chr1 839741 840250 839788 Y NA SAMD11 NA NA NA NA SAMD11 18010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA AURKAIP1 12543 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 7729547 7729971 7729640 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 99358 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.21448517636362 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 8686491 8686867 8686745 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 188835 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 9291783 9292106 9291820 Y NA H6PD H6PD,GPR157,SLC2A5,SLC2A7,MIR34A,SPSB1,SLC25A33,TMEM201 IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 728 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 9318130 9318195 9318182 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 25296 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 10853772 10853865 10853819 Y NA NA NA NA NA NA TARDBP 216549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 10853986 10854555 10854168 Y ANGPTL7,CASZ1 NA NA NA NA NA TARDBP 215859 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 10997518 10997835 10997575 Y CASZ1 NA NA NA NA NA TARDBP 72579 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr1 12493313 12493712 12493478 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 182025 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 15666999 15667145 15667070 Y NA NA CTRC,EFHD2 IMR90 Hi-C 24141950 EFHD2 67246 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 15827976 15828116 15828046 Y NA CASP9,DNAJC16 NA NA NA NA CASP9 22913 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 NA NA NA NA NA RP11-169K16.8 65352 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.29437347759999 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MFAP2 73626 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA NA CROCC K562 ChIA-PET 22265404 MFAP2 64547 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr1 22829217 22829453 22829426 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 52873 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr1 24680333 24680598 24680466 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL3 59686 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 24833128 24833464 24833216 Y RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3 RCAN3 NA NA NA NA RCAN3 5741 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 24878735 24879052 24878918 Y NA NA NA NA NA NA RCAN3 51348 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 25559638 25560067 25559796 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 SYF2 NA NA NA NA SYF2 2645 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 26101389 26101767 26101516 Y PDIK1L,LDLRAP1,MAN1C1,FAM54B SEPN1 NA NA NA NA SEPN1 22900 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr1 27154485 27154771 27154729 Y WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18 PIGV,ZDHHC18 NA NA NA NA ZDHHC18 3284 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 28011929 28012287 28012105 Y NA IFI6,FAM76A STX12,FAM76A,PPP1R8,WASF2,IFI6 IMR90 Hi-C 24141950 IFI6 15200 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.12869110581817 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 29253461 29253677 29253525 Y EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 41858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 29517304 29517322 29517313 Y NA SRSF4,MECR,PTPRU NA NA NA NA SRSF4 10805 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 31517703 31518005 31517854 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 18833 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 32250836 32250955 32250895 Y IQCC BAI2 NA NA NA NA BAI2 22342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 32405536 32405898 32405618 Y NA PTP4A2 NA NA NA NA PTP4A2 2559 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 33232248 33232565 33232367 Y NA S100PBP,YARS NA NA NA NA S100PBP 47803 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 33596124 33596280 33596183 Y NA TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 49380 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 36397577 36397741 36397665 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 154735 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 40331340 40331501 40331388 Y PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1 TRIT1 NA NA NA NA TRIT1 15682 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 41914594 41914877 41914736 Y HIVEP3,SCMH1,SCMH1 NA SCMH1,EDN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXO6 89000 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 43402778 43403133 43403049 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 19397 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 43997843 43998152 43997977 Y PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 8985 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 44703858 44704161 44704010 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 26731 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr1 44962677 44962982 44962698 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 93811 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 45195062 45195154 45195109 Y RNF220 RNU5F-1,KIF2C,RPS8,RPS15AP11 NA NA NA NA KIF2C 8336 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 45298718 45299070 45298894 Y NA PLK3,RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA PTCH2 7665 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 46575103 46575175 46575140 Y PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA TSPAN1 63570 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 47718105 47718425 47718265 Y NA TAL1 TAL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAL1 22213 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 51997947 51998232 51998197 Y NA RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS15 14947 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 52193707 52193852 52193763 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 148625 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 54150852 54151742 54151620 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 202665 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 54925355 54925634 54925492 Y NA SSBP3 TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 48203 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 55400798 55400903 55400847 Y NA DHCR24 DHCR24,TMEM61,BSND,TTC22,USP24,HEATR8-TTC4 IMR90 Hi-C 24141950 DHCR24 49907 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 56992489 56992799 56992673 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 116175 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 57024882 57025247 57025166 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 83727 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 121127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 61522505 61523042 61522705 Y NFIA,NFIA,NFIA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 193574 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 64127998 64128504 64128154 Y ROR1 NA NA NA NA NA ITGB3BP 70606 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 66782459 66782839 66782588 Y PDE4B NA NA NA NA NA WDR78 605731 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 68321515 68321736 68321554 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 24365 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 69441381 69441536 69441435 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1 480477 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr1 84083536 84083914 84083802 Y PRKACB NA NA NA NA NA TTLL7 378919 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 85143846 85143980 85143979 Y SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP RP11-484D4.3,SSX2IP NA NA NA NA SSX2IP 10506 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 86071867 86071976 86071922 Y NA DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,ZNHIT6 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 27423 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 86072885 86073441 86073156 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 28441 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 88694004 88694059 88694042 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 453846 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 89339924 89340210 89340169 Y PKN2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 15417 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr1 89382528 89382593 89382561 Y NA GTF2B NA NA NA NA GTF2B 26901 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 91154949 91155305 91155127 Y NA NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 159902 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 91183313 91183764 91183661 Y BARHL2 NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 131443 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 26.9067435100363 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA NA NA NA NA NA GLMN 144948 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 92981474 92981835 92981655 Y NA NA NA NA NA NA GLMN 218930 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 93032261 93032386 93032324 Y NA NA NA NA NA NA EVI5 223575 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 93414710 93414781 93414746 Y NA FAM69A NA NA NA NA FAM69A 10276 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 98070725 98071007 98070866 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 61468 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 221450 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 100828525 100828922 100828611 Y SASS6 CDC14A NA NA NA NA CDC14A 19941 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.21448517636362 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 37779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 112276731 112276883 112276807 Y C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183 DDX20,FAM212B NA NA NA NA DDX20 18984 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 112438367 112438956 112438733 Y NA NA NA NA NA NA FAM212B 141921 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA WNT2B 65207 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 113734243 113734639 113734494 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 24627 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 115296637 115296935 115296808 Y NA NRAS,CSDE1,SIKE1 NA NA NA NA CSDE1 2362 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 117368438 117368774 117368618 Y NA NA PTGFRN K562 ChIA-PET 22265404 FTH1P22 52193 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr1 118653984 118654263 118654124 Y NA NA NA NA NA NA WDR3 183641 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 118792385 118792801 118792430 Y NA NA NA NA NA NA WDR3 322042 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 120255895 120256325 120256050 Y ADAM30 NA NA NA NA NA HMGCS2 53203 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 120692453 120692808 120692620 Y NBPF7,NOTCH2 NA NA NA NA NA NOTCH2 82213 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 581054 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 87115 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 145701524 145701615 145701570 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 92488 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 9.8032321315636 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 149989448 149989604 149989509 Y NA OTUD7B,VPS45 NA NA NA NA OTUD7B 8823 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P,CA14 NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 150668096 150668276 150668180 Y NA GOLPH3L NA NA NA NA GOLPH3L 466 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 151344220 151344519 151344431 Y NA PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4 NA NA NA NA SELENBP1 1011 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 153929776 153930098 153929954 Y NA GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CRTC2 675 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 154151566 154151965 154151766 Y NA TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 13159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 155052572 155053010 155052866 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1 NA NA NA NA EFNA3 18348 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 156676478 156676824 156676750 Y C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2 NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 2870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 157082632 157083078 157082974 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 NA NA NA NA ETV3 23188 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA NA LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 KIRREL 158437 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 159914077 159914586 159914278 Y NHLH1,VANGL2,IGSF9 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA IGSF9 691 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 160202735 160202981 160202855 Y SLAMF6,CD48,FCRL6,DCAF8 PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 26553 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 160639828 160639998 160639908 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 222772 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 160972513 160972848 160972620 Y SLAMF7,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 16290 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 161170933 161171185 161171002 Y ADAMTS4,NDUFS2 USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,FCER1G,TOMM40L NA NA NA NA NDUFS2 6039 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 161329163 161329482 161329254 Y FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G SDHC NA NA NA NA SDHC 47116 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A NA NA NA NA NA HSPA7 73182 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A HSPA7 NA NA NA NA HSPA7 8131 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 162666168 162666338 162666209 Y NA NA NA NA NA NA DDR2 67005 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 162846595 162846764 162846655 Y DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 NA C1orf110,RGS4,RGS5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 189801 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr1 163588435 163588629 163588532 Y NA NA NA NA NA NA RGS5 298858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 166895888 166895941 166895915 Y ILDR2 ILDR2 NA NA NA NA ILDR2 46778 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 167035961 167036358 167035977 Y NA NA NA NA NA NA ILDR2 93242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 167135568 167135867 167135776 Y NA RP11-277B15.1 CD247,POU2F1,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-277B15.1 5494 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 167766380 167766616 167766548 Y SFT2D2,CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 20870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 170633923 170634526 170634465 Y PRRX1 PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 4054 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 173816933 173817269 173817101 Y NA DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5 NA NA NA NA ZBTB37 17951 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 173984193 173984403 173984298 Y GPR52,ZBTB37,RC3H1 RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 5032 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 174132741 174133010 174132876 Y NA RABGAP1L NA NA NA NA RABGAP1L 6193 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 178121154 178121309 178121232 Y RASAL2 NA NA NA NA NA RASAL2 60290 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 180237101 180237317 180237140 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 115132 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 184357629 184357933 184357738 Y EDEM3 C1orf21 NA NA NA NA C1orf21 3437 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 186851648 186851759 186851704 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 55563 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 186935248 186935528 186935344 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PLA2G4A 139163 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 187647524 187647721 187647623 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 851439 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 192508796 192509150 192509060 Y NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 174163 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 198526099 198526320 198526230 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 402006 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 198591244 198591462 198591360 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 467151 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 201084133 201084558 201084403 Y NA NA NA NA NA NA TMEM9 54144 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NA NA NA NA NA IPO9 176471 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 202216987 202217221 202217073 Y UBE2T NA NA NA NA NA LGR6 55958 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 202217450 202217807 202217629 Y NA NA NA NA NA NA LGR6 56421 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA NA NA NA NA NA CHI3L1 52631 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 BTG2,FMOD NA NA NA NA FMOD 21549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 203398304 203398692 203398536 Y NA PRELP PRELP,ATP2B4,FMOD,PPFIA4,BTG2,LOC730227,CHIT1 IMR90 Hi-C 24141950 PRELP 44264 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr1 206668423 206669203 206668750 Y NA RP11-534L20.4 NA NA NA NA RP11-534L20.4 31045 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 211998326 211998558 211998442 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 3556 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 212688112 212688319 212688216 Y NA ATF3 ATF3,BATF3,VASH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF3 48357 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr1 213160414 213160619 213160568 Y VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA ANGEL2 26549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA ESRRG 534812 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 218633382 218633612 218633512 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 115805 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 218647012 218647232 218647162 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 129435 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 221567491 221567844 221567649 Y NA NA C1orf140,HLX IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 345674 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 224014874 224015267 224015181 Y CAPN2,FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 16407 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.30027924690906 chr1 224924986 224925307 224925147 Y NA NA NA NA NA NA DNAH14 156657 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 226219862 226220210 226220014 Y H3F3A,C1orf55 H3F3A H3F3A,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 27342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 226361229 226361382 226361305 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 11049 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 226443007 226443187 226443097 Y NA NA NA NA NA NA LIN9 52383 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB NA NA NA NA NA PSEN2 164469 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.54584991992726 chr1 229196056 229196102 229196080 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 208673 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 229229415 229229758 229229591 Y RHOU NA RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 175017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 230212552 230213069 230212856 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 21016 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 231036878 231036937 231036909 Y NA C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 33543 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 231531776 231531955 231531804 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 26835 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 232760730 232761090 232760801 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2,DISC2,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 204843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.30027924690906 chr1 236430059 236430250 236430155 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 13069 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 237007861 237008154 237008008 Y NA NA NA NA NA NA MTR 51251 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 237206585 237207004 237206623 Y ACTN2,RYR2 NA NA NA NA NA MTR 249975 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA MTR 677641 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 10.2203909456727 chr1 238106545 238106849 238106747 Y NA NA NA NA NA NA LINC01139 540474 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 243644284 243644683 243644595 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 226964 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 243876652 243876733 243876693 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 135648 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 243893800 243893985 243893919 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 118396 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 244462616 244463099 244462949 Y AKT3,AKT3,ADSS NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 150337 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr1 245082176 245082355 245082237 Y EFCAB2 EFCAB2 SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EFCAB2 48652 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 246038342 246038749 246038555 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 629865 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 246147829 246148201 246147973 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 520413 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr1 246588477 246588670 246588563 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 79944 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA NA NA NA NA NA ZNF669 60892 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 438578 438619 438599 Y DIP2C NA NA NA NA NA ZMYND11 260173 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 903940 904213 904109 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 71351 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 3909715 3910075 3909901 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 84242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 6234464 6234853 6234702 Y NA NA NA NA NA NA RBM17 105514 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 10747328 10747568 10747448 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 904185 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 12823373 12823670 12823432 Y NA NA NA NA NA NA OPTN 315779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 17044035 17044524 17044318 Y VIM,TRDMT1,ST8SIA6 NA NA NA NA NA RSU1 186508 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 17091174 17091427 17091362 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 150626 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 17384125 17384326 17384225 Y VIM ST8SIA6-AS1 NA NA NA NA ST8SIA6-AS1 42609 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 17569630 17569764 17569656 Y VIM NA PTPLA IMR90 Hi-C 24141950 PTPLA 87612 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 18583664 18583897 18583754 Y NSUN6,ARL5B NA NA NA NA NA CACNB2 156058 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 20841595 20841995 20841796 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 619121 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-275N1.1 77370 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 22026318 22026683 22026671 Y EBLN1 NA NA NA NA NA RN7SKP37 193389 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 22201596 22201935 22201928 Y EBLN1 RN7SKP37 NA NA NA NA RN7SKP37 18137 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 22265792 22265961 22265887 Y NA RN7SKP37,DNAJC1 NA NA NA NA DNAJC1 24737 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 22625615 22626028 22625937 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 17475 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 29010919 29011116 29010957 Y NA BAMBI LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 46648 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 29184035 29184352 29184192 Y BAMBI NA LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 219764 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 29195098 29195451 29195275 Y NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 230827 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 34907489 34907514 34907502 Y NA NA NA NA NA NA PARD3 194739 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM CREM NA NA NA NA CREM 24495 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 NA NA NA NA NA CCNY 398200 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr10 38418230 38418599 38418292 Y NA ZNF37A NA NA NA NA ZNF37A 36966 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 43249715 43249807 43249770 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 26442 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF NA NA NA NA HNRNPF 48279 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr10 51039519 51039692 51039605 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 71094 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 52217733 52218081 52217894 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 164842 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 52261858 52262194 52262143 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 120729 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr10 54367095 54367120 54367106 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 295039 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 63701578 63701680 63701630 Y NA NA NA NA NA NA RTKN2 324786 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA RTKN2 273554 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 64004719 64005076 64004899 Y ARID5B RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 21390 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 65078433 65078736 65078637 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 144986 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr10 68718064 68718186 68718126 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA CTNNA3 735741 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 69550767 69550960 69550901 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 44964 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 69579652 69579872 69579788 Y DNAJC12 DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 16052 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 73725868 73726411 73726297 Y C10orf105,CHST3 NA NA NA NA NA PSAP 116742 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 73946489 73946835 73946688 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 26952 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 74453097 74453245 74453141 Y CCDC109A MCU NA NA NA NA MCU 3208 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 76633406 76633470 76633438 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 50066 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 77022416 77022492 77022443 Y NA COMTD1,HMGA1P5 COMTD1,ZNF503-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1P5 11912 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr10 88804079 88804159 88804119 Y NA FAM35A,GLUD1 NA NA NA NA FAM35A 47759 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 89735979 89736206 89736070 Y PTEN RP11-380G5.3 NA NA NA NA RP11-380G5.3 32720 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 93300438 93300742 93300617 Y NA NA NA NA NA NA HECTD2 132342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 93697836 93698042 93697939 Y NA FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA BTAF1 16310 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 95513454 95513618 95513536 Y FRA10AC1,LGI1 NA LGI1,O3FAR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FRA10AC1 53125 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 97302511 97302656 97302624 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 16515 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 99401742 99402052 99401841 Y C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 10398 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 99497485 99497673 99497579 Y NA MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA ZFYVE27 2607 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 102491662 102491849 102491769 Y PAX2 NA NA NA NA NA FAM178A 178477 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 103051353 103051800 103051498 Y NA NA BTRC,FLJ41350,FBXW4,LBX1,POLL,DPCD,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8,LOC100289509 IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 60020 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr10 104473144 104473537 104473339 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 849 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 104556220 104556459 104556323 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 55521 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 106065731 106065880 106065781 Y NA MIR4482-1,ITPRIP,CCDC147-AS1 NA NA NA NA ITPRIP 30282 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.29437347759999 chr10 108990726 108990863 108990795 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2690448 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 111666185 111666517 111666351 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 14794 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 112401121 112401469 112401220 Y SMC3,RBM20 RBM20 NA NA NA NA RBM20 686 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 114292106 114292272 114292196 Y ZDHHC6,VTI1A NA NA NA NA NA VTI1A 87350 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 116582671 116583074 116582920 Y NA FAM160B1 NA NA NA NA FAM160B1 3168 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 116776820 116777128 116776974 Y NA NA ATRNL1 IMR90 Hi-C 24141950 ATRNL1 73996 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 119113606 119113787 119113696 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 19191 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 119157808 119158126 119157971 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24830 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 119300827 119301053 119300919 Y VAX1,EMX2 EMX2,EMX2OS NA NA NA NA EMX2 872 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 125730230 125730378 125730329 Y NA NA NA NA NA NA OAT 375167 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr10 125978087 125978302 125978152 Y NA NA NA NA NA NA OAT 127243 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 126325148 126325486 126325317 Y NA NA NA NA NA NA FAM53B 105352 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 126354654 126355022 126354738 Y NA NA NA NA NA NA FAM53B 75816 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 127574091 127574564 127574346 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 2683 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 132011680 132011894 132011722 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 79017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 10.4289703527272 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA INPP5A 88778 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr10 134266616 134267060 134266753 Y LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92 NA NA NA NA NA INPP5A 82264 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 364521 364678 364634 Y NA IFITM3,B4GALNT4 ANO9,SIGIRR,B4GALNT4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 3118 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 2176984 2177085 2177035 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P30 177921 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 2234751 2234909 2234870 Y ASCL2 NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL26P30 120097 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 2238005 2238048 2238027 Y NA NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL26P30 116958 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 3035655 3035952 3035816 Y MRGPRG NAP1L4,RNU1-91P,CARS NA NA NA NA NAP1L4 24048 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 3090855 3091125 3090991 Y NA RNU1-91P,CARS NA NA NA NA CARS 14012 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 6224718 6224948 6224898 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 28993 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 7636630 7636941 7636786 Y PPFIBP2,OR5P3 NA NA NA NA NA PPFIBP2 104101 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 8679125 8679412 8679143 Y NA RPL27A NA NA NA NA RPL27A 22546 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 8988846 8989081 8988967 Y ZNF143,DENND5A,TMEM9B,NRIP3 TMEM9B,NRIP3 NA NA NA NA TMEM9B 4288 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 9018976 9019300 9019138 Y NA TMEM9B,NRIP3 NA NA NA NA NRIP3 4296 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 9824167 9824574 9824403 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 140543 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 11326137 11326382 11326218 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2003C8.2 407268 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 11641691 11641934 11641813 Y GALNTL4 NA NA NA NA NA USP47 219036 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 12214399 12214709 12214476 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 100856 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr11 12222498 12222995 12222733 Y MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 108955 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr11 17307346 17307410 17307378 Y NA NA B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 NUCB2 79646 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 RP11-613F22.5,TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 19736892 19737150 19737126 Y NAV2 NA NA NA NA NA E2F8 475725 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 23079827 23079841 23079834 Y NA NA NA NA NA NA SVIP 229982 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 28795482 28795636 28795549 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 667627 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 30494476 30494761 30494619 Y NA NA NA NA NA NA MPPED2 111658 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 33209856 33210115 33209986 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 27939 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 35325239 35326726 35325689 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 166822 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 35341087 35341212 35341143 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 182670 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 46085573 46085592 46085583 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 55393 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-702F3.3 73228 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr11 47168963 47169205 47169084 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 27471 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 48028604 48028990 48028813 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 28491 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 AP000640.10,MRPL16 NA NA NA NA AP000640.10 17164 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr11 60871198 60871450 60871295 Y CD6,SDHAF2,CD5 NA NA NA NA NA VPS37C 55639 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 60888310 60888547 60888414 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 38542 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 61319246 61319400 61319342 Y NA LRRC10B,SYT7 NA NA NA NA SYT7 27220 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS2 6739 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 63639638 63639903 63639715 Y NA MARK2,RCOR2 NA NA NA NA MARK2 35238 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 65059737 65059988 65059827 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20301 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 65069384 65069573 65069479 Y NA POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 10716 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 14.3919790867636 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr11 66511038 66511198 66511076 Y KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2 SPTBN2,C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 1116 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 67253659 67253853 67253760 Y PTPRCAP,NUDT8,AIP CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2 NA NA NA NA AIP 5147 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8 NA NA NA NA NDUFS8 30950 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 71493756 71493898 71493829 Y NA FAM86C1 NA NA NA NA FAM86C1 2658 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 73095869 73096760 73096281 Y FCHSD2,RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 10560 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 73490242 73490316 73490279 Y NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6045 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 74077556 74077917 74077717 Y NA PGM2L1 NA NA NA NA PGM2L1 29601 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 NA NA NA NA NA NEU3 160225 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 75538796 75538953 75538875 Y NA UVRAG NA NA NA NA UVRAG 14584 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 163545 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 75781411 75781582 75781473 Y NA NA NA NA NA NA WNT11 138198 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 78073883 78074276 78074154 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 53118 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 78728809 78729043 78728943 Y ODZ4 NA NA NA NA NA NARS2 444890 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 78947816 78948005 78947917 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 663897 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 79117451 79117736 79117547 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 833532 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 82918019 82918384 82918270 Y PCF11,ANKRD42 ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1 NA NA NA NA RP11-727A23.1 3663 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 85463912 85464270 85464111 Y CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2 NA CCDC89 IMR90 Hi-C 24141950 SYTL2 55914 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 85521123 85521272 85521226 Y SYTL2,SYTL2 SYTL2,AP000974.1 NA NA NA NA SYTL2 939 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 85859429 85859678 85859556 Y EED NA PICALM,EED,CCDC83 IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 80505 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 86185128 86185335 86185247 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 173875 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 86222200 86222363 86222315 Y NA NA NA NA NA NA ME3 159315 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 86328094 86328121 86328109 Y NA NA NA NA NA NA ME3 53557 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 95177768 95177916 95177842 Y NA NA NA NA NA NA SESN3 214063 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 103281581 103281752 103281672 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 3196 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr11 105933861 105934087 105933948 Y NA AASDHPPT,KBTBD3 NA NA NA NA AASDHPPT 10141 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 106491098 106491425 106491260 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD3 544606 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 109208614 109208734 109208674 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 674862 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 109897717 109898316 109898195 Y ZC3H12C NA ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 63771 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 110317898 110318249 110318012 Y FDX1 FDX1 NA NA NA NA FDX1 19291 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 113502036 113502415 113502165 Y NA NA NA NA NA NA ZW10 140118 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 113552333 113552865 113552581 Y NA NA NA NA NA NA ZW10 89668 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 115093237 115093486 115093408 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 280189 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 115372753 115373113 115372889 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 562 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 116790672 116791048 116790863 Y NA NA APOA4,APOA1,APOC3 IMR90 Hi-C 24141950 AP000936.1 113719 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5864 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 119598046 119598312 119598172 Y USP2 PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 252 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 120053242 120053546 120053328 Y NA OAF POU2F3,LOC649133 IMR90 Hi-C 24141950 OAF 25929 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 122936469 122936659 122936561 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 4531 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 123234100 123234303 123234163 Y NA NA NA NA NA NA HSPA8 302162 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 123293400 123293723 123293427 Y NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF202 316660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 123327975 123328380 123328056 Y NA NA CLMP,HSPA8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF202 282003 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 123335007 123335161 123335084 Y NA NA CLMP,HSPA8,MIR4493 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF202 275222 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 123414630 123415056 123414666 Y NA NA NA NA NA NA ZNF202 195327 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 124458771 124459153 124459140 Y OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1 TBRG1 NA NA NA NA TBRG1 31579 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 124638889 124639135 124639012 Y NA NRGN,RP11-677M14.2,ESAM NA NA NA NA ESAM 8703 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 124939817 124940091 124939961 Y TBRG1,SLC37A2 TMEM218 NA NA NA NA TMEM218 39568 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 125032699 125033051 125032875 Y NA PKNOX2 NA NA NA NA PKNOX2 116 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr11 125145861 125146105 125145988 Y PKNOX2,FEZ1 NA NA NA NA NA PKNOX2 113278 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 54693 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 126838913 126839134 126839118 Y KIRREL3 NA NA NA NA NA ST3GAL4 615378 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 1387073 1387485 1387229 Y ERC1 NA NA NA NA NA WNT5B 249572 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 1532185 1532472 1532256 Y ERC1 NA NA NA NA NA WNT5B 104585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 1699844 1700200 1699934 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 1131 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr12 2444773 2444895 2444888 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 333072 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 2467250 2467467 2467306 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 355549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 2902210 2902546 2902293 Y NA FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6 NA NA NA NA FKBP4 91 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 3108245 3108552 3108282 Y NA TEAD4 NA NA NA NA TEAD4 41749 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 3761240 3761323 3761284 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB4B 110662 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 3771576 3771874 3771725 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB4B 100111 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 4425726 4425978 4425852 Y NA CCND2,C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 2393 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 4770172 4770413 4770176 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 13911 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 6250118 6250545 6250361 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL,IFFO1,CHD4 NA VWF,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 56336 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 7040569 7040832 7040702 Y NA SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2 NA NA NA NA ATN1 8943 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 7100414 7100432 7100423 Y NA RNU7-1,EMG1,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 6063 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 9228740 9228924 9228916 Y NA NA NA NA NA NA M6PR 128189 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 10113074 10113503 10113390 Y CD69,CLEC2B,OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC12A,CLEC12A NA NA NA NA NA GABARAPL1 249554 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 10515405 10515669 10515567 Y NA RP11-277P12.20 NA NA NA NA RP11-277P12.20 1037 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 11987514 11987811 11987531 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 186726 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 12255233 12255559 12255327 Y BCL2L14 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 6538 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 12408234 12408471 12408413 Y NA LRP6 NA NA NA NA LRP6 9475 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 12602381 12602995 12602706 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 94368 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 12766295 12766634 12766503 Y DUSP16,CREBL2 CREBL2 NA NA NA NA CREBL2 3534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 12872470 12873013 12872652 Y MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1 GPR19,CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 6478 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 14549073 14549306 14549114 Y WBP11,ATF7IP ATF7IP NA NA NA NA ATF7IP 32463 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 15408630 15408974 15408946 Y NA NA NA NA NA NA RERG 90635 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA DERA 491593 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA DERA 492147 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 23770675 23770997 23770816 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 330969 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 571469 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr12 25445837 25446089 25445962 Y BCAT1 KRAS NA NA NA NA KRAS 43967 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.29437347759999 chr12 27006268 27006662 27006518 Y NA ITPR2 ITPR2,TM7SF3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 22137 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 28433746 28433796 28433771 Y NA NA NA NA NA NA RP11-967K21.1 92447 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 29194633 29194954 29194755 Y NA NA CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 105082 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 25.4466876606544 chr12 33048688 33048837 33048763 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 914 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 33072560 33072656 33072597 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 24786 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA ALG10B 395685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 39808802 39808894 39808882 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 26298 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 45264449 45264779 45264614 Y NELL2,NELL2,NELL2 NELL2 NA NA NA NA NELL2 48852 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 45627812 45628672 45628351 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 19988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 46848355 46848425 46848370 Y NA NA SLC38A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-96H19.1 72893 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 47191369 47191677 47191464 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 415907 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM106C 39923 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 49370069 49370445 49370342 Y NA ARF3,RP11-386G11.5,PRKAG1 NA NA NA NA RP11-386G11.5 19705 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 51327584 51327783 51327682 Y NA METTL7A NA NA NA NA METTL7A 12329 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 52279748 52280043 52279838 Y NR4A1 NA NA NA NA NA ACVR1B 63408 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 52366669 52367046 52366914 Y NR4A1,GRASP ACVR1B NA NA NA NA ACVR1B 23218 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 33866 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA NA NA NA NA NA C12orf44 96681 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 52597722 52597879 52597816 Y KRT71 NA NA NA NA NA C12orf44 136692 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 53398446 53398634 53398511 Y NA EIF4B NA NA NA NA EIF4B 504 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 53612468 53612778 53612580 Y TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 11986 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP7,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 54072437 54072838 54072741 Y CSAD,MAP3K12,ATF7,ATF7,ATP5G2,CALCOCO1 RP11-972K6.1,ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 3245 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.96300873403635 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 54372759 54373189 54372957 Y HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10 HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8 NA NA NA NA HOXC10 3660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 56150085 56150369 56150213 Y OR6C6,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 15021 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 56831514 56831759 56831654 Y IKZF4 TIMELESS,SPRYD4,GLS2 NA NA NA NA TIMELESS 9428 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.84022339752725 chr12 57557421 57557508 57557464 Y NA LRP1,STAT6 NA NA NA NA STAT6 33499 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 58349067 58349080 58349075 Y XRCC6BP1 RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 15743 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 62685666 62685938 62685802 Y C12orf61,MON2,USP15 USP15 NA NA NA NA USP15 33547 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 63183822 63183886 63183851 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 142931 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 64855437 64855720 64855602 Y C12orf66,TBK1 TBK1 NA NA NA NA TBK1 11777 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 66237933 66238219 66238043 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 22022 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 66311039 66311339 66311117 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 95128 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr12 69070582 69070990 69070845 Y MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2 RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RPL7P42 5385 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA NA NA NA NA NA CPSF6 55209 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr12 77771188 77771377 77771281 Y CSRP2 NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 54767 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 78140052 78140235 78140144 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 82450 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 79462781 79463098 79462967 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 619779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr12 88064249 88064502 88064338 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 361121 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr12 89740084 89740418 89740292 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4630 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 89910622 89910739 89910701 Y NA POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4 NA NA NA NA POC1B 7062 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-654D12.2 129252 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 91775053 91775433 91775292 Y NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-796E2.4 761916 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 91972476 91973067 91972734 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 564282 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 92501411 92501848 92501769 Y NA RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 35501 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 94158186 94158524 94158355 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 89035 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 94581330 94581746 94581508 Y TMCC3,PLXNC1 NA CCDC41 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 270018 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 95100273 95100466 95100365 Y NA NA PLXNC1,CCDC41,NDUFA12,TMCC3 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 248509 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 96659033 96659395 96659303 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 72873 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 96752607 96752772 96752695 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 39566 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 99532172 99532427 99532300 Y ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B NA NA NA NA NA APAF1 495253 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 99786605 99786971 99786790 Y ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B NA NA NA NA NA UHRF1BP1L 747655 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 100518805 100519127 100519119 Y NA UHRF1BP1L NA NA NA NA UHRF1BP1L 15499 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 100970454 100970954 100970686 Y NA GAS2L3 NA NA NA NA RP11-575G13.2 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 102169550 102169734 102169688 Y NA NA NA NA NA NA GNPTAB 52982 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 105020354 105020448 105020373 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 173281 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 105038686 105039023 105038871 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 191613 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 111881338 111881509 111881420 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 39586 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 112566952 112567278 112567115 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA TRAFD1 5647 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 112741741 112742068 112741904 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 112087 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 113644189 113644365 113644286 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA TPCN1 12490 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 113667617 113667862 113667654 Y DTX1,IQCD,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 10718 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 114200256 114200532 114200390 Y NA RP11-438N16.1 NA NA NA NA RP11-438N16.1 8956 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 116893494 116893818 116893640 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 75409 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 117173952 117174265 117174216 Y MED13L,MAP1LC3B2 C12orf49 NA NA NA NA RNFT2 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 117255942 117256291 117256058 Y NA NA NA NA NA NA HRK 60955 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 118815733 118815925 118815736 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA SUDS3 3548 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.6316439904727 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 23540 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 122517490 122517922 122517629 Y RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 2862 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 125026162 125026505 125026332 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 338709 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 337221 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 125030582 125031087 125030838 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 334127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr12 130570123 130570399 130570261 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA FZD10 74605 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 130570935 130571227 130570972 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA FZD10 73777 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr12 131249995 131250369 131250318 Y NA NA NA NA NA NA STX2 71442 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 131941405 131941587 131941511 Y NA NA NA NA NA NA SFSWAP 252039 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 132663524 132663727 132663659 Y SFSWAP,EP400,FBRSL1 DDX51,NOC4L NA NA NA NA NOC4L 36531 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 133414550 133414990 133414881 Y NA RPS11P5,GOLGA3 GOLGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GOLGA3 11106 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr12 133701272 133701384 133701332 Y ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10 ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 3675 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 20555489 20555876 20555683 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 24679 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA GJA3 88714 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 20771601 20771692 20771689 Y NA GJA3 NA NA NA NA GJA3 38413 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 21400254 21400509 21400379 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 54157 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 21517643 21517924 21517794 Y LATS2 XPO4 CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO4 42456 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 22009901 22010336 22010211 Y NA ZDHHC20 NA NA NA NA ZDHHC20 21173 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 22583629 22583981 22583861 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 382475 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 24148254 24148621 24148289 Y SGCG,TNFRSF19 NA NA NA NA NA SACS 142413 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 171566 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 24290088 24290194 24290124 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 170834 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH NA SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 66738 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 25115809 25116061 25115886 Y RNF17 PARP4 NA NA NA NA PARP4 30861 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 27142181 27142413 27142195 Y NA WASF3 NA NA NA NA WASF3 12341 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 27198783 27198789 27198786 Y NA NA NA NA NA NA WASF3 68943 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 28470399 28470626 28470551 Y NA PDX1 NA NA NA NA PDX1 21531 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 28496959 28497228 28497151 Y NA PDX1,CDX2 NA NA NA NA PDX1 4802 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 28530575 28530960 28530888 Y CDX2 PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 12316 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 8098 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 28540285 28540611 28540449 Y LNX2,CDX2 PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 2665 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr13 28787263 28787277 28787270 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 613 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA LINC01058 KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01058 11592 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 31151476 31151709 31151594 Y C13orf26,USPL1 HMGB1,USPL1 TEX26-AS1,LINC00426,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 HMGB1 38025 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 31407198 31407336 31407268 Y HSPH1 NA USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX5AP 99553 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA ALOX5AP 136912 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 32725009 32725223 32725116 Y NA NA NA NA NA NA BRCA2 162388 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 33762622 33762899 33762709 Y STARD13,STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 159868 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 33825211 33825616 33825598 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 97151 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr13 34186963 34187337 34187175 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 202849 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 34216569 34217156 34216982 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 173030 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 35753666 35753901 35753767 Y NA NA NA NA NA NA NBEA 239242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 38740377 38740756 38740564 Y NA NA NA NA NA NA UFM1 181230 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 40945871 40945887 40945879 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 292847 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 41226066 41226446 41226348 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 12288 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 41468341 41468634 41468483 Y NA SUGT1P3 NA NA NA NA SUGT1P3 25276 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 42425541 42425797 42425648 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 418492 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 42683498 42683540 42683519 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 160749 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 42929313 42929481 42929382 Y TNFSF11,KIAA0564,AKAP11 NA AKAP11 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP11 85024 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 43938999 43939258 43939099 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 343660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 44028316 44028697 44028507 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 330347 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 44620658 44620684 44620670 Y ENOX1 NA NA NA NA NA CCDC122 168831 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 44765408 44765809 44765737 Y NA NA SERP2,TSC22D1,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC122 313581 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 44891829 44892158 44891994 Y NA NA SERP2,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 257125 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 52402 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 46709325 46709604 46709495 Y NA NA NA NA NA NA LRRC63 74479 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 48478393 48478707 48478627 Y RB1 NA NA NA NA NA SUCLA2-AS1 94818 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 SUCLA2-AS1 NA NA NA NA SUCLA2-AS1 47390 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 48639735 48640044 48639890 Y NA NUDT15,SUCLA2,MED4 NA NA NA NA MED4 27223 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 20959 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 49688107 49688286 49688182 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 131761 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 50671086 50671325 50671206 Y NA MIR16-1,DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 16779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 50675373 50675756 50675618 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 21066 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 242490 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 51800117 51800150 51800132 Y DLEU7,FAM124A FAM124A NA NA NA NA FAM124A 5614 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 51897423 51897587 51897505 Y NA NA FAM124A,DHRS12 IMR90 Hi-C 24141950 FAM124A 102920 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 52319871 52320068 52319946 Y NA NA NA NA NA NA DHRS12 56225 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 52537870 52538200 52538035 Y UTP14C ATP7B,ALG11 NA NA NA NA ATP7B 45430 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 60635732 60636010 60635830 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 100111 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 60716670 60717071 60716778 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 19050 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 60723538 60723946 60723707 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 12175 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 61157781 61157905 61157871 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 189190 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr13 67081521 67081801 67081799 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 2433377 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 67464284 67464840 67464525 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 2816140 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 71340580 71340843 71340601 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 1098487 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 71362393 71362632 71362470 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 1076698 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 72349266 72349293 72349278 Y DACH1 NA NA NA NA NA DACH1 90037 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 72359501 72359862 72359720 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 79468 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 72366390 72366725 72366609 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 72605 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 72385563 72385700 72385665 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 53630 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 72438548 72439003 72438895 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 327 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.33727051287271 chr13 72439142 72439615 72439332 Y DACH1 NA NA NA NA NA DACH1 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 73486233 73486587 73486410 Y NA NA NA NA NA NA DIS3 131999 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 74184794 74185193 74184838 Y NA NA PIBF1 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5P1 511671 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 75882191 75882614 75882549 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 171636 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 75904010 75904233 75904150 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 150017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 75933518 75933672 75933595 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 120578 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 75965393 75965547 75965541 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 88703 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 75966064 75966537 75966363 Y TBC1D4 NA NA NA NA NA TBC1D4 87713 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr13 76390114 76390391 76390144 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 197544 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 77338551 77338941 77338664 Y NA NA KCTD12 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD12 119599 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 77453598 77454010 77453765 Y FBXL3,KCTD12 KCTD12 NA NA NA NA KCTD12 4530 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 80122895 80122985 80122937 Y NA NA NA NA NA NA NDFIP2 69608 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 90486324 90486483 90486404 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1511591 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 93915220 93915506 93915338 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 38125 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 460527 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 13355 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 96376622 96376681 96376676 Y DNAJC3 DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DNAJC3 49229 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 97302981 97303007 97302994 Y NA NA NA NA NA NA MBNL2 568681 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 97877294 97877762 97877400 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 5606 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr13 97991476 97991911 97991864 Y MBNL2 NA NA NA NA NA RAP2A 92565 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 98082020 98082299 98082214 Y MBNL2,RAP2A RAP2A RAP2A IMR90 Hi-C 24141950 RAP2A 2177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99644715 99645037 99644840 Y DOCK9 NA NA NA NA NA DOCK9 91842 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr13 99647205 99647378 99647259 Y UBAC2,UBAC2,GPR18,DOCK9 NA NA NA NA NA DOCK9 89501 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99772014 99772367 99772137 Y GPR18 DOCK9 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK9 35135 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99922932 99923366 99923036 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 56920 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99930007 99930140 99930028 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 63995 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99931812 99933023 99932107 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 65800 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99933643 99933940 99933792 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 67631 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99962652 99963115 99962844 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 96640 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 99974545 99974749 99974637 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 108533 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 100278698 100278861 100278780 Y NA CLYBL NA NA NA NA CLYBL 21779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 101041976 101042276 101042034 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P47 148252 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 101310141 101310446 101310274 Y TMTC4 TMTC4,NALCN-AS1 NA NA NA NA TMTC4 14901 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 102925517 102925660 102925589 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 321693 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 105792553 105792815 105792695 Y DAOA NA NA NA NA NA ARGLU1 1425697 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 107448247 107448283 107448269 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G1P5 134462 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 110138208 110138554 110138379 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 267061 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 110181276 110181465 110181371 Y IRS2 NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 224150 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 110322109 110322425 110322268 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 83190 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 110426988 110427362 110427201 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 9553 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 110631754 110631774 110631764 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 194839 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 110790027 110791241 110790617 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA COL4A2 164918 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 111068169 111068419 111068294 Y RAB20,ANKRD10 NA NA NA NA NA COL4A1 110673 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 112347236 112347393 112347316 Y NA NA SOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD44 356999 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 113179985 113180373 113180107 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 60108 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr13 114809032 114809271 114809129 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 86815 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 22080552 22080764 22080649 Y NA NA NA NA NA NA SALL2 77202 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA HAUS4 24781 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 HAUS4,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 24058094 24058646 24058322 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2,DHRS2 NA NA NA NA AP1G2 22815 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA DHRS2 66439 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NYNRIN 4274 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 27631441 27631502 27631472 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 566481 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 32941850 32942320 32942112 Y NA RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 9686 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr14 34987475 34987508 34987491 Y EAPP EAPP NA NA NA NA EAPP 19408 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 35250371 35250766 35250653 Y SRP54,BAZ1A NA NA NA NA NA CFL2 68342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 35767605 35767844 35767749 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 21766 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 39892906 39893200 39893154 Y FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 6504 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 41099089 41099243 41099183 Y NA NA NA NA NA NA LRFN5 975530 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.58874695519998 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 LRFN5 NA NA NA NA LRFN5 365 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 50328882 50329315 50329091 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10961 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 51460024 51460383 51460203 Y TRIM9 NA NA NA NA NA PYGL 50570 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 52337471 52337915 52337583 Y PTGER2,GNG2 GNG2 NA NA NA NA GNG2 46558 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 53399403 53399746 53399574 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 17407 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 53598795 53599062 53598929 Y DDHD1 DDHD1 NA NA NA NA DDHD1 18938 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 58449709 58450271 58450031 Y NA NA C14orf37 IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P3 155726 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr14 58766869 58767218 58767044 Y ARID4A RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA ARID4A 3766 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 60618583 60618767 60618659 Y PPM1A,C14orf135,DHRS7 DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 15807 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 64584533 64584935 64584736 Y NA NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 218382 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 64705009 64705329 64705170 Y PLEKHG3,SYNE2 NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 97988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 64912318 64912487 64912430 Y ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5 AKAP5 NA NA NA NA AKAP5 17730 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 65172114 65172865 65172414 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 3294 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 65347160 65347466 65347258 Y RAB15 SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB SPTB IMR90 Hi-C 24141950 SPTB 2559 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 67416708 67417057 67416792 Y GPHN NA NA NA NA NA MPP5 288769 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 320025 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 68933312 68933746 68933512 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 327444 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 69155852 69156106 69155979 Y NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 105084 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 73919503 73919783 73919743 Y NA NUMB,C14orf169 NA NA NA NA NUMB 8565 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 74224542 74224784 74224663 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45414 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 76027371 76027398 76027385 Y NA FLVCR2,RP11-507E23.1 NA NA NA NA FLVCR2 15562 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 76243945 76244101 76244023 Y TGFB3 NA NA NA NA NA C14orf1 118413 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 76446236 76446389 76446309 Y NA TGFB3 NA NA NA NA TGFB3 945 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 80972596 80972697 80972671 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 451164 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 81019191 81019257 81019224 Y DIO2,CEP128 NA NA NA NA NA CEP128 404604 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 81036045 81036252 81036151 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 387609 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 201352 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 91267745 91267886 91267834 Y NA TTC7B NA NA NA NA TTC7B 12937 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 91406372 91406636 91406631 Y NA NA NA NA NA NA C14orf159 118041 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 93776910 93777138 93777024 Y PRIMA1 BTBD7 NA NA NA NA BTBD7 20300 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 99382985 99383133 99383054 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 562083 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.17158814109089 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 100264706 100265066 100264858 Y NA NA NA NA NA NA EML1 62676 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 100883887 100884104 100884057 Y BEGAIN WDR25,WARS NA NA NA NA WARS 42745 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 102226478 102227031 102226824 Y HSP90AA1 PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 343 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 102227271 102227509 102227387 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 1136 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.38016754814544 chr14 102971480 102971658 102971568 Y NA ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 2478 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 103112299 103112666 103112355 Y NA NA NA NA NA NA RCOR1 55301 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 105536057 105536658 105536303 Y CRIP1,GPR132 NA NA NA NA NA CDCA4 50572 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 105653618 105653649 105653635 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA NUDT14 7958 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr14 105665519 105665885 105665604 Y NA JAG2,NUDT14,BTBD6 NA NA NA NA NUDT14 19859 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 105760670 105760918 105760811 Y C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1 BTBD6,PACS2,BRF1 NA NA NA NA PACS2 3982 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA C14orf80 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 20547295 20547641 20547374 Y NA NA LOC348120,REREP3,POTEB IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2283754 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 25646289 25646668 25646556 Y SNURF,SNRPN,UBE3A UBE3A NA NA NA NA UBE3A 35460 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 25678066 25678357 25678212 Y NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 3771 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 33028976 33029226 33029070 Y GREM1 GREM1 NA NA NA NA GREM1 20801 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 33122479 33122828 33122652 Y GREM1 NA NA NA NA NA GREM1 114304 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 33502141 33502453 33502281 Y NA FMN1 TMCO5B IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 17244 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 34597819 34597943 34597881 Y NA SLC12A6,NOP10 NA NA NA NA SLC12A6 30318 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8A,GOLGA8B 71262 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 208049 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 37175924 37176266 37175984 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 215238 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 40179429 40179904 40179805 Y NA EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2AK4 44443 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 40388043 40388381 40388211 Y NA BMF NA NA NA NA BMF 10712 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 40669843 40670190 40669979 Y GPR176,PAK6,DISP2 C15orf52,IVD NA NA NA NA IVD 25496 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 24693 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr15 41581854 41582095 41581909 Y NA OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1 NA NA NA NA OIP5-AS1 7666 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 42792289 42792533 42792361 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 LRRC57,HAUS2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAP23 10858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 43081091 43081306 43081168 Y NA NA NA NA NA NA CDAN1 53767 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 43321563 43321622 43321602 Y NA NA NA NA NA NA UBR1 74689 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 46528514 46528549 46528532 Y NA NA NA NA NA NA SLC30A4 715509 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 46545564 46545905 46545872 Y NA NA NA NA NA NA SLC30A4 732559 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 48687688 48687982 48687829 Y FBN1 NA NA NA NA NA RP11-154J22.1 65635 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 49598906 49599159 49599033 Y NA NA NA NA NA NA COPS2 153048 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 50876708 50877085 50876843 Y NA NA NA NA NA NA TRPM7 99927 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 52438848 52438958 52438938 Y NA GNB5 NA NA NA NA GNB5 42608 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 52734000 52734377 52734331 Y NA NA NA NA NA NA MYO5A 84870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr15 58183047 58183076 58183062 Y NA NA GCOM1 IMR90 Hi-C 24141950 POLR2M 300816 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 59030118 59030538 59030425 Y RNF111,ADAM10 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 9639 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 59226674 59226915 59226795 Y NA SLTM FAM63B MCF7 ChIA-PET 22265404 SLTM 2822 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 59469975 59470287 59470131 Y NA NA NA NA NA NA CCNB2 74698 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 59478138 59478489 59478268 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 82861 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 59978652 59978797 59978720 Y BNIP2 GTF2A2,BNIP2 NA NA NA NA BNIP2 936 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 65054489 65054592 65054541 Y NA RBPMS2 NA NA NA NA RBPMS2 11194 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 66121036 66121211 66121107 Y DPP8,DPP8,DIS3L,DENND4A DENND4A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4A 38405 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 71385768 71386181 71385996 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 202644 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 71523971 71524257 71524148 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 340847 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 33.5812845357817 chr15 71594937 71595146 71594940 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 411813 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 71677897 71678187 71678028 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 494773 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 72337253 72337262 72337258 Y SENP8,SENP8,SENP8,MYO9A,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 67337 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 72897243 72897463 72897311 Y SENP8,SENP8,MYO9A,TMEM202 NA NA NA NA NA BBS4 79064 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 73478919 73479295 73478923 Y NA NA NA NA NA NA NEO1 136868 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 73611065 73611428 73611349 Y C15orf60,HCN4 NA NA NA NA NA NEO1 269014 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 74909072 74909376 74909224 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 20231 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 75495544 75495835 75495599 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39 C15orf39 NA NA NA NA C15orf39 9560 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 77489220 77489376 77489298 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN3 114894 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA LINGO1 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 78754081 78754185 78754133 Y ACSBG1 IREB2 NA NA NA NA IREB2 26308 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 80149264 80149318 80149291 Y ST20,ST20-MTHFS,ST20,MTHFS,MTHFS MTHFS NA NA NA NA MTHFS 38403 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 83620312 83620736 83620674 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 31925 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 83817881 83818018 83817954 Y NA NA NA NA NA NA HDGFRP3 56752 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 85725231 85725336 85725284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 196466 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 86267591 86267810 86267701 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 68451 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 86337060 86337529 86337372 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 799 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 89878895 89879173 89879043 Y NA POLG,MIR9-3 NA NA NA NA POLG 2803 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 90094923 90095099 90095011 Y RHCG NA NA NA NA NA KIF7 101583 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 90379956 90380186 90379992 Y NA NA NA NA NA NA AP3S2 55388 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 5294 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr15 95038030 95038277 95038153 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 1613504 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 99444571 99445210 99444854 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 254371 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 101733484 101734132 101733815 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 56005 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr15 101818299 101818511 101818407 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 14976 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr15 101834172 101834455 101834316 Y TM2D3,TARSL2,SNRPA1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 802051 802260 802100 Y NA METRN,FAM173A,HAGHL,NARFL,CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA NARFL 12722 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 1585996 1586318 1586108 Y NA TELO2 NA NA NA NA TELO2 44651 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 2065446 2065768 2065545 Y NA TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 RAB26 MCF7 ChIA-PET 22265404 NPW 7519 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr16 3207486 3207903 3207712 Y SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29708 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA ZNF174 NA NA NA NA ZNF174 33998 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr16 3763227 3763392 3763351 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 2206 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 4944877 4945061 4944987 Y HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 49534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 6353433 6353832 6353638 Y NA NA NA NA NA NA NAGPA 1271291 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 9147014 9147397 9147240 Y ABAT C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 36108 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 11295999 11296122 11296015 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 45354 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 12713340 12713716 12713664 Y NA NA SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 CPPED1 182158 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 13873618 13873819 13873731 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 138195 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 14397958 14398068 14398015 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 234780 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 15498743 15498890 15498817 Y NA MPV17L,C16orf45 NA NA NA NA MPV17L 11132 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 17463561 17463824 17463658 Y XYLT1 NA NA NA NA NA RPS15A 1335881 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 22421466 22421891 22421890 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 24595 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr16 22767811 22767852 22767832 Y NA NA NA NA NA NA RRN3P3 320775 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 23431856 23432257 23432204 Y USP31,COG7 COG7 SCNN1B IMR90 Hi-C 24141950 COG7 30244 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 25121755 25122029 25121858 Y SLC5A11 LCMT1 NA NA NA NA LCMT1 705 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 27278659 27278775 27278715 Y JMJD5 NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 544 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 28176884 28177249 28177153 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 43992 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 29709853 29709969 29709906 Y QPRT SPN,QPRT NA NA NA NA QPRT 37253 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 29712327 29712432 29712378 Y HIRIP3,QPRT SPN,QPRT NA NA NA NA QPRT 39727 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 30458943 30459145 30459094 Y SEPHS2 ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SEPHS2 3441 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 30579441 30579843 30579693 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA AC002310.7 1728 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.38016754814544 chr16 30855963 30856257 30856110 Y NA MIR4519,BCL7C,CTF1 CTF1,BCL7C,MIR762,FBXL19,FBXL19-AS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MIR4519 28387 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 31880759 31881790 31880862 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 KIAA0664L3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF267 1289 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 46671518 46671564 46671541 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 17980 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr16 47176557 47176930 47176742 Y NETO2 NETO2 NA NA NA NA NETO2 649 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 47281592 47281819 47281707 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 105684 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 47454284 47454574 47454519 Y NA PHKB,ITFG1 NA NA NA NA PHKB 38460 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 48631315 48631363 48631339 Y NA N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 20696 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 50127559 50128142 50127811 Y TMEM188,ADCY7 HEATR3 NA NA NA NA HEATR3 29707 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 52052 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 50287533 50287795 50287656 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 102704 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 50501772 50501939 50501899 Y NA NA NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 NKD1 78302 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr16 50573093 50573439 50573278 Y BRD7,NKD1 NKD1 NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 NKD1 6802 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 50679822 50680132 50679910 Y NA RP11-401P9.6,NOD2 NA NA NA NA RP11-401P9.6 34227 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 53128013 53128430 53128279 Y RBL2 CHD9 NA NA NA NA CHD9 41068 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 54961070 54961275 54961203 Y NA IRX5 NA NA NA NA CRNDE 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 66619876 66620093 66620023 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CMTM3 15684 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.58874695519998 chr16 67047765 67048035 67047886 Y FBXL8,CES4A CBFB NA NA NA NA CBFB 12984 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 68234152 68234458 68234209 Y NA ESRP2,PLA2G15 NA NA NA NA ESRP2 35547 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 69225511 69225823 69225667 Y HAS3 SNTB2 NA NA NA NA SNTB2 6479 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr16 70973998 70974194 70974080 Y VAC14 NA NA NA NA NA VAC14 140934 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 71753676 71753893 71753785 Y HPR,PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 2711 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA PMFBP1 250381 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr16 72460868 72461258 72460965 Y NA NA NA NA NA NA PMFBP1 252091 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 72751239 72751276 72751266 Y NA NA HP,HPR IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 340321 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 72972740 72973001 72972925 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 118596 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 73031148 73031384 73031285 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 60213 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 73076128 73076469 73076445 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 15128 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 74901429 74901821 74901545 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF1 129107 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 75683626 75683906 75683817 Y NA ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA KARS 3085 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 776970 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 79041696 79041799 79041748 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 910386 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 80648932 80649251 80648956 Y NA NA NA NA NA NA CDYL2 186975 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 81659418 81659741 81659491 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 182643 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA CMIP 183067 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 82687139 82687406 82687299 Y NA NA HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 485308 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 84172759 84173286 84173220 Y NA MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C MBTPS1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HSDL1 3511 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 84208911 84209121 84208992 Y OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C HSDL1,DNAAF1,TAF1C NA NA NA NA TAF1C 9548 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 84279833 84280065 84279949 Y NA NA ATP2C2,DNAAF1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1C 61164 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr16 84544701 84544717 84544711 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104966 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 84545075 84545257 84545139 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104426 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr16 84624738 84624752 84624744 Y HSDL1,COTL1 COTL1 NA NA NA NA COTL1 24931 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 84784930 84785133 84785062 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53346 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 85020713 85021068 85020917 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 22073 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 9.38607331745451 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 85346294 85346686 85346622 Y FAM92B NA KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0513 286919 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 86587305 86587716 86587504 Y NA MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 464 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 22658 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 87810498 87810587 87810524 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 12900 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr16 87840547 87840941 87840913 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42949 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 87901718 87902209 87902044 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 624 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 88836450 88836610 88836518 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 13009 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr16 89468980 89469266 89469225 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 85703 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 595370 595681 595607 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27276 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 693293 693510 693390 Y RNMTL1 DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GLOD4 9712 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 1046722 1046841 1046786 Y NA NA NA NA NA NA TIMM22 148365 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 1267059 1267122 1267091 Y NA YWHAE NA NA NA NA YWHAE 34550 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 1863470 1863779 1863610 Y SGSM2,SGSM2,RTN4RL1 NA NA NA NA NA DPH1 67625 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 2026015 2026378 2026080 Y SERPINF2,SERPINF2 NA NA NA NA NA OVCA2 82688 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 2166387 2166805 2166676 Y METTL16,SMG6,SMG6 SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 37872 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 2927507 2927680 2927594 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 433003 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 3534813 3534835 3534825 Y OR1A2,OR1A1,OR3A2,OR1E1,OR1E2 SHPK,CTNS,TAX1BP3 TRPV1 IMR90 Hi-C 24141950 SHPK 2781 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 4278382 4278689 4278533 Y UBE2G1 UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 10459 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 4753672 4753828 4753714 Y UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 18989 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3 NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 7115018 7115437 7115195 Y NA ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1 NA NA NA NA ACADVL 3007 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.96300873403635 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 8029074 8029494 8029268 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 3664 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 10.2203909456727 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 8531412 8531868 8531658 Y NA MYH10 NA NA NA NA MYH10 211 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 16878291 16878630 16878396 Y NA NA NA NA NA NA MPRIP 65229 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 17493657 17493822 17493814 Y RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT PEMT NA NA NA NA PEMT 635 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr17 17874756 17875050 17874778 Y NA TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA LRRC48 629 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.29437347759999 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr17 25672386 25672687 25672621 Y NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53284 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.96300873403635 chr17 25784873 25785075 25784939 Y WSB1,LGALS9 KSR1 KSR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KSR1 3203 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 25805507 25805777 25805623 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 23837 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 27264479 27264617 27264556 Y UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12 FLOT2,DHRS13,PHF12 NA NA NA NA PHF12 12172 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 27814311 27814661 27814484 Y NA NA NA NA NA NA TP53I13 76409 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 28041165 28041459 28041338 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 93240 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 29176780 29177123 29176952 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA ATAD5 19792 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 29334745 29335135 29334940 Y RAB11FIP4,OMG RNF135 NA NA NA NA RNF135 40942 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 30723443 30723679 30723561 Y NA C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 45600 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 34045470 34045815 34045642 Y NA RASL10B RASL10B IMR90 Hi-C 24141950 RASL10B 10853 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 36062721 36062883 36062777 Y DDX52,HNF1B NA NA NA NA NA DDX52 61228 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 36102823 36103051 36102995 Y ACACA,DDX52,HNF1B NA NA NA NA NA DDX52 101330 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 36480536 36480738 36480637 Y NA MRPL45,SOCS7 NA NA NA NA SOCS7 25373 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 NA NA NA NA NA SOCS7 65535 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 36758537 36758835 36758687 Y NA SRCIN1 NA NA NA NA SRCIN1 1348 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 36759357 36759542 36759426 Y NA SRCIN1 NA NA NA NA SRCIN1 641 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 37542274 37542291 37542284 Y NA FBXL20 NA NA NA NA FBXL20 14485 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 38464298 38464708 38464402 Y MSL1,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 854 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 39509244 39509577 39509399 Y KRT40,KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT38,KRT35,KRT37 KRT33A,KRT31 NA NA NA NA KRT33A 4180 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 39572748 39572757 39572754 Y NA KRT31 NA NA NA NA KRT31 20904 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA NA NA NA NA NA KRT31 101290 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 39823354 39823685 39823437 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 19452 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 40152830 40153154 40152992 Y NA CNP,NKIRAS2,DNAJC7 CNP,TTC25 IMR90 Hi-C 24141950 NKIRAS2 8246 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr17 42589268 42589584 42589359 Y C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104 GPATCH8 ATXN7L3,GPATCH8 K562 ChIA-PET 22265404 GPATCH8 10470 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 NA NA NA NA NA GPATCH8 55222 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 44234299 44234706 44234578 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 264551 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 44268679 44268848 44268762 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 298931 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 44341762 44341942 44341850 Y KIAA1267,KIAA1267 NA MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPT 372014 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 45515544 45515843 45515768 Y NA NA NA NA NA NA NPEPPS 82465 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 45980057 45980402 45980230 Y NA SP2,AC003665.1,PNPO NA NA NA NA SP2 8541 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 46314423 46314444 46314434 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 135704 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 46696942 46697254 46696999 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB9 4585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr17 47425065 47425127 47425096 Y MYST2,ZNF652,ZNF652 ZNF652 NA NA NA NA ZNF652 12708 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 48066634 48067004 48066930 Y NA DLX4,DLX3 NA NA NA NA DLX3 3584 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,SGCA,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 48908408 48908498 48908454 Y NA TOB1 TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483 IMR90 Hi-C 24141950 TOB1 34841 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 49196679 49197214 49196965 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 453 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA CA10 326141 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 50795913 50796132 50795928 Y NA NA NA NA NA NA CA10 560536 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 50838489 50838508 50838499 Y NA NA NA NA NA NA CA10 603112 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 53394900 53394943 53394922 Y NA NA NA NA NA NA HLF 54527 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 55210991 55211279 55211077 Y NA NA NA NA NA NA AKAP1 50538 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 55432914 55433044 55432979 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 101702 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 55501996 55502706 55502262 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 170784 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 55568668 55569013 55568840 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 237456 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 55938337 55938724 55938439 Y SUPT4H1,CUEDC1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12920 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 55952714 55953105 55953007 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 27297 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 56138078 56138257 56138212 Y NA DYNLL2 AKAP1,DYNLL2,MRPS23,VEZF1,SRSF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYNLL2 20519 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 56426877 56426962 56426920 Y MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 1492 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 56468859 56469318 56469005 Y RNF43 SUPT4H1,RNF43 NA NA NA NA RNF43 23638 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.7544293269818 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 57048474 57048847 57048688 Y YPEL2 NA NA NA NA NA TRIM37 133435 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 57298532 57298798 57298672 Y NA SMG8,GDPD1 NA NA NA NA GDPD1 2704 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 57908316 57908645 57908515 Y NA NA NA NA NA NA TUBD1 59659 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 42875 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 39039 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 19205 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 60947655 60947933 60947794 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 244893 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr17 63552177 63552345 63552261 Y NA AXIN2 NA NA NA NA AXIN2 3420 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 63654769 63655153 63655091 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 99004 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 63747410 63747660 63747535 Y CEP112,CEP112,AXIN2 NA NA NA NA NA AXIN2 191645 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 65897183 65897370 65897273 Y NA NA NA NA NA NA BPTF 77543 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 67315191 67315526 67315500 Y NA ABCA5 NA NA NA NA ABCA5 5859 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 71152430 71152655 71152530 Y C17orf80,SSTR2 SSTR2,COG1 NA NA NA NA SSTR2 6496 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 71227425 71227646 71227536 Y NA COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA C17orf80 1053 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 72989354 72989561 72989458 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 7627 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 73007152 73007476 73007237 Y RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 387 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 73007918 73008254 73008160 Y RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 1153 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 73860608 73860975 73860910 Y NA WBP2,TRIM65,MRPL38 UNC13D,UNK,WBP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBP2 10020 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 75199050 75199385 75199187 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 118252 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMC6 171692 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 12.5147644232727 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 23350 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.92011169876362 chr17 77778301 77778701 77778443 Y CBX2,CBX8,CBX4 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4819 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.42306458341816 chr17 78744627 78744900 78744734 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 218498 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79228717 79229006 79228862 Y NA AZI1,C17orf89,SLC38A10 NA NA NA NA C17orf89 17678 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 38277 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 38764 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA LINC00482 79360 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79368790 79369424 79369000 Y NA NA NA NA NA NA LINC00482 87742 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA LINC00482 88526 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79375864 79375954 79375909 Y DYSFIP1,BAHCC1 NA NA NA NA NA LINC00482 94816 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79399639 79399699 79399664 Y GCGR,BAHCC1 NA NA NA NA NA ACTG1 89174 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79439092 79439387 79439261 Y PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 49486 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 37315 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr17 79546845 79547000 79546944 Y PCYT2 C17orf70 NA NA NA NA C17orf70 27858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79779684 79779899 79779792 Y NA FAM195B,P4HB,ARHGDIA NA NA NA NA FAM195B 9279 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79925685 79926075 79926048 Y TSPAN10 SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1 ASPSCR1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ASPSCR1 6608 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 79949658 79950000 79949804 Y SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1 NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 16975 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr17 80104775 80104822 80104796 Y NA NA NA NA NA NA FASN 50567 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 80453708 80453979 80453866 Y LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2 C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 21610 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr17 80747083 80747366 80747210 Y ZNF750 TBCD NA NA NA NA TBCD 39143 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr18 813044 813594 813404 Y YES1 YES1 NA NA NA NA YES1 2497 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 2856906 2857063 2856987 Y EMILIN2 NA LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 154250 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 3213545 3213785 3213625 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 31694 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 5464285 5464628 5464403 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 164071 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 5542461 5543034 5542604 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 85665 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr18 9101793 9102110 9101852 Y RAB12,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA NDUFV2 1165 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 9554563 9554587 9554575 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 58651 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 10133595 10133911 10133753 Y NA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 221596 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr18 10201326 10201729 10201530 Y NA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 APCDD1 250896 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr18 11733869 11734165 11734017 Y NA GNAL MPPE1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAL 46914 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 12048672 12049055 12049000 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 69648 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 12059774 12060081 12059918 Y NA NA GNAL,IMPA2 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 80750 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 9.38607331745451 chr18 12153782 12153922 12153819 Y NA NA NA NA NA NA TUBB6 151746 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 12408700 12408821 12408736 Y NA AFG3L2,SLMO1 SPIRE1 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO1 2805 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 12455577 12455852 12455727 Y NA SLMO1 NA NA NA NA SLMO1 49682 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr18 13219877 13220140 13220009 Y C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA CEP192 230516 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 13542199 13542509 13542255 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 182150 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 11.0547085738909 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr18 19373794 19374099 19373861 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 90876 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 21808250 21808465 21808434 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 91308 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 21975077 21975273 21975220 Y OSBPL1A OSBPL1A,IMPACT NA NA NA NA OSBPL1A 571 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr18 23836366 23836416 23836389 Y TAF4B TAF4B NA NA NA NA TAF4B 32466 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr18 24290449 24290835 24290698 Y TAF4B NA NA NA NA NA KCTD1 55084 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 28720751 28720970 28720841 Y NA DSC2 NA NA NA NA DSC2 40373 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 16.8949319714181 chr18 28734237 28734361 28734251 Y DSC3,DSC1 NA NA NA NA NA DSC2 53859 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr18 28981595 28981685 28981659 Y NA NA NA NA NA NA DSG2 94321 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr18 33844964 33845139 33845043 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 30538 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 34052267 34052344 34052306 Y NA NA NA NA NA NA FHOD3 176590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 42419261 42419416 42419316 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 1125824 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 43344062 43344307 43344170 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 200933 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 43407687 43408063 43407797 Y PSTPIP2,EPG5 NA NA NA NA NA EPG5 137177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 45379355 45379691 45379492 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 75824 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr18 46253142 46253362 46253168 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 189725 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 46342129 46342429 46342253 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 278712 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 47357197 47357543 47357370 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 18867 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 47548085 47548102 47548094 Y NA NA NA NA NA NA MYO5B 171361 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 48274760 48275068 48274915 Y NA NA NA NA NA NA MRO 74704 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 48462357 48462700 48462360 Y ME2 ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA ELAC1 29661 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 52786792 52787169 52787029 Y NA NA NA NA NA NA CCDC68 162053 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 269024 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 53087708 53087819 53087727 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 242199 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 53107364 53107398 53107375 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 222620 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 53167517 53167871 53167822 Y TCF4 NA NA NA NA NA TCF4 162147 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr18 60087978 60088258 60088046 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2,TNFRSF11A,BCL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC2 99982 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr18 60544702 60545081 60544795 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 164030 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 60609893 60610245 60610069 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 229221 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 60859734 60859973 60859925 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 125388 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 60874386 60874946 60874584 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 110415 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 67682034 67682164 67682099 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 189017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr18 72683878 72684340 72684028 Y NA NA NA NA NA NA ZADH2 234963 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 72706567 72706772 72706660 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 212531 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 74104077 74104276 74104177 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 100870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 74735151 74735398 74735253 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 202588 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 445179 445348 445264 Y NA SHC2,MADCAM1 NA NA NA NA SHC2 13648 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 461817 462164 462146 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1 NA NA NA NA SHC2 2821 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 511222 511648 511350 Y RNF126,GZMM MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA TPGS1 5923 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 532930 533293 533259 Y C19orf6,C19orf22,ARID3A MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG NA NA NA NA CDC34 3216 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG NA NA NA NA BSG 4137 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 2394788 2394991 2394868 Y CSNK1G2,DOT1L,TMPRSS9 TIMM13 NA NA NA NA TIMM13 30901 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr19 2629688 2630134 2629953 Y DOT1L,OAZ1,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 70573 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 4620862 4621172 4621017 Y NA TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 16358 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 5287522 5287818 5287647 Y NA RPL32P34 NA NA NA NA RPL32P34 11777 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 6592539 6592761 6592714 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 NA NA NA NA NA TNFSF9 63529 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 7756040 7757119 7756175 Y ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2 TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 12311 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L,LRRC8E NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 9119402 9119531 9119475 Y NA NA NA NA NA NA ZNF317 129525 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 9974094 9974487 9974263 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA PIN1 30161 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,CCDC151,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA CTC-398G3.2 38928 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 11641329 11641510 11641441 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ECSIT 3340 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 12065633 12065838 12065735 Y NA ZNF700,ZNF763,CTD-2006C1.2 NA NA NA NA CTD-2006C1.2 30594 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 12896870 12897372 12897198 Y ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 2938 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 12901644 12901726 12901699 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 1334 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 13137197 13137461 13137217 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 32775 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 14089228 14089566 14089336 Y CCDC130,PKN1,CD97,RFX1 DCAF15,RFX1 NA NA NA NA RFX1 26285 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 14661096 14661426 14661346 Y NA TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 19448 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 14895618 14895793 14895687 Y CD97,DDX39A,PKN1,DNAJB1,EMR3,ZNF333,EMR2 EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA AC005255.3 5328 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 16772555 16772747 16772653 Y NA MED26,TMEM38A NA NA NA NA TMEM38A 2617 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA KCNN1 72943 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.58874695519998 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 18768622 18768973 18768794 Y KIAA1683 KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA KLHL26 22847 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 20747496 20747853 20747738 Y NA ZNF737 NA NA NA NA ZNF737 881 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 24216985 24217321 24217111 Y ZNF254 ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 2709 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 28225401 28225557 28225460 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1476891 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 28239770 28239799 28239785 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1462649 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 28278661 28279931 28279051 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1422517 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 30718140 30718340 30718240 Y NA NA NA NA NA NA URI1 305589 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 34398114 34398257 34398186 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 113276 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr19 35702745 35703411 35703060 Y ZNF792,FXYD5,FXYD5,FXYD5 NA NA NA NA NA USF2 54470 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr19 39810585 39810976 39810672 Y CLC,LRFN1 SAMD4B NA NA NA NA SAMD4B 20060 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 41803374 41803837 41803699 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 10257 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 41804006 41804567 41804366 Y TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 9527 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 14970 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 42711906 42712521 42712423 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA DEDD2 9771 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 NA CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 MEGF8 75158 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA GLTSCR2 94651 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 48974873 48974967 48974920 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 4584 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr19 49315464 49315783 49315738 Y NA BCAT2,HSD17B14 NA NA NA NA BCAT2 3178 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 49493898 49494273 49494153 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 294 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 49836983 49837445 49837293 Y SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37 DKKL1,TEAD2 NA NA NA NA DKKL1 25595 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA ALDH16A1 29950 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr19 50205874 50206272 50205974 Y NA BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C NA NA NA NA CPT1C 13719 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 55832834 55833432 55833321 Y FCAR,PPP1R12C,TMEM150B HSPBP1,BRSK1,SUV420H2 NA NA NA NA SUV420H2 15789 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14 NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 58218479 58218613 58218485 Y ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154 ZNF551,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF671 18379 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 58415823 58415990 58415970 Y NA ZNF417,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 9988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA MZF1 4477 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 739928 740199 740059 Y NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 64489 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.38016754814544 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 9894353 9894610 9894569 Y ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 86873 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 10258344 10258406 10258377 Y NA RRM2 NA NA NA NA RRM2 2049 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 11547236 11547448 11547321 Y NA NA ROCK2,PQLC3,C2orf50 IMR90 Hi-C 24141950 E2F6 56849 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 11720189 11720409 11720300 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 95312 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 11890513 11890846 11890740 Y LPIN1 NA NA NA NA NA LPIN1 74792 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 15594564 15594826 15594695 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 104628 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 16219682 16220075 16219855 Y NA NA NA NA NA NA MYCN 140996 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 16575995 16576348 16576051 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 269251 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 16576517 16576693 16576605 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 268906 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 20176136 20176469 20176303 Y WDR35 WDR35 NA NA NA NA WDR35 11423 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 20548410 20548604 20548507 Y NA PUM2 HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 1391 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 20726594 20726630 20726611 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 81759 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 24495048 24495317 24495183 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 60064 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 24859370 24859696 24859496 Y NA NA NA NA NA NA NCOA1 146587 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 25784383 25784764 25784574 Y NA NA NA NA NA NA DTNB 109739 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 25874787 25874953 25874848 Y RAB10 DTNB NA NA NA NA DTNB 19550 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 26352135 26352230 26352183 Y NA NA NA NA NA NA RAB10 97159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 27557346 27557529 27557503 Y DPYSL5,C2orf16 MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513 NA NA NA NA MPV17 10799 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 27631105 27631216 27631160 Y C2orf16 EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 551 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB NA NA NA NA PPP1CB 37190 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 36790074 36790520 36790216 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 80710 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 37491311 37491687 37491498 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 34455 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 37603882 37604154 37604086 Y QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 34165 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 35954 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 37864248 37864629 37864487 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 98982 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 37940534 37940802 37940700 Y CDC42EP3 CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 22809 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 38368766 38369153 38368894 Y CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 87557 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 39340813 39341200 39341198 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 8286 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 317515 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr2 43422005 43422472 43422185 Y THADA,THADA,ZFP36L2 ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 29276 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 44398343 44398537 44398440 Y NA PPM1B NA NA NA NA PPM1B 5235 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 44471855 44471912 44471885 Y NA NA NA NA NA NA PPM1B 78747 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 46265425 46265774 46265513 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 388941 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 46784048 46784469 46784214 Y NA RHOQ,ATP6V1E2 NA NA NA NA ATP6V1E2 16352 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 47297632 47297822 47297725 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 103918 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 47499706 47499760 47499719 Y C2orf61 NA TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 70453 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 58271974 58272513 58272036 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 139188 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 61080674 61081167 61080838 Y REL REL NA NA NA NA REL 25489 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.92011169876362 chr2 62536871 62537441 62537187 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 115623 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 64207040 64207416 64207228 Y NA VPS54 NA NA NA NA VPS54 36790 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 64352533 64352773 64352693 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 15600 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 64360908 64361228 64361132 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 7145 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 64367846 64368162 64368149 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 211 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 64368431 64369198 64368837 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 58 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 64995321 64996019 64995711 Y SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 19182 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 65086460 65086681 65086529 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110321 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 68432380 68432395 68432387 Y NA WDR92,PNO1,PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 48974 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 69309666 69309994 69309927 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 71356 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 69852685 69852770 69852748 Y NA ANXA4,AAK1 NA NA NA NA ANXA4 16787 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 70145725 70146134 70145771 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22905 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 70154281 70154743 70154417 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 31461 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 70174757 70175015 70174885 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 12382 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 70226418 70226806 70226612 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 39021 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 70255582 70255905 70255725 Y MXD1,PCBP1 NA NA NA NA NA PCBP1 56680 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 70270545 70270983 70270722 Y MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 41602 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 71050473 71050659 71050592 Y FIGLA,NAGK NA NA NA NA NA ADD2 57116 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 72416850 72417011 72416931 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 634159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 72541323 72541406 72541365 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 509764 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 72748040 72748317 72748179 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 302853 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr2 75063027 75063135 75063034 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 3919 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 75912574 75912759 75912685 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA GCFC2 23356 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 81709176 81709459 81709306 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM1 1179302 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.96300873403635 chr2 81781528 81781694 81781559 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM1 1251654 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 85932755 85933081 85932924 Y SH2D6 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 20379 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 96782666 96782871 96782861 Y NA DUSP2 NA NA NA NA DUSP2 26308 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 97222458 97223029 97222771 Y DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 21978 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 98598628 98598759 98598694 Y NA TMEM131 NA NA NA NA TMEM131 11629 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 100576722 100576856 100576853 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 455262 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 101669826 101670190 101670079 Y TBC1D8 NA NA NA NA NA RPL31 53649 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 101680419 101680493 101680454 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 64242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 102399741 102400097 102399970 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 88429 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 105430210 105430587 105430504 Y NA LINC01158 NA NA NA NA LINC01158 37054 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 105489803 105490153 105490078 Y GPR45,POU3F3 LINC01158 NA NA NA NA LINC01158 22162 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 105913488 105913594 105913541 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA TGFBRAP1 30897 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 106412674 106413002 106412675 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 53320 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 108146627 108146991 108146734 Y NA AC096669.3 NA NA NA NA AC096669.3 2684 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 109201604 109202307 109201998 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 52747 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 109934621 109934818 109934675 Y NA NA NA NA NA NA EDAR 330793 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.33727051287271 chr2 112463608 112463919 112463793 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 176348 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 RABL2A 299991 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr2 114634434 114634643 114634539 Y NA ACTR3 ACTR3 IMR90 Hi-C 24141950 ACTR3 10894 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 118847045 118847263 118847087 Y INSIG2 INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 3017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 120905923 120906046 120905986 Y EPB41L5,EPB41L5 NA NA NA NA NA TMEM185B 72938 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 127824493 127824859 127824771 Y MAP3K2,IWS1,BIN1 BIN1 NA NA NA NA BIN1 38072 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 128165400 128165641 128165534 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 21359 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 129194918 129195025 129194997 Y HS6ST1 NA NA NA NA NA HS6ST1 120767 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 129994679 129994961 129994820 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 920528 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA MZT2B 736193 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 134878887 134879265 134878997 Y NA MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 3333 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 135062328 135062641 135062375 Y NA NA NA NA NA NA MGAT5 186774 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 135701216 135701448 135701313 Y NA CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 26936 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 136314098 136314477 136314288 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA R3HDM1 27073 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 138059421 138059750 138059540 Y NA NA NA NA NA NA HNMT 659840 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 139112246 139112514 139112380 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 144754 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 144048951 144048966 144048960 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 1039169 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 147189297 147189317 147189307 Y NA NA NA NA NA NA PABPC1P2 153695 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 147562975 147563022 147563002 Y NA NA NA NA NA NA PABPC1P2 219963 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 148089200 148089222 148089211 Y NA NA NA NA NA NA ACVR2A 510864 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 148126586 148126890 148126739 Y NA NA NA NA NA NA ACVR2A 473196 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 159579446 159579724 159579618 Y NA NA CCDC148,LOC554201,PKP4,UPP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANC1 243422 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 160100045 160100277 160100255 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 41033 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 160226895 160226913 160226904 Y BAZ2B NA NA NA NA NA WDSUB1 85585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 160350650 160351006 160350912 Y MARCH7,CD302,BAZ2B AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 32883 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 163222961 163223077 163223019 Y KCNH7,GCA IFIH1,GCA NA NA NA NA GCA 49611 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 164322048 164322202 164322137 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 268320 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 166161416 166161745 166161474 Y SCN2A,SCN2A NA NA NA NA NA CSRNP3 162412 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 169203110 169203445 169203278 Y NA NA ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402 IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 STK39 100459 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr2 172101085 172101413 172101325 Y NA TLK1 METTL8,TLK1 IMR90 Hi-C 24141950 TLK1 15261 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 175463861 175463949 175463936 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA AC018890.6 53992 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 175540530 175540594 175540562 Y CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1 WIPF1,H3F3AP4 NA NA NA NA WIPF1 5050 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 175762241 175762347 175762322 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 179736 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD13,HOXD11,HOXD9,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2 NA NA NA NA HOXD11 2917 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.12869110581817 chr2 177486085 177486490 177486293 Y HOXD3 NA NA NA NA NA MTX2 353962 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr2 180560876 180561013 180560945 Y ZNF385B NA NA NA NA NA ZNF385B 163219 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 180579667 180579746 180579673 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA ZNF385B 144486 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 180585338 180585678 180585637 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA ZNF385B 138554 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 180625658 180625928 180625899 Y ZNF385B NA NA NA NA NA ZNF385B 98304 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 180724883 180725244 180725071 Y ZNF385B ZNF385B NA NA NA NA ZNF385B 651 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 190056615 190056806 190056658 Y NA COL5A2 GULP1,COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 14010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA HIBCH 130946 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 193242199 193242349 193242257 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 1134288 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.6316439904727 chr2 197623019 197623245 197623231 Y NA GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 39204 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 201454959 201455229 201455094 Y NA NA NA NA NA NA KCTD18 72452 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 201978583 201978718 201978642 Y CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 109 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 202517448 202517800 202517452 Y NA ALS2CR11,TMEM237,MPP4 NA NA NA NA TMEM237 11155 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 202897639 202898135 202897874 Y FZD7 NA NA NA NA NA DAZAP2P1 166474 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA DAZAP2P1 165924 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 203292079 203292309 203292231 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 52420 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 205036975 205037335 205037108 Y NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 AC009498.1 60373 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 22.3179965548363 chr2 205037741 205037858 205037800 Y NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 AC009498.1 59850 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr2 205318547 205318821 205318681 Y NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 PARD3B 89695 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 206439575 206439768 206439663 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 104946 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 206545726 206545923 206545825 Y NA NRP2 NA NA NA NA NRP2 1012 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr2 206564438 206564682 206564481 Y INO80D,NRP2 NRP2 NA NA NA NA NRP2 19724 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 206569997 206570271 206570078 Y NA NRP2 NA NA NA NA NRP2 25283 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1 NA NA NA NA CREB1 2961 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 208883092 208883191 208883110 Y PTH2R,C2orf80 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 5093 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 216558345 216558652 216558547 Y NA NA NA NA NA NA FN1 259450 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 216756224 216756565 216756395 Y NA NA LOC646324,FN1,ATIC IMR90 Hi-C 24141950 MREG 140254 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 216867934 216868318 216868147 Y TMEM169 MREG NA NA NA NA MREG 28501 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 217035180 217035407 217035275 Y NA NA PKI55 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC5 64993 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA IGFBP5 937 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 30430 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV NA NA NA NA NA WNT10A 84858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 225621293 225621621 225621457 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 173183 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr2 225711035 225711198 225711117 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 262925 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 226894785 226894963 226894843 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD1 803334 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 227427883 227428152 227428018 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 270145 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA RHBDD1 NA NA NA NA RHBDD1 41736 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 230736228 230736612 230736477 Y SP110 FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 48406 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 233377568 233377661 233377601 Y ECEL1,PRSS56 ECEL1,PRSS56,EIF4E2,TIGD1 MIR1471,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 PRSS56 5512 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr2 234630754 234630813 234630784 Y NA NA NA NA NA NA HJURP 130399 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 236562836 236563015 236562857 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 162103 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 237724521 237724572 237724547 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 267383 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 238611190 238611575 238611206 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 76971 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 20279 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 240302695 240302977 240302812 Y HDAC4 AC062017.1,HDAC4 NA NA NA NA AC062017.1 18153 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 241845496 241845803 241845554 Y NA NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 MTERFD2 193944 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 623135 623319 623297 Y NA SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8695 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 TMEM74B,RAD21L1 NA NA NA NA TMEM74B 8932 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA TMEM74B,RAD21L1 NA NA NA NA TMEM74B 4215 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 1259137 1259285 1259212 Y C20orf46,C20orf202 SNPH NA NA NA NA SNPH 14177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 38535 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 37961 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 1372355 1372517 1372472 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA NSFL1C 305305 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 2978820 2979208 2979015 Y NA MRPS26 NA NA NA NA MRPS26 45383 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 3156363 3156554 3156472 Y EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 17521 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 3538229 3538411 3538318 Y NA NA NA NA NA NA ATRN 88542 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 5741425 5741673 5741600 Y NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 12386 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA RP5-971N18.3,TMX4 NA NA NA NA RP5-971N18.3 19707 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 8412863 8413194 8412910 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 302039 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 8619924 8620034 8619979 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 427376 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 9813866 9814210 9813923 Y PAK7 PAK7 NA NA NA NA PAK7 3479 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 12250218 12250236 12250226 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 380847 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 12274197 12274212 12274205 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 404826 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 16555525 16555956 16555640 Y NA KIF16B NA NA NA NA KIF16B 3447 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 21058164 21058497 21058329 Y NA PLK1S1 NA NA NA NA PLK1S1 46127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 23226243 23226447 23226434 Y NAPB NA THBD IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 102926 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 25305837 25305970 25305904 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 63649 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 112354 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 26116339 26116766 26116505 Y NA NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 386485 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 30182515 30183026 30182914 Y NA ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 8060 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr20 30200712 30201016 30200864 Y TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121 ID1 NA NA NA NA ID1 9626 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 32828802 32829240 32829000 Y NA NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 68368 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 6916 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 34330989 34331372 34331294 Y SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39 ROMO1,NFS1,RBM39,PHF20 NA NA NA NA RBM39 2755 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 35239893 35239986 35239939 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 7756 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 36045421 36045655 36045607 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 26281 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 36341109 36341408 36341193 Y GHRH,CTNNBL1 CTNNBL1 NA NA NA NA CTNNBL1 20701 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 36389387 36389716 36389551 Y NA NA VSTM2L IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 68979 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 37499452 37499626 37499537 Y RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35 NA NA NA NA NA FAM83D 53329 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 37626282 37626666 37626585 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 37340 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 39212413 39212586 39212517 Y TOP1,MAFB NA NA NA NA NA MAFB 103294 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 39785946 39786458 39785968 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 22346 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr20 45210571 45210900 45210742 Y NA NA NA NA NA NA TP53RK 105518 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 47373433 47373685 47373559 Y PREX1 NA NA NA NA NA ARFGEF2 162742 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 47400245 47400718 47400585 Y ZNFX1,PREX1 NA NA NA NA NA ARFGEF2 135709 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 47455528 47455923 47455726 Y NA NA PREX1,ARFGEF2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARFGEF2 80504 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 48659627 48659945 48659786 Y NA NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,SNAI1,SLC9A8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 62091 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 48809447 48810205 48810164 Y B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 4071 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 49134968 49135201 49135019 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 10077 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 49539044 49539098 49539071 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 6423 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr20 50416342 50416699 50416509 Y NA ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33169 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 50665033 50665229 50665099 Y NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 153618 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 620584 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 PFDN4 431746 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 55403523 55403730 55403625 Y TFAP2C NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 201165 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 55968808 55969481 55968821 Y ZBP1,PMEPA1 RAE1,MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 4345 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 57125775 57125866 57125821 Y NA NA NA NA NA NA STX16 98462 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 58784200 58784511 58784424 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1043L13.1 123305 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 58955192 58955446 58955319 Y NA NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1043L13.1 294297 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 60939635 60939778 60939673 Y SLCO4A1,NTSR1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 61724045 61724282 61724168 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF1 121304 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.71153229170908 chr20 62709200 62709458 62709264 Y GMEB2,ZGPAT,LIME1,PCMTD2,RGS19,RGS19,OPRL1 ZNF512B,TCEA2,OPRL1 NA NA NA NA RGS19 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 84498 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 77534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 11184749 11185145 11184947 Y BAGE2,BAGE NA NA NA NA NA BAGE2 87769 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr21 16662871 16663259 16663022 Y NA NA SAMSN1,NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 227550 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 164779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 17568022 17568137 17568068 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 127180 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 17672058 17672352 17672205 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 231216 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 23538013 23538045 23538029 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 1241403 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 29656574 29656747 29656720 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 598946 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 30005077 30005224 30005162 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 250469 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 38986410 38986680 38986546 Y KCNJ6 NA NA NA NA NA DYRK1A 250318 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 39845079 39845092 39845088 Y NA NA NA NA NA NA ERG 186612 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr21 39860406 39860812 39860600 Y NA NA NA NA NA NA ERG 170892 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 40011652 40011749 40011697 Y NA ERG NA NA NA NA ERG 19955 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 40159439 40159794 40159507 Y NA ETS2 ETS2,LINC00114 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ETS2 15437 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 40277371 40277733 40277541 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 102140 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 40476284 40476629 40476514 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 77148 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 41441424 41441816 41441699 Y NA NA NA NA NA NA PCP4 204181 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 59473 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 44529146 44529448 44529286 Y U2AF1 CBS,U2AF1 NA NA NA NA U2AF1 3449 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 44819081 44819261 44819206 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 25747 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 45394155 45394780 45394371 Y AGPAT3,TRPM2,C21orf33 TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 35420 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 45543595 45544017 45543789 Y KRTAP10-6,TRPM2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 7470 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 45566076 45566451 45566257 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 14589 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 45577373 45578052 45577512 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 25886 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 8679 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr21 47012173 47012565 47012399 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2,COL18A1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 49848 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr21 47563985 47564239 47564071 Y NA NA NA NA NA NA LSS 82499 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 18264097 18264299 18264131 Y CECR2,BCL2L13,BID,BID BID NA NA NA NA BID 8561 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.71153229170908 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 19749283 19749521 19749403 Y NA SEPT5,TBX1 NA NA NA NA TBX1 7057 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 19941739 19941814 19941777 Y NA COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 14398 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 22010846 22011267 22010978 Y YPEL1 YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 6287 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.96300873403635 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 22186398 22186549 22186531 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 33421 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 22478098 22478432 22478244 Y CCDC116,YPEL1,ZNF280B NA NA NA NA NA TOP3B 142885 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr22 25381840 25382180 25381995 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SGSM1 181604 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 27131212 27131584 27131334 Y NA NA MN1,PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 64482 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr22 28372624 28372939 28372782 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 58502 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 29365910 29365950 29365937 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF3 88330 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 29467563 29467858 29467701 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 497 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 29469912 29470391 29470070 Y XBP1,KREMEN1 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 2846 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr22 29505815 29505935 29505933 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 38749 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 29591621 29591757 29591669 Y EMID1 EMID1 NA NA NA NA EMID1 8083 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 29595756 29595942 29595849 Y EMID1 EMID1 NA NA NA NA EMID1 3898 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 29765526 29765849 29765726 Y ZNRF3,RASL10A,CABP7,NEFH NA NA NA NA NA AP1B1 51319 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 31609195 31609531 31609513 Y RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 2970 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 31639861 31640267 31640177 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33636 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 32819656 32819735 32819695 Y RFPL3,TIMP3 FBXO7 NA NA NA NA FBXO7 48928 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 33170286 33170551 33170419 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 301623 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 33248825 33249077 33248981 Y SYN3 NA NA NA NA NA FBXO7 380162 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 35529944 35530291 35530139 Y ISX NA LARGE IMR90 Hi-C 24141950 CTA-714B7.5 94758 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr22 35555825 35556131 35555978 Y NA NA LARGE IMR90 Hi-C 24141950 CTA-714B7.5 68918 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 36325608 36325959 36325784 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 96514 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr22 38198030 38198142 38198086 Y NA H1F0,GCAT,MIR658,EIF3L,ANKRD54 NA NA NA NA H1F0 972 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 38859370 38859653 38859488 Y NA KDELR3,DDX17 NA NA NA NA KDELR3 2414 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 40573139 40573276 40573210 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 72069 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 40885973 40886127 40886071 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 121378 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr22 41844337 41844774 41844650 Y SHISA8,TEF,TEF,TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 3310 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 42679264 42679621 42679518 Y NA NA NA NA NA NA Z83851.1 83621 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr22 42696005 42696062 42696030 Y SEPT3,NFAM1 NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 Z83851.1 67180 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 42696920 42697075 42696965 Y NA NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 Z83851.1 66167 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 42839941 42840323 42840234 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 7912 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr22 43550927 43551235 43551079 Y ARFGAP3 MCAT,TSPO,TTLL12 NA NA NA NA TSPO 5407 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 44730251 44730590 44730516 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1L 161588 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 NUP50 NA NA NA NA NUP50 13846 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 30268 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 46771050 46771392 46771204 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 46278 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 48146543 48146838 48146641 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 121120 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 50590886 50591023 50590963 Y MIOX,CPT1B,C22orf41,MOV10L1,MOV10L1 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA PANX2 16137 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 50784754 50785397 50785059 Y PPP6R2 PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 5021 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 4764846 4765049 4764983 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA ITPR1 231814 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 5237403 5237551 5237430 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 10072 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 5791778 5792091 5791935 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 564447 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 10276652 10276834 10276729 Y NA TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 10873 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.42306458341816 chr3 14413329 14413583 14413465 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC6A6 28493 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr3 14730155 14730277 14730196 Y NA NA NA NA NA NA NR2C2 256814 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 16218160 16218375 16218215 Y GALNTL2 NA NA NA NA NA DPH3 86104 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 940686 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 17679954 17680161 17680022 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 804148 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 95933 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 704060 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 20205868 20206079 20206039 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 19705 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 20361977 20362317 20362175 Y NA NA NA NA NA NA SGOL1 136193 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 23389835 23390198 23389844 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 147324 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 25494741 25494759 25494749 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 209639 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 74888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 150696 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 33638872 33639200 33639124 Y NA NA NA NA NA NA CLASP2 118648 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 37304089 37304216 37304152 Y GOLGA4 GOLGA4,AC097359.1 NA NA NA NA AC097359.1 20403 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 37805955 37806276 37805982 Y ITGA9 NA NA NA NA NA AC093415.2 94995 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 38196189 38196645 38196332 Y VILL,MYD88,OXSR1 ACAA1,OXSR1 OXSR1 IMR90 Hi-C 24141950 OXSR1 7935 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 38497232 38497482 38497354 Y NA ACVR2B,EXOG NA NA NA NA ACVR2B 3890 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr3 42085178 42085330 42085254 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 31884 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 42410924 42411072 42410976 Y TRAK1,CCK,CCK,HHATL NA NA NA NA NA RP11-219I21.1 98060 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 42514954 42515471 42515310 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5822 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA ZDHHC3 20058 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 46971519 46971826 46971651 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 47347 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 47120016 47120037 47120026 Y SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12 NA NA NA NA NA SETD2 83420 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 47420724 47420876 47420775 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 223 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 48967045 48967316 48967140 Y NA SLC25A20,ARIH2 NA NA NA NA ARIH2 12791 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 52073968 52074235 52074157 Y GPR62 RPL29,DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 14331 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 53568043 53568300 53568167 Y SFMBT1 CACNA1D NA NA NA NA CACNA1D 41360 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 55224453 55224624 55224517 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-875H7.5 312665 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 58321418 58321818 58321477 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 4811 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 60018233 60018421 60018327 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 984423 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 65694421 65694810 65694689 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 327699 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 66022863 66023161 66022996 Y MAGI1 MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 354 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 66353986 66354551 66354135 Y SLC25A26 NA NA NA NA NA LRIG1 195136 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr3 69134869 69134938 69134904 Y TMF1 TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 2774 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71136796 71137147 71137136 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493993 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71222111 71222440 71222307 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 408700 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71267437 71267786 71267612 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 363354 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71293394 71293605 71293527 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 337535 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71464859 71465257 71465038 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 165883 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71490469 71490633 71490551 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 140507 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71535859 71536392 71536211 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 94748 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 72388262 72388804 72388511 Y RYBP NA SHQ1,GXYLT2,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 105265 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2 NA NA NA NA GXYLT2 42442 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr3 76605335 76605709 76605470 Y ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 124166 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 79674571 79674688 79674630 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 140277 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 80100853 80101105 80100983 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 285888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 81766105 81766391 81766248 Y NA GBE1 NA NA NA NA GBE1 42921 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 87101402 87101690 87101545 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 172731 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 402239 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 393031 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 212844 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA TBC1D23 208742 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 101046086 101046265 101046174 Y ZBTB11,SENP7,CEP97 NA NA NA NA NA SENP7 183820 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 646021 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 105416337 105416655 105416542 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 169741 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 107841863 107841996 107841935 Y NA CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 33991 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 111943889 111944218 111944054 Y NA NA NA NA NA NA CD200 104976 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 112069423 112069692 112069474 Y SLC9A10 CD200 NA NA NA NA CD200 20229 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 112076380 112076550 112076391 Y NA CD200 NA NA NA NA CD200 27186 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 114374818 114375057 114374945 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 601358 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 116145742 116145918 116145863 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 597627 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 120120515 120120873 120120694 Y FSTL1 FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 47227 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 122201925 122202222 122202174 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 29570 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 122476470 122476801 122476636 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 33870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 122516218 122516436 122516387 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA DIRC2 4576 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 123229622 123229815 123229688 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 72217 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 123478378 123478570 123478420 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 175989 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 124605050 124605342 124605178 Y ITGB5 ITGB5 NA NA NA NA ITGB5 12923 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 125200225 125200611 125200423 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 36430 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 126359707 126359720 126359714 Y NA TXNRD3NB,TXNRD3 NA NA NA NA TXNRD3 12278 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 368760 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 127416375 127416550 127416435 Y NA ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 26597 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 127473675 127474224 127473998 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 83897 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 127655460 127655715 127655545 Y KBTBD12 NA NA NA NA NA SEC61A1 112769 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr3 127795566 127796407 127795838 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 27082 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A NA NA NA NA RAB7A 32307 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr3 128967680 128967946 128967799 Y NA NA NA NA NA NA H1FX 65174 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 129572979 129573244 129573238 Y NA TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 37175 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 130637982 130638444 130638066 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C1 70543 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 131096350 131096447 131096399 Y NA NUDT16 NA NA NA NA NUDT16 2068 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 132261870 132262263 132261985 Y DNAJC13 NA NA NA NA NA UBA5 109027 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 133537876 133537890 133537883 Y NA SRPRB NA NA NA NA SRPRB 36999 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 135890782 135891068 135890882 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 23015 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 136631651 136631818 136631718 Y NA NA NA NA NA NA NCK1 52601 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 138410318 138410460 138410372 Y NA NA NA NA NA NA FAIM 84870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 139271371 139271598 139271484 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 123261 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 139344390 139344678 139344552 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 50181 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 139909278 139909663 139909338 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 257251 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr3 140186013 140186197 140186105 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A36 472475 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 141746457 141746834 141746789 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 14206 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 141758636 141758867 141758743 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 2173 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 141994757 141995052 141994916 Y NA NA GK5,TFDP2,ATP1B3,XRN1,GRK7 IMR90 Hi-C 24141950 GK5 52308 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 142130035 142130079 142130067 Y NA XRN1 NA NA NA NA XRN1 34825 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 143693787 143694146 143693885 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 5147 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 143696383 143696503 143696442 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 7743 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 144134299 144134312 144134306 Y NA NA NA NA NA NA C3orf58 445659 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 145883195 145883481 145883360 Y PLOD2,PLSCR4 PLOD2 PLOD2,PLSCR4,PLSCR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLOD2 3755 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 145959602 145959992 145959865 Y PLSCR4 PLSCR4 NA NA NA NA PLSCR4 6974 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 146955604 146955955 146955778 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 694953 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 148899476 148899525 148899501 Y AGTR1,AGTR1,TM4SF4,CP NA NA NA NA NA HPS3 54105 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 149669691 149669713 149669697 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 14459 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 149960024 149960302 149960150 Y NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 163820 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 156268270 156268550 156268410 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 2423 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 156822906 156823344 156823241 Y NA RP11-6F2.5 NA NA NA NA RP11-6F2.5 25276 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.7544293269818 chr3 158440805 158440990 158440882 Y MFSD1 MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 6997 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 160267928 160268193 160268163 Y NA SCARNA7,KPNA4 NA NA NA NA KPNA4 13183 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 167751925 167752226 167752094 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 59537 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 169300300 169300658 169300540 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 78748 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA EIF5A2 258584 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 171002565 171002750 171002646 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 173447 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 171816708 171816982 171816800 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 61290 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 171820468 171820770 171820540 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 65050 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 174159946 174160135 174160080 Y NA NAALADL2 NAALADL2 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 5583 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 174257765 174258124 174258055 Y NA NA NAALADL2 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 103402 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 177548160 177548535 177548360 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 634899 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 179049621 179049719 179049674 Y NA ZNF639,MFN1 NA NA NA NA ZNF639 10842 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 179550123 179550276 179550202 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 181580 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 180475891 180475917 180475905 Y NA NA NA NA NA NA FXR1 108012 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 738842 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 182613640 182613943 182613809 Y MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 87798 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 182887417 182887606 182887510 Y KLHL6,LAMP3,B3GNT5 NA NA NA NA NA MCCC1 55554 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 183242331 183242579 183242455 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 97765 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 183684356 183684550 183684447 Y NA ABCC5 NA NA NA NA ABCC5 49253 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA C3orf70 140855 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 185450719 185450896 185450815 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 89948 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 187891343 187891657 187891500 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 21498 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 188002342 188002742 188002584 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 132497 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 194048965 194049014 194048990 Y NA LRRC15 NA NA NA NA LRRC15 39458 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 194826238 194826399 194826316 Y FAM43A NA NA NA NA NA XXYLT1 163497 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 195153778 195154174 195153996 Y NA ACAP2 NA NA NA NA ACAP2 7633 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 195871770 195871934 195871856 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 64710 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 196071529 196071904 196071800 Y UBXN7,RNF168,LRRC33,PCYT1A,TM4SF19 TCTEX1D2 TM4SF19-TCTEX1D2 IMR90 Hi-C 24141950 TCTEX1D2 28359 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 770204 770556 770391 Y ZNF141 RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 3081 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 1339085 1339471 1339276 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57446 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 1843900 1844033 1843967 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA LETM1 11941 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 5734 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 3683 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 3829290 3829379 3829335 Y LYAR,LYAR,ADRA2C NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 ADRA2C 63215 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 3836768 3837443 3837153 Y NA NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 ADRA2C 70693 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.92011169876362 chr4 6513482 6513861 6513684 Y JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C NA NA NA NA NA MAN2B2 61041 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 6927054 6927600 6927345 Y KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 18085 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr4 7969878 7969938 7969908 Y SH3TC1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 30225 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 8614691 8614733 8614712 Y NA NA NA NA NA NA ACOX3 174241 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 10182011 10182277 10182105 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 65438 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 10956396 10956801 10956583 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 411650 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 11603431 11603452 11603441 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST1 174042 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 690843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 13257922 13258131 13258027 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 74907 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 16871833 16872157 16872139 Y LDB2 LDB2 NA NA NA NA LDB2 26275 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 17829390 17829398 17829394 Y CLRN2,NCAPG DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 18865 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 17853657 17853735 17853696 Y NA DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 43132 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 17938692 17938903 17938798 Y NA NA NA NA NA NA LCORL 82596 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 19825132 19825140 19825136 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 368515 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 20340711 20340985 20340805 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 87828 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 20445202 20445303 20445235 Y KCNIP4 NA NA NA NA NA SLIT2 192319 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 20521707 20522059 20521739 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 173846 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 20627000 20627372 20627197 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 68533 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 21602576 21603408 21603328 Y KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 906671 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 12848 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 24579124 24579339 24579231 Y NA DHX15 NA NA NA NA DHX15 4834 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 26076298 26076598 26076390 Y NA NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 86479 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 26994323 26994529 26994430 Y STIM2 NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 134102 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 37887233 37887434 37887366 Y TBC1D1 TBC1D1 NA NA NA NA TBC1D1 3274 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 39935708 39936100 39935904 Y NA PDS5A NA NA NA NA PDS5A 41476 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 40240312 40240963 40240621 Y RHOH,RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 183866 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 44712631 44712762 44712670 Y NA GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 13850 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 47495543 47495885 47495605 Y COMMD8 COMMD8,ATP10D NA NA NA NA ATP10D 10238 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 53879042 53879203 53879109 Y NA NA NA NA NA NA RASL11B 152585 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 66107153 66107671 66107555 Y NA NA NA NA NA NA RP11-807H7.1 426008 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 9.17749391039996 chr4 67430351 67431255 67431078 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 472507 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr4 68394565 68394648 68394607 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 170249 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 71544189 71544561 71544258 Y DCK,IGJ IGJ,UTP3,RUFY3 NA NA NA NA IGJ 973 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 74464812 74465326 74464976 Y RASSF6,RASSF6 NA NA NA NA NA RP11-692D12.1 341886 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 75859868 75860329 75860092 Y BTC,PARM1 PARM1 NA NA NA NA PARM1 3563 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 76750745 76750859 76750802 Y NA NA NA NA NA NA USO1 102968 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 77500789 77501039 77500904 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 146536 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 77611633 77612016 77611712 Y NA NA NA NA NA NA SEPT11 256840 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 78016666 78016743 78016704 Y CCNG2 CCNI SHROOM3,CCNG2 IMR90 Hi-C 24141950 CCNI 21508 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 78096366 78096378 78096373 Y NA CCNG2 NA NA NA NA CCNG2 20062 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 78977065 78977655 78977359 Y NA FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 341 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.58874695519998 chr4 79253143 79253310 79253148 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 217363 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 79264997 79265051 79265025 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 205622 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 79882 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 80932597 80932846 80932722 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 111762 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 82566342 82566814 82566582 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA RASGEF1B 396583 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr4 86664396 86664842 86664610 Y ARHGAP24 NA NA NA NA NA ARHGAP24 270129 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 87700627 87700837 87700672 Y PTPN13 NA NA NA NA NA AFF1 153317 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 87849171 87849370 87849272 Y HSD17B11 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 4784 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 87880821 87880990 87880863 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 11545 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 87882810 87883321 87882982 Y KLHL8,AFF1,AFF1 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 13534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 89202679 89202817 89202765 Y NA PPM1K NA NA NA NA PPM1K 1104 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 89534713 89535020 89534799 Y PPM1K,HERC3 NA NA NA NA NA NAP1L5 82366 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 1226835 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.7544293269818 chr4 93104192 93104578 93104286 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2022184 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 99848541 99848872 99848707 Y NA EIF4E NA NA NA NA EIF4E 916 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 103701783 103702159 103702029 Y NA MANBA,RP11-10L12.4 NA NA NA NA MANBA 21632 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 103781884 103782294 103782163 Y MANBA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA UBE2D3 5759 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 103788773 103788886 103788830 Y NA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA CISD2 638 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 103967476 103967511 103967493 Y NA SLC9B1,SLC9B2 NA NA NA NA SLC9B1 28580 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 106071010 106071297 106071196 Y TET2,TET2 TET2 NA NA NA NA TET2 5978 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 106227483 106227804 106227645 Y TET2,TET2 NA NA NA NA NA TET2 162451 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 106382528 106382833 106382619 Y TET2,TET2 PPA2 NA NA NA NA PPA2 10405 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 109047956 109048357 109048341 Y NA LEF1 NA NA NA NA LEF1 39755 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr4 112732930 112733119 112733025 Y NA NA NA NA NA NA C4orf32 331434 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 112814304 112814659 112814583 Y NA NA NA NA NA NA C4orf32 249894 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 113067380 113067784 113067656 Y LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32 C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 2827 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 113095488 113095850 113095539 Y NA C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 30935 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 113201272 113201525 113201422 Y TIFA ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 3140 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 114023484 114023505 114023495 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 286219 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 325456 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 114366444 114366711 114366574 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 314372 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 122487638 122487728 122487683 Y NA NA NA NA NA NA ANXA5 128540 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 124538169 124538584 124538401 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 222219 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 127544750 127544766 127544759 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 997660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 129389693 129389923 129389761 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 177787 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 129733811 129733921 129733891 Y NA NA NA NA NA NA C4orf33 278551 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 133266182 133266225 133266204 Y NA NA NA NA NA NA SCLT1 3253418 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 133292934 133293335 133293044 Y NA NA NA NA NA NA SCLT1 3280170 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 138989223 138989276 138989250 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 172227 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 139250529 139250714 139250650 Y SLC7A11 NA NA NA NA NA SLC7A11 89026 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 140850270 140850709 140850607 Y MAML3,CLGN NA NA NA NA NA MAML3 222629 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 140992977 140993283 140993131 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 80055 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 141013693 141013823 141013696 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 59515 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 141016837 141017139 141016990 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 56199 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 141021103 141021485 141021348 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 51853 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 141164479 141164682 141164571 Y MAML3 SCOC MAML3,MGST2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCOC 11758 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 141287573 141287758 141287638 Y NA RP11-425I13.1 NA NA NA NA RP11-425I13.1 1558 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 143588065 143588407 143588236 Y NA NA NA NA NA NA USP38 515663 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 145498597 145498714 145498656 Y NA NA NA NA NA NA HHIP 66459 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 146725275 146725660 146725360 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 132127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 147192653 147192904 147192792 Y ZNF827,SLC10A7 NA NA NA NA NA LSM6 97816 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C NA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 161535 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 150808373 150808555 150808464 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 188871 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 150955291 150955641 150955466 Y NA DCLK2 DCLK2 IMR90 Hi-C 24141950 DCLK2 41785 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.71153229170908 chr4 151017552 151017612 151017555 Y NA DCLK2 NA NA NA NA DCLK2 20126 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 151264145 151264674 151264371 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 266719 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 151316952 151317347 151317150 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 319526 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 151873741 151873900 151873783 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 60979 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 152033251 152033470 152033361 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 14526 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr4 154138645 154138936 154138742 Y NA NA NA NA NA NA TRIM2 67151 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA KIAA0922 162849 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169444605 169444881 169444719 Y NA PALLD,DDX60L NA NA NA NA DDX60L 12056 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169490335 169490520 169490463 Y PALLD DDX60L NA NA NA NA DDX60L 33398 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr4 169522008 169522260 169522060 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 65071 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169555491 169556032 169555691 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 98554 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169559850 169560019 169559874 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 102913 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 22.1094171477817 chr4 169646285 169646357 169646330 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 189348 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169722239 169722366 169722303 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 207060 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169849945 169850177 169850075 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 79249 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 175827737 175827964 175827860 Y NA NA NA NA NA NA HPGD 385432 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 183133398 183133793 183133630 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 68996 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 183161464 183161792 183161628 Y ODZ3 NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 97062 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 183397757 183397986 183397872 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 333355 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr4 184390171 184390713 184390483 Y NA CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 26427 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-739P1.2 208523 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 185331771 185332231 185332067 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 61503 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 185382837 185383066 185382954 Y NA IRF2 NA NA NA NA IRF2 10668 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 186760271 186760668 186760511 Y NA NA NA NA NA NA TLR3 227638 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr4 187948547 187948771 187948688 Y NA NA LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 302671 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 400756 401055 400906 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40203 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 672861 673336 673024 Y NA NA NA NA NA NA CEP72 62474 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TRIP13 105735 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 964244 964536 964396 Y NKD2 RP11-43F13.3,NKD2 SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-43F13.3 30887 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 1565484 1565589 1565562 Y NA LPCAT1,SDHAP3 NA NA NA NA SDHAP3 27146 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.79732636225453 chr5 7742239 7742282 7742261 Y NA NA NA NA NA NA MTRR 107017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 9544480 9544834 9544772 Y SEMA5A SEMA5A NA NA NA NA SEMA5A 293 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P7 63616 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 12670425 12670804 12670615 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 1471007 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 14208730 14209007 14208812 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 66919 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 30694167 30694547 30694365 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 357125 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 34048471 34048803 34048799 Y NA AMACR,C1QTNF3 NA NA NA NA C1QTNF3 6534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 34655418 34655812 34655539 Y NA RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 1076 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 34658306 34658537 34658364 Y RAI14,RAI14 RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 3964 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA RANBP3L 70269 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 36657665 36658163 36657813 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 53208 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 36681914 36682309 36681923 Y NA CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 40988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 37740558 37740859 37740716 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 363244 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 39025065 39025383 39025224 Y NA RICTOR NA NA NA NA RICTOR 47127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 44805965 44806268 44806131 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA RP11-53O19.1 611 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 50036304 50036403 50036354 Y NA NA NA NA NA NA PARP8 76571 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 53496834 53497083 53496859 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 107329 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 57376590 57376893 57376708 Y NA NA PLK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLK2 377194 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 57537303 57537570 57537449 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 216517 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 58165920 58166304 58166218 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 167284 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 58232883 58233370 58233101 Y PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 100218 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 29.8268552087999 chr5 58332286 58332474 58332297 Y PDE4D RP11-266N13.2 NA NA NA NA RP11-266N13.2 1114 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D RP11-266N13.2 NA NA NA NA RP11-266N13.2 26296 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 58391200 58391585 58391393 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 57612 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 58395760 58396044 58395902 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 62172 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr5 58400134 58400374 58400226 Y PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 66546 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 58420146 58420252 58420199 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 86558 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 58421119 58421626 58421279 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 87531 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 58422372 58422713 58422580 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 88784 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 58423022 58423147 58423096 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 89434 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 89723 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 58508843 58508938 58508881 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 175255 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 58616191 58616562 58616377 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 282603 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 58798066 58798450 58798258 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 464478 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 58926109 58926323 58926216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 592521 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 58951498 58952014 58951831 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 617910 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 59004737 59004748 59004743 Y PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 671149 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 64062726 64062917 64062822 Y NA SREK1IP1 NA NA NA NA CWC27 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 64372191 64372464 64372338 Y FAM159B NA CWC27,ADAMTS6 IMR90 Hi-C 24141950 CWC27 309434 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA ADAMTS6,CENPK,PPWD1 NA NA NA NA ADAMTS6 33855 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 65329982 65330329 65330156 Y NA NA NA NA NA NA SREK1 103470 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 151855 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 67643475 67643635 67643573 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 133927 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 71852331 71852540 71852377 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 237858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 72138720 72138932 72138785 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 28581 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 73209063 73209467 73209267 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 349552 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 74163639 74163858 74163748 Y NA FAM169A GFM2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM169A 2863 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 75789158 75789213 75789186 Y NA NA NA NA NA NA IQGAP2 92084 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 77814404 77814787 77814528 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 160065 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 79428091 79428419 79428255 Y SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 121479 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 79506276 79506503 79506404 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 43395 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 80705760 80705793 80705777 Y ACOT12 NA NA NA NA NA ZCCHC9 110351 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 80707651 80707683 80707665 Y SSBP2 NA NA NA NA NA ZCCHC9 112242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 EDIL3 NA NA NA NA EDIL3 683 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 86673186 86673474 86673330 Y CCNH,CCNH CCNH NA NA NA NA CCNH 33362 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C CTC-467M3.1,LINC00461 NA NA NA NA CTC-467M3.1 12867 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 87967371 87967797 87967486 Y MEF2C CTC-467M3.1,LINC00461 NA NA NA NA CTC-467M3.1 2239 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 90466120 90466308 90466241 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA ARRDC3 210868 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 93013083 93013343 93013254 Y NA NPM1P27 NA NA NA NA NPM1P27 4030 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 94380006 94380293 94380145 Y NA NA NA NA NA NA MCTP1 237986 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA ELL2 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 96475990 96476170 96476132 Y NA LIX1,RIOK2 NA NA NA NA LIX1 406 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 97445347 97445652 97445445 Y NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 226796 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 99386410 99387139 99386777 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 481827 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr5 104727804 104727950 104727869 Y NA RP11-6N13.1 NA NA NA NA RP11-6N13.1 1133 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 106632102 106632323 106632213 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 372273 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr5 106855785 106855959 106855826 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 148637 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 106900103 106900354 106900202 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 104242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 108329034 108329385 108329210 Y NA NA NA NA NA NA FER 247511 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 109207541 109207704 109207623 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 184474 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 112425460 112425614 112425558 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 115061 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 112628840 112629057 112628905 Y MCC,MCC NA NA NA NA NA MCC 193470 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 117452118 117452132 117452125 Y NA NA NA NA NA NA LINC00992 702913 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 117774677 117774715 117774696 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP2 532776 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 118747776 118748171 118748023 Y NA HSD17B4 NA NA NA NA HSD17B4 37967 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 123966351 123966687 123966497 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 115813 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 124006979 124007355 124007057 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 75145 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 126217588 126217612 126217598 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 107273 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 126708435 126708706 126708571 Y NA NA NA NA NA NA PRRC1 142595 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 133290184 133290209 133290197 Y NA C5orf15,VDAC1 NA NA NA NA C5orf15 12269 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 133864116 133864195 133864168 Y NA NA NA NA NA NA SEC24A 118284 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 134471631 134472059 134471710 Y C5orf20,PITX1 NA PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 103128 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 134475601 134475808 134475692 Y PITX1 NA LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY IMR90 Hi-C 24141950 PITX1 107098 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 134729736 134729896 134729816 Y NA H2AFY NA NA NA NA H2AFY 3708 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 135097584 135097864 135097724 Y NA NA TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A48 70474 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 137333439 137333810 137333723 Y NA NA NA NA NA NA FAM13B 51840 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 137785775 137785891 137785836 Y WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2 REEP2,EGR1 NA NA NA NA REEP2 13069 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 137833063 137833252 137833158 Y FAM53C,EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 33884 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 139464204 139464218 139464211 Y NA PURA CYSTM1,NRG2 IMR90 Hi-C 24141950 PURA 21144 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 139677985 139678148 139678067 Y NA PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 2558 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 141262176 141262446 141262287 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA KIAA0141 38927 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 146831561 146831956 146831686 Y PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55663 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 147463828 147464105 147463998 Y NA NA NA NA NA NA SPINK5 60582 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 150474739 150475397 150475230 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 3601 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 151129219 151129502 151129338 Y SLC36A1 RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 14437 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 159837617 159837836 159837727 Y NA C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA SLU7 8882 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 167241894 167242222 167242118 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 95526 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 167327544 167327856 167327700 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 181176 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 171326428 171326478 171326475 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 105399 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 171847636 171847998 171847816 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 31529 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 172208951 172208972 172208964 Y UBTD2 DUSP1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 12753 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr5 175974830 175975038 175974917 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,C5orf25,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 11804 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 178255974 178256130 178256077 Y NA ZNF354B ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 28824 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.38016754814544 chr5 179038504 179038699 179038602 Y NA HNRNPH1 NA NA NA NA HNRNPH1 21086 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr5 180600516 180600767 180600667 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 16157 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 286457 287090 286788 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 2540 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 290595 290748 290658 Y IRF4,DUSP22 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 965 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 304014 304108 304058 Y HUS1B DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 14384 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 319799 320052 319899 Y DUSP22,IRF4 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 30169 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 321888 322261 322075 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 32258 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 322947 323248 323077 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 33317 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 2299603 2299973 2299788 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 55621 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr6 3385907 3386183 3386010 Y SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 69073 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 343868 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr6 6008887 6009261 6009138 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 3687 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.21448517636362 chr6 6885637 6886125 6885854 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219705 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 7157997 7158379 7158000 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 52167 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 9037386 9037741 9037564 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B3 603592 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 11170049 11170298 11170253 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 127502 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 13147785 13147909 13147848 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 64379 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 14138760 14138894 14138788 Y CD83 CD83 NA NA NA NA CD83 22888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 15299924 15300312 15299931 Y NA NA NA NA NA NA JARID2-AS1 53059 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 15526544 15526623 15526553 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 134666 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 15554239 15554360 15554316 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 106929 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 16420932 16421664 16421198 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 184121 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 16714644 16714961 16714802 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 44408 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 16771345 16771373 16771363 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATXN1 11623 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr6 22148644 22148866 22148767 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 556672 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 23630929 23631073 23631036 Y NA NA NA NA NA NA MRS2 770080 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.71153229170908 chr6 23656570 23656900 23656609 Y NA NA NA NA NA NA MRS2 744253 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.38016754814544 chr6 25034556 25034972 25034914 Y C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 LRRC16A 242334 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.12869110581817 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr6 26322637 26323123 26322876 Y NA HIST1H4H,BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H4H 38875 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 27655152 27655475 27655306 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BL 118234 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 28603148 28603326 28603259 Y NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3 SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 21159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 93748 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr6 29949488 29949840 29949664 Y NA HLA-A NA NA NA NA HLA-A 42451 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 30910531 30910726 30910623 Y NA GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA VARS2 36512 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA C6orf48 10117 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 10466 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 33546480 33546561 33546538 Y LEMD2,B3GALT4,RGL2,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 461 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 35228332 35228733 35228603 Y PPARD,ZNF76 ZNF76,DEF6 NA NA NA NA ZNF76 3646 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 35331114 35331538 35331252 Y PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 22779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr6 35532430 35532714 35532506 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 10780 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 35681097 35681517 35681302 Y FKBP5 FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 12843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 35685740 35686068 35685867 Y NA FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 8292 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr6 36010041 36010276 36010159 Y NA MAPK14 NA NA NA NA MAPK14 16553 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr6 41153851 41154204 41154120 Y TREML4,TREM1,NFYA NA NA NA NA NA NFYA 115167 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 41472054 41472459 41472263 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 39705 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 41674655 41674829 41674723 Y TREM1,TFEB TFEB NA NA NA NA TFEB 27168 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 42369897 42370202 42370080 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 47587 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 42371710 42371838 42371791 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 45951 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 43757757 43757886 43757846 Y NFKBIE,TJAP1 VEGFA NA NA NA NA VEGFA 21836 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr6 45392235 45392572 45392528 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48545 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 47831581 47831627 47831604 Y NA NA NA NA NA NA CD2AP 388056 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA NA NA NA NA NA RPS17P5 451885 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 53734127 53734150 53734138 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 76832 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 57381063 57381299 57381127 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 203460 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 63803405 63803823 63803791 Y NA NA NA NA NA NA FKBP1C 115528 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 70479579 70479974 70479889 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 25029 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 80663174 80663336 80663221 Y NA ELOVL4,TTK NA NA NA NA ELOVL4 7877 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 81044945 81045591 81045323 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 230581 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 89473318 89473558 89473438 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 197790 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 90061423 90061611 90061503 Y RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 856 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 229607 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 90885505 90885892 90885812 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 118735 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 90970974 90971061 90971018 Y NA BACH2 NA NA NA NA BACH2 33566 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 90994076 90994276 90994132 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 10351 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 91004075 91004656 91004496 Y MDN1,BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 91008460 91008611 91008538 Y NA BACH2 NA NA NA NA BACH2 3833 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 92185644 92186055 92185825 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 890880 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 101902058 101902283 101902278 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 574810 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 109218749 109218814 109218782 Y NA RP11-249L21.4 NA NA NA NA RP11-249L21.4 8262 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 109755732 109756057 109756030 Y CD164 SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 NA NA NA NA SMPD2 3909 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 112110533 112110931 112110911 Y NA NA NA NA NA NA FYN 81724 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 112112583 112112889 112112849 Y NA NA NA NA NA NA FYN 79766 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 112629632 112629958 112629797 Y NA NA LAMA4,FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 55491 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 114662111 114662444 114662262 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 378 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 117003694 117003845 117003770 Y TSPYL4,TSPYL1,DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA KPNA5 3344 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 129984721 129985008 129984794 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 44362 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 130029433 130029625 130029566 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 63 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 131386975 131387183 131387097 Y EPB41L2,EPB41L2 EPB41L2 EPB41L2,AKAP7 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L2 4513 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.50295288465454 chr6 133843297 133843543 133843427 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 283561 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 134620325 134620468 134620398 Y NA SGK1 NA NA NA NA SGK1 16782 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 134768134 134768363 134768231 Y NA NA NA NA NA NA SGK1 130884 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 136492327 136492682 136492505 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 116307 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr6 141171716 141171869 141171793 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1294498 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 141204403 141204777 141204486 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1261590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 143123144 143123510 143123441 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 140828 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr6 143221710 143222285 143222093 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 42053 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 144283965 144283971 144283968 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99764 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 144284201 144284585 144284512 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99150 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 144587251 144587368 144587331 Y NA NA UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 TPT1P4 67149 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 148822303 148822649 148822378 Y NA NA NA NA NA NA SASH1 230863 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 148830845 148831563 148831298 Y UST NA NA NA NA NA UST 234901 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 148834877 148835159 148834957 Y UST NA NA NA NA NA UST 231305 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 149069640 149070024 149069807 Y UST UST NA NA NA NA UST 3176 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 150076607 150076998 150076645 Y KATNA1,LATS1 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 7806 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 151325792 151326084 151325926 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 92581 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 154753926 154754309 154754118 Y CNKSR3 NA NA NA NA NA CNKSR3 75484 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 157609644 157610034 157609839 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 132599 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 157639062 157639495 157639253 Y C6orf35 NA NA NA NA NA TMEM242 103138 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 158784092 158784407 158784250 Y NA NA NA NA NA NA GTF2H5 196708 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 159484779 159485166 159484982 Y TAGAP NA NA NA NA NA RSPH3 65560 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 160409606 160409719 160409663 Y IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 21475 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 331217 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr6 166711154 166711571 166711225 Y PRR18 SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 42508 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 790893 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 169368330 169368547 169368455 Y NA NA TCTE3,WDR27,C6orf70,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 731612 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 508552 508748 508658 Y ADAP1 NA NA NA NA NA HEATR2 255590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 1658452 1658596 1658524 Y ELFN1 PSMG3 NA NA NA NA PSMG3 49811 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 1883097 1883273 1883258 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 103170 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 2106199 2106418 2106303 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 164460 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 3453682 3454067 3453904 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 114602 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 3603136 3603457 3603297 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 264056 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 3877207 3877255 3877231 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 538127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 5631413 5631525 5631469 Y NA ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 974 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 7216835 7216977 7216903 Y NA C1GALT1 C1GALT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 22270 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 8199993 8200104 8200049 Y NA NA NA NA NA NA AC007009.1 99759 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 8300349 8300667 8300508 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 32 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 11606918 11607025 11606951 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 595419 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 11827353 11827497 11827425 Y THSD7A NA NA NA NA NA TMEM106B 421370 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 227754 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 17664691 17664931 17664811 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 313193 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 18901208 18901607 18901411 Y NA NA NA NA NA NA TWISTNB 845103 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 21928607 21928632 21928620 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 55070 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 22339389 22339576 22339483 Y RAPGEF5 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 210042 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 23375804 23376081 23376055 Y IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 102218 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 AC079780.3 3989 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC003090.1 106040 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC003090.1 107631 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC003090.1 107901 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 25897167 25897316 25897282 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC003090.1 108553 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC003090.1 113131 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr7 26004342 26004519 26004380 Y NA NA MIR148A MCF7 ChIA-PET 22265404 NFE2L3 185341 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 27386345 27386573 27386562 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P4 79048 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 27940559 27940968 27940768 Y NA NA NA NA NA NA AC004549.6 162545 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 28000804 28001209 28000940 Y NA NA NA NA NA NA JAZF1 217153 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 29041948 29042327 29041980 Y NA NA NA NA NA NA CHN2 117563 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 30204020 30204306 30204163 Y ZNRF2 AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 8873 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 30500037 30500161 30500099 Y NA NOD1 NA NA NA NA NOD1 16239 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 415606 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 38379769 38380269 38379922 Y NA AC006033.22 NA NA NA NA AC006033.22 30785 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 40952368 40952631 40952468 Y NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 CDK13 964732 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 42120488 42120725 42120693 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 154744 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 42258020 42258279 42258155 Y GLI3 GLI3 NA NA NA NA GLI3 17190 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 44884505 44884603 44884554 Y NA H2AFV,PURB NA NA NA NA H2AFV 1079 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 45616146 45616461 45616432 Y NA ADCY1 NA NA NA NA ADCY1 4407 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 47533820 47533921 47533853 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 86235 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 50769181 50769534 50769358 Y NA NA NA NA NA NA GRB10 89625 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 55167745 55167964 55167855 Y NA NA NA NA NA NA LANCL2 263177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 55635235 55635573 55635336 Y NA VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 3108 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 434088 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 70160459 70160922 70160898 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1098554 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.29437347759999 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 77028776 77029116 77028943 Y NA NA NA NA NA NA FAM185BP 279343 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 77042340 77042746 77042618 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA RSBN1L-AS1 280836 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 77953225 77953430 77953328 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 527103 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA GNAI1 838141 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 78947044 78947146 78947095 Y MAGI2 NA NA NA NA NA GNAI1 814125 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 80270298 80270436 80270331 Y CD36 NA NA NA NA NA GNAT3 130962 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr7 80272863 80273241 80273058 Y NA NA NA NA NA NA GNAT3 133527 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 80399893 80400101 80400015 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 149574 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr7 88207618 88207818 88207718 Y NA NA NA NA NA NA SRI 353310 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 89824940 89825230 89825139 Y NA STEAP1,STEAP2,C7orf63 NA NA NA NA STEAP2 30036 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 91466585 91467314 91466893 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 40720 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 92262528 92262734 92262631 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44820 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 94557636 94557931 94557784 Y PPP1R9A PPP1R9A NA NA NA NA PPP1R9A 23122 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 96748066 96748124 96748095 Y NA ACN9 NA NA NA NA ACN9 4164 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 20324 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 100167857 100168189 100168134 Y NA AGFG2,LRCH4,PCOLCE,PCOLCE-AS1,MOSPD3 NA NA NA NA LRCH4 13587 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 100433472 100433773 100433685 Y NA SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 10351 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 101062164 101062286 101062177 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 99060 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr7 101245696 101245932 101245814 Y MOGAT3 NA NA NA NA NA CUX1 211027 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr7 102056938 102057102 102057040 Y ORAI2 ORAI2,ALKBH4,LRWD1 NA NA NA NA ORAI2 14451 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 102512857 102513072 102512991 Y NA NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 125439 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 PMPCB,PSMC2,DNAJC2 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 104684659 104684988 104684665 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 33168 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 104771634 104771765 104771700 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 120143 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 54830 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 107567511 107567568 107567540 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38096 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 108011226 108011346 108011286 Y NRCAM,NRCAM NA NA NA NA NA NRCAM 83815 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 109682039 109682053 109682046 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 1047009 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 110778024 110778148 110778086 Y NA LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 48962 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 127806 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 111764528 111764737 111764684 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 79729 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 116483555 116483740 116483606 Y CAPZA2 CAPZA2 MET,TES IMR90 Hi-C 24141950 CAPZA2 34431 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 116804623 116804954 116804811 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 212235 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 120884704 120884786 120884745 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 149632 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 120942380 120942663 120942460 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 91755 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 120945288 120945594 120945402 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 88824 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 127665265 127665386 127665326 Y NA NA NA NA NA NA RBM28 316576 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.17158814109089 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.7544293269818 chr7 129460659 129460706 129460683 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 130083 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 206421 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 130665753 130666114 130665990 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 126741 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PLXNA4 411440 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 132170446 132170729 132170588 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 160718 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA4 109668 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 133431716 133432104 133431827 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 377948 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B4 117353 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 137346296 137346315 137346306 Y PTN NA NA NA NA NA PTN 319685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 137659854 137660135 137660099 Y NA CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 24678 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 137685065 137685809 137685664 Y TRIM24,CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 252 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 137932803 137932964 137932893 Y NA AC008155.2 AKR1D1,SVOPL IMR90 Hi-C 24141950 AC008155.2 48265 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 137942214 137942717 137942409 Y TRIM24 AC008155.2 NA NA NA NA AC008155.2 38512 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 138317555 138317877 138317771 Y KIAA1549,TRIM24,SVOPL,SVOPL NA NA NA NA NA AC020983.5 53848 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 139519969 139520263 139520114 Y LUC7L2 HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 44392 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 139589065 139589242 139589174 Y JHDM1D,TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 113488 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr7 139615919 139616013 139615969 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA HIPK2 140342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 139616229 139616509 139616457 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 140652 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 141501394 141501805 141501703 Y NA NA NA NA NA NA SSBP1 65273 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 8.76033509629087 chr7 141512676 141512822 141512821 Y TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 76555 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 141644604 141644810 141644796 Y TAS2R38,CLEC5A NA NA NA NA NA SSBP1 208483 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 148424586 148424815 148424779 Y NA CUL1 NA NA NA NA CUL1 31580 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 8.13459687512724 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr7 149318954 149319342 149319148 Y ZNF746,SSPO ZNF767 NA NA NA NA ZNF767 501 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 149323228 149323272 149323250 Y NA ZNF767 NA NA NA NA ZNF767 3385 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 151182414 151182755 151182660 Y AGAP3,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 32451 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 151192969 151193321 151193145 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21885 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 151986893 151987163 151987026 Y MLL3 NA NA NA NA NA GALNT11 266134 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 156444597 156444947 156444772 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA C7orf13 13249 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 156932490 156932855 156932681 Y NA UBE3C NA NA NA NA UBE3C 2883 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 157034052 157034373 157034213 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 50990 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 158493510 158493807 158493659 Y NCAPG2 NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 1713 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr7 158765978 158766170 158766074 Y NA NA NCAPG2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 118709 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 1897074 1897760 1897667 Y NA KBTBD11-OT1,KBTBD11,RP11-439C15.4 NA NA NA NA KBTBD11-OT1 19803 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA NA NA NA NA NA MYOM2 600014 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 3252665 3252838 3252782 Y NA NA NA NA NA NA MYOM2 1261510 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 6400051 6400348 6400277 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 137938 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 6605896 6606328 6606048 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 42018 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 17385893 17386107 17386000 Y SLC7A2,SLC7A2 SLC7A2,PDGFRL NA NA NA NA SLC7A2 33296 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 21624397 21624558 21624547 Y NPM2,GFRA2 NA NA NA NA NA XPO7 150622 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 FGF17 NA NA NA NA FGF17 29991 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPYSL2 62455 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 30462940 30463157 30463081 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E2 50611 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 30594719 30594985 30594839 Y NA GSR,UBXN8 UBXN8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBXN8 6955 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 PURG,WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA PURG,WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 31068137 31068428 31068254 Y NA NA NA NA NA NA WRN 178820 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 31115048 31115061 31115052 Y NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 WRN 225731 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 261637 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr8 36360158 36360320 36360239 Y NA NA NA NA NA NA RP11-962G15.1 274362 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 36441429 36441454 36441442 Y NA NA NA NA NA NA RP11-962G15.1 193228 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA RP11-150O12.1 KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150O12.1 33219 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr8 37404927 37405081 37405004 Y NA RP11-150O12.1 KCNU1,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 4620 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 37532791 37533173 37533002 Y NA ZNF703 NA NA NA NA ZNF703 18096 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr8 37749222 37749683 37749580 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 5302 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 38770998 38771507 38771224 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 14245 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 264510 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 41775383 41775559 41775471 Y NA NA ANK1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 131949 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 41851790 41851810 41851800 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 55698 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 NA NA NA NA NA RPL29P19 540824 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 56354040 56354307 56354063 Y XKR4 NA NA NA NA NA TGS1 329394 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 61705362 61705819 61705615 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 116025 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 3988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 72009245 72009445 72009345 Y NA NA NA NA NA NA EYA1 263022 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 74432524 74433240 74432853 Y C8orf84,RDH10 NA NA NA NA NA STAU2 224703 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 75418171 75418548 75418360 Y NA NA NA NA NA NA RP11-730G20.2 95931 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 75578837 75579082 75578960 Y NA NA NA NA NA NA RP11-730G20.2 64358 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 75605656 75605872 75605764 Y NA NA NA NA NA NA RP11-730G20.2 91177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 77128503 77128819 77128661 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 462635 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 77590079 77590470 77590424 Y ZFHX4 ZFHX4 NA NA NA NA ZFHX4 984 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 80659403 80659613 80659502 Y NA HEY1 NA NA NA NA HEY1 18485 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.30027924690906 chr8 80701258 80701483 80701350 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 23160 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 81015641 81015664 81015650 Y ZBTB10 NA NA NA NA NA MRPS28 75117 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 81587419 81587669 81587654 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 191565 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 81742521 81742946 81742703 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 279357 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 89124026 89124433 89124347 Y MMP16 NA NA NA NA NA MMP16 213821 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 89126455 89126855 89126580 Y NA NA NA NA NA NA MMP16 211399 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 94728357 94728657 94728477 Y NA FAM92A1,RBM12B,TMEM67 NA NA NA NA FAM92A1 19568 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 97171094 97171453 97171221 Y GDF6 NA NA NA NA NA UQCRB 74409 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 98865970 98866240 98866105 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 9042 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 99658802 99659210 99659171 Y NA NA NA NA NA NA STK3 293845 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 103401606 103401938 103401841 Y NA UBR5 NA NA NA NA UBR5 21131 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 105598029 105598284 105598149 Y TM7SF4,LRP12 LRP12 NA NA NA NA LRP12 968 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 105630140 105630377 105630280 Y TM7SF4,LRP12 LRP12 LRP12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP12 30888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 105716523 105716766 105716665 Y NA NA LRP12,DPYS IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 117271 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 106411260 106411358 106411309 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 82340 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 106444510 106444790 106444650 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 115590 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 107614798 107614912 107614855 Y OXR1,OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 93329 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 107665296 107665542 107665419 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 42699 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 107735956 107736285 107736121 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 27715 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 107775174 107775515 107775345 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 66933 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 222726 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 116474696 116474834 116474765 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 345065 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 116641527 116641923 116641875 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 177976 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 118969079 118969407 118969255 Y MED30 NA NA NA NA NA EXT1 152685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 119323544 119323883 119323714 Y SAMD12 NA NA NA NA NA EXT1 201452 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 120656261 120656532 120656398 Y NA ENPP2 ENPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ENPP2 27161 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 121649803 121649981 121649892 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 173532 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 121702901 121703232 121703165 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 120281 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 121815954 121816374 121816244 Y SNTB1 SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 7139 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 121821026 121821194 121821110 Y SNTB1 SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 2319 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 122361097 122361402 122361250 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 290228 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 125357334 125357543 125357438 Y NA TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 25390 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 125683699 125684014 125683857 Y NA NA NA NA NA NA MTSS1 54716 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 126451967 126452238 126452064 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11404 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 126834397 126834705 126834582 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 393834 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 126942677 126943005 126942794 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 502114 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 127438735 127439116 127438766 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 129004 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 11.0547085738909 chr8 127445250 127445715 127445335 Y FAM84B NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 122405 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 19.8150436701817 chr8 127445901 127446376 127445998 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 121744 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.9260174680727 chr8 127447013 127447387 127447083 Y FAM84B NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 120733 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 6.67454102574543 chr8 127489107 127489187 127489147 Y FAM84B NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 78933 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 127661075 127661484 127661171 Y FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 92437 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 8.13459687512724 chr8 127829528 127829825 127829677 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 260890 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.84022339752725 chr8 127840242 127840498 127840319 Y NA NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 271604 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 127844573 127844851 127844712 Y FAM84B NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 275935 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 127916866 127917178 127917022 Y FAM84B NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 312155 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 127927068 127927434 127927240 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 301899 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr8 127928770 127929133 127928805 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 300200 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.58874695519998 chr8 127950397 127950550 127950437 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 278783 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 127963308 127963680 127963494 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 265653 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128048074 128048382 128048201 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 180951 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 158704 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.50885865396361 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 129791 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 116138 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.7544293269818 chr8 128134721 128135121 128135085 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 94212 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128167127 128167527 128167484 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 61806 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.66863525643636 chr8 128171088 128171312 128171255 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 58021 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128176067 128176333 128176204 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 53000 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128180134 128180587 128180334 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48746 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128182261 128182424 128182343 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 46909 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128182729 128182789 128182759 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 46544 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128185119 128185731 128185383 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 43602 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128193341 128193750 128193748 Y NA CCAT1 MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 CCAT1 35583 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr8 128196669 128197128 128196955 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 32205 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128203137 128203490 128203390 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 25843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr8 128208934 128209645 128209301 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 19688 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128218099 128218752 128218687 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10581 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128222835 128223182 128223058 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 6151 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128227053 128227754 128227491 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1579 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128227982 128228299 128228180 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1034 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 7967 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128239593 128240207 128240123 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10260 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128257606 128258262 128257899 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 28273 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 4.79732636225453 chr8 128258299 128258698 128258657 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 28966 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128259400 128259918 128259781 Y MYC CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 30067 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 27.949640545309 chr8 128260594 128261000 128260832 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 31261 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.92011169876362 chr8 128264964 128265070 128265034 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 35631 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128265922 128266338 128266337 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 36589 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128277603 128277799 128277701 Y MYC CCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48270 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr8 128305149 128305567 128305521 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 75816 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 77601 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128308850 128309232 128309041 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 79517 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128333152 128333458 128333317 Y MYC NA NA NA NA NA CCAT1 103819 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr8 128403573 128403875 128403698 Y MYC NA NA NA NA NA CASC8 88509 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128407875 128408267 128408231 Y NA NA NA NA NA NA CASC8 84117 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr8 128412842 128413241 128413043 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CASC8 79143 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.33727051287271 chr8 128413471 128413778 128413602 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CASC8 78606 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128418204 128418600 128418512 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CASC8 73784 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 13.3490820514909 chr8 128435102 128435271 128435258 Y NA NA NA NA NA NA CASC8 57113 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128464193 128464263 128464228 Y NA CASC8 NA NA NA NA CASC8 28121 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128465837 128465850 128465844 Y NA CASC8 NA NA NA NA CASC8 26534 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128523245 128523266 128523257 Y NA CASC8 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CASC8 30861 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr8 128575770 128576030 128575897 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CASC8 83386 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128630700 128630869 128630842 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 114811 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128658139 128658542 128658339 Y MYC NA NA NA NA NA MYC 87138 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128678694 128678799 128678726 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 66881 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr8 128680816 128681380 128681307 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 64300 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128684085 128684435 128684260 Y NA NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 61245 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128684618 128684766 128684674 Y NA NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 60914 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128719033 128719247 128719140 Y NA MYC NA NA NA NA MYC 26433 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128734724 128735010 128734826 Y NA MYC NA NA NA NA MYC 10670 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128744100 128744550 128744397 Y NA MYC NA NA NA NA MYC 1130 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr8 128768623 128768723 128768690 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 22943 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr8 128772812 128773062 128772941 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 27132 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.71153229170908 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.08579407054545 chr8 128835085 128835527 128835341 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 30306 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr8 128865187 128865467 128865327 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 60408 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128871975 128872421 128872033 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 67196 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128878082 128878481 128878225 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 73303 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128879185 128879808 128879466 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 74406 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128883085 128883449 128883196 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 78306 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr8 128888912 128889201 128889088 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 84133 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128910613 128910985 128910818 Y MYC NA NA NA NA NA PVT1 105834 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.71153229170908 chr8 128911546 128911899 128911640 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 106767 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.50295288465454 chr8 128923296 128923609 128923453 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 97248 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.50295288465454 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr8 128944008 128944415 128944139 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 76442 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 128973364 128973763 128973565 Y MYC RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 47094 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr8 128988975 128989172 128989023 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 31685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128989961 128990273 128990255 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 30584 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr8 128993662 128993919 128993808 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26938 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 128999913 129000275 129000158 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 20582 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 129062971 129063389 129063062 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 42114 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 130279904 130280064 130280038 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 747311 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.71743806101815 chr8 130281342 130281797 130281625 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 745578 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 5.42306458341816 chr8 130284402 130285105 130284786 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 742270 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 117.221626764654 chr8 130285758 130286324 130285998 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 741051 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.92011169876362 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 134143122 134143607 134143263 Y ST3GAL1,NDRG1,PHF20L1 NA NA NA NA NA NDRG1 168658 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 140749303 140749395 140749351 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 717283 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 NA BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSNARE1 51397 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr8 143809767 143809928 143809818 Y C8orf55 JRK NA NA NA NA JRK 48381 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.29437347759999 chr8 144598131 144598463 144598197 Y PARP10 ZC3H3 NA NA NA NA ZC3H3 23160 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 GRINA NA NA NA NA GRINA 35424 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 145909522 145909717 145909620 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 328 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr8 146058579 146058595 146058588 Y ARHGAP39 ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5 NA NA NA NA ZNF7 7730 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 631583 631920 631840 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 163292 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 758228 758480 758338 Y KANK1 NA NA NA NA NA DMRT2 289874 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 3742705 3743097 3742775 Y NA NA GLIS3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-509J21.1 217982 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 4174938 4175110 4175024 Y GLIS3 NA NA NA NA NA SLC1A1 313334 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 4334414 4334840 4334611 Y NA NA GLIS3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A1 153604 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 4855592 4855625 4855609 Y NA MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 7301 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 5627107 5627559 5627241 Y CD274,RANBP6,KIAA2026,KIAA1432 KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 82 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 6958089 6958102 6958095 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 239226 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 8673225 8673587 8673438 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 37724 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 8771816 8771826 8771822 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 60505 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 454302 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.9260174680727 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr9 14958123 14958476 14958300 Y NA LDHAP4 NA NA NA NA LDHAP4 37791 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 14992180 14992514 14992235 Y NA NA NA NA NA NA LDHAP4 71848 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 18058532 18058898 18058697 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 412994 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 11.889026202109 chr9 18474958 18475225 18475032 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 3066 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr9 20484725 20484943 20484834 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 135599 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL9 236740 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 23850835 23851256 23851099 Y NA ELAVL2 NA NA NA NA ELAVL2 26500 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr9 26946072 26946289 26946254 Y PLAA,IFT74,IFT74 IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 611 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 27333351 27333416 27333383 Y IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 194363 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 27365157 27365383 27365271 Y MOBKL2B NA NA NA NA NA MOB3B 162396 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B NA NA NA NA MOB3B 36337 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.71153229170908 chr9 36231547 36231666 36231607 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA CLTA 42694 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 38386799 38386908 38386853 Y NA ALDH1B1,IGFBPL1 NA NA NA NA ALDH1B1 3753 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 68423908 68424365 68424207 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 29010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 6.25738221163634 chr9 71259918 71260255 71260087 Y NA NA PIP5K1B IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 58320 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 71413577 71413589 71413582 Y NA FAM122A NA NA NA NA FAM122A 20613 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 71567236 71567601 71567286 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 80574 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 71784003 71784073 71784064 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 135828 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 72781786 72782158 72781853 Y NA NA NA NA NA NA SMC5 89779 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 72837972 72838313 72838181 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 33624 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 73025378 73025559 73025525 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 1981 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 73701762 73702162 73701962 Y TRPM3 NA NA NA NA NA TRPM3 357658 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 73870587 73870996 73870794 Y NA NA TRPM3 IMR90 Hi-C 24141950 TRPM3 188824 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr9 74167536 74167704 74167695 Y NA RPL35AP21 NA NA NA NA RPL35AP21 34813 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 74511654 74511799 74511765 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 12627 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 80422497 80422534 80422513 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 221840 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 85378567 85378941 85378719 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 297151 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 86239584 86239974 86239757 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 80535 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 88346951 88347024 88346988 Y NA AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 7920 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 89129986 89130251 89130119 Y NA NA GAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 162617 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr9 91998036 91998395 91998345 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 66615 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 93862627 93863018 93862659 Y SYK,SYK,NFIL3 NA AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 259177 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA AUH 146794 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 96057493 96057765 96057581 Y ZNF484,ZNF484,C9orf129,WNK2 NA NA NA NA NA FAM120A 154239 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 96723182 96723238 96723197 Y NA BARX1 BARX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BARX1 7528 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr9 97622499 97622697 97622598 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 135516 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 97624826 97625112 97624969 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 137843 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 97881296 97881429 97881363 Y FBP1 NA NA NA NA NA FANCC 196562 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 97893656 97893882 97893768 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 184109 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 97966859 97967268 97967183 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 110723 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 97968410 97968794 97968763 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 109197 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 97969652 97969878 97969805 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 108113 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.46005584938181 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr9 98533985 98534279 98534014 Y NA NA LOC158435,C9orf102,FANCC,LINC00476,LINC00092 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 101980 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 98642406 98642593 98642483 Y PTCH1,PTCH1,C9orf102 LINC00476 NA NA NA NA LINC00476 6147 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 99535821 99536158 99535990 Y NA ZNF510 NA NA NA NA ZNF510 2253 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 102580616 102580992 102580865 Y NA RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA RP11-554F20.1 445 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 102646895 102646933 102646914 Y NA STX17 NA NA NA NA STX17 19982 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 NIPSNAP3A 222541 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 108621964 108622364 108622354 Y NA NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 167139 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 111034300 111034792 111034481 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-220D10.1 352321 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 111872786 111872983 111872905 Y NA NA NA NA NA NA CTNNAL1 98977 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 113202507 113202544 113202523 Y NA NA NA NA NA NA TXN 185587 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 113646742 113646840 113646791 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 152141 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 114721832 114722310 114722097 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 64786 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 114732038 114732216 114732127 Y NA NA UGCG,MIR3134,SUSD1 IMR90 Hi-C 24141950 UGCG 74992 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.29437347759999 chr9 114805021 114805139 114805071 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 130549 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 115031676 115032066 115031959 Y KIAA1958 NA NA NA NA NA PTBP3 61881 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 115523438 115523763 115523601 Y ZFP37 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA SNX30 12320 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 115657106 115657497 115657253 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA ZNF883 115010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478870 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 119018286 119018486 119018325 Y PAPPA NA NA NA NA NA PAPPA 104203 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 120162627 120162904 120162792 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 715046 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 11.471867388 chr9 120175638 120175763 120175745 Y ASTN2 NA NA NA NA NA TRIM32 728057 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 1075775 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 123640419 123640826 123640772 Y NA PSMD5,PHF19 NA NA NA NA PHF19 2813 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 124034360 124034626 124034492 Y GSN NA NA NA NA NA RAB14 51068 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA DAB2IP 171885 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 126116431 126116619 126116525 Y NA NA NA NA NA NA CRB2 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 126138103 126138404 126138241 Y NA CRB2 NA NA NA NA CRB2 21654 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 2.50295288465454 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA CRB2 180622 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 126448761 126449170 126449003 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 241261 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 126468286 126468378 126468332 Y STRBP,STRBP NA NA NA NA NA DENND1A 222053 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 127155102 127155374 127155331 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 20349 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 3.33727051287271 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 129285503 129285639 129285571 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 279646 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 130373507 130373780 130373645 Y GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1 FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA STXBP1 963 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 131929021 131929365 131929193 Y NA IER5L NA NA NA NA IER5L 9175 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-65J3.1 83347 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr9 132598761 132599163 132598839 Y NA TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78 NA NA NA NA C9orf78 2619 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 30920 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.25147644232727 chr9 134600757 134600889 134600837 Y RAPGEF1,NTNG2 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 12572 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 134608249 134608835 134608704 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 4626 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 136226163 136226469 136226316 Y NA SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96 NA NA NA NA SURF1 4611 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 136282042 136282102 136282072 Y NA SURF4,C9orf96,REXO4 NA NA NA NA REXO4 878 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 136688455 136688774 136688542 Y RPL7A,SLC2A6 NA NA NA NA NA SARDH 85378 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 136779643 136779949 136779796 Y NA NA NA NA NA NA VAV2 75777 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 511318 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chr9 137739401 137739789 137739783 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 532457 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chr9 138233554 138233668 138233594 Y NA NA OLFM1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R26 135257 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 138886133 138886389 138886266 Y NA UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 34907 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 139024359 139024752 139024554 Y NA NACC2,C9orf69 C9orf69 MCF7 ChIA-PET 22265404 C9orf69 15628 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 139223291 139223329 139223306 Y NA GPSM1,DNLZ,CARD9 NA NA NA NA GPSM1 3359 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 14.3919790867636 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chr9 140618604 140618831 140618749 Y NA NA NA NA NA NA EHMT1 107160 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 1524384 1524716 1524554 Y CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL SLC25A6,ASMTL NA NA NA NA SLC25A6 14767 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 2626782 2627186 2626915 Y ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99 CD99 NA NA NA NA CD99 19562 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 7901438 7901508 7901476 Y NA PNPLA4 NA NA NA NA PNPLA4 7658 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM2 51107 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 14584256 14584543 14584400 Y NA NA NA NA NA NA FANCB 304648 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 15871584 15871957 15871763 Y CA5B,ZRSR2,AP1S2 AP1S2 ZRSR2 K562 ChIA-PET 22265404 AP1S2 530 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 16176605 16176961 16176614 Y GRPR GRPR,RPL6P30 NA NA NA NA GRPR 36926 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 18445170 18445478 18445437 Y NA CDKL5 NA NA NA NA CDKL5 3467 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 PPEF1 NA NA NA NA PPEF1 1075 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA NA NA NA NA NA MAP7D2 239597 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 20628422 20628647 20628433 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 344899 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 23448720 23448865 23448793 Y NA NA NA NA NA NA PRDX4 231514 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 24187705 24188069 24187889 Y NA ZFX,ZFX-AS1 NA NA NA NA ZFX-AS1 21934 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 27121185 27121461 27121323 Y NA NA NA NA NA NA RP11-268G12.1 293653 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 29699916 29700254 29699978 Y NA NA NA NA NA NA GK 969222 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 30676806 30676985 30676878 Y CXorf21,GK GK NA NA NA NA GK 7330 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 32685890 32685903 32685897 Y NA NA NA NA NA NA TBCAP1 371609 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 39963356 39963613 39963579 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 70969 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 39963931 39964200 39963990 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 70382 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 39964528 39964690 39964611 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 69892 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 41308972 41309137 41309059 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 118321 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 42588439 42588616 42588528 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P4 632013 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 43579100 43579475 43579156 Y NA NA NA NA NA NA MAOA 65633 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA EFHC2 311830 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 44834978 44835378 44835063 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 104221 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 46487332 46487848 46487692 Y RP2,ZNF674,CHST7 NA NA NA NA NA CHST7 56113 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 47221453 47221809 47221639 Y USP11,ZNF81,SYN1 NA UBA1,USP11 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF41 118536 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 48571549 48571765 48571661 Y NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19604 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 48571837 48572283 48571996 Y TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1 SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19892 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 49011448 49011844 49011738 Y GATA1,HDAC6,MAGIX GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 14429 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 53172968 53173150 53172985 Y NA NA NA NA NA NA LINC01155 51641 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA KLF8 NA NA NA NA KLF8 12989 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 63554308 63554471 63554461 Y MTMR8 NA NA NA NA NA MTMR8 58862 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA NA NA NA NA NA SERBP1P1 95080 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 68851851 68852116 68851941 Y PJA1,EDA EDA NA NA NA NA EDA 17940 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.834317628218178 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA RPS4X 140764 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 73236075 73236382 73236224 Y CHIC1 RP13-36G14.3 NA NA NA NA RP13-36G14.3 47536 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 73510244 73510542 73510484 Y RLIM FTX NA NA NA NA FTX 867 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 73833460 73833840 73833652 Y NA RLIM NA NA NA NA RLIM 1008 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 74143243 74143469 74143354 Y KIAA2022 NA NA NA NA NA ABCB7 231098 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 74259170 74259182 74259176 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 115385 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 74370869 74370931 74370900 Y NA ABCB7 NA NA NA NA ABCB7 3636 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 75368142 75368530 75368366 Y NA NA NA NA NA NA LDHBP2 185714 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 79918713 79919107 79919058 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 144080 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 84475648 84475726 84475688 Y NA ZNF711 NA NA NA NA ZNF711 21271 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 99672872 99672953 99672909 Y NA PCDH19 NA NA NA NA PCDH19 9601 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.625738221163634 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA NA NA NA NA NA ARMCX6 77437 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 102063503 102063615 102063509 Y NA NA NA NA NA NA BHLHB9 89887 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 102880714 102880758 102880737 Y PLP1,PLP1 TCEAL3,TCEAL1 NA NA NA NA TCEAL1 874 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 7.50885865396361 chrX 106922076 106922520 106922399 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 IMR90 Hi-C 24141950 PRPS1 52339 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 106928255 106928525 106928381 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 58518 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 116850069 116850456 116850264 Y NA NA NA NA NA NA KLHL13 398847 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 117499894 117500112 117500003 Y NA WDR44 NA NA NA NA WDR44 21858 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 117635665 117635786 117635726 Y DOCK11 DOCK11 NA NA NA NA DOCK11 7804 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 117832906 117833107 117833025 Y DOCK11,LONRF3,IL13RA1 IL13RA1 NA NA NA NA IL13RA1 26428 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.8772146634909 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 129065451 129065820 129065554 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 27354 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 129982936 129983220 129983074 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 51988 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.417158814109089 chrX 130952432 130952771 130952603 Y NA NA NA NA NA NA MST4 202522 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 131159301 131159695 131159439 Y RAP2C,MBNL3,MST4,MST4 MST4 NA NA NA NA MST4 4008 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272 chrX 131909453 131909652 131909573 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST2 183771 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 134048475 134048529 134048502 Y MOSPD1 MOSPD1 NA NA NA NA MOSPD1 1178 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 138929859 138929869 138929864 Y CXorf66 NA NA NA NA NA ATP11C 95566 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 149865562 149865927 149865671 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 6127 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA NSDHL 129860 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 152648727 152649001 152648990 Y SLC6A8,ZNF275 NA NA NA NA NA ZNF275 51114 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 0.208579407054545 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE COLO-320 hg19 FANTOM5 1.04289703527272