chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	AGRN	40695	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,RP4-758J18.7,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3C,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	1772108	1772256	1772158	Y	TMEM88B,ATAD3C,CALML6,PRKCZ	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	48239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	2162325	2162996	2162733	Y	TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	20166	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.09110282802519
chr1	3373716	3374006	3373818	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	4726	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	3374928	3375314	3374967	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	5938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	6034742	6034859	6034801	Y	NA	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	KCNAB2	14667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	6336471	6336830	6336716	Y	ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7	ICMT,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	17436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	6337854	6338055	6337955	Y	NA	ICMT,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	18819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	6709089	6709221	6709155	Y	NA	PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	THAP3	26163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	99572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	7207208	7207593	7207350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	69827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	7313313	7313451	7313382	Y	NA	RNU1-8P	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	35893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	7489736	7490127	7489932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	212316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	7538871	7539273	7539100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	261451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	7540504	7540548	7540528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	263084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.58203516738822
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8107848	8108157	8108001	Y	NA	ERRFI1	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	23480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	34610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	69931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8450820	8451072	8450834	Y	RERE,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	74934	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8469706	8470061	8470001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	93820	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	8533889	8534027	8533958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	158003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8721734	8722143	8721896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	153559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	8724042	8724475	8724233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	151227	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	8875055	8875165	8875110	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	8986021	8986139	8986041	Y	NA	ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	48713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	9298798	9298942	9298853	Y	NA	H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	5964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	9355493	9355709	9355601	Y	NA	SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	4554	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	9399032	9399161	9399098	Y	NA	SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	48093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr1	10245595	10245867	10245731	Y	NA	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	22996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	10745709	10746041	10745880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	108666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	11415566	11415939	11415808	Y	NA	NA	FBXO2,FBXO44,UBIAD1	IMR90	Hi-C	24141950	UBIAD1	84303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	11791882	11792060	11791938	Y	NA	MAD2L2,AGTRAP	AGTRAP	IMR90	Hi-C	24141950	AGTRAP	2081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	12493910	12494304	12493999	Y	AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	181433	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	12508783	12509005	12508873	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	12589452	12589763	12589585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	85974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	12616547	12616769	12616712	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	58968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr1	14462881	14463117	14463012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	438188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	15585400	15585822	15585467	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1	FHAD1	NA	NA	NA	NA	FHAD1	13632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	15649550	15649749	15649647	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9	NA	EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	FHAD1	77782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	15697702	15697752	15697727	Y	NA	RP3-467K16.4,EFHD2	NA	NA	NA	NA	RP3-467K16.4	36177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	SLC25A34,TMEM82,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	5685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	16227810	16227873	16227842	Y	C1orf64,SPEN	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	55168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,C1orf64	NA	NA	NA	NA	C1orf64	10629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	16553276	16553594	16553536	Y	NA	RSG1	NA	NA	NA	NA	RSG1	8063	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	16770590	16770683	16770636	Y	NA	NECAP2	NA	NA	NA	NA	NECAP2	5423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.07296750675124
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1,CROCC	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	6.87305275108232
chr1	17411505	17411663	17411561	Y	NBPF1,PADI2	SDHB	NA	NA	NA	NA	SDHB	32840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	17962245	17962730	17962485	Y	PADI4	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	97915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	19264079	19264209	19264144	Y	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	16971	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	19333976	19334220	19334098	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	52796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	19839147	19839427	19839318	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,AKR7A2,CAPZB	CAPZB,RNU4-28P	CAPZB,C1orf151-NBL1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-28P	4060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	20780827	20780970	20780908	Y	PLA2G2A	CAMK2N1	OTUD3,LOC339505	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2N1	29743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	20806851	20807214	20807064	Y	NA	CAMK2N1,MUL1	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	3499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	21084820	21085159	21084988	Y	NA	KIF17,SH2D5,HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	26657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	21349725	21349786	21349755	Y	EIF4G3	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48460	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	21558552	21558736	21558644	Y	EIF4G3,ECE1,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	57175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	21588829	21589430	21588896	Y	ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	80567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	21649091	21649481	21649332	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	20516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	21916510	21916997	21916827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	76804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	61951	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	22375194	22375332	22375261	Y	CDC42	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	1788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	23178080	23178304	23178193	Y	C1QA,C1QC,C1QB	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	142748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	23542417	23542518	23542468	Y	HTR1D	LUZP1	KDM1A,LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	40116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	23721090	23721462	23721458	Y	ZNF436	ZNF436,TCEA3	HNRNPR,ZNF436	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF436	27155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	TCEA3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr1	23839318	23839630	23839474	Y	HNRNPR,ZNF436	ASAP3,E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	E2F2	16082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	23849183	23849405	23849280	Y	PNRC2,RPL11	ASAP3,E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	E2F2	6307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	23961555	23961694	23961621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL11	54575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	24235925	24236209	24236107	Y	RPL11,PNRC2,CNR2	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	37664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	24722613	24722643	24722628	Y	NA	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	17641	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	24732584	24732754	24732709	Y	NA	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	7530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	24833128	24833464	24833216	Y	RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	5741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	24854734	24855006	24854870	Y	NA	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	27347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	MAN1C1	NA	NA	NA	NA	MAN1C1	785	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	25969249	25969578	25969407	Y	PDIK1L,SYF2,C1orf63,TMEM57,LDLRAP1,MAN1C1,FAM54B	MAN1C1	SEPN1	IMR90	Hi-C	24141950	MAN1C1	27290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	26249033	26249281	26249192	Y	EXTL1,STMN1,STMN1,STMN1	MIR3917,STMN1	STMN1,PAFAH2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STMN1	17551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	26319994	26320468	26320326	Y	NA	PAFAH2,EXTL1	NA	NA	NA	NA	PAFAH2	2180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	26495448	26495637	26495606	Y	NA	ZNF593,RP11-231P20.2	NA	NA	NA	NA	ZNF593	1086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	26616527	26617019	26616745	Y	ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	12860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	26735858	26736255	26735942	Y	NA	DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	DHDDS	20518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.10923814929915
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr1	27021406	27021810	27021509	Y	NA	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.92745871490419
chr1	27160002	27160387	27160288	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	8801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.43652637554116
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	27772061	27772370	27772216	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	42299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	27831022	27831314	27831199	Y	NA	WASF2	SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR	IMR90	Hi-C	24141950	WASF2	16353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27863218	27863465	27863342	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	48549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	27926165	27926491	27926331	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	2451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	27928507	27928973	27928740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHDC1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	27985869	27985982	27985925	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	28389248	28389585	28389551	Y	NA	EYA3	NA	NA	NA	NA	EYA3	23622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr1	29104880	29105053	29104930	Y	NA	YTHDF2,OPRD1	NA	NA	NA	NA	OPRD1	31601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29140536	29140683	29140600	Y	NA	OPRD1	NA	NA	NA	NA	OPRD1	3882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29253461	29253677	29253525	Y	EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	41858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29370205	29370321	29370263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-604A21.1	63085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	30503990	30504255	30504120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	875353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	31216468	31217229	31216636	Y	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	162379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	31320336	31320627	31320524	Y	NA	NA	SDC3	K562	ChIA-PET	22265404	SDC3	58981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	31772172	31772177	31772175	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	4330	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.58203516738822
chr1	31921261	31921410	31921280	Y	NA	SERINC2,RP11-439L8.3	NA	NA	NA	NA	SERINC2	40849	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	RP11-439L8.3	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	26014	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.72754395923527
chr1	31944306	31944695	31944578	Y	NA	RP11-439L8.3	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	25146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.90932339363023
chr1	31947490	31947850	31947648	Y	NA	RP11-439L8.3	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	21991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	31950057	31950263	31950160	Y	NA	RP11-439L8.3	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	19578	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	RP11-439L8.3	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	13359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	RP11-439L8.3	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	6767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	RP11-439L8.3	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	45318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	COL16A1,BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL16A1	12683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	32237691	32238692	32237953	Y	NA	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	BAI2	9197	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	32250836	32250955	32250895	Y	IQCC	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	BAI2	22342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	32354934	32355150	32354987	Y	LCK,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	53307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	32656692	32656709	32656701	Y	ZBTB8A	TXLNA,CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP	NA	NA	NA	NA	CCDC28B	7278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	32732571	32732683	32732626	Y	LCK	EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,HDAC1	NA	NA	NA	NA	HDAC1	23004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	33131314	33131452	33131383	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4,SYNC	NA	NA	NA	NA	RBBP4	16571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC,KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	33203093	33203146	33203106	Y	NA	SYNC,KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	33645848	33646140	33645995	Y	HPCA,PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	33802277	33802571	33802529	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	39302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	36351655	36352020	36351717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	118087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	36397577	36397741	36397665	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	149935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	116288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	TEKT2,ADPRHL2,COL8A2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	36627717	36628369	36628068	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	8537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	36641160	36641451	36641218	Y	NA	TRAPPC3,MAP7D1,THRAP3	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	21980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	36715455	36715834	36715645	Y	EIF2C1,EIF2C3	THRAP3	NA	NA	NA	NA	THRAP3	27438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	36721428	36721771	36721600	Y	NA	THRAP3,SH3D21	NA	NA	NA	NA	THRAP3	33411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	37169397	37169618	37169483	Y	OSCP1,GRIK3	NA	NA	NA	NA	NA	CSF3R	222518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	37464724	37465074	37465012	Y	NA	GRIK3	NA	NA	NA	NA	GRIK3	32656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	37721552	37721986	37721683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01137	216026	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	37784198	37784531	37784441	Y	GRIK3,EPHA10	NA	GRIK3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01137	153481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	38391752	38391859	38391812	Y	NA	INPP5B	NA	NA	NA	NA	INPP5B	18870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	39629010	39629413	39629213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	84022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	39633654	39634014	39633702	Y	BMP8A	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	88666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	16420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	40081061	40081282	40081172	Y	BMP8A	PABPC4,HEYL	NA	NA	NA	NA	HEYL	22335	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	40628781	40629153	40628997	Y	NA	RLF	NA	NA	NA	NA	RLF	3736	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	40847285	40847634	40847387	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	38763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	40851431	40851768	40851472	Y	CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	42909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	41116840	41117088	41116964	Y	RIMS3	RIMS3,NFYC	NA	NA	NA	NA	RIMS3	12241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	41119684	41120000	41119793	Y	NA	RIMS3,NFYC	NA	NA	NA	NA	RIMS3	9329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	169513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	42204580	42205516	42204895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	294080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	42354251	42354647	42354385	Y	RIMKLA,HIVEP3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	144949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	43250353	43250859	43250610	Y	ZMYND12,WDR65,YBX1	LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23	NA	NA	NA	NA	C1orf50	19413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	43475221	43475543	43475382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	52501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	43653088	43653279	43653276	Y	NA	FAM183A,WDR65	NA	NA	NA	NA	WDR65	17268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	44230271	44230532	44230402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	60776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	44240162	44240471	44240217	Y	ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	70667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44354357	44354471	44354414	Y	SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13	ARTN	NA	NA	NA	NA	ARTN	42521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	44380893	44381202	44381004	Y	SLC6A9,B4GALT2,ARTN	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	ARTN	15790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44692988	44693156	44693052	Y	ATP6V0B	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	15861	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44703858	44704161	44704010	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	26731	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44897170	44897489	44897243	Y	NA	RNF220	NA	NA	NA	NA	RNF220	28304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	44941668	44941887	44941849	Y	C1orf228,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	72802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	45195062	45195154	45195109	Y	RNF220	RNU5F-1,KIF2C,RPS8,SNORD55,RPS15AP11	NA	NA	NA	NA	KIF2C	8336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	45283789	45284126	45283958	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	45670767	45670868	45670821	Y	PTCH2,ZSWIM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM5	99013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	45787067	45787234	45787139	Y	NA	ZSWIM5,HPDL,TOE1,MUTYH	NA	NA	NA	NA	HPDL	3311	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	46712372	46712767	46712489	Y	NSUN4	POMGNT1,RAD54L	NA	NA	NA	NA	RAD54L	1012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	47718105	47718425	47718265	Y	NA	TAL1	TAL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAL1	22213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	48710829	48711034	48710934	Y	NA	SLC5A9	NA	NA	NA	NA	SLC5A9	24472	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	49038282	49038602	49038503	Y	SPATA6,BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	102437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	49317577	49317713	49317702	Y	SPATA6,BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	BEND5	76936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	49902417	49902596	49902507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL4	584989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	50798792	50798875	50798836	Y	NA	NA	AGBL4	IMR90	Hi-C	24141950	ELAVL4	287106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	339924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	51302197	51302583	51302391	Y	FAF1	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	121352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	51415396	51415400	51415398	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	FAF1	8535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	51997947	51998232	51998197	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS15	14947	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	52193179	52193464	52193255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	149013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	52390204	52390438	52390419	Y	NA	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	47727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	52675788	52676068	52675922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFYVE9	69742	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	53092647	53093031	53092839	Y	NA	GPX7,FAM159A	NA	NA	NA	NA	FAM159A	3985	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	54765179	54765190	54765186	Y	NA	NA	MRPL37,CYB5RL	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	101470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	54941159	54941412	54941231	Y	TCEANC2,SSBP3,SSBP3	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	64007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	54941776	54941995	54941811	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	64624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	55340144	55340359	55340270	Y	HEATR8,C1orf177	DHCR24	NA	NA	NA	NA	DHCR24	10532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	56771744	56771759	56771752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	337215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	56797894	56798374	56798151	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAP2B	310600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	56972242	56972492	56972299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	136482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	56991269	56991531	56991390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	117443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	56992489	56992799	56992673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	116175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	57887813	57887926	57887901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8A	569334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	59884204	59884340	59884272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	123894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	60062084	60062408	60062209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	216050	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	60148393	60148656	60148541	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	129802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	61784447	61784809	61784578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	404286	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	62609116	62609459	62609128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	290509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	62810220	62810245	62810233	Y	NA	NA	KANK4	IMR90	Hi-C	24141950	USP1	89723	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	63886654	63886800	63886727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG6	55393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65307822	65308022	65307967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	99044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65364183	65364439	65364282	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	65748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	65503279	65503645	65503490	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	27775	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	65510370	65510451	65510413	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	20969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65701792	65701883	65701838	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	10019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	65731337	65731853	65731407	Y	DNAJC6	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	19435	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65758796	65759173	65758995	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	46894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	65775838	65775991	65775933	Y	PDE4B,DNAJC6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	63936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65946125	65946479	65946302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	61855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	65946781	65947169	65947001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	62511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	66881715	66881835	66881718	Y	TCTEX1D1,PDE4B	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	SGIP1	115231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	67494221	67494361	67494358	Y	SLC35D1,MIER1	SLC35D1	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	23421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	67867795	67868154	67868057	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	25944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	68340774	68341128	68340951	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	43624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	68354536	68354908	68354722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	57386	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	68364057	68364377	68364218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	66907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRAS3	57644	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	68640572	68640736	68640689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56067	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	68657070	68657479	68657271	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	39324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	70034819	70036254	70034877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	633049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	70806613	70806974	70806794	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	11443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	72155856	72156188	72156023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	590229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	72554223	72554508	72554339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	191909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	72656240	72656592	72656532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	89825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	72686486	72686621	72686551	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	59796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	72696545	72696864	72696705	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	49553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	72715442	72715840	72715642	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	30577	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr1	74970988	74971139	74971082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf173	166283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	C1orf173,TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	75683161	75683232	75683197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A5	391569	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	75694572	75694736	75694622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A5	380065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	76197113	76197244	76197179	Y	NA	ACADM	NA	NA	NA	NA	ACADM	9077	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSH4	384824	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	76776213	76776609	76776411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPI1P1	386865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	77031647	77031976	77031767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPI1P1	131498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	77385063	77385511	77385240	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	53937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	77403313	77403685	77403438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	72187	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	77522365	77522872	77522625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	69896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	77713696	77713788	77713742	Y	NA	PIGK,AK5	PIGK,AK5,ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	PIGK	30581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	78019403	78019530	78019478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	127574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	94366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	78469106	78469287	78469191	Y	DNAJB4	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	GIPC2	25880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	772546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	80768462	80768472	80768467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	903781	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	81240939	81241123	81241017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	431130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	81941853	81942198	81942026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN2	172008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	82103600	82103612	82103605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	81766	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	83153203	83153587	83153396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-147G16.1	428386	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	83528650	83529168	83528896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	795538	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	83997551	83997712	83997632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	326994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	83999021	83999395	83999211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	325311	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	84565296	84565652	84565634	Y	NA	PRKACB	NA	NA	NA	NA	PRKACB	23551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	84744562	84744926	84744685	Y	PRKACB,SAMD13,SAMD13	NA	DNASE2B,SAMD13,UOX,PRKACB	IMR90	Hi-C	24141950	RPF1	198016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	84970111	84970722	84970500	Y	NA	RPF1	NA	NA	NA	NA	GNG5	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	85034322	85034489	85034405	Y	CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	3674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	85457149	85457643	85457442	Y	GNG5,MCOLN2,BCL10,LPAR3	MCOLN2,WDR63	NA	NA	NA	NA	MCOLN2	3153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	85737728	85738105	85737917	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	2668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	87171187	87171726	87171422	Y	SH3GLB1	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	2928	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	87203929	87204214	87204072	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	35670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	87355999	87356364	87356182	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	21743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	89595596	89595852	89595818	Y	GTF2B,GBP3,GBP5,GBP4,GBP1,GBP2	GBP2	NA	NA	NA	NA	GBP2	18287	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	89887466	89887838	89887537	Y	GBP3,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	100557	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	90075464	90075685	90075572	Y	NA	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	20946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	90100291	90100368	90100330	Y	NA	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	3660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	92496267	92496651	92496624	Y	NA	EPHX4,BTBD8	NA	NA	NA	NA	EPHX4	2728	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	42826	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr1	93002551	93002867	93002761	Y	RPAP2,GLMN,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	52118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	53229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	93669062	93669462	93669176	Y	NA	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	24777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	RP5-1033H22.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1033H22.2	47399	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	94038553	94038921	94038737	Y	NA	RP5-1033H22.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1033H22.2	16835	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	94224546	94224929	94224684	Y	DNTTIP2	NA	MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L	IMR90	Hi-C	24141950	MIR760	85459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	94480579	94480958	94480750	Y	DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	107613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	94626535	94626661	94626598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	111963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	95258204	95258621	95258355	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,LOC729970	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	25216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	95263833	95264301	95264195	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	19536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	95593826	95594157	95593992	Y	NA	TMEM56	NA	NA	NA	NA	TMEM56	12932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	95811904	95812058	95811981	Y	NA	RP11-14O19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-14O19.2	32498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	97549999	97550397	97550198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	364778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	97594209	97594479	97594411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	408988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	97656052	97656450	97656352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	352807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	97731783	97731967	97731875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	277290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	98111566	98111887	98111829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	102309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	98177967	98178251	98178164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	168710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	98258555	98258669	98258612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	125936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	98315619	98315765	98315702	Y	DPYD	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	68840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	98425688	98426065	98426013	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	41083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	98437572	98437739	98437700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	52967	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	98459458	98459857	98459685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	53562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	98479796	98480152	98480044	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	33267	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	18761	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	98497100	98497277	98497188	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	16142	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	98499783	98500490	98500262	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	12929	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	91596	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	100966297	100966321	100966309	Y	NA	GPR88	NA	NA	NA	NA	GPR88	35372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	101664975	101665240	101665050	Y	NA	NA	SLC30A7	IMR90	Hi-C	24141950	DPH5	175331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	101764288	101764549	101764451	Y	S1PR1	NA	NA	NA	NA	NA	DPH5	274644	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	107767992	107768000	107767996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	170725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	108329022	108329589	108329361	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	176177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	108439709	108440134	108439910	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	65632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	108600214	108600460	108600397	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	94448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	108661190	108661332	108661267	Y	FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	80139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr1	109159407	109159722	109159520	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	42426	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr1	109677264	109677321	109677293	Y	NA	TMEM167B,SCARNA2,KIAA1324,C1orf194	NA	NA	NA	NA	C1orf194	22785	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109693905	109693990	109693948	Y	AKNAD1	KIAA1324,C1orf194	NA	NA	NA	NA	C1orf194	39426	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109754796	109754995	109754880	Y	NA	SARS,CELSR2	NA	NA	NA	NA	SARS	256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	109937534	109937767	109937651	Y	GSTM3,WDR47,CELSR2,PSRC1,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	110320163	110320291	110320225	Y	NA	GSTM3,EPS8L3	CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	15514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	EPS8L3	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	30200	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	110366477	110366702	110366587	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	61828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	110947330	110947681	110947535	Y	NA	LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	23889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	OVGP1,ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	112058803	112059167	112059005	Y	C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	23673	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	112387705	112387905	112387746	Y	KCND3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	91259	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	112437663	112437858	112437845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND3	91919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	113014906	113015158	113015047	Y	CAPZA1	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	78103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	113046545	113046667	113046606	Y	WNT2B	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	109742	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	113584893	113585079	113584961	Y	NA	RP11-31F15.2,LRIG2	SLC16A1,AKR7A2P1,RHOC,PPM1J	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-31F15.2	28648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	116588429	116588746	116588471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAB21L3	63630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	117051576	117051921	117051802	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	59740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	117493512	117493635	117493571	Y	NA	PTGFRN	CD101	IMR90	Hi-C	24141950	PTGFRN	42833	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	118208639	118208762	118208709	Y	MAN1A2	NA	FAM46C	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46C	62083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	119450998	119451282	119451141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX15	78897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	119503304	119503581	119503430	Y	NA	TBX15,RP4-712E4.1	NA	NA	NA	NA	TBX15	26598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	HMGCS2	NA	NA	NA	NA	HMGCS2	33648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	142536204	142536464	142536463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	1608344	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	145004446	145004804	145004625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	69382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	145454760	145454851	145454762	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	13537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	145701524	145701615	145701570	Y	NA	PDZK1	NA	NA	NA	NA	PDZK1	23303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	145702718	145703106	145702912	Y	NA	PDZK1	NA	NA	NA	NA	PDZK1	21812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	146753566	146753835	146753733	Y	NA	CHD1L,FMO5	NA	NA	NA	NA	FMO5	40866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	147072641	147072971	147072883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	61459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.43652637554116
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	195813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RP11-403I13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-403I13.5	13012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RP11-403I13.5	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-403I13.5	5589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	149853331	149853687	149853509	Y	PLEKHO1	HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB,SV2A,SF3B4	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BE	2545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	149888481	149888615	149888605	Y	NA	HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB,SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	SV2A	1047	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	151344220	151344519	151344431	Y	NA	PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4	NA	NA	NA	NA	SELENBP1	1011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	151386066	151386146	151386106	Y	NA	SELENBP1,PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	PSMB4	16056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	151422102	151422465	151422287	Y	NA	POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	7476	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ,CGN	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A6	34298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	153715466	153715694	153715559	Y	PGLYRP3,INTS3	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	16923	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	153767353	153767730	153767624	Y	NA	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	22523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	NUP210L,TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	154577703	154577929	154577737	Y	NA	UBE2Q1,CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	20546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	154734957	154735165	154735061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN3	105591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	154820307	154820671	154820489	Y	NA	KCNN3	NA	NA	NA	NA	KCNN3	20085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	154986150	154986272	154986211	Y	NA	SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	13023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	155052148	155052357	155052334	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1	NA	NA	NA	NA	EFNA3	17924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	155052572	155053010	155052866	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1	NA	NA	NA	NA	EFNA3	18348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	86518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	156073142	156073699	156073532	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	22778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	156462474	156462813	156462575	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	5807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	BCAN,RP11-284F21.7,NES	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	156781780	156782101	156782026	Y	MEF2D,ETV3L,SH2D2A,SH2D2A,NTRK1	HDGF,NTRK1,INSRR	NA	NA	NA	NA	NTRK1	1331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1,RP11-404O13.5	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1,RP11-404O13.5	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	158942717	158942925	158942799	Y	OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	24833	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	159054764	159054917	159054868	Y	MNDA,IFI16,AIM2	NA	CD1D,IFI16	IMR90	Hi-C	24141950	CADM3	84482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	159158093	159158524	159158429	Y	NA	CADM3	NA	NA	NA	NA	CADM3	18694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr1	159852272	159852569	159852526	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	160072097	160072234	160072133	Y	C1orf204,KCNJ10,KCNJ9,ATP1A2	IGSF8	NA	NA	NA	NA	IGSF8	5364	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	160202735	160202981	160202855	Y	SLAMF6,CD48,FCRL6,DCAF8	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	26553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	160230168	160230604	160230300	Y	NA	RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	160242090	160242278	160242184	Y	NA	RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19	NA	NA	NA	NA	DCAF8	10642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr1	160402251	160402521	160402355	Y	SLAMF7,SLAMF6,SLAMF1,LY9,CD48,CD244,SLAMF9	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	33875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	160407857	160407975	160407870	Y	SLAMF6,SLAMF1,LY9,CD48,DCAF8	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	39481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	160550267	160550490	160550484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL2	181891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	161002043	161002401	161002222	Y	NA	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	TSTD1	4379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	161329163	161329482	161329254	Y	FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G	SDHC,C1orf192	NA	NA	NA	NA	C1orf192	6182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	161348767	161349231	161349047	Y	NDUFS2	C1orf192	NA	NA	NA	NA	C1orf192	13103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	8572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	162729988	162730048	162730018	Y	NOS1AP,UHMK1	NA	NA	NA	NA	NA	UAP1	200665	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	162967342	162967569	162967443	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,C1orf110,RGS5	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	68996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	164289956	164290255	164290071	Y	NA	HMGB3P6	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	33749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	164655011	164655383	164655197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	132190	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	164719768	164719930	164719859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	196947	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	164750243	164750515	164750387	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	227422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	165204752	165205122	165204813	Y	RXRG	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1A	118830	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	165205285	165205518	165205385	Y	RXRG	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1A	118434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	165319408	165319638	165319524	Y	LMX1A,LMX1A	LMX1A	NA	NA	NA	NA	LMX1A	4314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	165323712	165323885	165323804	Y	NA	LMX1A	NA	NA	NA	NA	LMX1A	67	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	165674774	165675083	165674866	Y	NA	ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	8674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	165700999	165701037	165701018	Y	NA	ALDH9A1,RP11-466F5.8	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	34899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	166954369	166954473	166954424	Y	ILDR2,MAEL	ILDR2	ILDR2,GPA33	IMR90	Hi-C	24141950	ILDR2	11650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	167035961	167036358	167035977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR2	93242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	167313306	167313474	167313390	Y	MAEL,POU2F1	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	125240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	168337258	168337475	168337348	Y	NA	NA	LOC100505918,MIR557	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	88980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	168479157	168479362	168479223	Y	XCL2,XCL1	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	230879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	168479815	168480142	168480087	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	231537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	168483874	168484202	168483927	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	235596	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	168489681	168489889	168489789	Y	XCL2,XCL1	NA	LOC100505918,ATP1B1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	241403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	168582981	168583414	168583137	Y	NA	NA	ATP1B1,NME7,C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	334703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	169229816	169229911	169229864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NME7	105294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	169886878	169886942	169886910	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	25470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	172804293	172804464	172804387	Y	NA	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	393063	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	172874674	172874828	172874762	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	463444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	467349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	172882769	172883147	172883123	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,PRDX6,CENPL,DARS2,SNORD75,GAS5,SNORD81,SNORD47,SNORD78,SNORD79,SNORD77,LOC100506046,SNORD44,SNORD76,SNORD80,ZBTB37	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	471539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	172888696	172888994	172888711	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	477466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	172903010	172903534	172903241	Y	TNFSF18,TNFSF4	NA	TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	491780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	173081389	173081497	173081443	Y	NA	NA	TNFSF4,TNFSF18,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	362908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351971	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	173092552	173092771	173092714	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	173167258	173167319	173167289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	277086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	174907888	174908105	174908034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	58195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	175290630	175291019	175291015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	130495	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr1	175492766	175493084	175492925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNR	217822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	175548819	175548945	175548926	Y	TNR	NA	NA	NA	NA	NA	TNR	161961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	175571336	175571362	175571351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNR	139544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	175656174	175656298	175656236	Y	TNR	NA	NA	NA	NA	NA	TNR	54608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	175659647	175659870	175659824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNR	51036	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	176024233	176024593	176024503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	135122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	176174471	176174980	176174673	Y	RFWD2	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2,RP11-195C7.1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	176836644	176837016	176836830	Y	ASTN1	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN1	295093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	177151173	177151362	177151277	Y	ASTN1,FAM5B	ASTN1	NA	NA	NA	NA	ASTN1	19064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	177903071	177903284	177903119	Y	NA	SEC16B	NA	NA	NA	NA	SEC16B	48154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	178379281	178379736	178379396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	130151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	179144823	179145001	179144950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	96311	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	105132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	179187224	179187335	179187262	Y	AXDND1,ABL2,SOAT1	NA	NA	NA	NA	NA	SOAT1	73590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	179997226	179997609	179997386	Y	TOR1AIP1,CEP350	NA	NA	NA	NA	NA	CEP350	75353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	180612177	180612184	180612181	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	13037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	181149230	181149365	181149283	Y	NA	NA	MR1,XPR1,KIAA1614,ACBD6,STX6,IER5	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	93592	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	181459512	181459699	181459606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IER5	403874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	182140043	182140424	182140280	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	NA	NA	NA	NA	GLUL	218917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	182580570	182580950	182580946	Y	NA	RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	9027	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	182585205	182585710	182585424	Y	NA	RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	13662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	183579279	183579568	183579440	Y	NA	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	23324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	183836661	183836955	183836765	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	181856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	184005350	184005919	184005662	Y	RGL1,GLT25D2	TSEN15	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	12892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	184700299	184700688	184700567	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	21359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	185032022	185032401	185032047	Y	SWT1,SWT1,IVNS1ABP,RNF2	RNF2	NA	NA	NA	NA	RNF2	19526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	187235320	187235513	187235392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	892430	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	192458942	192459176	192459156	Y	RGS2,RGS13,RGS1	NA	RGS1,RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	224137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	193647067	193647431	193647225	Y	NA	NA	CDC73,B3GALT2	IMR90	Hi-C	24141950	B3GALT2	493283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	193726401	193726456	193726429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	572617	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	196317530	196317735	196317633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT2	258620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	196378121	196378217	196378169	Y	CFHR3,KCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT2	198138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	196379497	196379989	196379846	Y	CFHR3,KCNT2,CFH	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT2	196366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	196867253	196867632	196867443	Y	ZBTB41,F13B,CFHR3	NA	NA	NA	NA	NA	ASPM	246192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	197482296	197482309	197482303	Y	F13B,ZBTB41	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	173581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	197513718	197513772	197513745	Y	CRB1,DENND1B	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	142118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	197530309	197530378	197530355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	125512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	197739507	197739631	197739601	Y	NA	DENND1B	NA	NA	NA	NA	DENND1B	3195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	198591244	198591462	198591360	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	467151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	198887897	198888318	198888210	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	763804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	200750000	200750140	200750089	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	43314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	200831452	200831819	200831500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	124766	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	200865264	200865418	200865332	Y	C1orf106,C1orf106	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21B	125410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201494461	201494578	201494476	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	17877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201520953	201521395	201521173	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NAV1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	44369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201613135	201613506	201613321	Y	GPR37L1	NA	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSRP1	136551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201613549	201613726	201613638	Y	NA	NA	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSRP1	136965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr1	201620441	201620621	201620539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	143857	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201717986	201718364	201718179	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	77905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201742755	201743343	201743097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	52926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	202055098	202055409	202055277	Y	ELF3,GPR37L1	GPR37L1	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPR37L1	34577	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	202997835	202998093	202998001	Y	NA	TMEM183A,PPFIA4	NA	NA	NA	NA	PPFIA4	4209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIA4	107447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	203244129	203244381	203244323	Y	BTG2	RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	RP11-134P9.3	9899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	RP11-134P9.3	5149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr1	203293246	203293605	203293363	Y	ZBED6,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	20627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	203619380	203619832	203619595	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	25691	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	203965652	203965916	203965843	Y	NA	NA	ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13	IMR90	Hi-C	24141950	SOX13	74327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204058173	204058362	204058281	Y	SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	17930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204071387	204071653	204071532	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	31144	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	204254999	204255106	204255048	Y	PIK3C2B,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	73779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	204255998	204256379	204256352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	74778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	204274077	204274452	204274265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	70341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204358316	204358342	204358328	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	13523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204432329	204432499	204432494	Y	SOX13,PIK3C2B	PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	29353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204449745	204450007	204449876	Y	NA	PIK3C2B,MDM4	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	11845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	204641549	204641837	204641728	Y	PLEKHA6,LRRN2,LRRN2	LRRN2	NA	NA	NA	NA	LRRN2	11024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204653343	204653636	204653438	Y	PLEKHA6,TMEM81,NFASC,NFASC,LRRN2,LRRN2	LRRN2	NA	NA	NA	NA	LRRN2	482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	204800476	204800571	204800524	Y	PLEKHA6,PIK3C2B,LRRN2,TMCC2,NFASC,CNTN2,NFASC	NFASC	NA	NA	NA	NA	NFASC	4697	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	204811034	204811268	204811044	Y	NA	NFASC	NA	NA	NA	NA	NFASC	15255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	204902522	204902666	204902594	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,CNTN2,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	NFASC	106743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	204916243	204916629	204916322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFASC	120464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	204961641	204962301	204961818	Y	MDM4,RBBP5,NUAK2	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP5	126842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	204976101	204976640	204976291	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP5	112503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	205442172	205442546	205442359	Y	CNTN2,TMEM81	CDK18	KLHDC8A,NUAK2,MIR135B,LOC284576,LEMD1,CDK18	IMR90	Hi-C	24141950	CDK18	29177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	205466653	205467067	205466868	Y	TMEM81	CDK18	TMCC2,CDK18,KLHDC8A,LOC284576,LOC284578,MFSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDK18	4656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	205474556	205474866	205474575	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	2833	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	206668423	206669203	206668750	Y	NA	IKBKE,RASSF5,RP11-534L20.4	NA	NA	NA	NA	RASSF5	9676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	206748926	206749451	206749084	Y	IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	34453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	206751685	206751882	206751743	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	32022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	206921953	206922243	206922101	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	65664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	206931189	206931520	206931334	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,IL10	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	74900	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	206961206	206961566	206961310	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	IL10,DYRK3,MAPKAPK2,IL19,FAIM3,EIF2D,IL20	IMR90	Hi-C	24141950	MAPKAPK2	104917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	207610680	207610995	207610751	Y	NA	NA	PFKFB2,C4BPA,C4BPB,CR1,YOD1,CR2	IMR90	Hi-C	24141950	CD55	117827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	208085821	208086214	208085877	Y	CD34	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	45326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	208286487	208286766	208286698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	128899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	208314292	208314663	208314422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	101002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	208349565	208349646	208349606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	66019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	208349967	208350081	208350040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	65584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	208357514	208358085	208357775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57580	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	208358361	208358485	208358423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	208377298	208378003	208377521	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	37662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	208378283	208378515	208378291	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	37150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr1	208387951	208388224	208388088	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	27441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr1	208412497	208412696	208412591	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	208415648	208415868	208415811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2966	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	208442735	208442900	208442818	Y	NA	PLXNA2	PLXNA2,CD34	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA2	27070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	208711842	208712367	208712161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	296177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	209557331	209557442	209557421	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	117763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	209934463	209934573	209934515	Y	LAMB3,G0S2	RP1-28O10.1,C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	21331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	210056461	210057439	210056772	Y	NA	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	SYT14	52099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	210186039	210186345	210186192	Y	SYT14	NA	NA	NA	NA	NA	SYT14	76501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	269924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211210840	211210858	211210848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	94599	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	211423824	211424043	211423934	Y	NA	RCOR3	NA	NA	NA	NA	RCOR3	5676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	NEK2	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211912030	211912428	211912229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK2	65070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	212112200	212112293	212112250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	94591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	212182782	212182853	212182818	Y	NA	INTS7,DTL,RPL21P28	NA	NA	NA	NA	INTS7	24031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	212311960	212312104	212312056	Y	PPP2R5A	NA	PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL21P28	88589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	212447459	212447732	212447595	Y	NA	PPP2R5A,RP11-384C4.3	DTL,PPP2R5A,NENF	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R5A	9147	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	212723252	212723516	212723384	Y	BATF3,ATF3	ATF3	ATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	13160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr1	212923712	212923837	212923822	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	39287	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	213545455	213545863	213545754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	322866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	214126796	214127172	214127111	Y	PROX1	PROX1,PROX1-AS1	NA	NA	NA	NA	PROX1	27352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	214157858	214157941	214157900	Y	PROX1	PROX1,PROX1-AS1	PROX1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	PROX1-AS1	1032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	214162828	214163073	214162948	Y	PROX1	PROX1,PROX1-AS1	NA	NA	NA	NA	PROX1-AS1	3855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	11.7823761447126
chr1	214163432	214163790	214163677	Y	NA	PROX1,PROX1-AS1	NA	NA	NA	NA	PROX1-AS1	4459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	534812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	217105953	217106090	217106023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	203007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	218667919	218668153	218668036	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	150342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	241326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	219092056	219092203	219092132	Y	NA	NA	LOC643723	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	252983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	219224399	219224689	219224618	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	120497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	219230668	219230882	219230775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	114304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	219259195	219259565	219259379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	85621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	219497639	219497836	219497817	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	152453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	219633860	219634071	219633918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	288674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	220359525	220359939	220359742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	64973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	220443411	220443639	220443413	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	RAB3GAP2	157	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	220510650	220511010	220510830	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	66854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	221872429	221872689	221872559	Y	DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	40829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	221881394	221881826	221881629	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	31692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	221887766	221888016	221887890	Y	DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	25502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	221913881	221914483	221914426	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr1	222828361	222828786	222828451	Y	TLR5	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	38933	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	223349014	223349276	223349189	Y	TLR5	NA	SUSD4,CAPN8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DISP1	362608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	223351179	223351462	223351416	Y	TLR5	NA	SUSD4,CAPN8,TLR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DISP1	364773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	223356140	223356312	223356226	Y	NA	NA	CAPN8,SUSD4	IMR90	Hi-C	24141950	DISP1	369734	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	223362227	223362396	223362336	Y	NA	NA	CAPN8,SUSD4	IMR90	Hi-C	24141950	DISP1	375821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	224022197	224022347	224022288	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	9327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224023477	224023773	224023693	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	7901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224024642	224024959	224024902	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	6715	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224025511	224025803	224025713	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	5871	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	224026476	224026743	224026681	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	4931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	12.6005967103176
chr1	224393253	224393414	224393305	Y	NA	RP11-365O16.1,DEGS1	NA	NA	NA	NA	DEGS1	31795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224690718	224691054	224690869	Y	WDR26	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	67983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	224691192	224691563	224691423	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	68457	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224750692	224750877	224750770	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	127957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	188855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224819300	224819585	224819443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	196565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	167175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	225654906	225655584	225655524	Y	TMEM63A,LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	40279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	225721902	225722011	225721957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LBR	107275	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3,MIXL1	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	25811	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	226443007	226443187	226443097	Y	NA	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	33688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	226737265	226737393	226737330	Y	NA	C1orf95	NA	NA	NA	NA	C1orf95	2764	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	226867580	226868182	226867972	Y	ITPKB	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	6812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	30097	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	227315962	227315970	227315966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	188205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	227499470	227499818	227499796	Y	NA	CDC42BPA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	4357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	227953974	227954299	227954123	Y	IBA57	SNAP47,JMJD4	NA	NA	NA	NA	JMJD4	32862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	228686214	228686407	228686300	Y	NA	RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	13452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	228688608	228688902	228688729	Y	HIST3H2A	RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	15846	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	228978086	228978245	228978170	Y	RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	109262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	229074291	229074557	229074548	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	205467	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	230595195	230595532	230595329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	180703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	230724659	230724927	230724832	Y	NA	NA	TRIM67,LOC149373	IMR90	Hi-C	24141950	COG2	51308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	AGT	NA	NA	NA	NA	AGT	41278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	231513422	231513769	231513758	Y	NA	EXOC8,EGLN1	NA	NA	NA	NA	EXOC8	41824	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	232106545	232106680	232106599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	345984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	9.32771444789744
chr1	233241853	233241955	233241904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	157502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	234341903	234342254	234341929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	148498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234548581	234548830	234548706	Y	NA	RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	41242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234658291	234658851	234658374	Y	NA	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	45442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234668851	234669143	234668986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARBP1	56002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2,LINC00184	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,LINC00184	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,LINC00184	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,LINC00184	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,LINC00184	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	LINC00184,LINC01132	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	45575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234852227	234852379	234852265	Y	NA	LINC01132	LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,TOMM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	5410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr1	234857710	234858181	234857899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01132	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	1054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	234881537	234881788	234881657	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	23748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	234887087	234887295	234887193	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	29298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	234891292	234891478	234891345	Y	IRF2BP2	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	33503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235012060	235012373	235012284	Y	IRF2BP2,ARID4B	NA	LINC00184,IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,RBM34	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	154271	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235069269	235069652	235069381	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01132	211480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235090546	235090894	235090695	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	198358	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235091073	235091332	235091158	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	197920	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235096560	235096855	235096619	Y	ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	192397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	235158479	235158766	235158623	Y	NA	NA	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SNORA14B	130486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235183936	235184197	235184018	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506795,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	105055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	SNORA14B,TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SNORA14B	42395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235468267	235468477	235468372	Y	NA	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	20188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	235615040	235615273	235615157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	50508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235835688	235836968	235835896	Y	NA	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	23634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235850857	235851038	235851012	Y	LYST,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	38803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	235927486	235927702	235927520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG4	115432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	236179538	236179652	236179595	Y	NA	NID1	NA	NA	NA	NA	NID1	46810	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	236698906	236699167	236699014	Y	EDARADD,MTR	LGALS8	NA	NA	NA	NA	LGALS8	19606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	237007861	237008154	237008008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	51251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	237207715	237208218	237207860	Y	NA	RYR2	NA	NA	NA	NA	RYR2	4210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	237316905	237317075	237316908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	113400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	237335807	237336186	237335810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	132302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	237458744	237458994	237458869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	255239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	237459854	237460200	237460066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	256349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	241191454	241191834	241191645	Y	RGS7	RP11-435F13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	31360	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	241302172	241302404	241302286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	142078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	241693216	241693255	241693236	Y	KMO	FH	NA	NA	NA	NA	FH	12155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	243428005	243428394	243428166	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	10685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	243447752	243447803	243447788	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	30432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	243688123	243688227	243688212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	270803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	243781710	243782079	243781895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	230302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	243806306	243806448	243806376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	205933	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	243853401	243853550	243853530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	158831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	243876652	243876733	243876693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	135648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	244011895	244012034	244011933	Y	NA	AKT3	LOC339529	IMR90	Hi-C	24141950	AKT3	347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr1	244212276	244213430	244213047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	199895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.94559403617814
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	245217556	245217830	245217613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	86549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	245939665	245940062	245939864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	623378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	245958364	245958743	245958685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	642077	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	654826	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	246042512	246042669	246042578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	625945	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	246129057	246129404	246129358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	539210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246249452	246249819	246249636	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	418795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246297322	246297388	246297355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	371226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	246316735	246316955	246316845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr1	246317158	246317459	246317368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246323685	246324051	246324002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	344563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246432471	246432772	246432681	Y	SMYD3,CNST	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	235842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	246538507	246538660	246538597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	129954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	246730569	246731007	246730621	Y	AHCTF1,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	2823	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	246751015	246751281	246751184	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	23269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	246763574	246763751	246763579	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	35828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr1	247295865	247296225	247296038	Y	ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	30191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	247325578	247326237	247325673	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	37125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr1	249099326	249099454	249099407	Y	NA	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672	NA	NA	NA	NA	MIR3124	19122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr1	249117788	249118228	249118121	Y	SH3BP5L	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692	NA	NA	NA	NA	MIR3124	348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	438578	438619	438599	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	260173	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	830904	831008	830920	Y	DIP2C	NA	DIP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	LARP4B	144556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	1100843	1101035	1100898	Y	NA	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	7365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	1112826	1113160	1112997	Y	WDR37	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	19348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	1698787	1699160	1698974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	605309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	2473129	2473236	2473183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKP	633289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	3441336	3441600	3441518	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	228333	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	3850308	3850795	3850409	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	24835	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	3899382	3899877	3899626	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	73909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	4172866	4173257	4173063	Y	KLF6	NA	KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF6	347393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	121038	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	5113786	5114179	5114065	Y	AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	38240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	6074786	6074988	6074887	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM17	53962	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	7902237	7902611	7902424	Y	NA	TAF3	NA	NA	NA	NA	TAF3	43770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	8373481	8373809	8373699	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	515014	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	10831008	10831167	10831105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	820586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	11112343	11112864	11112373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	538889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	11192105	11192722	11192260	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	459031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	11555861	11556024	11555927	Y	USP6NL	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	95729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	11651765	11651937	11651850	Y	USP6NL,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	12	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	12261469	12261671	12261570	Y	NA	CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	NUDT5	25326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	12283843	12284276	12283949	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	NUDT5	47700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	12455599	12455959	12455812	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	66118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr10	13200624	13201003	13200885	Y	NA	MCM10	NA	NA	NA	NA	MCM10	551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	13692317	13692641	13692563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	65390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	13831161	13831325	13831243	Y	PRPF18	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	204234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	14697070	14697400	14697259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	117496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	16548527	16548808	16548668	Y	NA	RNU2-18P,C1QL3	NA	NA	NA	NA	C1QL3	13196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	16557217	16557368	16557293	Y	NA	RNU2-18P,C1QL3	NA	NA	NA	NA	C1QL3	4636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	16802586	16802595	16802591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	54932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	17456684	17457055	17456726	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	29749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	17470783	17471060	17470983	Y	TRDMT1,STAM,ST8SIA6	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	43848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr10	19917803	19917915	19917856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	971469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	20114711	20115092	20114787	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	1168377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	21218309	21218697	21218504	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	242419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr10	21389618	21389984	21389801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	71132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	21795346	21795467	21795386	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	25627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	22053811	22054026	22053942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	166046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	22555688	22555894	22555791	Y	NA	COMMD3	NA	NA	NA	NA	COMMD3	47009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	22625615	22626028	22625937	Y	DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	17475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.41839105426721
chr10	22726811	22727194	22727116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	118671	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr10	22764995	22765244	22765043	Y	ARMC3,SPAG6	NA	ARMC3	IMR90	Hi-C	24141950	BMI1	156855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	22887940	22888243	22888209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	113241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	22890368	22890535	22890414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	110949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	22921960	22922313	22922139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	79171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	22932994	22933290	22933224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	23336632	23336974	23336803	Y	NA	MSRB2	NA	NA	NA	NA	MSRB2	45461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	23344774	23344811	23344800	Y	NA	MSRB2	NA	NA	NA	NA	MSRB2	37624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	24917417	24917574	24917542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	93023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	25176621	25176794	25176706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	62739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr10	25602421	25602556	25602489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR158	140430	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	25640550	25640656	25640570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR158	178559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	25815030	25815346	25815189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR158	353039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	25868086	25868454	25868092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO3A	352742	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	26042706	26043028	26042829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO3A	178168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	26223879	26224018	26223959	Y	GAD2,MYO3A	MYO3A	NA	NA	NA	NA	MYO3A	2683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	27419520	27419901	27419745	Y	NA	ANKRD26,MASTL,YME1L1	NA	NA	NA	NA	MASTL	21852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr10	27991244	27991520	27991382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB18	200047	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	29228763	29229094	29228981	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	264492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	29280500	29280692	29280596	Y	NA	NA	LYZL1,BAMBI,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	316229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	29755539	29755855	29755808	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	59208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	29761620	29761743	29761682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	65289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	113795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	29924706	29925406	29925356	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	98304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	78620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	29970673	29971027	29970896	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	52683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	30347334	30347749	30347345	Y	KIAA1462	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	54674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	31073492	31073855	31073655	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	245011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	31289701	31290078	31290005	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	28788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr10	31770032	31770371	31770202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	162656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	31805465	31805855	31805582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	198089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr10	32038223	32038549	32038385	Y	NA	NA	ZNF438,ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	177193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr10	32215994	32216410	32215998	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	32460264	32460451	32460341	Y	NA	NA	ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	70043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	32579146	32579267	32579207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	86459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	32598255	32598442	32598434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	67284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	32607439	32608014	32607606	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	57712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	32639699	32640002	32639940	Y	NA	EPC1	EPC1,C10orf68	IMR90	Hi-C	24141950	EPC1	25724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	33406704	33407129	33406923	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	113984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	33797044	33797241	33797114	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	173854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	34421241	34421398	34421321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	529631	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	34439638	34439951	34439795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	511078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	34922261	34922558	34922409	Y	PARD3	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	28471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	35421114	35421320	35421181	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	7395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	35717658	35717859	35717796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	183705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	35739762	35740277	35740119	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	205809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	38418230	38418599	38418292	Y	NA	ZNF37A	NA	NA	NA	NA	ZNF37A	36966	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	43913618	43913796	43913710	Y	CSGALNACT2,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	ZNF487P	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-517P14.2	390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	44806540	44806774	44806646	Y	NA	NA	TMEM72-AS1,LOC100506835,ZNF32-AS3,RASSF4,ZNF32,C10orf136,LOC283033,CXCL12	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA3P1	522675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	45374285	45374680	45374305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF4	78175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	45439361	45439737	45439549	Y	NA	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	13118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	45453721	45453921	45453864	Y	ALOX5	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	45464299	45464380	45464314	Y	ZNF22,C10orf25	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	7878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	45469010	45469359	45469182	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	2899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	45491341	45491670	45491510	Y	C10orf10	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	ZNF22	2253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	45914844	45915133	45915015	Y	NA	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	47183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	59905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	45965771	45965877	45965832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	98110	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	47093518	47093811	47093665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	872870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	47588936	47589404	47589197	Y	NA	NA	LOC643650,SYT15,PPYR1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM21C	1368288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM21C	1435024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	49678205	49678472	49678354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	165507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	52613516	52613853	52613685	Y	A1CF	A1CF	NA	NA	NA	NA	A1CF	29582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	52614600	52614810	52614705	Y	NA	A1CF	NA	NA	NA	NA	A1CF	28625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	54367095	54367120	54367106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	909740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	60889159	60889241	60889200	Y	NA	PHYHIPL	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	45109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	PHYHIPL	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	1034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	PHYHIPL	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	15376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	61019605	61019954	61019626	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	85255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	61024836	61025127	61024964	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	90486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	61664562	61664999	61664893	Y	CCDC6	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	63697389	63697783	63697593	Y	NA	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	38330	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	63701578	63701680	63701630	Y	NA	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	42519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	65053315	65053443	65053389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	162265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	144986	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	125539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	98071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	JMJD1C	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	26566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	65793520	65793903	65793712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	132515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	67968655	67969045	67968849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	1626879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	68755189	68755293	68755241	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	840631	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	72507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	69582490	69582752	69582621	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	13172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	72082681	72083053	72082867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC20	57329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	74076833	74077036	74076912	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	35952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr10	74085147	74085316	74085305	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	27672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	74385233	74385288	74385261	Y	NA	MICU1,HMGN2P34	NA	NA	NA	NA	MICU1	1334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	74453097	74453245	74453141	Y	CCDC109A	MCU	NA	NA	NA	NA	MCU	3208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	74850921	74850988	74850953	Y	ANXA7,ECD	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	3744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	75211378	75211476	75211427	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	30924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	75221740	75221926	75221833	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	31357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	75337715	75337998	75337857	Y	CAMK2G,C10orf55,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	45713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	75349200	75349597	75349539	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	34114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	75408900	75409185	75408963	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54,AGAP5	NA	NA	NA	NA	USP54	25189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	75987927	75988078	75987990	Y	KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	78967	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	76682814	76683108	76682864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6B	99474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	76916394	76916800	76916595	Y	MYST4,SAMD8	NA	NA	NA	NA	NA	VDAC2	51112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,ZNF503-AS1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	77155063	77155414	77155221	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4250	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	77155629	77155954	77155896	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	3710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	77548245	77548262	77548254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	189247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	77803071	77803442	77803222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	444073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	78857417	78857654	78857522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	826724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	146007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	224207	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	80062995	80063366	80063293	Y	NA	NA	ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	271477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1-AS1	91529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	80772530	80772579	80772555	Y	PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1-AS1	53073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	80983096	80983503	80983267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	121722	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	80990068	80990387	80990161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	114838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	80997251	80997825	80997438	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	107400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	80998898	81000011	80999247	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	105214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	81005366	81005598	81005460	Y	PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	99627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	81085771	81086240	81085963	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	18985	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	82169935	82170184	82170082	Y	NA	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	FAM213A	4350	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	82247433	82247863	82247773	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	35511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	86104605	86104727	86104619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDHR1	152195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	86448211	86448543	86448377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	130012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	87752944	87753321	87753210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPAL	526251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	NA	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	WAPAL	118731	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	89864117	89864277	89864218	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	160858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	89875844	89876042	89875925	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS,ATAD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	172585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	90552469	90552762	90552637	Y	FAS,ANKRD22,LIPN	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	84729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	90643265	90643581	90643488	Y	LIPK,FAS,STAMBPL1	STAMBPL1	ACTA2	IMR90	Hi-C	24141950	STAMBPL1	5774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	92974122	92974225	92974155	Y	NA	PCGF5	NA	NA	NA	NA	PCGF5	3683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	93254153	93254526	93254340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	86057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	93924948	93925271	93925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	123573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	13521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	94460544	94460634	94460589	Y	CYP26C1	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	14599	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	94831659	94831948	94831694	Y	CYP26A1,CYP26A1	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6P1	135436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	96282867	96283106	96282931	Y	TBC1D12	HELLS	NA	NA	NA	NA	HELLS	20441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	RP11-310E22.5,RP11-310E22.4	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-310E22.5	17215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	RP11-310E22.4,PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	97089881	97090244	97090218	Y	CYP2C9,CYP2C8,SORBS1,SORBS1	PDLIM1	PDLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	41100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	97313430	97313789	97313690	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	5382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	97687985	97688127	97688056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	69873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	97809134	97809259	97809196	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	7983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	98396181	98396533	98396373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	50972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	98407335	98407523	98407430	Y	LCOR,C10orf12,PIK3AP1,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	62126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	98471163	98471312	98471235	Y	LCOR,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	6959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	98638142	98638499	98638253	Y	NA	LCOR	NA	NA	NA	NA	LCOR	48125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	98955508	98955686	98955604	Y	C10orf62	SLIT1	NA	NA	NA	NA	SLIT1	11831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	98956083	98956405	98956104	Y	C10orf62	SLIT1	NA	NA	NA	NA	SLIT1	12406	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	99305221	99305494	99305441	Y	SFRP5	MMS19,UBTD1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	PI4K2A	36637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	99368835	99368987	99368911	Y	NA	PI4K2A,MORN4	NA	NA	NA	NA	MORN4	22357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	101944283	101944461	101944347	Y	DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1	ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6	NA	NA	NA	NA	ERLIN1	1630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	102140082	102140467	102140275	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	8710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	102393526	102393544	102393535	Y	WNT8B,SEMA4G	NA	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB8	105769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	102618433	102618807	102618490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM178A	51519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr10	104428446	104428647	104428547	Y	NA	TRIM8,ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	TRIM8	26193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	104556220	104556459	104556323	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf32	55521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	104683249	104683568	104683410	Y	NA	CNNM2	NA	NA	NA	NA	CNNM2	7199	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	104838794	104839158	104838851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	111898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	104903006	104903392	104903228	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	47664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	105302775	105302952	105302862	Y	NA	RP11-416N2.3	NA	NA	NA	NA	RP11-416N2.3	3880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	105378585	105378932	105378690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-416N2.3	71753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	105448441	105448500	105448481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-416N2.3	141609	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	105519063	105519154	105519109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	156809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	105521334	105521711	105521524	Y	SH3PXD2A	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	154252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	105681714	105681858	105681786	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	OBFC1	5751	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2	NA	NA	NA	NA	GSTO2	39100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	106383721	106383738	106383730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTO2	357090	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	108717910	108718203	108718057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTO2	2691279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	110138864	110139232	110139127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	1542079	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	111666185	111666517	111666351	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	14794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	111694003	111694304	111694154	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	12692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	112051912	112052490	112052119	Y	ADD3,MXI1	SMNDC1	NA	NA	NA	NA	SMNDC1	10219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	112186754	112186909	112186851	Y	SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1	NA	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	68687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114035592	114035948	114035764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	62457	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114745782	114746117	114745950	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	37773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114816164	114816362	114816263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	108155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	116726934	116727115	116726983	Y	NA	TRUB1	NA	NA	NA	NA	TRUB1	30982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	SLC18A2	47730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	119107774	119108099	119107936	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	119686098	119686357	119686270	Y	NA	NA	CASC2	IMR90	Hi-C	24141950	CASC2	117433	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	120482173	120482528	120482344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLHR	129013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	121028416	121028802	121028728	Y	EIF3A,GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	63315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	121153244	121153752	121153743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	146468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	121154797	121155146	121155008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	145074	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	121161203	121161864	121161442	Y	EIF3A	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	138356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	123197092	123197323	123197208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	305855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	123283349	123283529	123283438	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	392112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	123418268	123418559	123418278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	267268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	123494191	123494316	123494254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	191511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	123539603	123539774	123539689	Y	TACC2,ATE1	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	146053	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	123681157	123681404	123681248	Y	NA	ATE1-AS1,ATE1	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	4423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	123923874	123924133	123924069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	177185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	125319379	125319483	125319410	Y	NA	NA	ACADSB,IKZF5,HMX3	IMR90	Hi-C	24141950	BUB3	407586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	126236352	126236744	126236559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	59205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	126339460	126339914	126339618	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	90924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	126359464	126359807	126359742	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	71031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	126490996	126491131	126491100	Y	NA	METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM175B	2642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	126782105	126782284	126782195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	65455	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127440633	127440786	127440709	Y	C10orf122,FANK1	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	69031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	127751033	127751319	127751198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	167925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127813462	127813834	127813648	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	230354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127824574	127824998	127824837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	241466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127835397	127835693	127835553	Y	NA	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	239331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127916240	127916659	127916465	Y	ADAM12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	158365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	127919956	127919968	127919963	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	155056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	128943463	128943803	128943552	Y	NA	FAM196A	NA	NA	NA	NA	FAM196A	48619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	128946859	128946983	128946921	Y	NA	FAM196A	NA	NA	NA	NA	FAM196A	45439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	129985931	129986341	129986216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	63282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	133467921	133468316	133468119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	325119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	133776164	133776302	133776237	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	17133	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr10	133834668	133834754	133834722	Y	LRRC27,LRRC27	BNIP3	PPP2R2D,BNIP3	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	41233	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	134124952	134125064	134125008	Y	NA	LRRC27	DPYSL4,LRRC27,STK32C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC27	18550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	134368659	134369026	134368959	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	19335	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	CALY,PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr10	135329777	135330170	135329974	Y	NA	NA	LOC619207,SYCE1	IMR90	Hi-C	24141950	MTG1	124179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	364521	364678	364634	Y	NA	IFITM3	ANO9,SIGIRR,B4GALNT4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IFITM3	38984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	469770	469895	469845	Y	B4GALNT4,CEND1	ANO9,PTDSS2,RNH1	NA	NA	NA	NA	PTDSS2	23502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	589256	589485	589371	Y	SIGIRR	RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7,CDHR5,SCT,DRD4	NA	NA	NA	NA	PHRF1	14770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	840856	841090	840896	Y	NA	SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,EFCAB4A,CD151,POLR2L,TSPAN4	NA	NA	NA	NA	TSPAN4	48	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	944711	944765	944751	Y	NA	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	21817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr11	1015139	1015297	1015218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP2A2	92245	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1089762	1090061	1089912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP2A2	166868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1320394	1320580	1320544	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	8304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1328544	1328761	1328705	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr11	1404202	1404317	1404259	Y	IFITM10,DUSP8	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	1412454	1412793	1412702	Y	NA	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	3325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1936655	1937042	1936845	Y	TSSC4,TSPAN32,C11orf21,TNNI2,LSP1	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	29466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1982665	1983112	1982762	Y	TH,IGF2,IGF2	MRPL23,MRPL23-AS1	NA	NA	NA	NA	MRPL23	16157	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	1989837	1990190	1989954	Y	IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2	MRPL23,MRPL23-AS1	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	18960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	2009660	2010154	2009976	Y	IGF2,IGF2,SYT8	MRPL23,MRPL23-AS1	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	2082720	2083054	2082737	Y	NA	NA	MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686	IMR90,K562,GM12878,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	MRPL23-AS1	73570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	2238430	2238670	2238577	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	ASCL2	51512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	2619837	2620105	2619972	Y	TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	99119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	2624209	2624341	2624275	Y	TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	94883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	2635710	2635980	2635769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	83244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	2643075	2643474	2643317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	75750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	2643944	2644417	2644202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	74807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr11	2705021	2705206	2705044	Y	NA	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	14018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	3831146	3831197	3831172	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	14124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	3859822	3860019	3859941	Y	NUP98,STIM1,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	RHOG	194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	6217696	6217859	6217762	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	36082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	HPX,TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	6564206	6564247	6564227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP8	58603	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	6676048	6676412	6676073	Y	OR52W1,APBB1,APBB1,TRIM3,OR2D2,OR2D3,ZNF214,DCHS1	TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	DCHS1	963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	7636630	7636941	7636786	Y	PPFIBP2,OR5P3	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	59512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	8273804	8274153	8274013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIC3	85202	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	8607763	8607778	8607771	Y	ASCL3,STK33	STK33	NA	NA	NA	NA	STK33	6058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	8727919	8728019	8727969	Y	ASCL3	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	25961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	8944739	8945112	8945060	Y	ASCL3	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	AKIP1	14053	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3,RP11-467K18.2	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	9240746	9240917	9240841	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	44020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	9786985	9787566	9787311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	103361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	10060683	10060760	10060722	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	252994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	10302186	10302573	10302380	Y	NA	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	SBF2	11181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	10347188	10347587	10347388	Y	ADM	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	ADM	22961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	10373282	10373523	10373408	Y	ADM,AMPD3	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	10373632	10373924	10373723	Y	NA	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	10373965	10374241	10374089	Y	LYVE1,EIF4G2	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	10388178	10388602	10388329	Y	ADM	NA	SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	63951	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	10545162	10545253	10545208	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	RNF141	15524	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	10549004	10549441	10549205	Y	AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	RNF141	11336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	11899555	11899888	11899585	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	38585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	143692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	55073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	13189363	13189539	13189451	Y	NA	NA	TEAD1,LOC100506305,ARNTL,RASSF10,BTBD10	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	106660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	13244798	13244951	13244872	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	51248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	13327996	13328024	13328011	Y	NA	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	31797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	13405133	13405443	13405288	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD10	77401	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1,CALCB	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1,CALCB	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	14916687	14916856	14916788	Y	CYP2R1	CYP2R1,CALCB	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	4889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	16457424	16457760	16457639	Y	SOX6,SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	174919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	17164162	17164523	17164517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C2A	63007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	17759845	17760217	17760031	Y	NA	KCNC1	NA	NA	NA	NA	KCNC1	5486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	17961947	17962284	17962116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGEF	70425	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	18649925	18650050	18650045	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	4288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	22814174	22814335	22814255	Y	SVIP	RP11-17A1.3,SVIP	NA	NA	NA	NA	RP11-17A1.3	34591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	26265748	26266047	26265944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	1117368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	26752813	26752940	26752820	Y	NA	NA	BBOX1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	630475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	26969207	26969439	26969286	Y	NA	NA	FIBIN,BBOX1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	413976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	27023421	27023808	27023612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	359607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	242769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	27380505	27380624	27380565	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	2791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	27419147	27419279	27419213	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	35732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	27451921	27452137	27452029	Y	NA	LGR4	NA	NA	NA	NA	LGR4	40185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	27481800	27481840	27481820	Y	NA	LGR4,LIN7C	NA	NA	NA	NA	LGR4	10482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	27682701	27682852	27682777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	27683148	27683223	27683174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	31630096	31630156	31630127	Y	PAX6	NA	NA	NA	NA	NA	ELP4	100799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	34331523	34331863	34331783	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	23687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	34368265	34368539	34368419	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NAT10,CAPRIN1	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	9016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	163848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	35091180	35092049	35091264	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	66368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	35840381	35840713	35840619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	122818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	36052486	36052576	36052531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	88955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	36331203	36331536	36331365	Y	PRR5L	COMMD9	NA	NA	NA	NA	COMMD9	22204	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	36590672	36591010	36590800	Y	RAG1,RAG2	C11orf74	NA	NA	NA	NA	C11orf74	23041	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	37809838	37809966	37809929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	1195787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	43569506	43569887	43569721	Y	C11orf96	HSD17B12	NA	NA	NA	NA	HSD17B12	6099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	120957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	43952542	43952620	43952581	Y	NA	C11orf96	NA	NA	NA	NA	C11orf96	7650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	43955473	43955506	43955502	Y	NA	C11orf96	NA	NA	NA	NA	C11orf96	10581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	44590064	44591217	44590888	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	6087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	44882780	44883083	44882907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	87757	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	44963197	44963482	44963283	Y	NA	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	7358	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	45000515	45000921	45000720	Y	SYT13,TSPAN18	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	29675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	45047638	45048022	45047830	Y	TSPAN18	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	76798	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	45685212	45685518	45685319	Y	SYT13,MAPK8IP1,CRY2,CRY2,CHST1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35C1	138105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46015298	46015560	46015479	Y	NA	NA	GYLTL1B,PEX16	K562	ChIA-PET	22265404	GYLTL1B	74126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46022978	46023304	46023145	Y	NA	NA	GYLTL1B,MAPK8IP1,C11orf94,PEX16	IMR90	Hi-C	24141950	GYLTL1B	81806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46135373	46135563	46135504	Y	PHF21A,AMBRA1	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	5422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr11	46275806	46275990	46275914	Y	NA	CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	21222	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46410888	46411787	46411136	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	10582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46412719	46412930	46412758	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	12413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46465667	46466056	46465959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDK	65361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46706691	46706778	46706735	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408,F2	NA	NA	NA	NA	ARHGAP1	13387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	46753121	46753488	46753304	Y	F2	ARHGAP1,ZNF408,F2	NA	NA	NA	NA	F2	14391	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	47402161	47402584	47402458	Y	MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	NA	NA	NA	NA	SLC39A13	24099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	47872031	47872166	47872095	Y	OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	3924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	47891173	47891544	47891408	Y	OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NUP160,RP11-793I11.1	PTPRJ,FNBP4	IMR90	Hi-C	24141950	NUP160	23066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	48009293	48009653	48009420	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	9180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	48029262	48029517	48029420	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	29149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	48034964	48035405	48035033	Y	OR4X1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	34851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	48053215	48053601	48053578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	53102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	48163334	48163507	48163430	Y	OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	163221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	48193627	48193663	48193645	Y	OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	193514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	57232201	57232685	57232388	Y	NA	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	6179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	57549936	57550183	57550060	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	31221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	57801296	57801572	57801563	Y	OR9I1,OR1S1,OR5B12,OR6Q1	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND1	282581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	ZFP91	24707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	58991694	58991757	58991742	Y	FAM111A,MPEG1,OR4D6,PATL1	NA	NA	NA	NA	NA	DTX4	54791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	59963490	59963874	59963781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL16	387145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	63632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	60930012	60930347	60930224	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,VPS37C	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2923	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	61064926	61064998	61064962	Y	NA	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	4030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	14001	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	61434550	61434949	61434623	Y	NA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	10956	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	7.03669686420333
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	61788241	61788385	61788315	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3,FADS2,RAB3IL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	55109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	62211626	62212261	62212170	Y	FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	SCGB1A1	NA	NA	NA	NA	SCGB1A1	41051	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr11	62272728	62273223	62272788	Y	ROM1	AHNAK	NA	NA	NA	NA	AHNAK	48484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	AHNAK	14680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	62586827	62586893	62586843	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	10667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	62588127	62588383	62588260	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	63370762	63370914	63370825	Y	RTN3,PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	11441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	63712623	63712721	63712672	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	8192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	45217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	57125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65184888	65185395	65184991	Y	FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	2850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.09110282802519
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	8.5094938822924
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65342581	65342818	65342732	Y	TIGD3,SIPA1,SIPA1,DKFZp761E198,KCNK7,MAP3K11,EHBP1L1	LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	EHBP1L1	1072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65379476	65379605	65379541	Y	FAU,CAPN1,RNASEH2C,EFEMP2,CCDC85B,C11orf68,FAM89B,MAP3K11	SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	MAP3K11	1248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr11	65583188	65583268	65583228	Y	NA	SNX32,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	SNX32	15844	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD,CST6	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	65905081	65905308	65905252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	69247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	66080826	66081241	66080906	Y	CD248	RAB1B,CNIH2,YIF1A,TMEM151A,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8	NA	NA	NA	NA	RIN1	21070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2,RNU1-84P	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr11	67028976	67029390	67029158	Y	NA	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	2491	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	RAD9A	13704	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	67270751	67271055	67270865	Y	NA	TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	PITPNM1	679	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	68065646	68065898	68065824	Y	CHKA,LRP5	C11orf24,LRP5	SUV420H1,C11orf24,LRP5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP5	12179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	68099033	68099353	68099110	Y	NA	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	20956	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	68141745	68141881	68141821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	63668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	68270416	68270689	68270553	Y	MRGPRD	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	44230	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAL	62037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr11	68924761	68925032	68924956	Y	TPCN2	NA	ORAOV1,CCND1,MYEOV	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	110396	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CCND1	270685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	70144122	70144421	70144277	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	29316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	70232495	70232810	70232653	Y	NA	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	CTTN	9700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	71493756	71493898	71493829	Y	NA	FAM86C1	NA	NA	NA	NA	FAM86C1	2658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	71658678	71659025	71658708	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NA	NA	NA	NA	RNF121	20931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	71702677	71703050	71702869	Y	FOLR3,IL18BP,IL18BP	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	64930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	72662392	72662530	72662447	Y	ARAP1,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT	NA	ATG16L2	IMR90	Hi-C	24141950	ATG16L2	139039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	72686902	72687109	72687004	Y	RELT,RELT	NA	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	163549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	72914563	72914688	72914621	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	P2RY2	12655	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	P2RY6	4925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	72985787	72986008	72985881	Y	FCHSD2,RELT,RELT,P2RY6	P2RY6,ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	P2RY6	12237	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	73014768	73014913	73014905	Y	NA	P2RY6,ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	2421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	73097153	73097443	73097265	Y	FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	11844	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	73126084	73126768	73126402	Y	RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	40775	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	73706852	73707125	73706985	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	DNAJB13,UCP2	UCP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UCP2	14500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	73722792	73723138	73723056	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	UCP2	UCP2	K562	ChIA-PET	22265404	UCP2	30440	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	74077556	74077917	74077717	Y	NA	PGM2L1	NA	NA	NA	NA	PGM2L1	29601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	74382761	74383066	74382912	Y	NA	NA	POLD3,CHRDL2,RNF169	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-864N7.2	72093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr11	74741185	74741498	74741409	Y	NA	NEU3	XRRA1,OR2AT4,SLCO2B1,SPCS2,NEU3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEU3	44006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	75537561	75537829	75537710	Y	ARRB1,DGAT2,UVRAG	UVRAG	NA	NA	NA	NA	UVRAG	13349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	163545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.76381460178318
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	WNT11	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT11	27137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	76574228	76574537	76574458	Y	OMP,ACER3	ACER3	NA	NA	NA	NA	ACER3	4317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	3883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	77762280	77762565	77762352	Y	NA	KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	7043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	77958364	77958560	77958462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	60496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	77960482	77960781	77960725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	62614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	78025089	78025245	78025191	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	102149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	78060066	78060579	78060413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	66815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	78073883	78074276	78074154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	53118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	78089939	78090271	78090187	Y	GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	37123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	78091808	78092073	78091933	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	35321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	78113040	78113383	78113360	Y	NA	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	14011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	78144030	78144327	78144179	Y	NA	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	16636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	80438038	80438259	80438146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1960312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	81696174	81696306	81696246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	702265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	82601745	82602138	82601973	Y	NA	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	6879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	82781050	82781223	82781203	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	85	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	82918019	82918384	82918270	Y	PCF11,ANKRD42	ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-727A23.1	3663	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	83670710	83671103	83670907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	675260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	85046447	85046583	85046515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	291046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	85451857	85452132	85451995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC89	56537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	55914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr11	85484523	85484565	85484546	Y	NA	SYTL2	NA	NA	NA	NA	SYTL2	35619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	86222200	86222363	86222315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	159315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	86355497	86355659	86355578	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	26019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr11	86804343	86804452	86804398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	57457	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	87251916	87252279	87252098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	505030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	88288248	88288652	88288406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	219293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	89893119	89893512	89893349	Y	NAALAD2	NAALAD2	NA	NA	NA	NA	NAALAD2	30436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	90016507	90016673	90016590	Y	NA	RP11-121L10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	2779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	90492070	90492284	90492177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	478342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	91477314	91477480	91477397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	1451650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	91958948	91959142	91959077	Y	FAT3	NA	FAT3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	969988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	91979590	91979911	91979751	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	949219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	91980380	91980674	91980445	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	948456	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr11	92081309	92081315	92081312	Y	NA	NA	FAT3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	847815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	92504926	92505284	92505105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	423846	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	92555481	92555703	92555592	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	373427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	93227642	93227915	93227778	Y	NA	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	38719	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	93262165	93262293	93262229	Y	SLC36A4,C11orf75	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	4341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	94574727	94574858	94574795	Y	LOC643037,PIWIL4,KDM4D	NA	NA	NA	NA	NA	CWC15	129918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	95416773	95416906	95416840	Y	NA	NA	SESN3,ENDOD1	IMR90	Hi-C	24141950	CEP57	104223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	102283995	102284326	102284226	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	NA	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	54789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	102317826	102318238	102318123	Y	BIRC3,BIRC2,TMEM123	TMEM123	NA	NA	NA	NA	TMEM123	20877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	103742967	103742991	103742981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFD	290116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	103801275	103801290	103801283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFD	231817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	103964860	103965229	103965142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFD	67878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP4	223325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CASP4	252725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	105115100	105115515	105115329	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CASP4	276937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	105513261	105513284	105513272	Y	GRIA4,GRIA4,KIAA1826	GRIA4	NA	NA	NA	NA	GRIA4	34540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	105579191	105579256	105579211	Y	KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA4	100470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr11	105590287	105590591	105590439	Y	GRIA4,GRIA4	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	102769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	105949400	105949669	105949535	Y	NA	AASDHPPT,KBTBD3	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	2908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	106577276	106577400	106577281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUCY1A2	309850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	106629947	106630142	106630045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUCY1A2	257108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	107540149	107540363	107540256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH8	105677	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	107846158	107846176	107846168	Y	NA	RAB39A,CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	31283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	108679072	108679281	108679081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	145320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	111402540	111402739	111402658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIK2	68376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	111805995	111806483	111806196	Y	IL18	DIXDC1	NA	NA	NA	NA	DIXDC1	10127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	112752270	112752453	112752335	Y	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM1	77544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	112833069	112833192	112833175	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	3072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	112839963	112840314	112840138	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	9966	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	112848761	112848859	112848810	Y	NA	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	18764	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	112941331	112941794	112941502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM1	111334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr11	113020811	113021147	113020979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	162012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	113113806	113113968	113113887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	69191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	113929515	113929738	113929537	Y	NA	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	1200	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	113962751	113963246	113962839	Y	NA	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	34436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	113970182	113970266	113970224	Y	NA	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	41867	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	113970445	113970762	113970549	Y	CLDN25,ZBTB16,ZBTB16	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	42130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	113999597	113999969	113999698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	71282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	114031661	114032121	114031976	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	94388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	114033536	114034161	114033636	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	92348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	114037766	114038216	114037805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	88293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr11	114039430	114039671	114039576	Y	CLDN25,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	86838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	114127214	114127717	114127406	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	114309073	114309125	114309098	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	115360673	115361056	115361024	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	12619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	APOA1	84006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	116857252	116857500	116857432	Y	SIK3	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	47267	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	116867531	116867975	116867966	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	36792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	116883407	116883544	116883525	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	21223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	116884410	116884712	116884644	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	20055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	116909494	116909823	116909659	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	4727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	117687155	117687422	117687274	Y	NA	FXYD2,RP11-728F11.4	NA	NA	NA	NA	FXYD2	9991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	117844226	117844440	117844276	Y	IL10RA	NA	DSCAML1,FXYD6-FXYD2,TMPRSS13,IL10RA,LOC100526771	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FXYD6	98025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	118806138	118806167	118806153	Y	NA	BCL9L	PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9L	11821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	119239128	119239276	119239217	Y	NA	MCAM,RNF26,C1QTNF5,USP2,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2	11160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr11	119395840	119396223	119396096	Y	CBL	NA	LOC100499227,PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	76795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	120218040	120218378	120218085	Y	NA	TMEM136,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	ARHGEF12	12253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	120463888	120464227	120463894	Y	GRIK4	NA	GRIK4	IMR90	Hi-C	24141950	GRIK4	83420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	121593077	121593718	121593342	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	TBCEL	700296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	318233	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	122940079	122940521	122940200	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	8141	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	123519920	123520232	123520133	Y	OR8D4,SCN3B	SCN3B	NA	NA	NA	NA	SCN3B	3720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	125670081	125670467	125670312	Y	CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2	NA	NA	NA	NA	NA	HYLS1	81042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	125985923	125986168	125986013	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	54693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	126191145	126191518	126191332	Y	NA	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	18932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	126286483	126286630	126286572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	62948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	126534137	126534148	126534143	Y	FOXRED1,KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	310602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	128159118	128159435	128159277	Y	NA	NA	ETS1,FLI1,LOC100507392	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	296018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	128169091	128169261	128169176	Y	NA	NA	ETS1,FLI1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	286192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	128294765	128294892	128294836	Y	NA	NA	ETS1,FLI1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	160561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	128323342	128323695	128323510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	131758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	128335578	128335794	128335665	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	119659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	128348079	128348401	128348240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	107052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr11	128376227	128376457	128376317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	128584156	128584534	128584279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	128703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	132162191	132162572	132162312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1377787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	GLB1L2	508318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	298364	298488	298415	Y	IQSEC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	197951	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	RP5-1154L15.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	13275	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	794631	794815	794739	Y	CCDC77,KDM5A	NA	NINJ2,WNK1,B4GALNT3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-218M22.1	56574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	864034	864343	864158	Y	CCDC77,KDM5A	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	4275	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1024438	1024795	1024721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	72424	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1208361	1208617	1208550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	110686	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1261364	1261638	1261529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	163689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1314182	1314497	1314340	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	ERC1	216507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1387073	1387485	1387229	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	289398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	293074	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	1428527	1428661	1428594	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	272670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1432132	1432276	1432219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	269055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1532185	1532472	1532256	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	168859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	116999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	NA	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	57711	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr12	2547305	2547477	2547330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	354642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	3180278	3180396	3180348	Y	NA	TSPAN9	TSPAN9	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN9	4125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	3194969	3195128	3195057	Y	NA	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	10448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	3857515	3857570	3857543	Y	NA	EFCAB4B	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	14415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	4335261	4335485	4335373	Y	NA	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf4	310189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1	NA	NA	NA	NA	RAD51AP1	20470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3	NA	NA	NA	NA	AKAP3	13959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	6713710	6714101	6713905	Y	PTPN6,ZNF384,LPAR5,CHD4	NOP2,CHD4,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	LPCAT3	19454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	7708490	7708654	7708586	Y	PEX5,CD163L1,SLC2A3,CD163	NA	NA	NA	NA	NA	CD163L1	77997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	9236028	9236753	9236097	Y	KLRG1	A2M	NA	NA	NA	NA	A2M	30072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	10306018	10306454	10306037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	56603	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	11721730	11722060	11721927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	78728	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	11933482	11933754	11933622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	132694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	12009987	12010279	12010170	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	209199	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	12032964	12033203	12033084	Y	BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	232176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	12605511	12605890	12605533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	97498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	12708006	12708373	12708190	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	4944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	12883612	12883681	12883638	Y	APOLD1	GPR19,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	17620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	12889732	12889911	12889754	Y	LOH12CR1,DUSP16,GPR19,CDKN1B,APOLD1	GPR19,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	23740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	13292095	13292429	13292230	Y	NA	NA	EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1467	96877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	13431254	13431391	13431326	Y	NA	NA	C12orf36	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1467	236036	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	13814153	13814481	13814422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134N1.2	553043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	RP11-134N1.2	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-134N1.2	43092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	14926467	14926701	14926675	Y	NA	HIST4H4,H2AFJ,WBP11,C12orf60	NA	NA	NA	NA	H2AFJ	1197	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	20069508	20069793	20069676	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	194139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	224306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	248940	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	22531570	22531607	22531589	Y	ABCC9	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	244402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	22654594	22654831	22654713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	121178	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	23746822	23747228	23747075	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	354738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	23770675	23770997	23770816	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	330969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	23779855	23779927	23779875	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	322039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	23934001	23934216	23934209	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	167750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	24020753	24020934	24020819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	81032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	24396980	24397002	24396991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	295014	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	24414416	24414645	24414531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	298879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	24717054	24717156	24717119	Y	NA	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	3530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	24770497	24770857	24770809	Y	NA	NA	SOX5,MIR920,BCAT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-444D3.1	56973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	24858416	24859124	24858977	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	144892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	24861258	24861655	24861631	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	147734	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	25245550	25245859	25245676	Y	LRMP	NA	NA	NA	NA	NA	CASC1	100237	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.10923814929915
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	26495152	26495452	26495369	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	219092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	26522536	26522924	26522687	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	246476	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	26538001	26538320	26538173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	261941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	26624362	26624835	26624675	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	348302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	26626326	26626794	26626426	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	350266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	26663094	26663473	26663334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	320658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	26921613	26921734	26921675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	62397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	26945295	26945340	26945320	Y	C12orf71,ITPR2	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	38791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	27557115	27557162	27557139	Y	C12orf71,KLHDC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	73328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	27565982	27566076	27566029	Y	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	82195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	29473475	29473492	29473484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	58630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	29872942	29873140	29873086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	62552	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	31602301	31602617	31602553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	82066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	32881013	32881116	32881065	Y	NA	RP11-278C7.1,YARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-278C7.1	2692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	39816699	39816988	39816844	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	18204	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	40382618	40382994	40382971	Y	LRRK2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	77398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	RPL30P13,SLC2A13	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	7562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	41680022	41680168	41680092	Y	PDZRN4	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	595778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	42470575	42470704	42470641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	65977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	45236452	45236616	45236517	Y	DBX2,NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	77015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	45638356	45638816	45638511	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	30532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	45703000	45703363	45703138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	95176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	46571692	46571878	46571769	Y	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	89922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	46804431	46804731	46804468	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	28969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	46887386	46887956	46887679	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	111924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	47185736	47186095	47186020	Y	NA	SLC38A4	NA	NA	NA	NA	SLC38A4	38096	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	48053201	48053247	48053224	Y	ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	44597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	48201899	48202220	48202071	Y	SENP1,PFKM,ASB8	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	22695	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C,COL2A1	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	COL2A1	825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	49592771	49592915	49592838	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1B,PRPH,TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TUBA1A	11664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	49626851	49627096	49626872	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	45744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	49866902	49867154	49867028	Y	PRPF40B,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH3	63786	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	50019010	50019299	50019155	Y	FMNL3	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	50019907	50020190	50020017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59906	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	50020601	50020960	50020800	Y	FMNL3,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	60600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	50067341	50067888	50067543	Y	TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	31620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	50555629	50555991	50555816	Y	ACCN2,DIP2B	CERS5	NA	NA	NA	NA	CERS5	3297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	50902358	50902765	50902415	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	5590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	50936330	50936621	50936410	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	39562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	51014249	51014685	51014387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2B	117481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	51833393	51833425	51833407	Y	NA	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	48742	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	51885274	51885441	51885406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN8A	96609	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	52146424	52146626	52146525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	133118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	52184760	52184919	52184839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	94825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	37418	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	52257879	52258204	52258030	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	21540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	16436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44,OR7E47P	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	52438699	52439014	52438738	Y	ACVR1B,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44,OR7E47P	NA	NA	NA	NA	C12orf44	22016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53340686	53341032	53340856	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	31	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53368339	53368600	53368386	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	26601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53445016	53445392	53445120	Y	IGFBP6,C12orf10,TENC1,TENC1,TENC1,SPRYD3	EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4,SPRYD3	NA	NA	NA	NA	RP11-983P16.4	830	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	MFSD5	30257	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	MFSD5	27213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	54052823	54053029	54052960	Y	NA	ATF7,ATP5G2	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	16163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	54149784	54149995	54149877	Y	PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	30255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	54228175	54228372	54228274	Y	ATP5G2	SNORD81	HOXC13,HOXC12,SMUG1	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD81	45086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	54746110	54746353	54746239	Y	PDE1B,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	COPZ1	53124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	COPZ1	59435	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	COPZ1	59685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr12	55414615	55414652	55414634	Y	OR6C76,OR6C75,OR6C65,OR6C2,OR6C74,OR6C3,OR6C6,OR10A7,OR9K2,NEUROD4	NEUROD4	NA	NA	NA	NA	NEUROD4	2886	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	56474601	56474862	56474633	Y	SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3	RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1	NA	NA	NA	NA	ERBB3	2960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	56614575	56614693	56614609	Y	NA	SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,SLC39A5,ANKRD52,COQ10A	NA	NA	NA	NA	RNF41	858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4,GLS2	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	56876109	56876291	56876201	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	3907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	7.69127331668736
chr12	57073427	57073817	57073648	Y	NA	BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	6342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	57079143	57079532	57079338	Y	NA	ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	57672745	57672985	57672868	Y	NA	NDUFA4L2	NA	NA	NA	NA	NDUFA4L2	40247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	57735992	57736374	57736348	Y	NA	NA	R3HDM2	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	86414	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	57822292	57822475	57822384	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	59061940	59062339	59062197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	249964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.23661161987225
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3,RP11-150C16.1	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	59426251	59426629	59426440	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150C16.1	113831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	60014654	60014825	60014740	Y	NA	SLC16A7	NA	NA	NA	NA	SLC16A7	26806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	62388270	62388603	62388449	Y	FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	263516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	62559325	62559470	62559411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	92649	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	62644447	62644716	62644645	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	USP15	MCF7	ChIA-PET	22265404	USP15	7403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	153991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	63241617	63241757	63241688	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	85060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	64401221	64401399	64401310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	165148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	65026482	65026674	65026578	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	24189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	66054663	66054864	66054812	Y	LEMD3	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-118B13.1	374151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-118B13.1	142742	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	66316992	66317322	66317175	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-118B13.1	111693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67107721	67107786	67107754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	353156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	186177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67275619	67275719	67275669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	185223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67319023	67319379	67319201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	141563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67361974	67362194	67362149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	98748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	67363946	67364340	67364143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	96602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67371255	67371618	67371453	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	89324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	67392180	67392257	67392219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	68685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67396755	67396891	67396823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	64051	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	67411263	67411633	67411591	Y	NA	RP11-123O10.4	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	49309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	68750184	68750421	68750327	Y	IL22,RAP1B	MDM1	RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	26023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	69006143	69006530	69006154	Y	CPM,IFNG,RAP1B	RAP1B	NA	NA	NA	NA	RAP1B	3524	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B	NA	NA	NA	NA	RAP1B	17128	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	69163885	69164101	69163897	Y	SLC35E3	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	25999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	69312043	69312322	69312251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	51028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	69724869	69725108	69724964	Y	LYZ	LYZ,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	15013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	69726696	69726959	69726870	Y	NA	LYZ,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	13162	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	70603919	70603997	70603958	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	30777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	70605032	70605426	70605086	Y	CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	29348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	70626158	70626373	70626266	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	8401	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	70644560	70644959	70644584	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	9420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	70648828	70649035	70648891	Y	RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	13688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	72236663	72237026	72236820	Y	NA	TBC1D15	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	5176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	72463324	72463574	72463504	Y	NA	TRHDE	NA	NA	NA	NA	TRHDE	15472	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	72690281	72690495	72690341	Y	TPH2,TRHDE	TRHDE-AS1	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	23594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr12	72691947	72692219	72692098	Y	TPH2,TRHDE	TRHDE-AS1	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	25260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	72728711	72729061	72728940	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	62024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	72767670	72768001	72767685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	100983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	72815461	72815843	72815652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	148774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	72875098	72875358	72875202	Y	TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	208411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	73636899	73637241	73637070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	970212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	73639499	73639785	73639508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	972812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	73660341	73660575	73660458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	993654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	74668744	74669132	74668938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	260419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	24179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	17530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76197528	76197897	76197766	Y	KRR1	NA	KRR1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	227815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76248800	76249037	76248808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	176675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76352762	76353194	76352954	Y	NA	NA	KRR1,PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	72518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76811286	76811641	76811626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS10	71064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76919848	76920276	76920185	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	31313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	77251083	77251471	77251277	Y	NA	CSRP2	NA	NA	NA	NA	CSRP2	19369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	77426192	77426447	77426357	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	30913	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	79323956	79323978	79323967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	79324302	79324765	79324409	Y	SYT1,SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr12	79325321	79325633	79325477	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	69548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	79356068	79356388	79356099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	100295	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	79362065	79362430	79362066	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	106292	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	79363511	79363565	79363558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	107738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	79444921	79445122	79445022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	189148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	79526323	79526826	79526502	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	270550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	79566745	79567141	79566931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	310972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	79670829	79671264	79670913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	411613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	322917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	79817704	79817772	79817737	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	265105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	79817950	79818263	79818028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	264614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	79848111	79848561	79848284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	234316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	79994209	79994302	79994256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	88575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	80137623	80137948	80137786	Y	NA	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90	Hi-C	24141950	PAWR	54746	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	80219716	80220141	80220058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	107099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	80327802	80327850	80327826	Y	NA	PPP1R12A	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	80907201	80907494	80907379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244J10.1	412088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	81171843	81172335	81171905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	157259	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	81886903	81887127	81886967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-315E17.1	117082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr12	82336470	82336631	82336552	Y	CCDC59	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIA2	185138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr12	83177526	83177865	83177863	Y	TMTC2	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	98867	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	83422828	83423206	83423017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	119904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	84468037	84468125	84468045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	837269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	86658149	86658358	86658243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALX1	986264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	87130786	87131140	87131095	Y	MGAT4C	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	1294483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr12	89461276	89461656	89461568	Y	DUSP6	NA	POC1B,DUSP6	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	283392	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	89579864	89580040	89579936	Y	NA	NA	DUSP6,POC1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	165008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	89637521	89637764	89637549	Y	POC1B,DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,DUSP6	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	107284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	89856198	89856331	89856264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	61470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	89910622	89910739	89910701	Y	NA	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	NA	NA	NA	NA	POC1B	7062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4,POC1B-GALNT4	60306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	90317829	90318295	90318123	Y	POC1B,ATP2B1	NA	C12orf37	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	216752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	90371593	90371911	90371750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	270516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92402520	92402848	92402650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	131842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	92415461	92415779	92415694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	118911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	92419313	92419515	92419511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	115175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92424488	92424877	92424862	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	109813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	92427755	92427874	92427825	Y	CLLU1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	106816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92428496	92429133	92428829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	105557	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	92458847	92459245	92459094	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	75445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	92464901	92465146	92464998	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	69544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	92471870	92472505	92472386	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	62185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92474192	92474586	92474423	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	60104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92484962	92485088	92485023	Y	BTG1	C12orf79	NA	NA	NA	NA	C12orf79	49602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92505299	92505700	92505686	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	28990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	92509431	92509711	92509674	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	24979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	92528487	92528918	92528861	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	5772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	92863747	92864031	92863808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	326074	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92890570	92890809	92890680	Y	CLLU1OS	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	352897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	92935399	92935847	92935710	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	385260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	93320988	93321201	93321103	Y	EEA1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94135673	94136306	94136137	Y	NUDT4,SOCS2	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	66522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94158186	94158524	94158355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	89035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	94179016	94179409	94179114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94190374	94190467	94190421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	121223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94439564	94439856	94439735	Y	SOCS2	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	100643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94493473	94493774	94493548	Y	NA	PLXNC1	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLXNC1	46725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94546167	94546575	94546217	Y	CRADD,TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	5668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94568373	94568733	94568631	Y	TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	27874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94580840	94581238	94580884	Y	TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	CCDC41	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	40341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	94581330	94581746	94581508	Y	TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	CCDC41	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	40831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	137747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	155313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	77597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	95034280	95034617	95034465	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	7721	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	95069867	95070333	95070014	Y	TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	27529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	95100273	95100466	95100365	Y	NA	NA	PLXNC1,CCDC41,NDUFA12,TMCC3	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC3	57935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	95199817	95200100	95199987	Y	VEZT	NA	TMCC3,PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC3	157479	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	95477787	95477978	95477880	Y	NA	NR2C1	NR2C1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR2C1	12308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	96502190	96502534	96502487	Y	NA	NA	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	LTA4H	66892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	96592675	96593197	96592888	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	6515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	CDK17	26793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	97108556	97108721	97108638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	190280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	97870154	97870565	97870199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR135A2	85025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	97917973	97918105	97918040	Y	NA	MIR135A2	NA	NA	NA	NA	MIR135A2	37485	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	98329389	98329500	98329445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR135A2	373799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	99541137	99541427	99541282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	504218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	101598548	101598928	101598901	Y	ANO4	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	72959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	102220478	102220758	102220699	Y	NA	GNPTAB,DRAM1	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	1958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	103348133	103348242	103348178	Y	NA	ASCL1,PAH	NA	NA	NA	NA	ASCL1	1222	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	103407081	103407257	103407170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAH	56893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	104675995	104676292	104676137	Y	GLT8D2,TXNRD1	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	18939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	36793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr12	104846909	104846975	104846916	Y	NA	CHST11	NA	NA	NA	NA	CHST11	98	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	104974037	104974383	104974060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	126964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	104998326	104998912	104998568	Y	TXNRD1,EID3,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	151253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	105031434	105031802	105031612	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	184361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	105043287	105043477	105043345	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	196214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	105062941	105063154	105062961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	215868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	105620091	105620351	105620275	Y	APPL2	C12orf75,APPL2	NA	NA	NA	NA	C12orf75	6717	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	105900072	105900358	105900257	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	181277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	106316355	106316701	106316396	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90	Hi-C	24141950	NUAK1	215110	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	106401702	106402025	106401865	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90	Hi-C	24141950	NUAK1	129786	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	107856980	107857227	107857220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD11	146790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	108054058	108054330	108054150	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	23179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	109061186	109061401	109061295	Y	SELPLG,SELPLG,SSH1	NA	NA	NA	NA	NA	CORO1C	61971	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	109093619	109093939	109093779	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	29433	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	109167575	109167781	109167683	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	44203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1,DAO	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1,DAO	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	109297152	109297589	109297254	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1,DAO	NA	NA	NA	NA	DAO	46444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	109553563	109553881	109553768	Y	DAO,ACACB,UNG	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5,ACACB	NA	NA	NA	NA	ACACB	1163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	110618684	110618848	110618757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	58544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	110735237	110735389	110735298	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	18676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	111336252	111336432	111336342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-46F2.3	57184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr12	111875686	111876044	111875771	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	33934	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr12	112464061	112464211	112464136	Y	NA	TMEM116,ERP29	NA	NA	NA	NA	ERP29	14941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	112566952	112567278	112567115	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	TRAFD1	5647	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	113490228	113490419	113490324	Y	DTX1	DTX1	NA	NA	NA	NA	DTX1	2095	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	113513069	113513377	113513212	Y	DTX1,DDX54	DTX1	NA	NA	NA	NA	DTX1	20555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	CCDC42B,DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	113684297	113684702	113684391	Y	NA	TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	27398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr12	113851482	113851626	113851554	Y	NA	SDSL	SDS	IMR90	Hi-C	24141950	SDSL	6416	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDSL	171229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	114449981	114450226	114450038	Y	NA	RBM19	RBM19,TBX5	IMR90	Hi-C	24141950	RBM19	47805	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	116561417	116561596	116561452	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	151547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	116572704	116573066	116572889	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	140077	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	116590030	116590409	116590220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	122734	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	116666460	116666763	116666749	Y	NA	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	46380	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	117241332	117241427	117241370	Y	C12orf49,HRK	NA	NA	NA	NA	NA	RNFT2	67236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	HRK	NA	NA	NA	NA	HRK	39636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	117478325	117478369	117478352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESC	56915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	117483062	117483484	117483386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESC	51800	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	117988619	117988948	117988784	Y	NOS1,NOS1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	362283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	118497859	118498236	118498048	Y	NA	RFC5	NA	NA	NA	NA	WSB2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	119398004	119398265	119398135	Y	NA	SRRM4	CCDC60	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM4	19035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	119646482	119646796	119646670	Y	SRRM4,CCDC60,HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	32035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr12	120179533	120179605	120179597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	75975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	120239357	120239612	120239538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	73483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	120453080	120453507	120453184	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	99799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	120835592	120835965	120835696	Y	NA	MSI1,RPS27P25,COX6A1,TRIAP1,GATC	SIRT4,PLA2G1B,MSI1,SRSF9,TRIAP1,DYNLL1,GATC,COX6A1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS27P25	30349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	120953454	120953584	120953519	Y	MSI1	SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	15699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	121245538	121245859	121245790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADS	84000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	121402785	121402795	121402791	Y	HNF1A	HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43	NA	NA	NA	NA	HNF1A	11551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	121425440	121425755	121425495	Y	NA	HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43	NA	NA	NA	NA	HNF1A-AS1	8672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	123233355	123233499	123233417	Y	CLIP1,HCAR2,HCAR3	DENR	CCDC62	IMR90	Hi-C	24141950	DENR	1822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	124486134	124486345	124486231	Y	NA	ZNF664,CCDC92,FAM101A	NA	NA	NA	NA	FAM101A	30346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	226810	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	125479851	125480155	125479863	Y	NA	DHX37,BRI3BP	NA	NA	NA	NA	BRI3BP	3605	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	125577703	125578001	125577737	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	29778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	129301742	129302776	129302427	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	3752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	129725693	129725893	129725793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	419165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	129871586	129871714	129871650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	565058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	130012974	130013180	130013078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	706446	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	130923831	130924224	130924207	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	274602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr12	130953209	130953314	130953258	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	245512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	131111744	131112133	131112105	Y	RIMBP2	NA	RIMBP2	IMR90	Hi-C	24141950	RIMBP2,RP11-662M24.2	86693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr12	131117194	131117823	131117569	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	81003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	131261153	131261348	131261240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	60463	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	131439876	131440100	131439986	Y	NA	GPR133	NA	NA	NA	NA	GPR133	3424	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr12	131510828	131511048	131510920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	74376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	131531831	131532167	131532121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	95379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	131707348	131707723	131707417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	270896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	132293483	132293821	132293495	Y	NA	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	17117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	25770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr12	133178906	133179327	133179219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE	82624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	133528012	133528357	133528019	Y	NA	CHFR,ZNF605	NA	NA	NA	NA	CHFR	2533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	21398890	21399124	21398998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	52793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	23485782	23486124	23485811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	217069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	24062649	24062979	24062814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACS	56808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	24191778	24192157	24192102	Y	NA	TNFRSF19	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	49269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	26003507	26003910	26003705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL1	129845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	26177966	26178190	26178081	Y	FAM123A,ATP8A2	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL1	304304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	26551633	26551678	26551661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	243113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	26564398	26564731	26564565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	230060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	27706563	27707017	27706898	Y	NA	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	37016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	27834117	27834352	27834235	Y	USP12	RPL21,SNORD102,RASL11A	NA	NA	NA	NA	SNORD102	6916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	27957593	27957812	27957644	Y	RASL11A,GTF3A	GTF3A	CDX2,GSX1	IMR90	Hi-C	24141950	GTF3A	38869	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	28470399	28470626	28470551	Y	NA	PDX1	NA	NA	NA	NA	PDX1	21531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	28534904	28535178	28535096	Y	LNX2,FLT3,PRHOXNB	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	8098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr13	28660576	28660679	28660628	Y	FLT3	PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3-AS1	49651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	28725313	28725682	28725498	Y	PAN3	PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3	14670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	28762730	28762825	28762778	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	23825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	29328831	29329051	29328862	Y	SLC46A3	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	37724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	29594016	29594197	29594075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP69	284718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	29638535	29638553	29638543	Y	MTUS2	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP69	240362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	30625878	30626131	30625964	Y	NA	NA	UBL3,LOC440131	IMR90	Hi-C	24141950	UBL3	203057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	30812389	30812594	30812492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	55690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	30867525	30867802	30867626	Y	KATNAL1	PRDX2P1,KATNAL1	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	30879792	30879814	30879803	Y	NA	PRDX2P1,KATNAL1	NA	NA	NA	NA	KATNAL1	171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	30963439	30963783	30963499	Y	NA	NA	LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1	IMR90	Hi-C	24141950	KATNAL1	83818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	NA	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	KATNAL1	90063	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	30980712	30980745	30980729	Y	KATNAL1	NA	KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KATNAL1	101091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	31151476	31151709	31151594	Y	C13orf26,USPL1	HMGB1,USPL1	TEX26-AS1,LINC00426,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	HMGB1	38025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	32501315	32501650	32501483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	82337	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	32725009	32725223	32725116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	121572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	33762622	33762899	33762709	Y	STARD13,STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	159868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	33841256	33841381	33841376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	81386	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	33896698	33896851	33896775	Y	NA	STARD13	NA	NA	NA	NA	STARD13	25916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	34083894	34084135	34084032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	161127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.09110282802519
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	35574872	35575244	35575038	Y	NBEA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	60448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	36853236	36853259	36853249	Y	CCNA1,C13orf38	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	NA	NA	NA	NA	CCDC169	16718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	37493371	37493714	37493499	Y	C13orf36,RFXAP,SMAD9	SMAD9,LAMTOR3P1	NA	NA	NA	NA	SMAD9	469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	40057425	40057642	40057534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFP	118023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	40331110	40331478	40331245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	103346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	40945871	40945887	40945879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	292847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	41177727	41178040	41178014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	60694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	41202839	41203181	41203053	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	35553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	41226066	41226446	41226348	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	12288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	41558714	41559024	41558959	Y	C13orf15,FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	64804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	41560539	41560879	41560717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	66629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	41574237	41574406	41574394	Y	FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	59004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	41825625	41825697	41825634	Y	KBTBD7,NAA16	MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	10045	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	473361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	139032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	42928710	42929002	42928842	Y	TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11	NA	AKAP11	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP11	84421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	43865785	43866112	43865949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	270446	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	44201276	44201468	44201373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	157576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	44359761	44360131	44359976	Y	ENOX1,ENOX1	ENOX1	NA	NA	NA	NA	ENOX1	717	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	45752820	45753055	45752934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	60170	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	47234173	47234447	47234310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCH1	108870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	SUCLA2-AS1	109006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	48478393	48478707	48478627	Y	RB1	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	94818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	49615947	49616340	49616144	Y	SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	67899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	49757640	49757959	49757800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	62088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	18138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	MIR16-1,DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	50857956	50857973	50857965	Y	NA	NA	DLEU2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	75926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	NA	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL34P26	169381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	51620780	51620813	51620797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B-AS1	137932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	51641920	51642198	51642053	Y	INTS6	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B-AS1	159072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	53028749	53028807	53028779	Y	NA	VPS36,CKAP2	NA	NA	NA	NA	CKAP2	1185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	54088217	54088578	54088398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	667442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	58992699	58992709	58992704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	1743412	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	67568177	67568566	67568563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	233902	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	71362393	71362632	71362470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	1076698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	71905168	71905271	71905222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	534059	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	71953138	71953396	71953261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	485934	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	72116042	72116082	72116062	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	323248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	72316062	72316072	72316067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	123258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	72366390	72366725	72366609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	72605	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	72385563	72385700	72385665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	53630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	72424218	72424283	72424251	Y	NA	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	15047	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	72437849	72438027	72438023	Y	NA	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	1303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	72438548	72439003	72438895	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr13	72996613	72996915	72996766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	278916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr13	74326809	74326882	74326846	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	379512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	74340193	74340396	74340347	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	365998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	74445258	74445348	74445303	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	261046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	75904010	75904233	75904150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	150017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	75965393	75965547	75965541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	88703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	76967658	76967689	76967675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	490851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	77297766	77298116	77297917	Y	NA	NA	LMO7,KCTD12	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD12	160424	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	78911933	78912082	78912037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF219	319232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	88383188	88383252	88383222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00351	2447452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00351	2448856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	91869538	91869920	91869747	Y	NA	NA	MIR17HG	K562	ChIA-PET	22265404	MIR17HG	128154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	92294972	92294984	92294978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	296898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	92868650	92868886	92868807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5-AS1	502981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	92900985	92901044	92901015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5-AS1	470823	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr13	92927934	92928164	92928120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5-AS1	443703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr13	92940642	92941183	92940919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5-AS1	430684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr13	93361116	93361155	93361136	Y	NA	GPC5-AS1	NA	NA	NA	NA	GPC5-AS1	10712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	93495866	93496249	93496058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5-AS1	123999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	93880621	93881133	93881009	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	3526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr13	93899040	93899272	93899121	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	21945	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr13	93915220	93915506	93915338	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	38125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr13	94297506	94297518	94297511	Y	GPC6	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	278293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	94472931	94472950	94472936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	453718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	94512612	94512940	94512928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	493399	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	94551696	94551729	94551713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	532483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	94583687	94584035	94583861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	564474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	94644641	94644702	94644672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	601809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	94706563	94706645	94706604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	539866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	94762314	94762622	94762468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	483889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	94913778	94913870	94913813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	332641	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	94976563	94976881	94976571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	269630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	95128334	95128746	95128451	Y	DCT	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	117765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	96199307	96199475	96199314	Y	NA	NA	DZIP1	IMR90	Hi-C	24141950	DZIP1	95482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	96332135	96332467	96332276	Y	NA	DZIP1,DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	4742	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	96517437	96517518	96517478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	186218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	97188079	97188190	97188135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	484343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	97302981	97303007	97302994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	568681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	97864377	97864530	97864454	Y	NA	MBNL2	MBNL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MBNL2	7158	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	98926557	98926890	98926623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP1	133741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	99169761	99169891	99169826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	58303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	99278853	99278891	99278872	Y	NA	CALM2P4	STK24,FARP1	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2P4	12602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	159803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	99880215	99880463	99880360	Y	GPR183	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	14203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	21650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	99963491	99964160	99963691	Y	NA	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	5832	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	99974545	99974749	99974637	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	16886	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	GPR183	55832	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr13	100035133	100035296	100035208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR183	77474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	100374428	100374651	100374540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	117509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	100399124	100399585	100399214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	142205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	100886726	100886738	100886732	Y	NA	NA	A2LD1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P18	85380	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr13	101041976	101042276	101042034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	148252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	102569627	102570054	102569972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF14	482070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr13	102696707	102696889	102696861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF14	355235	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	102784457	102784806	102784790	Y	FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	FGF14	267318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	102827333	102827727	102827645	Y	FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	FGF14	224397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	104371816	104371919	104371873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	876622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	106751889	106752019	106751954	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	466493	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	465240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr13	106777477	106777605	106777541	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	440907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	106803810	106804031	106803901	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	414481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	106808885	106809142	106808998	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	409370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	106810133	106810294	106810212	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	408218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	107001723	107002064	107002003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	216448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	107078443	107078580	107078574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	139932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	108099145	108099375	108099322	Y	FAM155A	NA	NA	NA	NA	NA	LIG4	769341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	108978746	108978885	108978817	Y	LIG4,ABHD13,TNFSF13B	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	110019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr13	110039921	110040112	110039986	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	365503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	110144647	110144871	110144759	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	260744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr13	110274718	110274736	110274728	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	130879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr13	110306752	110306910	110306889	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	98705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	110322109	110322425	110322268	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	83190	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	52916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	110359460	110359633	110359542	Y	IRS2	AL162497.1	MYO16,IRS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL162497.1	45982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	110521819	110522258	110522077	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	84904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr13	110787215	110787446	110787333	Y	RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	350300	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111180820	111181023	111180903	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	CARKD	84858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111312907	111313086	111312997	Y	NA	CARKD,ING1	NA	NA	NA	NA	CARKD	47026	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr13	111607450	111607830	111607755	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	42034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111623981	111624100	111624039	Y	ING1,C13orf16	NA	ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	58565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111699295	111699448	111699370	Y	NA	NA	ING1,ARHGEF7,ANKRD10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGEF7	65458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111719893	111720066	111720029	Y	NA	ARHGEF7	ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	44840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	111863058	111863169	111863068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	98152	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	112347236	112347393	112347316	Y	NA	NA	SOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD44	356999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	112711940	112712042	112711992	Y	NA	SNORD44	NA	NA	NA	NA	SNORD44	7548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	112867754	112868133	112868015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD44	163362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	113393010	113393289	113393150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	50367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	113549464	113549664	113549543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	71474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	113562235	113562531	113562394	Y	MCF2L	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	58607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	113597069	113597276	113597160	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	MCF2L-AS1	23862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	113685939	113686263	113686060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	64801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F7,F10,PROZ	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	PROZ	4058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	F10,PROZ	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	PROZ	2222	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	113870568	113870732	113870682	Y	MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	PCID2	9539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	114124603	114124675	114124639	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	18592	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr13	114270892	114271213	114271013	Y	DCUN1D2,TMCO3	TFDP1	NA	NA	NA	NA	TFDP1	33879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr13	114862790	114863121	114862935	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	32965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	114890433	114890784	114890662	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	5302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	114906463	114906564	114906535	Y	RASA3	RASA3	RASA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RASA3	10377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	21529107	21529436	21529241	Y	NA	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ARHGEF40	6993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	24014427	24014724	24014635	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4	NA	NA	NA	NA	THTPA	8492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	24018554	24018930	24018908	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4	NA	NA	NA	NA	THTPA	4286	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	24075347	24075692	24075500	Y	NA	AP1G2,JPH4,DHRS2	C14orf167	IMR90	Hi-C	24141950	DHRS2	21632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	25131991	25132384	25132236	Y	LTB4R,CTSG	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	221880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	26884947	26885117	26884976	Y	NOVA1	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	179843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	27263370	27263754	27263562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	198410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	27595143	27595156	27595150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	530183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	932436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr14	27998275	27998515	27998360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	933315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	28061472	28061526	28061498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	895590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr14	28109127	28109447	28109287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	847669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr14	28846944	28847285	28847115	Y	FOXG1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	109831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr14	28957970	28957982	28957974	Y	NA	RPL26P3	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	30663968	30664325	30664158	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	4864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	30768972	30768989	30768981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKD1	109868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	31165114	31165442	31165278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD1	75796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	COCH	NA	NA	NA	NA	COCH	18583	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	31408112	31408404	31408271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	66392	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	32833367	32833525	32833442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	118481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	32976944	32977104	32977024	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	24938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	33178444	33178576	33178508	Y	AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	223563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	33406991	33407386	33407042	Y	NA	NPAS3	NA	NA	NA	NA	NPAS3	4852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	33485809	33485898	33485821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	83670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	33756619	33756719	33756669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	354480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	33800321	33800549	33800409	Y	NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	398182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	33838745	33838916	33838831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	436606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	33950978	33951281	33951079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	548839	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr14	34033986	34034251	34034169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	631847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	34095367	34095561	34095464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	693228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	34162040	34162301	34162172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	759901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	34176402	34176558	34176443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	753004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	34407631	34407737	34407684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	521825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	34987475	34987508	34987491	Y	EAPP	EAPP	NA	NA	NA	NA	EAPP	19408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	35274619	35275001	35274810	Y	PPP2R3C,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	66548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	35435578	35435890	35435735	Y	NA	SRP54,RP11-85K15.2	NA	NA	NA	NA	SRP54	13273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	35666202	35666508	35666414	Y	BAZ1A,FAM177A1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	76447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	35767605	35767844	35767749	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	21766	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	35800965	35801124	35801022	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	55126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	37468951	37469405	37469233	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	170666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	10623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr14	39122804	39122976	39122949	Y	NA	NA	SSTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SSTR1	447600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	39637578	39637824	39637713	Y	NA	PNN	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6B	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	39664073	39664414	39664121	Y	SIP1,PNN	TRAPPC6B,PNN,MIA2	NA	NA	NA	NA	PNN	21686	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	MIA2,CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	39890491	39890736	39890687	Y	NA	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	8968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	41580196	41580481	41580339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1680492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	41585190	41585196	41585195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1685486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	41662407	41662459	41662451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1762703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	42263954	42264273	42264114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2364250	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	42286206	42286221	42286213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2386502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	42980587	42980987	42980723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	2383511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	43420114	43420297	43420206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1944201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	43816626	43817007	43816818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1547491	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	44072704	44073040	44072872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1291458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	45714299	45714525	45714379	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	6218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	47526400	47526720	47526539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	141587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	47637485	47637798	47637642	Y	NA	RPL13AP2	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	30509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	47843045	47843295	47843249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	174738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	47979335	47979399	47979362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	311028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	48030000	48030393	48030347	Y	MDGA2,MDGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	361693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr14	48184413	48184780	48184597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	516106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	49375724	49376075	49375898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS29	687333	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.10923814929915
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr14	50437883	50438206	50438091	Y	RPS29,RPL36AL,DNAAF2,NEMF,SOS2,METTL21D,ATP5S,ARF6	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	80073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	50552755	50553092	50552901	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	143184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	50562564	50562863	50562716	Y	RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	133413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr14	50988191	50988449	50988343	Y	NA	ATL1,MAP4K5	NA	NA	NA	NA	ATL1	8778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	52076708	52076858	52076794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	53392802	53392977	53392890	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	24176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	53598795	53599062	53598929	Y	DDHD1	DDHD1	NA	NA	NA	NA	DDHD1	18938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	54758286	54758405	54758397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN3	103162	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	54900763	54901015	54900977	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	39196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	55281865	55282028	55281930	Y	NA	NA	GCH1,WDHD1	IMR90	Hi-C	24141950	GCH1	85542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	55302493	55302656	55302575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCH1	64914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	55841053	55841315	55841186	Y	MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,ATG14	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	35261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	56393861	56394247	56394115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	188285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	56595447	56595666	56595543	Y	NA	PELI2	NA	NA	NA	NA	PELI2	12915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	150761	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	57343255	57343511	57343375	Y	OTX2,OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	390215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	57725803	57726155	57725979	Y	NA	EXOC5	NA	NA	NA	NA	EXOC5	7571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	58766869	58767218	58767044	Y	ARID4A	RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	ARID4A	3766	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	59106687	59106948	59106735	Y	NA	DACT1	NA	NA	NA	NA	DACT1	8002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	59216036	59216189	59216096	Y	ARID4A	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	43183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR135	68787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	60168972	60169358	60169165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	166326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	60214885	60214948	60214918	Y	RTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	120736	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	60330001	60330562	60330397	Y	NA	RTN1	NA	NA	NA	NA	RTN1	5122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	60776777	60777011	60776895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184C24.2	63294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	60778203	60778479	60778369	Y	PPM1A	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184C24.2	64720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	61188145	61188381	61188263	Y	NA	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	61652622	61652735	61652681	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	345	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	61865216	61865457	61865337	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM30B	118658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	62170336	62170562	62170449	Y	NA	HIF1A,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	10105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	63983921	63984319	63984190	Y	NA	PPP2R5E	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	23773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	64180685	64181078	64180882	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	11679	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	64584533	64584935	64584736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-544I20.2	218382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	64705009	64705329	64705170	Y	PLEKHG3,SYNE2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-544I20.2	97988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	65115289	65115345	65115316	Y	NA	NA	ZBTB25,ZBTB1,SPTB,PLEKHG3,CHURC1-FNTB,MTHFD1,PPP1R36,HSPA2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG3	53475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	65229015	65229197	65229106	Y	SPTB,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	65905118	65905243	65905181	Y	NA	FUT8	NA	NA	NA	NA	FUT8	29808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	65959136	65959304	65959206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	83826	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	66448805	66449095	66448950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	523030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	67562927	67563276	67562937	Y	TMEM229B,PLEKHH1	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	142550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11,RDH12	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68456427	68456429	68456428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	171931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68610058	68610732	68610311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	276181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68634149	68634509	68634347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	252404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	68749669	68750047	68749943	Y	RAD51L1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	136866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68827959	68828328	68828144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	58585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68831089	68831428	68831316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	55485	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	68943032	68943562	68943135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	56119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	69010932	69011443	69011159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	124019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	69155852	69156106	69155979	Y	NA	NA	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	105084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	69287859	69287985	69287926	Y	NA	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	26669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	69301401	69301774	69301727	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	40211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	69434857	69435075	69434960	Y	DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	9082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	69867695	69867997	69867846	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	ERH	4351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	70447892	70448065	70447949	Y	SMOC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	129044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	71253294	71253580	71253437	Y	NA	MAP3K9,RP6-65G23.3	NA	NA	NA	NA	MAP3K9	20671	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	71811948	71812060	71812004	Y	NA	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	25417	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	71865475	71866239	71865922	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	78944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	71955425	71955735	71955597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	168894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	71996595	71997083	71996703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	210064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	72021992	72022911	72022768	Y	SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	235461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	72083404	72083762	72083537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	296873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	72438276	72438928	72438440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	651745	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	73585185	73585324	73585255	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	15802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	101981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	73826978	73827275	73827127	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf43	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	99854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	73919503	73919783	73919743	Y	NA	RP1-240K6.3,NUMB,C14orf169	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	7346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	74607211	74607609	74607410	Y	NA	NA	VSX2	IMR90	Hi-C	24141950	LIN52	57712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	75492523	75492557	75492545	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	23678	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	76243945	76244101	76244023	Y	TGFB3	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf1	118413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	76343734	76343966	76343850	Y	NA	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	22513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	76401422	76401643	76401519	Y	ESRRB,TGFB3	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	34943	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	4584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	77488566	77488578	77488572	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4456	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	77498012	77498283	77498148	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	79886057	79886209	79886119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1537652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	80084258	80084404	80084331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1339457	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	80161976	80161991	80161984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1261870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	80972596	80972697	80972671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	451164	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.89118807235628
chr14	81713528	81713897	81713622	Y	NA	SNORA79,GTF2A1,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1P1	2621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	83623464	83623477	83623471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-406A9.2	516500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	84176891	84176909	84176900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-406A9.2	1069927	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	86053629	86053936	86053651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	59141	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	86066316	86066619	86066414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	71828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC8	382996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	89680457	89680908	89680785	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC8	391960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	89833380	89833593	89833517	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	249900	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	89950912	89951066	89950980	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	132427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	90049518	90049848	90049714	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	33645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	90055887	90056088	90056076	Y	NA	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	27405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	90081839	90081992	90081916	Y	FOXN3,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	1501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	91069038	91069054	91069046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	208192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	91162693	91162827	91162783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	117996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	91269936	91270352	91270297	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	10471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	91454457	91454803	91454684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	69874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	91528012	91528136	91528074	Y	SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	3032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	91752749	91752962	91752855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	129226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	92451454	92451633	92451538	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	53607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	93697718	93697880	93697787	Y	ITPK1,MOAP1	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	94851152	94851609	94851362	Y	SERPINA1	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	SERPINA1	3421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	94889921	94890056	94890007	Y	SERPINA1	SERPINA1,SERPINA11	NA	NA	NA	NA	SERPINA11	27071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	95060330	95060702	95060482	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	16012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	95811424	95811694	95811563	Y	NA	CLMN	GSC,CLMN	IMR90	Hi-C	24141950	CLMN	27181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX5	51030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	95981456	95981771	95981695	Y	NA	GLRX5,SCARNA13,SNHG10	NA	NA	NA	NA	GLRX5	16069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	96550045	96550377	96550264	Y	NA	C14orf132	NA	NA	NA	NA	C14orf132	46384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	96570939	96571330	96571109	Y	BDKRB2,BDKRB1	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf132	67278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	RP11-404P21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-404P21.3	6469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	99744019	99744279	99744133	Y	CYP46A1	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	200937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	100486645	100486967	100486738	Y	NA	NA	EVL,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	YY1	215668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	206840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	100503802	100504130	100503983	Y	NA	NA	EVL,DEGS2,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	YY1	198505	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	100807709	100808060	100808026	Y	WDR25,WDR25,WARS,WARS	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	22905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	100900581	100900857	100900682	Y	WARS,WARS	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	59439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	100952760	100952992	100952839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	111618	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	NA	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEG3	193890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102050999	102051149	102051091	Y	NA	DIO3OS	NA	NA	NA	NA	DIO3OS	26231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R5C	49347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102320812	102320943	102320878	Y	PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	94677	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102340393	102340589	102340458	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	88276	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102394756	102394884	102394784	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	33981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.40025573299325
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102868139	102868468	102868196	Y	HSP90AA1,RCOR1,TECPR2	CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	TECPR2	40839	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr14	103251609	103251698	103251662	Y	NA	TRAF3	NA	NA	NA	NA	TRAF3	9796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	103299136	103299384	103299260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3	57323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	103848844	103849188	103848935	Y	TNFAIP2,EIF5,MARK3	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	104228992	104229118	104229080	Y	NA	XRCC3,ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	ZFYVE21	48925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	104601589	104601707	104601649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf2	208983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	104993565	104993828	104993574	Y	NA	NA	KIF26A	IMR90	Hi-C	24141950	INF2	160115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	105265888	105266206	105266005	Y	NA	SIVA1,AKT1,RPS26P49	NA	NA	NA	NA	AKT1	5800	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	34630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	105760670	105760918	105760811	Y	C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1	BTBD6,PACS2,BRF1	NA	NA	NA	NA	PACS2	3982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr14	105790841	105790905	105790875	Y	NA	PACS2,BRF1	NA	NA	NA	NA	BRF1	10915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf80	1298739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	23041896	23042224	23042060	Y	NA	NIPA2	NA	NA	NA	NA	NIPA2	9469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	25555752	25555966	25555813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	126162	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	25606189	25606253	25606221	Y	UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	75875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	25608093	25608225	25608159	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	73903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	25624061	25624357	25624209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	57771	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	25641447	25641749	25641585	Y	NA	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	40379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	25766793	25766905	25766849	Y	NA	NA	LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	84665	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	26176179	26176311	26176243	Y	ATP10A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	494051	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	26881482	26881584	26881496	Y	GABRB3	NA	NA	NA	NA	NA	GABRB3	301102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	26935746	26936096	26935922	Y	GABRB3,GABRB3	NA	NA	NA	NA	NA	GABRB3	246590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	26958560	26958904	26958869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRB3	223782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRB3	150317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	28494622	28494982	28494802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	63816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	31627410	31627711	31627458	Y	NA	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	10352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	31645647	31645937	31645817	Y	NA	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	28589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	31680805	31681075	31680940	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	63747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	31780397	31780546	31780469	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	163339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	32974763	32975144	32974961	Y	NA	SCG5,GREM1	NA	NA	NA	NA	GREM1	33031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	33135808	33135977	33135886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	127633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	34627277	34627936	34627564	Y	SLC12A6,SLC12A6,SLC12A6,SLC12A6	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	35335893	35336175	35336034	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	57405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	35650165	35650403	35650284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	371677	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	510266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	36910960	36911073	36911017	Y	MEIS2,C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	41148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	37046763	37047120	37046943	Y	C15orf41	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	176951	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	37170652	37170846	37170749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	218694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	37203314	37203431	37203373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	186109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	37278170	37278456	37278428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	111084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	37403099	37403474	37403147	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	RP11-128A17.1,MEIS2	LOC100507466,C15orf41,MEIS2	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS2	11595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	509103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39449850	39450075	39449963	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	421205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	39541225	39541623	39541385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	329657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39559141	39559459	39559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	311821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39559889	39560120	39560079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	311160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39637466	39637772	39637619	Y	NA	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	233508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39650604	39651044	39650772	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	220236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	39684245	39684484	39684421	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	186796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	168788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	39706539	39706707	39706617	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	164573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	40339886	40340243	40340062	Y	PLCB2,BMF,BMF,BMF	SRP14	NA	NA	NA	NA	SRP14	10497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	40340748	40341007	40340885	Y	BMF,BMF,BMF	SRP14	NA	NA	NA	NA	SRP14	11359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	40365860	40366125	40365905	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	32968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	40463815	40464014	40463832	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	12591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	40730551	40730903	40730713	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	631	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	41199675	41199878	41199759	Y	DLL4	RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1	DLL4	IMR90	Hi-C	24141950	VPS18	15047	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	41219895	41220240	41219942	Y	NA	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.43652637554116
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	42786035	42786158	42786098	Y	SNAP23	SNAP23	NA	NA	NA	NA	SNAP23	4604	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	42792289	42792533	42792361	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	10858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	42833928	42834273	42834101	Y	NA	LRRC57,HAUS2,STARD9	NA	NA	NA	NA	LRRC57	4727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	43200953	43201247	43201100	Y	NA	TTBK2	NA	NA	NA	NA	TTBK2	9760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	43321563	43321622	43321602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR1	74689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	43803895	43804004	43803947	Y	TGM7,TP53BP1,MAP1A	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	2739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	43806421	43806594	43806505	Y	NA	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	5265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	44186295	44186523	44186409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR76	69134	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASC4	147459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	45005185	45005759	45005376	Y	CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	45076532	45076874	45076594	Y	B2M	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM69	57346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	46416141	46416404	46416273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	494795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr15	46441434	46441833	46441634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	520088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	46528514	46528549	46528532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	607168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	46545564	46545905	46545872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	624218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	47979261	47979603	47979432	Y	MYEF2	CTD-2270N23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	41529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	49739111	49739383	49739247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTWD1	171794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	50345341	50345603	50345432	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	126790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	50890405	50890451	50890426	Y	USP8,SPPL2A,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	86561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	51382019	51382273	51382147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	183150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	51413367	51413627	51413497	Y	NA	NA	TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN	IMR90	Hi-C	24141950	AP4E1	214498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	51481875	51482198	51481995	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	283006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	51515990	51516083	51516067	Y	SPPL2A,TNFAIP8L3,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	317121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	352824	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	51628727	51629122	51629096	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	283908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	51850561	51850924	51850712	Y	TMOD3,MAPK6,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	62106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	51912435	51913121	51913004	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	53063704	53063805	53063755	Y	NA	ONECUT1,RP11-209K10.2	NA	NA	NA	NA	ONECUT1	17468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	53942854	53943115	53943028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR72	109960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	55463152	55463211	55463182	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	24054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	55503902	55504218	55504040	Y	RAB27A,PIGB	RSL24D1	RSL24D1	K562	ChIA-PET	22265404	RSL24D1	16637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	55823075	55823485	55823135	Y	PYGO1	DYX1C1-CCPG1,DYX1C1	NA	NA	NA	NA	DYX1C1	24643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	55928441	55928509	55928475	Y	NA	PYGO1	NA	NA	NA	NA	PYGO1	49296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	56475345	56475479	56475412	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	58004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	56965853	56966086	56966042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNS1	210518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	57016270	57016644	57016457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF280D	192125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	57465140	57465369	57465208	Y	ZNF280D,TCF12	NA	LOC283663	IMR90	Hi-C	24141950	CGNL1	200796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	57529031	57529296	57529123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGNL1	136869	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	57614367	57614619	57614484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGNL1	51546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	57814441	57814703	57814560	Y	CGNL1	NA	NA	NA	NA	NA	GCOM1	67403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	59461586	59461962	59461756	Y	ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	66309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	60839009	60839501	60839122	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	69632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	60861865	60862603	60862448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	92488	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	60881604	60881753	60881652	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	112227	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	60927699	60928017	60927821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	158322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	60943205	60943249	60943239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	173828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	61113423	61113507	61113465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	344046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	61191372	61191904	61191714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	327614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	61264927	61265345	61265257	Y	NA	NA	NARG2	IMR90	Hi-C	24141950	RORA	254173	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	61329284	61329972	61329593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	189546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	61406057	61406438	61406248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	113080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	61459603	61459724	61459664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	59794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	61501689	61502023	61501856	Y	NA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	17495	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	61505182	61505193	61505186	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	14325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	61520020	61520614	61520340	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	62130295	62130308	62130301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-507B12.1	124925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	63208487	63208634	63208561	Y	NA	RP11-244F12.1	TLN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-244F12.1	34738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	63486176	63486338	63486267	Y	LACTB,USP3,RAB8B	RPS27L,RAB8B	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	6508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	63789918	63790251	63790145	Y	HERC1,LACTB,RAB8B,APH1B,USP3	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	4542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	FBXL22,USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	FBXL22	16134	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	64000367	64000635	64000532	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	108579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	64397616	64397971	64397713	Y	SNX1	DAPK2,FAM96A,SNX1,SNX22	NA	NA	NA	NA	SNX1	13294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	64919514	64919887	64919625	Y	NA	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	36336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	64991554	64991938	64991797	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	1542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	64995974	64996331	64996160	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	2494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	65103266	65103574	65103420	Y	NA	RBPMS2,PIF1,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PIF1	12293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	PLEKHO2	3880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr15	65185651	65186463	65186157	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	15638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr15	65277772	65277992	65277893	Y	OAZ2,PLEKHO2	SPG21,MTFMT	NA	NA	NA	NA	SPG21	2656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	65709516	65709749	65709576	Y	NA	IGDCC3,IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	3661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	66060795	66060948	66060877	Y	NA	RAB11A,DENND4A	NA	NA	NA	NA	DENND4A	21683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	66446289	66446658	66446570	Y	DIS3L,DIS3L	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF11	97427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr15	66464730	66464867	66464805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF11	79218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	66967847	66967978	66967897	Y	NA	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	24588	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	67348530	67348587	67348559	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	5514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	67378105	67378547	67378289	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	24004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	67409139	67409556	67409296	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	55038	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	28273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	68366463	68366575	68366519	Y	NA	PIAS1	NA	NA	NA	NA	PIAS1	21946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALML4	54729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF6	91124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	72666496	72666825	72666661	Y	NA	RP11-106M3.1	NA	NA	NA	NA	HEXA	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	72897243	72897463	72897311	Y	SENP8,SENP8,MYO9A,TMEM202	NA	NA	NA	NA	NA	BBS4	79064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	73032689	73032951	73032815	Y	PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	43236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	73308423	73308823	73308623	Y	NA	NA	NEO1,BBS4,ADPGK,LOC100287559	IMR90	Hi-C	24141950	ADPGK	232236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	74661495	74661657	74661620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	63151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	75073348	75073866	75073498	Y	ARID3B,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK	CSK,CPLX3	NA	NA	NA	NA	CSK	950	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	75075558	75076065	75075775	Y	ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK	CSK,CPLX3	NA	NA	NA	NA	CSK	3160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	75288966	75289325	75289146	Y	CPLX3,ULK3,SCAMP5	SCAMP5,RPP25,PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	75365607	75365911	75365770	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	NA	C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	PPCDC	51711	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	75470847	75471095	75470955	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39	C15orf39	C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	14889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	76658083	76658321	76658202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFA	56270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	76901664	76901845	76901842	Y	SCAPER	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	293940	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	77332766	77333147	77332913	Y	PSTPIP1	TSPAN3	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	41179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	77579824	77580262	77579914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	130224	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	77710600	77710857	77710802	Y	NA	PEAK1	NA	NA	NA	NA	HMG20A	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	78476376	78476653	78476619	Y	ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	CIB2	54490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	78598854	78599004	78598959	Y	NA	DNAJA4,WDR61	WDR61,IDH3A,DNAJA4,IREB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR61	8718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	79735078	79735475	79735257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMED3	133674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	79767814	79767956	79767881	Y	BCL2A1	NA	NA	NA	NA	NA	TMED3	166410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	81387226	81387398	81387312	Y	NA	NA	IL16,C15orf26	IMR90	Hi-C	24141950	MESDC1	95931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD5	435817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr15	82061645	82062005	82061987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD5	447121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	82117732	82117868	82117800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFTUD1	435236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	NA	NA	NA	NA	NA	EFTUD1	213293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83231949	83232133	83232017	Y	NA	RPS17L	NA	NA	NA	NA	RPS17L	24634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83329401	83329783	83329629	Y	AP3B2,CPEB1,CPEB1	RP11-752G15.3,RP11-752G15.4,AP3B2	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.3	14880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	83376680	83377056	83376874	Y	NA	RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	AP3B2	14	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	83412156	83412209	83412183	Y	NA	AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.6	5107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83605139	83605146	83605143	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	47515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	83681404	83681605	83681512	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	3011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83722004	83722168	83722109	Y	NA	C15orf40,BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	11938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83733499	83733939	83733822	Y	WHAMM	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83815089	83815145	83815117	Y	NA	TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	40930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	83857860	83858021	83857985	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	84040858	84041607	84041233	Y	NA	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	HDGFRP3	166088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	85361646	85361991	85361963	Y	ALPK3	ALPK3	NA	NA	NA	NA	ALPK3	3735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	85547085	85547484	85547285	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	25414	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	86267980	86268030	86268003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	89152639	89152930	89152746	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	9597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	89156201	89156887	89156382	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	5640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	89187882	89188205	89187952	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	10498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	89672226	89672631	89672291	Y	ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	5095	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	89727640	89727726	89727722	Y	ABHD2	HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	49914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.90932339363023
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	89878895	89879173	89879043	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	2803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90017364	90017928	90017702	Y	MESP1,C15orf42	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	141272	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A,WDR93	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90363996	90364798	90364610	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	7363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90547619	90547737	90547660	Y	ANPEP,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	4995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90563245	90563669	90563337	Y	ANPEP,AP3S2,IQGAP1,CIB1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	20621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90577561	90577868	90577654	Y	AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	34937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	90950706	90950784	90950761	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	91153046	91153352	91153276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRTC3	81889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	91399904	91400195	91399999	Y	CRTC3,VPS33B	FES,MAN2A2	BLM,CRTC3,FURIN,FES	IMR90	Hi-C	24141950	FES	24730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FES	7081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	91673099	91673438	91673113	Y	SV2B,SV2B	SV2B	NA	NA	NA	NA	SV2B	31919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	92400491	92400865	92400640	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	5566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	92461389	92461789	92461546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	66464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	92497568	92497970	92497770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	102643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	92509194	92509613	92509420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	114269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	92664917	92665299	92665108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	161772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	93121727	93122011	93122001	Y	C15orf32	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	130966	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	93130741	93130751	93130746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	122226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	93131436	93131762	93131609	Y	RGMA,C15orf32,FAM174B	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	121215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	93142854	93143118	93142986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	109859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	93180228	93180540	93180295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	72437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	93230839	93230845	93230842	Y	ST8SIA2,C15orf32	HMGN1P38,RP11-386M24.4	SLCO3A1	IMR90	Hi-C	24141950	HMGN1P38	22132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	95050162	95050468	95050315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	1625636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	95830783	95831278	95830942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1035889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	96155084	96155099	96155092	Y	NA	NA	NR2F2,LOC400456,LOC145820	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	712068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	96369112	96369214	96369163	Y	NA	NA	LOC400456,NR2F2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	497953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr15	96377158	96377292	96377225	Y	NA	NA	NR2F2,LOC400456	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	489875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	10985	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	97037762	97038044	97037995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	142296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	99943673	99944058	99943986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2A	71312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	101253659	101254026	101253922	Y	ALDH1A3	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	LINS	112224	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	101481026	101481320	101481182	Y	LRRK1	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	308817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	101807515	101807673	101807594	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	17378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	101818299	101818511	101818407	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	14976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	374352	374895	374583	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.92745871490419
chr16	1166792	1167154	1166886	Y	NA	SSTR5,CACNA1H	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1H	34087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	1175604	1175749	1175663	Y	RHBDL1,FBXL16,CACNA1H,BAIAP3,BAIAP3,BAIAP3,SSTR5	CACNA1H	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNA1H	25492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	1195094	1195464	1195280	Y	NA	CACNA1H	LMF1,CACNA1H,TPSD1	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1H	5777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	31098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	1239202	1239436	1239320	Y	BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	37961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	HS3ST6,NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST6	13288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr16	2518760	2519270	2519088	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	230	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr16	3031604	3031823	3031757	Y	PAQR4	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	PKMYT1	3064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr16	3055976	3056164	3056082	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	10282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr16	3345455	3345619	3345522	Y	OR1F1,SLX4,CLUAP1,C16orf90,OR2C1	ZNF263,ZNF75A,TIGD7	NA	NA	NA	NA	ZNF75A	7787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRL	55999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	SRL,TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr16	4422682	4422871	4422704	Y	NA	PAM16,VASN	NA	NA	NA	NA	VASN	2833	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr16	4985283	4985359	4985321	Y	NA	SEC14L5,PPL	NA	NA	NA	NA	SEC14L5	20959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	5085449	5085725	5085546	Y	NA	ALG1,NAGPA	NA	NA	NA	NA	NAGPA	3307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	6422300	6423402	6422643	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1276491	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	6537672	6538042	6537854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1391863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	6822644	6823191	6822880	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1676835	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	8010227	8010459	8010246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	703081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	8035197	8035214	8035207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	678326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	9141634	9142026	9141729	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	41479	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	9325793	9326174	9325910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	142288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	122047	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	11299930	11300255	11300088	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,SOCS1	RMI2,SOCS1	CLEC16A,RMI2,SNN,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	RMI2	41221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	11345704	11346020	11345999	Y	NA	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	2016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	11419517	11419755	11419648	Y	ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,CIITA,SOCS1	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	71481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	11946483	11946539	11946512	Y	NA	RSL1D1	NA	NA	NA	NA	RSL1D1	3041	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	12244428	12244806	12244617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX29	175834	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	12700714	12700789	12700756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	195085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	12713340	12713716	12713664	Y	NA	NA	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	CPPED1	182158	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	12761788	12762198	12762001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	133676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	14326449	14326637	14326520	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	163271	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	14402100	14402342	14402181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	238922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	15996854	15996874	15996863	Y	NA	FOPNL,RPL15P20,ABCC1	MYH11,ABCC1	IMR90	Hi-C	24141950	FOPNL	16372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	16214595	16215019	16214906	Y	NDE1,ABCC1	NA	ABCC6	IMR90	Hi-C	24141950	NOMO3	109333	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	17442362	17442541	17442464	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1118010	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	17545858	17546183	17546022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1221506	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	17685725	17686159	17686027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	1113546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	20910017	20910139	20910077	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	311	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	20915885	20916169	20915941	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	6179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM	634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	21566198	21566360	21566279	Y	DNAH3	SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9	METTL9,IGSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2547E10.2	36433	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	24595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	25564339	25564353	25564346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN2	297087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	25723900	25724286	25724093	Y	ZKSCAN2,HS3ST4	NA	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN2	456648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	27149778	27150235	27150058	Y	NA	NA	HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	127880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	27240450	27240772	27240769	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	37343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr16	27263252	27263592	27263361	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	14523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr16	27541388	27541697	27541538	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	17537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	27770598	27770827	27770713	Y	IL4R	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	211144	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	28169506	28169747	28169662	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	51494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	28179891	28180117	28180009	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	41124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	SPN,QPRT,C16orf54	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	29796508	29796713	29796645	Y	KCTD13,C16orf92,ALDOA	C16orf54,KIF22,MAZ,PRRT2,MVP	NA	NA	NA	NA	KIF22	3327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	31888166	31888535	31888469	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	31955307	31955602	31955455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	72228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	46671518	46671564	46671541	Y	NA	SHCBP1,VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	17980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	46863838	46864241	46863904	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr16	48657602	48657960	48657802	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	N4BP1	5543	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	50280304	50280568	50280347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD5	95475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	51182471	51182868	51182589	Y	SALL1,SALL1	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	51183106	51183414	51183179	Y	SALL1,SALL1	NA	NA	NA	NA	NA	SALL1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	51187930	51188326	51188194	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	4652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	51797343	51797505	51797414	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	119676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	52489873	52490156	52490047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOX3	89558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	52526808	52526987	52526898	Y	TOX3,TOX3	NA	NA	NA	NA	NA	TOX3	52727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	52558140	52558522	52558331	Y	NA	TOX3	NA	NA	NA	NA	TOX3	21192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	52564240	52564587	52564414	Y	TOX3	TOX3	NA	NA	NA	NA	TOX3	15127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	52579555	52579603	52579574	Y	NA	TOX3	NA	NA	NA	NA	TOX3	111	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	53128013	53128430	53128279	Y	RBL2	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	41068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	53915459	53915524	53915492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	179584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	54128589	54128847	54128718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	189828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	54961070	54961275	54961203	Y	NA	IRX5	NA	NA	NA	NA	CRNDE	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	55052989	55053317	55053111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX5	90215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	55470362	55470729	55470665	Y	NA	NA	SLC6A2,CES1P1	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT2	70181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	55790917	55791184	55791073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CES1	74065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	56246770	56247072	56246869	Y	NA	GNAO1	NA	NA	NA	NA	GNAO1	23468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	56314617	56314966	56314752	Y	MT3,MT1M,GNAO1,BBS2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAO1	91315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	56813469	56813757	56813613	Y	NA	NA	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	NUP93	51452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	56890645	56890781	56890713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD1	73179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	57422098	57422156	57422116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COQ9	57181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	NA	NA	NA	NA	NA	COQ9	56592	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	57622732	57623027	57622920	Y	GPR114	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	19537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	57701111	57701632	57701437	Y	FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	25073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	62021508	62021884	62021766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3255247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	63275323	63275660	63275492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEAN1	3183540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	66087157	66087293	66087245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEAN1	371907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	66433999	66434318	66434067	Y	NA	BEAN1	BEAN1,TK2	IMR90	Hi-C	24141950	BEAN1	24882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr16	66659405	66659873	66659770	Y	NA	CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	23628	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	CDH16,RRAD,FAM96B,CES2,CES3,CES4A	NA	NA	NA	NA	CES3	4726	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	67011641	67011860	67011695	Y	NA	FAM96B,CES2,CES3,CES4A,CBFB	NA	NA	NA	NA	CES4A	8632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	67689330	67689673	67689514	Y	NA	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	3040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	68418958	68419037	68419019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	57526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	68996002	68996219	68996099	Y	NA	NA	HAS3,CHTF8	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	141248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8,TMED6	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr16	70444676	70444732	70444694	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	26408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	70464772	70465160	70465031	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	5980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	70716686	70717066	70716876	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	70909910	70910012	70909961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	76846	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	71046758	71046771	71046763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	213694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	71580921	71580983	71580949	Y	NA	ZNF19	NA	NA	NA	NA	ZNF19	16009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	72257967	72258413	72258290	Y	NA	PMFBP1	HPR	IMR90	Hi-C	24141950	PMFBP1	49190	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMFBP1	250381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMFBP1	252091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	72882732	72883050	72882991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	208547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	72912475	72912642	72912542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	178955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	72965555	72965897	72965813	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	73023566	73023933	73023728	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	73353192	73353326	73353259	Y	NA	NA	HPR,HP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	261595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr16	75101005	75101352	75101179	Y	NA	LDHD	NA	NA	NA	NA	LDHD	47317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	CTRB1,BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	CTRB1,BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75359436	75359702	75359569	Y	NA	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	59485	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75420812	75420988	75420900	Y	NA	CFDP1	CTRB1,BCAR1,CTRB2	IMR90	Hi-C	24141950	CFDP1	44395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75454988	75455069	75455029	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	CFDP1	10314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75496858	75497008	75496924	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	75894725	75894834	75894802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KARS	214184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	77824907	77825111	77825009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT7	70496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	77979179	77979195	77979185	Y	VAT1L,WWOX	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	152115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	78325751	78325980	78325865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	194441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	78876925	78876962	78876944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	745615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	79534628	79534642	79534635	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	97969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	79635433	79635866	79635594	Y	MAF	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	2822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	80965900	80966145	80965922	Y	NA	NA	CMC2	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	71958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81557764	81558419	81558110	Y	CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	80989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	81684511	81685002	81684729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	85700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	77260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	DNAAF1	569	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	84624738	84624752	84624744	Y	HSDL1,COTL1	COTL1	NA	NA	NA	NA	COTL1	24931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	84633108	84633501	84633306	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	16182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	84855927	84856178	84856013	Y	CRISPLD2	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	4337	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	84869763	84870234	84870125	Y	CRISPLD2	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	18173	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85037797	85037883	85037799	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	5258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85456219	85456617	85456516	Y	FAM92B	NA	KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	265062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr16	85470615	85470779	85470696	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250900	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	85471045	85471389	85471119	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85473143	85473232	85473181	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	248447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85496879	85497321	85497140	Y	FAM92B,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	224358	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	85498599	85498960	85498791	Y	KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	222719	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	85499556	85499891	85499629	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	221788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85522483	85522579	85522531	Y	NA	NA	KIAA0182,FAM92B,KIAA0513,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	199100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	85558951	85559083	85559056	Y	KIAA0513,IRF8	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	162596	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	85570517	85570742	85570617	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	150937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr16	85601000	85601159	85601100	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120520	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85603902	85604423	85603949	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	117256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85726494	85726553	85726524	Y	NA	GINS2	NA	NA	NA	NA	GINS2	4815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	85904396	85904814	85904496	Y	COX4I1,IRF8	NA	IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	56254	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr16	87814047	87814397	87814161	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	16449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87843209	87843416	87843290	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	45611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	87888208	87888468	87888297	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	12626	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87901718	87902209	87902044	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87931288	87931492	87931437	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5,BANP	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	30194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	87952545	87952677	87952600	Y	BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	28173	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	87957908	87958324	87958193	Y	NA	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	22526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr16	88555955	88556054	88556005	Y	NA	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	38230	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	88575081	88575169	88575126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	57356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	88683643	88683946	88683795	Y	NA	ZC3H18,CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	31614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr16	88847421	88847701	88847601	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	1918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	88857121	88857244	88857196	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	7502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	88955496	88955935	88955760	Y	NA	TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	GALNS	34118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	CBFA2T3	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	49455	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr16	89086731	89086969	89086798	Y	NA	CBFA2T3	ACSF3,CBFA2T3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CBFA2T3	45119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr16	89184955	89185230	89185162	Y	CYBA,RNF166,RNF166,CBFA2T3	ACSF3	LINC00304,LOC400558,CDH15	IMR90	Hi-C	24141950	ACSF3	32172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr16	89323118	89323579	89323381	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	41000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr16	89382399	89382987	89382651	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	100281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr16	89688213	89688598	89688406	Y	NA	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	33655	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr16	90087429	90087721	90087595	Y	TUBB3,DBNDD1,PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	2893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	185919	186143	186025	Y	RNMTL1	RPH3AL	NA	NA	NA	NA	RPH3AL	47902	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	12.9278849365596
chr17	232485	232614	232550	Y	NA	RPH3AL,C17orf97	RPH3AL,VPS53	IMR90	Hi-C	24141950	RPH3AL	1431	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	234794	234851	234823	Y	DOC2B	RPH3AL,C17orf97	RPH3AL,DOC2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPH3AL	749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GEMIN4	540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	1094047	1094290	1094169	Y	SLC43A2,PITPNA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	195690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	1267059	1267122	1267091	Y	NA	YWHAE	NA	NA	NA	NA	YWHAE	34550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	1585953	1586309	1586247	Y	NA	TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	PRPF8	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF2,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	1666519	1666783	1666685	Y	RTN4RL1,WDR81,WDR81,SERPINF1	WDR81,MIR22HG,SERPINF2,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	3266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	1863470	1863779	1863610	Y	SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	62860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr17	2084621	2084734	2084671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119943	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2167377	2167408	2167381	Y	NA	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	37269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2652547	2653322	2653300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	158043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2719284	2719546	2719376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	224780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2751152	2751369	2751257	Y	PAFAH1B1,RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	256648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	2757819	2758227	2758154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	263315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	2807414	2807761	2807686	Y	OR3A2	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	312910	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr17	2910546	2910571	2910559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	416042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	3672212	3672474	3672258	Y	NA	GSG2,ITGAE	P2RX5-TAX1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAE	30063	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4065011	4065373	4065306	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4614568	4615368	4615020	Y	MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	2784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4663304	4663479	4663372	Y	ZNF232,C17orf87,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15	MED11,CXCL16,TM4SF5,GLTPD2,PSMB6,PLD2	NA	NA	NA	NA	TM4SF5	9700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	GLTPD2,PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	4950916	4951277	4951137	Y	NA	ZFP3	NA	NA	NA	NA	ZFP3	28266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	5412379	5412497	5412422	Y	USP6	DHX33,MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	24248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	5430157	5430402	5430333	Y	NLRP1	MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	42026	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	5854578	5854683	5854630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL2	466447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	6790647	6790875	6790776	Y	SLC16A11,DLG4,DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT1	57567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT1	89687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,BCL6B,SLC16A13,SLC16A11	NA	NA	NA	NA	BCL6B	813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ASGR1,ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	7784207	7784538	7784352	Y	POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	CHD3	1586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	8436852	8437236	8437053	Y	MYH10	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	94843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	8531412	8531868	8531658	Y	NA	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	9131847	9132010	9131919	Y	WDR16,NTN1	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	208988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	9981257	9981536	9981397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	178543	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	10029003	10029256	10029103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	130823	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	15368147	15368483	15368202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	106850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV2	57663	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV2	58866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	ZNF287,AC005822.1	NA	NA	NA	NA	ZNF287	17025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	17163211	17163219	17163215	Y	NA	FLCN,COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	COPS3	19388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	17319893	17320013	17319952	Y	FLCN	RPL13P12	NA	NA	NA	NA	RPL13P12	34567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	17420385	17420786	17420623	Y	NA	MED9,RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	22676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	17493657	17493822	17493814	Y	RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	19207556	19207821	19207642	Y	MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	71213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	20690369	20690534	20690439	Y	NA	SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	4411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	128282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25558342	25558695	25558519	Y	NA	NA	KSR1,WSB1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	60407	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr17	25707009	25707412	25707348	Y	NA	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	74258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25813907	25813958	25813933	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	32237	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25821459	25821654	25821516	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	39789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25823612	25823763	25823676	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	41942	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	25856308	25856397	25856353	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	74638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	25891638	25891876	25891756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	109968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	26135195	26135302	26135249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	231461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	26445565	26445699	26445591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	78802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	26578773	26579067	26578920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27255195	27255444	27255376	Y	PHF12,NUFIP2,UNC119,SDF2,PROCA1,NEK8,FLOT2	FLOT2,DHRS13,PIPOX,PHF12	NA	NA	NA	NA	PIPOX	20087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	27972817	27973010	27972914	Y	NA	CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	24892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	28019224	28019454	28019389	Y	NSRP1,NUFIP2,TAOK1,SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	71299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	28041794	28041800	28041797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	93869	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	28049478	28050072	28049903	Y	NUFIP2,TAOK1,SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	101553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	28166109	28166223	28166182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSH2	89071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	28210608	28210734	28210655	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	44560	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	28878844	28878974	28878919	Y	NA	SMURF2P1	CPD,GOSR1,LRRC37BP1,TMIGD1,SUZ12P	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2P1	46840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	19457	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	119610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	29717293	29717639	29717335	Y	OMG,RAB11FIP4	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	29787763	29788137	29787829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	71121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	29820298	29820473	29820377	Y	EVI2B,EVI2A,SUZ12	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	103656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	33373543	33373969	33373834	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	40369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	NA	NA	NA	NA	NA	AP2B1	115262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	33824805	33825214	33825002	Y	SLFN5,SLFN12L,CCL5	NA	NA	NA	NA	NA	AP2B1	77851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	34227790	34227961	34227895	Y	SLFN12L,CCL5	RDM1	NA	NA	NA	NA	RDM1	27816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	34467011	34467104	34467058	Y	LYZL6	NA	CCL4,CCL16,CCL14-CCL15,CCL14	IMR90	Hi-C	24141950	CCL14	139911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	35078576	35079010	35078700	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRM1	122575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS7	65535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	36748013	36748410	36748212	Y	NA	SRCIN1	ARHGAP23	IMR90	Hi-C	24141950	SRCIN1	11773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	37010933	37011093	37011014	Y	FBXO47,C17orf98	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	RPS20P35	1366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	37065070	37065230	37065172	Y	NA	LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	40958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	8339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	38263980	38264229	38263993	Y	RARA,RARA,MSL1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	38666550	38666883	38666717	Y	TNS4	NA	CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP4	68848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	39069125	39069341	39069249	Y	KRTAP3-2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM99	95767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT15	23430	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40152830	40153154	40152992	Y	NA	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	CNP,TTC25	IMR90	Hi-C	24141950	NKIRAS2	8246	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40155760	40155995	40155877	Y	STAT5A	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	5405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40215698	40216046	40215772	Y	ATP6V0A1	DNAJC7	RAB5C	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC7	44304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3,PTRF	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40628029	40628344	40628111	Y	NA	ATP6V0A1,AC067852.1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	19167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	40942176	40942529	40942199	Y	NA	EZH1,RAMP2,VPS25,WNK4,CNTD1,PSME3,BECN1	NA	NA	NA	NA	CNTD1	6281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	41042095	41042419	41042257	Y	NA	AOC3	NA	NA	NA	NA	AOC3	40894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	41428275	41428596	41428403	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	45731	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	42101631	42102033	42102001	Y	C17orf105,CD300LG,LSM12	TMEM101,LSM12,G6PC3	NA	NA	NA	NA	TMEM101	2317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	ASB16,TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	43034960	43035346	43035098	Y	ADAM11,HIGD1B,DCAKD,ACBD4,GFAP	KIF18B,C1QL1	KIF18B	IMR90	Hi-C	24141950	C1QL1	8093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	43053342	43053729	43053536	Y	NA	KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	C1QL1	9903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	43095998	43096402	43096133	Y	NA	NMT1,DCAKD	NA	NA	NA	NA	NMT1	30576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	43993191	43993527	43993444	Y	STH,MAPT	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	23443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44019661	44020036	44019768	Y	STH,CRHR1,MAPT	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	49913	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44135698	44135955	44135827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	165950	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	185731	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44232468	44232502	44232485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	262720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	44234299	44234706	44234578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	264551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr17	44268679	44268848	44268762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	298931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	45302836	45303175	45303013	Y	NA	CDC27	NA	NA	NA	NA	CDC27	38048	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	45317390	45317724	45317566	Y	TBKBP1	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	52602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	45725037	45725352	45725118	Y	SP2	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1,TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	37143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	29822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	46078613	46078939	46078781	Y	TBKBP1,TBX21,SP2	PRR15L,CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	34453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46083704	46083942	46083828	Y	NA	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	29450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46089554	46089940	46089788	Y	CBX1,CBX1,CDK5RAP3	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	23452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46217226	46217562	46217317	Y	CDK5RAP3,SKAP1	CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	SNX11	38507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	46226881	46226967	46226912	Y	TBX21,OSBPL7,LRRC46,SKAP1	CBX1,SNX11	SNX11	IMR90	Hi-C	24141950	SNX11	48162	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	46291488	46291927	46291575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	77782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	46318516	46318700	46318601	Y	SKAP1,HOXB4	NA	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	51009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	46334759	46335012	46334885	Y	OSBPL7,SKAP1	AC090627.1	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	34697	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46517436	46517771	46517529	Y	CDK5RAP3,SKAP1	SKAP1	SKAP1,HOXB3,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6	IMR90	Hi-C	24141950	SKAP1	11799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46583139	46583523	46583310	Y	SKAP1	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3	HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOXB-AS1	35390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	10719	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46654606	46654947	46654902	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB4	526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	6092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	3981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	47092021	47092148	47092036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-42P	67139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr17	47113510	47113580	47113552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-42P	88628	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF652	167326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	47337469	47337918	47337568	Y	CALCOCO2,UBE2Z	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF652	99917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	ZNF652	NA	NA	NA	NA	ZNF652	12708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	47941415	47941544	47941487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	70710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	50561518	50561825	50561670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1225629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	53875650	53875676	53875663	Y	NA	PCTP	NA	NA	NA	NA	PCTP	49310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	54994598	54994773	54994687	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	5199	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	54995280	54995673	54995559	Y	NA	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	5881	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	55447287	55447561	55447443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	116075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	55523126	55523573	55523446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	191914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	55628691	55629280	55629007	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	296137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	55978714	55978990	55978831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	51694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	55993641	55993992	55993778	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,CUEDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUEDC1	36692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	56012688	56013140	56012704	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,SRSF1,CUEDC1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	17544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	56013342	56013699	56013370	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	16985	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	56015325	56015755	56015655	Y	CUEDC1	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	14929	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	56419503	56419633	56419507	Y	OR4D2	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	8821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	56426877	56426962	56426920	Y	MTMR4,SUPT4H1	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	1492	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	57194064	57194075	57194070	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	11782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57443443	57443708	57443557	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	36393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57443948	57444266	57444003	Y	NA	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	36898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57512618	57512946	57512830	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-13P	99914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57866887	57867071	57866969	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	49556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	57975372	57975465	57975395	Y	NA	TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	RPS6KB1	6925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	58475654	58476033	58475933	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	USP32,PPM1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP32	21798	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	59150035	59150103	59150069	Y	BCAS3	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	397221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	60555037	60555507	60555099	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	36621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	60557252	60557333	60557299	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	34795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	60868052	60868313	60868162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	275924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	61748394	61748578	61748486	Y	NA	LIMD2	NA	NA	NA	NA	LIMD2	27954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	62612826	62613207	62613064	Y	NA	SMURF2	NA	NA	NA	NA	SMURF2	42979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63035715	63036037	63035950	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	14920	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63060882	63060952	63060917	Y	GNA13	GNA13	GNA13,RGS9	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	9925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	63160254	63160611	63160482	Y	GNA13	RGS9	NA	NA	NA	NA	RGS9	28705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63510856	63511230	63511043	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	44535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63550809	63551200	63551034	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	4565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	63654769	63655153	63655091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	99004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	64524337	64524637	64524487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	227583	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	64551659	64552047	64551761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	254905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	64669772	64670163	64669988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG5	159072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	64879689	64879708	64879699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG5	50454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	64961597	64961937	64961768	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	2571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	65130860	65131108	65130984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	108997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	65437128	65437554	65437154	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	65553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	65487114	65487504	65487449	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	115539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	65525014	65525424	65525241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	153439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	65611157	65611527	65611357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOL11	100422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	65991434	65991739	65991543	Y	C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	3669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	ARSG	69641	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	67172740	67173121	67172931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	148264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	67463547	67463710	67463574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	54708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	68282373	68282961	68282582	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	119559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	68340579	68340874	68340665	Y	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	177765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	68943933	68944102	68944047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	671017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	225327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	70484276	70484648	70484400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	136722	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	70511484	70511781	70511663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	109589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	70512872	70513243	70513164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	108127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	70585924	70586379	70586141	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	34991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	70779461	70779663	70779556	Y	CPSF4L	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	144850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	71064440	71064923	71064668	Y	CPSF4L	SLC39A11	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	21928	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	71439964	71440055	71440021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	133650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	71470506	71470810	71470640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	164192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72189661	72189728	72189666	Y	KIF19	RPL38,TTYH2	NA	NA	NA	NA	RPL38	7993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72241426	72241789	72241666	Y	NA	RPL38,TTYH2,DNAI2	NA	NA	NA	NA	DNAI2	26597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72247418	72247796	72247504	Y	NA	RPL38,TTYH2,DNAI2	NA	NA	NA	NA	DNAI2	20590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72364862	72365214	72365020	Y	BTBD17	KIF19	NA	NA	NA	NA	KIF19	44513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	72564769	72564992	72564860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB37	99725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72728741	72729539	72729096	Y	KIF19,KCTD2,GRIN2C,FADS6,RAB37,RAB37,RAB37	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	13252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72737762	72737935	72737848	Y	RAB37,RAB37	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	4856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	72830385	72830471	72830428	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	36685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72837172	72837380	72837244	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	29776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	73007152	73007476	73007237	Y	RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	73073656	73074040	73073685	Y	RAB37,RAB37,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	7782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	21247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	49762	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	73391809	73391943	73391876	Y	NA	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	GRB2	7847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2,MYO15B	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	RECQL5	35261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	74067493	74067877	74067630	Y	RNF157,FAM100B	SRP68,GALR2,EXOC7	NA	NA	NA	NA	SRP68	759	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	GALR2,EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.76381460178318
chr17	74188633	74188942	74188716	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	31945	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	74195648	74195812	74195731	Y	UBE2O,AANAT,FBF1,RNF157,FAM100B	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	25075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74269060	74269291	74269140	Y	RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNK,SPHK1,RNF157,FAM100B	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	34606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	74304435	74304789	74304685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPHK1	65876	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74444372	74444742	74444506	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	2546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	74481730	74482020	74481883	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	13852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74494294	74494838	74494393	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	1034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74525125	74525268	74525197	Y	NA	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	CYGB	19989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74696685	74696955	74696820	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	8143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	75111736	75111750	75111743	Y	SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	30938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	75662697	75663098	75662732	Y	NA	NA	TNRC6C,FLJ45079,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	251082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	21.764667045094
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	41743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	76595465	76595710	76595593	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	DNAH17,CYTH1,PGS1,USP36	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	180669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	76662391	76662551	76662479	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	113828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	76755330	76755871	76755547	Y	USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	20508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	76764263	76764724	76764556	Y	SOCS3,PGS1,USP36,CANT1,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	11655	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	76775899	76776536	76776049	Y	USP36,ENGASE,CYTH1	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	77952311	77952542	77952488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	55105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	77961931	77962339	77962251	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	45308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	77965696	77966573	77966281	Y	CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	41074	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.74567928050922
chr17	77970749	77971301	77971166	Y	CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	36346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	77979653	77979899	77979776	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	27748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr17	78023284	78023378	78023331	Y	NA	TBC1D16,CCDC40,GAA	NA	NA	NA	NA	CCDC40	14849	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	78229807	78229879	78229843	Y	EIF4A3	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	2786	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.94559403617814
chr17	78459744	78459968	78459843	Y	RPTOR	NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	10101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	78500391	78500494	78500444	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	RPTOR,NPTX1,LOC100294362,ENDOV	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL32P31	13509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	78552032	78552241	78552117	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	35413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	78560725	78560872	78560817	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	44106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	78747875	78748340	78748187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	215058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	79302293	79302557	79302318	Y	NA	SLC38A10,LINC00482	NA	NA	NA	NA	LINC00482	21245	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79313114	79313481	79313281	Y	NA	SLC38A10,LINC00482	SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,ACTG1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00482	32066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	35205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38764	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	79360	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	84012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	80628	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79399639	79399699	79399664	Y	GCGR,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79448388	79448678	79448571	Y	NPB,AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	29411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	79450324	79450444	79450386	Y	NA	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	27645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr17	80060759	80061000	80060880	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	6551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	80079695	80079832	80079748	Y	NA	FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	25487	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	80328282	80328672	80328333	Y	NA	SECTM1,TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	13159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	80594524	80594906	80594740	Y	UTS2R,WDR45L	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	59698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr17	80821746	80822299	80821973	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	113806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr17	81023754	81023954	81023854	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	TBCD,ZNF750,B3GNTL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	METRNL	11613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr18	322671	322833	322785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	56621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr18	679559	679568	679564	Y	NA	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	23219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	999057	999295	999176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	188510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	144253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	3058527	3058678	3058565	Y	MYL12B,SMCHD1,LPIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	47214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL4	517433	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	6187863	6188007	6187935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	225229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	7950764	7950916	7950843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA48	651613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	8661812	8662039	8661951	Y	NA	NA	ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	54369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	9009931	9010219	9010076	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	90409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	10726542	10726663	10726595	Y	NAPG	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	202640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	13137958	13138425	13138153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	148597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	13175824	13176186	13176005	Y	C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	186463	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr18	13219877	13220140	13220009	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	230516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	13374941	13375140	13375024	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	349519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	13376593	13376881	13376789	Y	RNMT,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	347778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	13418060	13418088	13418062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	306571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	13500609	13500835	13500766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223824	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	13542199	13542509	13542255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	182150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	18515990	18516559	18516297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	173253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	19373794	19374099	19373861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	90876	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	19415827	19415836	19415832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	132909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	19926493	19926623	19926531	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	179089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	20128581	20128874	20128764	Y	NA	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	247350	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	20492925	20493072	20492999	Y	NA	MIR4741	RBBP8	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4741	18240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	20651395	20651706	20651560	Y	C18orf8	NA	RIOK3,CABLES1,TMEM241	IMR90	Hi-C	24141950	CABLES1	60822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	20807173	20807418	20807275	Y	NPC1,C18orf8,RBBP8,RBBP8	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	94645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	21002815	21003000	21002900	Y	RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8	TMEM241,RIOK3	NA	NA	NA	NA	TMEM241	12925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	21176326	21176498	21176427	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	11464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	21975077	21975273	21975220	Y	OSBPL1A	OSBPL1A,IMPACT	NA	NA	NA	NA	OSBPL1A	571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	24446345	24446487	24446416	Y	KCTD1,KCTD1,CHST9,AQP4,AQP4	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	210980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	25536974	25537193	25537082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	218217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	25623626	25623889	25623758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	131521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	25645893	25646031	25645963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	109379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	25674451	25674773	25674612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	80637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	25691984	25692409	25692174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	63001	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	25754926	25755429	25755157	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	26735180	26735449	26735256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	979770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	29196916	29197276	29197096	Y	NA	TTR	NA	NA	NA	NA	TTR	27227	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	29628778	29629024	29628889	Y	RNF125,RNF138,RNF138	RNF125,RNF138	NA	NA	NA	NA	RNF125	32443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	30031695	30031949	30031822	Y	FAM59A	NA	NA	NA	NA	NA	MEP1B	268663	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	31140777	31140968	31140873	Y	NA	ASXL3	NA	NA	NA	NA	ASXL3	15611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	31229161	31229406	31229348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL3	72582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	31336306	31336396	31336375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL3	179727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr18	31460453	31460828	31460641	Y	NOL4,NOL4,NOL4	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL3	303874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	32291109	32291369	32291156	Y	MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	219855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	32300943	32301117	32301030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	229689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	32386590	32386868	32386730	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	168024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	32413678	32413828	32413755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	141064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	32414940	32415436	32415021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	139456	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	32424641	32425032	32424811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	32527945	32528002	32527974	Y	DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,ZNF397,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	26890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	32591696	32592078	32591800	Y	NA	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	36804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	32622568	32623026	32622758	Y	ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	67676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	32684186	32684352	32684206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	33071303	33071471	33071398	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	4484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	33389735	33389972	33389879	Y	ZNF24,ZNF396,INO80C	NA	NA	NA	NA	NA	C18orf21	160074	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	33737531	33737917	33737788	Y	NA	SLC39A6,ELP2,MOCOS	NA	NA	NA	NA	MOCOS	27565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	34406593	34406898	34406790	Y	NA	KIAA1328,TPGS2	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	34765473	34765582	34765528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	358315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	35009721	35010039	35009931	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	133961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	35024297	35024529	35024426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	119471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	35096057	35096363	35096210	Y	NA	CELF4	NA	NA	NA	NA	CELF4	47637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	35138994	35139043	35139019	Y	CELF4	CELF4	NA	NA	NA	NA	CELF4	4957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	35143959	35144425	35144260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	38923845	38924195	38924020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	608976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	39021552	39021652	39021602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	511519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr18	39140522	39140756	39140639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	392415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	39755452	39755827	39755639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	222281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	40289843	40290198	40289863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT4	565417	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	41345475	41345795	41345567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT4	489860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	42295257	42295574	42295401	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	37119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	42305633	42305950	42305768	Y	SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	47495	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	42324731	42325124	42324894	Y	SETBP1,SETBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	66593	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	42419261	42419416	42419316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	161123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	43582956	43583166	43583086	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	37716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	43632002	43632343	43632207	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2,HAUS1,ATP5A1	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	17895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	43830546	43830877	43830624	Y	EPG5,PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	NA	C18orf25	79027	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	44120296	44120642	44120476	Y	LOXHD1,LOXHD1	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA5	216578	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA5	55657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	44394118	44394485	44394384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA5	56898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	44605074	44605239	44605157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDHD2	69652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	45417757	45417861	45417809	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	37654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	45509504	45509774	45509639	Y	SMAD2	NA	ZBTB7C	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD2	53989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	45541725	45542128	45542097	Y	SMAD2,SMAD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	86210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	45915673	45915749	45915744	Y	NA	ZBTB7C	NA	NA	NA	NA	ZBTB7C	19374	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	286345	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	46354445	46354549	46354497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	291028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	393180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	12819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	47688363	47688450	47688407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC11	102442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	48462357	48462700	48462360	Y	ME2	ELAC1,SMAD4	NA	NA	NA	NA	ELAC1	29661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	48616016	48616044	48616031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD4	123606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	50096414	50096607	50096467	Y	DCC	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3C	1353740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	51447036	51447236	51447153	Y	STARD6,C18orf54	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	301922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	53204965	53205096	53205075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	124922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	55101559	55101949	55101758	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	1099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	55108186	55108329	55108231	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr18	55448232	55448442	55448350	Y	NA	ATP8B1	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	19891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	55710685	55710979	55710720	Y	NEDD4L	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	1086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	55880754	55881007	55880894	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	56081187	56081552	56081390	Y	NA	MIR122	NA	NA	NA	NA	MIR122	34754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	56096279	56096485	56096382	Y	NA	MIR122	NA	NA	NA	NA	MIR122	19821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	56117134	56117320	56117186	Y	NA	MIR122	NA	NA	NA	NA	MIR122	828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	56159165	56159246	56159180	Y	NA	MIR122	NA	NA	NA	NA	MIR122	42859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr18	56208513	56208704	56208597	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	57159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	56533618	56533625	56533622	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	5786	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	59997447	59997624	59997536	Y	NA	TNFRSF11A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11A	6927	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	HMSD,SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	66366333	66366541	66366437	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	CCDC102B	13905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	66405862	66406252	66406056	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	TMX3	25327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	66485407	66485776	66485461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX3	104872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	68044126	68044452	68044254	Y	NA	NA	RTTN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	89989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr18	70814652	70814839	70814746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	998261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	71730939	71731058	71731041	Y	FBXO15	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	82042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	71731822	71731991	71731885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	81109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	72501282	72501640	72501447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	238176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	72706567	72706772	72706660	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	212531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74061111	74061285	74061228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	143861	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74088486	74089010	74088832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	116136	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74195251	74195532	74195392	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	9614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74199867	74199923	74199879	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	5223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	74205649	74206020	74205889	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74230733	74230810	74230772	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	ZNF516,LOC284276	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-17M16.1	25256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	74237245	74237630	74237448	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	31768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74399023	74399139	74399084	Y	NA	NA	LOC284276,ZNF516	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF236	133424	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74556264	74556608	74556436	Y	NA	ZNF236	NA	NA	NA	NA	ZNF236	23701	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74732491	74732837	74732665	Y	MBP,MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	199928	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	74754529	74754928	74754700	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	221966	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74767591	74768136	74768025	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	235028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74768655	74769369	74768895	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	236092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74775208	74775557	74775363	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	242645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	246503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	74780891	74781094	74780990	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	248328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	270996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	74816269	74816488	74816400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	283706	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74821198	74821567	74821500	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	288635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	305101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	307587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	309342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	616514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	75177214	75177519	75177367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	644651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	76884362	76884757	76884560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	57077	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr18	77006633	77006788	77006711	Y	ATP9B	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	179348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	77442917	77443176	77442992	Y	PQLC1,ADNP2,NFATC1,CTDP1,CTDP1	CTDP1	NA	NA	NA	NA	CTDP1	5116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	77682652	77682872	77682762	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	26792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr18	78004258	78004625	78004566	Y	PARD6G	PARD6G	NA	NA	NA	NA	PARD6G	829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	437457	437640	437549	Y	PALM,HCN2,FGF22,SHC2	SHC2,MADCAM1	NA	NA	NA	NA	SHC2	21356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	441805	442098	441996	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2,ODF3L2	SHC2,MADCAM1	NA	NA	NA	NA	SHC2	16898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	445179	445348	445264	Y	NA	SHC2,MADCAM1	NA	NA	NA	NA	SHC2	13648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34,GZMM	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	660293	660821	660540	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126	NA	NA	NA	NA	RNF126	456	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	934999	935434	935086	Y	MIDN,CIRBP	MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	11218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	2332363	2332647	2332580	Y	REXO1,CSNK1G2,MKNK2,GNG7,SPPL2B	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	5744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	2599036	2599584	2599134	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	101123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	2679436	2679769	2679633	Y	NA	GNG7,DIRAS1	NA	NA	NA	NA	GNG7	20938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	2888802	2889178	2888846	Y	NA	ZNF555,ZNF57	NA	NA	NA	NA	ZNF57	9718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77,TLE6	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	3358221	3358724	3358471	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	3684195	3684491	3684434	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	13986	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	4061604	4061945	4061775	Y	SEMA6B,PLIN5	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	4067781	4068111	4067963	Y	SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	4381377	4381710	4381643	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	16834	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	4837640	4837813	4837751	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1,PLIN3	NA	NA	NA	NA	TICAM1	7924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	5940860	5941142	5941001	Y	NA	FUT5,NDUFA11,VMAC,RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	35011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	5966194	5966581	5966386	Y	CAPS	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	9572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	5968660	5968756	5968716	Y	PSPN,SLC25A41,TMEM146,PRR22,NRTN,RFX2,ACSBG2	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	5989815	5989915	5989890	Y	SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	13662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	84805	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	6071128	6071397	6071200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	94975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	6238228	6238618	6238539	Y	RFX2	RFX2,MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	39341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	7266028	7266415	7266222	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	25630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	7559450	7559827	7559455	Y	NA	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	7665007	7665263	7665135	Y	INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543	CAMSAP3,XAB2,STXBP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP3	6219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	7701239	7701460	7701364	Y	NA	CAMSAP3,XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	STXBP2	1472	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr19	9402141	9402360	9402251	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	30088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	9747838	9748099	9747855	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	17763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	9748883	9749171	9749027	Y	OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	18808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	9757386	9757713	9757550	Y	NA	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	26063	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr19	9895815	9895899	9895870	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	40593	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	9919463	9919725	9919715	Y	ZNF846,FBXL12	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	16767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	NA	NA	NA	NA	NA	PIN1	112303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10304383	10304612	10304534	Y	TYK2,KRI1,ILF3	S1PR2,DNMT1	PPAN-P2RY11,EIF3G	MCF7	ChIA-PET	22265404	S1PR2	35336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10346765	10347120	10347031	Y	TYK2,S1PR5,S1PR5,DNM2,ATG4D,ZNF846,FBXL12,C19orf66,PPAN,ICAM3	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4	NA	NA	NA	NA	DNMT1	6803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10526573	10526793	10526623	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	14359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10534715	10535011	10534785	Y	C19orf66,ICAM1,ICAM3,S1PR5,S1PR5,DNM2,CDKN2D,CDKN2D,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	22501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10562469	10562629	10562543	Y	NA	KEAP1	NA	NA	NA	NA	KEAP1	49788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	10862011	10862152	10862080	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	35256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	10988040	10988081	10988060	Y	NA	TMED1,C19orf38,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	7851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12245844	12245929	12245887	Y	NA	ZNF788,ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136	NA	NA	NA	NA	ZNF20	3293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12261625	12261922	12261774	Y	NA	ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136,CTD-2666L21.1	NA	NA	NA	NA	ZNF625	3624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr19	12844296	12844608	12844453	Y	NA	FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1	NA	NA	NA	NA	C19orf43	707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	7.03669686420333
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13023589	13024232	13023881	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	HOOK2,DNASE2,GCDH,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	FARSA	18619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13095998	13096573	13096246	Y	ZNF490,ZNF791,TNPO2,TNPO2,MAST1	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	7849	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13133010	13133371	13133241	Y	FBXW9,NFIX	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	28588	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	13570149	13570399	13570274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC130	270175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13597293	13597592	13597549	Y	C19orf57,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC130	242982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13721187	13721366	13721219	Y	NA	NA	CACNA1A,MRI1,C19orf53,ZSWIM4,CCDC130	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	119208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13732373	13732509	13732441	Y	NA	NA	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	108065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13743837	13744244	13743993	Y	NA	NA	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	96330	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	17.1826318777058
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	13975574	13976059	13975671	Y	CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	38955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,C19orf67,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr19	14229419	14229865	14229637	Y	CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	C19orf67,SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	PRKACA	2523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	14480472	14481175	14480644	Y	ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	DDX39A	NA	NA	NA	NA	DDX39A	47017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	14789611	14789897	14789753	Y	OR7A17,OR1I1,SLC1A6	ZNF333	NA	NA	NA	NA	ZNF333	8716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NA	NA	NA	NA	NA	ILVBL	99498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	15492858	15492952	15492905	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	4249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	95558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	15974006	15974442	15974280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	69235	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	15975239	15975290	15975265	Y	OR10H2,OR10H3	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	68387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	16229373	16229857	16229589	Y	NA	RAB8A	NA	NA	NA	NA	RAB8A	8934	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	17131732	17132248	17131919	Y	NA	CPAMD8	NA	NA	NA	NA	CPAMD8	3377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18131070	18131394	18131314	Y	FCHO1,PDE4C,ARRDC2,MAST3	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	21129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	18395702	18395850	18395798	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	MIR3188	4815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr19	18498524	18498706	18498615	Y	ARRDC2,IFI30,JUND	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	18528819	18529396	18529072	Y	ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18589714	18590055	18589946	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,ELL,LRRC25	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	40882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18600936	18601077	18601043	Y	NA	ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	29860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18606803	18607671	18607185	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,KLHL26,ELL,LRRC25	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	23266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18625662	18626077	18625893	Y	UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL	ELL,FKBP8,KXD1	NA	NA	NA	NA	ELL	4860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18722417	18722765	18722581	Y	GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L	UBA52,C19orf60,TMEM59L,KLHL26	NA	NA	NA	NA	TMEM59L	6177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18740732	18741107	18740923	Y	NA	C19orf60,TMEM59L,KLHL26	NA	NA	NA	NA	KLHL26	4668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18810961	18811220	18811091	Y	NA	CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	18474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	18852715	18852875	18852814	Y	GDF1,GDF15	NA	NA	NA	NA	NA	CRTC1	60228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr19	19005223	19006062	19005586	Y	TMEM59L,KLHL26,CRTC1,SUGP2,SLC25A42,NCAN,HAPLN4,HOMER3,HOMER3,GDF1	GDF1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	CERS1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	19248225	19248392	19248286	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	19504149	19504345	19504247	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	9514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	19589693	19590012	19589853	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	34533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	19866097	19866485	19866349	Y	TSSK6	ZNF14	NA	NA	NA	NA	ZNF14	24191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	21497472	21497811	21497647	Y	ZNF430,ZNF429,ZNF100,ZNF708,ZNF493	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	12416	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	21511296	21511520	21511376	Y	NA	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	1069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P34	165441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	27739791	27740195	27739990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1962253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28165867	28166194	28166138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1536254	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28208615	28209033	28208726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1493415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28225401	28225557	28225460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1476891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28234930	28234990	28234960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1467458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28248561	28250861	28250165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1451587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	28914991	28915131	28915061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	787317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	29054828	29055190	29055009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	647258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	30195599	30196138	30195979	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	8226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	31618240	31618367	31618270	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	URI1	1205689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	32447611	32447906	32447759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	386594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	32866000	32866258	32866129	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	DPY19L3	28191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	33382845	33383180	33383014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP89	77717	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1599	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	34071655	34071900	34071798	Y	NA	CHST8	CHST8,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	CHST8	38961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	34746041	34746169	34746166	Y	KIAA0355	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	2599	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	35453242	35453666	35453504	Y	ZNF792	ZNF30,ZNF792,GRAMD1A	NA	NA	NA	NA	ZNF792	289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	35704787	35705279	35704999	Y	NA	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	31954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	35763394	35763606	35763496	Y	U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	5513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	36020756	36020837	36020796	Y	NA	DMKN,TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	13660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	36241217	36241384	36241301	Y	MAG,LRFN3	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,HSPB6,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	LIN37	3955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	36345881	36346198	36346012	Y	FFAR2,TYROBP,NFKBID	PRODH2,KIRREL2,APLP1,NPHS1,NFKBID,HCST	NA	NA	NA	NA	KIRREL2	1118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	36420868	36421156	36420949	Y	FFAR2,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP	NFKBID,HCST,LRFN3	NFKBID,HCST	MCF7	ChIA-PET	22265404	LRFN3	3104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	ZNF146	36980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	37942009	37942313	37942161	Y	ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569	ZNF570,ZNF569	NA	NA	NA	NA	ZNF570	14174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	ZNF570,ZNF569	NA	NA	NA	NA	ZNF570	3160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	38480533	38480757	38480643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	84665	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	38536828	38537171	38536963	Y	ZNF571,ZNF573	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	140960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	38717073	38717581	38717079	Y	NA	DPF1,SPINT2	NA	NA	NA	NA	DPF1	773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	YIF1B	14252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	38807798	38808031	38807971	Y	MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C	YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	KCNK6	453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	38917975	38918308	38918233	Y	LGALS7,RINL,MAP4K1	FAM98C	NA	NA	NA	NA	FAM98C	26200	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	39171828	39172087	39171896	Y	FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	35539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	39810585	39810976	39810672	Y	CLC,LRFN1	SAMD4B	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	20060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	39891902	39892845	39892340	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	2608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr19	40473949	40474218	40474067	Y	ZNF546,FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546	NA	NA	NA	NA	PSMC4	694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	41014841	41015014	41014895	Y	MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SPTBN4	44693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	41037324	41037469	41037389	Y	ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	43288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	41254580	41254859	41254762	Y	SHKBP1,ADCK4	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	SNRPA	38	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr19	41849661	41849907	41849784	Y	HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	TMEM91	4909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42440101	42440390	42440246	Y	ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	21152	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42493914	42494230	42494205	Y	TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	5419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	42654657	42654924	42654791	Y	TMEM145	POU2F2	NA	NA	NA	NA	CTC-378H22.2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	CTC-378H22.2,POU2F2,DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	POU2F2	5462	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	42711906	42712521	42712423	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2	POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	9771	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42756581	42756634	42756608	Y	ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.27288226242015
chr19	42789863	42790090	42789919	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	14160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	42913594	42913985	42913852	Y	NA	CNFN	NA	NA	NA	NA	CNFN	21155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	42924318	42924497	42924408	Y	NA	CNFN	NA	NA	NA	NA	CNFN	31879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	44138598	44138945	44138732	Y	ZNF575,ZNF284,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,LOC390940,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4	NA	NA	NA	NA	CADM4	3046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	44616064	44616441	44616271	Y	KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284	ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234	NA	NA	NA	NA	ZNF225	1730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	44824668	44825027	44825022	Y	NA	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	17469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	45427550	45427884	45427705	Y	IGSF23,APOE,APOC1,APOC4,APOC2	TOMM40,APOE,APOC1,APOC2,CLPTM1	NA	NA	NA	NA	APOC1	12046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	45604142	45604476	45604278	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	11488	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	45616872	45617353	45617125	Y	NA	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	24218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	CKM	68046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	46104301	46104701	46104603	Y	NOVA2,GPR4	GPR4,OPA3,EML2	NA	NA	NA	NA	OPA3	831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	46379598	46379943	46379895	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	7433	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	46385401	46385465	46385433	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr19	47324064	47324441	47324224	Y	NA	SLC1A5,AP2S1	NA	NA	NA	NA	AP2S1	27808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	AP2S1	95991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47487878	47488175	47487946	Y	ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM160	61713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47613894	47614902	47614503	Y	PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47689758	47690163	47690151	Y	GLTSCR1,BBC3	BBC3	NA	NA	NA	NA	BBC3	43860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	47826848	47827155	47827019	Y	ZC3H4,ZNF541,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	23383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47926520	47926706	47926665	Y	NA	MEIS3,SLC8A2	NA	NA	NA	NA	MEIS3	5740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	22869	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	47961170	47962467	47962382	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	10958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	SLC8A2,KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	48016569	48017036	48016994	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA	SLC8A2,KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	72	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	48017457	48017515	48017486	Y	NA	SLC8A2,KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	49386525	49386775	49386581	Y	CD37,PPP1R15A	HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1,DHDH	NA	NA	NA	NA	PPP1R15A	12876	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr19	49486890	49487028	49486959	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	7539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	26338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	49710890	49711280	49711224	Y	IZUMO1,PPP1R15A,RPS11,FCGRT,CD37	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM4	51892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	50417620	50417965	50417778	Y	NA	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	11994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50825197	50825861	50825498	Y	NA	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50835103	50835475	50835356	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	KCNC3	331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50835948	50836015	50835982	Y	IL4I1,NR1H2,KCNC3	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	KCNC3	1176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50990086	50990332	50990328	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	12076	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr19	51003635	51004295	51004006	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	8315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	51774338	51774710	51774481	Y	NA	CD33	NA	NA	NA	NA	CD33	48018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	52227755	52228377	52227966	Y	HAS1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	33716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	52674093	52674226	52674127	Y	ZNF836	ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF836	1197	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	53128477	53128840	53128754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	53635063	53635358	53635174	Y	ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347	ZNF160,ZNF415,ZNF347	NA	NA	NA	NA	ZNF415	733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	54145720	54146081	54145890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC008753.3	130772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	54355100	54355465	54355199	Y	VSTM1,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,PRKCG	CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7	HELA,K562,H1ESC,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	MYADM	12012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,PRKCG	NA	NA	NA	NA	MYADM	6258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	54707641	54707712	54707644	Y	NA	LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	5031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr19	54713468	54714085	54713942	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	10858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr19	55619280	55619321	55619308	Y	NA	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	7606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	55721470	55721547	55721521	Y	NA	SYT5,TMEM86B,PPP6R1	NA	NA	NA	NA	TMEM86B	18100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	TMEM238	12795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr19	55937400	55937853	55937600	Y	SYT5,BRSK1,SHISA7	TMEM238,RPL28,UBE2S,ISOC2,ZNF628	NA	NA	NA	NA	UBE2S	20255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	56098668	56099098	56098905	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	8457	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	56673673	56673939	56673846	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	31705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	56674605	56674737	56674681	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	32637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	66232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	56811653	56811926	56811777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	65542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	57965552	57965851	57965609	Y	NA	ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF749	20855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr19	58217187	58217439	58217313	Y	NA	ZNF551,ZNF671,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF671	19553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF671,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF671	765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	58501905	58502197	58501915	Y	ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135	ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	CTD-2368P22.1	9232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	19719	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr19	58824678	58824957	58824818	Y	ZNF256	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497	NA	NA	NA	NA	ERVK3-1	9963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.76381460178318
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	MGC2752	3527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	932598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	3352595	3352738	3352719	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	26915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	3699787	3700199	3700016	Y	NA	ALLC	NA	NA	NA	NA	ALLC	3586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	6903255	6903557	6903407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAD2	100380	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	6912526	6912690	6912595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAD2	91247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	7571177	7571382	7571249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	515654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	8295099	8295585	8295262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00299	226166	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	8369680	8369964	8369925	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00299	151787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	8597253	8597584	8597383	Y	KIDINS220	NA	LOC100506274,LINC00299,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00299	75502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	8607846	8607981	8607914	Y	NA	NA	LINC00299,LOC100506274,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00299	86095	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	8610036	8610282	8610139	Y	NA	NA	LINC00299,LOC100506274,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00299	88285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	8621577	8621887	8621772	Y	NA	NA	LOC100506274,LOC339788,LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00299	99826	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	8712183	8712281	8712245	Y	NA	AC011747.4	LINC00299,LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011747.4	9641	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	8927568	8927875	8927735	Y	NA	KIDINS220	NA	NA	NA	NA	KIDINS220	47885	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	9427289	9427526	9427454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	10441145	10441558	10441458	Y	KLF11	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	10522808	10523000	10522904	Y	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ODC1	63630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	11443913	11444199	11444137	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	42257	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	11483029	11483376	11483266	Y	NA	ROCK2,AC099344.2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	3080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	12538008	12538228	12538087	Y	TRIB2	NA	LPIN1,LOC100506474,TRIB2,MIR4262	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	316787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	13447993	13448374	13448173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	592978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	15629690	15629929	15629800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	69525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	16575995	16576348	16576051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	269251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	16789989	16790292	16790153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	55307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	16834406	16834473	16834440	Y	NA	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	11126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	16835049	16835704	16835307	Y	FAM49A	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	9895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	16835834	16836491	16836452	Y	FAM49A	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	9108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	17129381	17129602	17129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	283782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	19150904	19151018	19150988	Y	NA	NA	MIR4757,OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	410958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	23743180	23743526	23743353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	137092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	24234264	24234694	24234378	Y	MFSD2B	MFSD2B,C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	MFSD2B	3313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	24324329	24324521	24324426	Y	NA	SF3B14,TP53I3,PFN4	NA	NA	NA	NA	TP53I3	17598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89641	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	24495048	24495317	24495183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	86266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA1	139264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	24941895	24942247	24942153	Y	NCOA1	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	71758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	25352140	25352468	25352150	Y	DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3B	89141	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	124324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	25517596	25517908	25517752	Y	DNAJC27,DNMT3A	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	45551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	25545894	25546051	25546003	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	17408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	25784383	25784764	25784574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	109739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	26291590	26291772	26291648	Y	FAM59B,RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	36614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	26328559	26328812	26328686	Y	FAM59B,RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	73583	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	28018603	28018692	28018648	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	26019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	28085867	28086253	28086060	Y	NA	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	BRE	24555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	28124092	28124474	28124302	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	12127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	28134368	28134411	28134390	Y	NA	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	22403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	28856660	28856889	28856764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	115617	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	28939068	28939564	28939261	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	32942	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	29055098	29055343	29055221	Y	SPDYA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	35824	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	30644745	30644849	30644777	Y	NA	LCLAT1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	23243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	30788740	30788786	30788763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	120648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	139720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37576725	37576898	37576775	Y	STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT	PRKD3,QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	7008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	61767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37827811	37828357	37828118	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	AC006369.2	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	2532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37843563	37844180	37844009	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	AC006369.2	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC006369.2	18284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37844190	37844662	37844373	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	AC006369.2	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC006369.2	18911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37845314	37845753	37845669	Y	NA	AC006369.2	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC006369.2	20035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37852383	37852553	37852466	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	AC006369.2	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	27104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37853380	37853621	37853410	Y	EIF2AK2,EIF2AK2	AC006369.2	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	28101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.10923814929915
chr2	37856694	37857004	37856833	Y	NA	AC006369.2	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	31415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	AC006369.2	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	33042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr2	37868257	37868517	37868387	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	AC006369.2	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	42978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	55615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	37881606	37881960	37881783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	56327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	58743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	37893644	37893973	37893812	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	AC006369.2	68365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	38212559	38212760	38212660	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	243950	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	38552581	38552739	38552658	Y	NA	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	49688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	38701036	38701355	38701264	Y	NA	RPLP0P6	ATL2,GALM,CYP1B1,SRSF7,HNRPLL	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP0P6	5565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	38840461	38840529	38840511	Y	GALM	NA	GALM,HNRPLL,ATL2,SRSF7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GALM	50523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	38949741	38950194	38950072	Y	HNRPLL,SRSF7	SRSF7,GEMIN6	NA	NA	NA	NA	SRSF7	26442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	39078847	39079086	39078967	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	39340813	39341200	39341198	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	8286	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	40328052	40328434	40328415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	323645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	41997270	41997551	41997541	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	275609	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	42329971	42330163	42329978	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	56811	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	42332532	42332812	42332662	Y	EML4	NA	EML4,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	59372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	42412542	42412681	42412587	Y	NA	EML4	NA	NA	NA	NA	EML4	18052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	42869718	42869759	42869739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC025750.7	111136	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	20896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	43151826	43152270	43152066	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	134093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	43153788	43153898	43153799	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	136055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	43205442	43205824	43205685	Y	MTA3,HAAO	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	187709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	43206770	43207218	43206984	Y	HAAO	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	189037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	43527782	43528145	43528003	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	76034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	43942410	43942694	43942547	Y	PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	56484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	44577605	44577885	44577745	Y	NA	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	9116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	44805618	44805736	44805677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	218529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	44935582	44935781	44935667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	228557	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	45160746	45160936	45160765	Y	SIX3	RP11-89K21.1,SIX3	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	3402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	45177079	45177275	45177123	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3,AC012354.8	NA	NA	NA	NA	SIX3	10177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	45968952	45969144	45969027	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	92468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	46212455	46212485	46212471	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	306321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	46784048	46784469	46784214	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	16352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	AC106869.2	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC106869.2	48773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	48696599	48696946	48696773	Y	NA	PPP1R21	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	30862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	423074	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	50701819	50701837	50701828	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	352979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	50777651	50777841	50777746	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	276975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	50951878	50951957	50951935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	102859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	54270419	54270555	54270547	Y	GPR75,ACYP2	NA	SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	74442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	54330282	54330384	54330333	Y	NA	NA	SPTBN1,RTN4,EML6,ACYP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSME4	134305	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	131636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	54971761	54972012	54971777	Y	NA	EML6	NA	NA	NA	NA	EML6	23125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	55346891	55347057	55346962	Y	NA	RTN4	RTN4,EML6,C2orf63	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	9134	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	55364745	55365096	55365046	Y	NA	RTN4	RTN4,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	26988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	55558772	55559057	55558882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIF2	64289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	56276359	56276680	56276532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	127085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	57707334	57707464	57707399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	425322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	57717910	57718134	57718035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	414652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	57861899	57862248	57862095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	270538	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	58266393	58266527	58266430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	133607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	60133192	60133207	60133200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	476533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	60696747	60696946	60696847	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	81756	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	60757053	60757301	60757153	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	21401	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	60795566	60795727	60795647	Y	KIAA1841,KIAA1841,BCL11A	BCL11A	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	BCL11A	16864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	60889987	60890156	60890096	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	91209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61034167	61034304	61034235	Y	REL,PAPOLG	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	52802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	28925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61385752	61386084	61385930	Y	REL	C2orf74,AHSA2	NA	NA	NA	NA	C2orf74	15509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61935190	61935438	61935314	Y	NA	NA	USP34,XPO1,FAM161A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM161A	143840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr2	62386116	62386510	62386313	Y	NA	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	34738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	63122149	63122353	63122251	Y	EHBP1,EHBP1,OTX1	NA	NA	NA	NA	NA	AC009501.4	151422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	63514058	63514136	63514097	Y	WDPCP	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	238866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	64175541	64175571	64175556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS54	68635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	64367846	64368162	64368149	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	64439546	64439941	64439735	Y	SERTAD2,AFTPH,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	PELI1	69958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	64821728	64822106	64821796	Y	SLC1A4,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	72263	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	65146455	65146831	65146643	Y	RAB1A,ACTR2,SLC1A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	66780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	65440417	65440444	65440431	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	LOC400958,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007318.5	10280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	66673073	66673647	66673570	Y	NA	MEIS1,MEIS1-AS3	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	14471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	66721852	66722243	66721943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	63250	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	143297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	67486839	67487275	67486977	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	135176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	67908840	67908848	67908844	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	286389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	68994240	68994671	68994448	Y	FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	APLF	301547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	69857892	69858266	69858093	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	11291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	70154281	70154743	70154417	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	31461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2,ATP6V1B1	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	678454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	634159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	72426245	72426403	72426323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	624767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	72789461	72789923	72789792	Y	EXOC6B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	261247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	74237302	74237493	74237398	Y	NA	DGUOK-AS1,AC073046.25,TET3	DGUOK	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	9462	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	74258403	74258434	74258418	Y	NA	AC073046.25,TET3	DGUOK,STAMBP,ACTG2,TET3,BOLA3,BOLA3-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	30563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	74297420	74297667	74297536	Y	MOBKL1B	FNBP1P1	NA	NA	NA	NA	FNBP1P1	48140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	75076703	75076941	75076867	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	17595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	78055629	78055831	78055731	Y	NA	AC105399.2	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	42121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	78328146	78328439	78328293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	314638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	78386991	78387304	78387148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	373483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	78401270	78401306	78401289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	387762	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	78464924	78465229	78465077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	451416	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	78525487	78525634	78525561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	511979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	78631329	78631672	78631604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	617821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	85186958	85187334	85187145	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	8882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	85505021	85505175	85505098	Y	TMSB10,TMEM150A,ATOH8	TGOLN2	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	48373	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	85567649	85568034	85567918	Y	NA	TGOLN2,ELMOD3,RETSAT	TGOLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELMOD3	11483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	85673142	85673285	85673214	Y	NA	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	29587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	85943878	85943960	85943919	Y	SH2D6	RNU1-38P	ATOH8	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	9500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	86102907	86103036	86102912	Y	NA	ST3GAL5	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	11101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	86132237	86133031	86132663	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	18100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	86262586	86262681	86262652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	68597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	86262986	86263343	86263241	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	67935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	86299445	86299644	86299569	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	31634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	88899554	88899981	88899832	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	25113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	90485310	90485405	90485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	1496148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	91845288	91845519	91845445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2856126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	DUSP2	NA	NA	NA	NA	DUSP2	26308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	FER1L5,KANSL3	NA	NA	NA	NA	FER1L5	14466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	88784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	98389575	98389609	98389594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	110381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	98598628	98598759	98598694	Y	NA	TMEM131	NA	NA	NA	NA	TMEM131	11629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWA3B	121353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	99085276	99085461	99085369	Y	NA	INPP4A	COA5,UNC50	IMR90	Hi-C	24141950	INPP4A	25959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	99268200	99268767	99268592	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	45158	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	99318923	99319110	99319017	Y	NA	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	26479	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	99723014	99723348	99723222	Y	TSGA10	C2orf15,LIPT1,TSGA10	NA	NA	NA	NA	C2orf15	32600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	100124156	100124186	100124170	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	19659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	101884483	101884674	101884578	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	TBC1D8,SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	SNORD89	2837	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	102241918	102242303	102242103	Y	RNF149,IL1R2,MAP4K4,MAP4K4	NA	RFX8,MAP4K4,CREG2	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K4	69009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	102380179	102380656	102380455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	68867	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	102399741	102400097	102399970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	88429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	102492851	102493221	102493042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	181539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	102699368	102699976	102699672	Y	IL1R1,MAP4K4,MAP4K4	IL1R1	IL1R2,IL1RL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	20364	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105430210	105430587	105430504	Y	NA	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	37054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105461382	105461873	105461636	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01158	5768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr2	105466558	105467231	105466773	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01158	410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105477972	105479094	105478260	Y	NA	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01159	7959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105479098	105479298	105479181	Y	NA	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01159	7755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105479896	105480034	105479980	Y	NA	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01159	7019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105489803	105490153	105490078	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01159	2750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105676474	105676490	105676482	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	24033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	105868744	105869077	105868909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBRAP1	75414	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105913488	105913594	105913541	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	TGFBRAP1	30897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	106372489	106372812	106372543	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	13135	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	106412674	106413002	106412675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	53320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	106415106	106415442	106415380	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	55752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	106416912	106417146	106416970	Y	C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	57558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	106417583	106417937	106417755	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	58229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	106480374	106480732	106480408	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	121020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	106484597	106484940	106484748	Y	UXS1	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	125243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	106809174	106809856	106809272	Y	UXS1	UXS1	NA	NA	NA	NA	UXS1	379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	109201604	109202307	109201998	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	52747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	109228635	109228941	109228810	Y	GCC2,RANBP2,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	79778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	109790230	109790424	109790331	Y	SH3RF3	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	46426	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	109864376	109864774	109864388	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	120572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	109883526	109883741	109883650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	139722	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	110016494	110016637	110016500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	272690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	113341105	113341247	113341152	Y	POLR1B	POLR1B,CHCHD5,AC079922.2	NA	NA	NA	NA	CHCHD5	1288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	113448371	113448563	113448450	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC20A1	46937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	47169	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	113562551	113562581	113562567	Y	IL1A	CKAP2L	CKAP2L	IMR90	Hi-C	24141950	CKAP2L	42297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	113582240	113582548	113582356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	61986	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	113845910	113846038	113845919	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	121061	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	114126317	114126521	114126419	Y	IL1F10,IL1F10	NA	PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	159218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	115201274	115201661	115201437	Y	DPP10	DPP10	NA	NA	NA	NA	DPP10	3398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	115944602	115944633	115944617	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	27682	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	116027974	116028021	116027995	Y	DPP10,DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	111054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	116360896	116361163	116361028	Y	DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	443976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	118578074	118578451	118578195	Y	CCDC93,DDX18	DDX18	NA	NA	NA	NA	DDX18	7848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	118722673	118722961	118722817	Y	NA	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	46748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	120891923	120892273	120892121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	86711	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	121040381	121040601	121040491	Y	NA	RALB	NA	NA	NA	NA	RALB	44741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	122297511	122297730	122297621	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	11054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	122313325	122313599	122313462	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	26868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	122405703	122406017	122405860	Y	NA	CLASP1,NIFK-AS1	NA	NA	NA	NA	NIFK-AS1	477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	125531573	125531803	125531688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP2	1781936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	127819018	127819251	127819149	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	43680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	BIN1	52473	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	128136277	128136580	128136554	Y	NA	MAP3K2,PROC	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	7461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	PROC	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	PROC	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	131110123	131110429	131110276	Y	NA	IMP4,CCDC115,PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	1151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	131483096	131483424	131483352	Y	FAM123C	AC140481.8	NA	NA	NA	NA	AC140481.8	28028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	AC140481.8	NA	NA	NA	NA	AC140481.8	25919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	AC140481.8	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC140481.8	44140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	132182653	132182963	132182773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2A	65353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	137139482	137140258	137140029	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	265747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	139289140	139289372	139289256	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	31769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	139342135	139342417	139342276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	84764	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	140977991	140978216	140978106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	1720620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	142789500	142789791	142789646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	97479	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	743512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	143962821	143963156	143962989	Y	ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1075551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	145171988	145172585	145172261	Y	GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	83853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	145215157	145215664	145215657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	64483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	148279824	148280174	148279855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	319912	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	148389005	148389228	148389160	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	210858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	149527542	149527937	149527740	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	102882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	149633974	149634183	149633979	Y	NA	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	3155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	149634441	149634782	149634502	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	3622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	149645940	149646152	149646140	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	15121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	149819679	149819759	149819686	Y	KIF5C	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	188860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	150314581	150314916	150314749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144449.1	126794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	150470264	150470563	150470414	Y	NA	AC144449.1,MMADHC	RND3,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	MMADHC	27934	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	152356804	152357129	152357077	Y	NEB	NA	NA	NA	NA	NA	RIF1	92407	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	153319384	153319598	153319488	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	129633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	153354098	153354480	153354204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	164347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	153568262	153568351	153568307	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	4056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	154335936	154336181	154336134	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	2614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	154379200	154379581	154379374	Y	NA	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	45878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	154442869	154442990	154442930	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	4811	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	154446220	154446391	154446306	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	1410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	154448468	154448804	154448636	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	154729073	154729474	154729153	Y	NA	GALNT13	NA	NA	NA	NA	GALNT13	2647	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	154903292	154903466	154903385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT13	176866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	155556801	155556983	155556830	Y	NA	KCNJ3	NA	NA	NA	NA	KCNJ3	3990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr2	155558133	155558529	155558331	Y	KCNJ3	KCNJ3	NA	NA	NA	NA	KCNJ3	5322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	155569761	155570004	155569789	Y	NA	KCNJ3	NA	NA	NA	NA	KCNJ3	16950	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	155717139	155717166	155717153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ3	164328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	156219806	156220106	156219936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ3	666995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	156949297	156949674	156949418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	247186	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr2	158323410	158323576	158323494	Y	ACVR1C,CYTIP	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1C	159941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	158658740	158658947	158658861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	71427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	158712267	158712700	158712451	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	17674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	160106082	160106269	160106215	Y	MARCH7	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	35041	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	160491864	160492115	160492090	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	BAZ2B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAZ2B	20661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	160752173	160752279	160752226	Y	LY75	NA	NA	NA	NA	NA	CD302	99420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	161924330	161924566	161924395	Y	TANK	NA	RBMS1,ITGB6	IMR90	Hi-C	24141950	TANK	66853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	162094289	162094955	162094372	Y	NA	AC009299.3	NA	NA	NA	NA	AC009299.3	4295	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	AC009299.3	NA	NA	NA	NA	AC009299.3	3839	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	162817649	162818074	162817753	Y	IFIH1	NA	NA	NA	NA	NA	DPP4	110978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	163222658	163222682	163222670	Y	GCA	IFIH1,GCA	NA	NA	NA	NA	GCA	49308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	163222961	163223077	163223019	Y	KCNH7,GCA	IFIH1,GCA	NA	NA	NA	NA	GCA	49611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	163376672	163376691	163376681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	203322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	163477809	163478160	163477991	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH7	215080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	163578974	163579343	163579088	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH7	113897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	163695900	163696326	163696258	Y	NA	KCNH7	NA	NA	NA	NA	KCNH7	2660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	164553215	164553632	164553445	Y	NA	FIGN	NA	NA	NA	NA	FIGN	36890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	165640958	165641192	165641060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC019181.2	54067	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	165766653	165766876	165766835	Y	SLC38A11,COBLL1	SLC38A11	NA	NA	NA	NA	SLC38A11	43159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	165777057	165777208	165777083	Y	NA	SLC38A11	NA	NA	NA	NA	SLC38A11	32827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	166534089	166534369	166534230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP3	209932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	166555238	166555468	166555315	Y	CSRNP3	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP3	231081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	166705742	166705996	166705870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	102357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	168150182	168150557	168150197	Y	NA	AC074363.1	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	2501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	168263159	168263570	168263327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	115478	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr2	168291941	168292335	168292012	Y	B3GALT1	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	144260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	168633177	168633438	168633308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	469213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	169203110	169203445	169203278	Y	NA	NA	ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402	IMR90,Islet	Hi-C,4C	24141950,24413736	STK39	100459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	169347640	169347834	169347737	Y	NA	CERS6	NA	NA	NA	NA	CERS6	37268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	169434382	169434732	169434541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	124010	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	170777121	170777463	170777246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	95153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	170856738	170857087	170856755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	174770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	171997679	171997950	171997833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	87874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	172693152	172693396	172693274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAT1	83562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	172961678	172962145	172962061	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	3483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	172962291	172962684	172962615	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	2944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	173826948	173827225	173827025	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	228946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	173876038	173876102	173876070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	278036	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	174776201	174776462	174776332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	51968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	174886492	174886884	174886848	Y	SP3	NA	CIR1,SP3,ZAK,OLA1	IMR90	Hi-C	24141950	SP3	58062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	73342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	81223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	175753579	175753941	175753870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHN1	114156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHN1	105750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	176608884	176609040	176608962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	256527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD13,HOXD11,HOXD10	NA	NA	NA	NA	HOXD10	1222	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	177047108	177047317	177047213	Y	NA	HOXD1,HOXD-AS1,AC016739.2	NA	NA	NA	NA	HOXD1	3990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	177861889	177862194	177862097	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA3	213097	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	179056084	179056225	179056143	Y	NA	OSBPL6	MIR548N	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL6	983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	180044911	180045098	180045020	Y	SESTD1	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	82419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	180123713	180123938	180123827	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	3579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	180871045	180871158	180871103	Y	NA	CWC22	NA	NA	NA	NA	CWC22	1205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	182418889	182419281	182419085	Y	NEUROD1,CERKL	NA	NA	NA	NA	NA	CERKL	124111	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	183876955	183877317	183877185	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	24269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	184619513	184619865	184619689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBPP2	148666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	185522686	185523010	185522766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	61593	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	185595976	185596316	185596146	Y	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	134883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	186616540	186616923	186616825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	731960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	186638782	186639016	186638929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	709867	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	186645587	186645801	186645694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	703082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	186832070	186832214	186832142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	516669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	188326523	188326725	188326579	Y	NA	CALCRL	NA	NA	NA	NA	CALCRL	15336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	189391407	189391613	189391501	Y	GULP1	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	237011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	190235497	190235832	190235693	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	68327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	12229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	190741113	190741271	190741187	Y	NA	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	1064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr2	191217459	191217900	191217739	Y	NA	INPP1,HIBCH	NA	NA	NA	NA	HIBCH	10540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191377806	191377826	191377816	Y	NA	TMEM194B	NA	NA	NA	NA	TMEM194B	19622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191416774	191417126	191416837	Y	MFSD6,TMEM194B	TMEM194B	NA	NA	NA	NA	TMEM194B	19326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191540578	191540944	191540683	Y	NA	NAB1	NA	NA	NA	NA	NAB1	31106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191660541	191660565	191660553	Y	NA	NA	STAT1,MFSD6,GLS,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	GLS	82988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	191826753	191827142	191827070	Y	NA	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	29151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	100900	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	192082382	192082563	192082473	Y	MYO1B,MYO1B	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	25348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	192084344	192084437	192084391	Y	NA	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	23474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	192112527	192112680	192112632	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	4616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	209084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	206332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	192882025	192882303	192882164	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	172044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	192889960	192890123	192890039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	168312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	194212584	194212652	194212618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1154149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	196919358	196919780	196919466	Y	NA	DNAH7	NA	NA	NA	NA	DNAH7	11756	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	197004793	197005261	197004933	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	33966	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	197195800	197196140	197196081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	156573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	197420372	197420700	197420626	Y	NA	HECW2	NA	NA	NA	NA	HECW2	35716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	197934773	197935033	197934860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	144253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	197974548	197974560	197974555	Y	ANKRD44	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	151275	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	198081229	198081750	198081370	Y	MARS2,HSPD1,HSPD1	ATP5G2P3	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	44085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	198144443	198144693	198144592	Y	NA	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	18608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	198224203	198224295	198224249	Y	NA	NA	PGAP1,ANKRD44	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD44	50306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	198525365	198525756	198525561	Y	NA	RFTN2,MARS2	NA	NA	NA	NA	RFTN2	13013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	198702876	198702992	198702942	Y	NA	PLCL1	NA	NA	NA	NA	PLCL1	35450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	198712532	198712968	198712610	Y	SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,PLCL1	PLCL1	NA	NA	NA	NA	PLCL1	45106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	198782595	198782956	198782734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL1	115169	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	198813030	198813252	198813074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL1	145604	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	198834136	198834535	198834225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL1	166710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	200209653	200209909	200209897	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	110514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	200270966	200271332	200271300	Y	NA	SATB2-AS1	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	49091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	200579268	200579381	200579325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	134515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	200850363	200850607	200850485	Y	NA	C2orf47,TYW5	SPATS2L,KCTD18	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TYW5	31904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	200912605	200912617	200912611	Y	NA	NA	SPATS2L,KCTD18	IMR90	Hi-C	24141950	TYW5	94146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	201238754	201239056	201238905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	70150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	201262818	201262970	201262894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	94214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	201273148	201273356	201273255	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	99375	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	201289842	201289940	201289893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	82791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	201397001	201397079	201397012	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	14494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	202204679	202205066	202204873	Y	NA	STRADB	NA	NA	NA	NA	STRADB	45515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	202302698	202302857	202302778	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR	TRAK2	NA	NA	NA	NA	TRAK2	11445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	203231501	203231745	203231624	Y	NA	BMPR2	BMPR2,NOP58	IMR90	Hi-C	24141950	BMPR2	7914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	203292079	203292309	203292231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	52420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	203503987	203504299	203504102	Y	NOP58,ALS2CR8,ALS2CR8,FAM117B	FAM117B	NA	NA	NA	NA	FAM117B	6086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	203520524	203520862	203520558	Y	NA	FAM117B	NA	NA	NA	NA	FAM117B	22623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	204288063	204288423	204288243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABI2	97121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	204393119	204393487	204393303	Y	NA	RAPH1	NA	NA	NA	NA	RAPH1	4646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	204676480	204676691	204676598	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	278347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	205530118	205530314	205530216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	121602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	205595294	205595620	205595457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	186778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	206564438	206564682	206564481	Y	INO80D,NRP2	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	19724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	206935678	206936046	206935862	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	11283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS1	54126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	208883092	208883191	208883110	Y	PTH2R,C2orf80	PLEKHM3	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	5093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	210442932	210443275	210443104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	156150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	210547424	210547820	210547680	Y	MAP2,MAP2,UNC80	NA	NA	NA	NA	NA	UNC80	86897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	211032670	211033036	211032982	Y	NA	AC006994.2	NA	NA	NA	NA	AC006994.2	1206	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	213697090	213697822	213697143	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	ERBB4	295525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216216233	216216482	216216439	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	41693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216222058	216222324	216222191	Y	FN1	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	47518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216483720	216484034	216483877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	184744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216576202	216576464	216576327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	277226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216589057	216589191	216589146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	290081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216698635	216698894	216698754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	197925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	216710914	216711300	216711110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	185519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	216867934	216868318	216868147	Y	TMEM169	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	28501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	216880783	216881070	216880972	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	15749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	216948718	216948931	216948849	Y	NA	TMEM169,PECR,XRCC5	NA	NA	NA	NA	PECR	3040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	217106974	217107312	217107143	Y	TMEM169	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH4	127438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	19685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	217487227	217487455	217487235	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	DIRC3,IGFBP2,XRCC5,RPL37A,IGFBP5,RUFY4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP2	8096	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	217501395	217501614	217501574	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	5844	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	AC007563.5	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	AC007563.5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	217561099	217561345	217561263	Y	NA	AC007563.5,IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	2851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	217639400	217639563	217639456	Y	NA	NA	DIRC3,TNS1,IGFBP5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP5	81152	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	217639856	217640183	217640035	Y	NA	NA	DIRC3,TNS1,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	81608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	217725896	217726248	217726076	Y	NA	TNP1,AC007557.1	NA	NA	NA	NA	TNP1	3109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	217797120	217797464	217797294	Y	NA	NA	DIRC3,TNP1,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	AC007557.1	63625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	217876929	217877326	217877128	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC007557.1	143434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	218017889	218017912	218017895	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	AC007557.1	284394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	218038981	218039219	218039100	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AC007557.1	305486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	218767248	218767888	218767577	Y	TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	97830	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	VIL1	9441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	219648056	219648806	219648528	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,TTLL4,CYP27A1	CYP27A1	NA	NA	NA	NA	CYP27A1	3584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	219819543	219819875	219819831	Y	RESP18,PTPRN,PTPRN,DNAJB2,CDK5R2,CCDC108	CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4	CDK5R2,NHEJ1,TTLL4,WNT6,WNT10A	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5R2	2502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	5566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.60017048866217
chr2	219844869	219844996	219844902	Y	NA	CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	CRYBA2	11147	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr2	219862366	219862575	219862480	Y	FEV	CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4,CCDC108	NA	NA	NA	NA	AC097468.4	2362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	219972742	219972853	219972823	Y	NA	IHH	LOC100129175,CRYBA2,CCDC108,LOC151300,FEV,MIR375,IHH	IMR90	Hi-C	24141950	IHH	49553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	220374836	220375176	220374958	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF	NA	NA	NA	NA	GMPPA	13247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	221802042	221802413	221802264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	634509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	222242662	222242904	222242783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	194018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	223757137	223757389	223757313	Y	NA	ACSL3	NA	NA	NA	NA	ACSL3	33485	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	223776983	223777159	223777060	Y	SGPP2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	53331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	223823432	223823602	223823532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE4	90930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	223922386	223922775	223922580	Y	KCNE4	KCNE4	NA	NA	NA	NA	KCNE4	7854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	224334117	224334308	224334166	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	130913	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCG2	50939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr2	224428219	224428432	224428353	Y	NA	SCG2	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	36789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	224761528	224761781	224761678	Y	WDFY1	WDFY1	NA	NA	NA	NA	WDFY1	46323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	227331006	227331180	227331162	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	331295	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	229407284	229407450	229407381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	726551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	229887916	229887920	229887918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	246081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	229940536	229940917	229940727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	193084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	230008208	230008295	230008257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	125706	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	230133790	230134515	230134391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	230274489	230274615	230274507	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	140488	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	231636017	231636396	231636213	Y	NA	BANF1P3	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	47899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	231815227	231815438	231815333	Y	NA	NA	ITM2C,LOC151484,GPR55,LOC348761,SPATA3,CAB39,C2orf72	IMR90	Hi-C	24141950	C2orf72	84767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	232176481	232176522	232176502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	81732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	232479434	232479727	232479552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	89878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	232505425	232505799	232505482	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	63806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	232840477	232840577	232840527	Y	DIS3L2	DIS3L2	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	16522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A1	36081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	235231865	235232186	235231915	Y	ARL4C	NA	SPP2,ARL4C,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	171511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	235400661	235400783	235400733	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	2914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	235702224	235702360	235702292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	156257	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	672359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	237341356	237341565	237341461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	650390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	508840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	238016795	238017153	238016975	Y	NA	COPS8,AC105760.2	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	24335	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	238036930	238037258	238037105	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	44470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	238187174	238187402	238187364	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	194714	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr2	238578306	238578453	238578407	Y	COL6A3	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	44087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	238578518	238578831	238578655	Y	COL6A3	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	44299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	238609405	238609661	238609494	Y	MLPH,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	75186	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	238779455	238779579	238779499	Y	RAMP1	RAMP1	NA	NA	NA	NA	RAMP1	13919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	238832423	238832667	238832502	Y	NA	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	40802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	239034841	239035063	239035020	Y	LRRFIP1,KLHL30	ESPNL,FAM132B	NA	NA	NA	NA	ESPNL	28043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	239080379	239080669	239080523	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14756	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	239085902	239086198	239086162	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	20279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	239108088	239108227	239108158	Y	ILKAP	FAM132B,ILKAP,HES6	NA	NA	NA	NA	ILKAP	2143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	239129575	239129683	239129630	Y	NA	ILKAP,HES6	NA	NA	NA	NA	HES6	17620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	239762168	239762270	239762219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASB1	428785	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr2	240134215	240134581	240134421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	186549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	240199614	240199929	240199643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	121201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	240207243	240207370	240207354	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	113760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	240213505	240213689	240213606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	107441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	240249100	240249193	240249159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	71937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	240361184	240361566	240361235	Y	NA	AC062017.1,HDAC4	HDAC4,NDUFA10	IMR90	Hi-C	24141950	HDAC4	39836	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	240920223	240920529	240920311	Y	NA	NDUFA10	NA	NA	NA	NA	NDUFA10	42290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	241585712	241586190	241585819	Y	DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN10	61579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr2	241719064	241719393	241719333	Y	KIF1A	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	38332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr2	241771658	241772038	241771862	Y	KIF1A	KIF1A,AGXT	ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7	IMR90	Hi-C	24141950	KIF1A	13933	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	241845496	241845803	241845554	Y	NA	AGXT	LOC200772,SNED1,MTERFD2	IMR90	Hi-C	24141950	AGXT	39600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	AC005237.4,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr2	242710043	242710405	242710079	Y	NA	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	38049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr2	242714145	242714474	242714395	Y	NEU4,D2HGDH,GAL3ST2	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	42151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	321375	321752	321587	Y	NA	ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3	NA	NA	NA	NA	NRSN2	3674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	483361	483443	483402	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	CSNK2A1	39022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	519765	520062	519888	Y	NA	CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	CSNK2A1	2403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	623135	623319	623297	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8695	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr20	623492	623974	623709	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	625872	626198	626085	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	5816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1083260	1083345	1083304	Y	SCRT2	PSMF1	RSPO4	IMR90	Hi-C	24141950	PSMF1	8561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1,TMEM74B	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1167289	1167675	1167648	Y	NA	TMEM74B	NA	NA	NA	NA	TMEM74B	3230	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	TMEM74B	NA	NA	NA	NA	TMEM74B	4215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1259137	1259285	1259212	Y	C20orf46,C20orf202	SNPH	NA	NA	NA	NA	SNPH	14177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1307828	1308261	1308086	Y	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	62868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	60578	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	1333009	1333271	1333126	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	38535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	37961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSFL1C	305305	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	STK35	270820	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	2236537	2236677	2236642	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	TGM3	IMR90	Hi-C	24141950	STK35	156280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	2450025	2450398	2450237	Y	NA	SNORD119,SNRPB	NA	NA	NA	NA	SNRPB	526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	2964753	2965068	2964761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS26	59523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	2978820	2979208	2979015	Y	NA	MRPS26	NA	NA	NA	NA	MRPS26	45383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	5622884	5622997	5622941	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	GPCPD1,C20orf196	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	33212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	5741425	5741673	5741600	Y	NA	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	12386	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	5816621	5816994	5816701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-55P	51707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	6594261	6594618	6594466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	151693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	6684913	6685132	6685035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	61179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	6975107	6975482	6975156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	228796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	7978054	7978163	7978110	Y	NA	RP5-971N18.3,TMX4	NA	NA	NA	NA	RP5-971N18.3	19707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	7998924	7999176	7999047	Y	NA	RP5-971N18.3,TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	8435134	8435511	8435284	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	324310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	8534755	8534925	8534840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	423931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	8737014	8737369	8737294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	310041	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	9089602	9089856	9089687	Y	NA	PLCB4	NA	NA	NA	NA	PLCB4	42192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	10477280	10477577	10477381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	64410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	10838051	10838409	10838189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	213037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	11948339	11948596	11948468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	78968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	13318186	13318523	13318232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	299064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	13473886	13474103	13473974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	143484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	13734374	13734725	13734663	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	28807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	14500869	14501154	14501002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	184607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	14697041	14697213	14697128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	380779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	14800025	14800243	14800134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	483763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	16217961	16218181	16218074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	333897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	17297416	17297740	17297578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK2	92664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	17440988	17441274	17441131	Y	PCSK2	NA	NA	NA	NA	NA	DSTN	107234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	19323791	19324082	19323937	Y	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	671678	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	19408281	19408453	19408368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	587307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	114042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	20009163	20009558	20009361	Y	NA	NAA20,C20orf26,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	NAA20	13403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	20343522	20343915	20343617	Y	NA	INSM1	INSM1	IMR90	Hi-C	24141950	INSM1	2850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	20344554	20345237	20344967	Y	NA	INSM1	INSM1	IMR90	Hi-C	24141950	INSM1	1528	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr20	20347223	20347613	20347293	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	20391161	20391545	20391351	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	44396	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	21489032	21489415	21489222	Y	PAX1,NKX2-2	NKX2-2,RP5-984P4.4	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	3249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	21501213	21501475	21501344	Y	NKX2-2	NKX2-2,RP5-984P4.4	PLK1S1	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-984P4.4	7365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	21501663	21502213	21501986	Y	PLK1S1,NKX2-4,NKX2-2,PAX1	NKX2-2,RP5-984P4.4	PLK1S1	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-984P4.4	6627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.76381460178318
chr20	22471596	22471813	22471642	Y	FOXA2,FOXA2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	85467	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.43652637554116
chr20	22555806	22556424	22556290	Y	NA	LINC00261,FOXA2	NA	NA	NA	NA	LINC00261	856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr20	22558447	22558719	22558568	Y	FOXA2,FOXA2	LINC00261,FOXA2	NA	NA	NA	NA	LINC00261	1167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr20	22905662	22905881	22905772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXA2	341569	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	23087078	23087428	23087253	Y	CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	241945	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	23122999	23123199	23123050	Y	THBD,CD93,NXT1,GZF1,CST3	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	206174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	23132994	23133379	23133148	Y	THBD,CD93,GZF1,CST3	NA	THBD	K562	ChIA-PET	22265404	NXT1	195994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	24116508	24116689	24116681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	331146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	24603017	24603374	24603110	Y	TMEM90B	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	155182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	24603886	24604015	24603951	Y	TMEM90B	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	156051	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	24608551	24608896	24608878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	160716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	24802781	24802981	24802881	Y	NA	NA	FLJ33581,SYNDIG1	IMR90	Hi-C	24141950	SYNDIG1	354946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	25299092	25299564	25299289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	70055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	116327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	29518777	29518943	29518821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1B	90914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30104625	30104737	30104681	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	4394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30105267	30105465	30105369	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	5036	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30111445	30111879	30111615	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	11214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	COX4I2	NA	NA	NA	NA	COX4I2	25556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	COX4I2,BCL2L1	NA	NA	NA	NA	COX4I2	38984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	30538610	30538727	30538660	Y	DUSP15,DUSP15,DUSP15,TTLL9	PDRG1,XKR7	NA	NA	NA	NA	PDRG1	715	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	31093631	31093822	31093727	Y	HCK,PLAGL2,MAPRE1	NA	NA	NA	NA	NA	C20orf112	77054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	32826582	32826856	32826719	Y	TP53INP2	NA	EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	70752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	33150860	33150919	33150894	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	18202	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	33158757	33159079	33158986	Y	TP53INP2	MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	26099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	33653192	33653349	33653271	Y	NA	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	25325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	33943108	33943431	33943270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF6	72320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	34093619	34093844	34093641	Y	NA	ERGIC3	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	33926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	34127589	34128004	34127717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	34303643	34304038	34303890	Y	NA	ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1	NA	NA	NA	NA	NFS1	18362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	64633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr20	35489284	35489554	35489419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	88692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	35583660	35583902	35583783	Y	TGIF2,TGIF2,TGIF2	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5414	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	35922737	35923093	35922847	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	6696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	35923453	35923684	35923588	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	7412	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	35985970	35986139	35986055	Y	NA	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	14882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36041191	36041579	36041445	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	30357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36045421	36045655	36045607	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	26281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	36050245	36050646	36050634	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	21290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36339461	36339780	36339670	Y	GHRH,CTNNBL1	CTNNBL1	NA	NA	NA	NA	CTNNBL1	19053	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36534418	36534720	36534476	Y	NA	VSTM2L	NA	NA	NA	NA	VSTM2L	4919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	36542426	36542653	36542463	Y	NA	VSTM2L	NA	NA	NA	NA	VSTM2L	12927	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	36542931	36543304	36543133	Y	NA	VSTM2L	NA	NA	NA	NA	VSTM2L	13432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	37515821	37516052	37515937	Y	ACTR5,PPP1R16B	FAM83D	NA	NA	NA	NA	FAM83D	36903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	37626282	37626666	37626585	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	37340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	38844790	38845079	38844935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	470801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	38953913	38954078	38953962	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	361802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	39091983	39092134	39092059	Y	NA	NA	MAFB	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAFB	223746	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	39787054	39787387	39787188	Y	NA	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	23454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	39878072	39878223	39878164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX3	66089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	39938508	39938643	39938544	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	5669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	39939044	39939335	39939233	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	4977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	42118767	42119112	42118938	Y	PTPRT,TOX2,SGK2,L3MBTL1	SRSF6,L3MBTL1	SGK2	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL1	15208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.43652637554116
chr20	42545648	42546044	42545953	Y	NA	TOX2	NA	NA	NA	NA	TOX2	4144	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	42718699	42718853	42718776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	118747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	42828501	42828745	42828623	Y	NA	OSER1-AS1,GDAP1L1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	8855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	43021871	43022017	43021941	Y	HNF4A,HNF4A	HNF4A,HNF4A-AS1	NA	NA	NA	NA	HNF4A-AS1	329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	43123975	43124199	43124088	Y	C20orf111,STK4,ADA,SERINC3	RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	TTPAL	21449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	43181922	43182397	43182243	Y	SERINC3	SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	PKIG	23496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	43214930	43215275	43215159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIG	56504	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK4	96875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	43709360	43709760	43709560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK4	116245	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	RBPJL,MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,TP53TG5,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	TP53TG5,PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	44633606	44634146	44634047	Y	PCIF1,CD40,ZNF335	ZNF335,SLC12A5	SLC12A5,NCOA5	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A5	14210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr20	45266832	45266970	45266902	Y	NA	TP53RK	NA	NA	NA	NA	TP53RK	49448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	45825158	45825275	45825178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1050K3.3	126654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	45858819	45859007	45858915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	124560	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr20	45943818	45944172	45944095	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	39395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	23191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	46115894	46116142	46116064	Y	NCOA3	NCOA3	NCOA3,ZMYND8,EYA2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	12459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	46116511	46116614	46116567	Y	NCOA3	NCOA3	NCOA3,ZMYND8,EYA2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	11987	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	46239342	46239637	46239413	Y	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	110741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	171015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	46417679	46418052	46417809	Y	NA	NA	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	289078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	46632163	46632260	46632228	Y	SULF2	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NCOA3	503562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47316327	47316412	47316396	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	126008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47339273	47339687	47339536	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	102733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47397993	47398168	47398081	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	44252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47400245	47400718	47400585	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	41702	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47443501	47443751	47443699	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	1081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47470610	47470767	47470691	Y	NA	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	28190	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	47544338	47544681	47544534	Y	DDX27	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	7911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	47773105	47773432	47773269	Y	NA	STAU1	NA	NA	NA	NA	STAU1	29472	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47784409	47784640	47784548	Y	PREX1,ZNFX1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	18264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	47796581	47796870	47796726	Y	NA	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	6034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48054154	48054330	48054242	Y	NA	KCNB1	NA	NA	NA	NA	KCNB1	42854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48158294	48158522	48158408	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	24161	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	48165703	48166239	48166052	Y	PTGIS	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	16444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	48168443	48168863	48168748	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	13820	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	48200728	48200848	48200788	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	18045	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	48201281	48201539	48201531	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	18598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48221158	48221415	48221229	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	38475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48311078	48311758	48311363	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	16657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	48317822	48318037	48318021	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48688468	48688637	48688554	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	41859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48707582	48707967	48707775	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	22529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48717588	48717974	48717858	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	12522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48753681	48754062	48753956	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	14112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48763985	48764114	48764046	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	48810888	48811172	48811109	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	5512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48887193	48887486	48887291	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	NA	PARD6B,CEBPB,PTPN1,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	81817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48922474	48922671	48922573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	117098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	146419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	49133154	49133451	49133362	Y	CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	8263	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	49134968	49135201	49135019	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	10077	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	49720229	49720557	49720393	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS3	146866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	50027410	50027791	50027676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	149579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	50054102	50054305	50054204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	123065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	50100584	50100753	50100686	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	76617	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	50141744	50142683	50142582	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	34687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	50152017	50152389	50152105	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	24981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	2999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	50272756	50273155	50272761	Y	ATP9A	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	95386	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	51110889	51111034	51110969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	292042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	51855373	51855391	51855382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	268427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	52268867	52269118	52269044	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	44421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	52271592	52271787	52271702	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	47146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52323078	52323315	52323172	Y	NA	NA	SUMO1P1,ZNF217	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	98632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52353948	52354213	52354172	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	129502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	52367753	52368082	52368002	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	143307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52374184	52374569	52374228	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	149738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	52380425	52380741	52380578	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	155979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	52450407	52450594	52450483	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	225961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52480421	52480878	52480693	Y	ZNF217,PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	255975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52520115	52520714	52520380	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,ZNF217,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	295669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52530834	52531236	52530898	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	291150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	52743384	52744045	52743713	Y	NA	NA	DOK5,PTPRT,SULF2,CYP24A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	78341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	52831217	52831490	52831439	Y	NA	PFDN4	NA	NA	NA	NA	PFDN4	8831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	55862686	55862776	55862731	Y	NA	NA	BMP7	IMR90	Hi-C	24141950	RAE1	61290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	56550215	56550469	56550425	Y	NA	NA	ZBP1,CTCFL,PCK1,PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	332026	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr20	56983736	56983744	56983737	Y	NA	VAPB	NA	NA	NA	NA	VAPB	21558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	57420469	57420802	57420636	Y	NA	GNAS,GNAS-AS1,RP1-309F20.3	NA	NA	NA	NA	GNAS-AS1	3156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	ATP5E	NA	NA	NA	NA	ATP5E	47226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	57722243	57722385	57722335	Y	STX16,PHACTR3,ZNF831	NA	MIR298,GNAS-AS1,MIR296,ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	106279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	57741298	57741742	57741512	Y	ZNF831	NA	ZNF831,SLMO2-ATP5E,GNAS-AS1,GNAS	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	125334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	58631661	58631838	58631749	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	118309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	59581209	59581224	59581218	Y	CDH4	NA	C20orf197	IMR90	Hi-C	24141950	TAF4	1057642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	60256764	60257074	60256889	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	381792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	60529765	60530009	60529928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	108857	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr20	60735261	60735480	60735370	Y	NA	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	18439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	60939635	60939778	60939673	Y	SLCO4A1,NTSR1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	61585167	61585546	61585389	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr20	61585554	61585775	61585703	Y	SLC17A9	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	62285983	62286092	62286038	Y	NA	GMEB2,CTD-3184A7.4,STMN3,RTEL1	NA	NA	NA	NA	RTEL1	1071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr20	62726888	62727073	62727008	Y	NA	ZNF512B,SOX18,TCEA2	NA	NA	NA	NA	TCEA2	47699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	16222795	16222981	16222977	Y	NA	NA	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRIP1	212340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	16354668	16355055	16354876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	80266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	16431175	16431558	16431528	Y	NA	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	3763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	16662871	16663259	16663022	Y	NA	NA	SAMSN1,NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	227550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	17054611	17055027	17054700	Y	USP25	USP25	USP25	IMR90	Hi-C	24141950	USP25	45317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	17153700	17154031	17153865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	53356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	17906222	17906467	17906345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	805878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	19152664	19153229	19152933	Y	C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	36474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	19410366	19410536	19410451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL37P3	145564	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	20000884	20000961	20000923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL109763.2	129360	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr21	20089064	20089357	20089211	Y	NA	AL109763.2	NA	NA	NA	NA	AL109763.2	40964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	1241403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	26795177	26795760	26795474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL39	182069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	28300536	28300937	28300780	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	35895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	28942556	28942990	28942803	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	605724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	29186148	29186441	29186404	Y	NA	NA	LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	849316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr21	29461833	29462120	29461977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	793573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	29476694	29476903	29476871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	778790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr21	29656574	29656747	29656720	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	598946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	29660800	29661042	29660922	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	594651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.76381460178318
chr21	29791196	29791277	29791236	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00113	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	464416	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr21	29793976	29794351	29794164	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00113	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	461342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	30005077	30005224	30005162	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	250469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.58203516738822
chr21	30555048	30555502	30555259	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	4088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	30754427	30754628	30754578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	190035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	30802537	30802636	30802587	Y	NA	NA	C21orf7	IMR90	Hi-C	24141950	BACH1	238145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	30924978	30925301	30925140	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	360586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	30927917	30928144	30928028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	363525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	32125164	32125226	32125195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	804332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	33104933	33105321	33105127	Y	NA	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	2545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	34020244	34020455	34020360	Y	SYNJ1,SYNJ1	C21orf59	NA	NA	NA	NA	C21orf59	37068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	34075111	34075304	34075194	Y	NA	SYNJ1	NA	NA	NA	NA	SYNJ1	23055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	35976444	35976765	35976605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	532574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	770917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	774064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	776003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	778702	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	783552	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	810334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36577614	36577815	36577724	Y	NA	NA	RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RUNX1	797150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	36612524	36612748	36612636	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	762217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	36638663	36638676	36638670	Y	NA	NA	RUNX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RUNX1	736289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	37694250	37694633	37694410	Y	NA	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	3763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	37850474	37850838	37850572	Y	NA	AP000695.6	NA	NA	NA	NA	AP000695.6	49816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr21	38189032	38189251	38189142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIM2	119599	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	38629602	38630247	38630025	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	8015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	38825760	38825986	38825873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	89668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	38839400	38839766	38839583	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	103308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	38986410	38986680	38986546	Y	KCNJ6	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	250318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr21	38988988	38989241	38989189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	252896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr21	39112163	39112449	39112332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	174300	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	39430494	39430871	39430698	Y	DSCR4	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	143745	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	39593313	39593902	39593631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	306564	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	39635387	39635785	39635510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	348638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	39810382	39810731	39810524	Y	ERG	NA	NA	NA	NA	NA	ERG	220973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	39863643	39864017	39863843	Y	ERG	NA	NA	NA	NA	NA	ERG	167687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	40159439	40159794	40159507	Y	NA	ETS2	ETS2,LINC00114	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETS2	15437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	40317605	40318001	40317816	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	142374	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	40331056	40331378	40331206	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	155825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	40338093	40338255	40338153	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	162862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr21	40361689	40362112	40361935	Y	NA	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	ETS2	186458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	40386657	40387043	40386856	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	166734	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	40690087	40690386	40690238	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	1099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	40814197	40814412	40814270	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	LCA5L	1319	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	41048329	41048488	41048408	Y	SH3BGR	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf88	65581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	42108090	42108273	42108169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCAM	108792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	44074543	44074777	44074593	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	2797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	44091107	44091303	44091206	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	19361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	44103716	44104369	44104011	Y	UBASH3A,WDR4	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	31970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	44278308	44278654	44278481	Y	NA	WDR4,NDUFV3	NA	NA	NA	NA	WDR4	19024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr21	44465598	44466060	44465736	Y	PKNOX1	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	28993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	44469974	44470172	44470008	Y	CBS	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	24881	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	44529146	44529448	44529286	Y	U2AF1	CBS,U2AF1	NA	NA	NA	NA	U2AF1	3449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	44631926	44632172	44632049	Y	NA	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	106229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	44831131	44831382	44831257	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	13626	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr21	44876530	44876883	44876692	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	31522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45065485	45065706	45065596	Y	NA	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	11668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45080522	45080871	45080626	Y	TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	RRP1B	3093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45359018	45359208	45359125	Y	ICOSLG,C21orf2,TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	70992	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr21	45543595	45544017	45543789	Y	KRTAP10-6,TRPM2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	7470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45557942	45558217	45558021	Y	AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6455	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45587301	45587635	45587415	Y	PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	C21orf33	K562	ChIA-PET	22265404	C21orf33	35814	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45720945	45721140	45721043	Y	NA	PFKL,C21orf2	NA	NA	NA	NA	PFKL	3011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45914106	45914226	45914202	Y	NA	LRRC3,AP001065.15,C21orf90	NA	NA	NA	NA	AP001065.15	10646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr21	45916945	45917393	45917003	Y	NA	LRRC3,AP001065.15,C21orf90	NA	NA	NA	NA	AP001065.15	13485	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45925590	45925994	45925768	Y	NA	AP001065.15,C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	9105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	AP001065.15,C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	8679	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	31919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	46385193	46385585	46385338	Y	POFUT2,ITGB2	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	27268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47010868	47011351	47011033	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47191109	47191365	47191237	Y	NA	NA	LOC100129027,SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	129501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47212658	47212880	47212769	Y	NA	NA	ADARB1,SLC19A1,PCBP3	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	151050	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47236151	47236483	47236315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	163168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47312098	47312312	47312190	Y	SLC19A1,SLC19A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	87339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47394030	47394545	47394409	Y	LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	5106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47442529	47442669	47442610	Y	NA	COL6A1	NA	NA	NA	NA	COL6A1	42878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	47543656	47544056	47543951	Y	NA	COL6A2,FTCD	NA	NA	NA	NA	COL6A2	27645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2,FTCD	NA	NA	NA	NA	FTCD	18329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2,FTCD	NA	NA	NA	NA	FTCD	9242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr21	47968526	47968894	47968542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	84185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	59185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	17722377	17722633	17722505	Y	CECR2,BCL2L13,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	50551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	18452405	18452779	18452681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	52546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	18538907	18539143	18539025	Y	NA	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	PEX26	19546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	19043288	19043502	19043327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGCR2	64465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	19073720	19074078	19073888	Y	NA	DGCR2	NA	NA	NA	NA	DGCR2	33889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.40025573299325
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	19410653	19410889	19410838	Y	HIRA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	6536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	19427862	19428165	19428014	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	5059	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	19874514	19874924	19874610	Y	TRMT2A,C22orf29,GNB1L	C22orf29,GNB1L	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNB1L	34052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	19972525	19972715	19972620	Y	NA	COMT,TXNRD2,ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	29616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	19983308	19983423	19983389	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	20142939	20143182	20143142	Y	NA	RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8	27960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr22	20258205	20258516	20258358	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	10253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	20911751	20912048	20911845	Y	PI4KA,THAP7,PI4KA,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	63551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	21221716	21221966	21221814	Y	NA	SNAP29,PI4KA,CRKL	NA	NA	NA	NA	PI4KA	10011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	22205229	22205454	22205405	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	14516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	22231244	22231441	22231355	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	PPM1F	K562	ChIA-PET	22265404	MAPK1	11274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B,IGLV4-69	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	22535916	22536143	22536038	Y	NA	IGLV6-57	LOC96610,VPREB1	IMR90	Hi-C	24141950	IGLV6-57	11970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	22861017	22861374	22861318	Y	ZNF280B	ZNF280B,PRAME	NA	NA	NA	NA	ZNF280B	131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	23183063	23183389	23183239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAZ	227151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	23413714	23413937	23413833	Y	NA	GNAZ	NA	NA	NA	NA	GNAZ	3174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	23863249	23863551	23863355	Y	NA	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	120336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr22	24752898	24753006	24752951	Y	UPB1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	58841	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	24756229	24756614	24756466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	55233	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	15543	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	24799556	24799967	24799568	Y	NA	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	11880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	24878539	24879065	24878732	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	66692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	24948988	24949121	24949055	Y	ADORA2A	SNRPD3,FAM211B	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	350	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	53550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	25373601	25373706	25373654	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	78420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	25466969	25467233	25467138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD56	171788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	25587613	25587664	25587639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5L	211680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	25883503	25883619	25883561	Y	NA	CRYBB2P1	MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	CRYBB2P1	41431	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	26393268	26393631	26393416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEZ6L	169809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	26455753	26456126	26455940	Y	MYO18B	NA	MYO18B,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	SEZ6L	107314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	26462921	26463001	26462961	Y	NA	NA	MYO18B,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	SEZ6L	100439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	26967025	26967265	26967145	Y	TFIP11	HMGB1P10,TPST2	NA	NA	NA	NA	HMGB1P10	12533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	27043800	27044733	27044318	Y	SEZ6L	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	3408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC28-AS1	247638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	28372624	28372939	28372782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	28475489	28475734	28475658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	161367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	28879777	28880035	28879909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	255984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	29188218	29188399	29188309	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	6186	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	29218930	29219398	29218977	Y	NA	XBP1,CTA-292E10.6	TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,HSCB,CHEK2,C22orf31	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	24259	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	29339124	29339474	29339174	Y	NA	NA	KREMEN1,C22orf31	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	61544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	29591621	29591757	29591669	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	8083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	29600744	29600965	29600829	Y	CHEK2,EWSR1,EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	29601085	29601300	29601289	Y	NA	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	1245	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	30102464	30102720	30102592	Y	NA	CABP7	NA	NA	NA	NA	CABP7	11353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	30579877	30580163	30580047	Y	MTMR3,SF3A1,DUSP18,OSM,LIF	NA	OSM,LIF	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	103453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	NA	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	81517	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	31571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	30808332	30808723	30808528	Y	NA	SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	7037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	30938421	30938985	30938910	Y	LIF,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18	NA	NA	NA	NA	NA	TCN2	61840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	31291343	31291446	31291429	Y	SEC14L4,OSBP2	MORC2-AS1	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2-AS1	24849	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	31294163	31294373	31294268	Y	OSBP2	MORC2-AS1	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2-AS1	21922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	31626331	31627201	31626769	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	20106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	31629034	31629491	31629163	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	22809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	32806612	32806674	32806643	Y	RFPL2,RFPL3,TIMP3	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	61989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	32869636	32869823	32869707	Y	C22orf42,RFPL2,RFPL3	FBXO7	NA	NA	NA	NA	FBXO7	973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	33862454	33862588	33862512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	666767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	34055725	34056096	34055879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	860038	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	34073272	34073505	34073390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	877585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	34249918	34249944	34249938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	1054231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	34263249	34263475	34263362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	1067562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	34315412	34315698	34315644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	1119725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	35274275	35274384	35274330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-714B7.5	350665	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	35503589	35503961	35503775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-714B7.5	121088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	35528321	35528338	35528332	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	96711	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	35529944	35530291	35530139	Y	ISX	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	94758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	35549716	35550091	35549904	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	74958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	35555825	35556131	35555978	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	68918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	35708559	35708961	35708654	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	15291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	36828742	36828858	36828800	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14,TXN2	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1119A7.14	20133	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	36829412	36829614	36829519	Y	FOXRED2,FOXRED2	MYH9,RP5-1119A7.14,TXN2	TXN2,MYH9	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1119A7.14	19377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	36866824	36867261	36867092	Y	NA	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	8816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	37316628	37317004	37316672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPST	96672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	37897761	37897917	37897872	Y	NA	MFNG,CARD10	NA	NA	NA	NA	CARD10	15632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	37986436	37986718	37986607	Y	CYTH4,SH3BP1,EIF3L,LGALS2,GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	NA	NA	NA	NA	GGA1	15763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38057516	38057596	38057556	Y	NA	SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP	NA	NA	NA	NA	PDXP	4782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38069633	38069980	38069807	Y	RAC2,CYTH4,GGA1,SH3BP1	SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP	NA	NA	NA	NA	LGALS1	18	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38573037	38573156	38573097	Y	EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	MAFF	22733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38601471	38601546	38601509	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	1774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38624836	38625209	38625138	Y	JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF	MAFF,PLA2G6,TMEM184B	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	25139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	38846181	38846564	38846216	Y	NA	KDELR3	NA	NA	NA	NA	KDELR3	15503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	38859370	38859653	38859488	Y	NA	KDELR3,DDX17	NA	NA	NA	NA	KDELR3	2414	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	40309233	40309614	40309424	Y	CACNA1I,GRAP2	UQCRFS1P1	FAM83F	IMR90	Hi-C	24141950	UQCRFS1P1	39940	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	40323368	40324104	40323679	Y	GRAP2	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1P1	54075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	40680802	40681181	40680841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSL	59326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	41079087	41079368	41079234	Y	MCHR1	MKL1,GAPDHP37	NA	NA	NA	NA	GAPDHP37	10632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.07296750675124
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	42257974	42258323	42258180	Y	CENPM	SREBF2	NA	NA	NA	NA	SREBF2	30865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	42315897	42316153	42316014	Y	CENPM,SHISA8,TNFRSF13C	SHISA8,TNFRSF13C,CENPM	NA	NA	NA	NA	TNFRSF13C	4669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	42718410	42718572	42718489	Y	NA	Z83851.1	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	44670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	43165805	43166293	43166166	Y	NFAM1,ARFGAP3	NA	ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	50501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	43283489	43283802	43283626	Y	NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	31377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	43288479	43288908	43288801	Y	NFAM1,PACSIN2,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	36367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	43319068	43319405	43319376	Y	NFAM1,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	66956	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	43369643	43369761	43369702	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	43602706	43602942	43602824	Y	NA	TTLL12	NA	NA	NA	NA	TTLL12	21567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	44321391	44321759	44321599	Y	PNPLA3	PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5	NA	NA	NA	NA	PNPLA3	3772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	44572775	44572960	44572868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-796I17.5	221868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	44731310	44731638	44731630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	160540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	44993593	44993881	44993680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	101415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	45015871	45016262	45016114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	123693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	45081354	45081559	45081463	Y	NA	NA	PARVB,KIAA1644,SAMM50	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	189176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	45575306	45575472	45575328	Y	FAM118A,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	NUP50	17584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	45623668	45623768	45623700	Y	KIAA0930	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	10882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,UPK3A,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	UPK3A	13649	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	45820096	45820426	45820265	Y	NA	SMC1B,RIBC2	NA	NA	NA	NA	RIBC2	12524	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	72139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	46441533	46441708	46441621	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	5877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	46982383	46982526	46982455	Y	NA	GRAMD4	TRMU,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	47173530	47173804	47173706	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	17012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	47498045	47498267	47498202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	341527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	47848340	47848433	47848387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	176990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50262824	50262951	50262946	Y	TUBGCP6,MLC1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	17334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	50272789	50273094	50272966	Y	NA	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	27299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50336699	50336868	50336781	Y	SELO	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	15293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50364171	50364294	50364188	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12010	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr22	50590886	50591023	50590963	Y	MIOX,CPT1B,C22orf41,MOV10L1,MOV10L1	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	16137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50608010	50608409	50608105	Y	MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	850	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	50680113	50680250	50680180	Y	SELO	SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11	NA	NA	NA	NA	TUBGCP6	1171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50741057	50741253	50741136	Y	PIM3,TRABD	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	50764173	50764461	50764208	Y	NA	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	15272	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr22	51080489	51080596	51080545	Y	NA	MAPK8IP2,CHKB,ARSA,SHANK3	SHANK3,LOC100144603,CHKB-CPT1B,ARSA,NCAPH2,LMF2,PPP6R2,SBF1	IMR90	Hi-C	24141950	ARSA	15882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr22	51138872	51139009	51138949	Y	SELO	SHANK3	NA	NA	NA	NA	SHANK3	28029	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	3219649	3219829	3219819	Y	NA	CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	3639816	3640081	3639965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN1	199040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	LRRN1	NA	NA	NA	NA	LRRN1	15372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	3975411	3975745	3975578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN1	136290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	4428359	4428568	4428464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUMF1	78397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	4867902	4868594	4868233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	150207	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	132714	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	4891899	4892323	4892162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	126478	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	9733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	5237403	5237551	5237430	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	EDEM1	10072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	7015968	7016152	7016014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	1525241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	8435443	8435709	8435689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	105684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	8500443	8500771	8500604	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	40622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	8544131	8544195	8544133	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	2738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	8906303	8906783	8906429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	96674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	9197454	9197478	9197466	Y	NA	SRGAP3-AS2	NA	NA	NA	NA	SRGAP3-AS2	34699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	10202652	10202802	10202719	Y	TATDN2,VHL,IRAK2	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	1747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	10266595	10266861	10266739	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	20846	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	10592435	10592665	10592609	Y	NA	NA	ATP2B2	IMR90	Hi-C	24141950	SEC13	231573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	12555203	12555562	12555379	Y	NA	TSEN2,MKRN2	NA	NA	NA	NA	TSEN2	31272	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	12584271	12584371	12584321	Y	NA	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	12142	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	13040844	13041238	13041111	Y	RAF1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	71379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	13061201	13061436	13061325	Y	NUP210,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	51181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr3	15285479	15285699	15285585	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	39820	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	15783171	15783247	15783208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	141833	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	16352603	16353027	16352777	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	47897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	16380469	16380852	16380674	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	75763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	16385971	16386232	16386102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	81265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	17248138	17248312	17248225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	943432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	17404652	17404912	17404782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	1079397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	978919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	941290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	940686	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	17990676	17990823	17990753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	493486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	18013789	18014053	18013921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	470256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	18022713	18023080	18023018	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	461229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	18024656	18024931	18024818	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	459378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	18210791	18210985	18210888	Y	TBC1D5,TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	273324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr3	18366679	18366900	18366790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	117409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	18399008	18399057	18399033	Y	SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	85252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	18415394	18415659	18415606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	68650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	18430720	18430774	18430747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	53535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	18453300	18453576	18453481	Y	NA	TBC1D5,AC144521.1,SATB1	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	30733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	KCNH8	NA	NA	NA	NA	KCNH8	423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	19588918	19588928	19588923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	397589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A,RNU4-85P	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	20098670	20099049	20098920	Y	RAB5A	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	19155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	20122748	20122899	20122825	Y	NA	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	43233	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1-AS1,SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1-AS1	22551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	20931659	20931901	20931719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL1	705875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	1203165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	22755487	22755669	22755574	Y	UBE2E2	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	486842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	24340917	24341295	24341106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	193478	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	24364500	24364733	24364617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	170040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	24370369	24370393	24370381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	164380	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	24459735	24459834	24459785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	74939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	24506233	24506581	24506477	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	28192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr3	24525285	24525656	24525591	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	9117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	24563741	24564038	24564033	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	28968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	7.36398509044535
chr3	25473876	25474077	25473977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	230321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr3	27957485	27957491	27957488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	195279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	27984483	27984771	27984759	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	222277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	28050894	28051260	28051082	Y	EOMES,CMC1	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	229815	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	28078428	28078736	28078583	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	202339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	28534381	28534544	28534465	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00693	79738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	30700179	30700500	30700249	Y	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	54185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	30784727	30784829	30784780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	138733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	31268600	31269021	31268879	Y	NA	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	303109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	32002546	32002801	32002555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL10	114271	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	32412858	32413131	32413058	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	18032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	32673	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.07296750675124
chr3	33002804	33002999	33002866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	70356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	33977707	33978124	33977933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	139863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	34293697	34294081	34293889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	455853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	34342174	34342425	34342178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	504330	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	34466240	34466377	34466243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	628396	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	34543919	34544003	34543961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	706075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	34546800	34546816	34546806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	708956	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.94559403617814
chr3	35706105	35706656	35706353	Y	ARPP21	NA	NA	NA	NA	NA	STAC	713180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	36937540	36937792	36937666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	95003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	37304089	37304216	37304152	Y	GOLGA4	GOLGA4,AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	20403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	37332823	37333208	37333001	Y	NA	AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	49137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	37344922	37345358	37345096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	61236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	38207945	38208258	38208101	Y	VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	3365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	39191403	39191804	39191748	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	2249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	XIRP1	9434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	40341288	40341806	40341708	Y	EIF1B	EIF1B	NA	NA	NA	NA	EIF1B	7369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	40822763	40822917	40822840	Y	NA	RP11-761N21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-761N21.2	21727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	42078040	42078206	42078049	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	24746	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	42093899	42094516	42094168	Y	NA	TRAK1	ZNF621,ZNF620,TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	40605	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	42108049	42108561	42108178	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	54755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	42237448	42237989	42237678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	184154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	ZNF662	NA	NA	NA	NA	ZNF662	22430	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	111255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	43458781	43458976	43458878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	132777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	44652575	44652865	44652702	Y	ZNF445,ZNF502,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197	ZNF660,ZNF197,ZNF35	NA	NA	NA	NA	ZNF197	28195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	44654573	44654874	44654724	Y	ZNF445,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197	ZNF660,ZNF197,ZNF35	NA	NA	NA	NA	ZNF197	30193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	44697594	44698203	44697878	Y	NA	ZNF35,RP11-944L7.4	NA	NA	NA	NA	ZNF35	9375	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	45161726	45162069	45161866	Y	TMEM158	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	23845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	45681547	45681721	45681608	Y	LIMD1	SACM1L	NA	NA	NA	NA	SACM1L	46827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	45684271	45684561	45684439	Y	NA	SACM1L	NA	NA	NA	NA	SACM1L	43987	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	46177032	46177307	46177205	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CCR1,CCR2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	141716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	47000781	47001063	47000953	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	18110	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	47072517	47072982	47072882	Y	NBEAL2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	51017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	47078393	47078462	47078449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	56893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	47134411	47134793	47134602	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	68664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	47875023	47875428	47875228	Y	NA	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	32624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	48469321	48469953	48469633	Y	NA	CCDC51,ATRIP	NA	NA	NA	NA	PLXNB1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	49696171	49696492	49696217	Y	NA	APEH,RNF123,MST1	APEH,MST1,RNF123	IMR90	Hi-C	24141950	APEH	12943	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	50040739	50040850	50040788	Y	SEMA3B	NA	NA	NA	NA	NA	RBM6	65299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	50243484	50243685	50243589	Y	HYAL1,SLC38A3	SLC38A3,GNAI2	NA	NA	NA	NA	SLC38A3	2805	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	50377372	50377700	50377536	Y	NA	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	50642550	50642869	50642710	Y	NA	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	4082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	52009750	52010220	52010093	Y	NA	RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29	NA	NA	NA	NA	ABHD14A-ACY1,ACY1	2684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	52235110	52235291	52235183	Y	PBRM1,PBRM1,GLYCTK,DNAH1	POC1A,ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M	NA	NA	NA	NA	ALAS1	5008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	52334165	52334539	52334405	Y	NA	GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	WDR82	14129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	52625235	52625395	52625315	Y	DNAH1,PBRM1	NA	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	58165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	52926819	52927340	52927162	Y	PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110	TMEM110-MUSTN1,TMEM110	NA	NA	NA	NA	TMEM110-MUSTN1	2238	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	53107324	53107487	53107433	Y	TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	53380883	53380907	53380896	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	1229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	53876999	53877298	53877116	Y	CHDH	CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	CHDH	1119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	55103844	55104087	55103966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5A	417886	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	55178043	55178603	55178498	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	343370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	55194265	55194440	55194343	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	327533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	55194450	55194988	55194909	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	326985	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	55219456	55219785	55219624	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	302188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	55223485	55223775	55223588	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	298198	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	55224453	55224624	55224517	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	297349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	55255839	55256126	55255983	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	265847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr3	55319384	55319763	55319619	Y	WNT5A	NA	CACNA2D3,ERC2,WNT5A	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	202210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	55364571	55364745	55364625	Y	NA	NA	CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	157228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	4320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	56013802	56014004	56013903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	486387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	57564978	57565360	57565163	Y	FAM116A,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	16587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	57779621	57779638	57779630	Y	FAM116A,SLMAP	SLMAP	NA	NA	NA	NA	SLMAP	40444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	57937235	57937402	57937348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	54725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	58162589	58162663	58162637	Y	KCTD6	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	58570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	58335663	58335765	58335715	Y	PXK	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	19056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	58390134	58390421	58390274	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	27163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	58469083	58469272	58469182	Y	NA	KCTD6	NA	NA	NA	NA	KCTD6	6569	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	58984210	58984527	58984399	Y	NA	C3orf67	NA	NA	NA	NA	C3orf67	49283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	60067500	60067675	60067588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1033690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	60360991	60361355	60361182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	873778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	60745368	60745684	60745652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	489449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	60777295	60777669	60777482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	457464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	60804439	60804744	60804592	Y	FHIT	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	430389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	61579072	61579152	61579112	Y	PTPRG	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	33829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	61667893	61667951	61667922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	58829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	62214246	62214436	62214339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	88212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	62400515	62400779	62400769	Y	NA	PTPRG-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	47510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	62422700	62423042	62422978	Y	C3orf14,FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	69695	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr3	62427415	62427809	62427798	Y	FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	74410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	62572991	62573174	62573036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	219986	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	62638435	62638623	62638529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	220431	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	62780450	62780695	62780574	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	78359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr3	62926615	62926793	62926705	Y	CADPS	LINC00698	NA	NA	NA	NA	LINC00698	7312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr3	63848274	63848561	63848418	Y	NA	THOC7	NA	NA	NA	NA	THOC7	695	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	63946118	63946531	63946303	Y	NA	NA	LOC100507062	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	61127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	64136720	64136844	64136782	Y	THOC7,PSMD6	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	129062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	64313187	64313399	64313330	Y	PRICKLE2	NA	PRICKLE2	IMR90	Hi-C	24141950	PRICKLE2	115753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	64330217	64330685	64330502	Y	NA	NA	PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879	IMR90	Hi-C	24141950	PRICKLE2	98467	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	65013149	65013388	65013334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	341473	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	65016570	65016819	65016695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	344894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	65909802	65910182	65909992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	66139931	66140052	66139993	Y	NA	SLC25A26	NA	NA	NA	NA	SLC25A26	22646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	69228052	69228449	69228187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	95957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	69237386	69237579	69237483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	105291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	69376031	69376377	69376298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4B	213357	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	69582774	69582816	69582795	Y	NA	FRMD4B	NA	NA	NA	NA	FRMD4B	6918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	69826244	69826723	69826526	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	39658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-460N16.1	128502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	70905629	70905860	70905775	Y	NA	NA	FOXP1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP1	725280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71031841	71032211	71032107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	598929	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71080443	71080735	71080627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	550405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71116020	71116294	71116249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	514846	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71136796	71137147	71137136	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	71137411	71137566	71137489	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	71153323	71153512	71153422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	477628	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71176805	71177031	71176814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	454109	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	71255455	71255729	71255602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	375411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71293394	71293605	71293527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	337535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	71298409	71298581	71298470	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	332559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71348436	71348626	71348532	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	282514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71436688	71437201	71436910	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	193939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71478043	71478236	71478134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	152904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	71490469	71490633	71490551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	140507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71494304	71494367	71494336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	136773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	71535859	71536392	71536211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	94748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	71543445	71543660	71543534	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	87480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71628462	71628802	71628743	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	2338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00877	96309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	72445751	72445968	72445860	Y	NA	RYBP	NA	NA	NA	NA	RYBP	48101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	72539985	72540363	72540053	Y	RYBP	RYBP	LOC201617,RYBP,SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	45916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	72936024	72936237	72936180	Y	RYBP,EBLN2	SHQ1,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	SHQ1	26959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	73492361	73492586	73492474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	179505	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	73611832	73612189	73612011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	59902	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	PDZRN3	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	25523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	75199894	75200047	75199971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	282214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	75765975	75766371	75766287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF717	66363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	76577806	76578430	76578088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	96637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	77129404	77129782	77129499	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	648235	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	77239163	77239286	77239225	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	757994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	77632301	77632638	77632470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	1151132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	78848211	78848429	78848320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	966536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	78867121	78867519	78867219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	947446	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr3	79013956	79013976	79013966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	800989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	79674571	79674688	79674630	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	140277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	81766105	81766391	81766248	Y	NA	GBE1	NA	NA	NA	NA	GBE1	42921	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	85011127	85011790	85011174	Y	NA	CADM2	NA	NA	NA	NA	CADM2	4995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	85071263	85071596	85071400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	65131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	85094285	85094567	85094426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	88153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	85120525	85120655	85120534	Y	CADM2	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	114393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	85158641	85158936	85158716	Y	CADM2	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	152509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	85318532	85318917	85318639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	312400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	87336210	87336427	87336319	Y	NA	NA	CGGBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CHMP2B	61789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	89163442	89163800	89163560	Y	NA	EPHA3	NA	NA	NA	NA	EPHA3	8768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA6	194756	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	96786728	96787034	96786881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA6	255303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	97006900	97007017	97006959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	474348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	97211520	97211837	97211678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	269528	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	98291884	98292296	98292041	Y	OR5H6,OR5H2,CLDND1	CPOX	NA	NA	NA	NA	CPOX	18271	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	98497288	98497481	98497360	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	121052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr3	98509261	98509585	98509483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	108948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	99575221	99575605	99575379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	402239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	398108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	99581173	99581391	99581282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	396453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	393031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99587238	99587483	99587373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	390361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99596957	99597300	99597045	Y	TBC1D23	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	380544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99620045	99620512	99620235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	357332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99664130	99664284	99664246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	313560	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99751196	99751332	99751292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	226512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	99782957	99783256	99783070	Y	NA	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	194588	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	100898529	100898766	100898648	Y	NA	NA	ABI3BP,GPR128	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-301G23.1	269510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	101046086	101046265	101046174	Y	ZBTB11,SENP7,CEP97	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	183820	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	101355184	101355535	101355371	Y	NA	ZBTB11,RPL24	NA	NA	NA	NA	ZBTB11	38804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	103522825	103523125	103522973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	646021	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	105416337	105416655	105416542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	169741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	106782352	106782425	106782408	Y	NA	NA	CBLB	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00883	175114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	107148837	107149015	107148915	Y	NA	NA	LOC344595,BBX,LOC100302640	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BBX	90768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	107376610	107376921	107376801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	136827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	107802397	107802714	107802497	Y	MYH15,HHLA2	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	5158	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	107803224	107803878	107803522	Y	NA	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	3994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	107807468	107807936	107807811	Y	MYH15,CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	110800210	110800608	110800220	Y	NA	PVRL3,PVRL3-AS1	NA	NA	NA	NA	PVRL3-AS1	11810	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	62601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	111484180	111484533	111484208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	92657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	111866338	111866609	111866454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf52	63156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	112069423	112069692	112069474	Y	SLC9A10	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	20229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	112436805	112436974	112436889	Y	NA	NA	CD200R1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	70428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	112465605	112465931	112465711	Y	CCDC80,CD200R1	NA	CD200R1,CCDC80,CD200R1L,GTPBP8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	99228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	112531892	112532184	112532038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC80	165515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	112677670	112678011	112677841	Y	NA	GTPBP8	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	29754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	113209161	113209501	113209331	Y	NA	SPICE1,SIDT1	NA	NA	NA	NA	SPICE1	22533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	113470106	113470294	113470144	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	6240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	113473473	113473635	113473557	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	9607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	114078948	114079017	114078985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	305488	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	114100743	114101091	114100917	Y	ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	327283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	114144881	114145214	114145066	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	371421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	114146274	114146539	114146501	Y	ZDHHC23,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	372814	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	114229118	114229529	114229296	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	455658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	114289543	114289832	114289667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	516083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	114349924	114350199	114350024	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	513919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	114354102	114354718	114354116	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	509400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	114373701	114374062	114373901	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	490056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	114374818	114375057	114374945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	489061	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	114577698	114578255	114577941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	285863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	114724447	114724794	114724621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	139324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	115337526	115337854	115337690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	473408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	115595102	115595314	115595123	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	730984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	115863058	115863426	115863241	Y	LSAMP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	880119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	115941110	115941531	115941311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	802014	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	116145742	116145918	116145863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	597627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	116795917	116796024	116795971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	52372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119237356	119237846	119237595	Y	ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH,TMEM39A,POGLUT1	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	21977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	119289113	119289616	119289250	Y	ARHGAP31,CD80,COX17,ADPRH	ADPRH,PLA1A	TIMMDC1,ADPRH,PLA1A,POPDC2	IMR90	Hi-C	24141950	ADPRH	6499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119315385	119315520	119315495	Y	TMEM39A,POGLUT1,CD80,ADPRH,COX17	ADPRH,PLA1A,RP11-190C22.1	NA	NA	NA	NA	PLA1A	696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	119326663	119326906	119326785	Y	NA	ADPRH,PLA1A,RP11-190C22.1	NA	NA	NA	NA	PLA1A	11974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119357693	119358081	119357897	Y	GSK3B,ARHGAP31,ADPRH	PLA1A,RP11-190C22.1,COX17	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	4696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR1I2	147056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	120355972	120356358	120356256	Y	NA	NDUFB4,HGD	NA	NA	NA	NA	NDUFB4	42816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	120361404	120361730	120361550	Y	NA	NDUFB4,HGD	NA	NA	NA	NA	HGD	37688	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	120819033	120819273	120819055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5L	194114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	120857899	120858271	120857953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5L	232980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	120895438	120895899	120895449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5L	270519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	121149194	121149225	121149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	61732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	121474851	121475213	121475072	Y	NA	GOLGB1	GOLGB1	K562	ChIA-PET	22265404	GOLGB1	8249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	122151664	122151964	122151814	Y	NA	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	122464996	122465160	122465078	Y	PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	45511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	123388051	123388291	123388171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	85662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	124188163	124188429	124188181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	258784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	NA	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	HEG1	191610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	125235229	125235600	125235483	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	1441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	126074775	126075511	126074965	Y	ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15	KLF15	NA	NA	NA	NA	KLF15	490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	126359707	126359720	126359714	Y	NA	TXNRD3NB,TXNRD3	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	12278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	127469268	127470071	127469577	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	79490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	128135736	128135843	128135790	Y	GATA2,GATA2,GATA2,C3orf27,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	262075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128327283	128327483	128327387	Y	GATA2,GATA2,GATA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	70435	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128329972	128330294	128330133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	67624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128337505	128337705	128337543	Y	KIAA1257,GP9	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	60213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	128538992	128539042	128539017	Y	DNAJB8,C3orf27	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	57131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128735204	128735460	128735306	Y	NA	KIAA1257	GP9	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1257	15671	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	128822143	128822374	128822225	Y	H1FOO	RAB43	NA	NA	NA	NA	RAB43	17270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128837764	128838022	128837873	Y	MBD4,H1FX,C3orf37,C3orf37,KIAA1257,ISY1,CNBP,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	1622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	128838520	128838686	128838629	Y	MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	128964355	128964687	128964560	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	63590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	129344975	129345039	129344984	Y	NA	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	21314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	131168625	131168945	131168770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL3	50882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	132138974	132139193	132139084	Y	NA	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	4604	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	132164768	132165015	132164817	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	30398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	134206320	134206511	134206427	Y	CEP63,CEP63,CEP63	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	ANAPC13	2762	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	136067042	136067151	136067097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	99894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	136533824	136534225	136534025	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	44671	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	137938227	137938395	137938336	Y	ARMC8	DBR1,ARMC8	NA	NA	NA	NA	ARMC8	34118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	138109159	138109469	138109274	Y	NA	MRAS,ESYT3	NA	NA	NA	NA	ESYT3	41959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.74567928050922
chr3	139253953	139254145	139254018	Y	NA	RBP1	NA	NA	NA	NA	RBP1	2526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	139715933	139715982	139715958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	63906	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	139824639	139824888	139824698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	172612	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	139898460	139898757	139898544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	246433	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	139909278	139909663	139909338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	257251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	139922309	139922336	139922321	Y	CLSTN2	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	270282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr3	140005716	140005856	140005800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	353689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	140077980	140078337	140078159	Y	CLSTN2	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	425953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	140126617	140126801	140126710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	474590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	140186013	140186197	140186105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	472475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	140491226	140491601	140491296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	167071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	140814051	140814257	140814186	Y	NA	SPSB4	NA	NA	NA	NA	SPSB4	45807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	140960734	140961103	140960784	Y	ACPL2	ACPL2	NA	NA	NA	NA	ACPL2	15166	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	141129371	141129776	141129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	74113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	141173878	141174028	141173977	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	29861	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	141174545	141175038	141174891	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28851	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	141515444	141515577	141515511	Y	TFDP2,GK5,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF7	60398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	141746457	141746834	141746789	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	14206	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	141758240	141758617	141758356	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	2423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	141833838	141834123	141833981	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	32263	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	142164400	142165110	142164972	Y	XRN1	NA	NA	NA	NA	NA	XRN1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	143550197	143550392	143550264	Y	C3orf58	SLC9A9	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	14981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	143693787	143694146	143693885	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	5147	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	143696383	143696503	143696442	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	7743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	143853302	143853504	143853403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	164662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	144134299	144134312	144134306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	445659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR2,PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR2,PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	148320086	148320294	148320209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPB1	186595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	148781596	148781850	148781723	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20491	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	148781933	148782210	148782183	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF4	84696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	149194266	149194620	149194394	Y	CP,TM4SF4	TM4SF4,RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	TM4SF4	4505	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	149666531	149666918	149666689	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	17254	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	15530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	149669691	149669713	149669697	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	14459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	150417166	150417289	150417212	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A	NA	NA	NA	NA	RP11-103G8.2	2062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	150482569	150482635	150482602	Y	NA	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2	3305	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	150987276	150987626	150987385	Y	P2RY12,MED12L	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	185792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	151507223	151507685	151507381	Y	NA	RP11-64D22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-64D22.2	21007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	151922139	151922351	151922251	Y	AADACL2	MBNL1	MBNL1,LOC401093	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MBNL1	37266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	151923088	151923367	151923343	Y	MBNL1	MBNL1	MBNL1,LOC401093	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MBNL1	36250	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	41561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	152091128	152091426	152091240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	105784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	152120876	152121103	152120983	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	135532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	155281187	155281565	155281523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCH1	179291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	156210737	156211059	156210900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	59914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	156229646	156229758	156229715	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	41215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	156402848	156403019	156402937	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	12681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	156444390	156444661	156444493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	54223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	156480605	156480801	156480703	Y	NA	PA2G4P4	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	45720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	156558833	156558838	156558836	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	17563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	156839965	156840160	156840071	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1	NA	NA	NA	NA	CCNL1	36389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	158070419	158070585	158070503	Y	MFSD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-538P18.2	216270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-538P18.2	60001	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	159647586	159647883	159647684	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4	IMR90	Hi-C	24141950	SCHIP1	91936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	159765726	159765787	159765757	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf80	175636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	159983948	159984179	159984064	Y	NA	C3orf80	NA	NA	NA	NA	C3orf80	42525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	160714920	160715128	160715024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	105356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	160735129	160735256	160735193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	85228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	163153271	163153291	163153281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SI	1640992	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	163939562	163939697	163939594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SI	854586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	165102012	165102226	165102071	Y	SLITRK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-85M11.2	179264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	167181640	167181820	167181812	Y	SERPINI2	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	84506	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	167737805	167738014	167737910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	73749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	169299138	169299197	169299168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	80209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	170841724	170842009	170841889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	217242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171279805	171280182	171279912	Y	PLD1,FNDC3B	NA	SLC2A2,TNIK,EIF5A2,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	PLD1	246558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171789788	171790157	171789907	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	34370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171792323	171792831	171792493	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	36905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171825348	171825521	171825406	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	69930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	171863188	171863575	171863224	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	107770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171878014	171878468	171878150	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	122596	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171897555	171897878	171897648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	142137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171935922	171936083	171936003	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	180504	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	173176022	173176131	173176077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	63948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	173197299	173197871	173197356	Y	NLGN1	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	85225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	173767282	173767499	173767320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	325535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr3	173789505	173789779	173789642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	303255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	173790508	173790769	173790639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	302265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	173873395	173873401	173873398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	219633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	174055038	174055321	174055185	Y	NA	RP11-393N4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	37713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	176504226	176504517	176504371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	408744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	176776147	176776153	176776150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	137108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	176916249	176916425	176916364	Y	NA	TBL1XR1	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	2988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	177234134	177234201	177234168	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	298452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	177542015	177542147	177542058	Y	NA	RP11-91K9.1	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	9362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	177548160	177548535	177548360	Y	NA	RP11-91K9.1	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	15507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	177623365	177623625	177623388	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	90712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	177979552	177979945	177979765	Y	NA	KCNMB2	NA	NA	NA	NA	KCNMB2	8775	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	178226659	178226898	178226744	Y	NA	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-33A14.1	125454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	178236576	178236655	178236649	Y	KCNMB2	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-33A14.1	135371	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	178236932	178237225	178237103	Y	KCNMB2,KCNMB2	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-33A14.1	135727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	178239862	178239999	178239925	Y	NA	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-33A14.1	138657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr3	178423779	178424120	178423952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33A14.1	322574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	178432864	178433172	178432931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33A14.1	331659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	178435674	178435882	178435779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33A14.1	334469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	178532692	178532946	178532777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	255121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	178699167	178699475	178699434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	88592	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	178752797	178753279	178753036	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	34788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	178754661	178754788	178754723	Y	KCNMB3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	33279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	178787910	178788066	178787991	Y	ZMAT3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	179161841	179162229	179161903	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	5149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	179372057	179372188	179372123	Y	NA	USP13	NA	NA	NA	NA	USP13	3514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	179550123	179550276	179550202	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	181580	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	179603641	179603964	179603803	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	235098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	179659956	179660305	179660211	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	291413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	179671739	179671761	179671750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	303196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	179685404	179685725	179685692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	316861	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	179687230	179687579	179687379	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	318687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	181132362	181132384	181132378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	295330	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	181414061	181414442	181414162	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	13272	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	181443678	181444149	181443742	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	15964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr3	181473928	181474194	181474085	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	46214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	181500507	181500584	181500556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	72793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	181674999	181675167	181675083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	247285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	181876844	181877235	181877011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	449130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	182973593	182973879	182973736	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	182980670	182980835	182980709	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr3	183067117	183067522	183067194	Y	KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	77044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	183231092	183231442	183231267	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	86526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf70	140855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	184775166	184775451	184775309	Y	VPS8	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf70	93351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2,RP11-537I16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-537I16.2	16653	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	186252092	186252491	186252158	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	DNAJB11,TBCCD1	NA	NA	NA	NA	DNAJB11	30701	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr3	187004502	187004623	187004526	Y	MASP1	MASP1	NA	NA	NA	NA	MASP1	3187	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	187697421	187697657	187697609	Y	NA	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2,LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	LPP-AS2	172188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	188103161	188103345	188103235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	233316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	189508534	189508810	189508672	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	529454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	190252374	190252607	190252502	Y	CLDN1,IL1RAP	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	22534	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	190336230	190336434	190336308	Y	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	106390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	191620991	191621297	191621143	Y	PYDC2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	576125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	191781460	191781643	191781536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	701910	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	192315409	192315812	192315620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	167741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	192332888	192333028	192332958	Y	FGF12	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	150525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	192369931	192370325	192369972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	113228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	192414098	192414374	192414109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	69179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	11.6187320315915
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	193689142	193689560	193689382	Y	ATP13A3,OPA1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-407B7.1	97199	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	193993457	193993565	193993509	Y	NA	NA	LOC647323,LOC100131551	IMR90	Hi-C	24141950	HES1	141523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	194210438	194211060	194210799	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	6033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	194292309	194292723	194292589	Y	NA	TMEM44-AS1	FLJ34208,ATP13A3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	10017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	194981425	194981579	194981527	Y	ACAP2	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	8317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	195258657	195259038	195258847	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	9171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	195632869	195633225	195632990	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	173835	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	195946520	195946837	195946671	Y	LRRC33,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	65991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	196105226	196105537	196105382	Y	PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	UBXN7	51808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	196208308	196208582	196208445	Y	NA	RNF168	NA	NA	NA	NA	RNF168	20057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr3	196761683	196762044	196761813	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	MFI2-AS1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	MFI2	6996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	196948967	196949228	196949097	Y	NA	NA	MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	74943	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	83185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr3	197840450	197840806	197840557	Y	LRCH3,IQCG	NA	LMLN,ANKRD18DP	IMR90	Hi-C	24141950	LMLN	155379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	765995	766248	766202	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	7389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	926994	927308	927151	Y	NA	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	2819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	1184509	1184886	1184846	Y	RNF212,CRIPAK	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	15864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	1237849	1238004	1237927	Y	NA	SPON2,CTBP1,MAEA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	3737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	1968542	1968629	1968571	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	73060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	1970462	1970680	1970571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	71009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	3372879	3372940	3372901	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	80124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	5587454	5587568	5587511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	121707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	5671799	5672167	5671822	Y	CRMP1	EVC2,EVC	NA	NA	NA	NA	EVC2	37108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	6171690	6172033	6171999	Y	PPP2R2C,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	28285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	6172675	6172972	6172793	Y	NA	JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	27346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	6223621	6224023	6223692	Y	PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	JAKMIP1,WFS1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	23303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	6278017	6278414	6278100	Y	PPP2R2C,CRMP1,JAKMIP1	WFS1	NA	NA	NA	NA	WFS1	8441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr4	6311062	6311148	6311105	Y	NA	WFS1	NA	NA	NA	NA	WFS1	41486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	6732812	6732932	6732874	Y	TBC1D14,TBC1D14	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	23205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	6912537	6913143	6912820	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	3568	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	6928884	6929127	6929009	Y	KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	19915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	7142827	7143002	7142919	Y	NA	NA	SORCS2,AFAP1-AS1,AFAP1	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL1	74903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	7834057	7834311	7834184	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	105342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	7877911	7878253	7878055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	61400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	8546577	8546699	8546638	Y	LOC650293,GPR78	NA	ACOX3,METTL19,GPR78,CPZ	IMR90	Hi-C	24141950	ACOX3	106127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	9605717	9605843	9605777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A9	448717	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	10459917	10460083	10460004	Y	NA	ZNF518B	NA	NA	NA	NA	ZNF518B	2883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	12547084	12547157	12547119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	93104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	12731127	12731400	12731265	Y	NA	NA	LOC285547,LOC285548,NKX3-2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-352E6.2	90866	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	13250215	13250573	13250395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	82465	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	50346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	13329661	13329866	13329822	Y	NA	HSP90AB2P	HSP90AB2P	IMR90	Hi-C	24141950	HSP90AB2P	3172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	15297006	15297030	15297019	Y	NA	NA	C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	172459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	15368371	15368749	15368556	Y	CD38,CPEB2,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	100740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	15488697	15488958	15488934	Y	NA	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	19208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	17495942	17496188	17496050	Y	MED28,LAP3	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	15669	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	17938692	17938903	17938798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCORL	82596	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	21930853	21931229	21931116	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	584448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	22270180	22270523	22270471	Y	NA	NA	LOC100505912	IMR90	Hi-C	24141950	GPR125	245154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr4	23879721	23879980	23879976	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	23732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	23890124	23890507	23890316	Y	PPARGC1A	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	13205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	25828026	25828318	25828201	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	35064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	26886069	26886538	26886211	Y	TBC1D19,STIM2	STIM2,RP11-293A21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	25848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	27012249	27012271	27012260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	152028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	34995876	34996042	34995959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1248089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	36191564	36191723	36191675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	52408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	38077689	38078094	38077874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	117633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	38084338	38084956	38084492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	124282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	38101433	38101948	38101596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	141377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	38673994	38674276	38674074	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	9490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	38674773	38675062	38674906	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	10269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	38679741	38680082	38679809	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	15237	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	38735219	38735515	38735398	Y	NA	TLR10	KLF3,TBC1D1,FLJ13197	IMR90	Hi-C	24141950	TLR10	47096	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	39038547	39038755	39038651	Y	NA	KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	5904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	39813102	39813401	39813252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2K	115438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	40165955	40166245	40166174	Y	NA	RHOH	NA	NA	NA	NA	RHOH	24428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	120938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	40791893	40792102	40791997	Y	NSUN7	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	41979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	42819226	42819612	42819419	Y	ATP8A1,GRXCR1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A1	162104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	45867500	45867852	45867676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA2	607395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	45914442	45914779	45914611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA2	560468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	48727605	48727679	48727642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRYL	52660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	48753826	48753871	48753849	Y	NA	FRYL	NA	NA	NA	NA	FRYL	26468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	53023897	53024042	53023970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA18	108400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	RASL11B	NA	NA	NA	NA	RASL11B	383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	53862934	53863152	53863043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	136477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	53890542	53890886	53890882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	164085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	53921700	53922021	53921911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	195243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54032997	54033196	54033097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	197046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54568898	54569145	54569018	Y	CHIC2	NA	SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	FIP1L1	327088	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54771921	54772318	54772120	Y	NA	NA	FIP1L1,LNX1,SCFD2,RPL21P44,CHIC2,GSX2,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	156539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54866446	54866641	54866544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	62216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54890749	54890967	54890889	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	37890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54928262	54928437	54928381	Y	NA	CHIC2,GSX2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2,GSX2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54951124	54951140	54951133	Y	NA	CHIC2,GSX2	SCFD2,CHIC2,FIP1L1,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	GSX2	12550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2,GSX2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	GSX2	5555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr4	55093024	55093294	55093182	Y	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	55093767	55093987	55093860	Y	NA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	57048653	57048701	57048677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	171600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	57152895	57152955	57152925	Y	KIAA1211,ARL9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	67346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	57459098	57459424	57459263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THEGL	64323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	62068799	62069364	62069049	Y	LPHN3	LPHN3	NA	NA	NA	NA	LPHN3	3823	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	62161520	62161812	62161666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN3	96544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	62212497	62212753	62212605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN3	147521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	62258611	62258962	62258787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN3	193635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr4	62391434	62391750	62391592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	247818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	62735817	62735992	62735905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	96249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	62769366	62769586	62769476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	129798	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	65473910	65474488	65474148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	179283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	65475793	65476032	65475913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	181166	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	365752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	426377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr4	67438719	67438955	67438878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-584P21.4	871030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	67972662	67972987	67972824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-584P21.4	336998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	71695000	71695080	71695041	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	8582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	71768830	71769244	71769107	Y	DCK,MOBKL1A	MOB1B	NA	NA	NA	NA	MOB1B	2787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	71861834	71861975	71861905	Y	IGJ,MOBKL1A,DCK	DCK	NA	NA	NA	NA	DCK	5579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	74464812	74465326	74464976	Y	RASSF6,RASSF6	RASSF6	NA	NA	NA	NA	RASSF6	19022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr4	74472194	74472476	74472318	Y	RASSF6,RASSF6	RASSF6	NA	NA	NA	NA	RASSF6	11872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	74600882	74601361	74601097	Y	ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL8	2862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	75097904	75098121	75097961	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	120013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	75945312	75945392	75945352	Y	PARM1	NA	NA	NA	NA	NA	PARM1	89007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	76837000	76837401	76837201	Y	NA	NAAA	NA	NA	NA	NA	NAAA	22803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	77121153	77121281	77121217	Y	NA	SCARB2,FAM47E	NA	NA	NA	NA	SCARB2	11765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	77133814	77134170	77133987	Y	NAAA,CXCL10,CXCL11	SCARB2,FAM47E	NA	NA	NA	NA	FAM47E	621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	77665499	77665596	77665548	Y	STBD1,SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	203260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	77931984	77932418	77932077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNI	62740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	78016666	78016743	78016704	Y	CCNG2	CCNI	SHROOM3,CCNG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCNI	21508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	78656019	78656351	78656260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	82418	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	196220	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	79671266	79671448	79671350	Y	BMP2K	BMP2K	LOC100505702,FRAS1,ANXA3,BMP2K	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP2K	24048	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	80900549	80900754	80900650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	143854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	80958042	80958450	80958250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	86158	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	81199073	81199101	81199087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf22	55773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	81392904	81393098	81393001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf22	138030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	82416605	82416972	82416704	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	546425	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	82434115	82434502	82434253	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	528895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	82646318	82646551	82646422	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	316846	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	83383009	83383387	83383198	Y	NA	ENOPH1	NA	NA	NA	NA	ENOPH1	33294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	83419173	83419188	83419181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOPH1	69458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP9	63864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	84029980	84030193	84029996	Y	NA	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	26035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	84196492	84196601	84196547	Y	NA	COQ2	NA	NA	NA	NA	COQ2	7466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	84887961	84887976	84887969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	432894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	85047369	85047537	85047456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	454595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	85797280	85797425	85797336	Y	WDFY3	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	88113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	86435968	86436285	86436110	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	41701	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	86664396	86664842	86664610	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	270129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	87048261	87048368	87048363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK10	464916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	63604	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	88074850	88075090	88074969	Y	DSPP	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	84376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	88310144	88310324	88310202	Y	AFF1,HSD17B11	HSD17B11,NUDT9	NA	NA	NA	NA	HSD17B11	214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	88443267	88443740	88443428	Y	DSPP,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	101533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	89677444	89677595	89677520	Y	FAM13A	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	60058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	89922113	89922454	89922284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	108095	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	90174156	90174307	90174302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	52854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	90215736	90216024	90215874	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	11137	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	90220005	90220418	90220105	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	6743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	90226723	90227111	90227016	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	50	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	90850750	90851156	90851023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	93284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	92218724	92218762	92218742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	1461258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	92239234	92239407	92239321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	1481768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	96332977	96333151	96333005	Y	UNC5C	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR1B	655858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	99344407	99344641	99344524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	163872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	99469455	99469759	99469656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	108021	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	99575135	99575326	99575229	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	99845137	99845196	99845164	Y	NA	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	4592	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	101989384	101989498	101989458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	277439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	102113415	102113532	102113437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	153405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	102200557	102200885	102200839	Y	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	66052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	102237823	102238346	102238192	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	28591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	102243269	102243535	102243491	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	23402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	102254740	102255090	102255043	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	11847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	103541931	103542312	103542286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	121445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	103608721	103609347	103609253	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	70804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	RP11-10L12.4	3214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	104228091	104228235	104228147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	110525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	106112779	106113198	106113105	Y	TET2,TET2	TET2	NA	NA	NA	NA	TET2	47747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	106114825	106115208	106114882	Y	NA	TET2	NA	NA	NA	NA	TET2	49793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	106227483	106227804	106227645	Y	TET2,TET2	NA	NA	NA	NA	NA	TET2	162451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	106383790	106383988	106383871	Y	TET2,TET2	PPA2	NA	NA	NA	NA	PPA2	9250	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	109047956	109048357	109048341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	139086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	109318263	109318610	109318312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34-AS1	221006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	110125324	110125640	110125483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24B	227288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	110464231	110464470	110464351	Y	NA	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	14891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	110623287	110623426	110623357	Y	LRIT3	CASP6,PLA2G12A	NA	NA	NA	NA	CASP6	548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr4	112913088	112913237	112913174	Y	TIFA,AP1AR	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	151316	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	113095488	113095850	113095539	Y	NA	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	30935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,TIFA	NA	NA	NA	NA	TIFA	23753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	114104327	114104616	114104364	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	234863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	114312053	114312195	114312124	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	27284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	114366444	114366711	114366574	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	26965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	114367129	114367387	114367298	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	27650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	114382932	114383313	114383209	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	43453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	114390310	114390498	114390393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	50831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	114525266	114525292	114525279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	155791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	114554794	114555018	114554909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	126065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	114563561	114563906	114563734	Y	CAMK2D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	117177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	116470249	116470634	116470442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDST4	437217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM1L1	484131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	119187150	119187543	119187362	Y	NA	SNHG8	NA	NA	NA	NA	SNHG8	10321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	121265421	121265690	121265531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	279192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	121670758	121670998	121670880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM5	171027	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	129494967	129495325	129495148	Y	NA	NA	LARP1B,PHF17,PGRMC2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	286983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	129733811	129733921	129733891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	278551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	129834414	129834678	129834574	Y	PHF17,SCLT1,C4orf33,C4orf33	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	177794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	134191473	134191538	134191506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-553P9.3	1851396	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	139156559	139157143	139156950	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	4360	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr4	140074901	140075184	140075104	Y	NA	ELF2	CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1	IMR90	Hi-C	24141950	ELF2	21188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	140650307	140650710	140650510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	65385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140696118	140696274	140696196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	111196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140727942	140728268	140728103	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	143020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140737173	140737338	140737263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	152251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140793640	140793753	140793693	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	208718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140850270	140850709	140850607	Y	MAML3,CLGN	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	222629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140868265	140868315	140868290	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	205023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140891718	140892054	140891918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	181284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	140986447	140986603	140986580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	86735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	141019887	141020108	141020058	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	53230	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	141020500	141020888	141020694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	52450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	141021103	141021485	141021348	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	51853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	141071159	141071540	141071326	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	1798	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	141164479	141164682	141164571	Y	MAML3	SCOC	MAML3,MGST2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCOC	11758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	141209212	141209581	141209237	Y	NA	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	32772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	141218386	141218686	141218436	Y	MAML3,SCOC	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41946	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	143521441	143521512	143521455	Y	INPP4B	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	245073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	144280232	144280410	144280287	Y	USP38,SMARCA5,GAB1	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	24317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	146674591	146674889	146674740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	137176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	146703198	146703494	146703347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	154293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	146764373	146764705	146764540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	93082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	146815736	146815927	146815832	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	41860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	147192653	147192904	147192792	Y	ZNF827,SLC10A7	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	97816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	147194396	147194957	147194565	Y	ZNF827,LSM6	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	99559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	147710837	147711224	147710894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU4F2	152792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	149109723	149110098	149109949	Y	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	253752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	149124468	149124612	149124541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	239238	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	149364278	149364693	149364534	Y	NR3C2	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NR3C2	428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	149366972	149367375	149367074	Y	NA	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NR3C2	3122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	151264145	151264674	151264371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	670205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	151681778	151681989	151681952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	252890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-610P16.1	101672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	152582106	152582499	152582283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PET112	97676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	189693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	153412522	153412921	153412842	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	42332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	153424227	153424394	153424311	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	30859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	9125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	154235645	154236052	154235798	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	27749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	154248193	154248592	154248328	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	15209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	194968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	158165713	158165951	158165760	Y	GRIA2,GRIA2	GRIA2	NA	NA	NA	NA	GRIA2	42379	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	158186667	158186917	158186738	Y	PDGFC,GLRB,GLRB	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA2	63333	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	158219771	158220072	158219781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA2	96437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr4	158245873	158246053	158245956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA2	122539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	158815027	158815407	158815217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-597D13.9	274497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	159112760	159112996	159112870	Y	TMEM144	RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	TMEM144	7760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	159717804	159718257	159718169	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	29514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	159740045	159740169	159740127	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	51755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	162371144	162371411	162371278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL5	711776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	162625637	162625896	162625763	Y	FSTL5	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL5	457291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	162684841	162685083	162684938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL5	398104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	163021917	163022313	163022263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL5	60874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	200219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	164688247	164688444	164688347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	424263	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	164780413	164780536	164780475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	516429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	612373	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA3P	651653	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr4	168154040	168154351	168154284	Y	SPOCK3,SPOCK3	SPOCK3	NA	NA	NA	NA	SPOCK3	93	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	169420329	169420517	169420424	Y	NA	PALLD,DDX60L	NA	NA	NA	NA	PALLD	4112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	169722239	169722366	169722303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	207060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	170026437	170026753	170026620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	97011	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	173077271	173077317	173077294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	1010587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr4	174106562	174106852	174106704	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	17759	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	174667670	174667818	174667761	Y	HAND2	NA	NA	NA	NA	NA	RANP6	114148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	174945090	174945120	174945105	Y	HAND2	NA	NA	NA	NA	NA	CEP44	257708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	175148409	175148685	175148547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP44	54143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	176340355	176340496	176340426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRA3	591890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	176340534	176340934	176340734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRA3	592069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	176349248	176349641	176349474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRA3	600783	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	176452577	176452812	176452695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	532173	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	178362238	178362457	178362307	Y	NA	AGA	NA	NA	NA	NA	AGA	581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	179336968	179337246	179337206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	300953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	180219335	180219346	180219341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1183320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	182230221	182230632	182230434	Y	NA	RP11-665C14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-665C14.2	46039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr4	182397139	182397379	182397259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-665C14.2	212957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	182826694	182826707	182826700	Y	NA	NA	ODZ3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-665C14.2	642512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	183133398	183133793	183133630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	703296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	183353287	183353302	183353295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	483787	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	183536176	183536411	183536208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	300678	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	185214730	185214925	185214872	Y	IRF2	NA	IRF2,CCDC111,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	178809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	185296048	185296446	185296396	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	97288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr4	185331149	185331516	185331503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	62218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	185740732	185741181	185740991	Y	NA	ACSL1	NA	NA	NA	NA	ACSL1	4791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	186455582	186456046	186455940	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	186481104	186481365	186481225	Y	NA	PDLIM3	PDLIM3,SORBS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM3	26338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	186487747	186487895	186487817	Y	UFSP2	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	32981	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	40301	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	186594730	186595126	186594900	Y	SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SNX25	RP11-626E13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-626E13.1	9691	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr4	186621921	186622234	186622189	Y	NA	RP11-626E13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-626E13.1	36882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	186650716	186651019	186650922	Y	SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-626E13.1	65677	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	188533466	188533620	188533609	Y	NA	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-713C19.1	492092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	190504163	190504534	190504471	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	124334	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.40025573299325
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	18.0008524433108
chr5	148457	148511	148484	Y	NA	PLEKHG4B	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4B	10084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	175502	175522	175512	Y	NA	PLEKHG4B,CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4B	37129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	366173	366499	366337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHRR	63882	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	486422	486571	486496	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5,SLC9A3	NA	NA	NA	NA	CTD-2228K2.5	15209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	523225	523441	523256	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	1239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.27288226242015
chr5	757060	757343	757251	Y	TPPP	NA	ZDHHC11,SLC9A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	65550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	758121	758535	758359	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,BRD9,CEP72,TRIP13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	66611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC11	64078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	11.2914438053495
chr5	1182870	1183091	1183042	Y	SLC6A19,SLC6A18	NA	LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	72720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	23280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	2669640	2670190	2669944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	870126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	6449899	6450414	6450093	Y	UBE2QL1	UBE2QL1	NA	NA	NA	NA	UBE2QL1	3163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	6452962	6453210	6453103	Y	NA	UBE2QL1	NA	NA	NA	NA	UBE2QL1	6226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	6485735	6486094	6485897	Y	NA	UBE2QL1	NA	NA	NA	NA	UBE2QL1	38999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	6.87305275108232
chr5	7397224	7397590	7397441	Y	C5orf49,ADCY2	ADCY2	NA	NA	NA	NA	ADCY2	2903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr5	7421559	7421813	7421686	Y	NA	ADCY2	NA	NA	NA	NA	ADCY2	27238	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	7607273	7607485	7607393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY2	212952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	7662909	7663198	7663053	Y	ADCY2,C5orf49	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	186101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	7784884	7784893	7784889	Y	ADCY2	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	64406	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	7803003	7803387	7803159	Y	MTRR	MTRR,C5orf49	NA	NA	NA	NA	MTRR	45912	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	7824130	7824491	7824311	Y	ADCY2,C5orf49	MTRR,C5orf49,FASTKD3	NA	NA	NA	NA	MTRR	24808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	8843874	8844185	8844159	Y	NA	NA	SEMA5A	IMR90	Hi-C	24141950	FASTKD3	976724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	9681641	9681655	9681648	Y	NA	NA	TAS2R1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM173B	566354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	10270287	10270466	10270406	Y	NA	FAM173B,CCT5,CMBL	NA	NA	NA	NA	CCT5	22254	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	10692588	10692818	10692805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	66566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	11035965	11036506	11036174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	276581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	11524882	11524979	11524955	Y	CTNND2	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	377176	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	12099131	12099529	12099330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	196976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	12331154	12331499	12331312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	428999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	12658501	12658830	12658774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	756346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14109130	14109647	14109337	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32164	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14174472	14174896	14174531	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	32661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14178655	14179133	14178814	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	36844	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14208730	14209007	14208812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14668408	14668752	14668531	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	5635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14739809	14739939	14739877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	56570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	14926139	14926359	14926282	Y	NA	NA	FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	56252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	16133001	16133217	16133109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	330684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	16309962	16310362	16310162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	153539	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	16539355	16539674	16539525	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	75454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	17177639	17177702	17177672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	113932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	118211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	93865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	17255490	17256325	17255691	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	87400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	17401080	17401430	17401245	Y	BASP1	FTH1P10	BASP1,LOC285696	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P10	48347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	21392233	21392585	21392409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	52291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	21539943	21540207	21540075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	200001	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	21933936	21933993	21933965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPD1P1	53242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	24595497	24595875	24595702	Y	CDH10	CDH10	NA	NA	NA	NA	CDH10	47212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	25098064	25098181	25098123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	90584	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	25424909	25424931	25424920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	236144	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	25443137	25443499	25443483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	254372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	25456035	25456404	25456210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	267270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	32349231	32349269	32349250	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	38116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	34001406	34001643	34001533	Y	AMACR	AMACR,C1QTNF3	NA	NA	NA	NA	AMACR	4577	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	34006520	34007060	34007033	Y	C1QTNF3,AMACR	AMACR,C1QTNF3	NA	NA	NA	NA	AMACR	300	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr5	34037436	34037722	34037670	Y	NA	AMACR,C1QTNF3	NA	NA	NA	NA	C1QTNF3	4215	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR,C1QTNF3	NA	NA	NA	NA	C1QTNF3	6534	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	34835599	34835693	34835610	Y	NA	TTC23L	NA	NA	NA	NA	TTC23L	1245	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	35136467	35136726	35136597	Y	PRLR	NA	NA	NA	NA	NA	PRLR	92068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	35159419	35159781	35159689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLR	69013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	35220570	35220626	35220598	Y	AGXT2,PRLR	PRLR	NA	NA	NA	NA	PRLR	8168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	35784597	35784905	35784716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPSL	151976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	36030784	36031024	36030904	Y	UGT3A2	UGT3A1,UGT3A2	NA	NA	NA	NA	UGT3A1	31654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	36119586	36119746	36119728	Y	SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	30317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	36229884	36229947	36229916	Y	UGT3A1,C5orf33,C5orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	79793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	36689194	36689678	36689532	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	33619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	32421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	36898243	36898633	36898363	Y	NIPBL	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NIPBL	23382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	53296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	37102128	37102249	37102189	Y	NA	RPS4XP6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	18970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	37209037	37209204	37209072	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	38326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	37311676	37311784	37311730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP155	57499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	NA	NA	NA	NA	NA	LIFR	159970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	38680372	38680698	38680535	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90	Hi-C	24141950	LIFR	73916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	39014770	39014929	39014863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	57581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	39025065	39025383	39025224	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	47127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	39069838	39069965	39069908	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	2545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	39141974	39141983	39141979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	69464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	39210009	39210436	39210253	Y	RICTOR	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	137499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	40263385	40263650	40263545	Y	NA	NA	PTGER4,TTC33	IMR90	Hi-C	24141950	TTC33	490427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	41294971	41295128	41295059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD3	213602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	41446274	41446654	41446465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD3	62076	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	41465247	41465490	41465440	Y	PLCXD3	PLCXD3	NA	NA	NA	NA	PLCXD3	43240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	41497221	41497345	41497332	Y	NA	PLCXD3	NA	NA	NA	NA	PLCXD3	11385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	41509799	41509858	41509829	Y	PLCXD3	PLCXD3	NA	NA	NA	NA	PLCXD3	1069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	41856929	41857024	41856977	Y	NA	OXCT1,C5orf51	NA	NA	NA	NA	OXCT1	11597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	42505068	42505257	42505244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHR	83189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43034859	43034967	43034962	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC648987	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC025171.1	4710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43105884	43106284	43106088	Y	NA	ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC153684,LOC100132356,ZNF131	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2201E18.3	40363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43303282	43303485	43303367	Y	NA	HMGCS1	NA	NA	NA	NA	HMGCS1	8129	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	43632069	43632220	43632145	Y	NA	NNT,NNT-AS1	NA	NA	NA	NA	NNT-AS1	30737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	49989954	49990143	49990051	Y	EMB,PARP8	PARP8	NA	NA	NA	NA	PARP8	30221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	52155124	52155267	52155195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELO	73350	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	180211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	203990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	53466021	53466779	53466401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	137633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	53848607	53848967	53848787	Y	NA	SNX18	NA	NA	NA	NA	SNX18	37018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	53879713	53879860	53879787	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	68124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	53886788	53887029	53886875	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	75199	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	54033914	54034212	54034128	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	222325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	54777886	54777973	54777929	Y	SKIV2L2	RNF138P1	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	46556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	55288370	55289209	55288952	Y	IL6ST	NA	NA	NA	NA	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	56131312	56131556	56131415	Y	GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1	MAP3K1	NA	NA	NA	NA	MAP3K1	21911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	58134614	58134758	58134713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	258566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	483836	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	58375824	58376057	58376052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	499776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	58395760	58396044	58395902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	519712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	58418380	58418697	58418552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	542332	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	58420146	58420252	58420199	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	544098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	547263	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	58428038	58428165	58428144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	551990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	58575824	58576193	58576112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	699776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	58866470	58866828	58866806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	949119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	58874550	58874813	58874554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	941134	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	58952543	58952885	58952791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	863062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	729270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	59917855	59917860	59917858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	76157	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	60258688	60258981	60258835	Y	NA	ERCC8,NDUFAF2	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	19732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	60751661	60751965	60751750	Y	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	65963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	60921621	60921766	60921694	Y	C5orf64	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	235923	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	60930420	60930711	60930566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	244722	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	61917589	61917885	61917879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKS1B	111280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	63506762	63506909	63506842	Y	NA	RNF180	NA	NA	NA	NA	RNF180	47091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	64056126	64056496	64056311	Y	NA	SREK1IP1,CWC27	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	6016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	64727937	64728302	64728145	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	47445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	64809602	64809952	64809754	Y	NA	ADAMTS6,CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	33855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	65220429	65221204	65220462	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	65228217	65228394	65228309	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	7914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	65329982	65330329	65330156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	103470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	28070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr5	65932774	65933082	65932801	Y	NA	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	42598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	66014464	66014844	66014629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4	124288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	MAST4-AS1	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	8847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	67066519	67066839	67066639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	442709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	67103829	67104163	67104152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	405385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	67410541	67410768	67410614	Y	PIK3R1,PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	98780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	67875476	67875860	67875665	Y	PIK3R1	CTC-537E7.2	NA	NA	NA	NA	CTC-537E7.2	48119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	70938164	70938422	70938252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC2	57049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	70991073	70991448	70991288	Y	NA	CARTPT	NA	NA	NA	NA	CARTPT	21542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	71481497	71481884	71481610	Y	MAP1B	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	80436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	71896178	71896784	71896469	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	213355	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	71998945	71999238	71999064	Y	NA	NA	ZNF366,TNPO1	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	110901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	72138720	72138932	72138785	Y	TNPO1	TNPO1	NA	NA	NA	NA	TNPO1	28581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	72234221	72234359	72234290	Y	FCHO2	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	15449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	72511984	72512100	72512037	Y	FOXD1	RP11-60A8.1	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	4210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	RP11-60A8.1	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	4537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr5	72599094	72599410	72599166	Y	NA	NA	FCHO2,BTF3,FOXD1,TMEM171	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	91320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	72715317	72715478	72715398	Y	NA	FOXD1	FCHO2,TMEM171,TMEM174,FOXD1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	26874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	72764124	72764182	72764153	Y	NA	FOXD1,BTF3	FCHO2,TMEM174,FOXD1,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	21772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	72880420	72880664	72880571	Y	NA	UTP15,ANKRA2	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	20909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	73439577	73439790	73439675	Y	ENC1	NA	RGNEF,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	HEXB	494058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	75763076	75763442	75763238	Y	IQGAP2,S100Z	NA	NA	NA	NA	NA	IQGAP2	66002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	76086859	76087104	76086921	Y	F2R,F2RL1	NA	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2R	76991	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	76422152	76422524	76422338	Y	NA	ZBED3-AS1,ZBED3	NA	NA	NA	NA	ZBED3	41004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	77148404	77148543	77148518	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	14061	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	77582031	77582256	77582186	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	6323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	77797282	77797316	77797309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	142943	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	77837654	77837953	77837804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	183315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	78270986	78271091	78271032	Y	NA	ARSB	NA	NA	NA	NA	ARSB	8819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	78411121	78411135	78411130	Y	NA	BHMT2,BHMT	NA	NA	NA	NA	BHMT	5519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	78612719	78612843	78612781	Y	JMY	CTC-451P13.1	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	33978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	78744780	78744887	78744834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-342F17.1	59370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	78990549	78990790	78990669	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	84606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	80253952	80254094	80254023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	305150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	80564528	80564843	80564784	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	30536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	80707651	80707683	80707665	Y	SSBP2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC9	112242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	80898051	80898414	80898329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	147202	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	81661583	81662026	81661933	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	89187	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	82339174	82339396	82339285	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	31921	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	82769870	82770125	82769934	Y	TMEM167A,VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	82952253	82952601	82952427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	62831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	83674189	83674553	83674373	Y	EDIL3	EDIL3	NA	NA	NA	NA	EDIL3	4058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	84744146	84744237	84744174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDIL3	1065535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	85303843	85303915	85303880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	607806	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	7.69127331668736
chr5	85789046	85789185	85789116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	122536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	85833622	85833763	85833693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	77958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	86619927	86620237	86620117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58222	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	86663167	86663443	86663248	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	280858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	91571858	91572108	91571983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-348J24.2	195444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	40958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	93304446	93304744	93304683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	140660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	93316390	93316647	93316523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	128757	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	94380006	94380293	94380145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	237986	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2154I11.2	47821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	NA	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2154I11.2	104755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	95240158	95240487	95240414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	55218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	RP11-254I22.1	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-254I22.1	19892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	96022483	96022592	96022538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	119211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	96142552	96142955	96142798	Y	CAST,CAST,LNPEP	ERAP1	NA	NA	NA	NA	ERAP1	749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	96217415	96217751	96217602	Y	CAST,CAST	ERAP2	NA	NA	NA	NA	ERAP2	7772	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	96902008	96902041	96902023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2278B20.1	231264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	99389717	99390411	99390143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	478555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	102304978	102305194	102305031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIP5K2	148659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	102544271	102544391	102544342	Y	NA	C5orf30	NA	NA	NA	NA	C5orf30	48012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	106837531	106838094	106837969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	166502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	106862612	106863005	106862809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	141591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	106900103	106900354	106900202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	104242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	106901710	106902084	106901897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	102512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	108071450	108071807	108071776	Y	FER	FER	FER	IMR90	Hi-C	24141950	FER	9716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	108391550	108391948	108391605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	310027	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	109125780	109125881	109125831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	102713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	109207541	109207704	109207623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	184474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	111054290	111054596	111054444	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	208002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	111523730	111523898	111523814	Y	NA	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	29507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	112509140	112509432	112509369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	198741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	112661132	112661145	112661139	Y	MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	161382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	113030376	113030581	113030479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	182996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	AC010226.4,TMED7-TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	115286552	115286773	115286663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2287O16.1	99213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	115420076	115420175	115420113	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	1388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	115676265	115676288	115676277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	219970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	115855956	115855969	115855965	Y	NA	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	40289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr5	115860298	115860305	115860302	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	35953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr5	115911792	115912152	115911976	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	3162	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	118257403	118257748	118257576	Y	NA	PTMAP2	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	49743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	118368421	118368671	118368600	Y	TNFAIP8,TNFAIP8,DMXL1	DTWD2,DMXL1,CTB-161M19.4	TNFAIP8,DMXL1	IMR90	Hi-C	24141950	DMXL1	2796	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	118667521	118667660	118667595	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	65134	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	119434159	119434302	119434231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	420267	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	119994126	119994308	119994217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	980234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	122181959	122182300	122182177	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	4825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	123774307	123774708	123774529	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	307792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	123966351	123966687	123966497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	115813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	94961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	84939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	124085012	124085124	124085092	Y	NA	ZNF608	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF608	2512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	124593106	124593253	124593226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	450180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	124748569	124748778	124748675	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	605643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	126217588	126217612	126217598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	107273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	126708435	126708706	126708571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC1	142595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	130715394	130715800	130715520	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	136208	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	131446640	131446942	131446887	Y	RAPGEF6,IL5,RAD50,IL3,CSF2	NA	IL3,P4HA2	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM4	144422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	131830040	131830170	131830098	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	5550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	132137425	132137486	132137431	Y	SEPT8,SEPT8	SEPT8,SOWAHA,SHROOM1	NA	NA	NA	NA	SEPT8	3447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	133259809	133260031	133259966	Y	NA	C5orf15	FSTL4,HSPA4	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf15	42447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	133266048	133266394	133266263	Y	NA	C5orf15	NA	NA	NA	NA	C5orf15	36084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	133470244	133470404	133470305	Y	NA	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	21842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	18431	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	37651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	AC005355.2	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	839	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	103128	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	134527149	134527274	134527245	Y	NA	NA	CATSPER3,PCBD2,H2AFY,PITX1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	158646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	137390960	137391202	137391142	Y	KLHL3,REEP2,NME5	FAM13B	FAM13B,BRD8,KIF20A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM13B	5310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	137785775	137785891	137785836	Y	WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	REEP2	13069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	137826508	137826985	137826545	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	27329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr5	137833063	137833252	137833158	Y	FAM53C,EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	33884	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	182646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNA1	296743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	303483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	138290386	138290689	138290535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	316752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	138325344	138325620	138325482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	281821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	138436608	138436808	138436708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	170633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	138608448	138608665	138608563	Y	LRRTM2,MATR3,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	MATR3	1007	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139017086	139017541	139017145	Y	CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	7343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	CTB-35F21.2	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CTB-35F21.2	32974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	CTB-35F21.2	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CTB-35F21.2	32684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139132414	139132610	139132513	Y	NA	CTB-35F21.2	UBE2D2,CXXC5,DNAJC18,NRG2,CYSTM1	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-35F21.2	8606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139135408	139135879	139135750	Y	NA	CTB-35F21.2	UBE2D2,CXXC5,DNAJC18,NRG2,CYSTM1	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-35F21.2	11600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	139570156	139570435	139570301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	84794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139633683	139634086	139633757	Y	SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	46620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	139641396	139641769	139641570	Y	SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	38937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139652898	139653497	139653234	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	27209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139677985	139678148	139678067	Y	NA	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	2558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	139988781	139989053	139988891	Y	HBEGF,ANKHD1,EIF4EBP3,SRA1,APBB3,SLC35A4,CD14,CD14	SLC35A4,APBB3,CD14,TMCO6,IK,NDUFA2,MIR3655	NA	NA	NA	NA	APBB3	17444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	22059	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	56558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	140985133	140985553	140985464	Y	TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	11069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	141311332	141311399	141311366	Y	NA	KIAA0141,RNF14	NA	NA	NA	NA	KIAA0141	9959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	141394614	141394984	141394650	Y	PCDH12	GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	4008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	141444983	141445199	141445045	Y	NA	NDFIP1	FGF1,NDFIP1,GNPDA1,ARAP3,FCHSD1	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	40871	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	142349397	142349744	142349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	201448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	142361615	142361922	142361810	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	213666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	142378250	142378447	142378318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	230301	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	142541504	142541934	142541585	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	168236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	142701946	142702250	142702195	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	7920	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	142960828	142960965	142960872	Y	NR3C1,NR3C1	NA	HMHB1,NR3C1,ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	147751	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	142985989	142986227	142986124	Y	NR3C1,NR3C1	NA	NR3C1,ARHGAP26,HMHB1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	172912	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	143078144	143078385	143078261	Y	NA	NA	ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	265067	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	143685934	143686297	143686110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD16	137538	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	143702129	143702425	143702277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD16	153733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	143858927	143858997	143858987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD16	310531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	144920892	144921143	144921082	Y	NA	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	291789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	145094622	145094634	145094628	Y	GRXCR2	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	118298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	145150590	145150800	145150695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID2	62132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	146200379	146200464	146200463	Y	PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	261883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	83636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	146832241	146832308	146832261	Y	JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	369894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	146890135	146890280	146890247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	427788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	147343599	147343802	147343701	Y	FBXO38	NA	NA	NA	NA	NA	SPINK13	301941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINK13	181638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	147605275	147606051	147605859	Y	NA	SPINK13	NA	NA	NA	NA	SPINK13	39692	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	148551862	148552080	148551971	Y	NA	ABLIM3	AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	32816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	149525289	149525473	149525405	Y	SYNPO	NA	NA	NA	NA	NA	TIGD6	146559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	149667554	149667894	149667725	Y	SYNPO,SLC6A7,CAMK2A	NA	NA	NA	NA	NA	TCOF1	67308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	149668238	149668366	149668283	Y	SYNPO,SLC6A7,CAMK2A	NA	NA	NA	NA	NA	TCOF1	66836	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	149849253	149849476	149849346	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	13905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	153809274	153809597	153809436	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	13813	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	156939273	156939536	156939403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	61247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	157023315	157023779	157023637	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM19	22532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	157257409	157257732	157257678	Y	NA	CLINT1	NA	NA	NA	NA	CLINT1	26451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	157833982	157834188	157834134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLINT1	549799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158166813	158166864	158166841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	357905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158201990	158201999	158201995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	322770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	158245937	158246321	158246106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	278448	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158326675	158326933	158326881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	197836	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158364876	158365080	158364964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	159689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158380752	158381154	158381061	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B,EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	143615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158448175	158448456	158448348	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	76313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158471730	158472045	158472013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	52724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	158478339	158478495	158478452	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	46274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	32852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	158521683	158522288	158522053	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	2481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	158528865	158528877	158528871	Y	NA	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-175K6.1	3374	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	159480874	159481257	159481243	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	46754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	159714411	159714605	159714509	Y	NA	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	31151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	159720972	159721325	159721087	Y	PWWP2A,SLU7,CCNJL	RP11-34P1.2,CCNJL	FABP6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-34P1.2	37712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	159951614	159951766	159951649	Y	FABP6	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	104785	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	160225395	160225777	160225587	Y	ATP10B	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	378566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	160754027	160754417	160754191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRB2	219633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	160809035	160809329	160809276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRB2	164721	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	162811410	162811429	162811421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-541P9.3	50903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	167439777	167440090	167439882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	276566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	167716783	167717259	167717053	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	167909535	167909826	167909541	Y	NA	RARS	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	RARS	1624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	882328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	170289548	170289859	170289780	Y	NA	RANBP17	NA	NA	NA	NA	RANBP17	2674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	170552523	170552751	170552637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	259369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	170878093	170878163	170878150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	65973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	171135787	171136029	171135908	Y	NA	NA	FGF18	IMR90	Hi-C	24141950	FBXW11	295848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	171581047	171581366	171581364	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	32024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	171601698	171602038	171601921	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	11352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	171660495	171660734	171660615	Y	NA	STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	STK10	47105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	171709316	171709633	171709569	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	171845132	171845429	171845292	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	34098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	172127299	172127478	172127433	Y	NEURL1B	CTB-79E8.3	NA	NA	NA	NA	CTB-79E8.3	45583	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	172200337	172200842	172200639	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	4139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	172225425	172225974	172225664	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	29227	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	172262088	172262814	172262509	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	2810	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	172283530	172283741	172283563	Y	NA	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	24252	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	172451248	172451363	172451250	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	42488	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	173237626	173237876	173237751	Y	NA	NA	BOD1	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	75407	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	173293652	173293800	173293732	Y	CPEB4	CPEB4	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	19483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	173346462	173346760	173346662	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	33179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	173347710	173348091	173347729	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	34427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	174906234	174906555	174906308	Y	NA	SFXN1	NA	NA	NA	NA	SFXN1	4169	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	175098063	175098392	175098192	Y	HRH2	RN7SKP148	NA	NA	NA	NA	RN7SKP148	44872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	176337374	176337559	176337468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5A	101896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr5	176421508	176421945	176421807	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	25689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	176543923	176544044	176544003	Y	TSPAN17,PRR7,DBN1	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	NSD1	13982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DOK3,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DOK3,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	177513304	177513421	177513395	Y	NA	RP11-889L3.1,RMND5B	NHP2,RMND5B,HNRNPAB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-889L3.1	32699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	RMND5B	14570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	177784112	177784688	177784252	Y	AGXT2L2	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	154604	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	178323440	178323622	178323554	Y	NA	ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2	NA	NA	NA	NA	ZFP2	2545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	179513863	179514025	179513944	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	16745	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	MAPK9	907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	255735	255985	255880	Y	DUSP22	DUSP22	IRF4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP22	33645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	440153	440531	440212	Y	NA	NA	IRF4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP22	150523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	501922	502087	502051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	189030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr6	1654317	1654529	1654407	Y	NA	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	45636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	2029223	2029245	2029234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	214681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	2330490	2330806	2330587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	86508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	2738073	2738511	2738408	Y	NA	MYLK4,WRNIP1	NA	NA	NA	NA	MYLK4	10689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	2818084	2818421	2818253	Y	SERPINB9	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	2872094	2872570	2872534	Y	NA	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	31854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	3069574	3070273	3069674	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1,BPHL	LOC100507194,WRNIP1	K562	ChIA-PET	22265404	RIPK1	7349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	3317564	3317616	3317590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	87600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	3341734	3342066	3341935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	111770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	3351823	3351920	3351872	Y	TUBB2B,SLC22A23	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	103336	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	5157743	5158129	5157936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	101043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	5206171	5206360	5206265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	52812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRN1	343868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	8450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	5997075	5997523	5997169	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	7677	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	3687	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	6610078	6610432	6610277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	495398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr6	6726025	6726320	6726159	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	379510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	6856813	6857789	6856950	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	248041	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	6882933	6883109	6883005	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	222721	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	7043208	7043422	7043355	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	62408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	7112981	7113125	7113000	Y	RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	7151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	10771427	10771996	10771700	Y	ELOVL2,MAK	TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	25400	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	10825104	10825395	10825250	Y	ELOVL2	MAK	NA	NA	NA	NA	MAK	11369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	11139608	11139936	11139820	Y	TMEM170B,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	97061	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	11236748	11236970	11236788	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	143611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	11270585	11270869	11270602	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	109712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	11299498	11299626	11299552	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	80955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	11414898	11415336	11414989	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NEDD9,C6orf228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	34317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	12052115	12052407	12052202	Y	HIVEP1	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	45120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	12273843	12273861	12273852	Y	NA	NA	HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	HIVEP1	266848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	12359398	12359540	12359483	Y	HIVEP1	NA	TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	HIVEP1	352403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	465972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	482132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	13636617	13636971	13636795	Y	TBC1D7,GFOD1,CD83	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	23058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	13709903	13710182	13710119	Y	TBC1D7,CD83,RANBP9	RANBP9	SIRT5,NOL7	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	14397488	14397752	14397620	Y	RNF182,RNF182,RNF182	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	281616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	14405473	14405724	14405599	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	289601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	14725890	14726226	14726089	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	518301	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	14759070	14759272	14759192	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	485255	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	14884214	14884345	14884265	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	360182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	14891991	14892395	14892124	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	352132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	14945973	14946248	14946214	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	298279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15299924	15300312	15299931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	55397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15365610	15365867	15365688	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	121083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15436683	15436898	15436793	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	192156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15474239	15474654	15474451	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	186635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	15535179	15535578	15535319	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	125711	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	15541251	15541598	15541282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119691	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15562106	15562371	15562285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	98918	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15569583	15569742	15569685	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	91547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15580663	15580900	15580755	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	80389	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	15616123	15616332	15616207	Y	JARID2	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	44957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	171367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	SUMO2P13,FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	18020711	18021071	18020890	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KIF13A	34857	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	18407685	18408142	18407784	Y	RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	DEK	144631	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	19298680	19298958	19298819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	504025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	19448405	19448469	19448461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	354514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	20868773	20869042	20868908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	336085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	20877706	20877968	20877723	Y	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	345018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	20910575	20910817	20910696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	377887	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	20978432	20978689	20978561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	445744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	21028713	21029000	21028890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	496025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.92745871490419
chr6	21129910	21130117	21129994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	461855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	21141154	21141340	21141254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	450632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	23630929	23631073	23631036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-209A6.1	600920	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	23656570	23656900	23656609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-209A6.1	626561	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	24584505	24584676	24584669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0319	59707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	24996712	24997040	24996893	Y	TDP2	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	22065	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	25034556	25034972	25034914	Y	C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	59909	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	25352378	25352572	25352400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	75072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	25405177	25405324	25405251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	127871	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	25406864	25407254	25406949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	129558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	25497718	25497827	25497789	Y	TRIM38	NA	NA	NA	NA	NA	SCGN	152637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	25630252	25630438	25630350	Y	SCGN	SCGN	NA	NA	NA	NA	SCGN	20026	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.23661161987225
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr6	26143490	26143769	26143630	Y	NA	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D	NA	NA	NA	NA	HIST1H1E	10790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	27416333	27416557	27416445	Y	NA	ZNF184	NA	NA	NA	NA	ZNF184	22340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2AI	117816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AI	67542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	27740489	27740807	27740621	Y	NA	HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H4J	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AI	33092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AI	13566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	28080593	28080792	28080693	Y	NA	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	28099505	28099599	28099552	Y	OR2B2,OR2B6,ZNF187,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	49442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	29447385	29447671	29447510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLA-G	345073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	29949488	29949840	29949664	Y	NA	HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	42451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	37324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	30247447	30247451	30247450	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	22086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	30519269	30519607	30519590	Y	NA	PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	3056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	31334700	31334921	31334854	Y	NFKBIL1,C6orf27,ATP6V1G2	HLA-B,HCP5	HCG27	MCF7	ChIA-PET	22265404	HLA-B	11735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	31529822	31530211	31530167	Y	HLA-B,STK19,HSPA1B,TNF,LST1	SNORD84,DDX39B,ATP6V1G2-DDX39B,NFKBIL1,ATP6V1G2,TNF	NA	NA	NA	NA	TNF	11133	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr6	31942054	31942322	31942254	Y	NA	SKIV2L,STK19	NA	NA	NA	NA	STK19	5186	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	33181288	33181504	33181396	Y	NA	COL11A2,SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25	NA	NA	NA	NA	RING1	7016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	33396313	33396709	33396628	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	10466	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	33950913	33951144	33951041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	196000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	34110371	34110716	34110594	Y	PACSIN1,GRM4	NA	NA	NA	NA	NA	CYCSP55	74500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	34615040	34615205	34615123	Y	NA	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	47431	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	34624445	34624747	34624649	Y	TAF11	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	34625381	34625487	34625387	Y	HMGA1	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	35185451	35185811	35185631	Y	NA	ZNF76	NA	NA	NA	NA	ZNF76	38875	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	35279423	35279720	35279457	Y	FKBP5,TAF11,ZNF76,RPL10A,DEF6	DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	15828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	SLC26A8,MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	36214394	36214548	36214454	Y	SRPK1,MAPK14,BRPF3,STK38,PXT1,KCTD20	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-179N16.6	51412	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	36391779	36391863	36391821	Y	NA	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	16681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	36399958	36400295	36400126	Y	NA	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	8249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	36761501	36761809	36761749	Y	NA	CPNE5	NA	NA	NA	NA	CPNE5	43969	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr6	37098455	37099411	37099295	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	36568	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	37366071	37366087	37366081	Y	NA	RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	46323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	37470188	37470996	37470682	Y	NA	CCDC167	CCDC167,FTSJD2,MDGA1,RNF8,MIR4462,BTBD9	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CCDC167	4490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	37750628	37750998	37750792	Y	MDGA1	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	34277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	37879889	37880256	37879963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	94614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	38265340	38265548	38265422	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	340376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	38450593	38450822	38450666	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	155102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	39279620	39279758	39279742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYSD1	198655	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	39317410	39317439	39317426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYSD1	236445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	39886697	39886822	39886760	Y	NA	MOCS1,RP1-278E11.3	NA	NA	NA	NA	MOCS1	13468	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	40463742	40464103	40464095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN2	89101	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	41219899	41219963	41219959	Y	NA	TREM1	NA	NA	NA	NA	TREM1	32494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	41472054	41472459	41472263	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	39705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	41546441	41546593	41546496	Y	FRS3	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	32082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	41675584	41675662	41675651	Y	TREM1,TFEB	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	26335	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	42011738	42011769	42011754	Y	NA	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	4326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.41839105426721
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	42694331	42694739	42694439	Y	KLC4,KLC4,CUL9,TRERF1,C6orf226,PRPH2,TBCC	TBCC	NA	NA	NA	NA	TBCC	17819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr6	42739653	42739820	42739731	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226	TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	27095	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	42879334	42879417	42879389	Y	NA	RPL7L1,C6orf226,CNPY3,RPL24P4	NA	NA	NA	NA	CNPY3	15521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	42982951	42983183	42983012	Y	NA	PEX6,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2	NA	NA	NA	NA	KLHDC3	3000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	43085846	43085863	43085854	Y	NA	PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	43840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	43242978	43243220	43243076	Y	GNMT,KLC4,SLC22A7,CRIP3	CRIP3	SLC22A7,CRIP3,ZNF318	IMR90	Hi-C	24141950	CRIP3	31315	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	43332066	43332081	43332075	Y	NA	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	3135	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	43757757	43757886	43757846	Y	NFKBIE,TJAP1	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	21836	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	43804281	43804391	43804327	Y	TCTE1,CAPN11,ABCC10,C6orf154,MAD2L1BP,RSPH9	NA	VEGFA,RSPH9,MRPS18A,LOC100132354,MAD2L1BP,POLH,GTPBP2,TMEM63B,C6orf223,CAPN11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VEGFA	68360	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	27904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	44020614	44020967	44020695	Y	NFKBIE	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	19422	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	44632359	44632804	44632603	Y	NA	NA	CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	279097	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	44783475	44783845	44783660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	430213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	45294493	45294953	45294580	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	45297606	45298153	45297881	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	45537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	41388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	45313959	45314320	45314140	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	29370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	45330194	45330521	45330358	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	13169	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	47275760	47275938	47275849	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	119	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	RP3-437C15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-437C15.1	1925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	52242466	52242866	52242548	Y	NA	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	PAQR8	18247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	52345672	52345732	52345729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	62566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	52591404	52591712	52591556	Y	NA	GSTA2	NA	NA	NA	NA	GSTA2	34655	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	17.0189877645848
chr6	52911792	52912057	52911925	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	FBXO9	2732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr6	53381866	53382077	53382067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	97691	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	53489073	53489386	53489175	Y	NA	GCLC	KLHL31	IMR90	Hi-C	24141950	GCLC	9305	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	COL21A1	NA	NA	NA	NA	COL21A1	39521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr6	56459514	56459884	56459699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL21A1	202622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	273520	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	56573677	56574046	56573938	Y	NA	NA	DST,BEND6,ZNF451	IMR90	Hi-C	24141950	DST	243380	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	56779787	56780031	56779873	Y	NA	DST,BEND6	BAG2,ZNF451,BEND6,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	DST	37395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	57052407	57052730	57052411	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	17283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	57178706	57179008	57178897	Y	RAB23	PRIM2	BAG2,ZNF451,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	PRIM2	1103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	57251417	57251660	57251585	Y	KIAA1586	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	73814	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	64386722	64387357	64386973	Y	PHF3	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	42997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	64813713	64813775	64813744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	469988	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	67225027	67225145	67225086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	2118114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	70479579	70479974	70479889	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	25029	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	70505414	70505608	70505498	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	411	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	71133094	71133376	71133235	Y	NA	FAM135A	NA	NA	NA	NA	FAM135A	12450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	298335	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	75283394	75283535	75283452	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL12A1	630232	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	75853490	75853812	75853630	Y	COL12A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	59955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	79597447	79597572	79597510	Y	NA	IRAK1BP1	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	22258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	79718228	79718616	79718429	Y	PHIP	NA	NA	NA	NA	NA	PHIP	67337	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	80487784	80488033	80487927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL2	148784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	81048044	81048318	81048128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	233680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	82564309	82564319	82564314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	103818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	83756669	83757034	83756938	Y	PGM3,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	18351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	84570320	84570549	84570344	Y	NA	RIPPLY2,CYB5R4	NA	NA	NA	NA	CYB5R4	2958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	84761974	84762047	84762024	Y	NA	MRAP2	NA	NA	NA	NA	MRAP2	20499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	90061423	90061611	90061503	Y	RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	90818937	90819075	90819003	Y	BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	185552	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	91320632	91321099	91320814	Y	MAP3K7,MAP3K7	MAP3K7	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	25868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	91792357	91792687	91792522	Y	MAP3K7,MAP3K7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	497593	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	91881447	91881774	91881612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	586683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	92185644	92186055	92185825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	890880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	94127729	94128504	94127840	Y	NA	EPHA7	NA	NA	NA	NA	EPHA7	464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	94443419	94443467	94443447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	316154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	95149839	95150112	95150046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	873307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	95445556	95445774	95445747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	577645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	96278764	96279091	96278932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT9	182769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr6	96616633	96616738	96616686	Y	FUT9	NA	NA	NA	NA	NA	FUT9	154773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	97681036	97681361	97681334	Y	NA	MMS22L	NA	NA	NA	NA	MMS22L	47732	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	97908458	97908789	97908626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	179365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	99279577	99279776	99279667	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	99279823	99280075	99279977	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	505	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	POU3F2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	99292960	99293281	99293125	Y	NA	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	12380	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	100012296	100012415	100012356	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	2434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	100676865	100677032	100676949	Y	NA	NA	SIM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	299120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	101211686	101211775	101211752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	115473	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	102299830	102299843	102299837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	972582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	102355867	102356256	102356058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	1028619	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	102471700	102472091	102472046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	1144452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	102688376	102688518	102688447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	1361128	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	107774853	107775271	107775085	Y	BEND3	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	3497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	108324190	108324471	108324239	Y	NA	SEC63,RPL3P7	NA	NA	NA	NA	RPL3P7	301	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	108961437	108961619	108961493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	82399	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	109011028	109011405	109011217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	131990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	109102631	109102946	109102736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC2	64673	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	109158885	109159026	109158956	Y	NA	ARMC2	NR2E1,FOXO3,LINC00222,ARMC2,SESN1,LACE1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	8593	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	109288163	109288636	109288487	Y	FOXO3,SMPD2,MICAL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-249L21.4	61087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	109637041	109637243	109637127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD164	64519	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	110418117	110418342	110418281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF1	80865	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	110502951	110503352	110503102	Y	FIG4,CDC40	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	CDC40	3607	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	110812850	110813232	110813170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDO	78085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	111666861	111666999	111666959	Y	REV3L,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	88310	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr6	111675383	111675464	111675424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	96832	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	111727743	111727975	111727836	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	74739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	111744480	111744594	111744536	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	58120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	111841823	111842197	111842010	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	38905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	112062889	112063206	112062987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	129449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	112072134	112072549	112072500	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	120106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	112163238	112163349	112163330	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	29306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	112192236	112192610	112192499	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	45	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	113772353	113772409	113772395	Y	NA	NA	MARCKS,FLJ34503	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	404132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	170525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr6	114603610	114603654	114603632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	58555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	114662587	114662962	114662866	Y	NA	HS3ST5	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr6	115064151	115064163	115064157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	401942	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	115392062	115392420	115392336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	729853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	117585963	117586004	117585985	Y	NA	VGLL2	NA	NA	NA	NA	VGLL2	1242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	117819510	117819668	117819589	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	46530	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	117914764	117915043	117914904	Y	NA	GOPC	NA	NA	NA	NA	GOPC	6648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	118648714	118648964	118648839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLN	218497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	119606195	119606320	119606258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	62606	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	119764172	119764289	119764182	Y	MAN1A1	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	95246	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.90932339363023
chr6	120445667	120446036	120445852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	776741	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	121396728	121397112	121396920	Y	C6orf170	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-35P	376155	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	121530032	121530291	121530288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-35P	242976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	122211841	122211969	122211905	Y	NA	NA	GJA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-18P	318825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1,PKIB	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	122990249	122990620	122990435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	117695	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	123013285	123013516	123013365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	94799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	125622252	125622475	125622321	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	126071522	126071828	126071676	Y	NA	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	HEY2	4712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	127618608	127618885	127618797	Y	NA	RNF146,ECHDC1	NA	NA	NA	NA	RNF146	32853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	127745246	127745525	127745387	Y	RNF146	RP3-403A15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	9256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	127769705	127769797	127769751	Y	NA	RP3-403A15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	14924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	127778453	127778833	127778741	Y	NA	RP3-403A15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	23672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	54164	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	142728	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	143192	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	128331151	128331455	128331303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	493005	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	128747260	128747445	128747404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	92425	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	128816273	128816626	128816620	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	23244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	410707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	129480057	129480411	129480316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	548959	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	130453386	130453776	130453491	Y	L3MBTL3,SAMD3,SAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	120542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	131595636	131595766	131595737	Y	MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	140830	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	131671156	131671520	131671462	Y	NA	NA	AKAP7	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP7	216350	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23,RNU4-18P	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	132057565	132057807	132057687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP1	69349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	133839183	133839299	133839241	Y	EYA4	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	279447	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	135344059	135344242	135344151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	77952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	135804002	135804049	135804028	Y	NA	LINC00271,AHI1	NA	NA	NA	NA	LINC00271	12440	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	136312028	136312251	136312140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	296738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	136434966	136435173	136435049	Y	BCLAF1	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	173816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	136492327	136492682	136492505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	116307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	136702762	136702864	136702842	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	93773	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	136716338	136716450	136716395	Y	MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	107349	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	136729350	136729610	136729525	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	120361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	136908722	136909081	136908931	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	38765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	137244333	137244577	137244412	Y	SLC35D3	SLC35D3	NA	NA	NA	NA	SLC35D3	2931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	138045007	138045495	138045466	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	140856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	138112672	138112919	138112777	Y	NA	NA	TNFAIP3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	73432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr6	139213986	139214343	139214165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	93055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	139859712	139859864	139859773	Y	HECA	NA	CITED2,LOC100132735	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	165955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	140930496	140930538	140930517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1236739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	143150171	143150307	143150239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	114031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	143171849	143172301	143172148	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	92037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	143200640	143200895	143200768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	63443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	143864167	143864345	143864273	Y	NA	FUCA2,PHACTR2	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	8185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	143918177	143918387	143918274	Y	NA	NA	PHACTR2,ZC2HC1B,PLAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	PHACTR2	62195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	144015519	144015660	144015590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	146821	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	144053697	144053884	144053799	Y	STX11,PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	108597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	144283195	144283286	144283251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	100449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	144975415	144975576	144975532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	370578	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	144982592	144982877	144982735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	377755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	145131744	145132215	145131879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	526907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	145588326	145588537	145588434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2A	466623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	147831138	147831275	147831225	Y	SAMD5	SAMD5	NA	NA	NA	NA	SAMD5	3075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	148358652	148358995	148358836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	148424761	148425105	148424843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	166335	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	148535046	148535159	148535103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	56281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	148564785	148565120	148564953	Y	NA	SASH1	SASH1,SAMD5	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	26320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	148595298	148595608	148595453	Y	NA	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	3858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	148823673	148823949	148823781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232233	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	150498998	150499409	150499161	Y	NA	PPP1R14C	NA	NA	NA	NA	PPP1R14C	36786	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	150525741	150526115	150525928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R14C	63529	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	151302311	151302568	151302430	Y	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	116097	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	151325792	151326084	151325926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	92581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	151373285	151373500	151373395	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	45165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	151391768	151392248	151391859	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	26417	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	109319	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	152495125	152495413	152495269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	461523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	153411582	153411939	153411751	Y	MTRF1L	RGS17	NA	NA	NA	NA	RGS17	38445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	154676071	154676546	154676403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	153247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	154753926	154754309	154754118	Y	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	75484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	154800404	154800771	154800746	Y	NA	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	29022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	154830409	154830718	154830573	Y	CNKSR3	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	154858221	154858762	154858474	Y	CNKSR3	CNKSR3,RPS4XP8	IPCEF1,OPRM1,CNKSR3	IMR90	Hi-C	24141950	CNKSR3	28428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	155306251	155306499	155306375	Y	TIAM2	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	253792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	156139110	156139232	156139181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	505483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	156139676	156139707	156139692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	506049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	156717523	156717937	156717690	Y	ARID1B	NA	NOX3	IMR90	Hi-C	24141950	ARID1B	379126	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	157110744	157110907	157110826	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	13681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157144043	157144235	157144146	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	46980	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157163922	157164341	157164233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	66859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157168828	157169241	157169084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	71765	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157174408	157174845	157174627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	77345	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	157176246	157176601	157176399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	79183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157297453	157297730	157297519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	200390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr6	157411919	157412211	157412008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	314856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr6	157639062	157639495	157639253	Y	C6orf35	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	103138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	157694703	157694954	157694858	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	47679	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	157936149	157936334	157936215	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC14	135984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	158182288	158182636	158182583	Y	SNX9	NA	SNX9,ZDHHC14,TMEM242,SYNJ2,SERAC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	59660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	158375265	158375579	158375328	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	25309	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	158440159	158440546	158440248	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	39271	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	158515424	158515781	158515670	Y	SYNJ2,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SERAC1	71531	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	158670119	158670409	158670245	Y	NA	NA	TULP4,TMEM181	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	82735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	158808734	158809093	158808911	Y	TMEM181	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	146375	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	32206	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	159359890	159360005	159359951	Y	EZR	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	59214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	159360638	159360649	159360643	Y	TAGAP	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	58570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	160382613	160382870	160382731	Y	SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R	IGF2R	PNLDC1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2R	5261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	161678868	161678882	161678875	Y	NA	AGPAT4	MAP3K4	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT4	14211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	162527778	162527928	162527812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRG	618236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	164198350	164198619	164198404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	365318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	166711154	166711571	166711225	Y	PRR18	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	42508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	166795008	166795404	166795174	Y	NA	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	40929	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-514O12.4	251994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	167461087	167461406	167461193	Y	RNASET2,GPR31,CCR6	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	50417	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	167834861	167835135	167834902	Y	NA	NA	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	CCR6	311566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr6	167837583	167837890	167837668	Y	FGFR1OP,UNC93A,MLLT4	NA	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	CCR6	314288	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.60017048866217
chr6	168076868	168077090	168076978	Y	UNC93A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf123	118449	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	C6orf123,MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	7.03669686420333
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	KIF25-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF25-AS1	38625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	168375482	168375653	168375488	Y	NA	KIF25-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF25-AS1	20104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	168789584	168789819	168789635	Y	NA	NA	CCR6	IMR90	Hi-C	24141950	SMOC2	50012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.10923814929915
chr6	170403251	170403438	170403365	Y	TCTE3,FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	194123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	170461603	170461884	170461744	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135677	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr6	170461964	170462067	170462016	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	170491997	170492052	170492021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	105509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.58203516738822
chr6	170492436	170492647	170492551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	104914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr6	170577975	170578174	170578069	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	DLL1	19387	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	DLL1	7961	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.92745871490419
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	366062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	184582	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	387969	388196	388081	Y	PDGFA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	169737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr7	409137	409513	409244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	148420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	543299	543586	543435	Y	GET4,CYP2W1,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	14347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	592302	592713	592583	Y	PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	34369	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	16.3644113121008
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	1017371	1017727	1017512	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,CYP2W1	COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	4136	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	1099866	1100419	1100164	Y	ADAP1,COX19,ZFAND2A,MAFK	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	17654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	1140726	1141099	1140817	Y	SUN1,TMEM184A	C7orf50	NA	NA	NA	NA	C7orf50	34797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr7	1329910	1330257	1330187	Y	NA	NA	UNCX	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND2A	131515	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	1546091	1546367	1546260	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	1546424	1546775	1546565	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	1658452	1658596	1658524	Y	ELFN1	PSMG3	NA	NA	NA	NA	PSMG3	49811	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	1959743	1960348	1960159	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	179816	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	1968189	1968469	1968397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	188262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr7	1990940	1991132	1991045	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	211013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	2145561	2145831	2145692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	125047	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2150639	2150902	2150796	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	119976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2221939	2222311	2222112	Y	IQCE	MAD1L1	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	48567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2550421	2551074	2550672	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	258	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2697261	2697345	2697303	Y	IQCE	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	27676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2738537	2739051	2738765	Y	LFNG,CARD11	NA	GNA12	IMR90	Hi-C	24141950	TTYH3	68952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2744937	2745164	2745051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	75352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	2749963	2750288	2750147	Y	LFNG,LFNG,CARD11	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	80378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2827851	2827916	2827884	Y	NA	AC006028.11	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	45339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2842322	2842519	2842421	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	30736	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	2843425	2843709	2843567	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	29546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2875013	2875360	2875015	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	1758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	3490744	3491107	3491069	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	151664	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	4773446	4773760	4773608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	92058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	AC092610.12,RADIL	NA	NA	NA	NA	RADIL	7663	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	TNRC18	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC18	8623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	5710055	5710429	5710241	Y	WIPI2,WIPI2,TNRC18,FBXL18,USP42,RNF216,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	79616	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	5718052	5718263	5718155	Y	USP42	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	87613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	5733172	5733453	5733321	Y	CCZ1,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	85917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	6145406	6145878	6145682	Y	USP42	EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	USP42	2891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	7139165	7139472	7139292	Y	NA	NA	C1GALT1,LOC100131257	K562	ChIA-PET	22265404	C1GALT1	55093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	7298097	7298125	7298111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	103532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	7440005	7440326	7440141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIOS	164177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	7608686	7608956	7608841	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	4183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	7804088	7804477	7804243	Y	NA	RPA3,RPL23AP51	NA	NA	NA	NA	RPL23AP51	23922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	7896018	7896243	7896099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	110182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	7911710	7911812	7911761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	94613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	7984706	7984926	7984839	Y	GLCCI1	GLCCI1	RPA3,LOC729852	IMR90	Hi-C	24141950	GLCCI1	21499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	8016516	8016759	8016566	Y	GLCCI1	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	10091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	8295276	8295343	8295310	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	4520	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	8300349	8300667	8300508	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	32	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	8482629	8482725	8482675	Y	NXPH1	NXPH1	NA	NA	NA	NA	NXPH1	11044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	8530046	8530057	8530051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	58461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	8663784	8663976	8663856	Y	NXPH1	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	192199	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	10196582	10196962	10196873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA4	780921	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	10276978	10277222	10277208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA4	700661	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr7	11089099	11089199	11089149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	77600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	11827353	11827497	11827425	Y	THSD7A	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	42327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	11859641	11859960	11859801	Y	THSD7A	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	9864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	8774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	11867283	11867421	11867420	Y	NA	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	2403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr7	11869426	11869707	11869551	Y	NA	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	13368007	13368354	13368181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	643526	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	13372875	13373192	13373034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	648394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	13512547	13512927	13512737	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	516123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	13553275	13553295	13553283	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	475755	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	13592138	13592417	13592278	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	436633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	13694099	13694114	13694107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	334936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	13700759	13700990	13700876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	328060	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	13758700	13759051	13758876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	269999	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr7	13818689	13818849	13818801	Y	ETV1	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	210201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	15109433	15109619	15109527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGMO	490021	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	15957269	15957287	15957277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEOX2	232832	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	16302411	16302620	16302516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	156327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	16751358	16751548	16751453	Y	NA	TSPAN13	NA	NA	NA	NA	TSPAN13	39612	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	17336947	17337086	17336970	Y	NA	AHR	NA	NA	NA	NA	AC003075.4	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	227019	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	17702282	17702491	17702387	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	275633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	17721637	17721811	17721724	Y	NA	NA	HDAC9,AGR2,AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	256313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	18264800	18264892	18264864	Y	HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	140228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	19119779	19120171	19119934	Y	NA	TWIST1	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST1	35124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	19157963	19158297	19158271	Y	NA	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	2668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	19640371	19640397	19640383	Y	TMEM196	NA	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	106313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	20163699	20164108	20163996	Y	NA	AC005062.2	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	13968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	AC005062.2	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	19163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	20202226	20202605	20202544	Y	NA	AC005062.2	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	24150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	20217388	20217681	20217578	Y	TWISTNB,MACC1	AC005062.2,MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	37346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	20414219	20414454	20414223	Y	NA	ITGB8	NA	NA	NA	NA	ITGB8	45894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	20439186	20439753	20439406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	70861	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	20516668	20517013	20516807	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB8	148343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	21139045	21139343	21139263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23P8	274100	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	21222695	21222703	21222699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	242949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	22011633	22011901	22011770	Y	NA	CDCA7L	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	27931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	22337709	22337719	22337714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	211899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	38439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	23346374	23346675	23346525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	126928	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	23410116	23410259	23410188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	97827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	23411315	23411579	23411447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	96507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.10923814929915
chr7	23853769	23853785	23853777	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	AC006026.13	135364	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	24092646	24092866	24092724	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	NPY	228916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	24739704	24740021	24739930	Y	DFNA5,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	67223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	24823380	24823654	24823545	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	16136	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	24882463	24882674	24882596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	75219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	24950753	24950942	24950870	Y	CYCS,OSBPL3	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	68311	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	25010250	25010501	25010375	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	8752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	25872655	25872829	25872766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	317031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	25892049	25892317	25892170	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2	IMR90	Hi-C	24141950	NFE2L3	297543	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	25899920	25900213	25900190	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90	Hi-C	24141950	NFE2L3	289647	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.43652637554116
chr7	25992296	25992472	25992423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	197388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.94559403617814
chr7	26007044	26007425	26007148	Y	HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	182435	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	26129103	26129367	26129259	Y	SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NA	SNX10,HOXA10-HOXA9,MIR196B,HOXA9,CBX3,HNRNPA2B1,NFE2L3,HOXA-AS3,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	60493	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	26140883	26141586	26141235	Y	SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	48274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.27288226242015
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	26355868	26356236	26355954	Y	NA	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	26327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	26361230	26361345	26361289	Y	SNX10,SNX10,SNX10	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	31689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	AC004540.4,AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	24337	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	26523285	26523306	26523295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	87072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	26815721	26816027	26815980	Y	SNX10,SNX10,SKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP2	216831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	26888997	26889313	26889155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP2	143545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	27143635	27143783	27143725	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	1613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	27149064	27149414	27149148	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	3668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	27176942	27177056	27176971	Y	HOXA3,HOXA5	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA5	4231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	27188378	27188640	27188509	Y	NA	HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA6	156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	27206716	27206932	27206874	Y	HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10	HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA10-AS	478	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	27531639	27532015	27531830	Y	NA	EIF4HP1	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	35171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	27774263	27774520	27774391	Y	NA	TAX1BP1,AC004549.6	NA	NA	NA	NA	TAX1BP1	2430	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	98953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	28192724	28193110	28193000	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	24831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	28194446	28194874	28194789	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	23067	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	28195097	28195228	28195166	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	22713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	29115131	29115317	29115226	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	44573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	29268868	29269165	29269017	Y	CHN2	CPVL	NA	NA	NA	NA	CPVL	35801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	29382815	29383281	29382928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	149748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	29486224	29486601	29486413	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	253157	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	29835746	29835982	29835865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	190234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	30204020	30204306	30204163	Y	ZNRF2	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	8873	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	30206134	30206379	30206282	Y	ZNRF2	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	10987	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	30224515	30225078	30224817	Y	ZNRF2	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	29368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	30257510	30257901	30257519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	62363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	30369303	30369603	30369448	Y	NA	ZNRF2,AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	39384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	30514545	30514933	30514653	Y	NA	NOD1	NA	NA	NA	NA	NOD1	1467	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	31598096	31598244	31598170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R17	126085	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	32133021	32133498	32133272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	399397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	32290521	32290760	32290638	Y	PDE1C	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	242135	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	32531348	32531711	32531530	Y	PDE1C,PDE1C,PDE1C	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	LSM5	1184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	33598181	33598239	33598235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	431325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	33708733	33708947	33708840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	541877	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BBS9	595374	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	34316740	34316919	34316850	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	907015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.45466169681512
chr7	35629037	35629048	35629043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	104133	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	35730076	35730471	35730274	Y	SEPT7,EEPD1,HERPUD2	HERPUD2	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	2710	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	35767397	35767554	35767480	Y	HERPUD2	HERPUD2	SEPT7	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD2	34216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	36760728	36761001	36760824	Y	AOAH	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	332994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	38272460	38272983	38272698	Y	TARP	NA	NA	NA	NA	NA	STARD3NL	56636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	38664238	38664553	38664451	Y	POU6F2	AMPH	NA	NA	NA	NA	AMPH	4614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	38712091	38712232	38712098	Y	STARD3NL,TARP	AMPH	NA	NA	NA	NA	AMPH	42924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	40129508	40130170	40129872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	141872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	40343749	40343875	40343812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	356113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	40580986	40581112	40581049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	593350	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	41048804	41049055	41048930	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	CDK13	1061168	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	41852761	41853250	41853017	Y	INHBA	NA	LOC285954,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	1096654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	43625905	43626316	43625996	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	5548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	43644873	43645023	43645002	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	24516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,PGAM2,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	47293209	47293414	47293276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	326742	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	51.7115397462384
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr7	47515604	47515892	47515680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104264	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	47536985	47537239	47537063	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	82917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	47542893	47543371	47543076	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	76785	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	47553531	47553930	47553845	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	66226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	47579966	47580265	47580181	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	39891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	48430589	48430763	48430671	Y	HUS1,UPP1,UPP1	NA	NA	NA	NA	NA	UPP1	304364	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	49177785	49177982	49177884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPP1	1051560	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	50250206	50250548	50250304	Y	FIGNL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	265540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	50484533	50484862	50484717	Y	NA	FIGNL1	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	31226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	DDC	NA	NA	NA	NA	DDC	28268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	50603281	50603405	50603343	Y	NA	DDC	NA	NA	NA	NA	DDC	27749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	DDC	NA	NA	NA	NA	DDC	35697	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	50682806	50683075	50682899	Y	DDC	NA	NA	NA	NA	NA	DDC	51652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	50807671	50808051	50807982	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	51108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	50948563	50948792	50948678	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	55235458	55235690	55235573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	195451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	55542922	55542955	55542935	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95726	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	55614421	55614857	55614666	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	23824	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	55615946	55616205	55616135	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	22476	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	55725404	55725623	55725518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUMO2P3	72214	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1467054	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	64733908	64734317	64734037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF92	102395	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr7	66096553	66096745	66096681	Y	NA	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	KCTD7	4685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	69069799	69069881	69069840	Y	NA	AUTS2	NA	NA	NA	NA	AUTS2	7894	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	69091011	69091330	69091153	Y	NA	AUTS2	NA	NA	NA	NA	AUTS2	29106	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	69308115	69308415	69308239	Y	AUTS2,AUTS2	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	246210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	69409562	69409698	69409630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	347657	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	70160459	70160922	70160898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	1098554	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	72939749	72940060	72940006	Y	BAZ1B	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	5141	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	73037168	73037552	73037436	Y	MLXIPL	TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	295	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	75675722	75675985	75675853	Y	NA	STYXL1,MDH2	NA	NA	NA	NA	MDH2	353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.92745871490419
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	75940045	75940212	75940167	Y	NA	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	10184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	76627484	76628238	76628092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185BP	121195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	77344619	77344946	77344783	Y	RSBN1L	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L	20859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	77561991	77562080	77562036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	135869	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	78048924	78048941	78048933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	622802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	79776985	79777288	79777110	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	15714	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	80886424	80886607	80886516	Y	NA	NA	SEMA3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNAI1	1125153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	81108173	81108384	81108283	Y	NA	NA	SEMA3C,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA2D1	962730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	81233474	81233832	81233648	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA2D1	837282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	81582871	81583219	81583134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	487895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	81584968	81585322	81585145	Y	CACNA2D1	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	485792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	81655164	81655347	81655329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	415767	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	81851268	81851277	81851273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	219837	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	81858656	81858971	81858814	Y	CACNA2D1	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	212143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	81894820	81895003	81894975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	176111	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	81927516	81927685	81927601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	143429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	82014296	82014582	82014440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	56532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	84613691	84613734	84613712	Y	NA	AC074183.4	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	46130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	86534596	86534997	86534797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	152018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	86561279	86561598	86561380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	125417	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	87482976	87483203	87483077	Y	NA	DBF4,SLC25A40	NA	NA	NA	NA	DBF4	20328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	88657273	88657647	88657446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRI	802965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	90236421	90236455	90236438	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CDK14	142683	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	90637974	90638276	90638003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	253507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	90711391	90711663	90711528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	180120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	91466585	91467314	91466893	Y	NA	MTERF	NA	NA	NA	NA	MTERF	40720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	92261903	92262272	92262087	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	44195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	92282305	92282698	92282463	Y	LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	64597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	92847144	92847362	92847311	Y	HEPACAM2	HEPACAM2,CCDC132	NA	NA	NA	NA	HEPACAM2	6475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	GNG11	317504	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	93426376	93426400	93426388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG11	122611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	73514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	95137857	95138175	95137904	Y	ASB4	NA	NA	NA	NA	NA	PON2	75347	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	95238124	95238400	95238252	Y	PON1,PON3	PDK4,AC002451.3	NA	NA	NA	NA	AC002451.3	14130	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	95554206	95554454	95554332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I1	154340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	95645399	95645785	95645516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I1	245533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	95674465	95674690	95674578	Y	DYNC1I1,FLJ42280	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I1	274599	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	95765148	95765192	95765170	Y	DYNC1I1,FLJ42280	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	184267	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	95807779	95807791	95807785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	141668	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	96600471	96600829	96600650	Y	NA	DLX6,DLX6-AS1	NA	NA	NA	NA	DLX6	32031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	96622528	96622811	96622637	Y	NA	DLX6,DLX6-AS1,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX6	10049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	96642145	96642338	96642223	Y	DLX6,DLX5	DLX6,DLX6-AS1,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX6-AS1	768	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	96646199	96646417	96646378	Y	DLX6,DLX5	DLX6,DLX6-AS1,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX6-AS1	4822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	96657052	96657215	96657134	Y	DLX6,DLX5	DLX6,DLX6-AS1,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX5	4643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	96748066	96748124	96748095	Y	NA	ACN9	NA	NA	NA	NA	ACN9	4164	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	97763037	97763356	97763224	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	28840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	97763424	97763629	97763532	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	29227	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	97773212	97773327	97773270	Y	NA	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	39015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	98286893	98287005	98286947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRAP	186551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	98990795	98991133	98991082	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	13131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	99684818	99685168	99684993	Y	TSC22D4,PILRB,PILRA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	COPS6	241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	99962576	99962959	99962740	Y	MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	25045	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	100167857	100168189	100168134	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,PCOLCE,PCOLCE-AS1,MOSPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-44M6.3	2103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A9	11917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	100809834	100810470	100810178	Y	NA	SERPINE1,AP1S1,VGF,ZNHIT1,PLOD3	NA	NA	NA	NA	VGF	2960	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	101022292	101022423	101022358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	59188	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	101045498	101045795	101045583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	82394	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	101377148	101377442	101377338	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	79517	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.07296750675124
chr7	102104317	102104602	102104460	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	LRWD1	941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	102959356	102959407	102959404	Y	PMPCB,DNAJC2	DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PSMC2	23294	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	103181471	103181723	103181644	Y	NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-276O3.4	194423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	104618643	104618978	104618693	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	32513	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	104626890	104627731	104627241	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	23760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	104907808	104907896	104907852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	129859	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	104960256	104960357	104960307	Y	MLL5,SRPK2	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	77398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	104992589	104992852	104992773	Y	NA	SRPK2	NA	NA	NA	NA	SRPK2	44903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	105988057	105988433	105988164	Y	FLJ36031,NAMPT	NA	NAMPT,CCDC71L,PIK3CG	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NAMPT	63285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	107136125	107136576	107136361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	65353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	107461501	107461649	107461575	Y	NA	SLC26A3	NA	NA	NA	NA	SLC26A3	19831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	108015500	108015588	108015544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	79573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	108095684	108095814	108095727	Y	NRCAM,NRCAM	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	325972	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	111819433	111819596	111819575	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	24870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	113100139	113100486	113100313	Y	GPR85,GPR85,GPR85	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	343471	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	477184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	113724652	113724941	113724845	Y	FOXP2	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	113772890	113773070	113772980	Y	NA	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	48508	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	331955	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	117509516	117509657	117509617	Y	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	312429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	117863844	117864014	117863854	Y	ANKRD7	NAA38	NA	NA	NA	NA	NAA38	41758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	118520575	118520914	118520745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	698489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	119269873	119270211	119270042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	275218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	261423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	119300626	119300913	119300840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	244516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	119342265	119342557	119342442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	202872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	119435371	119435694	119435534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	109735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	120030311	120030667	120030374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	465789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	120046229	120046628	120046268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	449828	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	120532080	120532359	120532220	Y	NA	TSPAN12	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	35624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	120884704	120884786	120884745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	149632	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	122253933	122254165	122254049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P31	65179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	123903491	123903761	123903674	Y	NA	NA	GPR37,LOC154872	IMR90	Hi-C	24141950	GPR37	499920	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	124402716	124403225	124402962	Y	GPR37	GPR37	NA	NA	NA	NA	GPR37	456	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRM8	549857	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	126658207	126658487	126658347	Y	GRM8	NA	NA	NA	NA	NA	GRM8	232861	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	127455662	127455822	127455742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SND1	165428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	127663304	127663714	127663503	Y	IMPDH1,GCC1,LRRC4	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	318248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	127665265	127665386	127665326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	316576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.07296750675124
chr7	128603332	128603696	128603619	Y	ATP6V1F,IRF5,IRF5,IRF5,TSPAN33	NA	NA	NA	NA	NA	TNPO3	89502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	129095634	129096008	129095821	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RNU1-72P	26337	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	129246747	129246901	129246817	Y	NA	NRF1	NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	2654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	130005430	130005716	130005580	Y	TMEM209	CPA1	NA	NA	NA	NA	CPA1	12464	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	130013597	130013906	130013823	Y	CPA2,CPA1	CPA1	NA	NA	NA	NA	CPA1	4274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	130151792	130152099	130151899	Y	NA	MEST,MIR335	NA	NA	NA	NA	MIR335	17840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	130669444	130669692	130669631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	123163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	130739026	130739346	130739289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	53509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	131105085	131105454	131105312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1-AS	94104	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	131166569	131166943	131166757	Y	PODXL	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	74033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	131271012	131271384	131271093	Y	NA	PODXL	NA	NA	NA	NA	PODXL	30036	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	132401480	132401808	132401644	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	70033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	133390444	133390812	133390625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGUK	419240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	135120473	135120740	135120725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT4	72135	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	135738489	135738866	135738610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	78388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	137659854	137660135	137660099	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	24678	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	137671053	137671416	137671301	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	13397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	138250447	138250496	138250473	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	107368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	138778060	138778462	138778282	Y	NA	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	14003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	138779904	138780459	138780182	Y	NA	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	12006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	139320693	139321014	139320839	Y	PARP12,LUC7L2	NA	NA	NA	NA	NA	ERHP1	103707	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	139354231	139354464	139354322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	121113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	139366770	139367125	139366961	Y	TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	139367160	139367381	139367316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108196	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	139410403	139410671	139410537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	64906	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	139420496	139420947	139420749	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	54630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	139425752	139426584	139426362	Y	TBXAS1,JHDM1D	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	48993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	139431881	139432226	139432135	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	43351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	139929659	139930294	139929953	Y	TBXAS1,RAB19,JHDM1D	NA	JHDM1D,LOC100134229	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP12	168138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	140338889	140339239	140339064	Y	NA	ADCK2,DENND2A,NDUFB2	DENND2A,MKRN1	IMR90	Hi-C	24141950	ADCK2	31714	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	140572858	140572991	140572984	Y	BRAF	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	49573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	140774728	140775101	140774915	Y	NA	RNU4-74P	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	24679	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	140776370	140776415	140776407	Y	LOC100131199	RNU4-74P	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	26321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	140807032	140807954	140807105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	56983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	140808107	140808453	140808225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	58058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	140880261	140880624	140880319	Y	LOC100131199	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	130212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	141016311	141016374	141016343	Y	TAS2R3,WEE2	NA	NA	NA	NA	NA	AGK	232615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	141052183	141052582	141052369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGK	196407	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	141380130	141380660	141380538	Y	NA	KIAA1147,RNU1-82P	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	19293	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	141851969	141852212	141852091	Y	WEE2,TAS2R4,TAS2R5,OR9A4,TAS2R38	NA	NA	NA	NA	NA	MGAM	246356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	142519257	142519562	142519385	Y	TAS2R39,OR9A2	NA	EPHB6,TRPV5	IMR90	Hi-C	24141950	PRSS1	63938	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	145847092	145847701	145847439	Y	CNTNAP2	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	35639	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	145860816	145861156	145860986	Y	CNTNAP2	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	49363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	145925339	145925571	145925397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	113886	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	145932628	145933064	145932806	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	121175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr7	145933200	145933594	145933373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	121747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	145940282	145940834	145940467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	128829	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	145943025	145943194	145943108	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	131572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	145946351	145946582	145946467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	134898	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	145973417	145973757	145973587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	161964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	145974420	145974737	145974579	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	162967	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr7	145996406	145996791	145996515	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	184953	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	146054322	146054858	146054524	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	242869	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr7	146086153	146086538	146086171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	274700	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr7	146179295	146179312	146179304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	367842	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	146189423	146189726	146189575	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	377970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr7	146343004	146343369	146343187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	531551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	146553535	146553793	146553664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	742082	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	146573041	146573429	146573238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	761588	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	148269293	148269443	148269383	Y	NA	AC005229.5	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	6050	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	148553939	148554320	148554152	Y	CUL1,EZH2,EZH2	EZH2	NA	NA	NA	NA	EZH2	25093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	148637842	148638122	148637883	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	149232526	149232604	149232565	Y	SSPO	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	39618	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	149280287	149280529	149280408	Y	NA	ZNF767	NA	NA	NA	NA	ZNF767	39314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	150520183	150520563	150520402	Y	REPIN1,ABP1	TMEM176A,TMEM176B	NA	NA	NA	NA	TMEM176B	23735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	150948540	150948854	150948603	Y	NA	ABCF2,CHPF2	NA	NA	NA	NA	CHPF2	20965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	151192969	151193321	151193145	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21885	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	151622915	151623433	151623313	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	LOC100505483,PRKAG2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRKAG2	50705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	152123020	152123275	152123182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	247975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.96372935745209
chr7	154746550	154746681	154746616	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	46113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	154985078	154985219	154985136	Y	INSIG1	NA	INSIG1,HTR5A,LOC100128264	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INSIG1	102267	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	156290432	156290782	156290467	Y	RNF32	NA	SHH,LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	RNF32	140193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	156792805	156792864	156792835	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	8481	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	157034052	157034373	157034213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	50990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157054104	157054271	157054188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	71042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157112606	157112849	157112710	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	13226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157131379	157131690	157131421	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	5304	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157227632	157227698	157227667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	101557	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr7	157405982	157406183	157406105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	279907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr7	157485564	157486050	157485938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	359489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157557490	157557665	157557578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	431415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157629246	157629505	157629365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	503171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	157639011	157639249	157639125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	512936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157673991	157674159	157674024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	547916	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157793988	157794028	157794008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	584452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	157840945	157841296	157841083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	537184	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr7	157885320	157885690	157885593	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	492790	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr7	157945202	157945430	157945313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	433050	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	158044474	158044782	158044628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	333698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	158145128	158145561	158145413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	232919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	153489	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	158301829	158302021	158301840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	76459	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	158357376	158357683	158357548	Y	NA	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	20797	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	158378369	158378681	158378482	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr7	158765978	158766170	158766074	Y	NA	NA	NCAPG2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR60	118709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	1736486	1736690	1736554	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	25818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	3252665	3252838	3252782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	1390016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	3552666	3552917	3552915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	1089937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	4026631	4026760	4026730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	616094	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	6119351	6119643	6119456	Y	MCPH1	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	142470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	60983	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.07296750675124
chr8	6481206	6481441	6481325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANGPT2	62276	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	6575644	6576065	6575803	Y	MCPH1,AGPAT5	CTD-2541M15.1,AGPAT5	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	11766	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	10681939	10682203	10682138	Y	RP1L1	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	13191	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	10692830	10693156	10692993	Y	NA	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	2238	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	10770133	10770731	10770512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	74739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	10873844	10874251	10874241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	178450	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	10875664	10875852	10875757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	180270	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	11001237	11001609	11001584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR6	55266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	11036366	11036550	11036458	Y	MTMR9,XKR6	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	20325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	11311289	11311840	11311810	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	18384	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.92745871490419
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	11319529	11319661	11319595	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	10563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	11322764	11323135	11322939	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	7089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr8	11558749	11558994	11558836	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	26281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	11560575	11560973	11560829	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	28107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	11562739	11563084	11562994	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	30271	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	11755941	11756161	11756072	Y	CTSB	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	30984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	13515427	13515756	13515570	Y	NA	NA	KIAA1456,DLC1	IMR90	Hi-C	24141950	DLC1	144260	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	15443006	15443379	15443076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	170282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	15546823	15547116	15546970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	274099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	16476986	16477261	16477122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	534277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	16609902	16609923	16609912	Y	VPS37A	NA	TUSC3,MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	401615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	16898778	16899115	16898947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	112423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	17165650	17166030	17165840	Y	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	63263	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	17194213	17194219	17194216	Y	SLC7A2,SLC7A2	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR7	74818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	17385893	17386107	17386000	Y	SLC7A2,SLC7A2	SLC7A2,PDGFRL	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	33296	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	17467552	17467711	17467600	Y	MTMR7,MTUS1	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	35610	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	17583613	17583759	17583634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTUS1	72667	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	17708923	17709156	17709065	Y	MTMR7,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	52069	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	17893767	17894158	17893964	Y	NAT1,ASAH1,ASAH1	CTD-2547L16.1,ASAH1	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	46219	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	18722659	18722821	18722740	Y	PSD3	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	217419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	18768857	18769292	18769046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	170948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	18854306	18854486	18854451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	85754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	19236420	19236600	19236592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	296180	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	19293000	19293226	19293113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	352760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	20055803	20056436	20056187	Y	ATP6V1B2	SLC18A1,ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	2925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	20064190	20064507	20064297	Y	ATP6V1B2	SLC18A1,ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	11312	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	21167334	21167434	21167384	Y	GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	607746	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	21624397	21624558	21624547	Y	NPM2,GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	150622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	22441359	22441704	22441532	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	7567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	22468597	22468907	22468752	Y	TNFRSF10C,EGR3,PDLIM2,PDLIM2,BIN3	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13483	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	23034603	23034952	23034670	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP7	64198	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	25348135	25348483	25348309	Y	CDCA2	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	33622	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	26262808	26263041	26262925	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	SDAD1P1	24339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	26447042	26447356	26447232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	77251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	27517363	27517693	27517481	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	27978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	27630770	27631068	27630863	Y	NA	ESCO2,CCDC25	NA	NA	NA	NA	CCDC25	2600	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	8636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	80225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	28859805	28860025	28859905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	51427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	28930417	28930501	28930459	Y	NA	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	18965	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29083031	29083529	29083345	Y	KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	35112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29316675	29316889	29316765	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	110490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29498600	29498751	29498676	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	292415	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29513867	29514215	29514082	Y	KIF13B	NA	DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	307682	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	29630716	29630847	29630782	Y	NA	NA	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	307876	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29631647	29631969	29631808	Y	NA	NA	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	306754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	29707370	29707567	29707471	Y	MBOAT4	NA	MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM66	231156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	29938783	29938843	29938811	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	TMEM66	60	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29948448	29949236	29948548	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	1678	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	29957112	29957836	29957408	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24,MBOAT4	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	6198	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	30262933	30263230	30262977	Y	NA	RBPMS	NA	NA	NA	NA	RBPMS	22989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	30280646	30281238	30280961	Y	MBOAT4	RBPMS	NA	NA	NA	NA	RBPMS	40702	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	31498667	31498926	31498727	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	382809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr8	31500789	31500847	31500818	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	380888	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	31584463	31584620	31584542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	297115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	31770088	31770106	31770098	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	111629	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr8	31861794	31862187	31861910	Y	NRG1	NRG1-IT1	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	19548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.94559403617814
chr8	31888630	31888701	31888666	Y	NA	NRG1-IT1	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	6895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	32052985	32053085	32053036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	171250	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	32084575	32084724	32084674	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	202840	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	32174217	32174584	32174401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	292482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	32240573	32240939	32240756	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	358838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	32491615	32491938	32491677	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	609880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	33456177	33456579	33456440	Y	DUSP26	RNF122,DUSP26	NA	NA	NA	NA	DUSP26	553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	33579772	33580017	33579844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP26	124148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.61830580993612
chr8	36758959	36759166	36759082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-962G15.1	124277	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	38216773	38217155	38217067	Y	WHSC1L1,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	20635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	40016557	40016909	40016733	Y	NA	C8orf4	NA	NA	NA	NA	C8orf4	7568	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	41160567	41160649	41160637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD65	121525	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	41851790	41851810	41851800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	55698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	48434780	48435210	48435108	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	214438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	48746170	48746340	48746217	Y	MCM4	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	96522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	49175738	49176128	49175933	Y	NA	NA	SNAI2,MCM4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	119022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	49430601	49430974	49430806	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	135451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	52797055	52797111	52797083	Y	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	12624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	53013780	53014013	53013897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	203895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	53607875	53608327	53608179	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	48076	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM68	60354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM68	72587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	58314676	58315001	58314766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	410273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	58333215	58333500	58333329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	428812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	59786438	59786547	59786493	Y	UBXN2B	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	61327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	59821707	59822062	59821885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	96596	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	59849492	59849915	59849740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	124381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	59878188	59878486	59878337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	151113	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	59949464	59949741	59949603	Y	TOX	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	79858	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	59974801	59974880	59974841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	54719	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	59980234	59980420	59980383	Y	NA	RP11-25K19.1,TOX	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	49179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	59983682	59983838	59983818	Y	NA	RP11-25K19.1,TOX	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	45761	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	59995784	59996163	59995974	Y	NA	RP11-25K19.1,TOX	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	33436	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	60832747	60832939	60832831	Y	NA	NA	TOX	IMR90	Hi-C	24141950	CA8	359032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	RP11-91I20.2,CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-91I20.2	123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	RP11-91I20.2,CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	61705362	61705819	61705615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC022182.1	114793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	61708880	61709194	61708899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC022182.1	111418	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	61825257	61825601	61825298	Y	NA	AC022182.1	NA	NA	NA	NA	AC022182.1	4645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	AC022182.1	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	AC022182.1	29878	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	64908546	64908816	64908686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE22	581998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	66742209	66742357	66742281	Y	NA	PDE7A	NA	NA	NA	NA	PDE7A	10200	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	66791613	66791826	66791725	Y	PDE7A	PDE7A	NA	NA	NA	NA	PDE7A	39056	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	71188678	71189062	71188836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	124978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	71459765	71459799	71459782	Y	NA	NA	NCOA2	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM1	58823	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1,RP11-382J12.1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	72917567	72918022	72917791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	529604	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	73227505	73227652	73227579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	219974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	73230861	73231003	73230932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	216623	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	73333960	73334345	73334224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	113281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	73481000	73481171	73481085	Y	KCNB2	KCNB2	NA	NA	NA	NA	KCNB2	33374	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr8	73492870	73493054	73492949	Y	NA	KCNB2	NA	NA	NA	NA	KCNB2	45244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	73497405	73497640	73497408	Y	NA	KCNB2	NA	NA	NA	NA	KCNB2	49779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	73519574	73520002	73519704	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	71948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.29101758369411
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	111470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr8	73605435	73605486	73605461	Y	KCNB2,TERF1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	157809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	100789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr8	73733862	73734193	73733971	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	57782	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr8	73742215	73742578	73742518	Y	NA	RP11-1145L24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	49397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	73785443	73785827	73785649	Y	KCNB2	RP11-1145L24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	6148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	73799378	73799441	73799410	Y	KCNB2	RP11-1145L24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	7403	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	73819735	73820065	73819911	Y	NA	RP11-1145L24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	27760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	74282734	74282969	74282907	Y	NA	RP11-434I12.3	STAU2,LOC100128126,RDH10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-434I12.3	13586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	74371877	74372089	74371987	Y	RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-434I12.3	102729	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	74637544	74637721	74637705	Y	NA	STAU2	NA	NA	NA	NA	STAU2	20222	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	75135577	75135926	75135753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP1	95439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	75221301	75221616	75221459	Y	NA	GDAP1,JPH1	NA	NA	NA	NA	GDAP1	9749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	75418171	75418548	75418360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	95931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	75494116	75494334	75494225	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	20145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	75574618	75574942	75574782	Y	GDAP1,GDAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	60139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	76035291	76035498	76035400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	282651	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.76381460178318
chr8	76316572	76316672	76316622	Y	HNF4G	HNF4G	NA	NA	NA	NA	HNF4G	1477	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	77389631	77389653	77389643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	201801	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	77464469	77464479	77464474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	126975	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	77469082	77469378	77469240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	122076	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	77590079	77590470	77590424	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	984	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	77731385	77731402	77731393	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4-AS1	137872	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	80008079	80008434	80008257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	581705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	80859511	80859794	80859653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	80730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	80991495	80991889	80991678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	50971	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	81015641	81015664	81015650	Y	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	75117	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	81035979	81036376	81036336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	95455	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	81041762	81041917	81041834	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	99550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr8	81050951	81051119	81051010	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	90348	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	81059132	81059394	81059212	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	82073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	81400222	81400395	81400296	Y	ZBTB10	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	4368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	81489520	81489653	81489606	Y	NA	NA	ZBTB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB10	93666	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	82738373	82738533	82738453	Y	NA	SNX16	NA	NA	NA	NA	SNX16	14568	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	83490846	83490929	83490888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX16	737745	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	83600691	83600995	83600934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX16	847590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.78194992305713
chr8	85136696	85136911	85136758	Y	NA	RALYL	NA	NA	NA	NA	RALYL	43674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	85296015	85296611	85296285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALYL	202993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	85472216	85472229	85472220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALYL	379194	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr8	85475808	85476019	85475813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALYL	382786	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	85709918	85710114	85710016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRCC1	307268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	86542715	86542978	86542892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CA2	168634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	89124026	89124433	89124347	Y	MMP16	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118P15.2	139633	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	90270902	90271148	90271067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	496807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	90627835	90627903	90627892	Y	NA	NA	MMP16	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37B2.1	140052	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	90986800	90987074	90986966	Y	RIPK2,OSGIN2,OSGIN2,NBN	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	DECR1	24559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	92045909	92045927	92045918	Y	TMEM55A	TMEM55A,GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	TMEM55A	5365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	92112003	92112264	92112167	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	31579	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	92356363	92356503	92356424	Y	SLC26A7	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	275939	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	93037158	93037539	93037349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-100L22.2	850326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	93587171	93587290	93587231	Y	NA	NA	RUNX1T1,FLJ46284	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-100L22.2	300575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	LINC00535	17696	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	95003706	95004122	95004001	Y	NA	NA	LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	135671	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	95089628	95089913	95089904	Y	NA	NA	GEM,CDH17,RAD54B	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1247B1.1	123367	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	95786265	95786660	95786406	Y	RAD54B,KIAA1429	INTS8	NA	NA	NA	NA	INTS8	36879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	95976096	95976285	95976193	Y	PLEKHF2	TP53INP1,RP11-347C18.3	C8orf69,TP53INP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-347C18.3	15831	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	97174234	97174570	97174431	Y	GDF6	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRB	71292	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	97669610	97669970	97669871	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	166031	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	98051049	98051098	98051078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	237078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	98454033	98454434	98454234	Y	NA	NA	PTDSS1,SDC2,CPQ,TSPYL5	IMR90	Hi-C	24141950	TSPYL5	165857	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	98572408	98572537	98572454	Y	NA	NA	PTDSS1,CPQ,SDC2,TSPYL5,MTDH	IMR90	Hi-C	24141950	MTDH	81870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	98841899	98841938	98841919	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	33344	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	98843281	98843693	98843349	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31589	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	99485745	99486120	99486088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	181124	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	101912406	101912993	101912785	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	6432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	101913945	101914105	101914022	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	7971	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	102120764	102121998	102120921	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF706	94423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	102149452	102149813	102149564	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	66608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	102373140	102373427	102373201	Y	NA	NACAP1	GRHL2,NACAP1,NCALD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NACAP1	1118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	102665065	102665479	102665281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP1	293043	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	102879018	102879156	102879087	Y	NCALD,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	NCALD	255979	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	103109879	103110286	103110195	Y	UBR5,NCALD	NCALD	NA	NA	NA	NA	NCALD	24849	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	103134704	103135007	103134756	Y	UBR5,NCALD	NCALD	NA	NA	NA	NA	NCALD	128	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	103401606	103401938	103401841	Y	NA	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	21131	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	103543077	103543292	103543136	Y	NCALD,UBR5	NA	UBR5,ODF1	IMR90	Hi-C	24141950	UBR5	120008	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	103757592	103757997	103757773	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	57748	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	KB-1732A1.1	NA	NA	NA	NA	KB-1732A1.1	6885	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	12356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	104108865	104109263	104109003	Y	NA	BAALC	FZD6,CTHRC1,DCAF13	IMR90	Hi-C	24141950	BAALC	41675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	CTHRC1,DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	104553511	104553813	104553575	Y	NA	RP11-1C8.4,RP11-5A11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	15804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.63644113121008
chr8	104792192	104792465	104792329	Y	RIMS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	222575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	105087342	105087776	105087510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	511476	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	105212578	105212580	105212579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	386672	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	105290785	105291073	105290860	Y	LRP12	NA	RIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	308179	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	105359609	105360177	105359969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	239075	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	105487204	105487256	105487230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	111996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	108287452	108287481	108287467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	579211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	108317294	108317670	108317585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	609053	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	108375233	108375335	108375292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	666992	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	109132004	109132262	109132106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	313300	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	110647152	110647483	110647459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	54537	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	110922372	110922703	110922477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	220352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	114058689	114058941	114058782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	327957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	115322659	115322858	115322759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSMD3	875331	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	115707569	115707650	115707588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	1112249	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	116441706	116441935	116441732	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	377964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	116641527	116641923	116641875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	177976	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	116879779	116880131	116880045	Y	TRPS1	NA	TRPS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRPS1	59880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	117889939	117890223	117890034	Y	RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	4834	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	119323544	119323883	119323714	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	201452	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	119419771	119420080	119419851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	212154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	119536968	119537364	119537323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	94870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	119781554	119781682	119781618	Y	NA	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	9114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	120586611	120586914	120586761	Y	NOV,TAF2,ENPP2	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP2	96779	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	120656261	120656532	120656398	Y	NA	ENPP2	ENPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ENPP2	27161	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	120684106	120684406	120684274	Y	NA	ENPP2	NA	NA	NA	NA	ENPP2	413	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	121080226	121080708	121080602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPTOR	196269	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	121574734	121575043	121574888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	119092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	121619256	121619602	121619580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	163614	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	121628287	121628559	121628462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	172645	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr8	121649803	121649981	121649892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	173532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr8	121737162	121737328	121737239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	86185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	121815954	121816374	121816244	Y	SNTB1	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	7139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	121821026	121821194	121821110	Y	SNTB1	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	2319	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	122347057	122347434	122347232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	523544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	123106451	123106468	123106460	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX2	685165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	123554742	123554841	123554763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	236792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124013159	124013422	124013291	Y	NA	DERL1	NA	NA	NA	NA	DERL1	39241	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf76	81977	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	124407044	124407322	124407183	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	19268	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	124529265	124529734	124529486	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	21712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124547812	124548082	124548041	Y	NA	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	3364	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124549741	124550229	124550044	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1217	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124552481	124552488	124552485	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1035	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124699718	124700050	124699886	Y	FBXO32	ANXA13	NA	NA	NA	NA	ANXA13	47597	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124747351	124747363	124747357	Y	ANXA13	ANXA13,FAM91A1	NA	NA	NA	NA	ANXA13	284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124889263	124889525	124889394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	110567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	124934433	124934622	124934528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	155737	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125193673	125194016	125193878	Y	NA	ARF1P3	TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1,TRMT12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARF1P3	31509	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125210059	125210285	125210207	Y	FAM91A1,TMEM65,RNF139	ARF1P3	TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ARF1P3	47895	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125275002	125275221	125275161	Y	RNF139	RP11-383J24.1	FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	6703	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125304968	125305098	125305033	Y	NA	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	23044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125341304	125341312	125341308	Y	NA	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	41621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	125382714	125382961	125382953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125539571	125539718	125539637	Y	RNF139	NDUFB9,TATDN1	RNF139	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NDUFB9	9626	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125646597	125646950	125646829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	91780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	125659031	125659039	125659035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	79691	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	125672540	125672913	125672841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	65817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	125683084	125683301	125683193	Y	MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	55429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	125683699	125684014	125683857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	54716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	125698372	125698715	125698641	Y	NA	MTSS1	NA	NA	NA	NA	MTSS1	40015	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	125984707	125984742	125984718	Y	ZNF572	ZNF572,SQLE	NA	NA	NA	NA	ZNF572	1167	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126112372	126112753	126112532	Y	TRIB1,NSMCE2	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	10290	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126193275	126193543	126193371	Y	NA	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	91193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126268557	126268681	126268622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	166475	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr8	126296437	126296656	126296547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	143907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126322031	126322772	126322054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	117791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126359319	126359378	126359337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	81185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	126451967	126452238	126452064	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	126452500	126452812	126452633	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	126508271	126508573	126508428	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	67708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126706494	126706783	126706659	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	265931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	126710312	126710685	126710478	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	269749	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	127002409	127002822	127002662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	561846	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	127104655	127104821	127104738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	463299	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	127391569	127391909	127391842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	176211	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	127574722	127575027	127574875	Y	NA	RP11-89K10.1,FAM84B	NA	NA	NA	NA	FAM84B	6084	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	127640965	127641019	127640992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	72327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	127661075	127661484	127661171	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	92437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128196669	128197128	128196955	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	32205	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128259400	128259918	128259781	Y	MYC	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	30067	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128311072	128311242	128311156	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	81739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128333152	128333458	128333317	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	103819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128413471	128413778	128413602	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	184138	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128883085	128883449	128883196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	78306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129115789	129116244	129116059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129279863	129280046	129279972	Y	NA	NA	MYC,MIR1208	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU4-25P	259006	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129535046	129535177	129535106	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	514189	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	548193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	129593885	129594223	129593976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	573028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129655139	129655338	129655239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	634282	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	129706266	129706412	129706340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	685409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	130222982	130222992	130222987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	804383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	130643011	130643232	130643122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	384143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	130996669	130996803	130996748	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	131089372	131089764	131089568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	61997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	131114299	131114376	131114317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	86924	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	131260848	131261137	131260957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	192769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	131269679	131269819	131269766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	184087	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	131271729	131272058	131271952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	181848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	132658196	132658445	132658435	Y	HHLA1	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	255890	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	133257165	133257466	133257335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	342830	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	133490570	133490736	133490650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	195102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	133508104	133508400	133508366	Y	NA	NA	KCNQ3,LRRC6	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC6	177438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	133846055	133846325	133846220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	60437	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	134206657	134207025	134206839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	105240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	134895169	134895357	134895247	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST3GAL1	312986	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	135164588	135164739	135164681	Y	NA	NA	ST3GAL1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAT	558553	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	135469388	135469911	135469674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	253381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	135695599	135695940	135695747	Y	NA	ZFAT	NA	NA	NA	NA	ZFAT	27352	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	MIR30D	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	27302	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr8	136476552	136476867	136476709	Y	NA	KHDRBS3	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	8852	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	139270111	139270285	139270199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135B	236780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	139279809	139280062	139279816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135B	227003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	139293707	139293714	139293711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135B	213351	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	139299523	139299711	139299616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135B	207354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	139470723	139471056	139470890	Y	NA	FAM135B	NA	NA	NA	NA	FAM135B	36009	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	139692214	139692696	139692462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135B	185149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	139695488	139695863	139695605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135B	188423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	139756041	139756387	139756229	Y	COL22A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	167862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr8	139799567	139799714	139799659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	124535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	140716297	140716707	140716660	Y	NA	KCNK9	NA	NA	NA	NA	KCNK9	2998	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	140843827	140843872	140843850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK9	130528	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	141358966	141359028	141358983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	107650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	141725005	141725293	141725149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	205608	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	141804565	141804680	141804623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	205635	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr8	141920743	141920803	141920776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	89512	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	142141816	142141930	142141883	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	16439	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	142411426	142411896	142411690	Y	DENND3,SLC45A4,PTP4A3	PTP4A3,CTD-3064M3.4	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-3064M3.4	10752	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr8	142424106	142424307	142424175	Y	NA	PTP4A3,CTD-3064M3.4,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	CTD-3064M3.4	23432	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	142425618	142425919	142425790	Y	NA	PTP4A3,CTD-3064M3.4,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	CTD-3064M3.4	24944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00051	75931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	GRINA	NA	NA	NA	NA	GRINA	35424	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr8	145083268	145083683	145083273	Y	NA	GRINA,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9	NA	NA	NA	NA	PARP10	1257	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	145118322	145118976	145118932	Y	LOC100130274,SPATC1	PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN	NA	NA	NA	NA	OPLAH	1587	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,SCRT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	145558616	145559185	145558966	Y	ZNF517,ZNF34,LRRC24,KIFC2,CYHR1,SCRT1	BOP1,HSF1,DGAT1,SCRT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	SCRT1	673	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chr8	145847503	145847804	145847651	Y	SCRT1,KIFC2,ZNF34,ARHGAP39	NA	ARHGAP39,ZNF251	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	61390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr8	145938520	145938651	145938564	Y	NA	ARHGAP39,ZNF251	NA	NA	NA	NA	ARHGAP39	29326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr9	114399	114756	114578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	98098	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	224646	225023	224847	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	11792	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	225416	225914	225497	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	12562	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	226208	226591	226300	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	13354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	278768	279182	278781	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	65914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	442373	442547	442460	Y	NA	KANK1	NA	NA	NA	NA	KANK1	25744	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	677967	678108	678032	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	209676	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	972038	972418	972053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	503747	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	2241493	2241738	2241696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	2490043	2490145	2490094	Y	NA	NA	KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	VLDLR	129689	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	2613992	2614264	2614088	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	5570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	2839342	2839735	2839533	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	2506	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	3470131	3470258	3470195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	53746	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	3507863	3508210	3507917	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	3508264	3508975	3508586	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15029	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	3971837	3971870	3971849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	374522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	4083576	4083986	4083877	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	262406	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	4334414	4334840	4334611	Y	NA	GLIS3	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	11552	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	4530559	4530733	4530650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	129565	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	4715214	4715412	4715290	Y	AK3	CDC37L1,AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	24631	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	5895206	5895407	5895334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	64089	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	5901129	5901190	5901160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	70012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	6564380	6564534	6564488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-106A1.2	72605	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	7149898	7149929	7149914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	326391	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	8576629	8576984	8576673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	134327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	8675420	8675557	8675548	Y	NA	RP11-134K1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	35754	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	8771816	8771826	8771822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	60505	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	14251419	14251628	14251514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	145354	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	14271164	14271559	14271500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	125423	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	14301558	14301649	14301604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	95333	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	15306066	15306408	15306119	Y	NA	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	708	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	15477137	15477463	15477300	Y	NA	PSIP1,FTH1P12	NA	NA	NA	NA	PSIP1	31554	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	16344409	16344763	16344480	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	BNC2	524078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	16729817	16729878	16729869	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	138963	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	17520540	17520838	17520658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GL2	56242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	18438830	18439003	18438962	Y	NA	NA	FAM154A,ADAMTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-296P7.4	585887	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	18767233	18767447	18767340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	257443	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	18768460	18768476	18768467	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	256414	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	18857353	18857783	18857553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	167107	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	19184256	19184894	19184463	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	36968	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	19633870	19634262	19634172	Y	ACER2,SLC24A2	NA	NA	NA	NA	NA	ACER2	226945	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	21081727	21081778	21081753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLAD2	52092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	21699320	21699393	21699347	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	101149	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	21809706	21810111	21809856	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	9164	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	21984231	21984381	21984318	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	8919	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	22012524	22012846	22012594	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	2370	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	22040932	22041035	22040938	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	30778	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	22792837	22793126	22792982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	347997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	23622735	23622745	23622740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	201590	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	23639161	23639473	23639317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	184862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	23850835	23851256	23851099	Y	NA	ELAVL2	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	26500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	26436913	26437234	26437074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT74	507803	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	27416206	27416570	27416389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	111209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	28649799	28650020	28649948	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1077935	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	30078257	30078387	30078322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	608716	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	31790390	31790408	31790400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	592210	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	31966420	31966696	31966558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	415922	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	32004800	32005157	32005020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	377461	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.09110282802519
chr9	32437038	32437275	32437091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	54420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	32524178	32524624	32524592	Y	DDX58	TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	33202575	33202797	33202660	Y	NA	B4GALT1,SPINK4	SMU1,B4GALT1,SPINK4	IMR90	Hi-C	24141950	SPINK4	13566	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	33350411	33350624	33350531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFX1	61902	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	34124231	34124372	34124320	Y	NA	DCAF12	NA	NA	NA	NA	DCAF12	1025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	34588619	34588889	34588721	Y	NA	CNTFR,DCTN3,SIGMAR1	NA	NA	NA	NA	CNTFR	498	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	35232989	35233276	35233133	Y	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	NA	UNC13B	72990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	35516545	35516820	35516591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	86547	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,NPR2,SPAG8,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	NPR2	19802	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	36231547	36231666	36231607	Y	NA	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	34114	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	33655	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	32675	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	36294075	36294254	36294162	Y	OR13J1,OR2S2	RNU4-53P,GNE	RNF38,CLTA,GNE	IMR90	Hi-C	24141950	GNE	19022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	36869466	36869710	36869657	Y	ZCCHC7,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	162393	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	36951908	36952256	36952225	Y	ZCCHC7,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	79847	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	37035251	37035762	37035526	Y	ZCCHC7,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	3148	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	37035783	37036025	37035954	Y	ZCCHC7,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	3680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	4538	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	37197498	37198123	37197885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78962	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37295997	37296383	37296038	Y	PAX5,ZCCHC7,FRMPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	124280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37902777	37903120	37902949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	103343	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37924173	37924321	37924247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	124739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37930298	37930375	37930337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	130864	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	102917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	38008217	38008489	38008387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	58721	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	38035956	38036107	38036020	Y	NA	SHB	NA	NA	NA	NA	SHB	31103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGM5P2	2690091	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	72101775	72101805	72101790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBA1	183417	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.89118807235628
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	2.1273734705731
chr9	73036465	73036957	73036835	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	73085472	73085592	73085532	Y	NA	NA	TRPM3,SMC5,KLF9	IMR90	Hi-C	24141950	KLF9	57932	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	73145722	73145876	73145799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	118182	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	73168765	73169157	73169115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	141225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	74056463	74056568	74056515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	145949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	74293239	74293379	74293310	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90722	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	74657404	74657841	74657552	Y	TMEM2,ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	GDA	69670	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	75201715	75201894	75201832	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	223552	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	75518800	75519107	75519099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	174251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	75549526	75549619	75549601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	143739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	80354506	80354684	80354595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	289690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	80548294	80548580	80548559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	95794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	81329740	81329936	81329769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	419681	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	81332135	81332473	81332353	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	PSAT1	422076	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	81586798	81586848	81586823	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD2P9	417371	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	81641483	81641834	81641545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	362385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	85378567	85378941	85378719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	297151	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	86044941	86045010	86044976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	106451	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	86088348	86088544	86088498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	62917	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	86238855	86239256	86239056	Y	UBQLN1,GKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	81253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	86239584	86239974	86239757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	80535	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	87326939	87327108	87327024	Y	NTRK2,NTRK2,NTRK2	NA	NA	NA	NA	NA	RMI1	733313	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	88286391	88286647	88286519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	68297	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	88935508	88935794	88935577	Y	NA	ISCA1,ZCCHC6	NA	NA	NA	NA	ZCCHC6	31575	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	90133886	90134005	90133888	Y	NA	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	4212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	91125141	91125399	91125267	Y	NA	NA	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2	IMR90	Hi-C	24141950	SPIN1	123807	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	92171593	92171895	92171765	Y	NA	GADD45G	SECISBP2,SEMA4D	IMR90	Hi-C	24141950	GADD45G	46033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	92276961	92277319	92277054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	59033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	92887274	92887574	92887411	Y	NA	NA	UNQ6494,SYK,DIRAS2	IMR90	Hi-C	24141950	GADD45G	669346	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	93862627	93863018	93862659	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	259177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	93954665	93954922	93954788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	167273	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	93959484	93959867	93959681	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	162328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	93975322	93975401	93975365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	146794	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	94123007	94123342	94123181	Y	NA	AUH	NA	NA	NA	NA	AUH	812	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	94565955	94566119	94566028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	144325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	94614253	94614381	94614318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	96063	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	94660957	94661066	94661012	Y	NA	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	49378	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	94668024	94668724	94668369	Y	ROR2	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	41720	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	95388417	95388814	95388616	Y	FGD3,CENPP	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	41733	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	95860928	95861146	95861059	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	SUSD3,C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	4428	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	96057122	96057472	96057169	Y	ZNF484,ZNF484,WNK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120A	154532	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	96057493	96057765	96057581	Y	ZNF484,ZNF484,C9orf129,WNK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120A	154239	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	96335202	96335517	96335360	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	1172	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	96377714	96377795	96377762	Y	PHF2	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	41025	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	96434811	96435085	96434948	Y	PHF2	NA	NA	NA	NA	NA	PHF2	98122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	96901972	96902054	96902023	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	37062	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	96919415	96919512	96919464	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	19604	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr9	97758166	97758608	97758351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	271183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	97895370	97895760	97895554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	182231	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	97906311	97906710	97906505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	171281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	97950881	97951234	97951005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	126757	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	98210362	98210561	98210462	Y	PTCH1	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	23284	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98218146	98218184	98218162	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	31068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98262009	98262267	98262138	Y	PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	15072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98273818	98274186	98273872	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98619422	98619821	98619622	Y	NA	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	16438	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98642406	98642593	98642483	Y	PTCH1,PTCH1,C9orf102	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	6147	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98744078	98744248	98744144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	107819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98789709	98789934	98789859	Y	C9orf102	NA	LOC158435	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	116355	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	98979716	98980057	98980045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4BP3	73427	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	99132173	99132333	99132255	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	11659	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	99171138	99171308	99171256	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	3572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	99213129	99213681	99213680	Y	ZNF510,CDC14B,HABP4	RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	HABP4	2646	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	99334926	99335181	99335054	Y	NA	CDC14B	HABP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC14B	44931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	100144851	100144941	100144896	Y	NA	TDRD7	NA	NA	NA	NA	TDRD7	27291	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	100265790	100266140	100265924	Y	HEMGN,ANP32B,TMOD1,TMOD1	TMOD1	NA	NA	NA	NA	TMOD1	4328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	100994380	100994637	100994474	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	21278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	101554135	101554384	101554323	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	2863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	101998006	101998474	101998251	Y	ALG2,SEC61B	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	15660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	102391260	102391441	102391334	Y	ERP44,NR4A3	NA	SEC61B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554F20.1	188730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	103317087	103317229	103317158	Y	C9orf30-TMEFF1,TMEFF1,LPPR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF1	114527	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	104004490	104004540	104004515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL50	154356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	105188189	105188275	105188232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIN3A	689327	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	105248809	105248820	105248818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIN3A	749947	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	7.36398509044535
chr9	107597613	107597745	107597668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3B	73175	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	107979204	107979331	107979268	Y	TAL2,SLC44A1,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	SLC44A1,ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A1	25572	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	108166209	108166576	108166239	Y	NA	FSD1L	NA	NA	NA	NA	FSD1L	41501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	108220808	108221168	108220887	Y	NA	FSD1L	NA	NA	NA	NA	FSD1L	12731	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	108474101	108474491	108474408	Y	TMEM38B	TMEM38B	NA	NA	NA	NA	TMEM38B	19276	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	108621964	108622364	108622354	Y	NA	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	167139	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	108623002	108623305	108623152	Y	FSD1L,FSD1L,TAL2	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	168177	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	109159029	109159177	109159103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF462	464201	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	109655091	109655246	109655169	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	31713	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	109655422	109655715	109655552	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	32044	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	110109718	110109795	110109757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	66300	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	110227888	110228126	110228018	Y	KLF4	KLF4	NA	NA	NA	NA	KLF4	22637	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	110819751	110819910	110819831	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	525080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	111034300	111034792	111034481	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-220D10.1	352321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	112076384	112076614	112076499	Y	NA	EPB41L4B	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	4630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	112091755	112092133	112091802	Y	PTPN3	EPB41L4B	EPB41L4B	MCF7	ChIA-PET	22265404	EPB41L4B	10511	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	112162175	112162241	112162208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	80931	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	112262069	112262452	112262225	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	3479	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	113493915	113494112	113494002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	476995	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	113515835	113516213	113516024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	498915	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	114808602	114808743	114808666	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	126945	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	114819352	114819642	114819392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	116046	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	115258728	115258879	115258816	Y	SNX30,SUSD1,ROD1	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	KIAA1958	11601	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	115657106	115657497	115657253	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF883	115010	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	115757286	115757809	115757590	Y	NA	ZNF883	NA	NA	NA	NA	ZNF883	14698	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	116398496	116398888	116398553	Y	C9orf43,RGS3	NA	C9orf43,RGS3,BSPRY,ALAD	IMR90	Hi-C	24141950	RGS3	193485	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	116648716	116649282	116648886	Y	NA	ZNF618	NA	NA	NA	NA	ZNF618	12154	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	116987864	116988161	116988001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	72024	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	117080236	117080340	117080297	Y	TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	164396	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	117131457	117132230	117131898	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	133500	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	117134599	117134885	117134873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	130845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	117159955	117160026	117159991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	105704	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	653212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	118028504	118028557	118028531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	657018	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	118704303	118704501	118704353	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	743080	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	118838142	118838541	118838342	Y	NA	NA	LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	609040	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	119329308	119329509	119329406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	118072	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	119451109	119451442	119451274	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	3528	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	119836202	119836379	119836375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	388621	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1075775	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	120613271	120613631	120613451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1165690	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	122806056	122806349	122806093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	534099	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123237192	123237494	123237347	Y	MEGF9,FBXW2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	102954	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	123346430	123346633	123346540	Y	TRAF1	CDK5RAP2	CDK5RAP2	K562	ChIA-PET	22265404	CDK5RAP2	5982	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123455501	123455738	123455670	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	19010	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123546044	123546305	123546215	Y	TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2	FBXW2,PSMD5-AS1	NA	NA	NA	NA	FBXW2	7385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123635278	123635355	123635317	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2251	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123834475	123834791	123834714	Y	TRAF1,TRAF1	C5,CNTRL	CNTRL,TRAF1,MEGF9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNTRL	350	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123839324	123839437	123839423	Y	CNTRL	C5,CNTRL	CNTRL,MEGF9,FBXW2,TRAF1,C5,RAB14	IMR90	Hi-C	24141950	CNTRL	4183	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	123877856	123878087	123877972	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	42715	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	123878647	123878673	123878659	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	43506	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	124363625	124363839	124363710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	380333	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	124462644	124463047	124462791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	390838	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	124704763	124705076	124704868	Y	TTLL11,MRRF,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	148809	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	125811144	125811514	125811213	Y	NA	NA	MIR600HG	IMR90	Hi-C	24141950	RABGAP1	110032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	125956223	125956395	125956307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72460	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	125956755	125956816	125956769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126002195	126002288	126002252	Y	OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	26567	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	126105825	126105916	126105882	Y	NA	NA	RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STRBP	76970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126169211	126169592	126169399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	140356	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126200869	126200875	126200873	Y	RABGAP1,GPR21,DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	172014	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126302696	126302988	126302896	Y	LHX2	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	273841	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	126624648	126624917	126624783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	65514	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126644407	126644614	126644564	Y	LHX2	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	45817	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126683805	126684169	126683927	Y	NA	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	6262	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	126978996	126979273	126979176	Y	DENND1A,NEK6,NEK6	NEK6	DENND1A,NEK6,PSMB7	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	38612	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	127040505	127040685	127040582	Y	NEK6,NEK6	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	22620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	127165878	127166187	127166033	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	9536	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	127356875	127357120	127357108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR6A1	174469	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	127433186	127433516	127433351	Y	NR6A1	NA	NA	NA	NA	NA	NR6A1	98073	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	127458498	127458770	127458741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR6A1	72819	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	127468042	127468336	127468195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR6A1	63253	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.09110282802519
chr9	128274126	128274455	128274251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	193058	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	128530354	128530667	128530385	Y	NA	PBX3	NA	NA	NA	NA	PBX3	22730	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	84491	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	128597374	128597723	128597549	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	89750	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	128908654	128909040	128908854	Y	NA	NA	PBX3	IMR90	Hi-C	24141950	PBX3	401030	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	129405263	129405520	129405376	Y	NA	LMX1B	NA	NA	NA	NA	LMX1B	30541	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	C9orf117,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	C9orf117	5376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	130590782	130591142	130590862	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	CDK9,FPGS,AK1	NA	NA	NA	NA	FPGS	35906	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	131543592	131543786	131543687	Y	NA	ZER1,TBC1D13,ENDOG,C9orf114	GLE1,SPTAN1,WDR34,SET,PKN3,ZDHHC12,ZER1,LOC100506100,TBC1D13,ENDOG,C9orf114,CCBL1,LRRC8A,NUP188,DOLK,FAM73B,DOLPP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBC1D13	3697	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	131645612	131645749	131645679	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1	NA	NA	NA	NA	CCBL1	2839	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	132081691	132082085	132081888	Y	NA	RP11-65J3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-65J3.1	10494	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	132171147	132171349	132171255	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	72381	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.80008524433108
chr9	132176730	132177172	132176936	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	66558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132220495	132220692	132220545	Y	FAM73B,USP20,USP20,C9orf78,ASB6	LINC00963	PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	23038	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	NA	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	68314	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42780	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132379342	132379626	132379484	Y	NA	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	ASB6	22818	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132568357	132568650	132568524	Y	TOR1B	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1B	4925	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132712659	132713039	132713009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	90434	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132718798	132719167	132719105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	84306	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132758529	132758977	132758901	Y	FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	44496	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	132785309	132785843	132785545	Y	USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	17630	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	132847110	132847326	132847217	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	33405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	133001906	133002144	133002026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCS1	69049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	133978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	134552911	134553181	134553024	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	60280	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	134609553	134609906	134609765	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3555	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	134770006	134770262	134770128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	156545	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	134774819	134775116	134774968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	161358	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	134953880	134954115	134953996	Y	MED27	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	585	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chr9	135088716	135088744	135088730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG2	53382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	135989434	135989663	135989519	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	47638	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	135989897	135990476	135990426	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	46825	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chr9	136226163	136226469	136226316	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96	NA	NA	NA	NA	SURF1	4611	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	136574282	136574774	136574604	Y	NA	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	28303	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	26298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	136746393	136746610	136746453	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	109116	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	136753303	136753756	136753577	Y	C9orf7,VAV2	NA	SARDH	IMR90	Hi-C	24141950	VAV2	101970	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	5.23661161987225
chr9	136779643	136779949	136779796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	75777	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chr9	137193665	137194015	137193832	Y	NA	RXRA	RXRA	MCF7	ChIA-PET	22265404	RXRA	12929	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	137231518	137231916	137231717	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	24574	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	137348030	137348540	137348200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	141086	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	137718262	137718824	137718799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	511318	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	138808024	138808108	138808066	Y	GLT6D1	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	10366	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139024359	139024752	139024554	Y	NA	NACC2,C9orf69	C9orf69	MCF7	ChIA-PET	22265404	C9orf69	15628	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139294189	139294305	139294248	Y	TRAF2,FAM69B,INPP5E	DNLZ,CARD9,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E	NA	NA	NA	NA	SDCCAG3	8756	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139446698	139446837	139446768	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	8034	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139540778	139541198	139541031	Y	NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7	MIR126,AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MIR126	21856	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139541579	139541677	139541660	Y	NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7	MIR126,AGPAT2	SEC16A,C9orf163	K562	ChIA-PET	22265404	MIR126	21377	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139591698	139592004	139591952	Y	C8G	MIR126,AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	AGPAT2	11823	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chr9	139595249	139595639	139595357	Y	SEC16A,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2	MIR126,AGPAT2,FAM69B,SNHG7	SNORA43,SNHG7	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM69B	9383	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139606234	139606418	139606254	Y	LCNL1,FUT7,CLIC3,C9orf142,ABCA2,KIAA1984	MIR126,AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	1212	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,C8G,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	6.70940863796132
chr9	140132594	140132714	140132654	Y	LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	951	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	3.10923814929915
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chr9	140274735	140275080	140274933	Y	CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	40634	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	140526461	140526811	140526551	Y	NA	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	15017	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	ARSE	848556	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	9700566	9700851	9700709	Y	LOC100288814	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	84658	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	84120	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	9896256	9896650	9896356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	84952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	10135057	10135251	10135239	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	12033	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	10712546	10712862	10712704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	136911	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	11722971	11723163	11723070	Y	NA	NA	ARHGAP6	IMR90	Hi-C	24141950	MSL3	51115	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	12969360	12969905	12969572	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	21322	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	13170049	13170410	13170120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	178822	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	16176605	16176961	16176614	Y	GRPR	GRPR,RPL6P30	NA	NA	NA	NA	GRPR	36926	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	17856457	17856771	17856610	Y	NA	RAI2	NA	NA	NA	NA	RAI2	20686	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	19360956	19361021	19360989	Y	NA	PDHA1	NA	NA	NA	NA	PDHA1	945	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	19842655	19843035	19842813	Y	RPS6KA3,SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	60684	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	22253958	22253963	22253961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	297267	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	25029418	25029558	25029499	Y	PCYT1B,PCYT1B,ARX	ARX	NA	NA	NA	NA	ARX	2507	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	25029750	25030072	25029911	Y	PCYT1B,ARX	ARX	NA	NA	NA	NA	ARX	1993	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	28999435	28999810	28999466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-268G12.1	1584321	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	30744406	30744763	30744585	Y	CXorf21,GK	NA	NA	NA	NA	NA	GK	74930	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	31519130	31519361	31519245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB3	527929	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	32685890	32685903	32685897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCAP1	371609	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	33686045	33686057	33686052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-305F18.1	56568	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	38130522	38130869	38130628	Y	CYBB,RPGR	NA	NA	NA	NA	NA	RPGR	53948	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	39018443	39018533	39018484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	359758	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	39055539	39055797	39055668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	396854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	39087394	39087538	39087449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	428709	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	39473708	39474029	39473869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	171361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	39680161	39680842	39680511	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	34771	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	39719669	39720024	39719856	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	74279	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	39950207	39950578	39950448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84004	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.818220565605039
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	40031344	40032243	40032130	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	2339	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chrX	40132742	40132979	40132844	Y	ATP6AP2	NA	BCOR	K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	98160	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	41301456	41301878	41301579	Y	NA	NA	DDX3X	K562	ChIA-PET	22265404	DDX3X	110805	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	41413588	41413590	41413589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	222937	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	41538171	41538545	41538500	Y	CASK	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	242171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	41594711	41594837	41594774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	185879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	42390700	42390987	42390889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P4	434274	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chrX	44834978	44835378	44835063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	104221	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	44877456	44877597	44877527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	146699	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	45645081	45645275	45645187	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	40551	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	45668056	45668432	45668257	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	40488	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	45989834	45990282	45989950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCNAP3	72871	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	46435390	46435934	46435628	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	4171	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	47440734	47441109	47440922	Y	CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1,SYN1	NA	NA	NA	NA	TIMP1	1022	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	48782253	48782568	48782411	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5	NA	NA	NA	NA	PIM2	7952	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	49108550	49108714	49108667	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	15592	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	53467183	53467489	53467297	Y	FAM156A,TSPYL2,IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	7863	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	56839801	56840427	56840156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	77791	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	57634372	57634764	57634423	Y	NA	ZXDB	NA	NA	NA	NA	ZXDB	18103	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.30915290496806
chrX	67382331	67382438	67382385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	269317	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	67624994	67625390	67625192	Y	NA	OPHN1	NA	NA	NA	NA	OPHN1	26365	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	67724193	67724408	67724299	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	8028	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145420	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145914	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	88083	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	73352212	73352497	73352336	Y	NA	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	39228	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	74033137	74033450	74033294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA2022	109832	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	74143243	74143469	74143354	Y	KIAA2022	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA2022	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	74143858	74143903	74143869	Y	KIAA2022	KIAA2022	NA	NA	NA	NA	KIAA2022	576	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	74370869	74370931	74370900	Y	NA	ABCB7	NA	NA	NA	NA	ABCB7	3636	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	75368142	75368530	75368366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEE1	277516	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	76056271	76056538	76056478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEE1	410225	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	78006102	78006454	78006278	Y	LPAR4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF9B	612899	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	83998682	83998698	83998690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOOL	258134	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	84443490	84443657	84443574	Y	SATL1,ZNF711	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF711	53340	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	85196824	85197022	85197001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	103544	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	85278748	85279124	85278988	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	21442	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.14550879184705
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	85294512	85294785	85294645	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	5781	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	85404728	85405017	85404880	Y	DACH2	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	104162	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	93615949	93615975	93615962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L3	689382	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	96701855	96702106	96701982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	764193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	96737764	96737861	96737813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	800102	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chrX	102880714	102880758	102880737	Y	PLP1,PLP1	TCEAL3,TCEAL1	NA	NA	NA	NA	TCEAL1	874	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	103597874	103598258	103598063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM199X	188573	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	GNG5P2	100620	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	109563862	109564162	109564033	Y	NA	GNG5P2	NA	NA	NA	NA	GNG5P2	24039	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	115004721	115004876	115004807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	78546	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	117896439	117896822	117896632	Y	NA	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	36904	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	122343995	122344043	122344020	Y	GRIA3	NA	NA	NA	NA	NA	MRRFP1	94361	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	125556519	125556645	125556582	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	48223	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	4.58203516738822
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	129226171	129226435	129226352	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	16256	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	1.47279701808907
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chrX	130942336	130942500	130942419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	212793	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	130952432	130952771	130952603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	202522	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	132400242	132400521	132400363	Y	NA	RNU1-115P	NA	NA	NA	NA	RNU1-115P	29398	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	PHF6	199118	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.490932339363023
chrX	134718222	134718415	134718313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF449	241501	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	135940631	135940874	135940833	Y	HTATSF1	RBMX,RP11-308D16.4	NA	NA	NA	NA	RBMX	20049	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	136647486	136647742	136647575	Y	NA	ZIC3	NA	NA	NA	NA	ZIC3	1185	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	149863384	149863571	149863479	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3949	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.981864678726046
chrX	149865562	149865927	149865671	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	6127	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.654576452484031
chrX	152753051	152753292	152753194	Y	NA	TREX2,BGN,HAUS7	BGN	MCF7	ChIA-PET	22265404	BGN	5105	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP	NA	NA	NA	NA	L1CAM	5827	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrX	153306272	153306572	153306565	Y	ABCD1,ARHGAP4,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1	IRAK1	NA	NA	NA	NA	IRAK1	22841	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrY	2871660	2871926	2871783	Y	RPS4Y1,ZFY,ZFY	NA	NA	NA	NA	NA	ZFY	70548	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	193325	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrY	15473779	15474095	15474059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	116458	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrY	15507754	15507810	15507782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	82743	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.163644113121008
chrY	15547664	15548123	15547956	Y	TMSB4Y	UTY	NA	NA	NA	NA	UTY	42430	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015
chrY	18611855	18612137	18611996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	1862879	CAGE	ECC12	hg19	FANTOM5	0.327288226242015