chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	3398864	3399114	3399029	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	29874	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	3620035	3620325	3620180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRAP73	52710	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	6034742	6034859	6034801	Y	NA	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	KCNAB2	14667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	8875055	8875165	8875110	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	537	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	9889535	9889880	9889709	Y	KIF1B	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	6951	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	11376903	11377179	11377126	Y	NA	UBIAD1	NA	NA	NA	NA	UBIAD1	45640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	11798209	11798600	11798405	Y	FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6	MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	AGTRAP	4068	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	12509354	12509466	12509435	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166271	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	15673118	15673422	15673270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	60969	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	3332	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	40400	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.48768906480945
chr1	17534687	17534794	17534729	Y	NA	PADI1,PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI1	5066	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	19274997	19275345	19275068	Y	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	5835	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	19324821	19325090	19324988	Y	TAS1R2,IFFO2	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2,UBR4	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	43641	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	19360402	19360809	19360663	Y	IFFO2	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	79222	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr1	20780827	20780970	20780908	Y	PLA2G2A	CAMK2N1	OTUD3,LOC339505	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2N1	29743	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	21349725	21349786	21349755	Y	EIF4G3	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48460	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	23113356	23113555	23113472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	78024	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	23123668	23124069	23123697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	88336	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	23387479	23387794	23387637	Y	ZNF436	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	43538	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	24265492	24265740	24265616	Y	SRSF10	RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	8133	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	24680333	24680598	24680466	Y	NA	GRHL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	36521	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	GRHL3,NIPAL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	48021	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	25011612	25011937	25011775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRM1	55405	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr1	27185457	27185720	27185644	Y	C1orf172,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	1913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	28050414	28050762	28050588	Y	NA	STX12	NA	NA	NA	NA	FAM76A	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	31375562	31375695	31375629	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	3913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.31330461156898
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	106986	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	32001284	32001534	32001384	Y	NA	RP11-73M7.1,TINAGL1	NA	NA	NA	NA	RP11-73M7.1	37640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	RP11-73M7.1,TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	23584	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC,KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	33220963	33221073	33221021	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15477	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21088	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33622437	33622835	33622675	Y	PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	22825	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	33716636	33716974	33716805	Y	KIAA1522	ZNF362,AL513327.1	ZSCAN20,PHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF362	3172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	36627717	36628369	36628068	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	8537	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	4.18522687777134
chr1	41343431	41343839	41343651	Y	NA	CITED4	KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	17413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	41823971	41824199	41824094	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1395	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	43426742	43427095	43427089	Y	CLDN19,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4022	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A1-AS1	111089	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	44380893	44381202	44381004	Y	SLC6A9,B4GALT2,ARTN	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	ARTN	15790	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	46009549	46009894	46009666	Y	IPP,GPBP1L1,TOE1,TESK2	MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1,NASP	PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AKR1A1	4321	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	48178329	48178566	48178448	Y	NA	NA	CYP4A22,CMPK1,FOXD2,MGC12982	IMR90	Hi-C	24141950	CMPK1	380860	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	48539473	48539610	48539596	Y	LOC388630	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	371998	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42,LDLRAD1	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	54695028	54695502	54695289	Y	NA	MRPL37,CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	31319	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	57923576	57923755	57923707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	596397	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	9073	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	59083966	59084335	59084186	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42800	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN,LINC01135	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	61549054	61549253	61549232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	220123	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	123576	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	3770	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	78350506	78350835	78350671	Y	FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	1363	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	78386302	78386347	78386324	Y	NEXN	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	34104	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr1	83528650	83529168	83528896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	795538	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr1	85005554	85005595	85005576	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	32568	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	85313015	85313206	85313127	Y	GNG5,MCOLN2,LPAR3,C1orf52,BCL10	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	43690	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	85710539	85710684	85710606	Y	NA	SYDE2,C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	C1orf52	12671	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	87355999	87356364	87356182	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	21743	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	91322848	91323191	91323185	Y	NA	RP4-665J23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	7641	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	186435	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	92270160	92270686	92270504	Y	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99206	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	93032261	93032386	93032324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	132105	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	92882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.66207351804993
chr1	94161111	94161471	94161388	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	77529	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	95258204	95258621	95258355	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,LOC729970	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	25216	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	95267524	95267667	95267664	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	16170	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	98275580	98275856	98275718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	108749	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	98788970	98789228	98789135	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SNX7	336008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	101313094	101313246	101313170	Y	SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	VCAM1,LOC100128787,CDC14A,SLC30A7,EXTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EXTL2	46308	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	103424078	103424427	103424253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	641886	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	108132692	108133060	108132878	Y	NTNG1,NTNG1,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	535425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	115700	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	110363861	110364229	110364029	Y	GNAI3,AMPD2	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CSF1	86635	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	111677638	111678032	111677835	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	CEPT1	2217	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	111729234	111729498	111729366	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	DRAM2	48396	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	112196411	112196803	112196596	Y	C1orf183,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	DDX20	99064	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	114244987	114245321	114245197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54790	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	NA	NA	NA	NA	NA	NGF	273246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	116291091	116291334	116291215	Y	CASQ2	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL1	108517	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	117424835	117425013	117424940	Y	PTGFRN	PTGFRN	PTGFRN	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	25666	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	119401140	119401399	119401296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX15	128780	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	120692453	120692808	120692620	Y	NBPF7,NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	82213	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439A17.7	648739	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	144908806	144909147	144908897	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	99062	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	85772	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.13892015832851
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	150800498	150800843	150800671	Y	NA	ARNT	NA	NA	NA	NA	ARNT	46401	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM5,THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr1	151943125	151943453	151943289	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	21413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151945068	151945221	151945146	Y	TUFT1,S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	19645	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	151945504	151945625	151945562	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	19241	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151949461	151949565	151949513	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	15301	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	151962641	151962839	151962740	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2027	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11,TCHHL1	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	NA	NA	NA	NA	NA	TCHHL1	56651	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCHHL1	80839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	4.35961133101182
chr1	153285394	153285679	153285564	Y	NA	PGLYRP4,S100A9	NA	NA	NA	NA	PGLYRP4	33637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.58030250369513
chr1	153358841	153359368	153359086	Y	S100A9,S100A12,S100A4,S100A8	PGLYRP4,S100A9,S100A12,S100A8,S100A7A	NA	NA	NA	NA	S100A8	2296	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,S100A14,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	154392646	154393050	154392862	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	16977	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156073142	156073699	156073532	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	22778	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156089405	156089622	156089466	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	25535	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19976	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	11467	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SEMA4A,SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	2989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156133837	156133883	156133860	Y	C1orf182,RHBG,HAPLN2,C1orf61,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,MEX3A,PAQR6,PAQR6	SEMA4A,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	18680	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SEMA4A,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19778	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156676478	156676824	156676750	Y	C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	2870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	157010714	157010878	157010796	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	2284	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	157245880	157246130	157246005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	139614	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	159054764	159054917	159054868	Y	MNDA,IFI16,AIM2	NA	CD1D,IFI16	IMR90	Hi-C	24141950	AIM2	59969	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	159083627	159083815	159083767	Y	NA	AIM2	NA	NA	NA	NA	AIM2	31071	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	160376163	160376541	160376381	Y	NA	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	7787	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	160377718	160378261	160377994	Y	IGSF9	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	9342	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	7.32414703609985
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	F11R	292821	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	160737478	160737714	160737604	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	F11R	251424	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	165868061	165868423	165868295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCO1	73069	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	168961520	168961569	168961544	Y	NA	NA	ATP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1B1	111366	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	171652961	171653360	171653094	Y	NA	PFN1P1	NA	NA	NA	NA	PFN1P1	14882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	172150201	172150456	172150219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	260774	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	175158150	175158288	175158209	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	1847	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	175416133	175416252	175416193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	255998	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	178252303	178252477	178252337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	191439	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	179108920	179109313	179109132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	60408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	179997226	179997609	179997386	Y	TOR1AIP1,CEP350	NA	NA	NA	NA	NA	CEP350	75353	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	183166871	183167293	183166889	Y	NA	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	13498	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	183178797	183178927	183178861	Y	NA	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	25424	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	184603995	184604243	184604119	Y	RNF2,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	117804	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	184758240	184758595	184758304	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	36193	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	184828541	184828899	184828707	Y	IVNS1ABP,FAM129A	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	106494	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	185536131	185536449	185536350	Y	NA	NA	IVNS1ABP,SWT1,MIR548F1,HMCN1	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	251670	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	186851648	186851759	186851704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	55563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	187677375	187677585	187677480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	881290	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	192487767	192488105	192487936	Y	RGS1	NA	RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	195208	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	192783033	192783090	192783086	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	6864	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	193726401	193726456	193726429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	637254	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	779842	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	199032913	199033260	199033245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	908820	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	14415	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	201277004	201277220	201277102	Y	NA	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	26424	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	201295169	201295564	201295367	Y	PKP1	PKP1,TNNT2	NA	NA	NA	NA	PKP1	44589	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	201366439	201366550	201366506	Y	PKP1,LAD1	TNNT2,LAD1	NA	NA	NA	NA	LAD1	186	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	203506114	203506504	203506389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	87185	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	203723839	203723956	203723897	Y	NA	ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	38826	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	204349568	204349875	204349782	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	29044	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	204383374	204383435	204383377	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	4455	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	205173095	205173476	205173227	Y	CNTN2,RBBP5,CDK18	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	5251	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	205257253	205257766	205257562	Y	RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	31117	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	205265235	205265548	205265359	Y	TMEM81,KLHDC8A	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	23335	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	205288770	205288915	205288818	Y	TMEM81,RBBP5,NUAK2	NA	NA	NA	NA	NA	NUAK2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	207063537	207063710	207063660	Y	RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	5078	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	435	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	207203424	207203586	207203506	Y	C1orf116	C1orf116,PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	C1orf116	515	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209528830	209529176	209528970	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	70989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr1	209538127	209538433	209538258	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR205HG	61732	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209542596	209542897	209542763	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	57268	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209556903	209557123	209556922	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	43042	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	27808	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209577571	209577627	209577601	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	22538	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	21346	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	209589374	209589797	209589586	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR205HG	10368	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	209590107	209590333	209590233	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR205HG	9832	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr1	209600780	209600928	209600808	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	615	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	209601291	209601611	209601405	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	1126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	12.0325272735926
chr1	209766433	209766919	209766698	Y	CAMK1G	RP1-272L16.1	NA	NA	NA	NA	RP1-272L16.1	27415	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209783856	209783983	209783869	Y	NA	RP1-272L16.1,LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	39828	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209798058	209798744	209798639	Y	NA	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	25067	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209806744	209806957	209806914	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	16854	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209827285	209827712	209827546	Y	LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	3474	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209828801	209829023	209828911	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	4990	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	209830400	209831026	209830727	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	6589	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209938931	209939742	209939534	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3,C1orf74	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	16162	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	209978699	209978810	209978755	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6	C1orf74,IRF6,DIEXF	NA	NA	NA	NA	IRF6	1234	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	210442761	210442899	210442830	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	38617	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	211780151	211780642	211780410	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1	K562	ChIA-PET	22265404	SLC30A1	30067	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	212256975	212257253	212257095	Y	DTL,INTS7	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	33604	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	212311960	212312104	212312056	Y	PPP2R5A	NA	PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL21P28	88589	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	212671541	212672116	212671670	Y	NA	NA	ATF3,NSL1,TATDN3,BATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	64560	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	214490616	214490868	214490808	Y	SMYD2	SMYD2	NA	NA	NA	NA	SMYD2	38171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	215132018	215132196	215132107	Y	KCNK2	NA	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	89941	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	115805	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	219264603	219264919	219264762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	80267	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	220510650	220511010	220510830	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	66854	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	NA	NA	NA	NA	NA	MARC2	50705	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	222002644	222003471	222003177	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	89126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.8364579712904
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	227499470	227499818	227499796	Y	NA	CDC42BPA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	4357	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	109840	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	110504	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RAB4A	15711	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	231868761	231869568	231868969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSNAX	206362	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	232428903	232429197	232429192	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	536736	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	232454898	232455086	232454992	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	510847	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	233763307	233763375	233763341	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15557	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	234767593	234767925	234767750	Y	TARBP1	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	24322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	49383	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	NA	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	50663	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	115572	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	164880	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	3148	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	19535	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	235842870	235843206	235843038	Y	NA	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	30816	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	236083263	236083651	236083332	Y	GPR137B	LYST	LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	38323	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	236579529	236579860	236579770	Y	MTR,LGALS8,EDARADD	NA	NA	NA	NA	NA	ENO1P1	64605	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	236658748	236658778	236658775	Y	NA	ENO1P1,LGALS8	NA	NA	NA	NA	ENO1P1	14283	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr1	241364891	241365186	241365103	Y	RGS7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	204797	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	241392345	241392701	241392526	Y	RGS7,KMO	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	232251	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	25016	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	243487001	243487352	243487082	Y	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	69681	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	243688123	243688227	243688212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	270803	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	243893800	243893985	243893919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	118396	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.31330461156898
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	246147829	246148201	246147973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	520413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	247295865	247296225	247296038	Y	ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	30191	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	3710838	3711066	3710976	Y	KLF6	NA	KLF6	K562	ChIA-PET	22265404	KLF6	114407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	3797195	3797502	3797389	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	27971	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	3807382	3807563	3807453	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	17910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	3852273	3852886	3852712	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	26800	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	4712833	4713220	4712996	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	5126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	118302	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	5334474	5334640	5334544	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	117874	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML5,CALML3	NA	NA	NA	NA	CALML5	8200	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	CALML5,CALML3,RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	CALML3	23957	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	5608647	5608913	5608759	Y	NA	CALML3,RP13-463N16.6,RP11-336A10.5,RP11-336A10.4	NET1,CALML5	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-463N16.6	27168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6,RP11-336A10.5,RP11-336A10.4	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP13-463N16.6	2782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr10	6017924	6018316	6018090	Y	RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	RP11-536K7.3	NA	NA	NA	NA	IL15RA	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr10	7227327	7227801	7227548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-554I8.2	449983	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	8408171	8408387	8408297	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GATA3	314604	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	9139521	9139818	9139671	Y	NA	NA	TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	GATA3	1045954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	10839185	10839573	10839228	Y	CELF2	SFTA1P	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	4242	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	11061356	11061896	11061544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	226413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	14447046	14447458	14447244	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	54683	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	14955590	14955884	14955736	Y	HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2	SUV39H2,DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	SUV39H2	36771	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	15179834	15179919	15179877	Y	NA	RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	28773	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	16548527	16548808	16548668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTER	71585	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	17104584	17104750	17104681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	137303	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	21816987	21817223	21817104	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3871	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	22932460	22932672	22932594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68812	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	23721651	23721890	23721808	Y	OTUD1	OTUD1	OTUD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	OTUD1	4308	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	24754185	24754590	24754306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	256007	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	24917417	24917574	24917542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	93023	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	78620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	29978009	29978233	29978173	Y	SVIL	SVIL	NA	NA	NA	NA	SVIL	45477	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	72739	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	30471622	30471929	30471877	Y	KIAA1462	NA	KIAA1462,SVIL	IMR90	Hi-C	24141950	MTPAP	189448	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	32438322	32438553	32438446	Y	NA	RPS4XP11	KIF5B,ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	48101	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	32606832	32606984	32606880	Y	CCDC7,C10orf68,EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	58742	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	34924725	34924738	34924731	Y	NA	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	26291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	43249248	43249682	43249506	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr10	43635714	43636276	43636098	Y	HNRNPF,HNRNPF,CSGALNACT2	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	3780	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	43936251	43936518	43936384	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	22065	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	47057375	47057652	47057526	Y	NA	NA	GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL	IMR90	Hi-C	24141950	SYT15	87975	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	168349	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	48577583	48577860	48577722	Y	NA	NA	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	224559	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	52085013	52085461	52085351	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	62275	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	54367095	54367120	54367106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	138802	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	60091544	60091861	60091608	Y	IPMK,UBE2D1	UBE2D1	UBE2D1	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2D1	874	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	678826	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	63658924	63659147	63659031	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	93060	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	63778860	63779091	63779011	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	119801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	63823957	63824187	63824054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	164898	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	64413068	64413194	64413115	Y	NRBF2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	149322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	65053315	65053443	65053389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	162265	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	65078745	65079133	65078939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	144589	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	66085994	66086251	66086123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	424989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	68773371	68773438	68773405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	868989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	71386629	71386882	71386756	Y	NA	C10orf35	NA	NA	NA	NA	C10orf35	1125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	73476938	73477043	73477009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	54212	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	74055686	74056073	74056016	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	24008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	74086996	74087315	74087159	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	25673	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	74850921	74850988	74850953	Y	ANXA7,ECD	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	3744	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr10	75653245	75653472	75653359	Y	NA	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	13463	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	76053029	76053199	76053114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	144069	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	76916394	76916800	76916595	Y	MYST4,SAMD8	NA	NA	NA	NA	NA	VDAC2	51112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	77155063	77155414	77155221	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4250	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	79291885	79292096	79291976	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	141919	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	79561522	79561805	79561686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	122573	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr10	80684242	80684460	80684352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	142332	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	80860192	80860276	80860234	Y	NA	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	33400	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	80908110	80909032	80908408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	81318	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	81010188	81010619	81010281	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	94606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	81086644	81087006	81086940	Y	NA	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	18219	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	81191596	81191949	81191846	Y	NA	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	11434	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	NA	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	WAPAL	119278	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD1	78974	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	91055339	91055739	91055572	Y	NA	RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	3973	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	92695341	92695597	92695444	Y	NA	NA	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	RPP30	65868	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	97020432	97020603	97020519	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	28178	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	97048077	97048324	97048201	Y	SORBS1	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	457	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	98455139	98455586	98455510	Y	LCOR,TM9SF3,PIK3AP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP5	52459	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	99305221	99305494	99305441	Y	SFRP5	MMS19,UBTD1,HOGA1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	HOGA1	36586	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	101666342	101666477	101666411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	101199	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	105452274	105452407	105452303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	223556	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	105530330	105530632	105530481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	145331	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	143752	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	105630366	105630555	105630455	Y	GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	45408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	106065321	106065564	106065443	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30598	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	114707857	114707918	114707888	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	91	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	115085951	115086304	115086160	Y	CASP7,TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	350638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	116163429	116163722	116163475	Y	AFAP1L2	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	914	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr10	116392908	116393338	116393223	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	49424	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	116556570	116556696	116556633	Y	NA	FAM160B1	AFAP1L2,ABLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160B1	22807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	116902844	116903191	116903017	Y	ATRNL1	NA	NA	NA	NA	NA	TRUB1	206892	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	119107774	119108099	119107936	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24879	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	120591750	120591972	120591861	Y	NA	NA	C10orf46	IMR90	Hi-C	24141950	NANOS1	195256	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	120632969	120633291	120633120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	153937	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	122270774	122271036	122270905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-572P18.1	158056	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	122836934	122837187	122837105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	54050	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.13892015832851
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr10	126373894	126374059	126373997	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	56779	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	126411752	126412342	126412027	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	18496	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	127130064	127130207	127130136	Y	MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS21P6	276818	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	129948422	129948582	129948473	Y	NA	MKI67	FAM196A,DOCK1,CLRN3,PTPRE,MKI67,GLRX3	IMR90	Hi-C	24141950	MKI67	25773	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	134235789	134236113	134236058	Y	NA	PWWP2B	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PWWP2B	27117	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr10	134826942	134827305	134827042	Y	NA	NA	LOC399829,INPP5A	IMR90	Hi-C	24141950	KNDC1	144646	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511	NA	NA	NA	NA	ADAM8	15244	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	4064	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM3	25304	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	741538	741804	741722	Y	IRF7,IRF7	EPS8L2,TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5	NA	NA	NA	NA	TALDO1	3525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	944711	944765	944751	Y	NA	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	21817	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	1328544	1328761	1328705	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	123	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	1339329	1339358	1339344	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	10445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	1936655	1937042	1936845	Y	TSSC4,TSPAN32,C11orf21,TNNI2,LSP1	TNNT3,MRPL23	NA	NA	NA	NA	TNNT3	1750	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	2197020	2197182	2197031	Y	KRTAP5-6,ASCL2,TH	TH	NA	NA	NA	NA	TH	5913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	2200082	2200579	2200535	Y	SYT8,ASCL2,IGF2,TH	TH	NA	NA	NA	NA	TH	8975	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	3190882	3191107	3191009	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	4913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	7719377	7719648	7719531	Y	NA	CYB5R2	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	22924	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	8727919	8728019	8727969	Y	ASCL3	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	25961	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	8756335	8756571	8756455	Y	ST5,ASCL3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL27A	54377	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	9623030	9623285	9623166	Y	ZNF143,WEE1,WEE1	WEE1	NA	NA	NA	NA	WEE1	29802	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	9787824	9788205	9787956	Y	NA	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	9985	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	225973	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	10063724	10063946	10063792	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	249808	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	10510755	10511001	10510868	Y	ZBED5	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	17722	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	10633912	10633952	10633935	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,RNF141	NA	NA	NA	NA	NA	MRVI1-AS1	73093	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	10634601	10634999	10634904	Y	MRVI1,MRVI1,MRVI1	NA	NA	NA	NA	NA	MRVI1-AS1	73782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	7722	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	4368	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12111660	12111980	12111765	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MICAL2	1563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12129916	12130012	12129964	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	16373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr11	12204138	12204505	12204342	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	90595	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	55073	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	14362320	14362599	14362499	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	21453	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	16001674	16002038	16001856	Y	SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	630641	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	16392942	16393234	16393088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	239445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	17335831	17335998	17335921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	108131	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	20072115	20072502	20072253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	310729	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	27235010	27235184	27235094	Y	NA	NA	LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	148231	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	27725050	27725226	27725138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	123823	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	29302148	29302272	29302237	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	579986	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	31489332	31489346	31489341	Y	NA	IMMP1L,ELP4	NA	NA	NA	NA	IMMP1L	39846	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	31946597	31946955	31946776	Y	NA	NA	ELP4,IMMP1L	IMR90	Hi-C	24141950	RCN1	114658	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	33313001	33313236	33313097	Y	NA	HIPK3	NA	NA	NA	NA	HIPK3	36783	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	33394151	33394320	33394196	Y	C11orf41	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	117933	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	34265315	34265482	34265399	Y	ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	90068	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	34331523	34331863	34331783	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	23687	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	34939	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104890	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	35061713	35062540	35061871	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	95039	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	35257615	35257771	35257693	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	99198	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	35527662	35527995	35527828	Y	NA	PAMR1	NA	NA	NA	NA	PAMR1	21853	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	35986660	35987036	35986965	Y	NA	LDLRAD3	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	23129	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	36132577	36133046	36132774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	169046	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	36409166	36409282	36409224	Y	PRR5L,PRR5L,PRR5L	NA	NA	NA	NA	NA	PRR5L	93328	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	36678662	36678763	36678713	Y	PRR5L	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	64611	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	43955473	43955506	43955502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	55112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	45122042	45122442	45122242	Y	PRDM11	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	151202	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr11	45255111	45255224	45255172	Y	CHST1,SYT13	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	284271	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	NA	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	93222	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	46379063	46379180	46379102	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	21126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	46444740	46444848	46444831	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	44434	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	46706691	46706778	46706735	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ARHGAP1	13387	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	46732586	46732756	46732638	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	12218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	46753121	46753488	46753304	Y	F2	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	32753	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	47215723	47215949	47215852	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PACSIN3	9729	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	47226153	47226377	47226265	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2,ACP2	DDB2,PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DDB2	8116	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	48163334	48163507	48163430	Y	OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	163221	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	60871198	60871450	60871295	Y	CD6,SDHAF2,CD5	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37C	55639	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	60917835	60918043	60917849	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	9046	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.23153359721418
chr11	61463458	61463769	61463630	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	NA	NA	NA	NA	NA	FEN1	94340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	62319122	62319673	62319430	Y	WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	AHNAK	IMR90	Hi-C	24141950	AHNAK	2034	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	62588127	62588383	62588260	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	5663	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	63605376	63605474	63605425	Y	FERMT3,LGALS12,RTN3,MARK2	C11orf84,MARK2	NA	NA	NA	NA	MARK2	976	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	66738286	66738892	66738415	Y	POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1	PC,SYT12	PC,SYT12,RHOD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PC	14439	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	67142500	67143040	67142970	Y	CDK2AP2,CLCF1,PPP1CA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	3445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	68110280	68110464	68110374	Y	NA	LRP5	PPP6R3	IMR90	Hi-C	24141950	LRP5	32203	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	127588	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	69927034	69927161	69927098	Y	ANO1	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	4626	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	69965939	69966135	69966116	Y	NA	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	43531	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	70005779	70006157	70005922	Y	ANO1,CTTN,PPFIA1,FADD	FADD	NA	NA	NA	NA	FADD	41112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	70371334	70371589	70371462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	128740	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	71780398	71780482	71780403	Y	IL18BP,IL18BP	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1,FOLR3	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	8900	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	72462370	72462747	72462399	Y	NA	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	39897	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	72546015	72546343	72546157	Y	PDE2A,ARAP1,ARAP1,FCHSD2,ATG16L2	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	22662	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr11	82601745	82602138	82601973	Y	NA	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	6879	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	82781050	82781223	82781203	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	85	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	85849950	85850344	85850227	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	71026	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	85894125	85894474	85894278	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,C11orf73,CCDC83,SYTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EED	59112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	86447030	86447398	86447213	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	52703	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	87871692	87871803	87871780	Y	NA	RAB38	NA	NA	NA	NA	RAB38	34832	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	94574727	94574858	94574795	Y	LOC643037,PIWIL4,KDM4D	NA	NA	NA	NA	NA	CWC15	129918	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	RP11-712B9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	1085	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	95963875	95964372	95964111	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	109972	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	96024131	96024308	96024240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	50036	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	102140637	102141105	102140856	Y	NA	BIRC3	YAP1,BIRC2,MMP20,BIRC3,C11orf70	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	45110	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	102176886	102177264	102177169	Y	NA	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2,BIRC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	8951	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	104579946	104579965	104579955	Y	NA	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CASP4	258198	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	104838372	104838510	104838471	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4	CASP4	NA	NA	NA	NA	CASP4	209	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	104917614	104917898	104917725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CARD17,CASP1	52260	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	113999597	113999969	113999698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	126540	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	114162916	114163328	114163238	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	114224881	114225192	114225037	Y	NA	RBM7,C11orf71	FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM7	43560	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	116310023	116310403	116310367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUD13	331301	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	116802235	116802679	116802498	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	102088	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	118570293	118570500	118570426	Y	MPZL3,CD3E,CD3D,CD3G,UBE4A,MLL,VPS11,RPS25,DDX6,CCDC84	NA	BCL9L,DDX6,CXCR5,MIR4492,FOXR1,UPK2	IMR90	Hi-C	24141950	DDX6	89358	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr11	119540378	119540644	119540511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL1	57150	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	119564027	119564313	119564171	Y	TRIM29,PVRL1	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	33481	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	119703414	119703632	119703459	Y	NA	NA	TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	105620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	121289334	121289764	121289479	Y	SORL1	SORL1	SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	31148	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	121335104	121335660	121335286	Y	SORL1	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	14192	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	16504	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	122614600	122615453	122614815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	90217	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	141044	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr11	125340433	125340486	125340459	Y	PKNOX2,DDX25,FEZ1	FEZ1	NA	NA	NA	NA	FEZ1	23727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	128339730	128340284	128340256	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	115169	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	128376227	128376457	128376317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78996	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	128388897	128389626	128389454	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	65827	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	35899	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	129507501	129507545	129507523	Y	BARX2,NFRKB	NA	BARX2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	176169	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr11	134509789	134510106	134509920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACAD8	388400	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	2467250	2467467	2467306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	355549	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	3326549	3326840	3326665	Y	TSPAN9	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	7453	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	3563518	3563854	3563701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT8	75003	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	4274113	4274463	4274167	Y	CCND2	NA	NA	NA	NA	NA	CCND2	106475	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	45224	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	44613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP4	81609	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	9802084	9802505	9802358	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	NA	NA	NA	NA	NA	DDX12P	203259	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	9855016	9855380	9855049	Y	KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	165355	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	10113074	10113503	10113390	Y	CD69,CLEC2B,OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC12A,CLEC12A	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	92339	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	10116971	10117241	10117106	Y	OLR1,CLEC12A,CLEC12A	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	96236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	10514396	10514426	10514411	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	28	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	11838255	11838510	11838381	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	37467	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	11911642	11913422	11912121	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	110854	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	12038206	12038369	12038301	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	162409	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	88880	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	12592534	12593034	12592768	Y	BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	84521	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	13376628	13377027	13376828	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28978	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	14426552	14426694	14426609	Y	PLBD1,ATF7IP	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P11	89743	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	15105208	15105676	15105381	Y	WBP11,ARHGDIB	ERP27,ARHGDIB	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	6986	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO3	207314	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO3	206807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	19260911	19261231	19261176	Y	NA	PLEKHA5	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	19417	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	19550535	19550852	19550634	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	4127	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.40591805045465
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	426587	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15571	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	27565982	27566076	27566029	Y	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	82195	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	27745630	27745707	27745691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71266	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	3520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	28127967	28128359	28128243	Y	PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	4329	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	56117	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	32559552	32559716	32559634	Y	BICD1	NA	BICD1,FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	270418	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	32635235	32635487	32635321	Y	NA	NA	FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	194647	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	32688261	32688652	32688566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	141482	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	32881013	32881116	32881065	Y	NA	RP11-278C7.1,YARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-278C7.1	2692	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	42984702	42985091	42984897	Y	GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	2545	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	45628991	45629732	45629167	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	21167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	46886273	46886657	46886465	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	110811	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	46947043	46947401	46947166	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	171581	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	47661403	47661671	47661594	Y	NA	NA	FAM113B,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	189669	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	48294417	48294695	48294497	Y	OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	40136	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	50926707	50927114	50926974	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	29939	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	52525424	52525587	52525584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	58197	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	52540237	52540565	52540533	Y	NA	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	43219	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	90871	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	52888449	52888608	52888529	Y	C12orf44,KRT6A,KRT5	KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT6A	3408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	52915277	52915747	52915499	Y	C12orf44	KRT6C,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	2806	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr12	52916140	52916794	52916224	Y	KRT76,KRT1,KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	3669	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	KRT79,KRT78	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT78	26905	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	KRT78	NA	NA	NA	NA	KRT78	41039	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	53359181	53359363	53359294	Y	PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	17443	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	54384983	54385161	54385072	Y	TARBP2,ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC9	HOXC11,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC9	1518	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	33875	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	56690284	56690436	56690361	Y	NA	ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2	NA	NA	NA	NA	RP11-977G19.11	1490	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	56729298	56729459	56729406	Y	NA	RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	PAN2	3461	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	56752579	56752932	56752841	Y	ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A	RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	STAT2	640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	6.80099367637843
chr12	57162340	57162564	57162470	Y	PAN2,PAN2,APOF,SPRYD4,GLS2,RDH16,GPR182,HSD17B6	NACA,PRIM1	NA	NA	NA	NA	PRIM1	18183	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	59364972	59365264	59365118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	52669	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	59434557	59434696	59434648	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	122254	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	59449084	59449472	59449406	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	136781	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	59460921	59461120	59461028	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	148618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	60014088	60014384	60014181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	701785	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	62609319	62609899	62609601	Y	C12orf61,USP15	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	42220	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	56896	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	153991	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	64855437	64855720	64855602	Y	C12orf66,TBK1	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	11777	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	66027921	66028196	66028033	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	33272	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	48150	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	67090	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	92285	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	186177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	67275619	67275719	67275669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	185223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	67319023	67319379	67319201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	141563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	67361974	67362194	67362149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	98748	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	67396755	67396891	67396823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	64051	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	68221654	68222227	68222103	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	181536	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	68314351	68314796	68314502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK2	274233	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.26699789212614
chr12	69122207	69122406	69122269	Y	NA	NUP107,SLC35E3	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	15480	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	69305634	69305702	69305668	Y	RAP1B,LYZ,CPM,CPM	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	57648	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	69402346	69402644	69402509	Y	RAP1B,SLC35E3,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	38996	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	69403025	69403359	69403177	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	39675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	75877380	75877665	75877492	Y	GLIPR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	4920	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-114H23.1	155843	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr12	76345818	76345948	76345927	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	29847	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	76751627	76751939	76751780	Y	NA	BBS10	NA	NA	NA	NA	BBS10	11405	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	78061184	78061442	78061321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	161243	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	89604193	89604309	89604249	Y	NA	NA	LOC728084,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	140739	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	89727563	89727887	89727725	Y	ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	17161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	90150470	90150910	90150738	Y	NA	ATP2B1	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2B1	49393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	90175016	90175190	90175077	Y	DUSP6,POC1B,ATP2B1	NA	C12orf37,LOC338758	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	73939	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	92505299	92505700	92505686	Y	NA	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	31649	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	92910105	92910423	92910265	Y	EEA1,BTG1,CLLU1OS	NA	LOC256021	MCF7	ChIA-PET	22265404	BTG1	372432	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBMS2P1	320387	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	95043067	95043319	95043087	Y	TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	729	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	95597894	95598075	95597980	Y	NA	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	11183	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	96642925	96643253	96643074	Y	CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	56765	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	96794959	96795305	96795211	Y	CDK17	CDK17,RN7SKP11	NA	NA	NA	NA	CDK17	2621	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP11	8803	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	21349	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUAK1	203335	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	106640032	106640193	106640140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	53514	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	69211	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	109083720	109083964	109083780	Y	SSH1	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	39408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	110319208	110319481	110319350	Y	C12orf34,C12orf76	TRPV4,GLTP,TCHP	NA	NA	NA	NA	GLTP	2915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	113417741	113417850	113417751	Y	NA	OAS3,OAS2	NA	NA	NA	NA	OAS2	3541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	671887	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	116530359	116530538	116530483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	182605	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-148B3.1	81354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B3.1	59845	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	118313927	118314150	118314016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	135243	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	118744725	118745093	118744968	Y	TAOK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P5	62848	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	120179533	120179605	120179597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	75975	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	121366513	121366710	121366614	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	C12orf43,SPPL3,POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL12P33	13965	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	121367131	121367281	121367257	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	C12orf43,SPPL3,POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL12P33	14583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	121498035	121498283	121498257	Y	P2RX4,CAMKK2,P2RX7,OASL	C12orf43,OASL	SPPL3,C12orf43,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,HNF1A,P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RNF10,POP5,CABP1,UNC119B,ACADS,HNF1A-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	OASL	22990	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	122444524	122444823	122444769	Y	BCL7A	BCL7A	NA	NA	NA	NA	BCL7A	10505	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	122519763	122520228	122519936	Y	ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP	MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	5135	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr12	122952702	122952803	122952758	Y	CLIP1,HCAR1	CLIP1,ZCCHC8	LOC100507066,CLIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC8	30715	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	123352500	123352698	123352696	Y	VPS37B	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	26293	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr12	123367402	123367963	123367875	Y	VPS37B	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	11028	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	367671	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	361380	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254030	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	247592	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	125171572	125171968	125171622	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	193246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	127567979	127568114	127568034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.2	60963	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	RP11-575F12.2,AC079949.1	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.2	18217	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	127942413	127942644	127942529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	293741	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	FZD10	179669	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr12	131272601	131272867	131272734	Y	NA	STX2	NA	NA	NA	NA	STX2	48944	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	132995729	132996120	132995925	Y	NA	NA	P2RX2,GALNT9,POLE,FBRSL1,LOC100507055,EP400NL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	68017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.96453570508804
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3,GJB2	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	20986336	20986694	20986525	Y	GJB2,GJB6	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	111302	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	20993930	20994321	20994126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	103675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	21398890	21399124	21398998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	52793	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	21893563	21893874	21893643	Y	NA	MIPEPP3	ZDHHC20	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEPP3	23285	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	24131522	24131823	24131734	Y	SACS	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	10686	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	26475840	26476144	26475975	Y	CDK8	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	318647	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	30879792	30879814	30879803	Y	NA	PRDX2P1,KATNAL1	NA	NA	NA	NA	KATNAL1	171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	175921	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	33003304	33003483	33003393	Y	NA	N4BP2L1	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	2989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	33051019	33051050	33051035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	50704	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	33698210	33698586	33698501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	224181	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	7.32414703609985
chr13	41059784	41060179	41060032	Y	MRPS31,FOXO1	NA	TTL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXO1	178555	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	41589057	41589218	41589148	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	44192	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	41624170	41624528	41624466	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90	Hi-C	24141950	WBP4	8882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	42143744	42143800	42143772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	260403	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	42222511	42222753	42222632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	339170	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	42276592	42276928	42276845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	393251	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	139032	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr13	43617981	43618110	43618046	Y	TNFSF11	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	22642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	43635759	43636150	43635822	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	40420	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	44420814	44421049	44420930	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	30371	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	44436870	44437053	44436962	Y	ENOX1	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	14367	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	273481	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	268192	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr13	45038641	45038649	45038645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	110634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	45813210	45813281	45813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1-AS1	100199	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	207294	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	47129209	47129516	47129266	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3906	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr13	49288768	49288781	49288774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSME2P2	54483	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	50701411	50701707	50701686	Y	ARL11	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	3555	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	51034237	51034585	51034411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	100338	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	51168515	51168827	51168588	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	234616	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	51204178	51204550	51204306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	270279	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	51466138	51466579	51466443	Y	RNASEH2B	RNASEH2B	DLEU2,GUCY1B2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	15235	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	53028749	53028807	53028779	Y	NA	VPS36,CKAP2	NA	NA	NA	NA	CKAP2	1185	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	67493315	67493487	67493401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	4753712	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	71340580	71340843	71340601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	906356	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	72333025	72333078	72333052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	85826	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	73486233	73486587	73486410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3	131999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	73909414	73909609	73909563	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	145749	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	74706134	74706569	74706487	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	74864558	74864878	74864747	Y	KLF12	NA	KLF12	IMR90	Hi-C	24141950	KLF12	158164	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	76336754	76337033	76336914	Y	COMMD6,LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	144184	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	77453598	77454010	77453765	Y	FBXL3,KCTD12	KCTD12	NA	NA	NA	NA	KCTD12	4530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	77599424	77599520	77599503	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3	NA	NA	NA	NA	FBXL3	94	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	77897670	77898015	77897832	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	1170	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	80122895	80122985	80122937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	69608	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	80611659	80611975	80611764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	301111	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	81824429	81824558	81824494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	911343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	94706563	94706645	94706604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	539866	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	96332135	96332467	96332276	Y	NA	DZIP1,DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	4742	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	96488083	96488280	96488182	Y	NA	NA	DNAJC3	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC3	160690	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	96498991	96499334	96499248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	171598	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	96517437	96517518	96517478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	186218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	99934075	99934613	99934350	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	68063	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	99950103	99950501	99950500	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	84091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	101075706	101076016	101075848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	249331	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	102663427	102663801	102663614	Y	FGF14,FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	583552	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	109852673	109853050	109852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	583865	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	527101	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	514704	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr13	111044675	111045176	111044974	Y	COL4A1,COL4A2	NA	NA	NA	NA	NA	RAB20	166904	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	NA	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	ATP11A	242945	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	20516120	20516206	20516163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC5	255947	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	20895931	20896136	20896054	Y	RNASE3,RNASE6,TEP1,TMEM55B,PNP	TEP1,OSGEP,APEX1,TMEM55B,PNP	NA	NA	NA	NA	TEP1	16343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANG	138277	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17,SLC39A2	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	22736761	22737207	22736959	Y	NA	NA	OXA1L,SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAJ23	250187	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	22952580	22952652	22952617	Y	REM2	TRAJ23	SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAJ23	34742	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	23083172	23083436	23083304	Y	NA	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	ABHD4	18026	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	23222866	23223018	23222950	Y	NA	OXA1L,CTD-2555K7.2	NA	NA	NA	NA	OXA1L	10713	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	23367708	23367835	23367778	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5	NA	NA	NA	NA	RBM23	18558	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	24716186	24716316	24716212	Y	NA	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	6306	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4S1	131687	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	36583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A,RP11-176H8.1	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	33433361	33433472	33433420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	481355	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	34483058	34483197	34483106	Y	NA	NA	EGLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SPTSSA	446365	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	34504920	34505230	34505078	Y	NA	NA	EGLN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	424332	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr14	34987475	34987508	34987491	Y	EAPP	EAPP	NA	NA	NA	NA	EAPP	19408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	35666202	35666508	35666414	Y	BAZ1A,FAM177A1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	76447	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	35767605	35767844	35767749	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	21766	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	35801463	35801750	35801570	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	54525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	35809142	35809263	35809220	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	47012	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	36073737	36073816	36073791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	201782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	39890491	39890736	39890687	Y	NA	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	8968	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	44437752	44437871	44437812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	926627	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr14	50090977	50091033	50091007	Y	METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2	RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2	NA	NA	NA	NA	MGAT2	5488	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	66080	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	21664	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	51136928	51137372	51137340	Y	NA	SAV1	NA	NA	NA	NA	SAV1	3879	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	51830897	51831022	51831007	Y	TRIM9	RP11-255G12.3	NA	NA	NA	NA	RP11-255G12.3	30831	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	51837532	51837771	51837653	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	NA	NA	NA	NA	RP11-255G12.3	24082	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	3789	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	51975090	51975414	51975252	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	21272	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	51985478	51985553	51985508	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	31660	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	52063277	52063629	52063461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	109459	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	52064245	52064576	52064411	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	110427	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	52076708	52076858	52076794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122890	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER2	156301	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	55173516	55173842	55173679	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	141701	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	55538737	55539349	55538846	Y	FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	22388	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	55544097	55544118	55544108	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27748	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.66207351804993
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	55589903	55590059	55589993	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	1075	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM9	110000	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	60629133	60629293	60629144	Y	NA	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	5281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	61654939	61655124	61655060	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	2662	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	61804524	61805115	61804707	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	16988	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	61855306	61855686	61855500	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	67770	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	61939634	61940081	61939867	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	152098	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	61993253	61993443	61993274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	166788	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	62040859	62041355	62041035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	118876	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	62053265	62053527	62053394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	106704	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	62092032	62092339	62092186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	67892	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr14	64403874	64404095	64403883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	86191	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	65147051	65147198	65147125	Y	NA	PLEKHG3	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG3	21622	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	65637410	65637773	65637587	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	69997	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	68320437	68320759	68320587	Y	ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	RAD51B	35941	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	68420679	68421053	68420830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	136183	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	68699331	68699744	68699520	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	187169	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	68850156	68850330	68850199	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	36583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	68884830	68884917	68884875	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	1996	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	68933312	68933746	68933512	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	46399	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	69076965	69077322	69077310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.3	72960	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	69169939	69170184	69170014	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	19657	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	69171999	69172408	69172198	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	21717	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	69512620	69512951	69512699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	68463	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	69516483	69516670	69516577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	72326	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	70152055	70152259	70152141	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	39358	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	70251267	70251371	70251319	Y	SLC10A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59650	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	273048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	274367	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	45854	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	74228325	74228451	74228378	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	49197	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	74741846	74742137	74741995	Y	FCF1	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25622	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	43525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr14	75037027	75037351	75037159	Y	NA	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	39955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	75688633	75689211	75688968	Y	DLST,FOS	TMED10,RP11-293M10.2	PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	34903	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	75701379	75701456	75701414	Y	FOS	RP11-293M10.2,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	22658	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	75920164	75920191	75920178	Y	JDP2	JDP2	NA	NA	NA	NA	JDP2	27745	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT43	147497	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	77396429	77396646	77396562	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-7F17.7	27335	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	77473789	77473986	77473849	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	19048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	77503944	77504718	77504558	Y	NA	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	10910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	77509664	77510215	77509840	Y	IRF2BPL	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	16630	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	77577466	77577695	77577651	Y	NA	TMEM63C	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	3216	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	77639599	77639692	77639653	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63C	58688	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	77871382	77871440	77871411	Y	NA	SAMD15,TMED8	NA	NA	NA	NA	TMED8	29930	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	80857236	80857459	80857352	Y	NA	DIO2	NA	NA	NA	NA	DIO2	5136	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	81036045	81036252	81036151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	183945	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	81375179	81375565	81375372	Y	STON2,CEP128	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	48296	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	81484958	81485153	81484991	Y	TSHR	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	61097	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	112375	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	125810	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	89895882	89896217	89896119	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	139944	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	89897229	89897488	89897403	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	141291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	89935615	89935871	89935745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	147622	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	90280261	90280500	90280379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	138621	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	91267745	91267886	91267834	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	12937	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	91406372	91406636	91406631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	113900	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	91833483	91833974	91833648	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	48214	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	92932520	92932674	92932620	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	45444	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	93510584	93510744	93510686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	69921	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	93569992	93570233	93570210	Y	KIAA1409,C14orf109,C14orf109	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	10432	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	94735054	94735340	94735197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINA1	119690	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	94808145	94809286	94808819	Y	SERPINA1	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	SERPINA1	45744	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	94840163	94840451	94840311	Y	SERPINA1	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	SERPINA1	14579	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	95596986	95597082	95597060	Y	NA	DICER1	NA	NA	NA	NA	DICER1	25265	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	98741028	98741056	98741042	Y	C14orf177	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf64	298567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	206840	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	100633368	100633655	100633513	Y	YY1	NA	NA	NA	NA	NA	YY1	68980	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	318116	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	102288392	102288845	102288491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	62257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	102340393	102340589	102340458	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	88276	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	102342938	102343183	102343098	Y	PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	85682	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	102868139	102868468	102868196	Y	HSP90AA1,RCOR1,TECPR2	CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	TECPR2	40839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	102989903	102989915	102989909	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	15767	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	RP11-736N17.8,TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr14	105546439	105546836	105546640	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	60954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	105549558	105549976	105549724	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	64073	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr14	105660827	105661024	105660911	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	15167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr15	20547295	20547641	20547374	Y	NA	NA	LOC348120,REREP3,POTEB	IMR90	Hi-C	24141950	TUBGCP5	2283754	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	20858746	20859095	20858885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	1972300	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	25608093	25608225	25608159	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	73903	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	31555534	31555833	31555755	Y	MTMR10,KLF13	RP11-16E12.1,RP11-16E12.2	LOC283710,OTUD7A,KLF13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-16E12.2	34493	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	33603911	33604068	33604029	Y	FMN1,RYR3	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	698566	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr15	37170652	37170846	37170749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	218694	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	182090	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	37249666	37249815	37249741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	139725	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	18009	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	41185333	41185514	41185432	Y	INO80,CHP,VPS18	RHOV,VPS18,DLL4	NA	NA	NA	NA	VPS18	705	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr15	42083275	42083582	42083459	Y	NA	MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B	NA	NA	NA	NA	MAPKBP1	18643	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	43810666	43810996	43810786	Y	MAP1A	TP53BP1	NA	NA	NA	NA	TP53BP1	9740	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76,PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	4337	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	55940	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	45932818	45933115	45932936	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	11472	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	50948351	50948714	50948533	Y	NA	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	28298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	51477619	51477870	51477745	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	82146	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	202714	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	52369278	52369628	52369325	Y	MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5,BCL2L10	GNB5,BCL2L10,MYO5C	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2184D3.1	15864	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.66207351804993
chr15	52774147	52774333	52774216	Y	MAPK6,MYO5A	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	44914	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	53942854	53943115	53943028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM214A	942840	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	56341448	56341541	56341527	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4	57504	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	56419675	56420043	56419859	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	113440	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	56965853	56966086	56966042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNS1	210518	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	59138361	59138756	59138559	Y	NA	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	16618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	59461586	59461962	59461756	Y	ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	66309	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	62949406	62949470	62949438	Y	LACTB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1069G10.2	236541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	63427902	63428515	63428147	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L	NA	NA	NA	NA	LACTB	15903	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	64385169	64385477	64385384	Y	NA	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	847	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	64940943	64941327	64941079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	52153	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	65174333	65174776	65174649	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	42245	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	66295314	66295348	66295331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	212683	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	67409139	67409556	67409296	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	55038	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	28273	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	68652766	68652805	68652797	Y	NA	NA	FEM1B	IMR90	Hi-C	24141950	FEM1B	84625	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	68821473	68821531	68821481	Y	NA	CORO2B	ITGA11,FEM1B	IMR90	Hi-C	24141950	CORO2B	47777	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	68933457	68933606	68933532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO2B	64149	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	70797214	70797333	70797235	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	256599	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	71373131	71373408	71373250	Y	NA	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	190007	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	71677897	71678187	71678028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	494773	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	71733741	71734068	71733788	Y	THSD4	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	550617	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	72671459	72671771	72671611	Y	PARP6,ARIH1,HEXA	HEXA,RP11-106M3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-106M3.1	1408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	73032689	73032951	73032815	Y	PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	43236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	73488522	73488835	73488645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	146471	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	78031317	78031646	78031484	Y	LINGO1	NA	NA	NA	NA	NA	HMG20A	320563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	79272176	79272521	79272351	Y	NA	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	32260	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	40910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	188157	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	81125183	81125474	81125331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	55499	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	81596403	81597133	81596761	Y	MESDC1,STARD5	STARD5,RP11-761I4.3	NA	NA	NA	NA	STARD5	17391	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	81607386	81607689	81607446	Y	MESDC1,IL16,IL16,STARD5	STARD5,RP11-761I4.3	NA	NA	NA	NA	STARD5	6835	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	82274392	82274506	82274449	Y	FAM154B	NA	MEX3B	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	61976	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	83683180	83683566	83683373	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	4787	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	83847712	83847957	83847821	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	26813	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	83879617	83879962	83879641	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	4847	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	83990986	83991134	83991044	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	39520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	86111518	86111581	86111550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	189716	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	88348186	88348352	88348346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00052	230026	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	89183173	89183667	89183329	Y	ABHD2,ISG20	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	5789	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr15	89945047	89945578	89945231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	68955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	90379956	90380186	90379992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP3S2	55388	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	BLM	NA	NA	NA	NA	BLM	49562	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	92293461	92293635	92293548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	101290	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	95790334	95790617	95790588	Y	NA	NA	NR2F2	IMR90	Hi-C	24141950	MCTP2	1017567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	96807705	96807805	96807755	Y	NA	NA	LOC400456	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	59362	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	96872860	96873000	96872921	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	4270	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	98047383	98047776	98047510	Y	ARRDC4	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	413008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	99123840	99124144	99123964	Y	NA	NA	IGF1R	MCF7	ChIA-PET	22265404	IGF1R	66056	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr15	99318481	99318879	99318554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	128281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	99991066	99991337	99991202	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	24033	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	101462538	101462736	101462613	Y	NA	ALDH1A3,LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	5118	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	101481750	101481996	101481861	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	24330	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	145023	145249	145139	Y	NHLRC4	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	20017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	405208	405433	405399	Y	NA	AXIN1,MRPL28,TMEM8A,NME4,DECR2	NA	NA	NA	NA	AXIN1	4535	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr16	1347371	1347380	1347376	Y	NA	UBE2I	NA	NA	NA	NA	UBE2I	6168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	4456	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	20027	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	3202363	3202472	3202417	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	24585	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	4102835	4103049	4102865	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	61137	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	8931520	8931573	8931545	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	29293	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	10956294	10956664	10956435	Y	NUBP1,CIITA	NA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	DEXI	77653	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	11484891	11485075	11484982	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	136855	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	11702109	11702428	11702257	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	25809	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	12641085	12641468	12641420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	254406	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	12647143	12647394	12647326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	248480	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	12776887	12777112	12777000	Y	CPPED1	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	118762	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	16214258	16214439	16214353	Y	ABCC1	NA	ABCC6	IMR90	Hi-C	24141950	NOMO3	109913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	19221625	19221975	19221736	Y	SMG1,COQ7	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	44332	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	21375136	21375337	21375232	Y	DNAH3,CRYM,METTL9	NA	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	64966	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	22366801	22367164	22366982	Y	POLR3E,CDR2	NA	NA	NA	NA	NA	POLR3E	60071	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	23069980	23070197	23070103	Y	USP31	NA	NA	NA	NA	NA	USP31	88394	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	23473263	23473545	23473445	Y	SCNN1G,GGA2	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	10762	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr16	33971109	33971442	33971126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2088030	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	48545095	48545474	48545284	Y	SIAH1	NA	SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	SIAH1	64782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	48610830	48611144	48611073	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	40915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	48645394	48646040	48645807	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	6019	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	49044263	49044492	49044405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	392204	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	50287533	50287795	50287656	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	9485	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	55052989	55053317	55053111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX5	90215	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	56581201	56581558	56581471	Y	MT3,GNAO1,BBS2	BBS2	MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP	IMR90	Hi-C	24141950	BBS2	29006	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	57674508	57674887	57674647	Y	PLLP,CX3CL1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	31944	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	57927623	57928192	57928041	Y	GPR97,ZNF319	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	32666	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	58460815	58461210	58460990	Y	NDRG4,NDRG4,NDRG4	NA	NA	NA	NA	NA	SETD6	86173	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	59002662	59002836	59002667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	236401	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	67435763	67435871	67435819	Y	NA	ZDHHC1,HSD11B2	NA	NA	NA	NA	ZDHHC1	12865	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	68418958	68419037	68419019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	57526	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	69019845	69020210	69019891	Y	NA	NA	CHTF8,HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	117257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	334538	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	79623380	79623748	79623651	Y	NA	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	8863	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	79635433	79635866	79635594	Y	MAF	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	2822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	79674460	79674887	79674671	Y	NA	MAF	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	41849	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	79692252	79692530	79692298	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	59641	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	186975	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	80971971	80972227	80972105	Y	CENPN	NA	NA	NA	NA	NA	CENPN	65876	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	81503648	81503971	81503709	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	26873	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	82685978	82686417	82686161	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	27570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	83029672	83029964	83029912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	371264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	83069400	83069774	83069647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	410992	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	83136521	83136871	83136696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	478113	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	83399347	83399604	83399475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	439844	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,TAF1C,RP11-486L19.2	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	84424110	84424272	84424217	Y	NECAB2	ATP2C2	NA	NA	NA	NA	ATP2C2	23977	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.58030250369513
chr16	84676809	84677221	84677048	Y	KIAA1609	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	85020713	85021068	85020917	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	22073	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	85785568	85785942	85785758	Y	C16orf74	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	2833	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	86963366	86964014	86963688	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	364509	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	87781357	87781475	87781397	Y	C16orf95	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16123	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	87843209	87843416	87843290	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	45611	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	88555955	88556054	88556005	Y	NA	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	38230	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr16	89323118	89323579	89323381	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	41000	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	595370	595681	595607	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27276	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	872261	872610	872409	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	8400	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr17	1667462	1668045	1667797	Y	PITPNA,SLC43A2,WDR81,WDR81	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	4209	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	1994416	1994643	1994603	Y	HIC1,HIC1	HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	38968	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	2307798	2307958	2307865	Y	PAFAH1B1	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	4297300	4297441	4297368	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29377	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	6470839	6471155	6470959	Y	PITPNM3,TXNDC17	PITPNM3	PITPNM3	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM3	13025	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	66220	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	6829288	6829561	6829425	Y	SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12P2	74108	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	8407322	8407642	8407416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDEL1	92873	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	9368693	9368815	9368742	Y	GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	109093	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	14206072	14206436	14206180	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	3672	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	14206970	14207459	14207274	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	4570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr17	15850564	15850918	15850801	Y	ADORA2B	ADORA2B,TTC19	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	4333	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	16191035	16191327	16191109	Y	TRPV2	NA	CENPV	IMR90	Hi-C	24141950	CENPV	63643	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	NA	NA	NA	NA	NA	UBB	93610	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	18106383	18106643	18106603	Y	NA	ALKBH5,LLGL1	NA	NA	NA	NA	LLGL1	20258	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	19321074	19321220	19321147	Y	NA	MAPK7,B9D1,MFAP4	NA	NA	NA	NA	MFAP4	32521	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	SLC47A2,ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	25609022	25609410	25609177	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	9692	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	25784873	25785075	25784939	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	KSR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KSR1	3203	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	26552347	26552427	26552387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	91694	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	28716902	28717301	28716970	Y	SSH2,NSRP1,CPD,CPD,GOSR1	CPD	NA	NA	NA	NA	CPD	12979	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	29210096	29210162	29210129	Y	NA	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	21676	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	30846365	30846870	30846526	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	34728	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	31177798	31177958	31177878	Y	CDK5R1	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	24237	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	35741498	35741507	35741502	Y	NA	ACACA,TADA2A	NA	NA	NA	NA	ACACA	23402	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	35841037	35841412	35841225	Y	NA	DUSP14	DUSP14	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP14	6525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	38607821	38607996	38607876	Y	NA	TOP2A,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	10119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr17	38656717	38656888	38656754	Y	KRT24,KRT10,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	868	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr17	39509244	39509577	39509399	Y	KRT40,KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT38,KRT35,KRT37	KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	27078	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	3372	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	39662733	39662908	39662821	Y	JUP,KRTAP3-1,KRT9,KRT36,KRT13,KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	2776	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	KRT14,KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT14	5161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr17	39782029	39782271	39782148	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT14,KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT17	2935	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	40628029	40628344	40628111	Y	NA	ATP6V0A1,AC067852.1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	19167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	40942176	40942529	40942199	Y	NA	EZH1,VPS25,PSME3,BECN1	NA	NA	NA	NA	VPS25	18722	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	41478754	41478975	41478864	Y	ARL4D	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	4427	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chr17	42278333	42278607	42278473	Y	ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	2852	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1	384914	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	598973	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	46079914	46080281	46080131	Y	NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2	PRR15L,CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	33111	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB6,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB6	17949	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB6,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB6	17123	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	46767725	46768126	46768067	Y	NA	RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	RP11-357H14.17	45340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	47081081	47081234	47081133	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8307	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALNT2	62380	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	47765495	47765594	47765536	Y	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	11899	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	47928830	47928921	47928887	Y	FAM117A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	58125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	COL1A1	20876	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	48981540	48981884	48981711	Y	RSAD1	TOB1	TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	38201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	84749	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	54674985	54675165	54675040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	234295	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	54876339	54876519	54876454	Y	DGKE	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	32941	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	56025910	56026308	56026041	Y	SUPT4H1	CUEDC1,VEZF1	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	4376	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	56419503	56419633	56419507	Y	OR4D2	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	8821	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P,RNU1-108P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	57866887	57867071	57866969	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	49556	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	59780215	59780354	59780263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	113652	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	115348	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	MRC2	52970	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	153511	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	61127299	61127625	61127462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	394114	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	61282907	61283291	61283099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	238448	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	10653	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	63050573	63051275	63051229	Y	NA	NA	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	63060882	63060952	63060917	Y	GNA13	GNA13	GNA13,RGS9	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	9925	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA13	588973	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	102432	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	64499082	64499411	64499095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	202328	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	64708077	64708220	64708107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	250806	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	65318264	65318584	65318454	Y	NA	PSMD12	NA	NA	NA	NA	PSMD12	42159	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	67205913	67206151	67206032	Y	ABCA8,ABCA10,ABCA5	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	115234	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	67270709	67270940	67270826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	50445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70374697	70374707	70374702	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9-AS1	158720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70407350	70407568	70407445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	191373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70412502	70412837	70412669	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	196525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70426216	70426228	70426222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	195142	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70443498	70443728	70443613	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	177642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70499253	70499546	70499535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	121824	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	70664433	70664574	70664507	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	29822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	71768	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	71024945	71025268	71025108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	61583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	71870252	71870422	71870335	Y	NA	NA	LINC00469,LOC400620	IMR90	Hi-C	24141950	RPL38	327299	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	72241426	72241789	72241666	Y	NA	RPL38,CTD-2514K5.2,TTYH2	NA	NA	NA	NA	TTYH2	33773	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	146414	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	72830385	72830471	72830428	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	36685	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	73684314	73684419	73684412	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	23045	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	74413626	74413718	74413672	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	33570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	74593355	74593659	74593547	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6	CYGB,ST6GALNAC2,ST6GALNAC1	ST6GALNAC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ST6GALNAC2	12317	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75041584	75041844	75041683	Y	SEPT9	LINC00338,SEC14L1	MGAT5B,SRSF2,MFSD11,METTL23,SEC14L1,SEPT9	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00338,SEC14L1	38954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.05714914397371
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	75302276	75302607	75302432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	221478	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	231793	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75417194	75417582	75417357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	336396	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	75422359	75422648	75422577	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	341561	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75450694	75450827	75450755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	369896	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75461366	75461740	75461543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	380568	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	409356	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.7546869569356
chr17	76154299	76154669	76154484	Y	C17orf99	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	7970	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	76169246	76169385	76169328	Y	PGS1,SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	6607	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	76373562	76373700	76373631	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	841	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	77481345	77481685	77481515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX2	268246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	78102448	78102482	78102466	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	16500	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr17	79064673	79065032	79064884	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	57725	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	79066626	79066874	79066750	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	59678	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80796209	80796714	80796435	Y	METRNL,ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80805995	80806457	80806155	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	9541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	20909	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80821746	80822299	80821973	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	25292	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80832515	80832930	80832613	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36061	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr17	80834043	80834346	80834307	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	37589	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr17	81057799	81057924	81057864	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	22232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr18	2653655	2653795	2653729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	6355893	6356010	6355962	Y	ARHGAP28,L3MBTL4	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	105004	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	8949988	8950319	8950097	Y	NA	NA	CCDC165,RAB12	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	150309	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9648954	9649088	9649002	Y	PPP4R1	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1	35716	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9758210	9758472	9758414	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	52048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9829152	9829470	9829321	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	82529	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr18	9850032	9850097	9850065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	61902	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9850282	9850437	9850360	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	61562	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr18	12765132	12765369	12765274	Y	CEP76	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	64356	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	12839100	12839985	12839163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	87657	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	13500609	13500835	13500766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223824	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	19279600	19279639	19279620	Y	NA	ABHD3,MIB1	NA	NA	NA	NA	ABHD3	3127	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	19373794	19374099	19373861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	90876	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	19453532	19453543	19453538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	170614	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	19681135	19681153	19681144	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	66251	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	19862450	19862773	19862669	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	115046	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29,LAMA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	150248	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	DSC1	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC1	46026	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	29032478	29032594	29032536	Y	NA	DSG3,DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG3	6720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	33093148	33093751	33093628	Y	GALNT1	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	17193	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr18	34547272	34547713	34547483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	140114	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	46543550	46543788	46543750	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	441929	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	19820	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	47794579	47794725	47794639	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	11419	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB27B	230392	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	53167517	53167871	53167822	Y	TCF4	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	162147	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	55255652	55255824	55255739	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	3648	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	56672148	56672229	56672220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	132480	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	61085026	61085396	61085214	Y	VPS4B	VPS4B	NA	NA	NA	NA	VPS4B	2320	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	61121848	61122109	61121956	Y	SERPINB10,SERPINB12,SERPINB5	VPS4B,SERPINB5	NA	NA	NA	NA	SERPINB5	19885	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	61565801	61566233	61565950	Y	NA	SERPINB2,SERPINB10	NA	NA	NA	NA	SERPINB10	3393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	309342	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	77218531	77218849	77218576	Y	NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	64675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr18	77723013	77723575	77723504	Y	HSBP1L1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	452	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.13892015832851
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	STK11	2126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	1942586	1943099	1942836	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3398	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	2093042	2093330	2093188	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	1342	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	3124672	3124910	3124852	Y	GNA15	GNA11,GNA15	NA	NA	NA	NA	GNA15	9281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	3153392	3153939	3153476	Y	GNA15,FZR1	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	3154006	3154458	3154241	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19815	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	5357360	5357663	5357512	Y	NA	PTPRS	PTPRS,ZNRF4,KDM4B,SAFB2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRS	18546	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	5435162	5435432	5435167	Y	NA	NA	KDM4B,PTPRS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRS	96348	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	5940860	5941142	5941001	Y	NA	FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3	NA	NA	NA	NA	CAPS	31142	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	6092440	6092966	6092758	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	104617	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	58264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	OLFM2	NA	NA	NA	NA	OLFM2	11008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	12957682	12957886	12957783	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,HOOK2,DNASE2,GCDH	NA	NA	NA	NA	HOOK2	23668	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	14126359	14126500	14126444	Y	NANOS3,IL27RA	RFX1,IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	10508	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	15310768	15311119	15311001	Y	NA	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	976	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	95558	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	15974006	15974442	15974280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	69235	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	17961350	17961505	17961471	Y	FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3	RPL18A	PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL18A	7180	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	18131991	18132570	18132392	Y	MAP1S,FCHO1,KCNN1,PGPEP1,LRRC25,JUND,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	74033	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	18874702	18875152	18875024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF1	65595	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	28231226	28231711	28231495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470737	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	30198391	30198719	30198555	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	5645	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	3229	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	33382845	33383180	33383014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP89	77717	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH1	98322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	33784292	33784447	33784359	Y	CEBPG,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	7023	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	GRAMD1A,SCN1B	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	35704787	35705279	35704999	Y	NA	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	31954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	35763394	35763606	35763496	Y	U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	5513	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	36030863	36031038	36030900	Y	NA	KRTDAP,DMKN,SBSN,TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	3459	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	ZNF146	36980	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	37795242	37795359	37795301	Y	ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1	HKR1	NA	NA	NA	NA	HKR1	6380	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	41701582	41701929	41701850	Y	CYP2A13,CYP2F1	CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	4628	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	41827649	41828097	41827915	Y	HNRNPUL1,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	13555	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	42634554	42634824	42634791	Y	POU2F2	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F2	63913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	POU2F2,DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	POU2F2	5462	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr19	43770053	43770115	43770084	Y	NA	PSG9	NA	NA	NA	NA	PSG9	1567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	PSG9	63866	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr19	44165978	44166186	44166121	Y	NA	ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	PLAUR	6513	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	9958	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	45952039	45952594	45952534	Y	GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	16659	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL2,IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL2	39593	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	46688176	46688573	46688180	Y	PTGIR	IGFL2,IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	42436	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	46698925	46699055	46698990	Y	NA	IGFL1	IGFL3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFL1	31954	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	47783225	47783533	47783379	Y	ZNF541	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	25988	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	35697	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.66207351804993
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	DHX34	44769	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	49486890	49487028	49486959	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	7539	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,NAPSA,POLD1	NA	NA	NA	NA	NAPSA	5408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	156765	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	52734516	52734674	52734594	Y	ZNF610	PPP2R1A,ZNF766	NA	NA	NA	NA	ZNF766	36150	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF845	107141	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.09261343888567
chr19	54352555	54352808	54352773	Y	VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM	MYADM,AC008753.6	CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7	HELA,K562,H1ESC,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	MYADM	14669	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	54548907	54549052	54548979	Y	NLRP12,NLRP12,VSTM1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	54984	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	54707641	54707712	54707644	Y	NA	LENG1,TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	5031	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr19	55034604	55034910	55034757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP5	52193	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	55699968	55700281	55700219	Y	NA	SYT5	NA	NA	NA	NA	SYT5	10159	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	NAT14	36839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	56789143	56789486	56789342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	88266	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	56807694	56808027	56807709	Y	NLRP13,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	69725	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	66516	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	58781089	58781297	58781193	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	ZNF8	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF8	7021	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	605283	605589	605326	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	69850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	1115244	1115256	1115249	Y	SNTG2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	439805	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	86855	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	3352595	3352738	3352719	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	26915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	8743061	8743194	8743128	Y	ID2	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	73781	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	10721200	10721506	10721353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOL10	106595	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	11094315	11094675	11094498	Y	C2orf50,KCNF1	NA	FLJ33534,C2orf50	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA6	118212	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	11443913	11444199	11444137	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	42257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	16054729	16054969	16054864	Y	NA	RP11-120J4.1,MYCN	NA	NA	NA	NA	MYCN	23717	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	17090018	17090382	17090090	Y	FAM49A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	244419	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	106096	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20382454	20382566	20382495	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	40628	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20384416	20384642	20384519	Y	HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	38552	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20412281	20412403	20412381	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10791	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20417309	20417694	20417511	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	5500	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20432677	20432919	20432791	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	9483	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20435780	20436055	20435965	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	12586	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20690620	20690861	20690695	Y	NA	RHOB	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOB	45785	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	24512394	24512744	24512638	Y	NA	RPL36AP13	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	42637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	25784383	25784764	25784574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	109739	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	26231667	26232185	26231781	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	22791	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	26258152	26258567	26258448	Y	RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	3176	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	26521727	26522029	26521734	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	7386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr2	28077414	28077634	28077524	Y	ZNF513,ZNF513,RBKS	BRE,RBKS	MRPL33	IMR90	Hi-C	24141950	BRE	33174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	28600937	28601380	28601351	Y	RBKS,BRE,BRE,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	RBKS,BRE,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,MRPL33,LOC100505716,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	11935	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	28668874	28669088	28668964	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	BRE,RBKS,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC104695.3	53335	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	29055098	29055343	29055221	Y	SPDYA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	35824	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	29439591	29440302	29440265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	121020	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	30391485	30391578	30391503	Y	YPEL5	YPEL5	NA	NA	NA	NA	YPEL5	23678	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	30889265	30889652	30889547	Y	NA	NA	YPEL5,LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	221173	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	31393678	31393691	31393685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD3	61189	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	33863068	33863290	33863179	Y	NA	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	40619	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	36603527	36603925	36603600	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	22458	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	38323202	38323810	38323564	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYP1B1	11234	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	38599092	38599284	38599189	Y	FAM82A1	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	3143	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	40676285	40676532	40676459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	159661	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	41963199	41963639	41963355	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	195224	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	182425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	43358229	43358771	43358564	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	92977	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	43685237	43685474	43685356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135711	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	43746950	43747270	43747109	Y	ZFP36L2	NA	LOC100129726,ZFP36L2	K562	ChIA-PET	22265404	THADA	73915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	45411635	45411970	45411804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	190083	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	45968952	45969144	45969027	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	92468	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	46536857	46537129	46536993	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	18051	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	46554101	46554217	46554159	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	35295	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	47282124	47282371	47282214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	115130	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	50637304	50637504	50637355	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1882782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	161250	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	160872	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	131636	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	55320625	55320761	55320684	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,EML6,RTN4	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	16996	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	60693527	60693793	60693660	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	83787	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	60694019	60694324	60694172	Y	BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	84279	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	64438053	64438269	64438160	Y	SERTAD2,AFTPH,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	PELI1	68465	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	64490373	64490733	64490649	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	120785	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	64587056	64587400	64587325	Y	NA	NA	AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	91703	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	65067098	65067261	65067167	Y	SLC1A4,RAB1A	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	90959	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	65609993	65610402	65610168	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	47369	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	70172627	70172794	70172718	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	14603	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	70174757	70175015	70174885	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	12382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	70823866	70823963	70823915	Y	TGFA	TGFA	NA	NA	NA	NA	TGFA	44541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	634159	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	72541323	72541406	72541365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	509764	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	73774930	73775287	73775109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALMS1	164044	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	73967118	73967501	73967310	Y	NA	TPRKB,DUSP11	NA	NA	NA	NA	TPRKB	4591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	75114636	75114786	75114714	Y	NA	AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	28489	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	AC104135.3,POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	75219008	75219394	75219161	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	35389	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	82896168	82896224	82896196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	147031	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	86121717	86122002	86121863	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	7580	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	88629818	88629863	88629841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL2	161983	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	95925847	95925871	95925861	Y	NA	PROM2	PROM2	IMR90	Hi-C	24141950	PROM2	12330	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr2	96871048	96871111	96871053	Y	ASTL,DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7	NA	NA	NA	NA	STARD7	1452	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	48395	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	98290312	98290690	98290542	Y	TMEM131	COX5B,ACTR1B,RNU4-8P	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	11118	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	88784	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	99250910	99251133	99251091	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	27868	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	99551773	99552038	99551906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf15	203910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	101972073	101972519	101972434	Y	NA	RNF149,CREG2	NA	NA	NA	NA	CREG2	29538	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	102492851	102493221	102493042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	181539	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	103280963	103281189	103281017	Y	IL1RL2,SLC9A2	SLC9A2	NA	NA	NA	NA	SLC9A2	46797	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	104583969	104584295	104584132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	1068146	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	106407466	106407922	106407723	Y	NA	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	48112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	106444120	106444569	106444380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	84766	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	109201604	109202307	109201998	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	52747	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	109228635	109228941	109228810	Y	GCC2,RANBP2,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	79778	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	112789561	112789661	112789622	Y	MERTK	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	21139	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	113545433	113545578	113545488	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1A	5266	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	113556767	113557612	113557074	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	IL37,CKAP2L,CHCHD5,IL1A,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1A	16600	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	113563232	113563409	113563324	Y	IL36G,IL1RN	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1A	23065	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	113634636	113634920	113634776	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	IL1B,CKAP2L,IL1A,IL37	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	42156	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	113643095	113643585	113643305	Y	IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G	NA	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1B	50615	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	113869431	113870096	113869786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL36RN	55216	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	256849	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	223627	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	124260647	124260891	124260797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1767968	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	129131715	129132088	129131976	Y	NA	NA	HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	57564	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	133593617	133593946	133593782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	166465	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	134098730	134098873	134098801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	671578	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	134570885	134571181	134570989	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT5	304373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	139198512	139198615	139198564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	58653	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	143624367	143624985	143624879	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	8082	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	148366263	148366285	148366274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	233801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMADHC	219754	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	150440132	150440521	150440417	Y	NA	MMADHC	NA	NA	NA	NA	MMADHC	1809	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	151385444	151385651	151385488	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	7874	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	151389498	151389697	151389616	Y	NA	RND3	RBM43,RND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	3828	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	157038752	157038990	157038871	Y	NR4A2	NA	NR4A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR4A2	157870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	157330960	157331271	157331070	Y	GPD2	GPD2	NA	NA	NA	NA	GPD2	41158	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	157350071	157350391	157350185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	60269	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	662369	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	160491864	160492115	160492090	Y	NA	BAZ2B	BAZ2B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAZ2B	20661	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	160858239	160858486	160858430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	58635	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	267758	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	22054	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	168858571	168859104	168858832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	243547	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	168911148	168911462	168911308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	191189	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	171623254	171623407	171623331	Y	NA	EIF2S2P4,AC007405.4,AC007405.6,GAD1	NA	NA	NA	NA	AC007405.4	1869	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	172961678	172962145	172962061	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	3483	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	173061382	173062264	173061777	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	95754	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	173316258	173316587	173316571	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	26176	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	174518967	174519016	174518991	Y	NA	NA	OLA1,CIR1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7	301419	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	118037	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD11,HOXD8,HOXD-AS2	NA	NA	NA	NA	HOXD11	2917	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	6.97537812961891
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	179471296	179471384	179471314	Y	TTN	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	87386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	182418889	182419281	182419085	Y	NEUROD1,CERKL	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	98960	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	187409105	187409391	187409239	Y	ITGAV,ITGAV	ITGAV	ITGAV	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGAV	43401	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	100900	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	192066963	192067214	192067088	Y	STAT4,MYO1B,MYO1B	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1B	40697	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	192170125	192170408	192170266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	62214	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	205616	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	1432402	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	197078069	197078253	197078160	Y	STK17B	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	38842	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	197779870	197780287	197779995	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	10233	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	199565057	199565374	199565265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	768615	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	203830057	203830223	203830140	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	47298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	206613471	206613845	206613585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	68757	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	207663978	207664088	207664013	Y	NA	FASTKD2,MDH1B	NA	NA	NA	NA	MDH1B	35707	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	208123048	208123437	208123243	Y	NA	AC007879.7	KLF7,CREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	20674	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	208198321	208198507	208198422	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	95947	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	97638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	208202390	208203219	208202610	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	100016	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	208602415	208602802	208602609	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	28151	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	213400949	213401339	213401014	Y	ERBB4	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	613812	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	216529638	216529897	216529693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	230743	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	217400220	217400574	217400443	Y	NA	RPL37A,AC098820.3	DIRC3,XRCC5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AC098820.3	38736	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	219750853	219751263	219750987	Y	RQCD1,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	7768	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16962	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	CHPF	6038	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	222392667	222392822	222392760	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	44100	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	223170887	223171031	223170916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPP2	116205	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	223776983	223777159	223777060	Y	SGPP2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	53331	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	223824867	223825201	223825044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	101215	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	224810635	224810927	224810791	Y	AP1S3	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	2531	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	225621293	225621621	225621457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	173183	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	226896202	226896600	226896518	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	765875	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	227002262	227002653	227002458	Y	NA	NA	LOC646736,IRS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	659822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	227415451	227415852	227415652	Y	NA	NA	LOC646736,IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	246623	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	228276107	228276256	228276208	Y	AGFG1	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	AGFG1	58612	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	230784453	230784592	230784556	Y	NA	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	426	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	231658746	231658958	231658902	Y	SP140L,SP100,SP100	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	68396	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	231901045	231901225	231901135	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	18353	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	99477	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	235187648	235187782	235187715	Y	ARL4C	NA	TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	215915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	235353626	235353934	235353758	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	49763	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	235354817	235355457	235355266	Y	ARL4C	ARL4C	SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	48240	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	237341356	237341565	237341461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	72620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	237654357	237654656	237654652	Y	CXCR7	NA	CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	240172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	237677514	237677881	237677605	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	263329	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	271188	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	238832423	238832667	238832502	Y	NA	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	40802	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14795	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr2	239085902	239086198	239086162	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	20279	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	239593183	239593431	239593307	Y	NA	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	161242	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	115777	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	240168373	240168774	240168689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	152574	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	53682	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	240884529	240884700	240884591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA10	78119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr2	242679689	242679905	242679763	Y	ATG4B,D2HGDH	ING5,D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	7695	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	1154843	1155127	1154985	Y	FAM110A,SIRPB2,SIRPB1	NA	NA	NA	NA	NA	PSMF1	62937	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	76052	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	1398801	1399138	1399021	Y	FKBP1A	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	26995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	1415597	1415981	1415837	Y	NA	FKBP1A,NSFL1C	FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NSFL1C	36506	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	1785698	1786068	1785859	Y	SIRPA,SIRPA	NA	LOC100289473,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	87086	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	63717	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	2978820	2979208	2979015	Y	NA	MRPS26	NA	NA	NA	NA	MRPS26	45383	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	3188788	3188839	3188809	Y	NA	UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	1274	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	4016729	4016906	4016897	Y	NA	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	14177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	4674724	4674919	4674762	Y	NA	PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	9842	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	4942791	4943059	4943002	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	45880	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr20	5741425	5741673	5741600	Y	NA	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	12386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	5816621	5816994	5816701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-55P	51707	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	6094285	6094396	6094341	Y	NA	FERMT1	NA	NA	NA	NA	FERMT1	7795	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	6889340	6889532	6889436	Y	NA	NA	HAO1	IMR90	Hi-C	24141950	BMP2	143029	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	9733190	9733588	9733389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK7	84101	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	11098477	11098718	11098579	Y	NA	NA	C20orf94	IMR90	Hi-C	24141950	JAG1	473463	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	13035099	13035480	13035216	Y	SPTLC3	SPTLC3	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	47472	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	13036502	13036844	13036725	Y	NA	SPTLC3	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	48875	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	13221839	13221847	13221843	Y	NA	ISM1	NA	NA	NA	NA	ISM1	21421	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	17538189	17538505	17538334	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	9360	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	17830512	17830807	17830760	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	17830949	17831353	17831268	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	19716018	19716528	19716293	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	19824	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	19816564	19816804	19816639	Y	C20orf26	RIN2	RIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RIN2	48361	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	19917960	19918777	19918135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIN2	52795	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	19922797	19923187	19922871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIN2	57632	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	283878	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	23140057	23140426	23140138	Y	THBD,CD93,NXT1,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	111679	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	25267859	25268242	25268026	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	41154	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	29833463	29833838	29833651	Y	DEFB121,DEFB116	RP5-854E16.2	NA	NA	NA	NA	RP5-854E16.2	38800	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr20	32826582	32826856	32826719	Y	TP53INP2	NA	EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	70752	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6,FAM83C	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	FAM83C	28081	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	33907005	33907177	33907091	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6,FAM83C	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	FAM83C	28801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6,FAM83C	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	FAM83C	30064	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	34470947	34471302	34471125	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	2279	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	35960561	35961009	35960864	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	10079	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	36046410	36046637	36046524	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	25299	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	36056702	36057072	36056829	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	14864	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TGM2	3728	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	37606792	37607147	37606919	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	17850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	38844790	38845079	38844935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	470801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	39135119	39135769	39135457	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	180111	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	42571412	42571561	42571487	Y	C20orf111	TOX2	NA	NA	NA	NA	TOX2	29908	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	KCNS1,WFDC5,PI3	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	WFDC5	25519	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	43876988	43877346	43877094	Y	NA	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	3859	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	46162026	46162326	46162051	Y	NA	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NCOA3	33425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	46394797	46395044	46394952	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	18316	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	47544338	47544681	47544534	Y	DDX27	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	7911	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	48467762	48467975	48467793	Y	NA	SLC9A8	NA	NA	NA	NA	SLC9A8	40512	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	48496798	48497000	48496896	Y	NA	SPATA2	NA	NA	NA	NA	SPATA2	33080	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	48532841	48533167	48533004	Y	SPATA2,SPATA2	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	2761	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	48903106	48903611	48903352	Y	NA	RP11-290F20.3	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-290F20.3	21083	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	49047228	49047674	49047434	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	77217	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	49454379	49454475	49454388	Y	NA	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	44948	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	ADNP	NA	NA	NA	NA	ADNP	29532	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	50178083	50178314	50178273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	170758	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	95991	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	52374184	52374569	52374228	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	149738	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	52516053	52516507	52516332	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	272005	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	222373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2C	177198	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	55965649	55965902	55965759	Y	NA	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	1186	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	56831956	56832171	56832064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1L	50324	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	57087528	57087608	57087568	Y	NA	APCDD1L,APCDD1L-AS1	NA	NA	NA	NA	APCDD1L	579	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	57586300	57586427	57586364	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5998	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	57596187	57596442	57596344	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	ATP5E	8995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	60011356	60011607	60011563	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	185874	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	60529765	60530009	60529928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	108857	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr20	61077731	61078086	61077930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES2	97390	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PTK6	3461	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr20	62545436	62545544	62545492	Y	NA	DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1	NA	NA	NA	NA	RNU1-134P	7128	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	16222795	16222981	16222977	Y	NA	NA	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRIP1	212340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	17153700	17154031	17153865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	53356	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	18706000	18706364	18706182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXADR	176336	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	19220730	19220877	19220804	Y	NA	C21orf91,RPL37P3	C21orf91	IMR90	Hi-C	24141950	C21orf91	31027	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	27335144	27335525	27335335	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	205921	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	27340051	27340173	27340112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	201273	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	489684	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	35010521	35010538	35010530	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	ITSN1	2168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr21	36326686	36327019	36326981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	341245	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	36511746	36511757	36511752	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6,SETD4	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	526305	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	19644	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	38825760	38825986	38825873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	89668	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	39631762	39632036	39631899	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	104634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	39661705	39662059	39661845	Y	KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	134577	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	39722623	39722941	39722785	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	195495	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	39832417	39832659	39832533	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	305289	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	39860406	39860812	39860600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	314419	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40018484	40018900	40018698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	156331	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40211972	40212276	40212079	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	36741	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40386657	40387043	40386856	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	166734	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40388041	40388127	40388084	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	165650	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40476284	40476629	40476514	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	77148	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	40716228	40716377	40716303	Y	NA	BRWD1,HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	HMGN1	3196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	43089019	43089272	43089054	Y	RIPK4	NA	LINC00111	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK4	95994	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr21	43174806	43174946	43174886	Y	NA	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	10320	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr21	43426535	43426580	43426552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	54536	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	ERVH48-1,PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	ERVH48-1	12229	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	44425410	44425661	44425536	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	32790	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr21	44856189	44856512	44856455	Y	NA	SIK1,LINC00319	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00319	7969	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00319	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00319	49985	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00319	72303	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00319	73178	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	45237788	45238060	45237872	Y	TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	30394	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	45275167	45275241	45275205	Y	NA	MYL6P1,AGPAT3	AGPAT3,PDXK,LOC284837,TRAPPC10	IMR90	Hi-C	24141950	MYL6P1	944	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	46726845	46727332	46727050	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	21032	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr21	47469357	47469652	47469491	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	46359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	59185	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	18404666	18404945	18404902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	100380	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr22	19331396	19331535	19331466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	54157	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	19749283	19749521	19749403	Y	NA	TBX1	NA	NA	NA	NA	TBX1	7057	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	20207380	20207531	20207452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4R	61238	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr22	20885626	20885829	20885752	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	37426	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	20886351	20886470	20886411	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	38151	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	21132162	21132336	21132252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP29	78935	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	22186398	22186549	22186531	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	33421	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	22187099	22187411	22187395	Y	PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	32559	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	22290676	22291029	22290778	Y	MAPK1,PPM1F	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	PPM1F	14180	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	22440278	22440428	22440355	Y	MAPK1,PPM1F	NA	TOP3B,LOC96610	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TOP3B	105065	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	24470506	24470556	24470531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABIN1	64864	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	24536526	24536664	24536595	Y	LOC391322,C22orf13	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	38563	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	25373601	25373706	25373654	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	386426	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	394665	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	25390259	25390306	25390285	Y	NA	NA	KIAA1671	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM211B	403084	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	26150935	26151135	26151006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRBK2	192119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	27816576	27816924	27816809	Y	NA	NA	MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	197888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	254091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	29281576	29281858	29281717	Y	NA	ZNRF3	C22orf31,KREMEN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	3996	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	29467563	29467858	29467701	Y	NA	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	497	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	31639861	31640267	31640177	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33636	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	31645719	31645849	31645807	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	39494	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	33000436	33000667	33000542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	131773	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	33243745	33243918	33243862	Y	NA	TIMP3,Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	10502	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	11263	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	34315412	34315698	34315644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	216506	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	35708559	35708961	35708654	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	15291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	36448788	36448904	36448856	Y	NA	RBFOX2	RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	26315	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-633O19__A.1	23476	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr22	37655075	37655389	37655235	Y	NA	Z82188.1,RAC2	CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	16587	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	38294842	38295023	38294932	Y	CARD10,CDC42EP1,SH3BP1,MICALL1	MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	4641	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	39570711	39571096	39570941	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	24032	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	40781478	40781596	40781515	Y	NA	ADSL,SGSM3	NA	NA	NA	NA	SGSM3	16883	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	44757371	44757617	44757493	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	134561	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	36789	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	46330758	46331082	46331012	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	39927	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	8.02168484906174
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr22	46934347	46934575	46934459	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3280	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr22	50364171	50364294	50364188	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12010	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	3202241	3202572	3202332	Y	NA	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	16822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	40890	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	5058332	5058543	5058409	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	38686	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	5101342	5101770	5101615	Y	BHLHE40	NA	ITPR1,EGOT,LOC100507582,BHLHE40	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8B	60135	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	11237617	11237805	11237677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	60838	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	12723455	12723677	12723573	Y	RAF1	RAF1	TMEM40,RAF1,MKRN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAF1	19730	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	13920516	13920583	13920566	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	898	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	13932354	13932493	13932424	Y	NA	WNT7A,TPRXL	C3orf19,WNT7A,TMEM43,CHCHD4	IMR90	Hi-C	24141950	WNT7A	12736	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	271895	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	15783171	15783247	15783208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	116031	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	16647619	16647698	16647658	Y	DAZL,DAZL	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	94086	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	17307041	17307245	17307143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	464882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	700704	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr3	19470380	19470682	19470561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB5A	515889	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	20200050	20200329	20200065	Y	NA	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	25455	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	24340917	24341295	24341106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	193478	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	24370369	24370393	24370381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	164380	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	24506233	24506581	24506477	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	28192	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	26688087	26688474	26688152	Y	LRRC3B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	835437	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	27448684	27449023	27448831	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	74888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	87236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	27971881	27971920	27971901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	209675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	27984483	27984771	27984759	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	222277	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	28367464	28367703	28367584	Y	NA	AZI2,ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	AZI2	20915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	29412640	29413015	29412700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	92167	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	36805780	36806178	36806113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRANK1	178370	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr3	38144034	38144304	38144167	Y	VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88	ACAA1,MYD88	NA	NA	NA	NA	ACAA1	32429	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr3	41158856	41159369	41159156	Y	NA	NA	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNB1	74959	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	42002407	42002746	42002471	Y	ULK4	ULK4	NA	NA	NA	NA	ULK4	485	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	2843	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	44654573	44654874	44654724	Y	ZNF445,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197	ZNF197,ZNF35	NA	NA	NA	NA	ZNF197	30193	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	21144	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	46553469	46553539	46553504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-24F11.2	106919	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	47004561	47004925	47004746	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	14248	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	50377372	50377700	50377536	Y	NA	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	961	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	52039668	52039907	52039792	Y	NA	PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29,DUSP7	RPL29	K562	ChIA-PET	22265404	RPL29	11710	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	52088878	52089257	52089156	Y	ACY1,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	312	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	52278175	52278351	52278252	Y	PBRM1,PBRM1,WDR82,GLYCTK,TWF2,PPM1M,PPM1M	ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	334	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	53360286	53360418	53360351	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	19236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	56814931	56815295	56815113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	99666	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG	828899	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	69228052	69228449	69228187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	95957	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	71222111	71222440	71222307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	408700	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	71447361	71447554	71447492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	183586	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	71478043	71478236	71478134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	152904	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	107533	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	80049303	80049456	80049382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	234338	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	99579150	99579217	99579184	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223831	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	227268	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	99587238	99587483	99587373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	231919	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	99600050	99600430	99600273	Y	FILIP1L,C3orf26	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	230927	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	100482455	100482783	100482461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	56250	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr3	106276246	106276374	106276310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00883	681165	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	107850030	107850463	107850156	Y	MYH15,CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	42158	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	111420857	111420932	111420895	Y	NA	PLCXD2,PHLDB2	PHLDB2,CD96,ABHD10	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDB2	28412	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	4780	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	111456632	111456831	111456661	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	7288	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	111521164	111521550	111521388	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	71820	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	111723588	111723714	111723651	Y	SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3	ABHD10,TAGLN3	NA	NA	NA	NA	TAGLN3	8077	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	112214148	112214395	112214254	Y	BTLA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	64161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	112404368	112404581	112404378	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	37991	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	112543206	112543267	112543237	Y	C3orf17	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	164498	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	83902	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	115503837	115504240	115504182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639719	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	116953465	116953707	116953586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	209920	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	117626867	117627207	117627037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	883322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	119142297	119142580	119142348	Y	ARHGAP31,NR1I2,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	43097	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	119866352	119866515	119866428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	54610	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	121638049	121638246	121638101	Y	CSTA,ILDR1	SLC15A2	NA	NA	NA	NA	SLC15A2	27113	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.26699789212614
chr3	122151664	122151964	122151814	Y	NA	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	125200225	125200611	125200423	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	36430	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	209278	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	126700801	126701293	126700904	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	279738	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	369236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	128134219	128134423	128134321	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	71632	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	128214371	128214730	128214426	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4	DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-475N22.4	8316	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	128310952	128311168	128311056	Y	DNAJB8,RAB7A,GATA2,GATA2,GATA2	NA	EEFSEC,GATA2,LOC90246	IMR90	Hi-C	24141950	RPN1	86750	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	128957834	128958071	128957930	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	57069	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	129318465	129318690	129318565	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	4971	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	129543558	129543741	129543650	Y	MBD4,H1FOO,TMCC1,TMCC1	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	66678	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	130073130	130073578	130073320	Y	ATP2C1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R4	390095	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	132167229	132167399	132167330	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	32859	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	26009	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	134100770	134101008	134100801	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL2	8449	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr3	141102647	141102881	141102782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	61592	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	141659994	141660128	141660061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	67028	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	147744234	147744618	147744426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	138467	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	149566176	149566232	149566181	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	37681	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	151065337	151065743	151065553	Y	CLRN1,P2RY14,GPR87,P2RY13,P2RY12	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	32597	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	151923088	151923367	151923343	Y	MBNL1	MBNL1	MBNL1,LOC401093	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MBNL1	36250	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	153003780	153003941	153003880	Y	NA	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	125751	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	154987917	154988101	154988024	Y	NA	PABPC1P10	NA	NA	NA	NA	PABPC1P10	37495	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	156444390	156444661	156444493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	54223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	156529352	156529637	156529452	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	2831	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	156847368	156847750	156847738	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	28799	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	158447066	158447110	158447086	Y	NA	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	877	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	159465414	159465509	159465463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	239028	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	159514645	159514911	159514780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	189626	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	337527	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	336917	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	169378305	169378656	169378554	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	750	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	171542633	171542898	171542814	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	15893	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	171592038	171592451	171592208	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	65298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	171826024	171826613	171826515	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	70606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	176776147	176776153	176776150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	137108	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	176862590	176862993	176862904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	50268	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	178423779	178424120	178423952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	363947	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	183010054	183010455	183010255	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	41022	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	183086947	183087263	183087034	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	57303	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	C3orf65	NA	NA	NA	NA	C3orf65	34913	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	186926447	186926523	186926484	Y	NA	RPL39L	NA	NA	NA	NA	RPL39L	29751	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	188017658	188018009	188017791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	147813	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	188109949	188110178	188110065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	240104	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	188151524	188151812	188151760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	281679	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	188618525	188618672	188618589	Y	NA	TPRG1,TPRG1-AS1	NA	NA	NA	NA	TPRG1	44331	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	189034066	189034494	189034299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	312711	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	189508534	189508810	189508672	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	161329	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	189544866	189545241	189545054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	197661	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	189559377	189559697	189559485	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	212172	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr3	189626513	189626760	189626607	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	211466	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	189632708	189632930	189632825	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	205296	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	190041292	190041577	190041442	Y	NA	CLDN1	NA	NA	NA	NA	CLDN1	3028	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	190252374	190252607	190252502	Y	CLDN1,IL1RAP	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	22534	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr3	191620991	191621297	191621143	Y	PYDC2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	576125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr3	193548514	193548983	193548724	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	239581	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	264088	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	193588211	193588236	193588227	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	263698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	47562	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	195542423	195542578	195542499	Y	MUC20,MUC4	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5275	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	195632869	195633225	195632990	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2	NA	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	196352325	196352506	196352427	Y	SENP5,LRRC33	LINC01063,PIGX	SENP5,FBXO45,C3orf43,PAK2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01063	4952	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	196381001	196381149	196381075	Y	PCYT1A,TM4SF19,SENP5,MFI2,MFI2,LRRC33	LINC01063,PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	16355	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	196761683	196762044	196761813	Y	NA	MFI2-AS1,MFI2	MFI2-AS1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	MFI2	6996	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	43553	43799	43797	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	7380	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	47637	47939	47761	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	3240	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	48171	48447	48418	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	2732	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	330052	330352	330160	Y	NA	ZNF141	NA	NA	NA	NA	ZNF141	449	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	770204	770556	770391	Y	ZNF141	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	3081	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	867282	867339	867287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAK	56822	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	1753782	1754101	1753962	Y	FGFR3	SLBP,TMEM129,TACC3,FGFR3	NA	NA	NA	NA	TACC3	32555	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	3085381	3085754	3085447	Y	NA	HTT	NA	NA	NA	NA	HTT	10973	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	6171690	6172033	6171999	Y	PPP2R2C,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	NA	WFS1	97543	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	6495576	6495698	6495612	Y	JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C,PPP2R2C	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2B2	79204	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	10001685	10001951	10001818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A9	52609	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	13483063	13483398	13483224	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	13484540	13485001	13484899	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	551	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	13623241	13623510	13623376	Y	NA	AC006445.7	NA	NA	NA	NA	AC006445.7	8713	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	15074859	15075210	15075035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	72561	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	15895700	15895839	15895750	Y	FGFBP1	FGFBP1	CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	42524	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	15915213	15915572	15915412	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	22791	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	15922988	15923279	15923080	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	15084	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	22270180	22270523	22270471	Y	NA	NA	LOC100505912	IMR90	Hi-C	24141950	GPR125	245154	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr4	24599702	24600087	24599863	Y	NA	DHX15	SOD3,CCDC149	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	15529	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	NA	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	75834	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	25522149	25522297	25522223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC4	145314	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	26994323	26994529	26994430	Y	STIM2	NA	NA	NA	NA	NA	STIM2	137023	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	32142342	32142554	32142470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH7	1422305	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	36078000	36078189	36078065	Y	DTHD1,ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	165942	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	38102941	38103486	38103298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	142885	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	38162520	38162833	38162765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	202464	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	38525630	38525737	38525685	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF3	138080	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	38567143	38567404	38567260	Y	NA	NA	KLF3,FLJ13197,TBC1D1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	96413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	38673994	38674276	38674074	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	9490	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	38735219	38735515	38735398	Y	NA	NA	KLF3,TBC1D1,FLJ13197	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-617D20.1	70715	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr4	39935708	39936100	39935904	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	41476	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	40765283	40765623	40765452	Y	RBM47	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	15369	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	40994779	40995404	40995184	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	221327	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	41130759	41131325	41130803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	85406	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	41999139	41999467	41999284	Y	NA	SLC30A9	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	8650	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	44712631	44712762	44712670	Y	NA	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	13850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	48339625	48339996	48339981	Y	NA	SLAIN2	TEC,SLAIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLAIN2	1343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	53890542	53890886	53890882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	164085	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	57937505	57937813	57937783	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	36115	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	65473910	65474488	65474148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	179283	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	72559235	72559359	72559297	Y	NA	NA	SLC4A4	IMR90	Hi-C	24141950	DCK	702980	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	74593361	74593798	74593698	Y	NA	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	10425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	75097904	75098121	75097961	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	EPGN	74069	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	75187079	75187238	75187159	Y	EPGN	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	14889	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	75228037	75228384	75228211	Y	NA	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	476	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	75274406	75274726	75274555	Y	AREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	45546	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr4	75411825	75412170	75412032	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	182965	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	75557908	75558335	75558035	Y	EREG,AREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	EREG	329048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr4	76106676	76106845	76106762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP6	330311	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	77011342	77011736	77011528	Y	NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11	NA	NA	NA	NA	NA	CXCL11	50774	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	77275383	77275784	77275690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB2	142337	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	77724798	77724936	77724862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	92066	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	79253143	79253310	79253148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	217363	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	84359899	84360122	84360011	Y	NA	HELQ,MRPS18C	NA	NA	NA	NA	HELQ	14887	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	84773321	84773491	84773400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	318254	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	87048261	87048368	87048363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	465100	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr4	88074850	88075090	88074969	Y	DSPP	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	84376	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	89099576	89099877	89099636	Y	HERC6,HERC5	NA	PKD2	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG2	50597	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	89922113	89922454	89922284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	304727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	103485535	103485935	103485588	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	65049	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	106071010	106071297	106071196	Y	TET2,TET2	TET2	NA	NA	NA	NA	TET2	5978	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	106324406	106324791	106324687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	68447	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	106391866	106392288	106392204	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	950	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	108783895	108784172	108784033	Y	SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	40176	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	108819119	108819373	108819246	Y	NA	CYP2U1	NA	NA	NA	NA	CYP2U1	31152	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	114382932	114383313	114383209	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	43453	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	130453969	130454188	130454043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	441205	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	133409064	133409406	133409234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	3396300	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	140650307	140650710	140650510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	65385	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	140696118	140696274	140696196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	111196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	140748220	140748477	140748349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	163298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	143471391	143471615	143471483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	294970	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	144276815	144277022	144276900	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	20900	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	144401789	144402147	144401968	Y	NA	SMARCA5	NA	NA	NA	NA	SMARCA5	30469	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	146546923	146547210	146547042	Y	ZNF827	MMAA	NA	NA	NA	NA	MMAA	9508	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	146674591	146674889	146674740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	137176	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	148693975	148694157	148694066	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	42761	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	150756513	150756641	150756613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	240785	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	153180278	153180573	153180364	Y	NA	NA	PET112,FAM160A1,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXW7	274680	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	189693	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr4	155239135	155239272	155239204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRG1	230315	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	158125886	158126027	158125941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	235340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	378130	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	164543460	164543823	164543698	Y	MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	457387	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	164741001	164741233	164741117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	654928	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	790284	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	169522008	169522260	169522060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	65071	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	169791118	169791499	169791286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	137927	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	169849945	169850177	169850075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	79249	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr4	169868186	169868202	169868194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	61224	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	170096424	170096523	170096474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	93733	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	177715411	177715680	177715585	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	3530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	181271168	181271409	181271288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	1792993	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	183536176	183536411	183536208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	300678	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	183730445	183730610	183730498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	106479	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	183826285	183826336	183826311	Y	NA	DCTD	NA	NA	NA	NA	DCTD	10753	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	184270914	184271169	184271084	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	92575	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	4.01084242453087
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC11	140467	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	185324238	185324411	185324337	Y	ACSL1,IRF2,CASP3	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	69323	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD37	87567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	40301	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	186594730	186595126	186594900	Y	SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SNX25	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	139964	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	186738363	186738465	186738414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	249841	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr4	187597728	187597911	187597833	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	47965	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	187680620	187680766	187680713	Y	NA	FAT1	LOC339975,FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	34744	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr4	187834148	187834163	187834155	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	188272	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	413817	414070	413960	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	27188	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	584616	584947	584782	Y	NA	CEP72	SLC9A3,CEP72,TRIP13,TPPP	IMR90	Hi-C	24141950	CEP72	25440	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	2487787	2487964	2487876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	262281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	2750184	2750594	2750355	Y	C5orf38,IRX2	IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	2758153	2758545	2758351	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	IRX2	7184	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	3304230	3304631	3304430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX1	289537	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.05714914397371
chr5	7272852	7272956	7272879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	508848	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	13591800	13592064	13591902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH5	350588	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	14037561	14037744	14037653	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94909	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	14110836	14111023	14110985	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	30788	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	14174472	14174896	14174531	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	32661	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	14742718	14742956	14742837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	53553	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	16698370	16698703	16698671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	83203	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	118354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	17177639	17177702	17177672	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	37454	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	9830	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	24155781	24155941	24155882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	653649	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	1658354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	32028303	32028410	32028357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	144046	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	32274798	32274903	32274861	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	36212	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	34587608	34588326	34587915	Y	NA	NA	RAI14	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	66016	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	38514652	38514707	38514680	Y	NA	CTD-2263F21.1,MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	40956	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	38872248	38872554	38872396	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	28288	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	39224309	39224533	39224438	Y	FYB	FYB	NA	NA	NA	NA	FYB	48097	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	39256594	39256894	39256792	Y	RICTOR,FYB	FYB	NA	NA	NA	NA	FYB	15736	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	3.13892015832851
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	FYB	443917	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	FYB	448698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	40396530	40396675	40396612	Y	PTGER4	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	280925	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	40411118	40411409	40411246	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	266191	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	40735267	40735522	40735406	Y	NA	TTC33	NA	NA	NA	NA	TTC33	18555	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	42465969	42466319	42466144	Y	GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR	NA	NA	NA	NA	NA	SEPP1	419175	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	31500	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	52332019	52332357	52332083	Y	FST,ITGA2	ITGA2,CTD-2175A23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2175A23.1	47911	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	52545484	52545615	52545603	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS2	141591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	52615248	52615546	52615363	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	158693	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	52619379	52619641	52619531	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	154598	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr5	52627320	52627670	52627488	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST,NDUFS4	IMR90	Hi-C	24141950	FST	146569	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	52633703	52633938	52633784	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	FST	140301	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr5	53298305	53298413	53298402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	305999	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	55811954	55812276	55812115	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	13055	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	57389991	57390128	57390060	Y	NA	NA	PLK2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLK2	363959	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	605797	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	691041	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	58874550	58874813	58874554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	906727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	59041159	59041490	59041319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	740050	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	60571773	60571988	60571884	Y	ZSWIM6	NA	NDUFAF2	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM6	54112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	60600910	60601202	60601013	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	24898	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	64224703	64224806	64224755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	161946	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	65898344	65898352	65898348	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	8168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	MAST4-AS1	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	8847	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	67448850	67449023	67448936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	60525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	67806918	67806931	67806925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	297370	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	CTC-498J12.1,SLC30A5	NA	NA	NA	NA	CTC-498J12.1	815	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	71045616	71045849	71045733	Y	NA	NA	MCCC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MCCC2	164501	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	182388	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	71852331	71852540	71852377	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	237858	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	73926262	73926632	73926507	Y	FAM169A	HEXB,ENC1	NA	NA	NA	NA	HEXB	7216	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	76110007	76110333	76110205	Y	NA	F2RL1	NA	NA	NA	NA	F2RL1	2425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	77589539	77589820	77589680	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	960	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	78439900	78440059	78439990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	89802	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	RP11-342F17.1,HOMER1,RP11-342F17.2	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-342F17.2	20277	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	79422868	79423198	79423038	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	126700	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	80927026	80927304	80927299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	118312	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	81702078	81702394	81702360	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	129682	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	82327653	82327993	82327823	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	43324	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	86417910	86418259	86418047	Y	NA	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	143446	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	86663167	86663443	86663248	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43393	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	91949366	91949620	91949441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	1067753	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	94412847	94413065	94412956	Y	MCTP1	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	205214	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	95179469	95179934	95179619	Y	NA	GLRX	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	22760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	95227563	95227763	95227704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	67942	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr5	95507678	95508048	95507916	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	211903	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	96022483	96022592	96022538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	119211	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	96051794	96052190	96051986	Y	LNPEP	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	89613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	96159684	96160037	96159828	Y	CAST,CAST	ERAP1,ERAP2	CAST,RIOK2,ERAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERAP1	17881	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	96902008	96902041	96902023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2278B20.1	231264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	97444170	97444562	97444463	Y	NA	NA	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	227886	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr5	100163819	100164102	100163976	Y	ST8SIA4,ST8SIA4	NA	NA	NA	NA	NA	FAM174A	294810	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	106862612	106863005	106862809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	141591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	106906858	106907181	106907119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97415	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	106907307	106907511	106907485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97085	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	108791627	108791782	108791705	Y	NA	PJA2	PJA2	IMR90	Hi-C	24141950	PJA2	47932	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	109207541	109207704	109207623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	184474	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	112509140	112509432	112509369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	198741	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	112602603	112602927	112602766	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	219600	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	112629156	112629538	112629463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	192989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	114881094	114881387	114881239	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	2503	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr5	115070693	115071068	115070974	Y	CDO1	NA	NA	NA	NA	NA	TMED7	104004	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	118320389	118320797	118320598	Y	NA	PTMAP2,DTWD2	NA	NA	NA	NA	DTWD2	1443	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	118368421	118368671	118368600	Y	TNFAIP8,TNFAIP8,DMXL1	DTWD2,DMXL1,CTB-161M19.4	TNFAIP8,DMXL1	IMR90	Hi-C	24141950	DMXL1	2796	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	118626064	118626362	118626186	Y	DMXL1,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	23677	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	118627745	118627943	118627845	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	25358	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	118670685	118671156	118670901	Y	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	68298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	118677194	118677610	118677495	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	74807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	118701841	118702237	118702039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	83901	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	119940626	119940961	119940736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	142653	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	122181959	122182300	122182177	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	4825	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	344224	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr5	123774307	123774708	123774529	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	307792	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	123966351	123966687	123966497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	115813	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	125730040	125730374	125730276	Y	C5orf48,ALDH7A1,GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	36216	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf63	71695	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	131595834	131595951	131595900	Y	KIF3A,PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	4470	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	131763102	131763516	131763179	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	18774	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	131764930	131765294	131765112	Y	NA	C5orf56,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	20602	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	133435759	133436442	133436277	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	11960	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.1	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	31064	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	NA	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	68908	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.1	92728	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	133864116	133864195	133864168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.1	93714	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	133880902	133881116	133881009	Y	PCBD2,CDKL3,PHF15	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	101363	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	133890161	133890536	133890268	Y	TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	91943	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-276P9.1	101864	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	134729023	134729250	134729122	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	4354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	182646	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	138262166	138262549	138262196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	317510	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	329197	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	139040519	139041115	139040855	Y	PAIP2	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	15635	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	22059	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	39933	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	56558	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	142174275	142174448	142174377	Y	ARHGAP26	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	26326	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	146047313	146047450	146047388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCERG1	222439	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	146200379	146200464	146200463	Y	PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	261883	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINK5	60582	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	147777538	147777934	147777556	Y	NA	FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	16040	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	148505231	148505419	148505389	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	13627	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	148664180	148664379	148664280	Y	NA	AFAP1L1	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	14746	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	148832906	148833066	148832986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	95941	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	148836415	148836621	148836572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	92386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	149261958	149262272	149262115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	76028	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	149979570	149980059	149979818	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	928	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	150261861	150262245	150261884	Y	IRGM	ZNF300	NA	NA	NA	NA	ZNF300	20300	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	150385694	150386089	150385927	Y	SYNPO,GPX3	NA	NA	NA	NA	NA	TNIP1	85049	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	150464543	150466084	150465220	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	5054	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	150873344	150873758	150873456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A1	58737	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	150902961	150903053	150903007	Y	FAT2	FAT2	NA	NA	NA	NA	FAT2	43452	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	151017311	151017607	151017366	Y	FAT2	SPARC	SLC36A1,FAT2,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	47119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	10.6374516476688
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	156939273	156939536	156939403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL4	54246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	157284724	157285025	157284835	Y	NIPAL4,ADAM19	CLINT1	LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	158248563	158248909	158248669	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF145	386152	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	158667490	158667750	158667579	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145,CTB-11I22.2,UBLCP1	ADRA1B	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-11I22.2	14767	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	159355194	159355367	159355277	Y	NA	ADRA1B	NA	NA	NA	NA	ADRA1B	13404	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	159496389	159496537	159496463	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	47893	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	159637065	159637397	159637293	Y	FABP6	FABP6,RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	FABP6	24691	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	160344282	160344296	160344289	Y	ATP10B	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	497453	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	162483984	162483999	162483992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-541P9.3	378333	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	167088894	167089267	167088997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	57101	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	167157088	167157552	167157214	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	10720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	167171330	167171561	167171437	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	24962	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr5	167197574	167197786	167197665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	51206	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	78551	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	167243466	167243587	167243564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	97098	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr5	167243967	167244280	167244072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	97599	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	167298999	167299254	167299082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	152631	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	171581047	171581366	171581364	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	32024	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr5	171847636	171847998	171847816	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	31529	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	172228151	172228566	172228394	Y	DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	30712	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr5	173957114	173957459	173957290	Y	NA	NA	MSX2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MSX2	192077	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	7330	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	179513863	179514025	179513944	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	16745	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr6	1311552	1311897	1311757	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	877	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	1641578	1641903	1641733	Y	NA	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	32897	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr6	1798121	1798343	1798232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	189440	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	2128026	2128199	2128099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	115727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	2767771	2767941	2767856	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	4123	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	2877769	2878087	2877933	Y	SERPINB9,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	37529	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	24636	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	30302	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	3308463	3308483	3308477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMG4	78826	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	3317564	3317616	3317590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMG4	87927	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	183257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	4318505	4318856	4318766	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,PPP1R3G	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	184674	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	5280343	5280601	5280557	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	21066	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	6657678	6658009	6657847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	447821	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	6678540	6678781	6678655	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	427049	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	6856813	6857789	6856950	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	248041	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	7112981	7113125	7113000	Y	RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	7151	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	7480187	7480515	7480351	Y	DSP	NA	DSP	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DSP	59293	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	7651015	7651415	7651215	Y	NA	NA	BMP6,MUTED-TXNDC5,PIP5K1P1	IMR90	Hi-C	24141950	SNRNP48	62583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	10084518	10084797	10084586	Y	NA	NA	LOC100506207,LOC100130275,TFAP2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	333095	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	LINC00518	8419	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	10587786	10588136	10587948	Y	TMEM14B,GCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	104792	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	236293	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	169978	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	11212824	11213214	11213068	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	167367	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	150873	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	11270585	11270869	11270602	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	109712	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	11277838	11278167	11278081	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	102414	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	11278482	11278599	11278588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	101982	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	11316345	11316699	11316437	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	63882	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	11342197	11342524	11342271	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	38057	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr6	11350374	11351151	11350648	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	29430	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	11414898	11415336	11414989	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NEDD9,C6orf228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	34317	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	11732067	11732789	11732417	Y	NEDD9,NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	196129	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	12242168	12242480	12242308	Y	HIVEP1,EDN1	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	46116	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	12287477	12287842	12287503	Y	NA	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	754	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	12577591	12578036	12577836	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	288995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	13455271	13455432	13455317	Y	NA	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	30462	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	13671877	13672171	13672102	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83	RANBP9	NOL7,SIRT5	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	37625	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	14100441	14100877	14100648	Y	CD83	CD83	RNF182	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	14995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	14211875	14212265	14212161	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	96003	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	14732820	14733791	14733202	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510736	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	14733801	14734229	14733883	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	14929648	14930020	14929845	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	314507	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	15365610	15365867	15365688	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	118745	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	15569583	15569742	15569685	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	91547	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	200010	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	16607418	16607798	16607611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	151571	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	16690265	16690543	16690477	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	68826	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	16713666	16713734	16713668	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45635	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	18016545	18016825	18016604	Y	NA	KIF13A	TPMT,NHLRC1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13A	30691	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	18153083	18153444	18153238	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	23904	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	18419977	18420304	18420012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	53198	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	19448405	19448469	19448461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	762201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	20978432	20978689	20978561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	445744	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	21264288	21264471	21264361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	327501	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	22222867	22222924	22222901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	630895	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	25406864	25407254	25406949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	129558	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	25511627	25511972	25511799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	234321	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	25525007	25525226	25525060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	247701	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	27136362	27136689	27136526	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AH	23501	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	49442	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	28146	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30175844	30176213	30176153	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2991	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30519269	30519607	30519590	Y	NA	PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	3056	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	21450	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30736850	30737361	30737156	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	26519	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	30785907	30786494	30786279	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	55704	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr6	32577297	32577935	32577770	Y	GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1	HLA-DRB1	NA	NA	NA	NA	HLA-DRB1	21672	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1	NA	NA	NA	NA	BRD2-IT1	20028	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	34992488	34992843	34992549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	137446	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	36656050	36656213	36656132	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	LAP3P2,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	13745	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	37024161	37024556	37024514	Y	NA	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	72087	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	39317410	39317439	39317426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYSD1	236445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	39393880	39394120	39394000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYSD1	312915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	40904550	40904902	40904649	Y	UNC5CL	NA	APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL	IMR90	Hi-C	24141950	NFYA	133782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	41623844	41623904	41623860	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	21224	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	42081758	42081907	42081849	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	26450	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	42898508	42898648	42898552	Y	NA	C6orf226,CNPY3,RPL24P4,PEX6	NA	NA	NA	NA	CNPY3	3570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	43244173	43244568	43244268	Y	NA	NA	SLC22A7,CRIP3,ZNF318	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF318	90648	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	46686763	46687109	46687028	Y	PLA2G7,PLA2G7	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	68085	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P5	396291	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	53734127	53734150	53734138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	76832	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	54604535	54604549	54604543	Y	NA	KRASP1	NA	NA	NA	NA	KRASP1	28832	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	64814643	64814659	64814650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	470918	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	70479579	70479974	70479889	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	25029	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	72179171	72179414	72179328	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	50699	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25410	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	73355182	73355469	73355282	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25662	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	73728224	73728284	73728227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	242654	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	73833038	73833304	73833144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	137634	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	74518792	74518970	74518881	Y	MB21D1,CD109,CD109	NA	NA	NA	NA	NA	CD109	115284	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	75914223	75914620	75914578	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	456	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	76467215	76467333	76467230	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	10306	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	79718228	79718616	79718429	Y	PHIP	NA	NA	NA	NA	NA	PHIP	67337	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	79753259	79753564	79753411	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	32389	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	80777050	80777287	80777243	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	37077	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	82554529	82554698	82554614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	94038	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	84139998	84140114	84140099	Y	ME1	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	1201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	91168030	91168508	91168309	Y	NA	NA	BACH2,MDN1,CASP8AP2,GJA10	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K7	126256	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	92644130	92644239	92644185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	1349366	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	95887569	95887862	95887716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	135557	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	99279823	99280075	99279977	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	113774	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	105743987	105744339	105744163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREP	104620	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	108239964	108240066	108240015	Y	NA	SEC63	NA	NA	NA	NA	SEC63	37327	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr6	109011028	109011405	109011217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	131990	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	111739300	111739614	111739444	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	REV3L	63304	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	113748852	113749029	113748940	Y	NA	RP1-124C6.1	MARCKS,FLJ34503	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-124C6.1	3594	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	113975639	113976185	113975774	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	6363	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	RP11-367G18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-367G18.1	36530	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	114131008	114131408	114131371	Y	NA	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	45133	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	116476913	116476984	116476947	Y	TSPYL4	NA	NA	NA	NA	NA	NT5DC1	56901	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	116708158	116708375	116708238	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26F	72158	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	116731952	116732286	116732048	Y	DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	48247	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	116772615	116772756	116772721	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	7777	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	119131601	119131904	119131835	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	81480	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	119366243	119366474	119366359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM9	111916	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	121398601	121398951	121398918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	355887	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	121759226	121759877	121759689	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	4388	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1,PKIB	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	125424080	125424400	125424202	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	13795	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	125426714	125426967	125426959	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	11228	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	125579970	125580036	125580003	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	41246	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	126267356	126267782	126267584	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	8145	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	128830157	128830356	128830243	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	9514	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23,RNU4-18P	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	132787299	132787948	132787832	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	44389	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	134504980	134505079	134505030	Y	SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	132171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	134700193	134700599	134700296	Y	SGK1,SGK1	NA	ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	62943	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	135435494	135435847	135435630	Y	NA	HBS1L	AHI1	IMR90	Hi-C	24141950	HBS1L	13300	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	158550	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	138149142	138149492	138149237	Y	OLIG3,TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	36859	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	138353138	138353418	138353320	Y	PERP	NA	PERP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PERP	73230	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	138356192	138356530	138356352	Y	NA	NA	PERP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PERP	70118	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	139351818	139352158	139351992	Y	CCDC28A,C6orf115,HECA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	44420	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	139899473	139899647	139899531	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	205716	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	142644630	142644955	142644766	Y	NA	GPR126	NA	NA	NA	NA	GPR126	23639	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	143221710	143222285	143222093	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	42053	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	149022109	149022176	149022143	Y	SASH1	UST	LOC100128176,UST	IMR90	Hi-C	24141950	UST	44288	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	150577051	150577247	150577096	Y	RAET1G,ULBP2,RAET1L,PPP1R14C	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-7P	68652	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	150588952	150589102	150589017	Y	RAET1G,PPP1R14C	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-7P	56797	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	150647426	150647808	150647617	Y	NA	RNU4-7P	PPP1R14C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-7P	1527	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	151178145	151178545	151178467	Y	MTHFD1L	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	6140	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	151770191	151770744	151770510	Y	NA	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	RMND1	515	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	313723	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	152887777	152887895	152887836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	69041	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	155916760	155916771	155916766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	283133	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	157411919	157412211	157412008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	314856	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr6	159999734	159999818	159999804	Y	NA	NA	FNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	WTAP	144799	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	161549553	161550030	161549828	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	138794	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	161693137	161693518	161693484	Y	NA	AGPAT4	MAP3K4	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT4	44	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	161790443	161790679	161790575	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	97350	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	161796504	161796762	161796717	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	103411	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	163746157	163746288	163746242	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	86744	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	163972161	163972427	163972234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	139129	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	166420168	166420416	166420184	Y	T	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	333663	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	331217	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	166795008	166795404	166795174	Y	NA	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	40929	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	166970262	166970784	166970543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	216183	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	167395299	167395692	167395496	Y	NA	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	RP1-167A14.2	14861	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	169588480	169588865	169588804	Y	NA	RP11-417E7.1	WDR27,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	27461	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	170364764	170365251	170365177	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	TCTE3	215109	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	170468202	170468424	170468316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	129137	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	170491997	170492052	170492021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	105509	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	170501868	170502090	170502073	Y	DLL1	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	95471	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	9.76552938146647
chr6	170654095	170654292	170654195	Y	FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	56304	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	409137	409513	409244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	148420	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	1092665	1092797	1092731	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	10453	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	2306623	2306831	2306646	Y	MAD1L1	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	26766	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	2569854	2570215	2570046	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19691	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	2575019	2575461	2575251	Y	NA	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	BRAT1	17900	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	2744937	2745164	2745051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	75352	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	2842322	2842519	2842421	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	30736	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	3307587	3307977	3307629	Y	NA	NA	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	CARD11	226008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	4133088	4133284	4133186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	548104	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	5650367	5650762	5650403	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	19928	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	6296618	6296924	6296769	Y	CCZ1	CYTH3	NA	NA	NA	NA	CYTH3	13351	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	6319055	6319208	6319146	Y	NA	CYTH3	USP42	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH3	8780	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	7608686	7608956	7608841	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	4183	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	12463736	12464090	12463948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	214869	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	16751358	16751548	16751453	Y	NA	TSPAN13	NA	NA	NA	NA	TSPAN13	39612	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	17336947	17337086	17336970	Y	NA	AHR	NA	NA	NA	NA	AC003075.4	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	17409796	17409963	17409863	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	72815	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	AC017060.1	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC017060.1	31959	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr7	17701568	17701856	17701681	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC017060.1	105035	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	20254261	20255002	20254926	Y	MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	25	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	21260621	21260992	21260836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	204660	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	22640442	22640878	22640827	Y	IL6	NA	LOC100506178,IL6,KLHL7	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P6	90824	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	74454	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	102218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	23410116	23410259	23410188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	97827	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	24795767	24795828	24795792	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11416	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	24828501	24828972	24828786	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	21257	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	24947142	24947425	24947387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	71828	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX10	131009	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	27143635	27143783	27143725	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	1613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	27176174	27176251	27176224	Y	HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA10-AS	NA	NA	NA	NA	HOXA5	5036	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	27386345	27386573	27386562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P4	79048	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	27642128	27642466	27642297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBADH	58148	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	28666375	28666568	28666485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	329435	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	29321344	29321971	29321667	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	88277	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	30206134	30206379	30206282	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	115544	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS,AC005154.6	NA	NA	NA	NA	AC005154.6	26339	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	33079333	33079582	33079400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP9	67431	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	38695355	38695603	38695479	Y	NA	NA	AMPH	IMR90	Hi-C	24141950	VPS41	274391	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	40938770	40939089	40938937	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	801617	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chr7	40961938	40962183	40962107	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	778523	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	41738328	41738691	41738507	Y	INHBA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	2015	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	42174635	42174902	42174765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	100567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	43625293	43625372	43625313	Y	URGCP,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	4936	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	44658456	44658730	44658526	Y	PURB,TMED4,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	14285	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	47575953	47576318	47576309	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	43838	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr7	50418144	50418701	50418411	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	97387	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	55063666	55063958	55063856	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	20756	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	55142882	55143327	55143024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	58168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	55245390	55245594	55245555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1P2	80355	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	55253994	55254266	55254079	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1P2	71683	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	56014247	56014598	56014343	Y	NA	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	2888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	57456304	57456589	57456447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1284035	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	72939749	72940060	72940006	Y	BAZ1B	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	5141	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	73989785	73989913	73989858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	80081	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	75449549	75449901	75449725	Y	NA	CCL26,RHBDD2	HIP1,CCL26,CCL24,POR,TMEM120A,STYXL1,MDH2	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	20019	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	75922960	75923105	75923022	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	6756	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	77042821	77043194	77043007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	121398	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	86320673	86320677	86320675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	366338	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	86561279	86561598	86561380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	125417	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	86946167	86946460	86946286	Y	NA	TP53TG1,CROT	NA	NA	NA	NA	TP53TG1	26371	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	90250368	90250899	90250569	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CDK14	156630	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	91456025	91456190	91456079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERF	51844	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	91466585	91467314	91466893	Y	NA	MTERF	NA	NA	NA	NA	MTERF	40720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	92233387	92233691	92233548	Y	NA	FAM133B	FAM133B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	15679	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	92373404	92373742	92373580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	90055	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	92437286	92437617	92437517	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	26180	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	92673041	92673276	92673159	Y	NA	NA	CDK6,FAM133B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAMD9	72060	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	100342957	100343164	100343095	Y	NA	POP7	NA	NA	NA	NA	POP7	41281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	101558411	101558603	101558507	Y	SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	101452	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	102452256	102452586	102452421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	64838	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	102959356	102959407	102959404	Y	PMPCB,DNAJC2	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PSMC2	23294	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	104684659	104684988	104684665	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	33168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RINT1	52601	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	105711914	105712310	105712244	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	38712	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	105766301	105766504	105766403	Y	NA	SYPL1	CDHR3,ATXN7L1,SYPL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	15279	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	108015500	108015588	108015544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	133089	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	110856868	110857086	110856977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	343487	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	115873924	115874179	115873941	Y	TES	TES	NA	NA	NA	NA	TES	25377	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	116202174	116202561	116202326	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	39335	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	122273442	122273779	122273758	Y	CADPS2	RPS26P31	NA	NA	NA	NA	RPS26P31	45565	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	122319383	122319737	122319553	Y	NA	RPS26P31	NA	NA	NA	NA	RPS26P31	39	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	123558914	123558958	123558950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASL	171793	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	125245004	125245035	125245020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420H19.3	306072	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	129598516	129598781	129598654	Y	NRF1,UBE2H,UBE2H	UBE2H	UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2H	7727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	130530611	130530821	130530670	Y	NA	NA	MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329	IMR90	Hi-C	24141950	COPG2	179013	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	206421	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	130665753	130666114	130665990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	126741	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	132106504	132106703	132106622	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	658145	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	134247089	134247493	134247269	Y	LRGUK	AKR1B10,AKR1B15	NA	NA	NA	NA	AKR1B15	15201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	134836004	134836265	134836096	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49	NA	NA	NA	NA	TMEM140	5180	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr7	135459124	135459310	135459189	Y	NA	NA	C7orf73,SLC13A4,FAM180A	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	113880	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	135738489	135738866	135738610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	78388	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	138643234	138643648	138643551	Y	TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	20416	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	109651	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	140015850	140016530	140016109	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB19	85313	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	140497709	140498045	140497887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB2	109132	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	142246179	142246560	142246372	Y	EPHB6	NA	EPHB6	IMR90	Hi-C	24141950	EPHB6	304232	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	143856214	143856503	143856359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM115A	258923	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	66552	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr7	155752755	155752934	155752845	Y	SHH	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC009403.2	316856	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC009403.2	318659	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	157085416	157085724	157085621	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	40351	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr7	157691639	157691978	157691861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	565564	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr7	158196067	158196294	158196241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	299226	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.26699789212614
chr7	158357376	158357683	158357548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	137837	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	1693574	1694042	1693752	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7902	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	1736486	1736690	1736554	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	25818	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	6274860	6275007	6274938	Y	MCPH1	MCPH1	NA	NA	NA	NA	MCPH1	12747	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	6394489	6394505	6394499	Y	AGPAT5,ANGPT2	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	132376	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	8746516	8746997	8746809	Y	CLDN23	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	2158	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	121498	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	10591008	10591121	10591065	Y	RP1L1,SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	104236	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	10922710	10923064	10922845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR6	133811	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	11282611	11282836	11282801	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	47388	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	11690057	11690160	11690110	Y	NA	SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB	NA	NA	NA	NA	RP11-297N6.4	31980	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	11734631	11734824	11734746	Y	CTSB	CTSB	CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	9674	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	14762942	14763011	14762975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	509713	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	19553967	19554124	19554035	Y	NA	NA	CSGALNACT1	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	59416	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	19576483	19576522	19576494	Y	NA	CSGALNACT1	CSGALNACT1,SH2D4A,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	37018	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	22522684	22522941	22522886	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	1720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	22838413	22838742	22838578	Y	NA	RHOBTB2	BIN3,TNFRSF10B,RHOBTB2,PEBP4,C8orf58,KIAA1967,LOC286059	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB2	4188	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	23353842	23353942	23353892	Y	TNFRSF10C,SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	30376	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	23390028	23390384	23390041	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	5710	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	25092167	25092564	25092364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	51929	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	25133664	25134104	25133793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	93426	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	137853	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	27209291	27209793	27209526	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	42292	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	27474556	27474730	27474657	Y	NA	CLU,SCARA3	SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLU	4008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	28355222	28355409	28355286	Y	NA	FBXO16,FZD3	NA	NA	NA	NA	FZD3	5493	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	29248095	29248236	29248197	Y	NA	DUSP4	MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	41910	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chr8	29948448	29949236	29948548	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	1678	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	30580467	30580796	30580574	Y	GSR	GSR,UBXN8	NA	NA	NA	NA	GSR	2647	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	32642880	32643214	32643047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	685726	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	5.92907141017607
chr8	36758959	36759166	36759082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150O12.1	650535	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	38781974	38782296	38782041	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	25221	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	48265617	48265884	48265750	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191124	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	49611840	49612006	49611979	Y	SNAI2	EFCAB1	NA	NA	NA	NA	EFCAB1	33864	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	49783004	49783154	49783067	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	49145	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	55018716	55018874	55018809	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	LYPLA1,MRPL15	LYPLA1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LYPLA1	6139	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	56352496	56352535	56352512	Y	XKR4	NA	NA	NA	NA	NA	TGS1	331166	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	56885324	56886256	56885536	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	LYN	94952	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	57122742	57122884	57122813	Y	NA	PLAG1,CHCHD7	NA	NA	NA	NA	CHCHD7	497	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	59491466	59491801	59491581	Y	UBXN2B,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	27983	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	62385898	62385985	62385942	Y	CLVS1	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	239170	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	62427686	62427987	62427837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	197168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	66863902	66864441	66863992	Y	RRS1,PDE7A	NA	PDE7A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE7A	111345	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	71031909	71031920	71031915	Y	NA	RNU1-101P	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	43642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	71124105	71124438	71124275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	135838	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	161252	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	72835218	72835410	72835314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	80515	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	74371877	74372089	74371987	Y	RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7	165853	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	74637544	74637721	74637705	Y	NA	STAU2	NA	NA	NA	NA	STAU2	20222	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	76442700	76442993	76442806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	547950	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	79675234	79675631	79675433	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40127	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	NA	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS28	234269	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	80720328	80720556	80720442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	219968	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	81749885	81750162	81750025	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	272141	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	86378354	86378674	86378384	Y	LRRCC1,CA2	CA2	NA	NA	NA	NA	CA2	4273	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	90838382	90838725	90838688	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK2	70407	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	94850124	94850307	94850200	Y	PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17728	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	95003706	95004122	95004001	Y	NA	NA	LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	135671	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	95943173	95943450	95943312	Y	NA	CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3	NA	NA	NA	NA	TP53INP1	16189	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	95974189	95974483	95974287	Y	TP53INP1	TP53INP1,RP11-347C18.3	C8orf69	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-347C18.3	13924	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	97272793	97273157	97272974	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	850	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	97845398	97845726	97845580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	573455	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	99485745	99486120	99486088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	181124	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	100803946	100804239	100804046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	100051	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81963	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	101500158	101500422	101500292	Y	NA	NA	RNF19A,GRHL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	69590	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	101679774	101679926	101679916	Y	NA	SNX31	FLJ42969,SNX31,PABPC1	IMR90	Hi-C	24141950	SNX31	6131	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	101880714	101880933	101880768	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	YWHAZ,ZNF706	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAZ	82683	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	101914244	101914460	101914402	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	49156	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102100153	102100310	102100232	Y	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	116111	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102191448	102191797	102191796	Y	NA	ZNF706	NA	NA	NA	NA	ZNF706	24624	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102449376	102449720	102449428	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	52940	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	102516990	102517159	102517011	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	14330	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102543448	102543645	102543547	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	40788	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	102665065	102665479	102665281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHL2	162405	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	103757592	103757997	103757773	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	91462	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	103906775	103907150	103906829	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	2683	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr8	117889939	117890223	117890034	Y	RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	4834	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	119049251	119049636	119049444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	72456	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	119264701	119264795	119264748	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	142609	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	120217398	120217670	120217528	Y	MAL2	MAL2	NA	NA	NA	NA	MAL2	42125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	120232000	120232286	120232044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	56727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	123845065	123845251	123845073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	53432	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	19539	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	125304968	125305098	125305033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	77835	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	126335524	126335526	126335525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	105037	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	126984156	126984525	126984411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	543593	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	127938432	127938773	127938643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	290560	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	128219153	128219489	128219426	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	9844	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128231853	128232218	128232163	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	2520	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	128412842	128413241	128413043	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	183509	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128413471	128413778	128413602	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	184138	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128519696	128520090	128519909	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	225590	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128678694	128678799	128678726	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	66881	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128680448	128680536	128680487	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	65144	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	30584	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	129196843	129197355	129196931	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	175986	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	130315048	130315337	130315217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDMC	481797	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	130907129	130907396	130907263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDMC	109995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	131148484	131148822	131148654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	121109	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	131201084	131201473	131201279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	173709	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	131291188	131291588	131291505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	162318	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	131503797	131504200	131504000	Y	NA	ASAP1	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	49891	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	133993345	133993776	133993430	Y	SLA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	207727	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	134065338	134065765	134065507	Y	TMEM71,PHF20L1,TG,SLA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	246500	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	134131797	134131957	134131879	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	180308	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	141212639	141212826	141212733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	253852	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	142082969	142083325	142083150	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	42052	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	142084181	142084412	142084295	Y	PTK2	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	40965	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	142919518	142919535	142919527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P38	452343	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	143864627	143864692	143864660	Y	NA	SLURP1,LYPD2,LYNX1,LY6D	NA	NA	NA	NA	LY6D	1316	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	143869768	143870087	143870041	Y	PSCA,SLURP1,LYNX1,LY6D	SLURP1,LYPD2,LYNX1,LY6D	NA	NA	NA	NA	LY6D	3760	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	144094701	144094997	144094860	Y	LY6K,C8orf55	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	2402	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H	14534	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	144950990	144951185	144951055	Y	C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	358	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	631583	631920	631840	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	163292	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	3508264	3508975	3508586	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15029	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	3575908	3576060	3576000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	51185	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	3576230	3576494	3576362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	51507	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	4892272	4892588	4892430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	90445	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	5901129	5901190	5901160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	70012	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	6004392	6004777	6004642	Y	NA	KIAA2026,RANBP6	NA	NA	NA	NA	KIAA2026	1124	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	10094485	10094558	10094522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1005609	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	10446077	10446442	10446410	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1357201	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	20484725	20484943	20484834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	135599	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	21016783	21016802	21016795	Y	IFNA1,IFNA6,IFNA5,IFNW1	PTPLAD2	NA	NA	NA	NA	PTPLAD2	12833	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	21491701	21492113	21492049	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	18071	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	21696721	21697113	21696912	Y	IFNA8	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103429	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	21702719	21702756	21702738	Y	IFNA5,IFNA6,IFNA8,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	97786	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	21833147	21834014	21833177	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	32605	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	23639161	23639473	23639317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	184862	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	24920693	24920988	24920699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	755868	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	27352450	27352737	27352522	Y	IFT74,IFT74,PLAA,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	175042	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	28365593	28365784	28365689	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	793729	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	29826427	29826586	29826507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	32701589	32701944	32701680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB6	130429	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	33350411	33350624	33350531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFX1	61902	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	33445339	33445789	33445589	Y	AQP3	NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	33458514	33458840	33458724	Y	NA	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	12905	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	35924357	35924707	35924422	Y	NA	HRCT1,YBX1P10	NA	NA	NA	NA	HRCT1	20168	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	42928	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	41948	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	107013	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	37371196	37371387	37371281	Y	PAX5,ZCCHC7,FBXO10,ZBTB5	GRHPR	NA	NA	NA	NA	GRHPR	49276	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	37908726	37909073	37908864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	109292	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1B1	46909	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2974818	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2972666	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	71413577	71413589	71413582	Y	NA	FAM122A	NA	NA	NA	NA	FAM122A	20613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	72801648	72801771	72801710	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	70166	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.09261343888567
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	75201715	75201894	75201832	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	223552	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	75602878	75603123	75602991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	90235	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	75733325	75733499	75733412	Y	ANXA1	ALDH1A1,ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	31174	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	75797609	75797655	75797632	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	32936	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	81154672	81154952	81154897	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	PSAT1	244613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	88357534	88357780	88357692	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	2590	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	88474562	88474738	88474650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA35	79323	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	88598937	88598983	88598960	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	44876	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	88935508	88935794	88935577	Y	NA	ISCA1,ZCCHC6	NA	NA	NA	NA	ZCCHC6	31575	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	91125141	91125399	91125267	Y	NA	NA	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2	IMR90	Hi-C	24141950	SPIN1	123807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	96377714	96377795	96377762	Y	PHF2	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	41025	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	96901972	96902054	96902023	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	37062	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	97520794	97521111	97520953	Y	C9orf3	C9orf3	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	33811	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97685167	97685467	97685319	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	198184	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97688379	97688667	97688436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	201396	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97839686	97839862	97839737	Y	PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	238129	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	97895370	97895760	97895554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	182231	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	HSD17B3,SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	100548546	100549029	100548790	Y	FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	64507	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	FOXE1	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	47272	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	100788386	100788828	100788550	Y	NA	ANP32B,NANS	NA	NA	NA	NA	NANS	28193	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	100908591	100908763	100908677	Y	NA	TRIM14,CORO2A	TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM14	29097	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	108284643	108284789	108284719	Y	NA	FKTN	NA	NA	NA	NA	FKTN	33622	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	108623002	108623305	108623152	Y	FSD1L,FSD1L,TAL2	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	168177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	109714113	109714149	109714131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF462	90735	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	109933165	109933377	109933258	Y	KLF4	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110041	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	110514044	110514454	110514287	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	219373	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	111025609	111025952	111025781	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	361161	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	111313727	111314112	111313882	Y	NA	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-220D10.1	73001	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	113044793	113045024	113044909	Y	NA	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	27873	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	113646742	113646840	113646791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	152141	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	C9orf84	NA	NA	NA	NA	C9orf84	49492	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	114678571	114678728	114678577	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	21525	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	115625683	115626114	115625766	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	114565	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	115914968	115915416	115915186	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	SLC31A2	NA	NA	NA	NA	SLC31A2	3746	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	117040965	117041219	117041139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	125125	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr9	117137275	117137511	117137393	Y	DFNB31,DFNB31	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	128219	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	117878279	117878434	117878355	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	102	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	117883580	117883602	117883591	Y	TNFSF15,TNC,DEC1	TNC	TNC,DEC1	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	5044	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	146162	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr9	118378080	118378500	118378342	Y	NA	NA	PAPPA,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	499544	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	119836202	119836379	119836375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	388621	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1075775	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	123478444	123478636	123478538	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	3696	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	124040831	124041134	124040970	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	57539	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	124125049	124125440	124125316	Y	NA	STOM	NA	NA	NA	NA	STOM	5091	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	124134922	124135274	124134953	Y	NA	STOM	GSN	MCF7	ChIA-PET	22265404	STOM	4391	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	124161523	124161647	124161545	Y	NA	STOM	GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM	IMR90	Hi-C	24141950	STOM	30992	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.22069117268331
chr9	124462644	124463047	124462791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	135308	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.09261343888567
chr9	124527423	124527640	124527529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	200087	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	127466904	127467345	127467172	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	48158	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	127468042	127468336	127468195	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	49296	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	127943373	127943395	127943384	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	6823	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.04630671944284
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr9	131560607	131560712	131560660	Y	NA	ZER1,TBC1D13,ENDOG,C9orf114	NA	NA	NA	NA	TBC1D13	13124	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	131660472	131660616	131660545	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1,DOLK,NUP188	NA	NA	NA	NA	CCBL1	17699	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.56946007916425
chr9	132814142	132814504	132814316	Y	TOR1B	FNBP1,GPR107	NCS1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR107	437	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr9	134508781	134509131	134508955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	104126	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	134515858	134516155	134515990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	97306	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	134576377	134576829	134576707	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	36632	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	134602820	134603314	134602971	Y	PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	10147	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	134882586	134882673	134882600	Y	SETX,NTNG2,MED27	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	70622	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	135287067	135287190	135287129	Y	NA	TTF1,C9orf171	NA	NA	NA	NA	C9orf171	3637	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	234260	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.9182289856452
chr9	137233458	137233505	137233466	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	26514	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	137247900	137248164	137247916	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	40956	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	137285570	137286195	137285918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	78626	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	137305745	137306050	137305907	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	98801	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chr9	138797876	138798018	138797978	Y	CAMSAP1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	218	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	138915703	138915918	138915811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC1	64477	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chr9	140143070	140143291	140143174	Y	LCNL1,ABCA2,SLC34A3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	9405	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	8895175	8895564	8895377	Y	FAM9A,FAM9A,FAM9B	NA	NA	NA	NA	NA	KAL1	196948	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	8955651	8955925	8955865	Y	TBL1X	NA	TBL1X	IMR90	Hi-C	24141950	KAL1	257424	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	194651	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	10586151	10586408	10586285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	263365	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	10851081	10851118	10851099	Y	NA	MID1	NA	NA	NA	NA	MID1	1308	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	11722971	11723163	11723070	Y	NA	NA	ARHGAP6	IMR90	Hi-C	24141950	MSL3	51115	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	15354246	15354416	15354344	Y	ZRSR2,CA5B,MOSPD2,PIGA	PIGA	NA	NA	NA	NA	PIGA	2570	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	15769418	15769925	15769650	Y	PIGA,CA5B,ZRSR2	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	36670	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	ARX	632386	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	40693990	40694519	40694253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	70718	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	41538171	41538545	41538500	Y	CASK	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	242171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	43576697	43576992	43576709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	63230	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	43577926	43578322	43578048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	64459	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	45305345	45305614	45305509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-245M24.1	57019	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	11995	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	45645081	45645275	45645187	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	40551	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	45665386	45665505	45665456	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	43415	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	45666628	45666834	45666726	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42086	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	46436763	46437171	46436936	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	5544	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	47423323	47423681	47423373	Y	CDK16,CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	4807	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	48348956	48349364	48349102	Y	PORCN,PORCN,FTSJ1	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	15986	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chrX	53083409	53083784	53083564	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	GPR173	7136	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	56839801	56840427	56840156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	77791	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	64464605	64464940	64464771	Y	ZC4H2,ZC3H12B	NA	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	212012	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	64821176	64821755	64821551	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	14919	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	64891840	64892073	64891978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	85583	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	64898955	64899156	64899089	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	92698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.697537812961891
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53104	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	74259170	74259182	74259176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	115385	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	79830053	79830147	79830110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	233040	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.39507562592378
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	ARMCX1	NA	NA	NA	NA	ARMCX1	9960	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	89887	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.09261343888567
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A14	327100	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	2.44138234536662
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	4.88276469073323
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	133756354	133756493	133756422	Y	NA	NA	MIR450A2,MGC16121,MIR450A1,LOC100506757,MIR450B,MIR542	IMR90	Hi-C	24141950	HPRT1	164171	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	134718222	134718415	134718313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX26B	65638	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	138215503	138215737	138215513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	809698	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	147499581	147499753	147499673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P8	367828	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.871922266202363
chrX	149865562	149865927	149865671	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	6127	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	1.74384453240473
chrX	150562078	150562258	150562159	Y	NA	VMA21	VMA21	MCF7	ChIA-PET	22265404	VMA21	729	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	153308986	153309188	153309114	Y	NA	IRAK1	IRAK1,MIR718	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRAK1	25555	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrX	153600469	153600779	153600667	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	227	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrY	2871660	2871926	2871783	Y	RPS4Y1,ZFY,ZFY	LINC00278	NA	NA	NA	NA	LINC00278	2707	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrY	2872046	2872325	2872195	Y	RPS4Y1,ZFY,ZFY	LINC00278	NA	NA	NA	NA	LINC00278	3093	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrY	7144120	7144309	7144226	Y	NA	PRKY	NA	NA	NA	NA	PRKY	4107	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrY	7637940	7638259	7638201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKY	497927	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.523153359721418
chrY	14775457	14775545	14775476	Y	NA	TTTY15	NA	NA	NA	NA	TTTY15	3192	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	193325	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.348768906480945
chrY	18565059	18565303	18565181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN4Y	1932541	CAGE	HSC-3	hg19	FANTOM5	0.174384453240473