chr1	839741	840250	839788	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	18010	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RP11-465B22.3	21720	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	1286847	1286913	1286880	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	4117	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	2230678	2230895	2230769	Y	SKI,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	88519	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	2253622	2253773	2253699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	67373	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	3521167	3521613	3521414	Y	NA	MEGF6,TPRG1L,WRAP73	NA	NA	NA	NA	MEGF6	4446	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	7461964	7462325	7462107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	367004	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	7609389	7609632	7609504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	219697	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	36638	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	117846	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	113345	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1-IT1	2141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	10496880	10497075	10496978	Y	KIF1B	PGD,APITD1,APITD1-CORT,PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	APITD1,APITD1-CORT	8721	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	12493313	12493712	12493478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	182025	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	12589452	12589763	12589585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	85974	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	12614115	12614248	12614183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	61489	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	14992426	14992802	14992486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	69226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	16500084	16500309	16500220	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19502	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr1	19280139	19280583	19280395	Y	UBR4,IFFO2	IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	19333976	19334220	19334098	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	52796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	20806851	20807214	20807064	Y	NA	CAMK2N1,MUL1	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	3499	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	20808010	20808395	20808205	Y	NA	CAMK2N1,MUL1	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	2318	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	22076024	22076450	22076245	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	31649	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	22375194	22375332	22375261	Y	CDC42	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	1788	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	23542417	23542518	23542468	Y	HTR1D	LUZP1	KDM1A,LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	40116	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	24229023	24229388	24229190	Y	NA	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	FUCA1	36239	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	27893464	27893671	27893490	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	35271	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	28437697	28438098	28437903	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566	IMR90	Hi-C	24141950	EYA3	24490	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	29224369	29224479	29224424	Y	EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	12766	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr1	31401933	31402089	31402038	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	22325	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	31944306	31944695	31944578	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63894	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	75791	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TINAGL1	24526	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	33232248	33232565	33232367	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	S100PBP	47803	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	38739267	38739533	38739400	Y	NA	NA	POU3F1	IMR90	Hi-C	24141950	UTP11L	266337	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	39327096	39327575	39327204	Y	NA	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	RP5-864K19.4	3424	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	43426742	43427095	43427089	Y	CLDN19,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	4212	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	43427522	43427762	43427666	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	4992	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	5856	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	6760	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	10333	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	46555686	46555960	46555823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R3	84200	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	339924	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	53020482	53020832	53020657	Y	BTF3L4,PRPF38A,ZYG11B,FAM159A,ZCCHC11	ZCCHC11	NA	NA	NA	NA	ZCCHC11	3323	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	56797894	56798374	56798151	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAP2B	310600	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	61517483	61517553	61517518	Y	NA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	188552	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	320855	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	61662774	61662930	61662815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	333843	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	64417224	64417447	64417336	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	109868	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	68166463	68166766	68166597	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	17719	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.66462122766757
chr1	68945486	68945782	68945636	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	15122	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	75694572	75694736	75694622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX8	102453	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	772913	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	87171187	87171726	87171422	Y	SH3GLB1	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	2928	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	90137741	90138074	90137909	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	41110	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	182680	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	94429275	94429464	94429371	Y	GCLM	NA	ABCA4,ARHGAP29	IMR90	Hi-C	24141950	GCLM	56309	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	95508067	95508435	95508367	Y	NA	ALG14	NA	NA	NA	NA	ALG14	28066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	97308752	97309076	97308966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	123531	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	100820585	100820838	100820683	Y	HIAT1,CDC14A	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	12001	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	100827551	100827774	100827683	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	18967	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	108122481	108123055	108122789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	618416	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	110175406	110175537	110175472	Y	NA	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	18680	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	110336950	110337403	110337105	Y	GSTM2,CSF1	EPS8L3	CSF1,FAM40A,AHCYL1,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	32301	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	110358971	110359415	110359330	Y	GNAI3,AMPD2	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	54322	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	110548379	110548612	110548408	Y	NA	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	23071	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	112384057	112384387	112384222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	87611	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	NA	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A1-AS1	101878	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	117132073	117132239	117132154	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	20412	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	119401140	119401399	119401296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-712E4.1	140616	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439A17.7	648739	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	144941125	144941602	144941408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	131381	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	145519496	145519624	145519499	Y	NBPF10,TXNIP	LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,PEX11B	NA	NA	NA	NA	PEX11B	5244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	183723	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr1	153504746	153504953	153504860	Y	PGLYRP3,S100A7L2,SLC39A1	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	667	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	155052148	155052357	155052334	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1	NA	NA	NA	NA	EFNA3	17924	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	155066604	155066635	155066620	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	DPM3,KRTCAP2,EFNA1,TRIM46,SLC50A1	IMR90	Hi-C	24141950	EFNA1	31301	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	158779760	158780042	158779908	Y	PYHIN1,IFI16,MNDA	NA	PYHIN1,CD1A	IMR90	Hi-C	24141950	IFI16	187716	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	159878004	159878104	159878054	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	10051	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	161998457	161998829	161998746	Y	ATF6	OLFML2B,NOS1AP	DUSP12,ATF6,OLFML2B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OLFML2B	6813	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	164717528	164717907	164717706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	194707	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	167461792	167462175	167462164	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	58829	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	DNM3	NA	NA	NA	NA	DNM3	23568	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	175902819	175902853	175902836	Y	NA	RP11-318C24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	13708	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	178235815	178236162	178236004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	174951	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	179555221	179555646	179555325	Y	TDRD5,TDRD5,TDRD5	TDRD5	NA	NA	NA	NA	TDRD5	3102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	53391	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	180727103	180727211	180727157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPR1	127963	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	181459512	181459699	181459606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1E	79274	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	182176105	182176350	182176203	Y	NA	NA	CACNA1E	IMR90	Hi-C	24141950	GLUL	182991	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	182538682	182538808	182538746	Y	NA	RNASEL,RGS16	NA	NA	NA	NA	RNASEL	17583	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	182682922	182683008	182682965	Y	DHX9	NA	RGS8,RNASEL	IMR90	Hi-C	24141950	NPL	73420	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	74610	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	183877295	183877615	183877384	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	141196	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	183912062	183912419	183912241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	106392	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	184506061	184506260	184506127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	151869	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	184700299	184700688	184700567	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	21359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	184724887	184725142	184725036	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	2840	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	184929910	184930144	184930114	Y	TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	11538	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	186818504	186818763	186818666	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	22419	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	186892657	186892915	186892791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	96572	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	187267139	187267250	187267195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	471054	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX9	85857	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr1	200076437	200076447	200076441	Y	NR5A2	NA	NA	NA	NA	NA	NR5A2	81707	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	200862818	200862950	200862864	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	4642	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	201084133	201084558	201084403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM9	54144	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	201366439	201366550	201366506	Y	PKP1,LAD1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	69815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	113368	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	112029	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3,RP11-465N4.4	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-465N4.4	38691	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	202027341	202027750	202027511	Y	NA	RP11-465N4.4	RNPEP,ELF3,NAV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-465N4.4	49860	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	204358316	204358342	204358328	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	20577	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	205257253	205257766	205257562	Y	RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	31117	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	205638734	205639222	205638979	Y	SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	8365	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	207413364	207413503	207413411	Y	IL19,CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	79350	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	208387951	208388224	208388088	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	27441	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	132391	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	209915892	209916078	209915980	Y	NA	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	39826	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	212655370	212655477	212655424	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	51141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	212808992	212809268	212809126	Y	VASH2,PPP2R5A	RP11-338C15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-338C15.3	27508	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	212855580	212855934	212855830	Y	NA	RP11-338C15.3,BATF3	NA	NA	NA	NA	BATF3	15393	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	213088828	213089171	213088880	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	32691	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	218546684	218546887	218546789	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	29107	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	218553747	218554148	218553928	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	36170	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	219498496	219498646	219498574	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	153310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	223907308	223907681	223907376	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	20013	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.99783424105977
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	225934674	225934968	225934833	Y	ENAH	SRP9	NA	NA	NA	NA	SRP9	28563	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.66570410713768
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	230241590	230241986	230241849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	50054	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	10.9960294419429
chr1	233809261	233809638	233809364	Y	KCNK1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK1	61511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	164880	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	191182	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	236430059	236430250	236430155	Y	NA	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	13069	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	241693216	241693255	241693236	Y	KMO	FH	NA	NA	NA	NA	FH	12155	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	25016	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr1	241790752	241791037	241791008	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	6195	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	241804319	241804678	241804577	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	7087	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3C	52027	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr1	243995795	243995860	243995825	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	16521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	49442	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF669	60892	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	307117	307186	307176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	128712	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	384217	384634	384602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	205812	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	587865	588161	588097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	145522	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	652657	652929	652820	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	80754	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	699938	700531	700398	Y	DIP2C	DIP2C	NA	NA	NA	NA	DIP2C	33152	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	3123873	3124204	3123982	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	17348	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	3145163	3145536	3145437	Y	PFKP	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	38638	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	3893365	3894190	3893886	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	67892	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	112948	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	4989909	4990226	4990068	Y	AKR1C3,AKR1C1	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	57113	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	5045021	5045414	5045392	Y	AKR1C2	AKR1C2,AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C2	12809	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	5113786	5114179	5114065	Y	AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	38240	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	5316994	5317070	5317001	Y	NA	NA	tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1CL1	74545	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1CL1	91195	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	4.49837568079483
chr10	5336164	5336286	5336241	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1CL1	93715	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	45786	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	6449763	6450038	6449901	Y	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	170225	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	6600320	6600578	6600409	Y	RBM17,RBM17,PRKCQ	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	19685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	12950339	12950416	12950378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	189033	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	13807715	13808056	13807951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	180788	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr10	14931162	14931541	14931180	Y	NA	SUV39H2	NA	NA	NA	NA	SUV39H2	12343	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	16548527	16548808	16548668	Y	NA	RNU2-18P	NA	NA	NA	NA	RNU2-18P	32525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	16802586	16802595	16802591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	54932	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	21241912	21242237	21242078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	218879	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	21243289	21243672	21243624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	217444	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	22894974	22895386	22895290	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	106098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	22922432	22922728	22922682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	78756	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	23569380	23569726	23569528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD1	156472	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	29924706	29925406	29925356	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	228375	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	328815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr10	33403327	33403662	33403511	Y	NA	NA	ITGB1,NRP1,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	110607	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	33422989	33423776	33423207	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	130269	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	33537661	33538041	33537751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	85149	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	33541909	33542109	33542065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	81081	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	33547800	33548221	33548104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	74969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	34439638	34439951	34439795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	662302	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	35425292	35425645	35425387	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2	NA	NA	NA	NA	CUL2	47722	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	37595882	37596202	37595976	Y	ANKRD30A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF248	548832	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	42391693	42392005	42391916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF37BP	654265	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	43761301	43761565	43761418	Y	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	NA	FXYD4	103525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	45434472	45434743	45434608	Y	OR13A1,ALOX5	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	18112	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	59905	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	47008240	47008359	47008300	Y	GPRIN2	SYT15	NA	NA	NA	NA	SYT15	38840	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	111136	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	47092142	47092537	47092340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	122742	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	47093518	47093811	47093665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	124118	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	160094	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	168349	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	52085013	52085461	52085351	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	62275	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	60422217	60422354	60422286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	151317	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	63823957	63824187	63824054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	164898	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	64320064	64320236	64320175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	242280	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	71827466	71827672	71827569	Y	NA	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	16914	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	73398011	73398245	73398040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	133010	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	74037393	74037499	74037446	Y	NA	DDIT4	DNAJB12	IMR90	Hi-C	24141950	DDIT4	5715	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr10	74070583	74070739	74070681	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	38905	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	74836640	74837022	74836864	Y	NA	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	17710	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	74850921	74850988	74850953	Y	ANXA7,ECD	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	3744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	75887856	75888019	75887938	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	AP3M1	20802	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	79268227	79268357	79268284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	127996	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	141919	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	79545596	79545879	79545660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	138499	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	79596032	79596523	79596221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	87855	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	81088418	81088982	81088641	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	16243	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	82296466	82296516	82296492	Y	NA	RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	2768	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	86089822	86090305	86090054	Y	FAM190B	NA	NA	NA	NA	NA	CDHR1	137412	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	91173615	91173677	91173627	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	1272	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr10	93283444	93283748	93283596	Y	HECTD2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	107063	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	13521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	94516915	94517155	94517045	Y	HHEX,EXOC6	NA	EXOC6,KIF11,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHEX	70970	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	95145053	95145431	95145242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	94643	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	97048077	97048324	97048201	Y	SORBS1	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	457	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	97308667	97309047	97308880	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	10124	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	117342	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	99302907	99303185	99303057	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,ANKRD2,HOGA1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD2	27013	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	99356549	99356930	99356740	Y	NA	ANKRD2,HOGA1,PI4K2A,MORN4	NA	NA	NA	NA	PI4K2A	14418	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	101105244	101105424	101105335	Y	NA	CNNM1	NA	NA	NA	NA	CNNM1	18388	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	101537826	101537964	101537919	Y	ABCC2	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	2525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	583	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	101543856	101543953	101543936	Y	COX15,ABCC2	ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	3367	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	102488726	102488983	102488821	Y	NA	NA	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM178A	181343	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	102490299	102490653	102490523	Y	PAX2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM178A	179673	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr10	103051353	103051800	103051498	Y	NA	NA	BTRC,FLJ41350,FBXW4,LBX1,POLL,DPCD,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8,LOC100289509	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	60020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	103699141	103699397	103699242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	114553	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	33467	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	219421	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr10	105630915	105631032	105630972	Y	GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	44931	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr10	105720019	105720413	105720265	Y	NA	OBFC1,SLK	SH3PXD2A,SLK	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLK	4546	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112123790	112124003	112123953	Y	MXI1	NA	SMC3,DUSP5,RBM20	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	61081	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	112159079	112159451	112159258	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	96145	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112174673	112174737	112174702	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	80859	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112185759	112186089	112185825	Y	SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1	NA	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	69507	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112263780	112264181	112263965	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	8184	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112401121	112401469	112401220	Y	SMC3,RBM20	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	686	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	114891441	114891844	114891554	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	183432	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	114940347	114940490	114940443	Y	CASP7,TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232338	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	114940720	114940897	114940795	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr10	116776820	116777128	116776974	Y	NA	NA	ATRNL1	IMR90	Hi-C	24141950	TRUB1	80868	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	116902844	116903191	116903017	Y	ATRNL1	NA	NA	NA	NA	NA	TRUB1	206892	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	120968752	120969030	120968753	Y	EIF3A,GRK5	SFXN4,PRDX3,GRK5	NA	NA	NA	NA	GRK5	3651	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	121031141	121031480	121031339	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	66040	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr10	123914446	123914761	123914722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167757	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	126406559	126407126	126406852	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	23712	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	127432481	127432807	127432790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	77010	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	127919956	127919968	127919963	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	155056	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	128947297	128947480	128947351	Y	NA	FAM196A	NA	NA	NA	NA	FAM196A	44942	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr10	131438209	131438380	131438294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	174761	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	133454610	133454819	133454663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	338616	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	7.33068629462861
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf91	20574	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	4.49837568079483
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr11	589256	589485	589371	Y	SIGIRR	RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7,CDHR5	NA	NA	NA	NA	PHRF1	14770	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	NA	NA	NA	NA	NA	MUC5AC	76035	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	1423	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	1241085	1241212	1241149	Y	NA	MUC5B	NA	NA	NA	NA	MUC5B	1084	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	1245627	1245992	1245771	Y	NA	MUC5B	NA	NA	NA	NA	MUC5B	3331	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	1751706	1752102	1751905	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-3,KRTAP5-5,KRTAP5-6	RP11-295K3.1,CTSD	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	26179	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	1773349	1773482	1773395	Y	IFITM10	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	4799	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	10620	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	1935889	1936214	1936052	Y	IGF2,KRTAP5-3,TNNI2,TNNI2,TNNT3	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	30294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	2402008	2402516	2402305	Y	KCNQ1	RPL26P30,CD81,CD81-AS1,TSSC4	NA	NA	NA	NA	CD81-AS1	4786	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	2643944	2644417	2644202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	74807	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	2961841	2962060	2961969	Y	KCNQ1	SLC22A18,PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	13156	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	9732058	9732249	9732166	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	48434	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	10681207	10681687	10681411	Y	ADM,MRVI1,MRVI1	NA	LYVE1,MRVI1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CTR9	88847	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	10735359	10735758	10735614	Y	AMPD3	CTR9	MRVI1,MRVI1-AS1,RNF141,AMPD3,MTRNR2L8,LYVE1	IMR90	Hi-C	24141950	CTR9	34776	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	114475	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	14827	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	12204138	12204505	12204342	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	90595	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	14563953	14564333	14564143	Y	NA	COPB1,PSMA1	NA	NA	NA	NA	PSMA1	24063	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1,CALCB	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	17307346	17307410	17307378	Y	NA	NA	B7H6	IMR90	Hi-C	24141950	NUCB2	79646	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	18646989	18647318	18647154	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	7020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	20016658	20016921	20016770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	366310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	23079827	23079841	23079834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	229982	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	30127536	30127914	30127726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDC1	1261443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	32728667	32728946	32728768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3M	125323	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	163848	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CAT	217107	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALX4	89548	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	48004294	48004631	48004323	Y	CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	4181	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	48028604	48028990	48028813	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	28491	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	48040170	48040457	48040234	Y	NA	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	40057	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	48102794	48103200	48102989	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	102681	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	56677602	56677921	56677758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	412505	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	23816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	59582834	59583156	59582993	Y	NA	MRPL16,TCN1	NA	NA	NA	NA	MRPL16	6489	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.49801472097146
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	62202402	62202418	62202410	Y	WDR74	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	65784	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	62248272	62248499	62248283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	62972	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	62272728	62273223	62272788	Y	ROM1	RP11-864I4.4,AHNAK	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	38248	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.33249109374547
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	65910089	65910568	65910423	Y	NA	NA	KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	74255	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	67103841	67103862	67103852	Y	NA	ANKRD13D,SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	18581	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	4147	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	67144956	67145205	67145097	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	5901	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	68065646	68065898	68065824	Y	CHKA,LRP5	C11orf24,LRP5	SUV420H1,C11orf24,LRP5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP5	12179	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	7929	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	40467	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	FADD	251431	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	70390	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	73989657	73990002	73989928	Y	NA	P4HA3	PPME1	IMR90	Hi-C	24141950	P4HA3	30700	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr11	74397873	74397982	74397928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864N7.2	57177	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	74814562	74814987	74814735	Y	ARRB1	SLCO2B1	XRRA1,LOC100507050	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO2B1	4954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	75537561	75537829	75537710	Y	ARRB1,DGAT2,UVRAG	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	13110	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	11.6624554687273
chr11	76510532	76510646	76510589	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	NA	NA	NA	NA	RP11-21L23.3	18426	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	77960482	77960781	77960725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	62614	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	79881401	79881554	79881478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1597482	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	86222200	86222363	86222315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	159315	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	86389449	86389613	86389533	Y	NA	ME3	ME3,PRSS23	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	7771	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	86642953	86643307	86643130	Y	NA	FZD4	NA	NA	NA	NA	FZD4	21126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	95163190	95163241	95163211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESN3	199485	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	101881929	101882102	101882031	Y	NA	C11orf70	NA	NA	NA	NA	C11orf70	34072	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	103495901	103496466	103496275	Y	NA	NA	DYNC2H1,PDGFD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37O16.8	217516	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	103742967	103742991	103742981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFD	290116	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	105048525	105048618	105048576	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	CASP1	IMR90	Hi-C	24141950	CASP5	156630	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	105060205	105060677	105060502	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CASP5	168310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	109990513	109990553	109990536	Y	NA	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	28426	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	110228106	110228348	110228289	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	NA	RDX	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RDX	62659	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	111195850	111196227	111196025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAYN	212778	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	113828537	113828676	113828607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	84245	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	117050933	117051273	117050997	Y	SIDT2	PAFAH1B2,SIDT2,TAGLN,PCSK7	NA	NA	NA	NA	SIDT2	3484	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	118755477	118755626	118755517	Y	ATP5L,MLL,ARCN1,DDX6,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	23791	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.83194965401041
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	119341099	119341491	119341199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	90611	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	122177708	122178168	122177914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-820L6.1	113411	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	122587982	122588633	122588143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	63599	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr11	126209269	126209556	126209430	Y	NA	DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	13979	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	127859699	127859802	127859739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	595651	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	472140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	130036262	130036668	130036368	Y	PRDM10	NA	NA	NA	NA	NA	APLP2	98530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	3239416	3239801	3239467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	54895	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf5	479758	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf5	287556	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	6684613	6684668	6684641	Y	NA	GAPDH,NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	NOP2	8756	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	RNU7-1,EMG1,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	6063	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	8813796	8814159	8813977	Y	MFAP5	RP11-438L7.3,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	RIMKLB	18037	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	11880176	11880196	11880186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	79388	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	11898142	11898564	11898233	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	97354	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	11911642	11913422	11912121	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	110854	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	12504083	12504386	12504252	Y	BCL2L14,MANSC1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	MANSC1	2608	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	12556548	12557081	12556810	Y	CDKN1B,LOH12CR1	LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	48535	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	12592534	12593034	12592768	Y	BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	84521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	12602381	12602995	12602706	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	94368	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	12661595	12661928	12661772	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	51389	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	12735834	12736179	12735985	Y	NA	DUSP16,CREBL2	LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP16	22517	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	4.16516266740262
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL30P11	102512	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	14987002	14987060	14987033	Y	NA	WBP11,C12orf60	NA	NA	NA	NA	C12orf60	32496	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE3A	420339	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	20732540	20732626	20732597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	212361	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	20950319	20950359	20950339	Y	NA	SLCO1B3	NA	NA	NA	NA	SLCO1B3	11277	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	SLCO1B3	NA	NA	NA	NA	SLCO1B3	13588	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	16.9938636830027
chr12	21162401	21162431	21162416	Y	SLCO1B3,SLCO1B1,LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO1B1	119705	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	24903057	24903444	24903231	Y	SOX5	NA	SOX5	IMR90	Hi-C	24141950	BCAT1	196949	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137588	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B	70000	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	42598855	42599145	42599001	Y	YAF2,YAF2,YAF2	YAF2,PPHLN1	NA	NA	NA	NA	YAF2	31006	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	46571692	46571878	46571769	Y	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	89922	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	47074564	47074850	47074707	Y	NA	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	299102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.33249109374547
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	47606052	47606349	47606300	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	134318	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	47613849	47614234	47614042	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	142115	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	47744016	47744137	47744058	Y	NA	NA	FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	272282	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	49371065	49371287	49371156	Y	NA	ARF3,RP11-386G11.5,PRKAG1	NA	NA	NA	NA	RP11-386G11.5	18863	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT4	58707	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	53892109	53892322	53892185	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	262	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	54017367	54017528	54017445	Y	NA	ATF7,RP11-972K6.1	NA	NA	NA	NA	ATF7	671	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	54133160	54133497	54133297	Y	ATF7,ATP5G2	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	13631	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	7.66389930802082
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	57557421	57557508	57557464	Y	NA	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	33499	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	57855378	57855667	57855523	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS,ARHGAP9	NA	NA	NA	NA	GLI1	3460	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	59542738	59542911	59542783	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	230435	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	153991	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	65026482	65026674	65026578	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	24189	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2	NA	NA	NA	NA	HMGA2	26779	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr12	69180946	69181662	69181342	Y	NA	SLC35E3,MDM2	SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	18294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	69305634	69305702	69305668	Y	RAP1B,LYZ,CPM,CPM	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	57648	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	76197528	76197897	76197766	Y	KRR1	NA	KRR1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	227815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	76429051	76429248	76429150	Y	NA	PHLDA1,NAP1L1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	3339	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	76938616	76938968	76938946	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	12621	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	79279208	79279511	79279476	Y	NA	SYT1	NA	NA	NA	NA	SYT1	23435	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	NA	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	139240	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	81096686	81096945	81096788	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	232649	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	82362285	82362429	82362357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	388155	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	92427755	92427874	92427825	Y	CLLU1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	106816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	92446330	92446640	92446498	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	88050	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	92501411	92501848	92501769	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	32842	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr12	94241673	94241891	94241710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	172522	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	94566673	94567025	94566856	Y	TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	26174	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	137747	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	96659033	96659395	96659303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	72873	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	96828064	96828263	96828182	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17	LTA4H,ELK3,CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	CDK17	35726	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	97525416	97525919	97525503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	226415	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	97962496	97962841	97962674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	663495	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	98793447	98793582	98793503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPO	113708	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	102734344	102734692	102734517	Y	NA	NA	IGF1	IMR90	Hi-C	24141950	NUP37	222442	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	1011	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	104791559	104791875	104791716	Y	TXNRD1	NA	CHST11,SLC41A2,C12orf45	IMR90	Hi-C	24141950	CHST11	55198	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	104999582	105000032	104999671	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	152509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	106694592	106694855	106694698	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	885	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	107723329	107723653	107723513	Y	NA	BTBD11	NA	NA	NA	NA	BTBD11	13139	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	109899131	109899209	109899162	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	13998	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	110704832	110705217	110705054	Y	PPTC7	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	11344	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	110735237	110735389	110735298	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	18676	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	115103963	115104215	115104201	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	15754	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	116930750	116930937	116930851	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00173	38290	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	116946674	116946880	116946778	Y	NA	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22347	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	117173952	117174265	117174216	Y	MED13L,MAP1LC3B2	C12orf49	NA	NA	NA	NA	RNFT2	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	118123457	118123641	118123524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	281147	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	121402785	121402795	121402791	Y	HNF1A	HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43	NA	NA	NA	NA	HNF1A	11551	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr12	122227826	122228273	122227974	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11036	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	122444524	122444823	122444769	Y	BCL7A	BCL7A	NA	NA	NA	NA	BCL7A	10505	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	122517490	122517922	122517629	Y	RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	2862	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	12.1622749888157
chr12	124009741	124009949	124009845	Y	NA	RILPL1	NA	NA	NA	NA	RILPL1	6316	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	46301	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	130624608	130625033	130624823	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	696778	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	131249995	131250369	131250318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	71442	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	132647278	132647407	132647355	Y	SFSWAP,ULK1,FBRSL1	DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2	NA	NA	NA	NA	NOC4L	20285	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT9	66152	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	25485313	25485583	25485398	Y	PARP4,PABPC3,NUPL1,MTMR6	CENPJ	NA	NA	NA	NA	CENPJ	9435	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	27957593	27957812	27957644	Y	RASL11A,GTF3A	GTF3A	CDX2,GSX1	IMR90	Hi-C	24141950	GTF3A	38869	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	29098028	29098422	29098225	Y	PAN3	NA	FLT1,PAN3	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	72548	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	30486131	30486179	30486155	Y	NA	NA	HSPH1,UBL3,KATNAL1	IMR90	Hi-C	24141950	UBL3	63310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	30982567	30982782	30982669	Y	NA	LINC01058,UBE2L5P	KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	11592	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	35817825	35818146	35817986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	303401	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	41173351	41173594	41173358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	65140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	41175520	41175699	41175610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	63035	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	41560539	41560879	41560717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	66629	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	41627549	41627939	41627788	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WBP4	5471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	44237239	44237376	44237308	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	121668	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	207294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	29452	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	51641920	51642198	51642053	Y	INTS6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	152305	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	67204176	67204298	67204237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	598170	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	340742	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	67674730	67675228	67675034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	127240	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	22.4918784039742
chr13	76336754	76337033	76336914	Y	COMMD6,LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	144184	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	77453598	77454010	77453765	Y	FBXL3,KCTD12	KCTD12	NA	NA	NA	NA	KCTD12	4530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	2012969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	93880621	93881133	93881009	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	3526	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	93947360	93947697	93947394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	70265	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	94472931	94472950	94472936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	595836	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	94785518	94785984	94785813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	460527	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	95128334	95128746	95128451	Y	DCT	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	117765	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	95877314	95877344	95877329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	74343	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	95926561	95926799	95926680	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	24888	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	95938060	95938332	95938319	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	13355	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	95951518	95951672	95951596	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	15	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	96488083	96488280	96488182	Y	NA	NA	DNAJC3	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC3	160690	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	99135278	99135706	99135580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	92488	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	99931812	99933023	99932107	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	80784	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	101075706	101076016	101075848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	249331	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	109115794	109116062	109115942	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD13	247067	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	597640	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	110322109	110322425	110322268	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	83190	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	110401088	110401398	110401243	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	4217	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	111172874	111173635	111173314	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	38445	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	MCF2L	NA	NA	NA	NA	MCF2L	32318	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L,MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F7,F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.16480170757925
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr13	114810103	114810577	114810313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	85509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	22461074	22461199	22461141	Y	OR10G3,OR4E2	NA	NA	NA	NA	NA	SALL2	457724	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	SLC7A7,MRPL52,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC7A7	2462	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	SLC7A7,MRPL52,LRP10	NA	NA	NA	NA	MRPL52	11343	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	24604383	24604748	24604550	Y	NA	PCK2,DCAF11,PSME1,RNF31,PSME2,IRF9	NA	NA	NA	NA	PSME1	1016	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	24743214	24743836	24743517	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1,CIDEB	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	4269	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	27311220	27311475	27311345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	246260	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	31732842	31733131	31732940	Y	NA	NA	AP4S1,HEATR5A,HECTD1,STRN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	57832	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	32670916	32671247	32671221	Y	NA	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	126917	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr14	34532843	34533079	34532927	Y	EGLN3	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	396483	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	38052956	38053419	38053189	Y	FOXA1	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	9633	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	39768270	39768447	39768359	Y	PNN,MIA2	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	35782	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	C14orf182	NA	NA	NA	NA	C14orf182	32371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr14	52378269	52378599	52378273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	75594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	7.99711232141303
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34	NA	NA	NA	NA	FBXO34	29918	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	55770530	55770967	55770803	Y	GCH1,MAPK1IP1L,LGALS3,FBXO34,FBXO34	FBXO34	NA	NA	NA	NA	FBXO34	34509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	220856	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	62026213	62026731	62026533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	133500	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	62454456	62454478	62454466	Y	SYT16	NA	SYT16	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	157369	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	65140427	65140812	65140646	Y	SYNE2,ZBTB1,PLEKHG3,MAX,CHURC1	PLEKHG3	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG3	28008	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	65193422	65193546	65193484	Y	ZBTB1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	24602	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	65293635	65294075	65293719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHURC1	85004	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	65524481	65524844	65524562	Y	PLEKHG3	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	42569	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	65959136	65959304	65959206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	83826	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	68662623	68662933	68662778	Y	RDH12	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	223980	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	69171999	69172408	69172198	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	88782	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	69404659	69405002	69404945	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	39155	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	69417007	69417266	69417043	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	26891	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	69598076	69598493	69598218	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	19374	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	70104251	70104682	70104439	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	27938	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	70447892	70448065	70447949	Y	SMOC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	129044	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	145817	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	72530304	72530701	72530359	Y	RGS6,RGS6	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	743773	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	72985924	72986043	72985987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF4	404997	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF4	258523	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	36	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	74949377	74949710	74949544	Y	NA	ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	ISCA2	8713	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	75125565	75125963	75125764	Y	NA	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	44215	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	75963682	75963938	75963768	Y	C14orf1,BATF	NA	TMED10,NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	JDP2	71263	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	77209394	77209765	77209502	Y	C14orf166B	VASH1	NA	NA	NA	NA	VASH1	16767	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr14	79135034	79135191	79135113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	870608	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr14	88531180	88531607	88531441	Y	KCNK10	LINC01146	NA	NA	NA	NA	LINC01146	42286	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	91102939	91103218	91103079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	177605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	91697855	91698086	91698043	Y	C14orf159,SMEK1,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	172875	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	92446493	92446853	92446680	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	58387	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	93114264	93114489	93114415	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	98558	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	93192576	93192808	93192662	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	20239	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	95065322	95065753	95065523	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	10961	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	95779970	95780439	95780333	Y	DICER1,CLMN	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	3804	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	208740	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr14	99753863	99754151	99754065	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	191065	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	101029795	101030067	101029931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	188653	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	102226478	102227031	102226824	Y	HSP90AA1	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	343	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.16588458704936
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	103539359	103539722	103539623	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	17560	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.99783424105977
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr14	105198821	105199110	105199005	Y	C14orf180,ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	10298	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.99927808035326
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1262554	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	25555752	25555966	25555813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	126162	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	25587380	25587405	25587393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	94723	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	26131844	26132173	26132009	Y	NA	ATP10A	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	23527	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	26854717	26854952	26854835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	254558	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	33125525	33125772	33125733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	117350	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	33158575	33159178	33158960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	150400	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	33502141	33502453	33502281	Y	NA	FMN1	TMCO5B	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	17244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	34290038	34290177	34290053	Y	NA	AVEN	NA	NA	NA	NA	AVEN	39200	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	208049	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	38157700	38157714	38157707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRED1	384813	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	438868	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	24693	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	42236399	42236774	42236695	Y	NA	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	26002	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	44073726	44074107	44073917	Y	NA	PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,ELL3,MFAP1,WDR76	NA	NA	NA	NA	ELL3	5985	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr15	45929603	45930187	45929917	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	8257	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	49598906	49599159	49599033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS2	153048	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr15	51172834	51173079	51172965	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25790	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	52545063	52545254	52545150	Y	MAPK6	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	40741	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	56475850	56476168	56476009	Y	MNS1	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	57315	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	59461586	59461962	59461756	Y	ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	66309	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	62017918	62017955	62017937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	332717	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	62130295	62130308	62130301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	220364	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	63427902	63428515	63428147	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L	NA	NA	NA	NA	LACTB	15903	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	63663812	63664001	63663921	Y	LACTB,RAB8B	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	8359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	63664402	63664810	63664706	Y	LACTB,CA12	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	7550	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr15	63894930	63894962	63894946	Y	FBXL22	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	3142	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	64385169	64385477	64385384	Y	NA	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	847	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	65165332	65165600	65165447	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	PIF1,PLEKHO2,ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	33244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr15	65403116	65403434	65403296	Y	ANKDD1A,PDCD7	PDCD7	UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD7	20740	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr15	67393197	67393867	67393527	Y	SMAD3	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	39096	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67394592	67394967	67394687	Y	NA	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	40491	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	67401891	67402640	67402087	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	47790	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67423316	67423661	67423503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	69215	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67426476	67426864	67426547	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	72375	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	67926783	67927143	67926830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	93736	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	68078361	68078371	68078366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	245314	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	68238127	68238678	68238396	Y	NA	NA	PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	105839	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	68265864	68265976	68265920	Y	NA	NA	PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	78541	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	68588456	68588855	68588647	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20315	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr15	69650842	69650990	69650924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF23	53595	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	70797214	70797333	70797235	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	256599	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	71571969	71572363	71572175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388845	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	71657535	71657734	71657662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	474411	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	71677897	71678187	71678028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	494773	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	71840441	71840454	71840446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	564145	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr15	71872548	71872837	71872596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	531762	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	72003894	72004173	72003980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	400426	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	72520083	72520441	72520217	Y	ARIH1,PKM2,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	111165	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	72671459	72671771	72671611	Y	PARP6,ARIH1,HEXA	HEXA,RP11-106M3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-106M3.1	1408	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	74801015	74801389	74801202	Y	NA	UBL7,ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	30129	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	75449127	75449383	75449255	Y	NA	C15orf39	PPCDC,SCAMP5	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	36601	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	77332766	77333147	77332913	Y	PSTPIP1	TSPAN3	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	41179	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	78356048	78356390	78356219	Y	NA	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	11676	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	CRABP1	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CRABP1	36915	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.83194965401041
chr15	79153464	79153800	79153632	Y	RASGRF1	NA	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ADAMTS7	51691	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	40910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr15	79635470	79635474	79635472	Y	NA	TMED3	NA	NA	NA	NA	TMED3	34066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	81607386	81607689	81607446	Y	MESDC1,IL16,IL16,STARD5	STARD5,RP11-761I4.3	NA	NA	NA	NA	STARD5	6835	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	83857860	83858021	83857985	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16749	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	83869144	83869263	83869183	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5507	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	83992236	83992397	83992320	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	117466	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	85566958	85567254	85567106	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	45287	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	85662697	85662918	85662803	Y	PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	141026	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	86130202	86130404	86130208	Y	AKAP13,AKAP13	RP11-815J21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-815J21.2	8793	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	86337060	86337529	86337372	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	799	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	88801535	88801887	88801766	Y	NA	NTRK3	NA	NA	NA	NA	NTRK3	3536	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	89183856	89184198	89184027	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	6472	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr15	90602725	90603219	90603002	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	40517	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	92509194	92509613	92509420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	114269	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	ASB9P1,FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	98400609	98400736	98400673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	789464	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	99214674	99215061	99214732	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	24474	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	99295015	99295222	99295065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	104815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.16480170757925
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	99499686	99499980	99499831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	136440	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	101253659	101254026	101253922	Y	ALDH1A3	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-66B24.5	428	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-66B24.5	7401	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	101499118	101499600	101499493	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	41698	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr15	101986303	101986813	101986523	Y	CHSY1,TM2D3	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	76592	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	68447	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr16	1239202	1239436	1239320	Y	BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	37961	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	1585996	1586318	1586108	Y	NA	TELO2	NA	NA	NA	NA	TELO2	44651	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	2209355	2209786	2209516	Y	NPW	RAB26,SNORD60,TRAF7,CASKIN1,MLST8	NA	NA	NA	NA	TRAF7	5656	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	2557760	2557909	2557835	Y	SRRM2,PDPK1,CEMP1	C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	3962	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	FLYWCH2	45043	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	4102835	4103049	4102865	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	61137	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr16	4713771	4714092	4713866	Y	CORO7,NAGPA,GLYR1,MGRN1	MGRN1,NUDT16L1	NA	NA	NA	NA	NUDT16L1	27603	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr16	6105784	6106157	6105923	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	959975	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	7488424	7488536	7488480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1225004	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	9171086	9171431	9171335	Y	C16orf72,USP7	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	12074	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	11670817	11671132	11670939	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	57105	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	11705983	11706695	11706338	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	21542	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.49909760044157
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	15611948	15612359	15612167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	85796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr16	16070854	16071189	16071093	Y	NDE1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	29420	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	19822629	19822921	19822772	Y	NA	NA	GPRC5B	IMR90	Hi-C	24141950	GPRC5B	72568	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	21295163	21295477	21295440	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	14693	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	21622558	21622759	21622643	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	16019	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	22211037	22211162	22211126	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EEF2K	4441	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	23455511	23455803	23455657	Y	SCNN1G	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	6698	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	23473263	23473545	23473445	Y	SCNN1G,GGA2	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	10762	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	23831613	23831716	23831661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1	144636	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	24855986	24856230	24856033	Y	NA	SLC5A11	NA	NA	NA	NA	SLC5A11	824	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.49909760044157
chr16	24863023	24863279	24863154	Y	NA	SLC5A11	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	SLC5A11	7861	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	24865270	24865636	24865496	Y	SLC5A11	SLC5A11	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	SLC5A11	10108	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	27149778	27150235	27150058	Y	NA	NA	HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	127880	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	RRN3P2	84240	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	29709853	29709969	29709906	Y	QPRT	QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	37253	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.16588458704936
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	31264985	31265278	31265093	Y	STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM	NA	NA	NA	NA	NA	PYCARD	52214	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	31888684	31889219	31888998	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	47072084	47072446	47072376	Y	DNAJA2	NA	ABCC11,DNAJA2,NETO2,ITFG1,PHKB,ABCC12	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJA2	66385	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	49316261	49316466	49316357	Y	CBLN1,C16orf78	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	664202	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.99927808035326
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr16	53134908	53135206	53135001	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	47963	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	53947888	53947948	53947918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	212013	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	57428268	57428658	57428438	Y	GPR56	CX3CL1	NA	NA	NA	NA	CX3CL1	23898	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	CDH16,FAM96B,CES2,CES3,CES4A	NA	NA	NA	NA	CES3	4726	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	68433458	68433594	68433558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT7	90581	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69516681	69516730	69516706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5B	60253	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	72912475	72912642	72912542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	178955	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	73031148	73031384	73031285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	60213	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.49909760044157
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	77217218	77217275	77217245	Y	NA	MON1B,SYCE1L	NA	NA	NA	NA	MON1B	5457	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	78565966	78565983	78565974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	434656	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	80208286	80208441	80208438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	364190	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	81666319	81666849	81666608	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	103853	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	81877175	81877498	81877479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	106473	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	84634431	84634711	84634540	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	14972	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr16	85456219	85456617	85456516	Y	FAM92B	NA	KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	265062	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	85902945	85903076	85903011	Y	NA	NA	IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	54803	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	86855510	86855797	86855532	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	256653	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	87823236	87823449	87823367	Y	FBXO31,CA5A	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25638	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	87892287	87892434	87892361	Y	FBXO31	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	8660	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	6.49765376114809
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr17	200517	200885	200707	Y	RPH3AL	RPH3AL	NA	NA	NA	NA	RPH3AL	33160	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr17	1987683	1987948	1987816	Y	MNT,SLC43A2,WDR81,HIC1,HIC1	OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	44356	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	2087949	2088276	2088112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	116401	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	2162010	2162402	2162193	Y	SMYD4,METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	42275	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	2614073	2614260	2614119	Y	KIAA0664	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	119569	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	3694919	3695190	3695001	Y	CTNS,ZZEF1,P2RX1	ITGAE	NA	NA	NA	NA	ITGAE	7347	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	4617083	4617473	4617191	Y	NA	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	5299	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	GLTPD2,PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	6656419	6656747	6656461	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	98433	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	6839831	6840063	6839905	Y	XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49	NA	LOC100506713,ALOX12,ALOX12P2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC027763.2	73605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.33249109374547
chr17	8029074	8029494	8029268	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	28330	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.16588458704936
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr17	9741106	9741641	9741382	Y	NA	GLP2R	RCVRN,GAS7	IMR90	Hi-C	24141950	GLP2R	17583	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX10-AS1	395451	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr17	15153959	15154348	15154277	Y	NA	PMP22	NA	NA	NA	NA	PMP22	12295	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	17098696	17098916	17098799	Y	MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN	PLD6,FLCN	NA	NA	NA	NA	PLD6	8713	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	18825562	18825708	18825647	Y	FAM83G,TRIM16L	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83G	80409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	20204150	20204477	20204216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS3P2	285894	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	25821459	25821654	25821516	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	39789	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	4.83158869418704
chr17	25859435	25859718	25859540	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	77765	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr17	30602097	30602417	30602219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf75	72625	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	30923806	30924081	30923942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	112169	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	32232833	32233051	32232942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	347253	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	33786708	33787098	33786905	Y	NA	SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	12852	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	35292129	35292558	35292512	Y	ACACA,LHX1,AATF	AATF	NA	NA	NA	NA	AATF	11617	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	36062721	36062883	36062777	Y	DDX52,HNF1B	HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	40354	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	36073088	36073441	36073335	Y	ACACA,HNF1B	HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	29796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	36103612	36103841	36103732	Y	HNF1B	HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	375	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	8339	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38482426	38483282	38482568	Y	IKZF3,MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	18982	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38602883	38603101	38603015	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	5181	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38607821	38607996	38607876	Y	NA	TOP2A,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	10119	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	38648531	38648872	38648707	Y	KRT10,MSL1,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	6977	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	51646	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	38708057	38709216	38708396	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	52208	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	38754136	38754450	38754306	Y	NA	SMARCE1	KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17	IMR90	Hi-C	24141950	SMARCE1	48310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	39113005	39113367	39113263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT20	73526	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	39832714	39833014	39832798	Y	RAB5C,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,EIF1	EIF1	SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,EIF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF1	10123	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.16480170757925
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	44135698	44135955	44135827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	165950	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1,TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	37143	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	45775278	45775495	45775446	Y	OSBPL7,TBX21	TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	33115	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB6	17123	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr17	47913501	47913854	47913589	Y	TMEM92	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	42796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr17	47929255	47929264	47929260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	58550	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	47941415	47941544	47941487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	70710	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr17	48421685	48421964	48421826	Y	NA	XYLT2,MRPL27,EME1	NA	NA	NA	NA	XYLT2	232	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	48716691	48717083	48716761	Y	CHAD,SPAG9	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6553	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	49027288	49027482	49027366	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	7214	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	52502771	52502784	52502778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	471964	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	54833294	54833574	54833432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	75886	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	59434096	59434461	59434196	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	40796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	59645902	59646266	59646152	Y	NA	NACA2	NA	NA	NA	NA	NACA2	20297	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	61796482	61796787	61796636	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	19950	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	62612826	62613207	62613064	Y	NA	SMURF2	NA	NA	NA	NA	SMURF2	42979	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	64959449	64959766	64959607	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	423	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	66382740	66382853	66382787	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	68801	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	188409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	69437254	69437446	69437407	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467,SLC39A11	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	177673	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	225327	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	70512872	70513243	70513164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	108127	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	70680022	70680249	70680147	Y	NA	LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	45411	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	71439964	71440055	71440021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	133650	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	72237741	72237847	72237784	Y	CD300LF,CD300LD,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A,TTYH2,DNAI2	RPL38,TTYH2	NA	NA	NA	NA	TTYH2	30088	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	73074678	73074996	73074848	Y	LLGL2,C17orf28,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	6826	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.49801472097146
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7	NA	NA	NA	NA	EXOC7	18943	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.16552362722599
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	74713062	74713219	74713141	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	JMJD6	7647	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	75229995	75230416	75230213	Y	SRSF2,SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	149197	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr17	75359988	75360125	75360083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	279190	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	75388510	75388802	75388677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	307712	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr17	75421302	75421687	75421325	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	340504	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr17	75422359	75422648	75422577	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	341561	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	4.83158869418704
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	76992140	76992468	76992317	Y	NA	LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1	NA	NA	NA	NA	CANT1	11481	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	77117014	77117407	77117247	Y	NA	ENGASE	NA	NA	NA	NA	ENGASE	47993	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	77404221	77404595	77404558	Y	RBFOX3	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	335200	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	77469645	77469864	77469711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX2	280067	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	78232717	78232863	78232812	Y	NA	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	52	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr17	78725388	78725609	78725479	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	208769	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	3489	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr17	81130559	81130928	81130814	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	94992	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr18	679559	679568	679564	Y	NA	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	23219	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	9375216	9375438	9375327	Y	NA	TWSG1	NA	NA	NA	NA	TWSG1	42451	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	12606965	12607268	12607096	Y	PTPN2,SPIRE1	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	48774	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	13219877	13220140	13220009	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	230516	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	13542199	13542509	13542255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	182150	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	19279600	19279639	19279620	Y	NA	ABHD3,MIB1	NA	NA	NA	NA	ABHD3	3127	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	21336252	21336608	21336275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	95403	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	24581946	24582207	24582077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	346581	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	32558962	32559433	32559316	Y	ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	4070	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	33057648	33057699	33057650	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF24,ZNF396,INO80C	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	18256	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	45494348	45494736	45494572	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	38833	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	45790060	45790073	45790067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	273344	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	54116049	54116272	54116143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR7	200302	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	55671810	55671869	55671840	Y	NA	NEDD4L	NEDD4L,ATP8B1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4L	37730	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr18	56194097	56194141	56194127	Y	NEDD4L,MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	71722	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	56212323	56212488	56212463	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	53375	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	56394566	56394962	56394680	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	57948	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	56896223	56896454	56896339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	91514	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	60984165	60984609	60984519	Y	BCL2	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	BCL2	752	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	SERPINB11	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB11	37706	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr18	68044126	68044452	68044254	Y	NA	NA	RTTN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	89989	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	71731822	71731991	71731885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	81109	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	71950185	71950349	71950304	Y	NA	CYB5A	NA	NA	NA	NA	CYB5A	6902	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234039	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr18	74774000	74774964	74774473	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	241437	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	74805603	74805845	74805816	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	273040	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	18.1601092298754
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	CFD,MED16,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	1453873	1454140	1454045	Y	C19orf26,MUM1,APC2	DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	17515	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	2264561	2264657	2264590	Y	TMPRSS9,SPPL2B	SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1	NA	NA	NA	NA	OAZ1	2828	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	4063699	4063930	4063813	Y	NA	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	1013	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	4369210	4369467	4369256	Y	ZBTB7A,CCDC94,TICAM1,SEMA6B	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	MPND	27686	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	6067299	6067617	6067410	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	91146	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	6516969	6517178	6517079	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TNFSF9	11832	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	7440359	7440731	7440482	Y	NA	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	17268	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	7456079	7456435	7456169	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1564	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	OLFM2	NA	NA	NA	NA	OLFM2	11008	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	10148101	10148280	10148177	Y	NA	COL5A3,C3P1,C19orf66	NA	NA	NA	NA	C3P1	1622	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	13113447	13113871	13113605	Y	ZNF490,TNPO2,TNPO2,MAST1,NFIX	GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9025	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	15752781	15753122	15752960	Y	BRD4,AKAP8,RAB8A,HSH2D,CYP4F3	CYP4F3,CYP4F12	NA	NA	NA	NA	CYP4F3	3074	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F2	58811	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	16394356	16394632	16394513	Y	NWD1,KLF2	KLF2	EPS15L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF2	38996	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	18131991	18132570	18132392	Y	MAP1S,FCHO1,KCNN1,PGPEP1,LRRC25,JUND,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	74033	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	18498524	18498706	18498615	Y	ARRDC2,IFI30,JUND	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14983	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	27732067	27732764	27732500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1969684	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	28218670	28219232	28218933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1483216	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	28219787	28220540	28220091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1481908	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	28232001	28232276	28232191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470172	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	32842918	32843112	32843016	Y	ZNF507	ZNF507	NA	NA	NA	NA	ZNF507	8418	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	32866000	32866258	32866129	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	DPY19L3	28191	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	33784292	33784447	33784359	Y	CEBPG,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	7023	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	33789888	33790286	33790087	Y	NA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	1184	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	GRAMD1A,SCN1B	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.83231061383378
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	ZNF146	36980	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	38717073	38717581	38717079	Y	NA	SPINT2,PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	SPINT2	15094	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	PPP1R14A,C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	40969437	40969789	40969613	Y	BLVRB	SERTAD1,SERTAD3,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	BLVRB	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	27405	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	28849	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL,C19orf69	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAMP3	75725	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAMP3	65777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	DEDD2	29017	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.99927808035326
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	45129392	45129792	45129578	Y	PVRL2,GEMIN7,GEMIN7,PVR	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	15306	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	45189303	45189576	45189367	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	44205	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr19	45231729	45232033	45231881	Y	IGSF23,CLASRP,APOC2	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	16929	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	45242034	45242469	45242251	Y	RELB,CLASRP,BCL3	BCL3	BCL3	K562	ChIA-PET	22265404	BCL3	6493	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	46379598	46379943	46379895	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	7433	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	46694	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	46698925	46699055	46698990	Y	NA	IGFL1	IGFL3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFL1	31954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	59077	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS1	72615	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	NPAS1,TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	C5AR1	1654	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.4987366406182
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,PRR24,C5AR1,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	C5AR1	14358	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	27273	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	47827247	47827358	47827293	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	23180	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	47867147	47867265	47867191	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16609	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,KPTN	NA	NA	NA	NA	MEIS3	29420	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	48167427	48167718	48167620	Y	NA	EHD2	NA	NA	NA	NA	EHD2	46882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	48927915	48927964	48927940	Y	NA	KDELR1,GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	GRWD1	19066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	49051864	49052159	49052158	Y	NA	SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	1173	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	49690208	49690571	49690516	Y	NA	TRPM4	NA	NA	NA	NA	TRPM4	31210	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9014	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121505	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF845	107141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	79524	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	54654	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	54523388	54523781	54523608	Y	TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	80255	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	54713468	54714085	54713942	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	10858	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14,SBK2	NA	NA	NA	NA	SBK2	14879	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	SBK2	14871	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr19	57125625	57125769	57125697	Y	ZSCAN5A,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,PEG3,ZNF71	ZNF71	NA	NA	NA	NA	ZNF71	20993	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr2	3172486	3172640	3172538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	207013	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	8617164	8617264	8617232	Y	NA	NA	LOC100506274,LINC00299,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	199711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	8773908	8774094	8774001	Y	NA	ID2,AC011747.7	LINC00299,LOC339788,LOC100506274,ID2	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	42881	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	10950898	10951279	10951023	Y	NA	PDIA6	ATP6V1C2	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA6	24824	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	15309828	15310293	15310034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	389161	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	15603966	15604351	15604182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	95103	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	19986322	19986559	19986384	Y	TTC32	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	113188	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	20345416	20345679	20345548	Y	NA	NA	PUM2,WDR35,MATN3,SDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC1	77515	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	20379968	20380084	20380011	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	43110	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	24238466	24238799	24238602	Y	NA	C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	C2orf44	31646	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	62972	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UQCRHP2	5015	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.99927808035326
chr2	26241064	26241266	26241191	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	13710	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	26943701	26943984	26943834	Y	GPR113	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	41173	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	37818	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	6.16444074775588
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	27942982	27943239	27943170	Y	RBKS	AC074091.13,MRPL33	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	6383	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	28215985	28216067	28216026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	104020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	29050679	29050871	29050775	Y	NA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	40296	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36603527	36603925	36603600	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	22458	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	37308622	37308977	37308800	Y	NA	HEATR5B	NA	NA	NA	NA	HEATR5B	508	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	38333760	38333892	38333836	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP1B1	1152	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	38368766	38369153	38368894	Y	CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	33722	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	38384417	38384601	38384509	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	49373	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	39683895	39683929	39683912	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	21442	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	41141715	41142190	41142075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	305522	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	42068299	42068635	42068587	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	90228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	42149327	42149700	42149496	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	9163	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr2	42155945	42156079	42156067	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2784	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	42193606	42193918	42193678	Y	PKDCC	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	34743	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	42869718	42869759	42869739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC025750.7	111136	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	43692800	43693176	43692988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	128009	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	44514582	44514974	44514779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREPL	72027	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	44518633	44519032	44518761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREPL	67969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	46100592	46100616	46100604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	224108	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	46456791	46456944	46456828	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1,PIGF	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	61862	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	46554101	46554217	46554159	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	35295	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	46593968	46594050	46594011	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	75162	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	46636668	46636826	46636747	Y	NA	NA	EPAS1,PRKCE,RHOQ,PIGF,CRIPT	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	117862	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	46997897	46997963	46997932	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	73806	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr2	47229826	47230084	47229931	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	62832	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	47418967	47419222	47419129	Y	NA	CALM2	TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	17227	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	70453	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	48118003	48118146	48118074	Y	NA	FBXO11	NA	NA	NA	NA	FBXO11	12786	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	54643124	54643489	54643323	Y	NA	SPTBN1	ACYP2,C2orf73,SPTBN1	IMR90	Hi-C	24141950	SPTBN1	37933	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr2	54806978	54807402	54807168	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	125556	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr2	61464355	61464721	61464539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	61802	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	64015274	64015563	64015419	Y	PELI1,UGP2	WDPCP	UGP2	IMR90	Hi-C	24141950	WDPCP	37414	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	66652427	66652950	66652646	Y	MEIS1	MEIS1	LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS1	5634	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr2	69309666	69309994	69309927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	71356	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	70000495	70000634	70000556	Y	MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	54140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	70784432	70784674	70784554	Y	NA	TGFA	TGFA	K562	ChIA-PET	22265404	TGFA	5107	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	73774930	73775287	73775109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALMS1	164044	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	74259703	74260366	74260024	Y	NA	AC073046.25	TET3,ACTG2,BOLA3	IMR90	Hi-C	24141950	AC073046.25	49444	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	86121717	86122002	86121863	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	7580	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	86163596	86163679	86163638	Y	NA	ST3GAL5	POLR1A,ST3GAL5,ATOH8,LOC90784,LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	49459	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	86307060	86307219	86307140	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	24059	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	86922220	86922584	86922381	Y	NA	RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3	NA	NA	NA	NA	RMND5A	22712	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr2	87014966	87015089	87014978	Y	CD8B,CD8A,KDM3A,KDM3A,RNF103,CD8A	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP3,RNF103-CHMP3	68721	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	87019569	87019949	87019758	Y	CD8B,CD8A,CD8A	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP3,RNF103-CHMP3	73324	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.4987366406182
chr2	91960340	91960566	91960493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2971178	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	89408	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	28407	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	139	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	101680419	101680493	101680454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	64242	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	105461382	105461873	105461636	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	5768	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	109201604	109202307	109201998	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	52747	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	28076	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26628	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4782	394130	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr2	115983015	115983392	115983035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1337478	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	118432554	118432885	118432720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	137341	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	118737562	118738119	118738029	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	31590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	120039875	120040023	120039961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	60491	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	120471879	120471933	120471906	Y	NA	TMEM177,PTPN4	EPB41L5,PTPN4,TMEM185B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM177	37136	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	120585811	120586026	120585918	Y	PTPN4	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN4	70604	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	121156856	121157127	121156991	Y	INHBB	NA	INHBB,LOC84931	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INHBB	55137	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	122297511	122297730	122297621	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	11054	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	PROC	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1,MYO7B	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	133111183	133111270	133111216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	60877	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	911578	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	142137791	142137799	142137795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	749471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	6497	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	143628214	143628759	143628425	Y	NA	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	4308	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	143697269	143697638	143697450	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	64202	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	143787887	143787977	143787916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	154820	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	143841282	143841488	143841338	Y	KYNU,ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	208215	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr2	145420866	145421073	145420998	Y	ZEB2	TEX41	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	TEX41	2461	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	149527542	149527937	149527740	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	102882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr2	151323622	151323873	151323744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	69652	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	151385444	151385651	151385488	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	7874	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	152356804	152357129	152357077	Y	NEB	NA	NA	NA	NA	NA	RIF1	92407	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	153277978	153278373	153278235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	88227	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	158673009	158673352	158673181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	57022	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	158687871	158687996	158687910	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	42378	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	160219490	160219798	160219643	Y	MARCH7,CD302	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	78180	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	160646880	160647090	160646985	Y	NA	CD302	NA	NA	NA	NA	CD302	5663	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	147543	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	161065805	161066369	161066265	Y	CD302	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	148684	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	161078300	161078513	161078433	Y	ITGB6	NA	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	161179	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	161083916	161084239	161083958	Y	CD302,ITGB6	NA	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	166795	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	166779898	166780276	166780103	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	28077	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	168366215	168366278	168366264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	218534	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	169434382	169434732	169434541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	124010	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	169894823	169895302	169894971	Y	DHRS9,DHRS9	DHRS9	ABCB11	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS9	23997	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	175459812	175460479	175460357	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	WIPF1	85165	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHN1	105750	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	183950583	183950613	183950599	Y	NA	NCKAP1,DUSP19,NUP35	NA	NA	NA	NA	DUSP19	9296	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	187194208	187194220	187194214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	154663	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	188414787	188415077	188415012	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	13410	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	189391407	189391613	189391501	Y	GULP1	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	237011	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	192717272	192717408	192717316	Y	NA	AC098617.1,SDPR	NA	NA	NA	NA	SDPR	7291	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.33249109374547
chr2	192775335	192775569	192775423	Y	OBFC2A,SDPR	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	65354	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	192839658	192840009	192839864	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	129677	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	192893540	192893930	192893543	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	164505	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	196439142	196439289	196439263	Y	NA	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	441	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	197023417	197023933	197023871	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	15294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	200839985	200840279	200840201	Y	NA	C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	TYW5	21526	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	203131534	203131826	203131673	Y	FAM117B,NOP58	SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	3095	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	205836059	205836159	205836109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	427543	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	208004399	208004541	208004470	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	25450	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	208602415	208602802	208602609	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	28151	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	64529	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	211413660	211414008	211413843	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	73254	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	216558345	216558652	216558547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	259369	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	216767989	216768230	216768091	Y	NA	NA	LOC646324,FN1,ATIC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MREG	128589	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	217181584	217181763	217181674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	93374	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	218857857	218858115	218857951	Y	NA	TNS1	TNS1,RUFY4	IMR90	Hi-C	24141950	TNS1	7603	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	5566	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	221802042	221802413	221802264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	634509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr2	224852422	224852838	224852675	Y	NA	WDFY1,MRPL44,SERPINE2	NA	NA	NA	NA	MRPL44	32301	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	225742533	225742839	225742686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	162323	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	225782519	225782936	225782741	Y	DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	122226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	228238680	228239026	228238902	Y	CCL20,AGFG1,TM4SF20	TM4SF20	NA	NA	NA	NA	TM4SF20	5685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	228253438	228253721	228253534	Y	CCL20,AGFG1	TM4SF20	TM4SF20,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF20	8727	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	228270733	228271155	228270942	Y	NA	TM4SF20	C2orf83,AGFG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF20	26022	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	228522025	228522410	228522050	Y	CCL20,AGFG1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	58318	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	228578021	228578290	228578242	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	2438	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	231528896	231529139	231528971	Y	GPR55,SP110,SP140	CAB39	NA	NA	NA	NA	CAB39	46421	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	231658746	231658958	231658902	Y	SP140L,SP100,SP100	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	68396	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	233876295	233876308	233876302	Y	NEU2,NGEF	NGEF	NA	NA	NA	NA	NGEF	313	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	235388083	235388436	235388365	Y	NA	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	15261	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	235732390	235732720	235732555	Y	NA	NA	SH3BP4,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	125897	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	235748055	235748426	235748121	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	110191	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr2	236172421	236172477	236172436	Y	NA	NA	AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP1	228256	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	237117535	237117935	237117735	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	GBX2	42523	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	407971	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr2	238036930	238037258	238037105	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	44470	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	238411273	238411418	238411341	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	19202	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14795	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	239772979	239773251	239773061	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	18306	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr2	239968226	239968465	239968347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST2	213553	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	239997480	239997793	239997637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST2	242807	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.66534314731431
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	53464	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	240866823	240867270	240867165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA10	95549	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr2	242698564	242698745	242698671	Y	THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	26570	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr2	243028160	243028467	243028224	Y	ATG4B	AC093642.5	NA	NA	NA	NA	AC093642.5	317	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	453687	453779	453733	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	12490	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	625872	626198	626085	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	5816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	641092	641461	641194	Y	NA	SRXN1	SRXN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRXN1	9078	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	2812856	2812910	2812883	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	VPS16	6439	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	3188788	3188839	3188809	Y	NA	UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	1274	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr20	3348660	3349006	3348744	Y	FASTKD5,UBOX5,GFRA4	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	37266	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	ADRA1D	NA	NA	NA	NA	ADRA1D	28999	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	4423594	4423998	4423801	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	ADRA1D	195873	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	4487937	4488131	4488040	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	PRNP	176751	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	5053777	5054341	5054121	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,SLC23A2	NA	NA	NA	NA	NA	PCNA	50931	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	5588948	5589498	5589341	Y	CDS2,TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	174	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.16588458704936
chr20	5635212	5635550	5635485	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	45540	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr20	5717960	5718260	5718168	Y	C20orf196	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10779	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	6684913	6685132	6685035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	61179	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	8435134	8435511	8435284	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	324310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	9065873	9065924	9065899	Y	NA	PLCB4	NA	NA	NA	NA	PLCB4	18463	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	9254416	9254452	9254434	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	207006	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	10472654	10473100	10472965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	59784	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	13221839	13221847	13221843	Y	NA	ISM1	NA	NA	NA	NA	ISM1	21421	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	13317482	13317575	13317520	Y	ESF1	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	117064	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	13434936	13435260	13435184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	182327	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	19983799	19983958	19983881	Y	NA	NAA20,C20orf26	NA	NA	NA	NA	NAA20	11802	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	20009163	20009558	20009361	Y	NA	NAA20,C20orf26,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	NAA20	13403	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	22392618	22392869	22392732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	164411	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	22471596	22471813	22471642	Y	FOXA2,FOXA2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	85467	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	FOXA2	180073	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	25029209	25029550	25029408	Y	NA	ACSS1,VSX1	NA	NA	NA	NA	ACSS1	8066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	33236140	33236313	33236227	Y	AHCY,TP53INP2,MYH7B	PIGU	NA	NA	NA	NA	PIGU	26597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	72970	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	34681523	34681969	34681863	Y	EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1	EPB41L1	LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPB41L1	4097	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	35922737	35923093	35922847	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	6696	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	35972053	35972195	35972121	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	965	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	36042310	36042952	36042529	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	28984	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	36046410	36046637	36046524	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	25299	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TGM2	3728	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	37501358	37501511	37501425	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	51444	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	39346769	39346927	39346856	Y	NA	MAFB	NA	NA	NA	NA	MAFB	30889	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK4	96875	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	43869504	43869693	43869682	Y	DBNDD2,SLPI	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	11512	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	44135747	44136004	44135876	Y	ZNF335	NA	NA	NA	NA	NA	PIGT	93030	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	45599929	45600258	45600137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA2	78666	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	45988883	45989283	45988988	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5316	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	46162026	46162326	46162051	Y	NA	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NCOA3	33425	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	46320177	46320280	46320230	Y	SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	93080	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	47470610	47470767	47470691	Y	NA	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	28190	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.83194965401041
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	49032230	49032497	49032297	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	92394	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	52684102	52684485	52684350	Y	PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	104027	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	CYP24A1,PFDN4	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	3492	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr20	53262462	53262813	53262618	Y	DOK5	NA	NA	NA	NA	NA	RPL12P4	426342	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	54994060	54994381	54994298	Y	C20orf107,CASS4,CASS4,C20orf43	AURKA,CSTF1	NA	NA	NA	NA	CSTF1	28633	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	160352	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	57236406	57236742	57236622	Y	RAB22A,STX16	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	11916	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	60500389	60500694	60500636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	138172	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	7.99711232141303
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	61724045	61724282	61724168	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	7389	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	61822824	61823015	61822948	Y	NA	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	22571	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	ZGPAT	22592	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.3321301339221
chr21	11184749	11185145	11184947	Y	BAGE2,BAGE	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT4P2	1218164	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	15442714	15442952	15442833	Y	NA	AP001347.6	NA	NA	NA	NA	AP001347.6	44972	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	16354668	16355055	16354876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	80266	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	17125389	17125620	17125425	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	25045	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	17568022	17568137	17568068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	467678	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	17681993	17682347	17682285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	581649	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	859056	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	27353741	27354048	27353953	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	187398	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	29461833	29462120	29461977	Y	NA	AL035610.1	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	43100	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr21	30555048	30555502	30555259	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	4088	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	36074753	36075133	36074820	Y	KCNE2	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	89312	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	36207924	36208159	36208081	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222483	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	4.33176917409873
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	231255	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	18991	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	37694250	37694633	37694410	Y	NA	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	3763	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	40331056	40331378	40331206	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	155825	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	44752617	44753007	44752874	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	2698	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3373	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	44759656	44759904	44759692	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	9737	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	10794	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	44761192	44761567	44761446	Y	CRYAA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	11273	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	44764269	44764611	44764455	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	14350	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr21	44859375	44859527	44859442	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	4954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	44862613	44862764	44862681	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	1717	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	45029471	45029828	45029593	Y	PDXK	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	47546	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	45065485	45065706	45065596	Y	NA	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	11668	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr21	45154719	45155048	45154820	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	17744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	46387960	46388437	46388173	Y	POFUT2,ITGB2	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	30035	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	46738832	46739011	46738964	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	33019	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	46749567	46749782	46749739	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	43754	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	46749941	46750271	46750188	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	44128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	19703205	19703405	19703340	Y	NA	SEPT5,TBX1	NA	NA	NA	NA	SEPT5	3218	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	19946850	19947150	19946987	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	19509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	20258205	20258516	20258358	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	10253	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	18274	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	22440278	22440428	22440355	Y	MAPK1,PPM1F	NA	TOP3B,LOC96610	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TOP3B	105065	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	24080371	24080411	24080401	Y	NA	GUSBP11,ZNF70,CHCHD10,SMARCB1	NA	NA	NA	NA	ZNF70	10868	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGSM1	148495	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	27503626	27504166	27503976	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	436896	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	27508990	27509624	27509325	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	442260	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	29124446	29124891	29124760	Y	NA	HSCB,CHEK2,CCDC117	NA	NA	NA	NA	HSCB	11128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	30631749	30632163	30631958	Y	RNF215,MTFP1,GAL3ST1	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	8677	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	30647782	30648063	30647863	Y	SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6942	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr22	30652191	30652351	30652329	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11351	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	10.3296034151585
chr22	30938421	30938985	30938910	Y	LIF,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18	SEC14L4,SIRPAP1,GAL3ST1	NA	NA	NA	NA	SIRPAP1	1898	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	31030399	31030736	31030505	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18	NA	NA	NA	NA	SLC35E4	760	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	31278490	31278624	31278556	Y	SEC14L4	NA	NA	NA	NA	NA	TUG1	86039	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	34055725	34056096	34055879	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	42810	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	35709404	35709640	35709485	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	16136	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOL6	58627	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	36748222	36748386	36748297	Y	NA	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	33677	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	9245	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	36866824	36867261	36867092	Y	NA	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	8816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	37731445	37731637	37731610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-63G5.5	89843	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	37897761	37897917	37897872	Y	NA	CARD10	NA	NA	NA	NA	CARD10	15632	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1,LGALS2	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	40016485	40016775	40016630	Y	MGAT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS19BP1	89625	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	40781478	40781596	40781515	Y	NA	ADSL,SGSM3	NA	NA	NA	NA	SGSM3	16883	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	43400219	43400728	43400510	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	8423	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	153927	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr22	46035019	46035329	46035174	Y	NA	CTA-941F9.9,ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	30349	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	CTA-941F9.9,ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	46462776	46462894	46462836	Y	NA	RP6-109B7.3,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	15191	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	20329	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	25031	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	27058	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	46973801	46973805	46973803	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	3892	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	47045339	47045722	47045527	Y	PPARA,TTC38	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD4	75430	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	NA	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM19A5	847344	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	48883958	48884244	48884181	Y	FAM19A5	FAM19A5	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	686	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	453587	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr22	49769098	49769971	49769308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	449189	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr22	50414821	50415138	50414874	Y	BRD1,TUBGCP6,TRABD,PANX2,HDAC10,PIM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIM3	62660	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	50608010	50608409	50608105	Y	MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	850	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr22	50980817	50981280	50981217	Y	NA	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	1564	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr22	50982591	50982963	50982680	Y	NA	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3-AS1	8440	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.99855616070652
chr3	14444961	14445761	14445267	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	2885	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	C3orf20	NA	NA	NA	NA	C3orf20	509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	15341871	15342528	15342442	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	38347	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	15541087	15541411	15541231	Y	ANKRD28,CAPN7,SH3BP5,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ	NA	NA	NA	NA	NA	METTL6	61014	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	15598070	15598395	15598206	Y	ANKRD28,CAPN7,SH3BP5,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	BTD	42453	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	15847096	15847637	15847448	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	51641	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	16489627	16489868	16489748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	184921	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	17661435	17661830	17661633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	819276	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	95933	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	24506233	24506581	24506477	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	28192	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr3	29725037	29725420	29725261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	404564	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	37221290	37221535	37221382	Y	NA	LRRFIP2	LRRFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	1645	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	37304089	37304216	37304152	Y	GOLGA4	GOLGA4,AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	20403	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	PLCD1	NA	NA	NA	NA	PLCD1	3632	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	41725291	41725392	41725346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK4	276530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	42122071	42122336	42122239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	68777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	43298650	43298841	43298752	Y	CCDC13,ABHD5,SNRK	SNRK	HIGD1A,CCDC13,ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	SNRK	27163	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	44036592	44036799	44036686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR138-1	116905	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	112870	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	11.3292424553351
chr3	44073188	44073424	44073310	Y	NA	NA	FAM198A,ANO10,MIR138-1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	80280	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	45609249	45609611	45609389	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	14363	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	45681547	45681721	45681608	Y	LIMD1	SACM1L	NA	NA	NA	NA	SACM1L	46827	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr3	46967558	46967892	46967707	Y	KLHL18,NBEAL2	NA	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	51281	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	53106812	53106929	53106871	Y	TMEM110,SFMBT1	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28046	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	53272912	53273168	53273085	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	14900	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	53568043	53568300	53568167	Y	SFMBT1	CACNA1D	NA	NA	NA	NA	CACNA1D	41360	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	56154046	56154390	56154129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	434799	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	56818012	56818198	56818042	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	102747	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA12	167147	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	57197470	57197866	57197668	Y	NA	RP11-157F20.1,IL17RD	NA	NA	NA	NA	IL17RD	4468	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	57564978	57565360	57565163	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	16587	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr3	57969350	57969849	57969627	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	22278	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr3	60695765	60695821	60695814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	539312	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	61728117	61728514	61728321	Y	NA	RPL10AP6	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1337	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	64136720	64136844	64136782	Y	THOC7,PSMD6	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	129062	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	64147375	64147623	64147507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	139717	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	67512199	67512308	67512254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	190730	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	67741334	67741732	67741533	Y	NA	SUCLG2,RP11-81N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	38213	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	72742209	72742242	72742224	Y	NA	NA	LOC201617,PROK2,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	SHQ1	166823	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	81541330	81541813	81541427	Y	GBE1	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	267499	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	89163442	89163800	89163560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	799136	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA6	194756	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	98509261	98509585	98509483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	108948	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	11769	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	275797	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	99749892	99750279	99749982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	81078	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	112076880	112077055	112076913	Y	BTLA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	201501	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BOC	151074	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	114246828	114247170	114246841	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	473368	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	115696572	115696769	115696673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	832454	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	116793804	116794496	116794150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	50259	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	118900816	118900962	118900889	Y	UPK1B,B4GALT4	IGSF11,UPK1B	NA	NA	NA	NA	UPK1B	10452	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	120355972	120356358	120356256	Y	NA	NDUFB4,HGD	NA	NA	NA	NA	NDUFB4	42816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	120361404	120361730	120361550	Y	NA	NDUFB4,HGD	NA	NA	NA	NA	HGD	37688	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	123526629	123526951	123526787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	151613	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	123662416	123662605	123662519	Y	NA	CCDC14	NA	NA	NA	NA	CCDC14	15959	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	123762181	123762190	123762188	Y	NA	NA	KALRN,ROPN1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	83617	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	148482	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	17349	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	128831103	128831496	128831287	Y	NA	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	8148	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	128957834	128958071	128957930	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	57069	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	129486149	129486279	129486214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	124140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	140186013	140186197	140186105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	472475	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	141131755	141132151	141131882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	71738	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	147331675	147331840	147331755	Y	ZIC4,ZIC4,ZIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	551245	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	CP	NA	NA	NA	NA	CP	5001	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF18,TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	149194266	149194620	149194394	Y	CP,TM4SF4	TM4SF4,RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	TM4SF4	4505	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	151507223	151507685	151507381	Y	NA	AADAC	NA	NA	NA	NA	AADAC	22140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	161837	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	155316441	155316741	155316588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCH1	144115	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	156852547	156853124	156852850	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	23425	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	223996	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	161126891	161127108	161126997	Y	NA	NA	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	NMD3	306407	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	180190	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	169344202	169344434	169344318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	136414	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	171495458	171495728	171495684	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	31012	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	171543191	171543627	171543455	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	16451	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	172298614	172298796	172298710	Y	TNFSF10,TNFSF10	NA	NCEH1,TNFSF10,FNDC3B,GHSR,ECT2	IMR90	Hi-C	24141950	NCEH1	128212	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	173767282	173767499	173767320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	325535	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	176504226	176504517	176504371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	408744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	179687230	179687579	179687379	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	318687	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.16552362722599
chr3	183024720	183025033	183024891	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	55688	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	184655907	184656134	184656021	Y	VPS8	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	127976	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	185956078	185956394	185956322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKG	121632	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	31468	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	188103161	188103345	188103235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	233316	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	188324508	188324886	188324659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	454663	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	188475500	188475699	188475599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	605655	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	815284	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	192997761	192997785	192997774	Y	NA	HRASLS	NA	NA	NA	NA	HRASLS	40847	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.99891712052989
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	196064212	196064579	196064504	Y	WDR53,ZDHHC19	TCTEX1D2,TM4SF19	NA	NA	NA	NA	TM4SF19	838	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	83185	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	683740	684022	683889	Y	GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3	MYL5,ATP5I,PCGF3	NA	NA	NA	NA	PCGF3	13515	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr4	765995	766248	766202	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	7389	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	SLC26A1	6027	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	3483238	3483365	3483266	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	48921	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	5054462	5054541	5054502	Y	NA	STK32B	NA	NA	NA	NA	STK32B	3293	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	6887984	6888235	6888115	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	20734	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	6893983	6894399	6894044	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	14570	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	6895356	6895637	6895499	Y	KIAA0232	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	13332	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	6918330	6918775	6918508	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	9361	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	8223394	8223615	8223527	Y	METTL19,SH3TC1	SH3TC1	NA	NA	NA	NA	SH3TC1	41595	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMX1	283212	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	10174055	10174638	10174268	Y	NA	NA	WDR1,CLNK	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	57482	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB28	201297	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	15651682	15652058	15651870	Y	NA	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	29227	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	17827662	17827866	17827764	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	17137	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	18559711	18560044	18559878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCORL	538212	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	23879721	23879980	23879976	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	23732	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	24057283	24057564	24057438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	153571	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	24227575	24227894	24227795	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1A	323863	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	24472474	24473298	24472910	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	110875	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	26338276	26338542	26338322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPJ	175199	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	28385121	28385506	28385314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1524900	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	35027106	35027343	35027234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1216788	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	38857753	38857899	38857797	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	1315	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	11.3292424553351
chr4	39045195	39045532	39045360	Y	NA	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	536	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	51393	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	41365078	41365459	41365240	Y	NA	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	5454	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	41509451	41509766	41509557	Y	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	149827	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	41875913	41876282	41876100	Y	PHOX2B	NA	PHOX2B,LIMCH1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM33	58855	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVMER34-1	109945	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr4	68266370	68266649	68266476	Y	NA	RP11-584P21.4	NA	NA	NA	NA	RP11-584P21.4	43336	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	68487662	68488005	68487834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	76892	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	74464812	74465326	74464976	Y	RASSF6,RASSF6	RASSF6	NA	NA	NA	NA	RASSF6	19022	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	74922344	74922785	74922568	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL3,CXCL2	CXCL3	K562	ChIA-PET	22265404	CXCL3	19820	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	75557908	75558335	75558035	Y	EREG,AREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	159561	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	75886267	75886485	75886344	Y	PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	29962	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	78708574	78708903	78708795	Y	CNOT6L	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	29866	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	4.16516266740262
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	84491178	84491513	84491320	Y	COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	36111	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	86410493	86410688	86410582	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	16226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	63604	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr4	88899947	88900287	88900059	Y	NA	SPP1,PKD2	NA	NA	NA	NA	SPP1	5128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr4	90174156	90174307	90174302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	52854	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr4	90212945	90213002	90212979	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	14159	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	95542272	95542471	95542377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR1B	134648	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	100325584	100326020	100325850	Y	ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	NA	NA	NA	NA	NA	ADH1C	53400	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	102173679	102174077	102173884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	92860	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	103483964	103484649	103484311	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	63478	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	103541931	103542312	103542286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	121445	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	106887801	106887968	106887883	Y	NPNT	NA	NA	NA	NA	NA	INTS12	72658	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	108631161	108631506	108631267	Y	SGMS2,SGMS2	PAPSS1	NA	NA	NA	NA	PAPSS1	8102	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	108819119	108819373	108819246	Y	NA	CYP2U1	NA	NA	NA	NA	CYP2U1	31152	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	325456	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	114563561	114563906	114563734	Y	CAMK2D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	117177	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	122703678	122703696	122703687	Y	NA	EXOSC9,CCNA2	NA	NA	NA	NA	EXOSC9	16776	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	133409064	133409406	133409234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	659064	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	135287127	135287346	135287189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	1218657	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	139067903	139068306	139067999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	93197	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr4	139177153	139177364	139177274	Y	SLC7A11	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	15650	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	140850270	140850709	140850607	Y	MAML3,CLGN	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	222629	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	140897225	140897350	140897279	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	175988	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	141021103	141021485	141021348	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	51853	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr4	143012897	143013276	143013057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	457145	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	147192653	147192904	147192792	Y	ZNF827,SLC10A7	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	97816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	149109723	149110098	149109949	Y	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	458509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	151264145	151264674	151264371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	266719	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	152048107	152048440	152048274	Y	LRBA,LRBA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	29382	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	142073	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	155239135	155239272	155239204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRG1	230315	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	156487574	156487799	156487699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP9	191452	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	157718385	157718680	157718607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	171866	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	160191202	160191310	160191258	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	502912	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	161240057	161240222	161240140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	1551767	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	164688247	164688444	164688347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	424263	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	166315734	166315907	166315821	Y	NA	CPE	NA	NA	NA	NA	CPE	35388	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	169849945	169850177	169850075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	79249	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	174112816	174113032	174112924	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	24013	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	174422100	174422381	174422300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30	132980	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	175261747	175261928	175261838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	58332	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	175501777	175502117	175501960	Y	HPGD	NA	NA	NA	NA	NA	HPGD	59472	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	176452577	176452812	176452695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	532173	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	177699134	177699410	177699361	Y	NA	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	12471	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	2084030	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	183568083	183568352	183568218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	268737	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	208523	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	185189434	185189785	185189717	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	203949	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	189048639	189048958	189048819	Y	NA	RP11-713C19.1,TRIML2	NA	NA	NA	NA	TRIML2	19882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr4	190197516	190197817	190197669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	662126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	190489859	190490580	190490206	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	369363	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.16588458704936
chr5	1103805	1104368	1103973	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	5782	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	1105639	1106251	1106127	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	3899	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	2758153	2758545	2758351	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	IRX2	7184	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	14036813	14036909	14036843	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94161	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	15216648	15217026	15216659	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	346761	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	118211	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	93865	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	17401080	17401430	17401245	Y	BASP1	FTH1P10	BASP1,LOC285696	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P10	48347	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01021	623119	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	32714238	32714628	32714433	Y	NPR3,NPR3	NPR3	NA	NA	NA	NA	NPR3	27062	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	32768263	32768639	32768422	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	NPR3	81087	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	34525926	34526105	34525960	Y	NA	NA	RAI14,RAD1,BRIX1,TTC23L,DNAJC21	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	128237	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	34587608	34588326	34587915	Y	NA	NA	RAI14	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	66016	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	34877157	34877486	34877355	Y	NA	BRIX1,RAD1	NA	NA	NA	NA	BRIX1	35995	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	37740558	37740859	37740716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	363244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	39197782	39197949	39197879	Y	RICTOR,FYB	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	125272	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	42949793	42950117	42950048	Y	ZNF131,C5orf39	NA	LOC648987,LOC153684	IMR90	Hi-C	24141950	SEPP1	64299	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	44331	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	44875784	44875973	44875831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	68757	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	54817845	54817996	54817921	Y	NA	RNF138P1,PPAP2A	SKIV2L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF138P1	6533	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	55830072	55830234	55830153	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	31173	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58186995	58187365	58187085	Y	PDE4D	NA	PDE4D	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-266N13.2	146223	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58314415	58314788	58314579	Y	NA	RP11-266N13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	18800	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58316206	58316509	58316424	Y	NA	RP11-266N13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	17079	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	RP11-266N13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	1114	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	RP11-266N13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	26296	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	58375824	58376057	58376052	Y	NA	RP11-266N13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	42236	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	58408556	58408894	58408726	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	74968	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58422372	58422713	58422580	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	88784	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	89723	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58428038	58428165	58428144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	94450	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	111540	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58497739	58497828	58497784	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	164151	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58508843	58508938	58508881	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	175255	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58575824	58576193	58576112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	242236	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58798066	58798450	58798258	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	464478	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	483344	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	58866470	58866828	58866806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	532882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	58874550	58874813	58874554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	540962	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	58952543	58952885	58952791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	618955	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	59057056	59057135	59057102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	723468	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	60624078	60624207	60624180	Y	ELOVL7,ZSWIM6	ZSWIM6	ZSWIM6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZSWIM6	1893	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	65220429	65221204	65220462	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.66570410713768
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	182388	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	72218346	72218584	72218427	Y	NA	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	31224	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	72234221	72234359	72234290	Y	FCHO2	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	15449	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	229716	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	73209063	73209467	73209267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	349552	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	76103019	76103387	76103332	Y	F2RL1	F2RL1	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	9371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	77825252	77825732	77825631	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	170913	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	127506	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	78095218	78095295	78095257	Y	NA	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	31374	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	78439900	78440059	78439990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	89802	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	82771448	82771603	82771549	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	6164	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	85833622	85833763	85833693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	77958	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	88063737	88063896	88063817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM161B	500444	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	90662566	90662573	90662570	Y	NA	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	14603	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr5	94038768	94039036	94038830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	86459	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	94412847	94413065	94412956	Y	MCTP1	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	205214	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	94843632	94843977	94843805	Y	NA	TTC37,ARSK	NA	NA	NA	NA	TTC37	44734	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr5	95157129	95157323	95157255	Y	NA	GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	420	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	95170246	95170624	95170377	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	13537	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	95205682	95206201	95205913	Y	GLRX,ELL2	GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	48973	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	95873123	95873359	95873236	Y	LNPEP,CAST,CAST	CAST	ELL2,PCSK1,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	14152	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	100720192	100720438	100720315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA4	483222	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	102304978	102305194	102305031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIP5K2	148659	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	102847325	102847595	102847369	Y	NA	NUDT12	NA	NA	NA	NA	NUDT12	48899	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	107555103	107555441	107555272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL17	160358	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	111734624	111734920	111734701	Y	APC	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	18093	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,TMED7-TICAM2	NA	NA	NA	NA	FEM1C	35009	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	131833002	131833333	131833168	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8512	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	131981394	131981469	131981432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	89861	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr5	132581339	132581487	132581431	Y	ANKRD43	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	195685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-276P9.1	97894	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-276P9.1	101864	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	136359479	136359669	136359574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	168162	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	137001727	137002094	137002034	Y	FAM13B	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA0	85945	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr5	137795643	137795861	137795752	Y	FAM13B,FAM53C,ETF1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	3318	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	138499803	138499980	138499892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	107461	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	138727034	138727338	138727139	Y	LOC389333	SLC23A1,SPATA24	NA	NA	NA	NA	SLC23A1	8792	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	139049454	139050310	139049802	Y	MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	24570	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	140381128	140381335	140381222	Y	NA	PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	PCDHAC2	37308	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	140381838	140382244	140382041	Y	DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2	PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	PCDHAC2	38018	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	56558	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	141260592	141260733	141260664	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC3,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1	PCDH1,KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	3781	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	141917041	141917377	141917209	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	213021	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	142182965	142183820	142183151	Y	ARHGAP26	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	35016	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	142383259	142383413	142383268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	235310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	142785420	142785784	142785543	Y	NR3C1	NR3C1	ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	27293	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	145356389	145356594	145356491	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	42247	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	147777538	147777934	147777556	Y	NA	FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	16040	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	155202123	155202494	155202309	Y	NA	NA	PPP1R2P3	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL22	883493	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	156471573	156471840	156471835	Y	NA	HAVCR1	NA	NA	NA	NA	HAVCR1	12290	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	156476668	156477024	156476779	Y	HAVCR1,HAVCR1	HAVCR1	NA	NA	NA	NA	HAVCR1	7106	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	156608991	156609777	156609547	Y	FNDC9,CYFIP2,CYFIP2,ITK	HAVCR2,MED7	NA	NA	NA	NA	MED7	24961	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL4	69987	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	157297918	157298287	157298172	Y	NA	CLINT1	CLINT1	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	13735	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	28531	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	158876999	158877252	158877089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	188910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.4987366406182
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	159658144	159658427	159658268	Y	SLU7	FABP6,RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	24833	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	167744761	167745078	167744891	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	28105	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	167909535	167909826	167909541	Y	NA	RARS	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	RARS	1624	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	168055373	168055394	168055384	Y	NA	CTC-575D19.1	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	14056	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	168279021	168279443	168279141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	237704	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	171660495	171660734	171660615	Y	NA	STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	STK10	47105	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172209593	172209865	172209663	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	13395	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172288216	172288483	172288386	Y	DUSP1,C5orf41,ERGIC1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	28938	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172350033	172350394	172350214	Y	NA	RPL26L1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	33338	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	22163	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	173205731	173206004	173205814	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	34517	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	174975764	174976154	174976035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFXN1	73699	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	175347355	175347516	175347492	Y	NA	NA	CPLX2	IMR90	Hi-C	24141950	CPLX2	126042	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	176782864	176783054	176782988	Y	NA	MXD3,LMAN2,GRK6	NA	NA	NA	NA	LMAN2	6011	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	178069436	178069827	178069736	Y	NA	CLK4	ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6	IMR90	Hi-C	24141950	CLK4	13820	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	179770152	179770325	179770205	Y	NA	GFPT2	NA	NA	NA	NA	GFPT2	8062	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	179894931	179895217	179894999	Y	NA	CTC-573N18.1,CNOT6	GFPT2,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT6	24195	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	286457	287090	286788	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	2540	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	466739	466879	466809	Y	HUS1B	NA	NA	NA	NA	NA	IRF4	77000	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	1055850	1056126	1055989	Y	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	254549	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	2429511	2429720	2429615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	185529	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	2872094	2872570	2872534	Y	NA	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB9	28944	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	5280343	5280601	5280557	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	21066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	7692548	7692711	7692643	Y	NA	BMP6	PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	32319	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	9516527	9516706	9516607	Y	NA	NA	LOC100130275,TFAP2A,LINC00518	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2A	901186	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	10520494	10520618	10520557	Y	NA	GCNT2	NA	NA	NA	NA	GCNT2	30038	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	10552532	10552740	10552636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	62076	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	11212824	11213214	11213068	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	167367	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	11316345	11316699	11316437	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	63882	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	12287477	12287842	12287503	Y	NA	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	754	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.16588458704936
chr6	12315136	12315383	12315260	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	26540	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr6	12332214	12332482	12332362	Y	NA	EDN1	EDN1,TMEM170B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EDN1	43618	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	12484193	12484504	12484246	Y	EDN1	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	27838	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	12485726	12485919	12485760	Y	NA	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	26423	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	13428547	13428865	13428634	Y	RANBP9,TBC1D7,GFOD1,GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	GFOD1	57029	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RANBP9	501265	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	14777704	14777964	14777898	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	466563	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	MYLIP	309465	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	171014	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	16687739	16687973	16687884	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	71396	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	16712557	16713382	16713252	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45987	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	24584505	24584676	24584669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0319	59707	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr6	24659946	24660207	24660006	Y	TDP2,C6orf62	KIAA0319,TDP2,ACOT13	NA	NA	NA	NA	TDP2	5054	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	24927472	24927654	24927651	Y	ALDH5A1,TDP2,C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	GMNN	154313	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.99891712052989
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	91714	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	19.3263547767482
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	93748	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15,ZNF311	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.3321301339221
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	TRIM39	37784	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	30785907	30786494	30786279	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	53305	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr6	33216178	33216307	33216243	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2	NA	NA	NA	NA	HCG25	867	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	34514432	34514838	34514655	Y	NA	SPDEF	NA	NA	NA	NA	SPDEF	7272	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr6	34521580	34522143	34521703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDEF	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	34625381	34625487	34625387	Y	HMGA1	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37149	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	36702912	36703302	36703109	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,PXT1,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PIM1,FGD2	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	60607	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr6	37210217	37210497	37210343	Y	TMEM217,TMEM217	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	13051	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	37673638	37673745	37673684	Y	NA	NA	MDGA1	K562	ChIA-PET	22265404	ZFAND3	111530	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	40964017	40964029	40964023	Y	NA	NA	UNC5CL,APOBEC2,C6orf130	IMR90	Hi-C	24141950	NFYA	74655	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73071	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	41341728	41341773	41341752	Y	FRS3	NA	NA	NA	NA	NA	TREM1	89271	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	41546441	41546593	41546496	Y	FRS3	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	32082	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	41906927	41907077	41907010	Y	CCND3	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20001	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	41907242	41907431	41907365	Y	TAF8,TFEB,CCND3	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20316	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	44020614	44020967	44020695	Y	NFKBIE	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	54297	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr6	44618318	44618334	44618326	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	265056	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	44924205	44924374	44924290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	419316	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	45354242	45354498	45354371	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	10552	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	47220408	47220656	47220576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	54985	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	47275760	47275938	47275849	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	119	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	49521190	49521511	49521254	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5077	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	53838542	53838554	53838548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	181247	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	COL21A1	NA	NA	NA	NA	COL21A1	39521	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	57354557	57355032	57354719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	176954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	64088639	64088972	64088831	Y	NA	NA	EYS	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A1	140694	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	64150073	64150241	64150156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	79425	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	22.9916979240625
chr6	64813713	64813775	64813744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	469988	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	71133094	71133376	71133235	Y	NA	FAM135A	NA	NA	NA	NA	FAM135A	12450	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	74194767	74195136	74194952	Y	NA	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	25466	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	74861347	74861685	74861516	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	CD109	457839	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	83935269	83935637	83935453	Y	NA	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	PGM3	33614	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	84101816	84101824	84101820	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	36973	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	84139998	84140114	84140099	Y	ME1	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	1201	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	RP11-30P6.6,NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-30P6.6	16592	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	88499265	88499658	88499500	Y	AKIRIN2	NA	ORC3	IMR90	Hi-C	24141950	AKIRIN2	89338	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	90788132	90788473	90788314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	250519	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	90994449	90994671	90994572	Y	MDN1,BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	300093	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	92185644	92186055	92185825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	890880	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	99272215	99272664	99272374	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	121185	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	100051584	100051769	100051603	Y	NA	CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	PRDM13	837	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	105401566	105401766	105401705	Y	LIN28B	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	1157	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	61320	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	108239964	108240066	108240015	Y	NA	SEC63	NA	NA	NA	NA	SEC63	37327	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	68738	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	125579970	125580036	125580003	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	41246	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	126579500	126579620	126579560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPW	79700	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	128675135	128675339	128675237	Y	PTPRK,PTPRK	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	164531	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	128816273	128816626	128816620	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	23244	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	128830157	128830356	128830243	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	9514	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	131671156	131671520	131671462	Y	NA	NA	AKAP7	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP7	216350	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	133932660	133932952	133932806	Y	NA	NA	MGC34034,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	338356	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	134085872	134085913	134085879	Y	NA	NA	TCF21,MGC34034	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	185395	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	136729350	136729610	136729525	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	120361	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	136813959	136814231	136814138	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	55726	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	137558650	137558845	137558763	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	IFNGR1,OLIG3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IFNGR1	20064	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	138495604	138495926	138495622	Y	NA	KIAA1244	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	14546	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97600	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	142648297	142648491	142648394	Y	NA	GPR126	NA	NA	NA	NA	GPR126	27306	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	142698366	142698689	142698587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR126	77375	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	143123144	143123510	143123441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	140828	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	143864167	143864345	143864273	Y	NA	FUCA2,PHACTR2	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	8185	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	144053697	144053884	144053799	Y	STX11,PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	108597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	144644192	144644433	144644313	Y	NA	UTRN	NA	NA	NA	NA	UTRN	39355	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	147831138	147831275	147831225	Y	SAMD5	SAMD5	NA	NA	NA	NA	SAMD5	3075	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	148443958	148444368	148444103	Y	NA	NA	SAMD5	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	147072	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	148651197	148651450	148651307	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	59757	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	148822303	148822649	148822378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	230863	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	149080716	149081059	149080880	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	14252	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	149532522	149532762	149532649	Y	ZC3H12D,TAB2	TAB2	NA	NA	NA	NA	TAB2	5015	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	151248402	151248558	151248480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	63717	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	151647622	151647708	151647665	Y	NA	NA	ZBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB2	62975	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	153411582	153411939	153411751	Y	MTRF1L	RGS17	NA	NA	NA	NA	RGS17	38445	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	158464788	158465005	158464892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	63900	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	SYTL3	72390	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	159211450	159211647	159211549	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	26797	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr6	159495451	159495612	159495554	Y	SYTL3,TAGAP	NA	TAGAP	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	76232	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	161794970	161795177	161795007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	101877	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	162477618	162478021	162477976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARK2	668782	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr6	163833338	163833600	163833428	Y	QKI	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	306	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	165837337	165837347	165837342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	560744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	166364914	166365167	166365041	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	32924	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr6	166386011	166386354	166386183	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	11737	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	166398427	166398527	166398479	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	336	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	166420168	166420416	166420184	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	20632	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	22766	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	590494	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr6	170838453	170838652	170838543	Y	NA	PSMB1,TBP	NA	NA	NA	NA	PSMB1	21777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM20C	182125	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.4987366406182
chr7	1574153	1574602	1574313	Y	NA	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5803	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr7	1707278	1707453	1707366	Y	NA	NA	MAD1L1,KIAA1908	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG3	98637	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	2298793	2298985	2298883	Y	LFNG,SNX8	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	18936	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	2306623	2306831	2306646	Y	MAD1L1	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	26766	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	2647516	2647699	2647608	Y	SNX8,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	21886	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	2797465	2798227	2798113	Y	SNX8,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	75028	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	2838950	2839257	2839071	Y	SNX8,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	33998	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	7835201	7835604	7835382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23AP51	55035	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	8295276	8295343	8295310	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	4520	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	10043571	10043672	10043621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA4	934211	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	158534	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	17225443	17225596	17225470	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	110650	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	198690	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	22398962	22399217	22399216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	150401	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	74454	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	23411315	23411579	23411447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	96507	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	23488792	23489118	23488955	Y	KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	18968	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	381465	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	24882463	24882674	24882596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	75219	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	26697823	26697978	26697927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	261610	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	28000804	28001209	28000940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	217153	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	29325062	29325307	29325213	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	91995	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	30500037	30500161	30500099	Y	NA	NOD1	NA	NA	NA	NA	NOD1	16239	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	32133021	32133498	32133272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	203443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BBS9	595374	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr7	37255343	37255621	37255439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	231231	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.33249109374547
chr7	43608248	43608485	43608352	Y	NA	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	11872	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	43626451	43626626	43626528	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	6094	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	43644873	43645023	43645002	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	24516	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	43835897	43835899	43835898	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	39618	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	44764845	44765151	44764999	Y	RAMP3	ZMIZ2	NA	NA	NA	NA	ZMIZ2	21029	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	45495394	45495553	45495539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY1	116186	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	45928899	45929352	45929108	Y	IGFBP1	IGFBP1,IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP1	2943	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	45947887	45948101	45948023	Y	NA	IGFBP1,IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	11372	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	47367058	47367181	47367120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	252975	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	47475545	47475747	47475668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	144409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	47610205	47610436	47610283	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	9720	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr7	50321209	50321522	50321293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	194566	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1467054	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	68164626	68164642	68164634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	897263	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	73015142	73015298	73015257	Y	NA	BCL7B,TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	21575	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.49945856026494
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	73704690	73704803	73704747	Y	CLIP2	RFC2,CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	2885	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	75563701	75564093	75563872	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	37183	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	75598574	75598701	75598640	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	23276	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	75675722	75675985	75675853	Y	NA	STYXL1,MDH2	NA	NA	NA	NA	MDH2	353	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	77753891	77754159	77754025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	327769	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	79844591	79844960	79844776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	83320	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	81234008	81234151	81234026	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	684333	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	83865799	83865921	83865847	Y	NA	NA	SEMA3A,SEMA3D	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3A	254119	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	90236421	90236455	90236438	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN12	225386	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	93204906	93205045	93204997	Y	NA	CALCR	NA	NA	NA	NA	CALCR	2864	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	TFPI2,GNG11	NA	NA	NA	NA	TFPI2	6637	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	94687971	94688075	94688023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	153457	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	94751086	94751478	94751282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	216572	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	94781809	94782176	94781990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PON1	241497	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	95305973	95306357	95306276	Y	NA	NA	ASB4	IMR90	Hi-C	24141950	PDK4	82170	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	98048213	98048460	98048408	Y	BRI3	RPS3AP26,BAIAP2L1	BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAIAP2L1	19833	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	99684818	99685168	99684993	Y	TSC22D4,PILRB,PILRA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1	NA	NA	NA	NA	COPS6	241	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	99785086	99785350	99785241	Y	ZKSCAN1,MCM7,GATS	C7orf43,GPC2	NA	NA	NA	NA	GPC2	12091	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	101586234	101586281	101586260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	129275	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	101609189	101609564	101609377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	152230	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr7	101930729	101931104	101930861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	71215	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	104842983	104843396	104843385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	191492	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	105041443	105041755	105041449	Y	NA	SRPK2	SRPK2,PUS7	IMR90	Hi-C	24141950	SRPK2	3688	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	106018568	106018864	106018729	Y	NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	93796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr7	107842206	107842455	107842327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMB1	200506	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	107875663	107876003	107875815	Y	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	219158	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	110470494	110470759	110470627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC003088.1	297683	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	110732834	110733321	110733005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	467252	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	110856868	110857086	110856977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	343487	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	111156714	111156954	111156834	Y	NA	IMMP2L	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	43619	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	111721905	111722337	111722086	Y	ZNF277,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	122129	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	111819433	111819596	111819575	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	24870	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	331955	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	116452966	116453226	116453141	Y	CAPZA2	CAPZA2	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	3842	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	123410612	123410856	123410679	Y	NA	WASL	WASL	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WASL	23491	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	129176186	129176414	129176275	Y	NRF1	NA	NA	NA	NA	NA	NRF1	73141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	130552122	130552429	130552276	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	43640	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130692586	130692952	130692786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	96517	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	130696655	130697004	130696978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95851	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130697034	130697567	130697379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95288	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130713444	130713747	130713733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	79108	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	130720133	130720826	130720768	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	72029	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	131010342	131010498	131010376	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1-AS	NA	NA	NA	NA	MKLN1-AS	483	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	131580267	131580830	131580536	Y	NA	NA	PLXNA4	IMR90	Hi-C	24141950	PODXL	339291	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	132441115	132441141	132441128	Y	NA	NA	FLJ40288	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD3	323707	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	132484487	132484560	132484524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	280288	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	5.66462122766757
chr7	134142605	134142975	134142790	Y	AKR1B1	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	569	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	134247089	134247493	134247269	Y	LRGUK	AKR1B10,AKR1B15	NA	NA	NA	NA	AKR1B15	15201	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr7	134514825	134515095	134514960	Y	STRA8	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	87822	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	135459124	135459310	135459189	Y	NA	NA	C7orf73,SLC13A4,FAM180A	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	113880	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	137311444	137311452	137311448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	373361	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	137928273	137928746	137928445	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.2	52483	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	138588804	138589334	138589100	Y	TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	74730	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	139616229	139616509	139616457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	140652	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	139782179	139782472	139782326	Y	NA	PARP12	NA	NA	NA	NA	PARP12	20658	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	148685182	148685277	148685231	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	38456	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	149193399	149193541	149193458	Y	ZNF467,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	491	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	149266694	149267035	149266833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF767	52808	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	87147	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	152235560	152235891	152235729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	103580	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	NA	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SHH	141408	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	157557490	157557665	157557578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	431415	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	270529	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr8	1694228	1694696	1694461	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7248	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	60983	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr8	6415254	6415472	6415345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	148258	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr8	8746516	8746997	8746809	Y	CLDN23	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	2158	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	16898778	16899115	16898947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	112423	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	16965727	16966045	16965748	Y	NA	ZDHHC2	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	45493	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	17165650	17166030	17165840	Y	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	63263	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	17553591	17554013	17553880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	102841	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	17665479	17665814	17665519	Y	NA	RP11-156K13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	8625	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	17893767	17894158	17893964	Y	NAT1,ASAH1,ASAH1	CTD-2547L16.1,ASAH1	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	46219	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	18836263	18836433	18836318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	103807	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	19414490	19414802	19414647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	198738	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	19467797	19468008	19467904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	145532	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	19522969	19523285	19523139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	90255	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	19533548	19533780	19533688	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	79760	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr8	21541404	21541810	21541602	Y	DOK2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	233370	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	21544652	21544869	21544767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	230311	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	22068132	22068339	22068246	Y	NA	BMP1,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	MIR320A	32217	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	22626037	22626421	22626168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGR3	77222	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	22858849	22858903	22858877	Y	NA	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15919	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	25092167	25092564	25092364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	51929	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	25133664	25134104	25133793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	93426	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	26437404	26437761	26437433	Y	PNMA2,DPYSL2,DPYSL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	67613	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	27251047	27251329	27251099	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	84048	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	28193434	28193777	28193606	Y	NA	RPL5P22	NA	NA	NA	NA	RPL5P22	38234	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	8636	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	29213594	29213602	29213597	Y	NA	DUSP4	DUSP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP4	7409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr8	29412011	29412162	29412114	Y	NA	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	205826	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.49909760044157
chr8	29419877	29419995	29419892	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP4	213692	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	3.16552362722599
chr8	29533274	29533303	29533292	Y	NA	NA	DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	327089	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	29694007	29694401	29694188	Y	NA	NA	DUSP4,C8orf75,LOC286135	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM66	244322	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	30363851	30364149	30364000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	122934	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	30435369	30435466	30435408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	78302	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	30580467	30580796	30580574	Y	GSR	GSR,UBXN8	NA	NA	NA	NA	GSR	2647	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	32191944	32192171	32192069	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1	697042	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-84O15.1	1203648	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr8	37773592	37773777	37773685	Y	NA	RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	18607	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	38223626	38223954	38223916	Y	DDHD2,DDHD2	WHSC1L1,LETM2	DDHD2,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	WHSC1L1	13836	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	40207660	40208018	40207838	Y	NA	CTA-392C11.1	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-392C11.1	8739	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	40273499	40273632	40273622	Y	NA	NA	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-392C11.1	74578	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	41462271	41462436	41462354	Y	NA	AGPAT6,RP11-360L9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	28384	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	41851790	41851810	41851800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	55698	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	48242793	48242802	48242797	Y	NA	NA	PRKDC	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA5P12	168300	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	48434780	48435210	48435108	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	67961	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	48814148	48814416	48814291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	56327	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	56798106	56798776	56798363	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	7734	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	56891091	56891632	56891326	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	RPS20	93437	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	62427686	62427987	62427837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	197168	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	8676	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4470	54289	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	66934530	66934705	66934628	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	181973	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	283440	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	71129648	71130032	71129927	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	115234	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	71459765	71459799	71459782	Y	NA	NA	NCOA2	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM1	58823	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	71522610	71523035	71522826	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	3988	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	72743502	72744020	72743667	Y	NA	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	RP11-383H13.1	5100	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	72947235	72947530	72947318	Y	NA	TRPA1	NA	NA	NA	NA	TRPA1	38322	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	79578942	79579038	79579012	Y	IL7,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	HEY1	1099060	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	86853135	86853591	86853380	Y	NA	NA	CA2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP6V0D2	143961	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	90912887	90913271	90913166	Y	NA	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	800	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	91479808	91480381	91480048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	321479	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	95976096	95976285	95976193	Y	PLEKHF2	TP53INP1,RP11-347C18.3	C8orf69,TP53INP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-347C18.3	15831	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	100803946	100804239	100804046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	100051	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	57582	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	101455424	101455703	101455525	Y	PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	KB-1615E4.2	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1615E4.2	30200	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	101471062	101471309	101471191	Y	NA	KB-1615E4.2	SPAG1,RNF19A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	14594	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	101486265	101486558	101486389	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A	KB-1615E4.2	SPAG1,RNF19A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	362	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	43224	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	103549220	103549421	103549330	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116709	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr8	103549503	103549899	103549700	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116231	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	103741796	103742226	103742065	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	73519	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	103803215	103803631	103803453	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	12114	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	KB-1732A1.1	NA	NA	NA	NA	KB-1732A1.1	6885	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	104457896	104458033	104457972	Y	NA	DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	SLC25A32	32479	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	106878097	106878155	106878126	Y	NA	NA	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	192597	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	107054607	107054687	107054647	Y	OXR1	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	16065	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	107972770	107973116	107972943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	264529	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	108452941	108453080	108453009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	744700	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	109647939	109647957	109647950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	202377	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	115322659	115322858	115322759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	935761	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	119395540	119395777	119395661	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	236457	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	121737162	121737328	121737239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	86185	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	121815954	121816374	121816244	Y	SNTB1	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	7139	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	20536	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	128112845	128113195	128113019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	116138	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128179610	128179821	128179807	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	49512	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46544	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128196669	128197128	128196955	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	32205	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1579	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128333152	128333458	128333317	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	103819	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128680448	128680536	128680487	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	65144	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128772812	128773062	128772941	Y	NA	MYC,PVT1	NA	NA	NA	NA	MYC	27132	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128865187	128865467	128865327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	60408	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128888912	128889201	128889088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	84133	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	115052	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	242687	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	129180743	129180870	129180780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	375964	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	PVT1	764271	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	131011351	131011453	131011402	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	15922	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	134105467	134105714	134105585	Y	TG,SLA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	206551	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	134453521	134453599	134453592	Y	SLA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-458A3.1	117281	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	134513057	134513519	134513217	Y	SLA,ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	68664	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	136424351	136424597	136424474	Y	NA	KHDRBS3	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	43103	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	141972530	141972881	141972765	Y	NA	PTK2	NA	NA	NA	NA	PTK2	37434	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	142033227	142033651	142033460	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	22912	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	142046833	142047172	142047003	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	36518	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	12.662094508904
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	142275441	142276204	142275736	Y	NA	SLC45A4	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	40200	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	143086235	143086279	143086257	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	TSNARE1	396322	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	143479468	143479691	143479580	Y	NA	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	2910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	143534907	143535056	143534986	Y	CYP11B2,TSNARE1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	52306	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	143864627	143864692	143864660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6K	85098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr8	144959402	144959607	144959478	Y	C8orf73,MAPK15,EPPK1	PUF60,NRBP2	PLEC,NRBP2,PUF60	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRBP2	37202	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr8	145887419	145887725	145887588	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP39	21469	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	145995593	145996127	145996081	Y	COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34	ZNF251,ZNF34,RPL8	NA	NA	NA	NA	ZNF34	14603	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	225416	225914	225497	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	12562	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	755797	756516	755921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	287506	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	969561	969923	969742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	501270	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	1052526	1052586	1052563	Y	DMRT2,DMRT2,DMRT2	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	584235	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	303183	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr9	4296901	4297617	4297146	Y	GLIS3	GLIS3	NA	NA	NA	NA	GLIS3	48775	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr9	14316018	14316353	14316263	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	80629	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	14320331	14320603	14320385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	76379	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr9	19161675	19162031	19161810	Y	PLIN2,ACER2	PLIN2	DENND4C,PLIN2,HAUS6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLIN2	14387	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	19231297	19231777	19231673	Y	PLIN2	NA	DENND4C	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	84009	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	20356496	20357005	20356641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	263537	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	26921358	26921728	26921543	Y	NA	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	IFT74	23309	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	28813062	28813251	28813159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1241198	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	29826427	29826586	29826507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860517	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	33814905	33815171	33814978	Y	UBE2R2,UBAP1	UBE2R2	NA	NA	NA	NA	UBE2R2	394	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	34158490	34158839	34158617	Y	NA	DCAF12,UBAP1	DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBAP1	18164	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	34375136	34375287	34375212	Y	NA	KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	285	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	35490989	35491345	35491127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	112022	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	35491656	35492052	35492019	Y	OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	111315	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	82515	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.49909760044157
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	36166552	36166755	36166690	Y	CREB3,TLN1	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	22098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	36231547	36231666	36231607	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	CLTA	42694	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	6.16444074775588
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.33285205356884
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.16624554687273
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	75511457	75511847	75511682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	181511	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	75518800	75519107	75519099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	174251	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	75562890	75563230	75563163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	130128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.66606506696105
chr9	75612572	75612897	75612823	Y	NA	NA	ALDH1A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1A1	80461	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	75819791	75820342	75820052	Y	ANXA1	NA	RORB	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	55118	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	199070	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	81238285	81238685	81238485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	328226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	84270722	84271111	84271084	Y	NA	TLE1	NA	NA	NA	NA	TLE1	31109	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	85888522	85888919	85888721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	212430	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	86051693	86051979	86051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	99482	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	90117444	90117744	90117580	Y	DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	DAPK1	7301	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	90326659	90327327	90326985	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	188442	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	91146731	91147178	91146985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	145397	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	97672080	97672130	97672087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	185097	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	98345688	98346044	98345866	Y	NA	NA	FANCC,SLC35D2,LINC00092,C9orf102,LOC158435	IMR90	Hi-C	24141950	PTCH1	68349	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	13981	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	102007294	102007527	102007424	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	24948	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	110266981	110267369	110267173	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	16218	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	110514044	110514454	110514287	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	219373	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	112173287	112173639	112173503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN3	84951	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	112230117	112230469	112230293	Y	NA	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	28121	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	112950452	112950705	112950539	Y	NA	C9orf152	NA	NA	NA	NA	C9orf152	17764	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	113681942	113682364	113682085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	116617	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	114364049	114364191	114364143	Y	KIAA0368,GNG10	PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10	NA	NA	NA	NA	PTGR1	3914	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	114678571	114678728	114678577	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	21525	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	116304651	116305008	116304842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	99640	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	117647197	117647589	117647272	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	230947	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	117732454	117732820	117732578	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	LOC100505478,TNFSF15,DFNB31,TNFSF8,AKNA,C9orf91	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	145716	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	146162	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	118496415	118496674	118496563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	417409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	118849643	118849804	118849724	Y	NA	NA	PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	64279	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	3771	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	5230	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	119066427	119066819	119066625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	152344	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	119311432	119311888	119311785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	135693	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	119329308	119329509	119329406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	118072	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	1.83267157365715
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	122678487	122678506	122678497	Y	NA	NA	DBC1,SKAP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	CDK5RAP2	661942	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	123393159	123393348	123393336	Y	TRAF1,MEGF9	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	52711	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	123455501	123455738	123455670	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	19010	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	126695812	126695993	126695905	Y	PSMB7	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	5381	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	126964717	126965059	126964872	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,LOC100129034,PSMB7	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	52826	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	127044216	127044998	127044297	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	26331	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	127509473	127509808	127509481	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	21781	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	130342769	130343108	130342811	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	3501	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	132114489	132114812	132114671	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	21910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	70706	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	132373475	132373922	132373518	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	28522	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	132751387	132751642	132751502	Y	USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	51831	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.999639040176629
chr9	134508781	134509131	134508955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	104126	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chr9	134610888	134611363	134611119	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	2098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	136327922	136327947	136327935	Y	RALGDS,RALGDS,ADAMTSL2,SLC2A6	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	14312	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	138951822	138952279	138951999	Y	SEC16A,NOTCH1,NACC2	NACC2	NA	NA	NA	NA	NACC2	32852	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	139466507	139466851	139466737	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	27843	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	139591698	139592004	139591952	Y	C8G	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	AGPAT2	11823	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chr9	139608163	139608561	139608378	Y	EGFL7,EGFL7,NPDC1,FAM69B	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	3141	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.16588458704936
chr9	140190695	140190800	140190760	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	3903	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	180061	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	10547215	10547494	10547354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	302279	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	10587173	10587276	10587225	Y	MID1	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	262497	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	11061735	11061767	11061751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120D5.1	65494	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	12990588	12990700	12990658	Y	TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	527	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	147098	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	GPX1P1	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPX1P1	21166	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chrX	13687345	13687715	13687534	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	RAB9A	17529	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	15713039	15713439	15713221	Y	NA	TMEM27,CA5BP1,CA5B	NA	NA	NA	NA	CA5B	8086	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	16769633	16769754	16769694	Y	NA	CTPS2,SYAP1,TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	32796	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	19360956	19361021	19360989	Y	NA	PDHA1	NA	NA	NA	NA	PDHA1	945	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	19741660	19741797	19741748	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	161922	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	24027801	24028121	24027962	Y	NA	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	42712	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	29699916	29700254	29699978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR0B1	625461	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	30675885	30676221	30676093	Y	CXorf21,GK	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	GK	6409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	33221652	33221797	33221725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCAP1	164140	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	38165166	38165490	38165328	Y	RPGR	RPGR	NA	NA	NA	NA	RPGR	19327	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	38338792	38338989	38338897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN7	79634	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	39950207	39950578	39950448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84004	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	45618389	45618809	45618683	Y	NA	MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	13859	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	45666628	45666834	45666726	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42086	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	48777238	48777933	48777700	Y	TBC1D25,WAS,PQBP1,PPP1R3F,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5	NA	NA	NA	NA	PIM2	2937	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	53467837	53468052	53468003	Y	KDM5C	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	8517	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	54207583	54207867	54207725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120C	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	58292059	58292236	58292148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P17	282939	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	67728770	67728923	67728861	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	12605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNB1	140605	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	GJB1	NA	NA	NA	NA	GJB1	30910	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	74259170	74259182	74259176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	115385	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.499819520088315
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	89887	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.666426026784419
chrX	109315579	109315956	109315731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	71720	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	109330355	109330526	109330451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	86496	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	117885861	117886125	117885896	Y	LONRF3	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	26326	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	118819274	118819809	118819515	Y	UBE2A,UBE2A,SEPT6	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	5524	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.833032533480524
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	130706744	130706880	130706830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	448413	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	150047001	150047063	150047035	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	18226	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	2.99891712052989
chrX	151149745	151149882	151149808	Y	NA	GABRE	NA	NA	NA	NA	GABRE	8593	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.33321301339221
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	A549	hg19	FANTOM5	0.166606506696105