NA RNF122 1345190 4724 chr8 36998483 37007637 37002158,37005720 N,Y NA;NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF703 545664 4725 chr8 37292144 37294500 37293297 N NA NA KCNU1,ZNF703 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 258801 4726 chr8 37389180 37391567 37390248 N NA NA KCNU1,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF703 161734 4727 chr8 37400925 37402825 37401478 N NA NA KCNU1,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF703 150476 4728 chr8 38402405 38404284 38402545 N NA NA FGFR1,LETM2,C8orf86,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFR1 76053 4729 chr8 38407819 38411245 38409877 N NA NA FGFR1,C8orf86,RNF5P1,LETM2,WHSC1L1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFR1 81467 4730 chr8 38516821 38519844 38517746 N NA NA C8orf86,FGFR1,LETM2,RNF5P1,WHSC1L1 IMR90 Hi-C 24141950 TACC1 65860 4731 chr8 38731847 38735554 38732533 N NA PLEKHA2 HTRA4,TACC1,PLEKHA2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA2 23199 4732 chr8 39681 41693 40409 N NA NA NA NA NA NA ZNF596 140507 4733 chr8 39974558 39978377 39976772 Y IDO1 C8orf4 C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 32610 4734 chr8 40189692 40203134 40201108 N NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 178705 4735 chr8 40206521 40209098 40207602 N NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 195534 4736 chr8 41058076 41060334 41059171 N NA NA SFRP1,GOLGA7 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA7 287747 4737 chr8 41981076 41984332 41983679 N NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,IKBKB IMR90 Hi-C 24141950 AP3M2 26132 4738 chr8 41995563 41998965 41998050 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 11499 4739 chr8 42512957 42514380 42513494 N NA NA SLC20A2,VDAC3,C8orf40,KAT6A,PLAT,AP3M2,POLB,DKK4,CHRNB3,CHRNA6,RNF170 IMR90 Hi-C 24141950 SLC20A2 115889 4740 chr8 43092628 43097865 43093021,43097055 Y,N HOOK3;NA NA NA NA NA NA HGSNAT 97036 4741 chr8 43413371 43416342 43414716 N NA NA NA NA NA NA HGSNAT 417779 4742 chr8 43782687 43784265 43783604 N NA NA NA NA NA NA HGSNAT 787095 4743 chr8 46857017 46857762 46857470 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 1315727 4744 chr8 46946269 46948219 46947837 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 1225270 4745 chr8 47515853 47524871 47523384 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 648618 4746 chr8 49220483 49222488 49221381 N NA NA SNAI2,UBE2V2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 299488 4747 chr8 49281491 49284980 49282801 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 360496 4748 chr8 49291779 49311886 49293992,49309925 N,N NA;NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 370784 4749 chr8 49317694 49323389 49321480 N NA NA SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 396699 4750 chr8 49325893 49334984 49333151 N NA NA SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 404898 4751 chr8 49339777 49342458 49341089 N NA NA SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 418782 4752 chr8 49344112 49346051 49344786 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 423117 4753 chr8 49502975 49505967 49503921 N NA NA SNAI2,EFCAB1,MCM4,UBE2V2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAI2 328032 4754 chr8 49539603 49545399 49541774,49540793 N,N NA;NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 SNAI2 288600 4755 chr8 50312212 50315453 50314118 N NA NA NA NA NA NA SNAI2 478213 4756 chr8 52090272 52092421 52091288 N NA NA NA NA NA NA PCMTD1 719314 4757 chr8 53378364 53382459 53379901 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA RB1CC1 244567 4758 chr8 53707857 53710755 53707927,53709146 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RB1CC1 80831 4759 chr8 53711435 53714740 53713352 N NA NA NA NA NA NA RB1CC1 84409 4760 chr8 53734802 53739952 53737376,53739069 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RB1CC1 107776 4761 chr8 53754966 53758495 53756446 N NA NA NA NA NA NA RB1CC1 127940 4762 chr8 53801555 53809054 53807100 N NA NA NA NA NA NA RB1CC1 174529 4763 chr8 54432981 54438988 54433735,54436547 N,N NA;NA NA SOX17 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1H 316862 4764 chr8 55465673 55473725 55467102 N NA NA NA NA NA NA SOX17 95178 4765 chr8 55475330 55481216 55475821 N NA NA NA NA NA NA SOX17 104835 4766 chr8 55786061 55788965 55786997 N NA NA NA NA NA NA SOX17 415566 4767 chr8 55794380 55796911 55795575 N NA NA NA NA NA NA SOX17 423885 4768 chr8 55806703 55809659 55807854,55808710 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SOX17 436208 4769 chr8 57593149 57595999 57594442 N NA NA NA NA NA NA IMPAD1 310431 4770 chr8 57686722 57687698 57687288 N NA NA NA NA NA NA IMPAD1 218732 4771 chr8 57787752 57790295 57789032 Y NA NA CHCHD7,PLAG1 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 116135 4772 chr8 57801036 57803756 57802614 N NA NA CHCHD7,PLAG1 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 102674 4773 chr8 58502580 58504656 58503560 N NA NA NA NA NA NA LOC100507651 370932 4774 chr8 59665049 59666928 59665756 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 NSMAF 92645 4775 chr8 59670739 59673221 59672010 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 NSMAF 98335 4776 chr8 6037069 6040487 6037999 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 223582 4777 chr8 6048147 6054979 6049134 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 209090 4778 chr8 60528246 60531730 60530036 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 RAB2A 897739 4779 chr8 60578360 60580254 60579150 N NA NA NA NA NA NA RAB2A 849215 4780 chr8 60605812 60608785 60607477 N NA NA NA NA NA NA RAB2A 820684 4781 chr8 61565452 61568328 61566315 N NA CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 22996 4782 chr8 6169802 6172752 6171370 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 91317 4783 chr8 61849521 61851393 61850416 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 258197 4784 chr8 61935605 61938671 61936278 N NA NA CHD7,RAB2A IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 344281 4785 chr8 62671351 62675583 62673100 N NA ASPH ASPH,MIR4470 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASPH 44152 4786 chr8 62678514 62681032 62679837 Y NA NA ASPH,MIR4470 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASPH 51315 4787 chr8 65151390 65154318 65152642 N NA NA NA NA NA NA YTHDF3 1070269 4788 chr8 6538762 6546644 6546172 N NA AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 AGPAT5 19234 4789 chr8 70031113 70037449 70033184 Y NA NA NA NA NA NA SLCO5A1 709850 4790 chr8 7043199 7048550 7043734 N NA NA NA NA NA NA XKR5 350033 4791 chr8 70906053 70908098 70907087 N NA NA NA NA NA NA SLCO5A1 158754 4792 chr8 72465557 72467249 72466684 N NA NA NA NA NA NA LOC100132891 288109 4793 chr8 72587562 72591896 72587997 N NA NA NA NA NA NA LOC100132891 163462 4794 chr8 72994643 73028293 73014343,72995770,73019445 N,N,N NA;NA;NA NA TRPA1,LOC100132891 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100132891 239285 4795 chr8 74085406 74088116 74086287 N NA NA NA NA NA NA RPL7 117753 4796 chr8 74266622 74270652 74268854 N NA NA RDH10,RPL7,STAU2,LOC100128126 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RDH10 59785 4797 chr8 75086896 75091722 75090723 N NA NA NA NA NA NA JPH1 141840 4798 chr8 76315418 76339986 76320522 N NA NA NA NA NA NA JPH1 1081856 4799 chr8 77317310 77319993 77318560 N NA NA ZFHX4 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX4 273522 4800 chr8 78823603 78829549 78828140 N NA NA NA NA NA NA PKIA 598787 4801 chr8 78845760 78854818 78852814 N NA NA NA NA NA NA PKIA 573518 4802 chr8 79349335 79352480 79350967 N NA NA NA NA NA NA PKIA 75856 4803 chr8 79419944 79421394 79420761 N NA PKIA PKIA IMR90 Hi-C 24141950 PKIA 6942 4804 chr8 79556026 79557900 79556453 N NA ZC2HC1A ZC2HC1A MCF7 ChIA-PET 22265404 ZC2HC1A 20382 4805 chr8 79932615 79934915 79933857 N NA NA NA NA NA NA ZC2HC1A 354333 4806 chr8 80031077 80034582 80032289 N NA NA NA NA NA NA ZC2HC1A 452795 4807 chr8 80275383 80279441 80278053 N NA NA NA NA NA NA HEY1 400657 4808 chr8 80700356 80709058 80701293,80706718 Y,N HEY1;NA HEY1 HEY1,MRPS28,TPD52 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 20258 4809 chr8 80764669 80766949 80766288 N NA NA MRPS28,HEY1 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 84571 4810 chr8 8080417 8083939 8081114,8082372 N,N NA;NA FLJ10661 NA NA NA NA FLJ10661 2153 4811 chr8 81168128 81171865 81170520 N NA NA NA NA NA NA TPD52 84292 4812 chr8 81211995 81215173 81213281 N NA NA NA NA NA NA TPD52 128159 4813 chr8 81234155 81235978 81234980 N NA NA NA NA NA NA TPD52 150319 4814 chr8 81258671 81265606 81260243,81262158 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZBTB10 132842 4815 chr8 81488181 81494943 81490386 N NA NA ZBTB10,TPD52,PAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZBTB10 89733 4816 chr8 81830015 81832061 81831046 Y ZBTB10,PAG1 ZNF704 ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF704 42999 4817 chr8 82139004 82141642 82139793 N NA NA PAG1,ZBTB10 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 51076 4818 chr8 8246158 8249151 8247642 Y NA SGK223 FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 6901 4819 chr8 83169640 83171786 83170529 N NA NA NA NA NA NA SNX16 415119 4820 chr8 83586730 83590509 83588324 N NA NA NA NA NA NA SNX16 832209 4821 chr8 8393119 8397364 8395387 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 153862 4822 chr8 8400786 8410265 8402943,8407853,8406081 N,N,N NA;NA;NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 161529 4823 chr8 84142774 84146434 84143476 N NA NA NA NA NA NA SNX16 1388253 4824 chr8 8456426 8459375 8457935 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 217169 4825 chr8 8466776 8469679 8468627 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 227519 4826 chr8 8481858 8486601 8483595,8484371 N,N NA;NA NA SGK223,MFHAS1,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 242601 4827 chr8 8491258 8494498 8492966 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 252001 4828 chr8 8497326 8500601 8499065 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 258069 4829 chr8 85003856 85007820 85006620 N NA NA NA NA NA NA LRRCC1 1011503 4830 chr8 8521261 8535146 8522856 N NA NA SGK223,FLJ10661,ERI1,MFHAS1,CLDN23 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 282004 4831 chr8 86843947 86853543 86845355,86849112 N,N NA;NA NA CA2 MCF7 ChIA-PET 22265404 REXO1L2P 95420 4832 chr8 86854800 86857441 86855621 N NA NA CA2 MCF7 ChIA-PET 22265404 REXO1L2P 106273 4833 chr8 86865259 86869570 86866769 N NA NA NA NA NA NA REXO1L2P 116732 4834 chr8 87301421 87304711 87302845 N NA NA WWP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 WWP1 50283 4835 chr8 87317491 87320858 87318348 N NA WWP1 WWP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 WWP1 34136 4836 chr8 87840015 87841832 87840879 N NA NA NA NA NA NA CPNE3 313359 4837 chr8 87851783 87855908 87854777 N NA NA NA NA NA NA CPNE3 325127 4838 chr8 88985629 88988258 88986912 N NA NA NA NA NA NA MMP16 351459 4839 chr8 89436190 89439875 89437762 N NA NA NA NA NA NA MMP16 96473 4840 chr8 8944798 8954247 8946251 N NA NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 ERI1 84484 4841 chr8 89708039 89709759 89708835 N NA NA NA NA NA NA MMP16 368322 4842 chr8 89942275 89944188 89943268 N NA NA NA NA NA NA MMP16 602558 4843 chr8 89950994 89955931 89952346,89954415 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MMP16 611277 4844 chr8 90264304 90272377 90271107 Y NA NA NA NA NA NA RIPK2 497598 4845 chr8 9044500 9051041 9046096,9048166 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ERI1 184186 4846 chr8 90544762 90553470 90547671 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 216505 4847 chr8 90608053 90612753 90609395 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 157222 4848 chr8 90617995 90629383 90624088,90627977 N,N NA;NA NA MMP16 IMR90 Hi-C 24141950 RIPK2 140592 4849 chr8 90708062 90710985 90710148 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 58990 4850 chr8 90712243 90719561 90715453 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 50414 4851 chr8 90834799 90840830 90838343,90836671 N,N NA;NA NA OSGIN2,RIPK2,NBN MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RIPK2 64824 4852 chr8 91373966 91376640 91375137 N NA NA NA NA NA NA TMEM64 281493 4853 chr8 91478370 91482099 91480019 Y NA NA DECR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM64 176034 4854 chr8 91483337 91485157 91483822 N NA NA DECR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM64 172976 4855 chr8 91547686 91550393 91549103 N NA NA NA NA NA NA TMEM64 107740 4856 chr8 91681972 91684364 91683372 Y NA TMEM64 TMEM64,NECAB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMEM64 23839 4857 chr8 92610944 92614949 92612736,92613380 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LRRC69 496097 4858 chr8 9304974 9307987 9305866 N NA NA NA NA NA NA TNKS 105458 4859 chr8 93149789 93153146 93151201 N NA NA NA NA NA NA FLJ46284 645142 4860 chr8 94240503 94249108 94242137 N NA NA NA NA NA NA FLJ46284 442215 4861 chr8 94882721 94889675 94886687 N NA PDP1 FAM92A1,C8orf39,RBM12B,MIR378D2,PDP1 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 39408 4862 chr8 94890993 94894914 94892602 Y NA PDP1 TMEM67,PDP1,MIR378D2 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 34169 4863 chr8 94897425 94899467 94898017 N NA PDP1 TMEM67,PDP1,MIR378D2 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 29616 4864 chr8 95001718 95005047 95003825 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 72635 4865 chr8 96001437 96023160 96002136 N NA TP53INP1,C8orf38 CCNE2,C8orf37,LOC100616530,PLEKHF2,C8orf69,TP53INP1,MIR3150B,MIR3150A,C8orf38 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C8orf38 14054 4866 chr8 96111471 96122924 96112735 N NA PLEKHF2 MIR3150A,MIR3150B,C8orf38,C8orf69,PLEKHF2,C8orf37 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHF2 23025 4867 chr8 98304083 98307136 98306260 N NA TSPYL5 PTDSS1,CPQ,TSPYL5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSPYL5 13907 4868 chr8 98554882 98559111 98556861 N NA NA PTDSS1,SDC2,CPQ IMR90 Hi-C 24141950 MTDH 97296 4869 chr8 98775338 98776959 98775758 N NA LAPTM4B LAPTM4B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LAPTM4B 10850 4870 chr8 99370201 99373016 99370999 N NA NA POP1,STK3,VPS13B,NIPAL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POP1 240680 4871 chr9 100465343 100467243 100466333 N NA XPA XPA K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 XPA 5652 4872 chr9 100562870 100570430 100565291 N NA NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 103179 4873 chr9 101943029 101945231 101944098 Y ALG2 ALG2,SEC61B ERP44,INVS,TEX10,NR4A3 IMR90 Hi-C 24141950 ALG2 39015 4874 chr9 103140554 103144152 103142242 N NA TEX10 NA NA NA NA TEX10 25295 4875 chr9 103172813 103175585 103174085 Y NA C9orf30-TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf30-TMEFF1 28603 4876 chr9 106993392 106997505 106995145 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 136851 4877 chr9 107721938 107724920 107723706 Y NIPSNAP3A,ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC286367 185305 4878 chr9 107728967 107732332 107730704 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC286367 192334 4879 chr9 107751404 107774289 107753534,107755849,107755958,107756443 N,Y,Y,N NA;ABCA1;ABCA1;NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC286367 214771 4880 chr9 107828539 107835850 107833542,107830408 Y,N NA;NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 171079 4881 chr9 107887952 107891998 107889572 N NA NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 114931 4882 chr9 109974288 109976942 109975922 Y KLF4 NA NA NA NA NA RAD23B 68575 4883 chr9 110473010 110477293 110474422 N NA NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RAD23B 427493 4884 chr9 110510675 110519816 110513388,110517791 N,Y NA;KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAD23B 465158 4885 chr9 110802265 110805466 110803654 N NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 756748 4886 chr9 110810500 110817170 110811754 N NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 764983 4887 chr9 110817804 110821284 110819531 N NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 772287 4888 chr9 111203971 111207996 111206452 N NA NA NA NA NA NA IKBKAP 488612 4889 chr9 111234885 111237789 111236610 N NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IKBKAP 458819 4890 chr9 111240082 111241964 111241128 N NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IKBKAP 454644 4891 chr9 112524811 112535780 112534162 N NA PALM2-AKAP2 PALM2-AKAP2,C9orf152 IMR90 Hi-C 24141950 PALM2-AKAP2 6797 4892 chr9 113596371 113599389 113597870 N NA NA LPAR1,MUSK IMR90 Hi-C 24141950 TXN 577451 4893 chr9 114612815 114616376 114614569 N NA UGCG MIR3134,SUSD1,UGCG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 42830 4894 chr9 114628593 114630311 114629113 N NA UGCG MIR3134,SUSD1,C9orf84,UGCG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 28895 4895 chr9 114718587 114724673 114721309 N NA NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 59381 4896 chr9 116410923 116419692 116413178 N NA NA C9orf43,RGS3,ALAD,RNF183,WDR31,CDC26,SLC31A1,PRPF4,POLE3,HDHD3,BSPRY IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF618 218870 4897 chr9 117278262 117281451 117279482 N NA NA DFNB31,C9orf91,AKNA,ATP6V1G1,TNFSF8 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP6V1G1 68543 4898 chr9 117311842 117317376 117314399 Y TNFSF8,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1 ATP6V1G1 DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V1G1 32618 4899 chr9 117451987 117455605 117453844 N NA NA DFNB31,AKNA,LOC100505478,TNFSF8,TNFSF15,TNC,DEC1 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 78281 4900 chr9 118350919 118355316 118353353 N NA NA ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 470383 4901 chr9 118410618 118414278 118412527 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 530082 4902 chr9 118429273 118437543 118430995,118435232 Y,N NA;NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 548737 4903 chr9 118452414 118455630 118453852 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 571878 4904 chr9 118705106 118708230 118706870 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 741351 4905 chr9 118757738 118761751 118760414,118758884,118760380 Y,Y,Y NA;NA;NA NA PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 687830 4906 chr9 118764218 118766088 118765001 N NA NA PAPPA,LINC00474,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 683493 4907 chr9 120534267 120537265 120535055 N NA NA NA NA NA NA TLR4 67814 4908 chr9 121404097 121407179 121405610 N NA NA NA NA NA NA TLR4 937644 4909 chr9 122725509 122727376 122726040 N NA NA CDK5RAP2 IMR90 Hi-C 24141950 CDK5RAP2 615061 4910 chr9 123819581 123821115 123820786 N NA CNTRL NA NA NA NA CNTRL 29459 4911 chr9 125539262 125542134 125540730 N NA PDCL OR1J1 IMR90 Hi-C 24141950 PDCL 48801 4912 chr9 126839719 126842839 126840775 N NA NA STRBP,DENND1A,NEK6,LHX2 IMR90 Hi-C 24141950 DENND1A 147302 4913 chr9 127013555 127015436 127014499 N NA NEK6 NEK6 MCF7 ChIA-PET 22265404 NEK6 4449 4914 chr9 128165634 128176692 128168986,128172612 N,Y NA;NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 141523 4915 chr9 130368642 130372106 130370893 N NA FAM129B,STXBP1 AK1,STXBP1,LRSAM1,MIR3911,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,FAM129B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STXBP1 2380 4916 chr9 130763082 130766721 130764230 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 20270 4917 chr9 131442493 131443762 131442654 N NA WDR34,SET,PKN3,ZDHHC12,LOC100506100 SET K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SET 2172 4918 chr9 131959841 131962499 131960870 N NA IER5L IER5L,C9orf50,METTL11A,C9orf106,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,ASB6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 IER5L 19301 4919 chr9 131986699 131990990 131988340 Y NA IER5L LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,ASB6,SH3GLB2,CRAT IMR90,K562,MCF7,HELA Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 IER5L 46159 4920 chr9 132007057 132007777 132007748 N NA NA LOC100506190,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,ASB6,C9orf50,PTGES IMR90,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 IER5L 66517 4921 chr9 132030632 132032965 132031139 N NA NA LOC100506190,C9orf50,PTGES,C9orf106,IER5L,METTL11A,TOR1A,TOR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5L 90092 4922 chr9 132037362 132041395 132040418 N NA NA LOC100506190,PTGES,C9orf106,IER5L,SH3GLB2,DOLPP1,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7,GM12878,HELA,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 IER5L 96822 4923 chr9 132219620 132224773 132223269 Y C9orf106,TOR1B LOC100506190 PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 26166 4924 chr9 132318653 132338213 132325531,132330651,132333063 N,N,N NA;NA;NA NA DOLPP1,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL11A 50222 4925 chr9 132537921 132541401 132539585 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 24031 4926 chr9 13261410 13281983 13278814,13268618 N,Y NA;NA MPDZ MPDZ,NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 11045 4927 chr9 133836833 133839157 133838170 N NA LAMC3 FIBCD1,PRDM12,NUP214,FUBP3,ABL1,LAMC3,QRFP,AIF1L,EXOSC2,LOC100272217 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAMC3 45347 4928 chr9 134245566 134251784 134248921 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B NA PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 53693 4929 chr9 13664924 13667044 13665969 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 414559 4930 chr9 137393321 137396369 137394847 Y NA NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR5 392111 4931 chr9 137426357 137429653 137428376 N NA NA UBE2D2 MCF7 ChIA-PET 19890323 WDR5 425147 4932 chr9 137435686 137438564 137436467 N NA NA NA NA NA NA WDR5 434476 4933 chr9 137441148 137455767 137443934 N NA NA COL5A1,RXRA MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR5 439938 4934 chr9 137515642 137517585 137516924 N NA NA COL5A1,RXRA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR5 514432 4935 chr9 138057053 138059427 138058679 N NA NA OLFM1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506599 304668 4936 chr9 139158212 139162687 139159301 N NA QSOX2 QSOX2,LHX3,C9orf69 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 QSOX2 20525 4937 chr9 139450461 139469883 139466731,139468469,139462620 Y,N,Y NA;NA;C9orf69 NOTCH1 C9orf163,SEC16A,MIR4674,NOTCH1,EGFL7,AGPAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOTCH1 10223 4938 chr9 15377184 15381378 15379440 N NA SNAPC3 TTC39B IMR90 Hi-C 24141950 SNAPC3 41404 4939 chr9 16056668 16065421 16059103,16063065 N,Y NA;NA NA BNC2,CNTLN,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 PSIP1 545665 4940 chr9 16202061 16204529 16203609 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 PSIP1 691058 4941 chr9 16206220 16209062 16207347 N NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 PSIP1 695217 4942 chr9 16335355 16339353 16336746 N NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 795685 4943 chr9 16343362 16346280 16344531 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 788758 4944 chr9 16922361 16924380 16923535 N NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 210658 4945 chr9 16963022 16969824 16964339 N NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 165214 4946 chr9 18313162 18317115 18314522 N NA NA NA NA NA NA RRAGA 732257 4947 chr9 18377723 18381182 18379298 N NA NA ADAMTSL1,FAM154A IMR90 Hi-C 24141950 RRAGA 668190 4948 chr9 18458877 18461374 18460147 N NA NA ADAMTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RRAGA 587998 4949 chr9 19229058 19256581 19230365 N NA DENND4C DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4C 34168 4950 chr9 21578499 21593907 21590778,21591770 N,N NA;NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 208728 4951 chr9 21615514 21618018 21616554 N NA NA MIR31HG,MTAP IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 184617 4952 chr9 21680328 21689388 21683977,21688523,21681841 N,N,Y NA;NA;NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 113247 4953 chr9 21795685 21798498 21796927 N NA MTAP MIR31HG,IFNE,KLHL9,IFNA1 IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 4137 4954 chr9 22147073 22150248 22148391 Y NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2B,CDKN2A IMR90 Hi-C 24141950 DMRTA1 296592 4955 chr9 22236331 22281538 22239605 N NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2A,C9orf53,CDKN2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 165302 4956 chr9 2240923 2244036 2242579 N NA NA FLJ35024,VLDLR,KIAA0020,SMARCA2 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA2 225581 4957 chr9 23848818 23852083 23851074 Y NA ELAVL2 NA NA NA NA ELAVL2 22755 4958 chr9 26256878 26264433 26261078 N NA NA NA NA NA NA TUSC1 578022 4959 chr9 26722164 26727381 26723740,26723831,26725994 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA C9orf82 165445 4960 chr9 27688511 27696807 27690508 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 114647 4961 chr9 27864141 27866554 27865241 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 290277 4962 chr9 2875297 2876414 2876069 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 31167 4963 chr9 29287299 29293289 29292382 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 1713435 4964 chr9 29428922 29457024 29450378 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 1855058 4965 chr9 31136575 31138224 31137726 N NA NA NA NA NA NA ACO1 1246377 4966 chr9 31303625 31305040 31304242 N NA NA NA NA NA NA ACO1 1079561 4967 chr9 31807046 31808890 31808001 N NA NA NA NA NA NA ACO1 575711 4968 chr9 31847484 31865240 31848643 N NA NA NA NA NA NA ACO1 519361 4969 chr9 32927667 32931219 32930835 N NA NA NA NA NA NA APTX 70420 4970 chr9 34160308 34163437 34161973 N NA DCAF12,UBAP1 PRSS3,UBAP1,UBAP2,KIF24,SNORD121B,DCAF12,NUDT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 15566 4971 chr9 34164787 34166189 34165985 N NA DCAF12,UBAP1 UBAP1,UBAP2,KIF24,SNORD121B,DCAF12,NUDT2 IMR90 Hi-C 24141950 UBAP1 12814 4972 chr9 34168972 34172875 34171291 N NA DCAF12,UBAP1 UBAP2,UBAP1,KIF24,DCAF12 IMR90 Hi-C 24141950 UBAP1 6128 4973 chr9 35021097 35025494 35023309 N NA DNAJB5,VCP C9orf131 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB5 31459 4974 chr9 35960869 35965970 35962376 N NA NA C9orf128 IMR90 Hi-C 24141950 RECK 70940 4975 chr9 36468496 36474415 36473144,36468706 N,N NA;NA NA RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 67301 4976 chr9 36566458 36569577 36567058 N NA MELK RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 3282 4977 chr9 36764924 36769238 36765856 N NA NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 192065 4978 chr9 37469961 37473741 37472267 N NA GRHPR,ZBTB5,POLR1E GRHPR,POLR1E,FBXO10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBTB5 4554 4979 chr9 38140721 38155389 38141962,38144585 N,Y NA;NA NA SHB,ALDH1B1,MCART1 IMR90 Hi-C 24141950 SHB 71511 4980 chr9 38169366 38174690 38171483 N NA NA DCAF10,SHB IMR90 Hi-C 24141950 SHB 100156 4981 chr9 38209742 38222389 38219935 N NA NA MCART1 IMR90 Hi-C 24141950 SHB 140532 4982 chr9 38308611 38320682 38311211,38319286 N,N NA;NA NA MCART1,DCAF10,SHB IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 71979 4983 chr9 38381376 38386657 38383731 N NA ALDH1B1 FBXO10,TOMM5,SHB,ALDH1B1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALDH1B1 6004 4984 chr9 38670981 38674158 38672713 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 278320 4985 chr9 38679969 38682780 38681330 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 287308 4986 chr9 38686795 38689632 38687602 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 294134 4987 chr9 42241659 42243581 42242719 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L2 473653 4988 chr9 42250350 42264268 42251690,42259190 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L2 452966 4989 chr9 42753209 42763190 42754176 N NA FOXD4L2 NA NA NA NA FOXD4L2 35975 4990 chr9 42811255 42823313 42819125,42811936 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L2 94021 4991 chr9 44070248 44071804 44070759 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 918432 4992 chr9 44118445 44118853 44118823 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 871383 4993 chr9 44242571 44253511 44245372,44251788 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27C 736725 4994 chr9 44312170 44313527 44313154 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 676709 4995 chr9 44322943 44332683 44326224 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 657553 4996 chr9 44872801 44881295 44874775,44879270 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27C 108941 4997 chr9 45352352 45362291 45355315 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 362116 4998 chr9 45437977 45495974 45441926 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 231055 4999 chr9 46111930 46169165 46113348,46116559 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27A 384901 5000 chr9 46386026 46390537 46386256 N NA NA NA NA NA NA KGFLP1 297029 5001 chr9 5267323 5271161 5269122 N NA INSL4 C9orf46 IMR90 Hi-C 24141950 INSL4 35904 5002 chr9 5600844 5609571 5608659 N NA KIAA1432 INSL6,JAK2,RCL1,CD274 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1432 19548 5003 chr9 5620195 5626896 5625387 N NA KIAA1432 RCL1,KIAA1432,JAK2,PDCD1LG2,ERMP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1432 2223 5004 chr9 5874743 5883283 5879858 N NA ERMP1 ERMP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ERMP1 41662 5005 chr9 66454539 66471768 66458549,66465882,66454662,66457894 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 LOC642236 1982607 5006 chr9 66551400 66563504 66553930 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1890871 5007 chr9 66693704 66701879 66694995,66700063 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 1752496 5008 chr9 6678054 6696966 6681355,6680245 Y,N UHRF2,KDM4C;NA NA KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KDM4C 60675 5009 chr9 66857126 66859605 66858362 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1594770 5010 chr9 66963170 66989995 66963801,66971185,66973699 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 1464380 5011 chr9 6701954 6708611 6704239 N NA KDM4C KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 49030 5012 chr9 67300929 67308502 67302475 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1145873 5013 chr9 67317284 67318828 67318122 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1135547 5014 chr9 68294186 68313042 68299299,68307270 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 141333 5015 chr9 68359916 68366981 68365354 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 87394 5016 chr9 68796814 68801835 68797703 N NA NA NA NA NA NA LOC100132352 70273 5017 chr9 69149872 69152482 69150568 N NA PGM5P2,FOXD4L6 NA NA NA NA PGM5P2 2018 5018 chr9 69709864 69711931 69710998 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 507660 5019 chr9 69778596 69791185 69779352,69788427 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 576392 5020 chr9 69798578 69803325 69801070,69802854 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 596374 5021 chr9 69814264 69828025 69824879 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 612060 5022 chr9 69828874 69850281 69844817 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 626670 5023 chr9 69854564 69863173 69861840 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 652360 5024 chr9 69869618 69871361 69869778 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 667414 5025 chr9 69876722 69884873 69880820,69877930,69882697 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 674518 5026 chr9 70645203 70662510 70646391,70651453,70653525 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CBWD3 194329 5027 chr9 72585879 72588147 72586533 N NA NA MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3 IMR90 Hi-C 24141950 PTAR1 211003 5028 chr9 72589211 72593169 72591289 Y NA NA MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3,PTAR1,TJP2 IMR90 Hi-C 24141950 PTAR1 214335 5029 chr9 72635159 72638266 72636330 N NA NA MAMDC2,LOC100507299,SMC5,TRPM3,C9orf135,LOC100507244 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 235612 5030 chr9 72644612 72647984 72645791 N NA NA MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 225894 5031 chr9 72652227 72653945 72653322 N NA NA MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 219933 5032 chr9 73031643 73043349 73034179 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 2070 5033 chr9 73053169 73055661 73053670 N NA KLF9 TRPM3,KLF9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF9 23596 5034 chr9 75003561 75005859 75004104 N NA ZFAND5 TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 23398 5035 chr9 75047935 75050237 75048697 N NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 67772 5036 chr9 75055051 75059990 75057723 N NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND5 74888 5037 chr9 75087873 75090063 75088602 Y ZFAND5 NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 107710 5038 chr9 75091539 75095074 75092724,75094118 N,N NA;NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND5 111376 5039 chr9 75105990 75108798 75106972 N NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 125827 5040 chr9 75746338 75748775 75747187 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 18006 5041 chr9 75834452 75836774 75835300 Y NA NA RORB IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 67671 5042 chr9 76263375 76263855 76263443 N NA NA NA NA NA NA ANXA1 496594 5043 chr9 76297426 76301681 76299484,76301070 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA ANXA1 530645 5044 chr9 76463620 76467626 76466064 N NA NA NA NA NA NA ANXA1 696839 5045 chr9 76508030 76513740 76511994 N NA NA NA NA NA NA ANXA1 741249 5046 chr9 76588195 76596463 76594260 N NA NA NA NA NA NA ANXA1 821414 5047 chr9 79189918 79201399 79191999 N NA NA PRUNE2 IMR90 Hi-C 24141950 RPSAP9 176403 5048 chr9 79540549 79543606 79541443 N NA NA PRUNE2 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13A 248755 5049 chr9 80828819 80840185 80830681 N NA CEP78 CEP78 MCF7 ChIA-PET 22265404 CEP78 10806 5050 chr9 81321616 81324265 81322991 N NA NA NA NA NA NA PSAT1 409557 5051 chr9 81479758 81483454 81481747 N NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 567699 5052 chr9 81483979 81488195 81486655 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 571920 5053 chr9 81636569 81639651 81638252 N NA NA NA NA NA NA PSAT1 724510 5054 chr9 83180504 83180949 83180661 N NA NA NA NA NA NA TLE1 1122647 5055 chr9 83609631 83611924 83610401 N NA NA NA NA NA NA TLE1 691672 5056 chr9 84000799 84006171 84004693 Y NA NA TLE1 IMR90 Hi-C 24141950 TLE1 297425 5057 chr9 84439215 84442358 84440615 N NA NA TLE1 IMR90 Hi-C 24141950 TLE1 135619 5058 chr9 84455805 84460995 84457661 N NA NA TLE1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE1 152209 5059 chr9 84635325 84637785 84636235 N NA NA NA NA NA NA TLE1 331729 5060 chr9 86784461 86788650 86785478,86785976 N,Y NA;NA NA C9orf64,SLC28A3,HNRNPK,RMI1 IMR90 Hi-C 24141950 RMI1 188824 5061 chr9 87826536 87830118 87827381 N NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 526826 5062 chr9 88759710 88763962 88760858 N NA NA NA NA NA NA C9orf153 110557 5063 chr9 88815425 88817386 88816728 N NA NA NAA35 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf153 57133 5064 chr9 89019871 89023889 89021544 N NA NA GAS1,DAPK1,ZCCHC6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC6 50469 5065 chr9 89037790 89039858 89037987 N NA NA GAS1,DAPK1,LOC440173,C9orf170,LOC494127 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 68388 5066 chr9 89597051 89599691 89598756 N NA GAS1 LOC494127,GAS1,C9orf170 IMR90 Hi-C 24141950 GAS1 34947 5067 chr9 89799375 89801964 89800350 N NA C9orf170 C9orf170 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf170 35816 5068 chr9 89808017 89815595 89809621,89813377 N,N NA;NA C9orf170 GAS1,ZCCHC6,C9orf170 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf170 44458 5069 chr9 89819735 89823478 89821399 N NA NA NA NA NA NA C9orf170 56176 5070 chr9 89825692 89830542 89827615 N NA NA ZCCHC6 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf170 62133 5071 chr9 89989583 89992420 89990493,89990668 N,Y NA;NA NA DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf170 226024 5072 chr9 90000803 90004661 90002815 N NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf170 237244 5073 chr9 90524981 90527811 90527258 N NA NA NA NA NA NA CDK20 61884 5074 chr9 90884572 90886246 90885295 N NA NA NXNL2,SPIN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPIN1 117051 5075 chr9 91135767 91140117 91137652 N NA NA SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2,CDK20,NXNL2,S1PR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPIN1 132470 5076 chr9 91388097 91389701 91388916 N NA NA SHC3,MIR4289,LOC286238,S1PR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S1PR3 216661 5077 chr9 93725555 93728148 93726916 N NA NA ROR2,LOC100129316,AUH,SYK IMR90 Hi-C 24141950 AUH 396058 5078 chr9 94276557 94279036 94277591 N NA NA NFIL3 IMR90 Hi-C 24141950 NFIL3 90413 5079 chr9 96901360 96904085 96902622 N NA NA NA NA NA NA PTPDC1 108284 5080 chr9 97410348 97414734 97411548 Y ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3 NA FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 74217 5081 chr9 97434630 97437047 97435699 N NA NA FANCC,C9orf3 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 51904 5082 chr9 98331925 98334718 98333145 N NA NA FANCC,LOC158435,C9orf102,SLC35D2,LINC00476 IMR90 Hi-C 24141950 PTCH1 52678 5083 chr9 99468306 99469716 99468996 N NA NA BDAG1,HSD17B3 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf21 50707 5084 chr9 99986827 99988311 99987973 N NA BDAG1 NA NA NA NA BDAG1 12397 5085 chrX 102658851 102668780 102659679 N NA WBP5,NGFRAP1 NGFRAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NGFRAP1 27583 5086 chrX 103568794 103571284 103570043 N NA NA NA NA NA NA FAM199X 157638 5087 chrX 106916005 106922165 106920294 Y TSC22D3,TSC22D3 PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 44351 5088 chrX 109082443 109085368 109083605 N NA NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 105822 5089 chrX 10955948 10960324 10958610 N NA NA NA NA NA NA HCCS 169082 5090 chrX 11036152 11043378 11036493 N NA NA NA NA NA NA HCCS 86028 5091 chrX 110860810 110863474 110861692 N NA NA NA NA NA NA ALG13 60872 5092 chrX 114958130 114988255 114983207,114974215,114965261,114977202,114986515,114980185,114962328,114959472,114971220,114968241 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA PLS3 162953 5093 chrX 115072955 115086647 115085446 N NA NA NA NA NA NA PLS3 277778 5094 chrX 117414548 117416663 117415646 N NA NA NA NA NA NA IL13RA1 444896 5095 chrX 118339566 118346673 118341534,118342652 N,N NA;NA PGRMC1 NA NA NA NA PGRMC1 23538 5096 chrX 118467079 118471039 118468592 N NA NA NA NA NA NA SLC25A43 62219 5097 chrX 118507397 118510311 118508898 N NA SLC25A43 SLC25A43 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A43 22947 5098 chrX 118636003 118639041 118637587 N NA SLC25A5,SLC25A5-AS1 SOWAHD IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A5-AS1 32920 5099 chrX 118929594 118936085 118930573 N NA RPL39 RPL39,UPF3B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL39 3988 5100 chrX 119619010 119621944 119619837 N NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 15806 5101 chrX 11970014 11974220 11971857 N NA NA FRMPD4,MSL3 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3 193736 5102 chrX 12024659 12028017 12026181 N NA NA NA NA NA NA MSL3 248381 5103 chrX 120325057 120331274 120325811 N NA NA NA NA NA NA GLUD2 143595 5104 chrX 120336901 120343413 120338315 N NA NA NA NA NA NA GLUD2 155439 5105 chrX 122897616 122902131 122899036 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 30712 5106 chrX 124338275 124340945 124338354,124339829 N,N NA;NA NA NA NA NA NA STAG2 1243800 5107 chrX 125605417 125607802 125606487 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 2510942 5108 chrX 128409434 128415679 128412950 N NA NA NA NA NA NA SMARCA1 241781 5109 chrX 128994078 128994406 128994289 N NA ZDHHC9,UTP14A NA NA NA NA ZDHHC9 16168 5110 chrX 129089130 129093401 129091357 N NA UTP14A,BCORL1 UTP14A K562 ChIA-PET 22265404 BCORL1 45763 5111 chrX 12972401 12976601 12974691 N NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16625 5112 chrX 130626881 130631772 130630162 N NA NA NA NA NA NA LOC286467 332899 5113 chrX 130784209 130785874 130784824 N NA NA NA NA NA NA LOC286467 178797 5114 chrX 13241146 13243463 13242463 N NA NA TMSB4X,LOC100133123 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMSB4X 247920 5115 chrX 133801921 133806012 133804558 N NA NA LOC100506757,PLAC1,MGC16121,HPRT1,MIR450A1,MIR450A2,MIR450B,MIR542 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM122B 125250 5116 chrX 133821617 133824319 133823386 N NA NA LOC100506757,PLAC1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM122B 106943 5117 chrX 133851270 133853983 133852542 N NA NA LOC100506757,FAM122B,PLAC1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM122B 77279 5118 chrX 13414381 13418484 13416773 Y NA NA FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB9A 288756 5119 chrX 134460198 134461358 134460548 N NA ZNF449 NA NA NA NA ZNF449 17338 5120 chrX 135212046 135216526 135213153 N NA FHL1 SLC9A6,FHL1 IMR90 Hi-C 24141950 FHL1 12335 5121 chrX 135219911 135225666 135220674 N NA FHL1 SLC9A6,FHL1 IMR90 Hi-C 24141950 FHL1 3195 5122 chrX 135340652 135344741 135342133 N NA NA MAP7D3,SLC9A6,FHL1,ARHGEF6 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FHL1 111791 5123 chrX 135990553 136013889 135992065 N NA RBMX RBMX,ARHGEF6 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBMX 27614 5124 chrX 136520278 136521861 136520462 N NA NA NA NA NA NA RBMX 557339 5125 chrX 138977733 138980200 138978943 N NA NA NA NA NA NA ATP11C 63286 5126 chrX 139605736 139609406 139607816 N NA NA NA NA NA NA RP1-177G6.2 182518 5127 chrX 148957460 148960039 148958999 N NA MAGEA8 NSMCE2 MCF7 ChIA-PET 19890323 MAGEA8 49902 5128 chrX 151148301 151156503 151150312,151154591 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAGEA4 66940 5129 chrX 151661176 151671989 151670079 N NA NA NA NA NA NA MAGEA6 195256 5130 chrX 152064227 152078776 152065831 N NA NA CETN2,NSDHL,ZNF185 MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 64716 5131 chrX 152340167 152348619 152341076 N NA NA NA NA NA NA PNMA6C 99348 5132 chrX 16201534 16205912 16203915 Y NA NA CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S2 328434 5133 chrX 1988722 2005583 1990508,2002618 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 469298 5134 chrX 20379493 20381968 20380485 N NA NA RPS6KA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPS6KA3 94743 5135 chrX 21183643 21185544 21184746 N NA NA NA NA NA NA MBTPS2 672112 5136 chrX 21816120 21820038 21817653 N NA MBTPS2 NA NA NA NA MBTPS2 37618 5137 chrX 21950150 21952748 21950677 Y NA SMS SMS K562 ChIA-PET 22265404 SMS 5967 5138 chrX 23783120 23787372 23785932 N NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 13903 5139 chrX 30909655 30913489 30911507 N NA NA NA NA NA NA NR0B1 582160 5140 chrX 30923554 30927072 30925149 N NA NA NA NA NA NA NR0B1 596059 5141 chrX 38092237 38094519 38093232 N NA SRPX RPGR,SRPX IMR90 Hi-C 24141950 SRPX 12060 5142 chrX 39547017 39550467 39548383 N NA NA NA NA NA NA BCOR 486115 5143 chrX 39588642 39592340 39590003 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 444242 5144 chrX 39611920 39616772 39615113 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 419810 5145 chrX 39679955 39683327 39680520 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 353255 5146 chrX 39753468 39757918 39755166 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 278664 5147 chrX 39761760 39764801 39763362 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 271781 5148 chrX 39765743 39770175 39768075 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 266407 5149 chrX 39865589 39877172 39873641 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 159410 5150 chrX 40632240 40634705 40633254 Y ATP6AP2,MED14 MED14 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 37436 5151 chrX 40651914 40656343 40653703 N NA NA USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 57110 5152 chrX 40723881 40728565 40726714 Y ATP6AP2,MED14 NA USP9X,CXorf38,MED14,LOC100132831 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 129077 5153 chrX 40729228 40732981 40730844 N NA NA USP9X,CXorf38,MED14,LOC100132831 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 134424 5154 chrX 40767079 40770662 40769183 N NA NA MED14 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 172275 5155 chrX 40803461 40804576 40803813 N NA NA USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 140312 5156 chrX 40867675 40870712 40869822 N NA NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 74176 5157 chrX 40873182 40875638 40874267 N NA NA MED14,USP9X,LOC100132831 IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 69250 5158 chrX 40882912 40886828 40885927 N NA NA USP9X,MED14 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 58060 5159 chrX 41300176 41303140 41301768 Y NA NA DDX3X K562 ChIA-PET 22265404 DDX3X 107525 5160 chrX 43034800 43040774 43036159 N NA NA NA NA NA NA MAOA 474635 5161 chrX 45211674 45215068 45212866 N NA NA NA NA NA NA KDM6A 479251 5162 chrX 45331419 45342275 45332428,45338868 N,N NA;NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 KDM6A 598996 5163 chrX 45363566 45381524 45374644,45366296,45374814,45376819 Y,Y,Y,Y NA;NA;NA;NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 KDM6A 631143 5164 chrX 45481453 45484501 45482645 N NA NA MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 KDM6A 749030 5165 chrX 45567381 45577405 45569667,45571221,45574808 Y,N,N NA;NA;NA NA MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF673 729219 5166 chrX 45620112 45669066 45622786,45630275,45658913,45648736,45661873,45634655,45666404,45668188 N,N,N,Y,N,N,Y,Y NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF673 637558 5167 chrX 46023226 46026818 46024994 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 279806 5168 chrX 46037907 46042582 46039885 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 264042 5169 chrX 46174485 46191820 46185851,46189526,46182848 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF673 114804 5170 chrX 46650754 46653034 46651791 N NA SLC9A7,RP2 RP2,CXorf31,PHF16,SLC9A7,CHST7,ZNF674,LOC401588 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A7 32282 5171 chrX 47371087 47379130 47372722,47375857,47377763 N,N,N NA;NA;NA ZNF41,ARAF CDK16,USP11,UBA1,ARAF,SYN1,ZNF41 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF41 28742 5172 chrX 47381238 47386573 47382939 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 33926 5173 chrX 47674306 47676625 47675484 N NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 19676 5174 chrX 48498876 48501424 48499622 N NA WDR13 NA NA NA NA WDR13 42996 5175 chrX 48518781 48520483 48519659 N NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 34648 5176 chrX 48527557 48530864 48529298 N NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 24267 5177 chrX 48593793 48597642 48596060 N NA SUV39H1 SUV39H1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUV39H1 38662 5178 chrX 48721421 48727921 48726414,48723393 N,N NA;NA ERAS,PCSK1N,PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 27274 5179 chrX 49396359 49398428 49397606 N NA NA NA NA NA NA LOC158572 245531 5180 chrX 49968295 49974001 49969235 N NA NA NA NA NA NA USP27X 323825 5181 chrX 51039604 51040294 51039913 N NA NUDT10 NA NA NA NA NUDT10 34789 5182 chrX 51146987 51154810 51149786 N NA NA NA NA NA NA NUDT10 71904 5183 chrX 51361204 51364953 51361786 N NA NA NA NA NA NA GSPT2 121528 5184 chrX 52002608 52008137 52004846 N NA NA NA NA NA NA MAGED4B 74689 5185 chrX 53722177 53726811 53725271 N NA HUWE1 HUWE1 K562 ChIA-PET 22265404 HUWE1 8504 5186 chrX 53739812 53745197 53742716 N NA HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 26139 5187 chrX 53753024 53754887 53754087 N NA HUWE1 HUWE1 IMR90 Hi-C 24141950 HUWE1 39351 5188 chrX 54445299 54448786 54447349 N NA TSR2 NA NA NA NA TSR2 18067 5189 chrX 54663802 54669892 54665936 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 107158 5190 chrX 55934060 55937383 55935054 N NA NA NA NA NA NA RRAGB 189950 5191 chrX 562895 566219 563046 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 944820 5192 chrX 57846491 57850117 57848705 Y NA NA NA NA NA NA ZXDA 86950 5193 chrX 62393089 62394974 62393826 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 176244 5194 chrX 62517448 62519484 62518362 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 51734 5195 chrX 63106731 63109313 63108664 N NA NA NA NA NA NA FAM123B 316311 5196 chrX 63140799 63143342 63141494 N NA NA NA NA NA NA FAM123B 282282 5197 chrX 63785742 63786296 63786132 N NA NA NA NA NA NA FAM123B 360118 5198 chrX 64806920 64809418 64808220 N NA NA NA NA NA NA LAS1L 52234 5199 chrX 64824098 64827592 64825655 N NA NA MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 59919 5200 chrX 64861803 64867422 64864044 N NA MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 20089 5201 chrX 68560387 68562322 68560549 N NA NA NA NA NA NA PJA1 175022 5202 chrX 68774879 68777259 68776411 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 389514 5203 chrX 71028137 71030973 71029937 N NA NA NA NA NA NA NHSL2 99965 5204 chrX 75364153 75367670 75365264 N NA CXorf26 NA NA NA NA CXorf26 25101 5205 chrX 76566805 76569062 76568202 N NA NA NA NA NA NA ATRX 472657 5206 chrX 79181531 79187131 79182187 N NA NA NA NA NA NA BRWD3 878102 5207 chrX 79547758 79552541 79549941 N NA NA NA NA NA NA BRWD3 512692 5208 chrX 7955460 7959740 7956411 N NA NA NA NA NA NA TBL1X 1471595 5209 chrX 79766993 79769365 79767976 N NA NA NA NA NA NA BRWD3 295868 5210 chrX 84130113 84132106 84131224 N NA NA NA NA NA NA APOOL 126792 5211 chrX 86743619 86756972 86754591 N NA NA NA NA NA NA CHM 1441053 5212 chrX 86972232 86986015 86983447 N NA NA NA NA NA NA CHM 1669666 5213 chrX 8724362 8727802 8726034 N NA NA NA NA NA NA TBL1X 703533 5214 chrX 87791334 87793123 87791640 N NA NA NA NA NA NA CHM 2488768 5215 chrX 91004752 91014349 91007956 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 315155 5216 chrX 91031072 91036773 91034319 N NA NA NA NA NA NA PABPC5 341475 5217 chrX 9116349 9118730 9117306 N NA NA NA NA NA NA TBL1X 312605 5218 chrX 93956592 93960141 93958614 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 1979521 5219 chrX 95567750 95571956 95570379 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 367706 5220 chrX 95706072 95776819 95718886 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 162843 5221 chrX 98625915 98634796 98627241 N NA NA NA NA NA NA TSPAN6 1256998 5222 chrY 10013621 10033103 10014806,10016703,10025053,10019310,10028934,10031555 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 8544197 5223 chrY 13136654 13142660 13137779 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 11667230 5224 chrY 13193863 13194846 13194249 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 11724439 5225 chrY 13250696 13266889 13258871 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 11781272 5226 chrY 13332763 13346495 13334795 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 11863339 5227 chrY 13351060 13373242 13359194,13370731 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 11881636 5228 chrY 13450332 13459492 13453774,13456314,13457677 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 11980908 5229 chrY 13463109 13490357 13467338,13474534,13489967,13478929 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 11993685 5230 chrY 13645946 13672045 13646354,13651080,13661834,13659428,13648444,13655569,13652821,13664702,13668465 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12176522 5231 chrY 13679639 13695036 13683185,13681008,13684933,13686884,13689793,13691471,13693307 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12210215 5232 chrY 13695993 13696702 13695995 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12226569 5233 chrY 13699285 13699751 13699356 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12229861 5234 chrY 13713861 13725012 13713996,13718953,13716798,13722382 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12244437 5235 chrY 13730737 13748632 13733596,13731594,13739202,13737160,13744809,13742775,13748394 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12261313 5236 chrY 13798503 13840501 13802353,13808625,13810021,13833396,13830297,13813945,13826753,13819770,13804920,13799348,13822740,13815638,13818016,13835163,13828696,13839735 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12329079 5237 chrY 13860488 13870686 13862673,13869844 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 12391064 5238 chrY 17161013 17164703 17161179 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 15691589 5239 chrY 1939319 1941287 1940478 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 469895 5240 chrY 1944056 1956650 1952136 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 474632 5241 chrY 19757989 19758279 19758135 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 18288565 5242 chrY 20421379 20421792 20421648 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 18951955 5243 chrY 28582463 28587744 28583702 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 27113039 5244 chrY 28785516 28790980 28790145,28786763 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 27316092 5245 chrY 28792378 28796733 28793315,28796620 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 27322954 5246 chrY 28798843 28803866 28799922,28803156 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 27329419 5247 chrY 28807914 28810307 28808388 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 27338490 5248 chrY 28815032 28817462 28815596 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 27345608 5249 chrY 512895 516230 513046 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 944809 5250 chrY 58820457 58830125 58824159,58827708 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VAMP7 383824 5251 chrY 58841229 58847336 58846305,58843157 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VAMP7 366613 5252 chrY 58905664 58917028 58906139,58912764,58910179,58916570 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA VAMP7 296921 5253 chrY 58968072 58998512 58970217,58983970,58972767,58996837 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA VAMP7 215437 5254 chrY 59001123 59014321 59003494 N NA NA NA NA NA NA VAMP7 199628 5255 chrY 59026267 59033824 59029024,59033086 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VAMP7 180125 5256 chrY 8979382 8979692 8979537 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 7509958 5257 chrY 9929308 9944421 9930880 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 8459884