chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr1	1005293	1005547	1005421	Y	HES4	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	1098630	1098901	1098641	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	48889	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1124600	1124942	1124659	Y	HES4	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	40469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	SDF4,B3GALT6,UBE2J2,SCNN1D	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	2230678	2230895	2230769	Y	SKI,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	88519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	138833	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	51771	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.14034391841354
chr1	7947650	7947935	7947793	Y	TNFRSF9	NA	CAMTA1,VAMP3,PER3,UTS2,TNFRSF9	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF9	50991	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	52933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	73049	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	113720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	8724042	8724475	8724233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	151227	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	8849339	8849636	8849462	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	26066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	8953388	8953557	8953428	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	16080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	9179840	9180024	9179949	Y	NA	GPR157	NA	NA	NA	NA	GPR157	7205	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	9840833	9841244	9840865	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	41340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	9889535	9889880	9889709	Y	KIF1B	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	6951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	11050864	11051128	11051022	Y	NA	TARDBP	C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	TARDBP	19286	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	11122928	11123178	11122962	Y	NA	SRM,EXOSC10	NA	NA	NA	NA	SRM	4847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	12046023	12046196	12046108	Y	FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2	MFN2,MIIP	NA	NA	NA	NA	MFN2	7785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	94725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	12614115	12614248	12614183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	61489	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	15059594	15059681	15059648	Y	KAZN	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	136394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	15416988	15417263	15417153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	59765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	15585949	15586132	15586039	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1	FHAD1	NA	NA	NA	NA	FHAD1	14181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	15623648	15623823	15623707	Y	PLEKHM2,EFHD2,TMEM51,TMEM51	NA	EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	FHAD1	51880	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	15666999	15667145	15667070	Y	NA	NA	CTRC,EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	67246	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	16007283	16007579	16007390	Y	FHAD1,EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,PLEKHM2	PLEKHM2	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	1248	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	5685	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	16209325	16209770	16209445	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	36683	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	16227810	16227873	16227842	Y	C1orf64,SPEN	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	55168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	38733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	16553276	16553594	16553536	Y	NA	RSG1	NA	NA	NA	NA	RSG1	8063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MFAP2	73626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	MFAP2	64547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.33066779225679
chr1	17518941	17519138	17519054	Y	ATP13A2,PADI3	NA	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI3	54455	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	17578205	17578469	17578334	Y	NA	PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	4612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	10.087165313692
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	19271920	19272097	19272021	Y	NA	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	9083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	19324821	19325090	19324988	Y	TAS1R2,IFFO2	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2,UBR4	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	43641	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr1	19360402	19360809	19360663	Y	IFFO2	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	79222	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	19926811	19926972	19926927	Y	TMCO4	MINOS1,RPS14P3,NBL1	NA	NA	NA	NA	MINOS1	5334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.80487815221898
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	21724067	21724372	21724186	Y	NA	NBPF3	ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48	IMR90	Hi-C	24141950	NBPF3	40249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	22260274	22260656	22260512	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	1134	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	23123668	23124069	23123697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	88336	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.75969617072705
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	24519628	24519970	24519647	Y	GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	52017	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	24680333	24680598	24680466	Y	NA	GRHL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	36521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	24712127	24712358	24712257	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	27926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	24968619	24968979	24968799	Y	RUNX3,SRRM1	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	12412	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	25095502	25095845	25095665	Y	NA	CLIC4	NA	NA	NA	NA	CLIC4	25654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	25273584	25273924	25273754	Y	NA	RUNX3	CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	15688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2,RPS6KA1	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS6KA1	26383	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	27185457	27185720	27185644	Y	C1orf172,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	1913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	27519342	27519481	27519412	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A1	27870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27891553	27891803	27891694	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	37139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	28776524	28777127	28776532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCC1	53328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	31231730	31232072	31231886	Y	NA	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	3063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	88475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	SNRNP40	29711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	31944306	31944695	31944578	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63894	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	RP11-73M7.1,TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	23584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	32263216	32263220	32263219	Y	NA	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	SPOCD1	16432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	32715599	32716062	32715681	Y	PTP4A2,BSDC1,LCK,LCK	IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,HDAC1	NA	NA	NA	NA	MTMR9LP	10378	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1522	22973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21088	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr1	36877889	36878288	36878089	Y	NA	STK40,LSM10,OSCP1,MRPS15	NA	NA	NA	NA	LSM10	16396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	37721552	37721986	37721683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01137	216026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	38495782	38495936	38495884	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L	NA	NA	NA	NA	UTP11L	22852	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	39598673	39599090	39598722	Y	MACF1	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53685	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	39657786	39658129	39657912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	112798	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.18872454919732
chr1	41178788	41178979	41178866	Y	ZMPSTE24,SMAP2,SMAP2,ZNF642,DEM1,ZNF684,CITED4,NFYC,NFYC	RIMS3,NFYC	KCNQ4	IMR90	Hi-C	24141950	NFYC	23468	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	41365158	41365531	41365407	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	39140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	302257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	42354251	42354647	42354385	Y	RIMKLA,HIVEP3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	144949	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	42385609	42385954	42385889	Y	FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	113642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	43400932	43401203	43401085	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	21327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44302297	44302456	44302338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	94536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr1	44331438	44331658	44331560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	65334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44354357	44354471	44354414	Y	SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13	ARTN	NA	NA	NA	NA	ARTN	42521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44378405	44378587	44378508	Y	CCDC24,B4GALT2,ARTN	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	ARTN	18405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	44380893	44381202	44381004	Y	SLC6A9,B4GALT2,ARTN	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	ARTN	15790	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	33.021192111803
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44950888	44951090	44950987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82022	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	44951424	44951733	44951502	Y	TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	45028023	45028056	45028040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM53	110171	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	45298718	45299070	45298894	Y	NA	PLK3,TCTEX1D4,RNU5E-6P	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	15049	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	46712372	46712767	46712489	Y	NSUN4	POMGNT1,RAD54L	NA	NA	NA	NA	RAD54L	1012	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	46793807	46793895	46793851	Y	NA	LRRC41,UQCRH,NSUN4	NSUN4	IMR90	Hi-C	24141950	NSUN4	9954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	48484635	48484856	48484695	Y	NA	NA	LOC388630	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-329A14.1	414783	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	51298202	51298577	51298390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	125358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	51809780	51810107	51809799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF11	109837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	51997947	51998232	51998197	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS15	14947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	54150852	54151742	54151620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	202665	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42,LDLRAD1	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	59049880	59049917	59049902	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	8714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	9073	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	59083966	59084335	59084186	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42800	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	59986893	59986899	59986896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	226583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	61415107	61415301	61415257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	86176	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	61549054	61549253	61549232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	220123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	62072423	62072573	62072509	Y	NA	NA	INADL	IMR90	Hi-C	24141950	TM2D1	116522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	62362299	62362490	62362395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	156150	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	64051806	64051915	64051861	Y	NA	PGM1,ITGB3BP	NA	NA	NA	NA	PGM1	5032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	67867795	67868154	67868057	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	25944	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	68657070	68657479	68657271	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	39324	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	68688308	68688621	68688465	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	8182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	LRRC7	NA	NA	NA	NA	LRRC7	14453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2-AS2	1204213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	75694572	75694736	75694622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	493300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	75972237	75972619	75972428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	215417	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	76080205	76080672	76080321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	107364	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	78350506	78350835	78350671	Y	FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	1363	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	78469106	78469287	78469191	Y	DNAJB4	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	26247	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	83506477	83506486	83506482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	818220	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	83530346	83530531	83530439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	794175	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	84289999	84290187	84290093	Y	TTLL7,SAMD13,SAMD13,PRKACB	RP11-475O6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	34519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	85244079	85244161	85244120	Y	NA	NA	GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	89593	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	85328527	85328795	85328739	Y	BCL10	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	28101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	85843881	85844049	85844014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	103108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	86805161	86805335	86805245	Y	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	NA	ODF2L	54688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	87166281	87166485	87166383	Y	NA	SH3GLB1	CLCA1,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	1774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	87171187	87171726	87171422	Y	SH3GLB1	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	2928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	87203929	87204214	87204072	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	35670	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	88292387	88292883	88292561	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	500236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	89112806	89113177	89112978	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	34728	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.04518198149192
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	42826	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.37904842304056
chr1	92947789	92948106	92947980	Y	GFI1,GFI1	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	2327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	93032261	93032386	93032324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	81828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	93414710	93414781	93414746	Y	NA	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	10276	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	112754	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	92882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	7.23230720604332
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	71480	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94169341	94169462	94169391	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69538	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94169670	94169961	94169880	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69039	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94234014	94234407	94234233	Y	NA	RP11-488P3.1	BCAR3,FNBP1L,LOC100129046	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	4593	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94371317	94371601	94371445	Y	NA	DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	GCLM	1365	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94937052	94937396	94937225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCD3	55119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	94991460	94991992	94991709	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	13364	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	94992236	94992413	94992325	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	12943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	RP11-86H7.7	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	26074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	95179307	95179605	95179478	Y	F3	NA	F3,ABCD3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	91567	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	95258204	95258621	95258355	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,LOC729970	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	25216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	95263833	95264301	95264195	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	19536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	95645260	95645496	95645354	Y	RWDD3,TMEM56,TMEM56-RWDD3	NA	NA	NA	NA	NA	RWDD3	52215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	97549999	97550397	97550198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	364778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	97949201	97949316	97949277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	59941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	98512823	98513144	98512962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	128218	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	67841	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	100113534	100114036	100113879	Y	AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	4035	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	100138994	100139323	100139068	Y	NA	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	29495	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	100169951	100170218	100170031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	59969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	100859089	100859486	100859291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL2	156983	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	101230885	101231097	101230991	Y	NA	NA	CDC14A	IMR90	Hi-C	24141950	EXTL2	128457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	108122481	108123055	108122789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	525214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	108143362	108143805	108143489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	546095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	108199393	108199592	108199493	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	541879	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	108231996	108232161	108232053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	509310	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	108650339	108650754	108650436	Y	FAM102B,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	90717	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	109515208	109515609	109515409	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	CLCC1	11097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	109693905	109693990	109693948	Y	AKNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	SCARNA2	53090	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	109788948	109789150	109789063	Y	GSTM3	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	1491	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	115700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr1	110363861	110364229	110364029	Y	GNAI3,AMPD2	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CSF1	86635	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	110879130	110879445	110879277	Y	CSF1	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	2	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	4371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	111758440	111759106	111758811	Y	CD53,RAP1A,CEPT1,DENND2D,CHI3L2	NA	WDR77,OVGP1,C1orf88	IMR90	Hi-C	24141950	DRAM2	77602	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	112276731	112276883	112276807	Y	C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183	DDX20,FAM212B	NA	NA	NA	NA	DDX20	18984	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	112438367	112438956	112438733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141921	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	113046545	113046667	113046606	Y	WNT2B	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	109742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	113525578	113525919	113525789	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC16A1	27943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	113734243	113734639	113734494	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	114258659	114258989	114258824	Y	NA	PHTF1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	41122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	115046601	115046805	115046703	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	4976	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	115296637	115296935	115296808	Y	NA	NRAS,CSDE1,SIKE1	NA	NA	NA	NA	CSDE1	2362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	115713702	115714032	115713976	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	SIKE1	392396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	116191587	116191760	116191750	Y	NA	VANGL1	NA	NA	NA	NA	VANGL1	9013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	116588429	116588746	116588471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	71310	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	117051576	117051921	117051802	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	59740	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	117074509	117074935	117074769	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	36726	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	117080047	117080432	117080232	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	31229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	117082797	117083071	117083005	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	28590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	117103380	117103518	117103480	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	8143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	117112460	117112738	117112567	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	117424835	117425013	117424940	Y	PTGFRN	PTGFRN	PTGFRN	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	25666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	117533270	117533527	117533328	Y	CD58,CD101	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-27K13.3	66585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	118678137	118678411	118678252	Y	NA	SPAG17	NA	NA	NA	NA	SPAG17	47435	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	119401140	119401399	119401296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX15	128780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr1	120147764	120147961	120147863	Y	HSD3B1	GAPDHP33,ZNF697	NA	NA	NA	NA	GAPDHP33	9962	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	120255895	120256325	120256050	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	55474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439A17.7	648739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	142536204	142536464	142536463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	1608344	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	15122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	50527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	145005016	145005394	145005195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	62344	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	145036432	145036531	145036463	Y	NA	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	37655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	145702718	145703106	145702912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF115	93682	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	62698	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	147012349	147012550	147012481	Y	NA	BCL9	ACP6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	1167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	NA	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNVU1-19	289129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	3037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	149989448	149989604	149989509	Y	NA	OTUD7B,VPS45	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	8823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	150510569	150510713	150510587	Y	NA	ECM1,LINC00568,ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL4	9171	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	151386066	151386146	151386106	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	PSMB4	16056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	151422102	151422465	151422287	Y	NA	POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	7476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	151943125	151943453	151943289	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	21413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	151945068	151945221	151945146	Y	TUFT1,S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	151949461	151949565	151949513	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	15301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	151952807	151953143	151952837	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	11723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	152025147	152025277	152025212	Y	NA	S100A11	THEM4,S100A11,TCHH,TCHHL1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	S100A11	6764	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	152137288	152137323	152137306	Y	CELF3,CELF3,CELF3,HRNR	RPTN	S100A11	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPTN	7584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	RPTN	NA	NA	NA	NA	RPTN	10675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	19.5081970689326
chr1	152198460	152198859	152198660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTN	68756	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	152878925	152879083	152878954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVL	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	153095466	153095607	153095484	Y	NA	SPRR2C	NA	NA	NA	NA	SPRR2C	15578	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	153285394	153285679	153285564	Y	NA	PGLYRP4	NA	NA	NA	NA	PGLYRP4	33637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	153525322	153525412	153525387	Y	PGLYRP3,S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A4	S100A6,S100A5,S100A4,S100A2	S100A4,S100A5	K562	ChIA-PET	22265404	S100A4	4710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A5,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A2,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	154391539	154392211	154392184	Y	GATAD2B,CRTC2,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	15870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	154395894	154396284	154395999	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	20225	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	154405619	154406249	154405788	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	154579303	154579782	154579555	Y	UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR	UBE2Q1,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	18693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	154997722	154998120	154997917	Y	NA	FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3	NA	NA	NA	NA	ADAM15	22922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MTX1,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MTX1	11531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	155568911	155569221	155569066	Y	ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676	IMR90	Hi-C	24141950	ASH1L	38313	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	156067665	156067930	156067834	Y	NA	UBQLN4,LAMTOR2,RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,MEX3A	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LMNA	17301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	156645551	156645913	156645806	Y	NES	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	NES	362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	159083627	159083815	159083767	Y	NA	AIM2	NA	NA	NA	NA	AIM2	31071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	159878004	159878104	159878054	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	10051	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	159914077	159914586	159914278	Y	NHLH1,VANGL2,IGSF9	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	160377718	160378261	160377994	Y	IGSF9	NA	NA	NA	NA	NA	COPA	66528	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.52099166610004
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	67039	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	10720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	160737478	160737714	160737604	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	30441	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr1	161356382	161356652	161356546	Y	FCRLB,ATF6,FCER1G,FCGR2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDHC	74335	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr1	161469487	161469783	161469607	Y	HSPA6,ATF6,FCER1G,FCGR2A	NA	FCGR2A	K562	ChIA-PET	22265404	SDHC	187440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	162511455	162511984	162511719	Y	UAP1,UHMK1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	17339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	164389251	164389388	164389267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	65247	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr1	164655011	164655383	164655197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	132190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	164686304	164686686	164686418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	163483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	164734934	164735098	164735029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	212113	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	164736884	164737252	164737025	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	214063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	165323712	165323885	165323804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST3	274213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	165635693	165636148	165635824	Y	NA	MGST3,ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	29952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	167035961	167036358	167035977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-277B15.1	93716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	167416859	167417570	167417161	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	103434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	167520671	167521013	167520898	Y	CREG1	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	167615681	167615774	167615728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL1	72655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	167630871	167631089	167630883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL1	57340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	169464285	169464545	169464529	Y	BLZF1,SLC19A2	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	AL021068.1	10905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	172150201	172150456	172150219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	260774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	173382392	173382663	173382522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	61742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	173816933	173817269	173817101	Y	NA	DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	NA	NA	NA	NA	ZBTB37	17951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	174220636	174220943	174220783	Y	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	94088	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	178758932	178759269	178759101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGPS2	66632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	179279883	179280253	179280030	Y	AXDND1,TOR3A,ABL2,SOAT1	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	18958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	180251899	180252130	180252121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	129930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	180554738	180554883	180554800	Y	MR1	XPR1	XPR1,ACBD6	IMR90	Hi-C	24141950	XPR1	44257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr1	180612177	180612184	180612181	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	13037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	181149230	181149365	181149283	Y	NA	NA	MR1,XPR1,KIAA1614,ACBD6,STX6,IER5	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	93592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	182056560	182056703	182056632	Y	NA	NA	TEDDM1,GLUL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	302638	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	183166871	183167293	183166889	Y	NA	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	13498	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	183171353	183171815	183171539	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	17980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	183178797	183178927	183178861	Y	NA	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	25424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	184603995	184604243	184604119	Y	RNF2,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	117804	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	184852237	184852590	184852311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	89092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	186892657	186892915	186892791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	96572	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	192500254	192500504	192500353	Y	RGS1	NA	UCHL5,RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	182809	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	91557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	195602290	195602557	195602425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	1016451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53	NA	NA	NA	NA	C1orf53	38520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	198625518	198626374	198625745	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	501425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	726145	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	198889384	198889935	198889528	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	765291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	779842	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	14415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	201244405	201244769	201244526	Y	PKP1	PKP1	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	PKP1	5811	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	201295169	201295564	201295367	Y	PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	44589	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	201366439	201366550	201366506	Y	PKP1,LAD1	LAD1	NA	NA	NA	NA	LAD1	186	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	201611388	201611697	201611489	Y	NA	NAV1	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	NAV1	20977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	201613135	201613506	201613321	Y	GPR37L1	NAV1	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAV1	22724	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	201618983	201619286	201619160	Y	NA	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28572	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	201768733	201769083	201768901	Y	NA	IPO9,IPO9-AS1	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	27186	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr1	204044571	204044810	204044641	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	4328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	204058173	204058362	204058281	Y	SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	17930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	204098794	204099127	204098964	Y	NA	ETNK2	NA	NA	NA	NA	ETNK2	20180	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	204254999	204255106	204255048	Y	PIK3C2B,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	123813	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	204976101	204976640	204976291	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP5	112503	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	205257253	205257766	205257562	Y	RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	31117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	205288770	205288915	205288818	Y	TMEM81,RBBP5,NUAK2	NA	NA	NA	NA	NA	NUAK2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	205410761	205411314	205411209	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	11768	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	205442172	205442546	205442359	Y	CNTN2,TMEM81	LEMD1,CDK18	KLHDC8A,NUAK2,MIR135B,LOC284576,LEMD1,CDK18	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD1	19090	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	206748926	206749451	206749084	Y	IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	34453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	206751685	206751882	206751743	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	32022	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	206807155	206807335	206807245	Y	NA	EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	DYRK3	274	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	206879935	206880172	206880039	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	23646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	206918122	206918360	206918230	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	61833	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	207203424	207203586	207203506	Y	C1orf116	C1orf116,PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	C1orf116	515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	YOD1	41414	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	207489914	207490291	207489981	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	CD55,YOD1,PFKFB2,CR2,CR1	IMR90	Hi-C	24141950	CD55	2562	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	208314292	208314663	208314422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	101002	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	208412497	208412696	208412591	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209556903	209557123	209556922	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	43042	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209557331	209557442	209557421	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	42723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209562668	209562976	209562782	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	37189	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	27808	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	21346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	209589374	209589797	209589586	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR205HG	10368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	209590107	209590333	209590233	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR205HG	9832	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	209591220	209591436	209591361	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR205HG	8729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	209600780	209600928	209600808	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	615	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	209601291	209601611	209601405	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	1126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	10.087165313692
chr1	209606620	209606963	209606837	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	6455	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209783856	209783983	209783869	Y	NA	RP1-272L16.1,CAMK1G,LAMB3	NA	NA	NA	NA	CAMK1G	28794	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209798058	209798744	209798639	Y	NA	CAMK1G,LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	25067	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	209806744	209806957	209806914	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	16854	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	209822403	209823008	209822758	Y	TRAF3IP3,G0S2,LAMB3	LAMB3	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	803	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209827285	209827712	209827546	Y	LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	3474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	209829183	209829498	209829302	Y	IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	5372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr1	209831470	209831550	209831510	Y	TRAF3IP3,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	7659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209930913	209931012	209930979	Y	G0S2,TRAF3IP3	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	24892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209934463	209934573	209934515	Y	LAMB3,G0S2	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	21331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209938931	209939742	209939534	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3,C1orf74	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	16162	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	209989263	209989693	209989489	Y	LOC642587,LAMB3,LAMB3,IRF6	C1orf74,IRF6,DIEXF	DIEXF,TRAF3IP3	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DIEXF	9659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	210058060	210058292	210058164	Y	LAMB3	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	58708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	212923712	212923837	212923822	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	39287	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	534812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	220359525	220359939	220359742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	64973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	220671702	220671851	220671777	Y	MARK1	MARK1	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	MARK1	27717	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	90545	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	221887766	221888016	221887890	Y	DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	25502	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	221913881	221914483	221914426	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	363	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.9500200445703
chr1	222142763	222142919	222142838	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	229245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	222502119	222502129	222502124	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	HHIPL2	217316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	222593417	222593447	222593433	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	HHIPL2	125998	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	223471564	223471629	223471608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD4	63915	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	223904365	223904567	223904454	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	17070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	223907308	223907681	223907376	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	20013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	224019430	224020596	224019827	Y	FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	11078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	6.37584977374871
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	167175	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	225778250	225778416	225778333	Y	ENAH	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	60428	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	226288544	226288864	226288784	Y	C1orf55,H3F3A	H3F3A	C1orf55,H3F3A,ACBD3	IMR90	Hi-C	24141950	H3F3A	40992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	226430284	226430401	226430343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	57853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr1	228124828	228124930	228124870	Y	ARF1,ARF1	WNT9A	NA	NA	NA	NA	WNT9A	8669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	228686214	228686407	228686300	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	13452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	109840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	110504	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	111200	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	167718	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	229546837	229547142	229546975	Y	C1orf96,ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	94961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	231036878	231036937	231036909	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	33543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	231720748	231721061	231720886	Y	TSNAX	NA	NA	NA	NA	NA	TSNAX	58349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	234534667	234535013	234534780	Y	NA	RP5-827C21.2,RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	27328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234721506	234721689	234721614	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	21582	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	234757412	234757805	234757606	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	LOC100506810	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IRF2BP2	14141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234767593	234767925	234767750	Y	TARBP1	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	12110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.043582656846
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	13899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	234891292	234891478	234891345	Y	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	111257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	235068890	235069050	235068971	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-443B7.3	45501	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	7398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	18463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	19535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	235242792	235242999	235242934	Y	NA	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	235486836	235487237	235487205	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	1428	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	236026992	236027471	236027217	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	17469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	236083263	236083651	236083332	Y	GPR137B	LYST	LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	38323	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	24.8372655365435
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	241392345	241392701	241392526	Y	RGS7,KMO	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	232251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	NA	NA	NA	NA	NA	OPN3	66462	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.75969617072705
chr1	243893800	243893985	243893919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	118396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.8064774768649
chr1	243995795	243995860	243995825	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	16521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	245255337	245255432	245255385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	60855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	245563795	245563810	245563803	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	247508	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	246316735	246316955	246316845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	246323685	246324051	246324002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	344563	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	246730569	246731007	246730621	Y	AHCTF1,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	2823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr1	246743297	246743408	246743371	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	15551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.04518198149192
chr1	249099326	249099454	249099407	Y	NA	SH3BP5L,ZNF672	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	19378	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	384217	384634	384602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	205812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	3123873	3124204	3123982	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	17348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	3808656	3808872	3808754	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	16601	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	3845999	3846426	3846282	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	20526	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	4289203	4289519	4289251	Y	NA	LINC00702	KLF6,LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	5099	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr10	5353665	5354015	5353799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	98499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	5504427	5504665	5504478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	51913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	CALML3	33591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr10	5553514	5553674	5553594	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5	FAM208B,NET1,CALML3,CALML5	IMR90	Hi-C	24141950	CALML3	11250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	11794	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	23176	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	24305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr10	5590507	5590769	5590638	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	24802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	25254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	5593718	5593999	5593816	Y	NET1,CALML3	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6	NET1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-116G8.5	28013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr10	5596279	5596669	5596478	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6	NET1,ASB13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-116G8.5	30574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	5606066	5606314	5606283	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6,RP11-336A10.5	NET1,CALML5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP13-463N16.6	29767	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr10	5607602	5608000	5607781	Y	CALML3	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6,RP11-336A10.5	NET1,CALML5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP13-463N16.6	28081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	5608647	5608913	5608759	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6,RP11-336A10.5,RP11-336A10.4	NET1,CALML5	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-463N16.6	27168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6,RP11-336A10.5,RP11-336A10.4	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP13-463N16.6	2782	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	7902237	7902611	7902424	Y	NA	TAF3	NA	NA	NA	NA	TAF3	43770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	ECHDC3	84537	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	135463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	141749	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	13692317	13692641	13692563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	65390	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	13785282	13785678	13785616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	158355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	13812005	13812243	13812123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	185078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	14215783	14216000	14215795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	286141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	15179834	15179919	15179877	Y	NA	RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	28773	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	15250389	15250538	15250457	Y	MEIG1,OLAH	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	41697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	15300658	15300993	15300826	Y	ACBD7,FAM171A1	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	91966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	16548527	16548808	16548668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTER	71585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	21333319	21333508	21333415	Y	NEBL,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	127608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	22053811	22054026	22053942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	166046	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	22726811	22727194	22727116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	118671	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	22817226	22817294	22817260	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	184190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	22887940	22888243	22888209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	113241	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	22907073	22907416	22907362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	94068	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	22972039	22972536	22972328	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	28948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	23737770	23738059	23737888	Y	OTUD1	OTUD1	NA	NA	NA	NA	OTUD1	11572	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	24754185	24754590	24754306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	256007	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	25117521	25117545	25117533	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	106924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	25190845	25191315	25190947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENKUR	111774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	25348919	25349256	25349121	Y	NA	ENKUR,THNSL1	ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THNSL1	45332	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	25357102	25357468	25357353	Y	NA	NA	ARHGAP21	IMR90	Hi-C	24141950	THNSL1	53515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	26191189	26191209	26191199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	793379	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	209028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	27130056	27130389	27130223	Y	NA	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	17627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	27608918	27609295	27609159	Y	ABI1,MASTL,ACBD5	NA	PDSS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ACBD5	79859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	29766430	29766710	29766570	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	70099	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	30092989	30093361	30093263	Y	SVIL	NA	SVIL,KIAA1462,MIR604	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	69279	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	30736122	30736481	30736327	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	15256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	32301568	32301771	32301670	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	41588	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32579146	32579267	32579207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	86459	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32607439	32608014	32607606	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	57712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32611846	32612286	32612204	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	53440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32639699	32640002	32639940	Y	NA	EPC1	EPC1,C10orf68	IMR90	Hi-C	24141950	EPC1	25724	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32668626	32668988	32668673	Y	EPC1,C10orf68	EPC1	EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	EPC1	2900	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	33415190	33415378	33415349	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	122470	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	34421241	34421398	34421321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	529631	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	34924725	34924738	34924731	Y	NA	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	26291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	35059349	35059608	35059479	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	42645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	35195075	35195256	35195166	Y	NA	SS18L2P1	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	32937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	37778060	37778402	37778231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-162G10.1	329508	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	38149659	38150080	38149945	Y	ZNF248	RP11-162G10.1,RP11-162G10.5,ZNF248	NA	NA	NA	NA	ZNF248	4625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	38418230	38418599	38418292	Y	NA	ZNF37A	NA	NA	NA	NA	ZNF37A	36966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	43782816	43783033	43782934	Y	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	119581	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	43936251	43936518	43936384	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	22065	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	44973584	44973727	44973656	Y	NA	NA	TMEM72-AS1,ZNF32-AS3	IMR90	Hi-C	24141950	RASSF4	479128	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	45439361	45439737	45439549	Y	NA	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	13118	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	45453721	45453921	45453864	Y	ALOX5	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	45464299	45464380	45464314	Y	ZNF22,C10orf25	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	7878	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	111136	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	160094	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	168349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.42582972917841
chr10	48482238	48482583	48482338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF488	129214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	49598208	49598504	49598305	Y	NA	NA	MAPK8,ARHGAP22	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	85510	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	49745028	49745223	49745126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	232330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	ASAH2,DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr10	52058471	52058580	52058526	Y	NA	DYNC1I2P1	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	35733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	52081951	52082279	52082036	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	52085013	52085461	52085351	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	62275	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr10	52154516	52154956	52154688	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	131778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	52217733	52218081	52217894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	164842	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	52300578	52300747	52300601	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	82176	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	54208151	54208375	54208306	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	19918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	54211545	54211936	54211751	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	16357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54224630	54224737	54224684	Y	NA	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-346D6.6	3556	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	18264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr10	54293866	54294084	54293893	Y	DKK1	NA	LOC100506939,DKK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-346D6.6	65573	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	54314755	54315032	54314894	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-346D6.6	86462	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	54317967	54318032	54318000	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-346D6.6	89674	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	54329490	54329893	54329885	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	101197	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54367095	54367120	54367106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	138802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.66293490915951
chr10	54412187	54412602	54412476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	183894	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54434489	54434618	54434547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	206196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54438333	54438755	54438445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	210040	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	54454130	54454506	54454318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	225837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54461546	54461786	54461617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	233253	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	54463812	54464030	54463937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	235519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr10	54471417	54471775	54471523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	243124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	54484465	54484478	54484473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	256172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	54737961	54738286	54738123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	509668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	55377812	55377822	55377817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	1149519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	61580750	61581126	61580938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	83288	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	61664562	61664999	61664893	Y	CCDC6	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	148	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	62140958	62141228	62141093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	394861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	62174641	62174784	62174750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	361305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	62674070	62674082	62674076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB1	85116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	63747685	63748213	63747937	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	88626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	63778860	63779091	63779011	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	119801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	98071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	69582490	69582752	69582621	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	13172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	69856894	69857171	69856968	Y	NA	HERC4	MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	23789	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	70805220	70805884	70805439	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	NA	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	58733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,HKDC1,RP11-227H15.4	NA	NA	NA	NA	HKDC1	627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HK1	81364	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	71145067	71145367	71145287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	63862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	71228522	71228843	71228683	Y	NA	TSPAN15	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	19293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	71283312	71283690	71283502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	74083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	71386629	71386882	71386756	Y	NA	C10orf35	NA	NA	NA	NA	C10orf35	1125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	73528339	73528873	73528813	Y	CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	2382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	73649387	73649415	73649393	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSAP	40261	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	73735695	73736076	73735808	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	13572	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	73887320	73887439	73887380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-570G20.1	60260	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	73954988	73955333	73955161	Y	NA	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	RP11-570G20.1	7289	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74078612	74078870	74078849	Y	PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	34118	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	74081865	74082262	74082021	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30726	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74082335	74082540	74082412	Y	DDIT4	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30448	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74086996	74087315	74087159	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	25673	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74091361	74091474	74091418	Y	SPOCK2,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	21514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	74327257	74327510	74327437	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	56389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	74877758	74878048	74877901	Y	NA	P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	NUDT13	9541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	75179357	75179732	75179545	Y	ZMYND17	ANXA7,RP11-345K20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	722	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr10	75653245	75653472	75653359	Y	NA	CAMK2G	NA	NA	NA	NA	CAMK2G	20902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	75654322	75654573	75654437	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G	NA	NA	NA	NA	CAMK2G	21979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	76053029	76053199	76053114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	144069	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	77022416	77022492	77022443	Y	NA	COMTD1,HMGA1P5	COMTD1,ZNF503-AS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HMGA1P5	11912	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	77155629	77155954	77155896	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	3710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	77189888	77190112	77189953	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	30224	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr10	78271231	78271613	78271422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	1111567	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	146007	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr10	79979357	79979662	79979507	Y	NA	NA	RPS24,ZMIZ1,LOC283050,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	187839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.75969617072705
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	80897644	80897901	80897807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	70852	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	80908110	80909032	80908408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	81318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	80918312	80918688	80918452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	81028676	81029041	81028720	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	76184	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	81088418	81088982	81088641	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	16243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	46720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	83724255	83724618	83724338	Y	NRG3,NRG3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	1512333	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	84112610	84112657	84112652	Y	NRG3,NRG3	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	1726528	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPAL	274790	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	89735979	89736206	89736070	Y	PTEN	RP11-380G5.3	NA	NA	NA	NA	RP11-380G5.3	32720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	89802399	89802689	89802412	Y	NA	NA	RNLS,CFL1P1,ATAD1,KLLN,PTEN,LIPF,LIPM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	99140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	90597409	90597808	90597517	Y	LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22	ANKRD22,STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	ANKRD22	11767	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	90753757	90754132	90754032	Y	NA	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	5343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	91010610	91010883	91010698	Y	NA	IFIT2	NA	NA	NA	NA	IFIT2	48829	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	91056885	91057091	91056998	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	2621	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	91189163	91189205	91189186	Y	SLC16A12	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	16820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	92373999	92374273	92374136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTR7	241398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	94001133	94001473	94001377	Y	CPEB3,CPEB3	CPEB3,MARCH5	NA	NA	NA	NA	CPEB3	47371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	94195534	94195885	94195710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDE	135948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.32906846761086
chr10	96282867	96283106	96282931	Y	TBC1D12	HELLS	NA	NA	NA	NA	HELLS	20441	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	97020432	97020603	97020519	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	28178	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	97038434	97038774	97038645	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	10007	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	97048077	97048324	97048201	Y	SORBS1	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	117342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	98507799	98508110	98507962	Y	LCOR,PIK3AP1	NA	PIK3AP1,SLIT1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL13AP5	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	99172845	99172912	99172879	Y	C10orf12,ZFYVE27,ZFYVE27,FRAT2	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	11005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	99173709	99174019	99173866	Y	FRAT1,ZFYVE27,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	101170653	101170798	101170732	Y	SLC25A28	GOT1,RP11-441O15.3	NA	NA	NA	NA	GOT1	17583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr10	101666342	101666477	101666411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	101199	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	101736797	101737134	101736959	Y	BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	30542	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	101744070	101744300	101744185	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	23376	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	101767938	101768201	101768028	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	262	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	102488726	102488983	102488821	Y	NA	NA	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM178A	181343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr10	102831127	102831150	102831139	Y	NA	PDZD7,SFXN3	NA	NA	NA	NA	SFXN3	42136	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	103514539	103514868	103514704	Y	NA	NPM3	NA	NA	NA	NA	NPM3	26302	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	103807032	103807259	103807146	Y	NA	C10orf76,HPS6	NA	NA	NA	NA	C10orf76	6691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	104102854	104103008	104102931	Y	ACTR1A	NFKB2	PSD,FBXL15,NFKB2	IMR90	Hi-C	24141950	NFKB2	48859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	104903006	104903392	104903228	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	47664	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	105530330	105530632	105530481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	145331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	143752	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	105610087	105610227	105610144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	65736	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	105611177	105611504	105611341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	64459	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	105630915	105631032	105630972	Y	GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	44931	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	105631960	105632231	105632145	Y	GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	43732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	105725440	105725838	105725745	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	SLK	481	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.0935626122757
chr10	105879871	105880258	105880137	Y	NA	COL17A1,SFR1	NA	NA	NA	NA	SFR1	55	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	106065321	106065564	106065443	Y	NA	MIR4482-1,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30598	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	106082205	106082621	106082398	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	13541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	106094943	106095283	106095247	Y	NA	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	879	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	109563158	109563160	109563159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	2118151	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	114707857	114707918	114707888	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	91	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.09196328762977
chr10	116163429	116163722	116163475	Y	AFAP1L2	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr10	118643126	118643297	118643273	Y	KIAA1598	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	35410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	119256221	119256343	119256282	Y	KIAA1598,KCNK18,EMX2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	123243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	120429091	120429309	120429186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM204A	329251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	120553145	120553353	120553220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	233875	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	120850460	120850786	120850708	Y	NA	EIF3A,FAM45A	EIF3A,PRDX3,SFXN4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM45A	10812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	121076325	121076636	121076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	139980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	121503034	121503182	121503110	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	94152	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	122918665	122919069	122918920	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	RP11-159H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	27428	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	123219385	123219723	123219573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	136249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	123494191	123494316	123494254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	138219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	123914446	123914761	123914722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167757	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64307	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	122137	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr10	125792973	125793185	125793048	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	58021	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	126330634	126331273	126330949	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	99565	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	126712433	126712623	126712473	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	108721	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	127472572	127472831	127472732	Y	NA	UROS,BCCIP	NA	NA	NA	NA	UROS	36986	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	127591696	127592016	127591824	Y	NA	DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	8588	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	127714877	127714997	127714888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	131769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	129786361	129786590	129786527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRE	83036	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	131644019	131644215	131644117	Y	EBF3	NA	NA	NA	NA	NA	EBF3	115890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	133763722	133764008	133763747	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	29427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.37744909839464
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	INPP5A	18146	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr10	135071993	135072118	135072056	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511	NA	NA	NA	NA	ZNF511	47861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27233	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM3,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM3	25304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM3,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	3583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	1863948	1864140	1864052	Y	IFITM10,TNNI2	SYT8	NA	NA	NA	NA	SYT8	17239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	1865419	1866172	1865684	Y	C11orf21,TNNI2,LSP1	SYT8	NA	NA	NA	NA	SYT8	18710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	1935889	1936214	1936052	Y	IGF2,KRTAP5-3,TNNI2,TNNI2,TNNT3	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	30294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	1936655	1937042	1936845	Y	TSSC4,TSPAN32,C11orf21,TNNI2,LSP1	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	29466	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	2200082	2200579	2200535	Y	SYT8,ASCL2,IGF2,TH	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P30	154427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	206017	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	2933631	2934118	2933874	Y	NA	SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	14567	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	3831146	3831197	3831172	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	14124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	7426320	7426390	7426356	Y	SYT9	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP2	106139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	7719377	7719648	7719531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP2	186848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	7733058	7733320	7733201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP2	200529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	219408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	225973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr11	10373965	10374241	10374089	Y	LYVE1,EIF4G2	ADM,AMPD3	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	46105	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	10510755	10511001	10510868	Y	ZBED5	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	17722	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	11430416	11430497	11430457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP47	430473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	13113120	13113298	13113209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-497E21.3	84414	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	13189363	13189539	13189451	Y	NA	NA	TEAD1,LOC100506305,ARNTL,RASSF10,BTBD10	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	106660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	13598009	13598366	13598274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAR1	89851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr11	15179085	15179582	15179334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	267287	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	15837558	15838109	15837858	Y	NA	NA	C11orf58	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf58	794570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	16357706	16357868	16357787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	274811	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	16819555	16819819	16819584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX6	60417	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	17307346	17307410	17307378	Y	NA	NA	B7H6	IMR90	Hi-C	24141950	NUCB2	79646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	12477	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT3	449652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	19968611	19968779	19968666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT3	438297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	20072115	20072502	20072253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT3	334574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	24953714	24954095	24953889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	2103869	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	242769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	27235010	27235184	27235094	Y	NA	NA	LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	148231	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	27350498	27350718	27350608	Y	BDNF	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	32697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	92616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	30510063	30510254	30510126	Y	FSHB,MPPED2,MPPED2	NA	NA	NA	NA	NA	MPPED2	96165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	31630096	31630156	31630127	Y	PAX6	NA	NA	NA	NA	NA	ELP4	100799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18089	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	34661390	34661585	34661450	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	20750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	EHF	66237	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	35297997	35298240	35298173	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	139580	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	35986660	35987036	35986965	Y	NA	LDLRAD3	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	23129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	36052486	36052576	36052531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	88955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	36331203	36331536	36331365	Y	PRR5L	COMMD9	NA	NA	NA	NA	COMMD9	22204	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	37809838	37809966	37809929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	1195787	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	120957	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	43952542	43952620	43952581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	52181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	124866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	45067583	45067753	45067679	Y	CD82	NA	SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	96743	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	45122042	45122442	45122242	Y	PRDM11	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	151202	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-430H10.1	172317	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.85485810764868
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	46058881	46059222	46059206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	81763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	46094625	46094954	46094790	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	46031	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	87257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	46379063	46379180	46379102	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	21126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	46385171	46385493	46385285	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	14813	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	46706691	46706778	46706735	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ARHGAP1	13387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	46753121	46753488	46753304	Y	F2	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	32753	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	48063635	48064268	48063917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	63522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	ZFP91	3013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	59034118	59034187	59034153	Y	OR4D6,OR4D10,OR5A1,OR4D9,OR10V1	NA	NA	NA	NA	NA	DTX4	97215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	60931528	60932206	60931841	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	4439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS1	NA	NA	NA	NA	TMEM258	6917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	43360	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.47261103531626
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	62324383	62324580	62324456	Y	WDR74,NXF1,EML3	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	2676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	63496405	63496421	63496415	Y	NAA40	RTN3,C11orf95	NA	NA	NA	NA	C11orf95	37692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	NAA40	NA	NA	NA	NA	NAA40	18352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr11	64205023	64205244	64205073	Y	CDC42BPG,RPS6KA4	NA	NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,PYGM	IMR90,K562,H1ESC,HELA,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	RPS6KA4	80403	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	64320859	64321220	64321040	Y	C11orf85	NA	SLC22A12,NRXN2	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KA4	196239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	64363562	64364093	64364079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SF1	180165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	64631898	64632818	64632128	Y	CDC42EP2,FAU,EHD1	CDC42BPG,EHD1,ATG2A	NA	NA	NA	NA	EHD1	20950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	64653025	64653383	64653280	Y	TIGD3,RASGRP2,PYGM,SF1,SF1,SF1,MAP4K2,EHD1,ATG2A	CDC42BPG,EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	64987523	64987676	64987600	Y	NA	CAPN1,POLA2	NA	NA	NA	NA	POLA2	39557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65184888	65185395	65184991	Y	FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	2850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	10.2774891875352
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	14950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65555605	65556077	65555902	Y	TSGA10IP,CATSPER1	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	3112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65559034	65559399	65559282	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	6541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65581703	65581968	65581801	Y	CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198	OVOL1,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	29210	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.71131553994328
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65894211	65894464	65894385	Y	NA	NA	RAB1B,KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	58377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65910089	65910568	65910423	Y	NA	NA	KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	74255	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	65949541	65949768	65949655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLC2	72997	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	21940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	66829661	66830298	66829741	Y	NA	RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	7372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	66844888	66845141	66844944	Y	RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	22599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	67032465	67032551	67032477	Y	NA	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	68110280	68110464	68110374	Y	NA	LRP5	PPP6R3	IMR90	Hi-C	24141950	LRP5	32203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	IFITM9P	127851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	166115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	69808413	69808546	69808480	Y	NA	NA	ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	FADD	238723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	69894907	69895080	69894991	Y	ANO1	NA	ANO1,FADD,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	FADD	152189	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	70005779	70006157	70005922	Y	ANO1,CTTN,PPFIA1,FADD	FADD	NA	NA	NA	NA	FADD	41112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	71749092	71749250	71749171	Y	NA	LRTOMT,NUMA1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	40132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	72431268	72431435	72431330	Y	FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	47633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr11	72906397	72906513	72906453	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT	IMR90,MCF7	Hi-C,3C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	P2RY2	20830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	73014768	73014913	73014905	Y	NA	P2RY6,ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	2421	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	75491254	75491442	75491286	Y	UVRAG,DGAT2	DGAT2,UVRAG	NA	NA	NA	NA	DGAT2	22697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr11	75920696	75920900	75920748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	143692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	76285451	76285730	76285592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf30	131484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	78426480	78426845	78426663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	142561	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	846126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr11	80411023	80411358	80411196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1987213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	82918019	82918384	82918270	Y	PCF11,ANKRD42	ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-727A23.1	3663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	282552	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	86452946	86453377	86453076	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	46724	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	86841159	86841223	86841164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	94273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	88153223	88153558	88153356	Y	NA	NA	GRM5	IMR90	Hi-C	24141950	CTSC	84268	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	88154831	88155112	88154926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	85876	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	92767972	92767992	92767983	Y	NA	NA	SLC36A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	161138	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	93343191	93343552	93343372	Y	NA	KIAA1731	NA	NA	NA	NA	KIAA1731	49253	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	94440479	94440817	94440610	Y	KDM4DL	AMOTL1	PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	2882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	94480491	94481212	94480556	Y	AMOTL1	AMOTL1	AMOTL1,PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	42894	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	RP11-712B9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	1085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	94886240	94886569	94886506	Y	CWC15,KDM4DL,SESN3,SRSF8	RP11-712B9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	4537	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	99462687	99463068	99462783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	1093316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	MMP10,MMP1,MMP3	NA	NA	NA	NA	MMP1	11473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	102753440	102753618	102753537	Y	NA	MMP3,MMP12	MMP3,LOC100288077	IMR90	Hi-C	24141950	MMP12	9676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	103281581	103281752	103281672	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	3196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	104579946	104579965	104579955	Y	NA	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CASP4	258198	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	107497100	107497238	107497124	Y	NA	ELMOD1	NA	NA	NA	NA	ELMOD1	37283	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	108679072	108679281	108679081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	145320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	108741188	108741366	108741295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	207436	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	111307551	111307700	111307641	Y	POU2AF1	NA	LAYN,C11orf53,C11orf92,LOC100132078,ALG9,FDX1,ARHGAP20	IMR90	Hi-C	24141950	SIK2	163415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	111402540	111402739	111402658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIK2	68376	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	112016607	112016779	112016693	Y	DIXDC1	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	16061	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	201112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	114162916	114163328	114163238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM7	105424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3,MPZL2	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46	NA	NA	NA	NA	IFT46	48483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT46	51423	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.28228716147302
chr11	118783640	118784096	118783954	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	119461410	119461749	119461531	Y	CBL	KRT8P7	LOC100499227,USP2,PVRL1,TRIM29,GRIK4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	11269	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	119562613	119562997	119562902	Y	TRIM29,PVRL1	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	34797	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	119595869	119596204	119596037	Y	NA	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	1590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	119598046	119598312	119598172	Y	USP2	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	120079363	120079802	120079708	Y	NA	TRIM29,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	120083069	120083545	120083438	Y	GRIK4,ARHGEF12,OAF	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	3594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	120512132	120512391	120512245	Y	NA	NA	GRIK4	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF12	306345	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr11	121293459	121293790	121293625	Y	NA	SORL1	SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	27122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	121493426	121493689	121493485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	172514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	122552605	122552791	122552717	Y	NA	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	28222	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	122956299	122956503	122956402	Y	NA	SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	24361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	122989373	122989577	122989478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	57435	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	123353850	123354009	123353930	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	SCN3B	169943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	123407861	123408201	123408031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	115751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	123414630	123415056	123414666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	108896	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	123519920	123520232	123520133	Y	OR8D4,SCN3B	SCN3B	NA	NA	NA	NA	SCN3B	3720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	124514246	124514548	124514258	Y	OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1,SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	TBRG1	23514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	124940571	124941111	124940841	Y	TBRG1,SLC37A2	SLC37A2,TMEM218	NA	NA	NA	NA	SLC37A2	9608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	125997963	125998111	125998066	Y	NA	NA	CDON	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	66733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	126029421	126029682	126029619	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	HYLS1,CDON	IMR90	Hi-C	24141950	FAM118B	49627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	126515042	126515485	126515173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	291507	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	128078462	128078679	128078487	Y	NA	NA	FLI1,ETS1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	376774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	128385518	128386026	128385881	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	69427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	35899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	128947199	128947514	128947458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53AIP1	136159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	129013172	129013631	129013445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	133588	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	129920821	129921218	129921018	Y	APLP2	TCEB2P2,APLP2	APLP2,PRDM10,NFRKB,LINC00167,ST14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APLP2	16514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	129993921	129994394	129994167	Y	PRDM10,APLP2	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	33063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr11	130016455	130016576	130016492	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	10881	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB44	209599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	130743628	130743895	130743754	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	40509	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr11	134509789	134510106	134509920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLB1L2	310021	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	GLB1L2	508318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	833741	833842	833785	Y	NA	WNK1	NINJ2,B4GALNT3,WNK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNK1	25917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	1024438	1024795	1024721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	72424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	293074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	1512706	1512846	1512771	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	188485	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	3313495	3313728	3313584	Y	NRIP2	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	5368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	3326549	3326840	3326665	Y	TSPAN9	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	7453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	4224292	4224419	4224354	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf5	203952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	4252128	4252433	4252201	Y	EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf5	175938	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	6187612	6187773	6187703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	119108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.0935626122757
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	6311406	6311775	6311432	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	4525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr12	6332021	6332332	6332117	Y	LPAR5	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	25140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	59752	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	45224	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	44613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr12	6525626	6525956	6525791	Y	NA	LTBR,SCNN1A,RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL	TNFRSF1A,PLEKHG6,SCNN1A,TAPBPL,VAMP1,LOC678655,CD27,IFFO1,GAPDH	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-102E24.9	19708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	6586836	6587095	6586846	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,TPI1,TPI1	RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10	NA	NA	NA	NA	VAMP1	8683	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	6063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	8725184	8725464	8725363	Y	NECAP1,CLEC4A,CLEC6A,M6PR,CLEC4D,CLEC4E	NA	KLRG1	IMR90	Hi-C	24141950	RIMKLB	106732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	9855016	9855380	9855049	Y	KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	165355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	11736764	11737137	11736922	Y	TAS2R42	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	11872628	11873141	11872822	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	71840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	11884596	11884909	11884601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	83808	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	11898142	11898564	11898233	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	97354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	11919566	11919967	11919675	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	12030986	12031138	12031062	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	169640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	12038206	12038369	12038301	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	162409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	88880	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	12599819	12600045	12599926	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	91806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	45889	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	12991466	12991515	12991491	Y	NA	DDX47,RPL13AP20	NA	NA	NA	NA	DDX47	27216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	13050548	13050563	13050554	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	8832	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	13320198	13320450	13320349	Y	NA	EMP1	APOLD1,HTR7P1,EMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	27200	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	13376628	13377027	13376828	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28978	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	14426966	14427222	14427069	Y	PLBD1,ATF7IP	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP	89388	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	492147	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	19260911	19261231	19261176	Y	NA	PLEKHA5	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	19417	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	19550535	19550852	19550634	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	4127	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	20950319	20950359	20950339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	638190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	20959036	20959191	20959158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	629358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	22.3630551765813
chr12	21059259	21059529	21059394	Y	SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	529020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	22428776	22428931	22428867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAS	231668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	426587	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	24959393	24959656	24959538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	140737	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	24991472	24991796	24991668	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	108597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	26440996	26441185	26441046	Y	NA	NA	BHLHE41,ITPR2,SSPN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	163446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	26538001	26538320	26538173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	260451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	26944008	26944360	26944283	Y	STK38L,C12orf71	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	39771	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	27332593	27333057	27332936	Y	STK38L	NA	STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	61844	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	27379304	27379685	27379495	Y	NA	STK38L	STK38L,MED21,FGFR1OP2	IMR90	Hi-C	24141950	STK38L	15216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	27497251	27497478	27497364	Y	MED21,ARNTL2	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	13464	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	27565982	27566076	27566029	Y	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	82195	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	27931494	27931809	27931627	Y	MANSC4	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS35	69788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	27975028	27975451	27975289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS35	113322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	164064	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	28126453	28126843	28126791	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	157339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	104297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	28186002	28186387	28186254	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	97795	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	28283625	28284072	28283761	Y	PTHLH,PTHLH	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	28433746	28433796	28433771	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	36600	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	30575373	30575740	30575557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO8	271180	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	32742557	32742716	32742609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	87418	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	33044985	33045279	33045082	Y	NA	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	2495	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	33048688	33048837	33048763	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	RPL30P13,SLC2A13	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	7562	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	41264985	41265046	41264997	Y	CNTN1	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	180741	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	43699836	43700036	43699910	Y	NA	NA	PRICKLE1,PPHLN1,ZCRB1	IMR90	Hi-C	24141950	PUS7L	450584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	44386878	44387178	44387042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	159108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	44976377	44976736	44976725	Y	NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	336895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	45644542	45644793	45644668	Y	ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	36718	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	46902978	46903383	46903115	Y	NA	NA	SLC38A2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-96H19.1	127516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.32906846761086
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	46953166	46953383	46953275	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	177704	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47058276	47058667	47058611	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	282814	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47096740	47097106	47096923	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	321278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	47185736	47186095	47186020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	285639	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47294477	47294629	47294480	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	177105	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.04518198149192
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47482441	47482676	47482559	Y	NA	AMIGO2	AMIGO2	K562	ChIA-PET	22265404	AMIGO2	10707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47606052	47606349	47606300	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	134318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47608427	47608826	47608720	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	136693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	47661403	47661671	47661594	Y	NA	NA	FAM113B,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	189669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr12	47702305	47702647	47702429	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	230571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	59919	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	49678404	49678529	49678467	Y	NA	TROAP	NA	NA	NA	NA	TROAP	36490	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	50911573	50911988	50911666	Y	SLC11A2,DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	14805	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	50924450	50924587	50924549	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	27682	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	51014249	51014685	51014387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2B	117481	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	51057988	51058419	51058261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	97074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	51787794	51788248	51788116	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	3143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	52525424	52525587	52525584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	58197	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.75809684608113
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr12	52571070	52571435	52571234	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	52580785	52580889	52580797	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	2895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	52583620	52584080	52583828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	52609215	52609817	52609526	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25431	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	52624014	52624394	52624158	Y	KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40230	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	52916140	52916794	52916224	Y	KRT76,KRT1,KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	3669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	52973884	52973999	52973956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT5	61413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	53253974	53254173	53254090	Y	RARG,KRT6A,KRT5	KRT4	KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT4	47639	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	53270322	53270511	53270351	Y	RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78	NA	EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	63987	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	53969356	53969561	53969448	Y	NA	ATF7	NA	NA	NA	NA	ATF7	48638	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	54690191	54690205	54690198	Y	NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	NFE2	2700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10	299381	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	DGKA	24895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	56434218	56434302	56434260	Y	OR6C4,OR10P1	SUOX,IKZF4,RPS26,ERBB3	NA	NA	NA	NA	RPS26	581	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	6.7564975214352
chr12	57162340	57162564	57162470	Y	PAN2,PAN2,APOF,SPRYD4,GLS2,RDH16,GPR182,HSD17B6	NACA,PRIM1	NA	NA	NA	NA	PRIM1	18183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	57557421	57557508	57557464	Y	NA	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	33499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	57672745	57672985	57672868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHMT2	51635	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	58134915	58135263	58135010	Y	ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,DDIT3,MBD6,MARCH9,AGAP2	OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,CYP27B1,METTL21B,METTL1,TSFM	NA	NA	NA	NA	AGAP2	975	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	58271285	58271589	58271437	Y	NA	CTDSP2	AVIL,CTDSP2	IMR90	Hi-C	24141950	CTDSP2	32763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	59310774	59310957	59310933	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	1346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	59434557	59434696	59434648	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	122254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	59449084	59449472	59449406	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	136781	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	62575569	62575732	62575651	Y	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	76387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf61	56618	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	64349679	64350074	64349795	Y	TBK1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	113606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	66027921	66028196	66028033	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	33272	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	66216365	66216749	66216512	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	HMGA2	454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	19179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	23936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	92285	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	67411263	67411633	67411591	Y	NA	RP11-123O10.4	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	49309	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	69006143	69006530	69006154	Y	CPM,IFNG,RAP1B	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RAP1B	3524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr12	69179281	69179795	69179458	Y	CPM,RAP1B	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20161	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	69401246	69401453	69401353	Y	RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	201290	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	70937766	70937789	70937778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	77906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	71039604	71039990	71039715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	179744	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	74437082	74437415	74437248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	492136	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	13357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	75986624	75986957	75986791	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	83208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	76045179	76045405	76045348	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	141763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	76053870	76054229	76054024	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	150454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr12	76272060	76272354	76272328	Y	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	153358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	77551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr12	78061184	78061442	78061321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	E2F7	603824	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	78940817	78940832	78940824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	1142045	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79324302	79324765	79324409	Y	SYT1,SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	758112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79325321	79325633	79325477	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	757244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79341300	79341393	79341341	Y	SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	741484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79356068	79356388	79356099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	726489	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	278360	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79817950	79818263	79818028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	264614	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79918085	79918441	79918422	Y	NA	NA	SYT1	IMR90	Hi-C	24141950	PAWR	164436	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	NA	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	139240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	80098707	80098999	80098853	Y	NA	PAWR	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	15830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	80327802	80327850	80327826	Y	NA	RP11-84G21.1,PPP1R12A	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	562	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	81171843	81172335	81171905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244J10.1	676730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	84902694	84902984	84902888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	402410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	87822808	87822965	87822871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	602658	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	88064249	88064502	88064338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	361121	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	88703962	88704349	88704186	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	TMTC3	169889	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	88826876	88827166	88827020	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	KITLG	145462	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	92474192	92474586	92474423	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	60104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	92490612	92490822	92490679	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	43868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	92505299	92505700	92505686	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	28990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr12	92947125	92947543	92947361	Y	EEA1,BTG1	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	373564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	92995849	92996628	92996444	Y	EEA1,BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EEA1	324479	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	93305938	93306210	93306048	Y	CLLU1OS	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	14897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	93320988	93321201	93321103	Y	EEA1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	93382025	93382373	93382199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	60918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	93410290	93410649	93410470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	64802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	94158186	94158524	94158355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	89035	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	94241673	94241891	94241710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	172522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBMS2P1	320387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	138437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.42582972917841
chr12	95012768	95013068	95012914	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	29270	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	95037595	95038737	95038539	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	3601	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr12	95043067	95043319	95043087	Y	TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr12	95155432	95155603	95155503	Y	NA	NA	TMCC3	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC3	113094	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	95492031	95492186	95492111	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	26552	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	95597894	95598075	95597980	Y	NA	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	11183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	96027120	96027372	96027186	Y	LTA4H	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	NTN4	155558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	NTN4	134714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96592675	96593197	96592888	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	6515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr12	96637849	96638243	96638007	Y	LTA4H,ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	51689	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96648142	96648594	96648361	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	61982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96659033	96659395	96659303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	72873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96664847	96665248	96665048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	78687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96685157	96685428	96685293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	98997	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP11	8803	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr12	97205009	97205147	97205078	Y	NA	NA	NEDD1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD1	93854	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	98818500	98818672	98818666	Y	NA	RNU4-41P,SLC9A7P1	LOC100128191,TMPO	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-41P	8684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	100628061	100628323	100628191	Y	NA	ACTR6,RP11-175P13.3,SCYL2	NA	NA	NA	NA	SCYL2	30595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	101099927	101100118	101100023	Y	NA	NA	SLC17A8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-575G13.2	129405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	102169550	102169734	102169688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	52982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	104225376	104225573	104225475	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	7402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	1011	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	21349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	104791559	104791875	104791716	Y	TXNRD1	NA	CHST11,SLC41A2,C12orf45	IMR90	Hi-C	24141950	CHST11	55198	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	104925240	104925499	104925325	Y	CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	78167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	105031434	105031802	105031612	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	184361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	105032549	105032903	105032843	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	185476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	105037664	105038031	105037900	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	190591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	105089120	105089756	105089331	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	242047	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	105177272	105177383	105177327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	173139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	107494078	107494256	107494167	Y	NA	CRY1	CRY1,BTBD11	IMR90	Hi-C	24141950	CRY1	8471	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	107723329	107723653	107723513	Y	NA	BTBD11	NA	NA	NA	NA	BTBD11	13139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	108056293	108056559	108056439	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	20950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	108776877	108777008	108776943	Y	NA	NA	WSCD2	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	129954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	108920909	108921183	108921031	Y	NA	FICD,SART3,ISCU	NA	NA	NA	NA	FICD	13947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	109035890	109036155	109035901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81532	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109037814	109037911	109037861	Y	SSH1,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	83456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	109084686	109085066	109084867	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	38306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	109093619	109093939	109093779	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	29433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	109249389	109249909	109249762	Y	CORO1C,SSH1,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	23	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	109900309	109900503	109900403	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	12704	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	110071631	110071992	110071655	Y	NA	NA	C12orf34,MGC14436	IMR90	Hi-C	24141950	MMAB	61952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	110694570	110694771	110694670	Y	PPTC7,ARPC3	ATP2A2	ATP2A2,IFT81,ANKRD13A,GIT2,C12orf76,ANAPC7,ARPC3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	21790	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	110735237	110735389	110735298	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	18676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	111001824	111001977	111001904	Y	NA	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	17148	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr12	111095518	111095878	111095698	Y	PPTC7,HVCN1,HVCN1	TCTN1	NA	NA	NA	NA	TCTN1	45686	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	111868510	111869152	111868792	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	113670739	113671157	113670856	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	13840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	114200256	114200532	114200390	Y	NA	RP11-438N16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-438N16.1	8956	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr12	116383050	116383163	116383141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	329980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	116666460	116666763	116666749	Y	NA	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	46380	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	117173952	117174265	117174216	Y	MED13L,MAP1LC3B2	C12orf49	NA	NA	NA	NA	RNFT2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	117480044	117480441	117480323	Y	TESC	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW8	133283	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	118815733	118815925	118815736	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	SUDS3	3548	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120153680	120153798	120153737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	50122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	120450063	120450486	120450317	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	102820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120453080	120453507	120453184	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	99799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120665661	120665757	120665705	Y	ACADS	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	28567	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr12	120689817	120690140	120689965	Y	CCDC64,RAB35,RNF10,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2	NA	NA	NA	NA	PXN	11434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120728531	120728703	120728617	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2	PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-2	825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121021309	121021477	121021390	Y	NA	POP5,RPL11P5	NA	NA	NA	NA	POP5	4108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121245538	121245859	121245790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADS	84000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121367131	121367281	121367257	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	C12orf43,SPPL3,POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL12P33	14583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	121402785	121402795	121402791	Y	HNF1A	C12orf43	NA	NA	NA	NA	C12orf43	49510	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121460857	121460983	121460961	Y	NA	C12orf43,OASL	NA	NA	NA	NA	C12orf43	8552	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr12	121715307	121715461	121715407	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	18650	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	121904317	121904475	121904368	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	NA	RNF34	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF34	68473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	122224293	122224471	122224351	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	122363309	122363443	122363412	Y	NA	PSMD9	NA	NA	NA	NA	PSMD9	38672	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	12.9420234213407
chr12	122952702	122952803	122952758	Y	CLIP1,HCAR1	CLIP1,ZCCHC8	LOC100507066,CLIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC8	30715	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	123352500	123352698	123352696	Y	VPS37B	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	26293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.23550585533517
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	123367402	123367963	123367875	Y	VPS37B	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	11028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	123387713	123388070	123387892	Y	NA	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	8722	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	123555205	123555330	123555222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	77232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	123917456	123917702	123917658	Y	SBNO1,RILPL2	RILPL2,SNRNP35	NA	NA	NA	NA	RILPL2	1562	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	419959	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	452167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	124916261	124916578	124916546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	448636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	361380	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr12	125028947	125029179	125029054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	336035	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	125073637	125073873	125073849	Y	UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	291341	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254030	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	160132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	125229298	125229517	125229417	Y	NA	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	135697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr12	125353523	125353887	125353860	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	SCARB1	11327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	125412421	125412524	125412468	Y	NA	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	RPL22P19	5917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	6796	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	126780658	126780679	126780668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00944	474278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	127208914	127209015	127208965	Y	NA	LINC00944	NA	NA	NA	NA	LINC00944	45942	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	127910118	127910304	127910194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	261446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr12	129296403	129296565	129296505	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	9963	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	132014283	132014643	132014520	Y	NA	NA	GPR133	IMR90	Hi-C	24141950	SFSWAP	178983	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	NA	NA	NA	NA	NA	ULK1	61957	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr12	132315862	132315946	132315904	Y	MMP17	NA	NA	NA	NA	NA	ULK1	61250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr12	132349078	132349283	132349182	Y	NA	ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	27913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr12	132356836	132357024	132356894	Y	SFSWAP,ULK1	ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	20172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	33720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	20419964	20420131	20420036	Y	PSPC1,ZMYM5	ZMYM5	NA	NA	NA	NA	ZMYM5	15645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	21241518	21241702	21241584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT88	102933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	NA	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	66738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	27142181	27142413	27142195	Y	NA	WASF3	NA	NA	NA	NA	WASF3	12341	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	27706563	27707017	27706898	Y	NA	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	37016	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	27808177	27808245	27808213	Y	NA	RPL21,RASL11A	USP12,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	RPL21	15201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	30808946	30809107	30809021	Y	KATNAL1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	59177	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	LINC00426,LINC01058	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00426	20402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	31004513	31004723	31004587	Y	USPL1	LINC01058	KATNAL1,LINC00426,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	10139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr13	31308709	31309017	31308774	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	118879	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	31746734	31747017	31746876	Y	NA	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	HSPH1	12209	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	32052041	32052268	32052184	Y	NA	NA	RXFP2	IMR90	Hi-C	24141950	B3GALTL	279968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	32212790	32213050	32212929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	205928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	33822427	33822802	33822649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	99965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	34727619	34727920	34727781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	337433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr13	37723502	37723846	37723737	Y	FAM48A,CSNK1A1L	NA	POSTN,LINC00547	IMR90	Hi-C	24141950	ALG5	151104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	40057425	40057642	40057534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFP	118023	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	40677084	40677323	40677230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	449320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	41173351	41173594	41173358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	65140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	41187555	41187952	41187790	Y	ELF1,ELF1,FOXO1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	50782	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	41560539	41560879	41560717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	66629	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	41825625	41825697	41825634	Y	KBTBD7,NAA16	MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	10045	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	42162855	42163294	42163201	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	279514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	42231052	42231244	42231148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	347711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	385716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	197890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	139032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	68254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	44420814	44421049	44420930	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	30371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	261884	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	45059021	45059160	45059095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	90123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	45752820	45753055	45752934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	60170	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	45774024	45774110	45774098	Y	KCTD4	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	81374	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	45813210	45813281	45813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1-AS1	100199	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	46696032	46696143	46696084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	71138	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	46736375	46736487	46736423	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	47519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr13	46739572	46740633	46739908	Y	NA	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	43373	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	46747616	46748160	46748034	Y	C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	35846	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	46752144	46752602	46752461	Y	C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	31404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	49433672	49433840	49433729	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3A	114208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	49455753	49455899	49455811	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3A	92149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	49627008	49627200	49627078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	78960	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	49688107	49688286	49688182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	131761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	49814374	49814506	49814440	Y	MLNR,CAB39L	CDADC1	NA	NA	NA	NA	CDADC1	5541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	50555707	50555861	50555784	Y	NA	SPRYD7,TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	12163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	50857956	50857973	50857965	Y	NA	NA	DLEU2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	75926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	51176389	51176436	51176413	Y	NA	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	242490	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	51902603	51902909	51902835	Y	NA	NA	DHRS12	IMR90	Hi-C	24141950	FAM124A	108100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	340742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	67674730	67675228	67675034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	127240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.28228716147302
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	73909414	73909609	73909563	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5P1	236291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	73985614	73985783	73985667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P1	312491	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr13	75800411	75800558	75800473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	253692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	76336754	76337033	76336914	Y	COMMD6,LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	144184	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	77899332	77899971	77899636	Y	KCTD12,FBXL3,MYCBP2	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	147	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	80122895	80122985	80122937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	69608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	80319311	80319640	80319476	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP2	266024	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	88259012	88259340	88259160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	1887389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	90053531	90053928	90053634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1944146	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	95128334	95128746	95128451	Y	DCT	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	117765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	95620867	95621252	95621220	Y	NA	NA	CLDN10	IMR90	Hi-C	24141950	SOX21-AS1	257897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	97263096	97263285	97263191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	559360	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	97913986	97914316	97914087	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	42298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	98082020	98082299	98082214	Y	MBNL2,RAP2A	RAP2A	RAP2A	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2A	2177	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr13	99130571	99130717	99130631	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	97477	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	99135278	99135706	99135580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	92488	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	99599525	99599781	99599653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	251183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	99647205	99647378	99647259	Y	UBAC2,UBAC2,GPR18,DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	203586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	99772014	99772367	99772137	Y	GPR18	NA	MIR548AN,UBAC2	IMR90	Hi-C	24141950	UBAC2-AS1	78597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	99931812	99933023	99932107	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	65800	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	69832	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	99973342	99973591	99973472	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	107330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	99991522	99991909	99991574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	125510	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	100115582	100115885	100115820	Y	NA	TM9SF2	MIR548AN,UBAC2	IMR90	Hi-C	24141950	TM9SF2	35786	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	100631413	100631577	100631494	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	449	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	100886726	100886738	100886732	Y	NA	NA	A2LD1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P18	85380	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	101075706	101076016	101075848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	114512	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	101202947	101203040	101202996	Y	NA	RPS26P47	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	12419	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	101392317	101392331	101392324	Y	NA	NALCN-AS1	NALCN,A2LD1	IMR90	Hi-C	24141950	NALCN-AS1	33738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	103557671	103557972	103557679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	62477	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	104663923	104664083	104664030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	1168729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	106808885	106809142	106808998	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	217769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	107070030	107070366	107070265	Y	NA	LINC00460	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	43119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	107124360	107124455	107124408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	94057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	107160222	107160504	107160362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	58008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr13	107170805	107171068	107170962	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	47444	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr13	109572126	109572187	109572157	Y	MYO16,MYO16	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	703399	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	628940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	627878	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	527101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	514704	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr13	110631754	110631774	110631764	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	194839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	110709567	110709794	110709737	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	246365	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	208817	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	111044675	111045176	111044974	Y	COL4A1,COL4A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	87179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr13	111607450	111607830	111607755	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	42034	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	111609846	111610157	111610005	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	44430	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr13	111616634	111616920	111616701	Y	NA	NA	LINC00346,ING1,ANKRD10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD10	51218	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr13	111623981	111624100	111624039	Y	ING1,C13orf16	NA	ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	58565	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr13	111633427	111633785	111633577	Y	NA	NA	ARHGEF7,LINC00346,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	68011	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	113294900	113294930	113294914	Y	C13orf35	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	47713	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	113373357	113373630	113373494	Y	ATP11A	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	30714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	171523	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	NA	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	ATP11A	242945	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	113660175	113660436	113660306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL4A	200116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL4A	183178	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	51806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	114080351	114080489	114080411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	62778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	114124603	114124675	114124639	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	18592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	114127046	114127213	114127130	Y	GRTP1,DCUN1D2	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	16054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr13	114301802	114302224	114301872	Y	GAS6	NA	NA	NA	NA	NA	TFDP1	64789	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	24016944	24017157	24017064	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	6059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	24058094	24058646	24058322	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2,DHRS2	NA	NA	NA	NA	AP1G2	22815	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS2	66439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	25312812	25313037	25312925	Y	CMA1,CTSG,STXBP6	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	402701	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	25464405	25464804	25464526	Y	CMA1,CTSG,GZMB,STXBP6	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	269738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	959401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	29227815	29227890	29227853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	270699	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4S1	92092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	32261719	32262250	32261957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5	281070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	32852666	32852915	32852789	Y	NA	RP11-320M16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.2	32265	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr14	34504920	34505230	34505078	Y	NA	NA	EGLN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	424332	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	35346506	35346753	35346630	Y	PSMA6,EAPP,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	BAZ1A	3653	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	35800965	35801124	35801022	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	55126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	35855857	35856187	35856101	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	88	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	35869907	35870271	35870165	Y	FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	1684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	36623912	36623974	36623948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBIP	163908	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	37465189	37465490	37465428	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21-AS1	173603	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	37468951	37469405	37469233	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21-AS1	169688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	37587049	37587449	37587434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21-AS1	51644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	37980657	37980979	37980818	Y	SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-356O9.2	53321	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	39664073	39664414	39664121	Y	SIP1,PNN	TRAPPC6B,PNN	NA	NA	NA	NA	PNN	21686	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	43816626	43817007	43816818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1547491	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr14	45483090	45483569	45483224	Y	NA	KLHL28	NA	NA	NA	NA	KLHL28	25956	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	45518258	45518310	45518284	Y	PRPF39	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	8733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	30013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	50497743	50497949	50497828	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	C14orf182,SOS2,C14orf183,ARF6,METTL21D	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-58E21.3	7998	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	21664	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	51074312	51074388	51074350	Y	TRIM9,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	48468	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	51144322	51144826	51144405	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,NIN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	11273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	51393835	51393896	51393861	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	15558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	51834333	51834594	51834461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	119224	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	51862095	51862490	51862300	Y	FRMD6,FRMD6	NA	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	91328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	NA	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	87834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	51975090	51975414	51975252	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	21272	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	52063277	52063629	52063461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	109459	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	52069018	52069473	52069211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	115200	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	52372298	52373220	52372436	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	80973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	168413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	53598795	53599062	53598929	Y	DDHD1	DDHD1	NA	NA	NA	NA	DDHD1	18938	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	54443717	54444101	54443910	Y	NA	BMP4	NA	NA	NA	NA	BMP4	20238	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	54649490	54649642	54649566	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	211925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	CGRRF1	178361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	29146	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	59744882	59745126	59745004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	91518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	60629133	60629293	60629144	Y	NA	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	5281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr14	61188472	61188761	61188676	Y	PPM1A	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	61612107	61612325	61612234	Y	SIX1	PRKCH	SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	39952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	61801818	61802258	61801925	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	14282	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	150732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr14	61978357	61978646	61978426	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181212	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	62015577	62015884	62015776	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	144347	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	62170336	62170562	62170449	Y	NA	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS1	9795	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	63829601	63829975	63829789	Y	WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	178117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	64403874	64404095	64403883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	86191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	64584533	64584935	64584736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-544I20.2	218382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr14	65524481	65524844	65524562	Y	PLEKHG3	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	42569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	65601506	65601634	65601523	Y	NA	MAX	FUT8,LOC645431	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	34093	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	CTD-2509G16.2	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	35052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	68529528	68529897	68529655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	245032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	68699331	68699744	68699520	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	187169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	68850156	68850330	68850199	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	36583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	126589	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	69247587	69247770	69247677	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	13420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	69396600	69396876	69396795	Y	ZFP36L1,DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	47281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	69425235	69425583	69425528	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	18574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	69512620	69512951	69512699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	68463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	70152055	70152259	70152141	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	39358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	70251267	70251371	70251319	Y	SLC10A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59650	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	274367	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	71249264	71249522	71249393	Y	NA	MAP3K9,RP6-65G23.3	NA	NA	NA	NA	MAP3K9	24729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	71425019	71425182	71425094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCNX	52897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	71838643	71839069	71838909	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	52112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	71996595	71997083	71996703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	210064	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	74741846	74742137	74741995	Y	FCF1	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25622	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	74981330	74981609	74981543	Y	NPC2	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	NPC2	22450	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	47569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr14	75037027	75037351	75037159	Y	NA	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	43999	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	42330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	75087327	75087770	75087539	Y	PGF,EIF2B2,LTBP2	CTD-2207P18.2	YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	5977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	75688633	75689211	75688968	Y	DLST,FOS	TMED10,RP11-293M10.2	PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	34903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	75963682	75963938	75963768	Y	C14orf1,BATF	NA	TMED10,NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	JDP2	71263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	77425025	77425260	77425132	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1044	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	77488566	77488578	77488572	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr14	78129695	78129950	78129826	Y	NA	SPTLC2,ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	42413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	80857236	80857459	80857352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	566402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	81088140	81088388	81088236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	335473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	81220509	81220785	81220647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	203076	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr14	81867886	81868104	81867969	Y	GTF2A1,GTF2A1	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	32705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	112375	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.18872454919732
chr14	86053629	86053936	86053651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	59141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	86066316	86066619	86066414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	71828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	86073952	86074255	86074109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	79464	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	87930298	87930498	87930398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA7	918770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	88461350	88461753	88461554	Y	GALC,GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA7	387515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	89772713	89772723	89772718	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	16775	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	90909944	90910315	90910244	Y	NA	CALM1	CALM1,TTC7B	MCF7	ChIA-PET	22265404	CALM1	49098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91002583	91003004	91002750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	141737	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91090658	91091172	91090732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	189651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91528012	91528136	91528074	Y	SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	3032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91716270	91716863	91716728	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	165325	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91724533	91724847	91724784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	157341	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91734470	91734656	91734563	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	147532	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91759632	91759894	91759768	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	122294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	91833483	91833974	91833648	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	48214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	92446493	92446853	92446680	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	58387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	242514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	93569992	93570233	93570210	Y	KIAA1409,C14orf109,C14orf109	ITPK1,RP11-371E8.2	NA	NA	NA	NA	ITPK1	10432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	93891373	93891762	93891568	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD7	93935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	94016026	94016414	94016228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD7	218588	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	94453312	94453802	94453544	Y	NA	OTUB2	LINC00521	MCF7	ChIA-PET	22265404	OTUB2	36873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr14	94471808	94471845	94471827	Y	NA	OTUB2	NA	NA	NA	NA	OTUB2	18830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	94748201	94748526	94748499	Y	SERPINA6,SERPINA5,SERPINA4,SERPINA3,SERPINA11,SERPINA1,SERPINA10,SERPINA10	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R4	137736	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	95065322	95065753	95065523	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	10961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	95691488	95691499	95691495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	69141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	95861859	95861987	95861923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	77616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	99710504	99710936	99710666	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	24925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	91505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr14	100045606	100045757	100045663	Y	CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	22606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr14	100264706	100265066	100264858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML1	62676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	101151381	101151698	101151540	Y	RTL1,DLK1	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	310239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	318116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	102288392	102288845	102288491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	62257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr14	102429527	102429743	102429691	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	103539359	103539722	103539623	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	17560	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	103781496	103782004	103781810	Y	EXOC3L4,TNFAIP2	EIF5	RCOR1,EIF5,MARK3,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF5	15877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	103993761	103994083	103993826	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	104228992	104229118	104229080	Y	NA	XRCC3,ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	ZFYVE21	48925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	104356058	104356494	104356205	Y	TRMT61A,PPP1R13B	PPP1R13B,C14orf2	PPP1R13B,LOC145216	MCF7	ChIA-PET	22265404	C14orf2	36112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	104483678	104483886	104483733	Y	ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf2	91072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf2	190447	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr14	105290315	105290696	105290451	Y	GPR132	AKT1,RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	4812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	34630	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr14	105440243	105440515	105440379	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105549558	105549976	105549724	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	64073	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr14	105631701	105632085	105631796	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	1076	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,C14orf80	NA	NA	NA	NA	C14orf80	6059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.18872454919732
chr14	106164516	106164556	106164555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-731F5.1	94822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	20547295	20547641	20547374	Y	NA	NA	LOC348120,REREP3,POTEB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-603B24.2	1996448	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	20596893	20597220	20597190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1946869	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	20612710	20612766	20612738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1931323	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	20616457	20616559	20616506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1927530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	20858746	20859095	20858885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1684994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	637959	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	22908894	22909338	22909142	Y	NA	CYFIP1	NA	NA	NA	NA	CYFIP1	18889	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	22938552	22938923	22938737	Y	CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	48547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	25587380	25587405	25587393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	94723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	25608093	25608225	25608159	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	73903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	26416756	26416952	26416854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	734628	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	28494622	28494982	28494802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	63816	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	29631690	29632071	29631913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	71657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	236254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	30128383	30128423	30128398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	130645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	31757580	31757887	31757714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	140522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	32140399	32140767	32140585	Y	NA	OTUD7A	NA	NA	NA	NA	OTUD7A	20225	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	33083952	33084023	33083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	178607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	33148173	33148432	33148370	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	242828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	33172991	33173188	33173143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	267646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	33299476	33299841	33299744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMN1	185056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	34531616	34532056	34531745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	96205	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	34807090	34807442	34807248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA8A,GOLGA8B	71262	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	1090	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	35599049	35599138	35599102	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	9408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	199113	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	35803904	35804280	35804092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	214263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	36897694	36898088	36897999	Y	C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	27882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	37169508	37169702	37169583	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	60848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	37398990	37399302	37399145	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	RP11-128A17.1,MEIS2	NA	NA	NA	NA	MEIS2	7486	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	GPR176	NA	NA	NA	NA	GPR176	46115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	40200668	40200777	40200723	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	10316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	40361212	40361596	40361446	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	SRP14	31823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	40365860	40366125	40365905	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	32968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	40385571	40385715	40385643	Y	BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	13378	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	40395466	40395787	40395613	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	3306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	41264604	41264924	41264664	Y	NA	CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	21444	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	42213328	42213713	42213448	Y	NA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	49063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	42220921	42221174	42221042	Y	NA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	41602	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	42226071	42226526	42226165	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	36250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	42261117	42261163	42261140	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	1613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	42549506	42549513	42549508	Y	PLA2G4E	GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	13918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	RPS3AP47	8323	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	43462121	43462322	43462222	Y	NA	CCNDBP1	NA	NA	NA	NA	CCNDBP1	12994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	43511253	43511414	43511298	Y	CCNDBP1,EPB42	CCNDBP1	NA	NA	NA	NA	CCNDBP1	35937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	44073726	44074107	44073917	Y	NA	PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,ELL3,MFAP1,WDR76	NA	NA	NA	NA	ELL3	5985	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	55940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	45875981	45876250	45876116	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	45096	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr15	48975243	48975418	48975260	Y	NA	NA	FBN1,SHC4,CEP152	IMR90	Hi-C	24141950	CEP152	125925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	50192335	50192466	50192401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTWD1	281158	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	50634288	50634665	50634477	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	10860	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr15	51413367	51413627	51413497	Y	NA	NA	TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN	IMR90	Hi-C	24141950	AP4E1	214498	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	51477619	51477870	51477745	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	278750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	51545625	51545914	51545808	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	346756	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	352824	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	314415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	51619340	51619705	51619523	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	293325	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	51628727	51629122	51629096	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	283908	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	51868984	51870333	51869210	Y	NA	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	42697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	52349753	52350120	52349937	Y	NA	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	35372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	52369278	52369628	52369325	Y	MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	GNB5,BCL2L10,MYO5C	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2184D3.1	15864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.42423040453249
chr15	52395777	52396019	52395882	Y	DMXL2,TMOD3,MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.5	5057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	52734000	52734377	52734331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5A	84870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	52777453	52777711	52777581	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	41536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	55559739	55560363	55560096	Y	RAB27A,PIGB	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	48795	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	56331775	56332089	56331933	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	47831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	56341448	56341541	56341527	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4	57504	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	56419675	56420043	56419859	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	113440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	56830115	56830472	56830182	Y	RFX7,ZNF280D,TCF12	NA	NA	NA	NA	NA	TEX9	295908	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	57016270	57016644	57016457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF280D	192125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	57798359	57798473	57798399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCOM1	83633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	59492312	59492582	59492437	Y	BNIP2,ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	97035	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	75499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	59646649	59647004	59646975	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	15888	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr15	59649595	59649770	59649683	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	FAM81A	13122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	59848106	59848258	59848124	Y	GCNT3	RP11-112N19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	4814	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	60757802	60757969	60757886	Y	NA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	NARG2	11390	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	60835043	60835413	60835301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	65666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	RP11-244F12.3,LACTB	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.3	28810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	63432131	63432432	63432186	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	15788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	63789918	63790251	63790145	Y	HERC1,LACTB,RAB8B,APH1B,USP3	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	4542	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	64754012	64754177	64754162	Y	NA	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	3071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	AC069368.3	3874	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	65174333	65174776	65174649	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	42245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	65176143	65176677	65176391	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	44055	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr15	67378105	67378547	67378289	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	24004	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	37502	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	33898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	68878617	68878894	68878756	Y	CORO2B	NA	NA	NA	NA	NA	SPESP1	229666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	68933457	68933606	68933532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPESP1	174954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	69817910	69818170	69818070	Y	NA	NA	C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	74787	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr15	70289516	70289879	70289625	Y	NA	NA	LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	98636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	72041767	72041974	72041871	Y	SENP8	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	362625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	72265573	72265641	72265607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	138958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	73032689	73032951	73032815	Y	PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	43236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	73435699	73435965	73435801	Y	NEO1,HCN4	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	93648	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	73493017	73493414	73493026	Y	NEO1	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	150966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	74221354	74221537	74221415	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	5024	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	74226590	74227025	74226821	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	10260	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	74493587	74493665	74493592	Y	CCDC33,ISLR	RP11-60L3.1,STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	74679306	74679684	74679409	Y	NA	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	45124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	74899091	74899429	74899332	Y	PPCDC,CLK3,CLK3	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	10250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	75400106	75401427	75400997	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39	NA	C15orf39,SCAMP5,PPCDC	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C15orf39	84557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	75820261	75820616	75820439	Y	NA	PTPN9	NA	NA	NA	NA	PTPN9	49014	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	75939210	75939595	75939262	Y	NA	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	76218014	76218024	76218019	Y	NA	FBXO22	NA	NA	NA	NA	FBXO22	23814	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	76353098	76353448	76353273	Y	NA	NRG4,C15orf27	NA	NA	NA	NA	C15orf27	2920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	77710600	77710857	77710802	Y	NA	PEAK1	NA	NA	NA	NA	HMG20A	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	77739736	77739821	77739778	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	28982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	NA	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IREB2	60119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P116	62515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P116	126755	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	80194397	80194544	80194472	Y	ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	MTHFS	6676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	81069569	81069760	81069666	Y	MESDC1,KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	81291796	81292315	81292076	Y	NA	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	501	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	81316981	81317108	81317017	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	25686	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	81607386	81607689	81607446	Y	MESDC1,IL16,IL16,STARD5	STARD5,RP11-761I4.3	NA	NA	NA	NA	STARD5	6835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	83603228	83603538	83603384	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	49123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	83681404	83681605	83681512	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	3011	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	83862328	83862648	83862488	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	12122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr15	83956370	83956763	83956596	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	4904	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	83957181	83957322	83957252	Y	NA	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	5715	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	65397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	85225191	85225385	85225287	Y	PDE8A,ZNF592	WDR73,NMB,SEC11A	NA	NA	NA	NA	NMB	25397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	85516737	85517139	85516966	Y	NA	PDE8A	ALPK3,PDE8A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE8A	4532	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	85662697	85662918	85662803	Y	PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	141026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	85711891	85712151	85712051	Y	NA	NA	PDE8A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE8A	190220	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	85725231	85725336	85725284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	196466	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	85874454	85874742	85874552	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	47060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	85951741	85952026	85951782	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13,CTD-2262B20.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2262B20.1	4433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13,CTD-2262B20.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2262B20.1	303	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	CTD-2262B20.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2262B20.1	30589	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	86020857	86021180	86020870	Y	KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2262B20.1	64398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	89156201	89156887	89156382	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	5640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	89648424	89648609	89648517	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	19734	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00925	103036	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.23550585533517
chr15	90363996	90364798	90364610	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	NA	NA	NA	NA	NA	AP3S2	70776	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90371902	90372049	90371963	Y	ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	NA	NA	NA	NA	NA	AP3S2	63525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90456787	90457058	90456927	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	C15orf38	2599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90641433	90641611	90641526	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	2125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	90649995	90650276	90650136	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	6259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90945502	90945781	90945680	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	16052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLM	72770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	7723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B,AC068831.10	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	69528	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	NA	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	CHD2	60372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2,MIR3175	NA	NA	NA	NA	MIR3175	12413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	74413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	96742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	94815502	94815543	94815523	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	42735	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	96103160	96103444	96103266	Y	NA	NA	NR2F2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	763723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	98304362	98304376	98304369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	156408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	98964843	98965105	98964974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	225095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.99680135070815
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99318481	99318879	99318554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	128281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr15	99342514	99342944	99342658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	152314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	161808	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99387614	99387887	99387660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	161137	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	152359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	99399333	99399603	99399475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	149421	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99399661	99400083	99399913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	148941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	140039	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	139509	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	132655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPEP1L	103814	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99561438	99561561	99561500	Y	NA	PGPEP1L	PGPEP1L,IGF1R	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PGPEP1L	12414	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99787833	99788088	99787963	Y	NA	TTC23,LRRC28,HSP90B2P	NA	NA	NA	NA	TTC23	1340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99823818	99824190	99823994	Y	MEF2A,MEF2A	TTC23,LRRC28,HSP90B2P	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	27981	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	99965380	99965718	99965580	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,MEF2A,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	49652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99973623	99973819	99973721	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	41551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	100049015	100049413	100049233	Y	MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28,TTC23	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	33645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	100651295	100651582	100651483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	379529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	101253659	101254026	101253922	Y	ALDH1A3	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	LINS	112224	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	101261253	101261648	101261594	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	119818	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr15	101462538	101462736	101462613	Y	NA	ALDH1A3,LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	5118	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr15	101481026	101481320	101481182	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	23606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr15	101481750	101481996	101481861	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	24330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	101790495	101790968	101790609	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr15	102213485	102213850	102213667	Y	NA	TM2D3,TARSL2	NA	NA	NA	NA	TM2D3	22891	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	RPUSD1	22436	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	220754	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	220322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	1150049	1150415	1150232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	203133	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	1166792	1167154	1166886	Y	NA	NA	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	186394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	1179495	1179558	1179527	Y	NA	NA	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	173990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	1347371	1347380	1347376	Y	NA	UBE2I	NA	NA	NA	NA	UBE2I	6168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,GNPTG	NA	NA	NA	NA	GNPTG	17732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr16	2212881	2213081	2213004	Y	NA	RAB26,SNORD60,TRAF7,MLST8,PGP	NA	NA	NA	NA	TRAF7	9182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	4456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	2845811	2846048	2845884	Y	OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2	NA	NA	NA	NA	TCEB2	20513	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	20027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	2910811	2910988	2910899	Y	ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	PRSS22	4640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	3858926	3859164	3859045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	69563	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	3889135	3889287	3889211	Y	NA	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	39440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.28388648611894
chr16	4732185	4732598	4732284	Y	CORO7,ROGDI	NUDT16L1,C16orf71,ANKS3	NA	NA	NA	NA	NUDT16L1	9097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr16	4985283	4985359	4985321	Y	NA	PPL	NA	NA	NA	NA	PPL	23383	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr16	5920372	5920634	5920563	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	774563	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	6192188	6192510	6192349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1046379	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	6882597	6882937	6882663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1736788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	8032889	8032980	8032935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	680560	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	10672211	10672611	10672411	Y	ATF7IP2,EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	10672618	10672930	10672712	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	63	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	10847001	10847390	10847044	Y	CIITA,NUBP1	NUBP1	NA	NA	NA	NA	NUBP1	11358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr16	11194136	11194543	11194329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	146933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11284462	11284734	11284689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	56742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	11666045	11666804	11666319	Y	ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	61433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11713232	11713400	11713276	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	14837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr16	11764274	11764504	11764414	Y	ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	NA	NA	NA	NA	SNN	4004	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	12049208	12049600	12049404	Y	NA	GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166B2.1	18900	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	12647143	12647394	12647326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	248480	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	12700714	12700789	12700756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	195085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	14326449	14326637	14326520	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	163271	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	14603035	14603210	14603110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	121375	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	15140552	15140757	15140655	Y	NA	NTAN1	NA	NA	NA	NA	NTAN1	7164	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	16131643	16131874	16131759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	90209	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	20729381	20729771	20729568	Y	LYRM1,DCUN1D3	THUMPD1	NA	NA	NA	NA	THUMPD1	21635	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	21375136	21375337	21375232	Y	DNAH3,CRYM,METTL9	NA	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	64966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	22082738	22082854	22082796	Y	OTOA	VWA3A	NA	NA	NA	NA	VWA3A	19005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	22432961	22433094	22433028	Y	NA	SMG1P1,CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	SMG1P1	13235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	23069980	23070197	23070103	Y	USP31	NA	NA	NA	NA	NA	USP31	88394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	23364862	23365207	23364921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG7	97294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	27248798	27249418	27249027	Y	KIAA0556,IL4R,IL21R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	28697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	27763534	27763923	27763729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	204080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	28108728	28108802	28108745	Y	APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	112439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	28179891	28180117	28180009	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	41124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	29126776	29127012	29126904	Y	SPNS1	NA	NA	NA	NA	NA	SPNS1	143234	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	SPNS1	184861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	AC002310.7	1728	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.75969617072705
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	30831973	30832104	30832038	Y	NA	ZNF629	NA	NA	NA	NA	ZNF629	35450	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	31361586	31361900	31361748	Y	ARMC5,STX4,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS,PYCARD,ITGAM,ITGAX	ITGAX	NA	NA	NA	NA	ITGAX	2555	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	33952235	33952334	33952272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069156	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	47208056	47208220	47208138	Y	NA	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	32148	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	47454284	47454574	47454519	Y	NA	PHKB,ITFG1	NA	NA	NA	NA	PHKB	38460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	48545095	48545474	48545284	Y	SIAH1	NA	SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	SIAH1	64782	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	48645394	48646040	48645807	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	6019	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	48657602	48657960	48657802	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	N4BP1	5543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	49487989	49488142	49488067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR3	609710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	50297167	50297573	50297410	Y	NA	ADCY7	PAPD5,BRD7,ADCY7	IMR90	Hi-C	24141950	ADCY7	19119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	50315764	50316400	50316123	Y	SNX20,NOD2,CYLD,CYLD,TMEM188,PAPD5,ADCY7	ADCY7	PAPD5,BRD7,ADCY7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADCY7	37716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	53077641	53077824	53077723	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	9121	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	53114402	53114975	53114686	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	27457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	53915459	53915524	53915492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	179584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	54128589	54128847	54128718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	189828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	54415438	54415695	54415567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	96763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	55535734	55536073	55535896	Y	NA	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	4837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	56371820	56372146	56371983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	85304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	56640479	56640669	56640573	Y	NA	MT2A,MT1E,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1E,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	56813469	56813757	56813613	Y	NA	NA	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	NUP93	51452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	57269711	57269965	57269822	Y	NA	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	7045	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	12303	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	58160772	58161211	58161024	Y	C16orf80	C16orf80	NA	NA	NA	NA	C16orf80	143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	58277502	58277617	58277563	Y	NA	CSNK2A2,CCDC113,AC009107.1,GINS3	CCDC113	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC113	14441	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	58445622	58445902	58445848	Y	NA	NDRG4	NA	NA	NA	NA	NDRG4	48848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	66398320	66398884	66398869	Y	CDH5	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	41543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	66416918	66416958	66416940	Y	NA	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	66557840	66558108	66558016	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	26339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	CES3	4726	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	66993598	66994056	66993790	Y	NA	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	CES3	458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	67149596	67149757	67149715	Y	LRRC29,LRRC29,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70	C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD	NA	NA	NA	NA	C16orf70	7735	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	68234152	68234458	68234209	Y	NA	ESRP2,PLA2G15	NA	NA	NA	NA	ESRP2	35547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	68433458	68433594	68433558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	72026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	68544131	68544336	68544235	Y	NA	ZFP90	SMPD3,CDH1,PRMT7,CDH3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	17657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	68778758	68779020	68778839	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	9630	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	68804487	68804868	68804749	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	35359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr16	69019845	69020210	69019891	Y	NA	NA	CHTF8,HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	117257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.61615360302166
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr16	69865358	69865753	69865556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP2	71149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	70060239	70060493	70060397	Y	EXOSC6,WWP2	PDXDC2P	NA	NA	NA	NA	PDXDC2P	37355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	71904264	71904408	71904360	Y	PHLPP2,ZNF821	ATXN1L,IST1,ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	22831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	72257967	72258413	72258290	Y	NA	NA	HPR	IMR90	Hi-C	24141950	TXNL4B	131637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	72966138	72966319	72966212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	74083907	74083919	74083914	Y	NA	NA	HPR	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD7	244754	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	74494901	74495019	74494960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-252A24.2	94763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	74509119	74509400	74509260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-252A24.2	108981	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	74604517	74604869	74604693	Y	FA2H	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	34143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	75290169	75290488	75290250	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	9463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	75454988	75455069	75455029	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	CFDP1	10314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	77217218	77217275	77217245	Y	NA	MON1B,SYCE1L	NA	NA	NA	NA	MON1B	5457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	78090271	78090541	78090406	Y	NA	WWOX	NA	NA	NA	NA	WWOX	40769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	78179636	78179783	78179719	Y	NA	WWOX	NA	NA	NA	NA	WWOX	48326	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	78199099	78199491	78199298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	67789	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	78325751	78325980	78325865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	194441	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	78565966	78565983	78565974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	434656	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	78776344	78776829	78776566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	645034	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	78830248	78830546	78830432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	698938	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	79692252	79692530	79692298	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	DYNLRB2	880101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	80401862	80402147	80402005	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	DYNLRB2	170484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	80971971	80972227	80972105	Y	CENPN	NA	NA	NA	NA	NA	CENPN	65876	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	81434776	81434850	81434813	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	41925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81503648	81503971	81503709	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	26873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81555726	81556034	81555821	Y	CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	78951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81634791	81634955	81634874	Y	GAN	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	135747	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81659418	81659741	81659491	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	81666319	81666849	81666608	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	103853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81732062	81732263	81732080	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	38439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81785976	81786155	81786044	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	PLCG2	ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720	IMR90	Hi-C	24141950	PLCG2	15274	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	81871176	81871311	81871248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	100474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	81876424	81876656	81876582	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	105722	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	82397637	82397646	82397642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	195806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	82667775	82667948	82667787	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	9367	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	29059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	82693893	82694152	82693974	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	35485	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	82733427	82733620	82733554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	75019	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	83480656	83480733	83480694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	358715	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,DNAAF1,TAF1C,RP11-486L19.2	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	84390991	84391238	84391128	Y	OSGIN1,COTL1	ATP2C2	ATP2C2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2C2	8895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	84523883	84523965	84523925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C2	123750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	84641438	84641605	84641502	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	8078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	84674948	84675055	84674964	Y	KLHL36	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	5076	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	84676809	84677221	84677048	Y	KIAA1609	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2910	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr16	84677292	84677600	84677448	Y	NA	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85037797	85037883	85037799	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	5258	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85062384	85062545	85062427	Y	ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	3009	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	6.37584977374871
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	85346294	85346686	85346622	Y	FAM92B	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	286919	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85418434	85418651	85418593	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	303028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85424430	85424739	85424585	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	296940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85557334	85557622	85557547	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	164057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85617282	85617663	85617577	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	104016	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	85734545	85734806	85734797	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	12866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	85995905	85996102	85996008	Y	NA	NA	IRF8,COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	147763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	FOXF1,MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87807027	87807287	87807138	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	9429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	87811234	87811383	87811309	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr16	87823592	87823837	87823720	Y	NA	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	7.80327882757305
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	87888208	87888468	87888297	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	12626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87899593	87899990	87899750	Y	BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	1104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	87986927	87987379	87987279	Y	ZCCHC14,SLC7A5,BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	6077	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88102746	88103509	88103226	Y	BANP,BANP	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	121896	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88560841	88560974	88560886	Y	FAM38A,CBFA2T3,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	43116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88829964	88830251	88830166	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	19368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr16	88836450	88836610	88836518	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	13009	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr16	88860126	88860280	88860179	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	CDT1	7341	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88988977	88989104	88989054	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNS	67599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNS	70326	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	89241276	89241597	89241419	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	CDH15	5101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.47261103531626
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr16	89672117	89672737	89672683	Y	NA	RPL13,SNORD68,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	SNORD68	46275	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr16	90024486	90024764	90024610	Y	NA	TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	DEF8	12153	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	505873	506062	505986	Y	VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	52725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	881410	881576	881449	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	400	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	2143435	2143643	2143533	Y	HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	61034	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	2409124	2409453	2409310	Y	NA	METTL16	NA	NA	NA	NA	METTL16	3732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	2612424	2612524	2612493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	117920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	2627139	2627523	2627311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	132635	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	3698279	3698691	3698534	Y	ZZEF1,ATP2A3	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	3846	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	3699697	3700093	3699885	Y	ZZEF1,ATP2A3	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	2444	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	3701968	3702398	3702112	Y	CTNS,ZZEF1,P2RX1	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	4297300	4297441	4297368	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	69691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	4950916	4951277	4951137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF1C	51673	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	6470839	6471155	6470959	Y	PITPNM3,TXNDC17	NA	PITPNM3	IMR90	Hi-C	24141950	TXNDC17	70923	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	66220	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	6822879	6823265	6823073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67699	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	6839831	6840063	6839905	Y	XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49	NA	LOC100506713,ALOX12,ALOX12P2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC027763.2	73605	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	20328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX10-AS1	395451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	15061931	15062018	15061975	Y	NA	NA	HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA74	413315	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	15363919	15364293	15364237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	111040	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	15850564	15850918	15850801	Y	ADORA2B	ADORA2B,TTC19	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	4333	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	45443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr17	17725605	17725781	17725666	Y	NA	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	12544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	17851403	17851564	17851499	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	22172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	18032331	18032623	18032472	Y	TOM1L2,MYO15A	DRG2,MYO15A	NA	NA	NA	NA	MYO15A	22311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	18106383	18106643	18106603	Y	NA	ALKBH5,LLGL1	NA	NA	NA	NA	LLGL1	20258	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	19207556	19207821	19207642	Y	MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	71213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	19627830	19628049	19627942	Y	MAPK7,MAPK7	SLC47A2	NA	NA	NA	NA	SLC47A2	7538	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	SLC47A2	NA	NA	NA	NA	SLC47A2	36098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	20814751	20814975	20814753	Y	KCNJ18	RP11-344E13.3,CCDC144NL	NA	NA	NA	NA	CCDC144NL	17298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	21029344	21029732	21029473	Y	MAP2K3,MAP2K3,KCNJ18,C17orf103	DHRS7B	NA	NA	NA	NA	DHRS7B	4667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	128282	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	22069559	22069863	22069667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	593837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	25415234	25415538	25415430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	9.23070788139739
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	25676124	25676302	25676192	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	57022	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	26214261	26214593	26214427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	152170	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	89928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	28050852	28051063	28050953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	102927	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	28416461	28416826	28416644	Y	NA	NSRP1	NA	NA	NA	NA	NSRP1	23713	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	19457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	29816760	29817002	29816913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	100118	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	30115229	30115607	30115424	Y	NA	NA	RAB11FIP4,C17orf79,MIR193A,MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	UTP6	111177	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	31598855	31599016	31598936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	396660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	32562458	32562865	32562656	Y	CCL8,CCL7	NA	CCL13	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	723684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	33179831	33179955	33179851	Y	NA	NA	SLC35G3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	106594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	33378276	33378529	33378387	Y	SLFN5,SLFN12L,ZNF830,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	35809	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	33383216	33383365	33383329	Y	SLFN5,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	30973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12	NA	NA	NA	NA	SLFN12	29106	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34887	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	NA	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	MMP28	74896	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	35281857	35282039	35281949	Y	LHX1	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	9921	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr17	36062721	36062883	36062777	Y	DDX52,HNF1B	NA	NA	NA	NA	NA	DDX52	61228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	36480536	36480738	36480637	Y	NA	MRPL45,SOCS7	NA	NA	NA	NA	SOCS7	25373	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	37010933	37011093	37011014	Y	FBXO47,C17orf98	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	RPS20P35	1366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	37065070	37065230	37065172	Y	NA	LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	40958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	37768157	37768448	37768265	Y	NA	STARD3	NEUROD2	K562	ChIA-PET	22265404	STARD3	22870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	37862068	37862252	37862166	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2,ERBB2	ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	PGAP3	11018	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	38680852	38681157	38680975	Y	NA	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TNS4,RARA,CDC6,GJD3,TOP2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	25003	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	38699205	38699580	38699386	Y	RARA,CCR7	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	43356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	39509244	39509577	39509399	Y	KRT40,KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT38,KRT35,KRT37	NA	NA	NA	NA	NA	AC019349.5	145658	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	AC019349.5,KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	AC019349.5,KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	AC019349.5,KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	39705098	39705383	39705310	Y	NA	AC019349.5,KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	22538	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	KRT14,KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT14	5161	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr17	40608913	40609089	40609017	Y	NA	PTRF,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	51	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	41409196	41409569	41409556	Y	TMEM106A	TMEM106A	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM106A	47342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	41478754	41478975	41478864	Y	ARL4D	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	4427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	41546701	41546836	41546769	Y	NA	DHX8	DHX8,ARL4D,LOC100130581	IMR90	Hi-C	24141950	DHX8	12397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	SOST	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	SOST	36668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	42439883	42440065	42439974	Y	NA	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	FAM171A2	640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	42619291	42619496	42619449	Y	NA	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	13429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	43398309	43398621	43398414	Y	NA	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	5895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	268397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	44342171	44342447	44342244	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPT	372423	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.85325878300275
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	45343380	45343597	45343479	Y	TBKBP1	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	78592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	46034209	46034446	46034327	Y	NA	AC003665.1,PNPO,PRR15L,CDK5RAP3	NA	NA	NA	NA	PRR15L	965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	20861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB9,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	47585577	47585730	47585714	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	14922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	47647130	47647802	47647650	Y	NA	NA	ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NGFR	76475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	48136569	48136863	48136794	Y	NA	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	5237	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	29397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	NA	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM92	58692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	53047778	53047982	53047880	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	COX11	3632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	NA	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MMD	181370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	55763716	55764071	55763861	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	161346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	55952714	55953105	55953007	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	27297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	57443948	57444266	57444003	Y	NA	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	36898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	57839956	57840355	57840071	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	56969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	58228293	58228479	58228403	Y	CA4	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR6	74001	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	270370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	61796482	61796787	61796636	Y	NA	STRADA	NA	NA	NA	NA	STRADA	20543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	62491373	62491767	62491605	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	62958497	62958860	62958615	Y	NA	LRRC37A3,AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	10834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	63035715	63036037	63035950	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	14920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	508381	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	64128284	64128318	64128301	Y	CEP112,CEP112	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	57884	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	64503657	64504241	64503882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	206903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	64695504	64695853	64695677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	398750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	64796276	64796554	64796503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	443551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	64947420	64948018	64947947	Y	NA	NA	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HELZ	292087	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	NA	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HELZ	291493	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	65220181	65220399	65220279	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	19706	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	65258633	65258801	65258718	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	SNORA8	6784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	65990543	65990874	65990748	Y	AMZ2,BPTF,C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	2778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	66231111	66231433	66231269	Y	BPTF,SLC16A6	AMZ2,ARSG	NA	NA	NA	NA	AMZ2	10282	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	66452097	66452412	66452224	Y	SLC16A6	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	188409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	67259496	67259857	67259677	Y	ABCA5	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	61528	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	67603336	67603572	67603425	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	194497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	69068010	69068257	69068112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	546862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr17	70374697	70374707	70374702	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	RPL32P33	246663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	225327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	70398105	70398184	70398145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	223186	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr17	70443498	70443728	70443613	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	177642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70464411	70464702	70464656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	156668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70483632	70483939	70483786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	137431	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70484276	70484648	70484400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	136722	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	70577972	70578326	70578149	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	43044	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr17	70585924	70586379	70586141	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	34991	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	71768	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70878609	70878955	70878782	Y	CPSF4L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	207896	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70924179	70924389	70924230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	162462	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	70939903	70940361	70940187	Y	SSTR2,C17orf80	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	146490	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	21247	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.28388648611894
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr17	74359249	74359572	74359412	Y	RHBDF2,SPHK1,SPHK1	SPHK1,PRPSAP1	PRPSAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPHK1	11093	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	74368264	74368743	74368490	Y	SPHK1,SPHK1	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	1922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	75041584	75041844	75041683	Y	SEPT9	LINC00338,SEC14L1	MGAT5B,SRSF2,MFSD11,METTL23,SEC14L1,SEPT9	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00338,SEC14L1	38954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	75096190	75096538	75096428	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	15392	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr17	75223747	75224089	75223824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	142949	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	75302276	75302607	75302432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	221478	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	231793	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.66453423380543
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	423701	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	75567632	75567995	75567917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6C	430254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	75872051	75872295	75872261	Y	TMC6,SOCS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6C	125954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	15.4162337813029
chr17	76154299	76154669	76154484	Y	C17orf99	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	7970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	76379911	76380778	76380428	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	7190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	76434499	76434541	76434520	Y	TMEM235	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	61778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	76588219	76588768	76588537	Y	NA	NA	DNAH17,CYTH1,USP36	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	187611	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	76912078	76912524	76912123	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	6945	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	77178893	77179196	77179046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	77216681	77217055	77216976	Y	RBFOX3	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	147660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	77788517	77788922	77788877	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	15035	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	77816646	77816987	77816930	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	5418	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	77961931	77962339	77962251	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	45308	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.23390653068924
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	78134342	78134588	78134495	Y	NA	EIF4A3	EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A3	15360	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.42582972917841
chr17	78735331	78735538	78735429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	218712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	78800697	78801105	78800867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	162293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	78824691	78824852	78824790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	138546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr17	78844194	78844503	78844331	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	118895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	78864265	78865139	78864341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	98259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	78901796	78901941	78901869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	61457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	79024187	79024380	79024262	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	17239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79064673	79065032	79064884	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	57725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	79107096	79107396	79107264	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	87403	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79313114	79313481	79313281	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,ACTG1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM105	10640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	79439092	79439387	79439261	Y	PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	38702	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79622532	79622843	79622719	Y	NA	TSPAN10,NPLOC4,CCDC137,HGS,ARL16,MRPL12,SLC25A10	NA	NA	NA	NA	CCDC137	8551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	79949658	79950000	79949804	Y	SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	16975	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	79950743	79950987	79950865	Y	SLC25A10,GCGR,DCXR,PCYT2	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	18060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1,TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr17	80794045	80794420	80794166	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	2034	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr17	80832515	80832930	80832613	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36061	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	7.23230720604332
chr17	80834043	80834346	80834307	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	37589	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr17	80889616	80889925	80889758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	93162	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr17	81103238	81103635	81103449	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	67671	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1P1	95844	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	222573	222827	222703	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	43223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr18	679559	679568	679564	Y	NA	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	23219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	28430	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr18	2056727	2056859	2056778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	512649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	2653655	2653795	2653729	Y	NA	CBX3P2	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	2854165	2854304	2854234	Y	NA	NA	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN2	157009	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	2979905	2979994	2979950	Y	SMCHD1	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	31319	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	3509218	3509430	3509419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	99612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	3610673	3610894	3610785	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	201067	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	3630146	3630509	3630328	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	220540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	3787478	3787640	3787637	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	377872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	4004554	4004687	4004639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	594948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	7958203	7958469	7958242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	393423	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9129786	9129925	9129855	Y	PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9554563	9554587	9554575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	58651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9643596	9643835	9643765	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	30358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9658069	9658457	9658201	Y	PPP4R1	PPP4R1,RAB31	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	44831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	9835366	9835644	9835528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	76355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9866165	9866386	9866293	Y	RAB31	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	45613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr18	10766591	10766813	10766750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	242689	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	12059774	12060081	12059918	Y	NA	NA	GNAL,IMPA2	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	80750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	13408431	13408818	13408626	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	315841	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	19453532	19453543	19453538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	170614	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	20128581	20128874	20128764	Y	NA	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	247350	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	21364980	21365182	21365090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	97573	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	23943332	23943387	23943360	Y	KCTD1	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4B	139432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	24251818	24252166	24251992	Y	KCTD1	KCTD1	NA	NA	NA	NA	KCTD1	16453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.66453423380543
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	DSC1	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC1	46026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	29032478	29032594	29032536	Y	NA	DSG3,DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG3	6720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	29034115	29034481	29034298	Y	DSC3,DSG3	DSG3,DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG3	8357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	32436094	32436130	32436112	Y	DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	118762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	33042221	33042422	33042327	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	33533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	33093148	33093751	33093628	Y	GALNT1	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	17193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	33878609	33878753	33878681	Y	FHOD3	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	2932	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	34052267	34052344	34052306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHOD3	176590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	34215471	34215669	34215572	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	191400	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	34532943	34533308	34533124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	125785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	38447528	38447658	38447616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1085513	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	63676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	45398335	45398609	45398472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	56906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46297484	46297823	46297654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	177258	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	46365443	46365671	46365554	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	109410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	18262	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	13311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7077	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46482815	46483020	46482939	Y	NA	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7734	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	43105	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.61455427837573
chr18	46582084	46582553	46582428	Y	SMAD7,DYM	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	107003	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	46754603	46754925	46754865	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	230792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	49747981	49748377	49748370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3C	1005307	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	51151759	51152047	51151782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	597111	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	51675484	51675804	51675634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	73354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	51699489	51699550	51699520	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	49608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	53004994	53005474	53005290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	324544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	54439234	54439547	54439439	Y	WDR7	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	122403	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	54487568	54487957	54487622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	170737	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	55448232	55448442	55448350	Y	NA	ATP8B1	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	19891	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	56208933	56209328	56209119	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	56535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	56337372	56337558	56337406	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	754	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	56533618	56533625	56533622	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	197000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	201305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	57566379	57566616	57566437	Y	NA	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	1199	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	57594468	57594884	57594545	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PMAIP1	29288	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	59617219	59617435	59617354	Y	NA	NA	CDH20,PIGN	IMR90	Hi-C	24141950	PIGN	234916	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr18	60263992	60264160	60264076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	75752	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	60474704	60474908	60474800	Y	ZCCHC2,PHLPP1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	94032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	60904218	60904684	60904493	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	80677	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	SERPINB4,SERPINB3	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB3	23322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	67711885	67712217	67712098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	158964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	67815165	67815405	67815286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	55776	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	72916177	72916455	72916218	Y	NA	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	2848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	307587	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	77267133	77267456	77267187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	170345	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr18	77327843	77328066	77328013	Y	NA	NA	NFATC1,ATP9B	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	109735	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr19	863983	864016	863999	Y	NA	MED16,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	MED16	27202	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	933164	933556	933549	Y	NA	MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	9383	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1133172	1133384	1133209	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	31236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1207906	1208235	1208159	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	STK11	20500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	NA	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP8B3	62725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	7.23230720604332
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2093042	2093330	2093188	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	1342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2625547	2625690	2625618	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A3	112460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	2926811	2926963	2926923	Y	NA	ZNF57,ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	ZNF77	16006	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	3131132	3131258	3131157	Y	NA	GNA11,GNA15	NA	NA	NA	NA	GNA15	2933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	3222791	3223093	3222942	Y	NA	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	39230	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	3231384	3231772	3231576	Y	ZNF555,ZNF77,TLE2,C19orf29,CELF5,CELF5	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	47823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	3450938	3451227	3451079	Y	GNA15	DOHH	NA	NA	NA	NA	DOHH	47711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	3459088	3459397	3459251	Y	NA	DOHH,FZR1	NA	NA	NA	NA	DOHH	39541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr19	3521162	3521389	3521298	Y	FZR1	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16891	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr19	4061318	4061457	4061400	Y	SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	3486	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	4084320	4084813	4084566	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	19377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	5517224	5517513	5517434	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	103533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	5829202	5829624	5829506	Y	NA	DUS3L,FUT3	NA	NA	NA	NA	FUT3	19861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	84805	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	6092440	6092966	6092758	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	104617	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	48461	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	6600003	6600291	6600148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	70993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	7440359	7440731	7440482	Y	NA	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	17268	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	7456079	7456435	7456169	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	7456481	7456588	7456536	Y	LRRC8E,ARHGEF18	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1411	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr19	8634080	8634404	8634151	Y	MARCH2,PRAM1,MYO1F	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF414	57032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	8638437	8638868	8638608	Y	RAB11B,PRAM1,MYO1F	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF414	61389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF414	97102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	119941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	9684452	9684634	9684543	Y	NA	ZNF426,ZNF121,ZNF561	NA	NA	NA	NA	ZNF121	8575	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	9733198	9733520	9733415	Y	NA	ZNF121,ZNF561	NA	NA	NA	NA	ZNF561	3123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	10215832	10216068	10215900	Y	S1PR5,S1PR5,ANGPTL6	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,SNORD105B,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	867	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	10865897	10866291	10865968	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	39142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	10988040	10988081	10988060	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	7851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.37904842304056
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	12947043	12947383	12947213	Y	MAST1	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN,HOOK2,DNASE2	NA	NA	NA	NA	RTBDN	2801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	12957682	12957886	12957783	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN,HOOK2,DNASE2,GCDH	NA	NA	NA	NA	RTBDN	13440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.66453423380543
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	13324184	13324516	13324349	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	64955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	13944151	13944331	13944193	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	39877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	13959901	13960035	13959978	Y	CCDC130,RFX1,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	54979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	14664309	14664503	14664361	Y	OR7C2	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	16371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	14665322	14665552	14665478	Y	SLC1A6	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	15322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	14789611	14789897	14789753	Y	OR7A17,OR1I1,SLC1A6	ZNF333	NA	NA	NA	NA	ZNF333	8716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	15321082	15321623	15321224	Y	RASAL3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	11290	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	15944737	15944873	15944829	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	6966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr19	16193841	16194249	16194048	Y	NA	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	TPM4	18010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	16480475	16480862	16480751	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	46847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	16510195	16510544	16510471	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	70352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	16560891	16561165	16561157	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	19731	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	17127706	17127720	17127713	Y	NA	CPAMD8	NA	NA	NA	NA	CPAMD8	7905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	17131732	17132248	17131919	Y	NA	CPAMD8	NA	NA	NA	NA	CPAMD8	3377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	17224246	17224646	17224434	Y	MED26,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	39655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.33066779225679
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	18504645	18504988	18504829	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,UBA52,ELL,LRRC25	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	21104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	18528819	18529396	18529072	Y	ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1145	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	18600936	18601077	18601043	Y	NA	ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	29860	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	18603161	18603534	18603395	Y	NA	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	27403	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	18874702	18875152	18875024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF1	65595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	21617862	21618096	21617867	Y	NA	ZNF493	NA	NA	NA	NA	ZNF493	39941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr19	28208615	28209033	28208726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1493415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	28252106	28252716	28252616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	32866000	32866258	32866129	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	DPY19L3	28191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	33664629	33664677	33664651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH1	94843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	33740333	33740640	33740371	Y	NA	NA	CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPA	50830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	33841444	33841736	33841590	Y	NA	CEBPA,CEBPG	CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPG	20500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	34301645	34301872	34301668	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	16807	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr19	35605566	35605978	35605759	Y	MAG,FFAR1,LGI4	FXYD3,LGI4,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,LGI4,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	35661278	35661320	35661299	Y	FFAR2	LGI4,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	17645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	36202440	36202452	36202444	Y	CD22,FFAR1,NFKBID,ZBTB32,U2AF1L4	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55	NA	NA	NA	NA	IGFLR1	28902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	38186506	38186731	38186619	Y	ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573	ZNF607	NA	NA	NA	NA	ZNF607	21960	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF1	143058	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	38674383	38674545	38674477	Y	ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1	DPF1	NA	NA	NA	NA	DPF1	43809	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	40466097	40466407	40466254	Y	ZNF546,FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546	NA	NA	NA	NA	PSMC4	8505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	30176	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	41037324	41037469	41037389	Y	ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	43288	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	41701582	41701929	41701850	Y	CYP2A13,CYP2F1	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	4628	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,B3GNT8,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42027706	42027846	42027786	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	42711906	42712521	42712423	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	9771	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr19	42902919	42903213	42903066	Y	TMEM145	NA	CNFN	MCF7	ChIA-PET	22265404	MEGF8	75158	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42924318	42924497	42924408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	96557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	42925830	42926271	42926103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	98069	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	44113081	44113405	44113330	Y	NA	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4	NA	NA	NA	NA	ZNF428	8621	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45189303	45189576	45189367	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	44205	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	45826869	45827146	45827057	Y	DMPK,RTN2,CKM	KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	7546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	9958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	45952039	45952594	45952534	Y	GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	16659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	OPA3,EML2,GIPR	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3	NA	NA	NA	NA	CALM3	39864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	AP2S1	95991	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.94842071992437
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,PRR24,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	PRR24	29496	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	47890403	47890638	47890521	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	30142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	47892475	47892975	47892646	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	27805	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	49832847	49832906	49832877	Y	PTH2	CTC-301O7.4,DKKL1,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	8959	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	CTC-301O7.4,DKKL1,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	4420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,FLT3LG,RPL13A,SNORD32A,SNORD33,SNORD34,SNORD35A,RPS11,SNORD35B,FCGRT	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	51059089	51059663	51059341	Y	KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	46479	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	47334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.47421035996219
chr19	51221435	51221859	51221691	Y	KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1	NA	NA	NA	NA	NA	C19orf81	70733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	51465501	51465788	51465642	Y	SYT3,SYT3,LOC342918,ACPT,KLK14,IGLON5,ETFB,C19orf75,KLK4	KLK5,KLK6,KLK8,KLK9	NA	NA	NA	NA	KLK6	5141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF845	107141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	53917190	53917573	53917346	Y	NA	ZNF765,ZNF761	NA	NA	NA	NA	ZNF761	15654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	79524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	54116077	54116235	54116154	Y	NA	NA	DPRX	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF813	147088	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	55699968	55700281	55700219	Y	NA	TNNT1	NA	NA	NA	NA	TNNT1	41246	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	56789143	56789486	56789342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	88266	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr19	56805864	56806246	56806055	Y	NLRP11,NLRP8,NLRP5,ZSCAN5A,ZNF583,ZNF583,ZNF583	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	71506	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	66516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	57965552	57965851	57965609	Y	NA	ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF749	20855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr19	58217187	58217439	58217313	Y	NA	ZNF551,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF551	25850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	44565	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	MGC2752	3527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	129541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	934141	934402	934285	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	258702	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	1676691	1676995	1676843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	1001252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	1046711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	1725652	1725860	1725698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	1050213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	3508183	3508316	3508315	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	13191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	3699787	3700199	3700016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7	78992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	6091756	6092149	6091862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAD2	911788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	8144336	8144872	8144521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	672103	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9427289	9427526	9427454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82395	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr2	9428594	9428712	9428653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	83700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9475782	9475835	9475817	Y	KIDINS220,ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB1BP1	85841	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	10984211	10984590	10984279	Y	NA	PDIA6	C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDIA6	8108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	11162773	11163017	11162914	Y	NA	NA	ATP6V1C2,PDIA6,KCNF1,FLJ33534	IMR90	Hi-C	24141950	PQLC3	130307	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	11443913	11444199	11444137	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	42257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	68329	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	15309828	15310293	15310034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	389161	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	15339978	15339997	15339988	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	359457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	15397207	15397542	15397373	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	301912	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	15570627	15571117	15570982	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	128337	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	15629690	15629929	15629800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	69525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	15783989	15784378	15784047	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NA	NA	NA	NA	NA	DDX1	54687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	16770965	16771342	16771154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	74257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	17005594	17005646	17005620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	159995	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	106096	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.23550585533517
chr2	19150904	19151018	19150988	Y	NA	NA	MIR4757,OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	410958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	19464609	19464927	19464768	Y	NA	NA	NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	TTC32	634820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20341243	20341467	20341355	Y	NA	NA	PUM2,WDR35,MATN3,SDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC1	81727	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20372050	20372172	20372122	Y	SDC1,SDC1	NA	MATN3,SDC1,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	SDC1	51022	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20379968	20380084	20380011	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	43110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20384416	20384642	20384519	Y	HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	38552	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr2	20412281	20412403	20412381	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10791	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	20412962	20413136	20413039	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10058	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr2	20417309	20417694	20417511	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	5500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.37904842304056
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	1527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	20435780	20436055	20435965	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	12586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	23095033	23095160	23095097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	510928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	23631132	23631189	23631161	Y	NA	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	25044	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	24324329	24324521	24324426	Y	NA	SF3B14,TP53I3,PFN4	NA	NA	NA	NA	TP53I3	17598	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	24512394	24512744	24512638	Y	NA	RPL36AP13	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	42637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	154309	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	124324	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	25545894	25546051	25546003	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	17408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	26231667	26232185	26231781	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	22791	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	26241064	26241266	26241191	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	13710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	26291590	26291772	26291648	Y	FAM59B,RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	36614	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr2	26634949	26635470	26635230	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	GPR113	67264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	26919291	26919602	26919376	Y	NA	AC015977.5	NA	NA	NA	NA	AC015977.5	19913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.9500200445703
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr2	27557346	27557529	27557503	Y	DPYSL5,C2orf16	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513	NA	NA	NA	NA	MPV17	10799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr2	28003613	28003725	28003670	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	11029	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28077414	28077634	28077524	Y	ZNF513,ZNF513,RBKS	BRE,RBKS	MRPL33	IMR90	Hi-C	24141950	BRE	33174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28181257	28181638	28181448	Y	C2orf16	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	69292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28567642	28567818	28567722	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	45497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28582195	28582710	28582283	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	30605	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28600937	28601380	28601351	Y	RBKS,BRE,BRE,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	RBKS,BRE,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,MRPL33,LOC100505716,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	11935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC104695.3	43978	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	152037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	37190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	29055098	29055343	29055221	Y	SPDYA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	35824	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	29349196	29349466	29349333	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	30625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	29352302	29352469	29352324	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	33731	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	29435309	29435425	29435367	Y	SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	116738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	29485561	29485725	29485698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	166990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	NA	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL5	72855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	30791728	30792075	30791902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	123636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN13	153314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	30889265	30889652	30889547	Y	NA	NA	YPEL5,LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CAPN13	151756	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	33111186	33111571	33111379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	58468	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	33295461	33295712	33295665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	125422	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	34402780	34402960	34402870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98A	580331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	37043619	37043714	37043667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	147901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	37199283	37199286	37199285	Y	NA	STRN	NA	NA	NA	NA	STRN	7668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	37497492	37497655	37497574	Y	HEATR5B	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	40636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	37972203	37972477	37972340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	8592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	82480	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	39340813	39341200	39341198	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	8286	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	40899157	40899397	40899276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	62964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	42068299	42068635	42068587	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	204525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	42149327	42149700	42149496	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	123460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	226687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	AC016735.2	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	49050	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43567873	43568259	43568066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	116125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43630412	43630826	43630435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	178664	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43685237	43685474	43685356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43705862	43706134	43705998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	115051	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43746950	43747270	43747109	Y	ZFP36L2	NA	LOC100129726,ZFP36L2	K562	ChIA-PET	22265404	THADA	73915	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	43846144	43846165	43846154	Y	NA	THADA,PLEKHH2	PLEKHH2,LRPPRC,ABCG5,DYNC2LI1,ABCG8	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHH2	16247	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	44542790	44543096	44543052	Y	SLC3A1	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	43905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	44944979	44944991	44944986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	276561	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	45881346	45881543	45881445	Y	NA	SRBD1,PRKCE	NA	NA	NA	NA	PRKCE	4862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	46689045	46689341	46689164	Y	TTC7A,MCFD2,RHOQ	NA	EPAS1,PRKCE,PIGF,CRIPT,ATP6V1E2,RHOQ,LOC388946,SOCS5,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOQ	77604	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	47214273	47214540	47214407	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	47279	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1876835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	53331505	53331666	53331586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	661263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54165408	54165630	54165519	Y	NA	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	ACYP2	30345	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54270419	54270555	54270547	Y	GPR75,ACYP2	NA	SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	74442	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54714209	54714329	54714214	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	32787	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54751942	54752182	54752042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	70520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	131636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	102693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54967479	54967831	54967651	Y	NA	EML6	NA	NA	NA	NA	EML6	18843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	54971761	54972012	54971777	Y	NA	EML6	NA	NA	NA	NA	EML6	23125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	55248216	55248544	55248355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	89213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	55360588	55360689	55360671	Y	NA	RTN4	RTN4,C2orf63,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	22831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	55364745	55365096	55365046	Y	NA	RTN4	RTN4,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	26988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	56344982	56345239	56345001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007743.1	65666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	59662882	59663257	59663070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	946483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	60228228	60228402	60228315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	381338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	60712095	60712413	60712305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	66289	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	60760023	60760353	60760231	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	18349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	61140048	61140151	61140100	Y	REL	REL	NA	NA	NA	NA	REL	33392	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REL	58707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	61204524	61204872	61204698	Y	NA	PEX13,PUS10	REL	IMR90	Hi-C	24141950	PEX13	37488	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	61207503	61207627	61207564	Y	NA	PEX13,PUS10	NA	NA	NA	NA	PEX13	34733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr2	62422210	62422461	62422453	Y	NA	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	962	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	62881470	62881867	62881666	Y	NA	EHBP1	EHBP1,TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	EHBP1	17119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	64368431	64369198	64368837	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	58	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	65440417	65440444	65440431	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	LOC400958,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007318.5	10280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	65583296	65583698	65583484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRED2	74073	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	68971664	68971962	68971728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	266348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	69012672	69013051	69012681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	225259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	69036777	69036835	69036806	Y	ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	201475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	69040869	69041120	69040946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	197190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	69309666	69309994	69309927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	71356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	69533320	69533461	69533391	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78921	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	70145725	70146134	70145771	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	70154281	70154743	70154417	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	31461	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	70255582	70255905	70255725	Y	MXD1,PCBP1	NA	NA	NA	NA	NA	PCBP1	56680	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	70273102	70273420	70273221	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	39165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	678454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	634159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	72713565	72713630	72713598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	337540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	72748040	72748317	72748179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	302853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	72774678	72774916	72774797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	276254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	74298270	74298885	74298717	Y	MOBKL1B	FNBP1P1	NA	NA	NA	NA	FNBP1P1	46922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	74930564	74930823	74930694	Y	NA	AC007387.2	NA	NA	NA	NA	AC007387.2	49123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	75770641	75770653	75770647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	101256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	75775367	75775568	75775468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	96341	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	78631329	78631672	78631604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	617821	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	80264039	80264430	80264177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	123831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.66293490915951
chr2	81781528	81781694	81781559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	1261561	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	81820947	81821308	81821128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	1221947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	85465044	85465114	85465079	Y	SH2D6	NA	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	88434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	85483180	85483288	85483234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	70260	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	86922220	86922584	86922381	Y	NA	RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3	NA	NA	NA	NA	RMND5A	22712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826664	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	95925847	95925871	95925861	Y	NA	PROM2	PROM2	IMR90	Hi-C	24141950	PROM2	12330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	NEURL3	19761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	97222458	97223029	97222771	Y	DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	21978	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	97472369	97472711	97472456	Y	ANKRD36,ARID5A,KIAA1310,CNNM3	CNNM4,CNNM3,ANKRD23,ANKRD39	CNNM3	IMR90	Hi-C	24141950	CNNM3	7271	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	89408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	99081402	99081780	99081544	Y	TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	INPP4A	22085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	99452356	99452772	99452668	Y	TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	106767	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	525815	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	101872333	101872649	101872491	Y	RNF149	TBC1D8,SNORD89	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	5005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	102492851	102493221	102493042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R2	113085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	102516830	102516950	102516890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R2	89356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	103104673	103104833	103104753	Y	IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP	NA	NA	NA	NA	NA	IL18R1	178684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	106412674	106413002	106412675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	53320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	106545066	106545218	106545146	Y	NA	NA	LOC285000	IMR90	Hi-C	24141950	NCK2	185712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	106809174	106809856	106809272	Y	UXS1	UXS1	NA	NA	NA	NA	UXS1	379	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	111829364	111829577	111829485	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	45378	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	112375521	112375561	112375551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	264706	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	112789561	112789661	112789622	Y	MERTK	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	21139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	113448371	113448563	113448450	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NT5DC4	28500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	113450750	113451037	113450852	Y	NA	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	113571813	113572166	113571903	Y	NA	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	20314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	113576216	113576532	113576373	Y	IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	15948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	113581693	113582026	113582010	Y	NA	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	10454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	113582240	113582548	113582356	Y	NA	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	9932	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	113635122	113635394	113635287	Y	NA	IL1B	IL1B,CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	42642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	113835949	113836406	113836219	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	IL36G	107169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	113916006	113916157	113916098	Y	IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN	NA	IL1RN,LOC654433,PAX8,PSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAX8-AS1	50942	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr2	114126317	114126521	114126419	Y	IL1F10,IL1F10	NA	PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	159218	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	114134240	114134872	114134598	Y	IL36G,IL36B,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	167141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	114652011	114652405	114652035	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	6474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	118722673	118722961	118722817	Y	NA	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	46748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	120222602	120222796	120222714	Y	NA	TMEM37	NA	NA	NA	NA	TMEM37	37125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	120905923	120906046	120905986	Y	EPB41L5,EPB41L5	NA	NA	NA	NA	NA	AC012363.4	66074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	AC012363.4,TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALB	204727	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC3	73929	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	128119420	128119722	128119576	Y	NA	MAP3K2	IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	24319	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	128136277	128136580	128136554	Y	NA	MAP3K2	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	7461	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	29424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2B	736193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.33066779225679
chr2	131112712	131112965	131112906	Y	NA	IMP4,CCDC115,PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	1132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	NA	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM168B	293213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	131582042	131582382	131582235	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	266651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	131586593	131586950	131586772	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	262083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	133803546	133803723	133803632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	376394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	134544977	134545065	134545021	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT5	330489	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	139342135	139342417	139342276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	84764	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	142789500	142789791	142789646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	843276	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	143720663	143721004	143720729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	87596	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	146497977	146498288	146498235	Y	NA	NA	DKFZp686O1327,ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	405179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	149017229	149017560	149017414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORC4	240082	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr2	149267026	149267240	149267133	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	132769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	149416749	149416956	149416876	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	16740	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	150999673	151000010	150999769	Y	NA	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	393515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	152971717	152971973	152971845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	58533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	153429708	153430091	153429909	Y	PRPF40A	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	142316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	156832393	156832495	156832444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	364365	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	158102968	158103210	158103130	Y	NA	NA	NR4A2,GALNT5	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1C	380307	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	159951081	159951241	159951194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANC1	127935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	160059380	160059738	160059444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	81572	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	160371940	160372153	160372033	Y	MARCH7,LY75,CD302,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	54173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	160817748	160817942	160817845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	99179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	161013283	161013451	161013369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	96162	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	161014381	161014772	161014663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	97260	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITGB6	61519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	161077067	161077509	161077240	Y	ITGB6	ITGB6	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	48890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	161085071	161085550	161085302	Y	NA	ITGB6	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	40849	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	161086140	161086681	161086297	Y	NA	ITGB6	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	39718	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	161177458	161178011	161177649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB6	51059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	161924330	161924566	161924395	Y	TANK	NA	RBMS1,ITGB6	IMR90	Hi-C	24141950	TANK	66853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	164501816	164502222	164502220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	88300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	165371083	165371396	165371192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	104962	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP3	162412	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	166523404	166523752	166523720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT3	125440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	166631165	166631444	166631305	Y	NA	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	GALNT3	17748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	AC009495.2	190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	AC009495.2	21885	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	166734901	166734996	166734949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	73357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	168911148	168911462	168911308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016723.4	115494	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	169347640	169347834	169347737	Y	NA	CERS6	NA	NA	NA	NA	CERS6	37268	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	169402356	169402715	169402396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	91984	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	169434382	169434732	169434541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	124010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	171003090	171003284	171003187	Y	NA	NA	UBR3	IMR90	Hi-C	24141950	UBR3	321122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	173061382	173062264	173061777	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	95754	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	174016358	174016802	174016556	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	200746	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	177047108	177047317	177047213	Y	NA	HOXD-AS2,AC009336.24,HOXD-AS1,AC016739.2	NA	NA	NA	NA	HOXD-AS1	4369	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	177419249	177419407	177419328	Y	NA	NA	HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01117	81031	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	177518737	177518933	177518835	Y	NA	LINC01117,LINC01116	HOXD10,HOXD11,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD9,HOXD4,MIR10B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01116	18078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr2	178131060	178131559	178131324	Y	NA	MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	12322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	178261376	178261686	178261570	Y	NA	AGPS,AC074286.1,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	5951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	180325251	180325377	180325327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	197734	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	182655515	182655597	182655556	Y	NA	NA	SSFA2,PPP1R1C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SSFA2	98963	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	187194208	187194220	187194214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	154663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	187318926	187319192	187319071	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	29691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	187409105	187409391	187409239	Y	ITGAV,ITGAV	ITGAV	ITGAV	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGAV	43401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR75	260332	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	NA	NA	NA	NA	NA	AC019178.2	63630	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	191447882	191447975	191447929	Y	NA	NA	TMEM194B,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	50434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	191708638	191708846	191708778	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	191709136	191709198	191709167	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	191709790	191710154	191709972	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	33399	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	191992847	191993155	191993001	Y	STAT4	STAT4	NA	NA	NA	NA	STAT4	21167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	192034233	192034465	192034355	Y	MYO1B,MYO1B	STAT4	MYO1B,STAT4,OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STAT4	19911	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	192066963	192067214	192067088	Y	STAT4,MYO1B,MYO1B	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1B	40697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	192112527	192112680	192112632	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	4616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	192123995	192124097	192124046	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	16084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr2	192170125	192170408	192170266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	62214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	206332	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	164749	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	194838514	194838698	194838568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	1600003	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	197078069	197078253	197078160	Y	STK17B	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	38842	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	197787148	197787421	197787192	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	3099	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	200209653	200209909	200209897	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	124080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	201289842	201289940	201289893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	82791	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10	NA	NA	NA	NA	CASP10	32977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	202100663	202100910	202100770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP10	55059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	202127532	202127774	202127615	Y	CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CASP8	NA	NA	NA	NA	NA	CASP10	81928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	202302698	202302857	202302778	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR	TRAK2	NA	NA	NA	NA	TRAK2	11445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	203159775	203160145	203159798	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	31336	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	203726604	203726681	203726643	Y	FAM117B,CYP20A1,ABI2,ICA1L,ICA1L,ALS2CR8,ALS2CR8	ICA1L	NA	NA	NA	NA	ICA1L	8027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	204667019	204667435	204667267	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	268886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	206613471	206613845	206613585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	68757	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	207348794	207348941	207348896	Y	NA	ADAM23	NA	NA	NA	NA	ADAM23	42531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	97638	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208259563	208259980	208259919	Y	NA	NA	KLF7	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	132481	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208369274	208369395	208369347	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	23066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208378687	208378932	208378791	Y	CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	13529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	208602415	208602802	208602609	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	28151	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	210046809	210047163	210046986	Y	MAP2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	239619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	210233724	210233884	210233805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	52898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	212368666	212368999	212368856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC013404.1	206752	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	213708586	213709017	213708777	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	IKZF2	306134	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	213842063	213842076	213842069	Y	IKZF2,IKZF2	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	173075	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	216216233	216216482	216216439	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	41693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	216222811	216223009	216222866	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48271	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	614516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr2	218764264	218764471	218764407	Y	TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	101247	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	185571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	187477	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	199947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	NA	NA	NA	NA	NA	NHEJ1	195329	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.1	6236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	220695146	220695491	220695319	Y	SLC4A3	NA	NA	NA	NA	NA	AC009502.1	147629	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	223757137	223757389	223757313	Y	NA	ACSL3	NA	NA	NA	NA	ACSL3	33485	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	223824867	223825201	223825044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	101215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	226979861	226980232	226980018	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	682243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	227002262	227002653	227002458	Y	NA	NA	LOC646736,IRS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	659822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr2	227015814	227016273	227016071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	646202	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	227331006	227331180	227331162	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	331295	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	227508782	227509042	227508912	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	153433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr2	227849549	227849707	227849645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	151252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	228331050	228331499	228331159	Y	NA	AGFG1	AGFG1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	3369	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	230118973	230119267	230119206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO36	665751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	231636017	231636396	231636213	Y	NA	BANF1P3	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	47899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	46389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	233283707	233283952	233283753	Y	ALPPL2	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	14154	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	233563344	233563704	233563468	Y	NA	GIGYF2	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	3335	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	206788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr2	234156397	234156705	234156566	Y	INPP5D,DGKD	ATG16L1,SCARNA5	NA	NA	NA	NA	SCARNA5	25668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	17245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	32501	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	235354817	235355457	235355266	Y	ARL4C	ARL4C	SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	48240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	235732390	235732720	235732555	Y	NA	NA	SH3BP4,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	125897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr2	236930696	236930917	236930807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	143173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	237654357	237654656	237654652	Y	CXCR7	NA	CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	337299	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr2	237657869	237658188	237658029	Y	NA	NA	CXCR7	MCF7	ChIA-PET	22265404	COPS8	333767	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	237677514	237677881	237677605	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	314074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	237678524	237678883	237678772	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	313072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	305881	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr2	237878112	237878296	237878204	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	113659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	239034841	239035063	239035020	Y	LRRFIP1,KLHL30	KLHL30,FAM132B	NA	NA	NA	NA	KLHL30	10300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	KLHL30,FAM132B	NA	NA	NA	NA	KLHL30	5291	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.47421035996219
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr2	239631175	239631419	239631288	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	ASB1	297792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	240243731	240244004	240243870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	77126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	AC005237.4,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr2	242425566	242425726	242425646	Y	NA	STK25	NA	NA	NA	NA	STK25	21419	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	242791150	242791474	242791404	Y	NA	PDCD1,AC131097.3	NA	NA	NA	NA	PDCD1	7586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr2	243028160	243028467	243028224	Y	ATG4B	AC093642.5	NA	NA	NA	NA	AC093642.5	317	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	268547	268840	268655	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12	NA	NA	NA	NA	C20orf96	550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	453687	453779	453733	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	12490	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr20	1333009	1333271	1333126	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	30663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115061	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	1785698	1786068	1785859	Y	SIRPA,SIRPA	NA	LOC100289473,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	87086	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	1786412	1786943	1786683	Y	NA	NA	LOC100289473,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	86211	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	63717	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	1925678	1926256	1925964	Y	SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	52524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	3377596	3377907	3377772	Y	C20orf194	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	8365	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	3993168	3993585	3993445	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	4493607	4493844	4493709	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	PRNP	171038	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	5900000	5900262	5900165	Y	GPCPD1,TRMT6	TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	TRMT6	28920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	6094285	6094396	6094341	Y	NA	FERMT1	NA	NA	NA	NA	FERMT1	7795	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	7058177	7058257	7058218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	311866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	7967671	7967684	7967678	Y	NA	TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	30792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr20	11831025	11831188	11831107	Y	BTBD3	BTBD3	NA	NA	NA	NA	BTBD3	38183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	14248741	14249040	14248807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	67222	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	16331149	16331548	16331320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	220530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	17830512	17830807	17830760	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110782	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	17830949	17831353	17831268	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	18650258	18650491	18650292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	83721	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	19804713	19804972	19804782	Y	NA	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	68361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	114042	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	19967147	19967464	19967305	Y	NA	NAA20	NA	NA	NA	NA	NAA20	28296	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	20009163	20009558	20009361	Y	NA	NAA20,C20orf26,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	NAA20	13403	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	21170951	21171134	21171012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	66327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	XRN2	135078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	21489032	21489415	21489222	Y	PAX1,NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NA	XRN2	207090	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	22743134	22743499	22743315	Y	NA	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	585874	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	584873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr20	23075489	23075921	23075757	Y	THBD,CD93,GZF1	NA	SSTR4	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	253452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	23077676	23077974	23077860	Y	THBD	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	251399	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr20	23123782	23124035	23123853	Y	NA	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	205338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	23136585	23137102	23136883	Y	THBD,CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	192271	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	23140057	23140426	23140138	Y	THBD,CD93,NXT1,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	188947	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	24709936	24710315	24710275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS1	327301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	116327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr20	29649919	29650288	29650100	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	40062	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	30190743	30190994	30190797	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	92	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	30705137	30705472	30705281	Y	HCK,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	9828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr20	31127706	31127839	31127777	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	43037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	31687729	31687935	31687834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	282030	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	33152713	33153029	33152857	Y	TP53INP2	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	50499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	33643621	33643805	33643685	Y	TP53INP2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	34869	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	33735973	33736225	33736096	Y	TRPC4AP,EDEM2	PROCR	NA	NA	NA	NA	PROCR	21651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	33907745	33907913	33907842	Y	MMP24,GDF5	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36957	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	33943108	33943431	33943270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF6	72320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr20	35489284	35489554	35489419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	88692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	35572677	35573004	35572914	Y	RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5242	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	35874402	35874620	35874497	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41421	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	35960561	35961009	35960864	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	10079	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36041191	36041579	36041445	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	30357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36042310	36042952	36042529	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	28984	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36050245	36050646	36050634	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	21290	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	36616982	36617239	36617111	Y	NA	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	42631	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	NA	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPRD1B	136760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	36899646	36899868	36899757	Y	BPI	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG11	173353	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	37435049	37435642	37435193	Y	RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR5	59964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	37603521	37603525	37603523	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	14579	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	38844790	38845079	38844935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-52P	805766	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	39091983	39092134	39092059	Y	NA	NA	MAFB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU2-52P	558711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	39632234	39632572	39632465	Y	MAFB,TOP1	RNU2-52P,TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU2-52P	18273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	RNU2-52P,TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	39878072	39878223	39878164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX3	66089	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	41577893	41577991	41577942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF6	506577	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	42118767	42119112	42118938	Y	PTPRT,TOX2,SGK2,L3MBTL1	SRSF6	SGK2	IMR90	Hi-C	24141950	SRSF6	34199	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr20	42718699	42718853	42718776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPH2	95365	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	42847207	42847559	42847248	Y	NA	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	9607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	43272652	43273023	43272879	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA,RP11-445H22.3	NA	NA	NA	NA	ADA	5851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr20	43569969	43570092	43570031	Y	RBPJL,TP53TG5,STK4	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	17035	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFDC5	51465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	43700046	43700199	43700110	Y	NA	WFDC5	NA	NA	NA	NA	WFDC5	41614	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	43744637	43744818	43744729	Y	WFDC5	WFDC5	NA	NA	NA	NA	WFDC5	2824	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	WFDC5,PI3	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	WFDC5	25519	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	43869504	43869693	43869682	Y	DBNDD2,SLPI	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	11512	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	44062032	44062200	44062120	Y	KCNS1,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,WFDC11,WFDC6	PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	19315	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	44136889	44137182	44137082	Y	NA	WFDC2	NA	NA	NA	NA	WFDC2	40543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	WFDC3	8067	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF335	23299	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	44658598	44659307	44659051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA5	57284	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	45399106	45399311	45399226	Y	NA	NA	NCOA3,EYA2,ZMYND8,C1orf201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	TP53RK	82688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.9500200445703
chr20	45526625	45526933	45526720	Y	NA	EYA2,RP11-323C15.2	NA	NA	NA	NA	RP11-323C15.2	1432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	45787211	45787318	45787265	Y	EYA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1050K3.3	88707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	23191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	46122337	46122452	46122395	Y	NA	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NCOA3	6149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	46162026	46162326	46162051	Y	NA	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NCOA3	33425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	46394797	46395044	46394952	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	18316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	46420724	46421103	46420967	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	7364	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	46556797	46557054	46556926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	143437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	46601191	46601469	46601377	Y	SULF2,SULF2	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	187831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	7.23230720604332
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1,SNORD12B,SNORD12	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	48065517	48065771	48065626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD12	170297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.37904842304056
chr20	48200728	48200848	48200788	Y	PTGIS	NA	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	B4GALT5	127567	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr20	48496798	48497000	48496896	Y	NA	SPATA2	NA	NA	NA	NA	SPATA2	33080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	48617449	48617575	48617507	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	19913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	48707582	48707967	48707775	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	22529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	48760872	48761304	48761158	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	6870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49047228	49047674	49047434	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	77217	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.56777297223788
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	49063008	49063172	49063083	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	61719	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49067387	49067853	49067497	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B	IMR90	Hi-C	24141950	PTPN1	57038	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	49130261	49130753	49130448	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	5370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49134968	49135201	49135019	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	10077	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	49487134	49487591	49487436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	57930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49598879	49599145	49599015	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3,KCNG1	NA	NA	NA	NA	MOCS3	25516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	49976918	49977375	49977162	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	339252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr20	50072988	50073809	50073517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	275263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	50098116	50098381	50098249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	250691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	50692863	50693237	50693120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	125610	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	52374184	52374569	52374228	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	149738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	52516990	52517464	52517242	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	292544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	52570477	52570680	52570623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	251706	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	52726626	52726868	52726743	Y	CYP24A1	NA	CYP24A1,DOK5	IMR90	Hi-C	24141950	PFDN4	95518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	NA	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	81749	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	PFDN4	NA	NA	NA	NA	PFDN4	37366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr20	52812299	52812959	52812479	Y	NA	PFDN4	SULF2,DOK5,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PFDN4	9427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	53262462	53262813	53262618	Y	DOK5	NA	NA	NA	NA	NA	RPL12P4	426342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	160352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	161109	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	55403523	55403730	55403625	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	201165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	55780606	55780977	55780774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP7	58708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr20	55985197	55985345	55985270	Y	RBM38,ZBP1	RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	20734	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	56256436	56256465	56256451	Y	RBM38,ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28127	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr20	56577898	56577909	56577904	Y	NA	NA	PMEPA1,C20orf85,ZBP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PMEPA1	293306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	56592321	56592469	56592395	Y	PMEPA1,PMEPA1	NA	ZBP1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	290026	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	57032377	57032636	57032571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APCDD1L	55551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	57579440	57580501	57580194	Y	NA	ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	57734969	57735118	57735019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	119005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	57739159	57739461	57739442	Y	ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	123195	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	61565	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	58552421	58552506	58552458	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3	PPP1R3D	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	39069	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	58803424	58803657	58803451	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	290072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	812000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	60500389	60500694	60500636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	138172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr20	60500931	60501230	60501128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	137636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr20	60735261	60735480	60735370	Y	NA	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	18439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	60972798	60973035	60972874	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	7306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	61001783	61002051	61001918	Y	NA	RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	21442	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,OGFR-AS1	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr20	61804100	61804419	61804293	Y	DIDO1	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	41167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	61903396	61903541	61903451	Y	NKAIN4	ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	ARFGAP1	1259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	62243705	62243960	62243817	Y	TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,PRIC285,PRIC285,GMEB2	GMEB2,CTD-3184A7.4,RTEL1	NA	NA	NA	NA	GMEB2	12434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	RTEL1,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	ZGPAT	22592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.75809684608113
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	11118249	11118623	11118434	Y	NA	NA	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	TPTE	90530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	15906159	15906635	15906455	Y	HSPA13,SAMSN1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	152354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	15940274	15940507	15940416	Y	HSPA13,NRIP1,SAMSN1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	186469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	16222795	16222981	16222977	Y	NA	NA	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRIP1	212340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr21	16596629	16597038	16596898	Y	NRIP1	NA	NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	161308	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr21	17103695	17103792	17103750	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	3351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	859056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	18984370	18984546	18984496	Y	NA	BTG3	NA	NA	NA	NA	BTG3	1105	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr21	26980548	26980842	26980671	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	2719	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	27242944	27243154	27243052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	136960	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr21	27285950	27286116	27286033	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	179966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	29186148	29186441	29186404	Y	NA	NA	LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	232292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	29461833	29462120	29461977	Y	NA	AL035610.1	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	43100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	346961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.04518198149192
chr21	30009367	30009732	30009551	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	245961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	9.04038400755414
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	30751100	30751464	30751308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	186708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	32553780	32554124	32553993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	376166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	32862869	32863036	32862944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	67254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chr21	33104933	33105321	33105127	Y	NA	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	2545	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	34587985	34588369	34588051	Y	NA	IFNAR2,IL10RB	IFNAR2,TMEM50B,IFNGR2	IMR90	Hi-C	24141950	IFNAR2	11837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	34674511	34674777	34674731	Y	OLIG2,OLIG1,IFNAR2,SON,IFNGR2,GART,GART,IL10RB,IFNAR1	IL10RB,IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	19957	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	34736733	34736848	34736790	Y	OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNAR1,IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	36354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	34801962	34801998	34801980	Y	NA	IFNGR2,TMEM50B	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	28760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	35312592	35312729	35312724	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	26308	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	241981	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	36349860	36350141	36349984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	364419	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	36351037	36351195	36351156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	365596	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	36356108	36356416	36356285	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr21	36392735	36393025	36392943	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	407294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	37843578	37844008	37843756	Y	NA	AP000695.6	NA	NA	NA	NA	AP000695.6	42920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	38346647	38347014	38346835	Y	NA	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	9835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	39616792	39617335	39616969	Y	KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ15	89664	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	39860406	39860812	39860600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	314419	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	40018484	40018900	40018698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	156331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr21	40159439	40159794	40159507	Y	NA	ETS2	ETS2,LINC00114	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETS2	15437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	40182920	40183779	40183392	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	7689	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr21	40209875	40210169	40209958	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	34644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	40211972	40212276	40212079	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	36741	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	40225341	40225561	40225501	Y	ETS2	NA	LINC00114,ETS2,PSMG1,BRWD1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	50110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	40361689	40362112	40361935	Y	NA	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	ETS2	186458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	42543184	42543509	42543444	Y	BACE2	BACE2,PLAC4	NA	NA	NA	NA	BACE2	5456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	43089019	43089272	43089054	Y	RIPK4	NA	LINC00111	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK4	95994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr21	43183711	43183960	43183836	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	1306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr21	43431472	43431831	43431677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	59473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C2CD2	105245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr21	44727448	44727599	44727495	Y	PKNOX1,SIK1	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	117409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	44765825	44766380	44766074	Y	PKNOX1	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	78628	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.33066779225679
chr21	44831891	44832268	44832005	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	12740	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	16058	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	20588	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	44930607	44930875	44930782	Y	PDXK,SIK1	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	33193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	39370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr21	44942511	44942810	44942777	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	45097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.33066779225679
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	45198694	45199238	45199184	Y	NA	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	4368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	45203235	45203378	45203292	Y	NA	CSTB,RRP1	CSTB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RRP1	4016	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	45573018	45573302	45573138	Y	PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	21531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	45574660	45575436	45575042	Y	NA	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	23173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	8679	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	46172768	46173172	46172977	Y	NA	UBE2G2	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	46762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	46185657	46185775	46185721	Y	NA	UBE2G2	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	34159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr21	46549530	46549961	46549631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	57762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	47543656	47544056	47543951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSS	102682	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr21	47564330	47564867	47564460	Y	S100B,FTCD	NA	NA	NA	NA	NA	LSS	81871	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	257381	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr22	17722796	17723268	17723123	Y	CECR2,BCL2L13,IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	50970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	18452405	18452779	18452681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	52546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr22	18986650	18986787	18986716	Y	MICAL3,TUBA8	DGCR5	NA	NA	NA	NA	DGCR5	30623	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	19941739	19941814	19941777	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	14398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	19972525	19972715	19972620	Y	NA	COMT,TXNRD2,ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	29616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	19983834	19983932	19983883	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18399	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	18274	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	20310414	20310572	20310493	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	DGCR6L	4811	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	20885626	20885829	20885752	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	37426	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	21979927	21980091	21980009	Y	NA	YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	YDJC	2262	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	23338343	23338736	23338580	Y	NA	NA	RTDR1,GNAZ,ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNAZ	71804	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	23528251	23528416	23528284	Y	BCR	RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	8360	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	23624437	23624690	23624563	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	104546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	23647336	23647705	23647592	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	95208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	24553775	24554108	24553934	Y	NA	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	21119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	130790	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	24878539	24879065	24878732	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	70406	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	53550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	25349333	25349980	25349695	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	54152	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	86659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11,HMGB1P10	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr22	27131212	27131584	27131334	Y	NA	NA	MN1,PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	64482	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	27870917	27871291	27871105	Y	NA	NA	PITPNB,MN1,TTC28,TTC28-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-929C8.5	200716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-929C8.5	202578	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.37904842304056
chr22	28261904	28262359	28262203	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	51005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	29280564	29280869	29280661	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	2984	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	29621754	29622103	29621915	Y	NA	EMID1,EWSR1,RHBDD3	NA	NA	NA	NA	EMID1	21914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	29705410	29705600	29705517	Y	GAS2L1	EWSR1,RHBDD3,GAS2L1	NA	NA	NA	NA	GAS2L1	4838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	64094	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	31639418	31639541	31639442	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	31645719	31645849	31645807	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	39494	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	31854917	31854933	31854925	Y	NA	SFI1,EIF4ENIF1	NA	NA	NA	NA	SFI1	27741	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	32819656	32819735	32819695	Y	RFPL3,TIMP3	BPIFC,FBXO7	NA	NA	NA	NA	BPIFC	38736	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr22	33202971	33203258	33203149	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	7284	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	33252376	33252746	33252411	Y	NA	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	1674	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	11263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	35071606	35071625	35071616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-714B7.5	553424	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	35555825	35556131	35555978	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	68918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	36448788	36448904	36448856	Y	NA	RBFOX2	RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	26315	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.47421035996219
chr22	36746983	36747265	36747123	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	34798	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	36765300	36765605	36765487	Y	APOL3,NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	16458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-633O19__A.1	23476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	36821515	36821891	36821703	Y	IFT27	MYH9,RP4-633O19__A.1	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-633O19__A.1	38844	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	36847830	36847945	36847861	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB	TXN2	NA	NA	NA	NA	TXN2	28132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	38003646	38003923	38003656	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1,PDXP	NA	NA	NA	NA	GGA1	1165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	38137969	38138286	38138127	Y	TRIOBP	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	46958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	38351215	38351232	38351224	Y	NA	POLR2F,C22orf23	NA	NA	NA	NA	C22orf23	3539	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	39091291	39091422	39091336	Y	NA	CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1	NA	NA	NA	NA	JOSD1	4139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	39377467	39377527	39377498	Y	DNAL4,CBX6,APOBEC3B	APOBEC3B,APOBEC3C,APOBEC3D	NA	NA	NA	NA	APOBEC3B	1115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr22	39705997	39706111	39706064	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	8283	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	40384673	40384943	40384833	Y	FAM83F	FAM83F	NA	NA	NA	NA	FAM83F	4010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr22	41839332	41839605	41839469	Y	TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	1422	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	42257974	42258323	42258180	Y	CENPM	SREBF2	NA	NA	NA	NA	SREBF2	30865	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	43165805	43166293	43166166	Y	NFAM1,ARFGAP3	NA	ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	50501	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	44321391	44321759	44321599	Y	PNPLA3	PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5	NA	NA	NA	NA	PNPLA3	3772	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	44759236	44759683	44759589	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1644	52505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	45642150	45642482	45642292	Y	NA	KIAA0930	LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	7500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	46035019	46035329	46035174	Y	NA	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	30349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr22	46812032	46812341	46812187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMU	87260	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	46934347	46934575	46934459	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr22	46935060	46935431	46935290	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr22	48841400	48841543	48841513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	815977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50232497	50232886	50232656	Y	TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2	BRD1,ZBED4	ZBED4	K562	ChIA-PET	22265404	ZBED4	12604	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50248429	50248807	50248623	Y	TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4	BRD1,ZBED4	NA	NA	NA	NA	ZBED4	2939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr22	50625511	50626004	50625814	Y	BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	TRABD	3167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50741799	50742849	50742615	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	1207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETMAR	488335	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	35312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	8003437	8003558	8003498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	537835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	8529087	8529361	8529226	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	12032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	9129610	9129876	9129760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	126153	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	9287603	9287640	9287617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD3	114886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	10231143	10231913	10231419	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	26594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	10246146	10246525	10246336	Y	NA	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	41182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	11197111	11197379	11197271	Y	VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	114616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	11314967	11316155	11315793	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	2972	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	11612359	11612503	11612424	Y	HRH1,ATG7	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	147717	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	12621651	12621927	12621686	Y	RPL32	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	25138	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	12688995	12689498	12689361	Y	RAF1	RAF1	NA	NA	NA	NA	RAF1	14227	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	13555033	13555410	13555088	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	35480	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	13555627	13555924	13555826	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	36074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A,TPRXL	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr3	14413329	14413583	14413465	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC6A6	28493	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	14692297	14692322	14692310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	250221	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	15352253	15352542	15352441	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	28333	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	16097736	16098110	16098018	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	198458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	16380469	16380852	16380674	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	75763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	17345014	17345355	17345310	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	502855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	20082717	20083237	20083200	Y	RAB5A,KAT2B	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	3202	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	20201632	20201832	20201780	Y	KAT2B	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	23952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	23206478	23206499	23206488	Y	NA	UBE2E2	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	36012	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	23609558	23609766	23609671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E1	235628	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	75330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	27574847	27574895	27574871	Y	NA	NA	AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	50936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.18872454919732
chr3	27719100	27719312	27719216	Y	NA	AC098614.2,EOMES	NEK10,SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	42894	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr3	27957485	27957491	27957488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	195279	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	27984483	27984771	27984759	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	222277	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	28050894	28051260	28051082	Y	EOMES,CMC1	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	229815	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	29106794	29107135	29106965	Y	NA	NA	RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS3	213338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	29660032	29660218	29660060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	339559	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	30535531	30535813	30535695	Y	NA	NA	TGFBR2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	110181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	NA	NA	NA	NA	NA	CMTM6	80825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	33081513	33081785	33081661	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	8158	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	37344922	37345358	37345096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	61236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	37595659	37595670	37595665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093415.2	305601	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	37805955	37806276	37805982	Y	ITGA9	NA	NA	NA	NA	NA	AC093415.2	94995	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	NA	NA	NA	NA	NA	ACAA1	103725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	38144034	38144304	38144167	Y	VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88	ACAA1,MYD88	NA	NA	NA	NA	ACAA1	32429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	39192828	39193549	39193225	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	504	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	40271568	40271827	40271633	Y	EIF1B	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1B	77348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	42108049	42108561	42108178	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	54755	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	42518371	42518582	42518469	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	9239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	2843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.52099166610004
chr3	44092844	44093119	44092982	Y	NA	NA	FAM198A	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	361758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	45161726	45162069	45161866	Y	TMEM158	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	23845	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	21144	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	20102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	45185924	45186005	45185965	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	45609249	45609611	45609389	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	14363	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	46427756	46428118	46427902	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	RP11-24F11.2,CCRL2	CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-24F11.2	18432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	46989533	46989702	46989634	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	29471	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	47078393	47078462	47078449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	56893	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr3	48734201	48734270	48734236	Y	NA	NCKIPSD,IP6K2	NA	NA	NA	NA	NCKIPSD	12404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	49171125	49171202	49171164	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71	NA	NA	NA	NA	LAMB2	2574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	4232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	50280308	50280577	50280437	Y	RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B,IFRD2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	18584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	50280819	50280975	50280878	Y	RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,UBA7,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B,IFRD2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	19095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	50638353	50638905	50638586	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	8046	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	50639346	50639782	50639525	Y	C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.0935626122757
chr3	52079728	52079827	52079778	Y	DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	8739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	52088878	52089257	52089156	Y	ACY1,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	52502448	52502781	52502494	Y	ABHD14B,NISCH	SEMA3G,TNNC1,NISCH	NA	NA	NA	NA	NISCH	15314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	53362706	53362961	53362819	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	16693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	56642253	56642384	56642319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	53064	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA12	167147	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	56957686	56958168	56958064	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA12	134301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	57779621	57779638	57779630	Y	FAM116A,SLMAP	SLMAP	NA	NA	NA	NA	SLMAP	40444	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	58859909	58860302	58860288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	173508	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	58984210	58984527	58984399	Y	NA	C3orf67	NA	NA	NA	NA	C3orf67	49283	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	59273031	59273129	59273094	Y	NA	NA	FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	239221	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	59413085	59413290	59413187	Y	NA	NA	FAM3D,FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	379275	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	59452459	59452783	59452526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	418649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	59488457	59488969	59488744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	454647	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	59526553	59526908	59526731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	492743	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	59545502	59545850	59545701	Y	NA	NA	FAM3D,FHIT,C3orf67	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	511692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	59552195	59552456	59552219	Y	NA	NA	FAM3D,FHIT,C3orf67	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	518385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	63629436	63629448	63629442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC7	218131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	66348485	66348581	66348534	Y	SLC25A26	NA	LRIG1	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG1	201106	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	67040750	67040873	67040812	Y	NA	KBTBD8	KBTBD8	MCF7	ChIA-PET	22265404	KBTBD8	5854	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	67455058	67455415	67455236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	247623	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	69218338	69218527	69218433	Y	FRMD4B	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	86243	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	69228052	69228449	69228187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	95957	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	69376031	69376377	69376298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	243936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	71031841	71032211	71032107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	598929	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	71267437	71267786	71267612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	363354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	71293394	71293605	71293527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	337535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	71478043	71478236	71478134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	152904	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	71588104	71588187	71588146	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	42953	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	72397214	72397486	72397325	Y	RYBP	NA	SHQ1,RYBP,GXYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	96583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	72445751	72445968	72445860	Y	NA	RYBP	NA	NA	NA	NA	RYBP	48101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	72536556	72536893	72536709	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	42487	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	74439527	74439583	74439555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	1042678	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	78848211	78848429	78848320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	966536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	87022678	87022843	87022761	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	15426	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	87038252	87038431	87038423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	97508761	97509065	97508913	Y	NA	ARL6	NA	NA	NA	NA	ARL6	27396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	97509307	97509490	97509360	Y	NA	ARL6	NA	NA	NA	NA	ARL6	27942	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99262027	99262447	99262268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2021J15.1	642759	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	422284	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99575221	99575605	99575379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	402239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	398108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	395016	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	393031	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99596957	99597300	99597045	Y	TBC1D23	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	380544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99752092	99752383	99752194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	225461	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99782957	99783256	99783070	Y	NA	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	194588	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	104014158	104014524	104014365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALCAM	1069229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	104155776	104156155	104156140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALCAM	927598	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	106984184	106984525	106984343	Y	NA	LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00883	26645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	107706134	107706639	107706380	Y	NA	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101233	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	107846269	107846510	107846297	Y	CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	38397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	111449138	111449249	111449194	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	95	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	4780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr3	111456632	111456831	111456661	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	7288	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	111480028	111480653	111480348	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	30684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	111481970	111482358	111482172	Y	PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	32626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr3	111484180	111484533	111484208	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	34836	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr3	111521164	111521550	111521388	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	71820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	111834106	111834381	111834309	Y	BTLA,C3orf52,GCET2	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	30924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	111943889	111944218	111944054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf52	140707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	112351265	112351470	112351440	Y	NA	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	14907	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	112739908	112740217	112740094	Y	CD200R1	GTPBP8,RP11-572M11.4,C3orf17	NA	NA	NA	NA	C3orf17	3200	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	113470106	113470294	113470144	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	6240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	114078948	114079017	114078985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	305488	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	114257066	114257260	114257069	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	483606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	115511576	115511993	115511793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	171405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	118561016	118561389	118561159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT4	396561	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	119368834	119369205	119369020	Y	NR1I2	RP11-190C22.1,COX17	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	15837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	119758013	119758347	119758179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	52917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	119864415	119864682	119864534	Y	COX17,GSK3B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	52673	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	121149194	121149225	121149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	61732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	121374377	121374548	121374517	Y	EAF2,HCLS1,GOLGB1	HCLS1	NA	NA	NA	NA	HCLS1	3226	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	121638049	121638246	121638101	Y	CSTA,ILDR1	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	86019	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	13.0371853582623
chr3	121778262	121778510	121778467	Y	EAF2,CD86	ILDR1	NA	NA	NA	NA	ILDR1	39211	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	122033411	122033646	122033535	Y	CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,KPNA1,HSPBAP1,DTX3L,DIRC2,CSTA	CSTA	CCDC58,CD86,CASR	IMR90	Hi-C	24141950	CSTA	8445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	122074989	122075000	122074995	Y	NA	CSTA,CCDC58,FAM162A	NA	NA	NA	NA	CCDC58	25078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	122151096	122151154	122151125	Y	KPNA1	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	122648361	122648742	122648615	Y	NA	NA	LOC100129550	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA5	135167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	123356199	123356268	123356234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	123388051	123388291	123388171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	85662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	123511285	123511578	123511394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK	89600	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	123587912	123588093	123588031	Y	ADCY5	MYLK	NA	NA	NA	NA	MYLK	13085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	125053590	125053890	125053754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A8	57569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	125341186	125341562	125341359	Y	NA	OSBPL11	NA	NA	NA	NA	OSBPL11	29252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDC	65895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	74839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	2213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	15639	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA1	239994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA1	240445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	127416375	127416550	127416435	Y	NA	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	26597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	132800	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	27082	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128054461	128054660	128054529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	151395	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128325000	128325227	128325090	Y	DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2,KIAA1257	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	72691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128338287	128338590	128338558	Y	RAB7A	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	59328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128538992	128539042	128539017	Y	DNAJB8,C3orf27	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	57131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	129543558	129543741	129543650	Y	MBD4,H1FOO,TMCC1,TMCC1	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	66678	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16	41376	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	132164768	132165015	132164817	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	30398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	133147395	133147694	133147637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDV3	142880	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	134100770	134101008	134100801	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL2	8449	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	134145641	134145965	134145857	Y	NA	NA	ANAPC13,AMOTL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMOTL2	53320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	134286307	134286601	134286455	Y	CEP63,CEP63,CEP63	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC13	82749	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	135861520	135861675	135861598	Y	MSL2,MSL2	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	52408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NME9	56409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	139271371	139271598	139271484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-319G6.1	164714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	139633599	139633968	139633784	Y	NA	NA	CLSTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-319G6.1	526942	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	141659994	141660128	141660061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	67028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	142130035	142130079	142130067	Y	NA	XRN1	NA	NA	NA	NA	XRN1	34825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	147072976	147073090	147073034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	809995	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	148660888	148660915	148660902	Y	NA	GYG1	CPB1,CPA3	IMR90	Hi-C	24141950	GYG1	46213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPS3	97472	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	148963630	148964002	148963862	Y	NA	NA	GYG1,HPS3,CP,TM4SF18,HLTF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPS3	118259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	149057749	149057981	149057865	Y	NA	TM4SF1	NA	NA	NA	NA	TM4SF1	35671	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	149533104	149533741	149533325	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	4609	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	150417166	150417289	150417212	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A	NA	NA	NA	NA	RP11-103G8.2	2062	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	150456267	150456381	150456351	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	21343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	150478267	150478712	150478564	Y	TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	543	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	151016558	151016712	151016648	Y	MED12L,P2RY12,GPR87	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	16028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	151486383	151486557	151486470	Y	NA	RP11-64D22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-64D22.2	167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	151739734	151740181	151739895	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	SUCNR1	150303	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	151993494	151994006	151993570	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	8150	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	151996540	151996946	151996646	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	11196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	152091128	152091426	152091240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	105784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	152120876	152121103	152120983	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	135532	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	152705631	152705718	152705686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P2RY1	154895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	152848416	152848799	152848521	Y	RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	29230	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	153002176	153002347	153002282	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	124147	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	153003780	153003941	153003880	Y	NA	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	125751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	154513316	154513730	154513557	Y	NA	NA	MME,LOC100507537	IMR90	Hi-C	24141950	MME	226183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	154987917	154988101	154988024	Y	NA	PABPC1P10	NA	NA	NA	NA	PABPC1P10	37495	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr3	155705974	155706059	155706016	Y	NA	SETP14	NA	NA	NA	NA	SETP14	2881	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156149618	156149810	156149747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	121163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.9500200445703
chr3	156210737	156211059	156210900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	59914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156229646	156229758	156229715	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	41215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156403084	156403595	156403347	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	12917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156443600	156443618	156443611	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	53433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	2421	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156558833	156558838	156558836	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	17563	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	156839965	156840160	156840071	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1	NA	NA	NA	NA	CCNL1	36389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	156852547	156853124	156852850	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	23425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	114249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	158048767	158049059	158048913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	227123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLF1	60098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	158461822	158462112	158461908	Y	NA	MFSD1	RARRES1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MFSD1	13835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	159352300	159352686	159352493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	351851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	210776	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	159514256	159514624	159514440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	189913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	159540179	159540477	159540438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	164060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	162020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	337527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	336917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	165217698	165218028	165217864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	335232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	167181640	167181820	167181812	Y	SERPINI2	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	268907	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	167579478	167579761	167579515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINI1	128447	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	303079	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	169378305	169378656	169378554	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	169941070	169941418	169941334	Y	MYNN,MYNN,LRRIQ4,PHC3	PHC3,PRKCI	NA	NA	NA	NA	PRKCI	2917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	NA	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	140452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170463049	170463502	170463289	Y	CLDN11	NA	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	122770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170579509	170579531	170579522	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	6741	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170613123	170613340	170613232	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	11142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170712510	170712744	170712722	Y	SLC2A2	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	88028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170795068	170795319	170795194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	170586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	170966636	170966947	170966845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	209250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	103894	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	172234609	172234750	172234680	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	4547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	172325180	172325357	172325227	Y	NA	NA	TNFSF10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF10	85883	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	172418207	172418359	172418236	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	8649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	172423916	172424228	172424139	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	2780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	176439687	176439857	176439773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	473404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	177167478	177167833	177167747	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	254217	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	177383116	177383499	177383118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	469855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	178435674	178435882	178435779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	352185	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	182978108	182978472	182978157	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	9076	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	182980670	182980835	182980709	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11638	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr3	183088664	183088916	183088772	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	119632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	183224815	183225118	183224901	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	126238	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	184458237	184458578	184458314	Y	NA	MAGEF1	VPS8,EPHB3,POLR2H,CLCN2,FAM131A,EIF4G1,THPO,CHRD,MAGEF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAGEF1	30401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	199839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	185482318	185482647	185482554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf65	54002	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	185905496	185905742	185905693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	79389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	187086881	187087203	187087089	Y	BCL6,RTP4	RTP4	NA	NA	NA	NA	RTP4	2761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	31468	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	187912287	187912441	187912353	Y	BCL6,LPP	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	42442	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	187980692	187981197	187980748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	110847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	188017658	188018009	188017791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	147813	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	188057374	188057458	188057417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	187529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	188156976	188157533	188157052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	287131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	188303228	188303359	188303294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	359644	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	188324508	188324886	188324659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	338117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	188475500	188475699	188475599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	187304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	188537744	188538118	188537883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	124885	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	188618525	188618672	188618589	Y	NA	TPRG1,TPRG1-AS1	NA	NA	NA	NA	TPRG1	44331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	189508534	189508810	189508672	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	161329	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	189544866	189545241	189545054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	197661	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	189557440	189557782	189557660	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	210235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	189559377	189559697	189559485	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	212172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr3	189569925	189569928	189569927	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	222720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	189618419	189618524	189618473	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	218229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	189626513	189626760	189626607	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	209993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	189632708	189632930	189632825	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	203823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	42806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr3	190252374	190252607	190252502	Y	CLDN1,IL1RAP	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	22534	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	190335085	190335347	190335197	Y	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	105245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	190581013	190581092	190581053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	351173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	193548514	193548983	193548724	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	239581	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr3	193588211	193588236	193588227	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-135A1.3	219114	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-135A1.3	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	RP11-135A1.3	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr3	194022185	194022450	194022442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	170251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	194029385	194029774	194029648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	177451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	194048965	194049014	194048990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	168079	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	157244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	194824432	194824598	194824501	Y	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	165298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	194826238	194826399	194826316	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	163497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	194973636	194973680	194973658	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	16216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	162657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	195542423	195542578	195542499	Y	MUC20,MUC4	NA	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	90369	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	195573980	195574341	195574135	Y	MUC20,MUC4	NA	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	58606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr3	196208308	196208582	196208445	Y	NA	RNF168	NA	NA	NA	NA	RNF168	20057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	196244998	196245175	196245085	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	NA	NA	NA	NA	RNF168	16359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	196761683	196762044	196761813	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	MFI2-AS1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	MFI2	6996	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	196948967	196949228	196949097	Y	NA	NA	MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	74943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	196995168	196995509	196995411	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	28662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr3	197033346	197033465	197033406	Y	DLG1	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	9175	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr3	197121526	197121880	197121703	Y	DLG1	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	97355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	AC024560.3	137768	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	47637	47939	47761	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	3240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	693278	693552	693364	Y	GAK,MFSD7,PCGF3	MYL5,ATP5I,PCGF3	NA	NA	NA	NA	PCGF3	3985	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	770204	770556	770391	Y	ZNF141	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	3081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	1339085	1339471	1339276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	2413768	2414486	2414055	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3904	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	3389642	3390154	3389980	Y	HTT,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	96887	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	3390647	3391111	3390815	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	97892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	3469404	3469760	3469670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	62526	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	3484611	3485071	3484896	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	47215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	3488499	3488826	3488767	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	43460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	6918330	6918775	6918508	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	9361	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	6989470	6989868	6989678	Y	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	NA	TADA2B	51758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	7209017	7209262	7209117	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	16752	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	7674956	7675119	7675023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	78698	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	79300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	7834057	7834311	7834184	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	80240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	7962509	7962775	7962724	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	22856	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	8119010	8119317	8119178	Y	ABLIM2	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	39242	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	8411022	8411421	8411226	Y	NA	ACOX3	NA	NA	NA	NA	ACOX3	29029	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	8614691	8614733	8614712	Y	NA	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	22304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr4	9693091	9693174	9693121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-448G15.1	312932	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	10001685	10001951	10001818	Y	NA	RP11-448G15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-448G15.1	4155	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	10976046	10976392	10976234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR572	392059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	11428604	11428950	11428674	Y	NA	HS3ST1	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	12140209	12140385	12140275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	499876	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	12165799	12166164	12165982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	474097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	12189077	12189099	12189089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	451162	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.09196328762977
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB28	201297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	13908947	13909321	13909089	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,LOC152742	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	276724	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr4	14780950	14781106	14781029	Y	NA	NA	LOC441009	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	688383	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	15536628	15536631	15536630	Y	NA	NA	FBXL5	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	67139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	15596739	15596980	15596942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	84305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	15757957	15758240	15758119	Y	FBXL5,TAPT1,CD38	RP11-115L11.1	C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115L11.1	26707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	15895700	15895839	15895750	Y	FGFBP1	FGFBP1	CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	42524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr4	15915213	15915572	15915412	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	22791	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	15922988	15923279	15923080	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	15084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	21792715	21792997	21792947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	155425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	22270180	22270523	22270471	Y	NA	NA	LOC100505912	IMR90	Hi-C	24141950	GPR125	245154	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr4	22363170	22363219	22363195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	152458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	25867382	25867475	25867429	Y	SLC34A2	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	4000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	36210207	36210423	36210315	Y	NA	ARAP2	NA	NA	NA	NA	ARAP2	33708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	38525630	38525737	38525685	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF3	138080	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	38567143	38567404	38567260	Y	NA	NA	KLF3,FLJ13197,TBC1D1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	96413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.28388648611894
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	39614591	39614990	39614756	Y	NA	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	23770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	39638477	39638619	39638541	Y	C4orf34	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	39813102	39813401	39813252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2K	115438	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	51393	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	40589734	40590029	40589952	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	40863	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	40623743	40623952	40623867	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	6940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	40687361	40687578	40687507	Y	NA	NA	RBM47,NSUN7	IMR90	Hi-C	24141950	RBM47	56469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	279160	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	273179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	40998550	40998604	40998585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	218127	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr4	48125578	48125743	48125738	Y	TEC	NA	NA	NA	NA	NA	CNGA1	108889	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	48339625	48339996	48339981	Y	NA	SLAIN2	TEC,SLAIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLAIN2	1343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	48532180	48532355	48532269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAIN2	190841	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	48700290	48700744	48700528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRYL	79595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVMER34-1	109945	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	53879042	53879203	53879109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVMER34-1	263235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	55454548	55454853	55454761	Y	KIT	NA	KIT	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFRA	361284	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	57278248	57278433	57278373	Y	NA	AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	PPAT	21348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	57604009	57604127	57604068	Y	NA	RPL17P20	THEGL	IMR90	Hi-C	24141950	RPL17P20	29783	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	57765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	68487662	68488005	68487834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	76892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	72125321	72125676	72125518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCK	269066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	73887463	73887489	73887476	Y	NA	COX18	ADAMTS3	IMR90	Hi-C	24141950	COX18	45983	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	74570970	74571346	74571160	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2,CXCL1	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	32877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	75094731	75095678	75095332	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	116840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	75228037	75228384	75228211	Y	NA	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	75274406	75274726	75274555	Y	AREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	45546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	75557908	75558335	75558035	Y	EREG,AREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	EREG	329048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	75811840	75811948	75811897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREG	582980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	76106676	76106845	76106762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP6	330311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	76766915	76767076	76766993	Y	NAAA,CXCL9,CXCL11,CXCL10	NA	NA	NA	NA	NA	NAAA	93128	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	78705418	78705617	78705518	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	33152	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	78823537	78823752	78823560	Y	NA	MRPL1	NA	NA	NA	NA	MRPL1	41863	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	79537274	79537650	79537411	Y	BMP2K	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	27407	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	79550555	79550802	79550658	Y	NA	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	14255	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	79566071	79566139	79566107	Y	NA	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	1014	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	82553061	82553360	82553250	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B	410037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	83680712	83680815	83680808	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37195	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	84153273	84153480	84153394	Y	THAP9,PLAC8,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2	NA	PLAC8,COPS4	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	50587	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	85047369	85047537	85047456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	454595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	85868944	85869302	85869263	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	16236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	86704673	86705059	86704806	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	310406	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	87048261	87048368	87048363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	465100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	13534	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	88024894	88025201	88025055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	134265	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	88310144	88310324	88310202	Y	AFF1,HSD17B11	HSD17B11,NUDT9	NA	NA	NA	NA	HSD17B11	214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	88446974	88447282	88447233	Y	MEPE,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	105240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	88474539	88474761	88474650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	132805	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	89438192	89438391	89438292	Y	NA	HERC3,PIGY	NA	NA	NA	NA	HERC3	1808	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	89667506	89667617	89667562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGY	226566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGY	306518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	90212945	90213002	90212979	Y	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115D19.1	257505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	292131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	92985275	92985297	92985287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2141465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	95406092	95406259	95406175	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	35055	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	99319477	99319794	99319573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	138942	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	99845137	99845196	99845164	Y	NA	AC019131.1,EIF4E	NA	NA	NA	NA	AC019131.1	3942	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	99848541	99848872	99848707	Y	NA	AC019131.1,EIF4E	NA	NA	NA	NA	AC019131.1	266	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	100738800	100739047	100738840	Y	NA	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	2810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	100743158	100743523	100743354	Y	RG9MTD2,H2AFZ,DDIT4L,DAPP1	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	7168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	102153053	102153484	102153407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	113453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	102243269	102243535	102243491	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	23402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	102254740	102255090	102255043	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	11847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	103536028	103536474	103536149	Y	NHEDC1,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	115542	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	103605742	103606270	103606017	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	73881	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr4	103701783	103702159	103702029	Y	NA	MANBA,RP11-10L12.4	NA	NA	NA	NA	MANBA	21632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	103793013	103793145	103793075	Y	MANBA,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	4878	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	110469853	110470280	110470027	Y	SEC24B,CCDC109B	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	9081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	111086740	111086853	111086804	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	31502	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	112732930	112733119	112733025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	331434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	113201272	113201525	113201422	Y	TIFA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	3140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	113572868	113573168	113573031	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	C4orf21	16717	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	325456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr4	114369024	114369155	114369101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	311928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	291278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	119115424	119115493	119115457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	82371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.66453423380543
chr4	119815891	119816222	119816082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24D	58053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	119946666	119946843	119946767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP53	184899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	120205306	120205694	120205553	Y	NA	C4orf3	NA	NA	NA	NA	C4orf3	17906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	121266106	121266305	121266196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	279877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	NA	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	BBS12	52662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	128894970	128895372	128895225	Y	NA	C4orf29,MFSD8	NA	NA	NA	NA	MFSD8	9820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	129308281	129308471	129308363	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	96375	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	139156559	139157143	139156950	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	4360	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	139158628	139158837	139158817	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	2666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	140096766	140097018	140096889	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2	ELF2	ELF2,NAA15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELF2	394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	141021103	141021485	141021348	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	51853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	141217539	141217769	141217667	Y	NA	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41099	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	143186679	143186969	143186824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	579616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	143206374	143206633	143206590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	559952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	143325385	143325488	143325414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	441097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	143337797	143338156	143337961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	428429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	143393475	143393485	143393480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	373100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	146674591	146674889	146674740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	137176	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	148654111	148654384	148654270	Y	PRMT10	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	2897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	151241204	151241585	151241396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	243778	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	151681778	151681989	151681952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	252890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	152048107	152048440	152048274	Y	LRBA,LRBA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	29382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	SH3D19	NA	NA	NA	NA	SH3D19	18469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	SH3D19	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3D19	1248	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr4	152367520	152367754	152367585	Y	NA	RP11-610P16.1,FAM160A1	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	39152	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	152650918	152651090	152650938	Y	NA	PET112	NA	NA	NA	NA	PET112	29085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	189693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	153384076	153384094	153384085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	71159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	153424227	153424394	153424311	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	30859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	9125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	153599392	153599746	153599719	Y	FBXW7,ARFIP1,TMEM154	TMEM154	NA	NA	NA	NA	TMEM154	75	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	153630965	153631147	153631056	Y	NA	TMEM154	TMEM154	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM154	31648	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	158941982	158942153	158942075	Y	TMEM144	NA	FAM198B,GRIA2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-597D13.9	147751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	159085222	159085591	159085435	Y	NA	RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	RP11-597D13.9	4313	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	164688247	164688444	164688347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	424263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	164871108	164871241	164871176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	607124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	612373	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA3P	651653	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr4	166315734	166315907	166315821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMO1	68959	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	166331391	166331603	166331463	Y	C4orf39,CPE	NA	NA	NA	NA	NA	MSMO1	84616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	167969514	167970188	167969851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLL1	1177104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	168818156	168818524	168818473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60	419434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	169408175	169408648	169408311	Y	DDX60,DDX60L	PALLD,DDX60L	DDX60,DDX60L,PALLD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PALLD	7569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	169490335	169490520	169490463	Y	PALLD	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	33398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	169543340	169543625	169543506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	86403	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	169718415	169718594	169718475	Y	DDX60,DDX60L	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	210832	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	169802596	169802736	169802661	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	126690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	169849945	169850177	169850075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	79249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	173917824	173917970	173917931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	169934	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr4	174112212	174112389	174112298	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	23409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	174112816	174113032	174112924	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	24013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr4	174285204	174285286	174285258	Y	NA	HMGB2,SAP30	SAP30	K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	3834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	176340534	176340934	176340734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA4	773888	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	177191849	177192202	177191988	Y	ASB5	SPCS3,RP11-87F15.2	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPCS3	46913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	184208528	184208558	184208557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	155186	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	184270201	184270461	184270317	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	93283	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	184270914	184271169	184271084	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	92575	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	8.56457432294603
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	184423820	184424211	184423984	Y	STOX2	NA	NA	NA	NA	NA	ING2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	53095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr4	184751768	184752101	184751917	Y	NA	STOX2	ENPP6,STOX2,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	20483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr4	185613623	185613900	185613762	Y	CCDC111	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	44960	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	87445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	186481104	186481365	186481225	Y	NA	PDLIM3	PDLIM3,SORBS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM3	26338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	40301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr4	186730607	186731122	186730955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	257184	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr4	189048639	189048958	189048819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219G10.1	220220	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr4	190197516	190197817	190197669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA4P	194302	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	1182870	1183091	1183042	Y	SLC6A19,SLC6A18	NA	LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	72720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	2719879	2719902	2719892	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	30343	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	2750184	2750594	2750355	Y	C5orf38,IRX2	IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	4565513	4565575	4565544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS16	572868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	6.7564975214352
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	10551479	10551871	10551616	Y	NA	ANKRD33B	MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33B	10571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr5	14408020	14408375	14408038	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	171509	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	581914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	16723637	16724009	16723823	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	108470	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	16740893	16741285	16741194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	125726	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	CTB-55B8.1	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	44889	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	16898106	16898497	16898302	Y	MYO10	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	2253	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	9830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	18745140	18745321	18745192	Y	NA	CTD-2023M8.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	858	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPD1P1	1423072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	24155781	24155941	24155882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	653649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	27309667	27310060	27309866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	2120902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1292603	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	CTD-2206G10.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2206G10.2	26639	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	32768263	32768639	32768422	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	238524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	35281144	35281439	35281292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	353446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	32421	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	37311676	37311784	37311730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP155	57499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	37740558	37740859	37740716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	363244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	38846956	38846992	38846979	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	2996	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	38866844	38867106	38866976	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	22884	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	39194499	39195200	39195005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	77430	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	39256594	39256894	39256792	Y	RICTOR,FYB	FYB	NA	NA	NA	NA	FYB	15736	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	40391782	40391988	40391884	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	285612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	40411118	40411409	40411246	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	266191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	41288648	41289018	41288835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD6	449362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	31500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	18848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	43303282	43303485	43303367	Y	NA	HMGCS1	NA	NA	NA	NA	HMGCS1	8129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	49719324	49719499	49719409	Y	PARP8	EMB	NA	NA	NA	NA	EMB	17583	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	52319874	52320078	52320019	Y	NA	ITGA2,CTD-2175A23.1	LOC257396	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2175A23.1	35766	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	52332019	52332357	52332083	Y	FST,ITGA2	ITGA2,CTD-2175A23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2175A23.1	47911	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr5	52333334	52333832	52333660	Y	NA	CTD-2175A23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2175A23.1	49226	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr5	52545484	52545615	52545603	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS2	141591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	310514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	286546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	53848607	53848967	53848787	Y	NA	SNX18	NA	NA	NA	NA	SNX18	37018	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	55737283	55737549	55737459	Y	MAP3K1	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	61350	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	55830072	55830234	55830153	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	31173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	58165920	58166304	58166218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	411833	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	58317891	58318186	58317997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	563804	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	58374119	58374354	58374236	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	620032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	58866470	58866828	58866806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	914712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	59041159	59041490	59041319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	740050	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	59042319	59042506	59042428	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	739034	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	59057056	59057135	59057102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	724405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	59917855	59917860	59917858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	76157	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr5	60600910	60601202	60601013	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	24898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	61100852	61101227	61101135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	415154	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	61843905	61844215	61843940	Y	NA	CKS1B	NA	NA	NA	NA	CKS1B	37596	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	67294770	67295126	67294965	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	214422	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC2	337395	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCD2	107973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	72511984	72512100	72512037	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	230252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	229716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	72880420	72880664	72880571	Y	NA	UTP15,ANKRA2	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	20909	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	72950370	72950710	72950420	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	90859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	74805918	74806308	74805968	Y	NA	POLK	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	75763076	75763442	75763238	Y	IQGAP2,S100Z	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156N15.1	92576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77148404	77148543	77148518	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	14061	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77412957	77413018	77412987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP3B1	175561	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77581141	77581448	77581332	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	7131	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77825252	77825732	77825631	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	170913	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77827534	77827604	77827573	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	173195	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	127506	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	77888034	77888302	77888035	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	121603	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	78439900	78440059	78439990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	89802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	RP11-342F17.1,HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	78843882	78844075	78843988	Y	NA	RP11-342F17.1,HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35842	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	79531979	79532366	79532173	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	17532	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr5	80263371	80263585	80263478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	314569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	82886397	82886761	82886578	Y	VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	514715	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	93697867	93698390	93698151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-461G12.2	204855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	95227563	95227763	95227704	Y	NA	C5orf27	NA	NA	NA	NA	C5orf27	41627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	95298372	95298734	95298686	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	ELL2	2597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	95400695	95400848	95400808	Y	ELL2	NA	ELL2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	104920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	95555701	95555931	95555845	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	259926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	97645408	97646168	97645558	Y	RGMB	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	26280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	108329034	108329385	108329210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	247511	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	108391550	108391948	108391605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	310027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	109257413	109257833	109257636	Y	MAN2A1	NA	TMEM232	IMR90	Hi-C	24141950	MAN2A1	234346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	110057836	110058086	110057958	Y	NA	SLC25A46,TMEM232	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	13751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	110797509	110797845	110797534	Y	NA	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	48443	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	110830968	110831101	110831035	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	15187	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	111482049	111482383	111482271	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	11840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	112383528	112383665	112383560	Y	DCP2,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	73129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	112585948	112586168	112586156	Y	MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	236359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	112602603	112602927	112602766	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	219600	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	112611486	112611688	112611586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	210839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	112629156	112629538	112629463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	192989	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	118670685	118671156	118670901	Y	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	68298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	118701841	118702237	118702039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	83901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	120396721	120396798	120396760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	598748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF474	53585	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	121519182	121519443	121519230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF474	55974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	404650	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	123935187	123935581	123935384	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	207345	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	124006979	124007355	124007057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	135571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	124077955	124078154	124078062	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	64772	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	125730040	125730374	125730276	Y	C5orf48,ALDH7A1,GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	36216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	125779791	125780174	125779834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	85967	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	127421091	127421133	127421112	Y	NA	SLC12A2	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	3633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	128695122	128695392	128695339	Y	NA	NA	ADAMTS19	MCF7	ChIA-PET	22265404	ISOC1	266678	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	130592761	130592914	130592850	Y	NA	CDC42SE2	CDC42SE2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42SE2	13575	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	131747457	131747923	131747553	Y	NA	SLC22A5,AC034220.3,C5orf56,AC116366.5	NA	NA	NA	NA	C5orf56	3129	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	131981394	131981469	131981432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	89861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	131989640	131989693	131989667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	81637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	132368718	132369095	132368932	Y	AFF4,ZCCHC10	AC010240.3,ZCCHC10,HSPA4	ZCCHC10,HSPA4,AFF4	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZCCHC10	8422	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	133435759	133436442	133436277	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	11960	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	133463735	133464046	133463858	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	15333	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	18816	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	133750575	133750781	133750672	Y	NA	CDKL3,UBE2B,CDKN2AIPNL,AC005355.1	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	4986	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.1	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	31064	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.1	92728	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND6P4	1315	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr5	134405285	134405568	134405423	Y	NA	C5orf66,PITX1	H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	PITX1	36782	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	103128	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	PITX1	107098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	135356057	135356513	135356322	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	6071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	137785775	137785891	137785836	Y	WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	REEP2	13069	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	138258617	138258897	138258757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	171619	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	138325344	138325620	138325482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	238346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	139050998	139051193	139051098	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	26114	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA,IGIP	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2	NA	NA	NA	NA	ZMAT2	22016	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	140714021	140714065	140714043	Y	PCDHB12,PCDHB15,PCDHGC4	TAF7,PCDHGA1,PCDHGA2,PCDHGB1,PCDHGA4,PCDHGB2,PCDHGA6	NA	NA	NA	NA	PCDHGA2	2474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	26705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	43330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	141163260	141163447	141163330	Y	SLC25A2,PCDHGA2,PCDHGA3,PCDHGB2,PCDHGB3,PCDHGA6,PCDHGA7,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4,PCDHGC5,NDFIP1	NA	LOC729080,KIAA0141,PCDH12,RNF14,PCDH1	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	93364	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	142609232	142609364	142609290	Y	NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	100806	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	142642050	142642362	142642163	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	67808	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	145326011	145326414	145326305	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	11869	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	145426337	145426723	145426491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	112195	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	145455339	145455700	145455520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	104523	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCERG1	553700	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	148293572	148293925	148293745	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	89416	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr5	149267173	149267449	149267330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	70851	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	149318595	149318961	149318771	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	19339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	149853688	149853975	149853788	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	9406	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	149857006	149857314	149857147	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,NDST1,RBM22,TCOF1	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	6067	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	149945724	149945760	149945742	Y	SYNPO,ZNF300	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	32882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	150401918	150402484	150402308	Y	GPX3,TNIP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNIP1	68654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	150593680	150594043	150593885	Y	DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	GM2A	3969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	150902961	150903053	150903007	Y	FAT2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A1	88354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	150974691	150975014	150974782	Y	SLC36A3	NA	FAT2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A1	160084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	151017311	151017607	151017366	Y	FAT2	NA	SLC36A1,FAT2,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	126332	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	14.5597763490083
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	153939934	153940118	153940082	Y	NA	NA	FAM114A2,MFAP3,SAP30L	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	116417	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	154071115	154071211	154071188	Y	NA	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	19251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr5	158521683	158522288	158522053	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF145	112773	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145,CTB-11I22.2	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	159496389	159496537	159496463	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	47893	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	162483984	162483999	162483992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-541P9.3	378333	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167011273	167011672	167011457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	134696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167034408	167034621	167034436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	111747	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167088894	167089267	167088997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	57101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	19438	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	167157088	167157552	167157214	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	10720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	167171330	167171561	167171437	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	24962	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167197574	167197786	167197665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	51206	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	78551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167243466	167243587	167243564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	97098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr5	167243967	167244280	167244072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	97599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167259769	167260121	167259976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	113401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167654020	167654325	167654175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	62331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	169578231	169578535	169578387	Y	NA	NA	KCNIP1,KCNMB1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM196B	172487	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	170289548	170289859	170289780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	522261	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	170878093	170878163	170878150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	65973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	171094849	171095086	171094946	Y	NA	NA	FBXW11,FGF18	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1	282729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	171601698	171602038	171601921	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	11352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr5	171847636	171847998	171847816	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	31529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	172205264	172205447	172205353	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP1	9066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	172443523	172443809	172443650	Y	DUSP1,C5orf41	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	34763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	173957114	173957459	173957290	Y	NA	NA	MSX2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MSX2	192077	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr5	175302369	175302773	175302579	Y	DRD1,CPLX2,C5orf25,CPLX2	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP148	249178	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	176337374	176337559	176337468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	110075	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	177373047	177373130	177373089	Y	PROP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-889L3.1	107475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	177607687	177607881	177607743	Y	NA	NHP2,HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	21627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	177647239	177647603	177647383	Y	CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	17731	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	SQSTM1	24980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	179399876	179400065	179399971	Y	RNF130,RASGEF1C	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9B	67017	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr5	179496400	179496705	179496553	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	MAPK9	907	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	1641578	1641903	1641733	Y	NA	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	32897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	2658960	2659503	2659308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	104145	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	2818084	2818421	2818253	Y	SERPINB9	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21819	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	2818912	2819151	2819031	Y	SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21089	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	2982794	2982947	2982869	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2	SERPINB6	MCF7	ChIA-PET	22265404	NQO2	3274	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	3069574	3070273	3069674	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1,BPHL	LOC100507194,WRNIP1	K562	ChIA-PET	22265404	RIPK1	7349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	24636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	30302	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	3426515	3426916	3426721	Y	NA	SLC22A23	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	28340	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	3592685	3593043	3592856	Y	NA	NA	SLC22A23	IMR90	Hi-C	24141950	SLC22A23	137429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	FAM50B	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	21107	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	183257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	4352111	4352211	4352192	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	218280	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	4603647	4603982	4603794	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	100411	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	4688350	4688741	4688427	Y	NA	CDYL	CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	15652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	5246431	5246752	5246693	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	LYRM4	12420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	5287917	5288162	5288028	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	28640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	401666	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	6657678	6658009	6657847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	447821	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr6	6712780	6713068	6712936	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	392762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	6851413	6851674	6851488	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	254156	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	6970116	6970321	6970219	Y	NA	NA	LY86	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	135509	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	9839255	9839267	9839261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	578625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	10082661	10082901	10082747	Y	NA	NA	LOC100506207,LOC100130275,TFAP2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	334991	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.42742905382434
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	11139608	11139936	11139820	Y	TMEM170B,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	240645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	236293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	183282	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	169978	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	150873	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	11263609	11264019	11263885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	116562	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	11321238	11321480	11321378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	59101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr6	11414898	11415336	11414989	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NEDD9,C6orf228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	34317	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	11733258	11733396	11733348	Y	NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	197320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	11769423	11769725	11769659	Y	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	233485	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	11772710	11773287	11772940	Y	NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	233708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	12277553	12277959	12277761	Y	HIVEP1,EDN1	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	10637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	12484193	12484504	12484246	Y	EDN1	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	27838	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	13454706	13455038	13454979	Y	RANBP9,TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	30856	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	14759070	14759272	14759192	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	485255	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	14762682	14762941	14762784	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	481586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	14837546	14837947	14837747	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	406580	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	15062704	15063082	15062942	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	181445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	15066743	15067555	15067031	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	176972	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr6	15299924	15300312	15299931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	55397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	15365610	15365867	15365688	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	121083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	15535179	15535578	15535319	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	125711	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	15569583	15569742	15569685	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	91547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	15580663	15580900	15580755	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	80389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	15902018	15902163	15902127	Y	MYLIP	NA	MYLIP	K562	ChIA-PET	22265404	MYLIP	225193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16422379	16422759	16422608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	185568	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16474193	16474630	16474472	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	237382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16669504	16669854	16669679	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	89515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16690098	16690263	16690180	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	69106	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	16747394	16747788	16747685	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	11581	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	16771345	16771373	16771363	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATXN1	11623	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	17864491	17864751	17864619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	121103	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	18016545	18016825	18016604	Y	NA	KIF13A	TPMT,NHLRC1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13A	30691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	18020711	18021071	18020890	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KIF13A	34857	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	18148522	18148811	18148697	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,TPMT,KDM1B	NHLRC1	IMR90	Hi-C	24141950	TPMT	4494	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	18308493	18308879	18308567	Y	NA	DEK	RNF144B	IMR90	Hi-C	24141950	DEK	45439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	18391380	18391715	18391394	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	24601	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	18626849	18627153	18627001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	260070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	20604004	20604027	20604016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	71316	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	21141154	21141340	21141254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	450632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	21264288	21264471	21264361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	327501	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	21603523	21603934	21603831	Y	SOX4	SOX4	NA	NA	NA	NA	SOX4	11551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	21856086	21856579	21856474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	264114	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	24686171	24686408	24686290	Y	DCDC2	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	ACOT13	20908	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	25352378	25352572	25352400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	75072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	25406864	25407254	25406949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	129558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	26169489	26169538	26169514	Y	BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BE	12420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	26437952	26438171	26438062	Y	HIST1H4G,BTN1A1	BTN3A1,BTN2A3P,BTN3A3,BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN3A3	529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	26462244	26462270	26462257	Y	BTN2A1,BTN2A1	BTN2A3P,BTN3A3,BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	6094	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	27637197	27637397	27637297	Y	OR2B6,OR2B2	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	136312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27740489	27740807	27740621	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	32902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	28280673	28280945	28280934	Y	NKAPL	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	28299231	28299616	28299424	Y	GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	16075	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	28302002	28302386	28302196	Y	NA	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	13305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	28805076	28805418	28805247	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	29829189	29829211	29829201	Y	NA	HLA-G,HLA-H	ZNRD1-AS1,HLA-J,HCG9	IMR90	Hi-C	24141950	HLA-H	24139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	29949488	29949840	29949664	Y	NA	HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-J	22520	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	26974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	TRIM39	37784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	30519269	30519607	30519590	Y	NA	PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	3056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	30604064	30604457	30604261	Y	NA	MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,PTMAP1,C6orf136,DHX16,PPP1R18	NA	NA	NA	NA	PTMAP1	4655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	32834766	32835076	32834920	Y	BRD2,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP1	15011	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	CUTA	2671	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	33684801	33685193	33684861	Y	NA	NA	MNF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LEMD2	69720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	34048216	34048600	34048360	Y	NA	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	136616	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	34992488	34992843	34992549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	137446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35016451	35016706	35016532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	161409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35279423	35279720	35279457	Y	FKBP5,TAF11,ZNF76,RPL10A,DEF6	DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	15828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35532430	35532714	35532506	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	10780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35561770	35562146	35562007	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	40120	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35570271	35570732	35570662	Y	MAPK14,DEF6,PPARD,RPL10A	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	48621	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35875551	35875739	35875654	Y	SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1	SRPK1	NA	NA	NA	NA	SRPK1	11380	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	35993910	35993966	35993936	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	422	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	PXT1	591	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	36736958	36737143	36737020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	94653	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	37424991	37425195	37425093	Y	NA	CCDC167	CCDC167	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC167	40503	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	37745135	37745338	37745265	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	39937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	38185251	38185625	38185371	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	399976	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	39949042	39949079	39949061	Y	DAAM2,MOCS1	MOCS1,RP1-278E11.3	KIF6	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-278E11.3	24470	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	41341728	41341773	41341752	Y	FRS3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP4	170391	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	41686086	41686432	41686391	Y	NA	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	15565	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42067343	42067714	42067701	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	40643	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42219475	42219699	42219588	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	35872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42300744	42300888	42300812	Y	UBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	116901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42722931	42723177	42723029	Y	NA	ATP6V0CP3,TBCC	UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	10373	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	43085846	43085863	43085854	Y	NA	PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	43840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	43295599	43295850	43295834	Y	TJAP1	CRIP3,ZNF318	NA	NA	NA	NA	CRIP3	21064	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	43332066	43332081	43332075	Y	NA	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	3135	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	43701754	43702119	43701846	Y	TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	TMEM63B,MRPS18A,LOC100132354,CAPN11,XPO5,POLH,RSPH9,VEGFA,C6orf223,MRPL14,SLC29A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VEGFA	33802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr6	43945734	43945924	43945799	Y	NFKBIE	NA	LOC100132354,POLH,MAD2L1BP,RSPH9,GTPBP2,VEGFA,C6orf223,MRPS18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	94465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	43978439	43978901	43978686	Y	NFKBIE	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.1	61488	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	44002049	44002379	44002368	Y	NFKBIE,GTPBP2	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	38010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	30636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	44010067	44010199	44010133	Y	C6orf223	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	30190	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.42582972917841
chr6	44610699	44610959	44610866	Y	NFKBIE	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	257437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	44891116	44891398	44891337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	452292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	44949602	44949944	44949774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	393746	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	45294493	45294953	45294580	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48737	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	45313959	45314320	45314140	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	29370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	45317803	45318343	45317888	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	25347	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	45391331	45391628	45391429	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47641	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr6	45665421	45665594	45665503	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	321731	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	94404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	49521190	49521511	49521254	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5077	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	52345672	52345732	52345729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	62566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	53199994	53200715	53200310	Y	FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	11232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	53225493	53225821	53225675	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	13546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	53348299	53348382	53348306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	131386	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	54604535	54604549	54604543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83B	105020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	54845767	54846152	54846043	Y	GFRAL	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83B	136198	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	54904951	54905261	54905001	Y	NA	NA	MLIP	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83B	195382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	56459514	56459884	56459699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	357542	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	56811664	56812033	56811848	Y	NA	DST,BEND6	BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DST	5393	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	64308595	64308777	64308676	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	34948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	64629183	64629230	64629207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	285458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	70479579	70479974	70479889	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	25029	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	71548622	71548700	71548661	Y	FAM135A	NA	NA	NA	NA	NA	SMAP1	173143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	73335940	73336259	73335964	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	6420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	73355182	73355469	73355282	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25662	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	73378236	73378609	73378395	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	48716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	73504067	73504420	73504243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	174547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	73861458	73861626	73861542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	109312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	75914223	75914620	75914578	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	75977936	75978331	75978062	Y	NA	COX7A2,TMEM30A	NA	NA	NA	NA	TMEM30A	14353	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	76367901	76367953	76367944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP6	58676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	76494746	76495208	76494920	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	37837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	80487784	80488033	80487927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL2	148784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	80777050	80777287	80777243	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	37077	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	80927558	80927693	80927666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	113194	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	82631547	82631830	82631690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	171056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr6	82785578	82785603	82785590	Y	NA	NA	C9orf46	MCF7	ChIA-PET	19890323	IBTK	169868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	83106802	83107017	83106898	Y	NA	TPBG	TPBG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPBG	35879	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	83546132	83546541	83546207	Y	NA	NA	UBE3D,IBTK	IMR90	Hi-C	24141950	DOPEY1	228844	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	83745270	83745402	83745336	Y	NA	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	29983	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	83756669	83757034	83756938	Y	PGM3,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	18351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	83793136	83793338	83793237	Y	PRSS35,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	17751	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	83893224	83893469	83893362	Y	RWDD2A,PGM3,PGM3	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	RWDD2A	7629	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	83935269	83935637	83935453	Y	NA	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	PGM3	33614	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	86370103	86370257	86370180	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	16194	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	86377022	86377042	86377037	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	9409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	89746839	89747007	89746941	Y	NA	PNRC1	PNRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PNRC1	41463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	90031448	90031662	90031542	Y	PNRC1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	28905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	90596283	90596734	90596349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	58670	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	90860237	90860588	90860527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	144039	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	91112012	91112325	91112109	Y	BACH2,BACH2	NA	BACH2,CALN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	BACH2	107385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	91168030	91168508	91168309	Y	NA	NA	BACH2,MDN1,CASP8AP2,GJA10	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K7	126256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	105073456	105073750	105073604	Y	LIN28B	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	232044	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	105214871	105215235	105215053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	90559	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	105743987	105744339	105744163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREP	104620	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	106433951	106434222	106434177	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	97973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	106582399	106582514	106582457	Y	AIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	50204	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr6	106970547	106970941	106970751	Y	PRDM1,PRDM1,ATG5	AIM1	NA	NA	NA	NA	AIM1	12817	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	108169525	108169909	108169631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	107484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	108239964	108240066	108240015	Y	NA	SEC63	NA	NA	NA	NA	SEC63	37327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	108324190	108324471	108324239	Y	NA	SEC63,RPL3P7	NA	NA	NA	NA	RPL3P7	301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.0935626122757
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	109011028	109011405	109011217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	131990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	109035823	109035995	109035909	Y	NA	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90	Hi-C	24141950	ARMC2	131624	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	110502951	110503352	110503102	Y	FIG4,CDC40	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	CDC40	3607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	110870639	110870789	110870697	Y	NA	NA	RPF2,CDK19	IMR90	Hi-C	24141950	DDO	135874	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	111612312	111612528	111612438	Y	AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	33761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	111614404	111614762	111614615	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	35853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	111748625	111749047	111748803	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	53667	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	111841823	111842197	111842010	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	38905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	112125712	112126337	112125987	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	66318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	113388033	113388045	113388040	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	581231	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	113882209	113882518	113882322	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	86758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	113966975	113967088	113966980	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	2188	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	113975639	113976185	113975774	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	6363	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.42582972917841
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	RP11-367G18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-367G18.1	36530	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	116247686	116248075	116247881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRK	131846	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	116708579	116708861	116708730	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL1	109513	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	117769226	117769320	117769257	Y	NA	DCBLD1	DCBLD1,GOPC,ROS1	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD1	3660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	118648714	118648964	118648839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-632C17__A.1	330576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	118964875	118965125	118965000	Y	MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	CEP85L	64113	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	119129812	119130192	119130083	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	83192	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	119523776	119524187	119523976	Y	FAM184A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM184A	55224	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	121398601	121398951	121398918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	355887	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	121530032	121530291	121530288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	224547	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	125278816	125279129	125278841	Y	NA	RNF217,RP11-510H23.1	NA	NA	NA	NA	RNF217	2562	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	125282351	125282561	125282440	Y	NA	RNF217,RP11-510H23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-510H23.1	166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	125335634	125335813	125335724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-510H23.1	53449	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	125424080	125424400	125424202	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	13795	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	125426714	125426967	125426959	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	11228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	125579970	125580036	125580003	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	41246	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	125622252	125622475	125622321	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	126197747	126198095	126197755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HINT3	77832	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	127618608	127618885	127618797	Y	NA	RNF146,ECHDC1	NA	NA	NA	NA	RNF146	32853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	127907573	127907629	127907601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	152792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	128496365	128496708	128496537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	343162	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	128675135	128675339	128675237	Y	PTPRK,PTPRK	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	164531	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	128816273	128816626	128816620	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	23244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	128830157	128830356	128830243	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	9514	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	129822062	129822220	129822139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	207150	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	133837061	133837238	133837150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBPL1	434070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	134743944	134744382	134744175	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	106694	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr6	135636764	135637196	135637190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYB	136311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	136795244	136795664	136795596	Y	MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	74293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	137438439	137438749	137438739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	99837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	138153323	138153539	138153451	Y	NA	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	32812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	138290142	138290398	138290268	Y	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	103791	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	139209045	139209410	139209228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	97988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	139213986	139214343	139214165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	93055	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	139300314	139300341	139300327	Y	NHSL1	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	7057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr6	139720926	139720937	139720932	Y	NA	CITED2	CITED2,LOC100132735	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	27169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	139899473	139899647	139899531	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	205716	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	141171716	141171869	141171793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1294498	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	141204403	141204777	141204486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1261590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	141873662	141873944	141873832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	592423	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr6	143204143	143204540	143204474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	59798	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	143221710	143222285	143222093	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	42053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	143516746	143517148	143516792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	137113	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	144053697	144053884	144053799	Y	STX11,PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	108597	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	144975415	144975576	144975532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	370578	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	148685178	148685519	148685372	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	93738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	148705087	148705550	148705368	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	113647	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	149368124	149368336	149368236	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	16415	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	150176203	150176399	150176290	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	7800	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	150200694	150201094	150200866	Y	NA	LRP11,RAET1E,RAET1G	NA	NA	NA	NA	RAET1E	16144	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	150576036	150576243	150576102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R14C	113824	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	150577051	150577247	150577096	Y	RAET1G,ULBP2,RAET1L,PPP1R14C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R14C	114839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	150590987	150591352	150591048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R14C	128775	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	151178145	151178545	151178467	Y	MTHFD1L	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	6140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr6	151373285	151373500	151373395	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	45165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	151701197	151701769	151701451	Y	C6orf97,ZBTB2	ZBTB2	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	8914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr6	155181312	155181660	155181451	Y	TIAM2,TIAM2	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	128853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	141362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	155306251	155306499	155306375	Y	TIAM2	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	253792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	155347473	155347806	155347688	Y	NA	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-477D19.2	228052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	155526313	155526389	155526351	Y	NA	RP11-477D19.2	TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-477D19.2	49469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	157726321	157726550	157726459	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	16083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	158424430	158424803	158424679	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	23542	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	158525965	158526121	158526043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERAC1	61191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.47421035996219
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr6	159434370	159434675	159434475	Y	TAGAP	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	15151	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	159495451	159495612	159495554	Y	SYTL3,TAGAP	NA	TAGAP	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	76232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	160137124	160138386	160137829	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	6231	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	160409606	160409719	160409663	Y	IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	21475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	161450213	161450498	161450260	Y	NA	MAP3K4	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	39454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	161536644	161536718	161536688	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	125885	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	163098494	163098513	163098505	Y	PARK2,PACRG,PACRG	PACRG,PARK2	NA	NA	NA	NA	PACRG	47651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	163107728	163108018	163107873	Y	PARK2,PACRG	PACRG,PARK2	NA	NA	NA	NA	PACRG	38146	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	163881453	163881850	163881463	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	48421	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	169368330	169368547	169368455	Y	NA	NA	TCTE3,WDR27,C6orf70,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	192472	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	170208297	170208700	170208496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTE3	58642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	170461603	170461884	170461744	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135677	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr6	170461964	170462067	170462016	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135494	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr6	170467648	170467815	170467737	Y	TCTE3,FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	129746	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	170492436	170492647	170492551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	104914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	170501868	170502090	170502073	Y	DLL1	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	95471	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.66453423380543
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM20C	182125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	409137	409513	409244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	148420	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr7	416236	416525	416371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	141408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	950197	950303	950276	Y	NA	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	36008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	1013884	1014155	1013955	Y	NA	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	1035018	1035209	1035116	Y	NA	ADAP1,COX19,GPR146	NA	NA	NA	NA	COX19	21783	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	1598591	1598955	1598779	Y	NA	MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	TMEM184A	134	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	1959266	1959659	1959487	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	179339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	2101889	2102279	2102085	Y	ELFN1	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	168599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	2356665	2356933	2356799	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	34788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	2675785	2676022	2675959	Y	SNX8,LFNG	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	6200	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	2797465	2798227	2798113	Y	SNX8,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	75028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	5452779	5453024	5452968	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	10021	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr7	5650367	5650762	5650403	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	19928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	7199160	7199187	7199178	Y	NA	C1GALT1	COL28A1	IMR90	Hi-C	24141950	C1GALT1	4595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	544048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	15957269	15957287	15957277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	501660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	17192314	17192682	17192564	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	143564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	18548166	18548343	18548284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	570042	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	18583507	18583829	18583636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	571466	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	19746950	19747169	19747121	Y	NA	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	20217388	20217681	20217578	Y	TWISTNB,MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	37346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	20447290	20447655	20447472	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	78965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	22386592	22386681	22386637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	162937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	23346374	23346675	23346525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	72788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	23410116	23410259	23410188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	97827	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	23411315	23411579	23411447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	96507	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	23488792	23489118	23488955	Y	KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	18968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr7	24820839	24820982	24820878	Y	NA	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	13595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53333	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	25002827	25003181	25002973	Y	C7orf31,OSBPL3	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	16072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	26317891	26318244	26318068	Y	NA	AC010677.5,SNX10	HNRNPA2B1,CBX3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC010677.5	4076	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	26815721	26816027	26815980	Y	SNX10,SNX10,SKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP2	216831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	27531639	27532015	27531830	Y	NA	EIF4HP1	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	35171	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	27774829	27775014	27774922	Y	NA	TAX1BP1,AC004549.6	NA	NA	NA	NA	TAX1BP1	1936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	98953	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	29115131	29115317	29115226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	117750	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	29217860	29218383	29218096	Y	CHN2,CPVL	CPVL	CHN2	IMR90	Hi-C	24141950	CPVL	14684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	29268868	29269165	29269017	Y	CHN2	CPVL	NA	NA	NA	NA	CPVL	35801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	29534563	29534631	29534599	Y	WIPF3	NA	NA	NA	NA	NA	AC007255.8	66655	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	29645878	29645994	29645936	Y	NA	AC007255.8,PRR15	PRR15	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRR15	44451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	30188805	30188913	30188846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8	123785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr7	30206134	30206379	30206282	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	115544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BBS9	595374	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	34316740	34316919	34316850	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	1149884	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	34529792	34529930	34529861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	1203251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	35629037	35629048	35629043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	104133	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	415606	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	39774001	39774145	39774098	Y	CDK13,RALA	LINC00265	NA	NA	NA	NA	LINC00265	2770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	40007110	40007159	40007135	Y	NA	CDK13	NA	NA	NA	NA	CDK13	19474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	40138099	40138142	40138120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	150463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	40580986	40581112	40581049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	593350	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	41173932	41174138	41174035	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	566568	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	41406895	41407296	41407096	Y	NA	NA	C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	333410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	NA	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	PSMA2	147408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr7	43593728	43593915	43593801	Y	NA	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	26442	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4,AC004951.5	NA	NA	NA	NA	AC004951.5	30881	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	44658456	44658730	44658526	Y	PURB,TMED4,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	14285	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	44845785	44846169	44845977	Y	DDX56	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	11506	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	44855333	44855416	44855373	Y	TBRG4,H2AFV	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	21054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	45019224	45019585	45019470	Y	OGDH,ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G	SNHG15,CCM2	NA	NA	NA	NA	SNHG15	4975	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	46691314	46691685	46691473	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	SEPT7P2	884697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47293209	47293414	47293276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	326742	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47366502	47366627	47366552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	253529	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47367058	47367181	47367120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	252975	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47475545	47475747	47475668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	144409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	47496897	47497228	47497063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	122928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47505797	47506192	47505996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	113964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr7	47517591	47517776	47517700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	102380	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47518819	47519136	47519085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	101020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	98063	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr7	47533820	47533921	47533853	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	86235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47542893	47543371	47543076	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	76785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47554592	47554957	47554775	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	65199	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47573930	47574208	47574136	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	45948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr7	47709189	47709374	47709294	Y	UPP1,UPP1,HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	89033	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	193358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	190582	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	48122110	48122308	48122209	Y	NA	C7orf57,UPP1	UPP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	UPP1	3917	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	48126389	48126700	48126545	Y	NA	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	164	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	48240591	48240965	48240675	Y	NA	ABCA13	NA	NA	NA	NA	ABCA13	31536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	854474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55035120	55035446	55035284	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	49268	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	55063452	55063479	55063466	Y	NA	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	21235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	55063666	55063958	55063856	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	20756	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	55134555	55134962	55134733	Y	NA	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	49841	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	55142882	55143327	55143024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	58168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr7	55167745	55167964	55167855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	83031	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55198488	55198937	55198616	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	113774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr7	55230228	55230334	55230281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1P2	95615	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55235458	55235690	55235573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1P2	90259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55245390	55245594	55245555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1P2	80355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	CALM1P2	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	CALM1P2	2993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	55436942	55437154	55437048	Y	NA	LANCL2	NA	NA	NA	NA	LANCL2	5801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr7	55541787	55541962	55541880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	96719	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	55542922	55542955	55542935	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95726	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	55543241	55543436	55543358	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	55576461	55576688	55576528	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	61993	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55604306	55604799	55604689	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	33882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55635235	55635573	55635336	Y	NA	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	3108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	55637465	55637727	55637601	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	55637986	55638270	55638071	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	411	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	56173322	56173423	56173410	Y	NA	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1467054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1796107	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	63775449	63776053	63775748	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	9612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	65790150	65790379	65790243	Y	RABGEF1,KCTD7,TPST1	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	121964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	69308115	69308415	69308239	Y	AUTS2,AUTS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-859M6.1	1204330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	70113143	70113470	70113265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-859M6.1	2009358	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr7	73037168	73037552	73037436	Y	MLXIPL	TBL2	NA	NA	NA	NA	TBL2	46047	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	WBSCR22	32741	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.85485810764868
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	73443567	73443942	73443908	Y	CLIP2,ELN	NA	NA	NA	NA	NA	LIMK1	51321	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	75449549	75449901	75449725	Y	NA	CCL26,RHBDD2	HIP1,CCL26,CCL24,POR,TMEM120A,STYXL1,MDH2	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	20019	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	75522158	75522529	75522343	Y	RHBDD2	POR	NA	NA	NA	NA	POR	3989	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	75675722	75675985	75675853	Y	NA	STYXL1,MDH2	NA	NA	NA	NA	MDH2	353	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr7	75920543	75920716	75920673	Y	NA	NA	HSPB1	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAG	65632	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	75926781	75926853	75926816	Y	HSPB1	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAG	59495	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	YWHAG	NA	NA	NA	NA	YWHAG	38722	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	75993529	75993613	75993570	Y	POR	YWHAG,SRCRB4D	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7181	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	YWHAG	22825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	86561279	86561598	86561380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	125417	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	86946167	86946460	86946286	Y	NA	TP53TG1,CROT	NA	NA	NA	NA	TP53TG1	26371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	86948267	86948659	86948457	Y	CROT	TP53TG1,CROT	NA	NA	NA	NA	TP53TG1	24172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr7	87453552	87453801	87453676	Y	NA	DBF4,SLC25A40	NA	NA	NA	NA	DBF4	49730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	87886356	87886519	87886436	Y	STEAP4	SRI	NA	NA	NA	NA	SRI	32048	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	90250368	90250899	90250569	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CDK14	156630	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	90305838	90306207	90306023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK14	212100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	91466585	91467314	91466893	Y	NA	MTERF	NA	NA	NA	NA	MTERF	40720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	GNG11	317504	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	95867967	95868008	95867988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	81451	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	96356973	96357275	96357162	Y	NA	SHFM1	NA	NA	NA	NA	SHFM1	19770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	98048213	98048460	98048408	Y	BRI3	RPS3AP26,BAIAP2L1	BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAIAP2L1	19833	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	98724585	98724789	98724635	Y	ZNF394,SMURF1	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	14934	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	MYH16	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	MYH16	24733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	MYH16,ARPC1A	NA	NA	NA	NA	MYH16	37506	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	101372678	101373024	101372861	Y	NA	NA	CUX1,EMID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	83935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	102958965	102959200	102958983	Y	NA	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	23096	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	102959356	102959407	102959404	Y	PMPCB,DNAJC2	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PSMC2	23294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	RP11-325F22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-325F22.2	18121	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	104601504	104601791	104601630	Y	SRPK2,MLL5	RP11-325F22.2,LINC01004	NA	NA	NA	NA	RP11-325F22.2	21994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	104612836	104613032	104612935	Y	NA	RP11-325F22.2,LINC01004	NA	NA	NA	NA	RP11-325F22.2	33326	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	104771634	104771765	104771700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	120143	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	104842983	104843396	104843385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	191492	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	104884738	104885065	104884890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	152690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	104960256	104960357	104960307	Y	MLL5,SRPK2	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	77398	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	105489836	105490303	105490021	Y	NA	ATXN7L1,CDHR3	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	24747	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	105508245	105508445	105508345	Y	NA	ATXN7L1,CDHR3	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	6605	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	105714803	105715079	105714993	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	35943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	107205466	107205592	107205534	Y	COG5	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	COG5	2507	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	107939769	107940082	107939931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	208595	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	111745442	111745761	111745634	Y	ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	98705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	112517846	112518028	112517949	Y	IFRD1,C7orf60	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf60	59943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	114018736	114018896	114018817	Y	FOXP2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	294354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	331955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	115873924	115874179	115873941	Y	TES	TES	NA	NA	NA	NA	TES	25377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	115912136	115912451	115912327	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	12983	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	115955390	115955624	115955546	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	29956	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr7	116035470	116035688	116035648	Y	NA	NA	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	AC002066.1	101831	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	116135780	116136169	116135975	Y	NA	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	AC002066.1	1350	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr7	116181805	116181927	116181813	Y	CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	18966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	116202174	116202561	116202326	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	39335	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr7	116319612	116319902	116319758	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	9168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	118520575	118520914	118520745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	698489	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	120420685	120421066	120420916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	75390	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	121170486	121170616	121170551	Y	NA	NA	FAM3C,WNT16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	136068	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	123284312	123284364	123284338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5	88003	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	127876972	127877440	127877187	Y	IMPDH1,LRRC4	NA	PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM28	104522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.9500200445703
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	128915299	128915657	128915368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCYL2	52435	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129005588	129005946	129005786	Y	AHCYL2,NRF1,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	42265	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129010616	129010786	129010717	Y	NA	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	37425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129078824	129079119	129078920	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	30613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129084265	129084564	129084426	Y	AHCYL2,FAM40B	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	36054	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129095634	129096008	129095821	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RNU1-72P	26337	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129246747	129246901	129246817	Y	NA	NRF1	NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	2654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr7	129460659	129460706	129460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	130083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129508183	129508482	129508331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	82307	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	129609674	129609888	129609791	Y	NA	UBE2H	AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2H	18885	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	130151792	130152099	130151899	Y	NA	MIR335	NA	NA	NA	NA	MIR335	17840	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	130644314	130644883	130644570	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48245	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	130692586	130692952	130692786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	96517	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	131307786	131308102	131307944	Y	NA	NA	PODXL	MCF7	ChIA-PET	22265404	PODXL	66810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	157112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	133706471	133706698	133706584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGUK	103354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr7	134475089	134475514	134475151	Y	CALD1	CALD1	NA	NA	NA	NA	CALD1	48086	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.47421035996219
chr7	135015340	135015403	135015372	Y	STRA8	NA	NA	NA	NA	NA	WDR91	121024	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	135120473	135120740	135120725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT4	72135	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	135395183	135395352	135395286	Y	NA	C7orf73	NA	NA	NA	NA	C7orf73	49939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	135446640	135446883	135446777	Y	FAM180A	NA	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	101396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr7	136635462	136635508	136635485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	859789	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	139367160	139367381	139367316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	139420496	139420947	139420749	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	54630	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	139498127	139498170	139498155	Y	TBXAS1	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	22550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr7	141334636	141334647	141334642	Y	TAS2R3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	65306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	141380130	141380660	141380538	Y	NA	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	19293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	141492164	141492415	141492290	Y	TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	56043	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	144539515	144539760	144539575	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPK1	8027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.80807680151083
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr7	151033271	151033667	151033458	Y	SLC4A2,AGAP3,RHEB,PRKAG2,NUB1	NUB1	NA	NA	NA	NA	NUB1	3118	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	305822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	151955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009403.2	144484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	NA	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC009403.2	308476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	155752755	155752934	155752845	Y	SHH	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC009403.2	316856	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	156544134	156544345	156544262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf13	112786	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	156792805	156792864	156792835	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	8481	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	156804828	156804838	156804833	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	3483	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	157085416	157085724	157085621	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	40351	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr7	157225296	157225625	157225465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	99221	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr7	157405982	157406183	157406105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	279907	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr7	158196067	158196294	158196241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	299226	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.75969617072705
chr7	158808159	158808606	158808258	Y	VIPR2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR60	160890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	981095	981315	981205	Y	NA	NA	ZNF596	IMR90	Hi-C	24141950	ERICH1	294989	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	1113582	1113707	1113595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	427476	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	1693574	1694042	1693752	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr8	1694228	1694696	1694461	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7248	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	1911297	1911510	1911444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOM2	79645	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	6443237	6443295	6443265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	120435	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	6455509	6456036	6456003	Y	ANGPT2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	107694	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	8787622	8787836	8787719	Y	NA	MFHAS1	MFHAS1,FLJ10661,SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	MFHAS1	38467	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	10117948	10118255	10118046	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	208170	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	121498	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	11013396	11013600	11013498	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	43275	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	11036366	11036550	11036458	Y	MTMR9,XKR6	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	20325	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	11311289	11311840	11311810	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	18384	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr8	14762942	14763011	14762975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	509713	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	17583613	17583759	17583634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	73095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	17708923	17709156	17709065	Y	MTMR7,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	52069	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	18768857	18769292	18769046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	170948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	18998257	18998415	18998308	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	58017	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	19354386	19355027	19354891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	185258	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr8	22522684	22522941	22522886	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	1720	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	22855581	22855914	22855756	Y	EGR3,EGR3,EGR3	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	12651	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	22858322	22858618	22858470	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15392	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	24858208	24858485	24858356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	181753	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	25284653	25284746	25284700	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	KCTD9	29246	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	27200806	27201031	27200919	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	33807	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	27209291	27209793	27209526	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	42292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	27248451	27248615	27248585	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	81452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	27449540	27450013	27449597	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	CLU	20535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	27474556	27474730	27474657	Y	NA	CLU,SCARA3	SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLU	4008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	27972693	27972953	27972823	Y	NA	ELP3	NA	NA	NA	NA	ELP3	27503	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	28562756	28562912	28562834	Y	EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3	106770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	28634516	28634595	28634556	Y	KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	INTS9	111164	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	28635981	28636227	28636104	Y	EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	INTS9	109532	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	29948448	29949236	29948548	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	1678	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	32491615	32491938	32491677	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	837002	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	32603273	32603561	32603417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	725379	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	32642880	32643214	32643047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	685726	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	261637	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	35270986	35270995	35270991	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	110286	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	37929132	37929304	37929218	Y	NA	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	31456	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	38867572	38867594	38867583	Y	C8orf86	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	15184	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	40032102	40032537	40032342	Y	IDO1	NA	NA	NA	NA	NA	IDO1	274308	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	215802	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	41819161	41819283	41819222	Y	POLB	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	88225	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	42184337	42184357	42184347	Y	NA	POLB	NA	NA	NA	NA	POLB	9615	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	42356471	42356680	42356560	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	38389	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	42383718	42383741	42383730	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	11328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	42398083	42398473	42398470	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	3014	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	42748560	42748749	42748647	Y	THAP1,HOOK3	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	47885401	47885427	47885415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	181314	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	48265617	48265884	48265750	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	48343978	48344357	48344119	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	158814	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	48350721	48350922	48350822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	152249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	48581816	48581989	48581954	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	67659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	49638531	49638925	49638704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	193374	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	49701443	49701572	49701502	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAI2	130727	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	49783004	49783154	49783067	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	49145	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	821254	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	55018716	55018874	55018809	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	LYPLA1,MRPL15	LYPLA1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LYPLA1	6139	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	56796346	56796794	56796413	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	5974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	56798106	56798776	56798363	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	7734	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	56919441	56919801	56919730	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	64659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	57594764	57594896	57594825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	95820	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	59476129	59476409	59476167	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	12646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	59497301	59497891	59497607	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	33818	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	9.23070788139739
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	13095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	67626224	67626609	67626278	Y	SGK3,VCPIP1,SGK3	VCPIP1,C8orf44,SGK3	NA	NA	NA	NA	SGK3	3571	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	67694398	67694637	67694506	Y	VCPIP1,SGK3,SGK3	NA	NA	NA	NA	NA	SGK3	71745	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	68097028	68097398	68097213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	103010	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	1271261	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	70310732	70311124	70310931	Y	NA	NA	C8orf34	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA2	1002916	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	71106642	71106934	71106707	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	207106	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	71124105	71124438	71124275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	189602	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	71129648	71130032	71129927	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	184008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	164370	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	71188678	71189062	71188836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	124978	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	72143679	72143939	72143809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA1	128528	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	72947235	72947530	72947318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA1	674768	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	232607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	74079546	74079746	74079651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDH10	125101	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	75135577	75135926	75135753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP1	95439	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	76148779	76148868	76148824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	169281	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	75688	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	79000264	79000479	79000281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	425895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	15.0355860336164
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	81015641	81015664	81015650	Y	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	75117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	81041762	81041917	81041834	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	99550	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	81695028	81695405	81695288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	299174	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	81782792	81783006	81782996	Y	ZBTB10,ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	239297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	81962809	81963138	81963038	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	59165	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	82019096	82019493	82019305	Y	PAG1	PAG1,RP11-1149M10.2	NA	NA	NA	NA	PAG1	2810	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	86168048	86168180	86168124	Y	NA	C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	CA13	37232	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	86378354	86378674	86378384	Y	LRRCC1,CA2	CA2	NA	NA	NA	NA	CA2	4273	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	87014840	87015227	87015062	Y	NA	ATP6V0D2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D2	17288	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	87046438	87046558	87046501	Y	NA	ATP6V0D2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D2	48886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE3	178901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90105251	90105649	90105450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	662306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90270902	90271148	90271067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	496807	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90443511	90443699	90443605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	324256	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90479154	90479488	90479317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	288467	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	90556024	90556173	90556098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	211782	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	90627835	90627903	90627892	Y	NA	NA	MMP16	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37B2.1	140052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90741352	90741628	90741481	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	DECR1,RIPK2,NBN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-37B2.1	26327	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90776453	90776674	90776498	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	8478	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90838382	90838725	90838688	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK2	70407	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90845997	90846144	90846052	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSGIN2	65943	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	91064955	91065319	91065136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBN	51499	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	LINC00535	17696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	94850124	94850307	94850200	Y	PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17728	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	97272793	97273157	97272974	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	99485745	99486120	99486088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	181124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	99526737	99526942	99526761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	222116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	309465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	100808377	100808591	100808586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	95699	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	101500158	101500422	101500292	Y	NA	NA	RNF19A,GRHL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	69590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	101679774	101679926	101679916	Y	NA	NA	FLJ42969,SNX31,PABPC1	IMR90	Hi-C	24141950	PABPC1	53111	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	101773934	101774280	101774106	Y	NA	PABPC1	SNX31,PABPC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	40897	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	21757	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.90323873843245
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	102100153	102100310	102100232	Y	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	116111	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	102171817	102172037	102171960	Y	YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44384	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	102449376	102449720	102449428	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	52940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	102450789	102450808	102450799	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	51852	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr8	102513804	102514123	102513992	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	11144	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	102516990	102517159	102517011	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	14330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr8	102543448	102543645	102543547	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	40788	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	103549503	103549899	103549700	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116231	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	64663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	103757592	103757997	103757773	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	57748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	49089	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1732A1.1,KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	103918538	103918841	103918687	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	14446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	104090039	104090169	104090107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	58748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	104198945	104199161	104199050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD6	109500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	104457896	104458033	104457972	Y	NA	DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	SLC25A32	32479	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	107054607	107054687	107054647	Y	OXR1	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	16065	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	107709391	107709773	107709582	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	1150	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	109230205	109230491	109230349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	215071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	116507305	116507631	116507503	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	312268	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	117175146	117175377	117175262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	355247	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr8	118776615	118776789	118776702	Y	NA	NA	MED30,EXT1,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	245663	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	118778404	118778792	118778598	Y	NA	NA	EXT1	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	247452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	118859857	118860327	118860104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	261765	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	118958698	118959000	118958912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	163092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	119303956	119304407	119304075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	181864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	120232000	120232286	120232044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	56727	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	120331278	120331302	120331291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	156005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	122157265	122157468	122157378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	494162	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	122347057	122347434	122347232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	304196	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	123050237	123050548	123050394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	398607	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	123317783	123317849	123317816	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	666153	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	123398501	123398841	123398672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	653822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	123446302	123446696	123446499	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	DERL1	605967	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	123554742	123554841	123554763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	497822	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	123801301	123801636	123801353	Y	ZHX2	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	251027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	123882951	123883328	123883140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	169335	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	123883965	123883977	123883971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	168686	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	144180	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	19539	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	124337288	124337362	124337325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX1	51507	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	124478396	124478824	124478461	Y	NA	NA	FBXO32,ANXA13,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	WDYHV1	51431	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	124529265	124529734	124529486	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	21712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	124547812	124548082	124548041	Y	NA	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	3364	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	124549741	124550229	124550044	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1217	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	124608792	124609080	124608936	Y	FBXO32	NA	ANXA13,FBXO32,KLHL38	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO32	57346	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	124684984	124685340	124685256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	93356	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	124934433	124934622	124934528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	155737	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	125304968	125305098	125305033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	77835	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	125357334	125357543	125357438	Y	NA	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	25390	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr8	125466570	125466668	125466619	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	5522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	125672540	125672913	125672841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	65817	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	126193275	126193543	126193371	Y	NA	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	91193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	126245115	126245425	126245196	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	143033	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	126354343	126354802	126354718	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	85761	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	126400704	126400965	126400873	Y	NA	TRIB1	TRIB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	39598	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	126451967	126452238	126452064	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	126518421	126518590	126518541	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB1	77858	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	126525260	126525748	126525427	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	84697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	126541064	126541373	126541286	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	100501	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	127438735	127439116	127438766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	129004	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	127574722	127575027	127574875	Y	NA	RP11-89K10.1,FAM84B	NA	NA	NA	NA	FAM84B	6084	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	127840242	127840498	127840319	Y	NA	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	271604	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	127908732	127908971	127908856	Y	NA	NA	MYC,LOC727677,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	340094	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128048074	128048382	128048201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	479436	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128068284	128068629	128068554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	499646	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128112845	128113195	128113019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	544207	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	NA	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYC	517926	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128259400	128259918	128259781	Y	MYC	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	485762	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128260594	128261000	128260832	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	484680	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	438397	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr8	128407875	128408267	128408231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	337413	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128413471	128413778	128413602	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	331902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	128519696	128520090	128519909	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	225590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	128523245	128523266	128523257	Y	NA	NA	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	222414	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128575770	128576030	128575897	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	169650	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	128608525	128608821	128608655	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	136859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	128680448	128680536	128680487	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	65144	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr8	128772812	128773062	128772941	Y	NA	MYC,PVT1	NA	NA	NA	NA	MYC	27132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128835085	128835527	128835341	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	30306	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128879185	128879808	128879466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	74406	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	30584	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	16124	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	150545	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	130983929	130984348	130984047	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	43027	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	130996669	130996803	130996748	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30572	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	131011351	131011453	131011402	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	15922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	131264949	131265429	131265208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	237574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	131271729	131272058	131271952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	244354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	131296989	131297286	131297259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	269614	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	327107	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	132658196	132658445	132658435	Y	HHLA1	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	255890	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	132789873	132790159	132790016	Y	NA	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	124176	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	134065338	134065765	134065507	Y	TMEM71,PHF20L1,TG,SLA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	246500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	134258134	134258466	134258300	Y	PHF20L1,NDRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	53799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	134287657	134287800	134287798	Y	NA	NDRG1,CTC-458A3.1	NA	NA	NA	NA	NDRG1	24465	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	134387761	134388081	134387916	Y	NA	ST13P6	TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	30168	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	135635794	135636288	135636020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	87004	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr8	136936407	136936454	136936431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	1213115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	141266447	141267055	141266903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	199623	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	142082969	142083325	142083150	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	42052	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	142084181	142084412	142084295	Y	PTK2	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	40965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	142182442	142182863	142182588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	57065	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	142248811	142249092	142249020	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	67312	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	142286712	142287093	142287044	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	29311	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	142386413	142386490	142386444	Y	GPR20	GPR20,PTP4A3	NA	NA	NA	NA	GPR20	11046	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr8	143404071	143404506	143404336	Y	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	78095	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	143758809	143759081	143758941	Y	NA	PSCA,JRK,LY6K	NA	NA	NA	NA	JRK	2305	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	143869768	143870087	143870041	Y	PSCA,SLURP1,LYNX1,LY6D	SLURP1,RP11-706C16.7,LYNX1,LY6D	NA	NA	NA	NA	LY6D	3760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr8	144032047	144032423	144032233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6E	64976	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	144094701	144094997	144094860	Y	LY6K,C8orf55	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	2402	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.47261103531626
chr8	144112654	144112974	144112830	Y	CYP11B2	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	15255	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	144302525	144302816	144302585	Y	LY6H,LY6H,LY6H	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	24464	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	144684263	144684410	144684337	Y	NA	NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623	NA	NA	NA	NA	EEF1D	4552	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H	14534	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	3.52099166610004
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	145040615	145041072	145040959	Y	GSDMD,EEF1D,PARP10	PLEC,GRINA,PARP10	NA	NA	NA	NA	PLEC	7830	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	145887419	145887725	145887588	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP39	21469	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	145909522	145909717	145909620	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	328	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	637253	637595	637415	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	168962	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	758228	758480	758338	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT2	289874	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	3470131	3470258	3470195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	53746	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	5446001	5446185	5446074	Y	NA	CD274	INSL6,CD274,PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	2318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	5459353	5459726	5459436	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	10850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	10446077	10446442	10446410	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1357201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	13088815	13089048	13088932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	188541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	14251419	14251628	14251514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	145354	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	16321710	16321985	16321848	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	796029	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	16917257	16917516	16917383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTLN	215464	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	18478894	18479067	18478986	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	545823	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21016783	21016802	21016795	Y	IFNA1,IFNA6,IFNA5,IFNW1	PTPLAD2	NA	NA	NA	NA	PTPLAD2	12833	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	21491701	21492113	21492049	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	18071	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	21589940	21590292	21590223	Y	IFNW1,IFNA6,IFNA1	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	32272	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21674915	21675193	21674990	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	117247	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21677834	21678156	21678014	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	120166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21688773	21688952	21688863	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	111590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21702719	21702756	21702738	Y	IFNA5,IFNA6,IFNA8,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	97786	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	21984231	21984381	21984318	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	8919	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	26436913	26437234	26437074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT74	507803	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	29211344	29211542	29211410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1618681	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	32524178	32524624	32524592	Y	DDX58	TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	34158490	34158839	34158617	Y	NA	DCAF12,UBAP1,AL353662.2	DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBAP1	18164	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	34375136	34375287	34375212	Y	NA	KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	285	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	34394792	34394981	34394887	Y	NA	KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	19941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr9	36231547	36231666	36231607	Y	NA	CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	42694	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	37270797	37270994	37270913	Y	PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	149669	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	4937201	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	66471270	66471410	66471340	Y	NA	NA	LOC642236	IMR90	Hi-C	24141950	FAM122A	4921554	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	66843628	66843847	66843730	Y	NA	NA	LOC642236	IMR90	Hi-C	24141950	FAM122A	4549117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	68299584	68299663	68299624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	3093301	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2974818	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2968599	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	68429583	68429926	68429755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2963038	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2937408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	71791709	71792066	71791753	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	57500	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	72717148	72717358	72717253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	154579	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	72731610	72732001	72731807	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	139936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	72781786	72782158	72781853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	89779	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	72801648	72801771	72801710	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	70166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.951619369216226
chr9	73036465	73036957	73036835	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8925	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	73224625	73224828	73224734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	197085	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	74318584	74318670	74318629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	110936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	74398068	74398402	74398258	Y	TMEM2	TMEM2	TMEM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMEM2	31204	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	74581601	74581796	74581711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf85	57175	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	75580383	75580516	75580515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	112842	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	76299237	76299618	76299309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	534564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	77765912	77766310	77766149	Y	OSTF1	NA	NA	NA	NA	NA	OSTF1	64453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	77854155	77854441	77854300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSTF1	152696	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	78507446	78507579	78507560	Y	PCSK5	PCSK5	NA	NA	NA	NA	PCSK5	3886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	79018113	79018533	79018297	Y	NA	RFK,GCNT1	NA	NA	NA	NA	RFK	10680	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	79257487	79257560	79257491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	72756	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	79303501	79303668	79303622	Y	GCNT1	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	118770	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	81641483	81641834	81641545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	362385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	85587803	85587810	85587807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	88282	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	86051693	86051979	86051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439K3.1	219447	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	86088348	86088544	86088498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	231965	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	86239584	86239974	86239757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	80535	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	87370377	87370471	87370425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	416705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	87466967	87467081	87467024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	513295	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	87555242	87555574	87555409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	601570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	88286391	88286647	88286519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	68297	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	88298792	88299000	88298900	Y	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	55944	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	88357534	88357780	88357692	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	2590	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	88902044	88902242	88902143	Y	NA	ISCA1	NA	NA	NA	NA	ISCA1	6368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	89190934	89191346	89191092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC6	223565	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	89381829	89382120	89381981	Y	ZCCHC6	NA	ZCCHC6,GAS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDC20P1	242447	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	90407699	90408115	90407854	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179553	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	91022048	91022386	91022218	Y	NA	SPIN1	NA	NA	NA	NA	SPIN1	20714	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.33226711690272
chr9	92762358	92762553	92762476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-389K14.3	431234	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	93683361	93683758	93683679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYK	121292	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.23710517998109
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	94249438	94249755	94249665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIL3	65294	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	94834730	94835154	94834963	Y	OGN	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	40512	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	95452860	95453088	95452974	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	22313	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	96377714	96377795	96377762	Y	PHF2	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	41025	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	96434811	96435085	96434948	Y	PHF2	NA	NA	NA	NA	NA	PHF2	98122	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	96901972	96902054	96902023	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	37062	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.71291486458921
chr9	97288097	97288106	97288102	Y	FBP1,FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIATL1	153264	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	97679079	97679413	97679326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	192096	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	97688379	97688667	97688436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	201396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	97699905	97700054	97699963	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	212922	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	97710922	97711259	97710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	223939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	98262009	98262267	98262138	Y	PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	15072	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	98629500	98629569	98629535	Y	NA	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	6690	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	98789709	98789934	98789859	Y	C9orf102	NA	LOC158435	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	116355	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	HSD17B3,SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	99132173	99132333	99132255	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	11659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	99408748	99408964	99408853	Y	C9orf21	CDC14B	NA	NA	NA	NA	CDC14B	28636	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	100454693	100454853	100454773	Y	TSTD2,XPA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2786	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	FOXE1	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	47272	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	100969722	100969939	100969831	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	16800	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	101088730	101088899	101088782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	72815	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	102006739	102006945	102006777	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	24393	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	102195698	102196356	102196027	Y	TGFBR1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NA	SEC61B	213352	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	NA	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TEX10	60609	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	103795840	103796119	103795981	Y	LPPR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-394D2.1	304318	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RP11-490D19.6,RNF20	NA	NA	NA	NA	RP11-490D19.6	19869	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	106995057	106995251	106995156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	140516	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	RP11-217B7.2,ABCA1	NA	NA	NA	NA	RP11-217B7.2	18109	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	107723549	107723790	107723714	Y	NIPSNAP3A,ABCA1	RP11-217B7.2,ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	35031	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr9	107769025	107769996	107769532	Y	FSD1L,FSD1L,ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	80507	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	107814689	107815137	107814792	Y	NA	NA	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	126171	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	107950174	107950339	107950255	Y	FSD1L,FSD1L,ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC44A1	54564	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	108052780	108053053	108052862	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	47877	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	109933165	109933377	109933258	Y	KLF4	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110041	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	110109718	110109795	110109757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	66300	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	59864	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	110517575	110517896	110517754	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	266812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	110819751	110819910	110819831	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	567203	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	111313727	111314112	111313882	Y	NA	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-220D10.1	73001	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	111315008	111315237	111315108	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-220D10.1	71876	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	111578254	111578597	111578428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKBKAP	115799	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chr9	111872786	111872983	111872905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	98977	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	C9orf84	NA	NA	NA	NA	C9orf84	49492	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	114784464	114784581	114784539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	127418	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	114823556	114823978	114823803	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	111710	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	115440529	115440762	115440646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-276E15.4	69974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	115523438	115523763	115523601	Y	ZFP37	RP11-276E15.4,SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	12320	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	115657106	115657497	115657253	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	145988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	115982258	115982474	115982402	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	FKBP15,SLC31A1	NA	NA	NA	NA	SLC31A1	450	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	116987864	116988161	116988001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	72024	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	117080236	117080340	117080297	Y	TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	164396	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	117566825	117567042	117566994	Y	TNFSF15	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	195339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	146162	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.75969617072705
chr9	118350454	118350525	118350489	Y	DEC1	NA	ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	471918	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	118378080	118378500	118378342	Y	NA	NA	PAPPA,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	499544	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	119836202	119836379	119836375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	388621	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	121571098	121571456	121571292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1768992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	122115957	122116135	122116045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1224313	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	123658471	123658684	123658522	Y	TRAF1,TRAF1	PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	PHF19	20865	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	124462644	124463047	124462791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	135308	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.42423040453249
chr9	124463473	124463936	124463619	Y	TTLL11,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	136137	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.56937229688381
chr9	124704763	124705076	124704868	Y	TTLL11,MRRF,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	148809	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	125956223	125956395	125956307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72460	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	126187790	126188025	126187905	Y	RABGAP1,GPR21,CRB2	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	158935	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	126200869	126200875	126200873	Y	RABGAP1,GPR21,DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	172014	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	126232587	126232866	126232722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	203732	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	126237774	126237937	126237796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	208919	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	126291594	126291648	126291621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	262739	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	126629474	126629619	126629528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	60812	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127155102	127155374	127155331	Y	DENND1A	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	20349	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127165878	127166187	127166033	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	9536	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127356039	127356231	127356145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	62515	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	127356875	127357120	127357108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	61626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127433186	127433516	127433351	Y	NR6A1	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	14440	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127458498	127458770	127458741	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	39752	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127466904	127467345	127467172	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	48158	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	127509473	127509808	127509481	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	21781	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	128299092	128299304	128299184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168209	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	128394575	128395007	128394820	Y	PPP6C	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	72506	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	129466839	129467134	129467067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	92117	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	129525777	129525955	129525866	Y	FAM125B	ZBTB43	LMX1B,FAM125B	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB43	39330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	129590383	129590427	129590410	Y	ZBTB43	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	25098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	130179463	130179679	130179569	Y	NA	SLC2A8,ZNF79,SNORA65,RPL12,LRSAM1	NA	NA	NA	NA	ZNF79	4982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,AK1	NA	NA	NA	NA	AK1	36777	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	130675929	130676130	130676030	Y	NA	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	1187	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	131988173	131988389	131988342	Y	NA	IER5L	LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50	IMR90,K562,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IER5L	49633	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	NA	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	51611	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.856457432294603
chr9	132107111	132107275	132107178	Y	C9orf78,C9orf106	RP11-65J3.1	IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,ASB6,METTL11A,PPP2R4	H1ESC,HELA,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	RP11-65J3.1	14532	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	132114054	132114292	132114085	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	21475	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	132171147	132171349	132171255	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	72381	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chr9	132508719	132508991	132508915	Y	NA	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	4335	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	132705367	132705623	132705495	Y	C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	97850	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	132963704	132964128	132963904	Y	NCS1	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	30847	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	134511243	134511633	134511541	Y	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	101828	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	134553923	134554245	134554041	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	59216	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	134610888	134611363	134611119	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	2098	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	134652581	134652848	134652715	Y	NA	RAPGEF1	MED27,NTNG2,SETX	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	39120	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	134950793	134951083	134950938	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	2212	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1,C9orf171	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	135481058	135481229	135481144	Y	CEL	NA	NA	NA	NA	NA	GTF3C4	62193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	135991045	135991361	135991245	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	45940	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	135999727	136000118	136000091	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	37183	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	136017634	136018138	136017813	Y	GTF3C4,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	19163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	136226163	136226469	136226316	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96	NA	NA	NA	NA	SURF1	4611	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	136292897	136293168	136293034	Y	SLC2A6,RALGDS	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	REXO4	11733	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	136688455	136688774	136688542	Y	RPL7A,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	166952	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	136695399	136695776	136695532	Y	RPL7A,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	159950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	4.94842071992437
chr9	136746393	136746610	136746453	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	109116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	136753303	136753756	136753577	Y	C9orf7,VAV2	NA	SARDH	IMR90	Hi-C	24141950	VAV2	101970	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	136800116	136800268	136800192	Y	C9orf7	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	55458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chr9	137215635	137215833	137215709	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	8691	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	137220336	137220598	137220352	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13392	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.52259099074596
chr9	137221806	137221969	137221887	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14862	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	137247900	137248164	137247916	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	40956	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	5.70971621529735
chr9	137250651	137250992	137250728	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	43707	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	137257724	137257990	137257923	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	50780	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.99840067535407
chr9	137266309	137266655	137266544	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	59365	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	137267558	137268069	137267755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	60614	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.475809684608113
chr9	137268826	137268961	137268858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	61882	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	137285570	137286195	137285918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	78626	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	137305745	137306050	137305907	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	98801	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	137394714	137394986	137394879	Y	NA	NA	COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	136634	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	138292600	138292752	138292676	Y	NA	NA	OLFM1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R26	76173	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	138666183	138666357	138666270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	130717	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	138796932	138797111	138797062	Y	CAMSAP1	RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	138808024	138808108	138808066	Y	GLT6D1	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	10366	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chr9	138851660	138852030	138851974	Y	UBAC1	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	434	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	138852334	138852387	138852361	Y	CARD9	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	1108	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	138915703	138915918	138915811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC1	64477	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	139294189	139294305	139294248	Y	TRAF2,FAM69B,INPP5E	DNLZ,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E	NA	NA	NA	NA	SDCCAG3	8756	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	139737773	139737949	139737875	Y	NA	PHPT1,EDF1,TRAF2	NA	NA	NA	NA	PHPT1	3227	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	139919787	139920355	139920165	Y	NA	C9orf142,CLIC3,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1	NA	NA	NA	NA	ABCA2	1012	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	24.2662939150138
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.0935626122757
chr9	140132594	140132714	140132654	Y	LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	951	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chr9	140163781	140164247	140164025	Y	NA	RNF208,C9orf169,TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	30116	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140190695	140190800	140190760	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	3903	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140205114	140205300	140205216	Y	PNPLA7,NOXA1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	10411	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	3507652	3507856	3507754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	121793	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	10587173	10587276	10587225	Y	MID1	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	262497	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	11131962	11132102	11132014	Y	HCCS	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	4541	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	GPX1P1	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPX1P1	21166	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	15354246	15354416	15354344	Y	ZRSR2,CA5B,MOSPD2,PIGA	PIGA	NA	NA	NA	NA	PIGA	2570	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	15695028	15695432	15695331	Y	ZRSR2,AP1S2,PIGA	TMEM27,CA5BP1	NA	NA	NA	NA	CA5BP1	3973	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chrX	20281516	20281702	20281609	Y	SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3	RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	1821	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	38079037	38079366	38079180	Y	SRPX	SRPX	NA	NA	NA	NA	SRPX	341	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	39055539	39055797	39055668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	396854	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chrX	40692126	40692324	40692241	Y	NA	MKRN4P	NA	NA	NA	NA	MKRN4P	388	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	41097774	41098084	41098012	Y	USP9X,GPR82,DDX3X	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	92567	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	375123	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chrX	44173548	44173763	44173665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	226484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	44877456	44877597	44877527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	146699	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	229453	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	45645081	45645275	45645187	Y	NA	MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	40551	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	45647781	45648040	45647909	Y	NA	MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43251	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	45663739	45663972	45663886	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	44948	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chrX	46120012	46120235	46120091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	64845	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	46495805	46496079	46496076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	64586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	46524990	46525241	46525097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A7	91249	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	46651969	46652131	46652053	Y	ZNF674,CHST7,RP2	SLC9A7,RP2	CHST7,ZNF674,LOC401588,SLC9A7,RP2,PHF16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A7	35479	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chrX	47440734	47441109	47440922	Y	CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1,SYN1	NA	NA	NA	NA	TIMP1	1022	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	47467971	47468313	47468102	Y	NA	ARAF,TIMP1,SYN1,ELK1,UXT	NA	NA	NA	NA	SYN1	8939	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	48348956	48349364	48349102	Y	PORCN,PORCN,FTSJ1	SLC38A5,FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	15986	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.14194324305947
chrX	48350817	48351213	48350906	Y	WAS,RBM3,PORCN,OTUD5	SLC38A5,FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	14137	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	48643715	48644055	48643827	Y	NA	HDAC6	NA	NA	NA	NA	HDAC6	13729	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	48646841	48647202	48647168	Y	GATA1	HDAC6	NA	NA	NA	NA	HDAC6	10582	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	48938465	48938570	48938518	Y	NA	TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW	NA	NA	NA	NA	PRAF2	8735	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	49008826	49009047	49008937	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	NA	NA	NA	NA	PLP2	17226	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chrX	49117018	49117310	49117218	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	6996	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	54207583	54207867	54207725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120C	0	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	56839801	56840427	56840156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	77791	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	57634372	57634764	57634423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	323233	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	65114053	65114269	65114162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	307796	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	71785357	71785413	71785385	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	5540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	73236075	73236382	73236224	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	73916	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53104	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	74259170	74259182	74259176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	115385	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chrX	87351155	87351521	87351339	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	929	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	708473	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX6	77437	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX5	211407	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	104559193	104559437	104559342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUM1L1	850861	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	2.75969617072705
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	107313303	107313469	107313386	Y	NA	PSMD10,ATG4A	NA	NA	NA	NA	PSMD10	19379	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	109382352	109382583	109382468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	138493	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	114819160	114819326	114819285	Y	NA	PLS3	NA	NA	NA	NA	PLS3	25659	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	444982	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	117487110	117487426	117487273	Y	DOCK11,WDR44	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	9074	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	11.8952421152028
chrX	123606177	123606254	123606218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	514115	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	124338810	124338926	124338869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	1246748	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.61775292766758
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chrX	129216343	129216741	129216485	Y	SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	25950	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	129219006	129219116	129219059	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	23575	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	130880517	130880959	130880705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	274334	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	130942336	130942500	130942419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	212793	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	130952432	130952771	130952603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	202522	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	132089755	132090160	132089782	Y	NA	HS6ST2	NA	NA	NA	NA	HS6ST2	3263	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	132678168	132678604	132678343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-417G15.1	124395	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	134718222	134718415	134718313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX26B	65638	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	145570962	145570973	145570968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-150K15.1	861226	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	148684727	148685116	148684922	Y	NA	TMEM185A	NA	NA	NA	NA	TMEM185A	26452	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.761295495372981
chrX	149863384	149863571	149863479	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3949	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	152064300	152064566	152064432	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	66789	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chrX	152997863	152998070	152997986	Y	TMEM187,RENBP,MECP2,IRAK1,ARHGAP4,ABCD1	SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3	NA	NA	NA	NA	ABCD1	9540	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrX	153308986	153309188	153309114	Y	NA	IRAK1	IRAK1,MIR718	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRAK1	25555	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.190323873843245
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.570971621529735
chrX	153600469	153600779	153600667	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	227	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	1.04678130613785
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chrY	2817706	2817951	2817827	Y	NA	ZFY	NA	NA	NA	NA	ZFY	16594	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrY	2872046	2872325	2872195	Y	RPS4Y1,ZFY,ZFY	ZFY-AS1,LINC00278	NA	NA	NA	NA	LINC00278	3093	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrY	7143028	7143486	7143308	Y	AMELY	PRKY	NA	NA	NA	NA	PRKY	3015	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrY	14775457	14775545	14775476	Y	NA	TTTY15	NA	NA	NA	NA	TTTY15	3192	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.666133558451358
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	193325	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.285485810764868
chrY	15473779	15474095	15474059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	116458	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrY	15507754	15507810	15507782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	82743	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226
chrY	21046816	21047207	21047093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXLNG2P	679992	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.38064774768649
chrY	28555183	28555400	28555298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5819572	CAGE	Ca9-22	hg19	FANTOM5	0.0951619369216226