chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	1143531	1144198	1143599	Y	MIB2,LOC441869,TNFRSF18,TNFRSF4	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	21213	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	19954	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	7327634	7328033	7327873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	484250	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO44	152485	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	19324821	19325090	19324988	Y	TAS1R2,IFFO2	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2,UBR4	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	43641	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	22260274	22260656	22260512	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	1134	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	23076914	23077145	23077061	Y	NA	EPHB2	NA	NA	NA	NA	EPHB2	41582	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	26022319	26022793	26022555	Y	SEPN1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPN1	101874	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	27626897	27627231	27626926	Y	NA	TMEM222,RP11-4K3__A.5	NA	NA	NA	NA	TMEM222	19420	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	27871123	27871471	27871363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	56454	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	6.64209450968924
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	COL16A1,BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL16A1	12683	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	32227408	32227911	32227671	Y	NA	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	583	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	39651405	39651741	39651429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	106417	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	59910700	59911009	59910820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	150390	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	60062084	60062408	60062209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	301774	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	436256	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	60209079	60209290	60209185	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	448769	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1	NA	NA	NA	NA	TM2D1	19720	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32125	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32873	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	68036173	68036524	68036291	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	112220	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	68118588	68118809	68118774	Y	GADD45A	GADD45A	GADD45A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	29935	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	14.9447126468008
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2-AS2	1204213	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	78002564	78002920	78002661	Y	NA	NA	ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	ZZZ3	144184	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	78561383	78561632	78561506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	118524	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	78957462	78957762	78957688	Y	PTGFR	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44L	125845	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL7	2193245	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	152521	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	143186	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	94201362	94201612	94201551	Y	NA	NA	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR3	109094	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26007	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	94784984	94785158	94785071	Y	NA	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	11665	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	8231	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	836	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	372241	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	VCAM1	NA	NA	NA	NA	VCAM1	18969	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	110963862	110964269	110963971	Y	CD53	LAMTOR5-AS1,SLC16A4	SLC16A4,LOC440600,HBXIP,ALX3,KCNC4,SLC6A17,RBM15,PROK1,CYMP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC16A4	32158	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	111262637	111262920	111262791	Y	LRIF1,CD53	NA	NA	NA	NA	NA	LRIF1	241781	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	120608824	120609208	120608880	Y	NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	1032	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	145113904	145114998	145114671	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	19684	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	146764405	146764804	146764606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	52114	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	150510569	150510713	150510587	Y	NA	ECM1,ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL4	9171	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A4,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A4	20406	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A16,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	153671679	153672046	153671861	Y	NA	SNAPIN,ILF2,INTS3	NA	NA	NA	NA	INTS3	26497	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	SLC39A1	1327	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr1	154299137	154299452	154299353	Y	UBAP2L,ATP8B2,IL6R	ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	3108	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	9.96314176453386
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	162830850	162831244	162831104	Y	NA	C1orf110	NA	NA	NA	NA	C1orf110	5361	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	162846595	162846764	162846655	Y	DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	C1orf110	C1orf110,RGS4,RGS5	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf110	9990	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	164723371	164723492	164723438	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	200550	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	164750243	164750515	164750387	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	227422	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	295096	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	173081389	173081497	173081443	Y	NA	NA	TNFSF4,TNFSF18,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	92955	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	181130674	181130808	181130711	Y	STX6,MR1,IER5	NA	STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	75036	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	88078	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	183926817	183926936	183926877	Y	GLT25D2	NA	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	91875	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	187267139	187267250	187267195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	471054	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	199019703	199019754	199019729	Y	NA	NA	LOC100131234	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	334515	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	201500233	201500477	201500437	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	23649	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	201709797	201710423	201710148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	85846	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	203524939	203525564	203525325	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	68125	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	8.30261813711155
chr1	203525711	203525894	203525744	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	67795	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	206807155	206807335	206807245	Y	NA	EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	DYRK3	274	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	206931189	206931520	206931334	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,IL10	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	74900	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD46	213510	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr1	209542596	209542897	209542763	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	103028	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	209562668	209562976	209562782	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	123100	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	209820544	209820823	209820626	Y	G0S2,LAMB3	G0S2,HSD11B1	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	G0S2	25942	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	209915892	209916078	209915980	Y	NA	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	39826	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	212811770	212812141	212812009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF3	75094	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	215130656	215131050	215130800	Y	KCNK2,KCNK2	KCNK2	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNK2	46068	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	154412	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	219264603	219264919	219264762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	80267	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	219514172	219514180	219514178	Y	NA	NA	RRP15,TGFB2,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-95P13.1	99804	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	221143804	221143903	221143854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	94105	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIA3	150224	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	224685994	224686507	224686055	Y	NA	NA	WDR26,CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	63259	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	227982614	227983033	227982728	Y	CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	61502	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	228978086	228978245	228978170	Y	RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	109262	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	229374566	229374670	229374620	Y	NA	RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RAB4A	30152	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	235850857	235851038	235851012	Y	LYST,ARID4B	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	185076	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	236135691	236135959	236135881	Y	GPR137B	NA	LYST	IMR90	Hi-C	24141950	NID1	90503	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	240967891	240968036	240967952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-467I20.3	169539	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr1	243428005	243428394	243428166	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	10685	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	644331	644586	644526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	89097	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	652657	652929	652820	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	80754	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	3088088	3088382	3088199	Y	NA	PFKP	PFKP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKP	18143	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	5707430	5707726	5707563	Y	NA	ASB13,FAM208B	NA	NA	NA	NA	ASB13	872	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	6190431	6190630	6190601	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	5550	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	14155606	14155791	14155699	Y	FRMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	346350	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	17028207	17028677	17028581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	170680	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	17034715	17035049	17034848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	177188	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	17067559	17067950	17067759	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	174103	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	29922205	29922549	29922392	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	101161	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	31073492	31073855	31073655	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	245011	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	31293680	31294164	31294019	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	24702	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	31423488	31423889	31423800	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	104622	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	31805465	31805855	31805582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	198089	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	33503049	33503394	33503286	Y	ITGB1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	119796	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	33522627	33522949	33522766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	100241	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	33654776	33655204	33655009	Y	NA	NRP1	PARD3,NRP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	31586	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	33701574	33701923	33701712	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	78384	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	45374285	45374680	45374305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF4	78175	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	50776206	50776746	50776485	Y	PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	30622	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	131012	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	NA	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DKK1	174501	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	714505	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	62185134	62185430	62185353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	350659	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	69856894	69857171	69856968	Y	NA	HERC4	MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	23789	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	71626507	71626840	71626632	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	66863	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	75349200	75349597	75349539	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	34114	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	78920467	78920779	78920602	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	475574	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	79069997	79070387	79070206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	325966	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	79176142	79176460	79176291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	219893	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	79383458	79383833	79383807	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	12520	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	79389440	79389814	79389806	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	6539	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	80091311	80091643	80091437	Y	NA	NA	LOC100132987,LOC283050,ZMIZ1,RPS24	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00856	84806	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	80516479	80516892	80516667	Y	ZMIZ1	NA	LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ1	309900	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	80841621	80841843	80841705	Y	NA	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	14829	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	93373148	93373298	93373228	Y	NA	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	17513	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr10	99449337	99449738	99449607	Y	C10orf28,RRP12,PI4K2A	AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	AVPI1	4257	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	100419876	100420005	100419941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPS1	215192	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	101543856	101543953	101543936	Y	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	NA	COX15	53999	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	101767938	101768201	101768028	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	262	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	103591495	103591519	103591507	Y	BTRC,KCNIP2,KCNIP2	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	14799	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	104406463	104406725	104406695	Y	NFKB2,NFKB2,TRIM8	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	4210	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	81090	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	119294820	119294982	119294904	Y	EMX2	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2	4973	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	119306449	119306812	119306494	Y	NA	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2OS	3870	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	127822846	127823186	127823128	Y	MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	239738	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	127932254	127933051	127932680	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	141973	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	14827	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	12177917	12178047	12177953	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	64374	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	12306799	12307179	12306992	Y	MICAL2,PARVA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	89553	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.98157088226693
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.15130906855578
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	15219194	15219222	15219209	Y	INSC	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	307396	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	146598	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	135691	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	32109079	32109545	32109351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	277140	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	35053022	35053283	35053109	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104296	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	37525697	37526074	37525816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	911646	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CTD-2589M5.4,CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	28900	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	62211626	62212261	62212170	Y	FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	99210	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	32237	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.15130906855578
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	68775199	68775469	68775336	Y	NA	MRGPRF,TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	MRGPRF	3408	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	72546015	72546343	72546157	Y	PDE2A,ARAP1,ARAP1,FCHSD2,ATG16L2	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	22662	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARHGEF17	48709	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	73989657	73990002	73989928	Y	NA	P4HA3	PPME1	IMR90	Hi-C	24141950	P4HA3	30700	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	143692	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	77445522	77445800	77445629	Y	NA	FTH1P16	NA	NA	NA	NA	FTH1P16	1451	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	846126	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	85802534	85802824	85802626	Y	NA	PICALM	PICALM	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	23610	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	87139431	87139805	87139524	Y	NA	NA	GRM5	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	392545	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	88269213	88269357	88269284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	200258	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	97836778	97837204	97837004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	1715625	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	100747572	100748094	100747776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	191188	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	103401149	103401246	103401211	Y	NA	NA	DYNC2H1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC2H1	422989	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	104128696	104129051	104128955	Y	NA	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFD	95589	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	106239516	106239921	106239716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	293024	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	108741188	108741366	108741295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	207436	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	117050933	117051273	117050997	Y	SIDT2	PAFAH1B2,SIDT2,TAGLN,PCSK7	NA	NA	NA	NA	SIDT2	3484	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	122063445	122063834	122063519	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	42429	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	122086038	122086153	122086090	Y	NA	NA	SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR100	65022	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	141044	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	125246008	125246410	125246210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ1	117803	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	126571241	126571490	126571472	Y	ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL3	299865	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	128149754	128150077	128149906	Y	NA	NA	KCNJ1,FLI1,ETS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	305376	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr11	130767627	130768066	130767878	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16338	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	262453	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	3108245	3108552	3108282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	75969	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	5566178	5566568	5566311	Y	NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	26900	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5	252901	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	8147722	8148111	8148026	Y	NA	FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	35188	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	10794413	10794704	10794528	Y	NA	MAGOHB	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	30191	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	224306	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8	NA	NA	NA	NA	RASSF8	20128	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr12	32607110	32607326	32607203	Y	NA	NA	FGD4,DNM1L,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	222808	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21A	1341386	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21A	730977	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC38A2	153325	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	PRKAG1	41756	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	49866902	49867154	49867028	Y	PRPF40B,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	MCRS1	92782	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	51327584	51327783	51327682	Y	NA	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	12329	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,RARG,MFSD5	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	53890170	53890360	53890251	Y	MFSD5	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	1487	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr12	53892109	53892322	53892185	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	262	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	65005842	65006280	65005896	Y	GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	3549	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	66034360	66034755	66034412	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	39711	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	48150	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	66048868	66049228	66049091	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	54219	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	66076049	66076269	66076159	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	81400	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr12	71085208	71085379	71085280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	450068	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	71697189	71697197	71697193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN8	136481	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr12	76060831	76060974	76060901	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	157415	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	76178520	76178723	76178659	Y	NA	NA	PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	246989	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	76256965	76257237	76257100	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	168475	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	52394	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	79803401	79803717	79803562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	91459	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	89532084	89532176	89532144	Y	DUSP6	NA	POC1B	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	212872	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	89550047	89551250	89550882	Y	NA	NA	POC1B,LOC728084	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	193798	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	89619217	89620117	89619718	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	DUSP6,LOC728084,POC1B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP6	124931	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	89638877	89639212	89638989	Y	POC1B,DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,DUSP6	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	105836	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	92428496	92429133	92428829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	108216	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	96842223	96842407	96842329	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	22959	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	104675995	104676292	104676137	Y	GLT8D2,TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	3495	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUAK1	203335	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	109030971	109031245	109031128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	76613	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG	NA	NA	NA	NA	UNG	37197	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	111847309	111847501	111847415	Y	ALDH2,SH2B3	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	5557	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	111883923	111883990	111883957	Y	NA	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	42171	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	116946674	116946880	116946778	Y	NA	NA	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf49	226995	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	118745418	118745709	118745623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAOK3	63041	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	122229588	122230472	122229850	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	8837	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	125033431	125034089	125033755	Y	UBC	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	16046	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	23288	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	127715364	127715787	127715548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	66692	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr12	129871586	129871714	129871650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	565058	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	21653965	21654176	21654071	Y	LATS2	LATS2	LATS2,SAP18	IMR90	Hi-C	24141950	LATS2	20279	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	30963439	30963783	30963499	Y	NA	NA	LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1	IMR90	Hi-C	24141950	KATNAL1	83818	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	31422053	31422459	31422280	Y	C13orf33	NA	USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26	IMR90	Hi-C	24141950	HMGB1	232319	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	31439697	31440107	31440029	Y	C13orf33	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1	249963	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	34296005	34296236	34296099	Y	NA	NA	STARD13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RFC3	93950	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr13	34527456	34527530	34527492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	137270	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	34736797	34736997	34736924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	346611	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	36466425	36466659	36466542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	236784	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	36501740	36502135	36501882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	201308	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	40139698	40140018	40139948	Y	NA	LHFP	NA	NA	NA	NA	LHFP	35647	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	44359761	44360131	44359976	Y	ENOX1,ENOX1	ENOX1	NA	NA	NA	NA	ENOX1	717	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	44379216	44379443	44379336	Y	ENOX1	ENOX1	ENOX1,DNAJC15,EPSTI1,TNFSF11,CCDC122,LACC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ENOX1	20172	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	49688107	49688286	49688182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	131761	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	52218212	52218391	52218309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	61568	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	52923212	52923413	52923314	Y	NA	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	THSD1	55216	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	73011619	73011852	73011740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	263979	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	74184794	74185193	74184838	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF5	557680	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	75882191	75882614	75882549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	171636	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	76269053	76269192	76269124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	76483	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	77297766	77298116	77297917	Y	NA	NA	LMO7,KCTD12	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD12	160424	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	93880621	93881133	93881009	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	3526	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	102784457	102784806	102784790	Y	FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	462547	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	110902548	110902879	110902758	Y	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	53280	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr13	111039905	111040155	111040082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	82409	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	114162944	114163163	114163069	Y	LAMP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	19634	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	114810103	114810577	114810313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	85509	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	22080552	22080764	22080649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL2	77202	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MRPL52	2521	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	23320228	23321035	23320800	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	16462	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	30663968	30664325	30664158	Y	PRKD1	NA	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	G2E3	362004	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	409598	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	33178444	33178576	33178508	Y	AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	634445	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	RPS19P3,SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	50090977	50091033	50091007	Y	METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2	RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2	NA	NA	NA	NA	MGAT2	5488	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	51136928	51137372	51137340	Y	NA	SAV1	NA	NA	NA	NA	SAV1	3879	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	3789	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6-AS2	55266	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN3	287501	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	54902274	54902529	54902415	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	40707	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	124189	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	127235	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	65749378	65749653	65749574	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	125657	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	320025	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	68717033	68717146	68717097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	432537	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	246476	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	69361596	69361764	69361692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	82393	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	71710428	71710751	71710653	Y	NA	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	74415	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	LTBP2	36285	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	77466876	77467234	77466958	Y	ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL	RP11-7F17.7,IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	25800	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	87930298	87930498	87930398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	527511	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	89493430	89493694	89493607	Y	NA	NA	EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	204933	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	93049409	93049740	93049647	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	71291	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	93252078	93252440	93252261	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN,GOLGA5	GOLGA5	K562	ChIA-PET	22265404	GOLGA5	6136	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	100497913	100498157	100498035	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	204478	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.15130906855578
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr15	25678066	25678357	25678212	Y	NA	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	3771	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	26854717	26854952	26854835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRB3	327734	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	102835	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	33418806	33419006	33418854	Y	NA	NA	FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	GREM1	410631	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	36720333	36720777	36720654	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf41	149035	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	37398990	37399302	37399145	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	MEIS2	NA	NA	NA	NA	MEIS2	7486	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	40390220	40390395	40390296	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	NA	NA	NA	NA	NA	SRP14	60831	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	41264604	41264924	41264664	Y	NA	CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	21444	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	43801380	43801544	43801432	Y	TP53BP1	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	224	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	50347446	50348347	50347721	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	GABPB1	297258	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	59226674	59226915	59226795	Y	NA	SLTM	FAM63B	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLTM	2822	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1E	75706	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	PLEKHO2	3880	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	65176143	65176677	65176391	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	44055	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr15	71344757	71344812	71344802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	161633	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr15	71373131	71373408	71373250	Y	NA	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	190007	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr15	74287730	74287905	74287836	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	2716	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1	NA	NA	NA	NA	ODF3L1	36485	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr15	81219891	81220152	81220022	Y	STARD5	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	60067	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	56752	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr15	98698078	98698430	98698265	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	237294	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	226443	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	99965380	99965718	99965580	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,MEF2A,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	49652	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr15	101234924	101235169	101235060	Y	ALDH1A3	NA	ALDH1A3,LRRK1,ASB7	IMR90	Hi-C	24141950	LINS	93489	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	ZG16B,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	ZNF174	NA	NA	NA	NA	ZNF174	33998	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP4	86994	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	4582537	4582680	4582608	Y	NA	NMRAL1	HMOX2,NMRAL1	IMR90	Hi-C	24141950	NMRAL1	38773	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	14402100	14402342	14402181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	238922	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	17499199	17499488	17499485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	1300217	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	49317625	49318405	49317904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	665566	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	50229271	50229507	50229375	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	48541	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	51183106	51183414	51183179	Y	SALL1,SALL1	NA	NA	NA	NA	NA	SALL1	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	55521029	55521357	55521152	Y	MMP2	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	19553	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	61921949	61922053	61922001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3155688	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	65020062	65020376	65020219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	137639	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	69777344	69777472	69777408	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	9371	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr16	70980057	70980287	70980181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	146993	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	71123508	71123782	71123642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALB2	266834	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	73102477	73102709	73102578	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	10880	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	73461043	73461303	73461173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	369446	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	77533444	77533555	77533500	Y	ADAMTS18	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT7	220856	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	82667775	82667948	82667787	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	9367	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr16	85355565	85356105	85355766	Y	NA	NA	FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	296190	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	10642	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	86664163	86664323	86664252	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	65306	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	86713823	86714104	86713964	Y	FOXC2	NA	FOXL1,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	114966	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	88540534	88540913	88540729	Y	FAM38A,CTU2,APRT,ZNF469	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	22809	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	773525	773702	773655	Y	RNMTL1	NA	NA	NA	NA	NA	GLOD4	89944	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	2075592	2075724	2075696	Y	HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	120144	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	2077546	2077639	2077593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	122098	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	2084810	2085252	2085043	Y	HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119425	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	13249594	13249869	13249742	Y	HS3ST3A1	NA	HS3ST3B1,HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST3A1	253375	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	13460367	13460669	13460622	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	42575	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	17319893	17320013	17319952	Y	FLCN	RPL13P12	NA	NA	NA	NA	RPL13P12	34567	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	1020	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH3A2	106941	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr17	28031718	28032050	28032008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	83793	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	28033249	28033691	28033498	Y	NUFIP2,TAOK1,SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	85324	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2A	49870	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	29887922	29888057	29887990	Y	NA	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	EVI2A	241020	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	32581116	32581488	32581294	Y	NA	CCL2,CCL7	NA	NA	NA	NA	CCL2	812	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	38708057	38709216	38708396	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	52208	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	39110175	39110404	39110304	Y	KRTAP3-2	NA	NA	NA	NA	NA	KRTAP1-5	71050	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	39536188	39536609	39536415	Y	NA	KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	46	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	NA	NA	NA	NA	NA	KRT34	149803	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1	139256	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF652	167326	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	SGCA	15813	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	57502934	57503327	57503130	Y	YPEL2	NA	YPEL2	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	95884	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	60970243	60970809	60970465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	267481	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	62705157	62705447	62705234	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	48971	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	63752923	63753189	63753062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	433013	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	63996608	63996849	63996729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	189353	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	64795831	64796224	64796168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	443881	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	64963064	64963179	64963122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	276926	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	66030294	66030564	66030453	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	659	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	67603336	67603572	67603425	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	194497	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	70122851	70122907	70122879	Y	NA	SOX9	NA	NA	NA	NA	SOX9	7690	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	75422359	75422648	75422577	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	147708	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNGR2	207843	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	78962835	78962976	78962910	Y	NA	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	CHMP6	422	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	METTL4	36133	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr18	3660906	3661002	3660956	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	251300	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPPE1	40050	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	12076743	12076871	12076848	Y	NA	NA	GNAL	IMR90	Hi-C	24141950	MPPE1	169521	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPE1	185186	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	21415229	21415459	21415332	Y	C18orf8,NPC1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	155278	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	25502058	25502147	25502103	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	253263	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	25754926	25755429	25755157	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	33390167	33390262	33390215	Y	ZNF24,ZNF396,INO80C	NA	NA	NA	NA	NA	C18orf21	159784	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	34160410	34160525	34160482	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	246544	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	42295257	42295574	42295401	Y	SETBP1,SETBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	1006518	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.15130906855578
chr18	43382830	43382969	43382904	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC14A1	80738	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	43542357	43542726	43542619	Y	PSTPIP2,C18orf25,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	2514	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr18	46473942	46474323	46474293	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	758	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	57386849	57386991	57386920	Y	NA	CCBE1,RPS26P54	CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	CCBE1	24237	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	74171783	74172228	74172071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	360335	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	327206	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	255133	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr18	74409297	74409534	74409399	Y	NA	NA	ZNF516	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF236	123029	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	510583	510951	510744	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34,GZMM	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5284	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	13233224	13233603	13233413	Y	WDR83,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	6307	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	14545712	14545849	14545765	Y	NDUFB7,PKN1	DDX39A,PKN1,PTGER1	NA	NA	NA	NA	PKN1	3847	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	TPM4	227712	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	JUND,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	20606211	20606644	20606560	Y	ZNF90	ZNF826P	NA	NA	NA	NA	ZNF826P	436	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	28917737	28917979	28917845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	784469	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	31371885	31372199	31372043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	466254	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	14986	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	15495	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	17070	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	18683	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	43380742	43381113	43380927	Y	PSG5	NA	PSG10P	IMR90	Hi-C	24141950	PSG3	138021	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,ERCC1	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CD3EAP	35696	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ERCC1	32973	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	7192	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	49430301	49430612	49430410	Y	IZUMO1,PPP1R15A,FTL	NUCB1,BAX,FTL	NA	NA	NA	NA	BAX	25460	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	5.81183269597809
chr19	54548907	54549052	54548979	Y	NLRP12,NLRP12,VSTM1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	54984	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	SSC5D	33439	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	9795695	9795818	9795794	Y	NA	YWHAQ	YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAQ	26552	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	NA	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	93617	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	11547236	11547448	11547321	Y	NA	NA	ROCK2,PQLC3,C2orf50	IMR90	Hi-C	24141950	ROCK2	60780	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	11894336	11894526	11894507	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	78615	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	12633247	12633315	12633291	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	221700	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	12860025	12860219	12860122	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	5010	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	12959326	12959589	12959403	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	104311	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	12964548	12964753	12964651	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	109533	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEN1	108459	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	28668874	28669088	28668964	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	BRE,RBKS,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC104695.3	53335	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	31520585	31520905	31520706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD3	65705	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	33383509	33383834	33383717	Y	FAM98A	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	213470	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	33435749	33436022	33435923	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	265710	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	37853380	37853621	37853410	Y	EIF2AK2,EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	109990	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	37993289	37993401	37993340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	29678	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	37998725	37999059	37998933	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	35114	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	38009711	38009894	38009885	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	46100	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	38333760	38333892	38333836	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP1B1	1152	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	40260196	40260378	40260267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	255789	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	40261444	40261729	40261611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	257037	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	42190702	42191089	42190887	Y	NA	NA	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	82071	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	42278314	42278459	42278342	Y	NA	PKDCC	NA	NA	NA	NA	PKDCC	5154	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	317515	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	47039745	47040099	47039914	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	101197	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	47041376	47041664	47041544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	99632	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	9.13287995082271
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	47109327	47109734	47109459	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	31562	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	47299215	47299677	47299496	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102063	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	47420372	47420663	47420518	Y	NA	CALM2	EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	18632	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	55320625	55320761	55320684	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,EML6,RTN4	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	16996	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	58105448	58105884	58105678	Y	NA	VRK2	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	VRK2	26902	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD1	122765	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	69533320	69533461	69533391	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78921	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	74616605	74616668	74616637	Y	NA	DCTN1,C2orf81,WDR54	NA	NA	NA	NA	DCTN1	546	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	6550	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	85982713	85983043	85983025	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	6246	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	86224309	86224458	86224357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106820	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	86452715	86452898	86452804	Y	RNF103,RMND5A	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	MRPL35	28237	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092675.3	147261	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.98157088226693
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	102133779	102134093	102133972	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	MAP4K4,RFX8,CREG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP4K4	177219	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	106026144	106026496	106026333	Y	GPR45,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	26474	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	113398370	113398650	113398523	Y	NA	AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	2784	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	118739522	118739775	118739730	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	29934	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	118741787	118742055	118741993	Y	CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	27654	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALB	629280	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	127844543	127844919	127844728	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	18012	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	137133886	137134003	137133945	Y	CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	260151	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	151323622	151323873	151323744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	69652	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	151385999	151386295	151386059	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	7230	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	151477368	151477581	151477492	Y	RND3	NA	RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	83843	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	151768299	151768310	151768305	Y	NA	NA	RND3	IMR90	Hi-C	24141950	RBM43	348083	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	156832393	156832495	156832444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	364365	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	158030373	158030519	158030484	Y	NA	NA	NR4A2,GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT5	81591	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	161150962	161151085	161151045	Y	CD302	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	111308	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD11,HOXD10,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD4	NA	NA	NA	NA	HOXD10	1222	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	12.4539272056673
chr2	185595976	185596316	185596146	Y	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	134883	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	186785756	186786079	186786020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	562804	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	189064441	189064772	189064607	Y	NA	NA	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	GULP1	89624	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	189653445	189653579	189653502	Y	NA	DIRC1	NA	NA	NA	NA	DIRC1	614	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	190477917	190478080	190477982	Y	NA	SLC40A1,ASNSD1	SLC40A1,WDR75,ASNSD1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC40A1	31433	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	209084	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	206332	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	164749	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	5.81183269597809
chr2	197466180	197466534	197466307	Y	NA	NA	CCDC150,HECW2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF3C3	195915	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	200270966	200271332	200271300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	62657	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10	NA	NA	NA	NA	CASP10	32977	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	204550155	204550270	204550210	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	152022	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	205530118	205530314	205530216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	121602	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	208123048	208123437	208123243	Y	NA	AC007879.7	KLF7,CREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	20674	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	213708586	213709017	213708777	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPAG16	438096	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	216290729	216290756	216290730	Y	FN1	FN1,AC012462.1	NA	NA	NA	NA	FN1	8139	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	216522690	216522921	216522813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	223714	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	216636605	216637052	216636855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	259767	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	216638374	216638853	216638649	Y	FN1	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	257966	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	216695142	216695306	216695226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	201513	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	217204686	217204947	217204817	Y	MARCH4	MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	29803	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	217414791	217414849	217414821	Y	IGFBP2	NA	DIRC3,IGFBP2,RPL37A,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	AC098820.3	53307	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr2	218258363	218258761	218258688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	606957	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	218576069	218576235	218576145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	289483	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	218785631	218785811	218785787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	79907	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	218804414	218804685	218804602	Y	TNS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	61033	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	218844837	218845198	218845020	Y	TNS1	TNS1	RUFY4,TNS1	IMR90	Hi-C	24141950	TNS1	20520	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	218857857	218858115	218857951	Y	NA	TNS1	TNS1,RUFY4	IMR90	Hi-C	24141950	TNS1	7603	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	CYP27A1	129043	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC4A3	603383	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	224666540	224666974	224666854	Y	AP1S3	AP1S3	NA	NA	NA	NA	AP1S3	33770	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	224951199	224951592	224951399	Y	NA	SERPINE2	NA	NA	NA	NA	SERPINE2	49163	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	225010758	225010857	225010808	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINE2	108722	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	225774741	225775150	225774924	Y	CUL3,DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	130012	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	225965618	225965990	225965841	Y	NA	NA	DOCK10	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK10	60456	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	227526564	227526855	227526789	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	135620	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	232054877	232055306	232054968	Y	HTR2B,ARMC9	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	5954	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	232055335	232055819	232055722	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	5441	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	206788	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP40	135151	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	87966	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr2	235353626	235353934	235353758	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	49763	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	68798	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	238188791	238189175	238189021	Y	COL6A3	NA	MLPH,COL6A3,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A3	131843	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	238223884	238224369	238224058	Y	COL6A3	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A3	96649	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	AC112721.2,MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	239129575	239129683	239129630	Y	NA	ILKAP,HES6	NA	NA	NA	NA	HES6	17620	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr2	242500447	242500594	242500505	Y	NEU4,BOK	BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	4311	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr20	7822678	7823042	7822860	Y	NA	NA	BMP2,HAO1,FERMT1	IMR90	Hi-C	24141950	TMX4	175434	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	18686203	18686430	18686281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	119666	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	19796265	19796476	19796342	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	59913	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	XRN2	135078	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	31045263	31045487	31045417	Y	KIF3B	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	101108	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	32753335	32753546	32753441	Y	NA	NA	ITCH,AHCY,PXMP4,ZNF341,DYNLRB1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2S2	55197	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	33803083	33803443	33803260	Y	NA	PROCR,MT1P3	TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MT1P3	369	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	NNAT,BLCAP	NA	NA	NA	NA	NNAT	14724	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	36772576	36772945	36772677	Y	RPRD1B,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	20035	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TGM2	3728	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	37501358	37501511	37501425	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	51444	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	43181922	43182397	43182243	Y	SERINC3	SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	PKIG	23496	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	7.4723563234004
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	48868757	48869061	48868987	Y	NA	NA	PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB,LOC284751,PARD6B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	63381	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	48903106	48903611	48903352	Y	NA	NA	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90	Hi-C	24141950	CEBPB	97730	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	48950504	48950697	48950581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	145128	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	146419	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	49120900	49121269	49120978	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	3622	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,PRPF6	NA	NA	NA	NA	PRPF6	1130	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr20	62959416	62959580	62959492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	74322	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	17568022	17568137	17568068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	467678	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr21	28218728	28219247	28219071	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3000	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr21	28288547	28289033	28288781	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	47799	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	28336800	28337144	28336952	Y	ADAMTS1,ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	30005077	30005224	30005162	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	250469	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	30009367	30009732	30009551	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	245961	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	30126542	30126837	30126741	Y	NA	NA	LINC00113,ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	128856	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr21	30555048	30555502	30555259	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	4088	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	33836273	33836551	33836412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	72834	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	46295070	46295864	46295519	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	3318	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	46786853	46787266	46786994	Y	COL18A1,POFUT2	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	35786	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr21	47411286	47411466	47411356	Y	NA	COL6A1	NA	NA	NA	NA	COL6A1	11635	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.15130906855578
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	24603179	24603438	24603254	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	27952	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	27616278	27616656	27616487	Y	NA	RP5-1172A22.1	MIAT,PITPNB	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	2032	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	28536034	28536328	28536157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	221912	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28	235661	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr22	37307870	37308165	37308085	Y	NA	CSF2RB	NA	NA	NA	NA	CSF2RB	200	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	37703985	37704250	37704217	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	NA	RAC2	65497	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,RP5-1177I5.3,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1177I5.3	1681	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	38023382	38023702	38023683	Y	RAC2,CYTH4,GGA1,GGA1,NOL12	GGA1,SH3BP1,LGALS1	NA	NA	NA	NA	SH3BP1	4959	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	17355	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	20329	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	25031	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	27058	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,MIR4763	NA	NA	NA	NA	MIR4763	26182	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr22	46516040	46516252	46516108	Y	NA	MIR4763,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	8594	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	47150443	47150659	47150583	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	5859	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.15130906855578
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr22	50764173	50764461	50764208	Y	NA	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	15272	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	49173	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	8978841	8979048	8978945	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	24409	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	11230556	11230841	11230699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	53777	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	13231333	13231490	13231397	Y	NA	NA	LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	IQSEC1	118716	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	13517617	13517913	13517760	Y	NA	HDAC11	HDAC11	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	HDAC11	1311	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	14257734	14258042	14257871	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	39451	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	16145048	16145389	16145286	Y	NA	NA	GALNTL2,ANKRD28,DPH3,OXNAD1	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	159090	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	18485117	18485365	18485120	Y	NA	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	SATB1	37	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr3	29321469	29321877	29321696	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	996	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	29800986	29801236	29801157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	480513	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	30646968	30647109	30647039	Y	TGFBR2	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	974	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	37332823	37333208	37333001	Y	NA	AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	49137	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	38193404	38193826	38193575	Y	VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	OXSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OXSR1	10754	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	43913925	43914045	43914001	Y	ANO10	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	182839	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	45146738	45147081	45147019	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38833	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	421281	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	52271619	52271840	52271686	Y	PBRM1,WDR82,GLYCTK,TWF2,PPM1M,PPM1M	ALDOAP1,ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	TWF2	343	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	57164609	57165207	57164899	Y	NA	RP11-157F20.1,IL17RD	NA	NA	NA	NA	RP11-157F20.1	963	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	60112666	60113022	60112844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1078856	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	287455	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	71031841	71032211	71032107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	598929	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr3	98625177	98625421	98625283	Y	DCBLD2	DCBLD2,CTD-2021J15.1	DCBLD2	K562	ChIA-PET	22265404	CTD-2021J15.1	5909	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	11769	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	98689970	98690253	98690112	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	7649	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	98691142	98691300	98691170	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	6602	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	98848000	98848317	98848116	Y	DCBLD2	NA	COL8A1,MIR548G	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	150098	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	100755056	100755464	100755248	Y	NA	ABI3BP	ABI3BP	IMR90	Hi-C	24141950	ABI3BP	44697	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	101899188	101899342	101899284	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	354353	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	111480028	111480653	111480348	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	30684	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	111721363	111721636	111721520	Y	NA	ABHD10,TAGLN3	NA	NA	NA	NA	TAGLN3	5852	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	112315835	112316301	112316186	Y	NA	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	ATG3	36942	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	114165361	114165710	114165642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	391901	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163092	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	115724212	115724599	115724432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	384041	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	115939995	115940280	115940138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	599824	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	123478378	123478570	123478420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK	122608	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	124564415	124564677	124564502	Y	HEG1,ITGB5	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	53588	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	124786089	124786383	124786283	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	13287	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	27082	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	139018358	139018692	139018412	Y	FOXL2,C3orf72	NA	BPESC1	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	87882	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	139491345	139491740	139491614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-319G6.1	384688	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	141133650	141133961	141133787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	69928	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	6974	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	146031799	146032049	146031857	Y	PLSCR4	NA	PLOD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLSCR4	64833	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	151514227	151514622	151514246	Y	NA	AADAC	NA	NA	NA	NA	AADAC	15203	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	156795249	156795685	156795532	Y	C3orf55	NA	NA	NA	NA	NA	CCNL1	80864	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	157248554	157248748	157248629	Y	VEPH1	VEPH1,C3orf55	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	660	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	170471340	170471726	170471533	Y	NA	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	14186	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	170527835	170528013	170527928	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58259	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	170529231	170529401	170529316	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI,RPL22L1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	56871	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	171789788	171790157	171789907	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	34370	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	103894	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	174987266	174987320	174987290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	447138	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	177623981	177624160	177624047	Y	NA	RP11-2L8.1	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-2L8.1	26451	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF639	60042	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	179687230	179687579	179687379	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5L	65262	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	140423	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	188816884	188817275	188817066	Y	NA	NA	BCL6	IMR90	Hi-C	24141950	LPP-AS2	947039	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	189626513	189626760	189626607	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	209993	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	42806	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	194210438	194211060	194210799	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	6033	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	80855	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1	NA	NA	NA	NA	LETM1	18763	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	3203733	3204143	3203890	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	88612	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	10182011	10182277	10182105	Y	WDR1	NA	WDR1,CLNK,ZNF518B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	65438	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	188667	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr4	16629750	16630155	16629855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDB2	268277	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	20198231	20198535	20198383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT2	54348	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	21345990	21346140	21346137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	650085	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	26522760	26523014	26522887	Y	NA	NA	RBPJ,CCKAR,TBC1D19,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D19	53045	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	30719661	30720023	30719741	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	14	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	38080568	38081008	38080843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D1	189860	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	38084338	38084956	38084492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D1	193630	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	38102941	38103486	38103298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D1	212233	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr4	38871281	38871430	38871296	Y	NA	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3983	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr4	57940962	57941225	57941094	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	32703	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr4	74569694	74570920	74570464	Y	ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	33303	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	77545422	77545888	77545544	Y	SCARB2	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	322968	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	77546849	77546886	77546883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	321970	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	77674311	77674688	77674546	Y	SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	194168	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	77869090	77869312	77869177	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	234	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	80958042	80958450	80958250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	86158	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	81119203	81119473	81119338	Y	PRDM8,PRDM8	NA	NA	NA	NA	NA	FGF5	66280	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	86684588	86684743	86684670	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	290321	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	86704673	86705059	86704806	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	310406	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	88939808	88939842	88939826	Y	NA	SPP1,RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	PKD2	12988	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	89534713	89535020	89534799	Y	PPM1K,HERC3	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	82366	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	89885623	89885749	89885686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	268237	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	99580316	99580421	99580372	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2536	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	103360821	103361254	103361183	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10406	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	37521	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	111086740	111086853	111086804	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	31502	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	114367129	114367387	114367298	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	27650	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	114758655	114758927	114758807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	77572	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	9.96314176453386
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	40966	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	127699482	127699754	127699681	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	842672	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	36151	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	138975341	138975477	138975408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	186026	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	142566860	142567240	142566949	Y	ZNF330,IL15	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-362F19.1	315088	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	SH3D19	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3D19	1248	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	159101630	159101785	159101708	Y	NA	RP11-597D13.9,FAM198B	NA	NA	NA	NA	FAM198B	9160	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	169490335	169490520	169490463	Y	PALLD	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	33398	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	174443845	174444302	174443959	Y	HAND2	HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2	5078	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	183418367	183418505	183418425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	418584	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr4	189144165	189144266	189144216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219G10.1	124912	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr4	190285262	190285611	190285472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	343257	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	1313264	1313453	1313378	Y	NA	CLPTM1L	NA	NA	NA	NA	CLPTM1L	29761	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr5	7882044	7882425	7882249	Y	NA	MTRR,FASTKD3	NA	NA	NA	NA	FASTKD3	14894	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	14673178	14673249	14673214	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	10405	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	1267494	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	5.81183269597809
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	33313222	33313474	33313360	Y	NA	NA	NPR3,TARS	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2203K17.1	125251	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	19955	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	44331	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	45793437	45793825	45793631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	986410	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	52332019	52332357	52332083	Y	FST,ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	48863	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	54197279	54197516	54197431	Y	NA	NA	SNX18,HSPB3,ARL15,CDC20B,GPX8,GZMK,CCNO,ESM1	IMR90	Hi-C	24141950	ESM1	118983	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	57112814	57113117	57112881	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	336178	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	59492329	59492580	59492443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	288960	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	67410541	67410768	67410614	Y	PIK3R1,PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	98780	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	67770442	67770449	67770446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	260894	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	71748206	71748633	71748536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	133733	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	77814404	77814787	77814528	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	160065	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	77821454	77822246	77822105	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	167115	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	77826174	77826769	77826484	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	171835	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	77830052	77831195	77830385	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	175713	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	77843471	77844086	77843723	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	189132	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	77890894	77891278	77891114	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	172566	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	77892981	77893377	77893333	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	170467	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	78102378	78102749	78102647	Y	NA	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	38534	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	79428091	79428419	79428255	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	121479	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	83214867	83215139	83214962	Y	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	199435	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	83221150	83221158	83221154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	205718	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	RP11-254I22.1	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-254I22.1	19892	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	95414896	95415105	95415065	Y	GLRX,ELL2	RP11-254I22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-254I22.1	31077	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	95555701	95555931	95555845	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	171882	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	178922	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	95676015	95676411	95676184	Y	ELL2	NA	ELL2,C5orf27,MIR583,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	182560	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	112020535	112020963	112020695	Y	NA	APC	APC	IMR90	Hi-C	24141950	APC	20232	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	119940626	119940961	119940736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	142653	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	121425326	121425585	121425567	Y	NA	LOX	SRFBP1,ZNF474,LOC100505841,LOX	IMR90	Hi-C	24141950	LOX	13346	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	104813	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	125782209	125782552	125782386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	88385	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	131430055	131430830	131430575	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	22572	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	131560740	131561286	131561173	Y	IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2	PDLIM4	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	30078	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr5	131561409	131561561	131561506	Y	PDLIM4,P4HA2,P4HA2	PDLIM4	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	29803	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	56760	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	135353008	135353244	135353057	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	9340	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	142628573	142629016	142628894	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C1	184061	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	143267812	143268155	143268024	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1,YIPF5	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	280123	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	146915248	146915516	146915371	Y	DPYSL3	DPYSL3	DPYSL3	IMR90	Hi-C	24141950	DPYSL3	27629	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	147603808	147604119	147603866	Y	SPINK6,SPINK13	SPINK6,SPINK13	NA	NA	NA	NA	SPINK6	23451	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	150536063	150536329	150536162	Y	ANXA6	ANXA6	NA	NA	NA	NA	ANXA6	620	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	153008472	153008835	153008712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAP3	407631	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	157001390	157002014	157001697	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	607	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	157029541	157029807	157029692	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM19	28758	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	159402452	159402764	159402629	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	31356	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	167372516	167372785	167372694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARS	538665	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	171847636	171847998	171847816	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	31529	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	172281377	172281706	172281433	Y	DUSP1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	22099	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr5	180244883	180245420	180245077	Y	MGAT1,MGAT1	MGAT1,LINC00847,ZFP62	NA	NA	NA	NA	MGAT1	4231	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	298712	298948	298810	Y	DUSP22,IRF4	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	9082	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	FAM50B	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	21107	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	11615625	11615765	11615678	Y	NA	NA	HIVEP1,EDN1,ADTRP	IMR90	Hi-C	24141950	HIVEP1	391230	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	17925685	17925969	17925835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	59885	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	18148522	18148811	18148697	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	TPMT	NHLRC1	IMR90	Hi-C	24141950	TPMT	4494	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	21987708	21987959	21987863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	395736	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	36152	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	30811913	30812084	30812025	Y	NA	DDR1	FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	30114	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	33950913	33951144	33951041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	196000	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	35133552	35133743	35133648	Y	NA	SCUBE3	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3	IMR90	Hi-C	24141950	SCUBE3	46447	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	36321421	36321620	36321472	Y	CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD20	86924	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN1A	13302	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	95453	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR2	108733	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	43978439	43978901	43978686	Y	NFKBIE	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	113750	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	50700112	50700495	50700303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P5	178474	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	52522235	52522527	52522515	Y	NA	TMEM14A	NA	NA	NA	NA	TMEM14A	11380	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	73330314	73330844	73330342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	640094	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	74432369	74432753	74432573	Y	MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109	CD109	NA	NA	NA	NA	CD109	28861	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	81253590	81253803	81253687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	439226	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	82564309	82564319	82564314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	103818	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	83935269	83935637	83935453	Y	NA	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	PGM3	33614	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr6	88499265	88499658	88499500	Y	AKIRIN2	NA	ORC3	IMR90	Hi-C	24141950	AKIRIN2	89338	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	90596283	90596734	90596349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	58670	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	112974	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	100012296	100012415	100012356	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	2434	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	106252415	106252491	106252453	Y	PRDM1	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	403456	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	106532439	106532606	106532449	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG5	239060	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	112356617	112357007	112356811	Y	TRAF3IP2	TUBE1	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	49725	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	112573913	112574044	112574030	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	97	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	112619249	112619579	112619380	Y	LAMA4	LAMA4	LAMA4	IMR90	Hi-C	24141950	LAMA4	45108	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	121759226	121759877	121759689	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	4388	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	229556	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	130922387	130922557	130922422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	237508	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	130992314	130992487	130992401	Y	NA	NA	TMEM200A	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM200A	307435	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	135636764	135637196	135637190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	179293	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	138194322	138194912	138194642	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	7971	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	138213585	138213859	138213696	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	27234	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	139860975	139861228	139861133	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167218	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	139909356	139909574	139909434	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	215599	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	140029935	140030328	140030123	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	336178	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	140064888	140065017	140064953	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	371131	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	140383051	140383491	140383322	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	689294	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	140400470	140400745	140400517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	706713	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr6	140858869	140859245	140859045	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1165112	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	143718495	143718881	143718689	Y	NA	NA	AIG1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAT2	50929	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	144284201	144284585	144284512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	99150	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	146866760	146867250	146866919	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	3931	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	152012429	152012574	152012475	Y	ZBTB2,C6orf97,ESR1	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	36603	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	153411582	153411939	153411751	Y	MTRF1L	RGS17	NA	NA	NA	NA	RGS17	38445	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr6	159315379	159315577	159315478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	76935	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A	NA	NA	NA	NA	PDE10A	24211	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	166967000	166967189	166967118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	212921	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	168533513	168533636	168533561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	307911	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	169475360	169475647	169475438	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	176492	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	391299	391474	391458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	166459	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	1970944	1971123	1971068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	299755	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	1975652	1975765	1975709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	295113	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	13889552	13889950	13889896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	139100	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	23904639	23904947	23904793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC126	269641	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr7	25068217	25068495	25068356	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL3	48964	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	27231816	27231998	27231907	Y	HOXA10,HOXA11,HOXA13	HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13	NA	NA	NA	NA	HOXA13	5727	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	141190	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr7	32202741	32202908	32202813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	329987	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	39641991	39642218	39642176	Y	RALA	YAE1D1,RALA	LINC00265	IMR90	Hi-C	24141950	RALA	18864	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chr7	39661364	39661771	39661496	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	282	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	46385021	46385087	46385052	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	425548	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	46597190	46597387	46597291	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	637717	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	47691174	47691510	47691360	Y	C7orf69,TNS3,C7orf65	NA	TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	71018	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	72929530	72929887	72929777	Y	NA	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	4721	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	80512986	80513276	80513113	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	36399	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	84267436	84267624	84267532	Y	NA	NA	SEMA3A	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3A	147396	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	93688988	93689431	93689251	Y	NA	AC003092.1	TFPI2,GNG11,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	38843	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	99678619	99678725	99678657	Y	NA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	ZNF3	448	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.15130906855578
chr7	101596326	101596693	101596419	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	139367	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	102514621	102514825	102514690	Y	NA	LRRC17	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC17	36613	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	LRRC17	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC17	34819	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RINT1	52601	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	114459820	114459999	114459910	Y	NA	NA	FOXP2	IMR90	Hi-C	24141950	MDFIC	100210	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr7	116332814	116332936	116332875	Y	CAPZA2,TES	MET	NA	NA	NA	NA	MET	22370	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	121783025	121783385	121783205	Y	PTPRZ1,AASS	AASS	NA	NA	NA	NA	AASS	691	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	121951485	121951902	121951877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASS	169151	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr7	128472556	128472915	128472760	Y	NA	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4125	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	128473236	128473666	128473355	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4805	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	128549999	128550078	128550039	Y	NA	ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	49119	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	131580267	131580830	131580536	Y	NA	NA	PLXNA4	IMR90	Hi-C	24141950	PODXL	339291	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	134378159	134378392	134378229	Y	AKR1B1,CALD1	BPGM,CALD1	NA	NA	NA	NA	BPGM	48599	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	151480048	151480422	151480235	Y	PRKAG2,GALNTL5	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	91788	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	153585684	153585818	153585716	Y	DPP6,DPP6,DPP6	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3B	1130850	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	17463292	17463534	17463469	Y	MTMR7,MTUS1	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	31350	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	18985501	18986149	18985818	Y	NA	PSD3	LOC100128993,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	45261	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	22103553	22103662	22103605	Y	NA	MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	POLR3D	2936	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	29028606	29028803	29028712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP4	177382	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	30278706	30278862	30278761	Y	NA	RBPMS	NA	NA	NA	NA	RBPMS	38762	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	33051592	33051837	33051715	Y	NA	NA	NRG1	IMR90	Hi-C	24141950	FUT10	277103	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	6.64209450968924
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	41015718	41016076	41015872	Y	SFRP1	NA	SFRP1	IMR90	Hi-C	24141950	SFRP1	148940	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	41146046	41146081	41146065	Y	SFRP1	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	18935	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	49344700	49344905	49344800	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	49550	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	49783004	49783154	49783067	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	49145	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	33131	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	67419818	67420060	67419977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	80555	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	67424340	67424761	67424541	Y	C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	85077	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	67447907	67448273	67448065	Y	MYBL1,C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	108644	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	704433	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	69837388	69837920	69837570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	538939	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	90556024	90556173	90556098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	211782	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	90627835	90627903	90627892	Y	NA	NA	MMP16	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37B2.1	140052	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	95003706	95004122	95004001	Y	NA	NA	LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	135671	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	95246535	95247070	95246768	Y	GEM	GEM	CDH17	IMR90	Hi-C	24141950	GEM	25508	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	98001253	98001769	98001454	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	286407	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	102185716	102186115	102186035	Y	NA	ZNF706	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	30306	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	103549220	103549421	103549330	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116709	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	104117409	104117806	104117725	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32	BAALC	FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1	IMR90	Hi-C	24141950	BAALC	33132	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	117484091	117484236	117484201	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	292506	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	119485123	119485454	119485409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	146780	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	COL14A1	74856	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	122176324	122176668	122176537	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	474962	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	122906081	122906401	122906188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	254451	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	123141624	123141882	123141720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-94A24.1	296908	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	124642629	124642836	124642770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO32	91183	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	128237300	128237732	128237515	Y	NA	NA	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	507948	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	438397	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	130639363	130639590	130639478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	387785	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	306817	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	RPL8	5186	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	758228	758480	758338	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	1254862	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-106A1.2	43756	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	16203449	16203717	16203596	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	521095	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	16505238	16505575	16505407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	219237	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	16506213	16506544	16506471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	218268	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	18474958	18475225	18475032	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	3066	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	18695	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	21674915	21675193	21674990	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	117247	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	21685022	21685416	21685227	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	115126	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	21708302	21708720	21708435	Y	IFNA6,IFNA1,MTAP	NA	MIR31HG,IFNE	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	91822	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1615829	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	35491656	35492052	35492019	Y	OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	111315	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	35492185	35492605	35492350	Y	RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	110762	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	36166552	36166755	36166690	Y	CREB3,TLN1	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	22098	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	37924173	37924321	37924247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	124739	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	128361	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	73198481	73198826	73198654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	170941	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	81627556	81627780	81627606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	376439	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	81637955	81638246	81638090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	365973	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	2.49078544113347
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	13981	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	100969722	100969939	100969831	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	16800	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	101081243	101081884	101081560	Y	GABBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	65328	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	104137974	104138033	104138006	Y	NA	MRPL50,ZNF189	NA	NA	NA	NA	MRPL50	20863	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	110266981	110267369	110267173	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	16218	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	112569081	112569243	112569086	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	28312	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	112580267	112580505	112580395	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	C9orf152	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP2	39498	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	112827300	112827392	112827326	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	189528	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	113413222	113413721	113413633	Y	LPAR1	NA	LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10	IMR90	Hi-C	24141950	SVEP1	73062	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	113560028	113560416	113560156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	219868	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	114812842	114813221	114813099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	122467	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	118412488	118412760	118412588	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	501323	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	118453042	118453852	118453530	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	460231	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	118701397	118701694	118701515	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	212389	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	118858385	118858739	118858560	Y	NA	NA	LINC00474,PAPPA,LOC100128505,ASTN2	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	55344	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	3771	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1075775	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	354907	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	125869246	125869355	125869301	Y	OR1L3,OR1K1,GPR21	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	159500	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	131900982	131901116	131901071	Y	ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	CRAT	29514	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	137535299	137535511	137535433	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	3679	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	9.13287995082271
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	55534	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chr9	140312019	140312179	140312116	Y	LCNL1,ABCA2,FAM166A,C9orf173	EXD3	NA	NA	NA	NA	EXD3	3535	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	1367285	1367756	1367429	Y	P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	141861	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	11722971	11723163	11723070	Y	NA	ARHGAP6	ARHGAP6	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP6	41150	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	13097151	13097463	13097240	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	105924	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	GPX1P1	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPX1P1	21166	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NA	NA	NA	NA	NA	SCML1	357941	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	968076	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	37764139	37764531	37764292	Y	NA	NA	DYNLT3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYNLT3	59249	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	40792948	40793319	40793225	Y	ATP6AP2	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	27711	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	45305345	45305614	45305509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-245M24.1	57019	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	11995	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chrX	45376807	45376988	45376867	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	14174	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	4.98157088226693
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	47221089	47221361	47221213	Y	NA	NA	USP11,ZNF157,UBA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF41	118984	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	145010	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-323P24.3	273914	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	64255385	64255512	64255449	Y	ZC4H2	ZC4H2	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	2792	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	3.32104725484462
chrX	106943627	106943904	106943732	Y	TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	73890	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	109645744	109645944	109645869	Y	NA	AMMECR1	TMEM164	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMMECR1	35517	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	115004721	115004876	115004807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	211220	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	149186886	149187270	149187078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXorf40B	81857	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	0.830261813711155
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	15242A	hg19	FANTOM5	1.66052362742231