chr1	839741	840250	839788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	52439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	856539	856757	856714	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	NOC2L	35932	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr1	1093610	1093958	1093954	Y	ATAD3C,TMEM88B	C1orf159,TNFRSF18	NA	NA	NA	NA	C1orf159	43869	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2,SCNN1D	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,RP4-758J18.7,VWA1,ATAD3C,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	2068660	2068858	2068763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	73301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	2172142	2172385	2172270	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,PANK4,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	29983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	2253622	2253773	2253699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	67373	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr1	2509702	2510198	2509855	Y	SKI,TNFRSF14	TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	5732	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	138833	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	51771	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	4394518	4394542	4394530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf174	579661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	4729528	4729775	4729656	Y	AJAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf174	914671	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	6088225	6088518	6088328	Y	TNFRSF25,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	37692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	6360191	6360625	6360507	Y	PLEKHG5,PLEKHG5,HES2	GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	41156	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	6451759	6451831	6451795	Y	NA	ACOT7,HES2,ESPN	NA	NA	NA	NA	ACOT7	620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	334349	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	7813654	7813829	7813742	Y	NA	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	VAMP3	15500	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	7947650	7947935	7947793	Y	TNFRSF9	UTS2	CAMTA1,VAMP3,PER3,UTS2,TNFRSF9	IMR90	Hi-C	24141950	UTS2	36078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	36638	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	52503	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	71850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	72619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8181009	8181247	8181098	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	96211	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	113290	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	120979	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	113345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	103496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	9224991	9225286	9225137	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	14977	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	9291783	9292106	9291820	Y	NA	H6PD	H6PD,GPR157,SLC2A5,SLC2A7,MIR34A,SPSB1,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	H6PD	728	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	9960528	9960713	9960585	Y	NA	CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1	NA	NA	NA	NA	CTNNBIP1	7681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	10695291	10695734	10695495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	158973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	10723795	10723954	10723885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	130753	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	10804844	10805001	10804872	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	49706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO44	152485	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	12485613	12485784	12485698	Y	PRAMEF1,AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	189953	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	14843752	14844090	14843930	Y	KAZN	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	79110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	15416988	15417263	15417153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	59765	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	15587806	15588435	15587851	Y	NA	FHAD1	NA	NA	NA	NA	FHAD1	16038	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	15664307	15664455	15664338	Y	NA	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	69936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	15738661	15738986	15738829	Y	SPEN,PLEKHM2,DDI2,EFHD2,CASP9,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	4270	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	15946733	15946892	15946831	Y	EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2	AGMAT,RP4-680D5.2,CHCHD2P6,DDI2	NA	NA	NA	NA	DDI2	4738	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16156384	16156536	16156435	Y	EFHD2,CASP9,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	3660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	16209325	16209770	16209445	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	36683	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,C1orf64	NA	NA	NA	NA	C1orf64	10629	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	16500084	16500309	16500220	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19502	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	RP11-380J14.1,PADI1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	3852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	17518941	17519138	17519054	Y	ATP13A2,PADI3	RP11-380J14.1,PADI1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	4663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	17534687	17534794	17534729	Y	NA	RP11-380J14.1,PADI1,PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI1	5066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr1	17896198	17896624	17896362	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	31868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	21650806	21651685	21651350	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	18312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	22089036	22089375	22089206	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	18724	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	23448967	23449247	23449107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	53054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	24229023	24229388	24229190	Y	NA	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	FUCA1	36239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	24519628	24519970	24519647	Y	GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	52017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	GRHL3,NIPAL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	48021	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	24736156	24736250	24736199	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	4034	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	25051605	25051987	25051744	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	17861	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	25823926	25824130	25824028	Y	NA	LDLRAP1	LDLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	43941	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	26677301	26677628	26677413	Y	CATSPER4,ZNF683	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	993	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.44948853788194
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	28776524	28777127	28776532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCC1	53328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	29104880	29105053	29104930	Y	NA	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	43747	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	31241795	31242280	31242065	Y	LAPTM5	NA	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	SDC3	137328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	RP11-439L8.3,RP11-73M7.1,TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	23584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	COL16A1,BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL16A1	12683	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC,KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21088	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	33454783	33455472	33455325	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	26497	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	38285621	38285821	38285720	Y	ZC3H12A,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	13764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	38291277	38291502	38291339	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	19420	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	39657786	39658129	39657912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	112798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.83711640341145
chr1	41343431	41343839	41343651	Y	NA	CITED4	KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	17413	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	41365158	41365531	41365407	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	39140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	41966127	41966464	41966357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	140533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	302257	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	42328578	42328878	42328730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	170718	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	43407355	43407700	43407616	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	14830	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	6570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	WDR65	101615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	43901568	43901739	43901659	Y	NA	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	HYI	15921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	44324219	44324394	44324336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	72598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	44354357	44354471	44354414	Y	SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13	ARTN	NA	NA	NA	NA	ARTN	42521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	45298718	45299070	45298894	Y	NA	PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	15049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	46351629	46351956	46351793	Y	C1orf190	NA	NA	NA	NA	NA	MAST2	100970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	46637652	46637852	46637691	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	893	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	51056997	51057361	51057215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	366574	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	51302197	51302583	51302391	Y	FAF1	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	121352	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	51442122	51442408	51442227	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	17705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	51986075	51986410	51986173	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	EPS15	3075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	51997947	51998232	51998197	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS15	14947	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9	NA	NA	NA	NA	ZFYVE9	22143	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	54260217	54260562	54260390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	55009665	55009918	55009852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	132513	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	55894779	55895033	55894906	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	215993	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	9073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN,LINC01135	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	59280364	59280505	59280397	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	59397559	59397706	59397597	Y	TACSTD2	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01135	148736	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	151190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	60144543	60144796	60144669	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	133662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	62609116	62609459	62609128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	290509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	63022251	63022602	63022448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	122283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	64197270	64197475	64197385	Y	NA	ROR1	ROR1,UBE2U,PGM1	IMR90	Hi-C	24141950	ROR1	40218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	64417224	64417447	64417336	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	109868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	64496116	64496488	64496302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	188760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1,RP11-182I10.3	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	123576	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	68858132	68858533	68858311	Y	NA	NA	WLS,LOC100289178	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	102371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	39652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	70745994	70746088	70746040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	72329	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	3770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	78350506	78350835	78350671	Y	FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	1363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr1	82168687	82169067	82168779	Y	NA	ST13P20	NA	NA	NA	NA	ST13P20	16311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	85737728	85738105	85737917	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	2668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	85744584	85744829	85744751	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	3811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	85992810	85993270	85993105	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	48663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	86016463	86016866	86016755	Y	NA	DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2	NA	NA	NA	NA	DDAH1	25067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	86035824	86036171	86035900	Y	NA	DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2	NA	NA	NA	NA	DDAH1	5762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	86049987	86050100	86050044	Y	NA	DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2	NA	NA	NA	NA	CYR61	5543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290M5.2	14764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290M5.2	15647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr1	88150561	88150732	88150650	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	358410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	89775606	89775953	89775816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBP4	112991	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	90101821	90102213	90101853	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	5190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	90190139	90190909	90190374	Y	GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	93508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	91322848	91323191	91323185	Y	NA	RP4-665J23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	7641	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	92048213	92048455	92048330	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	83805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	92270160	92270686	92270504	Y	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99206	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	92496267	92496651	92496624	Y	NA	EPHX4,BTBD8	NA	NA	NA	NA	EPHX4	2728	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94084336	94084510	94084423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	154490	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	149285	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	92882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.71193373836928
chr1	94169341	94169462	94169391	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94203705	94204234	94204026	Y	NA	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	34766	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	5939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94621912	94621923	94621919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	116701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94626535	94626661	94626598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	111963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94712051	94712193	94712123	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26431	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26007	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	94784984	94785158	94785071	Y	NA	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	11665	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	8231	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	3690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	836	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr1	94937052	94937396	94937225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCD3	55119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	95107584	95108052	95107918	Y	F3,SLC44A3,SLC44A3	RP11-86H7.7	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	19844	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	RP11-86H7.7	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	26074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	95155573	95156005	95155685	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	67833	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	95221261	95221551	95221307	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	62286	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	95276451	95276463	95276457	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,CNN3,SLC44A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01057	7374	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	95331900	95332266	95332157	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	CNN3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A3	48002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	96939460	96939794	96939627	Y	NA	EEF1A1P11	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	28974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	98111566	98111887	98111829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	102309	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	98177967	98178251	98178164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	168710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	98518546	98518920	98518639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	133941	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	98642709	98642844	98642773	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	31459	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	98677142	98677181	98677162	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	2839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	98789496	98789901	98789701	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1070A16.1	115193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	100827551	100827774	100827683	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	18967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	VCAM1	NA	NA	NA	NA	VCAM1	18969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	108650339	108650754	108650436	Y	FAM102B,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	90717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	109262615	109262764	109262672	Y	NA	PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	STXBP3	24532	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	109850258	109850620	109850439	Y	WDR47	PSRC1	NA	NA	NA	NA	PSRC1	26450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	EPS8L3	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	30200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr1	110366477	110366702	110366587	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	61828	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	CSF1	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	30719	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	110435112	110435421	110435324	Y	SORT1,SORT1	CSF1	CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,AHCYL1,GNAI3,GSTM4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	15443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	112438367	112438956	112438733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	115025085	115025405	115025244	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	26376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr1	115722074	115722498	115722181	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN2	91953	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	116918317	116918655	116918398	Y	NA	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5027	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	117047053	117047428	117047164	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	27286	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	117074509	117074935	117074769	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	117533270	117533527	117533328	Y	CD58,CD101	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-27K13.3	66585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	120608824	120609208	120608880	Y	NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	1032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	144536201	144536370	144536251	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	4163	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	117473	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	146624494	146624779	146624637	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	17350	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	146999335	146999532	146999436	Y	NA	BCL9	BCL9	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	11650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	147012349	147012550	147012481	Y	NA	BCL9	ACP6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	1167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	147344950	147345054	147345002	Y	NA	NA	GJA5	IMR90	Hi-C	24141950	ACP6	204332	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.92459813690723
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	150159099	150159241	150159135	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1,ANP32E,RNU2-17P	HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PLEKHO1	39726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr1	151486181	151486300	151486231	Y	SELENBP1,RORC,CGN	CGN,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	5195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	151696469	151696693	151696535	Y	NA	RIIAD1,MRPL9	NA	NA	NA	NA	RIIAD1	15560	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	151945504	151945625	151945562	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19241	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	RPTN,FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	RPTN	13330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	152137288	152137323	152137306	Y	CELF3,CELF3,CELF3,HRNR	RPTN,FLG-AS1	S100A11	MCF7	ChIA-PET	22265404	FLG-AS1	1278	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	RPTN,FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	154397743	154397997	154397805	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	22074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	154404273	154404562	154404390	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	28604	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	154405619	154406249	154405788	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	155097183	155097419	155097260	Y	NA	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	517	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	156133837	156133883	156133860	Y	C1orf182,RHBG,HAPLN2,C1orf61,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,MEX3A,PAQR6,PAQR6	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	27997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	156662788	156663099	156662881	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	BCAN,NES	IMR90	Hi-C	24141950	CRABP2	10509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	160377718	160378261	160377994	Y	IGSF9	NA	NA	NA	NA	NA	COPA	66528	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	10720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	160881277	160881698	160881498	Y	NA	ITLN1,RP11-312J18.5	CD244,ITLN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	18507	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1,ARHGAP30	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	161052363	161052546	161052461	Y	F11R,PVRL4	TSTD1,USF1,ARHGAP30,PVRL4,KLHDC9,NIT1,PFDN2,DEDD	NA	NA	NA	NA	PVRL4	4843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	161348767	161349231	161349047	Y	NDUFS2	NA	NA	NA	NA	NA	SDHC	66720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	8572	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	162511455	162511984	162511719	Y	UAP1,UHMK1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	17339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	162604417	162604795	162604606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UAP1	75094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	168050664	168051125	168050872	Y	SFT2D2	NA	NA	NA	NA	NA	GPR161	53696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	168337258	168337475	168337348	Y	NA	NA	LOC100505918,MIR557	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	88980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172305839	172305991	172305915	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	105239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	172418117	172418641	172418353	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	6887	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172468818	172469289	172468991	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	57588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172606833	172606931	172606882	Y	FASLG,C1orf9	NA	C1orf9,FASLG	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	195603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172853063	172853400	172853301	Y	NA	NA	LOC100506023,TNFSF18,TNFSF4	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	164703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	138747	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	172920935	172921277	172921095	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	96826	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	173433461	173433670	173433598	Y	NA	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	10735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	173816933	173817269	173817101	Y	NA	DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	NA	NA	NA	NA	ZBTB37	17951	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	177150553	177151051	177150740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	854034	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	178157578	178157966	178157615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	96714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	178298668	178299096	178298877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	210791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	204551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	3265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	180237101	180237317	180237140	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	39680	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	180389473	180389640	180389557	Y	NA	NA	LHX4,LOC100527964	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	80449	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	181081690	181081905	181081806	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	181082184	181082367	181082268	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26546	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	181110732	181111003	181110864	Y	STX6,MR1,IER5	NA	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	55094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	183132366	183132749	183132653	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	20624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	183149947	183150219	183150157	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	3154	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	183161027	183161375	183161120	Y	NA	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	7654	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183166871	183167293	183166889	Y	NA	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	13498	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183171353	183171815	183171539	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	17980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183178797	183178927	183178861	Y	NA	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	25424	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	88078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	95614	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2	NA	NA	NA	NA	NCF2	30703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183567713	183567879	183567843	Y	NCF2,NCF2	NCF2,ARPC5,RGL1	DKFZP564C196,SMG7,NCF2,LAMC1,NMNAT2,ARPC5,RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	NCF2	9702	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183577563	183577895	183577671	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2,ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	NCF2	19552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183578502	183578873	183578650	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2,ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	NCF2	20491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183579279	183579568	183579440	Y	NA	NCF2,ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	NCF2	21268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	183594812	183595033	183594923	Y	NA	NCF2,ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	7859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	185315613	185315702	185315663	Y	RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	SWT1	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	31152	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	185408687	185409225	185409010	Y	NA	NA	IVNS1ABP,LOC100288079	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	124226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	192776947	192777226	192777096	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	91557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	193490747	193490821	193490784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	401600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	193726401	193726456	193726429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	637254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf53	95117	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	198465277	198465448	198465363	Y	NA	NA	PTPRC,ATP6V1G3	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	341184	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	526837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	198887897	198888318	198888210	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	465951	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	449335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	199187777	199188161	199187969	Y	NA	NA	LOC100131234	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	166108	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	200321353	200321596	200321470	Y	DDX59,ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	55588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	200857233	200857815	200857711	Y	KIF21B	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	14415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	201244405	201244769	201244526	Y	PKP1	PKP1	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	PKP1	5811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201277004	201277220	201277102	Y	NA	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	26424	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	201277329	201277484	201277406	Y	PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	26749	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201463619	201463933	201463776	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	10436	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201520953	201521395	201521173	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NAV1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	44369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3,RP11-465N4.4	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-465N4.4	38691	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	202217450	202217807	202217629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGR6	56421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	202781525	202781905	202781812	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5	NA	NA	NA	NA	PCAT6	3443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	202823240	202823502	202823372	Y	NA	KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF	PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-480I12.5	5246	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	204254999	204255106	204255048	Y	PIK3C2B,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	73779	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	204255998	204256379	204256352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	74778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	204395183	204395520	204395303	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	16264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	204449745	204450007	204449876	Y	NA	PIK3C2B,MDM4	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	11845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	204653343	204653636	204653438	Y	PLEKHA6,TMEM81,NFASC,NFASC,LRRN2,LRRN2	LRRN2	NA	NA	NA	NA	LRRN2	482	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	205265235	205265548	205265359	Y	TMEM81,KLHDC8A	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	23335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	205449878	205450140	205449950	Y	RAB7L1,CNTN2	LEMD1,CDK18	KLHDC8A,NFASC,CNTN2,TMCC2,LOC284576,LEMD1,MIR135B,CDK18,MFSD4,SLC45A3	IMR90	Hi-C	24141950	CDK18	21583	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	206290243	206290662	206290573	Y	C1orf186	C1orf186,RP11-38J22.6,CTSE	NA	NA	NA	NA	C1orf186	3596	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	206642854	206643037	206642964	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE	IKBKE,RASSF5	NA	NA	NA	NA	IKBKE	1063	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	206918122	206918360	206918230	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	61833	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	206931189	206931520	206931334	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,IL10	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	74900	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	207063537	207063710	207063660	Y	RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24	RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	15254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	14535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.71193373836928
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	RP11-564A8.4,PIGR	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	9627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	207203424	207203586	207203506	Y	C1orf116	C1orf116,PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	C1orf116	515	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	207413364	207413503	207413411	Y	IL19,CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	79350	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	207581369	207581474	207581422	Y	CR1,CD46,YOD1,CD55	CR2	PFKFB2,C4BPA	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	44101	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	209538127	209538433	209538258	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR205HG	61732	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	209557331	209557442	209557421	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	42723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	209562668	209562976	209562782	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	37189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	209577571	209577627	209577601	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	22538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	209766433	209766919	209766698	Y	CAMK1G	RP1-272L16.1	NA	NA	NA	NA	RP1-272L16.1	27415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	209798058	209798744	209798639	Y	NA	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	25067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	209820544	209820823	209820626	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3,G0S2	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	2988	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	209822403	209823008	209822758	Y	TRAF3IP3,G0S2,LAMB3	LAMB3,G0S2	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	803	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	209827285	209827712	209827546	Y	LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	3474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	209829183	209829498	209829302	Y	IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	5372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.5746712029241
chr1	209830400	209831026	209830727	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	6589	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	209841164	209841607	209841345	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	LAMB3,G0S2	CAMK1G,G0S2,LAMB3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	G0S2	5158	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	210058060	210058292	210058164	Y	LAMB3	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	58708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	212182782	212182853	212182818	Y	NA	INTS7,DTL,RPL21P28	NA	NA	NA	NA	INTS7	24031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	212311960	212312104	212312056	Y	PPP2R5A	NA	PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL21P28	88589	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	212650622	212650921	212650683	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NENF	NSL1,ATF3,FAM71A,BATF3,FLVCR1,VASH2,ANGEL2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	46393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	212658172	212658571	212658328	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	53943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	212780782	212781279	212780943	Y	NA	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	44106	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	212844659	212845312	212845163	Y	RPS6KC1,BATF3,ATF3	BATF3	NA	NA	NA	NA	BATF3	26015	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	217247144	217247287	217247272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	555137	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	218523725	218524123	218523798	Y	NA	TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	6148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	218636802	218637167	218637004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	119225	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	154412	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	218757146	218757164	218757156	Y	NA	NA	LOC728463,RRP15,TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	239569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	241326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	218847947	218848245	218848113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	330370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	219455848	219455941	219455895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	110662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	221209079	221209530	221209425	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	250978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	221736961	221737125	221737063	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	176393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	221862665	221862854	221862747	Y	DUSP10,DUSP10	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP10	50664	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	221904432	221904724	221904722	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	8794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr1	221955945	221956219	221956110	Y	NA	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	42427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	221997414	221997699	221997620	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	83896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	222060426	222060817	222060685	Y	NA	NA	DUSP10	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP10	146908	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	222828361	222828786	222828451	Y	TLR5	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	38933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	223276523	223276867	223276768	Y	NA	TLR5	NA	NA	NA	NA	TLR5	37757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	4.63653187527652
chr1	224240602	224240763	224240683	Y	TP53BP2	NA	NVL	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO28	59026	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	188855	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	225881856	225882162	225882024	Y	ACBD3	ENAH,RP11-145A3.1	ENAH,EPHX1,C1orf55,SRP9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-145A3.1	4144	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	226007337	226007385	226007361	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	11543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	226189681	226190319	226189910	Y	H3F3A,C1orf55	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3A	57233	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	226443007	226443187	226443097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	52383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	226592689	226592838	226592760	Y	PSEN2,PARP1	PARP1,RP11-118H4.1	NA	NA	NA	NA	PARP1	942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	227982614	227983033	227982728	Y	CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	61502	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	228124828	228124930	228124870	Y	ARF1,ARF1	WNT9A	NA	NA	NA	NA	WNT9A	8669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	109840	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	110504	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.66215293641988
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	111200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	229544503	229544714	229544606	Y	ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	97389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	230089577	230089803	230089690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	101733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	230249347	230250007	230249645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	57811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	231036878	231036937	231036909	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	33543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	232117893	232118046	232117970	Y	TSNAX	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	357332	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	233763606	233763782	233763694	Y	NA	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15856	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	233809261	233809638	233809364	Y	KCNK1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK1	61511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234163168	234163347	234163228	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	124489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234254353	234254647	234254499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	215674	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	234275805	234276023	234275906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	214729	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234668851	234669143	234668986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARBP1	56002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr1	234749342	234749645	234749570	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	LINC00184,LOC100506810,ARID4B	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	6071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234767593	234767925	234767750	Y	TARBP1	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	12110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	RP4-781K5.4	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-781K5.4	32032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	78808	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	235096560	235096855	235096619	Y	ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.1,RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	6954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.1,RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	5739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.1,RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	3120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	RP11-443B7.1,RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	19535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr1	235242792	235242999	235242934	Y	NA	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47252	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	235243001	235243596	235243521	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	46655	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235468267	235468477	235468372	Y	NA	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	20188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	235468552	235468724	235468640	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	19941	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	241390681	241391063	241391027	Y	RGS7	NA	NA	NA	NA	NA	RGS7	127467	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3C	52027	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	243644284	243644683	243644595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	226964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	42384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	38427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	244267717	244267933	244267824	Y	NA	RP11-278H7.4	SDCCAG8,LOC339529,AKT3,ZNF238	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-278H7.4	13389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	244466323	244466598	244466461	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADSS	146838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	244467525	244467677	244467619	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADSS	145759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	245196282	245196669	245196476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	65275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	245255337	245255432	245255385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	60855	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	245958364	245958743	245958685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	642077	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	246038342	246038749	246038555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	629865	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	246297322	246297388	246297355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	371226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	246591935	246592203	246592010	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	76411	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	246763574	246763751	246763579	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	35828	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3528683	3528786	3528735	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	296687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3797195	3797502	3797389	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	27971	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	3800307	3800531	3800378	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	24942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	3811743	3812009	3811888	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	13464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	3853393	3854169	3853583	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	27920	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3867491	3867713	3867639	Y	NA	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	42018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	3929991	3930887	3930290	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	104518	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	3987998	3988450	3988285	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	162525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	4396174	4396330	4396296	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	112070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	4562295	4562487	4562387	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00704	155859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	4712833	4713220	4712996	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	5126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	4728868	4729211	4729108	Y	NA	LINC00704	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00704	10522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	4775344	4775645	4775580	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	AKR1E2	51176	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	4813646	4813900	4813754	Y	NA	AKR1E2	KLF6,PITRM1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	12921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	4895704	4895738	4895721	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	37058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	118302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	78123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	47891	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	5593718	5593999	5593816	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NET1	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-463N16.6	42082	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	5596279	5596669	5596478	Y	NA	RP13-463N16.6	NET1,ASB13	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-463N16.6	39412	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	5986377	5986825	5986602	Y	NA	IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	31325	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	6017924	6018316	6018090	Y	RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	6055445	6055662	6055528	Y	NA	IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	37295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	6182474	6182743	6182618	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	2138	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	6193489	6193806	6193647	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	8608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	6764164	6764384	6764289	Y	NA	RP11-554I8.2	LOC100507127,SFMBT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554I8.2	12960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	8408171	8408387	8408297	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	TAF3	549704	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	10631619	10631869	10631724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	203074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	184200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	215149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	165082	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	12307693	12308050	12307912	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT5	71550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	12313010	12313140	12313022	Y	UPF2,UPF2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	76341	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN	NA	NA	NA	NA	OPTN	3492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	205805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr10	14026617	14027027	14026853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	87256	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	14447046	14447458	14447244	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	54683	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	14605482	14605831	14605731	Y	HSPA14,DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	103341	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	14628830	14629278	14629071	Y	HSPA14	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	126689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	17104584	17104750	17104681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	137303	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	18897565	18897858	18897712	Y	NSUN6,ARL5B	NSUN6,ARL5B-AS1,ARL5B	NA	NA	NA	NA	NSUN6	40693	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	21291623	21291954	21291791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	169162	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	22904639	22904845	22904818	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	96639	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	22970665	22970972	22970902	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	30512	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	23801336	23801634	23801483	Y	OTUD1	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD1	75138	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	24740338	24740618	24740546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	269979	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	24745312	24745555	24745448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	265042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	25357102	25357468	25357353	Y	NA	NA	ARHGAP21	IMR90	Hi-C	24141950	THNSL1	53515	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	27130056	27130389	27130223	Y	NA	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	17627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	28230250	28230547	28230399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	55430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	29010919	29011116	29010957	Y	NA	BAMBI	LYZL1,BAMBI	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	46648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	213186	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	29922205	29922549	29922392	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	225874	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	29924706	29925406	29925356	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	228375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	248523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	328815	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	30092989	30093361	30093263	Y	SVIL	NA	SVIL,KIAA1462,MIR604	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	309062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	30331172	30331392	30331282	Y	MAP3K8,KIAA1462	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	71031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	30471622	30471929	30471877	Y	KIAA1462	NA	KIAA1462,SVIL	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	69199	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	30736122	30736481	30736327	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	15256	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	30742798	30743130	30743073	Y	NA	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	21932	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	30782963	30783595	30783168	Y	MAP3K8	NA	MAP3K8	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP3K8	62097	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	31364412	31364707	31364567	Y	NA	ZNF438	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	45546	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	31423488	31423889	31423800	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	104622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr10	32301568	32301771	32301670	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	41588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr10	33299093	33299340	33299217	Y	NA	ITGB1	ITGB1,C10orf68,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	6373	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	33537661	33538041	33537751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	85149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	33701574	33701923	33701712	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	78384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	35421114	35421320	35421181	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	7395	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	35589038	35589427	35589190	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	55085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	35848460	35848836	35848737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	314507	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH8	160392	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	47031609	47031850	47031726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	82137	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM25B	98464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM25B	65611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	FAM25B	NA	NA	NA	NA	FAM25B	41616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	47149103	47149407	47149372	Y	NA	FAM25B	NA	NA	NA	NA	FAM25B	30274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	49745028	49745223	49745126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	117087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	49814847	49815442	49815148	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	46868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	50385443	50385844	50385615	Y	C10orf128	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	359242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	52083052	52083210	52083101	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	60314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	52085013	52085461	52085351	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	62275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	52154516	52154956	52154688	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	131778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	52217733	52218081	52217894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	164842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	52329586	52329716	52329651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	53207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	18264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	54367095	54367120	54367106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-346D6.6	138802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	59452175	59452288	59452232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	573406	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	62174641	62174784	62174750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	361305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	62185134	62185430	62185353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	350659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	62491040	62491560	62491373	Y	ANK3	CDK1	NA	NA	NA	NA	CDK1	44529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	63814731	63815034	63814907	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	155672	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	65033384	65033629	65033527	Y	NRBF2,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	142334	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	59406	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	65149197	65149230	65149214	Y	NA	PRELID1P3	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	35827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACR2	65190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	71626507	71626840	71626632	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	66863	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	72416244	72416577	72416419	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS14	13982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	72433363	72433696	72433541	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	NA	NA	NA	NA	ADAMTS14	2804	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	72593001	72593337	72593129	Y	SGPL1	SGPL1	NA	NA	NA	NA	SGPL1	19284	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B	NA	NA	NA	NA	UNC5B	3461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	73529064	73529499	73529394	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	1756	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	73840531	73840743	73840590	Y	ASCC1,ASCC1,SPOCK2	SPOCK2	NA	NA	NA	NA	SPOCK2	6047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	74078612	74078870	74078849	Y	PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	34118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr10	74271285	74271561	74271407	Y	DDIT4,DNAJB12,CBARA1	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	112338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	74877758	74878048	74877901	Y	NA	P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	NUDT13	9541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr10	75654322	75654573	75654437	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	12362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	75931649	75931916	75931783	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	ADK	22689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	77533288	77533636	77533475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	373624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	78920467	78920779	78920602	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	763599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	79152642	79152983	79152827	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	531395	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	80062995	80063366	80063293	Y	NA	NA	ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	271477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	80122259	80122477	80122368	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	330741	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	80943996	80944377	80944135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	117204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	81005366	81005598	81005460	Y	PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	99627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	81090834	81091304	81091180	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr10	81956011	81956585	81956252	Y	ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	6743	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	82288045	82288198	82288158	Y	TSPAN14,SH2D4B	RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	5500	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	87752944	87753321	87753210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPAL	526251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	NA	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	WAPAL	118731	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD1	78974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	90488275	90488596	90488466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD22	120979	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	91020368	91020477	91020401	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	21045	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	92676361	92676755	92676735	Y	NA	RPP30,ANKRD1	NA	NA	NA	NA	ANKRD1	2278	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	94195534	94195885	94195710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDE	135948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	95136235	95136595	95136450	Y	MYOF	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L12.1	93920	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	95145053	95145431	95145242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	94643	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.6244520048735
chr10	95766976	95767368	95767096	Y	NA	PLCE1	NA	NA	NA	NA	PLCE1	15230	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	95873448	95873628	95873536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCE1	121702	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	97048077	97048324	97048201	Y	SORBS1	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	457	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	98433072	98433822	98433312	Y	LCOR,PIK3AP1,TM9SF3	PIK3AP1	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	44449	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	99168320	99168531	99168481	Y	C10orf12,ARHGAP19,FRAT1,ZFYVE27,FRAT2,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,EXOSC1,ZDHHC16	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RRP12	9193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	99174702	99174858	99174830	Y	ZFYVE27,PI4K2A,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	RRP12	K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	101048499	101048591	101048547	Y	NA	CNNM1	NA	NA	NA	NA	CNNM1	38265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	101666342	101666477	101666411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	101199	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	102792815	102793017	102792917	Y	NA	C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3	NA	NA	NA	NA	SFXN3	3824	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	103514539	103514868	103514704	Y	NA	NPM3	NA	NA	NA	NA	NPM3	26302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	103937930	103938271	103938070	Y	NA	PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	NOLC1	27997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	104364219	104364413	104364273	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	37840	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	104370147	104370568	104370420	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	31685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	104990991	104991184	104991120	Y	NA	NT5C2	SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	39935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50168	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	105466638	105466810	105466737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	146491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	105681714	105681858	105681786	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	OBFC1	5751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	106096287	106096870	106096611	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP,GSTO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITPRIP	125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	110360095	110360471	110360395	Y	NA	RP11-163F15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-163F15.1	40522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	111834173	111834352	111834276	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	80047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	111971446	111971590	111971518	Y	NA	MXI1	NA	NA	NA	NA	MXI1	6083	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112051912	112052490	112052119	Y	ADD3,MXI1	SMNDC1	NA	NA	NA	NA	SMNDC1	10219	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112086434	112086715	112086567	Y	DUSP5	SMNDC1	DUSP5,SMC3,RBM20,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	23725	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112113245	112113632	112113326	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	50536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	112117126	112117443	112117281	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	54417	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	112159079	112159451	112159258	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	96145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	112169656	112169922	112169805	Y	SMC3	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85674	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr10	112174147	112174523	112174256	Y	SMC3,DUSP5	NA	DUSP5,SMC3,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	81073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	112174673	112174737	112174702	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	80859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112263780	112264181	112263965	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	8184	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112295745	112296221	112296000	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5,SMC3	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	29228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	114570405	114570790	114570582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	137219	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	114940720	114940897	114940795	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr10	116163429	116163722	116163475	Y	AFAP1L2	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	116298178	116298480	116298375	Y	FAM160B1,C10orf118,ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	135663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	116776820	116777128	116776974	Y	NA	NA	ATRNL1	IMR90	Hi-C	24141950	TRUB1	80868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	118643126	118643297	118643273	Y	KIAA1598	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	35410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	118656077	118656284	118656258	Y	NA	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	48361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	119107774	119108099	119107936	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr10	120850460	120850786	120850708	Y	NA	EIF3A,FAM45A	EIF3A,PRDX3,SFXN4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM45A	10812	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	94093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	121031141	121031480	121031339	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	94796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	129045	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	121249100	121249168	121249139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	51052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	121261864	121262026	121262018	Y	NA	RGS10	NA	NA	NA	NA	RGS10	38194	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	122918665	122919069	122918920	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	RP11-159H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	27428	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	123777331	123777486	123777408	Y	PLEKHA1,TACC2	NSMCE4A,TACC2	NA	NA	NA	NA	TACC2	30642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	124249700	124250033	124249857	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	30659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	125847012	125847291	125847256	Y	NA	CHST15	NA	NA	NA	NA	CHST15	3915	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	126290018	126290347	126290264	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	112871	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	126773443	126773862	126773517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	73877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	126811654	126811843	126811733	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	35896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr10	127432481	127432807	127432790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	77010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	127751033	127751319	127751198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	167925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	127751937	127752037	127751987	Y	MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	168829	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	127752206	127752491	127752329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	169098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	128258462	128258762	128258558	Y	NA	NA	FANK1,DHX32,ADAM12	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00601	150014	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	129685028	129685334	129685080	Y	PTPRE	PTPRE	NA	NA	NA	NA	PTPRE	17991	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	129706206	129706827	129706528	Y	PTPRE	PTPRE	NA	NA	NA	NA	PTPRE	2881	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	133454610	133454819	133454663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK32C	688532	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK32C	263827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr10	134826942	134827305	134827042	Y	NA	NA	LOC399829,INPP5A	IMR90	Hi-C	24141950	TTC40	72615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	135092117	135092276	135092147	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	3745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	135107749	135108037	135107982	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	11942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	268826	269269	268945	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17866	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	813578	813760	813591	Y	NA	PDDC1,AP006621.5,SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,EFCAB4A,CD151,AP006621.8,POLR2L,TSPAN4	NA	NA	NA	NA	PNPLA2	3142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	1039894	1040259	1040094	Y	MUC6	MUC6,MUC2	AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC6	5188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	MUC6,MUC2	NA	NA	NA	NA	MUC2	494	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr11	1144773	1145129	1144879	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	4451	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	1423	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	3583	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	1794819	1794975	1794880	Y	NA	RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	2643	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	2705021	2705206	2705044	Y	NA	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	14018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	2933631	2934118	2933874	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18AS	10661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	2954251	2954383	2954325	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	5566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	8273804	8274153	8274013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3F	284006	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	8727919	8728019	8727969	Y	ASCL3	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	25961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	9732058	9732249	9732166	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	48434	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	10525473	10525590	10525553	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5,EIF4G2	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	3133	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	114475	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	14827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	12132692	12132808	12132735	Y	MICAL2	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	13161981	13162352	13162107	Y	NA	NA	LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-497E21.3	133275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	13359856	13360227	13360061	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	63657	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	13373049	13373395	13373164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	76850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	13986123	13986466	13986328	Y	SPON1	SPON1	NA	NA	NA	NA	SPON1	4209	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	14354673	14355035	14354941	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	29017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	16357706	16357868	16357787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	274811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	17008586	17008989	17008853	Y	PLEKHA7	RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	14026	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	19748565	19748818	19748690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	378294	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	28764751	28764902	28764829	Y	NA	RP11-115J23.1	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	42589	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	28776161	28776492	28776325	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	53999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	28778513	28778891	28778701	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	56351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	57132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	28853592	28853798	28853653	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	131430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	28864582	28864807	28864697	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	142420	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	29321986	29322293	29322123	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	599824	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	31630096	31630156	31630127	Y	PAX6	NA	NA	NA	NA	NA	ELP4	100799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr11	33012698	33013071	33012885	Y	NA	DEPDC7,TCP11L1	NA	NA	NA	NA	DEPDC7	22339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	33146392	33146678	33146610	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	35239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	33394151	33394320	33394196	Y	C11orf41	RP1-130L23.1	NA	NA	NA	NA	RP1-130L23.1	28442	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	33427027	33427076	33427050	Y	NA	RP1-130L23.1	C11orf41,C11orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-130L23.1	4265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	33668919	33669067	33668993	Y	NA	RP4-541C22.5	NA	NA	NA	NA	RP4-541C22.5	47180	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	33708893	33709097	33708996	Y	NA	RP4-541C22.5,CD59	NA	NA	NA	NA	RP4-541C22.5	7150	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	RP4-541C22.5,CD59	NA	NA	NA	NA	RP4-541C22.5	4056	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	RP4-541C22.5,CD59	NA	NA	NA	NA	RP4-541C22.5	2218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr11	33723473	33723762	33723676	Y	NA	RP4-541C22.5,CD59	NA	NA	NA	NA	RP4-541C22.5	7226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	RP4-541C22.5,CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34265315	34265482	34265399	Y	ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	90068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34322205	34322459	34322337	Y	NA	RP1-145M24.1	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	33091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	34368265	34368539	34368419	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NAT10,CAPRIN1	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	9016	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34426692	34426969	34426750	Y	ABTB2	ABTB2,CAT	ABTB2,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	31503	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34621875	34622041	34621973	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18089	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr11	34661390	34661585	34661450	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	20750	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	34939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	EHF	66237	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	35028328	35028731	35028507	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	92282	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	35053022	35053283	35053109	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104296	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	35088540	35088910	35088827	Y	NA	NA	CD44,PDHX,APIP	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	68669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	35094290	35094666	35094566	Y	NA	NA	CD44,PDHX,APIP	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	62913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	35268470	35268664	35268567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	110053	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	35825533	35825614	35825574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	137917	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	36173587	36173879	36173626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	135120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	40804649	40804950	40804800	Y	LRRC4C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	753034	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	43569506	43569887	43569721	Y	C11orf96	HSD17B12	NA	NA	NA	NA	HSD17B12	6099	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	43757440	43757801	43757621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	142560	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	43955473	43955506	43955502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	55112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	44123492	44123510	44123502	Y	NA	ACCS,EXT2	NA	NA	NA	NA	EXT2	8393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	44221715	44221986	44221792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	106616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	44306158	44306224	44306191	Y	ALX4	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	191059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	211883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	44596848	44597017	44596918	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	12871	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	45000515	45000921	45000720	Y	SYT13,TSPAN18	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	29675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	45067583	45067753	45067679	Y	CD82	NA	SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	96743	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	45122042	45122442	45122242	Y	PRDM11	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	151202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	45922261	45922718	45922513	Y	DGKZ,MAPK8IP1	PEX16	NA	NA	NA	NA	PEX16	15645	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CTD-2589M5.4,CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	34865	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CTD-2589M5.4,CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	28900	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	46275806	46275990	46275914	Y	NA	CTD-2589M5.4,CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	18108	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	46753121	46753488	46753304	Y	F2	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	32753	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	48034964	48035405	48035033	Y	OR4X1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	34851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	48077375	48077584	48077563	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	77262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	48163334	48163507	48163430	Y	OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	163221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	57045764	57045851	57045815	Y	NA	TNKS1BP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	44575	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	57200214	57200547	57200409	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3	SLC43A3,RTN4RL2	SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5	IMR90	Hi-C	24141950	SLC43A3	7161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	57324540	57324747	57324726	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,SERPING1	SLC43A1,TIMM10,UBE2L6,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	9010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	57333685	57333973	57333758	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6	TIMM10,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	23816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	59544042	59544226	59544124	Y	OR4D6,PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	32119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	60683096	60683305	60683236	Y	CYBASC3,CYBASC3,CD5,SLC15A3,CD6	PRPF19,TMEM109,TMEM132A,SLC15A3	NA	NA	NA	NA	TMEM109	3750	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	SLC15A3	NA	NA	NA	NA	SLC15A3	35565	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	60906916	60907198	60907057	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	19891	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	60917835	60918043	60917849	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	9046	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	60926054	60926399	60926274	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	14001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	61463458	61463769	61463630	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	17553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	61467819	61468013	61467906	Y	CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	21914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	43360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.48718946942832
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	HRASLS5,LGALS12,RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	63321382	63321591	63321464	Y	RARRES3,OTUB1	LGALS12,RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	19101	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63328335	63328557	63328446	Y	NA	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	26054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	32237	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	35441	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	63366734	63367020	63366890	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	15335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63377121	63377300	63377211	Y	HRASLS5,LGALS12,LGALS12,PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	5055	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63377789	63377920	63377869	Y	PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	4435	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	63496405	63496421	63496415	Y	NAA40	RTN3,C11orf95	NA	NA	NA	NA	C11orf95	37692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	63954598	63954956	63954814	Y	FERMT3,CCDC88B,OTUB1	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,RP11-783K16.14,VEGFB	NA	NA	NA	NA	STIP1	3854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	64427372	64427588	64427564	Y	BATF2	NA	NA	NA	NA	NA	SF1	116670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	64625998	64626454	64626155	Y	CDC42EP2,RASGRP2,SF1,SF1,FAU,BATF2,EHD1	MEN1,CDC42BPG,EHD1,MIR194-2	NA	NA	NA	NA	CDC42BPG	15957	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	64636604	64637051	64636910	Y	CDC42EP2,SF1,SF1,FAU,EHD1	CDC42BPG,EHD1,MIR194-2,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	16717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65184888	65185395	65184991	Y	FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	2850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr11	65220740	65221001	65220852	Y	NA	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	12	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65234874	65235172	65234954	Y	SNX32	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	14146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr11	65257502	65257849	65257676	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.92459813690723
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	65555605	65556077	65555902	Y	TSGA10IP,CATSPER1	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	3112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65559034	65559399	65559282	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	6541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65656792	65657262	65656985	Y	NA	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	CCDC85B	917	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.36200680438615
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	34.1178760633555
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	3.93667800731025
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	65910089	65910568	65910423	Y	NA	NA	KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	74255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,SPTBN2,C11orf80	NA	NA	NA	NA	SPTBN2	6715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	SPTBN2,C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SPTBN2	83	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	66844888	66845141	66844944	Y	RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	22599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	67103841	67103862	67103852	Y	NA	ANKRD13D,SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	18581	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr11	67142500	67143040	67142970	Y	CDK2AP2,CLCF1,PPP1CA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	3445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	4147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	68819655	68820046	68819874	Y	NA	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	5290	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	68924761	68925032	68924956	Y	TPCN2	NA	ORAOV1,CCND1,MYEOV	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	110396	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV,IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	1122	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	MYEOV,IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	248	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69089155	69089700	69089444	Y	MRGPRD	MYEOV,IFITM9P	CCND1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM9P	19881	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AP000439.3	109538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	40467	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	34276	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	69517228	69517437	69517319	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	FGF19	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	69639961	69640299	69640038	Y	NA	NA	FGF3	K562	ChIA-PET	22265404	FGF19	122551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69655407	69655781	69655522	Y	FGF19,FGF3	NA	ANO1	IMR90	Hi-C	24141950	FGF19	137997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	35162	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	34144	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	69894907	69895080	69894991	Y	ANO1	RP11-626H12.2,ANO1	ANO1,FADD,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	27328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	69927034	69927161	69927098	Y	ANO1	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	4626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	69969786	69970187	69969839	Y	NA	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	47378	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	70144122	70144421	70144277	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	29316	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr11	70575636	70576014	70576009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	333042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	71702677	71703050	71702869	Y	FOLR3,IL18BP,IL18BP	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	64930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	72348117	72348448	72348274	Y	NA	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	35187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	72808468	72808618	72808564	Y	NA	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	42688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	72906397	72906513	72906453	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT	IMR90,MCF7	Hi-C,3C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	P2RY2	20830	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	72909664	72909952	72909864	Y	RELT,RELT,P2RY2,P2RY2	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	P2RY2	17391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	74077556	74077917	74077717	Y	NA	PGM2L1	NA	NA	NA	NA	PGM2L1	29601	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	74540659	74541010	74540832	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	82746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	75537561	75537829	75537710	Y	ARRB1,DGAT2,UVRAG	UVRAG	NA	NA	NA	NA	UVRAG	13349	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	3522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	76898493	76898545	76898519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	122514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	78051007	78051295	78051151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	76099	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	78144030	78144327	78144179	Y	NA	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	16636	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	846126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr11	82918019	82918384	82918270	Y	PCF11,ANKRD42	ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-727A23.1	3663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	282552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	85520282	85520495	85520394	Y	SYTL2,SYTL2,SYTL2	SYTL2,AP000974.1	NA	NA	NA	NA	SYTL2	98	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	86262463	86262643	86262563	Y	FZD4	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	119035	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	86355497	86355659	86355578	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	26019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86399785	86399941	86399864	Y	NA	ME3	ME3,PRSS23	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	18107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86430919	86431170	86431045	Y	PRSS23	ME3	PRSS23,ME3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ME3	49241	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	86433528	86433764	86433646	Y	NA	NA	PRSS23,ME3	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	51850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86447030	86447398	86447213	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	52703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	86514780	86515120	86515008	Y	NA	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	14679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86620154	86620414	86620285	Y	NA	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	44019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86627337	86627645	86627491	Y	FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	36788	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4,RP11-736K20.6	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	86841159	86841223	86841164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	94273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	88089076	88089366	88089232	Y	NA	CTSC	CTSC	K562	ChIA-PET	22265404	CTSC	20121	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	95745158	95745721	95745455	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	88679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	95995362	95995593	95995538	Y	FAM76B,MAML2	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	78751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	96001743	96002080	96001866	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	72264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	100547720	100547959	100547794	Y	ARHGAP42	ARHGAP42	ARHGAP42	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP42	8425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	100590591	100590889	100590693	Y	NA	ARHGAP42	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	34207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	100596808	100596968	100596888	Y	NA	ARHGAP42	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	40424	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	102175501	102175731	102175600	Y	BIRC2	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC3	10484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	102176886	102177264	102177169	Y	NA	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2,BIRC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	8951	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	102189714	102190108	102189945	Y	BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3499	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	102191573	102191697	102191574	Y	NA	BIRC3,BIRC2	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC3	5358	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	102915030	102915337	102915161	Y	NA	DCUN1D5	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	45607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	104565898	104566071	104565977	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CASP4	272092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	108487361	108487672	108487557	Y	EXPH5	EXPH5,DDX10	NPAT,EXPH5,ATM	IMR90	Hi-C	24141950	EXPH5	24896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	108679072	108679281	108679081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	145320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	109957593	109958086	109957862	Y	FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZC3H12C	4001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	109958650	109959379	109958908	Y	NA	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	2708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	110002516	110002895	110002708	Y	RDX	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	40429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	111244804	111244862	111244833	Y	POU2AF1	NA	NA	NA	NA	NA	SIK2	226253	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	111853928	111854208	111854100	Y	NA	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	39330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	112016607	112016779	112016693	Y	DIXDC1	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	16061	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	112031842	112032080	112031914	Y	IL18,BCO2	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	113828537	113828676	113828607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	84245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	114033536	114034161	114033636	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	92348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	115636671	115636982	115636754	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	1004722	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	116864339	116864649	116864442	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	SIK3	102504	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	116867531	116867975	116867966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIK3	99178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3,MPZL2	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	118755477	118755626	118755517	Y	ATP5L,MLL,ARCN1,DDX6,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	23791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	118763139	118763505	118763387	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	15912	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.88689720536085
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	118785112	118785368	118785332	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	5695	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	119461410	119461749	119461531	Y	CBL	KRT8P7	LOC100499227,USP2,PVRL1,TRIM29,GRIK4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	11269	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	119590581	119590962	119590870	Y	NA	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	6832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	119615995	119616274	119616135	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	18201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	120083069	120083545	120083438	Y	GRIK4,ARHGEF12,OAF	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	3594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	120089762	120089841	120089801	Y	NA	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	10287	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	120302835	120303154	120303088	Y	OAF,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF12	97048	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	121335104	121335660	121335286	Y	SORL1	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	14192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	122527331	122527938	122527906	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	2948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	122587982	122588633	122588143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	63599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	122596029	122596361	122596043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	71646	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	122608190	122608588	122608260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	83807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	123345048	123345386	123345163	Y	NA	LINC01059	CLMP,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	21942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	123415728	123416106	123415962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01059	92622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN,RP11-677M14.2,VSIG2,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	8703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	126799997	126800007	126800001	Y	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL3	71348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	126838913	126839134	126839118	Y	KIRREL3	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	KIRREL3	32221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128078462	128078679	128078487	Y	NA	NA	FLI1,ETS1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	376774	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128204456	128204853	128204574	Y	NA	NA	FLI1,ETS1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	250600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128291574	128291714	128291646	Y	NA	NA	ETS1,FLI1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	163739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	128323342	128323695	128323510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	131758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128335578	128335794	128335665	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	119659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128341167	128341527	128341350	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128341794	128342415	128342241	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113038	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128348079	128348401	128348240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	107052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128352415	128352744	128352497	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	102709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128363188	128363283	128363236	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	92170	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128373673	128373898	128373813	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	81555	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128374504	128374665	128374585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	80788	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	128382635	128382833	128382761	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	72620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	35899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128422991	128423282	128423121	Y	ETS1	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	32171	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128523824	128524174	128523997	Y	NA	NA	KCNJ1,ETS1,LOC100507392,FLI1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	68371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129102482	129102753	129102618	Y	NA	ARHGAP32	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	44466	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129267460	129267723	129267619	Y	BARX2	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	23625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	32715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129781322	129781453	129781412	Y	APLP2	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	17837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129912030	129912233	129912119	Y	PRDM10,APLP2	PRDM10,TCEB2P2,APLP2	PRDM10,LINC00167,APLP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCEB2P2	10915	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129942098	129942391	129942179	Y	PRDM10	TCEB2P2,APLP2	NA	NA	NA	NA	APLP2	4366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	129993921	129994394	129994167	Y	PRDM10,APLP2	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	33063	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	130016455	130016576	130016492	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	10881	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	130036262	130036668	130036368	Y	PRDM10	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	8805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	130505078	130505260	130505180	Y	NA	NA	ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	188209	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	130506997	130507161	130507118	Y	NA	NA	ADAMTS15,ADAMTS8	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	190128	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	131759058	131759559	131759199	Y	NA	AP004372.1	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	5443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr11	131942118	131942474	131942248	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	177116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	132940132	132940357	132940242	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	884523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr11	133814977	133815479	133815368	Y	NCAPD3,IGSF9B	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	9401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr11	134509789	134510106	134509920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLB1L2	310021	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	1925056	1925234	1925157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	59879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	3239416	3239801	3239467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	54895	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	3313495	3313728	3313584	Y	NRIP2	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	5368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	3563518	3563854	3563701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	244422	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	4115951	4116335	4116221	Y	NA	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	135343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	4120809	4121079	4120983	Y	NA	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	140201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	4396260	4396408	4396285	Y	NA	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	31963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	5198025	5198415	5198167	Y	NA	NA	NTF3,KCNA6,ANO2,VWF	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA9	441764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	5915509	5915755	5915702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	391126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	4.54905014178074
chr12	5918139	5918518	5918331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	388363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	6187612	6187773	6187703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	119108	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	6276499	6276627	6276569	Y	VAMP1,TNFRSF1A	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	30254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	6278115	6278307	6278240	Y	TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	28574	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	5635	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	6622889	6622901	6622895	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	5501	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	6663248	6663743	6663420	Y	GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1	SCARNA10,GAPDH,NOP2	NA	NA	NA	NA	NOP2	12114	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	7040569	7040832	7040702	Y	NA	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	8943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2,C3AR1	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	9228740	9228924	9228916	Y	NA	A2M	NA	NA	NA	NA	A2M	37901	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	9758228	9758343	9758285	Y	KLRF2,KLRF1,KLRB1	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	40262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	9797730	9798098	9797800	Y	NA	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	507	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	9803369	9803672	9803507	Y	KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	4764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	9982493	9982805	9982658	Y	KLRB1,CD69,KLRD1,KLRD1,KLRF1	NA	NA	NA	NA	NA	CD69	70996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD69	75086	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	10514396	10514426	10514411	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	28	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	10794413	10794704	10794528	Y	NA	MAGOHB,STYK1	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	30191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	10824879	10825003	10824941	Y	NA	NA	MAGOHB,KLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	STYK1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	11648641	11648718	11648680	Y	NA	NA	BCL2L14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-434C1.1	50246	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	11898142	11898564	11898233	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	97354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	11915588	11916131	11915796	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	114800	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	11976145	11976420	11976223	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	175357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12038206	12038369	12038301	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	162409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	88880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr12	12162075	12162513	12162342	Y	ETV6,LOH12CR1,BCL2L14	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	38265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	12164191	12164556	12164498	Y	NA	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	36222	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12164636	12164912	12164798	Y	NA	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	35866	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	12185852	12185959	12185898	Y	ETV6,BCL2L14	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL2L14	14819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	12504083	12504386	12504252	Y	BCL2L14,MANSC1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	MANSC1	2608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12602381	12602995	12602706	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	94368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12609505	12609975	12609758	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	101492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	APOLD1	3838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	12991466	12991515	12991491	Y	NA	DDX47,RPL13AP20	NA	NA	NA	NA	DDX47	27216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	21.2580612394754
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	13050548	13050563	13050554	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	8832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6,GPRC5D	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	13247337	13247745	13247512	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	52119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	13277970	13278212	13278173	Y	EMP1	NA	EMP1,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	69438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	13292095	13292429	13292230	Y	NA	NA	EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	55221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	13320198	13320450	13320349	Y	NA	EMP1	APOLD1,HTR7P1,EMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	27200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	13325962	13326157	13326075	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	21493	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	13326583	13326856	13326645	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	20794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr12	13331850	13332340	13332007	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	15310	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	13332644	13332915	13332868	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	14735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	13347729	13348002	13347866	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	79	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	13376628	13377027	13376828	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	13403402	13403764	13403583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	55752	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	15121554	15121691	15121623	Y	NA	ERP27,ARHGDIB	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	8892	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	19343816	19343915	19343891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	63168	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	808173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	20959036	20959191	20959158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	629358	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	31.5809057919778
chr12	21059259	21059529	21059394	Y	SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	529020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	21162401	21162431	21162416	Y	SLCO1B3,SLCO1B1,LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	426118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	23746822	23747228	23747075	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	970813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	23804787	23805114	23804951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	1028778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	25104673	25105123	25105029	Y	BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	4280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	SSPN	5113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	NA	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	149944	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	27497251	27497478	27497364	Y	MED21,ARNTL2	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	13464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	27613510	27613909	27613776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	60455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	164064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	28127967	28128359	28128243	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	155823	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	28176067	28176342	28176190	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	107840	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	104297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	30570849	30571198	30571024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO8	275722	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	45033	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	31524246	31524432	31524371	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	46254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B	70000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	33044985	33045279	33045082	Y	NA	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	2495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	33072560	33072656	33072597	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	24786	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	39816699	39816988	39816844	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	18204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	42734111	42734478	42734288	Y	NA	ZCRB1	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	16191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	43699836	43700036	43699910	Y	NA	NA	PRICKLE1,PPHLN1,ZCRB1	IMR90	Hi-C	24141950	PUS7L	450584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	44936022	44936417	44936038	Y	NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	ANO6	671353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46867492	46867759	46867536	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	92030	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46902978	46903383	46903115	Y	NA	NA	SLC38A2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-96H19.1	127516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	10.2353628190067
chr12	47053760	47053887	47053821	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	278298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	5.59883094373014
chr12	47606052	47606349	47606300	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	134318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	198714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	47671815	47672221	47672059	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	200081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	48227481	48227636	48227559	Y	OR10AD1	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	2566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	48294417	48294695	48294497	Y	OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	40136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,RHEBL1,DHH,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	8956	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	49678404	49678529	49678467	Y	NA	TROAP	NA	NA	NA	NA	TROAP	36490	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	NA	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RACGAP1	85140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	50860078	50860266	50860172	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	36502	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	50926707	50927114	50926974	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	29939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	4.7240136087723
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	52571070	52571435	52571234	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12349	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	52580785	52580889	52580797	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	2895	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	52583620	52584080	52583828	Y	NA	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	52588987	52589174	52589068	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	5203	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	52609215	52609817	52609526	Y	NA	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT7	14487	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	52624014	52624394	52624158	Y	KRT7	KRT80,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT7	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	52624687	52625139	52624914	Y	KRT7	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT7	383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	52835077	52835369	52835228	Y	NA	KRT6A	KRT75	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT6A	49672	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	53229830	53230092	53229928	Y	PFDN5	KRT4	NA	NA	NA	NA	KRT4	23495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT4	66934	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	54072437	54072838	54072741	Y	CSAD,MAP3K12,ATF7,ATF7,ATP5G2,CALCOCO1	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	3245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	54145140	54145515	54145243	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	25611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	SNORD81	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD81	15886	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	55806634	55807051	55806823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	266279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264891	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	56474601	56474862	56474633	Y	SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3	RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1	NA	NA	NA	NA	ERBB3	2960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	56876109	56876291	56876201	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	3907	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	56914338	56914532	56914358	Y	NA	GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	RBMS2	625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	7.96083774811629
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	57557421	57557508	57557464	Y	NA	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	33499	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	62680768	62680820	62680794	Y	NA	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	28649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	64401221	64401399	64401310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	165148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	64575299	64575468	64575384	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	38608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	65005842	65006280	65005896	Y	GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	3549	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	111271	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	65888975	65889352	65889198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-221N13.3	105297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	65930655	65931175	65930934	Y	HMGA2	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	63474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	66025227	66025796	66025503	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	30578	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66027921	66028196	66028033	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	33272	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	48150	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	66050559	66051086	66050841	Y	LEMD3	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	55910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66089335	66089636	66089544	Y	IRAK3	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	94686	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	66136008	66136292	66136116	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	79619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	66216365	66216749	66216512	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	HMGA2	454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	19179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	23936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	RP11-366L20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	28920	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	66314249	66314458	66314355	Y	NA	RP11-366L20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	25801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66319590	66319707	66319630	Y	IRAK3	RP11-366L20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	20552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3	NA	NA	NA	NA	IRAK3	47633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	68314351	68314796	68314502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK2	274233	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr12	68382478	68382691	68382628	Y	IL22	NA	NA	NA	NA	NA	MDM1	341470	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	68752517	68752875	68752786	Y	NA	MDM1	RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	28356	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.66215293641988
chr12	69200663	69200867	69200763	Y	CPSF6,CPM,CPM,MDM1,RAP1B,NUP107,SLC35E3,MDM2	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	707	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	69724869	69725108	69724964	Y	LYZ	LYZ,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	15013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	71040722	71040853	71040780	Y	CNOT2,CNOT2,CNOT2,PTPRB	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMB4	282666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	71055637	71055848	71055742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMB4	297581	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	13357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-114H23.1	155843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-114H23.1	37148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	76345818	76345948	76345927	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	29847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	27634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	76353921	76354019	76353970	Y	NA	RP11-114H23.1	KRR1,PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-114H23.1	21776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	76364239	76364345	76364266	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	11450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	3668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-114H23.1	104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	76429051	76429248	76429150	Y	NA	PHLDA1,NAP1L1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	3339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	77426192	77426447	77426357	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	30913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.53697027137772
chr12	78544842	78545234	78545038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	322157	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	79941021	79941361	79941199	Y	PAWR	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	141516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	NA	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	139240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	81980877	81981126	81980998	Y	PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	769458	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	87657900	87657914	87657909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	767709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	89628967	89629343	89629087	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,LOC728084,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	115705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	89740427	89740813	89740638	Y	POC1B,ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	4235	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4,POC1B-GALNT4	60306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	90127113	90127954	90127635	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	26036	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	92517420	92517830	92517671	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	19519	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	92637830	92638067	92637978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	100157	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	92987343	92988147	92987837	Y	EEA1,BTG1	NA	DCN,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf74	106472	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	95037595	95038737	95038539	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	3601	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	95043067	95043319	95043087	Y	TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	729	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	95597894	95598075	95597980	Y	NA	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	11183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	96664847	96665248	96665048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	78687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	96685157	96685428	96685293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	98997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	96794959	96795305	96795211	Y	CDK17	CDK17,RN7SKP11	NA	NA	NA	NA	CDK17	2621	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	19948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	97205009	97205147	97205078	Y	NA	NA	NEDD1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD1	93854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	100970454	100970954	100970686	Y	NA	GAS2L3	NA	NA	NA	NA	RP11-575G13.2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	104193580	104193857	104193839	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	39118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	1011	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	104791559	104791875	104791716	Y	TXNRD1	NA	CHST11,SLC41A2,C12orf45	IMR90	Hi-C	24141950	CHST11	55198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	104912129	104912512	104912321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	65056	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	104974037	104974383	104974060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	126964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	105030278	105030644	105030428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	183205	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	105035767	105036007	105035871	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	188694	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	105038686	105039023	105038871	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	191613	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	105066347	105066673	105066397	Y	TXNRD1,TXNRD1,EID3,CHST11,SLC41A2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	219274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	105076733	105077008	105076882	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	229660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	106316355	106316701	106316396	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90	Hi-C	24141950	NUAK1	215110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUAK1	203335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	108699402	108699607	108699511	Y	CORO1C,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	FICD	207355	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	109030971	109031245	109031128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	76613	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG	NA	NA	NA	NA	UNG	37197	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	109899131	109899209	109899162	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	13998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr12	111866764	111867021	111866784	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	25012	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	111870317	111870607	111870392	Y	NA	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	28565	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	113908135	113908376	113908300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDSL	50093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	115103963	115104215	115104201	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	15754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	116530359	116530538	116530483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	182605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	158897	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	180351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	116990477	116990812	116990735	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf49	183063	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	118745418	118745709	118745623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAOK3	63041	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	120141173	120141195	120141185	Y	NA	PRKAB1	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	37615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	120803895	120804280	120803957	Y	NA	RPS27P25	NA	NA	NA	NA	RPS27P25	963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	122224293	122224471	122224351	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	122229588	122230472	122229850	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	8837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.18704333739458
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr12	124716985	124717336	124717220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	261197	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	262123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	124721310	124721532	124721425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	265522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr12	124926088	124926324	124926239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	124926476	124926613	124926576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr12	124937911	124938596	124938282	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	111539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	46301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	125197556	125198099	125197767	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	147421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr12	125332280	125332520	125332389	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	32694	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	125405622	125405939	125405923	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	5708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	AC079949.1	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	37812	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	127715364	127715787	127715548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	66692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	127770941	127771084	127771022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	122269	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	129325536	129325762	129325610	Y	SLC15A4	SLC15A4	SLC15A4	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC15A4	19008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	130610556	130610854	130610701	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662M24.2	587972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662M24.2	373844	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr12	132861217	132861370	132861294	Y	P2RX2,GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-977J11.2	188977	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	132903795	132904258	132904060	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	159879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	159436	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	33720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	20694627	20695029	20694906	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	38159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	21653965	21654176	21654071	Y	LATS2	LATS2	LATS2,SAP18	IMR90	Hi-C	24141950	LATS2	20279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	22009901	22010336	22010211	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	21173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	NA	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	66738	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	25691354	25691814	25691656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSP1	101813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	26551633	26551678	26551661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	243113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	27843033	27843378	27843206	Y	NA	RPL21,SNORD102,RASL11A	NA	NA	NA	NA	RASL11A	569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	28010544	28010826	28010685	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	11913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	29148829	29149214	29148994	Y	POMP	EIF4A1P7	FLT1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	21756	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	31314202	31314673	31314362	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	ALOX5AP	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	6557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	32212790	32213050	32212929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	205928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr13	32433681	32434084	32433895	Y	NA	EEF1DP3	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	14703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr13	34730516	34730744	34730573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	340330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	36501740	36502135	36501882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	201308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	38275506	38275878	38275580	Y	TRPC4	NA	NA	NA	NA	NA	POSTN	104525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	38740377	38740756	38740564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFM1	181230	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	40139698	40140018	40139948	Y	NA	LHFP	NA	NA	NA	NA	LHFP	35647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	40690248	40690533	40690364	Y	NA	NA	FOXO1	IMR90	Hi-C	24141950	COG6	462484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	41078224	41078580	41078410	Y	NA	NA	FOXO1,TTL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FOXO1	160154	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	41226066	41226446	41226348	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	12288	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	41586512	41586699	41586606	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	46711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	41589057	41589218	41589148	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	44192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	42534426	42534531	42534479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	309758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr13	44842198	44842383	44842274	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	103418	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	69999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	64710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr13	44884974	44885381	44885134	Y	CCDC122,TSC22D1	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	60420	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	58402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	44978399	44978598	44978577	Y	NA	SERP2	NA	NA	NA	NA	SERP2	32598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	45338378	45338728	45338554	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	189095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	51243019	51243169	51243094	Y	NA	NA	DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	238645	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	52393359	52393648	52393503	Y	INTS6,WDFY2,DHRS12,DHRS12	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	RP11-327P2.5	16926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	52956042	52956135	52956089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS36	66628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	53775107	53775689	53775457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	550263	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	53814883	53815070	53814977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	590039	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	60033102	60033487	60033176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	702634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	66687218	66687393	66687306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	5559806	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	67722025	67722418	67722226	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	4524781	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	72996613	72996915	72996766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	278916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	75939887	75940324	75940051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	113926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	76289938	76289995	76289967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	97368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	76336754	76337033	76336914	Y	COMMD6,LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	144184	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	77453598	77454010	77453765	Y	FBXL3,KCTD12	KCTD12	NA	NA	NA	NA	KCTD12	4530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	77599424	77599520	77599503	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3	NA	NA	NA	NA	FBXL3	94	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	77898193	77898346	77898226	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	77899332	77899971	77899636	Y	KCTD12,FBXL3,MYCBP2	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	81824429	81824558	81824494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	911343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	87776313	87776722	87776395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	544792	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	88259012	88259340	88259160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	62174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	88345046	88345403	88345227	Y	NA	MIR4500HG	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	23532	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	88383188	88383252	88383222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	61674	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	63078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	93495866	93496249	93496058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	380846	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	95948975	95948980	95948978	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	2707	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	96243281	96243667	96243475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3-AS1	83512	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	97551237	97551357	97551323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	320331	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr13	99130571	99130717	99130631	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	97477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	99135278	99135706	99135580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	92488	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	99223213	99223429	99223417	Y	STK24	STK24	NA	NA	NA	NA	STK24	4765	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr13	99403586	99403810	99403698	Y	SLC15A1	SLC15A1	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	678	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	99644715	99645037	99644840	Y	DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	91842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	99737310	99737596	99737454	Y	DOCK9	DOCK9	NA	NA	NA	NA	DOCK9	431	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	84816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	99950103	99950501	99950500	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	99075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	100008605	100009044	100008755	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	142627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	101820185	101820500	101820343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	246343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	102867161	102867537	102867349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	379816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	103752669	103752951	103752813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	257475	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	106803810	106804031	106803901	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	222880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	107001723	107002064	107002003	Y	NA	LINC00460	NA	NA	NA	NA	LINC00460	24847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	107070030	107070366	107070265	Y	NA	LINC00460	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	43119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	107124360	107124455	107124408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	94057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	108407171	108407488	108407466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	109595	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	109115794	109116062	109115942	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD13	247067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	109806235	109806377	109806339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	599238	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	597640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	596578	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	52916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	110390802	110390941	110390862	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	14674	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	110521819	110522258	110522077	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	84904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr13	110522374	110522680	110522537	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	85459	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	110631754	110631774	110631764	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	194839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	227615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	110780432	110780795	110780703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	343517	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	110995670	110995825	110995748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB20	216255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	111212014	111212166	111212090	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	NA	COL4A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB20	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr13	111568618	111569036	111568957	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	3202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	111594578	111594832	111594693	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ANKRD10,ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	29162	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	111609846	111610157	111610005	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	44430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr13	111623981	111624100	111624039	Y	ING1,C13orf16	NA	ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	58565	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	111659256	111659421	111659366	Y	NA	NA	ANKRD10,ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	93840	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	111695990	111696309	111696026	Y	NA	NA	ING1,ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	68597	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr13	113373357	113373630	113373494	Y	ATP11A	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	30714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr13	114611317	114611637	114611421	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	46271	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	22736761	22737207	22736959	Y	NA	NA	OXA1L,SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAV18	267416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	23158454	23158656	23158578	Y	SLC7A7	CTD-2555K7.1	DAD1,OXA1L,SLC7A7,ABHD4,REM2,LRP10	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2555K7.1	3088	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC7A7	2462	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	25476676	25476861	25476696	Y	NA	STXBP6	NA	NA	NA	NA	STXBP6	40642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	COCH	NA	NA	NA	NA	COCH	18583	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	35120187	35120582	35120411	Y	SNX6,SNX6	SNX6	SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C	IMR90	Hi-C	24141950	SNX6	22798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	35625298	35625573	35625393	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	35543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	35825324	35825456	35825405	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-561B11.1	30819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	35839188	35839529	35839227	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NFKBIA	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-561B11.1	16746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	36073737	36073816	36073791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	201782	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	39637578	39637824	39637713	Y	NA	PNN	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6B	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	39664073	39664414	39664121	Y	SIP1,PNN	TRAPPC6B,PNN,MIA2	NA	NA	NA	NA	PNN	21686	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	MIA2,CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	39890491	39890736	39890687	Y	NA	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	8968	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	45160440	45160781	45160566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	203717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	45505148	45505421	45505276	Y	NA	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	4104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	49979013	49979291	49979168	Y	C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	72006	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	C14orf182	NA	NA	NA	NA	C14orf182	32371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	3392	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	22550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	50562564	50562863	50562716	Y	RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	56617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	51074312	51074388	51074350	Y	TRIM9,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	48468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	51136928	51137372	51137340	Y	NA	SAV1	NA	NA	NA	NA	SAV1	3879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.01207987040302
chr14	51142431	51142560	51142495	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,CDKL1,NIN,PYGL	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	9382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	3789	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	52064245	52064576	52064411	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	110427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	52372298	52373220	52372436	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	80973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NA	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	93107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER2	156301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	53392802	53392977	53392890	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	24176	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	150295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55035984	55036343	55036300	Y	SAMD4A	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	4169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55094268	55094954	55094583	Y	GMFB,MAPK1IP1L,GCH1	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	62453	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55115744	55116109	55115959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	83929	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	55116749	55117607	55117330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	84934	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55120784	55121076	55120951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	88969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55173516	55173842	55173679	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	141701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	55544097	55544118	55544108	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27748	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr14	55569033	55569319	55569207	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	19509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.27452507089037
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55589903	55590059	55589993	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	1075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	58283600	58283763	58283750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	322234	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	58449709	58450271	58450031	Y	NA	NA	C14orf37	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P3	155726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr14	58637905	58638297	58638125	Y	NA	UBA52P3,ACTR10	NA	NA	NA	NA	ACTR10	26501	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACT1	96247	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	59130535	59130927	59130732	Y	NA	DACT1	NA	NA	NA	NA	DACT1	31850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	59216036	59216189	59216096	Y	ARID4A	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	43183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	59565112	59565514	59565267	Y	NA	NA	KIAA0586,DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	DAAM1	87850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR135	68787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	GPR135,JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	60629133	60629293	60629144	Y	NA	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	5281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	61188472	61188761	61188676	Y	PPM1A	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	95883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	61946614	61946719	61946667	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	88539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	61948602	61948733	61948613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	86525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	65145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	2262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	62052395	62052634	62052478	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	17137	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	62058743	62058958	62058799	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	23485	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	62219407	62219640	62219496	Y	HIF1A,SNAPC1	RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS2	3592	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	62636657	62636665	62636660	Y	SYT16	NA	RHOJ,KCNH5,GPHB5	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	339570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	63829601	63829975	63829789	Y	WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	178117	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr14	64584533	64584935	64584736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	266850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	64705009	64705329	64705170	Y	PLEKHG3,SYNE2	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1	147420	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	65115289	65115345	65115316	Y	NA	NA	ZBTB25,ZBTB1,SPTB,PLEKHG3,CHURC1-FNTB,MTHFD1,PPP1R36,HSPA2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG3	53475	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr14	65224783	65224915	65224850	Y	ZBTB1,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	55963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	65229015	65229197	65229106	Y	SPTB,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	65231601	65231863	65231701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	62781	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	CTD-2509G16.2	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	35052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	67562927	67563276	67562937	Y	TMEM229B,PLEKHH1	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	142550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	67728313	67728625	67728469	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	22487	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	68658646	68658820	68658748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	228093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	68677466	68677903	68677626	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	209010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	68925660	68925982	68925837	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	38747	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	68933312	68933746	68933512	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	46399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	68961774	68962026	68961864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	74861	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	79261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	78448	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr14	69065409	69066172	69065453	Y	ZFP36L1	CTD-2325P2.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	26990	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr14	69162018	69162337	69162187	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	11736	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	69162598	69162770	69162709	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	12316	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr14	69211654	69211802	69211728	Y	NA	ZFP36L1	RAD51B,ZFP36L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	49388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	69247587	69247770	69247677	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	13420	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	69252204	69252483	69252314	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	8707	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	69544472	69544808	69544638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF5	73059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	70152055	70152259	70152141	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	39358	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	70447892	70448065	70447949	Y	SMOC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	129044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	145817	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	147136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	RP6-65G23.1	NA	NA	NA	NA	RP6-65G23.1	1119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr14	71249264	71249522	71249393	Y	NA	MAP3K9,RP6-65G23.3	NA	NA	NA	NA	MAP3K9	24729	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	72050156	72050543	72050232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	263625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	72667667	72667865	72667766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	690944	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	73373247	73373392	73373372	Y	NA	DPF3,DCAF4,RP1-146I3.1	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPF3	14438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	103200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	73826978	73827275	73827127	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	101073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	74210197	74210586	74210513	Y	ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505	NA	NA	NA	NA	MIR4505	12864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	74220065	74220506	74220203	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505	NA	NA	NA	NA	MIR4505	2944	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	74220862	74221204	74221002	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505	NA	NA	NA	NA	MIR4505	2246	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	74224542	74224784	74224663	Y	NA	PNMA1,MIR4505	NA	NA	NA	NA	MIR4505	1092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	74238517	74238805	74238733	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	MIR4505	NA	NA	NA	NA	MIR4505	15067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	74741846	74742137	74741995	Y	FCF1	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	74981330	74981609	74981543	Y	NPC2	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	NPC2	22450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	43525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.6244520048735
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	LTBP2	36285	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	75086409	75086922	75086553	Y	PGF	LTBP2,CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	5059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	75087327	75087770	75087539	Y	PGF,EIF2B2,LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	5977	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	75607767	75608156	75607957	Y	FOS	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK9	15720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	75697272	75697400	75697329	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	26714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	76002139	76002648	76002337	Y	FOS,BATF	BATF,FLVCR2	NA	NA	NA	NA	BATF	15371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	76009076	76009592	76009288	Y	FOS,JDP2,BATF	BATF,FLVCR2	NA	NA	NA	NA	BATF	22308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	76032638	76033032	76032887	Y	FOS,BATF,FLVCR2	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	9928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	66642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	76564687	76564726	76564707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	117353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	NA	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BPL	61655	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	77639599	77639692	77639653	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	GSTZ1,POMT2	145535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	GSTZ1,POMT2	144949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	78031689	78031913	78031801	Y	SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	49203	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	78059840	78060228	78060134	Y	SNW1,SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	20888	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	81019191	81019257	81019224	Y	DIO2,CEP128	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	404604	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.36200680438615
chr14	88445167	88445328	88445280	Y	GPR65,GALC,GALC	GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	GALC	12681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	89935615	89935871	89935745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	147622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	90049518	90049848	90049714	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	33645	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	90875651	90876041	90875751	Y	NA	RPL21P11,CALM1	NA	NA	NA	NA	CALM1	14805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	91696123	91696361	91696283	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	171143	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	91716270	91716863	91716728	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	165325	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr14	91833483	91833974	91833648	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	48214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	91853544	91853834	91853633	Y	TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	28354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	92211789	92212017	92211903	Y	ATXN3,SMEK1	NA	NA	NA	NA	NA	SMEK1	236891	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	92938458	92938502	92938481	Y	NA	RIN3	RIN3	IMR90	Hi-C	24141950	RIN3	39616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	93114264	93114489	93114415	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	98558	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	93192576	93192808	93192662	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	20239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr14	93510584	93510744	93510686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	69921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr14	93569992	93570233	93570210	Y	KIAA1409,C14orf109,C14orf109	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	10432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	93635981	93636377	93636218	Y	NA	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	MOAP1	12896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	93698124	93698181	93698153	Y	NA	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	94811760	94811889	94811825	Y	NA	SERPINA6,SERPINA1	NA	NA	NA	NA	SERPINA6	24029	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr14	95596986	95597082	95597060	Y	NA	DICER1	NA	NA	NA	NA	DICER1	25265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	97685606	97685621	97685614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	423965	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	100045606	100045757	100045663	Y	CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	22606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	269	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	3288	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	100874667	100875097	100874987	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	WARS	33525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	101155057	101155401	101155388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	103307	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	107508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	403164	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	102001660	102001854	102001726	Y	PPP2R5C,PPP2R5C,DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1029J19.5	193591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-1029J19.5	18657	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	6569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.6244520048735
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	102971480	102971658	102971568	Y	NA	ANKRD9	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	2478	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANKRD9	19708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	103221108	103221258	103221164	Y	NA	TRAF3	NA	NA	NA	NA	TRAF3	20555	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	103272042	103272430	103272157	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	30229	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	103490121	103490395	103490347	Y	NA	CDC42BPB	NA	NA	NA	NA	CDC42BPB	31404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-736N17.8	1053	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	RP11-736N17.8,TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	103726827	103727460	103727139	Y	MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5	NA	EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	70421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	104009097	104009329	104009267	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	15576	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	104483678	104483886	104483733	Y	ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf2	91072	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	105198821	105199110	105199005	Y	C14orf180,ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	10298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105434041	105434308	105434245	Y	NA	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8386	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	105440243	105440515	105440379	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105500263	105500628	105500453	Y	NA	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	14778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	105500629	105500990	105500916	Y	CRIP1,GPR132	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	15144	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105533738	105533893	105533826	Y	NA	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	48253	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105536057	105536658	105536303	Y	CRIP1,GPR132	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA4	50572	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105541748	105541955	105541831	Y	CRIP1,PLD4,GPR132	NA	AHNAK2,GPR132	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	56263	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105546439	105546836	105546640	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	60954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105549558	105549976	105549724	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	64073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf80	1299302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	22897960	22898211	22898128	Y	CYFIP1,CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	7955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	25642287	25642724	25642425	Y	UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	39404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	26148464	26148705	26148613	Y	NA	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	40147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	29407243	29407640	29407337	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	152393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	30213334	30213722	30213356	Y	NA	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	45346	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	33123878	33123902	33123890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	218533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	257365	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	33299476	33299841	33299744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	394131	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	33494122	33494379	33494251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	588777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	34531616	34532056	34531745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	96205	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	34983371	34983524	34983448	Y	NA	NA	AQR,ZNF770	IMR90	Hi-C	24141950	GOLGA8B	104667	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	37175924	37176266	37175984	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	67264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	98737	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	39136416	39136749	39136509	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	280640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39175462	39175521	39175492	Y	NA	NA	FSIP1,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	308989	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	122333	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr15	39417556	39417775	39417675	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	66735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39425474	39425830	39425675	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	58680	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39447330	39447720	39447666	Y	NA	RP11-265N7.1	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	36790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39541225	39541623	39541385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-265N7.1	56715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39559141	39559459	39559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-265N7.1	74631	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39563210	39563560	39563357	Y	THBS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-265N7.1	78700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39683457	39683798	39683639	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	33598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39685855	39686105	39686012	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	31291	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	14904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39722195	39722553	39722498	Y	THBS1,C15orf54	RP11-624L4.1	C15orf53,FSIP1,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	4799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr15	39803650	39803776	39803696	Y	THBS1	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	67504	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	39921500	39921920	39921800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	50220	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	40077574	40077698	40077636	Y	NA	FSIP1	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	FSIP1	4543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	13095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	40339886	40340243	40340062	Y	PLCB2,BMF,BMF,BMF	SRP14	NA	NA	NA	NA	SRP14	10497	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	41219895	41220240	41219942	Y	NA	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	41788010	41788393	41788374	Y	NA	RPAP1	NA	NA	NA	NA	RPAP1	46074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	42226984	42227301	42227216	Y	LTK,MGA,JMJD7,VPS39,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	35475	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr15	42236399	42236774	42236695	Y	NA	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	26002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	42260184	42260317	42260307	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	2459	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	42699224	42699321	42699233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP23	82110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	42800654	42800904	42800762	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	19223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	43200953	43201247	43201100	Y	NA	TTBK2	NA	NA	NA	NA	TTBK2	9760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD5	53982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	8120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	9844	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	45754393	45754803	45754759	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	15768	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	45932818	45933115	45932936	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	11472	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	48311619	48311717	48311668	Y	NA	NA	SEMA6D,SLC12A1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	156997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	48388885	48389267	48389220	Y	SEMA6D,SLC24A5	NA	SEMA6D,SLC12A1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	79447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	48436189	48436527	48436248	Y	SLC24A5	MYEF2	NA	NA	NA	NA	MYEF2	32187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	49217829	49218211	49218108	Y	SHC4	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	49746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	50633863	50634132	50634006	Y	ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	11393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	50634288	50634665	50634477	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	10860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	52120789	52121195	52120954	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	CTD-2184D3.1,BCL2L10	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	55095328	55096039	55095750	Y	RAB27A,RSL24D1	NA	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	391226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	55559739	55560363	55560096	Y	RAB27A,PIGB	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	48795	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	156305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	56201661	56201754	56201731	Y	NEDD4	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	82190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	57798359	57798473	57798399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCOM1	83633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	57853638	57853874	57853726	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	28232	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	57857567	57857833	57857701	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	24273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	58732356	58732646	58732550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	307531	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	141759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	59023904	59024166	59024035	Y	RNF111	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	16011	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr15	59469464	59469853	59469728	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	59478138	59478489	59478268	Y	ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	82861	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	59862569	59862935	59862765	Y	NA	RP11-112N19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	19277	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	60699729	60699909	60699819	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	6647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	61520020	61520614	61520340	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	502	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	63486176	63486338	63486267	Y	LACTB,USP3,RAB8B	RPS27L,RAB8B	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	6508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr15	64000367	64000635	64000532	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	108579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	65148759	65148948	65148850	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	16671	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr15	65403116	65403434	65403296	Y	ANKDD1A,PDCD7	PDCD7	UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD7	20740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	65716164	65716565	65716475	Y	NA	IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	2754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.27452507089037
chr15	67378105	67378547	67378289	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	24004	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	67394592	67394967	67394687	Y	NA	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	SMAD3	40491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	37502	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	23518	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	67440032	67440420	67440131	Y	NA	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	2755	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	3398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	5070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	33898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	68993008	68993104	68993034	Y	CORO2B,CORO2B	NA	NA	NA	NA	NA	SPESP1	115456	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70006588	70006856	70006758	Y	TLE3	NA	C15orf50,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	263465	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70023380	70023641	70023505	Y	TLE3	NA	TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPLP1	280257	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70049728	70049802	70049765	Y	TLE3	NA	C15orf50,TLE3,LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	306605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70052375	70052953	70052736	Y	TLE3	NA	TLE3,LOC145837,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	309252	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	70641269	70641570	70641504	Y	TLE3	NA	TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	252754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70797214	70797333	70797235	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	256599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	70877631	70877741	70877691	Y	NA	NA	UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	176191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	71126164	71126470	71126369	Y	NA	LRRC49,LARP6	NA	NA	NA	NA	LRRC49	17108	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	71144876	71145062	71144944	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	378	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	71335765	71335967	71335867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	152641	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	71872548	71872837	71872596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	531762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	72448533	72448632	72448574	Y	TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A,GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	39494	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	72520083	72520441	72520217	Y	ARIH1,PKM2,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	31957	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	73926570	73926835	73926736	Y	PML	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	2095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	79798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	74464511	74464760	74464636	Y	CD276,LOXL1,PML,UBL7,UBL7,ISLR,ISLR	RP11-60L3.1,STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	28286	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr15	74693129	74693507	74693351	Y	SEMA7A,SEMA7A,ARID3B	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	31301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr15	74695295	74695591	74695423	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	29217	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	74720897	74721014	74720956	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A,UBL7	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	3794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	74722934	74723282	74723072	Y	CLK3,SEMA7A,SEMA7A,ARID3B	SEMA7A,UBL7	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	1526	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	74876114	74876298	74876206	Y	ULK3,CLK3	ARID3B,CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	12543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	74909072	74909376	74909224	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	20231	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	75402190	75402344	75402306	Y	PPCDC	NA	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	83640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	75460054	75460405	75460311	Y	NA	C15orf39	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	25579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA	NA	NA	NA	NA	ETFA	37307	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	77635534	77635848	77635691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	74638	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	77739736	77739821	77739778	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	28982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	78368268	78368362	78368315	Y	TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	79289232	79289594	79289505	Y	NA	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	49316	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	80149264	80149318	80149291	Y	ST20,ST20-MTHFS,ST20,MTHFS,MTHFS	MTHFS	NA	NA	NA	NA	MTHFS	38403	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	78588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr15	80880322	80880600	80880404	Y	ARNT2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	185630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	186521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	81082693	81083043	81082764	Y	KIAA1199	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	13009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	81219891	81220152	81220022	Y	STARD5	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	60067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	82398110	82398459	82398277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	61628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	80180	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	83992236	83992397	83992320	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	117466	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	HDGFRP3	173532	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2,EGLN1P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	85547085	85547484	85547285	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	25414	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	85628969	85629268	85629119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	107298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	85861581	85861931	85861753	Y	PDE8A,AKAP13	NA	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	59871	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	86088256	86088945	86088625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	166454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	89663203	89663358	89663281	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	14368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	90325168	90325324	90325249	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP	MESP1,ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	31309	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	90363996	90364798	90364610	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	7363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	90365179	90365539	90365285	Y	POLG,ZNF710,SEMA4B,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	8546	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	90371902	90372049	90371963	Y	ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	15269	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	90379956	90380186	90379992	Y	NA	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	23323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	90578178	90578635	90578479	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	35554	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1,TTLL13	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	CTD-3094K11.1	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	49218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	92489881	92490349	92490008	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	94956	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr15	93180228	93180540	93180295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	72437	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	ASB9P1,FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	93573195	93573591	93573395	Y	RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	148669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	93591014	93591138	93591077	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	166488	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	615688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96103160	96103444	96103266	Y	NA	NA	NR2F2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	763723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96807705	96807805	96807755	Y	NA	NA	LOC400456	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	59362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96884534	96884884	96884709	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	10044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96895727	96895870	96895799	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	766	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	96898438	96898666	96898552	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	2972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4721	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	98545444	98546413	98546248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	84660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	99559007	99559192	99559062	Y	NA	NA	PGPEP1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYNM	77228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	99992993	99993428	99993097	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	21942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	100651295	100651582	100651483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	379529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	100782475	100782658	100782574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASB7	358081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr15	101233795	101233911	101233855	Y	ASB7,ALDH1A3	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1,SELS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-66B24.5	20543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr15	101253659	101254026	101253922	Y	ALDH1A3	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-66B24.5	428	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-66B24.5	7401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr15	101462538	101462736	101462613	Y	NA	ALDH1A3,LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	5118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr15	101481026	101481320	101481182	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	23606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	124533	124922	124605	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	84	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	377235	377950	377755	Y	SOLH,RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	22723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	651803	652154	651979	Y	NA	PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	14446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	220754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	120859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	1696376	1696557	1696439	Y	NA	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	29700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	4456	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	ZG16B	7591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	2904626	2904661	2904644	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	1510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	3628962	3629267	3629135	Y	NA	SLX4	NA	NA	NA	NA	SLX4	30332	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	3996199	3996445	3996330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	67472	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	4063476	4063638	4063556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	100548	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	7700164	7700333	7700250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1013207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	8978616	8978978	8978797	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	17750	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	10953193	10953844	10953582	Y	EMP2	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	15211	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	10956294	10956664	10956435	Y	NUBP1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	12391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	11306642	11307050	11306835	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,SOCS1	RMI2,SOCS1	SOCS1,CLEC16A,RMI2,PRM3,PRM2,TNP2	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RMI2	34426	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	11473379	11473565	11473516	Y	ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,LITAF,CLEC16A,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS1	125343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	11705983	11706695	11706338	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	21542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	11707277	11708060	11707802	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	20177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	12224376	12224580	12224411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX29	155782	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	13530556	13530750	13530664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC4	481264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	14603035	14603210	14603110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	121375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	15576237	15576428	15576343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	50085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	23473263	23473545	23473445	Y	SCNN1G,GGA2	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	10762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	27542863	27543251	27543051	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	15983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.92459813690723
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	BCL7C	18052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	46753539	46753716	46753628	Y	NA	VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	ORC6	31984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	48645394	48646040	48645807	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	6019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	49056369	49056621	49056485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	404310	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	52785126	52785440	52785410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	97910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	55535734	55536073	55535896	Y	NA	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	4837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	57034523	57034824	57034736	Y	NLRC5	NLRC5	NA	NA	NA	NA	NLRC5	13126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	57338123	57338348	57338237	Y	NA	PLLP	NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A	IMR90	Hi-C	24141950	PLLP	21524	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	58766614	58766832	58766704	Y	NA	SLC38A7,GOT2	NA	NA	NA	NA	GOT2	353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	CDH5,LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	CDH5	17764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	66508767	66508904	66508846	Y	NA	BEAN1	NA	NA	NA	NA	BEAN1	49567	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	66555983	66556387	66556198	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	28060	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	CES3	4726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	67011641	67011860	67011695	Y	NA	FAM96B,CES2,CES3,CBFB	NA	NA	NA	NA	CES3	18501	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	67565199	67565482	67565398	Y	C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	14878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr16	68699559	68699790	68699677	Y	ESRP2	CDH3	NA	NA	NA	NA	CDH3	31467	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	68765918	68766309	68765994	Y	NA	CDH1	CDH3,CDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDH1	2819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.5746712029241
chr16	69819174	69819469	69819322	Y	NA	NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	24965	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	70444676	70444732	70444694	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	26408	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	70712649	70712861	70712739	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	5108	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	70749058	70749400	70749223	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	31089	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	70980057	70980287	70980181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	146993	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	73053285	73053647	73053466	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	37950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	73102477	73102709	73102578	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	10880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	74356396	74356719	74356558	Y	NA	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	27723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	75034413	75034614	75034514	Y	FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2342	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	CTRB1,BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	CTRB1,BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	77217218	77217275	77217245	Y	NA	MON1B,SYCE1L	NA	NA	NA	NA	MON1B	5457	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	80208286	80208441	80208438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	364190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	80838768	80839127	80839024	Y	CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	2542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	81434776	81434850	81434813	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	41925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	81491583	81491773	81491678	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	14808	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	81634791	81634955	81634874	Y	GAN	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	135747	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	84393830	84394115	84393945	Y	OSGIN1,CRISPLD2,COTL1	ATP2C2	ATP2C2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2C2	6018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	84523883	84523965	84523925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C2	123750	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	84636685	84637090	84636875	Y	ZDHHC7,KIAA0513,HSDL1,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	12593	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	84682643	84682972	84682859	Y	NA	COTL1,KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	2512	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	85608106	85608214	85608158	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	113465	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	85758517	85758802	85758746	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2,KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	23933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	85969764	85970393	85969905	Y	COX4I1,IRF8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568J23.1	121622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	165516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXL1	NA	NA	NA	NA	FOXL1	1525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	86664163	86664323	86664252	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	56189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90155	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	167147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	86795224	86795595	86795410	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	187250	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	356884	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	363255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	87843209	87843416	87843290	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	45611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	87888208	87888468	87888297	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	12626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr16	87901718	87902209	87902044	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	87904170	87904524	87904347	Y	FBXO31	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	3076	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	88450186	88450490	88450462	Y	NA	NA	CA5A,SLC7A5,BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	67235	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	88700249	88701257	88700631	Y	ACSF3,ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	14303	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr16	88836450	88836610	88836518	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	13009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr16	88839181	88839507	88839410	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	10112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	88848890	88849172	88848995	Y	CYBA,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	89323118	89323579	89323381	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	41000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	89382399	89382987	89382651	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	100281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	234794	234851	234823	Y	DOC2B	RPH3AL,C17orf97	RPH3AL,DOC2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPH3AL	749	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	773525	773702	773655	Y	RNMTL1	NA	NA	NA	NA	NA	GLOD4	89944	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr17	1521068	1521369	1521308	Y	CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	8811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	1926126	1926449	1926286	Y	NA	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	DPH1	4955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr17	1974774	1975359	1974921	Y	SCARF1,HIC1,HIC1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	19326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	2095819	2096093	2095903	Y	WDR81	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	108584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	2409124	2409453	2409310	Y	NA	METTL16	NA	NA	NA	NA	METTL16	3732	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	2863545	2863659	2863602	Y	OR3A2,OR1G1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	369041	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,INCA1,KIF1C	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	6655808	6656203	6655969	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	SLC13A5,XAF1	XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1	IMR90	Hi-C	24141950	XAF1	563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	6660646	6660876	6660666	Y	NA	SLC13A5,XAF1	NA	NA	NA	NA	XAF1	3880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13,SLC16A11	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	4.02415974080604
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	9549792	9549873	9549833	Y	NA	USP43	NA	NA	NA	NA	USP43	3777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	13249594	13249869	13249742	Y	HS3ST3A1	NA	HS3ST3B1,HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST3A1	253375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	13412933	13413137	13413069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	90107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	71821	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	14206578	14206754	14206653	Y	NA	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	4178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	14651633	14651936	14651698	Y	NA	RPS18P12	HS3ST3B1,HS3ST3A1,COX10	IMR90	Hi-C	24141950	RPS18P12	44782	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	15061931	15062018	15061975	Y	NA	NA	HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	PMP22	104625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	15790220	15790441	15790331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	55790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	15850564	15850918	15850801	Y	ADORA2B	ADORA2B,TTC19	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	4333	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	45443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	AC005822.1	NA	NA	NA	NA	AC005822.1	31407	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	16922074	16922240	16922157	Y	NA	TNFRSF13B,MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	21619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	17319893	17320013	17319952	Y	FLCN	RPL13P12	NA	NA	NA	NA	RPL13P12	34567	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	17677876	17678068	17678030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	60257	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	17766830	17766899	17766864	Y	LLGL1	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	28505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	18865012	18865259	18865128	Y	NA	FAM83G	NA	NA	NA	NA	FAM83G	40858	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27568035	27568215	27568131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	50921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	47040	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	28031718	28032050	28032008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIT1	112646	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	28041165	28041459	28041338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIT1	122093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	28690653	28690812	28690780	Y	SSH2,NSRP1,GOSR1,CPD,CPD	CPD	NSRP1,CPD,GOSR1,BLMH,TMIGD1,SLC6A4	IMR90	Hi-C	24141950	CPD	13111	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	42098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	29609076	29609437	29609257	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	29693	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	29717293	29717639	29717335	Y	OMG,RAB11FIP4	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	29816760	29817002	29816913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	100118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	29923737	29923924	29923895	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	207095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	30986703	30987068	30986886	Y	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	175066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	31159026	31159151	31159124	Y	NA	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	43044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	33349623	33350064	33349994	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL	LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	CCT6B	43526	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	33391990	33392005	33391998	Y	NA	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	22333	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34887	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	NA	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	MMP28	74896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	34227790	34227961	34227895	Y	SLFN12L,CCL5	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	21993	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	34948982	34949076	34949029	Y	DHRS11	DHRS11,MRM1	NA	NA	NA	NA	DHRS11	2754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	35208602	35208822	35208707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	95353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	35278050	35278157	35278104	Y	MRM1	AATF	LHX1,AATF	MCF7	ChIA-PET	22265404	AATF	26018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	36062721	36062883	36062777	Y	DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	40323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	36068867	36069181	36068997	Y	ACACA,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	34025	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	36102823	36103051	36102995	Y	ACACA,DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	155	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	36103612	36103841	36103732	Y	HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	36480536	36480738	36480637	Y	NA	MRPL45,SOCS7	NA	NA	NA	NA	SOCS7	25373	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	38374652	38374886	38374755	Y	KRT222,THRA,THRA,NR1D1,RARA,RAPGEFL1,WIPF2	RAPGEFL1,WIPF2	NA	NA	NA	NA	WIPF2	1096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	38440755	38440955	38440855	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	CDC6	930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	38466457	38466702	38466562	Y	IKZF3	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	3013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	38494956	38495329	38495143	Y	NA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	31512	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	38677736	38678132	38678052	Y	KRT24,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	21887	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	39110175	39110404	39110304	Y	KRTAP3-2	KRT23	NA	NA	NA	NA	KRT23	18289	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	39536188	39536609	39536415	Y	NA	KRT33B,KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	46	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	3372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	39802138	39802335	39802276	Y	NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	23044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr17	41162878	41163074	41162972	Y	TUBG1,CNTD1,NBR1,NBR1,ETV4	AARSD1,RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	IFI35	6136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	41428275	41428596	41428403	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	45731	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	41478754	41478975	41478864	Y	ARL4D	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	4427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	41546132	41546290	41546231	Y	NA	DHX8	LOC100130581,ARL4D,DHX8	IMR90	Hi-C	24141950	DHX8	12943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	41656262	41656390	41656311	Y	G6PC3	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	1274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.0995616038988
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	43084352	43084694	43084637	Y	NA	C1QL1,NMT1	NA	NA	NA	NA	C1QL1	40913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	43221862	43221955	43221890	Y	ACBD4,HEXIM1	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM1	729	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	43302645	43302970	43302880	Y	NA	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	5834	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	43389475	43389771	43389724	Y	FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14	MAP3K14	TEX34,LOC100133991	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	2643	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	43505725	43505980	43505806	Y	FMNL1,PLEKHM1,ARHGAP27	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	113311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	683428	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	598973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	44341762	44341942	44341850	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS7P11	455591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	44342171	44342447	44342244	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS7P11	455086	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.0995616038988
chr17	45317390	45317724	45317566	Y	TBKBP1	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	52602	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	45344750	45345107	45344929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	79962	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	45356357	45357027	45356891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	91569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP6,SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	46073519	46073818	46073669	Y	NA	PRR15L,CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP3	30343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	46291488	46291927	46291575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	112769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	46314423	46314444	46314434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	135704	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	46315130	46315301	46315294	Y	OSBPL7,CDK5RAP3,SKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	136411	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	46395351	46395518	46395501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP1	110119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	46583139	46583523	46583310	Y	SKAP1	HOXB2,HOXB-AS3	HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOXB2	37918	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6	NA	NA	NA	NA	HOXB-AS3	17282	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6	NA	NA	NA	NA	HOXB6	17949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6	NA	NA	NA	NA	HOXB6	17123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB6,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	47017432	47017466	47017449	Y	NA	ATP5G1,UBE2Z,SNF8	NA	NA	NA	NA	SNF8	3013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	47765495	47765594	47765536	Y	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	11899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	47913501	47913854	47913589	Y	TMEM92	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	42796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	48251038	48251269	48251124	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	25047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	48716691	48717083	48716761	Y	CHAD,SPAG9	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	49983117	49983475	49983437	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	647228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	53510591	53510934	53510743	Y	NA	MMD	MMD,TMEM100,PCTP	IMR90	Hi-C	24141950	MMD	13238	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	54864431	54864801	54864568	Y	TRIM25,SCPEP1	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	44659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	54997241	54997360	54997297	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	7842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	55101345	55101678	55101512	Y	NA	SCPEP1	NA	NA	NA	NA	SCPEP1	47879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	55434822	55435211	55435067	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	103610	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	55977135	55977456	55977362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	51718	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	56012688	56013140	56012704	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,SRSF1,CUEDC1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	17544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	56020686	56021039	56020762	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	9645	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	56705180	56705300	56705276	Y	NA	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4	K562	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	29366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	57837481	57837783	57837612	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	54494	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	77662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	60868052	60868313	60868162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165290	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	60872715	60872944	60872829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	169953	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561,ACE	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	61779769	61779866	61779823	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	3237	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	62072274	62072575	62072534	Y	NA	C17orf72,ICAM2	NA	NA	NA	NA	C17orf72	1136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr17	62487438	62487665	62487534	Y	ICAM2	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	3489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr17	62705157	62705447	62705234	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	48971	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	63179961	63180187	63180056	Y	NA	RGS9	NA	NA	NA	NA	RGS9	48412	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	63207974	63208314	63208101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	76425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	508381	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	64271821	64272172	64271887	Y	NA	PRKCA	PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCA	24582	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	64370414	64370595	64370515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	73660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	64432039	64432445	64432242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	135285	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	64690651	64690854	64690753	Y	PRKCA,CACNG4	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	268172	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	64695504	64695853	64695677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	263173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	64962057	64962755	64962345	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	3031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	64963064	64963179	64963122	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	4038	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	65525014	65525424	65525241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	153439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	66249573	66249956	66249626	Y	BPTF	AMZ2,ARSG	NA	NA	NA	NA	ARSG	3367	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	66284577	66285224	66284692	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	AMZ2,ARSG	NA	NA	NA	NA	ARSG	31254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	ARSG	69641	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	66380161	66380700	66380381	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	WIPI1	70954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	69068010	69068257	69068112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	546862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	70122851	70122907	70122879	Y	NA	SOX9	NA	NA	NA	NA	SOX9	7690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	179740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	70403681	70403886	70403813	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	187704	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	70407350	70407568	70407445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	191373	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	201238	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	70464411	70464702	70464656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	156668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	70499253	70499546	70499535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	121824	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	70585924	70586379	70586141	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	34991	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	72278744	72279201	72278906	Y	TMEM104,CD300LF,CD300LD,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A,TTYH2,TTYH2,DNAI2	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH2	71091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	CD300C	NA	NA	NA	NA	CD300C	25122	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	72728741	72729539	72729096	Y	KIF19,KCTD2,GRIN2C,FADS6,RAB37,RAB37,RAB37	CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	13252	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	72989354	72989561	72989458	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	7627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	73032786	73033119	73032977	Y	TSEN54,GGA3	ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5	NA	NA	NA	NA	KCTD2	6116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	73073656	73074040	73073685	Y	RAB37,RAB37,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	7782	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	73531533	73531826	73531590	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	12372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	73631575	73631992	73631838	Y	C17orf109	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	29204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr17	73734249	73734591	73734388	Y	GGA3,GRB2,GRB2,WBP2,UNC13D,ACOX1,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B	ITGB4,GALK1,UNK,H3F3B	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18841	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	74248222	74248574	74248373	Y	ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B	ATF4P3	RNF157	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF4P3	27335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74258854	74259227	74259062	Y	ST6GALNAC1	ATF4P3	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	37967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74444372	74444742	74444506	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	2546	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74496600	74496786	74496748	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	728	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	4.81149534226809
chr17	75124901	75125230	75125066	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	44103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	75134867	75135304	75135067	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	54069	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	75170939	75171192	75170955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	90141	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	75251434	75251777	75251766	Y	NA	NA	SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00338,SEC14L1	170636	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	198047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr17	75321712	75322201	75321955	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	240914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	75361925	75362048	75361987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	281127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	75468767	75469129	75469011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	387969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	76125814	76126042	76125869	Y	TNRC6C,PGS1,TMC6,TMC8,TMC6	TMC8,TMC6,SYNGR2	NA	NA	NA	NA	TMC6	446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	76247657	76247919	76247750	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6	BIRC5	NA	NA	NA	NA	BIRC5	39390	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	76330688	76331173	76330803	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	22985	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	76335027	76335218	76335120	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	18940	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	76529146	76529333	76529216	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	RN7SL454P	NA	NA	NA	NA	RN7SL454P	2009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	76643240	76643420	76643373	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	DNAH17,CYTH1	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SL454P	116103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	76912078	76912524	76912123	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	6945	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	77178893	77179196	77179046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	77788517	77788922	77788877	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	15035	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	77961931	77962339	77962251	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	45308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	78098181	78098723	78098426	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	20259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr17	78149249	78149503	78149364	Y	NA	EIF4A3	EIF4A3	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF4A3	30267	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr17	78431372	78431666	78431608	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,SLC26A11	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	44407	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	78735331	78735538	78735429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	218712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	78800697	78801105	78800867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	162293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr17	78962835	78962976	78962910	Y	NA	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	CHMP6	422	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr17	79024187	79024380	79024262	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	17239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79046413	79046604	79046526	Y	NA	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	39465	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	79123029	79123440	79123130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	71359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	79339701	79340108	79339894	Y	NA	TMEM105	SLC38A10,NPLOC4	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM105	37227	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	81612	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	27515	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80342594	80342740	80342634	Y	NA	TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	27471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr17	80805995	80806457	80806155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	98055	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	81066773	81067186	81066924	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31206	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr17	81150899	81151424	81151082	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	115332	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	323417	323617	323527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	57367	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr18	999057	999295	999176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	188510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	2653655	2653795	2653729	Y	NA	CBX3P2	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	7273554	7273981	7273852	Y	NA	NA	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRM	290799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	7460129	7460467	7460298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	104313	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	7512213	7512497	7512355	Y	NA	NA	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRM	52283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	8704091	8704364	8704199	Y	CCDC165	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	96648	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	8730480	8730718	8730581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	123037	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	9658069	9658457	9658201	Y	PPP4R1	PPP4R1,RAB31	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	44831	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr18	9758210	9758472	9758414	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	52048	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	9899069	9899359	9899167	Y	NA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	12640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	10950842	10951271	10951171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	426940	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	12679329	12679437	12679359	Y	NA	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2,CEP76	NA	NA	NA	NA	CEP76	21339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	19453532	19453543	19453538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	170614	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	19971591	19971926	19971755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA6	224187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	20131932	20132167	20132050	Y	NA	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	244057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	20492925	20493072	20492999	Y	NA	MIR4741	RBBP8	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4741	18240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	21002815	21003000	21002900	Y	RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8	TMEM241,RIOK3	NA	NA	NA	NA	TMEM241	12925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	21153994	21154335	21154180	Y	NA	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	10527	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	21173695	21174031	21173886	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	8833	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	21336252	21336608	21336275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	68845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	21415229	21415459	21415332	Y	C18orf8,NPC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	147822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	150248	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr18	21945811	21945986	21945899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPACT	58594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	22828001	22828237	22828119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPACT	823421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	23836366	23836416	23836389	Y	TAF4B	TAF4B	NA	NA	NA	NA	TAF4B	32466	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	25502058	25502147	25502103	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	253263	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	25695112	25695346	25695270	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	60064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	26741900	26742202	26742051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	986490	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	29599439	29599921	29599769	Y	RNF138,RNF138,TRAPPC8,RNF125	RNF125	NA	NA	NA	NA	RNF125	3104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	29665285	29665308	29665296	Y	TRAPPC8,RNF138	RNF138	NA	NA	NA	NA	RNF138	4510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	35024297	35024529	35024426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	617139	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	39520548	39520801	39520707	Y	NA	PIK3C3	PIK3C3	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3C3	12370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	43307603	43307620	43307613	Y	NA	SLC14A1	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	5511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr18	45353824	45354074	45353943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	101441	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	45529364	45529594	45529519	Y	NA	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	73849	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46317070	46317289	46317180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	157792	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46375185	46375303	46375244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	99778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46404939	46405048	46404994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	70033	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	46472885	46473143	46472966	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	1938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46473942	46474323	46474293	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.48718946942832
chr18	46582084	46582553	46582428	Y	SMAD7,DYM	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	107003	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	47216686	47217049	47216797	Y	NA	NA	MYO5B	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	121281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	47250062	47250416	47250239	Y	NA	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	87914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	47548085	47548102	47548094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	171361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	47626417	47626670	47626561	Y	MYO5B,MBD1,MBD1	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	92793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	51699489	51699550	51699520	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	49608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	53060777	53060994	53060923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	436038	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	54112700	54112877	54112794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR7	203697	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	54439234	54439547	54439439	Y	WDR7	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	122403	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	55474402	55474444	55474420	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP8B1	6069	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	55880754	55881007	55880894	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171155	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	56012421	56012506	56012466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	253357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	56096279	56096485	56096382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	169378	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	56337372	56337558	56337406	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	56571979	56572200	56572090	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	44147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	59996881	59997046	59996944	Y	KIAA1468,ZCCHC2	TNFRSF11A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11A	6361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	60118389	60118639	60118544	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	69601	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	60173605	60173906	60173662	Y	KIAA1468,ZCCHC2	ZCCHC2	ZCCHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZCCHC2	14334	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr18	60221448	60221638	60221488	Y	NA	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	33208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	61085026	61085396	61085214	Y	VPS4B	VPS4B	NA	NA	NA	NA	VPS4B	2320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	61549169	61549580	61549348	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2,SERPINB10	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	12243	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2,SERPINB10	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB10	11966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	61565801	61566233	61565950	Y	NA	SERPINB2,SERPINB10,HMSD	NA	NA	NA	NA	SERPINB10	3393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	64968652	64968919	64968666	Y	NA	NA	CCDC102B,TMX3	IMR90	Hi-C	24141950	DSEL	213298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	67158128	67158224	67158176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	712957	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	67616100	67616494	67616353	Y	CD226	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	254687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	71010965	71011298	71011132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	801802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	72208946	72209159	72209053	Y	FAM69C,CNDP1	CNDP2	NA	NA	NA	NA	CNDP2	47895	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	74162277	74162639	74162448	Y	ZNF516	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	42507	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74171783	74172228	74172071	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	32918	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74230733	74230810	74230772	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	ZNF516,LOC284276	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-17M16.1	25256	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74754529	74754928	74754700	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	88711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74773141	74773504	74773389	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	70135	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74775208	74775557	74775363	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	68082	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	63626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	34926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74818309	74818676	74818510	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	24963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	12830	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	5656	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	305438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	75598045	75598259	75598152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	754406	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	283297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr18	77245359	77245518	77245445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	192283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.48718946942832
chr19	342831	343179	342882	Y	MIER2	MIER2	NA	NA	NA	NA	MIER2	33	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	MIR4745	20717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26	NA	NA	NA	NA	STK11	2126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	ONECUT3	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ONECUT3	2822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	1755338	1755626	1755509	Y	NA	ONECUT3	NA	NA	NA	NA	ONECUT3	4966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	2627989	2628256	2628036	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A3	109894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	2770206	2770498	2770360	Y	DIRAS1,AES	SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554	NA	NA	NA	NA	SGTA	10871	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	3153392	3153939	3153476	Y	GNA15,FZR1	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	3177322	3177366	3177344	Y	AES,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	6195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	3562421	3562565	3562489	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	8210	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	4568924	4569300	4569153	Y	TICAM1,KDM4B,SEMA6B	PLIN5,LRG1,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	SEMA6B	11104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1,SEMA6B	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA6B	17468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	TICAM1,PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	5046594	5046918	5046679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	79469	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	5338459	5338816	5338637	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	62714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	5357360	5357663	5357512	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,KDM4B,SAFB2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL32P34	81615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	5435162	5435432	5435167	Y	NA	NA	KDM4B,PTPRS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL32P34	159417	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	5940860	5941142	5941001	Y	NA	FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3	NA	NA	NA	NA	CAPS	31142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	6067299	6067617	6067410	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	91146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	6092440	6092966	6092758	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	104617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr19	6801116	6801467	6801221	Y	SH2D3A,VAV1	SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	VAV1	30391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	7456079	7456435	7456169	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1564	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	7456481	7456588	7456536	Y	LRRC8E,ARHGEF18	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1411	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	7483723	7483869	7483787	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	25724	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	7525376	7525563	7525475	Y	NA	C19orf45,PEX11G	NA	NA	NA	NA	C19orf45	30299	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	7559450	7559827	7559455	Y	NA	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	9120594	9120838	9120762	Y	MUC16	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	30576	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	38916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	9748883	9749171	9749027	Y	OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	18808	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	10317020	10317257	10317138	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4	DNMT1	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR2	22691	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	10349944	10350302	10350123	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT1	9982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	10532501	10532989	10532676	Y	ICAM1,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	20287	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	10562469	10562629	10562543	Y	NA	KEAP1	NA	NA	NA	NA	KEAP1	49788	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	10829647	10829946	10829894	Y	ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	2892	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	10988040	10988081	10988060	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	7851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	11601973	11602308	11602059	Y	ZNF491,ZNF441	ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ZNF653	12430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	12131760	12131812	12131786	Y	NA	CTD-2006C1.2,ZNF433	NA	NA	NA	NA	ZNF433	12744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	3.23682413934399
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	12929124	12929310	12929217	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	MAST1	13455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	13095998	13096573	13096246	Y	ZNF490,ZNF791,TNPO2,TNPO2,MAST1	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	7849	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.92459813690723
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	13975574	13976059	13975671	Y	CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	38955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	14499980	14500202	14500091	Y	OR7A17,ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,CD97	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	CD97	10667	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	14895618	14895793	14895687	Y	CD97,DDX39A,PKN1,DNAJB1,EMR3,ZNF333,EMR2	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	5328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	15321082	15321623	15321224	Y	RASAL3	EPHX3	NA	NA	NA	NA	EPHX3	20623	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	15924857	15925192	15925108	Y	NA	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	12579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	15944737	15944873	15944829	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	6966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	16449243	16449463	16449304	Y	RAB8A,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	15615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	MAP1S	NA	NA	NA	NA	MAP1S	36681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	18154526	18154804	18154610	Y	IFI30	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	44585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	19248225	19248392	19248286	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	903	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	19973327	19973547	19973437	Y	NA	ZNF253,ZNF93	ZNF253	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF253	1148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	121713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	28219787	28220540	28220091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1481908	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	28244004	28244439	28244017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1458009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	28274249	28275061	28274473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1427387	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	30322162	30322300	30322231	Y	C19orf2,C19orf2,POP4,PLEKHF1,C19orf12	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	21357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	31618240	31618367	31618270	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	URI1	1205689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH1	98322	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	34071655	34071900	34071798	Y	NA	NA	CHST8,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	PEPD	60955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	34724001	34724111	34724046	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	19331	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	36437886	36438022	36437944	Y	GAPDHS,ETV2,WDR62	NFKBID,HCST,LRFN3,SDHAF1	NA	NA	NA	NA	LRFN3	13626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	38480533	38480757	38480643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	84665	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	38796841	38796867	38796854	Y	NA	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	4040	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39152764	39152958	39152839	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	16475	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39171828	39172087	39171896	Y	FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	35539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr19	39283371	39283483	39283427	Y	NA	ECH1	NA	NA	NA	NA	ECH1	37162	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39564346	39564568	39564426	Y	ZFP36,HNRNPL,NFKBIB	PAPL,PAK4	PAPL,SAMD4B,GMFG,LRFN1	IMR90	Hi-C	24141950	PAPL	7985	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39891902	39892845	39892340	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	2608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	39921308	39921946	39921495	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	2642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	41152132	41152466	41152220	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	42411	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	41802534	41802970	41802553	Y	B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	11124	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	41819266	41819494	41819482	Y	NA	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	5172	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42027706	42027846	42027786	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83084	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	19674	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42440101	42440390	42440246	Y	ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	21152	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	14970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42606774	42607144	42606983	Y	NA	ZNF574	NA	NA	NA	NA	ZNF574	36145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42618693	42618808	42618754	Y	NA	ZNF574	NA	NA	NA	NA	ZNF574	48064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	POU2F2,DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	POU2F2	5462	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42710307	42710321	42710316	Y	NA	POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	POU2F2	11570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42711906	42712521	42712423	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2	POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	9771	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	PSG9	63866	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	43973146	43973524	43973449	Y	PHLDB3	PHLDB3	LYPD3	K562	ChIA-PET	22265404	PHLDB3	33563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	44821121	44821451	44821434	Y	ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZNF180,ZFP112,ZNF227	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	13922	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45095975	45096232	45096112	Y	CLASRP,BCL3	PVR	CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23	IMR90	Hi-C	24141950	PVR	48866	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45195366	45195649	45195556	Y	RELB,CLASRP,BCL3	NA	NA	NA	NA	NA	PVR	50268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	PPP1R13L	24386	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr19	45954905	45955186	45955133	Y	GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB	IMR90	Hi-C	24141950	FOSB	14067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL2,IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL2	39593	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	47220951	47221042	47220998	Y	ZC3H4,PRKD2	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	PRKD2	2567	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	47221635	47221817	47221775	Y	ZC3H4,PRKD2	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	PRKD2	3251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	49057128	49057239	49057162	Y	NA	SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	3796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	23859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD33,RPS11,SNORD35B,FCGRT	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	51318804	51318947	51318869	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	KLK1	6096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	51898753	51899047	51898851	Y	SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1	ETFB	NA	NA	NA	NA	ETFB	31081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	112596	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	111813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF347	67075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr19	54288550	54288757	54288603	Y	ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX	AC008753.3	NA	NA	NA	NA	AC008753.3	11697	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCG	84799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	55909655	55909755	55909754	Y	PPP1R12C,TMEM150B	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	7390	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	56673673	56673939	56673846	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	31705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	56729112	56729434	56729273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF444	87144	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	80816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	57976528	57976751	57976646	Y	NA	ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	10187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	934141	934402	934285	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	258702	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	1590812	1591204	1590899	Y	NA	AC144450.2	PXDN,MYT1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC144450.2	35987	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	1661359	1661779	1661556	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	34168	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	1679499	1679591	1679561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	52308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	1725652	1725860	1725698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	98461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	7965738	7966104	7965909	Y	NA	NA	LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	AC011747.4	755818	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	8190570	8190676	8190607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	531246	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	8597253	8597584	8597383	Y	KIDINS220	NA	LOC100506274,LINC00299,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	AC011747.4	124338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	9427289	9427526	9427454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82395	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	9815627	9815977	9815711	Y	NA	YWHAQ	NA	NA	NA	NA	YWHAQ	46484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	10176248	10176551	10176348	Y	NA	KLF11,CYS1	NA	NA	NA	NA	KLF11	4425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	10430004	10430228	10430116	Y	NA	HPCAL1	HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	10787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	12959326	12959589	12959403	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	104311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	13069256	13069287	13069272	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1,MIR4262	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	214241	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	13447993	13448374	13448173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	592978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	13793212	13793312	13793262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	938197	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	15282327	15282677	15282506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	416777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	15782224	15782403	15782250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX1	52922	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	16575995	16576348	16576051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	269251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20384416	20384642	20384519	Y	HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	38552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20776456	20776666	20776584	Y	HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	72183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20795362	20795521	20795453	Y	HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	53328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	21691615	21691861	21691725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	670733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	23743180	23743526	23743353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	137092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	62972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	161636	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	24941895	24942247	24942153	Y	NCOA1	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	71758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	26235500	26235661	26235564	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2,HADHA,HADHB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	19315	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	26521727	26522029	26521734	Y	NA	EPT1	NA	NA	NA	NA	EPT1	7386	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	26634949	26635470	26635230	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	EPT1	105534	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	27942982	27943239	27943170	Y	RBKS	MRPL33	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	49345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	28215985	28216067	28216026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	104020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	28492228	28492339	28492284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	28582195	28582710	28582283	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	30605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	28583784	28584228	28583975	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	29087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	28589661	28589896	28589794	Y	FOSL2	FOSL2,AC104695.3	BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	23419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC104695.3	43978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	152037	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	28856660	28856889	28856764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	115617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	29050679	29050871	29050775	Y	NA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	40296	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	29435309	29435425	29435367	Y	SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	116738	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	29439591	29440302	29440265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	121020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	29751731	29752252	29752234	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	433160	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	LBH,AC104698.1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	11486	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	219814	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	33333903	33334283	33334018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	163864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	33383509	33383834	33383717	Y	FAM98A	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	213470	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	36687110	36687380	36687132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	106041	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37432341	37432705	37432523	Y	NA	AC007390.4,CEBPZ	NA	NA	NA	NA	AC007390.4	12461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37576725	37576898	37576775	Y	STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT	PRKD3,QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	7008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37605671	37605839	37605750	Y	CCDC75,QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	35954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	37815586	37815764	37815605	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	147847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	37883470	37883595	37883540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	80016	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	37892431	37892964	37892857	Y	QPCT,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	70647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	38003710	38004005	38003838	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	40099	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	38008241	38008581	38008345	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	44630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	38265039	38265434	38265056	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	69610	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	38323202	38323810	38323564	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYP1B1	11234	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	39917142	39917449	39917282	Y	TMEM178,TMEM178	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	86958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr2	40260196	40260378	40260267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1-AS1	248603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	41955228	41955283	41955256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	439207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	42046531	42047126	42046845	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	347364	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	42182061	42182670	42182320	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	211820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43358229	43358771	43358564	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	92977	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43440136	43440508	43440361	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	11240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	43635676	43636063	43635871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	183928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43666042	43666391	43666188	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	154794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43692800	43693176	43692988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	128009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	43705862	43706134	43705998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	115051	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	44398343	44398537	44398440	Y	NA	PPM1B	NA	NA	NA	NA	PPM1B	5235	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	44518633	44519032	44518761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREPL	67969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	44935582	44935781	44935667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	285771	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	44944979	44944991	44944986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	276561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	45411635	45411970	45411804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01121	136464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	46406206	46406535	46406438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	112271	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	46452124	46452363	46452229	Y	RHOQ	NA	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	66443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	47031260	47031826	47031474	Y	NA	NA	LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS5	107169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	47171092	47171539	47171232	Y	TTC7A,MCFD2	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	4098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	47229826	47230084	47229931	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	62832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr2	47418967	47419222	47419129	Y	NA	CALM2,AC106869.2	TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	17227	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	47496922	47497231	47497077	Y	NA	AC106869.2	TTC7A,CALM2,C2orf61,MCFD2,SOCS5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC106869.2	45989	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	48559553	48559778	48559608	Y	FOXN2	FOXN2	NA	NA	NA	NA	FOXN2	19777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	48718676	48719233	48718981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	52939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	53079014	53079114	53079064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	913815	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	54751942	54752182	54752042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	70520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	55248216	55248544	55248355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	89213	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	55320625	55320761	55320684	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,EML6,RTN4	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	16996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	56070301	56070618	56070423	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	78656	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	56116145	56116275	56116210	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	32999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	58266393	58266527	58266430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	133607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	60779041	60779656	60779263	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr2	62534127	62534336	62534147	Y	NA	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	112879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	64490373	64490733	64490649	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	120785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	64587056	64587400	64587325	Y	NA	NA	AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	91703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	65430351	65430659	65430505	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	ACTR2	IMR90	Hi-C	24141950	AC007318.5	214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr2	66385770	66386089	66385930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	272495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	68432380	68432395	68432387	Y	NA	WDR92,PNO1,PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	48974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	GKN2	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	GKN2	42245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	69163712	69163881	69163761	Y	NA	GKN2,GKN1	NA	NA	NA	NA	GKN2	14221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	69309666	69309994	69309927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKN1	109961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	69775512	69775573	69775543	Y	MXD1,GMCL1,ASPRV1,AAK1	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA4	93984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	70154281	70154743	70154417	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	31461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	70172627	70172794	70172718	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	14603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	70226911	70227071	70226991	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	39514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	70608938	70609447	70609175	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM136A	81716	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	70667389	70667575	70667482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFA	111750	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	71725442	71725771	71725690	Y	DYSF	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	46590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	71822891	71823089	71822990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYSF	144039	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	72748040	72748317	72748179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	302853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	72774678	72774916	72774797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	276254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	74259703	74260366	74260024	Y	NA	AC073046.25,TET3	TET3,ACTG2,BOLA3	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	31863	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	74982664	74982814	74982739	Y	NA	AC007387.2	HK2,SEMA4F,LOXL3	IMR90	Hi-C	24141950	AC007387.2	2718	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	75114636	75114786	75114714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HK2	55528	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	75141745	75142080	75142074	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	41539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	78033031	78033054	78033043	Y	NA	AC105399.2	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	19523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	85057054	85057454	85057405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	73295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	85186958	85187334	85187145	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	8882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	6550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	91960340	91960566	91960493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2971178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	92296858	92297270	92297210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097374.3	3267136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	96811828	96812146	96811999	Y	TMEM127,KIAA1310,ARID5A,ASTL,DUSP2	DUSP2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP2	2649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	96995983	96996007	96995995	Y	ITPRIPL1,ITPRIPL1	SNRNP200,ITPRIPL1,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	3518	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	NEURL3	19761	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	97222458	97223029	97222771	Y	DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	21978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	98364129	98364314	98364298	Y	TMEM131,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	85559	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	98910663	98910871	98910767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	148446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	99374660	99374852	99374788	Y	INPP4A,UNC50,MGAT4A	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	29071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	99723014	99723348	99723222	Y	TSGA10	C2orf15,LIPT1,TSGA10	NA	NA	NA	NA	C2orf15	32600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	100484034	100484497	100484368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	379537	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	100496681	100496959	100496872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	392184	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	401505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	101680419	101680493	101680454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	64242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	101972073	101972519	101972434	Y	NA	RNF149,CREG2	NA	NA	NA	NA	CREG2	29538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	102383406	102383725	102383568	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	72094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	102492851	102493221	102493042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R2	113085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	102549846	102550051	102549852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R2	56255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	102744535	102744807	102744707	Y	IL1RL2,IL1R1,MAP4K4,MAP4K4	NA	IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP	IMR90	Hi-C	24141950	IL1RL2	56626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	109228635	109228941	109228810	Y	GCC2,RANBP2,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	79778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	458145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	110863536	110863928	110863763	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	8215	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	111606246	111606509	111606357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACOXL	118096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	111829364	111829577	111829485	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	45378	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	112375521	112375561	112375551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	264706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	112459778	112460151	112459873	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	180116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	112462014	112462125	112462055	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	178142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	113570329	113570602	113570498	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	21878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	113573367	113573750	113573559	Y	IL1A	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	18730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	113576216	113576532	113576373	Y	IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	15948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	113581693	113582026	113582010	Y	NA	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	10454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	113835949	113836406	113836219	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PSD4	76496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	113847761	113847860	113847813	Y	IL1A,IL1B,IL37,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1F10,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PSD4	65042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	113916006	113916157	113916098	Y	IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN	PSD4	IL1RN,LOC654433,PAX8,PSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSD4	3104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	114126317	114126521	114126419	Y	IL1F10,IL1F10	NA	PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	159218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	165331	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	118740185	118740994	118740898	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	28715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	119669178	119669437	119669357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	309947	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	120971736	120972136	120971936	Y	NA	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	AC012363.4	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	AC012363.4,TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	121011894	121012098	121011996	Y	TMEM185B,RALB	AC012363.4,TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	RALB	16254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	121155649	121155973	121155708	Y	INHBB	NA	LOC84931,INHBB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	160009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	121480209	121480601	121480371	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	10598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	121495235	121495636	121495561	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4036	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	122297511	122297730	122297621	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	11054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP27C1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	129294867	129295138	129294889	Y	NA	NA	UGGT1,HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	220716	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	131112712	131112965	131112906	Y	NA	IMP4,CCDC115,PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	1132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	131582042	131582382	131582235	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	266651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	131683053	131683224	131683139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	165809	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	134570885	134571181	134570989	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	246851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	136404449	136404849	136404497	Y	R3HDM1	NA	NA	NA	NA	NA	UBXN4	92340	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	136887149	136887816	136887360	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	CXCR4	CXCR4	K562	ChIA-PET	22265404	CXCR4	13414	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	136996318	136996892	136996519	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	122583	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	139342135	139342417	139342276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	84764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	6497	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	144769205	144769351	144769311	Y	GTDC1,GTDC1	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	318784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	145078226	145078371	145078292	Y	ZEB2,GTDC1,GTDC1,GTDC1	GTDC1	NA	NA	NA	NA	GTDC1	9764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	147562975	147563022	147563002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P2	219963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	150999673	151000010	150999769	Y	NA	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	393515	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	152789657	152790028	152790018	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	106651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	153263916	153264284	153263950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	74165	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	153277978	153278373	153278235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	88227	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	157147606	157147983	157147795	Y	NA	NR4A2	NA	NA	NA	NA	NR4A2	48877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	158030373	158030519	158030484	Y	NA	NA	NR4A2,GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT5	81591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	158039321	158039798	158039630	Y	NA	NA	NR4A2,GALNT5,GPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GALNT5	72312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	44105	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	5821	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	158712267	158712700	158712451	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	17674	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	160646880	160647090	160646985	Y	NA	CD302	NA	NA	NA	NA	CD302	5663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	161071101	161071394	161071301	Y	ITGB6	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	55005	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	161150962	161151085	161151045	Y	CD302	ITGB6	NA	NA	NA	NA	ITGB6	24563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	161177458	161178011	161177649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB6	51059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	161607616	161608069	161607675	Y	TANK,TANK	NA	RBMS1,ITGB6	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	259311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	164530260	164530475	164530368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	60047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	164534395	164534690	164534543	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	55832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	165371083	165371396	165371192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	104962	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	463227	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	166523404	166523752	166523720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT3	125440	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	AC009495.2	190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	169677226	169677236	169677231	Y	NA	NOSTRIN	NA	NA	NA	NA	NOSTRIN	36177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	172287168	172287529	172287349	Y	TLK1	DCAF17,METTL8	NA	NA	NA	NA	DCAF17	1198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	172747551	172747817	172747684	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	29141	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	173316258	173316587	173316571	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	26176	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	173557830	173558066	173557982	Y	ZAK	NA	RAPGEF4,PDK1	IMR90	Hi-C	24141950	AC093818.1	138506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	174776201	174776462	174776332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	51968	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	73342	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	81223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	175837054	175837318	175837218	Y	NA	CHN1	NA	NA	NA	NA	CHN1	30779	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	176608884	176609040	176608962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	256527	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	178036272	178036551	178036470	Y	NFE2L2	HNRNPA3,AC079305.8	LOC100130691,NFE2L2,AGPS,HNRNPA3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPA3	38740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	178261376	178261686	178261570	Y	NA	AGPS,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	5951	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	182741385	182741846	182741532	Y	SSFA2	SSFA2	PPP1R1C	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	12714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	187409105	187409391	187409239	Y	ITGAV,ITGAV	ITGAV	ITGAV	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGAV	43401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	187420042	187420288	187420183	Y	ITGAV,ITGAV,ZC3H15	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	32504	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	189155414	189155583	189155499	Y	NA	GULP1	NA	NA	NA	NA	GULP1	1018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	189391407	189391613	189391501	Y	GULP1	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	237011	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	190741113	190741271	190741187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS1	94006	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	191709136	191709198	191709167	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34355	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	191826753	191827142	191827070	Y	NA	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	29151	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	208368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	205616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	192529976	192530334	192530120	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC098617.1	178931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	164033	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	196617949	196618273	196617953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	179248	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	197023417	197023933	197023871	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	15294	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	197097649	197097961	197097892	Y	NA	AC020571.3	NA	NA	NA	NA	AC020571.3	24787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	199736102	199736481	199736292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	583942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	201068220	201068604	201068412	Y	NA	NA	SPATS2L	IMR90	Hi-C	24141950	SPATS2L	100000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	201167757	201168004	201167857	Y	SPATS2L,SPATS2L	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	202209480	202209837	202209779	Y	NA	STRADB	NA	NA	NA	NA	STRADB	40744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	203341668	203341778	203341723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	102009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	204668913	204669218	204669026	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,ABI2	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	270780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	205318547	205318821	205318681	Y	NA	NA	PARD3B	IMR90	Hi-C	24141950	PARD3B	89695	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	205530118	205530314	205530216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	121602	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	205595294	205595620	205595457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	186778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	206562928	206563275	206563198	Y	INO80D,NRP2	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	18214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	206613471	206613845	206613585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	68757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	208195614	208195873	208195761	Y	NA	NA	KLF7,CREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	93240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	208369274	208369395	208369347	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	23066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	208378687	208378932	208378791	Y	CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	13529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	215735917	215736192	215736055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARD1	63489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	216522690	216522921	216522813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	223795	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	216695142	216695306	216695226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	201513	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	217180784	217180970	217180877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH4	53780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	19685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	217501395	217501614	217501574	Y	NA	PSMB3P2	NA	NA	NA	NA	PSMB3P2	27713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	614516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	219648056	219648806	219648528	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,TTLL4,CYP27A1	CYP27A1	NA	NA	NA	NA	CYP27A1	3584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16962	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	17960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	220138813	220139187	220138862	Y	INHA,CCDC108,ATG9A,GLB1L	ATG9A,ANKZF1,STK16,GLB1L,TUBA4A,DNAJB2	NA	NA	NA	NA	TUBA4A	1705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	220317654	220318040	220317775	Y	GMPPA,GMPPA	SPEG,GMPPA	NA	NA	NA	NA	SPEG	20086	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.1	6236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	222382501	222382744	222382664	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	54178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	222383007	222383509	222383204	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	53413	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	224477772	224478078	224477872	Y	NA	NA	AP1S3,KCNE4,SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	222666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	131064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	225307433	225307612	225307516	Y	FAM124B	NA	FAM124B,CUL3,SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	140498	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	227002262	227002653	227002458	Y	NA	NA	LOC646736,IRS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	659822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	227292366	227292516	227292441	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736,RHBDD1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	369959	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	227331006	227331180	227331162	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	331295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	227448462	227448628	227448535	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736,NYAP2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	213847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr2	227526564	227526855	227526789	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	135620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	227580904	227581301	227581103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	81174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	227665142	227665696	227665306	Y	IRS1	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	2667	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	228018054	228018265	228018160	Y	COL4A4	COL4A4,COL4A3	NA	NA	NA	NA	COL4A4	8564	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	228232228	228232344	228232275	Y	CCL20,AGFG1	MFF	NA	NA	NA	NA	MFF	44361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	228670402	228670815	228670563	Y	AGFG1,CCL20	CCL20	NA	NA	NA	NA	CCL20	5743	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	229887916	229887920	229887918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	246081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	230784453	230784592	230784556	Y	NA	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	426	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	231299753	231300176	231299905	Y	SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,SP100,SP100	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	21096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	231649547	231649844	231649697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	61429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	231822084	231822525	231822233	Y	GPR55	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	94730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	231915077	231915290	231915200	Y	C2orf72	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	4288	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	232055335	232055819	232055722	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	5441	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	AC017104.6,B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	AC017104.6,B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	232840477	232840577	232840527	Y	DIS3L2	DIS3L2	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	16522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGT1A10	72398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	87966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	235360536	235360912	235360678	Y	NA	ARL4C	TRPM8,ARL4C,SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	42785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr2	235952893	235953060	235952916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	94276	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	236172421	236172477	236172436	Y	NA	NA	AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP1	228256	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	236547901	236548387	236548201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	147168	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	238163095	238163472	238163243	Y	COL6A3	NA	COL6A3	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	170635	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	238187174	238187402	238187364	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	194714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	238384383	238384688	238384583	Y	LRRFIP1	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	7383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	238522988	238523293	238523146	Y	NA	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1,MLPH,RAB17,UBE2F-SCLY	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP1	10926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	238581844	238582251	238582110	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	47625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	238611190	238611575	238611206	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	76971	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14795	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	239287999	239288325	239288245	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	45058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr2	239467355	239467614	239467489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASB1	133972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	239772979	239773251	239773061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASB1	439596	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	AC062017.1	450383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	240168373	240168774	240168689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	152356	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr2	240195931	240196233	240196082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124897	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	241259629	241259983	241259806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC124861.1	66177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	241960934	241960944	241960939	Y	AQP12A,PASK	SNED1	NA	NA	NA	NA	SNED1	24679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	242425566	242425726	242425646	Y	NA	STK25	NA	NA	NA	NA	STK25	21419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr2	242484648	242485001	242484705	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	11135	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	478652	479003	478850	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	37455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	76052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	24402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	30663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	1398801	1399138	1399021	Y	FKBP1A	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	26995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	63717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	2648841	2649036	2648938	Y	NA	NOP56,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7	EBF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-686C3.7	5843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	2812856	2812910	2812883	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	VPS16	6439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	3348660	3349006	3348744	Y	FASTKD5,UBOX5,GFRA4	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	37266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	3520013	3520365	3520159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRN	70326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	3538229	3538411	3538318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRN	88542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	4045309	4045541	4045432	Y	C20orf27,CENPB,C20orf29	FTLP3	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	42757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	98793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	4203123	4203484	4203336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	103496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	4206645	4206924	4206784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	107018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	5042007	5042186	5042103	Y	PRNP,PRNP,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA-AS1,PCNA	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	53068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr20	5635212	5635550	5635485	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	45540	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	5739573	5739619	5739595	Y	PROKR2	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10534	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	7998924	7999176	7999047	Y	NA	TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	448	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	10468745	10468922	10468834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	55875	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	13317482	13317575	13317520	Y	ESF1	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	117064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	13380021	13380161	13380091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	179603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	14248741	14249040	14248807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	67222	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	14500869	14501154	14501002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	184607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	17538189	17538505	17538334	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	9360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	17876337	17876490	17876431	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD17	65099	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	18034343	18034358	18034351	Y	NA	PTMAP3,OVOL2	NA	NA	NA	NA	OVOL2	3474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	19638978	19639033	19639006	Y	C20orf26	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	97319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	19783112	19783320	19783290	Y	NA	RP1-122P22.2	RIN2,SLC24A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	46760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	19796265	19796476	19796342	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	59913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	19860938	19861220	19861002	Y	NA	RIN2	SLC24A3,RIN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RIN2	3945	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	19889354	19889507	19889429	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	24189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	19890524	19890778	19890583	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	25359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	20590950	20591282	20591151	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	99849	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	XRN2	135078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr20	22555806	22556424	22556290	Y	NA	LINC00261,FOXA2	NA	NA	NA	NA	LINC00261	856	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	22558447	22558719	22558568	Y	FOXA2,FOXA2	LINC00261,FOXA2	NA	NA	NA	NA	LINC00261	1167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	22743134	22743499	22743315	Y	NA	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	FOXA2	179041	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	FOXA2	180073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	22776496	22776845	22776664	Y	NA	NA	GZF1,NXT1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXA2	212403	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	23075489	23075921	23075757	Y	THBD,CD93,GZF1	THBD	SSTR4	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	47111	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	23360936	23361138	23361045	Y	SSTR4,NAPB	NXT1,RP3-322G13.7,RP3-322G13.5,GZF1,NAPB	NA	NA	NA	NA	GZF1	20149	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	25305837	25305970	25305904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	63649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	29636705	29636738	29636722	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	26848	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30111445	30111879	30111615	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	11214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30303594	30303801	30303667	Y	TTLL9,DUSP15	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	5991	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr20	30807220	30807332	30807276	Y	NA	TSPY26P,PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	POFUT1	13537	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	31171182	31171312	31171248	Y	DNMT3B,C20orf203	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	32142835	32143155	32142948	Y	C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B	NA	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	66954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	40630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	33055325	33055363	33055345	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	6916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	33803083	33803443	33803260	Y	NA	PROCR,MT1P3,MMP24	TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MT1P3	369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	33896147	33896435	33896303	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	25359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr20	34197138	34197351	34197252	Y	NA	FER1L4,SPAG4	NA	NA	NA	NA	FER1L4	3654	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	81621	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	34470947	34471302	34471125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	74092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	72970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	34681523	34681969	34681863	Y	EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1	EPB41L1	LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPB41L1	4097	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	64633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	35112957	35113192	35113075	Y	TGIF2	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	54695	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr20	35572677	35573004	35572914	Y	RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36042310	36042952	36042529	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	28984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36374070	36374256	36374109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNBL1	53662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr20	36618785	36619379	36619133	Y	RALGAPB,RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	40491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36693519	36693713	36693616	Y	RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	33571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36763112	36763416	36763201	Y	NA	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	29564	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36772576	36772945	36772677	Y	RPRD1B,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	20035	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TGM2	3728	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	36831796	36832119	36831958	Y	NA	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	38816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	1381	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	42955373	42955435	42955404	Y	NA	FITM2	NA	NA	NA	NA	FITM2	17564	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	KCNS1	NA	NA	NA	NA	KCNS1	37405	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	KCNS1,PI3	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	PI3	33808	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	DNTTIP1	8072	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335,MMP9	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	MMP9	13192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	46067997	46068157	46068096	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60444	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.83711640341145
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1,SNORD12B,SNORD12	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48313235	48313496	48313350	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	14919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr20	48533898	48534043	48533948	Y	B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	3818	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48688468	48688637	48688554	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	41859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48726581	48727101	48726820	Y	SPATA2,SPATA2	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	3395	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48838079	48838414	48838219	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB,RP11-290F20.3	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	32703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr20	48950504	48950697	48950581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	68481	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49157621	49157908	49157761	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	32730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49272019	49272462	49272221	Y	NA	FAM65C	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,ADNP	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65C	33603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49282822	49283060	49282941	Y	NA	FAM65C	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,ADNP,MIR645	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65C	23005	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49286898	49287066	49286958	Y	NA	FAM65C	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,EYA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM65C	18999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49341306	49341865	49341532	Y	NA	FAM65C,PARD6B	NCOA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARD6B	4216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	FAM65C,PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	FAM65C,PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	FAM65C,PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49943865	49944229	49943998	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3	IMR90	Hi-C	24141950	NFATC2	233141	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49967560	49968079	49967777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	209291	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49976918	49977375	49977162	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	199995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	49982226	49982434	49982404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	194936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	193837	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr20	50149435	50150104	50149627	Y	NFATC2	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	27266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	70300	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.92459813690723
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr20	50272756	50273155	50272761	Y	ATP9A	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	75917	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	50361169	50361338	50361278	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	12097	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	50366318	50366439	50366379	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	16734	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	50527143	50527170	50527154	Y	NA	NA	ZFP64,SALL4,ATP9A	IMR90	Hi-C	24141950	ATP9A	143970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	51071156	51071538	51071347	Y	NA	NA	BCAS1,TSHZ2	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	252309	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52271592	52271787	52271702	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	47146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52530834	52531236	52530898	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	291150	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52547344	52547891	52547567	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	274495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52551883	52552311	52551992	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	270075	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	256247	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	NA	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	81749	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	52753645	52754029	52753762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	68357	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	PFDN4	NA	NA	NA	NA	PFDN4	37366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.01207987040302
chr20	54729980	54730207	54730095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210B	201764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	104986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr20	55968808	55969481	55968821	Y	ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	4345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	56016094	56016430	56016231	Y	NA	HMGB1P1	NA	NA	NA	NA	HMGB1P1	45653	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.83711640341145
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr20	56291330	56291601	56291401	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	6738	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr20	56323662	56324029	56323724	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	39070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	56592321	56592469	56592395	Y	PMEPA1,PMEPA1	NA	ZBP1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	290026	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr20	56592800	56593208	56592856	Y	NA	NA	ZBP1,PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1L	289287	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	57236406	57236742	57236622	Y	RAB22A,STX16	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	11916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	57585788	57586041	57585915	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5486	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	57586300	57586427	57586364	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	58402426	58402798	58402570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	110554	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	60256764	60257074	60256889	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	381792	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	60758632	60758689	60758683	Y	GATA5,CABLES2	PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	41810	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	60874912	60875240	60875071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRM1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr20	60939635	60939778	60939673	Y	SLCO4A1,NTSR1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	61200879	61201219	61201079	Y	NA	NA	RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO4A1	70578	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	62260	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	61423534	61423709	61423679	Y	NA	OGFR	LAMA5,SLCO4A1,LOC100127888	MCF7	ChIA-PET	22265404	OGFR	10478	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	61554875	61554902	61554887	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	12402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	61822824	61823015	61822948	Y	NA	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	22571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	EEF1A2,PPDPF,PTK6,C20orf195	NA	NA	NA	NA	PTK6	3461	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr20	62176586	62176848	62176717	Y	NA	EEF1A2,PPDPF,PTK6,C20orf195	NA	NA	NA	NA	C20orf195	5525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr20	62456717	62456924	62456790	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2	ZBTB46,MIR1914,UCKL1-AS1,ZNF512B,UCKL1,TPD52L2,ABHD16B,DNAJC5	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB46	3673	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.92459813690723
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	16235978	16236341	16236284	Y	SAMSN1,NRIP1	AF127936.7	NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AF127936.7	15955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	16251857	16252256	16251994	Y	SAMSN1,NRIP1	AF127936.7	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AF127936.7	40	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	16431175	16431558	16431528	Y	NA	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	3763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	17103695	17103792	17103750	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	3351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	17125389	17125620	17125425	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	25045	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	17276028	17276063	17276046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	175684	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	251820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	18984370	18984546	18984496	Y	NA	BTG3	NA	NA	NA	NA	BTG3	1105	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	19171826	19171995	19171943	Y	C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	17708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	27353741	27354048	27353953	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	187398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	28942187	28942353	28942343	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	476380	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	28942556	28942990	28942803	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	475743	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	28945118	28945334	28945247	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	473399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	28962741	28962988	28962847	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	455745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	346961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr21	30567218	30567411	30567380	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	2826	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	30802537	30802636	30802587	Y	NA	NA	C21orf7	IMR90	Hi-C	24141950	BACH1	238145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	33042550	33042842	33042696	Y	NA	SOD1,SNORA81	NA	NA	NA	NA	SNORA81	7931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	34451403	34451550	34451500	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1	NA	NA	NA	NA	NA	IFNAR2	148656	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	35925582	35925949	35925790	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	59492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	232493	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36220749	36221095	36220890	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	235308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	241981	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36263020	36263336	36263172	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	277579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr21	36297204	36297617	36297417	Y	KCNE1,RCAN1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	311763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36336896	36337096	36337005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	351455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36339843	36340239	36340159	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	354402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	36349860	36350141	36349984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	364419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36351037	36351195	36351156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	365596	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	36356108	36356416	36356285	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370667	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	36379576	36379916	36379746	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	394135	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	37670543	37670742	37670650	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	19745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	37809570	37809739	37809678	Y	MORC3	AP000695.6	NA	NA	NA	NA	AP000695.6	8912	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	37868041	37868182	37868111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000695.6	67383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	38628157	38628175	38628166	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	10087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	39606574	39606948	39606733	Y	NA	NA	KCNJ6,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ15	79446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	39616792	39617335	39616969	Y	KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ15	89664	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	39627542	39628109	39627606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	100414	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	39654732	39655403	39655082	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	127604	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ15	196627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	40127775	40128062	40127985	Y	NA	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	47169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	40159439	40159794	40159507	Y	NA	ETS2	ETS2,LINC00114	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETS2	15437	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	40182920	40183779	40183392	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	7689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	40209875	40210169	40209958	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	34644	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	40225341	40225561	40225501	Y	ETS2	NA	LINC00114,ETS2,PSMG1,BRWD1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	50110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	40278958	40279421	40279192	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	103727	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	40338093	40338255	40338153	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	162862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	40386657	40387043	40386856	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	166734	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	41005118	41005297	41005205	Y	NA	C21orf88	SH3BGR	IMR90	Hi-C	24141950	C21orf88	22370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	42485232	42485526	42485376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3197	51958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	43084419	43084601	43084468	Y	ZNF295	NA	LINC00111	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK4	100665	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	43183711	43183960	43183836	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	1306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	43214290	43214658	43214474	Y	NA	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	29024	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	43835171	43835549	43835341	Y	C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	TMPRSS3	NA	NA	NA	NA	TMPRSS3	20216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	43885293	43886049	43885531	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	28069	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44425410	44425661	44425536	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	32790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44614192	44614410	44614235	Y	NA	NA	HSF2BP,LINC00313,SIK1	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	88495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	44631926	44632172	44632049	Y	NA	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	106229	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44727003	44727328	44727122	Y	RRP1,HSF2BP	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	117680	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44727448	44727599	44727495	Y	PKNOX1,SIK1	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	117409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	44752617	44753007	44752874	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	92001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	84095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr21	44761192	44761567	44761446	Y	CRYAA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	83441	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr21	44830426	44830842	44830489	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	14166	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44831891	44832268	44832005	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	12740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44856189	44856512	44856455	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00319	7969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	3069	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	44867284	44867543	44867469	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	2803	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	44908266	44908370	44908324	Y	NA	LINC00319,LINC00313	LINC00319,SIK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00313	10852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	20588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	39370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	40245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	44939768	44940090	44939875	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	42354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	44988675	44988868	44988840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	88506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.27452507089037
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr21	45198694	45199238	45199184	Y	NA	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	4368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	45558236	45558599	45558477	Y	PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6749	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	45573018	45573302	45573138	Y	PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	21531	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	46172768	46173172	46172977	Y	NA	UBE2G2	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	46762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	46302248	46302499	46302417	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	46302536	46302756	46302646	Y	NA	PTTG1IP	PTTG1IP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr21	47394030	47394545	47394409	Y	LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	5106	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr21	47637534	47637799	47637667	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	LSS	8939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	18155331	18155602	18155421	Y	NA	ATP6V1E1,BCL2L13	NA	NA	NA	NA	BCL2L13	45710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	19567520	19567808	19567610	Y	CLDN5	NA	HIRA,CLDN5,CLTCL1,UFD1L	IMR90	Hi-C	24141950	CDC45	102538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	20009239	20009629	20009574	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	6908	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	20885626	20885829	20885752	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	37426	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.48718946942832
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	23520668	23520822	23520745	Y	NA	RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr22	24603179	24603438	24603254	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	27952	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	24799556	24799967	24799568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	134690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	25458331	25458606	25458444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM1	258095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	27415901	27416173	27415987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-40G4P.1	134390	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	27503626	27504166	27503976	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	114522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	27508990	27509624	27509325	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	109064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	27527504	27527688	27527616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	91000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	27530003	27530818	27530508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	87870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	27531437	27531936	27531772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	86752	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	27536268	27536462	27536385	Y	NA	NA	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	82226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	254091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	129760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	28262860	28262973	28262918	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	50391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	29209751	29210048	29209892	Y	CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	15080	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	29281576	29281858	29281717	Y	NA	ZNRF3	C22orf31,KREMEN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	3996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	30018031	30018407	30018261	Y	NF2	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	20486	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	30096148	30096264	30096206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT5	64736	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr22	30608541	30609106	30608754	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	31734	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	30631749	30632163	30631958	Y	RNF215,MTFP1,GAL3ST1	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	8677	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr22	30647782	30648063	30647863	Y	SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	30652191	30652351	30652329	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	35708559	35708961	35708654	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	15291	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	35709404	35709640	35709485	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	16136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOL6	58627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.01207987040302
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	36448788	36448904	36448856	Y	NA	RBFOX2	RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	26315	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	36648054	36648234	36648105	Y	NA	APOL2,APOL1	NA	NA	NA	NA	APOL1	998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-633O19__A.1	23476	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.01207987040302
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	37981480	37981730	37981508	Y	NA	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	NA	NA	NA	NA	GGA1	20751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	38330051	38330075	38330063	Y	NA	MICALL1,POLR2F,C22orf23	NA	NA	NA	NA	POLR2F	16539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	38601471	38601546	38601509	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	1774	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	39270050	39270413	39270293	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3H,APOBEC3G	NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	CBX6	3731	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	39486366	39486808	39486580	Y	LOC646851,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3D,APOBEC3G,APOBEC3H	NA	NA	NA	NA	NA	APOBEC3G	51442	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	39570711	39571096	39570941	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	24032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr22	39635664	39635940	39635710	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	2816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	39686679	39687117	39686848	Y	NA	PDGFB,RPL3	CBX7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3	27277	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	39693596	39693744	39693670	Y	MGAT3	RPL3	NA	NA	NA	NA	RPL3	20650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	39844645	39844964	39844816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB1	50899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	41003149	41003516	41003333	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	27190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	42008568	42008780	42008674	Y	NA	PMM1,XRCC6	NA	NA	NA	NA	XRCC6	6343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	43178512	43178746	43178699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	A4GALT	63208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr22	43415245	43415535	43415390	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	6094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	43659776	43660445	43660004	Y	NA	Z99756.1	NA	NA	NA	NA	Z99756.1	9516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	45501114	45501367	45501144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	56295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	45554826	45555155	45554995	Y	KIAA0930	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	2507	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	45899980	45900171	45900075	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	3862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	CTA-941F9.9,ATXN10	NA	NA	NA	NA	CTA-941F9.9	29087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	46035019	46035329	46035174	Y	NA	CTA-941F9.9,ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	30349	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	CTA-941F9.9,ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	46159997	46160538	46160082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	94319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	46330758	46331082	46331012	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	39927	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	46370456	46370600	46370533	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	23980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr22	46483894	46484294	46483949	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	20123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	46771050	46771392	46771204	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	46278	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	46853394	46853669	46853532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELSR1	77398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	46934777	46935027	46934877	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	47330872	47331057	47330965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	174354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	47579960	47580142	47580051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	423442	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	50272789	50273094	50272966	Y	NA	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	27299	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	50449135	50449422	50449263	Y	TUBGCP6,HDAC10,PIM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIM3	96974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr22	50976397	50976540	50976449	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	7388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	4790332	4790663	4790474	Y	BHLHE40	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16924	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr3	5038569	5038695	5038648	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	18923	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	35312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	5058332	5058543	5058409	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	38686	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	5061219	5061509	5061357	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	41573	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	8807929	8808317	8808062	Y	OXTR	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3,EMC3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3	3450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	10234749	10235085	10234824	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	30200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	11187629	11187920	11187792	Y	HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	10850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	11197111	11197379	11197271	Y	VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	20332	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	11237617	11237805	11237677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	60838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	12555203	12555562	12555379	Y	NA	TSEN2,MKRN2	NA	NA	NA	NA	TSEN2	31272	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	13884272	13884624	13884569	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	34994	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	13932354	13932493	13932424	Y	NA	WNT7A	C3orf19,WNT7A,TMEM43,CHCHD4	IMR90	Hi-C	24141950	WNT7A	12736	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	14483549	14483880	14483666	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	41473	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	15351984	15352244	15352145	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	28631	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	15783171	15783247	15783208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	116031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	16024262	16024670	16024542	Y	NA	NA	ANKRD28,GALNTL2,MIR563	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	124984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	16440818	16441233	16441127	Y	DPH3,RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	112300	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	16647619	16647698	16647658	Y	DAZL,DAZL	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	94086	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	23609558	23609766	23609671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E1	235628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	23641244	23641540	23641467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E1	203854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	23782023	23782329	23782145	Y	NR1D2,UBE2E1	NA	UBE2E2,UBE2E1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	63065	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	23946487	23946815	23946592	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	RPL15	9221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	24506233	24506581	24506477	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	28192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	27396607	27396872	27396740	Y	NA	NEK10	NA	NA	NA	NA	NEK10	12079	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NEK10	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	NEK10	39509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr3	27756583	27756832	27756794	Y	EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	AC098614.2	84116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	29106794	29107135	29106965	Y	NA	NA	RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS3	213338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	30580477	30580787	30580641	Y	TGFBR2	NA	TGFBR2,RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	65207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	31149741	31150063	31149903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	422067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	31737462	31737733	31737598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	165332	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	31967720	31967825	31967773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF860	53438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	32339022	32339260	32339142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMTM8	60851	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	32434248	32434406	32434345	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	3085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	33063733	33064078	33063817	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	9277	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	33086079	33086426	33086309	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	12724	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	33478074	33478410	33478365	Y	NA	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	2453	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	36999426	36999810	36999630	Y	LRRFIP2,MLH1,MLH1,EPM2AIP1	TRANK1,EPM2AIP1,MLH1	EPM2AIP1,MLH1	K562	ChIA-PET	22265404	TRANK1	14878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	37259018	37259236	37259127	Y	NA	LRRFIP2,GOLGA4,AC097359.1	LRRFIP2,MLH1,EPM2AIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GOLGA4	23432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr3	37904355	37904605	37904570	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	2904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	38193404	38193826	38193575	Y	VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	OXSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OXSR1	10754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	41158856	41159369	41159156	Y	NA	NA	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNB1	74959	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	84464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	42514598	42514851	42514767	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5466	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	42514954	42515471	42515310	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.88689720536085
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	NA	NA	NA	NA	NA	HIGD1A	78541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	43220536	43220835	43220673	Y	CCDC13	NA	SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5	IMR90	Hi-C	24141950	SNRK	105169	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	43435481	43435714	43435568	Y	SNRK,ABHD5	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	89658	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	43913925	43914045	43914001	Y	ANO10	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	182839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	43935699	43936111	43935927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	204613	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	12.8598148238802
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	45141662	45142027	45141978	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43887	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	45146738	45147081	45147019	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38833	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	45240276	45240388	45240335	Y	NA	RPS24P8,TMEM158	NA	NA	NA	NA	TMEM158	25382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	45657242	45657607	45657425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	62356	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	45686431	45686643	45686512	Y	NA	SACM1L	SACM1L,LOC644714	IMR90	Hi-C	24141950	SACM1L	41905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	46440782	46440864	46440851	Y	NA	RP11-24F11.2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	RP11-24F11.2	5686	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	46546407	46546628	46546504	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC2	72961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	47026763	47026874	47026817	Y	KLHL18,NBEAL2	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	CCDC12	5263	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	47466111	47466297	47466204	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	45610	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	49105949	49106080	49106015	Y	ARIH2	DALRD3,IMPDH2,QRICH1,QARS	NA	NA	NA	NA	QRICH1	23716	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	49938038	49938186	49938111	Y	TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54	TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MST1R	1113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	50201601	50201845	50201760	Y	TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	11123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	50208155	50208394	50208279	Y	MAPKAPK3,RBM5,GNAI2	SEMA3F	GNAT1,SLC38A3,GNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3F	17677	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr3	50370591	50370860	50370724	Y	RBM6,SEMA3B,RASSF1	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	5551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	50664800	50665228	50664999	Y	GNAI2,MAPKAPK3	MAPKAPK3,CISH,DOCK3	NA	NA	NA	NA	CISH	17538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	51728520	51728585	51728552	Y	NA	TEX264	NA	NA	NA	NA	TEX264	33811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	52009750	52010220	52010093	Y	NA	RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29	NA	NA	NA	NA	ABHD14A-ACY1,ACY1	2684	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	52121101	52121264	52121190	Y	NA	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	32535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SNORD69,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	53024364	53024471	53024418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	54295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	53362706	53362961	53362819	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	16693	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	55194265	55194440	55194343	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-875H7.5	342849	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	55363946	55364201	55364163	Y	WNT5A	NA	CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-875H7.5	173088	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	56873709	56874050	56874038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	158444	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA12	167147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	57102609	57102968	57102819	Y	ARHGEF3	SPATA12,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	8389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	58038147	58038335	58038213	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	46020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	58168035	58168365	58168200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	52868	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	58192298	58192649	58192549	Y	NA	ABHD6	NA	NA	NA	NA	ABHD6	28584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	58984210	58984527	58984399	Y	NA	C3orf67	NA	NA	NA	NA	C3orf67	49283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr3	60695765	60695821	60695814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	539312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	62572991	62573174	62573036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	846211	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	863323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	64147375	64147623	64147507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	139717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	64674446	64674694	64674571	Y	ADAMTS9	ADAMTS9-AS2,ADAMTS9	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	2770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	65950044	65950258	65950163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	72251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	66507485	66507541	66507513	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	42146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	72532064	72532489	72532159	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	37995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	80239226	80239506	80239338	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	424261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	86842931	86843272	86843115	Y	VGLL3	NA	VGLL3	IMR90	Hi-C	24141950	VGLL3	194997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	87101402	87101690	87101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	63133	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	98255377	98255965	98255704	Y	NA	CLDND1,GPR15	NA	NA	NA	NA	GPR15	6634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	98483541	98483706	98483644	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	134827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	98497643	98498236	98497973	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	120297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	98509261	98509585	98509483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	108948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr3	98549481	98549862	98549828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	68671	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr3	98625177	98625421	98625283	Y	DCBLD2	DCBLD2,CTD-2021J15.1	DCBLD2	K562	ChIA-PET	22265404	CTD-2021J15.1	5909	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	98681428	98681771	98681644	Y	DCBLD2	LINC00973	MIR548G,COL8A1,DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	16131	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	11769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.44948853788194
chr3	98691142	98691300	98691170	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	6602	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	98848000	98848317	98848116	Y	DCBLD2	NA	COL8A1,MIR548G	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	150098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	99262027	99262447	99262268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	92872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr3	99356024	99356457	99356227	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	99367111	99367532	99367193	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	11792	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	227268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	99587238	99587483	99587373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	231919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	99761045	99761306	99761215	Y	TMEM45A	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	70051	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	99766371	99766625	99766459	Y	NA	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	64732	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	99768992	99769102	99769071	Y	C3orf26	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	62255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.66215293641988
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	101645465	101645839	101645546	Y	NA	NA	FAM55C,NFKBIZ,LOC152225	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	100630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.97437893885664
chr3	101899188	101899342	101899284	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	354353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	101901132	101901377	101901290	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFKBIZ	356297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	101914180	101914598	101914381	Y	NFKBIZ,NFKBIZ,ZPLD1	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	369345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	105416337	105416655	105416542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	169741	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	105486064	105486421	105486242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	99975	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	107657296	107657394	107657308	Y	CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	150478	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	107725103	107725159	107725131	Y	NA	NA	MYH15,CD47,IFT57,HHLA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	82713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111289781	111290083	111289847	Y	CD96	ZBED2	NA	NA	NA	NA	ZBED2	22207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111420857	111420932	111420895	Y	NA	PLCXD2,PHLDB2	PHLDB2,CD96,ABHD10	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDB2	28412	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111449138	111449249	111449194	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	95	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	4780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111481970	111482358	111482172	Y	PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	32626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111521164	111521550	111521388	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	71820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	111723588	111723714	111723651	Y	SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3	ABHD10,TAGLN3	NA	NA	NA	NA	TAGLN3	8077	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	111943889	111944218	111944054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD200	104976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	112109657	112110558	112110278	Y	CD200	NA	CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3	IMR90	Hi-C	24141950	CD200	60463	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	112994855	112995215	112995035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	236819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	113209161	113209501	113209331	Y	NA	SPICE1	NA	NA	NA	NA	SPICE1	22533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	114119592	114119835	114119768	Y	ZBTB20,KIAA1407,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-553L6.2	188432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	114146274	114146539	114146501	Y	ZDHHC23,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-553L6.2	215114	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	114231020	114231412	114231084	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-553L6.2	299860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	114287427	114287687	114287530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-553L6.2	356267	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	114742139	114742159	114742149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	121959	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	115408740	115409042	115408891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	68569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	205542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr3	115548074	115548457	115548266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	207903	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	115556507	115556695	115556650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	216336	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	218257	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	115595102	115595314	115595123	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	254931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	115724212	115724599	115724432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	384041	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	115776361	115776759	115776562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	436190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	449903	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	118561016	118561389	118561159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT4	396561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	119142297	119142580	119142348	Y	ARHGAP31,NR1I2,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	43097	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	119864415	119864682	119864534	Y	COX17,GSK3B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	52673	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	120286327	120286455	120286388	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	26701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	121638049	121638246	121638101	Y	CSTA,ILDR1	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	86019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	121933818	121933831	121933825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	108260	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	122151664	122151964	122151814	Y	NA	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18782	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	122464996	122465160	122465078	Y	PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	45511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	122486684	122487080	122486948	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	23591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	123321303	123321432	123321369	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	18914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	123388051	123388291	123388171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	85662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	123407272	123407514	123407399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	104883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	123587912	123588093	123588031	Y	ADCY5	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	90471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	124564415	124564677	124564502	Y	HEG1,ITGB5	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	53588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	124781797	124782117	124781832	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	8995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	124786089	124786383	124786283	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	13287	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	125053590	125053890	125053754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX4	183151	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	125113338	125113617	125113432	Y	NA	NA	HEG1,SLC12A8,ZNF148,SNX4,MUC13	IMR90	Hi-C	24141950	SNX4	123424	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	125200225	125200611	125200423	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	36430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr3	125712652	125712829	125712741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	79189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	126108107	126108472	126108304	Y	NA	KLF15	KLF15,CCDC37,ALDH1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF15	33822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	148482	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	209278	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.0995616038988
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	369236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	127265985	127266382	127266013	Y	NA	MCM2,TPRA1	CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	48684	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	127453672	127453937	127453742	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	63894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr3	127496785	127497122	127497034	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	42929	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	17349	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	127813021	127813267	127813144	Y	NA	SEC61A1,RUVBL1-AS1	NA	NA	NA	NA	RUVBL1-AS1	20368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	128538992	128539042	128539017	Y	DNAJB8,C3orf27	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	57131	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	128574396	128574627	128574512	Y	NA	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	21812	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	128838520	128838686	128838629	Y	MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	128958880	128959235	128959095	Y	H1FOO	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	58115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	129690304	129690667	129690526	Y	H1FOO	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	79885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	131090710	131090810	131090760	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	7509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	133747879	133748000	133747885	Y	C3orf36,SLCO2A1	SLCO2A1	NA	NA	NA	NA	SLCO2A1	21028	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	19741	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	134069780	134070244	134070081	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	3159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	134145641	134145965	134145857	Y	NA	NA	ANAPC13,AMOTL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMOTL2	53320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	135615560	135615771	135615666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	66744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	136427457	136427837	136427826	Y	STAG1	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	41383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC8	85955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	FOXL2,C3orf72	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXL2	29292	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	138839594	138839666	138839621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS22	116946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	139018358	139018692	139018412	Y	FOXL2,C3orf72	NA	BPESC1	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	87882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	141056151	141056465	141056211	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	15096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	141316631	141317016	141316779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	112742	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	142130035	142130079	142130067	Y	NA	XRN1	NA	NA	NA	NA	XRN1	34825	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	142225702	142226031	142225867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRN1	60798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	CP	NA	NA	NA	NA	CP	5001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF18,TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	149180653	149180836	149180808	Y	RNF13	RP11-278L15.6	HPS3,TM4SF18,TM4SF1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-278L15.6	29611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	149265788	149265935	149265852	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	55341	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	149333585	149333911	149333859	Y	TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	118590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	150086629	150086866	150086749	Y	NA	TSC22D2	RNF13,PFN2,TSC22D2,SERP1,EIF2A,LOC646903	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	37256	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	150456267	150456381	150456351	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	21343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	150478267	150478712	150478564	Y	TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	150482569	150482635	150482602	Y	NA	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2	3305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	151066126	151066377	151066226	Y	MED12L,GPR87,P2RY12	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	33386	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	151739734	151740181	151739895	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	219436	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	41561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	152215203	152215520	152215350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	229859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	154987917	154988101	154988024	Y	NA	PABPC1P10	NA	NA	NA	NA	PABPC1P10	37495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	155705974	155706059	155706016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPS	119649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	156444390	156444661	156444493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	54223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	156480605	156480801	156480703	Y	NA	PA2G4P4	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	45720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	156527707	156527883	156527795	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	1186	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	156849691	156850000	156849844	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	26549	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	159175843	159176214	159175971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	528323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	210776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	159540179	159540477	159540438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	164060	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	159983948	159984179	159984064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	130883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	2234994	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	169299138	169299197	169299168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	80209	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	169377431	169377952	169377740	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	1454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	170442364	170442688	170442585	Y	CLDN11	NA	CLDN11,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	143584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	NA	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	140452	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	171078129	171078522	171078326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	97675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	171146057	171146176	171146159	Y	NA	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	30021	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	171592038	171592451	171592208	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	65298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	171594447	171594730	171594655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	67707	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	103894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	172234609	172234750	172234680	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	4547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	172344996	172345137	172345044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	81871	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	172418207	172418359	172418236	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	8649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	172423916	172424228	172424139	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	2780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2	NA	NA	NA	NA	ECT2	43612	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	173789505	173789779	173789642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	303255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF639	60042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	NA	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	ACTL6A	96161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	182973593	182973879	182973736	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr3	183088664	183088916	183088772	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	55650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	184078263	184078665	184078465	Y	NA	EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H	NA	NA	NA	NA	POLR2H	757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	184301316	184301494	184301488	Y	NA	EPHB3	NA	NA	NA	NA	EPHB3	23744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	C3orf65	NA	NA	NA	NA	C3orf65	34913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	185905496	185905742	185905693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	79389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	186926447	186926523	186926484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASP1	81287	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	31468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	188012018	188012343	188012183	Y	LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	188017658	188018009	188017791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	147813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	190252374	190252607	190252502	Y	CLDN1,IL1RAP	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	22534	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	192610862	192611520	192611033	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	22430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	193546369	193546601	193546485	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	237436	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	264088	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr3	193588211	193588236	193588227	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	263698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr3	193988501	193988592	193988547	Y	FAM43A	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRC15	99880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	194029385	194029774	194029648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC15	58698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	47562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	46566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	194277383	194277706	194277514	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,GP5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	25034	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	194319358	194319899	194319518	Y	LRRC15	TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44	NA	NA	NA	NA	TMEM44-AS1	16618	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	157244	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	194839135	194839291	194839213	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	27309	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	4439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	194924510	194924749	194924615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	57910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	195531239	195531516	195531404	Y	NA	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5632	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	195542423	195542578	195542499	Y	MUC20,MUC4	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	46.1903552857736
chr3	195573980	195574341	195574135	Y	MUC20,MUC4	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	36832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr3	195627582	195627903	195627662	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	TNK2-AS1,TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	5044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	195632869	195633225	195632990	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2	TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	196001542	196001805	196001683	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,PCYT1A	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	11023	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	196948967	196949228	196949097	Y	NA	NA	MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	74943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	197007663	197007913	197007866	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	16258	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	197036480	197036785	197036693	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	12309	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	197044593	197044660	197044627	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	20422	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	197121526	197121880	197121703	Y	DLG1	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1	IMR90	Hi-C	24141950	AC128709.2	61396	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	AC128709.2	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	AC128709.2	31588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	AC128709.2	NA	NA	NA	NA	AC128709.2	33719	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC128709.2	64388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr3	197335598	197335855	197335727	Y	NA	AC024560.3	NA	NA	NA	NA	AC024560.3	16922	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	770204	770556	770391	Y	ZNF141	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	3081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	2174695	2175024	2174860	Y	NA	NA	NAT8L,C4orf48	IMR90	Hi-C	24141950	POLN	66824	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	5640113	5640289	5640201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	68986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	6989470	6989868	6989678	Y	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	NA	TADA2B	51758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	7649791	7650390	7650086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	103427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	7651364	7651970	7651802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	101847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	79300	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr4	7834057	7834311	7834184	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	80240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	92255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	7974971	7975417	7975298	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	35318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	8098106	8098298	8098202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	60261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	10053251	10053319	10053285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	63254	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	10956396	10956801	10956583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR572	411650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	11426480	11426816	11426649	Y	NA	HS3ST1,RP11-281P23.1	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	2573	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr4	11473418	11473587	11473515	Y	NA	HS3ST1,RP11-281P23.1	CLNK	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-281P23.1	4544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	11491481	11491591	11491506	Y	NA	RP11-281P23.1	CLNK	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-281P23.1	22607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	11603431	11603452	11603441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-281P23.1	134557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	11696419	11696433	11696426	Y	NA	NA	CLNK,HS3ST1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-281P23.1	227545	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	15651682	15652058	15651870	Y	NA	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	29227	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	15757957	15758240	15758119	Y	FBXL5,TAPT1,CD38	RP11-115L11.1,CD38	C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	CD38	19658	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	15895700	15895839	15895750	Y	FGFBP1	FGFBP1	CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	42524	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr4	15915213	15915572	15915412	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	22791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	15922988	15923279	15923080	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	15084	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	21785959	21786161	21786155	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	729516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	23981805	23981826	23981817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	602347	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	24079320	24079729	24079712	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	504444	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	24599702	24600087	24599863	Y	NA	DHX15	SOD3,CCDC149	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	15529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	25828026	25828318	25828201	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	35064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	26087064	26087357	26087217	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	75720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	26090058	26090547	26090383	Y	RBPJ,RBPJ	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	72530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	26175759	26175971	26175925	Y	NA	RBPJ	RBPJ	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	12682	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	34183539	34183770	34183747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	2060361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr4	35366903	35367060	35367024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	877071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	37477962	37478211	37478180	Y	C4orf19	C4orf19	NA	NA	NA	NA	C4orf19	24399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	37668347	37668621	37668474	Y	NA	RELL1	NA	NA	NA	NA	RELL1	17377	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	38080175	38080435	38080304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	120119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	39354929	39355678	39355646	Y	NA	RFC1	WDR19	IMR90	Hi-C	24141950	RFC1	10317	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	39813102	39813401	39813252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2K	115438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	1916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	40724553	40725127	40724836	Y	RBM47	NSUN7	CHRNA9,RBM47,NSUN7,N4BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NSUN7	24787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	193496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	41573569	41573937	41573753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	213945	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	42819226	42819612	42819419	Y	ATP8A1,GRXCR1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	828737	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	47121817	47122010	47121920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD8	341726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVMER34-1	109945	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr4	55080110	55080272	55080192	Y	CHIC2	PDGFRA	SCFD2,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFRA	12992	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	56453376	56453745	56453528	Y	NA	CLOCK,NMU	NA	NA	NA	NA	CLOCK	42071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	57278248	57278433	57278373	Y	NA	AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	PPAT	21348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	61590476	61590574	61590525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	1048994	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	62068799	62069364	62069049	Y	LPHN3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	570204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	68264537	68264852	68264695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	300045	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	68758436	68758452	68758444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6-AS1	193438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	69590341	69590581	69590489	Y	UGT2B17,UGT2A3,UGT2B15	NA	NA	NA	NA	NA	TMPRSS11E	279174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	73610067	73610408	73610238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX18	323064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	73673744	73673875	73673808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX18	259597	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	74355902	74356106	74356004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF6	128242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	74569694	74570920	74570464	Y	ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	33303	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	74570970	74571346	74571160	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2,CXCL1	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	32877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	74591640	74592145	74591915	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	12078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	74593361	74593798	74593698	Y	NA	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	10425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	75187079	75187238	75187159	Y	EPGN	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	41622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	75257879	75258118	75257951	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	29019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	75274406	75274726	75274555	Y	AREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	45546	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr4	75539265	75539284	75539274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTC	178612	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	75550011	75550323	75550221	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BTC	167573	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	75556698	75556816	75556809	Y	EREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	161080	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	75557908	75558335	75558035	Y	EREG,AREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	159561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	76487136	76487403	76487267	Y	NA	THAP6,RCHY1,C4orf26	NA	NA	NA	NA	C4orf26	7878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	77367704	77367795	77367750	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	13451	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	77511406	77511861	77511558	Y	ANKRD56,SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	157153	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr4	77543952	77543974	77543961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	189699	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	77674311	77674688	77674546	Y	SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	142314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	77752154	77752315	77752229	Y	NA	NA	SHROOM3,SEPT11,SOWAHB	IMR90	Hi-C	24141950	SOWAHB	64687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	77931984	77932418	77932077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNI	62740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	78742995	78743215	78743163	Y	CNOT6L	CNOT6L,MRPL1	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	4226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	78775607	78776169	78775749	Y	NA	CNOT6L,MRPL1	MRPL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL1	5505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	78979777	78980204	78980085	Y	NA	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	3053	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	79473983	79474151	79474067	Y	ANXA3	ANXA3	NA	NA	NA	NA	ANXA3	3310	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	79537274	79537650	79537411	Y	BMP2K	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	66601	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	79542673	79542832	79542752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	72000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	79628455	79628752	79628612	Y	NA	NA	LOC100505702,BMP2K	IMR90	Hi-C	24141950	BMP2K	66744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	81228486	81228584	81228534	Y	NA	C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	26290	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	81229160	81229644	81229481	Y	NA	C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	25230	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	81960750	81960835	81960793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf22	705876	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	84034119	84034423	84034342	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	21805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	84071761	84071998	84071930	Y	THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	15533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	84152800	84153100	84153049	Y	THAP9,PLAC8,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2	NA	PLAC8,COPS4	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	50967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	84469544	84469879	84469660	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	14477	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	84776291	84776536	84776414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	321224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	85668684	85668904	85668818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	166552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	85868944	85869302	85869263	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	16236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	86419517	86419845	86419727	Y	ARHGAP24	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	25250	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	86435968	86436285	86436110	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	41701	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	86647112	86647286	86647162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	252845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr4	87849171	87849370	87849272	Y	HSD17B11	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	4784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	13534	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	24845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	63604	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	87960081	87960248	87960138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	90805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	88024894	88025201	88025055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	134265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	88074850	88075090	88074969	Y	DSPP	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	84376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	1423447	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	92519231	92519397	92519314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	2488682	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	99469455	99469759	99469656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	108021	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	99575135	99575326	99575229	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	100739781	100739969	100739850	Y	RG9MTD2,DAPP1	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	3791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	102131266	102131303	102131283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	135634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	103089994	103090308	103090151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	260107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	106362976	106363368	106363172	Y	NA	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	29870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	106887801	106887968	106887883	Y	NPNT	NA	NA	NA	NA	NA	INTS12	72658	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	108758517	108758852	108758585	Y	SGMS2,SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	14798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	108760061	108760236	108760128	Y	NA	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	16342	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	108819119	108819373	108819246	Y	NA	CYP2U1	NA	NA	NA	NA	CYP2U1	31152	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	109513186	109513523	109513472	Y	NA	RPL34	NA	NA	NA	NA	RPL34	26199	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	111086740	111086853	111086804	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	31502	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	113067380	113067784	113067656	Y	LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	2827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	113095488	113095850	113095539	Y	NA	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	30935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	113572868	113573168	113573031	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	C4orf21	16717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	325456	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	291278	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	120130181	120130604	120130427	Y	NA	USP53	NA	NA	NA	NA	USP53	1138	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	120444503	120444790	120444647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	70557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	122609803	122610189	122610094	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	6079	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	122610538	122611647	122611314	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	4621	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	124410194	124410374	124410218	Y	NA	NA	SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY1	94244	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	129308281	129308471	129308363	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	96375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	138260702	138260710	138260707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23P2	106531	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	139067903	139068306	139067999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	93197	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	141017143	141017617	141017414	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	55721	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143059861	143060134	143059998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	504109	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143072986	143072994	143072990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	517234	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143185718	143186074	143185891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	580511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143186679	143186969	143186824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	579616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143276364	143276478	143276442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	490107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143337797	143338156	143337961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	428429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143471391	143471615	143471483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	294970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143485027	143485245	143485038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	281340	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143536371	143536723	143536559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	229862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143542265	143542456	143542361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	224129	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143588065	143588407	143588236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	178178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	143608710	143609035	143608873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	157550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	144280232	144280410	144280287	Y	USP38,SMARCA5,GAB1	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	24317	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	146015172	146015244	146015208	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	1840	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	146726845	146727018	146726937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	130769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr4	146764373	146764705	146764540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	93082	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	148990734	148991081	148990908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	339520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	149756405	149756578	149756515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	392555	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	152582106	152582499	152582283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PET112	97676	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	153190429	153190517	153190474	Y	NA	NA	FAM160A1,PET112,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-18H21.1	170523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	142073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	153599392	153599746	153599719	Y	FBXW7,ARFIP1,TMEM154	TMEM154	NA	NA	NA	NA	TMEM154	75	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	154463481	154463580	154463534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	77983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	154598070	154598582	154598380	Y	TLR2	TLR2	TLR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TLR2	22070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	154994537	154994972	154994863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR2	373885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	157868046	157868334	157868214	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22212	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	157869778	157870097	157870082	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	20449	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr4	159112760	159112996	159112870	Y	TMEM144	FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	TMEM144	7760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	159748095	159748254	159748211	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	59805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	160199508	160199928	160199727	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	511218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	164471489	164471679	164471583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	385416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	166603847	166604073	166603959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	323501	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	169408175	169408648	169408311	Y	DDX60,DDX60L	PALLD,DDX60L	DDX60,DDX60L,PALLD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PALLD	7569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	169479701	169480223	169479961	Y	NA	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	22764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	169490335	169490520	169490463	Y	PALLD	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	33398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	169646285	169646357	169646330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	189348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	169991170	169991417	169991322	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	61744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	170023521	170023783	170023621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	94095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	170193381	170193745	170193612	Y	SH3RF1	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	3125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	174112212	174112389	174112298	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	23409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	174112816	174113032	174112924	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	24013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	177191849	177192202	177191988	Y	ASB5	SPCS3,RP11-87F15.2	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPCS3	46913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	177459522	177459662	177459586	Y	VEGFC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-87F15.2	219913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	177575311	177575346	177575322	Y	SPATA4	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFC	136535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	177715411	177715680	177715585	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	3530	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	183161464	183161792	183161628	Y	ODZ3	NA	ODZ3	IMR90	Hi-C	24141950	AC108142.1	97062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	183568083	183568352	183568218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	268737	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	183727349	183727751	183727542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	109338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr4	183730445	183730610	183730498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	106479	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr4	183897058	183897307	183897172	Y	NA	NA	WWC2,FAM92A3	IMR90	Hi-C	24141950	DCTD	59969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	208523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	185304654	185305034	185304819	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	88700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	185331149	185331516	185331503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	62218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	185613623	185613900	185613762	Y	CCDC111	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	44960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	185740732	185741181	185740991	Y	NA	ACSL1	NA	NA	NA	NA	ACSL1	4791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	87445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC110	104154	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	186730607	186731122	186730955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	257184	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	187491323	187491675	187491487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	154201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr4	187606948	187607189	187607069	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	38687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.18704333739458
chr4	187621819	187622251	187622136	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	23625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr4	190801470	190801552	190801511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	58391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	379590	379862	379712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	61396	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	389983	390379	390026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	50879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	395451	395827	395512	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	45431	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr5	413817	414070	413960	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	27188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	777448	777883	777776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	85938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr5	957591	958302	957640	Y	NKD2	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	RP11-43F13.3	37121	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1111223	1111556	1111501	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	1073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1129967	1130071	1130019	Y	SLC12A7	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	19817	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1130725	1130985	1130924	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	20575	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr5	1139780	1140172	1139929	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,SLC12A7,TRIP13,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	29630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	23280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1512306	1512503	1512434	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	9589	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1516282	1516761	1516468	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	5331	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	1555263	1555850	1555560	Y	NA	LPCAT1,SDHAP3	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	33171	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	2740702	2741010	2740867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	941188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	3304230	3304631	3304430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	1504716	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	3311711	3311862	3311757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	1512197	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	3.93667800731025
chr5	8981221	8981557	8981405	Y	NA	NA	SEMA5A	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA5A	562630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	9345635	9345646	9345641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA5A	198541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	10551479	10551871	10551616	Y	NA	ANKRD33B	MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33B	10571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	10685117	10685512	10685343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	73872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	11524882	11524979	11524955	Y	CTNND2	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	765498	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	12246135	12246533	12246334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1486751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	14036813	14036909	14036843	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	14037218	14037324	14037271	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	14037561	14037744	14037653	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94909	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	14038478	14038912	14038655	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	95826	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	14039774	14040034	14039980	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	97122	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr5	14142332	14142650	14142445	Y	NA	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	14199302	14199513	14199379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	57491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.01207987040302
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	14408020	14408375	14408038	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	171509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	16698370	16698703	16698671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	83203	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO10	78511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	MYO10	NA	NA	NA	NA	MYO10	39198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	16927331	16927389	16927360	Y	NA	MYO10	NA	NA	NA	NA	MYO10	6983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	17118695	17119132	17119047	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	MYO10	184323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	17154796	17154999	17154850	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	188726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	24595497	24595875	24595702	Y	CDH10	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	213715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	1658354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD2	257019	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	32083300	32083310	32083305	Y	PDZD2	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	89146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	32283224	32283342	32283283	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	27773	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	32768263	32768639	32768422	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	238524	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	33313222	33313474	33313360	Y	NA	CTD-2066L21.3	NPR3,TARS	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2066L21.3	17206	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	33671500	33671855	33671579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	218442	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	33781524	33781664	33781594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	108633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	33834348	33834761	33834680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	55536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	33854695	33855218	33854933	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	35079	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	33892874	33893172	33893071	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	2577	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	34564903	34565130	34565039	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14,TTC23L,RAD1,BRIX1	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	89212	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	34710052	34710312	34710173	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	55710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	32421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPBL	154757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	38872248	38872554	38872396	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	28288	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	40405418	40405726	40405516	Y	PTGER4,CARD6	NA	NA	NA	NA	NA	PTGER4	271874	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	40689630	40689893	40689724	Y	NA	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	12030	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	40754670	40754884	40754791	Y	PTGER4	TTC33,PRKAA1	NA	NA	NA	NA	TTC33	593	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	42465969	42466319	42466144	Y	GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC152	288584	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	42999523	42999876	42999700	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	39801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	44875784	44875973	44875831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	68757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	52023689	52023809	52023721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA1	57921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52094372	52094720	52094546	Y	NA	ITGA1,PELO	NA	NA	NA	NA	PELO	12598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52327592	52327905	52327807	Y	ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	44436	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	52332019	52332357	52332083	Y	FST,ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	48863	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	52333334	52333832	52333660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA2	50178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	52545484	52545615	52545603	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS2	141591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52619379	52619641	52619531	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	154598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52630176	52630365	52630298	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	143874	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52633703	52633938	52633784	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	FST	140301	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52656041	52656180	52656111	Y	NA	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	FST	118059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52662185	52662487	52662317	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	111752	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr5	52715258	52715483	52715372	Y	FST	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	58756	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	54082287	54082402	54082339	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	270698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	309388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	55199167	55199571	55199365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL31RA	53960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr5	55575946	55576115	55576004	Y	NA	NA	MAP3K1,MIER3	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	222784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	55646435	55647044	55646625	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	151855	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	55654713	55655022	55654890	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	55655118	55655221	55655151	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143678	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	55786817	55787069	55786944	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	11830	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	55822981	55823358	55823162	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	24082	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	56731620	56731973	56731778	Y	NA	ACTBL2	PLK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTBL2	44663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	57111915	57112364	57112128	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	335279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	57112814	57113117	57112881	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	336178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	57158264	57158637	57158547	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	381628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	57537303	57537570	57537449	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	216517	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	57758033	57758252	57758173	Y	NA	PLK2	NA	NA	NA	NA	PLK2	3946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	58317891	58318186	58317997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	563804	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	59057056	59057135	59057102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	758812	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	729270	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	59917855	59917860	59917858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	76157	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	60600910	60601202	60601013	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	24898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	60751661	60751965	60751750	Y	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	65963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	64486221	64486631	64486280	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	289116	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	64498189	64498386	64498364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	277361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	64505244	64505511	64505327	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	270236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	64821420	64821488	64821458	Y	NA	ADAMTS6,CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	CENPK	35510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	65220429	65221204	65220462	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	65529315	65529329	65529322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	95516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	MAST4-AS1	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	8847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	67272998	67273055	67273003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	236493	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	67663192	67663439	67663285	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	153644	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	67752610	67752698	67752666	Y	PIK3R1	NA	PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIK3R1	243062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	CTC-498J12.1,SLC30A5	NA	NA	NA	NA	CTC-498J12.1	815	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	70938164	70938422	70938252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC2	57049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	182388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	71360595	71360904	71360750	Y	NA	MAP1B	CARTPT,MRPS27	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1B	40157	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	71790679	71790815	71790747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	176206	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	71852331	71852540	71852377	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	237858	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	72218346	72218584	72218427	Y	NA	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	31224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	72234221	72234359	72234290	Y	FCHO2	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	15449	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	RP11-60A8.1	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	4537	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr5	72607592	72607820	72607706	Y	NA	NA	FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	99818	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	72670335	72670728	72670600	Y	NA	NA	FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	BTF3	121505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	72672825	72672912	72672868	Y	NA	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	BTF3	119321	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	72950370	72950710	72950420	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	90859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	72995047	72995144	72995131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	135536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	73209063	73209467	73209267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	349552	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	73330710	73331077	73330894	Y	NA	NA	FAM169A,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRA2	471199	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	73981736	73982008	73981951	Y	HEXB	HEXB,ENC1	NA	NA	NA	NA	ENC1	46487	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	74861939	74862072	74862007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	55976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	74862624	74863010	74862882	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	56661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	74863696	74863807	74863784	Y	ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	57733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	75875096	75875329	75875221	Y	IQGAP2,S100Z	NA	NA	NA	NA	NA	F2R	134539	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	76086514	76086772	76086643	Y	F2R	F2RL1	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	25986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	76086859	76087104	76086921	Y	F2R,F2RL1	F2RL1	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	25654	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	76102045	76102389	76102284	Y	F2RL1	F2RL1,S100Z	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	10369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.18704333739458
chr5	76103019	76103387	76103332	Y	F2RL1	F2RL1,S100Z	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	9371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chr5	76110007	76110333	76110205	Y	NA	F2RL1,S100Z	NA	NA	NA	NA	F2RL1	2425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	76147668	76147777	76147734	Y	IQGAP2,S100Z	F2RL1,S100Z	NA	NA	NA	NA	S100Z	3842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	77412957	77413018	77412987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP3B1	175561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	77800435	77801147	77800993	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	146096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	77822722	77823939	77823093	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	168383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	78990549	78990790	78990669	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	84606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	79428091	79428419	79428255	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	121479	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr5	81661583	81662026	81661933	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	89187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	81717066	81717283	81717174	Y	NA	NA	VCAN,ATP6AP1L	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	144670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	82608517	82608916	82608727	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	156368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	82768927	82769141	82769084	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3643	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	82807080	82807411	82807109	Y	XRCC4,VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	41796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	2654	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	86316064	86316214	86316124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2161E19.1	137366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	86417249	86417398	86417310	Y	CCNH,CCNH	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	144307	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	86417910	86418259	86418047	Y	NA	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	143446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr5	86611168	86611502	86611258	Y	NA	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	49463	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	86629389	86629577	86629451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	67684	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	86663167	86663443	86663248	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	5689	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	88609683	88609884	88609784	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	411761	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	93304446	93304744	93304683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	140660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	95170246	95170624	95170377	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27,AC008592.5	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	13537	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27,AC008592.5	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	95179469	95179934	95179619	Y	NA	GLRX,C5orf27,AC008592.5	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C5orf27	6002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	NA	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELL2	107936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.5746712029241
chr5	102304978	102305194	102305031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIP5K2	148659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	105733568	105733839	105733591	Y	NA	NA	EFNA5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-6N13.1	1006897	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	106802102	106802350	106802226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	202246	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	106806041	106806198	106806107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	198398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	106907307	106907511	106907485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97085	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	73143	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	108170397	108170414	108170406	Y	FER	NA	NA	NA	NA	NA	FER	88874	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	109207541	109207704	109207623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	184474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	109891768	109891977	109891873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	179860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	110846985	110847356	110847238	Y	WDR36,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	697	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	114959651	114959879	114959766	Y	COMMD10	TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	115276815	115277206	115277011	Y	LOC644100	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	101260	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	115420076	115420175	115420113	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	1388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	118627745	118627943	118627845	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	25358	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	118678067	118678220	118678144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	75680	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	121499580	121499890	121499735	Y	NA	ZNF474	NA	NA	NA	NA	ZNF474	36372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	121506435	121506655	121506507	Y	NA	ZNF474	NA	NA	NA	NA	ZNF474	43227	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF474	53585	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	122108155	122108524	122108401	Y	SNX24,SNX2	SNX2	NA	NA	NA	NA	SNX2	167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	122322384	122322589	122322416	Y	NA	PPIC	NA	NA	NA	NA	PPIC	47847	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	344224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	84939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	124178131	124178310	124178211	Y	NA	RP11-436H11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	35205	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	125572604	125572646	125572625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	121178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	125782209	125782552	125782386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	88385	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	127211761	127211779	127211769	Y	NA	NA	SLC12A2,FLJ33630,PRRC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A2	205679	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	127421091	127421133	127421112	Y	NA	SLC12A2	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	3633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	130872269	130872423	130872341	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	96506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	131422074	131422446	131422224	Y	NA	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	14591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	131561409	131561561	131561506	Y	PDLIM4,P4HA2,P4HA2	PDLIM4	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	29803	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	131595834	131595951	131595900	Y	KIF3A,PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	4470	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	131747457	131747923	131747553	Y	NA	SLC22A5,AC034220.3,C5orf56,AC116366.5	NA	NA	NA	NA	C5orf56	3129	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	131795302	131795488	131795309	Y	NA	AC116366.5,IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	29002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	133435759	133436442	133436277	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	11960	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	133468017	133468495	133468331	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	19615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	37651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	AC005355.2	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	133890594	133890960	133890666	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	50351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	134469772	134469821	134469797	Y	C5orf20	NA	PCBD2,LOC340073,PITX1,CATSPER3,H2AFY	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	101269	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	136450174	136450503	136450334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	258857	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	137370531	137370718	137370637	Y	PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5	FAM13B	PKD2L2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM13B	14932	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	137795066	137795334	137795165	Y	FAM13B,FAM53C,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	3845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	138608448	138608665	138608563	Y	LRRTM2,MATR3,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	MATR3	1007	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	139040519	139041115	139040855	Y	PAIP2	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	15635	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.18704333739458
chr5	139633683	139634086	139633757	Y	SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	46620	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr5	139641396	139641769	139641570	Y	SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	38937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	139652898	139653497	139653234	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	27209	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	139691635	139691999	139691907	Y	HBEGF	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	10929	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	139724210	139724515	139724457	Y	SRA1,CD14,CD14,APBB3,HBEGF,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	HBEGF	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	139988781	139989053	139988891	Y	HBEGF,ANKHD1,EIF4EBP3,SRA1,APBB3,SLC35A4,CD14,CD14	SLC35A4,APBB3,CD14,TMCO6,IK,NDUFA2,MIR3655	NA	NA	NA	NA	APBB3	17444	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	8831	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	26705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	140900821	140901187	140900923	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	34013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	43330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	141054975	141055298	141055138	Y	PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4	HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3	NA	NA	NA	NA	ARAP3	4490	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	141475352	141475622	141475404	Y	NA	NDFIP1	FGF1,NDFIP1,ARAP3,FCHSD1,RNF14,GNPDA1,PCDH12	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	10448	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr5	141977799	141977936	141977865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	170013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142157420	142157683	142157517	Y	NA	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	9471	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	142356404	142356953	142356617	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	208455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142357164	142357537	142357332	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	209215	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	142388287	142389194	142388887	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	240338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142534225	142534485	142534355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	175685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr5	142624650	142624850	142624748	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	85320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	142785420	142785784	142785543	Y	NR3C1	NR3C1	ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	27293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	143569314	143569909	143569557	Y	KCTD16	YIPF5	NA	NA	NA	NA	YIPF5	21036	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	145455339	145455700	145455520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	104523	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	147218600	147219023	147218871	Y	SPINK1	NA	JAKMIP2	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf46	65078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	147777538	147777934	147777556	Y	NA	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	16040	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148170785	148171258	148171072	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	32898	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	148292484	148292904	148292843	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	88328	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	148293572	148293925	148293745	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	89416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	148505231	148505419	148505389	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	13627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr5	148510344	148510723	148510652	Y	NA	ABLIM3	AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABLIM3	8323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148514080	148514173	148514127	Y	NA	ABLIM3	ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	4873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148832906	148833066	148832986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	95941	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	93127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	148869266	148869383	148869317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	59624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	150169826	150170319	150169982	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	33155	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	150401918	150402484	150402308	Y	GPX3,TNIP1	GPX3	NA	NA	NA	NA	GPX3	3794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	150455023	150455538	150455407	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	15600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	150464543	150466084	150465220	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	5054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	151307213	151307514	151307357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	157120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	155202123	155202494	155202309	Y	NA	NA	PPP1R2P3	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL22	883493	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	155902989	155903114	155903052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2P3	372435	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	156224453	156224847	156224837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2P3	50702	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	157030326	157030804	157030600	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM19	29543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	157097652	157097963	157097872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THG1L	58242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF145	143144	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	158839407	158839958	158839513	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	NA	ADRA1B,IL12B,LOC285627	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	151318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	159480874	159481257	159481243	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	46754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	159637065	159637397	159637293	Y	FABP6	FABP6,RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	FABP6	24691	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	159688113	159688294	159688164	Y	CCNJL	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	4853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	589726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	167716783	167717259	167717053	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	167744761	167745078	167744891	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	28105	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	167909535	167909826	167909541	Y	NA	RARS	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	RARS	1624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	168055373	168055394	168055384	Y	NA	CTC-575D19.1	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	14056	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	169215174	169215454	169215255	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	190290	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	169262270	169262286	169262278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	143458	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	169398752	169398877	169398815	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	6867	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	169727677	169727933	169727842	Y	KCNMB1,LCP2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	321933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	169733349	169733836	169733608	Y	NA	NA	LCP2,KCNIP1,C5orf58	IMR90	Hi-C	24141950	FAM196B	327605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	171326428	171326478	171326475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	105399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	171600987	171601129	171601000	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	12261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	171601698	171602038	171601921	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	11352	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172205264	172205447	172205353	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP1	9066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172208951	172208972	172208964	Y	UBTD2	DUSP1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	12753	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	172308731	172309533	172309021	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	49453	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172729503	172729731	172729610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP1	160058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172730964	172731211	172731128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP1	161519	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	172761341	172761739	172761505	Y	STC2	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP1	191896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	160014	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	158878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	172883833	172884047	172883943	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	157616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr5	172899322	172899544	172899428	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	142119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	119633	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	173312606	173312854	173312733	Y	CPEB4	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	173586705	173586920	173586830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	273422	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	176245417	176245632	176245534	Y	EIF4E1B,UNC5A	UNC5A	NA	NA	NA	NA	UNC5A	9939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	7330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	178069436	178069827	178069736	Y	NA	CLK4	ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6	IMR90	Hi-C	24141950	CLK4	13820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	179038504	179038699	179038602	Y	NA	HNRNPH1	NA	NA	NA	NA	HNRNPH1	21086	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	SQSTM1	24980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	179496781	179497164	179497079	Y	HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	179787136	179787376	179787257	Y	OR2Y1	NA	GFPT2,MAPK9	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-129O4.1	68891	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	180600516	180600767	180600667	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	16157	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	422827	423098	422962	Y	DUSP22,IRF4	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	133197	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr6	1311552	1311897	1311757	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	1641578	1641903	1641733	Y	NA	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	32897	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	2299603	2299973	2299788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	55621	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	2818084	2818421	2818253	Y	SERPINB9	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	2818912	2819151	2819031	Y	SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21089	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	2853307	2853467	2853442	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	13067	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	3069574	3070273	3069674	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1,BPHL	LOC100507194,WRNIP1	K562	ChIA-PET	22265404	RIPK1	7349	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	FAM50B	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	21107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	4613428	4613746	4613742	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	90647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	5966118	5966226	5966172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F13A1	353020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	6483548	6483940	6483744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F13A1	164302	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	F13A1	367894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	6694635	6694734	6694680	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	F13A1	375389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	6713207	6713532	6713382	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	392298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	6970116	6970321	6970219	Y	NA	NA	LY86	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	135509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	7167368	7167553	7167460	Y	CAGE1,RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	61538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	9398519	9398525	9398522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	964725	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	10355646	10355875	10355765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	62017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr6	10383571	10383981	10383824	Y	TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	33911	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518,GCNT2	NA	NA	NA	NA	LINC00518	8419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr6	10458287	10458428	10458359	Y	NA	TFAP2A,LINC00518,GCNT2	NA	NA	NA	NA	LINC00518	25180	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	10587786	10588136	10587948	Y	TMEM14B,GCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	97330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	183282	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	169978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11212824	11213214	11213068	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	167367	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11270585	11270869	11270602	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	109712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr6	11356951	11357246	11357084	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	23335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11365255	11365579	11365551	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	15002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11393241	11393536	11393390	Y	NEDD9	NEDD9	NEDD9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	12660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	11732067	11732789	11732417	Y	NEDD9,NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	196129	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	11921182	11921467	11921322	Y	NA	NA	ADTRP,HIVEP1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-456H18.2	84436	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	12287477	12287842	12287503	Y	NA	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	12332214	12332482	12332362	Y	NA	EDN1	EDN1,TMEM170B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EDN1	43618	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	12484193	12484504	12484246	Y	EDN1	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	27838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14121845	14123283	14121874	Y	NA	CD83	NA	NA	NA	NA	CD83	5973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14271187	14271701	14271310	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	155315	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14638705	14639298	14639002	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	522833	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14706582	14707144	14706813	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	537383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14711169	14711813	14711625	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	532714	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14713126	14713654	14713380	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	530873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14733801	14734229	14733883	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr6	14735052	14735658	14735282	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	508869	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	14826835	14827098	14826967	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	417429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	14966546	14966931	14966759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	277596	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	15313668	15313748	15313709	Y	DTNBP1,JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	66803	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	15542142	15542162	15542152	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	16422379	16422759	16422608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	185568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	16652450	16652671	16652543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	106698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	16699529	16700051	16699938	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	59318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	17430018	17430227	17430123	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	38571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	18263099	18263635	18263391	Y	RNF144B,DEK	DEK	NA	NA	NA	NA	DEK	45	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	19477913	19478110	19478022	Y	ID4	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	324873	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	20604004	20604027	20604016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	71316	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	21808482	21808727	21808539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	216510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	21947021	21947287	21947156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	355049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr6	24302656	24303033	24302868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDC2	53247	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	24498598	24498722	24498660	Y	NA	ALDH5A1,GPLD1	NA	NA	NA	NA	GPLD1	5165	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	24743891	24744276	24743998	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	25458860	25459089	25458879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	181554	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.27452507089037
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr6	27136362	27136689	27136526	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AH	23501	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	28188130	28188520	28188276	Y	ZNF193	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	36491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	49442	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	93748	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	28805076	28805418	28805247	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	26974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.27452507089037
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	28146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	30247447	30247451	30247450	Y	NA	TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	TRIM39	44805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	TRIM39	37784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	30434534	30434831	30434712	Y	DDR1,DDR1,DDR1,DDR1	RANP1,HLA-E	PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RANP1	16886	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	30495647	30495976	30495809	Y	PPP1R11,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	26687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr6	30736850	30737361	30737156	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	26519	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	30785907	30786494	30786279	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	55704	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	30923441	30923743	30923649	Y	GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1	GTF2H4,VARS2,SFTA2,DPCR1,MUC21	NA	NA	NA	NA	DPCR1	16692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	ATF6B	42995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	32952668	32952702	32952685	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	BRD2-IT1	16659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	HLA-DOA	19118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	35026753	35026994	35026778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	153196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	35311267	35311540	35311417	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	2932	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	35457906	35458213	35458053	Y	TEAD3	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	4640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	36656050	36656213	36656132	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	LAP3P2,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	13745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	95453	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	37190361	37190574	37190538	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	32974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	37484293	37484960	37484497	Y	NA	CCDC167	CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC167	18595	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	37745135	37745338	37745265	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	39937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	41623844	41623904	41623860	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	21224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	42898508	42898648	42898552	Y	NA	C6orf226,CNPY3,RPL24P4,GNMT,PEX6	NA	NA	NA	NA	CNPY3	3570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,GNMT,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43505816	43505905	43505861	Y	ABCC10,TJAP1	POLR1C,LRRC73,YIPF3,XPO5,POLH	NA	NA	NA	NA	YIPF3	23088	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43636886	43637091	43636988	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	16437	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43757757	43757886	43757846	Y	NFKBIE,TJAP1	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	21836	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43975133	43975197	43975165	Y	CDC5L,C6orf223	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	8816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43977606	43978027	43977822	Y	NA	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	11289	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	43978439	43978901	43978686	Y	NFKBIE	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	12122	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	43979820	43980209	43980006	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	13503	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	44002811	44003092	44003040	Y	NFKBIE	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	36494	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	42884	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	45629	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	44019349	44019523	44019394	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,VEGFA,MRPS18A,MAD2L1BP,C6orf223	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf223	53032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	44610699	44610959	44610866	Y	NFKBIE	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	257437	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	44823725	44823846	44823786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	470463	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	44949602	44949944	44949774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	393746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	45294493	45294953	45294580	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48737	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	45299904	45300369	45300004	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43321	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	45319946	45320392	45320176	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	23298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	45391331	45391628	45391429	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47641	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	45575518	45575910	45575680	Y	NA	NA	RUNX2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SUPT3H	231828	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr6	45678135	45678537	45678416	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,SUPT3H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	334445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	47074438	47074572	47074520	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	66339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	94404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr6	47382599	47382792	47382666	Y	NA	NA	CD2AP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD2AP	60733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	451885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	52376478	52376751	52376615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62962	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	273867	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	57052407	57052730	57052411	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	17283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	57327654	57327860	57327770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	150051	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	57354557	57355032	57354719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	176954	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	64150073	64150241	64150156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	79425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	69308968	69309335	69309152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	1195668	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	69803382	69803773	69803578	Y	BAI3	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	701230	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	70808594	70808991	70808795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	303591	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	73330314	73330844	73330342	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	73975471	73975797	73975634	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	4533	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	74307690	74308056	74307857	Y	KHDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A5	53822	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	75853490	75853812	75853630	Y	COL12A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	59955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	81197510	81197656	81197595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	383146	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.0995616038988
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr6	87433521	87433927	87433716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1P1	396479	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	89591363	89591365	89591364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	79983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	90860237	90860588	90860527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	144039	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	99886915	99887218	99887074	Y	NA	COQ3,RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	15708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	99975087	99975427	99975257	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	USP45	7483	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	106565443	106565616	106565583	Y	PRDM1,PRDM1,ATG5	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	33248	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	107773333	107773402	107773368	Y	SOBP	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	5366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr6	108943872	108944029	108943998	Y	FOXO3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	64834	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	109035823	109035995	109035909	Y	NA	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90	Hi-C	24141950	ARMC2	131624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	109059217	109059645	109059338	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	107974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	109288163	109288636	109288487	Y	FOXO3,SMPD2,MICAL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-249L21.4	61087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	110094407	110094557	110094483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIG4	83908	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	110870639	110870789	110870697	Y	NA	NA	RPF2,CDK19	IMR90	Hi-C	24141950	DDO	135874	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	111758931	111759246	111759206	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	43468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	112134730	112134859	112134835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	57796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	112449250	112449618	112449554	Y	NA	TUBE1	NA	NA	NA	NA	TUBE1	42518	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	112525181	112525504	112525289	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	48637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	112552727	112553228	112552920	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	20913	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	113966975	113967088	113966980	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	2188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	118008335	118008695	118008355	Y	NA	NUS1	NA	NA	NA	NA	NUS1	13670	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	119468463	119468799	119468540	Y	FAM184A	NA	NA	NA	NA	NA	MCM9	214136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	126267356	126267782	126267584	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	8145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	126271537	126271736	126271680	Y	NA	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	4191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	126579500	126579620	126579560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPW	79700	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	128331151	128331455	128331303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	508415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	128793943	128794334	128794205	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	45536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	129822062	129822220	129822139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	207150	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	129822485	129822770	129822701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	206600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	129994496	129994751	129994657	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	34619	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	130022144	130022554	130022402	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	6816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	130513480	130513753	130513616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	180636	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	133837061	133837238	133837150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBPL1	434070	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	380399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	134088671	134088966	134088914	Y	NA	NA	MGC34034,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	182342	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	134700193	134700599	134700296	Y	SGK1,SGK1	NA	ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	62943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	134742048	134742399	134742278	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104798	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	134743944	134744382	134744175	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	106694	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	134943068	134943371	134943223	Y	NA	NA	LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	305818	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	136795244	136795664	136795596	Y	MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	74293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	136965409	136965459	136965418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	95452	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	136983395	136983458	136983427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	113438	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	138129336	138129581	138129459	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	56770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	138133089	138133355	138133227	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	52996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	138153323	138153539	138153451	Y	NA	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	32812	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	138786189	138786282	138786236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	63521	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	139861409	139861802	139861629	Y	HECA,CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	139909356	139909574	139909434	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	215599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	142290502	142290595	142290549	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	175772	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	142644630	142644955	142644766	Y	NA	GPR126	NA	NA	NA	NA	GPR126	23639	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	142648297	142648491	142648394	Y	NA	GPR126	NA	NA	NA	NA	GPR126	27306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	143163714	143164598	143164218	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	99740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	143248323	143248614	143248469	Y	NA	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	15724	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	143476820	143477010	143476926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	97187	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	143516746	143517148	143516792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	137113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	144066654	144067070	144066822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	95411	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	TPT1P4	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPT1P4	17211	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	146867560	146867942	146867733	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	4731	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	149082428	149082821	149082685	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	150010989	150011176	150011138	Y	NA	KATNA1,LATS1	NA	NA	NA	NA	LATS1	26216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	150259749	150260211	150260119	Y	NA	RAET1G,ULBP2	NA	NA	NA	NA	ULBP2	925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	151246480	151246919	151246675	Y	ZBTB2	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	61795	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	153491745	153492007	153491883	Y	NA	NA	OPRM1,IPCEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-475C16.1	109861	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	154975061	154975312	154975138	Y	SCAF8	NA	CNKSR3,OPRM1,IPCEF1	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	77147	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	155506879	155507250	155506955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	68608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	158424430	158424803	158424679	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	23542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr6	158982051	158982465	158982168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81306	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	75680	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	SYTL3	72390	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.74963466991567
chr6	159171374	159171393	159171384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	67051	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr6	159359890	159360005	159359951	Y	EZR	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	59214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	160699946	160700334	160700305	Y	LPA	RP1-276N6.2	NA	NA	NA	NA	RP1-276N6.2	8297	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	161549553	161550030	161549828	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	138794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	161607618	161607817	161607715	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	85276	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	164135216	164135461	164135424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	302184	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	165988383	165988522	165988473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	765557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	166964478	166964522	166964502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	210399	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	166967000	166967189	166967118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	212921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	166970262	166970784	166970543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	216183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	167001220	167001407	167001338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	247141	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	167038809	167038976	167038893	Y	RPS6KA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	278963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	131259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	168408262	168408655	168408498	Y	NA	NA	SMOC2,KIF25	IMR90	Hi-C	24141950	MLLT4	182660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	169569548	169569688	169569622	Y	NA	RP11-417E7.1	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	8529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr6	169827902	169828288	169828095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-417E7.1	266883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	8191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	89354	89662	89513	Y	NA	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20C	101307	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	FAM20C	NA	NA	NA	NA	FAM20C	562	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	543299	543586	543435	Y	GET4,CYP2W1,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	14347	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	850307	850449	850380	Y	SUN1,SUN1	SUN1	NA	NA	NA	NA	SUN1	3079	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr7	946891	947297	947190	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	32702	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	949099	949177	949151	Y	ZFAND2A,ADAP1	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	34910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	949613	949923	949864	Y	NA	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	35424	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	964406	964697	964471	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	28346	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	965289	965600	965408	Y	ZFAND2A,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	27443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	968255	968622	968448	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	24421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	988760	989207	989097	Y	ADAP1	ADAP1,COX19,CYP2W1	NA	NA	NA	NA	ADAP1	3836	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr7	1546091	1546367	1546260	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2602	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.66215293641988
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	1598591	1598955	1598779	Y	NA	MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	TMEM184A	134	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	1990940	1991132	1991045	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	211013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	2221939	2222311	2222112	Y	IQCE	MAD1L1	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	48567	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	2517395	2517647	2517521	Y	NA	LFNG	LFNG,BRAT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LFNG	32516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	2548054	2548433	2548213	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1730	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	2551232	2551336	2551252	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	1069	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	2860983	2861189	2861144	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	AC092610.12	NA	NA	NA	NA	AC092610.12	10114	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	5571967	5572766	5572739	Y	RBAK,RBAK	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	20538	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	5650367	5650762	5650403	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	19928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr7	8300349	8300667	8300508	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	32	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	14876245	14876455	14876355	Y	DGKB	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P21	767240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	17139132	17139382	17139242	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	196864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	17170041	17170200	17170099	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	166046	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	17273276	17274796	17274578	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	61450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	17314276	17314419	17314335	Y	AHR	AHR,AC003075.4	NA	NA	NA	NA	AHR	21827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	17315787	17316189	17315986	Y	NA	AHR,AC003075.4	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	20057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	AC017060.1	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC017060.1	31959	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	18548166	18548343	18548284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	423594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	18551067	18551390	18551179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	426495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	18560411	18560650	18560558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	435839	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	18563504	18563902	18563528	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	438932	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	18678711	18679112	18678888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	554139	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	18695404	18695888	18695683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	570832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20070639	20070953	20070726	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	30293	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20154173	20154365	20154304	Y	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	100662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20160280	20160875	20160444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	94152	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20163699	20164108	20163996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	90919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	20227353	20227778	20227635	Y	TWISTNB,ITGB8	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	27249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20228342	20228547	20228441	Y	TWISTNB,ITGB8	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	26480	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20239950	20240328	20240220	Y	TWISTNB	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	14699	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20242848	20242947	20242898	Y	NA	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	12080	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	20254261	20255002	20254926	Y	MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	25	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr7	20366116	20366290	20366150	Y	ITGB8	ITGB8	MACC1,TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB8	2035	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20414219	20414454	20414223	Y	NA	ITGB8	NA	NA	NA	NA	ITGB8	45894	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	22609345	22610034	22609690	Y	IL6	AC002480.4	NA	NA	NA	NA	AC002480.4	17290	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	22616988	22617783	22617407	Y	IL6	AC002480.4	NA	NA	NA	NA	AC002480.4	9541	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	AC002480.4	NA	NA	NA	NA	AC002480.4	4120	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	AC002480.4	NA	NA	NA	NA	AC002480.4	4386	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	22687053	22687419	22687223	Y	IL6	NA	LOC100506178,SNORD93,TOMM7,IL6,FAM126A	IMR90	Hi-C	24141950	AC002480.4	59729	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	381465	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	24795767	24795828	24795792	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	24803089	24803421	24803235	Y	DFNA5,DFNA5	DFNA5	DFNA5,OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	DFNA5	3823	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	24818395	24818855	24818677	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11151	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	25002827	25003181	25002973	Y	C7orf31,OSBPL3	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	16072	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	25010250	25010501	25010375	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	8752	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.5746712029241
chr7	25068217	25068495	25068356	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL3	48964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	25071903	25072051	25071977	Y	NA	NA	OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL3	52650	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	26193570	26193972	26193862	Y	SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	3710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	26333342	26333901	26333652	Y	SNX10,SNX10,CBX3,SNX10	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	3801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	26355868	26356236	26355954	Y	NA	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	26327	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	AC004540.4,AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	24337	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	26477083	26477150	26477118	Y	CBX3	AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	40870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	26589150	26589521	26589235	Y	SNX10	NA	LOC441204,KIAA0087	IMR90	Hi-C	24141950	AC004540.5	152937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	27386345	27386573	27386562	Y	NA	AC004009.3	NA	NA	NA	NA	AC004009.3	12889	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	141190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	28172246	28172388	28172317	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	45974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	28194446	28194874	28194789	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	23488	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	28733136	28733327	28733267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	396196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	SCRN1	NA	NA	NA	NA	SCRN1	22212	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	30188805	30188913	30188846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8	123785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	30265497	30265992	30265714	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	55931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS,AC005154.6	NA	NA	NA	NA	AC005154.6	26339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	32026855	32027150	32027002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	505745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	32202741	32202908	32202813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	329987	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	32546004	32546038	32546035	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	12966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	36787255	36787404	36787327	Y	NA	NA	AOAH	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P18	69160	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	12836	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	37635277	37635287	37635282	Y	NA	NA	ELMO1	IMR90	Hi-C	24141950	EPDR1	86159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	38750267	38750277	38750273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS41	219717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	39629281	39629774	39629554	Y	RALA	YAE1D1,AC004837.3,RALA	NA	NA	NA	NA	AC004837.3	17542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	39644763	39645050	39644891	Y	RALA	YAE1D1,AC004837.3,RALA	LINC00265	IMR90	Hi-C	24141950	AC004837.3	2266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	39695521	39695649	39695585	Y	NA	AC004837.3,RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	34439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	40129508	40130170	40129872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	141872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	41087461	41087737	41087599	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	652969	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	42026442	42026777	42026611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBA	285736	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	43626451	43626626	43626528	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	6094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	44136998	44137292	44137136	Y	POLM	POLM,POLD2	AEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	POLM	16859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	44297372	44297806	44297600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKT6	58805	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	44426024	44426371	44426281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	53848	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	44845785	44846169	44845977	Y	DDX56	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	11506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	44855333	44855416	44855373	Y	TBRG4,H2AFV	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	21054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	46691155	46691159	46691157	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	316141	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	46691314	46691685	46691473	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	315615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	46920965	46921354	46921105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004870.4	85946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	47092629	47092731	47092679	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	85329	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	47515604	47515892	47515680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr7	47691174	47691510	47691360	Y	C7orf69,TNS3,C7orf65	NA	TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	71018	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	48126389	48126700	48126545	Y	NA	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	164	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	48127053	48127182	48127123	Y	HUS1,UPP1,UPP1	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	828	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	48240591	48240965	48240675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPP1	114366	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr7	48429398	48429915	48429720	Y	HUS1,UPP1,UPP1	NA	NA	NA	NA	NA	UPP1	303173	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	50615386	50615579	50615483	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	99298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	50889237	50889584	50889351	Y	NA	GRB10	COBL,GRB10	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	30078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	50905745	50905993	50905866	Y	GRB10	GRB10	COBL,GRB10	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	46586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	55035120	55035446	55035284	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	49268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	55167745	55167964	55167855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	83031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	55198488	55198937	55198616	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	113774	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	55235458	55235690	55235573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	150744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	55253994	55254266	55254079	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	169280	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr7	55506510	55507071	55506539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	75369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	65790150	65790379	65790243	Y	RABGEF1,KCTD7,TPST1	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	121964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	70113143	70113470	70113265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-859M6.1	2009358	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	73309402	73309628	73309515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	54537	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	73625323	73625613	73625399	Y	LIMK1,LAT2	EIF4H,LAT2,RFC2	NA	NA	NA	NA	LAT2	13341	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	73686776	73686884	73686792	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	RFC2,LAT2,CLIP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIP2	14921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	75580822	75581199	75581009	Y	POR	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	40778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC005077.12	59736	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr7	75926781	75926853	75926816	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	3008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	77038853	77039042	77038951	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	125550	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	77057322	77057668	77057603	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	PION,PTPN12	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTPN12	106924	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	79050066	79050245	79050154	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	711026	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	81584968	81585322	81585145	Y	CACNA2D1	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	485792	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	84613691	84613734	84613712	Y	NA	AC074183.4	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	46130	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	87918906	87919150	87919043	Y	SRI	STEAP4	NA	NA	NA	NA	STEAP4	15056	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92260832	92261202	92261012	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43124	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	92261439	92261837	92261823	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43731	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	92271612	92271814	92271678	Y	SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	53904	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92273770	92274019	92273895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	56062	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92277080	92277232	92277129	Y	ANKIB1,GATAD1,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	59372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	92361219	92361296	92361260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	102501	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92373404	92373742	92373580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	90055	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92412911	92413100	92413006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	50697	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92459714	92460134	92460069	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	3663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92463754	92464079	92463922	Y	CDK6,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1,CDK6	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92533719	92534002	92533863	Y	SAMD9	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	CDK6	69811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92673041	92673276	92673159	Y	NA	NA	CDK6,FAM133B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAMD9	72060	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	NA	PON1	224347	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	95747900	95748043	95747945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	201416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	95867967	95868008	95867988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	81451	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	95913909	95914253	95914081	Y	SLC25A13	SLC25A13	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	35206	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	97995155	97995543	97995349	Y	NA	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	18353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	MYH16	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	MYH16	24733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	MYH16,ARPC1A	NA	NA	NA	NA	MYH16	37506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	99291105	99291222	99291169	Y	PTCD1,CYP3A43,CYP3A4,AZGP1,CYP3A5	CYP3A5	NA	NA	NA	NA	CYP3A5	15484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	99962576	99962959	99962740	Y	MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	25045	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	99966641	99967146	99966944	Y	C7orf59,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	29110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	100167857	100168189	100168134	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,MOSPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-44M6.3	2103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	100772917	100773243	100773005	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4547	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101372678	101373024	101372861	Y	NA	NA	CUX1,EMID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	83935	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	101596326	101596693	101596419	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	139367	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101707897	101708291	101708217	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	250938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	128808	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	103277543	103277794	103277680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-276O3.4	290495	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	105766301	105766504	105766403	Y	NA	SYPL1	CDHR3,ATXN7L1,SYPL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	15279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	105922869	105923204	105923197	Y	NA	NAMPT	NA	NA	NA	NA	NAMPT	1568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	106057745	106058020	106057851	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	132973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	107875663	107876003	107875815	Y	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NA	LAMB1	233963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	110732834	110733321	110733005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	467252	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	111641194	111641556	111641398	Y	ZNF277,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	202910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr7	112414156	112414445	112414299	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	14202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2,AC073130.3	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073130.3	8172	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	116058055	116058274	116058222	Y	NA	NA	CAV2,TES,MET,CAV1	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	AC002066.1	79245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	116181805	116181927	116181813	Y	CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	18966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	118520575	118520914	118520745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	698489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	1212450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	121170486	121170616	121170551	Y	NA	NA	FAM3C,WNT16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	136068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	123410612	123410856	123410679	Y	NA	WASL	WASL	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WASL	23491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.48718946942832
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr7	128500948	128501348	128501123	Y	NA	FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	68	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	128958632	128958719	128958676	Y	NA	NA	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	89492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	129410177	129410359	129410300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRF1	160622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	129418602	129418801	129418733	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169047	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr7	129420694	129421120	129420768	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	169669	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	129421490	129421976	129421792	Y	FAM40B	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	168813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	129540244	129540548	129540396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	50241	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	129649203	129649568	129649512	Y	NRF1	ZC3HC1	NA	NA	NA	NA	ZC3HC1	39723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130644314	130644883	130644570	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48245	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130735932	130736596	130736429	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	56259	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	131239359	131239620	131239490	Y	NA	PODXL	NA	NA	NA	NA	PODXL	1356	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	131307786	131308102	131307944	Y	NA	NA	PODXL	MCF7	ChIA-PET	22265404	PODXL	66810	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	131314351	131314532	131314442	Y	NA	NA	PODXL,MKLN1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PODXL	73375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	133706471	133706698	133706584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGUK	103354	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr7	134540961	134541304	134541061	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	113958	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	134835200	134835725	134835320	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49	NA	NA	NA	NA	TMEM140	4376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf73	85341	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	NA	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	98196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	135459124	135459310	135459189	Y	NA	NA	C7orf73,SLC13A4,FAM180A	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	113880	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	137663180	137663556	137663478	Y	CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	21257	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	137673807	137674359	137674139	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	10454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	109651	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr7	139366770	139367125	139366961	Y	TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108452	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	139367160	139367381	139367316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	141287085	141287318	141287296	Y	TAS2R5	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	38096	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	142554207	142554559	142554324	Y	EPHB6	TRBV30,EPHB6,TRPV6	NA	NA	NA	NA	EPHB6	3415	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	142823985	142823994	142823990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTK1	115192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	146230197	146230393	146230208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	1698709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr7	148685182	148685277	148685231	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	38456	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	150948540	150948854	150948603	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	20965	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	151039447	151039627	151039551	Y	SLC4A2,AGAP3,SMARCD3,SMARCD3,NUB1	NUB1	NA	NA	NA	NA	NUB1	2662	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	151452177	151452367	151452235	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	119760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	151493401	151493985	151493754	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	78142	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	151591335	151591652	151591492	Y	NA	PRKAG2-AS1,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	19125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	151823102	151823484	151823293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	102343	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	155744220	155744341	155744281	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8985	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8557	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	1232	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr7	157082402	157082699	157082633	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr7	157085416	157085724	157085621	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	40351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr7	157294785	157294882	157294834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	168710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	158167398	158167566	158167494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	210914	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	153489	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	158225517	158225999	158225657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	152481	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr7	158609735	158609944	158609833	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	11000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	158765978	158766170	158766074	Y	NA	NA	NCAPG2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR60	118709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr7	158905033	158905150	158905046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR60	257764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	1693574	1694042	1693752	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7902	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	1694228	1694696	1694461	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7248	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	2197132	2197346	2197239	Y	NA	NA	CSMD1	IMR90	Hi-C	24141950	KBTBD11	277088	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	2500921	2501118	2501014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	580877	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	6431105	6431496	6431367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	132234	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	8147008	8147233	8147135	Y	NA	NA	SGK223,MFHAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	94775	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.22474426894097
chr8	8241572	8241733	8241653	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	9775483	9776284	9775834	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	133494	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	121498	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	10591008	10591121	10591065	Y	RP1L1,SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	104236	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.18704333739458
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	11367839	11367991	11367915	Y	BLK	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	37615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	11373324	11373814	11373559	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	43100	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	11538128	11538263	11538240	Y	GATA4	GATA4	GATA4	IMR90	Hi-C	24141950	GATA4	5660	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	13210778	13210972	13210875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	160195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	15443006	15443379	15443076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	170282	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	16219402	16219917	16219607	Y	MSR1	NA	MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	791621	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	18523718	18524110	18523921	Y	NAT1,NAT1,NAT2	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	416130	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr8	18722659	18722821	18722740	Y	PSD3	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	217419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	18768857	18769292	18769046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	170948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	18836263	18836433	18836318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	103807	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	18991999	18992391	18992140	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	51759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	18998257	18998415	18998308	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	58017	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	19522969	19523285	19523139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	90255	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	20055803	20056436	20056187	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	2925	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	NA	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	73475	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1,PHYHIP	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22103553	22103662	22103605	Y	NA	PHYHIP,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	POLR3D	2936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	22535910	22536200	22536167	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	11249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22858849	22858903	22858877	Y	NA	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	22867059	22867413	22867162	Y	NA	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	24129	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	23353842	23353942	23353892	Y	TNFRSF10C,SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	30376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	23390028	23390384	23390041	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	5710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	23618921	23619563	23619216	Y	ENTPD4,ENTPD4	NA	STC1,ENTPD4	IMR90	Hi-C	24141950	NKX3-1	80481	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	23655999	23656321	23656218	Y	STC1	NA	STC1,SLC25A37	IMR90	Hi-C	24141950	STC1	53999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	24206605	24207043	24206844	Y	ADAM28,ADAMDEC1	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM28	57052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	24243913	24244131	24243977	Y	ADAM28,ADAMDEC1	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM28	94360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	240520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	25092167	25092564	25092364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	51929	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	137853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr8	26447042	26447356	26447232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	77251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	27387404	27387600	27387502	Y	PTK2B,PTK2B,EPHX2	NA	NA	NA	NA	NA	CLU	82948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	27547704	27547787	27547746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARA3	58319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	INTS9	108163	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29202154	29202365	29202273	Y	DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	3820	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29213594	29213602	29213597	Y	NA	DUSP4	DUSP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP4	7409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	29412862	29413263	29412985	Y	DUSP4,DUSP4	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	206677	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29413574	29413927	29413748	Y	DUSP4	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	207389	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr8	29419877	29419995	29419892	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP4	213692	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29495067	29495424	29495202	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	288882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	8.83565508307412
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29705863	29706038	29705974	Y	MBOAT4	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	232685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	29938783	29938843	29938811	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	TMEM66	60	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	32572764	32572916	32572840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	691029	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	34682233	34682421	34682327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-84O15.1	503073	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr8	37738160	37738666	37738484	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	16319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	37760968	37761285	37761070	Y	RAB11FIP1	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	5983	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr8	37773592	37773777	37773685	Y	NA	RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	18607	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38219963	38220671	38220346	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	DDHD2,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	WHSC1L1	17119	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38242599	38242872	38242674	Y	TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	874	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38384926	38385302	38385064	Y	HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR1	60574	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38816649	38817007	38816807	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	TM2D2	35336	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	39800131	39800493	39800357	Y	NA	IDO1	NA	NA	NA	NA	IDO1	42337	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	39976615	39976841	39976744	Y	IDO1	C8orf4	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	32148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	41570603	41570760	41570682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	136716	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	42149533	42149606	42149596	Y	NA	RP11-231D20.2,IKBKB,POLB	NA	NA	NA	NA	IKBKB	22713	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	42398083	42398473	42398470	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	3014	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	48350721	48350922	48350822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	152249	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	77792	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	49321087	49321473	49321210	Y	NA	RPL29P19	SNAI2,MCM4,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25937	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	49321878	49322114	49322046	Y	NA	RPL29P19	SNAI2,MCM4,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	26728	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	49541228	49541500	49541360	Y	SNAI2	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	EFCAB1	104370	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	49550038	49550119	49550080	Y	SNAI2	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	EFCAB1	95751	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	49701443	49701572	49701502	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	EFCAB1	55573	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	49783004	49783154	49783067	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	49145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	49815340	49815765	49815552	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	16534	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM150A	287193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	54720057	54720661	54720376	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	33457	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	55366813	55366957	55366864	Y	NA	NA	SOX17	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-53M11.3	97964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	55389317	55389516	55389419	Y	SOX17	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-53M11.3	75405	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	56796346	56796794	56796413	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	5974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	56903187	56904166	56903812	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	RPS20	80903	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	56916302	56916441	56916350	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	RPS20	68628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	59497301	59497891	59497607	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	33818	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	59717237	59717517	59717381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	146834	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	59763369	59763610	59763548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	192966	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	59980234	59980420	59980383	Y	NA	RP11-25K19.1,TOX	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	49179	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.83711640341145
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	61825257	61825601	61825298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	235920	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4470	54289	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	63162204	63162589	63162538	Y	NA	NKAIN3	NA	NA	NA	NA	NKAIN3	3054	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	64082499	64082747	64082682	Y	YTHDF3	YTHDF3	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	3387	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	67419818	67420060	67419977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	79398	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	67424340	67424761	67424541	Y	C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	83920	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	84637	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.66215293641988
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89360	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	67447907	67448273	67448065	Y	MYBL1,C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	76209	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	67454365	67454567	67454497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	69915	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	68499569	68499804	68499684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPA6	156816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	945488	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	71129648	71130032	71129927	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	115234	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	72743502	72744020	72743667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR9	1163902	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	72880263	72880309	72880290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	1038790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	74276592	74276996	74276782	Y	C8orf84,RDH10	NA	STAU2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7	70568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	74371877	74372089	74371987	Y	RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7	165853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	75688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	77590079	77590470	77590424	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	984	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	77731385	77731402	77731393	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4-AS1	137872	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	79578942	79579038	79579012	Y	IL7,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	IL7	136720	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr8	86378354	86378674	86378384	Y	LRRCC1,CA2	CA2	NA	NA	NA	NA	CA2	4273	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	89129707	89129875	89129814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118P15.2	145314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	89352633	89352940	89352786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118P15.2	368240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	90627835	90627903	90627892	Y	NA	NA	MMP16	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37B2.1	140052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	90845997	90846144	90846052	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSGIN2	65943	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	92337525	92337634	92337580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	257101	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	94850124	94850307	94850200	Y	PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17728	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	95943173	95943450	95943312	Y	NA	CCNE2,TP53INP1	NA	NA	NA	NA	TP53INP1	16189	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	57582	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	57076	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	101455424	101455703	101455525	Y	PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	KB-1615E4.2	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1615E4.2	30200	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	101511601	101511939	101511749	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A	KB-1615E4.2	NA	NA	NA	NA	KB-1615E4.2	25698	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	101512336	101512720	101512423	Y	SPAG1,SPAG1	KB-1615E4.2	NA	NA	NA	NA	KB-1615E4.2	26433	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	101514609	101515240	101514976	Y	YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A	KB-1615E4.2	NA	NA	NA	NA	KB-1615E4.2	28706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	101880714	101880933	101880768	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	YWHAZ,ZNF706	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAZ	82683	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	101881903	101882335	101882088	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	YWHAZ,ZNF706,FLJ42969	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAZ	81281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	101912406	101912993	101912785	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	50623	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	43224	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	102100153	102100310	102100232	Y	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	116111	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	102161878	102162231	102162054	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	54190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	102167683	102167913	102167765	Y	NA	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	48508	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	102171817	102172037	102171960	Y	YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44384	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	102373140	102373427	102373201	Y	NA	NACAP1	GRHL2,NACAP1,NCALD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NACAP1	1118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	102388506	102388737	102388522	Y	NA	NACAP1	NA	NA	NA	NA	NACAP1	16484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	102516990	102517159	102517011	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	14330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	103422542	103423104	103422992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR5	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	103486772	103487100	103486937	Y	NA	NA	ODF1	IMR90	Hi-C	24141950	UBR5	63703	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	13972	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	103803215	103803631	103803453	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	12114	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1,KB-1639H6.2	NA	NA	NA	NA	KB-1639H6.2	27976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	104357065	104357412	104357193	Y	CTHRC1	FZD6,RP11-318M2.2	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	48065	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	106290444	106290757	106290601	Y	NA	NA	ZFPM2	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	691192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	107665296	107665542	107665419	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	42699	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	107870700	107870850	107870776	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	162459	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	110324960	110325029	110324995	Y	NA	ENY2,NUDCD1	NA	NA	NA	NA	ENY2	19524	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	110589431	110589605	110589518	Y	NA	EBAG9	NA	NA	NA	NA	EBAG9	39491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544L4.1	183721	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	113064401	113064537	113064469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	1322361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	114744655	114744979	114744816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	357757	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	116441706	116441935	116441732	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	377964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	116641527	116641923	116641875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	177976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	118776615	118776789	118776702	Y	NA	NA	MED30,EXT1,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	245663	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	118958698	118959000	118958912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	163092	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	119013126	119013396	119013387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	108696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	119023512	119024035	119023740	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	98057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	119536968	119537364	119537323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	94870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	119856012	119856178	119856095	Y	NA	NA	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	83572	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	119862438	119862804	119862573	Y	NA	NA	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	89998	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	120063756	120064086	120063927	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF11B	101317	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	120066342	120066835	120066563	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF11B	103903	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	120217398	120217670	120217528	Y	MAL2	MAL2	NA	NA	NA	NA	MAL2	42125	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	120232000	120232286	120232044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	56727	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	120547207	120547221	120547214	Y	NA	NA	ENPP2	IMR90	Hi-C	24141950	NOV	120661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	121649803	121649981	121649892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	173532	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	121873597	121873929	121873801	Y	NA	NA	SNTB1,MRPL13,MTBP	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	50084	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	121939165	121939179	121939172	Y	NA	NA	SNTB1,MTBP,MRPL13	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	115652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	122157265	122157468	122157378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	333752	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	122755244	122755615	122755430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	103614	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	122906081	122906401	122906188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	254451	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	123957674	123957774	123957724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	94889	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124407044	124407322	124407183	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	19268	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	124547812	124548082	124548041	Y	NA	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	3364	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124549741	124550229	124550044	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1217	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	124552481	124552488	124552485	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1035	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124608792	124609080	124608936	Y	FBXO32	NA	ANXA13,FBXO32,KLHL38	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO32	57346	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124816728	124816894	124816751	Y	NA	FAM91A1	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	38032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124934433	124934622	124934528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	155737	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	124965382	124965556	124965469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	186686	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	125304968	125305098	125305033	Y	NA	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	23044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr8	125640439	125640642	125640477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	90740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	125764120	125764533	125764318	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	MTSS1	MTSS1,ZNF572,NDUFB9,TATDN1,LOC157381,SQLE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTSS1	25390	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126232781	126233016	126232896	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130699	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	126372255	126372562	126372409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	68001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126399593	126399657	126399625	Y	NA	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	40906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	127447013	127447387	127447083	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	120733	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128070328	128070629	128070508	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	158704	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46544	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128193341	128193750	128193748	Y	NA	CCAT1	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCAT1	35583	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	128196669	128197128	128196955	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	32205	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	128208934	128209645	128209301	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	19688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.01207987040302
chr8	128219153	128219489	128219426	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	9844	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr8	128222835	128223182	128223058	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	6151	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1579	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	128227982	128228299	128228180	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1034	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	128231853	128232218	128232163	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	2520	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.18704333739458
chr8	128237300	128237732	128237515	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	7967	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	128305149	128305567	128305521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	75816	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.5746712029241
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.71193373836928
chr8	128309901	128310145	128310009	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	80568	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	128352367	128352670	128352528	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	123034	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128519696	128520090	128519909	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	225590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	128608525	128608821	128608655	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	136859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128744100	128744550	128744397	Y	NA	MYC	NA	NA	NA	NA	MYC	1130	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128865187	128865467	128865327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	60408	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	128988975	128989172	128989023	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	31685	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	16124	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129062971	129063389	129063062	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	42114	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129139934	129140421	129140284	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	119077	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129180743	129180870	129180780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	159886	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129195465	129196052	129195562	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	174608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	129209230	129209523	129209417	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	188373	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	548193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	129659601	129660006	129659683	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	638744	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	130503275	130503416	130503346	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	GSDMC	293718	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr8	130697904	130698138	130698105	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	GSDMC	98996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	GSDMC	76576	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr8	131012344	131012436	131012358	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	14939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	131027030	131027189	131027125	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	186	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr8	131089372	131089764	131089568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	61997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	131260848	131261137	131260957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	192769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	131271729	131272058	131271952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	181848	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	131291188	131291588	131291505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	162318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	99046	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chr8	131495645	131495684	131495664	Y	NA	ASAP1	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	41739	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	134122288	134122488	134122388	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	189777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	134315401	134315895	134315622	Y	ST3GAL1	NDRG1	TG,NDRG1,ST3GAL1	IMR90	Hi-C	24141950	NDRG1	3136	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	ST13P6	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	49483	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	134453521	134453599	134453592	Y	SLA	ST13P6	NA	NA	NA	NA	ST13P6	35272	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	134580779	134581429	134580915	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	754	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	134664147	134664493	134664336	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST3GAL1	81964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	135493726	135493930	135493821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	229362	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	141189770	141190115	141189943	Y	TRAPPC9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	276563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	141361313	141361457	141361385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	105221	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	141972530	141972881	141972765	Y	NA	PTK2	NA	NA	NA	NA	PTK2	37434	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	142033227	142033651	142033460	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	22912	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	142082969	142083325	142083150	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	42052	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.48718946942832
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr8	142248811	142249092	142249020	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	67312	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	142286712	142287093	142287044	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	29311	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	142289630	142289814	142289772	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	26590	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	142716742	142717095	142716832	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P38	249567	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	143049473	143049646	143049554	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	TSNARE1	432955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	143757526	143757895	143757616	Y	NA	PSCA,JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	3491	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	144032047	144032423	144032233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6E	64976	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	144107532	144108153	144107940	Y	MAFA	LY6E,C8orf31	NA	NA	NA	NA	LY6E	10133	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr8	145995593	145996127	145996081	Y	COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34	ZNF251,ZNF34,RPL8	NA	NA	NA	NA	ZNF34	14603	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	2281532	2281772	2281628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	268190	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	2623377	2623723	2623671	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	3543	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	2839342	2839735	2839533	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	2506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3-AS1	146271	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	4210549	4210554	4210552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	135838	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	52676	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	4864348	4864647	4864448	Y	NA	MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	16057	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	5451547	5451984	5451704	Y	JAK2,KIAA1432,CD274	CD274	NA	NA	NA	NA	CD274	3044	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	5452329	5452752	5452399	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274	NA	NA	NA	NA	CD274	3826	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	5459353	5459726	5459436	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	10850	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	1004	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	5580709	5581016	5580868	Y	NA	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	46009	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	5901129	5901190	5901160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	70012	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	8576629	8576984	8576673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	134327	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	6.64861174567954
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr9	14395378	14395755	14395567	Y	NA	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	1227	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	16062752	16063225	16063009	Y	NA	NA	CNTLN,C9orf93,BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	537071	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	16344409	16344763	16344480	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	380049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	17520540	17520838	17520658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTLN	387560	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	18478894	18479067	18478986	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	7002	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	18695	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	21496569	21496909	21496764	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	13275	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	21576231	21576644	21576439	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	18563	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	21589940	21590292	21590223	Y	IFNW1,IFNA6,IFNA1	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	32272	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	21674915	21675193	21674990	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	117247	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	21677834	21678156	21678014	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	120166	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	21681581	21681928	21681849	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	118614	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	22040932	22041035	22040938	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	30778	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	22103396	22103678	22103511	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2B	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	93242	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	23452489	23452846	23452665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	1007649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	26243860	26243998	26243927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	567004	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	27155069	27155179	27155099	Y	TEK	NA	NA	NA	NA	NA	PLAA	209608	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	31790390	31790408	31790400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	592210	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	33229414	33229715	33229547	Y	NA	SPINK4,BAG1,CHMP5	NFX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPINK4	13051	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33233885	33234477	33234128	Y	NA	SPINK4,BAG1,CHMP5	NA	NA	NA	NA	SPINK4	17522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33268680	33268843	33268732	Y	NA	BAG1,CHMP5,NFX1	NA	NA	NA	NA	CHMP5	5740	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33446270	33446740	33446527	Y	SMU1,BAG1,NFX1,AQP3	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	661	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33814905	33815171	33814978	Y	UBE2R2,UBAP1	UBE2R2	NA	NA	NA	NA	UBE2R2	394	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	34158490	34158839	34158617	Y	NA	DCAF12,UBAP1	DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBAP1	18164	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	34179799	34180083	34180009	Y	UBE2R2,UBAP1	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	2796	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	34352304	34352500	34352353	Y	NA	SERPINH1P1,KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	22351	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	34375136	34375287	34375212	Y	NA	KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	285	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	36153117	36153150	36153134	Y	OR13J1,OR2S2,GLIPR2	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	GLIPR2	18385	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	37197498	37198123	37197885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78962	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	128361	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	37954084	37954355	37954258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	112329	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	38008217	38008489	38008387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	58195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1B1	46909	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	71784003	71784073	71784064	Y	TJP2	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	49794	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	71790550	71790929	71790586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	56341	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	71791709	71792066	71791753	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	57500	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	59201	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	71846971	71847094	71847051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	112762	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	74318584	74318670	74318629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	110936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	74515794	74516103	74515949	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	8323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	81486579	81486867	81486725	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD2P9	517352	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	81704987	81705355	81705134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	298864	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	84270722	84271111	84271084	Y	NA	TLE1,RP11-154D17.1	NA	NA	NA	NA	TLE1	31109	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	91096507	91096802	91096655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXNL2	51214	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.13726253544518
chr9	92042592	92043030	92042739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	68015	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	93833669	93833838	93833696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYK	271600	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	93862627	93863018	93862659	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	259177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	93892173	93892363	93892269	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	229832	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	93893646	93894080	93893930	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	228115	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	95860928	95861146	95861059	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	4428	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.31222600243675
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	97631649	97631973	97631839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	144666	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	97711275	97711380	97711332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	224292	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	98931605	98932004	98931930	Y	NA	EIF4BP3	FBP1,FANCC,LOC158435,LOC100507346,PTCH1,LOC158434	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	25316	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	99132173	99132333	99132255	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	11659	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	99182775	99182932	99182834	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	4164	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	100548546	100549029	100548790	Y	FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	90907	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	100841115	100841498	100841123	Y	C9orf156	NANS,TRIM14	NA	NA	NA	NA	NANS	24094	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	100981172	100981639	100981390	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	28250	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	101136906	101136938	101136922	Y	ANKS6	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	120991	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	101554135	101554384	101554323	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	2863	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	101573359	101573810	101573605	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	GALNT12	5378	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	102195698	102196356	102196027	Y	TGFBR1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NA	SEC61B	213352	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	105248809	105248820	105248818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF20	954676	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	109975791	109976065	109975989	Y	KLF4	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	67353	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	110514044	110514454	110514287	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	219373	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.699853867966267
chr9	112091755	112092133	112091802	Y	PTPN3	EPB41L4B	EPB41L4B	MCF7	ChIA-PET	22265404	EPB41L4B	10511	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	112578765	112579213	112578950	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	37996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	112813346	112813601	112813470	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	27708	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	112831833	112832445	112832154	Y	NA	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	46195	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	113507067	113507395	113507232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	291586	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	113570937	113571275	113571156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	227706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	113642497	113642777	113642637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	156204	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	113680597	113681099	113680790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	117882	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	113681942	113682364	113682085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	116617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	C9orf84	NA	NA	NA	NA	C9orf84	49492	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	114723325	114723781	114723480	Y	NA	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	66279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	114823556	114823978	114823803	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	111710	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	114960117	114960327	114960222	Y	NA	SUSD1	NA	NA	NA	NA	SUSD1	24429	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	117481130	117481475	117481264	Y	TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	84931	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	117566825	117567042	117566994	Y	TNFSF15	TNFSF15	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	419	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	117647197	117647589	117647272	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	80791	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	117671276	117671580	117671329	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	104870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	117691412	117691904	117691627	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	125006	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	118412488	118412760	118412588	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	533952	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	2.27452507089037
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556397	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	118953256	118953446	118953306	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	494135	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	122060480	122060822	122060651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1279626	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	123478444	123478636	123478538	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	3696	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	123635278	123635355	123635317	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	123839324	123839437	123839423	Y	CNTRL	CNTRL	CNTRL,MEGF9,FBXW2,TRAF1,C5,RAB14	IMR90	Hi-C	24141950	CNTRL	4183	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	123878647	123878673	123878659	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	43506	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	124463473	124463936	124463619	Y	TTLL11,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	136137	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.5746712029241
chr9	124527423	124527640	124527529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	200087	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	124664946	124665174	124665060	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	188711	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	125109314	125109437	125109338	Y	NA	PTGS1	TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS1	21387	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	125869246	125869355	125869301	Y	OR1L3,OR1K1,GPR21	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	159500	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	126302696	126302988	126302896	Y	LHX2	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	273841	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	127029560	127030143	127029899	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	11675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	127155102	127155374	127155331	Y	DENND1A	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	20349	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	127433186	127433516	127433351	Y	NR6A1	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	14440	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	127621077	127621225	127621167	Y	NA	RPL35,ARPC5L,RNU4-82P	NA	NA	NA	NA	RPL35	1035	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	130590782	130591142	130590862	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	CDK9,FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	23893	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	130681632	130682091	130681875	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	4315	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	130743802	130743907	130743855	Y	FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	3010	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	131673839	131674187	131673982	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,LRRC8A,LRRC8A	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1,DOLK,NUP188	NA	NA	NA	NA	PHYHD1	6987	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGES	53678	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132512351	132512751	132512561	Y	PTGES	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	575	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132514052	132514155	132514104	Y	NA	PTGES,TOR1B	NA	NA	NA	NA	PTGES	726	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	132778768	132779165	132778966	Y	ASB6,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	24308	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132785309	132785843	132785545	Y	USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	17630	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	132949592	132949704	132949653	Y	C9orf78	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	16735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	133001906	133002144	133002026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCS1	69049	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr9	134113096	134113636	134113575	Y	PRRC2B,NUP214,FAM78A	NA	NA	NA	NA	NA	NUP214	114148	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	134148574	134148792	134148687	Y	FAM78A	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	118688	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chr9	134532379	134532786	134532611	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	80675	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	134553923	134554245	134554041	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	59216	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	134600757	134600889	134600837	Y	RAPGEF1,NTNG2	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	12572	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	134610888	134611363	134611119	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	2098	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	135088716	135088744	135088730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG2	53382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	136282042	136282102	136282072	Y	NA	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	878	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	234260	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	136999790	136999893	136999856	Y	NA	WDR5	NA	NA	NA	NA	WDR5	1303	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	137233458	137233505	137233466	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	26514	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	137268460	137268716	137268601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	61516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chr9	138666183	138666357	138666270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	130717	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	138796932	138797111	138797062	Y	CAMSAP1	RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	138797876	138798018	138797978	Y	CAMSAP1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	218	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	139434156	139434495	139434364	Y	FUT7,NACC2,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	3819	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NOTCH1	24212	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	139466507	139466851	139466737	Y	NA	NOTCH1	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	NOTCH1	28193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	MIR4479,FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	3.93667800731025
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chr9	140190695	140190800	140190760	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	3903	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL41	54881	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	9509355	9509595	9509475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	80020	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM2	51107	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	SHROOM2,RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	9978783	9979047	9978917	Y	NA	WWC3	SHROOM2,WWC3	IMR90	Hi-C	24141950	WWC3	2555	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	10135057	10135251	10135239	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	12033	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	454304	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chrX	12390298	12390694	12390463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS2	416780	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	12988805	12989184	12988832	Y	TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	2043	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	12989837	12990050	12989934	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	1177	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	13002969	13003378	13003273	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	11742	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	15354246	15354416	15354344	Y	ZRSR2,CA5B,MOSPD2,PIGA	PIGA	NA	NA	NA	NA	PIGA	2570	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	15695028	15695432	15695331	Y	ZRSR2,AP1S2,PIGA	TMEM27,CA5BP1,CA5B	NA	NA	NA	NA	CA5BP1	3973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	16176605	16176961	16176614	Y	GRPR	GRPR,RPL6P30	NA	NA	NA	NA	GRPR	36926	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	20281516	20281702	20281609	Y	SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3	RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	1821	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	21097014	21097354	21097128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBTPS2	758400	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	21962010	21962116	21962060	Y	NA	SMS	NA	NA	NA	NA	SMS	5319	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	22538340	22538693	22538516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	581649	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	22909771	22909782	22909777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	770597	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	23800091	23800377	23800148	Y	NA	ACOT9,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	801	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	23806806	23807042	23806932	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,SAT1,RPL9P7	NA	NA	NA	NA	SAT1	7516	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	23971140	23971524	23971479	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	47083	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	24027801	24028121	24027962	Y	NA	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	42712	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	28999435	28999810	28999466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-12D5.5	1119425	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GK	991137	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	30674217	30674586	30674241	Y	NA	GK	NA	NA	NA	NA	GK	4741	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	39719669	39720024	39719856	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	74279	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	168684	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	39951266	39951579	39951437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	83003	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	32007	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	44877456	44877597	44877527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	146699	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	44927976	44928345	44928046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	197219	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45305345	45305614	45305509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	298080	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45338516	45338773	45338583	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	264921	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	228617	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45376807	45376988	45376867	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	226706	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	110636	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	45617544	45618196	45618069	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	13014	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	45618389	45618809	45618683	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	13859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	45631125	45631239	45631172	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	26595	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45645081	45645275	45645187	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	40551	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45648299	45648762	45648585	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43769	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45663739	45663972	45663886	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	44948	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	45666059	45666529	45666404	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42391	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	46120012	46120235	46120091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	64845	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	46125056	46125409	46125233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	59671	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	46487332	46487848	46487692	Y	RP2,ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	56113	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	46569898	46570252	46570035	Y	SLC9A7	SLC9A7	NA	NA	NA	NA	SLC9A7	46238	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	ARAF	35371	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	48348956	48349364	48349102	Y	PORCN,PORCN,FTSJ1	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	15986	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.612372134470484
chrX	48350817	48351213	48350906	Y	WAS,RBM3,PORCN,OTUD5	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	14137	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	48571549	48571765	48571661	Y	NA	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19604	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	53467183	53467489	53467297	Y	FAM156A,TSPYL2,IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	7863	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	64821176	64821755	64821551	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	14919	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	69386644	69386665	69386655	Y	NA	IGBP1	NA	NA	NA	NA	IGBP1	35345	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	70842464	70842816	70842607	Y	TAF1,OGT,CXCR3	NA	NA	NA	NA	NA	OGT	91531	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53104	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	75368142	75368530	75368366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	403393	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.5248904009747
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	99900251	99900361	99900308	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	3036	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	106985108	106985412	106985307	Y	TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	33160	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	107070299	107070693	107070500	Y	MID2	MID2	NA	NA	NA	NA	MID2	3314	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	107639720	107640073	107639886	Y	COL4A6	COL4A5	NA	NA	NA	NA	COL4A5	41001	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	113028207	113028379	113028299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSU72P1	594748	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	117487110	117487426	117487273	Y	DOCK11,WDR44	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	9074	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	4.02415974080604
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	120799323	120799330	120799327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	1037318	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.962299068453617
chrX	129121612	129121744	129121653	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	8529	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1	NA	NA	NA	NA	AIFM1	9468	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	129966535	129966828	129966682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	68380	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	130013053	130013179	130013116	Y	NA	ENOX2	NA	NA	NA	NA	ENOX2	22029	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	132772417	132772559	132772488	Y	NA	RP3-417G15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-417G15.1	30440	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	PHF6	199118	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	133646648	133646903	133646776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPRT1	54465	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	134048475	134048529	134048502	Y	MOSPD1	MOSPD1	NA	NA	NA	NA	MOSPD1	1178	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	147597431	147597520	147597476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U40455.1	319033	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.0497808019494
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	149865562	149865927	149865671	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	6127	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	1.39970773593253
chrX	152064300	152064566	152064432	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	66789	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.437408667478917
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.787335601462051
chrX	153084450	153084610	153084498	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	9410	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	L1CAM,ARHGAP4,NAA10	NA	NA	NA	NA	L1CAM	5827	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chrX	153389356	153389701	153389458	Y	ARHGAP4,RENBP,IKBKG,IKBKG,IKBKG,MECP2	MECP2	TKTL1,MECP2,NAA10,RENBP,HCFC1,FLNA,RPL10,DNASE1L1	IMR90,MCF7,HELA,K562,GM12878	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	MECP2	28144	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.349926933983134
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	153829365	153829583	153829391	Y	NA	AF277315.19	NA	NA	NA	NA	AF277315.19	2528	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.174963466991567
chrX	153956289	153956510	153956418	Y	TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3	GAB3,DKC1	NA	NA	NA	NA	GAB3	21348	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrY	2872046	2872325	2872195	Y	RPS4Y1,ZFY,ZFY	NA	NA	NA	NA	NA	ZFY	70934	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrY	7637940	7638259	7638201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKY	497927	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.874817334957834
chrY	14775457	14775545	14775476	Y	NA	TTTY15	NA	NA	NA	NA	TTTY15	3192	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.26244520048735
chrY	15507754	15507810	15507782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	82743	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrY	15547664	15548123	15547956	Y	TMSB4Y	UTY	NA	NA	NA	NA	UTY	42430	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrY	17567835	17568213	17567863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	818859	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrY	18611855	18612137	18611996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	1862879	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834
chrY	21046816	21047207	21047093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTY14	190095	CAGE	HuCCT1	hg19	FANTOM5	0.0874817334957834