chr1	839741	840250	839788	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	18010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	840753	841210	840812	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	17050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	855764	856157	855856	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	2103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	856539	856757	856714	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	1503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	858256	858648	858448	Y	SAMD11	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	918449	918555	918505	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	HES4	14997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	936652	937138	936860	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	C1orf170	K562	ChIA-PET	22265404	HES4	3100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.503528737185248
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.461510839583787
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	1070745	1071151	1070944	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	21004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	TAS1R3	983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425610668141653
chr1	1286847	1286913	1286880	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	4117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	1294735	1294982	1294877	Y	NA	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	DVL1	12005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	MRPL20	27778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr1	1772108	1772256	1772158	Y	TMEM88B,ATAD3C,CALML6,PRKCZ	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	48239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.444751831456909
chr1	2068660	2068858	2068763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	73301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	2111429	2112079	2111937	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	30080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	2254081	2254230	2254152	Y	HES5	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	66916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.813201821800367
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr1	2509702	2510198	2509855	Y	SKI,TNFRSF14	FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	5732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.798669039312453
chr1	3374928	3375314	3374967	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	5938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	3398864	3399114	3399029	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	29874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	51771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.70049669413412
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619693354791488
chr1	3728005	3728221	3728113	Y	NA	LRRC47,CEP104,DFFB	NA	NA	NA	NA	LRRC47	16937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.648638768285769
chr1	6040561	6040806	6040680	Y	NA	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	KCNAB2	8720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	6054896	6055025	6054948	Y	TNFRSF25,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	4363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	6221566	6221669	6221628	Y	PLEKHG5,CHD5	RNF207,RPL22	NA	NA	NA	NA	RNF207	41866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr1	6337854	6338055	6337955	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	18819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6354110	6354322	6354254	Y	ZBTB48,GPR153,ACOT7	GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	35075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	6451759	6451831	6451795	Y	NA	ACOT7,HES2	NA	NA	NA	NA	ACOT7	620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	6709089	6709221	6709155	Y	NA	PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	THAP3	26163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	334349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	7289758	7290075	7289881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	446374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	7327634	7328033	7327873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	484250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	7359415	7359679	7359556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	469650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr1	7461964	7462325	7462107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	367004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr1	7540504	7540548	7540528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	288781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	7609389	7609632	7609504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	219697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.815775233000583
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	8054249	8054565	8054423	Y	NA	PARK7,ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	29803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8107848	8108157	8108001	Y	NA	ERRFI1	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	23480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	52933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8154517	8154933	8154754	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	70149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	72280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	73049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8181009	8181247	8181098	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	83410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	8187209	8187385	8187282	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	77272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	66323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	8250099	8250155	8250127	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	14502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	9750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187893855960214
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	6617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.316244878933856
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	2116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.71402324640071
chr1	8264458	8264788	8264713	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	7384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412190998473223
chr1	8469706	8470061	8470001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-7P	205049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	303846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8875055	8875165	8875110	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1-IT1	2141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	8986021	8986139	8986041	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	48713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	8999811	9000211	8999889	Y	NA	NA	SLC2A5,SLC2A7	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	62503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	9241165	9241560	9241362	Y	NA	RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	9293549	9293739	9293591	Y	H6PD	H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	9298798	9298942	9298853	Y	NA	H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	5964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	9355493	9355709	9355601	Y	NA	SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	4554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819773616119104
chr1	9535183	9535425	9535306	Y	NA	NA	SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	62116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	9912448	9912800	9912669	Y	KIF1B,CLSTN1	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	29864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	10359215	10359483	10359349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF1B	90352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	10447707	10448369	10448247	Y	NA	PGD,APITD1,APITD1-CORT	NA	NA	NA	NA	PGD	8280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	10558276	10558621	10558397	Y	NA	PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	DFFA	27693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	10816030	10816223	10816138	Y	CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	38484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	10864514	10864918	10864748	Y	NA	CASZ1	PEX14,CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	9807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	10959985	10960148	10960064	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	11122928	11123178	11122962	Y	NA	SRM,EXOSC10	NA	NA	NA	NA	SRM	4847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	11761755	11762049	11761783	Y	PTCHD2,FBXO44,FBXO44,MAD2L2,C1orf187	FBXO44,FBXO2,FBXO6,MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	MAD2L2	12048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	RNU5E-1	2301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	12050736	12051137	12050880	Y	NPPA,NPPB,MFN2	MFN2,MIIP	NA	NA	NA	NA	MFN2	12498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	94725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	12485613	12485784	12485698	Y	PRAMEF1,AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	189953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	12544374	12544691	12544532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	131046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr1	15664307	15664455	15664338	Y	NA	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	69936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.267428152933953
chr1	15666999	15667145	15667070	Y	NA	NA	CTRC,EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	67246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	15673118	15673422	15673270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	60969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	15738146	15738632	15738365	Y	SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	3755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	15738661	15738986	15738829	Y	SPEN,PLEKHM2,DDI2,EFHD2,CASP9,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	4270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	15786440	15786713	15786642	Y	PLEKHM2,CTRC,CELA2A,CELA2B	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	52049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	15827976	15828116	15828046	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	22913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	15946733	15946892	15946831	Y	EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2	AGMAT,RP4-680D5.2,CHCHD2P6,DDI2	NA	NA	NA	NA	DDI2	4738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	16007283	16007579	16007390	Y	FHAD1,EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,PLEKHM2	PLEKHM2	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	1248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	5685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	16209325	16209770	16209445	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	36683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,HSPB7	NA	NA	NA	NA	HSPB7	4493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.624421887100376
chr1	16500084	16500309	16500220	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.270887642873947
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.680852415708204
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400507708216482
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP13A2	104719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.73238104739883
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.60748951436518
chr1	17254357	17254559	17254407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A2	81864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	17353741	17353845	17353793	Y	NA	ATP13A2,SDHB	ATP13A2	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	17318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	17454855	17455288	17455072	Y	PADI4	NA	PADI2,PADI1,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	SDHB	76190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	NA	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI3	55333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	17518941	17519138	17519054	Y	ATP13A2,PADI3	NA	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI3	54455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	17534687	17534794	17534729	Y	NA	PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	38799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	17557386	17557571	17557478	Y	NA	PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	16022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.04240639170078
chr1	17875004	17875168	17875086	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	10674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	17896198	17896624	17896362	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	31868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.335506193730656
chr1	19078001	19078369	19078185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	148906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	19190435	19190769	19190601	Y	NA	ALDH4A1	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	36506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	19778785	19779174	19779108	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	30892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178209757262733
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.515942176632355
chr1	20924301	20924404	20924353	Y	CDA	FAM43B,CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	10860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	21084820	21085159	21084988	Y	NA	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	26657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21510856	21510968	21510912	Y	ECE1,ECE1	EIF4G3	EIF4G3,DDOST,KIF17,HP1BP3,SH2D5	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4G3	9479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21558552	21558736	21558644	Y	EIF4G3,ECE1,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	57175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04283749433108
chr1	21588829	21589430	21588896	Y	ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	80567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	21611199	21611583	21611510	Y	EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	58414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	21643831	21644195	21643955	Y	ECE1,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	25802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	21649091	21649481	21649332	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	20516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	21650806	21651685	21651350	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	18312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.549616122435524
chr1	21663991	21664182	21664145	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	21664400	21664833	21664668	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	21724067	21724372	21724186	Y	NA	NBPF3	ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48	IMR90	Hi-C	24141950	NBPF3	40249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPL	97754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr1	21965161	21965473	21965377	Y	RAP1GAP	NA	NA	NA	NA	NA	ALPL	131303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.506258077934875
chr1	22076024	22076450	22076245	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	31649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr1	22106565	22106957	22106761	Y	NA	USP48	NA	NA	NA	NA	USP48	1142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	22231370	22231630	22231560	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	22366226	22366841	22366516	Y	USP48,ZBTB40	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	10279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	22375194	22375332	22375261	Y	CDC42	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	1788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	22611972	22612241	22612107	Y	WNT4	NA	C1QC,C1QB,EPHA8,C1QA,CDC42,WNT4,ZBTB40	IMR90	Hi-C	24141950	WNT4	143510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	23113356	23113555	23113472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	78024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr1	23542417	23542518	23542468	Y	HTR1D	LUZP1	KDM1A,LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	40116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	TCEA3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	23839318	23839630	23839474	Y	HNRNPR,ZNF436	ASAP3,E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	E2F2	16082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.73114869578705
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.390320494408341
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.53972378901192
chr1	23903714	23904323	23904234	Y	ID3	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	19429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	23912037	23912393	23912293	Y	PNRC2,RPL11	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	27752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.794670656193932
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr1	23961555	23961694	23961621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL11	54575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.864017739359529
chr1	23977708	23977880	23977794	Y	NA	RPL11	NA	NA	NA	NA	RPL11	38389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr1	24476382	24476609	24476496	Y	PNRC2,GRHL3	MYOM3,IL22RA1	IL22RA1	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	8771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	24518503	24518681	24518625	Y	PNRC2,GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	50892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr1	24833128	24833464	24833216	Y	RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	5741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	25344029	25344296	25344110	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	54417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr1	25348659	25349200	25348944	Y	SRRM1,RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	59047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr1	25357149	25357829	25357484	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	67537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.426723780961136
chr1	25823926	25824130	25824028	Y	NA	LDLRAP1	LDLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	43941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAP1	74673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	26617206	26617304	26617268	Y	SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	13539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	26634832	26635080	26634851	Y	NA	SH3BGRL3,CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	CD52	7368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	26642014	26642169	26642069	Y	FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,UBXN11,UBXN11,CD52	SH3BGRL3,CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	CD52	279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.48717058409101
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.817774424559843
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30715334288629
chr1	27154485	27154771	27154729	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	3284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	27154983	27155478	27155098	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	3782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	27165490	27165816	27165600	Y	NA	ZDHHC18,SFN,GPN2	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	14289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.68852080047677
chr1	27336678	27336931	27336804	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	27519342	27519481	27519412	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A1	27870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr1	27772061	27772370	27772216	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	42299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27831022	27831314	27831199	Y	NA	WASF2	SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR	IMR90	Hi-C	24141950	WASF2	16353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149108414219042
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	27871123	27871471	27871363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	56454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196081878209095
chr1	27891553	27891803	27891694	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	37139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225183221252787
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr1	28050414	28050762	28050588	Y	NA	STX12	NA	NA	NA	NA	FAM76A	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	28213825	28214033	28213970	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	RPA2,SMPDL3B	NA	NA	NA	NA	RPA2	25224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28238886	28239222	28239086	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	RPA2	35	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28268335	28268431	28268383	Y	NA	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	SMPDL3B	8831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	28305616	28305920	28305789	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	21643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28355043	28355235	28355139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA3	57972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	28389248	28389585	28389551	Y	NA	EYA3	NA	NA	NA	NA	EYA3	23622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	28437697	28438098	28437903	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566	IMR90	Hi-C	24141950	EYA3	24490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.856559866301015
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.558570071942637
chr1	28640564	28640739	28640692	Y	C1orf38,XKR8,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18	MED18	MED18	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED18	12774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	28813874	28814267	28814011	Y	EYA3	RCC1,SNHG3,SNORA73B	NA	NA	NA	NA	RCC1	16188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	29513219	29513546	29513454	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	6720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	29517304	29517322	29517313	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	10805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290914884928979
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	31109882	31110078	31109981	Y	NA	NA	PTPRU	IMR90	Hi-C	24141950	LAPTM5	118589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31517703	31518005	31517854	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	18833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	84858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00328612533168
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.762960123882159
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.721984234569888
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31772172	31772177	31772175	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	4330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	32166698	32166999	32166824	Y	COL16A1	NA	NA	NA	NA	NA	PEF1	58201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr1	32170830	32171205	32171045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI2	57289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	BAI2	47508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.971228407458654
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.57804098576024
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.24392398588002
chr1	32423598	32423720	32423682	Y	PTP4A2	PTP4A2	SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	15141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	32656692	32656709	32656701	Y	ZBTB8A	TXLNA,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP	NA	NA	NA	NA	IQCC	12527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	32701561	32701886	32701724	Y	NA	IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B	NA	NA	NA	NA	MTMR9LP	3335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351918016296285
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNC	54075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	54860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	54284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	53649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	52981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	33232248	33232565	33232367	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	S100PBP	47803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	33284832	33285123	33284978	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	YARS	3078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	33427851	33428169	33427991	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33433896	33434020	33433958	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	5610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33457914	33458607	33458311	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	29628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33463690	33463885	33463767	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	35404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33645848	33646140	33645995	Y	HPCA,PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33802277	33802571	33802529	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	39302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	35953903	35954237	35954109	Y	SFPQ,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	66837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr1	36397577	36397741	36397665	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	154735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	36428229	36428381	36428320	Y	STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	124095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	121088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204425830007387
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	36617554	36617914	36617691	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	1266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36721428	36721771	36721600	Y	NA	THRAP3,SH3D21	NA	NA	NA	NA	THRAP3	33411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	36853020	36853462	36853143	Y	NA	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	3523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18806767691315
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.625152036290742
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	38285621	38285821	38285720	Y	ZC3H12A,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	13764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	38308355	38308564	38308401	Y	ZC3H12A,SNIP1,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	14728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	38465723	38465839	38465779	Y	MTF1,FHL3	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	3439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	38466019	38466413	38466271	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	2865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	38469574	38470165	38469756	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	38518708	38519047	38518874	Y	NA	FHL3,UTP11L,POU3F1	POU3F1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	POU3F1	8258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	39629010	39629413	39629213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	84022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	39633654	39634014	39633702	Y	BMP8A	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	88666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	16420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.950853979842372
chr1	40283075	40283206	40283146	Y	PABPC4,RLF,MFSD2A	BMP8B	MYCL1	K562	ChIA-PET	22265404	BMP8B	30542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	40853198	40853308	40853253	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	44676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	41343431	41343839	41343651	Y	NA	CITED4	KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	17413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	41367669	41367867	41367801	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	41651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	41622480	41622650	41622563	Y	NA	NA	CTPS,LOC100507178	IMR90	Hi-C	24141950	SCMH1	83176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227756632453003
chr1	41962532	41962651	41962593	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	14188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	41966127	41966464	41966357	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	17783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	41967378	41967702	41967588	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	19034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	42073844	42074019	42073961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	125500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38632211128982
chr1	42149945	42149960	42149949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	201601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.438910186328538
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.440753448338388
chr1	43402214	43402581	43402425	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	43407355	43407700	43407616	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	14830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	6570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	WDR65	101615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43760174	43760222	43760211	Y	TIE1	EBNA1BP2	C1orf210	K562	ChIA-PET	22265404	EBNA1BP2	25567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283457011870465
chr1	44011575	44011705	44011627	Y	NA	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	22717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	44150815	44151139	44150977	Y	ST3GAL3,SLC6A9,IPO13	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	18356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08009108155579
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	44692988	44693156	44693052	Y	ATP6V0B	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	15861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	44950888	44951090	44950987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	44951424	44951733	44951502	Y	TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	45167170	45167180	45167175	Y	NA	TMEM53,RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C	NA	NA	NA	NA	RNU5F-1	18394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	45192729	45193123	45192925	Y	NA	RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C,RPS8,SNORD55	KIF2C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU5D-1	1719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	45298718	45299070	45298894	Y	NA	PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	15049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	45670767	45670868	45670821	Y	PTCH2,ZSWIM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM5	99013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	45909846	45909857	45909852	Y	NA	TESK2	NA	NA	NA	NA	TESK2	45015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	45990749	45991039	45990946	Y	NA	TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1	NA	NA	NA	NA	PRDX1	4030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236483547880411
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	46573980	46574380	46574180	Y	TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	64365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr1	46637172	46637331	46637258	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	1414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	46955737	46955918	46955906	Y	DMBX1	NA	FAAH,DMBX1,MKNK1	IMR90	Hi-C	24141950	MKNK1	124597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	46986321	46986408	46986365	Y	DMBX1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	94107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501529545625988
chr1	46999025	46999241	46999126	Y	ATPAF1-AS1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	81274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	47718105	47718425	47718265	Y	NA	TAL1	TAL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAL1	22213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.442369676268532
chr1	48224075	48224507	48224159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK1	426606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.17859317723647
chr1	48515615	48515747	48515671	Y	SPATA6	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	395861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	48515939	48516296	48516118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	395312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	49397467	49397500	49397484	Y	BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	461622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	50619908	50620155	50620032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL4	108222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51056997	51057361	51057215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	186651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	160001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr1	51097851	51098184	51098018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	145828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	51102056	51102361	51102067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	141651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	1576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	17715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	68010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51442122	51442408	51442227	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	17705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr1	51475380	51475551	51475487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	50963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51986075	51986410	51986173	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	EPS15	3075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	51997947	51998232	51998197	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS15	14947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	52044179	52044304	52044242	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL9	3328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	52341008	52341095	52341052	Y	CC2D1B,OSBPL9	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	1382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	52885344	52885737	52885540	Y	ZCCHC11	ORC1,PRPF38A	NA	NA	NA	NA	PRPF38A	17108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	53369161	53369511	53369336	Y	SCP2,ECHDC2	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	21373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	53482500	53482782	53482682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCP2	91599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42,LDLRAD1	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	54739679	54739787	54739710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	75970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.311289312545263
chr1	54749325	54749366	54749346	Y	NA	NA	CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	85616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	54765179	54765190	54765186	Y	NA	NA	MRPL37,CYB5RL	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	101470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739856355516249
chr1	55327144	55327486	55327453	Y	NA	RP11-67L3.5,DHCR24	NA	NA	NA	NA	RP11-67L3.5	23062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	55411305	55411465	55411371	Y	USP24	TMEM61	DHCR24,TMEM61,BSND,HEATR8-TTC4,USP24,C1orf177,PCSK9,TTC22	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM61	33000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	55431735	55431939	55431831	Y	NA	TMEM61	TMEM61,HEATR8-TTC4,BSND,PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM61	12526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	55506956	55507037	55506997	Y	NA	PCSK9	NA	NA	NA	NA	PCSK9	3735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	55894779	55895033	55894906	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	215993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	55909250	55909597	55909489	Y	NA	NA	PPAP2B,PRKAA2	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	230464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	56184456	56184884	56184686	Y	NA	NA	PRKAA2,PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	505670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	56771744	56771759	56771752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	337215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	56919158	56919299	56919214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	189675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	57948146	57948309	57948229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	564654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	57961356	57961707	57961532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	551256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	57988271	57988573	57988424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	524390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543044328116787
chr1	58225769	58226165	58225967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	286798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	59008745	59009101	59008916	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	DAB1	1305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	59049880	59049917	59049902	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	8714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr1	59280364	59280505	59280397	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.606046651043352
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.622422695541115
chr1	59281510	59281579	59281545	Y	JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	33725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.458398535205044
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	113921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	59394323	59394565	59394423	Y	NA	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	89494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	59395500	59395772	59395634	Y	JUN	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	88287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr1	59524373	59524568	59524471	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	40314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	59761390	59761720	59761439	Y	NA	FGGY	NA	NA	NA	NA	FGGY	1080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	59821110	59821407	59821235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	60800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	59910700	59911009	59910820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	150390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr1	61549054	61549253	61549232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	220123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178209757262733
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr1	61583915	61584228	61583999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	254984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	320855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	61662774	61662930	61662815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	333843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	61707460	61707670	61707565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	378529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	62609116	62609459	62609128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	290509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	62773248	62773553	62773401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	126415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1,RP11-182I10.3	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	65639675	65639734	65639705	Y	NA	AK4	NA	NA	NA	NA	AK4	28443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr1	65992905	65993110	65992971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	108635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	66724177	66724356	66724261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	664214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	66728047	66728190	66728184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	660380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	66736293	66736539	66736358	Y	PDE4B,PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	652031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	66757072	66757442	66757250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	631128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	66760490	66760861	66760661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	627709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	66782459	66782839	66782588	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	605731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	67883059	67883215	67883204	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	10883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	68257818	68258216	68258148	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	38934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68314949	68315302	68315127	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	17799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	68321515	68321736	68321554	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	24365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68340774	68341128	68340951	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	43624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68354536	68354908	68354722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	57386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68663588	68663867	68663728	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	32936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68858132	68858533	68858311	Y	NA	NA	WLS,LOC100289178	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	102371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68945486	68945782	68945636	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	15122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	70238650	70238794	70238722	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	430509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	70635460	70635702	70635581	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	LRRC40	33601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	70807938	70808237	70808103	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	10180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	71398250	71398442	71398389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2	146538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	72073753	72074154	72073955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2-AS2	528746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	72715442	72715840	72715642	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	30577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.15727900140902
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD45A	393817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.801745565623331
chr1	78957462	78957762	78957688	Y	PTGFR	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44L	125845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.403967198156476
chr1	80973840	80974001	80973921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	698252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	81968642	81968976	81968811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	216402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr1	84970111	84970722	84970500	Y	NA	RPF1	NA	NA	NA	NA	GNG5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0561012344501
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	85143846	85143980	85143979	Y	SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP	RP11-484D4.3,SSX2IP	NA	NA	NA	NA	SSX2IP	10506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	85710539	85710684	85710606	Y	NA	SYDE2,C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	C1orf52	12671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	85737728	85738105	85737917	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	2668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	85992810	85993270	85993105	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	48663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	86010067	86010444	86010393	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	86010493	86010816	86010648	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	86077140	86077408	86077190	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	32696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	86989178	86989418	86989299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLCA2	101409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	87239429	87239698	87239491	Y	NA	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr1	88694004	88694059	88694042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKN2	453846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	88716578	88716942	88716762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKN2	430963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89167079	89167239	89167155	Y	GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	19174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.787368712684828
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89739985	89740544	89740197	Y	GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5	GBP5	NA	NA	NA	NA	GBP5	3441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89887466	89887838	89887537	Y	GBP3,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	100557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	89942348	89942369	89942360	Y	NA	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	46026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	90075464	90075685	90075572	Y	NA	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	20946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	90137741	90138074	90137909	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	41110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	90190139	90190909	90190374	Y	GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	93508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr1	90374317	90375036	90374524	Y	LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	82844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	91793812	91793887	91793849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC7	170521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	92164446	92164626	92164554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	100718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	119515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	120286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	92189033	92189061	92189048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	125305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	134421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	92202579	92202753	92202666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	138851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	92218581	92218971	92218958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	150921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	93270252	93270588	93270467	Y	NA	EVI5,RPL5	EVI5	IMR90	Hi-C	24141950	EVI5	14291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	149285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	94093325	94093611	94093590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	145389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	112754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	94133922	94134283	94134103	Y	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	104717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	92882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06533126498817
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	80815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.98183527565303
chr1	94161111	94161471	94161388	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	77529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	71480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	94168203	94168325	94168229	Y	NA	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	70675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31401865329489
chr1	94169341	94169462	94169391	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	94169670	94169961	94169880	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94224546	94224929	94224684	Y	DNTTIP2	RP11-488P3.1	MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	14071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	5939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326432092741998
chr1	94309612	94309956	94309784	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	MIR760	432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	94332093	94332098	94332096	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	DNTTIP2	11376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	94684511	94684818	94684682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	53806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	95107584	95108052	95107918	Y	F3,SLC44A3,SLC44A3	RP11-86H7.7	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	19844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	RP11-86H7.7	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	26074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	95179307	95179605	95179478	Y	F3	NA	F3,ABCD3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	91567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	95221261	95221551	95221307	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	62286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	95249173	95249377	95249275	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	ABCD3,F3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	34460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	95267524	95267667	95267664	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	16170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	97291085	97291340	97291213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	105864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr1	98315619	98315765	98315702	Y	DPYD	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	68840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	98788970	98789228	98789135	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SNX7	336008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	98789496	98789901	98789701	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SNX7	335335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	100169951	100170218	100170031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	59969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	100703358	100703606	100703422	Y	NA	DBT,RP11-305E17.6	NA	NA	NA	NA	DBT	9784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	100828525	100828922	100828611	Y	SASS6	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	19941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr1	100859089	100859486	100859291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL2	156983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	104585164	104585551	104585358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	518851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	108132692	108133060	108132878	Y	NTNG1,NTNG1,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	535425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	108231996	108232161	108232053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	509310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.588748749737947
chr1	108870455	108870699	108870577	Y	NA	NA	SLC25A24	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC25A24	128984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr1	109093990	109094406	109094278	Y	NA	FAM102B	HENMT1,FAM102B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102B	6305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	109099158	109099479	109099238	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	1232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	109100040	109100237	109100058	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr1	109104473	109104583	109104556	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	3762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	109127044	109127234	109127073	Y	STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	26333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	109133637	109134097	109133761	Y	TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	32926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	109156863	109156955	109156909	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	45193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	109159407	109159722	109159520	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	42426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	109262615	109262764	109262672	Y	NA	PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	STXBP3	24532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	109515208	109515609	109515409	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	CLCC1	11097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	EPS8L3	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	30200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	110363861	110364229	110364029	Y	GNAI3,AMPD2	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	59212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	110364881	110365302	110365225	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	60232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.277615366742094
chr1	110366477	110366702	110366587	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	61828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373178522652346
chr1	110406868	110407271	110407021	Y	GNAI3,CSF1	CSF1	CSF1,GSTM2,GSTM4,GNAI3,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CSF1	43593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	CSF1	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	30719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr1	110438276	110438910	110438607	Y	NA	CSF1	CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,GNAI3,GSTM4,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CSF1	11954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	110879130	110879445	110879277	Y	CSF1	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	2	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	110895542	110895785	110895664	Y	NA	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	16414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	4371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	111178912	111179243	111179089	Y	RBM15,CD53	NA	KCNA2	K562	ChIA-PET	22265404	CD53	234532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	OVGP1,ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	111996023	111996307	111996190	Y	NA	OVGP1,ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	6025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	112143517	112143622	112143594	Y	CEPT1,CHI3L2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	60677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	112163412	112163797	112163622	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	112196411	112196803	112196596	Y	C1orf183,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	DDX20	99064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	112276731	112276883	112276807	Y	C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183	DDX20,FAM212B	NA	NA	NA	NA	DDX20	18984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	112942216	112942335	112942276	Y	CTTNBP2NL	CTTNBP2NL	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	5413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	113014906	113015158	113015047	Y	CAPZA1	WNT2B	NA	NA	NA	NA	WNT2B	7743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT2B	65207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	113086746	113087141	113086830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	72654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	NA	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A1-AS1	101878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	113525578	113525919	113525789	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC16A1	27943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	113683682	113683919	113683753	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	25697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	113684444	113684648	113684532	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	114477404	114477721	114477665	Y	RSBN1,HIPK1,HIPK1,HIPK1	DCLRE1B,AP4B1,HIPK1	NA	NA	NA	NA	HIPK1	7590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	114997819	114998047	114997990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	53734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	115025085	115025405	115025244	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	26376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	115046601	115046805	115046703	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	4976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	NA	NA	NA	NA	NA	SIKE1	283884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr1	115732772	115733197	115732900	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	SIKE1	411466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	116038305	116038519	116038336	Y	NA	NA	NGF,TSPAN2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	144055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	116039640	116039989	116039911	Y	NA	NA	NGF,TSPAN2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	142585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	117047053	117047428	117047164	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	27286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	117051576	117051921	117051802	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	22793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	117074509	117074935	117074769	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	117082797	117083071	117083005	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	8083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	117111804	117112156	117112090	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	117112460	117112738	117112567	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	117132073	117132239	117132154	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	20412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	117256857	117256976	117256917	Y	NA	IGSF3	CD101,TTF2	IMR90	Hi-C	24141950	IGSF3	48482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	117610144	117610413	117610279	Y	NA	RP11-27K13.3,TTF2	VTCN1,TRIM45	IMR90	Hi-C	24141950	TTF2	9219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	118415993	118416217	118416147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP2	54036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	119506251	119506502	119506377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	174517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	119668351	119668628	119668490	Y	WARS2	RP11-418J17.1,WARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	12391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	HMGCS2	NA	NA	NA	NA	HMGCS2	33648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	15122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	69659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	145113904	145114998	145114671	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL	SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	19684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319321405244734
chr1	145437595	145437817	145437681	Y	CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	1126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr1	145526651	145526817	145526757	Y	NA	RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,ANKRD35,PIAS3	NA	NA	NA	NA	PEX11B	12399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	147790636	147790862	147790749	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	14024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.30405892991108
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	149138053	149138113	149138087	Y	NA	PFN1P12	NA	NA	NA	NA	PFN1P12	25398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNVU1-17	NA	NA	NA	NA	RNVU1-17	23028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr1	150159099	150159241	150159135	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	ANP32E,RNU2-17P	HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ANP32E	47263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.27905823006392
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19206606003167
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	RP11-126K1.2	3391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151344220	151344519	151344431	Y	NA	PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4	NA	NA	NA	NA	SELENBP1	1011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	151422102	151422465	151422287	Y	NA	POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	7476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,THEM5	NA	NA	NA	NA	RORC	7042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM5,THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	151916920	151917624	151917271	Y	NA	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	36636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.422378212281365
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	151962641	151962839	151962740	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	152001678	152001977	152001894	Y	S100A10,S100A11	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	16406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.531971035568867
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.44708077351852
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCHH	55823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	153095466	153095607	153095484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A9	232723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	15331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278345515932461
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	S100A6	4175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400351778667072
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.517941368191616
chr1	153549643	153549828	153549736	Y	PGLYRP3,S100A7L2	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14,S100A1	S100A14,S100A13,S100A16,CHTOP,S100A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	S100A2	11277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A2,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.516445291743017
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467125450632453
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	21642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.670282238270945
chr1	153671679	153672046	153671861	Y	NA	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	22566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20225327383981
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr1	154166147	154166533	154166338	Y	NUP210L,TDRD10,CHRNB2,C1orf189	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	1023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	154299137	154299452	154299353	Y	UBAP2L,ATP8B2,IL6R	NA	NA	NA	NA	NA	HAX1	56150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154380711	154381076	154380883	Y	NA	IL6R	SHE	IMR90	Hi-C	24141950	IL6R	5042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154405619	154406249	154405788	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154577703	154577929	154577737	Y	NA	UBE2Q1,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	20546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	154579303	154579782	154579555	Y	UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR	UBE2Q1,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	18693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154582047	154582244	154582145	Y	UBAP2L,ATP8B2,PBXIP1,ADAR,ADAR	ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	16231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	154587281	154587469	154587375	Y	NA	ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	11006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.705799446083964
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155052572	155053010	155052866	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1	NA	NA	NA	NA	EFNA3	18348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	155064813	155064992	155064903	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	30589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	155097183	155097419	155097260	Y	NA	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.304944552306231
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.37902062412534
chr1	155469100	155469412	155469293	Y	MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	60409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.693996004345678
chr1	156089405	156089622	156089466	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	25535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.793940507003565
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	11467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SEMA4A,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	156249668	156250061	156249953	Y	NA	BGLAP,PAQR6,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	SMG5	559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	156405790	156406311	156406022	Y	NA	NA	RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,IQGAP3,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2D	62309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18660737853242
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83124776369966
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.746811113464101
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.58622900800912
chr1	156478154	156478558	156478328	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	9534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	156480721	156480806	156480764	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	12101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.923368864728826
chr1	156634807	156635020	156634939	Y	NES	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	5591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	156774360	156774606	156774510	Y	C1orf61	HDGF,SH2D2A	NA	NA	NA	NA	SH2D2A	10048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	157030350	157030742	157030546	Y	NA	ARHGEF11,KRT8P45	NA	NA	NA	NA	KRT8P45	10307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	157966753	157967127	157966789	Y	NA	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	5690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.580177763859949
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	158970513	158970716	158970581	Y	AIM2,IFI16	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	2755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	158983439	158983572	158983497	Y	NA	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	15681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	159142876	159143043	159143018	Y	OR10J5,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,CADM3,CADM3,DARC	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	175118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	159829428	159829783	159829606	Y	OR10J5,KCNJ9	C1orf204,CCDC19	NA	NA	NA	NA	C1orf204	6291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.535933640619523
chr1	159852272	159852569	159852526	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.334620114990879
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	160230168	160230604	160230300	Y	NA	RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	SUMO1P3,NCSTN,COPA,NHLH1	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	160345693	160345986	160345917	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1	NA	NA	NA	NA	NHLH1	10836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	SLAMF1,CD48	NA	NA	NA	NA	SLAMF1	24743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	CD48,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	10720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	161329163	161329482	161329254	Y	FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G	SDHC	NA	NA	NA	NA	SDHC	47116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.809203438681846
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1547766947391
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP12	135042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	162659800	162660152	162659976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	60637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	67005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr1	162954567	162954830	162954669	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,RGS5,C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	NUF2	279536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	164717528	164717907	164717706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	194707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.855446753481531
chr1	164734934	164735098	164735029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	212113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08085700881402
chr1	167416859	167417570	167417161	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	103434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	168446219	168446589	168446402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XCL1	97122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	169464285	169464545	169464529	Y	BLZF1,SLC19A2	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	AL021068.1	10905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	171652961	171653360	171653094	Y	NA	PFN1P1	NA	NA	NA	NA	PFN1P1	14882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232485164761891
chr1	172418117	172418641	172418353	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	6887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	172466564	172466703	172466653	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	55334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	172900674	172900969	172900756	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	117134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	172972573	172972790	172972603	Y	PRDX6	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	45313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	73811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	173382392	173382663	173382522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	61742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	173398914	173399297	173399234	Y	NA	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	45108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.271444427456
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	173958715	173958784	173958750	Y	NA	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	30651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	173984193	173984403	173984298	Y	GPR52,ZBTB37,RC3H1	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	5032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	174132741	174133010	174132876	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	6193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	176601179	176601401	176601333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	426395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	177131482	177131884	177131596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	873201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	177151173	177151362	177151277	Y	ASTN1,FAM5B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	853723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	178298668	178299096	178298877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	210791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	178378072	178378430	178378251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	131457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	179144823	179145001	179144950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABL2	51818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	179296885	179297079	179297006	Y	AXDND1,TOR3A,ABL2,SOAT1	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	35960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	3265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	180237101	180237317	180237140	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	39680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	52370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	53391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	180403880	180403893	180403887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	66196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	181081690	181081905	181081806	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	181082184	181082367	181082268	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	181096103	181096331	181096188	Y	NA	IER5	KIAA1614,IER5,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	40465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	181122099	181122260	181122227	Y	NA	NA	STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	66461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	182228543	182228906	182228715	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	182585205	182585710	182585424	Y	NA	RNASEL,RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	13662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	183178797	183178927	183178861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC1	188202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	183239968	183240242	183240112	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	SMG7	199109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	SMG7	197484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	189897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	183578502	183578873	183578650	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NCF2	20491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	183579279	183579568	183579440	Y	NA	NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NCF2	21268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	183594812	183595033	183594923	Y	NA	NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	ARPC5	7859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr1	183743084	183743343	183743214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	140192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	183836661	183836955	183836765	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	181856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr1	184700299	184700688	184700567	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	21359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185129185	185129369	185129253	Y	NA	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	SWT1	4973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185298342	185298619	185298496	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	IVNS1ABP	MCF7	ChIA-PET	22265404	IVNS1ABP	13881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	185615541	185615870	185615591	Y	NA	NA	SWT1,LOC100288079,IVNS1ABP	IMR90	Hi-C	24141950	HMCN1	85813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	186587444	186588060	186587743	Y	PTGS2,PLA2G4A,C1orf27	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS2	59499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	186612873	186613046	186612917	Y	PTGS2,PLA2G4A	PTGS2	NA	NA	NA	NA	PTGS2	34513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	186799738	186800031	186799804	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	3653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	186818021	186818219	186818132	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	21936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	186851648	186851759	186851704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	55563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	186892657	186892915	186892791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	96572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	186935248	186935528	186935344	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	139163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr1	186936898	186937303	186937025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	140813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	186970666	186971051	186970863	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	174581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	186975833	186976078	186975958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	179748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS1	326281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	192446152	192446393	192446247	Y	RGS2,RGS1	NA	UCHL5,RGS1,RGS13,RGS2,TROVE2,GLRX2	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	96464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192485848	192486563	192486155	Y	RGS2,RGS1	NA	RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	56294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192521878	192522349	192522267	Y	RGS1	RGS1	RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	20508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	192578246	192578789	192578443	Y	TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2	RGS1	UCHL5	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	35389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192776947	192777226	192777096	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192915458	192915787	192915575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP126	72343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	192924608	192924823	192924716	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP126	81493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.349188675546657
chr1	193583968	193584211	193584008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	494821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	193726401	193726456	193726429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	637254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	196376822	196377173	196376907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	241835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	196378121	196378217	196378169	Y	CFHR3,KCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	240791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	196379497	196379989	196379846	Y	CFHR3,KCNT2,CFH	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	239019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	196687933	196688159	196688046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	68925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	197747792	197747875	197747834	Y	NA	DENND1B	NA	NA	NA	NA	DENND1B	4966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53,LHX9	NA	NA	NA	NA	LHX9	29260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	198087299	198087585	198087454	Y	NEK7	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	36508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	198090244	198090551	198090353	Y	NA	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	33542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.767688656191047
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.11576421891822
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	198625518	198626374	198625745	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	19717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	45129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.606046651043352
chr1	198744833	198745259	198744926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRC	139032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A1HG	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	199711776	199712042	199711895	Y	NA	NA	NR5A2,C1orf98	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	357507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	200715755	200716027	200715890	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	9069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	77049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21B	124563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	200990087	200990628	200990489	Y	NA	KIF21B	NA	NA	NA	NA	KIF21B	200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.240326001449521
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	IGFN1	78053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202809602077243
chr1	201244405	201244769	201244526	Y	PKP1	NA	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFN1	86452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	201246115	201246382	201246194	Y	PKP1	NA	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFN1	88162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	201277004	201277220	201277102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNNT2	67670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr1	201277329	201277484	201277406	Y	PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNNT2	67406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	201280694	201280963	201280829	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNNT2	63927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	201295169	201295564	201295367	Y	PKP1	TNNT2	NA	NA	NA	NA	TNNT2	49326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	201463619	201463933	201463776	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	10436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	201613549	201613726	201613638	Y	NA	NA	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSRP1	136965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	113368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254128634747068
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	112029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399238665847589
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201768733	201769083	201768901	Y	NA	IPO9,IPO9-AS1	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	27186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	202003479	202003610	202003599	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	25998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	202027341	202027750	202027511	Y	NA	RP11-465N4.4	RNPEP,ELF3,NAV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-465N4.4	49860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.96649987514977
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARL8A	33993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	202249421	202249522	202249480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	59586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	203247243	203247485	203247301	Y	RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	24952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411425071214991
chr1	203297101	203297334	203297256	Y	LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	24482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.80835405069918
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	103948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	203506114	203506504	203506389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	87185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr1	203561987	203562359	203562082	Y	BTG2,ZC3H11A	ATP2B4	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	31330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	203869829	203870180	203870005	Y	ETNK2	SNRPE,HSPE1P6	SNRPE,REN,LINC00303,SOX13,ETNK2,PLEKHA6,LOC127841,PPP1R15B,GOLT1A	IMR90	Hi-C	24141950	HSPE1P6	967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	204044571	204044810	204044641	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	4328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	204098794	204099127	204098964	Y	NA	ETNK2	NA	NA	NA	NA	ETNK2	20180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK2	119340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	204255998	204256379	204256352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	122540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	204289566	204289863	204289752	Y	SOX13,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	89056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr1	204317952	204318184	204318134	Y	ETNK2,PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	60735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	204349568	204349875	204349782	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	29044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	204358316	204358342	204358328	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	20577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.4362170799914
chr1	204387566	204387645	204387629	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	8647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	204388302	204388627	204388415	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	9383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.16711902965591
chr1	204395183	204395520	204395303	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	16264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	204422279	204422591	204422449	Y	NA	PPP1R15B,PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	39261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	204430759	204431008	204430941	Y	SOX13,PIK3C2B	PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	30844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	204476628	204477018	204476840	Y	NA	PIK3C2B,MDM4	MDM4,PPP1R15B,PIK3C2B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MDM4	6493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	204800476	204800571	204800524	Y	PLEKHA6,PIK3C2B,LRRN2,TMCC2,NFASC,CNTN2,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN2	209754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	205173095	205173476	205173227	Y	CNTN2,RBBP5,CDK18	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	5251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.304944552306231
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	205283024	205283394	205283339	Y	RBBP5,NUAK2	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	5489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	205288770	205288915	205288818	Y	TMEM81,RBBP5,NUAK2	SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	205475126	205475451	205475289	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	3403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	206642854	206643037	206642964	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE	IKBKE,RASSF5	NA	NA	NA	NA	IKBKE	1063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	206645493	206645691	206645553	Y	RASSF5,MAPKAPK2,IKBKE,RASSF5	IKBKE,RASSF5	NA	NA	NA	NA	IKBKE	3702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	206688246	206688461	206688320	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5	IKBKE,RASSF5,RP11-534L20.4	NA	NA	NA	NA	RASSF5	9367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.366833762413314
chr1	206736469	206736632	206736474	Y	NA	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	RP11-534L20.4	36221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	206751685	206751882	206751743	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	32022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	206861410	206861458	206861434	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	5121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	206892674	206892943	206892811	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	36385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	206897147	206897463	206897235	Y	RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	40858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr1	206916099	206916418	206916260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	59810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	207063537	207063710	207063660	Y	RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	5078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr1	207064869	207064994	207064935	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	3794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr1	207079196	207079569	207079501	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1,C4BPB,C4BPA	NA	NA	NA	NA	C4BPB	5552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.867130043738272
chr1	207413364	207413503	207413411	Y	IL19,CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	79350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr1	207414217	207414394	207414309	Y	CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	78459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.14092039197016
chr1	207489914	207490291	207489981	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	CD55,YOD1,PFKFB2,CR2,CR1	IMR90	Hi-C	24141950	CD55	2562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr1	207585605	207585767	207585684	Y	CR2	CR2	C4BPA,PFKFB2,C4BPB	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	39808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	207589572	207589691	207589631	Y	NA	CR2	PFKFB2,C4BPA,C4BPB	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	35884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	207921430	207921703	207921565	Y	CR1L	CD46	CR1L	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	1699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	208028503	208028730	208028615	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	11765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	208029774	208030104	208029939	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	10391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	208357514	208358085	208357775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	208412497	208412696	208412591	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	208415648	208415868	208415811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	132391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	138944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	209590107	209590333	209590233	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5G2P1	150539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	209798058	209798744	209798639	Y	NA	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	25067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209806744	209806957	209806914	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	16854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	209820544	209820823	209820626	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	2988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209822403	209823008	209822758	Y	TRAF3IP3,G0S2,LAMB3	LAMB3	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	209844059	209844533	209844246	Y	NA	LAMB3	CAMK1G,HSD11B1	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	20248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU5A-8P	119323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr1	211753366	211753524	211753445	Y	TRAF5	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	3282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	211754949	211755173	211755061	Y	NA	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	4865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1,RP11-354K1.1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-354K1.1	24208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr1	211823764	211823781	211823773	Y	NA	RP11-354K1.1,NEK2,RP11-122M14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-354K1.1	12727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	RP11-354K1.1,NEK2,RP11-122M14.1	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	212256975	212257253	212257095	Y	DTL,INTS7	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	33604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	212261904	212262125	212262011	Y	PPP2R5A	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	38533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	212291571	212291809	212291658	Y	PPP2R5A	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	68200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	212311960	212312104	212312056	Y	PPP2R5A	NA	PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL21P28	88589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	212484976	212485048	212485012	Y	NA	PPP2R5A,RP11-384C4.3	TMEM206	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-384C4.3	4116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.561802527802926
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	215691115	215691317	215691220	Y	NA	KCTD3	KCNK2,CENPF,SMYD2,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	47418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	218375582	218375888	218375735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	80741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	218654144	218654396	218654237	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	136567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	241326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	219262446	219262621	219262479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	82565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	219955751	219955972	219955860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRS	262028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	220393912	220394294	220394186	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	30618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192969573830352
chr1	220671702	220671851	220671777	Y	MARK1	MARK1	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	MARK1	27717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	HLX	NA	NA	NA	NA	HLX	849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	221209079	221209530	221209425	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	159380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	221482496	221482661	221482579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP10	430857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	221567491	221567844	221567649	Y	NA	NA	C1orf140,HLX	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	345674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.320973411242743
chr1	221612801	221613016	221612980	Y	DUSP10,DUSP10	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	300502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	221613404	221613745	221613476	Y	NA	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	299773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	221614030	221614267	221614237	Y	DUSP10	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	299251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	221913881	221914483	221914426	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.738396057135515
chr1	222142763	222142919	222142838	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	229245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	222164724	222164904	222164771	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	251206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	222461432	222461724	222461569	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	HHIPL2	257721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	224019430	224020596	224019827	Y	FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	11078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.14918088304402
chr1	224528791	224528972	224528907	Y	NA	NVL,CNIH4	FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26	IMR90	Hi-C	24141950	NVL	12702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	WDR26	NA	NA	NA	NA	WDR26	24317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	224633276	224633598	224633406	Y	NA	WDR26	WDR26,FBXO28,CNIH4	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	10541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR,RP11-496N12.6	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	225954708	225954967	225954837	Y	NA	SRP9,EPHX1	ENAH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRP9	8564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	226005413	226005573	226005512	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	9619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	226288544	226288864	226288784	Y	C1orf55,H3F3A	H3F3A	C1orf55,H3F3A,ACBD3	IMR90	Hi-C	24141950	H3F3A	40992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25124336444803
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.649751881105252
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	226404092	226404450	226404271	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	31661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.640450746036888
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57,OBSCN,C1orf145	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19006686847241
chr1	228398942	228399222	228399120	Y	TRIM17,GJC2	IBA57,OBSCN,C1orf145	NA	NA	NA	NA	C1orf145	143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.880046598296041
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.60363144637648
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr1	229326926	229327085	229327016	Y	RHOU	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	77690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr1	229357329	229357959	229357668	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,C1orf96	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	46816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	229365571	229365974	229365758	Y	RHOU,SPHAR,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	38801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	230061007	230061186	230061097	Y	ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	130350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr1	230241590	230241986	230241849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	50054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr1	230248068	230248475	230248108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	56532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	230249347	230250007	230249645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	57811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	230595195	230595532	230595329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	180703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	AGT	NA	NA	NA	NA	AGT	41278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	231113054	231113423	231113208	Y	EXOC8,C1orf124,TTC13	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	ARV1	327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429836085339879
chr1	233249275	233249581	233249334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	164924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	233472763	233473058	233472911	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	PCNXL2	43304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	233763606	233763782	233763694	Y	NA	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	233809261	233809638	233809364	Y	KCNK1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK1	61511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	234163168	234163347	234163228	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	327405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	234250535	234250574	234250556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	240178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	234275805	234276023	234275906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	214729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.977956131326804
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	234658291	234658851	234658374	Y	NA	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	45442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.554727618373527
chr1	234669721	234669929	234669823	Y	NA	NA	LOC100506795	K562	ChIA-PET	22265404	TARBP1	56872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474080208580305
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	13899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	1054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	234987212	234987644	234987394	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	129423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	192181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	183098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	178848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	175183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	235122652	235122939	235122843	Y	NA	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	167312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	156829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	155813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TOMM20	43394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259587316246322
chr1	236026992	236027471	236027217	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	17469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	236135691	236135959	236135881	Y	GPR137B	NA	LYST	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	90751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	236162583	236163199	236162893	Y	GPR137B	NA	NA	NA	NA	NA	LYST	117643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr1	236764383	236764568	236764551	Y	NA	HEATR1	NA	NA	NA	NA	HEATR1	1236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	237007861	237008154	237008008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	51251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	237029172	237029469	237029246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	72562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	237509665	237509877	237509771	Y	RYR2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P1	367028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P1	491614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.65666032069122
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.344077179608654
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.296373566428234
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	240476321	240476487	240476382	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	144866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	241320009	241320104	241320058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	159915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	241775803	241776227	241776010	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	21005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	241790752	241791037	241791008	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	6195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	241804319	241804678	241804577	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	7087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29965969175991
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	243641103	243641443	243641320	Y	CEP170,SDCCAG8,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	223783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	244462616	244463099	244462949	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	150337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr1	244466323	244466598	244466461	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADSS	146838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr1	245082176	245082355	245082237	Y	EFCAB2	EFCAB2	SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EFCAB2	48652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	697228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr1	246297322	246297388	246297355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	371226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	246538507	246538660	246538597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	129954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	246730569	246731007	246730621	Y	AHCTF1,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	2823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	246743297	246743408	246743371	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	15551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	246763574	246763751	246763579	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	35828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418152795083139
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	247507326	247507475	247507401	Y	NA	ZNF496	ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	14178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	247524183	247524555	247524546	Y	NLRP3,NLRP3	ZNF496	ZNF496,AHCTF1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF496	31035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	179287	179666	179475	Y	NA	ZMYND11	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	354662	355000	354689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	176257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	587865	588161	588097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	145522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr10	1335739	1336079	1335908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	242261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	2256285	2256680	2256409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKP	849845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.343347030418287
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.357376697795539
chr10	3088088	3088382	3088199	Y	NA	PFKP	PFKP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKP	18143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	3145163	3145536	3145437	Y	PFKP	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	38638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	3511181	3511689	3511507	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	298178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3598970	3599136	3599051	Y	KLF6	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	226337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	3797195	3797502	3797389	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	27971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3853393	3854169	3853583	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	27920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	102650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	4394953	4395258	4395067	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	110849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	4396174	4396330	4396296	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	112070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	4775719	4776039	4775944	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00704	57373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	4891874	4892173	4892030	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	40623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	4983862	4984222	4983900	Y	NA	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	51066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	4989909	4990226	4990068	Y	AKR1C3,AKR1C1	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	57113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	5064109	5064385	5064247	Y	NA	AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C2	5886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5113786	5114179	5114065	Y	AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	38240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	TUBAL3	110581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr10	5334474	5334640	5334544	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	TUBAL3	110153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	87159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	76704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.267428152933953
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	75725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	74599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr10	5590507	5590769	5590638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	74125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	73624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313862723745479
chr10	5596279	5596669	5596478	Y	NA	NA	NET1,ASB13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-336A10.7	68225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP11-336A10.7	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-336A10.7	25624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	6013642	6013801	6013714	Y	PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	RP11-536K7.3,IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	4349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	6017924	6018316	6018090	Y	RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	RP11-536K7.3	NA	NA	NA	NA	IL15RA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	6281305	6281494	6281382	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	96424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	6333794	6333936	6333889	Y	PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	148913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	6503496	6503541	6503519	Y	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	116722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	6600320	6600578	6600409	Y	RBM17,RBM17,PRKCQ	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	19685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	6764164	6764384	6764289	Y	NA	RP11-554I8.2	LOC100507127,SFMBT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554I8.2	12960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	7285969	7286078	7285998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	165372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	7356268	7356516	7356367	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	94934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	89100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.360836187735533
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	11737081	11737223	11737138	Y	NA	ECHDC3	USP6NL	IMR90	Hi-C	24141950	ECHDC3	45142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	135463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	141749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr10	11940492	11940889	11940732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	142280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	11983561	11983569	11983563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	99600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	12002775	12003103	12002939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	80066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	12375218	12375432	12375325	Y	CAMK1D	CAMK1D	CAMK1D,OPTN,CCDC3,CDC123	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK1D	14049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	12490797	12491318	12490959	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	101316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	12751328	12751588	12751334	Y	CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	361847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	12762455	12762628	12762543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	372974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN	NA	NA	NA	NA	OPTN	3492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	13390886	13391219	13391148	Y	NA	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	2589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236483547880411
chr10	13884147	13884173	13884160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	257220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	14594148	14594360	14594257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	220536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	14601403	14601956	14601622	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	212940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	14602319	14602604	14602483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	212292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	14605482	14605831	14605731	Y	HSPA14,DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	209065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	190567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	172933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	15157630	15158203	15157954	Y	NA	ACBD7,RPP38	NA	NA	NA	NA	RPP38	20451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	RPP38	21540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	16481463	16481634	16481561	Y	NA	PTER,RNU2-18P	NA	NA	NA	NA	PTER	4521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	17569630	17569764	17569656	Y	VIM	NA	PTPLA	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLA	87612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	20134637	20134650	20134644	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	1188303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395049026717228
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	22046684	22046874	22046779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	173198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	22201596	22201935	22201928	Y	EBLN1	RN7SKP37	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	18137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22519481	22519667	22519580	Y	BMI1,EBLN1	NA	COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	83236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr10	22535612	22535856	22535691	Y	NA	NA	ARMC3,LOC100130992	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	67047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	22630393	22630515	22630474	Y	NA	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	22253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	22658531	22658793	22658663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	50391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22817226	22817294	22817260	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	184190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	22904639	22904845	22904818	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	96639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22907073	22907416	22907362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	94068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	22932460	22932672	22932594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22961361	22961802	22961720	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	39682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	23721651	23721890	23721808	Y	OTUD1	OTUD1	OTUD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	OTUD1	4308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr10	24740338	24740618	24740546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	269979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr10	25348919	25349256	25349121	Y	NA	ENKUR,THNSL1	ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THNSL1	45332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	209028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	207829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.964309427578667
chr10	28366743	28367106	28366855	Y	ARMC4	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	80766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	28725980	28726021	28726001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAC	93401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	29280500	29280692	29280596	Y	NA	NA	LYZL1,BAMBI,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	316229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	29420684	29421072	29420878	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	275259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	29493243	29493378	29493326	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	202953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	29546571	29546627	29546599	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	149704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	29907407	29907668	29907538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	211076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	248523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	29970673	29971027	29970896	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	274342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	29977181	29977518	29977482	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	280850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	328815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr10	30092989	30093361	30093263	Y	SVIL	NA	SVIL,KIAA1462,MIR604	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	309062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	305875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	30441068	30441357	30441150	Y	NA	KIAA1462	MTPAP,KIAA1462	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	38645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	30711320	30711474	30711381	Y	MAP3K8	MTPAP,MAP3K8	MAP3K8	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP3K8	9392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.586402372617435
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr10	30742798	30743130	30743073	Y	NA	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	21932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	30994223	30994518	30994467	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	273357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	31015875	31016223	31016049	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438,ERGIC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	MAP3K8	295009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.397778367466855
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427836893780619
chr10	32100174	32100489	32100483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	115253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	32316515	32316560	32316538	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	26799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	32438322	32438553	32438446	Y	NA	RPS4XP11	KIF5B,ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	48101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.779754910076903
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.693613040716562
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	33291145	33291309	33291227	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	1411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	33299093	33299340	33299217	Y	NA	ITGB1	ITGB1,C10orf68,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	6373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	33403327	33403662	33403511	Y	NA	NA	ITGB1,NRP1,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	110607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	33422989	33423776	33423207	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	130269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	33547800	33548221	33548104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	74969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr10	33625950	33626342	33626167	Y	NA	NRP1	NA	NA	NA	NA	NRP1	2760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	35424812	35424825	35424819	Y	CCNY	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	35425292	35425645	35425387	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	35717658	35717859	35717796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	183705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	43761301	43761565	43761418	Y	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	NA	FXYD4	103525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.39833515204891
chr10	44255352	44255616	44255516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	113048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	44359364	44359693	44359433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	217060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	44363607	44363971	44363643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	221303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	45422762	45423156	45422846	Y	ALOX5	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	29699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	45445885	45445945	45445917	Y	RASSF4	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	6910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	45461456	45461865	45461640	Y	OR13A1,ALOX5	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	8601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	59905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	47031609	47031850	47031726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	810961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.599474856724615
chr10	47034323	47034345	47034334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	813675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	47057375	47057652	47057526	Y	NA	NA	GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL	IMR90	Hi-C	24141950	FAM21C	836727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47169850973655
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	859888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	47092943	47093271	47093193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	872295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	47093518	47093811	47093665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	872870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	908846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	917101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317861106864
chr10	47149103	47149407	47149372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	928455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-463P17.1	674126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	48392377	48392594	48392484	Y	ZNF488,RBP3	ZNF488	NA	NA	NA	NA	ZNF488	39353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	48482238	48482583	48482338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF488	129214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	48591812	48592143	48591972	Y	ZNF488	NA	SYT15	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	238788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	49598208	49598504	49598305	Y	NA	NA	MAPK8,ARHGAP22	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	85510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	50776206	50776746	50776485	Y	PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	30622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400507708216482
chr10	50787572	50787883	50787845	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	41988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	ASAH2,DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	52079574	52079882	52079666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	56836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	52083052	52083210	52083101	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	60314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	52092316	52092324	52092320	Y	FAM21A,SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	69578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	54078280	54078480	54078433	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	54078781	54079176	54078966	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	54211545	54211936	54211751	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	16357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	54212412	54212659	54212464	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	15634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	18264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr10	59096410	59096633	59096523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	929061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	61632760	61633170	61633000	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	31244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	61860000	61860017	61860008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	195586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	62174641	62174784	62174750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	361305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63225634	63225799	63225694	Y	ARID5B	NA	ARID5B,TMEM26	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB1	466436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63540272	63540417	63540346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	486049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63571912	63572045	63571979	Y	TMEM26	NA	ARID5B,C10orf107,RHOBTB1	IMR90	Hi-C	24141950	RTKN2	454421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63596779	63597177	63597154	Y	NA	NA	RHOBTB1,C10orf107,ARID5B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTKN2	429289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	63658924	63659147	63659031	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	367319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	362649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.431452313270024
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	323282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	63736420	63736602	63736437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	289864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	273554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	183723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	64024468	64024613	64024559	Y	ARID5B	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	1853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	59406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	PRELID1P3,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	11753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr10	65460115	65460254	65460185	Y	NA	NA	JMJD1C	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	180992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	65467084	65467405	65467282	Y	JMJD1C	NA	JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	187961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.306560780236375
chr10	67154801	67155033	67154934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	571472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	69550767	69550960	69550901	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	44964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.14092039197016
chr10	69578155	69578433	69578238	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	17491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	69579652	69579872	69579788	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	16052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr10	69582490	69582752	69582621	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	13172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11781707994887
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4,MYPN	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	8635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636991256096894
chr10	69856894	69857171	69856968	Y	NA	HERC4,MYPN	MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	6741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.349535861107908
chr10	69900271	69900394	69900274	Y	MYPN	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	36359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	49395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr10	69947860	69948185	69948022	Y	RUFY2,RUFY2,MYPN	NA	NA	NA	NA	NA	MYPN	83948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,HKDC1,RP11-227H15.4	NA	NA	NA	NA	HKDC1	627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333159816610145
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr10	71239136	71239503	71239234	Y	NA	TSPAN15	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	29907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	71675422	71675425	71675424	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	115778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	71840822	71841222	71841056	Y	NA	AIFM2	NA	NA	NA	NA	AIFM2	49468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1,CALM2P2	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	72218739	72219166	72218841	Y	NA	NA	KIAA1274,SGPL1,EIF4EBP2,ADAMTS14,NODAL,C10orf27	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4EBP2	56604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	73124315	73124355	73124335	Y	NA	SLC29A3	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	47300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73357359	73357803	73357564	Y	C10orf105	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	173452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	73529949	73530323	73530195	Y	NA	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	73605642	73606023	73605974	Y	DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	NA	NA	NA	NA	PSAP	3103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr10	73627974	73628371	73628194	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	18848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr10	73649730	73650267	73649949	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSAP	40604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	73734357	73734754	73734458	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	12234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73735695	73736076	73735808	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	13572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	73840531	73840743	73840590	Y	ASCC1,ASCC1,SPOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST3	118408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73946489	73946835	73946688	Y	NA	ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	ANAPC16	26952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73954988	73955333	73955161	Y	NA	ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	ANAPC16	18454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.576562344370545
chr10	74016969	74017226	74017050	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	14452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	74019515	74019657	74019544	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	12021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.380863429790566
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1376347229831
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.67386741016269
chr10	74076833	74077036	74076912	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	35952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.486996763138074
chr10	74078612	74078870	74078849	Y	PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	34118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.801589636073919
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.998593371090657
chr10	74081865	74082262	74082021	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	74082335	74082540	74082412	Y	DDIT4	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	74085147	74085316	74085305	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	27672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.949393681461637
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.37684761161314
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr10	74453097	74453245	74453141	Y	CCDC109A	MCU	NA	NA	NA	NA	MCU	3208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr10	75179357	75179732	75179545	Y	ZMYND17	ANXA7,RP11-345K20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	75221740	75221926	75221833	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	31357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	75337715	75337998	75337857	Y	CAMK2G,C10orf55,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	45713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr10	75639469	75639705	75639592	Y	FUT11,NDST2	CAMK2G	VCL,CAMK2G,NDST2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CAMK2G	7126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415423454333511
chr10	75653245	75653472	75653359	Y	NA	CAMK2G	NA	NA	NA	NA	CAMK2G	20902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G	NA	NA	NA	NA	CAMK2G	34122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr10	75716399	75716797	75716501	Y	FUT11,NDST2	VCL	CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VCL	39075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	75887856	75888019	75887938	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	AP3M1	20802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	75931649	75931916	75931783	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	ADK	22689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	75987927	75988078	75987990	Y	KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	78967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	77290134	77290404	77290261	Y	SAMD8	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	68594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	77548245	77548262	77548254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	189247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	79006844	79007202	79006984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	677176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773913264948533
chr10	79731077	79731252	79731165	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	46699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	224207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	80122259	80122477	80122368	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	330741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	80166856	80166996	80166943	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	375338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.605890721493941
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739856355516249
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	80925867	80926207	80926136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	99075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	80990068	80990387	80990161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	114838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	81033900	81034354	81034135	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	70871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	81042130	81042560	81042322	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	62665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	81071549	81071690	81071644	Y	ZMIZ1,ZCCHC24,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	33535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr10	81080868	81081434	81081104	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	23791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	81085771	81086240	81085963	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	18985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	81088418	81088982	81088641	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	16243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	81248199	81248547	81248259	Y	NA	ZCCHC24,EIF5AL1	ZCCHC24,PPIF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF5AL1	21810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	81956011	81956585	81956252	Y	ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	6743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	82169935	82170184	82170082	Y	NA	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	FAM213A	4350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	46720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	82509932	82510235	82510106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	298010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	83263081	83263396	83263238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	1051159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr10	85324845	85324972	85324948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	514213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	85609014	85609374	85609152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	229811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.878394592298031
chr10	86089822	86090305	86090054	Y	FAM190B	NA	NA	NA	NA	NA	GHITM	192626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	36097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.979799393336652
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.362105230104426
chr10	88804079	88804159	88804119	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	FAM35A	47759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	89500062	89500398	89500217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	75287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	89508472	89508835	89508628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	66850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	89864117	89864277	89864218	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	160858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	90495559	90495751	90495657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	141740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90643265	90643581	90643488	Y	LIPK,FAS,STAMBPL1	STAMBPL1	ACTA2	IMR90	Hi-C	24141950	STAMBPL1	5774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90657069	90657527	90657362	Y	NA	STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	19578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90753757	90754132	90754032	Y	NA	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	5343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	91173615	91173677	91173627	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	1272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	92690903	92691268	92691118	Y	NA	ANKRD1	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	11870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346806520358281
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.179322870082216
chr10	92928766	92928934	92928784	Y	NA	PCGF5	RPP30	IMR90	Hi-C	24141950	PCGF5	48974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	92974122	92974225	92974155	Y	NA	PCGF5	NA	NA	NA	NA	PCGF5	3683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	92975258	92975295	92975277	Y	NA	PCGF5	NA	NA	NA	NA	PCGF5	2613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	93241945	93242217	93242081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	73849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	93254153	93254526	93254340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	86057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	93300438	93300742	93300617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	90069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr10	93301292	93301692	93301492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	89119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	93364636	93364917	93364795	Y	NA	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	25894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr10	93367671	93367850	93367762	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	22961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	93373148	93373298	93373228	Y	NA	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	17513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.986910080833917
chr10	93432082	93432315	93432239	Y	NA	PPP1R3C	LOC100188947,HECTD2,TNKS2,RPP30,PPP1R3C	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3C	41271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	93924948	93925271	93925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	123573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	93991232	93991452	93991342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	57392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.45076729753822
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	94367821	94367909	94367865	Y	CYP26C1,KIF11	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	16778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	94516915	94517155	94517045	Y	HHEX,EXOC6	NA	EXOC6,KIF11,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHEX	70970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr10	94520397	94520594	94520523	Y	NA	NA	EXOC6,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOC6	68341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	95223953	95224101	95224023	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	95224699	95224811	95224754	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354647357045912
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393935913897745
chr10	95675431	95675709	95675545	Y	NA	SLC35G1	NA	NA	NA	NA	SLC35G1	23701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	95902105	95902214	95902160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCE1	150359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	97120063	97120328	97120194	Y	SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	71282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	97239155	97239567	97239500	Y	SORBS1,SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	79604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	97809134	97809259	97809196	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	7983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	98308552	98308827	98308687	Y	LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	NPM1P26	9115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	99173709	99174019	99173866	Y	FRAT1,ZFYVE27,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	99334341	99334704	99334523	Y	NA	ANKRD2,HOGA1,PI4K2A	NA	NA	NA	NA	ANKRD2	4143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr10	99449337	99449738	99449607	Y	C10orf28,RRP12,PI4K2A	AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	AVPI1	4257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	100074404	100074582	100074525	Y	C10orf28,HPS1	NA	LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1,HPSE2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PYROXD2	98359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	100153906	100154210	100154161	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	18731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	101300631	101300706	101300670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	77660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr10	101537826	101537964	101537919	Y	ABCC2	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	2525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr10	101543856	101543953	101543936	Y	COX15,ABCC2	ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	3367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.647908619095402
chr10	101666342	101666477	101666411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	101199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	101736797	101737134	101736959	Y	BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	30542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	101767938	101768201	101768028	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	101944283	101944461	101944347	Y	DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1	ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6	NA	NA	NA	NA	ERLIN1	1630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	102030171	102030375	102030254	Y	SEC31B	CHUK,RP11-316M21.6,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2	NA	NA	NA	NA	CWF19L1	4734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	102067493	102067821	102067631	Y	DNMBP,ERLIN1,ERLIN1,BLOC1S2,BLOC1S2	CWF19L1,BLOC1S2,SCD	NA	NA	NA	NA	BLOC1S2	23024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27200075569343
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	102792815	102793017	102792917	Y	NA	C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1	NA	NA	NA	NA	SFXN3	3824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401237857406849
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr10	103453403	103453880	103453587	Y	LDB1,BTRC,MGEA5	FBXW4	NA	NA	NA	NA	FBXW4	351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	103708018	103708327	103708173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	105623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	103807032	103807259	103807146	Y	NA	C10orf76,HPS6	NA	NA	NA	NA	C10orf76	6691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	103876632	103876931	103876782	Y	NA	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	1279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.972497449827549
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	104683249	104683568	104683410	Y	NA	CNNM2	NA	NA	NA	NA	CNNM2	7199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	104769429	104769711	104769602	Y	INA	NA	NT5C2	IMR90	Hi-C	24141950	CNNM2	93379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	104780741	104781119	104780930	Y	LOC729020,PDCD11	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM2	104691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	104838794	104839158	104838851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	111898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	104953975	104954222	104954115	Y	C10orf26,C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	2919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	104956992	104957240	104957082	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	5936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	104990991	104991184	104991120	Y	NA	NT5C2,INA	SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	39935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	105000216	105000261	105000251	Y	NA	NT5C2,INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	34659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	33467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr10	105001544	105001968	105001663	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	32952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr10	105014349	105014646	105014389	Y	NA	INA	NA	NA	NA	NA	INA	20274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	105208274	105208534	105208404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD11	53869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	105302775	105302952	105302862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD11	148370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	105419490	105419843	105419666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	193458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.592747132856467
chr10	105654409	105654593	105654518	Y	NA	SH3PXD2A,OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	21370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr10	105725440	105725838	105725745	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	SLK	481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	106020526	106021193	106020581	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1	WDR96,GSTO1,MIR4482-1,GSTO2	NA	NA	NA	NA	MIR4482-1	4984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	106094943	106095283	106095247	Y	NA	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	106096287	106096870	106096611	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP,GSTO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITPRIP	125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	106109390	106109845	106109501	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP	K562	ChIA-PET	22265404	ITPRIP	13228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	108239646	108239791	108239719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	795566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	109306918	109307188	109307036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	1862838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr10	112159079	112159451	112159258	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	96145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr10	112174147	112174523	112174256	Y	SMC3,DUSP5	NA	DUSP5,SMC3,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	81073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450940662146529
chr10	112174673	112174737	112174702	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	80859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	112186754	112186909	112186851	Y	SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1	NA	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	68687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	112215418	112215452	112215427	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	40144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372292443912568
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr10	112617518	112617573	112617534	Y	ADRA2A,PDCD4	PDCD4,PDCD4-AS1	NA	NA	NA	NA	PDCD4	11992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr10	113639834	113639959	113639897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	333176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	113852369	113852641	113852488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	120494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.61752079862391
chr10	113855611	113855893	113855723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	117242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.62084270202346
chr10	114031765	114032053	114031942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	58630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	114109921	114110133	114110011	Y	NA	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	21643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr10	114139786	114140040	114139910	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	8010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	114707857	114707918	114707888	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	91	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	114816164	114816362	114816263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	108155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	115022033	115022434	115022235	Y	NA	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	314024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	115070178	115070533	115070251	Y	TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	362169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	115923622	115923898	115923760	Y	C10orf81	MIR2110,C10orf118	NA	NA	NA	NA	MIR2110	8040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf118	148527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	187173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	116561110	116561522	116561275	Y	NA	FAM160B1	AFAP1L2,ABLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160B1	17981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	116582671	116583074	116582920	Y	NA	FAM160B1	NA	NA	NA	NA	FAM160B1	3168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr10	116726934	116727115	116726983	Y	NA	TRUB1	NA	NA	NA	NA	TRUB1	30982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	117021659	117021668	117021663	Y	ATRNL1	NA	NA	NA	NA	NA	TRUB1	325707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	118154890	118154986	118154939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA12A	345099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	169474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	118894357	118894681	118894572	Y	VAX1	KIAA1598	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	10260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	118922718	118922822	118922754	Y	VAX1	KIAA1598	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	38621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	119069713	119069747	119069730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	63231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	120692616	120692979	120692798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	94249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	120850460	120850786	120850708	Y	NA	EIF3A,FAM45A	EIF3A,PRDX3,SFXN4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM45A	10812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499913317695843
chr10	121031141	121031480	121031339	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	66040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	121045137	121045528	121045521	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	80036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	100289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09377356337179
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	110070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	121154195	121154697	121154651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	145523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	121249100	121249168	121249139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	51052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	121544240	121544543	121544312	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	MCMBP	105525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr10	121655971	121656303	121656057	Y	NA	MCMBP,SEC23IP	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	5748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	121682284	121682432	121682358	Y	NA	MCMBP,SEC23IP	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	32061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr10	123027203	123027438	123027321	Y	NA	NA	FGFR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-159H3.1	135966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	123526019	123526096	123526058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	159731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	123626359	123626403	123626376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	59424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.77864179725742
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	123900798	123900950	123900924	Y	TACC2	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	154109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	124613518	124613778	124613722	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	23379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	124636899	124637143	124637021	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	14	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	120828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318591256054367
chr10	126212520	126212862	126212532	Y	NA	RPS10P18	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	35373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126330634	126331273	126330949	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	99565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	126359464	126359807	126359742	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	71031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126429723	126430192	126430042	Y	FAM53B	FAM53B,METTL10	NA	NA	NA	NA	FAM53B	646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126445536	126445891	126445571	Y	ZRANB1	FAM53B,METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	14698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	126712433	126712623	126712473	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	108721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126797219	126797324	126797258	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	50415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	126837951	126838191	126838020	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	9548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	127432481	127432807	127432790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	77010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	127577281	127577575	127577428	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	34	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	127591696	127592016	127591824	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	8588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	127821927	127822394	127822178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	238819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	128075178	128075883	128075417	Y	ADAM12	ADAM12,LINC00601	NA	NA	NA	NA	ADAM12	154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	128258462	128258762	128258558	Y	NA	NA	FANK1,DHX32,ADAM12	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00601	150014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr10	129718681	129718836	129718759	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	203813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	129721316	129721687	129721518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	200962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	129787766	129788203	129788000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	134446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	129799058	129799270	129799164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	123379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	129948422	129948582	129948473	Y	NA	MKI67	FAM196A,DOCK1,CLRN3,PTPRE,MKI67,GLRX3	IMR90	Hi-C	24141950	MKI67	25773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	131164300	131164553	131164427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	98895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	132429890	132430021	132429956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX3	497227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr10	133251588	133251750	133251630	Y	NA	NA	TCERG1L	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	541685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	133454610	133454819	133454663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	338616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	133742915	133743140	133742982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	50295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	133776164	133776302	133776237	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	17133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.791175388186074
chr10	134124952	134125064	134125008	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4,LRRC27,STK32C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK32C	18287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	134208745	134209013	134208865	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	73	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.2	4120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400507708216482
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67979297236011
chr10	134266616	134267060	134266753	Y	LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	10785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	134368659	134369026	134368959	Y	PWWP2B,INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	19335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511	NA	NA	NA	NA	ZNF511	46851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.660095024462804
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	RP11-326C3.2	15402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	353403	353830	353519	Y	CEND1,B4GALNT4	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	13966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.8491019932425
chr11	364521	364678	364634	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3	ANO9,SIGIRR,B4GALNT4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	3118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	589256	589485	589371	Y	SIGIRR	RP11-496I9.1,RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7	NA	NA	NA	NA	PHRF1	14770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	IRF7	NA	NA	NA	NA	IRF7	15193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	926738	926879	926801	Y	BRSK2,CEND1,AP2A2	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	3844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr11	1039894	1040259	1040094	Y	MUC6	MUC2	AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC2	32616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	1053255	1053594	1053287	Y	NA	MUC2	MUC5B,MOB2,AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC2	19281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	MUC2	NA	NA	NA	NA	MUC2	494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.862748696990636
chr11	1144773	1145129	1144879	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	4451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	1423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346806520358281
chr11	1228821	1229012	1228909	Y	NA	NA	MUC5B,TOLLIP,MOB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MUC5AC	79241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1241085	1241212	1241149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	87672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	1328544	1328761	1328705	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	1404202	1404317	1404259	Y	IFITM10,DUSP8	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.693421784704722
chr11	1595832	1596187	1595959	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	4682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	1768025	1768222	1768084	Y	IFITM10	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	10059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1773349	1773482	1773395	Y	IFITM10	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	4799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	10620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr11	1794819	1794975	1794880	Y	NA	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	11597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.40341086991904
chr11	1804182	1804577	1804353	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8	IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	RPL36AP39	7206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	1879618	1879880	1879749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC139143.2	56293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1989837	1990190	1989954	Y	IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2	MRPL23,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23	23329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	2008416	2008795	2008568	Y	NA	MRPL23,H19	NA	NA	NA	NA	H19	11905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.344963258348431
chr11	2009660	2010154	2009976	Y	IGF2,IGF2,SYT8	MRPL23,H19	NA	NA	NA	NA	H19	10546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr11	2238005	2238048	2238027	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2	69172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	2504772	2505160	2504942	Y	KCNQ1	KCNQ1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	40858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	2790402	2790588	2790507	Y	CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	114523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr11	2790945	2791119	2791011	Y	CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	113992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.292375183309713
chr11	2799950	2800256	2800114	Y	KCNQ1,CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	104855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	2847272	2847432	2847347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	57679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	2847671	2847794	2847733	Y	CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	57317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.439640335518905
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.710910942021968
chr11	2933631	2934118	2933874	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	14567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr11	3831146	3831197	3831172	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	14124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	3860220	3860837	3860518	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	RHOG	7	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	3880869	3881074	3880973	Y	NA	RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	MIR4687	5577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	4129900	4130200	4130091	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,C11orf40,OR52I1	RRM1	NA	NA	NA	NA	RRM1	15963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr11	4413870	4414271	4414071	Y	OR52K2,TRIM21	TRIM21	NA	NA	NA	NA	TRIM21	944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	4485531	4485899	4485569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM21	72605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	5301836	5302123	5301938	Y	HBB,HBD,HBG1,HBG2	NA	HBG1,HBG2	IMR90	Hi-C	24141950	OR51B5	60686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	6224718	6224948	6224898	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	28993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	6240600	6240982	6240757	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	12959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	6564206	6564247	6564227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP8	58603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	8607763	8607778	8607771	Y	ASCL3,STK33	STK33	NA	NA	NA	NA	STK33	6058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	8889520	8889803	8889779	Y	ST5	ST5,AKIP1	NA	NA	NA	NA	ST5	40695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	8935621	8935992	8935713	Y	RPL27A	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	AKIP1	4935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	8944739	8945112	8945060	Y	ASCL3	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	AKIP1	14053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	8988846	8989081	8988967	Y	ZNF143,DENND5A,TMEM9B,NRIP3	TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	NA	NA	NA	NA	TMEM9B	4288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	9060824	9061053	9060961	Y	ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,DENND5A	NRIP3	NA	NA	NA	NA	NRIP3	37228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.943552036333268
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.522286936871387
chr11	9639557	9639822	9639717	Y	WEE1	WEE1,SWAP70	LOC283104,LOC440028,SBF2,SWAP70,ZNF143	IMR90	Hi-C	24141950	SWAP70	43802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	9781782	9782109	9781859	Y	NA	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	3943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10323282	10323617	10323398	Y	NA	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-351I24.1	31	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10347188	10347587	10347388	Y	ADM	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	AMPD3	19328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	10373282	10373523	10373408	Y	ADM,AMPD3	ADM,AMPD3	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	45422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10373632	10373924	10373723	Y	NA	ADM,AMPD3	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	45772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	10510755	10511001	10510868	Y	ZBED5	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	17722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	10549004	10549441	10549205	Y	AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	RNF141	11336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	11774218	11774366	11774292	Y	NA	NA	GALNTL4	IMR90	Hi-C	24141950	USP47	86604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	114475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr11	12013824	12014110	12014066	Y	DKK3,DKK3,DKK3	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	99433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12065635	12065803	12065720	Y	NA	MICAL2	DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	47740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	12111660	12111980	12111765	Y	NA	MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MICAL2	1563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.332776852981029
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	12199343	12199732	12199431	Y	NA	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	85800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478425777260077
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.447481172206536
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38632211128982
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	13359856	13360227	13360061	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	63657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr11	13373049	13373395	13373164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	76850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	14354673	14355035	14354941	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	29017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	14563953	14564333	14564143	Y	NA	COPB1,PSMA1	NA	NA	NA	NA	PSMA1	24063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	14600110	14600431	14600207	Y	CYP2R1,PSMA1,PDE3B	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA1	60220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	14785995	14786323	14786008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3B	122726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	16762334	16762684	16762509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	129655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	16819555	16819819	16819584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	174741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	SNORD14A,RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	17183931	17184277	17184104	Y	NA	PIK3C2A,NUCB2	NA	NA	NA	NA	PIK3C2A	43253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	17230717	17231092	17230803	Y	NA	PIK3C2A,NUCB2	NA	NA	NA	NA	NUCB2	3017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	17307346	17307410	17307378	Y	NA	NA	B7H6	IMR90	Hi-C	24141950	NUCB2	79646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546886781685897
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	RP11-613F22.5,TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	18649925	18650050	18650045	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	4288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	19649981	19650160	19650072	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	279710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	19701731	19702025	19701818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	331460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	19968611	19968779	19968666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	414452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	20016658	20016921	20016770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	366310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	20134058	20134420	20134284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	248811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	20618541	20618661	20618593	Y	NA	RP11-701I24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-701I24.1	24809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	26003639	26003950	26003795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2507G9.1	204720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	27023421	27023808	27023612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	359607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	27350498	27350718	27350608	Y	BDNF	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	32697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	27419147	27419279	27419213	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	35732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	27725050	27725226	27725138	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	16379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.544540404565385
chr11	27740535	27740662	27740569	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	28588177	28588553	28588410	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	460322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	28764751	28764902	28764829	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	636896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	28792909	28793103	28792913	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	665054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	28853592	28853798	28853653	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	725737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	727349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	729998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	29141601	29141895	29141706	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1013746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	29321986	29322293	29322123	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1194131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	31489332	31489346	31489341	Y	NA	IMMP1L,ELP4	NA	NA	NA	NA	IMMP1L	39846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	31630096	31630156	31630127	Y	PAX6	NA	NA	NA	NA	NA	ELP4	100799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	31693471	31693827	31693649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	138112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	32109882	32110285	32110029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX6	272373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	32728667	32728946	32728768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRG4	120543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17530705190479
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	33146392	33146678	33146610	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	35239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	33200855	33201201	33201029	Y	HIPK3	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	18938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	33313001	33313236	33313097	Y	NA	HIPK3	NA	NA	NA	NA	HIPK3	36783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	33778086	33778269	33778178	Y	FBXO3	CD59,FBXO3	NA	NA	NA	NA	FBXO3	15820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	34084271	34084310	34084291	Y	NA	CAPRIN1,NAT10	NA	NA	NA	NA	CAPRIN1	13041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34265315	34265482	34265399	Y	ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	90068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	34272631	34272979	34272746	Y	LMO2,LMO2,ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	82571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	34393112	34393337	34393189	Y	ABTB2	RP1-145M24.1,ABTB2	ABTB2,ELF5,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	15557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164407123965187
chr11	34426692	34426969	34426750	Y	ABTB2	ABTB2,CAT	ABTB2,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	31503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	163848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34661390	34661585	34661450	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	CAT	202918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	CAT	217995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	PDHX	228200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	34919844	34920223	34920054	Y	ELF5,EHF	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	15153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr11	35053542	35053729	35053593	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	103850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	35099118	35099616	35099383	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	57963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.767688656191047
chr11	35109319	35109885	35109545	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	CD44,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	47694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	35296640	35296760	35296715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	138223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	35297997	35298240	35298173	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	139580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr11	35358493	35359078	35358891	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A2	80532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	35575444	35575679	35575584	Y	PAMR1,FJX1	NA	PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1	IMR90	Hi-C	24141950	FJX1	62056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	35880819	35881135	35880959	Y	NA	NA	FJX1,LDLRAD3,PRR5L,COMMD9,TRIM44,PAMR1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAD3	82396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	36442519	36442687	36442604	Y	COMMD9,PRR5L,PRR5L,TRAF6	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF6	87135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	38210456	38210607	38210524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	1596405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	43569506	43569887	43569721	Y	C11orf96	HSD17B12	NA	NA	NA	NA	HSD17B12	6099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	124866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	211883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	44547557	44547712	44547661	Y	NA	CD82	EXT2,CHST1,ACCS,CD82,TSPAN18	IMR90	Hi-C	24141950	CD82	36265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	45029715	45029834	45029778	Y	NA	NA	TP53I11,TSPAN18,PRDM11,LOC221122	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	58875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	45067583	45067753	45067679	Y	CD82	NA	SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	96743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.47698337028287
chr11	45255111	45255224	45255172	Y	CHST1,SYT13	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	284271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46022978	46023304	46023145	Y	NA	NA	GYLTL1B,MAPK8IP1,C11orf94,PEX16	IMR90	Hi-C	24141950	PEX16	84615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46058881	46059222	46059206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	81763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46077131	46077462	46077208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	63523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	46135373	46135563	46135504	Y	PHF21A,AMBRA1	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	5422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.402506899775743
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	NA	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	93222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.9831212967362
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	87257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.79103780164562
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	NA	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	81988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	46385171	46385493	46385285	Y	NA	DGKZ	NA	NA	NA	NA	DGKZ	32716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46412719	46412930	46412758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKZ	60264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	46444740	46444848	46444831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKZ	92285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr11	46963806	46964041	46963934	Y	NA	LRP4,C11orf49	NA	NA	NA	NA	C11orf49	7566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47100313	47100604	47100460	Y	MADD,MADD,LRP4	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	96072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	47108178	47108230	47108204	Y	HARBI1	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	88446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.523173015611165
chr11	47215723	47215949	47215852	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PACSIN3	9729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	47226153	47226377	47226265	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2	DDB2,PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DDB2	8116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	47252770	47253009	47252890	Y	NA	PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD	NA	NA	NA	NA	NR1H3	14842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47395886	47396392	47396204	Y	MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	MYBPC3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	30291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	47414965	47416043	47415133	Y	MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SPI1,SLC39A13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A13	10640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268541265753436
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.36593024861463
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	47867685	47867881	47867783	Y	OR4X1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	47891173	47891544	47891408	Y	OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NUP160,RP11-793I11.1	PTPRJ,FNBP4	IMR90	Hi-C	24141950	NUP160	23066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.496070864126733
chr11	47939528	47939960	47939626	Y	OR4B1,OR4S1,NUP160	RP11-793I11.1	PTPRJ,NUP160	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-793I11.1	14369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83747237245715
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	48041550	48042058	48041874	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	41437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	48163334	48163507	48163430	Y	OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	163221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	57044676	57044864	57044770	Y	UBE2L6,SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3	TNKS1BP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	45562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	57045764	57045851	57045815	Y	NA	TNKS1BP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	44575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr11	57269501	57269878	57269690	Y	NA	RTN4RL2,TIMM10	RTN4RL2	IMR90	Hi-C	24141950	TIMM10	26398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333159816610145
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149108414219042
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	59323878	59323962	59323920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP	57655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	61146248	61146454	61146376	Y	SLC15A3,VPS37C,DAGLA,CYBASC3,TMEM138,CYBASC3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7	DAK,DDB1,TMEM138,TMEM216,CPSF7,SDHAF2	NA	NA	NA	NA	TMEM216	10705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	61266317	61266637	61266368	Y	LRRC10B	NA	NA	NA	NA	NA	SDHAF2	70803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	61319246	61319400	61319342	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	27220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.34645933479703
chr11	61456345	61456647	61456520	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	10440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr11	61463458	61463769	61463630	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	17553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	61467819	61468013	61467906	Y	CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	21914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS1	NA	NA	NA	NA	TMEM258	6917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr11	61627935	61628213	61628074	Y	NA	FADS1,FADS3	NA	NA	NA	NA	FADS3	29310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.709294714091823
chr11	61742606	61743000	61742909	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	9474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	61746281	61746413	61746325	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	13149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	61780516	61780626	61780618	Y	NA	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.760613746761648
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.26150304708115
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.32370275199237
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr11	62264935	62265137	62265063	Y	WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	46334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	62272728	62273223	62272788	Y	ROM1	RP11-864I4.4,AHNAK	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	38248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31586191530474
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.470584940572446
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	62588127	62588383	62588260	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.601665304295715
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259587316246322
chr11	63321382	63321591	63321464	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	7264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63328335	63328557	63328446	Y	NA	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr11	63366734	63367020	63366890	Y	NA	HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	15335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	63639638	63639903	63639715	Y	NA	MARK2,RCOR2	NA	NA	NA	NA	MARK2	35238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.5175584045625
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63777072	63777136	63777104	Y	NA	COX8A,AP000721.4,OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	24306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63795964	63796221	63796065	Y	NA	OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	5221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63822776	63822835	63822807	Y	NA	RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	21334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	45217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	57125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.657245532231631
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	CCDC88B	2861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.736013901947139
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.534317412689378
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	64427372	64427588	64427564	Y	BATF2	NA	NA	NA	NA	NA	PYGM	98181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	64625998	64626454	64626155	Y	CDC42EP2,RASGRP2,SF1,SF1,FAU,BATF2,EHD1	MEN1,CDC42BPG,EHD1	NA	NA	NA	NA	CDC42BPG	15957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr11	65059026	65059409	65059335	Y	EHD1,BATF2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.868363308039302
chr11	65075657	65076292	65075967	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr11	65083603	65083722	65083697	Y	NA	CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	65121352	65121551	65121543	Y	NA	CDC42EP2,DPF2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8	NA	NA	NA	NA	TIGD3	1114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65151984	65152145	65152131	Y	NA	TIGD3,SLC25A45,NEAT1	NA	NA	NA	NA	FRMD8	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.39664827593309
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.55517843304667
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	MALAT1	24137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.620076318420604
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	MALAT1	23363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.74489720326858
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	9.91186212401438
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.653020115033406
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421265099461882
chr11	65249962	65250245	65250146	Y	NA	MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	12988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.285803388990976
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.921681532268385
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.573102854430551
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19423907254387
chr11	65257502	65257849	65257676	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.977225982136439
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.235370435060929
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510100531503985
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.64149366701532
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.64008703810598
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.359375889354799
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65328084	65328375	65328271	Y	NA	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	3683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	65379476	65379605	65379541	Y	FAU,CAPN1,RNASEH2C,EFEMP2,CCDC85B,C11orf68,FAM89B,MAP3K11	SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	MAP3K11	1248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739126206325882
chr11	65492459	65492791	65492625	Y	NA	KAT5,RNASEH2C	RNASEH2C	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNASEH2C	6041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2C	50795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr11	65581703	65581968	65581801	Y	CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198	MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	MUS81	40629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.47988607564081
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.14074702736185
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	66047866	66048291	66048031	Y	NA	KLC2,RAB1B,YIF1A,RP11-867G23.13	NA	NA	NA	NA	YIF1A	6350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	66093813	66094193	66094103	Y	NA	YIF1A,RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RIN1	8118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	66094685	66094783	66094735	Y	CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248	YIF1A,RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RIN1	7528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2,RNU1-84P	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	66374477	66374855	66374526	Y	NA	CTSF,CCS,CCDC87,RNU4-39P,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4	RBM14-RBM4	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-39P	5706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	21940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	66494345	66494720	66494567	Y	NA	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	15202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.982528734086282
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr11	66687548	66687652	66687598	Y	CARNS1	PC	NA	NA	NA	NA	PC	36195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	66717584	66717809	66717709	Y	CLCF1,ADRBK1	PC,C11orf86	NA	NA	NA	NA	PC	6038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	66738286	66738892	66738415	Y	POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1	PC,C11orf86,SYT12	PC,SYT12,RHOD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf86	1856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	66844888	66845141	66844944	Y	RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	22599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.484770537499109
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.754772101633278
chr11	66849173	66849303	66849226	Y	NA	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	26884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	67028976	67029390	67029158	Y	NA	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	2491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.83724579472207
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.434181654019651
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr11	67270751	67271055	67270865	Y	NA	TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	PITPNM1	679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.332776852981029
chr11	68714020	68714198	68714127	Y	NA	MRPL21,IGHMBP2	NA	NA	NA	NA	IGHMBP2	44710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68722813	68723020	68722901	Y	TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	IGHMBP2	53503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	68775199	68775469	68775336	Y	NA	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	38896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	68819125	68819319	68819197	Y	MRGPRD,TPCN2	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	4760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68823741	68823941	68823814	Y	IGHMBP2,TPCN2	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	9376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	68829234	68829348	68829304	Y	NA	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	14869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	MYEOV,IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	166115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	182668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr11	69639961	69640299	69640038	Y	NA	NA	FGF3	K562	ChIA-PET	22265404	FGF19	122551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.408695730465364
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	35162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	34144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	70162610	70162835	70162663	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	47804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.45493904526505
chr11	71493756	71493898	71493829	Y	NA	FAM86C1	NA	NA	NA	NA	FAM86C1	2658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	70390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72068743	72068761	72068752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPB	74931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	72194831	72195144	72194991	Y	ARAP1,IL18BP,IL18BP	NA	PDE2A,ARAP1,NUMA1,CLPB	IMR90	Hi-C	24141950	CLPB	51139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	72348117	72348448	72348274	Y	NA	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	35187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	72381210	72381586	72381345	Y	NA	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	2049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72426186	72426236	72426211	Y	ATG16L2,ARAP1	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	42551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	72909664	72909952	72909864	Y	RELT,RELT,P2RY2,P2RY2	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	P2RY2	17391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	P2RY2,ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	P2RY2	41112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	73036125	73036359	73036193	Y	NA	ARHGEF17,RELT	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	18791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.51371595099339
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720212077090332
chr11	73729347	73729733	73729506	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	36995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	73736954	73737107	73737038	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	44602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	73860209	73860535	73860372	Y	C2CD3	PPME1,C2CD3	NA	NA	NA	NA	PPME1	19609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	73989657	73990002	73989928	Y	NA	NA	PPME1	IMR90	Hi-C	24141950	C2CD3	109402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74314500	74314859	74314680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLD3	111604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	74382761	74383066	74382912	Y	NA	NA	POLD3,CHRDL2,RNF169	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-864N7.2	72093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.529744809929902
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75060567	75060771	75060596	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423994440211509
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	GDPD5,SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	75491254	75491442	75491286	Y	UVRAG,DGAT2	DGAT2,UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	DGAT2	22697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	75537561	75537829	75537710	Y	ARRB1,DGAT2,UVRAG	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	13110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75538796	75538953	75538875	Y	NA	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	14345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75883349	75883640	75883491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	206375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.64373687136857
chr11	75920696	75920900	75920748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.497914126136583
chr11	75945169	75945568	75945242	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	144447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.612235481732973
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	143692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	142963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr11	76389498	76389665	76389572	Y	ACER3	LRRC32	NA	NA	NA	NA	LRRC32	9707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	76463883	76464042	76463970	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	ACER3,TSKU,B3GNT6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	13225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.990369570773911
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	3522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.75019995521843
chr11	76510532	76510646	76510589	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	NA	NA	NA	NA	RP11-21L23.3	18426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	77271215	77271363	77271291	Y	NA	NA	MYO7A,GDPD4,CAPN5,PAK1,AQP11	IMR90	Hi-C	24141950	CLNS1A	75487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	77445522	77445800	77445629	Y	NA	FTH1P16	NA	NA	NA	NA	FTH1P16	1451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.860905434980785
chr11	77762280	77762565	77762352	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	26346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	77837663	77837947	77837805	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1	NA	NA	NA	NA	ALG8	10759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	77960482	77960781	77960725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	62614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	78091808	78092073	78091933	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	35321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	78777919	78778268	78778094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	494000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	80411023	80411358	80411196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1987213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr11	82610096	82610395	82610239	Y	PCF11,ANKRD42,RAB30	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	1079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	82781050	82781223	82781203	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	85	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	82805889	82806270	82806080	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	24924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	83066489	83066617	83066521	Y	NA	NA	DLG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC90B	71039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	111746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317130957673633
chr11	83291402	83291636	83291613	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	125146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	83312125	83312420	83312330	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	145869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	85046447	85046583	85046515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	291046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	85047149	85047448	85047300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	290181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	85702937	85703343	85703240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICALM	75581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	85802534	85802824	85802626	Y	NA	PICALM	PICALM	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	23610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	85862564	85862776	85862631	Y	NA	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PICALM	83640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	85873395	85873578	85873505	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90	Hi-C	24141950	EED	80008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	85874366	85874506	85874420	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90	Hi-C	24141950	EED	79080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	85884942	85885680	85885222	Y	NA	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	67906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr11	85887618	85887919	85887680	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	65667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr11	85888378	85888509	85888438	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	65077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	85894125	85894474	85894278	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,C11orf73,CCDC83,SYTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EED	59112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.460397726764304
chr11	85913184	85913318	85913234	Y	PICALM,PICALM	EED	PICALM,CCDC83,EED	IMR90	Hi-C	24141950	EED	40268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	85929463	85929753	85929608	Y	NA	EED	PICALM,CCDC83,EED,SYTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EED	23833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86195168	86195425	86195393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	183915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86262463	86262643	86262563	Y	FZD4	NA	NA	NA	NA	NA	PRSS23	237458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86355497	86355659	86355578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSS23	144442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	86447030	86447398	86447213	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	52703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.414537375593734
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr11	86514557	86514754	86514624	Y	NA	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	14456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	86514780	86515120	86515008	Y	NA	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	14679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	86527382	86527750	86527626	Y	FZD4,PRSS23	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	27281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4,RP11-736K20.6	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.641180895227254
chr11	88288248	88288652	88288406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	219293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	89114362	89114730	89114405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	839802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	92083144	92083535	92083339	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	845595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	93343191	93343552	93343372	Y	NA	KIAA1731	NA	NA	NA	NA	KIAA1731	49253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,SNORD5,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	94480491	94481212	94480556	Y	AMOTL1	AMOTL1	AMOTL1,PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	42894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr11	95525355	95525734	95525518	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	3782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	95990308	95990455	95990418	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	83889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	95995362	95995593	95995538	Y	FAM76B,MAML2	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	78751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	97538549	97538882	97538714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	1417396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	98114746	98115057	98114904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	1993593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr11	102176886	102177264	102177169	Y	NA	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2,BIRC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	8951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	102177495	102177798	102177653	Y	BIRC3	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2,BIRC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	8417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	102189714	102190108	102189945	Y	BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	102216514	102216961	102216815	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	MMP1,MMP3	NA	NA	NA	NA	MMP1	11473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	102867069	102867245	102867157	Y	NA	NA	MMP13,DCUN1D5,MMP3	IMR90	Hi-C	24141950	DCUN1D5	93699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	102956908	102957200	102957055	Y	NA	DCUN1D5,DYNC2H1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	3744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	104838372	104838510	104838471	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4	CASP4	NA	NA	NA	NA	CASP4	209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	104903346	104903498	104903407	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD17,CARD16	CASP1P2	NA	NA	NA	NA	CASP1P2	36770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	104917614	104917898	104917725	Y	NA	CASP1P2	NA	NA	NA	NA	CASP1P2	22370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	105034928	105035383	105035092	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	64770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	105115100	105115515	105115329	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CARD16,CASP1	144942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	107727726	107727971	107727842	Y	NA	RP11-832N8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	49175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	110182497	110182806	110182740	Y	NA	RDX,RP11-347E10.1	RDX,FDX1	IMR90	Hi-C	24141950	RDX	17050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	110228106	110228348	110228289	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	RP11-347E10.1	RDX	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-347E10.1	4251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	110251327	110251472	110251332	Y	RDX	RP11-347E10.1,FDX1	NA	NA	NA	NA	RP11-347E10.1	27472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	111195136	111195460	111195333	Y	C11orf93	NA	NA	NA	NA	NA	POU2AF1	128895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	111664556	111665052	111664796	Y	SIK2,BCO2	PPP2R1B	NA	NA	NA	NA	PPP2R1B	29405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	111824557	111824693	111824689	Y	NA	CRYAB	NA	NA	NA	NA	CRYAB	32111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	111990973	111991528	111991378	Y	IL18	C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18	NA	NA	NA	NA	SDHD	35346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	112028082	112028533	112028265	Y	IL18	IL18	NA	NA	NA	NA	IL18	4307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	112752270	112752453	112752335	Y	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC12	430798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	113055291	113055738	113055452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC12	127513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr11	113059055	113059658	113059425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC12	123593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	113568428	113568782	113568613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZW10	73751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	113999597	113999969	113999698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	126540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	114152118	114152374	114152253	Y	ZBTB16,NNMT	NNMT	NNMT	IMR90	Hi-C	24141950	NNMT	25609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.217725348194272
chr11	114162667	114162750	114162694	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	114162916	114163328	114163238	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.497914126136583
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	116462532	116462616	116462574	Y	NA	NA	FAM55B	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	179088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	116722234	116722744	116722542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF259	65468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	116867531	116867975	116867966	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	36792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	116884410	116884712	116884644	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	20055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	116909494	116909823	116909659	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	4727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	117016262	117016599	117016456	Y	NA	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	3279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	117687155	117687422	117687274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL3	433643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	118146006	118146232	118146062	Y	FXYD6,MPZL2	MPZL3,MPZL2	MPZL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MPZL2	12755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.305674701496598
chr11	118148186	118148361	118148275	Y	MPZL2	MPZL3,MPZL2	MPZL2,LOC100526771,TMPRSS4,SCN4B,SCN2B,MPZL3,CD3E,AMICA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MPZL2	14935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	17953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	18694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	118747459	118747842	118747737	Y	MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CCDC84,CBL,DDX6	MIR4492,UPK2,BCL9L	CXCR5	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4492	31575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.46783862110854
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	118785112	118785368	118785332	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	5695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	118786339	118786473	118786384	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	6922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.616233864851494
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.818887537379326
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318017036413411
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.362991308844204
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	119124696	119124715	119124706	Y	NA	CBL	NA	NA	NA	NA	CBL	49944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	119239128	119239276	119239217	Y	NA	MCAM,RNF26,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	11212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	119239478	119239727	119239579	Y	ABCG4,C1QTNF5,USP2	MCAM,RNF26,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	10761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	119241226	119241377	119241346	Y	NA	RNF26,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	9111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20169648925776
chr11	119341099	119341491	119341199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	90611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	119554350	119554716	119554654	Y	TRIM29,PVRL1	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	43078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	119626512	119626655	119626589	Y	USP2	PVRL1	LOC100499227,PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	28718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	120089762	120089841	120089801	Y	NA	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	10287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	120302835	120303154	120303088	Y	OAF,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF12	97048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	121107211	121107513	121107369	Y	SC5DL,SC5DL	NA	SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	213399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	16504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	28202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	122100877	122101142	122101009	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR100	79861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	122177708	122178168	122177914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-820L6.1	113411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	122292534	122292605	122292585	Y	NA	RP11-820L6.1	SORL1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.93046211716719
chr11	122311334	122311672	122311591	Y	NA	RP11-820L6.1	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	19755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr11	122312513	122312743	122312628	Y	NA	RP11-820L6.1	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	20934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	61784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	122936469	122936659	122936561	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	4531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289298656998835
chr11	122949899	122950101	122950094	Y	CLMP	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	17961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	122989373	122989577	122989478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	57435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	123015903	123016112	123016008	Y	NA	CLMP	NA	NA	NA	NA	CLMP	47877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	123293400	123293723	123293427	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	AP000783.1	5335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	123327975	123328380	123328056	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP,HSPA8	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	4869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	123335007	123335161	123335084	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP,HSPA8,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	11901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	123343327	123343490	123343416	Y	BSX	AP000783.1,LINC01059	HSPA8,CLMP,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	20221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.469698861832669
chr11	123345048	123345386	123345163	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	21942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	123352361	123352657	123352509	Y	OR8D4,OR6M1	LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	29255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	123353850	123354009	123353930	Y	NA	LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	30744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	54613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	123471620	123471812	123471715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	52140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	123666846	123667064	123666955	Y	OR6T1,OR6M1	RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	RNU1-21P	34211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	123950495	123950749	123950645	Y	VWA5A	VWA5A	VWA5A,OR8G1,OR8D2	IMR90	Hi-C	24141950	VWA5A	33320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	123984777	123984974	123984888	Y	VWA5A	VWA5A	NA	NA	NA	NA	VWA5A	708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr11	123992941	123993165	123993025	Y	NA	VWA5A	NA	NA	NA	NA	VWA5A	8872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	124111920	124112038	124111963	Y	TMEM225,SPA17	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	127851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr11	124146082	124146472	124146192	Y	VWA5A,OR8G2,OR8B12,TBRG1,OR8G5	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	162013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	124391253	124391530	124391392	Y	OR10G7,OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG1	99202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	8703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	38702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.430566234530246
chr11	125985079	125985242	125985162	Y	CDON,ST3GAL4	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	53849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr11	125985923	125986168	125986013	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	54693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	126029421	126029682	126029619	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	HYLS1,CDON	IMR90	Hi-C	24141950	FAM118B	49627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	126180283	126180636	126180409	Y	NA	FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	8070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	126191145	126191518	126191332	Y	NA	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	18932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	126209269	126209556	126209430	Y	NA	DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	13979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	126210041	126210184	126210131	Y	NA	DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	13351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	126554448	126554559	126554501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	330913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	128335578	128335794	128335665	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	119659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	128341794	128342415	128342241	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	128346619	128346923	128346838	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	108530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	128366966	128367159	128367092	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	88294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	128367325	128367539	128367441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	87914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	128579282	128579748	128579400	Y	FLI1,FLI1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	123829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	129282439	129282677	129282511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	135220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	129507501	129507545	129507523	Y	BARX2,NFRKB	NA	BARX2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	176169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	129601384	129601709	129601599	Y	NFRKB	NA	BARX2,ARHGAP32	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	82005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	32715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	129717042	129717234	129717138	Y	ST14,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	33328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr11	129730176	129730501	129730339	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	32984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557073995494039
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	130036262	130036668	130036368	Y	PRDM10	NA	NA	NA	NA	NA	APLP2	98530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	131211751	131211940	131211820	Y	NA	NA	NTM	IMR90	Hi-C	24141950	SNX19	427347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	131300322	131300556	131300481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	515918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr11	132774283	132774643	132774625	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	OPCML	625771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	134509789	134510106	134509920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GAT1	229977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	B3GAT1	428274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	57680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	52557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr12	775890	776284	776001	Y	NA	RP11-218M22.1,NINJ2	NINJ2,CCDC77,B4GALNT3,WNK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NINJ2	4945	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446212129837642
chr12	864034	864343	864158	Y	CCDC77,KDM5A	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	4275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	1314182	1314497	1314340	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	ERC1	216507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	116999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	NA	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	57711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	1769649	1770205	1769686	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	25535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227026483262636
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819773616119104
chr12	2103073	2103532	2103387	Y	FBXL14	DCP1B,RP5-1096D14.6	NA	NA	NA	NA	DCP1B	8169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	2893281	2893436	2893294	Y	NRIP2	CBX3P4,FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6	NRIP2,CACNA1C,FKBP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CBX3P4	8025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	3216295	3216423	3216359	Y	NA	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	31774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf5	287556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	46795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	4758958	4759134	4759102	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	2697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	5915509	5915755	5915702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	391126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr12	6187612	6187773	6187703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	119108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	61127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	59752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	45224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	44613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	16636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr12	6454526	6454970	6454793	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	5246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	6455086	6455266	6455191	Y	ZNF384,ZNF384,VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	5806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	5635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63187976015889
chr12	6586836	6587095	6586846	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,TPI1,TPI1	RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10	NA	NA	NA	NA	VAMP1	8683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr12	6713710	6714101	6713905	Y	PTPN6,ZNF384,LPAR5,CHD4	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.564375939003142
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.763343087511275
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13652161016362
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	6063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	8013004	8013217	8013212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3	73654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.41598023891556
chr12	8147722	8148111	8148026	Y	NA	FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	35188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.995828252273164
chr12	8813796	8814159	8813977	Y	MFAP5	RP11-438L7.3,MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	MFAP5	312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243941420938926
chr12	9106762	9106960	9106872	Y	KLRG1	PHC1,M6PR	M6PR	MCF7	ChIA-PET	22265404	M6PR	6211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	A2M	NA	NA	NA	NA	A2M	42107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.302215211556604
chr12	9803369	9803672	9803507	Y	KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	4764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr12	10306018	10306454	10306037	Y	NA	OLR1	NA	NA	NA	NA	OLR1	16283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	10458129	10458269	10458205	Y	KLRC3,KLRC4-KLRK1,KLRC1,KLRK1,KLRC4,KLRC2,KLRC1,KLRF1,KLRD1,KLRD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	56099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	10514396	10514426	10514411	Y	NA	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	28	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10246470073133
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.660095024462804
chr12	10522688	10522877	10522783	Y	KLRD1,KLRD1,KLRC3,KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4,KLRC2	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	8320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	10538589	10538605	10538596	Y	KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	KLRK1	3868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	10547253	10547637	10547463	Y	KLRD1,KLRD1,KLRK1,KLRC3,KLRC4-KLRK1,KLRC4,KLRC2	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1,KLRC2	NA	NA	NA	NA	KLRK1	4780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.58963528482235
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	STYK1	218197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	11486966	11487331	11487130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	164794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	11933482	11933754	11933622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	132694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	12164191	12164556	12164498	Y	NA	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	36222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr12	12609505	12609975	12609758	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	101492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	12766295	12766634	12766503	Y	DUSP16,CREBL2	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	3534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	12883612	12883681	12883638	Y	APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	17620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	45889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363721458034571
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr12	12991466	12991515	12991491	Y	NA	DDX47,RPL13AP20	NA	NA	NA	NA	DDX47	27216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.72935819055935
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.611505332542607
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	13050548	13050563	13050554	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	8832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.391050643598707
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.640833709666003
chr12	13255105	13255488	13255167	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	59887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr12	13325962	13326157	13326075	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	21493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	13331850	13332340	13332007	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	15310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	13332644	13332915	13332868	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	14735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL30P11	105420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	15315937	15316391	15316153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERG	183218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr12	15409824	15410065	15409954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERG	89544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425610668141653
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351535052667168
chr12	17520560	17520632	17520596	Y	NA	RP11-871F6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-871F6.2	30701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	18511225	18511610	18511392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	769038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	19260911	19261231	19261176	Y	NA	PLEKHA5	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	19417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2,EEF1A1P4	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr12	19914510	19914683	19914597	Y	NA	RNU1-146P	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	39141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	19932429	19932596	19932501	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	57060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83835845119693
chr12	20004635	20004650	20004642	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	87805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	20039612	20040013	20039813	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	52442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr12	20047049	20047293	20047237	Y	NA	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	45162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	20047799	20048015	20047920	Y	NA	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	44440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.368832953972574
chr12	20061866	20062155	20061952	Y	NA	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	30300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr12	20069508	20069793	20069676	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	22662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.755885214452761
chr12	20076637	20076989	20076813	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-405A12.1	15466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	7220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.52049734433293
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	31854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.50643189888781
chr12	20365637	20365979	20365748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	154200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13928672898111
chr12	20543386	20543422	20543406	Y	NA	PDE3A,RP11-284H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	22190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr12	20732540	20732626	20732597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	211344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	20746479	20746810	20746645	Y	LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	225283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	258881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.357376697795539
chr12	20959036	20959191	20959158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	437840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	454028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.847605916793903
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	GOLT1B	13287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	22428776	22428931	22428867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAS	231668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	444632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.28328364726215
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	25611028	25611430	25611226	Y	NA	NA	RASSF8,LOC100506451,IFLTD1,MIR4302	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-67P	55666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	25768042	25768407	25768182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-67P	212680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	NA	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	149944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	27430817	27431042	27430895	Y	NA	STK38L	NA	NA	NA	NA	STK38L	35916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	28176067	28176342	28176190	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	52429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	56117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	29581721	29581917	29581813	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	49599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	29844514	29844723	29844664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	90969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	29859887	29860252	29860216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	75440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	29903685	29903894	29903854	Y	NA	TMTC1	NA	NA	NA	NA	TMTC1	31798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283074048241349
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	31602301	31602617	31602553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM60A	124309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B-AS1	68826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr12	31886733	31886952	31886810	Y	NA	AMN1,RP11-467L13.5	C12orf35	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMN1	6625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	31899631	31900083	31899901	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	METTL20,AMN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-467L13.5	5568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-467L13.5	3085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	32263319	32263494	32263407	Y	NA	BICD1	NA	NA	NA	NA	BICD1	5550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	32543557	32543792	32543676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	285788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	38780295	38780779	38780600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	71915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	39094852	39095225	39095039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	204007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.381749508530343
chr12	39436965	39437093	39437022	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	137733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr12	39800065	39800203	39800134	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	34989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	40250890	40251201	40251046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	209191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	40382618	40382994	40382971	Y	LRRK2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	77398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	RPL30P13,SLC2A13	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	7562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	42537125	42537342	42537234	Y	NA	GXYLT1	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	42598855	42599145	42599001	Y	YAF2,YAF2,YAF2	YAF2,PPHLN1	NA	NA	NA	NA	YAF2	31006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.530474959120269
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.167136464714814
chr12	45703000	45703363	45703138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	95176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	45799443	45799701	45799572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	191619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	46380247	46380714	46380477	Y	SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	3189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.961807120908746
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219568610204122
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	46866769	46866797	46866784	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	91307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	46867492	46867759	46867536	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	92030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.247783874508036
chr12	46886273	46886657	46886465	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	110811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr12	46887386	46887956	46887679	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	111924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.535969418687388
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	46942703	46943018	46942760	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	167241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.852214297621243
chr12	46949913	46950236	46950181	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	174451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr12	46953166	46953383	46953275	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	177704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	46956686	46956942	46956800	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	181224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr12	47057089	47057400	47057270	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	281627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr12	47058276	47058667	47058611	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	282814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	47058808	47059020	47058972	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	283346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19083279573064
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	47583701	47583845	47583774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	111967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	47608427	47608826	47608720	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	136693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	198714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	48076459	48076736	48076534	Y	NA	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	21108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	48100473	48100834	48100653	Y	VDR,ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3,SLC48A1	NA	NA	NA	NA	RP1-197B17.3	2605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	48195468	48195540	48195504	Y	ASB8	SLC48A1,RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	29375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	48202856	48203019	48202950	Y	VDR,ASB8	RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	21896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.292375183309713
chr12	48415389	48415421	48415405	Y	OR10AD1	NA	COL2A1,TMEM106C,SENP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM106C	60037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	48815092	48815327	48815161	Y	PFKM,C12orf68,ZNF641	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF641	71895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	49198499	49198542	49198521	Y	LALBA	ADCY6,CACNB3,DDX23	NA	NA	NA	NA	CACNB3	7035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	49370069	49370445	49370342	Y	NA	ARF3,DDN,PRKAG1	NA	NA	NA	NA	DDN	20647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,RHEBL1,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	8956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.39423034267685
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	PRPH	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRPH	43789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	49866902	49867154	49867028	Y	PRPF40B,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH3	63786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	KCNH3,MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	50019907	50020190	50020017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	50324888	50325278	50324924	Y	FMNL3,NCKAP5L	RP11-469H8.6	LOC100286844,BCDIN3D,FAIM2,LOC283332,AQP2,AQP5,AQP6,ACCN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-469H8.6	29429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	RP11-469H8.6	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-469H8.6	14928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1,GPD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	50507967	50508334	50508141	Y	NA	SMARCD1,GPD1	NA	NA	NA	NA	GPD1	12365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	50784153	50784384	50784269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	51035200	51035582	51035391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	119911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.858176094231158
chr12	51322260	51322312	51322286	Y	DIP2B	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	7005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	51327584	51327783	51327682	Y	NA	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	12329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	51534048	51534251	51534150	Y	POU6F1	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	30675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	51551925	51552239	51552062	Y	NA	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	12687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	51608031	51608240	51608135	Y	BIN2	TFCP2,POU6F1,DAZAP2	NA	NA	NA	NA	POU6F1	1237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	57866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr12	51765347	51765619	51765517	Y	FIGNL2,GALNT6	NA	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	SMAGP	102673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	51787794	51788248	51788116	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	125120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	100565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52418719	52418897	52418793	Y	NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	52419301	52419935	52419633	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	52457778	52458372	52458110	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	2658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363721458034571
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30327511124932
chr12	52540237	52540565	52540533	Y	NA	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	43219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317130957673633
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	10.8130839520419
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.67040375878637
chr12	52543416	52543547	52543482	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491725295446962
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr12	52571070	52571435	52571234	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	52582905	52583052	52582979	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52583620	52584080	52583828	Y	NA	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	52588987	52589174	52589068	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	5203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	52591671	52592071	52591819	Y	GRASP,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	7887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr12	52592399	52592846	52592466	Y	ACVR1B,ACVR1B,GRASP,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	8615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	52594001	52594417	52594311	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	10217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.975382720126587
chr12	52597722	52597879	52597816	Y	KRT71	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	13938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	52609215	52609817	52609526	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	14487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr12	52624014	52624394	52624158	Y	KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT7	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467125450632453
chr12	52624687	52625139	52624914	Y	KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.483154309568965
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT83	NA	NA	NA	NA	KRT83	38664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.77050744447993
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT83	NA	NA	NA	NA	KRT83	38101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.24230775794988
chr12	52916140	52916794	52916224	Y	KRT76,KRT1,KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	3669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52950129	52950435	52950283	Y	KRT82	KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	37658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	53229080	53229305	53229193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	111350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT18	75137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr12	53266859	53267080	53267047	Y	NA	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	73575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5040855217673
chr12	53270322	53270511	53270351	Y	RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78	NA	EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	70144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	53301815	53302147	53302072	Y	KRT1,KRT76,KRT8	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	38508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.479155926450444
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	53365695	53366044	53365885	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	23957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.250130251628547
chr12	53370058	53370275	53370187	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18,KRT85,KRT84,KRT75,KRT6B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4B	27667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	53445016	53445392	53445120	Y	IGFBP6,C12orf10,TENC1,TENC1,TENC1,SPRYD3	EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4,SPRYD3,IGFBP6	NA	NA	NA	NA	RP11-983P16.4	830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	53610849	53611063	53610958	Y	NA	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	ITGB7	11758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	53611077	53612140	53611274	Y	PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	ITGB7	11986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.766072428260902
chr12	53890170	53890360	53890251	Y	MFSD5	MAP3K12,TARBP2,NPFF	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	1487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPFF	56044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54017367	54017528	54017445	Y	NA	ATF7,RP11-972K6.1	NA	NA	NA	NA	ATF7	671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	SNORD81	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD81	15886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC13-AS,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29531412308014
chr12	54384983	54385161	54385072	Y	TARBP2,ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC9	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC9	1518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	90	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539045944998266
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54415475	54415883	54415632	Y	NA	HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	8754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54416528	54417002	54416575	Y	NA	HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	7635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	54700865	54701198	54701063	Y	NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPZ1	7879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	30433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	29198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3129592099468
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ZNF385A,ITGA5	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	5713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr12	54804400	54804529	54804465	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A,ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	6715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	54814164	54814540	54814466	Y	GPR84	ZNF385A,ITGA5	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	2920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr12	56150085	56150369	56150213	Y	OR6C6,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	15021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	56193144	56193361	56193252	Y	OR6C3,OR6C75	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	SARNP	16179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	RNU1-69P,DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	DGKA	24895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	56614575	56614693	56614609	Y	NA	SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A	NA	NA	NA	NA	RNF41	858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	56690284	56690436	56690361	Y	NA	ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A	NA	NA	NA	NA	RP11-977G19.11	1490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	56914338	56914532	56914358	Y	NA	RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	RBMS2	625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.87008733125685
chr12	57073427	57073817	57073648	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	6342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	57079143	57079532	57079338	Y	NA	SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr12	57751585	57751906	57751872	Y	R3HDM2	NA	INHBC	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	70882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	57764553	57764898	57764725	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	57890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr12	57822292	57822475	57822384	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	57855378	57855667	57855523	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	GLI1	3460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	57986482	57986782	57986634	Y	R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25	DCTN2,PIP4K2C,B4GALNT1	NA	NA	NA	NA	PIP4K2C	3525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	58683353	58683702	58683528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	350029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	59995567	59995830	59995598	Y	NA	SLC16A7	NA	NA	NA	NA	SLC16A7	7719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	62608712	62608913	62608868	Y	C12orf61,USP15	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	43206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	62644447	62644716	62644645	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	USP15	MCF7	ChIA-PET	22265404	USP15	7403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	62650628	62651393	62650813	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	USP15	726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	62658681	62658957	62658715	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	USP15	6562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	63096065	63096306	63096205	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	100599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	63133542	63133622	63133582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	138076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	63241617	63241757	63241688	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	85060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	63304430	63304640	63304492	Y	PPM1H	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	22177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	64401221	64401399	64401310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	165148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	64574864	64574988	64574911	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	39088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	64955008	64955199	64955103	Y	C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	RASSF3,GNS,MIR548Z	IMR90	Hi-C	24141950	RASSF3	47094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	65015023	65015259	65015145	Y	TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	12730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	65026482	65026674	65026578	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	24189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	65037414	65037710	65037562	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	35121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	65063507	65064284	65063678	Y	C12orf66,TBK1,RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	61214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2	NA	NA	NA	NA	HMGA2	22022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.22904356622542
chr12	69122207	69122406	69122269	Y	NA	RPL7P42,NUP107,SLC35E3	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	15480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	69163885	69164101	69163897	Y	SLC35E3	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	25999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	69180946	69181662	69181342	Y	NA	SLC35E3,MDM2	SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	18294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	69305634	69305702	69305668	Y	RAP1B,LYZ,CPM,CPM	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	57648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	69312043	69312322	69312251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	51028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	69401246	69401453	69401353	Y	RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	37896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr12	69402346	69402644	69402509	Y	RAP1B,SLC35E3,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	38996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr12	69403025	69403359	69403177	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	39675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	69418832	69418872	69418851	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	55482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	69446892	69447106	69446965	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM,MDM2	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	83542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	69453304	69453583	69453490	Y	RAP1B,CPM,LYZ,CPM	NA	MDM2,CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	89954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	69458795	69459104	69458950	Y	NA	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	95445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	69460304	69460567	69460397	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	96954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr12	69462130	69462730	69462407	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	98780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19752474153092
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr12	69686526	69686874	69686654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYZ	53247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	69797421	69797731	69797518	Y	NA	YEATS4	NA	NA	NA	NA	YEATS4	45938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	69868200	69868446	69868430	Y	CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2	FRS2	NA	NA	NA	NA	FRS2	6071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	70382625	70382986	70382644	Y	CCT2,CCT2,RAB3IP	NA	CNOT2,KCNMB4,PTPRB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT2	251788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	70388549	70388859	70388715	Y	CCT2,CCT2,RAB3IP	NA	PTPRB	IMR90	Hi-C	24141950	CNOT2	245915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	70937766	70937789	70937778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	77906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	70940880	70941156	70941028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	81020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	71039604	71039990	71039715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	179744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	71055637	71055848	71055742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	195777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	71127373	71127661	71127517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	267513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	71770650	71771010	71770955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN8	62668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	72691947	72692219	72692098	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	460460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	74668744	74669132	74668938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-81H3.2	125183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	76034915	76034997	76034960	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	131499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76052717	76052819	76052768	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	149301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76119368	76119573	76119471	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	215952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	77551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	76685255	76685355	76685300	Y	NA	NA	NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	BBS10	54867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76751627	76751939	76751780	Y	NA	BBS10	NA	NA	NA	NA	BBS10	11405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	76982645	76982853	76982748	Y	OSBPL8	OSBPL8	OSBPL8,ZDHHC17	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL8	31056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	77426192	77426447	77426357	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	30913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382862621349826
chr12	79817950	79818263	79818028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	264614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	80098707	80098999	80098853	Y	NA	PAWR	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	15830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	81171843	81172335	81171905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	374069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	81405150	81405419	81405285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	607376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	82155346	82155393	82155380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	595191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	82203982	82204364	82204153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	546220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	82362285	82362429	82362357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	388155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.464970329523781
chr12	85389492	85389695	85389594	Y	NA	TSPAN19,LRRIQ1	NA	NA	NA	NA	TSPAN19	38360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.492072481008213
chr12	85674653	85675022	85674864	Y	ALX1	ALX1	NA	NA	NA	NA	ALX1	2768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.442752639897648
chr12	88526600	88526872	88526736	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	7121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	88531496	88531830	88531623	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	2163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	89520522	89520961	89520666	Y	DUSP6	NA	POC1B,DUSP6	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	224087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	89727563	89727887	89727725	Y	ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	17161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr12	89856198	89856331	89856264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	61470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	89910622	89910739	89910701	Y	NA	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	NA	NA	NA	NA	POC1B	7062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4,POC1B-GALNT4	60306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	90065963	90066366	90066126	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	34711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	90162772	90163253	90163116	Y	DUSP6,POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758,C12orf37	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP2B1	61695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	90345013	90345239	90345184	Y	POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-654D12.2	70571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654D12.2	210424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	91972476	91973067	91972734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCN	397576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C12orf79	361483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	92436632	92436991	92436801	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	97699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	92490612	92490822	92490679	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	43868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	92941921	92942046	92942003	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	379061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	92995849	92996628	92996444	Y	EEA1,BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EEA1	324479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr12	93305938	93306210	93306048	Y	CLLU1OS	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	14897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	94135673	94136306	94136137	Y	NUDT4,SOCS2	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	66522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	94179016	94179409	94179114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	94312014	94312280	94312201	Y	SOCS2	NA	SOCS2,LOC144481,CRADD	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	242863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	94316416	94316795	94316598	Y	SOCS2	NA	CRADD,SOCS2,MRPL42	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	247265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	94428471	94428481	94428476	Y	NA	NA	CRADD	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	359320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBMS2P1	320387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	138437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	94681590	94681805	94681698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	134940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	120294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr12	95492031	95492186	95492111	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	26552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.398508516657222
chr12	95840387	95840581	95840484	Y	METAP2	METAP2	VEZT,FGD6	IMR90	Hi-C	24141950	METAP2	24715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	96027120	96027372	96027186	Y	LTA4H	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	NTN4	155558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr12	96027575	96027687	96027629	Y	NA	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	NTN4	155243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	NTN4	134714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.143649732719787
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	96635574	96636027	96635766	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	49414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	96773991	96774080	96774036	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	NA	NA	NA	NA	CDK17	18258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP11	8803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr12	96813963	96814102	96814033	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	5162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	19948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr12	96842223	96842407	96842329	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	22959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	97962496	97962841	97962674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	663495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	98793447	98793582	98793503	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	16234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	98934224	98934627	98934333	Y	NA	TMPO,TMPO-AS1	NA	NA	NA	NA	TMPO-AS1	26024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	99021055	99021169	99021113	Y	NA	SLC25A3,SNORA53,IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	IKBIP	15722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	99043983	99044295	99044139	Y	NA	IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	APAF1	7064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.263429769815432
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	102186333	102186570	102186556	Y	NA	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	36146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	102220478	102220758	102220699	Y	NA	GNPTAB,DRAM1	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	1958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	102283097	102283236	102283152	Y	NA	DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	13968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	102285250	102285626	102285359	Y	DRAM1	DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	16121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	102329942	102330412	102330197	Y	DRAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DRAM1	60813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	397706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	104613052	104613575	104613267	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	5495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr12	104613868	104614024	104613970	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	6311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	1011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.207155170757014
chr12	104675995	104676292	104676137	Y	GLT8D2,TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	3495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	105037664	105038031	105037900	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	190591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	183988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	105837759	105838125	105838029	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	209743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.78064098881668
chr12	105839455	105839823	105839639	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	211439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	106381323	106381559	106381463	Y	NA	NA	NUAK1,C12orf75	IMR90	Hi-C	24141950	TCP11L2	312148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	106621316	106621679	106621542	Y	TCP11L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	72028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	106642668	106643242	106642944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	50465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	106682328	106682503	106682422	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	CKAP4,NUAK1,TCP11L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCP11L2	11204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	106694592	106694855	106694698	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	108511265	108511472	108511371	Y	NA	WSCD2	NA	NA	NA	NA	WSCD2	9776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	108520922	108521230	108521111	Y	NA	WSCD2	WSCD2	K562	ChIA-PET	22265404	WSCD2	18	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	1724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278345515932461
chr12	109030971	109031245	109031128	Y	NA	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	5236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109032155	109032517	109032383	Y	NA	RP11-689B22.2,SELPLG	ISCU,TMEM119,SELPLG	IMR90	Hi-C	24141950	SELPLG	6420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109037814	109037911	109037861	Y	SSH1,SELPLG	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	12079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	109058635	109058851	109058743	Y	NA	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	32900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.417266716343361
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437641143959645
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	110540205	110540443	110540322	Y	NA	C12orf76,IFT81	ANKRD13A,C12orf76,IFT81,ATP2A2,ANAPC7,ARPC3,GPN3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFT81	19697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	110618684	110618848	110618757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	58544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	110704832	110705217	110705054	Y	PPTC7	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	11344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr12	110931784	110931990	110931887	Y	NA	ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29	NA	NA	NA	NA	VPS29	5932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr12	111028698	111029042	111028796	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1	PPTC7,TCTN1	PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPTC7	9573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	111494792	111495250	111495130	Y	PPTC7,SH2B3,CUX2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM109A	309675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	111868510	111869152	111868792	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289801772109496
chr12	112534496	112534670	112534605	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	10156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.298372757987494
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	113417741	113417850	113417751	Y	NA	OAS3,OAS2	NA	NA	NA	NA	OAS2	3541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr12	113670739	113671157	113670856	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	13840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	113798034	113798144	113798106	Y	SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS	PLBD2	SDS,SDSL	IMR90	Hi-C	24141950	PLBD2	3663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P7	236632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P7	138715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P7	333728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	116530359	116530538	116530483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	182605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	117173952	117174265	117174216	Y	MED13L,MAP1LC3B2	C12orf49	NA	NA	NA	NA	RNFT2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	118632324	118632442	118632383	Y	NA	RPS2P5	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P5	49435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	119618645	119618705	119618687	Y	HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	4198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	120141173	120141195	120141185	Y	NA	PRKAB1	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	37615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120179533	120179605	120179597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	75975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120451614	120452059	120451867	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	101247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120453080	120453507	120453184	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	99799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465856408263559
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	120728531	120728703	120728617	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-1	337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr12	121471797	121472025	121471886	Y	P2RX4,CAMKK2,OASL	C12orf43,OASL	NA	NA	NA	NA	OASL	3020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	121498035	121498283	121498257	Y	P2RX4,CAMKK2,P2RX7,OASL	C12orf43,OASL	SPPL3,C12orf43,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,HNF1A,P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RNF10,POP5,CABP1,UNC119B,ACADS,HNF1A-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	OASL	22990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	121533843	121533975	121533917	Y	NA	NA	ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	OASL	58798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	121581639	121581946	121581768	Y	P2RX4,CAMKK2,OASL,P2RX7	NA	NA	NA	NA	NA	P2RX4	63714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121725097	121725322	121725221	Y	OASL,P2RX7,ORAI1,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	8789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121841505	121841570	121841538	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	5661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121888305	121888670	121888535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF34	52461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	64817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121976471	121976819	121976719	Y	NA	RP13-941N14.1,KDM2B	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	39878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.263429769815432
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.975609754206291
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429836085339879
chr12	122155083	122155323	122155204	Y	NA	MORN3,TMEM120B	NA	NA	NA	NA	TMEM120B	6425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr12	122224293	122224471	122224351	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239943037820405
chr12	122225058	122225273	122225168	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	122227473	122227629	122227504	Y	CAMKK2,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	122227826	122228273	122227974	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	122229588	122230472	122229850	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	8837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.325318979922515
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	122462417	122462775	122462615	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	7089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	122517490	122517922	122517629	Y	RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	2862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72108072077121
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr12	123583230	123583584	123583407	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	48978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	123636095	123636496	123636485	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	3533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr12	124009741	124009949	124009845	Y	NA	RILPL1	NA	NA	NA	NA	RILPL1	6316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	124108091	124108301	124108196	Y	NA	TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2	NA	NA	NA	NA	EIF2B1	8012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	124198913	124199092	124199012	Y	ATP6V0A2	TCTN2,ATP6V0A2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A2	4048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	124486134	124486345	124486231	Y	NA	ZNF664,CCDC92	NA	NA	NA	NA	CCDC92	30756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	367671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	124866398	124866679	124866460	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	411020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	452167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.897691685162698
chr12	124942584	124942823	124942638	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	422391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	124951666	124951729	124951686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	413485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	361380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	125026162	125026505	125026332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	338709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	337221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125030582	125031087	125030838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	334127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24740091087892
chr12	125052829	125053041	125052928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	312173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125110562	125110683	125110642	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.650637959845029
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	247592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.780988174377932
chr12	125117895	125118180	125118038	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	247034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720750970268858
chr12	125149282	125149430	125149311	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	215784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125165952	125166242	125166057	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	198972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr12	125166598	125166935	125166767	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	198279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr12	125169582	125169721	125169665	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	195493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	125179424	125179850	125179505	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	185364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr12	125185875	125186011	125185947	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	179203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	125188436	125188747	125188585	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	176467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125197556	125198099	125197767	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	167115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	160132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125288540	125288810	125288726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	76404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125332280	125332520	125332389	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	32694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	125395122	125395522	125395138	Y	NA	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	4392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	125412421	125412524	125412468	Y	NA	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	RPL22P19	5917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.378134089040938
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	6796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr12	125479851	125480155	125479863	Y	NA	DHX37,BRI3BP	NA	NA	NA	NA	BRI3BP	3605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125581977	125582373	125582099	Y	TMEM132B	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	34052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	127567979	127568114	127568034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	80558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	AC079949.1	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	37812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	127910118	127910304	127910194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	261446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	129305431	129305689	129305549	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	129415293	129415562	129415333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	108765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	129871586	129871714	129871650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	565058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	130610556	130610854	130610701	Y	RIMBP2	FZD10-AS1,FZD10	NA	NA	NA	NA	FZD10-AS1	33947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.469854791382079
chr12	130624608	130625033	130624823	Y	RIMBP2	FZD10-AS1,FZD10	NA	NA	NA	NA	FZD10-AS1	19768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423994440211509
chr12	130947882	130948028	130947955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD10	302878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	131272601	131272867	131272734	Y	NA	STX2	NA	NA	NA	NA	STX2	48944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	131405313	131405624	131405469	Y	RIMBP2,GPR133	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	50889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr12	131510828	131511048	131510920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	156404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.296373566428234
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	348564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr12	131706292	131706484	131706406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	351868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	131707348	131707723	131707417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	352924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr12	132203397	132203510	132203472	Y	ULK1	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	9771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225183221252787
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04594979870983
chr12	132349078	132349283	132349182	Y	NA	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	27913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr12	132356836	132357024	132356894	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	20172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr12	132861217	132861370	132861294	Y	P2RX2,GALNT9	RP13-895J2.2	NA	NA	NA	NA	RP13-895J2.2	11240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	132903795	132904258	132904060	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-895J2.2	53818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-895J2.2	54330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.635722213728
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	78489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr12	132970628	132971029	132970787	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	77697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	18309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	133069115	133069562	133069360	Y	ZNF26,FBRSL1	MUC8,FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	4978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	133602699	133602978	133602704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF140	51446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr13	20546038	20546426	20546233	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	15228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr13	20744892	20745400	20745185	Y	PSPC1	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	214082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	20748931	20749662	20749408	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	218121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	21405905	21405971	21405953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	59808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	RNU4-9P	3146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	22000564	22000681	22000573	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	30828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	22583629	22583981	22583861	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	382475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	23471356	23471597	23471410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	202643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	NA	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	SACS	127281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.653750264223772
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	171566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	24854044	24854200	24854080	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	230748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	25485313	25485583	25485398	Y	PARP4,PABPC3,NUPL1,MTMR6	CENPJ	NA	NA	NA	NA	CENPJ	9435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr13	27808177	27808245	27808213	Y	NA	RPL21,SNORD102,RASL11A	USP12,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	RPL21	15201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	28010544	28010826	28010685	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	11913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	28725313	28725682	28725498	Y	PAN3	PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3	14670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	29290769	29291025	29290846	Y	POMP	NA	NA	NA	NA	NA	POMP	59528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POMP	96501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr13	30717135	30717194	30717166	Y	NA	NA	UBL3,KATNAL1,HMGB1,USPL1,ALOX5AP,LINC00426,TEX26-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX2P1	151090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	LINC01058,UBE2L5P	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01058	24557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	30982567	30982782	30982669	Y	NA	LINC01058,UBE2L5P	KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	11592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	31783730	31783901	31783816	Y	NA	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	11657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	17236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	32664585	32664831	32664706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	61148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	32780608	32781010	32780825	Y	FRY,ZAR1L	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	106601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	32956405	32956487	32956432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	68794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	33728009	33728149	33728045	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	194618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	33733192	33733538	33733525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	189229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	33778763	33779029	33778994	Y	STARD13,STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	143738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	33822427	33822802	33822649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	99965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	33825211	33825616	33825598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	97151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	33841256	33841381	33841376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	81386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	34069113	34069239	34069161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	146346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.833959213045767
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	34217614	34217741	34217660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	172445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.929522368956017
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	34730516	34730744	34730573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	340330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	34914782	34915013	34914898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	524596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	35817825	35818146	35817986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	303401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	35887010	35887329	35887304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	372586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr13	38740377	38740756	38740564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFM1	181230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	39326204	39326315	39326228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PROSER1	283937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	40690248	40690533	40690364	Y	NA	NA	FOXO1	IMR90	Hi-C	24141950	COG6	462484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	41586512	41586699	41586606	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	46711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	41825625	41825697	41825634	Y	KBTBD7,NAA16	MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	10045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42162855	42163294	42163201	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	279514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	42231052	42231244	42231148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	347711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	42280247	42280717	42280439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	331459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	241248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42453037	42453433	42453235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	158743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	DGKH	NA	NA	NA	NA	DGKH	33825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr13	42967379	42967658	42967522	Y	TNFSF11,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	123090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	43294593	43294957	43294764	Y	NA	NA	ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	300382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278728479561577
chr13	43378134	43378246	43378162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	217093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	43382131	43382356	43382244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	212983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr13	43394813	43394889	43394876	Y	NA	NA	CCDC122,LACC1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	200450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	143494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr13	43467454	43467751	43467677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	127588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273616983623574
chr13	43656094	43656342	43656191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	60755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	43727960	43728297	43728107	Y	NA	NA	ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	132621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543427291745903
chr13	43866757	43867095	43866777	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	271418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	44115188	44115336	44115262	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	243708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	44165760	44165919	44165882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	193125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	44329047	44329228	44329222	Y	NA	ENOX1	NA	NA	NA	NA	ENOX1	29816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr13	44811516	44811943	44811701	Y	NA	NA	TSC22D1,SERP2,NUFIP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DGKZP1	270956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr13	44833229	44833563	44833337	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZP1	292669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	44842198	44842383	44842274	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	301638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr13	44845135	44845603	44845341	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	303680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr13	44846792	44847050	44846982	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	302233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	300410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	273481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.469854791382079
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	268192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.7540956219143
chr13	44882133	44882330	44882202	Y	NA	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	266953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.590747941297207
chr13	44884974	44885381	44885134	Y	CCDC122,TSC22D1	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	263902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.605160572303575
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	261884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr13	45030393	45030697	45030548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	118586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	45194278	45194532	45194405	Y	NA	TSC22D1	NUFIP1,TSC22D1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	44995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	45268219	45268248	45268234	Y	NA	NA	KIAA1704,NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	118936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.271617792064313
chr13	45496701	45496835	45496770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	64783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	45548667	45548813	45548740	Y	NA	NUFIP1	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	12805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	48073971	48074167	48074083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P3	261428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	SUCLA2-AS1	109006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr13	49305362	49305702	49305475	Y	ITM2B,RB1,LPAR6,RCBTB2,FNDC3A	PSME2P2	NA	NA	NA	NA	PSME2P2	37562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr13	49324068	49324506	49324074	Y	NA	PSME2P2	MED4	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	18758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr13	49357309	49357845	49357559	Y	NA	PSME2P2	ITM2B,CDADC1,FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	14045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr13	49365956	49366344	49366103	Y	RB1,RCBTB2,FNDC3A	PSME2P2	FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	22692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	49470564	49470768	49470657	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	77280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	49601050	49601794	49601184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	53002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr13	50209681	50209984	50209832	Y	SETDB2,ARL11	NA	NA	NA	NA	NA	RCBTB1	51962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	50216185	50216584	50216280	Y	CAB39L,SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	47027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	50534396	50534668	50534593	Y	NA	SPRYD7,TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	SPRYD7	25770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	18138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	50675373	50675756	50675618	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	21066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	52108681	52108727	52108704	Y	INTS6	WDFY2	MIR4703,WDFY2,DHRS12	IMR90	Hi-C	24141950	WDFY2	47917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr13	52218923	52219366	52219003	Y	WDFY2,DHRS12,DHRS12	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	62279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	52376068	52376210	52376139	Y	INTS6,WDFY2,DHRS12,DHRS12	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	DHRS12	83	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	54187301	54187338	54187320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	962457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	55208577	55208909	55208656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	1983733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	56150088	56150466	56150451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	2925244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	60338539	60338813	60338676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	397308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr13	60736273	60736548	60736444	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	61913756	61914115	61913935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	945165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr13	63021628	63021960	63021792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OR7E104P	1387206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr13	64563606	64563820	64563696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	84324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	67204176	67204298	67204237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2556032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	67442728	67443117	67443041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2794584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2813190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr13	67464284	67464840	67464525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2816140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	67577193	67577519	67577513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2929049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	67674730	67675228	67675034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3026586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	17.8988373868655
chr13	67686217	67686397	67686363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3038073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr13	67722025	67722418	67722226	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3073881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	67730122	67730387	67730193	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3081978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr13	69260181	69260548	69260436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	2986651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	70523555	70523686	70523621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	1723513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09938817442046
chr13	72206339	72206570	72206525	Y	DACH1	H3F3BP1	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	40629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	172579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	73768530	73768732	73768575	Y	NA	RNU4-10P	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	4865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.41273034799637
chr13	73909414	73909609	73909563	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	145749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290914884928979
chr13	73942793	73943059	73942972	Y	KLF5	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	179128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr13	73985614	73985783	73985667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	221949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr13	74550144	74550303	74550225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	156091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333159816610145
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.441866561157871
chr13	75882191	75882614	75882549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	171636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	75904010	75904233	75904150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	150017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	75965393	75965547	75965541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	88703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	76080337	76080543	76080459	Y	NA	TBC1D4,COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	26087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.406349353344853
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354647357045912
chr13	76289938	76289995	76289967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	97368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr13	76336754	76337033	76336914	Y	COMMD6,LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	144184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr13	77898193	77898346	77898226	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	77899332	77899971	77899636	Y	KCTD12,FBXL3,MYCBP2	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	79232403	79232753	79232546	Y	NA	RNF219	NA	NA	NA	NA	RNF219	1089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	80122895	80122985	80122937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	69608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	80611072	80611300	80611181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	301786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	85779521	85779874	85779724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	2541640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	87776313	87776722	87776395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	544792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	88259012	88259340	88259160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	62174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	88345046	88345403	88345227	Y	NA	MIR4500HG	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	23532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.761499825501424
chr13	88383188	88383252	88383222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	61674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.385591962099453
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	63078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.650290774283778
chr13	88466706	88467088	88466903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	145192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619849284340899
chr13	90053531	90053928	90053634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	1732017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	90167002	90167321	90167160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1830753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	90486324	90486483	90486404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1511591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	91580553	91580648	91580601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	417426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	92294972	92294984	92294978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5	246043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr13	92871734	92872145	92872019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	161637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	92874267	92874578	92874398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	164170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	92900985	92901044	92901015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	190888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr13	92927934	92928164	92928120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	217837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	92940642	92941183	92940919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	230545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	93001340	93001722	93001531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	291243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr13	93083293	93083662	93083475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	373196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63772140528726
chr13	93096966	93097333	93097096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	386869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr13	93361116	93361155	93361136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	651019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	95749553	95749872	95749713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	201815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	95931058	95931197	95931128	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	20490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	95951518	95951672	95951596	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	15	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	96498991	96499334	96499248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	171598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	96517437	96517518	96517478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	186218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.228642711192781
chr13	99121203	99121258	99121231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	106936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	99169761	99169891	99169826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	58303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	99223213	99223429	99223417	Y	STK24	STK24	NA	NA	NA	NA	STK24	4765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	99278853	99278891	99278872	Y	NA	CALM2P4	STK24,FARP1	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2P4	12602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	99655287	99655290	99655289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	195674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	99874246	99874352	99874282	Y	NA	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	8234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	99934075	99934613	99934350	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	68063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	99957911	99958107	99958020	Y	DOCK9,CLYBL,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	91899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	99974545	99974749	99974637	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	108533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	100010340	100010660	100010510	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	141011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	100077871	100078176	100078098	Y	GPR183	NA	MIR548AN,UBAC2,DOCK9,UBAC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM9SF2	73495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	100630794	100630989	100630800	Y	NA	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	1037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	100644149	100644384	100644267	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	12123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	102143126	102143433	102143292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	76283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	102403781	102404089	102404035	Y	NALCN	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	336938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	103244790	103245125	103245073	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	TPP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TPP2	2228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	103752669	103752951	103752813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	257475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	104371816	104371919	104371873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	876622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	107078443	107078580	107078574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	139932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	107188808	107188962	107188940	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	29550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	107222796	107223196	107222998	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	4284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr13	107448247	107448283	107448269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	134462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	108918601	108918948	108918826	Y	TNFSF13B,LIG4,ABHD13	LIG4,ABHD13,TNFSF13B	NA	NA	NA	NA	TNFSF13B	17013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	321544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.750426532953506
chr13	109572126	109572187	109572157	Y	MYO16,MYO16	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	325626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr13	109576446	109576812	109576641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	329946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	109597213	109597584	109597276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	350713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	561007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	562169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	109847392	109847697	109847628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	557918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	109852673	109853050	109852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	552565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	109895773	109895899	109895836	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	509716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	495801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26341233475653
chr13	110042212	110042565	110042393	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	363050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	110132729	110132862	110132798	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	272753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr13	110138208	110138554	110138379	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	267061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	110147333	110147690	110147511	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	257925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr13	110274718	110274736	110274728	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	130879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	52916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	110359460	110359633	110359542	Y	IRS2	AL162497.1	MYO16,IRS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL162497.1	45982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	110401088	110401398	110401243	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	4217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.179322870082216
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	111064452	111064750	111064655	Y	RAB20	COL4A2-AS2	NA	NA	NA	NA	COL4A2-AS2	48884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	111410023	111410076	111410050	Y	NA	ING1,CARS2	CARS2,LINC00346,ING1,COL4A2	IMR90	Hi-C	24141950	CARS2	46073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.37573449879366
chr13	111595123	111595236	111595180	Y	NA	ANKRD10	ANKRD10,ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	29707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	111609846	111610157	111610005	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	44430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	113294900	113294930	113294914	Y	C13orf35	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	47713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	171523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	113549464	113549664	113549543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	206821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	NA	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	F10	189412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.380863429790566
chr13	113597069	113597276	113597160	Y	MCF2L	NA	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	F10	177852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F10	97754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299485870806977
chr13	113704885	113705219	113705051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F10	69909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	33161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113828673	113828834	113828768	Y	ATP11A,DCUN1D2,CUL4A	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	CUL4A	31718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114064803	114065029	114064948	Y	NA	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	48357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr13	114065698	114065892	114065794	Y	MCF2L,ADPRHL1	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	49252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr13	114080351	114080489	114080411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	50904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.62647474813103
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	11444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	114124603	114124675	114124639	Y	NA	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	6718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114127046	114127213	114127130	Y	GRTP1,DCUN1D2	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	4180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.528128581999758
chr13	114301802	114302224	114301872	Y	GAS6	NA	NA	NA	NA	NA	TFDP1	64789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114445132	114445240	114445183	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	119806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187893855960214
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04914647650225
chr13	114834440	114834743	114834634	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	61343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	114927536	114927629	114927597	Y	RASA3	RASA3	RASA3,CDC16,FLJ44054,ATP4B,CHAMP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASA3	31450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr13	115078776	115079079	115078928	Y	NA	UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	CHAMP1	788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	20516120	20516206	20516163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC5	255947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.629533383038379
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17,RP11-84C10.4,SLC39A2	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	21564675	21565076	21564876	Y	NA	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	5805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	21577986	21578258	21578000	Y	NA	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	7105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.536316604248639
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	22080552	22080764	22080649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL3	103035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	23056506	23056666	23056661	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	23083172	23083436	23083304	Y	NA	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	ABHD4	18026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr14	23158454	23158656	23158578	Y	SLC7A7	CTD-2555K7.1	DAD1,OXA1L,SLC7A7,ABHD4,REM2,LRP10	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2555K7.1	3088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	23357263	23357473	23357436	Y	NA	LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	REM2	6889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.12087571485623
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	23554726	23554907	23554813	Y	SLC7A7,RBM23,ACIN1	CDH24,C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	C14orf119	7067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	23611395	23611621	23611510	Y	SLC7A8	C14orf119,ACIN1,SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	39262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.433451504829284
chr14	24008139	24008541	24008214	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	14675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1,LTB4R	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	27311220	27311475	27311345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	1576678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	31165114	31165442	31165278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD1	75796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-829H16.2	71678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr14	31732842	31733131	31732940	Y	NA	NA	AP4S1,HEATR5A,HECTD1,STRN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	57832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	32670916	32671247	32671221	Y	NA	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	126917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	128213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	32941850	32942320	32942112	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	9686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.621692546350748
chr14	32976944	32977104	32977024	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	24938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	32979007	32979394	32979291	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	27001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499183168505477
chr14	33402784	33403168	33402896	Y	NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	450778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	34407631	34407737	34407684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	521825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr14	34504920	34505230	34505078	Y	NA	NA	EGLN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	424332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.472584132131707
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	RPS19P3,SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	35120187	35120582	35120411	Y	SNX6,SNX6	SNX6	SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C	IMR90	Hi-C	24141950	SNX6	22798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35562791	35563105	35562948	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	PPP2R3C	26618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	35575000	35575033	35575017	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	PPP2R3C	14690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35625298	35625573	35625393	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	35543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr14	35755529	35755685	35755573	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	9690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.61880727605171
chr14	35825324	35825456	35825405	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-561B11.1	30819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr14	35839188	35839529	35839227	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NFKBIA	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-561B11.1	16746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254858783937435
chr14	35869907	35870271	35870165	Y	FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	1684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35875800	35875964	35875882	Y	SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	3845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	36977511	36977654	36977606	Y	MBIP,SFTA3,NKX2-1,NKX2-1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	147119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	37445830	37445969	37445900	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	194102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr14	39637578	39637824	39637713	Y	NA	PNN	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	44437752	44437871	44437812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	926627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	45483090	45483569	45483224	Y	NA	KLHL28	NA	NA	NA	NA	KLHL28	25956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	45505148	45505421	45505276	Y	NA	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	4104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	45518258	45518310	45518284	Y	PRPF39	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	8733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	45592379	45592731	45592576	Y	PRPF39	PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	FKBP3	9791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	45714299	45714525	45714379	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	6218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr14	47526400	47526720	47526539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	141587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	48109739	48110114	48110083	Y	MDGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	441432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	49000423	49000807	49000609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	1050490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	50237132	50237443	50237218	Y	KLHDC2	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	4806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	50256678	50256775	50256761	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	24352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.05881314014083
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33298645200183
chr14	50374574	50374717	50374657	Y	RPL36AL,MGAT2,C14orf182,C14orf183,ARF6	ARF6	NA	NA	NA	NA	ARF6	16764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	108078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.28724625231281
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	118040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	168019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	167466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	50988191	50988449	50988343	Y	NA	MAP4K5	NA	NA	NA	NA	MAP4K5	37395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	51136928	51137372	51137340	Y	NA	SAV1	NA	NA	NA	NA	SAV1	3879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr14	51142431	51142560	51142495	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,CDKL1,NIN,PYGL	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	9382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	51144322	51144826	51144405	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,NIN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	11273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	51286113	51286196	51286155	Y	PYGL,NIN	NIN	NA	NA	NA	NA	NIN	9643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr14	51434779	51434836	51434798	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	25325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	51830897	51831022	51831007	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	151000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52145900	52146294	52146052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	144619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	127064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52544712	52544946	52544828	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	11000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	13588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.53541309044996
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	50409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	88894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr14	53294197	53294464	53294329	Y	NA	GNPNAT1	FERMT2	IMR90	Hi-C	24141950	GNPNAT1	37811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr14	53302326	53302477	53302407	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	45940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.562185491432042
chr14	53399403	53399746	53399574	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	17407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr14	54649490	54649642	54649566	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	211925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	54899909	54900051	54899977	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	38342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333889965800512
chr14	55116749	55117607	55117330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	84934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.943552036333268
chr14	55569033	55569319	55569207	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	19509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2226277014561
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171864997023702
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	55589429	55589640	55589507	Y	NA	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr14	55589903	55590059	55589993	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	1075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	55593915	55594674	55594041	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	5087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	29146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	55921336	55921695	55921412	Y	NA	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	44760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399777559026116
chr14	56274024	56274269	56274148	Y	NA	RPL13AP3,LINC00520	NA	NA	NA	NA	LINC00520	12618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	56677019	56677095	56677057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	94487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	57047832	57047974	57047932	Y	PELI2,C14orf101	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	465300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	57264055	57264245	57264231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	469481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	57725682	57725794	57725735	Y	NA	EXOC5	NA	NA	NA	NA	EXOC5	7932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	58449709	58450271	58450031	Y	NA	NA	C14orf37	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P3	155726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM9	110000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	59221069	59221139	59221083	Y	NA	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	38233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	59565112	59565514	59565267	Y	NA	NA	KIAA0586,DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	DAAM1	87850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	JKAMP	87888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	59908838	59908842	59908840	Y	NA	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	40319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.528128581999758
chr14	61188145	61188381	61188263	Y	NA	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	124189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	61904242	61904399	61904321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	130859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	95883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.512829872253612
chr14	61946856	61947374	61946994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	87884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	61960014	61960497	61960231	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	74761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	65145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	61978357	61978646	61978426	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	56612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.594207431237201
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	56239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.780258025187565
chr14	61979288	61979588	61979394	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	55670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr14	61980898	61981080	61981008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	54178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr14	61985151	61985397	61985317	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	49861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	61993253	61993443	61993274	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	41815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	61993702	61994099	61993768	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	41159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr14	62025043	62025333	62025150	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	9925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr14	62026213	62026731	62026533	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	8527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	2262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819773616119104
chr14	62040859	62041355	62041035	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	5601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr14	62052395	62052634	62052478	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	17137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr14	62052734	62053075	62053015	Y	SYT16	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	17476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372292443912568
chr14	62058743	62058958	62058799	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	23485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	62061169	62061631	62061310	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	25911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	62069550	62069793	62069672	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	34292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	62115448	62115553	62115501	Y	PRKCH,SYT16	HIF1A,HIF1A-AS1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	44678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	62219407	62219640	62219496	Y	HIF1A,SNAPC1	RP11-618G20.1,SNAPC1	NA	NA	NA	NA	SNAPC1	7435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	63159002	63159168	63159087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH5	407587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	63236531	63236843	63236687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH5	329912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	63983921	63984319	63984190	Y	NA	PPP2R5E	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	23773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301988177476899
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1,RP11-804M7.2	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr14	64403874	64404095	64403883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	86191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	64912318	64912487	64912430	Y	ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	55943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.677392925768209
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr14	65115289	65115345	65115316	Y	NA	NA	ZBTB25,ZBTB1,SPTB,PLEKHG3,CHURC1-FNTB,MTHFD1,PPP1R36,HSPA2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG3	53475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	65224783	65224915	65224850	Y	ZBTB1,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	55963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	65229015	65229197	65229106	Y	SPTB,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr14	65229595	65229717	65229658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr14	65469693	65469823	65469758	Y	NA	RAB15	NA	NA	NA	NA	RAB15	32199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	65641048	65641253	65641171	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	73635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	65705887	65706189	65706012	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	138474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326588022291408
chr14	66511264	66511273	66511269	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	460852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	66856568	66856818	66856763	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	115307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	67728313	67728625	67728469	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	22487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11,RDH12	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.556691031864922
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr14	68456427	68456429	68456428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	171931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	68613334	68613955	68613742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	272958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	68658646	68658820	68658748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	228093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	68712620	68712855	68712738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	174058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	68835621	68835756	68835701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	51157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	68925660	68925982	68925837	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	38747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.143649732719787
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.507371190754358
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr14	69065409	69066172	69065453	Y	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	178496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	69149155	69149350	69149272	Y	ZFP36L1,DCAF5	NA	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	111840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	69171999	69172408	69172198	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	88782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	69281323	69281785	69281441	Y	DCAF5	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	20133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	69424468	69424783	69424642	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	19374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	69598076	69598493	69598218	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	19374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254128634747068
chr14	69867695	69867997	69867846	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	ERH	4351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr14	69913588	69913836	69913761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERH	50244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.195351729018728
chr14	70079600	70080000	70079702	Y	NA	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	3287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	70168752	70169016	70168820	Y	SLC8A3,KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	22601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	70447892	70448065	70447949	Y	SMOC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	129044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	145817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.603317310293725
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	147136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	NA	NA	NA	NA	NA	TTC9	58030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr14	71811948	71812060	71812004	Y	NA	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	25417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	72021176	72021324	72021237	Y	SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	234645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	73585185	73585324	73585255	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	15802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	101981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	73919503	73919783	73919743	Y	NA	RP1-240K6.3,NUMB,C14orf169	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	7346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	26595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	RP5-1021I20.1,RP5-1021I20.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	36	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.488612991068219
chr14	74949377	74949710	74949544	Y	NA	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	MIR4709	4470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	79561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	75492523	75492557	75492545	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	23678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241212080189299
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	75607767	75608156	75607957	Y	FOS	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK9	15720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	75649674	75650038	75649826	Y	FOS	TMED10	TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMED10	8340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr14	75688633	75689211	75688968	Y	DLST,FOS	TMED10,RP11-293M10.2	PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	34903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	75697272	75697400	75697329	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	26714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.235370435060929
chr14	75765697	75765964	75765861	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	6590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr14	75920164	75920191	75920178	Y	JDP2	JDP2	NA	NA	NA	NA	JDP2	27745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr14	76027371	76027398	76027385	Y	NA	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	15562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	66642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	77384574	77384777	77384608	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	77425025	77425260	77425132	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	77427398	77427552	77427469	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	3417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03038827681611
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-7F17.3	99346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	79886057	79886209	79886119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	965891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	80062928	80063212	80063068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	788888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	81375179	81375565	81375372	Y	STON2,CEP128	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	48296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.02494839467044
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	81867886	81868104	81867969	Y	GTF2A1,GTF2A1	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	32705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	86066316	86066619	86066414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2341M24.1	332435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	88472465	88473193	88472806	Y	GALC,GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA7	376075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	89466992	89467193	89467101	Y	FOXN3	NA	EFCAB11,FOXN3,PRO1768,EML5,TTC8,LOC400236,TDP1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	178495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC8	382996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	343793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	89770346	89770725	89770409	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	312768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	89772713	89772723	89772718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	310770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	201352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	89887223	89887427	89887324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	196066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	90055887	90056088	90056076	Y	NA	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	27405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	90168731	90169025	90168878	Y	NA	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	85238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	91134460	91134696	91134603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	146127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	101280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	101649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	91454457	91454803	91454684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	70177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	91511263	91511534	91511399	Y	NA	RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	13446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	91697855	91698086	91698043	Y	C14orf159,SMEK1,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	172875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	91759632	91759894	91759768	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	122294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	91814664	91814951	91814783	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	67237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	91827435	91827790	91827659	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	54398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.352804095036062
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	93035062	93035389	93035185	Y	RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	177658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	93119846	93119961	93119893	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	93086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	93192576	93192808	93192662	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	20239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.653367300594656
chr14	93510584	93510744	93510686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	69921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	93635981	93636377	93636218	Y	NA	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	MOAP1	12896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	95064751	95064770	95064761	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA12,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	11944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	95513227	95513493	95513361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	108854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr14	95522849	95523085	95522967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	99262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	BDKRB1	NA	NA	NA	NA	BDKRB1	19269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	97282222	97282363	97282293	Y	NA	VRK1	NA	NA	NA	NA	VRK1	20581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.69030948032598
chr14	99657940	99658586	99658223	Y	C14orf177,BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	286630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	99726837	99727734	99727584	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	217482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr14	100196933	100197043	100196991	Y	NA	EML1	NA	NA	NA	NA	EML1	4987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	100497913	100498157	100498035	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	204478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.217725348194272
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.247783874508036
chr14	100874667	100875097	100874987	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	RP11-638I2.10,WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	3731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.7538860228935
chr14	100882790	100883112	100882951	Y	NA	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	11854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	12951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70128051279588
chr14	100889838	100890227	100890041	Y	BEGAIN	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	18902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	100899876	100900012	100899943	Y	WARS,WARS	RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	28940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	100901180	100901603	100901493	Y	WARS,WARS	RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	30244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	100905618	100905757	100905695	Y	BEGAIN	RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	34682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.526285319989908
chr14	100906618	100906904	100906684	Y	NA	RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	35682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr14	101020509	101020866	101020628	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	30884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.447481172206536
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	28188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr14	101024059	101024421	101024266	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	27329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	101029795	101030067	101029931	Y	NA	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	21683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	BEGAIN	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BEGAIN	1893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEG3	83877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.25268622776986
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	SNORD114-19	NA	NA	NA	NA	SNORD114-19	14100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	102089844	102089938	102089891	Y	NA	NA	MEG8,LINC00523,MIR381,MIR376C,MIR654,MIR1185-1,MIR539,MIR376B,MIR495,MIR889,MIR1185-2,MIR300,MIR376A2,MIR376A1,MIR655,MIR487B	IMR90	Hi-C	24141950	DIO3	64156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	102340393	102340589	102340458	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	88276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102396001	102396203	102396103	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	32662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.01310917486429
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	102530459	102530762	102530662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR20	73078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr14	102819515	102819720	102819663	Y	WDR20,TRAF3,RCOR1,TECPR2,CINP,CINP	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	CINP	7533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102971480	102971658	102971568	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	2478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr14	102977207	102977381	102977329	Y	AMN	ANKRD9,CTD-2555C10.3	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	3071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00874480683094
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2555C10.3	17652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.914223659209872
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9,CTD-2555C10.3	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2555C10.3	15452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.658095832903544
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9,CTD-2555C10.3	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2555C10.3	12012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06333207342891
chr14	103251609	103251698	103251662	Y	NA	TRAF3	NA	NA	NA	NA	TRAF3	9796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103537585	103537989	103537775	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	15786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.921525602718974
chr14	103539359	103539722	103539623	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	17560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.536316604248639
chr14	103540554	103540738	103540645	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	18755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.545773668866414
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.46968142677376
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TNFAIP2	29772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393049835157968
chr14	103577820	103578081	103577991	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	9698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	103584331	103584767	103584436	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	3012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103672017	103672095	103672056	Y	NA	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr14	103672309	103672597	103672449	Y	EXOC3L4	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.59102955279836
chr14	103675395	103675682	103675539	Y	NA	NA	LOC100131366,EXOC3L4,EIF5,CDC42BPB,MARK3,RCOR1,TNFAIP2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	87616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103726827	103727460	103727139	Y	MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5	NA	EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	70421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr14	103867345	103867626	103867486	Y	NA	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	17616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103889614	103889901	103889771	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	39885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr14	104567152	104567615	104567473	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	35445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	19600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	104616017	104616378	104616259	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	12957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	104763034	104763369	104763107	Y	TMEM179	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26A	159974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.903533330291068
chr14	104766695	104767088	104766699	Y	TMEM179	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26A	163635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.285073239800609
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	2748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300216019997344
chr14	105191285	105191466	105191451	Y	NA	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	2762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr14	105198821	105199110	105199005	Y	C14orf180,ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	10298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr14	105290315	105290696	105290451	Y	GPR132	AKT1,RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	4812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.503755771264953
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	34630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr14	105434041	105434308	105434245	Y	NA	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.624421887100376
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr14	105440243	105440515	105440379	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	105625647	105625988	105625853	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	7173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	105630127	105630455	105630291	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	2706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105660348	105660502	105660414	Y	CRIP2,JAG2,NUDT14	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	14688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.921022487608313
chr14	105949862	105949973	105949911	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	1563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHV3-23	529198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	637959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278728479561577
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25595443	25596209	25595953	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	85919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25625771	25626455	25625879	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	55673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	25642287	25642724	25642425	Y	UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	39404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	25748610	25748872	25748744	Y	NA	NA	LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	66482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	25811823	25812139	25811960	Y	NA	NA	LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	129695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr15	26189125	26189384	26189256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	506997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	26359333	26359715	26359530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	677205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	27014024	27014086	27014055	Y	GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	1331896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	1225444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	27901122	27901398	27901260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	657400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr15	28339947	28339987	28339948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	218811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	28342283	28342646	28342468	Y	OCA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	216152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	236254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	31406091	31406308	31406200	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-16E12.1	99915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	31617195	31617521	31617244	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	31680805	31681075	31680940	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	63747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	31757580	31757887	31757714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	140522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	31799647	31800074	31799955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	182589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	257365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	33418806	33419006	33418854	Y	NA	NA	FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	513461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	34290038	34290177	34290053	Y	NA	AVEN	NA	NA	NA	NA	AVEN	39200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	34625973	34627107	34626354	Y	NA	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	1154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	34807090	34807442	34807248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA8A,GOLGA8B	71262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	35014105	35014549	35014217	Y	NA	NA	AQR,GJD2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTC1	71791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	RP11-323I15.2	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	2271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	1090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	199113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	36502579	36502898	36502738	Y	NA	RP11-184D12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-184D12.1	39560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	36720333	36720777	36720654	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf41	149035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	37175924	37176266	37175984	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	67264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	37278170	37278456	37278428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	111084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	37656383	37656399	37656391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	264879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	39371433	39371559	39371496	Y	NA	NA	C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	499721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	GPR176	NA	NA	NA	NA	GPR176	46115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	40179429	40179904	40179805	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	31189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	18009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	40361212	40361596	40361446	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	SRP14	31823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	40395466	40395787	40395613	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	3306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	40397293	40397725	40397605	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	ANKRD63,PLCB2,C15orf52,DISP2	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.4968010133171
chr15	40730551	40730903	40730713	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	24693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	41158071	41158384	41158228	Y	RHOV	RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	6103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510100531503985
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.17365595385684
chr15	41264604	41264924	41264664	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	21444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr15	41581854	41582095	41581909	Y	NA	OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1	NA	NA	NA	NA	OIP5-AS1	7666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	41741039	41741403	41741222	Y	NA	NDUFAF1,RTF1,ITPKA	NA	NA	NA	NA	ITPKA	42188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	41852021	41852342	41852130	Y	MAPKBP1,JMJD7,ITPKA,TYRO3	RPAP1,TYRO3	NA	NA	NA	NA	TYRO3	4148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	41920606	41920652	41920629	Y	NA	MGA	TYRO3,MAPKBP1,MGA	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	9184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr15	42226071	42226526	42226165	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	36250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr15	42547123	42547182	42547153	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	16249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	42549506	42549513	42549508	Y	PLA2G4E	GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	13918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	42723209	42723609	42723409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP23	57822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	42833928	42834273	42834101	Y	NA	LRRC57,HAUS2,STARD9	NA	NA	NA	NA	LRRC57	4727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	43200953	43201247	43201100	Y	NA	TTBK2	NA	NA	NA	NA	TTBK2	9760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	43321563	43321622	43321602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR1	74689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.167136464714814
chr15	43757406	43757566	43757505	Y	NA	TP53BP1	NA	NA	NA	NA	TP53BP1	43360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	44073726	44074107	44073917	Y	NA	PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,ELL3,MFAP1,WDR76	NA	NA	NA	NA	ELL3	5985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	44181815	44182145	44181980	Y	NA	PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	15373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.616964014041861
chr15	45004703	45005017	45004887	Y	CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr15	45005185	45005759	45005376	Y	CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr15	45076532	45076874	45076594	Y	B2M	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM69	57346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr15	45737363	45738279	45737765	Y	SQRDL,PLDN,SPATA5L1,C15orf48	GATM,SPATA5L1,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	8120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	9844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.644676163235113
chr15	45806628	45806688	45806658	Y	NA	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	6317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	45930863	45931040	45930963	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	9517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.66964153661984
chr15	49087141	49087279	49087204	Y	NA	CEP152	NA	NA	NA	NA	CEP152	14064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	49160709	49161101	49160898	Y	NA	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	6982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	49163848	49164006	49163956	Y	NA	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	4077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	49268018	49268116	49268067	Y	NA	SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	14377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	49598906	49599159	49599033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF7	114134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	49785048	49785439	49785238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF7	71755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	49939997	49940334	49940166	Y	NA	DTWD1	NA	NA	NA	NA	DTWD1	28820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	49967299	49967495	49967408	Y	FGF7,DTWD1	NA	GALK2,C15orf33,ATP8B4,DTWD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DTWD1	56122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	50140337	50140734	50140509	Y	FGF7,DTWD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647E9.1	55894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr15	50201915	50201939	50201930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647E9.1	117472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	50335306	50335619	50335473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	136774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	50408630	50408976	50408933	Y	USP8,HDC,GABPB1,ATP8B4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	63417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	50426655	50427246	50427087	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2,ATP8B4	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	45147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr15	50427574	50427814	50427745	Y	NA	SLC27A2,ATP8B4	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	44579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2,ATP8B4	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	42409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30765645799696
chr15	50475759	50476090	50475833	Y	SLC27A2	SLC27A2,ATP8B4	NA	NA	NA	NA	ATP8B4	2745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418152795083139
chr15	50633863	50634132	50634006	Y	ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	11393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	50634288	50634665	50634477	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	10860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr15	51169242	51169420	51169339	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,USP50,SPPL2A,AP4E1,ASB18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404,19890323	AP4E1	29449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	51172834	51173079	51172965	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	51173397	51173629	51173520	Y	USP8,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	51212270	51212627	51212449	Y	NA	AP4E1	NA	NA	NA	NA	AP4E1	13401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	51909690	51910017	51909879	Y	NA	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	3013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	52024012	52024470	52024199	Y	TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2	TMOD2,LYSMD2	NA	NA	NA	NA	TMOD2	17288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	52120789	52121195	52120954	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr15	52122599	52122915	52122757	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	2774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.483884458759331
chr15	52395777	52396019	52395882	Y	DMXL2,TMOD3,MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.5	5057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227026483262636
chr15	52545063	52545254	52545150	Y	MAPK6	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	40741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr15	52581885	52582216	52582049	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	3779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	52775985	52776386	52776074	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	42861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	55574844	55574949	55574897	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	34209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	55928441	55928509	55928475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	104779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	56029665	56029817	56029741	Y	NA	PRTG	NA	NA	NA	NA	PRTG	3471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	56331775	56332089	56331933	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	47831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.68707702446569
chr15	56341448	56341541	56341527	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4	57504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	56419675	56420043	56419859	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	113440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	56475345	56475479	56475412	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	58004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	56717939	56718122	56718071	Y	RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9	NA	NA	NA	NA	NA	TEX9	183732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	57323913	57324233	57324065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	115092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	57844002	57844282	57844063	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	37824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	57920264	57920408	57920336	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	POLR2M	38033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	58621992	58622651	58622224	Y	ADAM10,AQP9	NA	LIPC,ADAM10,FAM63B	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	417526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	58732356	58732646	58732550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	307531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	59226674	59226915	59226795	Y	NA	SLTM	FAM63B	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLTM	2822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	59469464	59469853	59469728	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	59469975	59470287	59470131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	59492312	59492582	59492437	Y	BNIP2,ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	97035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	59530226	59530327	59530289	Y	BNIP2,ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	132565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	59536723	59536869	59536795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	126023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	59566542	59566544	59566543	Y	MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	96348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.20736522612244
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	75499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.419265907902622
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	59666396	59666611	59666505	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	MYO1E	3297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	59848106	59848258	59848124	Y	GCNT3	RP11-112N19.2,GCNT3	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	4814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr15	59862569	59862935	59862765	Y	NA	RP11-112N19.2,GCNT3	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	19277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr15	60699729	60699909	60699819	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	6647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr15	60818402	60818756	60818740	Y	RORA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	49025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	60881604	60881753	60881652	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	112227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	62405210	62405473	62405223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	50009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	62411576	62411892	62411783	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	43590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	62430374	62430555	62430466	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	24927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	62499952	62500233	62500097	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	44470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr15	62896766	62896914	62896838	Y	NA	NA	TLN2	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	216041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	63432131	63432432	63432186	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	15788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	63550855	63551251	63551053	Y	NA	NA	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	71187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	63663812	63664001	63663921	Y	LACTB,RAB8B	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	8359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	63664402	63664810	63664706	Y	LACTB,CA12	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	7550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	63794488	63794915	63794759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423264291021142
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	63894930	63894962	63894946	Y	FBXL22	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	3142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	64188807	64189333	64189164	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	64666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	64288096	64288290	64288164	Y	HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	DAPK2	73942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	64385169	64385477	64385384	Y	NA	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.308404042246225
chr15	64397616	64397971	64397713	Y	SNX1	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	13294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202426638448127
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425454738592242
chr15	64754012	64754177	64754162	Y	NA	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	3071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	37654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	64932987	64933351	64933169	Y	PLEKHO2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	49809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	65027953	65028147	65028050	Y	NA	OAZ2,RBPMS2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	34473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	AC069368.3	3874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	65148759	65148948	65148850	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	16671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	65165332	65165600	65165447	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	33244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	65186654	65187183	65187027	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	54566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01858483507783
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.681426635349159
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348075562727175
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.52539924125013
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.34061768966866
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	66060795	66060948	66060877	Y	NA	RAB11A,DENND4A	NA	NA	NA	NA	DENND4A	21683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.341347838859027
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	66965990	66966192	66966090	Y	MAP2K1	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	26374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5736596390126
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.634609100908517
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.50719782614604
chr15	67175645	67176118	67175872	Y	NA	NA	IQCH,SMAD6,LOC100506686,SMAD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	177983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67341124	67341334	67341261	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	12767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr15	67348530	67348587	67348559	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	5514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67373443	67373710	67373534	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	19342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67393197	67393867	67393527	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	39096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	67409139	67409556	67409296	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	55038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	59235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67436996	67437215	67437119	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	82895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	79620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	33898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67716264	67716618	67716446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	94788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67867550	67867820	67867663	Y	NA	MAP2K5	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	34503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67982881	67982892	67982887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	149834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr15	68176779	68177152	68176934	Y	NA	NA	PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	167365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	68238127	68238678	68238396	Y	NA	NA	PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	105839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	68265864	68265976	68265920	Y	NA	NA	PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	78541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	69490173	69490404	69490203	Y	NA	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	39250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	69650842	69650990	69650924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF23	53595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr15	70052375	70052953	70052736	Y	TLE3	NA	TLE3,LOC145837,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	309252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	70289516	70289879	70289625	Y	NA	NA	LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	98636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.0338303316972
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.03221410376706
chr15	70392397	70392607	70392502	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	70766954	70767165	70766993	Y	TLE3	NA	C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	286767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	70767457	70767783	70767604	Y	TLE3	NA	C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	286149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255241747566551
chr15	70787270	70787553	70787302	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	266379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr15	70797214	70797333	70797235	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	256599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	71126164	71126470	71126369	Y	NA	LRRC49,LARP6	NA	NA	NA	NA	LRRC49	17108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr15	71149072	71149436	71149201	Y	LARP6	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	4574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	71984997	71985280	71985139	Y	SENP8	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	419319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr15	72133892	72134113	72134003	Y	NA	NA	NR2E3	IMR90	Hi-C	24141950	SENP8	270486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	72213908	72214290	72214099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	190309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	72520083	72520441	72520217	Y	ARIH1,PKM2,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	31957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	CELF6,HEXA	NA	NA	NA	NA	CELF6	6901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	72666496	72666825	72666661	Y	NA	RP11-106M3.1	NA	NA	NA	NA	HEXA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	73035188	73035310	73035249	Y	NA	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	40877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.36756391160368
chr15	74226590	74227025	74226821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STOML1	57938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	35515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	79798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	74492868	74493054	74492979	Y	NA	STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	74493587	74493665	74493592	Y	CCDC33,ISLR	RP11-60L3.1,STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr15	74681899	74682338	74682078	Y	SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	42470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74801015	74801389	74801202	Y	NA	UBL7,ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	30129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1,CYP1A2	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.685807982096796
chr15	75075558	75076065	75075775	Y	ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK	CYP1A2,CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	3160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	75384189	75384549	75384318	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,C15orf39	NA	NA	NA	NA	NA	PPCDC	70293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	75398506	75398605	75398540	Y	MAN2C1,CLK3,C15orf39	NA	C15orf39	MCF7	ChIA-PET	22265404	PPCDC	84610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	75445545	75445830	75445694	Y	SIN3A,SIN3A,CSK,C15orf39	C15orf39	PPCDC,C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	40154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	75449127	75449383	75449255	Y	NA	C15orf39	PPCDC,SCAMP5	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	36601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	75460054	75460405	75460311	Y	NA	C15orf39	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	25579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.195351729018728
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.407965581274997
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.383592770540193
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.500296281324959
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	75886318	75886335	75886327	Y	NA	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	16688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415267524784101
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.604047459484092
chr15	76218014	76218024	76218019	Y	NA	FBXO22	NA	NA	NA	NA	FBXO22	23814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	76455838	76456047	76455943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf27	105660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.497914126136583
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr15	76658083	76658321	76658202	Y	NA	ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	31018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	77340153	77340443	77340173	Y	PSTPIP1	TSPAN3	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	33883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	77739736	77739821	77739778	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	28982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	78031317	78031646	78031484	Y	LINGO1	NA	NA	NA	NA	NA	HMG20A	320563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	78286845	78286973	78286909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	81093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	78356048	78356390	78356219	Y	NA	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	11676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	78362503	78362904	78362579	Y	IREB2,DNAJA4,DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	5162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	78364826	78365348	78365071	Y	DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	2718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	NA	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IREB2	60119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	1171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P116	126755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	79635470	79635474	79635472	Y	NA	TMED3	NA	NA	NA	NA	TMED3	34066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.258857167055955
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	80828578	80828783	80828681	Y	ZFAND6	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	240901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	80880322	80880600	80880404	Y	ARNT2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	189084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	188157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	81317366	81317544	81317456	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	26071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	82302959	82303245	82303102	Y	NA	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	33237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237943846261145
chr15	83376680	83377056	83376874	Y	NA	RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	AP3B2	14	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	83412156	83412209	83412183	Y	NA	AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.6	5107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	83479679	83480264	83480017	Y	WHAMM	WHAMM	HOMER2	IMR90	Hi-C	24141950	WHAMM	3299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	83681404	83681605	83681512	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	3011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	83683180	83683566	83683373	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	4787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83712711	83713060	83712967	Y	NA	C15orf40,BTBD1	C15orf40	IMR90	Hi-C	24141950	BTBD1	21046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	83722004	83722168	83722109	Y	NA	C15orf40,BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	11938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83731534	83731663	83731576	Y	WHAMM,BTBD1	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	2443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	43105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83815089	83815145	83815117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	59625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	56752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	83847712	83847957	83847821	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	26813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr15	83862328	83862648	83862488	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	12122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	83869308	83869629	83869461	Y	SH3GL3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	80180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	HDGFRP3	173532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	85290443	85290837	85290532	Y	PDE8A,ZNF592	SEC11A,ZNF592	NA	NA	NA	NA	ZNF592	577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	85361646	85361991	85361963	Y	ALPK3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF592	71780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427453930151503
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr15	85516737	85517139	85516966	Y	NA	PDE8A	ALPK3,PDE8A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE8A	4532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	85547085	85547484	85547285	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	25414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	85566958	85567254	85567106	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	45287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	85628969	85629268	85629119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	107298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.282343899050982
chr15	85662697	85662918	85662803	Y	PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	141026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	85861581	85861931	85861753	Y	PDE8A,AKAP13	NA	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	59871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr15	85874454	85874742	85874552	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	47060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr15	85886798	85887001	85886900	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	34801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	85887676	85888027	85887852	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	33775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr15	85890027	85890200	85890120	Y	AKAP13	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	31602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202809602077243
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	86088256	86088945	86088625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	166454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86111518	86111581	86111550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	189716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86166895	86167159	86167083	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	169102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	86192682	86192944	86192801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	143317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86247990	86248195	86248102	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	88066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	86315137	86315409	86315289	Y	KLHL25	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	20852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr15	89648424	89648609	89648517	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	19734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr15	89878895	89879173	89879043	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	2803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	129754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	90056616	90056810	90056708	Y	RHCG	NA	NA	NA	NA	NA	KIF7	139872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90456787	90457058	90456927	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	C15orf38	2599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90581471	90581912	90581727	Y	AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	38847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90649995	90650276	90650136	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	6259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90669829	90670140	90669985	Y	NA	IDH2,SEMA4B	IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IDH2	26093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259970279875438
chr15	90708840	90709227	90709106	Y	NA	SEMA4B	CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	7004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346806520358281
chr15	90938187	90938493	90938325	Y	NA	ZNF774,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	8737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr15	90945502	90945781	90945680	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	16052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456052158084533
chr15	90957340	90957730	90957416	Y	FES,ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	91107423	91107655	91107549	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	36266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	91114363	91114916	91114453	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,IQGAP1	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	43206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.342233917598804
chr15	91131539	91131872	91131812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRTC3	60382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	91191799	91192162	91191976	Y	UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	66210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377020976221455
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLM	72770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	7723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B,AC068831.10	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	92400491	92400865	92400640	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	5566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	92404418	92404854	92404606	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	9493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	92509194	92509613	92509420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	114269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	8116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.522286936871387
chr15	93347056	93347810	93347183	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	10179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	17947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	93356811	93357105	93356909	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	19934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	ASB9P1	26620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.63993065221195
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASB9P1	37903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0609856963084
chr15	93376360	93376528	93376444	Y	NA	ASB9P1,CHD2	LOC100507217,CHD2,ASB9P1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASB9P1	39483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	93388455	93388698	93388628	Y	NA	CHD2	CHD2,LOC100507217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHD2	35828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	93425040	93425223	93425112	Y	C15orf32	CHD2,MIR3175	NA	NA	NA	NA	CHD2	514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2,MIR3175	NA	NA	NA	NA	MIR3175	12413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	74413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr15	93611936	93612095	93612013	Y	RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	166307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	94739822	94739990	94739899	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	32777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	94746622	94746847	94746732	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	25920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401237857406849
chr15	94850045	94850297	94850155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	77278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309673084615119
chr15	96886247	96886633	96886548	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	11757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	15958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	25697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478425777260077
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	26018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr15	98047383	98047776	98047510	Y	ARRDC4	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544M6.2	597165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	98698078	98698430	98698265	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544M6.2	53137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236483547880411
chr15	99259262	99259477	99259337	Y	SYNM	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	69062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr15	99318481	99318879	99318554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	115885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99318917	99319236	99319025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	115528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99342514	99342944	99342658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	91820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99366453	99366700	99366460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	68064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	99394435	99394579	99394453	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	40185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr15	99394824	99395158	99395067	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	39606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	38762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.03570937177492
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	38099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	37597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.551232350365668
chr15	99399661	99400083	99399913	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	34681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99401021	99401241	99401076	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	33523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	30708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	25779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.919335155147877
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	25249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.576562344370545
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	24787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	18395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.511369573872879
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	9807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.65847879653266
chr15	99450086	99450215	99450157	Y	IGF1R	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	15322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326432092741998
chr15	99559007	99559192	99559062	Y	NA	PGPEP1L	PGPEP1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	PGPEP1L	9983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11270558401087
chr15	99561438	99561561	99561500	Y	NA	PGPEP1L	PGPEP1L,IGF1R	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PGPEP1L	12414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99661093	99661479	99661184	Y	NA	SYNM	NA	NA	NA	NA	SYNM	24673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	99665380	99665686	99665571	Y	NA	SYNM	NA	NA	NA	NA	SYNM	28960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01762765180775
chr15	99708218	99708283	99708249	Y	NA	NA	SYNM	IMR90	Hi-C	24141950	SYNM	71798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99823818	99824190	99823994	Y	MEF2A,MEF2A	TTC23,LRRC28,HSP90B2P	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	27981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	99856918	99857221	99857070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	61081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99864304	99864757	99864539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	68467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99965380	99965718	99965580	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,MEF2A,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	49652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	101253659	101254026	101253922	Y	ALDH1A3	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-66B24.5	428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr15	101261253	101261648	101261594	Y	NA	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-66B24.5	6799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-66B24.5	7401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557960074233816
chr15	101462538	101462736	101462613	Y	NA	ALDH1A3,LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	5118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	101546574	101546638	101546606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRK1	89154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	101667290	101667533	101667378	Y	NA	NA	CHSY1,SELS,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	122604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	101667775	101667985	101667844	Y	CHSY1	NA	CHSY1,SELS,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	122152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr15	101790495	101790968	101790609	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr15	101860934	101861170	101861021	Y	CHSY1,TM2D3	SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	27447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	101945887	101945918	101945891	Y	OR4F6,OR4F15,PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	112400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	101979646	101980007	101979833	Y	PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	83398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	101999244	101999620	101999441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	63785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	163381	163878	163678	Y	NA	RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	NPRL3	22981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	369599	369830	369715	Y	NA	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	30843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.79006227536659
chr16	615969	616302	616108	Y	RGS11,NHLRC4	PIGQ,RAB40C	NA	NA	NA	NA	PIGQ	974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	RPUSD1	22436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243055342199149
chr16	1052842	1052973	1052908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTR5	67783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	11551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.04829663217496
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	12364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr16	1166792	1167154	1166886	Y	NA	SSTR5	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	SSTR5	46036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTR5	111583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr16	1519780	1519909	1519802	Y	SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	3672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	2006829	2006953	2006860	Y	C16orf79,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3	NA	NA	NA	NA	NDUFB10	556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	NPW	7519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.383592770540193
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	4456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.520670708941243
chr16	2518760	2519270	2519088	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	3877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr16	2557760	2557909	2557835	Y	SRRM2,PDPK1,CEMP1	C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	3962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	2657653	2657823	2657765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVK13-1	63622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	2844544	2844902	2844723	Y	MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2,PRSS21,ZG16B	PRSS41	K562	ChIA-PET	22265404	TCEB2	19246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	2845811	2846048	2845884	Y	OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2,PRSS21,ZG16B	NA	NA	NA	NA	PRSS21	19116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.755155065262394
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS21,ZG16B,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	ZG16B	7591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.505754962824214
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.61406130868392
chr16	2924940	2925188	2925019	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FLYWCH2	5999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.530857922749385
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.238099775810556
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.901881324293058
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.47369724495119
chr16	3207486	3207903	3207712	Y	SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	29708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	3512084	3512361	3512129	Y	OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1	ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1	NA	NA	NA	NA	NAA60	20473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	3628962	3629267	3629135	Y	NA	SLX4	NA	NA	NA	NA	SLX4	30332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	3908512	3908774	3908643	Y	NA	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	19953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	3996199	3996445	3996330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	67472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr16	4010667	4011135	4010934	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	81940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr16	4063476	4063638	4063556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	100548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr16	4102835	4103049	4102865	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	61137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr16	4186619	4186736	4186682	Y	NA	ADCY9	CREBBP,ADCY9,SRL,TRAP1,CORO7-PAM16,PAM16	IMR90	Hi-C	24141950	ADCY9	22433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602778417115198
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRL	55999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.822502956868731
chr16	4262475	4262771	4262673	Y	SRL	SRL	NA	NA	NA	NA	SRL	27310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	4264073	4264474	4264297	Y	SRL	SRL	NA	NA	NA	NA	SRL	25607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	SRL,TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.32982093449632
chr16	4343991	4344084	4344046	Y	NA	TFAP4	CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	22915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583673031867808
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.424724589401876
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	4582537	4582680	4582608	Y	NA	NMRAL1	HMOX2,NMRAL1	IMR90	Hi-C	24141950	NMRAL1	38773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.586402372617435
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.444368867827792
chr16	4985283	4985359	4985321	Y	NA	SEC14L5,PPL	NA	NA	NA	NA	SEC14L5	20959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	8035197	8035214	8035207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	678326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr16	9171086	9171431	9171335	Y	C16orf72,USP7	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	12074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	9277609	9277994	9277792	Y	NA	NA	ATF7IP2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf72	94104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr16	10710964	10711341	10711185	Y	EMP2	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	38409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.598205814355722
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.46022436215599
chr16	10746944	10747196	10747087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	74389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.02456452309127
chr16	10759043	10759292	10759209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	76351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr16	10885820	10885991	10885909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	50177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	10922717	10923252	10923012	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	45803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr16	10926179	10926902	10926382	Y	NA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	42153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	10956294	10956664	10956435	Y	NUBP1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	12391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr16	10965041	10965252	10965110	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	CIITA	NA	NA	NA	NA	CIITA	3803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11059393	11059782	11059502	Y	CIITA,SOCS1,CLEC16A	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	23048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	11155783	11156117	11155981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	119438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	11188261	11188580	11188312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	151916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1,PRM2	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11473379	11473565	11473516	Y	ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,LITAF,CLEC16A,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	PRM2	105042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	11644813	11645143	11645061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	83094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr16	11656662	11657039	11656990	Y	ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	71198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11670817	11671132	11670939	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	57105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11677764	11678427	11678146	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	LITAF	NA	NA	NA	NA	LITAF	49810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11691003	11692063	11691252	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF	MCF7	ChIA-PET	22265404	LITAF	36174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11702109	11702428	11702257	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	25809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11705983	11706695	11706338	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	21542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr16	11707277	11708060	11707802	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	20177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	11709603	11709900	11709765	Y	RUNDC2A	LITAF	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	18337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11713232	11713400	11713276	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	14837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.12254561225776
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.387208190029597
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.311133382995852
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1,TNFRSF17	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427453930151503
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	TNFRSF17,RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	12623440	12623621	12623531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	272253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	14051699	14052037	14051838	Y	NA	ERCC4,RPS26P52	NA	NA	NA	NA	RPS26P52	37163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	14097024	14097356	14097296	Y	NA	NA	MKL2,ERCC4,MIR193B	IMR90	Hi-C	24141950	MKL2	65822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr16	14396583	14397514	14397260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	233405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	14402100	14402342	14402181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	238922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.371562294722201
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	14472258	14472411	14472327	Y	NA	NA	PARN,MIR365A,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARN	252174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	14599774	14599935	14599866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	124650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	14621757	14621928	14621847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	102657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	15069619	15069687	15069631	Y	PDXDC1	PDXDC1	NA	NA	NA	NA	PDXDC1	3171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	15576237	15576428	15576343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	50085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47708608670551
chr16	15617016	15617455	15617336	Y	NDE1,KIAA0430	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	90864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.706948336971311
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr16	16115976	16116215	16116101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	74542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	16198084	16198445	16198250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	125907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	17463561	17463824	17463658	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1139209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	17485561	17485736	17485646	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1161209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	19106464	19106699	19106563	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	16555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	20915885	20916169	20915941	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	6179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	21566198	21566360	21566279	Y	DNAH3	SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9	METTL9,IGSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2547E10.2	36433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	21622558	21622759	21622643	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	16019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	22020044	22020453	22020259	Y	OTOA,VWA3A	C16orf52	VWA3A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf52	3085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194238616199245
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	22211037	22211162	22211126	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EEF2K	4441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr16	22229382	22229580	22229448	Y	NA	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	13779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	22406960	22407340	22407096	Y	NA	CDR2,RRN3P3	POLR3E,CDR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDR2	39146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	22933536	22933775	22933574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP31	224816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	23309711	23310080	23309897	Y	NA	NA	SCNN1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	USP31	151120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23455511	23455803	23455657	Y	SCNN1G	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	6698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23518606	23518950	23518778	Y	GGA2	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	12366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	23693851	23693869	23693860	Y	NA	PALB2,DCTN5,PLK1	NA	NA	NA	NA	PLK1	6874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	24263992	24264018	24264005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA1	78850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	24284906	24285056	24284981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA1	57812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	24363109	24363426	24363114	Y	CACNG3	SNORA1	NA	NA	NA	NA	SNORA1	20241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	24538501	24538703	24538598	Y	RBBP6	RBBP6	NA	NA	NA	NA	RBBP6	8311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	24855986	24856230	24856033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6A	116970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	25005690	25005854	25005767	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	19133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	25069852	25070174	25070015	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	44865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337888348919033
chr16	25430499	25430826	25430663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN2	163247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	27149778	27150235	27150058	Y	NA	NA	HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	127880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	27240450	27240772	27240769	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	37343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	27264305	27264607	27264422	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	13508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	27326906	27327374	27327287	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	3917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	27329776	27330351	27329940	Y	JMJD5,JMJD5,KIAA0556,IL21R,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	6787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr16	27541388	27541697	27541538	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	17537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	28108728	28108802	28108745	Y	APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	112439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	28153289	28153624	28153397	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	67617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	28496890	28497119	28497100	Y	NA	APOBR,CLN3	NA	NA	NA	NA	APOBR	6851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	28629445	28629457	28629451	Y	SBK1,IL27	SULT1A2,SULT1A1	NA	NA	NA	NA	SULT1A1	3489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	28860977	28861369	28861174	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	5056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	SPNS1	184861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,SEPT1,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	30545067	30545182	30545127	Y	ZNF764	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF747	894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	AC002310.7	1728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.86250468419665
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.714909325140488
chr16	30927821	30927845	30927833	Y	NA	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1,ORAI3,SETD1A	NA	NA	NA	NA	FBXL19	4531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	31125100	31125333	31125167	Y	STX4,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,PRSS36	NA	NA	NA	NA	KAT8	25	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,PRSS36	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	31888684	31889219	31888998	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	31891820	31892363	31891972	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	8741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr16	33952235	33952334	33952272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	34377841	34378195	34377988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2494762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	46792369	46792477	46792422	Y	MYLK3	NA	MYLK3,C16orf87	IMR90	Hi-C	24141950	ORC6	70814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr16	46863838	46864241	46863904	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	46920520	46920743	46920636	Y	NA	GPT2	NA	NA	NA	NA	GPT2	4230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	47454284	47454574	47454519	Y	NA	PHKB,ITFG1	NA	NA	NA	NA	PHKB	38460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198811218958722
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	48545095	48545474	48545284	Y	SIAH1	NA	SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	SIAH1	64782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	48657602	48657960	48657802	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	N4BP1	5543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	50313130	50313496	50313255	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	35082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	51670868	51671078	51670973	Y	NA	HNRNPA1P48	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	6589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	51795949	51796284	51796182	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	118282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	51806959	51807182	51807071	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	129292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	51946818	51947082	51946950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	269151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	53134908	53135206	53135001	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	47963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	53810167	53810347	53810243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	74292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	53946175	53946412	53946271	Y	RBL2,AKTIP	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	210300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr16	53947888	53947948	53947918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	212013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	54114585	54114959	54114772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-324D17.1	187699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr16	55119645	55120042	55119844	Y	NA	NA	FTO	IMR90	Hi-C	24141950	IRX5	156871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	55869661	55869957	55869814	Y	NA	CES1	NA	NA	NA	NA	CES1	4412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	55870128	55870546	55870373	Y	NA	CES1	NA	NA	NA	NA	CES1	4879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	56352339	56352494	56352417	Y	MT3,CES5A,GNAO1,BBS2	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	104956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	56585977	56586211	56586034	Y	MT3,GNAO1,BBS2	BBS2,MT4	AMFR,NUDT21,MT1B,BBS2,MT2A,MT3,MT1A,MT1JP,MT1DP,MT1M,MT1H,MT1X,MT1IP,MT1G,NUP93	IMR90	Hi-C	24141950	MT4	10750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	56640479	56640669	56640573	Y	NA	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	56882732	56883304	56883026	Y	NA	SLC12A3	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A3	13815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr16	56944688	56944705	56944692	Y	HERPUD1	SLC12A3,HERPUD1	NA	NA	NA	NA	HERPUD1	19255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	57034523	57034824	57034736	Y	NLRC5	NLRC5	NA	NA	NA	NA	NLRC5	13126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	57125471	57125887	57125617	Y	NA	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	1022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	57302834	57302977	57302910	Y	NA	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	PLLP	13622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr16	57338123	57338348	57338237	Y	NA	PLLP	NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A	IMR90	Hi-C	24141950	PLLP	21524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	CCL22,CX3CL1	NA	NA	NA	NA	CX3CL1	18081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr16	57510567	57510918	57510632	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	DOK4	8321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	12303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	57701111	57701632	57701437	Y	FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	25073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.07301617212639
chr16	57927623	57928192	57928041	Y	GPR97,ZNF319	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	32666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	58061325	58061443	58061395	Y	NA	MMP15	NA	NA	NA	NA	MMP15	3855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.308559971795636
chr16	58766614	58766832	58766704	Y	NA	SLC38A7,RP11-410D17.2,GOT2	NA	NA	NA	NA	GOT2	353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	60706684	60707081	60706883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	1940423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	66165018	66165370	66165247	Y	NA	NA	LOC283867,CDH11	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00920	275057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	66440915	66440994	66440955	Y	CMTM3,CMTM3	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	66619876	66620093	66620023	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	15684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	66719308	66719396	66719350	Y	NA	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	9214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.942282993964374
chr16	67345616	67346198	67345888	Y	RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4	PLEKHG4	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4	36203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	67538327	67538734	67538468	Y	NA	ATP6V0D1,FAM65A	AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,RLTPR,CTRL	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65A	11587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.9330355283674
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	67794099	67794447	67794264	Y	CTCF,GFOD2,DPEP2,RANBP10	GFOD2,RANBP10,TSNAXIP1	NA	NA	NA	NA	GFOD2	42775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	67993555	67993691	67993621	Y	NA	PSMB10,LCAT,SLC12A4	NA	NA	NA	NA	SLC12A4	7813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.308559971795636
chr16	68029500	68029744	68029642	Y	PSMB10,DPEP2,DDX28	SLC12A4,DDX28	NA	NA	NA	NA	DDX28	26026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.01507213201106
chr16	68281428	68281510	68281462	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	4221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	NA	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	57964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	68765918	68766309	68765994	Y	NA	NA	CDH3,CDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-36P	198500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	69225511	69225823	69225667	Y	HAS3	SNTB2	NA	NA	NA	NA	SNTB2	6479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.143649732719787
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69442470	69442627	69442557	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	1996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr16	69444205	69444538	69444372	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B,TERF2,COG8,NIP7,TMED6,MIR1538,NQO1,WWP2,NOB1	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	3731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	69477830	69478460	69477879	Y	NA	TERF2,CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	21402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	69516681	69516730	69516706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5B	60253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69556739	69556897	69556827	Y	HAS3,TERF2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2	IMR90	Hi-C	24141950	NFAT5	40100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.329317363041035
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286186352620092
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr16	69777344	69777472	69777408	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	9371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450210512956163
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.26497580590453
chr16	69865358	69865753	69865556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP2	71149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	70424558	70424975	70424714	Y	NA	DDX19A,ST3GAL2	NA	NA	NA	NA	DDX19A	45826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	70464772	70465160	70465031	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	5980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	70564094	70564236	70564165	Y	NA	COG4,SF3B3,SNORD111B	NA	NA	NA	NA	SNORD111B	2682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	70769740	70769941	70769843	Y	NA	NA	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	51771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	71734305	71734386	71734346	Y	PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	22218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	71931018	71931097	71931057	Y	DHX38,ATXN1L,KIAA0174	ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	3779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.433451504829284
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr16	72882732	72883050	72882991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	208547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	72958517	72958769	72958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	132828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	72966138	72966319	72966212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	72981236	72981554	72981364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	110043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	73023566	73023933	73023728	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr16	73099840	73099940	73099875	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	8243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	73102477	73102709	73102578	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	10880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.439640335518905
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773183115758166
chr16	73158236	73158440	73158308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	66639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.21739605403655
chr16	73175958	73176260	73176058	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	84361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	73185769	73185903	73185836	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	94172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	73206454	73206866	73206668	Y	NA	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	114857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr16	73210679	73210897	73210788	Y	ZFHX3	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	119082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr16	74356396	74356719	74356558	Y	NA	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	27723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	74545615	74545910	74545763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLG1	93102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	74610751	74610842	74610827	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	28170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393779984348334
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr16	74772099	74772485	74772392	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	34244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.65086545026936
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.88896476973529
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	75034413	75034614	75034514	Y	FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	75288221	75288577	75288338	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	11374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.67819508743893
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	75594050	75594208	75594144	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	CHST5,TMEM231	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GABARAPL2	4041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	75618166	75618518	75618190	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	19917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	78564720	78564924	78564822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	433410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	78830248	78830546	78830432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	698938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	79414931	79415415	79415101	Y	MAF	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	WWOX	1283621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	80060890	80061347	80061153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	774879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	186975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	141241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	80710391	80710578	80710565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	125648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	80838768	80839127	80839024	Y	CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	2542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.787942932325784
chr16	80965900	80966145	80965922	Y	NA	NA	CMC2	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	71958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.823616069688213
chr16	80971971	80972227	80972105	Y	CENPN	NA	NA	NA	NA	NA	CENPN	65876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.31099625280003
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr16	81434776	81434850	81434813	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	41925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81436864	81437191	81437044	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	39584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	77260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81763852	81764387	81764185	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	6315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	81871176	81871311	81871248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	100474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	82218616	82218871	82218675	Y	MPHOSPH6	MPHOSPH6	HSD17B2	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	16785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201540559708349
chr16	82663331	82663687	82663514	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	82693893	82694152	82693974	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	35485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	82733427	82733620	82733554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	75019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	83988181	83988500	83988282	Y	NA	OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	8294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr16	84424110	84424272	84424217	Y	NECAB2	NA	NA	NA	NA	NA	WFDC1	97858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	84631583	84631836	84631712	Y	ZDHHC7,KIAA0513,KLHL36,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	17847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	84633541	84633938	84633771	Y	NA	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	15745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	84682643	84682972	84682859	Y	NA	COTL1,KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	2512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	84704578	84704887	84704734	Y	NA	KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	24447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85020713	85021068	85020917	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	22073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	85062384	85062545	85062427	Y	ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	3009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33637483741153
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428722972520397
chr16	85557334	85557622	85557547	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	164057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.537046753439006
chr16	85600571	85600865	85600718	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	85606114	85606473	85606294	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	115206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	85608106	85608214	85608158	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	113465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85734545	85734806	85734797	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	12866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85751381	85751721	85751674	Y	NA	GINS2,C16orf74	NA	NA	NA	NA	GINS2	29702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	85758517	85758802	85758746	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2,KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	23933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324049937553621
chr16	85878522	85878578	85878550	Y	NA	COX4I1,RP11-568J23.1	LOC400550,COX4NB,IRF8,FLJ30679,MTHFSD,LOC146513,LOC732275,FOXF1,COX4I1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	30380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85950196	85950424	85950316	Y	COX4I1,IRF8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568J23.1	102054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	85995905	85996102	85996008	Y	NA	NA	IRF8,COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	147763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	86108709	86108885	86108797	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,FOXF1,MTHFSD,FLJ30679,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	260567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	86312346	86312714	86312528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF1	229419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.951201165403623
chr16	86374799	86375066	86374872	Y	IRF8	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF1	167067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	86377089	86377400	86377245	Y	NA	NA	LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	164733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299833056368228
chr16	86417419	86417805	86417701	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	124328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636452362918367
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.27198332063453
chr16	86499961	86500190	86500098	Y	FOXF1	FOXF1	NA	NA	NA	NA	FOXF1	41943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72492317434032
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	FOXF1,MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	10642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324588830732148
chr16	86619952	86620235	86620073	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	21095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	99272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.228642711192781
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	99787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	176264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	86795224	86795595	86795410	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	196367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr16	86855510	86855797	86855532	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	256653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	366001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	386553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	87756631	87757179	87757021	Y	KLHDC4	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	40419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	87780321	87780693	87780507	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.825615261247473
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.15166439036035
chr16	87823236	87823449	87823367	Y	FBXO31,CA5A	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	87823592	87823837	87823720	Y	NA	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.413807226403367
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.588401564176696
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.770297845459128
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr16	87888208	87888468	87888297	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	12626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr16	87901718	87902209	87902044	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	87904170	87904524	87904347	Y	FBXO31	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	3076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr16	87988913	87989737	87989395	Y	ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	8063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88063556	88063600	88063578	Y	BANP,BANP,BANP	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	82706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88365536	88366092	88365805	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	151633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	88366840	88367234	88367013	Y	BANP,BANP,ZC3H18,CYBA	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	150491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	88450186	88450490	88450462	Y	NA	NA	CA5A,SLC7A5,BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	67235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	88555955	88556054	88556005	Y	NA	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	38230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	88557943	88558427	88558193	Y	FAM38A,CBFA2T3,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	40218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	88683643	88683946	88683795	Y	NA	ZC3H18,CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	31614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	88919657	88920044	88919827	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,CBFA2T3	APRT,TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	TRAPPC2L	584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNS	70326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324588830732148
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	89380978	89381130	89380989	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	98860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89406185	89406252	89406205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	124067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	89410388	89410772	89410415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	128270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	89475542	89475927	89475838	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	79042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.955462360669714
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	89568763	89569125	89568979	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPG7	13438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204425830007387
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.620423503981855
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89683162	89683271	89683207	Y	DPEP1,C16orf55	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	38982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	89796817	89796910	89796864	Y	NA	SPATA2L,ZNF276	NA	NA	NA	NA	ZNF276	12009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	89893816	89894170	89893993	Y	SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	11229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	90088262	90088277	90088270	Y	PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	3726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr17	200517	200885	200707	Y	RPH3AL	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf97	57233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	209872	210104	209987	Y	VPS53	C17orf97	NA	NA	NA	NA	C17orf97	48014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	505873	506062	505986	Y	VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	52725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	508147	508415	508281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	50372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	594616	594984	594846	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	DBIL5P	400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	698193	698349	698271	Y	NA	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	14612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.660825173653171
chr17	1358484	1358816	1358590	Y	NA	CRK,MYO1C	NA	NA	NA	NA	CRK	5640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.424724589401876
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.643180086786515
chr17	1466992	1467380	1467296	Y	RILP	INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA	NA	NA	NA	NA	PITPNA	2882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1521068	1521369	1521308	Y	CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	8811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1523946	1524301	1524043	Y	NA	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	5879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1585953	1586309	1586247	Y	NA	RILP,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	PRPF8	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819043466928736
chr17	1970904	1971232	1971070	Y	HIC1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	15456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1973596	1973991	1973873	Y	NA	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	18148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1979194	1979509	1979218	Y	NA	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	23746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	2084621	2084734	2084671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	2087949	2088276	2088112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	116401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.560916449063148
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.541045136557527
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289645842560086
chr17	2307434	2307709	2307574	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	2610688	2611037	2610862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	67313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	2614073	2614260	2614119	Y	KIAA0664	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	64090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	2626418	2626796	2626607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	51554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	2627139	2627523	2627311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	50827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.95050725062575
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	50253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283457011870465
chr17	2863545	2863659	2863602	Y	OR3A2,OR1G1	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	185195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	3534813	3534835	3534825	Y	OR1A2,OR1A1,OR3A2,OR1E1,OR1E2	SHPK,CTNS,TAX1BP3	TRPV1	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	2781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	3791085	3791371	3791288	Y	OR1E2,ZZEF1,P2RX1	C17orf85,CAMKK1,P2RX1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1,P2RX1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.795400805384299
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.730938184077
chr17	4065011	4065373	4065306	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4437372	4437692	4437444	Y	NA	SPNS2,MYBBP1A	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	19234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4669663	4670012	4669759	Y	SPAG7,MINK1,C17orf87,C17orf107,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15	MED11,CXCL16,ZMYND15,PSMB6,PLD2	NA	NA	NA	NA	PSMB6	27427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,INCA1,KIF1C	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	6082341	6082630	6082487	Y	WSCD1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	263105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6375097	6375395	6375262	Y	WSCD1,AIPL1	FAM64A	NA	NA	NA	NA	FAM64A	29362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr17	6396224	6396493	6396421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	50489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6399359	6399733	6399545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	53624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	6470839	6471155	6470959	Y	PITPNM3,TXNDC17	PITPNM3	PITPNM3	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM3	13025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	6541812	6541912	6541862	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	TXNDC17	166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6771162	6771276	6771219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	142392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.306943743865492
chr17	6897797	6898308	6898020	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	15360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6938707	6938851	6938779	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	SLC16A13	1313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499183168505477
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.740239319145364
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.47006439040288
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.12723927444884
chr17	7781804	7782205	7782005	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1	NA	NA	NA	NA	CHD3	3919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.267428152933953
chr17	8029074	8029494	8029268	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	3664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47220162484721
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.634992064537633
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.985796968014435
chr17	8268468	8268891	8268818	Y	SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4	KRBA2,RPL26,NDEL1	NA	NA	NA	NA	KRBA2	9138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	8824079	8824459	8824269	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R6	55085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	8838354	8838934	8838685	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R6	69360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	321602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	9549792	9549873	9549833	Y	NA	USP43	NA	NA	NA	NA	USP43	3777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	9688019	9688182	9688075	Y	NA	DHRS7C,GLP2R	NA	NA	NA	NA	DHRS7C	4432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.62638620854183
chr17	9720284	9720569	9720567	Y	GAS7	DHRS7C,GLP2R	USP43,GLP2R	IMR90	Hi-C	24141950	GLP2R	2954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	9731829	9732213	9732092	Y	NA	DHRS7C,GLP2R	NA	NA	NA	NA	GLP2R	8306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19806363470945
chr17	9741106	9741641	9741382	Y	NA	DHRS7C,GLP2R	RCVRN,GAS7	IMR90	Hi-C	24141950	GLP2R	17583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.48424998732954
chr17	9772002	9772101	9772006	Y	NA	GLP2R	NA	NA	NA	NA	GLP2R	48479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	9797524	9797769	9797647	Y	RCVRN	NA	NA	NA	NA	NA	GLP2R	74001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr17	9875435	9875567	9875515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLP2R	151912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	10053386	10053763	10053585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	106316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	11266931	11267244	11267127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P21	504152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	COX10	134195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	15363919	15364293	15364237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	111040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	80954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.630263532228746
chr17	16191035	16191327	16191109	Y	TRPV2	NA	CENPV	IMR90	Hi-C	24141950	CENPV	63643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	TRPV2,FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	45443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.997983373381838
chr17	16796690	16796969	16796791	Y	CCDC144A,COPS3	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIP	146890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	16893867	16894139	16894047	Y	NA	MPRIP	MPRIP,FLCN	IMR90	Hi-C	24141950	MPRIP	49720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328048320672142
chr17	17163211	17163219	17163215	Y	NA	FLCN,COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	COPS3	19388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	17348587	17348892	17348689	Y	NA	MED9,RASD1	MED9,PEMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MED9	29408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17397062	17397447	17397255	Y	NA	MED9,RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17439265	17439511	17439439	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	41556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	17493657	17493822	17493814	Y	RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.52140085813161
chr17	17628792	17629315	17629145	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	46005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	17641556	17641857	17641643	Y	MYO15A	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	58769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	17644687	17645051	17644950	Y	TOM1L2,LRRC48,LLGL1	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	61900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.665936669591175
chr17	17725605	17725781	17725666	Y	NA	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	12544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.53287500571217
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17838975	17839310	17839078	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	34426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17847220	17847305	17847263	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	26431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	17862888	17863023	17862956	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	10713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	18153652	18153819	18153756	Y	NA	LLGL1,FLII	NA	NA	NA	NA	FLII	6411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr17	18242712	18242812	18242762	Y	FBXW10,SHMT1	TOP3A,SMCR8,SHMT1,EVPLL	NA	NA	NA	NA	SHMT1	22044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	18820621	18820763	18820720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPSAP2	79223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	19273192	19273452	19273316	Y	FAM83G,MAPK7,MAPK7	MAPK7,B9D1	NA	NA	NA	NA	MAPK7	5582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	19398359	19398685	19398615	Y	NA	SLC47A1	SLC47A2,B9D1,EPN2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	1661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.805205055563324
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	20012372	20012672	20012482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	101715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	20057823	20057990	20057893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	147166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	20204150	20204477	20204216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS3P2	285894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501529545625988
chr17	20690369	20690534	20690439	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	4411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243941420938926
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.793330509294743
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465856408263559
chr17	21272298	21272502	21272399	Y	KCNJ18	KCNJ12	C17orf51,KCNJ12	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ12	5007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	KCNJ12	NA	NA	NA	NA	KCNJ12	36757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33921106075932
chr17	21908682	21908761	21908685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	432960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr17	25676124	25676302	25676192	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	57022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.06661819876059
chr17	25707009	25707412	25707348	Y	NA	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	74258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr17	25793795	25793989	25793936	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	12125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25794670	25794745	25794710	Y	NA	KSR1	TBC1D3P5,KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	13000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr17	25981784	25982180	25981982	Y	NA	LGALS9	NA	NA	NA	NA	LGALS9	26960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	26307415	26307616	26307516	Y	TNFAIP1	NA	C17orf108	IMR90	Hi-C	24141950	NLK	59147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	26734916	26735044	26734980	Y	NA	SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	2701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,SNORD42A,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.263429769815432
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	27273335	27273648	27273499	Y	PHF12	DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	3141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	27429797	27430178	27430111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	75252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	27466057	27466305	27466181	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	39125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.632992872978373
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18149588259441
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	27814311	27814661	27814484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	76409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	27890961	27891203	27891032	Y	SSH2,ABHD15	ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	TP53I13	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339504576849177
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.296373566428234
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557960074233816
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	89928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr17	28070496	28070746	28070685	Y	SSH2,EFCAB5	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	122571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	28210608	28210734	28210655	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	44560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	28672650	28672985	28672901	Y	NSRP1,CPD,CPD	CPD	NSRP1,TMIGD1,GOSR1,CPD,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPD	30938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	KRT17P3,SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	29210096	29210162	29210129	Y	NA	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	21676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	19457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	42098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.802475714813698
chr17	29892134	29892258	29892202	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	175492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	32579434	32580053	32579676	Y	CCL8,CCL7	CCL2	NA	NA	NA	NA	CCL2	251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	32936342	32936566	32936435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	349983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	33349623	33350064	33349994	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL	LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	CCT6B	43526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	33786708	33787098	33786905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFN11	87988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	NA	NA	NA	NA	NA	SLFN11	88688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	33923571	33923796	33923685	Y	NA	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	PEX12	19689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	NA	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	MMP28	74896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	34445033	34445052	34445044	Y	LYZL6	CCL3	NA	NA	NA	NA	CCL3	29518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr17	34948982	34949076	34949029	Y	DHRS11	DHRS11,MRM1	NA	NA	NA	NA	DHRS11	2754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	35208602	35208822	35208707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	95353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr17	35608489	35608691	35608590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	156218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	35741498	35741507	35741502	Y	NA	ACACA,TADA2A	NA	NA	NA	NA	ACACA	23402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.952470207772517
chr17	36480536	36480738	36480637	Y	NA	MRPL45,SOCS7	NA	NA	NA	NA	SOCS7	25373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.717135550779453
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	36610879	36611283	36611138	Y	NA	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	28217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17515112235538
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	37010933	37011093	37011014	Y	FBXO47,C17orf98	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	RPS20P35	1366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr17	37024501	37024874	37024707	Y	NA	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3094997200068
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.170751884204219
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.240326001449521
chr17	38225703	38226086	38225816	Y	PPP1R1B,TCAP,THRA,THRA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1	NA	NA	NA	NA	MED24	10235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	38226807	38227182	38226872	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38227405	38227627	38227516	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.285073239800609
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418152795083139
chr17	38229285	38229466	38229392	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	13817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr17	38263980	38264229	38263993	Y	RARA,RARA,MSL1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38463315	38463694	38463488	Y	RARA	CDC6	NA	NA	NA	NA	RARA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	38467869	38468243	38468028	Y	NA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	4425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	38468655	38468865	38468706	Y	IKZF3,CCR7	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	5211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38514847	38514935	38514891	Y	NA	GJD3	NA	NA	NA	NA	GJD3	3132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr17	38648531	38648872	38648707	Y	KRT10,MSL1,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	6977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.956468590891039
chr17	38656717	38656888	38656754	Y	KRT24,KRT10,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38666550	38666883	38666717	Y	TNS4	TNS4	CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P	IMR90	Hi-C	24141950	TNS4	10701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4,CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr17	38677736	38678132	38678052	Y	KRT24,TNS4	TNS4,CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	21887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	38689625	38689996	38689764	Y	NA	TNS4,CCR7	NA	NA	NA	NA	CCR7	29728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	38705273	38706158	38705806	Y	GJD3,IGFBP4	TNS4,CCR7	NA	NA	NA	NA	CCR7	13566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.368832953972574
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	CCR7	NA	NA	NA	NA	CCR7	11913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	39003172	39003257	39003186	Y	KRTAP2-1,KRT10	TMEM99,KRT10,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT10	26325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67737549070931
chr17	39010500	39010808	39010654	Y	NA	TMEM99,KRT10,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT20	28671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr17	39536188	39536609	39536415	Y	NA	KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	46	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	6606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	7487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.396509325097961
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr17	39782029	39782271	39782148	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT14,KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT17	2935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr17	39802138	39802335	39802276	Y	NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	23044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.12901052397834
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.643910235976881
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73478063764611
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10011832361083
chr17	39956975	39957353	39957171	Y	KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	LEPREL4	9503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr17	40163251	40163440	40163343	Y	NA	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	1851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	40201052	40201290	40201078	Y	CNP	NKIRAS2,DNAJC7	HSPB9,KAT2A	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC7	29658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	40418689	40419364	40419075	Y	EZH1,KLHL11,DNAJC7,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,RAB5C,STAT3,STAT3,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	GHDC,HCRT,KCNH4,RAB5C	IMR90	Hi-C	24141950	STAT5B	7361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	40438296	40438586	40438441	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3,PTRF	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	40671173	40671319	40671240	Y	PTRF	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	40689876	40689925	40689901	Y	NA	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP	NA	NA	NA	NA	NAGLU	3686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	40942176	40942529	40942199	Y	NA	EZH1,VPS25,PSME3,BECN1	NA	NA	NA	NA	VPS25	18722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	41233585	41233852	41233719	Y	BRCA1	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	41648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	41324260	41324525	41324381	Y	TMEM106A	BRCA1,NBR2,NBR1	NA	NA	NA	NA	NBR1	3762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	41410079	41410140	41410127	Y	NA	NA	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL4D	64187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	41421158	41421352	41421255	Y	NA	NA	NBR1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4D	52975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	41500242	41500532	41500387	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	25915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	41685770	41686110	41685943	Y	TMEM106A,DHX8,DUSP3	ETV4	DHX8,MEOX1,SOST	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	30782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	41686923	41687254	41687162	Y	NA	ETV4	DHX8,MEOX1,SOST	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	31935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	SOST	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	SOST	36668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	SOST,DUSP3	NA	NA	NA	NA	SOST	6683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	42101631	42102033	42102001	Y	C17orf105,CD300LG,LSM12	PYY,TMEM101,LSM12,G6PC3	NA	NA	NA	NA	TMEM101	2317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185667630321248
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.394666063088112
chr17	42174643	42174888	42174769	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	24182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.21155440890818
chr17	42357085	42357361	42357237	Y	TMUB2,TMUB2,GPATCH8,GRN	SLC25A39	SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A39	42877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.928253326587123
chr17	42619291	42619496	42619449	Y	NA	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	13429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	42620579	42620851	42620665	Y	GJC1,FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	42620927	42621257	42621090	Y	FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	11668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	42706147	42706421	42706320	Y	NA	NA	GPATCH8,C17orf104,RUNDC3A,CCDC43,DBF4B,ITGA2B,FZD2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC43	58726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.507527120303767
chr17	42872286	42872458	42872432	Y	FMNL1,GRN	GJC1	NA	NA	NA	NA	GJC1	33726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,FAM187A,GFAP,KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.717482736340705
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.670665201900062
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.22700904820373
chr17	43301681	43302194	43301892	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	4870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	43302645	43302970	43302880	Y	NA	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	5834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.640450746036888
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399238665847589
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.85044259648631
chr17	43309202	43309383	43309263	Y	MAP3K14,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	12391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	43385085	43385291	43385153	Y	HEXIM1,FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14,ARHGAP27	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	7123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	43398309	43398621	43398414	Y	NA	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	5895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	RPS26P8	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	22736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	185731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	44213270	44213366	44213318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	243522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	44232468	44232502	44232485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	262720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	44261899	44262225	44262045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	292151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	44341762	44341942	44341850	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPT	372014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	44342171	44342447	44342244	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPT	372423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.738587313147354
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09707712376238
chr17	44849895	44850213	44850158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	52362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	CDC27	120552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	45317390	45317724	45317566	Y	TBKBP1	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	52602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.341347838859027
chr17	45725037	45725352	45725118	Y	SP2	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP6,SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.799902303613481
chr17	46168455	46168716	46168586	Y	NA	NFE2L1,CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	CBX1	8167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	46226881	46226967	46226912	Y	TBX21,OSBPL7,LRRC46,SKAP1	CBX1,SNX11	SNX11	IMR90	Hi-C	24141950	SNX11	48162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313288504104523
chr17	46510529	46510724	46510608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOXB2	110717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB5,HOXB6,HOXB8,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB5,HOXB6,HOXB8,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	3981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB6,HOXB8,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	47017432	47017466	47017449	Y	NA	ATP5G1,UBE2Z,SNF8,RNU1-42P	NA	NA	NA	NA	SNF8	3013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	47081081	47081234	47081133	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	47081384	47081547	47081466	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	47099859	47100181	47099940	Y	PRAC,IGF2BP1	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	27085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.05749042830054
chr17	47337469	47337918	47337568	Y	CALCOCO2,UBE2Z	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	31341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	ZNF652	NA	NA	NA	NA	ZNF652	12708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.641336824776664
chr17	47468290	47468719	47468487	Y	ZNF652,ZNF652	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	21527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr17	47647130	47647802	47647650	Y	NA	NXPH3	ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NXPH3	3418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.357376697795539
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	SGCA	15813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1791495054739
chr17	48504874	48504976	48504927	Y	NA	LRRC59,ACSF2,RSAD1	NA	NA	NA	NA	ACSF2	3355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	48716691	48717083	48716761	Y	CHAD,SPAG9	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr17	48870441	48870661	48870502	Y	NA	NA	TOB1,LINC00483,LOC400604,CACNA1G,SPAG9,WFIKKN2,ANKRD40	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	72678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	48908408	48908498	48908454	Y	NA	TOB1	TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	34841	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.533587263499012
chr17	48996377	48996488	48996474	Y	RSAD1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	23586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	48998350	48998465	48998408	Y	CHAD	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	21609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	49008376	49008926	49008868	Y	NA	RP11-700H6.1	WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	11148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr17	49027288	49027482	49027366	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	7214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	8014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290914884928979
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	11564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149108414219042
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr17	53394900	53394943	53394922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLF	54527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	54263832	54264049	54263912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOG	405011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372292443912568
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr17	54857525	54857918	54857805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	51542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	54864431	54864801	54864568	Y	TRIM25,SCPEP1	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	44659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	54876339	54876519	54876454	Y	DGKE	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	32941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	55288386	55288469	55288428	Y	NA	MSI2	MSI2	IMR90	Hi-C	24141950	MSI2	42743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr17	55292764	55293032	55292916	Y	NA	MSI2	MSI2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MSI2	38180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294530304418384
chr17	55501996	55502706	55502262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	170784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	55540558	55540950	55540705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	209346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	55740175	55740776	55740501	Y	MSI2,MSI2,DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	55741402	55741415	55741409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	55977135	55977456	55977362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	51718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	56426877	56426962	56426920	Y	MTMR4,SUPT4H1	MIR142,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	1492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	MIR142	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.445481980647275
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57500537	57500993	57500672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL2	93487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.384861812909086
chr17	57833423	57834077	57833636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	50436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	57847286	57847866	57847541	Y	YPEL2,RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	64299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.417266716343361
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539428908627382
chr17	57862470	57862813	57862554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	53814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06867060344662
chr17	57881973	57882438	57882250	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	34189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19149184039072
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.699993579023459
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	57908316	57908645	57908515	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	7982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.22629633407227
chr17	57932450	57932798	57932624	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	15823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.494454636196589
chr17	57952277	57952457	57952367	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	15847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	57966021	57966396	57966241	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	1908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	CA4	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CA4	12892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348805711917541
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	261797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	59327837	59328038	59327938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	147219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr17	59328360	59328558	59328442	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	146699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr17	59329573	59329874	59329791	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	145383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.471698053391929
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	60247601	60248070	60247921	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	106958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	60256998	60257133	60257064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	116355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	60557252	60557333	60557299	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	34795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	57483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	188296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr17	60795868	60796183	60796045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	203740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	264145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257240939125811
chr17	60868052	60868313	60868162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	275924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.419648871531737
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	276512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	60869162	60869387	60869275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	277034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.572372705240184
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	305158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	60970243	60970809	60970465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	378115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	450993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	61243701	61244044	61243838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	277695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	61274452	61274584	61274536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	247155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61299362	61299669	61299468	Y	MAP3K3	NA	MIR548W,DCAF7,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	222070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr17	61629052	61629111	61629082	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	3230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr17	61748394	61748578	61748486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K3	50619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61779039	61779508	61779383	Y	NA	STRADA	NA	NA	NA	NA	STRADA	37822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	STRADA	NA	NA	NA	NA	STRADA	29959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	61796482	61796787	61796636	Y	NA	STRADA	NA	NA	NA	NA	STRADA	20543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339001461738516
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr17	62252131	62252624	62252334	Y	LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1	ERN1,SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	30688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	62256473	62256785	62256630	Y	DDX5,ERN1	SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	35030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	62258830	62259200	62259015	Y	SCN4A	SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	37387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	62310016	62310373	62310195	Y	C17orf72	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	28288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	62403904	62404562	62404234	Y	ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	65243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557804144684405
chr17	62408874	62409016	62408933	Y	ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	62409252	62409599	62409468	Y	ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.3386184981094
chr17	62409604	62410133	62409977	Y	ICAM2,ERN1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.31859171239899
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	62966198	62966382	62966326	Y	DDX5,CEP95,RGS9,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	3312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	63060882	63060952	63060917	Y	GNA13	GNA13	GNA13,RGS9	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	9925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499027238956066
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	545803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr17	63996608	63996849	63996729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	189353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.609506140983346
chr17	64271821	64272172	64271887	Y	NA	APOH,PRKCA	PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APOH	21178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	64503657	64504241	64503882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	206903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	64690651	64690854	64690753	Y	PRKCA,CACNG4	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	393897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	64708077	64708220	64708107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	411323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	65130860	65131108	65130984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	108997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr17	65394789	65395150	65395019	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	23214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	65470400	65470556	65470469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	98825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	65471645	65472025	65471701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	100070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	65516763	65517072	65516877	Y	PITPNC1	NA	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	145188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65525014	65525424	65525241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	153439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	65897183	65897370	65897273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPTF	77543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	65991434	65991739	65991543	Y	C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	3669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04295764581263
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	66030294	66030564	66030453	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	66284577	66285224	66284692	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	AMZ2,ARSG,SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	66306496	66306595	66306536	Y	BPTF,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A6	21088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	66311166	66311345	66311242	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	25758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	66348483	66348670	66348577	Y	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	63075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.771183924198905
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.00186206136344
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.708911750462707
chr17	66379549	66379922	66379702	Y	SLC16A6,WIPI1	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	71732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286186352620092
chr17	66380161	66380700	66380381	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	WIPI1	70954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	66382740	66382853	66382787	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	68801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	66384429	66384662	66384544	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	66992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	66456929	66457226	66456998	Y	NA	WIPI1,PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	WIPI1	5275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	67729924	67730199	67729927	Y	NA	NA	KCNJ2-AS1,KCNJ2,KCNJ16	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	321085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	68133591	68133755	68133649	Y	KCNJ2	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	29059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	69558525	69558657	69558591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	56462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	69596730	69596951	69596781	Y	NA	LOC124685	NA	NA	NA	NA	LOC124685	18168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	70514986	70515384	70515137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	105986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	70577972	70578326	70578149	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	43044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	70585924	70586379	70586141	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	34991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	70680022	70680249	70680147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	58652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	85009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.33477604454029
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	91038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	70939903	70940361	70940187	Y	SSTR2,C17orf80	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	146490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr17	71024945	71025268	71025108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	61583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324588830732148
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.335506193730656
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	71427116	71427294	71427230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	120802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	71603632	71603970	71603800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	297318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	72543917	72544134	72544056	Y	TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	124927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	72596633	72597034	72596924	Y	TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	145757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.48282501541124
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.79049936481172
chr17	73091198	73091317	73091257	Y	TSEN54,LLGL2	SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	9376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.435067732759428
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	73319762	73319905	73319788	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	6352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73391809	73391943	73391876	Y	NA	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	GRB2	7847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr17	73456599	73456615	73456608	Y	NA	KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	21359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73531533	73531826	73531590	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	12372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339348647299766
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.366833762413314
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27215668524284
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74067493	74067877	74067630	Y	RNF157,FAM100B	EVPL,SRP68,EXOC7	NA	NA	NA	NA	SRP68	759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	74413626	74413718	74413672	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	33570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	74496062	74496568	74496378	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,ST6GALNAC2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	74525516	74525637	74525615	Y	NA	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	29644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74525744	74526079	74526045	Y	ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	29872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	74526422	74526750	74526585	Y	CYGB	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	30550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74593962	74594390	74594127	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6	ST6GALNAC2,ST6GALNAC1	ST6GALNAC2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ST6GALNAC2	12924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	74748247	74748435	74748347	Y	FAM100B,JMJD6,SRSF2	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	SRSF2	16791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	75112462	75112730	75112694	Y	SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	31664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr17	75160724	75161106	75160798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	79926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	198047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	231793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	75321712	75322201	75321955	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	240914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr17	75405377	75405733	75405639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	324579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75456086	75456409	75456172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	375288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	381004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76169246	76169385	76169328	Y	PGS1,SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	6607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76169539	76169762	76169683	Y	TMC6,SOCS3,PGS1,SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	6900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.458398535205044
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01908795018849
chr17	76318991	76319257	76319075	Y	NA	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	34901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76325206	76325964	76325662	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	28194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.355377506236279
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr17	76347582	76348110	76347694	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	6048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.321859489982521
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76382008	76383398	76383057	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	9287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76412850	76413399	76413170	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	40129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76438570	76439399	76439026	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	65849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr17	76480175	76480442	76480309	Y	TMEM235	RN7SL454P	NA	NA	NA	NA	RN7SL454P	46695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr17	76529146	76529333	76529216	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	RN7SL454P	NA	NA	NA	NA	RN7SL454P	2009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	76588219	76588768	76588537	Y	NA	NA	DNAH17,CYTH1,USP36	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SL454P	61082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76635137	76635288	76635196	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	CYTH1,DNAH17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SL454P	108000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76641957	76642289	76642128	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	DNAH17,CYTH1	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SL454P	114820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76669540	76669658	76669599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	106721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76744782	76745072	76745044	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	31307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76813236	76813533	76813481	Y	CYTH1,ENGASE,USP36	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	21990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583445997788102
chr17	77032690	77033106	77032818	Y	CYTH1,ENGASE	CANT1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	CANT1	28741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	77730841	77731207	77731024	Y	CBX8,CBX2	CBX2,CBX8	NA	NA	NA	NA	CBX2	18724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194238616199245
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	77803693	77803802	77803748	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	7426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.613001408991205
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr17	78134342	78134588	78134495	Y	NA	EIF4A3	EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A3	15360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	78149249	78149503	78149364	Y	NA	EIF4A3,SLC26A11,SGSH	EIF4A3	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF4A3	30267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.541045136557527
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	78289864	78290143	78290056	Y	NPTX1	NA	LOC100294362,ENDOV	IMR90	Hi-C	24141950	RNF213	57199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	78387431	78387634	78387516	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.44296269526307
chr17	78471918	78472124	78472096	Y	NA	NPTX1,RPL32P31,RPTOR	RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6	IMR90	Hi-C	24141950	NPTX1	22275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr17	78744627	78744900	78744734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	218498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78754047	78754707	78754061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	208691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78824691	78824852	78824790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	138546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	78900870	78900990	78900942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	62408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	78901796	78901941	78901869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	61457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	78958668	78958859	78958764	Y	NA	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	CHMP6	4539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	79024187	79024380	79024262	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	17239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	79107096	79107396	79107264	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	87403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.08941055963312
chr17	79123029	79123440	79123130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	71359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	79261011	79261270	79261067	Y	NA	C17orf89,SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	6077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	79302809	79302914	79302847	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	TMEM105	335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.16823214247539
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10646308384986
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	80628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr17	79399752	79400128	79399940	Y	NPB	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	77961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.64575349798673
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	79779684	79779899	79779792	Y	NA	FAM195B,PPP1R27,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	9279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr17	79925685	79926075	79926048	Y	TSPAN10	SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,AC137723.5,PYCR1,ASPSCR1	ASPSCR1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASPSCR1	6608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	AC137723.5,PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	79949658	79950000	79949804	Y	SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	16975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.10533253597147
chr17	80060759	80061000	80060880	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	6551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	80079695	80079832	80079748	Y	NA	FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	25487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	80199457	80199968	80199484	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	15184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	80214734	80215057	80214944	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.302215211556604
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.707451452081974
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.441483597528754
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1,TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.306560780236375
chr17	80546229	80546455	80546368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK2	70640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80594524	80594906	80594740	Y	UTS2R,WDR45L	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	59698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	80830952	80831086	80831038	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	34498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	81031472	81031760	81031658	Y	METRNL	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1	K562	ChIA-PET	22265404	METRNL	3807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478425777260077
chr17	81057799	81057924	81057864	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	22232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	81058904	81059222	81058949	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	23337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	81063257	81063563	81063336	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	27690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	81066773	81067186	81066924	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.518671517381983
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.934094971715493
chr17	81143253	81144043	81143500	Y	NA	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	107686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr17	81150899	81151424	81151082	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	115332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	222573	222827	222703	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	43223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	379694	380112	379776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	113644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	395862	395959	395924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	129812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543044328116787
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.20458221590142
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	RNU1-109P,YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2548368	2548472	2548420	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	21036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.233754207130784
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	2855586	2855865	2855617	Y	NA	NA	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN2	155448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	2963165	2963356	2963277	Y	TGIF1,MYL12B,METTL4,SMCHD1,EMILIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	47957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.398891480286338
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11832019505953
chr18	3385002	3385317	3385084	Y	NA	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	24289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.287802580550236
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.625534999919858
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.19641208505607
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.725826688138997
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.86980617136113
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr18	3639477	3639730	3639610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	229871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602048267924832
chr18	3676188	3676369	3676278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	266582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr18	3704951	3705065	3705044	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	295345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.32625872813368
chr18	3806540	3806805	3806758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	396934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	3816827	3817202	3817015	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	407221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr18	4002405	4002762	4002417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	592799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	4004554	4004687	4004639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	594948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	7048074	7048376	7048212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA1	67437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72292398278106
chr18	7273554	7273981	7273852	Y	NA	SNORA48	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA48	25170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	7950764	7950916	7950843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	385984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.448211321396903
chr18	8643425	8643722	8643508	Y	ANKRD12,ANKRD12,RAB12	RAB12	NA	NA	NA	NA	RAB12	35982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	8730480	8730718	8730581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	123037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377020976221455
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr18	9094792	9095105	9094897	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDUFV2	5523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	9101793	9102110	9101852	Y	RAB12,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	NDUFV2	1165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	9375216	9375438	9375327	Y	NA	TWSG1	NA	NA	NA	NA	TWSG1	42451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	9645725	9646120	9645908	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	32487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	9658069	9658457	9658201	Y	PPP4R1	PPP4R1,RAB31	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	44831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr18	9705290	9705640	9705469	Y	NA	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr18	9711641	9712077	9711750	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	5479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	9742767	9742849	9742828	Y	VAPA,RAB31	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	36605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr18	9753891	9754160	9754063	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	47729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.541428100186642
chr18	9755700	9755941	9755783	Y	RAB31	RAB31	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	49538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	9758210	9758472	9758414	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	52048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	99673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.559803336243666
chr18	9850282	9850437	9850360	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	61562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	9869849	9870152	9869995	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	41847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.508484303573841
chr18	9877272	9877635	9877453	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	34364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.445481980647275
chr18	9899069	9899359	9899167	Y	NA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	12640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.360992117284943
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.77495572958234
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	10544333	10544521	10544427	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	20431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	10852460	10852708	10852534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	328558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr18	11431991	11432229	11432112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAL	254726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	11490584	11490685	11490652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAL	196270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	11846235	11846388	11846281	Y	GNAL,GNAL	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	3007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.46752630566509
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.51347148185478
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.70141900728639
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	113384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	12336380	12336603	12336512	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	30712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12606965	12607268	12607096	Y	PTPN2,SPIRE1	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	48774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	14710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	12763760	12763785	12763774	Y	CEP192,C18orf1	NA	PTPN2	IMR90	Hi-C	24141950	CEP76	62984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12837862	12838421	12838235	Y	PTPN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	89221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	19415827	19415836	19415832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	132909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	19862450	19862773	19862669	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	115046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr18	20104385	20104397	20104392	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	271827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr18	20254145	20254527	20254453	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	121697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	20263132	20263811	20263406	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	112413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232641094311301
chr18	21337339	21337459	21337412	Y	C18orf45	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	96490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	21552370	21552656	21552582	Y	C18orf8,TTC39C,TTC39C	TTC39C	NA	NA	NA	NA	TTC39C	18081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.953236135030749
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	23624852	23624978	23624915	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	44203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	24107807	24108046	24107927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	127319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	24237719	24238162	24238112	Y	NA	KCTD1	TAF4B,KCTD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD1	2354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38832130284908
chr18	26231611	26231936	26231774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	1996246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSG2	288838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr18	29617639	29618031	29617775	Y	NA	RNF125	NA	NA	NA	NA	RNF125	21304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	30862088	30862282	30862185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	1192270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	32239709	32239834	32239782	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	168455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299485870806977
chr18	32439346	32439714	32439476	Y	ZNF397,ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	115178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	32671998	32672517	32672048	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	117106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	32674767	32675124	32674837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	119875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr18	32990022	32990156	32990089	Y	NA	ZNF396	GALNT1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF396	34721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	33038926	33039146	33039052	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	36809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	33057648	33057699	33057650	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF24,ZNF396,INO80C	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	18256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	33073738	33073904	33073824	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	2051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	33093148	33093751	33093628	Y	GALNT1	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	17193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr18	33185452	33185527	33185471	Y	ZNF397,GALNT1	GALNT1	NA	NA	NA	NA	GALNT1	26371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr18	33737531	33737917	33737788	Y	NA	SLC39A6,ELP2,MOCOS	NA	NA	NA	NA	MOCOS	27565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	111058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr18	33878609	33878753	33878681	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	113127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	34052267	34052344	34052306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	286785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	34406593	34406898	34406790	Y	NA	KIAA1328,TPGS2	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	34532943	34533308	34533124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	125785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr18	34915511	34915689	34915620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	228311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	35000619	35000729	35000675	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	143271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.676854032589683
chr18	35009721	35010039	35009931	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	133961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr18	35024297	35024529	35024426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	119471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	35028363	35028565	35028479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	115435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.43051302140348
chr18	35066308	35066547	35066428	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	77453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr18	37151664	37151869	37151793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	238025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	37629293	37629563	37629339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	715654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	38447528	38447658	38447616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1085513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	39540677	39540940	39540809	Y	NA	PIK3C3	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	7506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	42419261	42419416	42419316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	161123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	43250326	43250536	43250381	Y	EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	294704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr18	43373390	43373776	43373583	Y	PSTPIP2,EPG5	NA	SIGLEC15,SLC14A1,EPG5,SLC14A2	IMR90	Hi-C	24141950	EPG5	171464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	43381768	43381900	43381886	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPG5	163340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	43382830	43382969	43382904	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPG5	162271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	43542357	43542726	43542619	Y	PSTPIP2,C18orf25,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	2514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	43732950	43733330	43733193	Y	RNF165,C18orf25	C18orf25	NA	NA	NA	NA	C18orf25	18189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr18	43874380	43874525	43874458	Y	NA	RNF165	RNF165,LOXHD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF165	30247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.750809496582622
chr18	44372138	44372406	44372272	Y	RNF165,PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	123049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr18	44487034	44487390	44487355	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	8065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	44605074	44605239	44605157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDHD2	69652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202426638448127
chr18	45420480	45420806	45420653	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	34709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	45444466	45444807	45444662	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	10708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr18	45472001	45472124	45472045	Y	NA	SMAD2	SMAD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD2	16486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr18	45494348	45494736	45494572	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	38833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539428908627382
chr18	45529364	45529594	45529519	Y	NA	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	73849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636488140986231
chr18	45530162	45530545	45530368	Y	SMAD2,SMAD2	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	74647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.614234673292234
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317861106864
chr18	45541725	45542128	45542097	Y	SMAD2,SMAD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	86210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395049026717228
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.72509653894863
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.41651913209409
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46213796	46213995	46213850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	150379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr18	46354445	46354549	46354497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	120532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	46423062	46423579	46423314	Y	SMAD7	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	51502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	46428346	46428737	46428479	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	46344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	18262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	13311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581290876679432
chr18	46479420	46479772	46479694	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	4339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	43105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.464970329523781
chr18	46519156	46519437	46519250	Y	DYM,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	44075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	48397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	49074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr18	46543550	46543788	46543750	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	68469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.20731292094573
chr18	47252630	47252839	47252704	Y	LIPG	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	85491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	12819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	19820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr18	47794579	47794725	47794639	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	11419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	48462357	48462700	48462360	Y	ME2	ELAC1,SMAD4	NA	NA	NA	NA	ELAC1	29661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr18	48616016	48616044	48616031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD4	123606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	48720847	48721238	48721193	Y	NA	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	21436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	CCDC68	NA	NA	NA	NA	CCDC68	10960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	53332836	53333181	53332979	Y	NA	TCF4	NA	NA	NA	NA	TCF4	2818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	54070241	54070409	54070308	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	246165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	54487568	54487957	54487622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	170737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	54745075	54745213	54745144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	355704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	55095005	55095410	55095044	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	5507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.43807777706015
chr18	55098490	55098766	55098627	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	2151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.282187969501571
chr18	55101559	55101949	55101758	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	1099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr18	55108186	55108329	55108231	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.282343899050982
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377020976221455
chr18	55250571	55250884	55250819	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	1120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	55513608	55513807	55513708	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1,NEDD4L,ALPK2	IMR90	Hi-C	24141950	ATP8B1	45275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55863542	55863917	55863628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	153943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr18	55929917	55930363	55930116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	220318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	55957381	55957780	55957581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	247782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	56394566	56394962	56394680	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	57948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	56494810	56495111	56494923	Y	ALPK2	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	32721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219568610204122
chr18	56526446	56526759	56526519	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	1073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	56631378	56631745	56631564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	103546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	57541463	57541721	57541613	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1,CCBE1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PMAIP1	23459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	57572110	57572452	57572282	Y	PMAIP1	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	6930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	57585799	57586003	57585903	Y	PMAIP1	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	20619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr18	57620967	57621172	57621022	Y	NA	NA	PMAIP1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PMAIP1	55787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60117911	60118106	60117979	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	70134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60118389	60118639	60118544	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	69601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	60172936	60173272	60173091	Y	NA	ZCCHC2	ZCCHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZCCHC2	14968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.410191806913962
chr18	60221448	60221638	60221488	Y	NA	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	33208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60598497	60598585	60598560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	217825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	60877535	60878009	60877922	Y	SERPINB12,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	107352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60886280	60886709	60886627	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	98652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60905272	60905593	60905493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	79768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr18	60941193	60941490	60941349	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	43871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	60979120	60979234	60979125	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	6127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.830690979117612
chr18	61085026	61085396	61085214	Y	VPS4B	VPS4B	NA	NA	NA	NA	VPS4B	2320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr18	61121848	61122109	61121956	Y	SERPINB10,SERPINB12,SERPINB5	VPS4B,SERPINB5	NA	NA	NA	NA	SERPINB5	19885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.579830578298698
chr18	61185797	61185958	61185852	Y	KDSR,SERPINB12	SERPINB5	NA	NA	NA	NA	SERPINB5	43803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	SERPINB4,SERPINB3	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB3	23322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2,SERPINB10	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB10	11966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	61565801	61566233	61565950	Y	NA	SERPINB2,SERPINB10	NA	NA	NA	NA	SERPINB10	3393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	61852761	61853109	61852935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	217602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	63434118	63434346	63434234	Y	CDH7	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	1747871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31986029842326
chr18	65434285	65434424	65434346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	252068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr18	66373953	66374204	66374079	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	CCDC102B	6242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	66508189	66508486	66508312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX3	127654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	67158128	67158224	67158176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	712957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	67862254	67862313	67862284	Y	NA	RTTN	NA	NA	NA	NA	RTTN	8868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0072845084502
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	68087534	68087889	68087601	Y	CD226,SOCS6	NA	RTTN,SOCS6	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	133397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	68089361	68089784	68089523	Y	SOCS6	NA	RTTN,SOCS6	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	135224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	1276828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	71010965	71011298	71011132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	801802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	71730939	71731058	71731041	Y	FBXO15	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	82042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	71819121	71819367	71819268	Y	C18orf55	FBXO15,TIMM21	NA	NA	NA	NA	TIMM21	5375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	71916623	71916973	71916652	Y	CNDP2	CYB5A	NA	NA	NA	NA	CYB5A	40278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	72779359	72779673	72779506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	139630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	72837213	72837401	72837237	Y	NA	NA	ZNF407	IMR90	Hi-C	24141950	ZADH2	81902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	72919537	72919929	72919697	Y	ZADH2	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	72919988	72920296	72920123	Y	ZADH2,TSHZ1	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	73944750	73944917	73944845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	260560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418535758712255
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.193352537459468
chr18	74292470	74292738	74292612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	86993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.61461763692135
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74768655	74769369	74768895	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	74270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	74774000	74774964	74774473	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	68675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	63626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	74783964	74784198	74784017	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	59441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	39977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74805603	74805845	74805816	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	37794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	74813361	74814191	74813850	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	29448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	74816269	74816488	74816400	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	27151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	74819276	74819721	74819374	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	23918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74823541	74824614	74824455	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	19025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	13430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	12830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227026483262636
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	2934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	305438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	77331313	77331555	77331434	Y	NA	NA	NFATC1,ATP9B	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	106246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr18	77551694	77552094	77551810	Y	PQLC1,CTDP1	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	113893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr18	77682652	77682872	77682762	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	26792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	77715299	77715635	77715515	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	5635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	77936891	77937280	77937009	Y	CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	PARD6G	66149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348805711917541
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.276729288002317
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	661410	661735	661571	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	675402	675838	675677	Y	FSTL3	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	1010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.261586507805582
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.431296383720613
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2035223162087
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.24538428426076
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225027291703376
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	21.7075468178838
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	791303	791398	791349	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	791656	792058	791976	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	800594	800755	800691	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	MIR4745	2185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	AZU1,PRTN3,CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	934999	935434	935086	Y	MIDN,CIRBP	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	11218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	980601	980803	980725	Y	NA	WDR18,RNU6-2,CNN2	NA	NA	NA	NA	WDR18	371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	996390	996745	996544	Y	HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	WDR18	15216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.506102148385464
chr19	1069175	1069494	1069467	Y	C19orf22,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	HMHA1	5253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	HMHA1,POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr19	1126082	1126504	1126271	Y	MIDN,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	24146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	1140329	1140530	1140433	Y	NA	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	31752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20682587659929
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.430566234530246
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	SBNO2	11592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.464396109882825
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,C19orf26	NA	NA	NA	NA	SBNO2	17250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.625690929469269
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.709641899653074
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17753327754376
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.862748696990636
chr19	1400453	1400832	1400746	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	GAMT	884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.341347838859027
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	1410481	1410741	1410600	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	4913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	1411862	1412243	1411999	Y	HMHA1,CIRBP,REXO1	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	6294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	1453873	1454140	1454045	Y	C19orf26,MUM1,APC2	DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	17515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	1672372	1672532	1672504	Y	NA	TCF3	TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCF3	21768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	NA	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	75115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	NA	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP8B3	62725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377751125411822
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.2971037156186
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00566828052006
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29458397388977
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33933121224086
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415423454333511
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2264561	2264657	2264590	Y	TMPRSS9,SPPL2B	SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1	NA	NA	NA	NA	OAZ1	2828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.325701943551631
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.486996763138074
chr19	2528875	2529093	2529033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	54755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294757338498089
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268541265753436
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27399994725269
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr19	2599036	2599584	2599134	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	DIRAS1	119832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77,TLE6	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2974450	2974580	2974523	Y	NFIC,TLE2,TLE2	ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	TLE6	864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.90766975629466
chr19	3153392	3153939	3153476	Y	GNA15,FZR1	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3154006	3154458	3154241	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	3177322	3177366	3177344	Y	AES,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	6195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr19	3231384	3231772	3231576	Y	ZNF555,ZNF77,TLE2,C19orf29,CELF5,CELF5	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	47823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3338656	3338812	3338733	Y	NA	NFIC	ZNF77,CELF5,NFIC,DOHH,FZR1,C19orf77,C19orf29-AS1,GIPC3,TBXA2R,C19orf29,PIP5K1C,APBA3,MRPL54	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIC	18749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	3344211	3344472	3344340	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC	NFIC	NFIC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	NFIC	13089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.535586455058272
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.780258025187565
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	3387730	3388119	3388011	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	30169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr19	3398670	3398894	3398830	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	41109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	3428769	3429112	3428821	Y	TLE2,NFIC	C19orf77	NA	NA	NA	NA	C19orf77	49428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	3450938	3451227	3451079	Y	GNA15	C19orf77,DOHH	NA	NA	NA	NA	C19orf77	27313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	3503082	3503292	3503139	Y	TLE2,S1PR4,DOHH,DOHH,FZR1	C19orf77,DOHH,FZR1	NA	NA	NA	NA	FZR1	979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	3521162	3521389	3521298	Y	FZR1	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr19	3551628	3551981	3551925	Y	NA	FZR1,HMG20B,MFSD12	NA	NA	NA	NA	HMG20B	18794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr19	3562421	3562565	3562489	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	8210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.9539850835747
chr19	3570616	3571018	3570829	Y	C19orf28,HMG20B,GIPC3	MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.396665254647372
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	2910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	3693047	3693257	3693152	Y	RAX2	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	5220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	3923611	3923782	3923733	Y	ITGB1BP3	ATCAY,DAPK3	NA	NA	NA	NA	DAPK3	45339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr19	4052414	4052757	4052628	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	4059413	4059635	4059428	Y	CCDC94	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	5308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4061604	4061945	4061775	Y	SEMA6B,PLIN5	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	4061996	4062359	4062178	Y	NA	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr19	4123124	4123351	4123249	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	MAP2K2,CREB3L3	NA	NA	NA	NA	MAP2K2	998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	4379386	4379764	4379673	Y	NA	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	18780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	NA	NA	NA	NA	LRG1	28662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	LRG1	36802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252512406816923
chr19	4593399	4593778	4593587	Y	SEMA6B,TICAM1	TNFAIP8L1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP8L1	43752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4620862	4621172	4621017	Y	NA	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	16358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	MIR7-3HG,FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	TICAM1,PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5046594	5046918	5046679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	79469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290375991750453
chr19	5048305	5048678	5048483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	81180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	5091152	5091532	5091191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5336072	5336705	5336347	Y	PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	2109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5804044	5804378	5804211	Y	NA	DUS3L,FUT3	NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUS3L	14795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr19	6111447	6111675	6111584	Y	SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	85908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr19	6273754	6274259	6273940	Y	VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	3700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,CRB3,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	6516969	6517178	6517079	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TNFSF9	11832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	48461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.678123074958577
chr19	6579838	6580006	6579922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	50828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	6600003	6600291	6600148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	70993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	6601519	6601863	6601720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	72509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr19	6674780	6675150	6675080	Y	DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	NA	NA	NA	NA	NA	C3	53423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	6708735	6709024	6708902	Y	C3	C3,GPR108,TRIP10	NA	NA	NA	NA	C3	19549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	7445572	7445841	7445694	Y	ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	12158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7456079	7456435	7456169	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	7525376	7525563	7525475	Y	NA	C19orf45,PEX11G	NA	NA	NA	NA	C19orf45	30299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	C19orf45	7486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.391936722338485
chr19	7588336	7588755	7588571	Y	PEX11G,MCOLN1	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	MCOLN1	2824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7608551	7608716	7608681	Y	PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,C19orf59,STXBP2	PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PNPLA6	11661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,TRAPPC5,FCER2	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	8060665	8061040	8060896	Y	FLJ22184,FBN3	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73478063764611
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr19	8272965	8273383	8273152	Y	NA	CERS4	NA	NA	NA	NA	CERS4	3345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8426850	8427217	8427032	Y	LOC645781,ANGPTL4	RPS28,NDUFA7,KANK3,ANGPTL4,RAB11B,MARCH2	NA	NA	NA	NA	ANGPTL4	677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8518703	8518940	8518821	Y	NA	MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	HNRNPM	11052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8676425	8676449	8676437	Y	NA	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	2805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	9095662	9095964	9095813	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	5644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	9119402	9119531	9119475	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	29384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	9120594	9120838	9120762	Y	MUC16	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	30576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	38916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.757884406012021
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr19	9747838	9748099	9747855	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	17763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	10148101	10148280	10148177	Y	NA	C19orf66	NA	NA	NA	NA	C19orf66	46518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10215832	10216068	10215900	Y	S1PR5,S1PR5,ANGPTL6	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,SNORD105B,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10304383	10304612	10304534	Y	TYK2,KRI1,ILF3	S1PR2,DNMT1	PPAN-P2RY11,EIF3G	MCF7	ChIA-PET	22265404	S1PR2	35336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	10317020	10317257	10317138	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4	DNMT1	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR2	22691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	10523082	10523284	10523181	Y	C19orf66,ICAM3,S1PR5,S1PR5,ATG4D,TYK2	TYK2,MIR1181	CDC37	K562	ChIA-PET	22265404	MIR1181	10868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10529596	10529758	10529677	Y	NA	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	17382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	10678483	10678588	10678537	Y	TYK2,KRI1	ATG4D,KRI1,CDKN2D,SLC44A2	NA	NA	NA	NA	CDKN2D	748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	10715339	10715596	10715546	Y	ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	4206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr19	10723101	10723460	10723261	Y	NA	KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	11968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	10829647	10829946	10829894	Y	ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	2892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10983653	10983862	10983766	Y	CARM1	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	CARM1	3464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	11044199	11044446	11044323	Y	NA	YIPF2,C19orf52,SMARCA4	NA	NA	NA	NA	C19orf52	6790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309290120986003
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.477312664440594
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.385591962099453
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr19	11449020	11449400	11449210	Y	NA	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR	NA	NA	NA	NA	CCDC159	3960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	11641329	11641510	11641441	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	ECSIT	3340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	12065633	12065838	12065735	Y	NA	ZNF700,ZNF763	NA	NA	NA	NA	ZNF763	31743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	12724614	12724901	12724730	Y	ZNF136,ZNF44,ZNF563,ZNF564,JUNB,C19orf43,ZNF490,ZNF791,MAN2B1	ZNF791,ZNF490,CTD-2192J16.15	NA	NA	NA	NA	ZNF791	4882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	12844296	12844608	12844453	Y	NA	FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1	NA	NA	NA	NA	C19orf43	707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.89972711113445
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429836085339879
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428722972520397
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr19	12896870	12897372	12897198	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	2938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01969794789731
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	12929124	12929310	12929217	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	MAST1	13455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	13006078	13006409	13006086	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A	NA	NA	NA	NA	GCDH	6238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	13024998	13025376	13025029	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	SYCE2	2714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	13048278	13048689	13048364	Y	MAN2B1	GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	CALR	886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	13143095	13143350	13143204	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	38673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	13147424	13147812	13147700	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	43002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr19	13231642	13232105	13231971	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	4725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	13232387	13232613	13232547	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	5470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	13232805	13233031	13232944	Y	WDR83,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	5888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.677584181780049
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.12527495300739
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.806857061561334
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.552345463185151
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3178436718051
chr19	13783472	13783589	13783575	Y	NA	NA	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	56985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.628647304298601
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.627534191479119
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	13995440	13995781	13995611	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	19233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	14097142	14097697	14097482	Y	CCDC130,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA	DCAF15,PODNL1,RFX1,IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	18154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14241315	14241555	14241521	Y	NA	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	4213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	14315596	14315828	14315635	Y	NA	LPHN1	NA	NA	NA	NA	LPHN1	597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14485924	14486626	14486057	Y	NA	CD97,DDX39A	DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	2687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr19	14493470	14493891	14493578	Y	ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	CD97	4157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14499980	14500202	14500091	Y	OR7A17,ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,CD97	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	CD97	10667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14545997	14546246	14546106	Y	NA	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	PKN1	4132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	14570486	14570855	14570729	Y	OR7C2,ZNF333,IL27RA,DDX39A,PKN1	DDX39A,PKN1,GIPC1	NA	NA	NA	NA	PKN1	28621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.606429614672468
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14661096	14661426	14661346	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	19448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14670632	14670897	14670765	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	9977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377751125411822
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	14895618	14895793	14895687	Y	CD97,DDX39A,PKN1,DNAJB1,EMR3,ZNF333,EMR2	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	5328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14999338	14999543	14999395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	98217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	15321082	15321623	15321224	Y	RASAL3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	11290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415423454333511
chr19	15492858	15492952	15492905	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	4249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	15505627	15505808	15505718	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	17018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	15944737	15944873	15944829	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	6966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	9846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.458398535205044
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.51955759612176
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16229373	16229857	16229589	Y	NA	RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	8934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16230487	16230565	16230516	Y	TPM4	RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	10048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16364400	16364769	16364668	Y	NWD1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1M1	58011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16403791	16404489	16404426	Y	NA	KLF2	AP1M1,KLF2,EPS15L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF2	29139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16442138	16442160	16442149	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	8510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16477143	16477842	16477298	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	43515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16492713	16493267	16492962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16560891	16561165	16561157	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	19731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16573693	16573897	16573763	Y	HSH2D	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	6999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	16772555	16772747	16772653	Y	NA	MED26,TMEM38A	NA	NA	NA	NA	TMEM38A	2617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	17131732	17132248	17131919	Y	NA	CPAMD8	NA	NA	NA	NA	CPAMD8	3377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr19	17236053	17237400	17237360	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	51462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr19	17371801	17372164	17371849	Y	NXNL1,GTPBP3	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,MRPL34,DDA1,ABHD8	NR2F6	K562	ChIA-PET	22265404	BABAM1	3995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.551962499556035
chr19	17578706	17578913	17578810	Y	NA	TMEM221,SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	SLC27A1	1128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	FCHO1,B3GNT3	NA	NA	NA	NA	B3GNT3	13055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	18064785	18064952	18064869	Y	NA	CCDC124,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	CCDC124	22960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	18131991	18132570	18132392	Y	MAP1S,FCHO1,KCNN1,PGPEP1,LRRC25,JUND,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	22050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.55434511108903
chr19	18134654	18135106	18134872	Y	MAP1S,LRRC25,JUND,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	24713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	18154526	18154804	18154610	Y	IFI30	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	44585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18230044	18230277	18230172	Y	FCHO1,JAK3	MAST3,PIK3R2	NA	NA	NA	NA	MAST3	23441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.553614505554045
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	18393747	18393881	18393780	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	MIR3188	2860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr19	18401020	18401539	18401437	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,LRRC25,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	10133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.91516340742104
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19729770745122
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.98393627094568
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.40523624052537
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.532353999197983
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.624421887100376
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.426723780961136
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.824502148427991
chr19	18533547	18533601	18533574	Y	ARRDC2,IL12RB1	SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	5873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	18588665	18588964	18588926	Y	NA	ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	41973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	18589714	18590055	18589946	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,ELL,LRRC25	ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	40882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18606803	18607671	18607185	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,KLHL26,ELL,LRRC25	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	23266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18793678	18793914	18793817	Y	PDE4C	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	1191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr19	19078398	19078892	19078760	Y	ELL,GATAD2A,HOMER3	DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	HOMER3	28328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	19514283	19514636	19514393	Y	HOMER3,RFXANK,GMIP,GATAD2A	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	19648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	19570650	19571032	19570761	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	53513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	19571175	19572073	19571752	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	52472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	19589693	19590012	19589853	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	34533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	19711724	19712118	19712001	Y	RFXANK,GATAD2A,GMIP	PBX4,LPAR2,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	15607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF253	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF91	266883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	23310606	23310980	23310793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF91	265382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.327318171481775
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28217479	28217822	28217621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1484626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28239770	28239799	28239785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1462649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	28248561	28250861	28250165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1451587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	28252106	28252716	28252616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28252920	28253113	28253061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	28274249	28275061	28274473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1427387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr19	29875607	29875962	29875787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	173159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	30195599	30196138	30195979	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	8226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	30334239	30334593	30334547	Y	NA	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	33434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.507371190754358
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	992173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	32754044	32754196	32754068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	80304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	33049643	33049878	33049760	Y	NA	PDCD5	NA	NA	NA	NA	PDCD5	20096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	33165229	33165376	33165346	Y	NA	RGS9BP,ANKRD27,NUDT19	NA	NA	NA	NA	ANKRD27	127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	33664629	33664677	33664651	Y	NA	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.452209704515423
chr19	33740333	33740640	33740371	Y	NA	NA	CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPA	50830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr19	33796303	33796393	33796348	Y	SLC7A9,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	4833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	33888059	33888360	33888231	Y	CEBPA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	25823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.316244878933856
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.675740919770199
chr19	34746041	34746169	34746166	Y	KIAA0355	KIAA0355,RPL29P33	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	2599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr19	34752762	34752909	34752837	Y	NA	KIAA0355,RPL29P33	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	9320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.596589586425577
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	35100505	35100815	35100739	Y	ZNF302	SCGB1B2P	NA	NA	NA	NA	SCGB1B2P	33899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	35557782	35557965	35557875	Y	MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4	SCN1B,FXYD3	NA	NA	NA	NA	SCN1B	38194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	35605566	35605978	35605759	Y	MAG,FFAR1,LGI4	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	35634936	35635340	35635202	Y	NA	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	AC020907.2	6452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	35636009	35636339	35636175	Y	NA	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	7294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.277615366742094
chr19	35763394	35763606	35763496	Y	U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2	LSR,USF2,MAG	NA	NA	NA	NA	USF2	5513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	35763871	35764402	35764192	Y	FXYD1,FXYD1,HAMP	LSR,USF2,MAG	NA	NA	NA	NA	USF2	5990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	MAG	NA	NA	NA	NA	MAG	28651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr19	35920564	35920848	35920820	Y	GRAMD1A,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,MLL4,FFAR2	NA	NA	NA	NA	NA	DMKN	81712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	36376938	36377077	36377046	Y	NA	APLP1,NFKBID,HCST,LRFN3	NA	NA	NA	NA	NFKBID	14128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317130957673633
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	36891925	36892272	36892205	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP82	15286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	37171128	37171323	37171227	Y	NA	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	ZNF383,ZNF461,ZNF567,ZNF850	IMR90	Hi-C	24141950	AC074138.3	5028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	37822125	37822150	37822138	Y	NA	HKR1,ZNF527	NA	NA	NA	NA	HKR1	20386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	37894729	37894877	37894831	Y	NA	ZNF527	NA	NA	NA	NA	ZNF527	34766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	38186506	38186731	38186619	Y	ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573	ZFP30,ZNF607	NA	NA	NA	NA	ZFP30	5268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	WDR87,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	38470537	38470671	38470619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	74669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	C19orf33,YIF1B,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	38796841	38796867	38796854	Y	NA	C19orf33,YIF1B,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	4040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	39415058	39415337	39415248	Y	ZFP36,MAP4K1,HNRNPL,NFKBIB	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2,FBXO17	NA	NA	NA	NA	MRPS12	3851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	39755176	39755398	39755266	Y	ZFP36	NA	NA	NA	NA	NA	NCCRP1	69575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	39849240	39849632	39849436	Y	NA	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530	MED29,PAF1	IMR90	Hi-C	24141950	SAMD4B	18204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr19	39921308	39921946	39921495	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	2642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	40543471	40543758	40543711	Y	SPTBN4,ZNF546,ZNF780B	ZNF780B	NA	NA	NA	NA	ZNF780B	16358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	30176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.86636411648004
chr19	40942693	40943017	40942855	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	5595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	40969437	40969789	40969613	Y	BLVRB	SERTAD1,SERTAD3	NA	NA	NA	NA	BLVRB	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.355533435785689
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	41226531	41226793	41226653	Y	PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B	NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA	NA	NA	NA	NA	ADCK4	4419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41254580	41254859	41254762	Y	SHKBP1,ADCK4	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	SNRPA	38	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	41260796	41261188	41261093	Y	SERTAD1,CYP2A13,CYP2B6,CYP2A6,ADCK4,ITPKC	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	C19orf54	5338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	41680959	41681276	41681150	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	15678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr19	41702138	41702290	41702230	Y	ADCK4,ITPKC,TGFB1,CCDC97	CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	5184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41816681	41817091	41817051	Y	NA	CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	2587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAMP3	75725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAMP3	65777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19,CD79A,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	19674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	CD79A,ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	CD79A,ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	NA	RABAC1	53077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.830343793556361
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.7039924184866
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr19	42789863	42790090	42789919	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	14160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	43355116	43355369	43355287	Y	NA	PSG8,PSG1	NA	NA	NA	NA	PSG8	2474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	CD177	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	CD177	19969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.468968712642302
chr19	44124638	44124922	44124781	Y	CADM4	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	ZNF428	2612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	44138598	44138945	44138732	Y	ZNF575,ZNF284,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,LOC390940,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	CADM4	3046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,CADM4,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CADM4	10105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	44165978	44166186	44166121	Y	NA	ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	PLAUR	6513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr19	44196948	44197341	44197160	Y	NA	PLAUR	IRGC,SMG9,KCNN4,LYPD5,PLAUR	IMR90	Hi-C	24141950	PLAUR	24249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44249305	44249426	44249352	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	7716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	44283400	44283793	44283490	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr19	44284114	44284247	44284152	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.81671498121175
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr19	44440425	44440707	44440629	Y	NA	ZNF45,ZNF221,ZNF155	NA	NA	NA	NA	ZNF45	2995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425993631770769
chr19	44821121	44821451	44821434	Y	ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZNF180,ZFP112,ZNF227	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	13922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.479155926450444
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.692152742335828
chr19	45231729	45232033	45231881	Y	IGSF23,CLASRP,APOC2	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	16929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	45242034	45242469	45242251	Y	RELB,CLASRP,BCL3	BCL3	BCL3	K562	ChIA-PET	22265404	BCL3	6493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.320973411242743
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	30717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	45373382	45373614	45373476	Y	NA	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	18212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.726712766878774
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	CKM	68046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	45803954	45804164	45804074	Y	NA	CKM	NA	NA	NA	NA	CKM	20071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr19	45906934	45907335	45907067	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45952039	45952594	45952534	Y	GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	16659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45999277	45999601	45999579	Y	NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	8236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	OPA3,EML2,GIPR	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	46385401	46385465	46385433	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	46478594	46479000	46478748	Y	NA	CCDC61	NA	NA	NA	NA	CCDC61	17339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	46504246	46504437	46504355	Y	EML2,PNMAL2,PNMAL1,NOVA2	CCDC61	NA	NA	NA	NA	CCDC61	7907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	46694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33149037555323
chr19	46698925	46699055	46698990	Y	NA	IGFL1	IGFL3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFL1	31954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	46708652	46708841	46708747	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	22168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46802245	46802621	46802425	Y	IRF2BP1,MYPOP,DACT3,HIF3A,HIF3A,CCDC8	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	45630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	46876247	46876539	46876393	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	27996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46905606	46905628	46905621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	57355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46992955	46993234	46993212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	66664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,PTGIR	NA	NA	NA	NA	PTGIR	15820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792288501005556
chr19	47367294	47367354	47367334	Y	NA	AP2S1	SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	15045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	47458912	47459233	47458939	Y	ZC3H4,CCDC9	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM160	90655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr19	47613894	47614902	47614503	Y	PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	47689758	47690163	47690151	Y	GLTSCR1,BBC3	MIR3191,BBC3	NA	NA	NA	NA	MIR3191	38036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	47729030	47729228	47729064	Y	NA	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	MIR3191	831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501912509255104
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	C5AR1	1654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5822306248906
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,PRR24,C5AR1,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	C5AR1	14358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47814150	47814595	47814332	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	22870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.413807226403367
chr19	47817254	47817597	47817448	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	25974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	27273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr19	47833817	47834081	47833932	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47854917	47855115	47854986	Y	ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	4379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	47867147	47867265	47867191	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47867637	47867786	47867679	Y	ZC3H4,C5AR1,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	17099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47893291	47893410	47893319	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,GLTSCR1,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	27370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	48016569	48017036	48016994	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	72	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr19	48167427	48167718	48167620	Y	NA	EHD2	NA	NA	NA	NA	EHD2	46882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	48226445	48226596	48226537	Y	NA	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	11845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	48277326	48277623	48277440	Y	SLC8A2,PLA2G4C	GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80	NA	NA	NA	NA	SEPW1	2206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48352522	48352636	48352584	Y	NA	SULT2A1	NA	NA	NA	NA	SULT2A1	35018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	48629286	48629473	48629353	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	17212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48642255	48642637	48642446	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	29223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	48648975	48649130	48649035	Y	SYNGR4,SPACA4	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	22730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	48657871	48658185	48658028	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	13675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	48763023	48763379	48763092	Y	CARD8,IZUMO1,EMP3	CARD8	NA	NA	NA	NA	CARD8	5820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.514829063812873
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2,LMTK3	NA	NA	NA	NA	LMTK3	18067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	49051864	49052159	49052158	Y	NA	LMTK3,SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	1173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	49057128	49057239	49057162	Y	NA	LMTK3,SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	3796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.436910994769278
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr19	49386525	49386775	49386581	Y	CD37,PPP1R15A	HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1,DHDH	NA	NA	NA	NA	PPP1R15A	12876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.32297305914663
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.13379272575861
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	49482691	49482925	49482812	Y	NA	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	11642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.928253326587123
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	23859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	49524183	49524468	49524237	Y	CGB5	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	20673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	49590520	49590786	49590652	Y	NA	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	3844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	CTC-301O7.4,DKKL1,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	4420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	PRRG2,NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	50417620	50417965	50417778	Y	NA	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	11994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	50670716	50671002	50670859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK3	143513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,NAPSB	NA	NA	NA	NA	NR1H2	2927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	50990086	50990332	50990328	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	12076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543774477307153
chr19	51003635	51004295	51004006	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	8315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr19	51318804	51318947	51318869	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	KLK1	6096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	KLK1	14212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	51665562	51665592	51665577	Y	SIGLEC8,SIGLEC6,CD33	NA	NA	NA	NA	NA	CTU1	55935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	51898753	51899047	51898851	Y	SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1	ETFB,CLDND2	NA	NA	NA	NA	CLDND2	28496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.68702381133892
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	94	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	52674093	52674226	52674127	Y	ZNF836	ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF836	1197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF845	107141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.767688656191047
chr19	53917190	53917573	53917346	Y	NA	ZNF765,ZNF761	NA	NA	NA	NA	ZNF761	15654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	79524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	54049099	54049989	54049424	Y	ZNF160,ZNF845,ZNF761,ZNF813,NLRP12,ZNF331,ZNF331	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	80110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	54168099	54168226	54168160	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813,DPRX	NA	NA	NA	NA	NA	AC008753.3	108627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	94882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr19	54523388	54523781	54523608	Y	TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	80255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	54538982	54539278	54539125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	64758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	54916959	54917284	54917122	Y	NA	LENG8,LENG8-AS1	TTYH1,LENG8	IMR90	Hi-C	24141950	LENG8	40781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	55546101	55546409	55546255	Y	NA	RDH13	NA	NA	NA	NA	RDH13	34250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	RDH13	1947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	55619280	55619321	55619308	Y	NA	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	7606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55620515	55620603	55620559	Y	NA	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	6324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr19	55721470	55721547	55721521	Y	NA	PTPRH,PPP6R1	NA	NA	NA	NA	PTPRH	2596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55885541	55885905	55885786	Y	NA	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	5710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,SSC5D	NA	NA	NA	NA	SSC5D	33439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.457668386014678
chr19	56098668	56099098	56098905	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	8457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.72911372142074
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	56673673	56673939	56673846	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	31705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	80816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	56807694	56808027	56807709	Y	NLRP13,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	69725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	66516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	46108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211	NA	NA	NA	NA	ZNF211	36006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	58317986	58318160	58318072	Y	NA	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	6121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	44565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	58781089	58781297	58781193	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	ZNF8	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF8	7021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	58824678	58824957	58824818	Y	ZNF256	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG,ZNF497	NA	NA	NA	NA	ERVK3-1	9963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5004701022779
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	MZF1	4477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	ACP1	131799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr2	628526	628919	628630	Y	NA	TMEM18	FAM150B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	46520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr2	1590812	1591204	1590899	Y	NA	NA	PXDN,MYT1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PXDN	155420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	1725053	1725311	1725239	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	21313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	2524878	2525262	2524882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	778254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	7191649	7191931	7191786	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RSAD2	187712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8163067	8163278	8163219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	653697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8453183	8453334	8453274	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	363641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	8712183	8712281	8712245	Y	NA	NA	LINC00299,LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	104694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8743061	8743194	8743128	Y	ID2	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	73781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8767111	8767480	8767322	Y	NA	ID2	LINC00299,LOC339788,LOC100506274	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	49495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	8927568	8927875	8927735	Y	NA	KIDINS220	NA	NA	NA	NA	KIDINS220	47885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr2	9795695	9795818	9795794	Y	NA	YWHAQ,RP11-521D12.1	YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-521D12.1	18794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9815627	9815977	9815711	Y	NA	YWHAQ,RP11-521D12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-521D12.1	38726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	9826242	9826464	9826356	Y	NA	RP11-521D12.1	YWHAQ,ADAM17	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-521D12.1	49341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328048320672142
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283074048241349
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	10176248	10176551	10176348	Y	NA	AC010969.1,KLF11	NA	NA	NA	NA	KLF11	4425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.91149477480487
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202426638448127
chr2	10425680	10425925	10425803	Y	HPCAL1	HPCAL1	HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	15090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr2	10522808	10523000	10522904	Y	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ODC1	63630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.34061768966866
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.881123933047661
chr2	10572027	10572239	10572154	Y	NA	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	14391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.989412387503838
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr2	11483029	11483376	11483266	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	3080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450593476585279
chr2	11547236	11547448	11547321	Y	NA	NA	ROCK2,PQLC3,C2orf50	IMR90	Hi-C	24141950	E2F6	56849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	11720189	11720409	11720300	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	47947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	11837707	11837887	11837797	Y	E2F6,LPIN1	LPIN1,AC106875.1	GREB1,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AC106875.1	18121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	64464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr2	11893649	11894247	11893895	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	74063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	150719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232485164761891
chr2	12596433	12596805	12596535	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	258210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	12633247	12633315	12633291	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	221700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	13447993	13448374	13448173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	592978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	15332010	15332377	15332192	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	367077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	17967823	17967867	17967845	Y	MSGN1	GEN1,SMC6	NA	NA	NA	NA	SMC6	11642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	19273463	19273583	19273517	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	533517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	551446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20171563	20171753	20171690	Y	TTC32	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	16139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	89	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	20252703	20252899	20252848	Y	NA	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	2808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	20262884	20263152	20263015	Y	TTC32	LAPTM4A,RP11-644K8.1	WDR35,MATN3,LAPTM4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-644K8.1	12989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20407883	20408194	20408074	Y	RHOB,SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	15000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	1527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB,AC023137.2	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	20706791	20707147	20707052	Y	HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC023137.2	57988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr2	20709880	20710074	20709978	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90	Hi-C	24141950	AC023137.2	61077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.634992064537633
chr2	20726594	20726630	20726611	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC023137.2	77791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	20732744	20733106	20733037	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC023137.2	83941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.8670768306115
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20796774	20797139	20797030	Y	APOB,RHOB,GDF7	NA	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	51710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20817015	20817334	20817182	Y	RHOB,GDF7	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	31515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	20848318	20848468	20848370	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	21691615	21691861	21691725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC067959.1	249568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	23712282	23712487	23712385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	106194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	24122171	24122336	24122254	Y	NA	ATAD2B,UBXN2A,SDHCP3	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	25648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	24626364	24626604	24626483	Y	NA	ITSN2	CENPO,ADCY3,NCOA1,ITSN2,LOC375190,C2orf84,PTRHD1,EFR3B,DNAJC27,DNAJC27-AS1,POMC	IMR90	Hi-C	24141950	ITSN2	44781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NA	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	ITSN2	131763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	154309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	25021346	25021618	25021482	Y	NA	CENPO,PTRHD1	NA	NA	NA	NA	PTRHD1	7095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	25096617	25097268	25096771	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	43440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.378134089040938
chr2	25136821	25136958	25136890	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	3750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	25352140	25352468	25352150	Y	DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3B	89141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	25473699	25473887	25473786	Y	EFR3B	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	89572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	25517596	25517908	25517752	Y	DNAJC27,DNMT3A	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	45551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	25518028	25518279	25518198	Y	DNAJC27,DNMT3A	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	45180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	25646148	25646487	25646318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	82689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UQCRHP2	5015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	26235500	26235661	26235564	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2,HADHA,HADHB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	19315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	26241064	26241266	26241191	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	13710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	26258152	26258567	26258448	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	3176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	26259161	26259559	26259360	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	4185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	26605539	26605826	26605756	Y	RAB10	GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	37854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	26919291	26919602	26919376	Y	NA	AC015977.5,KCNK3	NA	NA	NA	NA	KCNK3	5672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	26943701	26943984	26943834	Y	GPR113	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	30082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	33315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.21468551264051
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333889965800512
chr2	26991953	26992165	26992073	Y	GPR113	CENPA	CENPA	IMR90	Hi-C	24141950	CENPA	6796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.83218705556621
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	SLC30A3,TRIM54,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	27629706	27629770	27629738	Y	NA	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr2	27942982	27943239	27943170	Y	RBKS	AC074091.13,MRPL33	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	6383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	AC074091.13,MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	21721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr2	28003613	28003725	28003670	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	11029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28077414	28077634	28077524	Y	ZNF513,ZNF513,RBKS	BRE,RBKS	MRPL33	IMR90	Hi-C	24141950	BRE	33174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	28124092	28124474	28124302	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	12127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28134368	28134411	28134390	Y	NA	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	22403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	28143450	28143703	28143578	Y	FOSL2,RBKS,BRE,BRE	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	31485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	28181257	28181638	28181448	Y	C2orf16	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	69292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	28215985	28216067	28216026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	104020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	28383730	28384110	28383893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	229205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28492228	28492339	28492284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.381749508530343
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	28497824	28498240	28497982	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	115075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28498872	28499304	28499073	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	114011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28579030	28579220	28579083	Y	RBKS,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	34095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216839269454495
chr2	28582195	28582710	28582283	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	30605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr2	28583371	28583537	28583468	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	29778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr2	28583784	28584228	28583975	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	29087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	28589272	28589573	28589455	Y	FOSL2	FOSL2,AC104695.3	BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	23742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr2	28589661	28589896	28589794	Y	FOSL2	FOSL2,AC104695.3	BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	23419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28600937	28601380	28601351	Y	RBKS,BRE,BRE,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	RBKS,BRE,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,MRPL33,LOC100505716,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	11935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	28621403	28621758	28621597	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	5864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC104695.3	43978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	28668874	28669088	28668964	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	BRE,RBKS,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC104695.3	53335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	152037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.17530750824941
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	28833397	28833696	28833546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	138810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	28939068	28939564	28939261	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	32942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	37190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.509753345942734
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.287072431359869
chr2	29746427	29746759	29746593	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	427856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	30644994	30645276	30645103	Y	LBH	LCLAT1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	22816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	30791728	30792075	30791902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	123636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN13	153314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	33805444	33805464	33805454	Y	RASGRP3	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	16985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	36189102	36189392	36189167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	391677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.828344601997101
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	36687110	36687380	36687132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	106041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr2	37813379	37813644	37813592	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	149967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	38340220	38340542	38340303	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP1B1	5176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	38369402	38369882	38369670	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	34358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr2	38375670	38375904	38375803	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	40626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr2	38395987	38396176	38396066	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	60534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	38401547	38402107	38401851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	54603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	38472288	38472516	38472419	Y	FAM82A1	RPL7P12,AC009229.5	FAM82A1,CYP1B1-AS1,CYP1B1	IMR90	Hi-C	24141950	AC009229.5	7556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	38552581	38552739	38552658	Y	NA	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	49688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	39059251	39059604	39059469	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	41471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	39227784	39228037	39227911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS1	121449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	39338546	39339120	39338978	Y	ARHGEF33	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	10366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr2	40740451	40740721	40740596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007317.1	230906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	42046531	42047126	42046845	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	111737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	42068299	42068635	42068587	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	90228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	42149327	42149700	42149496	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	9163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	42155945	42156079	42156067	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429453121710763
chr2	42157961	42158315	42158139	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.576718273919955
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr2	42182061	42182670	42182320	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	23198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.64027738142857
chr2	42190702	42191089	42190887	Y	NA	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	31839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499530354066727
chr2	42193606	42193918	42193678	Y	PKDCC	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	34743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.193352537459468
chr2	42194638	42194757	42194709	Y	NA	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	35775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr2	42278314	42278459	42278342	Y	NA	AC013480.2,PKDCC	NA	NA	NA	NA	PKDCC	5154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	42351253	42351626	42351357	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	42864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	42360195	42360705	42360352	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	33785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	42368526	42368635	42368598	Y	NA	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	42535809	42536204	42535901	Y	NA	NA	COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	COX7A2L	114024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	226687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	225762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43063239	43063414	43063325	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,ABCG8	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	201272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr2	43151826	43152270	43152066	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	112416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	43152648	43152978	43152751	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	111708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr2	43163572	43163725	43163650	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	100961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	43245528	43245689	43245593	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	18997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	1038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr2	43267467	43267802	43267635	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	2781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	4340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	37567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	43310956	43311104	43311039	Y	NA	AC016735.2	THADA,ZFP36L2,LOC100129726	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	46270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	43358229	43358771	43358564	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	92977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.05514405118003
chr2	43396497	43396745	43396689	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	LOC100129726,ZFP36L2,THADA	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	55003	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	43532128	43532543	43532333	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	80380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43567873	43568259	43568066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	116125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43762812	43762910	43762862	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	58275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43818575	43818651	43818610	Y	NA	THADA	NA	NA	NA	NA	THADA	2534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	44935582	44935781	44935667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	285771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	45237112	45237533	45237325	Y	SIX2	AC012354.8,SIX2	NA	NA	NA	NA	SIX2	2543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	45405025	45405418	45405218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIX2	170456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	45811183	45811373	45811272	Y	NA	SRBD1	NA	NA	NA	NA	SRBD1	25931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	46265425	46265774	46265513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	253032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr2	46303554	46303874	46303714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	214932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.402506899775743
chr2	46409270	46409537	46409436	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	109269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr2	46451921	46452099	46452016	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	66707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	46452124	46452363	46452229	Y	RHOQ	NA	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	66443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr2	46525633	46526278	46526263	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	6827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr2	46536857	46537129	46536993	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	18051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	46557036	46557117	46557077	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	38230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	46578990	46579175	46579103	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	60184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	46586439	46586863	46586504	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	67633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr2	47075244	47075442	47075379	Y	MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	65854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47100841	47101015	47100907	Y	NA	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	40281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.961197123199925
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	47212237	47212567	47212294	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	45243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	47214273	47214540	47214407	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	47279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	47229826	47230084	47229931	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	62832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	47297632	47297822	47297725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	103918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	47405225	47405390	47405334	Y	NA	CALM2	C2orf61	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	3485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47418967	47419222	47419129	Y	NA	CALM2	TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	17227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPCAM	70537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	47796567	47796699	47796698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079250.1	119686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	48118003	48118146	48118074	Y	NA	FBXO11	NA	NA	NA	NA	FBXO11	12786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	48718676	48719233	48718981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	52939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	71826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN1	625932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	50951878	50951957	50951935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN1	305717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	51010628	51010803	51010737	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN1	246871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	53331505	53331666	53331586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	661263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	53366403	53366414	53366408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	626515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	54111882	54111915	54111897	Y	NA	GPR75-ASB3,ASB3	NA	NA	NA	NA	ASB3	26585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.515942176632355
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08047404518491
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	55327095	55327368	55327210	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	10389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171864997023702
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	55329161	55329446	55329300	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	8311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	55379709	55379882	55379800	Y	SMEK2,RTN4	RTN4	NA	NA	NA	NA	RTN4	41952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	56070301	56070618	56070423	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	78656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	56089907	56090266	56090122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	59008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	56099404	56099776	56099646	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	49498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr2	61061403	61061827	61061632	Y	NA	REL	NA	NA	NA	NA	REL	44829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61112067	61112568	61112226	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	REL	5411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61126778	61127091	61126822	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	9347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	28925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	61204524	61204872	61204698	Y	NA	PEX13,PUS10	REL	IMR90	Hi-C	24141950	PEX13	37488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	61464355	61464721	61464539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	61802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	61898281	61898531	61898442	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90	Hi-C	24141950	XPO1	134520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.398508516657222
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.76916729758074
chr2	62534127	62534336	62534147	Y	NA	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	112879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	63129477	63129780	63129501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	145412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	64017775	64017931	64017855	Y	PELI1	WDPCP,UGP2	UGP2	IMR90	Hi-C	24141950	WDPCP	35046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	64207040	64207416	64207228	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	36790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	64552666	64552842	64552755	Y	PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	PELI1,AFTPH,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	126261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	64587056	64587400	64587325	Y	NA	NA	AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	91703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	64995321	64996019	64995711	Y	SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	19182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr2	65086460	65086681	65086529	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	65221577	65221744	65221661	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	7966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65440417	65440444	65440431	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	LOC400958,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007318.5	10280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65583296	65583698	65583484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRED2	74073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356646548605172
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	67486839	67487275	67486977	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	135176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.00165246234263
chr2	67680448	67680810	67680629	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	57997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	67751414	67751623	67751484	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	128963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	67876596	67876952	67876755	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	254145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	67878004	67878254	67878218	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	255553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	68432380	68432395	68432387	Y	NA	WDR92,PNO1,PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	48974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	GKN2	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	GKN2	42245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr2	69241314	69241782	69241454	Y	ANTXR1	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	3004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	69309666	69309994	69309927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	71356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	69390293	69390547	69390355	Y	ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	151983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr2	69424670	69425029	69424849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	186360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	69481133	69481450	69481229	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	130932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	69578985	69578997	69578991	Y	NA	GFPT1	NA	NA	NA	NA	GFPT1	33385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	70173540	70174234	70173890	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	13163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	70205559	70206094	70205928	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	18162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	70216700	70217012	70216811	Y	NA	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	29303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	70273102	70273420	70273221	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	39165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.682695677718053
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.34784898499209
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	70608938	70609447	70609175	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM136A	81716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	70847317	70847463	70847388	Y	FIGLA,ADD2,ADD2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFA	67992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2,ATP6V1B1	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	71228347	71228418	71228366	Y	ANKRD53	TEX261	TEX261	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TEX261	8272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.186780743140731
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	CYP26B1	451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.740239319145364
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	CYP26B1	43683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	72713565	72713630	72713598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	337540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	72789461	72789923	72789792	Y	EXOC6B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	261247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr2	73967118	73967501	73967310	Y	NA	TPRKB,DUSP11	NA	NA	NA	NA	TPRKB	4591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	74060180	74060503	74060342	Y	NA	STAMBP	NA	NA	NA	NA	STAMBP	6094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	74765672	74765911	74765792	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	LBX2,PCGF1,HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	AUP1	10606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	74801154	74801351	74801200	Y	DOK1	HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	AUP1	46088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	74930564	74930823	74930694	Y	NA	AC007387.2	NA	NA	NA	NA	AC007387.2	49123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.698377351093314
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	75103488	75103536	75103515	Y	LBX2,HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	44380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	75141745	75142080	75142074	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	41539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	75498571	75498680	75498627	Y	NA	NA	TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	POLE4	314952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr2	76538969	76539122	76539040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFC2	602854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr2	77488333	77488701	77488549	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM4	329744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	77555136	77555510	77555330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM4	262935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	78328146	78328439	78328293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	314638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	79168770	79169144	79168957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	1155262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	79897461	79897533	79897497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	490728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	84683355	84683532	84683444	Y	NA	SUCLG1	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	1637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	84878729	84879090	84878910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	193560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	85034355	85034669	85034421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	96080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.747853121753289
chr2	85057054	85057454	85057405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	73295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	85066726	85066734	85066730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	64015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	85093452	85093824	85093680	Y	NA	TMSB10	NA	NA	NA	NA	TMSB10	36925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.754041952442911
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31586191530474
chr2	85166635	85167198	85166950	Y	KCMF1,C2orf89	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	29018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr2	85185071	85185576	85185382	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	10640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	85404303	85404456	85404381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	76486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	85567649	85568034	85567918	Y	NA	TGOLN2,ELMOD3,RETSAT	TGOLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELMOD3	11483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	85632531	85633066	85632892	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	10489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2728693993743
chr2	85673142	85673285	85673214	Y	NA	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	29587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.893729080112042
chr2	85726317	85726428	85726373	Y	CAPG,VAMP8	MAT2A	TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAT2A	37860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.383592770540193
chr2	85932755	85933081	85932924	Y	SH2D6	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	20379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	85956315	85956539	85956423	Y	SH2D6	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	2855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	6550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351535052667168
chr2	86102907	86103036	86102912	Y	NA	ST3GAL5	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	11101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	86163596	86163679	86163638	Y	NA	ST3GAL5	POLR1A,ST3GAL5,ATOH8,LOC90784,LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	49459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	86224309	86224458	86224357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr2	86225783	86226050	86225999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	86262986	86263343	86263241	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	67935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	SNORD94,IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	SNORD94	27224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	86562971	86563338	86563025	Y	REEP1,REEP1	NA	NA	NA	NA	NA	REEP1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr2	88590567	88590888	88590740	Y	C2orf51	NA	NA	NA	NA	NA	KRCC1	237319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr2	88988290	88988604	88988447	Y	NA	RPIA	NA	NA	NA	NA	RPIA	558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	91786584	91786786	91786661	Y	NA	NA	LOC654342	IMR90	Hi-C	24141950	RPIA	2797422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178209757262733
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.186780743140731
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	DUSP2,AC012307.2	NA	NA	NA	NA	DUSP2	26308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	96811828	96812146	96811999	Y	TMEM127,KIAA1310,ARID5A,ASTL,DUSP2	DUSP2,AC012307.2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	AC012307.2	1077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr2	96813420	96813919	96813585	Y	NA	DUSP2,AC012307.2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	AC012307.2	2669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	96830596	96830784	96830751	Y	DUSP2	DUSP2,AC012307.2,STARD7	NA	NA	NA	NA	AC012307.2	19845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	96871048	96871111	96871053	Y	ASTL,DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7	NA	NA	NA	NA	STARD7	1452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	96922307	96922515	96922363	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1,SNRNP200	NA	NA	NA	NA	TMEM127	7217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	96995983	96996007	96995995	Y	ITPRIPL1,ITPRIPL1	SNRNP200,AC021188.4,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	3518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	97561594	97561991	97561828	Y	FAM178B	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	27100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	98290312	98290690	98290542	Y	TMEM131	COX5B,ACTR1B,RNU4-8P	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	11118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	88784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	99318923	99319110	99319017	Y	NA	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	26479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	99453667	99453923	99453920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	108078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	99792031	99792038	99792035	Y	NA	C2orf15,LIPT1,TSGA10,MITD1,MRPL30	NA	NA	NA	NA	MITD1	3483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	100685193	100685529	100685389	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	346589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	124173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289645842560086
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	101872333	101872649	101872491	Y	RNF149	TBC1D8,SNORD89	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	5005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	101884483	101884674	101884578	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	TBC1D8,SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	SNORD89	2837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	101922226	101922443	101922331	Y	NA	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	101922561	101923216	101923063	Y	NA	SNORD89	NA	NA	NA	NA	RNF149	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	101972073	101972519	101972434	Y	NA	RNF149,CREG2	NA	NA	NA	NA	CREG2	29538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.855290823932122
chr2	102353138	102353817	102353456	Y	IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	41826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	102382879	102383094	102382925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	71567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	102844003	102844653	102844435	Y	IL1R2,IL18RAP,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	81309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232485164761891
chr2	102854655	102855173	102854991	Y	IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	70789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	103280963	103281189	103281017	Y	IL1RL2,SLC9A2	SLC9A2	NA	NA	NA	NA	SLC9A2	46797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	103390349	103390733	103390541	Y	NA	MFSD9,TMEM182	NA	NA	NA	NA	TMEM182	38982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	105505799	105505908	105505854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	146533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	106712278	106712621	106712354	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	UXS1	96174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	107198328	107198702	107198515	Y	NA	NA	UXS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC114755.2	294819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	108146627	108146991	108146734	Y	NA	AC096669.3	NA	NA	NA	NA	AC096669.3	2684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	109506497	109506716	109506551	Y	LIMS1,CCDC138,EDAR	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	97112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	109514642	109514975	109514799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	88853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	109830137	109830521	109830352	Y	RANBP2	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	226309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	255530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr2	110016494	110016637	110016500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	353146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	110319562	110319852	110319693	Y	NA	SEPT10	NA	NA	NA	NA	SEPT10	49931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP1	101146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP1	88632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	112375521	112375561	112375551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	264706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	112383763	112383890	112383828	Y	NA	NA	ACOXL,BCL2L11	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	256377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	113008998	113009283	113009141	Y	ZC3H6	ZC3H8,ZC3H6	NA	NA	NA	NA	ZC3H8	1430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	47169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr2	113450750	113451037	113450852	Y	NA	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	49316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	113512242	113512462	113512374	Y	ZC3H6,IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	CKAP2L,IL1A	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	7792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	113551784	113552157	113551927	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	11617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	113552525	113552798	113552647	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	12358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	113569466	113569945	113569683	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	22535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	113581693	113582026	113582010	Y	NA	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	10454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	65291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	114046330	114046643	114046448	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	RABL2A	336163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	RABL2A	299991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr2	114634434	114634643	114634539	Y	NA	ACTR3	ACTR3	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR3	10894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	114644100	114644364	114644199	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	531884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	118739522	118739775	118739730	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	29934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	118740185	118740994	118740898	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	28715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	119989660	119989833	119989766	Y	NA	STEAP3	NA	NA	NA	NA	STEAP3	10276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr2	121480209	121480601	121480371	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	10598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	121650745	121651146	121650942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	159546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	122275440	122275469	122275455	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	10988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	122405703	122406017	122405860	Y	NA	CLASP1,NIFK-AS1	NA	NA	NA	NA	NIFK-AS1	477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	122480192	122480543	122480332	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	12136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	123419039	123419339	123419226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	926360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	BIN1	52473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC3	73929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	NA	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	128169566	128169991	128169902	Y	NA	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	25525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	128453755	128454028	128453898	Y	MAP3K2,IWS1,AMMECR1L,SFT2D3	SFT2D3	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	SFT2D3	2569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	128470034	128470252	128470136	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	13437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	128761594	128761964	128761779	Y	NA	SAP130	NA	NA	NA	NA	SAP130	21730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	128800612	128800796	128800698	Y	NA	SAP130,UGGT1	UGGT1,SAP130	IMR90	Hi-C	24141950	SAP130	16918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	128919923	128920212	128920008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT1	73149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	129381655	129381863	129381711	Y	NA	NA	UGGT1,HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	307504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	129901785	129902172	129901852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	793618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	130087212	130087247	130087228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	608543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	494673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	NA	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM168B	293213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr2	131582042	131582382	131582235	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	266651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr2	131586593	131586950	131586772	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	262083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	131745045	131745246	131745147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	103787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	132130244	132130505	132130374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2A	117811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	133640372	133640755	133640626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	213220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	133914495	133914622	133914567	Y	NCKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	487343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	134084028	134084575	134084301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	656876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.864903818099307
chr2	134193030	134193115	134193062	Y	NCKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	682439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.759883597571281
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	136971782	136972392	136972031	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	98047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	136996318	136996892	136996519	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	122583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.366450798784198
chr2	137003597	137004126	137003957	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	129862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr2	138829868	138830168	138829962	Y	NA	NA	HNMT	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNMT	110278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	139342135	139342417	139342276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	84764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	141602642	141602767	141602705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1284503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	141613060	141613069	141613065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1274201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	141844279	141844394	141844337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1042876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	142150307	142150490	142150399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	736780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	142222584	142223129	142223081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	664141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	142343061	142343470	142343446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	543800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	142404808	142405288	142404942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	481982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	142449001	142449164	142449004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	438106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	142647536	142647619	142647564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	239651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	142789500	142789791	142789646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	97479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	142874625	142874987	142874896	Y	LRP1B	LRP1B	NA	NA	NA	NA	LRP1B	12283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	142886868	142887183	142887052	Y	LRP1B	LRP1B	NA	NA	NA	NA	LRP1B	87	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	143077888	143078204	143078046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	190618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	143614638	143615023	143614910	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	18044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr2	143615203	143615596	143615531	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	17471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr2	143615896	143616223	143616082	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	16844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.99346444009375
chr2	143621045	143621348	143621064	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KYNU	11719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	143621410	143621600	143621515	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KYNU	11467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	143624367	143624985	143624879	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	8082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	6497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.969229215899397
chr2	143628214	143628759	143628425	Y	NA	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	4308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KY