chr1	855764	856157	855856	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	2103	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	856539	856757	856714	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	1503	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	941791	942135	942082	Y	HES4	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	ISG15,AGRN	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ISG15	4668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	1136075	1136463	1136398	Y	HES4,ISG15	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	3608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	1143531	1144198	1143599	Y	MIB2,LOC441869,TNFRSF18,TNFRSF4	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	3460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	TAS1R3	983	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,RP4-758J18.7,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,FAM213B	NA	NA	NA	NA	HES5	17731	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,FAM213B	NA	NA	NA	NA	HES5	18592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	138833	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	7609389	7609632	7609504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	219697	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	8215795	8215905	8215839	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	48752	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	2116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	8264458	8264788	8264713	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	69931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	8953388	8953557	8953428	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	16080	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	9535183	9535425	9535306	Y	NA	NA	SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	62116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	9760502	9760837	9760631	Y	NA	RP11-558F24.4	NA	NA	NA	NA	RP11-558F24.4	14889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	9840833	9841244	9840865	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	41340	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	9889535	9889880	9889709	Y	KIF1B	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	6951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	10556105	10556527	10556365	Y	NA	PEX14,DFFA	CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	DFFA	25522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	10853772	10853865	10853819	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	842	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	12240401	12240902	12240499	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B,VPS13D	VPS13D	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1B	15341	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	15416988	15417263	15417153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	59765	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	15664307	15664455	15664338	Y	NA	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	69936	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	15738661	15738986	15738829	Y	SPEN,PLEKHM2,DDI2,EFHD2,CASP9,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	4270	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	15739166	15739306	15739257	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	4775	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	15827976	15828116	15828046	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	22913	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	15835354	15835624	15835499	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	15405	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	38733	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr1	17019394	17019738	17019426	Y	SPATA21,NBPF1	EIF1AXP1	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	8844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr1	17253207	17253541	17253218	Y	NA	RP11-108M9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-108M9.4	39063	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	7.63249892794514
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	19324821	19325090	19324988	Y	TAS1R2,IFFO2	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2,UBR4	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	43641	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	19794978	19795283	19795050	Y	PLA2G2E,UBR4	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	14783	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	21349725	21349786	21349755	Y	EIF4G3	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	61951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	22836447	22836690	22836500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	60103	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	TCEA3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	107	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.70721376500193
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	GRHL3,NIPAL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	48021	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	24722613	24722643	24722628	Y	NA	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	17641	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	25344029	25344296	25344110	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	54417	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	26022319	26022793	26022555	Y	SEPN1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPN1	101874	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.05299957117806
chr1	27244420	27244792	27244551	Y	NA	GPN2,NUDC,GPATCH3,C1orf172	NA	NA	NA	NA	GPATCH3	19463	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	27645553	27645918	27645736	Y	NA	TMEM222,SYTL1,MAP3K6	NA	NA	NA	NA	TMEM222	733	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27926165	27926491	27926331	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	2451	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	28238886	28239222	28239086	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	RPA2	35	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	28500052	28500411	28500178	Y	STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,GMEB1,PTAFR,PTAFR	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC8	57125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	28618110	28618271	28618191	Y	ATPIF1	SESN2,MED18	NA	NA	NA	NA	SESN2	34072	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr1	30447163	30447510	30447328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-65J11.1	847565	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	31360609	31360977	31360897	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	18631	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	106986	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	SNRNP40	29711	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	75791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TINAGL1	24526	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	32701561	32701886	32701724	Y	NA	CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP	NA	NA	NA	NA	MTMR9LP	3335	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33457406	33457727	33457615	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	29120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33458800	33459074	33458865	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	30514	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	33802277	33802571	33802529	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	39302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	116288	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	36489072	36489418	36489191	Y	NA	NA	COL8A2,TEKT2,ADPRHL2	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT2	58258	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	36627717	36628369	36628068	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	8537	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	36721428	36721771	36721600	Y	NA	THRAP3,SH3D21	NA	NA	NA	NA	THRAP3	33411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	39598118	39598362	39598293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53130	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	39651405	39651741	39651429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	106417	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	39662647	39663006	39662738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	117659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	16420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	41343431	41343839	41343651	Y	NA	CITED4	KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	17413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	41823971	41824199	41824094	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1395	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	41885108	41885337	41885223	Y	EDN2	NA	EDN2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXO6	59514	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	41966127	41966464	41966357	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	17783	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	42071739	42071927	42071841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	123395	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	43250353	43250859	43250610	Y	ZMYND12,WDR65,YBX1	LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23	NA	NA	NA	NA	C1orf50	19413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	43407355	43407700	43407616	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	14830	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	43666420	43666443	43666435	Y	NA	WDR65	NA	NA	NA	NA	WDR65	30600	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	44354357	44354471	44354414	Y	SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13	ARTN	NA	NA	NA	NA	ARTN	42521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	44764661	44765046	44764854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERI3	53886	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	46632893	46633236	46633065	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	5509	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	46689426	46689696	46689549	Y	FAAH,C1orf190	PIK3R3,POMGNT1,RAD54L	NA	NA	NA	NA	POMGNT1	5449	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	46999025	46999241	46999126	Y	ATPAF1-AS1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	81274	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	47055088	47055141	47055115	Y	NA	MKNK1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	25374	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	48224075	48224507	48224159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK1	426606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	51034551	51034734	51034643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	389201	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	54052889	54052991	54052940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP8	261147	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	58002362	58002542	58002370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	718993	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	59008745	59009101	59008916	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	DAB1	1305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	59039624	59039692	59039640	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	TACSTD2	1474	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	9073	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	59083441	59083551	59083446	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42275	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	59083966	59084335	59084186	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42800	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	59524373	59524568	59524471	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	235742	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	151190	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	60062084	60062408	60062209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	216050	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	62609116	62609459	62609128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK4	173626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	68257818	68258216	68258148	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	38934	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	70040211	70040399	70040305	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	628904	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	71377	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	75445957	75446239	75446083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZ	248865	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	75798807	75799079	75799068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	388957	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	78171350	78171363	78171357	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	24246	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	81968642	81968976	81968811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	216402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	85826803	85827129	85827050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	86030	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	86805161	86805335	86805245	Y	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	NA	ODF2L	54688	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	89475726	89475778	89475752	Y	NA	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	GBP3	10799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	90374317	90375036	90374524	Y	LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	82844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94084336	94084510	94084423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	154490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	112754	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110974	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94133922	94134283	94134103	Y	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	104717	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	92882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	80815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.92528516294322
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	71480	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94168203	94168325	94168229	Y	NA	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	70675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	94234014	94234407	94234233	Y	NA	RP11-488P3.1	BCAR3,FNBP1L,LOC100129046	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	4593	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	NA	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	F3	108458	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	95179307	95179605	95179478	Y	F3	NA	F3,ABCD3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	104232	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	97535901	97536287	97536271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	350680	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	100140321	100140582	100140449	Y	NA	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	30822	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	108122481	108123055	108122789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	525214	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	108169181	108169438	108169310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	571914	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	108622242	108622251	108622249	Y	FAM102B,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	119220	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	108673419	108673672	108673564	Y	FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	67799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	110360957	110361372	110361052	Y	NA	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	78573	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	110879130	110879445	110879277	Y	CSF1	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	2	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	111251861	111252073	111251987	Y	LRIF1,CD53	NA	NA	NA	NA	NA	LRIF1	252628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	111735402	111735659	111735539	Y	CD53,LRIF1,RAP1A	CHI3L2,DENND2D	NA	NA	NA	NA	CHI3L2	5734	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	111735691	111736003	111735892	Y	CD53,LRIF1,RAP1A,C1orf162	CHI3L2,DENND2D	NA	NA	NA	NA	CHI3L2	5390	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	117424835	117425013	117424940	Y	PTGFRN	PTGFRN	PTGFRN	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	25666	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	75070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	120608824	120609208	120608880	Y	NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	1032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439A17.7	648739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	73337	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	145005016	145005394	145005195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	68792	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	145433530	145433648	145433615	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10	TXNIP,POLR3GL,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	2821	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	145435103	145435641	145435221	Y	CD160,TXNIP,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	828	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	3037	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2AA3,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	150294873	150295138	150294978	Y	PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3	MRPS21,PRPF3,RPRD2	NA	NA	NA	NA	PRPF3	2948	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	150772798	150773105	150772952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT	74139	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	RP11-126K1.2	3391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	151792678	151793001	151792838	Y	RORC	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2,THEM5	NA	NA	NA	NA	RORC	9347	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2,THEM5	NA	NA	NA	NA	AL450992.2	2608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.92528516294322
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM5,THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	151952807	151953143	151952837	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	11723	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	RPTN,FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.3614279588258
chr1	152878925	152879083	152878954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVL	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	153285394	153285679	153285564	Y	NA	PGLYRP4,S100A9	NA	NA	NA	NA	PGLYRP4	33637	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.14335656088451
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	15331	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	153525322	153525412	153525387	Y	PGLYRP3,S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A4	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	S100A4,S100A5	K562	ChIA-PET	22265404	S100A4	4710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A2,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	153715466	153715694	153715559	Y	PGLYRP3,INTS3	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	16923	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	154151566	154151965	154151766	Y	NA	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	13159	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	155097183	155097419	155097260	Y	NA	EFNA1,SLC50A1,DPM3,TRIM46,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	517	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,TRIM46,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	155433776	155433971	155433878	Y	MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L	96627	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	155484519	155484611	155484545	Y	KRTCAP2,GBA,SCAMP3,CLK2,RUSC1,RUSC1,RUSC1-AS1,RUSC1	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	45987	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	155916072	155916212	155916141	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	13881	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	156679562	156679883	156679727	Y	NA	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	5954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	157082632	157083078	157082974	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	KRT8P45,ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	23188	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1,CD1D	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1,CD1D	NA	NA	NA	NA	CD1D	668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	CD1D	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	158462836	158463187	158462989	Y	CD1B,CD1E,OR10T2	NA	NA	NA	NA	NA	CD1D	315099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	159083627	159083815	159083767	Y	NA	AIM2	NA	NA	NA	NA	AIM2	31071	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	159829428	159829783	159829606	Y	OR10J5,KCNJ9	C1orf204,CCDC19	NA	NA	NA	NA	C1orf204	6291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	160376163	160376541	160376381	Y	NA	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	7787	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	160377718	160378261	160377994	Y	IGSF9	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	9342	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL2	271452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	F11R	292821	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	161037907	161038726	161038256	Y	FCGR3A,FCGR3A,CD48,CD244,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1,PVRL4,KLHDC9,NIT1,PFDN2	NA	NA	NA	NA	PVRL4	18663	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	161052363	161052546	161052461	Y	F11R,PVRL4	TSTD1,USF1,PVRL4,KLHDC9,NIT1,PFDN2,DEDD	NA	NA	NA	NA	PVRL4	4843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	161706477	161706712	161706625	Y	HSPA6,FCRLB,ATF6	DUSP12,ATF6	DUSP12	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP12	10836	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	164685981	164686133	164686057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	163160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	164723371	164723492	164723438	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	200550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	164736884	164737252	164737025	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	214063	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	167461792	167462175	167462164	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	58829	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	167520671	167521013	167520898	Y	CREG1	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	168355862	168356010	168355936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	107584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	168368318	168368620	168368438	Y	TBX19	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	120040	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	168479157	168479362	168479223	Y	XCL2,XCL1	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	230879	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	168479815	168480142	168480087	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	231537	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	168483874	168484202	168483927	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	235596	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	168526950	168527356	168527080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	278672	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	169464285	169464545	169464529	Y	BLZF1,SLC19A2	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	AL021068.1	10905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	172142638	172142648	172142642	Y	DNM3,FASLG	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	268582	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	172327070	172327187	172327139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	84043	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	173092552	173092771	173092714	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	173816933	173817269	173817101	Y	NA	DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	NA	NA	NA	NA	ZBTB37	17951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	174220636	174220943	174220783	Y	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	94088	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	180613229	180613603	180613357	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	14089	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	180727103	180727211	180727157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPR1	127963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	181110732	181111003	181110864	Y	STX6,MR1,IER5	NA	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	55094	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	95614	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	74610	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	185343087	185343625	185343182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	58626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	192500254	192500504	192500353	Y	RGS1	NA	UCHL5,RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	182809	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	192577525	192577907	192577716	Y	NA	NA	UCHL5	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	105406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	197747792	197747875	197747834	Y	NA	DENND1B	NA	NA	NA	NA	DENND1B	4966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	200750000	200750140	200750089	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	43314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	200831452	200831819	200831500	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	26357	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	14415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	201277004	201277220	201277102	Y	NA	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	26424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr1	201280694	201280963	201280829	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	30114	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	201295169	201295564	201295367	Y	PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	44589	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	201463619	201463933	201463776	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	10436	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	201469668	201470038	201469853	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	4331	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	201500233	201500477	201500437	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	23649	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	92185	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	201709797	201710423	201710148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	85846	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	202003479	202003610	202003599	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	25998	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3,RP11-465N4.4	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-465N4.4	38691	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARL8A	33993	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	202219033	202219251	202219134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	89857	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	202781525	202781905	202781812	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5	NA	NA	NA	NA	PCAT6	3443	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	203294160	203294623	203294393	Y	RABIF,KLHL12,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	21541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	203617500	203617713	203617599	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	23811	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	203661733	203662076	203661795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	68044	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	204675739	204675945	204675909	Y	NA	LRRN2	LRRN2,NFASC	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRN2	22878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	205418015	205418182	205418073	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	4900	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	205475126	205475451	205475289	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	3403	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	14535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	207203424	207203586	207203506	Y	C1orf116	C1orf116,PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	C1orf116	515	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	207413364	207413503	207413411	Y	IL19,CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	79350	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	207414217	207414394	207414309	Y	CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	78459	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	207489914	207490291	207489981	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	CD55,YOD1,PFKFB2,CR2,CR1	IMR90	Hi-C	24141950	CD55	2562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr1	207551040	207551052	207551045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD55	58187	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	NA	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	98229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	208028503	208028730	208028615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD46	105101	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	208357514	208358085	208357775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57580	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	208358361	208358485	208358423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57180	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209577571	209577627	209577601	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	22538	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209585617	209585757	209585708	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	14408	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209589374	209589797	209589586	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR205HG	10368	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209600780	209600928	209600808	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209601291	209601611	209601405	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	1126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209783856	209783983	209783869	Y	NA	RP1-272L16.1,LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	39828	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209798058	209798744	209798639	Y	NA	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	25067	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209806744	209806957	209806914	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	16854	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209820544	209820823	209820626	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3,G0S2	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	2988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209829183	209829498	209829302	Y	IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	5372	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209830400	209831026	209830727	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	6589	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209833148	209833823	209833488	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	9337	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209921200	209921357	209921278	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	RP1-28O10.1,C1orf74	NA	NA	NA	NA	RP1-28O10.1	25730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209930913	209931012	209930979	Y	G0S2,TRAF3IP3	RP1-28O10.1,C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	24892	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209934463	209934573	209934515	Y	LAMB3,G0S2	RP1-28O10.1,C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	21331	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	RP1-28O10.1,C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	12504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	209978699	209978810	209978755	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6	C1orf74,IRF6,DIEXF	NA	NA	NA	NA	IRF6	1234	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	209989263	209989693	209989489	Y	LOC642587,LAMB3,LAMB3,IRF6	C1orf74,IRF6,DIEXF	DIEXF,TRAF3IP3	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DIEXF	9659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	209996933	209997272	209996990	Y	NA	C1orf74,IRF6,DIEXF	DIEXF,IRF6,C1orf74	K562	ChIA-PET	22265404	DIEXF	2080	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	211517513	211517976	211517713	Y	RD3,TRAF5,TRAF5	TRAF5,LINC00467	NA	NA	NA	NA	TRAF5	19556	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC30A1	36683	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	212780782	212781279	212780943	Y	NA	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	44106	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	214614073	214614284	214614198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	214648804	214649025	214648867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	74767	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	214712809	214712848	214712830	Y	NA	PTPN14	NA	NA	NA	NA	PTPN14	10944	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	241326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	219497639	219497836	219497817	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	152453	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	222060426	222060817	222060685	Y	NA	NA	DUSP10	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP10	146908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	222142763	222142919	222142838	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	229245	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	222163243	222163609	222163382	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	249725	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.14335656088451
chr1	224240602	224240763	224240683	Y	TP53BP2	NA	NVL	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO28	59026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	224685994	224686507	224686055	Y	NA	NA	WDR26,CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	63259	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr1	227315962	227315970	227315966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	188205	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	227499470	227499818	227499796	Y	NA	CDC42BPA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	4357	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	227953974	227954299	227954123	Y	IBA57	SNAP47,JMJD4	NA	NA	NA	NA	JMJD4	32862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	228688608	228688902	228688729	Y	HIST3H2A	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	15846	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr1	228973832	228974198	228974019	Y	RHOU	NA	RHOU,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	105008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	229527864	229528146	229528005	Y	NA	ACTA1	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	ACTA1	39699	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230061007	230061186	230061097	Y	ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	130350	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230212552	230213069	230212856	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	21016	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230241590	230241986	230241849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	50054	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	230594287	230594609	230594447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	181626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230645276	230645765	230645542	Y	NA	NA	URB2	IMR90	Hi-C	24141950	COG2	130470	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	230724659	230724927	230724832	Y	NA	NA	TRIM67,LOC149373	IMR90	Hi-C	24141950	COG2	51308	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	230978470	230978520	230978495	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	24815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	7.41442753000385
chr1	233249275	233249581	233249334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	164924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	234668851	234669143	234668986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARBP1	56002	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	8.06864172382772
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	13899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	1054	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC01132	50362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	16481	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	7398	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	3148	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	19535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	235242792	235242999	235242934	Y	NA	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47252	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TOMM20	43394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	235468552	235468724	235468640	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	19941	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	235615040	235615273	235615157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	50508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	236083263	236083651	236083332	Y	GPR137B	LYST	LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	38323	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	236109486	236110063	236109737	Y	LYST	NA	LYST,NID1,GNG4,B3GALNT2	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	64546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	241804319	241804678	241804577	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	7087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	243893800	243893985	243893919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	476480	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	397535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr1	247325578	247326237	247325673	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	37125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	438578	438619	438599	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	260173	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	1240958	1241356	1241181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	147480	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	3568141	3568290	3568192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	257183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	3797195	3797502	3797389	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	27971	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	3811743	3812009	3811888	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	13464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	3867491	3867713	3867639	Y	NA	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	42018	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	439736	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	4556552	4557090	4556825	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	269731	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	112948	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	118302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr10	5504427	5504665	5504478	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	34868	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML5,CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	CALML5	8200	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	CALML5,CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	22105	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	CALML5,CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	23176	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	24305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	5590507	5590769	5590638	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	24802	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	25254	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	5593718	5593999	5593816	Y	NET1,CALML3	CALML3,RP11-116G8.5	NET1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-116G8.5	28013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP11-336A10.5,RP11-336A10.4	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-336A10.5	11486	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	6764164	6764384	6764289	Y	NA	RP11-554I8.2	LOC100507127,SFMBT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554I8.2	12960	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	6836289	6836715	6836468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-554I8.2	58945	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	7235109	7235366	7235309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	216084	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	89100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	11054573	11055101	11054777	Y	CELF2,CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	596652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	135463	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN,CCDC3	NA	NA	NA	NA	CCDC3	3289	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	13812005	13812243	13812123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	185078	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	RPP38	21540	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	17254796	17255338	17255153	Y	VIM	TRDMT1,VIM	CUBN,TRDMT1,VIM	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRDMT1	12743	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	20219970	20220256	20220113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	116802	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	20292651	20293410	20292825	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	189483	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	20518444	20518755	20518482	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	415276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	21241912	21242237	21242078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	218879	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	22555688	22555894	22555791	Y	NA	COMMD3	NA	NA	NA	NA	COMMD3	47009	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	24754185	24754590	24754306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	256007	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	25348919	25349256	25349121	Y	NA	THNSL1	ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THNSL1	45332	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	27028326	27028583	27028339	Y	MASTL,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	43738	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	28700580	28701041	28700796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	79165	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	29556183	29556410	29556298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	139921	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	29887787	29888175	29887987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	191456	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	29970673	29971027	29970896	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	274342	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	29977181	29977518	29977482	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	280850	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTCHD3P1	376876	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	30092989	30093361	30093263	Y	SVIL	NA	SVIL,KIAA1462,MIR604	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTCHD3P1	396658	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTCHD3P1	400118	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	30736122	30736481	30736327	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	15256	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	31205866	31205987	31205927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF438	112879	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	32100174	32100489	32100483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	115253	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	32301568	32301771	32301670	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	41588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	34439638	34439951	34439795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	662302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	286891	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	34907489	34907514	34907502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	194739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	35640077	35640405	35640144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	106124	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	RET,CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	RET	30420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	47092943	47093271	47093193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	123543	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	168349	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	50138824	50138968	50138896	Y	WDFY4	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	606118	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	52081951	52082279	52082036	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	52266916	52267259	52267072	Y	SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	115664	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	52300578	52300747	52300601	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	82176	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	55358740	55359098	55358883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	1286684	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	61580750	61581126	61580938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	83288	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	62096782	62097076	62096929	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	432368	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	63736420	63736602	63736437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	77361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	93060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	63778860	63779091	63779011	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	119801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	63779948	63780456	63780395	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	120889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	63859069	63859192	63859131	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	167274	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	63979384	63979550	63979547	Y	NA	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	46916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	64337534	64337777	64337652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	205583	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	64413068	64413194	64413115	Y	NRBF2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	149322	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	98071	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	68010262	68010544	68010403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	1426933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	72507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	69550767	69550960	69550901	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	44964	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	69856894	69857171	69856968	Y	NA	HERC4	MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	23789	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	80202	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,RP11-227H15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-227H15.4	12814	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	71002181	71002454	71002318	Y	NA	RP11-227H15.4,HK1	NA	NA	NA	NA	RP11-227H15.4	11935	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HK1	81364	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	71145067	71145367	71145287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	63862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73530522	73531091	73530726	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73612356	73612502	73612445	Y	DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	NA	NA	NA	NA	PSAP	3230	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73627974	73628371	73628194	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	18848	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73746692	73746892	73746791	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	24569	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73838970	73839431	73839345	Y	CDH23,SPOCK2	SPOCK2	NA	NA	NA	NA	SPOCK2	7359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	73840531	73840743	73840590	Y	ASCC1,ASCC1,SPOCK2	SPOCK2	NA	NA	NA	NA	SPOCK2	6047	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	74070583	74070739	74070681	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	38905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	74081865	74082262	74082021	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30726	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	74082335	74082540	74082412	Y	DDIT4	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30448	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74174604	74174793	74174677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	61616	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74327257	74327510	74327437	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	56389	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74453097	74453245	74453141	Y	CCDC109A	MCU	NA	NA	NA	NA	MCU	3208	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	75211378	75211476	75211427	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	30924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr10	75931649	75931916	75931783	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	ADK	22689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	76053029	76053199	76053114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	144069	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	79559143	79559449	79559282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	124929	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	79651191	79651354	79651229	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	33024	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	80735323	80735872	80735375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90920	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	80943996	80944377	80944135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	117204	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	81010188	81010619	81010281	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	94606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	81045880	81046806	81046457	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	58419	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	81956011	81956585	81956252	Y	ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	6743	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	86448211	86448543	86448377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	130012	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	NA	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	WAPAL	118731	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	89500062	89500398	89500217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	75287	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	89990044	89990113	89990079	Y	LIPK	NA	PTEN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	286785	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	90258909	90259131	90259020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNLS	83156	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	90527399	90527667	90527447	Y	ANKRD22,LIPN	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD22	81908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	90552469	90552762	90552637	Y	FAS,ANKRD22,LIPN	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD22	56813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	93241945	93242217	93242081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	73849	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	93318603	93318995	93318800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	71816	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	94367821	94367909	94367865	Y	CYP26C1,KIF11	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	16778	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	95145053	95145431	95145242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	94643	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	95198614	95198817	95198708	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	41257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	95223953	95224101	95224023	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15973	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.05299957117806
chr10	95675431	95675709	95675545	Y	NA	SLC35G1	NA	NA	NA	NA	SLC35G1	23701	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	97038434	97038774	97038645	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	10007	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	97048077	97048324	97048201	Y	SORBS1	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	99096745	99096901	99096835	Y	NA	ARHGAP19,FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2	NA	NA	NA	NA	FRAT2	4287	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	99449337	99449738	99449607	Y	C10orf28,RRP12,PI4K2A	AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	AVPI1	4257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27,SFRP5	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	152695	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	101736797	101737134	101736959	Y	BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	30542	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	104364219	104364413	104364273	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	37840	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	104406463	104406725	104406695	Y	NFKB2,NFKB2,TRIM8	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	4210	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	104780741	104781119	104780930	Y	LOC729020,PDCD11	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM2	104691	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	33467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	81090	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	105725440	105725838	105725745	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	SLK	481	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	106065321	106065564	106065443	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30598	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	106082205	106082621	106082398	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	13541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	106094943	106095283	106095247	Y	NA	ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	879	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	106096287	106096870	106096611	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP,CCDC147-AS1	ITPRIP,GSTO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITPRIP	125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	106109390	106109845	106109501	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP,CCDC147-AS1	ITPRIP	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC147-AS1	1488	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	112113245	112113632	112113326	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	50536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	112115007	112115281	112115101	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	52298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	112169656	112169922	112169805	Y	SMC3	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85674	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	112295745	112296221	112296000	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5,SMC3	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	29228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	113852369	113852641	113852488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	120494	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr10	116275227	116275586	116275389	Y	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	112712	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr10	116282298	116282595	116282502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	119783	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	116392908	116393338	116393223	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	49424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	116582671	116583074	116582920	Y	NA	FAM160B1	NA	NA	NA	NA	FAM160B1	3168	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	116776820	116777128	116776974	Y	NA	NA	ATRNL1	IMR90	Hi-C	24141950	TRUB1	80868	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	118500407	118500818	118500725	Y	NA	HSPA12A	NA	NA	NA	NA	HSPA12A	322	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	118656077	118656284	118656258	Y	NA	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	48361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	138826	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	121076325	121076636	121076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	139980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	122263752	122264109	122263932	Y	NA	PPAPDC1A	NA	NA	NA	NA	PPAPDC1A	49286	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	122836934	122837187	122837105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	54050	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr10	123914164	123914234	123914222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167475	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	125770308	125770486	125770464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	80720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126315526	126315929	126315823	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	114909	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126337254	126337585	126337480	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	93253	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	126347478	126347709	126347686	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	83129	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126360075	126360476	126360334	Y	LHPP,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	70362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126389218	126389354	126389286	Y	NA	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	41484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126712433	126712623	126712473	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	108721	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126717665	126717735	126717700	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	113953	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126782105	126782284	126782195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	65455	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126811654	126811843	126811733	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	35896	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	127714877	127714997	127714888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	131769	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	128946859	128946983	128946921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	354881	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	129774599	129774927	129774767	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRE	71274	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	133763722	133764008	133763747	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	29427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.83492817323677
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8895	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr10	134266616	134267060	134266753	Y	LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	10785	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	134430075	134430311	134430209	Y	INPP5A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	80751	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	134975074	134975296	134975198	Y	NA	KNDC1	NA	NA	NA	NA	KNDC1	3123	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	13224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	4064	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	16705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr11	749835	750077	749967	Y	IFITM2,IRF7,IRF7,TMEM80,DEAF1,TALDO1	DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,CEND1,SLC25A22	NA	NA	NA	NA	TALDO1	4506	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	926738	926879	926801	Y	BRSK2,CEND1,AP2A2	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	3844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	MUC6,RP13-870H17.3	NA	NA	NA	NA	RP13-870H17.3	25489	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	1320394	1320580	1320544	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	8304	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	1768025	1768222	1768084	Y	IFITM10	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	NA	NA	NA	NA	IFITM10	1599	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	2082720	2083054	2082737	Y	NA	NA	MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686	IMR90,K562,GM12878,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	MRPL23	116212	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	2200082	2200579	2200535	Y	SYT8,ASCL2,IGF2,TH	NA	NA	NA	NA	NA	ASCL2	89603	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	4111553	4111947	4111636	Y	STIM1	RRM1	NA	NA	NA	NA	RRM1	1990	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	10099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	9060824	9061053	9060961	Y	ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,DENND5A	NRIP3	NA	NA	NA	NA	NRIP3	37228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	10323282	10323617	10323398	Y	NA	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-351I24.1	31	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	10510755	10511001	10510868	Y	ZBED5	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	17722	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	104493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	13045391	13045502	13045447	Y	NA	RASSF10,CTC-497E21.3	NA	NA	NA	NA	CTC-497E21.3	16685	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	13359856	13360227	13360061	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	63657	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	13373049	13373395	13373164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	76850	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	146598	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	20016658	20016921	20016770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	366310	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	20053197	20053569	20053404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	329662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	126840	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	27682701	27682852	27682777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58753	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	28864582	28864807	28864697	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	142420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	34661390	34661585	34661450	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	20750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	36132577	36133046	36132774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	169046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	36442519	36442687	36442604	Y	COMMD9,PRR5L,PRR5L,TRAF6	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF6	87135	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	ALX4	NA	NA	NA	NA	ALX4	2390	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	44758780	44759166	44758916	Y	NA	TSPAN18	TSPAN18,PRDM11,CD82,TP53I11,SYT13	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN18	12765	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	87257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr11	46379063	46379180	46379102	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	21126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	47226153	47226377	47226265	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2	DDB2,PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DDB2	8116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr11	57549936	57550183	57550060	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	31221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	63632	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	47643	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	61742606	61743000	61742909	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	9474	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK	53596	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	10314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	84501	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	64320859	64321220	64321040	Y	C11orf85	NA	SLC22A12,NRXN2	IMR90	Hi-C	24141950	NRXN2	167440	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr11	65220740	65221001	65220852	Y	NA	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	12	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.70721376500193
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	11.3397126929471
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	14950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	65910089	65910568	65910423	Y	NA	NA	KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	74255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,SPTBN2,C11orf80	NA	NA	NA	NA	SPTBN2	6715	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	66494345	66494720	66494567	Y	NA	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SPTBN2	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	SPTBN2,C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SPTBN2	83	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr11	66717584	66717809	66717709	Y	CLCF1,ADRBK1	PC,C11orf86	NA	NA	NA	NA	PC	6038	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	66738286	66738892	66738415	Y	POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1	PC,C11orf86,SYT12	PC,SYT12,RHOD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf86	1856	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.83492817323677
chr11	67142500	67143040	67142970	Y	CDK2AP2,CLCF1,PPP1CA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	3445	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	TPCN2	253169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	TPCN2	254814	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	CCND1	256313	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	127588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	126570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	70413927	70414164	70414002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	171333	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	70470330	70470512	70470409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	227736	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	70575636	70576014	70576009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	333042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	72450733	72450835	72450765	Y	P2RY2,P2RY2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	51809	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	72451817	72452230	72452044	Y	PDE2A	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	50414	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	72487947	72488068	72488008	Y	NA	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	14576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	73240043	73240049	73240046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	67185	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	73549407	73549618	73549556	Y	PLEKHB1	PAAF1	NA	NA	NA	NA	PAAF1	36126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	73722792	73723138	73723056	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	UCP2	UCP2	K562	ChIA-PET	22265404	UCP2	30440	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	CHRDL2,RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr11	75920696	75920900	75920748	Y	NA	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	76463883	76464042	76463970	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	ACER3,TSKU,B3GNT6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	13225	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	3522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	78426480	78426845	78426663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	142561	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	282552	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	85419491	85419865	85419792	Y	SYTL2	CREBZF	NA	NA	NA	NA	CREBZF	27540	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	85702937	85703343	85703240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICALM	75581	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	85884942	85885680	85885222	Y	NA	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	67906	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	86214866	86215096	86214981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	166582	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	86262463	86262643	86262563	Y	FZD4	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	119035	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	86433528	86433764	86433646	Y	NA	NA	PRSS23,ME3	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	51850	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	86452946	86453377	86453076	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	46724	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	87871692	87871803	87871780	Y	NA	RAB38	NA	NA	NA	NA	RAB38	34832	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	93248690	93248852	93248778	Y	SLC36A4,C11orf75	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	17782	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	93253925	93254245	93254149	Y	SLC36A4,C11orf75	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	12389	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	RP11-712B9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	1085	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	95778897	95779169	95779022	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	122418	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	95938142	95938441	95938252	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	135903	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	96169745	96169924	96169835	Y	NA	CCDC82,JRKL	ENDOD1	IMR90	Hi-C	24141950	JRKL	48592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr11	102140637	102141105	102140856	Y	NA	BIRC3	YAP1,BIRC2,MMP20,BIRC3,C11orf70	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	45110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	102175501	102175731	102175600	Y	BIRC2	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC3	10484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	102283995	102284326	102284226	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	NA	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	54789	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	108487361	108487672	108487557	Y	EXPH5	EXPH5,DDX10	NPAT,EXPH5,ATM	IMR90	Hi-C	24141950	EXPH5	24896	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	116873672	116874047	116873840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIK3	93106	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	118146006	118146232	118146062	Y	FXYD6,MPZL2	MPZL3,MPZL2	MPZL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MPZL2	12755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	122177708	122178168	122177914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-820L6.1	113411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	122292534	122292605	122292585	Y	NA	RP11-820L6.1	SORL1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.05299957117806
chr11	122527331	122527938	122527906	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	2948	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	123352361	123352657	123352509	Y	OR8D4,OR6M1	LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	29255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	123353850	123354009	123353930	Y	NA	LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	30744	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	123407861	123408201	123408031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01059	84755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	123414630	123415056	123414666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01059	91524	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	123513712	123514126	123514044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	96257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	8703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	126188574	126188806	126188644	Y	NA	TIRAP,DCPS,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	DCPS	16927	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	126210041	126210184	126210131	Y	NA	DCPS,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	13351	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr11	128604470	128604603	128604537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLI1	50040	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	128947199	128947514	128947458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	199705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	129244480	129244782	129244484	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	645	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	129246487	129246784	129246747	Y	BARX2	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	2652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	129287954	129288140	129288047	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	44119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	129507501	129507545	129507523	Y	BARX2,NFRKB	NA	BARX2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	176169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr11	130062798	130062918	130062846	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	35341	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	574296	574697	574406	Y	B4GALNT3	B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	6766	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	647081	647236	647154	Y	ERC1,SLC6A12,SLC6A12,B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	79551	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	690377	690646	690594	Y	NA	RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	47411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	1024438	1024795	1024721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	72424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	1211682	1211803	1211740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	114007	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	2454250	2454342	2454280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	342549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	3326549	3326840	3326665	Y	TSPAN9	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	7453	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	3563518	3563854	3563701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	244422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	3979182	3979441	3979276	Y	PARP11	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	1167	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6178640	6178845	6178761	Y	TNFRSF1A	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	128036	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6183650	6183782	6183713	Y	VWF	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	123099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	6311406	6311775	6311432	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	4525	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	PLEKHG6	14713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6455086	6455266	6455191	Y	ZNF384,ZNF384,VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	5806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6525626	6525956	6525791	Y	NA	LTBR,SCNN1A,RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL	TNFRSF1A,PLEKHG6,SCNN1A,TAPBPL,VAMP1,LOC678655,CD27,IFFO1,GAPDH	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-102E24.9	19708	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	10117700	10117916	10117803	Y	CLEC2B,OLR1,CLEC7A,CLEC12A	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	96965	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	10306018	10306454	10306037	Y	NA	OLR1	NA	NA	NA	NA	OLR1	16283	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	11867581	11867722	11867638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	66793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	11902953	11903896	11903427	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	102165	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	11951921	11952163	11952067	Y	ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	151133	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	11976145	11976420	11976223	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	175357	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	11983185	11983541	11983219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	182397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	11989252	11989963	11989497	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	188464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	12038206	12038369	12038301	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	237418	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	12592534	12593034	12592768	Y	BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	84521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	12654210	12654272	12654270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP16	59045	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	12663035	12663537	12663259	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	49780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	12708006	12708373	12708190	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	4944	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr12	12735834	12736179	12735985	Y	NA	DUSP16,CREBL2	LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP16	22517	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.05299957117806
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	13252845	13253278	13252954	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	57627	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	13320198	13320450	13320349	Y	NA	EMP1	APOLD1,HTR7P1,EMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	27200	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	13331850	13332340	13332007	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	15310	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	13332644	13332915	13332868	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	14735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	13376628	13377027	13376828	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	14426552	14426694	14426609	Y	PLBD1,ATF7IP	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP	89916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	15951437	15951560	15951539	Y	NA	NA	EPS8,PTPRO	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPS8	81703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	492147	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	19635536	19635865	19635672	Y	NA	EEF1A1P4,RP11-841C19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-841C19.1	23973	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	21162401	21162431	21162416	Y	SLCO1B3,SLCO1B1,LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	426118	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	22654594	22654831	22654713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	121178	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	27332593	27333057	27332936	Y	STK38L	NA	STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	61844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr12	27497251	27497478	27497364	Y	MED21,ARNTL2	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	13464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	27557115	27557162	27557139	Y	C12orf71,KLHDC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	73328	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	29581721	29581917	29581813	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	49599	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B	70000	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	32688261	32688652	32688566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	141482	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	42598855	42599145	42599001	Y	YAF2,YAF2,YAF2	YAF2,PPHLN1	NA	NA	NA	NA	YAF2	31006	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	42958967	42958984	42958976	Y	NA	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	23173	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	44386878	44387178	44387042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	159108	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	45638356	45638816	45638511	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	30532	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46804431	46804731	46804468	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	28969	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	46867492	46867759	46867536	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	92030	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	46886273	46886657	46886465	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	110811	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46953166	46953383	46953275	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	177704	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	46956686	46956942	46956800	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	181224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	47044408	47044812	47044711	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	268946	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	280057	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr12	47606052	47606349	47606300	Y	FAM113B	PCED1B-AS1	NA	NA	NA	NA	PCED1B-AS1	1890	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	PCED1B-AS1	NA	NA	NA	NA	PCED1B-AS1	3966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	47661403	47661671	47661594	Y	NA	NA	FAM113B,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	PCED1B-AS1	53164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	47671815	47672221	47672059	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCED1B-AS1	63576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	PCED1B-AS1	93229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	47749691	47750629	47750307	Y	NA	NA	FAM113B,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	PCED1B-AS1	141452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	48261486	48261659	48261573	Y	NA	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	36571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	59919	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	51035200	51035582	51035391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	119911	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr12	51534048	51534251	51534150	Y	POU6F1	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	30675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	52457778	52458372	52458110	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	2658	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52540237	52540565	52540533	Y	NA	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	43219	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.23371355059095
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52583620	52584080	52583828	Y	NA	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52588132	52588259	52588205	Y	FIGNL2,GRASP,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	4348	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52609215	52609817	52609526	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	14487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52624687	52625139	52624914	Y	KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	383	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	49739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.27107096911935
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	NA	KRT7	50351	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.23371355059095
chr12	52890343	52890794	52890475	Y	C12orf44,KRT7,KRT18,KRT18,KRT6A,KRT5	KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT6A	5302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52915277	52915747	52915499	Y	C12orf44	KRT6C,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	2806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	52916140	52916794	52916224	Y	KRT76,KRT1,KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	3669	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	53359181	53359363	53359294	Y	PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	17443	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	53627985	53628353	53628269	Y	NA	RARG,MFSD5,ESPL1	MFSD5	K562	ChIA-PET	22265404	RARG	3221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC6,HOXC9,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC9	5228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	RP11-834C11.4,SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	56238868	56238998	56238933	Y	IL23A,ZC3H10,MMP19	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	DNAJC14	16260	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	56690284	56690436	56690361	Y	NA	ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,CNPY2,PAN2	NA	NA	NA	NA	RP11-977G19.11	1490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	56752579	56752932	56752841	Y	ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A	CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	STAT2	640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	10.6854984991232
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBC	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	59449084	59449472	59449406	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	136781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	60465724	60465931	60465829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A7	477876	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	62559325	62559470	62559411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	92649	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	62609319	62609899	62609601	Y	C12orf61,USP15	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	42220	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	62712963	62713140	62713056	Y	C12orf61,MON2,USP15	FAM19A2	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	42032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	62725942	62726315	62725965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	55011	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	4215	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	130442	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	111271	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	67404997	67405349	67405173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	55593	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr12	69401246	69401453	69401353	Y	RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	37896	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	70626158	70626373	70626266	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	8401	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	6495	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	13357	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	75942985	75943289	75943108	Y	NA	KRR1	OSBPL8,NAP1L1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	39569	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr12	75946648	75946656	75946652	Y	NA	KRR1	OSBPL8,NAP1L1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	43232	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr12	75955852	75956146	75955999	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	52436	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	75983166	75983173	75983170	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	79750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr12	75986624	75986957	75986791	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	83208	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr12	76034915	76034997	76034960	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	131499	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	76052717	76052819	76052768	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	149301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	76053870	76054229	76054024	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	150454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76060831	76060974	76060901	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	157415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76061758	76061867	76061813	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	158342	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76104986	76105336	76105144	Y	NA	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRR1	201570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76114737	76114966	76114777	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	211321	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	278360	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	81699995	81700341	81700187	Y	PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	902221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	86051841	86052071	86051956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF9	176277	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	89632867	89633143	89633005	Y	NA	NA	POC1B,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	111905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	90065963	90066366	90066126	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	34711	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	120294	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	95012768	95013068	95012914	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	29270	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	95040140	95040532	95040337	Y	NA	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	1806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	95477787	95477978	95477880	Y	NA	NR2C1	NR2C1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR2C1	12308	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	95508307	95508578	95508443	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	42828	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	96027120	96027372	96027186	Y	LTA4H	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	USP44	83854	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	USP44	104726	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	96659033	96659395	96659303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	72873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	102009746	102010171	102009968	Y	MYBPC1	NA	NA	NA	NA	NA	CHPT1	78554	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	102186333	102186570	102186556	Y	NA	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	36146	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	105062941	105063154	105062961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	215868	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	106980117	106980333	106980234	Y	RIC8B,RFX4,RFX4,RFX4	NA	NA	NA	NA	NA	RIC8B	186040	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	108699402	108699607	108699511	Y	CORO1C,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	FICD	207355	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	108700100	108700298	108700252	Y	CORO1C,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	FICD	206664	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	110265870	110266305	110266084	Y	GIT2,ANKRD13A	TRPV4,GLTP	NA	NA	NA	NA	TRPV4	2907	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	110567516	110567657	110567554	Y	NA	IFT81	NA	NA	NA	NA	IFT81	7376	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	110633503	110633688	110633596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	73363	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	110682622	110683080	110682796	Y	ATP2A2	ATP2A2	ATP2A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2A2	33481	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	110704832	110705217	110705054	Y	PPTC7	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	11344	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	110931784	110931990	110931887	Y	NA	ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29	NA	NA	NA	NA	VPS29	5932	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	111015565	111016027	111015682	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	3098	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	111867956	111868269	111868101	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26204	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	111881338	111881509	111881420	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	39586	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	113417741	113417850	113417751	Y	NA	OAS3,OAS2	NA	NA	NA	NA	OAS2	3541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	113670739	113671157	113670856	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	13840	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	769522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	116308098	116308555	116308414	Y	NA	NA	RBM19,TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	404588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	120153680	120153798	120153737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	50122	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	120665661	120665757	120665705	Y	ACADS	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	28567	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	121497390	121497638	121497514	Y	OASL	C12orf43,OASL	SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	OASL	22345	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	121888305	121888670	121888535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF34	52461	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	122227826	122228273	122227974	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11036	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	12.8662124785361
chr12	122952702	122952803	122952758	Y	CLIP1,HCAR1	CLIP1,ZCCHC8	LOC100507066,CLIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC8	30715	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	123377732	123378127	123378026	Y	NA	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr12	124917398	124917599	124917459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	132536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	124926476	124926613	124926576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	46301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	125052829	125053041	125052928	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	2694	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	60743	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr12	125117895	125118180	125118038	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	67760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	130624608	130625033	130624823	Y	RIMBP2	FZD10-AS1,FZD10	NA	NA	NA	NA	FZD10-AS1	19768	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	131272601	131272867	131272734	Y	NA	STX2	NA	NA	NA	NA	STX2	48944	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	266536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	132349078	132349283	132349182	Y	NA	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	27913	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	132663524	132663727	132663659	Y	SFSWAP,EP400,FBRSL1	DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2	NA	NA	NA	NA	RP13-977J11.2	8513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	FBRSL1	93900	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	33720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	20546038	20546426	20546233	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	15228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	71493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	62937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	24701250	24701640	24701393	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	239692	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	27728821	27729155	27728988	Y	USP12	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	14878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	27843033	27843378	27843206	Y	NA	RPL21,SNORD102,RASL11A	NA	NA	NA	NA	RASL11A	569	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	31946752	31947136	31946962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	174679	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	32688606	32688996	32688801	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	85169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	33788488	33788595	33788542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	134172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	36630888	36631287	36631099	Y	DCLK1	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC169	238690	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	37611695	37611945	37611820	Y	NA	EXOSC8,ALG5	NA	NA	NA	NA	ALG5	39297	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	41438468	41438699	41438507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	55211	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	41586512	41586699	41586606	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	46711	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	41624170	41624528	41624466	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90	Hi-C	24141950	WBP4	8882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	42219317	42219744	42219583	Y	NAA16,C13orf15	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	335976	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	473361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	42397573	42397928	42397750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	446361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	44765408	44765809	44765737	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,LINC00284	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	179992	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	44845135	44845603	44845341	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	100198	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	44846792	44847050	44846982	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	98751	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	96928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	69999	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	64710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.48914236706064
chr13	44884974	44885381	44885134	Y	CCDC122,TSC22D1	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	60420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	58402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	44978399	44978598	44978577	Y	NA	SERP2	NA	NA	NA	NA	SERP2	32598	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	46926941	46927231	46927095	Y	LCP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRCH1	198072	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	49288768	49288781	49288774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	183399	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	49615947	49616340	49616144	Y	SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	67899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	49688107	49688286	49688182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	131761	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	50094191	50094472	50094332	Y	CAB39L,SETDB2,PHF11,PHF11	PHF11	NA	NA	NA	NA	PHF11	26445	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	50671086	50671325	50671206	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	16779	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	50796509	50797212	50796853	Y	NA	NA	DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	DLEU2	98653	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	51466138	51466579	51466443	Y	RNASEH2B	RNASEH2B,RNASEH2B-AS1	DLEU2,GUCY1B2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	15235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	52218212	52218391	52218309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	61568	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	53028749	53028807	53028779	Y	NA	VPS36,CKAP2	NA	NA	NA	NA	CKAP2	1185	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	53765519	53765549	53765534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	540675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	53814883	53815070	53814977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	590039	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	60723538	60723946	60723707	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	12175	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	73942793	73943059	73942972	Y	KLF5	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	179128	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	74340193	74340396	74340347	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	365998	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	76269053	76269192	76269124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	76483	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr13	76289938	76289995	76289967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	97368	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	76336754	76337033	76336914	Y	COMMD6,LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	144184	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	77899332	77899971	77899636	Y	KCTD12,FBXL3,MYCBP2	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	147	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	78114380	78114627	78114504	Y	NA	SCEL	NA	NA	NA	NA	SCEL	6571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	78158324	78158538	78158433	Y	MYCBP2,SLAIN1,SLAIN1,EDNRB,EDNRB	NA	NA	NA	NA	NA	SCEL	50515	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	80324347	80324731	80324539	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP2	271060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	93001340	93001722	93001531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	291243	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	95749553	95749872	95749713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	201815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	96498991	96499334	96499248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	171598	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	96517437	96517518	96517478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	186218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	99123285	99123381	99123333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	104813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	99128143	99128552	99128498	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99642	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	99130571	99130717	99130631	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	97477	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	99302784	99302934	99302858	Y	SLC15A1	CALM2P4	FARP1,STK24,SLC15A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALM2P4	11291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	99931812	99933023	99932107	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	80784	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	99933141	99933542	99933359	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	82113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	100010340	100010660	100010510	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	141011	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	100318044	100318289	100318076	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	61125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	100381217	100381321	100381285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	124298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	101310141	101310446	101310274	Y	TMTC4	TMTC4	NA	NA	NA	NA	TMTC4	14901	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	107124360	107124455	107124408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	94057	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	107160222	107160504	107160362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	58008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	107225813	107226005	107225909	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	7301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	107448247	107448283	107448269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	134462	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	628940	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	627878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	110401088	110401398	110401243	Y	NA	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	35517	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	227615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	208817	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	111174336	111174835	111174468	Y	ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	37245	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	106764	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	113946276	113946648	113946334	Y	NA	LAMP1	LAMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LAMP1	2908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	113982391	113982456	113982424	Y	NA	LAMP1,GRTP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	32835	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	114740287	114740680	114740494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	155406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	114743258	114743566	114743511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	152520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr13	114810103	114810577	114810313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	85509	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr13	114906463	114906564	114906535	Y	RASA3	RASA3	RASA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RASA3	10377	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	23466095	23466339	23466236	Y	CDH24,ACIN1	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	11036	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	24058094	24058646	24058322	Y	NA	THTPA,AP1G2	NA	NA	NA	NA	AP1G2	22815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	24081623	24081972	24081673	Y	NA	AP1G2	C14orf167	IMR90	Hi-C	24141950	AP1G2	46344	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP1G2	128484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	24716186	24716316	24716212	Y	NA	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	6306	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	24743214	24743836	24743517	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1,LTB4R2,CIDEB,LTB4R	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	4269	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	24747075	24747483	24747259	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1,LTB4R2,CIDEB,LTB4R	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	8130	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	32420109	32420203	32420156	Y	NA	NA	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-187E13.2	53905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	128213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr14	32979007	32979394	32979291	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	27001	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	59844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	37317346	37317701	37317507	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	192573	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	37980657	37980979	37980818	Y	SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC6	82073	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	38054173	38054544	38054319	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	8508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	41662407	41662459	41662451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1762703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	5806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	3392	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	3612	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	22550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	52008545	52008925	52008735	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	54727	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	168413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	53361596	53362059	53361840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT2	55094	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	54902274	54902529	54902415	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	40707	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	55538737	55539349	55538846	Y	FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	22388	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	55544097	55544118	55544108	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.01564215264967
chr14	55589429	55589640	55589507	Y	NA	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	601	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	56595447	56595666	56595543	Y	NA	PELI2	NA	NA	NA	NA	PELI2	12915	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	57424216	57424296	57424257	Y	OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	309430	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	59221069	59221139	59221083	Y	NA	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	38233	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.27107096911935
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	61547219	61547605	61547412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	101143	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	61801031	61801197	61801068	Y	NA	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	13495	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	61801818	61802258	61801925	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	14282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	61802565	61803086	61802823	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	15029	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	61808896	61809049	61808907	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	21360	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	61926511	61926958	61926677	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	138975	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	61978357	61978646	61978426	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	61993253	61993443	61993274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	166788	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	63159002	63159168	63159087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	848924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	64403874	64404095	64403883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	86191	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	64912318	64912487	64912430	Y	ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5	AKAP5	NA	NA	NA	NA	AKAP5	17730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	65140427	65140812	65140646	Y	SYNE2,ZBTB1,PLEKHG3,MAX,CHURC1	PLEKHG3	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG3	28008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	65147051	65147198	65147125	Y	NA	PLEKHG3	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG3	21622	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	65175295	65175757	65175503	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	6475	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	65189669	65189936	65189737	Y	ZBTB25,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	20849	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	65224783	65224915	65224850	Y	ZBTB1,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	55963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	65469693	65469823	65469758	Y	NA	RAB15	NA	NA	NA	NA	RAB15	32199	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	66856568	66856818	66856763	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	115307	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	67998625	67999040	67998762	Y	NA	PLEKHH1,TMEM229B	NA	NA	NA	NA	TMEM229B	169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11,RDH12	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	68835621	68835756	68835701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	51157	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	79261	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	78448	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	69361596	69361764	69361692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	82393	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	69404659	69405002	69404945	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	39155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	69533449	69533600	69533523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF5	84267	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	145817	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	147136	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	RP6-65G23.1	NA	NA	NA	NA	RP6-65G23.1	1119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	71249264	71249522	71249393	Y	NA	MAP3K9,RP6-65G23.3	NA	NA	NA	NA	MAP3K9	24729	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	73026467	73026767	73026635	Y	DPF3	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	332042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	15584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	74210197	74210586	74210513	Y	ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	12864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	74220862	74221204	74221002	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	2246	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	74615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	75447372	75447747	75447564	Y	NA	PGF,EIF2B2	MLH3,ZC2HC1C,NEK9,PGF,EIF2B2,ACYP1,RPS6KL1,DLST	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF2B2	19867	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	76243945	76244101	76244023	Y	TGFB3	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf1	118413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	77425025	77425260	77425132	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1044	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	TMEM63C	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63C	26014	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	77826239	77826291	77826265	Y	NA	GSTZ1,POMT2,SAMD15,TMED8	NA	NA	NA	NA	SAMD15	14741	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	80156436	80156705	80156544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	695395	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr14	81713528	81713897	81713622	Y	NA	GTF2A1,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1P1	2621	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	81867886	81868104	81867969	Y	GTF2A1,GTF2A1	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	32705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	85869762	85869890	85869826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2341M24.1	529164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	311674	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	89772713	89772723	89772718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	310770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	90910680	90911014	90910847	Y	NA	CALM1	CALM1,TTC7B	MCF7	ChIA-PET	22265404	CALM1	49834	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	112929	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	91556459	91556738	91556599	Y	NA	RPS6KA5	RPS6KA5,CCDC88C	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KA5	31479	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	91863961	91864070	91864025	Y	C14orf159,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	18118	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	93114264	93114489	93114415	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	98558	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	95779970	95780439	95780333	Y	DICER1,CLMN	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	3804	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	97647218	97647514	97647331	Y	NA	NA	C14orf177	IMR90	Hi-C	24141950	VRK1	385577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	3288	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	100504494	100504745	100504607	Y	NA	NA	EVL,DEGS2,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	YY1	197890	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	100874667	100875097	100874987	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	RP11-638I2.10,WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	3731	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	12951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	101020509	101020866	101020628	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	30884	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	28188	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	101024059	101024421	101024266	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	27329	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	101029795	101030067	101029931	Y	NA	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	21683	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEG3	83877	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	6569	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	102429527	102429743	102429691	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	102971480	102971658	102971568	Y	NA	ANKRD9	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	2478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANKRD9	19708	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	103112299	103112666	103112355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCOR1	55301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	103537585	103537989	103537775	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	15786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TNFAIP2	29772	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	103672309	103672597	103672449	Y	EXOC3L4	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	17.0095690394206
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	105191285	105191466	105191451	Y	NA	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	2762	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	105198821	105199110	105199005	Y	C14orf180,ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	10298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	105546439	105546836	105546640	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	60954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	22938552	22938923	22938737	Y	CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	48547	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OCA2	1009150	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	28339947	28339987	28339948	Y	NA	OCA2	NA	NA	NA	NA	OCA2	2517	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	31598782	31598890	31598869	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	18168	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	31627410	31627711	31627458	Y	NA	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	10352	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	31733081	31733438	31733352	Y	MTMR10,KLF13	NA	KLF13,OTUD7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF13	116023	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	33165962	33166239	33166177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	260617	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	33603911	33604068	33604029	Y	FMN1,RYR3	RYR3	NA	NA	NA	NA	RYR3	2748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	337585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	37249666	37249815	37249741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	379854	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39110575	39110868	39110718	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	254799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39447330	39447720	39447666	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	269676	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39484062	39484453	39484282	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1,C15orf53	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	232943	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39559141	39559459	39559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L4.1	157937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39684245	39684484	39684421	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	32912	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39696909	39697463	39697288	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,C15orf53	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	19933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	14904	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	39803650	39803776	39803696	Y	THBS1	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	67504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK4	31263	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	40463815	40464014	40463832	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	12591	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	41158071	41158384	41158228	Y	RHOV	SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	6103	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	41456018	41456111	41456065	Y	NA	INO80	NA	NA	NA	NA	INO80	49466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	42226984	42227301	42227216	Y	LTK,MGA,JMJD7,VPS39,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	35475	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	8120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	9844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr15	45929603	45930187	45929917	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	8257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	48785600	48785984	48785868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	150062	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	49598906	49599159	49599033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS2	153048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	50890405	50890451	50890426	Y	USP8,SPPL2A,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	86561	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	51173397	51173629	51173520	Y	USP8,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	51177416	51177715	51177636	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP4E1	21154	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	51382019	51382273	51382147	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	13200	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	51455036	51455205	51455156	Y	NA	NA	GLDN,TNFAIP8L3,CYP19A1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP8L3	59563	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	164608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52369278	52369628	52369325	Y	MAPK6	CTD-2184D3.1,BCL2L10	GNB5,BCL2L10,MYO5C	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2184D3.1	15864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	CTD-2184D3.1,BCL2L10	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	274	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	52395777	52396019	52395882	Y	DMXL2,TMOD3,MAPK6	CTD-2184D3.1,BCL2L10	NA	NA	NA	NA	BCL2L10	6953	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52402379	52402574	52402478	Y	BCL2L10	CTD-2184D3.1,BCL2L10	NA	NA	NA	NA	BCL2L10	398	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	52684587	52684775	52684686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5C	98592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52777453	52777711	52777581	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	41536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	52851602	52851989	52851853	Y	NA	MYO5A,ARPP19	NA	NA	NA	NA	ARPP19	8091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	55514866	55515077	55514981	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	27601	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	56330366	56330465	56330418	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	46422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	56331775	56332089	56331933	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	47831	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	56341448	56341541	56341527	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4	57504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	56475850	56476168	56476009	Y	MNS1	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	57315	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	56717939	56718122	56718071	Y	RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9	MNS1	NA	NA	NA	NA	MNS1	37213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	58732356	58732646	58732550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	307531	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr15	59469464	59469853	59469728	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74187	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59530226	59530327	59530289	Y	BNIP2,ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	132565	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	75499	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59642348	59642705	59642508	Y	BNIP2,RNF111	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	20187	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	59646649	59647004	59646975	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	15888	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59649595	59649770	59649683	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	13122	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59848106	59848258	59848124	Y	GCNT3	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2A2	99482	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	59862569	59862935	59862765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2A2	84805	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	60835043	60835413	60835301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	65666	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	60836612	60836644	60836628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	67235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	62405210	62405473	62405223	Y	NA	C2CD4A	NA	NA	NA	NA	C2CD4A	48034	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	63484209	63484716	63484320	Y	LACTB,USP3,RAB8B	RPS27L,RAB8B	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	4541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	63803463	63803731	63803481	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	8670	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	64060591	64060833	64060743	Y	USP3,HERC1,DAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	63308	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	64231829	64232283	64232065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	107688	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	64991554	64991938	64991797	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	1542	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	65054489	65054592	65054541	Y	NA	RBPMS2	NA	NA	NA	NA	RBPMS2	11194	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr15	65403116	65403434	65403296	Y	ANKDD1A,PDCD7	PDCD7	UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD7	20740	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67378105	67378547	67378289	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	24004	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	59235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	67468171	67468380	67468281	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	76758	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	28273	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	67533518	67533775	67533647	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	11363	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	67732554	67732598	67732576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	78808	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	68078361	68078371	68078366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	245314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	68579972	68580192	68580087	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	11831	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	68852393	68852527	68852460	Y	CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	16781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	70787270	70787553	70787302	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	266379	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	71008529	71008840	71008773	Y	NA	UACA	NA	NA	NA	NA	UACA	45092	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	72003894	72004173	72003980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	400426	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	72383313	72383702	72383619	Y	CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	SENP8	20897	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	72448533	72448632	72448574	Y	TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A,GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	39494	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	74283683	74283945	74283706	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	1018	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	74943465	74943852	74943659	Y	NA	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	42781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	75338663	75338960	75338803	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24767	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	75939210	75939595	75939262	Y	NA	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	163	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	76218014	76218024	76218019	Y	NA	FBXO22	NA	NA	NA	NA	FBXO22	23814	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	76819835	76820201	76820099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISL2	192770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	NA	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ADAMTS7	50735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	79381600	79382164	79381699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSH	141684	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	79973105	79973417	79973260	Y	NA	NA	TMED3,KIAA1024	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFS	214304	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	80275870	80275883	80275877	Y	ST20	BCL2A1	MTHFS,ST20-MTHFS,C15orf37,BCL2A1,ZFAND6,FAH	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2A1	14082	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	186521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr15	81069569	81069760	81069666	Y	MESDC1,KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	81099060	81099288	81099113	Y	NA	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	29376	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	81207632	81207924	81207778	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	72295	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	82274392	82274506	82274449	Y	FAM154B	NA	MEX3B	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	61976	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	83500589	83500717	83500653	Y	NA	WHAMM	NA	NA	NA	NA	WHAMM	24209	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	83603228	83603538	83603384	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	49123	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	83605762	83605980	83605871	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	46681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	65397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	85662697	85662918	85662803	Y	PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	141026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	85861581	85861931	85861753	Y	PDE8A,AKAP13	NA	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	59871	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	85886798	85887001	85886900	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	34801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	85887676	85888027	85887852	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	33775	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	85951741	85952026	85951782	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13,CTD-2262B20.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2262B20.1	4433	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	CTD-2262B20.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2262B20.1	30589	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	86020857	86021180	86020870	Y	KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2262B20.1	64398	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	86165783	86166027	86165915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	170234	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	86337060	86337529	86337372	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	86846270	86846590	86846430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	510009	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	89027924	89028249	89027989	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	19240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	89648424	89648609	89648517	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	19734	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	89923171	89923194	89923182	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	47079	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	90017364	90017928	90017702	Y	MESP1,C15orf42	RHCG	NA	NA	NA	NA	RHCG	19916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90241907	90242276	90242092	Y	NA	KIF7,PEX11A,WDR93	NA	NA	NA	NA	WDR93	9879	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90325168	90325324	90325249	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP	MESP1	NA	NA	NA	NA	MESP1	32627	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90436374	90436604	90436501	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	800	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	90547918	90548344	90548145	Y	NA	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	5294	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	90608117	90608795	90608159	Y	ANPEP,ZNF710,IQGAP1,CIB1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	34941	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90641433	90641611	90641526	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	2125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	91107423	91107655	91107549	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	36266	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	92400491	92400865	92400640	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	5566	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	92464513	92465010	92464828	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	69588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	92491090	92491332	92491214	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96165	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	5626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr15	93864881	93865242	93865107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	440355	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	94815502	94815543	94815523	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	42735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	94830973	94831315	94831184	Y	MCTP2	NA	MCTP2,NMUR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	MCTP2	58206	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	94850045	94850297	94850155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	77278	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	94868456	94868585	94868521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	95689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	97731038	97731056	97731047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	729728	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	98400609	98400736	98400673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	60048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	98545444	98546413	98546248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	84660	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	98698078	98698430	98698265	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	237294	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	98957223	98957617	98957414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	232583	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr15	99223373	99223476	99223421	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	33173	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr15	99289288	99289563	99289444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	99088	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99318481	99318879	99318554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	128281	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99358585	99358846	99358731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	168385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99366453	99366700	99366460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	176253	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99387614	99387887	99387660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	197414	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99410702	99410893	99410822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	220502	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99411740	99412504	99411960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	221540	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	191210	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr15	99450086	99450215	99450157	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	186205	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	99489789	99490246	99490040	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	146174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99499686	99499980	99499831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	136440	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99559007	99559192	99559062	Y	NA	NA	PGPEP1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYNM	77228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr15	99973623	99973819	99973721	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	41551	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	100914283	100914527	100914405	Y	ADAMTS17	ADAMTS17	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	34073	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr15	101102236	101102405	101102321	Y	NA	CERS3,ASB7,LINS	NA	NA	NA	NA	CERS3	19036	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	101261253	101261648	101261594	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	119818	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	101481026	101481320	101481182	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	23606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	101733484	101734132	101733815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	56005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	101807515	101807673	101807594	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	17378	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr15	101986303	101986813	101986523	Y	CHSY1,TM2D3	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	76592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	658205	658397	658303	Y	NA	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	20848	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr16	809662	809847	809755	Y	MSLN,MSLN,MSLN	METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1,GNG13	NA	NA	NA	NA	MSLN	900	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1,GNG13	NA	NA	NA	NA	GNG13	10100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	1210403	1210717	1210625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	142831	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	4456	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	10596760	10596940	10596850	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	75615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	10956294	10956664	10956435	Y	NUBP1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	12391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	11155783	11156117	11155981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	119438	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	11633611	11633797	11633714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	94440	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	11666045	11666804	11666319	Y	ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	61433	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	11670817	11671132	11670939	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	57105	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	11776552	11776999	11776845	Y	SOCS1,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	NA	NA	NA	NA	SNN	16282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	12049208	12049600	12049404	Y	NA	GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166B2.1	18900	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	12647143	12647394	12647326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX29	578549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	14050567	14050869	14050623	Y	MKL2	ERCC4	NA	NA	NA	NA	ERCC4	38553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	15140552	15140757	15140655	Y	NA	NTAN1	NA	NA	NA	NA	NTAN1	7164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	15801967	15802265	15802154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDE1	66843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	18056917	18057039	18056979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	742666	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	19221625	19221975	19221736	Y	SMG1,COQ7	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	44332	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	20266869	20267021	20266960	Y	NA	NA	GP2,UMOD	IMR90	Hi-C	24141950	THUMPD1	484385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	20863043	20863195	20863109	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	45995	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	22201170	22202123	22201439	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13480	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	CDR2	NA	NA	NA	NA	CDR2	24595	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	27242037	27242327	27242262	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	35788	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	27254406	27254878	27254778	Y	IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	23237	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	27299134	27299462	27299399	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	21019	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	27763534	27763923	27763729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	204080	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	28103790	28104177	28103984	Y	APOBR,XPO6,SBK1	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	117064	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	30458943	30459145	30459094	Y	SEPHS2	ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SEPHS2	3441	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	47208056	47208220	47208138	Y	NA	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	32148	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	47526942	47527306	47527022	Y	PHKB	PHKB,ITFG1	NA	NA	NA	NA	ITFG1	30882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	48645394	48646040	48645807	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	6019	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	50127559	50128142	50127811	Y	TMEM188,ADCY7	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	29707	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	50729249	50729875	50729684	Y	ADCY7,SNX20,NOD2,CYLD,CYLD	NOD2,CYLD	NA	NA	NA	NA	NOD2	3735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	50774747	50775040	50774945	Y	ADCY7,SNX20,NOD2,CYLD,CYLD	NOD2,CYLD	NA	NA	NA	NA	CYLD	786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	53114402	53114975	53114686	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	27457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	53134908	53135206	53135001	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	47963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	53810167	53810347	53810243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	74292	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	53915459	53915524	53915492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	179584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	54114585	54114959	54114772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	203716	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	54128589	54128847	54128718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	189828	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	56640479	56640669	56640573	Y	NA	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	368	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	GPR56,GPR97	NA	NA	NA	NA	GPR56	12303	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56,GPR97	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56,GPR97	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	57825127	57825454	57825291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	57485	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	66659405	66659873	66659770	Y	NA	CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	23628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr16	67345616	67346198	67345888	Y	RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4	PLEKHG4	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4	36203	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT7	72504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	68778758	68779020	68778839	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	9630	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	68794775	68795028	68794920	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	25647	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr16	68824913	68825217	68824976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH1	55785	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr16	69796957	69797361	69797156	Y	EXOSC6,WWP2	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	70712649	70712861	70712739	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	5108	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	70783169	70783447	70783290	Y	NA	VAC14	NA	NA	NA	NA	VAC14	49617	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	70980057	70980287	70980181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	146993	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	334538	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	73023566	73023933	73023728	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67664	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr16	73158236	73158440	73158308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	66639	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	74356396	74356719	74356558	Y	NA	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	27723	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	78325751	78325980	78325865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	194441	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	78830248	78830546	78830432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	698938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	79674460	79674887	79674671	Y	NA	MAF	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	41849	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	79692252	79692530	79692298	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	59641	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	80786602	80786755	80786668	Y	DYNLRB2,C16orf46	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	49471	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81434776	81434850	81434813	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	41925	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81503648	81503971	81503709	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	26873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr16	81585142	81585379	81585273	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	108367	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81617620	81618040	81617835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	140845	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81659418	81659741	81659491	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110961	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81842710	81842821	81842738	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	72008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81856913	81857368	81857087	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	86211	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	81979414	81979574	81979494	Y	CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	SDR42E1	63519	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	459695	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	484820	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85185210	85185759	85185517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	125835	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85346294	85346686	85346622	Y	FAM92B	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	286919	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85395325	85395548	85395434	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	326131	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85522483	85522579	85522531	Y	NA	NA	KIAA0182,FAM92B,KIAA0513,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	199100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85726494	85726553	85726524	Y	NA	GINS2	NA	NA	NA	NA	GINS2	4815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	87811234	87811383	87811309	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13636	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	87823592	87823837	87823720	Y	NA	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	89047475	89047792	89047657	Y	NA	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	CBFA2T3	5863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	DBIL5P	400	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	818912	819288	819089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	61722	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	872261	872610	872409	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	8400	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	872760	873162	873150	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	7848	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	873777	873849	873813	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	7161	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	881410	881576	881449	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	400	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	1094047	1094290	1094169	Y	SLC43A2,PITPNA	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	36025	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	1157102	1157245	1157179	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	26787	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	1986889	1987344	1987111	Y	MNT,SLC43A2,SCARF1,WDR81	OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	43562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	3706608	3706865	3706766	Y	NA	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	4071	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	3986731	3986836	3986770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZEF1	57478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4204226	4204625	4204419	Y	CAMKK1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	38952	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4297300	4297441	4297368	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29377	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4752478	4752731	4752552	Y	ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	17795	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	4756821	4757222	4756899	Y	MINK1	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	22138	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	4950916	4951277	4951137	Y	NA	ZFP3	NA	NA	NA	NA	ZFP3	28266	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	5430157	5430402	5430333	Y	NLRP1	MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	42026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	6470839	6471155	6470959	Y	PITPNM3,TXNDC17	PITPNM3	PITPNM3	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM3	13025	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	6771162	6771276	6771219	Y	NA	ALOX12P2	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	15982	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	6818045	6818590	6818345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	62865	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	66220	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	6822879	6823265	6823073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67699	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	6829288	6829561	6829425	Y	SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12P2	74108	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	6829755	6829811	6829784	Y	NA	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12P2	74575	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	6851869	6852198	6852047	Y	XAF1,GABARAP,RNASEK	NA	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	61470	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	8315497	8315747	8315606	Y	PIK3R6,CNTROB,PER1,C17orf59,NDEL1	KRBA2,RPL26,NDEL1	NDEL1,CCDC42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDEL1	1048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	8321205	8321455	8321300	Y	PIK3R5,PER1,VAMP2,C17orf59,CTC1,NDEL1	KRBA2,RPL26,NDEL1	CCDC42,RPL26,RNF222	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDEL1	6756	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	8436852	8437236	8437053	Y	MYH10	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	94843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	8824079	8824459	8824269	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	292000	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	9133558	9133821	9133662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	344087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	15869590	15869983	15869922	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	23359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	16922074	16922240	16922157	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	21619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	17420385	17420786	17420623	Y	NA	MED9,RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	22676	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	17439265	17439511	17439439	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	41556	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	17851403	17851564	17851499	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	22172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	17862888	17863023	17862956	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	10713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	18242712	18242812	18242762	Y	FBXW10,SHMT1	TOP3A,SMCR8,SHMT1,EVPLL	NA	NA	NA	NA	SHMT1	22044	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	19627830	19628049	19627942	Y	MAPK7,MAPK7	SLC47A2,ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	SLC47A2	7538	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	SLC47A2,ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	20755696	20755942	20755820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCDP1	69738	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	11.5577840908884
chr17	25856308	25856397	25856353	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	74638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	26712546	26712820	26712749	Y	NA	POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	VTN	14436	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	27367295	27367696	27367449	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	PHF12	90506	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	28049478	28050072	28049903	Y	NUFIP2,TAOK1,SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	101553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	28070496	28070746	28070685	Y	SSH2,EFCAB5	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	122571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	30907001	30907345	30907172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	95364	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	33407531	33407770	33407731	Y	NA	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	6568	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	33841707	33842053	33841976	Y	SLFN5,SLFN12L,CCL5	NA	UNC45B,SLFN13	IMR90	Hi-C	24141950	AP2B1	61012	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34887	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	33923571	33923796	33923685	Y	NA	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	PEX12	19689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	38467869	38468243	38468028	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	4425	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	38602883	38603101	38603015	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	5181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	38648531	38648872	38648707	Y	KRT10,MSL1,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	6977	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	51646	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	39010500	39010808	39010654	Y	NA	TMEM99,KRT10	NA	NA	NA	NA	KRT10	33653	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	39110175	39110404	39110304	Y	KRTAP3-2	KRT23	NA	NA	NA	NA	KRT23	18289	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	3372	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	39662733	39662908	39662821	Y	JUP,KRTAP3-1,KRT9,KRT36,KRT13,KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	2776	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	7487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19,KRT9	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	KRT9,KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT9	9582	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	39782029	39782271	39782148	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT17	2935	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	40418689	40419364	40419075	Y	EZH1,KLHL11,DNAJC7,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,RAB5C,STAT3,STAT3,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	GHDC,HCRT,KCNH4,RAB5C	IMR90	Hi-C	24141950	STAT5B	7361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	40671173	40671319	40671240	Y	PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	14871	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	41409196	41409569	41409556	Y	TMEM106A	TMEM106A	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM106A	47342	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	41500242	41500532	41500387	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	25915	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	42100535	42100831	42100709	Y	NA	NAGS,TMEM101,LSM12,G6PC3	NA	NA	NA	NA	TMEM101	1221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.48914236706064
chr17	42278333	42278607	42278473	Y	ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	2852	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	185731	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1,TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	37143	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP6,SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	46708678	46709096	46708978	Y	NA	HOXB6,HOXB8,RP11-357H14.17	HOXB8,HOXB9	IMR90	Hi-C	24141950	HOXB7	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	47966905	47967224	47967101	Y	DLX4,DLX3,TAC4	NA	LOC284080,ITGA3,SPOP,NXPH3,SLC35B1,DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX4,PDK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLX4	77110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48066634	48067004	48066930	Y	NA	DLX4,DLX3	NA	NA	NA	NA	DLX3	3584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48136569	48136863	48136794	Y	NA	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	5237	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	48206052	48206167	48206088	Y	NA	PDK2,SAMD14,PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	SAMD14	806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48208282	48208563	48208423	Y	NA	PDK2,SAMD14,PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	SAMD14	3036	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	SGCA	15813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	48981540	48981884	48981711	Y	RSAD1	TOB1,RP11-700H6.1	TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-700H6.1	38190	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	11564	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	53510591	53510934	53510743	Y	NA	MMD	MMD,TMEM100,PCTP	IMR90	Hi-C	24141950	MMD	13238	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	55517850	55518075	55517943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	186638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	55681566	55681740	55681592	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	243677	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	56391648	56391970	56391957	Y	NA	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	36484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P,RNU1-108P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	56705180	56705300	56705276	Y	NA	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4	K562	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	29366	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	56744054	56744558	56744332	Y	SUPT4H1	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	NA	NA	NA	NA	RNU1-108P	1996	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	59491856	59491969	59491928	Y	NA	TBX2,C17orf82,TBX4	NA	NA	NA	NA	C17orf82	4744	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	59780215	59780354	59780263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	113652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	77662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	153511	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	60868052	60868313	60868162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	60954347	60954674	60954509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	251585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	61282907	61283291	61283099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	238448	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	61796482	61796787	61796636	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	19950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	62004883	62005036	62004961	Y	CD79B	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf72	68675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	64695504	64695853	64695677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	263173	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	64947420	64948018	64947947	Y	NA	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	11008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	64959449	64959766	64959607	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	423	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	64963064	64963179	64963122	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	4038	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	65619223	65619512	65619368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOL11	92437	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	65897183	65897370	65897273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPTF	77543	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	ARSG	69641	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	66348483	66348670	66348577	Y	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	NA	ARSG	95160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20A	98800	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	70462396	70462597	70462589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158773	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	70484276	70484648	70484400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	136722	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	70499253	70499546	70499535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	121824	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	70511484	70511781	70511663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	109589	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	85009	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	91038	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	71064440	71064923	71064668	Y	CPSF4L	SLC39A11	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	21928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	CD300C	NA	NA	NA	NA	CD300C	25122	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	73291742	73292218	73291951	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	8151	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	73337527	73337917	73337722	Y	NA	AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	24117	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	73684314	73684419	73684412	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	23045	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	73734249	73734591	73734388	Y	GGA3,GRB2,GRB2,WBP2,UNC13D,ACOX1,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B	ITGB4,GALK1,UNK,H3F3B	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18841	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	73850621	73850811	73850693	Y	GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65	NA	NA	NA	NA	WBP2	33	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	74248222	74248574	74248373	Y	ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B	ATF4P3,RNF157	RNF157	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF157	13768	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	74481730	74482020	74481883	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	13852	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	74865730	74865894	74865782	Y	CYGB,MGAT5B	MGAT5B	NA	NA	NA	NA	MGAT5B	3192	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	75302276	75302607	75302432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	221478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	231793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	75318595	75318736	75318679	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237797	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	75883563	75884329	75884163	Y	TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6C	113920	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	8.94092731559288
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	76330688	76331173	76330803	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	22985	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	76409170	76409735	76409347	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	36449	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	77469645	77469864	77469711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX2	280067	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	77730841	77731207	77731024	Y	CBX8,CBX2	CBX2,CBX8	NA	NA	NA	NA	CBX2	18724	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	77788517	77788922	77788877	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	15035	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr17	78471918	78472124	78472096	Y	NA	NPTX1,RPL32P31,RPTOR	RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6	IMR90	Hi-C	24141950	NPTX1	22275	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	78800697	78801105	78800867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	162293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	78803936	78804105	78804080	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	159293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	78810006	78810317	78810174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	153081	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	79024187	79024380	79024262	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	17239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	79107096	79107396	79107264	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	87403	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	79228717	79229006	79228862	Y	NA	AZI1,C17orf89,SLC38A10	NA	NA	NA	NA	C17orf89	17678	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	60271	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	79925685	79926075	79926048	Y	TSPAN10	SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1	ASPSCR1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASPSCR1	6608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	80342594	80342740	80342634	Y	NA	HEXDC	NA	NA	NA	NA	HEXDC	31454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	80745153	80745621	80745526	Y	ZNF750	TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	37213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr17	80794045	80794420	80794166	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	2034	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr17	80796209	80796714	80796435	Y	METRNL,ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr17	80805995	80806457	80806155	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	9541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr17	80817904	80818262	80818042	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	21450	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	80821746	80822299	80821973	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	25292	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	80832515	80832930	80832613	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36061	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.27107096911935
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.01564215264967
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	81031472	81031760	81031658	Y	METRNL	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1	K562	ChIA-PET	22265404	METRNL	3807	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr17	81033239	81033614	81033398	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1	K562	ChIA-PET	22265404	METRNL	1953	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr17	81066773	81067186	81066924	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31206	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.27107096911935
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	8704091	8704364	8704199	Y	CCDC165	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	96648	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	8844710	8845084	8844897	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	237267	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	9612296	9612535	9612373	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	9658069	9658457	9658201	Y	PPP4R1	PPP4R1,RAB31	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	44831	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr18	10123098	10123445	10123261	Y	NAPG,RAB31,VAPA	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	211099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	11846235	11846388	11846281	Y	GNAL,GNAL	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	3007	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.83492817323677
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	19453532	19453543	19453538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	170614	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	21176326	21176498	21176427	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	11464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	21415229	21415459	21415332	Y	C18orf8,NPC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	147822	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	21552370	21552656	21552582	Y	C18orf8,TTC39C,TTC39C	TTC39C	NA	NA	NA	NA	TTC39C	18081	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.14335656088451
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	29032478	29032594	29032536	Y	NA	DSG3,DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG3	6720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	29952485	29952862	29952679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	282667	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	32436094	32436130	32436112	Y	DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	118762	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	33093148	33093751	33093628	Y	GALNT1	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	17193	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	35028363	35028565	35028479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	621205	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	45379355	45379691	45379492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	75824	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	45444466	45444807	45444662	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	10708	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	45529364	45529594	45529519	Y	NA	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	73849	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	46074456	46074621	46074556	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	11039	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	46345038	46345364	46345209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	281621	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	46481699	46482044	46481791	Y	NA	NA	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	CTIF	418282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	454769	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.66985634647353
chr18	47626417	47626670	47626561	Y	MYO5B,MBD1,MBD1	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	92793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	55710685	55710979	55710720	Y	NEDD4L	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	1086	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	55863542	55863917	55863628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	153943	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	55880754	55881007	55880894	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	55922134	55922493	55922309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	212535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	56571979	56572200	56572090	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	44147	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	57594468	57594884	57594545	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PMAIP1	29288	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	59257739	59257752	59257746	Y	NA	NA	PIGN,RNF152	IMR90	Hi-C	24141950	RPL30P14	187301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	61085026	61085396	61085214	Y	VPS4B	VPS4B	NA	NA	NA	NA	VPS4B	2320	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	66373953	66374204	66374079	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	CCDC102B	6242	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	67682034	67682164	67682099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	189017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	74088486	74089010	74088832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	116136	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr18	74277589	74278024	74277906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	72112	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	305101	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	616514	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	76498631	76498821	76498726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	328464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	76955177	76955415	76955295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	127892	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	77245359	77245518	77245445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	91503	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	77558494	77558673	77558529	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	120693	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr18	78004258	78004625	78004566	Y	PARD6G	PARD6G	NA	NA	NA	NA	PARD6G	829	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	863983	864016	863999	Y	NA	CFD,MED16,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	6530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	2489253	2489454	2489354	Y	BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	15133	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	2528875	2529093	2529033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	54755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	3154006	3154458	3154241	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	3404098	3404373	3404237	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	46537	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	3404656	3404792	3404728	Y	TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47095	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	3521162	3521389	3521298	Y	FZR1	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16891	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	3570616	3571018	3570829	Y	C19orf28,HMG20B,GIPC3	MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	PLIN5	NA	NA	NA	NA	PLIN5	33912	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	5141795	5142033	5141919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	133712	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	6273754	6274259	6273940	Y	VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	3700	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	6708735	6709024	6708902	Y	C3	C3,GPR108,TRIP10	NA	NA	NA	NA	C3	19549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr19	6801116	6801467	6801221	Y	SH2D3A,VAV1	SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	VAV1	30391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	7559450	7559827	7559455	Y	NA	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	9095662	9095964	9095813	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	5644	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	9120594	9120838	9120762	Y	MUC16	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	30576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	38916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	11044199	11044446	11044323	Y	NA	YIPF2,C19orf52,SMARCA4	NA	NA	NA	NA	C19orf52	6790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.05299957117806
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	12896870	12897372	12897198	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	2938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	13006078	13006409	13006086	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A	NA	NA	NA	NA	GCDH	6238	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	14276845	14277176	14277145	Y	NA	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	31077	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr19	15161016	15161340	15161178	Y	CASP14	CASP14	NA	NA	NA	NA	CASP14	2821	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	15944737	15944873	15944829	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	6966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	9846	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	15974006	15974442	15974280	Y	NA	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	36235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	16193841	16194249	16194048	Y	NA	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	TPM4	18010	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	18588665	18588964	18588926	Y	NA	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ISYNA1	41554	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	19574690	19574814	19574752	Y	GATAD2A,GMIP	NDUFA13	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	49731	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	28225401	28225557	28225460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1476891	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	28231226	28231711	28231495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	28234447	28234748	28234598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1467700	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	28252920	28253113	28253061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449335	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	30195599	30196138	30195979	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	8226	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	33382845	33383180	33383014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP89	77717	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	33841444	33841736	33841590	Y	NA	CEBPA,CEBPG	CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPG	20500	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr19	33963951	33964351	33964166	Y	NA	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	46349	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	34398114	34398257	34398186	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	113276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	35595565	35595951	35595710	Y	ZNF181,ZNF30	FXYD3,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	8781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	35763394	35763606	35763496	Y	U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	5513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	35927378	35927883	35927593	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,HCST,FFAR2	NA	NA	NA	NA	NA	KRTDAP	56577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINT2	157379	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	PPP1R14A,C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	39152764	39152958	39152839	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	16475	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	40969437	40969789	40969613	Y	BLVRB	SERTAD1,SERTAD3	NA	NA	NA	NA	BLVRB	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	42954515	42954747	42954627	Y	CEACAM1,LIPE	NA	CXCL17	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM1	108639	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	44165978	44166186	44166121	Y	NA	ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	PLAUR	6513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	44178452	44178782	44178557	Y	NA	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	5753	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	44283400	44283793	44283490	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	44773096	44773391	44773244	Y	LYPD5,ZNF221,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZFP112,ZNF227,ZNF233,ZNF233,ZNF235	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	33808	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45195366	45195649	45195556	Y	RELB,CLASRP,BCL3	NA	NA	NA	NA	NA	PVR	50268	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	45224647	45224919	45224783	Y	CEACAM16,CLASRP	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	24043	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45231729	45232033	45231881	Y	IGSF23,CLASRP,APOC2	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	16929	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45906934	45907335	45907067	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr19	45952039	45952594	45952534	Y	GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	16659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	OPA3,EML2,GIPR	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	59077	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	35697	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	47873037	47873766	47873365	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	DHX34	22499	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,SYNGR4,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	49430301	49430612	49430410	Y	IZUMO1,PPP1R15A,FTL	NUCB1,BAX,FTL	NA	NA	NA	NA	BAX	25460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	49486890	49487028	49486959	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	7539	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	49524183	49524468	49524237	Y	CGB5	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	29478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	49698080	49698342	49698211	Y	NA	TRPM4	NA	NA	NA	NA	TRPM4	39082	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD35A,RPS11,FCGRT	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr19	50888786	50889179	50888984	Y	ACPT,LOC342918	POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	3325	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121505	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	122043	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	1218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	55958750	55959125	55958938	Y	SYT5,BRSK1,COX6B2,FAM71E2,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ISOC2	12585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	80532	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	58217187	58217439	58217313	Y	NA	ZNF551,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF551	25850	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF776	18009	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr19	58501905	58502197	58501915	Y	ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135	ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	CTD-2368P22.1	9232	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	58911739	58912056	58911822	Y	NA	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	868	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	628526	628919	628630	Y	NA	TMEM18	FAM150B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	46520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	1590812	1591204	1590899	Y	NA	NA	PXDN,MYT1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PXDN	155420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	3280668	3280872	3280770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	98781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9920115	9920243	9920174	Y	NA	NA	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	61240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	11443913	11444199	11444137	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	42257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	15137397	15137594	15137457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	366587	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	15565715	15566065	15565846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	133389	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	15629690	15629929	15629800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	69525	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	19985229	19985530	19985434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	81091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20341243	20341467	20341355	Y	NA	NA	PUM2,WDR35,MATN3,SDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC1	81727	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20345416	20345679	20345548	Y	NA	NA	PUM2,WDR35,MATN3,SDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC1	77515	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20379968	20380084	20380011	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	43110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20407883	20408194	20408074	Y	RHOB,SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	15000	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20412281	20412403	20412381	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	20412962	20413136	20413039	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10058	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	20415166	20415327	20415249	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	7867	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20417309	20417694	20417511	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	5500	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	1527	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	20435780	20436055	20435965	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	12586	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB,AC023137.2	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20709880	20710074	20709978	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90	Hi-C	24141950	AC023137.2	61077	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89641	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	25096617	25097268	25096771	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	43440	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	25701614	25701880	25701747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	138155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113016	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	26231667	26232185	26231781	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	22791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	26521727	26522029	26521734	Y	NA	EPT1	NA	NA	NA	NA	EPT1	7386	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	28600937	28601380	28601351	Y	RBKS,BRE,BRE,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	RBKS,BRE,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,MRPL33,LOC100505716,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	11935	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	28621403	28621758	28621597	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	5864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC104695.3	43978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	29026080	29026331	29026243	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	53574	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	LBH	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	11486	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	30788063	30788262	30788163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	119971	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	139720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	37139828	37140219	37140054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	51396	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	37605671	37605839	37605750	Y	CCDC75,QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	35954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	38334903	38335105	38334999	Y	NA	NA	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP1B1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	38372999	38373624	38373225	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	37955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	38380770	38381135	38380953	Y	CDC42EP3,FAM82A1,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	45726	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	38552581	38552739	38552658	Y	NA	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	49688	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	41736624	41736708	41736667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	536452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	42328958	42329862	42329543	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	55798	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43494611	43494821	43494751	Y	NA	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	42863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43530162	43530544	43530351	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	78414	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43635676	43636063	43635871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	183928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	43705862	43706134	43705998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	115051	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	44577605	44577885	44577745	Y	NA	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	9116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	45161073	45161475	45161220	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	2863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	480	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	45881346	45881543	45881445	Y	NA	SRBD1,PRKCE	NA	NA	NA	NA	PRKCE	4862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	45974142	45974515	45974197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	97658	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	46561811	46562247	46561970	Y	SOCS5,SOCS5	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	43005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	47212823	47213029	47212897	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	45829	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	47285421	47285805	47285614	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	115935	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	47299215	47299677	47299496	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102063	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	51010628	51010803	51010737	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	2256106	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	53331505	53331666	53331586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	661263	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	55248216	55248544	55248355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	89213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	56089907	56090266	56090122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	59008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	60711222	60711498	60711369	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	67204	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr2	62422210	62422461	62422453	Y	NA	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	962	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	63287182	63287416	63287280	Y	OTX1	OTX1	NA	NA	NA	NA	OTX1	11990	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	63601034	63601048	63601041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	212695	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	66721852	66722243	66721943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	63268	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	66805277	66805644	66805568	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	146693	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	69309666	69309994	69309927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	71356	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	69750715	69750748	69750731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFU1	87955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	69857892	69858266	69858093	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	11291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70004336	70004726	70004528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	50048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70161598	70161791	70161659	Y	PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	25606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70273102	70273420	70273221	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	39165	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70296121	70296604	70296392	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	15981	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70608938	70609447	70609175	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM136A	81716	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70667389	70667575	70667482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFA	111750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	70823463	70823663	70823562	Y	TGFA	TGFA	NA	NA	NA	NA	TGFA	44138	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	71228347	71228418	71228366	Y	ANKRD53	ANKRD53,TEX261	TEX261	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TEX261	8272	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	72426245	72426403	72426323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	624767	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	72936183	72936496	72936380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	114674	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	74982664	74982814	74982739	Y	NA	AC007387.2	HK2,SEMA4F,LOXL3	IMR90	Hi-C	24141950	AC007387.2	2718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	75076703	75076941	75076867	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	17595	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	75114636	75114786	75114714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HK2	55528	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	75141745	75142080	75142074	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	41539	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	75219008	75219394	75219161	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	35389	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	85567649	85568034	85567918	Y	NA	TGOLN2,ELMOD3,RETSAT	TGOLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELMOD3	11483	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	85982713	85983043	85983025	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	6246	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	85997454	85997768	85997517	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	20987	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	90485310	90485405	90485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	1496148	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	95925847	95925871	95925861	Y	NA	PROM2,KCNIP3	PROM2	IMR90	Hi-C	24141950	PROM2	12330	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	96911483	96911666	96911570	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1	NA	NA	NA	NA	TMEM127	18066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	48395	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	99122556	99122993	99122631	Y	INPP4A,UNC50	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	63239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	99125275	99125485	99125370	Y	INPP4A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	65958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	99268200	99268767	99268592	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	45158	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	101397207	101397582	101397418	Y	C2orf29	NPAS2	NPAS2,RPL31,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS2	37032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	101944860	101945306	101945135	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	21697	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	101972073	101972519	101972434	Y	NA	RNF149,CREG2	NA	NA	NA	NA	CREG2	29538	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	167590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	106026144	106026496	106026333	Y	GPR45,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	26474	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	110016494	110016637	110016500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	353146	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	110319562	110319852	110319693	Y	NA	SEPT10	NA	NA	NA	NA	SEPT10	49931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	110863536	110863928	110863763	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	8215	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	111941595	111941939	111941767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	66640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	112375521	112375561	112375551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	264706	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	112462014	112462125	112462055	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	178142	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113388786	113388926	113388836	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	11042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	113544894	113545271	113545075	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1A	4727	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113550957	113551489	113551296	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	10790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113551784	113552157	113551927	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	11617	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113552525	113552798	113552647	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	12358	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113847761	113847860	113847813	Y	IL1A,IL1B,IL37,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1F10,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	255281	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	113869431	113870096	113869786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	276951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	113882661	113883329	113882998	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	290181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	114652011	114652405	114652035	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	6474	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	118740185	118740994	118740898	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	28715	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	BIN1	52473	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	29424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	LIMS2,SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	129381655	129381863	129381711	Y	NA	NA	UGGT1,HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	307504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	146472	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	136242341	136242686	136242514	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	44120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	138765071	138765376	138765123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	491892	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	6497	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	143695947	143696225	143696015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	62880	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	143697269	143697638	143697450	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	64202	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	143699726	143700104	143699915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	66659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	151377866	151378135	151377929	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	15390	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	151567491	151567674	151567620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	173966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	153302279	153302595	153302384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	112528	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	153568262	153568351	153568307	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	4056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	154446220	154446391	154446306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	873709	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	156949297	156949674	156949418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	247186	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	157038752	157038990	157038871	Y	NR4A2	NA	NR4A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR4A2	157870	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	157262022	157262267	157262175	Y	GPD2,NR4A2	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	27535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	157287649	157287933	157287736	Y	NR4A2,GPD2	GPD2	GPD2	K562	ChIA-PET	22265404	GPD2	1869	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	662369	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	158102968	158103210	158103130	Y	NA	NA	NR4A2,GALNT5	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1	627164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	159749466	159749905	159749830	Y	NA	NA	LY75-CD302,TANC1,WDSUB1,BAZ2B	IMR90	Hi-C	24141950	TANC1	73241	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	160219490	160219798	160219643	Y	MARCH7,CD302	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	78180	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	160817748	160817942	160817845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY75	58488	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	161083916	161084239	161083958	Y	CD302,ITGB6	ITGB6	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	42160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	161208357	161208687	161208675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	53706	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	164486140	164486494	164486462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	104028	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	165508598	165508853	165508726	Y	COBLL1	GRB14	GRB14	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRB14	32240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	165683192	165683287	165683237	Y	NA	AC019181.2,COBLL1	NA	NA	NA	NA	AC019181.2	11972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	165924693	165924835	165924764	Y	SCN3A,SCN2A,SCN2A,CSRNP3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A11	114658	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	166631165	166631444	166631305	Y	NA	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	GALNT3	17748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	AC009495.2	190	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	171544061	171544424	171544243	Y	NA	NA	MYO3B	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2S2P4	61797	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	172628972	172629294	172629196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	87053	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	172649817	172649933	172649875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	107898	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	172693152	172693396	172693274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAT1	83562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	173061382	173062264	173061777	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	95754	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	173360929	173361289	173361204	Y	PDK1	NA	NA	NA	NA	NA	PDK1	56812	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	175455723	175455851	175455784	Y	CIR1,WIPF1,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	WIPF1	89793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD11,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4	NA	NA	NA	NA	HOXD11	2917	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	9.15899871353417
chr2	177518737	177518933	177518835	Y	NA	LINC01117,LINC01116	HOXD10,HOXD11,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD9,HOXD4,MIR10B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01116	18078	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	179487942	179488336	179488251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	104032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	187318926	187319192	187319071	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	29691	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	190067676	190068381	190068047	Y	NA	NA	GULP1,COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	235778	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	12229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	191377806	191377826	191377816	Y	NA	TMEM194B	NA	NA	NA	NA	TMEM194B	19622	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	192066963	192067214	192067088	Y	STAT4,MYO1B,MYO1B	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1B	40697	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	192170125	192170408	192170266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	62214	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	196428777	196429172	196429092	Y	SLC39A10	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	9529	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	197188373	197188663	197188518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	149146	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	201268506	201268867	201268734	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	99902	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	202752724	202752776	202752749	Y	ALS2	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2	108812	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	82495	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	204548440	204549024	204548878	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	150307	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	97638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208366657	208366920	208366770	Y	METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	25541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208369274	208369395	208369347	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	23066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208378687	208378932	208378791	Y	CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	13529	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	213842063	213842076	213842069	Y	IKZF2,IKZF2	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	173075	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	216867934	216868318	216868147	Y	TMEM169	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	28501	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	412240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	218839495	218839769	218839643	Y	NA	NA	RUFY4,TNS1	IMR90	Hi-C	24141950	HMGB1P9	223388	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	218857857	218858115	218857951	Y	NA	NA	TNS1,RUFY4	IMR90	Hi-C	24141950	HMGB1P9	205042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	CRYBA2	27885	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	221372972	221373224	221373091	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	AC009502.1	825455	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	227524213	227524410	227524360	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	138065	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	227849549	227849707	227849645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	151252	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	228232228	228232344	228232275	Y	CCL20,AGFG1	MFF	NA	NA	NA	NA	MFF	44361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	228253438	228253721	228253534	Y	CCL20,AGFG1	NA	TM4SF20,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	MFF	65571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	228270733	228271155	228270942	Y	NA	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	63713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	228276107	228276256	228276208	Y	AGFG1	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	AGFG1	58612	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	228280402	228280578	228280475	Y	CCL20,AGFG1	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	AGFG1	54290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	228518288	228518647	228518367	Y	NA	NA	C2orf83	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A3	62081	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	228568825	228569005	228568935	Y	SLC19A3	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	11723	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	228717939	228718338	228718141	Y	NA	CCL20	WDR69	IMR90	Hi-C	24141950	CCL20	41381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	228742760	228743014	228742884	Y	WDR69	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	66202	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr2	230118973	230119267	230119206	Y	NA	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	14734	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	231227266	231227536	231227388	Y	NA	SP140L	NA	NA	NA	NA	SP140L	37367	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	231299753	231300176	231299905	Y	SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,SP100,SP100	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	21096	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	231515343	231515572	231515462	Y	GPR55,SP110,SP140	NA	CAB39,SP110,LOC151475	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	59988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85673	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	233353154	233353413	233353362	Y	ECEL1,PRSS56	ALPI,ECEL1	NA	NA	NA	NA	ECEL1	2616	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	UGT1A7,UGT1A6,UGT1A5	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	10326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	234614877	234615153	234615015	Y	NA	UGT1A7,UGT1A6,UGT1A5	NA	NA	NA	NA	UGT1A5	4485	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	UGT1A7,UGT1A6,UGT1A5	NA	NA	NA	NA	UGT1A5	4003	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	235542442	235542778	235542606	Y	NA	NA	SH3BP4,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	138745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	235732390	235732720	235732555	Y	NA	NA	SH3BP4,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	125897	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	235902163	235902381	235902255	Y	NA	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	43546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	52659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	237341356	237341565	237341461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	72620	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	237654357	237654656	237654652	Y	CXCR7	NA	CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	240172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	238598036	238598427	238598303	Y	ESPNL,UBE2F,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	63817	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	238807318	238807662	238807419	Y	PER2,ILKAP,ESPNL,UBE2F,RAMP1	RAMP1	NA	NA	NA	NA	RAMP1	41782	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	238832423	238832667	238832502	Y	NA	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	40802	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14795	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	239758150	239758505	239758333	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	3477	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	239767893	239768141	239768017	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	13220	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	240173626	240173903	240173698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	147227	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.92528516294322
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	240250439	240250711	240250592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	70419	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr2	241395144	241395496	241395485	Y	NA	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	AC110619.2	1013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr2	241585712	241586190	241585819	Y	DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN10	61579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	241899989	241900661	241900324	Y	NA	SNED1	NA	NA	NA	NA	SNED1	35594	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	478652	479003	478850	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	37455	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	1307828	1308261	1308086	Y	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	2975	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	24402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25714	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	63717	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	1925678	1926256	1925964	Y	SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	52524	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	2280034	2280402	2280127	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPB	169097	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	4090299	4090467	4090408	Y	SMOX	SMOX	LOC728228,PANK2,MIR103B2,ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	9160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	98793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	4674724	4674919	4674762	Y	NA	PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	9842	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	5059148	5059500	5059412	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	45772	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	466137	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	8534755	8534925	8534840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	536279	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	10197196	10197344	10197281	Y	SNAP25	SNAP25	NA	NA	NA	NA	SNAP25	134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	11831025	11831188	11831107	Y	BTBD3	BTBD3	NA	NA	NA	NA	BTBD3	38183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	13380021	13380161	13380091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	237426	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	17876337	17876490	17876431	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD17	65099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	19293639	19293701	19293669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	102349	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	19716018	19716528	19716293	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	19824	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr20	19717747	19718119	19717916	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	18233	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	19766218	19766359	19766289	Y	NA	RP1-122P22.2	RIN2,SLC24A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-122P22.2	29866	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	19783112	19783320	19783290	Y	NA	RP1-122P22.2	RIN2,SLC24A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	46760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	19912559	19913259	19912884	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	47394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	21147247	21147656	21147458	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	42623	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	283878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr20	23075489	23075921	23075757	Y	THBD,CD93,GZF1	THBD	SSTR4	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	47111	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	23117564	23117783	23117655	Y	NA	RP4-737E23.2	NA	NA	NA	NA	RP4-737E23.2	48982	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr20	23136585	23137102	23136883	Y	THBD,CD93,GZF1	RP4-737E23.2	NA	NA	NA	NA	RP4-737E23.2	29663	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	23347147	23347295	23347221	Y	THBD,CD93,GZF1	NXT1,RP3-322G13.5,GZF1	NA	NA	NA	NA	GZF1	6360	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	30190743	30190994	30190797	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	92	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30263216	30263335	30263276	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	30807220	30807332	30807276	Y	NA	TSPY26P,PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	POFUT1	13537	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	31687729	31687935	31687834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	282030	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	32142835	32143155	32142948	Y	C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B	NA	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	66954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	40630	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	33024983	33025234	33025016	Y	TP53INP2	FDX1P1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	37045	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	33896147	33896435	33896303	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	25359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	FER1L4,SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	34384504	34384863	34384702	Y	SPAG4,RBM39,SCAND1,PHF20	PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	26608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	35239893	35239986	35239939	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	7756	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	35362274	35362463	35362369	Y	NA	NDRG3,DSN1	NA	NA	NA	NA	NDRG3	10018	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	36042310	36042952	36042529	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	28984	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	36056702	36057072	36056829	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	14864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	36389387	36389716	36389551	Y	NA	NA	VSTM2L	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNBL1	68979	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	1381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr20	37603521	37603525	37603523	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	14579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	39620099	39620424	39620302	Y	MAFB,TOP1	RNU2-52P,TOP1	TOP1,PLCG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU2-52P	30421	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	39958158	39958419	39958360	Y	NA	ZHX3,LPIN3	PLCG1,ZHX3,LPIN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPIN3	9141	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	41675493	41675534	41675514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF6	409034	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	43709360	43709760	43709560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PI3	91757	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	43869504	43869693	43869682	Y	DBNDD2,SLPI	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	11512	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr20	43876988	43877346	43877094	Y	NA	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	3859	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	48075755	48075909	48075852	Y	KCNB1	KCNB1	NA	NA	NA	NA	KCNB1	21275	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	48385312	48385495	48385398	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	40933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	48467762	48467975	48467793	Y	NA	SLC9A8	NA	NA	NA	NA	SLC9A8	40512	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	48760872	48761304	48761158	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	6870	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr20	48938558	48938763	48938674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	56535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	48995783	48996016	48995938	Y	NA	NA	LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	113760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	49047228	49047674	49047434	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	77217	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	49170357	49170595	49170426	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	45466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	49341306	49341865	49341532	Y	NA	PARD6B	NCOA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARD6B	4216	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	193837	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	70300	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	50527143	50527170	50527154	Y	NA	NA	ZFP64,SALL4,ATP9A	IMR90	Hi-C	24141950	ATP9A	143970	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	51648602	51648709	51648656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	61656	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	51694232	51694450	51694303	Y	TSHZ2	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	107286	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	52196593	52196861	52196746	Y	TSHZ2,ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27585	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr20	52533564	52534521	52533763	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	253991	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	222373	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	CYP24A1	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	47875	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	56008066	56008273	56008156	Y	ZBP1	RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	43603	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	56255217	56255759	56255498	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28833	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	57739159	57739461	57739442	Y	ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	123195	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	RP11-157P1.5	1224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	60972798	60973035	60972874	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	7306	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr20	62176586	62176848	62176717	Y	NA	EEF1A2,PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PTK6	9863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	62482031	62482202	62482150	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914	IMR90	Hi-C	24141950	TPD52L2	12394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	62485386	62485810	62485510	Y	PRIC285	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914,ARFRP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPD52L2	8786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	16354668	16355055	16354876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	80266	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	17745935	17746301	17746052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	645591	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	2234105	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	27082933	27083032	27082983	Y	NA	GABPA,ATP5J	NA	NA	NA	NA	GABPA	21849	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	27353741	27354048	27353953	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	187398	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	29791196	29791277	29791236	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00113	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	464416	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	30276081	30276287	30276184	Y	C21orf7	N6AMT1	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	20388	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr21	30590117	30590529	30590261	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	25725	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	33247157	33247609	33247328	Y	NA	HUNK	NA	NA	NA	NA	HUNK	3529	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr21	33265141	33265272	33265205	Y	NA	HUNK	NA	NA	NA	NA	HUNK	21513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	33702310	33702533	33702421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIS18A	52930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	34718616	34718973	34718794	Y	OLIG2,OLIG1	IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	23882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	34752256	34752448	34752342	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	20754	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	34755296	34756154	34755534	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	IFNGR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	IFNGR2	17048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36167928	36168243	36168166	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	182487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36181032	36181199	36181134	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	195591	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	232493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234432	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36263020	36263336	36263172	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	277579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	36339843	36340239	36340159	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	354402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	18991	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	37670543	37670742	37670650	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	19745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr21	37868041	37868182	37868111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000695.6	67383	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	38062761	38063015	38062888	Y	NA	SIM2	CLDN14,HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	6418	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	38235070	38235202	38235136	Y	TTC3,HLCS	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	101610	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	39619401	39619932	39619765	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ15	92273	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	39635387	39635785	39635510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	108259	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	39661705	39662059	39661845	Y	KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	134577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40018484	40018900	40018698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	156331	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40182920	40183779	40183392	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	7689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr21	40209875	40210169	40209958	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	34644	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40225341	40225561	40225501	Y	ETS2	NA	LINC00114,ETS2,PSMG1,BRWD1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	50110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40278958	40279421	40279192	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	103727	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	40351521	40351908	40351683	Y	ETS2	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	ETS2	176290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40364699	40365059	40364949	Y	ERG	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	PSMG1	188718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40376938	40377126	40376993	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	176651	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr21	40484017	40484221	40484185	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	69556	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	40716228	40716377	40716303	Y	NA	BRWD1,HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	HMGN1	3196	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	42598872	42599018	42598944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	61144	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	42879173	42879227	42879200	Y	FAM3B,TMPRSS2,TMPRSS2	SNORA32	NA	NA	NA	NA	SNORA32	29906	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	43089019	43089272	43089054	Y	RIPK4	NA	LINC00111	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK4	95994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	43656900	43657065	43656980	Y	PRDM15,PRDM15,C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	39101	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	43688335	43688602	43688509	Y	C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCG1	70536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	43956047	43956238	43956187	Y	ABCG1,ABCG1	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	RSPH1	41583	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	44469974	44470172	44470008	Y	CBS	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	24881	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	44727448	44727599	44727495	Y	PKNOX1,SIK1	LINC00322	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00322	22320	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3373	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	44759656	44759904	44759692	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	9737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	10794	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	44792965	44793192	44793096	Y	NA	LINC00322	LINC00313,CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00322	43046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	8.72285591765159
chr21	44817742	44818046	44817914	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	26962	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44819081	44819261	44819206	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	25747	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44831131	44831382	44831257	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	13626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44832284	44832425	44832365	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	12583	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44848808	44849083	44848957	Y	CBS	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	SIK1	3800	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr21	44856189	44856512	44856455	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00319	7969	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	44859375	44859527	44859442	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	4954	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	3069	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.14335656088451
chr21	44862613	44862764	44862681	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	1717	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44876908	44877060	44877025	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	12427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	20588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	LINC00313,H2BFS	NA	NA	NA	NA	LINC00313	39370	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	LINC00313,H2BFS	NA	NA	NA	NA	LINC00313	40245	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr21	44937921	44938237	44938215	Y	NA	LINC00313,H2BFS	NA	NA	NA	NA	LINC00313	40507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	44942511	44942810	44942777	Y	PDXK	LINC00313,H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	40260	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	37534	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.23371355059095
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	45146832	45147391	45147298	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	9857	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	45557942	45558217	45558021	Y	AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6455	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr21	46336832	46337112	46336960	Y	NA	PTTG1IP,FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	20813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	46349799	46350126	46349963	Y	KRTAP10-12	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	7799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	47295042	47295436	47295304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	104215	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	59185	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	18056540	18056875	18056678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E1	52709	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	18155331	18155602	18155421	Y	NA	ATP6V1E1,BCL2L13	NA	NA	NA	NA	BCL2L13	45710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	18264435	18264847	18264620	Y	CECR2,ATP6V1E1,BCL2L13,USP18,BID,BID	BID	NA	NA	NA	NA	BID	8899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	18538907	18539143	18539025	Y	NA	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	PEX26	19546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr22	19941739	19941814	19941777	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	14398	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	19983308	19983423	19983389	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	21221716	21221966	21221814	Y	NA	SNAP29,PI4KA,CRKL	NA	NA	NA	NA	PI4KA	10011	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	22186398	22186549	22186531	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	33421	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	23624437	23624690	23624563	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	104546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SGSM1	181604	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	25390259	25390306	25390285	Y	NA	NA	KIAA1671	MCF7	ChIA-PET	22265404	SGSM1	190023	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	26150935	26151135	26151006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRBK2	192119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr22	27525231	27525565	27525473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-211A9.5	458501	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	129760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr22	29194018	29194404	29194339	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	29605025	29605391	29605212	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	5185	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	30620211	30620567	30620379	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	20273	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	31219107	31219239	31219180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORC2	143045	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.3614279588258
chr22	31226011	31226350	31226247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORC2	135934	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	31291343	31291446	31291429	Y	SEC14L4,OSBP2	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	70838	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	64094	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	31934846	31935146	31934960	Y	NA	EIF4ENIF1	NA	NA	NA	NA	EIF4ENIF1	44752	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	32042427	32042918	32042716	Y	RNF185,LIMK2	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	13500	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	32048774	32049039	32049031	Y	NA	PISD	SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L	GM12878,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	PISD	7379	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	33176423	33176673	33176603	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	19014	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	33202022	33202333	33202121	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	6335	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	33202971	33203258	33203149	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	7284	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	33240240	33240586	33240349	Y	NA	TIMP3,Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	13834	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	33243745	33243918	33243862	Y	NA	TIMP3,Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	10502	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	33252376	33252746	33252411	Y	NA	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	1674	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	11263	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	34315412	34315698	34315644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	1060992	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	35702518	35702966	35702671	Y	APOL6,TOM1,TOM1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	9250	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	35709404	35709640	35709485	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	16136	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	35710736	35710808	35710790	Y	APOL6,TOM1,TOM1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	17468	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	35767811	35768194	35767985	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	6160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36753062	36753318	36753212	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	28745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36755336	36755467	36755407	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	26596	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36759233	36759313	36759256	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	22750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-633O19__A.1	23476	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr22	36847830	36847945	36847861	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB	RP5-1119A7.14,TXN2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	1046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	9245	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	37582993	37583226	37583109	Y	NA	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	10199	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	38292237	38292573	38292408	Y	CARD10,SH3BP1,MICALL1	EIF3L,ANKRD54,MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	7091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	38294842	38295023	38294932	Y	CARD10,CDC42EP1,SH3BP1,MICALL1	MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	4641	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	39253318	39253463	39253391	Y	KCNJ4,LOC646851	NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	CBX6	12856	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	39349987	39350551	39350215	Y	DDX17,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3A	APOBEC3A,APOBEC3B	CBX6	IMR90	Hi-C	24141950	APOBEC3A	3241	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	39570081	39570473	39570178	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBX7	23402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	42257974	42258323	42258180	Y	CENPM	SREBF2	NA	NA	NA	NA	SREBF2	30865	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	42339043	42339310	42339264	Y	NA	TNFRSF13C,CENPM,SEPT3	NA	NA	NA	NA	CENPM	1858	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	42345988	42346366	42346055	Y	NA	TNFRSF13C,CENPM,SEPT3,WBP2NL	NA	NA	NA	NA	CENPM	4820	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	43067495	43067636	43067590	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	23921	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	PARVG	NA	NA	NA	NA	PARVG	24841	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	44756999	44757252	44757125	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	134926	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	45067693	45068028	45067921	Y	NUP50,PARVG,PRR5	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	SAMM50,PARVB,LINC00229,KIAA1644	IMR90	Hi-C	24141950	PRR5	5100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	45254258	45254434	45254345	Y	PHF21B	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	157903	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	45553376	45553664	45553597	Y	NA	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	3998	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WI2-85898F10.1,WNT7B	NA	NA	NA	NA	WI2-85898F10.1	43738	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	46330758	46331082	46331012	Y	NA	WI2-85898F10.1,WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	39927	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	46812032	46812341	46812187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMU	87260	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	47126357	47126654	47126612	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	5504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	47364562	47364667	47364649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	208044	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	50272789	50273094	50272966	Y	NA	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	27299	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr22	50341970	50342055	50341995	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	10106	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.83492817323677
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	4783422	4783695	4783523	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	7579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	4793961	4794169	4794077	Y	EDEM1,BHLHE40	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	2687	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	4801058	4801218	4801184	Y	NA	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	9784	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	4866672	4866828	4866731	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	60149	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	4867902	4868594	4868233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	58383	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	4870006	4870136	4870076	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	56841	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	4870806	4870892	4870849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	56085	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	4871506	4871670	4871602	Y	ITPR1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	55307	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	40890	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	4892426	4892911	4892721	Y	BHLHE40	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	34066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr3	5028057	5028369	5028268	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	5037242	5038218	5038020	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	17596	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	39920	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	9197454	9197478	9197466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	193997	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	10240437	10240684	10240523	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	35888	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	10593561	10593984	10593868	Y	NA	NA	ATP2B2	IMR90	Hi-C	24141950	SEC13	232699	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr3	13460446	13460799	13460651	Y	NA	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	637	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	15334615	15334919	15334862	Y	NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	45956	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	17345014	17345355	17345310	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	791481	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	941290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	940686	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	18005686	18005921	18005797	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	478388	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	18366679	18366900	18366790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	117409	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	24506233	24506581	24506477	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	28192	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	29496223	29496522	29496266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	175750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	29568670	29568984	29568828	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	248197	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	29800986	29801236	29801157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	480513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	31737462	31737733	31737598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	165332	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	33190938	33191178	33190994	Y	NA	CRTAP	NA	NA	NA	NA	CRTAP	37467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	VILL,PLCD1,DLEC1	NA	NA	NA	NA	PLCD1	3632	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	38195534	38195789	38195689	Y	VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	OXSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OXSR1	8791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	38216296	38216490	38216393	Y	NA	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	11716	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	39191403	39191804	39191748	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	2249	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	39192828	39193549	39193225	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	84464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	2843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	101913	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	45140818	45140977	45140897	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	44937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	20102	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	46228445	46228784	46228752	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	NA	NA	NA	NA	FYCO1	193129	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	46704560	46704953	46704713	Y	NA	ALS2CL	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	28241	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	49938038	49938186	49938111	Y	TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54	TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MST1R	1113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	50040739	50040850	50040788	Y	SEMA3B	NA	NA	NA	NA	NA	RBM6	65299	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	3192	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	50204844	50205012	50204945	Y	NA	SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	13326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	50280819	50280975	50280878	Y	RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,UBA7,RBM5,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B,IFRD2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	19095	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	50292420	50292632	50292507	Y	RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3	C3orf45,SEMA3B	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3B	10358	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	50639346	50639782	50639525	Y	C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	52079728	52079827	52079778	Y	DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	8739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	53272912	53273168	53273085	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	14900	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	53897423	53897785	53897604	Y	NA	CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	ACTR8	16444	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	56106137	56106188	56106158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	483001	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	56818012	56818198	56818042	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	102747	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	56873709	56874050	56874038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	158444	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	57957829	57958015	57957905	Y	NA	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	34112	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	58162589	58162663	58162637	Y	KCTD6	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	58570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	62311824	62311884	62311857	Y	NA	C3orf14,PTPRG-AS1	NA	NA	NA	NA	C3orf14	9176	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	237098	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	62924105	62924506	62924306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	571100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	64136720	64136844	64136782	Y	THOC7,PSMD6	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	129062	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	64475093	64475304	64475254	Y	NA	PRICKLE2,RP11-14D22.2	LOC100652759,LOC100287879,PRICKLE2,LOC100507062,PSMD6,ADAMTS9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRICKLE2,RP11-14D22.2	45941	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	66500646	66500979	66500813	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	48708	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	69228052	69228449	69228187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	95957	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	69262443	69262764	69262745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	130348	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	71441439	71441788	71441676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	189352	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	71478043	71478236	71478134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	152904	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	71687587	71687598	71687593	Y	NA	NA	FOXP1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP1	56447	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	87336210	87336427	87336319	Y	NA	NA	CGGBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CHMP2B	61789	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	98549481	98549862	98549828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	68671	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223910	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	107148336	107148412	107148401	Y	NA	NA	LOC344595,BBX,LOC100302640	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BBX	91371	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	4780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	111480028	111480653	111480348	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	30684	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	111481970	111482358	111482172	Y	PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	32626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	111521164	111521550	111521388	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	71820	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	112182390	112182567	112182476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	95989	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	112362530	112362627	112362586	Y	NA	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	3750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	112994855	112995215	112995035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BOC	67005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	113473473	113473635	113473557	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	9607	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	114231020	114231412	114231084	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	457560	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	114374818	114375057	114374945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	489061	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	117299509	117299697	117299683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	555964	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	117379734	117380078	117379965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	636189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	119864415	119864682	119864534	Y	COX17,GSK3B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	52673	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	120397505	120397688	120397597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E1	61796	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	120463141	120463503	120463258	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	3301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	120819033	120819273	120819055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL3	359193	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	121638049	121638246	121638101	Y	CSTA,ILDR1	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	86019	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr3	122033411	122033646	122033535	Y	CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,KPNA1,HSPBAP1,DTX3L,DIRC2,CSTA	CSTA	CCDC58,CD86,CASR	IMR90	Hi-C	24141950	CSTA	8445	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	122151096	122151154	122151125	Y	KPNA1	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18214	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	122208819	122209075	122208974	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	22717	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	122476470	122476801	122476636	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	33870	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	122699305	122699486	122699396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDIA5	84423	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	SLC12A8	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A8	31219	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	74839	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	127472997	127473428	127473061	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	66623	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	127473675	127474224	127473998	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	65827	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	17349	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	127539467	127539812	127539513	Y	MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	127962120	127962365	127962246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUVBL1	91363	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-475N22.4	10465	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	128538992	128539042	128539017	Y	DNAJB8,C3orf27	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	57131	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	128946609	128946967	128946881	Y	MBD4,KIAA1257,GP9,RAB43,ISY1,CNBP	CNBP	KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	45844	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	128957834	128958071	128957930	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	57069	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	129352569	129352710	129352632	Y	NA	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	28908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	132261870	132262263	132261985	Y	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	NA	UBA5	109027	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	138109159	138109469	138109274	Y	NA	MRAS,ESYT3	NA	NA	NA	NA	ESYT3	41959	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	139028849	139029030	139028940	Y	NA	NA	BPESC1,FOXL2,C3orf72,MRPS22,COPB2	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	77544	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	139344390	139344678	139344552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	50181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	146224364	146224853	146224698	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	35798	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	694953	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149108520	149108892	149108690	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	14868	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149229459	149229794	149229606	Y	NA	RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	19012	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149339543	149339560	149339552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	112941	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149533104	149533741	149533325	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	4609	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	150478267	150478712	150478564	Y	TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	543	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	151996540	151996946	151996646	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	11196	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	41561	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	152091128	152091426	152091240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	105784	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	152856443	152856813	152856615	Y	RAP2B	RAP2B	RAP2B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAP2B	21216	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr3	155705974	155706059	155706016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPS	119649	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	156443600	156443618	156443611	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	53433	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	156529352	156529637	156529452	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	2831	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	159116809	159117059	159116893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARRES1	668324	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	634521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	159514645	159514911	159514780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	600151	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	161371327	161371329	161371328	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	282659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	161521648	161521661	161521655	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	432980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	161579541	161579705	161579678	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	490873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	161731102	161731436	161731432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	642434	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	161835888	161836193	161836058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	747220	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	161852420	161852720	161852505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	763752	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	167181640	167181820	167181812	Y	SERPINI2	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	268907	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	169299138	169299197	169299168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	80209	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	169378305	169378656	169378554	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	169379063	169379412	169379208	Y	MECOM	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	170795068	170795319	170795194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	170586	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	171594447	171594730	171594655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	67707	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	171792323	171792831	171792493	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	36905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	171849993	171850504	171850202	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	94575	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	171856568	171857271	171856877	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	101150	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	172086059	172086253	172086084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	56626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	172366671	172366874	172366806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	60134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	172377276	172377377	172377327	Y	NA	NCEH1	NA	NA	NA	NA	NCEH1	49631	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	176916249	176916425	176916364	Y	NA	TBL1XR1	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	2988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	177307615	177308089	177307887	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	394354	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	179122098	179122379	179122239	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	44999	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	182642205	182642465	182642335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	59276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	182973152	182973434	182973425	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	182980670	182980835	182980709	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	182980917	182981737	182981029	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11885	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr3	184458237	184458578	184458314	Y	NA	MAGEF1	VPS8,EPHB3,POLR2H,CLCN2,FAM131A,EIF4G1,THPO,CHRD,MAGEF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAGEF1	30401	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	185034789	185035224	185034953	Y	NA	EHHADH,MAP3K13	NA	NA	NA	NA	MAP3K13	36060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	186903601	186903921	186903764	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	6905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	31468	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	188156976	188157533	188157052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	287131	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	188374364	188374933	188374638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	288070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	189559377	189559697	189559485	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	212172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr3	189626513	189626760	189626607	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	209993	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	42806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	190041292	190041577	190041442	Y	NA	CLDN1	NA	NA	NA	NA	CLDN1	3028	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr3	190252374	190252607	190252502	Y	CLDN1,IL1RAP	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	22534	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	192610862	192611520	192611033	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	22430	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	193546369	193546601	193546485	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	237436	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	193548514	193548983	193548724	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	239581	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-135A1.3	219504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	193590130	193590422	193590276	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-135A1.3	216928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	193689142	193689560	193689382	Y	ATP13A3,OPA1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-135A1.3	117790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-135A1.3	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	RP11-135A1.3	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	193993457	193993565	193993509	Y	NA	NA	LOC647323,LOC100131551	IMR90	Hi-C	24141950	HES1	141523	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	194022185	194022450	194022442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	170251	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	194029385	194029774	194029648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	177451	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	175187	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	162657	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	195628817	195629072	195628853	Y	NA	TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2	7744	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr3	196757369	196757726	196757658	Y	LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	2682	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	196995168	196995509	196995411	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	28662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	330052	330352	330160	Y	NA	ZNF141	NA	NA	NA	NA	ZNF141	449	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	867282	867339	867287	Y	NA	CPLX1	NA	NA	NA	NA	CPLX1	49296	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	3483238	3483365	3483266	Y	NA	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	20205	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	3493312	3493795	3493528	Y	NA	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	30279	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	6941693	6941980	6941913	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	32724	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	7962509	7962775	7962724	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	22856	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	10001685	10001951	10001818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A9	52609	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	13613048	13613249	13613164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB28	129059	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	15536628	15536631	15536630	Y	NA	NA	FBXL5	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	67139	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	15895700	15895839	15895750	Y	FGFBP1	FGFBP1	CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	42524	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr4	15922988	15923279	15923080	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	15084	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	22636233	22636363	22636286	Y	NA	RP11-10G12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10G12.1	42414	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr4	22676419	22676434	22676427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	51139	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	23879721	23879980	23879976	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	23732	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	23890635	23890864	23890849	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	12848	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	24227575	24227894	24227795	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1A	323863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	24263661	24263923	24263768	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	320250	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	24322640	24323331	24322979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	260842	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	24332761	24333117	24332939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	251056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	24471602	24472014	24471897	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112159	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	36078000	36078189	36078065	Y	DTHD1,ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	165942	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	38001084	38001300	38001133	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	41028	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	38567143	38567404	38567260	Y	NA	NA	KLF3,FLJ13197,TBC1D1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	96413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	38673994	38674276	38674074	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	9490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	7536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	96893	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	40564357	40564512	40564451	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	66380	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	51393	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	41509451	41509766	41509557	Y	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	149827	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	41569423	41569466	41569445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	209799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	47265985	47266214	47266100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD8	197522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	48532180	48532355	48532269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAIN2	190841	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	57905676	57905866	57905771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOA1	62687	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	57908977	57909199	57909089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	64729	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	57937505	57937813	57937783	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	36115	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	57940962	57941225	57941094	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	32703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	57947514	57947824	57947684	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	26104	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	68758436	68758452	68758444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPRSS11A	69406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr4	75183618	75183847	75183685	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	11428	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	75187079	75187238	75187159	Y	EPGN	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	14889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	75557908	75558335	75558035	Y	EREG,AREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	159561	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	77133814	77134170	77133987	Y	NAAA,CXCL10,CXCL11	SCARB2,FAM47E	NA	NA	NA	NA	FAM47E	621	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	78656019	78656351	78656260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	82418	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	79473983	79474151	79474067	Y	ANXA3	ANXA3	NA	NA	NA	NA	ANXA3	3310	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	79521197	79521480	79521236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	50524	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	82415060	82415676	82415310	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	547721	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	84153273	84153480	84153394	Y	THAP9,PLAC8,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2	NA	PLAC8,COPS4	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	50587	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	87048261	87048368	87048363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	465100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	87615730	87616123	87615813	Y	PTPN13,SLC10A6	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	102262	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	87626625	87626818	87626720	Y	PTPN13	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	113157	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	88443267	88443740	88443428	Y	DSPP,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	101533	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	95437375	95437547	95437461	Y	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	66338	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	95457390	95457546	95457468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	86353	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	99845137	99845196	99845164	Y	NA	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	4592	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	100739781	100739969	100739850	Y	RG9MTD2,DAPP1	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	3791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	102254048	102254281	102254164	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	12656	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	103360821	103361254	103361183	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	103793013	103793145	103793075	Y	MANBA,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	4878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	105980538	105980953	105980680	Y	TET2,TET2	NA	TET2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TET2	84079	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	106071010	106071297	106071196	Y	TET2,TET2	TET2	NA	NA	NA	NA	TET2	5978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	108783895	108784172	108784033	Y	SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	40176	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	108821168	108821439	108821243	Y	NA	CYP2U1	NA	NA	NA	NA	CYP2U1	29086	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	110464231	110464470	110464351	Y	NA	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	14891	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	114312053	114312195	114312124	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	27284	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	120439031	120439404	120439161	Y	PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	65085	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	122610538	122611647	122611314	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	4621	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	126757698	126757982	126757964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	1125811	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	129244714	129244881	129244798	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32808	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	129254148	129254471	129254310	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	42242	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	138975341	138975477	138975408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	186026	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	142215447	142215866	142215653	Y	ZNF330,IL15	RP11-362F19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362F19.1	35906	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	142250253	142250616	142250501	Y	ZNF330,IL15	RP11-362F19.1	IL15,INPP4B,ZNF330	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-362F19.1	1156	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr4	142269412	142269661	142269463	Y	ZNF330,IL15	RP11-362F19.1	IL15,INPP4B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362F19.1	17640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	142271356	142271489	142271421	Y	ZNF330,IL15	RP11-362F19.1	IL15,INPP4B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362F19.1	19584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	142559455	142559780	142559588	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	3703	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	142564611	142565296	142564927	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	8859	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	142569165	142569426	142569320	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	13413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	143012897	143013276	143013057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	457145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr4	143325385	143325488	143325414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	441097	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	143471391	143471615	143471483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	294970	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	143588065	143588407	143588236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	178178	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	146815736	146815927	146815832	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	41860	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	148729482	148729491	148729487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	78268	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	151769111	151769151	151769130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	165728	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	151873741	151873900	151873783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	60979	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	154176673	154176745	154176706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	87056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	159643443	159643599	159643521	Y	FNIP2,PPID	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	895	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	165882303	165882624	165882495	Y	CPE,C4orf39	RP11-366M4.2,NACA3P	NA	NA	NA	NA	NACA3P	19861	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	169559092	169559502	169559116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	169559850	169560019	169559874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102913	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	169757761	169758092	169757987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	171334	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	169791118	169791499	169791286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	137927	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr4	169839395	169839702	169839549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	89724	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr4	169868186	169868202	169868194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	61224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	170023521	170023783	170023621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	94095	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	170934636	170934767	170934702	Y	NA	MFAP3L	NA	NA	NA	NA	MFAP3L	17415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	175827737	175827964	175827860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	624322	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	181279045	181279446	181279246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	2557643	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	183826285	183826336	183826311	Y	NA	DCTD	NA	NA	NA	NA	DCTD	10753	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	53095	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr4	185331149	185331516	185331503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	62218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	187597728	187597911	187597833	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	47965	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr4	190801470	190801552	190801511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	58391	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	671573	671920	671762	Y	TPPP	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	19590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	1930136	1931342	1930853	Y	NA	CTD-2194D22.3,IRX4	NA	NA	NA	NA	IRX4	44786	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.14335656088451
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	12331154	12331499	12331312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1571770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	16740893	16741285	16741194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	125726	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	CTB-55B8.1	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	44889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	17177639	17177702	17177672	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	37454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	9830	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPD1P1	1423072	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	32349231	32349269	32349250	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	38116	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	34877157	34877486	34877355	Y	NA	BRIX1,RAD1	NA	NA	NA	NA	BRIX1	35995	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	38846956	38846992	38846979	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	2996	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	39069838	39069965	39069908	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	2545	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	40754670	40754884	40754791	Y	PTGER4	TTC33,PRKAA1	NA	NA	NA	NA	TTC33	593	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	45793437	45793825	45793631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	986410	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	52319874	52320078	52320019	Y	NA	ITGA2	LOC257396	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA2	36718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	310514	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	53358665	53359272	53358974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	245140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	54715918	54716192	54716055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	108337	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	55786817	55787069	55786944	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	11830	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	55822981	55823358	55823162	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	24082	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	56131312	56131556	56131415	Y	GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1	MAP3K1	NA	NA	NA	NA	MAP3K1	21911	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	56468272	56468727	56468348	Y	MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1	GPBP1	NA	NA	NA	NA	GPBP1	497	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	57158264	57158637	57158547	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	381628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58186995	58187365	58187085	Y	PDE4D	NA	PDE4D	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	432908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58314415	58314788	58314579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	560328	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58316206	58316509	58316424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	562119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	578199	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58343486	58343717	58343566	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	589399	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58358500	58358548	58358538	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	604413	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	605797	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	58375824	58376057	58376052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	621737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58395760	58396044	58395902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	641673	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58408149	58408473	58408383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	654062	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58408556	58408894	58408726	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	654469	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58418380	58418697	58418552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	664293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58420146	58420252	58420199	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	666059	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58421119	58421626	58421279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	667032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58422372	58422713	58422580	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	668285	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	669224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	691041	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58508843	58508938	58508881	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	754756	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58575824	58576193	58576112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	821737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58616191	58616562	58616377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	862104	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58798066	58798450	58798258	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	1017497	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	998657	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr5	58874550	58874813	58874554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	941134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	58900988	58901299	58901144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	914648	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	58926109	58926323	58926216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	889624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	58951498	58952014	58951831	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	863933	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	59041159	59041490	59041319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	774457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	59057056	59057135	59057102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	758812	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	59070253	59070532	59070393	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	745415	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	729270	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	64062726	64062917	64062822	Y	NA	SREK1IP1	NA	NA	NA	NA	CWC27	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	60119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	65878342	65878574	65878477	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	11602	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	28070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	7.63249892794514
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	MAST4-AS1	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	8847	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	66502779	66503107	66502965	Y	NA	CD180	MAST4,CD180,PIK3R1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD180	12152	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	CTC-498J12.1,SLC30A5	NA	NA	NA	NA	CTC-498J12.1	815	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr5	68712626	68712834	68712773	Y	NA	RAD17,TAF9,MARVELD2	NA	NA	NA	NA	MARVELD2	3687	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	72880420	72880664	72880571	Y	NA	UTP15,ANKRA2	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	20909	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	FAM169A	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM169A	2863	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	74616844	74617109	74616992	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	HMGCR	NA	NA	NA	NA	HMGCR	13045	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	77581141	77581448	77581332	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	7131	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	78525358	78525750	78525524	Y	NA	DMGDH,JMY	NA	NA	NA	NA	DMGDH	4111	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	78744780	78744887	78744834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOMER1	63153	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr5	78843882	78844075	78843988	Y	NA	HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35842	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	80055694	80056072	80055883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	106892	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	80564528	80564843	80564784	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	30536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	81465137	81465359	81465307	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	107037	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	204789	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	82807080	82807411	82807109	Y	XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	435398	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM161B	393339	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	92940140	92940350	92940245	Y	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	77023	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	95170246	95170624	95170377	Y	GLRX,ELL2	GLRX,AC008592.5	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	13537	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	95179469	95179934	95179619	Y	NA	GLRX,AC008592.5	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC008592.5	15556	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	95240158	95240487	95240414	Y	NA	AC008592.5	NA	NA	NA	NA	AC008592.5	44668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	266966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr5	99389717	99390411	99390143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	478555	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	106823409	106823505	106823457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	181091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	106855785	106855959	106855826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	148637	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	111523730	111523898	111523814	Y	NA	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	29507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	111535274	111535427	111535350	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	41051	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	111734624	111734920	111734701	Y	APC	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	18093	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	111742657	111742758	111742708	Y	NA	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	10255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	112602603	112602927	112602766	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	219600	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	112628840	112629057	112628905	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	193470	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	112661132	112661145	112661139	Y	MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	161382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	118165526	118165828	118165677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	141663	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	118667521	118667660	118667595	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	65134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	118670685	118671156	118670901	Y	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	68298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	118698549	118698602	118698556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	87536	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	121499580	121499890	121499735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	87600	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	404650	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	125782209	125782552	125782386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	88385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf63	71695	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	130739357	130739526	130739407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	160171	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	131747457	131747923	131747553	Y	NA	SLC22A5,AC034220.3,C5orf56	NA	NA	NA	NA	C5orf56	3129	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	131795302	131795488	131795309	Y	NA	IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	29002	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AFF4	26161	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	133455254	133455613	133455348	Y	NA	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	6852	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	133460352	133460406	133460379	Y	UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	11950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	18816	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.1,AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	31064	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.05299957117806
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-276P9.1	97894	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-276P9.1	101864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	136900041	136900222	136900186	Y	NA	SPOCK1	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	SPOCK1	31846	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	137001251	137001596	137001494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	69183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	137075973	137076263	137076118	Y	NA	HNRNPA0	NA	NA	NA	NA	HNRNPA0	11776	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.66985634647353
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	154401	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	138258617	138258897	138258757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	171619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	138262166	138262549	138262196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	175168	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	138499803	138499980	138499892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	107461	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	139049454	139050310	139049802	Y	MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	24570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	139724210	139724515	139724457	Y	SRA1,CD14,CD14,APBB3,HBEGF,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	HBEGF	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	30772	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	142721389	142721627	142721517	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	11219	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	142785420	142785784	142785543	Y	NR3C1	NR3C1	ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	27293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	142974978	142975222	142975128	Y	NR3C1,NR3C1	NA	ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	161901	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	145499175	145499563	145499369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	60660	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	146242419	146242610	146242553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	219737	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINK5	60582	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	147580878	147580957	147580917	Y	JAKMIP2,FBXO38	SPINK6,CTC-295J13.3	NA	NA	NA	NA	SPINK6	521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	147584875	147585351	147585146	Y	FBXO38	SPINK6,CTC-295J13.3	NA	NA	NA	NA	SPINK6	4518	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	147605275	147606051	147605859	Y	NA	SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	10082	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	147621065	147621397	147621193	Y	NA	SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	4932	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	147646107	147646243	147646175	Y	NA	CTC-295J13.3,SPINK13,SPINK7	NA	NA	NA	NA	SPINK13	364	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	147722722	147723108	147722793	Y	SPINK14,SPINK7	SPINK7,RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	SPINK7	32740	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	148292484	148292904	148292843	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	88328	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	148352583	148352893	148352766	Y	ADRB2	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-529P8.1	87987	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	149853688	149853975	149853788	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	9406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	150169826	150170319	150169982	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	33155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	150403259	150403641	150403341	Y	NA	GPX3	NA	NA	NA	NA	GPX3	5135	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	150902961	150903053	150903007	Y	FAT2	FAT2	NA	NA	NA	NA	FAT2	43452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	150965724	150965991	150965861	Y	FAT2	FAT2	SLC36A2,FAT2	IMR90	Hi-C	24141950	FAT2	19219	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	151017311	151017607	151017366	Y	FAT2	SPARC	SLC36A1,FAT2,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	47119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1	126930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	155546780	155547134	155546887	Y	NA	NA	SGCD	IMR90	Hi-C	24141950	HAVCR2	1020746	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	156891501	156891799	156891609	Y	HAVCR2,ADAM19,NIPAL4	NIPAL4	NA	NA	NA	NA	NIPAL4	6474	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	157257409	157257732	157257678	Y	NA	CLINT1	NA	NA	NA	NA	CLINT1	26451	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	157652885	157653003	157652944	Y	NA	NA	EBF1	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	368702	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145,CTB-11I22.2	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	158764609	158764870	158764738	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	AC008697.1	NA	NA	NA	NA	AC008697.1	28668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	159480874	159481257	159481243	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	46754	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	159951614	159951766	159951649	Y	FABP6	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	104785	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	163370663	163370808	163370730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2B	442543	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	589726	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	167241894	167242222	167242118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	474434	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	167372516	167372785	167372694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	343871	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	172202171	172203025	172202666	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	5973	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	172205264	172205447	172205353	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP1	9066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr5	172228151	172228566	172228394	Y	DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	30712	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr5	172264744	172264958	172264926	Y	DUSP1,C5orf41,ERGIC1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	5466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	172313877	172314602	172314167	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	54599	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr5	172327024	172327318	172327167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	56414	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr5	172328085	172328386	172328247	Y	DUSP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	55346	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	22163	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	173251298	173251668	173251379	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	61615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	173846628	173846975	173846845	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	302561	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr5	178034122	178034420	178034258	Y	ZNF354B,AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	NA	NA	NA	NA	COL23A1	18566	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	SQSTM1	24980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	MAPK9	907	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	180541875	180541994	180541989	Y	OR2Y1	NA	BTNL8,MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	74930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr6	2875221	2875651	2875270	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	34981	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	2992078	2992424	2992251	Y	NA	SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2	NA	NA	NA	NA	NQO2	5857	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	3511713	3512018	3511866	Y	NA	NA	PXDC1,SLC22A23	IMR90	Hi-C	24141950	SLC22A23	56457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	4358823	4359231	4358978	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	224992	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	5246431	5246752	5246693	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	LYRM4	12420	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	5280343	5280601	5280557	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	21066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	737155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	6467672	6467854	6467760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	637976	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	6469397	6469651	6469485	Y	LY86	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	636179	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	6678540	6678781	6678655	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	427049	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	6694635	6694734	6694680	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	411096	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	6712780	6713068	6712936	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	392762	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr6	6811454	6812228	6812086	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	293602	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	6856813	6857789	6856950	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	248041	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	6879215	6879409	6879309	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	226421	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	6881907	6882296	6882232	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	223534	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	6885637	6886125	6885854	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	7074033	7074425	7074227	Y	LY86,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	31405	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	7130548	7130794	7130662	Y	RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	24718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	7143191	7143555	7143322	Y	NA	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	37361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	7532623	7532708	7532667	Y	NA	DSP	CAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	DSP	7100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	7692548	7692711	7692643	Y	NA	BMP6	PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	32319	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr6	10458287	10458428	10458359	Y	NA	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	40395	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	11459328	11459680	11459376	Y	NA	NA	NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD9	78747	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	12577591	12578036	12577836	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	65249	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	13354550	13354809	13354680	Y	NA	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	27735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	13396164	13396432	13396321	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	69349	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	13636617	13636971	13636795	Y	TBC1D7,GFOD1,CD83	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	23058	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	13766479	13766874	13766549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	56683	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	14211875	14212265	14212161	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	96003	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	14884214	14884345	14884265	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	360182	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	15062704	15063082	15062942	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	181445	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	16420932	16421664	16421198	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	184121	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	86239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	16712557	16713382	16713252	Y	ATXN1	ATXN1	NA	NA	NA	NA	ATXN1	46340	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	17864491	17864751	17864619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	121103	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	18341418	18341503	18341461	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF144B	25276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	18343795	18344357	18344138	Y	RNF144B	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	22422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	18412355	18412775	18412483	Y	NA	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	45576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	18419977	18420304	18420012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	53198	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	19477913	19478110	19478022	Y	ID4	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	324873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	19819390	19819399	19819395	Y	NA	RP4-625H18.2,ID4	ID4	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID4	16218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr6	20575670	20575691	20575681	Y	NA	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	42982	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	21129910	21130117	21129994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	461855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	24799813	24800204	24799968	Y	DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1	GMNN	NA	NA	NA	NA	GMNN	26654	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	25497718	25497827	25497789	Y	TRIM38	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	220412	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr6	26016753	26016987	26016816	Y	HIST1H1A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	26143490	26143769	26143630	Y	NA	HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D	NA	NA	NA	NA	HIST1H1E	10790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	26304989	26305345	26305268	Y	NA	HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H4H	21227	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	28080593	28080792	28080693	Y	NA	ZNF165,ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	28188130	28188520	28188276	Y	ZNF193	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	36491	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	28299231	28299616	28299424	Y	GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	16075	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	28302002	28302386	28302196	Y	NA	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	13305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr6	29447385	29447671	29447510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLA-F	240881	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	26974	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.48914236706064
chr6	32072186	32072277	32072232	Y	C2,TNXB	ATF6B,FKBPL,PPT2	NA	NA	NA	NA	ATF6B	21753	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	32427743	32428120	32427936	Y	PRRT1	HLA-DRA	NA	NA	NA	NA	HLA-DRA	22124	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	33396313	33396709	33396628	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	10466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	33558672	33558897	33558785	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	12653	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	34992488	34992843	34992549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	137446	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	35228332	35228733	35228603	Y	PPARD,ZNF76	ZNF76,DEF6	NA	NA	NA	NA	ZNF76	3646	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	35270455	35270931	35270541	Y	TAF11,ANKS1A,ZNF76,DEF6,PPARD	ZNF76,DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	6860	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	36547678	36548077	36547769	Y	PI16,MTCH1	STK38,SRSF3	STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRSF3	12068	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	36656050	36656213	36656132	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	13745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	36660058	36660307	36660143	Y	FGD2,PXT1,STK38,SRSF3	CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	17753	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	36736958	36737143	36737020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	94653	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	95453	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	36821118	36821514	36821315	Y	NA	C6orf89,PPIL1	CPNE5	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf89	16132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	37024161	37024556	37024514	Y	NA	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	72087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	37190361	37190574	37190538	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	32974	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	37212541	37212901	37212835	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	10647	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	37269905	37270172	37270040	Y	C6orf89,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	TMEM217	45974	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	37745135	37745338	37745265	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	39937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	38450593	38450822	38450666	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	155102	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	41240266	41240381	41240323	Y	NFYA,TFEB,TREML2,TREML4,TREM1	TREM1	NA	NA	NA	NA	TREM1	12076	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	41342006	41342190	41342122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TREM1	89549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	41528607	41528881	41528714	Y	TAF8,CCND3,NFYA,TFEB	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	14248	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	41612844	41613289	41612975	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	10224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	42067343	42067714	42067701	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	40643	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	43635973	43636240	43636108	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	17288	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	43977606	43978027	43977822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	114624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44010067	44010199	44010133	Y	C6orf223	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	82452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	80166	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44019349	44019523	44019394	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,VEGFA,MRPS18A,MAD2L1BP,C6orf223	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	73128	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44026121	44027353	44026480	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	65298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44031882	44032664	44032378	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	59987	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	47978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44052522	44052743	44052633	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11,MRPL14,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	39908	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	44618318	44618334	44618326	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	265056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	44887030	44887214	44887174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	456476	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	46784396	46784595	46784543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	165718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	47214948	47215452	47215060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	60189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	47637505	47637670	47637588	Y	OPN5,GPR111	GPR111,GPR115	GPR115	IMR90	Hi-C	24141950	GPR115	13930	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	53174339	53174666	53174484	Y	FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	37281	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	53734127	53734150	53734138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	76832	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	56459514	56459884	56459699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL21A1	202622	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	57267458	57267955	57267680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	89855	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	73833038	73833304	73833144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	137634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	73861458	73861626	73861542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	109312	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	74194767	74195136	74194952	Y	NA	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	25466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	78176276	78176348	78176306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	1398841	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	79043157	79043230	79043194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	531959	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	79779425	79779709	79779568	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	6244	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	80777050	80777287	80777243	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	37077	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	88433013	88433258	88433054	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2-AS1,AKIRIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	23086	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	88441576	88441861	88441705	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2,AKIRIN2-AS1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	31649	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	88499265	88499658	88499500	Y	AKIRIN2	NA	ORC3	IMR90	Hi-C	24141950	AKIRIN2	89338	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	89440448	89440768	89440686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	230580	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	89744998	89746016	89745827	Y	UBE2J1,PNRC1	PNRC1	PNRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PNRC1	42454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	90994449	90994671	90994572	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	9956	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	91121051	91121489	91121257	Y	BACH2,BACH2	NA	BACH2,MIR4464	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	116424	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	97681036	97681361	97681334	Y	NA	MMS22L	NA	NA	NA	NA	MMS22L	47732	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	105743987	105744339	105744163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREP	104620	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	106048262	106048533	106048347	Y	NA	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	199303	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr6	106243976	106244328	106244157	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	287867	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	106442094	106442641	106442261	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89554	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	106582399	106582514	106582457	Y	AIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	50204	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	106643011	106643217	106643065	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	110816	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	106645133	106645598	106645505	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	112938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	AIM1	56310	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	110415658	110415810	110415734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF1	83397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	111025527	111025575	111025551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	109586	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	111739300	111739614	111739444	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	63100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	112449250	112449618	112449554	Y	NA	TUBE1	NA	NA	NA	NA	TUBE1	42518	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	113966016	113966399	113966296	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	2877	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	113966975	113967088	113966980	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	2188	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	113975639	113976185	113975774	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	6363	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	114085047	114085453	114085192	Y	MARCKS	NA	LAMA4	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	91088	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	116345065	116345141	116345103	Y	NA	FRK	NA	NA	NA	NA	FRK	34780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	125205098	125205436	125205268	Y	NA	NA	HEY2,RNF217,TPD52L1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF217	76255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	125579970	125580036	125580003	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	41246	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr6	126265741	126265870	126265827	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	10057	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	126267356	126267782	126267584	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	8145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	318120	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	129480057	129480411	129480316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	548959	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	130069572	130069764	130069691	Y	NA	ARHGAP18	ARHGAP18,L3MBTL3	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP18	40202	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	132554019	132554114	132554024	Y	TAAR5	NA	CTGF,LOC100507254,ENPP3,ENPP1	IMR90,K562,GM12878,H1ESC,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	STX7	278223	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	133837061	133837238	133837150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBPL1	434070	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	133843297	133843543	133843427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBPL1	427765	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	133932660	133932952	133932806	Y	NA	NA	MGC34034,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	338356	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	134264415	134264799	134264607	Y	NA	TBPL1	TBPL1,SLC2A12	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TBPL1	6509	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	134504980	134505079	134505030	Y	SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	132171	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	134614780	134615032	134614956	Y	SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	22218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	134620325	134620468	134620398	Y	NA	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	16782	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	134701422	134701794	134701609	Y	NA	NA	ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK1	64172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	136688131	136688248	136688227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	79142	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	136724164	136724966	136724405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	115175	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	136729350	136729610	136729525	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	120361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	136788990	136789214	136789102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	80743	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	136795244	136795664	136795596	Y	MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	74293	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	136839838	136840084	136840036	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	29873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	136907576	136907759	136907659	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	37619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	137082760	137083090	137082822	Y	MAP3K5	MAP3K5	NA	NA	NA	NA	MAP3K5	28566	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	137242009	137242335	137242164	Y	IL20RA,SLC35D3	SLC35D3	NA	NA	NA	NA	SLC35D3	607	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	137310723	137310892	137310775	Y	IL20RA,SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	IL20RA	53406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	137538142	137538256	137538167	Y	NA	IL22RA2,IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	330	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	138352596	138352732	138352664	Y	PERP	NA	KIAA1244,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PERP	73916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	138353138	138353418	138353320	Y	PERP	NA	PERP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PERP	73230	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	138353782	138354071	138353975	Y	NA	NA	PERP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PERP	72577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	138421052	138421264	138421123	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	5384	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	138890859	138891324	138891176	Y	PBOV1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	168191	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	143174967	143175237	143175142	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	89101	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	143329201	143329459	143329330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	50174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	143516746	143517148	143516792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	137113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	144007310	144007644	144007477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	151328	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	144474457	144475387	144474631	Y	PLAGL1,STX11	STX11,TPT1P4	NA	NA	NA	NA	STX11	4794	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	144585551	144585700	144585606	Y	NA	NA	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	TPT1P4	65449	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	144668159	144668272	144668217	Y	PLAGL1,STX11	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	148057	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	144982592	144982877	144982735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	462490	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	150200694	150201094	150200866	Y	NA	LRP11,RAET1E,RAET1G	NA	NA	NA	NA	RAET1E	16144	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	150259749	150260211	150260119	Y	NA	RAET1E,RAET1G,ULBP2,ULBP1	NA	NA	NA	NA	ULBP2	925	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	150577051	150577247	150577096	Y	RAET1G,ULBP2,RAET1L,PPP1R14C	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-7P	68652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	150958103	150958422	150958105	Y	PLEKHG1	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	39104	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	150963010	150963101	150963056	Y	PLEKHG1	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	44011	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	43210	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	157162870	157163071	157163026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	65807	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	158136804	158137189	158136890	Y	NA	NA	TMEM242,SNX9,ZDHHC14	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	105107	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	158424430	158424803	158424679	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	23542	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	158640222	158640658	158640460	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	52838	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	159171374	159171393	159171384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	67051	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32527	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	35481	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr6	159359890	159360005	159359951	Y	EZR	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	59214	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	160137124	160138386	160137829	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	6231	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	163098494	163098513	163098505	Y	PARK2,PACRG,PACRG	PARK2	NA	NA	NA	NA	PARK2	48290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	163976539	163976874	163976679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	143507	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	166364914	166365167	166365041	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	32924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr6	166378442	166378825	166378818	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	19266	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr6	166385606	166385834	166385795	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	12257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	166398427	166398527	166398479	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	336	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	166418787	166419137	166419099	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	19251	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	166754936	166755437	166755076	Y	SFT2D1	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	857	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	166901571	166901917	166901742	Y	SFT2D1,RNASET2	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	147492	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	167038809	167038976	167038893	Y	RPS6KA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	278963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr6	169316937	169317104	169317021	Y	NA	NA	WDR27,PHF10,C6orf70,PSMB1,C6orf120	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	598503	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	170501868	170502090	170502073	Y	DLL1	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	95471	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	DLL1	7961	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr7	89354	89662	89513	Y	NA	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	AC093627.10	57935	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	AC093627.10,FAM20C	NA	NA	NA	NA	FAM20C	562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM20C	182125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	949099	949177	949151	Y	ZFAND2A,ADAP1	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	34910	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	988760	989207	989097	Y	ADAP1	ADAP1,COX19,CYP2W1	NA	NA	NA	NA	ADAP1	3836	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.70721376500193
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr7	1574153	1574602	1574313	Y	NA	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5803	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	1598591	1598955	1598779	Y	NA	MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	TMEM184A	134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	2077835	2078163	2078150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	192715	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	2773642	2774144	2773933	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	99111	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	2800822	2801226	2800961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	72029	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	3018099	3018595	3018309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	62984	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	4747693	4747769	4747737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	66305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	4765280	4765661	4765569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83892	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	TNRC18	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC18	8623	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	5710055	5710429	5710241	Y	WIPI2,WIPI2,TNRC18,FBXL18,USP42,RNF216,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	79616	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	5733977	5734150	5734061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	85220	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	7268746	7268912	7268835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	74181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr7	7896018	7896243	7896099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	110182	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	8165403	8166093	8165752	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	133770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	8171530	8172177	8171751	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	127686	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	17139132	17139382	17139242	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	196864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	17315787	17316189	17315986	Y	NA	AHR,AC003075.4	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	20057	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC019117.1	151509	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	20123446	20123761	20123595	Y	TWISTNB,ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	83100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	21502446	21502711	21502550	Y	SP4	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	36794	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	22614875	22615270	22614981	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	65257	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	381465	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53333	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	24947142	24947425	24947387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	71828	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	26589150	26589521	26589235	Y	SNX10	NA	LOC441204,KIAA0087	IMR90	Hi-C	24141950	AC004540.5	152937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	26697823	26697978	26697927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	261610	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	27206716	27206932	27206874	Y	HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10	HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,HOXA10	NA	NA	NA	NA	HOXA10-AS	478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	TAX1BP1	100017	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	28205904	28206253	28206092	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	12109	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	28450839	28451193	28451101	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	113899	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	28471608	28471631	28471619	Y	CREB5,CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	134668	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	29294942	29295238	29295004	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	61875	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	30264220	30264659	30264440	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	57264	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	30265497	30265992	30265714	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	55931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	65766	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS,AC005154.6	NA	NA	NA	NA	AC005154.6	3667	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	31757734	31758047	31757891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	774848	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BBS9	595374	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX20	215061	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	36331807	36331936	36331811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	95479	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	36776109	36776821	36776493	Y	ELMO1,AOAH	NA	ELMO1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0895	348375	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	39115268	39115275	39115272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS41	145274	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	39644763	39645050	39644891	Y	RALA	YAE1D1,RALA	LINC00265	IMR90	Hi-C	24141950	RALA	16032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	40938770	40939089	40938937	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	CDK13	951134	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	42118085	42118260	42118176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	157209	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	42145452	42145673	42145563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	129796	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	42258020	42258279	42258155	Y	GLI3	GLI3	NA	NA	NA	NA	GLI3	17190	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	NA	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	PSMA2	147408	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr7	43801940	43802267	43802061	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	5661	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	44658456	44658730	44658526	Y	PURB,TMED4,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	14285	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	46691155	46691159	46691157	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	316141	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	46691314	46691685	46691473	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	315615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	47343610	47343904	47343861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	276252	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	50807671	50808051	50807982	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	51108	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	50948563	50948792	50948678	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89404	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	51189835	51190140	51189988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBL	192375	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr7	51417920	51418197	51418059	Y	NA	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	35405	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	55142882	55143327	55143024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	58168	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	55235458	55235690	55235573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	150744	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	55436942	55437154	55437048	Y	NA	LANCL2	NA	NA	NA	NA	LANCL2	5801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	55638699	55638887	55638779	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	18	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	65715824	65716062	65715909	Y	RABGEF1,KCTD7	TPST1	NA	NA	NA	NA	TPST1	47638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	70206735	70207047	70206891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	2089730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	73641053	73641366	73641100	Y	LIMK1,LAT2	LAT2,RFC2	NA	NA	NA	NA	RFC2	25408	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	73869161	73869472	73869346	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3041	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	73915723	73915843	73915806	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	49603	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	73989785	73989913	73989858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	80081	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	74020286	74020548	74020393	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	49446	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	74057565	74058043	74057767	Y	LAT2	GTF2I	GTF2I	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	GTF2I	11951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	75253450	75253956	75253637	Y	POR	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P3	97972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	75934206	75934543	75934471	Y	NA	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	4345	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	75993529	75993613	75993570	Y	POR	YWHAG,ZP3	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	86609428	86609776	86609602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	77239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	87918906	87919150	87919043	Y	SRI	STEAP4	NA	NA	NA	NA	STEAP4	15056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.39878537735419
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	AC002076.10	286718	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	BET1	180994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	97763037	97763356	97763224	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	28840	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	97763424	97763629	97763532	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	29227	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	98028342	98028618	98028511	Y	BRI3	RPS3AP26	NA	NA	NA	NA	BAIAP2L1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	99966641	99967146	99966944	Y	C7orf59,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	29110	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	100952176	100952182	100952179	Y	NA	RABL5	NA	NA	NA	NA	RABL5	10922	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	101377148	101377442	101377338	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	79517	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	101707897	101708291	101708217	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	250938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	101789481	101789757	101789558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	212562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	128808	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	104614051	104614727	104614598	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	36764	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	104626890	104627731	104627241	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	23760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	104684659	104684988	104684665	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	33168	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	104842983	104843396	104843385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	191492	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	106089773	106090176	106089868	Y	NAMPT,PIK3CG	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	165001	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	106358724	106358979	106358846	Y	NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-884M6.1	54478	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC003088.1	153741	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	325972	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	111156714	111156954	111156834	Y	NA	IMMP2L	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	43619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	112224523	112224575	112224552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFRD1	163500	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	115721454	115721656	115721555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TES	126891	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	115849891	115849987	115849939	Y	NA	TES	NA	NA	NA	NA	TES	1344	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	116804623	116804954	116804811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	212235	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	117472298	117472618	117472458	Y	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	349468	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	122310921	122310935	122310929	Y	TAS2R16	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS2	213878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	126894131	126894431	126894281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	175547	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	129598516	129598781	129598654	Y	NRF1,UBE2H,UBE2H	UBE2H	UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2H	7727	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	129650131	129650429	129650342	Y	NRF1	ZC3HC1	NA	NA	NA	NA	ZC3HC1	38862	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr7	130636331	130636776	130636707	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	40262	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130695403	130695870	130695708	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	96985	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130720133	130720826	130720768	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	72029	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	130799789	130800044	130799917	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	6854	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	132484487	132484560	132484524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	280288	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	132660683	132660693	132660688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	104155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	157112	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	134247089	134247493	134247269	Y	LRGUK	AKR1B10,AKR1B15	NA	NA	NA	NA	AKR1B15	15201	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	134475089	134475514	134475151	Y	CALD1	CALD1	NA	NA	NA	NA	CALD1	48086	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	134521262	134521714	134521389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	94259	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr7	135809318	135809401	135809360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	149217	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	137402741	137402885	137402822	Y	DGKI	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	126953	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	138779904	138780459	138780182	Y	NA	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	12006	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	139865327	139865485	139865448	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	NA	NA	NA	NA	PARP12	103806	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr7	143111009	143111369	143111185	Y	OR6V1,TAS2R41	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	EPHA1	7024	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	146573041	146573429	146573238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	1702064	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	150944094	150944397	150944255	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16519	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	150952931	150953287	150953115	Y	SMARCD3	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	SMARCD3	19695	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	151182414	151182755	151182660	Y	AGAP3,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	32451	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	151282868	151283053	151282986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	67662	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	151823102	151823484	151823293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	102343	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	152123020	152123275	152123182	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	8705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	87147	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	156444597	156444947	156444772	Y	NA	RNF32,C7orf13	NA	NA	NA	NA	C7orf13	13249	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	157943729	157944143	157943925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	551377	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	158196067	158196294	158196241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	299226	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.70721376500193
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	158609735	158609944	158609833	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	11000	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr7	158765978	158766170	158766074	Y	NA	NA	NCAPG2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR60	118709	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	1693210	1693378	1693280	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	8566	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	1873813	1874239	1874091	Y	KBTBD11	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	45805	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	60983	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	6721983	6722491	6722202	Y	NA	XKR5,DEFB1	NA	NA	NA	NA	DEFB1	11053	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	6722894	6722949	6722922	Y	NA	XKR5,DEFB1	NA	NA	NA	NA	DEFB1	10595	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	8787622	8787836	8787719	Y	NA	MFHAS1	MFHAS1,FLJ10661,SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	MFHAS1	38467	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr8	9774400	9774769	9774721	Y	TNKS,MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	135009	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	RP1L1	NA	NA	NA	NA	RP1L1	5952	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	15443006	15443379	15443076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	170282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	15546823	15547116	15546970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	274099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	18854306	18854486	18854451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	85754	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	18953463	18953695	18953605	Y	NA	PSD3	LOC100128993,CSGALNACT1,PSD3,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	13223	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	19066932	19067320	19067099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	101808	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	19319707	19319767	19319737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	150579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	19341372	19341590	19341526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	172244	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	19533548	19533780	19533688	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	79760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	19557842	19558052	19557944	Y	NA	NA	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	55488	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	19797796	19798054	19797934	Y	LPL	NA	NA	NA	NA	NA	INTS10	125145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1,PHYHIP	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22103553	22103662	22103605	Y	NA	PHYHIP,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	POLR3D	2936	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22240884	22241560	22241218	Y	C8orf58	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	18122	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22395519	22395867	22395693	Y	PPP3CC	RP11-382J24.2,SORBS3,PDLIM2	NA	NA	NA	NA	SORBS3	4632	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22535910	22536200	22536167	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	11249	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22778460	22778609	22778534	Y	CHMP7	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	64321	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	23390028	23390384	23390041	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	5710	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	23411826	23412031	23411908	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	27508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	24013716	24014104	24013764	Y	STC1	NA	STC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-148P	81045	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	25284653	25284746	25284700	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	KCTD9	29246	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	137853	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	27247455	27247667	27247558	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	80456	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	80225	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	28874740	28875053	28874870	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	36399	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	29204481	29204724	29204678	Y	NA	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	1461	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	29412862	29413263	29412985	Y	DUSP4,DUSP4	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	206677	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr8	33422539	33422669	33422567	Y	RNF122	NA	NA	NA	NA	NA	RNF122	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.01564215264967
chr8	37574092	37574593	37574403	Y	NA	ZNF703,ERLIN2,PROSC	NA	NA	NA	NA	ERLIN2	17524	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	37738160	37738666	37738484	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	16319	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	37760968	37761285	37761070	Y	RAB11FIP1	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	5983	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	38216773	38217155	38217067	Y	WHSC1L1,LETM2	WHSC1L1	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	20635	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	38313401	38313535	38313485	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	10817	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	38816649	38817007	38816807	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	TM2D2	35336	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	41160567	41160649	41160637	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	4367	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	42184337	42184357	42184347	Y	NA	POLB	NA	NA	NA	NA	POLB	9615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr8	42338924	42339272	42339098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	55797	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	42370484	42370865	42370805	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	24204	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	46856094	46856491	46856295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	1210250	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	47885401	47885427	47885415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	181314	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	48294076	48294490	48294332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	208681	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	48295911	48296182	48296008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	206989	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	48343978	48344357	48344119	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	158814	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	77792	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	48580617	48580970	48580793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	68678	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	49606082	49606224	49606171	Y	NA	EFCAB1	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	EFCAB1	39646	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	49611840	49612006	49611979	Y	SNAI2	EFCAB1	NA	NA	NA	NA	EFCAB1	33864	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	49701443	49701572	49701502	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	EFCAB1	55573	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	59529081	59529390	59529262	Y	SDCBP	NSMAF	NA	NA	NA	NA	NSMAF	41013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr8	62600598	62600698	62600684	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	24457	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	66863437	66863842	66863510	Y	PDE7A	NA	PDE7A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE7A	110880	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	71968659	71968838	71968749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LACTB2	389250	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	72743502	72744020	72743667	Y	NA	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	RP11-383H13.1	5100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	236574	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	395514	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	80701258	80701483	80701350	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	23160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	81615108	81615487	81615408	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	219254	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	81893837	81894122	81894063	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	128181	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	82044899	82045275	82045238	Y	PAG1	PAG1	PAG1	IMR90	Hi-C	24141950	PAG1	22596	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	86870702	86870997	86870771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	481970	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	87404027	87404214	87404101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	51060	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE3	178901	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	91479808	91480381	91480048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	321479	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	95943173	95943450	95943312	Y	NA	CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3	NA	NA	NA	NA	TP53INP1	16189	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	97173806	97174188	97174149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRB	71674	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	99225483	99225848	99225614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	78773	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	100461450	100461455	100461453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13B	437956	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.74457118353032
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	101455424	101455703	101455525	Y	PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	108978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	101484105	101484411	101484224	Y	NA	NA	SPAG1,RNF19A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	85601	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	101500158	101500422	101500292	Y	NA	NA	RNF19A,GRHL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	69590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	101774635	101775034	101774843	Y	RNF19A,YWHAZ	PABPC1	PABPC1,SNX31	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PABPC1	41598	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	101880714	101880933	101880768	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	YWHAZ,ZNF706	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAZ	82683	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	101887203	101887360	101887288	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	YWHAZ,ZNF706	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAZ	76256	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	102665065	102665479	102665281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHL2	162405	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	84763	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	103757592	103757997	103757773	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	91462	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	100344	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	103803215	103803631	103803453	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	70897	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	113558737	113559137	113558937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	827761	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	117711370	117711748	117711590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	64994	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	118958698	118959000	118958912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	163092	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	119013126	119013396	119013387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	108696	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	120288665	120289048	120288857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	113392	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	123957674	123957774	123957724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	94889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	125646597	125646950	125646829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	91780	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	125656235	125656588	125656492	Y	ZNF572,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	82142	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	125666841	125667071	125667041	Y	RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	71659	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128048074	128048382	128048201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	180951	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	128257606	128258262	128257899	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	28273	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128403573	128403875	128403698	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	174240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128578179	128578386	128578271	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	167294	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128684618	128684766	128684674	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	60914	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	128879185	128879808	128879466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	74406	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	16124	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	548193	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	130697904	130698138	130698105	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	GSDMC	98996	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	130703284	130703457	130703434	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSDMC	93677	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	130983929	130984348	130984047	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	43027	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	131007390	131007737	131007622	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	19638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	131012344	131012436	131012358	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	14939	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr8	131364558	131364729	131364627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	89177	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	131495645	131495684	131495664	Y	NA	ASAP1	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	41739	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	133508104	133508400	133508366	Y	NA	NA	KCNQ3,LRRC6	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC6	177438	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	134190473	134190743	134190608	Y	ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1	NA	TG,SLA,PHF20L1	IMR90	Hi-C	24141950	NDRG1	121522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr8	134258134	134258466	134258300	Y	PHF20L1,NDRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	53799	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	134287657	134287800	134287798	Y	NA	NDRG1,CTC-458A3.1	NA	NA	NA	NA	NDRG1	24465	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	CTC-458A3.1,ST13P6	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-458A3.1	32254	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	135635794	135636288	135636020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	87004	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	142289630	142289814	142289772	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	26590	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	142355986	142356286	142356136	Y	NA	SLC45A4,PTP4A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	39582	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	142386413	142386490	142386444	Y	GPR20	PTP4A3	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	13603	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	143757526	143757895	143757616	Y	NA	PSCA,JRK,LY6K	NA	NA	NA	NA	JRK	3491	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	144094701	144094997	144094860	Y	LY6K,C8orf55	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	2402	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr8	144107532	144108153	144107940	Y	MAFA	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	10133	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr8	144959402	144959607	144959478	Y	C8orf73,MAPK15,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	PLEC,NRBP2,PUF60	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	8770	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.27107096911935
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr8	146047058	146047297	146047178	Y	ZNF34	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	3552	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	278768	279182	278781	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	65914	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	749759	749963	749884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	281468	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	758228	758480	758338	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	289937	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	2839342	2839735	2839533	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	2506	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	208873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	4829866	4830028	4829909	Y	NA	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	18263	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	5893266	5893397	5893330	Y	MLANA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	62149	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	5901129	5901190	5901160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	70012	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	11.7758554888296
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	14213496	14213805	14213615	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	183177	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr9	15306066	15306408	15306119	Y	NA	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	708	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	15477137	15477463	15477300	Y	NA	PSIP1,FTH1P12	NA	NA	NA	NA	PSIP1	31554	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	18438830	18439003	18438962	Y	NA	NA	FAM154A,ADAMTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-296P7.4	585887	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	21576231	21576644	21576439	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	18563	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	21589940	21590292	21590223	Y	IFNW1,IFNA6,IFNA1	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	32272	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	21685022	21685416	21685227	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	115126	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	21696721	21697113	21696912	Y	IFNA8	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103429	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	21964976	21965347	21965178	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	27953	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	22026827	22027085	22026888	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	16673	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	22408637	22408662	22408639	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	36178	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	23622735	23622745	23622740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	1177895	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	27333351	27333416	27333383	Y	IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	194363	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	28365593	28365784	28365689	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	837814	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	32429787	32430147	32430005	Y	NA	ACO1	NA	NA	NA	NA	ACO1	47169	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	32443270	32443461	32443367	Y	TOPORS,DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	60652	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	33151008	33151398	33151341	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	13956	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	33158582	33158891	33158872	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	6463	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	33159013	33159478	33159222	Y	DNAJA1,NFX1,CHMP5,B4GALT1,SMU1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	5876	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	33159697	33160189	33160012	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	5165	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.96264258147161
chr9	33162668	33163130	33162954	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	2224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr9	33164497	33164994	33164772	Y	APTX,APTX,APTX,SMU1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	360	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.48914236706064
chr9	33268680	33268843	33268732	Y	NA	BAG1,CHMP5,NFX1	NA	NA	NA	NA	CHMP5	5740	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr9	33445339	33445789	33445589	Y	AQP3	NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	33446270	33446740	33446527	Y	SMU1,BAG1,NFX1,AQP3	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	661	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	33613912	33614120	33614004	Y	PRSS3	ANXA2P2	NA	NA	NA	NA	ANXA2P2	8103	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	34158490	34158839	34158617	Y	NA	DCAF12,UBAP1,AL353662.2	DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBAP1	18164	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	34233080	34233513	34233116	Y	NA	AL353662.2,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-571F15.3	10454	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	34375136	34375287	34375212	Y	NA	KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	285	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	34994561	34994784	34994673	Y	NA	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	DNAJB5	6923	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	42928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	107013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	4538	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	37908726	37909073	37908864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	109292	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	38035956	38036107	38036020	Y	NA	RP11-613M10.9,SHB	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	30577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	66471270	66471410	66471340	Y	NA	NA	LOC642236	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-764K9.4	1981965	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	59201	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	72344996	72345326	72345161	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	27549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	73021440	73021667	73021582	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5873	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chr9	73145053	73145085	73145070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	117513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	75200734	75200878	75200827	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	222571	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	75201715	75201894	75201832	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	223552	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	75797609	75797655	75797632	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	32936	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	85888522	85888919	85888721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439K3.1	56276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	88329158	88329382	88329166	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	25562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	91381840	91381977	91381906	Y	NA	NA	SHC3,MIR4289,LOC286238,SPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR3	222385	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr9	91841165	91841448	91841286	Y	NA	NA	SHC3,LOC286238	IMR90	Hi-C	24141950	CKS2	82665	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	93683361	93683758	93683679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYK	121292	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	LINC00484	NA	NA	NA	NA	LINC00484	35388	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	LINC00484	NA	NA	NA	NA	LINC00484	36136	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	93960145	93960482	93960197	Y	SYK,SYK,NFIL3	LINC00484	NA	NA	NA	NA	LINC00484	40290	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	94182259	94182597	94182338	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	1547	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	94587450	94587551	94587492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	122893	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	94614253	94614381	94614318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	96063	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr9	95442702	95442889	95442796	Y	IPPK	IPPK	IPPK	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPPK	12155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	95882095	95882646	95882428	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	11924	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	96057493	96057765	96057581	Y	ZNF484,ZNF484,C9orf129,WNK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120A	154239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr9	97411409	97411895	97411585	Y	ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3	FBP1	FBP1,FANCC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBP1	10878	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	97590305	97590486	97590422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	103322	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	97685167	97685467	97685319	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	198184	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	97715207	97715319	97715263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	228224	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	97969652	97969878	97969805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	108113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	85934	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	98583076	98583344	98583210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	52915	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	99334926	99335181	99335054	Y	NA	CDC14B	HABP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC14B	44931	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	FOXE1	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	47272	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	100969722	100969939	100969831	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	16800	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	101011075	101011589	101011252	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	4326	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	101015938	101016120	101016078	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	23	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	101366138	101366500	101366319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS6	190747	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	107640582	107640899	107640765	Y	NA	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	47619	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	18793	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	107983498	107983520	107983511	Y	NA	SLC44A1	SLC44A1,ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A1	21383	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	108042949	108043294	108043141	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	38046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	108166209	108166576	108166239	Y	NA	FSD1L	NA	NA	NA	NA	FSD1L	41501	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	109623887	109624414	109624068	Y	ZNF462	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	509	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	109627297	109627657	109627483	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3919	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	109655091	109655246	109655169	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	31713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	110266981	110267369	110267173	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	16218	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	110390815	110391213	110391017	Y	NA	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	96144	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	110401220	110401740	110401394	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	106549	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	110502996	110503145	110503135	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-438P9.1	208325	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr9	110811401	110811623	110811540	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	516730	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	111313727	111314112	111313882	Y	NA	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-220D10.1	73001	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	112181102	112181354	112181228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN3	77236	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	112238648	112239006	112238827	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	19584	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	114585349	114585680	114585428	Y	NA	C9orf84	MIR3134,C9orf84,SUSD1,UGCG	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf84	30061	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	114819352	114819642	114819392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	116046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	114835497	114835862	114835756	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	99826	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE3	110835	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	117152820	117152929	117152875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	112801	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	117208718	117208968	117208859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	56762	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	117647197	117647589	117647272	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	80791	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	117899267	117899603	117899435	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	20731	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	118953256	118953446	118953306	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA-AS2	95602	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	119066427	119066819	119066625	Y	NA	PAPPA-AS2	NA	NA	NA	NA	PAPPA-AS2	17379	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	123477335	123478104	123478033	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	2587	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	124121200	124121289	124121241	Y	NA	STOM	GSN	IMR90	Hi-C	24141950	STOM	9242	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	124125049	124125440	124125316	Y	NA	STOM	NA	NA	NA	NA	STOM	5091	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	124161523	124161647	124161545	Y	NA	STOM	GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM	IMR90	Hi-C	24141950	STOM	30992	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.14335656088451
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	125109314	125109437	125109338	Y	NA	PTGS1	TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS1	21387	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	125138740	125138980	125138872	Y	OR1L3	PTGS1	NA	NA	NA	NA	PTGS1	7916	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	126169211	126169592	126169399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	140356	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	126419320	126419718	126419519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	270713	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	126683805	126684169	126683927	Y	NA	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	6262	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	127155102	127155374	127155331	Y	DENND1A	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	20349	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	127457265	127457441	127457351	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	38519	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	127509473	127509808	127509481	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	21781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	128275898	128276280	128276126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	191233	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	128299092	128299304	128299184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168209	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	128415828	128415846	128415837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	51667	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	129381004	129381270	129381056	Y	LMX1B	LMX1B	NA	NA	NA	NA	LMX1B	6282	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	130332837	130333195	130333149	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	6073	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	C9orf117,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	C9orf117	5376	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	131645612	131645749	131645679	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1	NA	NA	NA	NA	CCBL1	2839	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	131660472	131660616	131660545	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1,DOLK,NUP188	NA	NA	NA	NA	CCBL1	17699	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	RP11-344B5.2	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-344B5.2	1769	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	132107499	132107735	132107644	Y	TOR1B,C9orf106	RP11-65J3.1	IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,ASB6,METTL11A,PPP2R4	H1ESC,HELA,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	RP11-65J3.1	14920	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132114054	132114292	132114085	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	21475	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	132114489	132114812	132114671	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	21910	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132115283	132115797	132115318	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	22704	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chr9	132176730	132177172	132176936	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	66558	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.92528516294322
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132385793	132386123	132385875	Y	C9orf106,TOR1B,PRRX2	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	ASB6	16321	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	132814142	132814504	132814316	Y	TOR1B	FNBP1,GPR107	NCS1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR107	437	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	134114047	134114338	134114158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP214	115099	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	134131602	134132161	134131829	Y	RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A	NA	NA	NA	NA	NA	NUP214	132654	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	134460892	134461019	134460973	Y	FAM78A,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	56237	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	134553923	134554245	134554041	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	59216	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	134619507	134619884	134619596	Y	FAM78A,RAPGEF1	RAPGEF1	RAPGEF1	K562	ChIA-PET	22265404	RAPGEF1	6046	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	134908976	134909021	134908999	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	44274	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	134913456	134913470	134913463	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	39825	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	135481058	135481229	135481144	Y	CEL	NA	NA	NA	NA	NA	GTF3C4	62193	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	135995063	135995322	135995085	Y	RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	41979	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	136001171	136001330	136001249	Y	SLC2A6,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	35971	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	3.48914236706064
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	137030495	137030803	137030732	Y	NA	WDR5	NA	NA	NA	NA	WDR5	32008	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	137215635	137215833	137215709	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	8691	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	137247900	137248164	137247916	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	40956	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	5.45178494853224
chr9	137259692	137260046	137259796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	52748	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.1807139794129
chr9	137267558	137268069	137267755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	60614	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	137272864	137273054	137272976	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	65920	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	137302036	137302210	137302202	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	95092	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr9	137788032	137788280	137788155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	176988	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	138764440	138764927	138764627	Y	NA	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	32147	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	138796932	138797111	138797062	Y	CAMSAP1	RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	138818727	138819161	138818918	Y	CAMSAP1,CARD9	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	21069	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	139591698	139592004	139591952	Y	C8G	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	AGPAT2	11823	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	2.61685677529548
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.30842838764774
chr9	140205114	140205300	140205216	Y	PNPLA7,NOXA1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	10411	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	140301767	140302162	140302062	Y	NA	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	13552	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	2301315	2301326	2301321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED1	115682	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	2625453	2625758	2625570	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99,ARSD	CD99,XG	NA	NA	NA	NA	CD99	18233	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	2626302	2626463	2626390	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX	CD99,XG	NA	NA	NA	NA	CD99	19082	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	2628097	2628730	2628199	Y	NA	CD99,XG	NA	NA	NA	NA	CD99	20877	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	3263317	3263504	3263415	Y	NA	MXRA5	NA	NA	NA	NA	MXRA5	635	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	180061	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	10547215	10547494	10547354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	302279	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	11158305	11158560	11158458	Y	ARHGAP6	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	30884	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	GPX1P1	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPX1P1	21166	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	14040371	14040544	14040433	Y	NA	GEMIN8	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	5468	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	202332	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	19859063	19859320	19859184	Y	SH3KBP1	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	44399	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	22007452	22007864	22007637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	50761	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	22015039	22015434	22015124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	58348	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	23799321	23799855	23799568	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	31	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	23919211	23919551	23919376	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	4506	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX,ZFX-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFX-AS1	21934	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	30679380	30679764	30679404	Y	NA	FTLP2	NA	NA	NA	NA	FTLP2	32965	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	38338792	38338989	38338897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN7	79634	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	39964938	39965503	39965246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69079	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	40841745	40842012	40841881	Y	NA	NA	MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	76508	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	41058503	41058566	41058535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP9X	115615	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	41125005	41125150	41125071	Y	NA	NA	DDX3X,USP9X	IMR90	Hi-C	24141950	DDX3X	65501	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	41242516	41242827	41242698	Y	DDX3X	NA	DDX3X,USP9X	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX3X	51865	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	41308972	41309137	41309059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	118321	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	41538171	41538545	41538500	Y	CASK	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	242171	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	46120012	46120235	46120091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	64845	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	46487332	46487848	46487692	Y	RP2,ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	56113	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	47360973	47361468	47361218	Y	CFP,CFP,ARAF	ZNF41	ZNF41,ARAF,SYN1,TIMP1,MIR4769	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF41	20628	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	48348956	48349364	48349102	Y	PORCN,PORCN,FTSJ1	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	15986	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	53740949	53741249	53741172	Y	KDM5C,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29276	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	57490949	57491197	57490977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	179810	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	64148338	64148413	64148376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	535005	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NLGN3	NA	NA	NA	NA	NLGN3	39172	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.654214193823869
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	88083	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	73756739	73756964	73756863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75488	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	75368142	75368530	75368366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEE1	277516	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chrX	106448636	106449011	106448824	Y	NA	NUP62CL	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	966	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	106804874	106804888	106804884	Y	NA	NA	PRPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PRPS1	64849	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.52649978558903
chrX	106985108	106985412	106985307	Y	TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	33160	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	109382352	109382583	109382468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	138493	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.43614279588258
chrX	110863259	110863845	110863518	Y	NA	EIF4BP7,ALG13	NA	NA	NA	NA	EIF4BP7	542	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	115364202	115364338	115364320	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A14	201452	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	123735078	123735231	123735154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	643016	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	4.14335656088451
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	134718222	134718415	134718313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX26B	65638	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chrX	139521736	139522104	139521978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	496301	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159
chrX	149534295	149534593	149534360	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	6606	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	1.09035698970645
chrX	150347417	150347568	150347539	Y	GPR50	GPR50	NA	NA	NA	NA	GPR50	4292	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	153093734	153093743	153093739	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	277	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	153600469	153600779	153600667	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	227	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.21807139794129
chrX	153829365	153829583	153829391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	G6PD	55578	CAGE	HOKUG	hg19	FANTOM5	0.872285591765159