chr1 936652 937138 936860 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN C1orf170 K562 ChIA-PET 22265404 HES4 3100 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA ISG15 769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 993498 993878 993664 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 384 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNF223 7147 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 1060905 1061095 1061000 Y RNF223 C1orf159 MIR429,MIR200B,MIR200A,ACAP3,SCNN1D,B3GALT6,SDF4,UBE2J2,C1orf159 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C1orf159 11164 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 1063914 1064111 1063979 Y AGRN,VWA1 C1orf159 B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C1orf159 14173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 1368471 1368786 1368620 Y RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1 CCNL2,MRPL20,TMEM88B,VWA1,ATAD3B NA NA NA NA VWA1 230 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 1793829 1793862 1793845 Y CDK11B,CDK11A GNB1 NA NA NA NA GNB1 26633 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 1952050 1952360 1952259 Y C1orf70,PRKCZ,GABRD NA NA NA NA NA TMEM52 103338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 1978731 1978937 1978887 Y NADK,PRKCZ NA NA NA NA NA TMEM52 130019 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 22237 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 7461964 7462325 7462107 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 367004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.05448370579771 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8121436 8121582 8121497 Y ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 36638 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 8181009 8181247 8181098 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 96211 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8229904 8230047 8229996 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 145106 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8571636 8571856 8571737 Y SLC45A1,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 195750 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8686491 8686867 8686745 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 188835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 8849339 8849636 8849462 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 26066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 9224991 9225286 9225137 Y NA GPR157 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 GPR157 37762 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 11753086 11753651 11753386 Y TNFRSF1B,MTHFR,CLCN6 FBXO44,FBXO2,FBXO6,MAD2L2,AGTRAP NA NA NA NA MAD2L2 3379 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 15416988 15417263 15417153 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 59765 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 15673118 15673422 15673270 Y NA NA NA NA NA NA EFHD2 60969 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 16500084 16500309 16500220 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19502 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 16502532 16502678 16502612 Y C1orf64 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 21950 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 17353741 17353845 17353793 Y NA MFAP2,ATP13A2,SDHB ATP13A2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 17318 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 18186786 18187057 18186877 Y NA NA ARHGEF10L,ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL8 106978 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 19264079 19264209 19264144 Y IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IFFO2 16971 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 20091332 20091506 20091448 Y PLA2G2A,TMCO4 TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 32932 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 20307927 20308140 20308053 Y NA PLA2G2A NA NA NA NA PLA2G2A 2995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 20806851 20807214 20807064 Y NA CAMK2N1,MUL1 NA NA NA NA CAMK2N1 3499 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 21650806 21651685 21651350 Y EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 18312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 23123668 23124069 23123697 Y NA NA NA NA NA NA EPHB2 88336 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 23542417 23542518 23542468 Y HTR1D LUZP1 KDM1A,LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 LUZP1 40116 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 24519628 24519970 24519647 Y GRHL3 NA MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 52017 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 48202 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 25855984 25856012 25855998 Y NA LDLRAP1 MAN1C1,LDLRAP1,TMEM57,C1orf135,FAM54B,RHCE,SEPN1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAP1 12059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 26677301 26677628 26677413 Y CATSPER4,ZNF683 CD52,UBXN11,AIM1L NA NA NA NA AIM1L 993 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 26678060 26678317 26678200 Y CNKSR1,AIM1L CD52,UBXN11,AIM1L NA NA NA NA AIM1L 304 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 27185457 27185720 27185644 Y C1orf172,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 1913 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr1 27337570 27337809 27337727 Y NA RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA FAM46B 243 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 27519342 27519481 27519412 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A1 27870 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 28143878 28144081 28143936 Y NA STX12,PPP1R8,SCARNA1 NA NA NA NA PPP1R8 11208 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 29598339 29598546 29598399 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 37311 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr1 31218107 31218539 31218451 Y LAPTM5 NA NA NA NA NA SDC3 161069 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 31430605 31430735 31430670 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 50997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 31976608 31977048 31976952 Y PUM1 NA LOC284551 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-73M7.1 62126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 32015159 32015590 32015321 Y NA RP11-73M7.1,TINAGL1 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-73M7.1 23584 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 32108020 32108204 32108102 Y NA PEF1 NA NA NA NA PEF1 293 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 32250836 32250955 32250895 Y IQCC BAI2 NA NA NA NA BAI2 22342 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 32253647 32254040 32253861 Y LCK BAI2 NA NA NA NA BAI2 25153 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr1 33089029 33089046 33089038 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 25458 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 33131314 33131452 33131383 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA RBBP4 16571 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 33182280 33182513 33182368 Y KIAA1522 NA SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBBP4 67537 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 33202470 33202806 33202641 Y ZBTB8OS,RBBP4,RBBP4,KIAA1522 NA KIAA1522 K562 ChIA-PET 22265404 S100PBP 77562 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 NA NA NA NA NA S100PBP 54284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 33284832 33285123 33284978 Y NA S100PBP,YARS NA NA NA NA YARS 3078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 33427851 33428169 33427991 Y PHC2,RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 117 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 36173458 36173573 36173482 Y TEKT2,EIF2C1 C1orf216 NA NA NA NA C1orf216 9500 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 36397577 36397741 36397665 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 154735 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 39327096 39327575 39327204 Y NA RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA RP5-864K19.4 3424 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr1 40561233 40561752 40561648 Y SMAP2,RLF NA NA NA NA NA PPT1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 41825927 41826139 41826062 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 333 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 41962532 41962651 41962593 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 NA NA NA NA NA FOXO6 156237 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 43405621 43405821 43405630 Y CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 16709 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 43407355 43407700 43407616 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 14830 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 5666 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 43473183 43473398 43473279 Y C1orf210,C1orf210,SLC2A1 NA NA NA NA NA SLC2A1-AS1 50463 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 43997843 43998152 43997977 Y PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 8985 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 44162019 44162313 44162287 Y NA KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 7182 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 45192729 45193123 45192925 Y NA RNU5F-1,KIF2C,RPS8,SNORD55 KIF2C IMR90 Hi-C 24141950 RNU5F-1 7155 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 46689426 46689696 46689549 Y FAAH,C1orf190 PIK3R3,POMGNT1,RAD54L NA NA NA NA POMGNT1 5449 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 47690580 47690745 47690639 Y PDZK1IP1,TAL1 PDZK1IP1,TAL1 NA NA NA NA TAL1 5147 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 49812572 49812854 49812712 Y NA NA NA NA NA NA SPATA6 876727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 196779 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 52088228 52088763 52088412 Y NA OSBPL9 NA NA NA NA OSBPL9 47377 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 52193179 52193464 52193255 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 149013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 52238666 52238881 52238774 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 103596 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 52390204 52390438 52390419 Y NA NRD1 NA NA NA NA NRD1 47727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 53703343 53703361 53703351 Y NA CPT2,C1orf123,MAGOH NA NA NA NA MAGOH 1061 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 54875187 54875373 54875227 Y NA SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 1779 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 54956081 54956394 54956179 Y NA NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 78929 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 55894779 55895033 55894906 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 215993 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 58969564 58969575 58969570 Y NA DAB1,OMA1 NA NA NA NA DAB1 40831 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 59228706 59229186 59229035 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 18599 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 59280364 59280505 59280397 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 32579 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 62119868 62120084 62119981 Y NA NA TM2D1,INADL IMR90 Hi-C 24141950 TM2D1 69011 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 62751605 62751997 62751995 Y NA KANK4 NA NA NA NA KANK4 31088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 64500766 64501176 64500970 Y UBE2U NA NA NA NA NA CFL1P3 193410 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 68036173 68036524 68036291 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 112220 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 68215256 68215932 68215330 Y NA NA NA NA NA NA GADD45A 66512 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr1 68663588 68663867 68663728 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 32936 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA SRSF11 39652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 77385063 77385511 77385240 Y ST6GALNAC5 NA NA NA NA NA RP4-706A16.3 207257 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA GIPC2 772546 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 85794698 85795078 85794848 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 53925 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr1 90274070 90274340 90274210 Y NA LRRC8D GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRC8D 10233 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 186435 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA NA NA NA NA NA GLMN 144948 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 94527681 94527931 94527843 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 154715 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 94535371 94535770 94535449 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 162405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA RP11-148B18.1 NA NA NA NA RP11-148B18.1 26646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-148B18.1 931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 94784984 94785158 94785071 Y NA ARHGAP29,RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 11665 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 95179307 95179605 95179478 Y F3 NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 104232 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 97433904 97434230 97434067 Y NA NA DPYD,MIR137HG,MIR2682 IMR90 Hi-C 24141950 PTBP2 248683 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 372241 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 31459 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 109079557 109079899 109079743 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 20812 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 109189516 109189718 109189617 Y TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,HENMT1 HENMT1,PRPF38B NA NA NA NA HENMT1 12430 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3,EPS8L3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS8L3 15514 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 110879130 110879445 110879277 Y CSF1 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA RBM15 2 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 111733520 111733879 111733740 Y NA NA NA NA NA NA DRAM2 52682 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 112163412 112163797 112163622 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80572 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 112918897 112919196 112919049 Y NA CTTNBP2NL WNT2B,ST7L,DDX20 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 17607 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 112942216 112942335 112942276 Y CTTNBP2NL CTTNBP2NL NA NA NA NA CTTNBP2NL 5413 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 113394964 113395159 113395070 Y NA RP3-522D1.1,RP11-426L16.8 FAM19A3,PPM1J IMR90 Hi-C 24141950 RP11-426L16.8 3699 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr1 113949729 113949849 113949733 Y NA MAGI3,RP11-512F24.1 NA NA NA NA MAGI3 18358 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 114576701 114577036 114576869 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 56638 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 115615204 115615232 115615217 Y NA TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 14889 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 116191587 116191760 116191750 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 9013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 117017908 117018073 117017956 Y ATP1A1 NA SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1OS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP1A1OS 58664 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 117493512 117493635 117493571 Y NA PTGFRN CD101 IMR90 Hi-C 24141950 PTGFRN 42833 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 117814674 117814878 117814758 Y NA NA VTCN1,TTF2,TRIM45 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VTCN1 63118 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 144927217 144927550 144927432 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 NA NA NA NA NA NBPF9 117473 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.0132427685033 chr1 149215297 149215704 149215586 Y NA RNU1-92P NA NA NA NA RNU1-92P 1997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 3037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 150800498 150800843 150800671 Y NA ARNT NA NA NA NA ARNT 46401 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 151284018 151284391 151284246 Y FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5 NA NA NA NA PI4KB 13800 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 151445792 151446161 151446000 Y C1orf56,RIIAD1,OAZ3 POGZ,CGN RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 POGZ 15851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 151485676 151485841 151485746 Y C2CD4D,CGN,TUFT1 CGN,TUFT1 NA NA NA NA CGN 4690 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.19144928618422 chr1 151486181 151486300 151486231 Y SELENBP1,RORC,CGN CGN,TUFT1 NA NA NA NA CGN 5195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr1 151580936 151581099 151580976 Y NA SNX27,RP11-404E16.1 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 1442 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 151696469 151696693 151696535 Y NA RIIAD1,MRPL9 NA NA NA NA RIIAD1 15560 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 151909443 151909536 151909490 Y S100A10 THEM4 THEM4,S100A10,CELF3,RORC IMR90 Hi-C 24141950 THEM4 29159 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 152116191 152116374 152116281 Y LCE3A FLG-AS1 NA NA NA NA FLG-AS1 22227 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA FLG-AS1 NA NA NA NA FLG-AS1 1778 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 153488459 153488748 153488622 Y PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14 S100A6,S100A3,S100A4 NA NA NA NA S100A6 17972 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A6,S100A3,S100A4,S100A16,S100A14 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 153549643 153549828 153549736 Y PGLYRP3,S100A7L2 S100A6,S100A3,S100A4,S100A16,S100A14,S100A1 S100A14,S100A13,S100A16,CHTOP,S100A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S100A4 29031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 154529043 154529152 154529118 Y NA UBE2Q1 NA NA NA NA UBE2Q1 352 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 154579303 154579782 154579555 Y UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR UBE2Q1,ADAR NA NA NA NA ADAR 18693 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 155098409 155098801 155098460 Y PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1 EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2 NA NA NA NA EFNA1 473 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 155469100 155469412 155469293 Y MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 NA NA NA NA NA ASH1L-AS1 60409 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 156074715 156075305 156075042 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 24351 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 156405790 156406311 156406022 Y NA NA RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,IQGAP3,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2D 62309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 156473111 156473378 156473326 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1 MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4491 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 157245880 157246130 157246005 Y NA NA NA NA NA NA ETV3 139614 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 159887185 159887340 159887284 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 6182 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 159907968 159908165 159908117 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA IGSF9 5221 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 159961374 159961617 159961522 Y SLAMF8,SLAMF9 IGSF9,PIGM NA NA NA NA PIGM 38166 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 160182240 160182579 160182410 Y NA PEA15,RP11-574F21.2 NA NA NA NA PEA15 9113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 160599558 160599933 160599827 Y NA NA NA NA NA NA VANGL2 231182 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 166453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 160881277 160881698 160881498 Y NA RP11-312J18.5 CD244,ITLN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312J18.5 18507 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 161050902 161051096 161051032 Y PVRL4 TSTD1,USF1,KLHDC9,NIT1,PFDN2,DEDD NA NA NA NA KLHDC9 15055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 161321309 161321798 161321423 Y ATF6,CD244,FCER1G SDHC NA NA NA NA SDHC 39262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA FCRLB 106847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 164719768 164719930 164719859 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 196947 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 167135568 167135867 167135776 Y NA RP11-277B15.1 CD247,POU2F1,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-277B15.1 5494 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 167722412 167722527 167722511 Y NA MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 33983 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 167730247 167730494 167730371 Y NA MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 41818 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 168382983 168383105 168383068 Y NA NA NA NA NA NA XCL2 128130 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 XCL2 101499 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 168467604 168467716 168467660 Y NA XCL2 NA NA NA NA XCL2 43519 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 168876326 168876730 168876527 Y NA NA ATP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1B1 196205 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 169464285 169464545 169464529 Y BLZF1,SLC19A2 SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA AL021068.1 10905 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 170630769 170630992 170630884 Y NA NA NA NA NA NA GORAB 131499 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 172418117 172418641 172418353 Y NA C1orf105,PIGC NA NA NA NA PIGC 6887 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 172499206 172499418 172499304 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 87976 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 173398914 173399297 173399234 Y NA PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 45108 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 175159885 175160247 175160001 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 180250812 180250948 180250921 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 128843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 181081690 181081905 181081806 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26052 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 181082184 181082367 181082268 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26546 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 182070634 182071001 182070793 Y NA NA CACNA1E IMR90 Hi-C 24141950 GLUL 288340 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr1 183161027 183161375 183161120 Y NA LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 7654 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 183166871 183167293 183166889 Y NA LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 13498 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 183567713 183567879 183567843 Y NCF2,NCF2 ARPC5,RGL1 DKFZP564C196,SMG7,NCF2,LAMC1,NMNAT2,ARPC5,RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 ARPC5 35013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 184005350 184005919 184005662 Y RGL1,GLT25D2 TSEN15 RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 12892 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 185250433 185250655 185250484 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 33806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 185264835 185265233 185265202 Y NA IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 19228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 186584119 186584256 186584169 Y NA NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 PTGS2 63303 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 466737 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 91557 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 198889384 198889935 198889528 Y PTPRC NA NA NA NA NA ATP6V1G3 381309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 200332454 200332650 200332616 Y ZNF281 ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 44534 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 200481491 200481643 200481567 Y NA NA NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 104307 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 200862818 200862950 200862864 Y NA C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 4642 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr1 200865264 200865418 200865332 Y C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr1 200865457 200866265 200866098 Y TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7281 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 201613549 201613726 201613638 Y NA NAV1 NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAV1 23138 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 25998 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 202045307 202045525 202045416 Y PPP1R12B,ELF3 GPR37L1 NA NA NA NA GPR37L1 44461 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 202054141 202054434 202054309 Y NA GPR37L1 ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPR37L1 35552 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 202055098 202055409 202055277 Y ELF3,GPR37L1 GPR37L1 ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPR37L1 34577 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 GPR37L1,ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR37L1 14795 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 202217450 202217807 202217629 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 91301 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 202324768 202324787 202324778 Y NA UBE2T,PPP1R12B NA NA NA NA PPP1R12B 8941 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 202737599 202737762 202737681 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA RP11-480I12.2 3053 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 202823240 202823502 202823372 Y NA KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-480I12.5 5246 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 203009674 203009974 203009765 Y NA TMEM183A,PPFIA4,ADORA1 PPFIA4,MYOG IMR90 Hi-C 24141950 PPFIA4 16048 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1,MYBPH NA NA NA NA MYBPH 41695 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr1 203259429 203259985 203259729 Y RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2 BTG2 NA NA NA NA BTG2 12634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 BTG2,FMOD NA NA NA NA FMOD 21549 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 NA NA NA NA NA ATP2B4 111155 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE NA NA NA NA NA ATP2B4 102204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 203506114 203506504 203506389 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B4 87185 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 203661733 203662076 203661795 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B4 68044 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 204289566 204289863 204289752 Y SOX13,PPP1R15B NA NA NA NA NA PPP1R15B 89056 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 204317952 204318184 204318134 Y ETNK2,PIK3C2B NA NA NA NA NA PPP1R15B 60735 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 204641549 204641837 204641728 Y PLEKHA6,LRRN2,LRRN2 NA NA NA NA NA MDM4 158038 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 205267691 205267999 205267801 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 20884 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 205426466 205427019 205426690 Y NA LEMD1,CDK18 KLHDC8A IMR90 Hi-C 24141950 LEMD1 3384 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 206897147 206897463 206897235 Y RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 40858 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 206918122 206918360 206918230 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 61833 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 206921953 206922243 206922101 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 65664 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 207265739 207265906 207265769 Y NA PFKFB2,YOD1,C4BPB,C4BPA NA NA NA NA C4BPB 5552 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 207413364 207413503 207413411 Y IL19,CD55 NA CD55 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD55 79350 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 207414217 207414394 207414309 Y CD55 NA CD55 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD55 78459 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 208357514 208358085 208357775 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 57580 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 209585617 209585757 209585708 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 14408 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 209600780 209600928 209600808 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 615 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 209827285 209827712 209827546 Y LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 3474 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.15020834888982 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 211786767 211786829 211786805 Y NA SLC30A1 SLC30A1,NEK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC30A1 36683 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A,RP11-384C4.3 NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 212723252 212723516 212723384 Y BATF3,ATF3 ATF3 ATF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF3 13160 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr1 213545455 213545863 213545754 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KC1 322866 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr1 214162828 214163073 214162948 Y PROX1 PROX1 NA NA NA NA PROX1 8304 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 214490616 214490868 214490808 Y SMYD2 SMYD2 NA NA NA NA SMYD2 38171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 216826283 216826325 216826308 Y NA NA NA NA NA NA ESRRG 482772 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 218553747 218554148 218553928 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 36170 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 221201107 221201163 221201135 Y HLX NA NA NA NA NA MARC1 243006 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 224019430 224020596 224019827 Y FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 11078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 4.10896741159541 chr1 224528791 224528972 224528907 Y NA NVL,CNIH4 FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26 IMR90 Hi-C 24141950 NVL 12702 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr1 226841860 226842030 226841923 Y ITPKB NA NA NA NA NA ITPKB 82994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 228633222 228633907 228633608 Y TRIM11,TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9653 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 228973832 228974198 228974019 Y RHOU NA RHOU,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 105008 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 228987774 228988279 228988087 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 118950 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 229357329 229357959 229357668 Y RAB4A RP5-1061H20.4,RAB4A RHOU,C1orf96 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 46816 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 229388898 229389111 229388968 Y URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96 RP5-1061H20.4,RAB4A RHOU,NUP133,ABCB10 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 15664 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 229409656 229409997 229409713 Y RAB4A RP5-1061H20.4,RAB4A NA NA NA NA RAB4A 4834 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 229601636 229601883 229601761 Y NA ACTA1,NUP133,RP4-613A2.1 NA NA NA NA ACTA1 33791 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA AGT,CAPN9 NA NA NA NA CAPN9 8191 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.60234602734376 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2,LINC00184 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 234737347 234737653 234737498 Y IRF2BP2 IRF2BP2,LINC00184 NA NA NA NA IRF2BP2 5618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2,LINC00184 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2,LINC00184 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2,LINC00184 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 234754264 234754665 234754337 Y NA IRF2BP2,LINC00184 ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00184 8392 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 234852227 234852379 234852265 Y NA NA LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,TOMM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00184 89170 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 234881537 234881788 234881657 Y NA NA NA NA NA NA LINC00184 118480 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC00184 145094 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 235091073 235091332 235091158 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 198919 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 235106929 235107153 235107059 Y TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 183098 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 236041479 236041632 236041556 Y NA LYST LYST,GNG4,B3GALNT2,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 3308 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 236658748 236658778 236658775 Y NA ENO1P1,LGALS8 NA NA NA NA ENO1P1 14283 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 244532902 244533005 244532971 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 80431 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS,C1orf101 NA NA NA NA ADSS 384 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 244894306 244894456 244894354 Y C1orf100,C1orf101 NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPU-AS1 122343 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 245217556 245217830 245217613 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB2 86549 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 245939665 245940062 245939864 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 623378 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 245971113 245971386 245971357 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 654826 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 246432471 246432772 246432681 Y SMYD3,CNST NA NA NA NA NA SMYD3 235842 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 246743297 246743408 246743371 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 15551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr1 246772310 246772610 246772421 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 44564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr1 246845240 246845409 246845305 Y NA SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 39940 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 903940 904213 904109 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 71351 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 3216614 3216797 3216708 Y NA PITRM1 NA NA NA NA PITRM1 3611 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3524547 3524820 3524727 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 300653 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 3528683 3528786 3528735 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 296687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 3710838 3711066 3710976 Y KLF6 NA KLF6 K562 ChIA-PET 22265404 KLF6 114407 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3782727 3783283 3782915 Y KLF6 KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42190 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3797195 3797502 3797389 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 27971 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3845250 3845852 3845788 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 19777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 3850308 3850795 3850409 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 24835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3867491 3867713 3867639 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42018 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 3893365 3894190 3893886 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 67892 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3929991 3930887 3930290 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 104518 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 3932191 3932411 3932301 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 106718 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 4895704 4895738 4895721 Y NA AKR1C1 NA NA NA NA AKR1C1 37058 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 4983862 4984222 4983900 Y NA NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 51066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 5105953 5106270 5106114 Y NA AKR1C2,AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 30407 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 5113786 5114179 5114065 Y AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3 AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 38240 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr10 5530637 5531333 5530982 Y NA NA NA NA NA NA NET1 78123 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.15020834888982 chr10 5535635 5536039 5535950 Y NA NA NA NA NA NA NET1 83121 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 10.135452948602 chr10 6094563 6094944 6094798 Y NA RBM17 NA NA NA NA RBM17 34006 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 6182474 6182743 6182618 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 2138 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 6193489 6193806 6193647 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 8608 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 176551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr10 6600320 6600578 6600409 Y RBM17,RBM17,PRKCQ PRKCQ NA NA NA NA PRKCQ 19685 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 7583205 7583490 7583242 Y NA NA NA NA NA NA ITIH2 159742 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 7583796 7584039 7583868 Y NA NA NA NA NA NA ITIH2 159193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 8088862 8088888 8088874 Y ITIH5,GATA3 GATA3 NA NA NA NA GATA3 4679 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 8145104 8145382 8145246 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 51537 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 8374227 8374893 8374382 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 280660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 8408171 8408387 8408297 Y NA NA FLJ45983,GATA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GATA3 314604 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 11017838 11018101 11017971 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 633652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 11284467 11284694 11284626 Y CELF2 NA NA NA NA NA USP6NL 367059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 11835953 11836243 11836176 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 53588 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 11917828 11918087 11917940 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 135463 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 11969895 11970071 11969983 Y NA NA NA NA NA NA UPF2 113098 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 12002775 12003103 12002939 Y NA NA NA NA NA NA UPF2 80066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 12543456 12543849 12543654 Y SEC61A2 NA NA NA NA NA CAMK1D 153975 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.46538044695725 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 13800483 13800712 13800626 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 173556 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 13807715 13808056 13807951 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 180788 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 14518978 14519126 14519049 Y NA FRMD4A FRMD4A IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 16837 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 14592372 14592822 14592665 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 90231 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 20134637 20134650 20134644 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA ARL5B 1188303 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 21241912 21242237 21242078 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 218879 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 21317807 21317920 21317859 Y C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 143196 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 120572 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 21716825 21717072 21716945 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA MLLT10 104022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr10 21824374 21824606 21824490 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 3280 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 21991974 21992366 21992143 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 170880 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr10 22726811 22727194 22727116 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 118671 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr10 22886209 22886449 22886322 Y PIP4K2A NA NA NA NA NA PIP4K2A 115035 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 23344774 23344811 23344800 Y NA MSRB2 NA NA NA NA MSRB2 37624 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 24417752 24418035 24417894 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1217 436077 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 24498955 24499204 24499146 Y KIAA1217 NA NA NA NA NA ARHGAP21 511393 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 24740338 24740618 24740546 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 269979 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 24745312 24745555 24745448 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 265042 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 25348919 25349256 25349121 Y NA ENKUR,THNSL1 ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THNSL1 45332 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 27419520 27419901 27419745 Y NA ANKRD26,MASTL,YME1L1 NA NA NA NA MASTL 21852 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 27961311 27961466 27961388 Y NA NA NA NA NA NA RAB18 170114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 28957755 28957993 28957831 Y BAMBI BAMBI BAMBI K562 ChIA-PET 22265404 BAMBI 6278 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 29043838 29044173 29044078 Y NA NA LOC100507605,LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 79567 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 29228333 29228416 29228371 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 264062 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 29228763 29229094 29228981 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 264492 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 29280500 29280692 29280596 Y NA NA LYZL1,BAMBI,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 316229 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 29615988 29616104 29616046 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 80227 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 29761620 29761743 29761682 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 65289 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 29907407 29907668 29907538 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 211076 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 29924706 29925406 29925356 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 228375 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 32047879 32048374 32048138 Y ZEB1 NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 167368 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr10 32215994 32216410 32215998 Y NA ARHGAP12 NA NA NA NA ARHGAP12 252 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 32598255 32598442 32598434 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 67284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 32621222 32621521 32621374 Y ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1 EPC1 NA NA NA NA EPC1 44205 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 33798158 33798349 33798267 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 174968 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 35102675 35103059 35102787 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 422 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM CREM NA NA NA NA CREM 24495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 38325428 38325718 38325598 Y ZNF25,ZNF37A ZNF33A NA NA NA NA ZNF33A 27850 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 43248764 43248842 43248800 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 27407 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 43905259 43905708 43905446 Y HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA HNRNPF 2645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 43936251 43936518 43936384 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 22065 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 44100382 44100859 44100681 Y CSGALNACT2 ZNF239,CAP1P2,ZNF485,ZNF32 NA NA NA NA ZNF485 527 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 47080536 47081217 47080878 Y GPRIN2 NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 131064 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 180022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 47137749 47138065 47137950 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 188277 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 47149103 47149407 47149372 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 199631 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 48482238 48482583 48482338 Y NA NA NA NA NA NA ZNF488 129214 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 49847565 49847971 49847911 Y NA ARHGAP22 NA NA NA NA ARHGAP22 14339 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 50243711 50244078 50243895 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 381401 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 51045236 51045418 51045327 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 76811 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 52082649 52082859 52082782 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 59911 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 52083052 52083210 52083101 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 60314 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 52153406 52153805 52153735 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 130668 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 52266916 52267259 52267072 Y SGMS1 NA NA NA NA NA SGMS1 115664 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr10 52614600 52614810 52614705 Y NA A1CF NA NA NA NA A1CF 28625 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54078781 54079176 54078966 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54138059 54138390 54138182 Y DKK1 NA NA NA NA NA DKK1 66003 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr10 54203502 54203868 54203680 Y DKK1 RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 24425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54208151 54208375 54208306 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 19918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54211545 54211936 54211751 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 16357 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54212412 54212659 54212464 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 15634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54212715 54213183 54212814 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 15110 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54224630 54224737 54224684 Y NA RP11-346D6.6 DKK1,LOC100506939 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-346D6.6 3556 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54232102 54232449 54232243 Y NA RP11-346D6.6 DKK1,LOC100506939 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-346D6.6 3809 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54434489 54434618 54434547 Y NA NA NA NA NA NA MBL2 94842 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 54774491 54774616 54774570 Y MBL2 NA NA NA NA NA MBL2 245031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 59976925 59976941 59976933 Y NA IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 48753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 60333947 60334347 60334030 Y BICC1 NA NA NA NA NA BICC1 63047 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 60727421 60727594 60727472 Y PHYHIPL,PHYHIPL,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA PHYHIPL 206756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 60935384 60935742 60935425 Y NA PHYHIPL NA NA NA NA PHYHIPL 1034 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 61019605 61019954 61019626 Y PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA PHYHIPL 85255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 61632760 61633170 61633000 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 31244 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 61997048 61997297 61997111 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 332634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 62140958 62141228 62141093 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 394861 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 62174641 62174784 62174750 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 361305 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 62330469 62330833 62330827 Y ANK3 NA NA NA NA NA CDK1 205256 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 63697389 63697783 63697593 Y NA ARID5B NA NA NA NA ARID5B 38330 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 63803306 63803648 63803427 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 144247 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 63805040 63805237 63805084 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 145981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 63806320 63806697 63806416 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 147261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 63842469 63842743 63842551 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 183410 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 64024468 64024613 64024559 Y ARID5B RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 1853 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 64291559 64291877 64291687 Y ZNF365 NA NA NA NA NA ZNF365 159608 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 86874 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 65226977 65227255 65227116 Y NA PRELID1P3,JMJD1C NA NA NA NA JMJD1C 3255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 65231848 65231938 65231929 Y NA PRELID1P3,JMJD1C,REEP3 NA NA NA NA JMJD1C 8126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 65388414 65388608 65388512 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 109291 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.19144928618422 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 119010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 33037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 71984000 71984297 71984282 Y NA PPA1 NA NA NA NA PPA1 7370 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 72202124 72202468 72202392 Y EIF4EBP2,NODAL EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 39989 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 72609400 72609769 72609596 Y NA SGPL1,PCBD1 NA NA NA NA SGPL1 35683 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 73398011 73398245 73398040 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 133010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 73526896 73527242 73527133 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 73599936 73600188 73600059 Y NA PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 8938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 73605642 73606023 73605974 Y DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP NA NA NA NA PSAP 3103 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 73722643 73722971 73722767 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 520 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 73725868 73726411 73726297 Y C10orf105,CHST3 CHST3 NA NA NA NA CHST3 3745 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 74453097 74453245 74453141 Y CCDC109A MCU NA NA NA NA MCU 3208 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 74925047 74925060 74925055 Y ANXA7,ECD FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 864 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 75004761 75005017 75004932 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 1603 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 76866248 76866511 76866390 Y NA SAMD8 NA NA NA NA SAMD8 8904 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 76985148 76985510 76985329 Y NA VDAC2,COMTD1,HMGA1P5 NA NA NA NA COMTD1 8278 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 78974815 78975138 78974939 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 421215 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 79147874 79148082 79147903 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 248271 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 79176142 79176460 79176291 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 219893 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 79346819 79347304 79347005 Y KCNMA1 KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 49049 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 141919 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 80166856 80166996 80166943 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 375338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 81959510 81960003 81959818 Y TSPAN14,SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 3325 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 81962798 81963579 81963388 Y SH2D4B,ANXA11 EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 82214819 82214901 82214871 Y TSPAN14 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 2897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 34918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 86093705 86094297 86093848 Y NA NA NA NA NA NA GHITM 196509 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 88471302 88471860 88471725 Y LDB3,LDB3,LDB3 BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 42547 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 89500062 89500398 89500217 Y NA NA NA NA NA NA PAPSS2 82692 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 89519838 89520126 89519981 Y NA NA NA NA NA NA ATAD1 78974 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 90320077 90320086 90320082 Y LIPK RNLS NA NA NA NA RNLS 22201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 90495559 90495751 90495657 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD22 113824 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 90689067 90689322 90689158 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 51576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 91010610 91010883 91010698 Y NA IFIT2 NA NA NA NA IFIT2 48829 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 IFIT2 NA NA NA NA IFIT2 39235 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 91127158 91127607 91127378 Y NA IFIT3,IFIT1,LIPA,IFIT5 LIPA,IFIT2,IFIT1B,SLC16A12,PANK1 IMR90 Hi-C 24141950 IFIT1 22696 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 92676361 92676755 92676735 Y NA RPP30,ANKRD1 NA NA NA NA ANKRD1 2278 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 94001133 94001473 94001377 Y CPEB3,CPEB3 CPEB3,MARCH5 NA NA NA NA CPEB3 47371 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 95198614 95198817 95198708 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 41257 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 95200243 95200778 95200520 Y CYP26C1,MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 39296 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 96282867 96283106 96282931 Y TBC1D12 HELLS NA NA NA NA HELLS 20441 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 97054774 97055369 97055126 Y ENTPD1,PDLIM1 PDLIM1 PDLIM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDLIM1 5993 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 97148349 97148600 97148588 Y NA NA PDLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 99568 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 97218383 97218641 97218563 Y NA NA NA NA NA NA SORBS1 100530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 97239836 97240237 97240046 Y SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 78934 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 97640254 97640658 97640438 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 117342 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 98396181 98396533 98396373 Y NA NA NA NA NA NA TM9SF3 50972 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 99167112 99167183 99167148 Y NA RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1,RRP12 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RRP12 7985 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 101425049 101425416 101425233 Y NA SLC25A28,ENTPD7,CUTC NA NA NA NA ENTPD7 7786 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15,ABCC2 NA NA NA NA ABCC2 583 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr10 102488726 102488983 102488821 Y NA NA PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM178A 181343 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 102490299 102490653 102490523 Y PAX2 NA NA NA NA NA FAM178A 179673 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 102491662 102491849 102491769 Y PAX2 NA NA NA NA NA FAM178A 178477 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 102831127 102831150 102831139 Y NA PDZD7,SFXN3,KAZALD1 NA NA NA NA KAZALD1 11529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 103124787 103125187 103124970 Y NA BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12967 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 103656859 103657173 103657045 Y NA NA MGEA5,LOC100289509,KCNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MGEA5 80163 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 103662146 103662497 103662405 Y NA NA NA NA NA NA MGEA5 85450 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 104504643 104504897 104504711 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 32348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 INA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INA 33467 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 105650011 105650288 105650237 Y GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK OBFC1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC1 25675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 105681714 105681858 105681786 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA OBFC1 5751 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 112123790 112124003 112123953 Y MXI1 NA SMC3,DUSP5,RBM20 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 61081 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 112155518 112156031 112155808 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92809 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr10 112617518 112617573 112617534 Y ADRA2A,PDCD4 PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 11992 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 114021080 114021581 114021336 Y NA GPAM TECTB IMR90 Hi-C 24141950 GPAM 47945 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 114148894 114149633 114149365 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 17118 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 121503034 121503182 121503110 Y NA NA MCMBP IMR90 Hi-C 24141950 BAG3 94152 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 122836934 122837187 122837105 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 54050 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 123313040 123313152 123313149 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 FGFR2 NA NA NA NA FGFR2 42820 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 123777331 123777486 123777408 Y PLEKHA1,TACC2 NSMCE4A,TACC2 NA NA NA NA TACC2 30642 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 123822805 123823045 123822957 Y ATE1,DMBT1 NA NA NA NA NA TACC2 76116 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 123914164 123914234 123914222 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 167475 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 124133234 124133500 124133290 Y NA PLEKHA1 NA NA NA NA PLEKHA1 1022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr10 124636899 124637143 124637021 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 14 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 126213697 126214091 126213879 Y NA RPS10P18 NA NA NA NA RPS10P18 36550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA DHX32 6555 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 129948422 129948582 129948473 Y NA MKI67 FAM196A,DOCK1,CLRN3,PTPRE,MKI67,GLRX3 IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 25773 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 133836748 133836839 133836756 Y STK32C,DPYSL4,JAKMIP3 BNIP3 BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 43313 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 12824 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr10 134221970 134222202 134222031 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 13298 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 INPP5A 18146 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 134826942 134827305 134827042 Y NA NA LOC399829,INPP5A IMR90 Hi-C 24141950 KNDC1 144646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 13224 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 4064 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr10 135191872 135192182 135191943 Y NA CALY,PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1 NA NA NA NA PAOX 1177 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 334344 334553 334421 Y NA RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 NA NA NA NA IFITM3 8807 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7,CDHR5 NA NA NA NA CDHR5 5114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 1053255 1053594 1053287 Y NA MUC2 MUC5B,MOB2,AP2A2 IMR90 Hi-C 24141950 MUC2 19281 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 1989837 1990190 1989954 Y IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2 MRPL23,MRPL23-AS1 NA NA NA NA MRPL23-AS1 18960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 2009660 2010154 2009976 Y IGF2,IGF2,SYT8 MRPL23,MRPL23-AS1 NA NA NA NA MRPL23-AS1 510 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 2223798 2223980 2223871 Y ASCL2 NA NA NA NA NA IGF2 54965 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 2226111 2226485 2226212 Y ASCL2 NA NA NA NA NA IGF2 57278 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 2746958 2747301 2747029 Y TSSC4 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 27734 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 4129900 4130200 4130091 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,C11orf40,OR52I1 RRM1 NA NA NA NA RRM1 15963 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 4232015 4232345 4232181 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1 NA OR52M1,TRIM68,OR52I1 IMR90 Hi-C 24141950 RRM1 118078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 5539705 5539835 5539765 Y UBQLN3,UBQLNL NA OR51B5 K562 ChIA-PET 22265404 TRIM34 99159 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 6344620 6344857 6344735 Y NA PRKCDBP NA NA NA NA PRKCDBP 4743 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 HPX,TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 7426320 7426390 7426356 Y SYT9 NA NA NA NA NA OLFML1 78229 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 7624372 7624649 7624458 Y NA NA NA NA NA NA CYB5R2 71804 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 7697344 7697564 7697416 Y NA CYB5R2 NA NA NA NA CYB5R2 891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 9588297 9588534 9588393 Y NA WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 4694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 9760793 9761081 9760939 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 16758 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 10350347 10350728 10350538 Y NA SBF2,RP11-351I24.1,ADM NA NA NA NA ADM 26120 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 10373632 10373924 10373723 Y NA ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 10681207 10681687 10681411 Y ADM,MRVI1,MRVI1 NA LYVE1,MRVI1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CTR9 88847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 10955517 10955651 10955533 Y NA NA EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 77174 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 10955665 10956051 10955935 Y NA NA EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 77322 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 12136145 12136580 12136313 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 22602 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 12180569 12180722 12180645 Y MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67026 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 12186762 12187077 12186920 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 73219 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 12199343 12199732 12199431 Y NA NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 85800 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 12204570 12205016 12204699 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 91027 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 12772830 12773175 12773002 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 78861 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 12821812 12822118 12821851 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 127843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 13984955 13985270 13985219 Y NA SPON1 NA NA NA NA SPON1 3041 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 14015074 14015443 14015259 Y RRAS2 SPON1 NA NA NA NA SPON1 33160 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 14785995 14786323 14786008 Y NA NA NA NA NA NA PDE3B 122726 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 16893238 16893541 16893423 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 101019 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 16945489 16945781 16945647 Y NA RP11-466H18.1 NA NA NA NA RP11-466H18.1 48779 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,AC084117.3,LDHAL6A NA NA NA NA AC084117.3 1256 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 19440729 19441084 19440796 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 70458 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 19748565 19748818 19748690 Y NA NA NA NA NA NA NAV2 378294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 20016658 20016921 20016770 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 366310 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 20024358 20024601 20024461 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 358630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 20046945 20047208 20047086 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 336023 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 22702311 22702414 22702353 Y GAS2,GAS2,GAS2 NA NA NA NA NA FANCF 56924 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 34621875 34622041 34621973 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18599 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 34622320 34622551 34622432 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18089 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 34676467 34676782 34676555 Y ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF EHF NA NA NA NA EHF 35827 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 43596990 43597530 43597260 Y NA HSD17B12 NA NA NA NA HSD17B12 21004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 43760547 43760939 43760743 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 139422 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 44883806 44884166 44884088 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 86674 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 47125777 47126225 47125967 Y NA NA NA NA NA NA ARFGAP2 70451 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 47252770 47253009 47252890 Y NA PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD NA NA NA NA NR1H3 14842 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 47421735 47422128 47421819 Y MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SLC39A13,PSMC3 SLC39A13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A13 4555 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 57045764 57045851 57045815 Y NA TNKS1BP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 44575 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 59315294 59315558 59315429 Y MPEG1,OR4D6,STX3,PATL1 NA NA NA NA NA OSBP 66059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 60843253 60843606 60843384 Y SLC15A3,TMEM138 NA CD5 IMR90 Hi-C 24141950 VPS37C 83483 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 60926054 60926399 60926274 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 690 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA VWCE,DAK,DDB1 NA NA NA NA VWCE 4484 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 61434550 61434949 61434623 Y NA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 10956 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 62226637 62226898 62226739 Y FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA AHNAK 94809 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA AHNAK 73208 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 63298876 63299223 63298998 Y OTUB1,MARK2,RARRES3 HRASLS5,LGALS12,RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 3058 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 35441 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 63744435 63744483 63744459 Y KCNK4 NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA AP000721.4 4343 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 64102702 64102834 64102750 Y NA ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA PRDX5 19142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 64631898 64632818 64632128 Y CDC42EP2,FAU,EHD1 CDC42BPG,EHD1,MIR194-2,ATG2A NA NA NA NA EHD1 20950 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 64653025 64653383 64653280 Y TIGD3,RASGRP2,PYGM,SF1,SF1,SF1,MAP4K2,EHD1,ATG2A CDC42BPG,EHD1,MIR194-2,ATG2A,PPP2R5B,GPHA2 NA NA NA NA EHD1 385 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 65069384 65069573 65069479 Y NA POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 10716 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 65076655 65076852 65076688 Y EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3437 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 5.20469205468753 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 65555605 65556077 65555902 Y TSGA10IP,CATSPER1 OVOL1 NA NA NA NA OVOL1 3112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 65656792 65657262 65656985 Y NA MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA CCDC85B 917 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 65875756 65875846 65875802 Y NA PACS1 NA NA NA NA PACS1 39922 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr11 65910089 65910568 65910423 Y NA NA KLC2 IMR90 Hi-C 24141950 PACS1 74255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 66118604 66119022 66118907 Y NA CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RP11-867G23.8 5183 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 66659730 66659912 66659812 Y CLCF1,RBM4 LRFN4 NA NA NA NA LRFN4 37612 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 66844888 66845141 66844944 Y RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 22599 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 66845381 66845631 66845497 Y TMEM134,SSH3,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23092 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 66845907 66846062 66845990 Y PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 67121988 67122388 67122127 Y POLD4,CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A NA NA NA NA POLD4 55 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 67895703 67896078 67896017 Y CHKA CHKA CHKA,SUV420H1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHKA 8792 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 68065646 68065898 68065824 Y CHKA,LRP5 C11orf24,LRP5 SUV420H1,C11orf24,LRP5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP5 12179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr11 68110280 68110464 68110374 Y NA LRP5 PPP6R3 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5 32203 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 68139622 68139837 68139714 Y TCIRG1,TCIRG1 NA NA NA NA NA LRP5 61545 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 68776292 68776545 68776410 Y MRGPRF TPCN2 MRGPRD IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 37820 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 68882412 68882724 68882575 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1,FADD,ANO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TPCN2 68047 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 69042063 69042459 69042261 Y NA NA MYEOV,CCND1,ORAOV1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP000439.1 195999 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 69197125 69197542 69197234 Y ORAOV1,MYEOV AP000439.1 MYEOV,CCND1 IMR90 Hi-C 24141950 AP000439.1 40916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 69235389 69235576 69235517 Y NA AP000439.1,AP000439.2 MYEOV,ORAOV1,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.1 2882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 69250208 69250340 69250290 Y NA AP000439.1,AP000439.2,AP000439.3 CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 7171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr11 69251942 69252241 69252024 Y NA AP000439.1,AP000439.2,AP000439.3 CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 5270 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 AP000439.1,AP000439.2,AP000439.3 CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 583 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr11 69452524 69453230 69453220 Y CCND1 CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 625 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 69632815 69633180 69632998 Y NA NA NA NA NA NA ORAOV1 144631 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 69794643 69794820 69794756 Y FADD,ANO1 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 127588 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 69795546 69795838 69795683 Y ANO1 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 126570 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 69811990 69812239 69812133 Y FGF4 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19 IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 110169 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 69832517 69832816 69832804 Y NA NA ANO1,FGF4,PPFIA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 89592 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 70079442 70079825 70079633 Y ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FADD 32173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 71256551 71256695 71256574 Y NA NA NA NA NA NA NADSYN1 94396 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 71404196 71404321 71404259 Y KRTAP5-11,FOLR1,FOLR1 NA NA NA NA NA FAM86C1 92235 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 71598174 71598491 71598315 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NA NA NA NA RP11-849H4.2 39209 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 71658678 71659025 71658708 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NA NA NA NA RNF121 20931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 71780398 71780482 71780403 Y IL18BP,IL18BP LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 8900 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 71936800 71937067 71937009 Y INPPL1 FOLR1,INPPL1 NA NA NA NA INPPL1 4055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 72452508 72452870 72452656 Y STARD10,ATG16L2,ARAP1 ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 49774 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 72462370 72462747 72462399 Y NA ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 39897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 72487947 72488068 72488008 Y NA ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ARAP1 14576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 72498496 72498726 72498679 Y STARD10 ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ARAP1 3918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr11 72808468 72808618 72808564 Y NA FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 42688 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 73014768 73014913 73014905 Y NA P2RY6,ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 2421 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr11 73722792 73723138 73723056 Y LIPT2,C2CD3,UCP2 UCP2 UCP2 K562 ChIA-PET 22265404 UCP2 30440 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 73860209 73860535 73860372 Y C2CD3 PPME1,C2CD3 NA NA NA NA PPME1 19609 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 73874303 73874639 73874471 Y NA PPME1,C2CD3 NA NA NA NA PPME1 5505 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 74176233 74176573 74176529 Y KCNE3 KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3 NA NA NA NA KCNE3 201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 CHRDL2,RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 74609863 74609988 74609926 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48257 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 74667774 74667939 74667906 Y RNF169 XRRA1,SPCS2,NEU3 NA NA NA NA SPCS2 9482 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 SLCO2B1 NA NA NA NA SLCO2B1 47796 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.32841486657074 chr11 75059269 75059623 75059491 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 1250 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 75080203 75080380 75080292 Y ARRB1 ARRB1,RPS3 RPS3,ARRB1,GDPD5,XRRA1,NEU3,SPCS2,SLCO2B1,LOC100507050,KLHL35,SERPINH1,MAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARRB1 19330 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 75537561 75537829 75537710 Y ARRB1,DGAT2,UVRAG UVRAG NA NA NA NA UVRAG 13349 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 76166443 76166917 76166638 Y NA RP11-111M22.3,C11orf30 NA NA NA NA C11orf30 12476 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5,MYO7A NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 76883031 76883248 76883107 Y NA MYO7A NA NA NA NA MYO7A 45721 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 77696711 77696891 77696801 Y NA INTS4 C11orf67,RSF1 IMR90 Hi-C 24141950 INTS4 6833 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 77837663 77837947 77837805 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1 NA NA NA NA ALG8 10759 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 78003105 78003596 78003355 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 105237 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 78025089 78025245 78025191 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA GAB2 102149 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 78048124 78048554 78048530 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA GAB2 78840 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 78073883 78074276 78074154 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 53118 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 78091808 78092073 78091933 Y GAB2,GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 35321 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 83222070 83222081 83222077 Y NA NA NA NA NA NA AP003026.1 55814 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA AP003026.1 111746 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 83396793 83397083 83396942 Y DLG2 NA NA NA NA NA AP003026.1 230537 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 84093911 84093923 84093916 Y NA NA NA NA NA NA AP003026.1 927655 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 84925311 84925429 84925371 Y NA NA NA NA NA NA TMEM126B 412200 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 85310773 85310968 85310871 Y NA TMEM126B,TMEM126A NA NA NA NA TMEM126B 26661 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 85419491 85419865 85419792 Y SYTL2 CREBZF,CCDC89 NA NA NA NA CCDC89 24171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 85845984 85846086 85845986 Y EED,PICALM,PICALM NA PICALM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PICALM 67060 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 86178922 86179317 86178974 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 167669 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 86229748 86229843 86229795 Y NA NA NA NA NA NA ME3 151835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 86804343 86804452 86804398 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 57457 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 88041244 88041443 88041379 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 27512 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 89893119 89893512 89893349 Y NAALAD2 NAALAD2 NA NA NA NA NAALAD2 30436 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 92767972 92767992 92767983 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 161138 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 94315162 94315340 94315237 Y NA FUT4 NA NA NA NA FUT4 40145 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 94882788 94883137 94883023 Y NA NA NA NA NA NA ENDOD1 61814 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 94978287 94978585 94978436 Y NA SESN3 SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 SESN3 14582 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 95525355 95525734 95525518 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 3782 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 95867848 95868058 95867952 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 206286 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 95996412 95996766 95996624 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 77578 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 102631066 102631384 102631342 Y BIRC2 MMP10,MMP1 NA NA NA NA MMP10 17975 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 105933861 105934087 105933948 Y NA AASDHPPT,KBTBD3 NA NA NA NA AASDHPPT 10141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 108487361 108487672 108487557 Y EXPH5 EXPH5,DDX10 NPAT,EXPH5,ATM IMR90 Hi-C 24141950 EXPH5 24896 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 108600247 108600616 108600285 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 66495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 110228106 110228348 110228289 Y ZC3H12C,FDX1,RDX RP11-347E10.1 RDX MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-347E10.1 4251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 111191582 111191686 111191634 Y NA NA NA NA NA NA SIK2 279429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 111402540 111402739 111402658 Y NA NA NA NA NA NA SIK2 68376 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 111853928 111854208 111854100 Y NA DLAT NA NA NA NA DLAT 39330 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 112655698 112656077 112655902 Y NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-356J5.12 516226 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 113948272 113948462 113948410 Y ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 19957 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB16 109451 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr11 115172228 115172553 115172441 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 201122 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 116061103 116061309 116061204 Y NA NA CADM1,FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 580395 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 116679644 116679851 116679748 Y APOC3,APOA1 BUD13,ZNF259,APOA4,APOC3,APOA1 APOA5,ZNF259 IMR90 Hi-C 24141950 APOA4 12171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 116864339 116864649 116864442 Y SIK3,PCSK7 AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 40118 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 117016262 117016599 117016456 Y NA SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 3279 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 117050933 117051273 117050997 Y SIDT2 PAFAH1B2,SIDT2,TAGLN,PCSK7 NA NA NA NA SIDT2 3484 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 118112268 118112532 118112411 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 8533 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr11 118148186 118148361 118148275 Y MPZL2 MPZL3,MPZL2 MPZL2,LOC100526771,TMPRSS4,SCN4B,SCN2B,MPZL3,CD3E,AMICA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MPZL2 14935 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 118187372 118187677 118187544 Y DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D CD3G,UBE4A NA NA NA NA CD3G 25382 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 118740767 118741727 118741016 Y MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6 MIR4492 DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4492 37690 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 118747459 118747842 118747737 Y MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CCDC84,CBL,DDX6 MIR4492,UPK2,BCL9L CXCR5 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4492 31575 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 12.8747645563323 chr11 118787524 118788054 118787588 Y NA MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 5819 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 2978 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 1525 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 118800879 118801266 118801161 Y MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 6562 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 119239128 119239276 119239217 Y NA MCAM,RNF26,C1QTNF5,USP2,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2 11160 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr11 119598046 119598312 119598172 Y USP2 PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 252 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 121153802 121153902 121153847 Y TECTA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 167010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 121289334 121289764 121289479 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 31148 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 122596029 122596361 122596043 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 71646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 123077641 123077822 123077735 Y NA CLMP CLMP IMR90 Hi-C 24141950 CLMP 13652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 123275970 123276355 123275979 Y NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 CLMP 211981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 126191145 126191518 126191332 Y NA TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 18932 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 126286483 126286630 126286572 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 62948 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 128608811 128609066 128608964 Y FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA ETS1 153358 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 128927593 128927968 128927781 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP32 219251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 129185836 129186114 129185975 Y NA ARHGAP32 ARHGAP32,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 38617 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr11 129717042 129717234 129717138 Y ST14,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA TMEM45B 33328 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 129942098 129942391 129942179 Y PRDM10 TCEB2P2,APLP2 NA NA NA NA APLP2 4366 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 131759058 131759559 131759199 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 974654 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 132774283 132774643 132774625 Y OPCML NA NA NA NA NA IGSF9B 1050237 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 132940132 132940357 132940242 Y OPCML NA NA NA NA NA IGSF9B 884523 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 GLB1L2 508318 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 647081 647236 647154 Y ERC1,SLC6A12,SLC6A12,B4GALNT3 NA NA NA NA NA B4GALNT3 79551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 864034 864343 864158 Y CCDC77,KDM5A WNK1 NA NA NA NA WNK1 4275 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 1024438 1024795 1024721 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 72424 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 2902210 2902546 2902293 Y NA CBX3P4,FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6 NA NA NA NA FKBP4 91 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 3180278 3180396 3180348 Y NA TSPAN9 TSPAN9 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN9 4125 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 3194969 3195128 3195057 Y NA TSPAN9 NA NA NA NA TSPAN9 10448 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 3326549 3326840 3326665 Y TSPAN9 RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 7453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 4120809 4121079 4120983 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 140201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 4380607 4381576 4381205 Y PARP11,CCND2 CCND2-AS2,C12orf5 NA NA NA NA CCND2 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 6202352 6202551 6202452 Y CD9,ANO2 NA NA NA NA NA CD9 104330 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 13546 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA PLEKHG6 14713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 6622889 6622901 6622895 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH NA NA NA NA SCARNA10 5501 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 7058106 7058233 7058157 Y ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA RNU7-1 7127 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 7058563 7058923 7058712 Y PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA RNU7-1 7584 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 7978463 7978836 7978682 Y DPPA3,SLC2A3,NANOG NA NA NA NA NA SLC2A14 62908 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr12 7987438 7987606 7987534 Y SLC2A3,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A NA NA NA NA NA SLC2A14 54138 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr12 8013004 8013217 8013212 Y NA SLC2A14 NA NA NA NA SLC2A14 28527 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 8112195 8112747 8112462 Y NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3 K562 ChIA-PET 22265404 SLC2A3 25324 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.69807067043587 chr12 8136037 8136329 8136183 Y NA SLC2A3,FOXJ2 SLC2A3,FOXJ2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXJ2 46970 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 9804148 9804385 9804240 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D RP11-705C15.4 NA NA NA NA RP11-705C15.4 5543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 10113074 10113503 10113390 Y CD69,CLEC2B,OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC12A,CLEC12A NA NA NA NA NA OLR1 209234 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA OLR1 NA NA NA NA OLR1 16283 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 10515405 10515669 10515567 Y NA RP11-277P12.20 NA NA NA NA RP11-277P12.20 1037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 10707948 10707962 10707955 Y NA NA CLEC1A,KLRC4-KLRK1 IMR90 Hi-C 24141950 MAGOHB 56260 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 11721730 11722060 11721927 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 78728 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 12038206 12038369 12038301 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA BCL2L14 162409 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 12255233 12255559 12255327 Y BCL2L14 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 6538 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 12352896 12352921 12352909 Y NA NA NA NA NA NA LRP6 65025 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 12556548 12557081 12556810 Y CDKN1B,LOH12CR1 LOH12CR2,LOH12CR1 NA NA NA NA LOH12CR1 48535 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 12711400 12711706 12711553 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP16 1611 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 13251023 13251431 13251083 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 55805 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr12 13325394 13325655 13325525 Y NA EMP1 HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EMP1 21995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 15910995 15911177 15911085 Y NA NA PTPRO IMR90 Hi-C 24141950 EPS8 122086 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 19260911 19261231 19261176 Y NA PLEKHA5 PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 19417 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 24856555 24856996 24856898 Y NA NA NA NA NA NA RP11-444D3.1 143031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 24858416 24859124 24858977 Y BCAT1 NA NA NA NA NA RP11-444D3.1 144892 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 24903057 24903444 24903231 Y SOX5 NA SOX5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-444D3.1 189533 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr12 24972596 24972806 24972748 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 127587 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 25380896 25381137 25381017 Y NA CASC1,LYRM5,KRAS NA NA NA NA KRAS 20733 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 25537800 25538060 25537930 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 135930 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 5.06772647430101 chr12 26400740 26401146 26400920 Y NA NA NA NA NA NA BHLHE41 124680 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 26945295 26945340 26945320 Y C12orf71,ITPR2 ITPR2 NA NA NA NA ITPR2 38791 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 27006268 27006662 27006518 Y NA ITPR2 ITPR2,TM7SF3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 22137 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 27174273 27174510 27174392 Y C12orf71 TM7SF3,MED21 NA NA NA NA MED21 794 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 27332593 27333057 27332936 Y STK38L NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 61844 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 31523025 31523181 31523129 Y METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A,RP11-771K4.1 NA NA NA NA RP11-771K4.1 2790 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 31523933 31524084 31523973 Y DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A,RP11-771K4.1 NA NA NA NA RP11-771K4.1 3698 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 31524246 31524432 31524371 Y NA FAM60A,RP11-771K4.1 NA NA NA NA RP11-771K4.1 4011 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 62855 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 32543557 32543792 32543676 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 285788 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 33044985 33045279 33045082 Y NA PKP2 NA NA NA NA PKP2 2495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 33137070 33137259 33137186 Y PKP2 NA NA NA NA NA PKP2 89296 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 39816699 39816988 39816844 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 18204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 45654086 45654401 45654190 Y NA ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 46262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr12 46381876 46382270 46382256 Y SLC38A2,SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 1633 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA RPAP3 485371 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 48227481 48227636 48227559 Y OR10AD1 HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 2566 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 48294417 48294695 48294497 Y OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR VDR NA NA NA NA VDR 40136 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C,COL2A1 TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 COL2A1 825 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 48431282 48431505 48431439 Y NA COL2A1 NA NA NA NA COL2A1 35013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 49198499 49198542 49198521 Y LALBA ADCY6,CACNB3,DDX23 NA NA NA NA CACNB3 7035 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 49739970 49740063 49739997 Y NA TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2 NA NA NA NA DNAJC22 1270 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 49801773 49801917 49801846 Y NA SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 43406 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 49822830 49822961 49822896 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2 64463 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1,GPD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 51177941 51178161 51178051 Y POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 22448 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 51786511 51786834 51786676 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,BIN2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 1860 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 51833393 51833425 51833407 Y NA GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 48742 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 101125 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 52262826 52263308 52263216 Y NA NA SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 80143 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 52278286 52278855 52278613 Y NR4A1 NA NA NA NA NA ACVR1B 64596 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 52439738 52439919 52439767 Y GRASP,NR4A1,NR4A1 NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 21111 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 NA KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf44 79934 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 NA KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf44 81180 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 52588987 52589174 52589068 Y ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA NA C12orf44 127957 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 NA NA NA NA NA KRT6A 210523 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 NA NA NA NA NA KRT6A 209960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 53264136 53264576 53264217 Y PFDN5 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRT4 57801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr12 53370058 53370275 53370187 Y NA KRT18,KRT8,EIF4B KRT8,EIF4B,KRT18,KRT85,KRT84,KRT75,KRT6B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF4B 27667 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 53445016 53445392 53445120 Y IGFBP6,C12orf10,TENC1,TENC1,TENC1,SPRYD3 EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4,SPRYD3,IGFBP6,SOAT2 NA NA NA NA RP11-983P16.4 830 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 53515585 53515944 53515597 Y NA SPRYD3,IGFBP6,SOAT2,RP11-1136G11.6 NA NA NA NA SOAT2 20283 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 54198975 54199124 54199050 Y NA SNORD81 HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD81 15886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 54372759 54373189 54372957 Y HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10 HOXC13,HOXC13-AS,HOXC12,HOXC10,HOXC6,HOXC8 NA NA NA NA HOXC10 3660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 54400493 54400742 54400596 Y HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 90 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 57026164 57026397 57026368 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 2203 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 57026737 57026855 57026796 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 1745 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 8.21793482319083 chr12 57079143 57079532 57079338 Y NA ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 627 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 NA NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 57300 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr12 63091878 63091979 63091882 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 97346 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 63096065 63096306 63096205 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 101533 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 63115696 63115706 63115701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 121164 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 63118880 63119001 63118911 Y NA NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 124348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 63126917 63127025 63126971 Y C12orf61 NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 132385 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 63133542 63133622 63133582 Y NA NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 139010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 65026482 65026674 65026578 Y NA RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 24189 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 66289506 66290040 66289751 Y NA NA NA NA NA NA HMGA2 73595 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.32841486657074 chr12 69305634 69305702 69305668 Y RAP1B,LYZ,CPM,CPM NA NA NA NA NA CPM 57648 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 69722229 69722626 69722379 Y LYZ LYZ,YEATS4 CPSF6,YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 17495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ LYZ,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 15013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 69726696 69726959 69726870 Y NA LYZ,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 13162 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 70630767 70631060 70630914 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 3714 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 71127373 71127661 71127517 Y NA NA NA NA NA NA RP11-611E13.2 492233 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 76352762 76353194 76352954 Y NA RP11-114H23.1 KRR1,PHLDA1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-114H23.1 22601 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 79608943 79609085 79609014 Y NA NA NA NA NA NA RP1-78O14.1 286091 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 79941021 79941361 79941199 Y PAWR RP1-78O14.1 SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-78O14.1 45845 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 80757444 80757599 80757522 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244J10.1 262331 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 83082881 83083305 83083086 Y NA NA NA NA NA NA CCDC59 332297 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 302617 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 383789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 BTG1 NA NA NA NA BTG1 19275 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 93321551 93321826 93321626 Y EEA1 EEA1 NA NA NA NA EEA1 444 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 93410290 93410649 93410470 Y NA NA NA NA NA NA AC138123.2 64802 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 93561648 93561951 93561715 Y NA RP11-511B23.2 NA NA NA NA RP11-511B23.2 45504 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 93709037 93709216 93709174 Y NA NA NA NA NA NA NUDT4 60443 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 93770329 93770575 93770474 Y NUDT4 NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 670 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 93971019 93971312 93971141 Y NA SOCS2,SOCS2-AS1 NA NA NA NA SOCS2-AS1 7475 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94158186 94158524 94158355 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 89035 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94178297 94178734 94178344 Y CRADD NA NA NA NA NA CRADD 109146 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94602005 94602423 94602109 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA PLXNC1 61506 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94602535 94602691 94602633 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA PLXNC1 62036 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 137747 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 94681590 94681805 94681698 Y NA NA NA NA NA NA RBMS2P1 134940 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94696122 94696451 94696433 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 120294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 94827148 94827488 94827330 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 10403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 96311989 96312050 96312020 Y NA NA NA NA NA NA SNRPF 61283 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 96810217 96810461 96810410 Y LTA4H,ELK3 CDK17 CDK17,ELK3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CDK17 17879 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 97962496 97962841 97962674 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 663495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA SLC9A7P1 LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC9A7P1 30251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 104193580 104193857 104193839 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 39118 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 109088465 109088864 109088838 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 34508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 21904 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 109899131 109899209 109899162 Y TRPV4,TRPV4,TRPV4 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 13998 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 112464061 112464211 112464136 Y NA TMEM116,ERP29 NA NA NA NA ERP29 14941 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 112534496 112534670 112534605 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 10156 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 112741741 112742068 112741904 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 112087 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 113938595 113938989 113938796 Y NA NA RBM19,DTX1 IMR90 Hi-C 24141950 SDSL 80553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 115105863 115106455 115106375 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 13514 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 116666460 116666763 116666749 Y NA MED13L NA NA NA NA MED13L 46380 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 116796896 116797249 116796984 Y NA NA MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 83753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 116865168 116865340 116865257 Y NA NA NA NA NA NA LINC00173 103887 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 116872040 116872309 116872217 Y NA NA NA NA NA NA LINC00173 96918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 116928717 116928987 116928846 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00173 40240 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 116946088 116946451 116946189 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22776 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 116946674 116946880 116946778 Y NA LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22347 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 117100450 117100717 117100699 Y NA RP11-497G19.1 MED13L,LINC00173,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-497G19.1 3063 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 117173952 117174265 117174216 Y MED13L,MAP1LC3B2 C12orf49 NA NA NA NA RNFT2 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 117480044 117480441 117480323 Y TESC NA NA NA NA NA TESC 54843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 117717563 117717963 117717621 Y NA NA NA NA NA NA FBXO21 91227 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 117871849 117872390 117872076 Y NOS1 NA NA NA NA NA FBXO21 245513 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 118605193 118605499 118605376 Y NA PEBP1,VSIG10 NA NA NA NA VSIG10 33362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 120666780 120666906 120666823 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN NA NA NA NA PXN-AS1 29686 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 121367131 121367281 121367257 Y NA SPPL3,RPL12P33,HNF1A,HNF1A-AS1 C12orf43,SPPL3,POP5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL12P33 14583 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 121425440 121425755 121425495 Y NA HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43,OASL NA NA NA NA HNF1A-AS1 8672 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 121866033 121866226 121866130 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 30189 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 121976471 121976819 121976719 Y NA RP13-941N14.1,KDM2B NA NA NA NA RP13-941N14.1 39878 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.42413950966285 chr12 122020670 122020879 122020764 Y KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3750 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 122086492 122086728 122086610 Y KDM2B,SETD1B,ORAI1 ORAI1 NA NA NA NA ORAI1 24037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 122462417 122462775 122462615 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 7089 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 5.47862321546055 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 262123 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 337221 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 313839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr12 125117108 125117622 125117163 Y NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 247592 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.05448370579771 chr12 125117895 125118180 125118038 Y NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 247034 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125149282 125149430 125149311 Y UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 215784 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125288540 125288810 125288726 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 76404 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125347630 125347766 125347649 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 17448 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125389117 125389584 125389422 Y NCOR2,UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 10330 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 1042 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 131513179 131513358 131513281 Y GPR133 NA NA NA NA NA GPR133 76727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 132265042 132265050 132265046 Y NA NA NA NA NA NA SFSWAP 71416 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 NA NA NA NA NA ULK1 61957 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 20419964 20420131 20420036 Y PSPC1,ZMYM5 ZMYM5 NA NA NA NA ZMYM5 15645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 23973487 23973793 23973652 Y NA SACS NA NA NA NA SACS 32048 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 24131522 24131823 24131734 Y SACS TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 10686 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA TNFRSF19 146492 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.0132427685033 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH SPATA13 SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 23252 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.05448370579771 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 27608814 27608959 27608884 Y WASF3,GPR12 NA RASL11A,USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 135074 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 27843033 27843378 27843206 Y NA RPL21,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.32841486657074 chr13 28530575 28530960 28530888 Y CDX2 PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 12316 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 8098 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr13 28540285 28540611 28540449 Y LNX2,CDX2 PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 2665 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 28554929 28555135 28555054 Y NA CDX2 NA NA NA NA CDX2 11653 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 36635 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 30415465 30415864 30415857 Y NA UBL3 NA NA NA NA UBL3 6957 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.73931160773028 chr13 30963439 30963783 30963499 Y NA LINC01058,UBE2L5P LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 30591 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058,UBE2L5P LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA LINC01058,UBE2L5P KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01058 11592 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA HSPH1 250589 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 32470605 32470630 32470618 Y NA NA NA NA NA NA FRY 132807 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 33003304 33003483 33003393 Y NA N4BP2L1 NA NA NA NA N4BP2L1 2989 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 33728009 33728149 33728045 Y STARD13 NA NA NA NA NA KL 139802 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 38740377 38740756 38740564 Y NA NA NA NA NA NA UFM1 181230 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 41173351 41173594 41173358 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 65140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 41187555 41187952 41187790 Y ELF1,ELF1,FOXO1 NA NA NA NA NA FOXO1 50782 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 41519573 41519973 41519773 Y NA SUGT1P3 NA NA NA NA SUGT1P3 25663 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 41624170 41624528 41624466 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 ELF1,MTRF1,NAA16 IMR90 Hi-C 24141950 WBP4 8882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 42162855 42163294 42163201 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 279514 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 42188044 42188379 42188211 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 304703 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 42228867 42229175 42229114 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 345526 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 42231052 42231244 42231148 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 347711 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 42280247 42280717 42280439 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 396906 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 43635759 43636150 43635822 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 40420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 43662550 43662935 43662749 Y EPSTI1 NA NA NA NA NA DNAJC15 67211 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 43865785 43866112 43865949 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 270446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 45194278 45194532 45194405 Y NA TSC22D1 NUFIP1,TSC22D1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 44995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 45813210 45813281 45813243 Y NA NA NA NA NA NA TPT1-AS1 100199 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 46095529 46095772 46095647 Y TPT1 NA NA NA NA NA COG3 58469 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 46102041 46102392 46102214 Y NA NA NA NA NA NA COG3 64981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 46244354 46244716 46244645 Y NA NA NA NA NA NA COG3 207294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 46709325 46709604 46709495 Y NA CPB2 NA NA NA NA CPB2 32114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.42413950966285 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 49814374 49814506 49814440 Y MLNR,CAB39L CDADC1 NA NA NA NA CDADC1 5541 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 50413145 50413317 50413231 Y NA KPNA3 EBPL,KPNA3 IMR90 Hi-C 24141950 KPNA3 48088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 51034237 51034585 51034411 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 100338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 51103280 51103738 51103647 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL34P26 169381 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 242490 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 51641920 51642198 51642053 Y INTS6 NA NA NA NA NA FAM124A 152305 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 51800117 51800150 51800132 Y DLEU7,FAM124A FAM124A NA NA NA NA FAM124A 5614 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 52505834 52506318 52505967 Y NA NA NA NA NA NA ATP7B 77312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 52537870 52538200 52538035 Y UTP14C ATP7B,ALG11 NA NA NA NA ATP7B 45430 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 52572353 52572390 52572372 Y NA ATP7B,ALG11,UTP14C NA NA NA NA ATP7B 11240 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 53765519 53765549 53765534 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 540675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 60570337 60570455 60570340 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 165666 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 60716670 60717071 60716778 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 19050 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 60835773 60835952 60835863 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 99652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 63021628 63021960 63021792 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 2053037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 4571971 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 172579 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 73982945 73982960 73982953 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 309822 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 74339681 74339964 74339912 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 366430 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 75904010 75904233 75904150 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 150017 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 76390114 76390391 76390144 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 197544 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 77453598 77454010 77453765 Y FBXL3,KCTD12 KCTD12 NA NA NA NA KCTD12 4530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 77899332 77899971 77899636 Y KCTD12,FBXL3,MYCBP2 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 147 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 78158324 78158538 78158433 Y MYCBP2,SLAIN1,SLAIN1,EDNRB,EDNRB NA NA NA NA NA SCEL 50515 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 79232403 79232753 79232546 Y NA RNF219 NA NA NA NA RNF219 1089 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 80078013 80078214 80078058 Y NA NDFIP2 NA NA NA NA NDFIP2 24726 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 91807857 91808125 91807991 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 189949 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 93083293 93083662 93083475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 373196 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 13355 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 98921705 98921995 98921808 Y NA NA NA NA NA NA FARP1 128889 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 98924976 98925080 98925019 Y NA NA NA NA NA NA FARP1 132160 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr13 99302784 99302934 99302858 Y SLC15A1 CALM2P4 FARP1,STK24,SLC15A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM2P4 11291 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 99403586 99403810 99403698 Y SLC15A1 SLC15A1 NA NA NA NA SLC15A1 678 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 99934888 99935365 99935021 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 22294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 106751889 106752019 106751954 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 466493 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr13 107124360 107124455 107124408 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 94057 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 107222796 107223196 107222998 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 4284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 107448247 107448283 107448269 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 229735 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 109115794 109116062 109115942 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD13 247067 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 109895773 109895899 109895836 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 541016 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 514704 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 110322109 110322425 110322268 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 114490 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 84904 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr13 110790027 110791241 110790617 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA IRS2 353112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 110965035 110965206 110965124 Y COL4A1,COL4A2 NA NA NA NA NA RAB20 246874 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 111212967 111213224 111213111 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 COL4A2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB20 887 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr13 111616634 111616920 111616701 Y NA NA LINC00346,ING1,ANKRD10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD10 51218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 113393010 113393289 113393150 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 50367 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 113514166 113514374 113514224 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 106764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr13 114270892 114271213 114271013 Y DCUN1D2,TMCO3 TFDP1 NA NA NA NA TFDP1 33879 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 21288613 21288985 21288797 Y NA RNASE6,RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 19176 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 22080552 22080764 22080649 Y NA NA NA NA NA NA SALL2 77202 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 22757693 22757837 22757724 Y NA TRAV38-2DV8 NA NA NA NA TRAV38-2DV8 10705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 22760629 22760776 22760704 Y NA TRAV38-2DV8 NA NA NA NA TRAV38-2DV8 13641 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 23029996 23030028 23030008 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 26147 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC7A7 2462 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA DHRS2 66439 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 24712544 24712898 24712739 Y DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2 TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA NA NA NA NA TINF2 2664 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 25397817 25398161 25397990 Y NA NA NA NA NA NA STXBP6 119342 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 25476676 25476861 25476696 Y NA STXBP6 NA NA NA NA STXBP6 40642 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 32261719 32262250 32261957 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187E13.1 149809 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr14 33041637 33041800 33041733 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 89631 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 34801443 34801630 34801553 Y NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127932 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 34802064 34802306 34802186 Y C14orf147 NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127256 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 34966252 34966485 34966304 Y NA SPTSSA,EGLN3,EAPP NA NA NA NA EGLN3 36272 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 35120187 35120582 35120411 Y SNX6,SNX6 SNX6 SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C IMR90 Hi-C 24141950 SNX6 22798 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 35825324 35825456 35825405 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA IMR90 Hi-C 24141950 RP11-561B11.1 30819 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 35855857 35856187 35856101 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 88 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 35869907 35870271 35870165 Y FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 1684 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 37465189 37465490 37465428 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 174581 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 37868853 37868985 37868906 Y NA NA NA NA NA NA RP11-356O9.2 165315 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 38052956 38053419 38053189 Y FOXA1 RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 9633 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 38054173 38054544 38054319 Y NA RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 8508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr14 38057887 38058022 38057995 Y FOXA1 RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 5030 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 39664073 39664414 39664121 Y SIP1,PNN TRAPPC6B,PNN,MIA2 NA NA NA NA PNN 21686 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 39890491 39890736 39890687 Y NA FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 8968 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 39892906 39893200 39893154 Y FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 6504 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 50237132 50237443 50237218 Y KLHDC2 KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 4806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 51434779 51434836 51434798 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 25325 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 52104818 52105424 52105148 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 151000 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 53392802 53392977 53392890 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 24176 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 53416335 53416646 53416599 Y GPR137C FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 507 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 54465835 54466164 54465918 Y NA BMP4 NA NA NA NA BMP4 42356 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 54573774 54574066 54573953 Y NA NA NA NA NA NA BMP4 150295 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 55144129 55144414 55144262 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 112314 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 55152891 55153126 55153104 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 121076 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 55249380 55249603 55249505 Y LGALS3,FBXO34,GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 NA NA NA NA NA GCH1 117967 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 55544097 55544118 55544108 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27748 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr14 55544307 55544654 55544518 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27958 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr14 55565587 55565828 55565708 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 23000 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 8.21793482319083 chr14 55584452 55585250 55584591 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 3578 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 55589429 55589640 55589507 Y NA LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 601 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 55589903 55590059 55589993 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 1075 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 56472041 56472329 56472134 Y NA NA PELI2 IMR90 Hi-C 24141950 PELI2 110203 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 56733293 56733420 56733313 Y PELI2 NA NA NA NA NA PELI2 150761 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr14 58705309 58705629 58705462 Y ARID4A ACTR10,PSMA3 NA NA NA NA PSMA3 3920 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 61811731 61812149 61812030 Y PRKCH RP11-902B17.1 NA NA NA NA RP11-902B17.1 24195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 62026213 62026731 62026533 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 133500 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 63829601 63829975 63829789 Y WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 178117 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 64705009 64705329 64705170 Y PLEKHG3,SYNE2 NA NA NA NA NA MTHFD1 147420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 65115289 65115345 65115316 Y NA NA ZBTB25,ZBTB1,SPTB,PLEKHG3,CHURC1-FNTB,MTHFD1,PPP1R36,HSPA2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG3 53475 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr14 65169606 65170310 65170032 Y NA PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 786 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 65224783 65224915 65224850 Y ZBTB1,PLEKHG3 NA NA NA NA NA PLEKHG3 55963 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 65705173 65705467 65705275 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 137760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 65722117 65722532 65722424 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FUT8 152778 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr14 65905118 65905243 65905181 Y NA FUT8 NA NA NA NA FUT8 29808 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr14 68281633 68281808 68281770 Y PLEK2,ZFYVE26 ZFYVE26,RAD51B NA NA NA NA ZFYVE26 326 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 68610058 68610732 68610311 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 276181 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 68644384 68644906 68644390 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 242007 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 68933312 68933746 68933512 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 46399 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 69065409 69066172 69065453 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 178496 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 69247986 69248278 69248131 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 12912 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 69417007 69417266 69417043 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 26891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 70020113 70020453 70020282 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0247 55860 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr14 70803999 70804244 70804143 Y NA COX16 NA NA NA NA COX16 20204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 11927 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 73657191 73657481 73657337 Y NA NA NA NA NA NA PSEN1 56065 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 28482 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 74224542 74224784 74224663 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45414 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45854 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 74238517 74238805 74238733 Y C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43 NA NA NA NA NA PNMA1 59389 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 74741846 74742137 74741995 Y FCF1 ABCD4,VRTN NA NA NA NA ABCD4 25622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 75125565 75125963 75125764 Y NA NA NA NA NA NA FCF1 51884 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 75750758 75751180 75750884 Y PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA FOS 7281 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 75768536 75769006 75768683 Y NA RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 9429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 75805872 75806011 75805941 Y NA RP11-293M10.5 JDP2,BATF,TMED10,NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.5 46765 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 76342346 76342569 76342455 Y BATF,TGFB3 IFT43 TGFB3 IMR90 Hi-C 24141950 IFT43 23910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 76734272 76734379 76734290 Y ESRRB NA NA NA NA NA TGFB3 286938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 77473789 77473986 77473849 Y NA RP11-7F17.1,IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 19048 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 77554689 77554897 77554781 Y NA TMEM63C KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63C 26014 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr14 81867886 81868104 81867969 Y GTF2A1,GTF2A1 STON2 NA NA NA NA STON2 32705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 81977973 81978150 81978054 Y NA SEL1L NA NA NA NA SEL1L 20055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 83674613 83674690 83674652 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 1676408 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 89771520 89771819 89771727 Y FOXN3,FOXN3 CAP2P1 NA NA NA NA CAP2P1 15582 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 89935615 89935871 89935745 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 147622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 89959649 89959712 89959681 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 123781 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 90167936 90168219 90168049 Y TDP1,FOXN3,FOXN3 NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 84443 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 90465200 90465384 90465297 Y NA EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA TDP1 45917 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 90975200 90975474 90975336 Y NA NA LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CALM1 114354 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 90988934 90989119 90989019 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 128088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 91002225 91002449 91002369 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 141379 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 91529481 91529737 91529617 Y SMEK1,GPR68,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 4501 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 92970203 92970533 92970302 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 7585 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 93510584 93510744 93510686 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 69921 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 93511721 93512085 93511905 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 68580 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr14 93540905 93541183 93541053 Y MOAP1,KIAA1409,C14orf109,C14orf109,BTBD7,ITPK1 ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 39482 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 95066800 95067322 95067074 Y SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3 SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3 NA NA NA NA SERPINA3 9392 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 96097186 96097458 96097322 Y NA NA NA NA NA NA SNHG10 97977 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 98666455 98666696 98666576 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 1278520 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B NA NA NA NA NA SETD3 208740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 100040610 100041006 100040947 Y SETD3,CCDC85C CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 27357 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr14 100448901 100449138 100448963 Y NA NA EML1,EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 DEGS2 175362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 100687969 100688087 100687996 Y NA YY1,RP11-638I2.4 YY1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 14548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 100807709 100808060 100808026 Y WDR25,WDR25,WARS,WARS SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA RP11-638I2.10 22905 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr14 102544859 102545271 102545048 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 58569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 103051810 103052039 103051996 Y NA RCOR1 TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 4959 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 103251609 103251698 103251662 Y NA TRAF3 NA NA NA NA TRAF3 9796 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 104583053 104583460 104583371 Y NA MIR203,KIF26A NA NA NA NA MIR203 1311 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.73931160773028 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr14 105368048 105368162 105368106 Y NA NA NA NA NA NA C14orf79 81950 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 105500263 105500628 105500453 Y NA CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 14778 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA C14orf80 1298739 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr15 20612710 20612766 20612738 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 2218629 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 22938552 22938923 22938737 Y CYFIP1 CYFIP1 NIPA2 IMR90 Hi-C 24141950 CYFIP1 48547 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 25597069 25597306 25597188 Y SNRPN,SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 84822 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 25623423 25623523 25623473 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 58605 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 30216999 30217403 30217070 Y TJP1 TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 41665 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA RP11-150L8.4 ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150L8.4 1090 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 35599049 35599138 35599102 Y NA RP11-150L8.4 ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150L8.4 9408 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39420923 39421276 39421056 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 296120 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39447330 39447720 39447666 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 269676 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39449850 39450075 39449963 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 267321 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39553586 39553959 39553839 Y NA NA NA NA NA NA RP11-624L4.1 163437 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39561378 39561942 39561743 Y THBS1 NA NA NA NA NA RP11-624L4.1 155454 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr15 39668694 39669075 39668948 Y NA RP11-624L4.1 THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 48321 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39696909 39697463 39697288 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,C15orf53 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 19933 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39703846 39704297 39704020 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 13099 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 39866856 39867109 39867069 Y FSIP1 THBS1 THBS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 THBS1 4171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 40192845 40193084 40192965 Y NA GPR176,EIF2AK4 NA NA NA NA GPR176 18009 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 40388043 40388381 40388211 Y NA BMF NA NA NA NA BMF 10712 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 41138213 41138409 41138269 Y RHOV,SPINT1,SPINT1 ZFYVE19,DNAJC17,PPP1R14D,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 3997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,PPP1R14D,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 5479 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr15 41788010 41788393 41788374 Y NA ITPKA,RPAP1 NA NA NA NA ITPKA 4419 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 41878002 41878382 41878246 Y NA RPAP1,TYRO3,MGA NA NA NA NA TYRO3 30129 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 42327713 42327843 42327787 Y MAPKBP1,PLA2G4B NA EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 64937 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 42833928 42834273 42834101 Y NA LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 4727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 43356735 43357067 43356746 Y NA UBR1 NA NA NA NA UBR1 39244 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr15 44073726 44074107 44073917 Y NA PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,MFAP1,WDR76 NA NA NA NA SERF2 6441 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 44181815 44182145 44181980 Y NA PIN4P1 NA NA NA NA PIN4P1 15373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 45004703 45005017 45004887 Y CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3028 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 48558649 48558658 48558654 Y SLC12A1 NA NA NA NA NA DUT 62550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 50620432 50620711 50620437 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 24814 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 51369445 51369616 51369500 Y TRPM7,SPPL2A NA NA NA NA NA AP4E1 170576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 51477619 51477870 51477745 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA AP4E1 278750 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 52153526 52153874 52153708 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 33701 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA RFX7,TEX9 NA NA NA NA RFX7 19298 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 57844002 57844282 57844063 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 37824 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 58574640 58574908 58574743 Y LIPC NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 465269 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 141759 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 59023904 59024166 59024035 Y RNF111 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 16011 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr15 59138361 59138756 59138559 Y NA RNF111 NA NA NA NA RNF111 16618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 59862569 59862935 59862765 Y NA RP11-112N19.2,GCNT3 NA NA NA NA RP11-112N19.2 19277 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 61113423 61113507 61113465 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 344046 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 62130295 62130308 62130301 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 220364 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 7.9440036624178 chr15 62896766 62896914 62896838 Y NA NA TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 216041 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 63142999 63143362 63143082 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 100010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 63368396 63368491 63368444 Y NA TPM1,RP11-244F12.3,LACTB NA NA NA NA RP11-244F12.3 28810 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 63439577 63439949 63439764 Y NA LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 8271 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 63766170 63766327 63766326 Y HERC1,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 28466 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr15 64060591 64060833 64060743 Y USP3,HERC1,DAPK2 NA NA NA NA NA HERC1 63308 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 64188807 64189333 64189164 Y USP3,HERC1 NA NA NA NA NA HERC1 64666 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 NA NA NA NA NA OAZ2 72252 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 65185651 65186463 65186157 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 15638 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 65186654 65187183 65187027 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16 ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 14918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 66125063 66125305 66125185 Y NA DENND4A SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND4A 42432 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 66301204 66301604 66301404 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 218573 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 66764584 66765048 66764851 Y NA SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4 NA NA NA NA SNAPC5 23103 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 67378105 67378547 67378289 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 24004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 68176779 68177152 68176934 Y NA NA PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 167365 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 68238127 68238678 68238396 Y NA NA PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 105839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 68260561 68260756 68260687 Y C15orf61 NA PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 83761 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA CALML4 54729 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 69453904 69454158 69454121 Y GLCE GLCE NA NA NA NA GLCE 2981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 69958901 69959304 69959004 Y TLE3 NA TLE3,C15orf50,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 215778 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 70787270 70787553 70787302 Y TLE3 NA TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 266379 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 70801545 70802091 70801763 Y TLE3 NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 251841 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 70867778 70867861 70867857 Y NA NA NA NA NA NA UACA 186071 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 70877631 70877741 70877691 Y NA NA UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 176191 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 71008529 71008840 71008773 Y NA UACA NA NA NA NA UACA 45092 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 72213908 72214290 72214099 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 190309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 73939698 73939908 73939794 Y NA NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 15223 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 74681899 74682338 74682078 Y SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 42470 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 74689389 74689592 74689450 Y SEMA7A,SEMA7A SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 35216 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 74909072 74909376 74909224 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 20231 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 75328661 75328897 75328778 Y MAN2C1,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 14765 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 75496316 75496728 75496439 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39 C15orf39 NA NA NA NA C15orf39 10332 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 76639629 76639850 76639740 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 77055500 77055901 77055892 Y NA NA NA NA NA NA SCAPER 139884 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 77351977 77352357 77352309 Y NA TSPAN3 PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN3 21969 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 78364826 78365348 78365071 Y DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 2718 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 78667581 78667654 78667595 Y NA CRABP1 CRABP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CRABP1 36915 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 83681404 83681605 83681512 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 3011 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 83722004 83722168 83722109 Y NA C15orf40,BTBD1 NA NA NA NA BTBD1 11938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 83992236 83992397 83992320 Y BNC1 NA NA NA NA NA HDGFRP3 117466 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 86131454 86131632 86131493 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 204629 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 86547032 86547326 86547179 Y AGBL1 NA NA NA NA NA KLHL25 210771 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 12745 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 90005846 90006063 90005954 Y NA NA NA NA NA NA POLG 129754 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA KIF7 877 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 90456787 90457058 90456927 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA C15orf38 2599 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 90951105 90951410 90951208 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21655 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 90955763 90956502 90956124 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 26313 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 92486330 92486707 92486433 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 340364 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 ASB9P1,FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3710 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 ASB9P1,FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 93779330 93779873 93779589 Y CHD2 NA NA NA NA NA RGMA 148897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 93864881 93865242 93865107 Y NA NA NA NA NA NA RGMA 234448 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr15 94670993 94671018 94671006 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 101749 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 95387780 95387932 95387839 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 615013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 96807705 96807805 96807755 Y NA NA LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 59362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 96867848 96868085 96868000 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 505 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 96871345 96871608 96871517 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 2755 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 98545444 98546413 98546248 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 84660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 99358585 99358846 99358731 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 168385 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 99403545 99404056 99403701 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 213345 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 99975346 99975780 99975666 Y NA MEF2A LRRC28,LYSMD4,MEF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2A 39590 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr15 102213485 102213850 102213667 Y NA TM2D3,TARSL2 NA NA NA NA TM2D3 22891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr16 145023 145249 145139 Y NHLRC4 SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 20017 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 643606 643989 643708 Y SSTR5,RAB40C,RAB40C PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A NA NA NA NA RAB40C 6249 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 1349375 1349723 1349678 Y NA UBE2I,BAIAP3 NA NA NA NA UBE2I 3825 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,BAIAP3,GNPTG NA NA NA NA BAIAP3 224 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB10 27349 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA NTN3 809 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS30P 4601 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr16 2904626 2904661 2904644 Y NA PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS22 1510 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 2955389 2955781 2955669 Y NA PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA FLYWCH1 4157 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 3031604 3031823 3031757 Y PAQR4 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA PKMYT1 3064 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 3060017 3060177 3060084 Y NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 6269 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 3237977 3238591 3238121 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 45630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 3931357 3931444 3931401 Y C16orf90 CREBBP NA NA NA NA CREBBP 2630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 4422682 4422871 4422704 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 2833 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 4880649 4880773 4880729 Y NA ROGDI,UBN1,GLYR1 NA NA NA NA UBN1 13893 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 4900331 4900638 4900507 Y MGRN1,UBN1,UBN1 ROGDI,UBN1,GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 4988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 9147014 9147397 9147240 Y ABAT C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 36108 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 10221722 10221780 10221751 Y NA NA NA NA NA NA ATF7IP2 196511 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 10596760 10596940 10596850 Y EMP2 NA NA NA NA NA EMP2 75615 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 10710369 10710537 10710438 Y NA EMP2 NA NA NA NA EMP2 37814 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 11188261 11188580 11188312 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 151916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 11299930 11300255 11300088 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,SOCS1 RMI2,SOCS1 CLEC16A,RMI2,SNN,TXNDC11 IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 41221 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 11345704 11346020 11345999 Y NA RMI2,SOCS1,PRM1 NA NA NA NA SOCS1 2016 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 11407202 11407368 11407306 Y NA PRM1 CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 PRM1 33995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 15738027 15738375 15738313 Y NA KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 2903 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 16055043 16055430 16055122 Y NDE1,NDE1,ABCC1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 13609 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 17257893 17258025 17257960 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 304713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 19103583 19103758 19103655 Y NA COQ7,ITPRIPL2 NA NA NA NA ITPRIPL2 19496 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 19222406 19222654 19222461 Y NA SYT17 NA NA NA NA SYT17 45113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 19532119 19532450 19532314 Y CCP110 RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62 NA NA NA NA GDE1 652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 20917792 20918142 20917892 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 DNAH3 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D3 8086 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 21295163 21295477 21295440 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 14693 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 21637887 21638686 21638408 Y CRYM,METTL9,IGSF6 METTL9 NA NA NA NA METTL9 31348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 22202219 22202462 22202295 Y NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 25025498 25025977 25025718 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 511 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 25069852 25070174 25070015 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 44865 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 25740472 25740795 25740634 Y ZKSCAN2,HS3ST4 NA NA NA NA NA ZKSCAN2 473220 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 27149778 27150235 27150058 Y NA NA HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 127880 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 27275592 27275718 27275658 Y NA NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 2397 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 27386500 27386691 27386620 Y C16orf82,IL21R,IL4R NA NA NA NA NA IL4R 63511 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 28496890 28497119 28497100 Y NA CLN3 NA NA NA NA CLN3 7777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 29709853 29709969 29709906 Y QPRT SPN,QPRT NA NA NA NA QPRT 37253 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 29954900 29955228 29955066 Y NA SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 4694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 30545067 30545182 30545127 Y ZNF764 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA ZNF747 894 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM NA NA NA NA NA FUS 75554 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 46671518 46671564 46671541 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 17980 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 47765433 47765682 47765558 Y NA NA ITFG1,ABCC12,NETO2,ABCC11,DNAJA2,PHKB IMR90 Hi-C 24141950 ITFG1 269373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 48657602 48657960 48657802 Y SIAH1,N4BP1 N4BP1 ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 5543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 49893175 49893278 49893262 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 204574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 50073136 50073358 50073247 Y ZNF423,TMEM188 HEATR3 NA NA NA NA HEATR3 24494 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 50554457 50554868 50554623 Y BRD7,NKD1 NKD1 NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 NKD1 25373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 50679822 50680132 50679910 Y NA NOD2 NA NA NA NA NOD2 45382 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 54415438 54415695 54415567 Y NA NA NA NA NA NA IRX3 96763 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 54961070 54961275 54961203 Y NA IRX5 NA NA NA NA CRNDE 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr16 56985400 56985562 56985481 Y NA HERPUD1,NLRC5 CETP IMR90 Hi-C 24141950 HERPUD1 21440 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 57564039 57564411 57564096 Y ZNF319,GPR114 DOK4,CCDC102A NA NA NA NA CCDC102A 4100 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 5.34165763507404 chr16 58451447 58451830 58451588 Y GOT2,NDRG4 NDRG4 NA NA NA NA NDRG4 42920 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 64096970 64097246 64097108 Y NA NA NA NA NA NA TK2 2487201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 66170755 66170866 66170865 Y NA NA CDH11,LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 TK2 413581 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 CA7,NAE1,PDP2,CDH16 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD CDH16,RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 66988106 66988414 66988274 Y NA CDH16,RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA CES3 4726 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 67047765 67048035 67047886 Y FBXL8,CES4A CBFB NA NA NA NA CBFB 12984 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 67435763 67435871 67435819 Y NA TPPP3,HSD11B2 NA NA NA NA TPPP3 10325 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 67513836 67514185 67514007 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,PSMB10,ACD,FAM65A,ATP6V0D1 ATP6V0D1,FAM65A NA NA NA NA ATP6V0D1 696 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.28717392927633 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 68415381 68415552 68415488 Y NA NA NA NA NA NA SMPD3 65039 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA SMPD3 61554 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 68778758 68779020 68778839 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 9630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 68818214 68818347 68818232 Y CDH1 CDH1 NA NA NA NA CDH1 49086 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 68824913 68825217 68824976 Y NA NA NA NA NA NA CDH1 55785 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8,TMED6 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 69603393 69603628 69603450 Y NA NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 6396 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr16 69796957 69797361 69797156 Y EXOSC6,WWP2 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2748 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 70727989 70728270 70728171 Y NA MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 10020 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 72257967 72258413 72258290 Y NA NA HPR IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 131637 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 72882732 72883050 72882991 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 208547 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 73031148 73031384 73031285 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 60213 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 75037611 75037819 75037667 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 5540 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 75683626 75683906 75683817 Y NA ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA KARS 3085 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 78275573 78275755 78275693 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 144263 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 80710391 80710578 80710565 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 137760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 81026963 81027197 81027054 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 10906 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 81555726 81556034 81555821 Y CMIP NA NA NA NA NA CMIP 78951 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 81592572 81592719 81592646 Y GAN,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 115797 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 81659418 81659741 81659491 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 110961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 82663331 82663687 82663514 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 4923 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 82685978 82686417 82686161 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 27570 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 83960761 83960901 83960832 Y NA MLYCD,OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA OSGIN1 18986 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 84545075 84545257 84545139 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104426 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 84548498 84548894 84548797 Y COTL1 NA NA NA NA NA COTL1 100789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 84799622 84799923 84799772 Y KLHL36 NA NA NA NA NA CRISPLD2 51667 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr16 85387544 85387685 85387655 Y NA NA LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0513 328169 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 85424430 85424739 85424585 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 296940 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 85456219 85456617 85456516 Y FAM92B NA KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 265062 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85470615 85470779 85470696 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 250900 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 85471045 85471389 85471119 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 250290 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85548685 85548970 85548791 Y NA NA KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 172709 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85569070 85569366 85569223 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 152313 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 85678973 85679150 85679027 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 42529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85903471 85903703 85903566 Y NA IRF8 IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 26706 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr16 85958354 85958601 85958447 Y IRF8 IRF8 NA NA NA NA IRF8 27945 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 85978806 85979044 85978907 Y NA IRF8 COX4I1,IRF8,COX4NB IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 48397 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 86018969 86019433 86019250 Y IRF8 NA COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 88560 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 87878915 87879213 87879066 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 21881 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 87904170 87904524 87904347 Y FBXO31 SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 3076 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr16 87981759 87982021 87981940 Y ZCCHC14,BANP,BANP,BANP BANP CA5A K562 ChIA-PET 22265404 BANP 909 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 88337697 88337985 88337883 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 88557943 88558427 88558193 Y FAM38A,CBFA2T3,ZFPM1 ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 40218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 88575081 88575169 88575126 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM1 57356 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,SNAI3,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 88836450 88836610 88836518 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 13009 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 88839181 88839507 88839410 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 10112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 89131990 89132116 89132053 Y NA ACSF3 CBFA2T3,ACSF3 IMR90 Hi-C 24141950 ACSF3 20667 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 4.10896741159541 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr16 89683162 89683271 89683207 Y DPEP1,C16orf55 CPNE7,DPEP1,CHMP1A NA NA NA NA DPEP1 5446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 189449 189776 189505 Y NA RPH3AL NA NA NA NA RPH3AL 44269 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 473610 473838 473725 Y FAM101B NA NA NA NA NA RPS4XP17 84949 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 851603 851932 851829 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 29078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 872261 872610 872409 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 8400 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr17 872760 873162 873150 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7848 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 873777 873849 873813 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7161 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF2,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 1926126 1926449 1926286 Y NA DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA DPH1 4955 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 2084621 2084734 2084671 Y NA NA NA NA NA NA SRR 119943 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 2087949 2088276 2088112 Y NA NA NA NA NA NA SRR 116401 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 2614073 2614260 2614119 Y KIAA0664 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 119569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 132635 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 4552128 4552263 4552196 Y NA NA NA NA NA NA PELP1 53369 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 4737531 4737755 4737558 Y PLD2,MINK1 GLTPD2,PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 2848 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 4753672 4753828 4753714 Y UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 18989 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 7380968 7381115 7381038 Y EIF5A TMEM102,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 4467 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 7657457 7657665 7657600 Y NLGN2,AMAC1L3,WRAP53 NA NA NA NA NA EFNB3 50937 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 9549792 9549873 9549833 Y NA USP43 NA NA NA NA USP43 3777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 10581804 10582199 10582113 Y MYH4 SCO1 NA NA NA NA SCO1 17493 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 14276548 14276781 14276600 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3B1 74148 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 16310492 16310776 16310647 Y NA UBB TRPV2,C17orf76-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 UBB 28380 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 16922074 16922240 16922157 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 21619 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 16924574 16924970 16924629 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 18889 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 17098696 17098916 17098799 Y MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN PLD6,FLCN NA NA NA NA PLD6 8713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 17686462 17687119 17686716 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 51206 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr17 17861466 17861608 17861562 Y SMCR8 TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 12128 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 20012372 20012672 20012482 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 101715 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 21003151 21003338 21003245 Y NA DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21339 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr17 25479961 25480088 25479965 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 139014 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 25568498 25568933 25568830 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 50169 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 25821459 25821654 25821516 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 39789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 25821729 25821988 25821800 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 40059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 6.84827901932569 chr17 25823612 25823763 25823676 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 41942 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 25833655 25833928 25833707 Y NA NA NA NA NA NA KSR1 51985 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 25981784 25982180 25981982 Y NA NA NA NA NA NA NOS2 143345 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 26216019 26216352 26216295 Y NA NA NA NA NA NA NOS2 90494 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 13.5595924582649 chr17 26458610 26458889 26458687 Y NA NA NA NA NA NA NLK 91847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 26712546 26712820 26712749 Y NA POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA VTN 14436 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 26734916 26735044 26734980 Y NA SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 2701 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 26894495 26894823 26894797 Y NA UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5 NA NA NA NA PIGS 2067 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 27100910 27101180 27101019 Y NA NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 31908 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 27192241 27192644 27192466 Y SPAG5,DHRS13 ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA ERAL1 12285 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 27220048 27220212 27220121 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA FLOT2 2485 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 27299558 27299805 27299699 Y NA PHF12 NA NA NA NA PHF12 22769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 27473466 27473709 27473569 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 31721 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 27890961 27891203 27891032 Y SSH2,ABHD15 ABHD15,ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA TP53I13 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 28070496 28070746 28070685 Y SSH2,EFCAB5 NA NA NA NA NA CORO6 122571 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 28431711 28432027 28431733 Y NA NSRP1 NA NA NA NA NSRP1 8512 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 28533256 28533617 28533437 Y SLC6A4 SLC6A4,SNORD63 NA NA NA NA SLC6A4 27403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 29609076 29609437 29609257 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 107205 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 79002 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 29816760 29817002 29816913 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 100118 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 30588630 30588823 30588726 Y NA NA NA NA NA NA C17orf75 86219 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 30886393 30886627 30886490 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 74756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 30923806 30924081 30923942 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 112169 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 31072918 31073214 31073077 Y NA NA NA NA NA NA MYO1D 128981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 32979074 32979302 32979236 Y NA NA NA NA NA NA ZNF830 307247 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 33407531 33407770 33407731 Y NA RFFL,RAD51D NA NA NA NA RFFL 6568 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA NA NA NA NA NA AP2B1 115967 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L NA NA NA NA NA AP2B1 115262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 35608489 35608691 35608590 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 156218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 36032703 36032990 36032855 Y NA DDX52 NA NA NA NA DDX52 31210 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 36062721 36062883 36062777 Y DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 40323 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 36068867 36069181 36068997 Y ACACA,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 34025 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 36101828 36102076 36101951 Y DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 1130 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 36102823 36103051 36102995 Y ACACA,DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 155 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 36103612 36103841 36103732 Y HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA HNF1B 375 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 NA NA NA NA NA SOCS7 65535 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 36813395 36813674 36813472 Y ARHGAP23,C17orf96,SRCIN1 C17orf96,MLLT6 NA NA NA NA C17orf96 15513 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 37024501 37024874 37024707 Y NA CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1 NA NA NA NA LASP1 389 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 37056956 37057300 37057070 Y NA SNORA21,RPL23,LASP1 NA NA NA NA LASP1 32844 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 37862068 37862252 37862166 Y GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2,ERBB2 ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7 NA NA NA NA PGAP3 11018 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 38227405 38227627 38227516 Y GSDMB THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 11937 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 38229285 38229466 38229392 Y GSDMB THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 13817 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 38263317 38263642 38263602 Y NA MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 8339 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 38263980 38264229 38263993 Y RARA,RARA,MSL1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9002 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 38467869 38468243 38468028 Y NA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 4425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 38707495 38707811 38707586 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA TNS4 51646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 39113005 39113367 39113263 Y NA KRT23 NA NA NA NA KRT23 21119 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 39682585 39682843 39682821 Y JUP,KRTAP4-11,KRT19 KRT19 NA NA NA NA KRT19 25 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 39832714 39833014 39832798 Y RAB5C,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,EIF1 EIF1,GAST SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,EIF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF1 10123 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 40071903 40071935 40071919 Y NA ACLY,TTC25,CNP NA NA NA NA ACLY 12860 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 40418689 40419364 40419075 Y EZH1,KLHL11,DNAJC7,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,RAB5C,STAT3,STAT3,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A GHDC,HCRT,KCNH4,RAB5C IMR90 Hi-C 24141950 STAT5B 7361 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 48225 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 41421158 41421352 41421255 Y NA NA NBR1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4D 52975 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 41658472 41658623 41658548 Y NA ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 3484 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.73931160773028 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr17 43095998 43096402 43096133 Y NA NMT1,DCAKD NA NA NA NA NMT1 30576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 43200086 43200194 43200154 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 7773 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 43253543 43253622 43253574 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 17476 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 44268679 44268848 44268762 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 298931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 44847625 44847956 44847902 Y WNT3 NA NA NA NA NA RPS7P11 50092 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 45867525 45867625 45867557 Y NA OSBPL7,MRPL10,LRRC46,SCRN2 NA NA NA NA OSBPL7 29575 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 46043736 46043949 46043771 Y PRR15L AC003665.1,PNPO,PRR15L,CDK5RAP3 NA NA NA NA CDK5RAP3 560 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 46291488 46291927 46291575 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 112769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 46696942 46697254 46696999 Y NA HOXB4,HOXB3,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 4585 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB3,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 47081081 47081234 47081133 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 8307 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 47098330 47098693 47098445 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 25556 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 47467973 47468124 47468044 Y ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 22122 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 47816909 47817569 47817208 Y ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 32533 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 47913501 47913854 47913589 Y TMEM92 KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 NA NA NA NA RP11-613C6.4 42796 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr17 48066634 48067004 48066930 Y NA DLX4,DLX3 NA NA NA NA DLX3 3584 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 48287695 48288075 48287880 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 10702 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 49008376 49008926 49008868 Y NA RP11-700H6.1 WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 11148 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 49075036 49075414 49075227 Y NA NA NA NA NA NA RP11-700H6.1 54962 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 49196679 49197214 49196965 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 49210436 49210615 49210551 Y SPAG9 SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 SPAG9,NME1-NME2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPAG9 14210 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 53047778 53047982 53047880 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA COX11 3632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 55763716 55764071 55763861 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 161346 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 55976255 55976501 55976378 Y OR4D2 NA NA NA NA NA MRPS23 50838 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 55978714 55978990 55978831 Y NA NA NA NA NA NA CUEDC1 51694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 56441767 56441894 56441848 Y NA SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 13313 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr17 56468859 56469318 56469005 Y RNF43 SUPT4H1,RNF43 NA NA NA NA RNF43 23638 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 62000 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57932450 57932798 57932624 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 15823 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57932982 57933345 57933242 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 16355 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57952277 57952457 57952367 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 15847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 57975372 57975465 57975395 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA RPS6KB1 6925 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA TBX2 261797 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 59784149 59784411 59784258 Y BRIP1 NA NA NA NA NA NACA2 117586 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA NA NA NA NA NA RP11-464D20.2 129839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA KCNH6,DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 62151740 62151983 62151921 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,C17orf60,DDX5,ERN1 NA NA NA NA NA ERN1 54196 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 63552177 63552345 63552261 Y NA AXIN2 NA NA NA NA AXIN2 3420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr17 63996608 63996849 63996729 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 189353 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 64646348 64646488 64646431 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 312538 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 64690651 64690854 64690753 Y PRKCA,CACNG4 NA NA NA NA NA CACNG4 268172 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 64948296 64948612 64948339 Y CACNG4 CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 10414 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 64962057 64962755 64962345 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 3031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.42413950966285 chr17 65318264 65318584 65318454 Y NA PSMD12 NA NA NA NA PSMD12 42159 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 65991969 65992126 65992052 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA C17orf58 4204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 66030294 66030564 66030453 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 659 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 67055729 67056007 67055895 Y ABCA6,ABCA9 NA NA NA NA NA ABCA8 106196 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 70113355 70113523 70113439 Y NA SOX9 NA NA NA NA SOX9 1638 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 70335121 70335458 70335290 Y NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 219960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 70398105 70398184 70398145 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 223186 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 70426216 70426228 70426222 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 195142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 70461830 70461987 70461862 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 159383 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 70514986 70515384 70515137 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 105986 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 70779461 70779663 70779556 Y CPSF4L NA NA NA NA NA LINC00511 144850 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 72044366 72044539 72044453 Y NA NA NA NA NA NA RPL38 153182 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 72745955 72746124 72746086 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3164 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 72780618 72780981 72780928 Y GPR142 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 9996 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr17 73073656 73074040 73073685 Y RAB37,RAB37,ARMC7 KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7 NA NA NA NA SLC16A5 7782 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 73087456 73087829 73087515 Y NA ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C NA NA NA NA SLC16A5 5634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr17 73351805 73351921 73351820 Y NA AC011933.1,GRB2 NA NA NA NA AC011933.1 38395 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 73426423 73426691 73426652 Y MRPS7 GRB2,KIAA0195 NA NA NA NA KIAA0195 8549 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr17 73531533 73531826 73531590 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2 NA NA NA NA LLGL2 12372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 73641652 73641951 73641723 Y CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA SAP30BP 19245 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 73805010 73805399 73805102 Y NA GALK1,UNK,H3F3B,WBP2 NA NA NA NA H3F3B 25036 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7,FOXJ1 NA NA NA NA FOXJ1 6388 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr17 74134600 74134832 74134764 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1 EXOC7,FOXJ1 NA NA NA NA FOXJ1 548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.0132427685033 chr17 74255513 74255743 74255629 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 21059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 74258854 74259227 74259062 Y ST6GALNAC1 ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 24400 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 29972 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 74994156 74994635 74994367 Y SRSF2 NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00338,SEC14L1 86163 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr17 75388510 75388802 75388677 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 307712 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 9.86152178782899 chr17 76147929 76148019 76147974 Y NA TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID NA NA NA NA SYNGR2 14620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76169246 76169385 76169328 Y PGS1,SYNGR2 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 6607 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76268764 76268973 76268872 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1 NA TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 60497 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 76335027 76335218 76335120 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 18940 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76357167 76357466 76357379 Y NA SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 3009 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76361692 76362147 76361865 Y NA SOCS3,PGS1 PGS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 7534 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76731686 76732147 76732043 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 44232 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr17 76801462 76801678 76801575 Y DNAH17,USP36,CYTH1 CYTH1,USP36 NA NA NA NA CYTH1 25083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.28717392927633 chr17 77778301 77778701 77778443 Y CBX2,CBX8,CBX4 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4819 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 77803693 77803802 77803748 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 7426 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 77814369 77814482 77814427 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 3141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 8.35490040357734 chr17 78087852 78088239 78088062 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA GAA 14497 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 78121490 78121818 78121740 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 2508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr17 78471918 78472124 78472096 Y NA NPTX1,RPL32P31,RPTOR RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6 IMR90 Hi-C 24141950 NPTX1 22275 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 78810006 78810317 78810174 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 153081 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 79107096 79107396 79107264 Y AATK NA NA NA NA NA AZI1 87403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 79313114 79313481 79313281 Y NA SLC38A10,LINC00482,TMEM105 SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,ACTG1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM105 10640 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 16851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 17338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 68280 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.2 27515 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 80029941 80030069 80030002 Y HEXDC STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA DUS1L 8178 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr17 80594524 80594906 80594740 Y UTS2R,WDR45L NA NA NA NA NA RAB40B 59698 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr17 80833209 80833609 80833394 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 125269 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr17 80834580 80834819 80834710 Y NA NA NA NA NA NA TBCD 126640 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 80845276 80845458 80845382 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 137336 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr17 81099382 81099733 81099616 Y NA NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 63815 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 813044 813594 813404 Y YES1 YES1 NA NA NA NA YES1 2497 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr18 2223503 2223515 2223509 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 345993 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 2302701 2302761 2302738 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 266747 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 2854165 2854304 2854234 Y NA EMILIN2 LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 EMILIN2 9137 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 2978254 2978441 2978377 Y NA LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 32872 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 2980400 2980653 2980492 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,SMCHD1,EMILIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 30660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 3383416 3383792 3383691 Y TGIF1,TGIF1 TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 25814 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 3612432 3612598 3612515 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 202826 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr18 3676188 3676369 3676278 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 266582 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 5629750 5630120 5629929 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P27 830894 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 6556939 6557309 6557113 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P27 95925 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr18 6661988 6662345 6662167 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP28 65372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr18 7460129 7460467 7460298 Y NA NA NA NA NA NA PTPRM 104313 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 8140065 8140370 8140233 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 467073 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 8730480 8730718 8730581 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 123037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 8912604 8912903 8912754 Y NA NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 187725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 8949988 8950319 8950097 Y NA NA CCDC165,RAB12 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 9219810 9220134 9219877 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD12 85584 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 9643596 9643835 9643765 Y NA PPP4R1 PPP4R1,VAPA,ANKRD12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1 30358 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 9812085 9812326 9812208 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA NA NA NA NA VAPA 99673 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 9835366 9835644 9835528 Y NA NA NA NA NA NA VAPA 76355 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 9838439 9838883 9838628 Y NA NA NA NA NA NA VAPA 73116 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 9877272 9877635 9877453 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 34364 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 10951449 10951581 10951501 Y FAM38B NA NA NA NA NA NAPG 427547 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr18 12765132 12765369 12765274 Y CEP76 NA NA NA NA NA CEP76 64356 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr18 12777545 12777688 12777651 Y NA NA NA NA NA NA CEP76 76769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.60234602734376 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 13137958 13138425 13138153 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 148597 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 13542199 13542509 13542255 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 182150 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 13562482 13563053 13562649 Y RNMT,C18orf19,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 161606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 13566903 13567274 13567096 Y RNMT,C18orf19,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 157385 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 13890423 13890585 13890504 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 165761 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 19090172 19090203 19090178 Y NA NA NA NA NA NA ESCO1 88642 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 19624308 19624603 19624566 Y NA NA NA NA NA NA GATA6 122801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr18 19862450 19862773 19862669 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 115046 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 20138967 20139156 20139093 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 237068 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 21002815 21003000 21002900 Y RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8 TMEM241,RIOK3 NA NA NA NA TMEM241 12925 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 29196916 29197276 29197096 Y NA TTR NA NA NA NA TTR 27227 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 33311016 33311295 33311162 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 151935 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 33711406 33711801 33711526 Y NA SLC39A6,ELP2 NA NA NA NA ELP2 3999 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 34107164 34107375 34107280 Y RPRD1A,FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 299694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 35114898 35115196 35115047 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 707740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 237620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 414813 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 46547875 46548139 46548027 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 DYM 437578 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 47252630 47252839 47252704 Y LIPG NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 85491 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr18 47325286 47325511 47325399 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 12819 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr18 49868333 49868847 49868665 Y DCC NA NA NA NA NA MEX3C 1125659 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 51860775 51860976 51860876 Y NA NA NA NA NA NA POLI 67001 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 52274779 52275056 52274934 Y NA NA NA NA NA NA RAB27B 108035 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 269024 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 55710685 55710979 55710720 Y NEDD4L NEDD4L NA NA NA NA NEDD4L 1086 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 55922134 55922493 55922309 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 212535 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 56161690 56161866 56161857 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 103997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr18 56359373 56359598 56359412 Y NA MALT1 NA NA NA NA MALT1 22755 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 68044126 68044452 68044254 Y NA NA RTTN IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 89989 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 70535937 70536272 70536159 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 1276828 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 74768655 74769369 74768895 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 236092 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 74774000 74774964 74774473 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 241437 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 76955177 76955415 76955295 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 127892 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 77218531 77218849 77218576 Y NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 64675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr18 77616666 77616803 77616722 Y NA NA KCNG2,CTDP1,PQLC1 IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 92861 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 675402 675838 675677 Y FSTL3 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA FSTL3 1010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 752652 753043 752777 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 42032 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 5.88951995662009 chr19 888565 888780 888647 Y SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A NA NA NA NA MED16 2438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 953220 953565 953383 Y EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA WDR18 27609 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.69807067043587 chr19 958944 959162 959060 Y NA R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA WDR18 22012 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 1133542 1133865 1133752 Y C19orf22,ARID3A,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 31606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 1284432 1284856 1284552 Y REEP6,ONECUT3,GAMT,EFNA2 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA EFNA2 279 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 1410481 1410741 1410600 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 4913 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 1632932 1633212 1633140 Y STK11 MBD3,UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 17392 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 2330710 2331138 2330903 Y NA SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 4091 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr19 2529574 2529858 2529677 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 55454 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 2888802 2889178 2888846 Y NA ZNF555,ZNF556,ZNF57 NA NA NA NA ZNF57 9718 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 2950130 2950295 2950189 Y NA ZNF77,TLE6 THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF77 7161 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 4061318 4061457 4061400 Y SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 3486 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 4375126 4375688 4375404 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 22856 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 4677231 4677531 4677381 Y NA TNFAIP8L1,C19orf10,DPP9 NA NA NA NA C19orf10 8849 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 5046594 5046918 5046679 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 79469 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 5968660 5968756 5968716 Y PSPN,SLC25A41,TMEM146,PRR22,NRTN,RFX2,ACSBG2 RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7397 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 6228782 6229121 6229035 Y NA RFX2,MLLT1 NA NA NA NA RFX2 31199 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 6423549 6423953 6423663 Y NA GTF2F1,KHSRP,CRB3,SLC25A23 NA NA NA NA KHSRP 744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 6766042 6766297 6766158 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 443 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 8051436 8051456 8051449 Y NA TIMM44,ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 17087 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 8115456 8115774 8115631 Y PRAM1,STXBP2,C19orf59 ELAVL1 NA NA NA NA CCL25 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 9895815 9895899 9895870 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 40593 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 9902440 9902843 9902543 Y ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 33649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 NA NA NA NA NA PIN1 112303 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 10352370 10352740 10352555 Y KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL4 7837 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 10865897 10866291 10865968 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 DNM2 NA NA NA NA DNM2 39142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 10949257 10949551 10949405 Y CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4 TMED1,CARM1 NA NA NA NA TMED1 4263 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr19 10992105 10992492 10992295 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 11916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 11375157 11375492 11375297 Y DOCK6 DOCK6 TSPAN16 MCF7 ChIA-PET 22265404 DOCK6 4000 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 DOCK6,CCDC159 NA NA NA NA DOCK6 33225 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 11675625 11675958 11675811 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 7436 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 11679134 11679427 11679281 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 10945 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 12724614 12724901 12724730 Y ZNF136,ZNF44,ZNF563,ZNF564,JUNB,C19orf43,ZNF490,ZNF791,MAN2B1 ZNF791,ZNF490,CTD-2192J16.15 NA NA NA NA ZNF791 4882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 12844296 12844608 12844453 Y NA FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1 NA NA NA NA C19orf43 707 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 12889371 12889726 12889619 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10584 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13048278 13048689 13048364 Y MAN2B1 GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1 NA NA NA NA CALR 886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13954357 13954714 13954441 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 50083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13955108 13955589 13955298 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 NA NA NA NA NA ZSWIM4 50834 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 14084978 14085262 14085120 Y NA DCAF15,RFX1 NA NA NA NA DCAF15 23674 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 14089228 14089566 14089336 Y CCDC130,PKN1,CD97,RFX1 DCAF15,RFX1 NA NA NA NA RFX1 26285 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 14126359 14126500 14126444 Y NANOS3,IL27RA RFX1,IL27RA NA NA NA NA RFX1 10508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 14172809 14173223 14173004 Y NA IL27RA,EEF1DP1,SAMD1 NA NA NA NA EEF1DP1 5931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 17.3946287090873 chr19 14241315 14241555 14241521 Y NA SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA ASF1B 4213 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 14545997 14546246 14546106 Y NA DDX39A,PKN1 NA NA NA NA PKN1 4132 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 14783026 14783447 14783388 Y CD97,PKN1,ZNF333,EMR3 ZNF333 NA NA NA NA ZNF333 15166 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 14999338 14999543 14999395 Y NA NA NA NA NA NA AC005255.3 98217 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 15310768 15311119 15311001 Y NA NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 976 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 15333627 15333747 15333631 Y SYDE1,NOTCH3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 23835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 15666666 15666804 15666739 Y NA NA NA NA NA NA CYP4F3 82903 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F3 197910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 16462018 16462188 16462137 Y CIB3 KLF2 NA NA NA NA KLF2 28390 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 16480475 16480862 16480751 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 46847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 16482225 16482879 16482589 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 48597 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 17200078 17200517 17200217 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15487 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18214987 18215493 18215283 Y NA MAST3,PIK3R2 NA NA NA NA MAST3 8384 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18365499 18365609 18365555 Y B3GNT3 KIAA1683,JUND,MIR3188 NA NA NA NA KIAA1683 17710 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18382556 18382948 18382783 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4 NA NA NA NA KIAA1683 371 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18393747 18393881 18393780 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4 NA NA NA NA MIR3188 2860 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 18533547 18533601 18533574 Y ARRDC2,IL12RB1 SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 5873 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 19003165 19003498 19003332 Y NCAN,GDF1 GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3 NA NA NA NA GDF1 1407 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 19432680 19432782 19432710 Y NA MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 3027 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 19483893 19484092 19484012 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 10543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 23310606 23310980 23310793 Y NA NA NA NA NA NA ZNF724P 120212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA URI1 959334 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 32732739 32732801 32732770 Y NA NA ZNF536 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF507 101699 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 33532238 33532582 33532339 Y RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 21212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 33538325 33538659 33538479 Y RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 15135 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 33789888 33790286 33790087 Y NA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 1184 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 33796303 33796393 33796348 Y SLC7A9,CEBPA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 4833 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 33875552 33875576 33875564 Y NA CEBPG NA NA NA NA CEBPG 13316 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 33894583 33894808 33894696 Y CEBPA CEBPG NA NA NA NA CEBPG 32347 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr19 34752762 34752909 34752837 Y NA KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 9320 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 35491833 35492367 35492256 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN NA NA NA NA GRAMD1A 8145 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 35494139 35494542 35494364 Y NA ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN NA NA NA NA GRAMD1A 10451 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 36241217 36241384 36241301 Y MAG,LRFN3 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55,ARHGAP33 NA NA NA NA LIN37 3955 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 36863070 36863255 36863179 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 4846 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 38470537 38470671 38470619 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 74669 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 38482400 38482784 38482644 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 86532 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 39167742 39168127 39167771 Y NA ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 31453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 39621407 39621638 39621523 Y NA PAPL,PAK4 NA NA NA NA PAK4 6997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 39645312 39645609 39645461 Y LGALS7B PAK4 NA NA NA NA PAK4 30902 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 39810585 39810976 39810672 Y CLC,LRFN1 GMFG,SAMD4B NA NA NA NA GMFG 20036 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 39891902 39892845 39892340 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 2608 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 41304071 41304255 41304136 Y SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA EGLN2 1170 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 41681944 41682199 41682187 Y NA CYP2S1,AXL CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2S1 14755 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 41814398 41814719 41814610 Y HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2 HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 304 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,B3GNT8,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 42606774 42607144 42606983 Y NA ZNF574 NA NA NA NA ZNF574 36145 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 PSG9 63866 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr19 44124638 44124922 44124781 Y CADM4 XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA ZNF428 2612 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 44294757 44295133 44294844 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 11348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 44555398 44555498 44555444 Y ZNF155,ZNF223 ZNF222,ZNF223,ZNF284,ZNF224 NA NA NA NA ZNF223 1878 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45100230 45100376 45100298 Y NA IGSF23,PVR CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23 IMR90 Hi-C 24141950 IGSF23 14564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45189303 45189576 45189367 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 PVR NA NA NA NA PVR 44205 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA CBLC NA NA NA NA BCL3 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.83503625082239 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr19 45584780 45584791 45584786 Y CEACAM16,NKPD1 CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA MARK4 4234 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45803954 45804164 45804074 Y NA KLC3 NA NA NA NA KLC3 30528 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 59077 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 47059268 47059423 47059384 Y NA GAPDHP38,CALM3 NA NA NA NA GAPDHP38 475 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,DACT3 NA NA NA NA DACT3 19419 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 47552678 47552827 47552750 Y NA NPAS1,TMEM160 NA NA NA NA TMEM160 2790 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 47610820 47611121 47611012 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3410 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.15020834888982 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 49051864 49052159 49052158 Y NA LMTK3 NA NA NA NA LMTK3 37418 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 49577003 49577438 49577313 Y SULT2B1,MAMSTR,KCNA7 SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 9238 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA ALDH16A1 29950 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr19 50004159 50004640 50004502 Y PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11 ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD32A,SNORD34,RPS11,SNORD35B,FCGRT NA NA NA NA FCGRT 3433 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 50417620 50417965 50417778 Y NA PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 11994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 50835948 50836015 50835982 Y IL4I1,NR1H2,KCNC3 NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA KCNC3 1176 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 51059089 51059663 51059341 Y KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9639 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9014 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr19 51197974 51198378 51198356 Y NA SYT3 NA NA NA NA SYT3 28323 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 53128477 53128840 53128754 Y NA NA NA NA NA NA ZNF83 62909 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 53425304 53425713 53425359 Y ERVV-1,ZNF320 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 18141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665 NA NA NA NA ZNF665 32764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 54116077 54116235 54116154 Y NA NA DPRX IMR90 Hi-C 24141950 ZNF813 147088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 54125750 54125846 54125808 Y NA NA NA NA NA NA AC008753.3 151007 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 54288550 54288757 54288603 Y ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX AC008753.3,MIR371A NA NA NA NA MIR371A 172 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr19 54291187 54291209 54291198 Y BIRC8,ZNF845,ZNF765,ZNF761,ZNF813 AC008753.3,MIR371A NA NA NA NA MIR371A 2258 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 54291781 54292027 54291904 Y ZNF331,DPRX,NLRP12 AC008753.3,MIR371A NA NA NA NA MIR371A 2852 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 54981954 54982383 54982298 Y NA LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5 NA NA NA NA CDC42EP5 28 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 55626810 55627228 55626935 Y ZNF865,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 55721470 55721547 55721521 Y NA TMEM86B,PPP6R1 NA NA NA NA TMEM86B 18100 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA TMEM238 12795 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 SBK2 14871 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr19 58480028 58480253 58480224 Y NA ZNF256,ZNF606 NA NA NA NA ZNF256 22985 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr19 58784706 58785064 58784920 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 NA NA NA NA ZNF8 3254 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 58911739 58912056 58911822 Y NA A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 868 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr19 59050036 59050316 59050176 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1758 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 3487019 3487372 3487201 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 34135 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.05448370579771 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA AC108488.4 1097 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 8712183 8712281 8712245 Y NA NA LINC00299,LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 104694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 8767111 8767480 8767322 Y NA ID2 LINC00299,LOC339788,LOC100506274 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 49495 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr2 8773908 8774094 8774001 Y NA ID2,AC011747.7 LINC00299,LOC339788,LOC100506274,ID2 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 42881 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 10258344 10258406 10258377 Y NA CYS1,RRM2 NA NA NA NA RRM2 2049 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 10441145 10441558 10441458 Y KLF11 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 130 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 10471190 10471549 10471320 Y HPCAL1,HPCAL1 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 30175 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 11531800 11532088 11531893 Y NTSR2,KCNF1,C2orf50 ROCK2 ROCK2,PDIA6,PQLC3,KCNF1,FLJ33534,C2orf50,GREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 45344 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 11547236 11547448 11547321 Y NA NA ROCK2,PQLC3,C2orf50 IMR90 Hi-C 24141950 E2F6 56849 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 12633247 12633315 12633291 Y NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 817526 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 12703502 12703613 12703558 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 887781 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 12928047 12928351 12928221 Y NA NA LPIN1,MIR4262,TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 1112326 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 15309828 15310293 15310034 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 389161 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 15332010 15332377 15332192 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 367077 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 16243100 16243429 16243303 Y NA NA NA NA NA NA MYCN 164414 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 16575995 16576348 16576051 Y NA NA NA NA NA NA MYCN 497309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr2 18481222 18481335 18481279 Y NA NA NA NA NA NA RDH14 258611 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 19548078 19548301 19548191 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 8113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 19788015 19788399 19788228 Y NA NA NA NA NA NA OSR1 231601 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 20386283 20386578 20386422 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 36616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 20793103 20793496 20793437 Y APOB NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 55353 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 20965440 20965780 20965672 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 55102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 24552849 24553177 24552876 Y NA RPL36AP13,ITSN2 NA NA NA NA RPL36AP13 2204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA NCOA1 139264 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 25021346 25021618 25021482 Y NA CENPO,PTRHD1 NA NA NA NA PTRHD1 7095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,UQCRHP2,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UQCRHP2 5015 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 26235500 26235661 26235564 Y RAB10 KIF3C,UQCRHP2,RAB10 FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2,HADHA,HADHB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 19315 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 26522632 26522929 26522714 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 6486 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 27543962 27544264 27544065 Y NA SLC30A3,TRIM54,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17 NA NA NA NA MPV17 2283 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 27631105 27631216 27631160 Y C2orf16 EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA PPM1G 551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 27988549 27989353 27988873 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 3231 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28024813 28024890 28024852 Y IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33 MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 32229 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28134368 28134411 28134390 Y NA BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 22403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28215985 28216067 28216026 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 104020 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 28303771 28304058 28303879 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 191806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 28496743 28497020 28496828 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 116295 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28653761 28654131 28653949 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 40446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28767576 28768254 28768064 Y WDR43,TRMT61B,SPDYA NA NA NA NA NA FOSL2 154261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr2 28903940 28904347 28904218 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA PPP1CB,SPDYA,PLB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 68159 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 28976141 28976573 28976382 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B PPP1CB,SPDYA SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 3635 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 29055098 29055343 29055221 Y SPDYA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 35824 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 29174818 29175149 29175047 Y NA NA NA NA NA NA WDR43 59309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 30440662 30440911 30440739 Y NA LBH,AC104698.1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 11486 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.46538044695725 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 36687110 36687380 36687132 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 106041 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 37383262 37383336 37383288 Y NA EIF2AK2,AC007390.4 NA NA NA NA EIF2AK2 1054 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 37858321 37858709 37858681 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 104902 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 37995727 37996117 37995888 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 32116 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 38003710 38004005 38003838 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 40099 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 38323202 38323810 38323564 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL7P12 132900 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 38369402 38369882 38369670 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 86828 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 39727713 39727883 39727798 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 65260 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 42149327 42149700 42149496 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 123460 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 42329971 42330163 42329978 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 56811 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 42360195 42360705 42360352 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 33785 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 42869718 42869759 42869739 Y NA NA NA NA NA NA AC025750.7 111136 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 43020336 43020977 43020619 Y HAAO HAAO NA NA NA NA HAAO 2603 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 43152648 43152978 43152751 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.2 111708 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 43201925 43202517 43202160 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.2 62169 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 43206770 43207218 43206984 Y HAAO NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.2 57468 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 43245528 43245689 43245593 Y NA AC016735.2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 AC016735.2 18997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 43265724 43265951 43265843 Y NA AC016735.2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 AC016735.2 1038 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 43267467 43267802 43267635 Y NA AC016735.2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.2 2781 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 43390138 43390489 43390286 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 61259 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 43401535 43402035 43401733 Y OXER1,THADA,THADA,ZFP36L2 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 49713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr2 43422005 43422472 43422185 Y THADA,THADA,ZFP36L2 ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 29276 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 43653578 43653957 43653847 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 167228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 44518633 44519032 44518761 Y NA SLC3A1 NA NA NA NA SLC3A1 18034 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 44849210 44849529 44849370 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 262121 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 44935582 44935781 44935667 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 285771 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 46554101 46554217 46554159 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 35295 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 46997897 46997963 46997932 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 NA NA NA NA NA SOCS5 73806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 47306951 47307378 47307182 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 94362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 47420372 47420663 47420518 Y NA CALM2 EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 18632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 47463585 47463776 47463681 Y NA NA CALM2,TTC7A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM2 61845 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1 NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 54330282 54330384 54330333 Y NA NA SPTBN1,RTN4,EML6,ACYP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSME4 134305 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 54801406 54802103 54801693 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 119984 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr2 54806978 54807402 54807168 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 125556 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 54816609 54817000 54816923 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA EML6 131636 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 54845847 54845943 54845895 Y NA NA NA NA NA NA EML6 102693 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 54861793 54862155 54861956 Y NA NA NA NA NA NA EML6 86481 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 61042064 61042390 61042227 Y NA NA NA NA NA NA PAPOLG 60699 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 61204524 61204872 61204698 Y NA PEX13 REL IMR90 Hi-C 24141950 PEX13 37488 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.28717392927633 chr2 64245195 64245602 64245370 Y NA VPS54 NA NA NA NA VPS54 989 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 64291243 64291430 64291349 Y NA VPS54 LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 47037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 64500610 64500974 64500772 Y NA NA PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 131022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 68263709 68263719 68263714 Y NA NA NA NA NA NA C1D 72361 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 69084387 69084602 69084502 Y PLEK,FBXO48,APLF NA NA NA NA NA APLF 391694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 APLF 442907 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 69250610 69250802 69250769 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 361580 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 69989990 69990667 69990520 Y NA NA GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 GMCL1 64107 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 70161598 70161791 70161659 Y PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 70202880 70203539 70203203 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 15483 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 70285414 70285703 70285559 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 26882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 70784432 70784674 70784554 Y NA NA TGFA K562 ChIA-PET 22265404 FAM136A 257210 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 72713565 72713630 72713598 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 337540 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 72732418 72732763 72732614 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 318407 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 74153090 74153262 74153147 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 1137 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 74237302 74237493 74237398 Y NA DGUOK-AS1,AC073046.25 DGUOK IMR90 Hi-C 24141950 AC073046.25 27043 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 74647656 74647929 74647851 Y SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81 DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS NA NA NA NA WDR54 851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 75043732 75043824 75043778 Y NA HK2 HK2,SEMA4F IMR90 Hi-C 24141950 HK2 15284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 76538969 76539122 76539040 Y NA NA NA NA NA NA GCFC2 602854 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 77377674 77377853 77377764 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA AC105399.2 635655 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 78055629 78055831 78055731 Y NA AC105399.2 NA NA NA NA AC105399.2 42121 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 78401270 78401306 78401289 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 387762 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 78478830 78479153 78479031 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 465322 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 78632836 78632912 78632895 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 619328 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 78683398 78683574 78683486 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 669890 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 82212744 82213103 82212921 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1824483 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 85186958 85187334 85187145 Y NA KCMF1 TMSB10,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 KCMF1 8882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P NA NA NA NA RNU1-38P 40102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 88899554 88899981 88899832 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 25113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 91845288 91845519 91845445 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2856126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 97206009 97206227 97206118 Y NA NEURL3,ARID5A NA NA NA NA ARID5A 5529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 97222458 97223029 97222771 Y DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 21978 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ZAP70 115188 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA VWA3B 121353 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 99077455 99077668 99077504 Y TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 18138 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 99250910 99251133 99251091 Y NA COA5,UNC50 NA NA NA NA UNC50 27868 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 100026434 100026453 100026444 Y NA NA NA NA NA NA TXNDC9 71269 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 101922561 101923216 101923063 Y NA SNORD89 NA NA NA NA RNF149 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 102173496 102173792 102173644 Y NA NA MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 137520 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 102353138 102353817 102353456 Y IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 41826 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr2 102478902 102479140 102479043 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 167590 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 102549846 102550051 102549852 Y NA NA NA NA NA NA IL1R1 128953 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 106008939 106009297 106009286 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 43673 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 108841436 108841459 108841449 Y NA NA SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 SULT1C2 61636 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 109686360 109686496 109686432 Y NA NA MALL,SEPT10,SH3RF3,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 EDAR 82532 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 110863536 110863928 110863763 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 8215 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr2 112699155 112699419 112699287 Y NA MERTK NA NA NA NA MERTK 45099 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 113341105 113341247 113341152 Y POLR1B POLR1B,CHCHD5,AC079922.2 NA NA NA NA CHCHD5 1288 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 113571140 113571483 113571425 Y IL37,IL1A NA NA NA NA NA CKAP2L 50886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 113571813 113572166 113571903 Y NA NA NA NA NA NA CKAP2L 51559 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 113576216 113576532 113576373 Y IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B NA NA NA NA NA CKAP2L 55962 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 114014908 114015299 114015271 Y NA PAX8-AS1 NA NA NA NA PAX8-AS1 47809 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 AC017074.2,MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 114652011 114652405 114652035 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 6474 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 119068196 119068550 119068541 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 126234 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA AC012363.4,TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 121155649 121155973 121155708 Y INHBB NA LOC84931,INHBB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INHBB 53930 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 121156856 121157127 121156991 Y INHBB NA INHBB,LOC84931 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INHBB 55137 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 121200367 121200763 121200697 Y NA NA NA NA NA NA INHBB 98648 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 122536391 122536587 122536559 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 43712 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr2 127837369 127837492 127837432 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 25439 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 127862609 127862665 127862637 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 266 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 128173465 128174362 128173731 Y SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC MAP3K2 NA NA NA NA PROC 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1,MYO7B NA NA NA NA IWS1 590 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 128773511 128773726 128773583 Y NA SAP130 NA NA NA NA SAP130 9968 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 129038080 129038421 129038313 Y NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 35730 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 129131715 129132088 129131976 Y NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 57564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37235 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 133226429 133226806 133226618 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 54282 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 LCT,MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 138825307 138825392 138825350 Y NA NA NA NA NA NA HNMT 105717 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 139342135 139342417 139342276 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 84764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 144769205 144769351 144769311 Y GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 318784 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 145136238 145136489 145136344 Y ZEB2 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 48103 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 149527542 149527937 149527740 Y EPC2 NA NA NA NA NA KIF5C 102882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 149981587 149981830 149981709 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6B 88966 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 37764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 150278954 150279172 150279087 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 94455 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 150470264 150470563 150470414 Y NA AC144449.1,MMADHC RND3,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 27934 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 150644765 150645076 150644921 Y NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 202435 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 152789657 152790028 152790018 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL5A 106651 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 153263916 153264284 153263950 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 74165 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 44105 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 158117931 158118105 158118018 Y GALNT5 GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 5821 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 159853491 159853713 159853657 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 30345 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 160097747 160098072 160097910 Y TANC1 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 43238 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 166671246 166671486 166671366 Y CSRNP3 GALNT3 NA NA NA NA GALNT3 22054 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 169347640 169347834 169347737 Y NA CERS6 NA NA NA NA CERS6 37268 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 169961196 169961524 169961361 Y NOSTRIN,DHRS9,DHRS9 NA NA NA NA NA SPC25 193315 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 171997679 171997950 171997833 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 87874 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 173145633 173146048 173145863 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA6 144034 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 174963658 174963852 174963755 Y NA NA NA NA NA NA SP3 135228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 175036157 175036485 175036321 Y NA NA NA NA NA NA OLA1 74941 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 175459812 175460479 175460357 Y CIR1,GPR155,WIPF1 AC018890.6 NA NA NA NA AC018890.6 49943 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 175519164 175519290 175519227 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 26354 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA H3F3AP4 118037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 178131060 178131559 178131324 Y NA MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA AC079305.10 3973 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 179487942 179488336 179488251 Y NA NA NA NA NA NA TTN-AS1 104032 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 180127574 180128171 180127755 Y NA SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 57 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 183877830 183878146 183878099 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 23440 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 188326523 188326725 188326579 Y NA NA NA NA NA NA TFPI 101762 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 189973214 189973535 189973374 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 69070 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 191660541 191660565 191660553 Y NA NA STAT1,MFSD6,GLS,NAB1 IMR90 Hi-C 24141950 GLS 82988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 192123995 192124097 192124046 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 16084 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 192430419 192430599 192430542 Y NA NA TMEFF2,OBFC2A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 322508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYO1B 392614 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 192503383 192503649 192503532 Y OBFC2A NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYO1B 395472 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA MYO1B 437071 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 454645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 192882025 192882303 192882164 Y TMEFF2 NA NA NA NA NA MYO1B 774114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 197004793 197005261 197004933 Y NA STK17B NA NA NA NA STK17B 33966 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 198328385 198328433 198328409 Y PLCL1 SF3B1,COQ10B,HSPE1,MOB4 NA NA NA NA COQ10B 12238 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 201167757 201168004 201167857 Y SPATS2L,SPATS2L SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 600 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 201270357 201270484 201270442 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 101753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 201289842 201289940 201289893 Y NA NA NA NA NA NA SGOL2 82791 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 201397001 201397079 201397012 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 14494 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 CASP10 NA NA NA NA CASP10 32977 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 CASP10 NA NA NA NA CASP10 33756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr2 203239784 203239912 203239798 Y NA BMPR2 NA NA NA NA BMPR2 125 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 203830574 203830808 203830669 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 46713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 204393119 204393487 204393303 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 4646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 204668913 204669218 204669026 Y NA NA RAPH1,CD28,ABI2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 270780 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 205530118 205530314 205530216 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 121602 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 205595294 205595620 205595457 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 186778 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 208883092 208883191 208883110 Y PTH2R,C2orf80 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 5093 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 208977857 208977982 208977919 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHM3 89573 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 210233724 210233884 210233805 Y NA NA NA NA NA NA RPE 631405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA IKZF2 NA NA NA NA IKZF2 37890 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr2 214566774 214567035 214566903 Y LOC100130451 NA NA NA NA NA SPAG16 419661 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 216216233 216216482 216216439 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 41693 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 216224117 216224404 216224261 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 49577 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 216394093 216394338 216394216 Y NA NA LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 AC012462.1 95117 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 216489283 216489494 216489351 Y FN1 NA NA NA NA NA AC012462.1 190307 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 216557446 216557685 216557585 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 258470 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr2 216576202 216576464 216576327 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 277226 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 216636605 216637052 216636855 Y NA NA NA NA NA NA MREG 259767 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 216695142 216695306 216695226 Y NA NA NA NA NA NA MREG 201513 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 217106974 217107312 217107143 Y TMEM169 NA NA NA NA NA XRCC5 136787 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 217181584 217181763 217181674 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAL1 93374 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 218083635 218083865 218083750 Y NA NA DIRC3,TNP1,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 TNP1 360848 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 218549825 218550302 218550107 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 315416 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 218701196 218701490 218701305 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 164228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 218767248 218767888 218767577 Y TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 97830 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1,VIL1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 219759139 219759434 219759370 Y WNT6,WNT10A WNT6,WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16054 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 30430 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV NA NA NA NA NA WNT10A 84858 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 222305020 222305156 222305087 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 131766 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131064 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 224773224 224773437 224773430 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 34667 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 227331006 227331180 227331162 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 331295 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 227389268 227389492 227389368 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 272983 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 228568825 228569005 228568935 Y SLC19A3 SLC19A3 NA NA NA NA SLC19A3 11723 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 228578021 228578290 228578242 Y NA SLC19A3 NA NA NA NA SLC19A3 2438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 230015685 230015803 230015793 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 118198 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 231915077 231915290 231915200 Y C2orf72 C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 4288 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 232479434 232479727 232479552 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 89878 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 233250431 233250842 233250658 Y NA ALPP,ALPPL2 NA NA NA NA ALPP 9187 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 235335674 235336048 235335859 Y ARL4C NA SPP2,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 67649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 235336071 235336661 235336603 Y ARL4C NA SPP2,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 67036 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 235372630 235373257 235372862 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 30440 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 235905010 235905389 235905297 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 46393 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 236453392 236453640 236453439 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 52659 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 237117535 237117935 237117735 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA GBX2 42523 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 237933842 237934085 237933935 Y NA NA CXCR7,IQCA1,ASB18 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPS8 57870 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 239080379 239080669 239080523 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 14756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 239772979 239773251 239773061 Y NA NA NA NA NA NA ASB1 439596 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 241796889 241797214 241796939 Y GPR35,AGXT KIF1A,AGXT,C2orf54 NA NA NA NA AGXT 8682 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 241856097 241856248 241856111 Y GPC1,RNPEPL1,SNED1 C2orf54 LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf54 21791 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 241960934 241960944 241960939 Y AQP12A,PASK NA NA NA NA NA MTERFD2 78803 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 242485030 242485360 242485049 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 10776 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 242702443 242702859 242702736 Y ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH,GAL3ST2 NA NA NA NA GAL3ST2 11381 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 242710043 242710405 242710079 Y NA D2HGDH,GAL3ST2 NA NA NA NA GAL3ST2 3835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr2 242728014 242728394 242728206 Y ATG4B GAL3ST2 NA NA NA NA GAL3ST2 13774 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 351057 351207 351131 Y NA SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 8054 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 478652 479003 478850 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA TBC1D20 37455 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1,TMEM74B NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA SDCBP2,FKBP1A NA NA NA NA SDCBP2 25126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 115061 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 1792448 1792844 1792660 Y NA NA STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 80310 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 1842464 1842590 1842566 Y NA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 30564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 1869680 1870159 1869931 Y NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 2995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 2280034 2280402 2280127 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA TGM3 NA NA NA NA TGM3 5387 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 2812856 2812910 2812883 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA VPS16 6439 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 4203123 4203484 4203336 Y NA NA NA NA NA NA SMOX 103496 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 6032121 6032454 6032230 Y LRRN4 CRLS1,LRRN4 NA NA NA NA LRRN4 241 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 6678677 6678999 6678684 Y NA NA NA NA NA NA BMP2 67312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 6684913 6685132 6685035 Y NA NA NA NA NA NA BMP2 61179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 6688727 6688944 6688822 Y BMP2 NA NA NA NA NA BMP2 57367 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 8380615 8380981 8380808 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 269791 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 9390788 9390859 9390825 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 343378 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 10651368 10651598 10651475 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 26354 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 10655214 10655688 10655561 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 30200 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 10692033 10692226 10692094 Y MKKS NA NA NA NA NA JAG1 67019 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 13088080 13088439 13088260 Y NA NA NA NA NA NA SPTLC3 100453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 13317482 13317575 13317520 Y ESF1 NA NA NA NA NA ISM1 117064 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 13379016 13379145 13379075 Y NA NA NA NA NA NA ISM1 178598 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 13473886 13474103 13473974 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 143484 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 13757612 13757978 13757886 Y NA ESF1 NA NA NA NA ESF1 5554 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr20 15282242 15282264 15282251 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 965980 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 17591305 17591483 17591343 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 42797 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 17830512 17830807 17830760 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110782 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 19408281 19408453 19408368 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 327899 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 19783112 19783320 19783290 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 46760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr20 19881587 19881718 19881652 Y RIN2,RIN2 NA NA NA NA NA NAA20 114042 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,C20orf26,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 21082914 21083089 21083038 Y NA PLK1S1 PLK1S1,NKX2-2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK1S1 21535 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 21486506 21486611 21486559 Y NA NA NA NA NA NA XRN2 204564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 22471596 22471813 22471642 Y FOXA2,FOXA2 NA NA NA NA NA LINC00261 85467 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 22905662 22905881 22905772 Y NA NA NA NA NA NA FOXA2 341569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 23640355 23640543 23640449 Y CST9 CST3 NA NA NA NA CST3 23245 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 25226687 25226893 25226791 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 25273617 25273934 25273643 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 46912 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 25305115 25305524 25305270 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 64095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 25445422 25445550 25445504 Y ACSS1,ABHD12 NA NA NA NA NA GINS1 59059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 112354 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 29518777 29518943 29518821 Y NA NA NA NA NA NA FRG1B 90914 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30158598 30158945 30158767 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 32141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30175524 30175854 30175562 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 15232 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30260311 30260679 30260495 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 49113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr20 30298803 30298834 30298814 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 10958 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30303594 30303801 30303667 Y TTLL9,DUSP15 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 5991 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 9.31365946628294 chr20 31269107 31269491 31269215 Y C20orf185,C20orf203 NA NA NA NA NA COMMD7 60312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 31350973 31351317 31351235 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 2782 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 32321714 32321896 32321832 Y NA E2F1,PXMP4,ZNF341 NA NA NA NA ZNF341 4251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 32783228 32783544 32783386 Y NA NA ITCH,ASIP,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P1 74952 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 6916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 33150860 33150919 33150894 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 48646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 33263826 33263865 33263846 Y MYH7B PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA PIGU 916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 33646463 33646512 33646488 Y TP53INP2,MYH7B TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 32162 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 33803083 33803443 33803260 Y NA PROCR,MT1P3,MMP24 TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6 IMR90 Hi-C 24141950 MT1P3 369 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 33811435 33811561 33811498 Y NA MT1P3,MMP24 NA NA NA NA MMP24 896 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 34303643 34304038 34303890 Y NA ROMO1,NFS1,RBM39 NA NA NA NA NFS1 18362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 34463368 34463773 34463624 Y NFS1 RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 9808 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA NA LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCAND1 107196 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 34790985 34791133 34791034 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 101125 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 35964748 35965459 35965134 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 48707 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 35972053 35972195 35972121 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC NA NA NA NA NA MANBAL 56012 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 36040566 36040861 36040811 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31075 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 36048250 36048624 36048494 Y VSTM2L RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 23312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 36831796 36832119 36831958 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 38816 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5 NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 37512879 37513131 37513021 Y ACTR5,PPP1R16B FAM83D NA NA NA NA FAM83D 39824 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 37626282 37626666 37626585 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 37340 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 40210012 40210373 40210193 Y NA CHD6 NA NA NA NA CHD6 34760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr20 42718699 42718853 42718776 Y NA NA NA NA NA NA JPH2 95365 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr20 42833040 42833424 42833233 Y C20orf111 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 4176 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 42955373 42955435 42955404 Y NA FITM2,HNF4A NA NA NA NA FITM2 17564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 42989238 42989527 42989524 Y NA HNF4A,HNF4A-AS1 NA NA NA NA HNF4A 6898 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 43023129 43023488 43023363 Y HNF4A HNF4A,HNF4A-AS1 NA NA NA NA HNF4A-AS1 783 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 43569969 43570092 43570031 Y RBPJL,TP53TG5,STK4 PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 17035 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 43970100 43970351 43970215 Y NA MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 4713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 43972131 43972359 43972259 Y NA MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 2705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 44855330 44855616 44855473 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 NA NA NA NA NA SLC35C2 135427 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 46067688 46067974 46067774 Y NCOA3 NA NCOA3,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 60627 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 46067997 46068157 46068096 Y NCOA3 NA NCOA3,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 60444 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 46162026 46162326 46162051 Y NA NCOA3 NA NA NA NA NCOA3 33425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 47316327 47316412 47316396 Y PREX1 NA NA NA NA NA PREX1 126008 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 48200728 48200848 48200788 Y PTGIS PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 18045 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 48285223 48285402 48285313 Y SPATA2,SLC9A8 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 43013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 48295598 48295872 48295769 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 32543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 48532841 48533167 48533004 Y SPATA2,SPATA2 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 2761 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr20 48533898 48534043 48533948 Y B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 3818 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 48598723 48598794 48598730 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 RNF114,SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 1187 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 48646361 48646933 48646559 Y NA SNAI1 TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 48825 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 48688468 48688637 48688554 Y NA UBE2V1 NA NA NA NA UBE2V1 41859 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 48726581 48727101 48726820 Y SPATA2,SPATA2 UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189 NA NA NA NA UBE2V1 3395 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 49120900 49121269 49120978 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 3622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 49341306 49341865 49341532 Y NA PARD6B NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PARD6B 4216 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 49345638 49345902 49345710 Y MOCS3,PARD6B PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 49350102 49350473 49350150 Y NA PARD6B NA NA NA NA PARD6B 4021 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 49378032 49378227 49378094 Y PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 31204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.60234602734376 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr20 49553399 49553600 49553500 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 7441 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 265173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 50134591 50134950 50134771 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 42420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 50272756 50273155 50272761 Y ATP9A NA NA NA NA NA NFATC2 95386 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 50361169 50361338 50361278 Y NA ATP9A NA NA NA NA ATP9A 21835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 276 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA SALL4 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.42413950966285 chr20 50527143 50527170 50527154 Y NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 SALL4 110084 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 50601567 50601698 50601647 Y NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SALL4 184508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52256215 52256545 52256380 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 31769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 52346173 52346470 52346387 Y NA NA ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 121727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr20 52356771 52357178 52357063 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 132325 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52364781 52365137 52364834 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 140335 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52380425 52380741 52380578 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 155979 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 256247 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 52749873 52750284 52750109 Y NA NA NA NA NA NA PFDN4 72102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 55838908 55839396 55838948 Y NA BMP7 NA NA NA NA BMP7 289 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 55880789 55880965 55880877 Y BMP7 BMP7,RAE1 NA NA NA NA BMP7 41104 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr20 55964119 55964506 55964297 Y ZBP1,MTRNR2L3,RBM38 RAE1,MTRNR2L3 NA NA NA NA RBM38 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 55968808 55969481 55968821 Y ZBP1,PMEPA1 RAE1,MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 4345 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 55973445 55973831 55973580 Y RBM38,ZBP1,PMEPA1 RAE1,MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 8982 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 57579440 57580501 57580194 Y NA ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 57596187 57596442 57596344 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA ATP5E 8995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 58437773 58438005 58437846 Y NA NA NA NA NA NA SYCP2 68705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 58459134 58459312 58459218 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177 SYCP2 NA NA NA NA SYCP2 47398 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 60328357 60328661 60328509 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 310205 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 60924549 60924827 60924688 Y TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5 ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 15541 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr20 61285550 61285806 61285682 Y BHLHE23 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 13753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 61646020 61646413 61646169 Y C20orf11,YTHDF1 NA NA NA NA NA SLC17A9 63968 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 7.12221018009872 chr20 61899212 61899429 61899321 Y NA ARFGAP1 NA NA NA NA ARFGAP1 2708 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 62176586 62176848 62176717 Y NA EEF1A2,PPDPF,SRMS NA NA NA NA SRMS 9 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 16288986 16289227 16289075 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 146094 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 18886111 18886899 18886569 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 3411 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 26745282 26745696 26745293 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 232133 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 29656574 29656747 29656720 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 598946 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr21 30567218 30567411 30567380 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 2826 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 34659541 34659728 34659635 Y NA IL10RB,IFNAR1 NA NA NA NA IL10RB 22878 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 34836293 34836479 34836379 Y OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 13839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 35057919 35058071 35057938 Y NA ITSN1,CRYZL1 NA NA NA NA CRYZL1 43687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr21 36234553 36234896 36234857 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 249112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 37670543 37670742 37670650 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 19745 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 38069098 38069172 38069127 Y NA SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 39656161 39656338 39656251 Y KCNJ15 NA NA NA NA NA ETS2 518893 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 39687013 39687366 39687190 Y NA NA NA NA NA NA ETS2 487865 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 40182920 40183779 40183392 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 7689 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 40211972 40212276 40212079 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 36741 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 40277371 40277733 40277541 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 102140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 40278958 40279421 40279192 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 103727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 40331056 40331378 40331206 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 155825 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 40338093 40338255 40338153 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 162862 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 40466991 40467348 40467127 Y ETS2 NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMG1 86429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 40690087 40690386 40690238 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 1099 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 40860443 40860729 40860586 Y NA SH3BGR NA NA NA NA SH3BGR 44662 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 43061172 43061376 43061276 Y NA NA PRDM15,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 RIPK4 123890 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 43188787 43189188 43188843 Y RIPK4 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3521 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 43214290 43214658 43214474 Y NA RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 29024 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 59473 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 43477244 43477358 43477313 Y NA NA ZNF295,UMODL1,C2CD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 C2CD2 105245 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 43892136 43892349 43892248 Y NA SLC37A1 NA NA NA NA SLC37A1 21769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44425410 44425661 44425536 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 32790 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 44752617 44753007 44752874 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 92001 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr21 44753663 44753942 44753875 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr21 44760713 44760913 44760830 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 84095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr21 44850435 44851222 44850996 Y CBS SIK1,LINC00319 CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 5427 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44859375 44859527 44859442 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA LINC00319 4954 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1,LINC00319 NA NA NA NA LINC00319 3069 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 44914466 44914931 44914660 Y PDXK,U2AF1,SIK1 LINC00319 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00319 49985 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK NA NA NA NA NA LINC00319 72303 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44937659 44937875 44937741 Y PDXK NA NA NA NA NA LINC00319 73178 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr21 44937921 44938237 44938215 Y NA NA NA NA NA NA LINC00319 73440 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 44939768 44940090 44939875 Y PDXK NA NA NA NA NA LINC00319 75287 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 44942511 44942810 44942777 Y PDXK NA NA NA NA NA LINC00319 78030 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 45065485 45065706 45065596 Y NA HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA HSF2BP 11668 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr21 45661962 45662435 45662161 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 3113 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 45890728 45891129 45890927 Y NA LRRC3,C21orf90 NA NA NA NA LRRC3 17359 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 8679 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 45968847 45969150 45969078 Y NA C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 33748 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 46496242 46496452 46496442 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 4474 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 46749567 46749782 46749739 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 43754 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 46749941 46750271 46750188 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 44128 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 46850245 46850628 46850488 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 27193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD COL6A2,FTCD NA NA NA NA FTCD 18329 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 17528836 17529213 17528959 Y NA IL17RA NA NA NA NA IL17RA 34631 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 18402838 18403339 18403237 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 101986 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 18551113 18551402 18551354 Y NA MICAL3,PEX26 BID,MICAL3,FLJ41941,PEX26 IMR90 Hi-C 24141950 PEX26 7287 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 18916909 18917370 18917163 Y MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH DGCR6,PRODH,DGCR5 NA NA NA NA PRODH 4696 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr22 19073720 19074078 19073888 Y NA DGCR2 NA NA NA NA DGCR2 33889 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 19683407 19683522 19683466 Y NA GP1BB UFD1L,TXNRD2,CLDN5,HIRA,GP1BB,SEPT5,TBX1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GP1BB 24946 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 19869401 19869687 19869604 Y NA C22orf29,GNB1L NA NA NA NA GNB1L 28939 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 20227933 20228240 20228087 Y NA RTN4R NA NA NA NA RTN4R 40529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 21132162 21132336 21132252 Y NA SERPIND1 NA NA NA NA SERPIND1 5995 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 22067448 22067680 22067564 Y YPEL1 NA NA NA NA NA PPIL2 62889 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 22478098 22478432 22478244 Y CCDC116,YPEL1,ZNF280B NA NA NA NA NA TOP3B 142885 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 22535916 22536143 22536038 Y NA NA LOC96610,VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 200703 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 23528251 23528416 23528284 Y BCR RTDR1,BCR NA NA NA NA BCR 8360 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 23963581 23963755 23963668 Y RTDR1,C22orf43 NA NA NA NA NA GUSBP11 93788 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 24594084 24594331 24594185 Y DDTL,GGT1 SUSD2 NA NA NA NA SUSD2 18857 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 24603797 24604355 24604162 Y GGT1,ADORA2A SUSD2 NA NA NA NA SUSD2 28570 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 24841280 24841490 24841385 Y ADORA2A ADORA2A,UPB1 NA NA NA NA UPB1 19716 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 24870306 24870552 24870389 Y GGT1 UPB1 NA NA NA NA UPB1 9100 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 24897452 24897663 24897568 Y NA UPB1 NA NA NA NA UPB1 36246 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr22 25381840 25382180 25381995 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD56 86659 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 26921035 26921055 26921043 Y TPST2 HPS4,SRRD,TFIP11,HMGB1P10 NA NA NA NA TFIP11 14564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 27870917 27871291 27871105 Y NA NA PITPNB,MN1,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 324195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 129760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 28879777 28880035 28879909 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 255984 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 29209751 29210048 29209892 Y CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 15080 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 29467563 29467858 29467701 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 497 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 29469912 29470391 29470070 Y XBP1,KREMEN1 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 2846 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr22 29505815 29505935 29505933 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 38749 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 29548778 29549084 29549009 Y XBP1,KREMEN1 NA NA NA NA NA EMID1 50756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 30096148 30096264 30096206 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT5 64736 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 30507531 30507567 30507549 Y LIF NA LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 133273 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 30608541 30609106 30608754 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF NA NA NA NA LIF 31734 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 30644816 30645407 30645321 Y NA LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 3976 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr22 30671576 30671914 30671807 Y NA LIF,GATSL3,TBC1D10A LIF,OSM IMR90 Hi-C 24141950 GATSL3 11702 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 30801557 30801812 30801706 Y OSM,CCDC157,SF3A1 SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA SEC14L2 10711 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA MORC2-AS1 MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2-AS1 18105 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 31639418 31639541 31639442 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 31854917 31854933 31854925 Y NA SFI1,EIF4ENIF1 NA NA NA NA SFI1 27741 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 33000436 33000667 33000542 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 131773 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 33176423 33176673 33176603 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 19014 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr22 33202022 33202333 33202121 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 6335 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 11263 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 34073272 34073505 34073390 Y NA SNORA76 NA NA NA NA SNORA76 25401 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 35772921 35773272 35773050 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2 IMR90 Hi-C 24141950 HMOX1 1082 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 36310688 36310985 36310744 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 111488 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 36748222 36748386 36748297 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 33677 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP4-633O19__A.1 23476 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr22 36815362 36815553 36815536 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-633O19__A.1 32691 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr22 36828742 36828858 36828800 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14,TXN2 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1119A7.14 20133 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 37316628 37317004 37316672 Y NA NA NA NA NA NA MPST 96672 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 37428831 37429188 37428927 Y CARD10,TMPRSS6,TST,MPST MPST,TST,KCTD17 KCTD17,TMPRSS6 IMR90 Hi-C 24141950 TST 15150 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6 NA NA NA NA C1QTNF6 44903 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 37813025 37813137 37813082 Y TRIOBP,PDXP,ELFN2 ELFN2 NA NA NA NA ELFN2 8368 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 37897761 37897917 37897872 Y NA CARD10 NA NA NA NA CARD10 15632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1,LGALS2 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 37997690 37997947 37997695 Y GGA1,GGA1 CDC42EP1,LGALS2,GGA1,SH3BP1 CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GGA1 4534 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr22 38057516 38057596 38057556 Y NA SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP NA NA NA NA PDXP 4782 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 38198030 38198142 38198086 Y NA H1F0,GCAT,MIR658,EIF3L,ANKRD54 NA NA NA NA H1F0 972 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 39570711 39571096 39570941 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 24032 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 39608827 39609203 39608881 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 29553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr22 39788576 39788924 39788704 Y MGAT3,CBX7,SYNGR1 SYNGR1,TAB1 NA NA NA NA TAB1 4822 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 39844645 39844964 39844816 Y NA NA NA NA NA NA TAB1 50899 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 39869379 39869438 39869422 Y NA ATF4 ATF4,SMCR7L IMR90 Hi-C 24141950 ATF4 44262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 40686331 40686363 40686350 Y MKL1,GRAP2,TNRC6B NA NA NA NA NA ADSL 54144 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 42257974 42258323 42258180 Y CENPM SREBF2 NA NA NA NA SREBF2 30865 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 42696920 42697075 42696965 Y NA NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 Z83851.1 66167 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 43130388 43130736 43130634 Y NA A4GALT CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2 IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 15084 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 43283489 43283802 43283626 Y NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 31377 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 43369643 43369761 43369702 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 39390 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 43500072 43500319 43500196 Y NA TTLL1,BIK,MCAT,TSPO MCAT,BIK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BIK 4435 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 44321391 44321759 44321599 Y PNPLA3 PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5 NA NA NA NA PNPLA3 3772 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 44541394 44541995 44541679 Y NA NA NA NA NA NA PARVB 148303 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 45067693 45068028 45067921 Y NUP50,PARVG,PRR5 PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 SAMM50,PARVB,LINC00229,KIAA1644 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5 5100 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 30268 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 45879926 45880282 45880095 Y NA FBLN1 FBLN1,NUP50,UPK3A,FAM118A,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 FBLN1 15836 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA CTA-941F9.9,ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA MIRLET7B NA NA NA NA MIRLET7B 26302 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 46944783 46944886 46944827 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 13716 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 47498614 47499010 47498804 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 342096 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 47525665 47525872 47525801 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 369147 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr22 49548057 49548240 49548148 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 670920 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 450168 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 50344780 50345228 50344944 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 6933 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr22 50738042 50738272 50738161 Y NA MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 5784 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 2139427 2139840 2139639 Y NA CNTN4 NA NA NA NA CNTN4 930 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr3 2194214 2194440 2194327 Y NA NA NA NA NA NA CNTN4 55717 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 108002 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 9733 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 46235 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 49173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 9926228 9926446 9926367 Y LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1 IL17RE,IL17RC,JAGN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 JAGN1 3792 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 10402355 10402452 10402401 Y FANCD2 SEC13 NA NA NA NA SEC13 41493 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr3 11581408 11581480 11581447 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 178740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 11612359 11612503 11612424 Y HRH1,ATG7 NA NA NA NA NA VGLL4 147717 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr3 13040844 13041238 13041111 Y RAF1 NA NA NA NA NA IQSEC1 71379 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 13460446 13460799 13460651 Y NA NUP210 NA NA NA NA NUP210 637 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 14246419 14246703 14246618 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 28136 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 NA NA NA NA NA NR2C2 271895 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 15330325 15330412 15330355 Y NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 NA NA NA NA NA SH3BP5 50463 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 16379433 16379643 16379566 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 74727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 16379697 16380223 16379925 Y DPH3 NA NA NA NA NA OXNAD1 74991 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 16385971 16386232 16386102 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 81265 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 18140643 18140862 18140682 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 343447 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 18252681 18253057 18252788 Y TBC1D5,SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 231252 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 23641244 23641540 23641467 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E1 203854 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 24340917 24341295 24341106 Y NA NA NA NA NA NA THRB 193478 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 24506233 24506581 24506477 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28192 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 24563741 24564038 24564033 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28968 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 27575366 27575733 27575573 Y NA RNU1-96P AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-96P 22004 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr3 27984483 27984771 27984759 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA EOMES 222277 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 28078428 28078736 28078583 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA CMC1 202339 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 31207703 31207815 31207739 Y STT3B NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 GADL1 273446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA TRIM71 301 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 4.10896741159541 chr3 33086079 33086426 33086309 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE NA NA NA NA SEC13P1 12724 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 33089398 33089551 33089467 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE,GLB1 NA NA NA NA SEC13P1 16043 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 33478074 33478410 33478365 Y NA UBP1 NA NA NA NA UBP1 2453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 33638872 33639200 33639124 Y NA NA NA NA NA NA CLASP2 118648 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 33758685 33758853 33758767 Y UBP1,UBP1,CLASP2 CLASP2 NA NA NA NA CLASP2 837 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 37495440 37496065 37495716 Y ITGA9 ITGA9 NA NA NA NA ITGA9 3834 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr3 38046580 38046956 38046768 Y SLC22A14 VILL,DLEC1 NA NA NA NA VILL 19030 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 38144034 38144304 38144167 Y VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88 ACAA1,MYD88 NA NA NA NA ACAA1 32429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 38209266 38209592 38209336 Y VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 4686 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 39512456 39512640 39512578 Y MYRIP,CX3CR1,CX3CR1,MOBP NA NA NA NA NA RPSA 66276 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 41014854 41015242 41015015 Y NA NA ULK4,CTNNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-761N21.2 213818 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 41725291 41725392 41725346 Y NA NA NA NA NA NA ULK4 276530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA CCK 84464 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 42922564 42922793 42922612 Y C3orf39 ZNF662 NA NA NA NA ZNF662 22430 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 43935699 43936111 43935927 Y NA NA NA NA NA NA ANO10 204613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.87627718811679 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 44697594 44698203 44697878 Y NA ZNF35 NA NA NA NA ZNF35 9375 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 46834 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 46152557 46153082 46152773 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 117241 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA LRRC2 72961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 19370 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr3 46990572 46990937 46990863 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 28236 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 47203467 47203704 47203598 Y NA SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 10 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 47898226 47898293 47898260 Y NA NA NA NA NA NA DHX30 55827 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 49275888 49276379 49276160 Y USP4,RHOA,AMIGO3,ARIH2,DALRD3 NA NA NA NA NA KLHDC8B 68844 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 49503154 49503264 49503210 Y NA NICN1,DAG1 NA NA NA NA DAG1 882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 50302065 50302532 50302296 Y SEMA3B GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1 NA NA NA NA SEMA3B 458 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 50639346 50639782 50639525 Y C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 7169 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 52652258 52652629 52652403 Y GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1 NA NA NA NA NA GNL3 60543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 53859957 53860202 53860080 Y CACNA1D,CHDH CHDH,IL17RB NA NA NA NA CHDH 18215 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA NA NA NA NA NA ERC2 982738 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 56106137 56106188 56106158 Y NA NA NA NA NA NA ERC2 394203 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 57958534 57958833 57958768 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 33294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 57995926 57996426 57996121 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3799 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 58035006 58035314 58035102 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 42879 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 58159699 58160034 58159862 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 61199 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 58457172 58457525 58457255 Y RPP14,RPP14,KCTD6 PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 18316 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 60360991 60361355 60361182 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 873778 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 62422700 62423042 62422978 Y C3orf14,FEZF2,CADPS NA NA NA NA NA RPL10AP6 695920 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 65013149 65013388 65013334 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 341473 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr3 65831008 65831290 65831149 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 191219 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 65939140 65939412 65939262 Y MAGI1 NA NA NA NA NA MAGI1 83097 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.19144928618422 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr3 66022863 66023161 66022996 Y MAGI1 MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 354 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 66503172 66503179 66503176 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 46508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 66549724 66550124 66549864 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 37 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 68072115 68072134 68072122 Y NA NA NA NA NA NA RP11-81N13.1 368994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 69262443 69262764 69262745 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 130348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 69337600 69337654 69337627 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 205505 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 71222111 71222440 71222307 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 408700 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 71293394 71293605 71293527 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 337535 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 75472638 75472968 75472803 Y NA FAM86DP NA NA NA NA FAM86DP 9293 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 78881449 78881566 78881507 Y NA NA NA NA NA NA RP11-6B4.1 2159453 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 79461669 79462063 79461996 Y ROBO1 NA NA NA NA NA RP11-6B4.1 1578956 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 87022678 87022843 87022761 Y VGLL3 VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 15426 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 88026085 88026449 88026267 Y NA NA NA NA NA NA C3orf38 170444 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 98411733 98411959 98411833 Y ST3GAL6 NA ST3GAL6 IMR90 Hi-C 24141950 CPOX 101166 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 576950 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 255752 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 251621 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 99582587 99582828 99582708 Y FILIP1L NA NA NA NA NA FILIP1L 248529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 99596957 99597300 99597045 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA FILIP1L 234057 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 99620045 99620512 99620235 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 210845 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 101109184 101109394 101109269 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 120691 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 105395533 105395739 105395657 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 190657 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr3 111481970 111482358 111482172 Y PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 32626 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 112103469 112103851 112103576 Y NA RP11-231E6.1 NA NA NA NA RP11-231E6.1 22130 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 112366095 112366266 112366169 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L,GTPBP8,CD200R1,C3orf17 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC80 111 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA QTRTD1 83902 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 114261968 114262342 114261973 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20-AS1 193310 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 115696572 115696769 115696673 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 1046776 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 117632292 117632433 117632362 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 888747 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 119068324 119068683 119068464 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT4 110374 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 119260475 119260793 119260651 Y NA TIMMDC1,ADPRH NA NA NA NA ADPRH 35322 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 119514057 119514298 119514132 Y NR1I2,NR1I2 NR1I2 NA NA NA NA NR1I2 16726 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA NR1I2 115776 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 119876721 119876867 119876800 Y NA NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 64979 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 120355972 120356358 120356256 Y NA NDUFB4,HGD NA NA NA NA NDUFB4 42816 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 120397505 120397688 120397597 Y NA HGD NA NA NA NA HGD 1730 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 122400701 122401439 122401076 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14 EIF4BP8,PARP14 NA NA NA NA PARP14 3236 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 124419861 124420177 124419915 Y KALRN UMPS NA NA NA NA UMPS 27036 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr3 124698484 124698857 124698671 Y NA MUC13 NA NA NA NA MUC13 27821 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 124786089 124786383 124786283 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 13287 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr3 124865861 124866318 124866168 Y OSBPL11 NA NA NA NA NA HEG1 93059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA RP11-124N2.1 91582 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 126569545 126569928 126569643 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA1 135509 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 2213 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 128054461 128054660 128054529 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475N22.4 151395 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 129572979 129573244 129573238 Y NA TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 37175 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 27353 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr3 134050159 134050571 134050486 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 22832 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr3 134053436 134053779 134053672 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 19624 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 135615560 135615771 135615666 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 66744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 136153802 136154197 136154172 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 186654 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 12.3269022347862 chr3 138634319 138634690 138634472 Y NA FOXL2,C3orf72 ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXL2 29292 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 139344390 139344678 139344552 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 50181 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 141050524 141051086 141050761 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 9469 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 141174545 141175038 141174891 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 28851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr3 141175186 141175511 141175311 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 28378 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 142585828 142586021 142585923 Y NA RP11-372E1.1 NA NA NA NA RP11-372E1.1 41258 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 143705621 143705974 143705695 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 16981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 145164438 145164687 145164563 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 375839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 149099928 149100323 149100052 Y TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 6276 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA TM4SF4 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF4 38319 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 NA NA NA NA NA PFN2 108725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 150943935 150944361 150944164 Y P2RY14 NA NA NA NA NA MED12L 142451 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 151993494 151994006 151993570 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 8150 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 152856443 152856813 152856615 Y RAP2B RAP2B RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 21216 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 153851002 153851262 153851130 Y ARHGEF26 ARHGEF26,ARHGEF26-AS1 NA NA NA NA ARHGEF26-AS1 13881 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 155316441 155316741 155316588 Y NA NA NA NA NA NA PLCH1 144115 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 156527707 156527883 156527795 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 1186 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 156529352 156529637 156529452 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 2831 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 156538683 156538849 156538764 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 2421 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 156837520 156837824 156837670 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 38725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr3 156839965 156840160 156840071 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1 RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 36389 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 158048767 158049059 158048913 Y NA NA NA NA NA NA SHOX2 226475 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 159175843 159176214 159175971 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 528323 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 162020 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 160267928 160268193 160268163 Y NA SCARNA7,KPNA4 NA NA NA NA KPNA4 13183 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 160735129 160735256 160735193 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 85228 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 161138601 161138921 161138632 Y NMD3,C3orf57 SPTSSB NMD3,PPM1L,B3GALNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSB 49933 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 161521648 161521661 161521655 Y OTOL1 NA NA NA NA NA SPTSSB 432980 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 167737805 167738014 167737910 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 73749 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 168939202 168939471 168939359 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 439935 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 170137645 170137870 170137713 Y SLC7A14,CLDN11,CLDN11 NA NA NA NA NA SKIL 64179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA SLC2A2 140527 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 171816708 171816982 171816800 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 61290 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 171855430 171855856 171855550 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 100012 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 172418207 172418359 172418236 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 8649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 172423916 172424228 172424139 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 2780 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 174157357 174157932 174157609 Y NA NAALADL2 NAALADL2 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 2994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 175695899 175696046 175695968 Y NA NA NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V1P2 261441 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 177018025 177018414 177018104 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 104764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 183079075 183079309 183079198 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L2 65257 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA C3orf70 140855 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 185450719 185450896 185450815 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 89948 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 185842493 185842801 185842568 Y NA ETV5 ETV5 K562 ChIA-PET 22265404 ETV5 16386 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 187607399 187607588 187607479 Y BCL6 NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 145884 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 187754201 187754558 187754362 Y NA NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 114514 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 187841029 187841328 187841153 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 27744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 187901313 187901616 187901372 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 31468 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 188149383 188149832 188149544 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 279538 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 188276216 188276468 188276344 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 386960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 188506419 188506821 188506595 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 156607 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 188618525 188618672 188618589 Y NA TPRG1-AS1 NA NA NA NA TPRG1-AS1 44756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 189192792 189192813 189192806 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 529364 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 190956161 190956506 190956333 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 88360 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 193597420 193597611 193597456 Y NA RP11-528A4.2 HES1,OPA1,LOC647323 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-528A4.2 37607 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.28717392927633 chr3 193983162 193983541 193983368 Y TMEM44 NA LOC647323,OPA1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC15 104931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 194298758 194299295 194298977 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 3445 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 194319358 194319899 194319518 Y LRRC15 TMEM44-AS1,TMEM44 NA NA NA NA TMEM44-AS1 16618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 194461690 194461887 194461800 Y FAM43A NA NA NA NA NA FAM43A 57068 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 195628817 195629072 195628853 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 177988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 196378860 196378951 196378906 Y LRRC33 LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 14214 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr3 196758283 196758681 196758467 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 3596 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 50610 50903 50681 Y NA ZNF595 NA NA NA NA ZNF595 276 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 770204 770556 770391 Y ZNF141 RP11-440L14.1,CPLX1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 3081 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 1339085 1339471 1339276 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 7251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 2764467 2764789 2764630 Y LOC402160 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 8364 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 6841864 6842265 6841993 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0232 60762 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 6895356 6895637 6895499 Y KIAA0232 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 13332 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr4 6974782 6974959 6974886 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D14 65813 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA NA NA NA NA NA CPZ 562368 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 9693091 9693174 9693121 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A9 361386 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 10053251 10053319 10053285 Y NA SLC2A9 NA NA NA NA SLC2A9 1241 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 11029361 11029726 11029544 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 338725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 690843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 18974 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 16003610 16004023 16003987 Y NA NA NA NA NA NA FGFBP1 65247 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 20340711 20340985 20340805 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 354920 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 21785959 21786161 21786155 Y KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA GPR125 729516 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 24599702 24600087 24599863 Y NA DHX15 SOD3,CCDC149 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 15529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr4 25536997 25537326 25537166 Y NA NA NA NA NA NA SLC34A2 117597 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 26175759 26175971 26175925 Y NA RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 12682 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 38281692 38282075 38281884 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 321636 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 38664467 38664838 38664653 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3 NA NA NA NA KLF3 650 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 160138 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 41162074 41162440 41162321 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 54291 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 41469951 41470276 41469966 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 110327 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 44712631 44712762 44712670 Y NA GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 13850 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 47495543 47495885 47495605 Y COMMD8 COMMD8,ATP10D NA NA NA NA ATP10D 10238 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 54886131 54886730 54886449 Y GSX2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 42127 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 54929171 54929915 54929573 Y CHIC2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 314 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr4 55093024 55093294 55093182 Y PDGFRA NA NA NA NA NA PDGFRA 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 57740482 57740676 57740556 Y PPAT,REST REST THEGL,SPINK2 IMR90 Hi-C 24141950 REST 31399 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 61590476 61590574 61590525 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 1048994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA NA NA NA NA NA RP11-584P21.4 1349225 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 68394565 68394648 68394607 Y NA NA NA NA NA NA RP11-584P21.4 84580 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 68487662 68488005 68487834 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 76892 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 69598714 69599110 69598795 Y UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3 NA NA NA NA NA UGT2A3 216399 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 69602663 69602782 69602708 Y UGT2B15,UGT2B11,UGT2B7,UGT2A3,UGT2B10 NA NA NA NA NA UGT2A3 212727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr4 70697485 70697758 70697651 Y SULT1B1 SULT1B1,SULT1E1 NA NA NA NA SULT1E1 26112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr4 70698476 70698796 70698636 Y UGT2A2 SULT1B1,SULT1E1 NA NA NA NA SULT1E1 25074 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 75554137 75554451 75554233 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 PARM1 301854 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr4 75585032 75585282 75585171 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARM1 271023 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr4 77041502 77041599 77041551 Y NA NUP54 NA NA NA NA NUP54 26069 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 77133814 77134170 77133987 Y NAAA,CXCL10,CXCL11 SCARB2,FAM47E NA NA NA NA FAM47E 621 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 77868010 77868840 77868612 Y NA SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 16 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 79882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 88008599 88008816 88008710 Y HSD17B11 NA NA NA NA NA TECRP1 139323 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 88038562 88038726 88038648 Y NA NA NA NA NA NA KLHL8 120740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 88130914 88131113 88130991 Y AFF1,HSD17B11 KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 28353 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 696530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 95469761 95469962 95469859 Y HPGDS,PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 98724 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr4 101977991 101978172 101977999 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 288765 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 103536028 103536474 103536149 Y NHEDC1,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 115542 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 103541931 103542312 103542286 Y NA NA NA NA NA NA NFKB1 121445 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 103678847 103679008 103678977 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 1143 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 103701783 103702159 103702029 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 21632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 103750426 103750532 103750434 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3 UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA UBE2D3 37521 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 104228091 104228235 104228147 Y NA NA NA NA NA NA CENPE 110525 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 106064596 106064807 106064750 Y NA TET2 TET2 K562 ChIA-PET 22265404 TET2 225 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 106416067 106416252 106416160 Y NA PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA EEF1A1P9 12212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 110497403 110497694 110497411 Y NA CCDC109B NA NA NA NA CCDC109B 18042 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 110623287 110623426 110623357 Y LRIT3 CASP6,PLA2G12A NA NA NA NA CASP6 548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 113208724 113209105 113209000 Y TIFA ALPK1,TIFA NA NA NA NA TIFA 3665 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 117474098 117474276 117474187 Y NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 530460 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 484131 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 124398959 124399392 124399124 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 83009 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 128059787 128060054 128059921 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 482372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 128752654 128753022 128752839 Y HSPA4L PLK4 NA NA NA NA PLK4 46994 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 129244135 129244496 129244419 Y NA PGRMC2,RP11-420A23.1 PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-420A23.1 32229 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 129494967 129495325 129495148 Y NA NA LARP1B,PHF17,PGRMC2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-420A23.1 283061 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 129609627 129610025 129609830 Y NA NA PHF17 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-420A23.1 397721 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 134191473 134191538 134191506 Y NA NA NA NA NA NA RP11-138I17.1 3940415 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 140074901 140075184 140075104 Y NA ELF2 CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 21188 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 140690476 140690707 140690592 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 105554 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 140819443 140819886 140819586 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 234521 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 140850270 140850709 140850607 Y MAML3,CLGN NA NA NA NA NA MAML3 222629 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 140897225 140897350 140897279 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 175988 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 140970177 140970718 140970535 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 102620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 144276815 144277022 144276900 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 20900 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 144280232 144280410 144280287 Y USP38,SMARCA5,GAB1 GAB1 NA NA NA NA GAB1 24317 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 148654111 148654384 148654270 Y PRMT10 ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 2897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 152226044 152226315 152226216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-610P16.1 101672 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 153630965 153631147 153631056 Y NA TMEM154 TMEM154 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM154 31648 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 153894415 153894544 153894479 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 38911 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 154127038 154127322 154127172 Y NA NA NA NA NA NA TRIM2 55544 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 154269495 154269528 154269512 Y TRIM2,MND1 MND1 NA NA NA NA MND1 5694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 154429389 154429734 154429551 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 43891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 155378623 155378919 155378786 Y NA NA NA NA NA NA PLRG1 90668 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 157863056 157863372 157863345 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 27174 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 159103850 159104073 159103996 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA FAM198B 11380 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 159112760 159112996 159112870 Y TMEM144 RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA TMEM144 7760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 159130594 159130739 159130610 Y TMEM144 RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA TMEM144 9838 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 159641149 159641258 159641192 Y NA ETFDH,C4orf46,PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 1290 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr4 159731152 159732543 159732097 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 42862 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 159748095 159748254 159748211 Y FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 59805 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 165728924 165729125 165729024 Y NA NA NA NA NA NA RP11-366M4.3 67031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 169490335 169490520 169490463 Y PALLD DDX60L NA NA NA NA DDX60L 33398 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 169868186 169868202 169868194 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 61224 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 169991170 169991417 169991322 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 61744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 169992046 169992220 169992129 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 62620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 170132939 170133158 170133049 Y SH3RF1 NA NA NA NA NA SH3RF1 57098 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 183161464 183161792 183161628 Y ODZ3 NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 97062 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 183397757 183397986 183397872 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 333355 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 183515054 183515204 183515166 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 321885 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 185269961 185270243 185270083 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 123491 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr4 186760271 186760668 186760511 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM3 305505 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 187597728 187597911 187597833 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 47965 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr4 187606948 187607189 187607069 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 38687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 757060 757343 757251 Y TPPP NA ZDHHC11,SLC9A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPPP 65550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 759096 759567 759320 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 TPPP 67586 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 1200004 1200495 1200211 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A7 89854 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 1315765 1316275 1315843 Y TERT TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 22581 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 1514952 1515327 1515072 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 6765 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 1516282 1516761 1516468 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 5331 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.05448370579771 chr5 9544480 9544834 9544772 Y SEMA5A SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 168 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 9547741 9548115 9547963 Y NA SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 3429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 10485180 10485474 10485337 Y NA ROPN1L,RPL30P7 NA NA NA NA RPL30P7 1458 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 10551479 10551871 10551616 Y NA ANKRD33B MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33B 10571 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 14250238 14250405 14250312 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 108427 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 14673178 14673249 14673214 Y NA EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 10405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 15008718 15008950 15008809 Y ANKH NA FAM105B,ANKH,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 138831 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 16492574 16492683 16492630 Y FAM134B ZNF622 NA NA NA NA ZNF622 28673 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 16855522 16855861 16855692 Y NA CTB-55B8.1 NA NA NA NA CTB-55B8.1 44889 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 118211 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 34006520 34007060 34007033 Y C1QTNF3,AMACR SLC45A2,AMACR,C1QTNF3 NA NA NA NA AMACR 300 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 34949030 34949157 34949062 Y NA BRIX1,RAD1,DNAJC21 NA NA NA NA DNAJC21 21332 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 36030784 36031024 36030904 Y UGT3A2 NA NA NA NA NA LMBRD2 119039 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 36119586 36119746 36119728 Y SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 30317 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr5 36174356 36174616 36174412 Y SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 24265 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr5 36243430 36243676 36243553 Y SLC1A3 NA NA NA NA NA SKP2 93339 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 32421 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RICTOR 411843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr5 38672702 38672722 38672712 Y NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 399788 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 39395044 39395463 39395161 Y NA C9 NA NA NA NA C9 27507 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 40967939 40968194 40968008 Y C6,C7 NA NA NA NA NA CARD6 128653 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 42468582 42468751 42468671 Y NA GHR NA NA NA NA GHR 46703 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 42858219 42858363 42858303 Y NIM1 SEPP1 NA NA NA NA SEPP1 27131 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 31500 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 43303282 43303485 43303367 Y NA HMGCS1 NA NA NA NA HMGCS1 8129 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 50522243 50522486 50522368 Y NA NA NA NA NA NA ISL1 154435 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 52332019 52332357 52332083 Y FST,ITGA2 ITGA2 NA NA NA NA ITGA2 48863 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 53358665 53359272 53358974 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 245140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 53460447 53460703 53460575 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 143709 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 53585796 53586153 53585818 Y NA ARL15,LINC01033 NA NA NA NA ARL15 18259 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 53598110 53598544 53598224 Y NA ARL15,LINC01033 NA NA NA NA ARL15 5868 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 55471391 55471677 55471521 Y IL6ST NA NA NA NA NA ANKRD55 55509 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 55625061 55625202 55625132 Y NA NA MAP3K1,IL6ST IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD55 97875 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 55646435 55647044 55646625 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD55 119249 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 55654713 55655022 55654890 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD55 127527 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 55655118 55655221 55655151 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD55 127932 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 55711184 55711637 55711363 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 87262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 55830072 55830234 55830153 Y NA AC022431.1 MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 31173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 56025254 56025318 56025310 Y MAP3K1,GPBP1,GPBP1 NA NA NA NA NA MAP3K1 84083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 56131312 56131556 56131415 Y GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1 MAP3K1 NA NA NA NA MAP3K1 21911 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 56737388 56737596 56737493 Y NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 269613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 58395760 58396044 58395902 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 641673 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 58420146 58420252 58420199 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 666059 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 58421119 58421626 58421279 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 667032 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 58423022 58423147 58423096 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 668935 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 669224 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 60239574 60239836 60239702 Y ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8 ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr5 60600910 60601202 60601013 Y ZSWIM6 ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 24898 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 61917589 61917885 61917879 Y NA NA NA NA NA NA CKS1B 111280 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 65220429 65221204 65220462 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 66518350 66518491 66518422 Y CD180 NA NA NA NA NA MAST4-AS1 220569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 67069285 67069755 67069460 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 439793 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.19144928618422 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 70991073 70991448 70991288 Y NA NA NA NA NA NA MCCC2 109958 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 71505945 71506221 71506083 Y NA NA NA NA NA NA PTCD2 107973 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 71790679 71790815 71790747 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 176206 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM171 97865 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 73926262 73926632 73926507 Y FAM169A HEXB,ENC1 NA NA NA NA HEXB 7216 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 74212679 74213001 74212847 Y NA CTD-2503O16.1 NA NA NA NA CTD-2503O16.1 12486 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 74862624 74863010 74862882 Y ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 56661 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 75832909 75833104 75832996 Y NA NA NA NA NA NA IQGAP2 135835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 F2RL1,S100Z F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 10369 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 F2RL1,S100Z F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 9371 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 77826174 77826769 77826484 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 171835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 78054058 78054218 78054140 Y NA CTD-2073O6.1,LHFPL2 NA NA NA NA LHFPL2 9626 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 78355695 78355721 78355708 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 75785 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 79376408 79376431 79376418 Y THBS4 NA NA NA NA NA MTX3 91326 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 79405751 79406102 79405927 Y NA NA NA NA NA NA MTX3 120669 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 79421543 79422183 79421865 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 127715 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 79480253 79480678 79480326 Y NA NA NA NA NA NA SERINC5 69220 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 79487807 79488093 79488033 Y SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 61805 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr5 81069582 81069591 81069587 Y NA SSBP2 SSBP2,ATG10,ZCCHC9 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 23966 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 82768408 82768816 82768560 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 3124 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA RPS3AP22 280858 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 95094861 95094991 95094889 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 GLRX IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2154I11.2 28862 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 95227563 95227763 95227704 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1 67942 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 95240158 95240487 95240414 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1 55218 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr5 95294794 95295285 95294896 Y ELL2 CTD-2337A12.1,ELL2 NA NA NA NA CTD-2337A12.1 420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 110797509 110797845 110797534 Y NA STARD4 NA NA NA NA STARD4 48443 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr5 110838164 110838531 110838380 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 7757 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 115908516 115909016 115908646 Y SEMA6A CTB-118N6.1 NA NA NA NA SEMA6A 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 119016321 119016356 119016339 Y NA CTC-507E12.1 NA NA NA NA CTC-507E12.1 2429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 122087226 122087448 122087366 Y NA SNX2 PRDM6 IMR90 Hi-C 24141950 SNX2 21243 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 122108155 122108524 122108401 Y SNX24,SNX2 SNX2 NA NA NA NA SNX2 167 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 124042490 124042759 124042619 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 39741 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 126985914 126986221 126985976 Y MEGF10,CTXN3 NA NA NA NA NA PRRC1 134613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 130730635 130730890 130730763 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 151449 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 130824249 130824445 130824350 Y FNIP1 NA NA NA NA NA RAPGEF6 144484 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 130971517 130972046 130971999 Y NA RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 2588 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 132368718 132369095 132368932 Y AFF4,ZCCHC10 AC010240.3,ZCCHC10,HSPA4 ZCCHC10,HSPA4,AFF4 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC10 8422 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr5 132576270 132576709 132576388 Y AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA NA HSPA4 190616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 133468017 133468495 133468331 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 19615 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 133880902 133881116 133881009 Y PCBD2,CDKL3,PHF15 AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 40659 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 134475601 134475808 134475692 Y PITX1 NA LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY IMR90 Hi-C 24141950 CTC-276P9.1 101864 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 134527149 134527274 134527245 Y NA NA CATSPER3,PCBD2,H2AFY,PITX1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-276P9.1 153412 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 134729736 134729896 134729816 Y NA H2AFY NA NA NA NA H2AFY 3708 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 134879348 134879728 134879405 Y NA NA NA NA NA NA H2AFY 145744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 135309178 135309390 135309247 Y LECT2 NA LECT2,SMAD5,SMAD5-AS1,TGFBI,VTRNA2-1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 53194 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 137333439 137333810 137333723 Y NA NA NA NA NA NA FAM13B 51840 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 137370531 137370718 137370637 Y PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5 FAM13B PKD2L2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 14932 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.73931160773028 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr5 138262166 138262549 138262196 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 175168 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 190951 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 139023017 139023340 139023136 Y NA CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 1544 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 139598972 139599011 139598993 Y ANKHD1 NA NA NA NA NA PFDN1 81695 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr5 139633683 139634086 139633757 Y SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 46620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 NA NA NA NA NA PCDHGA10 84896 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 140983787 140984197 140984031 Y PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 12425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 141256552 141256862 141256814 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 141375136 141375383 141375261 Y NA RNF14,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 15223 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 141825669 141826086 141825870 Y SPRY4 NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 121649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 142174878 142175359 142175023 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 26929 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 142305329 142305654 142305542 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 157380 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 142535933 142536319 142536126 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 173851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 142600445 142600900 142600783 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 109270 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 145319403 145319467 145319435 Y NA SH3RF2 NA NA NA NA SH3RF2 5261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 145426337 145426723 145426491 Y NA NA NA NA NA NA SH3RF2 112195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 147024840 147025034 147024978 Y DPYSL3,JAKMIP2 NA NA NA NA NA JAKMIP2 135304 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 147218600 147219023 147218871 Y SPINK1 SPINK1 JAKMIP2 IMR90 Hi-C 24141950 SPINK1 9251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 147343599 147343802 147343701 Y FBXO38 NA NA NA NA NA SPINK1 134250 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 148700478 148700631 148700542 Y NA GRPEL2,PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L IMR90 Hi-C 24141950 GRPEL2 22362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 148836415 148836621 148836572 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 92386 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 149267173 149267449 149267330 Y NA NA NA NA NA NA SLC26A2 70851 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.32841486657074 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA NA NA NA NA NA TIGD6 139516 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 149921548 149921861 149921663 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO 56781 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 151078700 151079028 151078874 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 13974 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 153955712 153955778 153955745 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L 132195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr5 156224453 156224847 156224837 Y NA NA NA NA NA NA HAVCR1 259283 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 156476668 156477024 156476779 Y HAVCR1,HAVCR1 HAVCR1 NA NA NA NA HAVCR1 7106 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr5 157097652 157097963 157097872 Y NA NA NA NA NA NA THG1L 58242 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 159480874 159481257 159481243 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 46754 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 159586814 159587463 159587155 Y PWWP2A,FABP6 PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 24911 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 159637065 159637397 159637293 Y FABP6 FABP6,RP11-34P1.2 NA NA NA NA FABP6 24691 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 159688113 159688294 159688164 Y CCNJL RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 4853 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 159951614 159951766 159951649 Y FABP6 NA NA NA NA NA PTTG1 104785 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 167126470 167126930 167126675 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 589726 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 167741798 167742197 167741960 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 25142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 167752204 167752623 167752553 Y PANK3 WWC1 RARS IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 35548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 171498342 171498743 171498483 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 66465 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 171505010 171505317 171505162 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 73133 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 172208951 172208972 172208964 Y UBTD2 DUSP1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 12753 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 172463160 172463425 172463226 Y NA NA C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V0E1 54400 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 173312606 173312854 173312733 Y CPEB4 CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 173846140 173846257 173846227 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 303279 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 174148035 174148467 174148121 Y MSX2 MSX2 NA NA NA NA MSX2 1069 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 175347355 175347516 175347492 Y NA NA CPLX2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP148 294164 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 COL23A1,CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 178206075 178206216 178206134 Y NA NA NA NA NA NA ZNF354A 50372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr5 179777875 179778220 179778048 Y OR2Y1 GFPT2 NA NA NA NA GFPT2 167 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 179787136 179787376 179787257 Y OR2Y1 GFPT2 GFPT2,MAPK9 IMR90 Hi-C 24141950 GFPT2 8749 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 179967202 179967410 179967248 Y NA CNOT6 NA NA NA NA CNOT6 47790 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 180244025 180244427 180244181 Y MGAT1,MGAT1 MGAT1,LINC00847,ZFP62 NA NA NA NA MGAT1 3373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr5 180615428 180615595 180615512 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 1329 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 1055850 1056126 1055989 Y FOXQ1 NA NA NA NA NA FOXQ1 254549 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr6 1131986 1132306 1132130 Y NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 178369 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 1250840 1251149 1250977 Y NA NA EXOC2,LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 59526 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 1311143 1311466 1311342 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 468 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.32841486657074 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr6 1641578 1641903 1641733 Y NA FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 32897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 2038182 2038509 2038345 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 205417 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 2763251 2763536 2763387 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 2875221 2875651 2875270 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 34981 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 2980500 2980669 2980575 Y SERPINB1,RIPK1,SERPINB9 SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NQO2 5552 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 2992078 2992424 2992251 Y NA SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 NA NA NA NA NQO2 5857 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 3166310 3166878 3166542 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 10550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 3209395 3209963 3209634 Y SERPINB9 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA PSMG4 19674 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 3409066 3409300 3409183 Y TUBB2B SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 45956 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 3426515 3426916 3426721 Y NA SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 28340 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 3511713 3512018 3511866 Y NA NA PXDC1,SLC22A23 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A23 56457 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1 SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 6811454 6812228 6812086 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293602 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 6970116 6970321 6970219 Y NA NA LY86 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 135509 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 7505623 7505742 7505694 Y RREB1,DSP DSP DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 34066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 7528818 7529102 7528955 Y NA DSP CAGE1,RIOK1,DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 10706 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 8180632 8181260 8180704 Y NA NA EEF1E1-MUTED IMR90 Hi-C 24141950 EEF1E1 79821 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 8545597 8545822 8545710 Y NA NA NA NA NA NA HULC 104548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 HULC 866157 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,GCNT2 NA NA NA NA TFAP2A 23634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 10552532 10552740 10552636 Y NA NA NA NA NA NA GCNT2 62076 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA ERVFRD-1 100104 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 11318376 11319012 11318732 Y TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 61569 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 11344526 11344935 11344784 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 35646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr6 11390283 11390548 11390416 Y NEDD9 NEDD9 NEDD9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NEDD9 9702 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 11834601 11834816 11834711 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 172179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 11944480 11944614 11944537 Y NA NA HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 62381 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 12291396 12291672 12291434 Y NA EDN1 NA NA NA NA EDN1 2800 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 12315136 12315383 12315260 Y NA EDN1 NA NA NA NA EDN1 26540 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 12332214 12332482 12332362 Y NA EDN1 EDN1,TMEM170B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EDN1 43618 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 12371691 12372070 12371982 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 83095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 12587436 12587655 12587553 Y NA NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 75094 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 12602673 12603131 12602821 Y NA NA TMEM170B,EDN1,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 90331 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 13303878 13304185 13304075 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 22630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 13391107 13391478 13391293 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D7 64292 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 13671877 13672171 13672102 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83 RANBP9 NOL7,SIRT5 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 37625 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 13762938 13763200 13763069 Y RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 53142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 15313668 15313748 15313709 Y DTNBP1,JARID2 NA NA NA NA NA JARID2 69141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 15526544 15526623 15526553 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 134666 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 16481928 16482422 16482245 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 245117 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 17430018 17430227 17430123 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 38571 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 17712711 17712926 17712817 Y NA NUP153 FAM8A1,NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 8055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 19477913 19478110 19478022 Y ID4 NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 324873 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 20211469 20211688 20211565 Y NA MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 799 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 20877706 20877968 20877723 Y CDKAL1 NA NA NA NA NA CDKAL1 345018 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 21738487 21738974 21738702 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 146515 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 24302656 24303033 24302868 Y NA NA NA NA NA NA DCDC2 53247 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 24348668 24348920 24348794 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 7360 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 25303199 25303368 25303284 Y NA LRRC16A NA NA NA NA LRRC16A 25893 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 25458860 25459089 25458879 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 181554 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.46538044695725 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 26233560 26233958 26233761 Y NA HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H1D 344 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 27637197 27637397 27637297 Y OR2B6,OR2B2 NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 27740489 27740807 27740621 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 32902 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr6 27780866 27781094 27780996 Y ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL NA NA NA NA HIST1H2BM 44 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 27798416 27798741 27798578 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H4K 1111 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 28302002 28302386 28302196 Y NA ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 13305 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN3 99262 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA XXbac-BPG308K3.5,HCG14 NA NA NA NA HCG14 27721 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 28985048 28985267 28985158 Y NA HCG15,ZNF311 TRIM27,LOC401242 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF311 13955 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 26974 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 28146 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 30495647 30495976 30495809 Y PPP1R11,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 26687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 30796195 30796565 30796398 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1 IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDR1 45633 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 30811913 30812084 30812025 Y NA DDR1 FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1 IMR90 Hi-C 24141950 DDR1 30114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,LY6G6C,DDAH2,CLIC1 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.69807067043587 chr6 32114130 32114430 32114186 Y GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,AGER,PBX2 NA NA NA NA PPT2 4788 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 33386765 33387072 33386901 Y HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 2671 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 8702 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 33602402 33602476 33602439 Y NA ITPR3 IP6K3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR3 16260 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 33818239 33818267 33818253 Y NA MLN GRM4,MLN,IP6K3,LINC00336,BAK1,GGNBP1,LEMD2,LOC100507584,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 MLN 48451 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 34048216 34048600 34048360 Y NA NA MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 CYCSP55 136616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 34173295 34173599 34173423 Y NA CYCSP55,HMGA1,C6orf1 C6orf106,RPS10-NUDT3,NUDT3,SNRPC,HMGA1,C6orf1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYCSP55 11617 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 35453228 35453566 35453395 Y NA FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 9287 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 36302760 36303107 36302825 Y NA C6orf222 NA NA NA NA C6orf222 98 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 36321421 36321620 36321472 Y CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7 C6orf222 NA NA NA NA C6orf222 18759 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 36391024 36391283 36391227 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA KCTD20 17261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 36391779 36391863 36391821 Y NA KCTD20,PXT1 NA NA NA NA KCTD20 16681 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA PXT1 591 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 36547678 36548077 36547769 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 12068 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 37095912 37096089 37096014 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 39890 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 37155093 37155653 37155211 Y TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1 PIM1 NA NA NA NA PIM1 19114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 39171657 39171958 39171719 Y NA KCNK5 NA NA NA NA KCNK5 23268 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 39886697 39886822 39886760 Y NA MOCS1,RP1-278E11.3 NA NA NA NA MOCS1 13468 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 40132230 40132456 40132336 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 207658 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 40964511 40964818 40964666 Y NA UNC5CL NA NA NA NA UNC5CL 40110 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 40965087 40965613 40965406 Y NA UNC5CL NA NA NA NA UNC5CL 39315 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr6 41008417 41008606 41008512 Y UNC5CL,TSPO2,TSPO2 UNC5CL,APOBEC2,NFYA NA NA NA NA UNC5CL 3489 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 41472054 41472459 41472263 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 39705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 42081758 42081907 42081849 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 26450 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 42722931 42723177 42723029 Y NA ATP6V0CP3,TBCC UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 10373 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 43085846 43085863 43085854 Y NA PTK7 NA NA NA NA PTK7 43840 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 43229544 43229904 43229724 Y TTBK1 NA CRIP3,ZNF318,SLC22A7 IMR90 Hi-C 24141950 CUL9 81631 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 43766474 43766976 43766784 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 30553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr6 43769637 43769823 43769746 Y NFKBIE,TJAP1 VEGFA NA NA NA NA VEGFA 33716 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 43771690 43772179 43771963 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 35769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 43774176 43774478 43774332 Y NA VEGFA NA NA NA NA VEGFA 38255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA VEGFA 158490 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 43975133 43975197 43975165 Y CDC5L,C6orf223 NA NA NA NA NA TMEM63B 117454 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 44396303 44396427 44396307 Y NA CDC5L NA NA NA NA CDC5L 43041 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 46825145 46825263 46825204 Y NA NA NA NA NA NA MEP1A 66018 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 47618805 47618920 47618863 Y OPN5 GPR115 NA NA NA NA GPR115 32680 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 47637505 47637670 47637588 Y OPN5,GPR111 GPR115 GPR115 IMR90 Hi-C 24141950 GPR115 13930 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 51642474 51642504 51642490 Y NA NA NA NA NA NA PKHD1 307919 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 51738790 51738977 51738878 Y NA NA NA NA NA NA PKHD1 211446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr6 52261634 52261809 52261784 Y EFHC1 PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA EFHC1 21297 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 52339756 52339820 52339788 Y NA NA NA NA NA NA EFHC1 56650 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 52389241 52389494 52389368 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 50219 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 52431726 52432083 52432005 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAM2 7630 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 52439625 52439825 52439764 Y TRAM2 NA NA NA NA NA TRAM2 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 52591404 52591712 52591556 Y NA GSTA2 NA NA NA NA GSTA2 34655 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 52841440 52841610 52841523 Y NA GSTA4 NA NA NA NA GSTA4 16566 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 53734127 53734150 53734138 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 76832 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA DST 520858 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 56315031 56315399 56315215 Y NA NA NA NA NA NA DST 502027 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 64088639 64088972 64088831 Y NA NA EYS IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A1 140694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 64150073 64150241 64150156 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 79425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 10.9572464309211 chr6 64168515 64168918 64168771 Y PTP4A1 NA NA NA NA NA PTP4A1 60748 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 70505414 70505608 70505498 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 411 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 70808594 70808991 70808795 Y NA NA NA NA NA NA LMBRD1 303591 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 72103736 72104124 72104114 Y NA NA NA NA NA NA OGFRL1 107230 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 75906514 75906841 75906796 Y NA COL12A1 NA NA NA NA COL12A1 6926 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 81198805 81198931 81198868 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 384441 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 82547816 82548067 82547911 Y FAM46A NA FAM46A MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM46A 87325 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.46538044695725 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E RP11-30P6.6,NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-30P6.6 16592 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 90031448 90031662 90031542 Y PNRC1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 28905 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 90596283 90596734 90596349 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 58670 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 90818937 90819075 90819003 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 185552 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 92907681 92907862 92907772 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 1612917 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 95887569 95887862 95887716 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 135557 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 100008682 100008928 100008805 Y NA USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 5921 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 100051584 100051769 100051603 Y NA CCNC,PRDM13 NA NA NA NA PRDM13 837 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 106328995 106329365 106329066 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 202830 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 106540002 106540199 106540101 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 7807 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 108239964 108240066 108240015 Y NA SEC63 NA NA NA NA SEC63 37327 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 108324190 108324471 108324239 Y NA SEC63,RPL3P7 NA NA NA NA RPL3P7 301 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1,NR2E1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 109102631 109102946 109102736 Y NA NA NA NA NA NA ARMC2 64673 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 111382725 111382978 111382849 Y AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10 SLC16A10 NA NA NA NA SLC16A10 23803 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 111612312 111612528 111612438 Y AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919 KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 33761 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 113951649 113952852 113952545 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 16424 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA RP11-367G18.1 NA NA NA NA RP11-367G18.1 36530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 114664746 114665107 114665068 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 334274 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 116247686 116248075 116247881 Y NA NA NA NA NA NA FRK 131846 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 123111983 123112340 123112183 Y PKIB,SMPDL3A FABP7,SMPDL3A NA NA NA NA SMPDL3A 3668 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 128617083 128617221 128617152 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 222649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 410707 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 130030425 130030727 130030721 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 1055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 132811280 132811490 132811390 Y VNN2,VNN2,VNN2,VNN1,STX7 STX7 NA NA NA NA STX7 20847 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 132832416 132832580 132832524 Y VNN1,STX7 STX7 NA NA NA NA STX7 79 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 137545116 137545441 137545236 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 6530 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 138045007 138045495 138045466 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 140856 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 138115529 138115913 138115812 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 70438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 138164498 138164657 138164583 Y TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 21694 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 138290142 138290398 138290268 Y TNFAIP3 NA NA NA NA NA TNFAIP3 103791 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 139852407 139852567 139852460 Y HECA NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 158650 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-899B16.1 87902 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 143864167 143864345 143864273 Y NA FUCA2,PHACTR2 NA NA NA NA PHACTR2 8185 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 143994840 143994998 143994919 Y NA NA NA NA NA NA PHACTR2 138858 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr6 144585551 144585700 144585606 Y NA NA UTRN IMR90 Hi-C 24141950 TPT1P4 65449 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 144587251 144587368 144587331 Y NA NA UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 TPT1P4 67149 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 144644192 144644433 144644313 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 124090 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 144931961 144932452 144932213 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 411859 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 147831138 147831275 147831225 Y SAMD5 SAMD5 NA NA NA NA SAMD5 3075 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 148424761 148425105 148424843 Y NA NA NA NA NA NA SASH1 166335 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr6 150076607 150076998 150076645 Y KATNA1,LATS1 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 7806 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 150958103 150958422 150958105 Y PLEKHG1 PLEKHG1 NA NA NA NA PLEKHG1 39104 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 151815811 151815987 151815867 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1,C6orf97 RMND1,C6orf211 NA NA NA NA C6orf211 44389 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 152634983 152635621 152635105 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 321315 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 4.51986415275496 chr6 154664890 154665258 154665161 Y IPCEF1 NA NA NA NA NA CNKSR3 164535 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 155545212 155545590 155545426 Y SCAF8 RP11-477D19.2 NA NA NA NA RP11-477D19.2 30268 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 155649228 155649931 155649893 Y NA TFB1M ARID1B,MIR4466 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 15601 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 158182288 158182636 158182583 Y SNX9 NA SNX9,ZDHHC14,TMEM242,SYNJ2,SERAC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 59660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 158184460 158184689 158184561 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 57607 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr6 158375265 158375579 158375328 Y NA SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 25309 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 158982051 158982465 158982168 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 26583 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 32206 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 17645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 16971 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr6 159284894 159285253 159285074 Y NA EZR,C6orf99 OSTCP1 K562 ChIA-PET 22265404 C6orf99 3718 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 159359890 159360005 159359951 Y EZR NA EZR IMR90 Hi-C 24141950 RSPH3 59214 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 161620136 161620467 161620302 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 72626 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 163784160 163784198 163784179 Y NA QKI PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 48834 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 166765505 166765751 166765595 Y NA SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 11426 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 167372859 167373027 167372950 Y GPR31,RNASET2 RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA RNASET2 4180 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 167688642 167688747 167688695 Y NA UNC93A SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 UNC93A 5985 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 168216462 168216639 168216532 Y NA C6orf123,MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 8963 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 7.53310692125826 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 169473606 169473776 169473633 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 626383 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA WDR27 271871 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 170203615 170204008 170203729 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 53960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 170208297 170208700 170208496 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 58642 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 170449336 170449548 170449442 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 148013 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr6 170589556 170589600 170589578 Y WDR27,TCTE3,TBP DLL1,FAM120B NA NA NA NA DLL1 7961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 AC093627.12 180914 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr7 475920 475996 475984 Y NA NA HEATR2,PRKAR1B MCF7 ChIA-PET 22265404 PDGFA 81937 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 543299 543586 543435 Y GET4,CYP2W1,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 14347 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr7 627421 627837 627508 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 69488 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 1017371 1017727 1017512 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,CYP2W1 ADAP1,COX19,CYP2W1 NA NA NA NA CYP2W1 3108 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 1501148 1501314 1501260 Y NA MICALL2,INTS1 NA NA NA NA MICALL2 4010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 1571848 1572026 1571934 Y ZFAND2A,TMEM184A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3498 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr7 2353156 2353455 2353307 Y NA EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 38266 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 2366728 2366801 2366785 Y SNX8,LFNG EIF3B,SNX8 FTSJ2,NUDT1,SNX8,EIF3B,KIAA1908,MAD1L1,MAFK,TFAMP1,PSMG3,TMEM184A,ELFN1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 24920 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 2661791 2662128 2661981 Y NA TTYH3 AMZ1,TTYH3 IMR90 Hi-C 24141950 TTYH3 7457 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr7 2744937 2745164 2745051 Y NA NA NA NA NA NA TTYH3 75352 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 4184588 4184872 4184657 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 496516 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 4778448 4778853 4778548 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 97060 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 4848839 4849223 4849185 Y NA NA NA NA NA NA AC092610.12 54212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 4913549 4913687 4913618 Y NA AC092610.12 NA NA NA NA AC092610.12 10114 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 5458136 5458686 5458477 Y FBXL18,TNRC18 TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 4359 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 5571351 5571818 5571666 Y WIPI2,ACTB FBXL18,ACTB NA NA NA NA FBXL18 19922 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 5571967 5572766 5572739 Y RBAK,RBAK FBXL18,ACTB NA NA NA NA FBXL18 20538 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 5596196 5596581 5596543 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 4834 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 5733172 5733453 5733321 Y CCZ1,USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 85917 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 5787686 5787972 5787829 Y NA RNF216 NA NA NA NA RNF216 31398 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 7139165 7139472 7139292 Y NA NA C1GALT1,LOC100131257 K562 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 55093 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 7604061 7604281 7604173 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 222 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr7 8016516 8016759 8016566 Y GLCCI1 GLCCI1 NA NA NA NA GLCCI1 10091 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 13057101 13057487 13057331 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 332620 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr7 13512547 13512927 13512737 Y NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P21 596078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 13694099 13694114 13694107 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P21 414891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 17402534 17402650 17402592 Y NA NA NA NA NA NA AC003075.4 65553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA AC017060.1 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 31959 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 18575593 18575869 18575740 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA SNX13 597469 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 20197239 20197492 20197368 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 57535 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr7 20217388 20217681 20217578 Y TWISTNB,MACC1 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 37346 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 20228342 20228547 20228441 Y TWISTNB,ITGB8 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 26480 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 15637 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 20254261 20255002 20254926 Y MACC1 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 25 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 20346814 20347223 20346902 Y NA ITGB8 TMEM196,MACC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB8 21102 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 20582388 20582432 20582424 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 214063 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 22398962 22399217 22399216 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 150401 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 47340 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 22742975 22743282 22743130 Y NA NA FAM126A,LOC100506178 IMR90 Hi-C 24141950 STEAP1B 72431 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2 NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 25897167 25897316 25897282 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292544 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 26143303 26143447 26143328 Y SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3 NA NA NA NA NFE2L3 46413 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1 232477 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 28505826 28505846 28505837 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1 287464 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 29235795 29236387 29235996 Y CHN2 CPVL NA NA NA NA CPVL 2728 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 29645878 29645994 29645936 Y NA AC007255.8,PRR15 PRR15 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRR15 44451 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 30203047 30203422 30203138 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF2 118501 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 30500037 30500161 30500099 Y NA NOD1 NA NA NA NA NOD1 16239 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 37358703 37358798 37358755 Y GPR141,ELMO1 NA NA NA NA NA NPM1P18 502139 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 43625905 43626316 43625996 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 5548 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 43912365 43912715 43912516 Y NA MRPS24 NA NA NA NA MRPS24 4873 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 44127636 44127736 44127679 Y YKT6,AEBP1 DBNL,POLM,POLD2 PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B IMR90 Hi-C 24141950 POLM 7497 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 44549904 44550285 44550054 Y NA AC004453.8,NUDCD3,NPC1L1 NA NA NA NA NUDCD3 21425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 44658456 44658730 44658526 Y PURB,TMED4,OGDH DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA OGDH 14285 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 46184955 46185274 46185142 Y NA NA NA NA NA NA SEPT7P2 378338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 4.10896741159541 chr7 47573930 47574208 47574136 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 45948 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 47612587 47612873 47612749 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 7283 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 50418144 50418701 50418411 Y IKZF1 NA NA NA NA NA FIGNL1 97387 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 50859334 50859716 50859525 Y NA GRB10 NA NA NA NA GRB10 175 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 51417920 51418197 51418059 Y NA COBL NA NA NA NA COBL 35405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 55014473 55014960 55014850 Y EGFR NA EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 69754 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr7 55235458 55235690 55235573 Y NA EGFR-AS1 NA NA NA NA EGFR-AS1 18937 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 55253994 55254266 55254079 Y SEC61G EGFR-AS1 NA NA NA NA EGFR-AS1 361 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 EGFR-AS1 67943 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 55541787 55541962 55541880 Y NA NA NA NA NA NA VOPP1 96719 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 56243524 56243790 56243559 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 71255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 434088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.60234602734376 chr7 66040596 66040908 66040816 Y NA NA NA NA NA NA KCTD7 50960 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 73156679 73157033 73156789 Y NA STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 5482 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 73157180 73157738 73157420 Y FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 5983 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr7 73236868 73237278 73236968 Y CLDN3,CLDN4 CLDN4,WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 17587 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 73994648 73994954 73994780 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 75040 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 75535277 75535559 75535332 Y NA POR NA NA NA NA POR 8759 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 77561991 77562080 77562036 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 135869 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 80360559 80360752 80360740 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 188923 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 80399893 80400101 80400015 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 149574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 83662977 83663317 83663147 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3A 456723 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 83865799 83865921 83865847 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 254119 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 90236421 90236455 90236438 Y NA NA CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 CDK14 142683 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 92340516 92340848 92340839 Y CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 122808 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 90055 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 92439060 92439368 92439205 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 24429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 94022848 94022915 94022881 Y NA NA NA NA NA NA CASD1 113616 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 95625996 95626320 95626115 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 323139 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 95807779 95807791 95807785 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 141668 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 95877265 95877280 95877275 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 72179 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 95913909 95914253 95914081 Y SLC25A13 SLC25A13 NA NA NA NA SLC25A13 35206 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 98028342 98028618 98028511 Y BRI3 RPS3AP26 NA NA NA NA BAIAP2L1 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 98047040 98047207 98047124 Y NA RPS3AP26,BAIAP2L1 BAIAP2L1 K562 ChIA-PET 22265404 BAIAP2L1 18660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 98383358 98383761 98383522 Y NA NA NA NA NA NA TRRAP 89795 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 98809347 98809684 98809536 Y ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7 NA SMURF1 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF1 69624 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr7 98970307 98970479 98970399 Y PTCD1,CPSF4 ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 435 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 99291105 99291222 99291169 Y PTCD1,CYP3A43,CYP3A4,AZGP1,CYP3A5 CYP3A5 NA NA NA NA CYP3A5 15484 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 100434359 100434559 100434459 Y SAP25,EPHB4 SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 11238 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 100760673 100761017 100760905 Y GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1 TRIM56,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM56 33953 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,AP1S1,VGF NA NA NA NA AP1S1 29594 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr7 101566593 101566799 101566736 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 109634 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 101707897 101708291 101708217 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 250938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.05448370579771 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA RP11-325F22.5,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.5 43033 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 105711914 105712310 105712244 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 38712 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 105714803 105715079 105714993 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 35943 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 107555392 107555607 107555420 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 25977 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr7 107925271 107925573 107925565 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 169588 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 107952376 107952906 107952758 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 142255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 112383831 112384204 112384019 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 44443 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 112414156 112414445 112414299 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 14202 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 116651956 116652355 116652105 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 59568 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 121150464 121150828 121150695 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 116046 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 127665265 127665386 127665326 Y NA NA NA NA NA NA RBM28 316576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 128500948 128501348 128501123 Y NA FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA ATP6V1F 68 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 129418602 129418801 129418733 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169047 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 NA NA NA NA NA CEP41 66368 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 131166569 131166943 131166757 Y PODXL NA NA NA NA NA PODXL 74033 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 131304608 131304982 131304803 Y NA NA PODXL MCF7 ChIA-PET 22265404 PODXL 63632 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 131307786 131308102 131307944 Y NA NA PODXL MCF7 ChIA-PET 22265404 PODXL 66810 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 134247089 134247493 134247269 Y LRGUK NA NA NA NA NA BPGM 82067 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 134498976 134499173 134499074 Y CALD1 NA NA NA NA NA CALD1 71973 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 134540961 134541304 134541061 Y CALD1 NA NA NA NA NA CALD1 113958 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 137544616 137544738 137544677 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 140075 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 137573369 137573542 137573460 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 111271 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 137659854 137660135 137660099 Y NA CREB3L2,AKR1D1 NA NA NA NA CREB3L2 24678 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 137661285 137661695 137661644 Y NA CREB3L2,AKR1D1 NA NA NA NA CREB3L2 23118 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 138643234 138643648 138643551 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 20416 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 139498127 139498170 139498155 Y TBXAS1 HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 22550 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 139939680 139939943 139939812 Y NA NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB19 161900 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 140271542 140271796 140271668 Y NA NA NA NA NA NA MKRN1 94173 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 142246179 142246560 142246372 Y EPHB6 NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 PRSS1 208759 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 143856214 143856503 143856359 Y NA NA NA NA NA NA FAM115A 258923 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 147109889 147110169 147110008 Y NA NA NA NA NA NA AC005229.5 1165324 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 148269293 148269443 148269383 Y NA AC005229.5 NA NA NA NA AC005229.5 6050 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 148824928 148825234 148824952 Y NA ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF398 3420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 151284346 151284467 151284405 Y SMARCD3,SMARCD3,WDR86 NA NA NA NA NA RHEB 69140 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 151442202 151442898 151442523 Y NA NA CRYGN,RHEB IMR90 Hi-C 24141950 PRKAG2-AS1 129229 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 155006028 155006426 155006187 Y NA NA NA NA NA NA INSIG1 81060 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr7 155383034 155383540 155383287 Y RBM33 NA LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM33 51605 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 156290432 156290782 156290467 Y RNF32 NA SHH,LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 RNF32 140193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 156409241 156409518 156409427 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA RNF32 21457 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 156412276 156412413 156412345 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA RNF32 18562 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 156544134 156544345 156544262 Y NA NA NA NA NA NA C7orf13 112786 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 156800292 156800601 156800569 Y MNX1,MNX1 MNX1 NA NA NA NA MNX1 744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 157082177 157082296 157082243 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43779 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 157255834 157256209 157256022 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 129759 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr7 158194918 158195318 158194932 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 300202 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr7 158225517 158225999 158225657 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 269521 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 1837817 1838203 1838066 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 67675 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 1908202 1908376 1908284 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 11668 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 3252665 3252838 3252782 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 1332621 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 6323096 6323426 6323195 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 60983 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr8 8242841 8243169 8242949 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 833 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 8637281 8637697 8637535 Y PPP1R3B,MFHAS1,CLDN23 RP11-211C9.1 NA NA NA NA RP11-211C9.1 292 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 8742026 8742246 8742225 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 6909 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 8883496 8883931 8883840 Y NA ERI1 NA NA NA NA ERI1 25839 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 8935191 8935379 8935249 Y NA NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 71705 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 9040807 9041224 9041065 Y NA PPP1R3B,RP11-10A14.4 NA NA NA NA RP11-10A14.4 33555 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 10676875 10677241 10677058 Y NA SOX7,PINX1 NA NA NA NA SOX7 18116 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 16981456 16981640 16981548 Y NA ZDHHC2 NA NA NA NA ZDHHC2 29898 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 17595582 17595868 17595676 Y NAT1 NA NA NA NA NA MTUS1 60558 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 18874321 18874582 18874494 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 65658 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 19414490 19414802 19414647 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 198738 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 19522969 19523285 19523139 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 90255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,REEP4,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 22222955 22223268 22223121 Y EPB49,SLC39A14,SLC39A14 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 22441359 22441704 22441532 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 7567 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 132419 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr8 22858322 22858618 22858470 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 15392 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 23405243 23405645 23405476 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 20925 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 23655999 23656321 23656218 Y STC1 NA STC1,SLC25A37 IMR90 Hi-C 24141950 STC1 53999 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NA NA NA NA NA DOCK5 240520 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 26008929 26009154 26009015 Y NA NA PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 137853 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 27219305 27219672 27219420 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52306 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 27219743 27220043 27219778 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52744 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 27265822 27266045 27265950 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA EPHX2 80251 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 27972693 27972953 27972823 Y NA ELP3 NA NA NA NA ELP3 27503 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 28890628 28890717 28890674 Y KIF13B CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 20735 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 29412011 29412162 29412114 Y NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 205826 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 29526859 29527039 29527017 Y NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 320674 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 29938783 29938843 29938811 Y NA TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA TMEM66 60 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 30358644 30358942 30358767 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 117727 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA DUSP26 124148 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr8 37446897 37447170 37447094 Y ZNF703 RP11-150O12.1,RP11-150O12.3 ZNF703 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-150O12.3 8206 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 37449026 37449149 37449088 Y RAB11FIP1,ZNF703 RP11-150O12.1,RP11-150O12.3 ZNF703 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-150O12.3 6227 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 37532791 37533173 37533002 Y NA ZNF703 NA NA NA NA ZNF703 18096 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 37751458 37752024 37751766 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2961 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 37757888 37758317 37758017 Y WHSC1L1,RAB11FIP1 RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2903 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.19144928618422 chr8 37761676 37761790 37761689 Y NA RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 6691 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 37939512 37939733 37939625 Y NA ASH2L ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASH2L 21027 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 38384926 38385302 38385064 Y HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86 NA NA NA NA NA FGFR1 60574 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 38624356 38624716 38624649 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1 TACC1 NA NA NA NA TACC1 40652 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 38867572 38867594 38867583 Y C8orf86 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 15184 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 39912317 39912749 39912459 Y C8orf4 NA C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 96240 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 41674575 41674631 41674603 Y ANK1 NA NA NA NA NA KAT6A 232877 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 41733569 41733873 41733722 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 173635 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 41775383 41775559 41775471 Y NA NA ANK1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 131949 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 42356471 42356680 42356560 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 38389 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 42377318 42377512 42377415 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 17557 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 224269 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 48579999 48580070 48580036 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 69578 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 48910578 48910837 48910684 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 8123 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 49550038 49550119 49550080 Y SNAI2 NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 254888 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 53059392 53059757 53059575 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 249507 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 53379796 53380092 53379874 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA RB1CC1 276311 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 55389317 55389516 55389419 Y SOX17 NA NA NA NA NA RP11-53M11.3 75405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17A4.1 108243 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 59499727 59499886 59499762 Y UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 36244 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 61626654 61626933 61626781 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37317 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.87627718811679 chr8 61657043 61657068 61657053 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 67706 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 62679636 62680132 62679874 Y NA NA ASPH,MIR4470 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4470 54289 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 66893726 66894034 66893791 Y PDE7A NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 141169 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 66935018 66935363 66935175 Y PDE7A NA NA NA NA NA PDE7A 182461 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA RRS1 80555 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 67425057 67425564 67425100 Y NA NA NA NA NA NA RRS1 85794 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 67626224 67626609 67626278 Y SGK3,VCPIP1,SGK3 VCPIP1,C8orf44,SGK3 NA NA NA NA SGK3 3571 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 70042378 70042779 70042585 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-101P 945488 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 70787574 70787763 70787675 Y SLCO5A1,SLCO5A1,SLCO5A1 NA NA NA NA NA RNU1-101P 200504 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 73799378 73799441 73799410 Y KCNB2 NA NA NA NA NA TERF1 119658 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 75179617 75179845 75179716 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 51520 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 75494116 75494334 75494225 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 20145 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 79578942 79579038 79579012 Y IL7,FAM164A NA NA NA NA NA PKIA 152568 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 248204 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 80859511 80859794 80859653 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 80730 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 80996547 80996769 80996670 Y TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 56023 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 81059132 81059394 81059212 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 82073 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 90838382 90838725 90838688 Y RIPK2,OSGIN2 NA OSGIN2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RIPK2 70407 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 94410297 94410678 94410357 Y NA NA NA NA NA NA FAM92A1 298111 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 94507560 94507986 94507856 Y NA NA NA NA NA NA FAM92A1 200803 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 95271404 95271652 95271620 Y GEM CDH17,GEM NA NA NA NA GEM 926 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 96197025 96197314 96197170 Y NA NA PLEKHF2,C8orf69 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHF2 52993 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 98877971 98878157 98878074 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA MATN2 911 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 101486265 101486558 101486389 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A KB-1615E4.2 SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 362 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 101500158 101500422 101500292 Y NA KB-1615E4.2 RNF19A,GRHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 14255 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 101512336 101512720 101512423 Y SPAG1,SPAG1 KB-1615E4.2 NA NA NA NA KB-1615E4.2 26433 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 101880714 101880933 101880768 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6 YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P6 25041 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 102185716 102186115 102186035 Y NA ZNF706 YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 30306 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 102191448 102191797 102191796 Y NA ZNF706 NA NA NA NA ZNF706 24624 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 102373140 102373427 102373201 Y NA NA GRHL2,NACAP1,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRHL2 129233 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 102449376 102449720 102449428 Y GRHL2 NA NACAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRHL2 52940 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 102467254 102467614 102467418 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 35046 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.958759062705597 chr8 102505982 102506363 102506168 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 3322 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 103918538 103918841 103918687 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 14446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 103939794 103939949 103939858 Y NA AZIN1 AZIN1,ATP6V1C1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 35702 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1,KB-1639H6.2 NA NA NA NA KB-1639H6.2 27976 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 107485450 107485801 107485626 Y NA NA NA NA NA NA OXR1 204977 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 107598628 107599080 107598706 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 109161 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 110248064 110248088 110248074 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 96465 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 115707569 115707650 115707588 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 1320671 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 118859857 118860327 118860104 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 261765 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 118894000 118894167 118894051 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 227925 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 119761036 119761418 119761238 Y TNFRSF11B RPS26P35 COLEC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 11022 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 119862438 119862804 119862573 Y NA NA TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 89998 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 124747351 124747363 124747357 Y ANXA13 ANXA13,FAM91A1 NA NA NA NA ANXA13 284 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr8 125656235 125656588 125656492 Y ZNF572,RNF139,MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 82142 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 125683699 125684014 125683857 Y NA NA NA NA NA NA MTSS1 54716 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr8 126522249 126522478 126522331 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 81686 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 126556751 126557301 126556981 Y NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 116188 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr8 128180134 128180587 128180334 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48746 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 128196669 128197128 128196955 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 32205 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 128218099 128218752 128218687 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10581 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr8 128578179 128578386 128578271 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 167294 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 129336748 129337038 129336807 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 315891 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 130703284 130703457 130703434 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM49B 323918 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 130720341 130720558 130720412 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 306817 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 130876466 130876830 130876577 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 150545 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 131027030 131027189 131027125 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 186 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 131089372 131089764 131089568 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 61997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 131276645 131276741 131276715 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 177165 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 131291188 131291588 131291505 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 162318 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr8 131495645 131495684 131495664 Y NA ASAP1 ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 41739 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 134089498 134089860 134089633 Y TG,SLA NA NA NA NA NA NDRG1 222405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 135469388 135469911 135469674 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 253381 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 135869837 135869951 135869873 Y NA NA NA NA NA NA MIR30D 54649 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr8 136587606 136587905 136587756 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 119906 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 138127767 138128050 138127889 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 1660067 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 139799567 139799714 139799659 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 1666964 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 141945462 141945818 141945641 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 64497 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 42052 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 142106680 142106937 142106833 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 18440 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 144072877 144073072 144072963 Y LYPD2,C8orf31 LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 24327 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr8 144094701 144094997 144094860 Y LY6K,C8orf55 LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 2402 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr8 144106773 144106936 144106849 Y NA LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA RP11-273G15.2 8919 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 144328155 144328364 144328211 Y NA ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA ZFP41 875 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 144609980 144610203 144610126 Y NA ZC3H3,GSDMD,NAPRT1 NA NA NA NA ZC3H3 11420 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA FAM83H 14534 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 144843026 144843252 144843141 Y NA FAM83H,FAM83H-AS1 SCRIB,PUF60 IMR90 Hi-C 24141950 FAM83H-AS1 28716 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 2281532 2281772 2281628 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 268190 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 2632517 2632641 2632572 Y KCNV2 VLDLR NA NA NA NA VLDLR 12683 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 5086081 5086478 5086137 Y CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2 NA NA NA NA NA RCL1 295212 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 5459353 5459726 5459436 Y JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274 PDCD1LG2 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 10850 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 5843832 5844207 5843936 Y NA ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 12715 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 6384866 6385180 6385056 Y NA UHRF2 NA NA NA NA UHRF2 25971 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 6564380 6564534 6564488 Y NA NA NA NA NA NA RP11-106A1.2 72605 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr9 6788210 6788382 6788241 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 69347 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.78055254502468 chr9 6958089 6958102 6958095 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 239226 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 454302 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr9 12421960 12422048 12422006 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 1811237 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 15306066 15306408 15306119 Y NA TTC39B NA NA NA NA TTC39B 708 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 17520540 17520838 17520658 Y NA NA NA NA NA NA CNTLN 387560 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 20552301 20552464 20552406 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 68078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 21964976 21965347 21965178 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 27953 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 27434079 27434197 27434145 Y NA NA NA NA NA NA MOB3B 93582 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 32556634 32556872 32556767 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA TOPORS 6083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr9 33172218 33172440 33172320 Y NA B4GALT1,SPINK4 B4GALT1,SPINK4 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT1 6864 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 33931170 33931493 33931332 Y UBAP1,UBE2R2 NA NA NA NA NA UBAP2 115454 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 34375136 34375287 34375212 Y NA KIF24,NUDT2,KIAA1161 NA NA NA NA KIAA1161 285 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 84777 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.23269022347862 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 35914292 35914707 35914657 Y NA NDUFA5P4,HRCT1 NA NA NA NA HRCT1 10103 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 36037997 36038326 36038187 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 3567 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 36232965 36233105 36233040 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 41948 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 36840898 36841246 36841074 Y NA NA NA NA NA NA MELK 270039 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 46909 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.83503625082239 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 71734977 71735184 71735061 Y NA NA NA NA NA NA FXN 86802 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 71793410 71793781 71793424 Y NA NA NA NA NA NA FXN 145235 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 72871058 72871439 72871223 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 498 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 78507446 78507579 78507560 Y PCSK5 PCSK5 NA NA NA NA PCSK5 3886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 82185317 82185693 82185378 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 629 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 93960145 93960482 93960197 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 161713 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 95732704 95733017 95732861 Y NINJ1,C9orf89,FGD3 FGD3 NA NA NA NA FGD3 24971 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 97273853 97274253 97274073 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 126278 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 97590305 97590486 97590422 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 103322 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 97770536 97771110 97770577 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 283553 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 97881296 97881429 97881363 Y FBP1 NA NA NA NA NA FANCC 196562 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 97966578 97966817 97966786 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 111174 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 98533065 98533456 98533266 Y NA NA LOC158435,LINC00476,C9orf102,FANCC,LINC00092 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 102803 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 98931605 98932004 98931930 Y NA EIF4BP3 FBP1,FANCC,LOC158435,LOC100507346,PTCH1,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 25316 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 99322452 99322838 99322645 Y ZNF782 NA HABP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC14B 57274 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 99334926 99335181 99335054 Y NA CDC14B HABP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC14B 44931 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 100548546 100549029 100548790 Y FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 90907 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 101136906 101136938 101136922 Y ANKS6 NA NA NA NA NA TBC1D2 120991 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 101883874 101884261 101884068 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 19554 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 107668768 107669725 107669153 Y SLC44A1,OR13C3 ABCA1 NA NA NA NA ABCA1 18793 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 108284643 108284789 108284719 Y NA FKTN NA NA NA NA FKTN 33622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 108623002 108623305 108623152 Y FSD1L,FSD1L,TAL2 NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 168177 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 110109718 110109795 110109757 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 66300 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 110130757 110130886 110130824 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 87339 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 112858157 112858314 112858244 Y AKAP2 NA NA NA NA NA RP11-151F5.2 72519 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 113680597 113681099 113680790 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 117882 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 114364049 114364191 114364143 Y KIAA0368,GNG10 PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10 NA NA NA NA PTGR1 3914 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 114790932 114791388 114791198 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 133886 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 114792518 114792641 114792625 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 135472 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 114828005 114828556 114828288 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 107132 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 115110736 115110930 115110781 Y NA PTBP3,HSDL2 NA NA NA NA PTBP3 16789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 115527127 115527401 115527315 Y NA RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA SNX30 16009 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA POLE3 110835 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chr9 116304651 116305008 116304842 Y NA NA NA NA NA NA POLE3 133699 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 NA NA NA NA NA POLE3 214325 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 117249092 117249487 117249472 Y NA DFNB31 NA NA NA NA DFNB31 16243 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 117566825 117567042 117566994 Y TNFSF15 TNFSF15 NA NA NA NA TNFSF15 419 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 117670443 117671027 117670891 Y TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 104037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 118473939 118474297 118474118 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 595403 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 123237192 123237494 123237347 Y MEGF9,FBXW2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 102954 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 171408 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA DAB2IP 171885 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 126138103 126138404 126138241 Y NA CRB2 NA NA NA NA CRB2 21654 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA CRB2 180622 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 126468286 126468378 126468332 Y STRBP,STRBP NA NA NA NA NA DENND1A 222053 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 126690123 126690365 126690192 Y DENND1A DENND1A NA NA NA NA DENND1A 66 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.36965580386514 chr9 128908654 128909040 128908854 Y NA NA PBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MAPKAP1 441141 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr9 129285503 129285639 129285571 Y NA NA NA NA NA NA LMX1B 89083 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 129286019 129286223 129286082 Y FAM125B,ZBTB43,ZBTB34 NA NA NA NA NA LMX1B 88499 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 129951111 129951299 129951234 Y NA GARNL3 NA NA NA NA GARNL3 33245 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 130590782 130591142 130590862 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS CDK9,FPGS,AK1 NA NA NA NA FPGS 35906 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 130743802 130743907 130743855 Y FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 3010 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 131988173 131988389 131988342 Y NA IER5L LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50 IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 IER5L 49633 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 132321078 132321454 132321255 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 77348 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 132359774 132359922 132359814 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A ASB6 NA NA NA NA ASB6 42522 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 132751387 132751642 132751502 Y USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA FNBP1 51831 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.91751812541119 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.50662138425165 chr9 134613837 134614689 134614350 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 376 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 135495171 135495179 135495175 Y NTNG2 GTF3C4,DDX31 NA NA NA NA GTF3C4 48243 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 136282042 136282102 136282072 Y NA SURF4,C9orf96,REXO4 NA NA NA NA REXO4 878 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 136292897 136293168 136293034 Y SLC2A6,RALGDS REXO4,SLC2A6 NA NA NA NA REXO4 11733 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 136753303 136753756 136753577 Y C9orf7,VAV2 NA SARDH IMR90 Hi-C 24141950 VAV2 101970 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chr9 138884665 138885093 138884961 Y NA UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 33439 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 139294189 139294305 139294248 Y TRAF2,FAM69B,INPP5E DNLZ,CARD9,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E NA NA NA NA SDCCAG3 8756 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 139466507 139466851 139466737 Y NA NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-611D20.2 27843 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.69807067043587 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.821793482319083 chrX 2816950 2817136 2817043 Y ARSH,ARSE ARSD NA NA NA NA ARSD 28256 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chrX 7896783 7897141 7896963 Y VCX PNPLA4 NA NA NA NA PNPLA4 3003 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 9700566 9700851 9700709 Y LOC100288814 NA NA NA NA NA SHROOM2 51645 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 10851081 10851118 10851099 Y NA MID1 NA NA NA NA MID1 1308 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 11455735 11455931 11455831 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 318347 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 12965371 12965491 12965432 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 25736 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 12972600 12972806 12972677 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 18421 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 13017682 13017863 13017801 Y TLR7,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 26455 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 13687345 13687715 13687534 Y TCEANC,RAB9A TCEANC,RAB9A NA NA NA NA RAB9A 17529 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 18637228 18637392 18637280 Y NA NA NA NA NA NA CDKL5 195525 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.684827901932569 chrX 18904504 18904672 18904535 Y NA NA NA NA NA NA PHKA2 96044 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 18904688 18905149 18904995 Y PHKA2 NA NA NA NA NA PHKA2 95567 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 2.60234602734376 chrX 19842655 19843035 19842813 Y RPS6KA3,SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 60684 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chrX 30840604 30840871 30840738 Y CXorf21,GK NA NA NA NA NA TAB3 150330 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 39680161 39680842 39680511 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 34771 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 39865489 39865898 39865566 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 168684 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 3.0132427685033 chrX 39866067 39866462 39866265 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 168120 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 39953251 39953461 39953335 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 81121 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 39966584 39967157 39966963 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 67425 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 40841745 40842012 40841881 Y NA NA MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 76508 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 41480372 41480697 41480463 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 289721 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 42802169 42802568 42802500 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P4 845743 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 44834978 44835378 44835063 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 104221 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 45241202 45241396 45241250 Y NA NA NA NA NA NA MIR222 363134 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 46125056 46125409 46125233 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 59671 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 46148096 46148185 46148140 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 36895 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 46182516 46182747 46182636 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 2333 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 46486030 46486395 46486144 Y RP2,ZNF674,CHST7 NA NA NA NA NA CHST7 54811 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 48571549 48571765 48571661 Y NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19604 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA SMC1A 18996 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P17 282939 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 69386644 69386665 69386655 Y NA IGBP1 NA NA NA NA IGBP1 35345 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA GDPD2,DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 GDPD2,DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO GJB1 NA NA NA NA GJB1 30910 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 84475648 84475726 84475688 Y NA ZNF711 NA NA NA NA ZNF711 21271 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA GPRASP2 50168 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.547862321546055 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 107639720 107640073 107639886 Y COL4A6 COL4A6,COL4A5 NA NA NA NA COL4A6 40654 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.09572464309211 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA EEF1GP5 303352 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 1.64358696463817 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 133847905 133848292 133848163 Y NA NA LOC100506757,FAM122B,PLAC1,MIR450A1,MGC16121,MIR542,MIR450A2,MIR450B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM122C 80527 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 138007531 138007947 138007713 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 294992 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 138215503 138215737 138215513 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 87202 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.273931160773028 chrX 149186886 149187270 149187078 Y NA NA NA NA NA NA CXorf40B 81857 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.410896741159541 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA NLGN4Y 1425077 CAGE CACO-2 hg19 FANTOM5 0.136965580386514