chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 8143203 8143348 8143235 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 58835 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 8499087 8499228 8499177 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 123201 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 9224991 9225286 9225137 Y NA GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 RP3-510D11.2 14977 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 13825180 13825414 13825304 Y NA NA NA NA NA NA PDPN 82546 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 21588829 21589430 21588896 Y ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 80567 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 30447163 30447510 30447328 Y NA NA NA NA NA NA PTPRU 886135 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 33463690 33463885 33463767 Y PHC2,RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 35404 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 57873517 57873674 57873652 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 764522 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 68657070 68657479 68657271 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 39324 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD13C 72329 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 84872292 84872455 84872374 Y NA NA NA NA NA NA RPF1 70487 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 91361231 91361653 91361295 Y NA NA NA NA NA NA ZNF644 124176 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 92269494 92269966 92269778 Y TGFBR3,RPAP2,GLMN NA NA NA NA NA TGFBR3 99926 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 93669062 93669462 93669176 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 24777 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA BCAR3 164588 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 94795618 94795987 94795955 Y NA NA ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 56994 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 95326006 95326167 95326065 Y NA NA CNN3 IMR90 Hi-C 24141950 CNN3 64667 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 96537517 96537524 96537521 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 372962 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 372241 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 258104 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA VCAM1 NA NA NA NA VCAM1 18969 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 107731970 107732212 107732091 Y NTNG1,NTNG1 NA NA NA NA NA NTNG1 51341 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 109572587 109572654 109572620 Y NA WDR47,TAF13 NA NA NA NA WDR47 10196 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 SARS 29540 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 111170436 111170835 111170599 Y LRIF1,CD53 NA NA NA NA NA SLC16A4 238732 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 116918317 116918655 116918398 Y NA ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5027 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 581054 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 49637 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 151249767 151250096 151249960 Y FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687 PSMD4,ZNF687,PI4KB NA NA NA NA ZNF687 1998 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 151945504 151945625 151945562 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 19241 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MTX1,THBS3,GBA NA NA NA NA MTX1 11531 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 158462836 158463187 158462989 Y CD1B,CD1E,OR10T2 NA NA NA NA NA CD1D 315099 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 162659800 162660152 162659976 Y NA NA NA NA NA NA DDR2 60637 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 164686304 164686686 164686418 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 163483 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 167322904 167323093 167323001 Y NA NA NA NA NA NA POU2F1 134838 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 167416331 167416548 167416443 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 104456 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 172445364 172445579 172445472 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 34134 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 178305054 178305336 178305195 Y RASAL2 NA NA NA NA NA RASAL2 244190 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 178661693 178662025 178661859 Y NA RALGPS2 NA NA NA NA RALGPS2 30275 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 179144823 179145001 179144950 Y NA NA NA NA NA NA ABL2 51818 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 181634022 181634294 181634141 Y NA NA NA NA NA NA IER5 578384 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 183877295 183877615 183877384 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 141196 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 186623829 186624230 186624111 Y PTGS2,PLA2G4A,C1orf27 PTGS2 NA NA NA NA PTGS2 23329 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 91557 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 201742755 201743343 201743097 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 52926 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 208349565 208349646 208349606 Y NA NA NA NA NA NA C1orf132 309070 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 210812063 210812447 210812256 Y HHAT,HHAT,KCNH1 NA NA NA NA NA HHAT 312467 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 219722653 219722988 219722821 Y NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 377467 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 226878935 226879345 226879207 Y ITPKB NA NA NA NA NA PARP1 285155 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 228274281 228274680 228274319 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5920 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 231036878 231036937 231036909 Y NA C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 33543 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 231750755 231751033 231750894 Y NA DISC1 NA NA NA NA DISC1 9528 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 13.2286401910402 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 241390681 241391063 241391027 Y RGS7 NA NA NA NA NA FH 289998 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA NA NA NA NA NA OPN3 57207 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 242068662 242068804 242068733 Y NA NA NA NA NA NA EXO1 59393 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 243644284 243644683 243644595 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 226964 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 245399077 245399186 245399185 Y KIF26B NA NA NA NA NA KIF26B 82790 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 246038342 246038749 246038555 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 629865 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 246147829 246148201 246147973 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 520413 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr1 246249452 246249819 246249636 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 418795 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr1 247507326 247507475 247507401 Y NA ZNF496 ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF496 14178 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 6183553 6183785 6183703 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 1096 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 6213842 6214122 6214025 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 28961 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 6333794 6333936 6333889 Y PFKFB3,PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 148913 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 258527 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 7153471 7153932 7153701 Y NA NA LOC100507127 IMR90 Hi-C 24141950 KIN 674058 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 7356268 7356516 7356367 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA KIN 471474 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr10 7362038 7362350 7362337 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA KIN 465640 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 12002775 12003103 12002939 Y NA NA NA NA NA NA UPF2 80066 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 14003091 14003406 14003339 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 376164 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 14026617 14027027 14026853 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 399690 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 22026318 22026683 22026671 Y EBLN1 NA NA NA NA NA MLLT10 205224 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 30490834 30491161 30490998 Y NA NA KIAA1462,SVIL,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 88411 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM CREM NA NA NA NA CREM 24495 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 44363607 44363971 44363643 Y NA NA NA NA NA NA ZNF32 221303 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 50243711 50244078 50243895 Y NA NA NA NA NA NA VSTM4 77476 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 NA SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM21A 212192 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 58240589 58240612 58240601 Y NA NA NA NA NA NA ZWINT 121553 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 60674120 60674133 60674127 Y BICC1 NA NA NA NA NA BICC1 403220 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 62174641 62174784 62174750 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 361305 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 63805040 63805237 63805084 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 145981 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 64982889 64983009 64982950 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 91839 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 68755189 68755293 68755241 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA SIRT1 887134 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA UNC5B 55850 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 75805462 75805520 75805491 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 49590 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 76032929 76032942 76032936 Y NA NA NA NA NA NA ADK 123969 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr10 89508472 89508835 89508628 Y NA NA NA NA NA NA ATAD1 90265 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 90760903 90761071 90761028 Y FAS FAS,ACTA2 NA NA NA NA ACTA2 11756 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 95146698 95147164 95146872 Y MYOF NA NA NA NA NA MYOF 92910 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 99096745 99096901 99096835 Y NA ARHGAP19,FRAT2 NA NA NA NA FRAT2 4287 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 99307029 99307251 99307137 Y NA PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 PI4K2A 34880 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 103514539 103514868 103514704 Y NA NPM3 NA NA NA NA NPM3 26302 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA ARL3 69834 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 111971446 111971590 111971518 Y NA MXI1 NA NA NA NA MXI1 6083 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 113855611 113855893 113855723 Y NA NA NA NA NA NA ACSL5 275883 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 119113606 119113787 119113696 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 19191 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 120997743 120998072 120997908 Y NA GRK5 NA NA NA NA GRK5 32642 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 121264797 121264861 121264829 Y NA RGS10 NA NA NA NA RGS10 35359 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 121452837 121453189 121453108 Y NA BAG3 NA NA NA NA BAG3 43955 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 127816655 127816897 127816742 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 233547 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr10 127932254 127933051 127932680 Y ADAM12 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 141973 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A NA NA NA NA NA AP2A2 150475 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 6667820 6668268 6668018 Y OR6A2,DCHS1 RRP8,ILK,TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17 NA NA NA NA DCHS1 6817 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr11 14785995 14786323 14786008 Y NA NA NA NA NA NA CYP2R1 125475 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 20053197 20053569 20053404 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 329662 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 27350498 27350718 27350608 Y BDNF CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 32697 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58753 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 650658 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 32551830 32551992 32551945 Y NA NA NA NA NA NA EIF3M 51352 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 47168963 47169205 47169084 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 27471 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 57549936 57550183 57550060 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 31221 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 65259637 65259913 65259840 Y SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3320 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 7.55922296630867 chr11 65656792 65657262 65656985 Y NA CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA CCDC85B 917 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 65695608 65695878 65695746 Y EHBP1L1,MAP3K11,RELA,DKFZp761E198 FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA DRAP1 10880 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 66080826 66081241 66080906 Y CD248 RAB1B,YIF1A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1 NA NA NA NA CD248 1274 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr11 66659730 66659912 66659812 Y CLCF1,RBM4 LRFN4 NA NA NA NA LRFN4 37612 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC,SYT12 PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 69089155 69089700 69089444 Y MRGPRD NA CCND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TPCN2 274790 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA NA NA NA NA NA RNF121 66878 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 77898869 77899120 77899016 Y RSF1,INTS4 USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 1001 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 78728809 78729043 78728943 Y ODZ4 NA NA NA NA NA NARS2 444890 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 95163190 95163241 95163211 Y NA NA NA NA NA NA SESN3 199485 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr11 95994127 95994433 95994401 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 79911 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 95995362 95995593 95995538 Y FAM76B,MAML2 NA NA NA NA NA MAML2 78751 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 99734583 99734830 99734707 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 821554 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 103964860 103965229 103965142 Y NA NA NA NA NA NA PDGFD 67878 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 106239516 106239921 106239716 Y NA NA NA NA NA NA AASDHPPT 295288 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 113708252 113709087 113708915 Y CLDN25 USP28 NA NA NA NA USP28 35205 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 113950793 113951339 113951236 Y TMPRSS5,ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 175170 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 114090772 114090945 114090857 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35564 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 118755477 118755626 118755517 Y ATP5L,MLL,ARCN1,DDX6,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 38691 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 121307019 121307215 121307117 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 13697 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 123008344 123008427 123008386 Y CLMP NA NA NA NA NA CLMP 55562 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 123519920 123520232 123520133 Y OR8D4,SCN3B NA NA NA NA NA ZNF202 90151 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr11 125184440 125184548 125184494 Y NA NA NA NA NA NA PKNOX2 151857 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 129267460 129267723 129267619 Y BARX2 NA NA NA NA NA TCEB2P2 633392 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA TCEB2P2 NA NA NA NA TCEB2P2 29174 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 45224 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 6537554 6537731 6537643 Y NA CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA CD27-AS1 21002 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA NA NA NA NA NA MAGOHB 68935 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA GPRC5A NA NA NA NA GPRC5A 16369 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr12 15758880 15759078 15758989 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 274185 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 23746822 23747228 23747075 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 354738 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 RP11-444D3.1 NA NA NA NA RP11-444D3.1 39718 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr12 32688261 32688652 32688566 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 141482 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 43699836 43700036 43699910 Y NA NA PRICKLE1,PPHLN1,ZCRB1 IMR90 Hi-C 24141950 PUS7L 450584 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr12 47033293 47033660 47033445 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 257831 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 51035200 51035582 51035391 Y NA NA NA NA NA NA ATF1 119911 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 56366 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr12 54198975 54199124 54199050 Y NA NA HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 79446 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 54752421 54752649 54752549 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 58595 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 58758718 58759055 58758893 Y XRCC6BP1 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC6BP1 425394 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 63026443 63026842 63026744 Y NA NA NA NA NA NA MON2 167846 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 63256455 63256601 63256528 Y PPM1H NA NA NA NA NA MON2 397858 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA XPOT 251064 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 67371255 67371618 67371453 Y GRIP1 NA NA NA NA NA CAND1 289443 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 72430811 72430977 72430894 Y TPH2,TRHDE TRHDE NA NA NA NA TRHDE 48069 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 72690281 72690495 72690341 Y TPH2,TRHDE NA NA NA NA NA TRHDE 211235 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 76352762 76353194 76352954 Y NA NA KRR1,PHLDA1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 72518 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 76375899 76376264 76376114 Y NA PHLDA1 PHLDA1,KRR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 49448 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 78134909 78135174 78135084 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 87511 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 83177526 83177865 83177863 Y TMTC2 NA NA NA NA NA CCDC59 426942 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 86488031 86488389 86488210 Y NA NA NA NA NA NA ALX1 816146 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 88810675 88811028 88810796 Y NA NA NA NA NA NA KITLG 161600 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 302617 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 92505299 92505700 92505686 Y NA BTG1 NA NA NA NA BTG1 31973 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 92509431 92509711 92509674 Y NA BTG1 NA NA NA NA BTG1 27962 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 92950016 92950145 92950085 Y NA NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 370962 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 93762169 93762549 93762358 Y NA NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 7110 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 94515739 94515960 94515846 Y NA NA PLXNC1,CCDC41,LOC144486 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 335804 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 96627830 96628313 96628063 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 41670 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 96648142 96648594 96648361 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 61982 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 96659033 96659395 96659303 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 72873 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA NA NA NA NA NA RPL18AP3 189853 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 106673820 106674177 106673990 Y TCP11L2 CKAP4 CKAP4,POLR3B,NUAK1,TCP11L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP4 21880 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 115889491 115890073 115889778 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 769522 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 119648635 119648890 119648691 Y CCDC60 NA NA NA NA NA PRKAB1 454668 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 123218047 123218405 123218295 Y CLIP1,RSRC2,HCAR2,HCAR3,VPS37B,C12orf65 DENR NA NA NA NA DENR 16916 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 124823049 124823325 124823212 Y FAM101A NA NA NA NA NA NCOR2 226810 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr12 129725693 129725893 129725793 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 419165 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 31439697 31440107 31440029 Y C13orf33 NA NA NA NA NA USPL1 249867 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 33825211 33825616 33825598 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 97151 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 66629 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 49688107 49688286 49688182 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 131761 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 50671086 50671325 50671206 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 16779 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 50675373 50675756 50675618 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 21066 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 74228674 74228703 74228690 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 477691 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 75939887 75940324 75940051 Y NA NA NA NA NA NA COMMD6 181251 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 76269053 76269192 76269124 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 76483 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 77078666 77078696 77078681 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 379844 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 96376622 96376681 96376676 Y DNAJC3 DNAJC3 NA NA NA NA DNAJC3 49229 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 111048888 111049110 111049017 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 91392 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A F10 PROZ IMR90 Hi-C 24141950 F10 31388 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 113928610 113928824 113928747 Y CUL4A LAMP1 NA NA NA NA LAMP1 20732 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 114301802 114302224 114301872 Y GAS6 NA NA NA NA NA TFDP1 64789 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 114634569 114634891 114634593 Y NA NA NA NA NA NA GAS6 69523 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr13 114906463 114906564 114906535 Y RASA3 RASA3 RASA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RASA3 10377 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 27997396 27997715 27997579 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 932436 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 30757003 30757069 30757036 Y NA NA NA NA NA NA PRKD1 97899 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 31732842 31733131 31732940 Y NA NA AP4S1,HEATR5A,HECTD1,STRN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD1 57832 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 32261719 32262250 32261957 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5 281070 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 33696803 33697225 33696871 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 1152804 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 33950978 33951281 33951079 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 978281 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 35666202 35666508 35666414 Y BAZ1A,FAM177A1,NFKBIA NA NA NA NA NA KIAA0391 76447 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 54804577 54804755 54804681 Y NA NA DDHD1,BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 56812 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 55173516 55173842 55173679 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 141701 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 65524481 65524844 65524562 Y PLEKHG3 MAX NA NA NA NA MAX 42569 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 69224405 69224743 69224667 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 RAD51B,ZFP36L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 36447 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 69425235 69425583 69425528 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 18574 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 69576488 69576915 69576681 Y NA DCAF5 NA NA NA NA DCAF5 40952 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 78031949 78032369 78032266 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 48747 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 82001912 82002020 82001966 Y NA SEL1L NA NA NA NA SEL1L 3707 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 91724533 91724847 91724784 Y NA GPR68 NA NA NA NA GPR68 6264 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 91869322 91869469 91869402 Y TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA SMEK1 105429 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 93018523 93018873 93018560 Y NA RIN3 NA NA NA NA RIN3 40405 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 93776910 93777138 93777024 Y PRIMA1 BTBD7 NA NA NA NA BTBD7 20300 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 100495518 100495795 100495680 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 206840 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 528 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 23041896 23042224 23042060 Y NA NIPA2 NA NA NA NA NIPA2 9469 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 27333003 27333354 27333179 Y NA NA NA NA NA NA AC145436.1 250317 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 32384266 32384605 32384436 Y CHRNA7 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 520740 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 33028073 33028475 33028235 Y NA GREM1 NA NA NA NA GREM1 19898 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 37169508 37169702 37169583 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 221802 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 37207397 37207450 37207424 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 184054 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 39915821 39916161 39915910 Y NA THBS1 NA NA NA NA THBS1 44541 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 39960796 39961183 39960855 Y NA NA NA NA NA NA THBS1 89516 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 40179429 40179904 40179805 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 31189 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 55581016 55581448 55581368 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 27911 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 55977497 55977782 55977636 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 55506 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 58939079 58939427 58939418 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 100750 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 60699729 60699909 60699819 Y NA ANXA2 NA NA NA NA ANXA2 6647 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr15 63602976 63602991 63602984 Y NA NA NA NA NA NA CA12 69369 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 64162328 64162563 64162529 Y NA HERC1 DAPK2,HERC1,FAM96A IMR90 Hi-C 24141950 HERC1 38187 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 67175645 67176118 67175872 Y NA NA IQCH,SMAD6,LOC100506686,SMAD3 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 177983 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 67341124 67341334 67341261 Y NA SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD3 12767 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 71657535 71657734 71657662 Y NA NA NA NA NA NA THSD4 270244 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 71840441 71840454 71840446 Y NA NA NA NA NA NA THSD4 453150 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr15 80149264 80149318 80149291 Y ST20,ST20-MTHFS,ST20,MTHFS,MTHFS MTHFS NA NA NA NA MTHFS 38403 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 90574620 90575072 90574763 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 NA NA NA NA NA IDH2 68664 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA BLM 68378 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 94815502 94815543 94815523 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 42735 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 96407754 96407930 96407841 Y NA NA LOC400456,NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 459237 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 96896232 96896529 96896359 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 766 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 99295015 99295222 99295065 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 104815 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 11188261 11188580 11188312 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 151916 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 11590987 11591512 11591296 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136725 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 12623440 12623621 12623531 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 272253 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 16214258 16214439 16214353 Y ABCC1 NA ABCC6 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC1 172824 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 17510624 17510767 17510687 Y XYLT1 NA NA NA NA NA RPS15A 1288938 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 20079556 20079735 20079646 Y IQCK,GPRC5B NA NA NA NA NA GPRC5B 184067 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 21375136 21375337 21375232 Y DNAH3,CRYM,METTL9 NA NA NA NA NA SLC7A5P2 154349 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 23518606 23518950 23518778 Y GGA2 GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 12366 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14 PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS,PYCARD NA NA NA NA PYCARD 10709 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 33952235 33952334 33952272 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069156 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr16 51186928 51187269 51186986 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 3650 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 3107 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 55740914 55740956 55740934 Y SLC6A2,SLC6A2 NA NA NA NA NA LPCAT2 200004 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 60966592 60966717 60966655 Y NA NA NA NA NA NA GOT2 2200331 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 67687517 67687714 67687560 Y HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A RLTPR,ACD,C16orf86 NA NA NA NA ACD 4999 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 80401381 80401567 80401473 Y NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 CDYL2 434659 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 81392292 81392329 81392311 Y NA NA NA NA NA NA CMIP 84446 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 7.55922296630867 chr16 85617282 85617663 85617577 Y NA NA LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 104016 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 85922437 85922658 85922589 Y COX4I1,IRF8 NA COX4NB,COX4I1,LOC400550,MTHFSD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 74295 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 86532148 86532503 86532334 Y NA FOXF1 NA NA NA NA FOXF1 9630 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 87498995 87499259 87499135 Y BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14 NA NA NA NA NA FBXO31 75247 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 88340379 88340720 88340472 Y NA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 177005 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 88535003 88535267 88535135 Y NA ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 17278 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 88968900 88968980 88968940 Y NA TRAPPC2L,GALNS NA NA NA NA GALNS 47522 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 2397010 2397265 2397138 Y NA NA LOC284009 IMR90 Hi-C 24141950 MNT 94598 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 2610688 2611037 2610862 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 116184 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 6925152 6925653 6925481 Y PLSCR3,C17orf49,BCL6B RNASEK,C17orf49 NA NA NA NA C17orf49 9338 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 13194 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 26894495 26894823 26894797 Y NA UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5 NA NA NA NA PIGS 2067 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 32586301 32586443 32586414 Y NA CCL2,CCL11 NA NA NA NA CCL2 5997 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 3374 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 38648531 38648872 38648707 Y KRT10,MSL1,TNS4 NA NA NA NA NA IGFBP4 50829 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 38707495 38707811 38707586 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA SMARCE1 94949 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 38708057 38709216 38708396 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA SMARCE1 93544 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 47342 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 48225 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr17 42620579 42620851 42620665 Y GJC1,FZD2 GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 12074 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 NA NA NA NA NA HEXIM2 69098 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB3 NA NA NA NA HOXB3 22305 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,RPS6KB1 NA NA NA NA RPS6KB1 5631 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 59473194 59473360 59473229 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 1897 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 59473431 59474098 59473741 Y TBX2,C17orf82 TBX2 NA NA NA NA TBX2 1159 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 59532462 59532698 59532510 Y NA TBX4 NA NA NA NA TBX4 4697 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 60745829 60746119 60745974 Y TLK2 MRC2 NA NA NA NA MRC2 43067 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 62526246 62526643 62526459 Y NA POLG2,DDX5 NA NA NA NA DDX5 23929 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 68985545 68985917 68985627 Y NA NA NA NA NA NA LOC124685 629202 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 71639437 71639585 71639501 Y SDK2 NA NA NA NA NA CDC42EP4 333123 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 74481730 74482020 74481883 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 13852 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 74748247 74748435 74748347 Y FAM100B,JMJD6,SRSF2 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA SRSF2 16791 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 113258 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr17 76767876 76768189 76768026 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 8190 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr17 81057799 81057924 81057864 Y METRNL METRNL NA NA NA NA METRNL 22232 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 106616 106942 106784 Y NA USP14 NA NA NA NA USP14 49441 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 4135348 4135809 4135745 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 725742 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 11995516 11995787 11995574 Y NA IMPA2 NA NA NA NA IMPA2 16492 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 12606965 12607268 12607096 Y PTPN2,SPIRE1 SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA SPIRE1 48865 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 19397108 19397142 19397125 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 114190 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4741 236213 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 21780839 21781231 21781002 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 63897 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 31336306 31336396 31336375 Y NA NA NA NA NA NA DTNA 734858 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 32414940 32415436 32415021 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 139456 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 32610382 32610507 32610471 Y ZNF24,MAPRE2 NA NA NA NA NA MAPRE2 55490 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 41924932 41925174 41925053 Y NA NA NA NA NA NA SLC14A1 1376918 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 43420676 43420820 43420745 Y NA NA NA NA NA NA SLC14A1 118584 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 44180221 44180655 44180458 Y LOXHD1,LOXHD1 NA NA NA NA NA KATNAL2 314800 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 46072108 46072320 46072224 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 8691 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 46254756 46255278 46254982 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 191339 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 46353431 46353823 46353627 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 290014 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 47839738 47839893 47839823 Y NA MBD1,CXXC1 CCDC11 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC1 27064 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 55922134 55922493 55922309 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 212535 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 56159165 56159246 56159180 Y NA NA NA NA NA NA ALPK2 134943 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 70535937 70536272 70536159 Y NA NETO1 NA NA NA NA NETO1 2556 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 11.338834449463 chr18 74803559 74803662 74803615 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 270996 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr18 77327843 77328066 77328013 Y NA NA NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 109735 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 933164 933556 933549 Y NA MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 9383 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 1126082 1126504 1126271 Y MIDN,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 24146 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 9402141 9402360 9402251 Y NA NA NA NA NA NA ZNF266 141894 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 12261625 12261922 12261774 Y NA ZNF20,ZNF625,ZNF136 NA NA NA NA ZNF625 3624 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 14570486 14570855 14570729 Y OR7C2,ZNF333,IL27RA,DDX39A,PKN1 DDX39A,PKN1,GIPC1 NA NA NA NA PKN1 28621 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 15283162 15283418 15283290 Y NA ILVBL,NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 26374 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 23017741 23017947 23017814 Y ZNF492 NA NA NA NA NA ZNF91 558415 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 29958744 29959023 29958884 Y NA NA NA NA NA NA POP4 133901 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 31618618 31618806 31618712 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 219647 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 31627886 31628274 31628183 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 210179 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 32021641 32022032 32021837 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ3 183188 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 33382845 33383180 33383014 Y NA NA NA NA NA NA CEP89 77717 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 39150238 39150530 39150365 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 13949 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 39919610 39919819 39919723 Y NA PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 4769 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 41849661 41849907 41849784 Y HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2 CCDC97,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TGFB1 7909 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA DEDD2 NA NA NA NA DEDD2 29017 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 46014236 46014617 46014413 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 6399 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 47531623 47531790 47531707 Y NA TMEM160 NA NA NA NA TMEM160 18098 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 48903450 48903602 48903513 Y NA TMEM143,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10640 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 51182448 51182932 51182864 Y NA SYT3,SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA SYT3 12797 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA NA NA NA NA NA CLEC11A 63314 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 7.55922296630867 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 9.44902870788584 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 121505 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,IL11,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 1148 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr19 56623049 56623274 56623140 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 7375 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 1715466 1715652 1715559 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 30972 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 1810384 1810763 1810574 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 63760 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 9815627 9815977 9815711 Y NA YWHAQ NA NA NA NA YWHAQ 46484 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B NA GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 93617 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr2 11443913 11444199 11444137 Y NA ROCK2 NA NA NA NA ROCK2 42257 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA UBXN2A 245798 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA PTRHD1 161882 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 28215985 28216067 28216026 Y NA NA NA NA NA NA BRE 105177 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB NA NA NA NA PPP1CB 37190 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 37116938 37117262 37117216 Y NA NA NA NA NA NA STRN 74353 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 38418747 38419129 38419037 Y NA NA NA NA NA NA CYP1B1 83703 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 42161610 42162017 42161892 Y NA NA NA NA NA NA PKDCC 111143 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 42328958 42329862 42329543 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 55798 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 43746950 43747270 43747109 Y ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2 K562 ChIA-PET 22265404 THADA 73915 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 46525633 46526278 46526263 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 6827 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 47306951 47307378 47307182 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 94362 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 54971761 54972012 54971777 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 290339 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 68428934 68429266 68429100 Y NA WDR92,PNO1 NA NA NA NA PNO1 45958 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 68668395 68668537 68668466 Y C1D,PROKR1,APLF FBXO48,APLF PPP3R1 K562 ChIA-PET 22265404 FBXO48 23853 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 69062805 69062948 69062879 Y PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ANTXR1 175362 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 74930564 74930823 74930694 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4F 51209 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 75836166 75836348 75836343 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 35561 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 77555136 77555510 77555330 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 457998 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 86132237 86133031 86132663 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 18100 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 86225783 86226050 86225999 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 105228 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 95982962 95983225 95982998 Y PROM2 KCNIP3 NA NA NA NA KCNIP3 21910 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 98389575 98389609 98389594 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 111005 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 101866406 101866620 101866513 Y NA TBC1D8 NA NA NA NA TBC1D8 708 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 102643904 102644218 102643997 Y NA IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 34786 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 109706111 109706459 109706286 Y NA NA EDAR,SEPT10,SH3RF3,LOC100287216 IMR90 Hi-C 24141950 RANBP2 372174 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 120971736 120972136 120971936 Y NA TMEM185B,RALB NA NA NA NA TMEM185B 6848 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 127841716 127842041 127841975 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 20890 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 6563 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 133561799 133561885 133561850 Y NA NA LYPD1,GPR39 IMR90 Hi-C 24141950 LYPD1 134647 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 134084028 134084575 134084301 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP5 239459 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 137139482 137140258 137140029 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA DARS 397812 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA SPOPL NA NA NA NA SPOPL 30736 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 143852347 143852525 143852358 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 219280 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 145122623 145122802 145122719 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA KYNU 1489556 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 160804631 160804934 160804783 Y NA NA NA NA NA NA CD302 151878 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 162948651 162948778 162948715 Y NA NA DPP4,SLC4A10 IMR90 Hi-C 24141950 FAP 150883 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 166649551 166649790 166649651 Y GALNT3 NA NA NA NA NA TTC21B 158563 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 168150182 168150557 168150197 Y NA NA NA NA NA NA SCN9A 919679 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 175464337 175464570 175464451 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 81074 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD13,HOXD11,HOXD10,HOXD-AS2 NA NA NA NA HOXD10 1222 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 51.0247550225835 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 AC079305.8 NA NA NA NA AC079305.8 29254 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 AC079305.8 NA NA NA NA AC079305.8 41336 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 180116495 180116858 180116779 Y SESTD1 SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 10659 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 189973214 189973535 189973374 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 69070 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 NA NA NA NA NA STAT1 69179 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS NA NA NA NA NA STAT1 68074 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 147063 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 207720131 207720140 207720136 Y NA NA FZD5 IMR90 Hi-C 24141950 MDH1B 91860 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 213352343 213352729 213352575 Y NA NA NA NA NA NA IKZF2 662422 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 216782951 216783107 216783015 Y NA NA FN1,LOC646324,ATIC,MREG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PECR 162571 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA IGFBP5 937 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 230015685 230015803 230015793 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 118198 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 233766797 233767190 233766879 Y NA NA NA NA NA NA NGEF 108792 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 235238832 235239060 235238933 Y ARL4C NA SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 164637 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA IQCA1 68798 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 238016795 238017153 238016975 Y NA COPS8 NA NA NA NA COPS8 24840 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 74081 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 238168767 238169127 238169034 Y NA NA NA NA NA NA COL6A3 151891 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 239755854 239755907 239755878 Y TWIST2 TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 1181 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 239779123 239779526 239779330 Y TWIST2 TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 24450 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 3660633 3661051 3660900 Y CENPB,ADAM33 NA NA NA NA NA ADAM33 0 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 3960925 3961306 3961172 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 32923 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr20 13088080 13088439 13088260 Y NA NA NA NA NA NA SPTLC3 100453 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 23360936 23361138 23361045 Y SSTR4,NAPB NXT1,RP3-322G13.5,GZF1,NAPB NA NA NA NA GZF1 20149 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 25305115 25305524 25305270 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 64095 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 26116339 26116766 26116505 Y NA NA NA NA NA NA ZNF337 440862 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA NA LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCAND1 107196 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 35172533 35172668 35172598 Y MYL9 MYL9,TGIF2 NA NA NA NA MYL9 4646 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 36056702 36057072 36056829 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 14864 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 37603521 37603525 37603523 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 14579 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 48168443 48168863 48168748 Y NA PTGIS NA NA NA NA PTGIS 13820 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 50040722 50041122 50041004 Y NA NA NA NA NA NA ATP9A 342051 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP24A1 433274 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 52480421 52480878 52480693 Y ZNF217,PFDN4 NA NA NA NA NA CYP24A1 307634 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr20 59619863 59620113 59619933 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 205369 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 17745935 17746301 17746052 Y NA NA NA NA NA NA USP25 645591 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA USP25 806565 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr21 17958916 17959192 17958984 Y NA NA NA NA NA NA USP25 858572 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 28219280 28219541 28219411 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3552 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 28336800 28337144 28336952 Y ADAMTS1,ADAMTS5 NA NA NA NA NA ADAMTS5 0 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 30126542 30126837 30126741 Y NA NA LINC00113,ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 128856 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 30751100 30751464 30751308 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 186708 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 35863434 35863747 35863591 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 121694 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 39723755 39724311 39724014 Y ETS2 NA NA NA NA NA ETS2 450920 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 40211972 40212276 40212079 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 36741 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr21 40393264 40393350 40393326 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 160427 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 42693256 42693286 42693271 Y NA MX2 NA NA NA NA MX2 38584 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 43188787 43189188 43188843 Y RIPK4 NA NA NA NA NA PRDM15 108403 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 38874 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 18916909 18917370 18917163 Y MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH NA NA NA NA NA DGCR2 190597 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 22231244 22231441 22231355 Y HIC2,MAPK1 MAPK1 PPM1F K562 ChIA-PET 22265404 MAPK1 11274 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 28114157 28114741 28114406 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 80745 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 28879777 28880035 28879909 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 255984 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 33252376 33252746 33252411 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 56689 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 NA NA NA NA NA TIMP3 69996 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 36765300 36765605 36765487 Y APOL3,NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 16458 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 40840291 40840428 40840373 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 75696 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 42073632 42073949 42073667 Y TOB2 C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 8994 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 45016324 45016531 45016433 Y PARVG,PARVG,PRR5 PRR5 NA NA NA NA PRR5 46062 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 45856175 45856449 45856334 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 39669 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 45900177 45900595 45900449 Y FBLN1 FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 4059 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 46835614 46835885 46835771 Y NA NA NA NA NA NA CELSR1 95182 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 47126357 47126654 47126612 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 5504 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 50273824 50274276 50274235 Y TUBGCP6,HDAC10,ZBED4 CRELD2,ALG12 NA NA NA NA CRELD2 35539 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr22 50738042 50738272 50738161 Y NA MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 5784 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 11261398 11261658 11261529 Y HRH1 NA NA NA NA NA ATG7 50337 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 15651699 15651909 15651804 Y NA BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 10361 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 16145048 16145389 16145286 Y NA NA GALNTL2,ANKRD28,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 159090 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 18782585 18783290 18782757 Y SATB1 NA NA NA NA NA SATB1 297505 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr3 31328894 31329155 31329025 Y NA NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 242975 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 31737462 31737733 31737598 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 165332 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 34811902 34812223 34812063 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 974058 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA SMARCC1 116343 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 52652258 52652629 52652403 Y GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1 NA NA NA NA NA GNL3 60543 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 58159699 58160034 58159862 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 61199 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 60013358 60013756 60013558 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 979548 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 219986 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 62780450 62780695 62780574 Y CADPS NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 427445 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr3 70881667 70881911 70881828 Y NA NA FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 749229 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 70956809 70957096 70956953 Y NA NA EIF4E3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 674044 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2 NA NA NA NA GXYLT2 42442 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R2 115837 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 73812106 73812354 73812245 Y NA NA PDZRN3,GXYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 140015 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 81522183 81522529 81522356 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 286783 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 101598094 101598345 101598104 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53259 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 105838688 105838919 105838809 Y NA NA CBLB MCF7 ChIA-PET 22265404 CBLB 252292 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 111265245 111265633 111265405 Y NA NA NA NA NA NA PHLDB2 183711 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 111723588 111723714 111723651 Y SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3 ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 27731 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163666 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 205542 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 119130443 119130516 119130480 Y NA NA NA NA NA NA TMEM39A 55161 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 121964741 121964940 121964825 Y CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,KPNA1,DTX3L,CSTA NA NA NA NA NA CCDC58 135138 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 122151096 122151154 122151125 Y KPNA1 NA NA NA NA NA FAM162A 50073 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 123356199 123356268 123356234 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 53810 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 125235229 125235600 125235483 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 1441 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA SLC41A3 108923 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA NA KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZXDC 84290 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 135890782 135891068 135890882 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 23015 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 136153802 136154197 136154172 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 186654 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 141133650 141133961 141133787 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 69928 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 147072976 147073090 147073034 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 812325 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 147331675 147331840 147331755 Y ZIC4,ZIC4,ZIC1 NA NA NA NA NA PLSCR1 1071024 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 148594741 148595111 148594926 Y NA NA NA NA NA NA GYG1 112017 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 148864917 148865175 148865046 Y NA HPS3 NA NA NA NA HPS3 19546 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 151971438 151971777 151971516 Y NA MBNL1 NA NA NA NA MBNL1 11821 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 154987917 154988101 154988024 Y NA NA NA NA NA NA MME 248004 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 159514645 159514911 159514780 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 600151 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 172366671 172366874 172366806 Y NA NA NA NA NA NA NCEH1 60134 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00578 80787 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 187912287 187912441 187912353 Y BCL6,LPP LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 42442 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 188324508 188324886 188324659 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 454663 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 188475500 188475699 188475599 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 605655 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 188618525 188618672 188618589 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 748680 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 188661502 188661787 188661650 Y NA NA LPP,LPP-AS2,BCL6,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 791657 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 188668723 188669229 188668886 Y NA NA LPP,BCL6,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPP-AS2 798878 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr3 195921077 195921299 195921227 Y UBXN7,RNF168,LRRC33,TM4SF19,PCYT1A NA NA NA NA NA PCYT1A 91529 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 49782 50031 49981 Y NA ZNF595 NA NA NA NA ZNF595 1148 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 1042563 1042904 1042662 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 40839 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 1170900 1171323 1171147 Y GAK,DGKQ,KIAA1530 SPON2 NA NA NA NA SPON2 29427 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 3483238 3483365 3483266 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 48921 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 3488499 3488826 3488767 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 43460 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA NA NA NA NA NA CPZ 562368 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 16629750 16630155 16629855 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 268277 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 21295458 21295643 21295624 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 599553 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 38857753 38857899 38857797 Y KLF3,TLR1,TLR6 FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 9399 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 39412092 39412306 39412201 Y NA RFC1,RPL9,LIAS NA NA NA NA RFC1 46097 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 77923148 77923272 77923214 Y CCNI NA NA NA NA NA SEPT11 54292 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 80010003 80010210 80010107 Y NA NA NA NA NA NA PAQR3 151411 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 88128179 88128500 88128218 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30966 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA NAP1L5 130072 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 95437375 95437547 95437461 Y PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 66338 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 103320279 103320457 103320336 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA NA NA NA NA NA NFKB1 100029 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 106305912 106306089 106306001 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 87149 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 111535166 111535692 111535412 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL6 416811 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 119932082 119932384 119932294 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO2 124086 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 120476359 120476426 120476393 Y PDE5A NA NA NA NA NA PDE5A 71720 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 122175136 122175358 122175235 Y TNIP3 NA NA NA NA NA NDNF 182960 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 129609627 129610025 129609830 Y NA NA PHF17 K562 ChIA-PET 22265404 PGRMC2 401643 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 144401789 144402147 144401968 Y NA SMARCA5 NA NA NA NA SMARCA5 30469 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C EDNRA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 EDNRA 25070 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 148426409 148426782 148426596 Y NA EDNRA NA NA NA NA EDNRA 26340 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 151564216 151564527 151564372 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L2 63139 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 153071306 153071435 153071360 Y NA NA PET112 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 391131 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 160199508 160199928 160199727 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA PPID 556960 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 160519936 160519948 160519942 Y NA NA NA NA NA NA PPID 877388 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 169718415 169718594 169718475 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA CBR4 210832 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 169849945 169850177 169850075 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 79249 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr4 184910732 184910983 184910894 Y C4orf41,IRF2 NA NA NA NA NA STOX2 138148 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA NSUN2 81469 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 9544480 9544834 9544772 Y SEMA5A SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 168 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 17249327 17249860 17249454 Y NA AC091878.1 NA NA NA NA AC091878.1 34171 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA AC091878.1 67340 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr5 18403562 18403676 18403619 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP21 355903 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 26017692 26017938 26017815 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 4677750 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 35924372 35924674 35924571 Y NA NA NA NA NA NA IL7R 73575 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 86031 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 37102128 37102249 37102189 Y NA NA NA NA NA NA C5orf42 145281 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 39292432 39292553 39292530 Y NA NA NA NA NA NA C9 130417 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2201E18.3 13805 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 52168603 52169046 52168938 Y PELO,ITGA1 NA NA NA NA NA PELO 86829 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 52633703 52633938 52633784 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 140301 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 53726385 53726569 53726477 Y NA NA CDC20B,ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 85020 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 58575824 58576193 58576112 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 242236 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 64358648 64358799 64358710 Y NA NA ADAMTS6,CWC27 IMR90 Hi-C 24141950 CWC27 295891 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 64755187 64755203 64755196 Y NA ADAMTS6 NA NA NA NA ADAMTS6 20544 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 65097290 65097569 65097365 Y ERBB2IP,SGTB NA NA NA NA NA SGTB 80428 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 72218346 72218584 72218427 Y NA FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 31224 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 76958449 76958840 76958645 Y NA WDR41 NA NA NA NA WDR41 44013 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 77829299 77829474 77829415 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 174960 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 80216788 80217158 80217017 Y NA RASGRF2 RASGRF2,MSH3 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRF2 37333 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 86610420 86610785 86610768 Y NA RASA1 NA NA NA NA RASA1 48715 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 87662538 87662727 87662633 Y NA NA NA NA NA NA TMEM161B 99245 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 91015868 91016069 91015978 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 338692 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 95179469 95179934 95179619 Y NA GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22760 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr5 97444908 97445288 97444914 Y NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 227160 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 100113377 100113868 100113542 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA FAM174A 244368 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA GIN1 148661 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 107795519 107795743 107795631 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 79720 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 115721196 115721558 115721420 Y NA NA SEMA6A IMR90 Hi-C 24141950 CTB-118N6.1 174700 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 119778960 119779078 119779019 Y NA PRR16 NA NA NA NA PRR16 18895 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 130971517 130972046 130971999 Y NA RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 2588 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 131595834 131595951 131595900 Y KIF3A,PDLIM4 PDLIM4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 4470 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 132137425 132137486 132137431 Y SEPT8,SEPT8 SEPT8,SHROOM1 NA NA NA NA SEPT8 3447 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,MTND4P12 NA NA NA NA MTND4P12 1823 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2 NA NA NA NA MTND4P12 0 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr5 138686401 138686737 138686569 Y NA PAIP2 NA NA NA NA PAIP2 11125 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 138727034 138727338 138727139 Y LOC389333 SPATA24 NA NA NA NA SPATA24 10439 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 141187107 141187320 141187214 Y PCDHGC3 NA KIAA0141,PCDH12,RNF14,PCDH1,LOC729080 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0141 114053 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 148836415 148836621 148836572 Y NA NA NA NA NA NA MIR143HG 52163 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr5 160809035 160809329 160809276 Y NA NA NA NA NA NA PTTG1 962206 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 169398141 169398453 169398335 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 672008 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 172729503 172729731 172729610 Y NA STC2 NA NA NA NA STC2 24775 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 320653 321052 320689 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 31023 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 1131986 1132306 1132130 Y NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 178369 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 5.6694172247315 chr6 3405490 3405872 3405865 Y TUBB2B NA NA NA NA NA TUBB2B 175526 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 10897145 10897485 10897326 Y NA NA NA NA NA NA SYCP2L 151118 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 11212824 11213214 11213068 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA SYCP2L 466797 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 12183004 12183212 12183108 Y HIVEP1,EDN1 NA NA NA NA NA EDN1 105384 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 15530882 15531100 15530987 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 130189 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 15541251 15541598 15541282 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 119691 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 16436821 16437137 16436938 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 200010 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 ATXN1 NA NA NA NA ATXN1 35327 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 17925685 17925969 17925835 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 59885 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 19147287 19147423 19147355 Y NA NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 655560 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 20877706 20877968 20877723 Y CDKAL1 NA NA NA NA NA CDKAL1 345018 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 21887910 21888037 21887975 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 295938 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 36547678 36548077 36547769 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 12068 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 37210217 37210497 37210343 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B NA NA NA NA TBC1D22B 13051 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 41929474 41929675 41929644 Y NA MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 42548 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 44175981 44176134 44176058 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2 SLC29A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC29A1 9108 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 47041238 47041252 47041245 Y NA NA TNFRSF21 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF21 234389 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA NA NA NA NA NA MCM3 871958 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 51773196 51773301 51773249 Y NA NA NA NA NA NA MCM3 374378 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 52345672 52345732 52345729 Y NA NA NA NA NA NA EFHC1 62566 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 53304487 53304630 53304561 Y NA NA GCM1,FBXO9,ELOVL5,KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL5 92540 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 56229630 56229801 56229716 Y NA COL21A1 DST IMR90 Hi-C 24141950 COL21A1 27091 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 56239637 56240034 56239826 Y NA COL21A1 DST IMR90 Hi-C 24141950 COL21A1 16858 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA COL21A1 NA NA NA NA COL21A1 39521 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 56315031 56315399 56315215 Y NA NA NA NA NA NA COL21A1 58139 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 79718228 79718616 79718429 Y PHIP NA NA NA NA NA PHIP 67337 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 87144768 87144816 87144792 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P27 349916 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 88160287 88160298 88160293 Y NA NA NA NA NA NA C6orf164 55447 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 89315918 89316052 89315985 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 355296 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 90943674 90944075 90943895 Y MDN1,BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 60552 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 106537985 106538349 106538117 Y PRDM1,PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 5790 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA NA NA NA NA NA MARCKS 170525 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 117914764 117915043 117914904 Y NA GOPC NA NA NA NA GOPC 6648 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 123154348 123154672 123154568 Y SERINC1,CLVS2,FABP7 SMPDL3A NA NA NA NA SMPDL3A 46033 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 126167488 126167529 126167508 Y NCOA7 NA NA NA NA NA NCOA7 67181 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 135804002 135804049 135804028 Y NA LINC00271,AHI1 NA NA NA NA LINC00271 12440 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 136312028 136312251 136312140 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 141194 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 143204143 143204540 143204474 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 59798 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 148443958 148444368 148444103 Y NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 147072 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 148588961 148589218 148589102 Y UST SASH1 SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 2222 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 151647622 151647708 151647665 Y NA NA ZBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB2 62975 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 151701197 151701769 151701451 Y C6orf97,ZBTB2 ZBTB2 NA NA NA NA ZBTB2 8914 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 152064394 152064417 152064406 Y NA NA NA NA NA NA C6orf211 292972 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 154800404 154800771 154800746 Y NA CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 29022 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 155179611 155179904 155179758 Y NA TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 27780 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 155443662 155443674 155443667 Y TIAM2 NA NA NA NA NA TIAM2 291831 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 157274060 157274135 157274104 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 176997 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 158136804 158137189 158136890 Y NA NA TMEM242,SNX9,ZDHHC14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 105107 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 158398935 158399083 158399028 Y NA SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 1805 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 158452388 158452885 158452569 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 51500 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 159234698 159235091 159235070 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 3353 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr6 166378442 166378825 166378818 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 19266 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr6 166385606 166385834 166385795 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 12257 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 3307587 3307977 3307629 Y NA SDK1 SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 SDK1 31103 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 AC073343.13,ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 7984706 7984926 7984839 Y GLCCI1 GLCCI1 RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 21499 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 18828374 18828759 18828502 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 326536 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 20228342 20228547 20228441 Y TWISTNB,ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 139778 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 20463565 20463840 20463661 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 95240 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 20488084 20488380 20488322 Y NA NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 119759 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 24960670 24960974 24960767 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 58279 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 26007044 26007425 26007148 Y HNRNPA2B1 NA NA NA NA NA CBX3 231357 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 23488 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 28505826 28505846 28505837 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 168886 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 28825008 28825257 28825133 Y NA NA NA NA NA NA CREB5 488068 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 39632170 39632581 39632314 Y RALA YAE1D1,RALA NA NA NA NA YAE1D1 28195 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 39644763 39645050 39644891 Y RALA YAE1D1,RALA LINC00265 IMR90 Hi-C 24141950 RALA 16032 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 47575600 47575737 47575669 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 44419 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 55542922 55542955 55542935 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95726 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 55600779 55601841 55601199 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36840 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 73739145 73739306 73739226 Y NA CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 37340 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 80360559 80360752 80360740 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 188923 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 81234371 81234711 81234707 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163043 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 86287114 86287421 86287268 Y KIAA1324L NA NA NA NA NA DMTF1 492256 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 92279692 92280069 92279965 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 61984 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 93997588 93997985 93997804 Y GNG11,SGCE,COL1A2 COL1A2 COL1A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 23888 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 94003622 94003870 94003684 Y NA COL1A2 NA NA NA NA COL1A2 18003 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA COL1A2 0 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 95030354 95030375 95030365 Y NA PON2 NA NA NA NA PON2 32135 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 98557558 98557720 98557639 Y KPNA7 NA NA NA NA NA TRRAP 84002 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 99994747 99995042 99994880 Y ACTL6B,PILRB MEPCE,PPP1R35 NA NA NA NA MEPCE 29371 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 NA NA NA NA NA LINC01004 53622 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 111696367 111696717 111696622 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 147749 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 114056337 114056620 114056363 Y NA NA NA NA NA NA FOXP2 331955 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 117953120 117953279 117953191 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 131034 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 119342265 119342557 119342442 Y NA NA NA NA NA NA ING3 1246246 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 120288404 120288421 120288413 Y NA NA NA NA NA NA ING3 300382 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 126214480 126214602 126214539 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 855376 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA NA IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL2B 56047 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 130552122 130552429 130552276 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 43640 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 130641725 130642119 130642041 Y MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 45656 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 130665753 130666114 130665990 Y NA NA NA NA NA NA MIR29A 69684 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 130720133 130720826 130720768 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 72029 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA4 109668 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 133223721 133224093 133223724 Y NA NA NA NA NA NA EXOC4 287892 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 98196 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 136495640 136495742 136495691 Y NA NA NA NA NA NA CHRM2 55674 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 140577074 140577378 140577094 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 45186 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr7 157255834 157256209 157256022 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 129759 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr7 157476988 157477433 157477353 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 350913 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 6663567 6663735 6663651 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 99837 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 10001455 10001759 10001620 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 91677 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 11690057 11690160 11690110 Y NA FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB NA NA NA NA RP11-297N6.4 31980 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 19534251 19534633 19534630 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 78907 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA NA DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 72868 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 22561043 22561327 22561142 Y PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 12228 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 23138717 23138953 23138815 Y LOXL2 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA R3HCC1 13084 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 STC1 90757 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 24279975 24280126 24280051 Y NA NA NA NA NA NA NEFM 488399 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 28635981 28636227 28636104 Y EXTL3 NA NA NA NA NA INTS9 109532 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr8 30358644 30358942 30358767 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS 118700 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 32642880 32643214 32643047 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 685726 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA NA NA NA NA NA RNF122 1960165 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 36360158 36360320 36360239 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150O12.1 1049381 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 38406722 38407104 38406913 Y NA NA FGFR1,C8orf86,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFR1 82370 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 38770998 38771507 38771224 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 14245 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 38926192 38926523 38926358 Y NA NA NA NA NA NA ADAM9 73804 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 41160567 41160649 41160637 Y NA SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 4367 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA CEBPD 214438 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 49430601 49430974 49430806 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAI2 401325 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 59713339 59713715 59713527 Y TOX NA NA NA NA NA NSMAF 142936 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 59959496 59959676 59959637 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 69923 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 59983682 59983838 59983818 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 45761 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 67668655 67668834 67668702 Y ADHFE1,SGK3,SGK3 SGK3 NA NA NA NA SGK3 46002 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 68633375 68633571 68633446 Y NA CPA6 NA NA NA NA CPA6 23049 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 72770493 72770720 72770591 Y MSC NA NA NA NA NA TRPA1 215132 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 77729936 77730258 77730097 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 138482 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 90105251 90105649 90105450 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 662306 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 92045909 92045927 92045918 Y TMEM55A TMEM55A,OTUD6B NA NA NA NA TMEM55A 5365 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 99952283 99952358 99952318 Y OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 697 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 103803215 103803631 103803453 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AZIN1 100461 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 104308052 104308138 104308090 Y NA FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA FZD6 523 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 106582164 106582354 106582260 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 253244 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 107870700 107870850 107870776 Y NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 TAGLN2P1 162459 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 110922372 110922703 110922477 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 220352 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 119049251 119049636 119049444 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 72456 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 123141624 123141882 123141720 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 489994 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 126268557 126268681 126268622 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0196 166475 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 126353679 126353867 126353799 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 86696 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 130897837 130898360 130898140 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 129015 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 131259857 131260132 131260043 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 193774 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 133538042 133538101 133538072 Y NA NA NA NA NA NA TMEM71 232857 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 134233745 134234256 134234169 Y NA WISP1 NA NA NA NA WISP1 32463 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr8 142278857 142279200 142279029 Y NA SLC45A4 DENND3,SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 37204 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 1467584 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 2465114 2465154 2465134 Y NA NA VLDLR,FLJ35024 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 154680 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 303183 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 4099830 4100173 4099979 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 246219 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 5901129 5901190 5901160 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 70012 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 14575436 14575689 14575562 Y ZDHHC21 NA NA NA NA NA ZDHHC21 115780 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 16666623 16666991 16666807 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 57821 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 16729817 16729878 16729869 Y BNC2 RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 5005 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 21681581 21681928 21681849 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 118614 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 32354 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 36040345 36040403 36040371 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 5915 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 37009861 37010203 37010032 Y PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 108333 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 3.77961148315433 chr9 37914600 37914735 37914730 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 115166 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 37938183 37938323 37938277 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 128361 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 72653472 72653608 72653542 Y NA NA MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 218329 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 78511057 78511456 78511257 Y NA PCSK5 NA NA NA NA PCSK5 7497 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 80159585 80159985 80159785 Y NA NA NA NA NA NA VPS13A 369316 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 81341677 81341857 81341765 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 431618 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 84889033 84889227 84889130 Y FAM75D1 NA NA NA NA NA RP11-154D17.1 586405 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 88588670 88588806 88588674 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 34609 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 91125141 91125399 91125267 Y NA NA SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2 IMR90 Hi-C 24141950 SPIN1 123807 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 102195698 102196356 102196027 Y TGFBR1,NR4A3 NA NA NA NA NA SEC61B 213352 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 102353104 102353513 102353353 Y TGFBR1,NR4A3 NA NR4A3 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A3 228624 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 110474119 110474209 110474164 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 223356 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 113021820 113022154 113021987 Y NA TXN TXNDC8,SVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 TXN 4900 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 113026614 113026796 113026705 Y NA TXN TXNDC8,SVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 TXN 9694 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 113202507 113202544 113202523 Y NA NA NA NA NA NA SVEP1 137616 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 113646742 113646840 113646791 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 152141 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 113709585 113709745 113709665 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 89236 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 114585349 114585680 114585428 Y NA NA MIR3134,C9orf84,SUSD1,UGCG IMR90 Hi-C 24141950 UGCG 71366 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 115509312 115509740 115509544 Y KIAA1958,ZNF883,ZFP37,SNX30 SNX30 C9orf80,SNX30,KIAA1958 IMR90 Hi-C 24141950 SNX30 1378 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA NA NA NA NA NA AKNA 235224 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 117261691 117262201 117261984 Y NA DFNB31 NA NA NA NA DFNB31 3529 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 117785314 117785612 117785505 Y NA NA NA NA NA NA TNC 92924 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 119066427 119066819 119066625 Y NA NA NA NA NA NA PAPPA 152344 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 120482943 120483330 120483020 Y TLR4 NA NA NA NA NA ASTN2 307595 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 123346430 123346633 123346540 Y TRAF1 CDK5RAP2 CDK5RAP2 K562 ChIA-PET 22265404 CDK5RAP2 5982 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 127861290 127861583 127861437 Y NA SCAI NA NA NA NA SCAI 42202 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 130590782 130591142 130590862 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS CDK9,FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 23893 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 131908135 131908616 131908494 Y METTL11A PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29924 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71936 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 132431533 132431827 132431685 Y NA ASB6,PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 5613 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 11.338834449463 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 139223291 139223329 139223306 Y NA GPSM1,DNLZ NA NA NA NA GPSM1 3359 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 140163781 140164247 140164025 Y NA TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 30116 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chr9 140169154 140169348 140169240 Y NA TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 35489 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 1524384 1524716 1524554 Y CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL SLC25A6,ASMTL NA NA NA NA SLC25A6 14767 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 3437014 3437322 3437139 Y ARSF,MXRA5 NA ARSF IMR90 Hi-C 24141950 MXRA5 174332 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X NA NA NA NA NA WWC3 547177 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 10143530 10143844 10143687 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 161928 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 180061 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 17856457 17856771 17856610 Y NA NA NA NA NA NA SCML1 102869 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 38742577 38742732 38742665 Y MID1IP1 NA MID1IP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPGR 557760 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 45493055 45493058 45493057 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1158E12.3 215862 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 35371 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A NA NA NA NA NA GPR173 111734 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 74266683 74266817 74266750 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 107750 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA TAF9B 515628 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA NA NA NA NA NA RP1-161N10.1 1270090 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 132400242 132400521 132400363 Y NA NA NA NA NA NA GPC4 146997 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 132780282 132780629 132780529 Y NA RP3-417G15.1 NA NA NA NA RP3-417G15.1 22370 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA PHF6 199118 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717 chrX 152648727 152649001 152648990 Y SLC6A8,ZNF275 NA NA NA NA NA ZNF275 51114 CAGE HGRT hg19 FANTOM5 1.88980574157717