chr1 839741 840250 839788 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 52439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 994198 994452 994303 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA RP11-465B22.3 1084 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-465B22.3 21720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 1136667 1137146 1136877 Y HES4,MIB2 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 23331 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 3077832 3078221 3078024 Y TPRG1L NA NA NA NA NA PRDM16 94100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 3227700 3227783 3227742 Y NA NA NA NA NA NA PRDM16 243968 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA PRDM16 245979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 3420761 3421065 3420920 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1L 118501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 7609389 7609632 7609504 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 219697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 52933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 8173446 8173525 8173493 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 89078 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 8194345 8194402 8194374 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 109977 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 8229904 8230047 8229996 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 145536 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 8450820 8451072 8450834 Y RERE,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 74934 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 8858188 8858497 8858477 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 17205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 9504221 9504505 9504342 Y SPSB1 NA SPSB1,H6PD,MIR34A,SLC25A33,TMEM201,PIK3CD IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 93036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 10057852 10058069 10058032 Y NA RBP7,UBE4B NA NA NA NA RBP7 2588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 10745709 10746041 10745880 Y NA NA NA NA NA NA CASZ1 108666 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 11392847 11393171 11393009 Y PTCHD2,MAD2L2,C1orf187 NA UBIAD1,PTCHD2 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 61584 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 11410602 11410834 11410718 Y NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 79339 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 11791882 11792060 11791938 Y NA MAD2L2,AGTRAP AGTRAP IMR90 Hi-C 24141950 AGTRAP 2081 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA KIAA2013 15342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 11990003 11990329 11990105 Y PLOD1 KIAA2013,PLOD1,MFN2 NA NA NA NA PLOD1 1933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 12599928 12600179 12600028 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 75558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr1 12600525 12600853 12600637 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 74884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 12616547 12616769 12616712 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 58968 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 15119702 15119955 15119829 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 196502 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 16156384 16156536 16156435 Y EFHD2,CASP9,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 3660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 16439002 16439355 16439225 Y NA FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2 FAM131C,CLCNKB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-276H7.2 40351 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA RNU1-1 SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-1 12489 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr1 17253207 17253541 17253218 Y NA RP11-108M9.4 NA NA NA NA RP11-108M9.4 39063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 17746173 17746585 17746297 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 17635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr1 17962245 17962730 17962485 Y PADI4 NA NA NA NA NA ARHGEF10L 97915 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 18667678 18667962 18667804 Y NA NA NA NA NA NA KLHDC7A 137462 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 19280139 19280583 19280395 Y UBR4,IFFO2 IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 19281204 19281307 19281256 Y NA IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 24 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB,RNU4-28P NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 20091332 20091506 20091448 Y PLA2G2A,TMCO4 TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 32932 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 21475659 21476054 21476002 Y EIF4G3,EIF4G3 EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 25323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 21588829 21589430 21588896 Y ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 80567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 21643831 21644195 21643955 Y ECE1,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 25802 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 21650806 21651685 21651350 Y EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 18312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 21895072 21895699 21895173 Y NA NA NA NA NA NA ALPL 61214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 21966400 21966607 21966504 Y NA RAP1GAP NA NA NA NA RAP1GAP 27194 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 22184381 22184621 22184499 Y NA NA LDLRAD2 IMR90 Hi-C 24141950 USP48 76282 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 23123668 23124069 23123697 Y NA NA NA NA NA NA EPHB2 88336 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 23387479 23387794 23387637 Y ZNF436 KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 43538 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 24229023 24229388 24229190 Y NA FUCA1,RP11-4M23.4 NA NA NA NA FUCA1 36239 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 24476382 24476609 24476496 Y PNRC2,GRHL3 IL22RA1 IL22RA1 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 8771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 48202 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 24722613 24722643 24722628 Y NA NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 17641 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 24968619 24968979 24968799 Y RUNX3,SRRM1 SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 12412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 25051079 25051208 25051162 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 25237083 25237520 25237460 Y NA NA NA NA NA NA RUNX3 52092 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 25246815 25246921 25246868 Y NA RUNX3 CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 42691 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 25360165 25361177 25360621 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 70553 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 26615016 26615421 26615346 Y SH3BGRL3,ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 11349 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 27021406 27021810 27021509 Y NA ARID1A NA NA NA NA ARID1A 882 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 27112764 27112917 27112859 Y WDTC1,SLC9A1,ZNF683,RPS6KA1,ZDHHC18,ARID1A PIGV,ZDHHC18 NA NA NA NA PIGV 801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 27414370 27414629 27414488 Y PIGV,GPATCH3 NA NA NA NA NA SLC9A1 76843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 27772061 27772370 27772216 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 42299 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 27986111 27986384 27986268 Y EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 10345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 28213825 28214033 28213970 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8 RPA2 NA NA NA NA RPA2 25224 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 28305616 28305920 28305789 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8 NA NA NA NA NA RPA2 66359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 28618110 28618271 28618191 Y ATPIF1 SESN2,MED18 NA NA NA NA SESN2 34072 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 31430605 31430735 31430670 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 50997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 31504221 31504603 31504488 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 32235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 31737918 31737951 31737935 Y NA NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA NKAIN1 27517 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 32166698 32166999 32166824 Y COL16A1 COL16A1 NA NA NA NA COL16A1 921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 32180603 32180986 32180867 Y PEF1,SPOCD1,COL16A1 COL16A1,BAI2 PEF1,COL16A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL16A1 12683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33405191 33405597 33405376 Y RNF19B TMEM54,RNF19B NA NA NA NA RNF19B 22689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33450112 33450483 33450353 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19B 21826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33454783 33455472 33455325 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 26497 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33622437 33622835 33622675 Y PHC2,TRIM62 TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 22825 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33804092 33804324 33804199 Y NA AL513327.1 NA NA NA NA AL513327.1 41117 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33804359 33804743 33804679 Y RNF19B,TRIM62,PHC2 AL513327.1 NA NA NA NA AL513327.1 41384 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 34628613 34629024 34628705 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN20 692367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 37944084 37944971 37944382 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5931 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 38311465 38311868 38311723 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 11424 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 38312444 38312820 38312535 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 10472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 38739267 38739533 38739400 Y NA NA POU3F1 IMR90 Hi-C 24141950 UTP11L 266337 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 39857791 39857995 39857869 Y NA KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 16156 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 40005546 40005959 40005647 Y NA PABPC4 NA NA NA NA PABPC4 34503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 40954031 40954187 40954167 Y ZNF684,DEM1 RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA RP11-656D10.3 18146 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 41040458 41040672 41040585 Y NA ZNF684 ZNF684,RIMS3,RLF,KCNQ4,ZNF642,NFYC IMR90 Hi-C 24141950 ZNF684 45225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 42275404 42275646 42275525 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 223950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 42351041 42351345 42351193 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 148251 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 42366364 42366624 42366514 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 43429290 43429917 43429491 Y CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 6570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 44302297 44302456 44302338 Y NA NA NA NA NA NA ARTN 94536 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC24 40653 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 44703858 44704161 44704010 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 26731 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 44897170 44897489 44897243 Y NA RNF220 NA NA NA NA RNF220 28304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 44950888 44951090 44950987 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 82022 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 44951424 44951733 44951502 Y TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220 NA NA NA NA NA RNF220 82558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 45085192 45085548 45085380 Y NA NA C1orf228,TMEM53 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM53 52679 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 46528388 46528566 46528496 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R3 111594 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 46573980 46574380 46574180 Y TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 65780 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 49317577 49317713 49317702 Y SPATA6,BEND5 NA NA NA NA NA SPATA6 381732 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 50619908 50620155 50620032 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 267017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 51454917 51455119 51455049 Y NA FAF1,CDKN2C NA NA NA NA CDKN2C 30500 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA EPS15 NA NA NA NA EPS15 47408 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 52193179 52193464 52193255 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 149013 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 52238666 52238881 52238774 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 103596 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 53369161 53369511 53369336 Y SCP2,ECHDC2 ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 21373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 53576083 53576397 53576240 Y NA NA PODN,SCP2 IMR90 Hi-C 24141950 CPT2 83704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 54052889 54052991 54052940 Y NA NA NA NA NA NA LRP8 261147 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 54260217 54260562 54260390 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93845 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 56733795 56734079 56733937 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 374895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 57024882 57025247 57025166 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 83727 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 57297998 57298181 57298090 Y NA NA DAB1,C1orf168,C8A,C8B IMR90 Hi-C 24141950 PRKAA2 189003 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 57854194 57854446 57854303 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 665706 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 57995135 57995251 57995193 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 524901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 59280364 59280505 59280397 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 32579 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 59608749 59609120 59609039 Y NA NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 124690 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 59821110 59821407 59821235 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 60800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 59910700 59911009 59910820 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 150390 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 59986893 59986899 59986896 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 226583 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 61369297 61369400 61369351 Y NA NA NA NA NA NA TM2D1 819695 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 62119868 62120084 62119981 Y NA NA TM2D1,INADL IMR90 Hi-C 24141950 TM2D1 69011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 63022251 63022602 63022448 Y NA NA NA NA NA NA USP1 122283 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 63886654 63886800 63886727 Y NA NA NA NA NA NA ALG6 55393 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 64254998 64255371 64255034 Y ROR1 ROR1 NA NA NA NA ROR1 17305 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 64558632 64559006 64558819 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P3 251276 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 65307822 65308022 65307967 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 99044 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 65421731 65422136 65422135 Y NA JAK1 NA NA NA NA JAK1 8051 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 65731337 65731853 65731407 Y DNAJC6 DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 19435 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 65992905 65993110 65992971 Y NA NA NA NA NA NA LEPROT 108635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 66546016 66546351 66546169 Y NA NA NA NA NA NA LEPROT 661746 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B NA NA NA NA NA WDR78 358223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 68314949 68315302 68315127 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 17799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 68354536 68354908 68354722 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 57386 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 68639460 68639856 68639657 Y NA NA NA NA NA NA WLS 56947 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA SRSF11 22556 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 75182913 75182976 75182918 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 13860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 76231463 76231678 76231570 Y NA ACADM,RABGGTB,SNORD45A NA NA NA NA RABGGTB 18201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 77013544 77013818 77013552 Y NA NA NA NA NA NA TPI1P1 149656 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 77399446 77399567 77399507 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC5 68320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 77897197 77897334 77897266 Y NA NA NA NA NA NA AK5 151461 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 78171350 78171363 78171357 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 24246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 78240205 78240392 78240373 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A USP33,ZZZ3,FAM73A IMR90 Hi-C 24141950 RP4-706L14.2 1656 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 79099852 79100232 79099854 Y NA IFI44L,IFI44 NA NA NA NA IFI44 13249 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 82137210 82137218 82137214 Y NA ST13P20 NA NA NA NA ST13P20 48160 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 84105621 84105937 84105917 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 218769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 84289121 84289390 84289361 Y SAMD13,SAMD13 RP11-475O6.1 NA NA NA NA RP11-475O6.1 35316 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 84289999 84290187 84290093 Y TTLL7,SAMD13,SAMD13,PRKACB RP11-475O6.1 NA NA NA NA RP11-475O6.1 34519 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 84746838 84747079 84746959 Y DNASE2B,DNASE2B NA SAMD13,UOX IMR90 Hi-C 24141950 RPF1 195863 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 84757421 84757614 84757534 Y DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13 NA UOX,DNASE2B IMR90 Hi-C 24141950 RPF1 185328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 85710539 85710684 85710606 Y NA SYDE2,C1orf52,BCL10 NA NA NA NA C1orf52 12671 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 85737728 85738105 85737917 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 2668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 85763626 85763846 85763779 Y NA C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 22853 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 85791287 85791404 85791348 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 50514 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 85836666 85837017 85836916 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 95893 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 85843881 85844049 85844014 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 103108 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 86000890 86001115 86001087 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 40818 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 86016463 86016866 86016755 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 25067 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 86035824 86036171 86035900 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 5762 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 86071867 86071976 86071922 Y NA DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,ZNHIT6 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 27423 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 34017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 89167079 89167239 89167155 Y GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1 PKN2 NA NA NA NA PKN2 19174 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 89382528 89382593 89382561 Y NA GTF2B NA NA NA NA GTF2B 26901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 89739985 89740544 89740197 Y GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5 GBP5 NA NA NA NA GBP5 3441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 90372321 90372729 90372378 Y LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 85151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 92198149 92198440 92198227 Y TGFBR3 NA NA NA NA NA TGFBR3 171452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 92781340 92781526 92781459 Y TGFBR3,RPAP2 RPAP2,GLMN NA NA NA NA GLMN 18796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 93270252 93270588 93270467 Y NA EVI5,RPL5 EVI5 IMR90 Hi-C 24141950 EVI5 14291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 94089710 94089715 94089713 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 178022 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94093325 94093611 94093590 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 181637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94125861 94126246 94126059 Y NA NA NA NA NA NA BCAR3 184460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA BCAR3 182680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA BCAR3 164588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 151368 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 94169341 94169462 94169391 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 141244 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94224034 94224429 94224106 Y NA NA MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 86277 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94626535 94626661 94626598 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 111963 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP29 26007 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94769345 94769627 94769486 Y NA ARHGAP29 ARHGAP29,ABCA4 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 30721 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 94891778 94892070 94891849 Y NA ABCD3 NA NA NA NA ABCD3 9845 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 108458 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 95221261 95221551 95221307 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 62286 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 95264854 95265185 95265083 Y F3 LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 18652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 95331900 95332266 95332157 Y NA LINC01057,SLC44A3 CNN3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 48002 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 95508067 95508435 95508367 Y NA ALG14 NA NA NA NA ALG14 28066 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 96476779 96477021 96476900 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 433465 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 97331396 97331825 97331594 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 146175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr1 98408796 98409171 98408982 Y NA DPYD DPYD,MIR137HG IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 24191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 100169951 100170218 100170031 Y NA NA NA NA NA NA FRRS1 59969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 100555117 100555459 100555393 Y NA SASS6 NA NA NA NA SASS6 41052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 100966297 100966321 100966309 Y NA NA NA NA NA NA CDC14A 157713 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA VCAM1 NA NA NA NA VCAM1 18969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 101469727 101469819 101469773 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 19615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 101757305 101757513 101757430 Y NA NA SLC30A7,DPH5 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR1 56861 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 103509479 103509769 103509633 Y NA NA NA NA NA NA COL11A1 62283 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 110355223 110355262 110355244 Y NA NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 GSTM3 72839 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 110454846 110455290 110455005 Y GSTM2,CSF1 CSF1 NA NA NA NA CSF1 3982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 110947330 110947681 110947535 Y NA LAMTOR5-AS1,SLC16A4 NA NA NA NA SLC16A4 15626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 113525578 113525919 113525789 Y NA SLC16A1-AS1,SLC16A1 SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC16A1 27943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 113683682 113683919 113683753 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 25697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 115025085 115025405 115025244 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 26376 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 115732772 115733197 115732900 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 102651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 115873164 115873576 115873409 Y NGF NGF NA NA NA NA NGF 5281 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 116192575 116192950 116192828 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 10001 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 116694646 116694883 116694753 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 177527 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 117110819 117111247 117111136 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 414 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 118153815 118153988 118153913 Y FAM46C FAM46C NA NA NA NA FAM46C 7259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 120255895 120256325 120256050 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 55474 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 120608824 120609208 120608880 Y NOTCH2 NOTCH2 NA NA NA NA NOTCH2 1032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 120686768 120686908 120686886 Y ZNF697,NOTCH2 NA NA NA NA NA NOTCH2 76528 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 144009977 144010738 144010098 Y NA NA NA NA NA NA NBPF8 134070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA NA NA NA NA NA NBPF9 131381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 87115 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 85772 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 73337 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 49637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 145065676 145066007 145065842 Y NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 8179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 145106553 145106772 145106662 Y NA PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 12333 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 145433530 145433648 145433615 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10 TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L NA NA NA NA TXNIP 2821 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 145519496 145519624 145519499 Y NBPF10,TXNIP LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,PEX11B NA NA NA NA PEX11B 5244 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 145702718 145703106 145702912 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 93682 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.37074634334636 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 5.51576674365767 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2BC,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2BC,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 22 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 149931955 149932255 149932237 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B MTMR11,SF3B4 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR11 25164 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 150231710 150231944 150231778 Y ECM1,CA14 ANP32E,RNU2-17P,APH1A,C1orf51,MRPS21 NA NA NA NA APH1A 8036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 150510569 150510713 150510587 Y NA ECM1,LINC00568,ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA ADAMTSL4 9171 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA CERS2 4090 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 151952807 151953143 151952837 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 11723 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 153525322 153525412 153525387 Y PGLYRP3,S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A4 S100A6,S100A3,S100A4,S100A2 S100A4,S100A5 K562 ChIA-PET 22265404 S100A4 4710 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16 NA NA NA NA S100A2 2652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 154359135 154359469 154359217 Y GATAD2B,DENND4B,CRTC2,RPS27,UBAP2L,ATP8B2 NA IL6R,ATP8B2,UBE2Q1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP8B2 63106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 154997722 154998120 154997917 Y NA FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3 NA NA NA NA ADAM15 22922 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 155066604 155066635 155066620 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 DPM3,KRTCAP2,EFNA1,TRIM46,SLC50A1 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA1 31301 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 155916072 155916212 155916141 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 13881 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 155944562 155945214 155944815 Y C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 NA NA NA NA ARHGEF2 29647 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 156118146 156118395 156118328 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 SLC25A44 NA NA NA NA SLC25A44 43485 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 156134935 156135401 156135063 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1 NA NA NA NA SLC25A44 26479 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 156632199 156632473 156632320 Y NA RP11-284F21.7,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 2983 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 156676478 156676824 156676750 Y C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2 RP11-284F21.7,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 2870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 156781780 156782101 156782026 Y MEF2D,ETV3L,SH2D2A,SH2D2A,NTRK1 HDGF NA NA NA NA HDGF 47063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 157964633 157965029 157964831 Y OR10T2 KIRREL NA NA NA NA KIRREL 3570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1154 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr1 158942717 158942925 158942799 Y OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1 IFI16 NA NA NA NA IFI16 24833 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,DCAF8 NA NA NA NA PEA15 30850 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 160242090 160242278 160242184 Y NA DCAF8,PEX19 NA NA NA NA DCAF8 10642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 160316870 160317108 160317002 Y SLAMF7,CD48,TAGLN2,NCSTN NCSTN,COPA NA NA NA NA COPA 5680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 160332348 160332525 160332392 Y SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2 NCSTN,COPA,VANGL2 NA NA NA NA COPA 21158 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 161170933 161171185 161171002 Y ADAMTS4,NDUFS2 USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4 NA NA NA NA ADAMTS4 4087 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 216649 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 135042 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 161973588 161973892 161973770 Y FCGR2A,FCGR3A,OLFML2B OLFML2B NA NA NA NA OLFML2B 17752 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 162603017 162603226 162603122 Y DDR2 DDR2 NA NA NA NA DDR2 3854 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 162709795 162709973 162709884 Y NOS1AP,DDR2 HSD17B7 NA NA NA NA HSD17B7 48519 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 162830850 162831244 162831104 Y NA C1orf110 NA NA NA NA C1orf110 5361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 162937771 162938014 162937902 Y C1orf110 NA RGS4,RGS5,C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 98551 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 164736884 164737252 164737025 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 214063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 167035961 167036358 167035977 Y NA NA NA NA NA NA RP11-277B15.1 93716 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 167424728 167425462 167425239 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 95542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 167615681 167615774 167615728 Y NA NA NA NA NA NA MPZL1 72655 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 168050664 168051125 168050872 Y SFT2D2 NA NA NA NA NA GPR161 53696 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 168526950 168527356 168527080 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 278672 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 170635008 170635144 170635076 Y PRRX1 PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 5139 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 170636506 170636902 170636792 Y PRRX1 PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 6637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 170637621 170637732 170637679 Y PRRX1 PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 7752 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 170669976 170670263 170670185 Y PRRX1 PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 40107 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 172327070 172327187 172327139 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 84043 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 172369341 172369683 172369640 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 41547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 172872881 172872916 172872899 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 461651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 172888696 172888994 172888711 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 477466 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 173370600 173370810 173370705 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 73595 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 176235705 176235715 176235710 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 61076 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 176244494 176244887 176244692 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 69865 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 177155509 177155571 177155544 Y ASTN1,FAM5B NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 849514 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 178207948 178208160 178207999 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 147084 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 181065454 181065797 181065538 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 9816 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 181081690 181081905 181081806 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 183237084 183237447 183237420 Y NA NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMG7 201904 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 183573035 183573933 183573835 Y NCF2,NCF2,ARPC5 ARPC5,RGL1 SMG7,SHCBP1L,NMNAT2,DKFZP564C196,NCF2,RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 ARPC5 28959 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 183846576 183846867 183846649 Y NMNAT2,RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 171944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 183854555 183854702 183854673 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 164109 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 184758240 184758595 184758304 Y SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3 EDEM3 NA NA NA NA EDEM3 36193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 184794829 184794875 184794854 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 72782 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 184812869 184813180 184813057 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 90822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 184852237 184852590 184852311 Y NA NA NA NA NA NA FAM129A 89092 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 184922808 184923031 184922923 Y EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A FAM129A NA NA NA NA FAM129A 18651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 185264835 185265233 185265202 Y NA IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 19228 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 185308384 185308771 185308525 Y FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 23923 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 185344563 185345243 185344914 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 60102 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 185389788 185390210 185390053 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP NA NA NA NA NA IVNS1ABP 105327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 186935248 186935528 186935344 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PLA2G4A 139163 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 187235320 187235513 187235392 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 439235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 192469407 192469758 192469583 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 213555 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 192481549 192481949 192481720 Y RGS2,RGS1 NA RGS2,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 201364 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 192507991 192508486 192508241 Y NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 174827 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 192524105 192524371 192524293 Y RGS1 NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 158942 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 192562673 192562880 192562865 Y RGS1 NA NA NA NA NA MIR4426 120433 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 192846727 192846972 192846813 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS2 RN7SKP126 NA NA NA NA RN7SKP126 3612 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 192914637 192914772 192914747 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA NA NA NA NA RN7SKP126 71522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA B3GALT2 NA NA NA NA B3GALT2 26920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 198840125 198840497 198840438 Y NA NA NA NA NA NA NEK7 716032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 726145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 198887897 198888318 198888210 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 763804 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 198898987 198899513 198899179 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 774894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 779842 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 200715755 200716027 200715890 Y NA CAMSAP2 NA NA NA NA CAMSAP2 9069 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 201445401 201445412 201445405 Y NAV1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 9036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 201463619 201463933 201463776 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 10436 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 201500233 201500477 201500437 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 23649 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 201524172 201524339 201524258 Y LMOD1 RP11-134G8.7,CSRP1 NAV1,RPS10P7,IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 CSRP1 47588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 201613549 201613726 201613638 Y NA NAV1 NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAV1 23138 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 201864045 201864232 201864194 Y NA SHISA4,LMOD1 NA NA NA NA SHISA4 8237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 202765097 202765528 202765162 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA KDM5B 11070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1 NA NA NA NA ADORA1 43291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 203524939 203525564 203525325 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 68125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 203794311 203794511 203794411 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 31529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 204476628 204477018 204476840 Y NA PIK3C2B,MDM4 MDM4,PPP1R15B,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MDM4 6493 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 205253892 205254222 205253971 Y NUAK2 NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 34661 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 205265235 205265548 205265359 Y TMEM81,KLHDC8A NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 23335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 206642854 206643037 206642964 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE IKBKE,RASSF5 NA NA NA NA IKBKE 1063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 206751685 206751882 206751743 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 32022 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 208135157 208135309 208135233 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 94662 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 210186039 210186345 210186192 Y SYT14 NA NA NA NA NA SYT14 76501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 211998326 211998558 211998442 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 3556 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 212102475 212102639 212102508 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 100361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 212315044 212315217 212315131 Y NA NA TMEM206,DTL,PPP2R5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL21P28 91673 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 212808992 212809268 212809126 Y VASH2,PPP2R5A RP11-338C15.3 NA NA NA NA RP11-338C15.3 27508 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 216550404 216550614 216550509 Y NA NA NA NA NA NA KCTD3 811669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 218523725 218524123 218523798 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 6148 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 218636802 218637167 218637004 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 119225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 218642170 218642366 218642271 Y NA NA TGFB2,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 124593 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 218662454 218662669 218662563 Y NA NA TGFB2,LOC728463,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 144877 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 221872429 221872689 221872559 Y DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 40829 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 222002644 222003471 222003177 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 89126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 222163243 222163609 222163382 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 249725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 222273748 222273768 222273757 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 360230 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 223147896 223148076 223147937 Y DISP1 NA NA NA NA NA DISP1 161490 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 223356140 223356312 223356226 Y NA TLR5 CAPN8,SUSD4 IMR90 Hi-C 24141950 TLR5 41516 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 223901276 223901546 223901311 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 13981 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 223907308 223907681 223907376 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 20013 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr1 224545542 224546006 224545661 Y FBXO28,CNIH4 NVL,CNIH4 NA NA NA NA CNIH4 2990 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 CNIH3,WDR26 NA NA NA NA CNIH3 21944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 224633276 224633598 224633406 Y NA CNIH3,WDR26 WDR26,FBXO28,CNIH4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 10541 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 224914627 224914789 224914675 Y NA NA NA NA NA NA DNAH14 167175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 225778250 225778416 225778333 Y ENAH NA NA NA NA NA ENAH 60428 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 226084943 226085104 226084975 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 11978 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 226288544 226288864 226288784 Y C1orf55,H3F3A H3F3A C1orf55,H3F3A,ACBD3 IMR90 Hi-C 24141950 H3F3A 40992 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 226361229 226361382 226361305 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 11049 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 226864749 226865297 226865095 Y ITPKB NA NA NA NA NA ITPKB 59727 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 226876730 226876990 226876858 Y C1orf95,ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 48034 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 228124828 228124930 228124870 Y ARF1,ARF1 NA NA NA NA NA ARF1 143431 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 228651177 228651630 228651444 Y HIST3H2A,HIST3H2BB HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 RNF187 IMR90 Hi-C 24141950 HIST3H2BA 850 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 228686214 228686407 228686300 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA RNF187 13452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 231531776 231531955 231531804 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 26835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 5.82219822941643 chr1 233809261 233809638 233809364 Y KCNK1 NA NA NA NA NA RNU4-77P 226734 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 327405 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 234254353 234254647 234254499 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 236105 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 234658291 234658851 234658374 Y NA TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 45442 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 234721506 234721689 234721614 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 21582 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 234737347 234737653 234737498 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 5618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 115572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 235112749 235113173 235112812 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 1378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 235835688 235836968 235835896 Y NA GNG4 NA NA NA NA GNG4 23634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 235927486 235927702 235927520 Y NA NA NA NA NA NA GNG4 115432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 236022018 236022676 236022299 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22264 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 236026992 236027471 236027217 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 17469 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 236082498 236082788 236082539 Y LYST,GPR137B,EDARADD LYST LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 37558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 236162583 236163199 236162893 Y GPR137B NA NA NA NA NA NID1 63263 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 237007861 237008154 237008008 Y NA NA NA NA NA NA MTR 51251 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 240433849 240434175 240434014 Y NA NA NA NA NA NA ADH5P3 102394 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 242054721 242054907 242054820 Y KMO EXO1 NA NA NA NA EXO1 45452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 243476313 243476499 243476468 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 58993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 243806306 243806448 243806376 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 205933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 243893800 243893985 243893919 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 118396 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 244011895 244012034 244011933 Y NA AKT3 LOC339529 IMR90 Hi-C 24141950 AKT3 347 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 244215508 244215901 244215527 Y AKT3,ZNF238,ZNF238 NA NA NA NA NA AKT3 203127 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 244894306 244894456 244894354 Y C1orf100,C1orf101 NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPU-AS1 122343 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 245255337 245255432 245255385 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 60855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 246042512 246042669 246042578 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 625945 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 246249452 246249819 246249636 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 418795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 246763574 246763751 246763579 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 35828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP5L 224300 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 644331 644586 644526 Y NA NA NA NA NA NA DIP2C 89097 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 916611 916806 916707 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 58758 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 1100843 1101035 1100898 Y NA IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 7365 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 3808656 3808872 3808754 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 16601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 3893365 3894190 3893886 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 67892 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 118302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 6055445 6055662 6055528 Y NA IL15RA NA NA NA NA IL15RA 37295 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 6212827 6212938 6212883 Y FBXO18 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 27946 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 6333794 6333936 6333889 Y PFKFB3,PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 148913 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 258527 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr10 6600320 6600578 6600409 Y RBM17,RBM17,PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 415439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 803694 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 13692317 13692641 13692563 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 65390 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 13915234 13915426 13915347 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 288307 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 14003091 14003406 14003339 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 376164 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 14012361 14012685 14012430 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 385434 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 14031797 14031930 14031864 Y FRMD4A NA NA NA NA NA PRPF18 404870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 14032375 14032782 14032539 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 405448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 15300658 15300993 15300826 Y ACBD7,FAM171A1 NA NA NA NA NA NMT2 91966 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 16548527 16548808 16548668 Y NA NA NA NA NA NA PTER 71585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 17028207 17028677 17028581 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 170680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 17046094 17046522 17046399 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 188567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 17254796 17255338 17255153 Y VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 CUBN,TRDMT1,VIM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRDMT1 12743 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 19267078 19267235 19267155 Y NA NA NA NA NA NA ARL5B 320744 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 20517791 20518055 20517886 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA MLLT10 1303039 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 434343 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 22961361 22961802 22961720 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 39682 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 22972039 22972536 22972328 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 28948 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 24925603 24925785 24925693 Y ARHGAP21 NA NA NA NA NA ARHGAP21 84812 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 26775274 26775560 26775412 Y APBB1IP,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA PDSS1 209028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 29280500 29280692 29280596 Y NA NA LYZL1,BAMBI,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 316229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 29755539 29755855 29755808 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 59208 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 29761620 29761743 29761682 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 65289 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 29845509 29845894 29845702 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 149178 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 29877671 29877896 29877784 Y NA NA NA NA NA NA SVIL 145814 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 29922205 29922549 29922392 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 101161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 30862777 30863009 30862928 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA LOC729668 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 141911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 31293680 31294164 31294019 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 24702 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 31770032 31770371 31770202 Y NA NA NA NA NA NA ZEB1-AS1 162656 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 31805465 31805855 31805582 Y NA NA NA NA NA NA ZEB1-AS1 198089 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA ITGB1 NA NA NA NA ITGB1 41416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 33503049 33503394 33503286 Y ITGB1 NA NA NA NA NA NRP1 119796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 33537661 33538041 33537751 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 85149 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 34815006 34815362 34815018 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 135667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 34922261 34922558 34922409 Y PARD3 RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 28471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM NA NA NA NA NA CUL2 60644 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 35589038 35589427 35589190 Y CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY NA NA NA NA NA CCNY 55085 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 35640077 35640405 35640144 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 106124 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 43422233 43422523 43422379 Y NA NA RET IMR90 Hi-C 24141950 BMS1 145984 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 44185624 44185942 44185694 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 43320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 45439361 45439737 45439549 Y NA RASSF4,C10orf10 NA NA NA NA RASSF4 13118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 45461973 45462312 45462295 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA RASSF4 9118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 45464299 45464380 45464314 Y ZNF22,C10orf25 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 7878 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF488 696953 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 49771020 49771173 49771105 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 91137 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 50385443 50385844 50385615 Y C10orf128 C10orf128 NA NA NA NA C10orf128 8786 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 52154516 52154956 52154688 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 131778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 52261858 52262194 52262143 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 120729 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 61639238 61639777 61639520 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 24637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 63658924 63659147 63659031 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 63814731 63815034 63814907 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 155672 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 63839926 63839992 63839961 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 180867 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 65125268 65125651 65125502 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 98071 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 650987 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 70846057 70846170 70846083 Y NA SRGN,VPS26A NA NA NA NA SRGN 195 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 71228522 71228843 71228683 Y NA TSPAN15 NA NA NA NA TSPAN15 19293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 72082681 72083053 72082867 Y NA NA NA NA NA NA LRRC20 57329 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA SLC29A3 50618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 73529064 73529499 73529394 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 1756 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 73599936 73600188 73600059 Y NA PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 8938 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 22240 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 73816879 73817073 73816976 Y NA NA NA NA NA NA CHST3 94756 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 73946489 73946835 73946688 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 26952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 74014911 74015029 74015003 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 16649 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 74078612 74078870 74078849 Y PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 34118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 74544491 74544662 74544597 Y NA NA NA NA NA NA MCU 94602 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 74917588 74917679 74917634 Y NA NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 8245 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 75211378 75211476 75211427 Y NA ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-345K20.2 30924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 75931649 75931916 75931783 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA ADK 22689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 75987927 75988078 75987990 Y KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK NA NA NA NA NA ADK 78967 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 76633406 76633470 76633438 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 50066 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 78594394 78594663 78594529 Y NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMA1 801690 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 78641476 78641804 78641730 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 754549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 79389440 79389814 79389806 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 6539 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 80122259 80122477 80122368 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 330741 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 80806888 80807057 80806949 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 19735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 80841621 80841843 80841705 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 14829 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 80918312 80918688 80918452 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 91520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 81006414 81006827 81006670 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 98398 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 81027973 81028590 81028056 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 81048115 81048599 81048253 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 56626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 82237584 82237869 82237663 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 25662 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 82296466 82296516 82296492 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN14 84544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 85324845 85324972 85324948 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P8 514213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 86104605 86104727 86104619 Y NA NA NA NA NA NA GHITM 207409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 88183544 88183868 88183698 Y NA NA NA NA NA NA WAPAL 95704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 89508472 89508835 89508628 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 66850 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 89735979 89736206 89736070 Y PTEN RP11-380G5.3 NA NA NA NA RP11-380G5.3 32720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 90618239 90618823 90618469 Y IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 STAMBPL1 ACTA2,ANKRD22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STAMBPL1 18668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 90711253 90711764 90711560 Y LIPF,CH25H,ACTA2 FAS,ACTA2 NA NA NA NA FAS 36650 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 90753757 90754132 90754032 Y NA FAS,ACTA2 NA NA NA NA ACTA2 4610 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 90844295 90844413 90844369 Y NA NA FAS,LIPA,CH25H IMR90 Hi-C 24141950 ACTA2 95148 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 91189163 91189205 91189186 Y SLC16A12 IFIT1,LIPA,IFIT5 NA NA NA NA IFIT5 16820 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 92923893 92924265 92924064 Y NA NA RPP30,NUDT9P1,PCGF5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 53643 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 93241945 93242217 93242081 Y NA NA NA NA NA NA HECTD2 73849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 93364636 93364917 93364795 Y NA PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 25894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 94520397 94520594 94520523 Y NA NA EXOC6,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOC6 68341 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 95039952 95040142 95040075 Y NA NA NA NA NA NA XRCC6P1 72568 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 95136235 95136595 95136450 Y MYOF NA NA NA NA NA MYOF 103479 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr10 95198614 95198817 95198708 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 41257 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 97054774 97055369 97055126 Y ENTPD1,PDLIM1 PDLIM1 PDLIM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDLIM1 5993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 97313430 97313789 97313690 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 5382 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 98332019 98332237 98332217 Y NA TM9SF3 NA NA NA NA TM9SF3 12972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 99174702 99174858 99174830 Y ZFYVE27,PI4K2A,RRP12 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 RRP12 K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 9059 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 99368835 99368987 99368911 Y NA HOGA1,PI4K2A,MORN4 NA NA NA NA MORN4 22357 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 100020230 100020246 100020237 Y NA NA NA NA NA NA PYROXD2 152695 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 100082942 100083374 100083163 Y C10orf28 NA LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PYROXD2 89567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 102251433 102251647 102251567 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 35182 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 103514539 103514868 103514704 Y NA FGF8,NPM3 NA NA NA NA FGF8 18986 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 103648556 103648892 103648724 Y NA NA NA NA NA NA MGEA5 71860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 103656859 103657173 103657045 Y NA NA MGEA5,LOC100289509,KCNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MGEA5 80163 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 103662146 103662497 103662405 Y NA NA NA NA NA NA MGEA5 85450 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 104388023 104388450 104388178 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 13803 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 104472705 104472855 104472743 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 410 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 104556220 104556459 104556323 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 55521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 106065321 106065564 106065443 Y NA MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30598 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 112220227 112220521 112220467 Y SMC3,DUSP5 DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 35075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr10 112263780 112264181 112263965 Y SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 8184 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 112432258 112432673 112432308 Y PDCD4 NA PDCD4,LOC282997 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 106809 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 112622155 112622422 112622262 Y DUSP5,SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1 PDCD4 NA NA NA NA PDCD4 7143 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 113990529 113990656 113990593 Y NA GPAM NA NA NA NA GPAM 17394 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 114031765 114032053 114031942 Y NA NA NA NA NA NA GPAM 58630 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 114139786 114140040 114139910 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 8010 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 114707857 114707918 114707888 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 91 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 114816164 114816362 114816263 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 108155 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 114823862 114824125 114823994 Y HABP2 NA NA NA NA NA TCF7L2 115853 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 114940720 114940897 114940795 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 232711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 115440649 115440877 115440799 Y CASP7 CASP7 NA NA NA NA CASP7 3707 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 116902844 116903191 116903017 Y ATRNL1 NA NA NA NA NA ATRNL1 51720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 104125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 120458241 120458267 120458251 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 328961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 121249100 121249168 121249139 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 51052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 121412148 121412380 121412196 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 3266 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 146053 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 125151623 125152081 125151906 Y HMX3,BUB3 NA NA NA NA NA BUB3 239830 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CPXM2 57133 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 126029584 126030073 126029818 Y CHST15 NA HMX3 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 75472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 126773443 126773862 126773517 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 73877 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 127535706 127535819 127535763 Y MMP21 UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA BCCIP 25591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 127574091 127574564 127574346 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 2683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 127822846 127823186 127823128 Y MMP21 NA NA NA NA NA FANK1 239738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 127865568 127866004 127865890 Y ADAM12,MMP21 NA NA NA NA NA ADAM12 209020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 127885539 127885886 127885833 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 189138 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 127919956 127919968 127919963 Y ADAM12 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 155056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 128947297 128947480 128947351 Y NA FAM196A NA NA NA NA FAM196A 44942 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 129742865 129742981 129742943 Y NPS NA NA NA NA NA MKI67 179668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr10 134053422 134053516 134053469 Y JAKMIP3 NA DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 DPYSL4 55018 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 1043654 1043838 1043746 Y MUC6 NA AP2A2 IMR90 Hi-C 24141950 AP2A2 120760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 1773349 1773482 1773395 Y IFITM10 IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7 NA NA NA NA IFITM10 3528 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 2624209 2624341 2624275 Y TRPM5 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 94883 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 2714612 2714953 2714746 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 4271 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 3792611 3792742 3792677 Y STIM1,RHOG,NUP98 PGAP2,NUP98 NA NA NA NA PGAP2 24212 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 3972663 3972822 3972742 Y STIM1 NA NA NA NA NA MIR4687 97371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 6222114 6222511 6222298 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 31430 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 6564206 6564247 6564227 Y NA NA NA NA NA NA RRP8 58603 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 6884595 6884618 6884606 Y DCHS1,OR2AG2,OR2AG1,OR6A2,OR2D2,OR10A4,OR2D3,OR10A2 NA NA NA NA NA ZNF215 61017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 7719377 7719648 7719531 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP2 186848 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr11 8632537 8632549 8632543 Y ASCL3 STK33 NA NA NA NA STK33 18701 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 8730669 8730993 8730843 Y NA RPL27A NA NA NA NA RPL27A 28711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 8848675 8849002 8848759 Y NA NA NA NA NA NA AKIP1 81684 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 8889520 8889803 8889779 Y ST5 AKIP1 NA NA NA NA AKIP1 40883 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 8944739 8945112 8945060 Y ASCL3 AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B NA NA NA NA AKIP1 14053 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 9907928 9908258 9908093 Y NA NA SWAP70,LOC440028,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 SBF2-AS1 130089 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 9997247 9997641 9997474 Y AMPD3 NA NA NA NA NA SBF2-AS1 219408 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 10063724 10063946 10063792 Y SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA NA NA NA NA SBF2 249808 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 10347188 10347587 10347388 Y ADM SBF2,RP11-351I24.1,ADM NA NA NA NA ADM 22961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 10350347 10350728 10350538 Y NA SBF2,RP11-351I24.1,ADM NA NA NA NA ADM 26120 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 10541440 10541628 10541530 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA MTRNR2L8 12717 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 10545162 10545253 10545208 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 15524 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 10634601 10634999 10634904 Y MRVI1,MRVI1,MRVI1 NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 73782 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 10681207 10681687 10681411 Y ADM,MRVI1,MRVI1 MRVI1 LYVE1,MRVI1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MRVI1 31848 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 11864878 11865300 11864975 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 3908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 12013824 12014110 12014066 Y DKK3,DKK3,DKK3 DKK3 NA NA NA NA DKK3 15206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 12146355 12146795 12146568 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 32812 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 190746 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 13139342 13139463 13139403 Y NA NA LOC100506305,RASSF10 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 156736 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 13359856 13360227 13360061 Y ARNTL NA NA NA NA NA ARNTL 63657 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 14436782 14437066 14436859 Y NA NA RRAS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRAS2 52730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 15837558 15838109 15837858 Y NA NA C11orf58 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 794570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 17335831 17335998 17335921 Y NA NA NA NA NA NA NUCB2 108131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 18444585 18444736 18444661 Y SAAL1 LDHA,AC084117.3,LDHC,LDHAL6A NA NA NA NA LDHC 12731 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 RP11-613F22.5,TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 20134058 20134420 20134284 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 248811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 27223366 27223795 27223565 Y NA NA LGR4,LIN7C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC34 159620 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 27255766 27256168 27256011 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 127247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 27693843 27694020 27693988 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 47585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 27740535 27740662 27740569 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 28831581 28831914 28831617 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 703726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 31946597 31946955 31946776 Y NA NA ELP4,IMMP1L IMR90 Hi-C 24141950 PAX6 109088 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 33074022 33074030 33074026 Y NA DEPDC7,TCP11L1 NA NA NA NA TCP11L1 15059 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 34356172 34356320 34356246 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NA NA NA NA RP1-145M24.1 622 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr11 34368265 34368539 34368419 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NAT10,CAPRIN1 IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 9016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 36442519 36442687 36442604 Y COMMD9,PRR5L,PRR5L,TRAF6 NA NA NA NA NA TRAF6 87135 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 43757440 43757801 43757621 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 142560 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 43955473 43955506 43955502 Y NA C11orf96 NA NA NA NA C11orf96 10581 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 44306158 44306224 44306191 Y ALX4 ALX4 NA NA NA NA ALX4 23492 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 44614236 44614384 44614314 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 30259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 44749241 44749630 44749607 Y TSPAN18 TSPAN18 PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 3226 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 44758780 44759166 44758916 Y NA TSPAN18 TSPAN18,PRDM11,CD82,TP53I11,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 12765 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 37979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 26745 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 46444740 46444848 46444831 Y NA NA NA NA NA NA DGKZ 92285 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 46538668 46539048 46538858 Y NA NA NA NA NA NA AMBRA1 74627 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 46753121 46753488 46753304 Y F2 ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ZNF408 32753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 47168963 47169205 47169084 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 27471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 48004294 48004631 48004323 Y CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 4181 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 57173815 57174163 57173968 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 SLC43A3 NA NA NA NA SLC43A3 18890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 57333685 57333973 57333758 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6 TIMM10,SERPING1 NA NA NA NA UBE2L6 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 57406709 57407290 57406997 Y OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6 SERPING1,AP000662.4,CLP1,YPEL4,ZDHHC5 NA NA NA NA AP000662.4 3212 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 57542885 57543297 57542929 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 24170 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 59323878 59323962 59323920 Y NA NA NA NA NA NA OSBP 57655 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 60532534 60532714 60532624 Y MS4A1,MS4A13 NA NA NA NA NA CCDC86 74830 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 62972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 62324383 62324580 62324456 Y WDR74,NXF1,EML3 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 2676 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL NA NA NA NA GANAB 935 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 63366734 63367020 63366890 Y NA HRASLS2,PLA2G16 NA NA NA NA PLA2G16 15335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 63370762 63370914 63370825 Y RTN3,PLA2G16,PLA2G16 HRASLS2,PLA2G16 NA NA NA NA PLA2G16 11441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA RP11-21A7A.2 57125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr11 64102702 64102834 64102750 Y NA ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA PRDX5 19142 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 64146714 64147096 64146808 Y NA RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 22094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65121352 65121551 65121543 Y NA CDC42EP2,DPF2,FRMD8 NA NA NA NA DPF2 22127 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65151984 65152145 65152131 Y NA NEAT1 NA NA NA NA FRMD8 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65248969 65249218 65249208 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 14015 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65249962 65250245 65250146 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 12988 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 4.90290377214015 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2 NA NA NA NA CATSPER1 8651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 65903912 65904457 65904250 Y NA NA NA NA NA NA PACS1 68078 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 67039199 67039528 67039325 Y TBC1D10C,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D NA NA NA NA ADRBK1 7318 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 69067534 69068152 69067999 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 7929 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 69339069 69339664 69339342 Y NA NA MYEOV,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 114191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 70159213 70159451 70159301 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 44407 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 71769812 71769929 71769891 Y NA LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 19453 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 72546015 72546343 72546157 Y PDE2A,ARAP1,ARAP1,FCHSD2,ATG16L2 ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ATG16L2 22662 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 72555518 72555570 72555544 Y ATG16L2 ATG16L2 NA NA NA NA ATG16L2 32165 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 72808468 72808618 72808564 Y NA FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 42688 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 74314500 74314859 74314680 Y NA NA NA NA NA NA POLD3 111604 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 CHRDL2,RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 NA NA NA NA NA NEU3 160225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 75186595 75186756 75186708 Y NA NA RPS3 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD15B 73130 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSKU 10324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr11 76510532 76510646 76510589 Y NA TSKU,RP11-21L23.3 NA NA NA NA RP11-21L23.3 18426 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr11 76534548 76534939 76534880 Y GDPD4 TSKU,RP11-21L23.3,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 34972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA KCTD14 3883 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 77837663 77837947 77837805 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1 NA NA NA NA ALG8 10759 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 78144030 78144327 78144179 Y NA GAB2 NA NA NA NA GAB2 16636 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 82710550 82710717 82710615 Y NA PRCP NA NA NA NA PRCP 30924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 82805889 82806270 82806080 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 24924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 82918019 82918384 82918270 Y PCF11,ANKRD42 ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1 NA NA NA NA RP11-727A23.1 3663 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 83682072 83682426 83682124 Y DLG2,DLG2,DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 686622 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 85047149 85047448 85047300 Y NA NA NA NA NA NA TMEM126B 290181 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 85484523 85484565 85484546 Y NA SYTL2 NA NA NA NA SYTL2 35619 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 85555514 85555895 85555623 Y NA SYTL2,AP000974.1 SYTL2,CCDC83,CCDC89,PICALM,EED IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000974.1 8091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 86381936 86382132 86382071 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 258 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 86447030 86447398 86447213 Y NA NA PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 52703 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 86527382 86527750 86527626 Y FZD4,PRSS23 PRSS23 NA NA NA NA PRSS23 27281 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 86642953 86643307 86643130 Y NA FZD4,RP11-736K20.6 NA NA NA NA FZD4 21126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 88329241 88329453 88329273 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 260286 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 93343191 93343552 93343372 Y NA KIAA1731 NA NA NA NA KIAA1731 49253 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 95745158 95745721 95745455 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 88679 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 95749380 95749532 95749413 Y NA NA NA NA NA NA MTMR2 92901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 95778897 95779169 95779022 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 122418 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 95990308 95990455 95990418 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 83889 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr11 95996412 95996766 95996624 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 77578 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 96071900 96072294 96072196 Y MAML2,JRKL,CCDC82 MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA MAML2 2050 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 102191573 102191697 102191574 Y NA BIRC3,BIRC2 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 5358 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 102631066 102631384 102631342 Y BIRC2 NA NA NA NA NA MMP13 193079 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 102834259 102834268 102834264 Y NA MMP13 MMP10,LOC100288077,MMP13,DCUN1D5 IMR90 Hi-C 24141950 MMP13 9796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 103316988 103317242 103317115 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 38603 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 104838372 104838510 104838471 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 CASP4 NA NA NA NA CASP4 209 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 104903346 104903498 104903407 Y CASP4,CASP4,CASP5,CARD17,CARD16 NA NA NA NA NA CASP4 65183 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 107555925 107556135 107556030 Y NA NA NA NA NA NA ELMOD1 96108 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 107846158 107846176 107846168 Y NA SLC35F2,RAB39A,CUL5 NA NA NA NA CUL5 31283 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr11 109990513 109990553 109990536 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 28426 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 111990651 111990899 111990830 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 35024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 114162155 114162496 114162247 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 114288977 114289308 114289144 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 18800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 115172228 115172553 115172441 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 201122 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 115360673 115361056 115361024 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 12619 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 115373347 115373590 115373469 Y NA CADM1 NA NA NA NA CADM1 85 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 116722234 116722744 116722542 Y NA NA NA NA NA NA ZNF259 65468 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 118481750 118482023 118481896 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 6595 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 118489001 118489167 118489084 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 13846 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 118783640 118784096 118783954 Y NA BCL9L NA NA NA NA BCL9L 10221 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 118784118 118784508 118784405 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 9809 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 118786339 118786473 118786384 Y NA BCL9L NA NA NA NA BCL9L 7844 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA BCL9L NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 121107211 121107513 121107369 Y SC5DL,SC5DL NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 213399 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 121288008 121288281 121288156 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 32631 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 121353016 121353670 121353326 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 32104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 121526040 121526695 121526415 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205128 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 121906863 121907080 121906924 Y NA NA SORL1,MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR125B1 61472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 61784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 122936469 122936659 122936561 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 4531 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 124552795 124553089 124552942 Y OR8B4,C11orf61 SPA17,SIAE NA NA NA NA SIAE 10514 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 125670081 125670467 125670312 Y CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2 NA NA NA NA NA HYLS1 81042 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 126204633 126204937 126204710 Y NA DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 18598 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 126322273 126322455 126322358 Y NA NA ST3GAL4 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL4 98738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 126573660 126573861 126573759 Y KIRREL3 NA NA NA NA NA ST3GAL4 350125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128323342 128323695 128323510 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 131758 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128374504 128374665 128374585 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 80788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128385518 128386026 128385881 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 69427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128584156 128584534 128584279 Y NA FLI1 NA NA NA NA FLI1 29726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128596798 128597188 128596845 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 42368 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 128947199 128947514 128947458 Y NA NA NA NA NA NA FLI1 392769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 129509159 129509661 129509390 Y BARX2 NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 253824 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr11 130743628 130743895 130743754 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 40509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 905489 905920 905534 Y NA WNK1 NA NA NA NA WNK1 45730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1428527 1428661 1428594 Y ERC1 NA NA NA NA NA WNT5B 208396 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1640952 1641788 1641475 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 3895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1699844 1700200 1699934 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 1131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 1717506 1717606 1717553 Y NA FBXL14 FBXL14,ERC1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 16175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1718029 1718183 1718131 Y ADIPOR2 FBXL14 FBXL14 MCF7 ChIA-PET 22265404 FBXL14 16698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 1769649 1770205 1769686 Y NA ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 25535 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 32576 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 2307539 2307834 2307597 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 195838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 2403977 2404382 2404036 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 292276 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 2749982 2750016 2749999 Y NA NA NA NA NA NA FKBP4 152103 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 2862367 2862509 2862453 Y NA FKBP4 NA NA NA NA FKBP4 39610 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 3239416 3239801 3239467 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN9 54895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 4380607 4381576 4381205 Y PARP11,CCND2 C12orf5 NA NA NA NA CCND2 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 4758958 4759134 4759102 Y NA NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 2697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 6278115 6278307 6278240 Y TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 28574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 7058563 7058923 7058712 Y PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA C12orf57 8422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2,C3AR1 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 9802084 9802505 9802358 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D NA NA NA NA NA DDX12P 203259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA NA NA NA NA NA KLRC2 75124 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11221356 11221421 11221389 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 100751 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11238086 11238323 11238205 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 83849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11755379 11755464 11755421 Y NA ETV6 ETV6 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 45324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11806275 11806670 11806607 Y BCL2L14,ETV6 ETV6 NA NA NA NA ETV6 5487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11864651 11864937 11864724 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 63863 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 11867581 11867722 11867638 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 66793 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11887448 11887775 11887612 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 86660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11898142 11898564 11898233 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 97354 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11902953 11903896 11903427 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 102165 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11909552 11909810 11909712 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 108764 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11911642 11913422 11912121 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 110854 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11918792 11919487 11919193 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118004 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 11987992 11988316 11988087 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 187204 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 12111679 12111898 12111693 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 LRP6 306048 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 NA NA NA NA NA LRP6 119365 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 12592534 12593034 12592768 Y BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA NA NA NA NA LOH12CR1 84521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 12594845 12595716 12595015 Y LOH12CR1,GPR19,DUSP16,CDKN1B,APOLD1 NA NA NA NA NA LOH12CR1 86832 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 12711400 12711706 12711553 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP16 1611 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 12872470 12873013 12872652 Y MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1 CDKN1B,APOLD1 NA NA NA NA APOLD1 3838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 12883612 12883681 12883638 Y APOLD1 CDKN1B,APOLD1 NA NA NA NA APOLD1 6761 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 13056884 13057235 13057060 Y GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A NA NA NA NA GPRC5A 15168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 13357534 13357828 13357577 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 9884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 14413561 14413925 14413703 Y NA RP11-134N1.2 ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-134N1.2 46037 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 14426552 14426694 14426609 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA RP11-134N1.2 59028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 14426966 14427222 14427069 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA RP11-134N1.2 59442 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 19496981 19496995 19496989 Y NA NA NA NA NA NA AEBP2 57984 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 19534179 19534194 19534187 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 20785 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 19932429 19932596 19932501 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-146P 57060 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 20365637 20365979 20365748 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-146P 490268 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 24991472 24991796 24991668 Y BCAT1 NA NA NA NA NA BCAT1 108597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr12 26142824 26143171 26142998 Y NA RASSF8,RASSF8-AS1 NA NA NA NA RASSF8-AS1 32126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 26440996 26441185 26441046 Y NA NA BHLHE41,ITPR2,SSPN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 163446 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 26484826 26485166 26485077 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 207276 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 26512613 26512980 26512754 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 235063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 26663094 26663473 26663334 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 320658 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 28179755 28179885 28179817 Y PTHLH,PTHLH NA PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 104297 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 29312653 29312987 29312866 Y NA FAR2 FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 12617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 29323817 29323981 29323882 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 23781 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 29859887 29860252 29860216 Y NA NA NA NA NA NA TMTC1 75440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 31469690 31470116 31469962 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 7876 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 32842101 32842415 32842258 Y NA DNM1L,RP11-278C7.1 NA NA NA NA DNM1L 11967 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 34500403 34500725 34500579 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 99987 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 42598855 42599145 42599001 Y YAF2,YAF2,YAF2 YAF2,PPHLN1 NA NA NA NA YAF2 31006 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 42984702 42985091 42984897 Y GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1 PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 2545 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 44522730 44522871 44522801 Y NA NA NA NA NA NA TMEM117 294960 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 45207855 45208059 45207957 Y NA NA NA NA NA NA ANO6 399711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 45628991 45629732 45629167 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 21167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 46614251 46614418 46614333 Y NA SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 47382 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 46845656 46846014 46845792 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 70194 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr12 46894676 46894859 46894768 Y SLC38A4 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 119214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 47033293 47033660 47033445 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 257831 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 47191369 47191677 47191464 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 280057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr12 47482441 47482676 47482559 Y NA AMIGO2 AMIGO2 K562 ChIA-PET 22265404 AMIGO2 10707 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 47670448 47670925 47670783 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 198714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 48282882 48283045 48282955 Y ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR NA NA NA NA NA VDR 51786 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 48415389 48415421 48415405 Y OR10AD1 NA COL2A1,TMEM106C,SENP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM106C 60037 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 49508076 49508435 49508256 Y NA RHEBL1,LMBR1L,RP11-386G11.10,TUBA1B NA NA NA NA LMBR1L 5393 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 49626851 49627096 49626872 Y NA TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 45744 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 49822830 49822961 49822896 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2 64463 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 50020601 50020960 50020800 Y FMNL3,PRPF40B NA NA NA NA NA PRPF40B 60600 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 50860078 50860266 50860172 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 36502 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 51057988 51058419 51058261 Y NA NA NA NA NA NA ATF1 97074 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr12 51608031 51608240 51608135 Y BIN2 TFCP2,POU6F1,DAZAP2 NA NA NA NA POU6F1 1237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 51720540 51720949 51720738 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6 NA NA NA NA NA SMAGP 57866 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54012118 54012371 54012242 Y PFDN5 ATF7 NA NA NA NA ATF7 5828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54072437 54072838 54072741 Y CSAD,MAP3K12,ATF7,ATF7,ATP5G2,CALCOCO1 ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 3245 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54088486 54088540 54088513 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 19294 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54149784 54149995 54149877 Y PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11 CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 30255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54391907 54392298 54392098 Y ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9 HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5 NA NA NA NA HOXC-AS1 113 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54400493 54400742 54400596 Y HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4 HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 90 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54413422 54413659 54413446 Y ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5 HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 10978 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54424968 54425277 54425216 Y HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 331 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 54690191 54690205 54690198 Y NFE2 CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1 NA NA NA NA NFE2 2700 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1,RP11-644F5.10 299381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 56729298 56729459 56729406 Y NA RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2 NA NA NA NA PAN2 3461 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 56876109 56876291 56876201 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 3907 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 2697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 56914338 56914532 56914358 Y NA GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA RBMS2 625 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.0643148575876 chr12 57458942 57459239 57459094 Y NA TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 20607 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 57494239 57494362 57494284 Y MBD6,STAT6 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA NAB2 13562 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 57672745 57672985 57672868 Y NA NDUFA4L2 NA NA NA NA NDUFA4L2 40247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31,AGAP2 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 58349067 58349080 58349075 Y XRCC6BP1 RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 15743 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 59061940 59062339 59062197 Y NA NA NA NA NA NA LRIG3 249964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 59542738 59542911 59542783 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150C16.1 230318 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 62644447 62644716 62644645 Y C12orf61,USP15 USP15 USP15 MCF7 ChIA-PET 22265404 USP15 7403 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 62727827 62728150 62727887 Y NA NA NA NA NA NA USP15 75708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 57300 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 63096065 63096306 63096205 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 101533 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 63115696 63115706 63115701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 121164 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 64575299 64575468 64575384 Y NA C12orf66,RPS11P6 NA NA NA NA C12orf66 38608 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 65037414 65037710 65037562 Y NA RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 35121 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 65063507 65064284 65063678 Y C12orf66,TBK1,RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 61214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 66008791 66009141 66009009 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 14142 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 66237933 66238219 66238043 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 22022 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 66316992 66317322 66317175 Y IRAK3 NA NA NA NA NA HMGA2 101081 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 66440623 66440641 66440633 Y NA NA HMGA2,MSRB3,LLPH IMR90 Hi-C 24141950 LLPH 81907 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 68705071 68705359 68705215 Y IL22 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18802 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr12 69163885 69164101 69163897 Y SLC35E3 SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 25999 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 69316243 69316419 69316405 Y RAP1B,CPM,CPM CPM NA NA NA NA CPM 46931 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6,RP11-1143G9.2 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA RP11-1143G9.2 NA NA NA NA RP11-1143G9.2 10349 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 70382625 70382986 70382644 Y CCT2,CCT2,RAB3IP NA CNOT2,KCNMB4,PTPRB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNOT2 251788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 70626158 70626373 70626266 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 8401 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 70940880 70941156 70941028 Y NA NA NA NA NA NA RP11-588H23.3 81020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 72102151 72102263 72102239 Y NA ZFC3H1,TMEM19,RAB21 NA NA NA NA TMEM19 24284 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 74668744 74669132 74668938 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 260419 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 75877380 75877665 75877492 Y GLIPR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 4920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 205760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 76375899 76376264 76376114 Y NA PHLDA1 PHLDA1,KRR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 49448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 76405800 76405899 76405843 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 19813 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 76942062 76942423 76942413 Y NA OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 9166 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 77771188 77771377 77771281 Y CSRP2 NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 54767 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 80219716 80220141 80220058 Y NA NA NA NA NA NA RP11-84G21.1 106540 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 80974115 80974384 80974233 Y MYF5 NA NA NA NA NA ACSS3 355210 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 88526600 88526872 88526736 Y NA CEP290,TMTC3 NA NA NA NA CEP290 7121 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 88527986 88528043 88528042 Y NA CEP290,TMTC3 NA NA NA NA CEP290 5950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 88703962 88704349 88704186 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 169889 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 90091098 90091469 90091453 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 9608 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 90115396 90115765 90115565 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 14319 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 90369532 90369616 90369574 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 268455 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 93805604 93805748 93805676 Y CRADD NUDT4,UBE2N NA NA NA NA UBE2N 28290 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 94153192 94153314 94153253 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 84041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 94539021 94539385 94539203 Y NA NA PLXNC1,CCDC41 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 312379 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA CCDC41 173456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 94681590 94681805 94681698 Y NA NA NA NA NA NA CCDC41 169959 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 94696122 94696451 94696433 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA CCDC41 155313 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA CCDC41 NA NA NA NA CCDC41 33416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 95012768 95013068 95012914 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 29270 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 104671230 104671489 104671317 Y TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 1011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA CHST11 NA NA NA NA CHST11 98 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 104925240 104925499 104925325 Y CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 78167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 104974037 104974383 104974060 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 126964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 105030278 105030644 105030428 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 183205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 105620091 105620351 105620275 Y APPL2 C12orf75,APPL2 NA NA NA NA C12orf75 6717 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 105711063 105711549 105711425 Y C12orf75 RP11-474B16.1 C12orf75,APPL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-474B16.1 7246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 106328094 106328476 106328238 Y CKAP4 NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUAK1 203335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 108699402 108699607 108699511 Y CORO1C,SELPLG NA NA NA NA NA FICD 207355 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109023569 109024011 109023688 Y SSH1,SELPLG,SELPLG NA NA NA NA NA ISCU 69211 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109032155 109032517 109032383 Y NA NA ISCU,TMEM119,SELPLG IMR90 Hi-C 24141950 ISCU 77797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109061186 109061401 109061295 Y SELPLG,SELPLG,SSH1 NA NA NA NA NA CORO1C 61971 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109116964 109117579 109117192 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5793 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109167575 109167781 109167683 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 44203 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 21904 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 109900309 109900503 109900403 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 12704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 110315331 110315497 110315413 Y MYO1H,GLTP GLTP,TCHP NA NA NA NA GLTP 796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 110618684 110618848 110618757 Y NA NA NA NA NA NA IFT81 58544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 110633503 110633688 110633596 Y NA NA NA NA NA NA IFT81 73363 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 111336252 111336432 111336342 Y NA NA NA NA NA NA RP1-46F2.3 57184 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 111883923 111883990 111883957 Y NA SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 42171 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 112215177 112215502 112215206 Y FAM109A,SH2B3,ALDH2 ALDH2 NA NA NA NA ALDH2 12486 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 112464061 112464211 112464136 Y NA TMEM116,ERP29 NA NA NA NA ERP29 14941 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 112545862 112545946 112545885 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 1036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 113478524 113478983 113478679 Y OAS1,OAS3,SLC24A6,SDSL,OAS2 DTX1 OAS2,DTX1 IMR90 Hi-C 24141950 DTX1 13531 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 113630509 113630869 113630677 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA DDX54 9225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 113667617 113667862 113667654 Y DTX1,IQCD,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 10718 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 113709766 113709965 113709824 Y OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,PLBD2 NA NA NA NA NA IQCD 52867 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 114029271 114029455 114029396 Y LHX5 NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 SDS 167165 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 115354392 115354675 115354479 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 234423 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 116570796 116571229 116571121 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 141914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 116590030 116590409 116590220 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 122734 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 116796896 116797249 116796984 Y NA NA MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 83753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 116821073 116821333 116821156 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 107930 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 116872040 116872309 116872217 Y NA NA NA NA NA NA LINC00173 96918 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 117480044 117480441 117480323 Y TESC NA NA NA NA NA FBXW8 133283 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr12 121460857 121460983 121460961 Y NA C12orf43,OASL NA NA NA NA C12orf43 8552 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 121841505 121841570 121841538 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 5661 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 121950322 121950543 121950327 Y SETD1B,RHOF NA NA NA NA NA KDM2B 66377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.98360931486387 chr12 123233355 123233499 123233417 Y CLIP1,HCAR2,HCAR3 DENR CCDC62 IMR90 Hi-C 24141950 DENR 1822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 123627472 123627989 123627683 Y C12orf65,C12orf65,C12orf65 PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 4573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 123916939 123917399 123917200 Y C12orf65,SBNO1,RILPL2 RILPL2,SNRNP35 NA NA NA NA RILPL2 1865 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 262123 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 451757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 125008756 125009019 125008888 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 356195 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 313839 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 125110878 125111184 125111029 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 254030 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 125221717 125221873 125221796 Y NCOR2,UBC NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 143341 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 125332280 125332520 125332389 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 32694 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr12 127730069 127730271 127730149 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 81397 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 129296403 129296565 129296505 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4 NA NA NA NA SLC15A4 9963 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA ZMYM2 113459 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 NA NA NA NA NA ZMYM2 162595 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 21102735 21102938 21102864 Y NA CRYL1,IFT88 NA NA NA NA CRYL1 4739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 21398890 21399124 21398998 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 52793 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA RNU4-9P,LATS2 NA NA NA NA RNU4-9P 3146 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 25856268 25856641 25856378 Y NA MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA MTMR6 3506 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 26475840 26476144 26475975 Y CDK8 NA NA NA NA NA RNF6 318647 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 27166168 27166184 27166175 Y GPR12,WASF3 WASF3 NA NA NA NA WASF3 36328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 27572004 27572077 27572041 Y NA NA RASL11A,USP12,MTIF3,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 171956 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 27808177 27808245 27808213 Y NA RPL21,SNORD102,RASL11A USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21 15201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 28010544 28010826 28010685 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 11913 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 28167075 28167372 28167253 Y NA LNX2,POLR1D NA NA NA NA LNX2 25169 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 28725313 28725682 28725498 Y PAN3 PAN3-AS1,PAN3 NA NA NA NA PAN3 14670 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 29148222 29148380 29148298 Y POMP EIF4A1P7 FLT1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A1P7 22590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 30407984 30408178 30408116 Y UBL3 NA NA NA NA NA SLC7A1 240159 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 30460222 30460586 30460404 Y NA NA UBL3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC7A1 292397 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 31439697 31440107 31440029 Y C13orf33 NA NA NA NA NA ALOX5AP 132052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 175921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 31619955 31620221 31620066 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 114304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 32470605 32470630 32470618 Y NA NA NA NA NA NA EEF1DP3 51627 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 32539898 32540079 32539992 Y N4BP2L1 NA NA NA NA NA EEF1DP3 120920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 33728009 33728149 33728045 Y STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 194618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 33858244 33858802 33858357 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 63965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 34069113 34069239 34069161 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 146346 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 8.27365011548651 chr13 34727619 34727920 34727781 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 337433 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 36853236 36853259 36853249 Y CCNA1,C13orf38 CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2 NA NA NA NA CCDC169 16718 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 37424486 37424865 37424682 Y NA RFXAP NA NA NA NA RFXAP 33125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 38740377 38740756 38740564 Y NA NA NA NA NA NA UFM1 181230 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 38874589 38874762 38874676 Y NA UFM1 NA NA NA NA UFM1 47224 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 41229483 41229797 41229615 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 8937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 66629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 42276592 42276928 42276845 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 393251 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 42422497 42422720 42422629 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA AKAP11 421569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 42705100 42705257 42705170 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 139032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 42849254 42849451 42849396 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 4965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 42969602 42969963 42969792 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 NA NA NA NA NA AKAP11 125313 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 43378134 43378246 43378162 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 186161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 43570775 43570983 43570833 Y EPSTI1 EPSTI1,DNAJC15 EPSTI1,ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 6368 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 43617981 43618110 43618046 Y TNFSF11 DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 22642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr13 43656094 43656342 43656191 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 60755 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 43796435 43796650 43796543 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 201096 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 43866757 43867095 43866777 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA DNAJC15 271418 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 44420814 44421049 44420930 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 30371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 44436870 44437053 44436962 Y ENOX1 LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 14367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 44446151 44446617 44446342 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 4803 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 44838473 44838853 44838527 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 310430 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 46082201 46082375 46082214 Y NA COG3 NA NA NA NA COG3 45141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 46676671 46676746 46676711 Y CPB2 NA NA NA NA NA ZC3H13 51777 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 46724053 46724328 46724215 Y NA NA NA NA NA NA LCP1 59678 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 46747616 46748160 46748034 Y C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 35846 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 47369610 47369907 47369759 Y NA ESD NA NA NA NA ESD 243 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 48464437 48464519 48464469 Y NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L4P3 128842 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr13 48478393 48478707 48478627 Y RB1 NA NA NA NA NA NUDT15 130996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 48907859 48907955 48907897 Y NA LINC00441,RB1 NA NA NA NA RB1 31972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 20959 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 49688107 49688286 49688182 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 131761 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13 NA NA NA NA TRIM13 29452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 50671086 50671325 50671206 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 16779 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 50703291 50703484 50703377 Y NA DLEU1,DLEU2 DLEU7,DLEU1,DLEU2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 5435 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 50704264 50704590 50704561 Y NA DLEU1,DLEU2 DLEU7,DLEU1,DLEU2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 6408 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 51464273 51464487 51464380 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 17327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 51466138 51466579 51466443 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 15235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 51508208 51508301 51508255 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 25360 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 51815944 51816141 51816055 Y INTS6 FAM124A NA NA NA NA FAM124A 21441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 51897423 51897587 51897505 Y NA NA FAM124A,DHRS12 IMR90 Hi-C 24141950 FAM124A 102920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 51902603 51902909 51902835 Y NA NA DHRS12 IMR90 Hi-C 24141950 FAM124A 108100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 52218212 52218391 52218309 Y NA NA NA NA NA NA WDFY2 61568 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr13 52475447 52475592 52475577 Y NA NA INTS6,ATP7B,ALG11,NEK5,NEK3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-327P2.5 99014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr13 55515473 55515560 55515510 Y NA NA NA NA NA NA PCDH8 2094698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 61157781 61157905 61157871 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 189190 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 64491531 64491783 64491579 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 156361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 64508473 64508866 64508848 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 139278 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 64563606 64563820 64563696 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 84324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 64589476 64589676 64589576 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 58468 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 64623751 64624068 64623941 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 24076 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr13 67298502 67298528 67298515 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 2650358 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 73768530 73768732 73768575 Y NA NA NA NA NA NA KLF5 141416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 74228674 74228703 74228690 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 477691 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 74377303 74377556 74377430 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 328838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 74445258 74445348 74445303 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 261046 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 75800411 75800558 75800473 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 253692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 75939473 75939484 75939479 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 114766 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 75939887 75940324 75940051 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 113926 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 80319311 80319640 80319476 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP2 266024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 84433897 84434216 84434044 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1937407 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 84480650 84480755 84480723 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1890868 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 88211990 88212263 88212129 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1840367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 90053531 90053928 90053634 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1944146 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 92900985 92901044 92901015 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 902911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 94644641 94644702 94644672 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 601809 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 94766317 94766480 94766414 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 480031 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 96284564 96284961 96284763 Y NA DZIP1,DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DZIP1 9996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 96366031 96366158 96366093 Y DNAJC3 DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DNAJC3 38638 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 97550852 97551225 97550967 Y NA NA NA NA NA NA MBNL2 320463 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 99128143 99128552 99128498 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 99161455 99162128 99161863 Y NA NA NA NA NA NA STK24 66066 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 99473598 99473661 99473659 Y NA NA NA NA NA NA STK24 245404 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 99628165 99628894 99628676 Y DOCK9 NA NA NA NA NA DOCK9 107985 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 99931812 99933023 99932107 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 24636 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 99991522 99991909 99991574 Y NA GPR183 NA NA NA NA GPR183 33863 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 100010340 100010660 100010510 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA GPR183 52681 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA GPR183 55832 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 100115582 100115885 100115820 Y NA TM9SF2 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 35786 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 100613415 100613606 100613513 Y NA ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 8557 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 102377146 102377246 102377196 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 274180 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 102404664 102405031 102404843 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 301698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 102412213 102412508 102412361 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 309247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 103244790 103245125 103245073 Y ERCC5,TPP2 TPP2 TPP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TPP2 2228 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 104371816 104371919 104371873 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 876622 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 105315212 105315547 105315380 Y NA NA NA NA NA NA LINC00460 1711364 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 107026666 107026873 107026771 Y NA LINC00460 NA NA NA NA LINC00460 38 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 107225813 107226005 107225909 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 7301 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 109329023 109329148 109329088 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 460296 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 597640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 109847392 109847697 109847628 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 557918 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr13 110359460 110359633 110359542 Y IRS2 AL162497.1 MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL162497.1 45982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 110401088 110401398 110401243 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA AL162497.1 4217 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr13 110709567 110709794 110709737 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 246365 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr13 110902548 110902879 110902758 Y COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA NA COL4A2 53280 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 110982194 110982608 110982413 Y NA COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 24698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr13 111013776 111014136 111013979 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 56280 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 111048888 111049110 111049017 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 91392 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 111061947 111062361 111062286 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 104451 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 111188602 111188989 111188936 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 COL4A2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB20 23091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 111564894 111565358 111565241 Y RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 58 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 113870568 113870732 113870682 Y MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10 CUL4A,PCID2 NA NA NA NA PCID2 9539 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 114162944 114163163 114163069 Y LAMP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 19634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 114548051 114548420 114548108 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 16626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 114565478 114566323 114565869 Y GAS6,GAS6,GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 114823856 114824029 114823926 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 72057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr13 114834440 114834743 114834634 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 61343 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 7.04792417245147 chr14 21339031 21339328 21339180 Y NA NA NA NA NA NA METTL17 116601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 23058743 23059118 23058931 Y REM2 DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 2568 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 23320228 23321035 23320800 Y RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7 MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 16462 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 23322319 23322495 23322408 Y NA MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA LRP10 16327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 23357263 23357473 23357436 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5 NA NA NA NA LRP10 18441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 23584186 23584501 23584299 Y C14orf119 C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA ACIN1 21363 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24008139 24008541 24008214 Y DHRS4L2,DHRS4L2,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,JPH4 THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4 NA NA NA NA THTPA 14675 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24014427 24014724 24014635 Y DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4 THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4 NA NA NA NA THTPA 8492 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA JPH4 117754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24454112 24454320 24454216 Y DHRS4L2,DHRS4L2 DHRS4,DHRS4L2 NA NA NA NA DHRS4L2 16964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24555845 24556044 24555945 Y LRRC16B,NRL LRRC16B,PCK2,DCAF11,PSME1 NA NA NA NA PCK2 5218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24604383 24604748 24604550 Y NA PCK2,DCAF11,PSME1,RNF31,PSME2,IRF9 NA NA NA NA PSME1 1016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NFATC4,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NFATC4 28784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 24986968 24987201 24987138 Y GZMB,CTSG,CMA1 NA NA NA NA NA SDR39U1 76857 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 25397817 25398161 25397990 Y NA NA NA NA NA NA SDR39U1 487706 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 30663968 30664325 30664158 Y PRKD1 PRKD1 PRKD1,FOXG1,C14orf23 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD1 4864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 31101250 31101606 31101429 Y NA SCFD1 NA NA NA NA SCFD1 11932 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 31400109 31400220 31400192 Y NA NA NA NA NA NA COCH 58389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr14 33126424 33126565 33126444 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 174418 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 34162040 34162301 34162172 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 767261 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 34407262 34407567 34407424 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 521995 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 34407631 34407737 34407684 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 521825 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 35625298 35625573 35625393 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 35543 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 35755957 35756376 35756177 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 10118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 35869907 35870271 35870165 Y FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 1684 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 36073737 36073816 36073791 Y NA NA NA NA NA NA NFKBIA 201782 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 37134370 37134658 37134514 Y NA PAX9 NA NA NA NA PAX9 9597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 38965761 38966052 38965907 Y NA NA NA NA NA NA SSTR1 290557 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 39892906 39893200 39893154 Y FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 6504 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 39954969 39955272 39955039 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 55265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 39958924 39958943 39958934 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 59220 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 41099089 41099243 41099183 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1199385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 45723245 45723364 45723320 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 2502 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 47696508 47696702 47696627 Y NA RPL13AP2 NA NA NA NA RPL13AP2 28201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr14 50465888 50466432 50466066 Y NA RP11-58E21.3 NA NA NA NA RP11-58E21.3 39515 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 50528497 50528810 50528555 Y NA RP11-58E21.3 NA NA NA NA RP11-58E21.3 22550 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 50531720 50532221 50531875 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 RP11-58E21.3 NA NA NA NA RP11-58E21.3 25773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 51862095 51862490 51862300 Y FRMD6,FRMD6 NA LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 91328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 51970793 51971031 51970913 Y TRIM9 FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 16975 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr14 52076708 52076858 52076794 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 122890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 144619 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 52163680 52163849 52163765 Y FRMD6 NA NA NA NA NA GNG2 127064 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 NID2 88894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr14 53020677 53020806 53020735 Y PTGDR,TXNDC16,GPR137C TXNDC16,GPR137C NA NA NA NA GPR137C 2811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 53294197 53294464 53294329 Y NA GNPNAT1 FERMT2 IMR90 Hi-C 24141950 GNPNAT1 37811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 53361596 53362059 53361840 Y NA NA NA NA NA NA FERMT2 55094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 53385393 53385542 53385402 Y DDHD1 FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 31611 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 53392802 53392977 53392890 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 24176 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 53399403 53399746 53399574 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 17407 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 53575786 53575939 53575850 Y DDHD1 DDHD1 NA NA NA NA DDHD1 42061 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 54443717 54444101 54443910 Y NA NA NA NA NA NA CDKN3 417466 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 55035984 55036343 55036300 Y SAMD4A SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 4169 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 55073001 55073254 55073103 Y NA SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 41186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 56806823 56806983 56806903 Y PELI2 NA PELI2,KTN1,LINC00520 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PELI2 224291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 59001974 59002022 59001998 Y NA NA NA NA NA NA DACT1 96663 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 59002332 59002438 59002384 Y NA NA NA NA NA NA DACT1 96247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 59744882 59745126 59745004 Y NA NA NA NA NA NA DAAM1 91518 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 59908838 59908842 59908840 Y NA GPR135,JKAMP NA NA NA NA GPR135 21218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 GPR135,JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 61108188 61108290 61108236 Y NA SIX1 NA NA NA NA SIX1 14687 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA PRKCH 81318 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 61571196 61571403 61571326 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA PRKCH 80874 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 61801031 61801197 61801068 Y NA NA NA NA NA NA PRKCH 148754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 61865216 61865457 61865337 Y PRKCH NA NA NA NA NA PRKCH 212939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 190118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 62052395 62052634 62052478 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 107597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 62053265 62053527 62053394 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 106704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 62058743 62058958 62058799 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 101273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 64976158 64976191 64976175 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB25 6227 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2509G16.2 59527 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 67728313 67728625 67728469 Y NA MPP5 NA NA NA NA MPP5 22487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 68281633 68281808 68281770 Y PLEK2,ZFYVE26 ZFYVE26,RAD51B NA NA NA NA ZFYVE26 326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68408350 68408505 68408421 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123854 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68409175 68409464 68409327 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 124679 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68613334 68613955 68613742 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 328838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68614207 68614598 68614344 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 329711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 68634149 68634509 68634347 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 349653 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68644384 68644906 68644390 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 359888 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr14 68699331 68699744 68699520 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA RAD51B 414835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68864007 68864486 68864182 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA ZFP36L1 396704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 68884830 68884917 68884875 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 376273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69019496 69019664 69019580 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 241526 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69022058 69022216 69022137 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 238974 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69178388 69178777 69178557 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 82413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69301401 69301774 69301727 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 40211 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69361596 69361764 69361692 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 82393 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69377319 69377610 69377464 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 66547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69402735 69403079 69402843 Y GALNTL1 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 41078 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69425235 69425583 69425528 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 18574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69434857 69435075 69434960 Y DCAF5 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 9082 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69507227 69507425 69507309 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 63070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 69512620 69512951 69512699 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 68463 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 70099072 70099485 70099117 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 22759 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 11927 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 73083921 73084271 73084094 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4,RBM25 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 274538 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 74220862 74221204 74221002 Y NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 30859 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 74918684 74918707 74918696 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 VRTN IMR90 Hi-C 24141950 MIR4709 26200 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 74981330 74981609 74981543 Y NPC2 MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA NPC2 22450 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75037027 75037351 75037159 Y NA NA NA NA NA NA NPC2 78147 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75086409 75086922 75086553 Y PGF NA LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FCF1 90925 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75125565 75125963 75125764 Y NA NA NA NA NA NA FCF1 51884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75448208 75448549 75448379 Y NA PGF,EIF2B2 MLH3,ZC2HC1C,NEK9,PGF,EIF2B2,ACYP1,RPS6KL1,DLST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF2B2 19065 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75492523 75492557 75492545 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 23678 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75761897 75762132 75762064 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS NA NA NA NA FOS 18420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 75920164 75920191 75920178 Y JDP2 JDP2 NA NA NA NA JDP2 27745 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 76081585 76081840 76081824 Y NA FLVCR2,RP11-507E23.1,TTLL5,C14orf1 NA NA NA NA TTLL5 16128 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 76343734 76343966 76343850 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 22513 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 76401422 76401643 76401519 Y ESRRB,TGFB3 IFT43,TGFB3 NA NA NA NA IFT43 34943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 76734272 76734379 76734290 Y ESRRB NA NA NA NA NA TGFB3 286938 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 77451554 77451690 77451632 Y NA RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL IRF2BPL,KIAA1737 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-7F17.1 18528 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 77488566 77488578 77488572 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 4456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 77517690 77517970 77517808 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-7F17.3 22717 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 77871382 77871440 77871411 Y NA SAMD15,TMED8 NA NA NA NA TMED8 29930 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 78031949 78032369 78032266 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 48747 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 78129695 78129950 78129826 Y NA SPTLC2,ALKBH1,SLIRP NA NA NA NA ALKBH1 42413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 79728948 79729331 79729131 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1464522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 81019191 81019257 81019224 Y DIO2,CEP128 NA NA NA NA NA CEP128 404604 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 81220509 81220785 81220647 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 203076 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 81484958 81485153 81484991 Y TSHR NA NA NA NA NA CEP128 61097 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr14 81867255 81867616 81867435 Y GTF2A1,GTF2A1,STON2 NA NA NA NA NA SEL1L 130589 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 81867886 81868104 81867969 Y GTF2A1,GTF2A1 NA NA NA NA NA SEL1L 130101 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 88336279 88336528 88336449 Y KCNK10,GPR65 NA NA NA NA NA GALC 121481 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 89671493 89671906 89671673 Y NA NA NA NA NA NA CAP2P1 84032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 89742753 89743028 89742926 Y NA CAP2P1 NA NA NA NA CAP2P1 12910 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 89770346 89770725 89770409 Y FOXN3,FOXN3 CAP2P1 NA NA NA NA CAP2P1 14408 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 89971054 89971245 89971134 Y TDP1,FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 112248 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 90465200 90465384 90465297 Y NA EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA TDP1 45917 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr14 91090658 91091172 91090732 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 189651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 91528012 91528136 91528074 Y SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 3032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 91827435 91827790 91827659 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 54398 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 92970203 92970533 92970302 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 7585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 93044640 93044810 93044725 Y NA NA NA NA NA NA RIN3 66522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 93312795 93313160 93313011 Y MOAP1,KIAA1409,C14orf142,C14orf109,C14orf109,BTBD7,RIN3 NA NA NA NA NA GOLGA5 54219 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 93697718 93697880 93697787 Y ITPK1,MOAP1 MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 94735054 94735340 94735197 Y NA NA NA NA NA NA IFI27L2 140464 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 95596986 95597082 95597060 Y NA DICER1 NA NA NA NA DICER1 25265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr14 100503802 100504130 100503983 Y NA NA EVL,DEGS2,EML1 IMR90 Hi-C 24141950 YY1 198505 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 100566376 100566553 100566536 Y EVL NA NA NA NA NA YY1 136082 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 100687969 100688087 100687996 Y NA YY1,RP11-638I2.4 YY1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 14548 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 100874667 100875097 100874987 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25 RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA WARS 33525 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 101029795 101030067 101029931 Y NA NA NA NA NA NA WARS 188653 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102188292 102188876 102188640 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 PPP2R5C 37259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102227271 102227509 102227387 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 1136 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102288392 102288845 102288491 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 62257 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr14 102415545 102415736 102415629 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13129 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 102544859 102545271 102545048 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 58569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102836975 102837187 102837062 Y NA CINP,TECPR2 NA NA NA NA TECPR2 9675 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 102971480 102971658 102971568 Y NA ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 2478 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr14 103097343 103097523 103097412 Y NA RCOR1 NA NA NA NA RCOR1 40345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 103112299 103112666 103112355 Y NA NA NA NA NA NA RCOR1 55301 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 103954462 103954719 103954539 Y MARK3,KLC1 CKB,TRMT61A NA NA NA NA CKB 32729 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 104018443 104019067 104018893 Y PPP1R13B CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P NA NA NA NA KLC1 7166 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr14 105493379 105493756 105493698 Y NA C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 7894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 6059 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr14 106284381 106284894 106284656 Y TEX22,C14orf80 NA NA NA NA NA TMEM121 293441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 20596893 20597220 20597190 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 2234175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 25555752 25555966 25555813 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 126162 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 25595443 25596209 25595953 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 85919 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 25608093 25608225 25608159 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 73903 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 26030419 26030730 26030600 Y ATP10A NA NA NA NA NA UBE3A 348291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 27333003 27333354 27333179 Y NA NA NA NA NA NA AC145436.1 250317 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA TJP1 236254 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 31598782 31598890 31598869 Y NA KLF13 OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 18168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 32974763 32975144 32974961 Y NA GREM1 NA NA NA NA GREM1 33031 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33032997 33033143 33033070 Y GREM1 GREM1 NA NA NA NA GREM1 24822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 33125525 33125772 33125733 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 117350 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33133022 33133309 33133285 Y GREM1 NA GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 GREM1 124847 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33134248 33134560 33134512 Y NA NA GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 GREM1 126073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33135808 33135977 33135886 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 127633 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33153988 33154297 33154060 Y GREM1 NA NA NA NA NA GREM1 145813 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33165962 33166239 33166177 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 157787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33169920 33170257 33170055 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 161745 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33188603 33188636 33188634 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 180428 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 33440518 33440847 33440783 Y NA NA FMN1 IMR90 Hi-C 24141950 GREM1 432343 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8A,GOLGA8B 71262 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 37656383 37656399 37656391 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 264879 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 38422177 38422570 38422209 Y NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 119957 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 38784019 38784367 38784201 Y RASGRP1 FAM98B NA NA NA NA FAM98B 39691 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 38943543 38943719 38943607 Y NA NA FAM98B,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 87767 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 39163582 39163767 39163675 Y RASGRP1,C15orf53 NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 307806 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 39175462 39175521 39175492 Y NA NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 319686 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 506216 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 39420923 39421276 39421056 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 450004 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr15 39432449 39432903 39432696 Y C15orf54 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 40179429 40179904 40179805 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 31189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 40361212 40361596 40361446 Y NA SRP14,BMF NA NA NA NA SRP14 31823 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 40385571 40385715 40385643 Y BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 13378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 40388043 40388381 40388211 Y NA BMF NA NA NA NA BMF 10712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 41456018 41456111 41456065 Y NA INO80 NA NA NA NA INO80 49466 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 41581854 41582095 41581909 Y NA OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1 NA NA NA NA OIP5-AS1 7666 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 41920606 41920652 41920629 Y NA MGA TYRO3,MAPKBP1,MGA IMR90 Hi-C 24141950 MGA 9184 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 42213328 42213713 42213448 Y NA EHD4 NA NA NA NA EHD4 49063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 43321563 43321622 43321602 Y NA NA NA NA NA NA UBR1 74689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 43361299 43361456 43361377 Y TP53BP1 UBR1 NA NA NA NA UBR1 34855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 43511253 43511414 43511298 Y CCNDBP1,EPB42 CCNDBP1 NA NA NA NA CCNDBP1 35937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 43757406 43757566 43757505 Y NA TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA TP53BP1 43360 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 44869897 44870156 44869963 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 42642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN NA NA NA NA NA SPATA5L1 55940 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 45938532 45938945 45938638 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 17186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 48011445 48011769 48011637 Y NA NA NA NA NA NA MYEF2 456945 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 48436189 48436527 48436248 Y SLC24A5 MYEF2 NA NA NA NA MYEF2 32187 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 50366687 50367005 50366873 Y GABPB1,ATP8B4 NA NA NA NA NA GABPB1-AS1 278520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 51172834 51173079 51172965 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25790 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 51868984 51870333 51869210 Y NA DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 42697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 52330351 52330361 52330356 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2184D3.1 55131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 52349753 52350120 52349937 Y NA CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 35372 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 52709691 52709954 52709774 Y NA NA NA NA NA NA MYO5A 109293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 55574844 55574949 55574897 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 34209 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 55581016 55581448 55581368 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 27710 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 56029665 56029817 56029741 Y NA PRTG NA NA NA NA PRTG 3471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 56201661 56201754 56201731 Y NEDD4 NA NA NA NA NA NEDD4 82190 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 56419675 56420043 56419859 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 113440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 56965853 56966086 56966042 Y NA NA NA NA NA NA MNS1 210518 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 59194300 59194605 59194559 Y NA RNF111,SLTM NA NA NA NA SLTM 29247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 59461586 59461962 59461756 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 66309 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 59469975 59470287 59470131 Y NA NA NA NA NA NA CCNB2 74698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 60883059 60884017 60883872 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 113682 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 61406057 61406438 61406248 Y NA NA NA NA NA NA RORA 113080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 61505182 61505193 61505186 Y RORA RORA NA NA NA NA RORA 14325 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 61520020 61520614 61520340 Y RORA RORA NA NA NA NA RORA 502 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 62130295 62130308 62130301 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 220364 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 62411576 62411892 62411783 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 60904 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 62896766 62896914 62896838 Y NA NA TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 216041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 63034731 63035286 63034964 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 208086 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 63142999 63143362 63143082 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 100010 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 63368396 63368491 63368444 Y NA TPM1,LACTB NA NA NA NA TPM1 35565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 63432131 63432432 63432186 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 15788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 37654 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 65176143 65176677 65176391 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 PLEKHO2,ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 25424 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 65589242 65589632 65589437 Y NA RNU5A-1,PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 1324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 65841762 65842141 65841952 Y PARP16 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 21006 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 67436996 67437215 67437119 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 82895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 86574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 56252 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 67867550 67867820 67867663 Y NA MAP2K5 NA NA NA NA MAP2K5 34503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 68176779 68177152 68176934 Y NA NA PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 167365 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 68238127 68238678 68238396 Y NA NA PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 105839 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 68633174 68633565 68633502 Y NA NA NA NA NA NA FEM1B 65033 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 68644845 68645256 68644912 Y PIAS1 NA NA NA NA NA FEM1B 76704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 68657439 68657730 68657635 Y NA NA NA NA NA NA ITGA11 64771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 69047234 69047604 69047293 Y NA NA ITGA11,CORO2B,MIR4312,ANP32A,MIR548H4 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32A 63632 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 70766954 70767165 70766993 Y TLE3 NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 286767 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 71144876 71145062 71144944 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 71176892 71177111 71177002 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA THAP10 6013 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 71677897 71678187 71678028 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 494773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 71840441 71840454 71840446 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 564145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 72265573 72265641 72265607 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 138958 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 HEXA NA NA NA NA HEXA 49382 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 72666496 72666825 72666661 Y NA RP11-106M3.1 NA NA NA NA HEXA 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 74221354 74221537 74221415 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 5024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 74226590 74227025 74226821 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 10260 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 74332904 74333192 74333031 Y NA STOML1,PML NA NA NA NA PML 47890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 74343707 74344076 74343754 Y NA NA NA NA NA NA PML 58693 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 74346326 74346621 74346416 Y NA NA NA NA NA NA PML 61312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA PML 127979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 74801015 74801389 74801202 Y NA UBL7,ARID3B NA NA NA NA ARID3B 30129 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 74902698 74903096 74902987 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 13857 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr15 75162332 75162702 75162478 Y MAN2C1,SEMA7A,SEMA7A,ARID3B,CLK3,CSK,PPCDC,C15orf39,SCAMP2 ULK3,SCAMP2,MPI NA NA NA NA SCAMP2 1004 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 76639629 76639850 76639740 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12564 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 77710600 77710857 77710802 Y NA PEAK1 NA NA NA NA HMG20A 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 78356048 78356390 78356219 Y NA TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 11676 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 78364826 78365348 78365071 Y DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 2718 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 79316775 79317175 79316975 Y RASGRF1 NA NA NA NA NA CTSH 76859 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 79669806 79669918 79669862 Y NA NA MTHFS,ST20-MTHFS,C15orf37,KIAA1024,ZFAND6 IMR90 Hi-C 24141950 TMED3 68402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 80126746 80127013 80126880 Y NA NA NA NA NA NA MTHFS 60708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 80164886 80165472 80165199 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS,MTHFS,MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA MTHFS 22249 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 80772387 80772765 80772517 Y ARNT2,KIAA1199 NA NA NA NA NA KIAA1199 296919 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 81197356 81197718 81197537 Y NA NA NA NA NA NA MESDC2 82501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 82374943 82375242 82374985 Y NA MEX3B MEX3B,EFTUD1 IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 38461 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 83329401 83329783 83329629 Y AP3B2,CPEB1,CPEB1 CPEB1,RP11-752G15.4,AP3B2 NA NA NA NA CPEB1 13789 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 83761220 83761490 83761347 Y TM6SF1 BTBD1,TM6SF1 BTBD1,MIR4515 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM6SF1 12669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 83817881 83818018 83817954 Y NA TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 43722 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16749 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 85566958 85567254 85567106 Y NA PDE8A NA NA NA NA PDE8A 45287 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 86131454 86131632 86131493 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 204629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 86192682 86192944 86192801 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 143317 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 86337060 86337529 86337372 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 89014009 89014390 89014200 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 5325 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 89183173 89183667 89183329 Y ABHD2,ISG20 AEN NA NA NA NA AEN 20646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2 NA NA NA NA ABHD2 35945 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 90402022 90402269 90402146 Y NA AP3S2 NA NA NA NA AP3S2 33305 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 90708840 90709227 90709106 Y NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 7004 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 90951105 90951410 90951208 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21655 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 90957340 90957730 90957416 Y FES,ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 91191799 91192162 91191976 Y UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1 NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 66210 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 91417545 91417844 91417693 Y NA MAN2A2 NA NA NA NA MAN2A2 25604 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 92486330 92486707 92486433 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 91405 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 92664917 92665299 92665108 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P5 161772 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 92674353 92674494 92674375 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 152577 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 93573195 93573591 93573395 Y RGMA NA NA NA NA NA CHD2 148669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 94815502 94815543 94815523 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 42735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 95029258 95029308 95029272 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 256491 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 96377158 96377292 96377225 Y NA NA NR2F2,LOC400456 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 489875 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 96872860 96873000 96872921 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 4270 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 15452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 96898438 96898666 96898552 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 29848 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 97129304 97129480 97129390 Y NA NA NR2F2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NR2F2-AS1 260714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 97404920 97405127 97405024 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2-AS1 536330 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 99403545 99404056 99403701 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 213345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 99499686 99499980 99499831 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 136440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 99661093 99661479 99661184 Y NA SYNM NA NA NA NA SYNM 24673 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 99864304 99864757 99864539 Y NA NA NA NA NA NA HSP90B2P 68467 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr15 100243855 100244145 100244036 Y NA LYSMD4 NA NA NA NA LYSMD4 27621 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 101462538 101462736 101462613 Y NA ALDH1A3,LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 5118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 101499118 101499600 101499493 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 41698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 101739961 101740273 101740216 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 49864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 101745424 101745566 101745486 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 44571 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr15 101805289 101805580 101805451 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 15152 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 101807515 101807673 101807594 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 17378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr15 101818299 101818511 101818407 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 14976 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 374933 375274 375175 Y RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 25399 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA TBC1D24 4456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 2955389 2955781 2955669 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA FLYWCH1 4157 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA CLDN9 6232 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 3309129 3309539 3309316 Y MMP25,NAT15,NAT15,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV ZNF200,MEFV,ZNF263,ZNF75A,TIGD7 NA NA NA NA ZNF263 2204 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr16 4010667 4011135 4010934 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 81940 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4063476 4063638 4063556 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 100548 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4420946 4421237 4421026 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 1097 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4436121 4436376 4436295 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 16272 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4451383 4451509 4451446 Y UBN1,UBN1,MGRN1,GLYR1,CORO7 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 22197 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4460708 4460927 4460812 Y CORO7 VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 12779 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4582537 4582680 4582608 Y NA NMRAL1 HMOX2,NMRAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NMRAL1 38773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 4944877 4945061 4944987 Y HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 49534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPL 15012 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 6557505 6557853 6557679 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1411696 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 6887273 6887583 6887429 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 1741464 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 8015278 8015380 8015329 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 698160 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 9162231 9162510 9162397 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 20995 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 9171086 9171431 9171335 Y C16orf72,USP7 C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 12074 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 9221431 9221974 9221622 Y USP7,C16orf72 C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 37926 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 10965393 10965955 10965450 Y NA NA NA NA NA NA DEXI 68362 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 11633611 11633797 11633714 Y NA NA NA NA NA NA LITAF 94440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 11644813 11645143 11645061 Y NA NA NA NA NA NA LITAF 83094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 11718451 11719196 11718665 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN CLEC16A,TXNDC11,PRM2,PRM1,LITAF,SNN,BCAR4,ZC3H7A IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 9041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 11776552 11776999 11776845 Y SOCS1,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN NA NA NA NA SNN 16282 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 12761788 12762198 12762001 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 133676 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 15769690 15769796 15769712 Y NA KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 34566 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 16070854 16071189 16071093 Y NDE1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 29420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 19714468 19714843 19714656 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 10935 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 19893504 19893863 19893602 Y NA GPRC5B NA NA NA NA GPRC5B 1626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 20729381 20729771 20729568 Y LYRM1,DCUN1D3 THUMPD1 NA NA NA NA THUMPD1 21635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 20915885 20916169 20915941 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 6179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 22202219 22202462 22202295 Y NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 22203475 22203890 22203761 Y POLR3E EEF2K UQCRC2,POLR3E,EEF2K,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 11713 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr16 23455511 23455803 23455657 Y SCNN1G COG7 NA NA NA NA COG7 6698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 23463654 23463771 23463713 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 1153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 28186234 28186473 28186328 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 34768 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS NA NA NA NA FUS 34049 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 33948799 33949141 33948910 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2065720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 34956727 34956933 34956830 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3073648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 46780849 46781142 46780994 Y MYLK3 NA NA NA NA NA ORC6 59294 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 46920520 46920743 46920636 Y NA GPT2 NA NA NA NA GPT2 4230 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 47324349 47324747 47324746 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 148441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 47765433 47765682 47765558 Y NA NA ITFG1,ABCC12,NETO2,ABCC11,DNAJA2,PHKB IMR90 Hi-C 24141950 ITFG1 269373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr16 51186928 51187269 51186986 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 3650 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 51670868 51671078 51670973 Y NA HNRNPA1P48 NA NA NA NA HNRNPA1P48 6589 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 53865846 53866045 53865946 Y NA NA NA NA NA NA FTO 129971 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 56314617 56314966 56314752 Y MT3,MT1M,GNAO1,BBS2 NA NA NA NA NA GNAO1 91315 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 56813469 56813757 56813613 Y NA NA MIR138-2 IMR90 Hi-C 24141950 NUP93 51452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 57674508 57674887 57674647 Y PLLP,CX3CL1,GPR56 GPR56 NA NA NA NA GPR56 31944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 57701111 57701632 57701437 Y FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97 NA NA NA NA NA GPR56 58547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr16 58159860 58159971 58159905 Y C16orf80 C16orf80 NA NA NA NA C16orf80 1383 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 64377838 64377886 64377853 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 780129 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 66558803 66559094 66558929 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 25353 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 66988106 66988414 66988274 Y NA RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA CES3 4726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 66993598 66994056 66993790 Y NA RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA CES3 458 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr16 68433458 68433594 68433558 Y NA NA NA NA NA NA PRMT7 90581 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 68779434 68779559 68779497 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-36P 212016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 69761641 69762033 69761837 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 2787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 5.82219822941643 chr16 70060239 70060493 70060397 Y EXOSC6,WWP2 PDXDC2P NA NA NA NA PDXDC2P 37355 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 70712649 70712861 70712739 Y NA MTSS1L NA NA NA NA MTSS1L 5108 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 70749058 70749400 70749223 Y NA MTSS1L MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 31089 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 71046758 71046771 71046763 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 213694 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 71070712 71070940 71070844 Y NA NA NA NA NA NA HYDIN 191685 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.98360931486387 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA HYDIN 190450 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 71731364 71731710 71731537 Y NA PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 24894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 73084736 73084892 73084798 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 6705 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 74672577 74672957 74672890 Y NA GLG1,RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 25822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 75286788 75287025 75286897 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 12926 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 75604496 75604511 75604504 Y NA TMEM231,GABARAPL2 NA NA NA NA GABARAPL2 6247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 78876925 78876962 78876944 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 745615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 79623380 79623748 79623651 Y NA MAF NA NA NA NA MAF 8863 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 80786602 80786755 80786668 Y DYNLRB2,C16orf46 NA NA NA NA NA CENPN 251348 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 80971971 80972227 80972105 Y CENPN NA NA NA NA NA CENPN 65876 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 81246705 81246958 81246860 Y BCMO1 NA NA NA NA NA GAN 99599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 81436864 81437191 81437044 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 39584 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 81785976 81786155 81786044 Y PLCG2,CMIP,CMIP PLCG2 ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 15274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 82216767 82216895 82216823 Y MPHOSPH6 MPHOSPH6 NA NA NA NA MPHOSPH6 14936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 82687139 82687406 82687299 Y NA NA HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 485308 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH6 487226 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 83347246 83347320 83347283 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 492128 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 83480656 83480733 83480694 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 358715 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 83715826 83716249 83715944 Y HSBP1 NA NA NA NA NA HSBP1 123199 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 83777004 83777385 83777194 Y HSDL1 NA NA NA NA NA HSBP1 62063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 84631160 84631348 84631297 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 18335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 84631583 84631836 84631712 Y ZDHHC7,KIAA0513,KLHL36,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 17847 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 84674948 84675055 84674964 Y KLHL36 COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 5076 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 84784930 84785133 84785062 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53346 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 84785578 84785829 84785712 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 84862837 84863219 84863017 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 11247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr16 84869763 84870234 84870125 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 18173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 85020713 85021068 85020917 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 22073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 86775121 86775409 86775225 Y NA NA FOXC2,FOXL1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 176264 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 386553 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 87359959 87360279 87360119 Y NA NA NA NA NA NA MAP1LC3B 55322 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 87878915 87879213 87879066 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 21881 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 88365536 88366092 88365805 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 151633 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 89241276 89241597 89241419 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA CDH15 5101 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 89468980 89469266 89469225 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 85703 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr16 89893816 89894170 89893993 Y SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 11229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 576455 576740 576580 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 17668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 594616 594984 594846 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27973 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 597415 597783 597745 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 25174 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 851603 851932 851829 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 29078 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 1014015 1014933 1014151 Y PITPNA,CRK,ABR NA NA NA NA NA ABR 115382 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 1092117 1092552 1092272 Y SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK ABR NA NA NA NA ABR 37763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 1101374 1101675 1101481 Y SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK ABR YWHAE,ABR,BHLHA9,TUSC5,CRK,PITPNA,LOC100306951,INPP5K,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 28640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 1157102 1157245 1157179 Y NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 26787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 1358484 1358816 1358590 Y NA CRK,MYO1C NA NA NA NA CRK 5640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 1773985 1774184 1774050 Y SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,WDR81,WDR81,SMYD4 RPA1,SMYD4,AC016292.3 NA NA NA NA AC016292.3 14245 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 2078039 2078451 2078156 Y TSR1,HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA SRR 126226 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 2084621 2084734 2084671 Y NA NA NA NA NA NA SRR 119943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 2198811 2198924 2198868 Y NA SRR,SMG6,SGSM2,TSR1 NA NA NA NA SRR 5753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 2307434 2307709 2307574 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 5022 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 2307798 2307958 2307865 Y PAFAH1B1 MNT NA NA NA NA MNT 5386 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 2751152 2751369 2751257 Y PAFAH1B1,RAP1GAP2 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 256648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 3986731 3986836 3986770 Y NA NA NA NA NA NA ZZEF1 57478 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4065011 4065373 4065306 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4107837 4108131 4108049 Y NA NA NA NA NA NA ANKFY1 57143 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4561785 4562090 4561947 Y NA PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2 NA NA NA NA PELP1 43542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4617083 4617473 4617191 Y NA PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16 NA NA NA NA ARRB2 5299 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4737531 4737755 4737558 Y PLD2,MINK1 PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 2848 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4812526 4812616 4812571 Y SMTNL2,ZNF232,KIF1C RNF167,SLC25A11,PFN1 NA NA NA NA RNF167 28687 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 4839784 4839936 4839857 Y C17orf107 RNF167,SLC25A11,PFN1,SPAG7,CAMTA2 NA NA NA NA RNF167 1367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,KIF1C,ZFP3 NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 6541812 6541912 6541862 Y NA TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100 NA NA NA NA TXNDC17 166 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 6790647 6790875 6790776 Y SLC16A11,DLG4,DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 122793 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 6822767 6822872 6822855 Y NA NA NA NA NA NA AC027763.2 90796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 6829288 6829561 6829425 Y SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1 NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 AC027763.2 84107 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 6829755 6829811 6829784 Y NA NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 AC027763.2 83857 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 6842907 6843154 6843090 Y NA NA ALOX12,LOC100506713 K562 ChIA-PET 22265404 AC027763.2 70514 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 6897797 6898308 6898020 Y NA AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13 NA NA NA NA AC027763.2 15360 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 7456067 7456382 7456285 Y ACAP1,WRAP53,CD68,CD68,TNFSF12 TNFSF12,TNFSF12-TNFSF13,SENP3,EIF4A1,SNORD10,CD68,MPDU1,AC113189.5 NA NA NA NA TNFSF12-TNFSF13 5651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 7784207 7784538 7784352 Y POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA CHD3 1586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 8532647 8532776 8532657 Y KRBA2 MYH10 NA NA NA NA MYH10 568 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 8958048 8958250 8958149 Y NA NTN1 NA NA NA NA NTN1 35189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 9741106 9741641 9741382 Y NA GLP2R RCVRN,GAS7 IMR90 Hi-C 24141950 GLP2R 17583 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 9772002 9772101 9772006 Y NA GLP2R NA NA NA NA GLP2R 48479 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 10053386 10053763 10053585 Y NA NA NA NA NA NA RPS27AP1 106316 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 10581804 10582199 10582113 Y MYH4 SCO1,TMEM220 NA NA NA NA SCO1 17493 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 9924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 15363919 15364293 15364237 Y NA NA NA NA NA NA SNORA74 111040 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 15368147 15368483 15368202 Y NA NA NA NA NA NA SNORA74 106850 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 15925215 15925448 15925362 Y ZNF286A,NCOR1 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24184 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL NA NA NA NA NA UBB 73385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA NA NA NA NA NA UBB 92407 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV NA NA NA NA NA UBB 93610 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 17163211 17163219 17163215 Y NA FLCN,COPS3,NT5M NA NA NA NA COPS3 19388 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 17397062 17397447 17397255 Y NA MED9,RASD1 NA NA NA NA RASD1 262 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 17439265 17439511 17439439 Y NA RASD1 NA NA NA NA RASD1 41556 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 17862888 17863023 17862956 Y NA TOM1L2 NA NA NA NA TOM1L2 10713 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 17874756 17875050 17874778 Y NA TOM1L2 NA NA NA NA TOM1L2 1020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 18032331 18032623 18032472 Y TOM1L2,MYO15A DRG2 NA NA NA NA DRG2 43131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 18153652 18153819 18153756 Y NA LLGL1,FLII NA NA NA NA FLII 6411 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ALDH3A2 106941 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 19664052 19664492 19664204 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ULK2 104757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 20012372 20012672 20012482 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 101715 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22,AC087393.1 NA NA NA NA USP22 908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 AC087393.1,DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 21188812 21189500 21189174 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 2828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA KCNJ12 NA NA NA NA KCNJ12 36757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.98360931486387 chr17 25672386 25672687 25672621 Y NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53284 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 25680204 25680481 25680340 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61102 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 25707009 25707412 25707348 Y NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 KSR1 74258 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 25805507 25805777 25805623 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 23837 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 25981784 25982180 25981982 Y NA LGALS9 NA NA NA NA LGALS9 26960 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 26216019 26216352 26216295 Y NA NA NA NA NA NA NLK 150411 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 26368091 26368384 26368254 Y NA NLK NA NA NA NA NLK 1328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 26552347 26552427 26552387 Y NA NA NA NA NA NA TMEM97 91694 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27264479 27264617 27264556 Y UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12 FLOT2,DHRS13,PIPOX,PHF12 NA NA NA NA PIPOX 10914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27273335 27273648 27273499 Y PHF12 DHRS13,PIPOX,PHF12 NA NA NA NA PIPOX 1883 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27473466 27473709 27473569 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 31721 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27568035 27568215 27568131 Y NA NA NA NA NA NA NUFIP2 50921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27582372 27582571 27582447 Y NA NUFIP2 NA NA NA NA NUFIP2 36565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27703475 27703981 27703860 Y TIAF1,MYO18A,GIT1,TAOK1 TAOK1,MIR4523 MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAOK1 11501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 27890961 27891203 27891032 Y SSH2,ABHD15 ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA TP53I13 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 28210608 28210734 28210655 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 44560 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 42098 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 229790 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr17 29920789 29921150 29921018 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 273887 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 30726822 30727202 30727012 Y NA PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 42077 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 31159026 31159151 31159124 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 347389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 31989736 31990099 31989896 Y ACCN1 NA NA NA NA NA CCL2 590205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 32049616 32049940 32049779 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 530364 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 32343858 32343943 32343901 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 236361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 32546346 32546705 32546474 Y NA CCL2 CCL2,CCL8,CCL13 IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 33599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 32909121 32909330 32909224 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 328817 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 33391990 33392005 33391998 Y NA RFFL NA NA NA NA RFFL 22333 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15,CCL5 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 34203240 34203349 34203295 Y NA CCL5 NA NA NA NA CCL5 2448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 36032703 36032990 36032855 Y NA DDX52 NA NA NA NA DDX52 31210 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 38095307 38095463 38095385 Y NA ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 13453 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 38231838 38232188 38231911 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 16370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 38464298 38464708 38464402 Y MSL1,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 854 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 38477236 38480096 38479169 Y IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 13792 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA NA NA NA NA NA KRT16 65631 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 39802138 39802335 39802276 Y NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT17 23044 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 40517094 40517456 40517393 Y NA STAT3 NA NA NA NA STAT3 21130 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 40628029 40628344 40628111 Y NA ATP6V0A1 NA NA NA NA ATP6V0A1 19167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 41017672 41017950 41017805 Y NA PSME3,BECN1,AOC2,AOC3 NA NA NA NA AOC3 16471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 47342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 41421158 41421352 41421255 Y NA NA NBR1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4D 52975 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 41500242 41500532 41500387 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 25915 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 56868 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 41938335 41938478 41938412 Y MPP2,LSM12,C17orf105,MPP3,CD300LG MPP3,MPP2 NA NA NA NA MPP3 29797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr17 42617265 42617502 42617370 Y NA GPATCH8,FZD2 NA NA NA NA FZD2 15423 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,ADAM11 NA NA NA NA DBF4B 14005 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 43034960 43035346 43035098 Y ADAM11,HIGD1B,DCAKD,ACBD4,GFAP KIF18B,C1QL1 KIF18B IMR90 Hi-C 24141950 C1QL1 8093 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 43230123 43230516 43230320 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 5551 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 43993191 43993527 43993444 Y STH,MAPT MAPT NA NA NA NA MAPT 23443 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr17 44850644 44850747 44850696 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 53111 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 TBX21 NA NA NA NA TBX21 29822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 46034209 46034446 46034327 Y NA AC003665.1,PNPO,CDK5RAP3 NA NA NA NA CDK5RAP3 8730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 46642274 46642589 46642562 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 12884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 46644443 46644754 46644601 Y HOXB9,HOXB8,HOXB6 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 10719 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 46647653 46647800 46647722 Y HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 7673 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 46654606 46654947 46654902 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 526 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB6 24 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 46708678 46709096 46708978 Y NA HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,RP11-357H14.17 HOXB8,HOXB9 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB7 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA ZNF652 167326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 48251038 48251269 48251124 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 25047 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA COL1A1 20876 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 48281415 48281783 48281599 Y NA COL1A1 SGCA,HILS1 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 4422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 50234090 50234252 50234171 Y CA10,CA10,CA10 NA NA NA NA NA UTP18 898201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 55952714 55953105 55953007 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 27297 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 56012688 56013140 56012704 Y NA CUEDC1 VEZF1,SRSF1,CUEDC1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 17544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 56020686 56021039 56020762 Y NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 9645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 56410599 56410851 56410735 Y RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR142 2730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 MIR142 NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 57046055 57046358 57046140 Y SEPT4 NA NA NA NA NA AC099850.1 135601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57518143 57518390 57518285 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1,SMG8,CLTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-13P 94470 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57698412 57698732 57698592 Y YPEL2,RNFT1,VMP1 CLTC NA NA NA NA CLTC 3193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA MIR21 54572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 12441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 58169287 58169683 58169398 Y RNFT1 HEATR6 HEATR6,LOC645638 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR6 14995 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA TBX2 261797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 60973132 60973339 60973182 Y TLK2 NA NA NA NA NA MRC2 270370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 61127299 61127625 61127462 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 424537 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 61243701 61244044 61243838 Y NA NA NA NA NA NA DCAF7 381778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 61299362 61299669 61299468 Y MAP3K3 NA MIR548W,DCAF7,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 DCAF7 326153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 61352706 61353153 61352892 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 DCAF7 272669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 61779769 61779866 61779823 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 3237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 62093758 62094015 62093997 Y NA C17orf72,ICAM2 NA NA NA NA ICAM2 1979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 62134316 62134543 62134430 Y MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1 ICAM2 NA NA NA NA ICAM2 38322 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 62409604 62410133 62409977 Y ICAM2,ERN1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 62586168 62586194 62586181 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 69992 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 63035715 63036037 63035950 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 14920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 63179961 63180187 63180056 Y NA RGS9 NA NA NA NA RGS9 48412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 508381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 63654769 63655153 63655091 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 523220 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 63747410 63747660 63747535 Y CEP112,CEP112,AXIN2 NA NA NA NA NA CEP112 438542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 64646348 64646488 64646431 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 312538 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 71286924 71287020 71286972 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 19294 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 71336325 71336719 71336454 Y NA CDC42EP4 CDC42EP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42EP4 30011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 72532761 72533135 72532770 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300LD,CD300C NA NA NA NA NA GPRC5C 113771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 72775758 72775904 72775844 Y CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LF SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 5136 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 73007152 73007476 73007237 Y RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 387 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19 NA NA NA NA SLC25A19 21247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 73312070 73312303 73312159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MIF4GD,SLC25A19 NA NA NA NA SLC25A19 28479 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3 NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 74337022 74337338 74337180 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 33327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.67717782910511 chr17 74359249 74359572 74359412 Y RHBDF2,SPHK1,SPHK1 SPHK1,PRPSAP1 PRPSAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPHK1 11093 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 74692944 74693312 74693210 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 11786 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 74704169 74704303 74704279 Y CYGB,PRCD MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 74752987 74753327 74752991 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA SRSF2 21531 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 303838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 307111 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75417194 75417582 75417357 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 336396 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75451587 75451956 75451821 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 370789 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75504499 75504824 75504660 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-80P 409356 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 4.90290377214015 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 76438570 76439399 76439026 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 NA NA NA NA NA PGS1 65849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 76635563 76635793 76635778 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA DNAH17,CYTH1 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 140586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 76643240 76643420 76643373 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA DNAH17,CYTH1 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 132959 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 76775899 76776536 76776049 Y USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 77803693 77803802 77803748 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 7426 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 77916401 77916581 77916489 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 91066 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 78102448 78102482 78102466 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 16500 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr17 78228476 78228940 78228764 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 3725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 37315 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr17 80066063 80066430 80066275 Y GCGR,DCXR DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 11855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80068190 80068440 80068326 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 13982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80158664 80158910 80158860 Y DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 FASN K562 ChIA-PET 22265404 CCDC57 9796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80239829 80239997 80239937 Y NA CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 10222 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80292742 80293207 80293087 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA NA CSNK1D 63135 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80592968 80593241 80593234 Y NA NA NA NA NA NA RAB40B 61363 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 80817363 80817528 80817446 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF NA NA NA NA NA TBCD 109423 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 81057799 81057924 81057864 Y METRNL METRNL NA NA NA NA METRNL 22232 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 NA NA NA NA NA C18orf56 55016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 813044 813594 813404 Y YES1 YES1 NA NA NA NA YES1 2497 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 2549022 2549121 2549072 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 20387 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 2641738 2642012 2641797 Y METTL4,EMILIN2,SMCHD1 SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 11725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 2658254 2658560 2658346 Y METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1 SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 4517 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 2845344 2845539 2845389 Y EMILIN2 EMILIN2 NA NA NA NA EMILIN2 316 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 3251422 3251674 3251471 Y MYOM1 MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 3509218 3509430 3509419 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 99612 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 3582686 3583234 3582964 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 173080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 3610673 3610894 3610785 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 201067 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 3650005 3650381 3650193 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 240399 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 4328751 4329143 4328947 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 919145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 7958203 7958469 7958242 Y NA NA NA NA NA NA PTPRM 393423 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 9129786 9129925 9129855 Y PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4301 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 9548277 9548390 9548335 Y ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1 NA NA NA NA NA PPP4R1 64848 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 9613164 9613539 9613352 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 9829152 9829470 9829321 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 82529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 10133595 10133911 10133753 Y NA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 221596 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 12330841 12331244 12331045 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 25173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 12336380 12336603 12336512 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 30712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 12641281 12641332 12641311 Y SPIRE1,SPIRE1,PSMG2 SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA SPIRE1 14801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 12837862 12838421 12838235 Y PTPN2 NA NA NA NA NA PTPN2 89221 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 12839100 12839985 12839163 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 87657 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 12880036 12880906 12880743 Y NA PTPN2 NA NA NA NA PTPN2 46736 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 13375364 13375636 13375393 Y RNMT,PTPN2,CEP192 NA NA NA NA NA RNMT 349023 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 19971591 19971926 19971755 Y NA NA NA NA NA NA GATA6 224187 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 20913960 20914007 20913982 Y NA NA NA NA NA NA TMEM241 101918 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 21336252 21336608 21336275 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD29 95403 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 22859742 22859981 22859862 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 70173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 22876042 22876109 22876076 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 54045 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 22929287 22929693 22929350 Y NA ZNF521 NA NA NA NA ZNF521 461 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 24120849 24120961 24120907 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 114404 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 476201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 32291109 32291369 32291156 Y MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 219855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 32684186 32684352 32684206 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 129294 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 35024297 35024529 35024426 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 617139 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 37629293 37629563 37629339 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 715654 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 42295257 42295574 42295401 Y SETBP1,SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 37119 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 42556167 42556181 42556174 Y NA NA NA NA NA NA SETBP1 298029 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 42864917 42865132 42865025 Y NA NA NA NA NA NA SIGLEC15 538345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 43297098 43297112 43297106 Y SLC14A2 NA NA NA NA NA SIGLEC15 106365 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA NA NA NA NA NA SIGLEC15 95857 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 43351602 43351892 43351629 Y SLC14A1 NA NA NA NA NA SIGLEC15 51585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 43360528 43360755 43360642 Y NA SIGLEC15 SIGLEC15,SLC14A1,EPG5 IMR90 Hi-C 24141950 SIGLEC15 42722 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 44392877 44393138 44393020 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 102317 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 44394118 44394485 44394384 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 100970 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 44605074 44605239 44605157 Y NA NA NA NA NA NA HDHD2 69652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 45454827 45455289 45455128 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 226 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 46074456 46074621 46074556 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 11039 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr18 46354445 46354549 46354497 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 291028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 46404939 46405048 46404994 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 341522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 46451209 46451517 46451363 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 387792 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 46455103 46455621 46455353 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 391686 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 397724 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 NA SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTIF 438763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 46557935 46558394 46558106 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 427323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 47252630 47252839 47252704 Y LIPG NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 85491 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 47325286 47325511 47325399 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 12819 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 47357197 47357543 47357370 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 18867 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 47785953 47786324 47786143 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 4568 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 47794579 47794725 47794639 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 3687 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 54439234 54439547 54439439 Y WDR7 NA NA NA NA NA TXNL1 122403 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 55105190 55105288 55105239 Y ST8SIA3,ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 4273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 55864213 55864707 55864433 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 154614 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 56161690 56161866 56161857 Y MALT1 NA NA NA NA NA ALPK2 132323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 56188177 56188434 56188359 Y MALT1 NA NA NA NA NA ALPK2 105755 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA ALPK2 100588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr18 56194097 56194141 56194127 Y NEDD4L,MALT1 NA NA NA NA NA ALPK2 100048 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 56199819 56200128 56199981 Y MALT1 NA NA NA NA NA ALPK2 94061 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 56206749 56207237 56207038 Y MALT1 NA NA NA NA NA ALPK2 86952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 56320590 56320820 56320652 Y MALT1 ALPK2,MALT1 ALPK2,MALT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALT1 15798 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 56631378 56631745 56631564 Y NA NA NA NA NA NA ZNF532 103546 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 59400195 59400366 59400256 Y KIAA1468 NA NA NA NA NA RPL30P14 329757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr18 60822545 60823046 60822712 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 162315 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 60827980 60828589 60828438 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 156772 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 60901936 60902433 60902315 Y VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 82928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 60966877 60967061 60966974 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 18300 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 66759442 66759620 66759531 Y NA NA NA NA NA NA DOK6 306671 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 67442113 67442512 67442133 Y NA NA NA NA NA NA DOK6 375822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 67616100 67616494 67616353 Y CD226 NA NA NA NA NA RTTN 254687 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 68001159 68001386 68001197 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 47022 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 68157445 68157550 68157476 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 203308 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 71819121 71819367 71819268 Y C18orf55 TIMM21 NA NA NA NA TIMM21 5375 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 72706567 72706772 72706660 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 212531 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 74556264 74556608 74556436 Y NA ZNF236 NA NA NA NA ZNF236 23701 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 74808374 74808713 74808562 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 275811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr18 77153646 77154504 77153944 Y ATP9B,NFATC1,NFATC1 NA NA NA NA NA CTDP1 283297 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr18 77483337 77483442 77483373 Y KCNG2 CTDP1 NA NA NA NA CTDP1 45536 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,GZMM,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 4137 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.0643148575876 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD NA NA NA NA MIR3187 12073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 980601 980803 980725 Y NA WDR18,RNU6-2,CNN2 NA NA NA NA WDR18 371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1016614 1016952 1016783 Y C19orf6 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA RNU6-2 2569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 1101850 1102062 1101942 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 HMHA1,POLR2E NA NA NA NA GPX4 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1207906 1208235 1208159 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA STK11 20500 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 1909763 1910077 1909925 Y KLF16 KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA ADAT3 6386 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 2051815 2052053 2051955 Y NA BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 2572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 2599036 2599584 2599134 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 101123 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 3450938 3451227 3451079 Y GNA15 DOHH NA NA NA NA DOHH 47711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 3603116 3603307 3603197 Y GIPC3,TBXA2R HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA TBXA2R 1531 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 4567148 4567365 4567215 Y TICAM1,SEMA6B PLIN5 NA NA NA NA PLIN5 33912 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 4970760 4971027 4970931 Y NA KDM4B NA NA NA NA KDM4B 3635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 5585977 5586132 5586057 Y NA SAFB,SAFB2 NA NA NA NA SAFB 34914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 5953003 5953253 5953208 Y SAFB2,FUT5 CAPS,RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 22900 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr19 6579838 6580006 6579922 Y NA CD70 NA NA NA NA CD70 22108 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 6668609 6668941 6668849 Y DENND1C,ZNF557,VAV1,GPR108,EMR1,TNFSF14 NA NA NA NA NA C3 59632 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 6708735 6709024 6708902 Y C3 C3,GPR108,TRIP10 NA NA NA NA C3 19549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 7483723 7483869 7483787 Y NA ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 25724 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 7714356 7714558 7714452 Y NA XAB2,STXBP2,C19orf59,TRAPPC5 NA NA NA NA STXBP2 14589 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 8051436 8051456 8051449 Y NA TIMM44,ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 17087 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 9402141 9402360 9402251 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 30088 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 9748883 9749171 9749027 Y OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 18808 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 OLFM2 NA NA NA NA OLFM2 11008 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 10215832 10216068 10215900 Y S1PR5,S1PR5,ANGPTL6 C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,EIF3G NA NA NA NA PPAN 867 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 10989126 10989500 10989238 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 8937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 11248443 11248964 11248826 Y NA SPC24 NA NA NA NA SPC24 15520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 11375157 11375492 11375297 Y DOCK6 DOCK6 TSPAN16 MCF7 ChIA-PET 22265404 DOCK6 4000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3 NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr19 13123653 13124120 13123822 Y WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 19231 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13153458 13153528 13153499 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 49036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA NA NA NA NA NA TRMT1 59023 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13231642 13232105 13231971 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 4725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13232387 13232613 13232547 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 5470 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 37361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 14315596 14315828 14315635 Y NA LPHN1 NA NA NA NA LPHN1 597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 15666666 15666804 15666739 Y NA NA NA NA NA NA WIZ 107904 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 16704980 16705245 16705094 Y KLF2,MED26 SLC35E1,MED26 NA NA NA NA SLC35E1 23787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 17190539 17191239 17190954 Y HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 5948 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 17236053 17237400 17237360 Y MED26,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 51462 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 17307223 17307519 17307336 Y MYO9B USE1,OCEL1,NR2F6 NA NA NA NA USE1 16636 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 17961350 17961505 17961471 Y FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3 RPL18A PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL18A 7180 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 18504645 18504988 18504829 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,UBA52,ELL,LRRC25 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 21104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 19192588 19193136 19192878 Y NA SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SLC25A42 19780 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 19571175 19572073 19571752 Y ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 52472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,ZNF90,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 21497472 21497811 21497647 Y ZNF430,ZNF429,ZNF100,ZNF708,ZNF493 ZNF708,ZNF738 NA NA NA NA ZNF708 12416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 22715195 22715609 22715437 Y NA ZNF98 NA NA NA NA ZNF98 1908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 28171356 28171363 28171360 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1531085 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 28208615 28209033 28208726 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1493415 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 28218670 28219232 28218933 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1483216 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 28225401 28225557 28225460 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1476891 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 28241688 28242434 28242171 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1460014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 28242746 28243185 28242855 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1459263 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 28248561 28250861 28250165 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1451587 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 28274249 28275061 28274473 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1427387 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 28463343 28463461 28463402 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1238987 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA URI1 959334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 31586649 31586851 31586836 Y NA NA ZNF507,TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 URI1 1174098 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 34398114 34398257 34398186 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 113276 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 34874880 34875495 34875019 Y NA GPI,PDCD2L,UBA2 NA NA NA NA PDCD2L 17794 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 IGFLR1 37792 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 36376938 36377077 36377046 Y NA APLP1,NFKBID,HCST,LRFN3 NA NA NA NA NFKBID 14128 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 36757480 36757645 36757542 Y NA ZNF565 ZNF146 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF565 22321 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 37894729 37894877 37894831 Y NA ZNF527 NA NA NA NA ZNF527 34766 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 37923813 37923829 37923821 Y NA ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 32658 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 38491114 38491333 38491222 Y PPP1R14A NA NA NA NA NA SIPA1L3 95246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 39152764 39152958 39152839 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 16475 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 39415058 39415337 39415248 Y ZFP36,MAP4K1,HNRNPL,NFKBIB NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2,FBXO17 NA NA NA NA MRPS12 3851 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 39621407 39621638 39621523 Y NA PAK4 NA NA NA NA PAK4 6997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 40459260 40459714 40459573 Y ZNF546,FCGBP CTC-471F3.4,PSMC4 FCGBP IMR90 Hi-C 24141950 CTC-471F3.4 11626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA PRX 5826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 40942693 40943017 40942855 Y NA PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 5595 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 41701582 41701929 41701850 Y CYP2A13,CYP2F1 RPL36P16,AXL NA NA NA NA AXL 21179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 41802534 41802970 41802553 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 11124 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 41814398 41814719 41814610 Y HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2 HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 41849661 41849907 41849784 Y HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 4909 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 42493914 42494230 42494205 Y TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3 RABAC1,ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 5419 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA POU2F2 5462 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 42750338 42750718 42750490 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA GSK3A 5561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 42756723 42757090 42756966 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 219 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 18683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8 NA NA NA NA PRR19 19259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 43267088 43267316 43267247 Y CEACAM1,PSG5 NA NA NA NA NA CEACAM1 203702 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 44124638 44124922 44124781 Y CADM4 XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA ZNF428 2612 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 44165978 44166186 44166121 Y NA ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA PLAUR 6513 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 44773096 44773391 44773244 Y LYPD5,ZNF221,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZFP112,ZNF227,ZNF233,ZNF233,ZNF235 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 33808 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 45195366 45195649 45195556 Y RELB,CLASRP,BCL3 NA NA NA NA NA PVR 50268 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L CKM,KLC3,ERCC2 NA NA NA NA KLC3 9958 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 45987073 45987327 45987197 Y NOVA2,RELB,CLASRP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA PPM1N 2708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 45999277 45999601 45999579 Y NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2 FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA RTN2 958 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 46014236 46014617 46014413 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 6399 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 46398825 46399093 46398978 Y EML2,EML2 SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA MYPOP 4769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 46504246 46504437 46504355 Y EML2,PNMAL2,PNMAL1,NOVA2 CCDC61 NA NA NA NA CCDC61 7907 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 47062362 47062544 47062453 Y NA GAPDHP38,CALM3 NA NA NA NA GAPDHP38 2464 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 47299930 47299995 47299963 Y NA SLC1A5 FKRP,STRN4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A5 10079 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 47610820 47611121 47611012 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3410 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 47689758 47690163 47690151 Y GLTSCR1,BBC3 BBC3 NA NA NA NA BBC3 43860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 48277326 48277623 48277440 Y SLC8A2,PLA2G4C GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80 NA NA NA NA SEPW1 2206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 48564289 48564682 48564441 Y CRX,KCNJ14,CABP5 PLA2G4C NA NA NA NA PLA2G4C 47392 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 48657871 48658185 48658028 Y NA PLA2G4C,LIG1 NA NA NA NA LIG1 13675 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 48903450 48903602 48903513 Y NA TMEM143,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 49486890 49487028 49486959 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 7539 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 49493898 49494273 49494153 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 294 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 49524183 49524468 49524237 Y CGB5 GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 29478 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 51012062 51012382 51012222 Y KLK6,SYT3,SHANK1 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 228 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 51665562 51665592 51665577 Y SIGLEC8,SIGLEC6,CD33 NA NA NA NA NA CTU1 55935 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr19 52323338 52323678 52323420 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 FPR1 NA NA NA NA FPR1 17975 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53635063 53635358 53635174 Y ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347 ZNF160,ZNF415,ZNF347 NA NA NA NA ZNF415 733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53660263 53660559 53660411 Y NA ZNF415,ZNF665 NA NA NA NA ZNF347 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr19 54707641 54707712 54707644 Y NA LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 5031 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 28507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58162762 58163096 58162801 Y NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF211 23001 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58398826 58399093 58399050 Y ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418 ZNF587,ZNF814,ZNF417 NA NA NA NA ZNF814 384 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF814,ZNF417,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135 NA NA NA NA ZNF135 10951 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58784706 58785064 58784920 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 NA NA NA NA ZNF8 3254 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr19 59058033 59058475 59058195 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA TRIM28 4575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 1725652 1725860 1725698 Y NA NA NA NA NA NA TMEM18 1050213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 1735614 1736022 1735851 Y PXDN NA NA NA NA NA TMEM18 1060175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 2105199 2105393 2105246 Y MYT1L NA NA NA NA NA TSSC1 1274260 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 8231020 8231604 8231329 Y NA NA NA NA NA NA ID2 585371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 8597253 8597584 8597383 Y KIDINS220 NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 219391 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 9641378 9641587 9641543 Y NA IAH1 NA NA NA NA IAH1 29591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 10430004 10430228 10430116 Y NA HPCAL1 HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 10787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 10549320 10549595 10549372 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1 NA NA NA NA ODC1 37035 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 10721200 10721506 10721353 Y NA NA NA NA NA NA NOL10 106595 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 12633247 12633315 12633291 Y NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 221700 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 12805628 12805875 12805752 Y NA TRIB2 LPIN1,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 49140 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 15594564 15594826 15594695 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 104628 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 15700375 15700622 15700454 Y DDX1,NBAS NBAS,DDX1 NA NA NA NA NBAS 921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 16122453 16123200 16122898 Y NBAS,MYCN NA NA NA NA NA RP11-120J4.1 114390 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 108459 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 20249984 20250622 20250147 Y TTC32,PUM2 MATN3,LAPTM4A NA NA NA NA LAPTM4A 195 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 21149421 21149424 21149423 Y NA NA NA NA NA NA HS1BP3 300572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 23275216 23275518 23275368 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 330570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 23609943 23610311 23610250 Y KLHL29 KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 3855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 161636 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 25473699 25473887 25473786 Y EFR3B NA NA NA NA NA DNMT3A 89572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 25517596 25517908 25517752 Y DNAJC27,DNMT3A DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 45551 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 25701614 25701880 25701747 Y NA NA NA NA NA NA DNMT3A 138155 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 27073037 27073234 27073155 Y NA DPYSL5 NA NA NA NA DPYSL5 4422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 27557346 27557529 27557503 Y DPYSL5,C2orf16 MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513 NA NA NA NA MPV17 10799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28024813 28024890 28024852 Y IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33 MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 32229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28383730 28384110 28383893 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 229205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28497824 28498240 28497982 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 115075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28498872 28499304 28499073 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 114011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 28544438 28544734 28544586 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 68581 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 121020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 30449373 30449624 30449515 Y YPEL5 LBH,AC104698.1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 2773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 30807812 30808169 30807846 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 139720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 30889265 30889652 30889547 Y NA NA YPEL5,LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 221173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 36790074 36790520 36790216 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 80710 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 37199283 37199286 37199285 Y NA STRN NA NA NA NA STRN 7668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37491311 37491687 37491498 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 34455 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37592833 37593153 37593092 Y NA PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 23116 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37842733 37843439 37843059 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 120172 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37854869 37855107 37855003 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 108504 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37860871 37861279 37860884 Y EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 102332 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37879485 37879782 37879514 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 83829 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 37893644 37893973 37893812 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 69638 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 37995727 37996117 37995888 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 32116 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38265442 38265742 38265584 Y CDC42EP3 NA NA NA NA NA CYP1B1 69302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 38333760 38333892 38333836 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 1152 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38348355 38348465 38348410 Y NA CYP1B1 CYP1B1,FAM82A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYP1B1 13311 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38356620 38356932 38356711 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 21576 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38357189 38357490 38357336 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 22145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38368766 38369153 38368894 Y CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 33722 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 38369402 38369882 38369670 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 34358 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 38372999 38373624 38373225 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 37955 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 38638 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38380770 38381135 38380953 Y CDC42EP3,FAM82A1,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 45726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38384417 38384601 38384509 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 49373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38395987 38396176 38396066 Y CDC42EP3 NA NA NA NA NA RPL7P12 60534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38398414 38398595 38398505 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 58115 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38401547 38402107 38401851 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 54603 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38405386 38405542 38405477 Y CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 51168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38409612 38409978 38409795 Y NA RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 46732 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 38414893 38415136 38415061 Y NA RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 41574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 38418747 38419129 38419037 Y NA RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 37581 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr2 38422036 38422352 38422194 Y FAM82A1,CYP1B1 RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 34358 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 42193606 42193918 42193678 Y PKDCC AC104654.2 C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 AC104654.2 34743 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 42535809 42536204 42535901 Y NA NA COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 COX7A2L 114024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 43650897 43651024 43650952 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 170161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 43672480 43672679 43672609 Y NA NA NA NA NA NA THADA 148506 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 43762812 43762910 43762862 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 58275 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 44577605 44577885 44577745 Y NA PREPL,CAMKMT NA NA NA NA PREPL 9116 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 46525633 46526278 46526263 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 6827 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 46542843 46542999 46542890 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 24037 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 46857387 46857788 46857588 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA PIGF 15129 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 4.29004080062263 chr2 47212823 47213029 47212897 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 45829 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 54861793 54862155 54861956 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 180371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 54971761 54972012 54971777 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 290339 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 55193261 55193511 55193360 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 144246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 61204524 61204872 61204698 Y NA PEX13,PUS10 REL IMR90 Hi-C 24141950 PEX13 37488 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr2 62375163 62375426 62375211 Y B3GNT2 B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 45822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 62386116 62386510 62386313 Y NA B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 34738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 62753696 62753810 62753753 Y NA TMEM17 TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 16667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 63023345 63023597 63023471 Y NA NA NA NA NA NA EHBP1 124359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 63129477 63129780 63129501 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 145412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 65173308 65173867 65173558 Y AFTPH,SERTAD2 SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 39744 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 65849750 65849939 65849914 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 191979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 66652427 66652950 66652646 Y MEIS1 MEIS1 LOC644838 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS1 5634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 68263709 68263719 68263714 Y NA NA NA NA NA NA C1D 72361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR1 102453 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 69241314 69241782 69241454 Y ANTXR1 ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 3004 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 69578985 69578997 69578991 Y NA GFPT1 NA NA NA NA GFPT1 33385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 69851897 69852398 69852223 Y NA ANXA4,AAK1 NA NA NA NA ANXA4 17159 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 70388970 70389092 70389031 Y NA NA NA NA NA NA AC016700.4 61287 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 71679813 71679928 71679869 Y NAGK,ZNF638,DYSF DYSF NA NA NA NA DYSF 961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 72255008 72255182 72255094 Y NA NA DYSF IMR90 Hi-C 24141950 DYSF 576156 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 72804113 72804334 72804239 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 246836 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 74206209 74206465 74206360 Y SLC4A5,MOBKL1B,TET3 AC073046.25,TET3 DGUOK MCF7 ChIA-PET 22265404 AC073046.25 3794 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 74237302 74237493 74237398 Y NA AC073046.25,TET3 DGUOK IMR90 Hi-C 24141950 TET3 9462 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 74722835 74723021 74722928 Y NA INO80B,WBP1,MOGS,MRPL53,TTC31,CCDC142,PCGF1,HTRA2,AUP1 NA NA NA NA PCGF1 10686 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 74968770 74968998 74968973 Y TLX2,HK2 NA HK2,SEMA4F IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4F 89415 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr2 75219008 75219394 75219161 Y NA POLE4 NA NA NA NA POLE4 35389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 75498571 75498680 75498627 Y NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 POLE4 314952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 75834246 75834589 75834429 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 37320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 81709176 81709459 81709306 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1320915 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 81781528 81781694 81781559 Y NA NA NA NA NA NA AC098817.3 1261561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 85242321 85242336 85242334 Y NA KCMF1 NA NA NA NA KCMF1 46105 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 85641965 85642472 85642157 Y TGOLN2,VAMP8,CAPG CAPG NA NA NA NA CAPG 1083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA CAPG NA NA NA NA CAPG 29587 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 86048153 86048345 86048249 Y ATOH8 NA NA NA NA NA ST3GAL5 65792 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 86692253 86692485 86692369 Y NA KDM3A NA NA NA NA KDM3A 26483 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 91786584 91786786 91786661 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 RPIA 2797422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2832276 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 96077364 96077399 96077382 Y NA FAHD2A NA NA NA NA FAHD2A 10895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 97206009 97206227 97206118 Y NA ARID5A NA NA NA NA ARID5A 5529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 98290312 98290690 98290542 Y TMEM131 COX5B,ACTR1B,RNU4-8P NA NA NA NA RNU4-8P 11118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA RNU4-8P 88784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 98598628 98598759 98598694 Y NA TMEM131 NA NA NA NA TMEM131 11629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 99064911 99065194 99064955 Y MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 5594 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 100814245 100814421 100814304 Y NA NA AFF3 IMR90 Hi-C 24141950 CHST10 217697 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 SNORD89,RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 102063368 102063658 102063441 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4 RFX8 CREG2 IMR90 Hi-C 24141950 RFX8 25507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 102238768 102239154 102238913 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4 NA RFX8,MAP4K4,CREG2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 72158 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 102643904 102644218 102643997 Y NA IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 34786 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 102712603 102712733 102712668 Y IL1R1,MAP4K4,MAP4K4 IL1R1 IL1R2,MAP4K4,IL1RL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 33599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 104488984 104489060 104489022 Y NA NA NA NA NA NA TMEM182 1137617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 106364522 106364900 106364611 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 5168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 106417583 106417937 106417755 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 58229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 108841436 108841459 108841449 Y NA NA SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 SULT1C2 61636 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 109789769 109790041 109789880 Y NA SH3RF3 NA NA NA NA SH3RF3 45965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 109821724 109821738 109821731 Y NA NA NA NA NA NA SH3RF3 77920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 110271705 110271931 110271836 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 97852 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 111958967 111959175 111959071 Y BCL2L11 NA BCL2L11 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L11 84012 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 112375521 112375561 112375551 Y NA NA NA NA NA NA ANAPC1 264706 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 112463608 112463919 112463793 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 176348 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 113380153 113380493 113380323 Y IL1A CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 2409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 113573367 113573750 113573559 Y IL1A IL1A NA NA NA NA IL1A 33200 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA PAX8 PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8 47922 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr2 114652011 114652405 114652035 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 6474 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 115177421 115177704 115177562 Y NA NA NA NA NA NA ACTR3 531884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 118578074 118578451 118578195 Y CCDC93,DDX18 DDX18 NA NA NA NA DDX18 7848 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 118738362 118738806 118738651 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 30903 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 120905923 120906046 120905986 Y EPB41L5,EPB41L5 NA NA NA NA NA TMEM185B 72938 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 122132591 122132855 122132729 Y CLASP1 NA NA NA NA NA AC013399.3 67020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 122405703 122406017 122405860 Y NA CLASP1,NIFK-AS1 NA NA NA NA NIFK-AS1 477 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 122479618 122479882 122479768 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 12797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 122660785 122660843 122660814 Y NA NA NA NA NA NA TSN 168106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 127975624 127975823 127975720 Y NA NA NA NA NA NA CYP27C1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 128207199 128207568 128207384 Y NA RNU4-48P NA NA NA NA RNU4-48P 20242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1 NA NA NA NA IWS1 590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA LIMS2,SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 129131715 129132088 129131976 Y NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 57564 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 129381655 129381863 129381711 Y NA NA UGGT1,HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 307504 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA MZT2B 736193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 135054765 135054954 135054860 Y MGAT5 NA NA NA NA NA MGAT5 179211 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 135062328 135062641 135062375 Y NA NA NA NA NA NA MGAT5 186774 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 135701216 135701448 135701313 Y NA CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 26936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 138765071 138765376 138765123 Y NA HNMT NA NA NA NA HNMT 45481 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 139001528 139001738 139001633 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 255530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 140168949 140169074 140169000 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 911578 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr2 141645666 141646020 141645843 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 1987047 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 144488458 144488893 144488487 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 599242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 145202638 145202856 145202713 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 77291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 145459514 145460320 145459781 Y GTDC1,ZEB2 TEX41 NA NA NA NA TEX41 35980 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 149566291 149566547 149566419 Y NA NA NA NA NA NA KIF5C 64272 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 150999673 151000010 150999769 Y NA NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 393515 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 152144821 152144962 152144854 Y RIF1,RIF1,RIF1,NMI RBM43,NMI NA NA NA NA NMI 250 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 153599082 153599296 153599189 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA PRPF40A 26571 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 154442869 154442990 154442930 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 4811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 662369 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 158687871 158687996 158687910 Y ACVR1,ACVR1 ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 42378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 158970320 158970633 158970479 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 239946 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 161078300 161078513 161078433 Y ITGB6 NA RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 161179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 161995122 161995254 161995230 Y TANK,TANK TANK NA NA NA NA TANK 3703 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 166796102 166796135 166796119 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 12218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 169677226 169677236 169677231 Y NA NA NA NA NA NA SPC25 90645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 170219794 170220267 170220091 Y LRP2 NA NA NA NA NA BBS5 113421 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 171679560 171679730 171679653 Y NA NA NA NA NA NA AC007405.6 53937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 171997679 171997950 171997833 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 87874 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 172649817 172649933 172649875 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 107898 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 172961678 172962145 172962061 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 3483 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 174776201 174776462 174776332 Y NA NA NA NA NA NA SP3 51968 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 175519164 175519290 175519227 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 26354 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 175525795 175526184 175525990 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 19460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA H3F3AP4 118037 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD11,HOXD10,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2 NA NA NA NA HOXD10 1222 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr2 178131060 178131559 178131324 Y NA MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 12322 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 183877830 183878146 183878099 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 23440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 187390995 187391341 187391159 Y NA ZC3H15 NA NA NA NA ZC3H15 42112 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 189994721 189995040 189994923 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 47565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 190040885 190041209 190041024 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 1396 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 190075572 190075716 190075672 Y DIRC1 COL5A2 COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 32967 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 12229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 190739727 190739922 190739832 Y NA C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 2413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 191281859 191282262 191281977 Y MFSD6 MFSD6 NA NA NA NA MFSD6 10778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 191724518 191724884 191724701 Y NA GLS GLS,STAT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 18669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 191810388 191810629 191810413 Y GLS AC067945.3 STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC067945.3 45664 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 191825811 191826187 191826065 Y NAB1,GLS,STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 30106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 193718012 193718039 193718028 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 1610101 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 194142383 194142416 194142400 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 2034472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 197327086 197327270 197327178 Y NA NA NA NA NA NA HECW2 129146 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 197686451 197686687 197686569 Y PGAP1,C2orf66 GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 24002 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 197974548 197974560 197974555 Y ANKRD44 NA NA NA NA NA ATP5G2P3 151275 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr2 201238754 201239056 201238905 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 70150 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 201273148 201273356 201273255 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SGOL2 99375 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 201777095 201777270 201777183 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR CLK1,PPIL3,NIF3L1,ORC2 NA NA NA NA NIF3L1 25045 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 201978583 201978718 201978642 Y CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 109 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 202127532 202127774 202127615 Y CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CASP8 CASP8 NA NA NA NA CASP8 31366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 202296875 202297065 202296939 Y ALS2 STRADB,TRAK2 NA NA NA NA TRAK2 17237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA DAZAP2P1 165924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 204373438 204373815 204373626 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 24318 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 204655322 204655465 204655389 Y NA NA RAPH1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 257189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 206439575 206439768 206439663 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 104946 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 206545726 206545923 206545825 Y NA NRP2 NA NA NA NA NRP2 1012 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 206569997 206570271 206570078 Y NA NRP2 NA NA NA NA NRP2 25283 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 207981292 207981447 207981370 Y NA KLF7 NA NA NA NA KLF7 48544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 208251681 208252088 208251871 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 140373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 208259563 208259980 208259919 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 132481 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 208348288 208348659 208348648 Y NA CREB1,AC007879.5 KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 43802 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 208472249 208472458 208472354 Y NA METTL21A NA NA NA NA METTL21A 16194 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 210937153 210937376 210937265 Y NA NA NA NA NA NA RPE 71864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 216135085 216135094 216135090 Y NA ATIC LOC100130451,SPAG16,MREG IMR90 Hi-C 24141950 ATIC 39446 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 216216233 216216482 216216439 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 41693 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 216222811 216223009 216222866 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48271 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 216522690 216522921 216522813 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 223714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 216698635 216698894 216698754 Y NA NA NA NA NA NA MREG 197925 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 217639400 217639563 217639456 Y NA NA DIRC3,TNS1,IGFBP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP5 81152 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr2 218261138 218261287 218261221 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 702890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1,PLCD4 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 221000091 221000153 221000122 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009502.1 452574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX3 334304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.67717782910511 chr2 223155643 223155970 223155818 Y PAX3,CCDC140 PAX3 NA NA NA NA PAX3 5745 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 223462160 223462364 223462326 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 56692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 223776983 223777159 223777060 Y SGPP2 NA NA NA NA NA ACSL3 53331 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 223824867 223825201 223825044 Y NA NA NA NA NA NA KCNE4 89331 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 223922386 223922775 223922580 Y KCNE4 KCNE4 NA NA NA NA KCNE4 7854 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 224333147 224333391 224333244 Y WDFY1 NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 131830 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 224477772 224478078 224477872 Y NA SCG2 AP1S3,KCNE4,SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 12551 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 225307433 225307612 225307516 Y FAM124B NA FAM124B,CUL3,SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 140498 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 225340678 225341017 225340847 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 107093 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 225841174 225841410 225841405 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 63752 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 225878647 225879031 225878803 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 26131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 226858171 226858617 226858345 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 189470 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 226891308 226891496 226891402 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 156591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 226895670 226896158 226895921 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 151929 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 226988054 226988110 226988074 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 59977 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 227015814 227016273 227016071 Y NA AC068138.1 NA NA NA NA AC068138.1 31814 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 227032212 227032233 227032223 Y NA AC068138.1 NA NA NA NA AC068138.1 15854 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 227665142 227665696 227665306 Y IRS1 IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 2667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 228280402 228280578 228280475 Y CCL20,AGFG1 NA C2orf83,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 54290 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 228578021 228578290 228578242 Y NA SLC19A3 NA NA NA NA SLC19A3 2438 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 230015685 230015803 230015793 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 118198 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 231348028 231348161 231348095 Y NA NA NA NA NA NA SP100 69371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 231901045 231901225 231901135 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA C2orf72 840 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 232026724 232026986 232026907 Y NA HTR2B,ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 34274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 232176754 232176953 232176854 Y NA NA NA NA NA NA ARMC9 115494 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 233180259 233180746 233180485 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E2 232016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 233766797 233767190 233766879 Y NA NA NA NA NA NA NGEF 108792 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA NA NA NA NA NA USP40 135151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 235282322 235282425 235282352 Y ARL4C NA NA NA NA NA ARL4C 121272 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 236172421 236172477 236172436 Y NA NA AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 AGAP1 228256 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 236698901 236699175 236699041 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 298168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 236910231 236910384 236910319 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 163706 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA IQCA1 68798 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 238188101 238188190 238188146 Y COPS8,COL6A3 NA COL6A3,MLPH,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 132828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 238188791 238189175 238189021 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 131843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 238223884 238224369 238224058 Y COL6A3 NA NA NA NA NA COL6A3 96649 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 238299841 238300132 238300017 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 COL6A3,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 20886 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr2 238391204 238391436 238391383 Y LRRFIP1,MLPH AC112721.2,MLPH NA NA NA NA MLPH 635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 25097 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 238609405 238609661 238609494 Y MLPH,LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 75186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 20279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 239762168 239762270 239762219 Y NA TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 7495 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 239997480 239997793 239997637 Y NA NA NA NA NA NA TWIST2 242807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 240144176 240144295 240144274 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 176835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 240906119 240906290 240906205 Y NA NA MIR4786 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 56529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 241395144 241395496 241395485 Y NA GPC1 NA NA NA NA GPC1 22056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 242262018 242262304 242262161 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 7542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 242300434 242300614 242300524 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 6776 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr2 242801923 242802843 242802016 Y NA NA NA NA NA NA D2HGDH 129929 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 623492 623974 623709 Y NA TCF15,SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8040 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1097798 1098000 1097899 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 5892 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 NA NA NA NA NA PSMF1 62937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 38535 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 37961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1372355 1372517 1372472 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1398801 1399138 1399021 Y FKBP1A FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 26995 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1800031 1800157 1800132 Y SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 72997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 1873360 1873375 1873370 Y NA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 2648841 2649036 2648938 Y NA NOP56,SNORD110,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7 EBF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-686C3.7 5843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 2812856 2812910 2812883 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA VPS16 6439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 3156363 3156554 3156472 Y EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 17521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 3170247 3170648 3170474 Y NA FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA DDRGK1 12683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 3286864 3286977 3286928 Y NA NA NA NA NA NA SLC4A11 69028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 3961377 3961729 3961667 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 32500 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 4070898 4071147 4070999 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 28480 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 4203123 4203484 4203336 Y NA ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 24237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 4211389 4211638 4211535 Y ADRA1D ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 16083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 4493607 4493844 4493709 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 PRNP 171038 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 5070783 5071219 5071039 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 34053 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 5072801 5072926 5072885 Y NA PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 32346 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 5079708 5080023 5079866 Y NA PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 25249 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 5155364 5155504 5155434 Y NA CDS2 NA NA NA NA CDS2 49932 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 6015657 6015992 6015825 Y NA CRLS1 NA NA NA NA CRLS1 30921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 6032121 6032454 6032230 Y LRRN4 CRLS1 NA NA NA NA CRLS1 47385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 7905442 7905630 7905536 Y HAO1 NA NA NA NA NA TMX4 92846 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 8737014 8737369 8737294 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 310041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 9053538 9053794 9053641 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 6128 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 9089602 9089856 9089687 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 42192 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 9100209 9100421 9100248 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 52799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 9384292 9384675 9384295 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 336882 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 9435541 9435717 9435640 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 388131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 9439217 9439498 9439406 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 391807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 9476940 9477296 9477117 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 429530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 10451023 10451290 10451134 Y NA MKKS NA NA NA NA MKKS 38153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 10455990 10456132 10456072 Y NA MKKS NA NA NA NA MKKS 43120 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 10486121 10486184 10486148 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 73251 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 10651368 10651598 10651475 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 26354 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 11831025 11831188 11831107 Y BTBD3 BTBD3 NA NA NA NA BTBD3 38183 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 13035099 13035480 13035216 Y SPTLC3 SPTLC3 NA NA NA NA SPTLC3 47472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 13221839 13221847 13221843 Y NA NA NA NA NA NA SPTLC3 234212 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 13380021 13380161 13380091 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 237426 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 13434936 13435260 13435184 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 182327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 13734374 13734725 13734663 Y NA ESF1 NA NA NA NA ESF1 28807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 17538189 17538505 17538334 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA BFSP1 9360 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 17591305 17591483 17591343 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 42797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 17830949 17831353 17831268 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110236 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 17876337 17876490 17876431 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD17 65099 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr20 18779270 18779601 18779408 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 212733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 19194656 19195454 19194994 Y NA SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 3366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 19202967 19203160 19203066 Y SLC24A3 SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 11677 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 19293639 19293701 19293669 Y NA NA NA NA NA NA SLC24A3 102349 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 19766218 19766359 19766289 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 29866 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 19783112 19783320 19783290 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 46760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 19796265 19796476 19796342 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 59913 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 19804713 19804972 19804782 Y NA NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 68361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 19837391 19837690 19837414 Y NA NA RIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 101039 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 20391161 20391545 20391351 Y NA NA NA NA NA NA RALGAPA2 299586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 20586775 20587103 20586803 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 104028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 20590950 20591282 20591151 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 99849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 20724152 20724406 20724200 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 33021 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 22558447 22558719 22558568 Y FOXA2,FOXA2 FOXA2 NA NA NA NA FOXA2 5374 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 180073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 23140057 23140426 23140138 Y THBD,CD93,NXT1,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 111679 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 24128672 24128748 24128730 Y NA NA FLJ33581 IMR90 Hi-C 24141950 CST3 511562 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 24137887 24138185 24138103 Y NA NA NA NA NA NA CST3 520777 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 25047846 25048544 25048538 Y NA ACSS1 ACSS1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 10230 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 25267859 25268242 25268026 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 41154 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 25273617 25273934 25273643 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 46912 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 25291624 25291957 25291812 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 64919 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 25838960 25839094 25839045 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 109106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 112354 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 116327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr20 26116339 26116766 26116505 Y NA NA NA NA NA NA MIR663A 113396 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 29650599 29650997 29650932 Y NA FRG1B NA NA NA NA FRG1B 40742 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30111445 30111879 30111615 Y HM13 HM13 NA NA NA NA HM13 11214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30158598 30158945 30158767 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 32141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L1 53816 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30298803 30298834 30298814 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 10958 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 30305141 30305549 30305422 Y PLAGL2,HCK BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 4243 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 31352490 31352753 31352633 Y C20orf203,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 4299 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 32803033 32803441 32803244 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 94167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 6916 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 33907005 33907177 33907091 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36217 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 33907745 33907913 33907842 Y MMP24,GDF5 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36957 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 34379775 34380017 34379908 Y SPAG4,RBM39,PHF20 PHF20 NA NA NA NA PHF20 21879 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 34479476 34479734 34479606 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 5895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr20 35112957 35113192 35113075 Y TGIF2 NA NA NA NA NA MYL9 54695 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35172533 35172668 35172598 Y MYL9 MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2 NA NA NA NA MYL9 4646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35212579 35212832 35212706 Y NA MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA TGIF2 12688 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35213949 35214340 35214145 Y NA MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA TGIF2 14058 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35489284 35489554 35489419 Y NA NA NA NA NA NA SAMHD1 88692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35923453 35923684 35923588 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 7412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 35947612 35947897 35947800 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 23191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 36040566 36040861 36040811 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 36042310 36042952 36042529 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 28984 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 36343336 36343680 36343577 Y MANBAL,SRC,RPRD1B,CTNNBL1 CTNNBL1 NA NA NA NA CTNNBL1 22928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 36618785 36619379 36619133 Y RALGAPB,RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 40491 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 36621379 36621533 36621455 Y NNAT,VSTM2L TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 38337 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 36772576 36772945 36772677 Y RPRD1B,BPI NA NA NA NA NA RPRD1B 112628 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 36780859 36781241 36781066 Y RPRD1B,RALGAPB,BPI NA NA NA NA NA RPRD1B 120911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 37501358 37501511 37501425 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA FAM83D 51444 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 39135119 39135769 39135457 Y MAFB NA NA NA NA NA MAFB 180111 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 39958158 39958419 39958360 Y NA ZHX3,LPIN3,EMILIN3 PLCG1,ZHX3,LPIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPIN3 9141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr20 42545648 42546044 42545953 Y NA TOX2 NA NA NA NA TOX2 4144 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 42648340 42648654 42648497 Y NA NA NA NA NA NA TOX2 106836 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 42698854 42699347 42699086 Y C20orf111 NA NA NA NA NA JPH2 114871 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 42718699 42718853 42718776 Y NA NA NA NA NA NA JPH2 95365 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 42809563 42809791 42809669 Y FITM2,JPH2 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA JPH2 4427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 42828501 42828745 42828623 Y NA JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 8855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 42833040 42833424 42833233 Y C20orf111 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 4176 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43123975 43124199 43124088 Y C20orf111,STK4,ADA,SERINC3 RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG NA NA NA NA TTPAL 21449 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43271158 43271637 43271427 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 7237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43321614 43322020 43321838 Y WISP2,KCNK15 ADA LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADA 42740 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43436178 43436522 43436351 Y NA RIMS4 NA NA NA NA RIMS4 457 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr20 43569969 43570092 43570031 Y RBPJL,TP53TG5,STK4 PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 17035 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43596220 43596403 43596301 Y SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 3105 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43744637 43744818 43744729 Y WFDC5 NA NA NA NA NA PI3 56699 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 43970100 43970351 43970215 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 4713 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 45006307 45006609 45006393 Y PCIF1,ZNF335 SLC35C2 NA NA NA NA SLC35C2 15264 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 45266832 45266970 45266902 Y NA TP53RK NA NA NA NA TP53RK 49448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 45825158 45825275 45825178 Y NA NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 154030 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 45944502 45944683 45944617 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 34622 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 46320177 46320280 46320230 Y SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 93080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 5.51576674365767 chr20 46705616 46705776 46705742 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 292256 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48040275 48040654 48040626 Y NA NA NA NA NA NA SNORD12 145055 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48295598 48295872 48295769 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 32543 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48385312 48385495 48385398 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48598723 48598794 48598730 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 RNF114,SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 1187 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48664895 48665291 48665189 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB NA SNAI1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2V1 65205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48763277 48763795 48763638 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 4379 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48763985 48764114 48764046 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 4060 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48810888 48811172 48811109 Y B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 5512 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48865015 48865181 48865091 Y NA NA PTPN1,CEBPB,FAM65C,MIR645,LOC284751,PARD6B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 59639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48889915 48890435 48890271 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645 IMR90 Hi-C 24141950 CEBPB 84539 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48902426 48902799 48902722 Y CEBPB NA LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 97050 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr20 48938558 48938763 48938674 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 133182 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 49130261 49130753 49130448 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 5370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP ADNP NA NA NA NA ADNP 29532 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 49539044 49539098 49539071 Y NA ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 6860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 49553399 49553600 49553500 Y NA ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 7441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 49947847 49948420 49948354 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 310181 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 50149435 50150104 50149627 Y NFATC2 NA NA NA NA NA ATP9A 233069 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 50272756 50273155 50272761 Y ATP9A NA NA NA NA NA ATP9A 110018 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 50366318 50366439 50366379 Y NA ATP9A NA NA NA NA ATP9A 16734 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr20 50664352 50664405 50664395 Y NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 154442 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 51110040 51110185 51110129 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 291193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 51842749 51842980 51842865 Y TSHZ2 NA NA NA NA NA TSHZ2 255803 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52196593 52196861 52196746 Y TSHZ2,ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27585 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 52213211 52213282 52213247 Y NA ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11164 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52238141 52238435 52238216 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 13695 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52333135 52333286 52333219 Y ZNF217 NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 108689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 52516053 52516507 52516332 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 272005 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 222373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 52718989 52719002 52718996 Y NA NA PFDN4,SULF2,CYP24A1,DOK5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 69510 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 53116440 53116542 53116504 Y DOK5 DOK5 NA NA NA NA DOK5 26304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 55965649 55965902 55965759 Y NA RAE1,MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 1186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 56016094 56016430 56016231 Y NA NA NA NA NA NA RBM38 51631 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 56232830 56233085 56232989 Y NA NA NA NA NA NA PMEPA1 51507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 56291330 56291601 56291401 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 6738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 56983736 56983744 56983737 Y NA VAPB NA NA NA NA VAPB 21558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr20 57236406 57236742 57236622 Y RAB22A,STX16 STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 11916 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 58437773 58438005 58437846 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 75347 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 58677979 58678143 58678083 Y NA NA C20orf197 MCF7 ChIA-PET 22265404 PPP1R3D 164627 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 59601014 59601048 59601031 Y CDH4 NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-429E11.2 727064 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 60735261 60735480 60735370 Y NA LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 18439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 60758632 60758689 60758683 Y GATA5,CABLES2 PSMA7,SS18L1,HRH3 NA NA NA NA HRH3 34634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO4A1 70578 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 61371540 61371927 61371747 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR NA NA NA NA NA OGFR 62260 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 61423534 61423709 61423679 Y NA OGFR LAMA5,SLCO4A1,LOC100127888 MCF7 ChIA-PET 22265404 OGFR 10478 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 61505589 61505880 61505712 Y BHLHE23,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCFL5 14474 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 61514139 61514234 61514187 Y NA TCFL5 NA NA NA NA TCFL5 23024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 61808489 61808992 61808551 Y STMN3,NKAIN4,KCNQ2,EEF1A2,COL20A1,CHRNA4 YTHDF1 NA NA NA NA YTHDF1 36594 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA ZGPAT 22592 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr20 62908248 62908643 62908435 Y NA PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 23154 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr21 11095741 11096142 11095942 Y BAGE2,BAGE BAGE2 NA NA NA NA BAGE2 838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 77534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 11184749 11185145 11184947 Y BAGE2,BAGE NA NA NA NA NA BAGE2 87769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 16435480 16435873 16435862 Y NRIP1 NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 159 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 251820 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 304311 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 18147470 18147769 18147614 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 492381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 19156522 19156877 19156578 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 32826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 25487464 25487861 25487662 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 708016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 26823616 26823948 26823780 Y NA NA NA NA NA NA MIR155HG 108273 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 19836 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr21 27082933 27083032 27082983 Y NA GABPA,ATP5J NA NA NA NA GABPA 21849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 27285950 27286116 27286033 Y APP NA NA NA NA NA ATP5J 179966 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 27298348 27298650 27298452 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 192364 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 27335144 27335525 27335335 Y APP NA NA NA NA NA APP 205921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 28173911 28174139 28174005 Y ADAMTS1 ADAMTS1 ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS1 41589 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 28206130 28206252 28206191 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 9476 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 28207147 28207505 28207325 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 8223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr21 30555048 30555502 30555259 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA U3 4088 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 33999841 34000172 33999850 Y NA C21orf59 NA NA NA NA C21orf59 16665 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 34676580 34676831 34676700 Y OLIG2,OLIG1,IFNAR2,SON,IFNGR2,GART,GART,IL10RB,IFNAR1 IL10RB,IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 17903 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 34746472 34746562 34746528 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 26640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 34818143 34818502 34818323 Y OLIG2,OLIG1 IFNGR2,TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 31816 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 35308653 35309105 35308775 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 22369 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 35750965 35751183 35751074 Y KCNE1 AP000322.53 NA NA NA NA AP000322.53 43081 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 35918941 35919315 35919132 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 66126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 36220749 36221095 36220890 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 235308 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 36326686 36327019 36326981 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 341245 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 37486095 37486219 37486157 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 18991 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr21 38069098 38069172 38069127 Y NA SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 261 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 38346647 38347014 38346835 Y NA AP000704.5,HLCS NA NA NA NA AP000704.5 9835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 38500086 38500176 38500125 Y NA NA NA NA NA NA TTC3 56560 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 39649239 39650359 39649644 Y KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15 NA NA NA NA NA ETS2 524872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 40690087 40690386 40690238 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 1099 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 MIR3197,BACE2 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 44355985 44356328 44356154 Y NA PKNOX1 U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 PKNOX1 36292 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 44727003 44727328 44727122 Y RRP1,HSF2BP NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 117680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 15770 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 72994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 45065485 45065706 45065596 Y NA HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA HSF2BP 11668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 45426552 45426831 45426638 Y NA TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 3369 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 45558236 45558599 45558477 Y PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 6749 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 45580983 45581335 45581160 Y NA C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 29496 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 45592447 45593398 45592771 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 PWP2,ICOSLG IMR90 Hi-C 24141950 C21orf33 40960 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 45614142 45614593 45614385 Y NA ICOSLG AIRE,PFKL,ICOSLG,C21orf33,PWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ICOSLG 44256 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 46470710 46471152 46470922 Y NA LINC00162,ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 20616 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 46496242 46496452 46496442 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 4474 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr21 47167832 47168236 47167895 Y NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 106224 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 47238270 47238607 47238438 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 161044 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 47411286 47411466 47411356 Y NA COL6A1 NA NA NA NA COL6A1 11635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr21 47512247 47512670 47512489 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 3341 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 47543656 47544056 47543951 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 27645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 38874 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr21 47993556 47993894 47993723 Y DIP2A,S100B,PRMT2 NA NA NA NA NA PRMT2 59185 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr21 48003626 48004009 48003657 Y S100B,PRMT2 PRMT2 NA NA NA NA PRMT2 49070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 17202718 17203118 17202890 Y IL17RA,CECR1 NA NA NA NA NA IL17RA 360726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 17715051 17715201 17715110 Y GAB4,CECR5,CECR1 AC005300.5 NA NA NA NA AC005300.5 43225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 18551113 18551402 18551354 Y NA MICAL3,PEX26 BID,MICAL3,FLJ41941,PEX26 IMR90 Hi-C 24141950 PEX26 7287 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr22 19866426 19867011 19866578 Y ZDHHC8,DGCR6L,COMT C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 5801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 19869401 19869687 19869604 Y NA C22orf29,GNB1L,AC000078.5 NA NA NA NA AC000078.5 3125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 1702 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 20142939 20143182 20143142 Y NA RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA ZDHHC8 27960 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 20287043 20287283 20287165 Y NA XXbac-B444P24.10,DGCR6L NA NA NA NA XXbac-B444P24.10 1760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 20772547 20772776 20772578 Y PI4KA ZNF74,SCARF2 NA NA NA NA SCARF2 17370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 21131289 21131349 21131319 Y NA NA NA NA NA NA SNAP29 79922 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr22 22187099 22187411 22187395 Y PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 32559 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 22290676 22291029 22290778 Y MAPK1,PPM1F PPM1F,TOP3B NA NA NA NA PPM1F 14180 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 22861017 22861374 22861318 Y ZNF280B ZNF280B,ZNF280A,PRAME NA NA NA NA ZNF280B 131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 24795656 24796304 24795694 Y NA ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 15543 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 25349333 25349980 25349695 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 54152 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 27109967 27110337 27110138 Y NA CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 43237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 254091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 28261904 28262359 28262203 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 51005 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 29132423 29132599 29132510 Y NA HSCB,CHEK2,CCDC117 NA NA NA NA HSCB 3420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 29471077 29471334 29471238 Y KREMEN1 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 4011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 29548778 29549084 29549009 Y XBP1,KREMEN1 NA NA NA NA NA KREMEN1 81712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 30279863 30280214 30279898 Y NA ASCC2,MTMR3 NA NA NA NA MTMR3 2719 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 30440424 30440670 30440589 Y MTMR3,OSM,CCDC157 NA NA NA NA NA MTMR3 163280 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 30801557 30801812 30801706 Y OSM,CCDC157,SF3A1 SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA SEC14L2 10711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2 64094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 31639418 31639541 31639442 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 32027602 32027834 32027718 Y NA PISD NA NA NA NA PISD 28584 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 32983251 32983414 32983333 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 114588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 33202022 33202333 33202121 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 6335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 33238776 33239102 33239072 Y SYN3,SYN3 TIMP3,Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 15318 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 33243745 33243918 33243862 Y NA TIMP3,Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 10502 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 11263 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 130325 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 36748222 36748386 36748297 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 33677 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 36762359 36762844 36762518 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 19219 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 17637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 37624836 37624960 37624904 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,RAC2 NA NA NA NA RAC2 13528 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 38069633 38069980 38069807 Y RAC2,CYTH4,GGA1,SH3BP1 PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP NA NA NA NA LGALS1 18 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 38143248 38143734 38143618 Y LGALS1,TRIOBP,POLR2F NA NA NA NA NA TRIOBP 52237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 38599886 38600218 38600032 Y NA MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 39253318 39253463 39253391 Y KCNJ4,LOC646851 NPTXR,CBX6 NA NA NA NA CBX6 12856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 39462955 39463374 39463017 Y NA APOBEC3F,APOBEC3G NA NA NA NA APOBEC3G 28031 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 39695935 39696099 39695991 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 18295 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 39704707 39705214 39704970 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 9180 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 40451411 40451463 40451437 Y NA TNRC6B,RPL7P52 NA NA NA NA TNRC6B 12590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 41294862 41295130 41294948 Y NA ST13,XPNPEP3 NA NA NA NA XPNPEP3 43781 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr22 42485778 42486189 42485966 Y CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32 NAGA,NDUFA6,OLA1P1 NA NA NA NA NDUFA6 819 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 42696005 42696062 42696030 Y SEPT3,NFAM1 NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 OLA1P1 193048 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 43602706 43602942 43602824 Y NA TTLL12 NA NA NA NA TTLL12 21567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 45553376 45553664 45553597 Y NA NUP50 NA NA NA NA NUP50 4058 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 46008367 46008678 46008581 Y NA NA NA NA NA NA ATXN10 57000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 46393370 46393721 46393470 Y C22orf26 WNT7B C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT7B 22361 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763 NA NA NA NA C22orf26 16916 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763 NA NA NA NA MIR4763 26182 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 46770539 46770639 46770589 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 45767 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 46934347 46934575 46934459 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3280 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 47128172 47128501 47128260 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 3657 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr22 48146543 48146838 48146641 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 121120 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 49765184 49765573 49765231 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 283617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 50738042 50738272 50738161 Y NA MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 5784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 50743436 50743850 50743726 Y PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B NA NA NA NA CTA-384D8.31 4415 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 313575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA NA NA NA NA NA SETMAR 488335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 4516473 4516898 4516756 Y NA SUMF1,ITPR1-AS1,ITPR1 SUMF1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SUMF1 9508 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 4575529 4575739 4575617 Y NA ITPR1-AS1,ITPR1 NA NA NA NA ITPR1 42497 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 4782381 4782909 4782524 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 144068 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 143282 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 4908577 4908896 4908639 Y BHLHE40 AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 18081 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 49173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 5237403 5237551 5237430 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 10072 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 8502863 8503141 8502998 Y LMCD1 LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 38252 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 8906303 8906783 8906429 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 96674 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 9721492 9721576 9721535 Y IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC MTMR14,BRPF1 NA NA NA NA MTMR14 32375 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 10234749 10235085 10234824 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 30200 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 11237617 11237805 11237677 Y NA NA NA NA NA NA HRH1 60838 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 11336940 11337150 11337065 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 24945 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 11581408 11581480 11581447 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 178740 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 11591830 11592141 11591986 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 168079 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 12395386 12395555 12395486 Y RAF1,PPARG,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 68519 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 12398616 12399008 12398699 Y RAF1,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 71749 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 14451404 14452012 14451691 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 9328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 14470874 14471051 14471018 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 28798 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 14481755 14482066 14481803 Y C3orf19,XPC,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 39679 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 C3orf20 NA NA NA NA C3orf20 509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 15453852 15454017 15453935 Y NA EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 12845 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr3 16352603 16353027 16352777 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 47897 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 16379433 16379643 16379566 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 74727 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 16380469 16380852 16380674 Y DPH3 NA NA NA NA NA OXNAD1 75763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 17505233 17505390 17505312 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA RFTN1 951700 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 17506581 17506846 17506713 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA RFTN1 953048 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 940686 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr3 17661435 17661830 17661633 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 822479 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 17679954 17680161 17680022 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 804148 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 18210791 18210985 18210888 Y TBC1D5,TBC1D5,SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 273324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 18782261 18782430 18782338 Y SATB1 NA NA NA NA NA RAD23BP1 204096 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 19588918 19588928 19588923 Y NA NA NA NA NA NA EFHB 397589 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 19687209 19687217 19687213 Y NA NA NA NA NA NA EFHB 299300 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A,RNU4-85P NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 20205868 20206079 20206039 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 19705 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 23389835 23390198 23389844 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 147324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 24506233 24506581 24506477 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28192 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 24525285 24525656 24525591 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 9117 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 25462479 25462863 25462673 Y NA NA RARB IMR90 Hi-C 24141950 TOP2B 241535 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 26688087 26688474 26688152 Y LRRC3B NA NA NA NA NA NEK10 720477 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 26758769 26758926 26758778 Y LRRC3B NA NA NA NA NA NEK10 650025 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr3 27719100 27719312 27719216 Y NA AC098614.2,EOMES NEK10,SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 42894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 28083836 28084064 28083984 Y EOMES NA NA NA NA NA CMC1 197011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 29106794 29107135 29106965 Y NA NA RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS3 213338 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 29321469 29321877 29321696 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 29412640 29413015 29412700 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 92167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 29660758 29661082 29660950 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 340285 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 29799751 29800074 29799882 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 479278 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 31149741 31150063 31149903 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 422067 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 32823053 32823413 32823146 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 1725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 33089398 33089551 33089467 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE,GLB1 NA NA NA NA SEC13P1 16043 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 36937540 36937792 36937666 Y NA TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 46756 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 37218637 37218971 37218954 Y DCLK3,TRANK1,C3orf35 LRRFIP2 MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 4209 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr3 38227489 38227608 38227524 Y NA MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 22909 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619 NA NA NA NA ENTPD3-AS1 1331 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 41040807 41041115 41040961 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 193213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 42065241 42065265 42065254 Y NA TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 11947 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA TRAK1 167631 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 42514954 42515471 42515310 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5822 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr3 42518371 42518582 42518469 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 9239 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 42531634 42531985 42531932 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 2843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 43431181 43431702 43431413 Y SNRK,ABHD5 NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 93670 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr3 44643970 44644223 44644141 Y ZNF445,ZNF660,ZNF35,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 19590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 44697594 44698203 44697878 Y NA ZNF35,RP11-944L7.4 NA NA NA NA ZNF35 9375 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 44972207 44972481 44972421 Y NA EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA EXOSC7 42252 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA ZDHHC3 20058 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 46834 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA ALS2CL 186566 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 47134411 47134793 47134602 Y SETD2 NA NA NA NA NA SETD2 68664 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 47204029 47204492 47204291 Y NA SETD2 NA NA NA NA SETD2 572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 47420724 47420876 47420775 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 47466111 47466297 47466204 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 45610 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 50170782 50171102 50170830 Y NA RBM5,SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 19376 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 50980831 50981015 50980923 Y NA NA NA NA NA NA MIR4787 270320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 51728520 51728585 51728552 Y NA TEX264 NA NA NA NA TEX264 33811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52009750 52010220 52010093 Y NA RRP9,PARP3,GPR62,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29 NA NA NA NA ABHD14A-ACY1,ACY1 2684 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52081342 52081690 52081545 Y GPR62,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 6876 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52209021 52209264 52209148 Y WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M POC1A,ALDOAP1,ALAS1 POC1A,RPL29,WDR82,DUSP7,ALAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDOAP1 15922 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52287340 52287625 52287477 Y PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA PPM1M 9499 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52652258 52652629 52652403 Y GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1 NA NA NA NA NA GNL3 60543 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 52926819 52927340 52927162 Y PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110 TMEM110-MUSTN1,TMEM110 NA NA NA NA TMEM110-MUSTN1 2238 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 53272912 53273168 53273085 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A TKT NA NA NA NA TKT 14900 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 53897423 53897785 53897604 Y NA IL17RB,ACTR8,SELK NA NA NA NA ACTR8 16444 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 55194265 55194440 55194343 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 327533 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA WNT5A NA NA NA NA WNT5A 4320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 57096152 57096374 57096203 Y ASB14 NA NA NA NA NA RP11-157F20.1 69796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 58038147 58038335 58038213 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 46020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 58192298 58192649 58192549 Y NA ABHD6 NA NA NA NA ABHD6 28584 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 58202964 58203031 58202998 Y KCTD6,DNASE1L3,PXK ABHD6 DNASE1L3,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 ABHD6 18202 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 58469083 58469272 58469182 Y NA KCTD6 NA NA NA NA KCTD6 6569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 59862425 59862641 59862533 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 828615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 60301241 60301550 60301396 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 933583 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 60308394 60308706 60308548 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 926427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 60360991 60361355 60361182 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 873778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 60392594 60392829 60392710 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 842304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 60501466 60501824 60501659 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 733309 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 60695765 60695821 60695814 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 539312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 60804439 60804744 60804592 Y FHIT NA NA NA NA NA FHIT 430389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 61728117 61728514 61728321 Y NA RPL10AP6 NA NA NA NA RPL10AP6 1337 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 62214246 62214436 62214339 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 88212 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 62311824 62311884 62311857 Y NA C3orf14,PTPRG-AS1 NA NA NA NA C3orf14 9176 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 63942094 63942115 63942105 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 65543 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 64136720 64136844 64136782 Y THOC7,PSMD6 NA NA NA NA NA PSMD6 129062 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 65016570 65016819 65016695 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 344894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 69826244 69826723 69826526 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 39658 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 71158778 71158960 71158907 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 472180 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 71293394 71293605 71293527 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 337535 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 72388262 72388804 72388511 Y RYBP NA SHQ1,GXYLT2,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 105265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 72397214 72397486 72397325 Y RYBP NA SHQ1,RYBP,GXYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 96583 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 72536556 72536893 72536709 Y RYBP RYBP PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 42487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 81766105 81766391 81766248 Y NA GBE1 NA NA NA NA GBE1 42921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr3 88211290 88211624 88211397 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 14255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 98528384 98528734 98528634 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 89799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 98528830 98529143 98529110 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 89390 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 98625177 98625421 98625283 Y DCBLD2 DCBLD2 DCBLD2 K562 ChIA-PET 22265404 DCBLD2 6644 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 100912 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 219902 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 99579150 99579217 99579184 Y FILIP1L NA NA NA NA NA COL8A1 223831 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 99646991 99647087 99647049 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 184270 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 99724570 99724720 99724642 Y TBC1D23 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 106637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 100028092 100028475 100028284 Y TBC1D23 NIT2 NA NA NA NA NIT2 23070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 101146332 101146443 101146386 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 83642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 101556101 101556413 101556156 Y SENP7,ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NFKBIZ NA NA NA NA NFKBIZ 11266 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 101598094 101598345 101598104 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 104155776 104156155 104156140 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 927598 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 105416337 105416655 105416542 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 169741 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 105486064 105486421 105486242 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 99975 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 105716646 105717231 105716913 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 130250 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 105722948 105723182 105723045 Y CBLB NA NA NA NA NA CBLB 136552 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 106782352 106782425 106782408 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 175114 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 107564404 107564418 107564411 Y CCDC54 NA NA NA NA NA CD47 243454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 107706134 107706639 107706380 Y NA NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101233 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 107727876 107728085 107727993 Y CD47 NA MYH15,HHLA2 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 79787 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 110688601 110689002 110688903 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 97916 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 111866338 111866609 111866454 Y NA NA NA NA NA NA C3orf52 63156 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 112351265 112351470 112351440 Y NA CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 14907 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 112354601 112355057 112354782 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 11320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 113254837 113255012 113254902 Y NA SPICE1,SIDT1 NA NA NA NA SIDT1 5694 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114078948 114079017 114078985 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 305488 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr3 114119592 114119835 114119768 Y ZBTB20,KIAA1407,ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 346132 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114146274 114146539 114146501 Y ZDHHC23,ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 372814 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114257066 114257260 114257069 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 483606 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114261968 114262342 114261973 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 488508 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114271834 114271933 114271884 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 498374 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114307902 114308314 114307958 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 534442 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114349924 114350199 114350024 Y ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 513919 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 114373701 114374062 114373901 Y ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 490056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 117004639 117004922 117004781 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 261094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 119088312 119088468 119088390 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP31 77092 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 119758013 119758347 119758179 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 52917 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 119866352 119866515 119866428 Y NA NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 54610 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 120065370 120065692 120065535 Y NA LRRC58 NA NA NA NA LRRC58 494 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 120120515 120120873 120120694 Y FSTL1 FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 47227 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 121539764 121539854 121539811 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 12072 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 122151096 122151154 122151125 Y KPNA1 WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 122208819 122209075 122208974 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 22717 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 123351425 123351671 123351446 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 49036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 123355394 123355731 123355464 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 53005 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 123476863 123477567 123477241 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK 123611 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 123756806 123757178 123756992 Y NA NA KALRN,CCDC14 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 78242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 123762181 123762190 123762188 Y NA NA KALRN,ROPN1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 83617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 124419861 124420177 124419915 Y KALRN UMPS NA NA NA NA UMPS 27036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 124564415 124564677 124564502 Y HEG1,ITGB5 NA NA NA NA NA ITGB5 53588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 124708345 124708776 124708566 Y NA NA NA NA NA NA HEG1 64026 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 124773884 124774020 124773942 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 1082 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr3 125231315 125231583 125231558 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 5458 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 127487223 127487760 127487461 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 52291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 127813021 127813267 127813144 Y NA SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 44537 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 128214371 128214730 128214426 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-475N22.4 8316 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 128338287 128338590 128338558 Y RAB7A NA NA NA NA NA RPN1 59328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 128947996 128948470 128948199 Y MBD4,KIAA1257,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43,ISY1,CNBP CNBP KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 47231 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 128967680 128967946 128967799 Y NA NA NA NA NA NA H1FX-AS1 64289 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 129245456 129245718 129245564 Y RHO NA NA NA NA NA PLXND1 77943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 129543558 129543741 129543650 Y MBD4,H1FOO,TMCC1,TMCC1 NA NA NA NA NA TMCC1 66678 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 133132587 133132784 133132642 Y SRPRB,TMEM108 NA NA NA NA NA CDV3 157790 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 133295128 133295300 133295215 Y NA CDV3 NA NA NA NA CDV3 4554 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 133956955 133957302 133957129 Y NA RYK NA NA NA NA RYK 10387 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 15282 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 134051149 134051359 134051254 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 20731 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 134053436 134053779 134053672 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 19624 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 134069780 134070244 134070081 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 3159 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 134262801 134263184 134262890 Y CEP63,CEP63,CEP63 NA NA NA NA NA EPHB1 51459 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 135689254 135689617 135689436 Y MSL2,PPP2R3A PPP2R3A NA NA NA NA PPP2R3A 6739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 135827453 135827844 135827484 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 86239 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 135890782 135891068 135890882 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 23015 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 137990064 137990319 137990141 Y NA NA NA NA NA NA MRAS 74220 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.75788337182884 chr3 139898460 139898757 139898544 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 246433 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 141175186 141175511 141175311 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 28378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 141316631 141317016 141316779 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 112742 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 141659994 141660128 141660061 Y NA NA NA NA NA NA ATP1B3 67028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 142130035 142130079 142130067 Y NA XRN1 NA NA NA NA XRN1 34825 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 142844875 142844897 142844886 Y PAQR9,CHST2 CHST2 NA NA NA NA CHST2 8702 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 143162621 143163181 143162827 Y NA NA NA NA NA NA CHST2 326448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 146224364 146224853 146224698 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 35798 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 146257874 146258309 146258204 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 2342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 146269018 146269189 146269121 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 8367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 146955604 146955955 146955778 Y NA NA NA NA NA NA ZIC1 153254 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr3 147663875 147664087 147663997 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P20 218998 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA NA NA NA NA NA HPS3 97472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 149225388 149225682 149225672 Y RNF13 RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 14941 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 149330317 149330600 149330464 Y WWTR1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 119870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 149666531 149666918 149666689 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 17254 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 149933925 149934322 149934006 Y NA NA PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 167350 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 150453151 150453509 150453478 Y CLRN1 RP11-103G8.2,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2 25755 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 151593609 151593922 151593765 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1 365695 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr3 151996540 151996946 151996646 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 11196 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 152030036 152030551 152030147 Y MBNL1,MBNL1 MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 44692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 152100220 152100544 152100298 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 114876 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 152215203 152215520 152215350 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 229859 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 155316441 155316741 155316588 Y NA NA NA NA NA NA C3orf33 205399 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 155705974 155706059 155706016 Y NA NA NA NA NA NA GMPS 119649 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 156202207 156202259 156202239 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1 NA NA NA NA NA SSR3 68714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 156443600 156443618 156443611 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 53433 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 156757953 156758209 156758081 Y NA NA NA NA NA NA CCNL1 118340 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 156852547 156853124 156852850 Y NA CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 23425 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 158054879 158054980 158054930 Y NA NA NA NA NA NA MLF1 231972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 158070419 158070585 158070503 Y MFSD1 NA NA NA NA NA MLF1 216367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 158431050 158431280 158431158 Y NA MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 16707 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 158827452 158827795 158827624 Y NA NA NA NA NA NA MFSD1 379465 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 159493461 159493761 159493605 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 210776 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 162020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 100432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 164223490 164223778 164223777 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 1329482 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA TERC 1241 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 169941070 169941418 169941334 Y MYNN,MYNN,LRRIQ4,PHC3 PHC3,PRKCI NA NA NA NA PRKCI 2917 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 170430208 170430671 170430337 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 26483 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 170446657 170446914 170446737 Y NA RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 10240 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 170712510 170712744 170712722 Y SLC2A2 NA NA NA NA NA EIF5A2 88028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 171820468 171820770 171820540 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 65050 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 171863188 171863575 171863224 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 107770 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 171903822 171903993 171903901 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 148404 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 172038895 172038985 172038971 Y FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 103894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 172377276 172377377 172377327 Y NA NCEH1 NA NA NA NA NCEH1 49631 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 174949841 174950235 174950187 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-91P 375032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 177472457 177472684 177472465 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 314748 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 178699167 178699475 178699434 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 88592 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 178754661 178754788 178754723 Y KCNMB3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 33279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 178983793 178983839 178983817 Y KCNMB3 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 6732 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 179122098 179122379 179122239 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 44999 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 179550123 179550276 179550202 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 181580 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 184078263 184078665 184078465 Y NA EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H NA NA NA NA POLR2H 757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 184655907 184656134 184656021 Y VPS8 NA NA NA NA NA VPS8 127976 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 185463229 185463551 185463382 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 77293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 186746012 186746360 186746185 Y RTP1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 187004502 187004623 187004526 Y MASP1 NA NA NA NA NA RTP4 79497 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 187948643 187949049 187948891 Y LPP,LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 78798 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 187980692 187981197 187980748 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 110847 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 188012018 188012343 188012183 Y LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 142173 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 188109949 188110178 188110065 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 240104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 188223633 188224028 188223838 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 353788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 188224984 188225450 188225214 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 355139 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 188374364 188374933 188374638 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 504519 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 188535836 188535994 188535916 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 665991 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 188632491 188632766 188632583 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 762646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 189022377 189022942 189022424 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 813811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 192561492 192561800 192561547 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 72150 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 192604773 192605048 192605023 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28902 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 194461690 194461887 194461800 Y FAM43A AC106706.1 NA NA NA NA AC106706.1 37413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 194925332 194925664 194925571 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 64232 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 194981425 194981579 194981527 Y ACAP2 XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 8317 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 179157 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 195919575 195919687 195919655 Y NA NA NA NA NA NA PCYT1A 93141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 196378860 196378951 196378906 Y LRRC33 LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 14214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr3 197840450 197840806 197840557 Y LRCH3,IQCG NA LMLN,ANKRD18DP IMR90 Hi-C 24141950 LMLN 155379 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 765995 766248 766202 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 7389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 872986 873338 873012 Y KIAA1530,PIGG,TMEM175,DGKQ NA NA NA NA NA GAK 50823 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 924714 925388 925028 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK GAK,TMEM175 NA NA NA NA TMEM175 539 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 1535396 1535629 1535516 Y NA RP11-1398P2.1 KIAA1530 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1398P2.1 44351 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 NA NA NA NA NA C4orf48 74577 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 2762487 2762593 2762537 Y SH3BP2 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 6384 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 3390647 3391111 3390815 Y RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 97892 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 4854782 4854915 4854832 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 4478 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 S100P,MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 6989470 6989868 6989678 Y TBC1D14 NA NA NA NA NA TADA2B 51758 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 13250215 13250573 13250395 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 233416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 13439753 13439937 13439845 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 44052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-2 377756 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr4 13981901 13982273 13982087 Y NA NA LOC441009,CPEB2,BOD1L IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-2 437227 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 15074859 15075210 15075035 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 72561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 15485746 15486124 15486037 Y CC2D2A CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 16257 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 17581888 17582305 17582055 Y LAP3,MED28 LAP3,MED28 NA NA NA NA LAP3 5073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 19572039 19572379 19572208 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 115422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 19620943 19621209 19621076 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 164326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 19825132 19825140 19825136 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 368515 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 25808541 25808922 25808732 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L3 54460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 26198985 26199293 26199235 Y RBPJ,RBPJ RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 35908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 26343884 26344230 26344058 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 180807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 26449466 26449471 26449469 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 126588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 28607417 28607640 28607532 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 1747196 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 37074925 37075290 37075112 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 610708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 37956443 37956472 37956456 Y NA PTTG2 NA NA NA NA PTTG2 3584 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 38083648 38084173 38083860 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 123592 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 38821118 38821520 38821242 Y NA TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 34918 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 39048044 39048301 39048173 Y KLF3,TLR1,TLR6 TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 3385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 40057110 40057493 40057154 Y RHOH,N4BP2 N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 664 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 40240312 40240963 40240621 Y RHOH,RBM47 RHOH NA NA NA NA RHOH 49639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 40285709 40286008 40285843 Y RHOH CHRNA9 N4BP2,RHOH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHRNA9 49338 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 40674578 40674731 40674666 Y RBM47 NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NSUN7 75183 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 40674929 40675349 40675137 Y RBM47 NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NSUN7 74565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 40765283 40765623 40765452 Y RBM47 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 15369 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 160138 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 41880927 41881193 41881022 Y PHOX2B NA PHOX2B,LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM33 53944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 47121817 47122010 47121920 Y NA NA NA NA NA NA COMMD8 341726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 52725801 52726193 52725998 Y NA DCUN1D4 NA NA NA NA DCUN1D4 18635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 52873079 52873103 52873091 Y NA SGCB,SPATA18 NA NA NA NA SGCB 29545 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr4 55379564 55379871 55379718 Y NA NA SRD5A3 IMR90 Hi-C 24141950 KIT 142214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 57908977 57909199 57909089 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP7-AS1 64729 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 57947514 57947824 57947684 Y NA IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7-AS1 26104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 66899965 66900079 66900021 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 57765 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA RP11-396M11.1 NA NA NA NA RP11-396M11.1 2746 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr4 68487662 68488005 68487834 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 76892 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 68538149 68538306 68538215 Y NA UBA6,UBA6-AS1 NA NA NA NA UBA6 26591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 74593361 74593798 74593698 Y NA IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 10425 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 74982637 74982975 74982882 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 4746 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 75085679 75085856 75085791 Y NA NA NA NA NA NA EPGN 86334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 75411825 75412170 75412032 Y NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EREG 182965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 77868010 77868840 77868612 Y NA SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 16 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 77974492 77974926 77974738 Y CCNI CCNI NA NA NA NA CCNI 20232 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 78014068 78014466 78014356 Y CCNG2 CCNI SHROOM3,CCNG2 IMR90 Hi-C 24141950 CCNI 18910 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 78096366 78096378 78096373 Y NA CCNG2 NA NA NA NA CCNG2 20062 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 79083838 79083918 79083865 Y NA NA NA NA NA NA RP11-777B9.5 155996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 79253143 79253310 79253148 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 217363 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 79578189 79578564 79578235 Y BMP2K LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 13132 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 81119203 81119473 81119338 Y PRDM8,PRDM8 PRDM8 NA NA NA NA PRDM8 16170 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 83755588 83755973 83755970 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 37578 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 464630 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr4 87048261 87048368 87048363 Y NA NA NA NA NA NA PTPN13 465100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 88038562 88038726 88038648 Y NA NA NA NA NA NA KLHL8 120740 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 88943044 88943294 88943160 Y NA RNU1-36P,PKD2 NA NA NA NA PKD2 16224 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 89185531 89185830 89185781 Y NA ABCG2,PPM1K NA NA NA NA PPM1K 18091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 89726737 89726837 89726787 Y NA NA NA NA NA NA PIGY 285797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 282601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 95542272 95542471 95542377 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM5 171235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 99009822 99009923 99009829 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 170612 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 99344407 99344641 99344524 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 163872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 100861794 100861850 100861822 Y NA LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ NA NA NA NA DNAJB14 4033 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 102113415 102113532 102113437 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 153405 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 103655976 103656198 103656076 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 23953 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 103701783 103702159 103702029 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 21632 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 106188694 106188879 106188779 Y NA NA NA NA NA NA TET2 123662 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 106390941 106391445 106391094 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 1793 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 109513186 109513523 109513472 Y NA RPL34-AS1,RPL34 NA NA NA NA RPL34-AS1 26093 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 111085558 111085919 111085739 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 32436 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 113172339 113172711 113172527 Y NEUROG2 AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA AP1AR 21446 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 114525266 114525292 114525279 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 155791 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr4 119962106 119962357 119962246 Y NA NA NA NA NA NA USP53 169385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3,FABP2 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 120962747 120963053 120963021 Y NA MAD2L1 NA NA NA NA MAD2L1 23176 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 121264355 121264763 121264444 Y NA NA NA NA NA NA MAD2L1 278126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 121561847 121561947 121561897 Y NA NA NA NA NA NA PRDM5 280078 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 121596026 121596271 121596210 Y NA NA NA NA NA NA PRDM5 245754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 123751494 123751575 123751556 Y FGF2 FGF2 NA NA NA NA FGF2 5631 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 124374611 124374810 124374710 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 58661 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 129389693 129389923 129389761 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 181709 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 129834414 129834678 129834574 Y PHF17,SCLT1,C4orf33,C4orf33 NA NA NA NA NA C4orf33 177794 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 134046475 134046584 134046530 Y NA PCDH10 NA NA NA NA PCDH10 21886 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 134077378 134077602 134077486 Y NA PCDH10 NA NA NA NA PCDH10 8908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 139300997 139301320 139301159 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 139494 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 140235316 140235657 140235500 Y ELF2,RAB33B NAA15,NDUFC1 NA NA NA NA NDUFC1 13611 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA SCOC 208255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 141287573 141287758 141287638 Y NA RP11-425I13.1 NA NA NA NA RP11-425I13.1 1558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 143012897 143013276 143013057 Y NA NA NA NA NA NA IL15 457145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 143206374 143206633 143206590 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 559952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 148990734 148991081 148990908 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 339520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 149756405 149756578 149756515 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 1105191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 151264145 151264674 151264371 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 266719 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 152143714 152143771 152143743 Y SH3D19 NA NA NA NA NA SH3D19 101013 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 153265183 153265560 153265526 Y FBXW7 NA NA NA NA NA TIGD4 433356 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 153313306 153313343 153313324 Y NA NA NA NA NA NA TIGD4 385573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 153894415 153894544 153894479 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 38911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 154176673 154176745 154176706 Y NA NA NA NA NA NA MND1 87056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 154354806 154355109 154354963 Y TLR2 KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 30389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr4 157893618 157893834 157893797 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 3072 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr4 164528161 164528292 164528211 Y NAF1,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 442088 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 164583865 164584289 164584179 Y MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 497792 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 164741001 164741233 164741117 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 654928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 169791118 169791499 169791286 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 137927 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 169839395 169839702 169839549 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 89724 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr4 170026437 170026753 170026620 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 97011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 170132939 170133158 170133049 Y SH3RF1 NA NA NA NA NA SH3RF1 57098 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30,SCRG1 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30,SCRG1 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SCRG1 11808 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 174620122 174620295 174620211 Y NA NA NA NA NA NA RANP6 66600 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 174738394 174738663 174738529 Y NA NA NA NA NA NA RANP6 184872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 174945090 174945120 174945105 Y HAND2 NA NA NA NA NA CEP44 257708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 176672960 176673333 176673201 Y NA NA NA NA NA NA WDR17 311652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 178329034 178329328 178329176 Y NA AGA NA NA NA NA AGA 32329 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 180546541 180546896 180546719 Y NA NA NA NA NA NA AGA 2184884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 184042355 184042696 184042526 Y NA WWC2 NA NA NA NA WWC2 23909 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 184910732 184910983 184910894 Y C4orf41,IRF2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 3901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-739P1.2 208523 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 185382837 185383066 185382954 Y NA IRF2 NA NA NA NA IRF2 10668 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 185393561 185393895 185393573 Y ACSL1,CASP3,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 186495067 186495245 186495187 Y NA PDLIM3 NA NA NA NA PDLIM3 40301 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 186594730 186595126 186594900 Y SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SNX25 NA NA NA NA NA PDLIM3 139964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 187648916 187649309 187649113 Y NA FAT1 FAT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAT1 3040 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 187762182 187762435 187762391 Y NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 116306 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr4 188400076 188400296 188400188 Y NA NA NA NA NA NA FAT1 754200 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 190487491 190487755 190487631 Y FRG1 NA NA NA NA NA HSP90AA4P 95372 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 190498601 190498949 190498697 Y FRG1 NA NA NA NA NA HSP90AA4P 106482 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 190691 190901 190821 Y SDHA,LRRC14B CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 25429 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 389983 390379 390026 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 50879 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 557070 557448 557336 Y NA NA SLC9A3,TPPP,CEP72 IMR90 Hi-C 24141950 CEP72 52939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72,TPPP NA NA NA NA TPPP 34933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 112080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 5311411 5311643 5311527 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 107134 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 6.74149268669271 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 10565896 10566253 10566086 Y NA ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 3454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 10626840 10627122 10626983 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD33B 64398 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 10743646 10743952 10743932 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 15432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 11328840 11329134 11329023 Y NA NA NA NA NA NA DAP 569456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 12658501 12658830 12658774 Y NA NA NA NA NA NA CTB-51A17.1 1199617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 14199302 14199513 14199379 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 57491 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 14251046 14251256 14251151 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 109235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 14408020 14408375 14408038 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 171509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 14545472 14545570 14545529 Y NA FAM105A FAM105A,TRIO IMR90 Hi-C 24141950 FAM105A 34314 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 14673178 14673249 14673214 Y NA EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 10405 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 16740893 16741285 16741194 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 125726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 17249327 17249860 17249454 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP133 93865 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 20470673 20471013 20470843 Y NA NA NA NA NA NA RP11-774D14.1 138936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 1100991 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 2037529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 33371815 33372155 33371947 Y NA NA NPR3,LOC340113 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2203K17.1 66570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 33781524 33781664 33781594 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 108633 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 34655418 34655812 34655539 Y NA RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 1076 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 35924372 35924674 35924571 Y NA NA NA NA NA NA IL7R 73575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA NIPBL 154757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 38467529 38467846 38467689 Y NA CTD-2263F21.1 NA NA NA NA CTD-2263F21.1 1088 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 39395044 39395463 39395161 Y NA C9 NA NA NA NA C9 27507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 39399549 39400018 39399831 Y NA C9 NA NA NA NA C9 22952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 39527032 39527237 39527133 Y FYB NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 66630 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 40411118 40411409 40411246 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 40688188 40688473 40688414 Y PRKAA1,PTGER4 PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 10588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 40689630 40689893 40689724 Y NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 12030 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 41826733 41826755 41826744 Y NA OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 41866 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 42465969 42466319 42466144 Y GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR NA NA NA NA NA SEPP1 419175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 43034859 43034967 43034962 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC648987 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC025171.1 4710 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 43099724 43100011 43099805 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 ZNF131,LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2201E18.3 34203 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2201E18.3 40363 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 44875784 44875973 44875831 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 68757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 45570738 45571122 45570930 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 763711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 52715258 52715483 52715372 Y FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 58756 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 53298305 53298413 53298402 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 305999 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 53309437 53310024 53309694 Y ARL15 NA NA NA NA NA ARL15 294388 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 53317506 53317866 53317808 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 286546 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 53848607 53848967 53848787 Y NA SNX18 NA NA NA NA SNX18 37018 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 53998804 53998843 53998825 Y NA NA HSPB3,SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 187215 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 54039991 54040439 54040234 Y SNX18,SNX18 NA SNX18,GPX8,CDC20B IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 228402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 54715918 54716192 54716055 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 108337 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 54741987 54742107 54742028 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 82422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 54817845 54817996 54817921 Y NA RNF138P1,PPAP2A SKIV2L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF138P1 6533 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 54897039 54897427 54897238 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 68161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 55288370 55289209 55288952 Y IL6ST NA NA NA NA NA IL6ST 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 55444591 55444725 55444658 Y NA NA NA NA NA NA IL6ST 155770 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 55461813 55461854 55461833 Y IL6ST NA NA NA NA NA IL6ST 172992 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 55471391 55471677 55471521 Y IL6ST NA NA NA NA NA IL6ST 182570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 55575946 55576115 55576004 Y NA NA MAP3K1,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 222784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 56131312 56131556 56131415 Y GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1 MAP3K1 NA NA NA NA MAP3K1 21911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 56737388 56737596 56737493 Y NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 269613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 58358500 58358548 58358538 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 482452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 58374119 58374354 58374236 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 498071 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 58375824 58376057 58376052 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 499776 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 58400134 58400374 58400226 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 524086 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 58426345 58426806 58426483 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 550297 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 58816932 58817290 58817225 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 940884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 58900988 58901299 58901144 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 914648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 59084884 59085044 59084964 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 730903 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 59630308 59630442 59630415 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 185505 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 59735221 59735571 59735396 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 80376 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 59836852 59837180 59836950 Y ELOVL7 PDE4D NA NA NA NA PDE4D 20905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 60751661 60751965 60751750 Y ZSWIM6 NA NA NA NA NA RPL3P6 65963 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 64062726 64062917 64062822 Y NA SREK1IP1 NA NA NA NA CWC27 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 64328123 64328532 64328278 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA CWC27 265366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 64423186 64423354 64423272 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA CWC27 360429 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 47046 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 65932774 65933082 65932801 Y NA MAST4 NA NA NA NA MAST4 42598 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 66016454 66016847 66016518 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 126278 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4 255574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 67103829 67104163 67104152 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 405385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 68179946 68179956 68179951 Y NA NA NA NA NA NA CTC-498J12.1 157692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 68823946 68824105 68824026 Y NA OCLN NA NA NA NA OCLN 37827 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 71045616 71045849 71045733 Y NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 164501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 71481497 71481884 71481610 Y MAP1B NA NA NA NA NA MAP1B 80436 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 71648982 71649164 71649085 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 34509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 71790679 71790815 71790747 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 176206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 71852331 71852540 71852377 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 237858 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 238239 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 72234221 72234359 72234290 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 15449 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 72512311 72512636 72512493 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 229716 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 72607592 72607820 72607706 Y NA NA FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 134532 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 72792808 72793048 72792966 Y NA BTF3 NA NA NA NA BTF3 575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 72950370 72950710 72950420 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 90859 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 72995047 72995144 72995131 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 135536 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 73926262 73926632 73926507 Y FAM169A HEXB,ENC1 NA NA NA NA HEXB 7216 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 73981736 73982008 73981951 Y HEXB HEXB,ENC1 NA NA NA NA ENC1 46487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 74163639 74163858 74163748 Y NA FAM169A GFM2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM169A 2863 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 74863696 74863807 74863784 Y ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 57733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 75034241 75034569 75034405 Y NA POC5 NA NA NA NA POC5 22928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 76590045 76590451 76590191 Y NA NA NA NA NA NA ZBED3 208897 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 77765293 77765351 77765322 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 110954 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77779546 77779957 77779719 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 125207 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77791213 77791569 77791505 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 136874 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77797282 77797316 77797309 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 142943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 77803150 77803526 77803443 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 148811 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77835986 77836955 77836241 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 181647 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77892981 77893377 77893333 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 170467 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77940704 77941073 77940964 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 122771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 77974245 77974379 77974312 Y NA NA SCAMP1,LHFPL2,ARSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LHFPL2 89465 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 78525358 78525750 78525524 Y NA DMGDH,JMY NA NA NA NA DMGDH 4111 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 78744780 78744887 78744834 Y NA NA NA NA NA NA HOMER1 63153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 78990549 78990790 78990669 Y THBS4,CMYA5 NA NA NA NA NA PAPD4 84606 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 80898051 80898414 80898329 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 147202 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 80927026 80927304 80927299 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 118312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 81465137 81465359 81465307 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA RPS23 107037 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 81676731 81676900 81676816 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 104335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 81701396 81701769 81701673 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 82005927 82005935 82005931 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA XRCC4 365382 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 82356692 82356869 82356781 Y NA XRCC4,TMEM167A NA NA NA NA XRCC4 14448 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 82664194 82664491 82664355 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 100793 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 82769870 82770125 82769934 Y TMEM167A,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 4586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83214867 83215139 83214962 Y HAPLN1 NA NA NA NA NA HAPLN1 199435 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 83219939 83220298 83220055 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 204507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83266909 83267113 83267063 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 251477 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83305524 83305826 83305754 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 290092 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83583813 83583994 83583988 Y EDIL3 NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 94251 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83585889 83586179 83586107 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 92066 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83604677 83605057 83605023 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 73188 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83670446 83670810 83670539 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 7435 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr5 83674189 83674553 83674373 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 3692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 86619927 86620237 86620117 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 58222 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 88030090 88030417 88030349 Y MEF2C,MEF2C LINC00461 NA NA NA NA LINC00461 45232 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C NA NA NA NA MEF2C 26466 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 88171456 88171902 88171752 Y MEF2C,MEF2C MEF2C NA NA NA NA MEF2C 26020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 90167234 90167630 90167420 Y NA NA NA NA NA NA LYSMD3 343833 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 90485915 90486074 90486029 Y ARRDC3 NA GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-90P 78470 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 90579794 90579971 90579883 Y ARRDC3 RNU4-90P,LUCAT1 ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-90P 15250 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 90604425 90604632 90604611 Y NA RNU4-90P,LUCAT1 GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LUCAT1 3587 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 92913655 92914013 92913834 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P27 103360 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 93323557 93323685 93323621 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 121719 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 93697867 93698390 93698151 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 252463 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 94049532 94049756 94049644 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 97223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 94843632 94843977 94843805 Y NA TTC37,ARSK NA NA NA NA TTC37 44734 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95063779 95063897 95063838 Y NA RHOBTB3 NA NA NA NA RHOBTB3 16553 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95113820 95114121 95113969 Y NA GLRX NA NA NA NA GLRX 42588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 95179469 95179934 95179619 Y NA GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 95199166 95199388 95199264 Y GLRX,ELL2 GLRX NA NA NA NA GLRX 42457 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95240158 95240487 95240414 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1 55218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95403711 95404019 95403912 Y ELL2 RP11-254I22.1 ELL2,CAST,MIR583,C5orf27 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-254I22.1 19892 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95406696 95406840 95406768 Y NA RP11-254I22.1 ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 22877 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95414896 95415105 95415065 Y GLRX,ELL2 RP11-254I22.1 NA NA NA NA RP11-254I22.1 31077 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95483654 95483899 95483777 Y NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 99835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95562741 95563074 95562934 Y NA NA ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 178922 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 95571032 95571517 95571164 Y GLRX NA ELL2,RHOBTB3,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 187213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 95873123 95873359 95873236 Y LNPEP,CAST,CAST CAST ELL2,PCSK1,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 14152 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 96022483 96022592 96022538 Y NA NA NA NA NA NA ERAP1 119211 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 96028306 96028536 96028386 Y CAST,CAST NA NA NA NA NA ERAP1 113267 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 96475990 96476170 96476132 Y NA RIOK2 NA NA NA NA RIOK2 40794 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 808618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 107179705 107179785 107179745 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 536014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 108747394 108747617 108747516 Y MAN2A1 PJA2 NA NA NA NA PJA2 3699 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 108791627 108791782 108791705 Y NA PJA2 PJA2 IMR90 Hi-C 24141950 PJA2 47932 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 110924887 110925213 110925050 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 78599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 112218687 112219263 112218745 Y APC SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 23768 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 112242412 112242755 112242610 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA REEP5 13481 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 115719103 115719184 115719144 Y NA NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 177074 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 115721196 115721558 115721420 Y NA NA SEMA6A IMR90 Hi-C 24141950 CTB-118N6.1 174700 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 115860298 115860305 115860302 Y SEMA6A CTB-118N6.1 NA NA NA NA CTB-118N6.1 35953 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 118399353 118399657 118399513 Y NA DMXL1,CTB-161M19.4 DMXL1 K562 ChIA-PET 22265404 CTB-161M19.4 4928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 118678067 118678220 118678144 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 75680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 118701841 118702237 118702039 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 83901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 119476137 119476646 119476408 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 321327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 119848516 119848911 119848640 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 50543 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 120004624 120004640 120004633 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 206651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 121435613 121435728 121435671 Y NA LOX ZNF474,LOC100505841,LOX,SRFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOX 23633 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 125704201 125704675 125704554 Y C5orf48 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 10377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 125779791 125780174 125779834 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 85967 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 125782209 125782552 125782386 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 88385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 129563384 129563648 129563470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-114H7.1 759942 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 130971517 130972046 130971999 Y NA RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 2588 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 130976279 130976499 130976398 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 7350 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 131355679 131355760 131355752 Y RAPGEF6,IRF1 NA ACSL6 K562 ChIA-PET 22265404 FNIP1 224969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 NA NA NA NA NA PDLIM4 160534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 131560740 131561286 131561173 Y IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2 PDLIM4 NA NA NA NA PDLIM4 30078 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 131633963 131634368 131634191 Y IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 4955 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 131641002 131641297 131641050 Y NA PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 11994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 131774835 131775712 131775188 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.5 14429 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 131800033 131800450 131800090 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 6285 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 131833993 131834254 131834119 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 9503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 132001614 132001710 132001656 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 69620 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA AFF4 26161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 133455254 133455613 133455348 Y NA TCF7 NA NA NA NA TCF7 6852 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 133460352 133460406 133460379 Y UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 NA NA NA NA TCF7 11950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 133463735 133464046 133463858 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 15333 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 133470244 133470404 133470305 Y NA TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 21842 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA NA PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 93721 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 134602658 134602833 134602747 Y NA NA H2AFY,LOC340073,CATSPER3 IMR90 Hi-C 24141950 H2AFY 130771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 134791969 134792408 134792068 Y H2AFY NA H2AFY K562 ChIA-PET 22265404 H2AFY 58365 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 135356057 135356513 135356322 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 6071 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 137822279 137822351 137822306 Y NA REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 23100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 137833063 137833252 137833158 Y FAM53C,EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 33884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 137870529 137870619 137870574 Y FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 6370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 138078029 138078389 138078209 Y NA AC034243.1 CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3 IMR90 Hi-C 24141950 AC034243.1 8609 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA AC034243.1 NA NA NA NA AC034243.1 40304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 138248139 138248403 138248239 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 161141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 138262166 138262549 138262196 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 175168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 190951 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 138727034 138727338 138727139 Y LOC389333 SPATA24 NA NA NA NA SPATA24 10439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 139017086 139017541 139017145 Y CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 7343 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 139031397 139032095 139031636 Y C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 6513 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 139629538 139629745 139629587 Y NA NA NA NA NA NA PFDN1 50961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 139975060 139975424 139975289 Y HBEGF,ANKHD1,ZMAT2,IK,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3,CD14,TMCO6,IK,NDUFA2 SRA1,APBB3,HARS,SLC35A4 IMR90 Hi-C 24141950 APBB3 3723 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA NA NA NA NA NA PCDHGC3 56558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 142383259 142383413 142383268 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 235310 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 142974978 142975222 142975128 Y NR3C1,NR3C1 NA ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 161901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 143300463 143300651 143300509 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 247627 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 145166780 145167167 145167131 Y GRXCR2 PRELID2 NA NA NA NA PRELID2 45765 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 145447855 145448292 145447919 Y NA NA NA NA NA NA LARS 111931 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 145499175 145499563 145499369 Y NA NA NA NA NA NA LARS 60660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 146834939 146835189 146835093 Y DPYSL3,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 52430 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 148738164 148738422 148738235 Y PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L,MIR143HG NA NA NA NA PCYOX1L 2594 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 148788188 148788451 148788258 Y NA MIR143HG,MIR143 NA NA NA NA MIR143HG 3936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 148835583 148835880 148835720 Y NA MIR143 NA NA NA NA MIR143 29102 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 149285101 149285395 149285344 Y PDE6A NA NA NA NA NA SLC26A2 52905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 149379132 149379170 149379142 Y NA SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 149445526 149445798 149445671 Y SLC26A2,HMGXB3,CD74,CD74 NA NA NA NA NA TIGD6 66796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 149456060 149456090 149456075 Y NA NA NA NA NA NA TIGD6 77330 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 149522462 149523132 149522666 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 10303 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 149525289 149525473 149525405 Y SYNPO PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 7962 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 149979570 149980059 149979818 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 928 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 149985154 149985492 149985203 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 6512 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 150159490 150160262 150159991 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 22819 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 150161319 150161633 150161505 Y ANXA6,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 24648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 150447679 150448189 150447894 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 GPX3,TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 22949 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 150454717 150454894 150454780 Y NA TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 16244 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 150462985 150463261 150463131 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 7877 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 150474739 150475397 150475230 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 3601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 150938646 150939048 150938843 Y NA FAT2 NA NA NA NA FAT2 7457 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 151078700 151079028 151078874 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 13974 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 151097773 151098033 151097910 Y SPARC SPARC,RP11-54C4.1 SPARC,SLC36A1,ATOX1,G3BP1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 33047 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 151248150 151248319 151248235 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 98057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 153809274 153809597 153809436 Y NA SAP30L NA NA NA NA SAP30L 13920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 154313326 154313392 154313358 Y NA GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA GEMIN5 2377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 157817633 157817942 157817746 Y NA NA EBF1,LOC285626,IL12B IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 533450 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 158380752 158381154 158381061 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B,EBF1 NA NA NA NA NA EBF1 143615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 158385170 158385443 158385354 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 139326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 158448175 158448456 158448348 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 76313 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 158478339 158478495 158478452 Y EBF1 EBF1 NA NA NA NA EBF1 46274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 159402452 159402764 159402629 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 31356 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 159480874 159481257 159481243 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 46754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19947 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 159732256 159732561 159732409 Y NA RP11-34P1.2,CCNJL FABP6 IMR90 Hi-C 24141950 CCNJL 37842 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 159815159 159815328 159815245 Y NA CCNJL,C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA C5orf54 9776 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 162202155 162202531 162202344 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 659801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 559104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 167224919 167225220 167225022 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 491436 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 167243466 167243587 167243564 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 473069 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 167439777 167440090 167439882 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 276566 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 167558741 167558830 167558746 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 157826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 167639977 167640074 167640026 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 76582 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 168460125 168460505 168460446 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 265628 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 169665764 169666018 169665944 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2270F17.1 148479 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 225943 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA TLX3 71942 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 170878093 170878163 170878150 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 65973 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171298269 171298393 171298371 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 133484 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171326428 171326478 171326475 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 105399 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171431879 171432256 171432181 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 2 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171580373 171580774 171580468 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 32616 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171581047 171581366 171581364 Y NA STK10 NA NA NA NA STK10 32024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171606484 171606964 171606720 Y UBTD2,STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 6426 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 171834226 171834319 171834273 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 45208 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 172730964 172731211 172731128 Y NA STC2 NA NA NA NA STC2 23295 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 172901872 172902293 172901982 Y ATP6V0E1 NA LOC285593,STC2,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 139370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 173191567 173191754 173191643 Y CPEB4 NA CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 121529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 173311853 173312083 173311958 Y NA CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 1200 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 173346462 173346760 173346662 Y NA CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 33179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 173390340 173390538 173390358 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 77057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 173391394 173391777 173391587 Y CPEB4 NA NA NA NA NA CPEB4 78111 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 175841367 175841383 175841375 Y NA HIGD2A,NOP16,CLTB,FAF2 NA NA NA NA CLTB 187 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 176337374 176337559 176337468 Y NA NA NA NA NA NA UIMC1 110075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 178034122 178034420 178034258 Y ZNF354B,AGXT2L2,CLK4 COL23A1,CLK4 NA NA NA NA COL23A1 18566 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr5 178069436 178069827 178069736 Y NA CLK4 ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6 IMR90 Hi-C 24141950 CLK4 13820 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 179859627 179859895 179859761 Y NA CTC-573N18.1 NA NA NA NA CTC-573N18.1 6664 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 180600516 180600767 180600667 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 16157 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr5 180672693 180672910 180672808 Y NA TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9 NA NA NA NA GNB2L1 186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 293338 293822 293579 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 3708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA DUSP22 183058 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 2377151 2377429 2377354 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 133169 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 2992078 2992424 2992251 Y NA SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 NA NA NA NA NQO2 5857 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 3052992 3053074 3053033 Y NA HTATSF1P2,RIPK1 MYLK4,WRNIP1,DKFZP686I15217,NQO2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIPK1 9151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 3166310 3166878 3166542 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 10550 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 3904869 3905227 3905048 Y NA NA SLC22A23,FAM50B,BPHL,RIPK1,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 57249 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 4352111 4352211 4352192 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 218280 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 4778036 4778769 4778420 Y CDYL NA NA NA NA NA CDYL 73643 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 4931719 4931926 4931911 Y NA NA NA NA NA NA RPP40 70371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 4990656 4990905 4990781 Y NA RPP40 NA NA NA NA RPP40 11392 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 5246431 5246752 5246693 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA LYRM4 12420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 5266800 5267044 5266922 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 7523 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 343868 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 5724558 5724824 5724692 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 280376 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 5991749 5992069 5991903 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 13131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 5996432 5996750 5996575 Y NA NRN1 NA NA NA NA NRN1 8450 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 6001980 6002334 6002157 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 2866 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 6151506 6151793 6151650 Y F13A1 NA NA NA NA NA NRN1 146306 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 6851413 6851674 6851488 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 254156 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 7137966 7138068 7138020 Y RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 32136 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 7692548 7692711 7692643 Y NA NA PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 SNRNP48 104116 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 TFAP2A 901186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518,GCNT2 NA NA NA NA LINC00518 8419 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 10458287 10458428 10458359 Y NA TFAP2A,LINC00518,GCNT2 NA NA NA NA LINC00518 25180 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 10970926 10971179 10971053 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 71368 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 167522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 11212824 11213214 11213068 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 167367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 11321238 11321480 11321378 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 59101 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 12183004 12183212 12183108 Y HIVEP1,EDN1 NA NA NA NA NA EDN1 105384 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 12273843 12273861 12273852 Y NA EDN1 HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 14735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 12288471 12288892 12288524 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 13630387 13630831 13630754 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 16828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 13651430 13651585 13651505 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 37871 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 13762938 13763200 13763069 Y RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 53142 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 14452907 14453346 14453088 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 337035 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 14735052 14735658 14735282 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 508869 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 15022090 15022421 15022413 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 222106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 15299924 15300312 15299931 Y NA NA NA NA NA NA JARID2 55397 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 15372060 15372197 15372129 Y NA NA NA NA NA NA JARID2 127533 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 15474239 15474654 15474451 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 186635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 15485085 15485275 15485180 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 176014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 15580663 15580900 15580755 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 80389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 15614590 15614742 15614649 Y JARID2,DTNBP1 DTNBP1 NA NA NA NA DTNBP1 46547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16151584 16151748 16151704 Y NA MYLIP NA NA NA NA MYLIP 24228 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 16245085 16245414 16245229 Y NA GMPR NA NA NA NA GMPR 8274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16422379 16422759 16422608 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 185568 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16474193 16474630 16474472 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 237382 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16481404 16481763 16481500 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 244593 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16495109 16495178 16495163 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 258298 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16588159 16588355 16588257 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 171014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16636472 16636800 16636538 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 122569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16652450 16652671 16652543 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 106698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16668776 16668955 16668866 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 90414 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16690265 16690543 16690477 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 68826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16699529 16700051 16699938 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 59318 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 34974 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 17033300 17033417 17033356 Y RBM24 NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 RBM24 246160 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 17715315 17715544 17715493 Y NUP153 NUP153 NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 10659 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 17910535 17910706 17910642 Y RNF144B NA NA NA NA NA KIF13A 75148 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 17925685 17925969 17925835 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 59885 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 18148522 18148811 18148697 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,TPMT,KDM1B NHLRC1 IMR90 Hi-C 24141950 TPMT 4494 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 18308493 18308879 18308567 Y NA DEK RNF144B IMR90 Hi-C 24141950 DEK 45439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 18391380 18391715 18391394 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 24601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 18400891 18401631 18401172 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 34112 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 18419977 18420304 18420012 Y NA NA NA NA NA NA RNF144B 53198 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 18836304 18836461 18836383 Y NA NA NA NA NA NA RNF144B 469525 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 20069175 20069519 20069346 Y NA NA NA NA NA NA MBOAT1 141151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 20642705 20642902 20642804 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 110017 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 20877706 20877968 20877723 Y CDKAL1 NA NA NA NA NA CDKAL1 345018 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 21028713 21029000 21028890 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 496025 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 21946635 21946935 21946785 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 354663 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 22149387 22149566 22149505 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 557415 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 24228927 24229160 24229097 Y NA NA NA NA NA NA MRS2 171993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 24686171 24686408 24686290 Y DCDC2 TDP2,ACOT13,C6orf62 NA NA NA NA ACOT13 20908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 25137169 25137503 25137225 Y C6orf62 CMAHP NA NA NA NA CMAHP 27290 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 25174209 25174610 25174347 Y C6orf62 CMAHP CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 9416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 25178778 25179206 25179010 Y C6orf62 CMAHP CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 13985 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 25352378 25352572 25352400 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 75072 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 25525007 25525226 25525060 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 247701 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 25535758 25535798 25535770 Y HIST1H4B,HIST1H4A,HIST1H3B,HIST1H3A,HIST1H2AB NA NA NA NA NA LRRC16A 258452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr6 26006419 26006453 26006436 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3A 12265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 26219063 26219301 26219164 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH NA NA NA NA HIST1H2AE 3898 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 26462244 26462270 26462257 Y BTN2A1,BTN2A1 BTN2A3P,BTN3A3,BTN2A1 NA NA NA NA BTN2A1 6094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 26474981 26475187 26475084 Y NA BTN3A3,BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 18831 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 27143830 27144149 27143885 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 NA NA NA NA HIST1H2AH 30969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 27205361 27205470 27205416 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 28338 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 27261332 27261668 27261500 Y FKSG83 NA NA NA NA NA ZNF204P 75636 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 27637197 27637397 27637297 Y OR2B6,OR2B2 NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 10.4186705157978 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28280673 28280945 28280934 Y NKAPL PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28299231 28299616 28299424 Y GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1 ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 16075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28302002 28302386 28302196 Y NA ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 13305 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 5674 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28565127 28565440 28565259 Y NA SCAND3 SCAND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCAND3 16549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 128816 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 28715387 28715696 28715451 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 133398 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.37074634334636 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 29568471 29568641 29568556 Y MOG,GABBR1 NA NA NA NA NA HLA-F 119911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr6 30019374 30019509 30019439 Y NA HLA-J,ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA ZNRD1 5167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 36152 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30519269 30519607 30519590 Y NA PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 3056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30604064 30604457 30604261 Y NA MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,C6orf136,DHX16,PPP1R18 NA NA NA NA C6orf136 8359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30754817 30754946 30754888 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 44486 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30755729 30756010 30755821 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 45398 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30785907 30786494 30786279 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 55704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 31240851 31241006 31240942 Y NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B HLA-C,RPL3P2 NA NA NA NA HLA-C 2944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 31529822 31530211 31530167 Y HLA-B,STK19,HSPA1B,TNF,LST1 DDX39B,ATP6V1G2-DDX39B,NFKBIL1,ATP6V1G2,TNF NA NA NA NA TNF 11133 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 31761868 31762215 31762042 Y LY6G5C VARS,LSM2,C6orf48 NA NA NA NA VARS 138 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA C6orf48 10117 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.67717782910511 chr6 31942054 31942322 31942254 Y NA CFB,SKIV2L,STK19 NA NA NA NA STK19 5186 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 32075999 32076179 32076125 Y LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1 NA NA NA NA ATF6B 17851 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 32114130 32114430 32114186 Y GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3 NA NA NA NA PPT2 4788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr6 32787339 32787575 32787566 Y TAP1,PSMB8 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 16982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 32789030 32789171 32789101 Y HSD17B8,PSMB8 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 15386 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 32802290 32802518 32802510 Y NA TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 2039 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 32819276 32819643 32819486 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP1 112 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 32952668 32952702 32952685 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA NA NA NA NA HLA-DMA 17797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA NA NA NA NA HLA-DMA 21166 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 33018722 33018782 33018752 Y HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOA HLA-DPB1,HLA-DPA1 NA NA NA NA HLA-DPB1 22921 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 33159164 33159383 33159309 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 6839 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 33181288 33181504 33181396 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25 NA NA NA NA RING1 7016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 6949 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 33684801 33685193 33684861 Y NA IP6K3 MNF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IP6K3 27569 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 33712309 33712484 33712432 Y IP6K3 IP6K3,LEMD2 NA NA NA NA IP6K3 278 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 33792376 33792455 33792405 Y CUTA,C6orf1 LEMD2 IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD2 37463 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 33818239 33818267 33818253 Y NA NA GRM4,MLN,IP6K3,LINC00336,BAK1,GGNBP1,LEMD2,LOC100507584,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD2 63326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 34631608 34631780 34631736 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 30856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 34663389 34663600 34663462 Y NA C6orf106,RP3-375P9.2 NA NA NA NA C6orf106 753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 34992488 34992843 34992549 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 137446 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35171617 35171779 35171698 Y NA NA TCP11,ANKS1A,ZNF76,SCUBE3,UHRF1BP1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF76 52907 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35182884 35183485 35183160 Y NA ZNF76 NA NA NA NA ZNF76 41201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35201491 35201602 35201547 Y NA ZNF76 NA NA NA NA ZNF76 23084 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35331114 35331538 35331252 Y PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 22779 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35336371 35336758 35336422 Y NA PPARD NA NA NA NA PPARD 28036 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35457906 35458213 35458053 Y TEAD3 FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 4640 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 35561770 35562146 35562007 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 40120 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35595279 35595514 35595405 Y FKBP5,FKBP5 NA NA NA NA NA RP3-340B19.2 73629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 35866676 35867072 35866874 Y NA SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 20047 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 36203078 36203345 36203212 Y CDKN1A,CDKN1A BRPF3,RP1-179N16.6 NA NA NA NA RP1-179N16.6 40096 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 36204828 36205160 36205000 Y BRPF3,SRSF3,PXT1,KCTD20,CDKN1A,CDKN1A BRPF3,RP1-179N16.6 NA NA NA NA RP1-179N16.6 41846 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 36214394 36214548 36214454 Y SRPK1,MAPK14,BRPF3,STK38,PXT1,KCTD20 NA NA NA NA NA RP1-179N16.6 51412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 36404249 36404468 36404378 Y MAPK14,PNPLA1,STK38 KCTD20,PXT1 ETV7 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD20 4076 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA PXT1 591 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 36660058 36660307 36660143 Y FGD2,PXT1,STK38,SRSF3 CDKN1A NA NA NA NA CDKN1A 17753 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CDKN1A 95453 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 37094186 37094408 37094276 Y PPIL1 PIM1 PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 41571 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 37098455 37099411 37099295 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 36568 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 37269905 37270172 37270040 Y C6orf89,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA TMEM217 45974 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 37879889 37880256 37879963 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 94614 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 38122967 38123257 38123161 Y ZFAND3,BTBD9 NA NA NA NA NA ZFAND3 337692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 39886697 39886822 39886760 Y NA MOCS1,RP1-278E11.3 NA NA NA NA MOCS1 13468 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 40358061 40358307 40358251 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 433489 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 41031279 41031297 41031288 Y APOBEC2 NFYA NA NA NA NA NFYA 7387 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 41506487 41506686 41506561 Y NFYA,TREML4,TREM1,TFEB FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 5478 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 41649853 41650127 41649990 Y NA NA NA NA NA NA TFEB 51870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 41907242 41907431 41907365 Y TAF8,TFEB,CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20316 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 41929474 41929675 41929644 Y NA MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 42548 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 42013318 42013860 42013560 Y TFEB,TRERF1,CCND3 CCND3,TAF8 NA NA NA NA CCND3 2235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 42283170 42283354 42283262 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 99567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 42348376 42348588 42348501 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 69201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 42361651 42361664 42361659 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 56125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 42413186 42413554 42413522 Y NA TRERF1 GUCA1B,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 4235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 42982951 42983183 42983012 Y NA PEX6,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2 NA NA NA NA KLHDC3 3000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43073020 43073202 43073194 Y NA MRPL2,PTK7 NA NA NA NA PTK7 31014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43505816 43505905 43505861 Y ABCC10,TJAP1 POLR1C,YIPF3,XPO5,POLH NA NA NA NA YIPF3 23088 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43757757 43757886 43757846 Y NFKBIE,TJAP1 VEGFA NA NA NA NA VEGFA 21836 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43769637 43769823 43769746 Y NFKBIE,TJAP1 VEGFA NA NA NA NA VEGFA 33716 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43774176 43774478 43774332 Y NA VEGFA NA NA NA NA VEGFA 38255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA C6orf223 71592 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43975133 43975197 43975165 Y CDC5L,C6orf223 C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 8816 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 12122 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 44002049 44002379 44002368 Y NFKBIE,GTPBP2 C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 35732 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 42884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 45629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 44022822 44022968 44022901 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf223 56505 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 44396303 44396427 44396307 Y NA CDC5L NA NA NA NA CDC5L 43041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 44443307 44443732 44443616 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 90045 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 44783475 44783845 44783660 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 430213 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 406680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 45299468 45299716 45299591 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 5574 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 45313959 45314320 45314140 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 20065 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 45317803 45318343 45317888 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 23909 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 45368067 45368444 45368079 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 24377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 45503403 45503548 45503462 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 159713 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 45557969 45558292 45558091 Y NA NA RUNX2,CDC5L,SUPT3H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 214279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 45645081 45645602 45645424 Y NA NA RUNX2,CDC5L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 301391 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 45649659 45650055 45649841 Y NA NA RUNX2,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 305969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 46640633 46640732 46640698 Y NA SLC25A27 NA NA NA NA SLC25A27 21955 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 47074438 47074572 47074520 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR116 153758 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 47214948 47215452 47215060 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF21 60189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 47618805 47618920 47618863 Y OPN5 NA NA NA NA NA CD2AP 175280 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 52339756 52339820 52339788 Y NA NA NA NA NA NA EFHC1 56650 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 52345672 52345732 52345729 Y NA NA NA NA NA NA EFHC1 62566 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 52382425 52382779 52382512 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 56934 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 52389241 52389494 52389368 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 50219 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 52952230 52952503 52952367 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA ICK 27630 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 53165916 53166137 53165996 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 45810 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 53174339 53174666 53174484 Y FBXO9,ELOVL5 ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 37281 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 53175462 53175877 53175681 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 36070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 53205102 53205427 53205266 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 6520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 53925678 53925800 53925739 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 268383 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 54845767 54846152 54846043 Y GFRAL NA NA NA NA NA FAM83B 136198 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 56226991 56227307 56227149 Y NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 BEND6 590466 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 521205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 56315031 56315399 56315215 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 502374 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 56459514 56459884 56459699 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 357889 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA BEND6 BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BEND6 5740 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 57052407 57052730 57052411 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 17283 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 57122777 57122910 57122847 Y BAG2,RAB23,RAB23 RAB23 RAB23,ZNF451,BAG2,PRIM2,KIAA1586,BEND6 IMR90 Hi-C 24141950 RAB23 37699 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 57267458 57267955 57267680 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 89855 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 57313567 57313842 57313733 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 135964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 57327654 57327860 57327770 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 150051 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 57354557 57355032 57354719 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 176954 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 57381063 57381299 57381127 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 203460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 64055548 64055769 64055667 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1C 136197 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr6 64299850 64300199 64300025 Y NA PHF3 NA NA NA NA PHF3 43526 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 64771855 64771881 64771868 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 428130 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 65390704 65390953 65390803 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 1046979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 66497189 66497296 66497284 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2153464 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 70371691 70371695 70371693 Y NA NA NA NA NA NA LMBRD1 133308 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 70479579 70479974 70479889 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 25029 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 70489653 70490034 70489967 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 14969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 70885390 70885484 70885437 Y NA NA NA NA NA NA FAM135A 235160 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 72010402 72010735 72010435 Y NA OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 13896 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 72044589 72044818 72044676 Y OGFRL1 OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 48083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 72103028 72103231 72103130 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 8093 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 3049 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 73354930 73355043 73354987 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 615895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 73524800 73525128 73524864 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 445810 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 73851485 73852230 73851840 Y OOEP NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 118708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 74186150 74186447 74186193 Y MTO1 MB21D1,MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 16849 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 74194767 74195136 74194952 Y NA MB21D1,MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 25466 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 63729 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 64303 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 74444443 74444784 74444732 Y NA CD109 NA NA NA NA CD109 40935 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 75853490 75853812 75853630 Y COL12A1 NA NA NA NA NA COL12A1 59955 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 75906514 75906841 75906796 Y NA COL12A1 NA NA NA NA COL12A1 6926 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 75914223 75914620 75914578 Y COL12A1 COL12A1,COX7A2 NA NA NA NA COL12A1 456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 76467215 76467333 76467230 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 10306 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 80777050 80777287 80777243 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 37077 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82228967 82229122 82229026 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 231369 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82422345 82422435 82422390 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 38056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82444623 82444816 82444722 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 15675 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82554529 82554698 82554614 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 94038 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82631547 82631830 82631690 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 171056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82650994 82651260 82651099 Y FAM46A NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 FAM46A 190503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 82854780 82854947 82854862 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 100524 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 83745270 83745402 83745336 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 29983 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 83756669 83757034 83756938 Y PGM3,DOPEY1 DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 18351 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 84877511 84877669 84877594 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 57684 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 85087981 85088261 85088229 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 152628 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 85258714 85258725 85258720 Y NA NA NA NA NA NA TBX18 213512 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 85334002 85334301 85334152 Y NA NA NA NA NA NA TBX18 137936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 87881047 87881581 87881092 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 20496 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 87897430 87897787 87897609 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 36879 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 89315918 89316052 89315985 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 355296 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 89470471 89470676 89470540 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 200672 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 90031448 90031662 90031542 Y PNRC1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 28905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 90094957 90095218 90095193 Y NA UBE2J1,RRAGD,ANKRD6 NA NA NA NA RRAGD 24771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 90550185 90550523 90550354 Y NA MDN1,CASP8AP2 NA NA NA NA CASP8AP2 12572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 229607 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 90782420 90782788 90782672 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 221839 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 125532 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 90951466 90952108 90951796 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 52519 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 90956736 90956981 90956814 Y BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 47646 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 90983807 90984597 90984358 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 20030 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 92907681 92907862 92907772 Y NA NA NA NA NA NA RP11-127B16.1 523685 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 93255659 93255903 93255781 Y NA NA NA NA NA NA RP11-127B16.1 175644 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 97681036 97681361 97681334 Y NA MMS22L NA NA NA NA MMS22L 47732 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 99777728 99778013 99777871 Y POU3F2,C6orf168 NA NA NA NA NA COQ3 62067 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 99886915 99887218 99887074 Y NA COQ3,RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 15708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 99975087 99975427 99975257 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA USP45 7483 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 100007525 100007878 100007702 Y LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 6971 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 100012296 100012415 100012356 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 2434 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 105078095 105078422 105078222 Y LIN28B,HACE1 NA NA NA NA NA HACE1 227372 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 105443315 105443377 105443346 Y HACE1,LIN28B NA NA NA NA NA HACE1 137521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 105707945 105708326 105708046 Y NA NA NA NA NA NA POPDC3 82075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 106258484 106259193 106259052 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 273002 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 106307323 106307598 106307471 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 224597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 106416219 106416368 106416315 Y PRDM1 NA PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 115827 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 106442094 106442641 106442261 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89554 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 106485079 106485360 106485141 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 46835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 106582399 106582514 106582457 Y AIM1 NA NA NA NA NA PRDM1 50204 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 106612334 106612792 106612510 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 80139 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 106643011 106643217 106643065 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 110816 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA AIM1 56310 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 107976275 107976365 107976320 Y NA NA NA NA NA NA SOBP 167113 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 108324190 108324471 108324239 Y NA SEC63,RPL3P7 NA NA NA NA RPL3P7 301 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 108574394 108574619 108574507 Y NA SNX3,LACE1 NA NA NA NA SNX3 5845 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 108951509 108952142 108951722 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 72471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 109162509 109162938 109162684 Y NA ARMC2 FOXO3,ARMC2,SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 ARMC2 4681 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 109672770 109673128 109672949 Y NA CD164 NA NA NA NA CD164 28634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 109755732 109756057 109756030 Y CD164 SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 NA NA NA NA SMPD2 3909 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 110415658 110415810 110415734 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 83397 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 110418117 110418342 110418281 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 80865 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 110456590 110456951 110456841 Y WASF1,CDC40,C6orf186 WASF1,CDC40 NA NA NA NA WASF1 42256 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 111025527 111025575 111025551 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 109586 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 111560758 111560946 111560852 Y AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 17605 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 111614404 111614762 111614615 Y NA KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 35853 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 111784023 111784230 111784203 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 18484 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 111795712 111796054 111795883 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 6660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 111841823 111842197 111842010 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA REV3L 38905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 111949677 111949980 111949829 Y REV3L TRAF3IP2 TRAF3IP2,REV3L,TRAF3IP2-AS1,FYN MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRAF3IP2 24196 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 112170510 112170904 112170903 Y NA FYN NA NA NA NA FYN 21751 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 112192236 112192610 112192499 Y REV3L,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 45 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 113468828 113469029 113468929 Y NA NA MARCKS,LOC285758 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 500247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 113680929 113681231 113681080 Y NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 288045 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 113951649 113952852 113952545 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 16424 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA RP11-367G18.1 NA NA NA NA RP11-367G18.1 36530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 114016687 114017056 114016887 Y NA RP11-367G18.1 MARCKS MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-367G18.1 47411 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 114318333 114318559 114318390 Y NA RP3-399L15.3,HDAC2 NA NA NA NA HDAC2 11913 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 116550472 116550927 116550585 Y KPNA5,TSPYL4,TSPYL1 TSPYL4,DSE,TSPYL1 NA NA NA NA TSPYL4 22334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 116701798 116702097 116701822 Y NA NA NA NA NA NA FAM26F 78436 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 116713690 116714094 116713959 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA FAM26F 66439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 116731952 116732286 116732048 Y DSE,FAM26F FAM26F NA NA NA NA FAM26F 48247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 116772615 116772756 116772721 Y ZUFSP,DSE,FAM26F FAM26F NA NA NA NA FAM26F 7777 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 116778152 116778369 116778268 Y ZUFSP,DSE,FAM26F FAM26F NA NA NA NA FAM26F 2164 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 117003694 117003845 117003770 Y TSPYL4,TSPYL1,DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA KPNA5 3344 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 117914764 117915043 117914904 Y NA GOPC NA NA NA NA GOPC 6648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 119082982 119083196 119083043 Y NA NA SLC35F1,CEP85L IMR90 Hi-C 24141950 CEP85L 53744 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 119214275 119214495 119214295 Y C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 891 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 119523776 119524187 119523976 Y FAM184A NA NA NA NA NA FAM184A 55224 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 119635586 119635800 119635693 Y MCM9 MAN1A1 NA NA NA NA MAN1A1 33126 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 119896932 119897123 119897095 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 228006 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 122016612 122016787 122016747 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 243345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 122253904 122254092 122253993 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 HSF2 464599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 125424080 125424400 125424202 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 13795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 125622252 125622475 125622321 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 970 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 126108316 126108682 126108499 Y NA HEY2,NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 8009 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 126112858 126113033 126112985 Y TRMT11,HINT3,NCOA7 HEY2,NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 12551 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 126197747 126198095 126197755 Y NA NA NA NA NA NA HINT3 77832 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 126265741 126265870 126265827 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 10057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 126271537 126271736 126271680 Y NA HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 4191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 126621398 126621727 126621563 Y NA CENPW NA NA NA NA CENPW 37593 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 127638757 127639069 127638966 Y NA ECHDC1 NA NA NA NA ECHDC1 23685 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 127769705 127769797 127769751 Y NA KIAA0408 NA NA NA NA KIAA0408 8739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0408 202338 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0408 202802 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 128331151 128331455 128331303 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 508415 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 128496365 128496708 128496537 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 343162 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 128637396 128637725 128637581 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 202145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 128747260 128747445 128747404 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 92425 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 128921613 128921847 128921739 Y NA NA PTPRK MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTPRK 81743 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 129768788 129769141 129769019 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP18 260229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 130029105 130029310 130029206 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 60 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 130029433 130029625 130029566 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 63 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 130453386 130453776 130453491 Y L3MBTL3,SAMD3,SAMD3 NA NA NA NA NA L3MBTL3 120542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 131929733 131930009 131929873 Y NA MED23,RNU4-18P NA NA NA NA MED23 17360 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 132435629 132435820 132435727 Y NA NA LOC100507254,CTGF,STX7 IMR90,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CTGF 165116 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 133020075 133020153 133020114 Y NA NA NA NA NA NA RPS12 113427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 133837061 133837238 133837150 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 277325 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 133874375 133874708 133874541 Y NA NA LINC00326,EYA4,MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 EYA4 314639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 134609640 134610343 134609803 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 26907 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 135601929 135602188 135602098 Y MYB NA NA NA NA NA HBS1L 179735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA LINC00271 179293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 136316549 136316741 136316613 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 145715 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 136336050 136336507 136336258 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 165216 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 136702762 136702864 136702842 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 93773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 136965409 136965459 136965418 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 95452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 137227679 137227915 137227797 Y NA NA NA NA NA NA PEX7 85962 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 137231671 137231914 137231792 Y NA NA SLC35D3 IMR90 Hi-C 24141950 PEX7 89954 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 138225639 138226065 138225836 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 39288 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 138291437 138291772 138291605 Y PBOV1 NA NA NA NA NA TNFAIP3 105086 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 138777270 138777670 138777656 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 54602 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 138836081 138836260 138836164 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 113413 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 138914342 138914559 138914540 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 NHSL1 97149 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 139100392 139100553 139100462 Y NHSL1 CCDC28A NA NA NA NA CCDC28A 7735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 139300314 139300341 139300327 Y NHSL1 REPS1 NA NA NA NA REPS1 7057 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 139351818 139352158 139351992 Y CCDC28A,C6orf115,HECA REPS1 NA NA NA NA REPS1 44420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 139841535 139841931 139841798 Y HECA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 147778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 139861409 139861802 139861629 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC100132735 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 167652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 139899473 139899647 139899531 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 205716 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 140064888 140065017 140064953 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 371131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 140299062 140299512 140299364 Y NA NA CITED2,HECA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 605305 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr6 140930496 140930538 140930517 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 1236739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 141204403 141204777 141204486 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1261590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 143124343 143124671 143124507 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 139667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 143192899 143193375 143193200 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 70963 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 143223836 143224147 143224035 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 40191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 143516746 143517148 143516792 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 137113 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 143608872 143608912 143608892 Y NA NA NA NA NA NA ADAT2 160898 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 143770817 143770943 143770879 Y ADAT2 ADAT2,PEX3 NA NA NA NA PEX3 873 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 144283195 144283286 144283251 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 100449 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 144283965 144283971 144283968 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99764 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 144474457 144475387 144474631 Y PLAGL1,STX11 STX11,TPT1P4 NA NA NA NA STX11 4794 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 144500283 144500598 144500443 Y PLAGL1,UTRN,STX11 STX11,TPT1P4 NA NA NA NA TPT1P4 19504 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 144931961 144932452 144932213 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 411859 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 144996503 144996745 144996624 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 476401 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 145136843 145137199 145137021 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 616741 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 145147432 145147802 145147573 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 627330 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 145324405 145324583 145324494 Y NA NA UTRN IMR90 Hi-C 24141950 EPM2A 730577 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 145858725 145858739 145858732 Y NA NA NA NA NA NA EPM2A 196421 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 147124877 147125201 147125102 Y NA NA NA NA NA NA RAB32 262048 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 149081701 149082266 149082198 Y UST UST NA NA NA NA UST 15237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 149657882 149658028 149657899 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 120105 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 149829691 149830032 149829852 Y LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4 PPIL4 NA NA NA NA PPIL4 35142 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 150075680 150075936 150075837 Y SUMO4 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 6879 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 150176203 150176399 150176290 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 7800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 150286198 150286452 150286311 Y ULBP1 RAET1G,ULBP2,ULBP1,RAET1K NA NA NA NA ULBP1 3055 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 151248402 151248558 151248480 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1L 63717 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 151373285 151373500 151373395 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 45165 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 151391768 151392248 151391859 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 26417 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 151634197 151634634 151634284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP12 75063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 151647622 151647708 151647665 Y NA NA ZBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB2 62975 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 154441744 154441825 154441785 Y OPRM1,OPRM1 NA NA NA NA NA CNKSR3 387968 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 155181312 155181660 155181451 Y TIAM2,TIAM2 TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 29481 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 155253920 155254165 155254066 Y NA NA TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 102089 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 155438419 155438575 155438497 Y NA NA NA NA NA NA TFB1M 195052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 157158909 157159282 157158999 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 61846 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 157162870 157163071 157163026 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 65807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 157174408 157174845 157174627 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 77345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 157609644 157610034 157609839 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 132599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 157726321 157726550 157726459 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 16083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 158136804 158137189 158136890 Y NA NA TMEM242,SNX9,ZDHHC14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 105107 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 158185393 158186221 158185862 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 56075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 158424430 158424803 158424679 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 23542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 158439513 158439767 158439649 Y NA SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 38625 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 158452388 158452885 158452569 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 51500 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 158463343 158463878 158463391 Y SNX9,SYNJ2 NA NA NA NA NA SYNJ2 62455 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 158515424 158515781 158515670 Y SYNJ2,SYNJ2 NA NA NA NA NA SERAC1 71531 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 158525965 158526121 158526043 Y NA NA NA NA NA NA SERAC1 61191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 158595666 158595874 158595793 Y NA SERAC1,GTF2H5 NA NA NA NA GTF2H5 8282 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 75680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 159383408 159383511 159383422 Y NA RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 35708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 160135538 160135989 160135680 Y IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 8628 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 160144181 160144267 160144224 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 NA NA NA NA WTAP 350 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 160400282 160400543 160400410 Y SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 12151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 160409606 160409719 160409663 Y IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 21475 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 161607618 161607817 161607715 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 85276 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr6 161693137 161693518 161693484 Y NA AGPAT4 MAP3K4 IMR90 Hi-C 24141950 AGPAT4 44 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 162601238 162601606 162601422 Y NA NA NA NA NA NA PARK2 545197 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr6 163840967 163841346 163841003 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 7935 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 163950759 163951099 163950781 Y NA NA NA NA NA NA QKI 117727 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 163972161 163972427 163972234 Y NA NA NA NA NA NA QKI 139129 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 163976539 163976874 163976679 Y NA NA NA NA NA NA QKI 143507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 167002413 167002718 167002541 Y SFT2D1 NA NA NA NA NA SFT2D1 248334 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 202321 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 168216462 168216639 168216532 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 8963 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 168533513 168533636 168533561 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 307911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 169556642 169556776 169556709 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 4243 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 169568038 169568505 169568172 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 7019 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 169572627 169572772 169572742 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 11608 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA THBS2 175763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 170020305 170020690 170020593 Y NA NA NA NA NA NA WDR27 79469 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 170203615 170204008 170203729 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 53960 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 170589556 170589600 170589578 Y WDR27,TCTE3,TBP DLL1,FAM120B NA NA NA NA DLL1 7961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr6 170654095 170654292 170654195 Y FAM120B NA NA NA NA NA FAM120B 56304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 90161 90450 90245 Y FAM20C NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 100519 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C NA NA NA NA FAM20C 562 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 554641 554853 554825 Y NA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 3080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 1039490 1039728 1039629 Y NA ADAP1,COX19,GPR146 NA NA NA NA COX19 26255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 1066965 1067028 1066969 Y NA GPR146 NA NA NA NA GPR146 15184 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 1571848 1572026 1571934 Y ZFAND2A,TMEM184A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3498 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 1598591 1598955 1598779 Y NA MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA PSMG3-AS1 8754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2178123 2178459 2178160 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 92419 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2561604 2562123 2561810 Y LFNG,LFNG LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 11441 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2569854 2570215 2570046 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19691 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2575019 2575461 2575251 Y NA LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA BRAT1 17900 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2657383 2657705 2657445 Y IQCE,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11880 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2681143 2681305 2681209 Y SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3 TTYH3,AMZ1 NA NA NA NA TTYH3 11558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2749963 2750288 2750147 Y LFNG,LFNG,CARD11 AMZ1 NA NA NA NA AMZ1 32807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2750956 2751140 2751041 Y LFNG,LFNG,CARD11 AMZ1 NA NA NA NA AMZ1 33800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2778515 2778860 2778688 Y NA NA NA NA NA NA AMZ1 61359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2838950 2839257 2839071 Y SNX8,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 33998 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 3106976 3107174 3107069 Y NA NA SDK1,CARD11 IMR90 Hi-C 24141950 GNA12 225018 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 4660172 4660397 4660258 Y NA FOXK1 SDK1,FOXK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 20991 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 4778448 4778853 4778548 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 97060 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 5039702 5040026 5039789 Y NA RNF216P1,RBAK NA NA NA NA RNF216P1 28083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 5419074 5419498 5419154 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 43547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 5471668 5472052 5471860 Y NA TNRC18 WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC18 8623 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 5733172 5733453 5733321 Y CCZ1,USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 85917 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 5733977 5734150 5734061 Y NA NA NA NA NA NA RNF216 85220 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 8016516 8016759 8016566 Y GLCCI1 GLCCI1 NA NA NA NA GLCCI1 10091 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 8254354 8254751 8254559 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 247929 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 11089099 11089199 11089149 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 77600 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 16751358 16751548 16751453 Y NA TSPAN13 NA NA NA NA TSPAN13 39612 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 17029591 17029925 17029620 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN13 238431 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr7 17360383 17360757 17360401 Y NA AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AC003075.4 23402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 17446496 17446663 17446580 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 109515 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 17721637 17721811 17721724 Y NA NA HDAC9,AGR2,AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 256313 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 18563504 18563902 18563528 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA SNX13 585380 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 19017733 19017917 19017790 Y TWIST1 NA NA NA NA NA TWIST1 137378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 19024350 19024628 19024489 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 130667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 21254928 21255253 21254997 Y NA NA NA NA NA NA SP4 210399 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 22122614 22122929 22122771 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 138912 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 22213845 22214148 22213920 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 230143 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 22403573 22403885 22403824 Y RAPGEF5 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 145733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 22614875 22615270 22614981 Y IL6 AC002480.4 NA NA NA NA AC002480.4 12054 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA AC005682.5 2516 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 23289024 23289054 23289046 Y NA GPNMB NA NA NA NA GPNMB 15438 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA GPNMB 72788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 23410116 23410259 23410188 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 97827 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 24803089 24803421 24803235 Y DFNA5,DFNA5 DFNA5 DFNA5,OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 DFNA5 3823 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 24805002 24805275 24805152 Y DFNA5,DFNA5 DFNA5 DFNA5,MPP6,CYCS IMR90 Hi-C 24141950 DFNA5 1969 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 24818395 24818855 24818677 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 11151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 24947142 24947425 24947387 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 71828 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 25897167 25897316 25897282 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 25980642 25980887 25980804 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 208973 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 26815721 26816027 26815980 Y SNX10,SNX10,SKAP2 NA NA NA NA NA SKAP2 216831 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 98953 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 27907829 27908035 27907932 Y NA NA NA NA NA NA AC004549.6 129815 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 27923177 27923290 27923234 Y NA NA NA NA NA NA AC004549.6 145163 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1 141190 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 28094781 28094986 28094893 Y HIBADH NA NA NA NA NA JAZF1 123376 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 28205904 28206253 28206092 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 12109 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 29163209 29163338 29163275 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 3319 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 29389038 29389444 29389113 Y NA NA NA NA NA NA CPVL 155971 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 29628381 29628403 29628392 Y NA NA NA NA NA NA CPVL 395314 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 31923409 31923701 31923603 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 413240 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 31930551 31930715 31930633 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 406226 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 32090584 32090879 32090675 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 246062 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 32133021 32133498 32133272 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 203443 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 32546004 32546038 32546035 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 12966 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 34529792 34529930 34529861 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 694004 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 38750267 38750277 38750273 Y NA NA NA NA NA NA AMPH 81100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 40129508 40130170 40129872 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 141872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 40138099 40138142 40138120 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 150463 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 40938770 40939089 40938937 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 801617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 41826002 41826265 41826090 Y NA NA NA NA NA NA INHBA 85296 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 42026442 42026777 42026611 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 248692 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 42258020 42258279 42258155 Y GLI3 GLI3 NA NA NA NA GLI3 17190 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 42954351 42954549 42954430 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 C7orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C7orf25 4447 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43625293 43625372 43625313 Y URGCP,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 4936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43625905 43626316 43625996 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 5548 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 43732901 43733056 43732913 Y DBNL,STK17A NA NA NA NA NA BLVRA 63223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43912365 43912715 43912516 Y NA MRPS24 NA NA NA NA MRPS24 4873 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 44435204 44435581 44435393 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 69860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 68409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 44674941 44675231 44675112 Y PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 30770 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 45129269 45129527 45129398 Y ADCY1,NACAD NACAD,TBRG4 NA NA NA NA NACAD 2756 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 47258454 47258947 47258703 Y NA NA IGFBP1,IGFBP3,TNS3,C7orf69,PKD1L1 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 251154 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 47293209 47293414 47293276 Y NA NA NA NA NA NA AC004870.4 285909 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 47505797 47506192 47505996 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 113964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 47573930 47574208 47574136 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 45948 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA NA NA NA NA NA HUS1 190582 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 48294708 48294972 48294840 Y HUS1,UPP1,UPP1 NA NA NA NA NA ABCA13 85653 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 50615386 50615579 50615483 Y GRB10 NA NA NA NA NA FIGNL1 99298 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR CALM1P2 EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 CALM1P2 2993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 55572828 55572957 55572867 Y NA NA NA NA NA NA VOPP1 65724 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 56029737 56030120 56029923 Y CCT6A,MRPS17,GBAS GBAS,MRPS17 NA NA NA NA MRPS17 12225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 56173322 56173423 56173410 Y NA SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 1053 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 69091011 69091330 69091153 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 29106 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 69215481 69215818 69215531 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 153576 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 70253382 70253537 70253463 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 341618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 73705467 73705815 73705641 Y NA RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 3662 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 73987997 73988205 73988054 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 81789 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 74001829 74001994 74001904 Y NA NA GTF2I IMR90 Hi-C 24141950 GTF2I 68000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 74074203 74074528 74074318 Y LAT2,GTF2I GTF2I NA NA NA NA GTF2I 4209 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 75253450 75253956 75253637 Y POR NA NA NA NA NA PMS2P3 97972 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 75267293 75267635 75267464 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 98645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 77561991 77562080 77562036 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 135869 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 77953225 77953430 77953328 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 527103 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA GNAI1 838141 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 81234008 81234151 81234026 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 684333 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 83081582 83081807 83081725 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 291336 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 83865799 83865921 83865847 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 254119 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 84119513 84119698 84119606 Y NA SEMA3A NA NA NA NA SEMA3A 342 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 90242419 90242638 90242578 Y NA NA CDK14,FZD1 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN12 231384 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 90331258 90331430 90331344 Y NA NA CDK14,STEAP1 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 CLDN12 320223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 91466585 91467314 91466893 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 40720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 92263416 92263696 92263624 Y SAMD9,CDK6 NA FAM133B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBM48 107329 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 92277080 92277232 92277129 Y ANKIB1,GATAD1,CDK6 NA NA NA NA NA RBM48 120993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 AC002454.1 138234 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 92340516 92340848 92340839 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 122949 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 92361219 92361296 92361260 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 102501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 90055 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 92745192 92745375 92745297 Y SAMD9 SAMD9L NA NA NA NA SAMD9 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 93231275 93231507 93231391 Y CCDC132 NA NA NA NA NA TFPI2 286796 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 93688988 93689431 93689251 Y NA AC003092.1 TFPI2,GNG11,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 AC003092.1 38843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA COL1A2 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 94751086 94751478 94751282 Y NA RNU4-16P NA NA NA NA RNU4-16P 25547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 95765148 95765192 95765170 Y DYNC1I1,FLJ42280 NA NA NA NA NA SLC25A13 184267 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 95913909 95914253 95914081 Y SLC25A13 SLC25A13 NA NA NA NA SLC25A13 35206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 96592754 96592990 96592764 Y FLJ42280,DLX6,DLX5 NA NA NA NA NA DLX5 59419 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 96642423 96642668 96642630 Y NA DLX5 NA NA NA NA DLX5 9741 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 98650927 98651298 98651264 Y NA NA NA NA NA NA SMURF1 88425 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 98724585 98724789 98724635 Y ZNF394,SMURF1 SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 14934 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 99551289 99551506 99551376 Y ZCWPW1,PILRA,MEPCE,C7orf59,ZNF655,ZNF655 TRIM4 NA NA NA NA TRIM4 36066 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 99942530 99942666 99942614 Y OR2AE1,ZCWPW1,MEPCE,PILRA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 4999 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25045 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 101062164 101062286 101062177 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 99060 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr7 101930729 101931104 101930861 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIP1 71215 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 102464517 102464880 102464701 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 77099 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA RPL19P12,NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL19P12 7040 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 102790674 102790901 102790766 Y NAPEPLD RPL19P12,NAPEPLD NA NA NA NA NAPEPLD 2667 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 104607797 104607862 104607830 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 43629 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 43127 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 104618643 104618978 104618693 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 32513 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 104771634 104771765 104771700 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 120143 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 104884738 104885065 104884890 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 152690 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 104992589 104992852 104992773 Y NA SRPK2 NA NA NA NA SRPK2 44903 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 105766301 105766504 105766403 Y NA SYPL1 CDHR3,ATXN7L1,SYPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 15279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 105859767 105859956 105859881 Y NA NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 64816 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 106686077 106686421 106686249 Y GPR22 PRKAR2B NA NA NA NA PRKAR2B 2983 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 107567511 107567568 107567540 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38096 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 107939769 107940082 107939931 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 155079 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 111627210 111627406 111627307 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 217060 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 114018736 114018896 114018817 Y FOXP2 NA NA NA NA NA MDFIC 541313 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 115887290 115887609 115887434 Y NA TES,CAV2 NA NA NA NA CAV2 37825 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2,AC073130.3 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 8172 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 AC073130.3 CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 29282 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 116202174 116202561 116202326 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 39335 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 116223147 116223399 116223366 Y CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA TES,MET,CAV2,CAV1 GM12878,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 CAV1 60308 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 119269873 119270211 119270042 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 275218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 119300626 119300913 119300840 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 244516 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 119342265 119342557 119342442 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 202872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 120666718 120667076 120666787 Y NA NA NA NA NA NA ING3 77915 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 120703433 120703512 120703470 Y NA NA NA NA NA NA ING3 114630 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 120751060 120751219 120751140 Y NA NA NA NA NA NA ING3 162257 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 121170860 121171233 121171047 Y PTPRZ1 NA FAM3C,WNT16 IMR90 Hi-C 24141950 FAM3C 136442 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 121951485 121951902 121951877 Y NA NA NA NA NA NA AASS 169151 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 RBM28 174034 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 128603332 128603696 128603619 Y ATP6V1F,IRF5,IRF5,IRF5,TSPAN33 IRF5 NA NA NA NA IRF5 27666 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 128915299 128915657 128915368 Y NA NA NA NA NA NA AHCYL2 52435 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 128958632 128958719 128958676 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 89492 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129420694 129421120 129420768 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 169669 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129508183 129508482 129508331 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 82307 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129508753 129509075 129508928 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 81714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129540244 129540548 129540396 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 50241 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129589680 129589810 129589737 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 979 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 NA NA NA NA NA CEP41 66368 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 13676 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130614674 130615489 130615212 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 18605 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130641725 130642119 130642041 Y MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 45656 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48245 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 130658258 130658537 130658456 Y NA NA NA NA NA NA MIR29A 62189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130669444 130669692 130669631 Y NA NA NA NA NA NA MIR29A 73375 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130670866 130671152 130671128 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MIR29A 74797 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130675334 130675529 130675395 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MIR29A 79265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130696655 130697004 130696978 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95851 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130799789 130800044 130799917 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 6854 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 130875085 130875581 130875276 Y NA NA NA NA NA NA LINC-PINT 82150 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 130920397 130920794 130920689 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1-AS 90187 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 131580267 131580830 131580536 Y NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 PODXL 339291 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 132488555 132488726 132488642 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 157108 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 132656149 132656423 132656408 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 108425 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 133148039 133148314 133148177 Y NA NA NA NA NA NA EXOC4 212210 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 134378159 134378392 134378229 Y AKR1B1,CALD1 BPGM,CALD1 NA NA NA NA BPGM 48599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 134498976 134499173 134499074 Y CALD1 NA NA NA NA NA CALD1 71973 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 134571220 134571518 134571300 Y NA NA NA NA NA NA AGBL3 97741 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 135395183 135395352 135395286 Y NA C7orf73 NA NA NA NA C7orf73 49939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 98196 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 135459124 135459310 135459189 Y NA NA C7orf73,SLC13A4,FAM180A IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 113880 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 137544616 137544738 137544677 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 140075 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 137661285 137661695 137661644 Y NA CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 23118 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 137663180 137663556 137663478 Y CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 21257 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 138643234 138643648 138643551 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 20416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 138778060 138778462 138778282 Y NA ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 14003 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 138779904 138780459 138780182 Y NA ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 12006 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 138791748 138791993 138791908 Y UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 472 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 138858843 138859133 138858995 Y SVOPL TTC26 NA NA NA NA TTC26 42353 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 139320693 139321014 139320839 Y PARP12,LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103707 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 139358057 139358402 139358214 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 117175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 109651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 139425752 139426584 139426362 Y TBXAS1,JHDM1D HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 48993 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 139431881 139432226 139432135 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 43351 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 139975435 139975617 139975498 Y TBXAS1,JHDM1D NA PARP12,LOC100134229,JHDM1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC37A3 126616 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 140572858 140572991 140572984 Y BRAF BRAF NA NA NA NA BRAF 49573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 141215560 141215822 141215629 Y NA AGK LOC100507421 IMR90 Hi-C 24141950 AGK 33167 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 142942725 142943016 142942871 Y OR9A2,OR6V1,TAS2R41,FAM131B,FAM131B,TAS2R39,TAS2R40 GSTK1,TMEM139,CASP2 TMEM139,CASP2,CLCN1,ZYX,EPHA1,LOC285965 IMR90 Hi-C 24141950 GSTK1 3539 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 143048257 143048354 143048306 Y TRPV5,OR9A2,OR6V1,TAS2R40,TAS2R41,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA FAM131B 9509 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 148685182 148685277 148685231 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 38456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 149575159 149575279 149575218 Y NA ZNF862,ATP6V0E2,ATP6V0E2-AS1 NA NA NA NA ATP6V0E2-AS1 420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 150451392 150451664 150451621 Y GIMAP8,SLC4A2,GIMAP2,GIMAP5,LOC100128542 GIMAP1,TMEM176B NA NA NA NA GIMAP1 39747 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 WDR86 51247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 151192969 151193321 151193145 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21885 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 151489254 151489433 151489399 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 82694 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 154730644 154730988 154730877 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 61806 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 154743291 154743691 154743552 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49103 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 155049368 155049519 155049432 Y NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 37967 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr7 155678402 155678700 155678446 Y NA NA LMBR1 IMR90 Hi-C 24141950 AC009403.2 242503 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 156800292 156800601 156800569 Y MNX1,MNX1 MNX1 NA NA NA NA MNX1 744 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 157255834 157256209 157256022 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 129759 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 158167398 158167566 158167494 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 210914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr7 158595763 158596162 158596010 Y ESYT2 ESYT2 NA NA NA NA ESYT2 24782 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr7 158656529 158657066 158657015 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA WDR60 9260 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 1750336 1750494 1750412 Y NA CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 19648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 6274035 6274201 6274090 Y NA MCPH1 NA NA NA NA MCPH1 11922 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 6518047 6518428 6518274 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA CTD-2541M15.1 45302 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 5.51576674365767 chr8 6575644 6576065 6575803 Y MCPH1,AGPAT5 CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 11766 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 8939736 8940088 8939838 Y CLDN23,ERI1,PPP1R3B NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 66996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 8991645 8992043 8991844 Y NA PPP1R3B,RP11-10A14.4 NA NA NA NA PPP1R3B 15041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 10187572 10187859 10187580 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 277794 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 10681939 10682203 10682138 Y RP1L1 PINX1 NA NA NA NA PINX1 13191 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 11001237 11001609 11001584 Y NA NA NA NA NA NA XKR6 55266 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 11690057 11690160 11690110 Y NA SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB NA NA NA NA RP11-297N6.4 31980 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 11754568 11755261 11754938 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 29611 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 13122971 13123135 13123062 Y DLC1 NA NA NA NA NA DLC1 248032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 13393176 13393534 13393351 Y DLC1 DLC1,C8orf48 DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 DLC1 22009 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 16180098 16180302 16180200 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 831236 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 16280941 16281214 16281102 Y MSR1 NA NA NA NA NA ZDHHC2 730324 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 16476986 16477261 16477122 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 534277 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 16609902 16609923 16609912 Y VPS37A NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 401615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 16629867 16630175 16630011 Y ZDHHC2 NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 381363 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr8 17165650 17166030 17165840 Y PDGFRL NA NA NA NA NA CNOT7 63263 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 18768857 18769292 18769046 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 170948 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 18854306 18854486 18854451 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 85754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 19522969 19523285 19523139 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 90255 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr8 22240884 22241560 22241218 Y C8orf58 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 18122 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 22605845 22606262 22606042 Y NA NA NA NA NA NA EGR3 57030 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 22855581 22855914 22855756 Y EGR3,EGR3,EGR3 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 12651 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 23014689 23015093 23014900 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 4450 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 23020215 23020436 23020325 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 672 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 23211536 23211676 23211614 Y TNFRSF10D,LOXL2 NA NA NA NA NA LOXL2 69165 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 23436711 23436787 23436740 Y NA RNU4-71P NA NA NA NA RNU4-71P 18864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 23710742 23711028 23710888 Y STC1 STC1 NA NA NA NA STC1 422 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 24013716 24014104 24013764 Y STC1 NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-148P 81045 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 25904215 25904335 25904275 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R2A 242672 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 26468935 26469319 26469207 Y DPYSL2 NA NA NA NA NA DPYSL2 99144 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 27248451 27248615 27248585 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 81452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 28635981 28636227 28636104 Y EXTL3 NA NA NA NA NA EXTL3-AS1 79000 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 29631647 29631969 29631808 Y NA NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 306754 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 29705863 29706038 29705974 Y MBOAT4 NA NA NA NA NA TMEM66 232685 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 30168992 30169171 30169082 Y NA NA GTF2E2,MIR548O2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPMS 70773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 30733329 30733342 30733336 Y NA NA WRN IMR90 Hi-C 24141950 PPP2CB 63499 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA PURG,WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 32052985 32053085 32053036 Y NA NA NA NA NA NA NRG1 558083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 32191944 32192171 32192069 Y NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 697042 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 32558705 32558963 32558834 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 769977 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 33287156 33287526 33287341 Y NA FUT10 NA NA NA NA FUT10 41414 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA RP1-273G13.1 135724 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.67717782910511 chr8 33668021 33668356 33668148 Y NA RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 47385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 5.20933525789891 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 37929132 37929304 37929218 Y NA EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 31456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 38077409 38077725 38077419 Y NA BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B DDHD2 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD2 3011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 40056491 40056661 40056575 Y C8orf4 C8orf4 GOLGA7,ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 47502 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-392C11.1 74578 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 41649689 41649828 41649744 Y NKX6-3 NA NA NA NA NA NKX6-3 142834 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 42184337 42184357 42184347 Y NA POLB NA NA NA NA POLB 9615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 42383718 42383741 42383730 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 11328 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr8 48242793 48242802 48242797 Y NA NA PRKDC IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA5P12 168300 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 48295911 48296182 48296008 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 221418 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 48531592 48531742 48531667 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 117906 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 48746170 48746340 48746217 Y MCM4 NA NA NA NA NA CEBPD 96522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 50653553 50653944 50653741 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 821254 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 52797055 52797111 52797083 Y NA PCMTD1,RP11-110G21.1 NA NA NA NA PCMTD1 12624 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 53379796 53380092 53379874 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA RB1CC1 276311 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr8 56684291 56684685 56684461 Y NA TGS1,TMEM68 NA NA NA NA TMEM68 325 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 56818311 56818706 56818376 Y NA LYN NA NA NA NA LYN 27939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA NA NA NA NA NA LINC00968 79681 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 59497301 59497891 59497607 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 33818 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 59499727 59499886 59499762 Y UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 36244 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 61705362 61705819 61705615 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 116025 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 62566892 62567143 62567071 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 58012 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 62631895 62632623 62632238 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 6740 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 63074544 63074897 63074721 Y NKAIN3 NA NA NA NA NA ASPH 449389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 65684237 65684466 65684340 Y BHLHE22,CYP7B1 NA NA NA NA NA ARMC1 859976 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 66742209 66742357 66742281 Y NA PDE7A NA NA NA NA PDE7A 10200 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 66934530 66934705 66934628 Y PDE7A NA NA NA NA NA TRIM55 102426 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA TRIM55 NA NA NA NA TRIM55 492 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 67447907 67448273 67448065 Y MYBL1,C8orf45 NA NA NA NA NA MYBL1 76209 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 68090392 68090564 68090531 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 96374 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 704433 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 69744780 69745024 69744928 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 631835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 69902361 69902629 69902513 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 474230 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 70310732 70311124 70310931 Y NA NA C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 SULF1 65735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 71031909 71031920 71031915 Y NA RNU1-101P NA NA NA NA RNU1-101P 43642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 71569342 71569635 71569535 Y NA LACTB2,XKR9 NA NA NA NA LACTB2 9774 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 72143679 72143939 72143809 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1102P16.1 358321 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 5100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 72769938 72770232 72770085 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 15235 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 72770493 72770720 72770591 Y MSC RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 15790 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 72839217 72839615 72839291 Y NA NA NA NA NA NA MSC 84514 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 72917567 72918022 72917791 Y NA NA NA NA NA NA MSC 162864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 74432524 74433240 74432853 Y C8orf84,RDH10 NA NA NA NA NA STAU2 224703 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 74581626 74581813 74581790 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 76130 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 74625237 74625516 74625377 Y NA STAU2 NA NA NA NA STAU2 32427 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 74926613 74926741 74926708 Y UBE2W,TMEM70,LY96 TCEB1,TMEM70,RP11-367E12.4,LY96 NA NA NA NA LY96 25026 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 75688 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 79000264 79000479 79000281 Y NA NA NA NA NA NA IL7 715279 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 81050951 81051119 81051010 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 90348 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 81059132 81059394 81059212 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 82073 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 81587419 81587669 81587654 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 191565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 81915105 81915491 81915316 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 106812 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 81933989 81934508 81934361 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 87795 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 81938706 81938999 81938911 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 83304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 85136696 85136911 85136758 Y NA NA NA NA NA NA LRRCC1 880471 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 85296015 85296611 85296285 Y NA NA NA NA NA NA LRRCC1 720771 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 87358801 87359051 87358932 Y NA WWP1 NA NA NA NA WWP1 5834 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA SLC2A3P4 160140 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 90741352 90741628 90741481 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,RIPK2,NBN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 90797084 90797193 90797178 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 29109 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 91944929 91945085 91945007 Y NECAB1 NA NA NA NA NA TMEM55A 106207 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 92112003 92112264 92112167 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 31579 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 92128196 92128480 92128215 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 47772 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 94728357 94728657 94728477 Y NA FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67 NA NA NA NA LINC00535 17696 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 95089628 95089913 95089904 Y NA NA GEM,CDH17,RAD54B IMR90 Hi-C 24141950 KB-1247B1.1 123367 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 95132318 95132456 95132369 Y NA NA NA NA NA NA KB-1247B1.1 80824 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 95254687 95254848 95254768 Y GEM KB-1247B1.1,GEM CDH17 IMR90 Hi-C 24141950 GEM 17730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 95429933 95430227 95430143 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 55110 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 97361476 97361586 97361537 Y NA NA NA NA NA NA PTDSS1 89533 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 97410655 97411012 97410831 Y NA NA CPQ,TSPYL5,PTDSS1 IMR90 Hi-C 24141950 SDC2 92567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 97571754 97571902 97571855 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 68175 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 97801629 97801768 97801699 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 298050 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 97845398 97845726 97845580 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 341819 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 97923635 97924111 97923770 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 420056 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 97934277 97934647 97934426 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 430698 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 97975205 97975619 97975502 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 471626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 98038035 98038331 98038307 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 534456 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 99637150 99637421 99637401 Y NA NA NA NA NA NA STK3 315634 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 100803946 100804239 100804046 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 100051 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr8 101913945 101914105 101914022 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 7971 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 101914244 101914460 101914402 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 8270 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14749 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 21757 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 102015928 102016078 102016021 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 52312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 102120764 102121998 102120921 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 94423 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 102135026 102135273 102135149 Y NA NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 81148 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 102185716 102186115 102186035 Y NA ZNF706 YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 30306 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr8 102191448 102191797 102191796 Y NA ZNF706 NA NA NA NA ZNF706 24624 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 103401606 103401938 103401841 Y NA UBR5 NA NA NA NA UBR5 21131 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 104088692 104088862 104088809 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 NA NA NA NA NA ATP6V1C1 57401 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 104093090 104093280 104093223 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32,DCAF13 NA NA NA NA NA BAALC 57658 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 104117409 104117806 104117725 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 BAALC FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1 IMR90 Hi-C 24141950 BAALC 33132 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 104197283 104197454 104197448 Y NA BAALC NA NA NA NA BAALC 46345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 104308052 104308138 104308090 Y NA FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA FZD6 523 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 104331705 104332089 104331783 Y RIMS2 FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA RP11-318M2.2 22705 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 105011226 105011541 105011384 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1C8.4 499322 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 306720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 106779848 106780177 106780013 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 290575 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 106878097 106878155 106878126 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 192597 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 107598628 107599080 107598706 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 109161 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 107665296 107665542 107665419 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 42699 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 107972770 107973116 107972943 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 264529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 108314571 108314619 108314595 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 193664 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 108317294 108317670 108317585 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 190613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 108452941 108453080 108453009 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 55203 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 222726 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 110288477 110288741 110288621 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 55812 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 110589431 110589605 110589518 Y NA EBAG9 NA NA NA NA EBAG9 39491 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 114266349 114266595 114266472 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 120303 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 115322659 115322858 115322759 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 935761 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 117378539 117378781 117378660 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 397961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 117456775 117457003 117456919 Y NA NA TRPS1,LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 UTP23 319739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 117529764 117530094 117529930 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 246648 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 118778404 118778792 118778598 Y NA NA EXT1 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 247452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 118885059 118885357 118885328 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 236735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 119117518 119117887 119117807 Y NA EXT1 NA NA NA NA EXT1 4205 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 119303956 119304407 119304075 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 181864 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 119319913 119320138 119320129 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 197821 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 119485123 119485454 119485409 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 146780 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 119536200 119536581 119536442 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 95653 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 119536968 119537364 119537323 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 94870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 119917519 119917835 119917587 Y NA TNFRSF11B NA NA NA NA TNFRSF11B 44604 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 120609076 120609341 120609202 Y NA NA NA NA NA NA ENPP2 74352 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 123883965 123883977 123883971 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 92332 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 123953901 123954018 123953907 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 98645 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124013159 124013422 124013291 Y NA DERL1 NA NA NA NA DERL1 39241 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124050911 124051177 124051044 Y NA DERL1 NA NA NA NA DERL1 1486 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124363606 124363931 124363783 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2 62659 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 124407455 124407786 124407574 Y FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2 ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 18804 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124462485 124463022 124462596 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA WDYHV1 35520 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124529265 124529734 124529486 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 21712 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 124547812 124548082 124548041 Y NA FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 3364 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 124889263 124889525 124889394 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 110567 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 ARF1P3 TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 47895 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 125282085 125282316 125282201 Y NA NA FAM91A1,TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 100617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 125539571 125539718 125539637 Y RNF139 NDUFB9,TATDN1 RNF139 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NDUFB9 9626 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126187320 126187484 126187432 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85238 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126268557 126268681 126268622 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0196 166475 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126356295 126356567 126356410 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 83996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 126372255 126372562 126372409 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 68001 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126452500 126452812 126452633 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11937 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126541064 126541373 126541286 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 100501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 126556751 126557301 126556981 Y NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 116188 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128182729 128182789 128182759 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 562891 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128185119 128185731 128185383 Y NA NA NA NA NA NA MYC 559949 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128319902 128320220 128320122 Y NA NA NA NA NA NA MYC 425460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128871975 128872421 128872033 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 67196 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr8 129262418 129262536 129262473 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 241561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 129981605 129981909 129981758 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 960748 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 130577240 130577439 130577294 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 449936 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131011351 131011453 131011402 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 15922 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131058084 131058195 131058140 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30709 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131232940 131233341 131233190 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 205565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131260848 131261137 131260957 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 192769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131289962 131290145 131290029 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 163761 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131354482 131354860 131354810 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 99046 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 133624238 133624582 133624369 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 61256 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 133933038 133933436 133933099 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 147420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 134230111 134230161 134230154 Y ST3GAL1 NA NA NA NA NA NDRG1 82104 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 135763975 135764179 135764077 Y NA ZFAT ZFAT MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAT 40683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 141725005 141725293 141725149 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 205608 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 142289630 142289814 142289772 Y NA SLC45A4 SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 26590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 142411426 142411896 142411690 Y DENND3,SLC45A4,PTP4A3 PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 11333 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 143758809 143759081 143758941 Y NA JRK,LY6K NA NA NA NA JRK 2305 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 10133 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 145070098 145070262 145070188 Y NA PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH NA NA NA NA GRINA 7872 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 145887419 145887725 145887588 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP39 21469 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 2632517 2632641 2632572 Y KCNV2 VLDLR NA NA NA NA VLDLR 12683 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 2655543 2655805 2655674 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 35709 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 2839342 2839735 2839533 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 2506 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr9 3470131 3470258 3470195 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 53746 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 3576230 3576494 3576362 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 51507 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 303183 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 4829866 4830028 4829909 Y NA RCL1 NA NA NA NA RCL1 38997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1 NA NA NA NA RCL1 44350 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 5893266 5893397 5893330 Y MLANA NA NA NA NA NA ERMP1 62149 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 5895206 5895407 5895334 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 64089 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 11018357 11018684 11018521 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1793660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1746982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.98360931486387 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 15306066 15306408 15306119 Y NA TTC39B NA NA NA NA TTC39B 708 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 16062752 16063225 16063009 Y NA NA CNTLN,C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 537071 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 208360 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 16526132 16526493 16526417 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 198319 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 16681430 16681562 16681496 Y NA RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 43250 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 18695 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 19322727 19322852 19322790 Y NA NA NA NA NA NA RPS6 55400 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 19557640 19557719 19557680 Y ACER2,SLC24A2 NA NA NA NA NA ACER2 150715 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD2 66759 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 21699320 21699393 21699347 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 101149 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 21809706 21810111 21809856 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 9164 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 22026827 22027085 22026888 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 16673 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 22040932 22041035 22040938 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 30778 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 22216803 22217265 22216812 Y NA NA CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 206649 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr9 22310596 22310829 22310637 Y NA NA MTAP,DMRTA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 134011 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 27434079 27434197 27434145 Y NA NA NA NA NA NA PLAA 488618 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA PLAA 618655 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 32183281 32183478 32183392 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 199140 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 32429787 32430147 32430005 Y NA ACO1 NA NA NA NA ACO1 47169 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 32524178 32524624 32524592 Y DDX58 TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 35153448 35153469 35153459 Y NA FAM214B,UNC13B UNC13B,ATP8B5P IMR90 Hi-C 24141950 UNC13B 6530 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 35491656 35492052 35492019 Y OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 111315 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 35516545 35516820 35516591 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 86547 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 82515 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 35924357 35924707 35924422 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 20168 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 36040345 36040403 36040371 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 5915 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 36154326 36154976 36154382 Y TLN1,GLIPR2 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA GLIPR2 19594 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,RNU4-53P,GNE NA NA NA NA RNU4-53P 33655 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 36795051 36795090 36795071 Y NA NA NA NA NA NA MELK 224192 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 37378163 37378599 37378305 Y PAX5,ZCCHC7,FBXO10,ZBTB5 GRHPR NA NA NA NA GRHPR 42064 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr9 37859471 37859543 37859507 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 60037 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 68423908 68424365 68424207 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 29010 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr9 71413577 71413589 71413582 Y NA FAM122A NA NA NA NA FAM122A 20613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 72344996 72345326 72345161 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 27549 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 72695513 72695798 72695599 Y SMC5 MAMDC2 NA NA NA NA MAMDC2 39016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 73021810 73022419 73022127 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5121 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.14502040031132 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 73168765 73169157 73169115 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 141225 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 73198481 73198826 73198654 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 170941 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chr9 77588894 77589149 77589022 Y NA C9orf40 NA NA NA NA C9orf40 23092 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 79018113 79018533 79018297 Y NA RFK,GCNT1 NA NA NA NA RFK 10680 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 79207752 79208113 79207774 Y NA AL161626.1 NA NA NA NA AL161626.1 23021 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 80637884 80638322 80638164 Y NA GNAQ NA NA NA NA GNAQ 6052 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 81154672 81154952 81154897 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 244613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 81586798 81586848 81586823 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 417371 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 81627556 81627780 81627606 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 376439 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 431590 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 86785805 86786025 86785915 Y NA NA HNRNPK,RMI1,C9orf64,SLC28A3 IMR90 Hi-C 24141950 RMI1 192179 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 86854349 86854479 86854380 Y NA NA HNRNPK,RMI1 IMR90 Hi-C 24141950 RMI1 260723 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 88294983 88295025 88294997 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 59919 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 88346951 88347024 88346988 Y NA AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 7920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 90166692 90166955 90166778 Y NA RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 28475 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 91125141 91125399 91125267 Y NA NA SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2 IMR90 Hi-C 24141950 SPIN1 123807 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 91147328 91147523 91147436 Y NXNL2 NA NA NA NA NA SPIN1 145994 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 91654177 91654400 91654289 Y NA S1PR3 NA NA NA NA S1PR3 49815 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 91998036 91998395 91998345 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 66615 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 92004867 92005103 92005008 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 73446 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 92170883 92170999 92170941 Y NA GADD45G SECISBP2,SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 GADD45G 46929 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA RP11-305L7.3 NA NA NA NA RP11-305L7.3 32622 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 94123007 94123342 94123181 Y NA AUH NA NA NA NA AUH 812 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 94587450 94587551 94587492 Y NA NA NA NA NA NA ROR2 122893 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 94968812 94969005 94968908 Y NA NA NA NA NA NA IARS 85033 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 95029374 95029660 95029516 Y NA IARS NA NA NA NA IARS 24378 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 96335202 96335517 96335360 Y NA PHF2 NA NA NA NA PHF2 1172 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 96723182 96723238 96723197 Y NA BARX1,RP11-231K24.2 BARX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-231K24.2 7303 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 96845736 96845997 96845867 Y NA CYCSP24 NA NA NA NA CYCSP24 47424 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90963 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90183 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 97623374 97623749 97623496 Y C9orf3,C9orf3 NA NA NA NA NA C9orf3 136391 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 97679079 97679413 97679326 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 192096 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 97758166 97758608 97758351 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 271183 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 97966578 97966817 97966786 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 111174 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 98389369 98389482 98389428 Y NA NA LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 PTCH1 112030 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 98486890 98487110 98487000 Y PTCH1,PTCH1 NA C9orf102,SLC35D2,LINC00476,HSD17B3,LINC00092,LOC158435,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 149149 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 98629500 98629569 98629535 Y NA LINC00476 NA NA NA NA LINC00476 6690 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 100432763 100433089 100432926 Y TSTD2,XPA NCBP1,TSTD2,XPA NA NA NA NA XPA 24550 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 101871896 101872113 101872024 Y TGFBR1 TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 7576 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 102015806 102016715 102016602 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 33460 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 102646895 102646933 102646914 Y NA STX17 NA NA NA NA STX17 19982 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 105966405 105966781 105966517 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 887760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 RP11-217B7.2,ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 108220808 108221168 108220887 Y NA FSD1L NA NA NA NA FSD1L 12731 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 108266303 108266427 108266370 Y FSD1L,FSD1L,TMEM38B NA NA NA NA NA FKTN 51984 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 109714113 109714149 109714131 Y NA NA NA NA NA NA ZNF462 90735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 110500244 110500586 110500377 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-438P9.1 205573 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 110811401 110811623 110811540 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 516730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 28312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 112578065 112578653 112578312 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37296 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 112579595 112579724 112579673 Y NA PALM2-AKAP2,AKAP2 C9orf152 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP2 38826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 112730714 112730897 112730789 Y NA NA NA NA NA NA AKAP2 189945 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 204314 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 112861625 112861803 112861710 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 155117 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 112919210 112919591 112919336 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 97329 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 113515835 113516213 113516024 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 282768 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 113560028 113560416 113560156 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 238565 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 113570937 113571275 113571156 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 227706 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 114505631 114505796 114505739 Y NA NA NA NA NA NA GNG10 84016 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 114707434 114708001 114707643 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 50388 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 114774761 114774976 114774762 Y UGCG NA NA NA NA NA UGCG 117715 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958 NA NA NA NA KIAA1958 11601 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 115914968 115915416 115915186 Y SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15 SLC31A2 NA NA NA NA SLC31A2 3746 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 116031847 116032083 116031965 Y NA PRPF4,CDC26 NA NA NA NA PRPF4 3540 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 116341254 116341479 116341362 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 136243 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 117131457 117132230 117131898 Y DFNB31,DFNB31,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 133500 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 117134599 117134885 117134873 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 130845 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 117159955 117160026 117159991 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 105704 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNC 220925 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 117860552 117860777 117860665 Y NA TNC NA NA NA NA TNC 17759 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 480041 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 2.45145188607008 chr9 118378080 118378500 118378342 Y NA NA PAPPA,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 499544 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chr9 118412488 118412760 118412588 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 501323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 118413835 118414106 118413974 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 499977 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478870 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 118701397 118701694 118701515 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 212389 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 118704303 118704501 118704353 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 209582 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 118858385 118858739 118858560 Y NA NA LINC00474,PAPPA,LOC100128505,ASTN2 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 55344 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 119055041 119055304 119055148 Y PAPPA NA NA NA NA NA PAPPA 140958 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 120481913 120482131 120481990 Y TLR4 TLR4 NA NA NA NA TLR4 17303 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 123237192 123237494 123237347 Y MEGF9,FBXW2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 102954 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 123243513 123243809 123243661 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 96639 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 123546044 123546305 123546215 Y TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2 FBXW2 NA NA NA NA FBXW2 7385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 123878647 123878673 123878659 Y NA CNTRL NA NA NA NA CNTRL 43506 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 124040831 124041134 124040970 Y GSN NA NA NA NA NA RAB14 57539 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 124161523 124161647 124161545 Y NA STOM GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM IMR90 Hi-C 24141950 STOM 30992 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 124260871 124261375 124261091 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 65961 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 125654025 125654372 125654281 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 11248 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 125934200 125934213 125934207 Y OR1L4,OR1L6,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 94642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 125956755 125956816 125956769 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 72039 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 126029655 126030141 126030108 Y NA STRBP NA NA NA NA STRBP 800 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 126291594 126291648 126291621 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 262739 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 268216 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 126780358 126780798 126780587 Y NA LHX2 NA NA NA NA LHX2 18409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 127110676 127110867 127110772 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 64856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127165878 127166187 127166033 Y NA PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 9536 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127266277 127266534 127266531 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 90554 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127468042 127468336 127468195 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 49296 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127621077 127621225 127621167 Y NA RPL35,ARPC5L,RNU4-82P NA NA NA NA RPL35 1035 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127861290 127861583 127861437 Y NA SCAI NA NA NA NA SCAI 42202 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 11.0315334873153 chr9 128298527 128298744 128298662 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 128396600 128396979 128396804 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 70534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 128530354 128530667 128530385 Y NA PBX3 NA NA NA NA PBX3 22730 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 129263295 129263658 129263477 Y FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B NA NA NA NA NA LMX1B 111064 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 130834459 130834744 130834726 Y NA SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 5974 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 131136560 131136899 131136687 Y NA SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4962 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 132751387 132751642 132751502 Y USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA FNBP1 51831 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 132814142 132814504 132814316 Y TOR1B FNBP1,GPR107 NCS1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR107 437 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr9 133565926 133566149 133566038 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 959 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 133721974 133722320 133722184 Y NA NA QRFP,FIBCD1 IMR90 Hi-C 24141950 ABL1 134641 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 30920 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 134515858 134516155 134515990 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 97306 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 134908976 134909021 134908999 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 44274 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 134913456 134913470 134913463 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 39825 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 135989434 135989663 135989519 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 47638 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 136292897 136293168 136293034 Y SLC2A6,RALGDS REXO4,SLC2A6 NA NA NA NA REXO4 11733 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 136327922 136327947 136327935 Y RALGDS,RALGDS,ADAMTSL2,SLC2A6 REXO4,SLC2A6 NA NA NA NA SLC2A6 14312 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 137219951 137220008 137219980 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 13007 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 137305745 137306050 137305907 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 98801 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 186642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 137737455 137737738 137737674 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 205835 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 138977760 138977846 138977803 Y NA NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 7285 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 7.04792417245147 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B,C9orf173 NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B,C9orf173 NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 140169154 140169348 140169240 Y NA TUBB4B,C9orf173,NRARP NA NA NA NA NRARP 25355 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 140190695 140190800 140190760 Y NA C9orf173,NRARP NA NA NA NA NRARP 3903 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chr9 140341522 140341675 140341601 Y EHMT1,ANAPC2,NELF EXD3,NOXA1 NA NA NA NA NOXA1 25720 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chr9 140689053 140689448 140689207 Y NA NA NA NA NA NA EHMT1 177609 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 1514556 1514901 1514870 Y ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL SLC25A6 NA NA NA NA SLC25A6 4939 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 2067813 2068091 2068086 Y NA NA NA NA NA NA ZBED1 348917 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 2301315 2301326 2301321 Y NA NA NA NA NA NA ZBED1 115682 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 3102520 3102927 3102578 Y NA NA CXorf28 IMR90 Hi-C 24141950 ARSE 218234 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 3263317 3263504 3263415 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 366145 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 6217986 6218124 6218055 Y NA NA NA NA NA NA MIR4767 845777 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 7896783 7897141 7896963 Y VCX PNPLA4 NA NA NA NA PNPLA4 3003 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 9309120 9309320 9309226 Y TBL1X,TBL1X NA TBL1X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1X 120015 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 9536624 9537203 9536862 Y TBL1X,TBL1X NA NA NA NA NA TBL1X 107289 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM2 51107 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 9929375 9929481 9929417 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 52121 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 11460430 11460509 11460495 Y AMELX NA NA NA NA NA MSL3 313769 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 454304 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 13138325 13138351 13138340 Y NA NA FAM9C,LOC100133123,TMSB4X IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 147098 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 13282012 13282232 13282116 Y TLR7 GS1-600G8.5 LOC100133123 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-600G8.5 37339 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 13318186 13318365 13318276 Y NA GS1-600G8.5 NA NA NA NA GS1-600G8.5 1206 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chrX 13416625 13416882 13416754 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 21166 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 16671538 16671979 16671762 Y NA NA NA NA NA NA CTPS2 57080 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 16805192 16805460 16805250 Y TXLNG TXLNG NA NA NA NA TXLNG 2642 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chrX 19126282 19126386 19126334 Y GPR64 NA NA NA NA NA PDHA1 233625 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 19865115 19865333 19865186 Y SH3KBP1 SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 38386 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 20154251 20154286 20154269 Y NA MAP7D2,EIF1AX NA NA NA NA EIF1AX 3676 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 21947998 21948242 21948120 Y NA SMS MBTPS2,SMS IMR90 Hi-C 24141950 SMS 8449 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 22708356 22708573 22708502 Y NA NA NA NA NA NA SMS 751665 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 23806806 23807042 23806932 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 7516 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 23829236 23829783 23829513 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 29946 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 23971140 23971524 23971479 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 47083 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 25664451 25664736 25664645 Y MAGEB18 NA NA NA NA NA POLA1 954415 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 30630746 30631092 30631067 Y GK,CXorf21 FTLP2,GK NA NA NA NA FTLP2 15323 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 38130522 38130869 38130628 Y CYBB,RPGR NA NA NA NA NA SRPX 51826 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA RPGR 153975 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 38675493 38675777 38675643 Y NA MID1IP1 NA NA NA NA MID1IP1 16808 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 39614973 39615267 39615108 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 30123 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 39961698 39961932 39961714 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 72650 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 40749971 40750359 40750172 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 RP11-77G22.2 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 14878 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 41125005 41125150 41125071 Y NA NA DDX3X,USP9X IMR90 Hi-C 24141950 DDX3X 65501 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 41308972 41309137 41309059 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 118321 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA NDP 57840 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chrX 44774748 44775132 44774822 Y NA KDM6A NA NA NA NA KDM6A 43991 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 45241202 45241396 45241250 Y NA NA NA NA NA NA MIR221 362298 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 45488077 45488123 45488115 Y NA NA NA NA NA NA MIR221 115571 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 45570603 45570921 45570704 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 32773 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 45647781 45648040 45647909 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43251 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1,SYN1 NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 47880817 47881226 47880903 Y SYN1 ZNF182,ZNF630 NA NA NA NA ZNF182 19440 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 48390158 48390246 48390210 Y NA PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3 NA NA NA NA TBC1D25 5599 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 48571549 48571765 48571661 Y NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19604 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 48794332 48794681 48794452 Y PORCN,TBC1D25,WAS,PQBP1,TFE3,PPP1R3F,FOXP3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1 NA NA NA NA OTUD5 18967 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 49117018 49117310 49117218 Y PIM2,PPP1R3F,FOXP3 HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 6996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 53145490 53145857 53145592 Y NA TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 24163 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 53292881 53293274 53292937 Y NA KDM5C NA NA NA NA KDM5C 40277 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA SMC1A 18996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 53741584 53742291 53741941 Y KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8 HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 29911 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chrX 56839801 56840427 56840156 Y NA NA NA NA NA NA UQCRBP1 77791 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 273914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 64627187 64627345 64627245 Y MSN NA NA NA NA NA LAS1L 125310 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 65294905 65295133 65294938 Y MSN NA NA NA NA NA HEPH 85258 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 67430932 67431161 67431047 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 220594 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 69386644 69386665 69386655 Y NA IGBP1 NA NA NA NA IGBP1 35345 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA NA NA NA NA NA PDZD11 145420 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA RPS4X 140764 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 73237406 73237798 73237506 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 75247 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 73340869 73341139 73340910 Y RLIM NA NA NA NA NA FTX 170270 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 74958533 74958836 74958643 Y ZDHHC15,MAGEE2 NA NA NA NA NA UPRT 466613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA NA NA NA NA NA UPRT 468902 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chrX 75368142 75368530 75368366 Y NA NA NA NA NA NA LDHBP2 185714 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 77306835 77307068 77306952 Y NA PGK1 NA NA NA NA PGK1 11617 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA LPAR4 92243 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.83858891455256 chrX 79827525 79827860 79827693 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 235327 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.5321574287938 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 99913933 99914424 99914133 Y SYTL4,SYTL4 TSPAN6,SRPX2 NA NA NA NA SRPX2 16718 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 102063503 102063615 102063509 Y NA NA NA NA NA NA BHLHB9 89887 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chrX 109016670 109016888 109016809 Y ACSL4 ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 42038 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 109017803 109018393 109018148 Y NA ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 43171 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 110863259 110863845 110863518 Y NA EIF4BP7,ALG13 NA NA NA NA EIF4BP7 542 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 115004721 115004876 115004807 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 78546 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 155061 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 117487110 117487426 117487273 Y DOCK11,WDR44 WDR44 NA NA NA NA WDR44 9074 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 117885861 117886125 117885896 Y LONRF3 IL13RA1 NA NA NA NA IL13RA1 26326 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 4.29004080062263 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 1.22572594303504 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 3.0643148575876 chrX 128364824 128364943 128364883 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 290534 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 129121612 129121744 129121653 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 8529 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 129216343 129216741 129216485 Y SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1 ELF4 NA NA NA NA ELF4 25950 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1 NA NA NA NA AIFM1 9468 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 133646648 133646903 133646776 Y NA NA NA NA NA NA HPRT1 54465 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 149863384 149863571 149863479 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3949 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.612862971517519 chrX 152980497 152980777 152980637 Y NA SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3 NA NA NA NA BCAP31 7375 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 153144826 153145116 153145102 Y NA CYCSP45,L1CAM NA NA NA NA L1CAM 27561 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 153152883 153153053 153153003 Y RENBP CYCSP45,L1CAM,ARHGAP4,NAA10 NA NA NA NA L1CAM 19624 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10 NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 153389356 153389701 153389458 Y ARHGAP4,RENBP,IKBKG,IKBKG,IKBKG,MECP2 MECP2 TKTL1,MECP2,NAA10,RENBP,HCFC1,FLNA,RPL10,DNASE1L1 IMR90,MCF7,HELA,K562,GM12878 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 MECP2 28144 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.30643148575876 chrX 153956289 153956510 153956418 Y TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 21348 CAGE HTMMT hg19 FANTOM5 0.919294457276279