chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	19.615220598257
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	1063914	1064111	1063979	Y	AGRN,VWA1	C1orf159	B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1orf159	14173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr1	1070745	1071151	1070944	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	21004	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	1124600	1124942	1124659	Y	HES4	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	40469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	2253622	2253773	2253699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	67373	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	138833	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	3398864	3399114	3399029	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	29874	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	4707853	4708108	4707981	Y	NA	AJAP1	NA	NA	NA	NA	AJAP1	4684	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	4728864	4729054	4728975	Y	NA	AJAP1	NA	NA	NA	NA	AJAP1	16072	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	4729528	4729775	4729656	Y	AJAP1	AJAP1	NA	NA	NA	NA	AJAP1	16736	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	5184476	5184496	5184487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AJAP1	471684	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	37068	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	8143203	8143348	8143235	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	58835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	113345	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	8721734	8722143	8721896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	153559	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	8849339	8849636	8849462	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	26066	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	8953388	8953557	8953428	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	16080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	9241165	9241560	9241362	Y	NA	RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	902	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	9960528	9960713	9960585	Y	NA	CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1	NA	NA	NA	NA	CTNNBIP1	7681	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	10447707	10448369	10448247	Y	NA	PGD,APITD1,APITD1-CORT	NA	NA	NA	NA	PGD	8280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	10559059	10559458	10559098	Y	NA	PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	DFFA	28476	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	10853772	10853865	10853819	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	842	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	11122928	11123178	11122962	Y	NA	SRM,EXOSC10	NA	NA	NA	NA	SRM	4847	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	PTCHD2	NA	NA	NA	NA	PTCHD2	22326	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	12127865	12128182	12128023	Y	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	NA	MIIP	50342	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	12508783	12509005	12508873	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166732	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	13917058	13917313	13917229	Y	PRDM2,PDPN	PDPN	NA	NA	NA	NA	PDPN	9098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	14467397	14467540	14467499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	442704	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	RP11-169K16.4,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	3332	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	38733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	16401814	16401932	16401873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	77774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	17253207	17253541	17253218	Y	NA	RP11-108M9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-108M9.4	39063	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	RP11-380J14.1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	3852	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	19735064	19735194	19735147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZB	74872	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	19837772	19837831	19837816	Y	NA	CAPZB	CAPZB,C1orf151-NBL1	IMR90	Hi-C	24141950	CAPZB	27706	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	22647063	22647428	22647272	Y	NA	NA	C1QC,C1QB,WNT4,CDC42,C1QA,EPHA8	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB40	128916	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	22692086	22692330	22692263	Y	NA	NA	C1QC,C1QB,EPHB2,EPHA8,WNT4,C1QA	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB40	84014	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	23912037	23912393	23912293	Y	PNRC2,RPL11	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	27752	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	24477754	24478041	24477856	Y	NA	IL22RA1	IL22RA1	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	10143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	25095502	25095845	25095665	Y	NA	CLIC4	NA	NA	NA	NA	CLIC4	25654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	25528711	25528727	25528719	Y	NA	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	28266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	25802039	25802147	25802084	Y	C1orf63	RHCE,TMEM57	NA	NA	NA	NA	TMEM57	46651	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	26745463	26745863	26745681	Y	NA	DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	DHDDS	10910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	27154485	27154771	27154729	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	3284	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	27353661	27353962	27353706	Y	TMEM222,MAP3K6,TRNP1	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46B	16334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	28486078	28486440	28486257	Y	STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,PTAFR,PTAFR	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC8	71096	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	28618110	28618271	28618191	Y	ATPIF1	SESN2,MED18	NA	NA	NA	NA	SESN2	34072	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	29101544	29101853	29101799	Y	EPB41	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	40411	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	30447163	30447510	30447328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRU	886135	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	31216468	31217229	31216636	Y	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	162379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	31517703	31518005	31517854	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	18833	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	32166698	32166999	32166824	Y	COL16A1	NA	NA	NA	NA	NA	PEF1	58201	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	33220963	33221073	33221021	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15477	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	33427851	33428169	33427991	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	117	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2,COL8A2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	39598118	39598362	39598293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53130	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	39598673	39599090	39598722	Y	MACF1	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53685	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	39633654	39634014	39633702	Y	BMP8A	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	88666	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	39644229	39644606	39644401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	99241	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	40081061	40081282	40081172	Y	BMP8A	PABPC4	NA	NA	NA	NA	PABPC4	40599	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	40848967	40849502	40849291	Y	MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	40445	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr1	42073844	42074019	42073961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	125500	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	42092770	42093067	42092919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	144426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	42204580	42205516	42204895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	256236	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	43250353	43250859	43250610	Y	ZMYND12,WDR65,YBX1	LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23	NA	NA	NA	NA	C1orf50	19413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	43475221	43475543	43475382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	52691	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	43976930	43977350	43977026	Y	NA	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	11508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	45286834	45287205	45286951	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	3165	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R3	111594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	46555686	46555960	46555823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R3	84200	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R3	64985	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	47729037	47729382	47729210	Y	NA	TAL1,STIL	TAL1	K562	ChIA-PET	22265404	TAL1	33145	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	51475380	51475551	51475487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	50963	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	53092647	53093031	53092839	Y	NA	GPX7	NA	NA	NA	NA	GPX7	26603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	54804829	54805209	54805022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	71943	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	56797894	56798374	56798151	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAP2B	310600	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	57297998	57298181	57298090	Y	NA	NA	DAB1,C1orf168,C8A,C8B	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAA2	189003	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	57854194	57854446	57854303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	665706	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	57885160	57885452	57885308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	634700	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	59352858	59352971	59352932	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	105073	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	124690	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	59910700	59911009	59910820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	150390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	59986893	59986899	59986896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	226583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	62605206	62605403	62605332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK4	177682	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	62948948	62949316	62949132	Y	KANK4,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	48980	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	64417224	64417447	64417336	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	109868	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	64505281	64505575	64505361	Y	ROR1,UBE2U	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	197925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	65527577	65527856	65527728	Y	NA	NA	AK4	K562	ChIA-PET	22265404	AK4	83376	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	65677177	65677293	65677243	Y	JAK1,LEPROT,LEPROT,LEPR	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	34609	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	21.4932736342604
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	68316516	68316582	68316549	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	19366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	68321515	68321736	68321554	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	24365	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	39652	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	71377	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	77385063	77385511	77385240	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	53937	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	77547345	77547669	77547455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGK	135446	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	77980165	77980378	77980255	Y	AK5	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	166726	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	77986592	77986666	77986629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	160438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	78703686	78703842	78703764	Y	NEXN	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	260827	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	79154444	79154658	79154581	Y	NA	IFI44	NA	NA	NA	NA	IFI44	40963	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	80339305	80339338	80339322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	1225824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	85349108	85349420	85349289	Y	LPAR3	NA	NA	NA	NA	NA	MCOLN2	111376	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	85614354	85614436	85614429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYDE2	50293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	85796595	85797055	85796822	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55822	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	85843881	85844049	85844014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	103108	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	85950230	85950550	85950520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	91383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	85991291	85991622	85991523	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	50311	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	86010067	86010444	86010393	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31489	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	86035824	86036171	86035900	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	5762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	86049987	86050100	86050044	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	CYR61	5543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	28441	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	88292387	88292883	88292561	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	500236	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	91793812	91793887	91793849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC7	170521	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	92218581	92218971	92218958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	154853	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr1	94527681	94527931	94527843	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	154715	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	95388205	95388608	95388523	Y	NA	CNN3,RP4-639F20.1	NA	NA	NA	NA	CNN3	2226	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL2	156983	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	107928213	107928398	107928306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	247584	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	109938897	109939079	109938975	Y	TMEM167B,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	324	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	111191148	111191392	111191279	Y	LRIF1,CD53,KCNA3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	259444	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	113014906	113015158	113015047	Y	CAPZA1	WNT2B	NA	NA	NA	NA	WNT2B	7743	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	113045318	113045599	113045574	Y	NA	WNT2B	NA	NA	NA	NA	WNT2B	38155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr1	113574968	113575168	113575068	Y	NA	LRIG2	CTTNBP2NL,PPM1J,MOV10,RHOC,SLC16A1	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG2	38663	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	120026458	120026860	120026657	Y	NA	HSD3B1	NA	NA	NA	NA	HSD3B1	20961	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	120052717	120053071	120052727	Y	HSD3B1	HSD3B1	NA	NA	NA	NA	HSD3B1	4896	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439A17.7	648739	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	144987154	144987391	144987382	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	86795	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	62698	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	149029458	149029500	149029498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-14N7.2	103136	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	NA	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNVU1-19	289129	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4	NA	NA	NA	NA	SF3B4	12664	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	150294873	150295138	150294978	Y	PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3	C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2	NA	NA	NA	NA	PRPF3	2948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	150772798	150773105	150772952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT	74139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	151795693	151795913	151795794	Y	TCHHL1,RORC,RORC	TDRKH	NA	NA	NA	NA	TDRKH	33801	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	151945068	151945221	151945146	Y	TUFT1,S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	152878925	152879083	152878954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCE1E	122235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A16,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	21642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	153762591	153763309	153762932	Y	NPR1	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	17761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	NUP210L,TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr1	154529043	154529152	154529118	Y	NA	UBE2Q1	NA	NA	NA	NA	UBE2Q1	352	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MUC1	3476	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	BCAN,RP11-284F21.7,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	156864713	156865066	156864817	Y	PEAR1	PEAR1	NA	NA	NA	NA	PEAR1	3223	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	CD1D	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	CD1D	28048	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	CD1D	NA	NA	NA	NA	CD1D	668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	159083627	159083815	159083767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM3	55584	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	159914077	159914586	159914278	Y	NHLH1,VANGL2,IGSF9	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	IGSF9	691	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.67752190578963
chr1	159961374	159961617	159961522	Y	SLAMF8,SLAMF9	IGSF9,SLAMF9,LINC01133,PIGM	NA	NA	NA	NA	LINC01133	32366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	160376163	160376541	160376381	Y	NA	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	7787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	SLAMF1	80996	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	160881277	160881698	160881498	Y	NA	ITLN1,RP11-312J18.5	CD244,ITLN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	18507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.38212375067445
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP12	135042	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	162954567	162954830	162954669	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,RGS5,C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	81735	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	164389251	164389388	164389267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	65247	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	164717528	164717907	164717706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	194707	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	167313306	167313474	167313390	Y	MAEL,POU2F1	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	125240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	172305839	172305991	172305915	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	105239	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	172327070	172327187	172327139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	84043	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	172870197	172870622	172870564	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	147481	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	175834402	175834688	175834528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	54423	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	175902819	175902853	175902836	Y	NA	RP11-318C24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	13708	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	176806612	176806627	176806620	Y	FAM5B,ASTN1	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN1	325482	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	177155509	177155571	177155544	Y	ASTN1,FAM5B	ASTN1	NA	NA	NA	NA	ASTN1	23400	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	177178348	177178736	177178542	Y	NA	ASTN1	NA	NA	NA	NA	ASTN1	46239	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	178207948	178208160	178207999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	147084	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	178252303	178252477	178252337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	191439	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	179555221	179555646	179555325	Y	TDRD5,TDRD5,TDRD5	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P54	130771	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	180251899	180252130	180252121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	54478	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	181042855	181043067	181042961	Y	NA	MR1,IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	181065454	181065797	181065538	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	9816	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	181081690	181081905	181081806	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26052	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr1	181122099	181122260	181122227	Y	NA	NA	STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	66461	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	183149947	183150219	183150157	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	3154	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	183239968	183240242	183240112	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	86595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	95614	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	183256519	183256577	183256548	Y	NMNAT2	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	103146	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	183549376	183549721	183549479	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	53171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	183576409	183576668	183576606	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	26224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	184005350	184005919	184005662	Y	RGL1,GLT25D2	TSEN15	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	12892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	184506061	184506260	184506127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	151869	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	186042920	186043354	186043253	Y	HMCN1,OCLM	NA	NA	NA	NA	NA	PRG4	220051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	192691567	192691932	192691775	Y	NA	MIR4426	RGS13	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	8254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	B3GALT2	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	26920	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	196376822	196377173	196376907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT2	199182	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53,LHX9	NA	NA	NA	NA	LHX9	29260	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	449335	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	200715755	200716027	200715890	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	9069	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	200831452	200831819	200831500	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	26357	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	201424936	201425126	201425034	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	11239	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	12634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203289937	203290406	203290261	Y	BTG2	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	BTG2	17318	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203293246	203293605	203293363	Y	ZBED6,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	BTG2	20627	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203294985	203295146	203295066	Y	NA	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	BTG2	22366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	103948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203525711	203525894	203525744	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	67795	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203661733	203662076	203661795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	68044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	204071387	204071653	204071532	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	31144	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	204349568	204349875	204349782	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	4775	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	204916243	204916629	204916322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFASC	120464	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	205254805	205255191	205255039	Y	RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	33692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	206290243	206290662	206290573	Y	C1orf186	CTSE	NA	NA	NA	NA	CTSE	24797	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	206918122	206918360	206918230	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	61833	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	206931189	206931520	206931334	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,IL10	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	74900	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	207063537	207063710	207063660	Y	RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	5078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	207064869	207064994	207064935	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	3794	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1,C4BPB,C4BPA	NA	NA	NA	NA	C4BPB	5552	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	208415648	208415868	208415811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	209422787	209423049	209422934	Y	NA	ATP5G2P1	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5G2P1	16519	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	214648804	214649025	214648867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	74767	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	214712809	214712848	214712830	Y	NA	PTPN14	NA	NA	NA	NA	PTPN14	10944	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	218523725	218524123	218523798	Y	NA	TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	6148	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	218774491	218774602	218774534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	256914	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	218847947	218848245	218848113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	330370	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	219632644	219633145	219633054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	287458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	223904365	223904567	223904454	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	17070	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	223907308	223907681	223907376	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	20013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	224019430	224020596	224019827	Y	FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	11078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	5.00814142934222
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	WDR26	NA	NA	NA	NA	WDR26	24317	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	225778250	225778416	225778333	Y	ENAH	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	60428	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	225845408	225845613	225845516	Y	ENAH	ENAH	NA	NA	NA	NA	ENAH	6564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	229527864	229528146	229528005	Y	NA	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	NUP133	113957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	229690998	229691240	229691190	Y	ABCB10	NUP133,RP4-613A2.1,ABCB10	NUP133	K562	ChIA-PET	22265404	ABCB10	1202	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	231513422	231513769	231513758	Y	NA	EXOC8,EGLN1	NA	NA	NA	NA	EXOC8	41824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	231531271	231531676	231531476	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	27114	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	231531776	231531955	231531804	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	26835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	231944869	231945038	231944953	Y	EXOC8	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	184308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	232362022	232362384	232362201	Y	NA	NA	SIPA1L2,TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	DISC1	601461	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	233763606	233763782	233763694	Y	NA	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15856	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	236856658	236857048	236856853	Y	ACTN2	ACTN2	NA	NA	NA	NA	ACTN2	8904	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr1	238106545	238106849	238106747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	540474	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	238811242	238811567	238811347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	163919	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr1	241093225	241093542	241093384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-467I20.3	294873	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	241364891	241365186	241365103	Y	RGS7	NA	NA	NA	NA	NA	FH	315875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	242609605	242610011	242609798	Y	PLD5,PLD5	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	75987	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	243447752	243447803	243447788	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	30432	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	243876652	243876733	243876693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	135648	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	244763140	244763529	244763408	Y	ADSS,EFCAB2	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	149704	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	49442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF669	60892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	21.0759285151485
chr10	384217	384634	384602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	205812	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	1112826	1113160	1112997	Y	WDR37	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	19348	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.92141583378296
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	5535635	5536039	5535950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	83121	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	6051095	6051553	6051345	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	32945	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	6193489	6193806	6193647	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	8608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	8373481	8373809	8373699	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	515014	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	10831008	10831167	10831105	Y	NA	SFTA1P	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	3776	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	10914098	10914350	10914196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	79155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	10953472	10953723	10953520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	118529	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	215149	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	12002775	12003103	12002939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	80066	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	12283843	12284276	12283949	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	NUDT5	47700	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	12749537	12749904	12749742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	360056	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	14417107	14417451	14417285	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B,PRPF18	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	84690	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	14518978	14519126	14519049	Y	NA	FRMD4A	FRMD4A	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	16837	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	16548527	16548808	16548668	Y	NA	RNU2-18P	NA	NA	NA	NA	RNU2-18P	32525	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	17697506	17697813	17697679	Y	ST8SIA6,STAM	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	13382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	20115618	20116154	20115807	Y	PLXDC2	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	12450	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	20517791	20518055	20517886	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	414623	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	20841595	20841995	20841796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	619121	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	24917417	24917574	24917542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	93023	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	29195098	29195451	29195275	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	230827	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	29966336	29966345	29966343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	436078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	35421114	35421320	35421181	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	7395	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	42799437	42799735	42799586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNYL2	165953	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	42817169	42817557	42817529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNYL2	148131	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	45868742	45869084	45868822	Y	ANUBL1,OR13A1,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	1081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	47128793	47129187	47128991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	159393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	160094	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	NA	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	1188946	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	50776206	50776746	50776485	Y	PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	30622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	50787572	50787883	50787845	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	41988	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr10	52082649	52082859	52082782	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59911	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	131012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	NA	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DKK1	174501	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	56854357	56854710	56854534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L5	502040	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	59452175	59452288	59452232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	573406	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	60674120	60674133	60674127	Y	BICC1	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	403220	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A9	558018	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	61632760	61633170	61633000	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	31244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	61860000	61860017	61860008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	195586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	62140958	62141228	62141093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	394861	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	62307595	62307995	62307795	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	228094	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	64413068	64413194	64413115	Y	NRBF2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	149322	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	65231848	65231938	65231929	Y	NA	PRELID1P3,JMJD1C,REEP3	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	8126	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	66499441	66499455	66499448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	83874	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	68802540	68803252	68802892	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	118776	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	71002181	71002454	71002318	Y	NA	RP11-227H15.4,HK1	NA	NA	NA	NA	RP11-227H15.4	11935	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACR2	65190	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	71840822	71841222	71841056	Y	NA	H2AFY2,AIFM2	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	30270	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	7.72088470356926
chr10	72992169	72992442	72992307	Y	C10orf105	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	16184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr10	73124315	73124355	73124335	Y	NA	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	CDH23	30336	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	73528339	73528873	73528813	Y	CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	2382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	73840531	73840743	73840590	Y	ASCC1,ASCC1,SPOCK2	SPOCK2	NA	NA	NA	NA	SPOCK2	6047	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr10	74174604	74174793	74174677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	61616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	74453097	74453245	74453141	Y	CCDC109A	MCU	NA	NA	NA	NA	MCU	3208	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	75408900	75409185	75408963	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54,AGAP5	NA	NA	NA	NA	USP54	25189	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	75987927	75988078	75987990	Y	KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	78967	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	76997919	76998322	76998050	Y	NA	VDAC2,COMTD1	NA	NA	NA	NA	COMTD1	4131	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	77155063	77155414	77155221	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4250	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	77189888	77190112	77189953	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	30224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	77300831	77301201	77300915	Y	NA	NA	KCNMA1,C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	57797	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	77793352	77793789	77793572	Y	C10orf11	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	434354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	78698062	78698447	78698255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	697906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	79324798	79325050	79324993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	71303	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr10	80116901	80117035	80117003	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	325383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	81179342	81179695	81179519	Y	NA	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	23688	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	81864199	81864479	81864400	Y	NA	PLAC9	NA	NA	NA	NA	PLAC9	24959	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	82176099	82176325	82176238	Y	C10orf58	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	FAM213A	10514	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	85937530	85937952	85937586	Y	NA	GHITM	NA	NA	NA	NA	GHITM	40334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	86108374	86108507	86108453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	209692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	88183544	88183868	88183698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	59294	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	89508472	89508835	89508628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	66850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr10	90495559	90495751	90495657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	141740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS,ACTA2	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr10	91020368	91020477	91020401	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	IFIT2	NA	NA	NA	NA	IFIT2	39235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	91055339	91055739	91055572	Y	NA	IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	3973	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	92676361	92676755	92676735	Y	NA	RPP30,ANKRD1	NA	NA	NA	NA	ANKRD1	2278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	92690903	92691268	92691118	Y	NA	ANKRD1	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	11870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr10	95081157	95081194	95081175	Y	O3FAR1	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6P1	113773	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr10	95223953	95224101	95224023	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15973	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	99174702	99174858	99174830	Y	ZFYVE27,PI4K2A,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	RRP12	K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9059	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	99302007	99302242	99302124	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,ANKRD2,HOGA1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD2	27956	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	99305221	99305494	99305441	Y	SFRP5	MMS19,UBTD1,ANKRD2,HOGA1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD2	24704	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	99334341	99334704	99334523	Y	NA	ANKRD2,HOGA1,PI4K2A	NA	NA	NA	NA	ANKRD2	4143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	5761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	103453403	103453880	103453587	Y	LDB1,BTRC,MGEA5	FBXW4	NA	NA	NA	NA	FBXW4	351	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	103876632	103876931	103876782	Y	NA	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	1279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	104364219	104364413	104364273	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	37840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	105436153	105436400	105436275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	176901	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	106020526	106021193	106020581	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1	WDR96,GSTO1	NA	NA	NA	NA	GSTO1	27412	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	112113245	112113632	112113326	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	50536	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	114745782	114746117	114745950	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	37773	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	114891441	114891844	114891554	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	183432	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr10	114940347	114940490	114940443	Y	CASP7,TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	119107774	119108099	119107936	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24879	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	129045	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	121544240	121544543	121544312	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	MCMBP	105525	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	121655971	121656303	121656057	Y	NA	MCMBP,SEC23IP	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	5748	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	122836934	122837187	122837105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	54050	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr10	126021099	126021412	126021201	Y	CHST15	NA	CHST15	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	84133	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	126212520	126212862	126212532	Y	NA	RPS10P18	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	35373	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	DHX32	8441	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	127770762	127770961	127770902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	187654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr10	134826942	134827305	134827042	Y	NA	NA	LOC399829,INPP5A	IMR90	Hi-C	24141950	TTC40	72615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	368352	368730	368427	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR	NA	NA	NA	NA	B4GALNT4	556	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	589256	589485	589371	Y	SIGIRR	RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7	NA	NA	NA	NA	PHRF1	14770	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	1015139	1015297	1015218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP2A2	92245	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	NA	NA	NA	NA	NA	AP2A2	150475	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	2847272	2847432	2847347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	57679	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	8730669	8730993	8730843	Y	NA	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	28711	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr11	9588297	9588534	9588393	Y	NA	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	4694	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	9703256	9703389	9703323	Y	WEE1	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	19632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	9710363	9710796	9710568	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	26739	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	9786985	9787566	9787311	Y	NA	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	9146	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	219408	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	10060683	10060760	10060722	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	252994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	11547720	11547907	11547841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP47	313063	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	14827	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12136145	12136580	12136313	Y	MICAL2	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	22602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12180569	12180722	12180645	Y	MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67026	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr11	12199343	12199732	12199431	Y	NA	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	85800	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	12561282	12561501	12561392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	132468	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	279551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	13373049	13373395	13373164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	76850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	13984955	13985270	13985219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAR1	296738	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	15987256	15987361	15987309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	645318	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	16001674	16002038	16001856	Y	SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	630641	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	16121256	16121272	16121264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	511407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	16188431	16188789	16188610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	443890	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	16357706	16357868	16357787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	274811	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	16392942	16393234	16393088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	239445	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	16411231	16411535	16411524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	221144	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHC	5256	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	19440729	19441084	19440796	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	70458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	19748565	19748818	19748690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	378294	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	19962898	19963229	19963064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	420002	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	20041538	20041793	20041666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	341438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	20053197	20053569	20053404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	329662	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	20134058	20134420	20134284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	248811	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	23079827	23079841	23079834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	229982	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	26003639	26003950	26003795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2507G9.1	204720	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	27649683	27650045	27649864	Y	NA	RP11-587D21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	48456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	27657269	27657593	27657433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	56042	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	651439	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr11	28853592	28853798	28853653	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	725737	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	727349	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	32055625	32055984	32055796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	223686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	35132711	35132959	35132793	Y	CD44	CD44	PDHX,CD44,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	25458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	36678662	36678763	36678713	Y	PRR5L	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	64611	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	41471316	41471693	41471422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	86291	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.92141583378296
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	124866	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	44596231	44596678	44596336	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	12254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	44633503	44633675	44633616	Y	PRDM11	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	49526	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	44722938	44723067	44723002	Y	NA	TSPAN18	EXT2,TSPAN18,SYT13,CD82,PRDM11	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN18	22948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	44882780	44883083	44882907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	87757	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	44963197	44963482	44963283	Y	NA	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	7358	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-430H10.1	172317	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	45680274	45680465	45680372	Y	NA	CHST1	NA	NA	NA	NA	CHST1	4707	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	46090973	46091088	46091031	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	49897	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	CTD-2589M5.4	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	23631	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	46706691	46706778	46706735	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ARHGAP1	13387	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	48029262	48029517	48029420	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	29149	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	48040860	48041151	48041006	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	40747	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	48163334	48163507	48163430	Y	OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	163221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	56663286	56663297	56663292	Y	OR5R1,OR5M9,OR5M3,OR5M8,OR5M11,OR5M10,OR5M1,OR5AP2,OR5AR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-100N3.2	161348	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	57324540	57324747	57324726	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,SERPING1	SLC43A1,TIMM10,UBE2L6,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	9010	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	57336823	57337050	57336962	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6	TIMM10,UBE2L6,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	3066	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	57366352	57366685	57366510	Y	RTN4RL2,SLC43A1,SLC43A1,UBE2L6,SERPING1,SERPING1	UBE2L6,SERPING1,AP000662.4,CLP1	NA	NA	NA	NA	SERPING1	3492	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr11	57559748	57559971	57559868	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5	CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	41033	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	60722044	60722202	60722056	Y	VPS37C,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SLC15A3	PRPF19,TMEM109,TMEM132A,SLC15A3	NA	NA	NA	NA	SLC15A3	4042	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	SLC15A3	NA	NA	NA	NA	SLC15A3	35565	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	60930012	60930347	60930224	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,VPS37C	VPS37C,PGA3	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2923	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	RPLP0P2	NA	NA	NA	NA	RPLP0P2	13755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	62211626	62212261	62212170	Y	FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	75008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	HRASLS5,LGALS12,RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr11	63328335	63328557	63328446	Y	NA	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	5663	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	8867	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	63366734	63367020	63366890	Y	NA	HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	15335	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	63639638	63639903	63639715	Y	NA	MARK2,RCOR2	NA	NA	NA	NA	MARK2	35238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	64320859	64321220	64321040	Y	C11orf85	NA	SLC22A12,NRXN2	IMR90	Hi-C	24141950	NRXN2	167440	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	64631898	64632818	64632128	Y	CDC42EP2,FAU,EHD1	CDC42BPG,EHD1,ATG2A	NA	NA	NA	NA	EHD1	20950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	64636604	64637051	64636910	Y	CDC42EP2,SF1,SF1,FAU,EHD1	CDC42BPG,EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	16717	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	65076655	65076852	65076688	Y	EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3437	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	65083603	65083722	65083697	Y	NA	CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr11	65581703	65581968	65581801	Y	CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198	MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	MUS81	40629	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD,CST6	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	66717584	66717809	66717709	Y	CLCF1,ADRBK1	PC	NA	NA	NA	NA	PC	6038	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	AP000439.2	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	21935	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	70107513	70107580	70107548	Y	NA	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	7226	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	70150439	70150493	70150466	Y	NA	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	35633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	71702677	71703050	71702869	Y	FOLR3,IL18BP,IL18BP	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	64930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	73034605	73034942	73034774	Y	NA	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	17271	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	73097153	73097443	73097265	Y	FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	11844	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	73134039	73134350	73134132	Y	RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	48730	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	74077556	74077917	74077717	Y	NA	PGM2L1	NA	NA	NA	NA	PGM2L1	29601	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	74742390	74742651	74742474	Y	ARRB1	NEU3	XRRA1,SPCS2,SLCO2B1,NEU3,OR2AT4,LOC100507050,ARRB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEU3	45211	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	75748582	75748924	75748753	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	224370	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	231663	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	75781411	75781582	75781473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	257199	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	142963	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	76271336	76271661	76271499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC32	108130	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	76285451	76285730	76285592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC32	94061	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	77156016	77156186	77156101	Y	PAK1	PAK1	NA	NA	NA	NA	PAK1	27494	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	3883	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78025089	78025245	78025191	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	102149	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78048124	78048554	78048530	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	78840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	78073883	78074276	78074154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	53118	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78091808	78092073	78091933	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	35321	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78113040	78113383	78113360	Y	NA	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	14011	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78131805	78132171	78132034	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	4411	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	78993859	78994112	78994035	Y	ODZ4	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	709940	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	79082463	79082536	79082500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	798544	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	67.1925641770082
chr11	84925311	84925429	84925371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	412200	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	86355497	86355659	86355578	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	26019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	89893119	89893512	89893349	Y	NAALAD2	NAALAD2	NA	NA	NA	NA	NAALAD2	30436	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	97836778	97837204	97837004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN5	1052479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	102631066	102631384	102631342	Y	BIRC2	MMP1	NA	NA	NA	NA	MMP1	35507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	103734297	103734569	103734418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	455912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	110581726	110581943	110581819	Y	ARHGAP20	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP20	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	112016607	112016779	112016693	Y	DIXDC1	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	16061	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	112028082	112028533	112028265	Y	IL18	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	4307	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	114152118	114152374	114152253	Y	ZBTB16,NNMT	NNMT	NNMT	IMR90	Hi-C	24141950	NNMT	25609	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	114162916	114163328	114163238	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	114224881	114225192	114225037	Y	NA	RBM7,C11orf71	FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM7	43560	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	114288977	114289308	114289144	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	18800	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	116857252	116857500	116857432	Y	SIK3	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	47267	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	117016262	117016599	117016456	Y	NA	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	3279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	117050933	117051273	117050997	Y	SIDT2	PAFAH1B2,SIDT2,TAGLN,PCSK7	NA	NA	NA	NA	SIDT2	3484	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	117852129	117852316	117852231	Y	NA	NA	IL10RA	K562	ChIA-PET	22265404	FXYD6	105928	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	118489001	118489167	118489084	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	13846	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	118489703	118490017	118489779	Y	NA	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	14548	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	17953	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	18694	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	119235704	119236132	119235932	Y	NA	MCAM,RNF26,C1QTNF5,USP2,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2	14304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	119239128	119239276	119239217	Y	NA	MCAM,RNF26,C1QTNF5,USP2,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2	11160	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	119239478	119239727	119239579	Y	ABCG4,C1QTNF5,USP2	MCAM,RNF26,C1QTNF5,USP2,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2	10709	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	120302835	120303154	120303088	Y	OAF,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK4	77314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	122052220	122052515	122052369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	67189	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	122993000	122993335	122993281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	61062	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	123036966	123037072	123037020	Y	NA	CLMP	NA	NA	NA	NA	CLMP	26917	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	123352361	123352657	123352509	Y	OR8D4,OR6M1	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF202	257726	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	125560855	125560979	125560917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHEK1	67819	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	125898187	125898226	125898207	Y	CDON	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	33004	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	125904022	125904031	125904027	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	27199	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	125976647	125976803	125976705	Y	NA	CDON	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	45417	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	125997963	125998111	125998066	Y	NA	NA	CDON	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	66733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.33876095289482
chr11	126001132	126001515	126001324	Y	CDON	NA	CDON	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	69902	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr11	126002239	126002432	126002336	Y	NA	NA	CDON	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	71009	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr11	126010526	126010866	126010726	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM118B	68443	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	128584156	128584534	128584279	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	29726	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	128589113	128589189	128589151	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	34683	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	129282439	129282677	129282511	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	38604	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	129942098	129942391	129942179	Y	PRDM10	TCEB2P2,APLP2	NA	NA	NA	NA	APLP2	4366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	130016455	130016576	130016492	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	10881	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	130253238	130253357	130253298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS15	63512	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	130767627	130768066	130767878	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	131924772	131924995	131924886	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1140368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	132411783	132412052	132411908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2P2	1580172	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	132604106	132604440	132604278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2P2	1387784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	132774283	132774643	132774625	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2P2	1217581	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	133429641	133429673	133429657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2P2	562551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8,GLB1L3	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	B3GAT1	428274	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	2467815	2468125	2467879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	356114	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	3340124	3340182	3340154	Y	NRIP2	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	21028	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	6175047	6175276	6175191	Y	VAMP1,TNFRSF1A	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	121649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	6280499	6281236	6280879	Y	NA	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	25645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	59752	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	6663248	6663743	6663420	Y	GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1	SCARNA10,GAPDH,IFFO1,NOP2	NA	NA	NA	NA	IFFO1	9	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	9804148	9804385	9804240	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	NA	NA	NA	NA	NA	DDX12P	205323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	105076	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	11721730	11722060	11721927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	78728	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	11898142	11898564	11898233	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	97354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	11919566	11919967	11919675	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118778	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	11933482	11933754	11933622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	132694	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	11976145	11976420	11976223	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	175357	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	12545388	12545784	12545562	Y	DUSP16,CDKN1B,APOLD1,LOH12CR1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	37375	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	45889	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	MIR614	8304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	13331850	13332340	13332007	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	15310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	14549073	14549306	14549114	Y	WBP11,ATF7IP	ATF7IP	NA	NA	NA	NA	ATF7IP	32463	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	24952536	24952732	24952634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	147661	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	25004985	25005042	25005012	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	95351	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	25086735	25086929	25086817	Y	NA	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	13464	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	RP11-283G6.5	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.5	42621	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	26512613	26512980	26512754	Y	NA	RP11-283G6.5	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	41960	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	26538001	26538320	26538173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	67348	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	26663094	26663473	26663334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	192441	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	26676709	26676991	26676900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	206056	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	26921613	26921734	26921675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	62397	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	27430817	27431042	27430895	Y	NA	STK38L	NA	NA	NA	NA	STK38L	35916	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	39094852	39095225	39095039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	204007	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	39436965	39437093	39437022	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	137733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	39800065	39800203	39800134	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	34989	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	42984702	42985091	42984897	Y	GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	2545	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	45703000	45703363	45703138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	95176	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	46272544	46272693	46272552	Y	ARID2,SLC38A1,SCAF11	NA	NA	NA	NA	NA	SCAF11	111210	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	13.3550438115793
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	47661403	47661671	47661594	Y	NA	NA	FAM113B,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	189669	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	198714	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	47787551	47787794	47787709	Y	NA	NA	AMIGO2,RPAP3	IMR90	Hi-C	24141950	RPAP3	310050	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	47787801	47788194	47788086	Y	NA	NA	AMIGO2,RPAP3	IMR90	Hi-C	24141950	RPAP3	309650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	48100473	48100834	48100653	Y	VDR,ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3,SLC48A1	NA	NA	NA	NA	RP1-197B17.3	2605	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	48204446	48204457	48204451	Y	NA	RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	20458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	48815092	48815327	48815161	Y	PFKM,C12orf68,ZNF641	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF641	71895	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	49203713	49203966	49203840	Y	NA	ADCY6,CACNB3,DDX23	NA	NA	NA	NA	CACNB3	1611	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	50902358	50902765	50902415	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	5590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	50924450	50924587	50924549	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	27682	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	50932147	50932418	50932300	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	35379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	51035200	51035582	51035391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	119911	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	51057988	51058419	51058261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	97074	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	51762689	51763227	51762914	Y	SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6,BIN2	GALNT6	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT6	21424	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52146424	52146626	52146525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN8A	164374	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52184760	52184919	52184839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	158532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	101125	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	100565	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	NA	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	80143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52366669	52367046	52366914	Y	NR4A1,GRASP	ACVR1B,GRASP,NR4A1	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	23218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr12	52438176	52438423	52438378	Y	NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	22607	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	52588987	52589174	52589068	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	5203	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr12	52596076	52596423	52596243	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12292	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	49739	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	52889322	52889458	52889391	Y	KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT6A	4281	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	52890343	52890794	52890475	Y	C12orf44,KRT7,KRT18,KRT18,KRT6A,KRT5	KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT6A	5302	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	53261473	53261693	53261598	Y	KRT2,KRT1,KRT77	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85	IMR90	Hi-C	24141950	KRT4	55138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	53266551	53266796	53266674	Y	NA	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	60216	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	53270322	53270511	53270351	Y	RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78	NA	EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	63987	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	56729298	56729459	56729406	Y	NA	RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	PAN2	3461	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	56752579	56752932	56752841	Y	ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A	RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	STAT2	640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	56914338	56914532	56914358	Y	NA	RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	RBMS2	625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	5.63415910801
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	59061940	59062339	59062197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	249964	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr12	62517177	62517433	62517258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	134686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	62559325	62559470	62559411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	92649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	57300	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	63256455	63256601	63256528	Y	PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	70216	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	64349679	64350074	64349795	Y	TBK1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	113606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	64574864	64574988	64574911	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	39088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	64855437	64855720	64855602	Y	C12orf66,TBK1	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	11777	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	65076423	65076649	65076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	74130	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr12	66697484	66697842	66697547	Y	HELB	HELB	NA	NA	NA	NA	HELB	3159	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	67141620	67141768	67141694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	319174	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	186177	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	67319023	67319379	67319201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	141563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	67362694	67363196	67363004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	97746	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	67363946	67364340	67364143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	96602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	67392180	67392257	67392219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	68685	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	67396755	67396891	67396823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	64051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	67404997	67405349	67405173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	55593	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	67411263	67411633	67411591	Y	NA	RP11-123O10.4	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	49309	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	68304216	68304460	68304338	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	264098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	68815961	68816179	68816160	Y	IL22	NA	NA	NA	NA	NA	MDM1	91800	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	69006143	69006530	69006154	Y	CPM,IFNG,RAP1B	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RAP1B	3524	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	70388549	70388859	70388715	Y	CCT2,CCT2,RAB3IP	NA	PTPRB	IMR90	Hi-C	24141950	CNOT2	245915	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	6495	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	76497491	76497684	76497588	Y	NA	NAP1L1	OSBPL8,KRR1,NAP1L1,BBS10	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	20678	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	77670807	77670928	77670868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	E2F7	213447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	78544842	78545234	78545038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	322157	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	78551172	78551540	78551259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	328487	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	78940817	78940832	78940824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	718132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	79526323	79526826	79526502	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	368350	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	79566745	79567141	79566931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	328035	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	135216	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	79803401	79803717	79803562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	91459	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	90659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	79817704	79817772	79817737	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	77404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	RP1-78O14.1	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-78O14.1	48215	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	80098707	80098999	80098853	Y	NA	PAWR	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	15830	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	81096686	81096945	81096788	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	232649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	83134280	83134513	83134356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	55621	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	83461267	83461506	83461387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	81604	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	84902694	84902984	84902888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	402410	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	86995053	86995240	86995159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	1430383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	90160950	90160962	90160958	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	LOC338758,C12orf37	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP2B1	59873	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	92396640	92396647	92396644	Y	CLLU1,CLLU1OS	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	141026	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	92415461	92415779	92415694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	121894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	92509431	92509711	92509674	Y	NA	BTG1	NA	NA	NA	NA	BTG1	27962	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	BTG1	NA	NA	NA	NA	BTG1	19275	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr12	92528487	92528918	92528861	Y	BTG1	BTG1	NA	NA	NA	NA	BTG1	8755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	92838592	92838871	92838646	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	300919	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	92947125	92947543	92947361	Y	EEA1,BTG1	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	373564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	96627063	96627293	96627178	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	40903	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	96637849	96638243	96638007	Y	LTA4H,ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	51689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	96813963	96814102	96814033	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	5162	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	19948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	98818500	98818672	98818666	Y	NA	NA	LOC100128191,TMPO	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMPO	88618	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	98831559	98831887	98831820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPO	75403	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	98840534	98840980	98840713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPO	66310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	102215696	102215835	102215766	Y	NA	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	6881	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	102329942	102330412	102330197	Y	DRAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DRAM1	60813	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	102734344	102734692	102734517	Y	NA	NA	IGF1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF1	137731	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	IGF1	NA	NA	NA	NA	IGF1	37185	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	102930045	102930144	102930098	Y	NA	NA	PARPBP,IGF1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF1	57622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	104613868	104614024	104613970	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	6311	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	104791559	104791875	104791716	Y	TXNRD1	NA	CHST11,SLC41A2,C12orf45	IMR90	Hi-C	24141950	EID3	96042	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	183988	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	105948050	105948070	105948060	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90	Hi-C	24141950	APPL2	320034	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUAK1	203335	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	106381323	106381559	106381463	Y	NA	NA	NUAK1,C12orf75	IMR90	Hi-C	24141950	NUAK1	150252	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	108920909	108921183	108921031	Y	NA	FICD,SART3,ISCU	NA	NA	NA	NA	FICD	13947	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	109167575	109167781	109167683	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	44203	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	109249389	109249909	109249762	Y	CORO1C,SSH1,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	23	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	110931784	110931990	110931887	Y	NA	ARPC3,GPN3,VPS29	NA	NA	NA	NA	VPS29	5932	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	111939312	111939650	111939575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN2	95830	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	113798034	113798144	113798106	Y	SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS	PLBD2	SDS,SDSL	IMR90	Hi-C	24141950	PLBD2	3663	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	769522	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	116308098	116308555	116308414	Y	NA	NA	RBM19,TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	404588	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr12	116383050	116383163	116383141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	329980	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	116498439	116498839	116498749	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	214304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	116821073	116821333	116821156	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	107930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	75409	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	119618645	119618705	119618687	Y	HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	4198	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	CCDC64	NA	NA	NA	NA	CCDC64	858	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	120486152	120486402	120486307	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC64	60479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	120666780	120666906	120666823	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	29686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	120689817	120690140	120689965	Y	CCDC64,RAB35,RNF10,PXN	PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	11434	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM2B	65040	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	123352500	123352698	123352696	Y	VPS37B	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	26293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	262123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	124926088	124926324	124926239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123811	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr12	124991138	124991309	124991172	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	58826	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	22142	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	125033431	125034089	125033755	Y	UBC	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	16046	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr12	125117895	125118180	125118038	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	67760	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	125288540	125288810	125288726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	76404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	23288	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	127254619	127255063	127254924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00944	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	131249995	131250369	131250318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2	51169	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr12	132647278	132647407	132647355	Y	SFSWAP,ULK1,FBRSL1	DDX51,NOC4L	NA	NA	NA	NA	NOC4L	20285	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr12	132903795	132904258	132904060	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT9	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	GALNT9	NA	NA	NA	NA	GALNT9	372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	7.30353958445741
chr13	20692936	20693199	20693068	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	71838	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	20704420	20704798	20704605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	60239	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	20711185	20711522	20711354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	53515	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	21517643	21517924	21517794	Y	LATS2	XPO4	CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	XPO4	42456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	23539399	23539627	23539538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	166686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	23720936	23721336	23721062	Y	NA	HMGA1P6	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	14623	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	23895900	23896291	23896206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACS	109550	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	29293854	29294204	29294003	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	2747	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.26017678667778
chr13	30808184	30808483	30808334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL1	71138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	30968898	30969238	30968927	Y	NA	NA	LINC00426,KATNAL1,USPL1,HMGB1,UBL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KATNAL1	89277	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	31444557	31445090	31444788	Y	C13orf26	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	254727	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	17236	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	32719251	32719642	32719447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	115814	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	34304425	34304581	34304508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	85605	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	34727619	34727920	34727781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	337433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.59079631023037
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	34781635	34781805	34781767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	391449	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	37430942	37430957	37430950	Y	NA	RFXAP	NA	NA	NA	NA	RFXAP	39581	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	41825625	41825697	41825634	Y	KBTBD7,NAA16	MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	10045	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	43410663	43410880	43410773	Y	NA	NA	CCDC122,ENOX1,TNFSF11,EPSTI1,DNAJC15	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	153527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	68254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	98143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	43727960	43728297	43728107	Y	NA	NA	ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	163553	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	44620658	44620684	44620670	Y	ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC122	168831	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	44842198	44842383	44842274	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	306900	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	273481	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	45774024	45774110	45774098	Y	KCTD4	KCTD4	NA	NA	NA	NA	KCTD4	849	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	46095529	46095772	46095647	Y	TPT1	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	58469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	46913143	46913601	46913410	Y	LCP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0226L	96724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	49123931	49124043	49124005	Y	FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2	RCBTB2	RCBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RCBTB2	18562	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	49288768	49288781	49288774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	183399	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	NA	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL34P26	169381	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	52537870	52538200	52538035	Y	UTP14C	ATP7B,ALG11	NA	NA	NA	NA	ATP7B	45430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	52545900	52546094	52546003	Y	UTP14C	ATP7B,ALG11	NA	NA	NA	NA	ATP7B	37536	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	52922324	52922434	52922379	Y	THSD1	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	THSD1	56195	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	52923212	52923413	52923314	Y	NA	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	THSD1	55216	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	61157781	61157905	61157871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	189190	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	61626383	61626760	61626680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	657792	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	3683725	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	477691	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	76256605	76256814	76256659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	64035	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	90465670	90466055	90465862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1532019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	94785518	94785984	94785813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	460527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	95925874	95926219	95926059	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	25468	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	95938060	95938332	95938319	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	13355	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	99278853	99278891	99278872	Y	NA	CALM2P4	STK24,FARP1	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2P4	12602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	99950103	99950501	99950500	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	84091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	100024364	100024560	100024446	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	127111	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	100886726	100886738	100886732	Y	NA	NA	A2LD1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P18	85380	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	103632689	103632781	103632693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	137495	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	108153519	108153767	108153691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	363316	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	627878	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	514704	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr13	110902548	110902879	110902758	Y	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	53280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	111174336	111174835	111174468	Y	ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	37245	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	111594578	111594832	111594693	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ANKRD10,ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	29162	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr13	114611317	114611637	114611421	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	46271	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr13	114944657	114944766	114944693	Y	NA	RASA3	ATP4B,TFDP1,RASA3,FLJ44054,CDC16,FAM70B	IMR90	Hi-C	24141950	RASA3	48571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr14	23260533	23260878	23260728	Y	RBM23,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	OXA1L,CTD-2555K7.2,SLC7A7,MRPL52,MMP14	NA	NA	NA	NA	CTD-2555K7.2	26762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	23322319	23322495	23322408	Y	NA	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	LRP10	16327	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr14	23611395	23611621	23611510	Y	SLC7A8	C14orf119,ACIN1,SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	39262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	24743214	24743836	24743517	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	4269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	25580202	25580566	25580328	Y	STXBP6	NA	STXBP6	IMR90	Hi-C	24141950	STXBP6	62699	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	30663023	30663420	30663280	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	3919	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	36583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	409598	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	32979007	32979394	32979291	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	435008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	34504920	34505230	34505078	Y	NA	NA	EGLN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	424332	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	34844314	34844466	34844419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	85096	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	35274619	35275001	35274810	Y	PPP2R3C,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	66548	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr14	35666202	35666508	35666414	Y	BAZ1A,FAM177A1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	76447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	35675118	35675537	35675232	Y	NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	70302	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	35767605	35767844	35767749	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	21766	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	36555858	36556103	36555981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-317N8.4	207651	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	39664073	39664414	39664121	Y	SIP1,PNN	TRAPPC6B,PNN	NA	NA	NA	NA	PNN	21686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-111A21.1	1157045	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	43777769	43777873	43777801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398E10.1	1472159	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	44804196	44804463	44804330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398E10.1	445569	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	45160440	45160781	45160566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398E10.1	89251	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	47696508	47696702	47696627	Y	NA	RPL13AP2	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	28201	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	49979013	49979291	49979168	Y	C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	72006	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	50090977	50091033	50091007	Y	METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2	RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2	NA	NA	NA	NA	MGAT2	5488	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr14	50497743	50497949	50497828	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	C14orf182,SOS2,C14orf183,ARF6,METTL21D	IMR90	Hi-C	24141950	ARF6	139933	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	168019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	50562564	50562863	50562716	Y	RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	133413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	51142431	51142560	51142495	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,CDKL1,NIN,PYGL	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	9382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	51144322	51144826	51144405	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,NIN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	11273	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	51286113	51286196	51286155	Y	PYGL,NIN	NIN	NA	NA	NA	NA	NIN	9643	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	51393835	51393896	51393861	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	15558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	51794326	51794480	51794403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX1	89446	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	53322931	53323139	53323035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	66545	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	53392802	53392977	53392890	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	24176	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	53533673	53533892	53533783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDHD1	84108	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	54465835	54466164	54465918	Y	NA	BMP4	NA	NA	NA	NA	BMP4	42356	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	150295	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	55144129	55144414	55144262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	112314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	55166048	55166175	55166112	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	134233	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	55240829	55240954	55240892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCH1	126616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	55281865	55282028	55281930	Y	NA	NA	GCH1,WDHD1	IMR90	Hi-C	24141950	GCH1	85542	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	56845316	56845513	56845413	Y	PELI2	NA	PELI2,RPL13AP3	IMR90	Hi-C	24141950	PELI2	262784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.46884934623371
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	59565112	59565514	59565267	Y	NA	NA	KIAA0586,DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	DAAM1	87850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	59874044	59874284	59874170	Y	NA	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	JKAMP	74877	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	61188145	61188381	61188263	Y	NA	MNAT1	NA	NA	NA	NA	MNAT1	11079	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	61822624	61823005	61822699	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	35088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	61933004	61933260	61933132	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	145468	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	62219407	62219640	62219496	Y	HIF1A,SNAPC1	RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS2	3592	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	65148642	65149174	65148980	Y	HSPA2,FNTB	PLEKHG3	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG3	19646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	65175295	65175757	65175503	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	6475	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	65193422	65193546	65193484	Y	ZBTB1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	24602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr14	65229595	65229717	65229658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60775	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	65691594	65691779	65691731	Y	NA	NA	FUT8,LOC645431,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	124181	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	68870731	68871233	68871108	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	15680	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	126589	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	69394861	69395248	69394898	Y	ZFP36L1,DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	48909	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	69396600	69396876	69396795	Y	ZFP36L1,DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	47281	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	69425235	69425583	69425528	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	18574	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	69533449	69533600	69533523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF5	84267	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	70161683	70161933	70161784	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	29684	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	71130340	71130625	71130448	Y	NA	TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	23836	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	71132254	71132379	71132336	Y	TTC9	TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	25750	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	71811948	71812060	71812004	Y	NA	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	25417	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	71829962	71830512	71830224	Y	PCNX,SIPA1L1	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	43431	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	71838643	71839069	71838909	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	52112	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	71839144	71839386	71839257	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	52613	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	73100225	73100572	73100516	Y	NA	NA	RGS6,DPF3	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	258237	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	73373247	73373392	73373372	Y	NA	DPF3,DCAF4,RP1-146I3.1	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPF3	14438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	73585185	73585324	73585255	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	15802	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	103200	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	74220065	74220506	74220203	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	31557	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	74224542	74224784	74224663	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	27279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	26595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	74981330	74981609	74981543	Y	NPC2	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	NPC2	22450	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	79561	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	75086409	75086922	75086553	Y	PGF	NA	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FCF1	90925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	75125565	75125963	75125764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCF1	51884	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	75644862	75644871	75644867	Y	NA	TMED10	NA	NA	NA	NA	TMED10	3528	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	75741549	75742051	75741730	Y	NEK9,JDP2,FLVCR2,BATF,FOS	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	LOC731223	IMR90	Hi-C	24141950	FOS	1426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	75920164	75920191	75920178	Y	JDP2	JDP2	NA	NA	NA	NA	JDP2	27745	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	76002139	76002648	76002337	Y	FOS,BATF	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-507E23.1	57901	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	76243945	76244101	76244023	Y	TGFB3	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf1	118413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	77195442	77195914	77195699	Y	VASH1,IRF2BPL,C14orf166B	VASH1	VASH1,ZDHHC22,ANGEL1	IMR90	Hi-C	24141950	VASH1	30618	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	77384574	77384777	77384608	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33481	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr14	77508586	77508871	77508699	Y	IRF2BPL	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	15552	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	77586318	77586417	77586388	Y	NA	TMEM63C	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	5407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	78031949	78032369	78032266	Y	SNW1,SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	48747	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	78047292	78047714	78047418	Y	NA	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	33402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	78121399	78121579	78121501	Y	NA	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	40283	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	78672489	78672521	78672505	Y	NA	NRXN3	NRXN3	IMR90	Hi-C	24141950	NRXN3	34213	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	78771631	78771988	78771787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	64897	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	79502772	79503033	79502836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	796038	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	112531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	86073952	86074255	86074109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	79464	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	89493430	89493694	89493607	Y	NA	NA	EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	204933	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	125810	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	90910680	90911014	90910847	Y	NA	CALM1	CALM1,TTC7B	MCF7	ChIA-PET	22265404	CALM1	49834	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	91069038	91069054	91069046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	208192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	91511263	91511534	91511399	Y	NA	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	C14orf159	13143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	91869322	91869469	91869402	Y	TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	12719	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	93510584	93510744	93510686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	69921	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.7994688697863
chr14	93569992	93570233	93570210	Y	KIAA1409,C14orf109,C14orf109	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	10432	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	93697718	93697880	93697787	Y	ITPK1,MOAP1	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	94748201	94748526	94748499	Y	SERPINA6,SERPINA5,SERPINA4,SERPINA3,SERPINA11,SERPINA1,SERPINA10,SERPINA10	SERPINA6	NA	NA	NA	NA	SERPINA6	39205	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	95775450	95775616	95775533	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	8627	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	96718007	96718377	96718192	Y	BDKRB1	BDKRB2,BDKRB1	NA	NA	NA	NA	BDKRB1	1784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	BDKRB1	NA	NA	NA	NA	BDKRB1	19269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	208740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	102288392	102288845	102288491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	62257	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	19600	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	105124209	105124541	105124354	Y	NA	RP11-982M15.6,INF2	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	20942	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	2748	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	34630	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1262554	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25018281	25018456	25018384	Y	SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN	SNRPN	NA	NA	NA	NA	SNRPN	48338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25209245	25209272	25209252	Y	NA	SNURF,SNHG14,SNORD64	NA	NA	NA	NA	SNURF	11064	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25554216	25554517	25554319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	127611	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25595443	25596209	25595953	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	85919	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25642287	25642724	25642425	Y	UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	39404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	25981968	25982324	25982145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	125993	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	27668360	27668703	27668532	Y	GABRG3	NA	NA	NA	NA	NA	GABRG3	453931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	28361004	28361387	28361316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBA2	766242	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	29407243	29407640	29407337	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	152393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	31680805	31681075	31680940	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	63747	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	35599049	35599138	35599102	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	320561	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	510266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	35989992	35990298	35990145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	711504	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	37249666	37249815	37249741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	141689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	38823791	38823961	38823868	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	31815	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	40463815	40464014	40463832	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	12591	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	ANKRD63,PLCB2,C15orf52	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	41199675	41199878	41199759	Y	DLL4	RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1	DLL4	IMR90	Hi-C	24141950	VPS18	15047	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	26018	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	45929603	45930187	45929917	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	8257	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	45933530	45934014	45933606	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	12184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	45938532	45938945	45938638	Y	NA	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	17186	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	46758762	46759114	46758953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	715184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	50620432	50620711	50620437	Y	NA	GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1	24894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	51872747	51872927	51872852	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	40103	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	51921191	51921424	51921391	Y	NA	DMXL2	DMXL2,LYSMD2,TMOD2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DMXL2	8161	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	52305327	52305801	52305485	Y	DMXL2,MAPK6	LEO1	LEO1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LEO1	43324	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	52402379	52402574	52402478	Y	BCL2L10	CTD-2184D3.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	16887	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	52774147	52774333	52774216	Y	MAPK6,MYO5A	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	44914	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	56940397	56940741	56940580	Y	ZNF280D,TCF12	NA	NA	NA	NA	NA	MNS1	185062	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	58183047	58183076	58183062	Y	NA	NA	GCOM1	IMR90	Hi-C	24141950	POLR2M	300816	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	58293229	58293587	58293482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	410998	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	59194300	59194605	59194559	Y	NA	RNF111,SLTM	NA	NA	NA	NA	SLTM	29247	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	60699729	60699909	60699819	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	6647	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	61340586	61340641	61340614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	571209	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	62499952	62500233	62500097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	149280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63085361	63085478	63085441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1069G10.1	88755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63142999	63143362	63143082	Y	NA	RP11-1069G10.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1069G10.1	30871	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63296233	63296451	63296342	Y	NA	TPM1,RP11-244F12.3	NA	NA	NA	NA	TPM1	36380	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	TPM1,RP11-244F12.3,LACTB	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.3	28810	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63372629	63373133	63372992	Y	NA	TPM1,RP11-244F12.3,LACTB	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.3	33043	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63771566	63772233	63772016	Y	HERC1,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP3	22560	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63792570	63793348	63792650	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	1445	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr15	63989218	63989619	63989416	Y	USP3,HERC1,DAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	97430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	37654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	64932987	64933351	64933169	Y	PLEKHO2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	49809	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	66006814	66006895	66006855	Y	NA	RAB11A	SLC24A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11A	9497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.92141583378296
chr15	67366599	67366961	67366679	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	12498	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	67426476	67426864	67426547	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	72375	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	79620	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	67468171	67468380	67468281	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	54404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALML4	54729	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	68657439	68657730	68657635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEM1B	89298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	69087536	69088004	69087836	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	SPESP1	20556	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	70161196	70161355	70161272	Y	TLE3	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	227160	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	70787270	70787553	70787302	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	266379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	71078596	71078640	71078618	Y	NA	UACA	UACA,LARP6	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	24664	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	71657535	71657734	71657662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	474411	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	73493017	73493414	73493026	Y	NEO1	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	150966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	73792691	73793089	73792708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPTN	131386	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	74289381	74289564	74289454	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	4367	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	32032	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	77579824	77580262	77579914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	130224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	78342105	78342280	78342151	Y	TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	25786	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	78357095	78357144	78357119	Y	NA	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	10922	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	78364826	78365348	78365071	Y	DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	2718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr15	78368268	78368362	78368315	Y	TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	202	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	80126746	80127013	80126880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFS	60708	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	80772387	80772765	80772517	Y	ARNT2,KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	77695	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	78588	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	81607386	81607689	81607446	Y	MESDC1,IL16,IL16,STARD5	STARD5,RP11-761I4.3	NA	NA	NA	NA	STARD5	6835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	83761220	83761490	83761347	Y	TM6SF1	BTBD1,TM6SF1	BTBD1,MIR4515	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM6SF1	12669	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	83778085	83778410	83778297	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3926	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	83847712	83847957	83847821	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	26813	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	83857860	83858021	83857985	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16749	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.33876095289482
chr15	83956370	83956763	83956596	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	4904	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	84040858	84041607	84041233	Y	NA	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	72373	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	65397	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	84118150	84118486	84118331	Y	NA	SH3GL3	NA	NA	NA	NA	SH3GL3	4170	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	85861581	85861931	85861753	Y	PDE8A,AKAP13	NA	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	59871	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	85951204	85951442	85951357	Y	AKAP13,PDE8A,AKAP13	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	29402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	87167883	87168150	87168017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	831622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	89183173	89183667	89183329	Y	ABHD2,ISG20	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	5789	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	89328925	89329315	89329120	Y	NA	NA	ACAN,HAPLN3	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	125327	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	129754	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	90365179	90365539	90365285	Y	POLG,ZNF710,SEMA4B,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	8546	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	90379956	90380186	90379992	Y	NA	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	23323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	90402022	90402269	90402146	Y	NA	ANPEP,AP3S2	NA	NA	NA	NA	AP3S2	33305	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FES	7081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr15	92497568	92497970	92497770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	102643	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	92612839	92613223	92613006	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	213848	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	92614363	92614588	92614456	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	212483	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	93130741	93130751	93130746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	122226	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	93142854	93143118	93142986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	109859	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	93230839	93230845	93230842	Y	ST8SIA2,C15orf32	HMGN1P38,RP11-386M24.4	SLCO3A1	IMR90	Hi-C	24141950	HMGN1P38	22132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	95050162	95050468	95050315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	277395	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2	NA	NA	NA	NA	NR2F2	16875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	99450086	99450215	99450157	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	186205	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	99856918	99857221	99857070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	61081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr15	100893578	100893850	100893781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASB7	246889	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	100914283	100914527	100914405	Y	ADAMTS17	NA	NA	NA	NA	NA	ASB7	226212	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	101945887	101945918	101945891	Y	OR4F6,OR4F15,PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	112400	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	199321	199454	199390	Y	HBM	NPRL3,HBQ1	NPRL3	K562	ChIA-PET	22265404	NPRL3	12462	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	374933	375274	375175	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	PDIA2,AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25399	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	381616	381944	381764	Y	NHLRC4,HAGHL,AXIN1	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	18729	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	507891	508134	507965	Y	NHLRC4	RAB11FIP3	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP3	34272	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	4186619	4186736	4186682	Y	NA	ADCY9	CREBBP,ADCY9,SRL,TRAP1,CORO7-PAM16,PAM16	IMR90	Hi-C	24141950	ADCY9	22433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	4420946	4421237	4421026	Y	NA	PAM16,VASN	NA	NA	NA	NA	VASN	1097	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	4426208	4426420	4426289	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	6359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	4985283	4985359	4985321	Y	NA	PPL	NA	NA	NA	NA	PPL	23383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	5666199	5666502	5666317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	520390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	5920372	5920634	5920563	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	774563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	5935459	5935793	5935620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	789650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	6132184	6132568	6132193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	986375	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr16	6250746	6250963	6250855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1104937	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	6615127	6615137	6615132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1469318	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	10374011	10374360	10374211	Y	NA	ATF7IP2	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	43931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	11277053	11277355	11277217	Y	LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	64121	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	11391500	11391628	11391615	Y	ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,CIITA,SOCS1	SOCS1	SOCS1,DEXI,CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SOCS1	43464	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	11421314	11421464	11421433	Y	ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,CIITA,SOCS1	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	73278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	16070854	16071189	16071093	Y	NDE1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	29420	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	16131643	16131874	16131759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	90209	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	16214258	16214439	16214353	Y	ABCC1	NA	ABCC6	IMR90	Hi-C	24141950	NOMO3	109913	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.17345119111852
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.26017678667778
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr16	20917792	20918142	20917892	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	DNAH3	IMR90	Hi-C	24141950	DCUN1D3	8086	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	23419986	23420351	23420270	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	42150	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	23455511	23455803	23455657	Y	SCNN1G	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	6698	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	23516061	23516396	23516252	Y	PRKCB,GGA2	GGA2,UBFD1	NA	NA	NA	NA	GGA2	14920	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	24363109	24363426	24363114	Y	CACNG3	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP6	183588	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	24431166	24431395	24431229	Y	RBBP6	NA	PRKCB	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP6	115619	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	24855986	24856230	24856033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6A	116970	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	24863023	24863279	24863154	Y	NA	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	124007	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	24865270	24865636	24865496	Y	SLC5A11	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	126254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	25072371	25072507	25072437	Y	SLC5A11	ARHGAP17,LCMT1	LCMT1,LOC100506655	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP17	47384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	25121755	25122029	25121858	Y	SLC5A11	LCMT1	NA	NA	NA	NA	LCMT1	705	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	27275592	27275718	27275658	Y	NA	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	2397	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	27329776	27330351	27329940	Y	JMJD5,JMJD5,KIAA0556,IL21R,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	6787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	27417796	27418436	27417849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL4R	94807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	30927821	30927845	30927833	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1,ORAI3,SETD1A	NA	NA	NA	NA	FBXL19	4531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	31223480	31223547	31223514	Y	ZNF629	FUS,PYCARD	NA	NA	NA	NA	PYCARD	10709	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	33948799	33949141	33948910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2065720	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	34973617	34973844	34973726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3090538	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	34977722	34977881	34977830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3094643	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	34978345	34978669	34978507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3095266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	34979653	34980053	34979874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3096574	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	48610830	48611144	48611073	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	40915	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	49056369	49056621	49056485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	404310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	50236881	50237262	50237048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD5	52052	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	50336956	50337409	50337067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD7	63436	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	50679822	50680132	50679910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	93829	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	50876551	50876846	50876632	Y	NA	NA	NKD1,LOC388276,NOD2	IMR90	Hi-C	24141950	CYLD	102590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	51068365	51068720	51068543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	294404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	51182471	51182868	51182589	Y	SALL1,SALL1	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	408510	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	53114402	53114975	53114686	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	27457	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	53128013	53128430	53128279	Y	RBL2	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	41068	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	57302834	57302977	57302910	Y	NA	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	PLLP	13622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	NA	NA	NA	NA	NA	COQ9	56592	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	63294066	63294457	63294335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	1225127	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	65047832	65047877	65047854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	110138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	65103847	65103999	65103923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	54016	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	65105283	65105525	65105355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	52490	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr16	65378012	65378388	65378200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	219997	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	66087157	66087293	66087245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH5	311240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	66170755	66170866	66170865	Y	NA	NA	CDH11,LOC283867	IMR90	Hi-C	24141950	CDH5	227667	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	66719308	66719396	66719350	Y	NA	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	9214	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	67011641	67011860	67011695	Y	NA	FAM96B,CES2,CES3,CES4A,CBFB	NA	NA	NA	NA	CES4A	8632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	67435763	67435871	67435819	Y	NA	TPPP3,ZDHHC1	NA	NA	NA	NA	TPPP3	10325	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	68303268	68303682	68303412	Y	THAP11,EDC4,PSMB10,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6	6835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPD3	65039	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	68526458	68526774	68526616	Y	NA	SMPD3,ZFP90	SMPD3,CDH1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	35219	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr16	68544131	68544336	68544235	Y	NA	ZFP90	SMPD3,CDH1,PRMT7,CDH3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	17657	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	68804487	68804868	68804749	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	35359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr16	71734305	71734386	71734346	Y	PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	22218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2,SNORD71	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	74610751	74610842	74610827	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	28170	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	75034413	75034614	75034514	Y	FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2342	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr16	75288221	75288577	75288338	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	11374	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	75291027	75291212	75291109	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	8739	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	75369399	75369431	75369415	Y	BCAR1,CFDP1	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	69448	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	75716922	75717191	75717044	Y	CHST5,TERF2IP	TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	KARS	36381	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	77868575	77868689	77868637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT7	114164	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	78830248	78830546	78830432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	698938	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr16	79619926	79620106	79620016	Y	MAF	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	12505	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	80208286	80208441	80208438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	364190	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	81503648	81503971	81503709	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	26873	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	84544701	84544717	84544711	Y	NA	NA	COTL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	COTL1	104966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	84633541	84633938	84633771	Y	NA	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	15745	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	84676809	84677221	84677048	Y	KIAA1609	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	84785578	84785829	84785712	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	84869763	84870234	84870125	Y	CRISPLD2	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	18173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	85028506	85028759	85028547	Y	COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	14382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	85037797	85037883	85037799	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	5258	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr16	85424430	85424739	85424585	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	296940	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	85726494	85726553	85726524	Y	NA	GINS2	NA	NA	NA	NA	GINS2	4815	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	86417419	86417805	86417701	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	124328	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	366001	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	87378694	87379151	87378934	Y	FBXO31	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3B	36450	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	88338212	88338634	88338285	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	89038174	89038503	89038425	Y	CYBA,PABPN1L,CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	NA	ACSF3	114280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	89388621	89389157	89388908	Y	ZNF276,C16orf7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	106503	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	89449545	89449691	89449606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	105278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	818912	819288	819089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	61722	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	872261	872610	872409	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	8400	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	881410	881576	881449	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	400	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.96477863156259
chr17	1533068	1533815	1533453	Y	CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	2888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	2084621	2084734	2084671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119943	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	2409124	2409453	2409310	Y	NA	METTL16	NA	NA	NA	NA	METTL16	3732	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	2927507	2927680	2927594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	249157	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	3699697	3700093	3699885	Y	ZZEF1,ATP2A3	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	2444	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	4081215	4081519	4081370	Y	UBE2G1,C17orf85,P2RX1,ATP2A3,ZZEF1	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	36753	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	4204226	4204625	4204419	Y	CAMKK1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	38952	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	4437372	4437692	4437444	Y	NA	SPNS2,MYBBP1A,SMTNL2	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	19234	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	4561785	4562090	4561947	Y	NA	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2	NA	NA	NA	NA	PELP1	43542	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	4615866	4616105	4615999	Y	MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	4082	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	4748416	4748776	4748678	Y	ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,C17orf87,MINK1,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	13733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	5736283	5736492	5736391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	62729	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr17	7784207	7784538	7784352	Y	POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	CHD3	1586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	8600572	8600969	8600801	Y	MYH10	NA	MYH10,RPL26,RNF222	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	68493	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	8602115	8602249	8602166	Y	MYH10	NA	MYH10	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	70036	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	8649167	8649702	8649446	Y	ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	117088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	8824079	8824459	8824269	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	98400	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	9133558	9133821	9133662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	210699	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	13412933	13413137	13413069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	90107	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	14508636	14508878	14508796	Y	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS18P12	97973	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	15153959	15154348	15154277	Y	NA	PMP22	NA	NA	NA	NA	PMP22	12295	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	15363919	15364293	15364237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDRT1	156533	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	CDRT1	126447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	TTC19	113141	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	NA	NA	NA	NA	NA	UBB	73385	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	NA	NA	NA	NA	NA	UBB	93610	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	17838975	17839310	17839078	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	34426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	19671444	19671619	19671528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK2	97630	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	19769871	19770228	19769963	Y	NA	ULK2	NA	NA	NA	NA	ULK2	622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	20204150	20204477	20204216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS3P2	285894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	25794670	25794745	25794710	Y	NA	KSR1	TBC1D3P5,KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	13000	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	25891638	25891876	25891756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALS9	62948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	RAB34,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	27568035	27568215	27568131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	50921	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	27703475	27703981	27703860	Y	TIAF1,MYO18A,GIT1,TAOK1	TAOK1,MIR4523	MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAOK1	11501	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	28031718	28032050	28032008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIT1	112646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIT1	118781	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	19457	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2B	NA	NA	NA	NA	EVI2B	42098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr17	29599453	29600092	29599789	Y	NA	EVI2B	NA	NA	NA	NA	EVI2B	39038	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	EVI2B	NA	NA	NA	NA	EVI2B	1490	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	29887922	29888057	29887990	Y	NA	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	171280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	29892134	29892258	29892202	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	175492	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	30115229	30115607	30115424	Y	NA	NA	RAB11FIP4,C17orf79,MIR193A,MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	UTP6	111177	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr17	30170148	30170249	30170215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP6	56535	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	30588630	30588823	30588726	Y	NA	RHBDL3	NA	NA	NA	NA	RHBDL3	2372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	30851083	30851355	30851281	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	39446	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	31072918	31073214	31073077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	128981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	31150044	31150344	31150182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	51851	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	31254083	31254387	31254296	Y	NA	TMEM98	NA	NA	NA	NA	TMEM98	1155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	32562458	32562865	32562656	Y	CCL8,CCL7	CCL2	CCL13	IMR90	Hi-C	24141950	CCL2	17439	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	32581116	32581488	32581294	Y	NA	CCL2	NA	NA	NA	NA	CCL2	812	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	33383216	33383365	33383329	Y	SLFN5,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	30973	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	35292129	35292558	35292512	Y	ACACA,LHX1,AATF	AATF	NA	NA	NA	NA	AATF	11617	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	36610879	36611283	36611138	Y	NA	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	28217	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	36947324	36947688	36947677	Y	NA	PCGF2,PSMB3,PIP4K2B,CWC25,MIR4727	NA	NA	NA	NA	PIP4K2B	6691	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	8339	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38440755	38440955	38440855	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	CDC6	930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38464298	38464708	38464402	Y	MSL1,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	854	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38488015	38488253	38488146	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	24571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38607821	38607996	38607876	Y	NA	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	10119	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	38648531	38648872	38648707	Y	KRT10,MSL1,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	50829	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38666550	38666883	38666717	Y	TNS4	NA	CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP4	68848	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	38680852	38681157	38680975	Y	NA	NA	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TNS4,RARA,CDC6,GJD3,TOP2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP4	83150	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT15	23430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	39695431	39695775	39695718	Y	NA	KRT15,KRT19,KRT14	KRT19	K562	ChIA-PET	22265404	KRT19	12871	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	32315	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	40517094	40517456	40517393	Y	NA	STAT3	NA	NA	NA	NA	STAT3	21130	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	41162878	41163074	41162972	Y	TUBG1,CNTD1,NBR1,NBR1,ETV4	AARSD1,RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	IFI35	6136	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	41409196	41409569	41409556	Y	TMEM106A	TMEM106A	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM106A	47342	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	41410079	41410140	41410127	Y	NA	TMEM106A	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM106A	48225	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	41656262	41656390	41656311	Y	G6PC3	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	1274	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	41657407	41657423	41657415	Y	MPP2	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	2419	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	NA	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP3	56868	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.33876095289482
chr17	42620927	42621257	42621090	Y	FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	11668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	44198056	44198387	44198212	Y	STH,KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	44234299	44234706	44234578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	264551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	47815825	47816028	47815963	Y	MYST2,FAM117A,DLX4,DLX4	SLC35B1,KAT7,FAM117A	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	31449	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	48290532	48290619	48290576	Y	NA	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	13539	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	49075036	49075414	49075227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG9	120812	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	53875650	53875676	53875663	Y	NA	PCTP	NA	NA	NA	NA	PCTP	49310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	54263832	54264049	54263912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCTP	437492	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf67	244009	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	55447287	55447561	55447443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	116075	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	55456674	55456859	55456690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	125462	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	55523126	55523573	55523446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	191914	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	55700521	55700792	55700709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	224625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P,RNU1-108P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr17	56705180	56705300	56705276	Y	NA	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4	K562	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	29366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	57276702	57276986	57276911	Y	NA	SKA2,PRR11,SMG8,GDPD1	NA	NA	NA	NA	SMG8	7775	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	57862470	57862813	57862554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	53814	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	57925185	57925429	57925290	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	8558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	57952277	57952457	57952367	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	15847	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	58467674	58467818	58467746	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,APPBP2,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	30013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	AC005884.1	68115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	59532462	59532698	59532510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	133865	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	60707106	60707291	60707232	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	4344	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	60795868	60796183	60796045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	93106	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	60965502	60965873	60965703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	262740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	61243701	61244044	61243838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	277695	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	62491373	62491767	62491605	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	219	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	62612826	62613207	62613064	Y	NA	SMURF2	NA	NA	NA	NA	SMURF2	42979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	63209763	63210018	63209891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	78214	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	508381	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr17	63937645	63937764	63937728	Y	CEP112	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	248438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	63996608	63996849	63996729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	189353	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	64566647	64567007	64566809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	269893	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	64981602	64981762	64981682	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	22576	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	66434083	66434422	66434387	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	17232	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20A	98800	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	67599219	67599477	67599295	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	190380	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	67756789	67757245	67756902	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	347950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	72637081	72637207	72637142	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF	NA	C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300LF,CD300E	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A3R1	105584	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	72684773	72685055	72684909	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	57736	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	73684314	73684419	73684412	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	23045	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	73850621	73850811	73850693	Y	GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65	NA	NA	NA	NA	WBP2	33	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	74494294	74494838	74494393	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	1034	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr17	74785319	74785747	74785427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF2	53863	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75116381	75116522	75116452	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	35583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	4194	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	6613	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	7160	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	10285	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	37940	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	75387909	75388384	75388205	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	113258	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75417194	75417582	75417357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	142543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75422359	75422648	75422577	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	147708	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	229848	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC6	171692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	76384421	76384943	76384751	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	11700	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	76912078	76912524	76912123	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	6945	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	77032690	77033106	77032818	Y	CYTH1,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	15794	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	77803693	77803802	77803748	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	7426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	77817686	77818105	77817998	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	6458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	78126105	78126434	78126234	Y	NA	EIF4A3	EIF4A3,CARD14,SLC26A11,SGSH	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4A3	7123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	78304141	78304261	78304201	Y	NPTX1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF213	71476	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	79056542	79056873	79056681	Y	NA	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	49594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	79126074	79126501	79126440	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	68298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	81612	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.2,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	3489	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr17	80842917	80843211	80843101	Y	C17orf62,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	134977	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L3	266575	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	6187863	6188007	6187935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	225229	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	6193210	6193559	6193391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	219677	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	6355893	6356010	6355962	Y	ARHGAP28,L3MBTL4	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	57226	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	6922958	6923281	6923120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA1	192532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	8730480	8730718	8730581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	123037	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	9612296	9612535	9612373	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	703	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	9643596	9643835	9643765	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	30358	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	9877272	9877635	9877453	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	34364	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr18	10086468	10086802	10086635	Y	NAPG,APCDD1	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	174469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	10544333	10544521	10544427	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	20431	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	12076743	12076871	12076848	Y	NA	NA	GNAL	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	97719	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	12763760	12763785	12763774	Y	CEP192,C18orf1	NA	PTPN2	IMR90	Hi-C	24141950	CEP76	62984	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	12777545	12777688	12777651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	76769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	13276704	13277362	13276805	Y	RNMT,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	287343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	13375364	13375636	13375393	Y	RNMT,PTPN2,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	349023	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	13501125	13501479	13501273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223180	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	13615424	13615980	13615703	Y	RNMT,C18orf19,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	108679	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	18512291	18512341	18512327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	177471	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	19373794	19374099	19373861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	90876	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	19759263	19759580	19759296	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	11859	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr18	20104385	20104397	20104392	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	271827	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	20263132	20263811	20263406	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	112413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	20402088	20402300	20402139	Y	NA	RBBP8	RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	25864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	20651395	20651706	20651560	Y	C18orf8	NA	RIOK3,CABLES1,TMEM241	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4741	140083	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	20835223	20835287	20835255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	180638	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	7.51221214401334
chr18	22813900	22814028	22813957	Y	ZNF521	NA	NA	NA	NA	NA	IMPACT	809320	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	25645418	25645770	25645581	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	109640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	25691984	25692409	25692174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	63001	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	25695112	25695346	25695270	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	60064	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	25754926	25755429	25755157	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	33038926	33039146	33039052	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	36809	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	33093148	33093751	33093628	Y	GALNT1	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	17193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	34052267	34052344	34052306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHOD3	176590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	35000619	35000729	35000675	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	593461	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	36903724	36904130	36903931	Y	NA	RPL7AP66	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	9509	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	38446239	38446490	38446414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1086681	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	39540677	39540940	39540809	Y	NA	PIK3C3	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	7506	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	39755452	39755827	39755639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	222281	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	39806393	39806644	39806462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	273222	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	43210324	43210708	43210352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	334532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	43297098	43297112	43297106	Y	SLC14A2	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	248128	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	44487034	44487390	44487355	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	8065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	45017912	45018159	45018036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IER3IP1	317167	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	45379355	45379691	45379492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	75824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	46242460	46242735	46242629	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	179043	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46354445	46354549	46354497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	120532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	18262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46467138	46467469	46467322	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	7612	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7077	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	49074	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	46543550	46543788	46543750	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	68469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	47512458	47512491	47512475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACAA2	174128	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	47548085	47548102	47548094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	171361	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	47688363	47688450	47688407	Y	NA	MYO5B	NA	NA	NA	NA	MYO5B	31013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	48616016	48616044	48616031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD4	123606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	48720847	48721238	48721193	Y	NA	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	21436	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	51703852	51704220	51704036	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	44938	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	CCDC68	NA	NA	NA	NA	CCDC68	10960	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	53004994	53005474	53005290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	324544	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	55480522	55480777	55480650	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1,NEDD4L,LOC100505549	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP8B1	12189	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	55957381	55957780	55957581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	247782	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	56161690	56161866	56161857	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	103997	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	56188177	56188434	56188359	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	77429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	56188664	56188776	56188720	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	77087	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.67752190578963
chr18	56194097	56194141	56194127	Y	NEDD4L,MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	71722	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	56208513	56208704	56208597	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	57159	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	56212323	56212488	56212463	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	53375	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	56232351	56232608	56232443	Y	MALT1	SNORD28	NA	NA	NA	NA	SNORD28	33255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	56571979	56572200	56572090	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	44147	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	57572110	57572452	57572282	Y	PMAIP1	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	6930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	57594468	57594884	57594545	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PMAIP1	29288	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	HMSD,SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	67682034	67682164	67682099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	189017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr18	68002975	68003345	68003133	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	48838	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	68089361	68089784	68089523	Y	SOCS6	NA	RTTN,SOCS6	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	135224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	70342014	70342252	70342154	Y	NA	CBLN2	FBXO15	IMR90	Hi-C	24141950	CBLN2	38258	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	2556	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr18	72706567	72706772	72706660	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	212531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	74171783	74172228	74172071	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	32918	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr18	74276166	74276377	74276252	Y	ZNF516	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	70689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr18	74277589	74278024	74277906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	72112	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	74804015	74805088	74804856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	271452	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	74815308	74815668	74815588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	282745	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr18	74818309	74818676	74818510	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	285746	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	76613052	76613164	76613109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	214121	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	77060474	77060624	77060564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	93232	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	77682652	77682872	77682762	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	26792	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr18	77715299	77715635	77715515	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	5635	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.96477863156259
chr19	800594	800755	800691	Y	NA	PTBP1,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5519	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26	NA	NA	NA	NA	STK11	2126	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	2186180	2186319	2186250	Y	NA	DOT1L,AP3D1,SF3A2,PLEKHJ1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	23716	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	2478921	2479315	2479258	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	4801	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	2503555	2504136	2503623	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	29435	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	3404656	3404792	3404728	Y	TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47095	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	3405079	3405252	3405203	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47518	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	3450938	3451227	3451079	Y	GNA15	C19orf77,DOHH	NA	NA	NA	NA	C19orf77	27313	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	4369210	4369467	4369256	Y	ZBTB7A,CCDC94,TICAM1,SEMA6B	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	MPND	27686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	LRG1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	LRG1	36802	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	4785303	4785662	4785510	Y	FSD1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	FEM1A	4066	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	5139337	5139604	5139434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	136141	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	6132012	6132373	6132181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	65210	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	6238228	6238618	6238539	Y	RFX2	RFX2,MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	39341	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr19	6273754	6274259	6273940	Y	VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	3700	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	6668609	6668941	6668849	Y	DENND1C,ZNF557,VAV1,GPR108,EMR1,TNFSF14	NA	NA	NA	NA	NA	C3	59632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	6801116	6801467	6801221	Y	SH2D3A,VAV1	SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	35517	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	7196747	7197124	7196928	Y	KIAA1543,INSR	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94921	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	7483723	7483869	7483787	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	25724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	7525376	7525563	7525475	Y	NA	C19orf45,PEX11G	NA	NA	NA	NA	C19orf45	30299	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	8635978	8636196	8636014	Y	MARCH2,PRAM1,MYO1F	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	37424	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	9973694	9973855	9973758	Y	ZNF266,FBXL12	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	29761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	10714716	10715205	10715003	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	3583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	10715339	10715596	10715546	Y	ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	4206	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	10728527	10728590	10728559	Y	NA	SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	17394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	10829647	10829946	10829894	Y	ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	2892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	10865897	10866291	10865968	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	39142	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	11044199	11044446	11044323	Y	NA	YIPF2,C19orf52,SMARCA4	NA	NA	NA	NA	C19orf52	6790	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	14089228	14089566	14089336	Y	CCDC130,PKN1,CD97,RFX1	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	RFX1	26285	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	16403791	16404489	16404426	Y	NA	KLF2	AP1M1,KLF2,EPS15L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF2	29139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	16462018	16462188	16462137	Y	CIB3	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	28390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	16557779	16558043	16557912	Y	RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	22853	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	16573693	16573897	16573763	Y	HSH2D	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	6999	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	17208293	17208806	17208572	Y	NA	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	23702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	17604234	17604409	17604322	Y	NA	SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	16029	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	18625662	18626077	18625893	Y	UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL	ELL,FKBP8,KXD1	NA	NA	NA	NA	ELL	4860	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	18811913	18812040	18811994	Y	UPF1,SLC25A42,JUND,FKBP8,UBA52,CRTC1	CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	19426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	20606211	20606644	20606560	Y	ZNF90	ZNF826P	NA	NA	NA	NA	ZNF826P	436	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	21689202	21689645	21689487	Y	ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	11718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	21891969	21892260	21892094	Y	ZNF100	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF100	56170	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.54743351245074
chr19	28181492	28181840	28181676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1520608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	28197525	28198373	28198039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1504075	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	28211511	28212598	28211607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1489850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	28225585	28226223	28225838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1476225	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	28232001	28232276	28232191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470172	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	28252106	28252716	28252616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449732	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	28279937	28280239	28280146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1422209	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	28914991	28915131	28915061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	787317	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	3229	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	32470893	32471107	32470968	Y	THEG5	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	363393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr19	33841444	33841736	33841590	Y	NA	CEBPA,CEBPG	CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPG	20500	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	34746041	34746169	34746166	Y	KIAA0355	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	2599	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	WTIP	NA	NA	NA	NA	WTIP	22839	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	35494139	35494542	35494364	Y	NA	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	10451	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	35557782	35557965	35557875	Y	MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4	SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	HPN	28372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	35763394	35763606	35763496	Y	U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	5513	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	35927378	35927883	35927593	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,HCST,FFAR2	NA	NA	NA	NA	NA	DMKN	74677	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	36449882	36450230	36450084	Y	NA	LRFN3,SDHAF1	NA	NA	NA	NA	LRFN3	25622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,COX7A1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	COX7A1	24673	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	AC074138.3	19449	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	ZNF569	NA	NA	NA	NA	ZNF569	4850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr19	38490005	38490506	38490269	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	94137	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	38721338	38721526	38721432	Y	NA	DPF1,SPINT2	NA	NA	NA	NA	DPF1	2984	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	38727709	38727942	38727826	Y	NA	DPF1,SPINT2	NA	NA	NA	NA	SPINT2	4733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	39171828	39172087	39171896	Y	FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	35539	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	39189644	39189919	39189773	Y	RINL	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN4	53355	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	39614894	39615098	39614961	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	484	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	20.2412382769248
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr19	41803374	41803837	41803699	Y	B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	10257	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,B3GNT8,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	42710307	42710321	42710316	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	11971	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	44066469	44066595	44066553	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF575,ETHE1,XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5	NA	NA	NA	NA	XRCC1	16030	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	44113081	44113405	44113330	Y	NA	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4	NA	NA	NA	NA	ZNF428	8621	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	44124638	44124922	44124781	Y	CADM4	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	ZNF428	2612	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	44137942	44138031	44138016	Y	ZNF575,ZNF221,LYPD5,ZNF428,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	CADM4	3960	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	44138598	44138945	44138732	Y	ZNF575,ZNF284,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,LOC390940,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	CADM4	3046	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,CADM4,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CADM4	10105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	44749585	44749846	44749685	Y	LYPD5,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZNF229,ZFP112,ZNF227,ZNF235,ZNF233,ZNF233	ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF233	2472	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	44824668	44825027	44825022	Y	NA	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	17469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45195366	45195649	45195556	Y	RELB,CLASRP,BCL3	NA	NA	NA	NA	NA	PVR	50268	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	45344497	45344782	45344640	Y	CEACAM16,NKPD1,CLASRP	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	2650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	27.7534504209382
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45803954	45804164	45804074	Y	NA	KLC3	NA	NA	NA	NA	KLC3	30528	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	45906934	45907335	45907067	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	6987	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	46014236	46014617	46014413	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	6399	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFL3	58025	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr19	47961170	47962467	47962382	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	10958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	48301309	48301509	48301460	Y	CABP5,CRX	SEPW1,RPL23AP80	NA	NA	NA	NA	RPL23AP80	5162	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	49046614	49046906	49046677	Y	NA	NA	SULT2B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPHK2	73642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	49482691	49482925	49482812	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	11642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	26338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	49590520	49590786	49590652	Y	NA	SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	3844	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	49775600	49775657	49775630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	66208	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	CTC-301O7.4,DKKL1,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	4420	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD34,RPS11,SNORD35B,FCGRT	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr19	50317454	50317522	50317488	Y	PTH2	AP2A1,FUZ,MED25,PTOV1	NA	NA	NA	NA	FUZ	1111	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	51059089	51059663	51059341	Y	KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9639	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9014	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	51221435	51221859	51221691	Y	KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1	SHANK1	NA	NA	NA	NA	SHANK1	728	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.71274327422704
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	32480	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	31697	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	30743	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	29988	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	52228457	52228756	52228505	Y	NA	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	3210	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	4069	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.59079631023037
chr19	52239330	52239749	52239573	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR2,FPR2,FPR1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	14083	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF845	107141	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	ZNF331	NA	NA	NA	NA	ZNF331	26278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	54052581	54053344	54052712	Y	NA	ZNF331	NA	NA	NA	NA	ZNF331	30346	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	55540419	55540558	55540460	Y	SHISA7,KIR2DL3,NCR1	RDH13,EPS8L1	NA	NA	NA	NA	RDH13	40101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	55600172	55600429	55600236	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	18784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,COX6B2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,COX6B2,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	TMEM238	12795	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	55909655	55909755	55909754	Y	PPP1R12C,TMEM150B	COX6B2,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	7390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14,SSC5D,SBK2	NA	NA	NA	NA	SBK2	14879	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	SBK2,ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	SBK2	14342	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	56064106	56064277	56064192	Y	ZNF579	SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1	NA	NA	NA	NA	SBK2	17650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.71274327422704
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	56698517	56698525	56698522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF444	56549	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF551	28241	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr2	1679499	1679591	1679561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	52308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	1725652	1725860	1725698	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	20764	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	7068069	7068244	7068157	Y	NA	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	12546	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	8144336	8144872	8144521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	672103	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	8456047	8456179	8456122	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	360796	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	10176248	10176551	10176348	Y	NA	KLF11,CYS1	NA	NA	NA	NA	KLF11	4425	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	10572027	10572239	10572154	Y	NA	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	14391	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr2	11673553	11673665	11673599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	E2F6	69256	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	15309828	15310293	15310034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	389161	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	15783989	15784378	15784047	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NA	NA	NA	NA	NA	DDX1	54687	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	15815563	15815811	15815751	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	DDX1	86261	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	19766934	19767238	19767086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSR1	210520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	20409195	20409404	20409321	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	13790	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	1527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	20435780	20436055	20435965	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	12586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	21518335	21518607	21518471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC067959.1	76288	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	21691615	21691861	21691725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC067959.1	249568	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr2	24213695	24213947	24213707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf44	56498	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	24941895	24942247	24942153	Y	NCOA1	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	71758	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	25473699	25473887	25473786	Y	EFR3B	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	89572	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	25514055	25514238	25514170	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	49221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	28018603	28018692	28018648	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	26019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	28303771	28304058	28303879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	191806	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB,SPDYA	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	29026080	29026331	29026243	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	SPDYA	NA	NA	NA	NA	SPDYA	22697	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	29055098	29055343	29055221	Y	SPDYA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	35824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	29649150	29649196	29649158	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	330579	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	30449373	30449624	30449515	Y	YPEL5	LBH	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	2773	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	30490099	30490308	30490211	Y	NA	LBH	NA	NA	NA	NA	LBH	37702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	30889265	30889652	30889547	Y	NA	NA	YPEL5,LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	221173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	33441691	33441836	33441744	Y	LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	217555	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	34215610	34215617	34215614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98A	393161	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	36603527	36603925	36603600	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	22458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr2	36980864	36981389	36981193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	109634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	37868257	37868517	37868387	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	95094	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	37881606	37881960	37881783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	81651	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	37893644	37893973	37893812	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	69638	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	37993289	37993401	37993340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	29678	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	37995152	37995275	37995251	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	31541	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	38003207	38003253	38003231	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	39596	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	38401547	38402107	38401851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	54603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	38417790	38418062	38417924	Y	CYP1B1	RPL7P12	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	38648	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	38770175	38770358	38770267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLP0P6	63255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	38949741	38950194	38950072	Y	HNRPLL,SRSF7	SRSF7,GEMIN6	NA	NA	NA	NA	SRSF7	26442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	39722003	39722381	39722147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	59550	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	40165659	40165900	40165832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	161252	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	42155945	42156079	42156067	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	42157961	42158315	42158139	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	548	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	42355776	42356012	42355884	Y	NA	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	38478	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	43023230	43023314	43023309	Y	NA	HAAO	NA	NA	NA	NA	HAAO	5497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	20896	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	43201925	43202517	43202160	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	184192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	185797	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	43336478	43336881	43336648	Y	OXER1	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	114867	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	43358229	43358771	43358564	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	92977	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	43818575	43818651	43818610	Y	NA	THADA,PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	THADA	2534	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	45164223	45164580	45164499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	56972	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	45405025	45405418	45405218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	183473	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46125185	46125467	46125284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	248701	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46292387	46292596	46292492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	226210	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46483860	46484088	46483965	Y	RHOQ	EPAS1	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	34718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46614603	46614745	46614671	Y	RHOQ	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	95797	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46797577	46797967	46797772	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	29881	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	46993562	46993962	46993767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	69471	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	47089688	47089819	47089748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	51477	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr2	47206692	47207332	47207009	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	39698	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	47212237	47212567	47212294	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	45243	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	47420372	47420663	47420518	Y	NA	CALM2	EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	18632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	52799520	52799826	52799685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	1193103	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	54714209	54714329	54714214	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	32787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	54751942	54752182	54752042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	70520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	135187	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	54900806	54901065	54900960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	219384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	55558772	55559057	55558882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIF2	64289	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	56070301	56070618	56070423	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	78656	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	56089907	56090266	56090122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	59008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	56267618	56267636	56267627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	118344	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	56344982	56345239	56345001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC85A	64019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	57034024	57034047	57034036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007743.1	623119	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	60712095	60712413	60712305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	66289	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	60889987	60890156	60890096	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	91209	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	62424513	62424632	62424578	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	3265	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	62753696	62753810	62753753	Y	NA	TMEM17	TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	16667	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	64500610	64500974	64500772	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	131022	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	65782552	65782570	65782560	Y	NA	NA	SPRED2,ACTR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRED2	124781	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr2	67124681	67124944	67124813	Y	NA	AC009474.2	LOC644838,MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC009474.2	18327	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.33876095289482
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	68989889	68990241	68990036	Y	PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	248069	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	69424670	69425029	69424849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	186360	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	70160460	70161117	70160745	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	PCBP1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ASPRV1	26280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	70161598	70161791	70161659	Y	PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	25606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	70255582	70255905	70255725	Y	MXD1,PCBP1	NA	NA	NA	NA	NA	PCBP1	56680	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	70273102	70273420	70273221	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	39165	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	70285414	70285703	70285559	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	26882	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	CYP26B1	43683	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	72789461	72789923	72789792	Y	EXOC6B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	261247	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	72804113	72804334	72804239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	246836	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr2	73142422	73142663	73142543	Y	NA	SPR,EMX1	NA	NA	NA	NA	EMX1	1033	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	73318348	73318566	73318457	Y	NA	SFXN5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	17601	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	74060180	74060503	74060342	Y	NA	STAMBP	NA	NA	NA	NA	STAMBP	6094	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	74298270	74298885	74298717	Y	MOBKL1B	FNBP1P1	NA	NA	NA	NA	FNBP1P1	46922	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	74930564	74930823	74930694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4F	51209	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	80261096	80261278	80261177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	126983	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	85034355	85034669	85034421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	96080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	85186958	85187334	85187145	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	8882	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	85492413	85492544	85492479	Y	SH2D6	NA	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	61004	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	85814700	85815022	85814855	Y	VAMP5	GGCX,VAMP8,VAMP5,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68	NA	NA	NA	NA	VAMP5	5169	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	86048153	86048345	86048249	Y	ATOH8	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	65792	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	86102907	86103036	86102912	Y	NA	ST3GAL5,AC105053.4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	11101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	86113603	86114063	86113862	Y	CAPG,GNLY,ST3GAL5	ST3GAL5,AC105053.4	LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	74	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5,AC105053.4	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	AC105053.4	6587	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	86121717	86122002	86121863	Y	NA	ST3GAL5,AC105053.4	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	AC105053.4	7314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	86132237	86133031	86132663	Y	NA	ST3GAL5,AC105053.4	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	AC105053.4	17834	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr2	86163596	86163679	86163638	Y	NA	ST3GAL5,AC105053.4	POLR1A,ST3GAL5,ATOH8,LOC90784,LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	AC105053.4	49193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	86224674	86224821	86224747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106457	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	87019569	87019949	87019758	Y	CD8B,CD8A,CD8A	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP3,RNF103-CHMP3	73324	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	88923115	88923478	88923431	Y	NA	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	1616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	91773979	91774217	91774117	Y	NA	NA	LOC654342	IMR90	Hi-C	24141950	RPIA	2784817	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	97211723	97211896	97211824	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,CNNM3,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	11243	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWA3B	121353	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	99453667	99453923	99453920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	108078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	99525863	99526206	99526035	Y	C2orf55	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	180274	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr2	99551773	99552038	99551906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf15	203910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	100323852	100324185	100324151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	219355	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	11.0596456564641
chr2	100496681	100496959	100496872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	392184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	124173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	101884483	101884674	101884578	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	TBC1D8,RNF149	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	17155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	102246727	102247245	102246928	Y	RNF149,MAP4K4,MAP4K4	NA	RFX8,MAP4K4,CREG2	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K4	64067	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	102382879	102383094	102382925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	71567	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	102399741	102400097	102399970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	88429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	167590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	102516830	102516950	102516890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	162054	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	102549846	102550051	102549852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	128953	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	102596960	102597162	102597070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	81842	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	102744535	102744807	102744707	Y	IL1RL2,IL1R1,MAP4K4,MAP4K4	NA	IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	65531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	103104673	103104833	103104753	Y	IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A2	129333	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	106009982	106010344	106010250	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	42626	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	106026144	106026496	106026333	Y	GPR45,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	26474	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	106416912	106417146	106416970	Y	C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	57558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	107501688	107501932	107501832	Y	ST6GAL2,ST6GAL2	ST6GAL2	NA	NA	NA	NA	ST6GAL2	124	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	109789769	109790041	109789880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	388556	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	109790230	109790424	109790331	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	389017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	109864376	109864774	109864388	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	463163	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	110863536	110863928	110863763	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	8215	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	113058633	113059002	113058901	Y	NA	ZC3H8,ZC3H6	NA	NA	NA	NA	ZC3H6	27462	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	113457946	113458361	113458065	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	NA	FLJ42351,SLC20A1,IL37,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	SLC20A1	56512	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	113465868	113466153	113465952	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	NA	FLJ42351,SLC20A1,IL37,CKAP2L,POLR1B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CKAP2L	54101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	114039556	114039944	114039632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	72457	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	165331	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	114653014	114653311	114653090	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	7477	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	115897297	115897567	115897434	Y	DPP10,DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	699421	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	116360896	116361163	116361028	Y	DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	1163020	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	116469497	116469517	116469506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	1271621	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	120905923	120906046	120905986	Y	EPB41L5,EPB41L5	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	72938	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	121299175	121299329	121299252	Y	NA	NA	RALB,GLI2,INHBB,LOC84931	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLI2	191870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	124260647	124260891	124260797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1767968	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	129131715	129132088	129131976	Y	NA	NA	HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	57564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2B	736193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	133407314	133407482	133407398	Y	LYPD1,LYPD1	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	19670	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	133803546	133803723	133803632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	376394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	137139482	137140258	137140029	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	265747	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	139289140	139289372	139289256	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	31769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	139464660	139464674	139464668	Y	NXPH2	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH2	71244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	139537003	139537180	139537022	Y	NA	NXPH2	NA	NA	NA	NA	NXPH2	1085	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	143697269	143697638	143697450	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	64202	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	143699726	143700104	143699915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	66659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	145795788	145796304	145796070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	515641	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	146506691	146506845	146506721	Y	NA	NA	DKFZp686O1327,ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	PABPC1P2	836167	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	148296630	148296767	148296652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	269148	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	149566291	149566547	149566419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	64272	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	151385444	151385651	151385488	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	7874	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	152210516	152210890	152210778	Y	RBM43,NMI,TNFAIP6	TNFAIP6	NA	NA	NA	NA	TNFAIP6	1216	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	154333342	154333495	154333419	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	20	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	154495676	154495864	154495770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRM	162354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	157147606	157147983	157147795	Y	NA	NR4A2	NA	NA	NA	NA	NR4A2	48877	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	157330960	157331271	157331070	Y	GPD2	GPD2	NA	NA	NA	NA	GPD2	41158	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	159271137	159271419	159271301	Y	UPP2	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	40057	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	159994086	159994676	159994284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	146634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	160057929	160058272	160058017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	83038	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	160059380	160059738	160059444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	81572	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	160097747	160098072	160097910	Y	TANC1	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	43238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	147543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	161065805	161066369	161066265	Y	CD302	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	148684	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	161083916	161084239	161083958	Y	CD302,ITGB6	NA	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	166795	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	161086140	161086681	161086297	Y	NA	NA	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	169019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	161150962	161151085	161151045	Y	CD302	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	111308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	161177458	161178011	161177649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	84382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	161208357	161208687	161208675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	53706	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	5.00814142934222
chr2	161244338	161244737	161244615	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	17656	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	161277229	161277590	161277411	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	14836	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	164486140	164486494	164486462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	104028	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	164501816	164502222	164502220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	88300	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	164518951	164519177	164519064	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	71345	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	165508598	165508853	165508726	Y	COBLL1	GRB14	GRB14	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRB14	32240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	169893346	169893881	169893427	Y	DHRS9,DHRS9	NA	ABCB11	K562	ChIA-PET	22265404	SPC25	125465	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	169928135	169928282	169928217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPC25	160254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	169961196	169961524	169961361	Y	NOSTRIN,DHRS9,DHRS9	NA	NA	NA	NA	NA	SPC25	193315	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr2	170221024	170221462	170221353	Y	NA	LRP2	NA	NA	NA	NA	LRP2	3829	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	171112437	171112843	171112772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	430469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr2	172628972	172629294	172629196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	87053	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	274717	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	174007383	174007707	174007544	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	209841	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	174129335	174129853	174129516	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	87695	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	174856370	174856618	174856494	Y	CIR1,SP3,SP3	SP3	SP3,OLA1	IMR90	Hi-C	24141950	SP3	27940	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	175540530	175540594	175540562	Y	CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1	WIPF1,H3F3AP4	NA	NA	NA	NA	WIPF1	5050	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	81223	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	175837054	175837318	175837218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR933	193119	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	178131060	178131559	178131324	Y	NA	MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	AC079305.10	3973	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	180098781	180098979	180098880	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	28538	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	182177649	182177833	182177744	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E3	347674	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	185595976	185596316	185596146	Y	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	134883	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	187922387	187922712	187922454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM171B	365689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	188326523	188326725	188326579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	101762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr2	188414787	188415077	188415012	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	13410	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	190739727	190739922	190739832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS1	92620	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	190954965	190955117	190955035	Y	C2orf88	NA	C2orf88,HIBCH,TMEM194B,MFSD6,OSGEPL1,PMS1,INPP1	IMR90	Hi-C	24141950	INPP1	251079	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	191825811	191826187	191826065	Y	NAB1,GLS,STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	30106	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr2	191826753	191827142	191827070	Y	NA	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	29151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	191876857	191877189	191877023	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	6497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	192112527	192112680	192112632	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	4616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	208368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	146347	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	192870555	192870805	192870799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	160574	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	192915570	192915970	192915770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	205589	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	193750404	193750590	193750488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	1040423	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	197098625	197098768	197098634	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	59398	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	197686451	197686687	197686569	Y	PGAP1,C2orf66	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	24002	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	201289842	201289940	201289893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	82791	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	201454959	201455229	201455094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD18	72452	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10	NA	NA	NA	NA	CASP10	32977	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	202102159	202102434	202102342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP10	56555	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	202104378	202104489	202104432	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	NA	CASP10	58774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	202560879	202561324	202561082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM237	54586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	82495	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	205530118	205530314	205530216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	121602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	206564438	206564682	206564481	Y	INO80D,NRP2	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	19724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	208602415	208602802	208602609	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	28151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	211571404	211571410	211571407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	231028	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	93874	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.05150422712185
chr2	214053816	214053901	214053846	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPAG16	93212	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	216222811	216223009	216222866	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48271	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	412240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	219177286	219177625	219177456	Y	NA	AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7	NA	NA	NA	NA	TMBIM1	21977	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	219194739	219194938	219194840	Y	ARPC2,ARPC2,USP37,TTLL4,RQCD1,PNKD,SLC11A1	TMBIM1,AC021016.7	NA	NA	NA	NA	AC021016.7	21860	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr2	219596297	219596622	219596516	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1	TTLL4,CYP27A1	NA	NA	NA	NA	TTLL4	22729	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	219598381	219598949	219598614	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,CYP27A1	TTLL4,CYP27A1	NA	NA	NA	NA	TTLL4	24813	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,CHPF,INHA,OBSL1	NA	NA	NA	NA	CHPF	6038	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	NA	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	SLC4A3	63704	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	220557392	220557516	220557454	Y	NA	NA	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	SLC4A3	67343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	221000091	221000153	221000122	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A3	510042	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	223824867	223825201	223825044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE4	89331	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	224564336	224564481	224564409	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	99115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	104129	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr2	224808298	224808709	224808400	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	194	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	225325353	225325370	225325362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	122740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	226988054	226988110	226988074	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC068138.1	59977	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	228018054	228018265	228018160	Y	COL4A4	COL4A4,COL4A3	NA	NA	NA	NA	COL4A4	8564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	228331050	228331499	228331159	Y	NA	AGFG1	AGFG1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	3369	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	228728073	228728272	228728126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	51515	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	230118973	230119267	230119206	Y	NA	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	14734	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	230784453	230784592	230784556	Y	NA	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	231533310	231533654	231533603	Y	SP110,SP140	CAB39	CAB39	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	41906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	231658746	231658958	231658902	Y	SP140L,SP100,SP100	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	68396	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	232054877	232055306	232054968	Y	HTR2B,ARMC9	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	5954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	232840477	232840577	232840527	Y	DIS3L2	DIS3L2	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	16522	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	233180259	233180746	233180485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPP	60498	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	233763823	233764207	233764133	Y	EFHD1,NGEF	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	43843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	234357256	234357513	234357369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	96103	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	5.00814142934222
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP40	142070	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	87966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	235335674	235336048	235335859	Y	ARL4C	NA	SPP2,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	67649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	235905010	235905389	235905297	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	46393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr2	237247429	237247691	237247614	Y	IQCA1	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	166494	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	68798	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	237677514	237677881	237677605	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	263329	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	237884627	237885186	237884982	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	106769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	238066036	238066584	238066320	Y	MLPH,COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	74081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	238512238	238512938	238512467	Y	LRRFIP1	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	RAB17	3981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	238611190	238611575	238611206	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	76971	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	240095	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	240143817	240143953	240143885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	177395	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	177053	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	240147854	240148066	240148024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	173282	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	124012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	240200846	240201180	240201020	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	120168	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	53682	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	NA	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV2	116345	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	241585712	241586190	241585819	Y	DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN10	61579	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr2	242485030	242485360	242485049	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	10776	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	242500447	242500594	242500505	Y	NEU4,BOK	BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	4311	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	242698564	242698745	242698671	Y	THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	26570	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr2	242714145	242714474	242714395	Y	NEU4,D2HGDH,GAL3ST2	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	42151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	623135	623319	623297	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8695	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	810241	810511	810380	Y	SDCBP2,SDCBP2,SRXN1,FAM110A,FAM110A,FAM110A	NA	NA	NA	NA	NA	SRXN1	178227	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	1744868	1745008	1744937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	128146	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	2802059	2802221	2802148	Y	CPXM1	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	VPS16	17128	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	3520013	3520365	3520159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRN	70326	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr20	3993168	3993585	3993445	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	98793	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	5070783	5071219	5071039	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	34053	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	5625689	5625867	5625799	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	GPCPD1,C20orf196	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	36017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	6142519	6142722	6142563	Y	NA	FERMT1	HAO1	IMR90	Hi-C	24141950	FERMT1	40328	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr20	6257849	6257983	6257916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT1	155658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	6594261	6594618	6594466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	151693	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	6678677	6678999	6678684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	67312	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	7741380	7741717	7741518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	256759	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	8210701	8210953	8210827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	99877	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	8437471	8437869	8437556	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	326647	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	9181393	9181497	9181455	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	133983	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	10469146	10469624	10469385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	56276	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	10477280	10477577	10477381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	64410	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	10585324	10585599	10585462	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	39415	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	13221839	13221847	13221843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	395740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	14248741	14249040	14248807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	67222	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	15282242	15282264	15282251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	965980	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	16373141	16373392	16373267	Y	OTOR	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	178686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	17591305	17591483	17591343	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	42797	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	17830512	17830807	17830760	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNX5	116816	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	17830949	17831353	17831268	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNX5	116270	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNX5	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	19860938	19861220	19861002	Y	NA	NA	SLC24A3,RIN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-122P22.2	124586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	20499728	20499916	20499822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	191215	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	20714961	20715479	20715201	Y	RALGAPA2	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	23830	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	21147247	21147656	21147458	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	42623	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	21172590	21172944	21172681	Y	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	67966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	NKX2-2	75448	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	6053	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	22555806	22556424	22556290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	471954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	283878	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	170704	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	30105267	30105465	30105369	Y	HM13	REM1,HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	5036	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	31560072	31560429	31560192	Y	CDK5RAP1	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	154373	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	33150860	33150919	33150894	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	18202	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	33643621	33643805	33643685	Y	TP53INP2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	34869	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	33653192	33653349	33653271	Y	NA	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	25325	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	33907745	33907913	33907842	Y	MMP24,GDF5	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	81621	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	72970	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	34479476	34479734	34479606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	65660	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	34566043	34566286	34566130	Y	RBM39	SCAND1	NA	NA	NA	NA	SCAND1	20649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	35251667	35252083	35251778	Y	NA	C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	19530	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	35273218	35273375	35273256	Y	RBL1,TGIF2,SAMHD1,SLA2	C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	41081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	36899646	36899868	36899757	Y	BPI	NA	NA	NA	NA	NA	TGM2	106666	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	37471404	37471600	37471507	Y	RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	81355	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	38739667	38739753	38739719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	576127	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	39878072	39878223	39878164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX3	66089	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr20	42381187	42381490	42381296	Y	C20orf111	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	87433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr20	42782324	42782724	42782613	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	31494	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	42948601	42948866	42948737	Y	NA	FITM2	GDAP1L1,FITM2,C20orf111,LOC100505783,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FITM2	10792	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr20	43152518	43152864	43152699	Y	NA	TTPAL,SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	SERINC3	3768	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADA	42740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	43869504	43869693	43869682	Y	DBNDD2,SLPI	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	11512	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr20	43876988	43877346	43877094	Y	NA	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	3859	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	45251611	45251999	45251807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC13A3	50715	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	46320177	46320280	46320230	Y	SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	93080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	47040513	47040840	47040677	Y	NA	NA	SULF2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00494	53820	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr20	47961628	47961789	47961714	Y	NA	NA	B4GALT5	IMR90	Hi-C	24141950	ZNFX1	68665	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48158294	48158522	48158408	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	24161	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48165703	48166239	48166052	Y	PTGIS	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	16444	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	48168443	48168863	48168748	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	13820	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr20	48174087	48174267	48174236	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	8416	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	48200728	48200848	48200788	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	18045	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48201281	48201539	48201531	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	18598	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48207635	48208270	48207977	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	24952	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48285223	48285402	48285313	Y	SPATA2,SLC9A8	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	43013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48385312	48385495	48385398	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	40933	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr20	48995783	48996016	48995938	Y	NA	NA	LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	128875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	49341306	49341865	49341532	Y	NA	PARD6B	NCOA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARD6B	4216	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	49358421	49358698	49358635	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	12340	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	49430215	49430240	49430227	Y	PARD6B,BCAS4,ADNP	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	20784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	ADNP	NA	NA	NA	NA	ADNP	29532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	21252	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	50063853	50064072	50063963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	113298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	50994608	50994684	50994647	Y	NA	NA	TSHZ2	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	175761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	51109650	51109945	51109791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	290803	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	51775056	51775397	51775227	Y	TSHZ2,TSHZ2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	449049	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	255623	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	55264382	55264603	55264519	Y	NA	PTMAP6	BMP7,TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	9967	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	57585788	57586041	57585915	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5486	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	57586300	57586427	57586364	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5998	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	57738628	57739096	57738774	Y	ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	122664	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	59761167	59761446	59761307	Y	NA	NA	CDH26,LOC284757,C20orf197,CDH4	IMR90	Hi-C	24141950	CDH4	64036	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	59828827	59829192	59829064	Y	CDH4	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	3345	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	59871380	59871440	59871410	Y	NA	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	45898	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr20	60811895	60811989	60811929	Y	GATA5,CABLES2	OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	315	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.54743351245074
chr20	60939635	60939778	60939673	Y	SLCO4A1,NTSR1,LAMA5	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	61057611	61057886	61057678	Y	NA	GATA5	NA	NA	NA	NA	GATA5	8585	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	61554875	61554902	61554887	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	12402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	43476	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr20	61724045	61724282	61724168	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	7389	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	16345757	16346184	16346094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	89137	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	806565	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	17958916	17959192	17958984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	858572	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	859056	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	27242944	27243154	27243052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	136960	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	27275894	27276232	27276045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	169910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr21	28796596	28796902	28796773	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	459764	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	28797067	28797570	28797293	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	460235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	30126542	30126837	30126741	Y	NA	NA	LINC00113,ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	128856	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.96477863156259
chr21	30567218	30567411	30567380	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	2826	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	30590117	30590529	30590261	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	25725	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	30610398	30610668	30610456	Y	USP16,BACH1,BACH1	LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	46006	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	30617454	30617803	30617527	Y	USP16,BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	53062	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	30675702	30676052	30675894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	111310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	30758449	30758782	30758692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	194057	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	32556885	32557051	32556941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOD1	472884	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	33301390	33301573	33301482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUNK	57762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	34659541	34659728	34659635	Y	NA	IL10RB,IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IL10RB	22878	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr21	34673242	34673650	34673467	Y	OLIG2,OLIG1,IFNAR2,SON,IFNGR2,GART,GART,IL10RB,IFNAR1	IL10RB,IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	21084	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr21	36181032	36181199	36181134	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	195591	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	36220332	36220721	36220527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234891	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	36392735	36393025	36392943	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	407294	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	36457286	36457490	36457388	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	471845	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	37558722	37558993	37558858	Y	NA	DOPEY2	NA	NA	NA	NA	DOPEY2	31642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr21	38074425	38074708	38074699	Y	NA	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	4992	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	38151764	38151954	38151859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIM2	82331	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	DSCR9,AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr21	39658761	39658879	39658842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	516352	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	40127775	40128062	40127985	Y	NA	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	47169	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	40376938	40377126	40376993	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	176651	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	40395176	40395277	40395227	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	158500	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	42610946	42611279	42611113	Y	BACE2	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	73218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	42619630	42619951	42619670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	81902	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	43832072	43832298	43832177	Y	NA	TMPRSS3	NA	NA	NA	NA	TMPRSS3	17117	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	43881012	43881164	43881098	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3373	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3744	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	15770	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	SIK1	92651	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	45590858	45591062	45590983	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	C21orf33,PWP2,ICOSLG	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C21orf33	39371	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr21	46295070	46295864	46295519	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	3318	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46298625	46298957	46298811	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTTG1IP	6873	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46302248	46302499	46302417	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10496	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr21	46302536	46302756	46302646	Y	NA	PTTG1IP	PTTG1IP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	46461202	46461645	46461341	Y	ITGB2,ADARB1	ADARB1	ADARB1,SSR4P1	K562	ChIA-PET	22265404	ADARB1	30123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr21	46470710	46471152	46470922	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	20616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr21	46549530	46549961	46549631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	57762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr21	46550297	46550615	46550364	Y	ITGB2	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	58529	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46786853	46787266	46786994	Y	COL18A1,POFUT2	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	35786	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	46850245	46850628	46850488	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	27193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	47266684	47266899	47266840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	132752	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	47370674	47370877	47370809	Y	NA	COL6A1	COL6A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A1	28774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr21	47469357	47469652	47469491	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	46359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	47968526	47968894	47968542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	84185	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr21	48003626	48004009	48003657	Y	S100B,PRMT2	PRMT2	NA	NA	NA	NA	PRMT2	49070	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	17091097	17091180	17091141	Y	IL17RA	TPTEP1	NA	NA	NA	NA	TPTEP1	10320	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TPTEP1	225517	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	17849400	17850329	17849515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	177574	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	18404666	18404945	18404902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	100380	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	18452405	18452779	18452681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	52546	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr22	20886351	20886470	20886411	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	38151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,XXbac-B135H6.15,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	23624437	23624690	23624563	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	104546	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	23725705	23725832	23725738	Y	NA	ZDHHC8P1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	17081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	24870306	24870552	24870389	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	58459	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	KIAA1671	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1671	35143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr22	25390259	25390306	25390285	Y	NA	KIAA1671	KIAA1671	MCF7	ChIA-PET	22265404	KIAA1671	43562	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	25458331	25458606	25458444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1671	111634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	25463741	25463900	25463813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1671	117044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	27109967	27110337	27110138	Y	NA	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	43237	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	27503626	27504166	27503976	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	114522	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	27525231	27525565	27525473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	93123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	27531437	27531936	27531772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	86752	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	27816576	27816924	27816809	Y	NA	NA	MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	197888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	29132423	29132599	29132510	Y	NA	HSCB,CHEK2,CCDC117	NA	NA	NA	NA	HSCB	3420	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	29601085	29601300	29601289	Y	NA	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	1245	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	30178140	30178286	30178234	Y	NA	ZMAT5,UQCR10	NA	NA	NA	NA	UQCR10	16782	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	30608541	30609106	30608754	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	31734	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	30634003	30634340	30634268	Y	TBC1D10A,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6500	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr22	30721148	30721367	30721290	Y	MTMR3,OSM,SLC35E4,TBC1D10A	GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D10A	113	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	31291343	31291446	31291429	Y	SEC14L4,OSBP2	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	70838	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	32042427	32042918	32042716	Y	RNF185,LIMK2	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	13500	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	32048774	32049039	32049031	Y	NA	PISD	SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L	GM12878,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	PISD	7379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	33202971	33203258	33203149	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	7284	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	33240240	33240586	33240349	Y	NA	TIMP3,Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	13834	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	11263	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	34315412	34315698	34315644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	216506	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	34317541	34317731	34317667	Y	LARGE	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	218635	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	35529944	35530291	35530139	Y	ISX	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	94758	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr22	36748222	36748386	36748297	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	33677	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	36765300	36765605	36765487	Y	APOL3,NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	16458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr22	37062717	37062867	37062806	Y	CACNG2	NA	NA	NA	NA	NA	IFT27	107433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	37310268	37310667	37310471	Y	RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB	CSF2RB	NA	NA	NA	NA	CSF2RB	2598	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	37445416	37445556	37445486	Y	NA	MPST,TST,KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	223	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr22	37663226	37663580	37663275	Y	MFNG,MFNG,NCF4,RAC2	Z82188.1,RAC2	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	24738	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	37897761	37897917	37897872	Y	NA	MFNG,CARD10,RP5-1177I5.3	NA	NA	NA	NA	CARD10	15632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,RP5-1177I5.3,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	38653163	38653507	38653358	Y	NA	TMEM184B	MAFF	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM184B	13533	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	39091291	39091422	39091336	Y	NA	CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1	NA	NA	NA	NA	JOSD1	4139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	40575185	40575584	40575306	Y	TNRC6B,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	74115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	42073632	42073949	42073667	Y	TOB2	C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	8994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	43741648	43742031	43741839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL12	160509	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	44417424	44417686	44417555	Y	PARVB	PARVB	NA	NA	NA	NA	PARVB	24333	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	36789	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr22	46483894	46484294	46483949	Y	C22orf26	RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	20123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	47330872	47331057	47330965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	174354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	47487256	47487562	47487389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	330738	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	50262824	50262951	50262946	Y	TUBGCP6,MLC1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	17334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	4783422	4783695	4783523	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	7579	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	4861560	4861757	4861659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGOT	70286	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	8652	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	9733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	5030402	5030899	5030722	Y	NA	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	11601	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	5038569	5038695	5038648	Y	BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	19768	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40	36157	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	46235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	5237403	5237551	5237430	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	EDEM1	10072	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	8978841	8979048	8978945	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	24409	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	10231143	10231913	10231419	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	26594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	10276652	10276834	10276729	Y	NA	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	10873	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	11645125	11645451	11645297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	114769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	11759856	11760132	11759896	Y	NA	VGLL4	NA	NA	NA	NA	VGLL4	88	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	12723455	12723677	12723573	Y	RAF1	RAF1	TMEM40,RAF1,MKRN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAF1	19730	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr3	13580930	13581161	13581030	Y	FBLN2	NA	HDAC11,FBLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HDAC11-AS1	61377	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	13920516	13920583	13920566	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	898	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	14457192	14457307	14457247	Y	NA	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	15116	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	14692297	14692322	14692310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	250221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	271895	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	15286616	15286745	15286681	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	40957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	15358234	15358387	15358263	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	22488	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	16102393	16102705	16102619	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	201774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	16444095	16444292	16444168	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	109241	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	16550067	16550455	16550405	Y	PLCL2,OXNAD1,RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	3078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	824779	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	941290	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	17622451	17622654	17622556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	861655	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	20201632	20201832	20201780	Y	KAT2B	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	23952	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	23432118	23432366	23432242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	189607	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	24563741	24564038	24564033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	577659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NEK10	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	NEK10	39509	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr3	27984483	27984771	27984759	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	222277	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	28078428	28078736	28078583	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	202339	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	29531228	29531586	29531407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	210755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	29568670	29568984	29568828	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	248197	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	29725037	29725420	29725261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	404564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	29735360	29735534	29735491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	414887	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	29736457	29736614	29736535	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	415984	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	30794572	30794739	30794667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	148578	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	31207703	31207815	31207739	Y	STT3B	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	364315	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	33478074	33478410	33478365	Y	NA	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	2453	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	36937540	36937792	36937666	Y	NA	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	46756	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	38207945	38208258	38208101	Y	VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	3365	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	38210566	38210752	38210690	Y	VILL,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	5986	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	39192828	39193549	39193225	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	504	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	39372633	39372790	39372689	Y	MOBP,CCR8	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	50049	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	42514954	42515471	42515310	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5822	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	2843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	4232	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	50201601	50201845	50201760	Y	TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2	SEMA3F,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	11123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	50204265	50204566	50204413	Y	HYAL2	SEMA3F,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	13787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	52081342	52081690	52081545	Y	GPR62,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	6876	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	52926819	52927340	52927162	Y	PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110	TMEM110-MUSTN1,TMEM110	NA	NA	NA	NA	TMEM110-MUSTN1	2238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	53876999	53877298	53877116	Y	CHDH	IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	IL17RB	1309	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	54856337	54856720	54856396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	198095	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	55377694	55377830	55377728	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	144143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr3	55384068	55384357	55384288	Y	NA	NA	CACNA2D3,ERC2,WNT5A	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	137616	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	55398457	55398867	55398717	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	123106	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	56769464	56769764	56769614	Y	CCDC66	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	54199	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	60112666	60113022	60112844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1078856	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	60501466	60501824	60501659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	733309	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	61728117	61728514	61728321	Y	NA	RPL10AP6	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1337	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	64200446	64200649	64200513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	192788	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	64800106	64800118	64800112	Y	ADAMTS9	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	128430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	66348485	66348581	66348534	Y	SLC25A26	NA	LRIG1	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG1	201106	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	66533474	66533812	66533569	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	15875	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	67040750	67040873	67040812	Y	NA	NA	KBTBD8	MCF7	ChIA-PET	22265404	LRIG1	491063	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	69228052	69228449	69228187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	95957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	69262443	69262764	69262745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	130348	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	69338000	69338210	69338108	Y	MITF	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	205905	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	71080443	71080735	71080627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	550405	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71436688	71437201	71436910	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	193939	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71447361	71447554	71447492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	183586	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71490469	71490633	71490551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	140507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71588104	71588187	71588146	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	42953	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71628462	71628802	71628743	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	2338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	72132186	72132563	72132457	Y	RYBP,FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4E3	330262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	72395827	72396075	72396000	Y	RYBP	NA	SHQ1,RYBP,GXYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	97994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	76292746	76292796	76292771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO2	338900	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	79674571	79674688	79674630	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	140277	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	86972169	86972375	86972272	Y	VGLL3	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	65894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	87033428	87033764	87033572	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	4505	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	87038252	87038431	87038423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	88046474	88046673	88046586	Y	ZNF654,CGGBP1,C3orf38	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf38	150220	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	89352653	89353050	89352849	Y	EPHA3	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P5	704442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	97240765	97240783	97240774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	240582	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	99262027	99262447	99262268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	92872	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	199928	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	99761045	99761306	99761215	Y	TMEM45A	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	70051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	100482455	100482783	100482461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	56250	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	101598094	101598345	101598104	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	53259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	101598551	101599071	101598955	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	53716	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	101899188	101899342	101899284	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	354353	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	101914180	101914598	101914381	Y	NFKBIZ,NFKBIZ,ZPLD1	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	369345	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	106984184	106984525	106984343	Y	NA	LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00883	26645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	107085712	107085944	107085942	Y	NA	NA	LOC344595,LOC100302640	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00883	128173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	107564404	107564418	107564411	Y	CCDC54	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	243454	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	107706134	107706639	107706380	Y	NA	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101233	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	107725103	107725159	107725131	Y	NA	NA	MYH15,CD47,IFT57,HHLA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	82713	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	107727876	107728085	107727993	Y	CD47	NA	MYH15,HHLA2	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	79787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	111289781	111290083	111289847	Y	CD96	ZBED2	NA	NA	NA	NA	ZBED2	22207	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	111834106	111834381	111834309	Y	BTLA,C3orf52,GCET2	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	30924	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	111943889	111944218	111944054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD200	104976	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	112069423	112069692	112069474	Y	SLC9A10	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	20229	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	112076880	112077055	112076913	Y	BTLA	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	27686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	112095378	112095510	112095470	Y	CD200	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	46184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	112095802	112096161	112095994	Y	CD200	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	46608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	112097877	112098105	112098057	Y	ATG3	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	48683	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	112109657	112110558	112110278	Y	CD200	NA	CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3	IMR90	Hi-C	24141950	CD200	60463	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	112182390	112182567	112182476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	95989	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	112351265	112351470	112351440	Y	NA	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	14907	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	114261968	114262342	114261973	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	488508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	115337526	115337854	115337690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	473408	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	115345321	115345682	115345589	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	481203	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	681595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	117379734	117380078	117379965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	334017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	118900816	118900962	118900889	Y	UPK1B,B4GALT4	UPK1B	NA	NA	NA	NA	UPK1B	10452	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	119023177	119023412	119023295	Y	NA	ARHGAP31	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31	11957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	120040705	120041102	120040904	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	25084	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	120120515	120120873	120120694	Y	FSTL1	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	47227	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	17.7371675622537
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	121820083	121820229	121820142	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CSTA,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A2	209147	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	122467278	122467457	122467368	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	43214	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	123511285	123511578	123511394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	166986	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	124564415	124564677	124564502	Y	HEG1,ITGB5	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	53588	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	124770854	124771405	124771326	Y	HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1397	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	124773884	124774020	124773942	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1082	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	124781797	124782117	124781832	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	8995	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	124786089	124786383	124786283	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	13287	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr3	125200225	125200611	125200423	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	36430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	148482	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	369236	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	127416375	127416550	127416435	Y	NA	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	26597	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	127453672	127453937	127453742	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	63894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	17349	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1,RUVBL1-AS1	NA	NA	NA	NA	RUVBL1-AS1	2913	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	128267469	128267837	128267725	Y	NA	NA	GATA2	K562	ChIA-PET	22265404	GATA2	57441	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	128312973	128313336	128313155	Y	NA	NA	EEFSEC,GATA2,LOC90246	IMR90	Hi-C	24141950	RPN1	84582	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	128337505	128337705	128337543	Y	KIAA1257,GP9	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	60213	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	128338287	128338590	128338558	Y	RAB7A	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	59328	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	128831103	128831496	128831287	Y	NA	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	8148	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	129335456	129335900	129335710	Y	MBD4	PLXND1	RPL32P3,C3orf25,IFT122,MBD4,H1FOO,PLXND1,TMCC1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXND1	11795	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	132164768	132165015	132164817	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	30398	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	132524079	132524175	132524127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP3	84776	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	133811108	133811508	133811147	Y	SLCO2A1	SLCO2A1	SLCO2A1,C3orf36	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO2A1	42080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	19741	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	134051149	134051359	134051254	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	20731	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	135615560	135615771	135615666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	66744	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	135828343	135828732	135828538	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	85351	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	135861520	135861675	135861598	Y	MSL2,MSL2	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	52408	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	136067042	136067151	136067097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	99894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	136427457	136427837	136427826	Y	STAG1	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	41383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	136533824	136534225	136534025	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	44671	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAS	74220	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	138109159	138109469	138109274	Y	NA	MRAS,ESYT3	NA	NA	NA	NA	ESYT3	41959	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	141129371	141129776	141129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	74113	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	141131755	141132151	141131882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	71738	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	141397804	141398070	141397938	Y	NA	NA	RASA2,ATP1B3,GRK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNF7	56976	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	141994757	141995052	141994916	Y	NA	NA	GK5,TFDP2,ATP1B3,XRN1,GRK7	IMR90	Hi-C	24141950	GK5	52308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	142844875	142844897	142844886	Y	PAQR9,CHST2	CHST2,PBX2P1	NA	NA	NA	NA	CHST2	8702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	145416082	145416315	145416265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P39	124211	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	145785304	145785639	145785521	Y	NA	RP11-274H2.3	NA	NA	NA	NA	RP11-274H2.3	332	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr3	145931100	145931141	145931121	Y	PLSCR5,PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	35825	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	6974	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	16.2764596453622
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149119420	149119639	149119543	Y	NA	TM4SF1	WWTR1,ANKUB1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	25768	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149180653	149180836	149180808	Y	RNF13	TM4SF4,RP11-278L15.6	HPS3,TM4SF18,TM4SF1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF4	8925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149194266	149194620	149194394	Y	CP,TM4SF4	TM4SF4,RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	TM4SF4	4505	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149225895	149226130	149226044	Y	RNF13	TM4SF4,RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	15448	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	149666531	149666918	149666689	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	17254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	150478267	150478712	150478564	Y	TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	151971438	151971777	151971516	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	11821	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	152236739	152236782	152236761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	251395	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	154688654	154689001	154688833	Y	MME,MME,MME,MME	NA	LOC100507537,MME	IMR90	Hi-C	24141950	MME	50912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	155382767	155382896	155382833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf33	139244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	155705974	155706059	155706016	Y	NA	SETP14	NA	NA	NA	NA	SETP14	2881	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	159175843	159176214	159175971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARRES1	727358	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	159465414	159465509	159465463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	649553	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	634521	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	621301	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	572545	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	159656528	159656799	159656753	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1,IL12A	IMR90	Hi-C	24141950	SMC4	458263	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	160195722	160195964	160195820	Y	NA	TRIM59,SCARNA7	NA	NA	NA	NA	TRIM59	5597	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	164223490	164223778	164223777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	1329482	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	164729324	164729626	164729510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	823634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	165533635	165533716	165533676	Y	BCHE	BCHE	NA	NA	NA	NA	BCHE	19544	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	165535017	165535196	165535158	Y	NA	BCHE	NA	NA	NA	NA	BCHE	18064	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	34.2222997671719
chr3	167579478	167579761	167579515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINI1	128447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	169344202	169344434	169344318	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	34972	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	170137645	170137870	170137713	Y	SLC7A14,CLDN11,CLDN11	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	2992	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	170138195	170138413	170138223	Y	NA	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	3542	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	170807604	170807852	170807633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	183122	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PP13439	3064	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	171543191	171543627	171543455	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	16451	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	171592038	171592451	171592208	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	65298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	171825348	171825521	171825406	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	69930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	171826024	171826613	171826515	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	70606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	172229975	172230511	172230380	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	8786	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	172325180	172325357	172325227	Y	NA	NA	TNFSF10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF10	85883	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	174652666	174653024	174652845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAALADL2	498303	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	176862590	176862993	176862904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	50268	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	177434552	177434810	177434802	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	97843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	177623365	177623625	177623388	Y	NA	RP11-2L8.1	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-2L8.1	26986	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	178236576	178236655	178236649	Y	KCNMB2	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	551412	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	178671519	178671916	178671775	Y	NA	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	116151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	178754661	178754788	178754723	Y	KCNMB3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	33279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr3	178755149	178755598	178755383	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	32469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	178787910	178788066	178787991	Y	ZMAT3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	179550123	179550276	179550202	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	181580	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	179685404	179685725	179685692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5L	67116	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	179687230	179687579	179687379	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5L	65262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	179850996	179851355	179851175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5L	98155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr3	179940928	179941172	179941050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5L	188087	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	180040639	180040822	180040650	Y	NA	NA	PEX5L	IMR90	Hi-C	24141950	TTC14	277096	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.71274327422704
chr3	180076528	180076864	180076696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC14	241054	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	181035769	181036114	181035791	Y	SOX2,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	330207	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	712583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	736707	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	738842	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr3	183010054	183010455	183010255	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	41022	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	183684356	183684550	183684447	Y	NA	ABCC5	NA	NA	NA	NA	ABCC5	49253	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf70	140855	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	185034789	185035224	185034953	Y	NA	EHHADH,MAP3K13	NA	NA	NA	NA	MAP3K13	36060	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	185036051	185036269	185036182	Y	NA	EHHADH,MAP3K13	NA	NA	NA	NA	MAP3K13	37322	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP2	75807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	185450719	185450896	185450815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	89948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	186926447	186926523	186926484	Y	NA	RPL39L	NA	NA	NA	NA	RPL39L	29751	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	188224984	188225450	188225214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	355139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	188618525	188618672	188618589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	748680	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	188661502	188661787	188661650	Y	NA	NA	LPP,LPP-AS2,BCL6,LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	LPP-AS2	791657	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	190956161	190956506	190956333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	88360	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr3	194210438	194211060	194210799	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	6033	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	194242291	194242478	194242395	Y	ATP13A3	ATP13A3	TMEM44,ATP13A3,GP5,FLJ34208,LSG1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	25198	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	194282077	194282468	194282283	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,XXYLT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	20272	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	194754255	194754281	194754268	Y	NA	NA	XXYLT1,LOC100507391,LSG1,FAM43A,PPP1R2	IMR90	Hi-C	24141950	XXYLT1	235615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	194909017	194909237	194909137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	80659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	195871770	195871934	195871856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	64710	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	196389876	196389952	196389914	Y	LRRC33	LINC01063,PIGX,CEP19	NA	NA	NA	NA	PIGX	25230	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr3	196995168	196995509	196995411	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	28662	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	197033346	197033465	197033406	Y	DLG1	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	9175	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	197044593	197044660	197044627	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	20422	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr3	197190389	197190580	197190458	Y	NA	NA	DLG1,BDH1,LOC100507086,MFI2,MFI2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	107614	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCGF3	54413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	765995	766248	766202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLX1	51738	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	DOK7	NA	NA	NA	NA	DOK7	24044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	3463022	3463837	3463465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOK7	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr4	3931557	3931999	3931672	Y	NA	FAM86EP	NA	NA	NA	NA	FAM86EP	23147	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	4394201	4394323	4394262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB49	104277	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	4475518	4475743	4475631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX18-AS1	66115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	7209017	7209262	7209117	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	16752	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	7326521	7326781	7326651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPL1	107919	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	7510082	7510101	7510091	Y	SORCS2	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPL1	75382	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	79300	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	7834057	7834311	7834184	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	80240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	92255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	7969878	7969938	7969908	Y	SH3TC1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	30225	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	7974971	7975417	7975298	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	35318	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	7981410	7981607	7981517	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	41757	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	10034211	10034588	10034478	Y	SLC2A9	RP11-448G15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-448G15.1	28105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	13914675	13914923	13914768	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB28	430686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	RAB28	438441	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	13981901	13982273	13982087	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,BOD1L	IMR90	Hi-C	24141950	RAB28	497912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	14780950	14781106	14781029	Y	NA	NA	LOC441009	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB2	221192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	15297006	15297030	15297019	Y	NA	NA	C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	172459	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	15368371	15368749	15368556	Y	CD38,CPEB2,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	100740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	15536628	15536631	15536630	Y	NA	NA	FBXL5	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	67139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr4	15757957	15758240	15758119	Y	FBXL5,TAPT1,CD38	RP11-115L11.1,CD38	C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	CD38	19658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	20197125	20197285	20197196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT2	55598	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	22663085	22663445	22663261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	64128	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	22676419	22676434	22676427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	51139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	NA	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	75834	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	26175759	26175971	26175925	Y	NA	RBPJ	RBPJ	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	12682	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	26689488	26689564	26689526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D19	113429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	26888311	26888739	26888468	Y	NA	STIM2	NA	NA	NA	NA	STIM2	31011	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	33064964	33065218	33065098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH7	2344927	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	36191564	36191723	36191675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	52408	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	38101433	38101948	38101596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	141377	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	38102941	38103486	38103298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	142885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.54743351245074
chr4	38674773	38675062	38674906	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	10269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	39354929	39355678	39355646	Y	NA	RFC1	WDR19	IMR90	Hi-C	24141950	RFC1	10317	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	39894546	39894889	39894718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	82687	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	40285086	40285251	40285162	Y	N4BP2,RHOH	NA	N4BP2,RHOH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	N4BP2	228640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	40765283	40765623	40765452	Y	RBM47	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	15369	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	40997224	40997582	40997567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	219149	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.96477863156259
chr4	46493775	46494150	46493963	Y	NA	GABRA2	NA	NA	NA	NA	GABRA2	18528	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	48840387	48840419	48840403	Y	NA	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	35158	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	52873079	52873103	52873091	Y	NA	SGCB,SPATA18	NA	NA	NA	NA	SGCB	29545	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	55093767	55093987	55093860	Y	NA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	503	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	57381480	57381484	57381482	Y	ARL9	THEGL	NA	NA	NA	NA	THEGL	13291	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	57831930	57832208	57832081	Y	NA	POLR2B,NOA1	NA	NA	NA	NA	POLR2B	9680	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	57960936	57961321	57961171	Y	NA	IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	13230	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	67430351	67431255	67431078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	472507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	73610067	73610408	73610238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS3	177551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	73634227	73634562	73634459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS3	201711	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	73673744	73673875	73673808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS3	241228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	73887463	73887489	73887476	Y	NA	COX18	ADAMTS3	IMR90	Hi-C	24141950	COX18	45983	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	75539265	75539284	75539274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTC	178612	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	75811840	75811948	75811897	Y	NA	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	44357	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	77121153	77121281	77121217	Y	NA	SCARB2	NA	NA	NA	NA	SCARB2	11765	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	77380282	77380659	77380469	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	26029	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	78290875	78290883	78290879	Y	CXCL13	NA	NA	NA	NA	NA	CCNG2	214571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	79521197	79521480	79521236	Y	NA	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	43577	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	79537274	79537650	79537411	Y	BMP2K	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	27407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	81199073	81199101	81199087	Y	NA	FGF5	NA	NA	NA	NA	FGF5	13320	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	81228486	81228584	81228534	Y	NA	FGF5,C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	26290	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	81229160	81229644	81229481	Y	NA	FGF5,C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	25230	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	85868944	85869302	85869263	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	16236	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	85873236	85873576	85873407	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	11962	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	87829502	87829621	87829563	Y	HSD17B11,AFF1	AFF1,C4orf36	NA	NA	NA	NA	AFF1	24533	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	87849171	87849370	87849272	Y	HSD17B11	AFF1,C4orf36	NA	NA	NA	NA	AFF1	4784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,C4orf36	NA	NA	NA	NA	C4orf36	27456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,C4orf36	NA	NA	NA	NA	C4orf36	38767	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf36	77526	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	87960081	87960248	87960138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf36	104727	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	88038562	88038726	88038648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	120740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	88074850	88075090	88074969	Y	DSPP	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	84376	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	88943044	88943294	88943160	Y	NA	SPP1,PKD2	NA	NA	NA	NA	PKD2	16224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	89299019	89299120	89299070	Y	NA	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	1128	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	89303859	89304128	89303998	Y	NA	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	5968	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	90439232	90439404	90439379	Y	NA	RP11-115D19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-115D19.1	31103	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	91238961	91239218	91239076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	481495	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	95406092	95406259	95406175	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	35055	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr4	99009822	99009923	99009829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	170612	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	99937707	99938078	99937893	Y	NA	METAP1	NA	NA	NA	NA	METAP1	22936	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	100731573	100731850	100731699	Y	NA	DAPP1	RG9MTD2,LOC256880,DNAJB14,H2AFZ	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DAPP1	4140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	101269712	101269900	101269796	Y	LAMTOR3	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZ	400167	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	101440272	101440596	101440446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZ	570727	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	102093748	102093766	102093752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	173171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	102173679	102174077	102173884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	92860	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	103596395	103596588	103596491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	83563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	103678847	103679008	103678977	Y	NA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	1143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	103701783	103702159	103702029	Y	NA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	21632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	103793013	103793145	103793075	Y	MANBA,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	4878	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	106362976	106363368	106363172	Y	NA	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	29870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	106887801	106887968	106887883	Y	NPNT	NA	NA	NA	NA	NA	INTS12	72658	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	110361567	110361723	110361645	Y	NA	SEC24B,SEC24B-AS1	NA	NA	NA	NA	SEC24B-AS1	8594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	110469853	110470280	110470027	Y	SEC24B,CCDC109B	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	9081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	113201272	113201525	113201422	Y	TIFA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	3140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.96477863156259
chr4	119946666	119946843	119946767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOZ2	108096	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	120024463	120024846	120024696	Y	NA	MYOZ2	SYNPO2,USP53,MYOZ2	IMR90	Hi-C	24141950	MYOZ2	30093	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	122606332	122606884	122606598	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	9384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	122609803	122610189	122610094	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	6079	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	122610538	122611647	122611314	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	4621	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr4	123096398	123096477	123096437	Y	IL2	KIAA1109	NA	NA	NA	NA	KIAA1109	24910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	40966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	124709037	124709145	124709084	Y	SPRY1	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	393087	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	127487763	127488061	127487932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	1054365	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	128083998	128084288	128084127	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	458138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	129389693	129389923	129389761	Y	NA	NA	PHF17,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	177787	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	130505538	130505741	130505620	Y	C4orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	492774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	133872156	133872185	133872177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-9G1.3	196086	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	134077378	134077602	134077486	Y	NA	RP11-9G1.3,PCDH10	NA	NA	NA	NA	PCDH10	8908	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	141779541	141779551	141779546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	104267	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	144276815	144277022	144276900	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	20900	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	146725275	146725660	146725360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	132127	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	146726845	146727018	146726937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	130769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	675	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	148693975	148694157	148694066	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	42761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	149716435	149716631	149716533	Y	NA	NA	NR3C2	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP10	1065221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	151241204	151241585	151241396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	243778	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	151314417	151314500	151314459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	316991	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	SH3D19	NA	NA	NA	NA	SH3D19	18469	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	152582106	152582499	152582283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PET112	97676	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	152650918	152651090	152650938	Y	NA	PET112	NA	NA	NA	NA	PET112	29085	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	153190429	153190517	153190474	Y	NA	NA	FAM160A1,PET112,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXW7	264736	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	153461614	153461859	153461737	Y	NA	FBXW7	NA	NA	NA	NA	FBXW7	6361	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	153894415	153894544	153894479	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	38911	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	154360422	154360809	154360778	Y	MND1,KIAA0922	KIAA0922	MND1,TRIM2,KIAA0922	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0922	24689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR2	72171	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	154577062	154577591	154577315	Y	TLR2	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	43061	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr4	159456414	159456798	159456682	Y	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	ETFDH	134479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	160160934	160161439	160160999	Y	FNIP2,RAPGEF2	NA	FNIP2,RAPGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	FNIP2	472644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	162565757	162566134	162565946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL5	517053	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	164414222	164414415	164414319	Y	TKTL2,C4orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	150238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	164465601	164465786	164465694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	201617	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	164471489	164471679	164471583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	207505	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	612373	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	165882303	165882624	165882495	Y	CPE,C4orf39	RP11-366M4.2,NACA3P,TRIM61	NA	NA	NA	NA	TRIM61	14196	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	167356237	167356241	167356239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	1075891	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	168818156	168818524	168818473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60	419434	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	169559092	169559502	169559116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	169868186	169868202	169868194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	61224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	170096424	170096523	170096474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	93733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr4	170547481	170547627	170547562	Y	CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	15697	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	170934636	170934767	170934702	Y	NA	MFAP3L	NA	NA	NA	NA	MFAP3L	17415	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	174210504	174211007	174210885	Y	GALNT7	HMGB2	NA	NA	NA	NA	HMGB2	43269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	174435467	174435730	174435599	Y	HAND2	HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2	13650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	178229393	178229664	178229462	Y	NA	NEIL3	NA	NA	NA	NA	NEIL3	403	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	181844755	181844937	181844843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	1219465	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	183161464	183161792	183161628	Y	ODZ3	NA	ODZ3	IMR90	Hi-C	24141950	AC108142.1	97062	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	183897058	183897307	183897172	Y	NA	NA	WWC2,FAM92A3	IMR90	Hi-C	24141950	DCTD	59969	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	184150030	184150375	184150203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC2	131584	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr4	184270201	184270461	184270317	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	93283	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	184270914	184271169	184271084	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	92575	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	184751768	184752101	184751917	Y	NA	NA	ENPP6,STOX2,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC11	173348	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	185331149	185331516	185331503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	62218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	186306025	186306048	186306047	Y	NA	LRP2BP,ANKRD37,UFSP2,C4orf47	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	9005	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr4	187590427	187590811	187590747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	55065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr4	187597728	187597911	187597833	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	47965	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.92141583378296
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr4	187622574	187622751	187622592	Y	FAT1	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	23125	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr4	190936592	190936699	190936668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	76649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	208612	208991	208802	Y	PLEKHG4B	CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC127	7339	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr5	1106623	1107163	1106965	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	2987	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	1182870	1183091	1183042	Y	SLC6A19,SLC6A18	NA	LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	72720	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	2719879	2719902	2719892	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	30343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	3595085	3595457	3595281	Y	NA	IRX1	NA	NA	NA	NA	IRX1	917	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	5311411	5311643	5311527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	107134	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.33876095289482
chr5	6927514	6927543	6927527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	296058	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	9263136	9263299	9263224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA5A	280888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	9547741	9548115	9547963	Y	NA	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	3429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	10485180	10485474	10485337	Y	NA	ROPN1L,RPL30P7	NA	NA	NA	NA	RPL30P7	1458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	10551479	10551871	10551616	Y	NA	ANKRD33B	MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33B	10571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	10692588	10692818	10692805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	66566	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	11648258	11648305	11648298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	888874	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	13325974	13326290	13326142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH5	616362	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	14037561	14037744	14037653	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94909	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	14545472	14545570	14545529	Y	NA	FAM105A	FAM105A,TRIO	IMR90	Hi-C	24141950	FAM105A	34314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	14672104	14672643	14672283	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	9331	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	14809867	14810211	14810035	Y	FAM105A,FAM105B	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	13358	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	15917889	15917998	15917895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL7	419584	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	16740893	16741285	16741194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	125726	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	17252511	17253031	17252811	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	37355	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	1339298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	24595497	24595875	24595702	Y	CDH10	CDH10	NA	NA	NA	NA	CDH10	47212	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	24740161	24740327	24740244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	97074	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	1658354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1292603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	31511930	31511946	31511938	Y	NA	DROSHA,C5orf22	NA	NA	NA	NA	DROSHA	18357	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr5	32714238	32714628	32714433	Y	NPR3,NPR3	NPR3	NA	NA	NA	NA	NPR3	27062	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	33807297	33807469	33807384	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	82828	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	34500643	34500963	34500832	Y	NA	NA	TTC23L,RAI14,RAD1	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	153379	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	34715239	34715402	34715248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	60897	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	34856339	34856427	34856383	Y	NA	TTC23L	NA	NA	NA	NA	TTC23L	19401	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	35853494	35854024	35853833	Y	SPEF2,IL7R	IL7R	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	IL7R	2697	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	36229884	36229947	36229916	Y	UGT3A1,C5orf33,C5orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	79793	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	36614653	36614946	36614866	Y	LMBRD2,RANBP3L,SLC1A3,SLC1A3	SLC1A3	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	10196	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr5	36681914	36682309	36681923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	77457	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	36693190	36693464	36693394	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	88733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	38467529	38467846	38467689	Y	NA	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	1088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	38546436	38546759	38546707	Y	NA	MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	8904	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	38680372	38680698	38680535	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90	Hi-C	24141950	LIFR	73916	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	38846956	38846992	38846979	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	2996	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	38866844	38867106	38866976	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	22884	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	39395044	39395463	39395161	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	27507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	22952	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	39519768	39520016	39519839	Y	DAB2	NA	DAB2	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	59366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	31239	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	49719324	49719499	49719409	Y	PARP8	EMB	NA	NA	NA	NA	EMB	17583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	53522595	53522810	53522723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	81602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	54777886	54777973	54777929	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	50905	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	55463907	55464287	55464105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	174912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	55555067	55555385	55555210	Y	NA	NA	ANKRD55,IL6ST,MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	243514	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	55830072	55830234	55830153	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	31173	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr5	56468272	56468727	56468348	Y	MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1	GPBP1	NA	NA	NA	NA	GPBP1	497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	56738135	56738571	56738168	Y	ACTBL2	ACTBL2	PLK2,ACTBL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	38065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	56790461	56790772	56790742	Y	NA	ACTBL2	ACTBL2,PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	13825	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	57111915	57112364	57112128	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	335279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	58422372	58422713	58422580	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	668285	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	59056590	59056824	59056644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	759123	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	60921621	60921766	60921694	Y	C5orf64	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	235923	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	64062726	64062917	64062822	Y	NA	SREK1IP1	NA	NA	NA	NA	CWC27	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	64368719	64369105	64368844	Y	FAM159B	NA	ADAMTS6,CWC27	IMR90	Hi-C	24141950	CWC27	305962	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	65814686	65814967	65814740	Y	MAST4	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	380887	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.17345119111852
chr5	65878342	65878574	65878477	Y	MAST4	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	444543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	484447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	65932774	65933082	65932801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	498975	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	744769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr5	66510755	66511249	66511045	Y	NA	NA	MAST4,PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIK3R1	998299	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	66786490	66786676	66786582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	722872	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	182388	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	76926862	76927205	76927123	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	12426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	77147501	77147797	77147637	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	14807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	77810178	77810481	77810268	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	155839	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	78686873	78686981	78686927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	108132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	79405751	79406102	79405927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTX3	120669	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	80026504	80026674	80026589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	77702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	188596	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	82807080	82807411	82807109	Y	XRCC4,VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	41796	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	2654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	83545538	83546053	83545791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	132192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr5	83585889	83586179	83586107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	92066	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	83588624	83588917	83588807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	89328	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	83652187	83652571	83652379	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	25674	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	83670446	83670810	83670539	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	7435	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	8.34690238223704
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr5	83790350	83790680	83790547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDIL3	111739	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	86417910	86418259	86418047	Y	NA	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	143446	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	86610420	86610785	86610768	Y	NA	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	48715	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	88252267	88252500	88252370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM161B	688974	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	89647964	89647976	89647970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	55627	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	94843632	94843977	94843805	Y	NA	TTC37,ARSK	NA	NA	NA	NA	TTC37	44734	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	95294794	95295285	95294896	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	420	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	95298372	95298734	95298686	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	ELL2	2597	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	266966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	96159684	96160037	96159828	Y	CAST,CAST	ERAP1,ERAP2	CAST,RIOK2,ERAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERAP1	17881	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	106802102	106802350	106802226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	202246	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	106837531	106838094	106837969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	166502	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	73143	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr5	107555103	107555441	107555272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL17	160358	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	110830968	110831101	110831035	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	15187	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr5	111018976	111019194	111019085	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	172688	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	111110231	111110436	111110341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	263943	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	112054250	112054372	112054293	Y	NA	APC	NA	NA	NA	NA	APC	13055	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	112509140	112509432	112509369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	198741	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	112602603	112602927	112602766	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	219600	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	112611486	112611688	112611586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	210839	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	112825129	112825430	112825300	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	MCC	2602	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	114027885	114027977	114027931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN2	333243	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	118165526	118165828	118165677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	141663	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	118747776	118748171	118748023	Y	NA	HSD17B4	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	37967	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	122181959	122182300	122182177	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	4825	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	84939	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	125730040	125730374	125730276	Y	C5orf48,ALDH7A1,GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	36216	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	126217588	126217612	126217598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	107273	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	127849179	127849476	127849294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN2	143402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	130730635	130730890	130730763	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	151449	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	131560740	131561286	131561173	Y	IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2	PDLIM4	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	30078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	C5orf56	30507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr5	133330374	133330645	133330542	Y	NA	C5orf15,VDAC1	C5orf15	IMR90	Hi-C	24141950	VDAC1	8179	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	133460352	133460406	133460379	Y	UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	11950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	PITX1	107098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	135097584	135097864	135097724	Y	NA	NA	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL14	184615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	136104885	136104913	136104899	Y	NA	NA	SPOCK1	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD5	638351	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	137237773	137238021	137237897	Y	WNT8A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	147629	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	182646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	138436608	138436808	138436708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	170633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	138838499	138838633	138838566	Y	TMEM173	ECSCR,TMEM173	NA	NA	NA	NA	ECSCR	1695	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	138851930	138852095	138852011	Y	NA	ECSCR,TMEM173	NA	NA	NA	NA	TMEM173	8425	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	139015811	139016118	139015905	Y	MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	8766	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	139598972	139599011	139598993	Y	ANKHD1	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	81695	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	139677985	139678148	139678067	Y	NA	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	2558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	22059	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	142406567	142406756	142406640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	258618	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	142642050	142642362	142642163	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	67808	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	142930383	142930535	142930459	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	117306	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	145094622	145094634	145094628	Y	GRXCR2	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	118298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	145455339	145455700	145455520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	104523	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	146783633	146784144	146783972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	103475	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	148292484	148292904	148292843	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	88328	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	148832906	148833066	148832986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	95941	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	148836415	148836621	148836572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	92386	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	148839357	148839440	148839397	Y	CSNK1A1	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	89567	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr5	149522462	149523132	149522666	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	10303	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	149660183	149660270	149660234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSI	56600	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	149696810	149697163	149696894	Y	SYNPO,PDGFRB	ARSI,TCOF1	SLC6A7,TCOF1,HMGXB3,CSF1R,CD74,PPARGC1B,PDGFRB,CDX1,ARSI,CAMK2A,RPS14,NDST1,TIGD6	IMR90	Hi-C	24141950	ARSI	19707	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	149853688	149853975	149853788	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	9406	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	149985154	149985492	149985203	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	6512	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	151108065	151108456	151108379	Y	NA	SPARC,RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	35483	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	153807428	153807565	153807497	Y	NA	SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L	15952	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	153855980	153856061	153856023	Y	HAND1	SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L	32463	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1	126930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	156476668	156477024	156476779	Y	HAVCR1,HAVCR1	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	90856	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	156503614	156503701	156503659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	64179	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	157030326	157030804	157030600	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM19	29543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	158438022	158438330	158438136	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	86439	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	28531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	158854760	158855055	158854852	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	166671	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	158876999	158877252	158877089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	188910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr5	158878372	158878607	158878465	Y	RNF145,RNF145,IL12B	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	190283	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PWWP2A	47677	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	159637065	159637397	159637293	Y	FABP6	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	45863	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	159896720	159897088	159896809	Y	NA	PTTG1	NA	NA	NA	NA	PTTG1	49891	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	589726	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	491436	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	167716783	167717259	167717053	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	127	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	167744761	167745078	167744891	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	28105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	168229147	168229460	168229328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	187830	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	168232470	168232861	168232812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	191153	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	168302839	168303219	168303163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	261522	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	168527289	168527410	168527350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT3	198723	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	168588352	168588495	168588423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT3	137638	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	171540284	171540310	171540295	Y	STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	73080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	171605314	171605550	171605494	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	7840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.67752190578963
chr5	171605811	171606325	171606156	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	7065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	171702162	171702431	171702281	Y	DUSP1,UBTD2,STK10	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	6644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	172313877	172314602	172314167	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	54599	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	172314817	172315056	172314937	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	55539	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.33876095289482
chr5	172328085	172328386	172328247	Y	DUSP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	55346	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr5	172463160	172463425	172463226	Y	NA	NA	C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V0E1	54400	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	172710965	172711353	172711102	Y	NA	STC2	ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	STC2	43153	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	172729503	172729731	172729610	Y	NA	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	24775	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	172730964	172731211	172731128	Y	NA	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	23295	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	NA	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	121529	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	119633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	173251298	173251668	173251379	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	61615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	173252274	173252478	173252451	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	60805	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr5	174194382	174194672	174194467	Y	NA	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	44846	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	178692524	178692976	178692825	Y	ADAMTS2	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	77455	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,LTC4S,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	LTC4S	12573	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	179894931	179895217	179894999	Y	NA	CTC-573N18.1,CNOT6	GFPT2,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT6	24195	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	180285670	180285966	180285744	Y	NA	MGAT1,LINC00847,ZFP62	NA	NA	NA	NA	ZFP62	320	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	2726588	2726793	2726728	Y	SERPINB9,SERPINB1,RIPK1,NQO2	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	36855	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	3797931	3798162	3798051	Y	NA	PXDC1,FAM50B	SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	47671	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.92141583378296
chr6	4613428	4613746	4613742	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	90647	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	5206171	5206360	5206265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	52812	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	5994378	5994644	5994564	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	735101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	6483548	6483940	6483744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	621890	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	9037386	9037741	9037564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	603592	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	9503675	9503928	9503802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	913964	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	10355646	10355875	10355765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	62017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	10587786	10588136	10587948	Y	TMEM14B,GCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	104792	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	10970926	10971179	10971053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	71368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	ERVFRD-1	NA	NA	NA	NA	ERVFRD-1	34082	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	11414898	11415336	11414989	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NEDD9,C6orf228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	34317	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	11772710	11773287	11772940	Y	NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	233708	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	12287477	12287842	12287503	Y	NA	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	754	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	12965020	12965354	12965088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	246934	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr6	13009334	13009508	13009424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	202780	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	13184302	13184661	13184471	Y	NA	RNU1-11P	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	27627	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	13261916	13262190	13262091	Y	RANBP9,GFOD1,GFOD1,TBC1D7	RNU1-11P	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	49628	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	13597663	13598060	13597862	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	15499	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	14556348	14556398	14556373	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	440476	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	15541251	15541598	15541282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119691	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	16694939	16695287	16695185	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	64435	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	16724246	16724395	16724344	Y	ATXN1	ATXN1	NA	NA	NA	NA	ATXN1	35327	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	17015732	17016108	17015919	Y	FLJ23152	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	256010	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	17033300	17033417	17033356	Y	RBM24	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	273578	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr6	17712711	17712926	17712817	Y	NA	NUP153	FAM8A1,NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	8055	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	19147287	19147423	19147355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	655560	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr6	19819390	19819399	19819395	Y	NA	RP4-625H18.2,ID4	ID4	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID4	16218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	21987708	21987959	21987863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	395736	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	22222867	22222924	22222901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	630895	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	24743891	24744276	24743998	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24827	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	24799813	24800204	24799968	Y	DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1	GMNN	NA	NA	NA	NA	GMNN	26654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	24981053	24981388	24981201	Y	NA	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	6406	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	25006784	25007291	25007025	Y	TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	32137	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	25007534	25007864	25007632	Y	TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	32887	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	25009821	25010191	25010012	Y	NA	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	35174	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	12.3116810137996
chr6	25034556	25034972	25034914	Y	C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	59909	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	25043414	25043566	25043497	Y	TDP2,C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	68767	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	25050592	25050945	25050684	Y	C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	75945	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr6	25137169	25137503	25137225	Y	C6orf62	CMAHP	NA	NA	NA	NA	CMAHP	27290	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	25177828	25178052	25177914	Y	C6orf62	CMAHP	CMAHP,FAM65B,LRRC16A	IMR90	Hi-C	24141950	CMAHP	13035	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	26034352	26034599	26034546	Y	NA	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AB	2556	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	26223563	26223671	26223616	Y	NA	HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H3E	180	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	26232920	26233434	26233137	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H2AH	32868	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	27261332	27261668	27261500	Y	FKSG83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	75636	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.13008839333889
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND3	128816	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	28885422	28885544	28885424	Y	NA	HCG14,TRIM27	NA	NA	NA	NA	TRIM27	4222	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	30448319	30448624	30448479	Y	NA	RANP1,HLA-E	MRPS18B,PPP1R10	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RANP1	3093	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	3.75610607200667
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	30497672	30498068	30497880	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PBMUCL1,PPP1R10,ATAT1,ATAT1	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	24595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	30811913	30812084	30812025	Y	NA	DDR1	FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	30114	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	TNXB,ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	TNXB	30076	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	32075999	32076179	32076125	Y	LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2	NA	NA	NA	NA	TNXB	4932	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	32789030	32789171	32789101	Y	HSD17B8,PSMB8	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	15386	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1	NA	NA	NA	NA	BRD2-IT1	20028	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	33602402	33602476	33602439	Y	NA	ITPR3	IP6K3	IMR90	Hi-C	24141950	ITPR3	16260	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr6	33712309	33712484	33712432	Y	IP6K3	IP6K3,LEMD2	NA	NA	NA	NA	IP6K3	278	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	180229	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	35453228	35453566	35453395	Y	NA	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	9287	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	36204828	36205160	36205000	Y	BRPF3,SRSF3,PXT1,KCTD20,CDKN1A,CDKN1A	BRPF3	NA	NA	NA	NA	BRPF3	42307	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	36214394	36214548	36214454	Y	SRPK1,MAPK14,BRPF3,STK38,PXT1,KCTD20	NA	NA	NA	NA	NA	BRPF3	51873	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	36318512	36318897	36318687	Y	CPNE5	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD20	89647	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	36802429	36803020	36802653	Y	PI16,CPNE5	CPNE5,C6orf89,PPIL1	NA	NA	NA	NA	CPNE5	2758	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	37067331	37067581	37067437	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	68398	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	37095912	37096089	37096014	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	39890	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	37104071	37104158	37104105	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	31821	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	37210217	37210497	37210343	Y	TMEM217,TMEM217	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	13051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	38185251	38185625	38185371	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	399976	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	39195802	39196179	39195967	Y	KCNK5	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	576	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	39850347	39850811	39850571	Y	NA	MOCS1	NA	NA	NA	NA	MOCS1	49479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73071	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	41512989	41513289	41513139	Y	NA	FOXP4	NA	NA	NA	NA	FOXP4	825	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	41528607	41528881	41528714	Y	TAF8,CCND3,NFYA,TFEB	FOXP4	NA	NA	NA	NA	FOXP4	16443	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	41686086	41686432	41686391	Y	NA	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	15565	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	41698347	41698506	41698456	Y	TFEB	TFEB,PRICKLE4	NA	NA	NA	NA	TFEB	3491	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	41906927	41907077	41907010	Y	CCND3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20001	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr6	42694331	42694739	42694439	Y	KLC4,KLC4,CUL9,TRERF1,C6orf226,PRPH2,TBCC	ATP6V0CP3,TBCC	NA	NA	NA	NA	ATP6V0CP3	1359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	43505816	43505905	43505861	Y	ABCC10,TJAP1	POLR1C,LRRC73,YIPF3,XPO5,POLH	NA	NA	NA	NA	YIPF3	23088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	82898	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	47978	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	44634916	44635472	44635214	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	281654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	45919439	45919785	45919549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP4	175945	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	52261634	52261809	52261784	Y	EFHC1	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	21297	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	52376478	52376751	52376615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62962	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	52416321	52416567	52416441	Y	NA	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	23146	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	52972904	52973327	52973040	Y	NA	ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	48304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	53174339	53174666	53174484	Y	FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	37281	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	53838542	53838554	53838548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	181247	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	56239637	56240034	56239826	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	577392	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	520858	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	273520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	56779787	56780031	56779873	Y	NA	DST,BEND6	BAG2,ZNF451,BEND6,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	DST	37395	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	57004936	57005232	57005084	Y	NA	BAG2	NA	NA	NA	NA	BAG2	29892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	57396616	57396964	57396757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	219013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	57408924	57409255	57409252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	231321	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	64299850	64300199	64300025	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	43526	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	64813713	64813775	64813744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	469988	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	65390704	65390953	65390803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	1046979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	69896068	69896326	69896076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	608677	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	71906987	71907342	71907159	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30A	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	89164	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	72051718	72051897	72051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	55212	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	72056766	72057142	72057043	Y	OGFRL1	NA	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR30A	54182	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	72103028	72103231	72103130	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	8093	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	72114373	72114910	72114587	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	3049	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	72233830	72234188	72234009	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	58236	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	74194767	74195136	74194952	Y	NA	MB21D1,MTO1,EEF1A1,RP11-505P4.5	NA	NA	NA	NA	MTO1	25466	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-505P4.5	60647	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	79718228	79718616	79718429	Y	PHIP	NA	NA	NA	NA	NA	PHIP	67337	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr6	84931248	84931348	84931298	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	4005	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	85484169	85484410	85484331	Y	NA	TBX18	TBX18	IMR90	Hi-C	24141950	TBX18	11932	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	85484432	85484730	85484624	Y	TBX18	TBX18	TBX18	IMR90	Hi-C	24141950	TBX18	12195	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	87433521	87433927	87433716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1P1	396479	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.38212375067445
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	89744998	89746016	89745827	Y	UBE2J1,PNRC1	PNRC1	PNRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PNRC1	42454	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	90681456	90681705	90681582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	143843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	90774597	90775020	90774993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	229607	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	90818937	90819075	90819003	Y	BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	185552	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	100012296	100012415	100012356	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	2434	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	106357126	106357152	106357139	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG5	414514	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	107621791	107622175	107621983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS2	156593	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	109011028	109011405	109011217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	131990	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	109558807	109559007	109558956	Y	SMPD2,MICAL1,CD164	NA	CD164,CCDC162P	K562	ChIA-PET	22265404	CD164	142755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	110418117	110418342	110418281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF1	80865	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	112078631	112078983	112078811	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	113672	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	112112583	112112889	112112849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	79766	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	112145008	112145393	112145362	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	47262	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	112170510	112170904	112170903	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	21751	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	112173257	112173622	112173448	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	19033	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	112294288	112295069	112294499	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN	NA	FYN,TRAF3IP2,TRAF3IP2-AS1,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	FYN	101633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	113505450	113505765	113505678	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS,HDAC2	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	670776	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	116707738	116708095	116707832	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL1	108672	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	116708579	116708861	116708730	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL1	109513	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	116731952	116732286	116732048	Y	DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26E	98523	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	116767554	116767785	116767590	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26E	63024	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	116778152	116778369	116778268	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26E	52440	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	121530032	121530291	121530288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	224547	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	122016612	122016787	122016747	Y	NA	NA	GJA1	IMR90	Hi-C	24141950	GJA1	261774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	125205098	125205436	125205268	Y	NA	NA	HEY2,RNF217,TPD52L1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF217	76255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	125426714	125426967	125426959	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	11228	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	125523153	125523251	125523202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	84958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	126267356	126267782	126267584	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	8145	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	128577381	128577403	128577392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	262467	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	128675135	128675339	128675237	Y	PTPRK,PTPRK	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	164531	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	129994496	129994751	129994657	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	34619	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	130922387	130922557	130922422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	237508	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	133383318	133383532	133383367	Y	EYA4	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	176204	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	135044677	135044952	135044807	Y	NA	NA	SGK1,ALDH8A1,LOC154092	IMR90	Hi-C	24141950	HBS1L	377242	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	137060855	137061112	137060984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K5	50544	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	137242009	137242335	137242164	Y	IL20RA,SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	100292	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	137558937	137559207	137559098	Y	NA	IFNGR1	IFNGR1,OLIG3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IFNGR1	20351	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	138019778	138020625	138020405	Y	IFNGR1,TNFAIP3	NA	TNFAIP3,IFNGR1,PERP	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	165726	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	138085431	138085825	138085756	Y	NA	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	100526	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	138131793	138132158	138131947	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	54193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	138194322	138194912	138194642	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	7971	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	139656661	139656994	139656829	Y	NA	CITED2	ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	36763	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	140069895	140070090	140070024	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	376138	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	140400470	140400745	140400517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	706713	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	141300848	141301178	141301014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1165189	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	142698366	142698689	142698587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR126	77375	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	143130260	143130659	143130530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	133679	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	143174967	143175237	143175142	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	89101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	143234166	143234456	143234293	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29882	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	143994840	143994998	143994919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	138858	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	144015519	144015660	144015590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	146821	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	144474457	144475387	144474631	Y	PLAGL1,STX11	STX11	NA	NA	NA	NA	STX11	4794	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	144479850	144480240	144479875	Y	NA	STX11	NA	NA	NA	NA	STX11	10187	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	NA	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	STX11	67650	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	144585551	144585700	144585606	Y	NA	NA	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	STX11	115888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	144587251	144587368	144587331	Y	NA	NA	UTRN,STX11	IMR90	Hi-C	24141950	STX11	117588	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	144931961	144932452	144932213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX11	462298	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	145131744	145132215	145131879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX11	662081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	145147432	145147802	145147573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX11	677769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	146867560	146867942	146867733	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	4731	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	147831138	147831275	147831225	Y	SAMD5	SAMD5	NA	NA	NA	NA	SAMD5	3075	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	148651197	148651450	148651307	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	59757	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	149382626	149382831	149382713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	154946	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	150286198	150286452	150286311	Y	ULBP1	RAET1G,ULBP2,ULBP1	NA	NA	NA	NA	ULBP1	3055	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	151178145	151178545	151178467	Y	MTHFD1L	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	6140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	151366985	151367228	151367157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	51437	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	152064394	152064417	152064406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	292972	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	152606341	152606739	152606594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	350197	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	10.0162828586844
chr6	154858221	154858762	154858474	Y	CNKSR3	CNKSR3,RPS4XP8	IPCEF1,OPRM1,CNKSR3	IMR90	Hi-C	24141950	CNKSR3	28428	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	155181312	155181660	155181451	Y	TIAM2,TIAM2	TIAM2	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	TIAM2	29481	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr6	157297453	157297730	157297519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	200390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	157609644	157610034	157609839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	132599	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	157726321	157726550	157726459	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	16083	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	159171374	159171393	159171384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	67051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr6	159284894	159285253	159285074	Y	NA	EZR,C6orf99	OSTCP1	K562	ChIA-PET	22265404	C6orf99	3718	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	159434370	159434675	159434475	Y	TAGAP	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	15151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	160137124	160138386	160137829	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	6231	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	163098494	163098513	163098505	Y	PARK2,PACRG,PACRG	PARK2	NA	NA	NA	NA	PARK2	48290	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr6	163972161	163972427	163972234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	139129	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	164758879	164759308	164759212	Y	NA	NA	PARK2,DKFZp451B082,PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	925847	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	166470192	166470586	166470296	Y	NA	NA	LINC00473,LOC441177	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00473	70656	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	166998471	166998754	166998610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	244392	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	167395299	167395692	167395496	Y	NA	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	RP1-167A14.2	14861	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.50407071467111
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	131259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	169278156	169278506	169278379	Y	NA	NA	WDR27,LINC00574	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	373633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	169473606	169473776	169473633	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	178363	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	169568038	169568505	169568172	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	83634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr6	169569548	169569688	169569622	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	82451	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr6	169572627	169572772	169572742	Y	NA	NA	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	79367	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	169573934	169574190	169574061	Y	NA	NA	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	77949	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	169827902	169828288	169828095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS2	175763	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr6	170449336	170449548	170449442	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	148013	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	11.26831821602
chr7	949099	949177	949151	Y	ZFAND2A,ADAP1	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	34910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	1013884	1014155	1013955	Y	NA	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	2362962	2363263	2363259	Y	AMZ1	EIF3B,SNX8	KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B	IMR90	Hi-C	24141950	EIF3B	28458	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	3568098	3568478	3568121	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	486519	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	4755132	4755354	4755253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	73744	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	5419074	5419498	5419154	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	43547	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5452779	5453024	5452968	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	10021	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	TNRC18	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC18	8623	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	5733977	5734150	5734061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	85220	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	8168743	8169144	8168949	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	130719	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	16886935	16887473	16887050	Y	NA	AGR2	NA	NA	NA	NA	AGR2	15878	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	158534	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	17082630	17082968	17082726	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	211573	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	19017733	19017917	19017790	Y	TWIST1	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	137378	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	19146147	19146774	19146493	Y	FERD3L,TWIST1	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	8521	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	20059372	20059444	20059408	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	19026	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	20160280	20160875	20160444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	119934	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	20414219	20414454	20414223	Y	NA	ITGB8	NA	NA	NA	NA	ITGB8	45894	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	20993749	20993911	20993806	Y	SP8	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	471741	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	102218	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	23853769	23853785	23853777	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	AC006026.13	135364	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	24772828	24773057	24772934	Y	DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	34187	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53333	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	26317891	26318244	26318068	Y	NA	AC010677.5,SNX10	HNRNPA2B1,CBX3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC010677.5	4076	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	27143635	27143783	27143725	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	1613	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	27386345	27386573	27386562	Y	NA	AC004009.3	NA	NA	NA	NA	AC004009.3	12889	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	98953	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	140769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr7	28243549	28243770	28243627	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	25187	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	29288404	29288769	29288539	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	55337	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	29534563	29534631	29534599	Y	WIPF3	NA	NA	NA	NA	NA	AC007255.8	66655	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	31923409	31923701	31923603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	609194	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	32133021	32133498	32133272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	399397	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	33708733	33708947	33708840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP9	561720	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	RP9	615217	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	34394594	34394965	34394781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	828969	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	35629037	35629048	35629043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	104133	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	35730076	35730471	35730274	Y	SEPT7,EEPD1,HERPUD2	HERPUD2,AC018647.3	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	2710	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	40952368	40952631	40952468	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	788075	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	42954351	42954549	42954430	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	C7orf25	K562	ChIA-PET	22265404	C7orf25	4447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	43625905	43626316	43625996	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	5548	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	43626451	43626626	43626528	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	6094	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	44658456	44658730	44658526	Y	PURB,TMED4,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	14285	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	44775082	44775384	44775244	Y	OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2	ZMIZ2	DDX56,TMED4,OGDH,PPIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ2	10796	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	44855333	44855416	44855373	Y	TBRG4,H2AFV	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	21054	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	46691155	46691159	46691157	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	731682	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	46691314	46691685	46691473	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	731841	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	98063	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	47604317	47604552	47604435	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	15604	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	190582	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	50769181	50769534	50769358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89625	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	51417920	51418197	51418059	Y	NA	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	35405	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	56173322	56173423	56173410	Y	NA	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1053	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	71255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	57471842	57471971	57471867	Y	NA	ZNF716	NA	NA	NA	NA	ZNF716	35912	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	69409562	69409698	69409630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	347657	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	72756043	72756175	72756109	Y	TYW1B,BCL7B	NSUN5	NA	NA	NA	NA	NSUN5	35179	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	76052692	76053023	76052931	Y	NA	ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	27857	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	77316787	77316835	77316811	Y	NA	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L-AS1	6747	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	77910166	77910185	77910178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	484044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	79776985	79777288	79777110	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	15714	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr7	79803492	79803786	79803598	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	42221	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	80337478	80337851	80337650	Y	NA	NA	SEMA3C	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	211824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	80355972	80356402	80356123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	193273	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	80441834	80442054	80441993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	107621	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	80488123	80488172	80488148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	61503	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	80886424	80886607	80886516	Y	NA	NA	SEMA3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA3C	336749	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	81233474	81233832	81233648	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	HGF	163922	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	81234008	81234151	81234026	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	HGF	163603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.71274327422704
chr7	81234371	81234711	81234707	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	HGF	163043	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	81247788	81247966	81247912	Y	NA	NA	HGF	IMR90	Hi-C	24141950	HGF	149788	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	81851268	81851277	81851273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	219837	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	82071570	82071737	82071656	Y	NA	CACNA2D1	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	90236421	90236455	90236438	Y	NA	AC002456.2	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	AC002456.2	11754	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	90637974	90638276	90638003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	253507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	90861359	90861732	90861539	Y	NA	FZD1	NA	NA	NA	NA	FZD1	30051	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	91142488	91142502	91142497	Y	MTERF	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	250705	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	92261439	92261837	92261823	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43731	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr7	92361219	92361296	92361260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	102501	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	92382003	92382200	92382102	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	81597	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	92412911	92413100	92413006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	50697	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	92437286	92437617	92437517	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	26180	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	92439060	92439368	92439205	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	24429	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	TFPI2,GNG11	NA	NA	NA	NA	TFPI2	6637	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	94280099	94280356	94280228	Y	NA	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	SGCE	3165	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	98724585	98724789	98724635	Y	ZNF394,SMURF1	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	14934	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	99678619	99678725	99678657	Y	NA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	ZNF3	448	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	99785086	99785350	99785241	Y	ZKSCAN1,MCM7,GATS	C7orf43,GPC2	NA	NA	NA	NA	GPC2	12091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	99962576	99962959	99962740	Y	MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	25045	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	99966641	99967146	99966944	Y	C7orf59,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	29110	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	100143295	100143664	100143516	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	8461	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	6.26017678667778
chr7	100144720	100144853	100144769	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9886	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr7	101062164	101062286	101062177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	99060	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	101566593	101566799	101566736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	109634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	101613260	101613283	101613272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	156301	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	101784419	101784868	101784539	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	217451	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	104395583	104395928	104395756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	255563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	104608110	104608364	104608281	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	43127	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	104857177	104857523	104857432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	180232	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	105602769	105602970	105602871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	87719	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	109666174	109666248	109666211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC003088.1	506563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	111156714	111156954	111156834	Y	NA	IMMP2L	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	43619	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	111455220	111455605	111455549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	254647	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	111885477	111885635	111885572	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	ZNF277	40834	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFRD1	88745	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	477184	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	114637628	114638014	114637704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	77419	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	115957025	115957120	115957073	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31591	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	116083167	116083483	116083344	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	TES,CAV2,CAV1,MET	IMR90,MCF7,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	CAV1	79356	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	120638134	120638217	120638176	Y	NA	ING3	NA	NA	NA	NA	ING3	49331	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	121783025	121783385	121783205	Y	PTPRZ1,AASS	AASS	NA	NA	NA	NA	AASS	691	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	126214480	126214602	126214539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	855376	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	127455662	127455822	127455742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SND1	165428	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	127665265	127665386	127665326	Y	NA	LRRC4	NA	NA	NA	NA	LRRC4	4774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	128473793	128474194	128473994	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	5362	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	128500948	128501348	128501123	Y	NA	FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	68	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	129014301	129014725	129014533	Y	AHCYL2,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	33486	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr7	129421490	129421976	129421792	Y	FAM40B	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	168813	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	130735932	130736596	130736429	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	56259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	130756735	130757090	130757043	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	MKLN1	35765	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	131581821	131581890	131581855	Y	NA	NA	PLXNA4	IMR90	Hi-C	24141950	PODXL	340845	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	411440	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	132441115	132441141	132441128	Y	NA	NA	FLJ40288	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA4	109668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	133431716	133432104	133431827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGUK	377948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	134475089	134475514	134475151	Y	CALD1	CALD1	NA	NA	NA	NA	CALD1	48086	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	134521262	134521714	134521389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	94259	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	134571220	134571518	134571300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	97741	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	134836004	134836265	134836096	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49	NA	NA	NA	NA	TMEM140	5180	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	11846	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	111553	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	137671053	137671416	137671301	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	13397	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	137928273	137928746	137928445	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.2	52483	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	138250447	138250496	138250473	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	107368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	138403353	138403545	138403448	Y	ZC3HAV1	AC020983.5	NA	NA	NA	NA	AC020983.5	31628	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	138755461	138755819	138755643	Y	SVOPL,ZC3HAV1	ZC3HAV1L,ZC3HAV1	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	36646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	140497709	140498045	140497887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB2	109132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	141285767	141286195	141285861	Y	TAS2R38,AGK	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	36778	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	144539515	144539760	144539575	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPK1	8027	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	144539832	144539937	144539881	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TPK1	8344	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	147109889	147110169	147110008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	1165324	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	149112304	149112563	149112312	Y	ZNF862	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF746	80345	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	149266694	149267035	149266833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF767	52808	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr7	151182414	151182755	151182660	Y	AGAP3,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	32451	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr7	151282868	151283053	151282986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	67662	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	151458371	151458727	151458520	Y	SMARCD3,SMARCD3,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	113483	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	151806252	151806472	151806362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	85493	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	151823102	151823484	151823293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	102343	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	25886	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	152365221	152365384	152365303	Y	MLL3	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	5866	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	155019709	155020044	155019877	Y	NA	NA	INSIG1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG1	67442	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009403.2	144484	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	157070019	157070314	157070105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	55761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	157131379	157131690	157131421	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	5304	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr7	157334866	157335140	157335002	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	208791	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	157840945	157841296	157841083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	654224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	270529	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	981095	981315	981205	Y	NA	NA	ZNF596	IMR90	Hi-C	24141950	ERICH1	294989	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	1386881	1387011	1386929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLN8	314933	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	1845111	1845463	1845298	Y	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	74581	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	1886265	1886735	1886461	Y	NA	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	33309	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	1897074	1897760	1897667	Y	NA	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	22284	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	2263330	2263439	2263406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	343286	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	8935191	8935379	8935249	Y	NA	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	71705	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	10079596	10079605	10079601	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	169818	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	12894442	12894833	12894561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1456	93291	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	16554450	16554835	16554744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	456703	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	16609902	16609923	16609912	Y	VPS37A	NA	TUSC3,MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	401615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	16629867	16630175	16630011	Y	ZDHHC2	NA	TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	381363	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	18127015	18127037	18127026	Y	NA	NA	PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	NAT1	101029	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	19591741	19592019	19591880	Y	NA	CSGALNACT1	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	21521	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	20064190	20064507	20064297	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	11312	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	22103553	22103662	22103605	Y	NA	MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	POLR3D	2936	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	22441359	22441704	22441532	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	7567	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	23016406	23016568	23016458	Y	ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	2975	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	23038375	23038737	23038576	Y	ENTPD4,ENTPD4,TNFRSF10D	TNFRSF10D,TNFRSF10A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	18832	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	23390028	23390384	23390041	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	5710	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	23401814	23402175	23401976	Y	TNFRSF10B	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	17496	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	23832365	23832575	23832443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-148P	100096	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	240520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	25092167	25092564	25092364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	51929	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	25096912	25097126	25097024	Y	DOCK5	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	56674	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	25306430	25306773	25306665	Y	NA	GNRH1,KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	KCTD9	7219	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	27200806	27201031	27200919	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	33807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	27209291	27209793	27209526	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	42292	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	27236352	27236561	27236406	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	69353	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	27494025	27494256	27494186	Y	STMN4,CHRNA2,CLU	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	4640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	28193434	28193777	28193606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF395	64441	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	8636	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	28569820	28569970	28569874	Y	ZNF395,FZD3,EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	12839	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	80225	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	29630716	29630847	29630782	Y	NA	NA	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	307876	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	30363851	30364149	30364000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS	123907	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	35270986	35270995	35270991	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	110286	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.92141583378296
chr8	36488969	36489000	36488983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF703	1062269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	37754518	37754975	37754800	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	10	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	37755287	37755548	37755453	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	302	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	37939512	37939733	37939625	Y	NA	ASH2L	ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASH2L	21027	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	38217250	38217535	38217393	Y	NA	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	20255	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2,HTRA4	NA	NA	NA	NA	HTRA4	34241	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	HTRA4,TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr8	38862169	38862388	38862283	Y	NA	HTRA4,TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	9781	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	39800131	39800493	39800357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM9	947743	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	43228534	43228608	43228571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	234978	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	48265617	48265884	48265750	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191124	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	224269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	48513197	48513620	48513373	Y	KIAA0146,CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	136028	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	48814148	48814416	48814291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	56327	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	49282720	49283033	49282877	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	12117	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	49430601	49430974	49430806	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	135451	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	54636276	54636450	54636366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	117668	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	54658367	54658716	54658684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	95402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	57122742	57122884	57122813	Y	NA	CHCHD7	NA	NA	NA	NA	CHCHD7	497	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	57389900	57390701	57390447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00968	79681	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	59476129	59476409	59476167	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	12646	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	59497301	59497891	59497607	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	33818	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	60136019	60136081	60136050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	106420	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	61825257	61825601	61825298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	235920	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	13095	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	67419818	67420060	67419977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	79398	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	67424340	67424761	67424541	Y	C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	83920	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	704433	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	69834272	69834684	69834491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	542175	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	334080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	70397333	70397695	70397418	Y	NA	SULF1	NA	NA	NA	NA	SULF1	20474	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	71031909	71031920	71031915	Y	NA	RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	17495	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	72922675	72922996	72922837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	62856	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	74002939	74003272	74003106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	83840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	74371877	74372089	74371987	Y	RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7	165853	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	74453012	74453349	74453181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAU2	204594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	75179617	75179845	75179716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP1	51520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	77729936	77730258	77730097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4-AS1	136423	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	77731385	77731402	77731393	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4-AS1	137872	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	82738373	82738533	82738453	Y	NA	SNX16	NA	NA	NA	NA	SNX16	14568	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE3	178901	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	89352633	89352940	89352786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AF121898.3	586687	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	91944929	91945085	91945007	Y	NECAB1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM55A	106207	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	92128196	92128480	92128215	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	47772	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	95132318	95132456	95132369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1247B1.1	80824	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	96858613	96858793	96858703	Y	NA	NA	LOC100616530	IMR90	Hi-C	24141950	GDF6	312227	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	96960626	96960710	96960668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDF6	210310	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	97136855	97137003	97136873	Y	NA	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	34017	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	97171094	97171453	97171221	Y	GDF6	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	74	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	97410655	97411012	97410831	Y	NA	NA	CPQ,TSPYL5,PTDSS1	IMR90	Hi-C	24141950	SDC2	92567	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	98045362	98045723	98045714	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	541783	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	99478821	99479039	99478921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	174200	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	100461450	100461455	100461453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13B	437956	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	101455424	101455703	101455525	Y	PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	108978	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	101773934	101774280	101774106	Y	NA	PABPC1	SNX31,PABPC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	40897	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	43224	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	102467254	102467614	102467418	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	250833	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	103109473	103109686	103109489	Y	UBR5,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	139660	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	103740665	103741062	103740742	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	74535	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	103741796	103742226	103742065	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	75666	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	103806867	103807011	103806958	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	67517	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	105523001	105523289	105523222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	75963	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	106411260	106411358	106411309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	82340	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	106511726	106511821	106511774	Y	ZFPM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	182806	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	106582164	106582354	106582260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	253244	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	108235435	108235863	108235712	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	527194	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	110288477	110288741	110288621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	55812	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	114445563	114445724	114445576	Y	CSMD3	CSMD3	NA	NA	NA	NA	CSMD3	1604	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	117461627	117461841	117461690	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	314901	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	117476077	117476257	117476175	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	300485	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	119023512	119024035	119023740	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	98057	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	119071597	119071694	119071650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	50398	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	119485123	119485454	119485409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	146780	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	119518110	119518355	119518233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	113879	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	119788546	119788868	119788707	Y	NA	NA	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	SAMD12	156312	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	123811167	123811696	123811506	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	19534	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	123953901	123954018	123953907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	98645	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	124407044	124407322	124407183	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	19268	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	124816728	124816894	124816751	Y	NA	FAM91A1	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	38032	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	125878645	125879203	125878949	Y	RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196	NA	MTSS1,NDUFB9,TATDN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF572	104337	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	126354343	126354802	126354718	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	85761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	126614927	126615093	126614982	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	174364	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	127386877	127387004	127386941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	181116	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	127387635	127388005	127387836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	180115	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	127435997	127436299	127436226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	131821	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	128239593	128240207	128240123	Y	NA	NA	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	505473	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	128260594	128261000	128260832	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	484680	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	128888912	128889201	128889088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	84133	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	129062971	129063389	129063062	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	42114	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	129129719	129130040	129129840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	108862	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	129180743	129180870	129180780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	159886	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	129205979	129206284	129206246	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	185122	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	129336748	129337038	129336807	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	315891	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	129348203	129348321	129348262	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	327346	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	129351022	129351309	129351127	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	330165	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	129981605	129981909	129981758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	960748	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	130222982	130222992	130222987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	804383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	131259857	131260132	131260043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	193774	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	131260848	131261137	131260957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	192769	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	133318227	133318435	133318380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	367403	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	133490941	133491318	133491130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	194520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	133508104	133508400	133508366	Y	NA	NA	KCNQ3,LRRC6	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC6	177438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	134141328	134141671	134141507	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	170594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	134206657	134207025	134206839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	105240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	CTC-458A3.1	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-458A3.1	32254	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	134453521	134453599	134453592	Y	SLA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-458A3.1	117281	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	134513057	134513519	134513217	Y	SLA,ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	68664	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	134552406	134552812	134552641	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	29371	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	134657388	134657825	134657633	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST3GAL1	75205	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	135697258	135697603	135697427	Y	NA	ZFAT	NA	NA	NA	NA	ZFAT	25689	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	135793082	135793308	135793195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	69790	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	NA	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	119198	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	139925414	139925432	139925424	Y	NA	COL22A1	NA	NA	NA	NA	COL22A1	1165	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141212639	141212826	141212733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	253852	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141655804	141656158	141655981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	136407	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141725005	141725293	141725149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	205608	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141800912	141801386	141801027	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	208929	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	142036879	142037195	142037043	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	26564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	142130425	142130596	142130486	Y	EIF2C2	DENND3	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	5048	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr8	142248811	142249092	142249020	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	67312	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	142289630	142289814	142289772	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	26590	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr8	142424633	142425265	142424919	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	24540	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	143049473	143049646	143049554	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	TSNARE1	432955	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	143758809	143759081	143758941	Y	NA	JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	2305	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	144108350	144108468	144108378	Y	NA	LY6E,RP11-273G15.2	NA	NA	NA	NA	RP11-273G15.2	10496	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	144785317	144785390	144785376	Y	NA	ZNF707,MAPK15,FAM83H	NA	NA	NA	NA	MAPK15	11039	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	694779	695236	694990	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	226488	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	708443	708758	708711	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	240152	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	751014	751390	751179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	282723	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	2623377	2623723	2623671	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	3543	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	3863148	3863487	3863216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	338425	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	3877182	3877575	3877493	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	352459	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	303183	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	4086123	4086410	4086330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	259982	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	4174938	4175110	4175024	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	171282	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	4340074	4340431	4340362	Y	NA	GLIS3	GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	5961	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	4715214	4715412	4715290	Y	AK3	CDC37L1,AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	24631	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	4759281	4759577	4759429	Y	NA	AK3,RCL1	JAK2,KIAA1432	IMR90	Hi-C	24141950	AK3	19238	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	5269155	5269233	5269193	Y	NA	NA	C9orf46	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	179270	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	1004	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	5582977	5583121	5583054	Y	NA	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	43904	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	5844710	5844756	5844733	Y	RANBP6	ERMP1	ERMP1	IMR90	Hi-C	24141950	ERMP1	13593	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	9758146	9758159	9758153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	669270	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	10027810	10028140	10027960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	582583	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	12421960	12422048	12422006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	390296	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	12779203	12779569	12779249	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	32775	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	13268477	13268830	13268663	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	8759	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	14213496	14213805	14213615	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	183177	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	14251419	14251628	14251514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	145354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	14575436	14575689	14575562	Y	ZDHHC21	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	115780	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	15477137	15477463	15477300	Y	NA	PSIP1,FTH1P12	NA	NA	NA	NA	PSIP1	31554	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	16085778	16085808	16085793	Y	NA	NA	C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	560097	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	16505238	16505575	16505407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	219237	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	16506213	16506544	16506471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	218268	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.38212375067445
chr9	16508530	16508711	16508621	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	216101	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.66938047644741
chr9	16510574	16510961	16510933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	213851	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	16515842	16516452	16516406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	208360	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	16729817	16729878	16729869	Y	BNC2	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	5005	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	18099109	18099372	18099241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GL2	522029	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	18438830	18439003	18438962	Y	NA	NA	FAM154A,ADAMTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-296P7.4	585887	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	19124098	19124309	19124196	Y	ACER2,PLIN2	HAUS6,PLIN2	NA	NA	NA	NA	PLIN2	22979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	19154059	19154539	19154234	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,PLIN2,DENND4C	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	6771	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	19184256	19184894	19184463	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	36968	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	20821674	20822013	20822003	Y	IFNA5,IFNA21	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	201132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313456	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	21964976	21965347	21965178	Y	NA	UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	44807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	27155069	27155179	27155099	Y	TEK	TEK	NA	NA	NA	NA	TEK	47930	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	32443270	32443461	32443367	Y	TOPORS,DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	60652	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	33268680	33268843	33268732	Y	NA	BAG1,CHMP5,NFX1	NA	NA	NA	NA	CHMP5	5740	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	34193349	34193568	34193460	Y	NA	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	16346	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	34394792	34394981	34394887	Y	NA	KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	19941	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5,CCL21	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	35490989	35491345	35491127	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	2865	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	35491656	35492052	35492019	Y	OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	3532	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	29917	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	32354	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	41948	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	37945283	37945292	37945288	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	121392	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.17345119111852
chr9	71393578	71393897	71393631	Y	FAM122A	FAM122A	NA	NA	NA	NA	FAM122A	614	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	71784003	71784073	71784064	Y	TJP2	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	49794	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	73164876	73165049	73164963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	137336	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	73168765	73169157	73169115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	141225	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr9	73184013	73184209	73184105	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	156473	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr9	73278368	73278569	73278469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	250828	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	73569162	73569421	73569277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	541622	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	75129013	75129167	75129063	Y	NA	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	150850	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	75886059	75886463	75886165	Y	ANXA1	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	121386	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	76299237	76299618	76299309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	534564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	80422497	80422534	80422513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	221840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	80559906	80560072	80560021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	84302	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.87805303600333
chr9	81641483	81641834	81641545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	362385	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	82493075	82493440	82493336	Y	TLE4	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	308387	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	84989090	84989102	84989097	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD95	487257	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	88935508	88935794	88935577	Y	NA	ISCA1,ZCCHC6	NA	NA	NA	NA	ZCCHC6	31575	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	90131164	90131697	90131347	Y	DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	6520	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	90150698	90151032	90150841	Y	NA	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	12481	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr9	91998036	91998395	91998345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2	66615	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	92276961	92277319	92277054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	59033	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	93558020	93558328	93558174	Y	SYK,SYK	SYK	SYK	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYK	3741	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	93683361	93683758	93683679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYK	121292	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	93754369	93754628	93754484	Y	NA	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3	IMR90	Hi-C	24141950	SYK	192300	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	94442528	94442868	94442728	Y	NA	NA	SYK,AUH,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-2,MIR3910-1,ROR2	IMR90	Hi-C	24141950	NFIL3	258384	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	94834730	94835154	94834963	Y	OGN	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	40512	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	95878204	95878686	95878424	Y	IPPK,PHF2,FAM120A,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	15884	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	96335202	96335517	96335360	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	1172	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chr9	97273853	97274253	97274073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIATL1	139020	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	97574717	97574955	97574837	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	87734	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	97699905	97700054	97699963	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	212922	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	99182775	99182932	99182834	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	4164	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	FOXE1	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	47272	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	101010652	101010785	101010720	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	5130	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	101015938	101016120	101016078	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	23	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	101016338	101016489	101016414	Y	NA	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	423	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	102276070	102276271	102276153	Y	NR4A3	NA	SEC61B,ALG2	IMR90	Hi-C	24141950	SEC61B	293724	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	107597613	107597745	107597668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	89644	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	108005367	108005618	108005429	Y	NA	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	464	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	109647843	109648061	109647872	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	24465	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	109655422	109655715	109655552	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	32044	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	109933165	109933377	109933258	Y	KLF4	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110041	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	109975791	109976065	109975989	Y	KLF4	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	67353	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	110109718	110109795	110109757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	66300	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	110130757	110130886	110130824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	87339	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	111759404	111759745	111759575	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	14064	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	112162175	112162241	112162208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	80931	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	112864001	112864218	112864083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	152702	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	112903621	112903940	112903708	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	112980	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	114723325	114723781	114723480	Y	NA	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	66279	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	115258728	115258879	115258816	Y	SNX30,SUSD1,ROD1	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	KIAA1958	11601	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	116274593	116274965	116274710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	69582	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	118412488	118412760	118412588	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	501323	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478870	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	118701397	118701694	118701515	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	212389	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chr9	118704303	118704501	118704353	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	209582	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	207058	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	119084686	119084813	119084781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	170603	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	121771632	121771910	121771804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	1307022	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.08672559555926
chr9	123237192	123237494	123237347	Y	MEGF9,FBXW2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	102954	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr9	125956223	125956395	125956307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72460	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	126119304	126119701	126119598	Y	NA	CRB2	NA	NA	NA	NA	CRB2	2855	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	126124461	126124723	126124613	Y	NA	CRB2	NA	NA	NA	NA	CRB2	8012	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	126126718	126127057	126126872	Y	CRB2	CRB2	NA	NA	NA	NA	CRB2	10269	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	CRB2	NA	NA	NA	NA	CRB2	37589	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	126160444	126160608	126160526	Y	NA	CRB2	NA	NA	NA	NA	CRB2	43995	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	126169211	126169592	126169399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRB2	52762	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	126895140	126895472	126895256	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	122413	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	127059883	127060148	127059983	Y	NA	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	41998	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	127165878	127166187	127166033	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	9536	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	127861290	127861583	127861437	Y	NA	SCAI	NA	NA	NA	NA	SCAI	42202	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	129175569	129176003	129175771	Y	ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	198719	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	129590383	129590427	129590410	Y	ZBTB43	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	25098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	130225118	130225493	130225306	Y	SH2D3C,SH2D3C,DPM2,LRSAM1	ZNF79,RPL12,LRSAM1	NA	NA	NA	NA	LRSAM1	13353	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	130281582	130281994	130281773	Y	TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	57274	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	130283548	130283912	130283802	Y	SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	55356	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	130342769	130343108	130342811	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	3501	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	131174776	131174899	131174838	Y	FAM102A,SLC25A25,DNM1	URM1,CERCAM,ODF2	NA	NA	NA	NA	CERCAM	2746	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	131929021	131929365	131929193	Y	NA	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	9175	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	132568357	132568650	132568524	Y	TOR1B	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1B	4925	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	132757819	132758165	132758070	Y	TOR1B,FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	45308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	134537317	134537597	134537547	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	75864	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	134573283	134574205	134573669	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	39256	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	134577502	134577617	134577602	Y	NA	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	35844	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	134600757	134600889	134600837	Y	RAPGEF1,NTNG2	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	12572	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	135089544	135089849	135089761	Y	NTNG2	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG2	54210	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	135995063	135995322	135995085	Y	RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	41979	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	136579870	136580130	136580087	Y	NA	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	22947	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chr9	136823955	136824162	136824035	Y	ADAMTSL2,SARDH,VAV2	VAV2	NA	NA	NA	NA	VAV2	31564	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	137535299	137535511	137535433	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	3679	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.46070791689148
chr9	137553986	137554190	137553995	Y	NA	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	22366	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	23862	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	139466507	139466851	139466737	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	27843	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	139595249	139595639	139595357	Y	SEC16A,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	SNORA43,SNHG7	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM69B	9383	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.92141583378296
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chr9	140655578	140655793	140655680	Y	PNPLA7	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	144134	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	4628683	4629054	4628903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	999034	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	8698180	8698491	8698336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAL1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	9309120	9309320	9309226	Y	TBL1X,TBL1X	NA	TBL1X	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1X	120015	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	9896256	9896650	9896356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	84952	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	180061	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	11131962	11132102	11132014	Y	HCCS	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	4541	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	12390298	12390694	12390463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS2	416780	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	147098	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	13282012	13282232	13282116	Y	TLR7	GS1-600G8.5	LOC100133123	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-600G8.5	37339	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	13809735	13809880	13809737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OFD1	58903	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	23799321	23799855	23799568	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	31	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	23806806	23807042	23806932	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	7516	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX	NA	NA	NA	NA	ZFX	22415	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	32431774	32431851	32431820	Y	DMD	NA	NA	NA	NA	NA	TBCAP1	625661	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	39619041	39619197	39619186	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	26193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.834690238223704
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	40749971	40750359	40750172	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	14878	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR34	65529	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC2	311830	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chrX	44173548	44173763	44173665	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	27155	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	45667037	45667329	45667199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR222	62507	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR222	63107	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	46182516	46182747	46182636	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	2333	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	47423323	47423681	47423373	Y	CDK16,CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	4807	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	47438054	47438403	47438273	Y	CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1,SYN1	NA	NA	NA	NA	TIMP1	1309	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	56839801	56840427	56840156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	77791	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	58230314	58230942	58230505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDA	295247	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chrX	68215899	68216039	68215946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA1	167597	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	73756739	73756964	73756863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75488	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	79965324	79965547	79965436	Y	BRWD3	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	97640	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	81977522	81977903	81977713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA6	1463030	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.626017678667778
chrX	96454742	96455056	96454899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	517080	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	103953879	103954145	103953966	Y	IL1RAPL2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM199X	544578	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	104559193	104559437	104559342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRK	505099	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	107639720	107640073	107639886	Y	COL4A6	COL4A5	NA	NA	NA	NA	COL4A5	41001	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	115398508	115398745	115398628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	315086	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.25203535733556
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	4.7994688697863
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	124338810	124338926	124338869	Y	NA	RP1-161N10.1	NA	NA	NA	NA	RP1-161N10.1	2623	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	2.29539815511519
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1	NA	NA	NA	NA	AIFM1	9468	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	130698816	130699203	130699008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	167139	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	GPC3	187840	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	133646648	133646903	133646776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPRT1	54465	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	135940631	135940874	135940833	Y	HTATSF1	RBMX,RP11-308D16.4	NA	NA	NA	NA	RBMX	20049	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	149084401	149084780	149084588	Y	NA	LINC00894,CXorf40B	NA	NA	NA	NA	LINC00894	20066	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	1.04336279777963
chrX	152753051	152753292	152753194	Y	NA	TREX2,BGN,HAUS7	BGN	MCF7	ChIA-PET	22265404	BGN	5105	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	153311757	153312308	153312067	Y	NA	IRAK1,MECP2	NA	NA	NA	NA	IRAK1	28326	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrX	153829365	153829583	153829391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	G6PD	55578	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926
chrY	14775457	14775545	14775476	Y	NA	TTTY15	NA	NA	NA	NA	TTTY15	3192	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.417345119111852
chrY	15547664	15548123	15547956	Y	TMSB4Y	UTY	NA	NA	NA	NA	UTY	42430	CAGE	ACC-MESO-4	hg19	FANTOM5	0.208672559555926